JP6590244B2 - 値付けされた物質量濃度標準物質の製造方法 - Google Patents
値付けされた物質量濃度標準物質の製造方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6590244B2 JP6590244B2 JP2015103187A JP2015103187A JP6590244B2 JP 6590244 B2 JP6590244 B2 JP 6590244B2 JP 2015103187 A JP2015103187 A JP 2015103187A JP 2015103187 A JP2015103187 A JP 2015103187A JP 6590244 B2 JP6590244 B2 JP 6590244B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- substance
- concentration
- standard
- measurement
- fcs
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Landscapes
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
Description
蛍光相関分光法(Fluorescence correlation spectroscopy:以下略して「FCS」と記載することがある)は、共焦点光学系を利用し、水溶液中に存在する蛍光分子がブラウン運動して生じる蛍光強度の時間ゆらぎを観測することで分子の拡散速度、数に関する情報を取得する手法として知られている(特許文献1、2等参照)。FCSはレーザー焦点領域である測定領域内の“分子数”の統計的解析にもとづき、直接物質量濃度を算出可能な数少ない方法である。FCSで得られる分子数を濃度に変換するには測定領域の体積を精確に求めることが必要である。現在、測定領域の体積はRhodamine 6Gの拡散定数(414μm2/s)と測定拡散時間の関係からガウシアンプロファイルのレーザー焦点領域を仮定して求められている(後述の図3参照)。一方、濃度既知の試料の測定を通じて測定領域の体積を求める理論も提唱されている(非特許文献1参照)が、用いる試料は実験者が調製したものであり標準物質といえる物ではなかった。
他にも、分子数を定量可能な蛍光相関解析はラスター走査画像相関分光法(RICS)やNumber & Brightness(N&B)解析が存在する。
図2は測定領域内に存在する分子数が少ない場合と、多い場合において測定した蛍光強度(Fluorescence Intensity)の時間変化I(t)と、それらの自己相関関数(Autocorrelation function)のグラフ
G(τ)=<I(t)I(t+τ)>/<I(t)>2
を模式的に示したものである。式内<>はアンサンブル平均であることを示す。蛍光相関分光法では、微小な測定領域で低濃度の蛍光物質を観察すると、1分子がブラウン運動によって拡散し測定領域内外を出入りすることで蛍光強度シグナルにゆらぎが生じる。測定領域内に同時に存在する分子数が少ない(すなわち濃度が低い)場合には、平均蛍光強度に対してゆらぎの幅が大きくなり、一方、分子数が多い(濃度が高い)場合にはゆらぎの幅が小さくなる。分子の数を反映するこのゆらぎの幅は自己相関関数では曲線の振幅(y軸)の高さで表現される。そして、原理的には自己相関関数のグラフのいわゆるy切片、すなわち零時間遅れのとき(τ=0のとき)の自己相関係数の値から1を引いた値が、分子数の絶対量Nの逆数1/Nになることが知られている。また、x軸で表される相関時間(τ)方向の減衰時間は分子の拡散速度、すなわち大きさを反映する。以上のパラメータは実測定では理論式に対するフィッティング解析等で求められる。
実効体積:Veff=π3/2ω0 3S
で求めるしかなかった。このように算出する実効体積では、焦点領域は3D-ガウシアンの強度分布を持つという仮定を前提にしており、実際のレーザーの焦点領域は装置条件次第できれいな楕円体からゆがんでいることが容易に推測され、計算で正確に見積もることは困難である。
一般的に、日常の分析で利用されるワーキングスタンダードとなる標準物質は、多様な試料を対象とする汎用的な標準物質となる。産業界には各利用者の測定系に合った標準物質のニーズが存在するが、全ての対象試料に対して一次標準物質(認証標準物質)を作製するには膨大なコストと時間がかかるため、各試料に対し標準を揃えることは現実的でない。したがって、いかにワーキングスタンダードとなる標準物質(二次標準、三次標準等)を簡便かつ理論的正確性を持って値付けするかが重要である。二次標準等の値づけは一次標準(認証標準)と比較して行うが、例えば核酸の場合、様々な生物種や遺伝子を対象とするため、大部分の試料で対象となる核酸の配列や鎖長が異なり、一般的な吸光法等では前記比較が不正確になってしまう。
そこで、本発明では以上の状況を鑑み、試料の種類によらない物質量濃度の値付け方法を提供することを課題とする。
本発明は、FCS測定を用いた物質量濃度一次標準物質(認証標準物質)にトレーサブルな物質量濃度標準物質の値付け方法であって、
蛍光染色した物質量濃度一次標準物質(認証標準物質)もしくはそれにトレーサブルな標準物質をFCS測定し、測定結果からFCS測定の測定領域中の分子数Nを求め、前記物質量濃度一次標準物質(認証標準物質)の標準濃度または質量濃度認証値を当該標準物質の既知分子量を用いて換算した物質量濃度もしくはそれにトレーサブルな標準物質濃度Cとアボガドロ数NAから、前記測定領域の体積Vを、式
V=N/(NA×C)
により算出して求める工程1と、
蛍光染色した値付け対象物質をFCS測定で測定し測定結果からFCS測定の測定領域中の分子数を求め、当該求めた分子数と、前記工程1で求めた測定領域の体積Vから、前記値付け対象物質の物質量濃度を、式
物質量濃度=当該求めた分子数/(NA×V)
により算出して求めた値で物質量濃度標準物質として値付けする工程2と、
からなる物質量濃度標準物質の値付け方法である。
