JP4519247B2 - Nucleic acid extraction and purification reagents - Google Patents
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Description
【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、核酸の精製および測定に使用しうる核酸の抽出精製用試薬に関する。さらに詳しくは、核酸を含有する試料から、ポリアニオン性物質の存在下で核酸結合能を有する固相担体を用い、煩雑な操作をすることなく、短時間で行う核酸抽出精製方法、および核酸の抽出精製キットに関する。
【0002】
【従来の技術】
核酸を含有する試料から核酸を抽出精製する方法は、遺伝子工学や臨床診断の分野において不可欠である。例えば、ある核酸を解析するにあたっては、核酸を含有する生物試料からDNAもしくはRNAを抽出精製する必要がある。また、感染症の診断においても、細菌やウイルスからDNAもしくはRNAを抽出した後、検出することが一般的である。
【0003】
生物試料においては一般的に、DNAやRNAといった核酸は、蛋白質、脂質、糖から構成される細胞膜や細胞壁などの殻の中に存在しており、また核酸は遊離した状態で存在しているのではなく、蛋白質と複合体を形成している。このため核酸を含有する生物試料から核酸を抽出精製する場合には、プロテアーゼによる酵素処理や界面活性剤などを用いた変性処理、また、超音波処理や熱処理により核酸を遊離させた後、フェノールやクロロホルムといった有機溶媒による抽出操作や塩化セシウムを用いた超遠心分離等により核酸を精製する必要があり、これらの手法は、遺伝子工学や臨床診断の分野において、用いる核酸の用途によって組み合わされ、至適化されているのが現状である。
【0004】
上記有機溶媒による抽出操作は、時間を要し煩雑な遠心操作を必要とし、また塩化セシウムを用いた超遠心操作も同様に時間を要し、脱塩も必要であり、コストがかかるという問題がある。
【0005】
一方、簡便な核酸抽出精製方法として、超常磁性金属酸化物を含む磁性シリカ粒子を用いる方法がある(特開平9−19292号公報)。この方法は核酸を含有する生物試料から遠心操作を行わずに非特異的に核酸を吸着させ、水またはTEバッファーなど低濃度の緩衝液を用いて磁性シリカ粒子から吸着した核酸を溶出後直ちに解析できるといった利点を持つ。しかし、カオトロピック物質によりイオン強度を高められた状態で核酸を吸着しうる磁性粒子は磁性シリカ粒子のみであり、市販されている一般的な磁性粒子、例えば、カルボキシル基やカルボキシル基にシラノール基が導入された官能基を持つ磁性粒子はカオトロピック物質によりイオン強度を高めた状態では核酸を吸着させることはできない。
【0006】
【発明が解決しようとする課題】
本発明の目的は、従前の技術が有する上記問題点を解決することであり、核酸を含有する試料から煩雑な操作をすることなく、短時間で核酸を抽出精製する試薬、その試薬を用いた核酸の精製方法及び核酸抽出精製キットを提供することである。
【0007】
【課題を解決するための手段】
上記課題を解決するために鋭意検討した結果、適当なポリアニオン性物質を用いることにより、上記のようにシリカでコーティングされたもののみでなく、例えばカルボキシル基やカルボキシル基にシラノール基が導入された担体にも核酸が効率良く吸着し、TEバッファーなど低濃度の緩衝液を用いて吸着した核酸を溶出できることを見出し本発明を完成させた。
【0008】
すなわち、本発明は、核酸を含有する試料から、核酸結合能を有する磁性粒子を使用することによって、核酸を抽出精製するに際して、デキストラン硫酸を液相に存在させることを特徴とする核酸の抽出精製用試薬である。別の本発明は、この抽出精製用試薬を利用した核酸の精製方法である。さらに別の本発明は、これら抽出精製に使用される試薬を含む、核酸の測定用キットである。
【0009】
本発明の核酸の精製方法は、下記のような工程からなる;
(a)核酸を含有する試料に、デキストラン硫酸溶液および磁性粒子を添加混合し、核酸を磁性粒子に結合させる、
(b)(a)工程における核酸−磁性粒子の複合体を洗浄液により洗浄する、
(c)(b)工程にて洗浄した核酸−磁性粒子複合体から用途に応じて、核酸を溶出させる。
【0010】
【発明の実施の形態】
