JP7142017B2 - 動態ドメインにおける低ランク近似を用いた動的磁気共鳴分光撮像の雑音除去 - Google Patents

動態ドメインにおける低ランク近似を用いた動的磁気共鳴分光撮像の雑音除去 Download PDF

Info

Publication number
JP7142017B2
JP7142017B2 JP2019543765A JP2019543765A JP7142017B2 JP 7142017 B2 JP7142017 B2 JP 7142017B2 JP 2019543765 A JP2019543765 A JP 2019543765A JP 2019543765 A JP2019543765 A JP 2019543765A JP 7142017 B2 JP7142017 B2 JP 7142017B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
rank
magnetic resonance
matrix
data
resonance imaging
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
JP2019543765A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2020507405A (ja
Inventor
ジェフリー アール. ブレンダー,
ジェイムズ ビー. ミッチェル,
和俊 山本
シュン キシモト,
ジーヴァ ピー. ムナシンヘ,
ヘルムート マークル,
ムラリー ケー. チェルクリ,
Original Assignee
ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ, アズ リプレゼンテッド バイ ザ セクレタリー, デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ, アズ リプレゼンテッド バイ ザ セクレタリー, デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ filed Critical ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ, アズ リプレゼンテッド バイ ザ セクレタリー, デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ
Publication of JP2020507405A publication Critical patent/JP2020507405A/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP7142017B2 publication Critical patent/JP7142017B2/ja
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01RMEASURING ELECTRIC VARIABLES; MEASURING MAGNETIC VARIABLES
    • G01R33/00Arrangements or instruments for measuring magnetic variables
    • G01R33/20Arrangements or instruments for measuring magnetic variables involving magnetic resonance
    • G01R33/44Arrangements or instruments for measuring magnetic variables involving magnetic resonance using nuclear magnetic resonance [NMR]
    • G01R33/48NMR imaging systems
    • G01R33/54Signal processing systems, e.g. using pulse sequences ; Generation or control of pulse sequences; Operator console
    • G01R33/56Image enhancement or correction, e.g. subtraction or averaging techniques, e.g. improvement of signal-to-noise ratio and resolution
    • G01R33/5608Data processing and visualization specially adapted for MR, e.g. for feature analysis and pattern recognition on the basis of measured MR data, segmentation of measured MR data, edge contour detection on the basis of measured MR data, for enhancing measured MR data in terms of signal-to-noise ratio by means of noise filtering or apodization, for enhancing measured MR data in terms of resolution by means for deblurring, windowing, zero filling, or generation of gray-scaled images, colour-coded images or images displaying vectors instead of pixels
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01RMEASURING ELECTRIC VARIABLES; MEASURING MAGNETIC VARIABLES
    • G01R33/00Arrangements or instruments for measuring magnetic variables
    • G01R33/20Arrangements or instruments for measuring magnetic variables involving magnetic resonance
    • G01R33/44Arrangements or instruments for measuring magnetic variables involving magnetic resonance using nuclear magnetic resonance [NMR]
    • G01R33/48NMR imaging systems
    • G01R33/483NMR imaging systems with selection of signals or spectra from particular regions of the volume, e.g. in vivo spectroscopy
    • G01R33/485NMR imaging systems with selection of signals or spectra from particular regions of the volume, e.g. in vivo spectroscopy based on chemical shift information [CSI] or spectroscopic imaging, e.g. to acquire the spatial distributions of metabolites
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T5/00Image enhancement or restoration
    • G06T5/10Image enhancement or restoration using non-spatial domain filtering
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T5/00Image enhancement or restoration
    • G06T5/50Image enhancement or restoration using two or more images, e.g. averaging or subtraction
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T5/00Image enhancement or restoration
    • G06T5/70Denoising; Smoothing
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/10Image acquisition modality
    • G06T2207/10016Video; Image sequence
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/10Image acquisition modality
    • G06T2207/10072Tomographic images
    • G06T2207/100764D tomography; Time-sequential 3D tomography
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/10Image acquisition modality
    • G06T2207/10072Tomographic images
    • G06T2207/10088Magnetic resonance imaging [MRI]

Landscapes

  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • High Energy & Nuclear Physics (AREA)
  • Condensed Matter Physics & Semiconductors (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
  • Artificial Intelligence (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Radiology & Medical Imaging (AREA)
  • Signal Processing (AREA)
  • Optics & Photonics (AREA)
  • Magnetic Resonance Imaging Apparatus (AREA)

