JP6829867B2 - 測定方法、及び測定システム - Google Patents
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Description
また、請求項1に記載の測定方法及び請求項2に記載の測定システムによれば、複合体は、測定対象と、第1担体と、第2担体とを有し、通過工程の前に、複合体から第1担体を解離することで解離複合体を生成する解離工程を含み、通過工程において、解離工程において生成された解離複合体を、電気泳動等によってポアに通過させ、測定工程において、通過工程において解離複合体をポアに通過させる際に生じる電気的変化に基づいて、解離複合体の大きさを測定し、特定工程において、測定工程において測定された解離複合体の大きさに基づいて、測定対象の個数を特定するので、第2担体と特異的な反応によって結合した測定対象の個数のみを正確に測定でき、測定の精度を一層向上させることが可能となる。また、解離複合体の大きさが複合体の大きさに比べてばらつきにくいことから、特定工程において測定対象の個数を特定しやすくなるので、測定の精度をさらに一層向上させることが可能となる。
まず、実施の形態の基本的概念について説明する。実施の形態は、概略的に、試料に含まれる測定対象を測定するための測定方法及び測定システムに関するものである。
次に、実施の形態の具体的内容について説明する。
まず、実施の形態1について説明する。この実施の形態1は、複合体の大きさに基づいて測定対象の個数を特定する形態である。
最初に、実施の形態1に係る測定システムの構成について説明する。図1は、本発明の実施の形態1に係る測定システムを例示する概要図である。図1に示すように、測定システム1は、概略的に、後述する図3の反応槽10、検出機構20、及び制御装置50を備えて構成されている。また、これら構成要素のうち、検出機構20の後述する第1電極部、後述する第2電極部、及び後述する検出部の各々と制御装置50とは、配線(図示省略)を介して電気的に接続されている。
後述する図3の反応槽10は、後述する図4(b)の複合体78を生成するための容器であり、例えば、ガラス材料、樹脂材料、セラミックス(窒化ケイ素、塩化ケイ素等)、金属材料、無機材料や有機材料等にて形成された公知の反応槽等を用いて構成されており、検出機構20の近傍位置に設けられている。
図1に戻り、検出機構20は、後述する図5の収容部30内の電気的変化(例えば、電流の変化等)を検出する機構であり、載置台(図示省略)、収容部30、後述する図5の基板40、通過部(図示省略)、及び検出部(図示省略)を備えている。
載置台は、収容部30を載置するための台であり、例えば、公知の載置台等を用いて構成されており、図示しない設置面上に載置されている。
図5の収容部30は、基板40を収容するための収容手段であり、下側収容部31及び上側収容部32を備えている。下側収容部31は、上面が開放された中空形状で形成されており、載置台の上面に載置されている。上側収容部32は、下面が開放された中空形状で形成されており、上側収容部32の開放部分(上側収容部32の下端部)が下側収容部31によって覆われるように設けられている。
基板40は、収容部30の下側収容部31と上側収容部32とを仕切るための板である。この基板40は、例えば任意の平面形状(例えば、十字状、矩形状、円形状等)を有する板状体にて形成されており、当該基板40の少なくとも一部が収容部30に収容されるように、略水平に設けられている。当該基板40の厚さは、後述するポア41の直径と同等かそれ以下であることが好ましい。例えば、Tsutsui et al., ACS NANO Vol.6, No.4, pp.3499−3505(2012)に記載の低アスペクト比ポアのように、ポアの直径と比して厚みの薄い基板を用いてもよい。基板40の厚さを低減することで、通過する粒子の状態(大きさ、形状等)をより精細に解析することができ、粒子上に存在する測定対象の個数をより高精度で測定することができる。
通過部は、複合体78をポア41に通過させる通過手段である。通過部は、好適には、複合体78を電気泳動によってポア41に通過させる構成を有し、第1電極部及び第2電極部を備える(いずれも図示省略)。
検出部は、収容部30内の電気的変化(実施の形態では、電流の変化等)を検出する検出手段である。この検出部は、例えば公知の電流計測センサ等を用いて構成されており、収容部30の内部又は収容部30の外部であって収容部30近傍位置に設けられており、収容部30(又は図示しない支持部材)に対して固定具等によって固定されている。
図1に戻り、制御装置50は、測定システム1を制御する装置であり、図1に示すように、操作部51、出力部52、電源部53、制御部54、及び記憶部55を備えている。なお、この制御装置50は、例えば公知のパーソナルコンピュータ等によって構成することができるので、その詳細な説明は省略する。
操作部51は、各種の情報に関する操作入力を受け付けるための操作手段である。この操作部51は、例えば、タッチパッド、リモートコントローラの如き遠隔操作手段、あるいはハードスイッチ等、公知の操作手段を用いて構成されている。
出力部52は、制御部54の制御に基づいて各種の情報を出力する出力手段であり、例えば液晶ディスプレイや有機ELディスプレイの如きフラットパネルディスプレイ等の公知の表示手段やスピーカー等の公知の音声出力手段等を用いて構成されている。
電源部53は、商用電源(図示省略)から供給された電力又は当該電源部53に蓄電された電力を、検出機構20の通過部及び検出部、並びに制御装置50の各部に供給する電力供給手段である。
制御部54は、制御装置50の各部を制御する制御手段である。この制御部54は、具体的には、CPU、当該CPU上で解釈実行される各種のプログラム(OSなどの基本制御プログラムや、OS上で起動され特定機能を実現するアプリケーションプログラムを含む)及びプログラムや各種のデータを格納するためのRAMの如き内部メモリを備えて構成されるコンピュータである。
記憶部55は、制御装置50の動作に必要なプログラム及び各種のデータを記録する記録手段であり、例えば、外部記録装置としてのハードディスク(図示省略)を用いて構成されている。ただし、ハードディスクに代えてあるいはハードディスクと共に、磁気ディスクの如き磁気的記録媒体、DVDやブルーレイディスクの如き光学的記録媒体、又はFlash Rom、USBメモリ、SDカードの如き電気的記録媒体を含む、その他の任意の記録媒体を用いることができる。
次に、このように構成された測定システム1を用いて行われる測定方法について説明する。図3は、第1反応工程の概要を示す概要図である。図4は、第2反応工程の概要を示す概要図であり、(a)は第2担体側抗体75と結合された第2担体76を加える前の状態を示す図であり、(b)は第2担体側抗体75と結合された第2担体76を加えた後の状態を示す図である。図5は、通過工程の概要を示す概要図であり、(a)は複合体78をポア41に通過させる前の状態を示す図であり、(b)は複合体78をポア41に通過させた後の状態を示す図である。以下の説明では、図3のX方向を測定システム1の左右方向(−X方向を測定ステムの左方向、+X方向を測定システム1の右方向)、図3のY方向を測定システム1の上下方向(+Y方向を測定システム1の上方向、−Y方向を測定システム1の下方向)、X方向及びY方向に直交する方向を前後方向(図3の紙面の手前側に至る方向を測定システム1の前方向、図3の紙面の奥側に至る方向を測定システム1の後方向)と称する。実施の形態1に係る測定方法は、上述したように、第1反応工程、第2反応工程、通過工程、測定工程、及び特定工程を含んでいる。以下では、各工程の詳細な内容について説明する。
最初に、第1反応工程について説明する。第1反応工程は、試料70に含まれる測定対象71を第1担体73に結合させるために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、図3に示すように、測定対象71と溶媒72から構成される試料70が収容されている反応槽10の中に、第1担体側抗体74と結合された第1担体73を加えた後、この第1担体73が加えられた試料70を攪拌する。ここで、上記第1担体73を加える量については任意であるが、例えば、試料70に含まれる測定対象71のすべてが第1担体側抗体74と反応(抗原抗体反応)することが可能な量に設定しており、一例として、上記反応の効率を向上させるために、測定対象71の量に対して上記第1担体73の量を過剰な量(例えば、測定対象71の量に対して100倍の量等)に設定している(なお、後述する第2反応工程の第2担体76を加える量についても同様とする)。次に、上記第1担体73が加えられてから所定時間が経過するまで、上記攪拌した試料70を所定温度(例えば、37℃)で放置する。この所定時間については、具体的には、測定対象71を第1担体側抗体74と反応させるまでに要すると一般的に想定される時間以上の時間に設定している。続いて、上記所定時間が経過した後、試料70のうち上記第1担体73と反応しなかった物質を除去するために洗浄を行う。この洗浄方法については任意であるが、例えば、上記第1担体73として磁性粒子を用いる場合には、反応槽10の一部(一例として反応槽10の側面部等)に設置された磁石(図示省略)によって、当該反応槽10の一部に測定対象71と反応した上記第1担体73及び測定対象71と反応しなかった上記第1担体73を集磁させた状態で、溶媒72等によって試料70のうち上記第1担体73と反応しなかった物質を洗い流す(なお、後述する第2反応工程の洗浄方法についても同様とする)。
次に、第2反応工程について説明する。第2反応工程においては、第1反応工程において反応された測定対象71を第2担体76に結合させるために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、図4(a)に示すように、反応槽10の中に第2担体側抗体75と結合された第2担体76を加えた後、この第2担体76が加えられた試料70を攪拌する。次に、上記第2担体76が加えられてから所定時間が経過するまで、上記攪拌した試料70を所定温度(例えば、37℃)で放置する。この所定時間については、具体的には、測定対象71を第2担体側抗体75と反応させるまでに要すると一般的に想定される時間以上の時間に設定している。続いて、上記所定時間が経過した後、測定対象71と反応しなかった上記第2担体76を除去するために洗浄を行う。
次に、通過工程について説明する。通過工程は、第2反応工程において生成された図4(b)に示す複合体78(第1担体73、第1担体側抗体74、測定対象71、第2担体側抗体75、及び第2担体76)を基板40のポア41に通過させるために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、図示しない送液管(例えばピペット等)によって反応槽10内から所定量の複合体78及び溶媒72を取り出し、当該取り出した複合体78及び溶媒72を検出機構20の収容部30内(具体的には、図5(a)に示す上側収容部32内)に注入する。この場合において、例えば、試料70の溶媒72と略同一の成分を有する溶媒72を収容部30の下側収納部31内にあらかじめ入れておくことが望ましい。次に、図5(b)に示すように、制御装置50の測定部54aによって、第1電極部及び第2電極部を介して収容部30内に電流Cを所定時間流すことで上記注入された複合体78を下方に移動させることにより(すなわち、電気泳動により)、当該複合体78をポア41に通過させる。この所定時間については、具体的には、上記注入された複合体78の所定個数がポア41を通過するまでに要すると一般的に想定される時間以上の時間に設定することが好ましい。この場合、上述した作業を、第2反応工程において生成された複合体78の所定個数をポア41に通過させるまで繰り返し行う。あるいは、通過する複合体78の個数にかかわらず予め時間を設定しておき(例えば10分間)、該設定時間内にポア41を通過する複合体78を解析する手法もとり得る。
次に、測定工程について説明する。測定工程は、複合体78の大きさを測定するために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、制御装置50の測定部54aによって、公知の電気的検出方法(例えば、電気的ナノパルス法等)を用いて、通過工程において電流Cを流し始めたタイミングで検出部による収容部30内を流れる電流Cの検出を行わせ、当該電流Cが流れる上記所定時間が経過するまで電流Cの検出を続けさせる(なお、この作業は、通過工程が終了するまで繰り返し行われる)。ここで、「電気的ナノパルス法」とは、電気を通した液体中でナノ粒子がポア41を通過する際に生じる電気抵抗の変化をパルス信号として得る方法である。また、「パルス信号」とは、ナノ粒子の大きさ(具体的には、ナノ粒子の体積)を示す信号であり、例えばパルス信号が高いほど大きな粒子であることを示す。次いで、制御装置50の測定部54aによって、記憶部55にあらかじめ記憶された関係データであって複合体78の大きさと電流Cの大きさとの関係を示す関係データ(例えば、複合体78の大きさと電流Cの大きさとの比例関係を示すデータ等)を参照しながら、上記検出した電流Cの変化(電流Cの時刻歴変化)に基づいて、通過工程においてポア41を通過した複合体78毎の大きさを特定させる。
続いて、特定工程について説明する。特定工程は、試料70に含まれる測定対象71の個数を特定するために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、制御装置50の特定部54bによって、複合体テーブル55aに格納されている複合体情報及び測定工程において測定された複合体78の大きさに基づいて、通過工程においてポア41を通過した複合体78毎の測定対象71の個数を特定させる。この測定対象71の個数の特定方法については任意であるが、実施の形態1においては、上記複合体情報の測定対象個数情報の中から、測定工程において測定された複合体78の大きさに対応する測定対象個数情報を抽出し、当該抽出した測定対象個数情報の値を複合体78の測定対象71の個数として特定する。例えば、測定工程において特定された複合体78の大きさ=160nmである場合に、図2に示す測定対象個数情報=1が抽出されると、複合体78の測定対象71の個数=1が特定される。次に、制御装置50の特定部54bによって、上記特定した複合体78毎の個数の合算値を試料70に含まれる測定対象71の個数として特定させる。続いて、制御装置50の制御部54によって、上記特定された試料70に含まれる測定対象71の個数を出力部52に出力させる。この上記測定対象71の個数の出力方法については任意であるが、例えば、出力部52(表示手段)の画面上に上記測定対象71の個数を表示させる。あるいは、上記測定対象71の個数を示す音声データ(一例として、「試料70に含まれる測定対象の個数が×××個でした」との定型メッセージを含む音声データ等)を出力部52(音声出力手段)を介して音声出力してもよい。
次に、実施の形態2について説明する。この実施の形態2は、解離複合体の大きさに基づいて測定対象の個数を特定する形態である。実施の形態2において、好適には、第1担体73は、所定のリンカーが固相化され、該リンカーを介して(必要に応じてプローブ分子、抗体等を更に介して)測定対象と結合可能な粒子である。その余の構成については、特記する場合を除いて、実施の形態1の構成と略同一であり、実施の形態1の構成と略同一の構成についてはこの実施の形態1で用いたものと同一の符号及び/又は名称を必要に応じて付して、その説明を省略する。
まず、実施の形態2に係る測定システムの構成について説明する。実施の形態2に係る測定システムは、概略的に、後述する図6の反応槽10、検出機構(図示省略)、後述する図6の解離部80、及び制御装置(図示省略)を備えて構成されている(ただし、制御装置の複合体テーブルを省略している)。また、これら構成要素のうち、検出機構の第1電極部、電極部、検出部、及び解離部80の各々と制御装置とは、配線を介して電気的に接続されている。
解離部80は、複合体78から第1担体73を解離することで後述する図7(b)の解離複合体90を生成する解離手段である。この解離部80は、第1担体73に固相化された所定のリンカーが光切断リンカーである場合、該リンカーを切断して複合体78から第1担体73を解離させることが可能な後述する図6の光DL(以下、「解離光DL」と称する)を照射する光照射装置等を用いて構成されており、反応槽10の近傍に設けられている。ここで「解離光DL」は、例えば、第1担体73と第2担体側抗体75との相互間で光切断反応を引き起こすことが可能な波長を有する光(一例として、極端紫外線、真空紫外線、近紫外線、可視光、近赤外線、中赤外線、遠赤外線等)等を含む概念である。前記光切断リンカーとしては、例えば2−ニトロベンジル基、p−ヒドロキシフェナシル基、(2−ニトロフェニル)エチル基、(クマリンー4−イル)メチル基等、公知の光切断リンカーをいずれも使用できる。
次に、このように構成された測定システム1を用いて行われる測定方法について説明する。図6は、解離工程の概要を示す概要図である。図7は、図6のA領域の拡大図であり、(a)は、複合体78から第1担体73が解離する状況を示す図であり、(b)は解離複合体90が生成された状態を示す図である。図8は、通過工程の概要を示す概要図であり、(a)は解離複合体90をポア41に通過させる前の状態を示す図であり、(b)は解離複合体90をポア41に通過させた後の状態を示す図である。実施の形態2に係る測定方法は、上述したように、第1反応工程、第2反応工程、解離工程、通過工程、測定工程、及び特定工程を含んでいる。なお、この測定方法のうち、第1反応工程及び第2反応工程は、実施の形態1に係る測定方法と同様であるので、説明を省略する。
まず、解離工程について説明する。解離工程は、通過工程の前に解離複合体90を生成するために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、制御装置の制御部によって、図6に示すように第2反応工程において生成された複合体78に対して解離光DLを解離部80から照射させて、図7(a)に示すように複合体78から第1担体73を解離させることにより、解離複合体90(具体的には、図7(b)に示す第1解離複合体91及び第2解離複合体92)を生成する。この解離光DLの照射方法については任意であるが、解離工程にて生成されたすべての複合体78から第1担体73を解離できるように照射することが望ましいので、例えば、図6に示すように、反応槽10に収容されている収容物(すなわち、解離複合体90及び溶媒72)の全体に対して解離光DLを照射する。あるいは、これに限られず、この収容物を撹拌しながら収容物の一部に対して解離光DLを照射してもよい。なお、このような解離は、不可逆的なものであるので、解離複合体90が反応槽10内の第1担体73と再度結合することはない。次に、反応槽10から解離後の第1担体73を除去する。この解離後の第1担体73の除去方法については任意であるが、例えば、反応槽10の一部(一例として反応槽10の側面部等)に設置された磁石(図示省略)によって、解離後の第1担体73を集磁させた状態で、解離複合体90及び溶媒72を別の反応槽10に移し変えることで除去する。
次に、通過工程について説明する。通過工程は、解離工程において生成された解離複合体90を基板40のポア41に通過させるために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、送液管によって反応槽10内から所定量の解離複合体90及び溶媒72を取り出し、当該取り出した解離複合体90及び溶媒72を検出機構の収容部30内(具体的には、図8(a)に示す上側収容部32内)に注入する。次に、図8(b)に示すように、制御装置の測定部によって、第1電極部及び第2電極部を介して収容部30内に電流Cを所定時間流すことで上記注入された解離複合体90を下方に移動させることにより(すなわち、電気泳動により)、当該解離複合体90をポア41に通過させる。この所定時間については、所定個数の解離複合体90がポア41を通過するまでに要すると一般的に想定される時間以上の時間に設定することが好ましい。又は、通過する解離複合体90の個数にかかわらず予め時間を設定しておき(例えば10分間)、該設定時間内にポア41を通過する解離複合体90を解析する手法もとり得る。
次に、測定工程について説明する。測定工程は、解離複合体90の大きさを測定するために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、制御装置の測定部によって、通過工程において電流Cを流し始めたタイミングで検出部による収容部30内を流れる電流Cの検出を開始させ、当該電流Cが流れる上記所定時間が経過するまで電流Cの検出を続けさせる(なお、この作業は、通過工程が終了するまで繰り返し行われる)。次いで、制御装置の測定部によって、記憶部にあらかじめ記憶された関係データであって解離複合体90の大きさと電流Cの大きさとの関係を示す関係データ(例えば、解離複合体90の大きさと電流Cの大きさとの比例関係を示すデータ等)を参照しながら、上記検出した電流Cの変化に基づいて、通過工程においてポア41を通過した解離複合体90毎の大きさを特定させる(すなわち、解離複合体90の大きさを測定する)。
続いて、特定工程について説明する。特定工程は、試料70に含まれる測定対象71の個数を特定するために、以下の手順で行われる。すなわち、まず、制御装置の特定部によって、測定工程において測定された解離複合体90の大きさに基づいて、試料70に含まれる測定対象71の個数を特定させる。この試料70に含まれる測定対象71の個数の特定方法については任意であるが、実施の形態2においては、通過工程においてポア41を通過した解離複合体90の中から、測定工程において測定された解離複合体90の大きさが記憶部にあらかじめ記憶された閾値以上(例えば、40nm以上等)となる解離複合体90(具体的には、第1解離複合体91)を特定し、当該特定した第1解離複合体91の個数の合計値を試料70に含まれる測定対象71の個数として特定することもできる。解離工程において生成される解離複合体90の種類が2種類(すなわち、図7(b)に示す第1解離複合体91と第2解離複合体92)であるので、実施の形態1に係る複合体テーブル55aを用いなくても、1つの閾値を用いることにより、第1解離複合体91及び第2解離複合体92の中から第1解離複合体91を特定できるからである。次いで、制御装置の制御部によって、上記特定された試料70に含まれる測定対象71の個数を出力部に出力させる。
以上、本発明の実施の形態について説明したが、本発明の具体的な構成及び手段は、特許請求の範囲に記載した各発明の技術的思想の範囲内において、任意に改変及び改良することができる。以下、このような変形例について説明する。
まず、発明が解決しようとする課題や発明の効果は、前記した内容に限定されるものではなく、本発明によって、前記に記載されていない課題を解決したり、前記に記載されていない効果を奏することもでき、また、記載されている課題の一部のみを解決したり、記載されている効果の一部のみを奏することがある。例えば、本発明に係る測定方法の測定作業の迅速化及び簡易化が従来と同程度であっても、従来と異なる方法により従来と同程度の測定作業の迅速化及び簡易化を有している場合には、本願発明の課題は解決されている。
また、上述した各電気的構成要素は機能概念的なものであり、必ずしも物理的に図示の如く構成されていることを要しない。すなわち、各部の分散や統合の具体的形態は図示のものに限られず、その全部または一部を、各種の負荷や使用状況などに応じて、任意の単位で機能的または物理的に分散又は統合して構成できる。例えば、制御装置を、相互に通信可能に構成された複数の装置に分散して構成し、これら複数の装置の一部に制御部を設けると共に、これら複数の装置の他の一部に記憶部を設けてもよい。
実施の形態や図面において例示した構成要素に関して、形状、数値、又は複数の構成要素の構造若しくは時系列の相互関係については、本発明の技術的思想の範囲内において、任意に改変及び改良することができる。
上記実施の形態1、2では、第2担体76が第1担体73よりも小さく形成されていると説明したが、これに限られず、例えば、第1担体73と同じ大きさ又はそれ以上の大きさであってもよい。
上記実施の形態1では、通過部が、第1電極部及び第2電極部を備えていると説明したが、これに限られない。例えば、第1電極部及び第2電極部に代えて、若しくは、これに加えて、加圧部を備え、通過工程において、当該加圧部を用いて収容部30の上側収容部32内に収容された複合体78及び溶媒72を下方に向けて加圧させてもよい。または、これに代えて、もしくはこれに加えて、収容部30と上側収容部32との溶媒の塩濃度に差を持たせたり、キャピラリー電気泳動による濃縮および分離工程を加えたりしてもよい(なお、実施の形態2についても同様とする)。特に、上記の手段を組合せて使用することにより、複合体78をポア41に効果的に通過させることが可能となる。
上記実施の形態1、2では、第1反応工程及び第2反応工程が行われると説明したが、これに限られず、例えば、あらかじめ生成された複合体78を用いる場合には、第1反応工程及び第2反応工程を省略してもよい。
上記実施の形態1では、複合体78の大きさと電流Cの大きさとの関係を示す関係データを参照しながら、検出部にて検出した電流Cの変化(電流Cの時刻歴変化)に基づいて、通過工程においてポア41を通過した複合体78毎の大きさを特定させると説明したが、これに限られない。例えば、同一の複合体78であっても、複合体78のポア41の通過の仕方(例えば、複合体78の通過方向が鉛直方向又は非鉛直方向であること、複数の複合体78が連続的又は断続的に通過すること等)によって複合体78の大きさが異なることから、例えば、検出部にて検出した電流Cの変化(電流Cの時刻歴変化)と、機械学習等によって得られたパターンデータであって複合体78のポア41の通過の仕方ごとの電流Cの変化のパターンデータとに基づいて、測定工程にて測定された複合体78の大きさを補正してもよい。一例として、上記電流Cの変化のパターンデータのうち、通過工程においてポア41を通過した所定の複合体78に対応する電流Cの変化が、複合体78の通過方向が鉛直方向であるパターンと一致する場合には、複合体78の大きさを補正しないものの、複合体78の通過方向が非鉛直方向であるパターンと一致する場合には、複合体78の大きさを補正する。
上記実施の形態2では、第2反応工程において生成された複合体78に対して解離光DLを解離部80から照射させることにより、光切断リンカーを切断して複合体78から第1担体73を解離させると説明したが、これに限られず、光切断リンカーに代えて、薬剤、酵素、タンパク変性剤(尿素等)、熱等で切断する各種リンカーを選択できる。そして、使用するリンカーに付随して、解離手段を適宜選択できる。例えば、解離部80に代えて(あるいは、解離部80と併用して)、リンカーを切断可能な薬剤(一例として、高濃度無機塩、還元剤のジチオトレイトールや2−メルカプトエタノール等)を複合体78及び溶媒72に加えてもよく、又は、リンカーを切断可能な酵素(一例として、タンパク質分解酵素、糖鎖切断酵素、脂肪酸分解酵素、核酸分解酵素等)又は尿素を複合体78及び溶媒72に加えてもよい。酵素で切断可能なリンカーとしては、例えば特許第3287249号に記載のリンカーなどが知られる。あるいは、解離部80から解離光DLを照射させることに代えて、複合体78から第1担体73を解離させることが温度に設定された熱を照射させてもよい。
実施例1:メチル化DNAのポアセンシングによる測定(実施の形態1)
(1)ストレプトアビジン結合磁性粒子(第1担体)の調製
50mMMES(pH=5.5)200μLに懸濁させた磁性粒子(micromod社製nanomag−D,COOH,130nm、商品番号:09−02−132)6mgに、50mg/mL エチル(ジメチルアミノプロピル) カルボジイミド 100μLおよび50mg/mL N-ヒドロキシスクシンイミド 100μLを加え、室温で30分間転倒混和した。200μLの50mMMES(pH=5.5)で2回洗浄した後、50mMMES(pH=5.5)に1.0mg/mLで溶解したストレプトアビジン(和光純薬製、商品番号:141−12851)を120μL加え、室温で30分間転倒混和することで、磁性粒子上にストレプトアビジンを結合させた。200μLの50mMMES(pH=5.5)で2回、400μLの2%BSAを含むTBSで3回洗浄することで、ストレプトアビジン結合磁性粒子を得た。
自社で取得した抗メチルシトシン抗体1G3について、Cytodiagnostics社製NHS−Activated Gold Nanoparticle Conjugation Kit(商品番号:CGN5K−40−1)を用いて、添付文書記載の方法により、抗体結合金ナノ粒子を調製した。
測定対象としては、配列が5’−GCC XGC AXG TCC TXG XGG−3’(Xは5−メチルシトシン、5’末端はビオチン標識)であり、北海道システムサイエンス社により人工合成されたメチル化DNAを使用した。まず、ストレプトアビジン結合磁性粒子(6.25μg)と測定対象核酸(500fmol)を75μLのPBSに懸濁させた後、37℃で30分間反応させ、ストレプトアビジン結合磁性粒子と測定対象核酸の複合体を形成させた。200μLのルミパルス洗浄液(富士レビオ社製)で洗浄した後、100μLの1.2×1011NPS/mLの抗メチルシトシン抗体結合金ナノ粒子溶液を加え、37℃で2.5時間反応させた。200μLのルミパルス洗浄液(自社製)で洗浄した後、250μLのPBSに懸濁し、ナノ粒子マルチアナライザー(IZON社製qNano)を用いて、粒径分布を測定した(第1試験体)。
また、測定対象核酸を含まない溶液を用い、複合体が形成されない試料も同様に測定した(第2試験体)。
図9は、第1試験体に関する試験体の大きさ毎の実験結果と、第2試験体に関する試験体の大きさ毎の実験結果とを示すグラフであり、横軸は試験体の大きさの測定値(図9では、「particle diameter(nm)」と示す)、縦軸は、試験体の大きさ毎の試験体の個数の合算値を試料70に含まれる試験体の個数(総数)で除算した値(図9では、「population(%)」と示す)を示す。図9に示すように、これらの実験結果から、試験体の大きさ毎の第1試験体の上記除算した値と第2試験体の上記除算した値とが異なることが確認された。また、第2試験体の上記除算した値が、試験体の大きさが大きくなるにしたがって、第1試験体の上記除算した値よりも高くなる傾向を示すことが確認された。以上のように、図9に示す実験結果から、磁気粒子の個数と複合体の個数とを区別して測定できることがわかり、実施の形態1に係る測定方法の有効性が確認できた。
(1)光切断リンカー結合抗PSA抗体の調製
抗PSA抗体(No.62,自社製)にNHS−PC−Biotin(Ambergen社製,商品番号PCB-N−005)を添付文書に記載の方法で結合させ、光切断リンカー結合抗PSA抗体を得た。
実施例1(1)と同様の方法でストレプトアビジン結合磁性粒子を調製した。このストレプトアビジン結合磁性粒子1mgに、2.7μgの光切断リンカー結合抗PSA抗体を加え、37℃で30分間転倒混和することで、磁性粒子上に光切断リンカー結合抗PSA抗体を結合させた。10mMTris緩衝液で3回洗浄することで、抗PSA抗体結合磁性粒子(光切断リンカー)を得た。
蛍光ナノ粒子(ライフテクノロジーズ社製Fluospheres,COOH,40nm、商品番号F8789)2.5mgに、10.0mg/mL 4−(4,6−ジメトキシ−1,3,5−トリアジン−2−イル)−4−メチルモルホリニウムクロリド 2.2μLを加え、室温で180分間転倒混和した。100mM炭酸水素ナトリウム水溶液に3.0mg/mLで溶解した抗PSA抗体(No.31,自社製)を40μL加え、室温で60分間転倒混和することで、蛍光ナノ粒子に抗PSA抗体を結合させた。100μLの190mMグリシン水溶液を加えた後、遠心分離により上精を除去することで、抗PSA抗体結合蛍光ナノ粒子を得た。
ルミパルスPSA標準液(富士レビオ社製)を必要に応じてPBSで希釈し、0、1、10、50、100ng/mLのPSA溶液(それぞれ第1、第2、第3、第4、第5試験体)を調製した。20μLの各試験体と、250μLの0015%の抗PSA抗体結合磁性粒子(光切断リンカー)を含有する溶液とを、37℃で10分間反応させ、抗PSA抗体結合磁性粒子(光切断リンカー)上にPSA抗原を捕捉した。750μLのルミパルス洗浄液(富士レビオ社製)で未結合物質を洗浄した後、250μLの32μg/mL抗PSA抗体結合蛍光ナノ粒子を含有する溶液を加え、37℃で10分間反応させた。500μLのルミパルス洗浄液で洗浄した後、100μLのPBSに懸濁し、365nmのUV光(浜松ホトニクス社製C11924−111およびL11922−401)を1分間照射した(解離工程)。磁性粒子を除いた上清をナノ粒子マルチアナライザー(IZON社製qNano)で計測し、10分間の粒子カウント数を測定した。
図10は、第1試験体から第5試験体の実験結果を示す表である。図10の実験結果から、第1試験体(PSA(測定対象)なし)の個数(カウント数)と、第2試験体から第5試験体(PSAあり)のカウント数とに有意な差が生じていることが確認された。また、PSAのカウント数が、PSAの濃度が高くなるにつれて、高くなる傾向を示すことが確認された。以上のように、図10に示す実験結果から、測定対象のカウント数が測定対象の濃度に依存して変化することがわかり、実施の形態2に係る測定方法の有効性が確認できた。
10 反応槽
20 検出機構
30 収容部
31 下側収容部
32 上側収容部
40 基板
41 ポア
50 制御装置
51 操作部
52 出力部
53 電源部
54 制御部
54a 測定部
54b 特定部
55 記憶部
55a 複合体テーブル
70 試料
71 測定対象
72 溶媒
73 第1担体
74 第1担体側抗体
75 第2担体側抗体
76 第2担体
78 複合体
80 解離部
90 解離複合体
91 第1解離複合体
92 第2解離複合体
C 電流
DL 解離光
Claims (2)
- 試料に含まれる測定対象を測定する測定方法であって、
前記測定対象を所定の担体と反応させることにより得られる複合体を、基板に設けられたポアに通過させる通過工程と、
前記通過工程において前記複合体を前記ポアに通過させる際に生じる電気的変化に基づいて、前記複合体の大きさを測定する測定工程と、
前記測定工程において測定された前記複合体の大きさに基づいて、前記測定対象の個数を特定する特定工程と、を含み、
前記複合体は、前記測定対象と、前記測定対象と結合可能な第1担体と、前記測定対象と結合可能な第2担体とを有し、
前記通過工程の前に、前記複合体から前記第1担体を解離することで解離複合体を生成する解離工程を含み、
前記通過工程において、前記解離工程において生成された前記解離複合体を、前記ポアに通過させ、
前記測定工程において、前記通過工程において前記解離複合体を前記ポアに通過させる際に生じる電気的変化に基づいて、前記解離複合体の大きさを測定し、
前記特定工程において、前記測定工程において測定された前記解離複合体の大きさに基づいて、前記測定対象の個数を特定する、
測定方法。 - 試料に含まれる測定対象を測定する測定システムであって、
ポアが形成された基板と、
前記測定対象を所定の担体と反応させることにより得られる複合体を、前記ポアに通過させる通過手段と、
前記通過手段にて前記複合体を前記ポアに通過させる際に生じる電気的変化に基づいて、前記複合体の大きさを測定する測定手段と、
前記測定手段にて測定された前記複合体の大きさに基づいて、前記測定対象の個数を特定する特定手段と、を備え、
前記複合体は、前記測定対象と、前記測定対象と結合可能な第1担体と、前記測定対象と結合可能な第2担体とを有し、
前記複合体から前記第1担体を解離することで解離複合体を生成する解離手段を備え、
前記通過手段は、前記解離手段にて生成された前記解離複合体を、前記ポアに通過させ、
前記測定手段は、前記通過手段にて前記解離複合体を前記ポアに通過させる際に生じる電気的変化に基づいて、前記解離複合体の大きさを測定し、
前記特定手段は、前記測定手段にて測定された前記解離複合体の大きさに基づいて、前記測定対象の個数を特定する、
測定システム。
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