JP6913323B2 - 評価装置、観察装置、及びプログラム - Google Patents
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Description
図1は、神経系の分化誘導の一例を示す図である。
未分化細胞CT1は、系DI11を経由して神経幹細胞CT11に分化する。また、未分化細胞CT1は、系DI12を経由して神経堤細胞CT12に分化する。神経幹細胞CT11は、系DI21を経由して神経細胞CT21に分化する。また、神経幹細胞CT11は、系DI22を経由してグリア前駆細胞CT22に分化する。神経堤細胞CT12は、系DI23を経由して末梢神経細胞CT23に分化する。グリア前駆細胞CT22は、系DI31を経由してオリゴデンドロサイトCT31に分化する。また、グリア前駆細胞CT22は、系DI32を経由してアストロサイトCT32に分化する。
本実施形態では、神経系の分化誘導の一例として、「未分化細胞→神経幹細胞→神経細胞」の培養や、「未分化細胞→神経幹細胞→グリア前駆細胞」の培養を行う。
この毒性評価について、具体的に説明する。培養中の細胞に対してマーカーによって免疫染色を行うと、分化誘導の進行に伴い、マーカーの発現の状態が変化する。例えば、あるマーカーは、細胞の分化誘導の進行に伴い発現が促進される。また、他のあるマーカーは、細胞の分化誘導の進行に伴い発現が抑制される。培養中の細胞に対して、細胞の分化誘導の進行に伴い発現が促進されるマーカーと、細胞の分化誘導の進行に伴い発現が抑制されるマーカーとを用いると、マーカーの発現の程度を評価することにより、分化誘導がどの程度進行したのかを評価することができる。また、上述のように分化誘導の進行の評価に適するマーカーを複数組み合わせると、単一のマーカーを用いた場合に比べて、細胞の分化誘導の進行の程度の評価が容易になる。
ここで、分化誘導の過程において、培養中の細胞に物質を添加した場合、物質を添加しない場合に比べて、細胞の分化誘導の進行の状況が変化することがある。例えば、培養中の細胞に物質を添加した場合、物質を添加しない場合に比べて、細胞の分化誘導の進行が促進されたり、進行が抑制されたりすることがある。
分化誘導の過程ある細胞に対して、物質を添加していない場合のマーカーの発現の状態と、物質を添加した場合におけるマーカーの発現の状態との比較により、この物質による細胞の分化誘導の進行への影響を評価することができる。すなわち、マーカーの発現の状態の対照実験を行うことにより、物質の毒性評価を行うことが可能となる。
1)複数サンプルを準備しておき、day1,day5,day10といった各時間帯で細胞を染色して観察するエンドポイント観察。
2)蛍光タンパク質を利用して同じサンプルを経過観察するタイムラプス観察。
以下、第1の実施形態における観察装置1について説明する。まず、図2を参照して観察装置1の構成について説明する。
図2は、本発明の実施形態による観察装置1の構成の一例を示す模式図である。
観察装置1は、細胞等を撮像することにより取得される画像に対して、画像処理を行う。以下の説明において、細胞等を撮像することにより取得される画像を、単に細胞画像とも記載する。観察装置1は、評価装置10と、顕微鏡装置20と、表示部30と、操作検出部40とを備える。
操作検出部40は、キーボードや不図示のマウスなどを備えており、評価装置10に対する操作を検出する。
図3は、本実施形態の評価装置10の機能構成を示すブロック図である。評価装置10は、演算部100と、記憶部200とを備えている。
記憶部200は、細胞種記憶部210と、系記憶部220と、マーカー記憶部230と、コントロール群記憶部240とを備えている。
すなわち、マーカー記憶部230には、マーカーと、当該マーカーの性質を示す情報とが関連付けて記憶される。
また、マーカー選択部130は、マーカー記憶部230に記憶されるマーカーの性質を示す情報と、過程とに基づいて、過程に応じたマーカーを選択するともいえる。
