JP7296636B2 - Alkoxyphenyl derivative, protected nucleoside and protected nucleotide, method for producing oligonucleotide, and method for removing substituent - Google Patents

Alkoxyphenyl derivative, protected nucleoside and protected nucleotide, method for producing oligonucleotide, and method for removing substituent Download PDF

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Description

本発明は、液相合成法によるオリゴヌクレオチドの合成を可能とするアルコキシフェニ
ル誘導体、それを結合したヌクレオシド保護体およびヌクレオチド保護体、それを用いた
簡易的に構築可能なオリゴヌクレオチド製造方法、ならびに、アルコキシフェニル誘導体
を結合したヌクレオシド保護体またはヌクレオチド保護体の選択的なアルコキシフェニル
誘導体部分の除去方法等に関する。
The present invention provides an alkoxyphenyl derivative that enables the synthesis of oligonucleotides by a liquid phase synthesis method, a nucleoside-protected body and a nucleotide-protected body bound thereto, a method for producing an oligonucleotide that can be easily constructed using the same, and The present invention relates to a method for selectively removing an alkoxyphenyl derivative portion of a protected nucleoside or nucleotide to which an alkoxyphenyl derivative is bound.

近年、オリゴヌクレオチドは、一般には、原料となるヌクレオチドを逐次連結していく
ことで合成可能であるが、20mer程度以上のオリゴヌクレオチドを合成する場合には
、2~3merヌクレオチドのビルディングブロック群を予め調製しておき、これの連結
を繰り返すことで所望の鎖長の生成物を得るブロックマ一合成法や、10塩基程度以上の
オリゴヌクレオチド間の連結でオリゴヌクレオチドを得るユニットカップリング(フラグ
メン卜縮合)合成法等も利用されている(たとえば、非特許文献1~3)。ホスホロアミ
ダイト法を用いたオリゴヌクレオチドの固相合成法は、目的物質であるオリゴヌクレオチ
ドの収率を高めるためには、大過剰のヌクレオシドホスホロアミダイト化合物とテトラゾ
ール系化合物とを使用しなければならないという問題点がある。また、固相合成法では、
設備面などのスケールアップに制限があり、また途中段階での反応の進行状況の確認や中
間体の構造解析が難しい面がある。
In recent years, oligonucleotides can generally be synthesized by sequentially linking nucleotides as starting materials, but in the case of synthesizing oligonucleotides of about 20mer or more, building blocks of 2 to 3mer nucleotides are prepared in advance. A blocker synthesis method that obtains a product of a desired chain length by repeating the ligation of this prepared product, and a unit coupling (fragment condensation) method that obtains an oligonucleotide by ligation between oligonucleotides of about 10 bases or more. ) are also used (for example, Non-Patent Documents 1 to 3). In solid-phase synthesis of oligonucleotides using the phosphoramidite method, a large excess of nucleoside phosphoramidite compound and tetrazole compound must be used in order to increase the yield of the target oligonucleotide. There is a problem. In addition, in the solid-phase synthesis method,
There are restrictions on scale-up in terms of equipment, etc., and it is difficult to check the progress of the reaction in the middle and to analyze the structure of the intermediate.

一方、これまでの液相合成法では、ヌクレオチドの脱保護、カップリング、酸化等の各
工程での精製操作が必要で煩雑となる等、多重合度のオリゴヌクレオチドを迅速に大量に
合成することが難しかった。このため、たとえば、特許文献1、2では、疑似固相保護基
を用いた液相合成の提案がなされているが、たとえば、当該疑似固相保護基の除去にも時
間を要し、さらには、疑似固相保護基を有するオリゴヌクレオチドから当該疑似固相保護
基のみを選択的に除去することが困難であることから、ビルディングブロックやフラグメ
ントの前駆体となる核酸塩基やリン酸基が保護されたヌクレオチド(以下、本明細書中に
おいて、「ヌクレオチド保護体」と呼ぶ場合もある。)の合成も困難であった。また、非
特許文献4では、Pd触媒を用いる接触還元により疑似固相保護基の除去が行われている
が、毒性のある重金属や危険な水素ガスを使用し、脱保護には20~40時間もの長時間
を要している。また、ヌクレオチドの保護基の一般的な脱保護条件での疑似固相保護基の
除去は行われておらず、その汎用性に課題があった。
On the other hand, conventional liquid-phase synthesis methods require complicated purification procedures in each step of deprotection, coupling, and oxidation of nucleotides. was difficult. For this reason, for example, Patent Documents 1 and 2 propose liquid-phase synthesis using a pseudo-solid-phase protecting group, but for example, it takes time to remove the pseudo-solid-phase protecting group, and furthermore, However, since it is difficult to selectively remove only the pseudo solid-phase protecting group from an oligonucleotide having a pseudo solid-phase protecting group, the nucleobases and phosphate groups that are precursors of building blocks and fragments are protected. It has also been difficult to synthesize such nucleotides (hereinafter sometimes referred to as "protected nucleotides" in this specification). In addition, in Non-Patent Document 4, the pseudo-solid-phase protective group is removed by catalytic reduction using a Pd catalyst. It takes a long time. In addition, the pseudo-solid-phase protecting group has not been removed under general deprotection conditions for protecting groups of nucleotides, and there is a problem in its versatility.

特許第5548852号Patent No. 5548852 国際公開第2012/157723号WO2012/157723

S.L.Beaucage,D.E.Bergstorm,G.D.Glick,R.A.Jones;Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry; John Wiley&Sons(2000)S. L. Beaucage, D.; E. Bergstorm, G.; D. Glick, R. A. Jones; Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry; John Wiley & Sons (2000) 関根光雄、齋藤烈編、「ゲノムケミストリー-人工核酸を活用する科学的アプローチ」、講談社サイエンティフィック(2003)Mitsuo Sekine, Retsu Saito, eds., "Genome Chemistry - A Scientific Approach Utilizing Artificial Nucleic Acids", Kodansha Scientific (2003) C.-H.Chen,et al.,Aust.J.Chem.,2010,63,227-235.C. -H. Chen, et al. , Aust. J. Chem. , 2010, 63, 227-235. Y.Matsuno,et al.,Org.Lett.,2016,18,800-803.Y. Matsuno, et al. , Org. Lett. , 2016, 18, 800-803.

本発明は、このような事情に照らし、オリゴヌクレオチドの合成のみならず、従来では
困難であったオリゴヌクレオチド保護体の簡易迅速な合成が可能となる汎用性の高いアル
コキシフェニル誘導体を提供することを目的とする。
In light of such circumstances, the present invention provides a highly versatile alkoxyphenyl derivative that enables not only the synthesis of oligonucleotides but also the easy and rapid synthesis of protected oligonucleotides, which has been difficult in the past. aim.

また、本発明は、オリゴヌクレオチドの合成のみならず、従来では困難であったオリゴ
ヌクレオチド保護体の簡易迅速な合成が可能となる汎用性の高い上記アルコキシフェニル
誘導体が結合した(以下、本明細書中において、「Tag化」と呼ぶ場合もある。)ヌク
レオシド保護体およびヌクレオチド保護体(以下、本明細書中において、各々、「Tag
化ヌクレオシド保護体」、「Tag化ヌクレオチド保護体」と呼ぶ場合もある。)を提供
することを目的とする。
In addition, the present invention provides not only the synthesis of oligonucleotides, but also the highly versatile alkoxyphenyl derivative that enables simple and rapid synthesis of protected oligonucleotides, which has been difficult in the past (hereinafter referred to as In some cases, it is also referred to as "tagging".) Nucleoside protected body and nucleotide protected body (hereinafter, in this specification, respectively, "Tag
It is sometimes referred to as "protected nucleoside" and "protected tagged nucleotide". ) is intended to provide

さらに、本発明は、上記アルコキシフェニル誘導体、または、上記Tag化ヌクレオシ
ド保護体もしくはTag化ヌクレオチド保護体を用いた、従来よりも汎用性の高いオリゴ
ヌクレオチドの製造方法(合成方法)を提供することを目的とする。
Furthermore, the present invention provides an oligonucleotide production method (synthesis method) that is more versatile than conventional ones, using the above alkoxyphenyl derivative, or the above tagged nucleoside protected form or tagged nucleotide protected form. aim.

また、本発明は、Tag化ヌクレオシド保護体またはTag化ヌクレオチド保護体にお
ける、Tag部分の選択的な除去方法を提供することを目的とする。なお、本発明におい
て、「Tag部分」とは、上記Tag化ヌクレオシド保護体またはTag化ヌクレオチド
保護体における、上記アルコキシフェニル誘導体由来の部分をいう。
Another object of the present invention is to provide a method for selectively removing the Tag portion in a protected nucleoside tagged or protected nucleotide tagged. In the present invention, "Tag portion" refers to a portion derived from the alkoxyphenyl derivative in the protected tagged nucleoside or protected nucleotide.

本発明者らは、上記課題を解決するため鋭意検討した結果、以下に示す新規アルコキシ
フェニル化合物およびその誘導体の創製に成功し、上記化合物により上記目的を達成でき
ることを見出して、本発明を完成するに至った。
The inventors of the present invention have made intensive studies to solve the above problems, and as a result, have succeeded in creating the novel alkoxyphenyl compounds and derivatives thereof shown below, and found that the above objects can be achieved by the above compounds, thereby completing the present invention. reached.

すなわち、本発明の化合物およびその誘導体は、一般式(1)(以下、本明細書中にお
いて、「化合物(1)」と呼ぶ場合もある。また、他の一般式で表される化合物もこれに
準ずる。)で表される。

Figure 0007296636000001

(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10~40のアルキル基を表
す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは同一、または
、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。) That is, the compounds and derivatives thereof of the present invention are represented by general formula (1) (hereinafter, sometimes referred to as "compound (1)" in the present specification). Compounds represented by other general formulas are also according to ).
Figure 0007296636000001

(In the formula,
Each R independently represents an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. )

本発明の化合物またはその誘導体によると、上記一般式(1)で表される構造を有する
ことにより、液相合成法によるオリゴヌクレオチドの合成のみならず、従来では困難であ
ったオリゴヌクレオチド保護体の合成が可能となる。より詳細には、本発明の化合物また
はその誘導体(アルコキシフェニル誘導体)は、ヌクレオシドまたはヌクレオチドとの結
合反応を介して、Tag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体を得る
ことが可能である。そして、得られたTag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレ
オチド保護体は、当該Tag部分が上記構造を有するため、極性溶媒の添加により、アミ
ダイトモノマーなどの副原料などとろ過操作などによって簡便に分離することができ、さ
らにTag部分のみを選択的にかつ速やかに除去することが可能であり、ひいてはオリゴ
ヌクレオチドの合成のみならず、従来では困難であったオリゴヌクレオチド保護体の合成
(製造)が可能となる。
According to the compound or derivative thereof of the present invention, by having the structure represented by the general formula (1), not only the synthesis of oligonucleotides by the liquid phase synthesis method, but also the protection of oligonucleotides, which has been difficult in the past, can be obtained. Synthesis becomes possible. More specifically, the compound of the present invention or a derivative thereof (alkoxyphenyl derivative) can obtain protected nucleoside tagged and protected nucleotide tagged via binding reaction with nucleoside or nucleotide. Then, the obtained tagged nucleoside protected body and tagged nucleotide protected body are easily separated from auxiliary materials such as amidite monomers by addition of a polar solvent and filtering operation etc., because the Tag portion has the above structure. Furthermore, it is possible to selectively and rapidly remove only the Tag portion, and as a result, it is possible to synthesize (manufacture) protected oligonucleotides, which has been difficult in the past, as well as to synthesize oligonucleotides. Become.

なお、上記化合物の誘導体とは、本発明の作用効果を損なわないものであれば、上記化
合物の化学構造を一部置換したものが広く含まれ、たとえば、末端のカルボキシル基(-
COOH)基のOH基部分が置換基で置き換わった化合物が含まれる。上記置換基として
は、ヌクレオシドまたはヌクレオチドと結合形成しやすいように脱離能が高い置換基等が
あげられ、たとえば、F、Cl、Br、I等のハロゲン原子や、アルコキシ基で置換され
たアルキルエステル構造などをあげることができる。また、上記置換基として、公知の脱
離基を適宜用いてもよい。
Derivatives of the above compounds broadly include those obtained by partially substituting the chemical structure of the above compounds as long as they do not impair the effects of the present invention.
COOH) groups in which the OH group portion is replaced with a substituent. Examples of the above-mentioned substituents include substituents having high leaving ability so as to facilitate bond formation with nucleosides or nucleotides. An ester structure and the like can be mentioned. Moreover, you may use a well-known leaving group suitably as said substituent.

また、本発明の化合物またはその誘導体において、一般式(2)で表される化合物また
はその誘導体であることが好ましい。

Figure 0007296636000002

(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10
~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。) Moreover, the compound or derivative thereof of the present invention is preferably a compound represented by the general formula (2) or a derivative thereof.
Figure 0007296636000002

(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently have 10 carbon atoms and may be substituted.
represents an alkyl group of ∼40.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. )

また、本発明の化合物またはその誘導体において、一般式(3)で表される化合物また
はその誘導体であってもよい。

Figure 0007296636000003

(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10~40のアルキル基を表
す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、また
は、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000004

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000005

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。) Moreover, the compound or its derivative of this invention WHEREIN: The compound represented by General formula (3) or its derivative may be sufficient.
Figure 0007296636000003

(In the formula,
Each R independently represents an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000004

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )
Figure 0007296636000005

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (3). )

上記構成を有する場合、上記Tag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド
保護体となるが、Tag部分が上記構造を有するため、特に液相合成(疑似液相合成を含
む)において、極性溶媒の添加により、アミダイトモノマーなどの副原料などとろ過操作
などによって簡便に分離することができ、さらにTag部分のみを選択的にかつ速やかに
除去することが可能であり、オリゴヌクレオチドの合成のみならず、従来では困難であっ
たオリゴヌクレオチド保護体の合成が可能となる。
When it has the above structure, it becomes the above tagged nucleoside protected body and tagged nucleotide protected body. , It can be easily separated from auxiliary materials such as amidite monomers by a filtration operation, etc., and it is possible to selectively and quickly remove only the Tag portion. It becomes possible to synthesize protected oligonucleotides, which has been difficult.

また、本発明におけるヌクレオシドは、一般には、プリンまたはピリミジン塩基と糖が
グリコシド結合したものを表すが、本発明の作用効果を損なわないものであれば、その類
縁体や当該一般構造を一部置換したものが広く含まれる。たとえば、塩基部分が必ずしも
プリンまた、ピリミジン構造ではないもの(たとえば、修飾塩基等)や、糖部分がD-リ
ボースまたはデオキシ-D-リボースではないもの(たとえば、一般式(5)、(8)で
示されるような、モルフォリノ型のモルフォリノヌクレオシド)などをあげることができ
る。
In addition, the nucleoside in the present invention generally represents a glycosidic bond between a purine or pyrimidine base and a sugar, but as long as it does not impair the action and effect of the present invention, its analogue or partial substitution of the general structure widely included. For example, base moieties are not necessarily purine or pyrimidine structures (e.g., modified bases, etc.), and sugar moieties are not D-ribose or deoxy-D-ribose (e.g., general formulas (5) and (8) and morpholino-type morpholino nucleosides, such as shown in the above.

また、本発明におけるヌクレオチドは、一般には、プリンまたはピリミジン塩基と糖が
グリコシド結合した上記ヌクレオシドのリン酸エステルを表すが、本発明の作用効果を損
なわないものであれば、その類縁体や当該一般構造を一部置換したものが広く含まれる。
たとえば、塩基部分が必ずしもプリンまたはピリミジン構造ではないもの(たとえば、修
飾塩基等)や、糖部分がD-リボースまたはデオキシ-D-リボースではないもの(たと
えば、モルフォリノ型のモルフォリノヌクレオチド)、また、リン酸エステル部分の1つ
のO原子がS原子に置き換わったホスホロチオエートの場合などをあげることができる。
In addition, the nucleotide in the present invention generally represents a phosphate ester of the above nucleoside in which a purine or pyrimidine base and a sugar are glycoside-bonded. Those with partial replacement of the structure are widely included.
For example, those in which the base moiety is not necessarily a purine or pyrimidine structure (e.g., modified bases, etc.), those in which the sugar moiety is not D-ribose or deoxy-D-ribose (e.g., morpholino-type morpholino nucleotides), Phosphorothioate in which one O atom of the phosphate ester moiety is replaced with an S atom can be mentioned.

また、本発明の化合物またはその誘導体において、一般式(6)で表される化合物また
はその誘導体であることが好ましい。

Figure 0007296636000006

(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10
~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000007

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000008

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。) Moreover, the compound or derivative thereof of the present invention is preferably a compound represented by the general formula (6) or a derivative thereof.
Figure 0007296636000006

(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently have 10 carbon atoms and may be substituted.
represents an alkyl group of ∼40.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000007

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )
Figure 0007296636000008

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )

また、本発明の化合物またはその誘導体において、Wが、水素原子、トリチル基、ジ(
1-6アルコキシ)トリチル基、モノ(C1-18アルコキシ)トリチル基、9-(9
-フェニル)キサンテニル基、または、9-(9-フェニル)チオキサンテニル基である
ことが好ましい。Wが上記いずれかである場合、より簡便にオリゴヌクレオチドの合成を
行うことができる。
Further, in the compound or derivative thereof of the present invention, W is a hydrogen atom, a trityl group, a di(
C 1-6 alkoxy)trityl group, mono (C 1-18 alkoxy)trityl group, 9-(9
-phenyl)xanthenyl group or 9-(9-phenyl)thioxanthenyl group is preferred. When W is any of the above, oligonucleotides can be synthesized more easily.

また、本発明の化合物またはその誘導体において、Rが、2位に電子求引性基を有す
るエチル基であることが好ましい。
Moreover, in the compound or derivative thereof of the present invention, R4 is preferably an ethyl group having an electron-withdrawing group at the 2-position.

また、本発明の化合物またはその誘導体において、Qが、水素原子、トリチル基、ジ(
1-6アルコキシ)トリチル基、モノ(C1-18アルコキシ)トリチル基、9-(9
-フェニル)キサンテニル基、または、9-(9-フェニル)チオキサンテニル基である
ことが好ましい。Qが上記いずれかである場合、より簡便にオリゴヌクレオチドの合成を
行うことができる。
Further, in the compound or derivative thereof of the present invention, Q is a hydrogen atom, a trityl group, a di(
C 1-6 alkoxy)trityl group, mono (C 1-18 alkoxy)trityl group, 9-(9
-phenyl)xanthenyl group or 9-(9-phenyl)thioxanthenyl group is preferred. When Q is any of the above, oligonucleotides can be synthesized more easily.

また、本発明の化合物またはその誘導体において、y1、または、y2が、1~100
であってもよい。
Further, in the compound or derivative thereof of the present invention, y1 or y2 is 1 to 100
may be

また、本発明の化合物またはその誘導体において、y1、または、y2が、1~30で
あってもよい。
In addition, in the compound or derivative thereof of the present invention, y1 or y2 may be 1-30.

また、本発明の化合物またはその誘導体において、y1、または、y2が、0であって
もよい。
In addition, y1 or y2 may be 0 in the compound or derivative thereof of the present invention.

また、本発明の化合物またはその誘導体において、nが、1、または、2であることが
好ましい。
Moreover, n is preferably 1 or 2 in the compound or derivative thereof of the present invention.

また、本発明の化合物またはその誘導体において、mが、2~4の整数であることが好
ましい。
In the compound or derivative thereof of the present invention, m is preferably an integer of 2-4.

一方、本発明の製造方法は、一般式(3)で表される化合物またはその誘導体を還元処
理する一般式(7)または(8)で表される化合物を得る工程(1)を含むものである。

Figure 0007296636000009

(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10~40のアルキル基を表
す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、また
は、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000010

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000011

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000012

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Figure 0007296636000013

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。) On the other hand, the production method of the present invention includes step (1) of obtaining a compound represented by general formula (7) or (8) by reducing the compound represented by general formula (3) or a derivative thereof.
Figure 0007296636000009

(In the formula,
Each R independently represents an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000010

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )
Figure 0007296636000011

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )
Figure 0007296636000012

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more. )
Figure 0007296636000013

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more. )

本発明の製造方法によると、上記Tag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオ
チド保護体を用いるため、特に液相合成(疑似液相合成を含む)において、極性溶媒の添
加により、アミダイトモノマーなどの副原料などとろ過操作などによって簡便に分離する
ことができ、さらにTag部分のみを選択的にかつ速やかに除去することが可能であり、
オリゴヌクレオチドの合成のみならず、従来では困難であったオリゴヌクレオチド保護体
の合成が可能となる。また、たとえば、特許文献2の提案に比べ、本発明の製造方法では
、より温和な条件下(たとえば、アンモニア水中35℃)での置換基除去(Tag部分の
脱離反応)が可能となり、また、より短時間での製造が可能となる。
According to the production method of the present invention, since the tagged nucleoside protected body and the tagged nucleotide protected body are used, especially in liquid phase synthesis (including pseudo-liquid phase synthesis), secondary raw materials such as amidite monomers can be obtained by adding a polar solvent. It can be easily separated by filtration operation etc., and it is possible to selectively and quickly remove only the Tag part,
It enables not only the synthesis of oligonucleotides but also the synthesis of protected oligonucleotides, which has been difficult in the past. In addition, for example, compared with the proposal of Patent Document 2, the production method of the present invention enables removal of substituents (elimination reaction of Tag moiety) under milder conditions (for example, 35° C. in ammonia water), and , making it possible to manufacture in a shorter time.

また、本発明のオリゴヌクレオチド保護体の製造方法において、一般式(6)で表され
る化合物またはその誘導体を還元処理する工程(1)を含むことが好ましい。

Figure 0007296636000014

(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10
~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000015

(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000016
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000017
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Figure 0007296636000018
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。) Moreover, the method for producing a protected oligonucleotide of the present invention preferably includes the step (1) of reducing the compound represented by the general formula (6) or its derivative.
Figure 0007296636000014

(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently have 10 carbon atoms and may be substituted.
represents an alkyl group of ∼40.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000015

(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )
Figure 0007296636000016
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )
Figure 0007296636000017
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more. )
Figure 0007296636000018
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more. )

また、本発明の製造方法において、上記還元処理が、ホウ素含有還元剤を用いる、また
は、ホウ素含有還元剤とアミンとを用いるものであることが好ましい。上記構成を有する
ことにより、オリゴヌクレオチド保護体をより簡便に合成することができる。
Moreover, in the production method of the present invention, the reduction treatment preferably uses a boron-containing reducing agent or uses a boron-containing reducing agent and an amine. By having the above structure, the protected oligonucleotide can be synthesized more easily.

また、本発明の製造方法において、上記ホウ素含有還元剤が、水素化ホウ素リチウム、
水素化ホウ素ナトリウム、水素化トリエチルホウ素リチウム、水素化ホウ素テトラブチル
アンモニウムであることが好ましい。上記構成を有することにより、オリゴヌクレオチド
保護体をより収率よく簡便に合成することができる。
Further, in the production method of the present invention, the boron-containing reducing agent is lithium borohydride,
Preferred are sodium borohydride, lithium triethylborohydride, and tetrabutylammonium borohydride. By having the above structure, the protected oligonucleotide can be easily synthesized with higher yield.

また、本発明の製造方法において、Wが、水素原子、トリチル基、ジ(C1-6アルコ
キシ)トリチル基、モノ(C1-18アルコキシ)トリチル基、9-(9-フェニル)キ
サンテニル基、または、9-(9-フェニル)チオキサンテニル基であることが好ましい
。Wが上記いずれかである場合、より簡便にオリゴヌクレオチド保護体の合成を行うこと
ができる。
Further, in the production method of the present invention, W is a hydrogen atom, a trityl group, a di(C 1-6 alkoxy)trityl group, a mono(C 1-18 alkoxy)trityl group, a 9-(9-phenyl)xanthenyl group, Alternatively, it is preferably a 9-(9-phenyl)thioxanthenyl group. When W is any of the above, protected oligonucleotides can be synthesized more easily.

また、本発明の製造方法において、Rが、2位に電子求引性基を有するエチル基であ
ることが好ましい。
Moreover, in the production method of the present invention, R4 is preferably an ethyl group having an electron-withdrawing group at the 2-position.

また、本発明の製造方法において、Qが、水素原子、トリチル基、ジ(C1-6アルコ
キシ)トリチル基、モノ(C1-18アルコキシ)トリチル基、9-(9-フェニル)キ
サンテニル基、または、9-(9-フェニル)チオキサンテニル基であることが好ましい
。Qが上記いずれかである場合、より簡便にオリゴヌクレオチドの合成を行うことができ
る。
Further, in the production method of the present invention, Q is a hydrogen atom, a trityl group, a di(C 1-6 alkoxy)trityl group, a mono(C 1-18 alkoxy)trityl group, a 9-(9-phenyl)xanthenyl group, Alternatively, it is preferably a 9-(9-phenyl)thioxanthenyl group. When Q is any of the above, oligonucleotides can be synthesized more easily.

また、本発明の製造方法において、y1、または、y2が、1~100であってもよい
In the production method of the present invention, y1 or y2 may be 1-100.

また、本発明の製造方法において、y1、または、y2が、1~30であってもよい。 Further, in the production method of the present invention, y1 or y2 may be 1-30.

また、本発明の製造方法において、y1、または、y2が、0であってもよい。 Moreover, in the production method of the present invention, y1 or y2 may be 0.

また、本発明の製造方法において、nが、1、または、2であることが好ましい。 Moreover, in the production method of the present invention, n is preferably 1 or 2.

また、本発明の製造方法において、mが、2~4の整数であることが好ましい。 Further, in the production method of the present invention, m is preferably an integer of 2-4.

他方、本発明のTag部分除去方法(置換基除去方法)は、一般式(3)で表される化
合物またはその誘導体を還元処理する工程(1)を含む。

Figure 0007296636000019
(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10~40のアルキル基を表
す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、また
は、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000020
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000021
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。) On the other hand, the Tag moiety removal method (substituent removal method) of the present invention includes step (1) of reducing the compound represented by general formula (3) or a derivative thereof.
Figure 0007296636000019
(In the formula,
Each R independently represents an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000020
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )
Figure 0007296636000021
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )

本発明のTag部分除去方法によると、上記Tag化ヌクレオシド保護体およびTag
化ヌクレオチド保護体を用いるため、当該Tag部分のみを選択的にかつ速やかに除去す
ることが可能である。また、上記作用効果を奏するのは、一般式(3)等におけるフェニ
ル基に直接結合しているカルボニル基(C=O基)、および、当該カルボニル基に結合し
ているX原子(O、S、NH、または、NR)がLiBH等の還元剤と何らかの相互
作用を形成し、より好適に還元反応がTag化合物部位で行われ易くなるため、選択的に
、より速やかに除去反応が進行するのではないかと推測しているが、当該推測により権利
範囲を限定するものではない。
According to the Tag portion removal method of the present invention, the above tagged nucleoside protected body and Tag
Since a protected nucleotide is used, it is possible to selectively and rapidly remove only the Tag portion. In addition, the above effects are achieved by the carbonyl group (C=O group) directly bonded to the phenyl group in the general formula (3), etc., and the X atoms (O, S , NH, or NR N ) forms some kind of interaction with a reducing agent such as LiBH 4 , making it easier for the reduction reaction to occur more favorably at the Tag compound site. Although it is speculated that it may do so, the speculation does not limit the scope of rights.

また、本発明のTag部分除去方法において、一般式(6)で表される化合物またはそ
の誘導体を還元処理する工程(1)を含むことが好ましい。

Figure 0007296636000022
(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10
~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000023
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000024
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。) Further, the method for removing Tag moieties of the present invention preferably includes step (1) of subjecting the compound represented by general formula (6) or its derivative to reduction treatment.
Figure 0007296636000022
(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently have 10 carbon atoms and may be substituted.
represents an alkyl group of ∼40.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000023
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )
Figure 0007296636000024
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )

また、本発明のTag部分除去方法において、上記還元処理が、ホウ素含有還元剤を用
いる、または、ホウ素含有還元剤とアミンとを用いるものであることが好ましい。上記構
成を有することにより、Tag化ヌクレオシド保護体またはTag化ヌクレオチド保護体
における、Tag部分の選択的除去を簡便に行うことができる。
In the method for removing Tag moieties of the present invention, the reduction treatment preferably uses a boron-containing reducing agent or uses a boron-containing reducing agent and an amine. By having the above-described structure, selective removal of the Tag portion in the protected nucleoside tagged or protected nucleotide tagged can be easily performed.

また、本発明のTag部分除去方法において、上記ホウ素含有還元剤が、水素化ホウ素
リチウム、水素化ホウ素ナトリウム、水素化トリエチルホウ素リチウム、水素化ホウ素テ
トラブチルアンモニウムであることが好ましい。上記構成を有することにより、Tag化
ヌクレオシド保護体またはTag化ヌクレオチド保護体における、Tag部分の選択的除
去をより収率よく行うことができる。
In the method for removing Tag moieties of the present invention, the boron-containing reducing agent is preferably lithium borohydride, sodium borohydride, lithium triethylborohydride, or tetrabutylammonium borohydride. By having the above structure, the selective removal of the Tag moiety in the protected nucleoside or protected nucleotide tagged can be performed more efficiently.

本発明の化合物またはその誘導体(化合物(1)、(2)等。アルコキシフェニル誘導
体。)は、新規化合物であって、これを用いることにより、上記Tag化ヌクレオシド保
護体およびヌクレオチド保護体を簡便に得ることが可能となる。
The compounds or derivatives thereof (compounds (1), (2), etc., alkoxyphenyl derivatives) of the present invention are novel compounds, and by using them, the above-mentioned tagged nucleoside protected bodies and nucleotide protected bodies can be easily obtained. can be obtained.

また、本発明の化合物またはその誘導体(化合物(3)、(6)等。Tag化ヌクレオ
シド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体等。)は、Tag部分が上記構造を有する
ため、特に液相合成(疑似液相合成を含む)において、極性溶媒の添加により、アミダイ
トモノマーなどの副原料などとろ過操作などによって簡便に分離することができ、さらに
Tag部分のみを選択的にかつ速やかに除去することが可能であり、液相合成法によるオ
リゴヌクレオチドの合成のみならず、従来では困難であったオリゴヌクレオチド保護体の
合成が可能となる。
In addition, the compounds of the present invention or derivatives thereof (compounds (3), (6), etc., protected nucleosides and protected nucleotides tagged, etc.) of the present invention have the above-mentioned structures, and are particularly suitable for liquid-phase synthesis ( Including pseudo-liquid phase synthesis), by adding a polar solvent, it can be easily separated from auxiliary materials such as amidite monomers by filtration operation, etc., and only the Tag portion can be selectively and quickly removed. It is possible to synthesize not only oligonucleotides by the liquid phase synthesis method but also protected oligonucleotides, which has been difficult in the past.

また、本発明の化合物またはその誘導体(化合物(7)、(8)等。オリゴヌクレオチ
ド等。)の製造方法は、上記Tag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保
護体を用いるため、従来よりも簡易迅速な液相合成法によるオリゴヌクレオチドの合成が
可能となる。
In addition, the method for producing the compounds of the present invention or derivatives thereof (compounds (7), (8), etc., oligonucleotides, etc.) is simpler than conventional methods because the above protected nucleosides and protected nucleotides are used. It enables the synthesis of oligonucleotides by a rapid liquid phase synthesis method.

また、本発明の化合物またはその誘導体(化合物(1)、(2)、(3)、(6)等。
アルコキシフェニル誘導体、Tag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保
護体等。)のTag部分除去方法(置換基除去方法)は、上記Tag化ヌクレオシド保護
体およびTag化ヌクレオチド保護体を用いるため、当該Tag部分のみを温和な条件下
で選択的にかつ速やかに除去することが可能である。
Also, compounds of the present invention or derivatives thereof (compounds (1), (2), (3), (6), etc.).
Alkoxyphenyl derivatives, tagged nucleoside protected bodies, tagged nucleotide protected bodies, and the like. ) uses the tagged nucleoside protected body and the tagged nucleotide protected body, so that only the Tag moiety can be selectively and rapidly removed under mild conditions. It is possible.

以下、本発明の実施の形態について詳細に説明する。 BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION Hereinafter, embodiments of the present invention will be described in detail.

〔アルコキシフェニル化合物およびその誘導体〕
本発明のアルコキシフェニル化合物およびその誘導体は、一般式(1)で表される化合
物またはその誘導体である。

Figure 0007296636000025
(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10~40のアルキル基を表
す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは同一、または
、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。) [Alkoxyphenyl compounds and derivatives thereof]
The alkoxyphenyl compounds and derivatives thereof of the present invention are compounds represented by general formula (1) or derivatives thereof.
Figure 0007296636000025
(In the formula,
Each R independently represents an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. )

上記一般式(1)において、Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数
10~40のアルキル基を表す。上記Rは、炭素数13~30のアルキル基であってもよ
く、炭素数15~20のアルキル基であってもよく、なかでも炭素数18のアルキル基が
好適なものとしてあげることができる。また、上記Rは、複数存在する場合にはそれぞれ
独立して、直鎖アルキル基であっても、分岐アルキル基であってもよいが、直鎖アルキル
基であることが好ましい。また、上記Rが炭素原子数10から40のアルキル基であるこ
とにより、本発明のTag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体の合
成が容易となるとともに、溶解度や分離能の向上作用も得ることができる。
In the general formula (1), each R independently represents an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms. The above R may be an alkyl group having 13 to 30 carbon atoms or may be an alkyl group having 15 to 20 carbon atoms, and an alkyl group having 18 carbon atoms is particularly preferable. In addition, when there are a plurality of Rs, they may each independently be a straight-chain alkyl group or a branched alkyl group, but a straight-chain alkyl group is preferable. In addition, when R is an alkyl group having 10 to 40 carbon atoms, the tagged nucleoside protected body and tagged nucleotide protected body of the present invention are easily synthesized, and the effect of improving solubility and separation ability is also obtained. be able to.

上記一般式(1)において、mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数
存在するROは同一、または、異なっていてもよい。mが、2~4の整数であることが好
ましく、mが、3であることがより好ましい。また、上記RO基は、フェニル基に直接結
合しているカルボニル基(C=O基)を1位とした場合、3位、4位、または、5位に結
合していることが好ましく、m=3の場合には、3位、4位、または、5位に結合してい
ることが好ましい。また、上記mの値を上記範囲内で調整することにより、本発明のTa
g化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体の非極性溶媒に対する溶解能
を調整することができる。
In the above general formula (1), m represents an integer of 1-5. When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different. m is preferably an integer of 2 to 4, more preferably m is 3. In addition, the RO group is preferably bonded to the 3-position, 4-position, or 5-position when the carbonyl group (C=O group) directly bonded to the phenyl group is the 1-position, and m =3, it is preferably attached to the 3-, 4- or 5-position. Further, by adjusting the value of m within the above range, the Ta of the present invention
It is possible to adjust the solubility of the g-nucleoside protected form and the tagged nucleotide protected form in a non-polar solvent.

上記一般式(1)において、Xは、O、S、NH、または、NRを表す。なかでも、
Xが、Oであることが好ましい。
In the above general formula (1), X represents O, S, NH, or NRN . Above all,
Preferably X is O.

上記一般式(1)において、nは、1~4の整数を表す。なかでも、nが、1、または
、2であることが好ましい。
In the above general formula (1), n represents an integer of 1-4. Among them, n is preferably 1 or 2.

上記一般式(1)において、Rは、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル
基を表す。上記Rとして、たとえば、メチル基、エチル基、1-プロピル基、1-メチ
ル-1-エチル基、1-ブチル基、1-メチル-1-プロピル基、1,1-ジメチル-1
-エチル基、2-メチル-1-プロピル基、1-ペンチル基、2-ペンチル基をあげるこ
とができる。
In general formula (1) above, R 3 N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. Examples of the R N include methyl group, ethyl group, 1-propyl group, 1-methyl-1-ethyl group, 1-butyl group, 1-methyl-1-propyl group, 1,1-dimethyl-1
-ethyl group, 2-methyl-1-propyl group, 1-pentyl group and 2-pentyl group.

また、本発明において、上記アルコキシフェニル化合物およびその誘導体は、一般式(
2)表される化合物またはその誘導体であることが好ましい。

Figure 0007296636000026
(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10
~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。) Further, in the present invention, the alkoxyphenyl compound and its derivative are represented by the general formula (
2) It is preferably a compound represented or a derivative thereof.
Figure 0007296636000026
(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently have 10 carbon atoms and may be substituted.
represents an alkyl group of ∼40.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. )

上記一般式(2)において、R、R、および、Rは、それぞれ独立して、置換さ
れていてもよい、炭素数10~40のアルキル基を表す。上記R、R、および、R
は、炭素数13~30のアルキル基であってもよく、炭素数15~20のアルキル基であ
ってもよく、なかでも炭素数18のアルキル基が好適なものとしてあげることができる。
また、上記R、R、および、Rは、それぞれ独立して、直鎖アルキル基であっても
、分岐アルキル基であってもよいが、すべて直鎖アルキル基であることが好ましい。
In general formula (2) above, R 1 , R 2 and R 3 each independently represent an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms. R 1 , R 2 and R 3 above
may be an alkyl group having 13 to 30 carbon atoms or may be an alkyl group having 15 to 20 carbon atoms, and an alkyl group having 18 carbon atoms is particularly preferable.
R 1 , R 2 and R 3 may each independently be a straight-chain alkyl group or a branched alkyl group, but all are preferably straight-chain alkyl groups.

上記一般式(2)において、X、n、および、Rは、上記一般式(1)と同様である
In general formula (2) above, X, n and RN are the same as in general formula (1) above.

また、本発明のアルコキシフェニル化合物およびその誘導体は、その合成手法を実施例
に例示しているが、その他、市販の原料を用いて公知の方法を用いて合成してもよい。
In addition, the alkoxyphenyl compounds and derivatives thereof of the present invention are exemplified in their synthesis methods in the examples, but they may be synthesized by using commercially available raw materials and using known methods.

〔Tag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体等〕
本発明におけるTag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体は、一
般式(3)で表される化合物またはその誘導体である。

Figure 0007296636000027
(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10~40のアルキル基を表
す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、また
は、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000028
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000029
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。) [Tagged Nucleoside Protected Body, Tagged Nucleotide Protected Body, etc.]
The protected nucleoside tagged and protected nucleotide tagged in the present invention are compounds represented by general formula (3) or derivatives thereof.
Figure 0007296636000027
(In the formula,
Each R independently represents an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000028
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )
Figure 0007296636000029
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )

上記一般式(3)において、R、m、X、n、Rは、上記一般式(1)と同様である
In general formula (3) above, R, m, X, n, and R N are the same as in general formula (1) above.

上記一般式(3)において、Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。 In the above general formula (3), Y represents the following general formula (4) or general formula (5).

上記一般式(4)において、Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Ba
seが2以上存在する場合には、複数存在するBaseは同一、または、異なっていても
よい。
In the above general formula (4), Base represents an optionally modified nucleic acid base. Ba
When two or more se exist, the plurality of Bases may be the same or different.

上記Baseとして、たとえば、アデニル基、グアニル基、シチジル基、チミジル基、若しくはウラシル基、および、これらの誘導体、ならびに、これらの修飾体をあげることができる。上記修飾体として、たとえば、極性基等が公知の保護基等で保護されたものであってもよい。また、オリゴヌクレオチド中に複数存在するBaseは、同一、または、異なっていてもよい。 Examples of the Base include an adenyl group, a guanyl group, a cytidyl group, a thymidyl group, a uracil group, derivatives thereof, and modifications thereof. As the modification, for example, a polar group or the like may be protected with a known protecting group or the like. Moreover, multiple Bases present in an oligonucleotide may be the same or different.

上記一般式(4)において、Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、
ハロゲンを表す。Bが2以上存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異な
っていてもよい。また、保護されている水酸基の場合には、保護基、保護方法として公知
の手法を適宜用いることができる。
In the above general formula (4), B is a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or
represents halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different. Moreover, in the case of a protected hydroxyl group, a known technique can be appropriately used as a protecting group and a protecting method.

上記一般式(4)において、Wは、水素原子、または、保護基を表す。Wが保護基の場
合には、保護基、保護方法として公知の手法を適宜用いることができる。
In general formula (4) above, W represents a hydrogen atom or a protecting group. When W is a protecting group, known techniques can be appropriately used as protecting groups and protecting methods.