また、本発明は、上記物質量濃度標準物質の値付け方法において、前記物質量濃度一次標準物質(認証標準物質)もしくはそれにトレーサブルな標準物質および前記値付け対象物質のFCS測定において、質量比混合法により希釈して測定した場合には、希釈倍率を勘案して前記測定領域の体積Vの算出および値付け対象物質の物質量濃度を算出することを特徴とする。
また、本発明は、上記物質量濃度標準物質の値付け方法によって値付けされた物質量濃度標準物質である。
本発明の工程1の一次標準物質(認証標準物質)もしくはそれにトレーサブルな標準物質による測定領域体積の算出では、従来の拡散定数からの推定ではなく、直接既知濃度の色素溶液(標準物質)をFCS測定することで、測定領域体積を精確に見積った。本発明の工程1によれば、測定領域の形状を考慮する必要が無く、体積のみを精確に求めることができる。前記既知濃度の標準物質は蛍光染色した核酸標準物質を用いても良い。
図4は、本発明の工程1の一例を示したものであり、この例では、FCS測定領域体積を求めるための標準物質(一次標準物質にトレーサブル)としてフルオレセイン物質量濃度標準溶液(Fluorescein NIST Traceable:Life Technologies社製)を利用した。この溶液を質量比混合法により測定濃度Cに希釈しFCS測定に供した。得られた測定領域内の平均分子数Nの値と試料調製濃度Cから、FCS測定領域体積VをV=N/(NA×C)より算出した。ここでNAはアボガドロ数である。図4中の実測例では、N=12.1、C=52nMであるので、最終的にV=0.390fLが得られた。この値はレーザー発振や光学系の条件、すなわち気温や湿度等の環境要因に影響されうるため装置調整回毎に測定する必要がある。
なお、フルオレセインは非常にガラス等への吸着が少ないため標準溶液に向いているが、pH依存的に蛍光強度が変化するという特徴をもつ。フルオレセインの蛍光強度はアルカリ性に最適値と持つため、希釈バッファーには100mMホウ酸バッファー(pH9.5)を用い、pHを一定に保った。
本発明の工程2では、上記工程1により算出したFCS測定領域体積Vを使って、被値付け物質に対して物質量濃度二次標準物質としての物質量濃度の値付けをFCS測定により行う。
ここでは、本発明の値付け方法の説明と同時に、本発明の値付け方法の妥当性をも検証可能とするために、被値付け物質として、本出願人のバイオメディカル研究部門および物質計測標準研究部門で開発したRNA標準溶液(NMIJ CRM6204-a)を用いた例で説明する。このRNA標準溶液は、一次標準物質(認証標準物質)であり、この物質を複数の異なる濃度に希釈したものに対して、本発明の値付け方法で物質量濃度標準として値付けした値を、一次標準物質(認証標準物質)としての認証値と比較することにより本発明の値付け方法の妥当性が検証できる。
このRNA標準溶液(以下「RNA500−A」等と記載することがある)を質量比混合法によって4つの混合比で希釈した試料を用い、核酸定量用のプローブであるQuant-iT RiboGreen RNA Assay kit(Life Technologies社製)で蛍光染色してFCS測定して得られた自己相関関数G(τ)のグラフを図5に示す。x軸は相関時間(τ)、y軸は相関関数値を表す。図5のグラフをそれぞれ理論式でフィッティング解析することで測定領域中の分子数Nが求まる。なお、図5中のRNA500A 44.5nmol/L、22.3nmol/L、11.1nmol/L、5.56nmol/Lは、RNA標準溶液を希釈した4種類の試料の物質量濃度を表しており、4本のグラフはそれぞれに対応している。
図5の自己相関関数G(τ)のグラフから得られた測定領域中の分子数を、工程1で得られた測定領域体積Vの値(V=0.390fL)で割り算して得た物質量濃度、すなわち1リットル当たりのRNAモル数をプロットしたのが図6のグラフであり、図6の横軸がRNA標準溶液の認証値から得られる物質量濃度(nmol/L)、縦軸がFCS測定から算出した本発明による値付け値となる物質量濃度(nmol/L)を表し、実線(横軸の値=縦軸の値を表す直線)上に載れば両者は完全に一致するといえ、図6からは本発明の値付け方法によってFCS測定で導き出された測定定量値はRNA標準溶液の認証値と誤差の範囲で一致していることがわかる。
なお、本発明の値付け用法に用いる標準物質、および被値付け対象となる二次標準物質の試料としては、蛍光標識さえ可能であれば核酸のみならずタンパク質、小分子等多様な標的物質に適用可能である。
Claims (2)
- FCS測定を用いた物質量濃度一次標準物質もしくは認証標準物質にトレーサブルな下位の物質量濃度標準物質の製造方法であって、
蛍光染色した物質量濃度一次標準物質、認証標準物質もしくはそれにトレーサブルな標準物質をFCS測定し、測定結果からFCS測定の測定領域中の分子数Nを求め、前記物質量濃度一次標準物質、認証標準物質の認証物質量濃度もしくはそれにトレーサブルな標準物質濃度Cとアボガドロ数NAから、前記測定領域の体積Vを、次式
V=N/(NA×C)
により算出して求める工程1と、
蛍光染色した値付け対象物質をFCS測定で測定し測定結果からFCS測定の測定領域中の分子数を求め、当該求めた分子数と、前記工程1で求めた測定領域の体積Vから、値付け対象物質の物質量濃度を、次式
物質量濃度=当該求めた分子数/(NA×V)
により算出して求めた値で物質量濃度標準物質として値付けする工程2と、
を含み、
前記物質量濃度一次標準物質、認証標準物質、物質量濃度標準物質および標準物質が核酸である、
物質量濃度標準物質の製造方法。 - 前記物質量濃度一次標準物質、認証標準物質もしくはそれにトレーサブルな標準物質および前記値付け対象物質のFCS測定において、質量比混合法により希釈して測定した場合には、希釈倍率を勘案して前記測定領域の体積Vの算出および値付け対象物質の物質量濃度を算出することを特徴とする請求項1に記載の物質量濃度標準物質の製造方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2015103187A JP6590244B2 (ja) | 2015-05-20 | 2015-05-20 | 値付けされた物質量濃度標準物質の製造方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2015103187A JP6590244B2 (ja) | 2015-05-20 | 2015-05-20 | 値付けされた物質量濃度標準物質の製造方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2016217887A JP2016217887A (ja) | 2016-12-22 |
