JP7348185B2 - キラル富化二本鎖rna剤 - Google Patents
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Description
5’nP-Na-(XXX)i-Nb-YYY-Nb-(ZZZ)j-Na-nq3’ (I)
によって表され、
式中:
i及びjはそれぞれ独立に、0又は1であり;
pとqはそれぞれ独立に、0~6であり;
各Naは独立に、0~25の修飾ヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド配列を表し、各配列は、少なくとも2つの異なる修飾ヌクレオチドを含み;
各Nbは独立に、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、又は6つの修飾ヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド配列を表し;
各np及びnqは独立に、オーバーハングヌクレオチドを表し;
Nb及びYは、同じ修飾を有しておらず;
XXX、YYY、及びZZZはそれぞれ独立に、3つの連続するヌクレオチド上に3つの同一の修飾の1つのモチーフを表す。
(a)(i)18~23ヌクレオチド長;
(ii)7~15位の3つの連続する2’-F修飾を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)18~23ヌクレオチド長;
(ii)鎖のどこかの少なくとも2’-F修飾;及び
(iii)(5’末端から数えて)最初の5つのヌクレオチドにおける少なくとも2つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、をさらに含み;
キラル修飾dsRNA剤は、少なくとも1つの鎖の1つ又は複数の位置に結合された1つ又は複数の親油性部分を有し、且つ
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有するか、又は二重鎖の両末端に2つの平滑末端を有する。
(a)(i)18~23ヌクレオチド長;
(ii)4つ未満の2’-F修飾を有するセンス鎖;
(b)(i)18~23ヌクレオチド長;
(ii)12未満の2’-F修飾;及び
(iii)(5’末端から数えて)最初の5つのヌクレオチドにおける少なくとも2つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、をさらに含み;
キラル修飾dsRNA剤は、少なくとも1つの鎖の1つ又は複数の位置に結合された1つ又は複数の親油性部分を有し、且つ
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有するか、又は二重鎖の両末端に2つの平滑末端を有する。
(a)(i)19~35ヌクレオチド長;
(ii)4つ未満の2’-F修飾を有するセンス鎖;
(b)(i)19~35ヌクレオチド長;
(ii)12未満の2’-F修飾;及び
(iii)(5’末端から数えて)最初の5つのヌクレオチドにおける少なくとも2つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、をさらに含み;
二重鎖領域は、19~25(好ましくは、19、20、21、又は22)塩基対である;
キラル修飾dsRNA剤は、少なくとも1つの鎖の1つ又は複数の位置に結合された1つ又は複数の親油性部分を有し、且つ
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有するか、又は二重鎖の両末端に2つの平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)(5’末端から数えて)3位、5位、7位、9~11位、13位、17位、19位、及び21位の2’-F修飾、及び2位、4位、6位、8位、12位、14~16位、18位、及び20位の2’-OMe修飾、及び1位の2’-F又は2’-OMeのいずれかでの修飾;及び
(iv)Rp配置又はSp配置のいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)23ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、3位、5位、9位、11~13位、15位、17位、19位、21位、及び23位の2’-OMe修飾、及び2位、4位、6~8位、10位、14位、16位、18位、20位、及び22位の2’F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)(5’末端から数えて)3位、5位、7位、9~11位、13位、15位、17位、19位、及び21位の2’-F修飾、及び2位、4位、6位、8位、12位、14位、16位、18位、及び20位の2’-OMe修飾、及び1位の2’-F又は2’-OMeのいずれかでの修飾;及び
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)23ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、3位、5位、7位、9位、11~13位、15位、17位、19位、及び21~23位の2’-OMe修飾、及び2位、4位、6位、8位、10位、14位、16位、18位、及び20位の2’F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)(5’末端から数えて)1~6位、8位、10位、及び12~21位の2’-OMe修飾、7位及び9位の2’-F修飾、及び11位のデオキシヌクレオチド(例えば、dT);及び
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)23ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、3位、7位、9位、11位、13位、15位、17位、及び19~23位の2’-OMe修飾、及び2位、4~6位、8位、10位、12位、14位、16位、及び18位の2’-F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)1~6位、8位、10位、12位、14位、及び16~21位の2’-OMe修飾、及び7位、9位、11位、13位、及び15位の2’-F修飾;及び
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)23ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、5位、7位、9位、11位、13位、15位、17位、19位、及び21~23位の2’-OMe修飾、及び2~4位、6位、8位、10位、12位、14位、16位、18位、及び20位の2’-F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)1~9位及び12~21位の2’-OMe修飾、及び10位及び11位の2’-F修飾:
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)23ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、3位、5位、7位、9位、11~13位、15位、17位、19位、及び21~23位の2’-OMe修飾、及び2位、4位、6位、8位、10位、14位、16位、18位、及び20位の2’-F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)3位、5位、7位、9~11位、及び13位の2’-F修飾、及び2位、4位、6位、8位、12位、及び14~21位の2’-OMe修飾、及び1位の2’-F又は2’-OMeのいずれかでの修飾;及び
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)23ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、3位、5~7位、9位、11~13位、15位、17~19位、及び21~23位の2’-OMe修飾、及び2位、4位、8位、10位、14位、16位、及び20位の2’-F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)1位、2位、4位、6位、8位、12位、14位、15位、17位、及び19~21位の2’-OMe修飾、及び3位、5位、7位、9~11位、13位、16位、及び18位の2’-F修飾;及び
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)25ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、4位、6位、7位、9位、11~13位、15位、17位、及び19~23位の2’-OMe修飾、2位、3位、5位、8位、10位、14位、16位、及び18位の2’-F修飾、及び24位及び25位のデオキシヌクレオチド(例えば、dT);並びに
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に4ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)1~6位、8位、12~21位の2’-OMe修飾、及び7位及び9~11位の2’-F修飾;及び
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)23ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、3~5位、7位、8位、10~13位、15位、及び17~23位の2’-OMe修飾、及び2位、6位、9位、14位、及び16位の2’-F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)1~6位、8位、及び12~21位の2’-OMe修飾、及び7位及び9~11位の2’-F修飾;及び
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)23ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、3~5位、7位、10~13位、15位、及び17~23位の2’-OMe修飾、及び2位、6位、8位、9位、14位、及び16位の2’-F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含み;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
(a)(i)19ヌクレオチド長;
(ii)3価分岐リンカーを介して付着した3つのGalNAc誘導体を含む、3’末端に付着したASGPRリガンド;
(iii)1~4位、6位、及び10~19位の2’-OMe修飾、及び5位及び7~9位の2’-F修飾;及び
(iv)Rp配置又はSp配置又はラセミのいずれかにある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するセンス鎖;並びに
(b)(i)21ヌクレオチド長;
(ii)(5’末端から数えて)1位、3~5位、7位、10~13位、15位、及び17~21位の2’-OMe修飾、及び2位、6位、8位、9位、14位、及び16位の2’-F修飾;及び
(iii)Rp配置にある結合リン原子を有する、5’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合、及びSp配置にある結合リン原子を有する、3’末端の1番目のヌクレオチド間結合におけるホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有するアンチセンス鎖、を含む;
キラル修飾dsRNA剤は、アンチセンス鎖の3’末端に2ヌクレオチドのオーバーハング、及びアンチセンス鎖の5’末端に平滑末端を有する。
1.低いGC含量、好ましくは約30~52%。
2.アンチセンス鎖上のdsRNAの15~19位にある少なくとも2つ、好ましくは少なくとも3つのA又はU塩基。
3.センス鎖の19位のA塩基。
4.センス鎖の3位のA塩基。
5.センス鎖の10位のU塩基。
6.センス鎖の14位のA塩基。
7.センス鎖の19位のC以外の塩基。
8.センス鎖の13位のG以外の塩基。
9.Tmは、50℃超、37℃超、30℃超、又は20℃超で不安定であり得る、dsRNA二重鎖の一方の鎖の分子間又は分子内構造をもたらす内部反復の特性を指す。
10.センス鎖の5位のU以外の塩基。
11.センス鎖の11位のA以外の塩基。
多種多様な物質が、本発明のオリゴヌクレオチドに結合することができる。好ましい部分は、直接的に又は介在テザーを介して間接的に、好ましくは共有結合で結合されるリガンドである。
q2A、q2B、q3A、q3B、q4A、q4B、q5A、q5B、及びq5Cは存在ごとに独立して、0~20を表し、反復単位は、同じであっても良いし、又は異なっていても良く;
P2A、P2B、P3A、P3B、P4A、P4B、P5A、P5B、P5C、T2A、T2B、T3A、T3B、T4A、T4B、T5A、T5B、T5Cはそれぞれ存在ごとに独立して、存在しないか、CO、NH、O、S、OC(O)、NHC(O)、CH2、CH2NH、又はCH2Oを表し;
Q2A、Q2B、Q3A、Q3B、Q4A、Q4B、Q5A、Q5B、Q5Cは存在ごとに独立して、存在しないか、アルキレン、置換アルキレンを表し、1つ以上のメチレンは、O、S、S(O)、SO2、N(RN)、C(R’)=C(R’’)、C≡C、又はC(O)の1つ以上によって中断又は終了させることができ;
R2A、R2B、R3A、R3B、R4A、R4B、R5A、R5B、R5Cはそれぞれ存在ごとに独立して、NH、O、S、CH2、C(O)O、C(O)NH、NHCH(Ra)C(O)、-C(O)-CH(Ra)-NH-、CO、CH=N-O、
L2A、L2B、L3A、L3B、L4A、L4B、L5A、L5B、及びL5Cは、リガンドを表す;即ち、それぞれ存在ごとに独立して、単糖(例えば、GalNAc)、二糖、三糖、四糖、オリゴ糖、又は多糖を表し;且つ
Raは、H又はアミノ酸側鎖である。
本明細書で使用される「dsRNA剤」、「siRNA」、及び「iRNA剤」は、標的RNA、例えば、mRNA、例えば、タンパク質をコードする遺伝子の転写物のサイレンシングを媒介することができる作用剤と互換的に使用される。便宜上、このようなmRNAは、本明細書ではサイレンシングされるmRNAとも呼ばれる。このような遺伝子は、標的遺伝子とも呼ばれる。一般に、サイレンシングされるRNAは、内在性遺伝子又は病原遺伝子である。加えて、mRNA以外のRNA、例えば、tRNA、及びウイルスRNAも標的とすることができる。
切断可能連結基は、細胞外で十分安定しているが、標的細胞に入ると切断されてリンカーが一緒に保持する2つの部分を放出する、連結基である。好ましい実施形態では、切断可能連結基は、対象の血液中又は第2の基準条件下(例えば、血液又は血清に存在する条件を模倣又は実現するように選択することができる)よりも、標的細胞内又は第1の基準条件下(例えば、細胞内の条件を模倣又は実現するように選択することができる)において、少なくとも10倍以上、好ましくは、少なくとも100倍速く切断する。
切断可能連結基の1つのクラスは、キラル修飾dsRNA剤に使用することができ、還元又は酸化時に切断される酸化還元性切断可能連結基である。還元的に切断可能な連結基の一例として、ジスルフィド連結基(-S-S-)が挙げられる。候補の切断可能連結基が適切な「還元的に切断可能な連結基」であるか否か、又は、例えば、特定のiRNA部分及び特定の標的作用剤と共に使用するのに適しているか否かを決定するために、本明細書に記載される方法を確認することができる。例えば、候補は、細胞、例えば、標的細胞で観察され得る切断速度を模倣する当分野で公知の試薬を使用してジチオスレイトール(DTT)又はた他の還元剤と共にインキュベートすることによって評価することができる。候補はまた、血液又は血清条件を模倣するために選択される条件下でも評価することができる。好ましい一実施形態では、候補化合物は、血中では最大で10%切断する。好ましい実施形態では、有用な候補化合物は、血液(又は細胞外の条件を模倣するように選択されるin vitroでの条件下)と比較して、細胞内(又は細胞内の条件を模倣するように選択されるin vitroでの条件下)では少なくとも2倍、4倍、10倍、又は100倍速く分解される。候補化合物の切断速度は、細胞内培地を模倣するように選択される条件下で標準的な酵素反応速度アッセイを使用して決定して、細胞外培地を模倣するように選択される条件と比較することができる。
リン酸系切断可能連結基は、キラル修飾dsRNA剤に使用することができ、リン酸基を分解又は加水分解する作用剤によって切断される。細胞内のリン酸基を切断する作用剤の一例として、細胞内の酵素、例えば、ホスファターゼが挙げられる。リン酸塩系の連結基の例としては、-O-P(O)(ORk)-O-、-O-P(S)(ORk)-O-、-O-P(S)(SRk)-O-、-S-P(O)(ORk)-O-、-O-P(O)(ORk)-S-、-S-P(O)(ORk)-S-、-O-P(S)(ORk)-S-、-S-P(S)(ORk)-O-、-O-P(O)(Rk)-O-、-O-P(S)(Rk)-O-、-S-P(O)(Rk)-O-、-S-P(S)(Rk)-O-、-S-P(O)(Rk)-S-、-O-P(S)(Rk)-S-が挙げられる。好ましい実施形態は、-O-P(O)(OH)-O-、-O-P(S)(OH)-O-、-O-P(S)(SH)-O-、-S-P(O)(OH)-O-、-O-P(O)(OH)-S-、-S-P(O)(OH)-S-、-O-P(S)(OH)-S-、-S-P(S)(OH)-O-、-O-P(O)(H)-O-、-O-P(S)(H)-O-、-S-P(O)(H)-O-、-S-P(S)(H)-O-、-S-P(O)(H)-S-、-O-P(S)(H)-S-である。好ましい実施形態は、-O-P(O)(OH)-O-である。これらの候補は、上記の方法と類似した方法を使用して評価することができる。
酸性切断可能連結基は、キラル修飾dsRNA剤に使用することができ、酸性条件下で切断される連結基である。好ましい実施形態では、酸性切断可能連結基は、約6.5以下(例えば、約6.0、5.5、5.0、又はそれ以下)のpHの酸性環境において、又は一般酸として機能し得る作用剤、例えば、酵素剤によって切断する。細胞において、特定のpHの低い細胞小器官、例えば、エンドソーム及びリソソームは、酸性切断可能連結基に切断環境を提供することができる。酸性切断可能連結基の例としては、限定されるものではないが、ヒドラゾン、エステル、及びアミノ酸エステルが挙げられる。酸性切断可能な基は、一般式:-C=NN-、C(O)O、又は-OC(O)を有し得る。好ましい一実施形態は、エステル(アルコキシ基)の酵素に結合した炭素が、アリール基、置換アルキル基、又は第3級アルキル基、例えば、ジメチルペンチル若しくはt-ブチルである場合である。これらの候補は、上記の方法と類似した方法を使用して評価することができる。
エステル系切断可能連結基は、キラル修飾dsRNA剤に使用することができ、細胞内の酵素、例えば、エステラーゼ及びアミダーゼによって切断される。エステル系切断可能連結基の例としては、限定されるものではないが、アルキレン基、アルケニレン基、及びアルキニレン基のエステルが挙げられる。エステル系切断可能連結基は、一般式:-C(O)O-又は-OC(O)-を有する。これらの候補は、上記の方法と類似した方法を用いて評価することができる。
ペプチド系切断可能連結基は、キラル修飾dsRNA剤に使用することができ、細胞内の酵素、例えば、ペプチダーゼ及びプロテアーゼによって切断される。ペプチド系切断可能連結基は、オリゴペプチド(例えば、ジペプチド、トリペプチドなど)及びポリペプチドが生じる、アミノ酸間に形成されるペプチド結合である。ペプチド系切断可能連結基は、アミド基(-C(O)NH-)を含まない。アミド基は、任意のアルキレン、アルケニレン、又はアルキニレン間で形成され得る。ペプチド結合は、ペプチド及びタンパク質が生成するアミノ酸間に形成されるアミド結合の特別な種類である。ペプチド系切断基は、一般に、ペプチド及びタンパク質が生じる、アミノ酸間に形成されるペプチド結合(即ち、アミド結合)に限定され、アミド官能基全体を含むものではない。ペプチド系切断可能連結基は、一般式:-NHCHRAC(O)NHCHRBC(O)-を有し、RA及びRBは、2つの隣接するアミノ酸のR基である。これらの候補は、上記の方法と類似した方法を使用して評価することができる。本明細書で使用される「糖質」は、それぞれの炭素原子に酸素原子、窒素原子、若しくは硫黄原子が結合した少なくとも6つの炭素原子(直鎖、分岐鎖、若しくは環状でも良い)を有する1つ以上の単糖単位から形成される糖質自体;又は、それぞれの炭素原子に酸素原子、窒素原子、若しくは硫黄原子が結合した少なくとも6つの炭素原子(直鎖、分岐鎖、若しくは環状でも良い)をそれぞれ有する1つ以上の単糖単位から形成される糖質部分をその一部として有する化合物を指す。
キラル修飾dsRNA剤は、医薬用途のために製剤することができる。本発明はさらに、本明細書で定義されるキラル修飾dsRNA剤を含む医薬組成物に関する。薬学的に許容され得る組成物は、単独で、或いは1種以上の薬学的に許容され得る担体(添加剤)、賦形剤、及び/又は希釈剤と共に製剤される、前述の実施形態の何れかの1種以上のキラル修飾dsRNA剤を治療有効量、含む。
本明細書で定義されるキラル修飾dsRNA剤又は本明細書で定義されるキラル修飾dsRNA剤を含む医薬組成物は、異なる送達経路を使用して対象に投与することができる。iRNAを含む組成物は、様々な経路によって対象に送達することができる。例示的な経路には、静脈内、筋肉内、くも膜下腔内、腹腔内、脳室内、皮下、局所、直腸、肛門、膣、鼻腔、肺、眼、及び経皮;並びに静脈内注射、筋肉内注射、髄腔内注射、皮下注射、及び眼注射が含まれる。本発明のiRNA分子及び/又はキラル修飾dsRNA剤は、投与に適した医薬組成物に含めることができる。そのような組成物は、典型的には、1種又は複数種のiRNA及び薬学的に許容される担体を含む。本明細書で使用される「薬学的に許容される担体」という語は、医薬投与に適合する、ありとあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤及び抗真菌剤、等張剤、及び吸収遅延剤などを含むものとする。薬学的に活性な物質のためのそのような媒体及び薬剤の使用は、当技術分野で周知である。従来の媒体又は薬剤が活性化合物と適合しない場合を除いて、組成物でのそれらの使用が企図される。補助的な活性化合物もまた、組成物に含めることができる。
一態様では、本発明は、本明細書で定義されるキラル修飾dsRNA剤、例えば、siRNA剤を対象(例えば、ヒト対象)に投与する方法を取り上げる。別の態様では、本発明は、対象における標的遺伝子の発現の阻害に使用される、本明細書で定義されるキラル修飾dsRNA剤に関する。この方法又は医療での使用は、(a)二本鎖部分が、14~40ヌクレオチド長、例えば、21~23ヌクレオチド長である、(b)標的RNA(例えば、外来性又は病原体標的RNA)に対して相補的である、且つ、任意選択により、(c)少なくとも1つの1~5ヌクレオチド長の3’オーバーハングを含む、キラル修飾dsRNA剤、例えば、siRNA剤、例えば、二本鎖siRNA剤の単位用量を投与するステップを含む。一実施形態では、単位用量は、体重1kg当たり10mg未満、又は体重1kg当たり10mg未満、5mg未満、2mg未満、1mg未満、0.5mg未満、0.1mg未満、0.05mg未満、0.01mg未満、0.005mg未満、0.001mg未満、0.0005mg未満、0.0001mg未満、0.00005mg未満、又は0.00001mg未満であり、且つ体重1kg当たり200nmol未満のRNA剤(例えば、約4.4×1016のコピー)、又は体重1kg当たり1500nmol未満、750nmol未満、300nmol未満、150nmol未満、75nmol未満、15nmol未満、7.5nmol未満、1.5nmol未満、0.75nmol未満、0.15nmol未満、0.075nmol未満、0.015nmol未満、0.0075nmol未満、0.0015nmol未満、0.00075nmol未満、0.00015nmol未満のRNA剤である。
本発明の実施形態は、標的遺伝子の発現を阻害する方法にも関する。この方法は、標的遺伝子の発現を阻害するのに十分な量の、前述の任意の実施形態におけるキラル修飾dsRNA剤を投与するステップを含む。本発明はさらに、標的細胞における標的遺伝子の発現を阻害するための、本明細書で定義されるキラル修飾dsRNA剤の使用に関する。好ましい一実施形態では、本発明はさらに、in vitroでの標的細胞における標的遺伝子の発現を阻害するためのキラル修飾dsRNA剤の使用に関する。
ヌクレアーゼ活性からsiRNAを保護する効果的な方法は、それらのホスホジエステル結合を、リン(Rp/Sp中心)においてキラルであるホスホロチオエート(PS)と交換することである。この実施例は、キラル的に純粋なヌクレオチド間ホスホロチオエート結合をsiRNA剤に導入する効率的な方法を実証し、結果として得られるキラル的に純粋な末端PS修飾siRNAが、in vivoでの薬理学的特性を維持又は改善すると共に、PS結合の数を減少させた。
様々なプロトコルを使用して、キラル的に純粋なPS結合をオリゴヌクレオチドに生じさせることができる:例えば、H-ホスホネート法、オリゴヌクレオチドレベルでのPSジアステレオ異性体の分離、ホスホラミダイト法のキラル純粋ジヌクレオチドビルディングブロック、又はオキサザホスホリジンアプローチ。
siRNAの末端位置(すなわち、センス鎖の5’-1PS、アンチセンス鎖の5’-1PS及び3’-1PS)における異なるジアステレオ異性体の生物学的影響を評価するために、8つのキラル的に純粋なsiRNA異性体及びそれらのエピマー混合物(表3に示されているsi1~si18)を、初代マウス肝細胞でのin vitro自由取り込み実験で試験した。すべてのsiRNAを、標的mRNA発現の阻害について段階的濃度で試験し、それらのIC50値を図3に示す。エピマー3PS混合物(mrTTRのsi1及びC5のsi2)はそれぞれ、0.38nM及び0.82nMのIC50値で強いノックダウンを示した。両方の標的において、2つのキラル的に純粋な3PS化合物、R/R-S(si5/si6)、及びS/R-S(si13/si14)は、エピマー3PS混合物と比較して有意に高い活性をもたらした。1つのキラルPS中心が変更された8つのキラル的に純粋なsiRNA異性体の直接比較(例えば、R/R-R対R/S-R)では、5’-1PSアンチセンス鎖にRpジアステレオマーを有するsiRNAが、すべてのケースでより高いin vitro活性をもたらした(mrTTRの場合は、si3、si5、si11、si13>si7、si9、si15、si17;C5の場合は、si4、si6、si12、si14>si8、si10、si16、si18)。他方、3’-1PSアンチセンス鎖のSpジアステレオマーは活性を改善した(mrTTRの場合は、si3、si7、si11、si15<si5、si9、si13、si17;C5場合は、si4<si6、si8<si10、si12<si14、si16<si18)。5’-1PSセンス鎖のRpジアステレオマーは、R/S-SからS/S-S(si9、si10>si17、si18)化合物を除いて、活性を改善した。
観察されたin vitro活性及びAgoローディング活性がin vivo活性に変換されることになるかどうかを理解するために、各化合物をWTマウスでスクリーニングして、キラル的に純粋な3PS修飾3’-GalNAcコンジュゲートsiRNAの有効性/持続時間に対する影響を決定し、そして6PSエピマー混合物siRNAと比較した。動物に各siTTR化合物を、6PS親ED80、2mg/kgで単回皮下投与した。循環マウスTTRタンパク質レベルを、投与の4日後、7日後、14日後、21日後、及び28日後に測定し、各サンプルを、その特定の動物の個々の投与前に対して正規化した。図7に示すように、6PS修飾エピマー混合物対照は、約85%のノックダウンを達成し、3PS修飾エピマー混合物は、4日目、7日目、及び14日目にノックダウンの減少(約70~60%)と合わせて、21/28日目にTTRレベルの迅速な回復を示し、動物がベースラインに戻った。3PS修飾エピマー混合物のin vivo活性の低下は、安定性に影響を与えるPS含量の減少に寄与し得る(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Zlatev et al.,“5’-C-Malonyl RNA:Small Interfering RNAs Modified with 5’-Monophosphate Bioisostere Demonstrate Gene Silencing Activity,”ACS Chemical Biology 11(4):953-960(2016)を参照)。5’末端アンチセンスSp立体異性体、si7/si9/si15/si17(表2)を有する化合物は、活性の大幅な低下を示し、これは5’エキソヌクレアーゼのSp PSジアステレオマー感受性に関連していた(PDIIによる分解を伴うジヌクレオチドモデルに示されている)。in vitroデータと一致して、ジアステレオマーsi5(R/R-S)及びsi13(S/R-S)は、他のジアステレオマーと比較して優れたin vivo活性を示し、それぞれは、エピマー6PS修飾混合物に匹敵する有効性を示したが、3PS修飾エピマー混合物よりも有効性が大幅に向上していた。
3つのキラル修飾ホスホロチオエート結合(3PS)を有するキラル的に純粋なdsRNA剤は、合成アプローチ1(キラルPSオリゴヌクレオチドアプローチのDMT-オン精製)及び/又はアプローチ2及び/又はアプローチ3を使用して合成した。
3a 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.17(s,2H),7.65(d,J=8.2Hz,1H),7.59(d,J=8.2Hz,1H),7.46(d,J=7.4Hz,2H),7.40-7.27(m,8H),6.92(d,J=8.8Hz,4H),5.94(d,J=4.8Hz,1H),5.85(d,J=3.4Hz,1H),5.66(d,J=8.1Hz,1H),5.35(d,J=8.1Hz,1H),5.25-5.16(m,1H),4.51-4.40(m,1H),4.36-4.10(m,7H),3.80(s,6H),3.48(s,3H),3.46(s,3H),3.45-3.43(m,2H),2.75-2.70(m,2H),0.93(s,9H),0.14(s,6H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 163.95,163.75,159.91,151.37,151.34,145.52,141.03,140.88,136.38,136.24,131.22,131.21,130.46,129.46,129.18,129.07,128.18,121.08,114.29,114.28,103.23,102.99,89.11,88.03,87.83,83.63,82.95,82.87,82.71,82.65,82.31,82.28,76.06,76.03,70.88,68.10,68.05,64.32,64.29,62.99,59.23,58.87,56.04,26.15,20.16,20.09,18.75,15.39,-4.36,-4.62.31P NMR(162MHz,CD3CN)δ 68.77. C50H62N5O15PSSi(M+Na)の分子量:計算値1086.3368、実測値1086.3392。
3b 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.09(s,2H),7.67(d,J=8.2Hz,1H),7.49(dd,J=21.3,7.8Hz,3H),7.34(d,J=8.9Hz,8H),7.06(d,J=7.7Hz,1H),6.91(d,J=8.9Hz,4H),5.93(d,J=4.7Hz,1H),5.81(d,J=3.2Hz,1H),5.64(d,J=8.1Hz,1H),5.33(d,J=8.1Hz,1H),5.26-5.17(m,1H),4.33-4.20(m,6H),4.13-4.09(m,1H),4.07-4.03(m,1H),3.80(s,6H),3.52(s,3H),3.45(s,3H),3.43(d,J=3.0Hz,2H),2.84(t,J=5.8Hz,2H),0.92(s,9H),0.12(s,6H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 163.89,163.73,159.90,159.89,151.37,151.28,145.59,141.00,140.92,138.31,136.33,136.20,131.25,131.23,129.15,129.05,128.14,121.34,114.26,114.26,103.17,102.98,89.20,88.01,87.95,83.59,82.78,82.71,82.67,82.62,82.43,82.40,75.97,75.93,70.66,67.77,67.72,64.57,64.54,62.87,59.28,58.83,56.02,26.16,20.22,20.15,18.74,15.39,-4.34,-4.61.31P NMR(162MHz,CD3CN)δ 69.27.C50H62N5O15PSSi(M+Na)の分子量:計算値1086.3368、実測値1086.3392。