また、Wが、水素原子、トリチル基、ジ(C1-6アルコキシ)トリチル基、モノ(C
1-18アルコキシ)トリチル基、9-(9-フェニル)キサンテニル基、または、9-
(9-フェニル)チオキサンテニル基であることが好ましい。Wが上記いずれかである場
合、より簡便にオリゴヌクレオチドの合成を行うことができる。
Further, W is a hydrogen atom, a trityl group, a di (C 1-6 alkoxy) trityl group, a mono (C
1-18 alkoxy)trityl group, 9-(9-phenyl)xanthenyl group, or 9-
A (9-phenyl)thioxanthenyl group is preferred. When W is any of the above, oligonucleotides can be synthesized more easily.

上記一般式(4)において、Rは、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル
基を表す。Rが2以上存在する場合には、複数存在するRは同一、または、異なって
いてもよい。また、Rが、2位に電子求引性基を有するエチル基であることが好ましい
。また、上記電子求引性基としては、たとえば、シアノ基が好ましい例としてあげること
ができる。
In general formula (4) above, R 4 represents an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms and having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different. Also, R4 is preferably an ethyl group having an electron-withdrawing group at the 2-position. Moreover, as said electron withdrawing group, a cyano group can be mentioned as a preferable example, for example.

上記一般式(4)において、Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合に
は、複数存在するZは、同一、または、異なっていてもよい。
In the above general formula (4), Z represents O or S. When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.

上記一般式(4)において、y1は、0以上の任意の整数を表す。y1が、1~100
であってもよく、1~50であってもよく、1~30であってもよく、1~20であって
もよく、1~10であってもよく、0であってもよい。
In the above general formula (4), y1 represents any integer of 0 or more. y1 is 1 to 100
, 1 to 50, 1 to 30, 1 to 20, 1 to 10, or 0.

上記一般式(4)において、*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。 In the above general formula (4), * represents the bonding site in the above general formula (3).

上記一般式(5)において、Baseは、上記一般式(4)と同様である。 In general formula (5) above, Base is the same as in general formula (4) above.

上記一般式(5)において、Qは、水素原子、または、保護基を表す。Qが保護基の場
合には、保護基、保護方法として公知の手法を適宜用いることができる。
In general formula (5) above, Q represents a hydrogen atom or a protecting group. When Q is a protecting group, known techniques can be appropriately used as protecting groups and protecting methods.

また、Qが、水素原子、トリチル基、ジ(C1-6アルコキシ)トリチル基、モノ(C
1-18アルコキシ)トリチル基、9-(9-フェニル)キサンテニル基、または、9-
(9-フェニル)チオキサンテニル基であることが好ましい。Qが上記いずれかである場
合、より簡便にオリゴヌクレオチドの合成を行うことができる。
Further, Q is a hydrogen atom, a trityl group, a di (C 1-6 alkoxy) trityl group, a mono (C
1-18 alkoxy)trityl group, 9-(9-phenyl)xanthenyl group, or 9-
A (9-phenyl)thioxanthenyl group is preferred. When Q is any of the above, oligonucleotides can be synthesized more easily.

上記一般式(5)において、Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキ
ル)アミノ基、または、4位窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよい
ピペラジノ基を表す。Vが2以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異
なっていてもよい。
In the above general formula (5), V is an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or a nitrogen atom at the 4-position protected by a protecting group, even if it is further substituted. represents a good piperazino group. When there are two or more Vs, the plurality of Vs may be the same or different.

上記一般式(5)において、y2は、0以上の任意の整数を表す。y2が、1~100
であってもよく、1~50であってもよく、1~30であってもよく、1~20であって
もよく、1~10であってもよく、0であってもよい。
In the above general formula (5), y2 represents any integer of 0 or more. y2 is 1 to 100
, 1 to 50, 1 to 30, 1 to 20, 1 to 10, or 0.

上記一般式(5)において、*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。 In the above general formula (5), * represents the bonding site in the above general formula (3).

また、本発明のTag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体は、一
般式(6)表される化合物またはその誘導体であることが好ましい。

Figure 0007296636000030
(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10
~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000031
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000032
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。) In addition, the protected nucleoside tagged and protected nucleotide tagged according to the present invention are preferably compounds represented by general formula (6) or derivatives thereof.
Figure 0007296636000030
(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently have 10 carbon atoms and may be substituted.
represents an alkyl group of ∼40.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000031
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )
Figure 0007296636000032
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )

上記一般式(6)において、R、R、R、X、n、および、Rは、上記一般式
(2)と同様である。
In general formula (6) above, R 1 , R 2 , R 3 , X, n, and RN are the same as in general formula (2) above.

上記一般式(6)において、Yは、上記一般式(3)と同様である。 In general formula (6) above, Y is the same as in general formula (3) above.

また、本発明のTag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体は、そ
の合成手法を実施例に例示しているが、その他、市販の原料を用いて公知の方法を用いて
合成してもよい。
In addition, the tagged nucleoside protected form and the tagged nucleotide protected form of the present invention are exemplified in the examples for their synthesis methods, but they may be synthesized by other known methods using commercially available raw materials. .

本発明のTag化ヌクレオシド保護体およびTag化ヌクレオチド保護体の製造方法(
合成方法)として、たとえば、上記アルコキシフェニル化合物またはその誘導体と、ヌク
レオシドまたはヌクレオチドとを結合させる方法で得ることができる。結合手法として、
たとえば、上記アルコキシフェニル化合物またはその誘導体と、ヌクレオシドまたはヌク
レオチドとを縮合反応させる方法をあげることができる。上記縮合反応を用いる場合、た
とえば、一般式(1)または(2)で表される上記アルコキシフェニル化合物と、ヌクレ
オシドまたはヌクレオチドとを縮合剤を用いて結合させる方法や、置換基等で反応性を高
めた一般式(1)または(2)で表される上記アルコキシフェニル化合物の誘導体(たと
えば、エステル誘導体、酸クロリド誘導体等)と、ヌクレオシドまたはヌクレオチドとを
用いて結合させる方法や、一般式(1)または(2)で表される上記アルコキシフェニル
化合物と、置換基等で反応性を高めたヌクレオシドまたはヌクレオチドとを用いて結合さ
せる方法を適宜用いることができる。
Tagged nucleoside protected form and tagged nucleotide protected form production method of the present invention (
Synthetic method), for example, a method of binding the above alkoxyphenyl compound or derivative thereof to a nucleoside or nucleotide. As a binding method,
For example, a method of condensing the alkoxyphenyl compound or derivative thereof with a nucleoside or nucleotide can be used. When the condensation reaction is used, for example, the alkoxyphenyl compound represented by the general formula (1) or (2) and a nucleoside or nucleotide are combined using a condensing agent, or the reactivity is increased by a substituent or the like. A method of binding a derivative of the alkoxyphenyl compound represented by the enhanced general formula (1) or (2) (e.g., ester derivative, acid chloride derivative, etc.) with a nucleoside or nucleotide, or ) or the alkoxyphenyl compound represented by (2), and a nucleoside or nucleotide whose reactivity is enhanced by a substituent or the like, can be appropriately used for bonding.

〔オリゴヌクレオチド保護体の製造方法、および、Tag部分除去方法等〕
本発明のオリゴヌクレオチド保護体の製造方法(合成方法)、および、本発明のTag
部分除去方法(置換基除去方法)は、一般式(3)で表される化合物またはその誘導体を
還元処理する工程(1)を含むものである。

Figure 0007296636000033
(式中、
Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10~40のアルキル基を表
す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは、同一、また
は、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000034
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000035
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(3)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000036
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Figure 0007296636000037
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。) [Method for producing protected oligonucleotide, method for removing Tag portion, etc.]
The production method (synthesis method) of the protected oligonucleotide of the present invention and the Tag of the present invention
The partial removal method (substituent removal method) includes step (1) of reducing the compound represented by general formula (3) or a derivative thereof.
Figure 0007296636000033
(In the formula,
Each R independently represents an optionally substituted alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000034
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )
Figure 0007296636000035
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the above general formula (3). )
Figure 0007296636000036
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more. )
Figure 0007296636000037
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more. )

上記オリゴヌクレオチド保護体の製造方法において、上記一般式(3)、(4)、(5
)は上記同様である。
In the method for producing an oligonucleotide protected body, the general formulas (3), (4), (5)
) is the same as above.

上記オリゴヌクレオチド保護体の製造方法における、上記一般式(7)において、Ba
se、B、W、R、Z、および、y1は、上記一般式(4)と同様である。
In the above general formula (7) in the method for producing the protected oligonucleotide, Ba
se, B, W, R 4 , Z, and y1 are the same as in general formula (4) above.

上記オリゴヌクレオチド保護体の製造方法における、上記一般式(8)において、Ba
se、Q、V、および、y2は、上記一般式(5)と同様である。
In the above general formula (8) in the method for producing an oligonucleotide protected body, Ba
se, Q, V, and y2 are the same as in general formula (5) above.

本発明のオリゴヌクレオチド保護体の製造方法、および、本発明のTag部分除去方法
において、一般式(6)で表される化合物またはその誘導体を還元処理する工程(1)を
含むことが好ましい。

Figure 0007296636000038
(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、置換されていてもよい、炭素数10
~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
Yは、下記一般式(4)、または、一般式(5)を表す。)
Figure 0007296636000039
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000040
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。
*は、上記一般式(6)における結合箇所を表す。)
Figure 0007296636000041
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Bは、水素原子、保護されていてもよい水酸基、または、ハロゲンを表す。Bが2以上
存在する場合には、複数存在するBは、同一、または、異なっていてもよい。
Wは、水素原子、または、保護基を表す。
は、電子求引性基を有する、炭素数1~4のアルキル基を表す。Rが2以上存在
する場合には、複数存在するRは同一、または、異なっていてもよい。
Zは、O、または、Sを表す。Zが2以上存在する場合には、複数存在するZは、同一
、または、異なっていてもよい。
y1は、0以上の任意の整数を表す。)
Figure 0007296636000042
(式中、
Baseは、修飾されていてもよい核酸塩基を表す。Baseが2以上存在する場合に
は、複数存在するBaseは同一、または、異なっていてもよい。
Qは、水素原子、または、保護基を表す。
Vは、炭素数1~6のアルコキシ基、ジ(C1-6アルキル)アミノ基、または、4位
窒素原子が保護基で保護され、さらに置換されていてもよいピペラジノ基を表す。Vが2
以上存在する場合には、複数存在するVは同一、または、異なっていてもよい。
y2は、0以上の任意の整数を表す。) The method for producing a protected oligonucleotide of the present invention and the method for removing a Tag moiety of the present invention preferably include step (1) of reducing the compound represented by general formula (6) or its derivative.
Figure 0007296636000038
(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently have 10 carbon atoms and may be substituted.
represents an alkyl group of ∼40.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
Y represents the following general formula (4) or general formula (5). )
Figure 0007296636000039
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )
Figure 0007296636000040
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more.
* represents a bonding site in the general formula (6). )
Figure 0007296636000041
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
B represents a hydrogen atom, an optionally protected hydroxyl group, or a halogen. When two or more B are present, the plural B may be the same or different.
W represents a hydrogen atom or a protecting group.
R 4 represents a C 1-4 alkyl group having an electron-withdrawing group. When two or more R 4 are present, the plurality of R 4 may be the same or different.
Z represents O or S; When there are two or more Z's, the multiple Z's may be the same or different.
y1 represents any integer of 0 or more. )
Figure 0007296636000042
(In the formula,
Base represents an optionally modified nucleobase. When two or more Bases exist, the plurality of Bases may be the same or different.
Q represents a hydrogen atom or a protecting group.
V represents an alkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, a di(C 1-6 alkyl)amino group, or an optionally substituted piperazino group whose 4-position nitrogen atom is protected by a protecting group. V is 2
When there are more than one V, the plurality of V may be the same or different.
y2 represents any integer of 0 or more. )

上記オリゴヌクレオチド保護体の製造方法、および、本発明のTag部分除去方法にお
いて、上記一般式(3)、(4)、(5)は上記同様である。
In the method for producing the protected oligonucleotide and the method for removing the Tag portion of the present invention, the above general formulas (3), (4) and (5) are the same as above.

上記オリゴヌクレオチド保護体の製造方法、および、本発明のTag部分除去方法にお
いて、上記一般式(7)において、Base、B、W、R、Z、および、y1は、上記
一般式(4)と同様である。
In the method for producing a protected oligonucleotide and the method for removing the Tag portion of the present invention, in the general formula (7), Base, B, W, R 4 , Z, and y1 are represented by the general formula (4). is similar to

上記オリゴヌクレオチド保護体の製造方法、および、本発明のTag部分除去方法にお
いて、上記一般式(8)において、Base、Q、V、および、y2は、上記一般式(5
)と同様である。
In the method for producing an oligonucleotide protected body and the method for removing the Tag portion of the present invention, in the general formula (8), Base, Q, V, and y2 are represented by the general formula (5
).

上記オリゴヌクレオチド保護体の製造方法、および、本発明のTag部分除去方法にお
いて、上記還元処理が、ホウ素含有還元剤を用いる、または、ホウ素含有還元剤とアミン
とを用いるものであることが好ましい。上記構成を有することにより、オリゴヌクレオチ
ド保護体をより簡便に合成することができる。
In the method for producing a protected oligonucleotide and the method for removing a Tag moiety of the present invention, the reduction treatment preferably uses a boron-containing reducing agent, or uses a boron-containing reducing agent and an amine. By having the above structure, the protected oligonucleotide can be synthesized more easily.

上記ホウ素含有還元剤として、公知のものを用いることができるが、なかでも、水素化
ホウ素リチウム、水素化ホウ素ナトリウム、水素化トリエチルホウ素リチウム、水素化ホ
ウ素テトラブチルアンモニウム等であることが好ましい。これらの化合物は単独で使用し
てもよく、また2種以上を混合して使用してもよい。上記構成を有することにより、オリ
ゴヌクレオチド保護体をより収率よく簡便に合成することができる。
As the boron-containing reducing agent, known ones can be used, and lithium borohydride, sodium borohydride, lithium triethylborohydride, tetrabutylammonium borohydride and the like are particularly preferable. These compounds may be used alone or in combination of two or more. By having the above structure, the protected oligonucleotide can be easily synthesized with higher yield.

上記ホウ素含有還元剤とアミンとを用いる場合、上記アミンとして、公知のものを用い
ることができるが、なかでも、ジイソプロピルエチルアミン、トリエチルアミン、ピリジ
ン等であることが好ましい。これらの化合物は単独で使用してもよく、また2種以上を混
合して使用してもよい。上記構成を有することにより、オリゴヌクレオチド保護体をより
収率よく簡便に合成することができる。
When the boron-containing reducing agent and amine are used, known amines can be used as the amine, and among them, diisopropylethylamine, triethylamine, pyridine and the like are preferable. These compounds may be used alone or in combination of two or more. By having the above structure, the protected oligonucleotide can be easily synthesized with higher yield.

上記工程(1)は、その合成手法、反応手法を一般式(6)等で表される化合物または
その誘導体の化学構造を損傷させない限り、その他、市販の原料を用いて公知の方法を用
いてもよい。
In the above step (1), as long as the synthesis method and reaction method do not damage the chemical structure of the compound represented by general formula (6) or the like or a derivative thereof, other known methods using commercially available raw materials can be used. good too.

上記工程(1)は、たとえば、一般式(6)等で表される化合物またはその誘導体を、
ホウ素含有還元剤、または、ホウ素含有還元剤とアミンとを有機溶媒に溶解または混合さ
せ、-10℃または室温下で撹拌し反応させる工程をあげることができる。
In the above step (1), for example, a compound represented by general formula (6) or a derivative thereof,
A process of dissolving or mixing a boron-containing reducing agent, or a boron-containing reducing agent and an amine in an organic solvent, and stirring the mixture at -10°C or room temperature for reaction can be mentioned.

また、本発明のオリゴヌクレオチド保護体の製造方法、および、本発明のTag部分除
去方法は、その合成手法、反応手法を実施例に例示しているが、その他、市販の原料を用
いて公知の方法を用いてもよい。
In addition, although the method for producing the protected oligonucleotide of the present invention and the method for removing the Tag portion of the present invention are illustrated in the examples, the synthesis method and the reaction method thereof are shown in the examples. method may be used.

本発明のTag化オリゴヌクレオチド保護体の製造方法としては、たとえば、2量体を
例とすると、上記Tag化ヌクレオシド保護体またはTag化ヌクレオチド保護体と、ア
ミダイト化したヌクレオシドまたはヌクレオチドとをカップリング反応させ(工程A)、
得られた2量体を酸化工程でリン酸エステル化し(工程B)、保護基Wの脱保護を行い(
工程C)、ろ別(工程D)を行うことにより、Tag化ヌクレオチド保護体の2量体を得
る方法をあげることができる。また、より高次の(n+1)量体は、当該手法を同様にn
回繰り返して得る方法や、一定程度の長さのヌクレオチド誘導体を用いてそれらを結合さ
せて得る方法などをあげることができる。
As a method for producing a tagged oligonucleotide protected body of the present invention, for example, taking a dimer as an example, the above tagged nucleoside protected body or tagged nucleotide protected body and an amidated nucleoside or nucleotide are subjected to a coupling reaction. Let (step A),
The obtained dimer is phosphorylated in an oxidation step (step B), and the protecting group W is deprotected (
A method of obtaining a dimer of a tagged nucleotide-protected compound by performing step C) and filtration (step D) can be mentioned. Higher-order (n+1)-mers also apply the technique to n
Examples include a method of obtaining by repeating a number of times, a method of obtaining by binding nucleotide derivatives of a certain length, and the like.

以下、本発明の構成と効果を具体的に示す実施例等について説明する。以下、実施例に
おける濃縮操作は特に指定のない限り、減圧下で行った。なお、実施例等における評価項
目は下記のようにして測定を行った。
Examples and the like that specifically show the configuration and effects of the present invention will be described below. Hereinafter, concentration operations in the examples were performed under reduced pressure unless otherwise specified. The evaluation items in Examples and the like were measured as follows.

H-NMRスペクトルの測定>
H-NMRスペクトルの測定は、核磁気共鳴装置(日本電子社製、製品名AL400
および日本電子社製、製品名ECS-600)を用い、内部標準としてテトラメチルシラ
ンを用いて行った。
<Measurement of 1 H-NMR spectrum>
1 H-NMR spectrum was measured using a nuclear magnetic resonance apparatus (manufactured by JEOL Ltd., product name AL400
and ECS-600 manufactured by JEOL Ltd.), using tetramethylsilane as an internal standard.

13C-NMRスペクトルの測定>
13C-NMRスペクトルの測定は、核磁気共鳴装置(日本電子社製、製品名AL40
0および日本電子社製、製品名ECS-600)を用い、内部標準としてテトラメチルシ
ランを用いて行った。
<Measurement of 13 C-NMR spectrum>
The 13 C-NMR spectrum was measured using a nuclear magnetic resonance apparatus (manufactured by JEOL Ltd., product name AL40
0 and ECS-600 manufactured by JEOL Ltd.), and tetramethylsilane as an internal standard.

<TOF/MSスペクトルの測定>
TOF/MSスペクトルの測定は、飛行時間型質量分析計(Waters社製、製品名
LCT-PremierXEおよび日本電子社製、製品名JMS T-100LP)を用
いて行った。
<Measurement of TOF/MS spectrum>
TOF/MS spectra were measured using time-of-flight mass spectrometers (manufactured by Waters, product name LCT-PremierXE and JEOL Ltd., product name JMS T-100LP).

1.2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸の
合成
(A)tert-ブチルエステルを経由する方法
〔実施例1-1〕
(1)3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸2-(tert-ブトキシ
)-2-オキソエチルの合成

Figure 0007296636000043
1. Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (A) Method via tert-butyl ester [Example 1-1]
(1) Synthesis of 2-(tert-butoxy)-2-oxoethyl 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoate
Figure 0007296636000043

3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸(1.80g,1.94mmol
)のTHF(10mL)懸濁液にトリエチルアミン(0.39g,3.87mmol)、
2-ブロモ酢酸tert-ブチル(0.76g,3.87mmol)を加えたのち、60
℃で2時間撹拌した。反応液を室温に冷却したのち、メタノール(54mL)を滴下する
ことで析出した固体をろ過した。固体をメタノールで洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し
、表題の化合物(1.95g,97%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.16-1.41(m,84H),1.41-1.57(m,6H),1.49(s
,9H),1.66-1.88(m,6H),3.95-4.11(m,6H),4.7
0(s,2H),7.31(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.02,22.48,22.66
,22.83,26.08,26.11,27.88,28.08,29.35,29.
40,29.56,29.64,29.65,29.70,29.97,30.22,3
0.36,31.76,31.93,32.10,61.66,69.35,73.51
,82.32,108.69,108.90,123.82,123.93,143.1
1,143.38,152.93,165.83,166.90.
TOF/MS(ESI):calcd for C67124Na[M+Na]
1063.9245,found 1063.9254.
3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoic acid (1.80 g, 1.94 mmol
) in THF (10 mL) was added triethylamine (0.39 g, 3.87 mmol),
After adding tert-butyl 2-bromoacetate (0.76 g, 3.87 mmol), 60
C. for 2 hours. After the reaction solution was cooled to room temperature, methanol (54 mL) was added dropwise, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with methanol and dried under reduced pressure at 50°C to give the title compound (1.95 g, 97%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.16-1.41 (m, 84H), 1.41-1.57 (m, 6H), 1.49 (s
, 9H), 1.66-1.88 (m, 6H), 3.95-4.11 (m, 6H), 4.7
0(s, 2H), 7.31(s, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.02, 22.48, 22.66
, 22.83, 26.08, 26.11, 27.88, 28.08, 29.35, 29.
40, 29.56, 29.64, 29.65, 29.70, 29.97, 30.22, 3
0.36, 31.76, 31.93, 32.10, 61.66, 69.35, 73.51
, 82.32, 108.69, 108.90, 123.82, 123.93, 143.1
1, 143.38, 152.93, 165.83, 166.90.
TOF/MS (ESI): calcd for C67H124O7Na [M+Na] +
1063.9245, found 1063.9254.

〔実施例1-2〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
の合成

Figure 0007296636000044
[Example 1-2]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid
Figure 0007296636000044

3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸2-(tert-ブトキシ)-2
-オキソエチル(5.21g,5.0mmol)のクロロホルム(20mL)溶液にトリ
フルオロ酢酸(11.40g,100.0mmol)を添加したのち、50℃で17時間
撹拌した。反応液を室温に冷却したのち、アセトニトリル(50mL)を滴下することで
析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-クロロホルム混合溶媒で洗浄したのち
、50℃で減圧乾燥し、表題の化合物(4.89g,99%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz)
,1.16-1.54(m,90H),1.69-1.88(m,6H),3.95-4
.11(m,6H),4.87(s,2H),7.30(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.08,22.68,26.06
,26.10,29.36,29.41,29.57,29.65,29.66,29.
72,30.35,31.93,60.49,69.30,73.57,108.53,
123.31,143.17,152.96,165.74.
TOF/MS(ESI):calcd for C63116Na[M+Na]
1007.8619,found 1007.8639.
3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoic acid 2-(tert-butoxy)-2
After adding trifluoroacetic acid (11.40 g, 100.0 mmol) to a solution of -oxoethyl (5.21 g, 5.0 mmol) in chloroform (20 mL), the mixture was stirred at 50°C for 17 hours. After cooling the reaction solution to room temperature, acetonitrile (50 mL) was added dropwise, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with an acetonitrile-chloroform mixed solvent and then dried under reduced pressure at 50° C. to give the title compound (4.89 g, 99%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=7.0 Hz)
, 1.16-1.54 (m, 90H), 1.69-1.88 (m, 6H), 3.95-4
. 11 (m, 6H), 4.87 (s, 2H), 7.30 (s, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.08, 22.68, 26.06
, 26.10, 29.36, 29.41, 29.57, 29.65, 29.66, 29.
72, 30.35, 31.93, 60.49, 69.30, 73.57, 108.53,
123.31, 143.17, 152.96, 165.74.
TOF/MS (ESI): calcd for C63H116O7Na [M+Na] +
1007.8619, found 1007.8639.

(B)ベンジルエステルを経由する方法
〔実施例1-3〕
(1)3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸2-ベンジルオキシ-2-
オキソエチルの合成

Figure 0007296636000045
(B) Method via benzyl ester [Example 1-3]
(1) 2-benzyloxy-2-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoate
Synthesis of oxoethyl
Figure 0007296636000045

3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸(0.90g,0.97mmol
)のクロロホルム(5mL)懸濁液にトリエチルアミン(0.20g,1.94mmol
)、2-ブロモ酢酸ベンジル(0.45g,1.94mmol)を加えたのち、50℃で
14時間撹拌した。反応液を室温に冷却したのち、メタノール(18mL)を滴下するこ
とで析出した固体をろ過した。固体をメタノールで洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、
表題の化合物(1.02g,97%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.16-1.41(m,84H),1.41-1.54(m,6H),1.66-1
.91(m,6H),3.95-4.08(m,6H),4.86(s,2H),5.2
3(s,2H),7.24-7.41(m,7H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.08,22.71,26.13
,26.16,29.40,29.43,29.46,29.62,29.69,29.
71,29.76,30.00,30.43,31.98,61.24,67.07,6
9.40,73.59,108.76,123.69,128.32,128.50,1
28.65,135.35,143.28,152.96,153.01,165.84
,167.77.
3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoic acid (0.90 g, 0.97 mmol
) in chloroform (5 mL) was added with triethylamine (0.20 g, 1.94 mmol).
) and benzyl 2-bromoacetate (0.45 g, 1.94 mmol) were added, followed by stirring at 50° C. for 14 hours. After the reaction solution was cooled to room temperature, methanol (18 mL) was added dropwise, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with methanol, it is dried under reduced pressure at 50°C.
The title compound (1.02 g, 97%) was obtained as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.16-1.41 (m, 84H), 1.41-1.54 (m, 6H), 1.66-1
. 91 (m, 6H), 3.95-4.08 (m, 6H), 4.86 (s, 2H), 5.2
3 (s, 2H), 7.24-7.41 (m, 7H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.08, 22.71, 26.13
, 26.16, 29.40, 29.43, 29.46, 29.62, 29.69, 29.
71, 29.76, 30.00, 30.43, 31.98, 61.24, 67.07, 6
9.40, 73.59, 108.76, 123.69, 128.32, 128.50, 1
28.65, 135.35, 143.28, 152.96, 153.01, 165.84
, 167.77.

〔実施例1-4〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
の合成

Figure 0007296636000046
[Example 1-4]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid
Figure 0007296636000046

3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸2-ベンジルオキシ-2-オキソ
エチル(0.91g,0.85mmol)のTHF(4.3mL)溶液に10%Pd-C
(0.09g)を加えたのち、水素風船下、40℃で19時間撹拌した。反応液を室温に
冷却したのち、セライトろ過により10%Pd-Cを除いた。ろ液を濃縮したのち、残渣
にアセトニトリル(18mL)を滴下することで析出した固体をろ過した。固体をアセト
ニトリルで洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、表題の化合物(0.84g,100%)
を白色固体として得た。
2-benzyloxy-2-oxoethyl 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoate (0.91 g, 0.85 mmol) in THF (4.3 mL) with 10% Pd—C
(0.09 g) was added, and the mixture was stirred at 40°C for 19 hours under a hydrogen balloon. After cooling the reaction solution to room temperature, 10% Pd—C was removed by celite filtration. After concentrating the filtrate, acetonitrile (18 mL) was added dropwise to the residue, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with acetonitrile, it was dried under reduced pressure at 50° C. to yield the title compound (0.84 g, 100%).
was obtained as a white solid.

2.チミジニル-[3’→5’]デオキシシチジニル-[3’→5’]-デオキシシチ
ジニル-[3’→5’]-デオキシシチジニル-[3’→5’]-デオキシグアニジル-
[3’→5’]-デオキシシチジニル-[3’→5’]-デオキシシチジニル-[3’→
5’]-チミジニル-[3’→5’]-デオキシグアニジル-[3’→5’]-チミジニ
ル-[3’→5’]-デオキシグアニジル-[3’→5’]-デオキシアデニリル-[3
’→5’]-デオキシシチジニル-[3’→5’]-デオキシアデニリル-[3’→5’
]-チミジニル-[3’→5’]-デオキシグアニジル-[3’→5’]-デオキシシチ
ジニル-[3’→5’]-デオキシアデニリル-[3’→5’]-チミジニル-[3’→
5’]-チミジン(20merオリゴ核酸)の合成
2. thymidinyl-[3′→5′]deoxycytidinyl-[3′→5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-deoxyg Anidyl
[3′→5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-deoxycytidinyl-[3′→
5′]-thymidinyl-[3′→5′]-deoxyguanidyl-[3′→5′]-thymidinyl-[3′→5′]-deoxyguanidyl-[3′→5′]- deoxyadenylyl-[3
'→5']-deoxycytidinyl-[3'→5']-deoxyadenylyl-[3'→5'
]-thymidinyl-[3′→5′]-deoxyguanidyl-[3′→5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-deoxyadenylyl-[3′→5′] -thymidinyl-[3'→
Synthesis of 5′]-thymidine (20mer oligonucleic acid)

〔実施例2-1〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000047
[Example 2-1]
(1) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl
Figure 0007296636000047

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(4.
95g,5.02mmol)、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン(
3.28g,6.03mmol)、1-メチルイミダゾール(2.27g,27.62m
mol)のTHF(50mL)懸濁液にCOMU(4.73g,11.05mmol)を
加えたのち、室温で3.5時間撹拌した。反応液にアセトニトリル(248mL)を滴下
することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-THF混合溶媒で洗浄した
のち、50℃で減圧乾燥し、表題の化合物(7.16g,95%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.16-1.54(m,93H),1.69-1.88(m,6H),2.42-2
.58(m,2H),3.42-3.55(m,2H),3.78(s,6H),3.9
5-4.05(m,6H),4.18(s,1H),4.82(s,2H),5.56(
d,1H,J=5.6Hz),6.40-6.50(m,1H),6.80-6.90(
m,4H),7.20-7.40(m,9H),7.61(s,1H),8.03(s,
1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.62,14.10,22.71
,26.11,26.15,29.38,29.45,29.61,29.68,29.
75,30.40,31.96,37.88,55.28,61.12,63.68,6
9.35,73.60,83.93,84.40,87.36,108.59,111.
66,113.43,123.26,127.29,128.08,128.19,13
0.10,130.15,135.20,135.25,135.32,144.22,
150.11,153.02,158.92,163.16,165.85,167.5
0.
TOF/MS(ESI):calcd for C9414613Na [M+
Na] 1534.0723, found 1534.0759.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (4.
95 g, 5.02 mmol), 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine (
3.28 g, 6.03 mmol), 1-methylimidazole (2.27 g, 27.62 m
mol) in THF (50 mL) was added with COMU (4.73 g, 11.05 mmol) and stirred at room temperature for 3.5 hours. Acetonitrile (248 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with an acetonitrile-THF mixed solvent and then dried under reduced pressure at 50° C. to obtain the title compound (7.16 g, 95%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.16-1.54 (m, 93H), 1.69-1.88 (m, 6H), 2.42-2
. 58 (m, 2H), 3.42-3.55 (m, 2H), 3.78 (s, 6H), 3.9
5-4.05 (m, 6H), 4.18 (s, 1H), 4.82 (s, 2H), 5.56 (
d, 1H, J = 5.6Hz), 6.40-6.50 (m, 1H), 6.80-6.90 (
m, 4H), 7.20-7.40 (m, 9H), 7.61 (s, 1H), 8.03 (s,
1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.62, 14.10, 22.71
, 26.11, 26.15, 29.38, 29.45, 29.61, 29.68, 29.
75, 30.40, 31.96, 37.88, 55.28, 61.12, 63.68, 6
9.35, 73.60, 83.93, 84.40, 87.36, 108.59, 111.
66, 113.43, 123.26, 127.29, 128.08, 128.19, 13
0.10, 130.15, 135.20, 135.25, 135.32, 144.22,
150.11, 153.02, 158.92, 163.16, 165.85, 167.5
0.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C94H146N2O13Na [M+
Na] + 1534.0723, found 1534.0759.

〔実施例2-2〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000048
[Example 2-2]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)thymidin-3′-yl acetate
Figure 0007296636000048

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル(6.95g,4.60m
mol)のジクロロメタン溶液(174mL)にピロール(1.54g,22.98mm
ol)、トリフルオロ酢酸(0.66g,5.75mmol)を加えたのち、室温で2.
5時間撹拌した。反応液にアセトン(52mL)とアセトニトリル(156mL)を滴下
することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-アセトン-ジクロロメタン
混合溶媒とアセトニトリルで洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、表題の化合物(5.0
4g,91%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.11-1.39(m,84H),1.43-1.51(m,6H),1.66(s
,1H),1.71-1.85(m,6H),1.95(s,3H),2.36-2.5
8(m,3H),3.89-3.97(m,2H),3.97-4.08(m,6H),
4.15(dd,1H,J=2.0,2.4Hz),4.84(s,2H),5.45-
5.53(m,1H),6.20(dd,1H,J=6.0,8.8Hz),7.29(
s,2H),7.45(d,1H,J=1.2Hz),8.59(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.58,14.12,22.70
,26.07,26.11,29.33,29.38,29.43,29.59,29.
67,29.68,29.73,30.35,31.94,36.99,61.12,6
2.57,69.24,73.58,75.97,84.91,86.46,108.3
6,111.48,123.17,136.41,143.09,150.29,152
.96,163.40,165.91,167.71.
TOF/MS(ESI):calcd for C7312811Na [M+
Na] 1231.9416, found 1231.9432.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl (6.95 g, 4.60 m
mol) in dichloromethane solution (174 mL) was added pyrrole (1.54 g, 22.98 mm
ol), and after adding trifluoroacetic acid (0.66 g, 5.75 mmol), the mixture was stirred at room temperature for 2.5 hours.
Stirred for 5 hours. Acetone (52 mL) and acetonitrile (156 mL) were added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with acetonitrile-acetone-dichloromethane mixed solvent and acetonitrile, it was dried under reduced pressure at 50° C. to give the title compound (5.0
4 g, 91%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.11-1.39 (m, 84H), 1.43-1.51 (m, 6H), 1.66 (s
, 1H), 1.71-1.85 (m, 6H), 1.95 (s, 3H), 2.36-2.5
8 (m, 3H), 3.89-3.97 (m, 2H), 3.97-4.08 (m, 6H),
4.15 (dd, 1H, J=2.0, 2.4Hz), 4.84 (s, 2H), 5.45-
5.53 (m, 1H), 6.20 (dd, 1H, J = 6.0, 8.8Hz), 7.29 (
s, 2H), 7.45 (d, 1H, J=1.2Hz), 8.59 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.58, 14.12, 22.70
, 26.07, 26.11, 29.33, 29.38, 29.43, 29.59, 29.
67, 29.68, 29.73, 30.35, 31.94, 36.99, 61.12, 6
2.57, 69.24, 73.58, 75.97, 84.91, 86.46, 108.3
6, 111.48, 123.17, 136.41, 143.09, 150.29, 152
. 96, 163.40, 165.91, 167.71.
TOF/MS (ESI): calcd for C73H128N2O11Na [ M+
Na] + 1231.9416, found 1231.9432.

〔実施例2-3〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((シアノエトキシ)(チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’
-イルの合成

Figure 0007296636000049
[Example 2-3]
(3) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((cyanoethoxy)(thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidine-3′
-Synthesis of yl
Figure 0007296636000049

アルゴン下で、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキ
シ)酢酸チミジン-3’-イル(1.00g,0.83mmol)、5’-O-(4,4
’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル-ホスホロアミダイト(1.23g,1
.65mmol)のジクロロメタン懸濁液(15mL)に5-ベンジルチオ-1H-テト
ラゾール(0.32g,1.65mmol)を加えたのち、室温で1.5時間撹拌した。
次に、クメンヒドロペルオキシド(含量82%)(0.23g,1.24mmol)を加
えたのち、室温で2時間撹拌した。反応液にピロール(0.56g,8.27mmol)
、トリフルオロ酢酸(0.28g,2.48mmol)を加えたのち、室温で2時間撹拌
した。反応液にアセトン(15mL)とアセトニトリル(45mL)を滴下することで析
出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-アセトン-ジクロロメタン混合溶媒とア
セトニトリルで洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、表題の化合物(1.20g,92%
)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.11-1.55(m,90H),1.65-2.05(m,12H),2.40-
2.60(m,4H),2.75-2.90(m,2H),3.84(s,2H),3.
95-4.10(m,6H),4.15-4.50(m,6H),4.85(s,2H)
,5.15-5.25(m,1H),5.35-5.55(m,1H),6.10-6.
35(m,2H),7.29(s,2H),7.35(d,1H,J=1.2Hz),7
.47(s,1H),9.60-9.95(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.42,12.46,14.10
,19.72,19.79,22.71,26.12,26.19,29.38,29.
43,29.49,29.63,29.70,29.75,30.43,31.96,3
6.47,36.56,38.46,61.14,61.91,62.00,62.63
,62.68,62.75,62.80,67.53,69.42,73.64,74.
66,74.77,78.94,79.12,82.33,82.40,82.48,8
5.60,85.66,85.79,86.02,86.21,86.35,108.6
1,111.27,111.33,111.73,111.82,116.58,116
.66,123.15,135.87,135.94,136.53,136.62,1
43.41,150.49,150.59,153.07,163.94,164.02
,165.96,167.79,167.83.
TOF/MS(ESI):calcd for C8614418PNa [M
+Na] 1589.0142, found 1589.0104.
Under argon, 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)thymidin-3′-yl acetate (1.00 g, 0.83 mmol), 5′-O-(4,4
'-Dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl-phosphoramidite (1.23 g, 1
. 65 mmol) in dichloromethane (15 mL) was added with 5-benzylthio-1H-tetrazole (0.32 g, 1.65 mmol), and the mixture was stirred at room temperature for 1.5 hours.
Next, cumene hydroperoxide (content 82%) (0.23 g, 1.24 mmol) was added, followed by stirring at room temperature for 2 hours. Pyrrole (0.56 g, 8.27 mmol) was added to the reaction solution.
, and trifluoroacetic acid (0.28 g, 2.48 mmol) were added, followed by stirring at room temperature for 2 hours. Acetone (15 mL) and acetonitrile (45 mL) were added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with acetonitrile-acetone-dichloromethane mixed solvent and acetonitrile, it was dried under reduced pressure at 50° C. to give the title compound (1.20 g, 92%
) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.11-1.55 (m, 90H), 1.65-2.05 (m, 12H), 2.40-
2.60 (m, 4H), 2.75-2.90 (m, 2H), 3.84 (s, 2H), 3.
95-4.10 (m, 6H), 4.15-4.50 (m, 6H), 4.85 (s, 2H)
, 5.15-5.25 (m, 1H), 5.35-5.55 (m, 1H), 6.10-6.
35 (m, 2H), 7.29 (s, 2H), 7.35 (d, 1H, J=1.2Hz), 7
. 47 (s, 1H), 9.60-9.95 (m, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.42, 12.46, 14.10
, 19.72, 19.79, 22.71, 26.12, 26.19, 29.38, 29.
43, 29.49, 29.63, 29.70, 29.75, 30.43, 31.96, 3
6.47, 36.56, 38.46, 61.14, 61.91, 62.00, 62.63
, 62.68, 62.75, 62.80, 67.53, 69.42, 73.64, 74.
66, 74.77, 78.94, 79.12, 82.33, 82.40, 82.48, 8
5.60, 85.66, 85.79, 86.02, 86.21, 86.35, 108.6
1, 111.27, 111.33, 111.73, 111.82, 116.58, 116
. 66, 123.15, 135.87, 135.94, 136.53, 136.62, 1
43.41, 150.49, 150.59, 153.07, 163.94, 164.02
, 165.96, 167.79, 167.83.
TOF/MS (ESI): calcd for C86H144N5O18PNa [ M
+ Na] + 1589.0142, found 1589.0104.