本発明において核酸とは、DNA、RNAを含みプラスミドDNAであってもよい。その長さは格別限定されないが、塩基配列として、好ましくは8個以上のものが適当である。
【0011】
また、本発明に用いられる核酸を含有する試料としては、核酸を含有するものであれば特に限定されないが、PCR産物、生物試料を例示することができる。生物試料とは生物に由来する試料を意味し、全血、血漿、血清、骨髄、バッフィーコート、尿、体液、唾液、鼻汁、涙液、糞便由来物、細胞培養物、細胞溶解物、培養培地等のような核酸を含有する可能性ある生物試料を例示することができる。
【0012】
また必要に応じて例えば生物試料をあらかじめ溶解し核酸を抽出してもよい。生体試料からの核酸の溶出・抽出方法としては、溶解液を加え、細胞を溶解させ、有機溶媒を加えて核酸を抽出させる方法が例示される。
【0013】
生体試料からの核酸の溶出に用いられる溶解液は、プロテアーゼが含まれることが好ましく、プロテアーゼとしては細胞膜の破壊や生物試料中に含まれる蛋白質を分解するものであれば特に限定されない。具体的には、プロナーゼ、プロテイナーゼK等が挙げられ、これらのうち、プロテイナーゼKが好ましく用いられる。その使用濃度としては、0.1〜1000U/mLの範囲で使用するのが好ましい。また緩衝液を溶解液に含有させることも可能で、pH6〜12の範囲が好適である。この緩衝剤としては、一般に使用されているものであれば特に限定されるものではないが、pH6〜12の範囲のいずれかのpHにおいて緩衝能を持つものが望ましく、例えば、1,3ビス[トリス(ヒドロキシメチル)メチルアミノ]プロパン、トリス[ヒドロキシメチル]アミノメタン等が挙げられ、その使用濃度としては、1〜500mmol/L、pHは6〜12の範囲が好ましい。
【0014】
さらに本発明に用いられる有機溶媒は、核酸の核酸結合能を有する固相担体への結合を妨げるものでなければ特に限定されない。本発明に用いられる有機溶媒の具体例としては、水飽和フェノール、緩衝液飽和フェノール、クロロホルム等が挙げられる。これらのうち、水飽和フェノールまたは緩衝液飽和フェノール、あるいはこれらの飽和フェノールとクロロホルムを適当な割合で混合したものが好ましい。
【0015】
また、核酸の溶解・抽出操作時に塩化ナトリウム、SDS、グリコーゲン等を適宜用いてもよい。
【0016】
本発明は、上記核酸を含有する試料から、核酸結合能を有する固相担体を使用することによって、核酸を分別するに際し、ポリアニオン性物質を液相に存在させることを特徴とする核酸の分別手段である。本発明による核酸の分別手段は、(a)吸着工程、(b)洗浄工程、(c)溶出工程の3段階に大きく分けられる。
【0017】
(a)吸着工程
この工程では、核酸を含有する試料に、ポリアニオン性物質溶液および核酸結合能を有する固相担体を添加、混合し、核酸を核酸結合能を有する固相担体に吸着させる。
【0018】
本発明に用いられるポリアニオン性物質は、核酸と固相担体との親和性を高めるポリアニオン性物質が含まれる。ポリアニオン性物質は、核酸の核酸結合能を有する固相担体への吸着を促進するものと推察される。ポリアニオン性物質としては、多価陰イオン性の物質であって核酸と固相担体との親和性を高めるものであれば特に限定されないが、その具体例としてデキストラン硫酸、リンタングステン酸マグネシウム、ヘパリン、コンドロイチン硫酸、ヒアルロン酸、デルマタン硫酸などが挙げられる。これらのうち、デキストラン硫酸が好ましく用いられ、その分子量は500〜500,000、その使用濃度としては0.5〜30%の範囲が好ましい。
【0019】
本発明に用いられるポリアニオン性物質溶液には、イオン強度を上げるために塩を添加しており、ポリアニオン性物質の作用を促進するものと推察される。用いられる塩の具体例としては、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化マグネシウムなどが挙げられるが、イオン強度を上げるものであれば特に限定されない。これらのうち、塩化ナトリウムが好ましく用いられ、その使用濃度としては、0.01〜3mol/Lの範囲が好ましい。
【0020】
