JP4877781B2 - Crystal production tool - Google Patents
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Description
本発明は、液−液拡散法の一種であるゲル・カウンタ・ディフュージョン法を用いて結晶を作製するときに使う結晶作製器具に関する。 The present invention relates to a crystal production tool used when producing a crystal using a gel counter diffusion method which is a kind of liquid-liquid diffusion method.
タンパク質を結晶化する手法のひとつとして、液−液拡散法が知られている。この液−液拡散法は、タンパク質溶液と沈殿剤とを接触させて、その自由界面で両者を拡散させて、タンパク質を部分的に過飽和状態にさせ、これによって、タンパク質を結晶化させるものである。この液−液拡散法を用いてタンパク質を結晶化させるときの条件をスクリーニングするためには、多数の条件について、同時に、微量のサンプルで結晶化の実験をできるようにすることが好ましい。そのような実験を可能にする器具として、特許文献1に開示されたような結晶化プレートが知られている。本発明はこの種の結晶化プレートに関連がある。
この特許文献1に開示されている結晶化プレートは、微量のサンプルで多数の結晶化条件についてスクリーニングが可能であり、プレート中に多数の細長い溝を形成して、その溝の内部でタンパク質溶液と沈殿剤を接触させるようにしている。この結晶化プレートは、タンパク質溶液の通路と沈殿剤の通路との間を開閉する開閉弁と、タンパク質溶液の供給口付近に配置したタンパク質溶液供給弁と、沈殿剤の供給口付近に配置した沈殿剤供給弁とを備えていて、これらの弁の開閉を制御することで、タンパク質溶液及び沈殿剤の供給作業を実施するとともに、タンパク質溶液と沈殿剤両者の間の相互拡散の開始を制御している。弁の開閉は、気体の圧力を利用しているため、加圧するための専用装置が必要である。拡散を開始した後は、一定期間後に開閉弁を閉じて、溶液からの水分の蒸発による濃度変化を利用して、結晶を析出させている。 The crystallization plate disclosed in Patent Document 1 can be screened for a large number of crystallization conditions with a small amount of sample. A large number of elongated grooves are formed in the plate, and the protein solution is formed inside the grooves. The precipitating agent is brought into contact. This crystallization plate has an on-off valve that opens and closes between a protein solution passage and a precipitation agent passage, a protein solution supply valve arranged near the protein solution supply port, and a precipitation arranged near the precipitation agent supply port. It is equipped with a reagent supply valve, and by controlling the opening and closing of these valves, the supply operation of the protein solution and the precipitant is performed, and the start of mutual diffusion between the protein solution and the precipitant is controlled. Yes. Since opening and closing of the valve utilizes gas pressure, a dedicated device for pressurization is required. After starting the diffusion, the on-off valve is closed after a certain period of time, and crystals are precipitated using the concentration change caused by the evaporation of moisture from the solution.
また、液−液拡散法の一種として、ゲル・カウンタ・ディフュージョン法が知られている(非特許文献1及び特許文献2)。このゲル・カウンタ・ディフュージョン法は、ゲルを挟んでタンパク質溶液と沈殿剤を配置するもので、これによって、タンパク質溶液と沈殿剤がゲルを通して混じり合って、タンパク質が結晶化するものである。本発明は、このゲル・カウンタ・ディフュージョン法に関連している。
さらに、本発明は、結晶作製器具に結晶を収容したままの状態で、結晶のX線回折測定ができることに関係しているが、この点に関連の深い公知技術として、次の特許文献3が知られている。
この特許文献3は、蒸気拡散法でタンパク質の結晶を作製するための結晶化プレートを開示しており、この結晶化プレートで作製した結晶をX線回折測定をする際に、結晶化プレートをそのままX線回折装置の試料ホルダーに取り付けている。この結晶化プレートは、蒸気拡散法を用いているので、結晶化プレートを水平にした状態でX線を照射する必要があり、試料の取り付け方法に制約がある。また、蒸気拡散法は、ゲル・カウンタ・ディフュージョン法のような細長い通路を必要としないので、比較的小さな結晶化プレートとすることができるが、ゲル・カウンタ・ディフュージョン法は、充分な長さの細長い通路を必要とする。したがって、ゲル・カウンタ・ディフュージョン法のための結晶化プレートは、蒸気拡散法の結晶化プレートのようには小さくならず、X線回折装置の試料ホルダーにそのまま取り付けることはできない。 This Patent Document 3 discloses a crystallization plate for producing a protein crystal by a vapor diffusion method. When the crystal produced by this crystallization plate is subjected to X-ray diffraction measurement, the crystallization plate is used as it is. It is attached to the sample holder of the X-ray diffractometer. Since this crystallization plate uses a vapor diffusion method, it is necessary to irradiate X-rays in a state where the crystallization plate is horizontal, and there are restrictions on the method of attaching the sample. In addition, the vapor diffusion method does not require an elongated passage like the gel counter diffusion method, so that it can be a relatively small crystallization plate. However, the gel counter diffusion method has a sufficiently long length. Requires an elongated passage. Therefore, the crystallization plate for the gel counter diffusion method is not as small as the vapor diffusion method crystallization plate, and cannot be directly attached to the sample holder of the X-ray diffractometer.
