JP4496338B2 - タンパク質結晶化スクリーニングチップ - Google Patents
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Description
Dimensions社製など)が、多くの企業で製造され、販売されている。しかしながら、これらの多くは、タンパク質の種類によって、沈殿剤や緩衝液の種類、濃度といった結晶化のための条件をある程度目安をつけて分類し、沈殿剤や緩衝液の組合せセットとしたものである。そのため、これらの多くは、新規のタンパク質に対しては、使うまでは適不適は全く予想のつかないものであり、既知のタンパク質に対しても、その適不適にかなり幅のある、試行錯誤的実験操作が求められる性格のものである。
(1)被検タンパク質の結晶化条件をテストし、スクリーニングするためのタンパク質結晶化スクリーニングチップであって、タンパク質の結晶化に際し、その速度を速め、あるいは緩める機能、及び/又はその析出する結晶の形状・形態を制御する機能を有する粘土鉱物を、その重量及び/又は厚みを場所により異にして配置してチップを構成したこと、上記粘土鉱物が、その基本骨格鎖−Si−O−を二次元的に広げ、層状構造を取る、フィロケイ酸塩からなり、かつ、カオリン(カオリナイト)、ハロイサイト、クリソタイル、タルク、スメクタイト、モンモリロナイト、カッ石、ギョガン石、リョクデイ石(クロライト)、パイロフィライト、アンチゴライト、エンデライト、サポナイトから選択される1種又は2種以上であること、を特徴とするタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
(2)上記粘土鉱物を、支持体上に配置してチップを構成したことを特徴とする、前記(1)に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
(3)上記粘土鉱物を、その付着粘土鉱物量を場所により異にして一枚のプレート上に配置してチップを構成したことを特徴とする、前記(2)に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
(4)上記粘土鉱物が、溶液中に溶解したタンパク質と接触することにより、そのタンパク質結晶形成制御機能を発揮することを特徴とする、前記(2)に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
(5)上記粘土鉱物が、緩衝溶液中に溶解したタンパク質と接触することにより、そのタンパク質結晶形成制御機能を発揮することを特徴とする、前記(4)に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
(6)上記緩衝溶液の溶媒蒸気を拡散させることで、上記粘土鉱物がタンパク質結晶形成制御機能を発揮することを特徴とする、前記(5)に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
(7)上記緩衝溶液の溶媒が、水であることを特徴とする、前記(6)に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
(8)被検タンパク質の結晶化条件をテストし、スクリーニングするためのタンパク質結晶化スクリーニングチップを製造する方法であって、タンパク質の結晶化に際し、その速度を速め、あるいは緩める機能、及び/又はその析出する結晶の形状・形態を制御する機能を有する粘土鉱物を用いて、種々の濃度の粘土分散溶液又はペーストを調製し、それぞれを所定の位置に設置し、乾燥することにより、複数の量の異なる粘土鉱物を配置してチップを構成すること、上記粘土鉱物が、その基本骨格鎖−Si−O−を二次元的に広げ、層状構造を取る、フィロケイ酸塩からなり、かつ、カオリン(カオリナイト)、ハロイサイト、クリソタイル、タルク、スメクタイト、モンモリロナイト、カッ石、ギョガン石、リョクデイ石(クロライト)、パイロフィライト、アンチゴライト、エンデライト、サポナイトから選択される1種又は2種以上であること、を特徴とするタンパク質結晶化スクリーニングチップの製造方法。
本発明のタンパク質結晶化スクリーニングチップは、被検タンパク質の結晶化条件をテストし、スクリーニングするために使用されるものであり、その基本構成は、タンパク質の結晶化に際し、その速度を速め、あるいは緩める機能、及び/又はその析出する結晶の形状・形態を制御する機能を有する粘土鉱物を、その重量及び/又は厚みを場所により異にして配置してチップを構成したこと、を特徴とするものである。
(チップ作製)
粘土をMilliQ水に分散させ、種々の濃度の粘土分散溶液を調製し、それぞれを1枚のプレート、例えば、スライドガラス上の所々に乗せ、風乾し、付着粘土量が場所によって異なるチップを作製した。より詳細に一例を述べると、10%、5%、2.5%、1%、0.5%、0.1%、0.05%及び0.01%フィロケイ酸塩分散水溶液を調製し、これらのそれぞれを、ピペットでスライドガラス上に滴下・塗布し、50℃で風乾することを、順次行うことにより、8本の量の異なる線状粘土膜を塗布したチップ(図1参照)を作製した。
対象とするタンパク質を緩衝溶液に溶かし、エッペンに入れ、4℃、10000rpmで10分間遠心し、溶液中の不溶物を取り除いた。この溶液に、予め遠心で不溶物を取り除いておいた沈殿剤溶解溶液を加え混合した。この混合溶液を、マイクロピペットを用いて、前記チップの線状粘土膜上に、膜を引っ掻かないように、ゆっくりと乗せた(図2参照)。このチップを、それが入る大きさの容器に、図3のように置き、容器底部にリザーバーとなる溶液も入れて密封し、所定温度に保った。粘土膜状に乗せた溶液の溶媒分子が粘土層間に入ると同時に、リザーバーへも蒸気拡散し、結晶化が起こった。
卵白リゾチーム溶液の濃度を50mg/mlから、20mg/ml、10mg/ml及び5mg/mlにした以外は、実施例1と全く同様にして、結晶化を行った。放置後1日半で、5mg/mlのものでは結晶が得られなかったが、20mg/mlと10mg/mlのものでは、共にタンパク質結晶が得られた。
粘土鉱物膜塗布チップを使用せず、従来の沈殿法で、濃度20mg/ml、10mg/ml及び5mg/mlの卵白リゾチーム溶液から、結晶化を試みた。操作法は、粘土膜が無いこと(卵白リゾチーム溶液は何も付着・塗布してないスライドガラス上)を除き、実施例1と同様とした。20mg/ml濃度のものでは、放置後2日にして、ようやく結晶があらわれたが、10mg/ml及び5mg/mlのものでは、結晶は認められず、その後も結晶生成はなかった。
タンパク質をリゾチームからカタラーゼ、タウマチン及びコンカナバリンAに変えた以外は、実施例1と全く同じ操作で、これらの3種のタンパク質の結晶化を試みた。それらのタンパク質の初期条件を、実施例1の場合も含め、表1に纏めた。いずれのタンパク質に対しても、モンモリロナイトの顕著な結晶化促進効果が認められた。
チップ中の粘土鉱物をモンモリロナイトからクロライトへ変えた以外は、実施例1と全く同じにして、結晶化を試みた。チップガラス上のクロライトが無い部分に比べ遅く、2日後にクロライト付着・塗布膜上に結晶が現れ、促進効果と言うよりは抑制効果が認められた。しかし、結晶出現速度は遅いものの、リゾチーム濃度10mg/mlでも2日後に結晶が現れた。因みに、粘土無しではこの濃度では結晶は得られない。この方法は、結晶化が遅くとも、目的にあった形質の結晶を得るのに、有力な方法の一つとなり得るものである。
チップ中の粘土鉱物をカオリンとし、タンパク質として、リゾチーム、タウマチン及びコンカナバリンAを用いて、実施例1と同様な操作でこれらのタンパク質の結晶化を行った。1日後に現れたリゾチーム、タウマチン及びコンカナバリンAそれぞれの結晶写真を、図5、6及び7に示す。
沈殿剤を含むリザーバーと混合せず、緩衝溶液に溶かしたタンパク質溶液そのものを、タンパク質結晶化溶液として用いた(すなわち、タンパク質溶液は、沈殿剤を含まない)以外は、実施例1と全く同様にして、リゾチーム、カタラーゼ、タウマチン及びコンカナバリンAで結晶化を試みた。各タンパク質の濃度は、表1に示した、それぞれ、沈殿剤である塩化ナトリウム、PEG4000、PIPES及び硫酸アンモニウムを含まないものと同じである。いずれのタンパク質も放置後1日で結晶が現れ(図8参照:チップ中の粘土はモンモリロナイト)、粘土が無い場合並びに粘土も沈殿剤も無い場合に比べて、顕著なタンパク質結晶化効果が認められた。
チップ中の粘土鉱物をカオリンとし、タンパク質として、リゾチーム及びコンカナバリンAを用いて、実施例13と同様な操作でこれらのタンパク質の結晶化を行った。1日後に現れたリゾチーム及びコンカナバリンAそれぞれの結晶写真を、図9及び10に示す。
チップ中の粘土鉱物をクロライトとし、タンパク質として、リゾチーム及びコンカナバリンAを用いて、実施例13と同様な操作でこれらのタンパク質の結晶化を行った。2日後に現れたリゾチーム及びコンカナバリンAそれぞれの結晶写真を、図11及び12に示す。
Claims (8)
- 被検タンパク質の結晶化条件をテストし、スクリーニングするためのタンパク質結晶化スクリーニングチップであって、タンパク質の結晶化に際し、その速度を速め、あるいは緩める機能、及び/又はその析出する結晶の形状・形態を制御する機能を有する粘土鉱物を、その重量及び/又は厚みを場所により異にして配置してチップを構成したこと、上記粘土鉱物が、その基本骨格鎖−Si−O−を二次元的に広げ、層状構造を取る、フィロケイ酸塩からなり、かつ、カオリン(カオリナイト)、ハロイサイト、クリソタイル、タルク、スメクタイト、モンモリロナイト、カッ石、ギョガン石、リョクデイ石(クロライト)、パイロフィライト、アンチゴライト、エンデライト、サポナイトから選択される1種又は2種以上であること、を特徴とするタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
- 上記粘土鉱物を、支持体上に配置してチップを構成したことを特徴とする、請求項1に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
- 上記粘土鉱物を、その付着粘土鉱物量を場所により異にして一枚のプレート上に配置してチップを構成したことを特徴とする、請求項2に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
- 上記粘土鉱物が、溶液中に溶解したタンパク質と接触することにより、そのタンパク質結晶形成制御機能を発揮することを特徴とする、請求項2に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
- 上記粘土鉱物が、緩衝溶液中に溶解したタンパク質と接触することにより、そのタンパク質結晶形成制御機能を発揮することを特徴とする、請求項4に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
- 上記緩衝溶液の溶媒蒸気を拡散させることで、上記粘土鉱物がタンパク質結晶形成制御機能を発揮することを特徴とする、請求項5に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
- 上記緩衝溶液の溶媒が、水であることを特徴とする、請求項6に記載のタンパク質結晶化スクリーニングチップ。
- 被検タンパク質の結晶化条件をテストし、スクリーニングするためのタンパク質結晶化スクリーニングチップを製造する方法であって、タンパク質の結晶化に際し、その速度を速め、あるいは緩める機能、及び/又はその析出する結晶の形状・形態を制御する機能を有する粘土鉱物を用いて、種々の濃度の粘土分散溶液又はペーストを調製し、それぞれを所定の位置に設置し、乾燥することにより、複数の量の異なる粘土鉱物を配置してチップを構成すること、上記粘土鉱物が、その基本骨格鎖−Si−O−を二次元的に広げ、層状構造を取る、フィロケイ酸塩からなり、かつ、カオリン(カオリナイト)、ハロイサイト、クリソタイル、タルク、スメクタイト、モンモリロナイト、カッ石、ギョガン石、リョクデイ石(クロライト)、パイロフィライト、アンチゴライト、エンデライト、サポナイトから選択される1種又は2種以上であること、を特徴とするタンパク質結晶化スクリーニングチップの製造方法。
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