本発明において用いられる核酸結合能を有する固相担体としては、ポリアニオン性物質の存在下で核酸を吸着保持しうる固体であれば、特に限定されない。具体的には、二酸化ケイ素、すなわちシリカが好ましく用いられる。また、シリカから構成される担体であるガラス、ケイソウ土、あるいはこれらを化学的修飾により表面処理を施したものや、さらに超常磁性金属酸化物等の他の物質との複合体も含まれる。さらにカルボキシル基やシラノール基およびこれらの組み合わせからなる官能基で表面を修飾したものや、さらに超常磁性金属酸化物等の他の物質との複合体も含まれる。これらのうち、吸着と溶出の効率を考えると、固相担体は粒子であることが好ましく、その大きさとしては0.05〜10μmの範囲が好ましい。
【0021】
本発明においては、上記溶解液以外の、有機溶媒からなる抽出液、ポリアニオン性物質溶液、核酸結合能を有する固相担体を別々に添加しても、あるいは同時に添加してもよい。
【0022】
(b)洗浄工程
この工程は、溶解液、有機溶媒、および核酸結合能を有する固相担体の混合物から、核酸が吸着した核酸結合能を有する固相担体のみを分離・洗浄する工程である。この時、洗浄液を使用して1〜3回程度、繰り返し洗浄するのが好ましい。
【0023】
本発明における核酸結合能を有する固相担体の分離のための具体的な手段は、使用する固相担体の形態により異なり、例えば核酸結合能を有する固相担体の場合には、遠心分離、ろ過等が好ましく、超常磁性金属酸化物を含ませておいたものを固相担体として使用する場合には、磁石等を用いて簡便な磁力による分離が可能となり、より好ましい。
【0024】
本発明において用いられる洗浄液としては、固相担体に保持された核酸の遊離を妨げるものや蛋白質の固相担体への吸着を妨げるものであれば、特に限定されない。具体的には、0.5〜2.5mol/L塩化ナトリウム溶液あるいは40〜100%エタノールで洗浄することが好ましい。
【0025】
(c)溶出工程
この工程は核酸が吸着した核酸結合能を有する固相担体から核酸を溶出させる工程であり、本発明に用いられる溶出液としては固相からの核酸の溶出を促進するものであれば、特に限定されない。具体的には、水あるいはTEバッファー[10mmol/Lトリス塩酸緩衝液、1mmol/L EDTA、pH8.0]が好ましい。この時回収した核酸は透析やエタノール沈殿等の脱塩、濃縮操作を施すことなく、制限酵素や核酸ポリメラーゼ等を使用した酵素反応に直接使用することができる。
【0026】
上記のように、本発明による核酸の精製方法は、単純な工程から構成されるため、核酸抽出精製キットならびに固相担体の分離操作や試薬分注操作を自動化した核酸抽出装置へ、容易に応用しうることは明らかである。
【0027】
【実施例】
以下、実施例により本発明をさらに具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。
【0028】
実施例1 血清に添加したDNAの回収
(1)DNA抽出材料の調製
λ−DNA(宝酒造 社製)1μgを秤取し、血清に加え、1μg/200μLとなるように調製し、DNA抽出材料とした。
【0029】
(2)λ−DNAの抽出精製
上記(1)にて調製した200μLのDNA抽出材料を3本の2mLのマイクロチューブに取り、それぞれに200μLの溶解液[50mmol/Lトリス(ヒドロキシル)アミノメタン−塩酸(pH8.0)、5mmol/L EDTA、0.25mol/L NaCl、1%SDS、20μg/mLグリコーゲン、120U/mLプロテイナーゼK]を加え、ボルテックスミキサーで混合し、56℃で30分間加温した。加温後、400μLのTEバッファー飽和フェノール/クロロホルムをそれぞれのチューブに加え、激しく攪拌した。
【0030】
これらに800μLのポリアニオン性物質溶液[20%デキストラン硫酸(平均分子量5000、シグマ社製)、2.5mol/L NaCl]を加えて混合し、40μLの異なる種類の0.1g/mL磁性粒子[(平均粒径3μm、四三酸化鉄15%含有、比表面積0.17m2/g、官能基 C3COOH;SiO2…SiOH:micromod社製 micromer−M)、(平均粒径 6.17μm、四三酸化鉄粒子43%含有、比表面積159m2/g、細孔容積279mm3/g、表面細孔直径3.2nm:他磁性粒子1・2)]をチューブに加え、室温で10分間混合した。
【0031】
次にチューブを磁気スタンドに設置して、磁性粒子をチューブ壁に集め、上清を除いた。磁気スタンドからチューブを外した後、さらに1mLの洗浄液[70%エタノール]を加えて、ボルテックスミキサーを用い、十分に混和した。同様に磁気スタンドにチューブを置き、上清を除き、この洗浄操作を2回繰り返した。上清を除いた後、マイクロチューブを56℃にセットしたヒートブロックに置き、10分間放置することによりチューブ内のエタノールを蒸発させ、取り除き、粒子を乾燥させた。これに50μLの滅菌水を添加し、56℃で10分間混合した後、磁気スタンドに置いて磁性粒子を集め、上清を回収した。