4a 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.45(d,J=1.9Hz,1H),11.38(d,J=1.9Hz,1H),7.66(d,J=8.1Hz,1H),7.59(d,J=8.1Hz,1H),7.37(d,J=7.5Hz,2H),7.32(t,J=7.7Hz,2H),7.25(d,J=8.8Hz,5H),6.90(d,J=7.9Hz,4H),5.85(d,J=5.4Hz,1H),5.82(d,J=4.8Hz,1H),5.62(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),5.43-5.37(m,2H),5.14-5.08(m,1H),4.31(ddd,J=10.3,6.8,3.1Hz,1H),4.27-4.22(m,1H),4.22-4.17(m,2H),4.17-4.01(m,4H),3.73(s,6H),3.38(s,3H),3.35(s,3H),3.33-3.28(m,3H),2.88-2.81(m,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 162.88,162.77,158.17,150.32,150.29,144.25,140.17,140.13,135.05,134.85,129.75,127.91,127.72,126.87,120.00,117.95,113.26,102.15,102.14,102.12,102.09,86.82,86.79,86.41,86.24,81.82,81.75,81.59,81.16,81.13,79.90,74.99,74.97,74.95,68.39,67.74,67.69,63.04,63.00,62.21,58.02,57.63,55.04,55.03,18.79,18.72.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 67.74.C44H48N5O15PS(M+Na)の分子量:計算値972.2503、実測値972.2500。
4b 1H NMR(400MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.09(s,2H),7.63(d,J=8.1Hz,1H),7.49-7.41(m,3H),7.37-7.21(m,7H),6.92-6.83(m,4H),5.90(d,J=4.7Hz,1H),5.78(d,J=3.3Hz,1H),5.60(d,J=8.1Hz,1H),5.32(d,J=8.1Hz,1H),5.23-5.13(m,1H),4.32-4.18(m,5H),4.15-4.05(m,2H),4.03-3.94(m,1H),3.77(s,7H),3.49(s,3H),3.46(s,3H),3.40(d,J=3.2Hz,2H),3.32(d,J=7.2Hz,1H),2.85-2.77(m,2H).13C NMR(101MHz,CD3CN)δ 163.89,163.78,159.90,151.40,151.30,145.63,141.06,140.97,136.35,136.26,131.26,131.23,129.16,129.07,128.15,118.68,114.28,103.19,103.04,88.95,87.99,83.60,82.83,82.74,82.68,82.61,82.42,82.38,75.92,75.88,69.70,68.32,68.27,64.55,64.51,62.90,59.28,59.09,56.03,20.21,20.12.31P NMR(162MHz,CD3CN)δ 69.20.C44H48N5O15PS(M+Na)の分子量:計算値972.2503、実測値972.2500。
5a 1H NMR 58(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.30(s,1H),7.67-7.62(m,1H),7.57(d,J=8.2Hz,1H),7.47-7.42(m,2H),7.37-7.30(m,6H),7.29-7.24(m,1H),6.90(d,J=8.8Hz,4H),5.92(d,J=4.7Hz,1H),5.88(dd,J=7.4,4.3Hz,1H),5.67-5.62(m,1H),5.37-5.30(m,1H),5.22-5.14(m,1H),4.49-4.36(m,1H),4.35-4.23(m,4H),4.22-4.14(m,1H),4.12-4.07(m,2H),3.95-3.91(m,1H),3.91-3.83(m,1H),3.81-3.75(m,7H),3.70-3.61(m,2H),3.49-3.46(m,5H),3.45-3.41(m,3H),2.74-2.64(m,4H),1.22-1.15(m,12H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 164.64,164.59,164.50,160.46,152.03,151.97,146.07,146.06,141.60,141.57,141.48,136.94,136.92,136.78,131.77,129.74,129.62,128.74,120.30,120.24,114.85,103.79,103.69,89.82,89.79,89.24,89.21,88.59,88.41,88.38,83.73,83.29,83.25,83.21,83.20,83.16,83.14,82.87,82.69,82.62,82.58,76.55,76.52,76.49,72.39,72.28,71.80,71.66,69.07,69.01,68.65,64.88,64.85,63.45,60.47,60.32,59.91,59.81,59.67,59.66,59.65,59.41,56.63,56.61,56.60,56.58,44.87,44.82,44.81,44.77,44.76,44.72,44.71,25.72,25.66,25.57,25.51,25.46,21.71,21.65,21.63,21.57,20.71,20.64.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 151.97,151.56,68.52.C53H65N7O16P2S(M+H)の分子量:計算値1150.3762、実測値1150.3782。
5b 1H NMR 61(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.09(s,2H),7.65(d,J=8.2Hz,1H),7.51-7.43(m,3H),7.37-7.30(m,6H),7.29-7.24(m,1H),6.89(d,J=7.7Hz,4H),5.92(t,J=4.8Hz,1H),5.83(dd,J=7.7,4.0Hz,1H),5.64-5.60(m,1H),5.34-5.30(m,1H),5.24-5.17(m,1H),4.42-4.15(m,8H),3.94-3.81(m,2H),3.78(s,6H),3.72-3.61(m,2H),3.50(d,J=3.0Hz,3H),3.47(s,2H),3.45-3.40(m,4H),2.86-2.79(m,2H),2.71-2.63(m,2H),1.21-1.15(m,12H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 163.87,163.82,163.76,159.91,151.40,151.37,151.32,145.60,145.59,140.96,140.92,136.34,136.20,131.25,131.23,129.15,129.06,128.15,114.28,103.25,103.19,103.13,89.41,88.80,88.04,88.03,87.91,87.89,83.20,83.18,82.70,82.41,81.95,81.88,81.83,76.03,75.99,71.54,71.42,71.06,70.92,68.15,68.11,67.79,67.75,64.58,64.54,62.94,62.91,59.88,59.73,59.36,59.30,59.21,59.13,59.11,58.86,58.84,56.03,44.28,44.25,44.18,44.15,25.17,25.11,25.09,25.03,24.99,24.96,24.93,24.91,21.15,21.08,21.03,20.22,20.15.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 151.68,151.44,68.80,68.77.C53H65N7O16P2S(M+H)の分子量:計算値1150.3762、実測値1150.3765。
6a 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 7.87(d,J=8.2Hz,1H),7.61(d,J=8.1Hz,1H),5.91(d,J=7.1Hz,1H),5.84(d,J=5.0Hz,1H),5.73-5.69(m,1H),5.65(d,J=8.1Hz,1H),5.06(ddd,J=10.4,4.7,1.8Hz,1H),4.34-4.28(m,1H),4.27-4.00(m,8H),3.82(t,J=5.1Hz,1H),3.64-3.57(m,2H),3.34(s,3H),3.33(s,3H),2.94(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.02,162.94,150.65,150.43,140.35,140.23,118.34,102.75,102.30,86.88,85.25,83.81,83.78,82.02,81.95,81.67,80.54,80.50,76.38,76.34,68.39,67.82,67.77,63.32,63.29,60.59,58.15,57.77,57.55,54.96,18.97,18.90.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.76.C23H30N5O13PS(M+H)の分子量:計算値648.1377、実測値648.1375。
6b 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.42(d,J=2.0Hz,1H),11.38(d,J=1.8Hz,1H),7.87(d,J=8.2Hz,1H),7.61(d,J=8.1Hz,1H),5.91(d,J=6.9Hz,1H),5.83(d,J=4.7Hz,1H),5.71(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),5.64(dd,J=8.1,2.2Hz,1H),5.42-5.36(m,2H),5.06(ddd,J=10.6,4.8,2.1Hz,1H),4.32-4.08(m,7H),4.05-4.00(m,1H),3.82(t,J=5.0Hz,1H),3.60(s,2H),3.36(s,6H),2.96(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 162.92,162.85,150.57,150.35,140.25,140.07,118.16,102.58,102.13,86.90,85.24,83.69,83.65,81.79,81.72,81.57,80.42,80.38,76.09,76.06,68.30,67.56,67.51,63.31,63.27,60.51,58.00,57.68,54.88,18.80,18.73.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.87.C23H30N5O13PS(M+Na)の分子量:計算値670.1196、実測値670.1216。
7a 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.12(d,J=8.2Hz,6H),8.02(d,J=8.1Hz,1H),6.04(s,1H),5.97(s,1H),5.90(d,J=8.1Hz,1H),5.85(d,J=8.0Hz,1H),4.91-4.83(m,1H),4.47(t,J=4.9Hz,1H),4.35-4.24(m,3H),4.24-4.12(m,2H),4.10-3.95(m,2H),3.95-3.84(m,1H),3.60(s,3H),3.56(s,3H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 165.84,165.76,151.22,151.18,141.32,141.18,102.30,101.87,87.44,87.12,82.93,82.89,82.85,82.51,82.43,81.35,81.32,71.46,71.42,67.83,63.72,63.66,59.45,58.09,57.76.31P NMR(202MHz,D2O)δ 56.74.C20H27N4O13PS(M+Na)の分子量:計算値617.0931、実測値617.0908。
7b 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.04(d,J=8.1Hz,1H),7.97(d,J=8.1Hz,1H),6.04(d,J=3.3Hz,1H),5.99(d,J=3.5Hz,1H),5.92-5.88(m,2H),4.88-4.83(m,1H),4.47(t,J=5.4Hz,1H),4.38-4.33(m,1H),4.31-4.19(m,4H),4.06(t,J=4.0Hz,1H),4.00-3.85(m,2H),3.57(s,3H),3.55(s,3H).13C NMR(126MHz,D2O)δ 166.11,166.02,151.42,141.34,102.32,102.14,87.27,87.15,83.23,83.19,82.73,82.70,82.63,81.31,81.28,71.42,71.38,67.96,64.46,64.41,59.90,58.09,57.90.31P NMR(202MHz,D2O)δ 55.55.C20H27N4O13PS(M+Na)の分子量:計算値617.0931、実測値617.0917。
10a 1H NMR(400MHz,アセトニトリル-d3)δ 7.90(d,J=8.1Hz 1H),7.61(d,J=8.1Hz,1H),7.43-7.38(m,2H),7.35-7.22(m,7H),6.91-6.84(m,4H),5.96(d,J=3.9Hz,1H),5.85(dd,J=19.3,2.1Hz,1H),5.65(d,J=8.0Hz,1H),5.27-5.19(m,2H),5.10(ddd,J=53.1,4.8,2.1Hz,1H),4.53-4.40(m,2H),4.34-4.22(m,2H),4.18-4.10(m,3H),4.06-3.98(m,1H),3.78(s,6H),3.58(dd,J=11.2,3.0Hz,1H),3.51(s,3H),3.48(dd,J=11.1,2.9Hz,1H),2.71(q,J=6.1Hz,2H),0.91(s,9H),0.14(d,J=4.8Hz,6H).13C NMR(126MHz,CD3OD)δ 166.07,165.91,160.01,152.27,151.88,146.40,143.10,143.08,142.11,137.34,131.21,129.29,128.67,127.67,124.20,118.61,113.98,113.85,103.30,103.18,94.14,94.09,92.62,92.58,91.62,91.59,91.34,91.31,87.83,87.79,87.70,85.34,85.30,82.97,82.87,82.79,77.47,77.43,77.39,70.90,70.77,67.47,67.42,64.57,64.53,61.95,59.28,59.26,55.71,55.67,26.16,19.99,19.92,18.92,-4.61,-4.79.31P NMR(162MHz,CD3CN)δ 67.12.19F NMR(376MHz,CD3OD)δ -209.65,-209.70,-209.75,-209.80,-209.84,-209.89,-210.14,-210.18,-210.23,-210.28,-210.32,-210.37.C49H59FN5O14PSSi(M+Na)の分子量:計算値1074.3168、実測値1074.3146。
10b 1H NMR(400MHz,アセトニトリル-d3)δ 7.93(d,J=8.1Hz,1H),7.49(d,J=8.1Hz,1H),7.41(d,J=7.4Hz,2H),7.32-7.22(m,7H),6.87(dd,J=9.0,2.4Hz,4H),5.94(d,J=3.7Hz,1H),5.73(dd,J=20.3,1.4Hz,1H),5.61(d,J=8.1Hz,1H),5.30-5.17(m,2H),5.16-4.98(m,1H),4.52-4.40(m,1H),4.35-4.23(m,3H),4.19-4.08(m,4H),4.01-3.94(m,1H),3.77(s,6H),3.54(s,4H),2.88(t,J=5.8Hz,2H),0.91(s,9H),0.13(d,J=3.6Hz,6H).13C NMR(126MHz,CD3OD)δ 165.98,165.87,160.41,160.37,151.95,151.71,145.68,143.24,141.78,136.26,131.67,131.60,131.23,129.57,129.31,129.01,128.67,128.25,118.62,114.30,114.29,113.99,103.10,102.90,94.22,92.72,92.28,91.99,88.61,88.59,83.16,83.14,82.78,82.72,82.36,82.29,75.76,75.73,70.56,70.43,67.12,67.08,64.68,64.64,62.40,59.21,55.77,26.19,20.85,20.02,19.96,18.92,-4.57,-4.76.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 67.90.19F NMR(376MHz,CD3OD)δ -208.37,-208.43,-208.48,-208.52,-208.57,-208.62,-208.77,-208.82,-208.87,-208.91,-208.96,-209.01.C49H59FN5O14PSSi(M+Na)の分子量:計算値1074.3168、実測値1074.3157。
11a 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.45(s,1H),11.41(s,1H),7.67(d,J=8.1Hz,1H),7.58(d,J=8.1Hz,1H),7.37(d,J=7.7Hz,2H),7.32(t,J=7.6Hz,2H),7.25(d,J=8.5Hz,5H),6.90(d,J=8.5Hz,4H),5.90-5.79(m,3H),5.74(s,1H),5.59(dd,J=8.0,1.7Hz,1H),5.39(dd,J=8.0,1.7Hz,1H),5.20-5.04(m,2H),4.44-4.36(m,1H),4.28-4.00(m,8H),3.73(s,6H),3.38(s,3H),2.84(q,J=5.5Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.02,162.77,158.16,150.27,150.08,144.24,140.87,140.20,135.04,134.84,129.74,127.89,127.72,126.86,117.91,113.24,102.12,102.09,101.86,101.85,93.47,91.99,88.94,88.64,86.54,86.52,86.23,81.15,81.10,80.17,80.10,79.94,79.91,74.88,68.09,67.96,67.34,67.31,63.02,62.98,62.15,57.99,55.02,54.86,18.76,18.69.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 67.99.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -206.87,-206.92,-206.98,-207.01,-207.06,-207.12.C43H45FN5O14PS(M+Na)の分子量:計算値960.2303、実測値960.2320。
11b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.45(s,1H),11.40(s,1H),7.70(d,J=8.1Hz,1H),7.54(d,J=8.1Hz,1H),7.41-7.35(m,2H),7.31(t,J=7.5Hz,2H),7.25(d,J=8.6Hz,5H),6.89(d,J=8.6Hz,4H),5.88-5.73(m,3H),5.57(d,J=8.1Hz,1H),5.36(d,J=8.1Hz,1H),5.19-5.02(m,2H),4.27-4.16(m,7H),4.02-3.96(m,1H),3.73(s,6H),3.41(s,3H),2.94(t,J=5.7Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 164.57,164.36,159.70,151.79,151.61,145.83,142.34,141.77,136.60,136.40,131.30,129.43,129.27,128.38,119.65,114.78,103.58,103.57,103.38,95.10,95.08,90.52,90.50,90.23,88.21,87.78,82.58,82.54,81.62,81.56,76.16,69.49,69.36,68.48,68.45,64.90,64.87,63.46,59.57,56.56,20.35,20.28.31P NMR(162MHz,DMSO)δ 68.27.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -206.61,-206.67,-206.72,-206.75,-206.81,-206.87.C43H45FN5O14PS(M+Na)の分子量:計算値937.89、実測値936.2。
12a 1H NMR 72(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.14(s,2H),7.66(dd,J=8.1,4.1Hz,1H),7.48-7.44(m,2H),7.38-7.28(m,8H),6.92(d,J=8.7Hz,4H),5.93(d,J=4.1Hz,1H),5.89-5.82(m,1H),5.63(d,J=8.1Hz,1H),5.34(dd,J=8.1,5.2Hz,1H),5.28-5.12(m,2H),4.60-4.48(m,2H),4.37-4.24(m,4H),4.19-4.07(m,3H),3.90-3.83(m,1H),3.80(s,6H),3.72-3.61(m,2H),3.49(d,J=3.3Hz,3H),3.44(d,J=3.0Hz,2H),2.75-2.65(m,4H),1.23-1.18(m,12H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 163.89,163.87,163.71,159.92,159.91,151.41,151.39,151.17,151.13,145.55,142.09,141.92,140.90,136.39,136.39,136.25,131.24,131.22,129.19,129.07,128.18,114.28,103.23,103.18,103.11,103.08,94.30,93.77,92.81,92.28,91.41,91.33,91.13,91.05,88.03,87.93,87.90,82.69,82.33,81.18,80.81,76.00,75.96,70.85,70.73,70.59,67.84,67.52,64.31,64.28,63.00,62.95,60.00,59.84,59.81,59.65,59.28,56.05,56.04,56.02,44.39,44.36,44.29,44.26,25.17,25.13,24.98,24.93,21.14,21.08,21.02,20.15,20.08.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 152.24,152.21,152.13,152.08,68.63,68.60.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -205.04,-205.07,-205.09,-205.12,-205.15,-205.17,-205.21,-205.23,-205.26,-205.29,-205.31,-205.64,-205.66,-205.69,-205.71,-205.75,-205.76,-205.78,-205.80,-205.83,-205.85,-205.89,-205.90.C52H62FN7O15P2S(M+H)の分子量:計算値1138.3562、実測値1138.3549。
12b 1H NMR 73(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.10(s,2H),7.66(d,J=8.2Hz,1H),7.46(d,J=8.2Hz,2H),7.38-7.28(m,8H),6.91(d,J=8.7Hz,4H),5.94-5.89(m,1H),5.82-5.71(m,1H),5.60-5.55(m,1H),5.36-5.30(m,1H),5.27-5.11(m,2H),4.60-4.35(m,2H),4.34-4.14(m,6H),4.11(q,J=4.6Hz,1H),3.89-3.82(m,1H),3.80(s,6H),3.71-3.62(m,2H),3.53-3.48(m,3H),3.44-3.37(m,2H),2.84(q,J=6.0Hz,2H),2.67(t,J=6.0Hz,2H),1.23-1.15(m,12H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 163.85,163.83,163.70,159.91,159.90,151.46,151.45,151.08,151.06,145.60,145.58,142.29,142.09,140.87,136.35,136.21,131.25,131.23,129.16,129.07,128.15,114.29,103.23,103.20,103.14,103.10,103.07,103.04,92.88,92.37,91.79,91.50,88.03,87.79,82.67,82.42,80.98,80.64,76.02,70.36,67.31,67.02,64.49,62.89,60.01,59.85,59.74,59.60,59.27,56.04,56.03,47.22,44.34,44.24,25.12,24.97,21.13,21.07,21.02,20.21,20.14.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 152.08,152.04,68.79,68.73.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -204.19,-204.22,-204.25,-204.25,-204.27,-204.30,-204.33,-204.36,-204.39,-204.41,-204.44,-204.47,-204.62,-204.64,-204.67,-204.69,-204.73,-204.75,-204.76,-204.78,-204.82,-204.83,-204.83,-204.87,-204.89.C52H62FN7O15P2S(M+H)の分子量:計算値1138.3562、実測値1138.3533。
13a 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.45(dd,J=5.5,2.0Hz,2H),7.88(d,J=8.2Hz,1H),7.61(d,J=8.1Hz,1H),5.94-5.81(m,3H),5.72(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),5.63(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),5.42(t,J=4.3Hz,1H),5.22-5.03(m,2H),4.47-4.37(m,1H),4.28-4.02(m,7H),3.61(s,2H),3.34(s,3H),2.95(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.07,162.84,150.59,150.13,140.93,140.07,118.17,102.61,101.93,93.48,92.00,88.90,88.62,85.20,83.67,80.41,80.37,80.21,80.14,76.15,76.12,68.07,67.93,67.25,67.21,63.17,63.14,60.56,57.96,54.88,18.83,18.76.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.74.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -206.85,-206.91,-206.96,-207.00,-207.05,-207.11.C22H27FN5O12PS(M+H)の分子量:計算値636.1177、実測値636.1168。
13b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.56-11.29(m,2H),7.88(d,J=8.2Hz,1H),7.61(d,J=8.1Hz,1H),5.95-5.80(m,3H),5.72(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),5.62(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),5.41(t,J=4.8Hz,1H),5.23-5.02(m,2H),4.42-4.32(m,1H),4.30-4.01(m,7H),3.59(s,2H),3.36(s,3H),2.96(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.55,163.33,151.05,150.58,141.50,140.54,118.62,103.07,102.37,94.01,92.53,89.56,89.27,85.68,84.19,84.16,80.92,80.88,80.63,80.56,76.58,76.54,68.50,68.37,67.60,67.56,63.77,63.74,60.99,58.47,55.36,19.27,19.20.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.85.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -206.40,-206.46,-206.52,-206.55,-206.60,-206.66.C22H27FN5O12PS(M+Na)の分子量:計算値658.0996、実測値658.0997。
14a 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.04-8.00(m,2H),6.12(d,J=17.7Hz,1H),5.97(m,1H),5.89-5.85(m,2H),5.27-5.09(m,1H),4.87-4.83(m,1H),4.53-4.46(m,1H),4.44-4.28(m,3H),4.27-4.14(m,2H),4.06-3.86(m,2H),3.60(s,3H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 165.95,151.27,151.10,141.38,141.19,102.19,101.90,94.13,92.65,88.40,88.12,87.41,82.88,82.83,81.34,80.84,80.77,71.48,71.44,67.51,67.38,63.00,62.94,59.48,57.76.31P NMR(202MHz,D2O)δ 56.78.19F NMR(376MHz,D2O)δ -203.43,-203.48,-203.49,-203.54,-203.57,-203.62,-203.63,-203.68.C19H24FN4O12PS(M+Na)の分子量:計算値605.0731、実測値605.0718。
14b 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.02-7.88(m,2H),6.09(d,J=18.4Hz,1H),5.99(d,J=3.8Hz,1H),5.89(d,J=8.1Hz,2H),5.21(dd,J=52.3,4.1Hz,1H),4.88-4.84(m,1H),4.55-4.42(m,1H),4.40-4.29(m,3H),4.29-4.16(m,2H),4.02-3.81(m,2H),3.57(s,3H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 165.97,151.34,151.09,141.75,141.36,102.16,102.11,94.01,92.53,88.82,88.54,87.21,83.22,83.18,81.32,81.28,80.93,80.85,71.54,71.49,67.66,67.53,63.70,63.66,59.94,57.89.31P NMR(202MHz,D2O)δ 55.68.19F NMR(376MHz,D2O)δ -202.94,-202.98,-202.99,-203.04,-203.07,-203.12,-203.13,-203.18.C19H24FN4O12PS(M+Na)の分子量:計算値605.0731、実測値605.0742。
