JP6721895B2 - Cell analysis result output device, cell analysis result output method and program - Google Patents

Cell analysis result output device, cell analysis result output method and program Download PDF

Info

Publication number
JP6721895B2
JP6721895B2 JP2015070410A JP2015070410A JP6721895B2 JP 6721895 B2 JP6721895 B2 JP 6721895B2 JP 2015070410 A JP2015070410 A JP 2015070410A JP 2015070410 A JP2015070410 A JP 2015070410A JP 6721895 B2 JP6721895 B2 JP 6721895B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
information
cell
group information
cells
analysis
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
JP2015070410A
Other languages
Japanese (ja)
Other versions
JP2016191565A (en
Inventor
竜司 加藤
竜司 加藤
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Tokai National Higher Education and Research System NUC
Original Assignee
Tokai National Higher Education and Research System NUC
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Tokai National Higher Education and Research System NUC filed Critical Tokai National Higher Education and Research System NUC
Priority to JP2015070410A priority Critical patent/JP6721895B2/en
Priority to PCT/JP2016/060146 priority patent/WO2016158962A1/en
Priority to EP16772843.5A priority patent/EP3275993B8/en
Priority to US15/563,155 priority patent/US10900950B2/en
Priority to SG11201708082RA priority patent/SG11201708082RA/en
Publication of JP2016191565A publication Critical patent/JP2016191565A/en
Priority to HK18109585.2A priority patent/HK1250169A1/en
Application granted granted Critical
Publication of JP6721895B2 publication Critical patent/JP6721895B2/en
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Landscapes

  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Description

本発明は、細胞分析結果出力装置、細胞分析結果出力方法及びプログラムに関する。 The present invention relates to a cell analysis result output device, a cell analysis result output method, and a program.

従来、がん研究における自然発生がんの検出、再生医療における治療用細胞以外の異種細胞の検出、間葉系幹細胞(MSC)の臨床研究等の分野において、細胞を染色する技術が広く用いられてきた。 BACKGROUND ART Conventionally, cell staining technology has been widely used in fields such as detection of spontaneous cancer in cancer research, detection of xenogeneic cells other than therapeutic cells in regenerative medicine, and clinical research of mesenchymal stem cells (MSCs). Came.

このような細胞を染色する技術を適用すると、染色によって細胞が破壊されてしまう。さらに、染色試薬は高価であり、細胞の染色自体が面倒である。
そこで、本発明者らは、非破壊で細胞に関する分析を行う技術について、安価かつ簡便に実現できるように研究開発をし続けている(特許文献1乃至5参照)。
When such a technique for staining cells is applied, the cells are destroyed by the staining. Furthermore, staining reagents are expensive and the staining of cells themselves is tedious.
Therefore, the inventors of the present invention have continued research and development on a technique for non-destructive analysis of cells so that it can be inexpensively and simply realized (see Patent Documents 1 to 5).

特開2011−232051号公報JP, 2011-232051, A 特開2011−229413号公報JP, 2011-229413, A 特開2011−229410号公報JP, 2011-229410, A 特開2011−229409号公報JP, 2011-229409, A 再表2010/098105号公報Re-table 2010/098105

しかしながら、細胞に関する分析を行う技術と一口にいっても、その分析内容は多岐に渡り、同一の分析内容であっても分析手法や条件も多種多様に存在する。このため、分析内容、分析手法、各種条件毎に異種類の分析モデルを夫々生成しておく必要がある。
このような、分析内容、分析手法、各種条件等が異なる各種各様な細胞に関する分析処理の結果を、ユーザに容易かつ効果的に認識させることが要求されていた。
However, even if it is said as a technique for analyzing cells, the analysis contents are various, and even if the same analysis contents are present, there are various kinds of analysis methods and conditions. Therefore, it is necessary to generate different types of analysis models for each analysis content, analysis method, and various conditions.
There has been a demand for the user to easily and effectively recognize the result of such an analysis process regarding various cells having different analysis contents, analysis methods, various conditions, and the like.

本発明は、このような状況に鑑みてなされたものであり、分析内容、分析手法、各種条件等が異なる各種各様な細胞に関する分析処理の結果を、ユーザに容易かつ効果的に認識させることを目的とする。 The present invention has been made in view of such a situation, and allows a user to easily and effectively recognize the result of an analysis process relating to various cells having different analysis contents, analysis methods, various conditions, and the like. With the goal.

上記目的を達成するため、本発明の一態様の細胞分析結果出力装置は、
複数の細胞からなる細胞集団を被写体として撮像された細胞画像の中から、所定条件により選定された1枚以上の細胞画像を単位として、前記単位に含まれる1以上の細胞画像のデータに基づいて、前記細胞の単体の形態的特徴又は前記細胞集団の形態的特徴に関するN種類(Nは1以上の整数値)の特徴パラメータの値を含む情報が、特徴群情報として保持されており、
比較対象の前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて、M種類(MはNとは独立した整数値)のパラメータの値から構成される比較対象情報が取得され、
比較相手の前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて、前記M種類のパラメータの値から構成される比較相手情報が取得され、
前記比較対象情報と前記比較相手情報との間の所定観点での距離が算出された場合、
前記比較対象情報を示す第1シンボルと、前記比較相手情報を示す第2シンボルとを含む画像であって、算出された前記距離に応じて表示形態が変化する画像の情報を、出力情報として出力する出力手段と、
を備える。
In order to achieve the above object, the cell analysis result output device of one embodiment of the present invention is
Based on the data of one or more cell images included in the unit, with one or more cell images selected under a predetermined condition as a unit from among the cell images obtained by capturing a cell population including a plurality of cells as a subject. , Information including the values of N kinds (N is an integer value of 1 or more) of characteristic parameters relating to the morphological characteristics of the cells alone or the morphological characteristics of the cell population is held as characteristic group information,
Based on at least one of the N types of feature parameters included in the feature group information to be compared, the comparison target information including M types (M is an integer value independent of N) of parameter values is Acquired,
Comparison target information composed of values of the M types of parameters is acquired based on at least one of the N types of feature parameters included in the feature group information of the comparison target,
When the distance from the predetermined viewpoint between the comparison target information and the comparison partner information is calculated,
The image information including the first symbol indicating the comparison target information and the second symbol indicating the comparison target information, the display form of which changes according to the calculated distance, is output as output information. Output means to
Equipped with.

本発明の一態様の細胞分析結果出力方法及びプログラムは、上述の本発明の一態様の細胞分析結果出力装置に対応する方法及びプログラムである。 A cell analysis result output method and program according to an aspect of the present invention are a method and a program corresponding to the cell analysis result output device according to an aspect of the present invention described above.

本発明によれば、分析内容、分析手法、各種条件等が異なる各種各様な細胞に関する分析処理の結果を、ユーザに容易かつ効果的に認識させることが実現可能になる。 According to the present invention, it is possible to make the user easily and effectively recognize the result of the analysis processing on various cells having different analysis contents, analysis methods, various conditions, and the like.

本発明の一実施形態に係る細胞分析装置のハードウェアの構成を示すブロック図である。It is a block diagram which shows the structure of the hardware of the cell analyzer which concerns on one Embodiment of this invention. 図1の細胞分析装置1の機能的構成のうち、細胞分析処理を実行するための機能的構成を示す機能ブロック図である。It is a functional block diagram which shows the functional structure for performing a cell analysis process among the functional structures of the cell analyzer 1 of FIG. 図2の細胞分析装置1の機能的構成のうち、特徴群情報生成部の機能的構成の詳細を示す機能ブロック図である。FIG. 3 is a functional block diagram showing details of the functional configuration of a feature group information generation unit in the functional configuration of the cell analysis device 1 of FIG. 2. 図3の特徴群情報生成部の画像数値化部の処理を説明する模式図である。4 is a schematic diagram illustrating a process of an image digitizing unit of the feature group information generating unit of FIG. 3. FIG. 特徴パラメータの具体的な10種類を説明する図である。It is a figure explaining ten concrete types of a characteristic parameter. 特徴群情報の生成の基になる細胞画像の一例を示す図である。It is a figure which shows an example of the cell image used as the basis of the production|generation of characteristic group information. 特徴群情報の一部を具体的に示す図である。It is a figure which shows a part of feature group information concretely. 特徴群情報の一部を具体的に示す図である。It is a figure which shows a part of feature group information concretely. 特徴群情報として、分析評価のために抽出される要素の違いを説明するための模式図である。It is a schematic diagram for demonstrating the difference of the element extracted for analysis evaluation as feature group information. 細胞集団における特徴量のうち有効なものの強調と組合せに基づいて、細胞画像から生成される特徴群情報を模式的に示す図である。It is a figure which shows typically the feature group information produced|generated from a cell image based on the emphasis and combination of the effective thing in the cell population. 分布中の情報強調のパターンの各種具体例を示している。The various specific examples of the pattern of information emphasis in distribution are shown. 経時変化という点を考慮した集団データの加工手法の各種具体例を示している。Various specific examples of the method of processing the collective data in consideration of the change over time are shown. ヘテロ性情報付加という点を考慮した集団情報の加工手法の各種具体例を示す図である。It is a figure which shows various specific examples of the processing method of group information in consideration of the point of adding heterogeneous information. ヘテロ性情報付加及び経時変化を考慮した加工がなされた特徴群情報の一例を示す図である。It is a figure which shows an example of the feature group information processed by adding heterogeneous information and time-dependent consideration. 従来のサンプルデータと、本実施形態の特徴群情報から生成されるサンプルデータとの違いを示す図である。It is a figure which shows the difference between the conventional sample data and the sample data produced|generated from the feature group information of this embodiment. 細胞品質変化を予測するための分析モデルの生成に用いるサンプルデータの一例を示す図である。It is a figure showing an example of sample data used for generation of an analytical model for predicting a change in cell quality. 図16のサンプルデータを用いて細胞品質変化を予測したときの予測精度を示す図である。It is a figure which shows the prediction precision at the time of predicting a cell quality change using the sample data of FIG. 図17の標準化タイプEのサンプルデータを用いて生成された分析モデルにより、実際に細胞品質変化を予測した結果を示す図である。It is a figure which shows the result of having actually predicted the cell quality change by the analytical model produced|generated using the sample data of the standardization type E of FIG. 所定の分析モデルの生成に用いられる、複数のサンプルデータの一例を示す図である。It is a figure showing an example of a plurality of sample data used for generation of a predetermined analysis model. 図19のサンプルデータを用いて、所定の分析モデルを生成する手法の2つの例を示している。Two examples of methods of generating a predetermined analysis model are shown using the sample data of FIG. 図17乃至図19で説明した例とは別の分析モデルの表現形態の一例を示している。An example of the expression form of the analysis model different from the examples described in FIGS. 17 to 19 is shown. 分析モデルの表現形態の一例であって、図21とは異なる例を示す図である。FIG. 22 is a diagram showing an example of the expression form of the analysis model, which is different from FIG. 21. 分析モデルの表現形態の一例であって、図21や図22とは異なる例を示す図である。FIG. 23 is a diagram showing an example of the expression form of the analysis model, which is different from the examples shown in FIGS. 21 and 22. 分析モデルの表現形態の一例であって、図21乃至図23とは異なる例を示す図である。FIG. 24 is a diagram showing an example of the expression form of the analysis model, which is different from the examples shown in FIGS. 21 to 23. サンプルデータ及び評価対象情報の生成の基になる特徴群情報の構成例を示す図である。It is a figure which shows the structural example of the feature group information used as the basis of generation of sample data and evaluation object information. 時間変化を考慮した図25の特徴群情報の構成例を示す図である。It is a figure which shows the structural example of the feature group information of FIG. 25 which considered the time change. 図26の構成の特徴群情報を用いて、サンプルデータ及び評価対象情報を比較する手法の一例を説明する図である。FIG. 27 is a diagram illustrating an example of a method of comparing sample data and evaluation target information using the feature group information having the configuration of FIG. 26. 出力情報を示す画面の一例を示す図である。It is a figure which shows an example of the screen which shows output information. 出力情報を示す画面の一例を示す図である。It is a figure which shows an example of the screen which shows output information.

以下、本発明の実施形態について、図面を用いて説明する。 Embodiments of the present invention will be described below with reference to the drawings.

図1は、本発明の一実施形態に係る細胞分析装置1のハードウェアの構成を示すブロック図である。
細胞分析装置1は、CPU(Central Processing Unit)11と、ROM(Read Only Memory)12と、RAM(Random Access Memory)13と、バス14と、入出力インターフェース15と、出力部16と、入力部17と、記憶部18と、通信部19と、ドライブ20とを備えている。
FIG. 1 is a block diagram showing a hardware configuration of a cell analyzer 1 according to an embodiment of the present invention.
The cell analyzer 1 includes a CPU (Central Processing Unit) 11, a ROM (Read Only Memory) 12, a RAM (Random Access Memory) 13, a bus 14, an input/output interface 15, an output unit 16, and an input unit. 17, a storage unit 18, a communication unit 19, and a drive 20.

CPU11は、ROM12に記録されているプログラム、又は、記憶部18からRAM13にロードされたプログラムに従って各種の処理を実行する。
RAM13には、CPU11が各種の処理を実行する上において必要なデータ等も適宜記憶される。
The CPU 11 executes various processes according to a program recorded in the ROM 12 or a program loaded from the storage unit 18 into the RAM 13.
The RAM 13 also appropriately stores data and the like necessary for the CPU 11 to execute various processes.

CPU11、ROM12及びRAM13は、バス14を介して相互に接続されている。このバス14にはまた、入出力インターフェース15も接続されている。入出力インターフェース15には、出力部16、入力部17、記憶部18、通信部19、及びドライブ20が接続されている。 The CPU 11, ROM 12, and RAM 13 are connected to each other via a bus 14. An input/output interface 15 is also connected to the bus 14. An output unit 16, an input unit 17, a storage unit 18, a communication unit 19, and a drive 20 are connected to the input/output interface 15.

出力部16は、ディスプレイやスピーカ等で構成され、各種情報を画像や音声で出力する。
入力部17は、キーボードやマウス等で構成され、各種情報を入力する。
記憶部18は、ハードディスクやDRAM(Dynamic Random Access Memory)等で構成され、各種データを記憶する。
通信部19は、図示せぬネットワークを介して他の装置(本実施形態では後述の図2の外部装置81や前処理装置82)との間で行う通信を制御する。
The output unit 16 includes a display, a speaker, and the like, and outputs various kinds of information as images and sounds.
The input unit 17 is composed of a keyboard, a mouse and the like, and inputs various information.
The storage unit 18 includes a hard disk, a DRAM (Dynamic Random Access Memory), or the like, and stores various data.
The communication unit 19 controls communication performed with other devices (an external device 81 and a preprocessing device 82 in FIG. 2, which will be described later in this embodiment) via a network (not shown).

ドライブ20には、必要に応じて、リムーバブルメディア31が適宜装着される。ドライブ20によってリムーバブルメディア31から読み出されたプログラムは、必要に応じて記憶部18にインストールされる。また、リムーバブルメディア31は、記憶部18に記憶されている各種データも、記憶部18と同様に記憶することができる。 A removable medium 31 is properly attached to the drive 20 as needed. The program read from the removable medium 31 by the drive 20 is installed in the storage unit 18 as needed. Further, the removable medium 31 can also store various data stored in the storage unit 18 similarly to the storage unit 18.

図2は、図1の細胞分析装置1の機能的構成のうち、細胞分析処理を実行するための機能的構成を示す機能ブロック図である。
細胞分析処理とは、1以上の細胞を被写体として含む画像(以下、「細胞画像」と呼ぶ)のデータと、所定の分析モデルとに基づいて、当該細胞に関する所定の分析を行い、その分析結果を出力するまでの一連の処理をいう。
ここで、細胞に関する所定の分析とは、当該細胞を被写体とする細胞画像に基づく分析であれば足りる意である。即ち、細胞に関する所定の分析は、当該細胞の種類や状態を分析することは勿論のこと、当該細胞の外部(周囲環境等)を分析することも含む広義な概念である。
FIG. 2 is a functional block diagram showing a functional configuration for executing a cell analysis process among the functional configurations of the cell analysis device 1 of FIG.
The cell analysis process is a result of performing a predetermined analysis on the cell based on data of an image including one or more cells as a subject (hereinafter referred to as “cell image”) and a predetermined analysis model, and the analysis result. Is a series of processes until output.
Here, the predetermined analysis regarding cells means that analysis based on a cell image in which the cells are the subject is sufficient. That is, the predetermined analysis regarding a cell is a broad concept including not only analyzing the type and state of the cell but also analyzing the outside (surrounding environment) of the cell.

細胞分析処理が実行される場合には、主にCPU11においては、図2に示すように、細胞画像入力部41と、特徴群情報生成部42と、ノイズ除去部43と、分析モデル生成部44と、評価対象情報取得部45と、評価対象情報取得部46と、分析部47と、出力情報生成部48とが機能する。
また、記憶部18の一領域には、特徴群情報DB61、細胞評価DB62、及び分析モデル保持部63が設けられる。
When the cell analysis processing is executed, mainly in the CPU 11, as shown in FIG. 2, a cell image input unit 41, a feature group information generation unit 42, a noise removal unit 43, and an analysis model generation unit 44. The evaluation target information acquisition unit 45, the evaluation target information acquisition unit 46, the analysis unit 47, and the output information generation unit 48 function.
Further, a feature group information DB 61, a cell evaluation DB 62, and an analysis model holding unit 63 are provided in one area of the storage unit 18.

細胞画像入力部41は、細胞画像のデータを入力する。ここで、細胞画像の提供元は、特に限定されず、図示せぬインターネット等を介して接続する外部装置81であってもよいし、細胞分析装置1の管理人等が保有する前処理装置82であってもよい。
つまり、細胞画像を提供する者を、以下、「ユーザ」と呼ぶならば、ユーザは、細胞分析装置1を保有しない場合等には、外部装置81を操作して、インターネット等を介して細胞画像のデータを細胞分析装置1に提供する。一方、ユーザは、細胞分析装置1を保有する場合等には、さらに前処理装置82も保有し、当該前処理装置82で生成した細胞画像のデータを細胞分析装置1に提供する。
前処理装置82は、細胞を調整する細胞調整部71と、当該細胞を撮影して細胞画像のデータとして出力する細胞撮影部72とを有している。
The cell image input unit 41 inputs cell image data. Here, the source of the cell image is not particularly limited, and may be an external device 81 connected via the Internet or the like (not shown), or a pre-processing device 82 held by the administrator of the cell analysis device 1 or the like. May be
That is, if a person who provides a cell image is hereinafter referred to as a “user”, the user operates the external device 81 to carry out the cell image via the Internet or the like when the user does not have the cell analyzer 1. The data of 1 is provided to the cell analyzer 1. On the other hand, when the user holds the cell analysis device 1, the user also holds the pretreatment device 82 and provides the cell analysis device 1 with the data of the cell image generated by the pretreatment device 82.
The pre-processing device 82 includes a cell adjustment unit 71 that adjusts cells, and a cell imaging unit 72 that images the cells and outputs them as cell image data.

特徴群情報生成部42は、細胞画像のデータを2値化し、その結果得られるデータ(以下、「2値化データ」と呼ぶ)から細胞オブジェクトを抽出し、当該細胞オブジェクトの1種類以上の形態的特徴の夫々を示すパラメータの各値から構成されるデータ、即ち数値化データを生成する。 The feature group information generation unit 42 binarizes the data of the cell image, extracts the cell object from the resulting data (hereinafter referred to as “binarized data”), and forms one or more types of the cell object. Data composed of respective values of parameters indicating respective physical characteristics, that is, digitized data is generated.

なお、以下、所定の形態的特徴を示すパラメータを、特に、「特徴パラメータ」と呼ぶ。また、特徴パラメータの値は、「形態的特徴量」とも呼ばれている。 In addition, hereinafter, a parameter indicating a predetermined morphological feature is particularly referred to as a “feature parameter”. The value of the characteristic parameter is also called “morphological characteristic amount”.

ここで、1枚の細胞画像は、複数の細胞からなる細胞集団、例えば同一容器内で培養される細胞集団(時間と共に細胞の個数が変化する場合もある)が被写体として撮像されたものである場合が多い。この場合、1枚の細胞画像には複数個の細胞オブジェクトが含まれており、複数個の細胞オブジェクト毎に1種類以上の特徴パラメータの各値が算出される。 Here, one cell image is an image of a cell population composed of a plurality of cells, for example, a cell population cultured in the same container (the number of cells may change with time) as an object. In many cases. In this case, one cell image includes a plurality of cell objects, and each value of one or more types of characteristic parameters is calculated for each of the plurality of cell objects.

このような細胞集団を被写体とする細胞画像の場合、細胞単体の特徴パラメータの値(形態的特徴量)も有意情報であるが、細胞集団についての特徴パラメータに関する情報(以下、「集団情報」と呼ぶ)も有用な情報である。
集団情報としては、例えば、細胞集団における所定の特徴パラメータのヒストグラムや、細胞集団における所定の特徴パラメータの統計値(平均値や分散値等の数値)が含まれる。
In the case of a cell image with such a cell population as a subject, the value of the feature parameter of the cell alone (morphological feature amount) is also significant information, but the information regarding the feature parameter of the cell population (hereinafter referred to as “population information”). Calling) is also useful information.
The population information includes, for example, a histogram of predetermined characteristic parameters in the cell population, and a statistical value (a numerical value such as an average value or a variance value) of the predetermined characteristic parameters in the cell population.

本実施形態では、細胞単体の特徴パラメータの値(細胞単体の形態的特徴量)と、集団情報をまとめて、以下、「特徴群情報」と呼ぶ。 In the present embodiment, the value of the characteristic parameter of the single cell (morphological characteristic amount of the single cell) and the population information are collectively referred to as “feature group information”.

ここで、特徴群情報は、1枚の細胞画像から得られた数値のみから構成されるとは限らない。
例えば所定の容器内の細胞集団が被写体とされ、時間経過と共に複数回細胞画像が撮像される場合がある。このような場合、撮像時刻が異なる複数枚の細胞画像の各データに基づいて、特徴群情報が生成される場合もある。
また例えば、異なる容器(ウェル等)で別々に培養された同一種類の細胞について、異なる容器毎に別々に撮影された複数枚の細胞画像の各データに基づいて、特徴群情報が生成される場合もある。
このように、特徴群情報は、任意の枚数の細胞画像の各データに基づいて生成され得る。
Here, the feature group information does not always include only the numerical values obtained from one cell image.
For example, a cell population in a predetermined container may be a subject, and cell images may be captured multiple times over time. In such a case, the feature group information may be generated based on each data of a plurality of cell images having different imaging times.
Further, for example, in the case where the feature group information is generated based on each data of a plurality of cell images separately photographed in different containers for the same type of cells separately cultured in different containers (well etc.) There is also.
In this way, the feature group information can be generated based on each data of the arbitrary number of cell images.

ノイズ除去部43は、分析モデルの生成に用いるサンプルデータとして、ノイズとなるデータを除去する。
ノイズとなるデータは、例えば、細胞の培養時において手技が不良であった際の細胞画像のデータ、即ち、当該細胞画像のデータに基づいて生成された特徴群情報等から抽出されるサンプルデータである。
The noise removing unit 43 removes noise data as sample data used to generate the analysis model.
The data that becomes noise is, for example, data of a cell image when a procedure is bad during cell culture, that is, sample data extracted from feature group information and the like generated based on the data of the cell image. is there.

分析モデル生成部44は、特徴群情報DB61に格納されている特徴群情報の少なくとも一部に基づいて、サンプルデータを生成する。
ここで、「特徴群情報の少なくとも一部に基づいて、サンプルデータを生成」するとは、特徴群情報の構成要素(特徴パラメータの値)の一部を単に抽出することのみならず、任意の個数の任意の種類の構成要素を用いて新たなデータを生成することも意味する。
The analysis model generation unit 44 generates sample data based on at least a part of the feature group information stored in the feature group information DB 61.
Here, "to generate sample data based on at least a part of the feature group information" means not only to extract some of the constituent elements (values of feature parameters) of the feature group information but also to select an arbitrary number of pieces. It also means to generate new data using any kind of components of.

分析モデル生成部44は、1以上のサンプルデータを用いて、細胞画像内の細胞に関する所定の分析を行うためのモデル(以下、「分析モデル」と呼ぶ)を生成する。 The analysis model generation unit 44 uses one or more sample data to generate a model (hereinafter, referred to as “analysis model”) for performing a predetermined analysis on the cells in the cell image.

ここで、細胞に関する所定の分析と一口にいっても、その分析内容は多岐に渡る。例えば、代表的な分析内容を挙げるだけでも、細胞の種類を分類する種類、培養されている細胞の状態を判断する種類、及び、細胞が培養されている外部環境を分析する種類という3種類が存在する。
従って、分析内容の種類毎に、分析モデルも複数種類存在する可能性がある。つまり、細胞の種類を分析するための分析モデルと、培養されている細胞の状態を判断するための分析モデルと、細胞が培養されている外部環境を分析するための分析モデルとの夫々では、異なる種類が採用されている場合が多い。
また、分析内容が同一種類であっても、多種多様な分析手法や各種条件等が存在する。従って、分析手法や各種条件によっても異なる種類の分析モデルが用いられる場合が多い。
Here, the content of the analysis is wide-ranging, even if it is referred to as a predetermined analysis regarding cells. For example, just to give a representative analysis content, there are three types: a type that classifies cell types, a type that determines the state of cultured cells, and a type that analyzes the external environment in which cells are cultured. Exists.
Therefore, there may be multiple types of analysis models for each type of analysis content. That is, in each of the analytical model for analyzing the cell type, the analytical model for judging the state of the cultured cells, and the analytical model for analyzing the external environment in which the cells are cultured, Often different types are used.
Even if the analysis contents are the same, there are various analysis methods and various conditions. Therefore, different types of analysis models are often used depending on the analysis method and various conditions.

分析モデルの種類が異なれば、その生成に用いられるサンプルデータの種類や構造も異なる場合が多い。
つまり、特徴群情報に含まれる全ての種類の特徴パラメータの値が、そのままサンプルデータとして常に用いられるわけではない。
即ち、分析内容、分析手法、各種条件等毎に、特徴パラメータの種類や個数が異なる組合せが抽出され、抽出された夫々の組合せに基づいて、サンプルデータが生成される場合もある。
If the type of analysis model is different, the type and structure of the sample data used to generate it are often different.
That is, the values of all types of feature parameters included in the feature group information are not always used as they are as sample data.
That is, a combination in which the type and number of characteristic parameters differ depending on the analysis content, analysis method, various conditions, etc. may be extracted, and sample data may be generated based on each extracted combination.

具体的には例えば、細胞集団における大きさの平均値(第1特徴パラメータ)と、細胞集団における大きさの分散値(第2特徴パラメータ)と、細胞集団における長さの平均値(第3特徴パラメータ)と、細胞集団における長さの分散値(第4特徴パラメータ)とを含む特徴群情報があったとする。
この場合、細胞の種類を分類する分析モデルの生成用に、第1特徴パラメータと第3特徴パラメータとの各値から、サンプルデータが生成される場合もある。
一方、培養されている細胞の状態を判断する分析モデルの生成用に、第2特徴パラメータと、第3特徴パラメータと、第4特徴パラメータとの各値から、サンプルデータが生成される場合もある。
Specifically, for example, the average value of the size in the cell population (first characteristic parameter), the variance value of the size in the cell population (second characteristic parameter), and the average value of the length in the cell population (third characteristic) It is assumed that there is feature group information including a parameter) and a variance value of the length in the cell population (fourth feature parameter).
In this case, sample data may be generated from the respective values of the first characteristic parameter and the third characteristic parameter in order to generate an analytical model for classifying cell types.
On the other hand, sample data may be generated from the respective values of the second characteristic parameter, the third characteristic parameter, and the fourth characteristic parameter in order to generate an analytical model for determining the state of the cells being cultured. ..

ここで、サンプルデータの構成要素は、特徴群情報の特徴パラメータの値がそのまま用いられる場合もある。しかしながら、図25乃至図27を参照して後述するが、特徴群情報の特徴パラメータとは別のパラメータの値が、サンプルデータの構成要素として新たに生成される場合もある。
つまり、特徴群情報のN種類(Nは1以上の整数値)の特徴パラメータに基づいて、M種類(MはNとは独立した1以上の整数値)のパラメータの各値から構成されるサンプルデータが生成される。
このM種類のパラメータは、N種類の特徴パラメータとは独立した概念である。即ち、分析内容、分析手法、各種条件等毎に、サンプルデータを構成するM種類のパラメータの種類や個数が異なる場合が多い。
Here, the values of the characteristic parameters of the characteristic group information may be used as they are as the constituent elements of the sample data. However, as will be described later with reference to FIGS. 25 to 27, a parameter value different from the characteristic parameter of the characteristic group information may be newly generated as a constituent element of the sample data.
That is, a sample composed of each value of M kinds of parameters (M is an integer value of 1 or more independent of N) based on N kinds (N is an integer value of 1 or more) of characteristic parameters of the feature group information. Data is generated.
The M types of parameters are concepts independent of the N types of characteristic parameters. That is, in many cases, the type and number of M types of parameters forming the sample data differ depending on the analysis content, analysis method, various conditions, and the like.

さらに、サンプルデータの基になる特徴群情報は、1枚の細胞画像から生成されるとは限らない。つまり、所定の条件で選択された1枚以上の細胞画像を単位として、当該単位から特徴群情報は生成される。
ここで、所定の条件は、特に限定されず、例えば「同一容器内の時刻t1乃至t5の夫々の細胞画像」という条件を採用してもよい。この条件が採用された場合、同一容器内の時刻t1乃至t5の夫々の5枚の細胞画像から得られた特徴群情報に基づいて、1のサンプルデータが生成される。
Furthermore, the feature group information on which the sample data is based is not always generated from one cell image. That is, the feature group information is generated from a unit of one or more cell images selected under a predetermined condition.
Here, the predetermined condition is not particularly limited, and for example, a condition of “each cell image in the same container at times t1 to t5” may be adopted. When this condition is adopted, one sample data is generated based on the feature group information obtained from the five cell images at the times t1 to t5 in the same container.

従って、サンプルデータには、異なる時刻々のデータ(数値)が含まれ得る。
具体的には例えば、上述の例の第1特徴パラメータ乃至第4特徴パラメータを含む特徴群情報があったとする。
そして、細胞の種類を分類する分析モデルの生成用に対しても、培養されている細胞の状態を判断する分析モデルの生成用に対しても、第3特徴パラメータの値が、サンプルデータのパラメータの値として採用されるものとする。
この場合であっても、細胞の種類を分類する分析モデルの生成用については、時刻t1と時刻t2との各値がサンプルデータに含められる一方で、培養されている細胞の状態を判断する分析モデルの生成用については、時刻t4の値がサンプルデータに含められる場合もある。
即ち、同じ特徴パラメータであっても時刻が異なる値は、夫々違う意味を持つ独立したデータである。このため、分析内容、分析手法、各種条件等毎の時間変化の違いを考慮して、サンプルデータが生成される場合がある。
Therefore, the sample data may include data (numerical values) at different times.
Specifically, for example, it is assumed that there is feature group information including the first to fourth feature parameters in the above example.
The value of the third characteristic parameter is the parameter of the sample data, both for generating an analytical model for classifying cell types and for generating an analytical model for determining the state of cultured cells. Shall be adopted as the value of.
Even in this case, for generation of the analysis model for classifying the cell types, the analysis of determining the state of the cultured cells while each value of the time t1 and the time t2 is included in the sample data. For model generation, the value at time t4 may be included in the sample data.
That is, even if the characteristic parameters are the same, different values at different times are independent data having different meanings. For this reason, sample data may be generated in consideration of the difference in time change for each analysis content, analysis method, various conditions, and the like.

以上まとめると、特徴群情報は、N種の特徴パラメータを少なくとも要素として含む、N次元以上の多次元情報である。
このような特徴群情報に含まれるN種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて生成される、M種類のパラメータの値から構成されるデータが、サンプルデータである。
つまり、サンプルデータのM種類のパラメータは、N種類の特徴パラメータとは独立したものであり、当然ながらN種類の特徴パラメータのうち幾種類かの特徴パラメータを含み得るが、それとは別のパラメータも含み得る。
ここで、特徴パラメータ以外の別のパラメータを、以下、「付帯パラメータ」と呼ぶ。付帯パラメータとしては、例えば時間のパラメータを採用することができる。また例えば、外部環境や各種条件等で定義されるパラメータも、付帯パラメータである。また例えば、後述の図25乃至図27の例のサンプルデータでは、所定の3次元空間を構築する各軸を示すパラメータが構成要素になっている。この各軸を示すパラメータもまた、付帯パラメータの一種である。
In summary, the feature group information is N-dimensional or more multidimensional information including at least N types of feature parameters as elements.
Data composed of M types of parameter values generated based on at least one of N types of feature parameters included in such feature group information is sample data.
That is, the M kinds of parameters of the sample data are independent of the N kinds of characteristic parameters, and of course, some kinds of the characteristic parameters of the N kinds of characteristic parameters can be included, but other parameters can also be included. May be included.
Here, other parameters than the characteristic parameters will be referred to as “incidental parameters” below. As the additional parameter, for example, a time parameter can be adopted. Further, for example, the parameters defined by the external environment, various conditions, etc. are also the auxiliary parameters. Further, for example, in the sample data of the examples of FIGS. 25 to 27 described later, the parameters indicating the respective axes forming the predetermined three-dimensional space are the constituent elements. The parameter indicating each axis is also a kind of additional parameter.

このように、本実施形態では、分析モデルの生成に際し、特徴群情報自体をそのままサンプルデータとして用いるのではなく、特徴群情報とは独立したM種類のパラメータを要素とするサンプルデータが用いられる。
このM種類のパラメータとしては、分析内容、分析手法、各種条件等に応じて、任意な種類の任意の個数の組み合わせを採用することができる。つまり、1の特徴群情報から、分析内容、分析手法、所定条件等に夫々適した異種類で異構造のサンプルデータを個別に生成することができる。その結果、分析内容、分析手法、所定条件等に夫々適した分析モデルの生成が可能になる。つまり、各種の分析モデル毎に適合するサンプルデータ(細胞分析用情報の1種)を効率的に生成することができる。
これにより、各種各様な分析内容、分析手法、所定条件等の夫々について、細胞に関する分析を総合的に行うことが容易かつ適切に可能になる。
As described above, in the present embodiment, when the analysis model is generated, the feature group information itself is not used as it is as the sample data, but the sample data having M kinds of parameters independent of the feature group information as elements is used.
As the M types of parameters, it is possible to employ an arbitrary number of combinations of arbitrary types according to the analysis content, analysis method, various conditions, and the like. That is, it is possible to individually generate sample data of different types and different structures suitable for the analysis content, the analysis method, the predetermined condition, etc. from one feature group information. As a result, it becomes possible to generate an analysis model suitable for the analysis content, the analysis method, the predetermined condition, and the like. That is, it is possible to efficiently generate sample data (one type of cell analysis information) that is suitable for each analysis model.
As a result, it becomes possible to easily and appropriately perform comprehensive analysis on cells with respect to various analysis contents, analysis methods, predetermined conditions, and the like.

つまり、図2の分析モデル生成部44は、分析内容、分析手法、各種条件等毎に、サンプルの細胞集団についての特徴群情報を特徴群情報DB61から検索し、当該特徴群情報に含まれるN種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて、M種類のパラメータの各値を要素とするサンプルデータを生成する。
そして、分析モデル生成部44は、分析内容、分析手法、各種条件等毎に種類や構造が異なるサンプルデータを1個以上用いて、分析内容、分析手法、各種条件等毎に複数の分析モデルを夫々生成する。
これらの各分析モデルは、各サンプルデータの種類や構造を示す情報と対応付けられて、分析モデル保持部63に保持される。
That is, the analysis model generation unit 44 in FIG. 2 searches the feature group information DB 61 for the feature group information regarding the cell population of the sample for each analysis content, analysis method, various conditions, etc., and N included in the feature group information. Based on at least one kind of the characteristic parameters of the kinds, sample data having each value of the M kinds of parameters as elements is generated.
Then, the analysis model generation unit 44 uses one or more sample data having different types and structures for each analysis content, analysis method, various conditions, and the like to generate a plurality of analysis models for each analysis content, analysis method, various conditions, etc. Generate each.
Each of these analysis models is held in the analysis model holding unit 63 in association with information indicating the type and structure of each sample data.

なお、分析モデル保持部63に保持された各種分析モデルは、新たな細胞画像についての特徴群情報が特徴群情報DB61に格納されると、その後適当なタイミングで、分析モデル生成部44によって適宜更新される。 It should be noted that the various analysis models held in the analysis model holding unit 63 are appropriately updated by the analysis model generation unit 44 at an appropriate timing after the feature group information about the new cell image is stored in the feature group information DB 61. To be done.

評価対象情報取得部45は、細胞画像に対応する評価対象情報を、外部装置81や、前処理装置82の細胞調整部71から取得して、細胞評価DB62に格納する。
細胞画像に対応する評価対象情報とは、当該細胞画像の被写体となる細胞集団(例えば所定容器内の細胞集団)に対して、所定の評価法を用いて行った破壊的細胞評価の結果を示す情報である。つまり、所定の細胞集団に対して、細胞画像とは別の手段で分析評価された情報が、評価対象情報である。
破壊的細胞評価は、特に限定されず、ゲノム、遺伝子発現、タンパク質、代謝産物、相互詐称、生体移植結果、治療成績等任意のものを採用することができる。
なお、評価対象情報は、数値化情報として細胞評価DB62に格納されると好適である。評価対象情報の値を、所定の分析モデルを生成する際のサンプルデータ(多次元情報)の要素値(所定のパラメータの値)として含めることができるからである。
The evaluation target information acquisition unit 45 acquires the evaluation target information corresponding to the cell image from the external device 81 or the cell adjustment unit 71 of the preprocessing device 82, and stores it in the cell evaluation DB 62.
The evaluation target information corresponding to the cell image indicates a result of the destructive cell evaluation performed by using a predetermined evaluation method on a cell population (for example, a cell population in a predetermined container) that is a subject of the cell image. It is information. That is, the information analyzed and evaluated by a means different from the cell image for the predetermined cell population is the evaluation target information.
The destructive cell evaluation is not particularly limited, and any one such as genome, gene expression, protein, metabolite, mutual spoofing, living transplantation result, therapeutic result, etc. can be adopted.
The evaluation target information is preferably stored in the cell evaluation DB 62 as digitized information. This is because the value of the evaluation target information can be included as the element value (value of the predetermined parameter) of the sample data (multidimensional information) when generating the predetermined analysis model.

評価対象情報取得部46は、分析評価の対象となる細胞の特徴群情報を、分析評価用の分析モデルに適合した形態で特徴群情報DB61から取得する。なお、このようにして評価対象情報取得部46により取得された情報を、以下、「評価対象情報」と呼ぶ。 The evaluation target information acquisition unit 46 acquires, from the feature group information DB 61, the feature group information of the cells to be analyzed and evaluated in a form suitable for the analysis evaluation analysis model. Note that the information acquired by the evaluation target information acquisition unit 46 in this manner is hereinafter referred to as “evaluation target information”.

分析評価用の分析モデルに適合した形態とは、当該分析モデルが生成される際に用いられたサンプルデータの形態と同様な形態(つまり、パラメータのM種類が夫々同一種類である形態)をいう。
即ち、上述したように、分析モデルの種類毎に、生成時に用いられたサンプルデータの形態が異なる場合がある。
従って、評価対象情報も、利用対象の分析モデルの生成時に用いられたサンプルデータと同様な形態である必要がある。
The form suitable for the analytical model for analytical evaluation means the same form as the form of the sample data used when the analytical model is generated (that is, the form in which the M types of parameters are the same type). ..
That is, as described above, the form of the sample data used at the time of generation may differ for each type of analysis model.
Therefore, the evaluation target information also needs to be in the same form as the sample data used when the analysis model to be used is generated.

つまり、評価対象情報取得部46は、分析評価の対象となる細胞の特徴群情報を特徴群情報DB61から検索し、当該特徴群情報に含まれるN種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて、M種類のパラメータの値から構成される情報を、評価対象情報として取得する。
この場合、「当該特徴群情報に含まれるN種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類」や、「M種類のパラメータ」は、利用対象の分析モデルのサンプルデータが生成されたときのものと同一種類である。
That is, the evaluation target information acquisition unit 46 searches the feature group information DB 61 for the feature group information of the cell to be analyzed and evaluated, and based on at least one of the N types of feature parameters included in the feature group information. , M types of parameter values are acquired as evaluation target information.
In this case, "at least one of N types of feature parameters included in the feature group information" and "M types of parameters" are the same types as those used when the sample data of the analysis model to be used is generated. Is.

分析部47は、評価対象情報と分析モデルとに基づいて、分析評価対象の細胞に関する分析処理を実行する。上述したように、分析内容、分析手法、各種条件等は、特に限定されず、各種各様な分析が可能になる。 The analysis unit 47 executes an analysis process on cells to be analyzed and evaluated based on the evaluation target information and the analysis model. As described above, the analysis content, analysis method, various conditions, etc. are not particularly limited, and various kinds of analysis can be performed.

出力情報生成部48は、分析評価対象の細胞に関する情報(例えば評価対象情報)と、当該細胞に対する分析処理結果を含む情報を、出力情報として生成する。そして、出力情報生成部48は、出力情報を出力部16や外部装置81に出力する。
なお、出力情報の具体例については、図28及び図29を参照して後述する。
The output information generation unit 48 generates, as output information, information including cells related to analysis and evaluation (e.g., evaluation target information) and information including analysis processing results for the cells. Then, the output information generation unit 48 outputs the output information to the output unit 16 or the external device 81.
A specific example of the output information will be described later with reference to FIGS. 28 and 29.

以上図2を参照して、細胞分析装置1の機能的構成例について説明した。
次に、このような図2の機能的構成を有する細胞分析装置1のうち、特徴群情報生成部42の詳細な構成について、図3を参照して説明する。
The functional configuration example of the cell analysis device 1 has been described above with reference to FIG.
Next, the detailed configuration of the feature group information generation unit 42 in the cell analyzer 1 having the functional configuration of FIG. 2 will be described with reference to FIG.

図3は、図2の細胞分析装置1の機能的構成のうち、特徴群情報生成部42の機能的構成の詳細を示す機能ブロック図である。 FIG. 3 is a functional block diagram showing details of the functional configuration of the feature group information generation unit 42 in the functional configuration of the cell analysis device 1 of FIG.

図3に示すように、特徴群情報生成部42において、画像数値化部91と、複数画像特徴群情報生成部92と、ヘテロ性情報付加部93と、経時変化情報付加部94と、特徴群情報出力部95とがCPU11(図1)において機能する。
また、記憶部18(図1)の一領域には、数値化情報蓄積部101と、第1特徴群情報蓄積部102と、第2特徴群情報蓄積部103と、第3特徴群情報蓄積部104とが設けられる。
As shown in FIG. 3, in the feature group information generation unit 42, the image digitization unit 91, the plural-image feature group information generation unit 92, the heterogeneity information addition unit 93, the temporal change information addition unit 94, and the feature group. The information output unit 95 functions in the CPU 11 (FIG. 1).
Further, in one area of the storage unit 18 (FIG. 1), the digitized information storage unit 101, the first feature group information storage unit 102, the second feature group information storage unit 103, and the third feature group information storage unit And 104 are provided.

画像数値化部91は、1枚の細胞画像のデータを処理単位として、処理単位のデータに対して所定の画像処理を施すことで、処理単位についての特徴群情報を生成する。
1枚の細胞画像から生成された特徴群情報、即ち、当該細胞画像に含まれる細胞オブジェクトの夫々の各種特徴パラメータの値(数値)の集合体からなる情報は、数値化情報蓄積部101に蓄積される。即ち、数値化情報蓄積部101は、1枚の細胞画像を単位として、複数単位の特徴群情報を蓄積する。
The image digitizing unit 91 generates feature group information for each processing unit by performing a predetermined image processing on the data of the processing unit with the data of one cell image as the processing unit.
Feature group information generated from a single cell image, that is, information consisting of an aggregate of values (numerical values) of various feature parameters of each cell object included in the cell image is accumulated in the digitized information accumulating unit 101. To be done. That is, the digitized information storage unit 101 stores a plurality of units of feature group information, with one cell image as a unit.

図4は、画像数値化部91の処理を説明する模式図である。
図4の例では、1枚の細胞画像G1のデータが処理単位として画像数値化部91に与えられる。
画像数値化部91は、細胞画像G1のデータから2値化データG2を生成する。画像数値化部91は、2値化データから「XXX」個(XXXは、任意の整数値)の細胞オブジェクト候補を抽出する。ここで、細胞オブジェクトとせずに候補としたのは、細胞ではないノイズとなるオブジェクト(以下、「ノイズオブジェクト」と呼ぶ)が含まれるからである。
FIG. 4 is a schematic diagram illustrating the processing of the image digitizing unit 91.
In the example of FIG. 4, the data of one cell image G1 is given to the image digitization unit 91 as a processing unit.
The image digitization unit 91 generates binarized data G2 from the data of the cell image G1. The image digitization unit 91 extracts "XXX" (XXX is an arbitrary integer value) cell object candidates from the binarized data. Here, the reason why the object is not a cell object but a candidate is that an object that becomes noise other than a cell (hereinafter, referred to as “noise object”) is included.

画像数値化部91は、各細胞オブジェクト候補の夫々に対して一意のID(Cell ID)を付し、各種特徴パラメータを夫々求める。即ち、各細胞オブジェクトが数値化されることになる。図4の例では、各細胞オブジェクト毎に、9種類の特徴パラメータ(Parameter1乃至9)の値が求められている。
このような各細胞オブジェクト毎の9種類の特徴パラメータの値(数値化データ)が網羅されたリストが、細胞画像G1の特徴群情報I1である。
The image digitization unit 91 attaches a unique ID (Cell ID) to each of the cell object candidates and obtains various characteristic parameters. That is, each cell object is digitized. In the example of FIG. 4, the values of nine types of characteristic parameters (Parameters 1 to 9) are obtained for each cell object.
A list of nine types of feature parameter values (numerical data) for each cell object is the feature group information I1 of the cell image G1.

ただし、細胞画像G1の特徴群情報I1には、ノイズオブジェクトについての数値化データ(9種類の特徴パラメータの値)も含まれている。
そこで、ステップS1において、画像数値化部91は、適当なアルゴリズムに従って、細胞オブジェクト候補からノイズオブジェクトを判定し、当該ノイズオブジェクトの数値化データを除外する。
図4の例では、IDが「Cell 001」及び「Cell 002」の細胞オブジェクト候補がノイズオブジェクトと判定されている。このため、細胞画像G1の特徴群情報I1から、当該ノイズオブジェクトについての数値化データが除外され、細胞画像G1の特徴群情報I2が生成される。
However, the feature group information I1 of the cell image G1 also includes numerical data (values of nine types of feature parameters) regarding the noise object.
Therefore, in step S1, the image digitization unit 91 determines a noise object from the cell object candidates according to an appropriate algorithm, and excludes the digitized data of the noise object.
In the example of FIG. 4, the cell object candidates whose IDs are “Cell 001” and “Cell 002” are determined to be noise objects. Therefore, the digitized data regarding the noise object is excluded from the feature group information I1 of the cell image G1, and the feature group information I2 of the cell image G1 is generated.

さらに、ステップS2において、画像数値化部91は、ステップS1とは異なる適当なアルゴリズムに従って、細胞オブジェクト候補からノイズオブジェクトを判定し、当該ノイズオブジェクトの数値化データを除外する。
図4の例では、IDが「Cell 003」及び「Cell 004」の細胞オブジェクト候補がノイズオブジェクトと判定されている。このため、細胞画像G1の特徴群情報I1から、当該ノイズオブジェクトについての数値化データが除外され、細胞画像G1の特徴群情報I3が生成される。
Further, in step S2, the image digitization unit 91 determines a noise object from the cell object candidates according to an appropriate algorithm different from step S1 and excludes the digitized data of the noise object.
In the example of FIG. 4, the cell object candidates whose IDs are “Cell 003” and “Cell 004” are determined to be noise objects. Therefore, the digitized data on the noise object is excluded from the feature group information I1 of the cell image G1, and the feature group information I3 of the cell image G1 is generated.

ステップS3において、画像数値化部91は、ノイズオブジェクトが除外された細胞オブジェクト候補を細胞オブジェクトとして確定して、細胞画像G1の特徴群情報I3を、数値化情報蓄積部101に記憶させる。 In step S3, the image digitization unit 91 determines the cell object candidate from which the noise object is excluded as a cell object, and stores the feature group information I3 of the cell image G1 in the digitized information storage unit 101.

なお、図4の例では、特徴パラメータの種類は、9種類とされたが、特にこれに限定されない。
例えば図5は、特徴パラメータの具体的な10種類を説明する図である。
図5において、1行は所定の種類の特徴パラメータを示している。1列目の項目は、パラメータ番号を示している。2列目の項目は、特徴パラメータの名称を示している。3列目の項目は、特徴パラメータの例(求め方)を示している。4列目の項目は、特徴パラメータの説明を示している。
In the example of FIG. 4, the number of types of characteristic parameters is nine, but the number of types is not particularly limited to this.
For example, FIG. 5 is a diagram illustrating ten specific types of characteristic parameters.
In FIG. 5, one line indicates a predetermined type of characteristic parameter. The item in the first column shows the parameter number. The item in the second column shows the name of the characteristic parameter. The item in the third column shows an example (method of obtaining) of the characteristic parameter. The item in the fourth column shows the description of the characteristic parameter.

「Total area」は、細胞(より正確には「細胞オブジェクト」であるが、本段落では単に「細胞」と呼ぶ)の面積を示す特徴パラメータである。
「Area」は、細胞内のHoleを除く面積を示す特徴パラメータである。ここで、Holeは、コントラストによって、細胞画像の明るさが閾値以上となる部分(位相差観察では白に近い状態となる箇所)である。
「Perimeter」は、細胞の外周の長さを示す特徴パラメータである。
「Length」は、細胞を横切る線のうちの最大値(細胞の全長)を示す特徴パラメータである。
「Breadth」は、「Length」に直交する線のうちの最大値(細胞の横幅)を示す特徴パラメータである。
「Inner radius」は、細胞の内周の半径を示す特徴パラメータである。
「Elliptical form factor」は、「Length」の値を「Breadth」で除した特徴パラメータである。
「Fiber Breadth」は、細胞を擬似的に線状と仮定した場合の幅(Fiber Lengthと直交する方向の長さ)を示す特徴パラメータである。
「Fiber Length」は、細胞を擬似的に線状と仮定した場合の長さを示す特徴パラメータである。
「Shape Factor」は、細胞の円形度(細胞の丸さ)を示す特徴パラメータである。
“Total area” is a characteristic parameter indicating the area of a cell (more precisely, “cell object”, but simply referred to as “cell” in this paragraph).
“Area” is a characteristic parameter indicating the area excluding the intracellular holes. Here, the hole is a portion where the brightness of the cell image is equal to or higher than a threshold value due to the contrast (a portion that becomes a state close to white in phase difference observation).
“Perimeter” is a characteristic parameter indicating the length of the outer circumference of the cell.
“Length” is a characteristic parameter that indicates the maximum value (the total length of the cell) of the line that crosses the cell.
"Breadth" is a characteristic parameter indicating the maximum value (cell width) of the line orthogonal to "Length".
"Inner radius" is a characteristic parameter indicating the radius of the inner circumference of the cell.
“Elliptical form factor” is a characteristic parameter obtained by dividing the value of “Length” by “Breadth”.
“Fiber Width” is a characteristic parameter indicating the width (length in the direction orthogonal to Fiber Length) when the cells are assumed to be pseudo linear.
“Fiber Length” is a characteristic parameter indicating the length of a cell assuming that the cell is pseudo linear.
“Shape Factor” is a characteristic parameter indicating the circularity of cells (roundness of cells).

なお、図5の例の特徴パラメータは例示に過ぎず、細胞オブジェクトから数値化可能な所定の形態的特徴を示すパラメータであれば、任意の種類を採用することができる。
また、1枚の細胞画像には、細胞集団が含まれているため、図示はしないが集団情報も求められ、特徴群情報に含められる。例えば上述の「Total area」の平均値や分散値等が、特徴群情報に含められ得る。
また、複数個の細胞の所定の形態的特徴量のヒストグラムが求められ、そのヒストグラム内の各ビンの値等が、特徴群情報に含められ得る。
Note that the feature parameters in the example of FIG. 5 are merely examples, and any type can be adopted as long as it is a parameter indicating a predetermined morphological feature that can be quantified from a cell object.
Further, since one cell image includes a cell population, although not shown, population information is also obtained and included in the feature group information. For example, the average value or the variance value of the above-mentioned “Total area” may be included in the feature group information.
In addition, a histogram of a predetermined morphological feature amount of a plurality of cells can be obtained, and the value of each bin in the histogram can be included in the feature group information.

図3に戻り、複数画像特徴群情報生成部92は、所定の規則に従って、複数枚の細胞画像からなる第1処理単位を決定して、第1処理単位に含まれる特徴群情報を数値化情報蓄積部101から取得する。
所定の規則は、特に限定されないが、ここでは、同一条件及び同一時間に撮像された複数の細胞画像が第1処理単位になるという規則が採用されている。
次に、複数画像特徴群情報生成部92は、数値化情報蓄積部101から取得した各特徴群情報について、各数値化データを結合したり整理することによって、第1処理単位の特徴群情報を生成する。
第1処理単位の特徴群情報は、第1特徴群情報蓄積部102に蓄積される。
Returning to FIG. 3, the multi-image feature group information generation unit 92 determines a first processing unit including a plurality of cell images according to a predetermined rule, and digitizes the feature group information included in the first processing unit as digitized information. It is acquired from the storage unit 101.
The predetermined rule is not particularly limited, but here, a rule that a plurality of cell images imaged under the same condition and at the same time become the first processing unit is adopted.
Next, the multi-image feature group information generation unit 92 combines the feature group information acquired from the digitized information storage unit 101 with each other and combines the digitized data to arrange the feature group information of the first processing unit. To generate.
The feature group information of the first processing unit is stored in the first feature group information storage unit 102.

ヘテロ性情報付加部93は、所定の規則に従って、複数枚の細胞画像からなる第2処理単位を決定して、第2処理単位に含まれる各特徴群情報を第1特徴群情報蓄積部102から取得する。
所定の規則は、特に限定されないが、ここでは、複数条件及び同一時間に撮像された複数の細胞画像が第2処理単位になるという規則が採用されている
次に、ヘテロ性情報付加部93は、取得した各特徴群情報について、各数値化データを結合したり整理することによって、ヘテロ性情報が付加された第2処理単位の特徴群情報を生成する。なお、ヘテロ性情報や第2処理単位の特徴群情報の具体例については、図12を参照して後述する。
第2処理単位の特徴群情報は、第2特徴群情報蓄積部103に蓄積される。
The heterogeneous information adding unit 93 determines a second processing unit including a plurality of cell images according to a predetermined rule, and outputs each feature group information included in the second processing unit from the first feature group information storage unit 102. get.
The predetermined rule is not particularly limited, but here, the rule that a plurality of cell images imaged at a plurality of conditions and at the same time become the second processing unit is adopted. Next, the heterogeneous information adding unit 93 For each of the acquired feature group information, the digitized data is combined or organized to generate the feature group information of the second processing unit to which the heterogeneity information is added. Specific examples of the heterogeneity information and the feature group information of the second processing unit will be described later with reference to FIG.
The feature group information of the second processing unit is stored in the second feature group information storage unit 103.

経時変化情報付加部94は、所定の規則に従って、複数枚の細胞画像からなる第3処理単位を決定して、第3処理単位に含まれる各特徴群情報を第2特徴群情報蓄積部103から取得する。
所定の規則は、特に限定されないが、ここでは、複数条件及び複数時間(時間変化する相異なる時間)に撮像された複数の細胞画像が第3処理単位になるという規則が採用されている
次に、経時変化情報付加部94は、取得した各特徴群情報について、各数値化データを結合したり整理することによって、経時変化の概念が付加された第3処理単位の特徴群情報を生成する。なお、経時変化の概念が付加された第3処理単位の特徴群情報の具体例については、図9乃至図12を参照して後述する。
第3処理単位の特徴群情報は、第3特徴群情報蓄積部104に蓄積される。
The temporal change information adding unit 94 determines a third processing unit including a plurality of cell images according to a predetermined rule, and outputs each feature group information included in the third processing unit from the second feature group information storage unit 103. get.
The predetermined rule is not particularly limited, but here, a rule is adopted in which a plurality of cell images captured under a plurality of conditions and a plurality of times (time varying at different times) serve as a third processing unit. The temporal change information adding unit 94 generates the characteristic group information of the third processing unit to which the concept of the temporal change is added, by combining or organizing the respective numerical data with respect to the acquired respective characteristic group information. Note that a specific example of the feature group information of the third processing unit to which the concept of change over time is added will be described later with reference to FIGS. 9 to 12.
The feature group information of the third processing unit is stored in the third feature group information storage unit 104.

特徴群情報出力部95は、適当なタイミングで、特徴群情報を第3特徴群情報蓄積部104から取得して、ノイズ除去や、タグ情報付加等をしたうえで、特徴群情報DB61に記憶する。 The feature group information output unit 95 acquires the feature group information from the third feature group information storage unit 104 at an appropriate timing, removes noise, adds tag information, and the like, and then stores the feature group information DB 61. ..

以上図3を参照して特徴群情報生成部42の詳細について説明したように、単一の細胞画像のデータは、画像数値化部91において画像処理が施されることで、数値化された特徴群情報となる。
従って、複数画像特徴群情報生成部92乃至特徴群情報出力部95の処理対象は、画像のデータ(イメージデータ)ではなく、数値化データたる特徴群情報である。従って、複数画像特徴群情報生成部92乃至特徴群情報出力部95をまとめて、「数値化情報処理部111」と適宜呼ぶ。
As described above in detail with reference to FIG. 3, the feature group information generation unit 42 performs the image processing on the data of the single cell image in the image digitization unit 91, thereby digitizing the features. It becomes group information.
Therefore, the processing targets of the plural-image feature group information generation unit 92 to the feature group information output unit 95 are not the image data (image data) but the feature group information that is digitized data. Therefore, the plural-image feature group information generation unit 92 to the feature group information output unit 95 are collectively referred to as a “digitized information processing unit 111” as appropriate.

ここで、図6乃至図8を参照して、特徴群情報DB61に記憶される特徴群情報の具体例について説明する。
図6は、特徴群情報の生成の基になる細胞画像の一例を示している。
細胞画像CAは、同一容器で培養された種類「CA」の細胞集団を撮像したたものである。
細胞画像CBは、同一容器で培養された種類「CB」の細胞集団を撮像したものである。
細胞画像CCは、同一容器で培養された種類「CC」の細胞集団を撮像したものである。
細胞画像CDは、同一容器で培養された種類「CD」の細胞集団を撮像したものである。
なお、図6の例では、各種類「CA」乃至「CD」について、1枚の細胞画像しか示されていないが、実際には、各種類毎に、別々の時刻t1乃至t10の各タイミングにおいて夫々撮像された10枚の細胞画像が存在するものとする。
なお、ここでいう「時刻」は、絶対的な時刻(世界標準時刻)ではなく、例えば培養開始から1時間後等、所定の基準時(培養開始時刻)からの相対的な時刻を意味する。
Here, a specific example of the feature group information stored in the feature group information DB 61 will be described with reference to FIGS. 6 to 8.
FIG. 6 shows an example of a cell image which is a basis for generating the feature group information.
The cell image CA is an image of a cell population of the type “CA” cultured in the same container.
The cell image CB is an image of a cell population of the type “CB” cultured in the same container.
The cell image CC is an image of a cell population of the type “CC” cultured in the same container.
The cell image CD is an image of a cell population of the type “CD” cultured in the same container.
Note that in the example of FIG. 6, only one cell image is shown for each type “CA” to “CD”, but in reality, for each type, at different timings from time t1 to t10. It is assumed that there are 10 cell images captured respectively.
The “time” mentioned here does not mean an absolute time (world standard time) but means a relative time from a predetermined reference time (culture start time), such as one hour after the start of culture.

図7及び図8は、特徴群情報の一部を具体的に示している。
特徴群情報の単位は上述したように特に限定されないが、図7及び図8の例では、細胞の種類が1単位とされ、4単位の特徴群情報が各列に夫々配置されている。
即ち、種類「CA」の細胞の特徴群情報の一部は、(項目名を抜かすと)左から第1列に配置されている。種類「CB」の細胞の特徴群情報の一部は、左から第2列に配置されている。種類「CC」の細胞の特徴群情報の一部は、左から第3列に配置されている。種類「CD」の細胞の特徴群情報の一部は、左から第4列に配置されている。
7 and 8 specifically show a part of the feature group information.
The unit of the characteristic group information is not particularly limited as described above, but in the example of FIGS. 7 and 8, the cell type is 1 unit, and the characteristic group information of 4 units is arranged in each column.
That is, a part of the feature group information of the cells of the type “CA” is arranged in the first column from the left (excluding the item name). Part of the characteristic group information of cells of the type “CB” is arranged in the second column from the left. Part of the characteristic group information of cells of the type “CC” is arranged in the third column from the left. Part of the characteristic group information of cells of the type “CD” is arranged in the fourth column from the left.

図7の例では、特徴群情報のうち、各細胞画像の細胞集団における所定特徴パラメータの統計値を要素とする一部が示されている。図7の一番左の列には、特徴群情報の要素名が含まれている。
ここで、「pas」とは(相対的な)時刻を示す。即ち、kpas(kは1乃至10の任意の整数値)は、時刻kに撮像された細胞画像から得られた値であることを示している。
「AVE」は平均値を、「SD」は標準偏差を、夫々示している。
例えば上から1番目の行の要素(Normal_Area_AVE_01pas)は、時刻t1の細胞画像に含まれるノーマルの細胞集団の「Area」の平均値を示している。
また例えば上から12番目の行の要素(Normal_Area_SD_02pas)は、時刻t2の細胞画像に含まれるノーマルの細胞集団の「Area」の標準偏差を示している。
In the example of FIG. 7, a part of the feature group information, which has the statistical value of the predetermined feature parameter in the cell population of each cell image as an element, is shown. The leftmost column in FIG. 7 contains element names of the feature group information.
Here, “pas” indicates (relative) time. That is, kpas (k is an arbitrary integer value from 1 to 10) is a value obtained from the cell image imaged at the time k.
“AVE” indicates the average value, and “SD” indicates the standard deviation.
For example, the element (Normal_Area_AVE_01pas) in the first row from the top indicates the average value of “Area” of the normal cell population included in the cell image at time t1.
Further, for example, the element (Normal_Area_SD_02pas) in the twelfth row from the top indicates the standard deviation of “Area” of the normal cell population included in the cell image at time t2.

図8の例では、特徴群情報のうち、各細胞画像の細胞集団における所定特徴パラメータについてのヒストグラムのビンを要素とする一部が示されている。図8の一番左の列には、特徴群情報の要素名が含まれている。
ここで、「bin」とはビンの番号を示す。番号の付し方は特に限定されないが、図8の例では、ヒストグラムが12分割(12ビン)から構成されるものとして、左から順に番号が付されている。
例えば上から1番目の行の要素(Area_1pas_1bin)は、時刻t1の細胞画像に含まれる細胞集団の「Area」のヒスグラムのうち、左から1番目のビンの値を示している。
In the example of FIG. 8, a part of the feature group information having the bin of the histogram for the predetermined feature parameter in the cell population of each cell image as an element is shown. The leftmost column in FIG. 8 includes element names of the feature group information.
Here, "bin" indicates a bin number. The numbering method is not particularly limited, but in the example of FIG. 8, the histogram is composed of 12 divisions (12 bins), and the numbers are assigned in order from the left.
For example, the element in the first row from the top (Area_1pas_1bin) indicates the value of the first bin from the left in the histogram of "Area" of the cell population included in the cell image at time t1.

ここで、図7及び図8においては、特徴群情報の各要素(各特徴パラメータ)は、その数値に応じて異なる色及び濃淡がつけられている。
とある領域の色や濃淡のパターンは、細胞の種類「CA」乃至「CD」毎に異なっていたり、特徴的であったりする。
ここで、「とある領域」とは、列方向にみて、連続している複数の項目からなる連続領域の場合もあるし、非連続となっている複数の項目から形成される領域の場合もある。例えば、図7の上から1乃至10行の連続領域(Normal_Area_AVEの部分)が「とある領域」であってもよい。また例えば、時刻t1,t3の非連続な部分(01pass1,03pass3という項目名を有する非連続な領域)が「とある領域」であってもよい。
ここで例えば、特徴群情報の「とある部分」では、細胞の種類「CA」乃至「CD」の分類が容易に可能となるような、色や濃淡のパターンが存在しているものとする。この場合、「とある領域」の色や濃淡のパターンを見比べる(実際の処理では類似度等の演算をする)ことで、細胞の種類「CA」乃至「CD」の分類を容易に行うことができる。
即ち、細胞の種類「CA」乃至「CD」を分類する分析モデルの生成や更新時には、「とある領域」の各項目値(各特徴パラメータの値)に基づいて、サンプルデータが生成される。
また、未知な細胞を被写体とする細胞画像が評価対象となり、当該未知な細胞を種類「CA」乃至「CD」の何れかに分類する場合、評価対象の特徴群情報のうち「とある領域」の各項目値(各特徴パラメータの値)に基づいて、評価対象情報が取得される。つまり、サンプルデータと同一形態の評価対象情報が取得される。
Here, in FIGS. 7 and 8, each element (each feature parameter) of the feature group information is given a different color and shade according to its numerical value.
The color and shade pattern of a certain region may be different or characteristic for each cell type “CA” to “CD”.
Here, "a certain area" may be a continuous area formed of a plurality of continuous items in the column direction, or an area formed of a plurality of non-continuous items. is there. For example, the continuous area (the area of Normal_Area_AVE) of the first to tenth rows from the top of FIG. 7 may be the “certain area”. Further, for example, the non-continuous portion at time t1 and t3 (the non-continuous area having the item names 01pass1 and 03pass3) may be the “certain area”.
Here, for example, it is assumed that in the “some part” of the feature group information, there is a color or shade pattern that enables easy classification of cell types “CA” to “CD”. In this case, it is possible to easily classify the cell types “CA” to “CD” by comparing the patterns of colors and shades of “a certain area” (calculation of the degree of similarity in the actual processing). it can.
That is, when generating or updating the analytical model for classifying the cell types “CA” to “CD”, sample data is generated based on each item value (value of each characteristic parameter) of “a certain area”.
In addition, when a cell image having an unknown cell as a subject is an evaluation target and the unknown cell is classified into any of the types “CA” to “CD”, “a certain area” in the feature group information of the evaluation target. The evaluation target information is acquired based on each item value (value of each characteristic parameter) of. That is, the evaluation target information having the same form as the sample data is acquired.

繰り返しになるが、特徴群情報における「とある領域」とは、分析モデルの種類に応じて、即ち、分析内容、分析手法、各種条件等に応じて、異なるものである。 Again, the “certain area” in the feature group information differs depending on the type of analysis model, that is, the analysis content, analysis method, various conditions, and the like.

ここで、特徴群情報のデータ量について考える。
特徴群情報の次元数N(データの容量)に特に制限がない場合には、細胞画像から得られるあらゆる特徴パラメータのあらゆる値の集合情報(以下、「全体情報」と呼ぶ)を、特徴群情報として採用することができる。
しかしながら、実際には、特徴群情報の次元数N(データの容量)に制限がある場合もある。このような場合には、細胞画像から得られるあらゆる特徴パラメータのあらゆる値の集合情報の一部を、特徴群情報として採用する必要がある。
一方で、情報量を絞り過ぎた特徴群情報では、高精度の分析の妨げになる。
つまり、考えられ得る全組合せの種類の集団情報の中から、分析内容、分析手法、各種条件等にとって好適な集団情報を含むような特徴群情報を生成する必要がある
Here, consider the data amount of the feature group information.
When there is no particular limitation on the number of dimensions N (data volume) of the feature group information, the set information of all values of all feature parameters obtained from the cell image (hereinafter referred to as “whole information”) is used as the feature group information. Can be adopted as
However, in reality, there may be a limit on the number of dimensions N (data capacity) of the feature group information. In such a case, it is necessary to adopt a part of the set information of all values of all feature parameters obtained from the cell image as the feature group information.
On the other hand, the feature group information with too small information amount hinders highly accurate analysis.
That is, it is necessary to generate feature group information that includes group information suitable for the analysis content, the analysis method, various conditions, etc. from the group information of all possible combinations.

図9は、特徴群情報として、分析評価のために抽出される要素の違いを説明するための模式図である。
例えば、図9の例では、細胞の種類「A」、「B」、及び「C」を分類する場合が想定されている。
FIG. 9 is a schematic diagram for explaining a difference in elements extracted for analysis and evaluation as the feature group information.
For example, in the example of FIG. 9, it is assumed that the cell types “A”, “B”, and “C” are classified.

図9(A)の例では、全体情報のうち、2個の細胞単体の特徴パラメータの値が、形としては恣意的に選抜され、時間方向ではランダムに抽出されたものが特徴群情報として採用されている。具体的には例えば、種類「A」の細胞の特徴群情報は、時間的に早いタイミングで撮像された細胞画像内の多数個の細胞(オブジェクト)から2個の細胞単体(オブジェクト)が恣意的に選抜され、当該2個の細胞単体の特徴パラメータの値が抽出されたものから生成されている。
この場合、同一の種類「A」であったとしても、1枚の細胞画像には多数の細胞オブジェクトが含まれており、特徴パラメータの値は夫々バラついている。従って、恣意的に抽出された2個の細胞単体の特徴パラメータの値は、種類「A」の代表値とは限らない。また、特徴パラメータの値は時間変化する場合もあり、ランダムな時間タイミングで抽出された2個の細胞単体の特徴パラメータの値が、種類「A」の代表的値とは限らない。
以上のことから、時間変化を考慮せずに、恣意的に選抜された幾つかの細胞単体の特徴パラメータの値のみを特徴群情報とした場合、細胞の種類「A」、「B」、及び「C」を精度よく分類することは困難な場合が多い。
In the example of FIG. 9(A), among the whole information, the values of the characteristic parameters of the two cells alone are arbitrarily selected as the shape, and randomly extracted in the time direction as the characteristic group information. Has been done. Specifically, for example, the feature group information of the cell of the type “A” is arbitrary from a large number of cells (objects) in a cell image captured at an early timing to two cell simple objects (objects). Is generated from the extracted values of the characteristic parameters of the two single cells.
In this case, many cell objects are included in one cell image even if they are of the same type “A”, and the values of the characteristic parameters are different. Therefore, the values of the feature parameters of the two arbitrarily extracted cells are not always representative values of the type "A". In addition, the value of the characteristic parameter may change with time, and the value of the characteristic parameter of the two single cells extracted at random time timings is not always the representative value of the type “A”.
From the above, when only the values of the characteristic parameters of some arbitrarily selected cells are used as the characteristic group information without considering the time change, the cell types “A”, “B”, and It is often difficult to accurately classify “C”.

そこで、例えば、1枚の細胞画像に含まれる細胞集団という観点と、時間変化という観点とに基づいて各特徴パラメータの値を抽出して、それらの集合体を特徴群情報とするよい。
例えば図9(B)の例では、全体情報のうち、形としては、細胞集団における特徴量の代表値が抽出され、時間的には、当該特徴量の代表値が定期的に抽出された場合の経時情報(時間方向の集合体)が、特徴群情報として採用される。
例えば図9(C)の例では、全体情報のうち、形としては、細胞集団における特徴量の情報全体が抽出され、時間的には、当該特徴量の情報全体が定期的に抽出された場合の経時情報(時間方向の集合体)が、特徴群情報として採用される。
ここで、図9に示すように、図9(A)→図9(B)→図9(C)に従って特徴群情報の情報量(次元Nの数)が増加していくことになる。
Therefore, for example, the values of the respective characteristic parameters may be extracted based on the viewpoint of the cell population included in one cell image and the viewpoint of the temporal change, and the aggregate thereof may be used as the characteristic group information.
For example, in the example of FIG. 9B, in the case where the representative value of the feature amount in the cell population is extracted as the shape and the representative value of the feature amount is regularly extracted in terms of the shape in the overall information. The information over time (aggregation in the time direction) is adopted as the feature group information.
For example, in the example of FIG. 9C, in the case of the whole information, as the shape, the entire information of the feature amount in the cell population is extracted, and in terms of time, the entire information of the feature amount is regularly extracted. The information over time (aggregation in the time direction) is adopted as the feature group information.
Here, as shown in FIG. 9, the information amount (the number of dimensions N) of the feature group information increases in accordance with FIG. 9(A)→FIG. 9(B)→FIG. 9(C).

しかしながら、上述したように、特徴群情報の次元数N(データの容量)に制限がある場合が多い。このような制限に対応するためには、全体情報に対して、情報の整理と選抜により好適なパラメータの値を抽出して、図9(D)の例のような特徴群情報を生成する必要がある。
即ち、例えば図9(D)の例に示すように、全体情報のうち、形としては、細胞集団における特徴量のうち有効なものの強調と組合せによる加工がなされたものが抽出され、時間的には、当該細胞集団における特徴量のうち有効なものの強調と組合せによる加工がなされたものが定期的に抽出された場合の経時情報(時間方向の集合体)が、特徴群情報として採用される。
However, as described above, the number of dimensions N (data capacity) of the feature group information is often limited. In order to cope with such a restriction, it is necessary to extract suitable parameter values by organizing and selecting information from the whole information and generating feature group information as shown in the example of FIG. 9D. There is.
That is, for example, as shown in the example of FIG. 9(D), as the shape of the overall information, the effective information of the feature quantities in the cell population that has been processed by being emphasized and combined is extracted and temporally extracted. For the feature group information, time-lapse information (aggregation in the time direction) in the case where effective ones of the feature quantities in the cell population and processed by combination are periodically extracted is adopted as the feature group information.

さらに、図10乃至図12を参照して、細胞集団における特徴量のうち有効なものの強調と組合せに基づく特徴群情報の生成手法について説明する。 Further, with reference to FIGS. 10 to 12, a method of generating the feature group information based on the emphasis and combination of effective ones of the feature amounts in the cell population will be described.

図10は、細胞集団における特徴量のうち有効なものの強調と組合せに基づいて、細胞画像から生成された特徴群情報を模式的に示す図である。
図10の例では、同一種類の細胞集団が所定容器で培養され、時間と共に細胞数も増加するものとする。
つまり、図10には、細胞画像Gaには1つの細胞のみが図示され、細胞画像Gbには2つの細胞のみが図示され、細胞画像Gcには4つの細胞のみが図示されていようにみえるが、当然ながら、図10の細胞画像Gに示すように、実際には細胞集団が所定容器に含まれている。つまり、図10の細胞は、1個の細胞を示しているのではなく、時間毎に増加する割合(=1:2:4)を示している。
FIG. 10 is a diagram schematically showing characteristic group information generated from a cell image based on the emphasis and combination of effective ones of the characteristic amounts in the cell population.
In the example of FIG. 10, it is assumed that the same type of cell population is cultured in a predetermined container and the number of cells increases with time.
That is, in FIG. 10, only one cell is shown in the cell image Ga, only two cells are shown in the cell image Gb, and only four cells are shown in the cell image Gc. Of course, as shown in the cell image G of FIG. 10, the cell population is actually contained in the predetermined container. That is, the cells in FIG. 10 do not show one cell, but show a ratio (=1:2:4) that increases with time.

第1時刻で撮影された細胞画像Gaからは、特徴群情報Iaが得られている。特徴群情報Iaは、N種類の特徴パラメータ(要素)として、各細胞毎の形、動き、及び表面という3つの形態的特徴量と、細胞集団の集団情報とを少なくとも含んでいる。ここで、集団情報としては、平均値や分散値等の統計値や、ヒストグラムのビンの値等がある。
例えば、集団情報として、細胞集団の「形」のヒストグラムから得られる数値データIka、細胞集団の「動き」のヒストグラムから得られる数値データIua、及び、細胞集団の「表面」のヒストグラムから得られる数値データIhaが、特徴群情報Iaに含まれている。
The feature group information Ia is obtained from the cell image Ga captured at the first time. The feature group information Ia includes, as N types of feature parameters (elements), at least three morphological feature quantities of a shape, a movement, and a surface of each cell, and population information of a cell population. Here, as the group information, there are statistical values such as an average value and a variance value, a bin value of a histogram, and the like.
For example, as the population information, numerical data Ika obtained from the "shape" histogram of the cell population, numerical data Iua obtained from the "movement" histogram of the cell population, and numerical values obtained from the "surface" histogram of the cell population The data Iha is included in the feature group information Ia.

ここで、各ヒストグラムを構成するビンのうち、ハッチングがかけられたビンが、特徴群情報Iaに含まれる情報(1つのビンを1つの要素とすれば、所定の1種類の特徴パラメータ)である。
ここで、細胞集団の「形」のヒストグラムでは、中央左側の3つのビンが、「形」を特徴づけるものである。換言すると、ヒストグラム全体では、「形」の特徴が薄らいでしまうため、「形」の特徴を「強調」すべく中央左側の3つのビンが抽出されている。
一方、「動き」の特徴を「強調」すべきビンとしては、「形」とは異なり、右側の5つのビンが抽出されている。また、「表面」の特徴を「強調」すべきビンとしては、「形」や「動き」とは異なり、両端の6つのビンが抽出されている。
これらの各特徴(形、動き、表面)毎に強調された情報(抽出されたビン)の夫々が、数値データIka、数値データIua、及び、数値データIhaの夫々である。
そして、これら数値データIka、数値データIua、及び、数値データIhaの「組合せ」により、特徴群情報Iaがつくられている。
Here, among the bins forming each histogram, the hatched bin is the information included in the feature group information Ia (one predetermined feature parameter if one bin is one element). ..
Here, in the “shape” histogram of the cell population, the three bins on the left side of the center characterize the “shape”. In other words, in the entire histogram, the "shape" feature is faint, so the three bins on the left side of the center are extracted to "emphasize" the "shape" feature.
On the other hand, unlike the “shape”, the five bins on the right side are extracted as the bins whose “motion” characteristics should be “emphasized”. Further, as the bins whose “surface” characteristics should be “emphasized”, six bins at both ends are extracted, unlike “shape” and “motion”.
The information (extracted bins) emphasized for each of these features (shape, movement, surface) is the numerical data Ika, the numerical data Iua, and the numerical data Iha, respectively.
Then, the characteristic group information Ia is created by the “combination” of the numerical data Ika, the numerical data Iua, and the numerical data Iha.

第2時刻で撮影された細胞画像Gbからは、特徴群情報Ibが得られている。特徴群情報Ibは、N種類の特徴パラメータ(要素)として、各細胞毎の形、動き、及び表面という3つの形態的特徴量と、細胞集団の集団情報とを少なくとも含んでいる。
例えば、集団情報として、細胞集団の「形」のヒストグラムから得られる数値データIkb、細胞集団の「動き」のヒストグラムから得られる数値データIub、及び、細胞集団の「表面」のヒストグラムから得られる数値データIhbが、特徴群情報Ibに含まれている。
つまり、各特徴(形、動き、表面)毎に強調された情報(抽出されたビン)の夫々が、数値データIkb、数値データIub、及び、数値データIhbの夫々である。そして、これら数値データIkb、数値データIub、及び、数値データIhbの「組合せ」により、特徴群情報Ibがつくられている。
The feature group information Ib is obtained from the cell image Gb taken at the second time. The feature group information Ib includes, as N types of feature parameters (elements), at least three morphological feature quantities of a shape, a movement, and a surface of each cell, and population information of a cell population.
For example, as the population information, numerical data Ikb obtained from the histogram of the “shape” of the cell population, numerical data Iub obtained from the histogram of the “movement” of the cell population, and numerical values obtained from the histogram of the “surface” of the cell population. The data Ihb is included in the feature group information Ib.
That is, the pieces of information (extracted bins) emphasized for each feature (shape, movement, surface) are the numerical data Ikb, the numerical data Iub, and the numerical data Ihb, respectively. Then, the characteristic group information Ib is created by the “combination” of the numerical data Ikb, the numerical data Iub, and the numerical data Ihb.

第3時刻で撮影された細胞画像Gcからは、特徴群情報Icが得られている。特徴群情報Icは、N種類の特徴パラメータ(要素)として、各細胞毎の形、動き、及び表面という3つの形態的特徴量と、細胞集団の集団情報とを少なくとも含んでいる。
例えば、集団情報として、細胞集団の「形」のヒストグラムから得られる数値データIkc、細胞集団の「動き」のヒストグラムから得られる数値データIuc、及び、細胞集団の「表面」のヒストグラムから得られる数値データIhcが、特徴群情報Icに含まれている。
つまり、各特徴(形、動き、表面)毎に強調された情報(抽出されたビン)の夫々が、数値データIkc、数値データIuc、及び、数値データIhcの夫々である。そして、これら数値データIkc、数値データIuc、及び、数値データIhcの「組合せ」により、特徴群情報Icがつくられている。
The feature group information Ic is obtained from the cell image Gc taken at the third time. The feature group information Ic includes, as N types of feature parameters (elements), at least three morphological feature quantities of the shape, movement, and surface of each cell, and population information of the cell population.
For example, as population information, numerical data Ikc obtained from the histogram of the "shape" of the cell population, numerical data Iuc obtained from the histogram of the "movement" of the cell population, and numerical values obtained from the histogram of the "surface" of the cell population. The data Ihc is included in the feature group information Ic.
That is, the information (extracted bin) emphasized for each feature (shape, motion, surface) is the numerical data Ikc, the numerical data Iuc, and the numerical data Ihc, respectively. Then, the characteristic group information Ic is created by the “combination” of the numerical data Ikc, the numerical data Iuc, and the numerical data Ihc.

このように、各特徴(形、動き、表面)毎に、分布中の情報強調のパターン、即ちヒストグラム中のどのビンを抽出して強調するするのかというパターンは異なっている。
このようなパターンは、図10の例の3種類に限定されず、任意の種類を設定することができる。
図11は、分布中の情報強調のパターンの各種具体例を示している。
図11(A)は、ヒストグラムの全分布情報を用いるパターンを示している。
ここで、ヒストグラムとして、個数での絶対値情報(図11の細胞画像Gから得られた各個数をそのままヒストグラム化したもの)と、データベース内の標準値を用いた標準正規化情報(図11の細胞画像Gから得られた各個数を正規化してヒストグラム化したもの)との両者を選択的に採用することができる。
図11(B)は、ヒストグラムの平均値・中央値を用いるパターンを示している。
図11(C)は、ヒストグラム(分布)中の80%信頼区間以内の情報を用いるパターンを示している。
図11(D)は、ヒストグラム(分布)中の平均値より上の情報を用いるパターンを示している。
図11(E)は、分布中の80%信頼区間以外の情報を用いるパターンを示している。
As described above, the pattern of information emphasis in the distribution, that is, the pattern of which bin in the histogram is extracted and emphasized is different for each feature (shape, motion, surface).
Such patterns are not limited to the three types shown in FIG. 10, and any type can be set.
FIG. 11 shows various specific examples of the information emphasis pattern in the distribution.
FIG. 11A shows a pattern using all distribution information of the histogram.
Here, as a histogram, absolute value information on the number (a number obtained by directly converting each number obtained from the cell image G in FIG. 11 into a histogram) and standard normalization information using standard values in the database (in FIG. 11). And a histogram obtained by normalizing each number obtained from the cell image G).
FIG. 11B shows a pattern using the average value/median value of the histogram.
FIG. 11C shows a pattern using information within the 80% confidence interval in the histogram (distribution).
FIG. 11D shows a pattern using information above the average value in the histogram (distribution).
FIG. 11E shows a pattern using information other than the 80% confidence interval in the distribution.

特徴群情報の生成に際し(或いは後述するサンプルデータの抽出に際し)、これらの全パターンの中から、各特徴(形、動き、表面)にとって、或いは分析内容、分析手法、各種条件にとって最適な指標(パターン)と経時点の組合せが用いられる。なお、経時点については、図12を参照して後述する。 When generating the feature group information (or extracting the sample data described later), from all of these patterns, the most suitable index for each feature (shape, motion, surface) or for the analysis content, analysis method, and various conditions ( Pattern) and the point in time are used. The time point will be described later with reference to FIG.

ここで、図10の特徴群情報Ia乃至Icの夫々は、図3の例でいえば、画像数値化部91において単一の細胞画像から作られた数値化情報であり、数値化情報蓄積部101に蓄積されるものである。
従って、図3を用いて上述したように、同一時間で同一条件の他の細胞画像(例えば複数のウェルの細胞画像)が存在するならば、複数画像特徴群情報生成部92により、当該他の細胞画像の特徴群情報と結合したり整理されたりし、その結果得られる第1単位の特徴群情報が第1特徴群情報蓄積部102に蓄積される。
ヘテロ性情報付加部93については、図12を参照して後述するものとして、経時変化情報付加部94の処理について説明する。
経時変化情報付加部94は、特徴群情報Ia乃至Icの夫々のうち、集団情報について、経時変化という点を考慮した加工(結合や整理等)をすることによって、第3処理単位の特徴群情報を生成する。
Here, in the example of FIG. 3, each of the feature group information Ia to Ic in FIG. 10 is digitized information created from a single cell image in the image digitization unit 91, and the digitized information storage unit It is stored in 101.
Therefore, as described above with reference to FIG. 3, if another cell image (for example, a cell image of a plurality of wells) under the same condition exists at the same time, the multi-image feature group information generation unit 92 causes the other The feature group information of the first unit, which is combined with or organized by the feature group information of the cell image, is stored in the first feature group information storage unit 102.
The heterogeneity information adding unit 93 will be described later with reference to FIG. 12, and the processing of the temporal change information adding unit 94 will be described.
The aging information adding unit 94 performs processing (combining, organizing, etc.) in consideration of the aging of the group information among the feature group information Ia to Ic, so that the feature group information of the third processing unit. To generate.

図12は、経時変化という点を考慮した集団データの加工手法の各種具体例を示している。
なお、上述の図12は、3つの異なるタイミングの細胞画像に基づく例とされているのに対して、この図12は4つの異なるタイミング(24h、48h、72h、及び96h)の細胞画像Ga,Gb,Gc,Gdに基づく例とされている。しかしながら、図12に示す各加工手法の考え方は図10の例にも同様に当てはまる。
FIG. 12 shows various specific examples of the method of processing the collective data in consideration of the change over time.
Note that, while FIG. 12 described above is an example based on cell images at three different timings, this FIG. 12 shows cell images Ga at four different timings (24h, 48h, 72h, and 96h). The example is based on Gb, Gc, and Gd. However, the concept of each processing method shown in FIG. 12 is similarly applied to the example of FIG.

図12の例では、先ず、標準化整理タイプAと、標準化整理タイプBとを選択的に採用することができるようになっている。
標準化整理タイプAとは、分布(ヒストグラム)として、上述の図11に示す、個数での絶対値情報(図11の細胞画像Gから得られた各個数をそのままヒストグラム化したもの)を採用するパターンである。
標準化整理タイプBとは、上述の図11に示す、データベース内の標準値を用いた標準正規化情報(図11の細胞画像Gから得られた各個数を正規化してヒストグラム化したもの)を採用するパターンである。
In the example of FIG. 12, first, the standardized rearrangement type A and the standardized rearrangement type B can be selectively adopted.
The standardized rearrangement type A is a pattern that employs the absolute value information on the number shown in FIG. 11 (a histogram obtained by directly converting each number obtained from the cell image G of FIG. 11) as a distribution (histogram). Is.
The standardized rearrangement type B adopts the standard normalization information (standardized each histogram obtained from the cell image G of FIG. 11 and made into a histogram) using the standard value in the database shown in FIG. 11 described above. Pattern.

図12(A)は、図11(A)のヒストグラムの全分布情報を用いるパターンを採用した場合の、時刻t1乃至t5の経時変化を考慮した特徴群情報を模式的に示したものである。
図12(B)は、図11(B)のヒストグラムの平均値・中央値を用いるパターンを採用した場合の、時刻t1乃至t5の経時変化を考慮した特徴群情報を模式的に示したものである。
図12(C)は、図11(C)のヒストグラム(分布)中の80%信頼区間以内の情報を用いるパターンを採用した場合の、時刻t1乃至t5の経時変化を考慮した特徴群情報を模式的に示したものである。
図12(D)は、図11(D)のヒストグラム(分布)中の平均値より上の情報を用いるパターンを採用した場合の、時刻t1乃至t5の経時変化を考慮した特徴群情報を模式的に示したものである。
図12(E)は、図11(E)の分布中の80%信頼区間以外の情報を用いるパターンを採用した場合の、時刻t1乃至t5の経時変化を考慮した特徴群情報を模式的に示したものである。
FIG. 12A schematically shows the feature group information in consideration of the change with time from time t1 to time t5 when the pattern using the entire distribution information of the histogram of FIG. 11A is adopted.
FIG. 12B schematically shows the feature group information in consideration of the temporal change from time t1 to t5 when the pattern using the average value/median value of the histogram of FIG. 11B is adopted. is there.
FIG. 12C schematically shows the feature group information in consideration of the change with time from time t1 to t5 when the pattern using the information within the 80% confidence interval in the histogram (distribution) of FIG. 11C is adopted. It is shown in the figure.
FIG. 12D schematically shows the feature group information in consideration of the change with time from time t1 to t5 when the pattern using the information above the average value in the histogram (distribution) of FIG. 11D is adopted. It is shown in.
FIG. 12(E) schematically shows the feature group information in consideration of the change over time from time t1 to t5 when the pattern using information other than the 80% confidence interval in the distribution of FIG. 11(E) is adopted. It is a thing.

次に、図13を参照して、図3のヘテロ性情報付加部93について具体的に説明する。
図13は、ヘテロ性情報付加という点を考慮した集団情報の加工手法の各種具体例を示している。
ヘテロ性情報付加とは、複数条件及び同一時間に撮像された複数の細胞画像の関係性を示す情報を付加することをいう。即ち、複数条件及び同一時間に撮像された複数の細胞画像から夫々得られた特徴群情報について、条件変化という点を考慮した加工(結合や整理等)をすることをいう。
Next, the heterogeneous information adding unit 93 of FIG. 3 will be specifically described with reference to FIG.
FIG. 13 shows various specific examples of a method of processing group information in consideration of the addition of heterogeneous information.
Heterogeneous information addition means addition of information indicating the relationship between a plurality of cell images captured at the same time and under a plurality of conditions. That is, it means that the feature group information obtained respectively from a plurality of cell images imaged at a plurality of conditions and at the same time is processed (combined, organized, etc.) in consideration of the condition change.

図13には、同一種類Aの細胞(異なる3つの容器)に対して、培養条件A、培養条件B、及び培養条件Cが夫々課された上で、培養された例が示されている。 FIG. 13 shows an example in which cells of the same type A (three different containers) are subjected to culture condition A, culture condition B, and culture condition C, respectively, and then cultured.

つまり、培養条件Aについては、時刻t1における特徴群情報IgAt1,時刻t2における特徴群情報IgAt2,時刻t3における特徴群情報IgAt3がまとめられて(加工されて)、特徴群情報IgAが構成される。
同様に、培養条件Bについては、時刻t1における特徴群情報IgBt1,時刻t2における特徴群情報IgBt2,時刻t3における特徴群情報IgBt3がまとめられて(加工されて)、特徴群情報IgBが構成される。
培養条件Cについては、時刻t1における特徴群情報IgCt1,時刻t2における特徴群情報IgCt2,時刻t3における特徴群情報IgCt3がまとめられて(加工されて)、特徴群情報IgcC構成される。
That is, for the culture condition A, the feature group information IgAt at time t1, the feature group information IgAt2 at time t2, and the feature group information IgAt3 at time t3 are collected (processed) to form feature group information IgA.
Similarly, for the culture condition B, the feature group information IgBt1 at the time t1, the feature group information IgBt2 at the time t2, and the feature group information IgBt3 at the time t3 are collected (processed) to form the feature group information IgB. ..
Regarding the culture condition C, the feature group information IgCt1 at the time t1, the feature group information IgCt2 at the time t2, and the feature group information IgCt3 at the time t3 are collected (processed) to form the feature group information IgcC.

さらに、培養条件Aの特徴群情報IgA,培養条件Bの特徴群情報IgB,培養条件Cの特徴群情報IgCの夫々が高次情報にまとめられて、特徴群情報Ig1が構成される。
つまり、培養条件という条件変化という点を考慮したヘテロ性情報が付加されたことになる。
さらに、高次情報における優先順位付けが行われて、細胞品質(ここでは細胞Aの品質)を表現する高次元情報としての特徴群情報Ig2が得られる。
Further, the feature group information IgA of the culture condition A, the feature group information IgB of the culture condition B, and the feature group information IgC of the culture condition C are combined into higher-order information to form feature group information Ig1.
That is, the heterogeneous information is added in consideration of the change in the condition of culture.
Furthermore, the higher-order information is prioritized, and the feature group information Ig2 as high-dimensional information expressing the cell quality (here, the quality of the cell A) is obtained.

所定の1条件の所定の1時刻の特徴群情報(例えば培養条件Aの時刻t1の特徴群情報IgAt1)と比較すると、特徴群情報Ig2は、ヘテロ性情報付加及び経時変化が考慮されている点で、細胞Aの品質をより良く表した情報となっている。 Compared with the characteristic group information at a predetermined time of one predetermined condition (for example, the characteristic group information IgAt1 at the time t1 of the culture condition A), the characteristic group information Ig2 takes into consideration heterogeneous information addition and change over time. Thus, the information is a better representation of the quality of cell A.

なお、図13の例では、経時変化を考慮した加工(結合や整理等)の後、ヘテロ性情報付加が行われているように説明したが、各時刻t1乃至t3毎にヘテロ性情報付加をした後に、それらをまとめるといった経時変化を考慮した加工(結合や整理等)をしてもよい。
つまり、図3の機能ブロック図は、後者の例の機能ブロック図となっているが、図13に併せて、経時変化情報付加部94とヘテロ性情報付加部93との配置順番を入れ替えても良い。
In the example of FIG. 13, it is described that the heterogeneous information is added after the processing (combining, rearranging, etc.) considering the temporal change, but the heterogeneous information is added at each time t1 to t3. After that, they may be processed (combined, organized, etc.) in consideration of changes with time such as putting them together.
That is, although the functional block diagram of FIG. 3 is a functional block diagram of the latter example, the arrangement order of the temporal change information adding unit 94 and the heterogeneous information adding unit 93 may be changed in accordance with FIG. good.

図14は、このようにして、ヘテロ性情報付加及び経時変化を考慮した加工がなされた各細胞品質を表す特徴群情報について、240種類集めたもの、即ち複数の細胞の品質を表す特徴群情報の一例を示している。
即ち、図14の例では、所定の1列が、1つの種類の細胞品質を表現する高次元情報としての特徴群情報となっている。
なお、図14の例では、240種類の細胞品質を表現する高次元情報を単に並べたものではなく、後述するクラスタリング等によって高次情報の類似度が近いもの同士が近くなるように配置されたものである。そういった点で、類似度の近い/遠いを示す分岐図は分析モデルの一種であると把握することもできるし、そのように把握した場合、図14のデータは、当該分析モデルを導出したサンプルデータ群と把握することもできる。
FIG. 14 shows a collection of 240 types of feature group information representing each cell quality that has been processed in this manner with the addition of heterogeneous information and changes taken into consideration, that is, feature group information representing the quality of a plurality of cells. Shows an example.
That is, in the example of FIG. 14, one predetermined column is feature group information as high-dimensional information expressing one type of cell quality.
In the example of FIG. 14, high-dimensional information expressing 240 types of cell qualities is not simply arranged, but the high-dimensional information having similar degrees of similarity is arranged closer to each other by clustering or the like described later. It is a thing. From this point of view, it is possible to understand that the bifurcation diagram showing closeness/distantness of similarity is a kind of analysis model, and in such a case, the data in FIG. 14 is the sample data from which the analysis model is derived. It can be understood as a group.

以上、図10乃至図14を参照して、特徴群情報の生成の一連の流れの具体例について説明した。
次に、図15乃至図27を参照して、当該特徴群情報からサンプルデータを生成して、当該サンプルデータを用いて分析モデルを生成するまでの一連の流れについて具体的に説明する。
Heretofore, a specific example of a series of flows for generating the feature group information has been described with reference to FIGS.
Next, with reference to FIGS. 15 to 27, a series of flows from generating sample data from the feature group information and generating an analysis model using the sample data will be specifically described.

図15は、従来のサンプルデータと、本実施形態の特徴群情報から生成されるサンプルデータとの違いを示す図である
図15の例のサンプルデータは、細胞品質変化を予測するための分析モデルを生成するために用いられるものとする。
FIG. 15 is a diagram showing the difference between the conventional sample data and the sample data generated from the feature group information of the present embodiment. The sample data of the example of FIG. 15 is an analysis model for predicting a change in cell quality. Shall be used to generate.

従来においても、本発明者らは、細胞集団の特徴の経時変化を考慮したサンプルデータP12を用いていた。ただし、サンプルデータP12は、各時刻の細胞画像Gから得られる、細胞集団の細胞形態の平均値の各時刻のデータ群P11を単に時系列順に並べられものである。
これに対して、本実施形態では、細胞集団の細胞形態の分布(ヒストグラム)から、図11に示す各パターン毎の情報が各時刻毎に抽出された集合体P21が得られる。当該集合体P21に基づいて特徴群情報P22が生成される。そして、当該特徴群情報P22がまとめられ(必要に応じて整理や加工がされて)、高次元の特徴群情報P23が得られる。
この特徴群情報P23から、任意の個数の任意の組合せのデータをサンプルデータとして採用することができる。
Conventionally, the present inventors have also used the sample data P12 in consideration of the change over time in the characteristics of the cell population. However, the sample data P12 is obtained by simply arranging the data group P11 at each time of the average value of the cell morphology of the cell population, which is obtained from the cell image G at each time.
On the other hand, in the present embodiment, the aggregate P21 in which the information for each pattern shown in FIG. 11 is extracted at each time is obtained from the distribution (histogram) of the cell morphology of the cell population. The feature group information P22 is generated based on the aggregate P21. Then, the feature group information P22 is collected (arranged and processed as necessary), and high-dimensional feature group information P23 is obtained.
From this feature group information P23, it is possible to adopt any number of data of any combination as sample data.

図16は、細胞品質変化を予測するための分析モデルの生成に用いるサンプルデータの一例を示している。
図16の例では、品質A乃至Eの夫々についてのサンプルデータの一例が示されている。
図16において、少数特徴量情報P1とは、図15の従来のサンプルデータP12に対応するものである。
高次元特徴量情報P2とは、図15の本実施形態の高次元の特徴群情報P23に対応するものである。
FIG. 16 shows an example of sample data used to generate an analytical model for predicting changes in cell quality.
The example of FIG. 16 shows an example of sample data for each of the qualities A to E.
In FIG. 16, the minority feature amount information P1 corresponds to the conventional sample data P12 of FIG.
The high-dimensional feature amount information P2 corresponds to the high-dimensional feature group information P23 of this embodiment shown in FIG.

図17は、図16のサンプルデータを用いて細胞品質変化を予測したときの予測精度を示している。
「細胞形態の平均」とは、図16の少数特徴量情報P1(図15の従来のサンプルデータP12)を用いた場合の予測精度を示している。
「標準化タイプA」とは、図16の高次元特徴量情報P2(図15の高次元の特徴群情報P23)のうち、図12(A)のヒストグラムの全分布情報を用いるパターンの時系列情報の部分をサンプルデータとして抽出し、当該サンプルデータを用いた場合の予測精度を示している。
「標準化タイプB」とは、図16の高次元特徴量情報P2(図15の高次元の特徴群情報P23)のうち、図12(B)のヒストグラムの平均値・中央値を用いるパターンの時系列情報の部分をサンプルデータとして抽出し、当該サンプルデータを用いた場合の予測精度を示している。
「標準化タイプC」とは、図16の高次元特徴量情報P2(図15の高次元の特徴群情報P23)のうち、図12(C)のヒストグラム(分布)中の80%信頼区間以内の情報を用いるパターンの時系列情報の部分をサンプルデータとして抽出し、当該サンプルデータを用いた場合の予測精度を示している。
「標準化タイプD」とは、図16の高次元特徴量情報P2(図15の高次元の特徴群情報P23)のうち、図12(D)のヒストグラム(分布)中の平均値より上の情報を用いるパターンの時系列情報の部分をサンプルデータとして抽出し、当該サンプルデータを用いた場合の予測精度を示している。
「標準化タイプE」とは、図16の高次元特徴量情報P2(図15の高次元の特徴群情報P23)のうち、図12(E)の分布中の80%信頼区間以外の情報を用いるパターンの時系列情報の部分をサンプルデータとして抽出し、当該サンプルデータを用いた場合の予測精度を示している。
FIG. 17 shows the prediction accuracy when the cell quality change is predicted using the sample data of FIG.
“Average of cell morphology” indicates prediction accuracy when the minority feature amount information P1 of FIG. 16 (conventional sample data P12 of FIG. 15) is used.
The “standardized type A” is time-series information of a pattern using all distribution information of the histogram of FIG. 12A in the high-dimensional feature amount information P2 of FIG. 16 (high-dimensional feature group information P23 of FIG. 15). The part of is extracted as sample data, and the prediction accuracy when the sample data is used is shown.
“Standardized type B” means a pattern in which the average value/median value of the histogram of FIG. 12B is used in the high-dimensional feature amount information P2 of FIG. 16 (high-dimensional feature group information P23 of FIG. 15). The prediction accuracy is shown when the sequence information portion is extracted as sample data and the sample data is used.
The “standardized type C” is within the 80% confidence interval in the histogram (distribution) of FIG. 12C, out of the high-dimensional feature amount information P2 of FIG. 16 (high-dimensional feature group information P23 of FIG. 15). The time-series information part of the pattern using information is extracted as sample data, and the prediction accuracy is shown when the sample data is used.
The “standardized type D” is the information above the average value in the histogram (distribution) of FIG. 12D among the high-dimensional feature amount information P2 of FIG. 16 (high-dimensional feature group information P23 of FIG. 15). The time-series information part of the pattern using is extracted as sample data, and the prediction accuracy is shown when the sample data is used.
The “standardized type E” uses information other than the 80% confidence interval in the distribution of FIG. 12E among the high-dimensional feature amount information P2 of FIG. 16 (high-dimensional feature group information P23 of FIG. 15). The prediction accuracy is shown when the time-series information part of the pattern is extracted as sample data and the sample data is used.

図17の例では、標準化タイプEが最も予測精度が良いことがわかる。
つまり、本実施形態では、高次元の特徴群情報P23から、任意の個数の任意の組合せ(全個数含む。つまり高次元の特徴群情報P23そのものを含む)の情報群をサンプルデータとして用いることができる。
従って、所定の分析モデルを生成するに際し、その分析モデルが用いられる分析内容、分析手法、各種条件等に適合したサンプルデータ(図17の例では標準化タイプE)を見つけることができれば、当該サンプルデータを用いて、分析内容、分析手法、各種条件等に適合した分析モデルを生成することが可能になる。
In the example of FIG. 17, it can be seen that the standardized type E has the best prediction accuracy.
That is, in the present embodiment, from the high-dimensional feature group information P23, an information group of an arbitrary number and arbitrary combination (including the total number, that is, including the high-dimensional feature group information P23 itself) can be used as sample data. it can.
Therefore, when generating a predetermined analysis model, if sample data (standardized type E in the example of FIG. 17) suitable for the analysis content, analysis method, various conditions, etc. in which the analysis model is used can be found, the sample data By using, it becomes possible to generate an analysis model suitable for the analysis content, analysis method, various conditions, and the like.

このようにして、図17の標準化タイプEのサンプルデータを用いて生成された分析モデルにより、実際に細胞品質変化を予測した結果が図18に示されている。
図18において、行方向は正答のラベルを示し、列方向は分析結果のラベルを示している。
所定種類(品質)の細胞・所定細胞培養条件の組に対して、55回の分析が行われ、その分析結果が四角印で示されている。つまり、正答のラベルと分析結果のラベルが一致する項目に、分析結果の四角印が付されている場合、予測が成功したことを示している。
図18に示すように、非常に高精度の予測ができていることがわかる。
FIG. 18 shows the result of actually predicting the change in cell quality by the analytical model generated using the standardized type E sample data in FIG. 17 in this way.
In FIG. 18, the row direction indicates the correct answer label, and the column direction indicates the analysis result label.
55 sets of analyzes were performed on a set of cells of a predetermined type (quality) and predetermined cell culture conditions, and the analysis results are shown by square marks. That is, when the square mark of the analysis result is attached to the item where the label of the correct answer and the label of the analysis result match, it indicates that the prediction is successful.
As shown in FIG. 18, it can be seen that the prediction can be performed with extremely high accuracy.

図19は、図15乃至図18で説明した例とは別の所定の分析モデルの生成に用いられる、複数のサンプルデータの一例を示している。
複数のサンプルデータIga乃至Igjは、上述したように、イメージデータではなく数値化データであり、具体的にはM種類のパラメータを要素として含む多次元情報である。
ここで、サンプルデータを構成する1要素の数値単体も、細胞の形態的特徴量等を示す値であり、有意情報である。
しかし、これらの各要素の組合せからなるサンプルデータIga乃至Igjは全体として、他のサンプルデータとの比較においてさらに特徴的な有意情報となる。
図19の例では、各要素はその値に応じた色や濃度で夫々表されており、これらの各要素の色や濃度の集合として形成される「模様」が、各サンプルデータIga乃至Igjの特徴をよく表す有意情報となっていることがわかる。
FIG. 19 shows an example of a plurality of sample data used for generating a predetermined analysis model different from the examples described in FIGS. 15 to 18.
As described above, the plurality of sample data Iga to Igj are not image data but numerical data, and specifically, are multidimensional information including M types of parameters as elements.
Here, a single numerical value element that constitutes the sample data is also a value indicating the morphological characteristic amount of the cell and is also significant information.
However, the sample data Iga to Igj formed by the combination of each of these elements, as a whole, serve as more characteristic and significant information in comparison with other sample data.
In the example of FIG. 19, each element is represented by a color and a density corresponding to the value thereof, and a “pattern” formed as a set of colors and a density of each of these elements corresponds to each of the sample data Iga to Igj. It can be seen that it is significant information that shows the characteristics well.

ここで、複数のサンプルデータIga乃至Igjの夫々に対して、所定の観点で総合的なスコアが与えられるものとする。
所定の観点は特に限定されないが、説明の便宜上例えば、細胞の種類を種類Aと種類Bとを分類するという観点が採用されているものとする。そして、スコアが100に近くなる程、種類Aに特有な特徴を多く含んでいる(種類Bに特有な特徴は少なくなっている)ものとする。逆に、スコアが0に近くなるほど種類Bに特有な特徴を多く含んでいる(種類Aに特有な特徴は少なくなっている)ものとする。
つまり、図19の例では、サンプルデータIgaは、スコアが「90」と最高値のため、種類Aに特有な特徴を多く含むデータである。逆に、サンプルデータIge乃至Ighは、スコアが「0」と最低値のため、種類Bに特有な特徴を多く含むデータである。サンプルデータIgiは、スコアが「50」と中央値のため、種類Aに特有な特徴も含むし、種類Bに特有な特徴を含むデータである。
Here, it is assumed that a comprehensive score is given to each of the plurality of sample data Iga to Igj from a predetermined viewpoint.
The predetermined viewpoint is not particularly limited, but for the sake of convenience of description, it is assumed that, for example, the viewpoint of classifying cell types into type A and type B is adopted. The closer the score is to 100, the more the characteristics peculiar to the type A are included (the characteristics peculiar to the type B are smaller). On the contrary, it is assumed that the closer the score is to 0, the more the characteristics peculiar to the type B are included (the characteristics peculiar to the type A are smaller).
That is, in the example of FIG. 19, the sample data Iga has a score of “90”, which is the highest value, so that the sample data Iga includes many features peculiar to the type A. On the contrary, since the sample data Ige to Igh have the lowest score of “0”, the sample data Ige to Igh are data including many characteristics peculiar to the type B. Since the sample data Igi has a median value of “50”, the sample data Igi is a data including the characteristic peculiar to the type A and the characteristic peculiar to the type B.

なお、複数のサンプルデータIga乃至Igjの夫々に対してスコアの与え方は、特に限定されない。
例えば複数のサンプルデータIga乃至Igjの夫々に対して、対応する評価対象情報(破壊テスト等別評価で得られた既知情報)が図2の細胞評価DB62に格納されている場合、当該評価対象情報に基づいてスコアを与える手法を採用してもよい。
The method of giving a score to each of the plurality of sample data Iga to Igj is not particularly limited.
For example, in the case where corresponding evaluation target information (known information obtained by evaluation such as destructive test) for each of the plurality of sample data Iga to Igj is stored in the cell evaluation DB 62 of FIG. You may employ the method of giving a score based on.

図20は、このような図19のサンプルデータIga乃至Igjを用いて、所定の分析モデルを生成する手法の2つの例を示している。
具体的には上記の例にあわせると、図20の例は、細胞の種類を種類Aと種類Bに分類するための分析モデルの生成例になる。
FIG. 20 shows two examples of methods for generating a predetermined analysis model using the sample data Iga to Igj shown in FIG.
Specifically, in combination with the above example, the example of FIG. 20 is an example of generation of an analytical model for classifying cell types into type A and type B.

図20(A)は、機械学習を用いた分析モデルの生成例である。
図20(A)の例では、分析モデル生成部44は、複数のサンプルデータIga乃至Igjを用いて機械学習を実行することにより、サンプルデータのM個のパラメータの各値Xを入力パラメータとしてスコアYを出力する関数(同図の例では、Y=aX+bX+cX)を生成又は更新する。
FIG. 20A is an example of generating an analysis model using machine learning.
In the example of FIG. 20A, the analysis model generation unit 44 executes machine learning using a plurality of sample data Iga to Igj, and scores each value X of M parameters of the sample data as an input parameter. A function that outputs Y (Y=aX+bX+cX in the example of the figure) is generated or updated.

ここで、未知の種類の細胞を被写体として含む細胞画像から特徴群情報が生成されて、特徴群情報DB61(図2)に格納されたものとする。
評価対象情報取得部46は、当該特徴群情報から、サンプルデータIga乃至Igjと同形態(M個のパラメータが同一)のデータを、評価対象情報として評価対象情報取得部46から取得する。
Here, it is assumed that the feature group information is generated from a cell image including an unknown type of cell as a subject and stored in the feature group information DB 61 (FIG. 2).
The evaluation target information acquisition unit 46 acquires, from the characteristic group information, data of the same form (M parameters are the same) as the sample data Iga to Igj as the evaluation target information from the evaluation target information acquisition unit 46.

この場合、分析部47は、評価対象情報のM個のパラメータの各値Xを入力パラメータとして上記関数に代入することで、評価対象情報のスコアYを算出する。
当該評価対象情報のスコアYが100に近い場合、当該評価対象情報に対応する細胞は、種類Aの可能性が高いと分析されたことになる。
当該評価対象情報のスコアYが0に近い場合、当該評価対象情報に対応する細胞は、種類Bの可能性が高いと分析されたことになる。
当該評価対象情報のスコアYが中間値の場合、当該評価対象情報に対応する細胞は、種類Aとも種類Bとも判断できないと分析されたことになる。
In this case, the analysis unit 47 calculates the score Y of the evaluation target information by substituting each value X of the M parameters of the evaluation target information as an input parameter into the function.
When the score Y of the evaluation target information is close to 100, it means that the cells corresponding to the evaluation target information are analyzed as being highly likely to be type A.
When the score Y of the evaluation target information is close to 0, it means that the cell corresponding to the evaluation target information is analyzed as being highly likely to be of type B.
When the score Y of the evaluation target information is an intermediate value, it means that the cell corresponding to the evaluation target information cannot be judged to be the type A or the type B.

つまり、「評価対象情報のM個のパラメータの各値Xを入力パラメータとして、当該評価対象情報のスコアYを出力する関数」は、細胞の種類を種類Aと種類Bに分類するための分析モデルの一例である。 That is, “a function that outputs the score Y of the evaluation target information with each value X of the M parameters of the evaluation target information as an input parameter” is an analysis model for classifying the cell type into the type A and the type B. Is an example.

図20(B)は、クラスタリング手法を用いた分析モデルの生成例である。
図20(B)の例では、分析モデル生成部44は、複数のサンプルデータIga乃至Igjを、所定のアルゴリズムを用いてクラス分類する。クラス分類の結果できるクラスの種類や個数は、複数のサンプルデータIga乃至Igjや所定のアルゴリズムに依存するが、ここでは、3つのクラスCA,CB,CNに分類されたものとする。
FIG. 20(B) is an example of generation of an analytical model using a clustering method.
In the example of FIG. 20B, the analysis model generation unit 44 classifies the plurality of sample data Iga to Igj into classes by using a predetermined algorithm. The type and number of classes that can be obtained as a result of class classification depend on a plurality of sample data Iga to Igj and a predetermined algorithm, but here, it is assumed that they are classified into three classes CA, CB, and CN.

ここで、図20(A)の上述の例と同様に、未知の種類の細胞を被写体として含む細胞画像から特徴群情報が生成されて、特徴群情報DB61(図2)に格納されているものとする。
評価対象情報取得部46は、当該特徴群情報から、サンプルデータIga乃至Igjと同形態(M個のパラメータが同一)のデータを、評価対象情報として評価対象情報取得部46から取得する。
Here, similar to the above-described example of FIG. 20A, the feature group information is generated from a cell image including cells of an unknown type as a subject and is stored in the feature group information DB 61 (FIG. 2). And
The evaluation target information acquisition unit 46 acquires, from the characteristic group information, data of the same form (M parameters are the same) as the sample data Iga to Igj as the evaluation target information from the evaluation target information acquisition unit 46.

この場合、分析部47は、当該評価対象情報を3つのクラスCA,CB,CNのうちの何れかに分類する。
当該評価対象情報がクラスCAに分類された場合、当該評価対象情報に対応する細胞は、種類Aの可能性が高いと分析されたことになる。
当該評価対象情報がクラスCBに分類された場合、当該評価対象情報に対応する細胞は、種類Bの可能性が高いと分析されたことになる。
また、当該評価対象情報がクラスCNに分類された場合、当該評価対象情報に対応する細胞は、種類Aとも種類Bとも判断できないと分析されたことになる。
In this case, the analysis unit 47 classifies the evaluation target information into any of the three classes CA, CB, and CN.
When the evaluation target information is classified into the class CA, it means that the cells corresponding to the evaluation target information are analyzed as being highly likely to be type A.
When the evaluation target information is classified into the class CB, it means that the cells corresponding to the evaluation target information are analyzed as being highly likely to be of type B.
Further, when the evaluation target information is classified into the class CN, it means that the cell corresponding to the evaluation target information cannot be judged to be the type A or the type B.

つまり、「評価対象情報を3つのクラスCA,CB,CNのうちの何れかに分類するモデル」が、細胞の種類を種類Aと種類Bに分類するための分析モデルの一例である。
ここで、クラス分類の手法は特に限定されず、例えば、サンプルデータIga乃至Igjの夫々と評価対象情報との類似度等を夫々求め、類似度等に基づいて当該評価対象情報を分類する、という手法を採用することもできる。この手法が採用された場合、「複数のサンプルデータIag乃至Igと、これらに基づいて生成された3つのクラスCA,CB,CN」により分析モデルは表される。
That is, "a model for classifying the evaluation target information into any of the three classes CA, CB, and CN" is an example of an analysis model for classifying the cell types into the type A and the type B.
Here, the method of class classification is not particularly limited. For example, the degree of similarity between each of the sample data Iga to Igj and the evaluation target information is obtained, and the evaluation target information is classified based on the similarity or the like. Techniques can also be adopted. When this method is adopted, the analysis model is represented by “a plurality of sample data Iag to Ig and three classes CA, CB, CN generated based on these”.

なお、図20(B)では、説明の便宜上、単純なクラス分類の話をした。
実際の分析モデルは、例えば図21に示すような、各サンプルデータに基づく領域(図21の楕円状の実線の領域)が積み重なって表される。
即ち、図21は、分析モデルの表現形態の一例を示している。
この分析モデル内の丸印は、サンプルデータ又は評価対象情報を示す。
Note that in FIG. 20B, a simple class classification is described for convenience of explanation.
An actual analytical model is represented by stacking regions (regions of elliptical solid lines in FIG. 21) based on each sample data as shown in FIG. 21, for example.
That is, FIG. 21 shows an example of the expression form of the analysis model.
Circles in this analysis model indicate sample data or evaluation target information.

評価対象情報qaは、種類Aの全細胞のサンプルデータに基づく領域内に含まれている。従って、当該評価対象情報qaに対応する細胞は、種類Aの可能性が非常に高いと分析されたことになる。
評価対象情報qbは、種類Aの多くの細胞のサンプルデータに基づく領域内に含まれている。従って、当該評価対象情報qbに対応する細胞は、種類Aの可能性が高い(ただし、評価対象情報qaと比較すると低い)と分析されたことになる。
The evaluation target information qa is included in the region based on the sample data of all cells of type A. Therefore, the cells corresponding to the evaluation target information qa have been analyzed as being highly likely to be of type A.
The evaluation target information qb is included in the region based on the sample data of many cells of type A. Therefore, the cells corresponding to the evaluation target information qb are analyzed as being highly likely to be of type A (however, lower than the evaluation target information qa).

一方、評価対象情報qcは、種類Bの全細胞のサンプルデータに基づく領域内に含まれている。従って、当該評価対象情報qcに対応する細胞は、種類Bの可能性が非常に高いと分析されたことになる。
評価対象情報qdは、種類Bの多くの細胞のサンプルデータに基づく領域内に含まれている。従って、当該評価対象情報qcに対応する細胞は、種類Bの可能性が高い(ただし、評価対象情報qcと比較すると低い)と分析されたことになる。
On the other hand, the evaluation target information qc is included in the area based on the sample data of all cells of type B. Therefore, the cells corresponding to the evaluation target information qc have been analyzed as having a very high possibility of type B.
The evaluation target information qd is included in the region based on the sample data of many cells of type B. Therefore, the cells corresponding to the evaluation target information qc have been analyzed as having a high possibility of type B (however, lower than the evaluation target information qc).

また、評価対象情報qeは、種類Aの細胞のサンプルデータに基づく領域と、種類Bの細胞のサンプルデータに基づく領域との重複領域に含まれている。従って、評価対象情報qeに対応する細胞は、種類Aとも種類Bとも判断できないと分析されたことになる。 Further, the evaluation target information qe is included in the overlapping area of the region based on the sample data of the type A cells and the region based on the sample data of the type B cells. Therefore, it is determined that the cell corresponding to the evaluation target information qe cannot be determined to be the type A or the type B.

以上説明したように、細胞に関する分析は、分析内容、分析手法、各種条件等という点で多岐に渡る。従って、分析内容、分析手法、各種条件等に適合したサンプルデータや評価対象情報を用いる必要があり、本実施形態ではこれを可能にしている。
換言すると、本実施形態のサンプルデータは、特徴群情報を単にそのまま抽出したものではなく、分析内容、分析手法、各種条件等に適合するように、その形態(パラメータ数Mやパラメータの種類の組合せ等)が変化する。
そして、分析内容、分析手法、各種条件等に適合する1以上のサンプルデータから、分析モデルが生成される。従って、当該分析モデルもまた、分析内容、分析手法、各種条件等に適合するものとなっている。
そして、未知の細胞に関する分析が行われる場合、当該未知の細胞のデータとしては、サンプルデータと同一形態の評価対象情報が評価対象情報取得部46により取得される。つまり、分析内容、分析手法、各種条件等に適合した評価対象情報が取得される。
分析部47は、分析内容、分析手法、各種条件等に夫々適合した評価対象情報と分析モデル(サンプルデータ)とを用いて、当該未知の細胞に関する分析処理を実行する。
このようにして、分析内容、分析手法、各種条件等の違いによらず、未知の細胞に関する分析が容易かつ適切に行われる。
つまり、
As described above, analysis of cells is diverse in terms of analysis content, analysis method, various conditions, and the like. Therefore, it is necessary to use sample data and evaluation target information that are suitable for the analysis content, analysis method, various conditions, etc., and this embodiment makes this possible.
In other words, the sample data of the present embodiment is not simply the feature group information extracted as it is, but its form (the number of parameters M or the combination of parameter types) is set so as to be suitable for the analysis content, analysis method, various conditions, and the like. Etc.) changes.
Then, an analysis model is generated from one or more sample data that matches the analysis content, analysis method, various conditions, and the like. Therefore, the analysis model is also adapted to the analysis content, analysis method, various conditions, and the like.
Then, when the analysis is performed on the unknown cell, the evaluation target information acquisition unit 46 acquires the evaluation target information having the same form as the sample data as the data of the unknown cell. That is, the evaluation target information that matches the analysis content, analysis method, various conditions, etc. is acquired.
The analysis unit 47 uses the evaluation target information and the analysis model (sample data) that are suitable for the analysis content, the analysis method, various conditions, and the like, and executes the analysis process on the unknown cell.
In this way, unknown cells can be easily and appropriately analyzed regardless of differences in analysis content, analysis method, various conditions, and the like.
That is,

さらに以下、分析部47による分析処理と、出力情報生成部48から出力される出力情報とについて、さらに詳しく説明する。 Furthermore, the analysis processing by the analysis unit 47 and the output information output from the output information generation unit 48 will be described in more detail below.

ここで、サンプルデータは、上述したように、M種類のパラメータ(各種の特徴パラメータや各種の付帯パラメータ)の数値の集合体、即ち数値化情報である。従って、複数のサンプルデータの集合体から生成される分析モデルもまた、数値化情報として表現することは容易である。
また、分析対象の細胞についても、評価対象情報が用いられる。この評価対象情報は、サンプルデータと同一形態の数値化情報である。
従って、このような評価対象情報と分析モデル(サンプルデータ)を利用した分析処理の結果を示す出力情報を、数値化情報の羅列(リスト等)で生成することは容易である。
しかしながら、細胞に関する分析を依頼したユーザにとっては、このような数値化情報の羅列(リスト等)だけが提示されても、分析結果等を容易に認識することはできない。
つまり、ユーザへの出力形態としては、数値化情報の羅列(リスト等)のみでは不十分であり、視認しやすい形態もあると好適である。
このようなユーザにとって視認しやすい出力形態を可能にするためには、分析モデルの表現形態が重要になってくる。
例えば上述の図21に示す分析モデルの表現形態、即ち、各サンプルデータに基づく領域(図21の楕円状の実線の領域)を積み重ねて分析モデルを表す形態は、ユーザにとって視認しやすい出力形態の一例である。
Here, as described above, the sample data is a set of numerical values of M kinds of parameters (various characteristic parameters and various incidental parameters), that is, digitized information. Therefore, it is easy to represent the analytical model generated from the aggregate of the plurality of sample data as the numerical information.
The evaluation target information is also used for cells to be analyzed. The evaluation target information is digitized information having the same form as the sample data.
Therefore, it is easy to generate the output information indicating the result of the analysis process using the evaluation target information and the analysis model (sample data) as a list (a list or the like) of digitized information.
However, the user who has requested the analysis of the cells cannot easily recognize the analysis result or the like even if only the list (list or the like) of such quantified information is presented.
That is, as an output form to the user, it is not enough to enumerate the digitized information (list, etc.), and it is preferable that there is a form that is easy to visually recognize.
In order to enable such an output form that is easily visible to the user, the expression form of the analysis model becomes important.
For example, the above-described expression form of the analysis model shown in FIG. 21, that is, the form in which the analysis model is formed by stacking the regions (the elliptical solid line regions in FIG. 21) based on each sample data is an output form that is easy for the user to visually recognize. This is an example.

図22は、分析モデルの表現形態の一例であって、図21とは異なる例を示す図である。
図22の例では、所定の2軸(X軸、Y軸)から構成される平面上に、各サンプルデータが点としてプロットされている。各サンプルデータは、自己が属するグループに応じて色分け(同図では異なるハッチングで分類)されている。つまり、同色のサンプルデータが分布する周辺領域が、当該色に対応するグループの領域を示している。
例えば、同図中第4象限においては、サンプルデータSAの付近には、第1色(同図では間隔が一番狭い斜線)のサンプルデータが集中している。
つまり、同図中第4象限の領域は主に、第1色に対応する第1グループの領域であるといえる。
同様に、同図中第1象限の領域(サンプルデータSBの周辺領域)は主に、第2色(同図では間隔が2番目に狭い斜線)に対応する第2グループの領域であるといえる。
Y軸の正側の周辺領域(サンプルデータSCの周辺領域)は主に、第3色(同図では間隔が一番広い斜線)に対応する第3グループの領域であるといえる。
X軸の負側の周辺領域(サンプルデータSDの周辺領域)は主に、第4色(同図では白抜き)に対応する第4グループの領域であるといえる。
FIG. 22 is a diagram showing an example of the expression form of the analysis model, which is different from the example shown in FIG.
In the example of FIG. 22, each sample data is plotted as a point on a plane composed of predetermined two axes (X axis, Y axis). Each sample data is color-coded (classified by different hatching in the figure) according to the group to which it belongs. That is, the peripheral area in which the sample data of the same color is distributed shows the area of the group corresponding to the color.
For example, in the fourth quadrant in the figure, the sample data of the first color (in the figure, the diagonal lines having the narrowest intervals) are concentrated near the sample data SA.
That is, it can be said that the region of the fourth quadrant in the figure is mainly the region of the first group corresponding to the first color.
Similarly, it can be said that the region of the first quadrant (peripheral region of the sample data SB) in the figure is mainly the region of the second group corresponding to the second color (the diagonal line having the second narrowest interval in the figure). ..
It can be said that the peripheral area on the positive side of the Y axis (the peripheral area of the sample data SC) is mainly the area of the third group corresponding to the third color (the diagonal line having the widest interval in the drawing).
It can be said that the peripheral region on the negative side of the X axis (peripheral region of the sample data SD) is mainly the region of the fourth group corresponding to the fourth color (white in the figure).

さらに、評価対象情報qも、図22の分析モデルを示す平面上にプロットすることが可能である。
これにより、ユーザは、評価対象情報qの配置位置はY軸の正側の周辺領域であるので、評価対象情報qに対応する細胞は第3グループに属する可能性が高い、と容易かつ即座に視認することができる。
Further, the evaluation target information q can also be plotted on the plane showing the analysis model of FIG.
Accordingly, the user easily and promptly finds that the arrangement position of the evaluation target information q is the peripheral region on the positive side of the Y axis, and thus the cells corresponding to the evaluation target information q are likely to belong to the third group. Can be seen.

ここで、サンプルデータや評価対象情報の各プロットの表現形態(色やシンボルの形状等)は、任意に可変できる。さらに、同一の細胞画像群から得られたサンプルデータであれば、分析内容、分析手法、各種条件等に応じて任意に表現形態を可変することができる。
例えば細胞の種類を分類するための分析モデルを表現する場合、各プロット点を種類毎に色分けをするという表現形態を採用することができる。
一方、例えば細胞の状態を判断するための分析モデルを表現する場合、各プロット点を状態毎にシンボルの形状を変えるという別の表現形態を採用することができる。例えば状態が、「良」では「〇」(丸印)となり、「中」では「△」(三角印)となり、「悪」では「△」になるような表現形態を採用することができる。
この場合、ユーザは、プロット点の色を見比べることで細胞の種類を比較することが容易かつ即座にできるし、プロットのシンボルの形状を見比べることで細胞の状態を比較することが容易かつ即座にできる。
Here, the expression form (color, symbol shape, etc.) of each plot of sample data and evaluation target information can be arbitrarily changed. Furthermore, if it is sample data obtained from the same cell image group, the expression form can be arbitrarily changed according to the analysis content, the analysis method, various conditions, and the like.
For example, when expressing an analytical model for classifying cell types, it is possible to adopt an expression form in which each plot point is color-coded for each type.
On the other hand, for example, when expressing an analysis model for determining the state of cells, another form of expression in which the shape of the symbol is changed at each plot point for each state can be adopted. For example, it is possible to adopt an expression form in which the state is “◯” (circle mark) when it is “good”, “Δ” (triangle mark) when it is “medium”, and “Δ” when it is “bad”.
In this case, the user can easily and quickly compare the cell types by comparing the colors of the plot points, and can easily and immediately compare the cell states by comparing the shapes of the symbols on the plot. it can.

さらにまた、X軸とY軸は任意の可変軸であり、ユーザの操作等により、容易に変更することが可能である。
具体的には、上述したように、サンプルデータ及び評価対象情報は、M種のパラメータを要素とする、M次元の多次元情報であると把握することができる。
従って、サンプルデータや評価対象情報のM種のパラメータに基づいて、2個の要素X,Yを生成するだけで、図22の平面へのプロット点が容易に決定される。
ここで、X軸とY軸とは、特に限定されず、任意でよい。
例えば、サンプルデータや評価対象情報のM次元のうち任意の2次元の軸をそのまま、X軸とY軸として採用することもできる。
また例えば、M次元のうち、任意の数の任意の次元を組合せて新たなX軸を生成し、それとは独立して、任意の数の任意の次元を組合せて新たなY軸を生成することもできる。
Furthermore, the X axis and the Y axis are arbitrary variable axes, and can be easily changed by a user's operation or the like.
Specifically, as described above, the sample data and the evaluation target information can be understood to be M-dimensional multidimensional information having M types of parameters as elements.
Therefore, the plot points on the plane of FIG. 22 can be easily determined only by generating the two elements X and Y based on the sample data and the M kinds of parameters of the evaluation target information.
Here, the X axis and the Y axis are not particularly limited and may be arbitrary.
For example, an arbitrary two-dimensional axis of the M dimensions of the sample data or the evaluation target information can be directly used as the X axis and the Y axis.
Further, for example, of M dimensions, an arbitrary number of arbitrary dimensions are combined to generate a new X axis, and independently of that, an arbitrary number of arbitrary dimensions are combined to generate a new Y axis. Can also

さらに、分析モデルの表現形態は、2次元空間である必要は特になく、任意の次元の空間でよい。
例えば図23は、分析モデルの表現形態の一例であって、図21や図22とは異なる例を示す図である。
即ち、分析モデルは、図21や図22の例では2次元空間で表されていたのに対して、図23の例では3次元空間で表されている。
ここで、3次元空間を構築する3軸については、2次元の場合と全く同様に、任意の可変軸であり、ユーザの操作等により、容易に変更することが可能である。
次元の削減は、原則として、元の情報に対する情報量削減(欠落)を意味している。つまり、図21乃至図23の何れの空間も、サンプルデータのM種のパラメータからなるM次元空間(Mが4以上の場合)が射影等されたものであり、元のサンプルデータに対して何らかの情報が欠落した空間となっている。従って、図21や図22の2次元空間と比較して、図23の3次元空間では、その次元数が多い分だけ情報の欠落量も少なくなるため、より多くの情報量をユーザは容易かつ即座に得ることができる。
Furthermore, the expression form of the analysis model does not have to be a two-dimensional space, and may be a space of any dimension.
For example, FIG. 23 is a diagram showing an example of the expression form of the analysis model, which is different from the examples shown in FIGS. 21 and 22.
That is, the analysis model is represented in the two-dimensional space in the examples of FIGS. 21 and 22, whereas it is represented in the three-dimensional space in the example of FIG.
Here, the three axes forming the three-dimensional space are arbitrary variable axes, just as in the case of the two-dimensional space, and can be easily changed by a user's operation or the like.
In principle, reduction of dimension means reduction (missing) of the amount of information with respect to the original information. That is, in any of the spaces in FIGS. 21 to 23, an M-dimensional space (when M is 4 or more) consisting of M kinds of parameters of the sample data is projected, etc. It is a space where information is missing. Therefore, in the three-dimensional space of FIG. 23, as compared with the two-dimensional space of FIG. 21 and FIG. 22, the amount of missing information decreases as the number of dimensions increases, so that the user can easily obtain a larger amount of information. You can get it instantly.

さらにまた、分析モデルの表現形態は、サンプルデータや評価対象情報が点としてプロットされる空間である必要は特になく、サンプルデータや評価対象情報の類似度が視認可能な形態であれば足りる。
ここで、2つのデータの類似度は、例えば2つのデータ間の距離として表すことができる。つまり、距離が近いデータ程類似していることになる。
このような距離感を容易に視認可能な表現形態が空間上の点(プロット)であることから、先ず、上述の図21乃至図23の分析モデルの表現形態について説明した。
次に、サンプルデータや評価対象情報の類似度が容易に視認可能となる別の表現形態について、図24を参照して説明する。
Furthermore, the expression form of the analysis model does not have to be a space in which the sample data and the evaluation target information are plotted as points, and it is sufficient if the similarity between the sample data and the evaluation target information can be visually recognized.
Here, the similarity between the two data can be represented as a distance between the two data, for example. That is, the closer the data is, the more similar the data is.
Since the expression form that allows such a sense of distance to be easily visually recognized is a point (plot) in space, first, the expression form of the analysis model of FIGS. 21 to 23 described above has been described.
Next, another expression form in which the similarity of sample data and evaluation target information can be easily visually recognized will be described with reference to FIG.

図24は、分析モデルの表現形態の一例であって、図21乃至図23とは異なる例を示す図である。
図24の例では、終端がある1本の線が、1つのデータを表している。
つまり、複数のサンプルデータの夫々を示す各線の集合体(以下、線を「枝」と呼び、枝の集合体の表現形態を「枝分岐図」と呼ぶ)は、当該複数のサンプルデータを用いて生成された分析モデルを表している。
上述したように、距離が近いほど類似しているので、距離が近い枝の集合体を、1つのグループとして把握することができる。
ここで、図22に示されるように枝の分岐ポイントが幾つか存在するので、枝の分岐ポイントの単位毎に、階層化したグループを生成することも容易にできる。
例えば図24の例では、第1階層においては、通常細胞と老化細胞に分類される。
さらに、夫々の第2階層においては、培養条件の違いにより複数のグループに分類されている。
FIG. 24 is a diagram showing an example of the expression form of the analysis model, which is different from the examples shown in FIGS. 21 to 23.
In the example of FIG. 24, one line with an end represents one piece of data.
In other words, an aggregate of each line indicating each of the plurality of sample data (hereinafter, the line is referred to as “branch” and an expression form of the aggregate of branches is referred to as “branch branch diagram”) uses the plurality of sample data. The analysis model generated by the above is shown.
As described above, the closer the distance is, the more similar the distances are to each other. Therefore, it is possible to grasp a group of branches having a short distance as one group.
Here, as shown in FIG. 22, since there are several branching points of the branch, it is possible to easily generate a hierarchical group for each unit of the branching point of the branch.
For example, in the example of FIG. 24, the cells are classified into normal cells and senescent cells in the first hierarchy.
Further, in each of the second layers, they are classified into a plurality of groups depending on the difference in culture conditions.

さらに、評価対象情報qも、図24の分析モデルを表す枝分岐図に対して、1つの枝としてプロットすることが容易に可能である。
これにより、ユーザは、枝分岐図における評価対象情報qの枝のプロット位置から、評価対象情報qに対応する細胞は、通常細胞のうち培養条件Aのグループに属する可能性が高い、と容易かつ即座に視認することができる。
Furthermore, the evaluation target information q can also be easily plotted as one branch on the branch branch diagram representing the analysis model of FIG.
Accordingly, the user can easily and easily find that the cells corresponding to the evaluation target information q are highly likely to belong to the group of the culture condition A among the normal cells from the plot position of the branch of the evaluation target information q in the branch bifurcation diagram. It can be seen immediately.

ここで、注意すべきは、図21乃至図24の例は、あくまでも各サンプルデータ(分析モデルの概要)と、評価対象情報との位置関係を、ユーザが容易に視認可能になるという観点で表現したものである。
つまり、上述したように、サンプルデータと評価対象情報とは、本来M次元の多次元情報である。このM次元を2次元や3次元に圧縮した空間として表現されたものが、図21乃至図24の例である。
つまり、図2の分析部47は、実際には、2次元や3次元のデータによる類似度を演算するのではなく、M次元の各サンプルデータと、M次元の評価対象情報との類似度を演算している。
ただし、説明の便宜上M=3として、各サンプルデータと評価対象情報との類似度の演算手法の概要について、図25乃至図27を参照して説明する。
つまり、図25乃至図27の例ででは、たまたまM=3次元の空間になったに過ぎず、本来的には図23の3次元空間とは異なるものである点に注意を要する。
Here, it should be noted that the examples of FIGS. 21 to 24 are expressed only from the viewpoint that the user can easily visually recognize the positional relationship between each sample data (outline of the analysis model) and the evaluation target information. It was done.
That is, as described above, the sample data and the evaluation target information are originally M-dimensional multidimensional information. What is expressed as a space obtained by compressing the M dimension into two dimensions or three dimensions is an example of FIGS. 21 to 24.
That is, the analysis unit 47 of FIG. 2 does not actually calculate the similarity based on the two-dimensional or three-dimensional data, but calculates the similarity between each M-dimensional sample data and the M-dimensional evaluation target information. I am calculating.
However, for convenience of explanation, assuming that M=3, an outline of a calculation method of the similarity between each sample data and the evaluation target information will be described with reference to FIGS. 25 to 27.
That is, in the examples of FIGS. 25 to 27, it should be noted that the M=3D space happens to be a different space, which is originally different from the 3D space of FIG.

図25は、サンプルデータ及び評価対象情報の生成の基になる特徴群情報の構成例を示している。
図25において、同図中横方向の項目は、所定細胞の細胞集団における所定観点(平均値、バランス、分布の形)での各要素(特徴パラメータ)を示している。即ち、サンプルデータの基になる特徴群情報には、図中横方向の各項目の値が、各要素の値として夫々含まれている。
同図中縦方向の項目は、所定細胞における個々の要素(特徴パラメータ)を示している。即ち、サンプルデータの基になる特徴群情報には、図中縦方向の各項目の値が、各要素の値として夫々含まれている。
なお、図25の例では、所定容器で培養される同一種類の細胞集団を被写体として、所定の時刻に撮像された細胞画像についての、特徴群情報ICtが示されている。
FIG. 25 shows a configuration example of the feature group information which is the basis of the generation of the sample data and the evaluation target information.
In FIG. 25, items in the horizontal direction in FIG. 25 indicate respective elements (feature parameters) from a predetermined viewpoint (mean value, balance, distribution form) in a cell population of predetermined cells. That is, the feature group information on which the sample data is based includes the value of each item in the horizontal direction in the drawing as the value of each element.
Items in the vertical direction in the figure indicate individual elements (feature parameters) in a predetermined cell. That is, the feature group information on which the sample data is based includes the value of each item in the vertical direction in the drawing as the value of each element.
Note that, in the example of FIG. 25, the feature group information ICt is shown for a cell image captured at a predetermined time, using a cell population of the same type cultured in a predetermined container as a subject.

この特徴群情報ICtは、細胞集団における所定観点の要素を示す横軸と、細胞の個々の要素を示す縦軸とからなる2次元空間の情報として構成されている。
ここで、単位情報Iuは、所定細胞についての、所定時刻における、当該所定細胞の個についての特徴パラメータの値群(縦軸の情報群)と、当該所定細胞を含む細胞集団における所定観点での特徴パラメータの値群(横軸の情報群)とに基づいて生成された情報である。
このような単位情報Iuを利用することで、所定細胞についての、所定時刻における、所定観点での細胞集団における位置付けを把握することができる。
例えば図25の左上端の斜線が引かれた単位情報Iuからは、細胞1(所定細胞)の各特徴パラメータの値(例えば長さ)についての、所定時刻における、集団細胞の各特徴パラメータの平均値といった観点(例えば集団全体の長さの平均値という観点)での比較が可能になる。
The feature group information ICt is configured as information in a two-dimensional space including a horizontal axis indicating elements of a predetermined viewpoint in the cell population and a vertical axis indicating individual elements of the cell.
Here, the unit information Iu is a value group (information group on the vertical axis) of the characteristic parameter for each of the predetermined cells at a predetermined time for the predetermined cell and a predetermined viewpoint in the cell population including the predetermined cell. It is information generated based on the value group of the characteristic parameter (information group on the horizontal axis).
By using such unit information Iu, it is possible to grasp the position of the predetermined cell in the cell population from a predetermined viewpoint at a predetermined time.
For example, from the unit information Iu indicated by the diagonal line at the upper left corner of FIG. 25, the average of each characteristic parameter of the population cell at a predetermined time for the value (for example, length) of each characteristic parameter of the cell 1 (predetermined cell). It becomes possible to make comparisons in terms of values (for example, the average value of the length of the entire population).

ここで、同一容器に含まれる細胞集団に対しては、時間方向にn回(時刻t1乃至時刻tnの夫々)に分けて細胞画像がその都度撮像されるものとする。
この場合、図25の特徴群情報ICtは、同一容器に含まれる細胞集団に対して、所定の時刻tk(kは、1乃至nの範囲内の任意の整数値)に撮像された細胞画像の様子を示すものである。
つまり、図26に示すように、同一容器に含まれる細胞集団に対して、時刻t1乃至tnの夫々に撮像された細胞画像の様子を示す、n個の特徴群情報ICt1乃至ICtnが得られる。
これらn個の特徴群情報ICt1乃至ICtnを時間方向に順次積層することで、特徴群情報ICが構成される。
Here, for the cell population contained in the same container, it is assumed that the cell image is captured n times in the time direction (each of time t1 to time tn).
In this case, the feature group information ICt of FIG. 25 is the cell image captured at a predetermined time tk (k is an arbitrary integer within the range of 1 to n) for the cell population contained in the same container. It shows the situation.
That is, as shown in FIG. 26, n pieces of feature group information ICt1 to ICtn showing the states of the cell images captured at times t1 to tn for the cell population contained in the same container are obtained.
The feature group information IC is configured by sequentially stacking these n pieces of feature group information ICt1 to ICtn in the time direction.

つまり、細胞の個々の情報を示す縦軸、細胞集団の所定観点での情報を示す横軸、及び時間変化を示す奥行軸で構成される3次元空間に、単位情報Iuが1以上配置された情報群が、特徴群情報ICである。
ここで、単位情報Iuの形態は、特に限定されないが、説明の便宜上、「有意情報(1)」であるか、「有意情報でない(0)」のかを示す2値を取る形態とする。
例えば、細胞の種類を分類する等の所定の分析内容が使われる場合において、各単位情報Iuにおける各要素(各種特徴パラメータ)の値の中に、細胞の種類を分類する際に支援となる値が含まれている可能性がある。このような値が含まれていれば、当該単位情報Iuは「有意情報(1)」となる。一方、細胞の種類を分類する際に支援となる値が含まれていなければ、当該単位情報Iuは「有意情報でない(0)」となる。
つまり、同一容器に含まれる同一種類の細胞であっても、個々の細胞の特徴、細胞集団の中での所定観点での位置付け、時間変化等に応じて、「有意情報(1)」になる場合もあるし、「有意情報でない(0)」となる場合もある。
That is, one or more unit information Iu is arranged in a three-dimensional space composed of a vertical axis indicating individual information of cells, a horizontal axis indicating information of a cell population from a predetermined viewpoint, and a depth axis indicating time change. The information group is the feature group information IC.
Here, the form of the unit information Iu is not particularly limited, but for convenience of explanation, it is assumed that it takes a binary value indicating whether it is “significant information (1)” or “not significant information (0)”.
For example, when a predetermined analysis content such as classifying cell types is used, a value that assists in classifying cell types in the values of each element (various characteristic parameters) in each unit information Iu May be included. If such a value is included, the unit information Iu becomes “significant information (1)”. On the other hand, if a value that assists in classifying cell types is not included, the unit information Iu is “not significant information (0)”.
In other words, even for cells of the same type contained in the same container, "significant information (1)" is obtained according to the characteristics of individual cells, the positioning from a predetermined viewpoint in the cell population, the time change, etc. In some cases, it may be “not significant information (0)”.

分析モデル生成部44(図2)は、同一容器に含まれる同一種類の細胞について時刻t1乃至tnの夫々に撮像されたn枚の細胞画像を1つの単位として、1つの特徴群情報ICを構築し、その1単位の特徴群情報ICの中から、「有意情報(1)」となる単位情報Iuのみを抽出する。
分析モデル生成部44は、このようにして抽出した複数個の単位情報Iuの集合体を、サンプルデータとして生成する。
ここで、単位情報Iuは、図26に示すように、特徴群情報ICを構築する3次元空間上の位置座標、つまり3次元情報で表すことができる。
即ち、図27に示すように、特徴群情報Icを構築する3次元空間上に夫々配置された、「有意情報(1)」の単位情報Iu(図27ではハッチングが付された単位情報Iu)の集合体が、サンプルデータになる。
例えば、図27の右上のサンプルデータICS1が、種類Aを示すものであるとする。また例えば、図27の中央下のサンプルデータICS2が、種類Bを示すものであるとする。
つまり、これらサンプルデータICS1,ICS2等の集合体が、細胞の種類を種類Aと種類Bに分類する分析モデルとなる。
The analysis model generation unit 44 (FIG. 2) constructs one feature group information IC with n cell images taken at times t1 to tn of cells of the same type contained in the same container as one unit. Then, only the unit information Iu that is “significant information (1)” is extracted from the one-unit feature group information IC.
The analysis model generation unit 44 generates the aggregate of the plurality of unit information Iu thus extracted as sample data.
Here, as shown in FIG. 26, the unit information Iu can be represented by position coordinates in a three-dimensional space that constructs the feature group information IC, that is, three-dimensional information.
That is, as shown in FIG. 27, the unit information Iu of “significant information (1)” (hatched unit information Iu in FIG. 27) arranged in the three-dimensional space that constructs the feature group information Ic, respectively. The collection of is the sample data.
For example, it is assumed that the sample data ICS1 on the upper right of FIG. 27 indicates the type A. Further, for example, it is assumed that the sample data ICS2 at the lower center of FIG. 27 indicates the type B.
That is, an aggregate of these sample data ICS1, ICS2, etc. becomes an analysis model for classifying cell types into type A and type B.

換言すると、単位情報Iuとは、図25の例でいえば、所定細胞単体の10個の要素(特徴パラメータ)と、集団情報の所定観点の10個の要素(特徴パラメータ)とを少なくとも含む特徴群情報が基礎となっている。これの各要素が、「有意情報(1)」か「有意情報でないか(0)」の観点でまとめられて、「有意情報(1)」の単位情報Iuが夫々、特徴群情報ICを構築する3次元空間上の位置座標、つまり3軸の要素で表されるようになったものである。
即ち、少なくとも20次元以上の特徴群情報から3次元のサンプルデータが抽出されたことと等価になる。
In other words, the unit information Iu is, in the example of FIG. 25, a feature including at least 10 elements (feature parameters) of a predetermined cell simple substance and 10 elements (feature parameters) of a predetermined viewpoint of population information. The group information is the basis. Each element of this is collected from the viewpoint of "significant information (1)" or "is not significant information (0)", and the unit information Iu of "significant information (1)" constructs the feature group information IC, respectively. Position coordinates in a three-dimensional space, that is, three-axis elements.
That is, it is equivalent to that three-dimensional sample data is extracted from at least 20-dimensional feature group information.

ここで、同一容器に含まれる未知の種類の細胞集団についても、時刻t1乃至tnの夫々に撮像されたn枚の細胞画像が1単位となり、この1単位が分析対象として与えられたものとする。
この場合、評価対象情報取得部46は、上述のサンプルデータICS1,ICS2と全く同様の手法で構築されるデータを、図27の左上に示す評価対象情報Ictとして取得する。
Here, also for a cell population of an unknown type contained in the same container, n cell images taken at times t1 to tn become one unit, and this one unit is given as an analysis target. ..
In this case, the evaluation target information acquisition unit 46 acquires data constructed by the same method as the sample data ICS1 and ICS2 described above as the evaluation target information Ict shown in the upper left of FIG.

分析部47は、評価対象情報IctとサンプルデータICS1との距離を算出することで類似度を求める。同様に、分析部47は、評価対象情報IctとサンプルデータICS2との距離を算出することで類似度を求める。
距離の算出手法は、特に限定されず、例えばユークリッド距離やマハラノビスの距離の手法を採用することができる。
図27の例では、評価対象情報IctとサンプルデータICS2との距離の方が、評価対象情報IctとサンプルデータICS1との距離よりも近いので、評価対象情報IctはサンプルデータICS2に類似していると判断される。
即ち、評価対象情報Ictに対応する細胞は、サンプルデータICS2が示す種類Bの可能性が高いと分析されたことになる。
The analysis unit 47 obtains the degree of similarity by calculating the distance between the evaluation target information Ict and the sample data ICS1. Similarly, the analysis unit 47 obtains the degree of similarity by calculating the distance between the evaluation target information Ict and the sample data ICS2.
The method for calculating the distance is not particularly limited, and for example, the Euclidean distance or Mahalanobis distance method can be adopted.
In the example of FIG. 27, since the distance between the evaluation target information Ict and the sample data ICS2 is shorter than the distance between the evaluation target information Ict and the sample data ICS1, the evaluation target information Ict is similar to the sample data ICS2. Is judged.
That is, the cells corresponding to the evaluation target information Ict are analyzed as being highly likely to be of type B indicated by the sample data ICS2.

出力情報生成部48は、このようにして分析部47により分析された結果と、評価対象情報取得部46により取得された評価対象情報とを含む出力情報を生成して、出力部16や外部装置81に出力する。 The output information generation unit 48 generates output information including the result analyzed by the analysis unit 47 in this way and the evaluation target information acquired by the evaluation target information acquisition unit 46, and outputs the output unit 16 or an external device. Output to 81.

図28は、出力情報を示す画面の一例を示している。
図28の例の画面G0には、分析対象の細胞(培養中の細胞)の種類等の分析結果が、数値を羅列したリストだけではなく、ユーザに視認しやすい所属スペースマップや所属マップとして表示される。
FIG. 28 shows an example of a screen showing output information.
On the screen G0 in the example of FIG. 28, the analysis results such as the type of cells to be analyzed (cells in culture) are displayed not only as a list of numerical values but also as a belonging space map or a belonging map that is easily visible to the user. To be done.

所属スペースマップは、図23を用いて上述したように、任意の軸の3次元空間上に、各種サンプルデータと、分析対象の細胞(培養中の細胞)を示す評価対象情報とを点でプロットしたマップである。図28の例では「Query」と記載されたプロット点(丸印)が、評価対象情報を示している。 As described above with reference to FIG. 23, the belonging space map plots various sample data and evaluation target information indicating cells to be analyzed (cells in culture) on dots in a three-dimensional space of arbitrary axes. This is the map. In the example of FIG. 28, the plot points (circles) described as “Query” indicate the evaluation target information.

画面G0においては、図29に示すように、所属スペースマップの代わりに、所属マップを表示させることも可能である。
所属マップは、図23を用いて上述したように、各種サンプルデータを1つの枝(線)と見立てて、近い枝ほど類似している様子を示す枝分岐図である。図27の例では「Query」と記載されたプロット点(丸印)が、評価対象情報を示している。
このように、ユーザは、所属スペースマップや所属マップをみるだけで、評価対象の細胞の分析結果(どのような種類に属する可能性が高いのか等)を即時かつ容易に視認することができるので、便宜である。
On the screen G0, as shown in FIG. 29, it is possible to display the belonging map instead of the belonging space map.
As described above with reference to FIG. 23, the affiliation map is a branch branch diagram showing that various sample data are regarded as one branch (line), and that the closer the branch is, the more similar the branch data is. In the example of FIG. 27, the plot points (circles) described as “Query” indicate the evaluation target information.
In this way, the user can instantly and easily visually recognize the analysis result of the cell to be evaluated (what kind of cell is likely to belong, etc.) simply by looking at the belonging space map and the belonging map. , Convenience.

その他特徴的なことは、分類結果を確率(可能性)で提示していることである。
つまり、種類Aと断定するのではなく、種類Aのサンプルとの類似度(種類Aになる確率)という観点で提示している。
これにより、ユーザにとってはより正確で有意な情報が得られる。例えば、上述したように、種類Aと種類Bの両方の可能性がある場合に、種類Aの可能性が少し高いだけなのに種類Aと断定された結果が提示されたとする。この場合、実際には種類Bであるとすると間違った分析結果を伝えたことになり、ユーザにとって後々困ったことが起こり得る。
これに対して、本実施形態では、種類Aと種類Bの両方の可能性があることが提示される。これにより、種類Bとなる可能性も考慮してユーザは検討できるので、実際に種類Bであった場合にも容易に対処することができる。
Another characteristic is that the classification result is presented by probability (probability).
That is, it is not determined as type A, but is presented in terms of the degree of similarity with the sample of type A (probability of becoming type A).
This provides more accurate and meaningful information for the user. For example, as described above, when there is a possibility of both the type A and the type B, it is assumed that the result determined to be the type A is presented although the possibility of the type A is slightly high. In this case, if it is actually the type B, it means that the wrong analysis result has been transmitted, and the user may have trouble later.
On the other hand, in the present embodiment, it is suggested that there are both possibilities of type A and type B. With this, the user can consider the possibility of becoming the type B, so that it is possible to easily deal with the case of the type B actually.

別な特徴的なこととしては、種類(細胞腫)を示す「評価確率」のみならず、「相同性スコア」も提示していることである。
即ち、説明の便宜上、細胞の種類を分類する分析手法を主に説明してきたが、サンプルデータと評価対象情報を同様に比較して分析することにより、「由来」の類似度も出力することが可能である。この「由来」の類似度が、相同性スコアである。
例えばランキング2位と3位のサンプルデータを比較すると、評価確率(種類の類似度)は2位のサンプルデータが「78」であるのに対して、3位のサンプルデータが「75」と大差ない。しかしながら、相同性スコア(由来の類似度)では、2位のサンプルデータが「80」であるのに対して、3位のサンプルデータが「70」と差が大きい。従って、ユーザは、分析対象の細胞の「由来」は、「脂肪」ではなく「骨髄」であるとある程度判断することが容易にできる。
Another characteristic is that not only the “evaluation probability” indicating the type (cytoma) but also the “homology score” are presented.
That is, for convenience of explanation, the analysis method for classifying cell types has been mainly described, but the similarity of “origin” can also be output by similarly comparing and analyzing sample data and evaluation target information. It is possible. This “origin” similarity is the homology score.
For example, when comparing the sample data of the second and third places in the ranking, the evaluation probability (similarity of the type) is “78” for the sample data of the second place, while the sample data of the third place is significantly different from “75”. Absent. However, in the homology score (similarity of origin), the sample data at the second place is “80”, whereas the sample data at the third place is “70”, which is a large difference. Therefore, the user can easily determine to some extent that the “origin” of the cell to be analyzed is “bone marrow” rather than “fat”.

以上本発明の一実施形態について説明したが、本発明は、上述の実施形態に限定されるものではなく、本発明の目的を達成できる範囲での変形、改良等は本発明に含まれるものである。 Although one embodiment of the present invention has been described above, the present invention is not limited to the above-described embodiment, and modifications, improvements, etc. within a range in which the object of the present invention can be achieved are included in the present invention. is there.

換言すると、本発明が適用される細胞分析結果出力装置は、次のような構成を取れば足り、その実施の形態は特に限定されない。つまり、上述の細胞分析装置1は、細胞分析結果出力装置の一例である。 In other words, the cell analysis result output device to which the present invention is applied may have the following configuration, and the embodiment thereof is not particularly limited. That is, the cell analysis device 1 described above is an example of a cell analysis result output device.

つまり、本発明が適用される細胞分析結果出力装置は、
複数の細胞からなる細胞集団を被写体として撮像された細胞画像の中から、所定条件により選定された1枚以上の細胞画像を単位として、前記単位に含まれる1以上の細胞画像のデータに基づいて、前記細胞の単体の形態的特徴又は前記細胞集団の形態的特徴に関するN種類(Nは1以上の整数値)の特徴パラメータの値を含む情報が、特徴群情報として保持されており、
比較対象の前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて、M種類(MはNとは独立した整数値)のパラメータの値から構成される比較対象情報が取得され、
比較相手の前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて、前記M種類のパラメータの値から構成される比較相手情報が取得され、
前記比較対象情報と前記比較相手情報との間の所定観点での距離が算出された場合、
前記比較対象情報を示す第1シンボルと、前記比較相手情報を示す第2シンボルとを含む画像であって、算出された前記距離に応じて表示形態が変化する画像の情報を、出力情報として出力する出力手段(例えば図2の出力情報生成部48)と、
そ備える。
これにより、分析内容、分析手法、各種条件等が異なる各種各様な細胞に関する分析処理の結果を、ユーザに容易かつ効果的に認識させることができる。
That is, the cell analysis result output device to which the present invention is applied,
Based on the data of one or more cell images included in the unit, with one or more cell images selected under a predetermined condition as a unit from among the cell images obtained by capturing a cell population including a plurality of cells as a subject. , Information including the values of N kinds (N is an integer value of 1 or more) of characteristic parameters relating to the morphological characteristics of the cells alone or the morphological characteristics of the cell population is held as characteristic group information,
Based on at least one of the N types of feature parameters included in the feature group information to be compared, the comparison target information including M types (M is an integer value independent of N) of parameter values is Acquired,
Comparison target information composed of values of the M types of parameters is acquired based on at least one of the N types of feature parameters included in the feature group information of the comparison target,
When the distance from the predetermined viewpoint between the comparison target information and the comparison partner information is calculated,
The image information including the first symbol indicating the comparison target information and the second symbol indicating the comparison target information, the display form of which changes according to the calculated distance, is output as output information. Output means (for example, the output information generation unit 48 in FIG. 2)
Prepare for it.
As a result, the user can easily and effectively recognize the result of the analysis process regarding various cells having different analysis contents, analysis methods, various conditions, and the like.

一連の処理をソフトウェアにより実行させる場合には、そのソフトウェアを構成するプログラムが、コンピュータ等にネットワークや記録媒体からインストールされる。
コンピュータは、専用のハードウェアに組み込まれているコンピュータであってもよい。また、コンピュータは、各種のプログラムをインストールすることで、各種の機能を実行することが可能なコンピュータ、例えば汎用のパーソナルコンピュータであってもよい。
When the series of processes is executed by software, a program forming the software is installed in a computer or the like from a network or a recording medium.
The computer may be a computer embedded in dedicated hardware. Further, the computer may be a computer capable of executing various functions by installing various programs, for example, a general-purpose personal computer.

このようなプログラムを含む記録媒体は、ユーザにプログラムを提供するために装置本体とは別に配布される図1のリムーバブルメディア31により構成されるだけでなく、装置本体に予め組み込まれた状態でユーザに提供される記録媒体等で構成される。リムーバブルメディア31は、例えば、磁気ディスク(フロッピディスクを含む)、光ディスク、又は光磁気ディスク等により構成される。光ディスクは、例えば、CD−ROM(Compact Disk−Read Only Memory),DVD(Digital Versatile Disk)等により構成される。光磁気ディスクは、MD(Mini−Disk)、等により構成される。また、装置本体に予め組み込まれた状態でユーザに提供される記録媒体は、例えば、プログラムが記録されている図3のROM112,図5のROM212や、図2の記憶部118,図5の記憶部216に含まれるハードディスク等で構成される。 The recording medium containing such a program is not only configured by the removable medium 31 of FIG. 1 which is distributed separately from the apparatus main body to provide the program to the user, but is also installed in the apparatus main body in advance. It is composed of a recording medium provided to the. The removable medium 31 is composed of, for example, a magnetic disk (including a floppy disk), an optical disk, a magneto-optical disk, or the like. The optical disk is configured by, for example, a CD-ROM (Compact Disk-Read Only Memory), a DVD (Digital Versatile Disk), or the like. The magneto-optical disk is composed of MD (Mini-Disk) or the like. Further, the recording medium provided in advance to the user in a state of being incorporated in the apparatus main body is, for example, the ROM 112 in FIG. 3 in which the program is recorded, the ROM 212 in FIG. 5, the storage unit 118 in FIG. It is composed of a hard disk and the like included in the unit 216.

なお、記録媒体に記録されるプログラムを記述するステップは、その順序に沿って時系列的に行われる処理はもちろん、必ずしも時系列的に処理されなくとも、並列的或いは個別に実行される処理をも含むものである。 The step of writing the program recorded in the recording medium is not limited to the processing performed in time series according to the order, but the processing performed in parallel or individually is not necessarily performed in time series. It also includes.

1・・・細胞分析装置、11・・・CPU、16・・・出力部、18・・・記憶部、31・・・リムーバブルメディア、41・・・細胞画像入力部、42・・・特徴群情報生成部、43・・・ノイズ除去部、44・・・分析モデル生成部、45・・・評価対象情報取得部、46・・・評価対象情報取得部、47・・・分析部、48・・・出力情報生成部、61・・・特徴群情報DB、62・・・細胞評価DB、63・・・分析モデル保持部、81・・・外部装置、82・・・前処理装置、91・・・画像数値化部、92・・・複数画像特徴群情報生成部、93・・・ヘテロ性情報付加部、94・・・経時変化情報付加部、95・・・特徴群情報出力部95、101・・・数値化情報蓄積部、102・・・第1特徴群情報蓄積部、103・・・第2特徴群情報蓄積部、104・・・第3特徴群情報蓄積部104 DESCRIPTION OF SYMBOLS 1... Cell analysis device, 11... CPU, 16... Output unit, 18... Storage unit, 31... Removable media, 41... Cell image input unit, 42... Feature group Information generation unit, 43... Noise removal unit, 44... Analysis model generation unit, 45... Evaluation target information acquisition unit, 46... Evaluation target information acquisition unit, 47... Analysis unit, 48... .. Output information generation unit, 61... Feature group information DB, 62... Cell evaluation DB, 63... Analysis model holding unit, 81... External device, 82... Preprocessing device, 91. ..Image digitizing unit 92...Multiple image feature group information generating unit 93...Heterogeneous information adding unit 94...Change information adding unit 95...Feature group information output unit 95 101... Digitized information storage unit, 102... First feature group information storage unit, 103... Second feature group information storage unit, 104... Third feature group information storage unit 104

Claims (6)

複数の細胞からなる細胞集団を被写体として撮像された細胞画像の中から、所定条件により選定された1枚以上の細胞画像を単位として、前記単位に含まれる1以上の細胞画像のデータに基づいて、前記細胞の単体の形態的特徴又は前記細胞集団の形態的特徴に関するN種類(Nは1以上の整数値)の特徴パラメータの値を含む情報が、特徴群情報として保持されており、
前記N種類の特徴パラメータから抽出される種類の数Mが、比較対象の細胞の特徴又は所定の分析の特徴に応じて1乃至Nの何れかに可変されるようになされており、
前記比較対象の細胞に関する前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて前記N種類の特徴パラメータから抽出された前記M種類のパラメータの値から構成される情報が、比較対象情報として取得され、
比較相手の細胞に関する前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて前記N種類の特徴パラメータから抽出された前記M種類のパラメータの値から構成される情報が、比較相手情報として取得され、
前記比較対象情報と前記比較相手情報との間の所定観点での距離が算出された場合、
前記比較対象情報を示す第1シンボルと、前記比較相手情報を示す第2シンボルとを含む画像であって、算出された前記距離に応じて表示形態が変化する画像の情報を、出力情報として出力する出力手段と、
を備える細胞分析結果出力装置。
Based on the data of one or more cell images included in the unit, with one or more cell images selected under a predetermined condition as a unit from among the cell images obtained by capturing a cell population including a plurality of cells as a subject. , Information including the values of N kinds (N is an integer value of 1 or more) of characteristic parameters relating to the morphological characteristics of the cells alone or the morphological characteristics of the cell population is held as characteristic group information,
The number M of types extracted from the N types of characteristic parameters is changed to any one of 1 to N according to the characteristics of cells to be compared or the characteristics of a predetermined analysis,
Information composed of the values of the M types of parameters extracted from the N types of characteristic parameters on the basis of at least one of said N types of characteristic parameters included in the feature group information regarding cells of the comparison is , it is obtained as compared information,
Information composed of the values of the M kinds of parameters extracted from the N kinds of characteristic parameters based on at least one kind of the N kinds of characteristic parameters included in the characteristic group information regarding the cells of the comparison partner , is obtained as compared to the other information,
When the distance from the predetermined viewpoint between the comparison target information and the comparison partner information is calculated,
The image information including the first symbol indicating the comparison target information and the second symbol indicating the comparison target information, the display form of which changes according to the calculated distance, is output as output information. Output means to
A cell analysis result output device comprising:
前記出力手段は、
前記M種類のパラメータに基づいて定義されるS個(SはM以下の整数値)の軸から構築される空間内に、
前記第1シンボルと前記第2シンボルとを、算出された前記距離に応じて変化する位置に配置させた様子を示す前記画像の情報を、前記出力情報として出力する
請求項1に記載の細胞分析結果出力装置。
The output means is
In a space constructed from S (S is an integer value of M or less) axes defined based on the M kinds of parameters,
The cell analysis according to claim 1, wherein information of the image showing a state in which the first symbol and the second symbol are arranged at positions that change according to the calculated distance is output as the output information. Result output device.
前記第1シンボルと前記第2シンボルは、前記空間に配置される点である
請求項2に記載の細胞分析結果出力装置。
The cell analysis result output device according to claim 2, wherein the first symbol and the second symbol are points arranged in the space.
前記第1シンボルと前記第2シンボルは、前記空間に配置される枝である
請求項2に記載の細胞分析結果出力装置。
The cell analysis result output device according to claim 2, wherein the first symbol and the second symbol are branches arranged in the space.
細胞に関する分析の結果を出力する装置が実行する細胞分析結果出力方法において、
複数の細胞からなる細胞集団を被写体として撮像された細胞画像の中から、所定条件により選定された1枚以上の細胞画像を単位として、前記単位に含まれる1以上の細胞画像のデータに基づいて、前記細胞の単体の形態的特徴又は前記細胞集団の形態的特徴に関するN種類(Nは1以上の整数値)の特徴パラメータの値を含む情報が、特徴群情報として保持されており、
前記N種類の特徴パラメータから抽出される種類の数Mが、比較対象の細胞の特徴又は所定の分析の特徴に応じて1乃至Nの何れかに可変されるようになされており、
前記比較対象の細胞に関する前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて前記N種類の特徴パラメータから抽出された前記M種類のパラメータの値から構成される情報が、比較対象情報として取得され、
比較相手の細胞に関する前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて前記N種類の特徴パラメータから抽出された前記M種類のパラメータの値から構成される情報が、比較相手情報として取得され、
前記比較対象情報と前記比較相手情報との間の所定観点での距離が算出された場合、
前記比較対象情報を示す第1シンボルと、前記比較相手情報を示す第2シンボルとを含む画像であって、算出された前記距離に応じて表示形態が変化する画像の情報を、出力情報として出力する出力ステップ、
を含む細胞分析結果出力方法。
In the cell analysis result output method executed by the device that outputs the analysis result of cells,
Based on the data of one or more cell images included in the unit, with one or more cell images selected under a predetermined condition as a unit from among the cell images obtained by capturing a cell population including a plurality of cells as a subject. , Information including the values of N kinds (N is an integer value of 1 or more) of characteristic parameters relating to the morphological characteristics of the cells alone or the morphological characteristics of the cell population is held as characteristic group information,
The number M of types extracted from the N types of characteristic parameters is changed to any one of 1 to N according to the characteristics of cells to be compared or the characteristics of a predetermined analysis,
Information composed of the values of the M types of parameters extracted from the N types of characteristic parameters on the basis of at least one of said N types of characteristic parameters included in the feature group information regarding cells of the comparison is , it is obtained as compared information,
Information composed of the values of the M kinds of parameters extracted from the N kinds of characteristic parameters based on at least one kind of the N kinds of characteristic parameters included in the characteristic group information regarding the cells of the comparison partner , is obtained as compared to the other information,
When the distance from the predetermined viewpoint between the comparison target information and the comparison partner information is calculated,
The image information including the first symbol indicating the comparison target information and the second symbol indicating the comparison target information, the display form of which changes according to the calculated distance, is output as output information. Output step to
A method for outputting cell analysis results including.
細胞に関する分析の結果を出力する制御を実行するコンピュータに、
複数の細胞からなる細胞集団を被写体として撮像された細胞画像の中から、所定条件により選定された1枚以上の細胞画像を単位として、前記単位に含まれる1以上の細胞画像のデータに基づいて、前記細胞の単体の形態的特徴又は前記細胞集団の形態的特徴に関するN種類(Nは1以上の整数値)の特徴パラメータの値を含む情報が、特徴群情報として保持されており、
前記N種類の特徴パラメータから抽出される種類の数Mが、比較対象の細胞の特徴又は所定の分析の特徴に応じて1乃至Nの何れかに可変されるようになされており、
前記比較対象の細胞に関する前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて前記N種類の特徴パラメータから抽出された前記M種類のパラメータの値から構成される情報が、比較対象情報として取得され、
比較相手の細胞に関する前記特徴群情報に含まれる前記N種類の特徴パラメータのうち少なくとも1種類に基づいて前記N種類の特徴パラメータから抽出された前記M種類のパラメータの値から構成される情報が、比較相手情報として取得され、
前記比較対象情報と前記比較相手情報との間の所定観点での距離が算出された場合、
前記比較対象情報を示す第1シンボルと、前記比較相手情報を示す第2シンボルとを含む画像であって、算出された前記距離に応じて表示形態が変化する画像の情報を、出力情報として出力する出力ステップ、
を含む制御処理を実行させるプログラム。
To the computer that executes the control that outputs the result of the cell analysis,
Based on the data of one or more cell images included in the unit, with one or more cell images selected under a predetermined condition as a unit from among the cell images obtained by capturing a cell population including a plurality of cells as a subject. , Information including the values of N kinds (N is an integer value of 1 or more) of characteristic parameters relating to the morphological characteristics of the cells alone or the morphological characteristics of the cell population is held as characteristic group information,
The number M of types extracted from the N types of characteristic parameters is changed to any one of 1 to N according to the characteristics of cells to be compared or the characteristics of a predetermined analysis,
Information composed of the values of the M types of parameters extracted from the N types of characteristic parameters on the basis of at least one of said N types of characteristic parameters included in the feature group information regarding cells of the comparison is , it is obtained as compared information,
Information composed of values of the M kinds of parameters extracted from the N kinds of characteristic parameters based on at least one kind of the N kinds of characteristic parameters included in the characteristic group information regarding cells of the comparison partner , is obtained as compared to the other information,
When the distance from the predetermined viewpoint between the comparison target information and the comparison partner information is calculated,
The image information including the first symbol indicating the comparison target information and the second symbol indicating the comparison target information, the display form of which changes according to the calculated distance, is output as output information. Output step to
A program that executes control processing including.
JP2015070410A 2015-03-30 2015-03-30 Cell analysis result output device, cell analysis result output method and program Active JP6721895B2 (en)

Priority Applications (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2015070410A JP6721895B2 (en) 2015-03-30 2015-03-30 Cell analysis result output device, cell analysis result output method and program
PCT/JP2016/060146 WO2016158962A1 (en) 2015-03-30 2016-03-29 Device for producing information for cell analysis, method for producing information for cell analysis, and program
EP16772843.5A EP3275993B8 (en) 2015-03-30 2016-03-29 Device for producing information for cell analysis, method for producing information for cell analysis, and program
US15/563,155 US10900950B2 (en) 2015-03-30 2016-03-29 Apparatus and analytical evaluation methods using morphological feature parameters of a cell or cell population
SG11201708082RA SG11201708082RA (en) 2015-03-30 2016-03-29 Device for producing information for cell analysis, method for producing information for cell analysis, and program
HK18109585.2A HK1250169A1 (en) 2015-03-30 2018-07-24 Device for producing information for cell analysis, method for producing information for cell analysis, and program

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2015070410A JP6721895B2 (en) 2015-03-30 2015-03-30 Cell analysis result output device, cell analysis result output method and program

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2016191565A JP2016191565A (en) 2016-11-10
JP6721895B2 true JP6721895B2 (en) 2020-07-15

Family

ID=57246448

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2015070410A Active JP6721895B2 (en) 2015-03-30 2015-03-30 Cell analysis result output device, cell analysis result output method and program

Country Status (1)

Country Link
JP (1) JP6721895B2 (en)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2021063654A (en) * 2017-12-28 2021-04-22 株式会社堀場製作所 Particle image display device, particle image display program, particle image display method, and particle measurement system

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPWO2010098105A1 (en) * 2009-02-26 2012-08-30 国立大学法人名古屋大学 Culture state evaluation apparatus, culture state evaluation method, incubator and program
JP2011030494A (en) * 2009-07-31 2011-02-17 Kirin Brewery Co Ltd Method for evaluating physiological state of yeast by using cell form quantification value
JP5854418B2 (en) * 2011-02-28 2016-02-09 国立大学法人名古屋大学 Cell culture environment evaluation method and apparatus

Also Published As

Publication number Publication date
JP2016191565A (en) 2016-11-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Duan et al. Corner proposal network for anchor-free, two-stage object detection
De Stefano et al. Reliable writer identification in medieval manuscripts through page layout features: The “Avila” Bible case
CN103703472B (en) The method and system at position and association attributes for determining the object in video
CN104517112B (en) A kind of Table recognition method and system
Ziamtsov et al. Machine learning approaches to improve three basic plant phenotyping tasks using three-dimensional point clouds
Poux et al. Smart point cloud: Definition and remaining challenges
CN109241741B (en) Malicious code classification method based on image texture fingerprints
JP6888484B2 (en) A search program, a search method, and an information processing device on which the search program operates.
CN109815987B (en) Crowd classification method and system
KR101386513B1 (en) Method for recognizing human action using weighted bag of features histogram based on spatial pyramid and random forest classifier
CN113177927A (en) Bone marrow cell classification and identification method and system based on multiple features and multiple classifiers
De Stefano et al. Layout measures for writer identification in mediaeval documents
EP2503006B1 (en) Method for tracking cells
JP6721895B2 (en) Cell analysis result output device, cell analysis result output method and program
JP2011154500A (en) Learning device, method for learning, identification device, method for identification and program
JP2016189702A (en) Cell analysis model creating device and cell analysis model creating method, cell analysis device and cell analysis method, and program
JP5765583B2 (en) Multi-class classifier, multi-class classifying method, and program
JP2014115920A (en) Multi-class identifier, method, and program
Kylberg Automatic virus identification using TEM: Image segmentation and texture analysis
WO2016158962A1 (en) Device for producing information for cell analysis, method for producing information for cell analysis, and program
JP5892275B2 (en) Multi-class classifier generation device, data identification device, multi-class classifier generation method, data identification method, and program
INTHIYAZ et al. YOLO (YOU ONLY LOOK ONCE) Making Object detection work in Medical Imaging on Convolution detection System.
CN113313213B (en) Data set processing method for accelerating training of target detection algorithm
JP6659120B2 (en) Information processing apparatus, information processing method, and program
JP2016189701A (en) Information creating device for cell analysis, information creating method for cell analysis and program

Legal Events

Date Code Title Description
A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20180322

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20190416

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20190617

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20191105

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20191227

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20200519

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20200609

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Ref document number: 6721895

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150

S111 Request for change of ownership or part of ownership

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313113

R350 Written notification of registration of transfer

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250