JP6771161B2 - Nucleic acid extractor - Google Patents

Nucleic acid extractor Download PDF

Info

Publication number
JP6771161B2
JP6771161B2 JP2018504026A JP2018504026A JP6771161B2 JP 6771161 B2 JP6771161 B2 JP 6771161B2 JP 2018504026 A JP2018504026 A JP 2018504026A JP 2018504026 A JP2018504026 A JP 2018504026A JP 6771161 B2 JP6771161 B2 JP 6771161B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
nucleic acid
container
acid extraction
sample
discharge port
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
JP2018504026A
Other languages
Japanese (ja)
Other versions
JPWO2017154349A1 (en
Inventor
宏明 橘
宏明 橘
成正 岩本
成正 岩本
徹 馬場
徹 馬場
章吾 澁谷
章吾 澁谷
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Panasonic Intellectual Property Management Co Ltd
Original Assignee
Panasonic Intellectual Property Management Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Panasonic Intellectual Property Management Co Ltd filed Critical Panasonic Intellectual Property Management Co Ltd
Publication of JPWO2017154349A1 publication Critical patent/JPWO2017154349A1/en
Application granted granted Critical
Publication of JP6771161B2 publication Critical patent/JP6771161B2/en
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M1/00Apparatus for enzymology or microbiology
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N1/02Devices for withdrawing samples
    • G01N1/10Devices for withdrawing samples in the liquid or fluent state
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N1/00Sampling; Preparing specimens for investigation
    • G01N1/28Preparing specimens for investigation including physical details of (bio-)chemical methods covered elsewhere, e.g. G01N33/50, C12Q

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Sustainable Development (AREA)
  • Hydrology & Water Resources (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Sampling And Sample Adjustment (AREA)

Description

本発明は、検体から核酸(デオキシリボ核酸、リボ核酸)を抽出するための核酸抽出装置、核酸抽出装置に用いられる核酸抽出ユニット、及び、検体から核酸を抽出するための核酸抽出方法に関する。 The present invention relates to a nucleic acid extraction device for extracting nucleic acid (deoxyribonucleic acid, ribonucleic acid) from a sample, a nucleic acid extraction unit used in the nucleic acid extraction device, and a nucleic acid extraction method for extracting nucleic acid from a sample.

飲料又は食品等に含まれる細菌等の微生物の検査においては、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR:polymerase chain reaction)等の核酸増幅法が利用されている。核酸増幅法は、培養法と比べて大幅に検査工程を高速化及び簡略化することができる利点がある。 Nucleic acid amplification methods such as polymerase chain reaction (PCR) are used in the examination of microorganisms such as bacteria contained in beverages or foods. The nucleic acid amplification method has an advantage that the test process can be significantly speeded up and simplified as compared with the culture method.

核酸増幅法を利用した検査を実施するためには、核酸増幅を行う前に検体から核酸を抽出する前処理が必要となる。従来、このような前処理としては、検体(検体原液)をフィルタでろ過することで検体に含まれる細菌等の検査対象物を捕捉し、核酸抽出試薬によって検査対象物から核酸を抽出する方法が知られている(例えば特許文献1)。 In order to carry out a test using the nucleic acid amplification method, a pretreatment for extracting nucleic acid from a sample is required before performing nucleic acid amplification. Conventionally, as such a pretreatment, a method of capturing a test object such as bacteria contained in the sample by filtering the sample (sample stock solution) with a filter and extracting nucleic acid from the test object with a nucleic acid extraction reagent has been used. It is known (for example, Patent Document 1).

特開平4−36197号公報Japanese Unexamined Patent Publication No. 4-36197

特許文献1に開示された従来の核酸抽出方法(前処理)は、検体を入れたシリンジにフィルタを通して検査対象物をろ過濃縮した後、このフィルタを取り外して核酸抽出試薬を入れた別のシリンジに再度取り付けて検査対象物を溶出して核酸を抽出するものである。 In the conventional nucleic acid extraction method (pretreatment) disclosed in Patent Document 1, after filtering and concentrating the test object through a syringe containing a sample, this filter is removed and another nucleic acid containing a nucleic acid extraction reagent is used. It is reattached to elute the test object and extract the nucleic acid.

しかしながら、従来の核酸抽出方法では、作業が煩雑な上に、作業中に検査対象物とは異なる菌等の不純物が、抽出した核酸を含む核酸抽出液に混入すること(コンタミ)が生じるリスクがある。 However, in the conventional nucleic acid extraction method, the work is complicated, and there is a risk that impurities such as bacteria different from the test object may be mixed in the nucleic acid extract containing the extracted nucleic acid (contamination) during the work. is there.

本発明は、このような課題を解決するためになされたものであり、作業性が簡便で、核酸抽出液に不純物が混入するリスクを大幅に軽減できる核酸抽出装置及び核酸抽出ユニット等を提供することを目的とする。 The present invention has been made to solve such a problem, and provides a nucleic acid extraction device, a nucleic acid extraction unit, and the like, which are easy to work with and can significantly reduce the risk of impurities being mixed in the nucleic acid extract. The purpose is.

上記目的を達成するために、本発明に係る核酸抽出装置の一態様は、検体から核酸を抽出するための核酸抽出ユニットを備え、前記核酸抽出ユニットは、容器と、前記容器内に検体を注入するための第1注入口と、少なくとも一部が前記容器内に配置され、前記第1注入口から注入された検体に含まれる核酸抽出対象物を捕捉する捕捉部と、前記捕捉部で捕捉された前記核酸抽出対象物から核酸を抽出するための核酸抽出試薬を前記容器内に注入するための第2注入口と、前記核酸抽出試薬によって前記核酸抽出対象物から抽出された核酸が含まれる核酸抽出液を前記容器から排出するための第1排出口と、前記検体を前記容器から排出するための第2排出口とを有し、前記容器は、前記捕捉部を境界として当該容器の内部空間を分割する第1容器部と第2容器部とを有し、前記第1注入口及び前記第2注入口は、前記第1容器部に設けられており、前記第1排出口及び前記第2排出口は、前記第2容器部に設けられている。 In order to achieve the above object, one aspect of the nucleic acid extraction device according to the present invention includes a nucleic acid extraction unit for extracting nucleic acid from a sample, and the nucleic acid extraction unit injects a container and a sample into the container. A first injection port for the purpose, at least a part thereof is arranged in the container, and a capture unit for capturing a nucleic acid extraction target contained in a sample injected from the first injection port, and a capture unit captured by the capture unit. A second injection port for injecting a nucleic acid extraction reagent for extracting nucleic acid from the nucleic acid extraction target into the container, and a nucleic acid containing the nucleic acid extracted from the nucleic acid extraction target by the nucleic acid extraction reagent. The container has a first discharge port for discharging the extract from the container and a second discharge port for discharging the sample from the container, and the container has an internal space of the container with the catching portion as a boundary. The first container portion and the second container portion are provided, and the first injection port and the second injection port are provided in the first container portion, and the first discharge port and the second injection port are provided. The discharge port is provided in the second container portion.

また、本発明に係る核酸抽出ユニットの一態様は、検体から核酸を抽出するための核酸抽出装置に用いられる核酸抽出ユニットであって、容器と、前記容器内に検体を注入するための第1注入口と、前記容器内に配置され、前記第1注入口から注入された検体に含まれる核酸抽出対象物を捕捉する捕捉部と、前記捕捉部で捕捉された前記核酸抽出対象物から核酸を抽出するための核酸抽出試薬を前記容器内に注入するための第2注入口と、前記核酸抽出試薬によって前記核酸抽出対象物から抽出された核酸が含まれる核酸抽出液を前記容器から排出するための第1排出口と、前記検体を前記容器から排出するための第2排出口とを備え、前記容器は、前記捕捉部を境界として当該容器の内部空間を分割するための第1容器部と第2容器部とを有し、前記第1注入口及び前記第2注入口は、前記第1容器部に設けられており、前記第1排出口及び前記第2排出口は、前記第2容器部に設けられている。 Further, one aspect of the nucleic acid extraction unit according to the present invention is a nucleic acid extraction unit used in a nucleic acid extraction device for extracting nucleic acid from a sample, and is a container and a first for injecting a sample into the container. The inlet, the capture unit that is placed in the container and captures the nucleic acid extraction target contained in the sample injected from the first injection port, and the capture unit that captures the nucleic acid from the nucleic acid extraction target captured by the capture unit. To discharge a second injection port for injecting a nucleic acid extraction reagent for extraction into the container and a nucleic acid extract containing the nucleic acid extracted from the nucleic acid extraction target by the nucleic acid extraction reagent from the container. The container is provided with a first discharge port and a second discharge port for discharging the sample from the container, and the container has a first container portion for dividing the internal space of the container with the capture portion as a boundary. It has a second container portion, the first injection port and the second injection port are provided in the first container portion, and the first discharge port and the second discharge port are the second container. It is provided in the section.

また、本発明に係る核酸抽出方法の一態様は、捕捉部に検体を通過させることによって前記検体に含まれる核酸抽出対象物を前記捕捉部で捕捉する捕捉工程と、前記捕捉部に核酸抽出試薬を導入することによって前記捕捉部で捕捉した前記核酸抽出対象物から核酸を抽出する核酸抽出工程と、抽出した前記核酸を含む核酸抽出液を前記捕捉部を通過させて回収する回収工程とを含む。 Further, one aspect of the nucleic acid extraction method according to the present invention is a capture step of capturing a nucleic acid extraction target contained in the sample by the capture unit by passing the sample through the capture unit, and a nucleic acid extraction reagent in the capture unit. Includes a nucleic acid extraction step of extracting nucleic acid from the nucleic acid extraction target captured by the capture unit by introducing the above, and a recovery step of collecting the nucleic acid extract containing the extracted nucleic acid through the capture unit. ..

本発明によれば、作業性が簡便で、核酸抽出液に不純物が混入するリスクを大幅に軽減できる。 According to the present invention, workability is simple, and the risk of impurities being mixed in the nucleic acid extract can be significantly reduced.

図1は、実施の形態に係る核酸抽出装置を模式的に示す斜視図である。FIG. 1 is a perspective view schematically showing a nucleic acid extraction device according to an embodiment. 図2は、実施の形態に係る核酸抽出装置における核酸抽出ユニットの周辺構造を示す要部拡大斜視図である。FIG. 2 is an enlarged perspective view of a main part showing the peripheral structure of the nucleic acid extraction unit in the nucleic acid extraction device according to the embodiment. 図3は、実施の形態に係る核酸抽出ユニットの斜視図である。FIG. 3 is a perspective view of the nucleic acid extraction unit according to the embodiment. 図4は、実施の形態に係る核酸抽出ユニットの断面図である。FIG. 4 is a cross-sectional view of the nucleic acid extraction unit according to the embodiment. 図5は、実施の形態に係る核酸抽出方法のフローチャートである。FIG. 5 is a flowchart of the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 図6Aは、実施の形態に係る核酸抽出方法において、検体を容器に注入するときの様子を示す図である。FIG. 6A is a diagram showing a state when a sample is injected into a container in the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 図6Bは、実施の形態に係る核酸抽出方法において、捕捉部で捕捉された核酸抽出対象物を示す図である。FIG. 6B is a diagram showing a nucleic acid extraction target captured by the capture unit in the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 図6Cは、実施の形態に係る核酸抽出方法において、核酸抽出試薬を容器に注入するときの様子を示す図である。FIG. 6C is a diagram showing a state when a nucleic acid extraction reagent is injected into a container in the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 図6Dは、実施の形態に係る核酸抽出方法において、核酸抽出試薬を捕捉部に保持させるときの様子を示す図である。FIG. 6D is a diagram showing a state when the nucleic acid extraction reagent is held in the capture unit in the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 図6Eは、実施の形態に係る核酸抽出方法において、核酸抽出液を第1容器部から第2容器部に移動させるときの様子を示す図である。FIG. 6E is a diagram showing a state when the nucleic acid extract is moved from the first container portion to the second container portion in the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 図6Fは、実施の形態に係る核酸抽出方法において、第2容器部に移動させた核酸抽出液の様子を示す図である。FIG. 6F is a diagram showing a state of the nucleic acid extract liquid moved to the second container portion in the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 図6Gは、実施の形態に係る核酸抽出方法において、核酸抽出液の容器から排出するときの様子を示す図である。FIG. 6G is a diagram showing a state when the nucleic acid extract is discharged from the container in the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 図7は、変形例1に係る核酸抽出ユニットの断面図である。FIG. 7 is a cross-sectional view of the nucleic acid extraction unit according to the first modification. 図8は、変形例2に係る核酸抽出ユニットの断面図である。FIG. 8 is a cross-sectional view of the nucleic acid extraction unit according to the second modification. 図9は、変形例3に係る核酸抽出ユニットの断面図である。FIG. 9 is a cross-sectional view of the nucleic acid extraction unit according to the third modification. 図10は、変形例4に係る核酸抽出ユニットの断面図である。FIG. 10 is a cross-sectional view of the nucleic acid extraction unit according to the modified example 4. 図11は、変形例5に係る核酸抽出ユニットの断面図である。FIG. 11 is a cross-sectional view of the nucleic acid extraction unit according to the modified example 5.

以下、本発明の実施の形態について、図面を参照しながら説明する。なお、以下に説明する実施の形態は、いずれも本発明の好ましい一具体例を示すものである。したがって、以下の実施の形態で示される、数値、形状、材料、構成要素、構成要素の配置位置及び接続形態、並びに、ステップ(工程)及びステップの順序などは、一例であって本発明を限定する主旨ではない。よって、以下の実施の形態における構成要素のうち、本発明の最上位概念を示す独立請求項に記載されていない構成要素については、任意の構成要素として説明される。 Hereinafter, embodiments of the present invention will be described with reference to the drawings. It should be noted that all of the embodiments described below show a preferred specific example of the present invention. Therefore, the numerical values, shapes, materials, components, the arrangement positions and connection forms of the components, the steps (processes), the order of the steps, and the like shown in the following embodiments are examples and limit the present invention. It is not the purpose of doing it. Therefore, among the components in the following embodiments, the components not described in the independent claims indicating the highest level concept of the present invention will be described as arbitrary components.

なお、各図は、模式図であり、必ずしも厳密に図示されたものではない。また、各図において、実質的に同一の構成に対しては同一の符号を付しており、重複する説明は省略又は簡略化する。 It should be noted that each figure is a schematic view and is not necessarily exactly illustrated. Further, in each figure, the same reference numerals are given to substantially the same configurations, and duplicate description will be omitted or simplified.

(実施の形態)
[核酸抽出装置]
実施の形態に係る核酸抽出装置100及び核酸抽出ユニット1の構成について、図1〜図4を用いて説明する。図1は、実施の形態に係る核酸抽出装置100を模式的に示す斜視図である。図2は、同核酸抽出装置100における核酸抽出ユニット1の周辺構造を示す要部拡大斜視図であり、核酸抽出装置100に設置された状態の核酸抽出ユニット1を示している。図3は、実施の形態に係る核酸抽出ユニット1の斜視図であり、図4は、同核酸抽出ユニット1の断面図である。
(Embodiment)
[Nucleic acid extractor]
The configurations of the nucleic acid extraction device 100 and the nucleic acid extraction unit 1 according to the embodiment will be described with reference to FIGS. 1 to 4. FIG. 1 is a perspective view schematically showing a nucleic acid extraction device 100 according to an embodiment. FIG. 2 is an enlarged perspective view of a main part showing the peripheral structure of the nucleic acid extraction unit 1 in the nucleic acid extraction device 100, and shows the nucleic acid extraction unit 1 in a state of being installed in the nucleic acid extraction device 100. FIG. 3 is a perspective view of the nucleic acid extraction unit 1 according to the embodiment, and FIG. 4 is a cross-sectional view of the nucleic acid extraction unit 1.

図1に示すように、核酸抽出装置100は、検体に含まれる被測定物から核酸を抽出するための核酸抽出ユニット1と、真空ポンプ2と、振動装置3とを備える。 As shown in FIG. 1, the nucleic acid extraction device 100 includes a nucleic acid extraction unit 1 for extracting nucleic acid from an object to be measured contained in a sample, a vacuum pump 2, and a vibration device 3.

検体(検体原液)に含まれる被測定物は、核酸を抽出する対象物(核酸抽出対象物)であって、例えば、細菌、ウイルス又は組織細胞等の微生物である。微生物を含む検体原液は、例えば、飲料から採取することができる。 The object to be measured contained in the sample (sample stock solution) is an object for extracting nucleic acid (nucleic acid extraction object), and is, for example, a microorganism such as a bacterium, a virus, or a tissue cell. The sample stock solution containing microorganisms can be collected from, for example, a beverage.

細菌、ウイルス又は組織細胞等の微生物は、PCR等による核酸増幅によって検査が行われる検査対象物である。つまり、核酸抽出装置100は、核酸増幅を行う前の前処理のために用いられる装置であり、核酸抽出装置100で抽出された核酸は、所望の検査に利用される。なお、本実施の形態における核酸抽出装置100では、抽出された核酸を含む液体(核酸抽出液)として回収される。 Microorganisms such as bacteria, viruses, and histiocytes are test objects that are tested by nucleic acid amplification such as PCR. That is, the nucleic acid extraction device 100 is a device used for pretreatment before performing nucleic acid amplification, and the nucleic acid extracted by the nucleic acid extraction device 100 is used for a desired test. In the nucleic acid extraction device 100 of the present embodiment, the nucleic acid is recovered as a liquid (nucleic acid extract) containing the extracted nucleic acid.

核酸抽出ユニット1は、検体から核酸の抽出処理を行うための処理ユニットであり、図2に示すように、核酸抽出装置100の反応ボックス4に設置される。本実施の形態において、核酸抽出ユニット1は、交換可能なカートリッジであり、反応ボックス4から取り外すことができる。核酸抽出ユニット1は、例えば、1回の核酸抽出処理ごとに交換される。なお、図1では、反応ボックス4の全面蓋を開いた状態を示している。 The nucleic acid extraction unit 1 is a processing unit for extracting nucleic acid from a sample, and is installed in the reaction box 4 of the nucleic acid extraction device 100 as shown in FIG. In this embodiment, the nucleic acid extraction unit 1 is a replaceable cartridge and can be removed from the reaction box 4. The nucleic acid extraction unit 1 is replaced, for example, in each nucleic acid extraction process. Note that FIG. 1 shows a state in which the entire lid of the reaction box 4 is opened.

核酸抽出ユニット1は、図3及び図4に示すように、容器10と、第1注入口21と、第2注入口22と、第1排出口31と、第2排出口32と、捕捉部40とを備える。 As shown in FIGS. 3 and 4, the nucleic acid extraction unit 1 includes a container 10, a first injection port 21, a second injection port 22, a first discharge port 31, a second discharge port 32, and a capture unit. 40 and.

容器10は、注入される検体及び核酸抽出試薬によって検体から核酸の抽出処理を行うための処理容器である。検体から抽出された核酸は、核酸抽出液となって容器10から排出される。 The container 10 is a processing container for extracting nucleic acid from the sample by the sample to be injected and the nucleic acid extraction reagent. The nucleic acid extracted from the sample becomes a nucleic acid extract and is discharged from the container 10.

容器10の材質は、特に限定されるものではないが、核酸抽出処理で加熱処理を行うことを可能とするために、容器10は、ポリプロピレン(PP)又はポリカーボネート(PC)等の耐熱性の高い樹脂材料、アルミニウム又はステンレス等の金属材料、あるいは、ガラス又はセラミック等の無機材料によって構成されているとよい。また、容器10として樹脂材料を用いた場合には、安価で軽量化を図ることができるという利点もある。また、容器10として金属材料又は高熱伝導性樹脂を用いた場合には、容器10の熱伝導性を向上させることができる。このため、加熱処理を行う場合には、容器10の少なくとも一部は、金属材料又は高熱伝導性樹脂によって構成されているとよい。なお、容器10は、上記の材料を組み合わせて構成されていてもよい。 The material of the container 10 is not particularly limited, but the container 10 has high heat resistance such as polypropylene (PP) or polycarbonate (PC) so that the heat treatment can be performed by the nucleic acid extraction treatment. It may be composed of a resin material, a metal material such as aluminum or stainless steel, or an inorganic material such as glass or ceramic. Further, when a resin material is used as the container 10, there is an advantage that the weight can be reduced at low cost. Further, when a metal material or a highly thermally conductive resin is used as the container 10, the thermal conductivity of the container 10 can be improved. Therefore, when heat treatment is performed, it is preferable that at least a part of the container 10 is made of a metal material or a highly thermally conductive resin. The container 10 may be formed by combining the above materials.

また、容器10の内面は、非親水性であるとよい。例えば、容器10の内面は、疎水性であるとよい。この場合、疎水性材料を用いて容器10を形成してもよいし、表面処理によって容器10の内面を疎水性にしてもよいし、疎水性を有する膜が容器10の内面にコーティングされていてもよい。 Further, the inner surface of the container 10 is preferably non-hydrophilic. For example, the inner surface of the container 10 may be hydrophobic. In this case, the container 10 may be formed by using a hydrophobic material, the inner surface of the container 10 may be made hydrophobic by surface treatment, or a hydrophobic film is coated on the inner surface of the container 10. May be good.

容器10は、第1容器部11と第2容器部12とによって構成されている。第1容器部11と第2容器部12とは、捕捉部40を境界として容器10の内部空間を分割している。本実施の形態において、容器10は、捕捉部40の本体部41を境界として上下方向に二分割されており、第1容器部11が上側の部品で、第2容器部12が下側の部品となっている。なお、第1容器部11については、さらに2つに分割されているが、これに限るものではない。 The container 10 is composed of a first container portion 11 and a second container portion 12. The first container portion 11 and the second container portion 12 divide the internal space of the container 10 with the catching portion 40 as a boundary. In the present embodiment, the container 10 is divided into two in the vertical direction with the main body 41 of the catching portion 40 as a boundary, the first container portion 11 is the upper component, and the second container portion 12 is the lower component. It has become. The first container portion 11 is further divided into two, but the present invention is not limited to this.

第1注入口21、第2注入口22、第1排出口31、第2排出口32及び捕捉部40は、容器10に設けられている。具体的には、第1注入口21、第2注入口22、第1排出口31及び第2排出口32は、容器10の隔壁に設けられており、捕捉部40は、本体部41が容器10の内部に位置するように容器10に固定されている。 The first injection port 21, the second injection port 22, the first discharge port 31, the second discharge port 32, and the capture unit 40 are provided in the container 10. Specifically, the first injection port 21, the second injection port 22, the first discharge port 31, and the second discharge port 32 are provided on the partition wall of the container 10, and the capture unit 40 has the main body 41 as the container. It is fixed to the container 10 so as to be located inside the 10.

第1注入口21は、容器10内に検体を注入するための検体注入口である。本実施の形態において、第1注入口21は、第1容器部11の上壁に設けられている。検体(検体原液)は、核酸抽出装置100に設置される検体投入カップ200から第1注入口21を介して第1容器部11に注入される。 The first injection port 21 is a sample injection port for injecting a sample into the container 10. In the present embodiment, the first injection port 21 is provided on the upper wall of the first container portion 11. The sample (sample stock solution) is injected into the first container portion 11 from the sample charging cup 200 installed in the nucleic acid extraction device 100 via the first injection port 21.

第1注入口21は、容器10の外部と第1容器部11の内部空間とを連通する配管である。具体的には、第1注入口21の一方の端部は、第1容器部11に接続され、第1注入口21の他方の端部は、検体投入カップ200に接続される。本実施の形態において、第1注入口21は、第1容器部11と一体的に形成されている。なお、第1注入口21は、容器10(第1容器部11)の上壁に設けられた貫通孔であってもよい。 The first injection port 21 is a pipe that communicates the outside of the container 10 with the internal space of the first container portion 11. Specifically, one end of the first injection port 21 is connected to the first container portion 11, and the other end of the first injection port 21 is connected to the sample charging cup 200. In the present embodiment, the first injection port 21 is integrally formed with the first container portion 11. The first injection port 21 may be a through hole provided in the upper wall of the container 10 (first container portion 11).

第2注入口22は、容器10内に核酸抽出試薬を注入するための核酸抽出試薬注入口である。本実施の形態において、第2注入口22は、第1注入口21と同様に第1容器部11の上壁に設けられているが、第1注入口21と異なる位置に設けられている。 The second injection port 22 is a nucleic acid extraction reagent injection port for injecting the nucleic acid extraction reagent into the container 10. In the present embodiment, the second injection port 22 is provided on the upper wall of the first container portion 11 like the first injection port 21, but is provided at a position different from that of the first injection port 21.

第2注入口22から注入される核酸抽出試薬は、捕捉部40で捕捉された核酸抽出対象物から核酸を抽出するための液体試薬であり、例えば核酸抽出対象物の細胞膜から核酸を取り出す作用を持つ。核酸抽出試薬は、核酸抽出装置100に設置される核酸抽出試薬容器300から第2注入口22を介して第1容器部11に注入される。 The nucleic acid extraction reagent injected from the second injection port 22 is a liquid reagent for extracting nucleic acid from the nucleic acid extraction target captured by the capture unit 40, and for example, has an action of extracting nucleic acid from the cell membrane of the nucleic acid extraction target. Have. The nucleic acid extraction reagent is injected into the first container portion 11 from the nucleic acid extraction reagent container 300 installed in the nucleic acid extraction device 100 via the second injection port 22.

第2注入口22は、第1容器部11に設けられた貫通孔である。貫通孔である第2注入口22には、第2注入口22(貫通孔)を塞ぐゴム栓22aが設けられている。ゴム栓22aは、核酸抽出試薬を第1容器部11内に注入するための針が貫通可能なゴム材料によって構成されている。核酸抽出試薬容器300内の核酸抽出試薬を第1容器部11内に注入する際、核酸抽出試薬容器300に設けられた針をゴム栓22aに貫通させる。これにより、核酸抽出試薬容器300から第2注入口22を介して液体試薬を第1容器部11内に注入することができる。なお、ゴム栓22aのゴム材料は、特に限定されるものではないが、例えば、シリコーンゴム又はフッ素ゴム等が用いられる。 The second injection port 22 is a through hole provided in the first container portion 11. The second injection port 22, which is a through hole, is provided with a rubber stopper 22a that closes the second injection port 22 (through hole). The rubber stopper 22a is made of a rubber material through which a needle for injecting the nucleic acid extraction reagent into the first container portion 11 can penetrate. When the nucleic acid extraction reagent in the nucleic acid extraction reagent container 300 is injected into the first container portion 11, the needle provided in the nucleic acid extraction reagent container 300 is passed through the rubber stopper 22a. As a result, the liquid reagent can be injected from the nucleic acid extraction reagent container 300 into the first container portion 11 via the second injection port 22. The rubber material of the rubber stopper 22a is not particularly limited, but for example, silicone rubber, fluororubber, or the like is used.