〔実施例2-4〕
(4)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O
-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2
-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノ
エトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ
)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’
-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(
(2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シ
アノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエト
キシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(チミジン-3’-イル)ホスホリル)-
-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオ
キシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-
イル)ホスホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル
)-N-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイル
デオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-チミジン-3’-イル)ホスホリル)-
-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イ
ル)ホスホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)
-N-ベンゾイルデオキシアデノシン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイル
デオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシアデノシン-
3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イソブチリルデ
オキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシシチジン-3
’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシアデノシン-3’-イル)ホスホリ
ル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成
[Example 2-4]
(4) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5 '-O
-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2
-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-( (2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′
-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(
(2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O -((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(thymidin-3'-yl)phosphoryl)-
N 4 -benzoyldeoxycytidine-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidine-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidine-3′-
yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl)phosphoryl )-thymidin-3′-yl)phosphoryl)-
N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)
-N 6 -benzoyldeoxyadenosine-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidine-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosine-
3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidine-3
Synthesis of '-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3'-yl)phosphoryl)thymidin-3'-yl)phosphoryl)thymidin-3'-yl

実施例2-3と同様の操作を18回繰り返して、表題の化合物(1.10g)を得た。
TOF/MS(ESI):m/z3114.3[M-3H]3-,2335.6[M-4
H]4-,1868.9[M-5H]5-,1557.6[M-6H]6-
The same procedure as in Example 2-3 was repeated 18 times to give the title compound (1.10 g).
TOF/MS (ESI): m/z 3114.3 [M-3H] 3- , 2335.6 [M-4
H] 4- , 1868.9 [M-5H] 5- , 1557.6 [M-6H] 6- .

〔実施例2-5〕
(5)脱保護、および、精製工程
実施例2-4で合成した化合物(50mg,5.4μmol)に28%アンモニア水(
2.1mL)を加えたのち、80℃で1.5時間加熱撹拌した。反応液を減圧下で濃縮し
たのち、濃縮残渣に0.1mol/L-酢酸トリエチルアミン緩衝液を加えることで析出
した不溶物をろ過により除去した。ろ液のC-18カートリッジ精製によって得られた溶
出液を乾燥し、目的物であるチミジニル-[3’→5’]デオキシシチジニル-[3’→
5’]-デオキシシチジニル-[3’→5’]-デオキシシチジニル-[3’→5’]-
デオキシグアニジル-[3’→5’]-デオキシシチジニル-[3’→5’]-デオキシ
シチジニル-[3’→5’]-チミジニル-[3’→5’]-デオキシグアニジル-[3
’→5’]-チミジニル-[3’→5’]-デオキシグアニジル-[3’→5’]-デオ
キシアデニリル-[3’→5’]-デオキシシチジニル-[3’→5’]-デオキシアデ
ニリル-[3’→5’]-チミジニル-[3’→5’]-デオキシグアニジル-[3’→
5’]-デオキシシチジニル-[3’→5’]-デオキシアデニリル-[3’→5’]-
チミジニル-[3’→5’]-チミジンを得た。
HPLC(shodexODP(4.6Φ×150mm),流速:1.0mL/min,
移動:0.1mol/Lトリエチルアミン-酢酸緩衝液、アセトニトリル gradie
nt:0-15min(2to98%アセトニトリル),Rt=3.9min(98.6
%)
TOF/MS(ESI):m/z3020.9[M-2H]2-,2013.4[M-3
H]3-,1509.8[M-4H]4-
[Example 2-5]
(5) Deprotection and Purification Step The compound (50 mg, 5.4 μmol) synthesized in Example 2-4 was added with 28% aqueous ammonia (
2.1 mL) was added, and the mixture was heated and stirred at 80° C. for 1.5 hours. After the reaction solution was concentrated under reduced pressure, 0.1 mol/L-triethylamine acetate buffer was added to the concentrated residue, and the precipitated insoluble matter was removed by filtration. The eluate obtained by C-18 cartridge purification of the filtrate is dried to give the target thymidinyl-[3′→5′]deoxycytidinyl-[3′→
5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-
Deoxyguanidyl-[3′→5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-thymidinyl-[3′→5′]-deoxy guanidyl-[3
'→5']-thymidinyl-[3'→5']-deoxyguanidyl-[3'→5']-deoxyadenylyl-[3'→5']-deoxycytidinyl-[3' →5′]-deoxyadenylyl-[3′→5′]-thymidinyl-[3′→5′]-deoxyguanidyl-[3′→
5′]-deoxycytidinyl-[3′→5′]-deoxyadenylyl-[3′→5′]-
Thymidinyl-[3′→5′]-thymidine was obtained.
HPLC (shodex ODP (4.6 Φ × 150 mm), flow rate: 1.0 mL / min,
Transfer: 0.1 mol/L triethylamine-acetate buffer, acetonitrile gradie
nt: 0-15 min (2 to 98% acetonitrile), Rt = 3.9 min (98.6
%)
TOF/MS (ESI): m/z 3020.9 [M-2H] 2- , 2013.4 [M-3
H] 3- , 1509.8 [M-4H] 4- .

(6)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イルの合成
〔実施例2-6〕
(縮合剤としてEDCI-HClを用いる場合)

Figure 0007296636000050
(6) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl [Example 2- 6]
(When using EDCI-HCl as a condensing agent)
Figure 0007296636000050

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(0.
87g,0.89mmol)、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン(
0.97g,1.77mmol)のTHF(9mL)溶液に4-ジメチルアミノピリジン
(0.02g,0.18mmol)と1-(3-ジメチルアミノプロピル)-3-エチル
カルボジイミド塩酸塩(0.34g,1.77mmol)を加えたのち、室温で14時間
撹拌した。反応液にアセトニトリル(18mL)を滴下することで析出した固体をろ過し
た。固体をアセトニトリル-THF混合溶媒で洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、粗体
(1.28g)を得た。粗体をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカゲル,展開溶
媒:クロロホルム-THF)で精製することにより、表題の化合物(1.06g,79%
)を白色固体として得た。
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (0.
87 g, 0.89 mmol), 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine (
4-dimethylaminopyridine (0.02 g, 0.18 mmol) and 1-(3-dimethylaminopropyl)-3-ethylcarbodiimide hydrochloride (0.34 g , 1.77 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 14 hours. Acetonitrile (18 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with an acetonitrile-THF mixed solvent and then dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a crude product (1.28 g). The title compound (1.06 g, 79%
) as a white solid.

〔実施例2-7〕
(縮合剤としてCDIを用いる場合)

Figure 0007296636000051
[Example 2-7]
(When using CDI as a condensing agent)
Figure 0007296636000051

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(9.
86g,10.0mmol)、4-ジメチルアミノピリジン(0.12g,1.0mmo
l)のジクロロメタン(210mL)懸濁液に1,1’-カルボニルジイミダゾール(2
.43g,15.0mmol)を加え、室温で1時間撹拌したのち、30~35℃で4時
間撹拌した。次に、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン(10.89
g,20.0mmol)を加え、室温で17時間撹拌した。さらに、反応液に5’-O-
(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン(1.09g,0.4mmol)を加えたの
ち、室温で4.5時間撹拌した。反応液にジクロロメタン(10mL)を加えたのち、ア
セトニトリル(400mL)を滴下することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニ
トリル-ジクロロメタン混合溶媒で洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、粗体(14.4
4g)を得た。粗体をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカゲル,展開溶媒:ジク
ロロメタン-メタノール)で精製することにより、表題の化合物(11.11g,74%
)を白色固体として得た。
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (9.
86 g, 10.0 mmol), 4-dimethylaminopyridine (0.12 g, 1.0 mmol
l) 1,1′-carbonyldiimidazole (2
. 43 g, 15.0 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour and then stirred at 30 to 35° C. for 4 hours. Then 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine (10.89
g, 20.0 mmol) was added and stirred at room temperature for 17 hours. Furthermore, 5'-O-
After adding (4,4′-dimethoxytrityl)thymidine (1.09 g, 0.4 mmol), the mixture was stirred at room temperature for 4.5 hours. After adding dichloromethane (10 mL) to the reaction solution, acetonitrile (400 mL) was added dropwise, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with an acetonitrile-dichloromethane mixed solvent, it was dried under reduced pressure at 50° C. to give a crude product (14.4
4g) was obtained. The title compound (11.11 g, 74%
) as a white solid.

3.2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5
’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-
(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イ
ル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシアデ
ノシン-3’-イルの合成
3.2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5
'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-
Synthesis of (4,4′-dimethoxytrityl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3′-yl

〔実施例3-1〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイルデオキシアデノシン-
3’-イルの合成

Figure 0007296636000052
[Example 3-1]
(1) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosine-
Synthesis of 3'-yl
Figure 0007296636000052

実施例2-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(1.97g,2.00mmol)と5’-O-(4,4’-ジ
メトキシトリチル)-N-ベンゾイルデオキシアデノシン(1.58g,2.40mm
ol)から表題の化合物(3.11g,96%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.11-1.40(m,84H),1.42-1.50(m,6H),1.71-1
.84(m,7H),2.73(dd,1H,J=4.4,12.8Hz),3.04-
3.13(m,1H),3.46(d,2H,J=4.0Hz),3.77(s,6H)
,3.99-4.05(m,6H),4.34-4.37(m,1H),4.86(s,
2H),5.67(d,1H,J=5.6Hz),6.51(dd,1H,J=5.6,
8.4Hz),6.79(d,2H,J=9.4Hz),7.18-7.29(m,7H
),7.31(s,2H),7.38(d,2H,J=7.2Hz),7.53(dd,
2H,J=7.2,7.6Hz),7.59-7.63(m,1H),8.03(d,2
H,J=7.2Hz),8.17(s,1H),8.74(s,1H),8.98(s,
1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.13,22.71,26.08
,26.11,29.33,29.38,29.43,29.60,29.67,29.
74,30.36,31.94,38.00,55.23,61.16,63.52,6
9.23,73.58,84.35,84.48,86.82,108.35,113.
25,123.22,123.32,127.03,127.85,127.95,12
8.08,128.91,129.99,130.04,132.82,133.66,
135.38,135.42,141.21,143.07,144.33,149.5
3,151.56,152.75,152.97,158.63,164.48,165
.89,167.38.
TOF/MS(ESI):calcd for C10114912Na [M
+Na] 1647.1100, found 1647.1149.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (1.97 g, 2.00 mmol) and 5′-O-(4,4′- dimethoxytrityl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosine (1.58 g, 2.40 mm
ol) gave the title compound (3.11 g, 96%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.11-1.40 (m, 84H), 1.42-1.50 (m, 6H), 1.71-1
. 84 (m, 7H), 2.73 (dd, 1H, J = 4.4, 12.8Hz), 3.04-
3.13 (m, 1H), 3.46 (d, 2H, J=4.0Hz), 3.77 (s, 6H)
, 3.99-4.05 (m, 6H), 4.34-4.37 (m, 1H), 4.86 (s,
2H), 5.67 (d, 1H, J=5.6Hz), 6.51 (dd, 1H, J=5.6,
8.4Hz), 6.79 (d, 2H, J = 9.4Hz), 7.18-7.29 (m, 7H
), 7.31 (s, 2H), 7.38 (d, 2H, J = 7.2 Hz), 7.53 (dd,
2H, J = 7.2, 7.6Hz), 7.59-7.63 (m, 1H), 8.03 (d, 2
H, J = 7.2 Hz), 8.17 (s, 1H), 8.74 (s, 1H), 8.98 (s,
1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.13, 22.71, 26.08
, 26.11, 29.33, 29.38, 29.43, 29.60, 29.67, 29.
74, 30.36, 31.94, 38.00, 55.23, 61.16, 63.52, 6
9.23, 73.58, 84.35, 84.48, 86.82, 108.35, 113.
25, 123.22, 123.32, 127.03, 127.85, 127.95, 12
8.08, 128.91, 129.99, 130.04, 132.82, 133.66,
135.38, 135.42, 141.21, 143.07, 144.33, 149.5
3, 151.56, 152.75, 152.97, 158.63, 164.48, 165
. 89, 167.38.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C101H149N5O12Na [ M
+ Na] + 1647.1100, found 1647.1149.

〔実施例3-2〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
-ベンゾイルデオキシアデノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000053
[Example 3-2]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3′-yl
Figure 0007296636000053

実施例2-2の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイ
ルデオキシアデノシン-3’-イル(3.00g,1.85mmol)から表題の化合物
(2.25g,92%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.11-1.40(m,84H),1.44-1.50(m,6H),1.71-1
.85(m,7H),2.53(dd,1H,J=5.6,14.0Hz),3.21-
3.28(m,1H),3.89-3.96(m,1H),3.98-4.06(m,6
H),4.36(s,1H),4.87(s,2H),5.70(d,1H,J=5.2
Hz),5.91(brs,1H),6.32(dd,1H,J=5.6,10.0Hz
),7.32(s,2H),7.54(dd,2H,J=7.2,8.0Hz),7.6
1-7.65(m,1H),8.03(d,2H,J=7.2Hz),8.07(s,1
H),8.79(s,1H),9.07(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.12,22.70,26.07
,26.11,29.33,29.37,29.42,29.59,29.67,29.
73,30.35,31.94,37.76,61.20,63.17,69.28,7
3.60,87.18,87.61,108.39,123.17,124.66,12
7.90,128.96,133.01,133.39,142.42,143.17,
150.40,150.68,152.26,153.00,164.42,165.9
7,167.41.
TOF/MS(ESI):calcd for C8013110Na [M+
Na] 1344.9794, found 1344.9828.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosine according to the method of Example 2-2 -3′-yl (3.00 g, 1.85 mmol) gave the title compound (2.25 g, 92%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.11-1.40 (m, 84H), 1.44-1.50 (m, 6H), 1.71-1
. 85 (m, 7H), 2.53 (dd, 1H, J = 5.6, 14.0Hz), 3.21-
3.28 (m, 1H), 3.89-3.96 (m, 1H), 3.98-4.06 (m, 6
H), 4.36 (s, 1H), 4.87 (s, 2H), 5.70 (d, 1H, J = 5.2
Hz), 5.91 (brs, 1H), 6.32 (dd, 1H, J = 5.6, 10.0Hz
), 7.32 (s, 2H), 7.54 (dd, 2H, J = 7.2, 8.0 Hz), 7.6
1-7.65 (m, 1H), 8.03 (d, 2H, J=7.2Hz), 8.07 (s, 1
H), 8.79 (s, 1H), 9.07 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.12, 22.70, 26.07
, 26.11, 29.33, 29.37, 29.42, 29.59, 29.67, 29.
73, 30.35, 31.94, 37.76, 61.20, 63.17, 69.28, 7
3.60, 87.18, 87.61, 108.39, 123.17, 124.66, 12
7.90, 128.96, 133.01, 133.39, 142.42, 143.17,
150.40, 150.68, 152.26, 153.00, 164.42, 165.9
7, 167.41.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C80H131N5O10Na [ M+
Na] + 1344.9794, found 1344.9828.

〔実施例3-3〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベ
ンゾイルデオキシアデノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000054
[Example 3-3]
(3) 5′-O-((2-cyanoethoxy)(thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyl 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid Synthesis of deoxyadenosin-3′-yl
Figure 0007296636000054

実施例2-3の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸N-ベンゾイルデオキシアデノシン-3’-イル(2.00g
,1.51mmol)とDMTr-dT-CE-ホスホロアミダイト(2.25g,3.
02mmol)から表題の化合物(2.50g,97%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.12-1.40(m,84H),1.43-1.50(m,6H),1.71-1
.85(m,9H),1.94(s,1H),2.22-2.51(m,2H),2.7
0-2.78(m,3H),3.14-3.26(m,1H),3.45-3.56(m
,1H),3.69-3.85(m,2H),3.95-4.07(m,6H),4.0
7-4.32(m,3H),4.40-4.48(m,3H),4.88(s,2H),
4.99-5.11(m,1H),5.67-5.73(m,1H),6.11-6.2
2(m,1H),6.50-6.58(m,1H),7.30(s,2H),7.41-
7.53(m,3H),7.57-7.61(m,1H),8.02-8.06(m,2
H),8.38(m,1H),8.81(m,1H),9.58-9.67(m,2H)

13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.43,14.14,19.66
,19.73,19.78,22.71,26.09,26.15,29.35,29.
38,29.46,29.61,29.68,29.74,29.99,30.38,3
1.94,36.57,36.87,38.35,61.13,61.84,61.92
,62.45,62.49,62.58,62.62,67.39,69.27,73.
61,74.81,75.06,78.89,79.19,79.24,82.98,8
3.05,83.12,84.47,84.54,85.43,85.48,85.62
,85.67,85.79,85.93,108.34,111.22,111.27,
116.52,116.64,123.01,123.82,124.08,128.2
7,128.31,128.69,128.72,132.87,132.94,133
.17,133.41,136.45,141.68,141.86,143.18,1
49.93,150.00,150.47,151.84,152.05,152.67
,153.01,163.81,163.86,165.43,165.53,165.
99,167.76.
TOF/MS(ESI):calcd for C9314717PNa [M
+Na] 1702.0520, found 1702.0604.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3′-yl (2.00 g) was prepared according to the method of Example 2-3.
, 1.51 mmol) and DMTr-dT-CE-phosphoramidite (2.25 g, 3.
02 mmol) gave the title compound (2.50 g, 97%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.12-1.40 (m, 84H), 1.43-1.50 (m, 6H), 1.71-1
. 85 (m, 9H), 1.94 (s, 1H), 2.22-2.51 (m, 2H), 2.7
0-2.78 (m, 3H), 3.14-3.26 (m, 1H), 3.45-3.56 (m
, 1H), 3.69-3.85 (m, 2H), 3.95-4.07 (m, 6H), 4.0
7-4.32 (m, 3H), 4.40-4.48 (m, 3H), 4.88 (s, 2H),
4.99-5.11 (m, 1H), 5.67-5.73 (m, 1H), 6.11-6.2
2 (m, 1H), 6.50-6.58 (m, 1H), 7.30 (s, 2H), 7.41-
7.53 (m, 3H), 7.57-7.61 (m, 1H), 8.02-8.06 (m, 2
H), 8.38 (m, 1H), 8.81 (m, 1H), 9.58-9.67 (m, 2H)
.
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.43, 14.14, 19.66
, 19.73, 19.78, 22.71, 26.09, 26.15, 29.35, 29.
38, 29.46, 29.61, 29.68, 29.74, 29.99, 30.38, 3
1.94, 36.57, 36.87, 38.35, 61.13, 61.84, 61.92
, 62.45, 62.49, 62.58, 62.62, 67.39, 69.27, 73.
61, 74.81, 75.06, 78.89, 79.19, 79.24, 82.98, 8
3.05, 83.12, 84.47, 84.54, 85.43, 85.48, 85.62
, 85.67, 85.79, 85.93, 108.34, 111.22, 111.27,
116.52, 116.64, 123.01, 123.82, 124.08, 128.2
7, 128.31, 128.69, 128.72, 132.87, 132.94, 133
. 17, 133.41, 136.45, 141.68, 141.86, 143.18, 1
49.93, 150.00, 150.47, 151.84, 152.05, 152.67
, 153.01, 163.81, 163.86, 165.43, 165.53, 165.
99, 167.76.
TOF/MS ( ESI): calcd for C93H147N8O17PNa [ M
+ Na] + 1702.0520, found 1702.0604.

〔実施例3-4〕
(4)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O
-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-
イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシア
デノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000055
[Example 3-4]
(4) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5 '-O
-(4,4'-dimethoxytrityl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosine-3'-
Synthesis of yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3′-yl
Figure 0007296636000055

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイ
ルデオキシアデノシン-3’-イル(7.98g,4.75mmol)、N-イソブチ
リル-DMTr-dG-CEホスホロアミダイト(11.97g,14.25mmol)
のジクロロメタン懸濁液(90mL)に5-ベンジルチオ-1H-テトラゾール(2.7
4g,14.25mmol)を加えたのち、室温で3時間撹拌した。次に、クメンヒドロ
ペルオキシド(含量82%)(2.64g,14.25mmol)加えたのち、室温で1
時間撹拌した。反応液にアセトン(120mL)とアセトニトリル(359mL)を滴下
することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-アセトン-ジクロロメタン
混合溶媒とアセトニトリル、メタノールで洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、表題の化
合物(10.86g,94%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.12-1.40(m,90H),1.43-1.50(m,6H),1.71-1
.93(m,9H),1.95-2.16(m,2H),2.35-2.87(m,9H
),3.16-3.37(m,3H),3.76(s,6H),3.99-4.05(m
,6H),4.09-4.43(m,10H),4.86(s,2H),5.07-5.
26(m,2H),5.65-5.71(m,1H),5.91-6.22(m,2H)
,6.49-6.54(m,1H),6.78(d,4H,J=8.4Hz),7.15
-7.27(m,8H),7.30(s,2H),7.34-7.36(m,2H),7
.43-7.48(m,2H),7.54-7.59(m,1H),7.69-7.71
(m,1H),7.98-8.02(m,2H),8.30-8.41(m,1H),8
.75-8.82(m,1H),9.43-9.58(m,1H),9.88-10.2
7(m,1H),12.09-12.22(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.23,12.36,14.13
,18.84,19.00,19.05,19.65,19.73,22.70,26.
09,26.15,29.35,29.37,29.46,29.61,29.68,2
9.74,29.77,30.38,31.94,35.89,36.47,36.63
,55.26,61.13,62.47,62.63,62.68,63.42,67.
55,69.28,73.61,74.86,75.05,79.76,81.43,8
3.08,83.59,84.68,86.85,108.33,111.11,111
.17,113.15,113.26,116.48,116.75,116.88,1
21.42,121.59,123.03,124.05,127.07,127.12
,127.78,127.85,127.98,128.06,128.74,129.
14,130.05,132.88,133.37,135.23,139.48,14
1.92,142.01,143.18,144.23,147.35,148.11,
148.27,148.49,149.98,150.09,151.80,152.6
0,153.01,155.40,155.47,158.62,158.68,164
.77,165.20,165.96,167.71,167.74,179.81,1
80.21.
TOF/MS(ESI):calcd for C1311861426Na
[M+Na] 2456.3036, found 2456.2988.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3′-yl (7.98 g, 4.75 mmol), N 2 -isobutyryl-DMTr-dG- CE phosphoramidite (11.97 g, 14.25 mmol)
5-benzylthio-1H-tetrazole (2.7
4 g, 14.25 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 3 hours. Next, cumene hydroperoxide (content 82%) (2.64 g, 14.25 mmol) was added, followed by 1
Stirred for an hour. Acetone (120 mL) and acetonitrile (359 mL) were added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with a mixed solvent of acetonitrile-acetone-dichloromethane, acetonitrile and methanol, and dried under reduced pressure at 50° C. to obtain the title compound (10.86 g, 94%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.12-1.40 (m, 90H), 1.43-1.50 (m, 6H), 1.71-1
. 93 (m, 9H), 1.95-2.16 (m, 2H), 2.35-2.87 (m, 9H
), 3.16-3.37 (m, 3H), 3.76 (s, 6H), 3.99-4.05 (m
, 6H), 4.09-4.43 (m, 10H), 4.86 (s, 2H), 5.07-5.
26 (m, 2H), 5.65-5.71 (m, 1H), 5.91-6.22 (m, 2H)
, 6.49-6.54 (m, 1H), 6.78 (d, 4H, J=8.4Hz), 7.15
-7.27 (m, 8H), 7.30 (s, 2H), 7.34-7.36 (m, 2H), 7
. 43-7.48 (m, 2H), 7.54-7.59 (m, 1H), 7.69-7.71
(m, 1H), 7.98-8.02 (m, 2H), 8.30-8.41 (m, 1H), 8
. 75-8.82 (m, 1H), 9.43-9.58 (m, 1H), 9.88-10.2
7 (m, 1H), 12.09-12.22 (m, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.23, 12.36, 14.13
, 18.84, 19.00, 19.05, 19.65, 19.73, 22.70, 26.
09, 26.15, 29.35, 29.37, 29.46, 29.61, 29.68, 2
9.74, 29.77, 30.38, 31.94, 35.89, 36.47, 36.63
, 55.26, 61.13, 62.47, 62.63, 62.68, 63.42, 67.
55, 69.28, 73.61, 74.86, 75.05, 79.76, 81.43, 8
3.08, 83.59, 84.68, 86.85, 108.33, 111.11, 111
. 17, 113.15, 113.26, 116.48, 116.75, 116.88, 1
21.42, 121.59, 123.03, 124.05, 127.07, 127.12
, 127.78, 127.85, 127.98, 128.06, 128.74, 129.
14, 130.05, 132.88, 133.37, 135.23, 139.48, 14
1.92, 142.01, 143.18, 144.23, 147.35, 148.11,
148.27, 148.49, 149.98, 150.09, 151.80, 152.6
0, 153.01, 155.40, 155.47, 158.62, 158.68, 164
. 77, 165.20, 165.96, 167.71, 167.74, 179.81, 1
80.21.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C131H186N14O26P2Na
[M+Na] + 2456.3036, found 2456.2988.

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4
,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イソブチリ
ルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシシチジン
-3’-イルの合成
〔実施例3-5〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイルデオキシシチジン-3
’-イルの合成

Figure 0007296636000056
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4
,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl
[Example 3-5]
(1) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N 4 -benzoyldeoxycytidine-3
'-yl synthesis
Figure 0007296636000056

実施例2-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(1.97g,2.00mmol)と5’-O-(4,4’-ジ
メトキシトリチル)-N-ベンゾイルデオキシシチジン(1.52g,2.40mmo
l)から表題の化合物(3.10g,97%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.12-1.53(m,90H),1.71-1.85(m,6H),2.36-2
.43(m,1H),2.83-2.95(m,1H),3.49(ddd,2H,J=
3.2,10.4,18.0Hz),3.78(s,3H),3.79(s,3H),3
.95-4.07(m,6H),4.30-4.35(m,1H),4.83(dd,2
H,J=16.0,23.6Hz),5.51-5.58(m,1H),6.33(dd
,1H,J=6.0,7.6Hz),6.86(dd,4H,J=2.4,8.8Hz)
,7.20-7.38(m,11H),7.50-7.54(m,2H),7.60-7
.64(m,1H),7.88(d,2H,J=7.2Hz),8.14(d,1H,J
=7.6Hz),8.40-8.60(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.09,22.70,26.10
,26.15,29.38,29.46,29.61,29.68,29.75,30.
40,31.95,39.47,55.26,61.10,63.17,69.33,7
3.59,75.77,84.68,87.32,108.54,113.46,123
.32,127.22,128.10,128.13,129.10,130.04,1
30.10,133.20,135.13,135.30,144.07,153.01
,158.84,165.81,167.43.
TOF/MS(ESI):calcd for C10014913Na [M
+Na] 1623.0988, found 1623.1069.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (1.97 g, 2.00 mmol) and 5′-O-(4,4′- dimethoxytrityl)-N 4 -benzoyldeoxycytidine (1.52 g, 2.40 mmo
l) gave the title compound (3.10 g, 97%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.12-1.53 (m, 90H), 1.71-1.85 (m, 6H), 2.36-2
. 43 (m, 1H), 2.83-2.95 (m, 1H), 3.49 (ddd, 2H, J =
3.2, 10.4, 18.0 Hz), 3.78 (s, 3H), 3.79 (s, 3H), 3
. 95-4.07 (m, 6H), 4.30-4.35 (m, 1H), 4.83 (dd, 2
H, J = 16.0, 23.6Hz), 5.51-5.58 (m, 1H), 6.33 (dd
, 1H, J = 6.0, 7.6Hz), 6.86 (dd, 4H, J = 2.4, 8.8Hz)
, 7.20-7.38 (m, 11H), 7.50-7.54 (m, 2H), 7.60-7
. 64 (m, 1H), 7.88 (d, 2H, J=7.2Hz), 8.14 (d, 1H, J
= 7.6Hz), 8.40-8.60 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.09, 22.70, 26.10
, 26.15, 29.38, 29.46, 29.61, 29.68, 29.75, 30.
40, 31.95, 39.47, 55.26, 61.10, 63.17, 69.33, 7
3.59, 75.77, 84.68, 87.32, 108.54, 113.46, 123
. 32, 127.22, 128.10, 128.13, 129.10, 130.04, 1
30.10, 133.20, 135.13, 135.30, 144.07, 153.01
, 158.84, 165.81, 167.43.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C100H149N3O13Na [ M
+ Na] + 1623.0988, found 1623.1069.

〔実施例3-6〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000057
[Example 3-6]
(2) Synthesis of N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetate
Figure 0007296636000057

実施例2-2の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-ベンゾイ
ルデオキシシチジン-3’-イル(3.04g,1.90mmol)から表題の化合物(
2.39g,97%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.20-1.51(m,90H),1.71-1.85(m,6H),2.46-2
.53(m,1H),2.69-2.80(m,1H),3.92-4.04(m,8H
),4.27(d,1H,J=2.4Hz),4.84(dd,2H,J=16.4,2
0.4Hz),5.51-5.53(m,1H),6.26(dd,1H,J=5.6,
7.6Hz),7.29(s,2H),7.48-7.62(m,4H),7.88(d
,2H,J=7.6Hz),8.28(d,1H,J=7.2Hz),8.66-8.9
1(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.10,22.71,26.10
,26.14,29.38,29.45,29.61,29.68,29.75,30.
39,31.95,38.46,61.15,62.37,69.34,73.61,7
5.80,85.82,88.44,108.55,123.25,127.61,12
9.07,133.25,143.25,145.32,153.01,162.38,
165.89,167.79.
TOF/MS(ESI):calcd for C7913111Na [M+
Na] 1320.9681, found 1320.9723.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N 6 -benzoyldeoxycytidine according to the method of Example 2-2 -3′-yl (3.04 g, 1.90 mmol) to the title compound (
2.39 g, 97%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.20-1.51 (m, 90H), 1.71-1.85 (m, 6H), 2.46-2
. 53 (m, 1H), 2.69-2.80 (m, 1H), 3.92-4.04 (m, 8H
), 4.27 (d, 1H, J = 2.4 Hz), 4.84 (dd, 2H, J = 16.4, 2
0.4 Hz), 5.51-5.53 (m, 1H), 6.26 (dd, 1H, J = 5.6,
7.6 Hz), 7.29 (s, 2H), 7.48-7.62 (m, 4H), 7.88 (d
, 2H, J = 7.6 Hz), 8.28 (d, 1H, J = 7.2 Hz), 8.66-8.9
1 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ14.10, 22.71, 26.10
, 26.14, 29.38, 29.45, 29.61, 29.68, 29.75, 30.
39, 31.95, 38.46, 61.15, 62.37, 69.34, 73.61, 7
5.80, 85.82, 88.44, 108.55, 123.25, 127.61, 12
9.07, 133.25, 143.25, 145.32, 153.01, 162.38,
165.89, 167.79.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C79H131N3O11Na [M+
Na] + 1320.9681, found 1320.9723.

〔実施例3-7〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-
イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000058
[Example 3-7]
(3) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(N 2 -isobutyryldeoxyguanosine-3′-
Synthesis of yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl
Figure 0007296636000058

実施例2-3の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸N-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イル(2.27g,
1.75mmol)とN-イソブチリルDMTr-dG-CE-ホスホロアミダイト(
2.94g,3.50mmol)から表題の化合物(3.02g,99%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.08-1.53(m,96H),1.70-1.84(m,6H),2.36-2
.62(m,2H),2.75-3.30(m,7H),3.75-3.87(m,2H
),3.98-4.04(m,6H),4.26-4.53(m,6H),4.78-4
.89(m,2H),5.26-5.29(m,1H),5.42-5.52(m,1H
),5.92-6.11(m,1H),6.24-6.38(m,1H),7.26-7
.28(m,2H),7.38-7.67(m,4H),7.80-7.89(m,2H
),7.95-8.00(m,1H),8.14-8.24(m,1H),10.22-
10.70(m,1H),12.08-12.22(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.14,18.96,18.99
,19.05,19.81,19.87,22.71,26.08,26.15,29.
34,29.38,29.46,29.61,29.68,29.75,30.37,3
1.94,36.01,36.06,38.37,38.83,39.11,61.09
,62.01,62.59,62.64,62.77,62.82,67.20,67.
51,69.25,73.60,74.76,75.03,80.49,83.50,8
3.75,84.57,84.81,86.32,87.91,88.04,97.29
,97.50,108.30,116.55,116.68,120.72,121.0
5,123.01,127.73,127.80,128.88,128.93,132
.71,132.81,133.28,138.19,138.30,143.13,1
44.20,144.42,147.79,147.99,148.16,148.33
,152.99,155.25,155.65,162.86,163.04,165.
92,165.95,167.77,167.85,179.77,180.03.
TOF/MS(ESI):calcd for C9615218PNa [M
+Na] 1773.0891, found 1773.0914.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl (2.27 g,
1.75 mmol) and N 2 -isobutyrylDMTr-dG-CE-phosphoramidite (
2.94 g, 3.50 mmol) gave the title compound (3.02 g, 99%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.08-1.53 (m, 96H), 1.70-1.84 (m, 6H), 2.36-2
. 62 (m, 2H), 2.75-3.30 (m, 7H), 3.75-3.87 (m, 2H
), 3.98-4.04 (m, 6H), 4.26-4.53 (m, 6H), 4.78-4
. 89 (m, 2H), 5.26-5.29 (m, 1H), 5.42-5.52 (m, 1H
), 5.92-6.11 (m, 1H), 6.24-6.38 (m, 1H), 7.26-7
. 28 (m, 2H), 7.38-7.67 (m, 4H), 7.80-7.89 (m, 2H
), 7.95-8.00 (m, 1H), 8.14-8.24 (m, 1H), 10.22-
10.70 (m, 1H), 12.08-12.22 (m, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.14, 18.96, 18.99
, 19.05, 19.81, 19.87, 22.71, 26.08, 26.15, 29.
34, 29.38, 29.46, 29.61, 29.68, 29.75, 30.37, 3
1.94, 36.01, 36.06, 38.37, 38.83, 39.11, 61.09
, 62.01, 62.59, 62.64, 62.77, 62.82, 67.20, 67.
51, 69.25, 73.60, 74.76, 75.03, 80.49, 83.50, 8
3.75, 84.57, 84.81, 86.32, 87.91, 88.04, 97.29
, 97.50, 108.30, 116.55, 116.68, 120.72, 121.0
5, 123.01, 127.73, 127.80, 128.88, 128.93, 132
. 71, 132.81, 133.28, 138.19, 138.30, 143.13, 1
44.20, 144.42, 147.79, 147.99, 148.16, 148.33
, 152.99, 155.25, 155.65, 162.86, 163.04, 165.
92, 165.95, 167.77, 167.85, 179.77, 180.03.
TOF/MS (ESI): calcd for C96H152N9O18PNa [ M
+ Na] + 1773.0891, found 1773.0914.

〔実施例3-8〕
(4)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O
-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イソ
ブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシシ
チジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000059
[Example 3-8]
(4) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5 '-O
Synthesis of -(4,4'-dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3'-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidin-3'-yl
Figure 0007296636000059

実施例3-4の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(N-イソブチリルデオ
キシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシシチジン-3’
-イル(2.80g,1.60mmol)とDMTr-dT-CEホスホロアミダイト(
3.58g,4.80mmol)から表題の化合物(3.44g,89%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.13-1.55(m,99H),1.71-1.84(m,6H),1.95-2
.14(m,2H),2.27-2.95(m,9H),3.00-3.55(m,3H
),3.73-3.81(m,6H),3.99-4.04(m,6H),4.14-4
.48(m,11H),4.82-4.85(m,2H),5.05-5.53(m,3
H),6.00-6.46(m,3H),6.76-6.87(m,4H),7.20-
7.36(m,11H),7.44-7.64(m,4H),7.72-7.88(m,
3H),8.11-8.22(m,1H),9.00-9.15(m,1H),10.2
9-10.49(m,1H),12.14-12.17(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.67,11.71,14.13
,18.86,18.90,18.94,18.98,19.00,19.59,19.
67,19.81,19.88,22.70,26.08,26.15,29.35,2
9.37,29.46,29.61,29.67,29.74,29.77,30.37
,31.94,35.88,38.67,55.29,61.13,62.66,62.
73,62.87,63.33,69.25,73.59,84.20,84.28,8
5.31,87.29,108.31,111.69,111.73,113.15,1
13.35,116.64,116.79,123.01,127.31,127.71
,127.77,128.08,128.99,129.14,130.09,133.
33,134.93,134.97,135.01,135.17,143.14,14
3.96,144.04,147.84,147.93,148.16,150.40,
150.48,152.99,155.48,158.83,163.52,165.9
6,167.86,179.65,179.76.
TOF/MS(ESI):calcd for C1301861227Na
[M+Na] 2432.2923, found 2432.2937.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(N 2 -isobutyryldeoxyguanosine) according to the method of Example 3-4 -3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidine-3′
-yl (2.80 g, 1.60 mmol) and DMTr-dT-CE phosphoramidite (
3.58 g, 4.80 mmol) gave the title compound (3.44 g, 89%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.13-1.55 (m, 99H), 1.71-1.84 (m, 6H), 1.95-2
. 14 (m, 2H), 2.27-2.95 (m, 9H), 3.00-3.55 (m, 3H
), 3.73-3.81 (m, 6H), 3.99-4.04 (m, 6H), 4.14-4
. 48 (m, 11H), 4.82-4.85 (m, 2H), 5.05-5.53 (m, 3
H), 6.00-6.46 (m, 3H), 6.76-6.87 (m, 4H), 7.20-
7.36 (m, 11H), 7.44-7.64 (m, 4H), 7.72-7.88 (m,
3H), 8.11-8.22 (m, 1H), 9.00-9.15 (m, 1H), 10.2
9-10.49 (m, 1H), 12.14-12.17 (m, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.67, 11.71, 14.13
, 18.86, 18.90, 18.94, 18.98, 19.00, 19.59, 19.
67, 19.81, 19.88, 22.70, 26.08, 26.15, 29.35, 2
9.37, 29.46, 29.61, 29.67, 29.74, 29.77, 30.37
, 31.94, 35.88, 38.67, 55.29, 61.13, 62.66, 62.
73, 62.87, 63.33, 69.25, 73.59, 84.20, 84.28, 8
5.31, 87.29, 108.31, 111.69, 111.73, 113.15, 1
13.35, 116.64, 116.79, 123.01, 127.31, 127.71
, 127.77, 128.08, 128.99, 129.14, 130.09, 133.
33, 134.93, 134.97, 135.01, 135.17, 143.14, 14
3.96, 144.04, 147.84, 147.93, 148.16, 150.40,
150.48, 152.99, 155.48, 158.83, 163.52, 165.9
6, 167.86, 179.65, 179.76.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C130H186N12O27P2Na
[M+Na] + 2432.2923, found 2432.2937.

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4
,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イ
ル)ホスホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イルの合成
〔実施例3-9〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン
-3’-イルの合成

Figure 0007296636000060
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4
,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl
[Example 3-9]
(1) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosine-3′- Synthesis of yl
Figure 0007296636000060

実施例2-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(1.97g,2.00mmol)と5’-O-(4,4’-ジ
メトキシトリチル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン(1.54g,2.40m
mol)から表題の化合物(3.14g,98%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.86-0.89(m,12H),1
.03(d,3H,J=6.8Hz),1.11-1.40(m,84H),1.42-
1.50(m,6H),1.70-1.83(m,6H),1.95(sept,1H,
J=6.8Hz),2.51(dd,1H,J=5.2,12.4Hz),3.17-3
.29(m,2H),3.42(dd,1H,J=3.2,10.4Hz),3.76(
s,3H),3.77(s,3H),3.98-4.05(m,6H),4.22(s,
1H),4.83(s,2H),5.70(d,1H,J=6.0Hz),6.07(d
d,1H,J=5.2,9.2Hz),6.76-6.82(m,4H),7.16-7
.38(m,9H),7.43-7.50(m,2H),7.71(s,1H),7.7
3(s,1H),11.96(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.13,18.64,18.77
,22.71,26.05,26.11,29.32,29.37,29.42,29.
60,29.66,29.68,29.74,29.75,29.77,30.33,3
1.94,36.17,37.21,55.24,61.24,63.48,69.30
,73.64,76.16,83.94,84.44,86.49,108.33,11
3.27,113.29,122.34,123.24,127.15,128.02,
129.99,135.47,135.77,137.83,143.04,144.7
0,147.18,148.02,152.94,155.38,158.74,166
.00,167.35,178.30.
TOF/MS(ESI):calcd for C9815113Na [M+
Na] 1629.1206, found 1629.1240.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (1.97 g, 2.00 mmol) and 5′-O-(4,4′- dimethoxytrityl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosine (1.54 g, 2.40 m
mol) gave the title compound (3.14 g, 98%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ 0.86-0.89 (m, 12H), 1
. 03 (d, 3H, J = 6.8Hz), 1.11-1.40 (m, 84H), 1.42-
1.50 (m, 6H), 1.70-1.83 (m, 6H), 1.95 (sept, 1H,
J = 6.8 Hz), 2.51 (dd, 1H, J = 5.2, 12.4 Hz), 3.17-3
. 29 (m, 2H), 3.42 (dd, 1H, J = 3.2, 10.4Hz), 3.76 (
s, 3H), 3.77 (s, 3H), 3.98-4.05 (m, 6H), 4.22 (s,
1H), 4.83 (s, 2H), 5.70 (d, 1H, J = 6.0 Hz), 6.07 (d
d, 1H, J = 5.2, 9.2Hz), 6.76-6.82 (m, 4H), 7.16-7
. 38 (m, 9H), 7.43-7.50 (m, 2H), 7.71 (s, 1H), 7.7
3(s, 1H), 11.96(s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.13, 18.64, 18.77
, 22.71, 26.05, 26.11, 29.32, 29.37, 29.42, 29.
60, 29.66, 29.68, 29.74, 29.75, 29.77, 30.33, 3
1.94, 36.17, 37.21, 55.24, 61.24, 63.48, 69.30
, 73.64, 76.16, 83.94, 84.44, 86.49, 108.33, 11
3.27, 113.29, 122.34, 123.24, 127.15, 128.02,
129.99, 135.47, 135.77, 137.83, 143.04, 144.7
0, 147.18, 148.02, 152.94, 155.38, 158.74, 166
. 00, 167.35, 178.30.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C98H151N5O13Na [M+
Na] + 1629.1206, found 1629.1240.