17a 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.43(s,1H),11.33(s,1H),7.77(d,J=8.0Hz,1H),7.57(d,J=8.1Hz,1H),7.42-7.36(m,2H),7.33-7.20(m,7H),6.91-6.84(m,4H),5.92(d,J=21.4Hz,1H),5.81(d,J=4.5Hz,1H),5.63(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),5.60-5.42(m,2H),5.36-5.24(m,1H),4.34-4.21(m,3H),4.21-4.06(m,2H),4.03-3.93(m,2H),3.86(t,J=4.8Hz,1H),3.73(s,6H),3.38(d,J=9.5Hz,1H),3.34(s,3H),3.29(dd,J=11.0,4.8Hz,1H),2.83-2.73(m,2H),0.87(s,9H),0.08(s,5H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.11,162.92,158.13,158.11,150.31,150.02,144.31,142.07,140.13,135.08,135.03,129.77,129.72,127.81,127.76,126.78,120.26,117.70,113.15,102.12,101.73,91.63,90.05,90.03,89.75,87.12,85.97,81.69,81.62,81.24,79.61,79.54,73.12,73.01,69.64,67.08,67.06,63.26,63.23,61.58,57.61,55.00,25.54,18.77,18.70,17.68,-4.88,-5.14.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.19.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -203.64,-203.70,-203.75,-203.78,-203.83,-203.89.C49H59FN5O14PSSi(M+Na)の分子量:計算値1074.368、実測値1074.3170。
17b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.51-11.46(m,1H),11.43-11.38(m,1H),7.80(d,J=8.1Hz,1H),7.56(d,J=8.2Hz,1H),7.38(d,J=7.5Hz,2H),7.31-7.20(m,7H),6.85(dd,J=8.9,2.1Hz,4H),5.91(d,J=21.8Hz,1H),5.78(d,J=4.0Hz,1H),5.63-5.46(m,2H),5.41(dd,J=8.0,2.0Hz,1H),5.38-5.25(m,1H),4.27-4.15(m,4H),4.15-4.06(m,2H),3.96-3.90(m,1H),3.86-3.81(m,1H),3.72(s,6H),3.41-3.36(m,1H),3.35(s,3H),3.29-3.24(m,1H),2.92(t,J=5.8Hz,2H),0.85(s,9H),0.07(s,3H),0.06(s,3H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.12,162.94,158.11,156.61,150.25,150.00,144.34,142.06,140.09,137.28,135.07,135.00,129.75,129.73,127.77,127.75,126.72,120.32,117.92,113.11,101.99,101.69,91.76,90.27,90.06,89.78,87.33,85.98,81.43,81.40,81.37,79.48,79.41,72.88,72.74,69.40,66.71,63.59,63.55,61.33,57.62,54.95,25.54,18.84,18.77,17.67,-4.86,-5.13.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.34.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -203.36,-203.42,-203.47,-203.50,-203.56,-203.61.C49H59FN5O14PSSi(M+Na)の分子量:計算値1074.368、実測値1074.3198。
18a 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.48(d,J=1.9Hz,1H),11.38(d,J=1.9Hz,1H),7.80(d,J=8.1Hz,1H),7.54(d,J=8.1Hz,1H),7.42-7.36(m,2H),7.30(t,J=7.6Hz,2H),7.28-7.20(m,5H),6.87(dd,J=9.0,2.4Hz,4H),5.91(d,J=21.7Hz,1H),5.84(d,J=5.0Hz,1H),5.63(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),5.54(dd,J=53.1,4.6Hz,1H),5.42(dd,J=8.0,2.1Hz,1H),5.40-5.36(m,1H),5.36-5.25(m,1H),4.28-4.21(m,2H),4.21-4.14(m,1H),4.14-4.06(m,2H),4.05-4.00(m,1H),4.00-3.93(m,1H),3.78(t,J=5.1Hz,1H),3.73(s,6H),3.34(s,4H),3.27(dd,J=11.1,4.7Hz,1H),2.83-2.76(m,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.14,162.89,158.13,158.11,150.34,150.01,144.31,142.07,139.97,135.09,135.02,129.77,129.72,127.82,127.77,126.79,117.77,113.17,102.14,101.69,91.75,90.26,90.10,89.81,86.59,85.98,81.84,81.77,81.61,79.52,79.45,72.99,72.87,68.28,67.78,67.75,63.21,63.18,61.47,57.61,55.01,18.75,18.68.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.19.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -207.61,-207.65,-207.66,-207.70,-207.75,-207.79,-207.80,-207.84.C43H45FN5O14PS(M+Na)の分子量:計算値960.2303、実測値960.2311。
18b 1H NMR 54(500MHz,DMSO-d6)δ 11.48(d,J=2.3Hz,1H),11.39(d,J=2.3Hz,1H),7.85-7.75(m,1H),7.53(dd,J=8.1,1.0Hz,1H),7.42-7.34(m,2H),7.31-7.27(m,2H),7.27-7.18(m,5H),6.90-6.83(m,4H),5.91(d,J=21.9Hz,1H),5.81(d,J=4.6Hz,1H),5.61-5.56(m,1H),5.51-5.46(m,1H),5.44-5.35(m,2H),5.35-5.24(m,1H),4.24-4.11(m,4H),4.11-4.03(m,2H),3.96-3.91(m,1H),3.77(t,J=5.0Hz,1H),3.72(s,6H),3.39-3.33(m,4H),3.29-3.23(m,1H),2.91(t,J=5.9Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.12,162.88,158.11,158.08,150.28,149.99,144.32,142.08,140.01,135.06,135.03,129.76,129.71,127.79,127.75,126.73,117.95,113.14,102.01,101.67,91.77,90.30,90.08,89.80,86.84,86.82,85.98,81.69,81.61,81.54,79.47,79.38,72.82,72.69,68.19,67.55,67.51,63.49,63.46,61.36,57.65,54.97,18.79,18.72.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.26.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -207.39,-207.43,-207.44,-207.48,-207.53,-207.57,-207.58,-207.62.C43H45FN5O14PS(M+Na)の分子量:計算値960.2303、実測値960.2313。
19a 31P NMR 70(202MHz,CD3CN)δ 152.01,151.47,68.80,68.74.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -204.73,-204.78,-204.82,-204.87,-204.92,-204.96,-205.01,-205.85,-205.90,-205.96,-206.00,-206.04,-206.10.C52H62FN7O15P2S(M+Na)の分子量:計算値1137.3484、実測値1138.2。
19b 31P NMR 71(202MHz,CD3CN)δ 151.78,151.53,68.77.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -205.53,-205.58,-205.63,-205.66,-205.71,-205.76,-205.77,-205.80,-205.84,-205.90.C52H62FN7O15P2S(M+H)の分子量:計算値1138.3562、実測値1138.3595。
20a 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.48(s,1H),11.41(s,1H),7.84(d,J=8.1Hz,1H),7.58(d,J=8.1Hz,1H),5.96(dd,J=18.8,3.0Hz,1H),5.85(d,J=5.0Hz,1H),5.67(ddd,J=7.8,5.5,2.1Hz,2H),5.53-5.29(m,3H),5.17-5.03(m,1H),4.34-4.08(m,6H),4.06-3.99(m,1H),3.80(t,J=5.1Hz,1H),3.76-3.66(m,1H),3.60(dt,J=12.1,4.0Hz,1H),3.34(s,3H),2.96(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.07,162.93,150.38,150.26,141.21,140.08,118.12,102.19,102.12,91.45,91.44,89.94,89.93,88.05,87.78,86.62,81.94,81.91,81.88,81.84,81.58,73.80,73.77,73.69,73.66,68.29,67.74,67.70,63.42,63.39,59.60,57.63,54.89,18.85,18.78.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.79.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -207.63,-207.67,-207.68,-207.72,-207.77,-207.81,-207.82,-207.86.C22H27FN5O12PS(M+Na)の分子量:計算値658.0996、実測値658.0989。
20b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.48(s,1H),11.41(s,1H),7.85(d,J=8.1Hz,1H),7.61(d,J=8.1Hz,1H),5.95(dd,J=18.9,2.9Hz,1H),5.84(d,J=4.8Hz,1H),5.66(ddd,J=14.1,8.1,2.1Hz,2H),5.52-5.29(m,3H),5.16-5.01(m,1H),4.34-4.17(m,4H),4.17-4.08(m,2H),4.08-3.99(m,1H),3.82(t,J=5.0Hz,1H),3.76-3.67(m,1H),3.58(dt,J=12.3,4.3Hz,1H),3.36(s,3H),2.95(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 163.07,162.93,150.35,150.25,141.22,140.23,118.06,102.11,102.09,91.48,91.46,89.96,89.94,88.13,87.86,86.85,81.88,81.82,81.79,81.72,81.58,73.58,73.54,73.46,73.43,68.27,67.76,67.72,63.47,63.44,59.52,57.67,54.88,18.81,18.75.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.83.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -207.48,-207.52,-207.53,-207.57,-207.62,-207.66,-207.67,-207.71.C22H27FN5O12PS(M+Na)の分子量:計算値658.0996、実測値658.0984。
21a 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.08(d,J=8.1Hz,1H),7.93(d,J=8.1Hz,1H),6.04(s,1H),5.98(d,J=18.3Hz,1H),5.92(d,J=8.1Hz,1H),5.85(d,J=8.1Hz,1H),5.47-5.21(m,1H),5.00-4.86(m,1H),4.47(t,J=5.3Hz,1H),4.36-4.24(m,4H),4.23-4.14(m,1H),4.12-3.99(m,2H),3.92-3.89(m,1H),3.55(s,4H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 165.96,165.81,151.24,150.95,141.86,141.31,102.37,101.81,92.52,92.50,91.02,89.60,89.32,87.01,82.83,82.66,82.59,81.63,81.56,70.94,70.90,70.82,70.78,67.85,63.76,63.71,58.93,58.09.31P NMR(202MHz,D2O)δ 56.82.19F NMR(376MHz,D2O)δ -200.17,-200.21,-200.22,-200.27,-200.30,-200.35,-200.36,-200.41.C19H24FN4O12PS(M+Na)の分子量:計算値605.0731、実測値605.0727。
21b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.29(s,1H),11.26(s,1H),8.76(s,1H),8.73(s,1H),8.69(s,1H),8.65(s,1H),8.03(d,J=7.3Hz,4H),7.69-7.59(m,2H),7.59-7.48(m,4H),6.47(dd,J=16.7,3.6Hz,1H),6.23-6.15(m,1H),5.93(dt,J=51.4,4.0Hz,1H),5.65-5.57(m,1H),5.54-5.42(m,1H),5.34(t,J=5.5Hz,1H),4.55-4.18(m,8H),3.78-3.58(m,2H),3.36(s,3H),2.97(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 166.11,165.94,151.37,151.04,142.23,141.30,102.37,101.94,92.44,92.42,90.94,90.92,89.76,89.47,86.99,82.80,82.72,82.70,81.73,81.67,70.40,70.35,70.27,70.23,67.90,64.59,64.54,59.21,58.09.31P NMR(202MHz,D2O)δ 55.97.19F NMR(376MHz,D2O)δ -200.30,-200.35,-200.40,-200.43,-200.49,-200.54.C19H24FN4O12PS(M+Na)の分子量:計算値605.0731、実測値605.0737。
24a 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.45(s,2H),8.60(s,1H),8.53(s,1H),8.30(d,J=8.1Hz,2H),8.09-7.97(m,4H),7.69-7.59(m,2H),7.58-7.47(m,4H),7.39-7.31(m,2H),7.26-7.15(m,7H),6.77(d,J=8.9Hz,4H),6.36-6.26(m,1H),6.12(d,J=3.8Hz,1H),5.97-5.80(m,2H),4.72(t,J=5.2Hz,1H),4.51-4.44(m,1H),4.44-4.34(m,3H),4.30-4.23(m,1H),4.23-4.13(m,1H),4.11-4.06(m,1H),3.73(s,6H),3.49(dd,J=11.3,2.5Hz,1H),3.44(s,3H),3.28(dd,J=11.3,4.2Hz,1H),2.69(q,J=6.6Hz,2H),0.96(s,9H),0.17(d,J=1.9Hz,6H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 159.70,152.98,152.77,152.37,151.17,151.02,145.79,144.20,143.36,136.66,133.61,131.05,129.71,129.68,129.28,129.06,128.81,127.90,125.76,114.03,92.97,91.45,88.39,88.12,88.02,87.25,83.68,83.62,81.43,74.58,74.57,71.51,68.82,64.39,62.38,59.04,55.96,26.20,20.12,20.05,18.78,-4.33,-4.53.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 68.98.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -207.65,-207.70,-207.75,-207.79,-207.84,-207.89.C65H69FN11O12PSSi(M+Na)の分子量:計算値1328.4237、実測値1328.4243。
24b 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.38(s,1H),8.68(s,1H),8.62(s,1H),8.31(s,1H),8.28(s,1H),8.00(d,J=7.7Hz,4H),7.71-7.60(m,2H),7.60-7.47(m,4H),7.38-7.31(m,2H),7.26-7.15(m,7H),6.83-6.68(m,4H),6.39-6.26(m,1H),6.12(d,J=3.6Hz,1H),6.07-5.87(m,2H),4.74(t,J=5.3Hz,1H),4.53-4.16(m,8H),3.78-3.67(m,6H),3.47(s,3H),3.32-3.26(m,1H),2.77(t,J=5.8Hz,2H),0.97(s,9H),0.18(s,6H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 159.66,152.82,152.49,151.20,151.05,145.84,144.25,143.35,136.64,136.54,134.93,134.84,133.70,133.63,131.06,131.04,129.73,129.70,129.23,129.02,127.84,125.81,125.77,114.01,92.92,91.41,88.36,88.09,87.25,83.59,83.50,81.54,81.48,74.77,74.66,74.63,71.33,68.33,68.29,64.65,62.29,59.04,26.22,20.20,20.13,18.79,-4.30,-4.47.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 68.84.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -208.52,-208.57,-208.62,-208.66,-208.71,-208.76.C65H69FN11O12PSSi(M+Na)の分子量:計算値1328.4238、実測値1328.4236。
25a 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.24(s,1H),11.20(s,1H),8.72(s,1H),8.64(s,1H),8.63(s,1H),8.60(s,1H),8.04-8.01(m,4H),7.63(t,J=7.3Hz,2H),7.53(t,J=7.6Hz,4H),7.29(d,J=7.4Hz,2H),7.20-7.14(m,7H),6.76(dd,J=8.9,2.0Hz,4H),6.55-6.45(m,1H),6.16(d,J=4.2Hz,1H),6.14-5.99(m,1H),5.94-5.83(m,1H),5.60-5.52(m,1H),4.48-4.45(m,2H),4.44-4.35(m,2H),4.34-4.26(m,1H),4.23-4.10(m,2H),4.08-4.00(m,1H),3.68(s,6H),3.39(d,J=10.4Hz,1H),3.35(s,3H),3.23(dd,J=11.1,4.5Hz,1H),2.84-2.80(m,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.60,165.55,158.00,151.92,151.77,151.65,151.42,150.61,150.47,144.45,143.82,142.78,135.20,133.25,133.22,132.46,132.44,129.63,129.59,128.47,128.42,127.65,127.63,126.61,125.78,125.73,117.82,113.02,91.42,89.91,86.49,86.22,85.78,85.61,82.69,82.62,81.73,79.85,79.78,73.47,73.44,73.36,73.33,68.70,68.04,68.00,63.24,63.20,61.39,57.72,54.95,18.76,18.69.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.93.19F NMR(376MHz,cd3cn)δ -208.25,-208.30,-208.35,-208.39,-208.44,-208.49.C59H55FN11O12PS(M+Na)の分子量:計算値1214.3372、実測値1214.3378。
25b 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.25(s,1H),11.21(s,1H),8.74(s,1H),8.68(s,1H),8.62(s,1H),8.60(s,1H),8.06-8.00(m,4H),7.63(t,J=7.4Hz,2H),7.53(t,J=7.6Hz,4H),7.28(d,J=8.3Hz,2H),7.19-7.11(m,7H),6.74(dd,J=9.0,2.5Hz,4H),6.49(dd,J=20.0,2.3Hz,1H),6.17(d,J=4.8Hz,1H),6.15-6.00(m,1H),5.95-5.84(m,1H),5.56(d,J=5.6Hz,1H),4.49-4.42(m,2H),4.35-4.25(m,3H),4.22-4.13(m,3H),3.67(s,6H),3.38(s,4H),3.22(dd,J=11.3,4.6Hz,1H),2.87(t,J=5.9Hz,2H).13C NMR 8(126MHz,DMSO)δ 165.59,165.56,157.96,151.92,151.79,151.69,151.42,150.63,150.48,144.47,143.83,142.80,135.21,133.26,133.22,132.46,132.43,129.62,129.58,128.47,128.42,127.62,127.62,126.56,125.79,125.75,117.93,112.99,91.45,89.93,86.50,86.22,85.87,85.59,82.66,82.59,81.76,79.80,79.72,73.15,73.12,68.62,67.99,67.95,63.49,63.45,61.21,57.75,54.92,18.77,18.70,-1.21.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.98.19F NMR(376MHz,cd3cn)δ -208.15,-208.20,-208.25,-208.29,-208.34,-208.39.C59H55FN11O12PS(M+Na)の分子量:計算値1214.3372、実測値1214.3363。
26a 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 8.57(s,1H),8.52(d,J=2.7Hz,1H),8.31-8.23(m,2H),8.05-7.96(m,4H),7.67-7.56(m,2H),7.56-7.43(m,4H),7.35-7.28(m,2H),7.23-7.11(m,7H),6.80-6.70(m,4H),6.32-6.24(m,1H),6.10(dd,J=9.1,4.3Hz,1H),5.97-5.74(m,2H),4.85-4.69(m,1H),4.58-4.32(m,4H),4.22-4.11(m,1H),4.11-3.97(m,1H),3.91-3.80(m,1H),3.71(s,8H),3.47(s,3H),3.41(s,3H),3.33-3.19(m,1H),2.73-2.61(m,3H),1.24-1.16(m,12H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 159.70,152.92,152.86,152.34,151.19,151.07,145.79,144.21,144.16,143.40,143.30,136.65,136.58,134.94,134.83,133.70,133.62,131.06,129.71,129.69,129.28,129.06,128.80,127.89,125.78,114.02,93.05,93.04,91.61,91.54,88.43,88.41,88.13,88.02,87.23,83.29,83.13,82.98,82.86,82.76,81.42,81.34,74.64,74.52,72.29,72.17,71.71,71.57,69.13,68.76,64.41,64.38,62.33,62.29,60.01,59.87,59.49,59.33,59.23,59.02,55.95,46.09,46.04,44.32,44.26,44.22,44.16,25.14,25.08,25.04,24.98,23.43,23.25,23.18,21.20,21.12,21.07,20.11,20.05.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 151.95,151.22,69.01.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -207.19,-207.24,-207.30,-207.35,-207.38,-207.44,-207.49,-207.54.C68H72FN13O13P2S(M+H)の分子量:計算値1392.4631、実測値1392.4681。
26b 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.33(s,1H),8.64(s,1H),8.60(d,J=2.2Hz,1H),8.28(d,J=1.7Hz,1H),8.24(d,J=5.4Hz,1H),8.02-7.94(m,4H),7.66-7.58(m,2H),7.56-7.48(m,4H),7.34-7.27(m,2H),7.24-7.09(m,7H),6.76-6.69(m,4H),6.34-6.26(m,1H),6.12-6.07(m,1H),6.04-5.80(m,2H),4.86-4.73(m,1H),4.55(dt,J=25.9,4.6Hz,1H),4.45-4.16(m,6H),3.96-3.73(m,2H),3.70(s,7H),3.50(s,2H),3.47-3.38(m,3H),3.28-3.19(m,1H),2.75(q,J=5.9,5.2Hz,2H),2.72-2.63(m,2H),1.25-1.18(m,12H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 159.66,152.93,152.51,151.22,151.08,145.86,145.84,144.23,144.22,143.42,143.27,136.63,136.54,134.95,134.87,133.70,133.62,131.06,131.04,129.73,129.70,129.24,129.02,128.79,127.84,125.85,125.80,125.72,114.01,92.91,91.42,88.49,88.32,88.06,87.98,87.25,83.23,83.08,82.92,82.64,81.56,81.51,74.75,72.10,71.97,71.59,71.45,68.63,68.29,64.65,64.61,62.29,60.02,59.87,59.50,59.34,59.27,59.02,55.95,46.09,46.04,44.34,44.28,44.24,44.18,25.20,25.16,25.10,25.00,23.25,23.18,21.21,21.15,21.09,20.19,20.13.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 151.89,151.30,68.73.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -208.53,-208.58,-208.63,-208.67,-208.72,-208.76,-208.81,-208.85,-208.90,-208.95.C68H72FN13O13P2S(M+H)の分子量:計算値1392.4631、実測値1392.4669。
27a 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.29(s,1H),11.26(s,1H),8.76(s,1H),8.73(s,1H),8.69(s,1H),8.65(s,1H),8.03(d,J=7.3Hz,4H),7.69-7.59(m,2H),7.59-7.48(m,4H),6.47(dd,J=16.7,3.6Hz,1H),6.23-6.15(m,1H),5.93(dt,J=51.4,4.0Hz,1H),5.65-5.57(m,1H),5.54-5.42(m,1H),5.34(t,J=5.5Hz,1H),4.55-4.18(m,8H),3.78-3.58(m,2H),3.36(s,3H),2.97(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.62,165.59,151.97,151.82,151.80,151.72,150.58,150.49,142.98,142.87,133.25,133.20,132.49,132.45,128.48,128.45,128.44,125.76,125.74,118.10,91.51,91.49,89.96,85.82,85.72,85.46,82.80,82.73,82.67,81.73,74.36,74.33,74.25,74.22,68.67,68.03,67.99,63.42,63.39,59.89,57.73,54.88,18.84,18.77.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.78.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -210.64,-210.67,-210.68,-210.72,-210.78,-210.81,-210.82,-210.85.C38H37FN11O10PS(M+Na)の分子量:計算値912.2065、実測値912.2079。
