JP7162607B2 - 抗hla-dq2.5/8抗体およびセリアック病の治療のためのその使用 - Google Patents
抗hla-dq2.5/8抗体およびセリアック病の治療のためのその使用 Download PDFInfo
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Description
主要組織適合性複合体(MHC)クラスIIに属するヒト白血球抗原(HLA)は、HLA-DR、HLA-DPおよびHLA-DQ、例えばHLA-DQ2.5および/またはHLA-DQ8(本明細書において、以降「HLA-DQ2.5/8」と呼ぶ)アイソフォームを含み、これらは細胞表面上でα(アルファ)鎖とβ(ベータ)鎖から構成されるヘテロ二量体を形成している。セリアック病患者の大多数(>90%)はHLA-DQ2.5ハプロタイプの対立遺伝子を有し、残りの患者の大部分はHLA-DQ8対立遺伝子を備えている(非特許文献6)。これらのアイソフォームは、グルテンペプチドに対してより強い親和性を有すると考えられる。他のアイソフォームと同様に、HLA-DQ2.5およびHLA-DQ8分子は、外因性源に由来するプロセシングされた抗原を、T細胞上のT細胞受容体(TCR)に提示する。セリアック病患者では、パンなどの高グルテン食品の消化の結果として、免疫原性のグルテンペプチド、例えばグリアジンペプチドが形成される(非特許文献2)。該ペプチドは小腸上皮を通って粘膜固有層に輸送され、トランスグルタミナーゼ2(TG2)のような組織トランスグルタミナーゼによって脱アミド化される。脱アミド化されたグリアジンペプチドは抗原提示細胞(APC)によってプロセシングされ、APCがそれらをHLA-DQ2.5/8分子にロードする。ロードされたペプチドはHLA-DQ2.5/8拘束性T細胞に提示され、自然免疫反応と適応免疫反応を活性化する。これは、小腸粘膜の炎症性損傷ならびに様々なタイプの胃腸障害、栄養欠乏症、および全身症状を含む症状を引き起こす。
現在実施可能なセリアック病治療法は、生涯にわたるグルテンフリー食(GFD)の順守である。しかし、現実的には、GFDを用いたとしてもグルテン曝露を完全に排除することは困難である。これらの患者に対する許容グルテン量はわずか約10~50mg/日である(非特許文献10)。GFD製造では二次汚染が広範囲に生じる可能性があり、GFDを十分に順守している患者においてさえも、微量のグルテンがセリアック病の症状を引き起こすことがある。このような意図しないグルテン曝露のリスクの存在下で、GFDに対する補助療法が必要とされている。
補助療法を必要とする上記の状況下において、本発明は抗HLA-DQ2.5/8抗体およびその使用方法を提供する。
特定の態様では、本発明の抗HLA-DQ2.5/8抗体(本明細書において、以降「本発明の抗体」とも呼ぶ)は、ヒトHLA-DQ2.5/8およびサルMHC-DQに対して結合活性を有する。
特定の態様では、本発明の抗体は、HLA-DRまたはHLA-DPに対して結合活性を実質的に有しない。
特定の態様では、本発明の抗体は、インバリアント鎖とHLA-DQ2.5/8との複合体に対して結合活性を実質的に有しない。
特定の態様では、本発明の抗体は、グリアジンなどのグルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5/8に結合する。
特定の態様では、本発明の抗体は、HLA-DQ2.5/8とTCRとの間の結合に対して中和活性を有する。
特定の態様では、本発明の抗体は、HLA-DQ2.5/8とHLA-DQ2.5/8拘束性CD4+ T細胞との間の相互作用をブロックする。
特定の態様では、本発明の抗体は、インバリアント鎖による細胞内在化(すなわち、インバリアント鎖が介在する急速な細胞内在化)を受けない。
特定の態様では、本発明の抗体は、pH依存的な作成または最適化を有する。
特定の態様では、本発明の抗体は、ヒト化抗体である。
特定の態様では、本発明の抗体は、特定の重鎖相補性決定領域(HCDR)を有する。
特定の態様では、本発明の抗体は、特定の軽鎖相補性決定領域(LCDR)を有する。
特定の態様では、本発明は、特定のHCDRおよびLCDRを有する抗体が結合するのと同じHLA-DQ2.5/8エピトープに結合する抗体を提供する。
特定の態様では、本発明は、HLA-DQ2.5/8結合について、特定のHCDRおよびLCDRを有する抗体と競合する抗体を提供する。
特定の態様では、本発明は、治療上有効な量の本発明の抗体を患者に投与する工程を含む、セリアック病を治療するための方法を提供する。
特定の態様では、本発明の抗体は、セリアック病の治療における使用のためのものである。
特定の態様では、本発明は、本発明の抗体および薬学的に許容される担体を含む、セリアック病の治療における使用のための薬学的組成物を提供する。
特定の態様では、本発明は、抗HLA-DQ2.5/8抗体をスクリーニングする方法を提供し、該方法は、抗体が目的の抗原に対して結合活性を有するかどうかを試験し、該目的の抗原に対して結合活性を有する抗体を選択する工程;該抗体が目的でない抗原に対して特異的結合活性を有するかどうかを試験し、該目的でない抗原に対して特異的結合活性を有しない抗体を選択する工程を含む。
特定の態様では、上記方法は、該抗体がHLA-DQ2.5/8とTCRとの間の結合に対して中和活性を有するかどうかを試験し、中和活性を有する抗体を選択する工程をさらに含む。
特定の態様では、上記方法は、該抗体がグリアジンなどのグルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5/8に結合するかどうかを試験し、グルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5/8に結合する抗体を選択する工程をさらに含む。
特定の態様では、本発明は、セリアック病の治療における使用のための薬学的製剤を調製する方法を提供し、該方法は、薬学的に許容される担体と、上記のスクリーニング方法(の工程)によって選択された本発明の抗体とを混合する工程を含む。
[1] 抗HLA-DQ2.5/8抗体であって、
a) HLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有し;
b) HLA-DRまたはHLA-DPに対して結合活性を実質的に有さず;かつ
c)インバリアント鎖とHLA-DQ2.5との複合体に対して結合活性を実質的に有しない、
抗HLA-DQ2.5/8抗体。