ゲル・カウンタ・ディフュージョン法の結晶化プレートを用いて結晶を作製した場合には、その結晶をX線回折装置で測定するためには、結晶化プレートから結晶を取り出す必要があった。結晶化プレートの内部に存在する結晶をそのままの状態でX線回折装置で測定するためには、結晶を保有する結晶化プレートをX線回折装置の試料ホルダーに取り付ける必要がある。しかしながら、従来の結晶化プレートは、X線回折装置の試料ホルダーに取り付けるにはサイズが大きすぎる。結晶化プレートのサイズを小さくすると、今度は、結晶化のための流路の長さが不十分となる。 When a crystal was prepared using a gel counter diffusion method crystallization plate, it was necessary to take out the crystal from the crystallization plate in order to measure the crystal with an X-ray diffractometer. In order to measure the crystals existing inside the crystallization plate as they are with the X-ray diffractometer, it is necessary to attach the crystallization plate holding the crystals to the sample holder of the X-ray diffractometer. However, the conventional crystallization plate is too large to be attached to the sample holder of the X-ray diffractometer. If the size of the crystallization plate is reduced, the length of the flow path for crystallization becomes insufficient.
本発明の目的は、ゲル・カウンタ・ディフュージョン法を用いて微量のサンプルで結晶化を実施できて、かつ、結晶を取り出すことなく結晶作製器具をそのままの状態でX線回折装置の試料ホルダーに取り付けることができる結晶作製器具を提供することにある。 An object of the present invention is to perform crystallization with a small amount of sample using the gel counter diffusion method, and attach the crystal preparation tool to the sample holder of the X-ray diffractometer without removing the crystal. An object of the present invention is to provide a crystal production tool that can be used.
本発明の結晶作製器具は、結晶化すべき物質を含む物質溶液から前記物質の結晶を作製するための結晶作製器具において、次の(ア)乃至(ウ)を備えている。(ア)次の(a)乃至(f)を備える流路プレート。(a)第1面と第2面を備える平板状の本体。(b)前記本体に形成された細長い流路であって、第1端部と第2端部を備えていて、流路の長手方向に延びるひとつの面が前記第2面に露出していて、流路に沿った前記第1端部から前記第2端部までの長さが前記第1端部から前記第2端部までの直線距離の3倍以上となるように流路が曲がっていることを特徴とする流路。(c)前記本体に形成された物質溶液導入口であって、一端が前記第1面に開口していて他端が前記流路の前記第1端部に連通している物質溶液導入口。(d)前記本体に形成された結晶生成溶液導入口であって、一端が前記第1面に開口していて他端が前記流路の前記第2端部に連通している結晶生成溶液導入口。(e)前記本体に形成されたゲル導入口であって、一端が前記第1面に開口していて他端が前記流路の途中において前記流路に連通しているゲル導入口。(f)前記本体に形成された空気抜き穴であって、一端が前記第1面に開口していて他端が前記流路の前記第1端部と前記ゲル導入口の間の地点において前記流路に連通している空気抜き穴。(イ)前記第1面を覆う第1カバーシートであって、少なくとも前記物質溶液導入口の開口、前記結晶生成溶液導入口の開口、前記空気抜き穴の開口及び前記ゲル導入口の開口を気密に覆う第1カバーシート。(ウ)前記第2面を覆う第2カバーシートであって、少なくとも前記流路の長手方向に延びる開口を気密に覆う第2カバーシート。 A crystal production tool of the present invention is a crystal production tool for producing a crystal of a substance from a substance solution containing a substance to be crystallized, and includes the following (a) to (c). (A) A flow path plate including the following (a) to (f). (A) A flat plate-like main body having a first surface and a second surface. (B) A long and narrow flow channel formed in the main body, which has a first end and a second end, and one surface extending in the longitudinal direction of the flow channel is exposed on the second surface. The flow path is bent so that the length from the first end to the second end along the flow path is at least three times the linear distance from the first end to the second end. A flow path characterized by being. (C) A substance solution introduction port formed in the main body, wherein one end is open on the first surface and the other end communicates with the first end of the flow path. (D) A crystal formation solution introduction port formed in the main body, one end of which opens to the first surface and the other end communicates with the second end of the flow path. mouth. (E) A gel inlet formed in the main body, one end of which is open on the first surface and the other end is in communication with the channel in the middle of the channel. (F) An air vent hole formed in the main body, one end of which is open on the first surface and the other end is located at a point between the first end of the flow path and the gel inlet. Air vent hole communicating with the road. (A) A first cover sheet covering the first surface, wherein at least the opening of the substance solution introduction port, the opening of the crystal formation solution introduction port, the opening of the air vent hole and the opening of the gel introduction port are airtight. A first cover sheet to cover. (C) A second cover sheet that covers the second surface, and airtightly covers at least an opening extending in the longitudinal direction of the flow path.
