JP5988212B2 - Method for producing triacylglycerol highly productive algae - Google Patents

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Description

本発明は、トリアシルグリセロール(以下、「TAG」という)高生産性藻類の作製方法、及びその方法によって作製された藻類、並びに前記藻類を用いたTAGの製造方法に関する。   The present invention relates to a method for producing triacylglycerol (hereinafter referred to as “TAG”) highly productive algae, algae produced by the method, and a method for producing TAG using the algae.

クラミドモナス・レインハーディ(Chlamydomonas reinhardtii、以下「C. reinhardtii」という場合がある。)などの藻類にTAG合成酵素遺伝子を導入し、それにより細胞中にTAG蓄積させることは従来から行われてきた(特許文献1、非特許文献1)。   Conventionally, TAG synthase gene is introduced into algae such as Chlamydomonas reinhardtii (hereinafter sometimes referred to as “C. reinhardtii”), and thereby TAG is accumulated in cells (patents). Document 1, Non-Patent Document 1).

例えば、非特許文献1には、C. reinhardtiiに、強発現プロモーターであるpsaDを付加したDGAT2遺伝子を導入し、これを窒素又は硫黄欠乏条件下で培養し、TAGを細胞中に蓄積させる方法が記載されている。特許文献1にも、非特許文献1と同様に、psaDを付加したDGAT2遺伝子を導入したC. reinhardtiiが記載されている。   For example, Non-Patent Document 1 discloses a method of introducing DGAT2 gene added with psaD, which is a strong expression promoter, into C. reinhardtii, culturing it in a nitrogen or sulfur deficient condition, and accumulating TAG in the cell. Have been described. Patent Document 1 also describes C. reinhardtii into which DGAT2 gene added with psaD is introduced, as in Non-Patent Document 1.

国際公開WO 2011/156520International publication WO 2011/156520

M. La Russa et al., J. Biotechnol. 2012 Apr 20.M. La Russa et al., J. Biotechnol. 2012 Apr 20.

上述したようにTAG合成酵素遺伝子を藻類に導入することにより、細胞中にTAGを蓄積させる方法は既に知られているが、それらの方法では十分な量のTAGを蓄積させることができなかった。例えば、非特許文献1には、窒素欠乏、硫黄欠乏のいずれの条件においても、DGAT2遺伝子導入株と野生株との間にTAGの蓄積量に統計的に意味のある差異はなかったと記載されている(Fig. 5など)。   As described above, methods for accumulating TAG in cells by introducing the TAG synthase gene into algae are already known, but those methods were unable to accumulate a sufficient amount of TAG. For example, Non-Patent Document 1 describes that there was no statistically significant difference in the accumulated amount of TAG between the DGAT2 gene-introduced strain and the wild strain under either nitrogen deficiency or sulfur deficiency conditions. (Fig. 5 etc.)

本発明は、このような背景の下、藻類の細胞中にTAGを効率的に蓄積させる手段を提供することを目的とする。   An object of the present invention is to provide a means for efficiently accumulating TAG in algae cells.

本発明者は、まず、従来の方法において十分な量のTAGが蓄積しないのはプロモーターに原因があるのではないかと考えた。即ち、TAGは栄養欠乏時に蓄積されるが、栄養欠乏時には、psaDのような強発現プロモーターは十分機能していないのではないかと考えた。そこで、強発現プロモーターに代えて、栄養欠乏応答プロモーターを使用するという発想を得た。   The present inventor first thought that there was a cause in the promoter that a sufficient amount of TAG did not accumulate in the conventional method. That is, although TAG is accumulated at the time of nutrient deficiency, we thought that a strong expression promoter such as psaD may not function sufficiently at the time of nutrient deficiency. Therefore, the idea of using a nutrient deficiency responsive promoter instead of a strong expression promoter was obtained.

また、本発明者は、窒素欠乏条件とリン欠乏条件におけるTAGの蓄積量とTAGの脂肪酸組成を調べた。その結果、1)増殖の盛んな細胞を植え継いだ場合、窒素欠乏条件よりリン欠乏条件の方がTAGの蓄積量が多いこと、2)窒素欠乏条件では、葉緑体の膜脂質由来の脂肪酸を含むTAGが多く、新しく合成された脂肪酸は少ないこと、3)窒素欠乏、リン欠乏のいずれの条件でも細胞の増殖は阻害されるが、リン欠乏条件では、窒素欠乏条件ほど、細胞の増殖は阻害されないことなどがわかった。これらの知見から、TAG高生産性藻類としては、窒素欠乏応答性のものよりも、リン欠乏応答性のものの方が好ましいという発想を得た。   In addition, the present inventor examined the accumulation amount of TAG and the fatty acid composition of TAG under nitrogen deficient condition and phosphorus deficient condition. As a result, 1) When proliferating cells are transplanted, the amount of TAG accumulated is higher in phosphorus deficient conditions than in nitrogen deficient conditions. 2) Fatty acids derived from chloroplast membrane lipids in nitrogen deficient conditions. 3) The number of newly synthesized fatty acids is small, and 3) cell growth is inhibited under both nitrogen deficiency and phosphorus deficiency conditions. I understood that it was not obstructed. From these findings, the idea that a TAG high-productive algae is preferable to a phosphorus deficiency responsive one is preferable to a nitrogen deficiency responsive one.

更に、本発明者は、リン欠乏応答プロモーターとしては、C. reinhardtiiのSQD2a遺伝子のプロモーターが好適であり、TAG合成酵素遺伝子としては、C. reinhardtiiのDGTT4遺伝子が好適であるという知見も得た。   Furthermore, the present inventor has also found that the promoter of the C. reinhardtii SQD2a gene is suitable as the phosphorus deficiency responsive promoter, and the DGTT4 gene of C. reinhardtii is suitable as the TAG synthase gene.

本発明は、以上の知見及び発想に基づき完成されたものである。   The present invention has been completed based on the above knowledge and idea.

即ち、本発明は、以下の(1)〜(7)を提供する。
(1)藻類に、リン欠乏応答プロモーターを付加したTAG合成酵素遺伝子を導入することを特徴とするTAG高生産性藻類の作製方法。
(2)リン欠乏応答プロモーターが、SQD2遺伝子のプロモーターであることを特徴とする(1)に記載のTAG高生産性藻類の作製方法。
(3)TAG合成酵素遺伝子が、DGAT2遺伝子であることを特徴とする(1)又は(2)に記載のTAG高生産性藻類の作製方法。
(4)TAG合成酵素遺伝子が、DGTT4遺伝子であることを特徴とする(1)又は(2)に記載のTAG高生産性藻類の作製方法。
(5)藻類が、クラミドモナス属、ナンノクロロプシス属、シュードコリシスチス属、フェオダクチラム属、オステレオコックス属、シアニディオシゾン属、クレブソルミディウム属、クロロキブス属、スピロギラ属、カラ属、コレオケーテ属、又はクロレラ属に属する藻類であることを特徴とする(1)乃至(4)のいずれかに記載のTAG高生産性藻類の作製方法。
(6)(1)乃至(5)のいずれかに記載の方法によって作製されたTAG高生産性藻類。
(7)(6)に記載のTAG高生産性藻類をリン欠乏条件下で培養し、藻類細胞中にTAGを蓄積させ、蓄積したTAGを採取することを特徴とするTAGの製造方法。
That is, the present invention provides the following (1) to (7).
(1) A method for producing a TAG highly productive algae, wherein a TAG synthase gene to which a phosphorus deficiency responsive promoter is added is introduced into algae.
(2) The method for producing a TAG highly productive algae according to (1), wherein the phosphorus deficiency responsive promoter is a promoter of the SQD2 gene.
(3) The method for producing a highly productive algae according to (1) or (2), wherein the TAG synthase gene is a DGAT2 gene.
(4) The method for producing a highly productive algae according to (1) or (2), wherein the TAG synthase gene is a DGTT4 gene.
(5) The algae is Chlamydomonas, Nannochloropsis, Pseudocollistis, Feodactylum, Osterococcus, Cyanidiosion, Klebsolmidium, Chlorochibus, Spirogyra, Kara, Choreokete The method for producing TAG highly productive algae according to any one of (1) to (4), which is an algae belonging to the genus or Chlorella.
(6) TAG highly productive algae produced by the method according to any one of (1) to (5).
(7) A method for producing TAG, comprising culturing the TAG highly productive algae according to (6) under phosphorus-deficient conditions, accumulating TAG in algal cells, and collecting the accumulated TAG.

本発明の高生産性藻類は、例えば、以下のような効果を有する。
(1)従来知られている藻類よりも、多くのTAGを蓄積する。
(2)TAG合成酵素遺伝子はリン欠乏応答プロモーターの制御下にあるので、通常培養時にこの遺伝子は発現しない。このため、TAG蓄積のタイミングをコントロールすることができる。
(3)通常条件に比べて増殖効率は低下するものの、リン欠乏条件下でもある程度の細胞増殖は可能なので、細胞を増殖させながら、TAGを蓄積させることも可能である。
(4)蓄積されるTAG中の脂肪酸は、既に合成されている脂質(葉緑体の脂質など)に由来するものではなく、新たに合成されたものなので、有用な特殊脂肪酸の生産にも有用である。
The highly productive algae of the present invention have the following effects, for example.
(1) Accumulate more TAG than conventionally known algae.
(2) Since the TAG synthase gene is under the control of a phosphorus deficiency responsive promoter, this gene is not expressed during normal culture. For this reason, the timing of TAG accumulation can be controlled.
(3) Although the proliferation efficiency is lower than that under normal conditions, cell growth is possible to some extent even under phosphorus-deficient conditions. Therefore, it is possible to accumulate TAG while growing cells.
(4) Accumulated fatty acids in TAG are not derived from already synthesized lipids (such as chloroplast lipids), but are newly synthesized, so they are also useful for the production of useful special fatty acids. It is.

培養液1 L当たりのTAG[mg]量を示す図。The figure which shows the amount of TAG [mg] per 1 L of culture solutions. TAGの脂肪酸組成を示す図。The figure which shows the fatty acid composition of TAG. 半定量PCRによる発現量を比較した図。The figure which compared the expression level by semi-quantitative PCR. SQD2のN末端領域を比較した図。枠で囲んであるのがC. reinhardtiiのSQD2aであり、矢印が開始メチオニンである。The figure which compared the N terminal area | region of SQD2. Surrounded by a frame is SQD2a of C. reinhardtii, and the arrow is the starting methionine. DGAT2のN末端領域を比較した図。枠で囲んであるのがC. reinhardtiiのDGTT1であり、矢印が開始メチオニンである。The figure which compared the N terminal area | region of DGAT2. Encircled is DGTT1 of C. reinhardtii, and the arrow is the starting methionine. TAG生産系強化のためのコンストラクトを示す図。The figure which shows the construct for TAG production system reinforcement. 半定量PCRによる各遺伝子の発現量を比較した図(1)。The figure which compared the expression level of each gene by semiquantitative PCR (1). 半定量PCRによる各遺伝子の発現量を比較した図(2)。The figure which compared the expression level of each gene by semiquantitative PCR (2). 半定量PCRによる各遺伝子の発現量を比較した図(3)。The figure which compared the expression level of each gene by semiquantitative PCR (3). HygR-pDGTT1-DGTT2〜4各変異株の培養液1 L当たりのTAG[mg] 量を示す図。The figure which shows the amount of TAG [mg] per 1 L culture solution of HygR-pDGTT1-DGTT2-4 each mutant. HygR-pSQD2a-DGTT2〜4各変異株の培養液1 L当たりのTAG[mg] 量を示す図。The figure which shows the amount of TAG [mg] per 1 L culture solution of HygR-pSQD2a-DGTT2-4 each mutant. 培養液1L当たりのTAG[mg] 量を示す図。The figure which shows the amount of TAG [mg] per 1L of culture solutions. 細胞当たりのTAG[pg] 量を示す図。The figure which shows the amount of TAG [pg] per cell. TAG脂肪酸組成を示す図。The figure which shows a TAG fatty acid composition.

以下、本発明を詳細に説明する。   Hereinafter, the present invention will be described in detail.

本発明のTAG高生産性藻類の作製方法は、藻類に、リン欠乏応答プロモーターを付加したTAG合成酵素遺伝子を導入することを特徴とするものである。   The method for producing TAG highly productive algae of the present invention is characterized in that a TAG synthase gene to which a phosphorus deficiency responsive promoter is added is introduced into algae.

リン欠乏応答プロモーターとしては、例えば、SQD2遺伝子のプロモーターを使用することができる。SQD2はスルホキノボシルジアシルグリセロール(SQDG)の合成に関与する酵素であり、この酵素やそれをコードする遺伝子については、多くの論文において報告されており(例えば、 Yu B, Xu C, Benning C., Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Apr;99(8):5732-7.)、また、この酵素のアミノ酸配列もデータベース上で公表されているので(例えば、C. reinhardtiiのSQD2(SQD2a)のアミノ酸配列はGenBank Accession No. XP_001689662に記載されている。)、当業者はSQD2遺伝子がどのようなものであるか理解することができる。SQD2遺伝子のプロモーターとしては、C. reinhardtiiのSQD2a遺伝子のプロモーターを使用することができ、その配列は配列番号1に示すとおりである。   As the phosphorus deficiency responsive promoter, for example, the promoter of the SQD2 gene can be used. SQD2 is an enzyme involved in the synthesis of sulfoquinovosyl diacylglycerol (SQDG), and this enzyme and the gene encoding it have been reported in many papers (eg Yu B, Xu C, Benning C ., Proc Natl Acad Sci US A. 2002 Apr; 99 (8): 5732-7.) Since the amino acid sequence of this enzyme is also published in the database (eg, SQD2 (SQD2a) of C. reinhardtii) The amino acid sequence of is described in GenBank Accession No. XP_001689662.), Those skilled in the art can understand what the SQD2 gene is. As the promoter of the SQD2 gene, the promoter of the SQD2a gene of C. reinhardtii can be used, and its sequence is as shown in SEQ ID NO: 1.

SQD2遺伝子のプロモーターの塩基配列としては、配列番号1に示す塩基配列、又は配列番号1に示す塩基配列と高い同一性を示す塩基配列であって、プロモーター活性を維持している塩基配列などを例示できる。ここでいう「高い同一性」とは、通常90%以上の同一性、好ましくは95以上の同一性、より好ましくは97%以上の同一性、更に好ましくは99%以上の同一性を意味する。なお、本明細書における「同一性」の値は、当業者に公知の相同性検索プログラムを用いて算出することができる。例えば、NCBIの相同性アルゴリズムBLAST(Basic local alignment search tool)においてデフォルト(初期設定)のパラメーターを用いることにより、算出することができる。   Examples of the nucleotide sequence of the promoter of the SQD2 gene include the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1, or the nucleotide sequence showing high identity with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1, and maintaining the promoter activity. it can. “High identity” here means usually 90% or more identity, preferably 95 or more identity, more preferably 97% or more identity, and even more preferably 99% or more identity. The value of “identity” in the present specification can be calculated using a homology search program known to those skilled in the art. For example, it can be calculated by using default (initial setting) parameters in NCBI homology algorithm BLAST (Basic local alignment search tool).

また、SQD2遺伝子のプロモーターの塩基配列は、配列番号1に示す塩基配列において1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列であって、プロモーター活性を維持している塩基配列であってもよい。ここでいう「1若しくは数個」とは、通常は、1〜10個であり、好ましくは、1〜5個であり、より好ましくは1〜3個であり、更に好ましくは1個である。また、「欠失、置換若しくは付加」には、人為的な変異のほか、個体差、種や属の違いに基づく場合などの天然に生じる変異(mutantやvariant)も含まれる。   The SQD2 gene promoter base sequence is a base sequence in which one or several bases are deleted, substituted or added in the base sequence shown in SEQ ID NO: 1, and the promoter sequence is maintained. There may be. The “one or several” referred to herein is usually 1 to 10, preferably 1 to 5, more preferably 1 to 3, and still more preferably 1. Further, “deletion, substitution or addition” includes not only artificial mutations but also naturally occurring mutations (mutants and variants) such as cases based on individual differences, species or genus differences.

TAG合成酵素遺伝子としては、例えば、DGAT2遺伝子を使用することができる。DGAT2はジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼの一種であり、この酵素やそれをコードする遺伝子については、多くの論文において報告されているので(例えば、Jay M. Shockey et al., The Plant Cell, Vol. 18 September 2006, 2294-2313、Miller et al., Plant Physiology, vol.154 2010, 1737-1752)、当業者はDGAT2遺伝子がどのようなものであるか理解することができる。   As the TAG synthase gene, for example, DGAT2 gene can be used. DGAT2 is a kind of diacylglycerol acyltransferase, and this enzyme and the gene encoding it are reported in many papers (for example, Jay M. Shockey et al., The Plant Cell, Vol. 18 September). 2006, 2294-2313, Miller et al., Plant Physiology, vol.154 2010, 1737-1752), those skilled in the art can understand what the DGAT2 gene is.

