JP6885598B2 - 未分化性低減による多能性幹細胞の分化促進法 - Google Patents
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Description
本出願は、参照によりここに援用されるところの日本出願特願2016-016785号優先権を請求する。
胚性幹細胞(ES細胞)や人工多能性幹細胞(iPS細胞)を分化誘導し、得られた細胞を用いる再生医療は国民の期待も大きく、早期の実現が待たれている治療法である。再生医療としては、iPS細胞由来の網膜色素上皮細胞移植治療が記憶に新しいが、細胞移植に適した成熟分化細胞を迅速かつ十分量作製する技術は、未だ発展途上であり開発の余地が大きい。
現在主流の多能性幹細胞から所望の細胞型への分化誘導法としては、各分化段階に適したサイトカイン・増殖因子を順次培地に添加し、胚様体や前駆細胞を経由させ分化させる方法である。この方法では、目的とする分化細胞を得るまでの培養期間が長いこと、分化誘導効率が高くないこと、異なる細胞系譜の細胞が混在することなどが問題となっている。
近年、組織特異的に発現する転写因子を単一又は複数組み合わせて、ES/iPS細胞に強制発現することにより細胞分化を方向づける試みが盛んに行われている。この転写因子を用いた分化誘導法は、ES/iPS細胞を直接目的の分化細胞へ誘導できるため、非常に有効な手段として期待されている。しかし、この手法をもってしても、細胞分化誘導効率が低いため、細胞の種類によっては、再生医療に必要な目的の分化細胞を十分量得るのが困難な状況である。
以上により、多能性幹細胞から目的の分化細胞をより迅速かつ均一、高効率に産生するための新たな分化誘導法の開発が求められていた。
先行技術である非特許文献1〜4は、ES/iPS細胞の分化誘導を促進させるシステムであり、一例として、ES/iPS細胞を骨格筋に分化誘導することを開示している。
しかし、これらの分化誘導方法は、本発明の分化誘導方法とは明らかに異なる。
しかし、所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を多能性幹細胞に導入して、効率的に所望の細胞型に分化誘導する方法を開示又は示唆をしていない。
さらに、多能性幹細胞の未分化性維持の低減だけでなく分化抵抗性を低減させることにより、より強力に短時間・高効率に所望の細胞型への分化誘導を行う方法を開発した。
以上により、本発明は完成した。
1.以下の(1)〜(8)のいずれか1を少なくとも含む多能性幹細胞を所望の細胞型へ分化させるための分化誘導キット、
(1)多能性幹細胞及びPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を強制発現させた多能性幹細胞、
(4)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物及び多能性幹細胞、
(5)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物がゲノムに挿入されている多能性幹細胞、
(6)POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞、
(7)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞、及び
(8)多能性幹細胞並びにPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び脱メチル化酵素遺伝子。
2.前記POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子は、POU5F1のsiRNAを発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子、及び/又はPOU5F1の抗体遺伝子である前項1に記載の分化誘導キット。
3.さらに、所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を含む前項1又は2に記載の分化誘導キット。
4.前記転写因子の転写因子遺伝子は、センダイウイルスベクターに担持されている前項1〜3のいずれか1に記載の分化誘導キット。
5.以下の(1)〜(8)のいずれか1を少なくとも含む多能性幹細胞を骨格筋細胞へ分化させるための分化誘導キット、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞並びに転写因子であるMYOD1、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、転写因子であるMYOD1並びに多能性幹細胞、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を強制発現させた多能性幹細胞並びに転写因子であるMYOD1、
(4)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物、転写因子であるMYOD1並びに多能性幹細胞、
(5)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物がゲノムに挿入されている多能性幹細胞並びに転写因子であるMYOD1、
(6)POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞並びに転写因子であるMYOD1、
(7)転写因子であるMYOD1、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞、及び
(8)多能性幹細胞並びに転写因子であるMYOD1、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び脱メチル化酵素遺伝子。
6.以下の(1)〜(8)のいずれか1を少なくとも含む多能性幹細胞を神経細胞へ分化させるための分化誘導キット、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞並びに転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2並びに多能性幹細胞、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を強制発現させた多能性幹細胞並びに転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2、
(4)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物、転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2並びに多能性幹細胞、
(5)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物がゲノムに挿入されている多能性幹細胞並びに転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2、
(6)POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞並びに転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2、
(7)転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞、及び
(8)多能性幹細胞並びに転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び脱メチル化酵素遺伝子。
7.以下の(1)〜(8)のいずれか1を少なくとも含む多能性幹細胞を肝細胞へ分化させるための分化誘導キット、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞並びに転写因子であるHNF1A、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、転写因子であるHNF1A並びに多能性幹細胞、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を強制発現させた多能性幹細胞並びに転写因子であるHNF1A、
(4)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物、転写因子であるHNF1A並びに多能性幹細胞、
(5)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物がゲノムに挿入されている多能性幹細胞並びに転写因子であるHNF1A、
(6)POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞並びに転写因子であるHNF1A、
(7)転写因子であるHNF1A、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞、及び
(8)多能性幹細胞並びに転写因子であるHNF1A、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び脱メチル化酵素遺伝子。
8.以下の(1)〜(6)のいずれか1に記載の前項3又は4に記載の分化誘導キット、
(1)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がMYOD1であり、かつ所望の細胞型が骨格筋細胞である、
(2)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がHNF1Aであり、かつ所望の細胞型が肝細胞である、
(3)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がSOX9であり、かつ所望の細胞型が軟骨細胞である、
(4)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がRUNX2であり、かつ所望の細胞型が骨細胞である、
(5)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がSPI1であり、かつ所望の細胞型が造血細胞である、及び
(6)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がASCL1であり、かつ所望の細胞型が神経細胞である。
9.以下の(1)〜(9)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を所望の細胞型へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物及び所望の細胞型への分化に必要な転写因子を多能性幹細胞に添加する工程、
(7)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞に添加する工程、
(8)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、脱メチル化酵素遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を多能性幹細胞に添加する工程、及び
(9)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程。
10.前記POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子は、POU5F1のsiRNAを発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子、又はPOU5F1の抗体遺伝子である前項9に記載の分化方法。
11.前記転写因子の転写因子遺伝子は、センダイウイルスベクターに担持されている前項9又は10に記載の分化方法。
12.以下の(1)〜(9)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を骨格筋細胞へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び転写因子であるMYOD1を多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び転写因子遺伝子であるMYOD1遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物及び転写因子であるMYOD1を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)転写因子であるMYOD1を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)転写因子であるMYOD1を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物及び転写因子であるMYOD1を多能性幹細胞に添加する工程、
(7)転写因子であるMYOD1を、POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞に添加する工程、
(8)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、脱メチル化酵素遺伝子及び転写因子であるMYOD1を多能性幹細胞に添加する工程、及び
(9)転写因子であるMYOD1を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程。
13.以下の(1)〜(9)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を神経細胞へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2を多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び転写因子遺伝子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物及び転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物及び転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2を多能性幹細胞に添加する工程、
(7)転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2を、POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞に添加する工程、
(8)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、脱メチル化酵素遺伝子及び転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2を多能性幹細胞に添加する工程、及び
(9)転写因子であるNEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及び/又はNEUROD2を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程。
14.以下の(1)〜(9)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を肝細胞へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び転写因子であるHNF1Aを多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び転写因子遺伝子であるHNF1A遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物及び転写因子であるHNF1Aを担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)転写因子であるHNF1Aを、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)転写因子であるHNF1Aを、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物及び転写因子であるHNF1Aを多能性幹細胞に添加する工程、
(7)転写因子であるHNF1Aを、POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞に添加する工程、
(8)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、脱メチル化酵素遺伝子及び転写因子であるHNF1Aを多能性幹細胞に添加する工程、及び
(9)転写因子であるHNF1Aを、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程。
15.以下の(1)〜(6)のいずれか1に記載の前項9〜11のいずれか1に記載の分化方法、
(1)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がMYOD1であり、かつ所望の細胞型が骨格筋細胞である、
(2)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がHNF1Aであり、かつ所望の細胞型が肝細胞である、
(3)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がSOX9であり、かつ所望の細胞型が軟骨細胞である、
(4)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がRUNX2であり、かつ所望の細胞型が骨細胞である、
(5)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がSPI1であり、かつ所望の細胞型が造血細胞である、及び
(6)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がASCL1であり、かつ所望の細胞型が神経細胞である。
(1)多能性幹細胞から細胞分化に要する時間の短縮及び分化誘導効率の向上。
(2)多能性幹細胞への遺伝子導入に、遺伝子の修飾合成mRNAを使用するので、導入した遺伝子が多能性幹細胞のゲノムへ取り込まれることがなく、細胞分化誘導後に癌化などのリスクがない。
(3)修飾合成mRNAを用いた多能性幹細胞への遺伝子導入については、遺伝子mRNAの添加時期や回数を容易に変化させることができるので、各細胞型に特有の最適な条件を選択できる。
(4)多能性幹細胞の未分化性維持を低減させる方法及び分化抵抗性を低減させる方法を組み合わせることにより、相乗的な多能性幹細胞から細胞分化に要する時間の短縮及び分化誘導効率の向上。
本発明の方法で使用する多能性幹細胞は、特に限定されないが、哺乳類由来が好ましく、特に好ましくはヒト由来である。例えば、ヒトES細胞、ヒトiPS細胞、又は、これらの任意の組み合わせであり、特に限定されず、組織や器官由来の組織幹細胞、皮膚の繊維芽細胞、さらには組織や器官に由来するあらゆる種類の細胞を含む。
多能性幹細胞では、多能性幹細胞の未分化性維持には、転写因子であるPOU5F1(配列番号1、2:POU domain, class 5, transcription factor 1 isoform 1:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_002692、別名:OCT3,OCT4,OTF3,OTF4, OTF-3,Oct-3,Oct-4, MGC22487)の発現が必須である。POU5F1は、生殖細胞や着床前初期胚といった多能性細胞で特異的に発現している。本発明の実施例では、所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1タンパク質の発現量を低減させた多能性幹細胞に導入すれば、効率的に所望の細胞型に分化誘導できることを確認している(参照:図1)。すなわち、本発明の「多能性幹細胞の未分化性維持を低減させる」とは、多能性幹細胞のPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させることを意味する。なお、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させることは、POU5F1の転写・翻訳のいずれかの段階の工程を阻害する及び/又は翻訳されたPOU5F1タンパク質活性を阻害することを含み、特に限定されない。
加えて、多能性幹細胞のPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた状態は、該除去又は該低減させてない多能性幹細胞のPOU5F1タンパク質の発現量(又はPOU5F1遺伝子の発現量)の程度と比較することにより、確認できる。例えば、多能性幹細胞のPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた状態(程度)は、除去又は低減させてない多能性幹細胞のPOU5F1タンパク質の発現量を100とした場合と比較して、95〜1、90〜2、85〜3、80〜4、75〜5、70〜6、65〜7、60〜8、50〜10、40〜15、30〜20、約25である。なお、多能性幹細胞のPOU5F1タンパク質の発現量の程度は、市販の抗POU5F1抗体を使用することにより容易に測定することができ、また、POU5F1の遺伝子発現量を自体公知の方法により測定することもできる。
多能性幹細胞では、分化に関わる遺伝子群の各プロモーター領域に"Bivalentdomain"という特殊なクロマチン構造が形成されており、幹細胞性維持状態では容易に発生・分化に関わる遺伝子群が発現しないように待機状態にある。本発明者らは、「"Bivalent domain"からH3K27me3というヒストンメチル基修飾が取り除かれる又は低減させることにより、所望の細胞型への分化誘導に必要な分化遺伝子の発現が迅速かつ効率的に促進される」ことを確認している(参照:図2)。
すなわち、本発明の「多能性幹細胞の所望の細胞型への分化抵抗性を低減させる」とは、多能性幹細胞のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させることを意味する。