27b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.27(d,J=13.1Hz,2H),8.77(d,J=5.5Hz,1H),8.68(d,J=8.1Hz,2H),8.03(d,J=8.0Hz,4H),7.68-7.49(m,6H),6.47(dd,J=16.9,3.5Hz,1H),6.21(d,J=4.4Hz,1H),5.93(dt,J=51.5,3.9Hz,1H),5.62(d,J=5.3Hz,1H),5.54-5.43(m,1H),5.32(t,J=5.5Hz,1H),4.55-4.48(m,2H),4.48-4.33(m,2H),4.31-4.18(m,4H),3.78-3.56(m,2H),3.39(s,3H),2.93(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.61,165.59,151.96,151.83,151.82,151.71,150.59,150.51,143.00,142.97,133.25,133.20,132.49,132.45,128.48,128.45,125.79,125.76,118.03,91.53,91.51,90.00,89.98,85.92,85.78,85.51,82.76,82.70,82.65,82.60,81.71,74.16,74.13,68.68,68.13,68.09,63.46,63.42,59.81,57.77,54.89,18.79,18.72.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.88.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -210.45,-210.48,-210.49,-210.53,-210.58,-210.62,-210.63,-210.66.C38H37FN11O10PS(M+Na)の分子量:計算値912.2065、実測値912.2053。
28a 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.39(s,1H),8.23(s,1H),8.14(s,1H),7.83(s,1H),6.15(d,J=16.1Hz,1H),6.00(d,J=3.6Hz,1H),5.41(dd,1H),5.14-5.01(m,1H),4.61(t,J=5.1Hz,1H),4.46-4.40(m,1H),4.40-4.32(m,2H),4.24-4.19(m,1H),4.14(d,J=13.1Hz,1H),4.11-4.05(m,1H),3.96(dd,J=13.2,3.6Hz,1H),3.48(s,3H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 154.90,154.50,152.67,151.81,147.56,146.83,138.86,138.69,118.31,117.86,92.36,90.86,87.70,87.44,85.89,83.97,82.90,82.82,81.63,81.56,71.31,71.27,71.19,71.15,68.23,63.34,63.29,59.01,58.33.31P NMR(202MHz,D2O)δ 57.21.19F NMR(376MHz,D2O)δ -200.83,-200.87,-200.89,-200.93,-200.96,-201.01,-201.03,-201.07.C21H26FN10O8PS(M+H)の分子量:計算値629.1456、実測値629.1449。
28b 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.28(s,2H),8.22(s,1H),8.13(s,13H),7.86(s,1H),6.14(d,J=15.9Hz,1H),6.06-5.98(m,1H),5.46(d,J=52.3Hz,1H),5.00(dtd,J=18.9,9.1,4.1Hz,1H),4.63(t,J=4.7Hz,1H),4.41-4.34(m,2H),4.28(s,2H),4.18(s,1H),4.07-4.01(m,1H),3.94-3.88(m,1H),3.48(s,4H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 154.97,154.67,152.67,151.92,147.82,147.11,139.16,138.56,118.38,117.96,92.16,90.64,87.31,87.04,85.65,83.56,83.12,83.04,82.12,82.06,70.37,70.31,70.25,70.19,68.23,64.81,64.80,64.77,59.24,58.25.31P NMR(202MHz,D2O)δ 55.40.19F NMR(376MHz,D2O)δ -202.19,-202.23,-202.24,-202.28,-202.32,-202.37,-202.38,-202.42.C21H26FN10O8PS(M+H)の分子量:計算値629.1456、実測値629.1452。
31a 1H NMR 77a(500MHz,DMSO-d6)δ 11.43(d,J=1.7Hz,1H),11.25(s,1H),8.60(d,J=6.9Hz,2H),8.04(d,J=7.5Hz,2H),7.67-7.60(m,2H),7.57-7.52(m,2H),7.39(d,J=7.6Hz,2H),7.29-7.23(m,6H),7.23-7.17(m,1H),6.84(dd,J=8.9,2.5Hz,4H),6.18(d,J=6.9Hz,1H),5.90-5.84(m,1H),5.63(dd,J=8.0,2.0Hz,1H),5.41-5.35(m,1H),5.22(dd,J=52.9,4.0Hz,1H),5.07-5.01(m,1H),4.49-4.40(m,2H),4.40-4.33(m,1H),4.27-4.14(m,3H),4.11-4.06(m,1H),3.72(s,6H),3.37(dd,J=10.7,4.6Hz,1H),3.34(s,4H),2.92-2.87(m,2H),0.85(s,9H),0.13-0.07(m,6H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.58,163.09,158.09,151.96,151.61,150.65,150.12,144.50,143.47,141.20,135.26,135.20,133.20,132.46,129.68,129.67,128.46,128.42,127.75,127.66,126.72,125.93,117.93,113.14,101.89,92.63,92.61,91.13,91.10,89.35,89.09,85.87,85.24,82.19,80.32,80.23,78.96,75.87,69.18,69.05,66.63,63.15,63.11,62.73,59.70,58.08,54.98,25.45,18.86,18.79,17.62,-4.97,-5.28.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.15.19F NMR(162MHz,DMSO)δ -214.77,-214.90,-215.02,-215.10,-215.23,-215.35.C57H64FN8O13PSSi(M+H)の分子量:計算値1179.3883、実測値1179.3904。
31b 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.43(d,J=1.8Hz,2H),11.24(s,1H),8.60(d,J=12.5Hz,2H),8.03(d,J=7.4Hz,2H),7.67-7.59(m,2H),7.57-7.52(m,2H),7.38(d,J=7.6Hz,2H),7.27-7.22(m,6H),7.22-7.16(m,1H),6.86-6.80(m,4H),6.16(d,J=6.6Hz,1H),5.88(d,J=20.9Hz,1H),5.63(dd,J=8.0,2.1Hz,1H),5.43-5.37(m,1H),5.22(dd,J=53.3,4.7Hz,1H),5.08-5.02(m,1H),4.46-4.39(m,1H),4.39-4.35(m,1H),4.33-4.20(m,4H),4.08-4.03(m,1H),3.71(s,6H),3.42-3.37(m,1H),3.36(s,3H),3.31-3.27(m,1H),2.95(t,J=5.8Hz,2H),0.87(s,9H),0.12(s,3H),0.11(s,3H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.58,163.10,158.07,151.87,151.56,150.64,150.11,144.52,143.71,141.19,135.25,135.19,133.21,132.45,129.67,128.46,128.42,127.71,127.64,126.67,126.00,118.05,113.10,101.88,92.69,91.22,89.46,89.15,85.81,85.52,82.20,80.20,80.13,78.90,75.76,68.98,68.86,66.13,63.41,62.57,58.11,54.96,25.49,18.88,18.81,17.63,-4.94,-5.21.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.36.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -206.39,-206.44,-206.49,-206.53,-206.58,-206.64.C57H64FN8O13PSSi(M+H)の分子量:計算値1179.3883、実測値1179.3907。
32a 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.47-11.40(m,1H),11.27(s,1H),8.61(d,J=7.0Hz,2H),8.04(d,J=7.6Hz,2H),7.68-7.58(m,2H),7.58-7.51(m,2H),7.43-7.36(m,2H),7.26(d,J=8.6Hz,6H),7.23-7.17(m,1H),6.85(dd,J=8.8,2.1Hz,4H),6.19(d,J=6.8Hz,1H),5.92-5.80(m,2H),5.62(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),5.43-5.34(m,1H),5.23-5.00(m,2H),4.51-4.40(m,2H),4.32-4.13(m,4H),4.12-4.04(m,1H),3.72(s,6H),3.41-3.36(m,1H),3.34(s,3H),3.33-3.28(m,1H),2.92(q,J=5.4Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.60,163.05,158.09,151.91,151.63,150.66,150.10,144.52,143.65,140.87,135.28,135.20,133.21,132.47,129.70,128.48,128.44,127.77,127.67,126.73,125.98,120.35,118.01,113.15,101.89,93.50,92.03,88.97,88.68,85.86,85.39,82.20,82.17,80.23,80.15,78.96,78.92,75.80,75.76,68.09,67.96,67.32,67.28,63.11,63.07,62.68,58.08,54.99,18.84,18.77.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 66.88.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -206.83,-206.88,-206.94,-206.97,-207.02,-207.08.C51H50FN8O13PS(M+H)の分子量:計算値1065.3018、実測値1065.3024。
32b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.45(d,J=1.7Hz,1H),11.27(s,1H),8.61(d,J=9.3Hz,2H),8.04(d,J=7.3Hz,2H),7.68-7.58(m,2H),7.58-7.50(m,2H),7.39(d,J=7.4Hz,2H),7.31-7.15(m,7H),6.84(dd,J=8.9,2.9Hz,4H),6.17(d,J=6.7Hz,1H),5.95-5.83(m,2H),5.62(dd,J=8.1,2.1Hz,1H),5.44-5.36(m,1H),5.24-5.00(m,2H),4.43-4.33(m,2H),4.31-4.19(m,4H),4.11-3.98(m,1H),3.71(s,6H),3.41-3.37(m,1H),3.36(s,3H),3.33-3.28(m,1H),2.96(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.61,163.07,158.08,152.05,151.89,151.72,151.61,150.66,150.44,150.11,144.54,143.75,142.92,140.86,135.30,135.23,133.27,133.22,132.48,132.44,129.69,128.48,128.44,127.76,127.67,126.71,126.02,118.14,113.14,101.92,93.59,92.09,89.03,88.74,86.26,85.85,85.52,82.58,82.24,82.21,80.16,80.09,78.91,78.88,75.71,75.67,68.62,67.99,67.85,66.96,66.92,63.38,63.34,62.62,61.12,58.10,57.53,54.98,18.86,18.79.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 67.00.19F NMR(376MHz,DMSO)δ -206.44,-206.50,-206.55,-206.58,-206.64,-206.69.C51H50FN8O13PS(M+H)の分子量:計算値1065.3018、実測値1065.3014。
33a 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.35(s,2H),8.57(s,1H),8.26(s,1H),8.02(d,J=7.6Hz,2H),7.65(t,J=7.4Hz,1H),7.55(t,J=7.7Hz,2H),7.52-7.46(m,1H),7.44(d,J=7.7Hz,2H),7.35-7.26(m,6H),7.25-7.20(m,1H),6.84(d,J=8.2Hz,4H),6.17-6.12(m,1H),5.85(dd,J=19.6,4.9Hz,1H),5.60(d,J=8.1Hz,1H),5.49-5.41(m,1H),5.26-5.10(m,1H),4.95-4.89(m,1H),4.62-4.51(m,1H),4.49-4.15(m,6H),3.89-3.77(m,2H),3.76(s,6H),3.70-3.61(m,2H),3.50-3.45(m,1H),3.43(d,J=3.1Hz,3H),3.42-3.36(m,1H),2.79-2.72(m,2H),2.70-2.63(m,2H),1.21-1.15(m,12H).13C NMR(126MHz,cd3cn)δ 163.94,159.80,152.98,151.20,151.16,151.12,145.82,145.82,143.78,143.77,142.02,141.87,136.67,134.92,133.68,131.15,131.12,129.73,129.25,129.14,128.93,128.02,125.89,119.63,114.16,103.15,103.07,94.34,93.80,92.84,92.27,91.38,91.28,91.10,90.99,87.55,87.36,87.33,83.62,83.59,83.55,81.32,81.29,80.96,80.91,80.89,80.84,76.98,76.95,70.87,70.77,70.75,70.62,67.95,67.91,67.65,67.60,64.33,64.29,63.64,59.96,59.81,59.77,59.62,59.42,56.00,44.36,44.34,44.26,44.24,25.18,25.12,25.02,24.99,24.97,24.96,24.93,24.92,21.14,21.08,21.07,21.01,20.20,20.13.31P NMR(202MHz,cd3cn)δ 152.06,152.03,68.66,68.64.19F NMR(376MHz,cd3cn)δ -198.90,-198.93,-198.95,-198.98,-199.01,-199.03,-199.04,-199.07,-199.09,-199.12,-199.15,-199.17,-199.55,-199.57,-199.60,-199.62,-199.65,-199.67,-199.69,-199.71,-199.74,-199.76,-199.79,-199.81.C60H67FN10O14P2S(M+H)の分子量:計算値1265.4096、実測値1265.4106。
33b 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.36(s,2H),8.57(s,1H),8.25(s,1H),8.01(d,J=7.5Hz,2H),7.65(t,J=7.4Hz,1H),7.55(t,J=7.7Hz,2H),7.46-7.40(m,3H),7.35-7.25(m,6H),7.24-7.19(m,1H),6.86-6.80(m,4H),6.13-6.09(m,1H),5.86-5.77(m,1H),5.61-5.58(m,1H),5.47-5.42(m,1H),5.28-5.13(m,1H),4.97-4.92(m,1H),4.64-4.48(m,1H),4.47-4.39(m,2H),4.37-4.17(m,4H),3.91-3.77(m,2H),3.75(s,6H),3.72-3.61(m,2H),3.49-3.44(m,1H),3.43(s,3H),3.40-3.35(m,1H),2.86-2.80(m,2H),2.70-2.64(m,2H),1.22-1.17(m,12H).13C NMR(126MHz,cd3cn)δ 163.94,159.78,159.77,152.99,151.20,151.16,151.13,145.86,143.89,142.34,142.14,136.66,134.93,133.67,131.16,131.12,129.73,129.25,129.11,128.93,127.99,119.61,118.68,114.16,103.19,103.12,94.42,93.86,93.84,92.93,92.36,92.34,91.77,91.49,87.53,87.52,87.43,87.41,83.73,83.69,83.65,81.26,81.23,81.12,81.09,81.05,81.02,80.75,80.70,80.67,80.63,77.15,77.12,70.63,70.58,70.50,70.45,70.38,70.32,67.34,67.31,67.06,67.03,64.52,64.48,63.66,61.04,60.00,59.85,59.77,59.61,59.36,55.99,44.37,44.34,44.27,44.24,25.21,25.15,25.04,25.01,24.98,24.95,24.93,21.22,21.16,21.10,21.03,20.25,20.18.31P NMR(202MHz,cd3cn)δ 151.97,151.94,68.75,68.71.19F NMR(376MHz,cd3cn)δ -197.89,-197.94,-197.97,-198.00,-198.02,-198.05,-198.08,-198.11,-198.16,-198.32,-198.34,-198.38,-198.40,-198.43,-198.45,-198.46,-198.48,-198.52,-198.54,-198.57,-198.59.C60H67FN10O14P2S(M+H)の分子量:計算値1265.4096、実測値1265.4065。
35a 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.22(s,1H),8.02(s,1H),7.68(d,J=8.1Hz,1H),6.03(d,J=3.5Hz,1H),5.76(d,J=17.3Hz,1H),5.50(d,J=8.1Hz,1H),5.02-4.85(m,2H),4.42(t,J=3.9Hz,1H),4.36-4.32(m,1H),4.31-4.15(m,3H),4.10-4.04(m,1H),3.92-3.77(m,2H),3.47(s,3H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 165.88,155.54,152.65,150.98,148.18,141.02,140.08,119.18,101.95,94.31,92.83,88.59,88.31,86.85,84.03,83.99,81.62,81.59,80.98,80.90,72.62,72.58,67.61,67.48,63.17,63.12,60.42,58.16.31P NMR(202MHz,D2O)δ 57.83.19F NMR(376MHz,D2O)δ -203.49,-203.54,-203.55,-203.60,-203.63,-203.68,-203.69,-203.74.C20H25FN7O10PS(M+H)の分子量:計算値606.1184、実測値606.1171。
35b 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.19(s,1H),8.04(s,1H),7.67(d,J=8.1Hz,1H),5.99(d,J=5.3Hz,1H),5.83(d,J=18.3Hz,1H),5.57(d,J=8.1Hz,1H),5.02(dd,J=52.4,4.2Hz,1H),4.93-4.87(m,1H),4.45(t,J=5.0Hz,1H),4.41-4.37(m,1H),4.36-4.27(m,1H),4.25-4.08(m,3H),3.84-3.72(m,2H),3.40(s,3H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 165.90,155.61,152.59,151.07,148.35,141.64,140.44,119.25,102.05,94.19,92.72,89.06,88.78,86.84,84.66,84.63,81.55,81.51,81.08,81.01,72.83,72.78,67.83,67.70,63.91,63.87,60.95,58.21.31P NMR(202MHz,D2O)δ 56.63.19F NMR(376MHz,D2O)δ -202.83,-202.88,-202.94,-202.97,-203.02,-203.08.C20H25FN7O10PS(M+H)の分子量:計算値606.1184、実測値606.1183。
38a 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.24(s,1H),11.23(s,1H),8.75(s,1H),8.69(s,1H),8.62(s,1H),8.57(s,1H),8.03(s,4H),7.70-7.58(m,2H),7.59-7.47(m,4H),7.44-7.33(m,2H),7.29-7.20(m,7H),6.88-6.80(m,4H),6.19(s,2H),5.44-5.30(m,1H),5.04(s,1H),4.72(s,1H),4.62(s,1H),4.54-4.46(m,1H),4.43(s,1H),4.37-4.28(m,1H),4.27-4.10(m,3H),3.70(s,6H),3.34(s,4H),3.31(s,4H),2.89(s,2H),0.91(s,9H),0.15(s,6H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.59,158.09,151.93,151.88,151.73,151.57,150.64,150.54,144.51,143.60,143.21,135.27,135.19,133.24,133.21,132.45,132.41,129.68,128.47,128.41,127.75,127.66,126.71,125.97,125.89,117.90,113.13,85.99,85.87,85.36,82.85,82.78,82.20,81.22,78.93,78.89,75.85,75.81,70.22,67.39,67.35,63.12,63.09,62.72,58.07,57.75,54.97,25.58,18.83,18.76,17.74,-4.84,-4.97.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.19.C66H72N11O13PSSi(M+Na)の分子量:計算値1340.4436、実測値1340.4451。
38b 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 11.24(s,1H),11.22(s,1H),8.76(s,1H),8.69(s,1H),8.62(s,1H),8.58(s,1H),8.04(d,J=6.4Hz,4H),7.67-7.60(m,2H),7.57-7.51(m,4H),7.38(d,J=6.7Hz,2H),7.24(d,J=7.2Hz,7H),6.86-6.77(m,4H),6.23-6.18(m,1H),6.18-6.14(m,1H),5.44-5.33(m,1H),5.05(s,1H),4.77-4.70(m,1H),4.62(s,1H),4.43-4.28(m,3H),4.28-4.16(m,3H),3.69(s,6H),3.35(s,7H),3.32(s,1H),2.94-2.88(m,2H),0.91(s,9H),0.15(s,6H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.58,158.06,151.87,151.74,151.55,150.65,150.54,144.52,143.74,143.17,135.26,135.19,133.26,133.22,132.44,132.40,129.67,128.46,128.41,128.40,127.70,127.64,126.65,126.02,125.86,118.00,113.09,85.96,85.82,85.54,82.80,82.73,82.24,81.21,78.89,75.75,70.08,67.04,63.36,63.32,62.60,58.09,57.76,54.94,25.59,18.82,18.75,17.74,-4.84,-4.95.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.32.C66H72N11O13PSSi(M+Na)の分子量:計算値1340.4436、実測値1340.4429。
39a 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.24(s,1H),11.23(s,1H),8.75(s,1H),8.66(s,1H),8.63(s,1H),8.56(s,1H),8.08-8.00(m,4H),7.68-7.59(m,2H),7.58-7.49(m,4H),7.42-7.36(m,2H),7.26(dd,J=8.1,5.2Hz,6H),7.22-7.15(m,1H),6.84(dd,J=8.9,2.9Hz,4H),6.25-6.16(m,2H),5.61-5.56(m,1H),5.42-5.35(m,1H),5.10-5.01(m,1H),4.55-4.40(m,4H),4.39-4.29(m,1H),4.27-4.11(m,3H),3.71(s,6H),3.37(s,4H),3.33(s,1H),3.31(s,3H),2.94-2.87(m,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.61,165.59,158.09,151.96,151.88,151.81,151.57,150.64,150.50,144.53,143.82,142.87,135.29,135.21,133.24,133.21,132.46,132.41,129.70,128.47,128.43,128.41,127.76,127.67,126.71,126.04,125.75,117.99,113.14,85.86,85.51,82.73,82.66,82.22,81.79,78.84,75.82,68.76,67.83,63.08,63.05,62.67,58.07,57.73,54.98,18.81,18.74.31P NMR(162MHz,DMSO)δ 68.18.C60H58N11O13PS(M+Na)の分子量:計算値1226.3572、実測値1226.3572。
39b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.25(s,1H),11.22(s,1H),8.76(s,1H),8.66(s,1H),8.62(s,1H),8.58(s,1H),8.07-8.00(m,4H),7.68-7.59(m,2H),7.59-7.49(m,4H),7.42-7.35(m,2H),7.30-7.21(m,6H),7.21-7.14(m,1H),6.83(dd,J=8.9,2.9Hz,4H),6.21(d,J=4.6Hz,1H),6.17(d,J=6.7Hz,1H),5.60(d,J=5.3Hz,1H),5.46-5.32(m,1H),5.13-4.98(m,1H),4.60-4.46(m,2H),4.46-4.39(m,1H),4.39-4.31(m,2H),4.31-4.14(m,3H),3.70(s,6H),3.39(s,3H),3.36(s,3H),3.34-3.27(m,2H),2.92(t,J=5.8Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.60,158.06,151.95,151.86,151.81,151.57,150.65,150.51,144.54,143.82,142.91,135.29,135.22,133.26,133.22,132.46,132.41,129.69,128.47,128.43,128.40,127.74,127.66,126.67,126.05,125.77,118.07,113.12,85.94,85.93,85.84,85.60,85.59,82.75,82.69,82.20,81.73,78.83,75.62,68.69,67.74,63.30,63.26,62.57,58.08,57.75,54.96,18.79,18.72.31P NMR(162MHz,DMSO)δ 68.27.C60H58N11O13PS(M+Na)の分子量:計算値1226.3572、実測値1226.3562。
40a 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.35(s,2H),8.63(s,1H),8.47(s,1H),8.39-8.33(m,1H),8.26(s,1H),8.00-7.97(m,4H),7.66-7.61(m,1H),7.61-7.55(m,1H),7.55-7.51(m,2H),7.50-7.46(m,2H),7.44-7.40(m,2H),7.31-7.28(m,4H),7.28-7.24(m,2H),7.21-7.17(m,1H),6.83-6.80(m,4H),6.18-6.14(m,1H),6.12-6.09(m,1H),5.44-5.38(m,1H),4.87-4.82(m,1H),4.82-4.75(m,1H),4.62-4.54(m,1H),4.53-4.43(m,2H),4.41-4.37(m,2H),4.20-4.11(m,2H),3.94-3.80(m,2H),3.73(s,6H),3.71-3.64(m,2H),3.47(s,2H),3.43-3.40(m,2H),3.36(s,4H),2.75-2.67(m,4H),1.24-1.19(m,12H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 159.78,152.89,151.13,151.10,145.87,144.08,143.52,143.40,136.68,134.94,133.66,133.59,131.15,131.12,129.72,129.68,129.26,129.23,129.12,128.91,127.98,125.99,125.86,114.15,88.46,88.04,87.50,87.44,83.54,83.18,83.01,81.16,76.96,72.38,71.77,71.76,68.81,68.56,64.26,63.61,60.04,59.89,59.39,59.22,58.97,56.00,44.36,44.29,44.19,25.19,25.14,25.00,21.13,21.08,20.15,20.08.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 152.07,151.35,68.79,68.75.C69H75N13O14P2S(M+H)の分子量:計算値1404.4831、実測値1404.4828。