〔実施例3-10〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000061
[Example 3-10]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl
Figure 0007296636000061

実施例2-2の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチ
リルデオキシグアノシン-3’-イル(3.05g,1.90mmol)から表題の化合
物(2.42g,98%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.20-1.50(m,96H),1.71-1.85(m,6H),2.48(d
d,1H,J=5.6,14.0Hz),2.72(sept,1H,J=6.8Hz)
,2.97-3.05(m,1H),3.49(brs,2H),3.86-4.05(
m,8H),4.26(s,1H),4.86(s,2H),5.59(d,1H,J=
6.0),6.13(dd,1H,J=5.6,9.2Hz),7.30(s,2H),
7.86(s,2H),8.82(s,1H),12.16(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.10,18.94,18.97
,22.71,26.09,26.15,29.38,29.45,29.61,29.
69,29.75,30.39,31.96,36.50,37.85,61.26,6
2.92,69.43,73.67,86.27,86.34,108.59,122.
49,123.26,138.42,143.34,147.09,147.73,15
3.04,155.01,166.02,167.52,178.69.
TOF/MS(ESI):calcd for C7713311Na [M+
Na] 1326.9899, found 1326.9879.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N 2 -isobutyryl according to the method of Example 2-2 Deoxyguanosin-3′-yl (3.05 g, 1.90 mmol) gave the title compound (2.42 g, 98%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.20-1.50 (m, 96H), 1.71-1.85 (m, 6H), 2.48 (d
d, 1H, J = 5.6, 14.0Hz), 2.72 (sept, 1H, J = 6.8Hz)
, 2.97-3.05 (m, 1H), 3.49 (brs, 2H), 3.86-4.05 (
m, 8H), 4.26 (s, 1H), 4.86 (s, 2H), 5.59 (d, 1H, J =
6.0), 6.13 (dd, 1H, J = 5.6, 9.2Hz), 7.30 (s, 2H),
7.86 (s, 2H), 8.82 (s, 1H), 12.16 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.10, 18.94, 18.97
, 22.71, 26.09, 26.15, 29.38, 29.45, 29.61, 29.
69, 29.75, 30.39, 31.96, 36.50, 37.85, 61.26, 6
2.92, 69.43, 73.67, 86.27, 86.34, 108.59, 122.
49, 123.26, 138.42, 143.34, 147.09, 147.73, 15
3.04, 155.01, 166.02, 167.52, 178.69.
TOF/MS (ESI): calcd for C77H133N5O11Na [ M+
Na] + 1326.9899, found 1326.9879.

〔実施例3-11〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イ
ソブチリルデオキシグアノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000062
[Example 3-11]
(3) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -iso Synthesis of butyryldeoxyguanosin-3′-yl
Figure 0007296636000062

実施例2-3の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル(2.25
g,1.72mmol)とDMTr-dT-CE-ホスホロアミダイト(2.57g,3
.45mmol)から表題の化合物(2.68g,94%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.05-1.52(m,96H),1.71-1.89(m,9H),2.24-2
.78(m,8H),3.38-3.49(m,1H),3.69-4.05(m,8H
),4.17-4.89(m,7H),5.20-5.29(m,1H),5.55-5
.66(m,1H),6.08-6.24(m,2H),7.30(s,2H),7.4
2-7.54(m,1H),7.68-7.73(m,1H),8.64-8.83(m
,1H),10.20-10.32(m,1H),12.11-12.22(m,1H)

13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.46,14.14,18.59
,18.93,19.06,19.42,19.66,19.71,19.73,19.
78,22.71,26.07,26.14,29.33,29.38,29.45,2
9.61,29.68,29.74,30.36,31.94,35.57,35.93
,38.42,61.12,61.24,61.71,61.89,62.56,62.
64,62.69,69.26,73.62,75.69,75.81,79.29,8
2.80,85.73,86.04,86.41,108.29,111.23,111
.32,116.46,116.51,122.39,122.98,123.03,1
36.55,136.78,139.04,143.11,143.18,147.93
,147.98,150.30,150.37,152.98,155.39,155.
59,163.53,163.62,166.00,166.12,167.69,16
7.86,179.92,180.04.
TOF/MS(ESI):calcd for C9014918PNa [M
+Na] 1684.0625, found 1684.0648.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl (2.25
g, 1.72 mmol) and DMTr-dT-CE-phosphoramidite (2.57 g, 3
. 45 mmol) gave the title compound (2.68 g, 94%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.05-1.52 (m, 96H), 1.71-1.89 (m, 9H), 2.24-2
. 78 (m, 8H), 3.38-3.49 (m, 1H), 3.69-4.05 (m, 8H
), 4.17-4.89 (m, 7H), 5.20-5.29 (m, 1H), 5.55-5
. 66 (m, 1H), 6.08-6.24 (m, 2H), 7.30 (s, 2H), 7.4
2-7.54 (m, 1H), 7.68-7.73 (m, 1H), 8.64-8.83 (m
, 1H), 10.20-10.32 (m, 1H), 12.11-12.22 (m, 1H)
.
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.46, 14.14, 18.59
, 18.93, 19.06, 19.42, 19.66, 19.71, 19.73, 19.
78, 22.71, 26.07, 26.14, 29.33, 29.38, 29.45, 2
9.61, 29.68, 29.74, 30.36, 31.94, 35.57, 35.93
, 38.42, 61.12, 61.24, 61.71, 61.89, 62.56, 62.
64, 62.69, 69.26, 73.62, 75.69, 75.81, 79.29, 8
2.80, 85.73, 86.04, 86.41, 108.29, 111.23, 111
. 32, 116.46, 116.51, 122.39, 122.98, 123.03, 1
36.55, 136.78, 139.04, 143.11, 143.18, 147.93
, 147.98, 150.30, 150.37, 152.98, 155.39, 155.
59, 163.53, 163.62, 166.00, 166.12, 167.69, 16
7.86, 179.92, 180.04.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C90H149N8O18PNa [M
+ Na] + 1684.0625, found 1684.0648.

〔実施例3-12〕
(4)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O
-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3
’-イル)ホスホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000063
[Example 3-12]
(4) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5 '-O
-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl)phosphoryl)thymidine-3
Synthesis of '-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3'-yl
Figure 0007296636000063

実施例3-4の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(チミジン-3’-イル)
ホスホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル(2.50g,1.
50mmol)とDMTr-dT-CEホスホロアミダイト(3.36g,4.51mm
ol)から表題の化合物(3.11g,89%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.4Hz)
,1.05-1.53(m,96H),1.71-1.88(m,13H),2.24-
2.87(m,10H),3.25-3.53(m,3H),3.72-3.81(m,
7H),3.95-4.05(m,6H),4.05-4.72(m,10H),4.8
1-4.91(m,2H),5.03-5.24(m,2H),5.55-5.61(m
,1H),5.95-6.43(m,3H),6.82-6.85(m,4H),7.1
8-7.37(m,12H),7.53(s,1H),7.73(s,1H),9.10
-9.31(m,2H),10.05-10.09(m,1H),12.18(s,1H
).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.68,11.72,12.33
,12.37,14.14,18.78,18.88,19.13,19.24,19.
58,19.65,19.70,19.77,22.70,26.08,26.16,2
9.34,29.38,29.46,29.62,29.68,29.74,29.77
,30.36,31.94,35.84,35.99,37.65,38.95,55.
29,61.18,62.62,62.77,62.83,63.26,67.10,6
7.45,69.27,73.63,75.55,79.91,82.62,82.87
,84.27,87.31,108.29,111.50,111.80,113.15
,113.35,116.66,116.74,116.86,122.51,122.
59,123.07,127.32,128.08,128.13,129.13,13
0.13,134.95,135.12,136.32,138.75,143.10,
143.99,147.93,147.97,148.04,150.28,150.3
7,150.60,150.69,152.98,155.49,155.54,158
.81,163.63,163.68,163.79,166.02,167.69,1
67.71,179.73,179.77.
TOF/MS(ESI):calcd for C1241831127Na
[M+Na] 2343.2658, found 2343.2742.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(thymidin-3′-yl)acid according to the method of Example 3-4
phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl (2.50 g, 1.
50 mmol) and DMTr-dT-CE phosphoramidite (3.36 g, 4.51 mm
ol) gave the title compound (3.11 g, 89%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.4 Hz)
, 1.05-1.53 (m, 96H), 1.71-1.88 (m, 13H), 2.24-
2.87 (m, 10H), 3.25-3.53 (m, 3H), 3.72-3.81 (m,
7H), 3.95-4.05 (m, 6H), 4.05-4.72 (m, 10H), 4.8
1-4.91 (m, 2H), 5.03-5.24 (m, 2H), 5.55-5.61 (m
, 1H), 5.95-6.43 (m, 3H), 6.82-6.85 (m, 4H), 7.1
8-7.37 (m, 12H), 7.53 (s, 1H), 7.73 (s, 1H), 9.10
-9.31 (m, 2H), 10.05-10.09 (m, 1H), 12.18 (s, 1H)
).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.68, 11.72, 12.33
, 12.37, 14.14, 18.78, 18.88, 19.13, 19.24, 19.
58, 19.65, 19.70, 19.77, 22.70, 26.08, 26.16, 2
9.34, 29.38, 29.46, 29.62, 29.68, 29.74, 29.77
, 30.36, 31.94, 35.84, 35.99, 37.65, 38.95, 55.
29, 61.18, 62.62, 62.77, 62.83, 63.26, 67.10, 6
7.45, 69.27, 73.63, 75.55, 79.91, 82.62, 82.87
, 84.27, 87.31, 108.29, 111.50, 111.80, 113.15
, 113.35, 116.66, 116.74, 116.86, 122.51, 122.
59, 123.07, 127.32, 128.08, 128.13, 129.13, 13
0.13, 134.95, 135.12, 136.32, 138.75, 143.10,
143.99, 147.93, 147.97, 148.04, 150.28, 150.3
7, 150.60, 150.69, 152.98, 155.49, 155.54, 158
. 81, 163.63, 163.68, 163.79, 166.02, 167.69, 1
67.71, 179.73, 179.77.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C124H183N11O27P2Na
[M+Na] + 2343.2658, found 2343.2742.

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4
,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イソブチリ
ルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成
〔実施例3-13〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-
イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000064
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4
,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl
[Example 3-13]
(1) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(N 2 -isobutyryldeoxyguanosine-3′-
Synthesis of yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl
Figure 0007296636000064

実施例2-3の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸チミジン-3’-イル(1.82g,1.50mmol)とN
-イソブチリル-DMTr-dG-CEホスホロアミダイト(2.52g,3.00mm
ol)から表題の化合物(2.43g,98%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=7.2Hz)
,1.00-1.41(m,90H),1.41-1.54(m,6H),1.71-1
.85(m,6H),1.92-2.00(m,3H),2.24-2.97(m,6H
),3.68-4.08(m,8H),4.14-4.54(m,6H),4.78-4
.92(m,2H),5.14-5.78(m,2H),5.95-6.24(m,2H
),7.27-7.43(m,3H),7.87-7.95(m,1H),10.19-
10.49(m,2H),12.24-12.38(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.35,14.14,19.01
,19.06,19.10,19.73,19.80,19.85,22.70,26.
07,26.14,29.33,29.38,29.45,29.61,29.68,2
9.74,30.02,30.36,31.77,31.94,35.80,35.92
,36.62,38.19,38.48,61.05,61.13,62.26,62.
44,62.49,62.70,62.75,66.12,67.37,69.21,7
3.58,74.51,80.47,80.64,82.33,82.40,85.33
,85.52,86.12,86.55,86.84,87.31,108.24,11
1.24,112.18,116.50,116.83,121.43,121.59,
123.05,123.08,136.55,137.73,138.66,138.9
9,143.02,143.06,147.75,147.78,148.49,150
.42,151.06,152.96,152.97,155.23,155.27,1
64.76,164.83,165.92,165.96,167.73,167.80
,180.26,180.45.
TOF/MS(ESI):calcd for C9014918PNa [M
+Na] 1684.0625, found 1684.0643.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)thymidin-3′-yl acetate (1.82 g, 1.50 mmol) and N 2
- isobutyryl-DMTr-dG-CE phosphoramidite (2.52 g, 3.00 mm
ol) gave the title compound (2.43 g, 98%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=7.2 Hz)
, 1.00-1.41 (m, 90H), 1.41-1.54 (m, 6H), 1.71-1
. 85 (m, 6H), 1.92-2.00 (m, 3H), 2.24-2.97 (m, 6H
), 3.68-4.08 (m, 8H), 4.14-4.54 (m, 6H), 4.78-4
. 92 (m, 2H), 5.14-5.78 (m, 2H), 5.95-6.24 (m, 2H
), 7.27-7.43 (m, 3H), 7.87-7.95 (m, 1H), 10.19-
10.49 (m, 2H), 12.24-12.38 (m, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.35, 14.14, 19.01
, 19.06, 19.10, 19.73, 19.80, 19.85, 22.70, 26.
07, 26.14, 29.33, 29.38, 29.45, 29.61, 29.68, 2
9.74, 30.02, 30.36, 31.77, 31.94, 35.80, 35.92
, 36.62, 38.19, 38.48, 61.05, 61.13, 62.26, 62.
44, 62.49, 62.70, 62.75, 66.12, 67.37, 69.21, 7
3.58, 74.51, 80.47, 80.64, 82.33, 82.40, 85.33
, 85.52, 86.12, 86.55, 86.84, 87.31, 108.24, 11
1.24, 112.18, 116.50, 116.83, 121.43, 121.59,
123.05, 123.08, 136.55, 137.73, 138.66, 138.9
9, 143.02, 143.06, 147.75, 147.78, 148.49, 150
. 42, 151.06, 152.96, 152.97, 155.23, 155.27, 1
64.76, 164.83, 165.92, 165.96, 167.73, 167.80
, 180.26, 180.45.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C90H149N8O18PNa [M
+ Na] + 1684.0625, found 1684.0643.

〔実施例3-14〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O
-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イソ
ブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000065
[Example 3-14]
(2) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5 '-O
Synthesis of -(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl
Figure 0007296636000065

実施例3-4の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(N-イソブチリルデオ
キシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル(2.20g,1.3
2mmol)とDMTr-dT-CE-ホスホロアミダイト(2.96g,3.97mm
ol)から表題の化合物(2.76g,90%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.13-1.47(m,96H),1.71-2.01(m,15H),2.35-
2.85(m,10H),3.31-3.51(m,2H),3.78(s,6H),3
.96-4.04(m,6H),4.05-4.59(m,10H),4.84(s,2
H),5.13-5.55(m,3H),6.11-6.42(m,3H),6.83(
d,4H,J=8.8Hz),7.16-7.37(m,12H),7.45-7.55
(m,1H),7.72-7.80(m,1H),9.23-10.39(m,3H),
12.15-12.21(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.70,12.39,12.45
,14.14,18.82,18.86,19.04,19.08,19.58,19.
65,19.74,19.80,22.70,26.08,26.15,29.34,2
9.38,29.46,29.61,29.68,29.74,29.77,30.37
,31.94,35.89,36.13,36.52,38.68,55.29,61.
12,62.74,62.89,63.22,63.32,67.12,69.23,7
3.60,74.76,79.03,79.98,82.49,84.28,85.14
,87.28,108.26,111.37,111.49,111.69,111.7
2,113.14,113.34,116.74,116.84,116.92,121
.89,121.96,123.02,127.08,127.31,127.76,1
27.85,128.08,129.13,130.11,134.94,134.99
,135.03,135.20,135.30,136.93,138.26,139.
46,143.07,143.96,144.04,147.98,148.02,14
8.14,148.23,150.46,150.57,150.62,152.97,
155.42,158.60,158.79,163.79,164.43,164.5
0,165.96,167.79,179.87,179.95.
TOF/MS(ESI):calcd for C1241831127Na
[M+Na] 2343.2658, found 2343.2693.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(N 2 -isobutyryldeoxyguanosine) according to the method of Example 3-4 -3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl (2.20 g, 1.3
2 mmol) and DMTr-dT-CE-phosphoramidite (2.96 g, 3.97 mm
ol) gave the title compound (2.76 g, 90%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.13-1.47 (m, 96H), 1.71-2.01 (m, 15H), 2.35-
2.85 (m, 10H), 3.31-3.51 (m, 2H), 3.78 (s, 6H), 3
. 96-4.04 (m, 6H), 4.05-4.59 (m, 10H), 4.84 (s, 2
H), 5.13-5.55 (m, 3H), 6.11-6.42 (m, 3H), 6.83 (
d, 4H, J=8.8Hz), 7.16-7.37 (m, 12H), 7.45-7.55
(m, 1H), 7.72-7.80 (m, 1H), 9.23-10.39 (m, 3H),
12.15-12.21 (m, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.70, 12.39, 12.45
, 14.14, 18.82, 18.86, 19.04, 19.08, 19.58, 19.
65, 19.74, 19.80, 22.70, 26.08, 26.15, 29.34, 2
9.38, 29.46, 29.61, 29.68, 29.74, 29.77, 30.37
, 31.94, 35.89, 36.13, 36.52, 38.68, 55.29, 61.
12, 62.74, 62.89, 63.22, 63.32, 67.12, 69.23, 7
3.60, 74.76, 79.03, 79.98, 82.49, 84.28, 85.14
, 87.28, 108.26, 111.37, 111.49, 111.69, 111.7
2, 113.14, 113.34, 116.74, 116.84, 116.92, 121
. 89, 121.96, 123.02, 127.08, 127.31, 127.76, 1
27.85, 128.08, 129.13, 130.11, 134.94, 134.99
, 135.03, 135.20, 135.30, 136.93, 138.26, 139.
46, 143.07, 143.96, 144.04, 147.98, 148.02, 14
8.14, 148.23, 150.46, 150.57, 150.62, 152.97,
155.42, 158.60, 158.79, 163.79, 164.43, 164.5
0, 165.96, 167.79, 179.87, 179.95.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C124H183N11O27P2Na
[M+Na] + 2343.2658, found 2343.2693.

〔実施例3-15〕
2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-チミジ
ン-3’-イル)ホスホロチオイル)-チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000066
[Example 3-15]
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
Synthesis of O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-thymidin-3′-yl)phosphorothioyl)-thymidin-3′-yl
Figure 0007296636000066

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸チミジ
ン-3’-イル(1.82g,1.50mmol)、DMTr-dT-CEホスホロアミ
ダイト(2.23g,3.00mmol)のジクロロメタン懸濁液(27mL)に5-ベ
ンジルチオ-1H-テトラゾール(0.58g,3.00mmol)を加えたのち、室温
で1.5時間撹拌した。次に、((N,N-ジメチルアミノメチリデン)アミノ)-3H
-1,2,4-ジチアゾリン-3-チオン(1.13g,4.50mmol)とピリジン
(0.87g,9.00mmol)を加えたのち、室温で1.5時間撹拌した。反応液に
アセトニトリル(109mL)を滴下することで析出した固体をろ過した。固体をアセト
ニトリル-ジクロロメタン混合溶媒とアセトニトリル、メタノールで洗浄したのち、50
℃で減圧乾燥し、表題の化合物(2.71g,96%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.11-1.53(m,93H),1.72-1.84(m,6H),1.92-1
.95(m,3H),2.28-2.49(m,3H),2.57-2.66(m,2H
),2.77(dd,1H,J=6.0,7.2Hz),3.39-3.50(m,2H
),3.79(s,6H),3.97-4.04(m,6H),4.09-4.40(m
,6H),4.83(d,2H,J=6.8Hz),5.31-5.43(m,2H),
6.27-6.32(m,1H),6.35-6.41(m,1H),6.82-6.8
6(m,4H),7.22-7.32(m,10H),7.37-7.39(m,2H)
,7.56(s,1H),8.69-8.91(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.79,12.58,14.14
,19.31,19.40,19.47,19.55,22.70,26.07,26.
13,29.32,29.38,29.44,29.60,29.68,29.73,3
0.35,31.94,36.78,39.00,55.29,61.06,62.65
,62.69,62.90,62.94,63.21,67.63,69.19,73.
56,75.01,75.09,80.18,82.27,82.36,84.40,8
4.53,84.91,85.39,87.31,108.25,111.74,111
.90,113.37,116.15,116.39,123.06,127.28,1
28.05,128.11,130.09,134.97,135.03,135.06
,135.30,143.01,144.04,150.22,150.27,150.
35,152.94,158.78,163.36,163.46,165.86,16
5.88,167.71,167.76.
TOF/MS(ESI):calcd for C10716219PSNa[
M+Na] 1907.1220,found 1907.1223.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)thymidin-3′-yl acetate (1.82 g, 1.50 mmol), DMTr-dT-CE phosphoramidite (2.23 g, 3 .00 mmol) in dichloromethane (27 mL) was added with 5-benzylthio-1H-tetrazole (0.58 g, 3.00 mmol), and the mixture was stirred at room temperature for 1.5 hours. ((N,N-dimethylaminomethylidene)amino)-3H
After adding -1,2,4-dithiazoline-3-thione (1.13 g, 4.50 mmol) and pyridine (0.87 g, 9.00 mmol), the mixture was stirred at room temperature for 1.5 hours. Acetonitrile (109 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with acetonitrile-dichloromethane mixed solvent, acetonitrile and methanol,
After drying under reduced pressure at °C, the title compound (2.71 g, 96%) was obtained.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.11-1.53 (m, 93H), 1.72-1.84 (m, 6H), 1.92-1
. 95 (m, 3H), 2.28-2.49 (m, 3H), 2.57-2.66 (m, 2H
), 2.77 (dd, 1H, J = 6.0, 7.2Hz), 3.39-3.50 (m, 2H
), 3.79 (s, 6H), 3.97-4.04 (m, 6H), 4.09-4.40 (m
, 6H), 4.83 (d, 2H, J=6.8Hz), 5.31-5.43 (m, 2H),
6.27-6.32 (m, 1H), 6.35-6.41 (m, 1H), 6.82-6.8
6 (m, 4H), 7.22-7.32 (m, 10H), 7.37-7.39 (m, 2H)
, 7.56 (s, 1H), 8.69-8.91 (m, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.79, 12.58, 14.14
, 19.31, 19.40, 19.47, 19.55, 22.70, 26.07, 26.
13, 29.32, 29.38, 29.44, 29.60, 29.68, 29.73, 3
0.35, 31.94, 36.78, 39.00, 55.29, 61.06, 62.65
, 62.69, 62.90, 62.94, 63.21, 67.63, 69.19, 73.
56, 75.01, 75.09, 80.18, 82.27, 82.36, 84.40, 8
4.53, 84.91, 85.39, 87.31, 108.25, 111.74, 111
. 90, 113.37, 116.15, 116.39, 123.06, 127.28, 1
28.05, 128.11, 130.09, 134.97, 135.03, 135.06
, 135.30, 143.01, 144.04, 150.22, 150.27, 150.
35, 152.94, 158.78, 163.36, 163.46, 165.86, 16
5.88, 167.71, 167.76.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C107H162N5O19PSNa [
M+Na] + 1907.1220, found 1907.1223.

4.2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸N
-ベンゾイル-5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメト
キシトリチル)-2’-O-メチルウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-O-メ
チルシチジン-3’-イルの合成
〔実施例4-1〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
-ベンゾイル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチルシ
チジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000067
4.2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N
4 -benzoyl-5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O-methyluridin-3′-yl)phosphoryl)-2′ Synthesis of -O-methylcytidin-3'-yl [Example 4-1]
(1) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 4 -benzoyl-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O-methylcytidine Synthesis of -3'-yl
Figure 0007296636000067

実施例2-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(1.97g,2.00mmol)とN-ベンゾイル-5’-
O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メチルシチジン(1.59g,2.
40mmol)から表題の化合物(2.96g,91%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.10-1.38(m,84H),1.42-1.50(m,6H),1.70-1
.85(m,6H),3.48(d,1H,J=11.6Hz),3.62(s,3H)
,3.69(d,1H,J=11.2Hz),3.71(s,1H),3.83(s,5
H),3.97-4.04(m,6H),4.18(d,1H,J=4.8Hz),4.
36(d,1H,J=8.4Hz),4.80-4.89(m,2H),5.29(dd
,1H,J=4.8Hz,8.4Hz),6.11(d,1H,J=1.6Hz),6.
90(dd,4H,J=2.0,8.8Hz),7.27-7.42(m,11H),7
.52(t,2H,J=7.6Hz),7.62(t,1H,J=7.6Hz),7.8
9(d,2H,J=7.6Hz),8.55(d,1H,J=6.4Hz),8.61-
8.72(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.14,22.70,26.07
,26.09,26.11,29.31,29.38,29.43,29.59,29.
66,29.68,29.73,30.34,31.94,52.31,55.24,5
9.15,60.47,60.72,61.06,69.14,70.07,73.53
,80.42,82.21,87.49,88.91,108.22,113.43,1
23.33,123.50,127.27,127.49,128.17,129.06
,130.06,130.08,133.17,135.07,135.22,142.
85,143.86,152.87,152.90,158.75,165.64,16
5.84,167.17,168.42.
TOF/MS(ESI):calcd for C10115114Na[M+
Na] 1653.1094,found 1653.1171.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (1.97 g, 2.00 mmol) and N 4 -benzoyl-5′- were prepared according to the method of Example 2-1.
O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-methylcytidine (1.59 g, 2.
40 mmol) gave the title compound (2.96 g, 91%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.10-1.38 (m, 84H), 1.42-1.50 (m, 6H), 1.70-1
. 85 (m, 6H), 3.48 (d, 1H, J=11.6Hz), 3.62 (s, 3H)
, 3.69(d, 1H, J=11.2Hz), 3.71(s, 1H), 3.83(s, 5
H), 3.97-4.04 (m, 6H), 4.18 (d, 1H, J=4.8Hz), 4.
36 (d, 1H, J = 8.4Hz), 4.80-4.89 (m, 2H), 5.29 (dd
, 1H, J=4.8 Hz, 8.4 Hz), 6.11 (d, 1 H, J=1.6 Hz), 6.
90 (dd, 4H, J=2.0, 8.8Hz), 7.27-7.42 (m, 11H), 7
. 52 (t, 2H, J=7.6Hz), 7.62 (t, 1H, J=7.6Hz), 7.8
9 (d, 2H, J = 7.6Hz), 8.55 (d, 1H, J = 6.4Hz), 8.61-
8.72 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.14, 22.70, 26.07
, 26.09, 26.11, 29.31, 29.38, 29.43, 29.59, 29.
66, 29.68, 29.73, 30.34, 31.94, 52.31, 55.24, 5
9.15, 60.47, 60.72, 61.06, 69.14, 70.07, 73.53
, 80.42, 82.21, 87.49, 88.91, 108.22, 113.43, 1
23.33, 123.50, 127.27, 127.49, 128.17, 129.06
, 130.06, 130.08, 133.17, 135.07, 135.22, 142.
85, 143.86, 152.87, 152.90, 158.75, 165.64, 16
5.84, 167.17, 168.42.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C101H151N3O14Na [ M+
Na] + 1653.1094, found 1653.1171.

〔実施例4-2〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000068
[Example 4-2]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 4 -benzoyl-2′-O-methylcytidin-3′-yl
Figure 0007296636000068

実施例2-2の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸N-ベンゾイル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル
)-2’-O-メチルシチジン-3’-イル(2.80g,1.72mmol)から表題
の化合物(2.26g,99%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.10-1.55(m,90H),1.70-1.85(m,6H),3.51(s
,3H),3.79-3.83(m,2H),3.95-4.08(m,7H),4.3
4(d,1H,J=4.8Hz),4.50(t,1H,J=4.8Hz),4.83-
4.90(m,2H),5.44(t,1H,J=4.8Hz),5.73(d,1H,
J=4.4Hz),7.29-7.30(m,2H),7.47-7.66(m,3H)
,7.90(d,2H,J=7.6Hz),8.16(d,1H,J=7.6Hz),8
.75-9.00(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.14,22.71,26.07
,26.11,29.30,29.38,29.42,29.59,29.66,29.
68,29.73,30.34,31.94,52.32,59.19,60.97,6
1.07,61.24,69.15,69.20,71.18,73.56,80.58
,83.43,92.64,108.28,123.20,123.50,127.61
,129.09,132.80,133.36,142.99,147.07,152.
87,152.93,162.63,165.85,167.66,168.43.
TOF/MS(ESI):calcd for C8013312Na[M+N
a]1350.9787,found 1350.9855.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 4 -benzoyl-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2 according to the method of Example 2-2 '-O-Methylcytidin-3'-yl (2.80 g, 1.72 mmol) gave the title compound (2.26 g, 99%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.10-1.55 (m, 90H), 1.70-1.85 (m, 6H), 3.51 (s
, 3H), 3.79-3.83 (m, 2H), 3.95-4.08 (m, 7H), 4.3
4 (d, 1H, J = 4.8Hz), 4.50 (t, 1H, J = 4.8Hz), 4.83-
4.90 (m, 2H), 5.44 (t, 1H, J=4.8Hz), 5.73 (d, 1H,
J = 4.4 Hz), 7.29-7.30 (m, 2H), 7.47-7.66 (m, 3H)
, 7.90 (d, 2H, J=7.6Hz), 8.16 (d, 1H, J=7.6Hz), 8
. 75-9.00 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.14, 22.71, 26.07
, 26.11, 29.30, 29.38, 29.42, 29.59, 29.66, 29.
68, 29.73, 30.34, 31.94, 52.32, 59.19, 60.97, 6
1.07, 61.24, 69.15, 69.20, 71.18, 73.56, 80.58
, 83.43, 92.64, 108.28, 123.20, 123.50, 127.61
, 129.09, 132.80, 133.36, 142.99, 147.07, 152.
87, 152.93, 162.63, 165.85, 167.66, 168.43.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C80H133N3O12Na [ M +N
a] + 1350.9787, found 1350.9855.

〔実施例4-3〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
-ベンゾイル-5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメ
トキシトリチル)-2’-O-メチルウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-O-
メチルシチジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000069
[Example 4-3]
(3) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 4 -benzoyl-5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4 '-dimethoxytrityl)-2'-O-methyluridin-3'-yl)phosphoryl)-2'-O-
Synthesis of methylcytidin-3'-yl
Figure 0007296636000069

実施例3-4の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸N-ベンゾイル-2’-O-メチルシチジン-3’-イル(2
.10g,1.58mmol)と5’-O-DMTr-2’-O-メチルウリジン-CE
ホスホロアミダイト(2.40g,3.16mmol)から粗体(2.80g)を得た。
粗体をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカゲル,展開溶媒:ジクロロメタン-メ
タノール)で精製することにより、表題の化合物(2.21g,70%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.10-1.53(m,90H),1.71-1.83(m,6H),2.50-2
.74(m,1H),2.79(t,1H,J=6.4Hz),3.46-3.76(m
,8H),3.77(s,3H),3.79(s,3H),3.97-4.04(m,6
H),4.11-4.58(m,7H),4.82-4.95(m,2H),5.13-
5.30(m,3H),5.86-6.08(m,2H),6.82-6.88(m,4
H),7.23-7.36(m,11H),7.51(t,2H,8.0Hz),7.6
1(t,1H,J=7.2Hz),7.82-8.05(m,4H),8.69-8.9
6(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.14,19.52,19.58
,22.70,26.07,26.13,29.33,29.38,29.45,29.
60,29.68,29.73,30.35,31.94,55.25,55.30,5
8.84,59.27,60.82,61.14,62.35,62.40,62.68
,62.73,65.55,66.16,69.19,69.90,70.16,73.
56,74.28,74.38,79.38,79.46,79.52,79.60,8
1.32,81.38,81.52,82.19,86.71,86.87,87.46
,90.07,90.64,102.58,102.62,108.24,113.34
,113.36,116.36,116.43,123.19,127.39,127.
44,127.64,128.10,128.12,128.26,128.29,12
9.04,130.21,130.27,130.30,133.28,134.64,
134.73,139.53,139.75,142.96,143.82,143.9
0,150.02,150.07,152.93,158.81,158.84,158
.86,162.70,162.73,165.77,165.81,167.22,1
67.26.
TOF/MS(ESI):calcd for C11416722PNa[M
+Na]2026.1769,found 2026.1764.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 4 -benzoyl-2′-O-methylcytidin-3′-yl (2
. 10 g, 1.58 mmol) and 5′-O-DMTr-2′-O-methyluridine-CE
A crude product (2.80 g) was obtained from the phosphoramidite (2.40 g, 3.16 mmol).
The crude product was purified by column chromatography (neutral silica gel, developing solvent: dichloromethane-methanol) to obtain the title compound (2.21 g, 70%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.10-1.53 (m, 90H), 1.71-1.83 (m, 6H), 2.50-2
. 74 (m, 1H), 2.79 (t, 1H, J=6.4Hz), 3.46-3.76 (m
, 8H), 3.77 (s, 3H), 3.79 (s, 3H), 3.97-4.04 (m, 6
H), 4.11-4.58 (m, 7H), 4.82-4.95 (m, 2H), 5.13-
5.30 (m, 3H), 5.86-6.08 (m, 2H), 6.82-6.88 (m, 4
H), 7.23-7.36 (m, 11H), 7.51 (t, 2H, 8.0Hz), 7.6
1 (t, 1H, J=7.2Hz), 7.82-8.05 (m, 4H), 8.69-8.9
6(m, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.14, 19.52, 19.58
, 22.70, 26.07, 26.13, 29.33, 29.38, 29.45, 29.
60, 29.68, 29.73, 30.35, 31.94, 55.25, 55.30, 5
8.84, 59.27, 60.82, 61.14, 62.35, 62.40, 62.68
, 62.73, 65.55, 66.16, 69.19, 69.90, 70.16, 73.
56, 74.28, 74.38, 79.38, 79.46, 79.52, 79.60, 8
1.32, 81.38, 81.52, 82.19, 86.71, 86.87, 87.46
, 90.07, 90.64, 102.58, 102.62, 108.24, 113.34
, 113.36, 116.36, 116.43, 123.19, 127.39, 127.
44, 127.64, 128.10, 128.12, 128.26, 128.29, 12
9.04, 130.21, 130.27, 130.30, 133.28, 134.64,
134.73, 139.53, 139.75, 142.96, 143.82, 143.9
0, 150.02, 150.07, 152.93, 158.81, 158.84, 158
. 86, 162.70, 162.73, 165.77, 165.81, 167.22, 1
67.26.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C114H167N6O22PNa [ M
+ Na] + 2026.1769, found 2026.1764.

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-
フルオロデオキシウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-フルオロ-N-イソブ
チリルデオキシグアノシン-3’-イルの合成
〔実施例4-4〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-フルオロ-N-イソブチリルデ
オキシグアノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000070
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-
Synthesis of fluorodeoxyuridin-3′-yl)phosphoryl)-2′-fluoro-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl
[Example 4-4]
(1) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-fluoro-N 2 -isobutyryldeoxy Synthesis of guanosin-3'-yl
Figure 0007296636000070

実施例2-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(1.97g,2.00mmol)と5’-O-(4,4’-ジ
メトキシトリチル)-2’-フルオロ-N-イソブチリルデオキシグアノシン(1.5
8g,2.40mmol)から表題の化合物(3.13g,96%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.81(d,3H,J=6.8Hz)
,0.88(t,9H,J=6.8Hz),0.94(d,3H,J=7.2Hz),1
.10-1.53(m,90H),1.70-1.87(m,6H),1.93(sep
t,1H,J=6.8Hz),3.17(d,1H,J=11.2Hz),3.59(d
,1H,J=11.2Hz),3.77(s,6H),3.97-4.05(m,6H)
,4.32-4.34(m,1H),4.85(d,1H,J=16.0Hz),4.9
2(d,1H,J=16.0Hz),5.92-6.07(m,2H),6.18-6.
24(m,1H),6.78(dd,4H,J=5.2,8.8Hz),7.16-7.
29(m,7H),7.30(s,2H),7.36(d,2H,J=8.0Hz),7
.79(s,1H),8.01(s,1H),11.92(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.14,18.39,18.47
,18.88,18.91,22.70,25.61,26.06,26.11,29.
30,29.38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,3
0.34,31.94,36.25,36.43,55.24,55.25,60.68
,60.84,61.24,67.98,69.25,70.85,71.00,73.
61,79.97,81.44,83.15,86.36,86.47,86.67,9
0.96,108.26,113.15,113.22,122.23,123.17,
127.08,127.13,127.76,127.85,127.89,127.9
8,129.13,129.85,129.92,135.20,135.66,138
.43,138.70,139.43,143.05,144.47,147.30,1
47.34,147.47,147.90,152.93,152.96,155.04
,155.31,158.62,158.69,165.65,165.89,167.
23,167.60,178.18,178.76.
TOF/MS(ESI):calcd for C9815013F[M+H]
1623.1136,found 1623.1160.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (1.97 g, 2.00 mmol) and 5′-O-(4,4′- dimethoxytrityl)-2′-fluoro-N 2 -isobutyryldeoxyguanosine (1.5
8 g, 2.40 mmol) gave the title compound (3.13 g, 96%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.81 (d, 3H, J=6.8 Hz)
, 0.88 (t, 9H, J = 6.8Hz), 0.94 (d, 3H, J = 7.2Hz), 1
. 10-1.53 (m, 90H), 1.70-1.87 (m, 6H), 1.93 (sep
t, 1H, J = 6.8 Hz), 3.17 (d, 1H, J = 11.2 Hz), 3.59 (d
, 1H, J = 11.2 Hz), 3.77 (s, 6H), 3.97-4.05 (m, 6H)
, 4.32-4.34 (m, 1H), 4.85 (d, 1H, J = 16.0 Hz), 4.9
2 (d, 1H, J=16.0Hz), 5.92-6.07 (m, 2H), 6.18-6.
24 (m, 1H), 6.78 (dd, 4H, J=5.2, 8.8Hz), 7.16-7.
29 (m, 7H), 7.30 (s, 2H), 7.36 (d, 2H, J=8.0Hz), 7
. 79 (s, 1H), 8.01 (s, 1H), 11.92 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.14, 18.39, 18.47
, 18.88, 18.91, 22.70, 25.61, 26.06, 26.11, 29.
30, 29.38, 29.42, 29.59, 29.66, 29.68, 29.73, 3
0.34, 31.94, 36.25, 36.43, 55.24, 55.25, 60.68
, 60.84, 61.24, 67.98, 69.25, 70.85, 71.00, 73.
61, 79.97, 81.44, 83.15, 86.36, 86.47, 86.67, 9
0.96, 108.26, 113.15, 113.22, 122.23, 123.17,
127.08, 127.13, 127.76, 127.85, 127.89, 127.9
8, 129.13, 129.85, 129.92, 135.20, 135.66, 138
. 43, 138.70, 139.43, 143.05, 144.47, 147.30, 1
47.34, 147.47, 147.90, 152.93, 152.96, 155.04
, 155.31, 158.62, 158.69, 165.65, 165.89, 167.
23, 167.60, 178.18, 178.76.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C98H150N5O13F [M+ H ]
+ 1623.1136, found 1623.1160.