このように、第1容器部11には検体及び核酸抽出試薬の液体が注入されるので、第1容器部11の内部空間の壁面における角部分の角度は、90度以上であるとよい。つまり、第1容器部11における任意の2つの壁面のなす角が90度以上であるとよい。これにより、検体及び核酸抽出試薬を第1容器部11に注入したときに、第1容器部11の内部空間の壁面に検体及び核酸抽出試薬が留まることを抑制することができる。 Since the liquid of the sample and the nucleic acid extraction reagent is injected into the first container portion 11 in this way, the angle of the corner portion on the wall surface of the internal space of the first container portion 11 is preferably 90 degrees or more. That is, it is preferable that the angle formed by any two wall surfaces in the first container portion 11 is 90 degrees or more. Thereby, when the sample and the nucleic acid extraction reagent are injected into the first container portion 11, it is possible to prevent the sample and the nucleic acid extraction reagent from staying on the wall surface of the internal space of the first container portion 11.

第1排出口31は、核酸抽出試薬によって核酸抽出対象物から抽出された核酸が含まれる核酸抽出液を容器10から排出するための核酸抽出液排出口である。本実施の形態において、第1排出口31は、第2容器部12の下壁に設けられている。 The first discharge port 31 is a nucleic acid extract discharge port for discharging the nucleic acid extract containing the nucleic acid extracted from the nucleic acid extraction target by the nucleic acid extraction reagent from the container 10. In the present embodiment, the first discharge port 31 is provided on the lower wall of the second container portion 12.

第1排出口31は、容器10の外部と第2容器部12の内部空間とを連通する配管である。具体的には、第1排出口31の一方の端部は、第2容器部12に接続され、第1排出口31の他方の端部は、配管を介して核酸抽出装置100に設置された回収容器400(核酸抽出液回収容器)に接続される。本実施の形態において、第1排出口31は、第2容器部12と一体的に形成されている。 The first discharge port 31 is a pipe that communicates the outside of the container 10 with the internal space of the second container portion 12. Specifically, one end of the first discharge port 31 was connected to the second container portion 12, and the other end of the first discharge port 31 was installed in the nucleic acid extraction device 100 via a pipe. It is connected to a recovery container 400 (nucleic acid extract recovery container). In the present embodiment, the first discharge port 31 is integrally formed with the second container portion 12.

第1排出口31から排出される核酸抽出液は、第1排出口31に接続された配管を通じて回収容器400に回収される。例えば、核酸抽出液は、送液ポンプ5によって容器10から回収容器400に送液されることで回収される。 The nucleic acid extract discharged from the first discharge port 31 is collected in the collection container 400 through a pipe connected to the first discharge port 31. For example, the nucleic acid extract is recovered by being pumped from the container 10 to the recovery container 400 by the liquid feed pump 5.

第2排出口32は、検体を容器10から排出するための検体排出口である。第2排出口32からは、容器10に注入された検体の廃液が排出される。つまり、第1容器部11から注入されて捕捉部40を通過した後の検体(ろ液)が第2排出口32から排出される。本実施の形態において、第2排出口32は、第2容器部12の側壁に設けられている。つまり、第2排出口32は、第1排出口31よりも捕捉部40に近い位置に設けられている。 The second discharge port 32 is a sample discharge port for discharging the sample from the container 10. The waste liquid of the sample injected into the container 10 is discharged from the second discharge port 32. That is, the sample (filter solution) that has been injected from the first container unit 11 and passed through the capture unit 40 is discharged from the second discharge port 32. In the present embodiment, the second discharge port 32 is provided on the side wall of the second container portion 12. That is, the second discharge port 32 is provided at a position closer to the catching portion 40 than the first discharge port 31.

また、第2排出口32の開口径(内径)は、第1排出口31の開口径(内径)の2倍以上であるとよい。一般的に、検体の廃液は大容量(例えば約100ml)で、核酸増幅のために回収される核酸抽出液は小容量(例えば約200μl)である。このため、本実施の形態のように、検体の廃液と核酸抽出液との排出経路を第1排出口31と第2排出口32とに分けるとともに、第2排出口32の開口径を第1排出口31の開口径の2倍以上とすることで、核酸抽出液が容器10の壁面に付着する等のロスを低減することができる。つまり、第1排出口31の開口径を小さくすることで、ロスが少なく核酸抽出液を排出することができる。例えば、第2排出口32の開口径は2mmであり、第1排出口31の開口径は0.5mmである。なお、第2排出口32の開口径は、第1排出口31の開口径の2倍以上でなくてもよく、第2排出口32の開口径は、第1排出口31の開口径と同じであってもよいし、第1排出口31の開口径よりも小さくてもよい。 Further, the opening diameter (inner diameter) of the second discharge port 32 is preferably twice or more the opening diameter (inner diameter) of the first discharge port 31. Generally, the waste liquid of the sample has a large volume (for example, about 100 ml), and the nucleic acid extract recovered for nucleic acid amplification has a small volume (for example, about 200 μl). Therefore, as in the present embodiment, the discharge route between the waste liquid of the sample and the nucleic acid extract is divided into the first discharge port 31 and the second discharge port 32, and the opening diameter of the second discharge port 32 is set to the first. By setting the opening diameter of the discharge port 31 to twice or more, it is possible to reduce losses such as the nucleic acid extract adhering to the wall surface of the container 10. That is, by reducing the opening diameter of the first discharge port 31, the nucleic acid extract can be discharged with less loss. For example, the opening diameter of the second discharge port 32 is 2 mm, and the opening diameter of the first discharge port 31 is 0.5 mm. The opening diameter of the second discharge port 32 does not have to be twice or more the opening diameter of the first discharge port 31, and the opening diameter of the second discharge port 32 is the same as the opening diameter of the first discharge port 31. It may be smaller than the opening diameter of the first discharge port 31.

第2排出口32は、容器10の外部と第2容器部12の内部空間とを連通する配管である。具体的には、第2排出口32の一方の端部は、第2容器部12に接続され、第2排出口32の他方の端部は、配管を介して核酸抽出装置100に設置された回収容器500(検体廃液回収容器)に接続される。本実施の形態において、第2排出口32は、第2容器部12と一体的に形成されている。 The second discharge port 32 is a pipe that communicates the outside of the container 10 with the internal space of the second container portion 12. Specifically, one end of the second discharge port 32 is connected to the second container part 12, and the other end of the second discharge port 32 is installed in the nucleic acid extraction device 100 via a pipe. It is connected to the collection container 500 (sample waste liquid collection container). In the present embodiment, the second discharge port 32 is integrally formed with the second container portion 12.

第2排出口32から排出される検体は、第2排出口32に接続された配管を通じて、回収容器500に回収される。例えば、検体の廃液は、真空ポンプ2によって容器10から回収容器500に送液されることで回収される。 The sample discharged from the second discharge port 32 is collected in the collection container 500 through the pipe connected to the second discharge port 32. For example, the waste liquid of the sample is collected by being sent from the container 10 to the collection container 500 by the vacuum pump 2.

捕捉部40は、第1注入口21から注入された検体に含まれる核酸抽出対象物を捕捉するための捕捉ユニットであり、少なくとも一部が容器10内に配置されている。本実施の形態において、捕捉部40は、検体に含まれる核酸抽出対象物をろ過によって捕捉する。 The capture unit 40 is a capture unit for capturing the nucleic acid extraction target contained in the sample injected from the first injection port 21, and at least a part thereof is arranged in the container 10. In the present embodiment, the capture unit 40 captures the nucleic acid extraction target contained in the sample by filtration.

捕捉部40は、核酸抽出対象物を捕捉して保持するための本体部41と、本体部41を支持する支持部42とを有する。捕捉部40は、本体部41が容器10の内部に位置するように容器10に固定されている。 The capture unit 40 has a main body portion 41 for capturing and holding the nucleic acid extraction target, and a support portion 42 for supporting the main body portion 41. The catching portion 40 is fixed to the container 10 so that the main body portion 41 is located inside the container 10.

本体部41は、板状の支持部42の上に載置されている。支持部42の本体部41に対応する中央部分には複数の貫通孔(目)が形成されている。つまり、支持部42は目皿である。また、支持部42の周辺部分は、第1容器部11と第2容器部12とで挟持されている。これにより、支持部42が容器10に固定されている。支持部42と第1容器部11と第2容器部12とは、例えば、4本のネジによって固定されている。 The main body 41 is placed on the plate-shaped support 42. A plurality of through holes (eyes) are formed in the central portion of the support portion 42 corresponding to the main body portion 41. That is, the support portion 42 is a perforated plate. Further, the peripheral portion of the support portion 42 is sandwiched between the first container portion 11 and the second container portion 12. As a result, the support portion 42 is fixed to the container 10. The support portion 42, the first container portion 11, and the second container portion 12 are fixed by, for example, four screws.

本実施の形態において、本体部41は、検体から核酸抽出対象物(微生物)をろ過して捕捉するためのフィルタ部である。具体的には、本体部41は、核酸抽出対象物の大きさより小さい微細な孔(目)を複数有するフィルタである。これにより。本体部41(フィルタ)によって、核酸抽出対象物を確実に捕捉することができる。本体部41の孔径は、例えば、0.45μmである。本体部41で捕捉された核酸抽出対象物は、本体部41上に保持される。また、本実施の形態では、核酸抽出対象物から抽出された核酸を本体部41に通過させるので、本体部41の孔の大きさは核酸の大きさよりも大きくしておくとよい。 In the present embodiment, the main body 41 is a filter for filtering and capturing a nucleic acid extraction target (microorganism) from a sample. Specifically, the main body 41 is a filter having a plurality of fine pores (eyes) smaller than the size of the nucleic acid extraction target. By this. The main body 41 (filter) can reliably capture the nucleic acid extraction target. The hole diameter of the main body 41 is, for example, 0.45 μm. The nucleic acid extraction target captured by the main body 41 is held on the main body 41. Further, in the present embodiment, since the nucleic acid extracted from the nucleic acid extraction target is passed through the main body 41, the pore size of the main body 41 may be made larger than the size of the nucleic acid.

本体部41としては、酢酸セルロース、ポリフッ化ビニリデン(PVDF:polyvinylidene difluoride)、ポリエーテルサルフォン(PES:polyethersulfone)、セルロースアセテート等の材質で作られたメンブレンフィルタ等を用いることができる。また、本体部41としては、検体に含まれる核酸抽出対象物を吸着させる機能を有する捕捉フィルタを用いてもよい。このような捕捉フィルタを用いることにより、検体から核酸抽出対象物を捕捉する速度を向上させることができる。なお、本実施の形態において、本体部41(フィルタ)は、平面状のフィルタであるが、これに限るものではなく、円筒状等のその他の形状のフィルタであってもよい。 As the main body 41, a membrane filter made of a material such as cellulose acetate, polyvinylidene fluoride (PVDF), polyethersulfone (PES), or cellulose acetate can be used. Further, as the main body 41, a capture filter having a function of adsorbing a nucleic acid extraction target contained in a sample may be used. By using such a capture filter, the rate of capturing the nucleic acid extraction target from the sample can be improved. In the present embodiment, the main body 41 (filter) is a flat filter, but the present invention is not limited to this, and a filter having another shape such as a cylindrical shape may be used.

支持部42の少なくとも一部は、アルミニウム等の金属材料又は高熱伝導性樹脂によって構成されているとよい。この場合、支持部42は、全部が金属材料又は高熱伝導性樹脂によって構成されていてもよい。支持部42の一部に金属材料を用いる場合、樹脂内に金属材料が埋め込まれたものでもよい。また、支持部42の表面は、親水性であるとよい。 At least a part of the support portion 42 may be made of a metal material such as aluminum or a high thermal conductive resin. In this case, the support portion 42 may be entirely made of a metal material or a high thermal conductive resin. When a metal material is used for a part of the support portion 42, the metal material may be embedded in the resin. Further, the surface of the support portion 42 is preferably hydrophilic.

真空ポンプ2は、容器10内の圧力を調整するための圧力調整部の一例である。本実施の形態において、真空ポンプ2の配管は、第2容器部12に接続されている。したがって、捕捉部40の上に液体が溜まっていて第2容器部12の内部空間が密閉されている場合、真空ポンプ2は、第2容器部12内の圧力を調整する。容器10内又は第2容器部12内の圧力は、真空ポンプ2の配管に設けられたリークバルブ6によって調整することができる。つまり、真空ポンプ2による減圧度は、リークバルブ6によって調整することができる。 The vacuum pump 2 is an example of a pressure adjusting unit for adjusting the pressure in the container 10. In the present embodiment, the piping of the vacuum pump 2 is connected to the second container portion 12. Therefore, when the liquid is accumulated on the trapping portion 40 and the internal space of the second container portion 12 is sealed, the vacuum pump 2 adjusts the pressure in the second container portion 12. The pressure in the container 10 or in the second container portion 12 can be adjusted by the leak valve 6 provided in the piping of the vacuum pump 2. That is, the degree of decompression by the vacuum pump 2 can be adjusted by the leak valve 6.

また、本実施の形態において、真空ポンプ2の配管は、第2排出口32に接続されている。つまり、真空ポンプ2の減圧口(減圧吸引口)は、第2容器部12に設けられた第2排出口32を兼ねている。 Further, in the present embodiment, the piping of the vacuum pump 2 is connected to the second discharge port 32. That is, the decompression port (decompression suction port) of the vacuum pump 2 also serves as the second discharge port 32 provided in the second container portion 12.

振動装置3は、容器10を振動させるための機能を有する。振動装置3によって容器10を振動させることで、容器10内の液体を撹拌させることができる。例えば、核酸抽出対象物が含まれる核酸抽出試薬を撹拌させることで核酸抽出反応を効果的に行うことができる。なお、振動装置3は、反応ボックス4に接触するように設けられている。 The vibrating device 3 has a function for vibrating the container 10. By vibrating the container 10 with the vibrating device 3, the liquid in the container 10 can be agitated. For example, the nucleic acid extraction reaction can be effectively carried out by stirring the nucleic acid extraction reagent containing the nucleic acid extraction target. The vibrating device 3 is provided so as to come into contact with the reaction box 4.

[核酸抽出方法]
次に、核酸抽出装置100を用いた核酸抽出方法について、図1を参照しながら、図5及び図6A〜図6Gを用いて説明する。図5は、実施の形態に係る核酸抽出方法のフローチャートである。図6A〜図6Gは、実施の形態に係る核酸抽出方法を説明するための模式断面図である。なお、図6A〜図6Gにおいては、第1注入口21及び第2注入口22(ゴム栓22a)については、検体210及び核酸抽出試薬の液の流れを分かりやすくするために正しい位置に図示されていない。
[Nucleic acid extraction method]
Next, the nucleic acid extraction method using the nucleic acid extraction device 100 will be described with reference to FIGS. 5 and 6A to 6G with reference to FIG. FIG. 5 is a flowchart of the nucleic acid extraction method according to the embodiment. 6A to 6G are schematic cross-sectional views for explaining the nucleic acid extraction method according to the embodiment. In FIGS. 6A to 6G, the first injection port 21 and the second injection port 22 (rubber stopper 22a) are shown at correct positions in order to make it easier to understand the flow of the liquids of the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent. Not.

本実施の形態における核酸抽出方法は、核酸抽出ユニット1を用いて検体に含まれる核酸抽出対象物から核酸を抽出する方法であり、図5に示すように、少なくとも、捕捉工程S1と、核酸抽出工程S2と、回収工程S3とを含む。 The nucleic acid extraction method in the present embodiment is a method of extracting nucleic acid from a nucleic acid extraction target contained in a sample by using the nucleic acid extraction unit 1, and as shown in FIG. 5, at least the capture step S1 and the nucleic acid extraction. A step S2 and a recovery step S3 are included.

捕捉工程S1は、捕捉部40に検体を通過させることによって検体に含まれる核酸抽出対象物を捕捉部40で捕捉する工程である。 The capture step S1 is a step in which the capture unit 40 captures the nucleic acid extraction target contained in the sample by passing the sample through the capture unit 40.

核酸抽出工程S2は、捕捉工程S1の後、捕捉部40に核酸抽出試薬を導入することによって捕捉部40で捕捉した核酸抽出対象物から核酸を抽出する工程である。 The nucleic acid extraction step S2 is a step of extracting nucleic acid from the nucleic acid extraction target captured by the capture unit 40 by introducing a nucleic acid extraction reagent into the capture unit 40 after the capture step S1.

回収工程S3は、核酸抽出工程S2の後、核酸抽出工程S2で抽出した核酸を含む核酸抽出液を、捕捉部40を通過させて回収する工程である。 The recovery step S3 is a step of recovering the nucleic acid extract containing the nucleic acid extracted in the nucleic acid extraction step S2 by passing it through the capture unit 40 after the nucleic acid extraction step S2.

以下、図6A〜図6Gを用いて、具体的な核酸抽出方法について説明する。 Hereinafter, a specific nucleic acid extraction method will be described with reference to FIGS. 6A to 6G.

[捕捉工程]
捕捉工程S1では、まず、図6Aに示すように、核酸抽出ユニット1に検体210を注入する。具体的には、核酸抽出対象物220を含む検体210(検体原液)が入った検体投入カップ200を核酸抽出装置100(図1参照)の所定の位置に設置して、検体投入カップ200から容器10に検体210に投入する。検体210を容器10に投入する際、第1排出口31に接続された配管に設けられたバルブ5aは閉じられている。バルブ5aは、例えば図1における送液ポンプ5に備えられているが、これに限るものではない。
[Capture process]
In the capture step S1, first, as shown in FIG. 6A, the sample 210 is injected into the nucleic acid extraction unit 1. Specifically, a sample charging cup 200 containing a sample 210 (sample stock solution) containing a nucleic acid extraction target 220 is installed at a predetermined position of the nucleic acid extraction device 100 (see FIG. 1), and a container is placed from the sample charging cup 200. 10 is charged into the sample 210. When the sample 210 is put into the container 10, the valve 5a provided in the pipe connected to the first discharge port 31 is closed. The valve 5a is provided in, for example, the liquid feed pump 5 in FIG. 1, but is not limited thereto.

検体210は、例えば、微生物を含む試料を滅菌希釈水等に懸濁することで作製することができる。検体210の溶液量は、例えば、10ml〜500mlであるが、これに限るものではない。なお、検体210に対しては、必要に応じて、固形成分を除去する等の前処理を行ってもよい。 The sample 210 can be prepared, for example, by suspending a sample containing a microorganism in sterile diluted water or the like. The amount of the solution of the sample 210 is, for example, 10 ml to 500 ml, but is not limited to this. If necessary, the sample 210 may be subjected to pretreatment such as removal of solid components.

検体投入カップ200から投入される検体210は、第1注入口21を介して第1容器部11に注入され、捕捉部40を通過して第2容器部12に流れる。 The sample 210 charged from the sample charging cup 200 is injected into the first container section 11 through the first injection port 21, passes through the capturing section 40, and flows into the second container section 12.

このとき、検体210は、捕捉部40によって濃縮される。つまり、検体210を捕捉部40に通過させることで検体210を濃縮することができる。 At this time, the sample 210 is concentrated by the capture unit 40. That is, the sample 210 can be concentrated by passing the sample 210 through the capture unit 40.

具体的には、検体210が捕捉部40を通過する際、検体210に含まれる核酸抽出対象物220が捕捉部40に捕捉される。本実施の形態において、検体210に含まれる核酸抽出対象物220は、捕捉部40の本体部41(フィルタ)を通過する際に本体部41に捕捉されて本体部41の上に留まる。 Specifically, when the sample 210 passes through the capture unit 40, the nucleic acid extraction target 220 contained in the sample 210 is captured by the capture unit 40. In the present embodiment, the nucleic acid extraction target 220 contained in the sample 210 is captured by the main body 41 when passing through the main body 41 (filter) of the capture unit 40 and stays on the main body 41.

図6Aに示すように、捕捉部40を通過した検体210(ろ液)は、廃液として第2排出口32を介して第2容器部12から排出され、核酸抽出装置100(図1参照)の所定の位置に設置された回収容器500に回収される。 As shown in FIG. 6A, the sample 210 (filter solution) that has passed through the capture unit 40 is discharged from the second container unit 12 as a waste liquid through the second discharge port 32, and is discharged from the nucleic acid extraction device 100 (see FIG. 1). It is collected in a collection container 500 installed at a predetermined position.

このとき、本実施の形態では、吸引ろ過によって検体210に含まれる核酸抽出対象物220を捕捉部40で捕捉している。具体的には、真空ポンプ2によって第1排出口31から容器10内の空気を排気(吸引)することで第2容器部12内を減圧して、第1容器部11内の圧力を第2容器部12内の圧力よりも高くする検体排出モードで第2容器部12内の圧力を調整している。このように容器10内の圧力を調整することで、容器10内に注入された検体210は、吸引されながら捕捉部40でろ過される。これにより、第1容器部11に注入された検体210を速やかに捕捉部40を通過させて第2容器部12に移動させることができるとともに、検体210の廃液を速やかに第2容器部12から排出させることができる。したがって、効率良く検体210を濃縮することができるとともに、検体210の廃液を速やかに容器10から排出させることができる。 At this time, in the present embodiment, the nucleic acid extraction target 220 contained in the sample 210 is captured by the capture unit 40 by suction filtration. Specifically, the vacuum pump 2 exhausts (sucks) the air in the container 10 from the first discharge port 31 to reduce the pressure in the second container portion 12 and reduce the pressure in the first container portion 11 to the second. The pressure inside the second container portion 12 is adjusted in the sample discharge mode in which the pressure is higher than the pressure inside the container portion 12. By adjusting the pressure in the container 10 in this way, the sample 210 injected into the container 10 is filtered by the capture unit 40 while being sucked. As a result, the sample 210 injected into the first container section 11 can be quickly passed through the capture section 40 and moved to the second container section 12, and the waste liquid of the sample 210 can be quickly moved from the second container section 12. Can be discharged. Therefore, the sample 210 can be efficiently concentrated, and the waste liquid of the sample 210 can be quickly discharged from the container 10.

なお、検体210を濃縮する際は、さらに、検体210を上部から加圧するとよい。これにより、さらに効率良く検体210を濃縮することができる。例えば、検体投入カップ200内の検体210の上部の空間領域を加圧するとよい。 When concentrating the sample 210, the sample 210 may be further pressurized from above. As a result, the sample 210 can be concentrated more efficiently. For example, the space area above the sample 210 in the sample charging cup 200 may be pressurized.

このように、検体210を容器10に注入して排出させると、図6Bに示すように、捕捉部40の本体部41の上には、本体部41で捕捉された核酸抽出対象物220が溜まることになる。 When the sample 210 is injected into the container 10 and discharged in this way, as shown in FIG. 6B, the nucleic acid extraction target 220 captured by the main body 41 accumulates on the main body 41 of the capture unit 40. It will be.

このようにして、捕捉工程S1では、捕捉部40に検体210を通過させることによって検体210に含まれる核酸抽出対象物220を捕捉部40で捕捉させている。 In this way, in the capture step S1, the capture unit 40 is allowed to capture the nucleic acid extraction target 220 contained in the sample 210 by passing the sample 210 through the capture unit 40.

なお、検体210を捕捉部40に通過させた後は、必要に応じて、さらに滅菌希釈水を第1注入口21等から第1容器部11に導入して捕捉部40を通過させることで核酸抽出対象物220を洗浄することができる。 After passing the sample 210 through the capture unit 40, if necessary, sterilized diluted water is further introduced into the first container unit 11 from the first injection port 21 or the like and passed through the capture unit 40 to pass the nucleic acid. The extraction target 220 can be washed.

[核酸抽出工程]
核酸抽出工程S2では、捕捉部40で捕捉した核酸抽出対象物220から核酸230を抽出する。
[Nucleic acid extraction process]
In the nucleic acid extraction step S2, the nucleic acid 230 is extracted from the nucleic acid extraction target 220 captured by the capture unit 40.

具体的には、まず、図6Cに示すように、核酸抽出装置100(図1参照)の所定の位置に設置された核酸抽出試薬容器300から容器10に核酸抽出試薬310を投入する。核酸抽出試薬310としては、例えば、簡易DNA抽出キット(株式会社カネカ)又はセルイーズ(Biocosm株式会社)を用いることができる。注入する核酸抽出試薬310の量は、例えば50μl〜200μlである。なお、核酸抽出試薬310を容器10に投入する際、第1排出口31に接続された配管のバルブ5aは閉じられたままである。 Specifically, first, as shown in FIG. 6C, the nucleic acid extraction reagent 310 is charged into the container 10 from the nucleic acid extraction reagent container 300 installed at a predetermined position of the nucleic acid extraction device 100 (see FIG. 1). As the nucleic acid extraction reagent 310, for example, a simple DNA extraction kit (Kaneka Corporation) or Celeas (Biocosm Co., Ltd.) can be used. The amount of the nucleic acid extraction reagent 310 to be injected is, for example, 50 μl to 200 μl. When the nucleic acid extraction reagent 310 is charged into the container 10, the valve 5a of the pipe connected to the first discharge port 31 remains closed.

核酸抽出試薬容器300から投入される核酸抽出試薬310は、第2注入口22を介して第1容器部11に注入される。具体的には、核酸抽出試薬容器300の針を第2注入口22(貫通孔)に設けられたゴム栓22aに貫通させて、核酸抽出試薬容器300から第1容器部11内に核酸抽出試薬310を注入する。なお、核酸抽出試薬310を容器10に注入する前に、死菌の不活性処理試薬等を容器10内に注入してもよい。 The nucleic acid extraction reagent 310 charged from the nucleic acid extraction reagent container 300 is injected into the first container section 11 via the second injection port 22. Specifically, the needle of the nucleic acid extraction reagent container 300 is passed through the rubber stopper 22a provided in the second injection port 22 (through hole), and the nucleic acid extraction reagent is penetrated from the nucleic acid extraction reagent container 300 into the first container portion 11. Inject 310. Before injecting the nucleic acid extraction reagent 310 into the container 10, an inert treatment reagent for killed bacteria or the like may be injected into the container 10.

容器10内に核酸抽出試薬310を注入して静置すると、捕捉部40に捕捉された核酸抽出対象物220が核酸抽出試薬310に反応する。これにより、核酸抽出対象物220から核酸230を抽出することができる。つまり、核酸抽出対象物220から核酸230が抽出される核酸抽出反応が行われる。つまり、核酸抽出対象物220の細胞膜と核酸230とが分離される。具体的には、図6Dに示すように、核酸抽出対象物220から核酸抽出試薬310に核酸230が溶出し、核酸230が含まれる核酸抽出液320が生成される。 When the nucleic acid extraction reagent 310 is injected into the container 10 and allowed to stand, the nucleic acid extraction target 220 captured by the capture unit 40 reacts with the nucleic acid extraction reagent 310. Thereby, the nucleic acid 230 can be extracted from the nucleic acid extraction target 220. That is, a nucleic acid extraction reaction is performed in which the nucleic acid 230 is extracted from the nucleic acid extraction target 220. That is, the cell membrane of the nucleic acid extraction target 220 and the nucleic acid 230 are separated. Specifically, as shown in FIG. 6D, the nucleic acid 230 is eluted from the nucleic acid extraction target 220 into the nucleic acid extraction reagent 310 to generate a nucleic acid extract 320 containing the nucleic acid 230.

なお、核酸抽出試薬310を容器10に注入して核酸抽出対象物220と核酸抽出試薬310とを混合させた後、適宜加熱してもよい。これにより、核酸抽出試薬310と核酸抽出対象物220との反応を促進させて核酸230を効率良く溶出させることができるので、核酸230の抽出を効率良く行うことができる。この場合、例えば、図1に示される加熱冷却ユニット7によって容器10を加熱することで核酸抽出試薬310を加熱することができる。加熱冷却ユニット7は、例えば、核酸抽出装置100の反応ボックス4に設けられており、例えば容器10及び捕捉部40の支持部42に接続されている。加熱冷却ユニット7としては、例えばペルチェ素子等を用いることができる。 The nucleic acid extraction reagent 310 may be injected into the container 10 to mix the nucleic acid extraction target 220 and the nucleic acid extraction reagent 310, and then appropriately heated. As a result, the reaction between the nucleic acid extraction reagent 310 and the nucleic acid extraction target 220 can be promoted to efficiently elute the nucleic acid 230, so that the nucleic acid 230 can be extracted efficiently. In this case, for example, the nucleic acid extraction reagent 310 can be heated by heating the container 10 with the heating / cooling unit 7 shown in FIG. The heating / cooling unit 7 is provided in, for example, the reaction box 4 of the nucleic acid extraction device 100, and is connected to, for example, the container 10 and the support portion 42 of the capture portion 40. As the heating / cooling unit 7, for example, a Peltier element or the like can be used.

また、核酸抽出対象物220と核酸抽出試薬310とを混合させた後に、振動装置3によって容器10を振動させて核酸抽出試薬310を撹拌させるとよい。これにより、核酸230の抽出をさらに効率良く行うことができる。 Further, after mixing the nucleic acid extraction target 220 and the nucleic acid extraction reagent 310, the container 10 may be vibrated by the vibrating device 3 to stir the nucleic acid extraction reagent 310. As a result, the extraction of nucleic acid 230 can be performed more efficiently.

このように、本実施の形態では、捕捉部40に核酸抽出試薬310を導入することによって核酸抽出対象物220の核酸抽出反応が行われ、核酸抽出対象物220から核酸230が抽出される。これにより、抽出された核酸230を含む核酸抽出液320が生成される。 As described above, in the present embodiment, the nucleic acid extraction reaction of the nucleic acid extraction target 220 is performed by introducing the nucleic acid extraction reagent 310 into the capture unit 40, and the nucleic acid 230 is extracted from the nucleic acid extraction target 220. As a result, a nucleic acid extract 320 containing the extracted nucleic acid 230 is generated.

このとき、図6Dに示すように、核酸抽出対象物220の核酸抽出反応は、容器10に注入された核酸抽出試薬310を捕捉部40の上に保持させて行うとよい。核酸抽出試薬310を捕捉部40の上に保持させることで、核酸抽出試薬310が捕捉部40の上に滞留する。この結果、核酸抽出対象物220が核酸抽出試薬310に一定時間浸されることになる。これにより、核酸230を溶出させやすくできるので、核酸230の抽出(溶出)を効率良く行うことができる。 At this time, as shown in FIG. 6D, the nucleic acid extraction reaction of the nucleic acid extraction target 220 may be carried out by holding the nucleic acid extraction reagent 310 injected into the container 10 on the capture unit 40. By holding the nucleic acid extraction reagent 310 on the capture unit 40, the nucleic acid extraction reagent 310 stays on the capture unit 40. As a result, the nucleic acid extraction target 220 is immersed in the nucleic acid extraction reagent 310 for a certain period of time. As a result, the nucleic acid 230 can be easily eluted, so that the nucleic acid 230 can be efficiently extracted (eluted).

核酸抽出試薬310を捕捉部40の上に保持させる場合、真空ポンプ2は、核酸抽出試薬310を捕捉部40の上に保持させる核酸抽出試薬保持モードで第2容器部12内の圧力を調整するとよい。具体的には、真空ポンプ2によって第2容器部12内を加圧して第2容器部12内の圧力を第1容器部11内の圧力よりも高くすればよい。これにより、容器10に注入された核酸抽出試薬310を捕捉部40上に保持させることができる。 When the nucleic acid extraction reagent 310 is held on the capture unit 40, the vacuum pump 2 adjusts the pressure in the second container unit 12 in the nucleic acid extraction reagent holding mode in which the nucleic acid extraction reagent 310 is held on the capture unit 40. Good. Specifically, the inside of the second container portion 12 may be pressurized by the vacuum pump 2 so that the pressure inside the second container portion 12 is higher than the pressure inside the first container portion 11. As a result, the nucleic acid extraction reagent 310 injected into the container 10 can be held on the capture unit 40.

この場合、捕捉部40の本体部41としては、通常時(第2容器部12を加圧していない時)に核酸抽出試薬310が本体部41を通過するようなフィルタを用いることができる。 In this case, as the main body 41 of the capture unit 40, a filter can be used so that the nucleic acid extraction reagent 310 passes through the main body 41 in the normal state (when the second container 12 is not pressurized).

[回収工程]
核酸抽出試薬310の注入が完了して捕捉部40上の核酸抽出対象物220の核酸抽出反応が完了した後は、真空ポンプ2による第2容器部12内の加圧を停止することで、図6Eに示すように、捕捉部40上に滞留している核酸抽出液320を、捕捉部40を通過させて第2容器部12に移動させることができる。例えば、リークバルブ6を開放することで、第2容器部12内を常圧にしたり、検体排出モード時の減圧度よりも低い減圧度となるように第2容器部12内の圧力を調整したりすればよい。
[Recovery process]
After the injection of the nucleic acid extraction reagent 310 is completed and the nucleic acid extraction reaction of the nucleic acid extraction target 220 on the capture unit 40 is completed, the pressurization in the second container unit 12 by the vacuum pump 2 is stopped. As shown in 6E, the nucleic acid extract 320 staying on the capture unit 40 can be moved to the second container unit 12 through the capture unit 40. For example, by opening the leak valve 6, the pressure inside the second container 12 can be adjusted to normal pressure, or the pressure inside the second container 12 can be adjusted so that the pressure is lower than the pressure reduced in the sample discharge mode. You can do it.

なお、核酸抽出試薬310を捕捉部40の上に保持させる方法としては、上記のような第2容器部12内の圧力を調整する方法に限るものではない。例えば、核酸抽出試薬保持モードを実行する代わりに、捕捉部40の本体部41として、第2容器部12内を減圧していない時に核酸抽出試薬310が本体部41上に保持されるようなフィルタを用いることでも実現できる。 The method of holding the nucleic acid extraction reagent 310 on the trapping unit 40 is not limited to the method of adjusting the pressure in the second container unit 12 as described above. For example, instead of executing the nucleic acid extraction reagent holding mode, as the main body 41 of the capture unit 40, a filter such that the nucleic acid extraction reagent 310 is held on the main body 41 when the inside of the second container 12 is not depressurized. It can also be realized by using.

この場合、図示しないが、捕捉部40の上に保持させた核酸抽出試薬310によって捕捉部40上の核酸抽出対象物220の核酸抽出反応が完了した後は、真空ポンプ2によって第2容器部12内を減圧して第1容器部11内の圧力を第2容器部12内の圧力よりも高くすればよい。これにより、核酸抽出反応が完了して捕捉部40上に滞留している核酸抽出液320を第2容器部12に移動させることができる。つまり、圧力差を利用して核酸抽出液320を第2容器部12に移動させることができる。このように、真空ポンプ2によって第2容器部12内を減圧して第1容器部11内の圧力を第2容器部12内の圧力よりも高くすることで、捕捉部40における核酸抽出液320を捕捉部40を介して第2容器部12に移動させる核酸抽出液移動モードで第2容器部12内の圧力を調整するとよい。 In this case, although not shown, after the nucleic acid extraction reaction of the nucleic acid extraction target 220 on the capture unit 40 is completed by the nucleic acid extraction reagent 310 held on the capture unit 40, the second container unit 12 is operated by the vacuum pump 2. The pressure inside the first container portion 11 may be reduced to be higher than the pressure inside the second container portion 12. As a result, the nucleic acid extract 320 that has completed the nucleic acid extraction reaction and remains on the capture unit 40 can be moved to the second container unit 12. That is, the nucleic acid extract 320 can be moved to the second container portion 12 by utilizing the pressure difference. In this way, the pressure inside the second container portion 12 is reduced by the vacuum pump 2 to make the pressure inside the first container portion 11 higher than the pressure inside the second container portion 12, so that the nucleic acid extract 320 in the capture unit 40 It is preferable to adjust the pressure in the second container portion 12 in the nucleic acid extract moving mode in which the is moved to the second container portion 12 via the trapping portion 40.

このとき、核酸抽出液移動モードにおける真空ポンプ2による減圧度は、上記の検体210を排出させる検体排出モードにおける真空ポンプ2による減圧度よりも低くするとよい。 At this time, the degree of decompression by the vacuum pump 2 in the nucleic acid extract transfer mode may be lower than the degree of decompression by the vacuum pump 2 in the sample discharge mode in which the sample 210 is discharged.

なお、検体排出モード及び核酸抽出液移動モードにおいて第2容器部12に遠心力がかかるように制御してもよい。これにより、検体210及び核酸抽出液320を効果的に回収することができる。 The second container portion 12 may be controlled so that a centrifugal force is applied in the sample discharge mode and the nucleic acid extract movement mode. As a result, the sample 210 and the nucleic acid extract 320 can be effectively recovered.

次に、図6Fに示すように、核酸230が含まれる核酸抽出液320が全て第2容器部12に移動した後は、図6Gに示すように、第1排出口31に接続された配管のバルブ5aを開けることによって核酸抽出液320を回収する。 Next, as shown in FIG. 6F, after all the nucleic acid extract 320 containing the nucleic acid 230 has moved to the second container portion 12, as shown in FIG. 6G, the pipe connected to the first discharge port 31 The nucleic acid extract 320 is recovered by opening the valve 5a.

具体的には、核酸230が含まれる核酸抽出液320を第1排出口31を介して第2容器部12から排出し、核酸抽出装置100(図1参照)の所定の位置に設置された回収容器400に核酸抽出液320を回収する。例えば、第2容器部12内の核酸抽出液320は、送液ポンプ5によって回収容器400に送液されて回収される。 Specifically, the nucleic acid extract 320 containing the nucleic acid 230 is discharged from the second container portion 12 via the first discharge port 31, and is collected at a predetermined position of the nucleic acid extraction device 100 (see FIG. 1). The nucleic acid extract 320 is collected in the container 400. For example, the nucleic acid extract 320 in the second container portion 12 is sent to the recovery container 400 by the liquid feed pump 5 and collected.

その後、図示しないが、回収した核酸抽出液320を用いて核酸検査(核酸分析)を行う。この場合、核酸230を検査する方法に合わせて核酸抽出液320に核酸検査試薬を混合させて検査溶液を得る。例えば、PCR法によって核酸検査を行う場合、核酸検査試薬として、PCR試薬を用いる。PCR試薬には、例えば、核酸230の量を蛍光発光強度で検査するための核酸染色蛍光試薬及び核酸を増幅させるための反応試薬等が含まれている。反応試薬は、例えば、PCRプライマやポリメラーゼ酵素、バッファー等である。 Then, although not shown, a nucleic acid test (nucleic acid analysis) is performed using the recovered nucleic acid extract 320. In this case, a nucleic acid test reagent is mixed with the nucleic acid extract 320 according to the method for testing the nucleic acid 230 to obtain a test solution. For example, when a nucleic acid test is performed by the PCR method, a PCR reagent is used as the nucleic acid test reagent. The PCR reagent includes, for example, a nucleic acid-staining fluorescent reagent for examining the amount of nucleic acid 230 by fluorescence emission intensity, a reaction reagent for amplifying nucleic acid, and the like. The reaction reagent is, for example, a PCR primer, a polymerase enzyme, a buffer, or the like.

PCR法による核酸検査は、例えば、検査流路であるマイクロ流路が形成された検査チップ(PCRチップ等)を用いて行うことができる。この場合、例えば、核酸抽出液320と核酸検査試薬との混合溶液を検査チップに導入してフローPCRによって核酸230を増幅し、光学検出装置によって増幅された核酸230を測定することで、核酸抽出対象物220(微生物)を同定することができる。 The nucleic acid test by the PCR method can be performed, for example, by using a test chip (PCR chip or the like) in which a microchannel, which is a test channel, is formed. In this case, for example, nucleic acid extraction is performed by introducing a mixed solution of the nucleic acid extract 320 and the nucleic acid test reagent into the test chip, amplifying the nucleic acid 230 by flow PCR, and measuring the nucleic acid 230 amplified by the optical detection device. The object 220 (nucleic acid) can be identified.

このように、本実施の形態における核酸抽出方法は、核酸検査方法に利用することができる。この場合、PCR法によって核酸230を検査することで、高感度及び高精度で核酸230の同定が可能となる。 As described above, the nucleic acid extraction method in the present embodiment can be used as a nucleic acid test method. In this case, by examining the nucleic acid 230 by the PCR method, the nucleic acid 230 can be identified with high sensitivity and high accuracy.