Description

(関連出願の引用)
本願は、米国仮出願第62/459,008号(2017年2月14日出願)の利益を主張し、上記出願は、その全体が参照により本明細書に引用される。
(分野)
本開示は、分光磁気共鳴撮像における改良された信号対雑音比を提供可能な方法および装置に関する。
(背景)
外因性代謝トレーサの分解は、13C MRIによって非侵襲的かつ精密に追跡されることができ、それは、多くのプロセスから生じ得る平衡状態を測定する静的技法に優る利点である。さらなる進歩は、3つの基本的な理由から生じる感度不良によって限定されたままである。第1に、注入され得る外因性トレーサの量は、高濃度溶液を調製し、多くの体積を注入することの困難と、多くの化合物の潜在的毒性とに起因して、少量のみに限定される。最も好ましい状況においても、外因性代謝トレーサの効果的な濃度は、従来のMRIにおいて検出される水信号をはるかに下回る。さらなる複雑性として、13Cは、同等の数の核のためのH(MRIにおいて通常使用される核)のそれと比較して、低い磁気回転比を有し、磁気回転比は、相対的感度に変換できる。最後に、代謝プロセスは、本質的に過渡的である。低感度を克服することに対する通常のアプローチは、単純に、より長く信号を取得し、走査を平均することである。しかしながら、多くの場合、絶対濃度ではなく、代謝物の回転率が、着目される。回転率は、癌および他の病理における潜在的標的である代謝酵素の活性に直結する。長い信号平均化は、回転率の回復を不可能にする。
生体内代謝の動態監視を可能にするために、動的核分極(DNP)が、13C標識トレーサの高速動的撮像を可能にするために開発された。動的核分極は、常磁性分子中の不対電子が、MRIによって検出される急回転を伴う原子核よりもはるかに広い範囲で磁場に整列させられ得るという事実を利用する。動的核分極は、検出のためにこの整列を不対電子から原子核に戻すように移行させる。MRIにおける信号は、整列の程度に比例するので、この分極移行は、好ましい状況において最大10,000倍のMRI信号の非常に大きい増加をもたらす。残念ながら、分極移行は、絶対零度付近の温度においてのみ効率的に起こり、室温になると、急速に減衰する。溶解DNP(dDNP)は、検出のために依然として利用可能な有意な量の分極を伴って室温まで約1Kで凍結トレーサを急速に溶解させることによって、代謝MRIを実行するために分極の一部を利用することに成功している。DNPは、多くの科学的利点において重要である。おそらく、最も印象的なこととして、DNPは、マウスモデル内の腫瘍解糖を撮像することによって、薬物標的関与を証明するために使用されている。
dDNPの印象的な技術的成果にもかかわらず、それは、特に、臨床設定において有意な不利点を有する:過分極が、絶対零度付近の温度で実施され、資本および動作費用の両方において高価である装置を要求すること。過分極は、過渡的であり、注入される代謝物の注入の直後に生産される生産物に代謝サイクルの分析を限定する。過分極は、その緩和時間が十分に緩慢であり、動態が決定され得る前に分極が喪失されない分子の少数の組に限定される。グルコース等の多くの重要な代謝物は、短い緩和時間を有し、この理由からDNPを用いて撮像することが困難または不可能である。本開示は、DNPなしに標識トレーサの生体内代謝の動態監視を可能にすることによって、これらの限界に対処可能な方法および装置を対象とする。
(要約)
方法は、複数の時間において少なくとも1つのボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられた磁気共鳴撮像信号を取得することと、磁気共鳴撮像信号をデータ行列として配列することとを含む。データ行列の特異値分解が、取得され、ランク低減させられ、ランク低減させられたデータ行列が、ランク低減させられた特異値分解に基づいて決定される。いくつかの例では、ランク低減は、分析物の数に基づく。さらなる例では、トレーサが、取得された磁気共鳴撮像信号がトレーサの代謝に関連付けられるように注入され、分析物は、トレーサまたはトレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む。一例では、分析物の数は、代謝生産物の数に対応する。
代表的実施形態によると、データ行列は、m×nデータ行列であり、mは、測定時間の数を表す整数であり、nは、測定された化学シフトの数を表す整数であり、特異値分解は、行列U、Σ、Vを含み、Uは、m×mユニタリ行列であり、Σは、対角線上に非負の実数を伴う対角m×n行列であり、Vは、n×n直交行列である。典型的には、ランク低減は、行列Σのr個の最も小さい対角値をゼロに設定し、行列Σ’を形成することを含み、ランク低減させられたデータ行列は、行列積U・Σ’・Vとして取得される。ある場合、行列ΣおよびΣ’の対角値は、行列の行において最大から最小に配列されている。なおもさらなる例では、磁気共鳴撮像信号は、複数の時間における複数のボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられ、各ボクセルのために、磁気共鳴撮像信号は、データ行列として配列され、データ行列の特異値分解が、取得され、次いで、ランク低減させられ、ランク低減させられたデータ行列が、複数のボクセルの各々のために生産される。
磁気共鳴撮像装置は、試料中に軸方向磁場を確立するために位置している磁石と、電磁パルスシーケンスを試料に印加するために位置している複数のコイルとを備えている。受信機が、印加された電磁パルスシーケンスに応答して、試料から電磁信号を検出するために位置する。コントローラが、電磁パルスシーケンスを選択的に印加するために複数のコイルに結合され、複数の試料ボクセルのための検出された信号に関連付けられた信号値を記憶し、複数の試料ボクセルのうちの少なくとも1つに関連付けられた行列表現に関連付けられた特異値分解をランク低減させることによって検出された信号を処理するために受信機に結合される。代表的例では、コントローラは、複数の試料ボクセルの各々に関連付けられた行列表現に関連付けられた特異値分解をランク低減させることによって検出された信号を処理し、特異値分解のランク低減は、分析物の数に基づく。さらなる例では、注入器が、試料の中にトレーサを注入するために位置し、注入器は、検出された電磁信号が注入されたトレーサの代謝に関連付けられるようにコントローラに結合され、分析物は、トレーサまたはトレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む。典型的には、分析物の数は、代謝生産物の数に対応する。典型的な例によると、ボクセルの各々のための行列表現は、m×nデータ行列であり、mは、測定時間の数を表す整数であり、nは、測定された化学シフトの数を表す整数であり、特異値分解は、行列U、Σ、Vを含み、Uは、m×mユニタリ行列であり、Σは、対角線上に非負の実数を伴う対角m×n行列であり、Vは、n×n直交行列である。いくつかの実施形態では、ランク低減は、行列Σのr個の最も小さい対角値をゼロに設定し、行列Σ’を形成することを含み、ランク低減させられたデータ行列は、行列積U・Σ’・Vとして取得される。一例では、磁気共鳴撮像信号は、複数の時間における複数のボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられ、各ボクセルのために、磁気共鳴撮像信号は、データ行列として配列され、データ行列の特異値分解が、取得され、次いで、ランク低減させられ、ランク低減させられたデータ行列が、複数のボクセルの各々のために生産される。他の例によると、画像が、ランク低減させられたデータ行列を使用して表示される。
方法は、複数の時間において複数のボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられた磁気共鳴撮像信号を取得することと、取得された磁気共鳴撮像信号をデータテンソルとして配列することとを含む。データテンソルのタッカー分解が、取得され、空間的または時間的にランク低減させられ、複数のボクセルの各々のための空間的または時間的に雑音除去されたボクセルデータを生産する。いくつかの例によると、トレーサが、取得された磁気共鳴撮像信号がトレーサの代謝に関連付けられるように注入され、分析物は、トレーサまたはトレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む。いくつかの例では、ランク低減は、代謝生産物の数に基づくスペクトルランク低減である。
他の方法は、少なくとも2つのパラメータの関数として複数のボクセルのための磁気共鳴撮像信号を取得することと、磁気共鳴撮像信号をデータテンソルとして配列することとを含む。データテンソルのタッカー分解が、取得され、2つのパラメータのうちの少なくとも1つに基づいて、複数のボクセルの各々のための処理されたボクセルデータを生産することに関してランク低減させられる。ある場合、ランク低減は、少なくとも2つのパラメータの両方に基づく。
(書類名)特許請求の範囲
(項目1)
方法であって、前記方法は、
磁気共鳴撮像システムにおいて、
少なくとも1つのボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられた磁気共鳴撮像信号を複数の時間において取得することと、
前記磁気共鳴撮像信号をデータ行列として配列することと、
前記データ行列の特異値分解を取得することと、
前記特異値分解をランク低減させることと、
前記ランク低減させられた特異値分解に基づいて、ランク低減させられたデータ行列を取得することと
を含む、方法。
(項目2)
分析物の数に基づいて、前記特異値分解をランク低減させることをさらに含む、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記取得された磁気共鳴撮像信号がトレーサの代謝に関連付けられるように前記トレーサを注入することをさらに含み、前記分析物は、前記トレーサまたは前記トレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む、項目2に記載の方法。
(項目4)
前記分析物の数は、代謝生産物の数に対応する、項目3に記載の方法。
(項目5)
前記データ行列は、m×nデータ行列であり、mは、測定時間の数を表す整数であり、nは、測定された化学シフトの数を表す整数であり、前記特異値分解は、行列U、Σ、V を含み、Uは、m×mユニタリ行列であり、Σは、対角線上に非負の実数を伴う対角m×n行列であり、V は、n×n直交行列である、項目1に記載の方法。
(項目6)
ランク低減は、前記行列Σのr個の最も小さい対角値をゼロに設定し、行列Σ’を形成することを含み、前記ランク低減させられたデータ行列は、行列積U・Σ’・V として取得される、項目5に記載の方法。
(項目7)
前記行列ΣおよびΣ’の対角値は、前記行列の行において最大から最小に配列されている、項目6に記載の方法。
(項目8)
前記磁気共鳴撮像信号は、前記複数の時間における前記複数のボクセルのための前記複数の化学シフトに関連付けられ、各ボクセルのために、前記磁気共鳴撮像信号は、データ行列として配列され、前記データ行列の特異値分解が、取得され、次いで、ランク低減させられ、ランク低減させられたデータ行列が、前記複数のボクセルの各々のために生産される、項目1に記載の方法。
(項目9)
磁気共鳴撮像装置であって、前記磁気共鳴撮像装置は、
試料中に軸方向磁場を確立するために位置している磁石と、
電磁パルスシーケンスを前記試料に印加するために位置している複数のコイルと、
前記印加された電磁パルスシーケンスに応答して、前記試料から電磁信号を検出するために位置している受信機と、
コントローラと
を備え、
前記コントローラは、前記複数のコイルに結合され、前記電磁パルスシーケンスを選択的に印加し、前記コントローラは、前記受信機に結合され、複数の試料ボクセルのための前記検出された信号に関連付けられた信号値を記憶し、前記複数の試料ボクセルのうちの少なくとも1つに関連付けられた行列表現に関連付けられた特異値分解をランク低減させることによって前記検出された信号を処理する、磁気共鳴撮像装置。
(項目10)
前記コントローラは、前記複数の試料ボクセルの各々に関連付けられた行列表現に関連付けられた特異値分解をランク低減させることによって前記検出された信号を処理する、項目9に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目11)
前記特異値分解の前記ランク低減は、分析物の数に基づく、項目10に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目12)
前記試料の中にトレーサを注入するために位置している注入器をさらに備え、前記注入器は、前記検出された電磁信号が前記注入されたトレーサの代謝に関連付けられるように前記コントローラに結合され、前記分析物は、前記トレーサまたは前記トレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む、項目11に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目13)
前記分析物の数は、代謝生産物の数に対応する、項目12に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目14)
各ボクセルのための前記行列表現は、m×nデータ行列であり、mは、測定時間の数を表す整数であり、nは、測定された化学シフトの数を表す整数であり、前記特異値分解は、行列U、Σ、V を含み、Uは、m×mユニタリ行列であり、Σは、対角線上に非負の実数を伴う対角m×n行列であり、V は、n×n直交行列である、項目13に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目15)
ランク低減は、前記行列Σのr個の最も小さい対角値をゼロに設定し、行列Σ’を形成することを含み、前記ランク低減させられたデータ行列は、行列積U・Σ’・V として取得される、項目14に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目16)
前記行列ΣおよびΣ’の対角値は、前記行列の行において最大から最小に配列されている、項目15に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目17)
前記磁気共鳴撮像信号は、前記複数の時間における前記複数のボクセルのための前記複数の化学シフトに関連付けられ、各ボクセルのために、前記磁気共鳴撮像信号は、データ行列として配列され、前記データ行列の特異値分解が、取得され、次いで、ランク低減させられ、ランク低減させられたデータ行列が、前記複数のボクセルの各々のために生産される、項目16に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目18)
前記ランク低減させられたデータ行列を使用して画像を表示することをさらに含む、項目17に記載の磁気共鳴撮像装置。
(項目19)
方法であって、前記方法は、
磁気共鳴撮像システムにおいて、
複数のボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられた磁気共鳴撮像信号を複数の時間において取得することと、
前記磁気共鳴撮像信号をデータテンソルとして配列することと、
前記データテンソルのタッカー分解を取得することと、
前記タッカー分解を空間的または時間的にランク低減させ、前記複数のボクセルの各々のための空間的または時間的に雑音除去されたボクセルデータを生産することと
を含む、方法。
(項目20)
前記ランク低減は、時間ランク低減である、項目19に記載の方法。
(項目21)
前記取得された磁気共鳴撮像信号がトレーサの代謝に関連付けられるように前記トレーサを注入することをさらに含み、前記分析物は、前記トレーサまたは前記トレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む、項目20に記載の方法。
(項目22)
前記ランク低減は、代謝生産物の数に基づくスペクトルランク低減である、項目21に記載の方法。
(項目23)
前記ランク低減は、測定されたデータと打ち切りモデルデータとの間の差異に基づく、項目19に記載の方法。
(項目24)
タッカー分解は、コアテンソルと、複数の直交因子行列とを含む、項目19に記載の方法。
(項目25)
前記データテンソルは、前記複数のボクセルの各々のためのデータ行列を含み、前記データ行列は、m×nデータ行列であり、mは、測定時間の数を表す整数であり、nは、測定された化学シフトの数を表す整数である、項目1に記載の方法。
(項目26)
方法であって、前記方法は、
磁気共鳴撮像システムにおいて、
少なくとも2つのパラメータの関数として複数のボクセルのための磁気共鳴撮像信号を取得することと、
前記磁気共鳴撮像信号をデータテンソルとして配列することと、
前記データテンソルのタッカー分解を取得することと、
前記2つのパラメータのうちの少なくとも1つに基づいて、前記タッカー分解をランク低減させ、前記複数のボクセルの各々のための処理されたボクセルデータを生産することと
を含む、方法。
(項目27)
前記処理されたボクセルデータは、前記ボクセルの各々のためのデータ行列として表される、項目26に記載の方法。
(項目28)
前記タッカー分解をランク低減させ、前記複数のボクセルの各々のための処理されたボクセルデータを生産することは、前記少なくとも2つのパラメータの両方に基づく、項目27に記載の方法。
(項目29)
前記処理されたボクセルデータは、雑音除去されたボクセルデータである、項目28に記載の方法。
図1は、特異値分解(SVD)およびタッカー分解信号処理を含む代表的磁気共鳴撮像(MRI)システムを図示する。 図2Aは、MRIスペクトルデータを取得し、ランク低減とともに特異値分解(SVD)を使用して取得されたデータを処理する代表的方法を図示する。 図2Bは、単一のボクセルに対する時間の関数としてのMRIスペクトルデータの代表的配列を図示する。 図3A-3Bは、ピルビン酸(173ppmの化学シフト)の乳酸(185ppmの化学シフト)への変換に関連付けられた良好な信号対雑音比を伴うピルビン酸DNP測定からの未加工データを示す。 図4A-4Bは、SVDおよび5へのランク低減を使用する検出および定量化後の図3A-3Bのデータを示す。未加工データ(図3A-3B)では、162.5ppmにおける重炭酸塩ピークは、全体的信号対雑音比が高いにもかかわらず、検出可能ではない。低ランク(すなわち、ランク低減させられた)近似を使用して、重炭酸塩代謝の動態プロファイルが、図4A-4Bに示されるように取得され、薬物処置と対照群との間の判別を可能にすることができる。重炭酸塩信号または動態についてのいかなる事前情報も、使用されなかった。 図5Aは、追加のノイジーデータを示し、図5Bは、5秒にわたる図5Aのデータの平均を示す。 図6Aは、SVDおよびランク低減を用いて処理された図5Aの信号を示す。2つの主要代謝生産物であるピルビン酸および乳酸に対応するピーク、ならびに副産物に対応する2つの小ピークが、明確に可視である。 図6Bは、SVD分解およびランク低減を取得された9倍のSNR強化を示す、化学シフトの関数としてのMRI信号振幅のグラフである。 図7は、ランク低減とともにSVDを使用する信号対雑音比(SNR)改良を示す。 図8A-8Dは、ランク低減させられたSVDに基づく雑音除去を図示するグルコース代謝に関連付けられた画像を示す。 図9Aおよび9Bは、それぞれ、雑音除去の有無別の個々のボクセルに関連付けられた信号を示す。図9Cは、64個のボクセルの各々のための雑音除去された信号を示す。図9Dは、1つのボクセルに対するノイジーデータを示す。 図10A-10Bは、雑音低減を伴わずに処理された過分極乳酸画像からのスペクトル画像データを示す。 図11A-11Bは、40から4への時間領域ランク低減とともにタッカー分解を介する雑音低減を用いて処理された図10A-10Bの画像データを示す。 図12A-12Bは、タッカー分解、40から4への時間領域ランク低減、および32から16への空間次元ランク低減を用いて処理された図10A-10Bの画像データを示す。 図13A-13Bは、スライス次元においてさらに処理された図12A-12Bの処理されたデータに対応するデータを示す。 図14は、代表的データ取得および処理システムの概略図である。 図15は、ランク低減とともにタッカー分解を使用する画像データ処理の代表的方法を図示する。 図16は、SVD雑音除去を用いて取得された複数分析物データを図示する。 図17は、ランク低減において選択する固有値の数を示す図5Aから取得された代表的スクリープロットである。 図18は、タッカー分解に基づく信号処理方法を図示する。 図19は、タッカー分解において成分の数を選択する際に使用するための代表的差異グラフである。 図20Aおよび20Cは、タッカー分解を図示する。図20Bは、タッカー分解の打ち切り(ランク低減)を図示する。
(詳細な説明)
本明細書および請求項で使用されるように、単数形「a」、「an」、および「the」は、文脈が別様に明確に指示しない限り、複数形を含む。加えて、用語「~を含む」は、「~を備えている」を意味する。さらに、用語「結合される」は、結合されるアイテムの間の中間要素の存在を除外しない。
本明細書に説明されるシステム、装置、および方法は、いかようにも限定的として解釈されるべきではない。代わりに、本開示は、単独で、ならびに互いとの種々の組み合わせおよび副次的組み合わせにおいて、種々の開示される実施形態の全ての新規かつ非自明な特徴および側面を対象とする。開示されるシステム、方法、および装置は、任意の具体的側面または特徴もしくはそれらの組み合わせに限定されない、または開示されるシステム、方法、および装置は、任意の1つ以上の具体的利点が存在する、もしくは問題が解決されることを要求しない。いずれの動作の理論も、解説を容易にするためのものであるが、開示されるシステム、方法、および装置は、そのような動作の理論に限定されない。
開示される方法のうちのいくつかの動作は、便利な提示のために特定の連続的順序で説明されるが、説明のこの様式は、特定の順序付けが下で記載される具体的言語によって要求されない限り、再配列を包含することを理解されたい。例えば、連続的に説明される動作は、ある場合、再配列または並行して実施され得る。さらに、簡易化のために、添付される図は、開示されるシステム、方法、および装置が他のシステム、方法、および装置と共に使用され得る種々の方法を示さないこともある。加えて、説明は、時として、開示される方法を説明するために、「~を生産する」および「~を提供する」のような用語を使用する。これらの用語は、実施される実際の動作の高レベルの抽象化である。これらの用語に対応する実際の動作は、特定の実装に応じて変動し、当業者によって容易に認識可能である。
いくつかの例では、値、プロシージャ、または装置は、「最低」、「最良」、「最小」等と称される。そのような説明は、多くの使用される機能的代替物の中からの選択が行われ得、そのような選択が他の選択よりも良好である、小さい、または別様に好ましい必要はないことを示すことを意図していることを理解されたい。
本明細書に開示されるものは、例えば、磁気共鳴分光撮像(MRSI)または他の磁気共鳴撮像(MRI)手技によって取得されるノイジー信号からの動的情報の回収を可能にする、信号処理方法および磁気共鳴撮像(MRI)装置である。典型的なMRI手技は、プロトンデカップリングを伴う単一パルスもしくは化学シフト撮像(CSI)パルスシーケンス、エコープラナー分光撮像、またはスペクトル符号化撮像シーケンスを含む。例証のために提供される一代表的例では、開示されるアプローチは、脚異種移植片を伴うマウスの尾静脈における13C標識トレーサの静脈内注入に応答して、代謝撮像において、または単一ボクセル測定において使用される。注入ポンプ(または他のポンプ)が、ヒト臨床用途のための手技をスケールアップするために使用され、注入が、代謝物測定シーケンスと同期され得る。この例は、便利な解説のために提供されるが、開示される方法および装置は、異なる磁気共鳴パルスシーケンスを使用し、他のトレーサと共に使用されることができ、概して、物質構成物の時間的発展を決定するために適用されることができ、代謝速度を推定することにおける使用に限定されない。
化学シフトのMR測定は、概して、複数の時間に行われ、化学シフトは、化学シフト値の連続的範囲に対して測定されることができ、典型的には、化学シフト値は、一連の離散値として処理される。均一に間隔を置かれた化学シフトおよび測定時間を選択することが便利であり得るが、それは、概して、不必要であり、恣意的間隔が、使用されることができる。より微細な増分が、着目範囲のために、またはより大きい変化率に関連付けられた値のために使用されることができる。便宜上、いくつかの例では、均一な時間および化学シフト増分が、使用される。データ行列およびテンソルが、太字(M)で、または斜字体(M)として記載され、そのような行列およびテンソルの要素が、特定の要素を識別する下付き文字を伴う斜字体(Mij)で記載される。行列Mの転置が、Mとして記載される。行列またはテンソル表現内のある項の排除は、概して、本明細書では、ランク低減または打ち切りと称される。概して、(例えば、値を0に設定することによって)ランク低減または打ち切りにおいて項を排除することが好ましいが、項は、代わりに、概して、項排除で利用可能な信号対雑音比を有意に減少させることを回避するために十分に小さい、小さい値を割り当てられることができる。
