JP6841140B2 - 画像解析装置、画像解析システム、及び、プログラム - Google Patents
画像解析装置、画像解析システム、及び、プログラム Download PDFInfo
- Publication number
- JP6841140B2 JP6841140B2 JP2017079786A JP2017079786A JP6841140B2 JP 6841140 B2 JP6841140 B2 JP 6841140B2 JP 2017079786 A JP2017079786 A JP 2017079786A JP 2017079786 A JP2017079786 A JP 2017079786A JP 6841140 B2 JP6841140 B2 JP 6841140B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- image
- well
- captured
- image analysis
- analysis
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Landscapes
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Description
図1は、実施形態に係る受精卵の画像解析システムの構成を示す。図示のように、画像解析システム100は、大別して撮影装置50と、画像解析装置60とを備える。撮影装置50は、培養容器10内の受精卵の画像を撮影し、記憶する。培養容器10内には複数の受精卵が載置されており、撮影装置50は受精卵を識別するための識別情報、例えば、受精卵が収容されているウェルの識別情報などと対応付けて撮影画像を記憶する。画像解析装置60は、撮影装置50から画像を取得し、画像の解析を行う。
図2は、培養容器10及び受精卵の撮影画像の例を示す。培養容器10は円形の容器であり、中央部に収容部11が形成されている。収容部11内には、複数(図2の例では5×5=25個)のウェル12が形成されている。ウェル12は受精卵を収容するための窪みであり、1つのウェル12に1つの受精卵が収容される。図2(A)に示すように、収容部11は培養液13で満たされている。
「容器ID−ウェル位置−焦点位置−撮影時刻」、
というファイル名、例えば、「容器ID−A1−M−t1」などのファイル名を付与して記憶部54に記憶する。これにより、記憶部54に記憶された多数の撮影画像をファイル名に基づいて識別することができる。
図5は、画像解析処理のフローチャートである。この処理は、主として画像解析装置60により行われる。実際には、画像解析装置60を構成するコンピュータが予め用意されたプログラムを実行することにより行われる。なお、前提として、撮影装置50により、同一患者に対応する1つの培養容器10内の受精卵について複数の撮影画像が生成され、記憶部54に記憶されているものとする。
(第1の方法)
第1の方法では、撮影装置50は、撮影画像の画像ファイルを収容したフォルダ内に、基準ウェルであることを示す情報又は基準ウェルのウェル番号などを含めておく。例えば、同一患者の受精卵の撮影画像を収容したフォルダ内に、「基準ウェル=A1」などと記述したファイルを含める。これにより、画像解析装置60は、撮影画像のフォルダ内に含まれる上記のファイルを参照し、基準ウェルを特定することができる。
第2の方法では、撮影装置50は、撮影時に、撮影画像のファイルに基準ウェルであることを示す情報を埋め込む。例えば、前述のように、画像ファイルのファイル名を、
「容器ID−ウェル位置−焦点位置−撮影時刻」
とする場合、基準ウェル12xの画像ファイルのファイル名には基準ウェルであることを示す符号「REF」を付与し、
「容器ID−ウェル位置−焦点位置−撮影時刻−REF」
などとする。これにより、画像解析装置60は、ファイル名の最後に「REF」がついているファイルを基準ウェルの画像ファイルと特定することができる。
上記の第1、第2の方法は、撮影装置50側で基準ウェルに関する情報を撮影画像のフォルダやファイルなどに付与する必要がある。これに対し、第3の方法では、画像解析装置60側で撮影画像を分析することにより基準ウェルを特定する。図6は、第3の方法を説明する図である。
図7は、第4の方法を説明する図である。第4の方法では、各ウェル12の近傍に、識別情報として、ウェルの識別マークが形成されている培養容器10aを使用する。図7に示す培養容器10aは、収容部11内に8個のウェル12aが形成されている。加えて、各ウェル12aの右横には、マーク13及び14が形成されている。ここで、マーク13は、8個のウェル12aの識別マークであり、図中の縦方向の3か所の位置におけるマークの有無によりNo.1〜No.8の8個のウェル12aを識別している。マーク14は、培養容器10の配置方向を規定しており、図7の例ではマーク14が右下に位置するように培養容器10を配置するのが正しい配置となっている。なお、図7における各ウェル12aの番号「(No.1)」などは、説明の便宜上付したものであり、実際の培養容器10aにこのような番号が設けられているわけではない。