[まとめ]
以上、本実施の形態に係る核酸抽出装置100によれば、検体210から核酸230を抽出するための核酸抽出ユニット1を備える。核酸抽出ユニット1は、容器10と、容器10内に検体を注入するための第1注入口21と、容器10内に配置され、第1注入口21から注入された検体210に含まれる核酸抽出対象物220を捕捉する捕捉部40と、捕捉部40で捕捉された核酸抽出対象物220から核酸230を抽出するための核酸抽出試薬310を容器10内に注入するための第2注入口22と、核酸抽出試薬310によって核酸抽出対象物220から抽出された核酸230が含まれる核酸抽出液320を容器10から排出するための第1排出口31と、検体210を容器10から排出するための第2排出口32とを有する。そして、容器10は、捕捉部40を境界として容器10の内部空間を分割する第1容器部11と第2容器部12とを有し、第1注入口21及び第2注入口22は、第1容器部11に設けられており、第1排出口31及び第2排出口32は、第2容器部12に設けられている。
[Summary]
As described above, according to the nucleic acid extraction device 100 according to the present embodiment, the nucleic acid extraction unit 1 for extracting the nucleic acid 230 from the sample 210 is provided. The nucleic acid extraction unit 1 is arranged in the container 10, the first injection port 21 for injecting a sample into the container 10, and the nucleic acid extraction contained in the sample 210 injected from the first injection port 21. A capture unit 40 that captures the object 220, and a second injection port 22 for injecting a nucleic acid extraction reagent 310 for extracting nucleic acid 230 from the nucleic acid extraction target 220 captured by the capture unit 40 into the container 10. A first discharge port 31 for discharging the nucleic acid extract 320 containing the nucleic acid 230 extracted from the nucleic acid extraction target 220 by the nucleic acid extraction reagent 310 from the container 10, and a first discharge port 31 for discharging the sample 210 from the container 10. It has two discharge ports 32. The container 10 has a first container portion 11 and a second container portion 12 that divide the internal space of the container 10 with the catching portion 40 as a boundary, and the first injection port 21 and the second injection port 22 are second. 1 The container portion 11 is provided, and the first discharge port 31 and the second discharge port 32 are provided in the second container portion 12.

これにより、上部の第1容器部11に検体210と核酸抽出試薬310とを注入することができるとともに、捕捉部40を介して下部の第2容器部12から廃液の検体210と核酸抽出液320とを排出することができる。これにより、同じ容器10を用いて検体210の濃縮と核酸230の抽出とを行った上で核酸230を含む核酸抽出液320を簡便に回収することができる。また、核酸抽出工程中に容器を移し替えることなく作業を行うことができるので、核酸抽出液320に不純物が混入することを抑制できる。しかも、上部の第1容器部11から下部の第2容器部12に検体210が流れるので、検体210から核酸抽出対象物220を捕捉部40で容易に捕捉することもできる。このように、本実施の形態によれば、作業性が簡便で、核酸抽出液320に不純物が混入するリスクを大幅に軽減することができる。これにより、高感度及び高精度で核酸230を抽出することができる。したがって、核酸抽出液320を用いた検査の精度を向上させることができる。 As a result, the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310 can be injected into the upper first container portion 11, and the waste liquid sample 210 and the nucleic acid extract 320 can be injected from the lower second container portion 12 via the capture unit 40. And can be discharged. As a result, the nucleic acid extract 320 containing the nucleic acid 230 can be easily recovered after concentrating the sample 210 and extracting the nucleic acid 230 using the same container 10. Further, since the work can be performed without transferring the container during the nucleic acid extraction step, it is possible to prevent impurities from being mixed in the nucleic acid extract 320. Moreover, since the sample 210 flows from the upper first container portion 11 to the lower second container portion 12, the nucleic acid extraction target 220 can be easily captured by the capture unit 40 from the sample 210. As described above, according to the present embodiment, the workability is simple and the risk of impurities being mixed in the nucleic acid extract 320 can be significantly reduced. As a result, nucleic acid 230 can be extracted with high sensitivity and high accuracy. Therefore, the accuracy of the test using the nucleic acid extract 320 can be improved.

また、本実施の形態において、核酸抽出装置100は、さらに、第2容器部12内の圧力を調整するための圧力調整部として真空ポンプ2を備えている。また、捕捉部40は、本体部41として、核酸抽出対象物220より小さい孔を複数有するフィルタを有する。そして、第2排出口32は、第1排出口31よりも捕捉部40に近い位置に設けられており、かつ、真空ポンプ2の減圧口を兼ねている。 Further, in the present embodiment, the nucleic acid extraction device 100 further includes a vacuum pump 2 as a pressure adjusting unit for adjusting the pressure in the second container unit 12. Further, the capture unit 40 has a filter having a plurality of pores smaller than the nucleic acid extraction target 220 as the main body unit 41. The second discharge port 32 is provided at a position closer to the capture unit 40 than the first discharge port 31, and also serves as a decompression port of the vacuum pump 2.

これにより、検査に必要な核酸抽出液320と廃液となる検体210とを同じ第2容器部12から排出する構成でありながらも、核酸抽出液320を効率良く回収することができる。 As a result, the nucleic acid extract 320 can be efficiently recovered even though the nucleic acid extract 320 required for the test and the sample 210 to be waste liquid are discharged from the same second container portion 12.

また、本実施の形態において、真空ポンプ2は、第2容器部12内を減圧して第1容器部11内の圧力を第2容器部12内の圧力よりも高くすることで、注入された検体210を第1容器部11から捕捉部40を通過させて第2容器部12に移動させる検体排出モードと、第2容器部12内を減圧して第1容器部11内の圧力を第2容器部12内の圧力よりも高くすることで、捕捉部40における核酸抽出液320を捕捉部40を介して第2容器部12に移動させる核酸抽出液移動モードとで第2容器部12内の圧力を調整する。この場合、核酸抽出液移動モードにおける真空ポンプ2による減圧度は、検体排出モードにおける真空ポンプ2による減圧度よりも低くしている。 Further, in the present embodiment, the vacuum pump 2 is injected by reducing the pressure in the second container portion 12 and making the pressure in the first container portion 11 higher than the pressure in the second container portion 12. A sample discharge mode in which the sample 210 is moved from the first container section 11 through the capture section 40 to the second container section 12, and the pressure inside the second container section 12 is reduced to reduce the pressure inside the first container section 11. In the nucleic acid extract moving mode in which the nucleic acid extract 320 in the trapping unit 40 is moved to the second container 12 via the trapping unit 40 by making the pressure higher than the pressure in the container portion 12, the pressure in the second container portion 12 Adjust the pressure. In this case, the degree of decompression by the vacuum pump 2 in the nucleic acid extract transfer mode is lower than the degree of decompression by the vacuum pump 2 in the sample discharge mode.

これにより、簡便な構造で、効率良く核酸抽出液320を回収することができる。 As a result, the nucleic acid extract 320 can be efficiently recovered with a simple structure.

また、本実施の形態において、真空ポンプ2は、第2容器部12内を加圧して第2容器部12内の圧力を第1容器部11内の圧力よりも高くすることで、容器10に注入された核酸抽出試薬310を捕捉部40上に保持させる核酸抽出試薬保持モードで第2容器部12内の圧力を調整している。 Further, in the present embodiment, the vacuum pump 2 pressurizes the inside of the second container portion 12 to make the pressure in the second container portion 12 higher than the pressure in the first container portion 11, thereby forming the container 10. The pressure inside the second container unit 12 is adjusted in the nucleic acid extraction reagent holding mode in which the injected nucleic acid extraction reagent 310 is held on the capture unit 40.

これにより、第2容器部12内の圧力を調整して捕捉部40上に核酸抽出試薬310を保持させた状態で核酸抽出反応を行うことができるので、核酸抽出液320を効率良く回収することができる。 As a result, the nucleic acid extraction reaction can be carried out in a state where the nucleic acid extraction reagent 310 is held on the capture unit 40 by adjusting the pressure in the second container unit 12, so that the nucleic acid extract 320 can be efficiently recovered. Can be done.

また、本実施の形態において、第2注入口22は、第1容器部11に設けられた貫通孔であり、貫通孔には、当該貫通孔を塞ぐゴム栓22aが設けられており、ゴム栓22aは、核酸抽出試薬310を第1容器部11内に注入するための針が貫通可能なゴム材料によって構成されている。 Further, in the present embodiment, the second injection port 22 is a through hole provided in the first container portion 11, and the through hole is provided with a rubber stopper 22a for closing the through hole. The 22a is made of a rubber material through which a needle for injecting the nucleic acid extraction reagent 310 into the first container portion 11 can penetrate.

これにより、容器10に注入された検体210及び核酸抽出試薬310が容器10から蒸発したり攪拌時に容器10から漏れたりすることを低減することができる。 Thereby, it is possible to reduce that the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310 injected into the container 10 evaporate from the container 10 or leak from the container 10 at the time of stirring.

また、本実施の形態において、捕捉部40は、検体210に含まれる核酸抽出対象物220を捕捉して保持するための本体部41と、本体部41を支持する支持部42とを有している。 Further, in the present embodiment, the capture unit 40 has a main body portion 41 for capturing and holding the nucleic acid extraction target 220 contained in the sample 210, and a support portion 42 for supporting the main body portion 41. There is.

これにより、本体部41において検体210に含まれる核酸抽出対象物220を捕捉することができる。 As a result, the nucleic acid extraction target 220 contained in the sample 210 can be captured in the main body 41.

この場合、支持部42の少なくとも一部は、金属によって構成されているとよい。あるいは、支持部42の少なくとも一部は、高熱伝導性樹脂によって構成されていてもよい。 In this case, at least a part of the support portion 42 may be made of metal. Alternatively, at least a part of the support portion 42 may be made of a high thermal conductive resin.

これにより、支持部42に接続された加熱冷却ユニット7によって、本体部41上の検体210、核酸抽出対象物220又は核酸抽出試薬310を効率良く加熱したり冷却したりすることができる。 As a result, the heating / cooling unit 7 connected to the support portion 42 can efficiently heat or cool the sample 210, the nucleic acid extraction target 220, or the nucleic acid extraction reagent 310 on the main body 41.

また、支持部42が高熱伝導性樹脂によって構成されていて金属によって構成されていない場合には、金属そのもの又は金属の腐食によって検査が阻害されることを低減することができる。 Further, when the support portion 42 is made of a high thermal conductive resin and is not made of a metal, it is possible to reduce that the inspection is hindered by the metal itself or the corrosion of the metal.

また、捕捉部40の支持部42の表面は、親水性であるとよい。 Further, the surface of the support portion 42 of the capture portion 40 is preferably hydrophilic.

これにより、検体210から核酸抽出対象物220を捕捉する速度を向上させることができる。つまり、検体210から核酸抽出対象物220を捕捉するのに要する時間を短縮することができる。 Thereby, the speed of capturing the nucleic acid extraction target 220 from the sample 210 can be improved. That is, the time required to capture the nucleic acid extraction target 220 from the sample 210 can be shortened.

また、本実施の形態において、容器10の少なくとも一部は、高熱伝導性樹脂によって構成されているとよい。 Further, in the present embodiment, it is preferable that at least a part of the container 10 is made of a highly thermally conductive resin.

これにより、容器10に接続された加熱冷却ユニット7によって、本体部41上の検体210、核酸抽出対象物220又は核酸抽出試薬310を効率良く加熱したり冷却したりすることができる。また、容器10として金属を用いないことで、金属そのもの又は金属の腐食によって検査が阻害されることを低減することができる。 As a result, the heating / cooling unit 7 connected to the container 10 can efficiently heat or cool the sample 210, the nucleic acid extraction target 220, or the nucleic acid extraction reagent 310 on the main body 41. Further, by not using a metal as the container 10, it is possible to reduce that the inspection is hindered by the metal itself or the corrosion of the metal.

また、本実施の形態において、第1容器部11の内部空間の壁面における角部分の角度は、90度以上であるとよい。 Further, in the present embodiment, the angle of the corner portion on the wall surface of the internal space of the first container portion 11 is preferably 90 degrees or more.

これにより、検体210及び核酸抽出試薬310を第1容器部11に注入したときに、第1容器部11の内部空間の壁面に検体210及び核酸抽出試薬310が留まることを抑制することができる。つまり、検体210及び核酸抽出試薬310の液ロスを低減できる。 As a result, when the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310 are injected into the first container portion 11, it is possible to prevent the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310 from staying on the wall surface of the internal space of the first container portion 11. That is, the liquid loss of the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310 can be reduced.

また、本実施の形態において、容器10の内面は、非親水性であるとよい。 Further, in the present embodiment, the inner surface of the container 10 is preferably non-hydrophilic.

これにより、検体210及び核酸抽出試薬310を第1容器部11に注入したときに、第1容器部11の内部空間の壁面に検体210及び核酸抽出試薬310が付着することを抑制することができる。つまり、検体210及び核酸抽出試薬310の液ロスを低減できる。 As a result, when the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310 are injected into the first container portion 11, it is possible to prevent the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310 from adhering to the wall surface of the internal space of the first container portion 11. .. That is, the liquid loss of the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310 can be reduced.

また、本実施の形態において、核酸抽出装置100は、さらに、容器10を振動させるための振動装置3を備えている。 Further, in the present embodiment, the nucleic acid extraction device 100 further includes a vibration device 3 for vibrating the container 10.

これにより、核酸抽出試薬310と核酸抽出対象物220とを撹拌混合させることができるので核酸230の抽出を効率良く行うことができるとともに、第1容器部11の内部空間の壁面に検体210及び核酸抽出試薬310が付着することを抑制することができる。 As a result, the nucleic acid extraction reagent 310 and the nucleic acid extraction target 220 can be agitated and mixed, so that the nucleic acid 230 can be efficiently extracted, and the sample 210 and the nucleic acid are placed on the wall surface of the internal space of the first container portion 11. It is possible to suppress the adhesion of the extraction reagent 310.

また、本実施の形態における核酸抽出方法は、捕捉部40に検体210を通過させることによって検体210に含まれる核酸抽出対象物220を捕捉部40で捕捉する捕捉工程S1と、捕捉部40に核酸抽出試薬310を導入することによって捕捉部40で捕捉した核酸抽出対象物220から核酸230を抽出する核酸抽出工程S2と、抽出した核酸230を含む核酸抽出液320を捕捉部40を通過させて回収する回収工程S3とを含む。 Further, in the nucleic acid extraction method in the present embodiment, the capture step S1 in which the capture unit 40 captures the nucleic acid extraction target 220 contained in the sample 210 by passing the sample 210 through the capture unit 40, and the nucleic acid in the capture unit 40. The nucleic acid extraction step S2 for extracting the nucleic acid 230 from the nucleic acid extraction target 220 captured by the capture unit 40 by introducing the extraction reagent 310, and the nucleic acid extract 320 containing the extracted nucleic acid 230 are passed through the capture unit 40 and collected. The recovery step S3 is included.

これにより、作業性が簡便で、核酸抽出液320に不純物が混入するリスクを大幅に軽減することができる。したがって、高感度及び高精度で核酸230を抽出することができる。 As a result, workability is simple, and the risk of impurities being mixed in the nucleic acid extract 320 can be significantly reduced. Therefore, the nucleic acid 230 can be extracted with high sensitivity and high accuracy.

(変形例)
以上、本発明に係る核酸抽出装置100、核酸抽出ユニット1及び核酸抽出方法等について、実施の形態に基づいて説明したが、本発明は、上記実施の形態に限定されるものではない。
(Modification example)
The nucleic acid extraction device 100, the nucleic acid extraction unit 1, the nucleic acid extraction method, and the like according to the present invention have been described above based on the embodiments, but the present invention is not limited to the above embodiments.

例えば、上記実施の形態において、第2排出口32を構成する管の第2容器部12側の端部は、第2容器部12の内壁と面一であったが、第2排出口32を構成する管の第2容器部12側の少なくとも一部を、第2容器部12の内方に向かって第2容器部12の内壁よりも突出させてもよい。 For example, in the above embodiment, the end of the pipe constituting the second discharge port 32 on the second container portion 12 side is flush with the inner wall of the second container portion 12, but the second discharge port 32 is used. At least a part of the constituent pipe on the second container portion 12 side may be projected inward of the second container portion 12 from the inner wall of the second container portion 12.

この場合、図7に示すように、第2排出口32を構成する管の第2容器部12側の端部の全周を第2容器部12の内壁から突出させるように突出部12aを設けてもよいし、図8に示すように、第2排出口32を構成する管の第2容器部12側の端部の上側部分のみを第2容器部12の内壁から突出させるように突出部12bを設けてもよい。 In this case, as shown in FIG. 7, a protruding portion 12a is provided so that the entire circumference of the end portion of the pipe constituting the second discharge port 32 on the second container portion 12 side protrudes from the inner wall of the second container portion 12. Alternatively, as shown in FIG. 8, the protruding portion so as to project only the upper portion of the end portion of the pipe constituting the second discharge port 32 on the second container portion 12 side from the inner wall of the second container portion 12. 12b may be provided.

このように、第2排出口32を構成する管の第2容器部12側の少なくとも一部を、第2容器部12の内方に向かって第2容器部12の内壁よりも突出させることで、第1容器部11から第2容器部12に核酸抽出液320を移動させるときに、核酸抽出液320が第2排出口32に浸入することを抑制できる。つまり、突出部12a及び12bがひさしとして機能し、核酸抽出液320が第2排出口32の管内に浸入することを抑制できる。したがって、核酸抽出液320を少ないロスで回収することができる。 In this way, by projecting at least a part of the pipe constituting the second discharge port 32 on the second container portion 12 side toward the inside of the second container portion 12 from the inner wall of the second container portion 12. When the nucleic acid extract 320 is moved from the first container 11 to the second container 12, it is possible to prevent the nucleic acid extract 320 from entering the second discharge port 32. That is, the protrusions 12a and 12b function as eaves, and the nucleic acid extract 320 can be prevented from entering the pipe of the second discharge port 32. Therefore, the nucleic acid extract 320 can be recovered with a small loss.

また、上記実施の形態における核酸抽出方法において、検体に含まれる死菌を不活性化して除去する死菌除去工程を行ってもよい。死菌除去工程は、死菌を除去するための死菌除去試薬(例えば死菌の核酸の増幅を阻害する試薬)を捕捉部40に導入することで死菌の核酸を反応不活化にする工程であり、捕捉工程S1の後に行われる。具体的には、死菌除去工程は、捕捉工程S1と核酸抽出工程S2との間に行われる。 Further, in the nucleic acid extraction method in the above-described embodiment, the killed bacterium removing step may be performed to inactivate and remove the killed bacterium contained in the sample. The killed bacterium removal step is a step of reacting and inactivating the killed bacterium nucleic acid by introducing a killed bacterium removing reagent (for example, a reagent that inhibits the amplification of the killed bacterium nucleic acid) into the capture unit 40. This is performed after the capture step S1. Specifically, the killed bacterium removal step is performed between the capture step S1 and the nucleic acid extraction step S2.

この場合、核酸抽出対象物を捕捉部40に捕捉した後、第1注入口21又は第2注入口22から死菌除去試薬を容器10内に投入することで核酸抽出対象物微生物を捕捉した捕捉部40上に死菌除去試薬を導入し、冷却しながら5分〜20分程度静置する。これにより、死菌を除去して生菌のみを捕捉部40に集菌することができる。死菌除去試薬としては、例えば、タカラバイオ株式会社製の「Viable Bacteria Selection Kit for PCR」等を用いることができる。また、死菌除去試薬を捕捉部40の本体部41(フィルタ)内に浸透させるために、真空ポンプ2によって軽く吸引する工程や撹拌する工程を適宜追加してもよい。さらに、必要に応じて、死菌除去工程は数回繰り返してもよい。なお、死菌除去試薬は、死菌除去工程が終了した後に、本体部41を通過させて第2排出口32等から排出してもよい。このように、捕捉工程S1の後に死菌除去工程を行うことで、生菌の核酸のみを抽出することができる。 In this case, after capturing the nucleic acid extraction target in the capture unit 40, the killed bacteria removing reagent is put into the container 10 from the first injection port 21 or the second injection port 22 to capture the nucleic acid extraction target microorganism. A dead bacterium removing reagent is introduced onto the part 40, and the mixture is allowed to stand for about 5 to 20 minutes while cooling. As a result, dead bacteria can be removed and only live bacteria can be collected in the capture unit 40. As the killed bacterium removing reagent, for example, "Viable Bacteria Selection Kit for PCR" manufactured by Takara Bio Inc. can be used. Further, in order to allow the killed bacteria removing reagent to permeate into the main body 41 (filter) of the trap 40, a step of lightly sucking by the vacuum pump 2 and a step of stirring may be added as appropriate. Further, if necessary, the killed bacteria removal step may be repeated several times. The killed bacteria removing reagent may be discharged from the second discharge port 32 or the like through the main body 41 after the killed bacteria removing step is completed. In this way, by performing the killed bacterium removal step after the capture step S1, only the nucleic acid of the live bacterium can be extracted.

また、上記実施の形態において、容器10は遮光部材によって構成されていたが、これに限るものではない。例えば、図9に示すように、容器10の少なくとも一部が透明材料によって構成されていてもよい。 Further, in the above embodiment, the container 10 is composed of a light-shielding member, but the present invention is not limited to this. For example, as shown in FIG. 9, at least a part of the container 10 may be made of a transparent material.

このように、容器10の一部を透明材料にすることによって、容器10の内部を観察することが可能となったり、容器10の内部に光を照射することが可能となったりする。この場合、例えば容器10の内部に光を照射するための光照射ユニット8を反応ボックス4内又は反応ボックス4の周辺に設けることができる。光照射ユニット8は、例えば、上記の死菌除去工程で用いられる。具体的には、容器10内に死菌除去試薬を導入して静置した後に光照射ユニット8によって光を照射することで、死菌と死菌除去試薬との反応を促進することができる。これにより、死菌の除去を効率良く行うことができる。 By making a part of the container 10 a transparent material in this way, it becomes possible to observe the inside of the container 10 and to irradiate the inside of the container 10 with light. In this case, for example, a light irradiation unit 8 for irradiating the inside of the container 10 with light can be provided in the reaction box 4 or in the vicinity of the reaction box 4. The light irradiation unit 8 is used, for example, in the above-mentioned killed bacteria removing step. Specifically, the reaction between the dead bacteria and the dead bacteria removing reagent can be promoted by introducing the killed bacteria removing reagent into the container 10 and allowing it to stand, and then irradiating with light by the light irradiation unit 8. As a result, dead bacteria can be efficiently removed.

また、上記実施の形態では、容器10に検体を注入するための第1注入口21と容器10に核酸抽出試薬を注入するための第2注入口22とを別々に設けたが、これに限るものではない。また、核酸抽出液を容器10から排出するための第1排出口31と検体を容器10から排出するための第2排出口32とについても別々に設けたが、これに限るものではない。 Further, in the above embodiment, the first injection port 21 for injecting the sample into the container 10 and the second injection port 22 for injecting the nucleic acid extraction reagent into the container 10 are separately provided, but the present invention is limited to this. It's not a thing. Further, the first discharge port 31 for discharging the nucleic acid extract from the container 10 and the second discharge port 32 for discharging the sample from the container 10 are also provided separately, but the present invention is not limited to this.

例えば、第1注入口21と第2注入口22とは、図10に示すように、1つの注入口23として構成されていてもよい。つまり、第1注入口21と第2注入口22とを兼用する1つの注入口23が容器10(第1容器部11)に設けられていてもよい。注入口23からは、検体が注入されたり核酸抽出試薬が注入されたりする。なお、検体210及び核酸抽出試薬310以外に、死菌除去試薬等のその他の液体を注入口23から注入してもよい。 For example, the first injection port 21 and the second injection port 22 may be configured as one injection port 23 as shown in FIG. That is, one injection port 23 that also serves as the first injection port 21 and the second injection port 22 may be provided in the container 10 (first container portion 11). A sample is injected or a nucleic acid extraction reagent is injected from the injection port 23. In addition to the sample 210 and the nucleic acid extraction reagent 310, other liquids such as a dead bacterium removing reagent may be injected from the injection port 23.

また、第1排出口31と第2排出口32とについても、図10に示すように、1つの排出口33として構成されていてもよい。つまり、第1排出口31と第2排出口32とを兼用する1つの排出口33が容器10(第2容器部12)に設けられていてもよい。排出口33からは、核酸抽出液が排出されたり検体が排出されたりする。なお、核酸抽出液及び検体以外に、容器10に導入されたその他の液体が排出口33から排出されてもよい。 Further, the first discharge port 31 and the second discharge port 32 may also be configured as one discharge port 33 as shown in FIG. That is, one discharge port 33 that also serves as the first discharge port 31 and the second discharge port 32 may be provided in the container 10 (second container portion 12). The nucleic acid extract is discharged or the sample is discharged from the discharge port 33. In addition to the nucleic acid extract and the sample, other liquids introduced into the container 10 may be discharged from the discharge port 33.

なお、図10では、注入口23及び排出口33をいずれも1つとしたが、これに限るものではなく、どちらか一方を図6A等に示すように2つに分けてもよい。 In FIG. 10, both the injection port 23 and the discharge port 33 are set to one, but the present invention is not limited to this, and one of them may be divided into two as shown in FIG. 6A and the like.

さらに、注入口23及び排出口33の各々が1つのみである場合、図11に示すように、捕捉部40の上流側に設けられた注入口23には、バルブ600を介して、検体投入カップ200及び核酸抽出試薬容器300が接続されていてもよい。これにより、バルブ600を制御することで検体投入カップ200からの検体と核酸抽出試薬容器300からの核酸抽出試薬との流れを切り替えることができる。また、捕捉部40の下流側に設けられた排出口33には、バルブ700を介して、回収容器400(不図示)で核酸抽出液を回収するための配管5bと回収容器500で検体の廃液(ろ液)を回収するための配管2bとが接続されていてもよい。これにより、バルブ700を制御することで核酸抽出液と検体の廃液との流れを切り替えることができる。 Further, when each of the injection port 23 and the discharge port 33 is only one, as shown in FIG. 11, the sample is charged into the injection port 23 provided on the upstream side of the capture unit 40 via the valve 600. The cup 200 and the nucleic acid extraction reagent container 300 may be connected. Thereby, by controlling the valve 600, the flow of the sample from the sample charging cup 200 and the nucleic acid extraction reagent from the nucleic acid extraction reagent container 300 can be switched. Further, at the discharge port 33 provided on the downstream side of the capture unit 40, the waste liquid of the sample is collected by the pipe 5b and the collection container 500 for collecting the nucleic acid extract in the collection container 400 (not shown) via the valve 700. A pipe 2b for collecting (filter liquid) may be connected. Thereby, the flow of the nucleic acid extract and the waste liquid of the sample can be switched by controlling the valve 700.

また、上記実施の形態では、検体210は捕捉部40に直接通過させたが、これに限らない。例えば、検体210を捕捉部40に通過させる前に、前処理として検体210をプレフィルタに通過させてもよい。一例として、検体投入カップ200と第1注入口21との間にプレフィルタを有する配管を挿入すればよい。このように、検体210を捕捉部40に通過させる前にプレフィルタに通過させることで、サイズの大きい不要な成分を除去することができる。これにより、検体210からの核酸抽出対象物220の捕捉を効率的に行うことができる。 Further, in the above embodiment, the sample 210 is directly passed through the capture unit 40, but the present invention is not limited to this. For example, the sample 210 may be passed through the pre-filter as a pretreatment before the sample 210 is passed through the capture unit 40. As an example, a pipe having a pre-filter may be inserted between the sample charging cup 200 and the first injection port 21. In this way, by passing the sample 210 through the pre-filter before passing it through the capture unit 40, it is possible to remove unnecessary components having a large size. This makes it possible to efficiently capture the nucleic acid extraction target 220 from the sample 210.

その他、各実施の形態及び変形例に対して当業者が思いつく各種変形を施して得られる形態や、本発明の趣旨を逸脱しない範囲で実施の形態における構成要素及び機能を任意に組み合わせることで実現される形態も本発明に含まれる。 In addition, it is realized by arbitrarily combining the components and functions in the embodiment and the embodiment obtained by applying various modifications that can be thought of by those skilled in the art to each embodiment and modification, and within the range not deviating from the gist of the present invention. The form to be used is also included in the present invention.

1 核酸抽出ユニット
2 真空ポンプ(圧力調整部)
10 容器
11 第1容器部
12 第2容器部
21 第1注入口
22 第2注入口
23 注入口(第1注入口、第2注入口)
22a ゴム栓
31 第1排出口
32 第2排出口
33 排出口(第1排出口、第2排出口)
40 捕捉部
41 本体部
42 支持部
100 核酸抽出装置
210 検体
220 核酸抽出対象物
230 核酸
310 核酸抽出試薬
320 核酸抽出液
1 Nucleic acid extraction unit 2 Vacuum pump (pressure regulator)
10 Container 11 1st container 12 2nd container 21 1st injection port 22 2nd injection port 23 Injection port (1st injection port, 2nd injection port)
22a Rubber stopper 31 1st discharge port 32 2nd discharge port 33 Discharge port (1st discharge port, 2nd discharge port)
40 Capture part 41 Main body part 42 Support part 100 Nucleic acid extractor 210 Specimen 220 Nucleic acid extraction target 230 Nucleic acid 310 Nucleic acid extraction reagent 320 Nucleic acid extract

Claims (12)

検体から核酸を抽出するための核酸抽出ユニットと、
力調整部とを備え、
前記核酸抽出ユニットは、
容器と、
前記容器内に検体を注入するための第1注入口と、
少なくとも一部が前記容器内に配置され、前記第1注入口から注入された検体に含まれる核酸抽出対象物を捕捉する捕捉部と、
前記捕捉部で捕捉された前記核酸抽出対象物から核酸を抽出するための核酸抽出試薬を前記容器内に注入するための第2注入口と、
前記核酸抽出試薬によって前記核酸抽出対象物から抽出された核酸が含まれる核酸抽出液を前記容器から排出するための第1排出口と、
前記検体の廃液を前記容器から排出するための第2排出口とを有し、
前記容器は、前記捕捉部を境界として当該容器の内部空間を分割する第1容器部と第2容器部とを有し、
前記第1注入口及び前記第2注入口は、前記第1容器部に設けられており、
前記第1排出口及び前記第2排出口は、前記第2容器部に設けられており、
前記第1注入口と前記第2注入口とは、別々に設けられている又は1つの注入口として構成されており、
前記第1排出口と前記第2排出口とは、別々に設けられており、
前記捕捉部は、前記核酸抽出対象物より小さい孔を複数有するフィルタを有し、
前記第2排出口は、前記第1排出口よりも前記捕捉部に近い位置に設けられており、かつ、前記圧力調整部の減圧口を兼ねており、
前記圧力調整部は、前記第2容器部内を加圧して前記第2容器部内の圧力を前記第1容器部内の圧力よりも高くすることで、前記容器に注入された前記核酸抽出試薬を前記捕捉部上に保持させる核酸抽出試薬保持モードで前記第2容器部内の圧力を調整する
核酸抽出装置。
A nucleic acid extraction unit for extracting nucleic acid from a sample,
And a pressure adjusting unit,
The nucleic acid extraction unit
With the container
A first injection port for injecting a sample into the container,
A capture unit that captures at least a part of the nucleic acid extraction target contained in the sample injected from the first injection port, which is arranged in the container.
A second injection port for injecting a nucleic acid extraction reagent for extracting nucleic acid from the nucleic acid extraction target captured by the capture unit into the container, and
A first discharge port for discharging the nucleic acid extract containing the nucleic acid extracted from the nucleic acid extraction target by the nucleic acid extraction reagent from the container, and
It has a second discharge port for discharging the waste liquid of the sample from the container.
The container has a first container portion and a second container portion that divide the internal space of the container with the catching portion as a boundary.
The first injection port and the second injection port are provided in the first container portion.
The first discharge port and the second discharge port are provided in the second container portion.
The first injection port and the second injection port are provided separately or are configured as one injection port.
The first discharge port and the second discharge port are provided separately.
The capture unit has a filter having a plurality of pores smaller than the nucleic acid extraction target.
The second discharge port is provided at a position closer to the catching portion than the first discharge port, and also serves as a decompression port of the pressure adjusting portion.
The pressure adjusting section pressurizes the inside of the second container section to make the pressure inside the second container section higher than the pressure inside the first container section, thereby capturing the nucleic acid extraction reagent injected into the container. A nucleic acid extraction device that adjusts the pressure inside the second container in the nucleic acid extraction reagent holding mode held on the container.
前記第2排出口を構成する管の前記第2容器部側の少なくとも一部は、前記第2容器部の内方に向かって前記第2容器部の内壁よりも突出している
請求項に記載の核酸抽出装置。
The first aspect of claim 1, wherein at least a part of the pipe constituting the second discharge port on the side of the second container portion projects inward of the second container portion from the inner wall of the second container portion. Nucleic acid extractor.
前記第2注入口は、前記第1容器部に設けられた貫通孔であり、
前記貫通孔には、当該貫通孔を塞ぐゴム栓が設けられており、
前記ゴム栓は、前記核酸抽出試薬を前記第1容器部内に注入するための針が貫通可能なゴム材料によって構成されている
請求項1又は2に記載の核酸抽出装置。
The second injection port is a through hole provided in the first container portion, and is a through hole.
The through hole is provided with a rubber stopper that closes the through hole.
The nucleic acid extraction device according to claim 1 or 2 , wherein the rubber stopper is made of a rubber material through which a needle for injecting the nucleic acid extraction reagent into the first container portion can penetrate.
前記容器の少なくとも一部は、透明材料によって構成されている
請求項1〜のいずれか1項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extraction device according to any one of claims 1 to 3 , wherein at least a part of the container is made of a transparent material.
前記捕捉部は、前記核酸抽出対象物を捕捉して保持するための本体部と、前記本体部を支持する支持部とを有する
請求項1〜のいずれか1項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extraction device according to any one of claims 1 to 4 , wherein the capture unit has a main body portion for capturing and holding the nucleic acid extraction target, and a support portion for supporting the main body portion.
前記支持部の少なくとも一部は、金属によって構成されている
請求項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extraction device according to claim 5 , wherein at least a part of the support portion is made of metal.
前記支持部の少なくとも一部は、高熱伝導性樹脂によって構成されている
請求項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extraction device according to claim 5 , wherein at least a part of the support portion is made of a highly thermally conductive resin.
前記支持部の表面は、親水性である
請求項のいずれか1項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extraction device according to any one of claims 5 to 7 , wherein the surface of the support portion is hydrophilic.
前記容器の少なくとも一部は、高熱伝導性樹脂によって構成されている
請求項1〜のいずれか1項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extraction device according to any one of claims 1 to 8 , wherein at least a part of the container is made of a highly thermally conductive resin.
前記第1容器部の内部空間の壁面における角部分の角度は、90度以上である
請求項1〜のいずれか1項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extractor according to any one of claims 1 to 9 , wherein the angle of the corner portion on the wall surface of the internal space of the first container portion is 90 degrees or more.
前記容器の内面は、非親水性である
請求項1〜10のいずれか1項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extraction device according to any one of claims 1 to 10 , wherein the inner surface of the container is non-hydrophilic.
さらに、前記容器を振動させるための振動装置を備える
請求項1〜11のいずれか1項に記載の核酸抽出装置。
The nucleic acid extraction device according to any one of claims 1 to 11 , further comprising a vibrating device for vibrating the container.
JP2018504026A 2016-03-10 2017-01-16 Nucleic acid extractor Expired - Fee Related JP6771161B2 (en)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2016047225 2016-03-10
JP2016047225 2016-03-10
JP2016166304 2016-08-26
JP2016166304 2016-08-26
PCT/JP2017/001164 WO2017154349A1 (en) 2016-03-10 2017-01-16 Nucleic acid extraction device, nucleic acid extraction unit, and nucleic acid extraction method

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JPWO2017154349A1 JPWO2017154349A1 (en) 2018-08-30
JP6771161B2 true JP6771161B2 (en) 2020-10-21

Family

ID=59790247

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2018504026A Expired - Fee Related JP6771161B2 (en) 2016-03-10 2017-01-16 Nucleic acid extractor

Country Status (2)

Country Link
JP (1) JP6771161B2 (en)
WO (1) WO2017154349A1 (en)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019043779A1 (en) * 2017-08-29 2019-03-07 横河電機株式会社 Nucleic acid extraction method and nucleic acid extraction device
CN107974393B (en) * 2018-01-08 2023-03-24 深圳市朗司医疗科技有限公司 Heating device applied to nucleic acid extraction system
CN111876312A (en) * 2020-08-12 2020-11-03 济南国益生物科技有限公司 Nucleic acid extraction kit and nucleic acid extraction method

Family Cites Families (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH03224474A (en) * 1990-01-29 1991-10-03 Shimadzu Corp Column for nucleic acid extraction
JP2003144149A (en) * 1997-03-31 2003-05-20 Takara Holdings Inc Isolation apparatus and method of using the same
EP1436405A4 (en) * 2001-08-20 2006-01-04 Whatman Inc Dna purification and recovery from high particulate and solids samples
JP2004208654A (en) * 2003-01-08 2004-07-29 Asahi Kasei Corp Nucleic acid isolation cartridge, and nucleic acid isolation device
JP2006121935A (en) * 2004-10-27 2006-05-18 Konica Minolta Medical & Graphic Inc Micro-reactor for inspecting biosubstance equipped with pretreatment means and waste liquid storage tank
JP4478588B2 (en) * 2005-01-31 2010-06-09 富士フイルム株式会社 Specific substance recovery apparatus and nucleic acid extraction apparatus using the same
JP2008122205A (en) * 2006-11-10 2008-05-29 Olympus Corp Specimen inspection kit, specimen inspection kit group and transfer support rack
US20090036665A1 (en) * 2007-07-11 2009-02-05 Gonzalo Domingo Disposable Sample Processing Unit
JP5011012B2 (en) * 2007-07-18 2012-08-29 株式会社日立ハイテクノロジーズ Nucleic acid extraction equipment
EP2087934A1 (en) * 2008-02-07 2009-08-12 Qiagen GmbH Method and device for processing a sample automatically
US8664377B2 (en) * 2009-09-30 2014-03-04 Samsung Electronics Co., Ltd. Method and apparatus for isolating nucleic acids
SG181161A1 (en) * 2009-12-02 2012-07-30 Univ Nanyang Tech A method and apparatus for recovering cells and their analysis
US9822356B2 (en) * 2012-04-20 2017-11-21 California Institute Of Technology Fluidic devices and systems for sample preparation or autonomous analysis
GB201316347D0 (en) * 2013-09-13 2013-10-30 Cancer Rec Tech Ltd Biological fluid filtration assembly
CN105874052B (en) * 2013-11-04 2019-05-21 查尔斯河实验室公司 Filtration system and its use
JP2015195784A (en) * 2014-04-03 2015-11-09 凸版印刷株式会社 Porous filter column, reagent cartridge, and nucleic acid extraction kit
JPWO2017203744A1 (en) * 2016-05-24 2019-01-10 パナソニックIpマネジメント株式会社 Nucleic acid testing equipment

Also Published As

Publication number Publication date
JPWO2017154349A1 (en) 2018-08-30
WO2017154349A1 (en) 2017-09-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6782998B2 (en) apparatus
US20230398537A1 (en) Apparatus, system and method for performing automated centrifugal separation
US20220170913A1 (en) Method for Processing Blood Sample
TWI624294B (en) Method and device for sample processing
CA2787268C (en) Liquid to liquid biological particle concentrator with disposable fluid path
JP6771161B2 (en) Nucleic acid extractor
US7837943B2 (en) Device and method for pre-treating and injecting liquid specimen
TW201329231A (en) Method and device for isolation of non-fat cells from an adipose tissue
JP2002153260A (en) Device for culturing and observing one cell with microscope for long period
CN108126522B (en) Separation chip, separation device and method for separating target particles in liquid sample
US20170268041A1 (en) Device for analyzing a biological sample
AU2020212005B2 (en) Methods and apparatus to selectively extract constituents from biological samples
CN108349631B (en) Discharge member with filter
JP5753839B2 (en) High concentration of organic micro-objects for microscopic imaging
RU2012122009A (en) DEVICE FOR CLEANING AND ENRICHMENT OF BIOLOGICAL SAMPLES AND METHOD OF CLEANING AND ENRICHMENT OF BIOLOGICAL SAMPLES
JP2018061451A (en) Nucleic acid extraction device and nucleic acid extraction method
WO2017203744A1 (en) Nucleic acid examination device
JPWO2007055165A1 (en) Nucleic acid separation method, nucleic acid testing microreactor, nucleic acid testing system
JP2009118780A (en) Microorganism detection method and filtration apparatus
JP2006280318A (en) Separating and recovering method
JP2021035353A (en) Microfluidic device including amplification reaction chamber
JP2006246835A (en) Separation/recovery container for density gradient
JP2017201969A (en) Microorganisms capturing device
KR102411672B1 (en) Apparatus for concentrating biological material with recoverable membranes
JP2018038342A (en) Microorganism capture device

Legal Events

Date Code Title Description
A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20180326

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20190416

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20190614

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20191203

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20200129

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20200616

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20200805

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20200818

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20200910

R151 Written notification of patent or utility model registration

Ref document number: 6771161

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151

LAPS Cancellation because of no payment of annual fees