流路が上述のように曲がっているので、流路プレートの平面サイズを小さくすることができる。流路プレートの本体の平面サイズは50mm×50mmの範囲内であることが好ましい。このサイズであれば、結晶を保有したままの結晶作製器具をX線回折装置の試料ホルダーに取り付けることができる。 Since the flow path is bent as described above, the planar size of the flow path plate can be reduced. The planar size of the main body of the flow path plate is preferably within a range of 50 mm × 50 mm. With this size, it is possible to attach a crystal production tool that holds crystals to the sample holder of the X-ray diffractometer.
流路プレートの本体の厚さは0.5〜2.0mmの範囲内であることが好ましい。厚さが0.5mm以下になると、流路プレートの強度が低下するとともに、結晶生成溶液導入口に充填できる結晶生成溶液の量が少なくなり過ぎる。厚さが2.0mm以上になると、結晶作製器具に収容したままの結晶をX線回折装置で測定する際に、流路プレートによるX線の吸収量が増加して好ましくない。より好ましくは、流路プレートの本体の厚さは0.8〜1.5mmの範囲内とする。 The thickness of the main body of the flow path plate is preferably in the range of 0.5 to 2.0 mm. When the thickness is 0.5 mm or less, the strength of the flow path plate is lowered, and the amount of the crystal forming solution that can be filled in the crystal forming solution introduction port becomes too small. When the thickness is 2.0 mm or more, the amount of X-ray absorption by the flow path plate is increased when the crystal as it is housed in the crystal production tool is measured with an X-ray diffractometer. More preferably, the thickness of the main body of the flow path plate is in the range of 0.8 to 1.5 mm.
流路は渦巻き状にすることが好ましい。こうすることで、小さな平面サイズの範囲内で流路の長さを十分長くできる。 The flow path is preferably spiral. By doing so, the length of the flow path can be made sufficiently long within the range of a small plane size.
結晶生成溶液導入口の平面サイズは空気抜き穴の平面サイズよりも大きく形成されているので、ゲル導入口から見て、結晶生成溶液導入口の側の流路抵抗と空気抜き穴の側の流路抵抗がアンバランスである。そこで、結晶生成溶液導入口と流路の第2端部との連通部分には、空気抜き穴と実質的に同じ平面サイズのバランス穴を結晶生成溶液導入口と一体に形成するのが好ましい。ゲル導入口に充填されたゲルは、流路の内部を両方向に流れて、一方は空気導入口に向かい、他方は結晶生成溶液導入口に向かう。この場合、空気抜き穴とバランス穴が実質的に同じ平面サイズなので、ゲル導入口から充填されたゲルは、その両側の流路にほぼ均等に充填される。そして、ゲル導入口から空気抜き穴までの流路の長さと、ゲル導入口からバランス穴までの流路の長さを実質的に等しくすれば、より均等にゲルが充填される。 Since the plane size of the crystal formation solution inlet is formed larger than the plane size of the air vent hole, the channel resistance on the crystal formation solution inlet side and the channel resistance on the air vent hole side as viewed from the gel inlet Is unbalanced. Therefore, it is preferable that a balance hole having substantially the same plane size as the air vent hole is formed integrally with the crystal formation solution introduction port at the communication portion between the crystal formation solution introduction port and the second end of the flow path. The gel filled in the gel inlet flows in both directions in the flow path, one going to the air inlet and the other going to the crystal forming solution inlet. In this case, since the air vent hole and the balance hole have substantially the same planar size, the gel filled from the gel introduction port is almost uniformly filled into the flow paths on both sides thereof. If the length of the flow path from the gel inlet to the air vent hole is substantially equal to the length of the flow path from the gel inlet to the balance hole, the gel is more evenly filled.
流路プレートの本体の材質はポリジメチルシロキサンとすることが好ましい。また、その場合に、第1カバーシートと第2カバーシートの材質はポリエチレンテレフタレート、ポリイミドまたはポリテトラフルオロエチレンとすることが好ましい。このような材質の組み合わせによれば、第1カバーシートと第2カバーシートは、特に接着剤を要することなく、流路プレートの本体に密着して、流路を気密に保つことができる。これらのカバーシートは、流路プレートの本体から容易には剥がれることがない。また、これらの材質の組み合わせは、X線の吸収が比較的少なくて、結晶作製器具をそのままX線回折装置の試料ホルダーに取り付けるのに適している。 The material of the main body of the flow path plate is preferably polydimethylsiloxane. In that case, the material of the first cover sheet and the second cover sheet is preferably polyethylene terephthalate, polyimide or polytetrafluoroethylene. According to such a combination of materials, the first cover sheet and the second cover sheet can be in close contact with the main body of the flow path plate without requiring an adhesive, and the flow path can be kept airtight. These cover sheets are not easily peeled off from the main body of the flow path plate. Further, the combination of these materials has relatively little absorption of X-rays, and is suitable for attaching the crystal production tool as it is to the sample holder of the X-ray diffraction apparatus.
流路プレートの流路の幅及び深さは0.05〜1.00mmの範囲内であることが好ましい。その範囲内で、結晶生成溶液及び物質溶液の特性と、必要とする結晶の大きさとから、最適な値を設定することができる。より好ましくは、流路の幅及び深さは0.1〜0.5mmの範囲内である。流路の幅と深さは、結晶生成の速度と、生成される結晶の大きさとに関連する。 The width and depth of the flow path of the flow path plate are preferably in the range of 0.05 to 1.00 mm. Within the range, an optimum value can be set from the characteristics of the crystal forming solution and the substance solution and the required crystal size. More preferably, the width and depth of the channel are in the range of 0.1 to 0.5 mm. The width and depth of the channel are related to the rate of crystal formation and the size of the crystals produced.
本発明の結晶作製器具は、ゲル・カウンタ・ディフュージョン法を用いて微量のサンプルで特にタンパク質を結晶化させるのに最適であるが、その他の物質を結晶化させるのに用いることもできる。 The crystal preparation instrument of the present invention is particularly suitable for crystallizing proteins with a very small amount of sample using the gel counter diffusion method, but can also be used for crystallizing other substances.
本発明によれば、ゲル・カウンタ・ディフュージョン法を用いて微量のサンプルで結晶化を実施できて、かつ、結晶を取り出すことなく結晶作製器具をそのままの状態でX線回折装置の試料ホルダーに取り付けることができる。また、空気抜き穴を設けているので、ゲルと物質溶液を導入する際に、流路内部の空気が容易に抜け、あまり圧力をかけなくてもゲルと物質溶液を充填することができる。 According to the present invention, crystallization can be performed with a small amount of sample using the gel counter diffusion method, and the crystal preparation tool is attached to the sample holder of the X-ray diffraction apparatus as it is without taking out the crystal. be able to. Further, since the air vent hole is provided, when the gel and the substance solution are introduced, the air inside the flow path is easily removed, and the gel and the substance solution can be filled without applying too much pressure.
以下、図面を参照して本発明の実施例を詳しく説明する。図1は本発明の結晶作製器具の一実施例の分解斜視図である。この結晶作製器具は、ゲル・カウンタ・ディフュージョン法を用いて物質溶液(結晶化すべき物質を含む溶液)から結晶を作製するための器具である。以下の説明では、タンパク質結晶を作製することを例にして説明する。この結晶作製器具は、流路プレート10、第1カバーシート12及び第2カバーシート14からなる。この結晶作製器具の使用方法を簡単に説明すると、流路プレート10の底面(第2面)に第2カバーシート14を貼り付けてから、物質溶液としてのタンパク質溶液と、結晶生成溶液としての沈殿剤と、ゲルを、それぞれ、タンパク質溶液導入口16(物質溶液導入口に相当する)と沈殿剤導入口18a,18b,18c(結晶生成溶液導入口に相当する)とゲル導入口20を介して、流路プレート10の流路内に充填する。それから、流路プレート10の上面に第1カバーシート12を貼り付ける。このように二つのカバーシート12、14で挟まれた状態の流路プレート10を、所定の温度で所定時間保持することで、流路プレート10の流路内でタンパク質の結晶が成長する。
Hereinafter, embodiments of the present invention will be described in detail with reference to the drawings. FIG. 1 is an exploded perspective view of an embodiment of the crystal production tool of the present invention. This crystal production instrument is an instrument for producing a crystal from a substance solution (a solution containing a substance to be crystallized) using a gel counter diffusion method. In the following description, the production of protein crystals will be described as an example. The crystal production tool includes a
流路プレート10は、平板状の本体に、タンパク質溶液と沈殿剤とゲルとが流れる細長い流路と、タンパク質溶液と沈殿剤とゲルのためのそれぞれの導入口16,18a,18b,18c,20と、空気抜き穴22とを形成したものである。流路プレート10の本体の平面形状は矩形であり、その平面サイズは26mm×12.2mmである。流路プレート10の厚さは1mmである。流路プレート10の本体の材質はポリジメチルシロキサン(Polydimethylsiloxane、略称はPDMS)である。このPDMSは無色透明なシリコーンゴムである。
The
第1カバーシート12と第2カバーシート14の平面サイズは、流路プレート10と同じ大きさか、それよりも若干大きくなっている。その材質は例えばポリエチレンテレフタレートである。これらのカバーシートは、厚さが0.05〜0.20mmで、透明である。
The planar sizes of the
流路プレート10と二つのカバーシート12,14は、すべて、可視光に対して透明であり、これにより、流路プレート10の内部の状況を外部から観察できる。
The
図2は流路プレート10の上面(第1面)を示した平面図である。破線で示したものは、流路プレート10の底面(第2面)側に露出するように形成された流路24である。流路24の第1端部26にはタンパク質溶液導入口16が連通しており、流路24の第2端部28には第1の沈殿剤導入口18aが連通している。第1の沈殿剤導入口18aは連通路30aを介して第2の沈殿剤導入口18bに連通しており、第2の沈殿剤導入口18bはさらに連通路30bを介して第3の沈殿剤導入口18cに連通している。沈殿剤導入口を3個直列に接続している理由は、沈殿剤の充填容量を増やすためである。流路プレート10は、厚さが1mmと薄くなっているので、沈殿剤の充填容量を増やすためには、沈殿剤導入口の平面サイズを大きくする必要がある。円形の沈殿剤導入口を形成する場合に、大きな直径のひとつの沈殿剤導入口を形成するよりも、小さな直径の沈殿剤導入口を複数個形成する方が、流路プレート10の平面サイズを小さくできる。また、大きな直径のひとつの沈殿剤導入口を形成するよりも、小さな直径の沈殿剤導入口を複数個形成する方が、流路プレートの強度を確保できる。この実施例では、3個の沈殿剤導入口に、合計で約60マイクロリットルの沈殿剤を充填できる。
FIG. 2 is a plan view showing the upper surface (first surface) of the
流路24の途中にはゲル導入口20が連通している。流路24において、ゲル導入口20とタンパク質導入口16の間の地点には、空気抜き穴22が連通している。タンパク質導入口16と沈殿剤導入口18a,18b,18cとゲル導入口20と空気抜き穴22は、それぞれ、流路プレート10の厚さ方向に貫通している。流路24は流路プレート10の底面(第2面)側に露出するように、所定の深さの溝として形成されている。
In the middle of the
流路プレート10に形成された流路24と各種の導入口16,18a,18b,18c,20と空気抜き穴22と連通路30a,30bのすべてをまとめて、以下、切り取り部と呼ぶことにする。
The
この流路プレート10の寸法を説明する。流路プレート10の平面形状は矩形であり、横方向の長さL1が12.2mmで、縦方向の長さL2が26mmである。X線回折装置の試料ホルダーにそのまま取り付けてX線回折測定が支障なく行われるためには、L1とL2がそれぞれ50mm以下であることが好ましい。流路24の形成位置を説明すると、流路プレート10の図示の左辺から距離L3=1.7mmだけ離れたところに、流路24が通っており、同様に、右辺から距離L4=1.7mmだけ離れたところに、流路24が通っている。また、上辺から距離L5=2.37mmだけ離れたところに、流路24が通っており、下辺から距離L6=2.9mmだけ離れたところに、流路24が通っている。流路24は全体として、概略、渦巻き状に形成されていて、このように曲がった経路にすることで、比較的小さな平面サイズの中で、十分な流路長さを確保している。流路24の第1端部26から第2端部28までの直線距離L7は約16mmであるが、流路24に沿って第1端部26から第2端部28までの長さ(流路の全長)を測ると、71.5mmである。したがって、流路の全長を直線距離L7で割ると約4.5倍になる。このように、流路を直線状に形成した場合と比較して、流路を曲線状に形成することで、比較的小さな平面サイズの範囲内に、十分な長さの流路を確保できる。流路の全長は、上述の直線距離の少なくとも3倍にすることが好ましい。
The dimensions of the
図3(A)は、流路プレートに形成された切り取り部を直線状に展開したときの展開図であり、流路プレートの底面側から見たものである。流路24の第1端部26から第2端部28までの長さL8(すなわち全長)は71.5mmである。第1端部26から空気抜き穴22までの長さL9は60mmである。空気抜き穴22から第2端部28までの長さL10は10mmである。長さL10の中点の位置にゲル導入口20が連通している。第1端部26にはタンパク質導入口16が連通しており、第2端部28には三つの沈殿剤導入口18a,18b,18cが直列に連通している。タンパク質導入口16の平面形状は直径D1の円形であり、D1は2.5mmである。
FIG. 3A is a development view when the cut-out portion formed in the flow path plate is developed in a straight line, and is viewed from the bottom surface side of the flow path plate. The length L8 (namely, full length) from the
図3(B)は、図3(A)に示した展開図のうち、空気抜き穴22から沈殿剤導入口18cまでの切り取り部を拡大して示した拡大展開図である。3個の沈殿剤導入口18a,18b,18cの平面形状は直径D2の円形であり、D2は5mmである。ゲル導入口20と空気抜き穴22の平面形状は直径D3の円形であり、D3は1.5mmである。流路24の第2端部28と沈殿剤導入口18aとの連通部にはバランス穴32が形成されている。このバランス穴32の平面形状も直径D3の円形である。バランス穴32と沈殿剤導入口18aは互いに一体につながっている。バランス穴32は、ゲル導入口20から見て、空気抜き穴22とちょうど対称の位置に形成されていて、しかも、同じ平面サイズになっている。このバランス穴32の存在により、ゲル導入口20から両側の流路24へと流れていくゲルは、空気抜き穴22とバランス穴32から均等にあふれ出すことになる。その結果、ゲルの充填が両側の通路へと均等になされる。空気抜き穴22よりも沈殿剤導入口18aの方が平面サイズが大きいので、バランス穴32が存在しないと仮定すると、ゲル導入口20から導入されたゲルは沈殿剤導入口18aの方へより流れやすくなる。
FIG. 3B is an enlarged development view in which the cut-out portion from the
流路24の幅W1は0.2mmである。三つの沈殿剤導入口18a,18b,18cを互いに連通させる二つの連通路30a,30bの幅W2は0.4mmである。連通路30a,30bの長さL11は1mmである。
The width W1 of the
図4(A)は流路24を直角に横切る切断面で切断したときの流路プレートの部分断面図である。流路プレート10の厚さt1は1mmであり、流路24の深さt2は0.2mmである。流路24の幅W1は0.2mmである。流路プレート10は上面(第1面)34と底面(第2面)36を備えていて、通路24のひとつの面(下側の面)が流路プレート10の底面(第2面)36に露出している。図4(B)は連通路30aを直角に横切る切断面で切断したときの流路プレートの部分断面図である。連通路30aの深さは流路24の深さt2と同じであり、連通路30aの幅W2は0.4mmである。連通路30bの断面形状も連通路30aと同じである。流路プレートに細長い流路を形成するには、フォトレジストを用いたリソグラフィー技術を用いることができる。
FIG. 4A is a partial cross-sectional view of the flow path plate when the
図5(A)は図3(A)に示した展開図の一部を拡大したものであり、図5(B)は、図5(A)の展開図に対応して、流路の長手方向に沿った切断面で流路プレートを切断した断面図である。図5(B)において、流路24の長手方向に延びるひとつの面(底面側の面)が流路プレート10の底面(第2面)36に露出するように形成されている。この流路24はゲル・カウンタ・ディフュージョン法でタンパク質を結晶化するための流路である。タンパク質溶液導入口16、沈殿剤導入口18a、バランス穴32、ゲル導入口20及び空気抜き穴22は、それらの一端(上端)が流路プレートの上面(第1面)34に開口していて、それらの他端(下端)は流路プレートの底面(第2面)36に開口するとともに、流路24に連通している。
5A is an enlarged view of a part of the development shown in FIG. 3A, and FIG. 5B corresponds to the development of FIG. It is sectional drawing which cut | disconnected the flow-path plate with the cut surface along a direction. 5B, one surface (surface on the bottom surface side) extending in the longitudinal direction of the
図6は、この結晶作製器具の使用方法を説明する断面図である。(A)乃至(C)は、いすれも、流路の長手方向に沿って切断した断面図である。まず、図6(A)に示すように、流路プレート10の底面(第2面)36に第2カバーシート14を貼り付ける。流路プレート10の本体の材質は弾力性のあるPDMSであり、第2カバーシート14の材質はポチエチレンテレフタレートであって、両者の密着性は優れており、第2カバーシート14を流路プレート10の底面36に押し付けるだけで、流路24を気密に封止するだけの密着性がある。次に、マイクロピペット(または、比較的低圧の加圧式注入シリンジ)を用いて、ゲル導入口20にゲル38を導入する。ゲル38はゲル導入口20から通路24の内部へと広がっていく。ゲルの導入量は、沈殿剤導入口18aに隣接するバランス穴32と空気抜き穴22のところにゲル38が見え始めるまでとする。空気抜き穴22とバランス穴32は同じ平面サイズで、かつ、ゲル導入口20から等距離の位置にあるので、ゲル38はゲル導入口20からその両側の流路へと均等に充填される。
FIG. 6 is a cross-sectional view for explaining how to use this crystal production tool. (A) thru | or (C) are all sectional drawings cut | disconnected along the longitudinal direction of a flow path. First, as shown in FIG. 6A, the
次に、図6(B)に示すように、マイクロピペットを用いて、沈殿剤導入口18aに沈殿剤40を導入する。このとき、3個の沈殿剤導入口18a,18b,18c(図2を参照)のすべてに沈殿剤40を導入する。沈殿剤40の導入量は、沈殿剤導入口の開口付近まで沈殿剤40を満たすまでとする。次に、マイクロピペット(または、比較的低圧の加圧式注入シリンジ)を用いて、タンパク質溶液導入口16にタンパク質溶液42を導入する。タンパク質溶液42は流路24の内部を進んでいくが、タンパク質溶液42が空気抜き穴22のところに到達すると、空気抜き穴22の内部を上昇する。タンパク質溶液42の導入量は、タンパク質溶液導入口16及び空気抜き穴22の開口付近までタンパク質溶液42を満たすまでとする。もし、空気抜き穴22が無いと仮定すると、充填済みのゲル38と、導入するタンパク質溶液42との間に、空気溜まりができてしまうおそれがある。空気抜き穴22があるおかげで、空気溜まりができるおそれはなく、空気が容易に逃げていく。
Next, as shown in FIG. 6B, the
沈殿剤40とタンパク質溶液42の導入が完了したら、図6(C)に示すように、流路プレート10の上面(第1面)34に第1カバーシート12を貼り付ける。第1カバーシート12も、第2カバーシート14と同様に、ポリエチレンテレフタレートでできているので、第1カバーシート12を流路プレート10の上面34に押し付けるだけで、タンパク質溶液導入口16の開口、沈殿剤導入口18a,18b,18cの開口、ゲル導入口20の開口、及び、空気抜き穴22の開口を、気密に封止するだけの密着性がある。カバーシート12、14の材質のポリエチレンテレフタレートは、水分の透過性が低いので、水分の蒸発による結晶化はほとんど起きないと考えられる。タンパク質の結晶化は、ゲル38を通して、タンパク質溶液42が沈殿剤40に拡散し、あるいは、沈殿剤40がタンパク質溶液42に拡散していく過程で、タンパク質溶液42中でタンパク質の濃度が過飽和になることで達成されると考えられる。図6(C)では、通路24内に生じたタンパク質結晶44を模式的に示している。
When the introduction of the
上述のように準備された結晶作製器具は、複数個まとめて、適当な透明なケースの中に入れてから、恒温装置の中にセットして、所定時間だけ静置しておき、タンパク質が結晶化するのを待つ。ケースと流路プレート10と二つのカバーシート12、14は、すべて透明なので、外部からタンパク質の結晶化の様子を確認できる。十分な大きさの結晶ができたことを確認できたら、結晶作製器具内に結晶を保持した状態で結晶作製器具をそのままX線回折装置の試料ホルダーに取り付けて、タンパク質結晶のX線回折測定を実施できる。これにより、例えば、タンパク質結晶の結晶構造解析ができる。流路プレート10は二つのカバーシート12,14で挟まれているので、直立させた状態で試料ホルダーに取り付けても、結晶や溶液が流出することがない。
Prepare a plurality of crystal preparation tools prepared as described above, put them in an appropriate transparent case, set them in a thermostatic apparatus, and let them stand for a predetermined time. Wait for it to turn. Since the case, the
本発明の結晶作製器具は、ゲル導入口、沈殿剤導入口及びタンパク質溶液導入口に、それぞれ、ゲル、沈殿剤及びタンパク質溶液を導入するだけでセットアップが完了するので、非常に簡便であり、サンプル量が微量であっても、再現性が良好である。そして、空気抜き穴があるので、ゲルとタンパク質溶液を導入する際に、大きな加圧力を必要としない。ひとつの結晶作製器具当たり(ひとつの条件当たり)のサンプル量は非常に少なくて済み、例えば、タンパク質溶液の必要量はマイクロリットルのオーダーである。 The crystal preparation instrument of the present invention is very simple because the setup is completed simply by introducing the gel, the precipitant, and the protein solution into the gel inlet, the precipitant inlet, and the protein solution inlet, respectively. Reproducibility is good even if the amount is very small. And since there exists an air vent hole, when introducing a gel and a protein solution, a big pressurizing force is not required. The amount of sample per crystal production tool (per condition) is very small, for example, the required amount of protein solution is on the order of microliters.
図7は複数の流路プレート10を共通のカバーシートで挟んだ状態を示す平面図である。本発明の結晶作製器具は、図1に示すように、ひとつの流路プレート10を二つのカバーシート12,14で挟む構造のほかに、図7に示すように、複数の流路プレート10を共通のカバーシートで挟んだ構造にすることもできる。このようにすると、小さいサイズの結晶作製器具を複数個まとめて取り扱うのに便利である。図7の例では、7個の流路プレート10を隣り合うように並べてから、これらを共通の第2のカバーシート14に貼り付けて、その状態で、ゲルと沈殿剤とタンパク質溶液の導入作業を行うことができる。その後、共通の第1のカバーシート12を貼り付ける。二つのカバーシート12,14は、7個の流路プレート10を並べた状態の寸法(85.4mm×26mm)に対して、その周囲に2mm程度突き出すようなサイズ(90mm×30mm)にしている。この状態のままで、結晶成長作業を行い、結晶をX線回折測定するときになって、個別の結晶作製器具に分離する。すなわち、隣り合う流路プレート10の境界線46のところで、上下のカバーシート12,14をカッターで切断することで、個別の結晶作製器具に分離できて、分離された結晶作製器具は、流路プレート10が上下のカバーシート12,14で挟まれた状態のものとなる。この状態の結晶作製器具を、結晶を保持したままで、X線回折装置の試料ホルダーに取り付けることができる。
FIG. 7 is a plan view showing a state in which a plurality of
この結晶作製器具を用いてタンパク質結晶を作製するときの導入材質については、特に制約はないが、例えば、次のようなものを使用できる。タンパク質溶液としては、例えば、リゾチーム溶液やソーマチン溶液、インスリン溶液などを使用できる。沈殿剤としては、タンパク質溶液の材質に対応した適当な沈殿剤を使用できる。ゲルとしては、例えば、アガロースゲルを使用できる。 Although there is no restriction | limiting in particular about the introductory material when producing a protein crystal using this crystal preparation instrument, For example, the following can be used. As the protein solution, for example, a lysozyme solution, a thaumatin solution, an insulin solution, or the like can be used. As the precipitant, an appropriate precipitant corresponding to the material of the protein solution can be used. For example, an agarose gel can be used as the gel.