MR測定は、図1に図示されるようなMRI装置100を使用して取得されることができる。装置100は、定数またはパルス状場勾配等の選択された磁場を試料に印加するように構成され得るコントローラ/インターフェース102を含む。軸方向磁石コントローラ104は、概して、実質的に一定の磁場Bを生産するように構成された軸方向磁石106と通信する。勾配コントローラ108は、電磁コイル110-112を使用して、一定または時変勾配磁場を選択された方向または方向の組に印加し、それぞれの磁場勾配ベクトル成分G、G、G、またはそれらの組み合わせを生産するように構成される。RF発生器114は、1つ以上のRFパルスを伝達コイル115を使用して試料に送達するように構成される。RF受信機116は、受信コイル118と通信し、急回転の正味磁化を検出または測定するように構成される。スライス選択勾配が、拡散勾配を印加するために使用される同一のハードウェアを用いて印加されることができる。勾配コントローラ108は、1つ以上の軸に沿ってパルスまたは他の勾配磁場を生産するように構成されることができる。そのような勾配および他の印加されるパルスの選択によって、種々の撮像および/または測定シーケンスが、適用されることができる。分析物または代謝物濃度の関数である変動を生産するシーケンスが、好ましい。典型的な例では、時間の関数としての化学シフトを含むデータが、取得される。
撮像のために、試料は、体積要素(ボクセル)に分割され、異なる時間におけるMR信号が、取得される。典型的な例では、複数の時間の各々における化学シフトの関数としての振幅が、いくつかまたは全ての着目ボクセルに対して取得される。コンピュータ124またはパーソナルコンピュータ、ワークステーション、携帯情報端末、ラップトップコンピュータ、スマートフォン、もしくはネットワーク化されたコンピュータ等の他の処理システムが、試料データの取得、制御、および/または分析のために提供されることができる。コンピュータ124は、概して、ハードディスク、フロッピー(登録商標)ディスクまたはCD-ROM等の取り外し可能記憶媒体、およびランダムアクセスメモリ(RAM)等の他のメモリを含む。データ取得または制御のためのコンピュータ実行可能命令が、フロッピー(登録商標)ディスクまたは他の記憶媒体上に提供されるか、もしくはローカルエリアネットワーク、インターネット、または他のネットワークを介してコンピュータ124に送達されることができる。信号取得、器具制御、および信号分析が、分散処理を用いて実施されることができる。例えば、信号取得および信号分析は、異なる場所で実施されることができる。コンピュータ124は、メモリ126内に記憶された好適なコンピュータ実行可能命令を使用して、ランク低減を伴う特異値分解またはタッカー分解を使用して信号対雑音比を改良するように構成されることもできる。信号評価が、記憶されたデータを遠隔プロセッサに通信することによって、信号取得から遠隔で実施されることができる。典型的には、種々の磁場が、注入器132によるトレーサの適用(概して、注入)と関連して、対象130に印加され、それから検出される。
典型的な例では、MRSIシーケンスが、使用され、その空間的エリア内に存在する代謝物を表す各点(ボクセル)におけるスペクトルを伴うデータグリッドをもたらす。動的MRSIでは、画像は、注入後に繰り返し取得され、生体内代謝の時間プロファイルを与える。DNPなしの通常条件のもとで、この信号は、ノイジーすぎて使用することができない。本明細書に開示される雑音除去アプローチは、典型的には、いくつかの代謝物のみが存在し、ある場合、関連付けられる信号が時間の関数として平滑に変動するという仮定に基づく。より正式には、スペクトル内の独立したピークの数は、データ点の数をはるかに下回る(スパース性)と仮定され、時点間の二次有限差分は、小さい。第1の仮定は、本質的に決して背かれず、典型的なMRSIスペクトルは、256個以上の点を有するが、数十程度の代謝物のみが、検出され、その上、非常に好ましい条件下のみで検出されることができる。時間における平滑変動に関する第2の仮定は、予期される時間スケールに合致するように下で説明されるような調節可能パラメータによって実装されることができるが、この仮定は、有用であり得る一方、それは、概して、必要ではない。方法および装置は、「雑音除去」と称されるが、雑音は、完全に除去される必要はない。
(ランク低減を伴うSVD)
処理は、行列における行を形成する各時点からのスペクトルを用いて各ボクセルのための行列Sを形成することによって開始される。雑音低減は、Sのランクを低減させることによって達成される。Sのランクは、Sの列(スペクトル)に及ぶベクトル空間である。より直感的には、Sのランクは、動的コースに存在する独立したスペクトルの数(または代替として、数学的に同等である独立した動態成分の数)である。1のランクは、信号が単一の時間プロファイルとともに減衰する単一のスペクトルとして完全に説明され得ることを示唆する。スペクトルおよび時間プロファイルは、任意の恣意的形状であり得るが、均一ではない。この場合、スペクトル内のいかなる個々のピークも、任意のその他と異なる速度で減衰しない。2のランクを伴う信号行列が、2つの異なる時間プロファイルを伴う2つのスペクトルの線形結合として説明されることができる。ランク3行列は、3つの異なる時間プロファイルを伴う3つのスペクトルの線形結合であり、以下同様である。この定義から、行列Sのランクは、サンプル中の代謝物の数にほぼ等しい。しかしながら、下で議論されるようなランク低減は、代謝物の数を上回るまたは下回るランクをもたらし、概して、ランク低減は、好適な出力(例えば、雑音除去)に基づいて選択されることができる。
実践では、信号は、雑音によって混乱させられる。雑音は、ランダムであり、周波数または時間において互いに関係づけられないので、測定された行列の実際のランクrは、スペクトル点の数(256個以上のもの)に近接する。しかしながら、雑音を伴わない実際の信号行列は、低ランクである。行列Sの低ランク近似(行列M)が、決定されるべきである。Sは、最初に、3つのより小さい行列の積に分解される。
Figure 0007142017000001
式中、[U,Σ,V]は、測定されたデータ行列Snoisyの特異値分解であり、雑音除去された低ランク近似Mlow rankが、見出されることができる。
Figure 0007142017000002
元々のノイジーな行列に対して、解は、Σの対角エントリがSSの固有値の平方根に等しく、Vの列がSSの固有ベクトルに等しく、Uの列がSSの固有ベクトルに等しいものである。これは、特異値分解として公知である。ランクrは、非ゼロ固有値の数に等しい。低ランク近似を得るために、Σにおける最も低いr-nの対角エントリが、ゼロに設定される。ランクrは、存在する(通常、事前に把握される)代謝物の数をわずかに上回るように推定されることができるか、またはランダム行列の性質を使用して固有値の分布から推定されることができる。結果は、Eckart-Young-Mirskyの定理によって、元々の信号行列Sに対する最良の低ランク近似であることが保証される。平滑さが、上記の方程式にペナルティ項を付与することによって強調されることができる。
Figure 0007142017000003
式中、BおよびBは、二次有限差分演算子である。方程式のこの改変された形態は、信号における急速な非生理的時間変化にペナルティを課し、パラメータaおよびaによって制御される。これらのパラメータの小さい値は、急速な変化を可能にし、大きい値は、平滑さを優先させる。実際の値は、特定の実験のために改変され得る。実証目的のために、aは、0に設定され、スペクトル領域における高分解能を可能にすることができる。
図2Aを参照すると、SVDおよびランク低減を使用して生体内で代謝物を測定または撮像する方法200は、202において、トレーサを注入することを含む。本明細書で使用されるように、トレーサは、生体内で代謝される、または化合物の代謝を刺激する任意の組成物である。204において、MRスペクトルが、複数の時間に画像アレイのために取得される。画像アレイは、典型的には、複数の体積要素(「ボクセル」)に対するデータを含むが、単一点(すなわち、単一ボクセル)測定も、行われることができる。206において、各着目ボクセル(または全てのボクセル)に対して、時間の関数としてのスペクトルデータの行列Mが、形成される。そのような行列は、図2Bに図示される。各行は、i=1,・・・・,mである時間iおよびj=1,・・・,nである化学シフトfに関連付けられた信号値Sijを含む。他の例では、行は、固定された化学シフトに関連付けられ、各列は、異なる時間に関連付けられることができる。典型的には、SVDは、列ベクトルがデータ空間に及ぶように配列され、そのような配列では、各行を異なる時間に割り当てることは、ランク低減が時間的に雑音除去されたデータをもたらすSVDを生産する。対照的に、行ベクトルを使用することは、ランク低減が空間的に雑音除去されたデータをもたらすSVDを生産する。図2Bでは、単一の行列Mのみが、示されるが、そのような配列は、概して、各着目ボクセルまたは全てのボクセルに対して形成される。
208において、いくつかまたは全てのm×nデータ行列MのSVDが、各MのためにSVDアレイU、Σ、Vを見出すために取得され、Uは、m×mユニタリ行列であり、Σは、対角線上に非負の実数(例えば、行列積MMの固有値)を伴う対角m×n行列であり、Vは、n×nユニタリ行列(典型的には、実数として表されるデータ値に関する直交行列)である。SVDは、所望される場合、行および列を置換することによって他のデータ配列を使用することができる。ステップ210において、各(またはいくつかの)ボクセルに対する対角行列Σが、選択されていない対角要素をゼロに設定することによって対応する行列Σ’にランク低減させられる。典型的には、トレーサ注入に応答して生産される代謝物の数に対応する非ゼロ対角エントリの数が、保持され、最大対角値のみが、保持される。概して、ΣおよびΣ’の行は、最大値が第1の行に現れ、次に最も大きいものが第2の行に現れ、以下同様であるように配列される。212において、各ボクセルのための雑音除去された信号行列M’が、次いで、積M’=UΣ’Vとして取得される。214において、雑音除去されたデータは、好ましいように、1つ以上の画像、一連の画像、または数値データとして表示されることができる。所望される場合、いくつかの異なるランク低減が、好ましいランク低減(すなわち、好ましい行列Σ’)を決定するために使用されることができる。
所望される場合、二次差分も、同様に使用されることができる。前進、中央、または逆二次差分が、使用されることができる。例えば、
Figure 0007142017000004
として定義される関数f(x)の中央二次差分が、使用されることができ、Δは、データ値の間の間隔(この場合、時間的または空間的平滑化が適用されるべきかどうかに応じて、時間的または空間的間隔のいずれか)を表す。この場合、雑音除去されたデータは、上で議論されるように、以下から取得される。
Figure 0007142017000005
およびaの種々の値が、使用されることができ、典型的な値は、0.01、0.02、0.05、0.10、0.20、0.50、または1.00、もしくは中間値である。
(SVDにおけるランクの数の選択)
SVDを使用するとき、ランクの数を選択するためのいくつかの方法が存在する。第1のものは、事前知識を使用することである。例えば、上記のように、最大でn個の代謝物が可能である場合、ランクは、n付近の数に設定されることができる。この数は、雑音レベルの付近であり得る低存在度代謝物を捕捉するためにわずかに高く設定されるか、または、代謝物の動態がリンクされており、したがって、線形に独立していないので、わずかに低く設定されることができる。したがって、n個の代謝物に対して、ランクは、nまたはn±1、2、3に設定されることができる。他の値も、同様に使用されることができ、これらの範囲の値が、概して、十分である。
