JP7209968B2 - 画像処理装置、画像処理装置の作動方法、画像処理装置の作動プログラム - Google Patents
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Description
図1において、本開示の技術に係る「ラマン散乱測定装置」の一例であるSERS測定装置10は、生体標本BSを試料とし、生体標本BSの生体組織の性状に応じた領域を判定するための病理診断に用いられる。生体標本BSは、例えば、癌が疑われる生体(ヒト、マウス等)の組織の一部を、メス等で切除して得られた組織切片である。SERS測定装置10では、ヘマトキシリンとエオシンといった色素で染色される前の生体標本BSが用いられる。以下、この非染色の生体標本BSを、生体標本BS_NSと表記する。
図17に示す第2実施形態では、第1光学顕微鏡画像MI_1および第2光学顕微鏡画像MI_2の各々において、同じ箇所であると推定される3つ以上の点のユーザの指定を受け付ける。そして、受け付けた3つ以上の点に基づいて座標変換行列MTCを導出する。
生体標本の少なくとも一部である非染色の測定領域をラマン散乱測定装置によって二次元走査して得られた、第1座標系で表されるラマンスペクトルデータ群を取得する第1取得プロセッサと、
前記ラマン散乱測定装置に備え付けの第1光学顕微鏡によって、少なくとも前記測定領域が非染色である前記生体標本を撮影した、前記第1座標系で表される第1光学顕微鏡画像を取得する第2取得プロセッサと、
少なくとも前記測定領域が色素で染色された前記生体標本を第2光学顕微鏡で撮影した、前記第1座標系とは異なる第2座標系で表される第2光学顕微鏡画像を取得する第3取得プロセッサと、
生体組織をその性状に応じた複数の領域に塗り分けるアノテーション作業を前記第2光学顕微鏡画像に対して行うことで作成された、前記第2座標系で表されるアノテーション画像を取得する第4取得プロセッサと、
前記第1光学顕微鏡画像および前記第2光学顕微鏡画像に基づいて、前記第1座標系と前記第2座標系の座標変換行列を導出する導出プロセッサと、
前記座標変換行列を用いて前記アノテーション画像を座標変換し、前記ラマンスペクトルデータ群に対応する対応アノテーション画像を生成する生成プロセッサと、
前記ラマンスペクトルデータ群に前記対応アノテーション画像を関連付ける関連付け処理プロセッサと、
を備える画像処理装置。
11 光電場増強基板
12 測定部
13 第1光学顕微鏡
20 励起光源
21 コリメートレンズ
22 スプリッター
23 反射鏡
24 対物レンズ
25 ステージ
26 フィルター
27 集光レンズ
28 分光器
30 画像処理装置
31 光学顕微鏡装置
32 ステージ
33 第2光学顕微鏡
40 ストレージデバイス
41 CPU
45 第1取得部
46 第2取得部
47 第3取得部
48 第4取得部
49 処理部
50 生成部
51 関連付け処理部
55 導出部
60 第1算出部
61 第2算出部
62 抽出部
63 除外処理部
70 座標変換部
71 切り出し処理部
72 解像度変換処理部
80 対応点指定画面
81 メッセージ
82 対応点指定ボタン
83 やり直しボタン
84 決定ボタン
90 受付部
a~f 係数
AI アノテーション画像
AI_A 座標変換後のアノテーション画像
AI_C 対応アノテーション画像
AI_R 解像度変換画像
AI_U 切り出し画像
BS 生体標本
BS_NS 非染色の生体標本
BS_S 染色された生体標本
CP1、CP2 第1対応点、第2対応点
CP1_O、CP2_O 第1外れ点、第2外れ点
DR 病理専門医
EL 励起光
F1、F2 第1特徴量、第2特徴量
G グラフ
IMTC 座標変換逆行列
M 測定位置のY1軸方向の個数
MA 測定領域
MI_1、MI_2 第1光学顕微鏡画像、第2光学顕微鏡画像
MP 測定位置
MTC 座標変換行列
N 測定位置のX1軸方向の個数
RSD ラマンスペクトルデータ
RSDG ラマンスペクトルデータ群
RSL ラマン散乱光
SI SERS画像
SP1、SP2 第1指定点、第2指定点
ST10、ST20、ST30、ST40、ST50、ST60、ST70、ST80、ST90、ST100、ST110、ST200、ST210、ST220、ST230、ST240、ST250、ST260 ステップ
X1、Y1 第1座標系
X2、Y2 第2座標系
Claims (9)
- 生体標本の少なくとも一部である非染色の測定領域をラマン散乱測定装置によって二次元走査して得られた、第1座標系で表されるラマンスペクトルデータ群を取得する第1取得部と、
前記ラマン散乱測定装置に備え付けの第1光学顕微鏡によって、少なくとも前記測定領域が非染色である前記生体標本を撮影した、前記第1座標系で表される第1光学顕微鏡画像を取得する第2取得部と、
少なくとも前記測定領域が色素で染色された前記生体標本を第2光学顕微鏡で撮影した、前記第1座標系とは異なる第2座標系で表される第2光学顕微鏡画像を取得する第3取得部と、
生体組織をその性状に応じた複数の領域に塗り分けるアノテーション作業を前記第2光学顕微鏡画像に対して行うことで作成された、前記第2座標系で表されるアノテーション画像を取得する第4取得部と、
前記第1光学顕微鏡画像および前記第2光学顕微鏡画像に基づいて、前記第1座標系と前記第2座標系の座標変換行列を導出する導出部と、
前記座標変換行列を用いて前記アノテーション画像を座標変換し、前記ラマンスペクトルデータ群に対応する対応アノテーション画像を生成する生成部と、
前記ラマンスペクトルデータ群に前記対応アノテーション画像を関連付ける関連付け処理部と、
を備える画像処理装置。 - 前記第1光学顕微鏡画像の画像特徴量である第1特徴量を算出する第1算出部と、
前記第2光学顕微鏡画像の画像特徴量である第2特徴量を算出する第2算出部と、
前記第1特徴量と前記第2特徴量が設定条件を満たす対応点を、前記第1光学顕微鏡画像および前記第2光学顕微鏡画像の各々から抽出する抽出部とを備え、
前記導出部は、前記対応点に基づいて前記座標変換行列を導出する請求項1に記載の画像処理装置。 - 前記抽出部において抽出した前記対応点からノイズである外れ点を除外する処理を実施する除外処理部を備え、
前記導出部は、前記外れ点除外後の前記対応点に基づいて前記座標変換行列を導出する請求項2に記載の画像処理装置。 - 前記第1光学顕微鏡画像および前記第2光学顕微鏡画像の各々において、同じ箇所であると推定される3つ以上の点のユーザの指定を受け付ける受付部を備え、
前記導出部は、前記受付部において受け付けた前記3つ以上の点に基づいて前記座標変換行列を導出する請求項1に記載の画像処理装置。 - 前記生成部は、前記座標変換後のアノテーション画像に対して、前記測定領域に合わせた切り出し処理を実施することで、前記対応アノテーション画像を生成する請求項1から請求項4のいずれか1項に記載の画像処理装置。
- 前記生成部は、前記座標変換後のアノテーション画像に対して、前記ラマンスペクトルデータ群の解像度に合わせた解像度変換処理を実施することで、前記対応アノテーション画像を生成する請求項1から請求項5のいずれか1項に記載の画像処理装置。
- 前記ラマンスペクトルデータ群は、表面増強ラマン散乱測定装置で測定されたものである請求項1から請求項6のいずれか1項に記載の画像処理装置。
- 生体標本の少なくとも一部である非染色の測定領域をラマン散乱測定装置によって二次元走査して得られた、第1座標系で表されるラマンスペクトルデータ群を取得する第1取得ステップと、
前記ラマン散乱測定装置に備え付けの第1光学顕微鏡よって、少なくとも前記測定領域が非染色である前記生体標本を撮影した、前記第1座標系で表される第1光学顕微鏡画像を取得する第2取得ステップと、
少なくとも前記測定領域が色素で染色された前記生体標本を第2光学顕微鏡で撮影した、前記第1座標系とは異なる第2座標系で表される第2光学顕微鏡画像を取得する第3取得ステップと、
生体組織をその性状に応じた複数の領域に塗り分けるアノテーション作業を前記第2光学顕微鏡画像に対して行うことで作成された、前記第2座標系で表されるアノテーション画像を取得する第4取得ステップと、
前記第1光学顕微鏡画像および前記第2光学顕微鏡画像に基づいて、前記第1座標系と前記第2座標系の座標変換行列を導出する導出ステップと、
前記座標変換行列を用いて前記アノテーション画像を座標変換し、前記ラマンスペクトルデータ群に対応する対応アノテーション画像を生成する生成ステップと、
前記ラマンスペクトルデータ群に前記対応アノテーション画像を関連付ける関連付け処理ステップと、
を備える画像処理装置の作動方法。 - 生体標本の少なくとも一部である非染色の測定領域をラマン散乱測定装置によって二次元走査して得られた、第1座標系で表されるラマンスペクトルデータ群を取得する第1取得部と、
前記ラマン散乱測定装置に備え付けの第1光学顕微鏡によって、少なくとも前記測定領域が非染色である前記生体標本を撮影した、前記第1座標系で表される第1光学顕微鏡画像を取得する第2取得部と、
少なくとも前記測定領域が色素で染色された前記生体標本を第2光学顕微鏡で撮影した、前記第1座標系とは異なる第2座標系で表される第2光学顕微鏡画像を取得する第3取得部と、
生体組織をその性状に応じた複数の領域に塗り分けるアノテーション作業を前記第2光学顕微鏡画像に対して行うことで作成された、前記第2座標系で表されるアノテーション画像を取得する第4取得部と、
前記第1光学顕微鏡画像および前記第2光学顕微鏡画像に基づいて、前記第1座標系と前記第2座標系の座標変換行列を導出する導出部と、
前記座標変換行列を用いて前記アノテーション画像を座標変換し、前記ラマンスペクトルデータ群に対応する対応アノテーション画像を生成する生成部と、
前記ラマンスペクトルデータ群に前記対応アノテーション画像を関連付ける関連付け処理部として、
コンピュータを機能させる画像処理装置の作動プログラム。
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Citations (4)
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JP2013257282A (ja) | 2012-06-14 | 2013-12-26 | Canon Inc | 画像処理方法および装置 |
JP2016514869A (ja) | 2013-03-19 | 2016-05-23 | シレカ セラノスティクス エルエルシー | スペクトル画像による生物試料の分析方法およびシステム |
US20160252719A1 (en) | 2015-02-27 | 2016-09-01 | University Of Pittsburgh - Of The Commonwealth System Of Higher Education | Depth-resolved spatial-domain low-coherence quantitative phase microscopy for unstained tissue and cells |
JP2018535471A (ja) | 2015-09-23 | 2018-11-29 | コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェKoninklijke Philips N.V. | 正規化及びアーチファクト補正のための画像処理方法及び画像処理装置 |
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Non-Patent Citations (2)
Title |
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BENARD, A. et al.,Analyst,Vol.139, No.5,2014年03月07日,pp.1044-1056 |
MAVARANI, L. et al.,Analyst,2013年07月21日,Vol.138, No.14,pp.4035-4039 |
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