【0032】
3種の磁性粒子を用いた回収液のうち、それぞれ5μLを1.0%アガロースゲルにアプライし、100V、40分間電気泳動を行った後、エチジウムブロマイド染色し、蛍光バイオイメージアナライザー[FMBIO(登録商標)II Multi−View:宝酒造社製]で検出した結果を図1に示す。
【0033】
(3)回収したλ−DNAの制限酵素消化
上記(2)λ−DNAの抽出精製において得られた回収液のうち10μLを取り、3μLの10×Mバッファー[100mmol/Lトリス−塩酸(pH7.5)、100mmol/L塩化マグネシウム、10mmol/Lジチオスレイトール、500mmol/L NaCl]、1μLの15U/μLのHind III(宝酒造社製)ならびに滅菌水を加え全量を30μLとし、37℃で16時間放置した結果、本発明による分別手段にて抽出精製されたλ−DNAは、制限酵素Hind IIIによって完全に切断されており、直ちに、制限酵素消化に使用できることが確認できた。
【0034】
【発明の効果】
本発明によれば、ポリアニオン性物質存在下で核酸結合能を有する固相担体を使用することにより、核酸を含有する試料から核酸を吸着させ、さらに適当な溶出液を使用することにより、煩雑な操作をすることなく、短時間で核酸を抽出精製することができる。
【図面の簡単な説明】
【図1】 λ−DNAを添加した血清から、ポリアニオン性物質存在下で磁性粒子によりλ−DNAが回収されたことを示す図である(実施例1)。図中、レーン1:λ−Hind IIIマーカー、レーン2:磁性粒子micromer−M(3μm)による回収1、レーン3:磁性粒子micromer−M(3μm)による回収2、レーン4:他磁性粒子1による回収1、レーン5:他磁性粒子1による回収2、レーン6:他磁性粒子2による回収1、レーン7:他磁性粒子2による回収2。回収1、2は、各磁性粒子について、同様のλ−DNA回収実験を2回行い、それぞれの結果を示している。[0001]
BACKGROUND OF THE INVENTION
The present invention relates to a reagent for extraction and purification of nucleic acid that can be used for purification and measurement of nucleic acid. More specifically, a method for extracting and purifying nucleic acid from a sample containing nucleic acid in a short time without a complicated operation using a solid phase carrier capable of binding nucleic acid in the presence of a polyanionic substance, and nucleic acid extraction It relates to a purification kit.
[0002]
[Prior art]
A method for extracting and purifying nucleic acid from a sample containing nucleic acid is indispensable in the fields of genetic engineering and clinical diagnosis. For example, when analyzing a certain nucleic acid, it is necessary to extract and purify DNA or RNA from a biological sample containing the nucleic acid. In diagnosis of infectious diseases, it is common to detect after extracting DNA or RNA from bacteria or viruses.
[0003]
In biological samples, nucleic acids such as DNA and RNA generally exist in shells such as cell membranes and cell walls composed of proteins, lipids, and sugars, and nucleic acids exist in a free state. Rather, it forms a complex with the protein. For this reason, when extracting and purifying nucleic acid from a biological sample containing nucleic acid, the nucleic acid is liberated by enzymatic treatment with protease, denaturation treatment using a surfactant, or ultrasonic treatment or heat treatment. It is necessary to purify the nucleic acid by extraction with an organic solvent such as chloroform or ultracentrifugation using cesium chloride. These techniques are combined and optimized in the fields of genetic engineering and clinical diagnosis depending on the use of the nucleic acid to be used. The current situation is that.
[0004]
The extraction operation using the organic solvent requires time and a complicated centrifugal operation, and the ultracentrifugation operation using cesium chloride similarly requires time, requires desalting, and is costly. is there.
[0005]
On the other hand, as a simple nucleic acid extraction and purification method, there is a method using magnetic silica particles containing a superparamagnetic metal oxide (Japanese Patent Laid-Open No. 9-19292). This method allows nucleic acid to be adsorbed nonspecifically from a biological sample containing nucleic acid without centrifugation and analyzed immediately after elution of nucleic acid adsorbed from magnetic silica particles using a low-concentration buffer such as water or TE buffer. Has the advantage of being able to. However, magnetic silica particles are the only magnetic particles that can adsorb nucleic acids in a state where the ionic strength is increased by a chaotropic substance, and general magnetic particles on the market, for example, silanol groups are introduced into carboxyl groups or carboxyl groups. The magnetic particles having a functional group cannot adsorb nucleic acid in a state where the ionic strength is increased by a chaotropic substance.
[0006]
[Problems to be solved by the invention]
An object of the present invention is to solve the above-mentioned problems of conventional techniques, and a reagent for extracting and purifying nucleic acid in a short time without complicated operation from a sample containing nucleic acid, and the reagent are used. A nucleic acid purification method and a nucleic acid extraction and purification kit are provided.
[0007]
[Means for Solving the Problems]
As a result of diligent studies to solve the above-mentioned problems, not only those coated with silica as described above, but also, for example, a carrier in which a silanol group is introduced into a carboxyl group or a carboxyl group by using an appropriate polyanionic substance In addition, the present inventors have found that the nucleic acid can be adsorbed efficiently and the adsorbed nucleic acid can be eluted using a low concentration buffer such as TE buffer.
[0008]
That is, the present invention relates to nucleic acid extraction and purification characterized in that dextran sulfate is present in the liquid phase when nucleic acid is extracted and purified from a sample containing nucleic acid by using magnetic particles having nucleic acid binding ability. Reagent. Another aspect of the present invention is a method for purifying a nucleic acid using this extraction and purification reagent. Yet another aspect of the present invention is a kit for measuring a nucleic acid containing reagents used for these extraction and purification.
[0009]
The nucleic acid purification method of the present invention comprises the following steps:
(A) A dextran sulfate solution and magnetic particles are added to and mixed with a sample containing nucleic acid to bind the nucleic acid to the magnetic particles .
(B) washing the nucleic acid- magnetic particle complex in step (a) with a washing solution;
(C) The nucleic acid is eluted from the nucleic acid- magnetic particle complex washed in the step (b) according to the intended use.
[0010]
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
In the present invention, the nucleic acid may include plasmid DNA including DNA and RNA. The length is not particularly limited, but preferably 8 or more base sequences are suitable.
[0011]
In addition, the sample containing the nucleic acid used in the present invention is not particularly limited as long as it contains a nucleic acid, and examples thereof include PCR products and biological samples. A biological sample means a sample derived from an organism, such as whole blood, plasma, serum, bone marrow, buffy coat, urine, body fluid, saliva, nasal discharge, tears, fecal matter, cell culture, cell lysate, culture medium Examples of biological samples that may contain nucleic acids such as.
[0012]
If necessary, for example, the biological sample may be dissolved in advance to extract the nucleic acid. Examples of the method for elution / extraction of nucleic acid from a biological sample include a method of adding a lysis solution, lysing cells, and adding an organic solvent to extract nucleic acid.
[0013]
The lysis solution used for elution of nucleic acid from a biological sample preferably contains a protease, and the protease is not particularly limited as long as it destroys cell membranes or decomposes proteins contained in the biological sample. Specific examples include pronase and proteinase K. Among these, proteinase K is preferably used. The concentration used is preferably in the range of 0.1 to 1000 U / mL. Moreover, it is also possible to contain a buffer solution in a solution, and the range of pH 6-12 is suitable. The buffering agent is not particularly limited as long as it is generally used, but it is desirable to have a buffering ability at any pH in the range of
[0014]
Furthermore, the organic solvent used in the present invention is not particularly limited as long as it does not hinder the binding of a nucleic acid to a solid phase carrier having a nucleic acid binding ability. Specific examples of the organic solvent used in the present invention include water saturated phenol, buffer saturated phenol, chloroform and the like. Of these, water-saturated phenol or buffer-saturated phenol, or a mixture of these saturated phenol and chloroform in an appropriate ratio is preferable.
[0015]
Further, sodium chloride, SDS, glycogen and the like may be appropriately used during the nucleic acid lysis / extraction operation.
[0016]
The present invention provides a nucleic acid separation means characterized in that a polyanionic substance is present in a liquid phase when a nucleic acid is separated from a sample containing the nucleic acid by using a solid phase carrier having nucleic acid binding ability. It is. The nucleic acid fractionating means according to the present invention can be broadly divided into three stages: (a) an adsorption process, (b) a washing process, and (c) an elution process.
[0017]
(A) Adsorption step In this step, a polyanionic substance solution and a solid phase carrier having nucleic acid binding ability are added to and mixed with a sample containing nucleic acid, and the nucleic acid is adsorbed to the solid phase carrier having nucleic acid binding ability.
[0018]
The polyanionic substance used in the present invention includes a polyanionic substance that enhances the affinity between the nucleic acid and the solid phase carrier. The polyanionic substance is presumed to promote the adsorption of a nucleic acid to a solid phase carrier having a nucleic acid binding ability. The polyanionic substance is not particularly limited as long as it is a polyanionic substance and enhances the affinity between the nucleic acid and the solid phase carrier. Specific examples thereof include dextran sulfate, magnesium phosphotungstate, heparin, Examples include chondroitin sulfate, hyaluronic acid, dermatan sulfate and the like. Of these, dextran sulfate is preferably used, its molecular weight is 500 to 500,000, and the concentration used is preferably 0.5 to 30%.
[0019]
A salt is added to the polyanionic substance solution used in the present invention to increase the ionic strength, and it is presumed that the action of the polyanionic substance is promoted. Specific examples of the salt used include sodium chloride, potassium chloride, magnesium chloride and the like, but are not particularly limited as long as the ionic strength is increased. Of these, sodium chloride is preferably used, and the concentration used is preferably in the range of 0.01 to 3 mol / L.
[0020]
The solid phase carrier having nucleic acid binding ability used in the present invention is not particularly limited as long as it is a solid that can adsorb and hold nucleic acid in the presence of a polyanionic substance. Specifically, silicon dioxide, that is, silica is preferably used. Further, glass, diatomaceous earth, which is a carrier composed of silica, or a material obtained by subjecting these to surface treatment by chemical modification, and a complex with another substance such as a superparamagnetic metal oxide are also included. Furthermore, those having a surface modified with a functional group comprising a carboxyl group, a silanol group, or a combination thereof, and a complex with another substance such as a superparamagnetic metal oxide are also included. Among these, considering the efficiency of adsorption and elution, the solid support is preferably a particle, and its size is preferably in the range of 0.05 to 10 μm.
[0021]
In the present invention, an extraction solution composed of an organic solvent, a polyanionic substance solution, and a solid phase carrier having a nucleic acid binding ability may be added separately or simultaneously.
[0022]
(B) Washing step This step is a step of separating and washing only the solid phase carrier having the nucleic acid binding ability adsorbed with the nucleic acid from the mixture of the solution, the organic solvent, and the solid phase carrier having the nucleic acid binding ability. At this time, it is preferable to repeatedly wash about 1 to 3 times using a washing liquid.
[0023]
The specific means for separating the solid phase carrier having the nucleic acid binding ability in the present invention varies depending on the form of the solid phase carrier to be used. For example, in the case of the solid phase carrier having the nucleic acid binding ability, centrifugation and filtration are performed. When a superparamagnetic metal oxide-containing material is used as a solid phase carrier, it is more preferable because it can be easily separated by a magnetic force using a magnet or the like.
