JP7303677B2 - 医用データ処理装置、医用データ処理方法、医用データ処理プログラム及び磁気共鳴イメージング装置 - Google Patents

医用データ処理装置、医用データ処理方法、医用データ処理プログラム及び磁気共鳴イメージング装置 Download PDF

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Description

本発明の実施形態は、医用データ処理装置、医用データ処理方法、医用データ処理プログラム及び磁気共鳴イメージング装置に関する。
近年、MRF(Magnetic Resonance Fingerprinting)のような、TR(Time of Repetition)、TE(Echo time)、FA(Flip Angle)をランダムに変化させた一連の撮像を行ない、辞書マッチングによってT1値、T2値といったパラメータを推定する手法が提案されている。また、辞書マッチング時間を低減するため、1回のRF(Radio Frequency)送信(1ショットともいう)ごとの信号値から生成される画像をそのまま辞書とするのではなく、特異値分解(SVD:Singular Value Decomposition)または主成分解析(PCA:Principal component analysis)によって、少数の画像にまとめることにより、辞書をコンパクトにする手法もある。
しかし、解析精度を向上させるためには辞書マッチングを繰り返し行なう必要があるため、短時間でのパラメータ推定を行うことは難しい。
そのため深層学習を用いた手法も提案されているが、深層学習においては信号値からT1値、T2値が直接推定されることになる。そのため、推定されたT1値、T2値といった値の信頼性をチェックするためには、大規模なシミュレーションを行う必要があり、信頼性を高めるための繰り返し演算を実行する場合に、計算コストおよび計算時間が大きくなってしまう。
なお、上述のようなMRFの例に限らず、一連のスパースなサンプリングデータが存在し、データの数値変化から定量値(またはパラメータ値)を求める場合においても同様の問題が生じる。すなわち、多数のスパースなサンプリングデータが類似性を持つため、少数のデータに圧縮することができる場合に、深層学習によって、少数のスパースなサンプリングデータを入力とし、定量値(またはパラメータ値)を出力する場合、深層学習を用いた推定では、必ずしもデータ整合性が保証されるわけではないので問題が生じる。
本発明が解決しようとする課題は、高速かつ信頼性の高い推定を行うことである。
本実施形態に係る医用データ処理装置は、取得部と、生成部と、最適化部とを含む。取得部は、スパースサンプリングされた複数の第1データを取得する。生成部は、前記複数の第1データの数よりも少ない組ごとの重み係数を用いて、当該組ごとに、前記複数の第1データのそれぞれに前記重み係数を乗算して加算することで、前記第1データの数よりも少ない数の第1圧縮データを生成する。最適化部は、観察対象についてスパースサンプリングされた複数の第1データから生成された複数の第1圧縮データが入力され、前記観察対象についてフルサンプリングされた複数の第2データから生成された複数の第2圧縮データの少なくともいずれか1つを出力するように学習された学習済みモデルに従い、前記生成部で生成された第1圧縮データから、第2圧縮データを出力する第1処理を実行する。
図1は、第1の実施形態に係る医用データ処理装置の構成を示すブロック図である。 図2は、第1の実施形態に係る医用データ処理装置の動作を示すフローチャートである。 図3は、反復回数を収束条件とする、第1の実施形態に係る医用データ処理装置の動作を示すフローチャートである。 図4は、第1の実施形態に係る撮像シーケンスの一例を示す図である。 図5は、本実施形態で想定するラジアルスキャンの一例を示す図である。 図6は、フル低ランク画像の概念および生成例について示す図である。 図7は、スパース低ランク画像の概念および生成例について示す図である。 図8は、重み係数と撮像シーケンスとを対応付けたルックアップテーブルの一例を示す図である。 図9は、本実施形態で用いる学習済みモデルを生成するシステムの一例を示す図。 図10は、第1の実施形態で用いる学習済みモデルの学習時の概念を示す図である。 図11は、第1の実施形態に係る学習済みモデルの利用時の概念を示す図である。 図12は、第1の実施形態に係る医用データ処理装置の第1の出力例を示す図である。 図13は、第1の実施形態に係る医用データ処理装置の第2の出力例を示す図である。 図14は、第2の実施形態に係る医用データ処理装置の動作を示すフローチャートである。 図15は、第2の実施形態に係る医用データ処理装置の出力例を示す図である。 図16は、第2の実施形態に係る医用データ処理装置のデータ処理を示す概念図である。 図17は、第3の実施形態に係る撮像シーケンスの一例を示す図である。 図18は、第3の実施形態に係る医用データ処理装置の動作を示す概念図である。 図19は、k空間データ用に学習した学習済みモデルを用いる場合の第3の実施形態に係る医用データ処理装置の動作を示す図である。 図20は、第3の実施形態に係る医用データ処理装置の出力例を示す図である。 図21は、第3の実施形態の変形例に係るパラレルイメージングにより処理する場合の概念を示す図である。 図22は、第4の実施形態に係る撮像シーケンスの一例を示す図である。 図23は、第4の実施形態に係るマルチコイルを用いた場合の最適化処理を示すフローチャートである。 図24は、第4の実施形態に係るデータサイズの分割例を示す図である。 図25は、定量値としてADCまたは拡散強調画像を算出する場合の第1の撮像シーケンス例を示す図である。 図26は、定量値としてADCまたは拡散強調画像を算出する場合の第2の撮像シーケンス例を示す図である。 図27は、定量値としてADCまたは拡散強調画像を算出する場合の第3の撮像シーケンス例を示す図である。 図28は、医用データ処理装置を含む磁気共鳴イメージング装置の全体構成を示す図である。
以下、図面を参照しながら本実施形態に係る医用データ処理装置、医用データ処理方法、医用データ処理プログラム及び磁気共鳴イメージング装置について説明する。以下の実施形態では、同一の参照符号を付した部分は同様の動作を行なうものとして、重複する説明を適宜省略する。
(第1の実施形態)
第1の実施形態に係る医用データ処理装置について、図1のブロック図を参照して説明する。
医用データ処理装置1は、処理回路2、入力インタフェース4、通信インタフェース6およびメモリ8を含む。
処理回路2は、取得機能21と、生成機能22と、最適化機能23と、推定機能24とを含む。処理回路2は、ハードウェア資源として図示していないプロセッサを有する。
取得機能21は、対象をスパースサンプリングする事により生成されたN個の第1データを取得する。Nは2以上の整数である。スパースサンプリングは、本実施形態では、通常行うべきサンプリング間隔よりも間引いた間隔となるサンプリング、または通常取得すべきサンプリング数よりも少ないサンプリング数となるサンプリング、またはナイキスト条件を満たしたサンプリング数よりも少ないサンプリング数となるサンプリングを示す。
生成機能22は、あらかじめ設定されたM組の、N個からなる重み係数をもちいて、それぞれの組について、N個の第1データに、対応する重み係数を乗算して加算することで、N個の第1データを圧縮し、M個の第1圧縮データを生成する。さらに第1圧縮データには、フーリエ変換、逆フーリエ変換、グリッディング等の付加的な信号処理が行なわれる場合もある。
最適化機能23は、上記M個の第1圧縮データが入力され、撮影対象をフルサンプリングする事により生成されたN個の第2データを、第1データと同様に圧縮する事により得られるM個の第2圧縮データの少なくともいずれか1つを出力するように学習された、学習済みモデルを少なくとも一部に用いた処理を行い、M個の第1圧縮データから、M個の第2圧縮データを出力する。
フルサンプリングは、本実施形態では、通常行うべきサンプリング間隔によるサンプリング、または通常取得すべきサンプリング数となるサンプリング、またはナイキスト条件を満たしたサンプリング数となるサンプリングを示す。
推定機能24は、M個の第2圧縮データに対して信号処理を行い、所望の定量値(またはパラメータ値)、例えば、T1、T2、PDといった定量値を推定する。推定機能24は、第2圧縮データに基づいてT1強調画像、T2強調画像といった画像データを生成してもよい。
なお、上述の第1データ、第2データ、第1圧縮データ、第2圧縮データ、および以下の実施形態で説明するk空間データ、サイノグラムk空間データなど、実施形態で説明する各データは、行列で表現されるデータである場合について説明するが、データが行列である場合に限らず、テンソルなど多次元配列であってもよい。
入力インタフェース4は、ユーザからの各種指示や情報入力を受け付ける回路を有する。入力インタフェース4は、例えば、マウス等のポインティングデバイス、あるいはキーボード等の入力デバイスに関する回路を有する。なお、入力インタフェース4が有する回路は、マウス、キーボードなどの物理的な操作部品に関する回路に限定されない。例えば、入力インタフェース4は、磁気共鳴イメージング装置100とは別体に設けられた外部の入力機器から入力操作に対応する電気信号を受け取り、受け取った電気信号を種々の回路へ出力するような電気信号の処理回路を有していてもよい。
通信インタフェース6は、有線または無線により外部装置とデータのやり取りを実行する。
メモリ8は、少なくとも、重み係数、学習済みモデル、推定値を格納する。メモリ8は、RAM(Random Access Memory)、フラッシュメモリ等の半導体メモリ素子、ハードディスクドライブ(HDD:Hard Disk Drive)、ソリッドステートドライブ(SSD:Solid State Drive)、光ディスク等である。また、記憶装置129は、CD-ROMドライブやDVDドライブ、フラッシュメモリ等の可搬性記憶媒体との間で種々の情報を読み書きする駆動装置等であってもよい。
なお、処理回路2における各種機能は、コンピュータによって実行可能なプログラムの形態でメモリ8へ記憶されている。処理回路2は、これら各種機能に対応するプログラムをメモリ8から読み出し、実行することで各プログラムに対応する機能を実現するプロセッサである。換言すると、各プログラムを読みだした状態の処理回路2は、図1の処理回路2内に示された複数の機能等を有することになる。
なお、図1においては単一の処理回路2にてこれら各種機能が実現されるものとして説明したが、複数の独立したプロセッサを組み合わせて処理回路2を構成し、各プロセッサがプログラムを実行することにより機能を実現するものとしても構わない。換言すると、上述のそれぞれの機能がプログラムとして構成され、1つの処理回路が各プログラムを実行する場合であってもよいし、特定の機能が専用の独立したプログラム実行回路に実装される場合であってもよい。
以下、本実施形態では、スパースサンプリングされた第1データとして、MR(Magnetic Resonance)装置により収集されたMR信号を用いて、T1値,T2値などのMR特性パラメータを推定する場合を例に説明する。
なお、T1値,T2値に限らず大規模データに基づく画像や、動画の処理など、N個のスパースサンプリングされたデータが存在し、当該N個のデータの数値変化からパラメータ値を求める場合であって、その数値変化がパラメータ値からシミュレーションでき、なおかつデータが類似性を持つため、上記と同様の処理により、N個未満の少数のデータに圧縮することができる場合にも、該当データを本実施形態に係る医用データ処理装置1で処理することができる。
次に、第1の実施形態に係る医用データ処理装置の動作について図2のフローチャートを参照して説明する。
ステップS201では、取得機能21により処理回路2が、所定のスパースサンプリングを行なう撮像シーケンス(以下、スパースサンプリング撮像シーケンスと呼ぶ)によりMR信号を取得する。このとき、MR信号によってk空間が充填され、N個にまとめられたk空間データを取得する。Nは2以上の整数である。N個にまとめられたk空間データがN個の第1データに対応する。以下ではN個にまとめられたk空間データをk空間データセットと呼ぶ事もある。
ステップS202では、生成機能22により処理回路2が、取得したN個にまとめられたk空間データを用いて、M個の圧縮画像を生成する。具体的には、取得されたN個にまとめられたk空間データのそれぞれについて、あらかじめ設定された、M組のN個からなる重み係数をもちいて、それぞれの組について、対応するk空間データと重み係数を乗算して加算する事により、M個の圧縮したk空間データを生成し、それを逆フーリエ変換することで、M個のスパース圧縮画像のセットが生成される。スパース圧縮画像は、スパースサンプリング撮像シーケンスにより得られたk空間データから生成した圧縮画像であることを現す。このM個のスパース圧縮画像が前記M個の第1圧縮データに対応する。
k空間データの重み付けに用いる、あらかじめ設定されたM組のN個からなる重み係数は、例えば、撮像シーケンスおよびスキャンの種類ごとに、撮像シーケンスと重み係数を対応付けたルックアップテーブルとして用意しておき、ステップS201で用いられた撮像シーケンスに対応する重み係数として取得すればよい。
ここで、ステップS201で行なった、スパースサンプリング撮像シーケンスに対応した、フルサンプリング撮像シーケンスを行なった場合、N個のk空間データは個別に逆フーリエ変換を行なうことにより、N個のフルサンプリング実空間画像に変換する事ができる。その場合、あるT1値、T2値を持った対象の画像では、その実空間信号値(画像の輝度に対応する)が、N個の画像でどのように変化するか、ブロッホシミュレーションにより計算する事ができる。すなわち、N個の実空間画像をt1, t2, … ,tNと番号付けした場合、t1, t2, …, tNにおける実空間信号値がどのように変化するべきかをあらかじめ計算する事ができる。これを以降、実空間信号変化とよぶ。実空間信号変化はT1値、T2値によって異なり、両者を対応づける事ができる。そこで、あらかじめ計算によって、T1値、T2値と実空間信号変化の対応を表として作成しておく事ができる。以降はこれを辞書と呼ぶ。
このとき、重み係数としては、辞書を用いて以下のように生成したものを用いる事ができる。たとえば上記辞書の実空間信号変化の全セットを取り出し並べる事により得られる行列に対して、特異値分解したときに得られる重み係数のうち、特異値が大きいほうから選択したM組を、重み係数として用いる事ができる。この場合、M個の圧縮画像は、N個のk空間データを使って生成した、ランクMに低ランク近似された画像となる。詳細は図7および図8を参照して後述する。なお、本方式においては、辞書は重み係数を求めるためにのみ用いている。
以下では例として、重み係数として、特異値分解によって得られた値を用いるため、スパース圧縮画像をスパース低ランク画像と呼ぶ事にする。またM個のスパース低ランク画像をまとめて、スパース低ランク画像セットと呼ぶこともある。
ステップS203では、最適化機能23により処理回路2が、M個のスパース低ランク画像に学習済みモデルを適用し、M個のフル低ランク画像を出力する。これが前記M個の第2圧縮データに対応する。
ここで、M個のフル低ランク画像とは、S201で用いた、スパースサンプリング撮像シーケンスに対応した、フルサンプリング撮像シーケンスで得られたN個のk空間データに対して、スパース低ランク画像を得たときと同様の処理を行なう事により得られるM個の画像のことである。図6を参照して後述する。なお、M個のフル低ランク画像をまとめて、フル低ランク画像セットと呼ぶ事もある。
入力であるスパース低ランク画像セットの数M(ランクM)に対して、出力となるフル低ランク画像セットの数は同じくM(ランクM)とすることが望ましいが、出力のランク数に対して、入力のランク数を多くすることにより、出力精度をよりよくすることもできる。また、出力のランク数に対して、入力のランク数を減らすことによって、出力の精度はやや落ちるものの、メモリ量、計算速度の点では高速化が可能となる。このように入力のランク数と出力のランク数は使用目的に応じて、適宜調節することができる。従って、上記のステップS203においては、出力するM個のフル低ランク画像は、例えば、所望のランクだけとしてもよく、少なくとも1つを出力するように処理することが好ましい。すなわち、M個全てを出力するものに限定されない。なお、以下の実施例では入力のランク数と出力のランク数が同じ場合について説明する。
ステップS204では、最適化機能23により処理回路2が、学習済みモデルを適用して得られたフル低ランク画像セットと、ステップS201で取得した、k空間データセットとのデータ整合性をチェックし、データ整合性を考慮した収束条件を満たすか否かを判定する。具体的には、得られたフル低ランク画像セットに逆変換を行い、整合性チェック用のスパースサンプリングされたk空間データセットであるチェック用k空間データセットを生成し、当該チェック用k空間データセットとステップS201で取得したk空間データセットとの差分の評価を含んだ誤差関数の値が閾値以下となるかを判定する。誤差関数の値が閾値以下となれば収束条件を満たすと判定し、ステップS206に進む。誤差関数の値が閾値よりも大きい場合は収束条件を満たさないと判定し、ステップS205に進む。
ステップS205では、最適化機能23により処理回路2が、学習済みモデルを適用するスパース低ランク画像セットを補正すべく、まず補正したフル低ランク画像セットを新たに生成し、それに対応するスパース低ランク画像セットを生成したのち、ステップS203に戻り同様の処理を繰り返す。つまり、収束条件を満たすまでステップS203からステップS205までの処理を繰り返す。
ステップS206では、推定機能24により処理回路2が、生成されたフル低ランク画像セットから、使用した撮像シーケンスから推定可能な各種定量値を推定する。例えば、T1値、T2値およびPD(Proton Density)値を算出する。フル低ランク画像セットからT1値、T2値およびPD値を算出する手法としては、例えば、辞書マッチングを行なってもよいし、解析的なフィッティング処理を実行してもよいし、ディープラーニングなどの機械学習により生成された学習済みモデルを適用して算出してもよい。
また、推定機能24により処理回路2は、T1値およびT2値の算出を介さず、直接T1強調画像およびT2強調画像を生成してもよい。この場合、フル低ランク画像セットから直接T1強調画像およびT2強調画像に変換できるような学習済みモデルを用いてもよい。
なお、ステップS203で生成されたフル低ランク画像セットが出力されてもよい。さらに、ステップS204で求められる誤差関数の値が設定値よりも大きければ、アラートを出力するようにしてもよい。
なお、図2の例では、チェック用k空間データセットと取得したk空間データセットとの差分の評価を含んだ誤差関数の値が閾値以下であるか否かを収束条件としたが、反復回数を収束条件としてもよい。
反復回数を収束条件とする、第1の実施形態に係る医用データ処理装置の動作例について図3のフローチャートを参照して説明する。なお、ステップS201からステップS203まで、ステップS205、およびステップS206の処理は図2と同様である。
ステップS301では、処理回数フラグを初期化する。例えば、処理回数フラグをゼロに設定する。
ステップS302では、ステップS203の学習済みモデルの適用回数が閾値以上であるか否かを判定する。言い換えれば、スパース低ランク画像セットから学習済みモデルを用いてフル低ランク画像セットを生成した回数が閾値以上であるか否かを判定する。学習済みモデルの適用処理の回数が閾値未満であれば、ステップS205に進み、学習済みモデルの適用回数が閾値以上であれば、ステップS206に進む。
ステップS303では、処理回数フラグを1つインクリメントし、ステップS203に戻り、同様の処理を繰り返す。
なお、処理回数フラグが1と設定されてもよい。すなわちステップS302の処理を繰り返さずに、ステップS302の処理を1度行ない、そのままフル低ランク画像セットが出力されてもよい。
また繰り返し終了時には誤差関数の値を計算し、設定値よりも大きければ、アラートを出力するようにしてもよい。
また、図2に示す誤差関数の値と閾値とによる判定処理と、図3に示す学習済みモデルの適用回数に関する判定処理とを組合せ、どちらか先に収束条件を満たせば、フル低ランク画像セットを出力する、またはステップS206に進むようにしてもよい。
次に、第1の実施形態に係る撮像シーケンスの一例について図4を参照して説明する。
図4は、IR-bSSFP(Inversion Recovery-balanced Steady-State Free Precession)撮像シーケンスであり、横軸が時間であり、縦軸がk空間MR信号値もしくは実空間信号値を模式的に示している。第1の実施形態では、IR-bSSFPにより2次元(2D)ラジアルスキャンが実施される。1ショットで1スポークをスキャンするように想定し、TE(Echo time)は2.5ms、TR(Time of Repetition)は5msに固定する。始めにIRパルス(180°パルス)を送信し、その後フリップアングル(FA)30度の撮像を400回(400ショット)実施し、2秒の待ち時間の後、フリップアングル(FA)60度の撮像を400回実施する。つまり、待ち時間を挟んでフリップアングルを変えた撮像を実施する一般的な撮像シーケンスとなっている。データ解析においてはショットごとにまとめて1つのデータとする事により、800個にまとめられたk空間データが得られる。この場合N=800に相当する。
なお、撮像シーケンスはIR-bSSFPに限らず、IR-FISP(Fast Imaging with Steady-state Precession)などのシーケンスを用いてもよい。
また、スキャン法としては、ラジアルスキャンに限らず、プロペラスキャン、スパイラルスキャンなどの他のスキャン法でもよい。
次に、本実施形態で想定するラジアルスキャンの一例について図5を参照して説明する。
図5は、横軸をkx、縦軸をkyとした場合のk空間におけるラジアルスキャンのトラジェクトリを示す。本実施形態では、図5に示すように、1ショットごとに、ラジアルスキャンのスポークの角度をゴールデンアングル(2π/(1+√5))増加(回転)させるものとする。ただしこれは一例にすぎず、スポーク角度の振り方はゴールデンアングルに限定したものではない。
このとき辞書は、撮像シーケンスに対応したフルサンプリング撮像(図6を用いて後述する)のブロッホシミュレーションを行なうことにより、T1値、T2値に対応した実空間信号変化を求め、その信号値の変化と、T1値、T2値との関係として作成することができる。もしくは、実空間でのブロッホシミュレーションで得られる実空間信号変化から直接、T1値、T2値との関係として作成する事もできる。
作成した辞書に対して、特異値分解(SVD:Singular Value Decomposition)、主成分解析(PCA:Principal component analysis)などの多変量解析、および非負値行列因子分解(NMF:Nonnegative Matric Factorization)などといった次元圧縮処理を適用する事により、低ランク近似を行なうための、M組の重み係数を求める事ができる。次元圧縮手法については、一般的な手法を用いればよい。例えば、SVDを用いる場合、得られた特異値の高い順にM組の重み係数を選ぶことによりに次元(ランク)をMに圧縮する事ができる。この場合、フル低ランク画像602の数Mはランク数に対応しており、この数としては後処理において必要となる画像の再現性の精度に応じた数であればよい。ここではM=5とした。つまりこの場合はN=800をM=5まで圧縮する事に対応する。
次にフル低ランク画像の概念および生成例について図6を参照して詳細に説明する。フル低ランク画像とは、各撮像時間ごと(t1, t2,t3, …)にフルサンプリング撮像に必要な全てのスポークを撮像したN個のk空間データに対して、各撮像時間ごと(t1, t2,t3, …)に上記のようにしてSVDで求められた重み係数を乗算して足し合わせることにより生成した、M個のフル低ランクk空間データを、逆フーリエ変換する事により生成したM個の低ランク画像である。フル低ランク画像セットが求まれば、逆処理によって各ショットでのフルサンプリング画像を近似画像として求める事が可能となり、T1値、T2値のような量を高い精度で求める事が可能となる。
より具体的には、SVD等を用いて辞書をランクMに低ランク近似する事により、各ショットに乗算するための重み係数603のセットが算出され、ショットごとにフルサンプリングしたN個のk空間データに重み係数603を乗算して足し合わせることにより、M個のフルサンプリング低ランクk空間データ604が生成される。M個のフルサンプリング低ランクk空間データ604をそれぞれ逆フーリエ変換することで、M枚のフル低ランク画像602が生成される。
なおフルサンプリングk空間信号は、数値ファントムの撮像シミュレーションによっても生成する事ができる。またすでに図4、図5を用いて説明した撮像(図7を用いて詳細を後述する)を、初期スポーク角度をゴールデンアングルだけ増加させながら、複数回繰り返して、1つにまとめる事によって生成する事もできる。すなわち、フルサンプリング撮像する場合は、フルサンプリングに必要なスポーク本数の回数、上記スパースサンプリング撮像を、スポーク角度の初期値をゴールデンアングルだけずらしながら行い、その全てのデータを撮像時間ごとにまとめる事により得る事ができる。他の撮像シーケンス、撮像トラジェクトリをもちいた場合においても、同様の方法により、フルサンプリングに必要な複数回の撮像を行い、すべてのk空間データを撮像時間ごとにまとめる事によりN個のフルサンプリングk空間データを得る事ができる。
一方、図4、図5を用いて説明したスパースサンプリング撮像1回の撮像で得られる、スパース低ランク画像の概念および生成例について図7を参照して詳細に説明する。
図7は、図6と同様のラジアルスキャンを想定した例である。図6に示すフルサンプリングの場合と違い、1ショットごとに、ラジアルスキャンにおける1スポーク分のトラジェクトリに沿ってMR信号が収集され、k空間が充填されることでk空間データが取得される。具体的には、撮像時間t1では、右下がりのスポークにそってMR信号を収集し、撮像時間t2では、右上がりのスポークに沿ってMR信号を収集する。つまり、撮像時間ごとにスパースサンプリングしたk空間データ701が取得される。
各撮像時間ごとのスパースサンプリングk空間データ701にM組の重み係数603を乗算して足し合わせることで、M個のスパースサンプリング低ランクk空間データ702が生成される。さらに、M個のスパースサンプリング低ランクk空間データ702それぞれを逆フーリエ変換することでM個のスパース低ランク画像703が生成される。なお、N個のスパースサンプリングk空間データ701に乗じるM組のN個からなる重み係数603は、基本的にはフル低ランク画像を生成した際の重み係数と同一の値を用いる。ただし場合によっては異なる重み係数を用いる事もできる。
次に、重み係数と撮像シーケンスとを対応付けたルックアップテーブルの一例について図8を参照して説明する。
図8に示すように、スキャンの種類および撮像シーケンス801とランク802ごとの重み係数603のセットとを対応付けて格納する。具体的には、例えばスキャンの種類および撮像シーケンス801が「S1」に対して、ランク802「ランク1」および重み係数603のセット「w1,w2,w3,…」と、ランク802「ランク2」および重み係数603のセット「w’1,w’2,w’3,…」とが対応付けられる。
次に、最適化機能23で用いる学習済みモデルをシミュレーション、または実際の測定データによって生成するシステムの一例を図9のブロック図に示す。学習はシミュレーションデータによって生成された学習用データセットや、実際のスパースサンプリング撮像データとスパースサンプリング撮像を複数回繰り返して1つにまとめる事により生成したフルサンプリング撮像データとのペアを用いて行なってもよい。
図9は、学習用データ生成装置90、学習用データ保管装置92と、モデル学習装置94と、医用データ処理装置1とを含む。
学習用データ生成装置90は、数値ファントムを用いた、ブロッホ撮像シミュレーションにより、フル低ランク画像セットとスパース低ランク画像セットとのペアを生成する。フル低ランク画像セットとしては、撮像のシミュレーションは行なわないで、実空間でのブロッホシミュレーションから直接生成してもよい。スパース低ランク画像は、実際の撮像シーケンスをシミュレーションした計算により得ることができる。ラジアルスキャンの場合は、各ショットでの、各スポークのk空間データをシミュレーションして生成する。得られた各ショットのk空間データに対して、対応する辞書のSVDから得られたM組の重み係数それぞれについて、乗算して足し合わせ、逆フーリエ変換することにより、M個のスパース低ランク画像を生成する事ができる。
学習用データ生成装置90は、M個のスパース低ランク画像とM個のフル低ランク画像とを1組の学習用データとして生成する。なお、学習用データは、撮像シーケンス、スキャン方法および撮像部位ごとに作成されることが望ましい。例えば、脳用の学習済みモデルを生成する場合は、頭部数値ファントムなどのファントムを用いて、白質、灰白質、骨、髄液などのT1値、T2値、PD値、およびスライス断面などの様々パラメータを適宜変えながら、シミュレーションによって各パラメータ条件の正解データとなるM個のフル低ランク画像と入力データとなるM個のスパース低ランク画像との組を生成する。なお、各低ランク画像は、実画像と虚画像とを含む。
学習用データ保管装置92は、学習用データ生成装置90において生成された学習用データを記憶する。例えば、学習用データ保管装置92は、大容量記憶装置が内蔵されたコンピュータである。また、学習用データ保管装置92は、コンピュータにケーブルや通信ネットワークを介して通信可能に接続された大容量記憶装置であってもよい。当該記憶装置としては、HDD、SSD、集積回路記憶装置等が適宜利用可能である。学習用データ保管装置には、シミュレーションにより生成した学習用データのほかにも、実際にフルサンプリング撮像とスパースサンプリング撮像を行なって作成した学習用データを保管する事もでき、シミュレーションにより生成した学習用データを用いた学習や、実際に撮像により得られた学習用データや、その両方を用いた学習を行なう事ができる。
モデル学習装置94は、学習用データ保管装置92に記憶された学習用データに基づいて、モデル学習プログラムに従い機械学習モデルに機械学習を行わせることで、学習済みモデルを生成する。本実施形態で想定する機械学習モデルとしては、ディープラーニングで用いられる多層化ネットワークを想定するが、決定木、カーネル回帰など学習用データから何らかの特徴を学習できる手法であれば、他の機械学習アルゴリズムであってもよい。他のモデル学習装置94は、CPU(Central Processing Unit)、GPU(Graphics Processing Unit)等の汎用プロセッサ、または機械学習専用に構成されたプロセッサを有するワークステーション等のコンピュータでもよい。
モデル学習装置94と学習用データ保管装置92とはケーブル、又は通信ネットワークを介して通信可能に接続されてもよい。また、学習用データ保管装置92がモデル学習装置94に搭載されてもよい。これらの場合、学習用データ保管装置92からモデル学習装置94へ学習用データが供給される。なお、モデル学習装置94と学習用データ保管装置92とは通信可能に接続されてなくてもよい。この場合、学習用データが記憶された可搬型記憶媒体を介して、学習用データ保管装置92からモデル学習装置94へ学習用データが供給される。
医用データ処理装置1とモデル学習装置94とはケーブル、又は通信ネットワークを介して通信可能に接続されてもよい。モデル学習装置94で生成された学習済みモデルが医用データ処理装置1へ供給され、学習済みモデルが医用データ処理装置1のメモリ8に記憶される。なお、医用データ処理装置1とモデル学習装置94とは、必ずしも通信可能に接続されてなくてもよい。この場合、学習済みモデルが記憶された可搬型記憶媒体等を介して、モデル学習装置94から医用データ処理装置1へ学習済みモデルが供給される。
次に、第1の実施形態に係る学習済みモデルの学習時の概念について図10を参照して説明する。図10は、学習前の多層ネットワークと、多層ネットワークに入力される学習用データとを示す。
モデル学習時には、例えば工場出荷時などにおいて、学習用データを用いて多層ネットワークを機械学習させればよい。また、修理時やソフトウェアのアップデート時において学習済みモデルをアップデートできるようにしてもよい。
多層ネットワークは、例えば、多層ニューラルネットワーク、畳み込みニューラルネットワークを想定するが、畳み込みネットワークから発展して派生したU-net、ResNet、DenseNetなど他のネットワーク構成を用いてもよい。また、学習させる多層ネットワーク40の構成を、GAN(Generative Adversarial Network)、DCGAN(Deep Convolutional GAN)、またはpix2pixで構成してもよい。
学習用データは、フル低ランク画像を正解データとし、対応するスパース低ランク画像を入力データとした1組のデータを、複数用意したデータセットとする。当該データセットを用いて多層ネットワークを学習させることで、学習済みモデルを生成する。学習用データを用いて多層ネットワークを学習させる手法について、一般的な学習を行えばよいため、ここでの詳細な説明は省略する。
次に、第1の実施形態に係る学習済みモデルの利用時の概念について図11を参照して説明する。
学習済みモデルの利用時には、スパース低ランク画像セットに、対応する撮像シーケンスおよびスキャン方法に基づく学習済みモデルを適用することによって、フル低ランク画像セットが生成される。なお、スパース低ランク画像セットに含まれる画像から同数の画像を含むフル低ランク画像セットを出力することに限らず、スパース低ランク画像セットを入力し、学習済みモデルを用いることで、少なくとも1つのフル低ランク画像を出力するようにしてもよい。つまり、モデルの学習時には、スパース低ランク画像セットに含まれる画像数に対応するフル低ランク画像を出力できるように学習されているため、後処理で必要となるフル低ランク画像の数にあわせてフル低ランク画像の出力数を調整できる。
ここで、低ランク近似の一例について数式を用いて説明する。
低ランク近似を用いることで、SVDを使って行列のランクを低減できる。例えば、辞書の実空間MR信号変化を並べて作った行列δを低ランク近似する事は、
Figure 0007303677000001
と表せる。上の(1)式がSVDを表し、下の(2)式が低ランク近似を表す。
ここで、上付きチルダ()は、低ランク近似を行った変数を示す。δは、低ランク近似した辞書を示す。上付きHは、エルミート転置を示す。u は、uの特異値が大きい順のR行からなる行列であり、その要素が重み係数である。重み係数は、このようにして辞書から求める事ができる。なお、Rは1以上の自然数である。他の変数についても重み係数の行列u を用いる事により低ランク近似できる。
続いて、ステップS203からステップS205における最適化手法の一例として、ADMM(Alternating Direction Method of Multipliers)法を用いる場合について説明する。本方式においては、S203からS205のステップはADMMと一体化して実行される。
まず、xを、低ランク近似したM個の画像を1つにまとめた行列とする。これは低ランク画像セットに対応する。D~は、xに最も一致する低ランク近似された期待値(学習済みモデルの出力から求められる、xがとると期待される正規化された値)の行列とすると、次の拡張ラグランジアンを考えることができる。
Figure 0007303677000002
ここで、yは、the scaled dual formのラグランジュ係数であり、μは、ペナルティパラメータである。Sは撮像によって得られたk空間データセットであり、Gは撮像シーケンスに対応したk空間のグリッディング、Fは撮像シーケンスに対応したフーリエ変換による、状態を変換する役割を果たすオペレータである。この式を満たすxが求めるべきフル低ランク画像セットとなる。(3)式において第1項はデータ整合性を表し、第2項は期待値との整合性を表す。
(3)式をADMM法を用いて解くには、更新式となる(4)式から(6)式までを用いることができる。
Figure 0007303677000003
なお、一般的なADMM法と異なり、ラグランジュ係数「y」を「y-D」に置き換えている。よって、近似ADMM法とも呼べる。
繰り返し収束のアルゴリズムとしては、まず、GおよびF~として、撮像シーケンスに対応したオペレータを用意する。
また、最初に(4)式を解く場合、j=0として、D 、x およびμに適当な初期値を代入し、y はゼロ行列とする。
ステップ1として、(4)式を解いて、x を求める。(4)式は、共役勾配(CG:conjugate gradient)法を用いて最小化問題として解けばよい。またこのときの残差を誤差関数の値とし、S204の判定に用いる事ができる。
ステップ2として、学習済みモデルを適用して(5)式の期待値D を求める。ステップ2は、フル低ランク画像セット(xj+1 +y )に対する期待値を求める事に対応するため、(xj+1 +y )から求めたスパース低ランク画像セットに学習済みモデルを適用してフル低ランク画像セットを生成する処理を行なう事により求める事ができる。このステップがS203に対応する。
このとき出力として得られたフル低ランク画像セットは正規化されていないため、ボクセル毎に信号値の絶対値が「1」となるように正規化することで得られる値を用いて、期待値Dを更新する。具体的には、ランクを「5」とした場合、5枚のフル低ランク画像の中のあるボクセルの信号値が、それぞれs1,s2,s3,s4,s5であった場合、(s1+s2+s3+s4+s51/2で各信号値を除算することで絶対値が「1」となるようにし、得られた値を期待値Dとすればよい。
ステップ3として、(6)式を用いてy を求める。y は、(6)式にステップ1およびステップ2で求めたx およびD を代入し、逆行列を求めて解いてもよいし、CG法などの数値計算により解いてもよい。また、学習済みモデルによるフル低ランク画像セットの生成精度が正確な場合、yの値が十分に小さくなるため、(DJ+1 ・DJ+1 H~・yJ+1 )の項を無視してもよい。ステップ3で、yを更新する事により、補正したフル低ランク画像セット(xj+1 +yj+1 )を新たに生成し、それに対応したスパース低ランク画像セットをG・F・(xj+1 +yj+1 )によって求める事ができ、このステップがS205に対応する。
以降は、jの値を1つインクリメントし、ステップ1に戻り、ステップ1からステップ3までを繰り返しながらx 、D およびy の値を求める。収束条件としては、繰り返し回数が閾値に達する場合に処理が収束したと判定してもよいし、(4)式の残差を誤差関数の値として用い、誤差関数の値が閾値よりも小さい場合に、処理が収束したと判定してもよい。この処理がS204に対応する。
また、ステップS203からステップS205における最適化手法の別の一例として、(7)式を用いて繰り返し処理を行い最適化の精度を向上させることができる。
Figure 0007303677000004
CNNは、スパース低ランク画像セットからフル低ランク画像セットを生成するUnetの畳み込みネットワークを示す。Gdc H~は、k空間データのデータ列を、カーテシアンのk空間にグリッディングするオペレータである。CNNの中の「FH~・Gdc H~・G・F・x」は、フル低ランク画像セットからスパース低ランク画像セットを求める操作を表す。
(7)式の第1項は、データ整合性を表しており、学習済みモデルを適用して得られたフル低ランク画像セットから求めたk空間データセット(G・F・x)と、ステップS201で取得したk空間データセット(S)との差分を計算する。(7)式の第2項は、学習済みモデルの精度(学習の整合性)を表しており、フル低ランク画像セットから求めたスパース低ランク画像セットに対して、学習済みモデルを適用して得られたフル低ランク画像セットと、元のフル低ランク画像セットとの差分を計算する。
(7)式が最小となるようにフル低ランク画像セットx に補正を加えながら繰り返し収束を行なう事により、最適な解を得ることができる。例えば、(7)式を解くにはCG法を用いることができるが、最小値を探索する当該式中に学習済みモデルによる処理が含まれるため、非線形CG法を用いることが望ましい。
この場合はCG法、非線形CG法と一体化して、S203,S204,S205のステップが実行される。
次に、第1の実施形態に係る医用データ処理装置1の出力結果の第1例について図12を参照して説明する。
図12上段は、5個のスパース低ランク画像を示す。図12に示す5個のスパース低ランク画像の中で、特異値が最大の画像がランク1、特異値が最小の画像がランク5と設定される。図12下段は、上段の5個のスパース低ランク画像から第1の実施形態に係る医用データ処理装置1により生成された、スパース低ランク画像のランクにそれぞれ対応する5個のフル低ランク画像である。
図12に示すように、ランク3からランク5までのスパース低ランク画像は、上位(ランク1およびランク2)よりも特異値が小さいため、ノイズが多く判別できない画像であるが、第1の実施形態に係る医用データ処理装置1によれば、ランク3からランク5についてもSN比が大きいフル低ランク画像を生成することができる。
次に、第1の実施形態に係る医用データ処理装置1の出力結果の第2例について図13を参照して説明する。
図13では、医用データ処理装置1の出力結果である5個のフル低ランク画像から推定された定量値、PD、1/T1および1/T2の推定結果を示す。
図13(a)は、正解データである。図13(b)は、比較のため従前の辞書マッチングにより得られる各推定値である。図13(c)は、最適化処理において、学習済みモデル適用処理の回数を1回とした場合の結果である。図13(d)は、学習済みモデル適用処理の回数を10回とした結果である。最適化手法としては近似ADMMを用いた。
図13(b)に示すように、従前の辞書マッチング手法では、ノイズが大きく、推定精度が悪い。一方、本実施形態に係る医用データ処理装置の処理結果である図13(c)のような学習済みモデル適用処理が1回でも画像の推定精度が向上しており、さらに図13(d)によれば、学習済みモデル適用処理を複数繰り返すことで、正解データである図13(a)に近い精度が得られており、画像の推定精度がさらに向上していることが分かる。
以上に示した第1の実施形態によれば、スパースサンプリングk空間データセットに基づくスパース低ランク画像セットに、ディープラーニングによる学習済みのUnetなどの畳み込みネットワークを適用することによって、フルサンプリングk空間データに基づくフル低ランク画像セットを生成する。これにより、高速かつ高精度に、スパース低ランク画像セットからフル低ランク画像セットを出力することができる。さらに、高速かつ高精度にフル低ランク画像を生成できるので、その後の処理により、T1値、T2値を算出する際も高速かつ精度の高いパラメータ推定を行うことができる。例えば、一般的な総当たりによる辞書マッチングと比較すると、本実施形態に係るデータ処理装置によれば10倍から1000倍程度高速に生成することができるため、計算時間及び精度を大幅な向上することができる。
(第2の実施形態)
第2の実施形態では、実空間画像ではなく、k空間データに対しても同様に実施することができる。
第2の実施形態に係る医用データ処理装置1の動作について図14のフローチャートを参照して説明する。
ステップS1401では、取得機能21により処理回路2が、所定のスパースサンプリング撮像シーケンスによりMR信号を収集し、N個にまとめたk空間データを取得する。
ステップS1402では、生成機能22により処理回路2が、取得したN個のk空間データにM組のN個からなる重み係数をそれぞれに乗算し加算することで、M個のスパース低ランクk空間データを生成する。k空間データセットの重み付けに用いる重み係数は、例えば、第1の実施形態における実空間画像の処理に対して用いたルックアップテーブルを用いて重み係数を用いてもよいし、k空間データセットの処理用に特化した重み係数のルックアップテーブルを作成し、当該ルックアップテーブルから重み係数を決定してもよい。例えば、フルサンプリングk空間データセットから、ランダムにデータを取り出してデータセットを作り、当該データセットに対してSVDを実行することによりk空間データセット用の重み係数を決定できる。
ステップS1403では、最適化機能23により処理回路2が、M個のスパース低ランクk空間データに学習済みモデルを適用し、M個のフル低ランクk空間データを生成する。ここで学習済みモデルは、M個のスパース低ランクk空間データからM個のフル低ランクk空間データを生成するように学習されたUnetを用いる。
ステップS1404では、最適化機能23により処理回路2が、学習済みモデルを適用して得られたM個のフル低ランクk空間データからチェック用k空間データセットを生成し、ステップS1402で取得したk空間データセットとの差分の評価を含んだ誤差関数が、データ整合性を考慮した収束条件を満たすか否かを判定する。具体的には誤差関数の値が閾値以下となれば収束条件を満たすと判定し、ステップS1406に進む。誤差関数の値が閾値よりも大きい場合は収束条件を満たさないと判定し、ステップS1405に進む。
ステップS1405では、最適化機能23により処理回路2が、補正したM個のフル低ランクk空間データと、対応するスパース低ランクk空間データとを新たに生成し、ステップS1403に戻り、収束条件を満たすまで処理を繰り返す。
ステップS1406では、例えば生成機能22により処理回路2が、M個のフル低ランクk空間データを逆フーリエ変換し、M個のフル低ランク画像を生成する。
ステップS1407では、推定機能24により処理回路2が、ステップS1406で生成されたM個のフル低ランク画像からT1値、T2値およびPD値を算出する。M個のフル低ランク画像からT1値、T2値およびPD値を算出する手法としては、第1の実施形態と同様である。
なお、上述のフローチャートでは、近似ADMMによる最適化処理を想定しているが、第1の実施形態と同様に処理できる。
次に、第2の実施形態に係る医用データ処理装置1の出力結果の一例について図15を参照して説明する。なお、実際には、M個のスパース低ランクk空間データに学習済みモデルを適用してM個のフル低ランクk空間データを出力しているが、視認性の関係上、逆フーリエ変換して画像として比較する。
図15上段は、5個のスパース低ランクk空間データから得られた5個のスパース低ランク画像であり、特異値が最大の画像がランク1、特異値が最小の画像がランク5と設定される。図15下段は、5個のフル低ランクk空間データから得られた5個のフル低ランク画像である。
図15に示すように、ランク1からランク5までのランクにおいても良好な推定結果がえられていることが分かる。
さらに、k空間データに限らず、ハイブリッド空間データを用いても、スパース低ランクデータセットからフル低ランクデータセットを推定することができる。ハイブリッド空間データは、ある次元については逆フーリエ変換が行われ、他の次元については逆フーリエ変換が行われていないk空間データである。たとえば、3次元(3D)撮像を行い、スライス方向であるkz方向だけ逆フーリエ変換を行ない、kx方向、ky方向については逆フーリエ変換を行なっていない、(kx,ky,z)空間がハイブリッド空間に当たる。このようなハイブリッと空間は3D撮像のときに、処理の簡略化に寄与できる。
つぎに、サイノグラム実空間データを用いた場合の医用データ処理装置のデータ処理について、図16を参照して説明する。
図16は、第2の実施形態に係る医用データ処理装置のデータ処理の概念を示す。ここで用いるサイノグラム実空間データは、k空間のスキャン方法としてラジアルスキャンが採用された場合、各スポークに対して、スポークに沿った1次元逆フーリエ変換を行って得られたデータを、スポークに沿った位置情報を縦軸とし、スポークの角度方向(θ方向)を横軸とした座標形式で表現したデータである。
例えば生成機能22により処理回路2が、ラジアルスキャンにより収集されたk空間データをスポークに沿って1次元逆フーリエ変換したのち、θ方向に沿って並べる事により、測定サイノグラム実空間データ1601を生成する。次にサイノグラム実空間データ1601の各スポーク(各θ)に対してM組の対応する重み係数を掛ける事により、M個のスパース低ランクサイノグラム実空間データ1602が生成される。
つぎに最適化機能23により処理回路2が、生成されたM個のスパース低ランクサイノグラム実空間データ1602に学習済みモデルを適用し、M個のフル低ランクサイノグラム実空間データ1603を生成する。学習済みモデルは、k空間の場合と同様に、正解データであるM個のフル低ランクサイノグラム実空間データと、入力データであるM個のスパース低ランクサイノグラム実空間データとをペアとした学習用データを複数用意して、Unetを学習させればよい。
続いて、最適化機能23により処理回路2が、生成されたN個のフル低ランクサイノグラム実空間データ1603から、対応する測定データを計算によって求め、チェック用サイノグラム実空間データを生成する。
そして、測定サイノグラム実空間データ1602とチェック用サイノグラム実空間データとをそれぞれ比較してその差分の評価を含んだ誤差関数の値が、閾値以下となるように、例えば、CGと近似ADMMとを用いた最適化手法により収束させる。これにより、最適なM個のフル低ランクサイノグラム実空間データ1603を推定することができる。
なお、スポークにそって1D逆フーリエ変換を行わず、縦軸をkr(k空間でのスポークの半径方向の波数)、横軸をスポークの角度θとおいて並べた、サイノグラムk空間でデータを表示した場合も同様に処理することができる。
なお、サイノグラム実空間データ、サイノグラムk空間データの特徴として、k空間におけるそれぞれのラジアルのスポークが独立して表示されるため、全ての測定データ点が表示されるという特徴がある。これに対してラジアル撮像した測定データを、カーテシアン座標にグリッディングした場合には、k空間中心(kx,kyがゼロ付近)では、多くのデータ点が重なりを持つ事になり、データ点数は減らされた状態となる。このため測定した全てのデータ点の情報を利用することができない。
また、撮像結果の再構成時にはラジアル座標からカーテシアン座標へ、もしくはその逆の変換(グリッディング)が必要となるが、そのための行列をNuFFT(Non-uniform FFT)などの方法によって計算すると、非常に大きな行列となり、高分解能の画像を再構成するためには多くのメモリが必要となる。一方、サイノグラム実空間データ、サイノグラムk空間データでは、全てのスポークと、全てのデータ点が独立に表現されているため、リグリッディングを行うための大きな行列は必要なく、低ランク画像とデータを元に戻すための重み係数の行列とが処理できるメモリ量あればよく、高分解能の撮像を行なった場合でも現実的なメモリ量で再構成を行うことができる。
なお、k空間データとして、ラジアルスキャンのトラジェクトリを用いたデータ収集の場合を例に述べたが、必ずしもラジアルスキャンの場合に限定されるわけではなく、スパイラルスキャンのトラジェクトリを用いたデータ収集であってもよい。
スパイラルスキャンのトラジェクトリの場合は、1ショットのk空間軌跡を直線状に引き伸ばして縦軸とし、スパイラルの回転角度を横軸として並べた擬似サイノグラムk空間データ、またはトラジェクトリにそって1D逆フーリエ変換を行なった擬似サイノグラム実空間データについて学習済みモデルを生成し、当該学習済みモデルを用いてデータ処理を行なえばよい。さらには、他の非カーテシアンスキャンによるデータ収集を行なった場合も、同様に処理および学習することができる。
以上に示した第2の実施形態によれば、k空間データ、ハイブリッド空間データ、サイノグラム実空間データ、サイノグラムk空間データのセットを機械学習させた学習済みモデルを用いることで、k空間、ハイブリッド空間、サイノグラム実空間、サイノグラムk空間においてスパースサンプリングデータセットからフルサンプリングデータセットを推定し、第1の実施形態と同様に処理することができる。k空間や、ハイブリッド空間、サイノグラム実空間、サイノグラムk空間においては、フーリエ変換や、グリッディング処理が不要もしくは、軽減される場合があり、特に3D撮像を行なう場合、第1の実施形態に比して計算時間やメモリの点で有利になる。
(第3の実施形態)
第1の実施形態及び第2の実施形態では、2次元撮像の例を説明したが、3次元撮像に対応した医用データ処理装置1によるデータ処理について説明する。
第3の実施形態に係る撮像シーケンスの一例について図17を参照して説明する。
撮像シーケンスおよびスキャン方法としては、上述の実施形態と同様にIR-bSSFPのラジアルスキャンを用いる。
図17の例では、IRとなる180°パルスを送信した直後に、フリップアングル30°の撮像を400ショット行い、その後2秒待ったあと、フリップアングル60°の撮像を400shot行なう。
続いて、2秒程度待ち時間を設けた後、スポイラーによって横磁化を消失させるまでを1サイクルとして、複数のサイクルによってMR信号を収集する。なお、1サイクルの撮像時間は約8秒であるため、一般的に被検体から観測されるT1値よりも十分に長く、サイクル毎の各ボクセルの信号強度はほぼ同じとなると考えられる。
このとき、1サイクルごとにz軸方向にも傾斜磁場をかけてkz方向にも位相エンコーディングを行い、kzスライスを選択しながら撮像を行なう。つまり、1サイクルの撮像中は、kzを固定し、kx-ky平面についてスポークの角度を変えながらMR信号を収集して、k空間を充填する。次のサイクルでは傾斜磁場強度を変更し、kzを変えて別のkzスライスにおけるkx-ky平面についてk空間を充填するためのMR信号を収集する。1サイクルの撮像は、kzが違う以外は全て同一の条件で繰り返すものとする。図17の例では、kz1、kz2、kz3、kz4とシーケンシャルにkzを変えながら撮像する。なお、撮像されるkzの順番はシーケンシャルでなくても構わず、kz=0を中心にセントリックに振って変えてもよいし、インタレースでもよいし、他の順番でもよい。
次に、第3の実施形態に係る医用データ処理装置1の動作について図18の概念図を参照して説明する。ここではランク数5、スライス数5の場合について説明する。
生成機能22により処理回路2が、kzスライスごと、つまり1サイクルごとに、取得したスパースサンプリングk空間データセットSkz1~5に5組の重み係数を乗算して足し合わせるあわせる事で、k空間データセットSkz1~5ごとに5つのスパース低ランクk空間データを生成する。スパース低ランクk空間データは、以下の(8)式のように表せる。
Figure 0007303677000005
次に、生成機能22により処理回路2が、各kzスライス当たり5つのスパース低ランクk空間データを、kz方向にまとめ、5つの3次元スパース低ランクk空間データを生成する。3次元スパース低ランクk空間データを3次元逆フーリエ変換することにより、5つの3次元スパース低ランク画像を生成する。画像のz方向のスライス数はkz平面のスライスの数と同じとなる。
5つのスライスの、5つのスパース低ランク画像は以下の(9)式のように表せる。
Figure 0007303677000006
続いて、最適化機能23により処理回路2が、各スライスのスパース低ランク画像セットに学習済みモデル(Unet)を適用し、各スライスのフル低ランク画像セットを生成する。スライスごとに処理できるため、上述した2次元のフル低ランク画像セットの生成と同様である。
5つのスライスの5つのフル低ランク画像は、以下の(10)式のように表せる。
Figure 0007303677000007
最適化機能23により処理回路2が、各スライスのフル低ランク画像を、z方向のスライスを全てまとめて3次元フル低ランク画像とし、3次元フーリエ変換によって、3次元フル低ランクk空間データに変換される。
5スライスの5つのフル低ランクk空間データは、(11)式のように表せる。
Figure 0007303677000008
最適化機能23により処理回路2が、処理を行うことで、スライス毎のフル低ランクk空間データセットから、スライス毎にチェック用k空間データセットS’kz1~5を得る。
最適化機能23により処理回路2が、チェック用k空間データセットS’kz1~5と実際の撮像から取得したk空間データセットSkz1~5とを比較することにより、上述の実施形態と同様な繰り返し処理を実施すればよい。
なお、図18の例は、実空間画像セットを用いて学習を行った学習済みモデルを用いた場合について説明したが、k空間データセットを用いて学習を行った学習済みモデルを用いてもよい。
k空間データセット用に学習した学習済みモデルを用いる場合の第3の実施形態に係る医用データ処理装置1の動作について図19を参照して説明する。
図19に示すように、k空間データセットに関する学習済みモデルは、学習時及び利用時には3次元フーリエ変換および逆フーリエ変換を行った各スライスのスパース低ランク画像セットを生成せずに、5つのスパース低ランクk空間データから直接、5つのフル低ランクk空間データを生成することができる。よって、3次元フーリエ変換および3次元逆フーリエ変換に要する計算時間を削減することができる。
なお、k空間データセットを用いた学習の場合、学習済みモデルはkzスライスごとに別々に学習を行い、kzごとに専用のUnetとして用意してもよいし、全てのkzスライスについて1つのUnetを学習させて、適用してもよい。
また、2次元撮像の場合と同じように、3次元撮像の場合でも、サイノグラム実空間、サイノグラムk空間での学習を行なったUnetを用いる事ができる。この場合は、2D画像と同じように、グリッディング処理を軽くする事ができるという特徴がある。
第3の実施形態に係る医用データ処理装置の出力結果について図20を参照して説明する。
図20は、頭部の8スライスの画像である。図20上段はPD画像、中段は1/T1画像、下段、1/T2画像をそれぞれ示す。図20に示すように、スライス間で同じ信号強度を保ったスライス画像を生成でき、結果として高速かつ高精度に3次元画像を生成できる。
(第3の実施形態に係る変形例)
第3の実施形態に係る変形例として、kz方向のスライスを撮像する際に、パラレルイメージングにより処理する場合について図21を参照して説明する。
図21は、図17と同様の撮像シーケンスを示す。ここで、kz平面のスライスを1おきに間引いてMR信号を収集する。図21の例では、kz1,kz3,kz5,kz7の各スライスのk空間を充填するようにMR信号を収集する。
撮像しなかったkz平面のスライスは、パラレルイメージング処理によって補間する。
具体的には、各サイクルにおいて、スポーク角度の振り方は同じにしているため、各サイクルにおいてn番目に収集されるスポークは全て同じ角度となり、kz-kr平面で見た場合に、1つの平面をなしている。また、n番目のスポークが撮像される1サイクル中でのタイミングは、各サイクルで全て同じとなるため、当該平面を構成しているスポークは、全て観察対象が同じ信号強度(コントラスト)を持った瞬間の撮像データとなる。
そこで当該平面にについて、2次元逆フーリエ変換を行う場合、観察対象がこの平面に投影された2次元画像を得ることができる。また、z方向には、k空間において1つ置きにデータを収集している影響により折り返しが発生する。よって、マルチコイルの撮像データおよび感度マップを用いて、一般的なパラレルイメージング処理(いわゆるSENSE,SPEEDERなど)で処理すればよい。
全てのスポーク角度において、折り返しを展開した画像を得られるため、それをフーリエ変換する事により、撮像しなかったkzスライスのk空間データを補間できる。補間されたk空間データを用いて、上述したように、最適化機能23による最適化処理を行えばよい。
なお、変形例による処理によれば、一般的なパラレルイメージングの枠組みを使う事ができるため、一般的なMRI装置で用いられているライブラリを利用できるというメリットもある。また、パラレルイメージング処理によれば、kz平面のスライスの撮像数は半分となるため、全体の撮像時間を半分にすることができる。
以上に示した第3の実施形態によれば、1サイクルで、1つのkzスライスの撮像を行い、複数サイクルを繰り返して3次元撮像を行なう。よって、3次元フーリエ変換、3次元逆フーリエ変換以外の処理は、スライスごとに行なうことができるため、他の処理は2次元の場合と同じ用に処理できる。このため、3次元撮像に対応する最適化処理であっても、メモリコスト及び計算コストを低減することができ、一般的なメモリサイズを備える計算機を用いて処理を行うことができる。よって、3次元再構成のために特殊な計算機を準備せずに、コストを低減できる。
(第4の実施形態)
第3の実施形態では、1つのkz平面のスライスを1サイクルで撮像する例を示すが、第4の実施形態では、複数のkzスライスを、複数のサイクルでグループとしてまとめて撮像してもよい。
第4の実施形態に係る撮像シーケンスの一例について図22を参照して説明する。
図22の例では、2つのサイクルを、1つのグループとしてまとめ、当該1つのグループで4つのkzスライスを撮像する例を示す。
この例では、同じグループにまとめた2つのサイクルは、FA、待ち時間、IR、TR、TE等の撮像条件を同じとする。上述の撮像方法と比較して第4の実施形態に係る撮像シーケンスでは、1つのサイクルで1つのkzスライスを充填するのではなく、1つのサイクル内でショットごとに4つのkz平面のスライスのうち1つを選ぶようにしていることが異なる。したがって、1グループによって、4つのkzスライスのk空間データを収集する。このグループごとのk空間データの収集を繰り返すことで、必要な全てのkzスライスのk空間データの収集を行なう。なおこの場合は、1サイクルで1スライスを撮像する場合と、1つの平面のラジアルのスポーク数を一致させるためには、1サイクルでのスポークの収集数を倍にする必要があるが、必要な撮像精度に応じて、調整する事ができる。
第4の実施形態では、低ランク近似のための重み係数の計算を行なうために、辞書としてはグループを単位とした信号値の変化を、T1値、T2値を変えたブロッホシミュレーションによって作成し、それをSVDによって低ランク近似し、ラジアルの各収集スポークにかける重み係数を計算する。
撮像後、医用データ処理装置1は、サイクルごとではなくグループごとに最適化処理を行なうことで、第3の実施形態に係るサイクルごとに最適化処理を行なう場合と同じように処理できる。
さらに、グループごとの処理を行う場合でも、マルチコイルを用いたパラレルイメージングによって処理を行うことができる。2つのサイクルを1つのグループとしてまとめ、1つのグループで8つのkzスライスを撮像する場合を考える。このとき1サイクルでのショット数は変えないとすると、同じ時間で収集できるkzの数は2倍となり、1つのkzスライスの撮像を行なうために必要な時間は半分となるため、全体の撮像時間は半分になる。但し、1つのkzスライスでのスポーク数は半分になる。
マルチコイルを用いた場合の最適化処理について図23のフローチャートを参照して説明する。
ステップS2301では、取得機能21により処理回路2が、上述した撮像シーケンスに沿って、複数のコイルによりMR信号を取得する。ここでは、被検体の頭部撮影を想定し、32チャンネルのヘッドコイルを用いる場合を想定する。この場合、32チャンネル分の信号を得られる。
ステップS2302では、処理回路2が、32chのコイルをより少数の仮想コイルに信号を圧縮する。これは、32チャンネル分の信号をそのまま最適化処理に用いると、処理サイズが大きいために必要となるメモリサイズが大きくなり、さらに計算時間も長くなってしまうため、実際のチャンネル数よりも少ないチャネル数の仮想コイルで受信した信号として圧縮する。ここでは、6チャンネルの仮想コイルに圧縮することを想定するが、これに限らず、処理可能なデータサイズ及び処理時間に応じて、チャンネル数を適宜変更してもよい。少数の仮想コイルに圧縮する方法としては、例えば、複数のコイルで取得した信号をSVDなどによってより少数の仮想コイルの信号としてまとめて用いればよい。
ステップS2303では、生成機能22により処理回路2が、仮想コイルごとに、k空間データを低ランク近似し、スパース低ランクk空間データセットを生成する。ここでは、6チャンネルの仮想コイルの信号について、チャンネルごとに5組の重み係数を乗算して足し合わせることで5つのスパース低ランクk空間データを生成する。よって、1グループのデータとしては、グループ収集するkz平面の8スライス、仮想コイルの6チャンネル、5個の低ランクk空間データであるため、8×6×5=240枚の2次元のスパース低ランクk空間データを得られる。
ステップS2304では、最適化機能23により処理回路2が、スパース低ランクk空間データセットに学習済みモデルを適用し、フル低ランクk空間データセットを生成する。
ステップS2305では、最適化機能23により処理回路2が、データ整合性を含んだ誤差関数が収束条件を満たすか否かを判定する。収束条件を満たせば、ステップS2307に進み、収束条件を満たさなければ、ステップS2306に進む。収束条件は上述の実施形態と同様である。
ステップS2306では、最適化機能23により処理回路2が、補正を加えたフル低ランクk空間データセットを新たに生成し、ステップS2304に戻り、同様の処理を繰り返す。
ステップS2307では、例えば生成機能22により処理回路2が、フル低ランクk空間データセットを逆フーリエ変換してフル低ランク画像を生成する。
ステップS2308では、推定機能24により処理回路2が、フル低ランク画像から各種定量値を算出する。
なお、メモリや処理量の制約がなければ、ステップS2302における仮想コイルに信号を圧縮する処理を用いずに、撮像に使用した複数のコイルのMR信号をそのままステップS2303で処理してもよい。
図23に示す最適化処理によれば、撮影に用いる複数のコイルのそれぞれで取得されるMR信号を全て活用して、フル低ランクk空間データおよびフル低ランク画像を生成することができる。
なお、学習済みモデルの学習時において、スパース低ランクk空間データのデータサイズを分割して学習させてよい。データサイズの分割例を図24に示す。
図24は、1スライスにおいて256×256ボクセルの解像度を有する2次元データを示す。
ここでは、2次元データを16等分に分割して、64×64の解像度の単位(以下、パッチ2401という)で学習を行ってもよい。このようにパッチ2401単位で処理することで、学習におけるデータサイズを減らすことができ、メモリ量を削減することができる。
学習としては、仮想コイルを用いたスパース低ランクk空間データセットを入力データとし、仮想コイルを用いたフル低ランクk空間データセットを正解データとして多層ネットワークを学習させればよい。
このように、複数のコイルのデータを一括して学習させることにより、パラレルイメージングにおけるデータ補間も同時に行なうことができる。さらに、パッチ学習と組み合わせることで、高速かつメモリコストを低減した処理を行うことができる。
なお、2次元Unet(2D-Unet)を用いて推定する方法について示したが、Unetとしては3次元Unet(3D-Unet)を用いてもよい。例えば、32x32x32ボクセルx6chx5ランクのスパース低ランクk空間データセットの3次元のパッチを入力し、フル低ランクk空間データセットの3Dパッチを出力できるように、多層ネットワークを学習させればよい。この場合は、3次元での畳み込みによる特徴量抽出および学習を行なうことができるため、3次元の空間情報を利用することができ2次元の場合よりも精度の向上が期待できる。
また上記のパラレルイメージングによる倍速率(acceleration factor)は例として2.0としたが、2以上の倍速率でもよい。また、学習は予めシミュレーションによって作成したデータを元に行い、その上で実際の撮像データを用いて転移学習してもよい。
続いて、定量値としてADC(apparent diffusion coefficient)または拡散強調画像を生成する場合の第1の撮像シーケンス例について図25を参照して説明する。
図25はSSFPによる2次元ラジアルスキャンを用いる場合を示す。
1つのTRの間に、モノポーラMPG(Motion Probing Gradient)2501を1度入れる場合を示す。SSFPにおいて、フリップ角αのRF信号とフリップ角-αのRF信号とを交互に送信するため、TRの1サイクル中でモノポーラMPGを1度行うことで、繰り返しの中でコヒーレンスパスを通じて、拡散強調画像を得ることができる。
次に、ADCまたは拡散強調画像を撮影する場合の第2の撮像シーケンス例について図26に示す。
図26は、バイポーラMPG2601を1度入れる場合を示す。なお、バイポーラMPG2601を入れる代わりに、異なる方向のモノポーラMPGを交互に入れてもよい。また、各TR期間においてMPGを入れる代わりに、数回のTR経過後に入れるようにしてもよい。
また、MPGとして、任意の波形を用いることで、q軌跡拡散MRI(QTI)と組み合わせてもよい。
以上に記述した撮像方法をDW-SSFPと呼ぶ。
次に、ADCまたは拡散強調画像を撮影する場合の第3の撮像シーケンス例について図27に示す。この撮像方法は拡散プレパレーションbSSFPと呼ぶ。
図27では、bSSFPにおける通常のRFパルスを送信する前に、磁化にコントラストを付けるための拡散プレパレーションパルス2701を送信する。なお、拡散プレパレーションパルス2701の後に全ての撮像を行う必要は無く、数回のTRの撮像を行なった後に、再び拡散プレパレーションパルス2701を送信するようなシーケンスでもよい。
DW-SSFP、拡散プレパレーションbSSFPともに、得られるMR信号は、PD値、T1値、T2値、ADCと各種撮像パラメータに依存するため、撮像シーケンスにあわせて、T1値、T2値、ADC値と信号強度との関係を計算して辞書を作成し、辞書から重み係数を求めたあと、T1値、T2値のみの推定を行なった場合と同じように、スパース低ランクk空間データセットを入力とし、フル低ランクk空間データセットを出力とするように、多層ネットワークを学習させることにより、ADCまたはその後の拡散強調画像を生成することができる。
なお、ADC値の推定精度を上げるためにはMPGパルスの強度を変えた2種類以上の撮像を行っておくことが望ましい。またMPGパルスの強度をゼロとした撮像を行なっておくことも望ましい。
以上に示した第4の実施形態によれば、3次元撮像または拡散強調画像用の撮像といったように、様々な撮像法に対しても医用データ処理装置により最適化処理を行うことができ、定量値を算出するために必要となる撮像シーケンスを用いることで、高速かつ高精度に所望の定量値を生成することができる。
(第5の実施形態)
第5の実施形態では、上述の実施形態に係る医用データ処理装置を含む磁気共鳴イメージング装置の全体構成について、図28を参照して説明する。図28は、本実施形態における磁気共鳴イメージング装置100の構成を示す図である。
図28に示すように、磁気共鳴イメージング装置100は、静磁場磁石101と、傾斜磁場コイル103と、傾斜磁場電源105と、寝台107と、寝台制御回路109と、送信コイル113と、送信回路115と、受信コイル117と、受信回路119と、シーケンス制御回路121と、バス123と、インタフェース125と、ディスプレイ127と、記憶装置129と、処理回路131とを備える。なお、磁気共鳴イメージング装置100は、静磁場磁石101と傾斜磁場コイル103との間に中空の円筒形状のシムコイルを有していてもよい。
静磁場磁石101は、中空の略円筒形状に形成された磁石である。なお、静磁場磁石101は、略円筒形状に限らず、開放型の形状で構成されてもよい。静磁場磁石101は、内部の空間に一様な静磁場を発生する。静磁場磁石101としては、例えば、超伝導磁石等が使用される。
傾斜磁場コイル103は、中空の円筒形状に形成されたコイルである。傾斜磁場コイル103は、静磁場磁石101の内側に配置される。傾斜磁場コイル103は、互いに直交するX、Y、Zの各軸に対応する3つのコイルが組み合わされて形成される。Z軸方向は、静磁場の方向と同方向であるとする。また、Y軸方向は、鉛直方向とし、X軸方向は、Z軸およびY軸に垂直な方向とする。傾斜磁場コイル103における3つのコイルは、傾斜磁場電源105から個別に電流供給を受けて、X、Y、Zの各軸に沿って磁場強度が変化する傾斜磁場を発生させる。
傾斜磁場コイル103によって発生するX、Y、Z各軸の傾斜磁場は、例えば、周波数エンコード用傾斜磁場(リードアウト傾斜磁場ともいう)位相エンコード用傾斜磁場およびスライス選択用傾斜磁場を形成する。スライス選択用傾斜磁場は、撮像断面を決めるために利用される。位相エンコード用傾斜磁場は、空間的位置に応じてMR信号の位相を変化させるために利用される。周波数エンコード用傾斜磁場は、空間的位置に応じてMR信号の周波数を変化させるために利用される。
傾斜磁場電源105は、シーケンス制御回路121の制御により、傾斜磁場コイル103に電流を供給する電源装置である。
寝台107は、被検体Pが載置される天板1071を備えた装置である。寝台107は、寝台制御回路109による制御のもと、被検体Pが載置された天板1071を、ボア111内へ挿入する。寝台107は、例えば、長手方向が静磁場磁石101の中心軸と平行になるように、磁気共鳴イメージング装置100が設置された検査室内に設置される。
寝台制御回路109は、寝台107を制御する回路であり、インタフェース125を介した操作者の指示により寝台107を駆動することで、天板1071を長手方向および上下方向へ移動させる。
送信コイル113は、傾斜磁場コイル103の内側に配置されたRFコイルである。送信コイル113は、送信回路115からRF(Radio Frequency)パルスの供給を受けて、高周波磁場に相当する送信RF波を発生する。送信コイル113は、例えば、全身コイル(以下、WBC(whole body coil)という)である。WBCは、送受信コイルとして使用されてもよい。WBコイルと傾斜磁場コイル103との間には、これらのコイルを磁気的に分離するための円筒状のRFシールドが設置される。
送信回路115は、シーケンス制御回路121の制御により、ラーモア周波数等に対応するRFパルス)を送信コイル113に供給する。
受信コイル117は、傾斜磁場コイル103の内側に配置されたRFコイルである。受信コイル117は、高周波磁場によって被検体Pから放射されるMR信号を受信する。受信コイル117は、受信されたMR信号を受信回路119へ出力する。受信コイル117は、例えば、1以上、典型的には複数のコイルエレメントを有するコイルアレイである。受信コイル117は、例えば、フェーズドアレイコイルである。
受信回路119は、シーケンス制御回路121の制御により、受信コイル117から出力されたMR信号に基づいて、デジタル化された複素数データであるデジタルのMR信号を生成する。具体的には、受信回路119は、受信コイル117から出力されたMR信号に対して各種信号処理を施した後、各種信号処理が施されたデータに対してアナログ/デジタル(A/D(Analog to Digital))変換を実行する。受信回路119は、A/D変換されたデータを標本化(サンプリング)する。これにより、受信回路119は、デジタルのMR信号(以下、MRデータと呼ぶ)を生成する。受信回路119は、生成されたMRデータを、シーケンス制御回路121に出力する。
シーケンス制御回路121は、処理回路131から出力された検査プロトコルに従って、傾斜磁場電源105、送信回路115および受信回路119等を制御し、被検体Pに対する撮像を行う。検査プロトコルは、検査に応じた各種パルスシーケンスを有する。検査プロトコルには、傾斜磁場電源105により傾斜磁場コイル103に供給される電流の大きさ、傾斜磁場電源105により電流が傾斜磁場コイル103に供給されるタイミング、送信回路115により送信コイル113に供給されるRFパルスの大きさ、送信回路115により送信コイル113にRFパルスが供給されるタイミング、受信コイル117によりMR信号が受信されるタイミング等が定義されている。
バス123は、インタフェース125と、ディスプレイ127と、記憶装置129と、処理回路131との間でデータを伝送させる伝送路である。バス123には、ネットワーク等を介して、各種生体信号計測器、外部記憶装置、各種モダリティなどが適宜接続されてもよい。例えば、生体信号計測器として、不図示の心電計がバスに接続される。
インタフェース125は、操作者からの各種指示や情報入力を受け付ける回路を有する。インタフェース125は、例えば、マウス等のポインティングデバイス、あるいはキーボード等の入力デバイスに関する回路を有する。なお、インタフェース125が有する回路は、マウス、キーボードなどの物理的な操作部品に関する回路に限定されない。例えば、インタフェース125は、磁気共鳴イメージング装置100とは別体に設けられた外部の入力機器から入力操作に対応する電気信号を受け取り、受け取った電気信号を種々の回路へ出力するような電気信号の処理回路を有していてもよい。
ディスプレイ127は、処理回路131におけるシステム制御機能1311による制御のもとで、画像生成機能により生成された各種磁気共鳴画像(MR画像)、撮像および画像処理に関する各種情報などを表示する。ディスプレイ127は、例えば、CRTディスプレイや液晶ディスプレイ、有機ELディスプレイ、LEDディスプレイ、プラズマディスプレイ、又は当技術分野で知られている他の任意のディスプレイ、モニタ等の表示デバイスである。
記憶装置129は、画像生成機能1313を介してk空間に充填されたMRデータ、画像生成機能1313により生成された画像データ等を記憶する。記憶装置129は、各種検査プロトコル、検査プロトコルを規定する複数の撮像パラメータを含む撮像条件等を記憶する。記憶装置129は、処理回路131で実行される各種機能に対応するプログラムを記憶する。記憶装置129は、例えば、RAM(Random Access Memory)、フラッシュメモリ等の半導体メモリ素子、ハードディスクドライブ(hard disk drive)、ソリッドステートドライブ(solid state drive)、光ディスク等である。また、記憶装置129は、CD-ROMドライブやDVDドライブ、フラッシュメモリ等の可搬性記憶媒体との間で種々の情報を読み書きする駆動装置等であってもよい。
処理回路131は、ハードウェア資源として図示していないプロセッサ、ROM(Read-Only Memory)やRAM等のメモリ等を有し、磁気共鳴イメージング装置100を統括的に制御する。処理回路131は、システム制御機能1311と、画像生成機能1313と、取得機能21と、生成機能22と、最適化機能23と、推定機能24とを有する。取得機能21と、生成機能22と、最適化機能23とおよび推定機能24は、上述の実施形態に係る医用データ処理装置1の処理回路2に含まれる機能と同様のため、ここでの説明を省略する。
処理回路131の各種機能は、コンピュータによって実行可能なプログラムの形態で記憶装置129へ記憶されている。処理回路131は、これら各種機能に対応するプログラムを記憶装置129から読み出し、実行することで各プログラムに対応する機能を実現するプロセッサである。換言すると、各プログラムを読みだした状態の処理回路131は、図1の処理回路131内に示された複数の機能等を有することになる。
なお、図1においては単一の処理回路131にてこれら各種機能が実現されるものとして説明したが、複数の独立したプロセッサを組み合わせて処理回路131を構成し、各プロセッサがプログラムを実行することにより機能を実現するものとしても構わない。換言すると、上述のそれぞれの機能がプログラムとして構成され、1つの処理回路が各プログラムを実行する場合であってもよいし、特定の機能が専用の独立したプログラム実行回路に実装される場合であってもよい。
なお、上記説明において用いた「プロセッサ」という文言は、例えば、CPU(Central Processing Unit)、GPU(Graphics Processing Unit)或いは、特定用途向け集積回路(Application Specific Integrated Circuit:ASIC)、プログラマブル論理デバイス(例えば、単純プログラマブル論理デバイス(Simple Programmable Logic Device:SPLD)、複合プログラマブル論理デバイス(Complex Programmable Logic Device:CPLD)、およびフィールドプログラマブルゲートアレイ(Field Programmable Gate Array:FPGA))等の回路を意味する。
プロセッサは、記憶装置129に保存されたプログラムを読み出し実行することで各種機能を実現する。なお、記憶装置129にプログラムを保存する代わりに、プロセッサの回路内にプログラムを直接組み込むよう構成しても構わない。この場合、プロセッサは回路内に組み込まれたプログラムを読み出し実行することで機能を実現する。なお、寝台制御回路109、送信回路115、受信回路119、シーケンス制御回路121等も同様に、上記プロセッサなどの電子回路により構成される。
処理回路131は、システム制御機能1311により、磁気共鳴イメージング装置100を制御する。具体的には、処理回路131は、記憶装置129に記憶されているシステム制御プログラムを読み出してメモリ上に展開し、展開されたシステム制御プログラムに従って磁気共鳴イメージング装置100の各回路を制御する。例えば、処理回路131は、システム制御機能1311により、インタフェース125を介して操作者から入力される撮像条件に基づいて、検査プロトコルを記憶装置129から読み出す。なお、処理回路131は、撮像条件に基づいて、検査プロトコルを生成してもよい。処理回路131は、検査プロトコルをシーケンス制御回路121に送信し、被検体Pに対する撮像を制御する。
なお、複数のRFパルスを含む励起パルスを印加する場合、処理回路131は、設定機能1315により、複数のRFパルスのうちの少なくとも1組のRFパルス間に反転パルスを含む励起パルスを印加し、かつ反転パルスの印加中にスポイラー傾斜磁場を印加する励起パルスシーケンスを設定する。反転パルスは、縦磁化の正負を反転する反転パルスであり、180°パルスまたはリフォーカスパルスともいう。スポイラー傾斜磁場は、横磁化を分散させる傾斜磁場であり、フロップスポイラーともいう。
処理回路131は、システム制御機能1311により、励起パルスシーケンスに従って励起パルスを印加し、スポイラー傾斜磁場を含む傾斜磁場を印加するように制御する。処理回路131は、システム制御機能1311により、励起パルスシーケンスを実行後、各種データ収集用のパルスシーケンスであるデータ収集シーケンスに従って、被検体PからのMR信号を収集し、MRデータを生成する。
処理回路131は、画像生成機能1313により、リードアウト傾斜磁場の強度に従って、k空間のリードアウト方向に沿ってMRデータを充填する。処理回路131は、k空間に充填されたMRデータに対してフーリエ変換を行うことにより、MR画像を生成する。例えば、処理回路131は、複素のMRデータから絶対値(Magnitude)画像を生成することが可能である。また、処理回路131は、複素のMRデータにおける実部データと虚部データとを用いて位相画像を生成することが可能である。処理回路131は、絶対値画像および位相画像などのMR画像を、ディスプレイ127や記憶装置129に出力する。
以上に示した第5の実施形態によれば、高速かつ高精度にフル低ランク画像を生成でき、当該フル低ランク画像に基づいて各種定量値MRI装置を提供できる。
以上説明した少なくとも1つの実施形態によれば、高速かつ信頼性の高い推定を行うことができる。
加えて、実施形態に係る各機能は、当該処理を実行するプログラムをワークステーション等のコンピュータにインストールし、これらをメモリ上で展開することによっても実現することができる。このとき、コンピュータに当該手法を実行させることのできるプログラムは、磁気ディスク(ハードディスクなど)、光ディスク(CD-ROM、DVD、Blu-ray(登録商標)ディスクなど)、半導体メモリなどの記憶媒体に格納して頒布することも可能である。
本発明のいくつかの実施形態を説明したが、これらの実施形態は、例として提示したものであり、発明の範囲を限定することは意図していない。これら実施形態は、その他の様々な形態で実施されることが可能であり、発明の要旨を逸脱しない範囲で、種々の省略、置き換え、変更を行うことができる。これら実施形態やその変形は、発明の範囲や要旨に含まれると同様に、特許請求の範囲に記載された発明とその均等の範囲に含まれるものである。
1 医用データ処理装置
2,131 処理回路
4 入力インタフェース
6 通信インタフェース
8 メモリ
21 取得機能
22 生成機能
23 最適化機能
24 推定機能
90 学習用データ生成装置
92 学習用データ保管装置
94 モデル学習装置
100 磁気共鳴イメージング装置
101 静磁場磁石
103 傾斜磁場コイル
105 傾斜磁場電源
107 寝台
109 寝台制御回路
111 ボア
113 送信コイル
115 送信回路
117 受信回路
119 受信コイル
121 シーケンス制御回路
123 バス
125 インタフェース
127 ディスプレイ
129 記憶装置
1071 天板
1311 システム制御機能
1313 画像生成機能

Claims (19)

  1. スパースサンプリングされた複数の第1データを取得する取得部と、
    前記複数の第1データの数よりも少ない組ごとの重み係数を用いて、当該組ごとに、前記複数の第1データのそれぞれに前記重み係数を乗算して加算することで、前記第1データの数よりも少ない数の第1圧縮データを生成する生成部と、
    観察対象についてスパースサンプリングされた複数の第1データから生成された複数の第1圧縮データが入力され、前記観察対象についてフルサンプリングされた複数の第2データから生成された複数の第2圧縮データの少なくともいずれか1つを出力するように学習された学習済みモデルに従い、前記生成部で生成された第1圧縮データから、第2圧縮データを出力する第1処理を実行する最適化部と、
    を具備する医用データ処理装置。
  2. 前記重み係数は、前記第2データの次元を圧縮することで得られる係数に基づき決定される、請求項1に記載の医用データ処理装置。
  3. 前記最適化部は、前記第2圧縮データから推定される推定第1データと前記取得部で取得した複数の第1データとの比較に基づき前記第1圧縮データを補正する第2処理と、前記第1処理とを、収束条件が満たされるまで繰り返し実行する、請求項1または請求項2に記載の医用データ処理装置。
  4. 前記最適化部は、ADMM(Alternating Direction Method of Multipliers)法を用いて、前記収束条件が満たされるまで前記第1処理と前記第2処理とを繰り返し実行する、請求項3に記載の医用データ処理装置。
  5. 前記第2圧縮データから定量値を推定する推定部をさらに具備する、請求項1から請求項4のいずれか1項に記載の医用データ処理装置。
  6. 前記生成部は、特異値分解または主成分解析を含む次元圧縮手法を用いて生成された重み係数を用いる、請求項2から請求項5のいずれか1項に記載の医用データ処理装置。
  7. 前記複数の第1データおよび前記複数の第2データは、画像データ、k空間データ、サイノグラムおよびハイブリッド空間データのいずれか1つである、請求項1から請求項5のいずれか1項に記載の医用データ処理装置。
  8. 前記複数の第1データは、k空間において、スライス選択方向にスライスが間引かれたデータであり、
    前記生成部は、前記間引かれたデータをパラレルイメージング処理により補間する請求項7に記載の医用データ処理装置。
  9. 前記複数の第1データはそれぞれ、各コイルで取得した信号に基づく複数のデータのセットであり、
    前記生成部は、前記セットごとに、前記第1圧縮データを生成し、
    前記最適化部は、前記複数の第1圧縮データを入力として、第2圧縮データを生成するように学習された前記学習済みモデルに従って、複数の前記セットの第1圧縮データから複数の第2圧縮データのうち少なくともいずれか1つを生成する、請求項1に記載の医用データ処理装置。
  10. 前記複数のデータのセットは、複数のコイルをまとめた仮想コイルの信号に基づくデータのセットである、請求項9に記載の医用データ処理装置。
  11. 前記複数の第1データは、反転パルスを用いて定常状態で収集された撮像データである、請求項1に記載の医用データ処理装置。
  12. 前記複数の第1データは、IR-bSSFP(Inversion Recovery-balanced Steady-State Free Precession)またはIR-FISP(Fast Imaging with Steady-state Precession)の撮像シーケンスを用いて収集された撮像データである、請求項1に記載の医用データ処理装置。
  13. 前記複数の第1データは、少なくともTR(Time of Repetition)とTE(Echo time)とが固定された撮像シーケンスを用いて収集された撮像データである、請求項1に記載の医用データ処理装置。
  14. 前記複数の第1データは、フリップアングルを30度に設定したパルスと、フリップアングルを60度に設定したパルスとを用いて収集された撮像データである、請求項1に記載の医用データ処理装置。
  15. 前記組は、実空間信号変化のセットから生成される行列に対して特異値分解した場合に得られる重み係数のうち、特異値が大きいほうから選択される数に対応する、請求項1に記載の医用データ処理装置。
  16. 前記第1圧縮データおよび前記第2圧縮データは、前記組に含まれるデータ数に対応するランク数に低ランク近似されたデータである、請求項1に記載の医用データ処理装置。
  17. スパースサンプリングされた複数の第1データを取得し、
    前記複数の第1データの数よりも少ない組ごとの重み係数を用いて、当該組ごとに、前記複数の第1データのそれぞれに前記重み係数を乗算して加算することで、前記第1データの数よりも少ない数の第1圧縮データを生成し、
    観察対象についてスパースサンプリングされた複数の第1データから生成された複数の第1圧縮データが入力され、前記観察対象についてフルサンプリングされた複数の第2データから生成された複数の第2圧縮データの少なくともいずれか1つを出力するように学習された学習済みモデルに従い、前記生成された第1圧縮データから、第2圧縮データを出力する第1処理を実行する、医用データ処理方法。
  18. コンピュータを、
    スパースサンプリングされた複数の第1データを取得する取得機能と、
    前記複数の第1データの数よりも少ない組ごとの重み係数を用いて、当該組ごとに、前記複数の第1データのそれぞれに前記重み係数を乗算して加算することで、前記第1データの数よりも少ない数の第1圧縮データを生成する生成機能と、
    観察対象についてスパースサンプリングされた複数の第1データから生成された複数の第1圧縮データが入力され、前記観察対象についてフルサンプリングされた複数の第2データから生成された複数の第2圧縮データの少なくともいずれか1つを出力するように学習された学習済みモデルに従い、前記生成機能により生成された第1圧縮データから、第2圧縮データを出力する第1処理を実行する最適化機能と、
    して実現させるための医用データ処理プログラム。
  19. 被検体に対してスパースサンプリングに対応する撮像シーケンスにより、スパースサンプリングされた複数の第1データを収集する収集部と、
    前記複数の第1データの数よりも少ない組ごとの重み係数を用いて、当該組ごとに、前記複数の第1データのそれぞれに前記重み係数を乗算して加算することで、前記第1データの数よりも少ない数の第1圧縮データを生成する生成部と、
    観察対象についてスパースサンプリングされた複数の第1データから生成された複数の第1圧縮データが入力され、前記観察対象についてフルサンプリングされた複数の第2データから生成された複数の第2圧縮データの少なくともいずれか1つを出力するように学習された学習済みモデルに従い、前記生成部で生成された第1圧縮データから、第2圧縮データを出力する第1処理を実行する最適化部と、
    を具備する磁気共鳴イメージング装置。
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