コントロール群とは、対照実験(又は、コントロール実験)における実験群のうちの統制群である。例えば、コントロール群の実験結果とは、基準条件下である、細胞に物質を加えない条件下の細胞分化の実験結果である。この一例では、分化過程にある細胞に対して所定の濃度の物質を加えた場合の細胞に対する影響を、この物質が加えられていない群(コントロール群)と、この物質が加えられている非基準条件下での群(対照群)とを比較する対照実験により判定する。
一例として未分化細胞CT1から神経幹細胞CT11に分化する場合について説明する。ウェルW内の細胞は、時刻T1から時刻T3までの間に、未分化細胞CT1から神経幹細胞CT11への分化が進行する。マーカーのうちCT3/4及びNANOGは、未分化細胞CT1よりも神経幹細胞CT11に対して反応する。マーカーのうちNESTIN及びSOX2は、神経幹細胞CT11よりも未分化細胞CT1に対して反応する。
時刻T1において、ウェルW内の細胞のうち、ほとんどの細胞が未分化細胞CT1である。この場合、時刻T1においては、ウェルW1内の細胞のうち、CT3/4及びNANOGに対する陰性群が陽性群に比べて多い。また、時刻T1においては、ウェルW2内の細胞のうち、NESTIN及びSOX2に対する陽性群が陰性群に比べて多い。
時刻T2において、ウェルW内の細胞は、未分化細胞CT1と神経幹細胞CT11との割合が同程度である。この場合、時刻T2においては、ウェルW1内の細胞のうち、CT3/4及びNANOGに対する陰性群と陽性群との割合が同程度である。また、時刻T2においては、ウェルW2内の細胞のうち、NESTIN及びSOX2に対する陰性群と陽性群との割合が同程度である。
時刻T3において、ウェルW内の細胞のうち、ほとんどの細胞が神経幹細胞CT11である。この場合、時刻T3においては、ウェルW1内の細胞のうち、CT3/4及びNANOGに対する陽性群が陰性群に比べて多い。また、時刻T3においては、ウェルW2内の細胞のうち、NESTIN及びSOX2に対する陰性群が陽性群に比べて多い。
すなわち、撮像部22は、マーカー選択部130が選択するマーカーを用いて培養される細胞を撮像した細胞画像を実験結果として出力する。
抑制マーカーを使用する場合、所定濃度の物質を加えた際の細胞のマーカー変化パターンが分化誘導の進行に伴い、マーカーの発現が促進されている場合は物質の添加により毒性を示したことになる。
また促進マーカーを使用する場合、所定濃度の物質を加えた際の細胞のマーカー変化パターンが分化誘導の進行に伴い、マーカーの発現が抑制されている場合は物質の添加により毒性を示したことになる。
換言すれば、毒性評価部160とは、対照実験の結果に基づいて、実験結果の状態を判定する状態判定部であるともいえる。
また、毒性評価部160とは、細胞分化の過程が撮像された分化過程画像と、基準条件下における細胞分化の実験結果とに基づいて、分化過程画像が示す細胞分化の過程の状態を判定する状態判定部であるともいえる。
次に、評価装置10の動作について図9から図17を参照して説明する。
図9は、本実施形態の評価装置10の全体の動作の一例を示す図である。この一例では、評価装置10が、対照実験におけるコントロール群の実験支援、及び対照群の実験支援を行う場合について説明する。この一例の場合、評価装置10の利用者は、操作検出部40が備えるキーボードによって、始点細胞種及び終点細胞種を入力することにより、実験対象の系を決める。
系判定部120は、始点細胞種及び終点細胞種を、操作検出部40から取得する(ステップS10、ステップS20)。系判定部120は、ステップS10及びステップS20において取得した始点細胞種及び終点細胞種に基づいて、実験対象の系を判定する(ステップS30)。
次に、評価装置10による撮像時期の提示の動作(ステップS100;ステップS110〜ステップS130)について説明する。