加えて、多能性幹細胞のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させた状態は、該除去又は該低減させてない多能性幹細胞のH3K27me3修飾の程度と比較することにより、確認できる。例えば、多能性幹細胞のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させた状態(程度)は、除去又は低減させてない多能性幹細胞のH3K27me3修飾の程度を100とした場合と比較して、95〜1、90〜2、85〜3、80〜4、75〜5、70〜6、65〜7、60〜8、50〜10、40〜20、約30である。なお、多能性幹細胞のH3K27me3修飾の程度は、市販の抗Histone H3K27me3抗体を使用することにより容易に測定することができるし、また、H3K27me3の遺伝子発現量を自体公知の方法により測定することもできる。
上記で述べたように、本発明の方法は、多能性幹細胞の未分化性維持を低減させる方法、さらには必要に応じて多能性幹細胞の所望の細胞型への分化抵抗性を低減させることができる方法であれば特に限定されないが、以下を例示することができる。
本発明の方法では、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子(POU5F1のsiRNA(small interfering RNA)を発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子、抗体遺伝子)、さらには、所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子の遺伝子を多能性幹細胞に添加(導入)することを含む。
同様に、本発明の方法では、必要に応じてH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、さらには、所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子の遺伝子を多能性幹細胞に添加(導入)することを含む。
なお、本明細書の「遺伝子」とは、二本鎖の核酸だけでなく、それを構成する正鎖(又はセンス鎖)又は相補鎖(又はアンチセンス鎖)などの各一本鎖、線状、環状を含み、さらに、特に言及しない限り、DNA、RNA 、mRNA、cDNA等を含む。
加えて、標的遺伝子とは、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、及び/又は、H3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、並びに所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子の両方を含む意味である。
なお、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子(又は、H3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子)及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子の多能性幹細胞の添加時期は、特に限定されないが、好ましくは、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子(又は、H3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子)を分化誘導に必要な転写因子の添加前に多能性幹細胞に添加することが好ましい。
さらに、各遺伝子(mRNA)の添加時期として、12〜64時間毎に1回以上、好ましくは、2〜5回、2〜4回、2〜3回、又は2回行うことを例示することができるが、特に限定されない。より具体的な方法は、以下に例示することができる。
文献「Warren et al., Cell Stem Cell, 2010 Nov5;7(5):618-30」に記載の方法を参照して、修飾mRNAを合成する。より詳しくは、mRNAは、所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子のアミノ酸配列をコードするテンプレートDNAを修飾したdNTPsの混合物{(dNTPs:3-0-Me-m7G(5′)ppp(5′)GARCA cap analog, 5-methylcytidine triphosphate、及びpseudouridine triphosphate)}を用いて、試験管内での転写により合成する。
哺乳類(特に、ヒト)の転写因子を発現するために、好ましくは、ヒト転写因子を発現可能なセンダイウイルスベクターを使用する。特に、Fタンパク質欠損等のセンダイウイルスベクターの変異体は、感染性が無く、操作が容易である(参照:Inoue et al., J Virol. 77: 23238-3246, 2003)。
単一又は2以上の所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子のカクテルを調製する。転写因子の形態は、特に限定されず、合成mRNAs、転写因子(又は複数の転写因子)を組み込んだセンダイウイルスベクター、合成mRNAsを含むナノ粒子カプセルのいずれでも良い。
これらの単一又は2以上の転写因子のカクテルを細胞に導入する方法は、特に限定されず、リポフェクタミンによるトランスフェクション、ウイルス感染等を利用する。本発明の方法で利用することができる一例の分化誘導工程の略図を図4に示す。
本発明の方法の工程において、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子(又は、H3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子)及び/又は所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を導入した自体公知の発現ベクターを使用することができる。本発明に用いる発現ベクターとしては、動物細胞発現プラスミドベクター、センダイウイルスベクター等を例示することができるが、特に限定されない。
本発明のPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物は、特に限定されないが、POU5F1のsiRNA、POU5F1のshRNA、POU5F1のアンチセンス鎖、POU5F1タンパク質に特異的に結合する抗体、阻害剤等である。
また、これらの化合物を単一で使用するだけではなく、複数の種類の化合物及び/又は低分子化合物を組み合わせることにより、効率的に「多能性幹細胞の未分化性を低減させる(多能性幹細胞のPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる)」ことができる。
本発明のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物は、特に限定されないが、脱メチル化酵素(特に、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を持つ脱メチル化酵素)、H3K27me3に特異的に結合する抗体、H3K27me3の修飾作用を持つポリコームタンパク質群(PcGタンパク質)の抗体、siRNA(特に、cationicsiRNA)、阻害剤等である。cationic siRNA は、transfectionのための試薬が不要である。
なお、低分子化合物としては、Valproic acid等のHistoneDeaceylase (HDAC)抑制剤を例示することができるが特に限定されない。
脱メチル化酵素としては、AOF (LSD1), AOF1 (LSD2), FBXL11 (JHDM1A),Fbxl10 (JHDM1B), FBXL19 (JHDM1C), KIAA1718 (JHDM1D), PHF2 (JHDM1E), PHF8(JHDM1F), JMJD1A (JHDM2A), JMJD1B (JHDM2B), JMJD1C (JHDM2C), JMJD2A (JHDM3A), JMJD2B(JHDM3B), JMJD2C (JHDM3C), JMJD2D (JHDM3D), RBP2 (JARID1A), PLU1 (JARID1B),SMCX (JARID1C), SMCY (JARID1D), Jumonji (JARID2), UTX (UTX), UTY (UTY), JMJD3(JMJD3), JMJD4 (JMJD4), JMJD5 (JMJD5), JMJD6 (JMJD6), JMJD7 (JMJD7), JMJD8(JMJD8)等を例示することができるが、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を持つ脱メチル化酵素として、JMJD3、UTX等が好ましい。
(1)上記いずれか1に記載の脱メチル化酵素の保護化誘導体、糖鎖修飾体、アシル化誘導体、又はアセチル化誘導体。
(2)上記いずれか1に記載の脱メチル化酵素と90%(又は、92%、94%、96%、98%、99%)以上の相同性を有し、かつ該脱メチル化酵素と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ酵素。
(3)上記いずれか1に記載の脱メチル化酵素において、100〜10個、50〜30個、40〜20個、10〜5個、5〜1個のアミノ酸が置換、欠損、挿入及び/又は付加しており、かつ該脱メチル化酵素と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ酵素。
(1)上記いずれか1以上の酵素のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子。
(2)上記いずれか1以上の酵素のアミノ酸配列において、1〜20(又は、1〜15、1〜10、1〜7、1〜5、1〜3)個のアミノ酸が置換、欠損、挿入及び/又は付加しており、かつ脱メチル化酵素と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を有するポリペプチドをコードする遺伝子。
(3)上記いずれか1以上の酵素のアミノ酸配列と90%(又は、92%、94%、96%、98%、99%)以上の相同性を有し、かつ脱メチル化酵素と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を有するポリペプチドをコードする遺伝子。
例えば成書に記載の方法(サムブルック(Sambrook)ら編、「モレキュラークローニング,ア ラボラトリーマニュアル 第2版」、1989年、コールドスプリングハーバーラボラトリー;村松正實編、「ラボマニュアル遺伝子工学」、1988年、丸善株式会社)に準じて、あるいはそれらの方法を改変して実施することができ、ウルマーの技術(ウルマー(Ulmer, K.M.)、「サイエンス(Science)」、1983年、第219巻、p.666-671)を利用することもできる。ペプチドの場合、変異の導入において、当該ペプチドの基本的な性質(物性、機能、生理活性又は免疫学的活性等)を変化させないという観点からは、例えば、同族アミノ酸(極性アミノ酸、非極性アミノ酸、疎水性アミノ酸、親水性アミノ酸、陽性荷電アミノ酸、陰性荷電アミノ酸及び芳香族アミノ酸等)の間での相互の置換は容易に想定される。
JMJD3は、ヒストンのH3K27me3の脱メチル化酵素(マウスNP_001017426、ヒトNP_001073893)として知られており、完全長(NP_001073893、配列番号3)でも多能性幹細胞のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ。驚くべきことに、本発明者らは、JmjCドメイン{配列番号4、触媒ドメイン:配列番号5(1376-1484番目のアミノ酸)}を持つJMJD3cは、完全長JMJD3と比較して、より強くH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つことを確認している。
JMJD3の好ましい塩基配列は、配列番号32に記載の塩基配列である。
(1)配列番号3に記載のアミノ酸配列の保護化誘導体、糖鎖修飾体、アシル化誘導体、又はアセチル化誘導体。
(2)配列番号3に記載のアミノ酸配列と90%(又は、92%、94%、96%、98%、99%)以上の相同性を有し、かつ該JMJD3と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つアミノ酸配列。
(3)配列番号3に記載のアミノ酸配列において、100〜10個、50〜30個、40〜20個、10〜5個、5〜1個のアミノ酸が置換、欠損、挿入及び/又は付加しており、かつ該JMJD3と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つアミノ酸配列。
(4)配列番号4に記載のアミノ酸配列の保護化誘導体、糖鎖修飾体、アシル化誘導体、又はアセチル化誘導体。
(5)配列番号4に記載のアミノ酸配列と90%(又は、92%、94%、96%、98%、99%)以上の相同性を有し、かつJMJD3cと実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つアミノ酸配列。
(6)配列番号4に記載のアミノ酸配列において、100〜10個、50〜30個、40〜20個、10〜5個、5〜1個のアミノ酸が置換、欠損、挿入及び/又は付加しており、かつ該JMJD3cと実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つアミノ酸配列。
(7)配列番号5に記載のアミノ酸配列を含み、かつJMJD3cと実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つアミノ酸配列。
「配列相同性」とは、通常、アミノ酸配列の全体で70%以上、好ましくは80%、より好ましくは85%以上、さらに好ましくは90%以上、さらにより好ましくは95%以上、最も好ましくは98%以上であることが適当である。
(1)配列番号3〜5のいずれか1に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子。
(2)配列番号3〜5のいずれか1に記載のアミノ酸配列において、1〜20(又は、1〜15、1〜10、1〜7、1〜5、1〜3)個のアミノ酸が置換、欠損、挿入及び/又は付加しており、かつ配列番号3〜5に記載のアミノ酸配列と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を有するポリペプチドをコードする遺伝子。
(3)配列番号3〜5のいずれか1に記載のアミノ酸配列と90%(又は、92%、94%、96%、98%、99%)以上の相同性を有し、かつ配列番号3〜5に記載のアミノ酸配列と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を有するポリペプチドをコードする遺伝子。
(4)配列番号6〜8、32のいずれか1に記載の塩基配列からなる遺伝子。
(5)配列番号6〜8、32のいずれか1に記載の塩基配列と相補的な塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ配列番号3〜5に記載のアミノ酸配列と実質的同質のH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を有するポリペプチドをコードする遺伝子。
(6)配列番号6〜8、32のいずれか1に記載の塩基配列からなるDNAにおいて、1〜50(又は、1〜40、1〜30、1〜20、1〜15、1〜10、1〜5、1〜3)個の塩基配列が置換、欠損、挿入及び/又は付加している遺伝子。
(7)配列番号6〜8、32のいずれか1に記載の塩基配列からなる遺伝子と90%(又は、92%、94%、96%、98%、99%)以上の相同性を有する遺伝子。
本発明の方法で使用する「所望の細胞型への高効率な分化誘導に必要な転写因子」の形態は、特に限定されないが、例えば、RNA, DNAなどの核酸、合成核酸、タンパク質等を例示することができるが特に限定されない。
また、本発明の方法において、所望の細胞型の例示として、骨格筋、肝臓(肝細胞)、神経細胞、軟骨細胞、骨細胞、造血細胞を例示することができる。
骨格筋の分化誘導方法は、以下の通りである。
MYOD1、NRF1、SALL4、ZIC1、KLF9、ZNF281、CTCF、HES1、HOXA2、TBX5、TP73、ERG、MAB21L3、PRDM1、NFIC、CTCFL、FOXP1、HEY1、PITX2、JUNB、KLF4、ESX1、TFAP2C、FOS、TFE3、FOSL1、GRHL2、TBX2、NFIB、IRF4から選択される単独、ないしは、2以上の転写因子を多能性幹細胞に導入する。特に、MYOD1を多能性幹細胞に導入することが好ましい。
肝臓(特に、肝臓、胎児肝臓)の分化誘導方法は、以下の通りである。
肝臓:HNF1A、TCF-1、SALL4、TGIF1、MAB21L3、ZIC1、EGFLAM、PITX2、HNF4A、NRF1、ZNF281、CTCFL、TP73、TFE3、DLX6、TCF4から選択される単独、ないしは、2以上の転写因子をヒト多能性幹細胞に導入する。
胎児肝臓:HNF1A、TCF-1、SIX5、HNF4A、SIN3A、ID1、HNF1Aから選択される単独、ないしは、2以上の転写因子をヒト多能性幹細胞に導入する。
特に、HNF1Aを多能性幹細胞に導入することが好ましい。
神経細胞の分化誘導方法は、以下の通りである。
NEUROG1、NEUROG2、NEUROG3、NEUROD1及びNEUROD2から選択される単独、ないしは、2以上、3以上、4以上、又は5の転写因子をヒト多能性幹細胞に導入する。
本発明の方法の工程において、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子(又は、H3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子)及び/又は所望の細胞型への高効率な分化誘導に必要な転写因子を多能性幹細胞のゲノムに導入する方法は、自体公知の方法を使用することができ、特に限定されない。好ましくは、導入する遺伝子が積極的に多能性幹細胞(特に、ヒトES細胞ゲノム)に組み込まれるような仕組みとして、Woltjenらが開発したPiggyBacトランスポゼース認識配列(PB配列)に挟まれた発現カセット(参照文献:Nature 458:766-770, 2009.)を使用することができる。該発現カセットでは、薬剤選別カセットを導入することで、効率良く遺伝子組換え多能性幹細胞株を樹立できる系(参照:図5)である。
本発明の方法の工程において、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物(又は、H3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物)(特に、タンパク質)及び/又は所望の細胞型への高効率な分化誘導に必要な転写因子(タンパク質)を多能性幹細胞のゲノムに導入する方法は、自体公知の方法を使用することができ、例えば、タンパク質導入試薬を用いる方法、細胞膜透過ペプチドを付加した融合タンパク質を用いる方法、マイクロインジェクション法などを挙げることができる。
本発明の「細胞膜透過性ペプチド」は、細胞内に移行する性質、より詳しくは、細胞膜を透過する性質、さらに詳しくは、細胞膜又は核膜を透過して細胞質内又は核内に透過する性質を有するペプチドである。該ペプチドのアミノ酸配列は、特に限定されないが、例えば、TAT(GRKKRRQRRRPQ:配列番号9)、r8{rrrrrrrr (D体-R):配列番号10}、MPG-8(βAFLGWLGAWGTMGWSPKKKRK:配列番号11)を例示することができる。
なお、標的タンパク質とは、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物(又は、H3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物)(特に、タンパク質)及び/又は所望の細胞型への高効率な分化誘導に必要な転写因子(タンパク質)の両方を含む。
上記以外の方法として、遺伝子ノックアウト法がある。遺伝子ノックアウト法により、「POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞」を作製することができる。「POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞」は、POU5F1遺伝子領域の配列が人為的に改変されたことによって、POU5F1遺伝子の正常な発現が阻害されていること、その結果、POU5F1の発現が抑制され、POU5F1タンパク質が正常に発現していないことを意味する。
また、「POU5F1遺伝子の一部又は全部を改変又は欠損している」における「全部」とは、POU5F1ゲノムDNAのタンパク質コーディング領域をいう。
また、「一部」とは、タンパク質コーディング領域の一部であって、POU5F1遺伝子の正常な発現を阻害するのに必要な長さの領域をいう。
さらに、「改変」とは、単一又は複数のヌクレオチドを置換、欠失、挿入、及び/又は付加させることにより、ゲノムDNA中の対象領域の塩基配列を他の塩基配列に改変することをいう。
本発明の多能性幹細胞を所望の細胞型へ高効率に分化誘導するための分化誘導キット(以後、「本発明のキット」と称する場合がある)は、以下のいずれか1以上の態様を含む。
上記の本発明の方法により、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びに/又はH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞を容易に作製可能である。
使用者は、該多能性幹細胞に、上述のように、所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を導入することにより、容易に、所望の細胞型へ分化誘導することができる。
また、ドキシサイクリン等で誘導可能な遺伝子構築物がゲノムに挿入されていることで、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、脱メチル化酵素等を一時的に強制発現することができる多能性幹細胞も対象である。
使用者は、キット用POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び/又は脱メチル化酵素遺伝子を多能性幹細胞に添加することにより、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びに/又はH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞を容易に作製可能である。
キット用抗POU5F1抗体遺伝子は、市販の抗体遺伝子等を例示することができるが、特に限定されない。
キット用脱メチル化酵素遺伝子は、脱メチル化酵素遺伝子(例えば、JMJD3c)のmRNA、DNA、タンパク質等を例示することができるが、特に限定されない。
使用者は、キット用POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び/又は脱メチル化酵素遺伝子並びに所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を含む遺伝子を多能性幹細胞に添加することにより、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びに/又はH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞を容易に作製し、さらに所望の細胞型へ高効率に分化誘導させることができる。
なお、これらの遺伝子は、1つの遺伝子上に存在していても良いし、別の遺伝子上でも良い。別の遺伝子上であれば、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子(又は、脱メチル化酵素遺伝子)と所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を同時又は別の時期に多能性幹細胞に添加することができる。
使用者は、キット用POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物及び/又は脱メチル化酵素を多能性幹細胞に添加することにより、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びに/又はH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞を容易に作製可能である。
使用者は、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び/又は脱メチル化酵素遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに導入することにより、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並び/又はH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞を容易に作製可能である。
なお、遺伝子構築物には、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び/又は脱メチル化酵素遺伝子だけでなく、プロモーター配列、遺伝子発現向上配列、マーカー遺伝子、レポーター配列、薬剤耐性遺伝子等を必要に応じて含んでもよい。
使用者は、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び/又は脱メチル化酵素遺伝子並びに所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに導入することにより、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びに/又はH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞を容易に作製し、さらに所望の細胞型へ分化誘導させることができる。
なお、これらの遺伝子は、1つの遺伝子上に存在していても良いし、別の遺伝子上でも良い。別の遺伝子上であれば、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び/又は脱メチル化酵素遺伝子と所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を同時又は別の時期に多能性幹細胞のゲノムで発現することができる。
なお、遺伝子構築物には、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び/又は脱メチル化酵素遺伝子並びに所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子だけでなく、プロモーター配列、遺伝子発現向上配列、マーカー遺伝子、レポーター配列、薬剤耐性遺伝子等を必要に応じて含んでもよい。
NANOG、SOX2、SOX3、KLF2、KLF4、KLF5、TBX3、ESRRB、SALL4、STAT3、ZIC3、LIN28及びTCF3は、未分化性維持に関するタンパク質として知られている。よって、NANOG、SOX2、SOX3、KLF2、KLF4、KLF5、TBX3、ESRRB、SALL4、STAT3、ZIC3、LIN28及びTCF3のタンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞は、所望の細胞型へ高効率に分化させることができると考えられる。
さらに、上記記載のいずれか1以上のタンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞(上記記載のいずれか1以上のタンパク質発現量を実質的に除去又は低減させた、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞)も本発明の対象とする。
加えて、上記記載のいずれか1以上のタンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子(さらには、脱メチル化酵素遺伝子等)並びに所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を多能性幹細胞に添加する工程を含む多能性幹細胞を所望の細胞型へ分化させる方法も本発明の対象とする。
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を多能性幹細胞に添加する工程。
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程。
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程。
(4)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞に添加する工程。
(5)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程。
(6)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物及び所望の細胞型への分化に必要な転写因子を多能性幹細胞に添加する工程。
(7)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1遺伝子が破壊された多能性幹細胞に添加する工程。
(8)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、脱メチル化酵素遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を多能性幹細胞に添加する工程。
(9)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程。
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を強制発現させた、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物がゲノムに挿入されている、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(4)POU5F1遺伝子が破壊された、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(5)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を強制発現させた、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物がゲノムに挿入されている、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(4)POU5F1遺伝子が破壊された、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(5)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を強制発現させた、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子を担持した遺伝子構築物がゲノムに挿入されている、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(4)POU5F1遺伝子が破壊された、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
(5)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する、所望の細胞型分化用多能性幹細胞。
以下に記載の材料及び方法を使用して実施例2〜6を行った。詳細は、以下の通りである。
ヒトES細胞(hESC)株であるSEES-3及びH9は、それぞれ国立成育医療研究センター(National Research Institute for Child Health and Development)及びアメリカのCell Research Instituteから入手した。ヒト誘導多能性幹細胞(hiPSC)株は、理化学研究所又は京都大学iPS細胞研究所から入手した。hESC/iPSCは、iMatrix-511(ニッピ)コーティングプレート上にStemFit AK-03培地(味の素)を用いて、フィーダー細胞を使用せず培養した。ROCK(Rho-associatedcoiled-coil forming kinase/Rho結合キナーゼ)阻害剤Y-27632は、継代時の細胞解離により誘導されるアポトーシスを抑えるために、細胞継代中に培地に添加した。
筋原性分化のために、hESC/iPSCは、iMatrix-511コーティングプレート上に、5% KSR、1 mM ピルビン酸ナトリウム、0.1 mM非必須アミノ酸アミノ酸、2 mMグルタミン、0.1 mM βメルカプトエタノール、及びペニシリン/ストレプトマイシン(50 U/50 μg/ml)を添加したαMEM(Gibco)の培地中で培養した。
アルブミン分泌肝細胞分化のために、hESC/iPSCは、Matrigel(BD)コーティングプレート上に、上記培地中で培養後、1 mM NaB, 100ng/ml ActivinA, 50 ng/ml Wnt3a, 1x B27, 2 mM GlutaMAXを添加したRPMI1640培地で1日培養し、次に1%DMSO, 0.5 mM MTG, 1% NEAA, 1mM GlutaMAX, 20% KSRを添加したDMEM培地で5日培養し、最後に 20 ng/ml HGF, 20 ng/ml OncostatinM, HCM培地(Lonza)で7日培養した。
POU5F1に対するsiRNA(センス鎖GCCCGAAAGAGAAAGCGAATT:配列番号12、アンチセンス鎖UUCGCUUUCUCUUUCGGGCCT:配列番号13)は、文献「Proceeding of national academy of sciences 109, 4485-4490 (2012)」で使用されている同一のものをApplied Biosystemsから購入して使用した(製品番号:s10873)。ネガティブコントロールのsiRNAについてもApplied Biosystemsから購入して使用した。siRNA導入は、添付の説明書の指示に従って、LipofectamineMessenger Max(Invitrogen)を用いて行った。導入細胞の生存率を向上させるために、B18Rインターフェロン阻害剤(eBioscience)を、培養培地に添加した。培地は、各導入の2〜3時間後に交換した。