40b 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 9.29(s,1H),8.65(d,J=1.7Hz,1H),8.49(s,1H),8.32-8.27(m,1H),8.27-8.23(m,1H),7.98(d,J=7.3Hz,2H),7.93(d,J=7.5Hz,2H),7.64(t,J=7.4Hz,1H),7.60-7.51(m,3H),7.46(t,J=7.7Hz,2H),7.43-7.38(m,2H),7.32-7.27(m,4H),7.24(t,J=7.7Hz,2H),7.18(t,J=7.3Hz,1H),6.80(dd,J=8.9,2.4Hz,4H),6.17-6.12(m,1H),6.05-6.00(m,1H),5.40-5.34(m,1H),4.95-4.82(m,2H),4.60(dt,J=25.6,4.5Hz,1H),4.46-4.37(m,2H),4.37-4.30(m,2H),4.30-4.21(m,3H),3.94-3.79(m,2H),3.72(s,7H),3.50(s,2H),3.45(s,1H),3.39-3.36(m,3H),3.36-3.32(m,1H),3.30-3.24(m,1H),2.79(q,J=6.1Hz,2H),2.73-2.66(m,2H),1.26-1.19(m,12H).13C NMR(126MHz,CD3CN)δ 159.74,152.89,151.12,145.90,144.22,144.17,143.54,143.40,136.68,134.95,133.67,133.56,131.15,131.10,129.74,129.65,129.20,129.09,128.90,127.94,126.03,126.01,125.81,125.74,119.70,114.13,88.60,88.58,88.13,87.48,83.62,83.11,82.80,82.69,81.00,77.11,72.19,72.06,71.70,71.56,68.12,68.10,64.42,64.39,63.61,60.05,59.90,59.53,59.30,59.06,55.98,44.35,44.30,44.25,44.20,25.21,25.15,25.12,25.07,25.01,21.23,21.16,21.10,20.19,20.12.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 151.85,151.29,68.84,68.75.C69H75N13O14P2S(M+H)の分子量:計算値1404.4831、実測値1404.4813。
41a 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.25(s,1H),11.23(s,1H),8.78(s,1H),8.76(s,1H),8.73(s,1H),8.68(s,1H),8.04(d,J=7.5Hz,4H),7.71-7.59(m,2H),7.59-7.47(m,4H),6.25-6.18(m,2H),5.60(d,J=4.9Hz,1H),5.42(t,J=5.6Hz,1H),5.29(dd,J=10.9,4.8Hz,1H),4.88-4.80(m,1H),4.57-4.45(m,3H),4.42-4.31(m,2H),4.30-4.20(m,3H),3.71-3.61(m,2H),3.38(s,3H),3.33(s,3H),2.98(t,J=5.9Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.62,152.11,151.99,151.83,150.63,150.51,142.94,133.25,133.22,132.47,132.43,128.48,128.44,128.42,125.80,125.75,118.17,85.88,85.06,84.71,82.84,82.77,81.75,80.52,80.49,76.42,76.39,68.73,67.91,67.86,63.18,63.15,60.86,58.03,57.73,54.88,18.84,18.77.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 67.94.C39H40N11O11PS(M+Na)の分子量:計算値924.2266、実測値901.4。
41b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 11.25(s,1H),11.22(s,1H),8.78(s,1H),8.76(s,1H),8.75(s,1H),8.68(s,1H),8.04(dd,J=5.8,3.9Hz,4H),7.69-7.59(m,2H),7.59-7.49(m,4H),6.22(d,J=4.0Hz,1H),6.18(d,J=7.2Hz,1H),5.61(d,J=4.9Hz,1H),5.42(t,J=5.7Hz,1H),5.29(ddd,J=10.9,4.8,1.9Hz,1H),4.91-4.76(m,1H),4.59-4.48(m,2H),4.47-4.34(m,2H),4.34-4.29(m,1H),4.29-4.21(m,3H),3.77-3.56(m,2H),3.41(s,3H),3.37(s,3H),2.96(t,J=5.9Hz,2H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 165.61,152.11,151.96,151.83,150.63,150.51,142.99,142.93,133.26,133.22,132.47,132.42,128.47,128.44,128.41,125.80,125.76,118.13,85.95,85.09,84.68,82.76,82.69,81.70,80.49,76.32,68.70,67.85,67.82,63.28,63.25,60.81,58.06,57.78,18.80,18.73.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.05.C39H40N11O11PS(M+Na)の分子量:計算値924.2266、実測値924.2268。
42a 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.41(s,1H),8.22(s,1H),8.11(s,1H),7.92(s,1H),6.04(d,J=4.4Hz,1H),5.99(d,J=3.9Hz,1H),5.05-4.99(m,1H),4.63(t,J=5.0Hz,1H),4.42-4.35(m,3H),4.31-4.19(m,3H),3.98-3.85(m,2H),3.52(s,3H),3.49(s,3H).13C NMR(126MHz,D2O)δ 157.75,157.50,155.31,154.76,150.78,150.34,142.44,141.89,121.29,120.85,89.31,88.42,86.39,86.20,86.01,84.02,75.23,71.37,67.00,63.01,60.98,60.47.31P NMR(202MHz,D2O)δ 57.51.C22H29N10O9PS(M+H)の分子量:計算値641.1656、実測値641.1668。
42b 1H NMR(500MHz,重水)δ 8.38(s,1H),8.20(s,1H),8.10(s,1H),7.97(s,1H),6.08(d,J=4.6Hz,1H),5.91(d,J=5.4Hz,1H),5.04-4.98(m,1H),4.67(t,J=4.7Hz,1H),4.43(t,J=5.0Hz,1H),4.41-4.37(m,2H),4.37-4.33(m,1H),4.26-4.20(m,2H),3.83-3.74(m,2H),3.50(s,3H),3.46(s,3H).13C NMR(126MHz,D2O)δ 157.74,155.22,154.74,151.11,150.55,142.85,141.96,121.48,120.97,89.24,88.19,86.99,86.26,86.18,85.74,83.92,75.42,71.50,67.87,63.51,60.91,60.54.31P NMR(202MHz,D2O)δ 56.27.C22H29N10O9PS(M+H)の分子量:計算値641.1656、実測値641.1655。
45 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 12.05(s,1H),11.55(s,1H),11.21(d,J=10.6Hz,1H),8.74(d,J=13.1Hz,1H),8.67(d,J=6.5Hz,1H),8.12(d,J=3.0Hz,1H),8.03(d,J=7.6Hz,2H),7.64(t,J=7.4Hz,1H),7.54(t,J=7.7Hz,2H),7.34(d,J=7.6Hz,2H),7.28-7.17(m,7H),6.86-6.79(m,4H),6.18(t,J=5.5Hz,1H),5.89(d,J=7.6Hz,1H),5.22-5.12(m,1H),4.78-4.66(m,2H),4.62-4.54(m,1H),4.49-4.24(m,3H),4.17(dq,J=13.4,8.0,7.1Hz,3H),3.72-3.69(m,6H),3.36-3.34(m,4H),3.31(s,3H),3.26-3.18(m,1H),2.93-2.83(m,2H),2.75-2.64(m,1H),1.13-1.05(m,6H),0.93-0.83(m,9H),0.12(s,6H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 179.96,165.55,158.10,154.65,151.82,151.77,151.69,150.53,148.98,148.94,148.36,144.37,143.21,137.00,136.89,135.09,133.21,132.44,129.69,129.63,128.44,128.40,127.77,127.65,126.76,126.72,125.87,120.29,120.27,118.01,117.98,113.12,86.12,86.02,85.93,83.73,83.49,82.75,82.46,82.45,81.20,79.52,76.13,70.21,70.01,67.80,67.20,63.34,63.19,63.03,59.69,58.16,58.10,57.75,54.96,54.94,34.76,25.56,25.54,18.75,18.70,17.70,-4.84,-4.97,-5.03.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.60,68.33.C63H74N11O14PSSi(M+H)の分子量:計算値1300.4723、実測値1300.4712。
46a 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 12.06(s,1H),11.58(s,1H),11.20(s,1H),8.74(s,1H),8.64(s,1H),8.11(s,1H),8.02(d,J=7.5Hz,2H),7.63(t,J=7.4Hz,1H),7.53(t,J=7.7Hz,2H),7.34(d,J=7.5Hz,2H),7.28-7.16(m,8H),6.86-6.80(m,4H),6.19(d,J=4.6Hz,1H),5.89(d,J=7.6Hz,1H),5.58(d,J=5.6Hz,1H),5.18(dd,J=10.0,4.4Hz,1H),4.76-4.69(m,1H),4.52-4.43(m,2H),4.35-4.26(m,3H),4.22-4.14(m,3H),3.70(s,6H),3.38(s,3H),3.35(s,3H),3.34-3.32(m,1H),3.24(dd,J=10.5,4.1Hz,1H),2.88(t,J=5.8Hz,2H),2.74-2.66(m,1H),1.10(s,3H),1.09(s,3H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 180.01,165.58,158.12,158.10,154.68,151.91,151.81,150.53,149.00,148.41,144.42,142.94,136.93,135.14,135.13,133.24,132.45,129.72,129.67,128.47,128.41,127.80,127.68,126.76,125.78,120.27,118.09,113.15,85.99,85.97,83.64,82.69,82.62,82.55,81.72,79.67,79.63,75.97,75.94,68.70,67.90,67.87,63.32,63.28,63.14,58.14,57.78,54.98,54.96,34.78,18.77,18.71.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 67.27.C57H60N11O14PS(M+H)の分子量:計算値1186.3858、実測値1186.3893。
46b 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 12.04(s,1H),11.54(s,1H),11.19(s,1H),8.72(s,1H),8.62(s,1H),8.10(s,1H),8.03(d,J=7.4Hz,2H),7.63(t,J=7.4Hz,1H),7.53(t,J=7.7Hz,2H),7.34(d,J=7.4Hz,2H),7.26(t,J=7.6Hz,2H),7.23-7.17(m,5H),6.86-6.79(m,4H),6.18(d,J=4.1Hz,1H),5.91(d,J=7.6Hz,1H),5.56(d,J=5.3Hz,1H),5.17(dd,J=10.1,4.4Hz,1H),4.76-4.69(m,1H),4.49-4.38(m,3H),4.35-4.26(m,2H),4.23-4.09(m,3H),3.71(s,6H),3.38(s,3H),3.36-3.32(m,1H),3.29(s,3H),3.22(dd,J=10.5,4.1Hz,1H),2.91-2.86(m,2H),2.74-2.66(m,1H),1.09(s,3H),1.08(s,3H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 179.98,165.57,158.12,158.10,154.67,151.85,151.77,150.50,148.96,148.38,144.39,142.86,136.93,135.13,135.09,133.22,132.45,129.71,129.66,128.46,128.41,127.79,127.67,126.77,125.74,120.28,118.06,113.14,85.97,83.63,82.60,82.54,81.80,79.68,79.64,76.12,76.08,68.79,68.20,68.15,63.20,63.06,63.02,58.08,57.79,54.98,54.97,34.78,18.81,18.77,18.75.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 67.16.C57H60N11O14PS(M+H)の分子量:計算値1186.3858、実測値1186.3885。
47a 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 8.70(d,J=2.4Hz,1H),8.33(d,1H),7.91(d,J=7.0Hz,2H),7.82(d,J=3.0Hz,1H),7.60(t,J=7.4Hz,1H),7.47(t,J=7.6Hz,2H),7.41(d,J=7.8Hz,2H),7.30-7.24(m,6H),7.23-7.18(m,1H),6.83-6.77(m,4H),6.17-6.10(m,1H),5.80-5.73(m,1H),5.28-5.21(m,1H),4.93-4.85(m,1H),4.73-4.63(m,2H),4.43-4.19(m,7H),3.97-3.75(m,2H),3.74(s,6H),3.73-3.65(m,3H),3.52(s,1H),3.47(s,2H),3.41(d,J=5.1Hz,3H),3.36-3.29(m,1H),3.29-3.22(m,1H),2.83-2.76(m,2H),2.73-2.67(m,2H),2.56-2.47(m,1H),1.26-1.20(m,12H),1.14-1.03(m,7H).13C NMR(126MHz,cd3cn)δ 180.83,159.79,159.77,156.25,152.92,152.85,152.74,151.01,149.77,149.19,149.18,145.82,145.81,143.99,143.86,138.53,138.50,136.62,136.53,136.52,134.61,133.68,131.18,131.11,131.04,129.77,129.66,129.18,129.11,129.06,128.93,128.78,128.02,125.86,125.79,122.41,122.39,119.74,119.71,114.14,114.01,88.85,88.40,87.49,86.22,83.96,83.93,83.20,83.11,82.91,82.89,82.73,82.69,82.67,82.62,81.58,81.55,77.01,76.97,76.93,72.05,71.92,71.59,71.47,68.24,68.21,67.94,67.90,64.44,64.40,64.16,64.13,60.02,59.88,59.50,59.34,59.30,59.28,59.06,59.05,55.97,55.91,48.19,44.32,44.26,44.22,44.16,36.78,25.19,25.17,25.14,25.11,25.05,25.00,24.99,24.95,21.21,21.15,21.10,20.19,20.13,19.84,19.27,19.26,19.19.31P NMR(202MHz,CD3CN)δ 151.68,151.17,68.81,68.70.C66H77N13O15P2S(M+H)の分子量:計算値1386.4936、実測値1386.4935。
47b 1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 8.75-8.70(m,1H),8.40-8.34(m,1H),8.00(d,J=7.6Hz,2H),7.84(s,1H),7.63(t,J=7.4Hz,1H),7.52(t,J=7.5Hz,2H),7.41(d,J=7.7Hz,2H),7.31-7.26(m,6H),7.23-7.18(m,1H),6.85-6.80(m,4H),6.18-6.14(m,1H),5.89-5.85(m,1H),5.36-5.27(m,1H),4.84-4.76(m,1H),4.67(dt,J=20.5,4.7Hz,1H),4.63-4.58(m,1H),4.54-4.37(m,3H),4.36-4.30(m,1H),4.18-4.01(m,2H),3.94-3.76(m,2H),3.74(s,6H),3.73-3.65(m,3H),3.49(s,1H),3.44(s,2H),3.36(s,4H),3.35-3.29(m,2H),2.73-2.64(m,4H),2.58-2.51(m,1H),1.25-1.20(m,12H),1.09-1.04(m,7H).13C NMR(126MHz,cd3cn)δ 180.97,180.95,159.81,159.78,156.30,152.90,152.79,151.00,149.55,149.54,149.19,149.16,145.73,143.92,143.79,138.59,138.54,136.60,136.54,136.53,134.67,133.73,131.13,131.05,129.72,129.36,129.22,129.12,128.93,128.05,125.91,125.84,122.44,122.43,119.74,114.14,113.99,88.80,88.40,87.50,87.49,86.67,86.65,83.71,83.64,83.48,83.43,83.25,83.21,83.17,83.13,82.90,82.88,82.70,82.66,81.95,81.92,76.65,72.45,72.33,71.81,71.68,68.92,68.88,68.69,68.64,64.21,64.18,63.87,63.84,60.03,59.88,59.28,59.25,58.99,58.97,55.98,55.97,48.18,44.33,44.26,44.24,44.16,36.77,25.15,25.14,25.10,25.08,25.04,24.98,24.92,21.20,21.15,21.13,21.07,20.11,20.04,19.76,19.45,19.44,19.10,19.09.31P NMR(202MHz,cd3cn)δ 152.00,151.26,68.81,68.72.C66H77N13O15P2S(M+H)の分子量:計算値1386.4936、実測値1386.4927。
48a 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 12.07(s,1H),11.67(s,1H),11.22(s,1H),8.77(s,1H),8.67(s,1H),8.30(s,1H),8.03(d,J=7.4Hz,2H),7.64(t,J=7.4Hz,1H),7.54(t,J=7.6Hz,2H),6.20(d,J=4.1Hz,1H),5.91-5.85(m,1H),5.61(d,J=5.5Hz,1H),5.37(t,J=5.3Hz,1H),5.19(dd,J=10.5,4.6Hz,1H),4.61(dt,J=7.7,3.4Hz,1H),4.54-4.46(m,2H),4.37(ddt,J=18.7,11.1,5.9Hz,2H),4.27-4.15(m,4H),3.59(d,J=4.5Hz,2H),3.40(s,3H),3.32(s,3H),2.93(t,J=5.8Hz,2H),2.77-2.67(m,1H),1.10(d,J=6.8Hz,6H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 180.06,165.61,164.38,154.71,151.92,151.84,150.52,149.01,148.45,143.00,137.10,133.22,132.46,128.46,128.43,125.80,119.97,118.17,86.00,84.65,84.64,83.66,82.71,82.64,81.70,80.83,80.79,76.70,76.66,71.06,68.70,67.95,67.91,63.27,63.24,60.72,58.01,57.81,34.76,18.81,18.77,18.73.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.30.C36H42N11O12PS(M+H)の分子量:計算値884.2551、実測値884.2556。
48b 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 12.06(s,1H),11.63(s,1H),11.20(s,1H),8.75(s,1H),8.66(s,1H),8.29(s,1H),8.02(d,J=7.3Hz,2H),7.64(t,J=7.4Hz,1H),7.54(t,J=7.6Hz,2H),6.20(d,J=4.1Hz,1H),5.88(d,J=7.9Hz,1H),5.62-5.55(m,1H),5.34(t,J=5.2Hz,1H),5.17(dd,J=10.5,4.6Hz,1H),4.63-4.55(m,1H),4.53-4.41(m,3H),4.37-4.29(m,1H),4.27-4.16(m,4H),3.62-3.50(m,2H),3.39(s,3H),3.27(s,3H),2.96(t,J=5.8Hz,2H),2.76-2.66(m,1H),1.09(d,J=6.7Hz,6H).13C NMR(126MHz,DMSO)δ 180.05,165.59,154.70,151.89,151.81,150.51,148.99,148.43,143.00,137.08,133.21,132.47,128.47,128.43,125.78,119.96,118.23,86.01,84.63,83.65,82.69,82.62,81.73,80.88,80.84,76.72,76.68,68.78,68.20,68.16,63.15,63.12,60.72,57.94,57.80,34.76,18.84,18.80,18.76.31P NMR(202MHz,DMSO)δ 68.19.C36H42N11O12PS(M+H)の分子量:計算値884.2551、実測値884.2552。
49a 1H NMR(400MHz,重水)δ 8.41(s,1H),8.17(s,1H),7.92(s,1H),6.14(d,J=4.9Hz,1H),5.75(d,J=5.1Hz,1H),5.04-4.95(m,1H),4.68(t,J=4.8Hz,1H),4.45-4.34(m,3H),4.34-4.27(m,1H),4.27-4.19(m,2H),3.79(d,J=3.1Hz,2H),3.49(d,J=8.3Hz,6H),3.36(s,1H),2.61(s,2H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 158.74,155.56,153.59,153.01,151.16,148.88,139.66,137.71,118.69,116.69,86.17,85.81,84.15,84.12,83.94,83.86,83.38,81.37,81.33,72.76,72.71,69.11,65.61,65.56,61.07,58.55,58.10.31P NMR(202MHz,d2o)δ 56.07.C22H29N10O10PS(M+H)の分子量:計算値657.1605、実測値657.1580。
49b 1H NMR(400MHz,重水)δ 8.46(s,1H),8.17(s,1H),7.90(s,1H),6.13(d,J=4.4Hz,1H),5.80(d,J=3.2Hz,1H),5.04(dt,J=11.4,5.6Hz,1H),4.65(t,J=4.9Hz,1H),4.43-4.37(m,1H),4.35-4.25(m,4H),4.25-4.16(m,1H),3.98-3.80(m,2H),3.51(d,J=9.7Hz,6H),2.61(s,2H).13C NMR(126MHz,d2o)δ 158.51,155.51,153.42,153.00,150.82,148.59,139.64,137.36,118.60,116.59,86.68,86.08,83.83,83.71,83.63,83.57,83.53,81.43,81.41,72.79,72.75,69.08,64.67,64.61,60.68,58.63,58.00.31P NMR(202MHz,d2o)δ 57.53.C22H29N10O10PS(M+H)の分子量:計算値657.1605、実測値657.1583。
1.2:Rf=0.18(ヘキサン:EtOAc、2:1)1H NMR(DMSO-d6,400MHz)δ 11.46(s,1H),7.87(d,J=8.0Hz,1H),7.22-7.38(m,9H),6.87-6.90(m,4H),5.89(d,J=20.4Hz,1H),5.32-5.34(d,J=8.4Hz,1H),5.12-5.27(m,1H),4.51(ddd,J=22.8Hz,8.8Hz,4.4Hz,1H),3.96-3.98(m,1H),3.73(s,6H),3.43(d,J=9.6Hz,1H),3.15(dd,J=11.0Hz,3.9Hz,1H),0.74(s,9H),0.034(s,3H),-0.059(s,3H).13C NMR(DMSO-d6,100MHz)δ 163.3,158.2,150.1,144.4,141.1,135.0,129.8,127.7,126.9,113.2,101.4,93.5,89.3,88.9,85.9,81.0,68.9,68.7,61.2,55.1,25.4,17.6,-4.9,-5.5.19F NMR(DMSO-d6,376MHz)δ -202.39,-202.44,-202.50,-202.53,-202.59,-202.65.C36H43FN2NaO7Si(M+Na)の分子量:計算値685.27、実測値685.3。
1.3:Rf=0.20(ヘキサン:EtOAc)。1H NMR(DMSO-d6,400MHz)δ 11.41(s,1H),7.89(d,J=8.0Hz,1H),5.89(dd,J=17.9Hz,1.9Hz,1H),5.64(d,J=8.0Hz,1H),5.03-5.23(m,2H),4.33(ddd,J=18.9Hz,7.1Hz,4.5Hz,1H),3.86-3.88(m,1H),3.76(d,J=12.0Hz,1H),3.54(d,J=12.0Hz,1H),0.87(s,9H),0.10(s,3H),0.10(s,3H).13C NMR(DMSO-d6,100MHz)δ 163.2,150.3,140.6,101.7,93.5,91.6,87.6,87.3,83.4,68.8,68.6,59.1,25.6,17.8,-4.9,-5.2.19F NMR(DMSO-d6,376MHz)δ -205.34,-205.38,-205.43,-205.48,-205.53,-205.57.C15H26FN2O5Si(M+H)の分子量:計算値361.16、実測値361.2。
1.6a:Sp異性体、Rf=0.47(ヘキサン:EtOAc、1:4)。1H NMR(CD3CN,400MHz)δ 9.29-9.31(m,2H),7.27-7.79(m,9H),6.91-6.93(m,4H),6.01(d,J=6.4Hz,1H),5.87(d,J=1.6Hz,0.5H),5.82(d,J=1.6Hz,0.5H),5.65(d,J=8.4Hz,1H),5.22(ddd,J=10.7Hz,5.1Hz,3.2Hz,1H),5.13(dd,J=4.7,1.6Hz,0.5H),5.00(dd,J=4.7,1.6Hz,0.5H),4.47-4.53(m,2H),4.13-4.38(m,6H),3.80(s,6H),3.67(dd,J=11.0Hz,3.5Hz,1H),3.38-3.58(m,4H),3.24(s,3H),2.71-2.75(m,2H),1.47(d,J=1.2Hz,3H),1.07(d,J=6.4Hz,3H),0.94(s,9H),0.17(s,3H),0.15(s,3H).13C NMR(CD3CN,100MHz)δ 164.8,164.3,160.2,152.0,151.5,151.1,145.9,142.3,137.3,136.6,131.5,129.4,128.5,125.2,114.6,112.2,103.4,94.7,92.8,91.4,91.0,88.4,87.4,83.5,82.3,82.2,81.6,77.7,77.3,77.2,75.7,70.8,70.7,68.1,64.6,64.2,57.3,56.3,28.2,26.4,20.5,20.4,19.0,16.4,15.7,12.6,-4.2,-4.4.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 67.17.19F NMR(CD3CN,376MHz)δ -203.34,-203.40,-203.45,-203.49,-203.54,-203.59.C53H67FN5NaO15PSSi(M+Na)の分子量:計算値1146.37、実測値1146.3。
1.6b:Rp異性体、Rf=0.27(ヘキサン:EtOAc、1:4)。1H NMR(CD3CN,400MHz)δ 9.33(brs,2H),7.27-7.50(m,9H),6.89-6.93(m,4H),6.00(d,J=6.6Hz,1H),5.75(dd,J=20.6,1.3Hz,1H),5.60(d,J=8.0Hz,1H),5.26(ddd,J=10.7Hz,5.1Hz,2.9Hz,1H),5.07(ddd,J=53.3Hz,4.8Hz,1.3Hz,1H),4.17-4.47(m,6H),4.04-4.06(m,1H),3.79(s,6H),3.70(dd,J=10.8Hz,3.2Hz,1H),3.49-3.58(m,2H),3.26-3.36(m,3H),3.25(s,3H),2.84(t,J=5.9Hz,2H),1.43(s,3H),1.10(d,J=6.2Hz,3H),0.92(s,9H),0.15(s,3H),0.14(s,3H).13C NMR(CD3CN,100MHz)δ 164.8,164.4,160.2,155.9,152.1,151.5,145.9,142.5,137.5,136.6,136.5,131.5,131.5,129.4,129.4,128.5,125.2,114.6,112.3,103.4,94.7,92.9,91.9,91.5,88.4,87.2,83.6,82.0,81.9,81.8,77.6,77.5,75.7,70.5,70.3,67.5,64.8,64.7,64.1,57.2,56.3,28.2,26.4,20.5,19.0,16.4,15.7,12.6,-4.2,-4.4.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 67.55.19F NMR(CD3CN,376MHz)δ -202.41,-202.47,-202.52,-202.56,-202.61,-202.67.
1.7a:Sp異性体、Rf=0.28(ヘキサン:EtOAc、1:4)。1H NMR(DMSO-d6,400MHz)δ 11.55-11.35(m,2H),7.69-7.54(m,1H),7.46(s,1H),7.19-7.43(m,10H),,6.89-6.91(m,4H),5.91(d,J=6.8Hz,1H),5.85(d,J=21.0Hz,1H),5.62(dd,J=8.0Hz,2.1Hz,1H),5.14-5.29(m,2H),4.06-4.49(m,8H),3.74(s,6H),3.71-3.72(m,2H),3.31-3.46(m,3H),3.17(s,3H),2.86(t,J=5.8Hz,2H),1.38(s,3H),0.88(s,9H),0.12(s,3H),0.11(s,3H).13C NMR(DMSO-d6,100MHz)δ 163.5,163.2,158.3,154.0,150.6,150.2,144.3,141.4,135.3,135.2,134.8,129.8,129.7,128.0,127.7,127.0,120.7,118.0,113.3,110.2,101.9,92.8,91.0,89.5,89.2,86.4,85.6,81.6,80.3,79.0,76.2,71.7,69.8,69.2,69.1,66.7,63.1,63.0,58.3,55.1,26.5,25.5,18.9,18.8,17.7,14.9,11.6,-4.9,-5.2.31P NMR(DMSO-d6,162MHz)δ 71.96.19F NMR(DMSO-d6,376MHz)δ -202.51,-202.57,-202.62,-202.65,-202.71,-202.76.C52H65FN5NaO15PSSi(M+Na)の分子量:計算値1132.36、実測値1132.2。
1.7b:Rp異性体、Rf=0.10(ヘキサン:EtOAc、1:4)。1H NMR(DMSO-d6,400MHz)δ 11.53-11.33(m,2H),7.57(d,J=8.1Hz,1H),7.48(s,1H),7.23-7.40(m,10H),6.88-6.90(m,4H),5.89(d,J=6.4Hz,1H),5.83(d,J=19.9Hz,1H),5.60(dd,J=8.1Hz,2.1Hz,1H),5.11-5.26(m,2H),3.97-4.45(m,8H),3.73(s,6H),3.70-3.77(m,2H),3.21-3.49(m,3H),3.20(s,3H),2.95(t,J=5.8Hz,2H),1.38(s,3H),0.85(s,9H),0.10(s,3H),0.090(s,3H).13C NMR(DMSO-d6,100MHz)δ 163.6,163.2,158.3,150.5,150.1,144.3,141.2,135.4,135.1,134.8,129.8,128.0,127.7,127.0,118.2,113.3,110.1,101.9,92.9,91.1,89.4,89.1,86.4,85.9,81.6,80.2,80.1,79.1,75.8,71.6,69.8,69.0,68.8,66.1,63.4,63.3,62.7,58.3,55.1,30.2,26.5,25.5,20.8,18.9,18.8,18.6,17.7,15.0,13.6,11.6,-4.9,-5.2.31P NMR(DMSO-d6,162MHz)δ 72.24.19F NMR(DMSO-d6,376MHz)δ -202.50,-202.56,-202.61,-202.65,-202.70,-202.76.C52H65FN5NaO15PSSi(M+Na)の分子量:計算値1132.36、実測値1132.2。
1.8a:Sp異性体、Rf=0.22 5%(DCM中、MeOH)。1H NMR(CD3CN,400MHz)δ 9.10(s,2H),7.24-7.49(m,11H),6.88-6.90(m,4H),5.97(d,J=6.8Hz,1H),5.74-5.88(m,1H),5.60(d,J=8.1Hz,1H),5.17(ddd,J=10.5Hz,4.9Hz,2.6Hz,1H),5.04(dd,J=52.5Hz,4.0Hz,1H),4.11-4.51(m,5H),3.87(d,J=7.1Hz,1H),3.77(s,6H),3.68-3.71(m,1H),3.32-3.51(m,4H),3.21(s,3H),2.72(td,J=5.5Hz,3.1Hz,2H),1.42(s,3H),1.04(d,J=6.1Hz,3H).13C NMR(CD3CN,100MHz)δ 164.8,164.3,160.3,152.1,151.5,145.9,142.0,137.3,136.7,136.6,131.5,129.5,128.6,114.7,112.4,103.3,95.6,93.7,91.0,90.7,88.5,87.1,83.7,82.0,81.9,77.6,75.8,69.9,69.7,68.4,64.6,64.5,64.3,57.2,56.4,20.5,20.4,16.4,12.6.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 72.66.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -204.02,-204.08,-204.13,-204.16,-204.22,-204.27.
1.8b:Rp異性体、Rf=0.21(CH2Cl2中、5%MeOH)。1H NMR(CD3CN,400MHz)δ 9.12(s,2H),7.24-7.46(m,11H),6.87-6.90(m,4H),5.97(d,J=6.6Hz,1H),5.74(d,J=19.3Hz,1H),5.57(d,J=8.1Hz,1H),5.22(ddd,J=10.7Hz,5.1Hz,2.9Hz,1H),5.03(dd,J=53.1Hz,4.7Hz,1H),4.43(t,J=5.3Hz,1H),4.19-4.36(m,3H),4.04(s,1H),3.77(s,6H),3.66-3.70(m,2H),3.41-3.56(m,2H),3.27-3.39(m,2H),3.23(s,3H),2.82(t,J=5.9Hz,2H),1.41(s,3H),1.07(d,J=6.1Hz,3H).13C NMR(CD3CN,100MHz)δ 164.8,164.3,160.3,152.1,151.5,146.0,142.3,137.3,136.7,136.6,131.5,129.5,128.5,114.7,112.4,103.4,95.5,93.6,91.5,91.2,88.4,87.3,83.6,81.8,81.7,77.6,77.5,77.4,75.8,69.8,69.7,68.1,68.0,64.8,64.7,64.2,57.2,56.4,20.5,16.4,12.6.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 72.86.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -203.18,-203.24,-203.29,-203.32,-203.38,-203.43.
1.9a:Sp異性体、Rf=0.26(CH2Cl2中、5%MeOH)。1H NMR(CD3CN,400MHz)δ 9.32(s,2H),7.24-7.53(m,11H),6.88-6.90(m,4H),5.97(d,J=6.8Hz,1H),5.84(d,J=19.2Hz,1H),5.63(d,J=8.1Hz,1H),5.22(ddd,J=10.4Hz,4.9Hz,2.5Hz,1H),5.04(dd,J=53.0Hz,4.5Hz,1H),4.08-4.55(m,8H),3.94(s,1H),3.77(s,6H),3.72-3.83(m,2H),3.48-3.51(m,2H),3.40(dd,J=11.0Hz,2.8Hz,1H),3.33(dd,J=11.0Hz,2.7Hz,1H),3.24(s,3H),2.72(td,J=5.6Hz,2.5Hz,2H),1.40(s,3H).13C NMR(CD3CN,100MHz)δ 174.4,164.8,164.3,160.2,152.1,151.5,145.9,141.8,137.3,136.6,136.5,131.5,129.4,125.1,114.6,112.4,103.2,95.6,93.7,90.8,90.5,88.4,87.1,83.6,83.5,81.9,81.8,81.5,81.4,77.9,73.4,71.8,69.7,69.5,68.1,64.5,64.4,64.2,59.6,56.3,20.5,20.4,12.6.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -204.24,-204.30,-204.35,-204.39,-204.44,-204.50.C43H47FN4O15PS(M-CH2CH2CN)の分子量:計算値941.25、実測値941.2。
1.9b:Rp異性体、Rf=0.21(CH2Cl2中、5%MeOH)。1H NMR(CD3CN,400MHz)δ 9.30(s,2H),7.22-7.48(m,11H),6.88-6.90(m,4H),5.96(d,J=6.5Hz,1H),5.70-5.80(m,1H),5.58(d,J=8.1Hz,1H),5.26(ddd,J=10.7Hz,5.1Hz,3.0Hz,1H),5.04(dd,J=52.8Hz,4.2Hz,1H),4.40(t,J=5.4Hz,1H),4.23-4.34(m,6H),4.00-4.08(m,1H),3.78-3.80(m,3H),3.77(s,6H),3.45-3.57(m,2H),3.36(dd,J=11.0Hz,2.9Hz,1H),3.30(dd,J=11.0Hz,2.6Hz,1H),3.26(s,3H),2.82(t,J=5.9Hz,2H),1.40(s,3H).13C NMR(CD3CN,100MHz)δ 164.8,164.3,160.2,152.1,151.4,145.9,142.2,137.3,136.6,136.5,131.5,129.4,125.1,114.6,112.3,103.3,95.5,93.6,91.4,91.1,88.3,87.3,83.5,81.7,81.4,77.6,77.5,73.4,71.7,69.7,69.5,68.0,67.9,64.7,64.1,59.6,56.3,20.5,20.4,12.5.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 72.76.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -203.21,-203.27,-203.32,-203.36,-203.41,-203.47.C43H47FN4O15PS(M-CH2CH2CN)の分子量:計算値941.25、実測値941.2。
1.10:Rf=0.39(ヘキサン:EtOAc、2:1)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 8.09(d,J=8.2Hz,1H),8.00-8.06(m,2H),7.76(t,J=7.4Hz,1H),7.55(t,J=7.7Hz,2H),7.15-7.44(m,9H),6.88-6.91(m,4H),5.94(d,J=20.0Hz,1H),5.56(d,J=8.0Hz,1H),5.23(dd,J=53.4Hz,4.4Hz,1H),4.52(ddd,J=23.3Hz,9.1Hz,4.4Hz,1H),3.92-4.09(m,1H),3.74(s,6H),3.47(d,J=10.3Hz,1H),3.20(dd,J=11.1Hz,3.6Hz,1H),0.74(s,9H),0.046(s,3H),-0.052(s,3H).13C NMR(101MHz,DMSO-d6)δ 169.3,161.9,158.2,149.6,148.7,144.3,141.8,135.6,135.1,134.9,131.0,130.5,129.8,129.4,127.9,127.7,126.9,123.9,113.2,100.9,93.4,91.6,89.5,89.2,85.9,81.2,68.6,68.4,61.0,55.1,25.4,17.5,-4.8,-5.4.19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -202.92(brs).C43H47FN2NaO8Si(M+Na)の分子量:計算値789.30、実測値789.2。
1.11:Rf=0.21(ヘキサン:EtOAc、1:1)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 8.14(d,J=8.2Hz,1H),8.03(d,J=7.4Hz,2H),7.80(t,J=7.4Hz,1H),7.61(t,J=7.8Hz,2H),5.90-5.96(m,2H),5.34(t,J=4.7Hz,1H),5.09-5.23(m,1H),4.38(ddd,J=20.3Hz,7.6Hz,4.4Hz,1H),3.92(d,J=7.5Hz,1H),3.81-3.95(m,1H),3.58(ddd,J=12.4Hz,4.8Hz,3.0Hz,1H),0.88(s,9H),0.122(s,3H),0.115(s,3H).13C NMR(100MHz,DMSO-d6)δ 169.40,161.9,148.9,141.3,135.6,131.1,130.5,129.5,101.2,93.6,91.8,88.1,87.8,83.6,68.5,68.3,58.7,25.5,17.7,-4.9,-5.1.19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ -204.99,-205.04,-205.10,-205.14,-205.19,-205.23.
1.12a:Sp異性体、Rf=0.71(ヘキサン:EtOAc、1:4)。1H NMR(400MHz,CD3CN)δ 9.10(s,1H),7.98-8.00(m,2H),7.24 -7.72(m,14H),6.88-6.90(m,4H),5.99(d,J=6.6Hz,1H),5.90(dd,J=18.5Hz,1.1Hz,1H),5.84(d,J=8.2Hz,1H),5.27(ddd,J=10.8Hz,5.1Hz,2.9Hz,1H),4.99 -5.13(m,1H),4.56(ddd,J=11.6Hz,6.6Hz,1.8Hz,1H),4.47(t,J=5.6Hz,1H),4.27-4.35(m,3H),4.12-4.18(m,3H),3.78-3.80(m,2H),3.77(s,6H),3.48-3.52(m,2H),3.40(dd,J=10.9Hz,3.0Hz,1H),3.33(dd,J=11.0Hz,2.7Hz,1H),3.24(s,3H),2.70(dd,J=9.3Hz,5.6Hz,2H),1.41(s,3H),0.91(s,9H),0.14(s,3H),0.13(s,3H).13C NMR(100MHz,CD3CN)δ 225.9,170.7,164.8,163.5,160.3,152.0,150.6,145.9,142.3,136.7,136.6,132.7,131.7,131.5,130.8,129.4,125.2,118.7,114.6,112.3,103.2,94.7,92.9,91.2,90.8,88.4,87.5,83.6,82.5,82.4,81.4,81.3,77.9,73.5,71.7,70.6,70.4,67.7,64.6,64.3,59.7,56.34,28.2,26.4,20.5,20.4,19.0,15.7,12.6,-4.2,-4.4.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 72.57.19F NMR(CD3CN,376MHz)δ -204.23,-204.28,-204.33,-204.37,-204.42,-204.48.C59H69FN5NaO16PSSi(M+Na)の分子量:計算値1236.38、実測値1236.3。
1.12b:Rp異性体、Rf=0.40(ヘキサン:EtOAc、1:4)。1H NMR(400MHz,CD3CN)δ 9.11(s,1H),7.97-7.99(m,2H),7.24-7.65(m,14H),6.88-6.90(m,4H),6.00(d,J=6.4Hz,1H),5.82-5.89(m,2H),5.31(ddd,J=10.9Hz,5.0Hz,3.1Hz,1H),5.02(dd,J=52.7Hz,4.5Hz,1H),4.43(t,J=5.7Hz,1H),4.22-4.34(m,6H),4.07-4.09(m,1H),3.80(t,J=4.2Hz,2H),3.76(s,6H),3.46-3.57(m,2H),3.40(dd,J=11.0Hz,2.8Hz,1H),3.34(dd,J=10.9Hz,2.6Hz,1H),3.26(s,3H),2.82(t,J=5.9Hz,2H),1.39(s,3H),0.89(s,9H),0.13(s,3H),0.11(s,3H).13C NMR(100MHz,CD3CN)δ 170.7,164.8,163.5 160.3,151.9,150.6,145.9,142.0,137.4,136.8,136.5,132.7,131.7,131.6,131.5,130.8,129.4,125.2,119.0,118.7,114.6,112.3,111.1,103.2,94.8,92.9,91.1,90.7,88.4,87.5,83.6,82.3,82.2,81.5,81.4,77.8,73.4,71.8,70.3,70.1,67.2,64.9,64.8,64.1,59.6,56.3,26.4,20.6,20.5,19.0,12.6,-4.2,-4.4.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 73.05.19F NMR(CD3CN,376MHz)δ -203.94,-203.99,-204.05,-204.08,-204.13,-204.19.C59H69FN5NaO16PSSi(M+Na)の分子量:計算値1236.38、実測値1236.3。
1.13a:Sp異性体、Rf=0.46(CH2Cl2中、5%MeOH)。1H NMR(400MHz,CD3CN)δ 9.22(s,1H),7.98 -8.00(m,2H),7.81(d,J=8.3Hz,1H),7.25-7.57(m,13H),6.89-6.91(m,4H),6.00(d,J=7.2Hz,1H),5.89(d,J=17.8Hz,1H),5.83(d,J=8.3Hz,1H),5.21(ddd,J=9.6Hz,4.7Hz,2.0Hz,1H),5.10(dd,J=52.7Hz,4.2Hz,1H),4.53(ddd,J=11.7Hz,6.1Hz,1.8Hz,1H),4.33-4.44(m,4H),4.12-4.22(m,3H),3.82-3.86(m,2H),3.77(s,6H),3.49(t,J=4.3Hz,2H),3.43(dd,J=11.0Hz,2.9Hz,1H),3.35(dd,J=11.0Hz,2.9Hz,1H),3.23(s,3H),2.73(dt,J=9.2Hz,4.7Hz,2H),1.41(s,3H).13C NMR(100MHz,CD3CN)δ 225.4,170.5,164.4,163.3,159.9,151.8,150.2,145.6,141.6,136.5,136.2,136.1,132.5,131.4,131.2,130.5,129.1,124.8,114.3,112.2,102.5,95.4,93.6,90.5,90.2,88.2,86.4,83.4,83.3,81.7,81.6,81.2,78.1,72.9,71.6,68.9,68.8,67.3,64.1,59.3,56.0,20.2,20.1,12.2.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 72.42.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -205.08,-205.13,-205.18,-205.21,-205.27,-205.32.
1.13b:Rp異性体、Rf=0.38(CH2Cl2中、5%MeOH)。1H NMR(400MHz,CD3CN)δ 9.17(s,1H),7.98(d,J=7.3Hz,2H),7.65(d,J=8.3Hz,1H),7.24-7.66(m,13H),6.88-6.90(m,4H),5.99(d,J=6.5Hz,1H),5.81-5.88(m,2H),5.29(ddd,J=10.8Hz,5.0Hz,3.0Hz,1H),5.05(dd,J=52.5Hz,4.3Hz,1H),4.43(t,J=5.4Hz,1H),4.09-4.35(m,7H),3.79-3.82(m,2H),3.76(s,6H),3.48-3.59(m,2H),3.40(dd,J=11.0Hz,2.9Hz,1H),3.34(dd,J=11.0Hz,2.7Hz,1H),3.26(s,3H),2.83(t,J=5.9Hz,2H),1.40(s,3H).13C NMR(100MHz,CD3CN)δ 170.3,164.4,163.1,159.9,151.6,150.2,145.6,141.6,136.6,136.5,136.2,132.4,131.4,131.2,130.5,129.1,124.8,114.3,112.0,102.8,95.2,93.4,90.6,90.2,88.1,87.1,83.3,83.2,81.6,81.5,81.1,77.4,77.3,73.1,71.4,69.2,69.0,67.4,67.3,64.5,63.8,59.3,56.0,20.2,20.1,12.2.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 72.89.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -204.52,-204.57,-204.58,-204.63,-204.66,-204.71,-204.77.
1.14a:Sp異性体、Rf=0.43(CH2Cl2:EtOAc、1:1)。1H NMR(400MHz,CD3CN)δ 9.08(s,1H),7.24-7.77(m,16H),6.88-6.90(m,4H),5.82-5.99(m,3H),5.13-5.31(m,2H),4.09-4.67(m,8H),3.31-3.87(m,16H),3.24(s,3H),2.64-2.86(m,4H),1.41(s,3H),1.15-1.28(m,12H).13C NMR(100MHz,CD3CN)δ 225.3,225.2,170.6,164.7,163.5,160.2,152.0,151.1,150.6,145.9,142.5,142.3,136.9,136.6,132.7,131.7,131.5,130.8,129.4,128.5,125.1,120.1,118.7,114.6,112.3,103.3,103.2,94.9,92.4,91.6,91.2,88.4,87.5,83.6,81.7,81.4,77.8,73.6,73.5,71.7,71.0,70.9,70.7,67.8,67.5,65.2,64.6,64.5,64.3,60.3,60.1,60.0,59.8,59.7,56.3,48.7,44.7,44.5,25.5,25.4,25.3,25.2,25.19,25.2,23.1,21.7,21.5,21.4,20.5,20.4,14.4,12.6,2.3,2.1,1.9,1.7,1.5,1.3,1.1.31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 156.40,156.36,156.28,72.67.19F NMR(376MHz,CD3CN)δ -201.75,-201.87,-202.37,-202.52.
1.14b:Rp異性体、Rf=0.23(CH2Cl2:EtOAc、1:1)。1H NMR(400MHz,CD3CN)δ 8.99(s,1H),7.24-7.99(m,16H),6.88-6.90(m,4H),5.99(dd,J=6.5Hz,3.0Hz,1H),5.87(dd,J=18.9Hz,8.5Hz,1H),5.81(dd,J=8.2Hz,1.5Hz,1H),5.10-5.34(m,2H),4.00-4.45(m,8H),3.32-3.84(m,16H),3.26(s,3H),2.62-2.84(m,4H),1.38(s,3H),1.13-1.24(m,12H).31P NMR(CD3CN,162MHz)δ 156.37,156.32,156.13,156.08,72.91,72.84.
1H NMR(500MHz,クロロホルム-d)δ 9.07(s,1H),8.80(s,1H),8.31(s,1H),8.06-8.00(m,2H),7.65-7.58(m,1H),7.53(t,J=7.6Hz,3H),7.42-7.36(m,3H),7.36-7.16(m,16H),6.83-6.74(m,5H),6.31(dd,J=17.2,1.7Hz,1H),5.88(d,J=6.4Hz,1H),5.32-5.20(m,2H),4.39(dd,J=7.1,3.7Hz,1H),3.94(dq,J=9.0,6.3Hz,1H),3.77(d,J=1.4Hz,8H),3.67-3.53(m,3H),3.40(dd,J=11.1,3.4Hz,1H),3.21(tt,J=10.6,6.6Hz,1H),1.20(dq,J=11.7,5.7Hz,2H),0.96(dq,J=12.6,8.9Hz,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 155.91,155.88.
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 9.06(s,1H),8.79(s,1H),8.22(s,1H),8.06-7.99(m,2H),7.66-7.48(m,3H),7.42-7.11(m,14H),6.83-6.68(m,4H),6.31(dd,J=16.9,2.2Hz,1H),5.85(t,J=4.8Hz,1H),4.37(dt,J=7.0,3.4Hz,1H),3.98(dq,J=8.6,6.2Hz,1H),3.74(d,J=1.7Hz,6H),3.63-3.51(m,2H),3.40(dd,J=11.0,4.1Hz,1H),3.18-3.05(m,1H),2.04(s,2H),1.63(d,J=8.6Hz,2H),1.26-1.14(m,1H),0.96(dq,J=12.6,8.7Hz,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 155.80,155.76.
1H NMR(500MHz,クロロホルム-d)δ 8.97(s,1H),8.66(d,J=7.4Hz,1H),7.45-7.39(m,2H),7.34(q,J=2.9Hz,5H),7.32-7.23(m,9H),7.03(d,J=7.5Hz,1H),6.90-6.82(m,4H),5.94(s,1H),5.89(d,J=6.2Hz,1H),4.73(ddd,J=9.5,7.4,4.8Hz,1H),4.31(dt,J=9.7,2.2Hz,1H),3.87(dq,J=9.2,6.4Hz,2H),3.81(d,J=3.0Hz,8H),3.66-3.49(m,7H),2.21(s,3H),1.67(s,4H),1.16(dtd,J=12.5,6.2,3.7Hz,2H),0.96(dq,J=12.5,9.2Hz,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 158.17,154.18.
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 9.28(s,1H),8.55(d,J=7.5Hz,1H),7.42-7.16(m,16H),6.96(d,J=7.5Hz,1H),6.91-6.73(m,4H),6.01(s,1H),5.76(d,J=6.4Hz,1H),4.73(ddd,J=9.2,7.7,4.7Hz,1H),4.31(dt,J=9.3,2.3Hz,1H),3.99-3.86(m,2H),3.86-3.68(m,9H),3.67-3.50(m,4H),3.17(tdd,J=10.5,7.7,5.8Hz,1H),2.23(s,3H),2.04(s,2H),1.66-1.56(m,2H),1.23-1.14(m,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 157.63.
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.96(s,1H),8.53(s,1H),8.15(s,1H),7.43-7.12(m,15H),6.80-6.70(m,4H),6.26(dd,J=18.3,1.7Hz,1H),5.89(d,J=6.4Hz,1H),5.30(dtd,J=16.3,8.2,4.5Hz,1H),4.34(dd,J=7.7,3.3Hz,1H),3.95(dq,J=8.9,6.3Hz,1H),3.76(d,J=1.3Hz,6H),3.65-3.51(m,2H),3.35(dd,J=11.0,3.5Hz,1H),3.26(s,3H),3.21(s,4H),2.04(s,1H),1.18(dt,J=11.6,5.9Hz,1H),0.95(dq,J=12.5,8.9Hz,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 154.97,154.94.
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.94(s,1H),8.08(s,1H),7.40-7.33(m,3H),7.33-7.19(m,10H),7.19-7.09(m,3H),6.76-6.67(m,4H),6.26(dd,J=18.1,2.1Hz,1H),5.83(dd,J=20.8,5.5Hz,2H),5.37-5.22(m,1H),4.33(dt,J=7.2,3.5Hz,1H),3.99(dq,J=8.7,6.2Hz,1H),3.73(s,6H),3.61-3.48(m,2H),3.36(dd,J=10.9,4.2Hz,1H),3.26(s,3H),3.21(s,3H),3.14-3.01(m,1H),2.04(s,1H),1.59(q,J=7.3Hz,2H),1.18(dt,J=12.0,6.1Hz,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 154.69,154.64.
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.61(s,1H),7.80(s,1H),7.47-7.39(m,2H),7.38-7.17(m,11H),6.86-6.77(m,3H),6.08(d,J=5.2Hz,1H),5.79(d,J=6.3Hz,1H),4.93(dt,J=9.9,4.9Hz,1H),4.36-4.23(m,2H),3.88(dq,J=8.6,6.2Hz,1H),3.78(d,J=2.0Hz,5H),3.64-3.45(m,2H),3.42-3.31(m,3H),3.23-3.04(m,6H),2.04(s,1H),1.30-1.16(m,2H),0.97(dq,J=12.5,8.7Hz,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 155.52.
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.62(s,1H),7.75(s,1H),7.44-7.14(m,15H),6.81-6.70(m,4H),6.11(d,J=5.9Hz,1H),5.74(d,J=6.4Hz,1H),4.83(ddd,J=9.6,5.2,3.9Hz,1H),4.35-4.25(m,2H),3.97-3.72(m,7H),3.58(ddt,J=14.0,10.4,7.2Hz,1H),3.48(s,3H),3.45-3.30(m,2H),3.23-3.05(m,7H),2.04(s,1H),1.21-1.10(m,1H),0.94(dq,J=12.6,8.8Hz,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 157.32.
1H NMR(400MHz,クロロホルム-d)δ 8.81(s,1H),8.21(d,J=7.2Hz,1H),7.43-7.13(m,16H),6.81-6.69(m,4H),5.72(dd,J=24.6,6.8Hz,2H),4.74(td,J=8.5,4.9Hz,1H),4.28(dt,J=9.0,2.4Hz,1H),3.99-3.85(m,2H),3.72(d,J=6.9Hz,6H),3.70-3.52(m,6H),3.13(d,J=13.7Hz,7H),1.17(dt,J=12.4,6.3Hz,1H),0.95(dq,J=12.5,8.7Hz,1H).31P NMR(202MHz,クロロホルム-d)δ 157.40.
1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 8.66(s,1H),8.08(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.42(m,2H),7.38-7.27(m,9H),7.27-7.21(m,2H),6.89-6.81(m,4H),5.86(d,J=1.8Hz,1H),5.78(d,J=6.4Hz,1H),5.63(d,J=7.2Hz,1H),4.78(td,J=8.5,5.0Hz,1H),4.13(dt,J=8.3,2.7Hz,1H),3.91-3.83(m,2H),3.75(s,6H),3.61-3.44(m,5H),3.38(dd,J=11.2,3.1Hz,1H),3.14(s,3H),3.13-3.02(m,4H),1.97(s,1H),1.65-1.54(m,2H).31P NMR(202MHz,アセトニトリル-d3)δ 153.90.
1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 8.90(s,1H),7.40-7.14(m,17H),6.79-6.72(m,5H),6.05(d,J=4.0Hz,1H),5.79(d,J=6.5Hz,1H),5.18(dt,J=9.7,5.4Hz,1H),4.74(dd,J=5.0,4.0Hz,1H),4.19(dt,J=5.8,3.7Hz,1H),4.02-3.91(m,1H),3.73(d,J=2.1Hz,7H),3.56(dddd,J=13.5,10.4,8.0,6.0Hz,1H),3.42(s,4H),3.23-3.02(m,9H).31P NMR(202MHz,アセトニトリル-d3)δ 150.80.
1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 8.89(s,1H),8.40(s,1H),8.12(s,1H),7.44-7.32(m,5H),7.32-7.13(m,11H),6.80-6.72(m,4H),6.05(d,J=4.5Hz,1H),5.89(d,J=6.5Hz,1H),5.15(dt,J=10.0,5.1Hz,1H),4.70(t,J=4.8Hz,1H),4.25-4.16(m,1H),3.93(dq,J=8.1,6.2Hz,1H),3.71(d,J=1.1Hz,6H),3.55-3.39(m,6H),3.29(dd,J=10.7,4.8Hz,1H),3.15(d,J=3.1Hz,6H),2.94(tdd,J=10.4,8.0,5.7Hz,1H).31P NMR(202MHz,アセトニトリル-d3)δ 153.21.
1H NMR(500MHz,アセトニトリル-d3)δ 8.68(s,1H),7.98(d,J=7.2Hz,1H),7.49-7.41(m,2H),7.38-7.28(m,8H),7.28-7.19(m,5H),6.87-6.80(m,4H),5.87(d,J=19.5Hz,1H),5.81(d,J=6.5Hz,1H),5.68(d,J=7.2Hz,1H),5.19(d,J=4.4Hz,1H),4.94(dtd,J=23.6,8.9,4.3Hz,1H),4.17(dt,J=9.2,2.7Hz,1H),3.89(dq,J=8.6,6.2Hz,1H),3.75(s,6H),3.60-3.48(m,2H),3.37(dd,J=11.2,3.3Hz,1H),3.14(s,3H),3.12-3.02(m,4H),2.10(s,1H),1.69-1.53(m,2H).31P NMR(202MHz,アセトニトリル-d3)δ 153.74,153.72
ヘビ毒ホスホジエステラーゼ(SVPDE)アッセイ:
キラル的に純粋な完全に脱保護された各ホスホロチオエートジヌクレオチドの1mg/mL H2O(ヌクレアーゼフリー)溶液を調製し、ヘビ毒ホスホジエステラーゼ(SVPDE)と共に37℃で48時間インキュベートし、逆相HPLCで分析した。各サンプルについて、個別の対照を調製した(酵素をH2Oで置き換えた)。SVPDEと対照実験の実験条件を表5に示す。
キラル的に純粋な各ホスホロチオエートジヌクレオチドの1mg/mL H2O(ヌクレアーゼフリー)溶液を調製し、ホスホジエステラーゼII(PDII)と共に37℃で48時間(及び5日間)インキュベートし、逆相HPLCで分析した。各サンプルについて、個別の対照を調製した(酵素をH2Oで置き換えた)。SVPDE及び対照実験の実験条件を表6に示す。
合成異性体の立体化学配置の割り当て方法
キラル的に純粋なPSジヌクレオチドホスホラミダイトビルディングブロックを使用して合成された立体的に純粋なオリゴヌクレオチドの立体化学を予測するために、「精製された異性体の立体化学配置の割り当て方法」(以下のセクションL.を参照)で説明される方法と同じ方法を利用した。これらの化合物は異性体混合物として合成されなかったため、オリゴヌクレオチドは、1つ(センス鎖)又は2つ(アンチセンス鎖)のキラル的に純粋な立体中心を含んでいた。31P-NMRを使用して、Rp異性体又はSp異性体のみが最終精製化合物に存在するかどうか、又はRp異性体とSp異性体の混合物が存在するかどうかを分析的に決定した。イオン交換分析を用いて、Rp異性体とSp異性体との間の保持時間差を確認した。これを行うために、1つの位置に異なる配置(しかしながら、アンチセンスの場合は反対側の末端に同じ配置)を含む化合物を一定の比率(例えば、75:25)で混合して、どの異性体がより速く溶出するかを決定した。これは、5’-DMT-オン(DMT:ジメトキシトリチル保護基)及び5’末端異性体のDMT-オフを用いて行って、上記の「精製異性体の立体化学配置の割り当て方法」のセクションで説明されている「フリップ」を視覚化した。
表8は、この実施例で使用されるmrTTR異性体の配置を予測するために使用される方法の要約である。
表9は、キラル的に純粋なジヌクレオチドホスホラミダイトを使用して合成されたC5異性体の配置を決定するために使用された方法の要約である。
一般的なオリゴヌクレオチドの合成及び分析
オリゴヌクレオチドは、市販のRNAアミダイト、ウリジンの5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシ-2’-フルオロ-、及び5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチル-3’-O-(2-シアノエチル-N、N-ジイソプロピル)ホスホラミダイト単量体、4-N-アセチルシチジン、6-N-ベンゾイルアデノシン、及び2-N-イソブチリルグアノシンを使用してBioautomation Mermade 12合成装置で合成した。標準的な固相オリゴヌクレオチド合成プロトコルを使用した。GalNAcリガンドを、記載の通りピロリジン足場間のホスホジエステル結合によってsiRNAのセンス(S)鎖の3’末端に共有結合させた(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Nair et al.,“Multivalent N-acetylgalactosamine-conjugated siRNA localizes in hepatocytes and elicits robust RNAi-mediated gene silencing,”J.Am.Chem.Soc.136:16958-61(2014);Parmar et al.,“5’-(E)-Vinylphosphonate:a stable phosphate mimic can improve the RNAi activity of siRNA-GalNAc conjugates,”ChemBioChem.17:985-89(2016)を参照)。ホスホロチオエート結合を、ピリジン中、0.1M 3-((N,N-ジメチル-アミノメチリデン)アミノ)-3H-1,2,4-ジチアゾール-5-チオン(DDTT)を使用して亜リン酸塩の酸化によって導入した。ホスホロチオエート異性体が合成後に分離された場合は、最終的なジメトキシトリチル保護基は合成の完了後に除去されなかった。
ジヌクレオチドホスホラミダイトビルディングブロックを手動で結合して、オリゴヌクレオチドを支持した、又は伸長させた。ジヌクレオチドホスホラミダイトは、乾燥アセトニトリル中、0.15M溶液として調製した。アクチベーター5-(エチルチオ)-1H-テトラゾール(乾燥アセトニトリル中、0.25M溶液)を使用した。1回の15分のカップリング時間を使用した。
アンチセンス鎖A-122625の4つのジアステレオマーへの精製
5’末端に1つと3’末端に1つの2つのホスホロチオエート結合を含むオリゴヌクレオチドA-122625(5’DMT-asUfuAfuAfgUfgAfguuAfuUfuUfgUfcasa-3’)を、4つのジアステレオマーに分離した。サンプルを水で約0.03mg/mlに希釈し、30μlを、Dionex DNAPac PA200イオン交換分析カラム、4mm×250mm(ThermoFisher)に30℃のカラム温度で注入した。緩衝液Aは、20mMリン酸ナトリウム、15%アセトニトリル、pH11とし、緩衝液Bは、1M臭化ナトリウムを追加した以外は同一とした。流量1mL/分で16分間に40%から68%の勾配を使用してDMT-オンのサンプルを分析した。16分間に31%から57%の勾配を使用して、DMT-オフのサンプルを分析した(図57を参照)。カラム温度は30℃に維持した。DMT-オンのA-122625の4つすべてのジアステレオマーのベースライン分離を、イオン交換HPLCによって達成した。DMT除去後、3’末端異性体のみを分離した。
それぞれ5’末端に1つのPSを有する、2つのGalNAcコンジュゲートセンス鎖A-141381及びA-141382を合成した。表10に示すように、A-141381は5’末端に2’F-Gを含み、A-141382は5’末端に2’OMe-Gを含んでいた。5’末端のホスホロチオエート異性体の効率的な分離を可能にするDMT-オンで精製を行った。
立体化学を予測するために、いくつかの方法を利用した。使用した1つのツールは、カップリングされるアミダイトの2’-修飾のサイズと性質に依存する、Rp異性体とSp異性体の合成比率とした。これらのカップリング反応は、オリゴヌクレオチド合成における所与のカップリング工程中に生成されるジアステレオ異性体比率を表すために、PSジヌクレオチドの合成によって模倣することができる。合成中、これらの比率は、リン酸の保護基(シアノエチル)及びアクチベーター型(0.5M ETT)が一定である限り、合成の規模又はオリゴヌクレオチド配列内の位置により大きな影響を受けない。
A-122625は、配列の3’末端の1つと5’末端の1つの2つのPS結合を含み、4つの異なる立体異性体をもたらす。5’-DMT保護基の除去後、陰イオン交換HPLC分析によって3’末端異性体のみ分離された。これは、5’末端に1つのPS結合を有するA-122628の合成及び分析によって確認された。表12に示すように、A-122628は、3’末端にPS結合がないことを除いて、A-122625と同じ配列を有する。A-122628のイオン交換HPLC分析では1つのピークのみが観察され、観察された分離が3’末端異性体に由来することを立証した。
上記の方法を利用して、センス鎖A-141381及びA-141382の両方で分離された2つの各異性体を同定した(配列は表10に示されている)。両方の配列は、5’末端に1つのPS結合を含む。A-141381は、5’末端に2’-F-G(Gf)を有し、A-141382は、5’末端に2’-OMe-G(g)を有する。
二環式オキサザホスホリジン(OAP)単量体を使用した第3のアプローチを、連続したキラル結合を含むすべての化合物に利用した。参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Wan et al.,“Synthesis,biophysical properties,and biological activity of second generation antisense oligonucleotides containing chiral phosphorothioate linkages,”Nucleic Acids Research 42(22):13456-68(2014)に記載されているパラメーターに従って、改良合成サイクルを最適化して使用した。2つの個別のサイクルが必要であり、1つは変更サイクルを使用したオリゴヌクレオチドの5’末端又は3’末端のいずれかにおけるキラルPSカップリング用であり、もう1つは標準的な固相オリゴヌクレオチド合成プロトコルを使用したPOヌクレオチドカップリングの内部ストレッチ用であった。
トランスフェクション
初代マウス肝細胞(PMH)をsiRNAでトランスフェクトしてサイレンシング効率を試験し、示された濃度のsiRNA(5μl)を、384ウェルプレートの1ウェル当たり4.9μlのOpti-MEM及び0.1μlのLipofectamine RNAiMax(Invitrogen,Carlsbad CA.cat#13778-150)と混合し、室温でインキュベートした。15分後、約5×103個の細胞を含む40μlのウィリアムズE培地(Life Tech)又はEMEM培地(ATCC)をウェルに加えた。RNA精製の前に、細胞を24時間インキュベートした。
自由取り込み実験をPMHで行った。siRNA(示された濃度で5μl)を、384ウェルプレートの1ウェル当たり5μlのOpti-MEMと混合した。15分後、約5×103個の細胞を含む40μlのウィリアムズE培地(Life Tech)又はEMEM培地(ATCC)をsiRNA混合物に加えた。RNA精製の前に、細胞を24時間インキュベートした。
DYNABEADs(Invitrogen、cat#61012)を使用するBioTek-EL406プラットフォームで自動化プロトコルを使用してRNAを単離した。簡単に述べると、50μlの溶解/結合緩衝液及び3μlの磁気ビーズを含む25μlの溶解緩衝液を各ウェルに加えた。プレートを電磁シェーカーで、室温で10分間インキュベートしてから、磁気ビーズを捕捉し、上清を除去した。次いで、ビーズに結合したRNAを、150μl/ウェルの緩衝液Aで2回、150μl/ウェルの緩衝液Bで1回洗浄した。次いで、ビーズを、150μlの溶出緩衝液で洗浄し、再捕捉し、上清を収集した。
cDNA合成は、ABIキットCat#4368813を使用して行った。DYNABEADSを使用して単離したRNAを含む384ウェルプレートのウェルに、1μlの10×緩衝液、0.4μlの25×dNTP、1μlの10×ランダムプライマー、0.5μlの逆転写酵素、0.5μlのRNase阻害剤、及び6.6μlのH2Oを含む10μlのマスターミックスを加えた。プレートを密封し、混合し、そして室温で10分間、電磁シェーカー上でインキュベートし、続いて37℃で2時間インキュベートした。
cDNA(2μl)を含む384ウェルプレート(Roche Cat#04887301001)の各ウェルに、0.5μlのマウスGAPDH TaqManプローブ(4352339E)、0.5μlのC5マウスプローブ(Mm00439275_ml)、又は適切な標的プローブ、及び5μlのLightcycler 480プローブマスターミックスを含むマスターミックスを加えた。LightCycler480リアルタイムPCRシステム(Roche)でリアルタイムPCRを行った。各siRNA濃度を2連で分析した。相対的な倍数変化を計算するために、リアルタイムデータを、ΔΔCt法を使用して分析し、非標的対照siRNAをトランスフェクトした細胞で行われるアッセイに対して正規化した。
全肝臓及びAgo2関連siRNAレベルの定量
投与後7日目にマウスを屠殺し、肝臓を液体窒素で急速冷凍し、さらなる分析のために粉砕して粉末にした。全siRNA肝臓レベルを、0.25%Triton-X100を含むPBS中、10mg/mlで肝臓粉末を再構成することによって測定した。組織懸濁液を、4℃の組織ホモジナイザー(Qiagen TissueLyser LT)で50サイクル/秒で5分間、5mmスチール製粉砕ボールでさらに粉砕した。次いで、ホモジナイズしたサンプルを95℃で5分間加熱し、短時間ボルテックスし、氷上で5分間静置した。次いで、サンプルを、4℃で5分間、21,000×gで遠心分離した。上清を含むsiRNAを新しい管に移した。siRNAセンス鎖及びガイド鎖のレベルを、以前に公開された方法(どちらも参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、Chen,“Real-time quantification of microRNAs by stem-loop RT-PCR,”Nucleic Acids Research 33:e179(2005);Pei et al.,“Quantitative evaluation of siRNA delivery in vivo,”RNA 16:2553-63(2010)を参照)に基づいてTaqman PCR(SL-RT QPCR)に従ったステムループ逆転写によって定量した。
Ago2結合siRNAを、FLAG-HAタグ付きヒトAgo2を過剰発現するHEK293細胞溶解物で定量した(上記のPeiらを参照)。細胞を溶解緩衝液(100mM KCl、20mM HEPES pH7.5、0.5mM TCEP、0.05%NP-40)中で穏やかに揺らしながら室温で30分間インキュベートすることによってHEK293溶解物を調製した。溶解物を遠心分離(25,000×g、20分、4℃)によって清澄化し、上清アリコートをドライアイスで凍結してから、-80℃で保存した。各70μlのin vitroローディング反応は、30mM HEPES(pH7.5)、100mM NaCl、5mM MgCl2、1mM DTT、0.03mg/mlクレアチンキナーゼ、25mM クレアチンリン酸、1U/μl Superase-Inヌクレアーゼ阻害剤、1mM ATP、0.2mM GTP、35μLのHEK293細胞溶解物、及び7μLの200nM siRNA二重鎖(合計1.4pmol)を含んでいた。ローディング反応物を37℃で4時間インキュベートした。インキュベーション後、反応物を、430μLの20mg/ml QAE 50陰イオン交換樹脂(GE Healthcare)を使用して、4℃で15分間回転させて浄化した。サンプルを酢酸セルロースフィルターカラムに通してQAE樹脂を除去してから、60μLのProtein G Dynabeads(Life Technologies)、3μlの抗HA抗体(Cell Signaling,3724S)、並びに1:100希釈のプロテアーゼ阻害剤(Sigma-Aldrich,P8340)及び1mM PMSF(Life Technologies)が新たに加えられて補充された600μlの溶解緩衝液を添加した。4℃での一晩のインキュベーション(免疫沈降)後、Ago2関連のsiRNAを加熱(50μL PBS、0.25%Triton;95℃、5分)により溶出し、上記のChen及びPeiらによって説明されているSL-RT QPCRによって定量した。
3’エキソヌクレアーゼSVPD安定性アッセイ
修飾オリゴヌクレオチドを、0.1mg/mlで50mM Tris-HCl(pH7.2)(Lonza Cat No.51236)及び10mM MgCl2(Ambion P/N AM9530G)の溶液に加えた。ヘビ毒ホスホジエステラーゼ(SVPD)(Worthington Cat#LS003926)を750mU/mlで混合物に加えた。酵素の添加直後に、サンプルをDionex DNAPac PA200カラム(4mm×250mm)に30℃で注入し、7.5分間かけて40%から55%の緩衝液Bの勾配で、流量1ml/分で流した。緩衝液Aは、20mMリン酸ナトリウム、15%アセトニトリル、pH11とし;緩衝液Bには、1M臭化ナトリウム(pH11)も含めた。アリコートを24時間にわたって1時間ごとに分析した。完全長オリゴヌクレオチドに対応するピーク下の面積を、0時間の時点(最初の注射)の面積に対して正規化した。半減期の計算では、一次崩壊速度論を前提とした。対照配列、dT19sdT(dTはデオキシチミジンである)を毎日分析し、半減期を、対照配列の半減期と比較して報告した。酵素を、1ml管に等分した1000mU/mlのストックとして調製し、-20℃で保存した。新しいアリコートを毎週使用した。
修飾オリゴヌクレオチドを0.1mg/mlで、50mM酢酸ナトリウム(pH6.5)(Sigma Cat.S8750-1kg)及び10mM MgCL2(Ambion P/N AM9530G)の溶液に加えた。ウシ脾臓由来ホスホジエステラーゼII(Worthington Cat#LS003602)を500mU/mlで混合物に加えた。酵素の添加直後に、サンプルをDionex DNAPac PA200カラム(4mm×250mm)に注入し、7.5分間かけて37%から52%の緩衝液Bの勾配で流量1ml/分で流した。緩衝液Aは、20mMリン酸ナトリウム、15%アセトニトリル、pH11とし;緩衝液Bには、1M臭化ナトリウムも含めた。アリコートを24時間にわたって1時間ごとに分析した。完全長オリゴヌクレオチドに対応するピーク下の面積を、0時間の時点(最初の注射)の面積に正規化した。半減期の計算では、一次崩壊速度論を前提とした。対照配列、dTsdT19を毎日分析し、半減期を、対照配列の半減期と比較して報告した。酵素を、1ml管に等分した2000mU/mlのストックとして調製し、-20℃で保存した。新しいアリコートを毎週使用した。
動物:
マウスを使用するすべての手順は、地方、州、及び連邦の規制に準拠したプロトコルを使用して、認定された検査施設職員が行った。実験プロトコルは、施設内動物管理使用委員会(Institutional Animal Care and Use Committee)、国際実験動物管理公認協会(Association for Assessment and Accreditation of Laboratory Animal Care International)(認定番号:001345)、及び実験動物福祉局(office of Laboratory Animal Welfare)(認定番号:#A4517-01)によって承認された。動物実験のサンプル数を決定する場合、IACUCガイドラインに従って必要とされる、最小数の動物を使用して得られるデータセットを信頼できるようにする数にするために必要な最終数を決定した。すべての動物を、試験開始までの48時間、社内で順化させた。約8週齢の雌C57BL/6マウスを、Charles River Laboratoriesから入手し、各群にランダムに割り当てた。すべての動物を、IACUCプロトコルに従って処置した。動物に、siRNA二重鎖又はPBS生理食塩水対照を10μl/kgで皮下投与した。siRNAをリン酸緩衝生理食塩水(Gibco)で希釈した。すべての投与溶液は、注入時まで4℃で保存した。投与後5日又は7日で動物を屠殺した。肝臓を採取し、分析のために急速冷凍した。
雄カニクイザル(未投与)を試験に使用した。各動物の投与時の体重は2~5kg以上であり、投与時の年代は若い成体/成体であった。
QIAzol試薬(Qiagen)を使用したRNAの単離は、PBS(1×)洗浄直後の成長している細胞、又はPBS洗浄後に収集した細胞ペレットに試薬を添加することによって行い、急速冷凍して-80℃で保存した。或いは、製造者の指示に従って、Qiagen RNAeasyキットを使用してサンプルからRNAを単離した。RNA濃度を、Nanodrop分光光度計(ThermoFisher Scientific)を使用して決定した。RNA濃度を、25ng/μlに調整した。cDNAを、Applied Biosystemsの逆転写キット(カタログ番号4368814)を使用して、250ngのRNAから作製した。RNAの定量のためのすべてのプローブは、遺伝子発現の分析を可能にする二重標識プローブを有するそれらのTaqman遺伝子発現系を利用してLife Technologiesから取得した。標的遺伝子の発現を、二重標識系を利用して各ウェルのGAPDHユビキタス対照に対して正規化した。Cp値を、Light Cycler 480(Roche)を使用して測定した。以下の式を使用して、相対的遺伝子発現:2-(C t Target)/2-(C t Control)を決定した。Taqmanプローブのカタログ番号:マウスC5(Mm00439275_m1)、マウスGAPDH 4352339E、マウスTTR(Mm00443267_ml)。
IACUC承認プロトコルに従って、最終投与の24時間後に眼窩後眼出血手順を利用して採血した。サンプルを、Becton Dickinson(BD)血清分離管(Fisher Scientific Cat#BD365967)に収集した。血清サンプルを、室温で1時間保持した後、微量遠心機において22×g、室温で10分間遠心した。-80℃で保存するために、血清を1.5mlマイクロ遠心管に移した。循環C5の分析のために収集した血清を、室温で15分間保持し、その後即座に4℃に下げてから、マイクロ遠心機において22×g、室温で10分間遠心分離した。
血清サンプルを1:4000に希釈し、マウスプレアルブミンの検出専用のALPCOが市販するキット(カタログ番号41-PALMS-E01)を使用してアッセイした。タンパク質濃度(μg/ml)を、社内で調製された精製TTR標準との比較により決定し、製造者の指示に従った。
循環マウスC5レベルを特異的に検出するためにELISAアッセイを開発した。一次抗体はヤギ抗ヒトC5(Complement Technologies#A220)とし、二次抗体はウシ抗ヤギIgG-HRP(Jackson ImmunoResearch 805-035-180)とし、これらは、他の種との交差反応性は最小限であった。抗体は0.8mg/mlで使用した。アッセイはTMB基質キットを使用して開発し、測定前に硫酸を使用して反応を停止させた。血清サンプルを、分析のために1から5,000に希釈した。
ELISAヒトアンジオポエチン様3 Quantikine ELISAキット(R&D Systems Cat#DANL30)を製造者のプロトコルに従って使用した。
ELISAヒト凝固因子XII全抗原ELISAキット(Molecular Innovations Cat#HFXIIKT-TOT)を製造者のプロトコルに従って使用した。
ELISAヒト全アンジオテンシノーゲンアッセイキット(IBL Cat#27412)を製造者のプロトコルに従って使用した。
アルゴノートタンパク質を、Ago-APP(ペプチドによるアルゴノートタンパク質親和性精製)(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Hauptmann et al.,“Peptide-Based Isolation of Argonaute Protein Complexes Using Ago-APP”in Tamas Dalmay,“MicroRNA Detection and Target Identification:Methods and Protocols,Methods in Molecular Biology,”vol.1580(Springer 2017)の改良型)を使用して非ヒト霊長類肝臓溶解物から単離した。Ago-APPは、ヒトタンパク質TNRC6Bに由来するペプチドに依存し、このヒトタンパク質TNRC6Bは、種を越えてアルゴノートタンパク質のPIWIドメインの2つのトリプトファン結合ポケットに結合することが知られているいくつかのGW(グリシン、トリプトファン)リピートを含む。ペプチドを、細菌からの精製を可能にするGSTタグ、及び抗FLAG抗体でコーティングされた磁気ビーズによるアルゴノートのプルダウン(pulldown)を可能にするFLAGタグを含むようにさらに修飾した。サンプル溶解物のAPPペプチド及び磁気ビーズとのインキュベーション後、磁石を使用してビーズを固定し、残りの溶解物を除去して廃棄した。ビーズを数回洗浄して、非特異的なバックグラウンド相互作用を取り除いた。アルゴノートがローディングされたsiRNAを、サンプルを煮沸することによって溶出し、RT-qPCRによるsiRNAの定量のために溶出液を収集した。
キラル的に純粋なPS結合を含むオリゴヌクレオチドを、実施例1~2のプロトコル(アプローチ1、2、及び3)を使用して調製した。キラル修飾ヌクレオチド間結合を含むsiRNA二重鎖の代謝安定性を評価した。
ラットにおける例示的なF12 siRNA及びそのキラルPS siRNA型の持続時間試験
例示的なF12 ELF siRNA及びそのキラルPS siRNA型を、ラットでの持続時間試験のために調べ、結果を図104A~図104Cに示す。図104Aは、使用したキラル修飾siRNAの構成モチーフ、使用した動物と用量、及び試験の期間を含む、持続時間試験の試験デザインを示す。図104Bは、ラットでの持続時間試験に使用したF12 ELF異性体の一覧を示す。図104Cは、50日目までのF12 ELFの持続時間試験の結果を示す。
例示的なF12 ELF siRNA及びそのセンス鎖キラルPS異性体を、28日目までのラットにおけるin vivo相対的タンパク質発現レベルについて調べ、結果を図105A~図105Cに示す。図105Aは、使用したキラル修飾siRNAの構成モチーフ、使用した動物と用量、及び試験の期間を含む、持続時間試験の試験デザインを示す。図105Bは、ラットでの持続時間試験に使用したF12 ELFセンス鎖異性体の一覧を示す。図105Cは、28日目までのF12 ELFセンス鎖異性体の持続時間試験の結果を示す。
例示的なF12 ELF siRNA及びそのキラルPS siRNA型を、35日目までのマウスにおけるin vivo相対的血漿発現レベルについて調べ、結果を図106A~図106Cに示す。図106Aは、使用したキラル修飾siRNAの配列変数と構成モチーフ、使用した用量、及び試験の期間を含む試験デザインを示す。図106Bは、使用したF12 ELF異性体の一覧を示す。図106Cは、35日目までのF12 ELF相対的血漿発現レベルの結果を示す。
例示的なF12 ELF siRNA及びそのキラルPS siRNA型を、初代マウス肝細胞及び初代カニクイザル肝細胞におけるin vitro自由取り込みIC50及びin vitroトランスフェクションIC50について調べ、結果を図107A~図107Cに示す。図107Aは、使用したキラル修飾siRNAの配列及び構成モチーフの一覧を示す。図107Bは、初代マウス及びカニクイザル肝細胞におけるin vitro自由取り込みIC50の結果を示す。図107Cは、初代マウス及びカニクイザル肝細胞におけるin vitroトランスフェクションIC50の結果を示す。
例示的なF12 ELF siRNA及びそのキラルPS siRNA型を、血漿PD、血漿PK、NHPにおける肝臓レベル、並びに肝臓におけるペプチドによるago親和性精製、及びRISCにローディングされた全アンチセンスのパーセントについて調べた。結果を図108A~図108Eに示す。図108Aは、使用したキラル修飾siRNAの用量、配列、及び構成モチーフの一覧を示す。図108Bは、NHPにおける血漿薬力学(PD)の結果(F12 ELF siRNA及びそのキラルPS siRNA型の相対的血漿レベル)を示す。図108Cは、NHPにおける血漿薬物動態学(PK)の結果を示す。図108Dは、NHPにおけるF12 ELF siRNA及びそのキラルPS siRNA型の肝臓レベルを示す。図108Eは、NHPにおけるペプチドによるアルゴノートタンパク質親和性精製(Ago-APP)及び肝臓におけるRISCにローディングされたアンチセンスの結果を示す。
例示的なC5、F12、hAGT siRNA及びそれらのキラルPS siRNA型を、初代マウス肝細胞及び初代カニクイザル肝細胞におけるin vitro自由取り込みIC50について調べ、結果を図109A及び図109Bに示す。図109Aは、使用したキラル修飾siRNAの配列及び構成モチーフの一覧を示す。図109Bは、初代マウス及びカニクイザル肝細胞におけるin vitro自由取り込みIC50の結果を示す。
例示的なC5、F12、及びhAGT siRNA並びにそれらのキラルPS siRNA型を、28日目又は48日目までのマウスにおけるin vivo相対的発現レベルについて調べ、結果を図110A~図110Cに示す。図110Aは、使用したキラル修飾siRNAの構成モチーフ、使用した用量、及び試験の期間を含む試験デザインを示す。図110Bは、使用したすべての配列の一覧を示す。図110Cは、28日目又は48日目までの相対的発現レベルの結果を示す。
例示的なF12及びAngptl3(ANG)siRNA及びそれらのキラルPS siRNA型を、NHPにおける血漿PDについて調べ、結果を図111A~図111Dに示す。図111Aは、使用したキラル修飾siRNAの構成モチーフ並びに使用した動物及び用量の一覧を示す。図111Bは、使用したすべての配列の一覧を示す。図111Cは、NHPにおけるF12配列1 siRNA及びそのキラルPS siRNA型の血漿薬力学(PD)の結果(相対的血漿レベル)を示す。図111Dは、NHPにおけるF12配列2及びAngptl3(ANG)siRNA並びにそれらのキラルPS siRNA型の血漿薬力学(PD)の結果(相対的血漿レベル)を示す。
最後に、本発明の好ましい実施態様を項分け記載する。
[実施態様1]
標的遺伝子の発現を阻害することができるキラル修飾二本鎖RNA(dsRNA)剤であって、センス鎖及びアンチセンス鎖を含み、各鎖は14~40ヌクレオチドを有し、
前記センス鎖が、5’末端に1つ又は複数の末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合を含み、
前記アンチセンス鎖が、5’末端に1つ又は複数の末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合、及び3’末端に1つ又は複数の末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合を含む、キラル修飾二本鎖RNA剤。
[実施態様2]
各末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合のキラル結合リン原子に関するキラル純度が少なくとも50%である、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様3]
各末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合がホスホロチオエート結合である、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様4]
前記末端のキラル修飾が、前記アンチセンス鎖の3’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在し、前記結合リン原子がSp配置にある、実施態様3に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様5]
末端のキラル修飾が、前記アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在し、前記結合リン原子がRp配置にある、実施態様3に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様6]
末端のキラル修飾が、前記センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在し、前記結合リン原子が、Rp配置又はSp配置のいずれかにある、実施態様3に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様7]
前記結合リン原子がSp配置にある、前記アンチセンス鎖の3’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、
前記結合リン原子がRp配置にある、前記アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、及び
前記結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、前記センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾鎖を含む、実施態様3に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様8]
4つ以上の末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合を含む、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様9]
前記結合リン原子がSp配置にある、前記アンチセンス鎖の3’末端の1番目及び2番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、
前記結合リン原子がRp配置にある、前記アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、及び
前記結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、前記センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾を含む、実施態様8に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様10]
5つ以上の末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合を含む、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様11]
前記結合リン原子がSp配置にある、前記アンチセンス鎖の3’末端の1番目、2番目、及び3番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、
前記結合リン原子がRp配置にある、前記アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、及び
前記結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、前記センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾を含む、実施態様10に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様12]
前記結合リン原子がSp配置にある、前記アンチセンス鎖の3’末端の1番目及び2番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、
前記結合リン原子がRp配置にある、前記アンチセンス鎖の3’末端の3番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、
前記結合リン原子がRp配置にある、前記アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、及び
前記結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、前記センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾を含む、実施態様10に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様13]
前記結合リン原子がSp配置にある、前記アンチセンス鎖の3’末端の1番目及び2番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、
前記結合リン原子がRp配置にある、前記アンチセンス鎖の5’末端の1番目及び2番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾、及び
前記結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、前記センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端のキラル修飾を含む、実施態様10に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様14]
6つ以上の末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合を含む、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様15]
8つ以上の末端のキラル修飾ヌクレオチド間結合を含む、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様16]
前記末端のキラル修飾ヌクレオチド間連結によって結合されたジヌクレオチドの各ヌクレオチドが独立に、非環状ヌクレオチド、LNA、HNA、CeNA、2’-O-メトキシアルキル、2’-O-メチル、2’-O-アリル、2’-C-アリル、2’-デオキシ、2’-フルオロ、2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)、2’-O-ジメチルアミノエトキシエチル(2’-O-DMAEOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、及び2’-ara-Fからなる群から選択される修飾で修飾される、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様17]
前記センス鎖及び前記アンチセンス鎖のそれぞれが独立に、非環状ヌクレオチド、LNA、HNA、CeNA、2’-O-メトキシアルキル、2’-O-メチル、2’-O-アリル、2’-C-アリル、2’-デオキシ、2’-フルオロ、2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)、2’-O-ジメチルアミノエトキシエチル(2’-O-DMAEOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、及び2’-ara-Fからなる群から選択される修飾で修飾される、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様18]
前記センス鎖及び前記アンチセンス鎖のそれぞれが15~30ヌクレオチドを有する、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様19]
前記センス鎖が19~22ヌクレオチドを有し、前記アンチセンス鎖が19~25ヌクレオチドを有する、実施態様13に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様20]
少なくとも1つのASGPRリガンドをさらに含む、実施態様1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様21]
前記ASGPRリガンドが、前記センス鎖又は前記アンチセンス鎖の3’末端に付着している、実施態様20に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様22]
前記ASGPRリガンドが、1つ又は複数の切断可能なリンカーを介して付着している、実施態様20に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様23]
前記ASGPRリガンドが、2価又は3価の分岐リンカーを介して付着した1つ又は複数のGalNAc誘導体である、実施態様20に記載のキラル修飾dsRNA剤。
[実施態様24]
前記ASGPRリガンドが、
[実施態様25]
実施態様1~24のいずれかに記載のキラル修飾dsRNA剤及び薬学的に許容される担体又は賦形剤を含む医薬組成物。
[実施態様26]
実施態様1~25のいずれかに記載のキラル修飾dsRNA剤を標的遺伝子の発現を阻害するのに十分な量で投与する工程を含む、標的遺伝子の発現を阻害するための方法。
[実施態様27]
前記キラル修飾dsRNA剤が、皮下投与又は静脈内投与によって投与される、実施態様30に記載の方法。
Claims (19)
- 標的遺伝子の発現を阻害することができるキラル修飾二本鎖RNA(dsRNA)剤であって、19~29ヌクレオチドを有するセンス鎖及び19~30ヌクレオチドを有するアンチセンス鎖を含み、
前記センス鎖は、5’末端の1番目、2番目、3番目、または4番目のヌクレオチド間結合に存在する1つ又は複数の末端キラル修飾ヌクレオチド間結合を含み、
前記アンチセンス鎖は、5’末端の1番目、2番目、3番目、または4番目のヌクレオチド間結合に存在する1つ又は複数の末端キラル修飾ヌクレオチド間結合、及び3’末端の1番目、2番目、3番目、または4番目のヌクレオチド間結合に存在する1つ又は複数の末端キラル修飾ヌクレオチド間結合を含み、
各末端キラル修飾ヌクレオチド間結合はホスホロチオエート結合であり、
末端キラル修飾が、前記アンチセンス鎖の3’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在し、その結合リン原子がSp配置にあり、かつ
末端キラル修飾が、前記アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在し、その結合リン原子がRp配置にある、キラル修飾二本鎖RNA剤。 - 各末端キラル修飾ヌクレオチド間結合のキラル結合リン原子に関するキラル純度が少なくとも50%である、請求項1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 前記センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に末端キラル修飾が存在し、その結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、請求項1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 4つ以上の末端キラル修飾ヌクレオチド間結合を含み、
結合リン原子がSp配置にある、アンチセンス鎖の3’末端の1番目及び2番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、
結合リン原子がRp配置にある、アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、及び
結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾
を含む、請求項1に記載のキラル修飾dsRNA剤。 - 5つ以上の末端キラル修飾ヌクレオチド間結合を含み、
(i)
結合リン原子がSp配置にある、アンチセンス鎖の3’末端の1番目、2番目、及び3番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、
結合リン原子がRp配置にある、アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、及び
結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾
を含む、あるいは
(ii)
結合リン原子がSp配置にある、アンチセンス鎖の3’末端の1番目及び2番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、
結合リン原子がRp配置にある、アンチセンス鎖の3’末端の3番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、
結合リン原子がRp配置にある、アンチセンス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、及び
結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾
を含む、あるいは
(iii)
結合リン原子がSp配置にある、アンチセンス鎖の3’末端の1番目及び2番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、
結合リン原子がRp配置にある、アンチセンス鎖の5’末端の1番目及び2番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾、及び
結合リン原子がRp配置又はSp配置のいずれかにある、センス鎖の5’末端の1番目のヌクレオチド間結合に存在する末端キラル修飾
を含む、
請求項1に記載のキラル修飾dsRNA剤。 - 6つ以上の末端キラル修飾ヌクレオチド間結合を含む、請求項1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 8つ以上の末端キラル修飾ヌクレオチド間結合を含む、請求項1に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 前記末端キラル修飾ヌクレオチド間連結によって結合されたジヌクレオチドの各ヌクレオチドが、独立に、非環状ヌクレオチド、LNA、HNA、CeNA、2’-O-メトキシアルキル、2’-O-メチル、2’-O-アリル、2’-C-アリル、2’-デオキシ、2’-フルオロ、2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)、2’-O-ジメチルアミノエトキシエチル(2’-O-DMAEOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、及び2’-ara-Fからなる群から選択される修飾で修飾されている、請求項1~7のいずれか一項に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 前記センス鎖及び前記アンチセンス鎖のそれぞれが独立に、非環状ヌクレオチド、LNA、HNA、CeNA、2’-O-メトキシアルキル、2’-O-メチル、2’-O-アリル、2’-C-アリル、2’-デオキシ、2’-フルオロ、2’-O-N-メチルアセトアミド(2’-O-NMA)、2’-O-ジメチルアミノエトキシエチル(2’-O-DMAEOE)、2’-O-アミノプロピル(2’-O-AP)、及び2’-ara-Fからなる群から選択される修飾で修飾されている、請求項1~7のいずれか一項に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 前記センス鎖及び前記アンチセンス鎖のそれぞれが19~25ヌクレオチドを有する、請求項1~9のいずれか一項に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 前記センス鎖が19~22ヌクレオチドを有し、前記アンチセンス鎖が19~25ヌクレオチドを有する、請求項1~9のいずれか一項に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 少なくとも1つのアシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)リガンドをさらに含む、請求項1~11のいずれか一項に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 前記ASGPRリガンドが、前記センス鎖又は前記アンチセンス鎖の3’末端に付着している、請求項12に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 前記ASGPRリガンドが、1つ又は複数の切断可能なリンカーを介して付着している、請求項12または13に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 前記ASGPRリガンドが、2価又は3価の分岐リンカーを介して付着した1つ又は複数のGalNAc誘導体である、請求項12~14のいずれか一項に記載のキラル修飾dsRNA剤。
- 請求項1~16のいずれか一項に記載のキラル修飾dsRNA剤及び薬学的に許容される担体又は賦形剤を含む医薬組成物。
- 請求項1~16のいずれか一項に記載のキラル修飾dsRNA剤を含む、標的遺伝子の発現を阻害するための組成物。
- 皮下投与又は静脈内投与によって投与される、請求項18に記載の組成物。
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