JP6590244B2 true JP6590244B2 (ja) | 2019-10-16 |
Family
ID=57578447
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2015103187A Active JP6590244B2 (ja) | 2015-05-20 | 2015-05-20 | 値付けされた物質量濃度標準物質の製造方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP6590244B2 (ja) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3543351B1 (en) | 2018-03-19 | 2022-08-10 | Ricoh Company, Ltd. | Nucleic acid sample-contained container, method for producing nucleic acid sample-contained container, and nucleic acid sample |
Family Cites Families (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP4217318B2 (ja) * | 1998-12-07 | 2009-01-28 | オリンパス株式会社 | 標的核酸の定量分析方法および装置 |
EP1935987A1 (en) * | 2006-12-22 | 2008-06-25 | Rigler, Rudolf | Detection of gene expression in cells by scanning FCS |
WO2008080417A1 (en) * | 2006-12-28 | 2008-07-10 | Flult Biosystems Gmbh | A method of determining characteristic properties of a sample containing particles |
JP2008228637A (ja) * | 2007-03-20 | 2008-10-02 | Tokushima Bunri Univ | 蛍光相関分光測定法を用いた過酸化水素量の測定方法及びその利用方法 |
JP2008261802A (ja) * | 2007-04-13 | 2008-10-30 | Olympus Corp | 検体サンプルの濃度自動分析システム及び濃度自動分析方法 |
DE102007033737A1 (de) * | 2007-07-18 | 2009-01-22 | MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Verfahren zum Bestimmen eines Messwerts auf der Basis von Einzelmolekülereignissen |
US20120050734A1 (en) * | 2009-04-15 | 2012-03-01 | Stefan Wennmalm | Inverse-fluorescence correlation spectroscopy |
JP2010276380A (ja) * | 2009-05-26 | 2010-12-09 | Olympus Corp | 蛍光相関分光分析装置及び方法並びにそのためのコンピュータプログラム |
JP5274590B2 (ja) * | 2011-01-27 | 2013-08-28 | 旭化成ファーマ株式会社 | ロイコ色素の安定化方法 |
-
2015
- 2015-05-20 JP JP2015103187A patent/JP6590244B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2016217887A (ja) | 2016-12-22 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Petrášek et al. | Precise measurement of diffusion coefficients using scanning fluorescence correlation spectroscopy | |
JP5250152B2 (ja) | 光分析装置、光分析方法並びに光分析用コンピュータプログラム | |
Hanley et al. | Fluorescence lifetime imaging: multi‐point calibration, minimum resolvable differences, and artifact suppression | |
US9488578B2 (en) | Single particle detection device, single particle detection method, and computer program for single particle detection, using optical analysis | |
US20130338968A1 (en) | Optical analysis device, optical analysis method and computer program for optical analysis using single light-emitting particle detection | |
JP2010276380A (ja) | 蛍光相関分光分析装置及び方法並びにそのためのコンピュータプログラム | |
US9863806B2 (en) | Optical analysis method and optical analysis device using the detection of light from a single light-emitting particle | |
US9329117B2 (en) | Optical analysis device, optical analysis method and computer program for optical analysis using single light-emitting particle detection | |
Levin et al. | Fluorescence correlation spectroscopy and quantitative cell biology | |
Hollis et al. | An optical model for quantitative Raman microspectroscopy | |
US9739698B2 (en) | Optical analysis device, optical analysis method and computer program for optical analysis using single light-emitting particle detection | |
US9528923B2 (en) | Optical analysis device, optical analysis method and computer program for optical analysis using single light-emitting particle detection | |
Buschmann et al. | Quantitative FCS: determination of the confocal volume by FCS and bead scanning with the microtime 200 | |
JP6590244B2 (ja) | 値付けされた物質量濃度標準物質の製造方法 | |
JP3447562B2 (ja) | 解析方法および解析装置 | |
US9103718B2 (en) | Optical analysis device and optical analysis method using a wavelength characteristic of light of a single light-emitting particle | |
Liu et al. | Parallelized fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM) based on photon reassignment | |
Titze et al. | Hyperspectral confocal imaging for high-throughput readout and analysis of bio-integrated microlasers | |
Enderlein | Fluorescence correlation spectroscopy (IUPAC technical report) | |
Krishnan et al. | Probing subtle fluorescence dynamics in cellular proteins by streak camera based fluorescence lifetime imaging microscopy | |
Junek et al. | Nanosecond compressive fluorescence lifetime microscopy imaging via the RATS method with a direct reconstruction of lifetime maps | |
Macháň et al. | Fluorescence Correlation Spectroscopy (FCS) | |
JP2018163162A (ja) | 微小粒子測定装置 | |
Balaji et al. | Quantitative measurement of the resolution and sensitivity of confocal microscopes using line‐scanning fluorescence correlation spectroscopy | |
Rüttinger et al. | Determination of the confocal volume for quantitative fluorescence correlation spectroscopy |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20180420 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20190418 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20190507 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190705 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190828 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20190904 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20190905 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6590244 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |