JP5524858B2 - 抗菌性化合物 - Google Patents
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Description
順不同に、上記AA(アミノ酸)の部分うち2つは陽イオン性アミノ酸、好ましくはリシンまたはアルギニンであるが、ヒスチジン、またはpH7.0の時に正電荷を持つ、遺伝子によってコードされていない、すなわち遺伝子組み替えしていないアミノ酸であってもよく;上記AAのうち1つは大きな親油性のR基を有するアミノ酸であり、該R基は14〜27個の非水素原子を有し、かつ好ましくは縮合または結合していてもよい環状基を2個以上、例えば2または3個有し、これらの環状基は非水素原子を通常5または6個、好ましくは6個含み;
Xは、分岐もしくは非分岐のC1〜C10のアルキル基またはアリール基(例えば、メチル基、エチル基、フェニル基)で置換されていてもよいが、好ましくは置換されていないN原子であり、この基はN、OおよびSから選ばれるヘテロ原子を最大2つまで含んでもよく;
Yは−Ra−Rb−、−Ra−Rb−Rb−および−Rb−Rb−Ra−から選ばれる基であり、
RaはC、O、SまたはN、好ましくはCであり、
RbはCであり、RaおよびRbのそれぞれはC1〜C4のアルキル基で置換されていてもよいし、置換されていなくてもよく、
好ましくは、Yは−Ra−Rb−(RaはCであることが好ましい)であり、この基は置換されていないことが好ましいが、Yが−Ra−Rb−Rc−または−Rb−Rb−Ra−であるときはRaおよびRbの1以上は置換されているのが好ましく;
Zは、それぞれ5または6個の非水素原子(好ましくはC原子)からなる環状基を1〜3個を含む基であり、該環状基のうち、2個以上は縮合していてもよく、該環状基のうち、1個以上は置換されていてもよく、これらの置換は、通常含まないだろうが極性基を含んでいてもよく、適当な置換基としてはハロゲン、好ましくは臭素またはフッ素、およびC1〜C4のアルキル基であり、Z部分は最大15個、好ましくは5〜12の非水素原子を含み、より好ましくはフェニル基である。
AA1は陽イオン性アミノ酸、好ましくはリシンまたはアルギニンであるが、ヒスチジン、またはpH7.0の時に正電荷を持つ、遺伝子によってコードされていない、すなわち遺伝子組み替えしていないアミノ酸であってもよく;
AA2は大きな親油性のR基を有するアミノ酸であり、該R基は14〜27個の非水素原子を有し、かつ好ましくは縮合または結合していてもよい環状基を2個以上、例えば2または3個有し、これらの環状基は非水素原子を通常5または6個、好ましくは6個含み;
X、YおよびZは上記のように定義される。
AA1−AA1−AA2−X−Y−Z (IV)
AA1、AA2、X、YおよびZは上記のように定義される。しかし、式(II)で表される分子が好ましい。
[本発明の分子のインビトロ活性]
2.0 原料および方法
2.1 抗菌剤
予め秤量した化合物1および2のバイアルはLytix Biopharma ASにより提供された。
この研究において使用する細菌分離株は、GR Micro Ltd.が保管する世界各地の調達源から来ており、非希釈ウマ血清の高タンパク質基質中に存在する高密度懸濁液として、最小限の継代培養で−70℃で冷凍保存されている。使用される種およびそれらの特徴を表1に示す。これらは54のグラム陽性菌、33のグラム陰性菌、10の真菌を含んでいた。
MICはClinical and Laboratory Standards Institute(CLSI、旧NCCLS)によって発行された微量液体希釈法による抗菌薬感受性試験で求めた。
M100−S15、第25巻、第1号、2005年1月、抗菌薬感受性試験実施基準;第15の補足情報
M11−A6、第24巻、第2号、嫌気性菌の抗菌薬感受性測定法;承認された基準−第6版
M27−A2、第22巻、第15号、液体希釈法による酵母の抗真菌薬感受性試験の標準法;承認された基準−第2版
M38−A、第22巻、第16号、液体希釈法による糸状菌の抗真菌薬感受性試験の標準法;承認された基準
MIC測定はGR Micro Ltd.で調製された抗菌剤または抗真菌剤を含む湿板を用いて行われた。
以下の対照(標準)菌株を試験菌株のパネルに含有させた。
黄色ブドウ球菌 Staphylococcus aureus(ATCC 29213)
大便連鎖球菌 Enterococcus faecalis(ATCC 29212)
肺炎球菌 Streptococcus pneumoniae(ATCC 49619)
緑濃菌 Pseudomonas aeruginosa(ATCC 27853)
カンジダ・クルセイ Candida krusei(ATCC 6258)
以下の対照菌株は試験菌株のパネルに追加的に用いられ、必要に応じて、対照薬が範囲内であることを確認するために含有させた。
カンジダ・パラシローシス Candida parapsilosis(ATCC 22019)
バクテロイデス・フラギリス Bacteroides fragilis(ATCC 25285)
エッゲルセラ・レンタ Eggerthella lenta(ATCC 43055)
3.0 結果
結果をシングルライン表示で表1に示す。繰り返し対照菌株の結果を表2に示す。凍結保存した、あるいは新たに調製したミューラー・ヒントンブロスを含むプレートからの結果を含め、対照菌株の結果は高度に再現性のあるものであることがわかる。なお、プレートを凍結しても、他の細菌株に対するMICに影響はなかった。
[化学薬品]
保護アミノ酸Boc−Trp−OH、Boc−Arg−OH、Boc−4−phenyl−PheおよびAc−Arg−OHはバッケム社から購入し、Boc−4−ヨードフェニルアラニン、Boc−3,3−ジフェニルアラニン、Boc−(9−アントリル)アラニンはアルドリッチ社から購入した。ペプチドのC末端を形成する、ベンジルアミン、2−フェニルエチルアミン、3−フェニルプロピルアミン、(R)−2−フェニルプロピルアミン、(S)−2−フェニルプロピルアミン、N,N−メチルベンジルアミン、N,N−エチルベンジルアミンおよびN,N−ジベンジルアミンは、N−エチルベンジルアミンをアクロス社から購入した以外は、フルカ社から購入した。ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(1−HOBt)、クロロトリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスフェート(PyCloP)およびo−(ベンゾトリアゾール−1−イル)−N,N,N’,N’−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(HBTU)は、フルカ社から購入した。4−n−ブチルフェニルボロン酸、4−t−ブチルフェニルボロン酸、4−ビフェニルボロン酸、2−ナフチルボロン酸、トリ‐o−トリルホスフィン、ベンジルブロミドおよび酢酸パラジウムはアルドリッチ社から購入した。溶媒はメルク社、リーデルデハーン社またはアルドリッチ社から購入した。
Boc−2,5,7−トリ−t−ブチルトリプトファン−OHの調製:H2N−Trp−OH(1.8g、8.8mmol)およびt−BuOH(4.7g、63.4mmol)の混合物をトリフルオロ酢酸(19mL)中、70℃で3時間撹拌する。得られたダークブラウンで半透明な溶液を室温で30分間かけてロータリーエバポレーターで濃縮し、7重量% NaHCO3を60mL滴下することによって粉砕する。得られた灰白色の粒状固体を真空ろ過によって回収した後、室温で24時間真空乾燥する。生成物は、沸点の近接する混合物である40%エタノール水溶液から結晶化することにより分離される。その量は一般に粗生成物1gに対し、約20mLである。
式AA1−AA2−AA1−NHCH2CH2Phで表わされる化合物のトリプシン耐性および抗菌活性を調べた。
それぞれのペプチドを0.1M NH4HCO3緩衝液(pH6.5)に溶解させ、最終的なペプチド濃度を1mg/mlとした。トリプシン1mgを0.1M NH4HCO3緩衝液(pH8.2)50mlに溶解させてトリプシン溶液を調製した。安定性の確認のため、新たに調製したトリプシン溶液250μl、およびペプチド溶液250μlをロッキングテーブル上で37℃下、0.1M NH4HCO3緩衝液(pH8.6)2ml中でインキュベートした。0.5mlのアリコートを様々な時間間隔でサンプリングし、1%TFAを含む水:アセトニトリル(60:40 v/v)0.5mlで希釈し、上述したRP−HPLCで分析した。37℃で0時間および20時間後に採取したトリプシン非添加のサンプルは陰性対照とした。分析の最初の5時間中に採取したサンプルの254nmにおけるピーク領域の積算はτ1/2を出すのに使用された。最初の24時間中に分解しなかったペプチドは安定だと分類された。
黄色ブドウ球菌ATCC 25923株、メチシリン耐性 黄色ブドウ球菌(MRSA)ATCC 33591株およびメチシリン耐性 表皮ブドウ球菌(MRSE)ATCC 27626株)のMICは、標準法を用いてToslab ASにより測定した;D.アムステルダム(Amsterdam)著、「液状培地での抗菌剤の感受性試験」、Antibiotics in Laboratory Medicine、第4版(Lorian,V.,Ed.)、ウィリアムズ・アンド・ウィルキンズ社、ボルチモア、1996年、p.75−78
マウスの皮膚を黄色ブドウ球菌または化膿連鎖球菌に感染させ、3時間間隔で合計3回の処置を行った。最後の処置から3時間後、皮膚生検体を集め、皮膚サンプル中にあるコロニー形成単位数(CFU)を計測した。
この試験の目的は、爪甲真菌症の治療のために、化合物2の抗菌効果(実施例1において説明)を調べることと、これを、ヒトの爪を使ってインビトロでTCCTTM感染させた爪モデルであるメドファーム社で販売のロセリル(登録商標)と比較することであった。
試験項目1はHCl塩としての化合物2である。参照項目1はロセリル(登録商標)ネイルラッカーである。
ChubTur(登録商標) System
・ChubTur(登録商標) Test Systemはメドファーム社によって作成された。
・ChubTur(登録商標) Test Systemは、供給源の詳細が下記のとおりであるT.rubrumを試験菌として用いて確立された。
・ChubTur(登録商標) Test Systemはその周辺温度で設定された。ただし、最終細胞のインキュベーションの温度は25±2℃である。
T.rubrumを接種したサブロー・デキストロース寒天(SDA)斜面はカーディフ大学から入手した。培養物を最初に爪甲真菌症の患者から単離した。受け取り後直ちに新しいSDA斜面上25℃で7日間、継代培養し、参照サンプルはグリセロール溶液中に入れ、極低温にして凍結させた。微生物は残存率を維持するために、3カ月ごとに継代培養した。培養物は、継代培養の後7日間25℃で保存し、必要になるまで2〜8℃で保存した。
<予備実験>
化合物2の調製
化合物2の飽和溶液は、10mgの化合物2を脱イオン水1mlに溶解させたものを用いて調製した。終夜撹拌した後、混合物を13,000rpmで5分間遠心分離し、上澄みを除去した、2〜8℃で14日間を超えない程度に保存した。
サブロー・デキストロース寒天の調製
簡単に言えば、65gの粉状のSDAを1Lの脱イオン水に添加した。寒天が目に見えて溶解するまで混合物を加熱した。その後、オートクレーブ中、121℃で15分間殺菌し、56℃まで冷却してから、25mlを滅菌した90mmのペトリ皿に移した。ペトリ皿は使用前に、ラミナーフローキャビネット内で蓋をわずかに(1cm程度)開けて30分間放置した。
リンゲル液はSOP 3080に記載されているように調製した。この溶液をオートクレーブ中、121℃で15分間殺菌した。
(i)90mmのSDAプレートにT.rubrumを添加し、斜面培養物から菌糸体や胞子を滅菌綿棒でそっと除去し、それを寒天表面に移した。
(ii)寒天プレートを25℃で7日間インキュベートした。
(iii)リンゲル液(20ml)で白色の胞子をプレート表面から洗い流した。
(iv)胞子懸濁液を滅菌ガーゼ(Smith+Nephew,Propax,7.5cm×7.5cm,8層織りガーゼスワブ,BP Type 13)でろ過して菌糸体や寒天の細片を除去した。
(v)胞子懸濁液の生菌数を計測し、胞子を適宜希釈または濃縮することにより、最終体積を20ml中、胞子数が約1×107cfu/mlとなるように調節した。
ヒトの爪先端を切って3mm×3mmの切片とする前に、爪を冷凍庫から取り出し、ラミナーフローキャビネット内に30分間置いて室温まで平衡化させた。その後、爪をそれぞれ以下のように軽く洗った:
(i)爪を70%エタノール水溶液に浸し、1分間ボルテックスした。
(ii)エタノール溶液をデカントし、新しい70%エタノール溶液で置換し、さらに1分ボルテックスした。
(iii)エタノール溶液をデカントし、リンゲル液で置換し、1分間ボルテックスし、デカントし、新しいリンゲル液で置換した。このリンゲル液で洗浄するプロセスは3回行い、各段階で洗浄溶液を交換した。
(iv)洗浄プロセスが終わったら、爪を滅菌したペトリ皿に蓋をせずに置き、室温で30分間、ラミナーフローキャビネット内で風乾させた。
ChubTur(登録商標) cellsは以下のように用いた。
(i)爪を準備したら、ChubTur(登録商標) cellsを組み立てる前に、それぞれの爪の厚みをノギスで測定した。
(ii)まず、T.rubrum(〜1×107cfu/mlを5μL)を爪の裏側に接種し、ラミナーフローキャビネット内で乾燥させ、ChubTur(登録商標) cellに背面を上にして載せた。receptor chamber(4.4±0.24cm3容)の半分まで滅菌したリンゲル液で満たした。
(iii)爪の微生物を十分に成長させるため、細胞を25±3℃で14日間、インキュベートした。
(iv)14日でChubTur(登録商標) cellsのインキュベーションを止め、化合物2を10μLとロセリル(登録商標)とを、微生物懸濁液を接種した側とは反対側の爪表面にそれぞれ別々に塗布した。化合物2およびロセリル(登録商標)を爪表面に塗布した後、細胞は25±3℃で再びインキュベーションした。
(v)5日間24時間ごとに複数回に渡って細胞に投与する方法が採られた(表5)。投与前に、爪表面を滅菌したリンゲル液で洗浄し、前に投与した過剰の化合物2およびロセリル(登録商標)を除去した。これを行った後、表5に示す投与法に従って、新たに10μL量の化合物2およびロセリル(登録商標)を適切な細胞に投与した。
阻害検査:製剤存在下における消去能
試験品の消去能試験は、既知濃度(n=3)のATP標準品に、10μLの化合物2、ロセリル(登録商標)およびプラセボを添加し、それを(試験品を含まない)標準品のみと比較することにより行った。10mg/mL〜1000ng/mLの範囲において、ATP標準品の蛍光強度に対する濃度を示す線形回帰曲線が得られた。種々のマトリックスの存在下でATP標準品と比較した結果を図3に示す。2つの製剤の吸収強度は標準品のみと比較して著しい低下を示すため、グラフから、化合物2およびロセリルは、既知濃度のATP標準溶液(750ng/mL)に添加すると消光効果を示すことがわかる。プラセボは標準品のみと著しい差異がないため、消光効果を示さなかった。
図4は、試験品(n=3)を塗布した感染した爪サンプルからのATP放出の変化ならびに感染対照および非感染対照である非処理の爪サンプルとの比較を示す(対照はn=2で試験した)。回復したATPの量が少なくなると、試験微生物に対する試験品の効率が高くなることに注目すべきである。非処理の感染対照は予想通りの高いATP回復をもたらし、非処理の非感染対照は非常にATP回復レベルが低かったことがグラフからわかる。また、化合物2およびロセリル(登録商標)は感染対照およびプラゼボと比べてATP回復が少ないことが観察され、試験微生物に対して効率がよいことを示した。プラゼボと非処理の感染対照との間には著しい差はなかった。
本発明に係る化合物をさらに調製し、さまざまな微生物に対する最小発育阻止濃度(MIC)を求めた。
Boc−Arg−Tbt−Arg−OMeのケン化
BocArgTbtArg−OMe・2HCl(2.5g、2.9mmol、国際公開第01/66147号に記載の方法で調製)をH2O(5ml)およびTHF(20ml)の混合物に溶解させた無色の溶液中に、LiOH・H2O(373mg,8.9mmol)を添加し、室温で30分間撹拌すると、急速に黄色に着色した:希HCl(52ml)と飽和食塩水(35ml)を添加し、得られた混合物をDCMで抽出した。DCMを蒸発させ、有機物質をDCMに再び溶解させ、Na2SO4で乾燥させ、ろ過および濃縮した。得られたBocArgTbtArg−OHは2.46g,93%であった。
BocArgTbtArgCO2H(365mg,0.35mmol)のTFA塩を、2−ブロモフェニルエチルアミン(53μl)のDMF(0.9ml)溶液と混合し、DIPEA(120μl)を混合した。PyBOP(194mg,0.37mmol)を添加する前に、反応混合物を室温で5分間撹拌し、その後3時間置いた。ワークアップする前に混合物をEtOAc(20ml)で希釈し、5%クエン酸溶液30mlで2回、5%NaHCO3溶液30mlで2回、飽和食塩水30mlで洗浄し、Na2SO4で乾燥、ろ過、濃縮した。カップリング試薬から生じた副生成物を含むオイル(432mg)として粗生成物が単離された。濃縮、および逆相クロマトグラフィーによる最終精製の前に、この粗生成物を4M HClを15ml含む1,4−ジオキサン溶液中に溶解させ、室温で30分撹拌することによりBoc基を除去した。
最小発育阻止濃度(mg/l)、
H−Arg−Tbt−Arg−NH−Y−Z
Claims (15)
- 式(II)で表される化合物。
AA 1 −AA 2 −AA 1 −X−Y−Z (II)
AA 1 は陽イオン性アミノ酸であり;
AA 2 はトリブチルトリプトファン(Tbt)、またはPhe(4−(2−Naphthyl))、Phe(4−(1−Naphthyl))、Bip(4−n−Bu)、Bip(4−Ph)およびBip(4−T−Bu)から選ばれるビフェニルアラニン誘導体から選ばれるアミノ酸であり;
XはN原子であり、該N原子は、N、OおよびSから選ばれるヘテロ原子を最大2個まで含んでいてもよい、分岐もしくは非分岐のC1〜C10のアルキル基またはアリール基で置換されていてもよく;
Yは−Ra−Rb −であり、
RaはCであり、
RbはCであり;RaおよびRbのそれぞれはC1〜C4のアルキル基で置換されているか、または非置換であり;
Zは、それぞれ5または6個の非水素原子からなる環状基を1個含む基であり、該環状基は置換されていてもよく;Z部分は最大15個の非水素原子を有し;
YZ間の結合は、YのRaまたはRbと、Zの環状基に属する非水素原子との共有結合である。 - ペプチドである、請求項1に記載の式(II)で表される化合物。
- 前記陽イオン性アミノ酸がリシンおよび/またはアルギニンである、請求項1または2に記載の式(II)で表される化合物。
- Xが非置換である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の式(II)で表される化合物。
- Yが−Ra−Rb−であって非置換である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の式(II)で表される化合物。
- Yが−CH2−CH2−である、請求項5に記載の式(II)で表される化合物。
- Zがフェニル基である、請求項1〜6のいずれか一項に記載の式(II)で表される化合物。
- −X−Y−Zが、合わせて−NHCH2CH2Phである、請求項1〜7のいずれか一項に記載の式(II)で表される化合物。
- 治療用である、請求項1〜9のいずれか一項に記載の化合物。
- 抗菌剤、抗真菌剤または抗腫瘍剤として用いられる、請求項1〜9のいずれか一項に記載の化合物。
- 請求項1〜9のいずれか一項に記載の化合物の抗菌剤としての使用。
- 適切な希釈剤、担体または賦形剤と混合して、請求項1〜9のいずれか一項に記載の化合物を含む製剤。
- 医薬製剤である、請求項13に記載の製剤。
- 局所的投与に適している、請求項14に記載の製剤。
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