〔実施例4-5〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
2’-フルオロ-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000071
[Example 4-5]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 2′-fluoro-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl
Figure 0007296636000071

実施例2-2の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-フルオロ
-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル(3.00g,1.85mmol
)から表題の化合物(2.40g,98%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.10-1.55(m,96H),1.70-1.85(m,6H),2.71(s
ept,1H,J=6.8Hz),3.37-3.72(brs,2H),3.80(d
,1H,J=11.6Hz),3.99-4.05(m,7H),4.34(d,1H,
J=4.0Hz),4.94(s,2H),5.69(dt,1H,J=4.4,52.
0Hz),5.78-5.84(m,1H),5.97(dd,1H,J=4.0,16
.0Hz),7.31(s,2H),7.90(s,1H),9.22(s,1H),1
2.15(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.14,18.85,18.95
,22.70,26.06,26.11,29.30,29.38,29.43,29.
60,29.68,29.74,30.33,31.94,36.32,60.86,6
9.24,71.25,71.39,73.60,82.89,87.22,87.55
,89.60,91.55,108.27,121.56,123.15,138.45
,142.99,147.29,148.08,152.91,155.03,165.
91,167.26,179.15.
TOF/MS(ESI):calcd for C7713211FNa[M+
Na]1344.9805,found 1344.9834.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-fluoro-N according to the method of Example 2-2 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl (3.00 g, 1.85 mmol
) gave the title compound (2.40 g, 98%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.10-1.55 (m, 96H), 1.70-1.85 (m, 6H), 2.71 (s
ept, 1H, J = 6.8Hz), 3.37-3.72 (brs, 2H), 3.80 (d
, 1H, J = 11.6 Hz), 3.99-4.05 (m, 7H), 4.34 (d, 1H,
J = 4.0 Hz), 4.94 (s, 2H), 5.69 (dt, 1H, J = 4.4, 52.
0 Hz), 5.78-5.84 (m, 1H), 5.97 (dd, 1H, J = 4.0, 16
. 0 Hz), 7.31 (s, 2H), 7.90 (s, 1H), 9.22 (s, 1H), 1
2.15(s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.14, 18.85, 18.95
, 22.70, 26.06, 26.11, 29.30, 29.38, 29.43, 29.
60, 29.68, 29.74, 30.33, 31.94, 36.32, 60.86, 6
9.24, 71.25, 71.39, 73.60, 82.89, 87.22, 87.55
, 89.60, 91.55, 108.27, 121.56, 123.15, 138.45
, 142.99, 147.29, 148.08, 152.91, 155.03, 165.
91, 167.26, 179.15.
TOF/MS ( ESI): calcd for C77H132N5O11FNa [M+
Na] + 1344.9805, found 1344.9834.

〔実施例4-6〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-
2’-フルオロデオキシウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-フルオロ-N
イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000072
[Example 4-6]
(3) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl) -
2'-fluorodeoxyuridin-3'-yl)phosphoryl)-2'-fluoro-N 2 -
Synthesis of isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl
Figure 0007296636000072

実施例3-4の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸2’-フルオロ-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’
-イル(2.20g,1.66mmol)と5’-O-DMTr-2’-フルオロ-デオ
キシウリジン-CEホスホロアミダイト(2.49g,3.33mmol)から表題の化
合物(3.07g,93%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):0.88(t,9H,J=7.2Hz),
0.97-1.53(m,96H),1.71-1.83(m,6H),2.56-2.
75(m,3H),3.37-3.66(m,2H),3.74-3.79(m,6H)
,3.97-4.55(m,12H),4.78-5.08(m,2H),5.08-5
.50(m,3H),5.70-6.01(m,4H),6.80-6.84(m,4H
),7.17-7.40(m,11H),7.57-7.73(m,2H),8.94-
9.07(m,1H),10.00(s,1H),12.18-12.26(m,1H)

δ13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.14,18.51,18.7
6,18.92,19.20,19.55,19.62,22.70,26.07,26
.14,29.33,29.38,29.45,29.60,29.68,29.74,
30.36,31.94,35.90,35.99,55.23,55.30,60.7
0,60.88,62.85,69.26,73.61,79.54,79.63,87
.17,87.21,102.93,108.31,113.31,116.34,11
6.52,122.55,122.61,122.95,122.98,127.25,
127.31,128.07,128.10,130.14,134.79,134.8
8,134.92,138.65,140.55,143.15,143.19,143
.92,144.02,147.71,147.74,148.30,148.43,1
49.68,149.98,152.98,152.99,155.30,155.48
,158.74,158.79,162.67,165.89,166.00,167.
20,179.68.
TOF/MS(ESI):calcd for C11016320PNa
[M+Na]2008.1587,found 2008.1593.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 2′-fluoro-N 2 -isobutyryldeoxyguanosine-3′ according to the method of Example 3-4
-yl (2.20 g, 1.66 mmol) and 5′-O-DMTr-2′-fluoro-deoxyuridine-CE phosphoramidite (2.49 g, 3.33 mmol) to give the title compound (3.07 g, 93 mmol). %) was obtained.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): 0.88 (t, 9 H, J=7.2 Hz),
0.97-1.53 (m, 96H), 1.71-1.83 (m, 6H), 2.56-2.
75 (m, 3H), 3.37-3.66 (m, 2H), 3.74-3.79 (m, 6H)
, 3.97-4.55 (m, 12H), 4.78-5.08 (m, 2H), 5.08-5
. 50 (m, 3H), 5.70-6.01 (m, 4H), 6.80-6.84 (m, 4H
), 7.17-7.40 (m, 11H), 7.57-7.73 (m, 2H), 8.94-
9.07 (m, 1H), 10.00 (s, 1H), 12.18-12.26 (m, 1H)
.
δ 13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.14, 18.51, 18.7
6, 18.92, 19.20, 19.55, 19.62, 22.70, 26.07, 26
. 14, 29.33, 29.38, 29.45, 29.60, 29.68, 29.74,
30.36, 31.94, 35.90, 35.99, 55.23, 55.30, 60.7
0, 60.88, 62.85, 69.26, 73.61, 79.54, 79.63, 87
. 17, 87.21, 102.93, 108.31, 113.31, 116.34, 11
6.52, 122.55, 122.61, 122.95, 122.98, 127.25,
127.31, 128.07, 128.10, 130.14, 134.79, 134.8
8, 134.92, 138.65, 140.55, 143.15, 143.19, 143
. 92, 144.02, 147.71, 147.74, 148.30, 148.43, 1
49.68, 149.98, 152.98, 152.99, 155.30, 155.48
, 158.74, 158.79, 162.67, 165.89, 166.00, 167.
20, 179.68.
TOF/MS ( ESI ) : calcd for C110H163N8O20F2PNa
[M+Na] + 2008.1587, found 2008.1593.

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-
O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-
O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イルの合成
〔実施例4-7〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-(tert-ブチルジメチル
シリル)ウリジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000073
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-
O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3'-yl)phosphoryl)-2'-
Synthesis of O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3′-yl [Example 4-7]
(1) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O-(tert-butyldimethylsilyl) Synthesis of uridin-3'-yl
Figure 0007296636000073

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(2.
46g,2.50mmol)と5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O
-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン(1.98g,3.00mmol)のジ
クロロメタン(25mL)懸濁液に、4-ジメチルアミノピリジン(0.03g,0.2
5mmol)と1-(3-ジメチルアミノプロピル)-3-エチルカルボジイミド塩酸塩
(0.58g,3.00mmol)を加えたのち、室温で5時間撹拌した。反応液にアセ
トニトリル(148mL)を滴下することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニト
リル-ジクロロメタン混合溶媒で洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、粗体(2.89g
)を得た。粗体をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカゲル,展開溶媒:ジクロロ
メタン-THF)で精製することにより、表題の化合物(2.76g,68%)を白色固
体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.08(s,3H),0.11(s,
3H),0.81-0.92(m,18H),1.04-1.53(m,90H),1.
70-1.84(m,6H),3.49(dd,2H,J=10.8,27.6Hz),
3.79(s,6H),3.79-4.04(m,6H),4.26-4.27(m,1
H),4.56(t,1H,J=5.2Hz),4.81(d,1H,J=16.0Hz
),4.96(d,1H,16.4Hz),5.30(d,1H,J=8.0Hz),5
.47(t,1H,J=4.0Hz),6.02(d,1H,J=5.6Hz),6.8
5(d,4H,J=8.4Hz),7.23-7.37(m,11H),7.85(d,
1H,J=8.4Hz),8.37(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ-5.22,-5.09,14.14
,17.87,22.71,25.51,26.07,26.11,29.30,29.
38,29.43,29.59,29.67,29.74,30.34,31.94,5
5.25,60.75,62.47,69.14,73.36,73.54,74.40
,81.20,87.58,88.03,102.56,108.25,113.40,
113.43,123.33,127.33,128.03,128.14,130.0
3,130.17,134.71,134.83,140.00,142.87,144
.10,150.14,152.89,158.78,158.83,162.59,1
65.67,167.10.
TOF/MS(ESI):calcd for C9915814SiNa[M
+Na]1650.1380,found 1650.1455.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (2.
46 g, 2.50 mmol) and 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O
To a suspension of -(tert-butyldimethylsilyl)uridine (1.98 g, 3.00 mmol) in dichloromethane (25 mL) was added 4-dimethylaminopyridine (0.03 g, 0.2
5 mmol) and 1-(3-dimethylaminopropyl)-3-ethylcarbodiimide hydrochloride (0.58 g, 3.00 mmol) were added, followed by stirring at room temperature for 5 hours. Acetonitrile (148 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with a mixed solvent of acetonitrile and dichloromethane, it was dried under reduced pressure at 50° C. to give a crude product (2.89 g
). The crude product was purified by column chromatography (neutral silica gel, developing solvent: dichloromethane-THF) to give the title compound (2.76 g, 68%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ 0.08 (s, 3H), 0.11 (s,
3H), 0.81-0.92 (m, 18H), 1.04-1.53 (m, 90H), 1.
70-1.84 (m, 6H), 3.49 (dd, 2H, J = 10.8, 27.6Hz),
3.79 (s, 6H), 3.79-4.04 (m, 6H), 4.26-4.27 (m, 1
H), 4.56 (t, 1H, J = 5.2Hz), 4.81 (d, 1H, J = 16.0Hz
), 4.96 (d, 1H, 16.4Hz), 5.30 (d, 1H, J = 8.0Hz), 5
. 47 (t, 1H, J=4.0Hz), 6.02 (d, 1H, J=5.6Hz), 6.8
5 (d, 4H, J=8.4Hz), 7.23-7.37 (m, 11H), 7.85 (d,
1H, J=8.4Hz), 8.37(s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ -5.22, -5.09, 14.14
, 17.87, 22.71, 25.51, 26.07, 26.11, 29.30, 29.
38, 29.43, 29.59, 29.67, 29.74, 30.34, 31.94, 5
5.25, 60.75, 62.47, 69.14, 73.36, 73.54, 74.40
, 81.20, 87.58, 88.03, 102.56, 108.25, 113.40,
113.43, 123.33, 127.33, 128.03, 128.14, 130.0
3, 130.17, 134.71, 134.83, 140.00, 142.87, 144
. 10, 150.14, 152.89, 158.78, 158.83, 162.59, 1
65.67, 167.10.
TOF/MS ( ESI): calcd for C99H158N2O14SiNa [M
+ Na] + 1650.1380, found 1650.1455.

〔実施例4-8〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
2’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000074
[Example 4-8]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 2′-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3′-yl
Figure 0007296636000074

実施例2-2の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-(t
ert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イル(2.60g,1.60mmol
)から表題の化合物(2.05g,97%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.04(s,3H),0.07(s,
3H),0.81-0.92(m,18H),1.11-1.53(m,90H),1.
70-1.85(m,6H),2.95-3.10(brs,1H),3.77-3.8
2(m,1H),3.93-4.04(m,7H),4.25-4.28(m,1H),
4.67(t,1H,J=5.2Hz),4.81(d,1H,16.0Hz),4.9
6(d,1H,16.0Hz),5.34(dd,1H,J=3.2,4.8Hz),5
.60(d,1H,J=5.6Hz),5.76(d,1H,J=8.0Hz),7.2
9(s,2H),7.63(d,1H,J=8.0Hz),8.71(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ-5.22,-5.19,14.14
,17.88,22.71,25.52,26.07,26.10,29.30,29.
38,29.42,29.59,29.66,29.68,29.73,30.34,3
1.94,60.84,61.84,69.20,72.78,73.24,73.57
,82.99,92.46,102.70,108.32,123.24,141.88
,142.99,150.17,152.92,162.72,165.78,167.
38.
TOF/MS(ESI):calcd for C7814012SiNa[M
+Na]1348.0073,found 1348.0115.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O-( t
ert-butyldimethylsilyl)uridin-3′-yl (2.60 g, 1.60 mmol
) gave the title compound (2.05 g, 97%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ 0.04 (s, 3H), 0.07 (s,
3H), 0.81-0.92 (m, 18H), 1.11-1.53 (m, 90H), 1.
70-1.85 (m, 6H), 2.95-3.10 (brs, 1H), 3.77-3.8
2 (m, 1H), 3.93-4.04 (m, 7H), 4.25-4.28 (m, 1H),
4.67 (t, 1H, J=5.2Hz), 4.81 (d, 1H, 16.0Hz), 4.9
6 (d, 1H, 16.0Hz), 5.34 (dd, 1H, J = 3.2, 4.8Hz), 5
. 60 (d, 1H, J = 5.6Hz), 5.76 (d, 1H, J = 8.0Hz), 7.2
9 (s, 2H), 7.63 (d, 1H, J=8.0 Hz), 8.71 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ -5.22, -5.19, 14.14
, 17.88, 22.71, 25.52, 26.07, 26.10, 29.30, 29.
38, 29.42, 29.59, 29.66, 29.68, 29.73, 30.34, 3
1.94, 60.84, 61.84, 69.20, 72.78, 73.24, 73.57
, 82.99, 92.46, 102.70, 108.32, 123.24, 141.88
, 142.99, 150.17, 152.92, 162.72, 165.78, 167.
38.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C78H140N2O12SiNa [M
+ Na] + 1348.0073, found 1348.0115.

〔実施例4-9〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-
2’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イル)ホスホリル)-
2’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000075
[Example 4-9]
(3) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl) -
2′-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3′-yl)phosphoryl)-
Synthesis of 2′-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3′-yl
Figure 0007296636000075

実施例3-4の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸2’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’
-イル(1.95g,1.47mmol)と5’-O-DMTr-2’-O-(tert
-ブチルジメチルシリル)ウリジン-CEホスホロアミダイト(2.53g,2.94m
mol)から表題の化合物(2.84g,92%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.03-0.13(m,12H),0
.86-0.90(m,27H),1.02-1.53(m,90H),1.68-1.
84(m,6H),2.45-2.69(m,1H),2.73(t,1H,J=6.0
Hz),3.48(d,1H,J=10.8Hz),3.60-3.68(m,1H),
3.76-3.84(m,6H),3.97-4.04(m,6H),4.10-4.5
8(m,8H),4.73-4.84(m,1H),4.90-5.03(m,2H),
5.20-5.25(m,2H),5.67-5.78(m,2H),5.95-6.0
3(m,1H),6.80-6.89(m,4H),7.21-7.44(m,12H)
,7.84(d,1H,J=8.0Hz),8.72-8.83(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ-5.27,-5.24,-5.07
,-4.94,-4.92,14.14,17.86,18.06,19.50,19.
57,19.65,22.70,25.50,25.55,25.60,26.07,2
6.13,29.32,29.38,29.44,29.60,29.68,29.74
,30.35,31.94,55.27,55.30,60.69,61.96,62.
37,62.42,62.58,62.63,69.19,71.39,71.60,7
2.86,73.00,73.57,74.47,79.43,79.51,81.75
,87.65,87.68,87.99,88.18,90.56,91.22,102
.54,102.64,103.05,103.13,108.28,113.39,1
16.31,116.40,123.21,127.43,128.13,128.21
,128.25,130.25,130.27,130.32,134.56,134.
65,134.70,134.73,139.84,140.05,140.15,14
2.97,143.01,143.92,143.97,149.95,150.19,
150.40,152.92,158.83,158.87,162.53,162.5
8,162.69,165.64,165.68,167.05,167.12.
TOF/MS(ESI):calcd for C11718622SiPN
a[M+Na]2123.2763,found 2123.2769.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 2′-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine-3′ according to the method of Example 3-4
-yl (1.95 g, 1.47 mmol) and 5′-O-DMTr-2′-O-(tert
-butyldimethylsilyl)uridine-CE phosphoramidite (2.53g, 2.94m)
mol) gave the title compound (2.84 g, 92%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ 0.03-0.13 (m, 12H), 0
. 86-0.90 (m, 27H), 1.02-1.53 (m, 90H), 1.68-1.
84 (m, 6H), 2.45-2.69 (m, 1H), 2.73 (t, 1H, J = 6.0
Hz), 3.48 (d, 1H, J=10.8Hz), 3.60-3.68 (m, 1H),
3.76-3.84 (m, 6H), 3.97-4.04 (m, 6H), 4.10-4.5
8 (m, 8H), 4.73-4.84 (m, 1H), 4.90-5.03 (m, 2H),
5.20-5.25 (m, 2H), 5.67-5.78 (m, 2H), 5.95-6.0
3 (m, 1H), 6.80-6.89 (m, 4H), 7.21-7.44 (m, 12H)
, 7.84 (d, 1H, J=8.0 Hz), 8.72-8.83 (m, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ -5.27, -5.24, -5.07
, -4.94, -4.92, 14.14, 17.86, 18.06, 19.50, 19.
57, 19.65, 22.70, 25.50, 25.55, 25.60, 26.07, 2
6.13, 29.32, 29.38, 29.44, 29.60, 29.68, 29.74
, 30.35, 31.94, 55.27, 55.30, 60.69, 61.96, 62.
37, 62.42, 62.58, 62.63, 69.19, 71.39, 71.60, 7
2.86, 73.00, 73.57, 74.47, 79.43, 79.51, 81.75
, 87.65, 87.68, 87.99, 88.18, 90.56, 91.22, 102
. 54, 102.64, 103.05, 103.13, 108.28, 113.39, 1
16.31, 116.40, 123.21, 127.43, 128.13, 128.21
, 128.25, 130.25, 130.27, 130.32, 134.56, 134.
65, 134.70, 134.73, 139.84, 140.05, 140.15, 14
2.97, 143.01, 143.92, 143.97, 149.95, 150.19,
150.40, 152.92, 158.83, 158.87, 162.53, 162.5
8, 162.69, 165.64, 165.68, 167.05, 167.12.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C117H186N5O22Si2PN
a[M+Na] + 2123.2763, found 2123.2769.

5.3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロピ
オン酸の合成
〔実施例5-1〕
(1)3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロ
ピオン酸tert-ブチルの合成

Figure 0007296636000076
5. Synthesis of 3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionic acid [Example 5-1]
(1) Synthesis of tert-butyl 3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionate
Figure 0007296636000076

3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸(2.78g,3.0mmol)
、4-ジメチルアミノピリジン(0.04g,0.3mmol)、3-ヒドロキシプロピ
オン酸tert-ブチル(4.39g,30.0mmol)、トリエチルアミン(0.4
6g,4.5mmol)のジクロロメタン(60mL)懸濁液に1-(3-ジメチルアミ
ノプロピル)-3-エチルカルボジイミド塩酸塩(0.86g,4.5mmol)を加え
たのち、室温で20時間撹拌した。反応液にアセトニトリル(180mL)を滴下するこ
とで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-ジクロロメタン混合溶媒で洗浄し
たのち、50℃で減圧乾燥し、粗体(3.07g)を得た。粗体をカラムクロマトグラフ
ィー(球状中性シリカゲル,展開溶媒:ジクロロメタン)で精製することにより、表題の
化合物(1.90g,60%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz)
,1.15-1.55(m,99H),1.70-1.85(m,6H),2.68(t
,2H,J=6.4Hz),3.95-4.05(m,6H),4.53(t,2H,J
=6.4Hz),7.23(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.08,22.68,26.08
,28.09,29.35,29.40,29.57,29.65,29.71,30.
35,31.93,35.42,60.72,69.25,73.51,80.97,1
08.19,124.57,152.84,166.14,169.93.
TOF/MS(ESI):calcd for C68126Na[M+Na]
1077.9401,found 1077.9427.
3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoic acid (2.78 g, 3.0 mmol)
, 4-dimethylaminopyridine (0.04 g, 0.3 mmol), tert-butyl 3-hydroxypropionate (4.39 g, 30.0 mmol), triethylamine (0.4
6 g, 4.5 mmol) in dichloromethane (60 mL) was added with 1-(3-dimethylaminopropyl)-3-ethylcarbodiimide hydrochloride (0.86 g, 4.5 mmol) and stirred at room temperature for 20 hours. bottom. Acetonitrile (180 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with an acetonitrile-dichloromethane mixed solvent and then dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a crude product (3.07 g). The crude product was purified by column chromatography (neutral silica gel, developing solvent: dichloromethane) to give the title compound (1.90 g, 60%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=7.0 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 99H), 1.70-1.85 (m, 6H), 2.68 (t
, 2H, J = 6.4 Hz), 3.95-4.05 (m, 6H), 4.53 (t, 2H, J
= 6.4Hz), 7.23(s, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.08, 22.68, 26.08
, 28.09, 29.35, 29.40, 29.57, 29.65, 29.71, 30.
35, 31.93, 35.42, 60.72, 69.25, 73.51, 80.97, 1
08.19, 124.57, 152.84, 166.14, 169.93.
TOF/MS (ESI): calcd for C68H126O7Na [M+Na] +
1077.9401, found 1077.9427.

〔実施例5-2〕
(2)3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロ
ピオン酸の合成

Figure 0007296636000077
[Example 5-2]
(2) Synthesis of 3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionic acid
Figure 0007296636000077

3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロピオン
酸tert-ブチル(2.75g,2.6mmol)のジクロロメタン(52mL)溶液
にメタンスルホン酸(3.75g,39.0mmol)を添加したのち、室温で20時間
撹拌した。反応液にアセトニトリル(156mL)を滴下することで析出した固体をろ過
した。固体をアセトニトリル-ジクロロメタン混合溶媒とアセトニトリルで洗浄したのち
、50℃で減圧乾燥し、表題の化合物(2.54g,98%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz)
,1.15-1.55(m,90H),1.70-1.85(m,6H),2.85(t
,2H,J=6.6Hz),3.95-4.10(m,6H),4.57(t,2H,J
=6.4Hz),7.23(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.10,22.71,26.10
,26.13,29.38,29.45,29.61,29.68,29.75,30.
38,31.96,33.54,59.99,69.34,73.57,108.35,
124.32,142.88,152.91,166.17.
TOF/MS(ESI):calcd for C64118Na [M+Na]
1021.8775,found 1021.8817.
To a solution of tert-butyl 3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionate (2.75 g, 2.6 mmol) in dichloromethane (52 mL) was added methanesulfonic acid (3.75 g, 39. 0 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 20 hours. Acetonitrile (156 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with an acetonitrile-dichloromethane mixed solvent and acetonitrile, and dried under reduced pressure at 50° C. to give the title compound (2.54 g, 98%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=7.0 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 90H), 1.70-1.85 (m, 6H), 2.85 (t
, 2H, J = 6.6 Hz), 3.95-4.10 (m, 6H), 4.57 (t, 2H, J
= 6.4Hz), 7.23(s, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ14.10, 22.71, 26.10
, 26.13, 29.38, 29.45, 29.61, 29.68, 29.75, 30.
38, 31.96, 33.54, 59.99, 69.34, 73.57, 108.35,
124.32, 142.88, 152.91, 166.17.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C64H118O7Na [M+Na]
+ 1021.8775, found 1021.8817.

2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)酢酸の
合成
〔実施例5-3〕
(1)2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)
酢酸tert-ブチルの合成

Figure 0007296636000078
Synthesis of 2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)acetic acid [Example 5-3]
(1) 2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamide)
Synthesis of tert-butyl acetate
Figure 0007296636000078

3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸(2.78g,3.0mmol)
、4-ジメチルアミノピリジン(0.04g,0.3mmol)、サルコシンtert-
ブチル塩酸塩(2.73g,15.0mmol)、トリエチルアミン(1.52g,15
.0mmol)のジクロロメタン(60mL)懸濁液に1-(3-ジメチルアミノプロピ
ル)-3-エチルカルボジイミド塩酸塩(0.86g,4.5mmol)を加えたのち、
室温で20時間撹拌した。反応液にアセトニトリル(180mL)を滴下することで析出
した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-ジクロロメタン混合溶媒で洗浄したのち、
50℃で減圧乾燥し、粗体(3.07g)を得た。粗体をカラムクロマトグラフィー(球
状中性シリカゲル,展開溶媒:ジクロロメタン-THF)で精製することにより、表題の
化合物(2.66g,84%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz)
,1.15-1.55(m,99H),1.70-1.85(m,6H),3.04(s
,3H),3.80-4.20(m,8H),6.63(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.01,22.66,26.13
,26.15,28.16,29.35,29.42,29.48,29.65,29.
71,30.39,31.93,69.51,73.52,82.02,106.19,
130.61,139.93,153.25,168.33,172.01.
TOF/MS(ESI):calcd for C68127NONa[M+Na]
1076.9561,found 1076.9591.
3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoic acid (2.78 g, 3.0 mmol)
, 4-dimethylaminopyridine (0.04 g, 0.3 mmol), sarcosine tert-
Butyl hydrochloride (2.73 g, 15.0 mmol), triethylamine (1.52 g, 15
. 0 mmol) in dichloromethane (60 mL) was added with 1-(3-dimethylaminopropyl)-3-ethylcarbodiimide hydrochloride (0.86 g, 4.5 mmol),
Stir at room temperature for 20 hours. Acetonitrile (180 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with an acetonitrile-dichloromethane mixed solvent,
It was dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a crude product (3.07 g). The crude product was purified by column chromatography (neutral silica gel, developing solvent: dichloromethane-THF) to give the title compound (2.66 g, 84%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=7.0 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 99H), 1.70-1.85 (m, 6H), 3.04 (s
, 3H), 3.80-4.20 (m, 8H), 6.63 (s, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.01, 22.66, 26.13
, 26.15, 28.16, 29.35, 29.42, 29.48, 29.65, 29.
71, 30.39, 31.93, 69.51, 73.52, 82.02, 106.19,
130.61, 139.93, 153.25, 168.33, 172.01.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C68H127NO6Na [M+Na]
+ 1076.9561, found 1076.9591.

〔実施例5-4〕
(2)2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)
酢酸の合成

Figure 0007296636000079
[Example 5-4]
(2) 2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamide)
Synthesis of acetic acid
Figure 0007296636000079

実施例5-2の方法に従って、2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシル
オキシ)ベンズアミド)酢酸tert-ブチル(2.53g,2.4mmol)から表題
の化合物(2.38g,99%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz)
,1.15-1.55(m,90H),1.70-1.85(m,6H),3.11(s
,3H),3.85-4.35(m,8H),6.15-6.30(brs,1H),6
.66(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.05,22.67,26.12
,29.36,29.43,29.61,29.66,29.72,29.98,30.
36,31.93,39.20,50.02,69.49,73.56,106.47,
129.16,140.27,152.97,153.24,172.11,172.9
2.
TOF/MS(ESI):calcd for C64118NO[M-H]
96.8959,found 996.8947.
The title compound (2.38 g) was obtained from tert-butyl 2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)acetate (2.53 g, 2.4 mmol) according to the method of Example 5-2. , 99%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=7.0 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 90H), 1.70-1.85 (m, 6H), 3.11 (s
, 3H), 3.85-4.35 (m, 8H), 6.15-6.30 (brs, 1H), 6
. 66(s, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.05, 22.67, 26.12
, 29.36, 29.43, 29.61, 29.66, 29.72, 29.98, 30.
36, 31.93, 39.20, 50.02, 69.49, 73.56, 106.47,
129.16, 140.27, 152.97, 153.24, 172.11, 172.9
2.
TOF/MS (ESI): calcd for C 64 H 118 NO 6 [MH] 9
96.8959, found 996.8947.

3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸の合成
〔実施例5-5〕
(1)3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸
tert-ブチルの合成

Figure 0007296636000080
Synthesis of 3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionic acid [Example 5-5]
(1) Synthesis of tert-butyl 3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionate
Figure 0007296636000080

3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)安息香酸(2.78g,3.0mmol)
、4-ジメチルアミノピリジン(0.04g,0.3mmol)、β-アラニンtert
-ブチルエステル塩酸塩(2.73g,15.0mmol)、トリエチルアミン(1.5
2g,15.0mmol)のジクロロメタン(60mL)懸濁液に1-(3-ジメチルア
ミノプロピル)-3-エチルカルボジイミド塩酸塩(0.86g,4.5mmol)を加
えたのち、室温で19.5時間撹拌した。反応液にアセトニトリル(180mL)を滴下
することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-ジクロロメタン混合溶媒で
洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、粗体(3.12g)を得た。粗体をカラムクロマト
グラフィー(球状中性シリカゲル,展開溶媒:ジクロロメタン-THF)で精製すること
により、表題の化合物(2.75g,87%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz)
,1.15-1.55(m,99H),1.70-1.85(m,6H),2.55(t
,2H,J=5.8Hz),3.66(q,2H,J=6.0Hz),3.95-4.0
5(m,6H),6.72(t,1H,J=6.0Hz),6.94(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.09,22.71,26.11
,28.16,29.38,29.43,29.61,29.68,29.74,30.
36,31.95,35.18,35.58,69.45,73.53,81.19,1
05.86,129.57,141.32,153.14,167.20,172.27

TOF/MS(ESI):calcd for C68127NONa[M+Na]
1076.9561,found 1076.9579.
3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoic acid (2.78 g, 3.0 mmol)
, 4-dimethylaminopyridine (0.04 g, 0.3 mmol), β-alanine tert
- butyl ester hydrochloride (2.73 g, 15.0 mmol), triethylamine (1.5
2 g, 15.0 mmol) in dichloromethane (60 mL) was added with 1-(3-dimethylaminopropyl)-3-ethylcarbodiimide hydrochloride (0.86 g, 4.5 mmol). Stirred for an hour. Acetonitrile (180 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with an acetonitrile-dichloromethane mixed solvent and then dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a crude product (3.12 g). The crude product was purified by column chromatography (neutral silica gel, developing solvent: dichloromethane-THF) to give the title compound (2.75 g, 87%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=7.0 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 99H), 1.70-1.85 (m, 6H), 2.55 (t
, 2H, J = 5.8 Hz), 3.66 (q, 2H, J = 6.0 Hz), 3.95-4.0
5 (m, 6H), 6.72 (t, 1H, J=6.0Hz), 6.94 (s, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.09, 22.71, 26.11
, 28.16, 29.38, 29.43, 29.61, 29.68, 29.74, 30.
36, 31.95, 35.18, 35.58, 69.45, 73.53, 81.19, 1
05.86, 129.57, 141.32, 153.14, 167.20, 172.27
.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C68H127NO6Na [M+Na]
+ 1076.9561, found 1076.9579.

〔実施例5-6〕
(2)3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸
の合成

Figure 0007296636000081
[Example 5-6]
(2) Synthesis of 3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionic acid
Figure 0007296636000081

実施例5-2の方法に従って、3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベン
ズアミド)プロピオン酸tert-ブチル(2.64g,2.5mmol)から表題の化
合物(2.52g,101%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=7.0Hz)
,1.15-1.55(m,90H),1.65-1.85(m,6H),2.74(t
,2H,J=5.8Hz),3.72(t,2H,J=5.8Hz),3.90-4.0
5(m,6H),6.95(s,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.06,22.71,26.16
,26.19,29.40,29.50,29.53,29.65,29.71,29.
77,30.44,31.98,33.68,35.85,39.37,69.77,7
3.67,106.51,128.33,142.29,153.35,168.43,
175.46.
TOF/MS(ESI):calcd for C64118NO[M-H]
96.8959,found 996.8912.
The title compound (2.52 g, 101%) was prepared from tert-butyl 3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionate (2.64 g, 2.5 mmol) according to the method of Example 5-2. ) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=7.0 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 90H), 1.65-1.85 (m, 6H), 2.74 (t
, 2H, J = 5.8 Hz), 3.72 (t, 2H, J = 5.8 Hz), 3.90-4.0
5 (m, 6H), 6.95 (s, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.06, 22.71, 26.16
, 26.19, 29.40, 29.50, 29.53, 29.65, 29.71, 29.
77, 30.44, 31.98, 33.68, 35.85, 39.37, 69.77, 7
3.67, 106.51, 128.33, 142.29, 153.35, 168.43,
175.46.
TOF/MS (ESI): calcd for C 64 H 118 NO 6 [MH] 9
96.8959, found 996.8912.

3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロピオン
酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)
チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成
〔実施例5-7〕
(1)3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロ
ピオン酸チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000082
3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)
Synthesis of thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl [Example 5-7]
(1) Synthesis of thymidin-3′-yl 3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionate
Figure 0007296636000082

3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロピオン
酸(2.40g,2.40mmol)、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チ
ミジン(1.57g,2.88mmol)、1-メチルイミダゾール(0.99g,12
.00mmol)のTHF(24mL)懸濁液にCOMU(2.06g,4.80mmo
l)を加えたのち、室温で6.5時間撹拌した。さらにCOMU(0.21g,0.48
mmol)を加えたのち、室温で17.5時間撹拌した。反応液にアセトニトリル(12
0mL)を滴下することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-THF混合
溶媒で洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、粗体(2.76g)を得た。粗体を精製せず
に次の反応に使用した。
3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionic acid (2.40 g, 2.40 mmol), 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl) thymidine (1.57 g) , 2.88 mmol), 1-methylimidazole (0.99 g, 12
. 00 mmol) of COMU (2.06 g, 4.80 mmol) in THF (24 mL).
l) was added and stirred at room temperature for 6.5 hours. Furthermore, COMU (0.21 g, 0.48
mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 17.5 hours. Acetonitrile (12
0 mL) was added dropwise, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with an acetonitrile-THF mixed solvent and then dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a crude product (2.76 g). The crude product was used for the next reaction without purification.

粗体(2.60g)のジクロロメタン溶液(68mL)にピロール(0.57g,8.5
0mmol)、トリフルオロ酢酸(0.24g,2.13mmol)を加えたのち、室温
で3.5時間撹拌した。さらにトリフルオロ酢酸(0.05g,0.43mmol)を加
えたのち、室温で1.5時間撹拌した。反応液にアセトン(20mL)とアセトニトリル
(61mL)を滴下することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-アセト
ン-ジクロロメタン混合溶媒とアセトニトリルで洗浄したのち、50℃で減圧乾燥し、粗
体(2.44g)を得た。粗体をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカゲル,展開
溶媒:ジクロロメタン-THF)で精製することにより、表題の化合物(0.52g,1
8%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.15-1.55(m,90H),1.65-1.85(m,7H),1.92(s
,3H),2.30-2.40(m,1H),2.45-2.55(m,1H),2.6
0-2.70(m,1H),2.80-2.90(m,2H),3.85-3.95(m
,2H),3.95-4.05(m,6H),4.05-4.10(m,1H),4.5
5-.65(m,2H),5.40-5.55(m,1H),6.10-6.20(m,
1H),7.22(s,2H),7.41(s,1H),8.58-8.64(m,1H
).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.57,14.14,22.71
,26.07,26.11,29.33,29.38,29.43,29.59,29.
67,29.74,30.02,30.34,31.94,34.16,36.90,6
0.05,62.58,69.24,73.54,75.25,85.10,86.67
,108.06,111.42,124.14,136.56,142.69,150.
26,152.87,163.40,166.10,170.43.
TOF/MS(ESI):calcd for C7413011Na[M+N
a] 1245.9572,found 1245.9548.
Pyrrole (0.57 g, 8.5 g) was added to a dichloromethane solution (68 mL) of the crude product (2.60 g).
0 mmol) and trifluoroacetic acid (0.24 g, 2.13 mmol) were added, and the mixture was stirred at room temperature for 3.5 hours. After adding trifluoroacetic acid (0.05 g, 0.43 mmol), the mixture was stirred at room temperature for 1.5 hours. Acetone (20 mL) and acetonitrile (61 mL) were added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with a mixed solvent of acetonitrile-acetone-dichloromethane and acetonitrile, and dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a crude product (2.44 g). The title compound (0.52 g, 1
8%) was obtained as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 90H), 1.65-1.85 (m, 7H), 1.92 (s
, 3H), 2.30-2.40 (m, 1H), 2.45-2.55 (m, 1H), 2.6
0-2.70 (m, 1H), 2.80-2.90 (m, 2H), 3.85-3.95 (m
, 2H), 3.95-4.05 (m, 6H), 4.05-4.10 (m, 1H), 4.5
5-. 65 (m, 2H), 5.40-5.55 (m, 1H), 6.10-6.20 (m,
1H), 7.22 (s, 2H), 7.41 (s, 1H), 8.58-8.64 (m, 1H
).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.57, 14.14, 22.71
, 26.07, 26.11, 29.33, 29.38, 29.43, 29.59, 29.
67, 29.74, 30.02, 30.34, 31.94, 34.16, 36.90, 6
0.05, 62.58, 69.24, 73.54, 75.25, 85.10, 86.67
, 108.06, 111.42, 124.14, 136.56, 142.69, 150.
26, 152.87, 163.40, 166.10, 170.43.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C74H130N2O11Na [M+N
a] + 1245.9572, found 1245.9548.

〔実施例5-8〕
(2)3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロ
ピオン酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリ
チル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000083
[Example 5-8]
(2) 3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionate 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl) ) thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl
Figure 0007296636000083

実施例3-4の方法に従って、3-((3,4,5-トリス((オクタデシルオキシ)
ベンゾイル)オキシ)プロピオン酸チミジン-3’-イル(1.50g,1.23mmo
l)とDMTr-dT-CEホスホロアミダイト(1.83g,2.45mmol)から
表題の化合物(2.22g,96%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.10-1.38(m,84H),1.41-1.50(m,9H),1.70-1
.83(m,7H),1.91(s,3H),2.30-2.46(m,3H),2.6
2-2.68(m,2H),2.75(t,1H,J=6.0Hz),2.84(dd,
2H,J=4.8,6.4Hz),3.37-3.42(m,1H),3.50-3.5
5(m,1H),3.79(s,6H),3.98-4.02(m,6H),4.12-
4.38(m,6H),4.56(dd,2H,J=4.8,7.2Hz),5.16-
5.20(m,1H),5.28-5.35(m,1H),6.21-6.26(m,1
H),6.38-6.44(m,1H),6.84(d,4H,J=7.6Hz),7.
21-7.32(m,10H),7.34-7.37(m,2H),7.50-7.59
(m,1H),8.91-9.06(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.72,12.46,14.13
,19.59,19.66,19.75,22.70,26.08,26.15,29.
37,29.46,29.61,29.67,29.74,30.36,31.94,3
3.94,36.62,38.95,55.29,59.89,59.93,62.39
,62.45,62.54,62.59,63.23,67.62,69.27,73.
55,74.09,79.77,79.82,79.87,79.92,82.52,8
4.29,84.34,84.46,84.53,85.36,85.57,87.34
,108.14,111.70,111.82,113.36,116.17,116.
36,124.17,127.34,128.08,128.14,130.13,13
4.94,135.03,135.07,135.35,135.49,142.74,
143.97,143.99,150.23,150.27,150.38,150.4
6,152.89,158.84,163.40,163.50,166.14,170
.29,170.34.
TOF/MS(ESI):calcd for C10816420PNa[M
+Na] 1905.1605,found 1905.1636.
3-((3,4,5-tris((octadecyloxy)
benzoyl)oxy)thymidin-3′-yl propionate (1.50 g, 1.23 mmo
l) and DMTr-dT-CE phosphoramidite (1.83 g, 2.45 mmol) gave the title compound (2.22 g, 96%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.10-1.38 (m, 84H), 1.41-1.50 (m, 9H), 1.70-1
. 83 (m, 7H), 1.91 (s, 3H), 2.30-2.46 (m, 3H), 2.6
2-2.68 (m, 2H), 2.75 (t, 1H, J=6.0Hz), 2.84 (dd,
2H, J = 4.8, 6.4Hz), 3.37-3.42 (m, 1H), 3.50-3.5
5 (m, 1H), 3.79 (s, 6H), 3.98-4.02 (m, 6H), 4.12-
4.38 (m, 6H), 4.56 (dd, 2H, J = 4.8, 7.2Hz), 5.16-
5.20 (m, 1H), 5.28-5.35 (m, 1H), 6.21-6.26 (m, 1
H), 6.38-6.44 (m, 1H), 6.84 (d, 4H, J=7.6Hz), 7.
21-7.32 (m, 10H), 7.34-7.37 (m, 2H), 7.50-7.59
(m, 1H), 8.91-9.06 (m, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.72, 12.46, 14.13
, 19.59, 19.66, 19.75, 22.70, 26.08, 26.15, 29.
37, 29.46, 29.61, 29.67, 29.74, 30.36, 31.94, 3
3.94, 36.62, 38.95, 55.29, 59.89, 59.93, 62.39
, 62.45, 62.54, 62.59, 63.23, 67.62, 69.27, 73.
55, 74.09, 79.77, 79.82, 79.87, 79.92, 82.52, 8
4.29, 84.34, 84.46, 84.53, 85.36, 85.57, 87.34
, 108.14, 111.70, 111.82, 113.36, 116.17, 116.
36, 124.17, 127.34, 128.08, 128.14, 130.13, 13
4.94, 135.03, 135.07, 135.35, 135.49, 142.74,
143.97, 143.99, 150.23, 150.27, 150.38, 150.4
6, 152.89, 158.84, 163.40, 163.50, 166.14, 170
. 29, 170.34.
TOF/MS (ESI): calcd for C108H164N5O20PNa [ M
+ Na] + 1905.1605, found 1905.1636.

2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)酢酸5
’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミ
ジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成
〔実施例5-9〕
(1)2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)
酢酸5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000084
2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)acetic acid 5
Synthesis of '-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl)phosphoryl)thymidin-3'-yl [Example 5-9]
(1) 2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamide)
Synthesis of 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl acetate
Figure 0007296636000084

2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)酢酸(
2.10g,2.10mmol)、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジ
ン(1.37g,2.52mmol)、1-メチルイミダゾール(0.86g,10.5
0mmol)のTHF(32mL)懸濁液にCOMU(1.80g,4.20mmol)
を加えたのち、室温で3.5時間撹拌した。さらにCOMU(0.27g,0.63mm
ol)を加えたのち、室温で20時間撹拌した。反応液にアセトニトリル(158mL)
を滴下することで析出した固体をろ過した。固体をアセトニトリル-THF混合溶媒で洗
浄したのち、50℃で減圧乾燥し、粗体(2.96g)を得た。粗体をカラムクロマトグ
ラフィー(球状中性シリカゲル,展開溶媒:ジクロロメタン-THF)で精製することに
より、表題の化合物(2.51g,78%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.15-1.55(m,93H),1.65-1.90(m,6H),2.35-2
.60(m,2H),3.08(s,3H),3.45-3.55(m,2H),3.7
9(s,6H),3.85-4.00(m,6H),4.10-4.40(m,3H),
5.50-5.60(m,1H),6.40-6.50(m,1H),6.65(s,2
H),6.80-6.90(m,4H),7.20-7.40(m,9H),7.62(
s,1H),8.36(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.64,14.07,22.71
,26.17,29.38,29.48,29.65,29.70,29.75,30.
41,31.97,38.01,55.30,63.79,69.54,73.58,7
6.72,84.09,84.54,87.42,106.36,111.64,113
.49,127.31,128.09,128.26,129.90,130.15,1
35.30,135.38,140.18,144.29,150.20,153.29
,159.01,163.21,168.70,172.20.
TOF/MS(ESI):calcd for C9514912Na[M+N
a] 1547.1039,found 1547.1042.
2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)acetic acid (
2.10 g, 2.10 mmol), 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine (1.37 g, 2.52 mmol), 1-methylimidazole (0.86 g, 10.5
COMU (1.80 g, 4.20 mmol) in a suspension of COMU (1.80 g, 4.20 mmol) in THF (32 mL)
was added, and the mixture was stirred at room temperature for 3.5 hours. Furthermore, COMU (0.27 g, 0.63 mm
ol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 20 hours. Acetonitrile (158 mL) was added to the reaction solution.
was added dropwise to filter the precipitated solid. The solid was washed with an acetonitrile-THF mixed solvent and then dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a crude product (2.96 g). The crude product was purified by column chromatography (neutral silica gel, developing solvent: dichloromethane-THF) to give the title compound (2.51 g, 78%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 93H), 1.65-1.90 (m, 6H), 2.35-2
. 60 (m, 2H), 3.08 (s, 3H), 3.45-3.55 (m, 2H), 3.7
9 (s, 6H), 3.85-4.00 (m, 6H), 4.10-4.40 (m, 3H),
5.50-5.60 (m, 1H), 6.40-6.50 (m, 1H), 6.65 (s, 2
H), 6.80-6.90 (m, 4H), 7.20-7.40 (m, 9H), 7.62 (
s, 1H), 8.36 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.64, 14.07, 22.71
, 26.17, 29.38, 29.48, 29.65, 29.70, 29.75, 30.
41, 31.97, 38.01, 55.30, 63.79, 69.54, 73.58, 7
6.72, 84.09, 84.54, 87.42, 106.36, 111.64, 113
. 49, 127.31, 128.09, 128.26, 129.90, 130.15, 1
35.30, 135.38, 140.18, 144.29, 150.20, 153.29
, 159.01, 163.21, 168.70, 172.20.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C95H149N3O12Na [M+N
a] + 1547.1039, found 1547.1042.

〔実施例5-10〕
(2)2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)
酢酸チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000085
[Example 5-10]
(2) 2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamide)
Synthesis of thymidin-3′-yl acetate
Figure 0007296636000085

実施例2-2の方法に従って、2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシル
オキシ)ベンズアミド)酢酸5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3
’-イル(2.36g,1.55mmol)から表題の化合物(1.86g,98%)を
白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.05-1.55(m,90H),1.65-1.85(m,6H),1.92(s
,3H),2.30-2.60(m,3H),3.09(s,3H),3.85-4.0
5(m,8H),4.05-4.35(m,3H),5.45(s,1H),6.05-
6.30(brs,1H),6.64(s,2H),7.44(s,1H),8.28(
s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.50,14.08,22.71
,26.17,29.38,29.47,29.51,29.65,29.70,29.
75,30.41,31.97,37.20,39.06,62.67,69.59,7
3.60,75.74,85.09,86.62,106.33,111.45,129
.86,136.38,140.23,150.26,153.33,163.22,1
68.96,172.29.
TOF/MS(ESI):calcd for C7413110Na[M+N
a] 1244.9732,found 1244.9786.
2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)acetic acid 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine-3 according to the method of Example 2-2
'-yl (2.36 g, 1.55 mmol) gave the title compound (1.86 g, 98%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.05-1.55 (m, 90H), 1.65-1.85 (m, 6H), 1.92 (s
, 3H), 2.30-2.60 (m, 3H), 3.09 (s, 3H), 3.85-4.0
5 (m, 8H), 4.05-4.35 (m, 3H), 5.45 (s, 1H), 6.05-
6.30 (brs, 1H), 6.64 (s, 2H), 7.44 (s, 1H), 8.28 (
s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.50, 14.08, 22.71
, 26.17, 29.38, 29.47, 29.51, 29.65, 29.70, 29.
75, 30.41, 31.97, 37.20, 39.06, 62.67, 69.59, 7
3.60, 75.74, 85.09, 86.62, 106.33, 111.45, 129
. 86, 136.38, 140.23, 150.26, 153.33, 163.22, 1
68.96, 172.29.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C74H131N3O10Na [M+N
a] + 1244.9732, found 1244.9786.

〔実施例5-11〕
(3)2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)
酢酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル
)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000086
[Example 5-11]
(3) 2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamide)
Synthesis of 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl acetate
Figure 0007296636000086

実施例3-4の方法に従って、2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシル
オキシ)ベンズアミド)酢酸チミジン-3’-イル(1.71g,1.40mmol)と
DMTr-dT-CE-ホスホロアミダイト(2.09g,2.80mmol)から表題
の化合物(2.54g,96%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.6Hz)
,1.05-1.55(m,93H),1.65-1.85(m,6H),1.91(s
,3H),2.30-2.55(m,3H),2.60-2.80(m,3H),3.0
8(s,3H),3.35-3.45(m,1H),3.50-3.60(m,1H),
3.78(s,3H),3.79(s,3H),3.90-4.05(m,6H),4.
10-4.45(m,8H),5.10-5.20(m,1H),5.30-5.45(
m,1H),6.10-6.30(brs,1H),6.35-6.45(m,1H),
6.64(s,2H),6.75-6.90(m,4H),7.15-7.40(m,1
0H),7.49(d,1H,J=6.4Hz),8.50-8.75(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.76,12.41,12.46
,14.07,19.63,19.70,19.78,19.85,22.70,26.
20,29.37,29.50,29.52,29.70,29.75,29.79,3
0.43,31.96,36.86,38.50,39.03,55.30,55.34
,61.99,62.10,62.50,62.55,62.63,63.33,67.
69,69.61,69.64,73.60,74.61,79.78,81.51,8
2.43,84.41,84.52,84.57,85.65,85.88,86.36
,87.47,106.43,111.40,111.78,111.83,111.8
9,113.31,113.50,116.07,116.42,127.09,127
.38,127.86,128.11,128.27,129.21,130.20,1
35.07,135.18,135.45,135.54,136.37,139.66
,140.30,144.12,147.51,150.16,150.21,150.
26,150.38,153.30,158.81,159.03,163.33,16
8.90,172.25,172.43.
TOF/MS(ESI):calcd for C10816519PNa[M
+Na] 1904.1765,found 1904.1780.
2-(N-Methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)thymidin-3′-yl acetate (1.71 g, 1.40 mmol) and DMTr-dT- CE-phosphoramidite (2.09 g, 2.80 mmol) gave the title compound (2.54 g, 96%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.6 Hz)
, 1.05-1.55 (m, 93H), 1.65-1.85 (m, 6H), 1.91 (s
, 3H), 2.30-2.55 (m, 3H), 2.60-2.80 (m, 3H), 3.0
8 (s, 3H), 3.35-3.45 (m, 1H), 3.50-3.60 (m, 1H),
3.78 (s, 3H), 3.79 (s, 3H), 3.90-4.05 (m, 6H), 4.
10-4.45 (m, 8H), 5.10-5.20 (m, 1H), 5.30-5.45 (
m, 1H), 6.10-6.30 (brs, 1H), 6.35-6.45 (m, 1H),
6.64 (s, 2H), 6.75-6.90 (m, 4H), 7.15-7.40 (m, 1
0H), 7.49 (d, 1H, J=6.4Hz), 8.50-8.75 (m, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.76, 12.41, 12.46
, 14.07, 19.63, 19.70, 19.78, 19.85, 22.70, 26.
20, 29.37, 29.50, 29.52, 29.70, 29.75, 29.79, 3
0.43, 31.96, 36.86, 38.50, 39.03, 55.30, 55.34
, 61.99, 62.10, 62.50, 62.55, 62.63, 63.33, 67.
69, 69.61, 69.64, 73.60, 74.61, 79.78, 81.51, 8
2.43, 84.41, 84.52, 84.57, 85.65, 85.88, 86.36
, 87.47, 106.43, 111.40, 111.78, 111.83, 111.8
9, 113.31, 113.50, 116.07, 116.42, 127.09, 127
. 38, 127.86, 128.11, 128.27, 129.21, 130.20, 1
35.07, 135.18, 135.45, 135.54, 136.37, 139.66
, 140.30, 144.12, 147.51, 150.16, 150.21, 150.
26, 150.38, 153.30, 158.81, 159.03, 163.33, 16
8.90, 172.25, 172.43.
TOF/MS (ESI): calcd for C108H165N6O19PNa [ M
+ Na] + 1904.1765, found 1904.1780.

3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン
-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成
〔実施例5-12〕
(1)3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000087
3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionic acid 5′-
Synthesis of O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl [Example 5-12]
(1) Synthesis of 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl 3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionate
Figure 0007296636000087

3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸(2.
20g,2.20mmol)、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン(
1.44g,2.64mmol)、1-メチルイミダゾール(0.90g,11.00m
mol)のTHF(44mL)懸濁液にCOMU(1.88g,4.40mmol)を加
えたのち、室温で3.5時間撹拌した。さらに1-メチルイミダゾール(0.36g,4
.4mmol)、COMU(0.94g,2.20mmol)を加えたのち、室温で68
時間撹拌した。反応液にアセトニトリル(220mL)を滴下することで析出した固体を
ろ過した。固体をアセトニトリル-THF混合溶媒とメタノールで洗浄したのち、50℃
で減圧乾燥し、粗体(3.07g)を得た。粗体をカラムクロマトグラフィー(球状中性
シリカゲル,展開溶媒:ジクロロメタン-THF)で精製することにより、表題の化合物
(2.01g,60%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.15-1.55(m,93H),1.60-1.85(m,6H),2.40-2
.55(m,2H),2.65-2.75(m,2H),3.40-3.55(m,2H
),3.65-3.75(m,2H),3.78(s,6H),3.95-4.05(m
,6H),4.14(d,1H,J=1.6Hz),5.47(d,1H,J=4.8H
z),6.42(t,1H,J=6.2Hz),6.59(t,1H,J=6.0Hz)
,6.80-6.90(m,4H),6.94(s,2H),7.20-7.45(m,
9H),7.60(s,1H),8.43(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.62,14.14,22.71
,26.11,29.38,29.45,29.61,29.68,29.74,30.
33,31.94,34.05,35.35,37.92,55.24,63.65,6
9.36,73.51,75.85,83.94,84.34,87.24,105.6
7,111.65,113.15,113.32,127.26,127.76,127
.85,128.06,128.10,129.12,130.04,130.08,1
35.03,135.24,135.35,141.26,144.12,150.23
,153.10,158.78,163.39,167.36,172.25.
TOF/MS(ESI):calcd for C9514912Na[M+N
a] 1547.1039,found 1547.1014.
3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionic acid (2.
20 g, 2.20 mmol), 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine (
1.44 g, 2.64 mmol), 1-methylimidazole (0.90 g, 11.00 m
mol) in THF (44 mL) was added with COMU (1.88 g, 4.40 mmol) and stirred at room temperature for 3.5 hours. Furthermore, 1-methylimidazole (0.36 g, 4
. 4 mmol), COMU (0.94 g, 2.20 mmol) was added, and then 68 at room temperature.
Stirred for an hour. Acetonitrile (220 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. After washing the solid with acetonitrile-THF mixed solvent and methanol,
and dried under reduced pressure to obtain a crude product (3.07 g). The crude product was purified by column chromatography (neutral silica gel, developing solvent: dichloromethane-THF) to give the title compound (2.01 g, 60%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 93H), 1.60-1.85 (m, 6H), 2.40-2
. 55 (m, 2H), 2.65-2.75 (m, 2H), 3.40-3.55 (m, 2H
), 3.65-3.75 (m, 2H), 3.78 (s, 6H), 3.95-4.05 (m
, 6H), 4.14 (d, 1H, J = 1.6Hz), 5.47 (d, 1H, J = 4.8H
z), 6.42 (t, 1H, J = 6.2Hz), 6.59 (t, 1H, J = 6.0Hz)
, 6.80-6.90 (m, 4H), 6.94 (s, 2H), 7.20-7.45 (m,
9H), 7.60 (s, 1H), 8.43 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.62, 14.14, 22.71
, 26.11, 29.38, 29.45, 29.61, 29.68, 29.74, 30.
33, 31.94, 34.05, 35.35, 37.92, 55.24, 63.65, 6
9.36, 73.51, 75.85, 83.94, 84.34, 87.24, 105.6
7, 111.65, 113.15, 113.32, 127.26, 127.76, 127
. 85, 128.06, 128.10, 129.12, 130.04, 130.08, 1
35.03, 135.24, 135.35, 141.26, 144.12, 150.23
, 153.10, 158.78, 163.39, 167.36, 172.25.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C95H149N3O12Na [M+N
a] + 1547.1039, found 1547.1014.

〔実施例5-13〕
(2)3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸
チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000088
[Example 5-13]
(2) Synthesis of thymidin-3′-yl 3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionate
Figure 0007296636000088

実施例2-2の方法に従って、3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベン
ズアミド)プロピオン酸5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-
イル(1.91g,1.25mmol)から表題の化合物(1.51g,99%)を白色
固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.15-1.55(m,90H),1.65-1.85(m,6H),1.91(s
,3H),2.30-2.55(m,2H),2.55-2.75(m,3H),3.6
5-3.75(m,2H),3.85-3.95(m,2H),3.95-4.05(m
,6H),4.05-4.10(m,1H),5.35-5.40(m,1H),6.1
6(dd,1H,J=6.0,8.4Hz),6.55-6.65(m,1H),6.9
5(s,2H),7.43(s,1H),8.25-8.55(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.51,14.09,22.71
,26.13,26.16,29.38,29.47,29.62,29.69,29.
75,29.99,30.38,31.96,34.26,35.57,37.12,6
2.57,69.57,73.59,75.09,85.06,86.65,106.0
4,111.41,129.08,136.51,141.64,150.33,153
.20,163.40,167.46,172.39.
TOF/MS(ESI):calcd for C7413110Na[M+N
a] 1244.9732,found 1244.9789.
3-(3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzamido)propionate 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine-3′- according to the method of Example 2-2
yl (1.91 g, 1.25 mmol) gave the title compound (1.51 g, 99%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 90H), 1.65-1.85 (m, 6H), 1.91 (s
, 3H), 2.30-2.55 (m, 2H), 2.55-2.75 (m, 3H), 3.6
5-3.75 (m, 2H), 3.85-3.95 (m, 2H), 3.95-4.05 (m
, 6H), 4.05-4.10 (m, 1H), 5.35-5.40 (m, 1H), 6.1
6 (dd, 1H, J = 6.0, 8.4Hz), 6.55-6.65 (m, 1H), 6.9
5 (s, 2H), 7.43 (s, 1H), 8.25-8.55 (m, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.51, 14.09, 22.71
, 26.13, 26.16, 29.38, 29.47, 29.62, 29.69, 29.
75, 29.99, 30.38, 31.96, 34.26, 35.57, 37.12, 6
2.57, 69.57, 73.59, 75.09, 85.06, 86.65, 106.0
4, 111.41, 129.08, 136.51, 141.64, 150.33, 153
. 20, 163.40, 167.46, 172.39.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C74H131N3O10Na [M+N
a] + 1244.9732, found 1244.9789.

〔実施例5-14〕
(3)3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チ
ミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルの合成

Figure 0007296636000089
[Example 5-14]
(3) 3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine- Synthesis of 3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl
Figure 0007296636000089

実施例3-4の方法に従って、3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベン
ズアミド)プロピオン酸チミジン-3’-イル(1.41g,1.15mmol)とDM
Tr-dT-CE-ホスホロアミダイト(1.71g,2.30mmol)から表題の化
合物(2.07g,95%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.15-1.55(m,93H),1.65-1.85(m,7H),1.90(d
,3H,J=1.2Hz),2.25-2.55(m,3H),2.55-2.80(m
,5H),3.30-3.45(m,1H),3.50-3.60(m,1H),3.6
0-3.75(m,2H),3.78(s,3H),3.79(s,3H),3.90-
4.05(m,6H),4.05-4.40(m,6H),5.10-5.25(m,1
H),5.30-5.40(m,1H),6.15-6.25(m,1H),6.40-
6.50(m,1H),6.75-6.90(m,4H),6.99(d,2H,J=3
.6Hz),7.20-7.40(m,9H),7.50-7.60(m,1H),8.
95-9.05(m,1H),9.05-9.15(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.72,12.49,14.14
,19.59,19.67,19.75,22.71,26.11,26.14,29.
38,29.47,29.63,29.69,29.75,29.78,30.35,3
1.94,34.03,35.53,35.58,36.64,38.95,55.29
,62.36,62.41,62.52,62.57,63.24,67.60,69.
38,73.53,73.84,79.90,82.35,82.44,84.25,8
4.32,84.39,85.48,85.67,87.35,105.86,111.
64,111.74,111.88,113.14,113.35,116.25,11
6.44,127.34,127.76,127.85,128.09,129.03,
129.13,130.13,134.91,134.95,135.00,135.0
7,135.48,135.61,141.22,143.93,143.97,150
.21,150.26,150.46,150.49,153.03,158.83,1
63.48,163.53,167.47,167.51,172.19.
TOF/MS(ESI):calcd for C10816519PNa[M
+Na] 1904.1765,found 1904.1807.
3-(3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzamido)thymidin-3′-ylpropionate (1.41 g, 1.15 mmol) and DM according to the method of Example 3-4.
Tr-dT-CE-phosphoramidite (1.71 g, 2.30 mmol) gave the title compound (2.07 g, 95%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.15-1.55 (m, 93H), 1.65-1.85 (m, 7H), 1.90 (d
, 3H, J=1.2Hz), 2.25-2.55(m, 3H), 2.55-2.80(m
, 5H), 3.30-3.45 (m, 1H), 3.50-3.60 (m, 1H), 3.6
0-3.75 (m, 2H), 3.78 (s, 3H), 3.79 (s, 3H), 3.90-
4.05 (m, 6H), 4.05-4.40 (m, 6H), 5.10-5.25 (m, 1
H), 5.30-5.40 (m, 1H), 6.15-6.25 (m, 1H), 6.40-
6.50 (m, 1H), 6.75-6.90 (m, 4H), 6.99 (d, 2H, J = 3
. 6Hz), 7.20-7.40 (m, 9H), 7.50-7.60 (m, 1H), 8.
95-9.05 (m, 1H), 9.05-9.15 (m, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.72, 12.49, 14.14
, 19.59, 19.67, 19.75, 22.71, 26.11, 26.14, 29.
38, 29.47, 29.63, 29.69, 29.75, 29.78, 30.35, 3
1.94, 34.03, 35.53, 35.58, 36.64, 38.95, 55.29
, 62.36, 62.41, 62.52, 62.57, 63.24, 67.60, 69.
38, 73.53, 73.84, 79.90, 82.35, 82.44, 84.25, 8
4.32, 84.39, 85.48, 85.67, 87.35, 105.86, 111.
64, 111.74, 111.88, 113.14, 113.35, 116.25, 11
6.44, 127.34, 127.76, 127.85, 128.09, 129.03,
129.13, 130.13, 134.91, 134.95, 135.00, 135.0
7, 135.48, 135.61, 141.22, 143.93, 143.97, 150
. 21, 150.26, 150.46, 150.49, 153.03, 158.83, 1
63.48, 163.53, 167.47, 167.51, 172.19.
TOF/MS (ESI): calcd for C108H165N6O19PNa [ M
+ Na] + 1904.1765, found 1904.1807.

6.2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(
4-(((6-(N-ベンゾイルアデニン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-2
-イル)メトキシ)(ジメチルアミノ)ホスホリル)-6-(チミン-1-イル)モルホ
リン-2-イル)メチルの合成
〔実施例6-1〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
(6-(チミン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル)メチルの合成

Figure 0007296636000090
6.2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (
4-(((6-(N 6 -benzoyladenin-9-yl)-4-tritylmorpholine-2
Synthesis of -yl)methoxy)(dimethylamino)phosphoryl)-6-(thymin-1-yl)morpholin-2-yl)methyl [Example 6-1]
(1) Synthesis of (6-(thymin-1-yl)-4-tritylmorpholin-2-yl)methyl 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetate
Figure 0007296636000090

実施例2-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(1.97g,2.00mmol)と6-(ヒドロキシメチル)
-4-トリチルモルホリン-2-イル)-5-メチルピリミジン-2,4-(1H,3H
)-ジオン(1.16g,2.40mmol)から表題の化合物(2.85g,98%)
を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.11-1.53(m,91H),1.68-1.83(m,6H),1.84(s
,3H),3.13(d,1H,J=12.0Hz),3.37(d,1H,J=11.
2Hz),3.98-4.04(m,6H),4.17(d,2H,J=5.2Hz),
4.37-4.41(m,1H),4.78(s,2H),6.13(dd,1H,J=
2.0,9.6Hz),7.00(s,1H),7.15-7.26(m,3H),7.
26-7.38(m,8H),7.34-7.58(m,6H),8.34(s,1H)

13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.45,14.13,22.70
,26.07,26.11,29.32,29.38,29.42,29.59,29.
66,29.68,29.73,30.35,31.94,49.01,51.85,6
0.89,65.08,69.19,73.55,74.58,80.50,108.3
1,110.68,123.33,126.64,127.97,129.13,135
.33,142.95,149.63,152.91,163.23,165.75,1
67.64.
TOF/MS(ESI):calcd for C9214310Na[M+N
a] 1473.0671,found 1473.0629.
According to the method of Example 2-1, 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (1.97 g, 2.00 mmol) and 6-(hydroxymethyl)
-4-tritylmorpholin-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4-(1H,3H
)-dione (1.16 g, 2.40 mmol) to title compound (2.85 g, 98%)
got
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.11-1.53 (m, 91H), 1.68-1.83 (m, 6H), 1.84 (s
, 3H), 3.13 (d, 1H, J=12.0 Hz), 3.37 (d, 1H, J=11.
2Hz), 3.98-4.04 (m, 6H), 4.17 (d, 2H, J = 5.2Hz),
4.37-4.41 (m, 1H), 4.78 (s, 2H), 6.13 (dd, 1H, J=
2.0, 9.6Hz), 7.00 (s, 1H), 7.15-7.26 (m, 3H), 7.
26-7.38 (m, 8H), 7.34-7.58 (m, 6H), 8.34 (s, 1H)
.
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.45, 14.13, 22.70
, 26.07, 26.11, 29.32, 29.38, 29.42, 29.59, 29.
66, 29.68, 29.73, 30.35, 31.94, 49.01, 51.85, 6
0.89, 65.08, 69.19, 73.55, 74.58, 80.50, 108.3
1, 110.68, 123.33, 126.64, 127.97, 129.13, 135
. 33, 142.95, 149.63, 152.91, 163.23, 165.75, 1
67.64.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C92H143N3O10Na [ M +N
a] + 1473.0671, found 1473.0629.

〔実施例6-2〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
(6-(チミン-1-イル)モルホリン-2-イル)メチルトリフルオロ酢酸塩の合成

Figure 0007296636000091
[Example 6-2]
(2) Synthesis of 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (6-(thymin-1-yl)morpholin-2-yl)methyl trifluoroacetate
Figure 0007296636000091

実施例2-2の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(6-(チミン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イ
ル)メチル(2.76g,1.90mmol)から表題の化合物(2.44g,97%)
を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.10-1.39(m,84H),1.42-1.50(m,6H),1.70-1
.83(m,6H),1.87(s,3H),2.95-3.16(m,2H),3.4
2(d,1H,J=11.2Hz),3.62-3.75(m,1H),3.95-4.
05(m,6H),4.31(d,1H,J=8.4Hz),4.46(d,2H,J=
10.0Hz),4.86(s,2H),6.17(d,1H,J=9.6Hz),7.
25(s,1H),7.30(s,2H),10.15-10.75(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.48,14.13,22.71
,26.09,26.15,29.35,29.39,29.47,29.63,29.
69,29.75,29.78,30.38,31.94,43.24,44.99,6
0.87,63.56,69.21,72.38,73.57,108.30,112.
18,114.99,117.90,123.12,134.33,143.10,15
0.40,152.99,162.55,162.90,163.78,166.02,
167.45.
TOF/MS(ESI):calcd for C7312910-CFCO
OH[M-H] 1320.9528,found 1320.9517.
(6-(thymin-1-yl)-4-tritylmorpholin-2-yl)methyl 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetate according to the method of Example 2-2 (2.76 g, 1.90 mmol) to the title compound (2.44 g, 97%)
got
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.10-1.39 (m, 84H), 1.42-1.50 (m, 6H), 1.70-1
. 83 (m, 6H), 1.87 (s, 3H), 2.95-3.16 (m, 2H), 3.4
2 (d, 1H, J=11.2Hz), 3.62-3.75 (m, 1H), 3.95-4.
05 (m, 6H), 4.31 (d, 1H, J = 8.4Hz), 4.46 (d, 2H, J =
10.0 Hz), 4.86 (s, 2H), 6.17 (d, 1H, J=9.6 Hz), 7.
25 (s, 1H), 7.30 (s, 2H), 10.15-10.75 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.48, 14.13, 22.71
, 26.09, 26.15, 29.35, 29.39, 29.47, 29.63, 29.
69, 29.75, 29.78, 30.38, 31.94, 43.24, 44.99, 6
0.87, 63.56, 69.21, 72.38, 73.57, 108.30, 112.
18, 114.99, 117.90, 123.12, 134.33, 143.10, 15
0.40, 152.99, 162.55, 162.90, 163.78, 166.02,
167.45.
TOF/MS ( ESI): calcd for C73H129N3O10 - CF3CO
OH [MH] - 1320.9528, found 1320.9517.

〔実施例6-3〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
(4-(((6-(N-ベンゾイルアデニン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-
2-イル)メトキシ)(ジメチルアミノ)ホスホリル)-6-(チミン-1-イル)モル
ホリン-2-イル)メチルの合成

Figure 0007296636000092
[Example 6-3]
(3) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (4-(((6-(N 6 -benzoyladenin-9-yl)-4-tritylmorpholine-)
Synthesis of 2-yl)methoxy)(dimethylamino)phosphoryl)-6-(thymin-1-yl)morpholin-2-yl)methyl
Figure 0007296636000092

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(6-
(チミン-1-イル)モルホリン-2-イル)メチルトリフルオロ酢酸塩(2.32g,
1.76mmol)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(4.16g,32.16m
mol)の1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン(16mL)-THF溶液(18m
L)に(6-(N-ベンゾイルアデニン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-2-
イル)メチルジメチルホスホロアミドクロリダート(3.81g,5.27mmol)を
加えたのち、室温で2.5時間撹拌した。反応液にメタノール(93mL)を加えて得ら
れたスラリー液を減圧濃縮した。濃縮残渣にメタノールを加えて得られたスラリー液を室
温で30分間撹拌したのち、ろ過した。固体をメタノールで洗浄したのち、50℃で減圧
乾燥し、粗体(3.23g)を得た。粗体をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカ
ゲル,展開溶媒:ジクロロメタン-メタノール)で精製することにより、表題の化合物(
1.96g,59%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.10-1.53(m,90H),1.55-1.97(m,12H),2.46(
d,3H,J=10.4Hz),2.63(d,3H,J=9.6Hz),2.46-2
.63(m,1H),3.12-3.60(m,4H),3.75-4.07(m,10
H),4.15-4.50(m,2H),4.78-4.91(m,2H),5.41-
5.53(m,1H),6.42(d,1H,J=10.4Hz),7.12-7.20
(m,4H),7.20-7.32(m,9H),7.40-7.58(m,8H),8
.05(d,2H,J=7.6Hz),8.07-8.10(m,1H),8.68-8
.80(m,1H),9.50-9.76(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.44,12.53,14.14
,22.70,26.08,26.12,29.32,29.38,29.43,29.
60,29.68,29.73,30.35,31.94,36.47,36.51,3
6.63,36.67,44.56,44.84,47.02,48.64,48.78
,52.81,53.10,60.93,64.23,65.34,65.69,69.
19,73.56,74.90,74.97,75.34,79.53,79.61,7
9.97,80.79,108.27,110.92,111.25,122.82,1
23.26,126.65,128.00,128.22,128.29,128.57
,128.63,129.16,132.47,132.57,133.49,133.
92,134,74,134.80,140.75,140.78,142.97,14
3.00,149.31,149.68,149.82,150.12,150.89,
151.40,152.65,152.77,152.92,152.94,163.6
2,165.02,165.23,165.82,165.84,167.56,167
.63.
TOF/MS(ESI):calcd for C1111651014PNa[
M+Na] 1916.2142,found 1916.2216.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (6-
(thymin-1-yl)morpholin-2-yl)methyltrifluoroacetate (2.32 g,
1.76 mmol), N,N-diisopropylethylamine (4.16 g, 32.16 m
mol) of 1,3-dimethyl-2-imidazolidinone (16 mL)-THF solution (18 mL
L) to (6-(N 6 -benzoyladenin-9-yl)-4-tritylmorpholine-2-
yl)methyldimethylphosphoroamide chloride (3.81 g, 5.27 mmol) was added and stirred at room temperature for 2.5 hours. The slurry obtained by adding methanol (93 mL) to the reaction solution was concentrated under reduced pressure. A slurry obtained by adding methanol to the concentrated residue was stirred at room temperature for 30 minutes and then filtered. After washing the solid with methanol, it was dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a crude product (3.23 g). The title compound (
1.96 g, 59%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.10-1.53 (m, 90H), 1.55-1.97 (m, 12H), 2.46 (
d, 3H, J = 10.4 Hz), 2.63 (d, 3H, J = 9.6 Hz), 2.46-2
. 63 (m, 1H), 3.12-3.60 (m, 4H), 3.75-4.07 (m, 10
H), 4.15-4.50 (m, 2H), 4.78-4.91 (m, 2H), 5.41-
5.53 (m, 1H), 6.42 (d, 1H, J=10.4Hz), 7.12-7.20
(m, 4H), 7.20-7.32 (m, 9H), 7.40-7.58 (m, 8H), 8
. 05 (d, 2H, J=7.6Hz), 8.07-8.10 (m, 1H), 8.68-8
. 80 (m, 1H), 9.50-9.76 (m, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.44, 12.53, 14.14
, 22.70, 26.08, 26.12, 29.32, 29.38, 29.43, 29.
60, 29.68, 29.73, 30.35, 31.94, 36.47, 36.51, 3
6.63, 36.67, 44.56, 44.84, 47.02, 48.64, 48.78
, 52.81, 53.10, 60.93, 64.23, 65.34, 65.69, 69.
19, 73.56, 74.90, 74.97, 75.34, 79.53, 79.61, 7
9.97, 80.79, 108.27, 110.92, 111.25, 122.82, 1
23.26, 126.65, 128.00, 128.22, 128.29, 128.57
, 128.63, 129.16, 132.47, 132.57, 133.49, 133.
92, 134, 74, 134.80, 140.75, 140.78, 142.97, 14
3.00, 149.31, 149.68, 149.82, 150.12, 150.89,
151.40, 152.65, 152.77, 152.92, 152.94, 163.6
2, 165.02, 165.23, 165.82, 165.84, 167.56, 167
. 63.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C111H165N10O14PNa [
M+Na] + 1916.2142, found 1916.2216.

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸(4-
(((6-(N-ベンゾイルシトシン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イ
ル)メトキシ)(ジメチルアミノ)ホスホリル)-6-(N-イソブチリルグアニン-
9-イル)モルホリン-2-イル)メチルの合成
〔実施例6-4〕
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
(6-(N-イソブチリルグアニン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル
)メチルの合成

Figure 0007296636000093
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (4-
(((6-(N 4 -benzoylcytosin-1-yl)-4-tritylmorpholin-2-yl)methoxy)(dimethylamino)phosphoryl)-6-(N 2 -isobutyrylguanine-
Synthesis of 9-yl)morpholin-2-yl)methyl [Example 6-4]
(1) (6-(N 2 -isobutyrylguanin-9-yl)-4-tritylmorpholin-2-yl)methyl 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetate Synthesis of
Figure 0007296636000093

実施例2-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(1.97g,2.00mmol)とN-(9-(6-(ヒドロ
キシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル))-6-オキソ-6,9-ジヒドロ
-1H-プリン-2-イル)イソブチルアミド(1.51g,2.60mmol)から表
題の化合物(3.00g,97%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.10-1.60(m,97H),1.70-1.90(m,7H),2.64(s
ept,1H),3.18(d,1H,J=12.0Hz),3.45(d,1H,J=
11.6Hz),3.95-4.15(m,6H),4.13-4.25(m,2H),
4.37-4.46(m,1H),4.72(d,1H,J=16.0Hz),4.84
(d,1H,J=16.0Hz),5.89(dd,1H,J=2.2,9.8Hz),
7.06-7.37(m,12H),7.39-7.55(m,5H),7.61(s,
1H),8.18(s,1H),11.92(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.14,18.93,19.03
,22.71,26.07,26.12,29.33,29.37,29.42,29.
60,29.67,29.74,30.35,31.94,36.64,49.04,5
2.24,60.90,65.03,69.25,73.58,74.22,80.36
,108.38,121.30,123.27,126.69,127.96,129.
18,136.12,143.08,147.32,147.42,152.95,15
5.36,165.98,167.61,177.85.
TOF/MS(ESI):calcd for C9614810Na[M+N
a] 1568.1155,found 1568.1176.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (1.97 g, 2.00 mmol) and N-(9-(6-(hydroxymethyl )-4-Tritylmorpholin-2-yl))-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-yl)isobutyramide (1.51 g, 2.60 mmol) to the title compound (3.00 g) , 97%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.10-1.60 (m, 97H), 1.70-1.90 (m, 7H), 2.64 (s
ept, 1H), 3.18 (d, 1H, J = 12.0 Hz), 3.45 (d, 1H, J =
11.6 Hz), 3.95-4.15 (m, 6H), 4.13-4.25 (m, 2H),
4.37-4.46 (m, 1H), 4.72 (d, 1H, J=16.0Hz), 4.84
(d, 1H, J = 16.0Hz), 5.89 (dd, 1H, J = 2.2, 9.8Hz),
7.06-7.37 (m, 12H), 7.39-7.55 (m, 5H), 7.61 (s,
1H), 8.18 (s, 1H), 11.92 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.14, 18.93, 19.03
, 22.71, 26.07, 26.12, 29.33, 29.37, 29.42, 29.
60, 29.67, 29.74, 30.35, 31.94, 36.64, 49.04, 5
2.24, 60.90, 65.03, 69.25, 73.58, 74.22, 80.36
, 108.38, 121.30, 123.27, 126.69, 127.96, 129.
18, 136.12, 143.08, 147.32, 147.42, 152.95, 15
5.36, 165.98, 167.61, 177.85.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C96H148N6O10Na [M+N
a] + 1568.1155, found 1568.1176.

〔実施例6-5〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
(6-(N-イソブチリルグアニン-9-イル)モルホリン-2-イル)メチルトリフ
ルオロ酢酸塩の合成

Figure 0007296636000094
[Example 6-5]
(2) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (6-(N 2 -isobutyrylguanin-9-yl)morpholin-2-yl)methyltrifluoroacetate Synthesis of
Figure 0007296636000094

実施例2-2の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(6-(N-イソブチリルグアニン-9-イル)-4-トリチ
ルモルホリン-2-イル)メチル(2.78g,1.80mmol)から表題の化合物(
2.45g,96%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.87(t,9H,J=6.8Hz)
,1.00-1.53(m,96H),1.69-1.88(m,6H),2.72-2
.88(m,1H),3.19-3.38(m,1H),3.44-3.63(m,1H
),3.75-4.13(m,8H),4.25-4.63(m,3H),4.69-4
.94(m,2H),6.06-6.31(m,1H),7.20-7.30(m,3H
),7.87-8.06(m,1H),10.19-10.63(brs,1H),12
.19-12.63(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.12,18.92,22.70
,26.09,26.16,29.35,29.38,29.47,29.63,29.
68,29.75,29.79,30.04,30.38,31.94,36.17,4
2.86,60.73,63.62,69.21,71.44,73.57,108.2
9,115.13,118.04,123.10,143.09,148.28,152
.95,156.00,165.93,167.50,180.39.
TOF/MS(ESI):calcd for C7713410-CFCO
OH[M-H] 1416.0012,found 1415.9960.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (6-(N 2 -isobutyrylguanin-9-yl)-4-tritylmorpholine according to the method of Example 2-2 -2-yl)methyl (2.78 g, 1.80 mmol) to the title compound (
2.45 g, 96%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.87 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.00-1.53 (m, 96H), 1.69-1.88 (m, 6H), 2.72-2
. 88 (m, 1H), 3.19-3.38 (m, 1H), 3.44-3.63 (m, 1H
), 3.75-4.13 (m, 8H), 4.25-4.63 (m, 3H), 4.69-4
. 94 (m, 2H), 6.06-6.31 (m, 1H), 7.20-7.30 (m, 3H
), 7.87-8.06 (m, 1H), 10.19-10.63 (brs, 1H), 12
. 19-12.63 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.12, 18.92, 22.70
, 26.09, 26.16, 29.35, 29.38, 29.47, 29.63, 29.
68, 29.75, 29.79, 30.04, 30.38, 31.94, 36.17, 4
2.86, 60.73, 63.62, 69.21, 71.44, 73.57, 108.2
9, 115.13, 118.04, 123.10, 143.09, 148.28, 152
. 95, 156.00, 165.93, 167.50, 180.39.
TOF/MS ( ESI): calcd for C77H134N6O10 - CF3CO
OH [M-H] - 1416.0012, found 1415.9960.