図10は、本実施形態の評価装置10による撮像時期の提示の動作の一例を示す図である。系判定部120は、ステップS30において判定した系を取得する(ステップS110)。系判定部120は、取得した実験対象の系について、撮像部22がウェルWを撮像する時期、すなわち撮像時期を判定する(ステップS120)。例えば、実験対象の系が、系ID_DI11である場合、上述した時刻T1、時刻T2及び時刻T3を、撮像時期として判定する。
系判定部120は、判定した撮像時期を結果出力部300に出力する。結果出力部300は、撮像時期の情報を表示部30に表示させる(ステップS130)。
次に、評価装置10による使用すべきマーカーの提示の動作(ステップS200;ステップS210〜ステップS230)について説明する。
図11は、本実施形態の評価装置10による撮像時期の提示の動作の一例を示す図である。マーカー選択部130は、ステップS30において系判定部120が判定した系を取得する(ステップS210)。マーカー選択部130は、ステップS210において取得した系に基づいて、マーカー記憶部230から実験対象の系に適合するマーカーを抽出する(ステップS220)。マーカー選択部130は、抽出したマーカーの情報を結果出力部300に出力する。結果出力部300は、マーカーの情報を表示部30に表示させる(ステップS230)。
図12は、本実施形態の評価装置10によるコントロール群の実験結果の登録の動作の一例を示す図である。
一例として、評価装置10の利用者が、表示部30に表示された撮像時期及びマーカーによってコントロール群の実験を行う場合について説明する。この場合、利用者は、操作検出部40が備えるキーボードに、実験対象の系を入力する。
コントロール群登録部140は、操作検出部40から実験対象の系を取得する(ステップS310)。コントロール群登録部140は、取得した系に基づいて、撮像時期を判定する(ステップS320)。この撮像時期の判定は、上述したように系判定部120が行ってもよい。
なお、コントロール群登録部140は、細胞画像を既知の画像処理手段によって加工した結果を、コントロール群の実験結果としてコントロール群記憶部240に記憶させてもよい。
図13は、本実施形態の評価装置10によるコントロール群のマーカー変化パターンの提示の動作の一例を示す図である。この一例において、評価装置10の利用者は、操作検出部40が備えるキーボードに、実験対象の系を入力する。
マーカー変化パターン抽出部150は、利用者がキーボードに入力した系を、操作検出部40から取得する(ステップS410)。マーカー変化パターン抽出部150は、ステップS410において取得した系に基づいて、コントロール群記憶部240を検索する。なお、コントロール群記憶部240に、実験結果IDと系IDとが関連付けられて記憶されている場合には、マーカー変化パターン抽出部150は、ステップS410において取得した系を検索キーにして、コントロール群記憶部240を検索する。マーカー変化パターン抽出部150は、検索の結果得られたコントロール群の実験結果を取得する(ステップS420)マーカー変化パターン抽出部150は、ステップS420において取得したコントロール群の実験結果を、コントロール群のマーカー変化パターンとして結果出力部300に出力する。結果出力部300は、コントロール群のマーカー変化パターンを表示部30に表示させる(ステップS430)。
図14は、本実施形態の評価装置10による毒性の評価の動作の一例を示す図である。この一例において、評価装置10の利用者は、操作検出部40が備えるキーボードに、実験対象の系を入力する。演算部100の各部は、キーボードに入力され操作検出部40が検出した系を取得する(ステップS510)。系判定部120は、系を取得し、取得した系に応じた撮像時期を判定する。また、マーカー選択部130は、系を取得し、取得した系に応じたマーカーを選択する。判定された撮像時期及び選択されたマーカーは、表示部30に表示される(ステップS520)。利用者は、ステップS520において表示されたマーカーを用いて細胞を染色する。染色は、利用者が手動で行ってもよいし、染色装置を備えたもので自動的に染色する構成でもよい。利用者は、対照実験の対照群としての細胞をウェルWに播種して、培養を開始する(ステップS530)。顕微鏡装置20の撮像部22は、ウェルプレートWPの各ウェルWを、ステップS520において判定した撮像時期によって撮像する(ステップS540)。細胞画像抽出部110は、ステップS540において撮像された画像から、細胞画像を抽出する(ステップS550)。毒性評価部160は、抽出された細胞画像を実験結果として、コントロール群の実験結果と比較する(ステップS560)。毒性評価部160は、ステップS560における比較結果に基づいて、毒性の評価結果を生成し、生成した評価結果を結果出力部300に出力する。結果出力部300は、表示部30に評価結果を表示させる(ステップS570)。
図15は、本実施形態の対照実験における対照群の一例を示す図である。この対照群には、互いに濃度が異なる化合物Aが含まれる。ここで、ウェルプレートWPのウェルW11には、濃度が0.1[mM]である化合物Aが付与されている。また、ウェルプレートWPのウェルW21は、濃度が1.0[mM]である化合物Aが付与されている。
図16は、本実施形態の毒性評価部160による実験結果の比較結果の一例を示す図である。同図は、図中左側群、M中央群、右側群のデータを開示しており、分化過程におけるいずれかの異なるタイミングでの実験結果である。同図では、左側群から右側群にいくに従って、分化が進行する場合の結果を示す。毒性評価部160は、コントロール群記憶部240からコントロール群の実験結果を取得する。また、毒性評価部160は、対照群の実験結果を細胞画像抽出部110から取得する。ここで、毒性評価部160は、コントロール群と対照群との実験結果が、比較的近い場合には、対照群の実験結果を「毒性が低い」と判定する。また、毒性評価部160は、コントロール群と対照群との実験結果が、比較的遠い場合には、対照群の実験結果を「毒性が高い」と判定する。図16に示す一例では、コントロール群の実験結果RC11と、対照群の実験結果RA11とは、類似している。したがって、毒性評価部160は、対照群の実験結果RA11及び実験結果RB11の実験に用いた化合物について「毒性が低い」と判定する。また、コントロール群の実験結果RC21と、対照群の実験結果RA21とは類似している。一方、コントロール群の実験結果RC21と、実験結果RB21とは、類似していない。この場合、毒性評価部160は、対照群の実験結果RA21の実験に用いた化合物について「毒性が低い」と判定する。また、毒性評価部160は、対照群の実験結果RB21の実験に用いた化合物について、対照群の実験結果RA21の実験に用いた化合物に比べて「毒性が高い」と判定する。つまり、毒性評価部160は、コントロール群の実験結果と、対照群の実験結果とについて、比較的類似度が高い場合には、「毒性が低い」と判定する。
また、本願発明は、基準条件下における細胞の画像から取得される情報を基に、非基準条件下における観察対象である細胞の観察条件を決定する観察条件決定部を備え構成でも良く、この場合、基準条件下における細胞の画像から取得される情報を基に、非基準条件下における観察対象である細胞の状態を判定する状態判定部備えなくてもよい。
更に、基準条件下における細胞の画像から取得される情報を基に、非基準条件下における観察対象である細胞の観察条件を決定し、これに従って観察した結果、所望の観察ができなかったことが判った場合(例えば取得画像解析から判定)、決定された前記観察条件を修正してもよい。例えば、神経突起の発生タイミングに着目し、このタイミングでの非基準条件下での観察を行うことを決定した場合、決定したタイミングにおいて神経突起の発生が無かった場合は、所定の観察時間を長くする、または新たに観察タイミングを設定するようにしてもよい。
「NESTIN」及び「SOX2」の発現がいずれも陽性である細胞について、「GalC」の発現が陽性であれば、当該細胞がグリア前駆細胞CT22であることを示す。「NESTIN」及び「SOX2」の発現がいずれも陽性である細胞について、「Tuj1」及び「MAP2」の発現がいずれも陽性であれば、当該細胞が神経前駆細胞CT24であることを示す。
「NESTIN」及び「SOX2」の発現がいずれも陰性である細胞について、「GalC」の発現が陽性であれば、当該細胞がグリア細胞CT25であることを示す。「NESTIN」及び「SOX2」の発現がいずれも陰性である細胞について、「Tuj1」及び「MAP2」の発現がいずれも陽性であれば、当該細胞が神経細胞CT21であることを示す。
以下、第2の実施形態における観察装置2について説明する。なお、上述した第1の実施形態の観察装置1と同様の構成及び動作については、同一の符号を付してその説明を省略する。
図19は、本実施形態の評価装置11の機能構成を示すブロック図である。観察装置2は、評価装置10に代えて、評価装置11を備えている。また、観察装置2は、顕微鏡装置20に代えて、顕微鏡装置25を備えている。上述した顕微鏡装置20が、細胞の蛍光画像を撮像するのに対し、本実施形態の顕微鏡装置25は、細胞の形態の画像を撮像する。例えば、顕微鏡装置25とは、位相差顕微鏡である。顕微鏡装置25は、撮像部26を備えている。撮像部26は、細胞の形態を撮像して位相差画像を生成する。この顕微鏡装置25は、例えば、タイムラプス顕微鏡である。撮像部26は、細胞分化の過程における細胞の形態を経時的に撮像する。
基準画像記憶部250には、上述した基準条件下において撮像部26が撮像する基準画像が記憶される。
なお、基準画像記憶部250には、基準画像そのものの情報に加えて、又は代えて、基準画像から抽出された、細胞の形態の情報が記憶されていてもよい。
細胞画像抽出部170は、撮像部26が撮像した画像から、細胞画像を抽出する。具体的な構成は、第1の実施形態において説明したため、記載を省略する。細胞画像抽出部170は、抽出した細胞画像を、演算部101の各機能部に供給する。
Claims (9)
- 観察対象の神経系細胞の細胞分化の状態を評価するため免疫染色する、前記細胞分化の過程に応じたマーカーであって、前記神経系細胞の分化の状態を評価するのに適合するマーカーを選択するマーカー選択部と、
異なる撮像時刻に撮像された細胞画像に基づき、前記細胞分化の状態を示す細胞画像を抽出する細胞画像抽出部と、
前記マーカー選択部で選択したマーカーを複数組み合わせて用いて、前記観察対象と同種の神経系細胞を基準条件下で細胞培養を行い、前記細胞画像抽出部で抽出した細胞画像を実験結果として記憶されている記憶部と、
前記マーカー選択部で選択したマーカーを複数組み合わせて用いて、前記観察対象の神経系細胞に対して非基準条件下で細胞培養を行い、前記細胞画像抽出部で抽出する細胞画像を実験結果として、前記記憶部に記憶された前記基準条件下の実験結果と比較し、前記非基準条件下における神経系細胞の細胞分化の状態を判定する状態判定部と、を備え、
前記マーカー選択部により前記細胞分化の過程に応じて選択される前記複数組み合わせのマーカーは、それぞれ異なる組み合わせのマーカーであって、前記神経系細胞の分化誘導の進行に伴い発現が促進される促進マーカーと発現が抑制される抑制マーカーとを含み、
前記状態判定部は、前記促進マーカーと前記抑制マーカーとの発現状態の変化に基づいて、前記細胞分化の状態を判定し、
前記非基準条件とは神経系細胞の分化誘導に影響する物質が神経系細胞に追加された条件であり、前記基準条件とは、前記物質が神経系細胞に追加されていない条件である
評価装置。 - 前記記憶部に記憶される実験結果は、前記神経系細胞の細胞分化の進行する時刻ごとに、前記基準条件下における細胞分化の実験結果として識別情報と関連付けられている
請求項1に記載の評価装置。 - 前記状態判定部は、
前記基準条件下における前記実験結果から抽出された前記マーカーの変化パターンに関わる情報と、前記非基準条件下における前記実験結果から抽出された前記マーカーの変化パターンに関わる情報とに基づいて前記非基準条件下における前記物質の毒性を評価する
請求項1に記載の評価装置。 - 複数の前記マーカーを記憶するマーカー記憶部をさらに備え、
前記マーカー選択部は前記神経系細胞の分化の過程に応じて前記マーカー記憶部に記憶された異なる前記組み合わせのマーカーを選択する
請求項1または請求項2に記載の評価装置。 - 前記評価装置は、前記基準条件下における神経系細胞の画像から取得される情報をもとに、前記非基準条件下における観察対象である神経系細胞の観察条件を決定する観察条件決定部を備える
請求項1に記載の評価装置。 - 前記基準条件下における前記細胞画像から取得される情報として、コントロール群のマーカー変化パターンを抽出するマーカー変化パターン抽出部をさらに備え、
前記状態判定部は、前記観察対象である神経系細胞のマーカー変化パターンと、前記コントロール群のマーカー変化パターンとを比較して、前記観察対象である神経系細胞の細胞分化の状態を判定する、
請求項1に記載の評価装置。 - 前記基準条件下として、前記神経系細胞の分化誘導の進行に影響しうる物質を添加しない条件下で前記神経系細胞の分化過程を撮像して得られた基準画像を記憶させた基準画像記憶部と、
前記基準画像が示す神経系細胞の形態の時間変化に基づいて、前記非基準条件下として、前記物質を添加した条件下で神経系細胞の分化過程を撮像して得られる分化過程画像の撮影条件を提示する撮影条件提示部と、をさらに備え、
前記状態判定部は、前記分化過程画像と前記基準画像とが示す神経系細胞の形態情報に基づいて、前記分化過程画像が示す分化過程の情報を判定する、
請求項1に記載の評価装置。 - 請求項1から請求項7のいずれか一項に記載の評価装置を備えた観察装置。
- コンピュータに、
観察対象の神経系細胞の細胞分化の状態を評価するため免疫染色する、前記細胞分化の過程に応じたマーカーであって、前記神経系細胞の分化の状態を評価するのに適合するマーカーを選択するマーカー選択ステップと、
異なる撮像時刻に撮像された細胞画像に基づき、前記細胞分化の状態を示す細胞画像を抽出する細胞画像抽出ステップと、
前記マーカー選択ステップで選択したマーカーを複数組み合わせて用いて、前記観察対象と同種の神経系細胞を基準条件下で細胞培養を行い、前記細胞画像抽出ステップで抽出した細胞画像を実験結果として記憶されている記憶ステップと、
前記マーカー選択ステップで選択したマーカーを複数組み合わせて用いて、前記観察対象の神経系細胞に対して非基準条件下で細胞培養を行い、前記細胞画像抽出ステップで抽出する細胞画像を実験結果として、前記記憶ステップに記憶された前記基準条件下の実験結果と比較し、前記非基準条件下における神経系細胞の細胞分化の状態を判定する状態判定ステップと、
を実行させるためのプログラムであって、
前記マーカー選択ステップにより前記細胞分化の過程に応じて選択される前記複数組み合わせのマーカーは、それぞれ異なる組み合わせのマーカーであって、前記神経系細胞の分化誘導の進行に伴い発現が促進される促進マーカーと発現が抑制される抑制マーカーとを含み、
前記状態判定ステップにより、前記促進マーカーと前記抑制マーカーとの発現状態の変化に基づいて、前記細胞分化の状態が判定され、
前記非基準条件とは神経系細胞の分化誘導に影響する物質が神経系細胞に追加された条件であり、前記基準条件とは、前記物質が神経系細胞に追加されていない条件である
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