mRNAを合成するテンプレートの調製のために、赤色蛍光タンパク質mCherry、緑色蛍光タンパク質Emerald及び組織特異的な転写因子{MYOD1(配列番号26), HNF1A(配列番号27), RUNX2(配列番号28), SOX9(配列番号29), SPI1(配列番号30)及びASCL1(配列番号31)} のタンパク質コーディング領域(Open Reading Frame, ORF)をmRNA安定性及び翻訳効率を増加させるマウスαグロビンの5' UTR及び3' UTRを含むpCRIIコンストラクトにサブクローニングした。
修飾mRNAは、文献「Cell stem cell 7,618-630 (2010)」の記載を基にして合成された。簡単に言及すると、T7プロモーターとポリA末端は、KAPA taq kit(Kapabiosystems)を用いてPCR反応で添加した。RNAは、ARCAcap analog(New England Biolabs)、ATP、GTP、5-Methyl-CTP(TriLink)、及びpseudo-UTP(TriLink)と共に、MEGAscript T7 kit(Ambion)を用いて、PCR産物から合成した。合成mRNAは、MEGAclear kit(Ambion)を用いて精製した。合成mRNA導入は、添付の説明書の指示に従って、Lipofectamine MessengerMax(Invitrogen)を用いて行った。導入細胞の生存率を向上させるために、B18Rインターフェロン阻害剤(eBioscience)を、培養培地に添加した。培地は、各導入の2〜3時間後に交換した。
以下の抗体を使用した。
POU5F1(Santa Cruz, sc-5279)
β-ACTIN(Cell Signaling, 4970S)
MyHC(R&D MAB4470)
ALBUMIN(Abcam ab10241)
AFP(R&D MAB1368)
細胞は、4%PFA中で10分間室温で固定し、そして、0.5% Triton-X含有PBS中で10分間透過処理した。細胞は、2%BSA含有PBS中で10分間ブロッキングし、そして、ブロッキング溶液中で1次抗体(1:500)と共に2〜3時間室温で若しくは一晩4℃で培養した。細胞は、PBS中で2回洗浄した後、ブロッキング溶液中でAlexa色素結合2次抗体(1:500;Invitrogen)と共に、1時間室温で培養した。核は、DAPI(Dako)で対比染色した。免疫蛍光は、倒立蛍光顕微鏡IX73(オリンパス)を用いて可視化した。画像は、オリンパスcellSensイメージングソフトウェアを用いて得た。
細胞は、サンプルバッファー(50 mM Tris-HCl pH6.8、2% SDS、6% 2-メルカプトエタノール、500 mg/ml尿素)で溶解した。タンパク質は、4-15%ポリアクリルアミドゲル(Biorad)を用いたSDS-PAGEにより分離し、そして、ポリフッ化ビニリデンメンブレン(Biorad)に電気的に転写した。メンブレンは、1時間、0.1% Tween-20含有Tris-buffered saline(TBST)及び5%スキムミルク中でブロッキングした。メンブレンは、TBST中で洗浄し、その後2% BSA含有TBS中で、2〜3時間室温で若しくは一晩4℃で1次抗体(1:1000で希釈)と共に培養した。メンブレンは、洗浄し、ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合2次抗体(GE)と共に1時間室温で培養した。メンブレンは、TBST中で洗浄し、そして、免疫反応性は、ECL Prime Detection Kit(GE)を用いて可視化し、さらにLuminescent Image Analyzer(LAS-4000; Fujifilm)を用いて検出した。
全RNAは、TRIzol reagent(Invitrogen)で単離し、そして、cDNAは、ReverTra Ace kit(東洋紡)を用いて、ランダムヘキサマーを用いて生成した。リアルタイムPCRは、SYBR Green PCR system(タカラ)を用いて行った。RT-PCR用プライマー配列を、以下に示す。
MYOGプライマー(Reverse):gaggccgcgttatgataaaa(配列番号15)
AFPプライマー(Forward):tgggacccgaactttcca(配列番号16)
AFPプライマー(Reverse):ggccacatccaggactagtttc(配列番号17)
COL1A1プライマー(Forward):cctggatgccatcaaagtct(配列番号18)
COL1A1プライマー(Reverse):tcttgtccttggggttcttg(配列番号19)
COL2A1プライマー(Forward):tttcccaggtcaagatggtc(配列番号20)
COL2A1プライマー(Reverse):cttcagcacctgtctcacca(配列番号21)
CD45プライマー(Forward):tcctggactcccaaaatctg(配列番号22)
CD45プライマー(Reverse):accttgaacccgaacatgag(配列番号23)
NESTINプライマー(Forward):tggttttccagagtcttcagtga(配列番号24)
NESTINプライマー(Reverse):gaaacagccatagagggcaaa(配列番号25)
本実施例では、POU5F1タンパク質の発現量を強制的に低減させた多能性幹細胞が作製できるかを確認した。詳細は、以下の通りである。
ヒトES細胞のPOU5F1に対するsiRNA(siPOU5F1)の効果を免疫ブロット法及び免疫染色法によって確認した(図6)。siPOU5F1を導入後3日目の細胞を解析したところ、ネガティブコントロールsiRNA(POU5F1に対するスクランブルsiRNA配列:siControl)を導入した細胞に比べて、POU5F1タンパク質が顕著に減少していることを確認した(図6)。siPOU5F1導入により、多能性幹細胞の分子マーカーであるNANOGタンパク質が減少した。
よって、siPOU5F1導入による多能性の消失を確認した。
ヒトES細胞は未分化性を維持しているときは、小さく丸い形をしている。siPOU5F1を導入すると細胞の形態が扁平な形に変化しており、POU5F1抑制によって分化方向に促進されていることを確認した(図7)。
本実施例では、POU5F1タンパク質の発現量を低減させた多能性幹細胞に所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を導入(添加)することにより、所望の細胞型への分化誘導が起るかどうかを確認した。詳細は、以下の通りである。
組織特異的な転写因子として、MYOD1(骨格筋)、HNF1A(肝臓)、RUNX2(骨細胞)、SOX9(軟骨)、SPI1(血液)及びASCL1(神経)を用いた。ネガティブコントロールとしてmCherry又はEmeraldのsynRNAを導入した。
siControl又はsiPOU5F1とsynRNAを同時に細胞へ導入(添加)し、1日後にさらに2回synRNAを導入した。その翌日(最初の導入の2日後)に細胞をサンプリングして解析を行った。培地は未分化性維持用の培地を用いた。その結果、siPOU5F1と転写因子を組み合わせて導入すると各組織の分化マーカーの発現が顕著に上昇していることを確認した(図8)。しかし、siControlや転写因子を単独で導入しても、分化マーカーの発現上昇はほとんど検出できなかった(図8)。
本実施例では、所望の細胞型への分化誘導の例として、筋形成を制御するマスター転写因子であるMYOD1を用いた筋形成分化(骨格筋細胞分化)のモデル並びにHNF1A(hepatocyte nuclear factor-1-alpha)を用いた肝細胞分化のモデルを採用した。なお、hESCにおけるMYOD1単独の強制発現は、エピジェネティックな変化及び転写変化の不足により、筋形成までの分化に向かうことが困難であることが知られている(参照:Cell reports 3, 661-670 (2013))。
siControl又はsiPOU5F1とMYOD1のsynRNA(MYOD1-synRNA)を同時にヒトES細胞に導入して、1日後にさらに2回、MYOD1-synRNAを導入した。このとき該細胞を骨格筋分化培地で培養した。
最初の導入の2日後に行った最後のsynRNA導入後の翌々日に細胞を固定し、免疫染色を行った。siControlを導入したES細胞では、MYOD1-synRNAを導入しても形態変化は殆ど起こらず、骨格筋の最終分化マーカーであるMyosin Heavy Chain(MyHC)を発現している細胞はわずかであった(図9)。
しかしながら、siPOU5F1を導入したES細胞を用いると、最後のMYOD1-synRNA導入から2日後には、線維状の筋細胞が高頻度で出現し、殆どの細胞がMyHC陽性を示し、骨格筋細胞に分化したことを確認した(図9)。
加えて、別のES細胞株(H9 hES細胞)及び複数のiPS細胞株(201B7 iPS細胞、409B2iPS細胞、RIKEN-1A iPS細胞及びtkDA3-4iPS細胞)でも同様の効果を得ることができた(図10)。
siControl又はsiPOU5F1とHNF1AのsynRNA(HNF1A-synRNA)を同時にヒトES細胞に導入して、1日後にさらに2回、HNF1A-synRNAを導入した。最初の導入の2日後に行った最後のsynRNA導入の翌日から肝細胞分化培地で培養して13日後に細胞を固定し、免疫染色を行った。siControlを導入したES細胞では、HNF1A-synRNAを導入しても肝細胞の分化マーカーであるAFPやALBUMIN(ALB)を発現している細胞はほとんど観察できなかった(図11)。 しかしながら、siPOU5F1とHNF1A-synRNAを導入した細胞では、ALBUMIN及びAFPが発現している細胞が多くみられ、肝細胞へと分化していることが確認できた(図11)。
本発明者らは、脱メチル化酵素を強制的に発現させた多能性幹細胞は、ヒト多能性幹細胞の分化抵抗性を消失させ、分化誘導を促進することを確認している。なお、POU5F1タンパク質の発現量を低減させる分子機構は、脱メチル化酵素を強制的に発現させる分子機構とは異なる。
そこで、POU5F1タンパク質の発現量の低減及び脱メチル化酵素の強制的な発現を組み合わせたPOU5F1タンパク質の発現量を低減させた及び脱メチル化酵素を強制的に発現させた多能性幹細胞に所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子を導入(添加)することにより、所望の細胞型への分化誘導が起るかどうかを確認した。詳細は、以下の通りである。
POU5F1タンパク質の発現量の低減又は脱メチル化酵素の強制的な発現のどちらかのみをsynRNAと組み合わせて分化させるよりも、POU5F1タンパク質の発現量の低減及び脱メチル化酵素の強制的な発現を組み合わせて分化させることによって、分化マーカー遺伝子MYOG(骨格筋)、AFP(肝細胞)、COL2A1(軟骨)、CD45(造血細胞)の発現が相乗的に上昇することを確認した(図12)。
より詳しくは、POU5F1タンパク質の発現量の低減及び脱メチル化酵素の強制的な発現を組み合わせることにより、POU5F1タンパク質の発現量を低減した場合と比較して、MYOGの発現が約18.2倍、AFPの発現が約5.2倍、COL2A1の発現が約2.8倍、及びCD45の発現が約2.2倍上昇した。
さらに、POU5F1タンパク質の発現量の低減及び脱メチル化酵素の強制的な発現の組み合わせは、脱メチル化酵素の強制的な発現した場合と比較して、MYOGの発現が約4.3倍、AFPの発現が約54.0倍、COL2A1の発現が約2.8倍、及びCD45の発現が約4.5倍上昇した。
加えて、肝細胞分化誘導において、POU5F1タンパク質の発現量の低減は、脱メチル化酵素の強制的な発現と比較して、約10.4倍発現が高かった。これにより、肝細胞分化誘導に関しては、POU5F1タンパク質の発現量の低減は、脱メチル化酵素の強制的な発現と比較して、優れた効果を示した。
本実施例では、実施例3の記載の実施例を基にして、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞を使用して各所望細胞型への分化を確認した。
4日間の培養中において、siPOU5F1と MYOD1遺伝子(配列番号33、配列番号34)を同時にヒト多能性幹細胞に1回導入して、続いてMYOD1遺伝子を3回導入した。4日間の培養で、骨格筋細胞に分化していることを確認した。
12日間の培養中において、siPOU5F1とHNF1A遺伝子(配列番号35、配列番号36)を同時にヒト多能性幹細胞に1回導入して、続いてHNF1A遺伝子を2回導入した。12日間の培養で、肝細胞に分化していることを確認した。
5日間の培養中において、siPOU5F1を、ヒト多能性幹細胞に1回導入し、続いてNEUROG1遺伝子(配列番号37、配列番号38)、NEUROG2遺伝子(配列番号39、配列番号40)、NEUROG3遺伝子(配列番号41、配列番号42)、NEUROD1遺伝子(配列番号43、配列番号44)及びNEUROD2遺伝子(配列番号45、配列番号46)を3回導入する。この5日間の培養で、神経細胞へ分化させることができる。
本実施例では、実施例3とは異なり、合成修飾mRNAではなくセンダイウイルスベクターを使用して、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた多能性幹細胞を使用して各所望細胞型への分化を確認する。
自体公知のセンダイウイルスベクター(33℃で働き、37℃で失活する)に、転写因子であるMYOD1遺伝子(配列番号33、配列番号34)をクローニングしたものを用いる。
ヒトES細胞又はiPS細胞の懸濁液にこのセンダイウイルスベクターを MOI (multiplicity of infection) 1〜100(25)で感染させる。その後、細胞を培養プレートに移し、33℃に保ったCO2 incubatorに3日間細胞を培養する。その後、37℃のCO2 incubatorに移し、培養を続けると、分化細胞である骨格筋細胞を観察できる。
自体公知のセンダイウイルスベクターに、転写因子であるHNF1A遺伝子(配列番号35、配列番号36)をクローニングしたものを用いる。
ヒトES細胞又はiPS細胞の懸濁液にこのセンダイウイルスベクターを MOI 1〜100(25)で感染させる。その後、細胞を培養プレートに移し、33℃に保ったCO2 incubatorに3日間細胞を培養する。その後、37℃のCO2incubatorに移し、培養を続けると、分化細胞である肝細胞を観察できる。
自体公知のセンダイウイルスベクターに、転写因子であるNEUROG3遺伝子(配列番号41、配列番号42)をクローニングしたものを用いる。
ヒトES細胞又はiPS細胞の懸濁液にこのセンダイウイルスベクターを MOI 1〜100(25)で感染させる。その後、細胞を培養プレートに移し、33℃に保ったCO2 incubatorに3日間細胞を培養する。その後、37℃のCO2incubatorに移し、培養を続けると、分化細胞である神経細胞(運動ニューロン)を観察できる。
以上の実施例により、本発明の多能性幹細胞を所望の細胞型へ高効率に分化させる方法及び多能性幹細胞を所望の細胞型へ高効率に分化させるための分化誘導キットは、少なくとも以下のいずれか1の効果を有することを確認した。
(1)多能性幹細胞から細胞分化に要する時間の短縮及び分化誘導効率の向上。
(2)多能性幹細胞への遺伝子導入に、遺伝子の修飾合成mRNAを使用するので、導入した遺伝子が多能性幹細胞のゲノムへ取り込まれることがなく、細胞分化誘導後に癌化などのリスクがない。
(3)修飾合成mRNAを用いた多能性幹細胞へ遺伝子導入については、遺伝子mRNAの添加時期や回数を容易に変化させることができるので、各細胞型に特有の最適な条件を選択できる。
(4)多能性幹細胞の未分化性維持を低減させる方法及び分化抵抗性を低減させる方法を組わせることにより、相乗的な多能性幹細胞から細胞分化に要する時間の短縮及び分化誘導効率の向上。
Claims (17)
- 以下の(1)〜(8)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を所望の細胞型へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子又は転写因子遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及びH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子を担持した遺伝子構築物、並びに所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子又は転写因子遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素の発現量を実質的に増加させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子又は転写因子遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子又は転写因子遺伝子を、POU5F1遺伝子が破壊され、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子が増加された多能性幹細胞に添加する工程、
(7)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子又は転写因子遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、及び
(8)所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子又は転写因子遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程、
ここで、該POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子は、POU5F1のsiRNAを発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子及び/又はPOU5F1の抗体遺伝子である、分化方法。
- 前記H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素は、JMJD3である請求項1に記載の分化方法。
- 前記転写因子遺伝子は、センダイウイルスベクターに担持されている請求項1又は2に記載の分化方法。
- 以下の(1)〜(6)のいずれか1に記載の請求項1〜3のいずれか1項に記載の分化方法、
(1)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がMYOD1であり、かつ所望の細胞型が骨格筋細胞である、
(2)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がHNF1Aであり、かつ所望の細胞型が肝細胞である、
(3)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がSOX9であり、かつ所望の細胞型が軟骨細胞である、
(4)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がRUNX2であり、かつ所望の細胞型が骨細胞である、
(5)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がSPI1であり、かつ所望の細胞型が造血細胞である、及び
(6)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がASCL1であり、かつ所望の細胞型が神経細胞である。
- 以下の(1)〜(8)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を骨格筋細胞へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び骨格筋細胞への分化誘導に必要な転写因子MYOD1遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び骨格筋細胞への分化誘導に必要な転写因子MYOD1遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及びH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子を担持した遺伝子構築物、並びに骨格筋細胞への分化誘導に必要な転写因子MYOD1遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)骨格筋細胞への分化誘導に必要な転写因子MYOD1遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素の発現量を実質的に増加させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)骨格筋細胞への分化誘導に必要な転写因子MYOD1遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)骨格筋細胞への分化誘導に必要な転写因子MYOD1遺伝子を、POU5F1遺伝子が破壊され、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子が増加された多能性幹細胞に添加する工程、
(7)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び骨格筋細胞への分化誘導に必要な転写因子MYOD1遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、及び
(8)骨格筋細胞への分化誘導に必要な転写因子MYOD1遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程、
ここで、該POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子は、POU5F1のsiRNAを発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子及び/又はPOU5F1の抗体遺伝子である、分化方法。
- 以下の(1)〜(8)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を肝細胞へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び肝細胞への分化誘導に必要な転写因子HNF1A遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び肝細胞への分化誘導に必要な転写因子HNF1A遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及びH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子を担持した遺伝子構築物、並びに肝細胞への分化誘導に必要な転写因子HNF1A遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)肝細胞への分化誘導に必要な転写因子HNF1A遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素の発現量を実質的に増加させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)肝細胞への分化誘導に必要な転写因子HNF1A遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)肝細胞への分化誘導に必要な転写因子HNF1A遺伝子を、POU5F1遺伝子が破壊され、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子が増加された多能性幹細胞に添加する工程、
(7)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び肝細胞への分化誘導に必要な転写因子HNF1A遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、及び
(8)肝細胞への分化誘導に必要な転写因子HNF1A遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程、
ここで、該POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子は、POU5F1のsiRNAを発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子及び/又はPOU5F1の抗体遺伝子である、分化方法。
- 以下の(1)〜(8)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を軟骨細胞へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び軟骨細胞への分化誘導に必要な転写因子SOX9遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び軟骨細胞への分化誘導に必要な転写因子SOX9遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及びH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子を担持した遺伝子構築物、並びに軟骨細胞への分化誘導に必要な転写因子SOX9遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)軟骨細胞への分化誘導に必要な転写因子SOX9遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素の発現量を実質的に増加させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)軟骨細胞への分化誘導に必要な転写因子SOX9遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)軟骨細胞への分化誘導に必要な転写因子SOX9遺伝子を、POU5F1遺伝子が破壊され、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子が増加された多能性幹細胞に添加する工程、
(7)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び軟骨細胞への分化誘導に必要な転写因子SOX9遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、及び
(8)軟骨細胞への分化誘導に必要な転写因子SOX9遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程、
ここで、該POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子は、POU5F1のsiRNAを発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子及び/又はPOU5F1の抗体遺伝子である、分化方法。
- 以下の(1)〜(8)のいずれか1に記載の工程を含む、多能性幹細胞を造血細胞へ分化させる方法、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び造血細胞への分化誘導に必要な転写因子SPI1遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、
(2)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び造血細胞への分化誘導に必要な転写因子SPI1遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(3)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及びH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子を担持した遺伝子構築物、並びに造血細胞への分化誘導に必要な転写因子SPI1遺伝子を担持した遺伝子構築物を多能性幹細胞のゲノムに挿入する工程、
(4)造血細胞への分化誘導に必要な転写因子SPI1遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素の発現量を実質的に増加させた多能性幹細胞に添加する工程、
(5)造血細胞への分化誘導に必要な転写因子SPI1遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物を強制発現させ、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素を強制発現させた多能性幹細胞に添加する工程、
(6)造血細胞への分化誘導に必要な転写因子SPI1遺伝子を、POU5F1遺伝子が破壊され、かつH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子が増加された多能性幹細胞に添加する工程、
(7)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子、H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子及び造血細胞への分化誘導に必要な転写因子SPI1遺伝子を多能性幹細胞に添加する工程、及び
(8)造血細胞への分化誘導に必要な転写因子SPI1遺伝子を、POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞に添加する工程、
ここで、該POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子は、POU5F1のsiRNAを発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子及び/又はPOU5F1の抗体遺伝子である、分化方法。
- 以下の(1)又は(2)を含む多能性幹細胞を所望の細胞型へ分化させるための分化誘導キット、
(1)POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させた並びにH3K27me3修飾を実質的に除去又は低減させたヒストンを有する多能性幹細胞、又は
(2)多能性幹細胞並びにPOU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子及びH3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素遺伝子、
ここで、該POU5F1タンパク質の発現量を実質的に除去又は低減させる作用を持つ化合物の遺伝子は、POU5F1のsiRNAを発現する遺伝子、POU5F1のshRNAを発現する遺伝子、POU5F1のアンチセンス鎖を発現する遺伝子及び/又はPOU5F1の抗体遺伝子である、分化誘導キット。
- 前記H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素は、JMJD3である請求項9に記載の分化誘導キット。
- さらに、所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子又は転写因子遺伝子を含む請求項9又は10に記載の分化誘導キット。
- 前記転写因子遺伝子は、センダイウイルスベクターに担持されている請求項11に記載の分化誘導キット。
- 以下の(1)〜(6)のいずれか1に記載の請求項9〜12のいずれか1項に記載の分化誘導キット、
(1)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がMYOD1であり、かつ所望の細胞型が骨格筋細胞である、
(2)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がHNF1Aであり、かつ所望の細胞型が肝細胞である、
(3)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がSOX9であり、かつ所望の細胞型が軟骨細胞である、
(4)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がRUNX2であり、かつ所望の細胞型が骨細胞である、
(5)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がSPI1であり、かつ所望の細胞型が造血細胞である、及び
(6)前記所望の細胞型への分化誘導に必要な転写因子がASCL1であり、かつ所望の細胞型が神経細胞である。
- 前記H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素は、JMJD3である請求項5に記載の分化方法。
- 前記H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素は、JMJD3である請求項6に記載の分化方法。
- 前記H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素は、JMJD3である請求項7に記載の分化方法。
- 前記H3K27me3のメチル基を取り除く作用を有する脱メチル化酵素は、JMJD3である請求項8に記載の分化方法。
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