JP7007199B2 - デュシェンヌ型筋ジストロフィーのための併用療法 - Google Patents
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Description
本発明は、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの処置のためのアンチセンスオリゴヌクレオチドとウイルスベクターとの併用に関する。
ジストロフィン異常症は、ジストロフィンと呼ばれる筋細胞膜下タンパク質をコードするDMD遺伝子の異常によって引き起こされる病状である。最も頻繁な遺伝子変化である大きな欠失に関して、表現型の重症度は、変異がジストロフィン転写物のタンパク質リーディングフレームに及ぼす影響により主として左右される。オープンリーディングフレームを破壊する変異により、デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)ではジストロフィンが存在しない。ベッカー型筋ジストロフィーという、より軽症の形態の疾患では、変異により、部分的機能性ジストロフィンをコードする、短いがフレーム内の転写物が生じる。ジストロフィンの構造(24個のスペクトリン様リピートからできたセントラルロッドドメイン)は、大きな内部欠失を許容し(1)、そのことが、機能性マイクロ-ジストロフィンcDNAを筋肉内に移入する古典的遺伝子治療及び標的エクソンスキッピングという2つの主要治療戦略の開発に導いた。両方のアプローチは、筋肉への効率的な遺伝子移入を可能にするアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターを使用して有望な結果を示した。エクソンスキッピング戦略は、フレーム外変異をフレーム内変異に変換し、内部欠失しているが、部分的機能性であるジストロフィンをもたらす。この治療アプローチは、アンチセンスオリゴヌクレオチド(AON)を使用して、特に最近の臨床試験ではいくらかの成功を示した(2~5)。AONは、免疫原性でないという絶大な利点を有するが、治療上の利益を維持するには定期的に注射しなければならないという欠点を有する。本発明者ら及びその他は、その代わりに、U7snRNA又はU1snRNAなどの核内低分子RNAを使用してアンチセンス配列を骨格筋又は心筋に導入できることを示した(6~8)。これらの治療用分子は、ジストロフィン欠損マウスモデル(7~9)及びジストロフィン欠損イヌGRMD(10;11)において治療用アンチセンスの永続的産生を確実にするAAV粒子としてベクター化される。AAV-U7のワンショット処置は、準(quasi-)ジストロフィンの回復を相当レベル達成するために十分であり、その回復は、筋力の有意な改善と関連する。
第1の態様では、本発明は、筋ジストロフィー治療産物をコードするウイルスベクターと組み合わせた、筋ジストロフィーの処置における使用のための、ジストロフィンのプレmRNAにエクソンスキッピングを誘導する能力がある単離されたアンチセンスオリゴヌクレオチド(AON)に関し、筋ジストロフィー治療産物は、例えば(i)ジストロフィンのプレmRNAにエクソンスキッピングを誘導する能力があるアンチセンスオリゴヌクレオチド又は(ii)機能性ジストロフィンタンパク質をコードするウイルスベクターのいずれかであり得、その際、該処置は、該ウイルスベクターを投与する前に該オリゴヌクレオチドを投与することを含む。
本発明者らは、本明細書において、筋ジストロフィーの2段階併用療法が先行技術において公知の処置戦略よりも有利であることを示す。本発明は、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの処置方法における使用のための、上記の単離されたアンチセンスオリゴヌクレオチドであって、ジストロフィンのプレmRNA内でエクソンスキッピングを誘導し、機能性ジストロフィンタンパク質をコードするmRNA転写物を産生するよう筋肉細胞を誘導するために適切なアンチセンスオリゴヌクレオチドに関し、その際、該単離されたAONは、目的とするウイルスベクター性デュシェンヌ型筋ジストロフィー療法の前に筋肉細胞の完全性を確保する。最初に、本明細書において提唱された併用療法は、ジストロフィンのプレmRNA内のエクソンスキッピングを誘導し、機能性ジストロフィンタンパク質をコードするmRNA転写物を産生するように筋肉細胞を誘導するために適切な、上記の単離されたAONを投与することを含む。第2段階では、本発明の方法は、デュシェンヌ型筋ジストロフィー治療産物をコードする少なくとも1種のウイルスベクターを同じ対象に投与することを含む。ウイルスベクター(又は治療用ウイルスベクター)は、筋肉細胞におけるジストロフィンの機能を回復するように設計される。例えば、筋肉細胞におけるジストロフィンの機能を回復することができる少なくとも1つのウイルスベクターは、(i)ジストロフィンのプレmRNA内にエクソンスキッピングを誘導し、機能性ジストロフィンタンパク質をコードするmRNA転写物を産生するように筋肉細胞を誘導することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドをコードする(以下の説明において「AONコードウイルス」としても称される)か、(ii)ジストロフィン遺伝子に特異的な1つ以上のエンドヌクレアーゼを提供するゲノム編集手段などの、該筋肉細胞のゲノムにおいてジストロフィン遺伝子を修正するための手段を筋肉細胞に導入するように設計されているか、又は(iii)機能性ジストロフィンタンパク質をコードするかの、いずれかのウイルスベクターである。
GGCCAAACCTCGGCTTACCTAAATAGAAGTTCATTTACACTAAC(配列番号:2)
に示される配列を含む。
- 第1に、ジストロフィンのプレmRNAの一部と相補的であり、このプレmRNAをmRNAにプロセシングする間にエクソンスキッピングを誘導することができる、単離されたアンチセンスオリゴヌクレオチド;及び
- 第2に、(i)ジストロフィンのプレmRNA内でエクソンスキッピングを誘導することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドをコードするか、(ii)ジストロフィン遺伝子編集手段をコードするか、又は(iii)機能性ジストロフィンをコードするかのいずれかなどである、デュシェンヌ型筋ジストロフィー治療産物をコードするウイルスベクター
の2段階投与を含む、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの処置に関する。
材料及び方法
ウイルスベクターの産生及び動物実験
1本鎖AAV1-U7ex23ベクター(7)、AAV1-U7scrベクター(13)及びAAV1-MD1(37)ベクターの作製のためにpAAV(U7smOPT-SD23/BP22)プラスミド、pAAV(U7smOPT-scr)プラスミド及びコドン最適化したpΔR4-R23/ΔCT(MD1)プラスミドを用いる3プラスミドのトランスフェクションプロトコールを利用した。リアルタイムPCRによってベクターの力価を決定し、ベクターゲノム/ml(vg/ml)として表現した。3月齢mdxマウスの前脛骨(TA)筋にPip6a-PMOオリゴヌクレオチド(GGCCAAACCTCGGCTTACCTGAAAT-配列番号:1)1nmoleを注射した(20)。追加的に、1E+10又は1E+11vgを含有するAAV1-U7scr、AAV1-U7ex23又はAAV1-MD1 50μlをC57BL/6(wt)又はmdxのTAに注射した。これらの動物実験を、筋学研究センター(Myology Research Center, Paris, France)で施設内審査委員会によって承認されたガイドライン及びプロトコールに従って行った。各実験について1群あたり最低で4匹のマウスに注射した。屠殺時に、筋肉を収集し、液体窒素で冷却したイソペンタン中で急速凍結し、-80℃で保存した。
Puregene Bloodキット(Qiagen)を使用してマウス筋肉からゲノムDNAを抽出した。Taqman(登録商標)Universal Master Mix(Applied Biosystems)を使用するStepOnePlus(商標)(Applied Biosystems)による絶対定量リアルタイムPCRによってゲノムDNA 100ngに対してAAVゲノム及びゲノムDNAのコピー数を測定した。ウイルスゲノムの配列を特異的に増幅するためにプライマー(フォワード:CTCCATCACTAGGGGTTCCTTG(配列番号:3)及びリバース:GTAGATAAGTAGCATGGC(配列番号:4))並びにプローブ(TAGTTAATGATTAACCC(配列番号:5))を使用した。参照試料としてpAAVプラスミドを10倍系列希釈した(107コピーから101コピー)。全てのゲノムDNA試料を2つ組で分析した。
NucleoSpin(登録商標)RNA II(Macherey-Nagel)を用いてマウス筋肉から総RNAを単離し、Superscript(商標)II及びランダムプライマー(Life technologies)を使用することによってRNA 200ngに対して逆転写(RT)を行った。ネステッドPCRによりスキッピングされていないジストロフィン転写物及びスキッピングされたジストロフィン転写物を検出し、既述のように定量した(9)。
プールされた筋肉切片を125mM スクロース、5mM トリス-HCl(pH6.4)、6% XTトリシン泳動緩衝液(Bio-Rad)、10% SDS、10% グリセロール、5% β-メルカプトエタノールで処理したものからタンパク質抽出物を得た。Pierce Compat-Able(商標)タンパク質アッセイ調製用試薬セット(Thermo Scientific)を用いて試料を精製し、Pierce BCAタンパク質アッセイキット(Thermo Scientific)を用いて総タンパク質濃度を決定した。試料を95℃で5分間変性させ、タンパク質 100μgをCriterion XT トリス-酢酸成形済みゲル3~8%(Bio-Rad)に負荷した。ジストロフィンに対する一次モノクローナル抗体(NCL-DYS1、1:50、Leica Biosystems;MANEX1011B、1:50、親切にもMuscular Dystrophy Association Monoclonal Antibody Resourceによって贈呈された(38))及びα-アクチニンに対する一次モノクローナル抗体(1:1000、Sigma-Aldrich)を用いて膜を探索し、続いてヒツジ抗マウス2次抗体(ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合型;1:15000)及びPierce ECLウエスタンブロット基質(Thermo Scientific)と共にインキュベートした。
12μmのTA切片を切り出し、NCL-DYS2モノクローナル抗体(1:50; Leica Biosystems)及びヤギ抗ウサギ2次抗体Alexa 488(1:1000; Life technologies)を使用してジストロフィンの発現について検査した。
非治療用ウイルスゲノムの維持に及ぼすAON前処置によるジストロフィン回復の効果
mdx筋線維の筋細胞膜でのジストロフィンの一時的発現を誘導するために、mdxの前脛骨(TA)筋肉に、mdxエクソンスキッピングに特に効率的なペプチド-ホスホロジアミダートモルホリノ(PPMO)アンチセンスオリゴヌクレオチドであるPip6a-PMO 11μgを注射した(20)。ジストロフィンの救済が高用量(1E+11ウイルスゲノム)で最適であった場合、2週間後に非治療用AAV-U7scrベクター(スクランブル非特異的配列を有する)を同じ筋肉に注射した(図1a)。本発明者らは、エクソンスキッピングを誘導することによりジストロフィンの発現を救済することができないこれらのU7scrベクターが3週間以内にジストロフィン欠損mdx筋肉から徹底的に失われることを以前に示した(13)。
U7ex23をコードするAAV1ベクター(AAV1-U7ex23)は、mdx筋肉において効率的なエクソン23のスキッピングにより準ジストロフィンの救済を可能にする。AAV1-U7ex23による準ジストロフィンの救済に及ぼすAONの前処置の利益を評価するために、本発明者らは、AAV1-U7ex23ベクターを注射する2週間前にmdxのTAにPip6a-PMOアンチセンスオリゴヌクレオチド 11μgを注射した(図2A)。低ベクター用量(1E+10ウイルスゲノム)を選択したのは、この用量が可能にする準ジストロフィンの救済が弱いからである(正常レベルの5%未満)(13)。
AAV-マイクロ-ジストロフィン遺伝子療法に対するAONの前処置の効力を評価するために、本発明者らは、マウスマイクロ-ジストロフィン(MD1)を発現しているAAV1-MD1ベクター(1E+10vg)(37)を注射する2週間前にmdxのTAにPip6a-PMO AONを注射した(図3a)。4週間後に、PPMO処置されたmdxのTAにおいてPPMO前処置により誘導された強いジストロフィン回復が観察された(図3c)。AAVのゲノムコピー数及びマイクロ-ジストロフィンの発現は、AAV1-MD1のみで処置された筋肉よりもPPMO/AAV1-MD1で処置された筋肉の方が3倍高く(図3b及びc)、これは、AAV-マイクロ-ジストロフィン遺伝子療法に及ぼすPPMOの前処置の利益を例証している。この実験は、AONの前処置がDMDのためのAAVに基づく遺伝子療法の全てを高める能力があるという概念実証を達成している。
間違いなくAAVのゲノムのエピソーム性のせいで、並びに壊死/生成のサイクルを受ける、異常に漏出性の膜を示す、加えてエキソーム及びマイクロ粒子の排出増加によって特徴付けられるジストロフィー性筋肉線維の脆弱性のせいで、AAVのゲノムはAAV-U7媒介エクソンスキッピング療法の間にジストロフィー性筋肉から急速に失われる(36)。本発明者らは、本明細書においてAAV-U7を注射する時点でPPMO前処置後の顕著な(>60%)準ジストロフィンの救済があることが、3週間後のmdx筋肉におけるウイルスゲノムの効率的な維持を可能にすることを示した。追加的に、ウイルスゲノムのこの当初の維持は、AAV-U7による準ジストロフィンの回復を6ヶ月後にRNAレベルで約6倍に、タンパク質レベルで約10倍に増加させる。
Claims (9)
- デュシェンヌ型筋ジストロフィー治療産物をコードするウイルスベクターと組み合わせた、デュシェンヌ型筋ジストロフィーの処置における使用のための、ジストロフィンのプレmRNAにエクソンスキッピングを誘導する能力がある単離されたアンチセンスオリゴヌクレオチド(AON)を含む医薬組成物であって、前記処置が、前記ウイルスベクターを投与する前に前記オリゴヌクレオチドを投与することを含み、前記ウイルスは、(i)ジストロフィンのプレmRNA内にエクソンスキッピングを誘導する能力があるアンチセンスオリゴヌクレオチドをコードするか、(ii)ジストロフィン遺伝子編集手段をコードするか、又は(iii)機能性ジストロフィンタンパク質をコードするかのいずれかのウイルスベクターである、医薬組成物。
- デュシェンヌ型筋ジストロフィーの処置における使用のための、ジストロフィンのプレmRNAにエクソンスキッピングを誘導する能力がある単離されたAONを含む医薬組成物であって、それを必要とする患者にデュシェンヌ型筋ジストロフィー治療用ウイルスベクターを投与する前に前処置として投与され、前記ウイルスは、(i)ジストロフィンのプレmRNAにエクソンスキッピングを誘導する能力があるアンチセンスオリゴヌクレオチドをコードするか、(ii)ジストロフィン遺伝子編集手段をコードするか、又は(iii)機能性ジストロフィンタンパク質をコードするかのいずれかのウイルスベクターである、医薬組成物。
- ウイルスベクターが、AAVベクターである、請求項1又は2記載の医薬組成物。
- AONが、ホスホロジアミダートモルホリノオリゴマーである、請求項1~3のいずれか一項記載の医薬組成物。
- AONが、ペプチド-ホスホロジアミダートモルホリノオリゴマーである、請求項1~3のいずれか一項記載の医薬組成物。
- AONが、Pip6a-PMOオリゴマーである、請求項1~5のいずれか一項記載の医薬組成物。
- ウイルスベクターが、U7-AONをコードする、請求項1~6のいずれか一項記載の医薬組成物。
- ウイルスベクターが、ミニ又はマイクロ-ジストロフィンなどの機能性切断型ジストロフィンをコードする、請求項1~6のいずれか一項記載の医薬組成物。
- (i)ジストロフィンのプレmRNAにエクソンスキッピングを誘導する能力がある単離されたAON;及び
(ii)デュシェンヌ型筋ジストロフィー治療用ウイルスベクター
を含み、
ウイルスベクターが、
- ジストロフィン遺伝子編集手段をコードする;又は
- 機能性ジストロフィンタンパク質をコードする、
キット。
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