別の方法は、スクリープロットに基づく。スクリープロットは、降順で各成分に関連付けられた固有値を表示する。スクリープロットにおける理想的なパターンは、急勾配曲線であり、屈曲、次いで、平坦または水平線が後に続く。ランクは、平坦線が雑音を表すため、屈曲点に設定される。図17は、代表的スクリープロットを図示し、3のランクが選択されるべきであることを示す。
スクリープロットは、最終的に、ランダム行列の固有値の分布の統計に基づく。m×n行列に対する最適な確かな閾値レベルτは、以下であることが示されている(Gavish and Donoho,「The Optimal Hard Threshold for Singular Values is 4/√3」 IEEE Trans. Inform. Theory 60:5040-5053 (2014)(参照することによって本明細書に組み込まれる)参照)。
Figure 0007142017000006
βは、アスペクト因子
Figure 0007142017000007
であり、σは、雑音レベルの標準偏差であり、それは、いかなる代謝物も存在することが把握されていないスペクトルの領域を検証することによって推測されることができる。τを下回る全ての特異値が、ゼロに設定される。
(ランク低減を伴うタッカー分解)
上で議論されるように、SVDベースのアプローチは、各ボクセルのためにデータ行列を使用してボクセル毎にデータを処理する。選択された時間および化学シフトに対応する行および列を有するデータ行列Mが、定義され、SVDを使用して雑音除去される。撮像に対して、同時空間的および時間的雑音除去が、同時に全てのボクセルにタッカー分解を使用して提供されることができる。タッカー分解は、空間および時間の両方における信号の進展を説明する画像に対応する行列の組にデータを分解する。SVDと同様、低ランク近似が、可能な限り多くの信号を保持しながら雑音を抑制する画像の線形結合を見出すために行われる。空間次元において雑音除去する能力は、画像を接続するあるパターンが存在する限り、方法が、任意のタイプの一連の医療画像に使用されることを可能にする。所望される場合、選択された行、列、または他の選択されたデータのみが、処理され、関連付けられるデータテンソルは、完全なデータセットを表すデータテンソルのそれよりも低いランクであり得る。全ての点に対する画像およびスペクトルデータ(すなわち、化学シフト)では、ボクセルデータは、画像の全てのボクセルに対する化学シフトおよび測定時間に対する値を含む、四次テンソルXとして表される。便利な解説のために、選択されたテンソル名およびプロシージャのみが、本明細書に議論される。概要が、例えば、Kolda and Bader,「Tensor Decompositions and Applications」 SIAM Review 51:455-500 (2009)(参照することによって本明細書に組み込まれる)に見出されることができる。
K×Lボクセルを含む画像に対して、各ボクセルは、m個の時間におけるn個の化学シフトに関連付けられ、K、L、M、Nの全ては、正の整数であり、ランク3または4のデータテンソルが、使用されることができる。例えば、四次データテンソルXK・LM・Nとして、または三次テンソルXK・L・M・Nとしての表現が、使用されることができる。SVDのように、因数分解が、要求される。I×J×K要素行列によって表されるXに対して、タッカー因数分解は、以下の形態である。
Figure 0007142017000008
式中、Gは、コアテンソルと称されることができ、A、B、Cは、それぞれ、I×P、J×Q、およびK×R因子行列であり、a,b,cは、対応する因子行列の列を指し、記号
Figure 0007142017000009
は、ベクトル外積を指す。タッカー分解は、以下のように要素毎に表されることもできる。
Figure 0007142017000010
式中、xijk、aip、bjq、およびckrは、G、A、B、およびCの要素である。A、B、Cは、直交行列であり、コアテンソルGは、直交テンソルである。Gは、
Figure 0007142017000011
であるようにサブテンソル
Figure 0007142017000012
が順序付けられるように配列されることができる。
K×LボクセルおよびSスライスを含む画像に対して、各ボクセルは、M個の時点において取得されるN個の自由誘導減衰点に関連付けられ、K、L、M、N、Sの全ては、正の整数であり、ランク4または5のデータテンソルが、使用されることができる。例えば、四次データテンソルXK・L・M・Nとして、または五次テンソルXK・L・M・N・Sとしての表現が、使用されることができる。SVDのように、因数分解が、要求される。I×J×K要素行列によって表される三次テンソルXに対して、タッカー因数分解は、以下の形態である。
Figure 0007142017000013
式中、Gは、コアテンソルと称されることができ、A、B、Cは、それぞれ、I×P、J×Q、およびK×R因子行列であり、a,b,cは、対応する因子行列の列を指し、記号
Figure 0007142017000014
は、ベクトル外積を指す。より高次のテンソル表現が、使用され、同一の方法で分解されることができる。
タッカー分解は、以下のように要素毎に表されることもできる。
Figure 0007142017000015
式中、gpqr、aip、bjq、およびckrは、G、A、B、およびCの要素である。A、B、Cは、直交行列であり、コアテンソルGは、直交テンソルである。Gは、
Figure 0007142017000016
であるようにサブテンソル
Figure 0007142017000017
が順序付けられるように配列されることができる。
タッカー分解におけるランク低減は、SVDよりも困難である傾向がある。SVDでは、本質的に1つの自由度、すなわち、保持すべき固有値の数が存在する。タッカー分解は、圧縮(コアテンソルGの打ち切り)が1つ以上の方向で実行され得、その他では実行されないという点で追加の柔軟性を有する。例えば、空間次元におけるランクは、図10A-13Bを参照して下で議論されるように、画像次元におけるランク低減を伴わずに低減させられることができる。概して、打ち切りは、好ましいように、いくつかまたは全てのデータ次元に対して選択されることができる。
一例では、本明細書では、「DifFit基準」と称されるプロシージャが、Timmerman and Kiers,「Three-mode principal components analysis: Choosing the numbers of components and sensitivity to local optima」 Brit J Math Stat Psy. 53:1-16 (2000)(参照することによって本明細書に組み込まれる)に説明されるように使用されることができる。代表的方法1800が、図18に図示される。1802において、トレーサが、注入され、データが、取得され、1804において、全タッカー分解が、取得される。1806において、逸脱度dが、いくつかまたは全ての可能である打ち切りに対して、タッカー分解のモデル(すなわち、打ち切りまたはランク低減モデル)と実際のデータとの間の平方和の差として決定される。1808において、共通の数の成分を伴うモデル内で、最小の逸脱度を伴うモデルが、選択される。成分の数が、次いで、1810において、例えば、図19に示されるグラフを使用して、成分の数の和の関数としての逸脱度に基づいて選択される。低減させられた数の成分が、次いで、1812において、雑音除去されたデータを提供するために使用され、それは、1814において、画像として、または1つ以上の場所における代謝速度として表示されることができる。
代表的例が、図19に図示される。点C、D、E、およびFは、同じ合計数の成分を伴う別の圧縮(すなわち、打ち切り)がより低い逸脱度を有するので、最適ではない。Bが、それが逸脱度におけるより大幅な改良に関連付けられるので、選択される。図17のスクリープロットとの類似性に留意されたい。C、D、およびBとして注記される点の全てが、同数の成分を有し、同一の雑音低減を提供するが、点Bに関連付けられた特定の成分は、測定されたデータに最も近いことに留意されたい。
タッカー分解および多次元SVD(通常、より高次のSVDまたはより高次の主成分分析と称される)の両方は、実験的N次元テンソルをコアテンソルおよび直交行列の組に分解する。より高次のSVDのいくつかの特性が、Bergqvist and Larsson,「The Higher-Order Singular Value Decomposition: Theory and an Application」 IEEE Signal Proc. Mag. 27:151-154 (2010)(参照することによって本明細書に組み込まれる)に提供されている。より高次のSVDとタッカー分解との間の差異は、コアテンソルの性質にある。より高次のSVDでは、コアテンソルにおける行列のスライスは、互いに直交する一方、タッカー分解では、それらは、そうであることが保証されない。多次元SVDは、したがって、より一般的なタッカー分解の特殊ケースと見なされることができる。Eckart-Youngの定理のいかなる類似物も、テンソルのために存在せず、したがって、データへのタッカー分解は、多次元SVDよりも良好な近似であり得ることに留意されたい。
PARAFAC(CANDECOMPおよびCanonical Polyadic分解としても公知である)も、タッカー分解の特殊ケースであり、Gは、超対角であると仮定される(全ての非対角エントリがゼロ)。これは、完全な分離性の仮定を行うことに等しい(下記参照)。本明細書で使用されるように、タッカー分解およびその変形は、多次元SVD、PARAFAC(CANDECOMPおよびCanonical Polyadic分解としても公知である)を含む。
図20Aおよび図20Cは、3方向アレイのタッカー分解を図示する。図20Cは、そのようなタッカー分解が打ち切られ得る様子を図示する。図20Cのタッカー分解では、打ち切りは、一連の展開において項のうちのいずれかを省略することによって、または関連付けられる値をゼロもしくは小さい数に設定することによって遂行されることができる。例えば、図20Bに示されるように、展開における項のうちのいずれかが、ゼロに低減させられることができる。
SVDおよびN次元タッカー分解の両方は、スパース性、すなわち、この具体的例では、注入されたトレーサの代謝に続いて、データがいくつかのベクトルのみから構築された近似を使用して忠実に再構築され得るという事実に依拠する。N次元タッカー分解は、関連する分離性の概念にも依拠する。数学的に、厳密な分離性は、行列がベクトル外積の線形結合として表され得ることを意味する。
Figure 0007142017000018
より一般的に述べると、分離性は、各次元におけるデータがその他から独立していることを意味する。画像内の位置上の代謝物の化学シフトの独立は、問題が、問題のこの部分がほぼ完全に分離可能であることを確実にすることを保証する。大部分に対して、動態も、同様に部分的に分離可能であり、各ボクセルにおける動態は、ほんのいくつかの異なるクラスに分類される。スパース性および分離性は、他の撮像モダリティに対して成り立たないこともあり、他のMRI用途からのデータに対してさえ成り立たないこともある。例えば、拡散fMRIからのfMRI信号は、信号が画像全体を通して強く変動するであろうため、より低い程度の分離性を示す可能性が高い。
ボクセル毎SVDは、基本的にローカルなプロシージャである一方、タッカー分解は、グローバルフィッティングのタイプである。例えば、ボクセル毎SVDおよびタッカー分解の両方においてスペクトルに対して5つの成分が選択される場合、ボクセル毎SVDでは、各ボクセルのための5つの異なる成分が存在することができる一方、タッカー分解では、5つの成分は、画像全体を通して同一である。
図15を参照すると、方法1500は、1502において、トレーサを注入することと、1504において、複数の時間において画像アレイに対するスペクトルデータを取得することとを含む。取得されたデータは、1506において、テンソルとして表され、1508において、タッカー分解を使用して処理される。1510において、タッカー分解は、代謝物の数に基づいて、またはいくつかの異なる低減を試行することによって、雑音を低減させるためにランク低減させられる。テンソル表現では、ランク低減は、化学シフト(すなわち、スペクトルデータ)に対して実施されることができるが、時間および空間次元に対して、ならびに1510において選択されるようなスライス方向にも実施されることができる。SVDに関して上で議論されるように、代表的データ配列は、スペクトル次元における雑音除去に関連付けられるが、時間的に雑音除去するために行および列を置換すること(またはSVD算出の対応する変化)によって適用され得る。テンソル表現では、雑音除去は、スペクトル、取得時間、および/または空間座標(x,y,z)のうちの1つ以上のものに関連付けられることができる。1512において、雑音除去されたデータが、取得され、1514において、雑音除去されたデータは、表示される画像、代謝速度、または取得されたデータに関連付けられた他の特徴を生成するために使用される。
(実施例1 単一点測定)
開示されるアプローチは、単一パルス(空間的に分解されない)MRI実験で13Cトレーサの代謝を追跡するために、41匹のマウスに適用された。300μLの過分極1-13Cピルビン酸の98mM溶液が、左脚に腫瘍異種移植片を帯びるヌードマウスの尾静脈の中に注入された。ピルビン酸は、正常細胞ではHCOに代謝され、ワールブルク効果を呈する癌細胞では乳酸に代謝される。過分極ピルビン酸を作製することに関与する溶解プロセスは、必ずしも完全ではなく、種々の品質のスペクトルをもたらす。理想的な状況では、信号は、DNP後に十分に強いので、主要なピルビン酸(173ppm)から乳酸(185ppm)への変換は、追加の信号処理を伴わずに検出されることができる(図3A参照)。その他では、信号は、殆ど検出可能ではない(図5A参照)。生化学は、これらの場合の各々において同一であるので、ノイジーデータにおけるピーク位置およびおおよその動態は、事前に把握される。図3Bは、未加工データから取得されるようなビタミンC処置前および処置後を伴う時間の関数としての重炭酸塩強度を示し、図4A-4Bは、SVDおよびランク低減を用いて取得された結果を示す。信号対雑音比における有意な改良が、明白である。時間の関数としての重炭酸塩強度は、図3Bでは明白ではない一方、図4Bでは明確に示される。図5Aは、異なる単一パルス測定に関する未加工データを示し、図5Bは、5回の走査にわたって平均されたデータを示す。SVD処理され、ランク低減させられたデータが、図6A-6Bに示され、信号対雑音比における有意な改良を呈する。
図7は、図4A-4Bおよび6A-6Bに図示される等、41 13Cピルビン酸トレーサ単一パルス動的核分極実験におけるランク低減(r=3)を使用するSNR改良を示す。SNRは、最大信号の強度を、信号が存在しないことが把握されるスペクトルの40点領域における標準偏差で除算したものとして定義される。
(実施例2 撮像)
図8A-8Dは、ランク低減させられたSVDに基づく雑音除去を図示する、グルコース代謝に関連付けられた画像を示す。50mgの均一に13C標識化されたグルコースが、ヌードマウスの尾静脈の中に注入され、担腫瘍マウスの脚の8×8画像が、90分にわたって12秒毎に取得された(合計で450枚の画像)。図8A-8Dの明るい輪は、腫瘍境界を表す。図8Aは、解剖学的画像であり、図8B-8Dは、雑音除去されたデータに基づく、走査の途中の(すなわち、走査225における)、それぞれ、乳酸、脂質、およびグルコース局所化の等高線図である。個々のボクセルに関連付けられた信号が、それぞれ、雑音除去の有無別で図9Aおよび9Bに示される。図9Cは、64個の各ボクセルのための雑音除去された信号を示し、図9Dは、1つのボクセルに対するノイジーデータを示す。
(実施例3 タッカー分解を用いた撮像)
過分極乳酸画像の組からの1つのスライスに関連付けられたデータが、図10A-13Bに図示される。雑音低減を伴わずに処理されたスペクトル画像データが、図10A-10Bに示され、40から4への時間領域ランク低減を伴うタッカー分解を介して雑音低減を用いて処理された(図11A-11B)、タッカー分解、40から4への時間領域ランク低減、および32から16への空間次元ランク低減を用いて処理され(図12A-12B)、スライス次元においてさらに処理される(図13A-13B)。データは、各代謝物のための一連の画像、すなわち、各時点で1つの画像をもたらすスペクトル選択的パルスシーケンスを使用して取得された。
(実施例4 複数の生産物の検出)
図16は、SVDおよびランク低減を使用する複数の生産物の検出を図示する。強い信号および弱い信号に関連付けられた5つの異なる代謝生産物が、検出され、定量化されている(2-ピルビン酸(強)207.8ppm、グルタミン酸184ppm、1-ピルビン酸ダブレット(弱)172.1および174ppm、2-ピルビン酸水和物(弱)96.4ppm、ならびにアシルカルニチン175ppm)。そのようなデータの時系列が、代謝速度の特性評価を可能にする。
(実施例5 データ取得および制御)
図14および以下の議論は、開示される技術が実装され得る例示的コンピューティング/データ取得環境の簡潔かつ一般的な説明を提供することを意図している。要求されないが、開示される技術は、パーソナルコンピュータ(PC)、モバイルコンピューティングデバイス、タブレットコンピュータ、または他の算出ならびに/もしくは制御デバイスによって実行されているプログラムモジュール等のコンピュータ実行可能命令の一般的な文脈で説明される。概して、プログラムモジュールは、特定のタスクを実施し、または特定の抽象データタイプを実装するルーチン、プログラム、オブジェクト、コンポーネント、データ構造等を含む。さらに、開示される技術は、ハンドヘルドデバイス、マルチプロセッサシステム、マイクロプロセッサベースまたはプログラマブル消費者用電子機器、ネットワークPC、ミニコンピュータ、メインフレームコンピュータ等を含む他のコンピュータシステム構成を用いて実装され得る。開示される技術は、タスクが通信ネットワークを通してリンクされる遠隔処理デバイスによって実施される分散コンピューティング環境内でも実践され得る。分散コンピューティング環境では、プログラムモジュールは、ローカルメモリ記憶デバイスおよび遠隔メモリ記憶デバイスの両方に位置し得る。
図14を参照すると、開示される技術を実装するための例示的システムは、1つ以上の処理ユニット1402と、システムメモリ1404と、システムメモリ1404を含む種々のシステムコンポーネントを1つ以上の処理ユニット1402に結合するシステムバス1406とを含む例示的な従来のPC1400の形態の汎用コンピューティングデバイスを含む。システムバス1406は、種々のバスアーキテクチャのうちのいずれかを使用するメモリバスまたはメモリコントローラ、周辺機器用バス、およびローカルバスを含むいくつかのタイプのバス構造のうちのいずれかであり得る。例示的システムメモリ1404は、読み取り専用メモリ(ROM)1408と、ランダムアクセスメモリ(RAM)1410とを含む。PC1400内の要素間の情報の転送に役立つ基本的ルーチンを含む基本入出力システム(BIOS)1412が、ROM1408内に記憶される。
例示的PC1400は、ハードディスクから読み取り、それに書き込むためのハードディスクドライブ、取り外し可能磁気ディスクから読み取る、またはそれに書き込むための磁気ディスクドライブ、および(CD-ROMもしくは他の光学式媒体等の)取り外し可能光学ディスクから読み取る、またはそれに書き込むための光学ディスクドライブ、ならびにソリッドステートドライブ等の1つ以上の記憶デバイス1430をさらに含む。そのような記憶デバイスは、それぞれ、ハードディスクドライブインターフェース、磁気ディスクドライブインターフェース、光学ドライブインターフェース、またはソリッドステートドライブインターフェースによってシステムバス1406に接続されることができる。ドライブおよびそれらの関連付けられたコンピュータ読み取り可能な媒体は、PC1400のためのコンピュータ読み取り可能な命令、データ構造、プログラムモジュール、および他のデータの不揮発性記憶装置を提供する。磁気カセット、フラッシュメモリカード、デジタルビデオディスク、CD、DVD、RAM、ROM等のPCによってアクセス可能であるデータを記憶し得る他のタイプのコンピュータ読み取り可能な媒体も、例示的動作環境内で使用され得る。
いくつかのプログラムモジュールは、オペレーティングシステムと、1つ以上のアプリケーションプログラムと、他のプログラムモジュールと、プログラムデータとを含む記憶デバイス1430内に記憶され得る。ユーザは、キーボードおよびマウス等のポインティングデバイス等の1つ以上の入力デバイス1440を通してPC1400の中にコマンドならびに情報を入力し得る。他の入力デバイスは、デジタルカメラ、マイクロホン、ジョイスティック、ゲームパッド、衛星テレビ受信用アンテナ、スキャナ等を含み得る。これらおよび他の入力デバイスは、多くの場合、システムバス1406に結合されたシリアルポートインターフェースを通して1つ以上の処理ユニット1402に接続されるが、パラレルポート、ゲームポート、またはユニバーサルシリアルバス(USB)等の他のインターフェースによって接続され得る。モニタ1446または他のタイプの表示デバイスも、ビデオアダプタ等のインターフェースを介してシステムバス1406に接続される。スピーカおよびプリンタ(図示せず)等の他の周辺出力デバイスが、含まれてもよい。
PC1400は、遠隔コンピュータ1460等の1つ以上の遠隔コンピュータへの論理接続を使用して、ネットワーク化された環境内で動作し得る。いくつかの例では、1つ以上のネットワークまたは通信接続1450が、含まれる。図14では、メモリ記憶デバイス1462のみが図示されているが、遠隔コンピュータ1460は、別のPC、サーバ、ルータ、ネットワークPC、またはピアデバイスもしくは他の一般的なネットワークノードであり得、典型的には、PC1400に対して上で説明された要素のうちの多くまたは全てを含む。パーソナルコンピュータ1400および/または遠隔コンピュータ1460は、論理的ローカルエリアネットワーク(LAN)および広域ネットワーク(WAN)に接続されることができる。そのようなネットワーク化環境は、オフィス、企業全体のコンピュータネットワーク、イントラネット、およびインターネットでは一般的である。
LANネットワーク化環境内で使用されるとき、PC1400は、ネットワークインターフェースを通してLANに接続される。WANネットワーク化環境内で使用されるとき、PC1400は、典型的には、インターネット等のWANを経由して通信を確立するためのモデムまたは他の手段を含む。ネットワーク化環境では、パーソナルコンピュータ1400またはその一部に対して描写されるプログラムモジュールが、LANまたはWAN上の遠隔メモリ記憶デバイスもしくは他の場所内に記憶され得る。示されるネットワーク接続は、例示的であり、コンピュータ間で通信リンクを確立する他の手段が、使用され得る。
メモリ1404は、概して、SVDおよびタッカー分解を実施するためのコンピュータ実行可能命令をそれぞれのメモリ部分1460、1462に含み、ランク低減および好適なランクの選択のためのプロシージャが、メモリ部分1461内に記憶される。データ取得および制御のためのコンピュータ実行可能命令は、トレーサ注入器1472(シリンジポンプ等)および磁気共鳴撮像システムとの使用のためのメモリ部分1470内に記憶される。取得および処理されたデータ(例えば、ランク低減させられたデータ)が、メモリ部分1471に記憶されたコンピュータ実行可能命令を使用して表示されることができる。上記のように、データ取得、処理、および器具制御は、MRIシステムに提供される、またはLANもしくはWANを使用して1つ以上の処理デバイスに分散されることができる。
上記の例は、代謝速度を決定するために、時間の関数としてのMR画像のシーケンスに関して説明される。しかしながら、開示されるアプローチは、信号対雑音比を改良し、1つ以上のデータパラメータに対する平滑化/雑音低減を提供するために、種々のデータタイプのうちのいずれかと共に使用されることができる。
技術を説明および例証したが、例証される実施形態は、配列および詳細において修正され得ることを認識されたい。例えば、ソフトウェアにおいて示される例証される実施形態の要素は、ハードウェアにおいて実装され得、逆もまた同様である。任意の実施例からの技術は、他の実施例のうちのいずれか1つ以上のものに説明される技術と組み合わせられることもできる。例証される実施形態は、例であり、本開示の範囲の限定として解釈されるべきではないことを認識されたい。例えば、本明細書に説明されるシステムおよびツールの種々のコンポーネントは、機能および使用において組み合わせられ得る。したがって、添付される請求項の範囲および精神内に該当する全ての主題を請求する。これらの節において具体的に対処される代替物は、単に、例示的であり、本明細書に説明される実施形態の全ての可能である代替物を構成するわけではない。

Claims (25)

  1. 方法であって、前記方法は、
    磁気共鳴撮像システムにおいて、
    少なくとも1つのボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられた磁気共鳴撮像信号を複数の時間において取得することと、
    前記磁気共鳴撮像信号をデータ行列として配列することと、
    前記データ行列の特異値分解を取得することと、
    分析物の数に基づいて、前記特異値分解をランク低減させることと、
    前記ランク低減させられた特異値分解に基づいて、ランク低減させられたデータ行列を取得することと
    前記取得された磁気共鳴撮像信号がトレーサの代謝に関連付けられるように前記トレーサを注入することと
    を含み、
    前記分析物は、前記トレーサまたは前記トレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む、方法。
  2. 前記分析物の数は、代謝生産物の数に対応する、請求項に記載の方法。
  3. 方法であって、前記方法は、
    磁気共鳴撮像システムにおいて、
    少なくとも1つのボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられた磁気共鳴撮像信号を複数の時間において取得することと、
    前記磁気共鳴撮像信号をデータ行列として配列することと、
    前記データ行列の特異値分解を取得することと、
    前記特異値分解をランク低減させることと、
    前記ランク低減させられた特異値分解に基づいて、ランク低減させられたデータ行列を取得することと
    を含み、
    前記データ行列は、m×nデータ行列であり、mは、測定時間の数を表す整数であり、nは、測定された化学シフトの数を表す整数であり、前記特異値分解は、行列U、Σ、Vを含み、Uは、m×mユニタリ行列であり、Σは、対角線上に非負の実数を伴う対角m×n行列であり、Vは、n×n直交行列である方法。
  4. ランク低減は、前記行列Σのr個の最も小さい対角値をゼロに設定し、行列Σ’を形成することを含み、前記ランク低減させられたデータ行列は、行列積U・Σ’・Vとして取得される、請求項に記載の方法。
  5. 前記行列ΣおよびΣ’の対角値は、前記行列の行において最大から最小に配列されている、請求項に記載の方法。
  6. 前記磁気共鳴撮像信号は、前記複数の時間における前記複数のボクセルのための前記複数の化学シフトに関連付けられ、各ボクセルのために、前記磁気共鳴撮像信号は、データ行列として配列され、前記データ行列の特異値分解が、取得され、次いで、ランク低減させられ、ランク低減させられたデータ行列が、前記複数のボクセルの各々のために生産される、請求項1に記載の方法。
  7. 磁気共鳴撮像装置であって、前記磁気共鳴撮像装置は、
    試料中に軸方向磁場を確立するために位置している磁石と、
    電磁パルスシーケンスを前記試料に印加するために位置している複数のコイルと、
    前記印加された電磁パルスシーケンスに応答して、前記試料から磁気共鳴撮像信号を検出するために位置している受信機と、
    コントローラと
    を備え、
    前記コントローラは、前記複数のコイルに結合され、前記電磁パルスシーケンスを選択的に印加することにより、
    複数のボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられた前記磁気共鳴撮像信号を複数の時間において取得することと、
    前記磁気共鳴撮像信号をデータテンソルとして配列することと、
    前記データテンソルのタッカー分解を取得することと、
    前記タッカー分解を空間的または時間的にランク低減させ、前記複数のボクセルの各々のための空間的または時間的に雑音除去されたボクセルデータを生産することと
    を行う、磁気共鳴撮像装置。
  8. 磁気共鳴撮像装置であって、前記磁気共鳴撮像装置は、
    試料中に軸方向磁場を確立するために位置している磁石と、
    電磁パルスシーケンスを前記試料に印加するために位置している複数のコイルと、
    前記印加された電磁パルスシーケンスに応答して、前記試料から電磁信号を検出するために位置している受信機と、
    コントローラと、
    前記試料の中にトレーサを注入するために位置している注入器
    を備え、
    前記コントローラは、前記複数のコイルに結合され、前記電磁パルスシーケンスを選択的に印加し、前記コントローラは、前記受信機に結合され、複数の試料ボクセルのための前記検出された電磁信号に関連付けられた信号値を記憶し、前記複数の試料ボクセルのうちの少なくとも1つに関連付けられた行列表現に関連付けられた特異値分解をランク低減させることによって前記検出された電磁信号を処理し、
    前記コントローラは、前記複数の試料ボクセルの各々に関連付けられた行列表現に関連付けられた特異値分解をランク低減させることによって前記検出された電磁信号を処理し、
    前記特異値分解の前記ランク低減は、分析物の数に基づき、
    前記注入器は、前記検出された電磁信号が前記注入されたトレーサの代謝に関連付けられるように前記コントローラに結合され、前記分析物は、前記トレーサまたは前記トレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む磁気共鳴撮像装置。
  9. 前記分析物の数は、代謝生産物の数に対応する、請求項に記載の磁気共鳴撮像装置。
  10. 各ボクセルのための前記行列表現は、m×nデータ行列であり、mは、測定時間の数を表す整数であり、nは、測定された化学シフトの数を表す整数であり、前記特異値分解は、行列U、Σ、Vを含み、Uは、m×mユニタリ行列であり、Σは、対角線上に非負の実数を伴う対角m×n行列であり、Vは、n×n直交行列である、請求項に記載の磁気共鳴撮像装置。
  11. ランク低減は、前記行列Σのr個の最も小さい対角値をゼロに設定し、行列Σ’を形成することを含み、前記ランク低減させられたデータ行列は、行列積U・Σ’・Vとして取得される、請求項10に記載の磁気共鳴撮像装置。
  12. 前記行列ΣおよびΣ’の対角値は、前記行列の行において最大から最小に配列されている、請求項11に記載の磁気共鳴撮像装置。
  13. 前記検出された電磁信号は、前記複数の時間における前記複数のボクセルのための前記複数の化学シフトに関連付けられ、各ボクセルのために、前記検出された電磁信号は、データ行列として配列され、前記データ行列の特異値分解が、取得され、次いで、ランク低減させられ、前記ランク低減させられたデータ行列が、前記複数のボクセルの各々のために生産される、請求項12に記載の磁気共鳴撮像装置。
  14. 前記ランク低減させられたデータ行列を使用して画像を表示することをさらに含む、請求項13に記載の磁気共鳴撮像装置。
  15. 方法であって、前記方法は、
    磁気共鳴撮像システムにおいて、
    複数のボクセルのための複数の化学シフトに関連付けられた磁気共鳴撮像信号を複数の時間において取得することと、
    前記磁気共鳴撮像信号をデータテンソルとして配列することと、
    前記データテンソルのタッカー分解を取得することと、
    前記タッカー分解を空間的または時間的にランク低減させ、前記複数のボクセルの各々のための空間的または時間的に雑音除去されたボクセルデータを生産することと
    を含む、方法。
  16. 前記ランク低減は、時間ランク低減である、請求項15に記載の方法。
  17. 前記取得された磁気共鳴撮像信号がトレーサの代謝に関連付けられるように前記トレーサを注入することをさらに含み、前記分析物は、前記トレーサまたは前記トレーサに関連付けられた1つ以上の代謝生産物を含む、請求項16に記載の方法。
  18. 前記ランク低減は、代謝生産物の数に基づくスペクトルランク低減である、請求項17に記載の方法。
  19. 前記ランク低減は、測定されたデータと打ち切りモデルデータとの間の差異に基づく、請求項15に記載の方法。
  20. タッカー分解は、コアテンソルと、複数の直交因子行列とを含む、請求項15に記載の方法。
  21. 前記データテンソルは、前記複数のボクセルの各々のためのデータ行列を含み、前記データ行列は、m×nデータ行列であり、mは、測定時間の数を表す整数であり、nは、測定された化学シフトの数を表す整数である、請求項15に記載の方法。
  22. 方法であって、前記方法は、
    磁気共鳴撮像システムにおいて、
    少なくとも2つのパラメータの関数として複数のボクセルのための磁気共鳴撮像信号を取得することと、
    前記磁気共鳴撮像信号をデータテンソルとして配列することと、
    前記データテンソルのタッカー分解を取得することと、
    前記2つのパラメータのうちの少なくとも1つに基づいて、前記タッカー分解をランク低減させ、前記複数のボクセルの各々のための処理されたボクセルデータを生産することと
    を含む、方法。
  23. 前記処理されたボクセルデータは、前記ボクセルの各々のためのデータ行列として表される、請求項22に記載の方法。
  24. 前記タッカー分解をランク低減させ、前記複数のボクセルの各々のための処理されたボクセルデータを生産することは、前記少なくとも2つのパラメータの両方に基づく、請求項23に記載の方法。
  25. 前記処理されたボクセルデータは、雑音除去されたボクセルデータである、請求項24に記載の方法。
JP2019543765A 2017-02-14 2018-02-14 動態ドメインにおける低ランク近似を用いた動的磁気共鳴分光撮像の雑音除去 Active JP7142017B2 (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201762459008P 2017-02-14 2017-02-14
US62/459,008 2017-02-14
PCT/US2018/018217 WO2018152231A1 (en) 2017-02-14 2018-02-14 Denoising of dynamic magnetic resonance spectroscopic imaging using low rank approximations in the kinetic domain

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2020507405A JP2020507405A (ja) 2020-03-12
JP7142017B2 true JP7142017B2 (ja) 2022-09-26

Family

ID=61283405

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2019543765A Active JP7142017B2 (ja) 2017-02-14 2018-02-14 動態ドメインにおける低ランク近似を用いた動的磁気共鳴分光撮像の雑音除去

Country Status (6)

Country Link
US (2) US20200049782A1 (ja)
EP (1) EP3583436B1 (ja)
JP (1) JP7142017B2 (ja)
AU (1) AU2018221015B2 (ja)
CA (1) CA3053157A1 (ja)
WO (1) WO2018152231A1 (ja)

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3853627A4 (en) * 2018-09-20 2022-06-08 Cedars-Sinai Medical Center STORAGE, DISPLAY AND ANALYSIS OF WEIGHTED MULTIDIMENSIONAL IMAGES
CN111257929B (zh) * 2020-02-17 2021-03-19 成都理工大学 一种奇异值衰减的降秩去噪方法
CN113180636B (zh) * 2021-04-29 2022-09-16 杭州微影医疗科技有限公司 干扰消除方法、介质及设备
CN113655534B (zh) * 2021-07-14 2022-05-17 中国地质大学(武汉) 基于多线性奇异值张量分解核磁共振fid信号噪声抑制方法
US20230236272A1 (en) * 2022-01-27 2023-07-27 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Deep learning-based water-fat separation from dual-echo chemical shift encoded imaging
CN115964619B (zh) * 2023-02-15 2023-09-22 霖鼎光学(江苏)有限公司 一种去除切削力信号噪声的方法、电子设备及存储介质

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20140286560A1 (en) 2011-11-06 2014-09-25 Mayo Foundation For Medical Education And Research Method for calibration-free locally low-rank encouraging reconstruction of magnetic resonance images
US20150285889A1 (en) 2014-04-02 2015-10-08 University Of Virginia Patent Foundation Systems and methods for accelerated imaging using variable density sampling and compressed sensing with parallel imaging
US20150302579A1 (en) 2014-04-21 2015-10-22 Case Western Reserve University Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Fingerprinting With Singular Value Decomposition (SVD) Compression
WO2016001836A2 (en) 2014-07-03 2016-01-07 Koninklijke Philips N.V. Multi-shot magnetic-resonance (mr) imaging system and method of operation thereof
US20160202336A1 (en) 2015-01-12 2016-07-14 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois System and method for high-resolution spectroscopic imaging

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5121337A (en) * 1990-10-15 1992-06-09 Exxon Research And Engineering Company Method for correcting spectral data for data due to the spectral measurement process itself and estimating unknown property and/or composition data of a sample using such method
MY107650A (en) * 1990-10-12 1996-05-30 Exxon Res & Engineering Company Method of estimating property and / or composition data of a test sample
US8862662B2 (en) * 2012-10-29 2014-10-14 The Boeing Company Determination of latent interactions in social networks
US20160284080A1 (en) * 2015-03-27 2016-09-29 Sabanci University Vasculature modeling
WO2018144573A1 (en) * 2017-01-31 2018-08-09 Regents Of The University Of Minnesota System and method for producing temporally resolved images depicting late-gadolinium enhancement with magnetic resonance imaging
US10775464B2 (en) * 2017-01-31 2020-09-15 Regents Of The University Of Minnesota System and method for dynamic, cardiac phase-resolved quantitative longitudinal relaxation parameter mapping
US10436871B2 (en) * 2017-04-24 2019-10-08 Cedars-Sinai Medical Center Low-rank tensor imaging for multidimensional cardiovascular MRI

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20140286560A1 (en) 2011-11-06 2014-09-25 Mayo Foundation For Medical Education And Research Method for calibration-free locally low-rank encouraging reconstruction of magnetic resonance images
US20150285889A1 (en) 2014-04-02 2015-10-08 University Of Virginia Patent Foundation Systems and methods for accelerated imaging using variable density sampling and compressed sensing with parallel imaging
US20150302579A1 (en) 2014-04-21 2015-10-22 Case Western Reserve University Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Fingerprinting With Singular Value Decomposition (SVD) Compression
WO2016001836A2 (en) 2014-07-03 2016-01-07 Koninklijke Philips N.V. Multi-shot magnetic-resonance (mr) imaging system and method of operation thereof
US20160202336A1 (en) 2015-01-12 2016-07-14 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois System and method for high-resolution spectroscopic imaging

Also Published As

Publication number Publication date
US20200049782A1 (en) 2020-02-13
CA3053157A1 (en) 2018-08-23
EP3583436B1 (en) 2022-09-28
AU2018221015A1 (en) 2019-08-29
JP2020507405A (ja) 2020-03-12
US20220214415A1 (en) 2022-07-07
EP3583436A1 (en) 2019-12-25
WO2018152231A1 (en) 2018-08-23
AU2018221015B2 (en) 2023-04-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7142017B2 (ja) 動態ドメインにおける低ランク近似を用いた動的磁気共鳴分光撮像の雑音除去
Moeller et al. NOise reduction with DIstribution Corrected (NORDIC) PCA in dMRI with complex-valued parameter-free locally low-rank processing
Brender et al. Dynamic imaging of glucose and lactate metabolism by 13C-MRS without hyperpolarization
Roy et al. Accelerated MRI of the fetal heart using compressed sensing and metric optimized gating
Bilgic et al. Fast image reconstruction with L2‐regularization
Sotiropoulos et al. Advances in diffusion MRI acquisition and processing in the Human Connectome Project
US7817838B2 (en) Method and system for constrained reconstruction of imaging data using data reordering
Soher et al. GAVA: spectral simulation for in vivo MRS applications
JP5926285B2 (ja) 任意k空間トラジェクトリの高速並行再構成
Bydder et al. Noise reduction in multiple-echo data sets using singular value decomposition
US10338178B2 (en) System and method for high-resolution spectroscopic imaging
Hugger et al. Fast undersampled functional magnetic resonance imaging using nonlinear regularized parallel image reconstruction
Holland et al. Compressed sensing reconstruction improves sensitivity of variable density spiral fMRI
Kim et al. Denoising of hyperpolarized 13C MR images of the human brain using patch‐based higher‐order singular value decomposition
Ting et al. Fast implementation for compressive recovery of highly accelerated cardiac cine MRI using the balanced sparse model
Qu et al. Convergence behavior of iterative SENSE reconstruction with non‐Cartesian trajectories
Jeurissen et al. Multi-tissue spherical deconvolution of tensor-valued diffusion MRI
Baete et al. Multiple‐echo diffusion tensor acquisition technique (MEDITATE) on a 3T clinical scanner
US20090060841A1 (en) Apparatus and method for combined use of variable flip angles and centric phase encoding in hyperpolarized 13c imaging
Huang Reliable estimation of brain intravoxel incoherent motion parameters using denoised diffusion‐weighted MRI
EP2757386A1 (en) Synthetic parameter-weigthed images based on relaxometry (SPARE)
Vaish et al. TL-HARDI: transform learning based accelerated reconstruction of HARDI data
Brender et al. PET by MRI: Glucose Imaging by 13C-MRS without Dynamic Nuclear Polarization by Noise Suppression through Tensor Decomposition Rank Reduction
Prčkovska et al. Optimal Short‐Time Acquisition Schemes in High Angular Resolution Diffusion‐Weighted Imaging
Moeller et al. Locally low-rank denoising in transform domains

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20190819

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20210129

A977 Report on retrieval

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007

Effective date: 20211228

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20220202

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20220428

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20220818

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20220912

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Ref document number: 7142017

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150