[2] グルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有する、[1]の抗体。
[3] グルテンペプチドがグリアジンである、[2]の抗体。
[4] サルMHC-DQに対して結合活性を有する、[1]の抗体。
[5] HLA-DQ2.5とHLA-DQ2.5拘束性CD4+ T細胞との間の相互作用をブロックし、かつHLA-DQ8とHLA-DQ8拘束性CD4+ T細胞との間の相互作用をブロックする、[1]の抗体。
[6] インバリアント鎖が介在する細胞内在化を伴うことなく、グルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に結合する、抗HLA-DQ2.5/8抗体。
[7] 以下の(1)~(16)のいずれか1つである、[1]の抗体:
(1) 配列番号:9のHCDR1配列、配列番号:17のHCDR2配列、配列番号:25のHCDR3配列、配列番号:41のLCDR1配列、配列番号:49のLCDR2配列、および配列番号:57のLCDR3配列を含む抗体;
(2) 配列番号:1のVH配列および配列番号:33のVL配列を含む抗体;
(3) 配列番号:10のHCDR1配列、配列番号:18のHCDR2配列、配列番号:26のHCDR3配列、配列番号:42のLCDR1配列、配列番号:50のLCDR2配列、および配列番号:58のLCDR3配列を含む抗体;
(4) 配列番号:2のVH配列および配列番号:34のVL配列を含む抗体;
(5) 配列番号:11のHCDR1配列、配列番号:19のHCDR2配列、配列番号:27のHCDR3配列、配列番号:43のLCDR1配列、配列番号:51のLCDR2配列、および配列番号:59のLCDR3配列を含む抗体;
(6) 配列番号:3のVH配列および配列番号:35のVL配列を含む抗体;
(7) 配列番号:12のHCDR1配列、配列番号:20のHCDR2配列、配列番号:28のHCDR3配列、配列番号:44のLCDR1配列、配列番号:52のLCDR2配列、および配列番号:60のLCDR3配列を含む抗体;
(8) 配列番号:4のVH配列および配列番号:36のVL配列を含む抗体;
(9) 配列番号:13のHCDR1配列、配列番号:21のHCDR2配列、配列番号:29のHCDR3配列、配列番号:45のLCDR1配列、配列番号:53のLCDR2配列、および配列番号:61のLCDR3配列を含む抗体;
(10) 配列番号:5のVH配列および配列番号:37のVL配列を含む抗体;
(11) 配列番号:14のHCDR1配列、配列番号:22のHCDR2配列、配列番号:30のHCDR3配列、配列番号:46のLCDR1配列、配列番号:54のLCDR2配列、および配列番号:62のLCDR3配列を含む抗体;
(12) 配列番号:6のVH配列および配列番号:38のVL配列を含む抗体;
(13) 配列番号:16のHCDR1配列、配列番号:24のHCDR2配列、配列番号:32のHCDR3配列、配列番号:48のLCDR1配列、配列番号:56のLCDR2配列、および配列番号:64のLCDR3配列を含む抗体;
(14) 配列番号:8のVH配列および配列番号:40のVL配列を含む抗体;
(15) (1)~(14)のいずれか1つの抗体が結合するのと同じHLA-DQ2.5エピトープおよびHLA-DQ8エピトープに結合する、抗体;
(16) HLA-DQ2.5およびHLA-DQ8の結合について(1)~(14)のいずれか1つの抗体と競合する抗体。
[8] セリアック病を治療するための方法であって、治療上有効な量の[1]~[7]のいずれか1つの抗体を患者に投与する工程を含む、方法。
[9] セリアック病の治療における使用のための[1]~[7]のいずれか1つの抗体。
[10] セリアック病の治療における使用のための薬学的組成物であって、[1]~[7]のいずれか1つの抗体および薬学的に許容される担体を含む、組成物。
[11] 抗HLA-DQ2.5/8抗体をスクリーニングする方法であって、
(a) 抗体がHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有するかどうかを試験し、HLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有する抗体を選択する工程;
(b) 抗体がHLA-DRまたはHLA-DPに対して特異的結合活性を有するかどうかを試験し、HLA-DRまたはHLA-DPに対して特異的結合活性を実質的に有しない抗体を選択する工程;
(c) 抗体がインバリアント鎖とHLA-DQ2.5との複合体に対して特異的結合活性を有するかどうかを試験し、インバリアント鎖とHLA-DQ2.5との複合体に対して特異的結合活性を実質的に有しない抗体を選択する工程
を含む方法。
[12] 抗体がグルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有するかどうかを試験し、グルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有する抗体を選択する工程
をさらに含む、[11]の方法。
[13] 抗体がサルMHC-DQに対して結合活性を有するかどうかを試験し、サルMHC-DQに対して結合活性を有する抗体を選択する工程
をさらに含む、[11]の方法。
[14] 抗体がHLA-DQ2.5とTCRとの間の結合およびHLA-DQ8とTCRとの間の結合に対して中和活性を有するかどうかを試験し、中和活性を有する抗体を選択する工程
をさらに含む、[11]の方法。
[15] セリアック病の治療における使用のための薬学的製剤を調製する方法であって、薬学的に許容される担体と、[11]の方法によって選択された抗体とを混合する工程を含む方法。