次に、上記の画像解析システムの変形例について説明する。以下の変形例は、適宜組み合わせて実施することができる。
(変形例1)
上記の実施形態では、複数のウェルから1つの基準ウェルを決定し、画像解析装置60は基準ウェルの撮影画像のみを解析して結果を出力している。その代わりに、1つの基準ウェルに加えて1つ又は複数の補助ウェルを決定し、画像解析装置60は基準ウェル及び補助ウェルについて撮影画像を解析して結果を出力するようにしてもよい。これにより、補助ウェルの画像解析結果を参考として取得することができるようになる。この場合、基準ウェルと補助ウェルの合計数を、撮影画像の総数より少なくすることが好ましい。例えば、補助ウェルの数を、1つの容器につき10個以下、好ましくは5個以下、さらに好ましくは3個以下などとしてもよい。他の例では、補助ウェルの数を1つの培養容器10における撮影画像の総数(図2(B)の例では25枚)の50%以下、好ましくは25%以下、さらに好ましくは10%以下などとしてもよい。
上記の実施形態のように基準ウェルのみについて画像解析結果が得られた後、他のウェルの画像解析を行う際には、基準ウェルの画像解析結果を利用して必要な補正を行うこととしてもよい。また、変形例1のように基準ウェル及び1つ以上の補助ウェルについて画像解析結果が得られた場合には、その後に他のウェルの解析を行う際、基準ウェルと補助ウェルの画像解析結果を用いて他のウェルの画像を補正しつつ解析を行ってもよい。
上記の画像解析システムでは、培養容器10に複数のウェル12が形成され、受精卵は各ウェル12に収容されているが、培養容器10にウェルが形成されていることは必須ではない。即ち、ウェルが形成されていない容器を使用する場合でも、同一の容器内に複数の受精卵が収容され、複数の受精卵の撮影画像が撮影される場合には本発明を適用することが可能である。
一般的に、同一の培養容器10には同一の患者の受精卵が収容される。よって、培養容器10毎に識別番号を付与しておき、多数の患者の画像解析を行う際には、制限された数の患者についてのみ画像解析を行うこととしてもよい。例えば、培養容器10に患者毎にユニークな識別番号を付与しておき、画像解析装置60は、予め決められた識別番号を有する培養容器10のみを画像解析の対象とするようにしてもよい。これにより、多数の患者のうちの所定数の患者のみを対象として画像解析を行うことができる。なお、識別番号は、培養容器10に貼り付けたバーコードシールやICタグにより付与することができる。また、培養容器10に手書きした患者名や患者IDなどを手入力してもよい。
上記の実施例では、カメラ52をX方向及びY方向に移動して1つのウェル12又は1つの受精卵毎に1枚の撮影画像を生成しているが、本発明の適用はこれには限られない。他の例では、複数のウェル又は受精卵を1視野内で1枚の全体画像として撮影し、画像処理により全体画像を各ウェル毎又は各受精卵毎の画像に分割することにより、ウェル又は受精卵毎の撮影画像を生成することとしてもよい。この場合でも、全体画像を分割して得られたウェル又は受精卵毎の複数の画像に対して、上述の第1〜第4の方法のいずれかを適用して基準撮影画像を特定し、解析を行えばよい。また、その場合に、変形例1のように、基準撮影画像に加えて補助撮影画像の解析を行っても良い。
上記の実施例では、1つのウェルに1つの受精卵が収容されているが、その代わりに、1つのウェルに複数(例えば2つ)の受精卵を収容してもよい。また、ウェルが形成されていない培養容器10を使用する場合でも、複数の受精卵を1つのグループとして容器に収容してもよい。この場合でも、画像解析装置60は、1つのウェル又は1つのグループの受精卵の単位で生成された複数の撮影画像から基準撮影画像を特定し、解析すればよい。また、基準撮影画像に加えて補助撮影画像を解析しても良い。
上記の実施形態では、撮影装置50は、撮影画像に対して患者ID、ウェル位置、カメラの焦点位置、撮影時刻などを示す属性情報をファイル名などに付加して記憶部54に記憶しているが、その際に、CRCコード、チェックサムデータなどを付加してもよい。これにより、撮影後に撮影画像のデータが改変されたり、誤ってファイル名が変更されたりして撮影画像の取り違えなどが生じることを防止することが可能となる。
12 ウェル
20 撮影画像
30 受精卵
50 撮影装置
51 照明
52 カメラ
53 制御部
54 記憶部
60 画像解析装置
Claims (11)
- 1つの容器に収容された複数の対象物を撮影した複数の撮影画像を取得する取得部と、