DGAT2遺伝子としては、例えば、DGTT4遺伝子を使用することができる。DGTT4は、C. reinhardtiiに含まれるDGAT2ファミリーに属するタンパク質であり、このタンパク質やそれをコードする遺伝子については、多くの論文において報告されているので(例えば、Boyle et al. The Journal of biological chemistry, 287 (2012), pp. 15811-15825、 Chen JE and Smith AG, J Biotechnol. 2012 Jun 29)、当業者はDGTT4遺伝子がどのようなものであるか理解することができる。DGTT4のアミノ酸配列及びそれをコードする遺伝子の塩基配列は、それぞれ配列番号3及び配列番号2に示すとおりである。本発明におけるDGTT4遺伝子には、C. reinhardtiiのDGTT4遺伝子(Cre03.g205050)だけでなく、他の生物におけるこの遺伝子に相当する遺伝子(ホモログなど)も含まれる。このようなC. reinhardtii以外の生物におけるDGTT4遺伝子の具体例としては、Volvox carteri f. nagariensisのDGAT2 (JGI protein ID77655)遺伝子、Ostreococcus tauriのDGAT2 (JGI protein ID 21937)遺伝子などを挙げることができる。   As the DGAT2 gene, for example, the DGTT4 gene can be used. DGTT4 is a protein belonging to the DGAT2 family contained in C. reinhardtii. Since this protein and the gene encoding it have been reported in many papers (for example, Boyle et al. The Journal of biological chemistry, 287 (2012), pp. 15811-15825, Chen JE and Smith AG, J Biotechnol. 2012 Jun 29), those skilled in the art can understand what the DGTT4 gene is. The amino acid sequence of DGTT4 and the base sequence of the gene encoding it are as shown in SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 2, respectively. The DGTT4 gene in the present invention includes not only the DGTT4 gene of C. reinhardtii (Cre03.g205050) but also a gene (such as a homolog) corresponding to this gene in other organisms. Specific examples of the DGTT4 gene in organisms other than C. reinhardtii include the DGAT2 (JGI protein ID77655) gene of Volvox carteri f. Nagariensis, the DGAT2 (JGI protein ID 21937) gene of Ostreococcus tauri, and the like.

DGTT4遺伝子の塩基配列としては、配列番号2に示す塩基配列を例示できる。また、DGTT4遺伝子の塩基配列は、配列番号2に示す塩基配列と高い同一性を示す塩基配列であって、活性(ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ活性など)のあるタンパク質をコードしている塩基配列であってもよい。ここでいう「高い同一性」とは、通常90%以上の同一性、好ましくは95以上の同一性、より好ましくは97%以上の同一性、更に好ましくは99%以上の同一性を意味する。   An example of the base sequence of the DGTT4 gene is the base sequence shown in SEQ ID NO: 2. The base sequence of the DGTT4 gene is a base sequence having high identity with the base sequence shown in SEQ ID NO: 2, and is a base sequence encoding a protein having activity (such as diacylglycerol acyltransferase activity). Also good. “High identity” here means usually 90% or more identity, preferably 95 or more identity, more preferably 97% or more identity, and even more preferably 99% or more identity.

また、DGTT4遺伝子の塩基配列は、配列番号3に示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、活性(ジアシルグリセロールアシルトランスフェラーゼ活性など)のあるタンパク質をコードするものであってもよい。ここでいう「1若しくは数個」とは、通常は、1〜10個であり、好ましくは、1〜5個であり、より好ましくは1〜3個であり、更に好ましくは1個である。また、「欠失、置換若しくは付加」には、人為的な変異のほか、個体差、種や属の違いに基づく場合などの天然に生じる変異(mutantやvariant)も含まれる。   The base sequence of the DGTT4 gene consists of an amino acid sequence in which one or several amino acids have been deleted, substituted or added in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3, and an active protein (such as diacylglycerol acyltransferase activity). You may code. The “one or several” referred to herein is usually 1 to 10, preferably 1 to 5, more preferably 1 to 3, and still more preferably 1. Further, “deletion, substitution or addition” includes not only artificial mutations but also naturally occurring mutations (mutants and variants) such as cases based on individual differences, species or genus differences.

TAG合成酵素遺伝子等の導入対象とする藻類は特に限定されず、例えば、クラミドモナス(Chlamydomonas)属、ナンノクロロプシス(Nannochloropsis)属、シュードコリシスチス(Pseudochoricystis)属、フェオダクチラム(Phaeodactylum)属、オステレオコックス(Ostreococcus)属、シアニディオシゾン(Cyanidioschyzon)属、クレブソルミディウム(Klebsormidium)属、クロロキブス(Chlorokybus)属、スピロギラ(Spirogyra)属、カラ(Chara)属、コレオケーテ(Coleochaete)属、又はクロレラ(Chlorella)属に属する藻類などを用いることができる。クラミドモナス属の藻類としては、クラミドモナス・レインハーディ(Chlamydomonas reinhardtii)などを例示でき、ナンノクロロプシス属の藻類としては、ナンノクロロプシス・オクラタ (Nannochloropsis oculata)、ナンノクロロプシス・サリナ(Nannochloropsis salina)、ナンノクロロプシス・ ガディタナ(Nannochloropsis gaditana)などを例示でき、シュードコリシスチス属の藻類としては、シュードコリシスチス・エリプソイディア(Pseudochoricystis ellipsoidea)などを例示でき、フェオダクチラム(Phaeodactylum)属の藻類としてはフェオダクチラム・トリコルヌーツム(Phaeodactylum tricornutum)を例示でき、オステレオコックス属の藻類としてはオステレオコックス・タウリ(Ostreococcus tauri)を例示でき、シアニディオシゾン属の藻類としてはシアニディオシゾン・メロラ(Cyanidioschyzon merolae)を例示でき、クレブソルミディウム属の藻類としてはクレブソルミディウム・フラチダム(Klebsormidium flaccidum)を例示でき、カラ属の藻類としては、カラ・フラギリス(Chara fragilis)を例示でき、コレオケーテ属の藻類としては、コレオケーテ・スクタータ(Coleochaete scutata)を例示でき、クロレラ属の藻類としては、クロレラ・ブルガリス(Chlorella vulgaris)などを例示できる。   Algae to be introduced, such as TAG synthase gene, are not particularly limited. For example, Chlamydomonas genus, Nannochloropsis genus, Pseudochoricystis genus, Phaeodactylum genus, Ostereo The genus Cosmo (Ostreococcus), the genus Cyanidioschyzon, the genus Klebsormidium, the genus Chlorokybus, the genus Spirogyra, the genus Chara, the genus Coleochaete, or the chlorella Algae belonging to the genus (Chlorella) can be used. Examples of the algae of the genus Chlamydomonas include Chlamydomonas reinhardtii, and the algae of the genus Nannochloropsis include Nannochloropsis oculata, Nannochloropsis salina, Nannochloropsis salina, Examples of the algae of the genus Pseudochoricystis (Pseudochoricystis ellipsoidea) and the algae of the genus Phaeodactylum (Phaeodactylum). Tricornutum (Phaeodactylum tricornutum) can be illustrated, Osterococcus tauri (Osterococcus tauri) can be illustrated as an algae of the genus Osterococcus (Cyanidioschyzon merolae) can be exemplified, Klebsormidium flaccidum can be exemplified as an algae of the genus Klebsormidium, and Chara fragilis can be exemplified as an algae of the genus Kalabs. Examples of the algae of the genus include Coleochaete scutata, and examples of the algae of the genus Chlorella include Chlorella vulgaris.

TAG合成酵素遺伝子にリン欠乏応答プロモーターを付加する操作やこれを藻類に導入する操作などは常法に従って行うことができる。   Operations such as adding a phosphorus deficiency responsive promoter to the TAG synthase gene and introducing it into algae can be performed according to conventional methods.

上述した方法によって作製されたTAG高生産性藻類の培養は、TAG蓄積時にリン欠乏条件下で培養すること以外、通常の藻類の培養と同様に行うことができる。例えば、藻類として、C. reinhardtiiを培養する場合、培地としては、TAP培地などを用いることができ、培養温度は2325℃程度とすることができ、培養時の光強度は1040μE/m2/secとすることができる。 The TAG highly productive algae produced by the above-described method can be cultured in the same manner as normal algae culture except that the TAG is accumulated under phosphorus-deficient conditions at the time of TAG accumulation. For example, when C. reinhardtii is cultured as an algae, TAP medium or the like can be used as the medium, the culture temperature can be about 2325 ° C., and the light intensity during culture is 1040 μE / m 2 / sec. It can be.

TAG高生産性藻類にTAGを蓄積させる場合は、リン欠乏条件下で培養する。リン欠乏条件下での培養は、増殖時に用いていた培地からリン成分(例えば、K2HPO4、KH2PO4など)を除くか、あるいは33μM以下にした培地を用いることにより行えばよい。通常、813日程度の培養で細胞中に十分な量のTAGが蓄積される。 When TAG is accumulated in TAG highly productive algae, it is cultured under phosphorus-deficient conditions. Cultivation under phosphorus-deficient conditions may be performed by removing a phosphorus component (for example, K 2 HPO 4 , KH 2 PO 4, etc.) from the medium used at the time of growth or using a medium having a concentration of 33 μM or less. Usually, a sufficient amount of TAG is accumulated in the cells after culturing for about 813 days.

TAGを蓄積した細胞からTAGの採取は常法に従って行うことができる。   TAG can be collected from cells that have accumulated TAG according to a conventional method.

以下、実施例により本発明を更に詳細に説明する。
〔実験材料〕
C. reinhardtii の野生株2種(C9株 CC-408 mt-、及びCW15株 CC-400 cw15 mt+)を使用した。両株ともChlamydomonas Center (http://chlamycollection.org/)から入手することができる。
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to examples.
[Experimental material]
Two wild strains of C. reinhardtii (C9 strain CC-408 mt- and CW15 strain CC-400 cw15 mt +) were used. Both strains are available from the Chlamydomonas Center (http://chlamycollection.org/).

実験に使用した遺伝子の遺伝子名とprotein ID(JGI Chlamydomonas reinhardtii 4.0)は、以下の通りである。   The gene name and protein ID (JGI Chlamydomonas reinhardtii 4.0) used in the experiment are as follows.

〔実験操作〕
(1)培養条件
Na2EDTA ・ 2H2O 5 g, ZnSO4 ・ 7H2O 2.2 g, H3BO3 1.14 g, MnCl2 ・ 4H2O 506 mg, FeSO4 ・ 7H2O 499 mg, CoCl2 ・ 6H2O 161 mg, CuSO4・ 5H2O 157 mg, ( NH4 )6Mo7O24 ・ 4H2O 110 mg, KOH 1.6gをイオン交換水 1Lへ溶解し、 Hutner’s trace elementsとして4℃に保存しておいた。
[Experimental operation]
(1) Culture conditions
Na 2 EDTA ・ 2H 2 O 5 g, ZnSO 4・ 7H 2 O 2.2 g, H 3 BO 3 1.14 g, MnCl 2・ 4H 2 O 506 mg, FeSO 4・ 7H 2 O 499 mg, CoCl 2・ 6H 2 O 161 mg, CuSO 4・ 5H 2 O 157 mg, (NH 4 ) 6 Mo 7 O 24・ 4H 2 O 110 mg, KOH 1.6 g are dissolved in 1 L of ion exchange water and stored at 4 ° C as Hutner's trace elements. Oita.

NH4Cl 400 mg , CaCl2 ・ 2H2O 51 mg, MgSO4 ・ 7H2O 100 mg, K2HPO4 119 mg, KH2PO4 60.3 mg, Hutner’s trace elements 10 mL, 酢酸 1 mL, Tris ( hydroxymethyl ) aminomethane 2.42 gをイオン交換水 998 mLへ溶解し、オートクレーブ滅菌してから液体TAP培地として使用した。プレート培地として使用する場合はINA Agar 12 gをオートクレーブ前に添加した。 NH 4 Cl 400 mg, CaCl 2・ 2H 2 O 51 mg, MgSO 4・ 7H 2 O 100 mg, K 2 HPO 4 119 mg, KH 2 PO 4 60.3 mg, Hutner's trace elements 10 mL, acetic acid 1 mL, Tris ( Hydroxymethyl) aminomethane (2.42 g) was dissolved in 998 mL of ion-exchanged water and autoclaved before use as a liquid TAP medium. When used as a plate medium, 12 g of INA Agar was added before autoclaving.

TAP培地を通常培養の培地として使用し、2030 μE/m2/sec, 23℃で旋回培養した。リン欠乏培地ではTAP培地から K2HPO4, KH2PO4をのぞき、窒素欠乏培地では NH4Clをのぞいた。
(2)脂質抽出
培養液100〜450 mLを800×g, 5分間遠心して、培養細胞を沈殿させ、イオン交換水1 mLに懸濁した後、-80℃ に保存した。
TAP medium was used as a medium for normal culture, and swirl culture was performed at 2030 μE / m 2 / sec, 23 ° C. In the phosphorus-deficient medium, K 2 HPO 4 and KH 2 PO 4 were removed from the TAP medium, and in the nitrogen-deficient medium, NH 4 Cl was removed.
(2) Lipid Extraction 100 to 450 mL of the culture solution was centrifuged at 800 × g for 5 minutes to precipitate the cultured cells, suspended in 1 mL of ion-exchanged water, and stored at −80 ° C.

凍結細胞を解凍し、クロロホルム 1 mL, メタノール 2 mLを添加し、10分おきに懸濁しながら1時間室温に置いた。800 g, 5分間スイングローターで遠心し、上清 4 mLを回収した。沈殿に1%(W/V)KCl 0.8 mL, クロロホルム 1 mL, メタノール 2 mLを添加し、懸濁した後、800×g, 5分間スイングローターで遠心し、上清 3.8 mLを先ほどの上清とあわせて回収した。上清 7.8 mLにクロロホルム 2 mL, 1%(W/V)KCl 1.2 mLを添加し、懸濁した後、800×g, 5分間スイングローターで遠心し、下層の脂質抽出液を回収した。脂質抽出液を乾燥させ、60 mg/mLになるようにクロロホルム:メタノール=2:1に溶解した後、-20℃ に保存した。
(3)脂質分析
脂質抽出液 50 μLを薄層シリカプレートにスポットし、ヘキサン:ジエチルエーテル:酢酸=160:40:4の展開液で45分間展開した。0.001%プリムリンを用いて、UV照射下でTAGを確認した。TAGがのっている部分のシリカを削り取り、1mM ペンタデカン酸 100 μL, 5% 塩酸/メタノールを500 μLを添加し、懸濁した後、85℃, 1時間静置した。ヘキサン 500 μLを添加し、懸濁した後、800×g, 5分間スイングローターで遠心し、上層のメチルエステル化した脂肪酸を回収した。下層に再びヘキサン500 μLを添加し、懸濁した後、800×g, 5分間スイングローターで遠心し、上層を回収した。メチルエステル化した脂肪酸を乾燥させた後、ヘキサン60 μLに溶解し、ガスクロマトグラフィサンプルとした。ガスクロマトグラフィはSHIMADZU GC-2014にHR-SS-10 (0.25 φ x 0.25 m) (SHINWA CHEMICAL INDUSTRIES, LTD.)を取り付けて行った。
(4)RNA抽出
凍結細胞に3倍量以上のRNA抽出液と3倍量以上の酸性フェノールを加え、凍ったまま超音波破砕(超音波15秒、氷冷30秒)を4回行った。20000×g,5分間, 4℃で遠心し、上清400〜500 μLを回収した。上清に酸性フェノール 300 μL, クロロホルム 300 μLを添加し、懸濁した後、140k rpm,5分間, 4℃で遠心し、上清400〜500 μLを回収し、この操作を5回繰り返した。上清の1/10倍量の3 M 酢酸ナトリウム、1倍量のイソプロパノールを添加し、懸濁した後、20000×g,5分間, 4℃で遠心した。沈殿物に70% エタノール 1 mL加え、20000×g,5分間, 4℃で遠心し、この操作を2回繰り返した後、沈殿物を乾燥させた。乾燥した沈殿を滅菌イオン交換水 400 μLに溶解した後、1 μg/μL以上の濃度の核酸であることを確認した。核酸 40 μLに10×DNase I Buffer 5 μL, DNase I 0.5 μL, 滅菌イオン交換水 4.5 μLを加え、37℃, 30分間静置した。酸性フェノール 50 μL, クロロホルム 50 μLを添加し、懸濁した後、20000×g,10分間, 4℃で遠心し、上清 35 μLを回収した。上清の1/10倍量の3 M 酢酸ナトリウム、1倍量のイソプロパノールを添加し、懸濁した後、20000×g,10分間, 4℃で遠心した。沈殿物に70% エタノール 150 μL加え、20000×g,10分間, 4℃で遠心し、この操作を2回繰り返した後、沈殿物を乾燥させた。乾燥した沈殿を滅菌イオン交換水 50 μLに溶解した後、1 μg/μL以上の濃度のRNAであることを確認した。
(5)cDNAの調製
RNA 1 μgに10 mM dNTP 0.5 μL, 100 mM oligo dT18 0.25 μL, RNase free water 3.65 μLを添加し、65℃, 5分間処理した後、氷上に静置した。さらに5xcDNA Synthesis Buffer 2 μL, 0.1 M DTT 0.5 μL, RNase OUT 0.5μL, Thermo Script RT 0.5 μL, RNase free water 0.5 μLを添加し、50℃, 40分間, 60℃, 20分間, 85℃, 5分間 処理した。得られたcDNAは-20℃ に保管した。
(6)半定量PCR法
LA PCR x10 buffer 1.5 μL, 2.5 mM dNTP 1.2 μL, MgCl2 1.05 μL, LA Taq 0.075 μL, 5 M ベタイン 1.5 μL, DMSO 0.45 μL, 10 μM primer_F 1.5 μL, 10 μM primer_R 1.5 μL, cDNA 0.2 μL, 滅菌イオン交換水 6.1 μLを懸濁し、PCR反応に用いた。PCR反応条件は以下の2stepで行った。
step1:94℃ 3分間
step2:94℃ 30秒間, 54℃ 30秒間, 72℃ 1分間を1834サイクル
プライマーは以下のものを使用した。
DGAT1_F TGGTGGAATGCGGCTACGGT(配列番号4)
DGAT1_R TCTGTTGAGCTTCTTGCGCA(配列番号5)
DGTT1_F CTATAAGCCAAGCATGGGTG(配列番号6)
DGTT1_R GCGCCTCTGTGGCAAATGCC(配列番号7)
DGTT2_F TGGCTATGTTGACGCTCTTC(配列番号8)
DGTT2_R TCTCTGCGATGCCTCCCACG(配列番号9)
DGTT3_F AGACGGAAGCAGATGGCAGG(配列番号10)
DGTT3_R GACAAAGATGTAGCGCTTGT(配列番号11)
DGTT4_F TTCAAGGAGTGCTGTATGAG(配列番号12)
DGTT4_R GTCAGCTGCAGCGGCGTGAA(配列番号13)
DGTT5_F AGCCCGCACGGCGCCTTCCC(配列番号14)
DGTT5_R TGACGTGTACATCTCCGCAATGC(配列番号15)
UGP3_F CATGAACGTGGTGCAGGAG(配列番号16)
UGP3_R GGTTGGAGACCAGGAAGGTG(配列番号17)
SQD2a_F GGTGCAGGTGTGGAAGAAGG(配列番号18)
SQD2a_R CGTGATGATGTCGGGGATG(配列番号19)
(7)プロモーター配列の獲得
C9株のゲノムを鋳型にPCR反応を行い、プロモーター領域pSQD2a, pDGTT1を得た。得られた約1kbの配列をpMD20-T vector(TAKARA)またはpZErO-2(Invitrogen)へ導入した。
The frozen cells were thawed, 1 mL of chloroform and 2 mL of methanol were added, and the mixture was left at room temperature for 1 hour while being suspended every 10 minutes. Centrifugation was performed with a swing rotor at 800 g for 5 minutes, and 4 mL of the supernatant was recovered. Add 1% (W / V) KCl (0.8 mL), chloroform (1 mL), and methanol (2 mL) to the precipitate, suspend it, and centrifuge at 800 × g for 5 minutes with a swing rotor. And recovered. Chloroform 2 mL, 1% (W / V) KCl 1.2 mL was added to the supernatant 7.8 mL, suspended, and centrifuged at 800 × g for 5 minutes with a swing rotor to recover the lower layer lipid extract. The lipid extract was dried, dissolved in chloroform: methanol = 2: 1 to 60 mg / mL, and stored at −20 ° C.
(3) Lipid analysis 50 μL of lipid extract was spotted on a thin-layer silica plate and developed with a developing solution of hexane: diethyl ether: acetic acid = 160: 40: 4 for 45 minutes. TAG was confirmed under UV irradiation using 0.001% primulin. The silica on the part where the TAG was placed was scraped, 100 μL of 1 mM pentadecanoic acid and 500 μL of 5% hydrochloric acid / methanol were added, suspended, and then allowed to stand at 85 ° C. for 1 hour. After adding 500 μL of hexane and suspending, it was centrifuged with a swing rotor at 800 × g for 5 minutes to recover the methyl esterified fatty acid in the upper layer. After adding 500 μL of hexane again to the lower layer and suspending it, the mixture was centrifuged at 800 × g for 5 minutes with a swing rotor, and the upper layer was recovered. The methyl esterified fatty acid was dried and then dissolved in 60 μL of hexane to obtain a gas chromatography sample. Gas chromatography was performed by attaching HR-SS-10 (0.25 φ x 0.25 m) (SHINWA CHEMICAL INDUSTRIES, LTD.) To SHIMADZU GC-2014.
(4) RNA extraction Three times or more of the RNA extract and 3 times or more of the acidic phenol were added to the frozen cells, and ultrasonication (15 seconds of ultrasonic waves, 30 seconds of ice cooling) was performed 4 times while frozen. Centrifugation was performed at 20000 × g for 5 minutes at 4 ° C., and 400 to 500 μL of supernatant was collected. 300 μL of acidic phenol and 300 μL of chloroform were added to the supernatant and suspended, and then centrifuged at 140 k rpm for 5 minutes at 4 ° C., and 400 to 500 μL of the supernatant was collected, and this operation was repeated 5 times. The supernatant was added with 1/10 volume of 3 M sodium acetate and 1 volume of isopropanol, suspended, and centrifuged at 20000 × g for 5 minutes at 4 ° C. 1 mL of 70% ethanol was added to the precipitate and centrifuged at 20000 × g for 5 minutes at 4 ° C. This operation was repeated twice, and then the precipitate was dried. The dried precipitate was dissolved in 400 μL of sterilized ion-exchanged water, and it was confirmed that the nucleic acid had a concentration of 1 μg / μL or higher. 10 × DNase I Buffer 5 μL, DNase I 0.5 μL, and sterilized ion-exchanged water 4.5 μL were added to 40 μL of nucleic acid and allowed to stand at 37 ° C. for 30 minutes. 50 μL of acidic phenol and 50 μL of chloroform were added and suspended, and then centrifuged at 20000 × g for 10 minutes at 4 ° C. to recover 35 μL of the supernatant. The supernatant was added with 1/10 volume of 3 M sodium acetate and 1 volume of isopropanol, suspended, and centrifuged at 20000 × g for 10 minutes at 4 ° C. 150 μL of 70% ethanol was added to the precipitate, and centrifuged at 20000 × g for 10 minutes at 4 ° C. This operation was repeated twice, and then the precipitate was dried. The dried precipitate was dissolved in 50 μL of sterilized ion-exchanged water and confirmed to be RNA having a concentration of 1 μg / μL or more.
(5) Preparation of cDNA
To 1 μg of RNA, 0.5 mM of 10 mM dNTP, 0.25 μL of 100 mM oligo dT18, and 3.65 μL of RNase free water were added, treated at 65 ° C. for 5 minutes, and allowed to stand on ice. Add 5xcDNA Synthesis Buffer 2 μL, 0.1 M DTT 0.5 μL, RNase OUT 0.5 μL, Thermo Script RT 0.5 μL, RNase free water 0.5 μL, and add 50 ° C, 40 minutes, 60 ° C, 20 minutes, 85 ° C, 5 minutes. Processed. The obtained cDNA was stored at -20 ° C.
(6) Semi-quantitative PCR method
LA PCR x10 buffer 1.5 μL, 2.5 mM dNTP 1.2 μL, MgCl 2 1.05 μL, LA Taq 0.075 μL, 5 M Betaine 1.5 μL, DMSO 0.45 μL, 10 μM primer_F 1.5 μL, 10 μM primer_R 1.5 μL, cDNA 0.2 μL, Sterile Ion exchange water (6.1 μL) was suspended and used for PCR reaction. PCR reaction conditions were performed in the following two steps.
step1: 94 ℃ for 3 minutes
step2: 94 ° C. for 30 seconds, 54 ° C. for 30 seconds, 72 ° C. for 1 minute for 1834 cycles The following primers were used.
DGAT1_F TGGTGGAATGCGGCTACGGT (SEQ ID NO: 4)
DGAT1_R TCTGTTGAGCTTCTTGCGCA (SEQ ID NO: 5)
DGTT1_F CTATAAGCCAAGCATGGGTG (SEQ ID NO: 6)
DGTT1_R GCGCCTCTGTGGCAAATGCC (SEQ ID NO: 7)
DGTT2_F TGGCTATGTTGACGCTCTTC (SEQ ID NO: 8)
DGTT2_R TCTCTGCGATGCCTCCCACG (SEQ ID NO: 9)
DGTT3_F AGACGGAAGCAGATGGCAGG (SEQ ID NO: 10)
DGTT3_R GACAAAGATGTAGCGCTTGT (SEQ ID NO: 11)
DGTT4_F TTCAAGGAGTGCTGTATGAG (SEQ ID NO: 12)
DGTT4_R GTCAGCTGCAGCGGCGTGAA (SEQ ID NO: 13)
DGTT5_F AGCCCGCACGGCGCCTTCCC (SEQ ID NO: 14)
DGTT5_R TGACGTGTACATCTCCGCAATGC (SEQ ID NO: 15)
UGP3_F CATGAACGTGGTGCAGGAG (SEQ ID NO: 16)
UGP3_R GGTTGGAGACCAGGAAGGTG (SEQ ID NO: 17)
SQD2a_F GGTGCAGGTGTGGAAGAAGG (SEQ ID NO: 18)
SQD2a_R CGTGATGATGTCGGGGATG (SEQ ID NO: 19)
(7) Acquisition of promoter sequence
A PCR reaction was carried out using the genome of the C9 strain as a template to obtain promoter regions pSQD2a and pDGTT1. The obtained sequence of about 1 kb was introduced into pMD20-T vector (TAKARA) or pZErO-2 (Invitrogen).

2x GC Buffer II 5 μL, 2.5 mM dNTP 1.6 μL, C9株のゲノム 1 μL, LA Taq 0.05 μL, 10 μM primer_F 1 μL, 10 μM primer_R 1 μL, 滅菌イオン交換水 1.35 μLを懸濁し、PCR反応に用いた。   Suspend 2x GC Buffer II 5 μL, 2.5 mM dNTP 1.6 μL, C9 strain genome 1 μL, LA Taq 0.05 μL, 10 μM primer_F 1 μL, 10 μM primer_R 1 μL, sterile ion-exchanged water 1.35 μL Using.

PCR反応条件は以下の3stepで行った。
step1 94℃ 2分間
step2 94℃ 45秒間, 55℃ 30秒間, 71℃ 1分30秒間を40サイクル
step3 71℃ 5分間
PCR reaction conditions were performed in the following 3 steps.
step1 94 ℃ for 2 minutes
step2 40 cycles of 94 ℃ 45 seconds, 55 ℃ 30 seconds, 71 ℃ 1 minute 30 seconds
step3 5 minutes at 71 ℃

プライマーは以下のものを使用した。
DGTT1_F2 AGCAGCCACACGTAGTTGTC(配列番号20)
DGTT1_R2 CACGAGCTCTAGTTGGTTCA(配列番号21)
SQD2a_F2 CGGGATAGTTGTAGCTGTAG(配列番号22)
SQD2a_R2 CGAAGAGTTGAGGTGTGTGTTC(配列番号23)
(8)DGTT2〜4遺伝子の配列の獲得
リン欠乏時のcDNAを鋳型にPCR反応を行い、 DGTT2〜4遺伝子の全長を得た。得られた約1kbの配列をpMD20-T vector(TAKARA)またはpZErO-2(Invitrogen)へ導入した。PCR反応液の組成は半定量PCR法と同様のものとした。
The following primers were used.
DGTT1_F2 AGCAGCCACACGTAGTTGTC (SEQ ID NO: 20)
DGTT1_R2 CACGAGCTCTAGTTGGTTCA (SEQ ID NO: 21)
SQD2a_F2 CGGGATAGTTGTAGCTGTAG (SEQ ID NO: 22)
SQD2a_R2 CGAAGAGTTGAGGTGTGTGTTC (SEQ ID NO: 23)
(8) Acquisition of DGTT2-4 gene sequence A PCR reaction was carried out using the phosphorus-deficient cDNA as a template to obtain the full length of the DGTT2-4 gene. The obtained sequence of about 1 kb was introduced into pMD20-T vector (TAKARA) or pZErO-2 (Invitrogen). The composition of the PCR reaction solution was the same as that of the semi-quantitative PCR method.

PCR反応条件は以下の3stepで行った。
step1 94℃ 3分間
step2 94℃ 30秒間, 54℃ 30秒間, 72℃ 1分間を41サイクル
step3 72℃ 3分間
プライマーは以下のものを使用した。
DGTT2_F2 ATGGCGATTGATAAAGCACC(配列番号24)
DGTT2_R2 TCAGCTGATGACCAGCGGTC(配列番号25)
DGTT3_F2 ATGGCAGGTGGAAAGTCAAACG(配列番号26)
DGTT3_R2 CTACTCGATGGACAGCGGGC(配列番号27)
DGTT4_F2 ATGCCGCTCGCAAAGCTGCG(配列番号28)
DGTT4_R2 CTACATTATGACCAGCTCCTC(配列番号29)
(9)C. reinhardtii形質転換法
TAP培地で1〜3×106 cells/mlになるまで培養したCW15株 50mLに 10%(v/v) Tween 20を50 μL添加して撹拌した。4℃, 800×g, 5分間スイングローターで遠心し、細胞を沈殿させた。上清をのぞいた後、終濃度1×108 cells/mlになるように、氷冷した40mM Sucrose/TAPに懸濁した。濃縮細胞 50 μLに0.1 mg/ml コンストラクトDNA 2 μL, キャリアssDNA(Salmon Sperm)1 μLを添加した。細胞懸濁液をエレクトロポレーション用キュベット(1 mm幅)に入れ、2000V/cm, 時定数 5 msecで1回電圧をかけた。40mM Sucrose/TAP 1 mLをキュベットへ添加し、細胞を懸濁した後、1.5 mLチューブへ移した。10〜20 μE/m2/sec, 23℃で静置した。24時間後、800× g, 5分間遠心し、細胞を沈殿させた。上清をのぞいた後、20%(w/v) コーンスターチ/40mM Sucrose/TAP 0.5 mLを添加し、10 μg/μL ハイグロマイシンを添加したTAPプレートに蒔いた。20〜30 μE/m2/sec, 23℃で静置し、生えて来たコロニーを形質転換株として新しいハイグロマイシン入りTAPプレートへ植えついだ。
PCR reaction conditions were performed in the following 3 steps.
step1 94 ℃ 3 minutes
step2 94 ° C for 30 seconds, 54 ° C for 30 seconds, 72 ° C for 1 minute for 41 cycles
step3 72 ° C for 3 minutes The following primers were used.
DGTT2_F2 ATGGCGATTGATAAAGCACC (SEQ ID NO: 24)
DGTT2_R2 TCAGCTGATGACCAGCGGTC (SEQ ID NO: 25)
DGTT3_F2 ATGGCAGGTGGAAAGTCAAACG (SEQ ID NO: 26)
DGTT3_R2 CTACTCGATGGACAGCGGGC (SEQ ID NO: 27)
DGTT4_F2 ATGCCGCTCGCAAAGCTGCG (SEQ ID NO: 28)
DGTT4_R2 CTACATTATGACCAGCTCCTC (SEQ ID NO: 29)
(9) C. reinhardtii transformation method
50 μL of 10% (v / v) Tween 20 was added to 50 mL of CW15 strain cultured to 1 to 3 × 10 6 cells / ml in TAP medium and stirred. The cells were precipitated by centrifugation at 4 ° C., 800 × g, 5 minutes with a swing rotor. After removing the supernatant, it was suspended in ice-cooled 40 mM Sucrose / TAP to a final concentration of 1 × 10 8 cells / ml. To 50 μL of concentrated cells, 2 μL of 0.1 mg / ml construct DNA and 1 μL of carrier ssDNA (Salmon Sperm) were added. The cell suspension was placed in an electroporation cuvette (1 mm width), and a voltage was applied once at 2000 V / cm and a time constant of 5 msec. 1 mL of 40 mM Sucrose / TAP was added to the cuvette to suspend the cells, and then transferred to a 1.5 mL tube. It was allowed to stand at 10 to 20 μE / m 2 / sec at 23 ° C. After 24 hours, the cells were precipitated by centrifugation at 800 × g for 5 minutes. After removing the supernatant, 0.5 mL of 20% (w / v) corn starch / 40 mM Sucrose / TAP was added, and the mixture was plated on a TAP plate to which 10 μg / μL hygromycin had been added. It was allowed to stand at 20 to 30 μE / m 2 / sec at 23 ° C., and the grown colonies were planted as transformants on a new hygromycin-containing TAP plate.

〔実験結果〕
(1)TAG/膜脂質合成系の制御検討
モデル藻類C. reinhardtiiでの脂質蓄積に関する知見として、窒素欠乏条件下で脂質が蓄積すること、脂質の中では貯蔵脂質であるTAGが蓄積すること、飽和脂肪酸の割合が増えることが報告されている(BMC Biotechnol. 2011; 11: 7.)。
〔Experimental result〕
(1) Control study of TAG / membrane lipid synthesis system
It is reported that lipid accumulation in the model algae C. reinhardtii is that lipid accumulates under nitrogen-deficient conditions, TAG as a storage lipid accumulates in lipids, and the percentage of saturated fatty acids increases. (BMC Biotechnol. 2011; 11: 7.).

一方で本発明者らがこれまで高等植物で着目してきたリン欠乏条件下での脂質蓄積については詳細な知見は無い。そこで、窒素欠乏とリン欠乏条件下でのTAG蓄積量の比較を行った。
(2)栄養欠乏条件下でのTAG蓄積量の比較
増殖が停止しているstationary phase、増殖が盛んなlogarithmic phase、窒素欠乏条件、リン欠乏条件の比較を行った。
On the other hand, there is no detailed knowledge about lipid accumulation under phosphorus-deficient conditions that the present inventors have focused on in higher plants. Therefore, the amount of TAG accumulation under nitrogen deficiency and phosphorus deficiency conditions was compared.
(2) Comparison of TAG accumulation amount under nutrient deficiency conditions Comparison was made between the stationary phase where growth stopped, the logarithmic phase where growth was active, nitrogen deficiency conditions, and phosphorus deficiency conditions.

logarithmic phase で窒素欠乏条件へ植え継いだ場合、油脂であるTAGの蓄積量が少なく、TAGを得るためには改良が必要であることがわかった。リン欠乏条件へ植え継いだ場合、増殖が窒素欠乏条件下ほど阻害されないこと、C16:4, C18:3などの多価不飽和脂肪酸の割合が減り、相対的に新規合成脂肪酸の割合は増えること、TAG蓄積量が多いことから、TAGの脂肪酸組成を膜脂質に含まれる脂肪酸から大きく改変するのに向いていることを見つけた(図1、図2)。
(3)脂質合成鍵遺伝子の探索
Diacylglycerol acyltransferase (DGAT)はTAG生合成の最終ステップを触媒する酵素である。DGATは動物、植物に広く存在する酵素であり、DGAT1, DGAT2の2種類が報告されている。
When planted in a nitrogen deficient condition in the logarithmic phase, the accumulation of TAG, which is an oil and fat, was small, and it was found that improvement was necessary to obtain TAG. When transplanted to phosphorus deficient conditions, growth is not inhibited as much as under nitrogen deficient conditions, the proportion of polyunsaturated fatty acids such as C16: 4, C18: 3 is decreased, and the proportion of newly synthesized fatty acids is relatively increased Since the amount of accumulated TAG was large, it was found that the composition of fatty acid of TAG is suitable for greatly modifying the fatty acid contained in the membrane lipid (FIGS. 1 and 2).
(3) Search for lipid synthesis key genes
Diacylglycerol acyltransferase (DGAT) is an enzyme that catalyzes the final step of TAG biosynthesis. DGAT is an enzyme widely present in animals and plants, and two types of DGAT1 and DGAT2 have been reported.

C. reinhardtiiでのDGATについて、公開データベース(JGI Chlamydomonas reinhardtii v4.0)を探索した結果、DGAT1が1種類、DGAT2が5種類(DGTT1-5)存在することがわかった。これらのうちDGTT1についてはN欠乏条件下でmRNA量の変化がみられること、DGTT2およびDGTT3については窒素欠乏条件下でmRNA量の変化が少ないことが報告されている(Plant physiol. 2010, Vol.154, 1737-1752)。   As a result of searching a public database (JGI Chlamydomonas reinhardtii v4.0) for DGAT in C. reinhardtii, it was found that there was one DGAT1 and five DGAT2 (DGTT1-5). Among these, it has been reported that DGTT1 shows a change in the amount of mRNA under N-deficient conditions, and DGTT2 and DGTT3 have a small change in the amount of mRNA under nitrogen-deficient conditions (Plant physiol. 2010, Vol. 154, 1737-1752).

C. reinhardtiiのC9株を1×10cells/mLになるようにTAP培地250mLへ植え継ぎ、 logarithmic phase(5〜6×10cells/mL)で細胞を遠心回収し、リン欠乏培地または窒素欠乏培地で洗浄した後、1×10cells/mLになるようにリン欠乏培地または窒素欠乏培地250mLへ植え継いだ。新規脂肪酸由来のTAGが蓄積され始める条件である植え継ぎ後5日目に培養液 1 mLから細胞を遠心機で回収し、-80℃に保管した後、RNAを抽出した。RNAから逆転写反応によりcDNAを得た。cDNAを鋳型にPCRで半定量的に各遺伝子発現を調べた。PCRの結果、DGAT1、DGTT1-4が発現していることが確認できた。DGTT5については発現が確認できなかった(図3)。 C. reinhardtii strain C9 was inoculated to 250 mL of TAP medium at 1 × 10 5 cells / mL, and cells were collected by centrifugation in a logarithmic phase (5-6 × 10 6 cells / mL). After washing with a deficient medium, the cells were passaged to 250 mL of a phosphorus-deficient medium or a nitrogen-deficient medium at 1 × 10 5 cells / mL. Cells were recovered from 1 mL of the culture solution using a centrifuge on the fifth day after planting, which is a condition where TAG derived from a new fatty acid begins to accumulate, and stored at −80 ° C., and then RNA was extracted. CDNA was obtained from RNA by reverse transcription. Each gene expression was examined semi-quantitatively by PCR using cDNA as a template. As a result of PCR, it was confirmed that DGAT1 and DGTT1-4 were expressed. Expression of DGTT5 could not be confirmed (FIG. 3).

C. reinhardtiiではDGAT1,DGAT2が発現していることが確認できたので、DGAT1またはDGAT2の上流に栄養欠乏条件になったときのみ強発現を誘導するプロモーターをつけ、小胞体膜で働くDGATを増やし、小胞体でのTAG蓄積を促進する方法を開発することにした。
(4)制御プロモーター探索
脂質合成鍵遺伝子の探索の時と同様にcDNAを作製し、各遺伝子発現量を比較した(図3)。比較した遺伝子はTAG生合成に関わる因子であるDGAT1およびDGAT2、本発明者らが以前に発見したSQDG生合成に関わる因子であるUGP3(Okazaki et al Plant Cell 2009)およびSQD2である。
In C. reinhardtii, it was confirmed that DGAT1 and DGAT2 were expressed. Therefore, a promoter that induces strong expression was added upstream of DGAT1 or DGAT2 only under nutrient deficiency conditions, and DGAT working in the endoplasmic reticulum membrane was increased. We decided to develop a method to promote TAG accumulation in the endoplasmic reticulum.
(4) Control promoter search cDNAs were prepared in the same manner as in the search for lipid synthesis key genes, and the expression levels of each gene were compared (FIG. 3). The genes compared are DGAT1 and DGAT2, which are factors involved in TAG biosynthesis, and UGP3 (Okazaki et al Plant Cell 2009) and SQD2, which are factors involved in SQDG biosynthesis previously discovered by the present inventors.

図3よりSQD2a,UGP3,DGTT1は栄養欠乏条件で発現上昇が確認された。このうち、SQD2aはリン欠乏条件で特異的に発現上昇が見られ、DGTT1は窒素欠乏、リン欠乏の両方の条件で発現上昇が見られた。DGAT1, DGTT2-4では顕著な発現上昇は確認されなかった。そこでSQD2aとDGTT1のプロモーター領域を制御プロモーターの候補とした。
(5)候補プロモーター(pSQD2a、pDGTT1)による鍵遺伝子制御
SQD2a、DGTT1は公開データベースでは開始コドンが決定できなかったので、cDNAをDNAシークエンスし、開始コドンを決定した。
From FIG. 3, SQD2a, UGP3, and DGTT1 were confirmed to increase in expression under nutrient deficiency conditions. Among them, SQD2a was specifically upregulated under phosphorus deficiency conditions, and DGTT1 was upregulated under both nitrogen deficiency and phosphorus deficiency conditions. DGAT1 and DGTT2-4 did not show a significant increase in expression. Therefore, the promoter regions of SQD2a and DGTT1 were selected as control promoter candidates.
(5) Key gene regulation by candidate promoters (pSQD2a, pDGTT1)
Since SQD2a and DGTT1 could not determine the start codon in the public database, the cDNA was sequenced to determine the start codon.

開始コドンを決定したので、そこから約1kb上流までをプロモーター領域pSQD2a、pDGTT1とした。   Since the start codon was determined, the promoter regions pSQD2a and pDGTT1 were defined as about 1 kb upstream from there.

C. reinhardtiiのゲノムを鋳型として、プロモーター領域pSQD2a, pDGTT1をPCRにより増幅した。またC. reinhardtiiのリン欠乏時のcDNAからDGTT2〜4遺伝子の配列を得た。pSQD2a, pDGTT1をDGTT2〜4遺伝子上流に接続し、pSQD2a-DGTT2〜4, pDGTT1-DGTT2〜4とした。変異株選抜用にハイグロマイシン遺伝子耐性遺伝子(HygR)を上流に接続し、HygR-pSQD2a-DGTT2〜4, HygR-pDGTT1-DGTT2〜4を得た(図6)。
(6)プロモーター(pSQD2a、pDGTT1)とDGAT遺伝子によるTAG増産
これらのコンストラクトをC. reinhardtiiへ形質転換し、ハイグロマイシンで選抜後、各変異株を2030株得た。変異株をリン欠乏条件におき半定量PCRにより各遺伝子の発現上昇が確認された株をさらに選抜した(図7、図8、図9)。
Promoter regions pSQD2a and pDGTT1 were amplified by PCR using the C. reinhardtii genome as a template. In addition, the sequences of DGTT2-4 genes were obtained from the C. reinhardtii phosphorus-deficient cDNA. pSQD2a and pDGTT1 were connected upstream of the DGTT2-4 gene to give pSQD2a-DGTT2-4 and pDGTT1-DGTT2-4. Hygromycin gene resistance gene (HygR) was connected upstream for selection of mutant strains to obtain HygR-pSQD2a-DGTT2-4, HygR-pDGTT1-DGTT2-4 (FIG. 6).
(6) Increased TAG production by promoter (pSQD2a, pDGTT1) and DGAT gene These constructs were transformed into C. reinhardtii and selected with hygromycin to obtain 2030 mutants. Mutants were placed under phosphorus-deficient conditions, and strains in which increased expression of each gene was confirmed by semi-quantitative PCR were further selected (FIGS. 7, 8, and 9).

各変異株から3株(図7、図8、図9で枠で囲んだ株)について、TAP培地, リン欠乏培地 各250 mLで培養し、TAG蓄積量を調べた(図10、図11)。   Three strains from each mutant strain (strains surrounded by a frame in FIGS. 7, 8, and 9) were cultured in 250 mL each of TAP medium and phosphorus-deficient medium, and the amount of accumulated TAG was examined (FIGS. 10 and 11). .

図10、図11より、HygR-pSQD2a-DGTT4#18,#19においてのみリン欠乏条件下でコントロール株よりも多くのTAG蓄積がみられた。#15はコントロール株と同程度のTAG蓄積しかみられなかったので、図79で#18,#19と同等の遺伝子発現がみられていた#21を候補株として、再度TAG蓄積を確認した(図12、図13)。   10 and 11, more TAG accumulation was observed in HygR-pSQD2a-DGTT4 # 18, # 19 than in the control strain under phosphorus-deficient conditions. # 15 had only the same level of TAG accumulation as the control strain, so TAG accumulation was confirmed again using # 21, which had gene expression equivalent to # 18 and # 19 in FIG. 79, as a candidate strain ( 12 and 13).

図12、図13よりリン欠乏条件下でHygR-pSQD2a-DGTT4株はコントロール株に比べて2〜3倍のTAGが蓄積していることを発見した。これはこれまでに報告のある藻類での強発現プロモーターを付加した油脂合成遺伝子導入による手法の45倍の蓄積であった。本手法は、植物よりもバイオマスの大きい、藻類におけるバイオディーゼル生産や有用脂質生産を実現するために、極めて有用性の高い手法である。   12 and 13, it was found that HygR-pSQD2a-DGTT4 strain accumulated 2-3 times more TAG than the control strain under phosphorus-deficient conditions. This was 45 times the accumulation of fat and oil synthesizing gene transfection methods with a strong expression promoter in algae reported so far. This technique is extremely useful in order to realize biodiesel production and useful lipid production in algae, which have larger biomass than plants.

さらに、リン欠乏条件下でHygR-pSQD2a-DGTT4株とコントロール株のTAGの脂肪酸組成は図14に示したように、図2と同様にC16:4, C18:3などの多価不飽和脂肪酸の割合が減り、相対的に新規合成脂肪酸の割合は増えていた。このことからTAGの脂肪酸組成を膜脂質に含まれる脂肪酸から大きく改変するのに向いていると考えられる。   Furthermore, the fatty acid composition of TAG of HygR-pSQD2a-DGTT4 and control strains under phosphorus-deficient conditions is as shown in FIG. 14, as in FIG. 2. The proportion decreased and the proportion of newly synthesized fatty acids increased relatively. This suggests that the fatty acid composition of TAG is suitable for greatly modifying the fatty acid contained in the membrane lipid.

今回の発明で使用したリン欠乏応答プロモーターpSQD2は通常培養時には発現を誘導しないので、油脂蓄積のタイミングをコントロールすることができる。リン欠乏条件下で細胞増殖させながら、油脂蓄積を行わせることができるので、新規脂肪酸合成に適している。これは有用な特殊脂肪酸を蓄積させるにも有効な方法である。   Since the phosphorus deficiency response promoter pSQD2 used in the present invention does not induce expression during normal culture, the timing of fat accumulation can be controlled. It is suitable for the synthesis of novel fatty acids because it allows fat and oil accumulation while allowing cells to grow under phosphorus-deficient conditions. This is an effective method for accumulating useful special fatty acids.

本発明は、TAG生産に関連する各種産業分野において利用可能である。   The present invention can be used in various industrial fields related to TAG production.

Claims (5)

クラミドモナス・レインハーディに属する藻類に、クラミドモナス・レインハーディに属する藻類由来のSQD2プロモーターを付加したトリアシルグリセロール合成酵素遺伝子を導入することを特徴とするトリアシルグリセロール生産性藻類の作製方法。 A method for producing a triacylglycerol- producing alga comprising introducing a triacylglycerol synthase gene to which an SQD2 promoter derived from an algae belonging to Chlamydomonas reinhardi is added to an algae belonging to Chlamydomonas reinhardi . トリアシルグリセロール合成酵素遺伝子が、DGAT2遺伝子であることを特徴とする請求項1に記載のトリアシルグリセロール生産性藻類の作製方法。 The method for producing a triacylglycerol- producing alga according to claim 1 , wherein the triacylglycerol synthase gene is a DGAT2 gene. トリアシルグリセロール合成酵素遺伝子が、DGTT4遺伝子であることを特徴とする請求項1に記載のトリアシルグリセロール生産性藻類の作製方法。 The method for producing a triacylglycerol- producing alga according to claim 1 , wherein the triacylglycerol synthase gene is a DGTT4 gene. 請求項1乃至3のいずれか一項に記載の方法によって作製されたトリアシルグリセロール生産性藻類。 Triacylglycerol- producing algae produced by the method according to any one of claims 1 to 3 . 請求項4に記載のトリアシルグリセロール生産性藻類をリン欠乏条件下で培養し、藻類細胞中にトリアシルグリセロールを蓄積させ、蓄積したトリアシルグリセロールを採取することを特徴とするトリアシルグリセロールの製造方法。 A triacylglycerol- producing alga according to claim 4 is cultured under phosphorus-deficient conditions, triacylglycerol is accumulated in the algal cells, and the accumulated triacylglycerol is collected. Method.
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