本明細書に記載または言及される技術および手順は、一般的によく理解されており、例えば以下に記載の広く利用される方法論などの従来の方法論を用いて当業者により常用されている:Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual 3d edition (2001) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.;Current Protocols in Molecular Biology (F.M. Ausubel, et al. eds., (2003));the series Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.): PCR 2: A Practical Approach (M.J. MacPherson, B.D. Hames and G.R. Taylor eds. (1995)), Harlow and Lane, eds. (1988) Antibodies, A Laboratory Manual, and Animal Cell Culture (R.I. Freshney, ed. (1987));Oligonucleotide Synthesis (M.J. Gait, ed., 1984);Methods in Molecular Biology, Humana Press;Cell Biology: A Laboratory Notebook (J.E. Cellis, ed., 1998) Academic Press;Animal Cell Culture (R.I. Freshney), ed., 1987);Introduction to Cell and Tissue Culture (J. P. Mather and P.E. Roberts, 1998) Plenum Press;Cell and Tissue Culture: Laboratory Procedures (A. Doyle, J.B. Griffiths, and D.G. Newell, eds., 1993-8) J. Wiley and Sons;Handbook of Experimental Immunology (D.M. Weir and C.C. Blackwell, eds.);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J.M. Miller and M.P. Calos, eds., 1987);PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., eds., 1994);Current Protocols in Immunology (J.E. Coligan et al., eds., 1991);Short Protocols in Molecular Biology (Wiley and Sons, 1999);Immunobiology (C.A. Janeway and P. Travers, 1997);Antibodies (P. Finch, 1997);Antibodies: A Practical Approach (D. Catty., ed., IRL Press, 1988-1989);Monoclonal Antibodies: A Practical Approach (P. Shepherd and C. Dean, eds., Oxford University Press, 2000);Using Antibodies: A Laboratory Manual (E. Harlow and D. Lane (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999);The Antibodies (M. Zanetti and J. D. Capra, eds., Harwood Academic Publishers, 1995);およびCancer: Principles and Practice of Oncology (V.T. DeVita et al., eds., J.B. Lippincott Company, 1993)。
本明細書の趣旨での「アクセプターヒトフレームワーク」は、下で定義するヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークに由来する、軽鎖可変ドメイン (VL) フレームワークまたは重鎖可変ドメイン (VH) フレームワークのアミノ酸配列を含む、フレームワークである。ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークに「由来する」アクセプターヒトフレームワークは、それらの同じアミノ酸配列を含んでもよいし、またはアミノ酸配列の変更を含んでいてもよい。いくつかの態様において、アミノ酸の変更の数は、10以下、9以下、8以下、7以下、6以下、5以下、4以下、3以下、または2以下である。いくつかの態様において、VLアクセプターヒトフレームワークは、VLヒト免疫グロブリンフレームワーク配列またはヒトコンセンサスフレームワーク配列と、配列が同一である。
(a) アミノ酸残基26-32 (L1)、50-52 (L2)、91-96 (L3)、26-32 (H1)、53-55 (H2)、および96-101 (H3)のところで生じる超可変ループ (Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987));
(b) アミノ酸残基24-34 (L1)、50-56 (L2)、89-97 (L3)、31-35b (H1)、50-65 (H2)、 および95-102 (H3)のところで生じるCDR (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991));
(c) アミノ酸残基27c-36 (L1)、46-55 (L2)、89-96 (L3)、30-35b (H1)、47-58 (H2)、および93-101 (H3) のところで生じる抗原接触 (MacCallum et al. J. Mol. Biol. 262: 732-745 (1996));ならびに、
(d) HVRアミノ酸残基46-56 (L2)、47-56 (L2)、48-56 (L2)、49-56 (L2)、26-35 (H1)、26-35b (H1)、49-65 (H2)、93-102 (H3)、および94-102 (H3)を含む、(a)、(b)、および/または(c)の組合せ。
一態様において、HVR残基は本明細書において示されたものを含む。
別段示さない限り、HVR残基および可変ドメイン中の他の残基(例えば、FR残基)は、本明細書では上記のKabatらにしたがって番号付けされる。
アミノ酸配列比較にALIGN-2が用いられる状況では、所与のアミノ酸配列Aの、所与のアミノ酸配列Bへの、またはそれとの、またはそれに対する%アミノ酸配列同一性(あるいは、所与のアミノ酸配列Bへの、またはそれとの、またはそれに対する、ある%アミノ酸配列同一性を有するまたは含む所与のアミノ酸配列A、ということもできる)は、次のように計算される:分率X/Yの100倍。ここで、Xは配列アラインメントプログラムALIGN-2によって、当該プログラムのAおよびBのアラインメントにおいて同一である一致としてスコアされたアミノ酸残基の数であり、YはB中のアミノ酸残基の全数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと等しくない場合、AのBへの%アミノ酸配列同一性は、BのAへの%アミノ酸配列同一性と等しくないことが、理解されるであろう。別段特に明示しない限り、本明細書で用いられるすべての%アミノ酸配列同一性値は、直前の段落で述べたとおりALIGN-2コンピュータプログラムを用いて得られるものである。
一局面において、本発明は、T細胞にグルテンペプチドを提示するHLA-DQ2.5/8への抗HLA-DQ2.5/8抗体の結合に一部基づくものである。特定の態様において、HLA-DQ2.5/8に結合する抗体が提供される。本発明の抗体は、例えば、セリアック病の診断または治療のために、有用である。
一局面において、本発明はHLA-DQ2.5/8に結合する、単離された抗体を提供する。特定の態様において、抗HLA-DQ2.5/8抗体(「本抗体」)は、以下の機能/特徴を有する。
*「結合活性を実質的に有しない」という特徴は、例えば図3~5のFACS結果に記載されるように定義することができる。特定の抗原に対して「結合活性を実質的に有しない」抗体は、実施例4.1の測定条件下で陰性対照(二次のみ)のMFI(平均蛍光強度)値の200%以下、好ましくは150%以下であるMFI値を有する。
*本発明の抗HLA-DQ2.5/8抗体は、実施例4.2に記載される測定条件下で、HLA-DQ2.5/グリアジンペプチドへの結合について1×10-8M以下、好ましくは7×10-9M以下の解離定数(Kd)を有し、かつ/またはそのような抗体は、HLA-DQ8/グリアジンペプチドへの結合について2×10-7M以下、好ましくは5×10-8M以下、より好ましくは1×10-8M以下の解離定数(Kd)を有する。
*「中和活性」という特徴は、例えば図6に記載されるように定義することができる。「中和活性」を有する抗体は、実施例4.3に記載される測定条件下で、1μg/mLの抗体濃度により、HLA-DQ2.5とTCRとの間の結合を95%以上、好ましくは97%以上、より好ましくは99%以上中和することができる。さらに、「中和活性」を有する抗体は、実施例4.3に記載される測定条件下で、1μg/mLの抗体濃度により、HLA-DQ8とTCRとの間の結合を95%以上、好ましくは97%以上、より好ましくは99%以上中和することができる。
DQN0016抗体については、それぞれ、配列番号:1、33、9、17、25、41、49、および57;
DQN0089抗体については、それぞれ、配列番号:2、34、10、18、26、42、50、および58;
DQN0092抗体については、それぞれ、配列番号:3、35、11、19、27、43、51、および59;
DQN0100抗体については、それぞれ、配列番号:4、36、12、20、28、44、52、および60;
DQN0157抗体については、それぞれ、配列番号:5、37、13、21、29、45、53、および61;
DQN0139抗体については、それぞれ、配列番号:6、38、14、22、30、46、54、および62;ならびに
DQN0177抗体については、それぞれ、配列番号:8、40、16、24、32、48、56、および64。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、≦1μM、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nMまたは≦0.001nM(例えば、10-8M以下、例えば10-8M~10-13M、例えば10-9M~10-13M)の解離定数 (Kd) を有する。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、抗体断片である。抗体断片は、これらに限定されるものではないが、Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv、および scFv断片、ならびに、後述する他の断片を含む。特定の抗体断片についての総説として、Hudson et al. Nat. Med. 9:129-134 (2003) を参照のこと。scFv断片の総説として、例えば、Pluckthun, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., (Springer-Verlag, New York), pp.269-315 (1994);加えて、WO93/16185;ならびに米国特許第5,571,894号および第5,587,458号を参照のこと。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含みインビボ (in vivo) における半減期の長くなったFabおよびF(ab')2断片についての論説として、米国特許第5,869,046号を参照のこと。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、キメラ抗体である。特定のキメラ抗体が、例えば、米国特許第4,816,567号;および、Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984) に記載されている。一例では、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、またはサルなどの非ヒト霊長類に由来する可変領域)およびヒト定常領域を含む。さらなる例において、キメラ抗体は、親抗体のものからクラスまたはサブクラスが変更された「クラススイッチ」抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合断片も含む。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当該技術分野において知られる種々の手法によって製造され得る。ヒト抗体は、van Dijk and van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 5: 368-74 (2001) および Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 20:450-459 (2008) に、概説されている。
本発明の抗体は、所望の1つまたは複数の活性を伴う抗体についてコンビナトリアルライブラリをスクリーニングすることによって単離してもよい。例えば、ファージディスプレイライブラリの生成や、所望の結合特性を備える抗体についてそのようなライブラリをスクリーニングするための、様々な方法が当該技術分野において知られている。そのような方法は、Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001) において総説されており、さらに例えば、McCafferty et al., Nature 348:552-554;Clackson et al., Nature 352: 624-628 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1992); Marks and Bradbury, in Methods in Molecular Biology 248:161-175 (Lo, ed., Human Press, Totowa, NJ, 2003); Sidhu et al., J. Mol. Biol. 338(2): 299-310 (2004); Lee et al., J. Mol. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004); Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34):12467-12472 (2004);およびLee et al., J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132(2004) に記載されている。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、抗体がグリコシル化される程度を増加させるまたは減少させるように改変されている。抗体へのグリコシル化部位の追加または削除は、1つまたは複数のグリコシル化部位を作り出すまたは取り除くようにアミノ酸配列を改変することにより、簡便に達成可能である。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体のFc領域に1つまたは複数のアミノ酸修飾を導入して、それによりFc領域変異体を生成してもよい。Fc領域変異体は、1つまたは複数のアミノ酸ポジションのところでアミノ酸修飾(例えば、置換)を含む、ヒトFc領域配列(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4のFc領域)を含んでもよい。
特定の態様において、抗体の1つまたは複数の残基がシステイン残基で置換された、システイン改変抗体(例えば、「thioMAbs」)を作り出すことが望ましいだろう。特定の態様において、置換を受ける残基は、抗体の、アクセス可能な部位に生じる。それらの残基をシステインで置換することによって、反応性のチオール基が抗体のアクセス可能な部位に配置され、当該反応性のチオール基は、当該抗体を他の部分(薬剤部分またはリンカー‐薬剤部分など)にコンジュゲートして本明細書でさらに詳述するようにイムノコンジュゲートを作り出すのに使用されてもよい。特定の態様において、以下の残基の任意の1つまたは複数が、システインに置換されてよい:軽鎖のV205(Kabatナンバリング);重鎖のA118(EUナンバリング);および重鎖Fc領域のS400(EUナンバリング)。システイン改変抗体は、例えば、米国特許第7,521,541号に記載されるようにして生成されてもよい。
特定の態様において、本明細書で提供される抗体は、当該技術分野において知られておりかつ容易に入手可能な追加の非タンパク質部分を含むように、さらに修飾されてもよい。抗体の誘導体化に好適な部分は、これに限定されるものではないが、水溶性ポリマーを含む。水溶性ポリマーの非限定的な例は、これらに限定されるものではないが、ポリエチレングリコール (PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ1,3ジオキソラン、ポリ1,3,6,トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれでも)、および、デキストランまたはポリ(n-ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド/エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール類(例えばグリセロール)、ポリビニルアルコール、および、これらの混合物を含む。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、その水に対する安定性のために、製造において有利であるだろう。ポリマーは、いかなる分子量でもよく、枝分かれしていてもしていなくてもよい。抗体に付加されるポリマーの数には幅があってよく、1つ以上のポリマーが付加されるならそれらは同じ分子であってもよいし、異なる分子であってもよい。一般的に、誘導体化に使用されるポリマーの数および/またはタイプは、これらに限定されるものではないが、改善されるべき抗体の特定の特性または機能、抗体誘導体が規定の条件下での療法に使用されるか否か、などへの考慮に基づいて、決定することができる。
例えば、米国特許第4,816,567号に記載されるとおり、抗体は組み換えの方法や構成を用いて製造することができる。一態様において、本明細書に記載の抗HLA-DQ2.5/8抗体をコードする、単離された核酸が提供される。そのような核酸は、抗体のVLを含むアミノ酸配列および/またはVHを含むアミノ酸配列(例えば、抗体の軽鎖および/または重鎖)をコードしてもよい。さらなる態様において、このような核酸を含む1つまたは複数のベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。さらなる態様において、このような核酸を含む宿主細胞が提供される。このような態様の1つでは、宿主細胞は、(1)抗体のVLを含むアミノ酸配列および抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、または、(2)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第一のベクターと抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第二のベクターを含む(例えば、形質転換されている)。一態様において、宿主細胞は、真核性である(例えば、チャイニーズハムスター卵巣 (CHO) 細胞)またはリンパ系の細胞(例えば、Y0、NS0、Sp2/0細胞))。一態様において、抗HLA-DQ2.5/8抗体の発現に好適な条件下で、上述のとおり当該抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を培養すること、および任意で、当該抗体を宿主細胞(または宿主細胞培養培地)から回収することを含む、抗HLA-DQ2.5/8抗体を作製する方法が提供される。
本明細書で提供される抗HLA-DQ2.5/8抗体は、当該技術分野において知られている種々の測定法によって、同定され、スクリーニングされ、または物理的/化学的特性および/または生物学的活性について明らかにされてもよい。
一局面において、本発明の抗体は、例えばELISA、ウエスタンブロット等の公知の方法によって、その抗原結合活性に関して試験される。
一局面では、結合/生物学的活性を有する抗HLA-DQ2.5/8抗体を同定するためのアッセイが提供される。そのようなアッセイは、本発明のスクリーニング方法において使用することができる。
本明細書に提供される抗HLA-DQ2.5/8抗体のいずれも治療方法に使用することができる。
組換えタンパク質の発現および精製
1.1. 組換えHLA-DQ2.5/33merグリアジンペプチドの発現および精製
発現および精製に使用した配列は、HLA-DQA1*0501(Protein Data Bankアクセッションコード4OZG; IMGT/HLAアクセッション番号HLA00613)およびHLA-DQB1*0201(Protein Data Bankアクセッションコード4OZG; IMGT/HLAアクセッション番号HLA00622)であり、これらは両方ともCAMPATH-1Hシグナル配列:MGWSCIILFLVATATGVHS(配列番号:67)を有する。HLA-DQA1*0501は、C47S変異、GGGGリンカー(配列番号:68)およびc-fosロイシンジッパー配列(PNAS, 1998 Sep 29;95(20): 11828-33)、ならびにFlagタグをHLA-DQA1*0501のC末端に有する。HLA-DQB1*0201は、33merグリアジンペプチド配列: LQLQPFPQPELPYPQPELPYPQPELPYPQPQPF(配列番号:69)、およびX因子切断リンカー(Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2007 Dec 1; 63(Pt 12): 1021-1025)をHLA-DQB1*0201のN末端に、GGGGGリンカー(配列番号:70)およびc-junロイシンジッパー配列(PNAS, 1998 Sep 29;95(20): 11828-33)、GGGGGリンカー、ならびにBAP配列(BMC Biotechnol. 2008; 8: 41)、8×HisタグをHLA-DQB1*0201のC末端に有する。
発現および精製に使用した配列は、HLA-DQA1*0301(Protein Data Bankアクセッションコード4GG6; IMGT/HLAアクセッション番号HLA00608)およびHLA-DQB1*0302(Protein Data Bankアクセッションコード4GG6; IMGT/HLAアクセッション番号HLA00627)であり、これらは両方ともCAMPATH-1Hシグナル配列:MGWSCIILFLVATATGVHSを有する。HLA-DQA1*0301は、SSADLVPRGGGGリンカー(配列番号:71)およびc-fosロイシンジッパー配列(PNAS, 1998 Sep 29;95(20): 11828-33)、ならびにFlagタグをHLA-DQA1*0301のC末端に有する。HLA-DQB1*0302は、グリアジンペプチド配列:QQYPSGEGSFQPSQENPQ(配列番号:72)、およびX因子切断リンカー(Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2007 Dec 1; 63(Pt 12): 1021-1025)をHLA-DQB1*0302のN末端に、SSADLVPRGGGGGリンカー(配列番号:73)およびc-junロイシンジッパー配列(PNAS, 1998 Sep 29;95(20): 11828-33)、GGGGGリンカー、ならびにBAP配列 (BMC Biotechnol. 2008; 8: 41)、8×HisタグをHLA-DQB1*0201のC末端に有する。
発現および精製に使用した配列は、HLA-DQA1*0501(Protein Data Bankアクセッションコード4OZG; IMGT/HLAアクセッション番号HLA00613)、HLA-DQB1*0201(Protein Data Bankアクセッションコード4OZG; IMGT/HLAアクセッション番号HLA00622)、インバリアント鎖(76-295)(全長インバリアント鎖についてはGenBankアクセッション番号NM_001025159/NP_001020330)であり、これらは全てがCAMPATH-1Hシグナル配列:MGWSCIILFLVATATGVHSを有する。HLA-DQA1*0501は、C47S変異、GGGGリンカーおよびc-fosロイシンジッパー配列(PNAS, 1998 Sep 29;95(20): 11828-33)をHLA-DQA1*0501のC末端に有する。HLA-DQB1*0201は、GGGGGリンカーおよびc-junロイシンジッパー配列(PNAS, 1998 Sep 29;95(20): 11828-33)、ならびに8×HisタグをHLA-DQB1*0201のC末端に有する。インバリアント鎖(76-295)は、Flagタグ、GCN4変異アミノ酸配列(Science. 1993 Nov 26;262(5138):1401-7)、およびGGGGSリンカー(配列番号:74)をインバリアント鎖(76-295)のN末端に有する。
発現および精製に使用した配列は、S2 TCRアルファ鎖(Protein Data Bankアクセッションコード4OZI)、S2 TCRベータ鎖(Protein Data Bankアクセッションコード4OZI)、D2 TCRアルファ鎖(Protein Data Bankアクセッションコード4OZG)、D2 TCRベータ鎖(Protein Data Bankアクセッションコード4OZG)、SP3.4 TCRアルファ鎖(Protein Data Bankアクセッションコード4GG6)、SP3.4 TCRベータ鎖(Protein Data Bankアクセッションコード4GG6)である。S2 TCRアルファ鎖は、CAMPATH-1Hシグナル配列:MGWSCIILFLVATATGVHS、およびBAP配列(BMC Biotechnol. 2008; 8: 41)、8×HisタグをS2 TCRアルファ鎖のC末端に有する。S2 TCRベータ鎖は、CAMPATH-1Hシグナル配列:MGWSCIILFLVATATGVH(配列番号:75)、およびFlagタグをS2 TCRベータ鎖のC末端に有する。D2 TCRアルファ鎖は、ラット血清アルブミン由来のシグナル配列:MKWVTFLLLLFISGSAFS(配列番号:76)、およびBAP配列(BMC Biotechnol. 2008; 8: 41)、8×HisタグをD2 TCRアルファ鎖のC末端に有する。D2 TCRベータ鎖は、ラット血清アルブミン由来のシグナル配列:MKWVTFLLLLFISGSAFS、およびFlagタグをD2 TCRベータ鎖のC末端に有する。SP3.4 TCRアルファ鎖は、CAMPATH-1Hシグナル配列:MGWSCIILFLVATATGVHS、およびBAP配列(BMC Biotechnol. 2008; 8: 41)、8×HisタグをSP3.4 TCRアルファ鎖のC末端に有する。SP3.4 TCRベータ鎖は、CAMPATH-1Hシグナル配列:MGWSCIILFLVATATGVHS、およびFlagタグをSP3.4 TCRベータ鎖のC末端に有する。
精製したTCRタンパク質は、BirAを用いてビオチン化し、次いでPE標識ストレプトアビジン(BioLegend)と混合し四量体TCRタンパク質を形成させた。
HLA-DQ2.5、HLA-DQ8、HLA-DR、HLA-DP、ならびにカニクイザルMHC-DQ対立遺伝子#1、#2、および#3を発現するBa/F3細胞株の樹立
HLA-DQA1*0501 cDNA(IMGT/HLAアクセッション番号HLA00613)、HLA-DQA1*0301 cDNA(IMGT/HLAアクセッション番号HLA00608)、HLA-DRA1*0101 cDNA(GenBankアクセッション番号NM_019111.4)、またはHLA-DPA1*0103 cDNA(IMGT/HLAアクセッション番号HLA00499)を発現ベクターpCXND3(WO/2008/156083)に挿入した。
抗DQ2.5抗体の作製
抗DQ2.5抗体を以下のように調製し、選択し、そしてアッセイした:
NZWウサギをHLA-DQ2.5/33merグリアジンペプチドを用いて皮内に免疫化した。2ヶ月間にわたって4回の反復投与を行い、続いて血液と脾臓を採取した。B細胞の選択のために、ビオチン化HLA-DQ2.5/33merグリアジンペプチドを調製した。抗原結合B細胞をビオチン化抗原で染色し、セルソーターを用いて選別し、次いで、WO2016098356A1に記載される手順に従ってプレーティングして、培養した。培養後、B細胞培養上清をさらなる分析のために回収し、B細胞ペレットを凍結保存した。
抗HLA-DQ2.5/8抗体の特徴決定
4.1. HLA-DQ2.5、HLA-DQ8、HLA-DR、およびHLA-DPへの抗体の結合解析
図1~5は、FACSで測定された、複数のMHCクラスII発現Ba/F3細胞株への抗HLA-DQ2.5/8抗体の結合を示す。HLA-DQ2.5発現Ba/F3細胞(Ba/F3-HLA-DQ2.5)、Ba/F3-HLA-DQ8、Ba/F3-HLA-DR、Ba/F3-HLA-DP、Ba/F3-cynoDQ C1、Ba/F3-cynoDQ C2、およびBa/F3-cynoDQ C3への抗HLA-DQ2.5/8抗体の結合を試験した。
pH7.4でのヒトHLA-DQ2.5/グリアジンペプチドおよびHLA-DQ8/グリアジンペプチドへの結合に対する抗HLA-DQ2.5/8抗体の親和性は、Biacore T200機器(GE Healthcare)を用いて37℃で測定した。アミンカップリングキット(GE Healthcare)を用いて、CM4センサーチップの全てのフローセルに抗ヒトFc(GE Healthcare)を固定化した。全ての抗体および分析物を、20mM ACES、150mM NaCl、0.05%Tween 20、0.005%NaN3を含むACES、pH7.4中で調製した。各抗体を抗ヒトFcによってセンサー表面上に捕捉した。抗体捕捉レベルは200共鳴単位(RU)を目指した。組換えヒトHLA-DQ2.5/グリアジンペプチドを、4倍連続希釈により調製した100nmおよび400nMで注入し、その後解離させた。一方、組換えヒトHLA-DQ8/グリアジンペプチドは、4倍連続希釈により調製した50~200nMで注入し、その後解離させた。各サイクルごとにセンサー表面を3M MgCl2で再生させた。Biacore T200評価ソフトウェア、バージョン2.0(GE Healthcare)を用いてデータを処理して1:1結合モデルにフィッティングさせることによって結合親和性を決定した。比較として市販の抗体(SPV-L3)を試験した。
図6は、抗HLA-DQ2.5/8抗体の中和活性を示す。ストレプトアビジンをコーティングした黄色粒子(Spherotech, SVFB-2552-6K)をブロッキング緩衝液(PBS / 2%BSA)中で室温にて振盪しながら30分間インキュベートした。遠心分離および上清の吸引後、0.167μg/mLの可溶性HLA-DQ2.5/33merグリアジンペプチドを1.2E+4ビーズ/μL溶液として添加し、96ウェルプレート(Sigma Aldrich, カタログ番号M2686)で室温にて振盪しながら60分間固定化した。HLA-DQ2.5/33merグリアジンペプチドの最終濃度は、D2 TCR中和アッセイでは0.075μg/mLであり、S2 TCR中和アッセイでは0.375μg/mLであった。HLA-DQ8/グリアジンペプチドの最終濃度は0.075μg/mLであった。該プレートをブロッキング緩衝液で洗浄し、連続希釈した抗HLA-DQ2.5/8抗体を添加して、室温で振盪しながら60分間インキュベートした。次いで、HLA-DQ2.5/33merグリアジンペプチドをコーティングしたビーズにD2 TCR、S2 TCR四量体-PEを添加し、かつHLA-DQ8/グリアジンペプチドをコーティングしたビーズにSP3.4 TCRを添加し、4℃で振盪しながら60分間インキュベートして、ブロッキング緩衝液で洗浄した。最終濃度は、D2 TCR四量体-PEについては0.15μg/mL、S2 TCR四量体-PEについては2.0μg/mL、SP3.4 TCR-PEについては0.15μg/mLであった。データ取得をLSR Fortessa(Becton Dickinson)で行い、続いてFlowJoソフトウェア(Tree Star)およびGraphPad Prismソフトウェア(GraphPad)を用いて解析した。
pH7.4でのヒトHLA-DQ/インバリアント鎖への抗HLA-DQ2.5抗体の結合応答は、Biacore T200機器(GE Healthcare)を用いて25℃で測定した。アミンカップリングキット(GE Healthcare)を用いて、CM4センサーチップの全てのフローセルに抗ヒトFc(GE Healthcare)を固定化した。全ての抗体および分析物を、20mM ACES、150mM NaCl、0.05%Tween 20、0.005%NaN3を含むACES、pH7.4中で調製した。各抗体を抗ヒトFcによってセンサー表面上に捕捉した。抗体捕捉レベルは200共鳴単位(RU)を目指した。組換えヒトHLA-DQ/インバリアント鎖(融合タンパク質)を100nMで注入し、続いて解離させた。各サイクルごとにセンサー表面を3M MgCl2で再生させた。
HLA-DQ/インバリアント鎖複合体を介した抗HLA-DQ抗体の内在化の比率を測定した。
Claims (9)
- 抗HLA-DQ2.5/8抗体であって、
a) HLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有し;
b) HLA-DRまたはHLA-DPに対して結合活性を実質的に有さず;
c)インバリアント鎖とHLA-DQ2.5との複合体に対して結合活性を実質的に有さず;
d) グルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有し;かつ
e) HLA-DQ2.5とHLA-DQ2.5拘束性CD4+ T細胞との間の相互作用をブロックし、かつHLA-DQ8とHLA-DQ8拘束性CD4+ T細胞との間の相互作用をブロックする、
抗HLA-DQ2.5/8抗体。 - グルテンペプチドがグリアジンである、請求項1に記載の抗体。
- サルMHC-DQに対して結合活性を有する、請求項1に記載の抗体。
- 以下の(1)~(12)のいずれか1つである、請求項1に記載の抗体:
(1) 配列番号:9のHCDR1配列、配列番号:17のHCDR2配列、配列番号:25のHCDR3配列、配列番号:41のLCDR1配列、配列番号:49のLCDR2配列、および配列番号:57のLCDR3配列を含む抗体;
(2) 配列番号:1のVH配列および配列番号:33のVL配列を含む抗体;
(3) 配列番号:11のHCDR1配列、配列番号:19のHCDR2配列、配列番号:27のHCDR3配列、配列番号:43のLCDR1配列、配列番号:51のLCDR2配列、および配列番号:59のLCDR3配列を含む抗体;
(4) 配列番号:3のVH配列および配列番号:35のVL配列を含む抗体;
(5) 配列番号:12のHCDR1配列、配列番号:20のHCDR2配列、配列番号:28のHCDR3配列、配列番号:44のLCDR1配列、配列番号:52のLCDR2配列、および配列番号:60のLCDR3配列を含む抗体;
(6) 配列番号:4のVH配列および配列番号:36のVL配列を含む抗体;
(7) 配列番号:13のHCDR1配列、配列番号:21のHCDR2配列、配列番号:29のHCDR3配列、配列番号:45のLCDR1配列、配列番号:53のLCDR2配列、および配列番号:61のLCDR3配列を含む抗体;
(8) 配列番号:5のVH配列および配列番号:37のVL配列を含む抗体;
(9) 配列番号:14のHCDR1配列、配列番号:22のHCDR2配列、配列番号:30のHCDR3配列、配列番号:46のLCDR1配列、配列番号:54のLCDR2配列、および配列番号:62のLCDR3配列を含む抗体;
(10) 配列番号:6のVH配列および配列番号:38のVL配列を含む抗体;
(11) (1)~(10)のいずれか1つの抗体が結合するのと同じHLA-DQ2.5エピトープおよびHLA-DQ8エピトープに結合する、抗体;
(12) HLA-DQ2.5およびHLA-DQ8の結合について(1)~(10)のいずれか1つの抗体と競合する抗体。 - セリアック病の治療における使用のための請求項1~4のいずれか一項に記載の抗体。
- セリアック病の治療における使用のための薬学的組成物であって、請求項1~4のいずれか一項に記載の抗体および薬学的に許容される担体を含む、組成物。
- 抗HLA-DQ2.5/8抗体をスクリーニングする方法であって、
(a) 抗体がHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有するかどうかを試験し、HLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有する抗体を選択する工程;
(b) 抗体がHLA-DRまたはHLA-DPに対して特異的結合活性を有するかどうかを試験し、HLA-DRまたはHLA-DPに対して特異的結合活性を実質的に有しない抗体を選択する工程;
(c) 抗体がインバリアント鎖とHLA-DQ2.5との複合体に対して特異的結合活性を有するかどうかを試験し、インバリアント鎖とHLA-DQ2.5との複合体に対して特異的結合活性を実質的に有しない抗体を選択する工程;
(d) 抗体がグルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有するかどうかを試験し、グルテンペプチドの存在下でHLA-DQ2.5およびHLA-DQ8に対して結合活性を有する抗体を選択する工程;
(e) 抗体がHLA-DQ2.5とTCRとの間の結合およびHLA-DQ8とTCRとの間の結合に対して中和活性を有するかどうかを試験し、中和活性を有する抗体を選択する工程
を含む方法。 - 抗体がサルMHC-DQに対して結合活性を有するかどうかを試験し、サルMHC-DQに対して結合活性を有する抗体を選択する工程
をさらに含む、請求項7に記載の方法。 - セリアック病の治療における使用のための薬学的製剤を調製する方法であって、薬学的に許容される担体と、請求項7に記載の方法によって選択された抗体とを混合する工程を含む方法。
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