[0024]
The washing solution used in the present invention is not particularly limited as long as it prevents the nucleic acid held on the solid phase carrier from being released or prevents the protein from adsorbing to the solid phase carrier. Specifically, it is preferable to wash with 0.5 to 2.5 mol / L sodium chloride solution or 40 to 100% ethanol.
[0025]
(C) Elution step This step is a step of eluting nucleic acid from a solid phase carrier having nucleic acid binding ability to which the nucleic acid is adsorbed, and the eluent used in the present invention is to promote elution of nucleic acid from the solid phase. If there is, it will not be specifically limited. Specifically, water or TE buffer [10 mmol / L Tris-HCl buffer, 1 mmol / L EDTA, pH 8.0] is preferable. The nucleic acid recovered at this time can be directly used for an enzyme reaction using a restriction enzyme, a nucleic acid polymerase, or the like without performing desalting and concentration operations such as dialysis and ethanol precipitation.
[0026]
As described above, since the nucleic acid purification method according to the present invention is composed of simple steps, it can be easily applied to nucleic acid extraction and purification kits and nucleic acid extraction devices that automate solid phase carrier separation and reagent dispensing operations. It is clear that this is possible.
[0027]
【Example】
EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described more specifically with reference to examples, but the present invention is not limited to these examples.
[0028]
Example 1 Recovery of DNA added to serum (1) Preparation of
[0029]
(2) Extraction and purification of λ-DNA 200 μL of the DNA extraction material prepared in (1) above was placed in three 2 mL microtubes, and 200 μL of each solution [50 mmol / L Tris (hydroxyl) aminomethane- Hydrochloric acid (pH 8.0), 5 mmol / L EDTA, 0.25 mol / L NaCl, 1% SDS, 20 μg / mL glycogen, 120 U / mL proteinase K] are added, mixed with a vortex mixer, and heated at 56 ° C. for 30 minutes. did. After warming, 400 μL of TE buffer saturated phenol / chloroform was added to each tube and stirred vigorously.
[0030]
800 μL of polyanionic substance solution [20% dextran sulfate (average molecular weight 5000, manufactured by Sigma), 2.5 mol / L NaCl] was added to these and mixed, and 40 μL of different types of 0.1 g / mL magnetic particles [(
[0031]
The tube was then placed on a magnetic stand and the magnetic particles were collected on the tube wall and the supernatant was removed. After removing the tube from the magnetic stand, 1 mL of a washing solution [70% ethanol] was further added and mixed well using a vortex mixer. Similarly, the tube was placed on a magnetic stand, the supernatant was removed, and this washing operation was repeated twice. After removing the supernatant, the microtube was placed on a heat block set at 56 ° C. and allowed to stand for 10 minutes to evaporate and remove the ethanol in the tube and dry the particles. 50 μL of sterilized water was added thereto and mixed at 56 ° C. for 10 minutes, and then placed on a magnetic stand to collect magnetic particles, and the supernatant was collected.
[0032]
5 μL of each of the collected liquids using three types of magnetic particles was applied to a 1.0% agarose gel, electrophoresed at 100 V for 40 minutes, and then stained with ethidium bromide, and fluorescence bioimage analyzer [FMBIO (registered) Trademark) II Multi-View: manufactured by Takara Shuzo Co., Ltd.] is shown in FIG.
[0033]
(3) Restriction enzyme digestion of recovered λ-DNA Take 10 μL of the recovered solution obtained in (2) extraction and purification of λ-DNA, 3 μL of 10 × M buffer [100 mmol / L Tris-HCl (
[0034]
【The invention's effect】
According to the present invention, by using a solid phase carrier having a nucleic acid binding ability in the presence of a polyanionic substance, nucleic acid is adsorbed from a sample containing nucleic acid, and further, by using an appropriate eluate, it is complicated. Nucleic acids can be extracted and purified in a short time without manipulation.
[Brief description of the drawings]
FIG. 1 shows that λ-DNA was recovered by magnetic particles in the presence of a polyanionic substance from serum added with λ-DNA (Example 1). In the figure, lane 1: λ-Hind III marker, lane 2:
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