JP6130448B2 - 草種の同定のための方法 - Google Patents
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Description
I型アレルギー性疾患、例えば、季節性アレルギー性鼻炎(花粉症)、結膜炎、アレルギー性喘息、及びアレルギー性皮膚炎などは、工業化国において、大きな健康問題を示す(Wuthrich et al. (1989) Int Arch Allergy Appl Immunol 90:3-10)。現在、先進国の人口の15〜20%が何らかの形態のアレルギーに悩まされていると見積もられる。
抗原特異的耐性は、他の正常な免疫系において、特定の抗原に対する、一つ又はいくつかの免疫反応、特に、有機体に対する有害な作用の原因となる反応、の強度の不在又は減少として定義される。
それ故、組成物中の特定の草アレルゲンの決定を可能にする方法のための、特に品質管理有機物又は薬物代理店からの要求がある。
本発明は、花粉アレルゲン由来のペプチドが、組成物中の特定の草抽出物の存在の同定に用いられるという、発明者らによる予期していなかった発見に起因する。
−組成物のサンプル中で、配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、及び配列番号5からなる群から選択される配列を含む又はからなる少なくとも一つのペプチドを検出し;
−それぞれ配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、又は配列番号5を含む又はからなるペプチドがサンプル中で検出された場合、ペレニアルライ、オオアワガエリ、カモガヤ、ハルガヤ、又はケンタッキーブルーグラスからの抽出物が組成物中に存在することを推定すること、
を含む。
−配列番号1からなるペプチド;
−配列番号2からなるペプチド;
−配列番号3からなるペプチド;
−配列番号4からなるペプチド;
−配列番号5からなるペプチド;
を含む。
本明細書で用いる用語「ペプチド」は、ペプチド結合により直線的に配列でお互いが繋がった、D- 又はL-アミノ酸残基の直線配列を含む分子を意味する。本明細書で用いる「アミノ酸」は、特に、20の天然に生ずるアミノ酸(すなわち、アラニン、アルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、システイン、グルタミン酸、グルタミン、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、セリン、スレオニン、トリプトファン、チロシン、及びバリン)、しかしまた、例えば、ヒドロキシプロリン、ホスホセリン、及びホスホスレオニンなどのようなインビボで見られる翻訳後修飾を有するアミノ酸;及び2-アミノアジピン酸、ヒドロキシリジン、イソデスモシン、ノル‐バリン、ノル‐ロイシン、及びオルニチンを含むがこれに限定されない他の珍しいアミノ酸、を含む。
方法
花粉抽出物及び5つの草花粉薬剤物質
ケンタッキーブルーグラス、カモガヤ、ペレニアルライ、ハルガヤ、及びオオアワガエリの花粉は、個別に4 g/Lの重炭酸アンモニウム溶液で、撹拌下で、24時間抽出された。抽出物は、さらに濾過され、濃縮され、凍結乾燥された。
草種特異的ペプチドの特定を確認するために、4つの草種を含む混合物に基づく薬剤物質は、トリプシン消化後に得られるペプチドパターンに関する質量分析(MS)技術により特徴付けられた。実験条件は、トリプシン消化の有効性を保障するために最初に最適化された。
種特異的群1アレルゲンペプチドの同定
花粉抽出物の3つの独立したバッチは、それぞれの草種について、それらのペプチドの特異性を確かめるために、分析された(ペレニアルライについて、図3及び図4に例示される)。
5つの草種のそれぞれについて種特異的群1ペプチドを同定した後、そのようなペプチドが5つの草花粉抽出物中で検出できるかどうか調査された。まず、ペプチドアレルゲン特異性を確かめるために、4種のみを含む草花粉原料が分析された。LC-MS/MS手法(ThermoElectron 製のLTQ-Orbitrap質量分析が用いられた)は、種特異的群1ペプチドを検出するために用いられた。全ての特異的ペプチドの存在は、これらのサンプル中でLC-MS/MSにより直接的に検出された。
Claims (19)
- 組成物中のオオアワガエリからの抽出物の存在を決定するための、配列番号2の配列からなるペプチドの使用。
- 組成物中のオオアワガエリ並びにカモガヤ、ハルガヤ、及びケンタッキーブルーグラスから選択される少なくとも一つの草種からの抽出物の存在を決定するための、配列番号2の配列からなるペプチド、並びに配列番号3、配列番号4、及び配列番号5からなる群から選択される配列からなる少なくとも一つのペプチドの使用。
- 組成物中のオオアワガエリ、カモガヤ、ハルガヤ、及びケンタッキーブルーグラスからの抽出物の存在をそれぞれ決定するための請求項2に記載の使用であって、前記ペプチドが、配列番号2、配列番号3、配列番号4、及び配列番号5の配列からなる、使用。
- 前記組成物が、医薬組成物である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の使用。
- 前記医薬組成物が、草アレルギーの治療のために意図される、請求項4に記載の使用。
- 前記抽出物が、草花粉抽出物である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の使用。
- 組成物中の草種からの抽出物の存在を検出するための方法であって、
−組成物中のサンプル中に、配列番号2の配列からなるペプチドを検出し;
−配列番号2からなるペプチドが前記サンプル中から検出された場合、オオアワガエリからの抽出物が組成物中に存在することを推定すること、
を含む、方法。 - −組成物中のサンプル中に、配列番号2の配列からなるペプチド、並びに配列番号3、配列番号4、及び配列番号5からなる群から選択される配列からなる少なくとも一つのペプチドを検出し;
−それぞれ配列番号2、配列番号3、配列番号4、又は配列番号5からなるペプチドがサンプル中から検出された場合、オオアワガエリ、カモガヤ、ハルガヤ、又はケンタッキーブルーグラスからの抽出物が組成物中に存在することを推定すること、
を含む、請求項7に記載の方法。 - −組成物中のサンプル中に、配列番号2、配列番号3、配列番号4、及び配列番号5の配列からなるペプチドを検出し;
−それぞれ配列番号2、配列番号3、配列番号4、又は配列番号5からなるペプチドがサンプル中から検出された場合、オオアワガエリ、カモガヤ、ハルガヤ、又はケンタッキーブルーグラスからの抽出物が組成物中に存在することを推定すること、
を含む、請求項8に記載の方法。 - 前記ペプチドの検出が、液体クロマトグラフィーと質量分析法との組み合わせにより行われる、請求項7〜9のいずれか一項に記載の方法。
- 前記サンプルが、ペプチドを検出する前に、タンパク質分解処理を受ける、請求項7〜10のいずれか一項に記載の方法。
- 前記タンパク質分解処理が、次にプロリンが続く場合を除いて、アミノ酸リジン及びアルギニンのカルボキシル側鎖においてペプチド鎖を切断するタンパク質分解処理である、請求項11に記載の方法。
- タンパク質分解処理が少なくとも一つのタンパク質分解酵素を含む、請求項11又は12に記載の方法。
- 前記タンパク質分解処理がトリプシンを含む、請求項13に記載の方法。
- 前記組成物が、草アレルギーの治療のために意図される医薬組成物である、請求項7〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抽出物が、草花粉抽出物である、請求項7〜15のいずれか一項に記載の方法。
- 組成物中のオオアワガエリからの抽出物の存在を検出するためのキットであって、配列番号2の配列からなるペプチドを含み、前記ペプチドは対照として用いられる、キット。
- 配列番号2からなるペプチド;及び
配列番号3、配列番号4、及び配列番号5からなる群から選択される配列からなる少なくとも一つのペプチドを含むキットであって、
ここで前記ペプチドは、対照として用いられ、そして前記キットは、組成物中のオオアワガエリ、並びにカモガヤ、ハルガヤ、及びケンタッキーブルーグラスから選択される少なくとも1つの草種からの抽出物の存在を検出するために用いられる、
請求項17に記載のキット。 - −配列番号2からなるペプチド;
−配列番号3からなるペプチド;
−配列番号4からなるペプチド;及び
−配列番号5からなるペプチド;
を含むキットであって、
ここで前記ペプチドは、対照として用いられ、そして前記キットは、組成物中のオオアワガエリ、カモガヤ、ハルガヤ、及びケンタッキーブルーグラスからの抽出物の存在を検出するために用いられる、
請求項18に記載のキット。
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