JP7099324B2 - がんの検査方法、がんの検査装置、検査プログラムおよびがんの検査システム - Google Patents
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Description
本発明の第2の態様によると、がんの検査装置は、生体試料における所定のアミノ酸の量に対応する信号と所定の原子間結合の量に対応する信号との比を算出するパラメータ算出部と、前記比に基づいて、前記生体試料が、がん細胞を含むか否かの判定を行うがん判定部と、前記判定に影響を与えるノイズ要素の量に対応する信号に基づいて、前記判定の信頼性を判断する信頼性判断部と、を備える。
本発明の第3の態様によると、検査プログラムは、生体試料における所定のアミノ酸の量に対応する信号と所定の原子間結合の量に対応する信号との比を算出する算出処理と、前記比を出力する、または、前記比に基づいて前記生体試料ががん細胞を含むか否かの判定を行った判定結果を出力する出力処理と、前記判定に影響を与えるノイズ要素の量に対応する信号に基づいて、前記判定の信頼性を判断する信頼性判断処理と、を処理装置に行わせる。
本発明の第4の態様によると、生体試料における所定のアミノ酸に対応する信号と所定の原子間結合に対応する信号とを測定する測定装置と、前記所定のアミノ酸の量に対応する信号と、前記所定の原子間結合の量に対応する信号との比を算出し、前記比を出力する、または、前記比に基づいて前記生体試料ががん細胞を含むか否かの判定を行った判定結果を出力する出力装置と、前記判定に影響を与えるノイズ要素の量に対応する信号に基づいて、前記判定の信頼性を判断する信頼性判断装置と、を備える。
なお、本実施形態において、「がん」とは、癌(癌腫)、肉腫、血液腫瘍およびその他の悪性腫瘍を含む。また、「生体試料」とは、生体から採取された細胞、組織、臓器、病理切片等に加え、生体内の細胞、組織、臓器を含む。
なお、図1では後方散乱された光を解析する構成になっているが、前方散乱された光を解析する構成にしてもよい。切片9からの光から解析可能な分光スペクトルが得られれば、検査装置100の構成は特に限定されない。また、ラマン散乱光以外の赤外分光法等により測定部2を構成してもよい。
切片9における関心領域90の数、形状および位置は特に限定されず、関心領域90における単位領域91の数、形状および位置は特に限定されない。
なお、入力データは、後述の通信部43を介して取得してもよい。
なお、表示部42は、感熱紙等の紙媒体に判定結果等を印字して出力する構成にしてもよい。
なお、上記判定パラメータにおける比は、例えば1:2のように表してもよいし、比率として1つの数値で表してもよい。
なお、上記ではがん領域よりも正常領域の方が、判定パラメータの値が大きいとしたが、判定パラメータが基づく統計データに合わせて適宜逆に設定され得る。また、上記では2つの判定閾値T2、T3を用いたが、3以上の判定閾値を用いてもよく、それに伴いがんが存在する可能性の高さに応じ段階的に領域を設定してもよい。
なお、判定閾値T1、T2、T3について、判定閾値と測定値とが等しい場合についてどちらに含めるかは適宜設定することができる。以下の信頼度判定閾値T4についても同様である。
なお、包埋剤に限らず、ノイズ要素、特に判定パラメータの測定に影響を与えるバックグラウンドとなる要素の量に対応する信号に基づいて、がん判定部52が行ったがん判定の信頼度を判定する構成にしてもよい。
(1)本実施形態のがんの検査方法は、生体試料における所定のアミノ酸の量に対応する信号と所定の原子間結合の量に対応する信号とを計測する工程と、両信号の比に基づいて、生体試料が、がん細胞を含むか否かの判定を行うものであり、がんの検査装置100は、上記比を算出するパラメータ算出部と、上記比に基づいて、生体試料ががん細胞を含むか否か判定するがん判定部とを備える。これにより、正確にがんが存在するか否かの判定を行うことができる。
(変形例1)
上述の実施形態においては、検査装置100が測定部2と情報処理装置40とを備える構成とした。しかし、測定部2に対応する装置と、情報処理装置40に対応する装置とが遠隔等にあり、通信により結ばれるシステムとしてもよい。
本実施形態の情報処理装置40の情報処理機能を実現するためのプログラムをコンピュータにより読み取り可能な記録媒体に記録して、この記録媒体に記録された、上述した判定パラメータの算出処理および判定処理等に関するがんの検査プログラムをコンピュータシステムに読み込ませ、実行させてもよい。なお、ここでいう「コンピュータシステム」とは、OS(Operating System)や周辺機器のハードウェアを含むものとする。また、「コンピュータ読み取り可能な記録媒体」とは、フレキシブルディスク、光磁気ディスク、光ディスク、メモリカード等の可搬型記録媒体、コンピュータシステムに内蔵されるハードディスク等の記憶装置のことをいう。さらに「コンピュータ読み取り可能な記録媒体」とは、インターネット等のネットワークや電話回線等の通信回線を介してプログラムを送信する場合の通信線のように、短時間の間、動的にプログラムを保持するもの、その場合のサーバやクライアントとなるコンピュータシステム内部の揮発性メモリのように、一定時間プログラムを保持するものを含んでもよい。また上記のプログラムは、前述した機能の一部を実現するためのものであってもよく、さらに前述した機能をコンピュータシステムにすでに記録されているプログラムとの組み合わせにより実現するものであってもよい。
がん組織からなることが既知の試料と、正常組織からなることが既知の試料とについて、ラマン散乱光の分光スペクトルを取得して判定パラメータおよび信頼度判定パラメータを測定した。切片9は、ヒトのすい臓の切片を用いた。すなわち、上記のがん細胞を含む試料はすい臓がんの試料である。試料をパラフィンを用いて固定し、標本を作成した後、公知の脱パラフィン処理を行った。脱パラフィン処理がされた試料に対し、10~1000μm2程度の面積の関心領域90を設定し、関心領域90を複数の単位領域に分割し、それぞれの単位領域に対し1μm程度のビーム径の波長532nmのレーザー光を照射してラマン散乱光を測定した。
なお、与えられた測定値からどのように判定閾値T1、T2、T3、信頼度判定閾値T4を設定するかは特に限定されず、がん組織および正常組織に関する任意の統計値を用いることができる。例えば、各パラメータの分布を正規分布で近似し、平均値から1σ点、2σ点、3σ点等の位置に判定閾値を設定してもよい。また、図9では測定点の一点を外れ値として検定により除いた。
日本国特許出願2016年第222985号(2016年11月16日出願)
Claims (13)
- 生体試料のがんの検査方法であって、
前記生体試料における所定のアミノ酸の量に対応する信号と所定の原子間結合の量に対応する信号とを計測する工程と、
前記信号に基づいて、前記生体試料が、がん細胞を含むか否かの判定を行う工程と、
前記判定に影響を与えるノイズ要素の量に対応する信号に基づいて、前記判定の信頼性を判断する工程と、
を備えるがんの検査方法。 - 請求項1に記載のがんの検査方法において、
前記所定のアミノ酸の量に対応する信号と、前記所定の原子間結合の量に対応する信号との比を算出する工程を備えるがんの検査方法。 - 請求項2に記載のがんの検査方法において、
前記所定の原子間結合で結合されている原子は、炭素原子を含むがんの検査方法。 - 請求項2または3に記載のがんの検査方法において、
前記所定の原子間結合は、飽和炭化水素におけるC-H結合、炭素原子間の二重結合、またはアミド結合であるがんの検査方法。 - 請求項2から4までのいずれか一項に記載のがんの検査方法において、
前記生体試料における所定のアミノ酸の量に対応する信号と所定の原子間結合の量に対応する信号とを計測する工程は、
前記生体試料に励起光を照射し、前記生体試料からの光の分光スペクトルを取得する工程を含み、
前記所定のアミノ酸の量に対応する信号と、前記所定の原子間結合の量に対応する信号との比を算出する工程は、
前記分光スペクトルにおける、前記所定のアミノ酸に対応する強度と前記所定の原子間結合に対応する強度とのデータに基づいて前記比を算出する工程を含む、がんの検査方法。 - 請求項5に記載のがんの検査方法において、
前記分光スペクトルは、ラマン散乱光の分光スペクトルであるがんの検査方法。 - 請求項6に記載のがんの検査方法において、
前記所定のアミノ酸に対応する強度は、前記ラマン散乱光のストークス散乱域における、半値幅の範囲に1003/cmを含むピークの強度であり、前記所定の原子間結合に対応する強度は、半値幅の範囲に1450/cmまたは1659/cmを含むピークの強度であるがんの検査方法。 - 請求項2から7までのいずれか一項に記載のがんの検査方法において、
(i)閾値を一つ設定し、前記比が、該閾値より大きいか否かに基づいて前記判定を行う、または
(ii)閾値を二つ設定し、前記比が、小さい閾値より小さいか、または大きい閾値より大きいかに基づいて判定を行う、がんの検査方法。 - 請求項1から8までのいずれか一項に記載のがんの検査方法において、
前記所定のアミノ酸は、フェニルアラニンであるがんの検査方法。 - 請求項1から9までのいずれか一項に記載のがんの検査方法において、
前記生体試料は、すい臓の組織であるがんの検査方法。 - 生体試料における所定のアミノ酸の量に対応する信号と所定の原子間結合の量に対応する信号との比を算出するパラメータ算出部と、
前記比に基づいて、前記生体試料が、がん細胞を含むか否かの判定を行うがん判定部と、
前記判定に影響を与えるノイズ要素の量に対応する信号に基づいて、前記判定の信頼性を判断する信頼性判断部と、を備えるがんの検査装置。 - 生体試料における所定のアミノ酸の量に対応する信号と所定の原子間結合の量に対応する信号との比を算出する算出処理と、
前記比を出力する、または、前記比に基づいて前記生体試料ががん細胞を含むか否かの判定を行った判定結果を出力する出力処理と、
前記判定に影響を与えるノイズ要素の量に対応する信号に基づいて、前記判定の信頼性を判断する信頼性判断処理と、を処理装置に行わせる検査プログラム。 - 生体試料における所定のアミノ酸に対応する信号と所定の原子間結合に対応する信号とを測定する測定装置と、
前記所定のアミノ酸の量に対応する信号と、前記所定の原子間結合の量に対応する信号との比を算出し、前記比を出力する、または、前記比に基づいて前記生体試料ががん細胞を含むか否かの判定を行った判定結果を出力する出力装置と、
前記判定に影響を与えるノイズ要素の量に対応する信号に基づいて、前記判定の信頼性を判断する信頼性判断装置と、
を備えるがんの検査システム。
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