〔実施例6-6〕
(3)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
(4-(((6-(N-ベンゾイルシトシン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-
2-イル)メトキシ)(ジメチルアミノ)ホスホリル)-6-(N-イソブチリルグア
ニン-9-イル)モルホリン-2-イル)メチルの合成

Figure 0007296636000095
[Example 6-6]
(3) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (4-(((6-(N 4 -benzoylcytosin-1-yl)-4-tritylmorpholine-)
Synthesis of 2-yl)methoxy)(dimethylamino)phosphoryl)-6-(N 2 -isobutyrylguanin-9-yl)morpholin-2-yl)methyl
Figure 0007296636000095

実施例6-3の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(6-(N-イソブチリルグアニン-9-イル)モルホリン-
2-イル)メチルトリフルオロ酢酸塩(2.27g,1.60mmol)と(6-(N
-ベンゾイルシトシン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル)メチルジメチ
ルホスホロアミドクロリダート(3.35g,4.80mmol)から表題の化合物(2
.87g,91%)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.88(t,9H,J=6.8Hz)
,1.00-1.56(m,96H),1.69-1.88(m,9H),2.38-2
.97(m,8H),3.06-3.69(m,5H),3.75-4.56(m,12
H),4.69-4.94(m,2H),5.34-5.63(m,1H),6.28-
6.50(m,1H),7.13-8.00(m,23H),8.69-8.94(br
s,1H),9.31-9.63(brs,1H),10.06-10.31(brs,
1H),12.13-12.31(m,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ14.13,19.01,19.04
,19.17,19.22,22.70,26.07,26.12,29.32,29.
37,29.43,29.60,29.67,29.73,29.98,30.35,3
1.94,36.17,36.27,36.64,36.68,36.74,36.78
,45.00,45.08,46.96,47.43,48.25,48.76,52.
48,60.82,60.90,64.27,65.84,69.20,69.22,7
3.57,74.31,74.51,75.41,79.30,80.47,81.36
,81.59,108.31,121.25,122.00,123.26,123.3
3,126.67,126.73,127.73,127.99,128.80,128
.98,132.71,133.07,133.27,136.19,137.10,1
42.90,143.01,147.88,148.00,148.09,152.89
,152.93,155.79,155.90,165.79,165.91,167.
56,167.58,178.67,179.37.
TOF/MS(ESI):calcd for C1141701115PNa[
M+Na] 1987.2513,found 1987.2521.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (6-(N 2 -isobutyrylguanin-9-yl)morpholine-
2-yl)methyl trifluoroacetate (2.27 g, 1.60 mmol) and (6-(N 4
-benzoylcytosin-1-yl)-4-tritylmorpholin-2-yl)methyldimethylphosphoroamide chloride (3.35 g, 4.80 mmol) to the title compound (2).
. 87 g, 91%).
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.88 (t, 9H, J=6.8 Hz)
, 1.00-1.56 (m, 96H), 1.69-1.88 (m, 9H), 2.38-2
. 97 (m, 8H), 3.06-3.69 (m, 5H), 3.75-4.56 (m, 12
H), 4.69-4.94 (m, 2H), 5.34-5.63 (m, 1H), 6.28-
6.50 (m, 1H), 7.13-8.00 (m, 23H), 8.69-8.94 (br
s, 1H), 9.31-9.63 (brs, 1H), 10.06-10.31 (brs,
1H), 12.13-12.31 (m, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 14.13, 19.01, 19.04
, 19.17, 19.22, 22.70, 26.07, 26.12, 29.32, 29.
37, 29.43, 29.60, 29.67, 29.73, 29.98, 30.35, 3
1.94, 36.17, 36.27, 36.64, 36.68, 36.74, 36.78
, 45.00, 45.08, 46.96, 47.43, 48.25, 48.76, 52.
48, 60.82, 60.90, 64.27, 65.84, 69.20, 69.22, 7
3.57, 74.31, 74.51, 75.41, 79.30, 80.47, 81.36
, 81.59, 108.31, 121.25, 122.00, 123.26, 123.3
3, 126.67, 126.73, 127.73, 127.99, 128.80, 128
. 98, 132.71, 133.07, 133.27, 136.19, 137.10, 1
42.90, 143.01, 147.88, 148.00, 148.09, 152.89
, 152.93, 155.79, 155.90, 165.79, 165.91, 167.
56, 167.58, 178.67, 179.37.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C114H170N11O15PNa [
M+Na] + 1987.2513, found 1987.2521.

7.脱Tag化の確認
〔実施例7-1〕
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-
O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イ
ソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジンの合成

Figure 0007296636000096
7. Confirmation of detagging [Example 7-1]
5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-
Synthesis of O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)thymidine
Figure 0007296636000096

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4
,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イソブチリ
ルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル(233mg,
0.10mmol)のTHF(9mL)-2-プロパノール(1mL)混合溶液を0℃に
冷却した。冷却下で、4mol/L-水素化ホウ素リチウム-THF溶液(0.125m
L,0.50mmol)を加えたのち、同温度で30分間撹拌した。反応液に塩化アンモ
ニウム水溶液を加えたのち、ジクロロメタンで3回抽出した。有機層を食塩水で洗浄した
のち、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過により硫酸ナトリウムを除いたのち、ろ液を濃
縮した。濃縮残渣をアセトニトリルに懸濁させることで析出した固体をろ過により除き、
ろ液を濃縮した。濃縮残渣のジメチルスルホキシド-メタノール混合溶液(1:1,5m
L)の一部(2.5mL)を分取クロマト装置で5回に分けて精製することにより、表題
の化合物(64mg,95%)を白色固体として得た。
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4
, 4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl (233 mg,
0.10 mmol) in THF (9 mL)-2-propanol (1 mL) was cooled to 0°C. Under cooling, 4 mol / L-lithium borohydride-THF solution (0.125 m
L, 0.50 mmol) was added, and the mixture was stirred at the same temperature for 30 minutes. After adding an aqueous solution of ammonium chloride to the reaction solution, extraction was performed three times with dichloromethane. The organic layer was washed with brine, dried over anhydrous sodium sulfate, filtered to remove sodium sulfate, and the filtrate was concentrated. Remove the solid precipitated by suspending the concentrated residue in acetonitrile by filtration,
The filtrate was concentrated. Dimethyl sulfoxide of concentrated residue - methanol mixed solution (1: 1, 5m
A portion (2.5 mL) of L) was purified by preparative chromatography in 5 portions to give the title compound (64 mg, 95%) as a white solid.

分取クロマト条件:カラム関東化学製MightysilRP-18GP(5μm,2
0Φ×250mm)、流速5mL/min、移動相アセトニトリル-水(グラジエント0
-30分(アセトニトリルの比率50→60%)。
H-NMR(600MHz,DMSO-d):δ1.12(d,6H,J=6.0H
z),1.42(d,3H,J=7.2Hz),1.74(d,3H,J=2.8Hz)
,2.07(s,1H),2.30-2.41(m,3H),2.60-2.90(m,
6H),3.18-3.29(m,2H),3.73(d,6H,J=4.2Hz),4
.00-4.43(m,12H),4.97(s,1H),5.10(s,1H),5.
51-5.52(m,1H),6.15-6.25(m,3H),6.88(d,4H,
J=9.0Hz),7.20-7.50(m,11H),8.17(q,1H,J=1.
8Hz),11.33-12.07(m,3H).
13C-NMR(151MHz,DMSO-d):δ10.56,10.88,17.
66,33.65,35.78,52.00,53.86,56.34,61.48,6
1.80,65.49,66.58,68.73,76.58,77.11,81.63
,82.11,82.52,82.87,84.98,90.73,108.72,11
2.08,116.98,119.14,125.69,126.46,126.77,
128.53,133.81,134.00,134.26,134.70,136.1
5,143.26,147.04,147.32,149.14,153.53,156
.99,162.50,168.14,178.89.
TOF/MS(ESI):calcd for C61691121Na [
M+Na] 1376.4, found 1376.6.
Preparative chromatography conditions: column Kanto Kagaku Mightysil RP-18GP (5 μm, 2
0 Φ × 250 mm), flow rate 5 mL / min, mobile phase acetonitrile-water (gradient 0
-30 min (proportion of acetonitrile 50→60%).
1 H-NMR (600 MHz, DMSO-d 6 ): δ 1.12 (d, 6H, J = 6.0H
z), 1.42 (d, 3H, J = 7.2Hz), 1.74 (d, 3H, J = 2.8Hz)
, 2.07 (s, 1H), 2.30-2.41 (m, 3H), 2.60-2.90 (m,
6H), 3.18-3.29 (m, 2H), 3.73 (d, 6H, J=4.2Hz), 4
. 00-4.43 (m, 12H), 4.97 (s, 1H), 5.10 (s, 1H), 5.
51-5.52 (m, 1H), 6.15-6.25 (m, 3H), 6.88 (d, 4H,
J=9.0 Hz), 7.20-7.50 (m, 11H), 8.17 (q, 1H, J=1.
8 Hz), 11.33-12.07 (m, 3H).
13 C-NMR (151 MHz, DMSO-d 6 ): δ 10.56, 10.88, 17.
66, 33.65, 35.78, 52.00, 53.86, 56.34, 61.48, 6
1.80, 65.49, 66.58, 68.73, 76.58, 77.11, 81.63
, 82.11, 82.52, 82.87, 84.98, 90.73, 108.72, 11
2.08, 116.98, 119.14, 125.69, 126.46, 126.77,
128.53, 133.81, 134.00, 134.26, 134.70, 136.1
5, 143.26, 147.04, 147.32, 149.14, 153.53, 156
. 99, 162.50, 168.14, 178.89.
TOF/MS ( ESI): calcd for C61H69N11O21P2Na [
M+Na] + 1376.4, found 1376.6.

〔実施例7-2〕
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-
O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’
-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシ
アデノシンの合成

Figure 0007296636000097
[Example 7-2]
5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-
O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosine-3'
-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosine
Figure 0007296636000097

実施例7-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シア
ノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-N-イソブチリルデオ
キシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N
-ベンゾイルデオキシアデノシン-3’-イル(244mg,0.10mmol)から表
題の化合物(55mg,75%)を黄色固体として得た。
H-NMR(600MHz,DMSO-d):δ1.17-1.30(m,7H),
1.74-1.79(m,3H),1.97-2.30(m,2H),2.45-2.5
1(m,2H),2.68-2.76(m,1H),2.79-2.83(m,1H),
2.96(dt,4H,J=6.4,12.4Hz),3.03-3.12(m,1H)
,3.22(t,1H,J=11.3Hz),3.77(s,6H),3.93(s,1
H),4.07-4.38(m,11H),5.07-5.45(m,5H),6.05
-6.45(m,3H),6.85(t,4H,J=10.7Hz),7.24(d,5
H,J=8.9Hz),7.29(t,2H,J=7.6Hz),7.36(d,2H,
J=7.6Hz),7.49-7.56(m,3H),7.65(t,1H,J=7.2
Hz),7.90(dt,1H,J=3.0,8.1Hz),8.07(d,2H,J=
7.6Hz),8.13-8.16(m,1H),10.89-12.13(m,3H)

13C-NMR(151MHz,DMSO-d):δ12.52,14.58,19.
33,35.33,36.13,37.02,55.48,60.34,62.73,6
3.24,64.06,67.31,68.33,70.66,77.30,79.12
,82.64,83.37,84.09,84.74,86.25,113.58,11
8.69,121.00,123.54,127.24,128.19,128.72,
128.94,130.23,132.68,133.50,134.55,135.7
7,136.46,137.81,139.68,145.08,148.56,149
.12,150.82,155.31,158.56,161.08,164.11,1
65.03,180.61.
TOF/MS(ESI):calcd for C68721420Na [
M+Na] 1489.4, found 1489.4.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2 -cyanoethoxy ) (5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 6
-benzoyldeoxyadenosin-3′-yl (244 mg, 0.10 mmol) gave the title compound (55 mg, 75%) as a yellow solid.
1 H-NMR (600 MHz, DMSO-d 6 ): δ 1.17-1.30 (m, 7H),
1.74-1.79 (m, 3H), 1.97-2.30 (m, 2H), 2.45-2.5
1 (m, 2H), 2.68-2.76 (m, 1H), 2.79-2.83 (m, 1H),
2.96 (dt, 4H, J=6.4, 12.4Hz), 3.03-3.12 (m, 1H)
, 3.22(t, 1H, J=11.3 Hz), 3.77(s, 6H), 3.93(s, 1
H), 4.07-4.38 (m, 11H), 5.07-5.45 (m, 5H), 6.05
-6.45 (m, 3H), 6.85 (t, 4H, J = 10.7 Hz), 7.24 (d, 5
H, J = 8.9 Hz), 7.29 (t, 2H, J = 7.6 Hz), 7.36 (d, 2H,
J = 7.6 Hz), 7.49-7.56 (m, 3H), 7.65 (t, 1H, J = 7.2
Hz), 7.90 (dt, 1H, J = 3.0, 8.1 Hz), 8.07 (d, 2H, J =
7.6Hz), 8.13-8.16 (m, 1H), 10.89-12.13 (m, 3H)
.
13 C-NMR (151 MHz, DMSO-d 6 ): δ 12.52, 14.58, 19.
33, 35.33, 36.13, 37.02, 55.48, 60.34, 62.73, 6
3.24, 64.06, 67.31, 68.33, 70.66, 77.30, 79.12
, 82.64, 83.37, 84.09, 84.74, 86.25, 113.58, 11
8.69, 121.00, 123.54, 127.24, 128.19, 128.72,
128.94, 130.23, 132.68, 133.50, 134.55, 135.7
7, 136.46, 137.81, 139.68, 145.08, 148.56, 149
. 12, 150.82, 155.31, 158.56, 161.08, 164.11, 1
65.03, 180.61.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C68H72N14O20P2Na [
M+Na] + 1489.4, found 1489.4.

〔実施例7-3〕
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-
O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イ
ソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシ
シチジンの合成

Figure 0007296636000098
[Example 7-3]
5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-
Synthesis of O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidine
Figure 0007296636000098

実施例7-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シア
ノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホ
スホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N
-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イル(243mg,0.10mmol)から表題
の化合物(57mg,79%)を白色固体として得た。
H-NMR(600MHz,DMSO-d):δ1.09-1.12(m,6H),
1.42(s,3H),1.75-2.10(m,4H),2.61-2.95(m,7
H),3.15-3.25(m,3H),3.70-3.77(m,7H),4.08-
4.36(m,11H),5.09(d,2H,J=41.9Hz),5.32(d,2
H,J=44.0Hz),6.18-6.29(m,3H),6.85-6.88(m,
4H),7.20-7.22(m,5H),7.29(q,2H,J=6.9Hz),7
.34(d,2H,J=7.6Hz),7.41-7.53(m,4H),7.86(d
,2H,J=7.6Hz),8.19(dt,1H,J=4.4,8.2Hz),8.8
4(q,1H,J=6.4Hz),11.34-12.05(m,3H).
13C-NMR(151MHz,DMSO-d):δ12.17,19.35,27.
86,35.35,55.56,57.07,63.19,63.61,67.29,6
8.60,70.86,78.19,78.93,82.62,83.40,83.86
,84.14,86.67,110.47,113.78,118.59,118.88
,120.91,127.38,128.02,128.69,130.24,131.
86,134.55,135.51,135.97,137.92,144.97,14
8.76,149.02,150.84,154.36,155.25,158.69,
164.09,165.95,166.18,180.60.
TOF/MS(ESI):calcd for C67721221Li [
M+Li] 1449.5, found 1449.6.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2 -cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)-N 4
-benzoyldeoxycytidin-3′-yl (243 mg, 0.10 mmol) gave the title compound (57 mg, 79%) as a white solid.
1 H-NMR (600 MHz, DMSO-d 6 ): δ 1.09-1.12 (m, 6H),
1.42 (s, 3H), 1.75-2.10 (m, 4H), 2.61-2.95 (m, 7
H), 3.15-3.25 (m, 3H), 3.70-3.77 (m, 7H), 4.08-
4.36 (m, 11H), 5.09 (d, 2H, J=41.9Hz), 5.32 (d, 2
H, J = 44.0 Hz), 6.18-6.29 (m, 3H), 6.85-6.88 (m,
4H), 7.20-7.22 (m, 5H), 7.29 (q, 2H, J=6.9Hz), 7
. 34 (d, 2H, J = 7.6Hz), 7.41-7.53 (m, 4H), 7.86 (d
, 2H, J=7.6 Hz), 8.19 (dt, 1H, J=4.4, 8.2 Hz), 8.8
4 (q, 1H, J=6.4Hz), 11.34-12.05 (m, 3H).
13 C-NMR (151 MHz, DMSO-d 6 ): δ 12.17, 19.35, 27.
86, 35.35, 55.56, 57.07, 63.19, 63.61, 67.29, 6
8.60, 70.86, 78.19, 78.93, 82.62, 83.40, 83.86
, 84.14, 86.67, 110.47, 113.78, 118.59, 118.88
, 120.91, 127.38, 128.02, 128.69, 130.24, 131.
86, 134.55, 135.51, 135.97, 137.92, 144.97, 14
8.76, 149.02, 150.84, 154.36, 155.25, 158.69,
164.09, 165.95, 166.18, 180.60.
TOF/MS ( ESI): calcd for C67H72N12O21P2Li [
M+Li] + 1449.5, found 1449.6.

〔実施例7-4〕
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-
O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-
3’-イル)ホスホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシンの合成

Figure 0007296636000099
[Example 7-4]
5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-
O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl)phosphoryl)thymidine-
Synthesis of 3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosine
Figure 0007296636000099

実施例7-1の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シア
ノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホ
スホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシ
ン-3’-イル(232mg,0.10mmol)から表題の化合物(63mg,93%
)を白色固体として得た。
H-NMR(600MHz,DMSO-d):δ1.12(d,6H,J=6.2H
z),1.42(d,3H,J=7.6Hz),1.73(d,3H,J=2.7Hz)
,2.07(s,1H),2.32-2.43(m,3H),2.61-2.91(m,
6H),3.20-3.29(m,2H),3.73(d,6H,J=3.8Hz),4
.04-4.43(m,12H),4.97(s,1H),5.10(s,1H),5.
51-5.52(m,1H),6.13-6.26(m,3H),6.88(d,4H,
J=8.9Hz),7.23(d,5H,J=7.6Hz),7.30(t,2H,J=
6.2Hz),7.36(d,2H,J=8.2Hz),7.43-7.47(m,2H
),7.89-8.18(m,1H),11.33-12.07(m,3H).
13C-NMR(151MHz,DMSO-d):δ10.46,10.84,17.
69,17.83,33.61,35.32,36.22,53.86,61.50,6
1.98,65.53,66.44,68.89,75.88,77.15,80.92
,81.78,82.16,82.47,82.92,83.51,85.00,108
.75,108.90,112.08,116.92,119.11,125.71,1
26.48,126.77,128.55,133.80,134.02,134.33
,134.53,136.24,143.27,146.96,147.20,149.
17,153.63,157.01,162.41,178.92.
TOF/MS(ESI):calcd for C61691121Na [
M+Na] 1376.4, found 1376.6.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2 -cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosine-3′- title compound (63 mg, 93%) from yl (232 mg, 0.10 mmol)
) as a white solid.
1 H-NMR (600 MHz, DMSO-d 6 ): δ 1.12 (d, 6H, J = 6.2H
z), 1.42 (d, 3H, J = 7.6 Hz), 1.73 (d, 3H, J = 2.7 Hz)
, 2.07 (s, 1H), 2.32-2.43 (m, 3H), 2.61-2.91 (m,
6H), 3.20-3.29 (m, 2H), 3.73 (d, 6H, J=3.8Hz), 4
. 04-4.43 (m, 12H), 4.97 (s, 1H), 5.10 (s, 1H), 5.
51-5.52 (m, 1H), 6.13-6.26 (m, 3H), 6.88 (d, 4H,
J = 8.9Hz), 7.23 (d, 5H, J = 7.6Hz), 7.30 (t, 2H, J =
6.2Hz), 7.36 (d, 2H, J = 8.2Hz), 7.43-7.47 (m, 2H
), 7.89-8.18 (m, 1H), 11.33-12.07 (m, 3H).
13 C-NMR (151 MHz, DMSO-d 6 ): δ 10.46, 10.84, 17.
69, 17.83, 33.61, 35.32, 36.22, 53.86, 61.50, 6
1.98, 65.53, 66.44, 68.89, 75.88, 77.15, 80.92
, 81.78, 82.16, 82.47, 82.92, 83.51, 85.00, 108
. 75, 108.90, 112.08, 116.92, 119.11, 125.71, 1
26.48, 126.77, 128.55, 133.80, 134.02, 134.33
, 134.53, 136.24, 143.27, 146.96, 147.20, 149.
17, 153.63, 157.01, 162.41, 178.92.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C61H69N11O21P2Na [
M+Na] + 1376.4, found 1376.6.

〔実施例7-5〕
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)
-チミジン-3’-イル)ホスホロチオイル)-チミジンの合成

Figure 0007296636000100
[Example 7-5]
5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)
-thymidin-3′-yl)phosphorothioyl)-thymidine
Figure 0007296636000100

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-チミジ
ン-3’-イル)ホスホロチオイル)-チミジン-3’-イル(189mg,0.10m
mol)のTHF(9mL)-2-プロパノール(1mL)混合溶液を0℃に冷却した。
冷却下で、4mol/L-水素化ホウ素リチウム-THF溶液(0.125mL,0.5
0mmol)を加えたのち、同温度で30分間撹拌した。反応液に塩化アンモニウム水溶
液を加えたのち、ジクロロメタンで3回抽出した。有機層を食塩水で洗浄したのち、無水
硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過により硫酸ナトリウムを除いたのち、ろ液を濃縮した。濃
縮残渣をアセトニトリルに懸濁させることで析出した固体をろ過により除き、ろ液を濃縮
した。濃縮残渣をカラムクロマトグラフィー(シリカゲル,展開溶媒:クロロホルム-メ
タノール)で精製することにより、表題の化合物(86mg,93%)を白色固体として
得た。
H-NMR(600MHz,CDCl):δ1.46(d,3H,J=15.8Hz
),1.91(d,3H,J=8.2Hz),2.21-2.79(m,6H),3.3
9-3.49(m,2H),3.79(d,6H,J=3.4Hz),4.08-4.5
2(m,8H),5.26-5.31(m,1H),6.25-6.41(m,2H),
6.85(dd,4H,J=2.7,8.9Hz),7.22-7.38(m,9H),
7.58(d,1H,J=24.1Hz),9.45-10.50(m,2H).
13C-NMR(151MHz,CDCl):δ11.90,12.57,19.43
,38.92,39.90,55.30,62.59,63.36,67.70,71.
03,80.38,84.66,85.46,87.28,111.32,111.97
,113.38,116.54,127.28,128.00,128.11,130.
06,135.00,135.80,144.09,150.64,150.92,15
8.74,163.98.
TOF/MS(ESI):calcd for C444813PSNa [M
+Na] 940.3, found 940.2.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-thymidin-3′-yl)phosphorothioyl)-thymidin-3′-yl (189 mg, 0.10 m
mol) in THF (9 mL)-2-propanol (1 mL) was cooled to 0°C.
Under cooling, 4 mol/L-lithium borohydride-THF solution (0.125 mL, 0.5
0 mmol) was added, and the mixture was stirred at the same temperature for 30 minutes. After adding an aqueous solution of ammonium chloride to the reaction solution, extraction was performed three times with dichloromethane. The organic layer was washed with brine, dried over anhydrous sodium sulfate, filtered to remove sodium sulfate, and the filtrate was concentrated. The solid precipitated by suspending the concentrated residue in acetonitrile was removed by filtration, and the filtrate was concentrated. The concentrated residue was purified by column chromatography (silica gel, developing solvent: chloroform-methanol) to give the title compound (86 mg, 93%) as a white solid.
1 H-NMR (600 MHz, CDCl 3 ): δ 1.46 (d, 3H, J = 15.8 Hz
), 1.91 (d, 3H, J=8.2Hz), 2.21-2.79 (m, 6H), 3.3
9-3.49 (m, 2H), 3.79 (d, 6H, J=3.4Hz), 4.08-4.5
2 (m, 8H), 5.26-5.31 (m, 1H), 6.25-6.41 (m, 2H),
6.85 (dd, 4H, J=2.7, 8.9Hz), 7.22-7.38 (m, 9H),
7.58 (d, 1H, J=24.1Hz), 9.45-10.50 (m, 2H).
13 C-NMR (151 MHz, CDCl 3 ): δ 11.90, 12.57, 19.43
, 38.92, 39.90, 55.30, 62.59, 63.36, 67.70, 71.
03, 80.38, 84.66, 85.46, 87.28, 111.32, 111.97
, 113.38, 116.54, 127.28, 128.00, 128.11, 130.
06, 135.00, 135.80, 144.09, 150.64, 150.92, 15
8.74, 163.98.
TOF/MS ( ESI ) : calcd for C44H48N5O13PSNa [ M
+ Na] + 940.3, found 940.2.

〔実施例7-6〕
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)
-2’-フルオロデオキシウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-フルオロ-N
-イソブチリルデオキシグアノシンの合成

Figure 0007296636000101
[Example 7-6]
5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)
-2′-fluorodeoxyuridin-3′-yl)phosphoryl)-2′-fluoro-N 2
- Synthesis of isobutyryldeoxyguanosine
Figure 0007296636000101

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-
フルオロデオキシウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-フルオロ-N-イソブ
チリルデオキシグアノシン-3’-イル(0.397g,0.200mmol)のTHF
(27mL)-2-プロパノール(3mL)の混合溶液を0~-10℃に冷却した。冷却
下で、4mol/L-水素化ホウ素リチウム-THF溶液(0.10mL,0.400m
mol)を加えたのち、同温度で20分間撹拌した。反応液に10%塩化アンモニウム水
溶液(4mL)を加えたのち分液し、有機層を10%食塩水で洗浄した。有機層を無水硫
酸ナトリウムで乾燥し、ろ過により硫酸ナトリウムを除いたのち、ろ液を濃縮した。濃縮
残渣にメタノールを添加することで析出した固体をろ過により除き、ろ液を濃縮、乾固し
た。濃縮残渣をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカゲル,展開溶媒:ジクロロメ
タン-メタノール)で精製することにより、表題の化合物(0.137g,67%)を白
色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ1.16-1.26(m,6H),2.
19(s,2H),2.45-2.87(m,3H),3.44-3.66(m,2H)
,3.72-3.75(m,6H),3.92-4.18(m,2H),4.25-4.
50(m,4H),4.89-5.55(m,6H),5.85-6.00(m,2H)

6.80-6.82(m,4H),7.15-7.30(m,7H),7.33-7.3
7(m,2H),7.71-7.82(m,2H),10.05-10.42(brs,
1H),10.55-10.87(brs,1H),12.36(s,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ18.75,18.85,19.01
,19.07,19.38,19.45,36.01,50.81,55.26,55.
28,60.65,62.85,67.86,80.26,81.13,87.13,8
7.19,87.53,87.88,90.59,92.53,102.62,113.
33,116.74,121.28,127.26,128.05,128.19,13
0.22,134.80,134.91,134.96,135.07,140.41,
144.01,144.11,148.00,148.06,148.50,148.5
5,150.44,155.70,158.76,163.72,180.33,180
.39.
TOF/MS(ESI):calcd for C474914PNa [
M+Na] 1041.2972, found 1041.2975.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-
fluorodeoxyuridin-3′-yl)phosphoryl)-2′-fluoro-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl (0.397 g, 0.200 mmol) in THF
A mixed solution of (27 mL)-2-propanol (3 mL) was cooled to 0 to -10°C. Under cooling, 4 mol/L-lithium borohydride-THF solution (0.10 mL, 0.400 m
mol) was added, and the mixture was stirred at the same temperature for 20 minutes. A 10% aqueous ammonium chloride solution (4 mL) was added to the reaction mixture, and the mixture was separated, and the organic layer was washed with 10% brine. The organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate, filtered to remove sodium sulfate, and the filtrate was concentrated. The solid precipitated by adding methanol to the concentrated residue was removed by filtration, and the filtrate was concentrated to dryness. The concentrated residue was purified by column chromatography (neutral silica gel, developing solvent: dichloromethane-methanol) to give the title compound (0.137 g, 67%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ1.16-1.26 (m, 6H),2.
19 (s, 2H), 2.45-2.87 (m, 3H), 3.44-3.66 (m, 2H)
, 3.72-3.75 (m, 6H), 3.92-4.18 (m, 2H), 4.25-4.
50 (m, 4H), 4.89-5.55 (m, 6H), 5.85-6.00 (m, 2H)

6.80-6.82 (m, 4H), 7.15-7.30 (m, 7H), 7.33-7.3
7 (m, 2H), 7.71-7.82 (m, 2H), 10.05-10.42 (brs,
1H), 10.55-10.87 (brs, 1H), 12.36 (s, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 18.75, 18.85, 19.01
, 19.07, 19.38, 19.45, 36.01, 50.81, 55.26, 55.
28, 60.65, 62.85, 67.86, 80.26, 81.13, 87.13, 8
7.19, 87.53, 87.88, 90.59, 92.53, 102.62, 113.
33, 116.74, 121.28, 127.26, 128.05, 128.19, 13
0.22, 134.80, 134.91, 134.96, 135.07, 140.41,
144.01, 144.11, 148.00, 148.06, 148.50, 148.5
5, 150.44, 155.70, 158.76, 163.72, 180.33, 180
. 39.
TOF / MS (ESI): calcd for C47H49N8O14F2PNa [
M+Na] + 1041.2972, found 1041.2975.

〔実施例7-7〕
-ベンゾイル-5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジ
メトキシトリチル)-2’-O-メチルウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-O
-メチルシチジンの合成

Figure 0007296636000102
[Example 7-7]
N 4 -benzoyl-5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O-methyluridin-3′-yl)phosphoryl)-2 '-O
- Synthesis of methylcytidine
Figure 0007296636000102

N,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.065g,0.50mmol)のTHF(
13.5mL)と2-プロパノール(1.5mL)の混合溶液を0~-10℃に冷却した
。冷却下で、4mol/L-水素化ホウ素リチウム-THF溶液(0.125mL,0.
50mmol)を加えたのち、同温度で10分間撹拌した。次に2-((3,4,5-ト
リス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸N-ベンゾイル-5’-O-(
(2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-メ
チルウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-O-メチルシチジン-3’-イル(0
.200g,0.10mmol)のTHF(0.9mL)-2-プロパノール(0.1m
L)の混合溶液を加えたのち、同温度で0.5時間撹拌した。反応液に10%塩化アンモ
ニウム水溶液(2mL)を加えたのち分液し、有機層を10%食塩水で洗浄した。有機層
を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過により硫酸ナトリウムを除いたのち、ろ液を濃縮し
た。濃縮残渣にメタノールを添加することで析出した固体をろ過により除き、ろ液を濃縮
、乾固した。濃縮残渣をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカゲル,展開溶媒:ジ
クロロメタン-メタノール)で精製することにより、表題の化合物(0.055g,53
%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ2.00-2.27(brs,2H),
2.55-2.74(m,1H),2.80(t,1H,J=6.2Hz),3.14-
3.41(m,1H),3.44-3.92(m,14H),4.03-4.64(m,
7H),5.12(q,1H,J=5.6Hz),5.27(t,1H,J=8.0Hz
),5.87-6.05(m,2H),6.78-6.89(m,4H),7.19-7
.64(m,12H),7.76-8.16(m,4H),9.05-9.42(brs
,1H),9.50-9.87(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ19.54,19.56,19.61
,19.64,55.28,55.32,58.80,58.82,58.93,61.
30,61.34,62.38,62.43,62.68,62.73,66.03,6
6.08,66.41,66.46,67.85,67.95,74.30,74.34
,74.42,74.47,81.32,81.41,81.49,81.58,81.
64,81.72,82.17,82.99,83.08,86.58,86.79,8
7.46,87.48,89.42,89.51,96.78,102.69,102.
71,113.39,116.35,116.48,127.37,127.42,12
7.80,127.85,128.12,128.25,128.29,128.57,
128.90,128.93,130.22,130.27,130.30,131.0
1,132.94,133.02,133.14,133.17,134.72,134
.75,134.82,134.84,139.51,139.66,143.90,1
43.97,144.26,150.43,154.73,158.81,158.85
,162.82,162.86,163.22,166.72.
TOF/MS(ESI):calcd for C515316PNa [M+
Na] 1059.3153, found 1059.3202.
N,N-diisopropylethylamine (0.065 g, 0.50 mmol) in THF (
13.5 mL) and 2-propanol (1.5 mL) was cooled to 0 to -10°C. Under cooling, 4 mol/L-lithium borohydride-THF solution (0.125 mL, 0.
50 mmol) was added, and the mixture was stirred at the same temperature for 10 minutes. Then 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid N 4 -benzoyl-5′-O-(
(2-Cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-O-methyluridin-3′-yl)phosphoryl)-2′-O-methylcytidin-3′-yl (0
. 200 g, 0.10 mmol) of THF (0.9 mL)-2-propanol (0.1 mL
After adding the mixed solution of L), the mixture was stirred at the same temperature for 0.5 hour. A 10% ammonium chloride aqueous solution (2 mL) was added to the reaction mixture, and the mixture was separated, and the organic layer was washed with 10% brine. The organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate, filtered to remove sodium sulfate, and the filtrate was concentrated. The solid precipitated by adding methanol to the concentrated residue was removed by filtration, and the filtrate was concentrated to dryness. The title compound (0.055 g, 53
%) was obtained as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ 2.00-2.27 (brs, 2H),
2.55-2.74 (m, 1H), 2.80 (t, 1H, J=6.2Hz), 3.14-
3.41 (m, 1H), 3.44-3.92 (m, 14H), 4.03-4.64 (m,
7H), 5.12 (q, 1H, J = 5.6Hz), 5.27 (t, 1H, J = 8.0Hz)
), 5.87-6.05 (m, 2H), 6.78-6.89 (m, 4H), 7.19-7
. 64 (m, 12H), 7.76-8.16 (m, 4H), 9.05-9.42 (brs
, 1H), 9.50-9.87 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ19.54, 19.56, 19.61
, 19.64, 55.28, 55.32, 58.80, 58.82, 58.93, 61.
30, 61.34, 62.38, 62.43, 62.68, 62.73, 66.03, 6
6.08, 66.41, 66.46, 67.85, 67.95, 74.30, 74.34
, 74.42, 74.47, 81.32, 81.41, 81.49, 81.58, 81.
64, 81.72, 82.17, 82.99, 83.08, 86.58, 86.79, 8
7.46, 87.48, 89.42, 89.51, 96.78, 102.69, 102.
71, 113.39, 116.35, 116.48, 127.37, 127.42, 12
7.80, 127.85, 128.12, 128.25, 128.29, 128.57,
128.90, 128.93, 130.22, 130.27, 130.30, 131.0
1, 132.94, 133.02, 133.14, 133.17, 134.72, 134
. 75, 134.82, 134.84, 139.51, 139.66, 143.90, 1
43.97, 144.26, 150.43, 154.73, 158.81, 158.85
, 162.82, 162.86, 163.22, 166.72.
TOF / MS ( ESI): calcd for C51H53N6O16PNa [M+
Na] + 1059.3153, found 1059.3202.

〔実施例7-8〕
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)
-2’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イル)ホスホリル)
-2’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジンの合成

Figure 0007296636000103
[Example 7-8]
5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)
-2′-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3′-yl)phosphoryl)
Synthesis of -2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine
Figure 0007296636000103

2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-
O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イル)ホスホリル)-2’-
O-(tert-ブチルジメチルシリル)ウリジン-3’-イル(0.420g,0.2
0mmol)のTHF(27mL)-2-プロパノール(3mL)の混合溶液を0~-1
0℃に冷却した。冷却下で、4mol/L-水素化ホウ素リチウム-THF溶液(0.2
5mL,1.00mmol)を加えたのち、同温度で1.5時間撹拌した。反応液に10
%塩化アンモニウム水溶液(4mL)を加えたのち分液し、有機層を10%食塩水で洗浄
した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過により硫酸ナトリウムを除いたのち、
ろ液を濃縮した。濃縮残渣にメタノールを添加することで析出した固体をろ過により除き
、ろ液を濃縮、乾固した。濃縮残渣をカラムクロマトグラフィー(球状中性シリカゲル,
展開溶媒:ジクロロメタン-メタノール)で精製することにより、表題の化合物(0.1
35g,60%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.11-0.15(m,12H),0
.89-0.93(m,18H),1.66-1.84(brs,2H),2.50-2
.77(m,3H),3.46-3.67(m,2H),3.80(s,6H),3.9
8-4.55(m,9H),4.92-4.96(m,1H),5.23-5.27(m
,1H),5.61-5.75(m,2H),5.97-6.00(m,1H),6.8
4-6.87(m,4H),7.14-7.45(m,10H),7.77-7.87(
m,1H),9.00-9.50(brs,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ-5.14,-4.98,-4.96
,-4.90,-4.82,-4.76,-4.74,-4.70,-4.68,17.
96,18.02,18.06,19.54,19.60,19.67,25.56,2
5.60,25.66,25.69,55.31,62.02,62.29,62.34
,62.52,62.57,62.62,67.06,67.12,67.32,69.
38,69.54,70.49,70.93,73.61,74.57,74.63,7
4.71,74.88,81.55,81.60,81.73,81.84,81.93
,82.01,87.37,87.65,87.85,87.95,88.05,91.
58,91.81,93.18,93.89,102.60,102.67,102.7
6,102.82,102.86,113.41,116.26,116.30,127
.41,127.45,128.13,128.17,128.21,130.16,1
30.23,130.29,130.34,134.65,134.69,134.72
,134.75,139.67,139.75,140.36,140.40,141.
65,141.77,143.99,144.03,149.97,150.09,15
0.19,150.40,150.55,150.75,158.83,158.88,
162.93,163.00,163.18.
TOF/MS(ESI):calcd for C547216SiPNa
[M+Na] 1156.4148, found 1156.4148.
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-
O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3'-yl)phosphoryl)-2'-
O-(tert-butyldimethylsilyl)uridin-3′-yl (0.420 g, 0.2
0 mmol) of THF (27 mL)-2-propanol (3 mL) to 0 to -1
Cooled to 0°C. Under cooling, 4 mol / L-lithium borohydride-THF solution (0.2
5 mL, 1.00 mmol) was added, and the mixture was stirred at the same temperature for 1.5 hours. 10 in the reaction liquid
% ammonium chloride aqueous solution (4 mL) was added, and the mixture was separated, and the organic layer was washed with 10% brine. After drying the organic layer with anhydrous sodium sulfate and removing the sodium sulfate by filtration,
The filtrate was concentrated. The solid precipitated by adding methanol to the concentrated residue was removed by filtration, and the filtrate was concentrated to dryness. Column chromatography (spherical neutral silica gel,
Developing solvent: dichloromethane-methanol) to give the title compound (0.1
35 g, 60%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ0.11-0.15 (m, 12H), 0
. 89-0.93 (m, 18H), 1.66-1.84 (brs, 2H), 2.50-2
. 77 (m, 3H), 3.46-3.67 (m, 2H), 3.80 (s, 6H), 3.9
8-4.55 (m, 9H), 4.92-4.96 (m, 1H), 5.23-5.27 (m
, 1H), 5.61-5.75 (m, 2H), 5.97-6.00 (m, 1H), 6.8
4-6.87 (m, 4H), 7.14-7.45 (m, 10H), 7.77-7.87 (
m, 1H), 9.00-9.50 (brs, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ -5.14, -4.98, -4.96
, -4.90, -4.82, -4.76, -4.74, -4.70, -4.68, 17.
96, 18.02, 18.06, 19.54, 19.60, 19.67, 25.56, 2
5.60, 25.66, 25.69, 55.31, 62.02, 62.29, 62.34
, 62.52, 62.57, 62.62, 67.06, 67.12, 67.32, 69.
38, 69.54, 70.49, 70.93, 73.61, 74.57, 74.63, 7
4.71, 74.88, 81.55, 81.60, 81.73, 81.84, 81.93
, 82.01, 87.37, 87.65, 87.85, 87.95, 88.05, 91.
58, 91.81, 93.18, 93.89, 102.60, 102.67, 102.7
6, 102.82, 102.86, 113.41, 116.26, 116.30, 127
. 41, 127.45, 128.13, 128.17, 128.21, 130.16, 1
30.23, 130.29, 130.34, 134.65, 134.69, 134.72
, 134.75, 139.67, 139.75, 140.36, 140.40, 141.
65, 141.77, 143.99, 144.03, 149.97, 150.09, 15
0.19, 150.40, 150.55, 150.75, 158.83, 158.88,
162.93, 163.00, 163.18.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C54H72N5O16Si2PNa
[M+Na] + 1156.4148, found 1156.4148.

5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)
チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジンの合成
〔実施例7-9〕
(1)3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)プロ
ピオン酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリ
チル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルからの合成

Figure 0007296636000104
5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)
Synthesis of thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidine [Example 7-9]
(1) 3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionate 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl) ) thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl
Figure 0007296636000104

実施例7-8の方法に従って、3-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)プロピオン酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4
,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イ
ル(0.377g,0.200mmol)から表題の化合物(0.136g,76%)を
白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ1.41(d,3H,J=5.4Hz)
,1.87(d,3H,J=2.0Hz),2.19-2.27(m,1H),2.34
-2.48(m,2H),2.62-2.77(m,3H),3.39(t,1H,J=
7.2Hz),3.47-3.52(m,1H),3.78(s,6H),4.07-4
.55(m,8H),5.12-5.18(m,1H),6.18-6.24(m,1H
),6.35-6.40(m,1H),6.84(d,4H,J=8.8Hz),7.2
1-7.31(m,8H),7.32-7.38(m,2H),7.51-7.58(m
,1H),9.92-10.14(m,2H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ11.78,12.45,12.49
,19.59,19.67,19.71,38.83,39.01,39.61,39.
67,55.31,62.45,62.50,62.60,62.65,63.31,6
7.74,70.84,80.08,84.40,84.50,85.60,87.30
,87.36,111.23,111.34,111.91,112.00,113.3
7,116.49,116.74,127.32,128.10,130.11,130
.14,134.98,135.01,135.04,135.19,136.00,1
44.01,144.06,150.69,151.00,151.05,158.80
,163.96,164.16.
TOF/MS(ESI):calcd for C444814PNa [M+
Na] 924.2833, found 924.2836.
3-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)propionic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4
,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl (0.377 g, 0.200 mmol) gave the title compound (0.136 g, 76%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ1.41 (d, 3H, J=5.4 Hz)
, 1.87 (d, 3H, J=2.0Hz), 2.19-2.27 (m, 1H), 2.34
-2.48 (m, 2H), 2.62-2.77 (m, 3H), 3.39 (t, 1H, J =
7.2 Hz), 3.47-3.52 (m, 1H), 3.78 (s, 6H), 4.07-4
. 55 (m, 8H), 5.12-5.18 (m, 1H), 6.18-6.24 (m, 1H
), 6.35-6.40 (m, 1H), 6.84 (d, 4H, J=8.8Hz), 7.2
1-7.31 (m, 8H), 7.32-7.38 (m, 2H), 7.51-7.58 (m
, 1H), 9.92-10.14 (m, 2H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 11.78, 12.45, 12.49
, 19.59, 19.67, 19.71, 38.83, 39.01, 39.61, 39.
67, 55.31, 62.45, 62.50, 62.60, 62.65, 63.31, 6
7.74, 70.84, 80.08, 84.40, 84.50, 85.60, 87.30
, 87.36, 111.23, 111.34, 111.91, 112.00, 113.3
7, 116.49, 116.74, 127.32, 128.10, 130.11, 130
. 14, 134.98, 135.01, 135.04, 135.19, 136.00, 1
44.01, 144.06, 150.69, 151.00, 151.05, 158.80
, 163.96, 164.16.
TOF/MS ( ESI): calcd for C44H48N5O14PNa [ M +
Na] + 924.2833, found 924.2836.

〔実施例7-10〕
(2)2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)
酢酸5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル
)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルからの合成

Figure 0007296636000105
[Examples 7-10]
(2) 2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamide)
Synthesis from 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl acetate
Figure 0007296636000105

2-(N-メチル-3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)酢酸5
’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミ
ジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル(189mg,0.10mmol
)のTHF(9mL)-2-プロパノール(1mL)混合溶液を0℃に冷却した。冷却下
で、4mol/L-水素化ホウ素リチウム-THF溶液(0.125mL,0.50mm
ol)を加えたのち、同温度で30分間撹拌した。反応液に塩化アンモニウム水溶液を加
えたのち、ジクロロメタンで3回抽出した。有機層を食塩水で洗浄したのち、無水硫酸ナ
トリウムで乾燥し、ろ過により硫酸ナトリウムを除いたのち、ろ液を濃縮した。濃縮残渣
をアセトニトリルに懸濁させることで析出した固体をろ過により除き、ろ液を濃縮した。
濃縮残渣をカラムクロマトグラフィー(シリカゲル,展開溶媒:クロロホルム-メタノー
ル)で精製することにより、表題の化合物(89mg,98%)を白色固体として得た。
TOF/MS(ESI):calcd for C444814PNa [M+
Na] 924.3, found 924.2.
2-(N-methyl-3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)acetic acid 5
'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl)phosphoryl)thymidin-3'-yl (189 mg, 0.10 mmol
) in THF (9 mL)-2-propanol (1 mL) was cooled to 0°C. Under cooling, 4 mol/L-lithium borohydride-THF solution (0.125 mL, 0.50 mm
ol) was added, and the mixture was stirred at the same temperature for 30 minutes. After adding an aqueous solution of ammonium chloride to the reaction solution, extraction was performed three times with dichloromethane. The organic layer was washed with brine, dried over anhydrous sodium sulfate, filtered to remove sodium sulfate, and the filtrate was concentrated. The solid precipitated by suspending the concentrated residue in acetonitrile was removed by filtration, and the filtrate was concentrated.
The concentrated residue was purified by column chromatography (silica gel, developing solvent: chloroform-methanol) to give the title compound (89 mg, 98%) as a white solid.
TOF/MS ( ESI): calcd for C44H48N5O14PNa [ M +
Na] + 924.3, found 924.2.

〔実施例7-11〕
(3)3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チ
ミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イルのから合成

Figure 0007296636000106
[Example 7-11]
(3) 3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine- 3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl
Figure 0007296636000106

3-(3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンズアミド)プロピオン酸5’-
O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン
-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル(189mg,0.10mmol)の
THF(9mL)-2-プロパノール(1mL)混合溶液を0℃に冷却した。冷却下で、
4mol/L-水素化ホウ素リチウム-THF溶液(0.125mL,0.50mmol
)を加えたのち、室温で1時間間撹拌した。反応液に塩化アンモニウム水溶液を加えたの
ち、ジクロロメタンで3回抽出した。有機層を食塩水で洗浄したのち、無水硫酸ナトリウ
ムで乾燥し、ろ過により硫酸ナトリウムを除いたのち、ろ液を濃縮した。濃縮残渣をアセ
トニトリルに懸濁させることで析出した固体をろ過により除き、ろ液を濃縮した。濃縮残
渣をカラムクロマトグラフィー(シリカゲル,展開溶媒:クロロホルム-メタノール)で
精製することにより、表題の化合物(74mg,82%)を白色固体として得た。
TOF/MS(ESI):calcd for C444814PNa [M+
Na] 924.3, found 924.2.
3-(3,4,5-tris(octadecyloxy)benzamido)propionic acid 5′-
O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl (189 mg, 0.10 mmol) in THF (9 mL) )-2-propanol (1 mL) mixed solution was cooled to 0°C. under cooling,
4 mol/L-lithium borohydride-THF solution (0.125 mL, 0.50 mmol
) was added and stirred at room temperature for 1 hour. After adding an aqueous solution of ammonium chloride to the reaction solution, extraction was performed three times with dichloromethane. The organic layer was washed with brine, dried over anhydrous sodium sulfate, filtered to remove sodium sulfate, and the filtrate was concentrated. The solid precipitated by suspending the concentrated residue in acetonitrile was removed by filtration, and the filtrate was concentrated. The concentrated residue was purified by column chromatography (silica gel, developing solvent: chloroform-methanol) to give the title compound (74 mg, 82%) as a white solid.
TOF/MS ( ESI): calcd for C44H48N5O14PNa [ M +
Na] + 924.3, found 924.2.

〔実施例7-12〕
(6-(N-ベンゾイルアデニン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル
)メチル P-(2-(ヒドロキシメチル)-6-チミン-1-イル)モルホリノ)-N
,N-ジメチルホスホノアミダートの合成

Figure 0007296636000107
[Example 7-12]
(6-(N 6 -benzoyladenin-9-yl)-4-tritylmorpholin-2-yl)methyl P-(2-(hydroxymethyl)-6-thymin-1-yl)morpholino)-N
, N-dimethylphosphonoamidate synthesis
Figure 0007296636000107

実施例7-7の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(4-(((6-(N-ベンゾイルアデニン-9-イル)-4
-トリチルモルホリン-2-イル)メトキシ)(ジメチルアミノ)ホスホリル)-6-(
チミン-1-イル)モルホリン-2-イル)メチル(0.379g,0.20mmol)
から表題の化合物(0.114g,61%)を白色固体として得た。
H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.87-1.95(m,6H),2.
01(s,1H),2.45-2.64(m,7H),3.06-4.04(m,9H)
,4.43-4.46(m,1H),5.52(dd,1H,J=2.4,10.4Hz
),6.41(dt,1H,J=2.4,10.0Hz),7.05-7.64(m,1
9H),8.03(d,2H,J=8.4Hz),8.09(s,1H),8.71-8
.80(m,1H),9.69-9.78(m,1H),10.28(s,1H),10
.75-11.05(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ12.41,12.45,36.54
,36.58,36.62,36.66,44.61,44,82,47.13,48.
68,48.78,52.80,52.85,62.72,62.78,65.46,6
5.61,75.07,75.14,75.45,75.52,78.06,78.13
,78.27,78.33,79.60,79.65,80.01,80.49,110
.96,111.03,122.47,122.78,126.65,128.00,1
28.24,128.41,128.49,128.62,129.17,132.61
,132.69,133.48,133.64,134.86,134.96,140.
94,149.54,149.75,149.82,150.02,151.23,15
1.42,152.66,152.75,163.75,163.79,165.25.
TOF/MS(ESI):calcd for C485110PNa [M+
Na] 949.3527, found 949.3545.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (4-(((6-(N 6 -benzoyladenin-9-yl)-4) was prepared according to the method of Example 7-7.
-tritylmorpholin-2-yl)methoxy)(dimethylamino)phosphoryl)-6-(
Thymin-1-yl)morpholin-2-yl)methyl (0.379 g, 0.20 mmol)
to give the title compound (0.114 g, 61%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ 0.87-1.95 (m, 6H),2.
01 (s, 1H), 2.45-2.64 (m, 7H), 3.06-4.04 (m, 9H)
, 4.43-4.46(m, 1H), 5.52(dd, 1H, J=2.4, 10.4Hz
), 6.41 (dt, 1H, J = 2.4, 10.0Hz), 7.05-7.64 (m, 1
9H), 8.03 (d, 2H, J = 8.4Hz), 8.09 (s, 1H), 8.71-8
. 80 (m, 1H), 9.69-9.78 (m, 1H), 10.28 (s, 1H), 10
. 75-11.05 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ12.41, 12.45, 36.54
, 36.58, 36.62, 36.66, 44.61, 44, 82, 47.13, 48.
68, 48.78, 52.80, 52.85, 62.72, 62.78, 65.46, 6
5.61, 75.07, 75.14, 75.45, 75.52, 78.06, 78.13
, 78.27, 78.33, 79.60, 79.65, 80.01, 80.49, 110
. 96, 111.03, 122.47, 122.78, 126.65, 128.00, 1
28.24, 128.41, 128.49, 128.62, 129.17, 132.61
, 132.69, 133.48, 133.64, 134.86, 134.96, 140.
94, 149.54, 149.75, 149.82, 150.02, 151.23, 15
1.42, 152.66, 152.75, 163.75, 163.79, 165.25.
TOF / MS (ESI): calcd for C48H51N10O8PNa [ M+
Na] + 949.3527, found 949.3545.

〔実施例7-13〕
(6-(N-ベンゾイルシトシン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル
)メチルP-(2-(ヒドロキシメチル)-6-(N-イソブチリルグアニン-9-イ
ル)モルホリノ)-N,N-ジメチルホスホノアミダートの合成

Figure 0007296636000108
[Example 7-13]
(6-(N 4 -benzoylcytosin-1-yl)-4-tritylmorpholin-2-yl)methyl P-(2-(hydroxymethyl)-6-(N 2 -isobutyrylguanin-9-yl) Synthesis of morpholino)-N,N-dimethylphosphonoamidate
Figure 0007296636000108

実施例7-7の方法に従って、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベ
ンゾイル)オキシ)酢酸(4-(((6-(N-ベンゾイルシトシン-1-イル)-4
-トリチルモルホリン-2-イル)メトキシ)(ジメチルアミノ)ホスホリル)-6-(
-イソブチリルグアニン-9-イル)モルホリン-2-イル)メチル(0.197g
,0.10mmol)から表題の化合物(0.052g,52%)を白色固体として得た

H-NMR(400MHz,CDCl):δ0.78-1.55(m,9H),2.
37-2.95(m,8H),3.08-3.94(m,9H),4.13-4.43(
m,2H),5.42-5.54(m,1H),6.22-6.38(m,1H),7.
05-7.80(m,19H),7.93(d,2H,J=7.2Hz),9.58-9
.92(brs,1H),10.64-10.86(brs,1H),12.05-12
.21(brs,1H).
13C-NMR(100MHz,CDCl):δ13.91,14.12,19.03
,19.06,19.28,22.69,25.76,28.55,29.36,29.
70,31.72,31.92,35.99,36.05,36.62,36.65,3
6.69,44.63,44.92,47.15,47.56,48.44,48.79
,52.26,52.42,61.85,62.58,62.73,65.66,66.
15,71.09,71.69,75.40,75.86,75.91,78.19,7
9.73,80.56,81.37,81.76,97.87,120.56,120.
92,126.65,127.96,128.04,128.70,128.83,12
8.92,129.13,131.00,132.21,132.97,133.02,
133.14,136.66,137.43,144.02,144.54,147.9
2,147.98,148.00,154.99,155.57,155.62,162
.69,163.09,167.24,179.62,179.86.
TOF/MS(ESI):calcd for C515611PNa [M+
Na] 1020.3898, found 1020.3942.
2-((3,4,5-Tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid (4-(((6-(N 4 -benzoylcytosin-1-yl)-4) was prepared according to the method of Example 7-7.
-tritylmorpholin-2-yl)methoxy)(dimethylamino)phosphoryl)-6-(
N 2 -isobutyrylguanin-9-yl)morpholin-2-yl)methyl (0.197 g
, 0.10 mmol) gave the title compound (0.052 g, 52%) as a white solid.
1 H-NMR (400 MHz, CDCl 3 ): δ 0.78-1.55 (m, 9H),2.
37-2.95 (m, 8H), 3.08-3.94 (m, 9H), 4.13-4.43 (
m, 2H), 5.42-5.54 (m, 1H), 6.22-6.38 (m, 1H), 7.
05-7.80 (m, 19H), 7.93 (d, 2H, J=7.2Hz), 9.58-9
. 92 (brs, 1H), 10.64-10.86 (brs, 1H), 12.05-12
. 21 (brs, 1H).
13 C-NMR (100 MHz, CDCl 3 ): δ 13.91, 14.12, 19.03
, 19.06, 19.28, 22.69, 25.76, 28.55, 29.36, 29.
70, 31.72, 31.92, 35.99, 36.05, 36.62, 36.65, 3
6.69, 44.63, 44.92, 47.15, 47.56, 48.44, 48.79
, 52.26, 52.42, 61.85, 62.58, 62.73, 65.66, 66.
15, 71.09, 71.69, 75.40, 75.86, 75.91, 78.19, 7
9.73, 80.56, 81.37, 81.76, 97.87, 120.56, 120.
92, 126.65, 127.96, 128.04, 128.70, 128.83, 12
8.92, 129.13, 131.00, 132.21, 132.97, 133.02,
133.14, 136.66, 137.43, 144.02, 144.54, 147.9
2, 147.98, 148.00, 154.99, 155.57, 155.62, 162
. 69, 163.09, 167.24, 179.62, 179.86.
TOF/MS ( ESI ): calcd for C51H56N11O9PNa [M+
Na] + 1020.3898, found 1020.3942.

〔実施例7-14〕
8mer体の脱Tag化の確認
(1)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O
-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2
-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノ
エトキシ)(N-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベ
ンゾイルデオキシアデノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホ
リル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベ
ンゾイルデオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシアデ
ノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’
-イル(8mer体)の合成
アルゴン下で、2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキ
シ)酢酸チミジン-3’-イル(1.19g,0.98mmol)、5’-O-(4,4
’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル-ホスホロアミダイト(1.46g,1
.96mmol)のジクロロメタン懸濁液(10mL)に5-ベンジルチオ-1H-テト
ラゾール(0.38g,1.96mmol)を加えたのち、室温で1.5時間撹拌した。
次に、ピリジン(0.93g,11.77mmol)と水(0.11g,5.89mmo
l)、ヨウ素(1.25g,4.91mmol)を加えたのち、室温で4時間撹拌した。
反応液に1.2mol/L-アスコルビン酸水溶液(3mL)を加えたのち、室温で15
分間撹拌した。反応液にアセトニトリル(24mL)を滴下することで析出した固体をろ
過した。固体をアセトニトリル-ジクロロメタン混合溶媒で洗浄したのち、50℃で減圧
乾燥し、DMTr体(2.22g)を得た。
[Example 7-14]
Confirmation of 8-mer detagging (1) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-( (2-cyanoethoxy)(5′-O
-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2
-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(N 4 -benzoyldeoxycytidine-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyl deoxyadenosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl)phosphoryl )-N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidine-3′
-yl (8mer form) Under argon, 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)thymidin-3′-yl acetate (1.19 g, 0.98 mmol), 5′ -O-(4,4
'-Dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl-phosphoramidite (1.46 g, 1
. 96 mmol) in dichloromethane (10 mL) was added with 5-benzylthio-1H-tetrazole (0.38 g, 1.96 mmol) and stirred at room temperature for 1.5 hours.
Then pyridine (0.93 g, 11.77 mmol) and water (0.11 g, 5.89 mmol)
l), iodine (1.25 g, 4.91 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 4 hours.
After adding 1.2 mol/L-ascorbic acid aqueous solution (3 mL) to the reaction solution,
Stir for a minute. Acetonitrile (24 mL) was added dropwise to the reaction solution, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with an acetonitrile-dichloromethane mixed solvent and then dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a DMTr form (2.22 g).

次に、DMTr体(1.83g,0.98mmol)のジクロロメタン懸濁液(15m
L)にピロール(0.33g,4.91mmol)、トリフルオロ酢酸(0.13g,1
.18mmol)を加えたのち、室温で1.5時間撹拌した。反応液にアセトニトリル(
37mL)とメタノール(18mL)を滴下することで析出した固体をろ過した。固体を
アセトニトリル-メタノール-ジクロロメタン混合溶媒で洗浄したのち、50℃で減圧乾
燥し、2mer体(1.48g)を得た。
Next, a suspension of DMTr form (1.83 g, 0.98 mmol) in dichloromethane (15 mL
L), pyrrole (0.33 g, 4.91 mmol), trifluoroacetic acid (0.13 g, 1
. 18 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1.5 hours. Acetonitrile (
37 mL) and methanol (18 mL) were added dropwise, and the precipitated solid was filtered. The solid was washed with a mixed solvent of acetonitrile-methanol-dichloromethane and then dried under reduced pressure at 50° C. to obtain a 2mer compound (1.48 g).

上記と同様の操作を6回繰り返して、8mer体(2.94g)を得た。
TOF/MS(ESI): m/z 2106.3 [M+2H]2+, 1403.9
[M+3H]3+
An operation similar to the above was repeated six times to obtain an 8-mer (2.94 g).
TOF/MS (ESI): m/z 2106.3 [M+2H] <2+> , 1403.9
[M+3H] 3+ .

〔実施例7-15〕
(2)2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸
5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O
-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2
-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノ
エトキシ)(N-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベ
ンゾイルデオキシアデノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホ
リル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベ
ンゾイルデオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシアデ
ノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’
-イルの脱Tag化
N,N-ジイソプロピルエチルアミン(65mg,0.50mmol)をジクロロメタ
ン(0.4mL)とTHF(0.2mL)、2-プロパノール(0.04mL)の混合溶
液に加え、0~-10℃に冷却した。次に、4mol/L-水素化ホウ素リチウム-TH
F溶液(0.125mL,0.50mmol)を加えたのち、同温度で20分間撹拌し、
還元試薬を調製した。あらかじめ、0~-10℃に冷却した8mer体(84mg,0.
02mmol)のジクロロメタン(4.2mL)-THF(1.8mL)-2-プロパノ
ール(0.4mL)混合液に還元試薬を添加し、同温度で40分間撹拌した。反応液に1
0%塩化アンモニウム水溶液(5mL)を加えたのち、ジクロロメタンで抽出した。有機
層を食塩水で洗浄したのち、有機層を濃縮、乾固した。濃縮残渣をジクロロメタンに懸濁
させることで析出した固体をろ取した。固体をジクロロメタンで洗浄したのち、減圧乾燥
し、5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’
-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-(
(2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シアノエトキシ)(5’-O-((2-シ
アノエトキシ)(N-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N
-ベンゾイルデオキシアデノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホ
スホリル)-N-イソブチリルデオキシグアノシン-3’-イル)ホスホリル)-N
-ベンゾイルデオキシシチジン-3’-イル)ホスホリル)-N-ベンゾイルデオキシ
アデノシン-3’-イル)ホスホリル)チミジン-3’-イル)ホスホリル)チミジン(
25mg)を得た。
TOF/MS(ESI): m/z 1621.9 [M+2H]2+, 1081.6
[M+3H]3+, 811.2 [M+4H]4+
[Example 7-15]
(2) 2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5 '-O
-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2
-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(N 4 -benzoyldeoxycytidine-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyl deoxyadenosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)-N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl)phosphoryl )-N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidine-3′
-Detag of yl N,N-diisopropylethylamine (65 mg, 0.50 mmol) was added to a mixed solution of dichloromethane (0.4 mL), THF (0.2 mL), and 2-propanol (0.04 mL). Cooled to -10°C. Next, 4 mol / L-lithium borohydride-TH
After adding F solution (0.125 mL, 0.50 mmol), the mixture was stirred at the same temperature for 20 minutes,
A reducing reagent was prepared. The 8-mer (84 mg, 0.25 mg, 0.25 mg,
02 mmol) of dichloromethane (4.2 mL)-THF (1.8 mL)-2-propanol (0.4 mL) mixture was added with the reducing reagent and stirred at the same temperature for 40 minutes. 1 in reaction liquid
After adding 0% aqueous ammonium chloride solution (5 mL), the mixture was extracted with dichloromethane. After washing the organic layer with brine, the organic layer was concentrated and dried. The solid precipitated by suspending the concentrated residue in dichloromethane was collected by filtration. After washing the solid with dichloromethane, it is dried under reduced pressure, and 5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'
-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-((2-cyanoethoxy)(5'-O-(
(2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(5′-O-((2-cyanoethoxy)(N 4 -benzoyldeoxycytidin-3′-yl)phosphoryl)-N 6
-benzoyldeoxyadenosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)-N 2 -isobutyryldeoxyguanosin-3′-yl)phosphoryl)-N 4
-benzoyldeoxycytidin-3′-yl)phosphoryl)-N 6 -benzoyldeoxyadenosin-3′-yl)phosphoryl)thymidin-3′-yl)phosphoryl)thymidine (
25 mg) was obtained.
TOF/MS (ESI): m/z 1621.9 [M+2H] <2+> , 1081.6
[M+3H] 3+ , 811.2 [M+4H] 4+ .

8.脱Tag化進行速度の比較
〔実施例8〕
2-((3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンゾイル)オキシ)酢酸5’-
O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル(A-Tag-dT-DM
Trと略す)とコハク酸3,4,5-トリス(オクタデシルオキシ)ベンジル5’-O-
(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジン-3’-イル(S-Tag-dT-DMTr
と略す)について、下記に示すアンモニア性塩基性条件下での脱Tag化進行速度を比較
した。
8. Comparison of detagging progress rate [Example 8]
2-((3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl)oxy)acetic acid 5′-
O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl (A-Tag-dT-DM
Tr) and 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyl succinate 5′-O-
(4,4′-dimethoxytrityl)thymidin-3′-yl (S-Tag-dT-DMTr
(abbreviated as )) were compared in terms of the rate of progress of detagging under the following ammoniacal basic conditions.

<脱Tag化条件>
A-Tag-dT-DMTr or S-Tag-dT-DMTr 50μmol
28%アンモニア水 2.0 mL
エタノール 0.5 mL
THF 0.5 mL
反応温度 35℃
<Detagging conditions>
A-Tag-dT-DMTr or S-Tag-dT-DMTr 50 μmol
28% ammonia water 2.0 mL
ethanol 0.5 mL
THF 0.5 mL
Reaction temperature 35°C

<dT-DMTr(脱Tag体)の生成率>

Figure 0007296636000109
<Production rate of dT-DMTr (untagged)>
Figure 0007296636000109

<HPLC条件>
カラム :Inertsil WP300 Diol(5μm,4.6Φ×150mm

流速 :1.0 mL/min
移動相 :n-hexane, CHCl-MeOH (1/1)
Gradient: 0-11 min; 5 to 30%(CHCl
-MeOH)
検出方法:UV(λ=254nm)
保持時間:A-Tag-dT-DMTr:Rt=4.23min,S-Tag-dT-
DMTr:Rt=4.17min,dT-DMTr:Rt=9.40min
生成率:(dT-DMTr)/[(A-Tag-dT-DMTr or S-Tag-
dT-DMTr)+(dT-DMTr)]
<HPLC conditions>
Column: Inertsil WP300 Diol (5 μm, 4.6Φ×150 mm
)
Flow rate: 1.0 mL/min
Mobile phase: n-hexane, CHCl 3 -MeOH (1/1)
Gradient: 0-11 min; 5 to 30% ( CHCl3
-MeOH)
Detection method: UV (λ = 254 nm)
Retention time: A-Tag-dT-DMTr: Rt = 4.23 min, S-Tag-dT-
DMTr: Rt = 4.17 min, dT-DMTr: Rt = 9.40 min
Production rate: (dT-DMTr) / [(A-Tag-dT-DMTr or S-Tag-
dT-DMTr) + (dT-DMTr)]

以上のように、A-Tagはオリゴ核酸合成の一般的な脱保護条件において、コハク酸
エステル体よりも速やかに脱Tag化されることを確認した。
As described above, it was confirmed that A-Tag is detagged more rapidly than the succinate under general deprotection conditions for oligonucleic acid synthesis.

9.合成例まとめ
以下、上述の各実施例における合成例をまとめたものを示す。
9. Summary of Synthesis Examples A summary of synthesis examples in each of the above-described examples is shown below.

9.1 3量体の合成

Figure 0007296636000110
9.1 Synthesis of trimers
Figure 0007296636000110

上記表2に示されるように、種々のTag結合3量体DNAオリゴマーを高い収率で得
ることができた。
As shown in Table 2 above, various Tag-bound trimeric DNA oligomers could be obtained in high yields.

9.2 2量体の合成

Figure 0007296636000111
9.2 Dimer Synthesis
Figure 0007296636000111

上記表3に示されるように、種々のTag結合オリゴヌクレオチド(2量体)を高い収
率で得ることができた。
As shown in Table 3 above, various Tag-linked oligonucleotides (dimers) could be obtained in high yields.

9.3 2量体の合成

Figure 0007296636000112
9.3 Dimer Synthesis
Figure 0007296636000112

上記表4に示されるように、種々のTag結合オリゴヌクレオチド(2量体)を高い収
率で得ることができた。
As shown in Table 4 above, various Tag-linked oligonucleotides (dimers) could be obtained in high yields.

9.4 2量体の合成

Figure 0007296636000113
9.4 Dimer Synthesis
Figure 0007296636000113

上記表5に示されるように、種々のTag結合オリゴヌクレオチド(2量体)を高い収
率で得ることができた。
As shown in Table 5 above, various Tag-linked oligonucleotides (dimers) could be obtained in high yields.

9.5 20量体の合成ならびに全脱保護

Figure 0007296636000114
9.5 Synthesis of 20-mer and Total Deprotection
Figure 0007296636000114

本発明のアルコキシフェニル誘導体およびTag化ヌクレオチド保護体を用いることに
より、上記のTag化オリゴヌクレオチド保護体(20量体)が簡易に得ることができた
。さらに、Tag部分ならびに保護基を除去することにより、オリゴヌクレオチドが簡便
に得ることができた。
By using the alkoxyphenyl derivative and tagged nucleotide protected body of the present invention, the tagged oligonucleotide protected body (20-mer) could be easily obtained. Furthermore, the oligonucleotide could be easily obtained by removing the Tag portion and the protecting group.

9.6 3量体の脱Tag

Figure 0007296636000115
9.6 Trimer Detag
Figure 0007296636000115

上記表6に示されるように、種々のTag化オリゴヌクレオチド保護体(3量体)のT
ag部分を除去し、各オリゴヌクレオチド保護体(3量体)を高い収率で得ることができ
た。
As shown in Table 6 above, T of various tagged oligonucleotide protected bodies (trimers)
By removing the ag portion, each protected oligonucleotide (trimer) could be obtained in high yield.

9.7 2量体の脱Tag

Figure 0007296636000116
9.7 Detagging Dimers
Figure 0007296636000116

上記表7に示されるように、種々のTag化オリゴヌクレオチド保護体(2量体)のT
ag部分を除去し、各オリゴヌクレオチド保護体(2量体)を高い収率で得ることができ
た。
As shown in Table 7 above, T of various tagged oligonucleotide protected bodies (dimers)
By removing the ag portion, each protected oligonucleotide (dimer) could be obtained in high yield.

9.8 2量体の脱Tag

Figure 0007296636000117
9.8 Detagging Dimers
Figure 0007296636000117

上記表8に示されるように、種々のTag化オリゴヌクレオチド保護体(2量体)のT
ag部分を除去し、各オリゴヌクレオチド保護体(2量体)を高い収率で得ることができ
た。
As shown in Table 8 above, the T of various tagged oligonucleotide protected bodies (dimers)
By removing the ag portion, each protected oligonucleotide (dimer) could be obtained in high yield.

9.9 2量体の脱Tag

Figure 0007296636000118
9.9 Detagging Dimers
Figure 0007296636000118

上記表9に示されるように、種々のTag化オリゴヌクレオチド保護体(2量体)のT
ag部分を除去し、各オリゴヌクレオチド保護体(2量体)を高い収率で得ることができ
た。
As shown in Table 9 above, the T of various tagged oligonucleotide protected bodies (dimers)
By removing the ag portion, each protected oligonucleotide (dimer) could be obtained in high yield.

本発明のアルコキシフェニル誘導体は、上記Tag化ヌクレオシド保護体およびTag
化ヌクレオチド保護体の製造等に利用可能である。また、本発明のTag化ヌクレオシド
保護体およびTag化ヌクレオチド保護体等、オリゴヌクレオチドの製造方法、ならびに
、Tag化ヌクレオシド保護体またはTag化ヌクレオチド保護体の選択的なTag部分
除去方法は、特に液相合成(疑似液相合成を含む)におけるオリゴヌクレオチド保護体の
合成に利用可能である。これらはいずれも、核酸医薬開発や生体機構解明等に非常に有用
な化合物および手法である。
The alkoxyphenyl derivative of the present invention is the above tagged nucleoside protected body and Tag
It can be used for the production of protected nucleotides. In addition, the method for producing an oligonucleotide such as a protected nucleoside and a protected nucleotide of the present invention, and a method for selectively removing a Tag portion of a protected nucleoside or a protected nucleotide of the present invention are particularly effective in a liquid phase. It can be used for the synthesis of oligonucleotide protectors in synthesis (including pseudo-liquid phase synthesis). All of these are extremely useful compounds and techniques for development of nucleic acid medicines, elucidation of biological mechanisms, and the like.

Claims (18)

下記部分構造で示されるTag部を有する、Tag化されたモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはTag化されたモノもしくはオリゴヌクレオチド。
Figure 0007296636000119
(式中、
Rは、それぞれ独立して、直鎖または分岐の、炭素数10~40のアルキル基を表す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
*は、モノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチドとの結合箇所を表し、
前記部分構造は、ヌクレオシドもしくはヌクレオチドの3’位に位置する炭素原子に置換する酸素原子に結合している、または、モルフォリノヌクレオシドもしくはモルフォリノヌクレオチドの5’位に位置する炭素原子に置換する酸素原子に結合している。)
A tagged mono- or oligonucleoside or a tagged mono- or oligonucleotide having a Tag portion shown in the partial structure below.
Figure 0007296636000119
(In the formula,
Each R independently represents a linear or branched alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
* represents the point of attachment to a mono- or oligonucleoside or mono- or oligonucleotide,
The partial structure is bound to the oxygen atom that replaces the carbon atom located at the 3'-position of the nucleoside or nucleotide, or the oxygen that replaces the carbon atom located at the 5'-position of the morpholinonucleoside or morpholinonucleotide. Bonded to an atom. )
前記部分構造は下記式で表される、請求項1に記載のモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチド。
Figure 0007296636000120
(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、直鎖または分岐の、炭素数10~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。)
2. The mono- or oligonucleoside or mono- or oligonucleotide according to claim 1, wherein said partial structure is represented by the following formula.
Figure 0007296636000120
(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently represent a linear or branched alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. )
前記部分構造は、ヌクレオシドまたはヌクレオチドの3’位に位置する炭素原子に置換する酸素原子に結合している、請求項1または2に記載のモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチド。 3. The mono- or oligonucleoside or mono- or oligonucleotide according to claim 1 or 2, wherein said partial structure is bound to the oxygen atom substituting the carbon atom located at the 3'-position of the nucleoside or nucleotide. 前記部分構造は、モルフォリノヌクレオシドまたはモルフォリノヌクレオチドの5’位に位置する炭素原子に置換する酸素原子に結合している、請求項1または2に記載のモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチド。 3. The mono- or oligonucleoside or mono- or oligonucleotide according to claim 1 or 2, wherein the partial structure is bound to the oxygen atom substituting the carbon atom located at the 5'-position of the morpholinonucleoside or morpholinonucleotide. 前記ヌクレオシドまたはヌクレオチドは、ホスフェート部分またはホスホロチオエート部分を有する、請求項1~3のいずれか1項に記載のモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチド。 A mono- or oligonucleoside or mono- or oligonucleotide according to any one of claims 1 to 3, wherein said nucleoside or nucleotide has a phosphate or phosphorothioate moiety. 前記ヌクレオシドまたはヌクレオチドは、Baseとして、アデニル基、グアニル基、シチジル基、チミジル基、または、ウラシル基を含む、請求項1~5のいずれか1項に記載のモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチド。 The mono- or oligonucleoside according to any one of claims 1 to 5, wherein the nucleoside or nucleotide contains an adenyl group, a guanyl group, a citidyl group, a thymidyl group, or a uracil group as Base. or mono- or oligonucleotides. nが、1、または、2である、請求項1~6のいずれか1項に記載のモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチド。 The mono- or oligonucleoside or mono- or oligonucleotide according to any one of claims 1 to 6, wherein n is 1 or 2. mが、2~4の整数である、請求項1、3~7のいずれか1項に記載のモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチド。 The mono- or oligonucleoside or mono- or oligonucleotide according to any one of claims 1, 3-7, wherein m is an integer of 2-4. 請求項1~8のいずれか1項に記載のTag化されたモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはTag化されたモノもしくはオリゴヌクレオチドを還元処理する工程を含む、モノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチドの製造方法。 A method for producing a mono- or oligonucleoside or mono- or oligonucleotide, comprising a step of reducing the tagged mono- or oligonucleoside or the tagged mono- or oligonucleotide according to any one of claims 1 to 8 . 前記還元処理が、ホウ素含有還元剤を用いる、または、ホウ素含有還元剤とアミンとを用いる、請求項9に記載の製造方法。 10. The production method according to claim 9, wherein the reduction treatment uses a boron-containing reducing agent or uses a boron-containing reducing agent and an amine. 前記ホウ素含有還元剤が、水素化ホウ素リチウム、水素化ホウ素ナトリウム、水素化トリエチルホウ素リチウム、水素化ホウ素テトラブチルアンモニウムである、請求項10に記載の製造方法。 11. The production method according to claim 10 , wherein the boron-containing reducing agent is lithium borohydride, sodium borohydride, lithium triethylborohydride, or tetrabutylammonium borohydride. 請求項1~8のいずれか1項に記載のTag化されたモノもしくはオリゴヌクレオシドまたはTag化されたモノもしくはオリゴヌクレオチドを還元処理する工程を含む、
前記Tag部の除去方法。
A step of reducing the tagged mono- or oligonucleoside or tagged mono- or oligonucleotide according to any one of claims 1 to 8,
A method for removing the Tag portion.
前記還元処理が、ホウ素含有還元剤を用いる、または、ホウ素含有還元剤とアミンとを用いる、請求項12に記載の除去方法。 13. The removal method of claim 12, wherein the reduction treatment uses a boron-containing reducing agent or uses a boron-containing reducing agent and an amine. 前記ホウ素含有還元剤が、水素化ホウ素リチウム、水素化ホウ素ナトリウム、水素化トリエチルホウ素リチウム、水素化ホウ素テトラブチルアンモニウムである、請求項13に記載の除去方法。 14. The removal method of claim 13 , wherein the boron-containing reducing agent is lithium borohydride, sodium borohydride, lithium triethylborohydride, tetrabutylammonium borohydride. 下記部分構造で示されるTag部を有する、Tag化剤。
Figure 0007296636000121
(式中、
Rは、それぞれ独立して、直鎖または分岐の、炭素数10~40のアルキル基を表す。
mは、1~5の整数を表す。mが2以上の場合には、複数存在するROは同一、または、異なっていてもよい。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
*は、脱離基との結合箇所を表し、前記脱離基は、ハロゲン、イミダゾール基、または、アルコキシ基である。)
A tagging agent having a tag portion represented by the partial structure below.
Figure 0007296636000121
(In the formula,
Each R independently represents a linear or branched alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
m represents an integer of 1 to 5; When m is 2 or more, multiple ROs may be the same or different.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
* represents a bonding site with a leaving group, and the leaving group is a halogen, an imidazole group, or an alkoxy group. )
前記部分構造は下記式で表される、請求項15に記載のTag化剤。
Figure 0007296636000122
(式中、
、R、および、Rは、それぞれ独立して、直鎖または分岐の、炭素数10~40のアルキル基を表す。
Xは、O、S、NH、または、NRを表す。
nは、1~4の整数を表す。
は、置換されていてもよい、炭素数1~6のアルキル基を表す。
*は、脱離基との結合箇所を表す。)
16. The tagging agent according to claim 15, wherein the partial structure is represented by the following formula.
Figure 0007296636000122
(In the formula,
R 1 , R 2 and R 3 each independently represent a linear or branched alkyl group having 10 to 40 carbon atoms.
X represents O, S, NH, or NRN .
n represents an integer of 1-4.
R N represents an optionally substituted alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
* represents a bonding site with a leaving group. )
前記nは、1または2である、請求項15または16に記載のTag化剤。 17. The tagging agent according to claim 15 or 16, wherein said n is 1 or 2. モノもしくはオリゴヌクレオシドまたはモノもしくはオリゴヌクレオチドのTag化に用いられる、請求項15~17のいずれか1項に記載のTag化剤。 The tagging agent according to any one of claims 15 to 17, which is used for tagging mono- or oligonucleosides or mono- or oligonucleotides.
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