二つのカバーシート12、14の材質は、PDMSとの間で密着性の良好なものとして、上述のポリエチレンテレフタレートを使うことができ、そのほかには、ポリイミドまたはポリテトラフルオロエチレンを使うことができる。
As the material of the two
10 流路プレート
12 第1カバーシート
14 第2カバーシート
16 タンパク質溶液導入口
18a,18b,18c 沈殿剤導入口
20 ゲル導入口
22 空気抜き穴
24 流路
26 第1端部
28 第2端部
30a,30b 連通路
32 バランス穴
34 流路プレートの上面(第1面)
36 流路プレートの底面(第2面)
38 ゲル
40 沈殿剤
42 タンパク質溶液
44 タンパク質結晶
46 境界線
DESCRIPTION OF
36 Bottom of flow path plate (second surface)
38
Claims (9)
(ア)次の(a)乃至(f)を備える流路プレート。
(a)第1面と第2面を備える平板状の本体。
(b)前記本体に形成された細長い流路であって、第1端部と第2端部を備えていて、流路の長手方向に延びるひとつの面が前記第2面に露出していて、流路に沿った前記第1端部から前記第2端部までの長さが前記第1端部から前記第2端部までの直線距離の3倍以上となるように流路が曲がっていることを特徴とする流路。
(c)前記本体に形成された物質溶液導入口であって、一端が前記第1面に開口していて他端が前記流路の前記第1端部に連通している物質溶液導入口。
(d)前記本体に形成された結晶生成溶液導入口であって、一端が前記第1面に開口していて他端が前記流路の前記第2端部に連通している結晶生成溶液導入口。
(e)前記本体に形成されたゲル導入口であって、一端が前記第1面に開口していて他端が前記流路の途中において前記流路に連通しているゲル導入口。
(f)前記本体に形成された空気抜き穴であって、一端が前記第1面に開口していて他端が前記流路の前記第1端部と前記ゲル導入口の間の地点において前記流路に連通している空気抜き穴。
(イ)前記第1面を覆う第1カバーシートであって、少なくとも前記物質溶液導入口の開口、前記結晶生成溶液導入口の開口、前記空気抜き穴の開口及び前記ゲル導入口の開口を気密に覆う第1カバーシート。
(ウ)前記第2面を覆う第2カバーシートであって、少なくとも前記流路の長手方向に延びる開口を気密に覆う第2カバーシート。 A crystal production instrument for producing a crystal of a substance from a substance solution containing a substance to be crystallized, comprising the following (a) to (c).
(A) A flow path plate including the following (a) to (f).
(A) A flat plate-like main body having a first surface and a second surface.
(B) A long and narrow flow channel formed in the main body, which has a first end and a second end, and one surface extending in the longitudinal direction of the flow channel is exposed on the second surface. The flow path is bent so that the length from the first end to the second end along the flow path is at least three times the linear distance from the first end to the second end. A flow path characterized by being.
(C) A substance solution introduction port formed in the main body, wherein one end is open on the first surface and the other end communicates with the first end of the flow path.
(D) A crystal formation solution introduction port formed in the main body, one end of which opens to the first surface and the other end communicates with the second end of the flow path. mouth.
(E) A gel inlet formed in the main body, one end of which is open on the first surface and the other end is in communication with the channel in the middle of the channel.
(F) An air vent hole formed in the main body, one end of which is open on the first surface and the other end is located at a point between the first end of the flow path and the gel inlet. Air vent hole communicating with the road.
(A) A first cover sheet covering the first surface, wherein at least the opening of the substance solution introduction port, the opening of the crystal formation solution introduction port, the opening of the air vent hole and the opening of the gel introduction port are airtight. A first cover sheet to cover.
(C) A second cover sheet that covers the second surface, and airtightly covers at least an opening extending in the longitudinal direction of the flow path.
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