JP6410464B2 - Dna断片化装置及びdna断片化方法 - Google Patents
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Description
(1) 試料液に付加するのは遠心力であり、試料液を直接加圧などするものではないので、そもそもDNA断片化効果が小さい。
(2) 断片化後のDNA断片の核酸サイズが安定していない(均一性が不十分である)。これは、オリフィスの形状寸法がコントロールされていないこと、DNAを含有する試料液がその粘性により微小オリフィス内に流入し始めるのが遠心機起動後の増速から等速回転に至るまでの間及びそれ以降のどの時点になるかのコントロールができないこと、及び厳密には微小オリフィス内における試料液の移動により回転半径が変化するので、一定した遠心力を試料液に対して及ぼすことができないこと、などの要因によるものである。
図1は、本発明のDNA断片化装置の一実施形態を説明するための図を示している。この図に示すように、本実施形態のDNA断片化装置1は、試料液収容部10、試料液移送手段13、流路末端部15、計測手段24及び駆動制御手段(30,33)から主に構成される。そして、本実施形態においては、試料液収容部10として円筒状のバレル(試料液収容部と同様、符号10を付することとする。)が、また試料液移送手段13としてプランジャー(同様に符号13を付することとする。)が使用され、両者の組み合わせによりシリンジを構成している。
本実施形態のDNA断片化装置の試料液中に含まれるDNAの断片化を行うための使用方法について以下説明する。
一般に、流体のオリフィス細孔内のせん断速度(シェアレート)DRは、次式(式1)で与えられ、細孔内のせん断応力τRは、次式(式2)で与えられる。このせん断速度とせん断応力とから、式3に示したように、粘度を求めることができる。
Claims (9)
- 試料液中に含まれるDNAを断片化するためのDNA断片化装置であって、
前記試料液を収容でき、当該試料液を移送する流路を有する試料液収容部と、
前記試料液収容部に連通して筒状部及び所定の内径の細孔を有するオリフィスを順次備え、当該オリフィスを通過した前記試料液を回収する回収部を取り付け可能な流路末端部と、
前記試料液収容部に収容された前記試料液を前記流路に沿って移送し、前記オリフィスの細孔に流入通過させるための試料液移送手段と、
前記試料液の前記細孔通過時に、当該試料液から前記オリフィスが受ける流れ方向の力を計測する計測手段と、
前記試料液移送手段の駆動制御により、前記力の計測結果に基づいて前記試料液の前記細孔通過時の流速を調節するように構成された駆動制御手段とを有することを特徴とするDNA断片化装置。 - 前記流路末端部は、その開口方向が鉛直となるように前記試料液の流路に配置されてなる請求項1に記載のDNA断片化装置。
- 前記試料液収容部は鉛直方向に配置された筒状体であり、前記試料液移送手段は前記筒状体の内部を上下に摺動するプランジャーである請求項1又は2に記載のDNA断片化装置。
- 前記流路末端部は、前記試料液収容部に着脱自在に接続可能なものである請求項1〜3のいずれか1項に記載のDNA断片化装置。
- 前記試料液移送手段は、前記試料液が前記オリフィスに導入されるまで該試料液を等速で移送するように構成されてなる請求項1〜4のいずれか1項に記載のDNA断片化装置。
- 試料液中に含まれるDNAを断片化するための方法であって、
前記試料液を試料液収容部内に収容する工程と、
試料液移送手段を駆動させ、前記試料液を前記試料液収容部内の流路に沿って等速で送り出し、さらに前記試料液収容部に連通する流路末端部における筒状部及びオリフィスに導入する工程と、
前記試料液が前記オリフィスの細孔を通過する際に、計測手段により前記オリフィスが受ける流れ方向の力を計測する工程と、
該計測結果に基づいて前記試料液の前記細孔内流速を調節すべく、駆動制御手段により前記試料液移送手段の駆動制御を行なわせる工程とを含むことを特徴とするDNA断片化方法。 - 前記流路末端部は、その開口方向が鉛直となるように前記試料液の流路に配置されてなる請求項6に記載のDNA断片化方法。
- 前記試料液収容部は鉛直方向に配置された筒状体であり、前記試料液移送手段は前記筒状体の内部を上下に摺動するプランジャーである請求項6又は7に記載のDNA断片化方法。
- 前記流路末端部は、前記試料液収容部に着脱自在に接続可能なものである請求項6〜8のいずれか1項に記載のDNA断片化方法。
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