JP7302847B2 - 新規フルオロジニトロフェニル化合物及びその用途 - Google Patents
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Description
で表される化合物又はその塩。
で表される化合物又はその塩である、項1に記載の化合物又はその塩。
(1)保護されていてもよい水酸基、
(2)アルコキシ基、
(3)保護されていてもよいカルボキシル基、
(4)アミド基、
(5)保護されていてもよいアミノ基、
(6)保護されていてもよいグアニジノ基、
(7)アルキル基及び水酸基からなる群より選択される少なくとも1種の基で置換されていてもよいアリール基、
(8)アルキル基及び水酸基からなる群より選択される少なくとも1種の基で置換されていてもよいヘテロアリール基、及び
(9)保護されていてもよいメルカプト基、
からなる群より選択される少なくとも1種の基で置換されていてもよいアルキル基である、項2又は3に記載の化合物又はその塩。
で表される化合物又はその塩、及び、式(6):
で表される化合物又はその塩、及び、式(6)で表される化合物を反応させる工程を含む、製法。
(1)当該不斉中心を有する化合物と、項5に記載の光学分割ラベル化剤とを反応させてラベル化された化合物を調製する工程、及び
(2)当該ラベル化された化合物を分析することにより、不斉中心を有する化合物の絶対立体配置を決定する工程、
を含む方法。
本発明の光学分割ラベル化剤でラベル化したアミノ酸の異性体(ジアステレオマー)分離能は、非特許文献1及び2に記載された既存の光学分割ラベル化剤でラベル化したものと同等以上である(例えば、表4、図4及び図5と非特許文献3とを参照)。
本明細書において、「含む」なる表現については、「含む」、「実質的にからなる」及び「からなる」の概念を包含する。
本発明のフルオロジニトロフェニル化合物は、式(1)で表される化合物又はその塩(特に、式(1A)で表される化合物又はその塩)であり、光学分割ラベル化剤として有用である。
(1)保護されていてもよい水酸基(当該水酸基の保護基として、例えば、トリアルキル(特にC1~C4アルキル)シリル基、テトラヒドロピラニル基、メトキシメチル基等が挙げられる。)、
(2)アルコキシ基(特にC1~C4アルコキシ基等が挙げられる。)、
(3)保護されていてもよいカルボキシル基(当該カルボキシル基の保護基としては、例えば、アリル基、ベンジル基、メチル基、エチル基、tert-ブチル基等が挙げられる。)、
(4)アミド基(当該アミド基の窒素原子は1又は2個のアルキル基(特にC1~C4アルキル基)を有していてもよい。)、
(5)保護されていてもよいアミノ基(当該アミノ基の保護基としては、例えば、ベンジル基、ベンジルオキシカルボニル基、アリルオキシカルボニル基、tert-ブトキシカルボニル基等が挙げられる。)、
(6)保護されていてもよいグアニジノ基(当該グアニジノ基の保護基としては、トシル基、tert-ブトキシカルボニル基等が挙げられる。)、
(7)アルキル基及び水酸基からなる群より選択される少なくとも1種(特に1~3種)の基で置換されていてもよいアリール基(当該アリール基としては、例えば、フェニル基、ナフチル基等が挙げられ、アルキル基としては、例えば、メチル基等のC1~C4アルキル基が挙げられる。)、
(8)アルキル基及び水酸基からなる群より選択される少なくとも1種(特に1~3種)の基で置換されていてもよいヘテロアリール基(当該ヘテロアリール基としては、例えば、ピリジル基、イミダゾリル基、インドリル基等が挙げられ、アルキル基としては、例えば、メチル基等のC1~C4アルキル基が挙げられる。)、
(9)保護されていてもよいメルカプト基(当該メルカプト基の保護基としては、例えば、アルキル基(特にC1~C4アルキル基)等が挙げられる。)、
等が挙げられる。当該アルキル基は、これらの置換基からなる群より選択される少なくとも1種(特に1~3種)の基を有していてもよい。
式(2)で表される化合物と式(3)で表される化合物とをアミド化反応(縮合反応)させて式(4)で表される化合物を得る。
クロロギ酸エステル又はカルボン酸クロライドの使用量は、式(2)で表される化合物1モルに対し、通常、1~2モル(特に、1~1.5モル)である。
式(3)で表される化合物の使用量は、式(2)で表される化合物1モルに対し、通常、1~2モル(特に、1~1.5モル)である。
式(4)で表される化合物の保護基(Y)を除去することにより、式(5)で表される化合物を得る。
式(5)で表される化合物又はその塩と、式(6)で表される化合物とを反応させることにより、式(1)で表される化合物を得る。式(6)で表される化合物は、市販されているか、或いは公知の方法に従い又は準じて当業者が容易に製造することができる。
溶媒としては、通常、水、ケトン溶媒(例えば、アセトン、メチルエチルケトン等)、エーテル溶媒(例えば、ジエチルエーテル、THF、ジオキサン、ジメトキシエタン等)、アミド溶媒(例えば、DMF、DMA、NMP等)等が挙げられる。これらの中から1種又は2種以上を用いることができる。
塩基としては、通常、無機塩基(例えば、炭酸水素ナトリウム、炭酸水素カリウム、炭酸ナトリウム、炭酸カリウム等のアルカリ金属の炭酸塩;水酸化ナトリウム、水酸化カリウム等のアルカリ金属の水酸化物等)、又は有機塩基(例えば、ピリジン、トリエチルアミン等)等が挙げられる。無機塩基を用いる場合、水溶液の形態で用いることが好ましい。
本発明の式(1)で表される化合物(特に、式(1A)で表される化合物)は、不斉中心を有する化合物(特にアミノ酸)の絶対立体配置を決定するための光学分割ラベル化剤として有用である。
(1)不斉中心を有する化合物と、式(1A)で表される化合物を含む光学分割ラベル化剤とを反応させてラベル化された化合物を調製する工程、及び
(2)当該ラベル化された化合物を分析することにより、不斉中心を有する化合物の絶対立体配置を決定する工程、
を含むことで、不斉中心を有する化合物(特にアミノ酸)の絶対立体配置を決定することができる。
Boc-L-バリン(2a) (R1=i-Pr, R2=H)(585 mg)のTHF (13 mL)溶液に、0℃の条件下、N-メチルモルホリン(0.33 mL)とクロロギ酸イソブチル(0.39 mL)を加え10分間撹拌した。次に0 ℃から室温に戻し、N,N-ジメチルエチレンジアミン (0.59 mL)とDMF (10 mL)を加え2時間撹拌し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加えた。続いて酢酸エチルで3回抽出し、飽和食塩水で2回洗浄したのち硫酸マグネシウムで乾燥させた。残った反応物の酢酸エチル溶液を酢酸エチルとヘキサンによる再結晶で精製したところ、化合物(4a)(R1=i-Pr, R2=H)を649 mg(収率84%)得た。
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 9.11 (d, J=7.4 Hz, 1H), 8.96 (d, J=7.4 Hz, 1H), 8.90 (m, 1H), 6.84 (d, J=13.2 Hz, 1H), 4.18 (t, J=6.9 Hz, 1H), 3.90 (m, 1H), 3.58 (m, 1H), 3.22 (t, J=5.4 Hz, 2H), 2.88 (s, 6H), 2.40 (m, 1H), 1.11 (d, J=6.9 Hz, 3H), 1.08 (d, J=6.9 Hz, 3H);
13C NMR (125 MHz, CDCl3) δ 170.29, 160.98, 158.82, 149.01, 128.02, 125.99, 101.90, 63.02, 58.09, 43.39, 34.42, 31.55, 19.30, 18.29;
HRMS(ESI) calcd for C15H23FN5O5 [M+H]+372.1678, found 372.1685;
[α]D 20=37.03 (c=0.79, アセトン);
化合物(1b)~(1d)はそれぞれ、対応する保護されたアミノ酸(Boc-D-バリン(2b)、Boc-L-ロイシン(2c)、Boc-D-ロイシン(2d))を原料に用いて、上記(1)の方法に従い合成した。
1H NMR及びHR-MS(ESI)はL-FDVDA (1a)と同一。
[α]D 20=-33.54 (c=0.71, アセトン)
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 9.15 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.73 (m, 1H), 6.57 (d, J=13.2 Hz, 1H), 6.53 (m, 1H), 4.00 (dd, J=13.7, 5.7 Hz, 1H), 3.33 (q, J=5.5 Hz, 2H), 2.37 (m, 2H), 2.14 (s, 6H), 1.85-1.75 (m, 3H), 1.04 (d, J=6.3 Hz 3H), 0.96 (d, J=6.3 Hz, 3H);
13C NMR (125 MHz, CDCl3) δ 169.94, 161.03, 158.87, 148.31, 127.76, 126.62, 102.11, 101.89, 57.30, 44.96, 41.87, 36.76, 25.06, 22.80, 21.87;
HRMS(ESI) calcd for C16H25FN5O5 [M+H]+ 386.1834, found 386.1833;
[α]D 20=21.46 (c=0.46, アセトン)
1H NMR及びHR-MS(ESI)はL-FDLDA (1c)と同一。
[α]D 20=-30.38 (c=0.62, アセトン)
市販のL-リシン(0.05mg)水溶液(50μL)に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(50μL)を加えた。さらに化合物(1a)のアセトン溶液(10mg/mL)を25μL加え、50℃で1時間撹拌した。次に反応混合物に1M塩酸を60μL加え、濃縮乾固した。得られた固形物にメタノール(500μL)を加え、孔径0.22μmのメンブレンフィルターでろ過し、得られたメタノール溶液をLC-MSで分析した。
上記(1)で調製した、L-ロイシンをL-FDLA、L-FDAA、化合物(1a)又は化合物(1c)でラベル化した4種混合物を、50% Bアイソクラティック条件で分析した。結果は図1-1及び表1の通りである。各種ラベル化体のポジティブイオンのピーク強度を、UV340nmで検出した各種ラベル化体のピーク面積で除した値を算出し比較したところ、化合物(1a)又は化合物(1c)でラベル化したL-ロイシンは、L-FDLA又はL-FDAAでラベル化したL-ロイシンと比較し、約10倍の検出感度上昇が認められた。またUV340nmによる検出と比較し、ESIポジティブモードでの検出では40倍以上の高感度で検出することができた。
上記(1)で調製した、L-リシンをL-FDLA、L-FDAA、化合物(1a)又は化合物(1c)でラベル化した4種混合物を、55% Bアイソクラティック条件で分析した。結果は図2及び表2の通りである。各種ラベル化体のポジティブイオンのピーク強度を、UV340nmで検出した各種ラベル化体のピーク面積で除した値を算出し比較したところ、化合物(1a)又は化合物(1c)でラベル化したL-リシンは、L-FDLA又はL-FDAAでラベル化したL-リシンと比較し、約3~9倍の検出感度上昇が認められた。またUV340nmによる検出と比較し、ESIポジティブモードでの検出ではおよそ10倍の高感度で検出することができた。
上記(1)で調製した、L-グルタミン酸をL-FDLA、L-FDAA、化合物(1a)又は化合物(1c)でラベル化した4種混合物を、55% Bアイソクラティック条件で分析した。結果は図3及び表3の通りである。各種ラベル化体のポジティブイオンのピーク強度を、UV340nmで検出した各種ラベル化体のピーク面積で除した値を算出し比較したところ、化合物(1a)又は化合物(1c)でラベル化したL-グルタミン酸は、L-FDLA又はL-FDAAでラベル化したL-グルタミン酸と比較し、約7~10倍の検出感度上昇が認められた。またUV340nmによる検出と比較し、ESIポジティブモードでの検出ではおよそ20倍の高感度で検出することができた。
上記(1)で調製した、各種D, L-アミノ酸の混合物を化合物(1a)でラベル化した混合物を含むメタノール溶液のうち1μLを用いて、60分かけた25%~55% Bのグラジエント条件で分析した。結果は図4及び表4の通りである。
上記(1)で調製した、各種D, L-アミノ酸の混合物を化合物(1c)でラベル化した混合物を含むメタノール溶液のうち1μLを用いて、60分かけた30%~60% Bのグラジエント条件で分析した。結果は図5及び表4の通りである。
化合物(1a)を遮光下、室温で3週間静置後、HPLCを用いて安定性を検討した(測定条件、検出条件は図6中に記載)。その結果、化合物(1a)は非常に安定であり室温保存が可能であることが判明した。
Claims (9)
- R1A及びR2Aのいずれか一方が水素原子であり、他方が置換基を有していてもよいアルキル基であり、AlkがC2~C10アルキレン基である、請求項2に記載の化合物又はその塩。
- R1A及びR2Aで示される置換基を有していてもよいアルキル基が、下記の基;
(1)保護されていてもよい水酸基、
(2)アルコキシ基、
(3)保護されていてもよいカルボキシル基、
(4)アミド基、
(5)保護されていてもよいアミノ基、
(6)保護されていてもよいグアニジノ基、
(7)アルキル基及び水酸基からなる群より選択される少なくとも1種の基で置換されていてもよいアリール基、
(8)アルキル基及び水酸基からなる群より選択される少なくとも1種の基で置換されていてもよいヘテロアリール基、及び
(9)保護されていてもよいメルカプト基、
からなる群より選択される少なくとも1種の基で置換されていてもよいアルキル基である、請求項2又は3に記載の化合物又はその塩。 - 請求項1~4のいずれかに記載の化合物又はその塩を含む光学分割ラベル化剤。
- 不斉中心を有する化合物の絶対立体配置を決定する方法であって、
(1)当該不斉中心を有する化合物と、請求項5に記載の光学分割ラベル化剤とを反応させてラベル化された化合物を調製する工程、及び
(2)当該ラベル化された化合物を分析することにより、不斉中心を有する化合物の絶対立体配置を決定する工程、
を含む方法。 - 前記不斉中心を有する化合物がアミノ酸である、請求項8に記載の方法。
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WO2004027388A2 (en) | 2002-09-23 | 2004-04-01 | Chromagen, Inc. | Novel green and orange fluorescent labels and their uses |
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Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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WO2004027388A2 (en) | 2002-09-23 | 2004-04-01 | Chromagen, Inc. | Novel green and orange fluorescent labels and their uses |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
BRUECKNER, H. ET AL.,High-performance liquid chromatographic separation of DL-amino acids derivatized with chiral variants of Sanger's reagent,JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY,1991年,vol. 555,pp.81-95 |
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