前記複数の撮影画像から、基準となる撮影条件下で撮影された撮影画像である1つの基準撮影画像を特定する特定部と、
前記1つの基準撮影画像を含む、前記複数の撮影画像の総数より少ない数の撮影画像を解析して解析結果を出力する解析部と、
を備えることを特徴とする画像解析装置。 - 前記特定部は、前記複数の対象物が配置された位置のうち、前記対象物の実際の位置に基づいて予め決められた基準位置において撮影された撮影画像を前記基準撮影画像と特定することを特徴とする請求項1に記載の画像解析装置。
- 前記撮影画像の各々には、前記対象物が配置された位置を示す情報が付与されており、
前記特定部は、前記位置を示す情報に基づいて、前記基準撮影画像を特定することを特徴とする請求項2に記載の画像解析装置。 - 前記複数の対象物はそれぞれウェル内に収容されており、
前記撮影画像は、前記対象物及び前記ウェルの画像を含み、
前記特定部は、前記撮影画像における前記ウェルの位置に基づいて前記基準撮影画像を特定することを特徴とする請求項1に記載の画像解析装置。 - 前記特定部は、前記複数の撮影画像のうち、当該撮影画像における前記ウェルの位置が最も中央に近い撮影画像を前記基準撮影画像と特定することを特徴とする請求項4に記載の画像解析装置。
- 前記複数の対象物はそれぞれウェル内に収容されており、
前記ウェルの各々には、各ウェルの識別情報が付されており、
前記特定部は、前記基準位置に対応するウェルの識別情報を予め記憶しており、当該識別情報に基づいて前記基準撮影画像を特定することを特徴とする請求項2に記載の画像解析装置。 - 前記基準撮影画像は、前記複数の対象物が配置された位置のうち、前記対象物の実際の位置に基づいて設定された照明条件下で撮影された撮影画像であることを特徴とする請求項1乃至6のいずれか一項に記載の画像解析装置。
- 前記解析部は、前記1つの基準撮影画像に加えて1つ又は複数の補助撮影画像を解析し、
前記解析部が解析の対象とする撮影画像の総数は、前記複数の撮影画像の総数よりも少ないことを特徴とする請求項1乃至7のいずれか一項に記載の画像解析装置。 - 前記解析部は、前記基準撮影画像及び前記補助撮影画像に基づいて、前記撮影画像を補正して解析を行うことを特徴とする請求項8に記載の画像解析装置。
- 請求項1乃至9のいずれか一項に記載の画像解析装置と、前記撮影画像を生成する撮影装置とを備える画像解析システムであって、
前記撮影装置は、
同一の容器内に配列された前記複数の対象物を撮影して前記複数の撮影画像を生成する撮影部と、
前記複数の撮影画像を記憶する記憶部と、
を備えることを特徴とする画像解析システム。 - コンピュータを備える画像解析装置により実行されるプログラムであって、
1つの容器に収容された複数の対象物を撮影した複数の撮影画像を取得する取得部、
前記複数の撮影画像から、基準となる撮影条件下で撮影された撮影画像である1つの基準撮影画像を特定する特定部、
前記1つの基準撮影画像を含む、前記複数の撮影画像の総数より少ない数の撮影画像を解析して解析結果を出力する解析部、
として前記コンピュータを機能させることを特徴とするプログラム。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2017079786A JP6841140B2 (ja) | 2017-04-13 | 2017-04-13 | 画像解析装置、画像解析システム、及び、プログラム |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2017079786A JP6841140B2 (ja) | 2017-04-13 | 2017-04-13 | 画像解析装置、画像解析システム、及び、プログラム |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2018179761A JP2018179761A (ja) | 2018-11-15 |
JP6841140B2 true JP6841140B2 (ja) | 2021-03-10 |
Family
ID=64275077
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017079786A Active JP6841140B2 (ja) | 2017-04-13 | 2017-04-13 | 画像解析装置、画像解析システム、及び、プログラム |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP6841140B2 (ja) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP7485728B2 (ja) | 2022-06-20 | 2024-05-16 | 株式会社Screenホールディングス | 基板処理装置、基板処理装置の制御方法 |
-
2017
- 2017-04-13 JP JP2017079786A patent/JP6841140B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2018179761A (ja) | 2018-11-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN111352227B (zh) | 显微镜系统中样本平面的距离确定 | |
US8098956B2 (en) | Digital microscope slide scanning system and methods | |
JP4970869B2 (ja) | 観察装置および観察方法 | |
US9145572B2 (en) | Observation system, recording medium, and control method of observation system | |
CN109417602B (zh) | 图像处理方法、图像处理装置、摄像装置及摄像方法 | |
EP3065105B1 (en) | Technique for determining the state of a cell aggregation, image processing program and image processing device using the technique, and method for producing a cell aggregation | |
US20090015666A1 (en) | Automated protein crystallization imaging | |
CN111985292A (zh) | 用于图像处理结果的显微镜方法、显微镜和具有验证算法的计算机程序 | |
US20200080992A1 (en) | Device and method for determining the action of active ingredients on nematodes and other organisms in aqueous tests | |
JP7097686B2 (ja) | 画像解析装置 | |
JP6841140B2 (ja) | 画像解析装置、画像解析システム、及び、プログラム | |
JP5430188B2 (ja) | 細胞画像解析装置及び細胞の画像を撮像する方法 | |
US11215808B2 (en) | Microscope parameter setting method and observation method recognizing the shape of a cell | |
JP7112181B2 (ja) | 画像処理方法および画像処理装置 | |
JP5343762B2 (ja) | 制御装置、およびその制御装置を用いた顕微鏡システム | |
JP2018019319A (ja) | 画像処理方法、画像処理装置、および撮像装置 | |
CN114326074A (zh) | 用于生成样品概览图像的方法和显微镜 | |
CN113947562A (zh) | 用于处理显微镜图像的显微系统、方法和计算机程序 | |
JP6980898B2 (ja) | 細胞画像処理装置 | |
KR20210099028A (ko) | 클론 선택을 가능하게 하기 위한 시스템 및 방법 | |
WO2023220725A2 (en) | Method of calibrating a microscope system | |
EA043190B1 (ru) | Системы и способы способствования клональной селекции | |
CN114729925A (zh) | 趋性解析方法、癌症评价方法、趋性解析系统以及程序 | |
JP2019017316A (ja) | 画像表示装置、プログラム及び制御方法 | |
JP2019017319A (ja) | 画像表示装置、プログラム及び制御方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20200227 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20201216 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20210119 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20210201 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6841140 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |