JP4220033B2 - Novel polypeptide - Google Patents
Novel polypeptide Download PDFInfo
- Publication number
- JP4220033B2 JP4220033B2 JP31150998A JP31150998A JP4220033B2 JP 4220033 B2 JP4220033 B2 JP 4220033B2 JP 31150998 A JP31150998 A JP 31150998A JP 31150998 A JP31150998 A JP 31150998A JP 4220033 B2 JP4220033 B2 JP 4220033B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- dna
- polypeptide
- cells
- poly
- acetyllactosamine
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims description 184
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 title claims description 168
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 title claims description 167
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 356
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 270
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 210
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 claims description 198
- KFEUJDWYNGMDBV-LODBTCKLSA-N N-acetyllactosamine Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](NC(=O)C)[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 KFEUJDWYNGMDBV-LODBTCKLSA-N 0.000 claims description 154
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 130
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 101
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 62
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 49
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 44
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 44
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 40
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 claims description 40
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 claims description 40
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 claims description 39
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 claims description 37
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 33
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 31
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 29
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 claims description 28
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 claims description 28
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 25
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 23
- PNIWLNAGKUGXDO-LNCRCTFVSA-N (2s,3r,4s,5r,6r)-2-[(2r,3s,4r,5r)-5-amino-4,6-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol Chemical group O[C@@H]1[C@@H](N)C(O)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 PNIWLNAGKUGXDO-LNCRCTFVSA-N 0.000 claims description 21
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims description 21
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 claims description 18
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 claims description 18
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 claims description 17
- 239000000047 product Substances 0.000 claims description 17
- HVCOBJNICQPDBP-UHFFFAOYSA-N 3-[3-[3,5-dihydroxy-6-methyl-4-(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]oxydecanoyloxy]decanoic acid;hydrate Chemical compound O.OC1C(OC(CC(=O)OC(CCCCCCC)CC(O)=O)CCCCCCC)OC(C)C(O)C1OC1C(O)C(O)C(O)C(C)O1 HVCOBJNICQPDBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 16
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 16
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 claims description 15
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims description 14
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 13
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 13
- 235000016127 added sugars Nutrition 0.000 claims description 12
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 12
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims description 12
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 claims description 11
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 claims description 11
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 claims description 11
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 claims description 11
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 claims description 11
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 claims description 11
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 claims description 10
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 claims description 10
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 claims description 10
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 10
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 10
- 108010046068 N-Acetyllactosamine Synthase Proteins 0.000 claims description 9
- OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N N-acetyl-beta-D-glucosamine Chemical group CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N 0.000 claims description 9
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 claims description 9
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 claims description 8
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 8
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 8
- KFEUJDWYNGMDBV-UHFFFAOYSA-N (N-Acetyl)-glucosamin-4-beta-galaktosid Natural products OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(CO)C1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 KFEUJDWYNGMDBV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 claims description 7
- HESSGHHCXGBPAJ-UHFFFAOYSA-N N-acetyllactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(C(O)CO)OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O HESSGHHCXGBPAJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 230000006870 function Effects 0.000 claims description 7
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 claims description 6
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 claims description 6
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 claims description 6
- -1 lactosamine oligosaccharide Chemical class 0.000 claims description 6
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 claims description 5
- LFTYTUAZOPRMMI-CFRASDGPSA-N UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine Chemical compound O1[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)C)[C@H]1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 LFTYTUAZOPRMMI-CFRASDGPSA-N 0.000 claims description 5
- HSCJRCZFDFQWRP-ABVWGUQPSA-N UDP-alpha-D-galactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 HSCJRCZFDFQWRP-ABVWGUQPSA-N 0.000 claims description 5
- LFTYTUAZOPRMMI-UHFFFAOYSA-N UNPD164450 Natural products O1C(CO)C(O)C(O)C(NC(=O)C)C1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC1C(O)C(O)C(N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 LFTYTUAZOPRMMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- HSCJRCZFDFQWRP-UHFFFAOYSA-N Uridindiphosphoglukose Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC1C(O)C(O)C(N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 HSCJRCZFDFQWRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 claims description 5
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 claims description 5
- 238000011532 immunohistochemical staining Methods 0.000 claims description 5
- 239000008101 lactose Substances 0.000 claims description 5
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 claims description 5
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 5
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 5
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 claims description 5
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 4
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 claims description 4
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 claims description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 4
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 claims description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 4
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 claims description 4
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 claims description 4
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 claims description 4
- 241000255789 Bombyx mori Species 0.000 claims description 3
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 claims description 3
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 claims description 3
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 claims description 3
- PNIWLNAGKUGXDO-UHFFFAOYSA-N Lactosamine Natural products OC1C(N)C(O)OC(CO)C1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 PNIWLNAGKUGXDO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000003047 N-acetyl group Chemical group 0.000 claims description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 3
- 238000001400 expression cloning Methods 0.000 claims description 3
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 claims description 3
- 108010035563 Chloramphenicol O-acetyltransferase Proteins 0.000 claims description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 2
- DOVBXGDYENZJBJ-ONMPCKGSSA-N lactosamine Chemical compound O=C[C@H](N)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O DOVBXGDYENZJBJ-ONMPCKGSSA-N 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 6
- HORYNJCIACQHGZ-BHVWUGLYSA-N 1-[(3R,4R,5S,6R)-3-amino-2,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]ethanone Chemical compound C(C)(=O)C1(O)[C@H](N)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O2)CO)[C@H](O1)CO HORYNJCIACQHGZ-BHVWUGLYSA-N 0.000 claims 3
- 235000020244 animal milk Nutrition 0.000 claims 2
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 claims 1
- 238000009395 breeding Methods 0.000 claims 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 claims 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 claims 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 claims 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 93
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 83
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 78
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 71
- 102100031500 Beta-1,4-glucuronyltransferase 1 Human genes 0.000 description 69
- 101710088655 Beta-1,4-glucuronyltransferase 1 Proteins 0.000 description 67
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 52
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 50
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 50
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 44
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 42
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 40
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 39
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 36
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 36
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 27
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 27
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 26
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 22
- 238000009739 binding Methods 0.000 description 22
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 22
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 22
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 21
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 18
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 18
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 18
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 18
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 18
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 17
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 16
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 15
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 15
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 15
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 15
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 14
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 14
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 14
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 14
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 14
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 14
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 13
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 13
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 13
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 12
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 12
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 12
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 12
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 12
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N Sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 12
- 238000012869 ethanol precipitation Methods 0.000 description 12
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 12
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 11
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 11
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 11
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 11
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 11
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 102000005348 Neuraminidase Human genes 0.000 description 10
- 108010006232 Neuraminidase Proteins 0.000 description 10
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 10
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 10
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 10
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 9
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 9
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 9
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 9
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 9
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 9
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Natural products CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 8
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 8
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 8
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 8
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 8
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 8
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 8
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 7
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 7
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 7
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 7
- 239000012194 insect media Substances 0.000 description 7
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L magnesium chloride Substances [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 7
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 7
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 7
- 238000011160 research Methods 0.000 description 7
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 7
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 7
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 6
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 6
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 6
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101150117895 LAMP2 gene Proteins 0.000 description 6
- 101150048357 Lamp1 gene Proteins 0.000 description 6
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 6
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 6
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 6
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 6
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical group OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 6
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 6
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 6
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 6
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 6
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 6
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 6
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 6
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 6
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 6
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 6
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 6
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 5
- 108700023372 Glycosyltransferases Proteins 0.000 description 5
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 5
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 5
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 5
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 5
- HMNZFMSWFCAGGW-XPWSMXQVSA-N [3-[hydroxy(2-hydroxyethoxy)phosphoryl]oxy-2-[(e)-octadec-9-enoyl]oxypropyl] (e)-octadec-9-enoate Chemical compound CCCCCCCC\C=C\CCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(=O)OCCO)OC(=O)CCCCCCC\C=C\CCCCCCCC HMNZFMSWFCAGGW-XPWSMXQVSA-N 0.000 description 5
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 5
- 210000000628 antibody-producing cell Anatomy 0.000 description 5
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Natural products CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 5
- 238000012136 culture method Methods 0.000 description 5
- 238000011161 development Methods 0.000 description 5
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 5
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 5
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 5
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 5
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 5
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 5
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 4
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 208000002109 Argyria Diseases 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 4
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L Calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 235000005956 Cosmos caudatus Nutrition 0.000 description 4
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 4
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 4
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 4
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 4
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 4
- 241000713869 Moloney murine leukemia virus Species 0.000 description 4
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 4
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 4
- NIGUVXFURDGQKZ-UQTBNESHSA-N alpha-Neup5Ac-(2->3)-beta-D-Galp-(1->4)-[alpha-L-Fucp-(1->3)]-beta-D-GlcpNAc Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@]3(O[C@H]([C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)C3)[C@H](O)[C@H](O)CO)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@@H](CO)O[C@@H](O)[C@@H]1NC(C)=O NIGUVXFURDGQKZ-UQTBNESHSA-N 0.000 description 4
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 4
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 4
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 4
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 4
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 4
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 4
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 4
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 4
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 4
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 4
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 4
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 4
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 4
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 4
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 4
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 4
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 4
- 238000013492 plasmid preparation Methods 0.000 description 4
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 description 4
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 4
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LPXQRXLUHJKZIE-UHFFFAOYSA-N 8-azaguanine Chemical compound NC1=NC(O)=C2NN=NC2=N1 LPXQRXLUHJKZIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960005508 8-azaguanine Drugs 0.000 description 3
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 3
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 3
- 102000011632 Caseins Human genes 0.000 description 3
- 108010076119 Caseins Proteins 0.000 description 3
- 241000186226 Corynebacterium glutamicum Species 0.000 description 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 3
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 3
- 102000051366 Glycosyltransferases Human genes 0.000 description 3
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 3
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 3
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 3
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 3
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 3
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 3
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 3
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 3
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 3
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 3
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000002459 blastocyst Anatomy 0.000 description 3
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 239000003398 denaturant Substances 0.000 description 3
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 235000020256 human milk Nutrition 0.000 description 3
- 210000004251 human milk Anatomy 0.000 description 3
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 3
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 3
- 238000000691 measurement method Methods 0.000 description 3
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 3
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 3
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 3
- LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K potassium phosphate Substances [K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 3
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 3
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- SXOUIMVOMIGLHO-AATRIKPKSA-N (E)-3-(indol-2-yl)acrylic acid Chemical compound C1=CC=C2NC(/C=C/C(=O)O)=CC2=C1 SXOUIMVOMIGLHO-AATRIKPKSA-N 0.000 description 2
- TVZGACDUOSZQKY-LBPRGKRZSA-N 4-aminofolic acid Chemical compound C1=NC2=NC(N)=NC(N)=C2N=C1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 TVZGACDUOSZQKY-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 2
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 2
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 2
- 108010021809 Alcohol dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000701489 Cauliflower mosaic virus Species 0.000 description 2
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920002271 DEAE-Sepharose Polymers 0.000 description 2
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 2
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 2
- 108010024212 E-Selectin Proteins 0.000 description 2
- 102100023471 E-selectin Human genes 0.000 description 2
- 108010031111 EBV-encoded nuclear antigen 1 Proteins 0.000 description 2
- 102100039788 GTPase NRas Human genes 0.000 description 2
- 102100021736 Galectin-1 Human genes 0.000 description 2
- 102000007563 Galectins Human genes 0.000 description 2
- 108010046569 Galectins Proteins 0.000 description 2
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 2
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 2
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108091005904 Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101000744505 Homo sapiens GTPase NRas Proteins 0.000 description 2
- 101000746367 Homo sapiens Granulocyte colony-stimulating factor Proteins 0.000 description 2
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 2
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 2
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 2
- 108010035766 P-Selectin Proteins 0.000 description 2
- 102100023472 P-selectin Human genes 0.000 description 2
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 2
- 108010021757 Polynucleotide 5'-Hydroxyl-Kinase Proteins 0.000 description 2
- 102000008422 Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase Human genes 0.000 description 2
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 2
- 102000052575 Proto-Oncogene Human genes 0.000 description 2
- 108700020978 Proto-Oncogene Proteins 0.000 description 2
- 229940123578 Selectin antagonist Drugs 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000019764 Soybean Meal Nutrition 0.000 description 2
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 2
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 2
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 2
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 2
- 239000008351 acetate buffer Substances 0.000 description 2
- 229960003896 aminopterin Drugs 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 2
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 238000005056 compaction Methods 0.000 description 2
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 2
- NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M coomassie brilliant blue Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=C1 NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 2
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 2
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 2
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 2
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 2
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 2
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 2
- FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N hypoxanthine Chemical compound O=C1NC=NC2=C1NC=N2 FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012744 immunostaining Methods 0.000 description 2
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 2
- PLVPPLCLBIEYEA-UHFFFAOYSA-N indoleacrylic acid Natural products C1=CC=C2C(C=CC(=O)O)=CNC2=C1 PLVPPLCLBIEYEA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 2
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 2
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 2
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 2
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 2
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 2
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 2
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 2
- 210000003712 lysosome Anatomy 0.000 description 2
- 230000001868 lysosomic effect Effects 0.000 description 2
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 description 2
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 2
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 2
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 2
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 2
- 210000005087 mononuclear cell Anatomy 0.000 description 2
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 2
- 210000000472 morula Anatomy 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 2
- 230000035764 nutrition Effects 0.000 description 2
- WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-N octanoic acid Chemical compound CCCCCCCC(O)=O WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 2
- 230000002611 ovarian Effects 0.000 description 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 2
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 2
- 229920002523 polyethylene Glycol 1000 Polymers 0.000 description 2
- 229940113116 polyethylene glycol 1000 Drugs 0.000 description 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 2
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 2
- GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M potassium dihydrogen phosphate Chemical compound [K+].OP(O)([O-])=O GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- XOJVVFBFDXDTEG-UHFFFAOYSA-N pristane Chemical compound CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C XOJVVFBFDXDTEG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 2
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 2
- 239000002412 selectin antagonist Substances 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 2
- 239000004455 soybean meal Substances 0.000 description 2
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 2
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 2
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 2
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 2
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 2
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 2
- 150000004044 tetrasaccharides Chemical class 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N (2R)-6-amino-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-amino-1-hydroxyethylidene)amino]-3-carboxy-1-hydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1,5-dihydroxy-5-iminopentylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=N[C@@H](CS)C(=N[C@@H](C)C(=N[C@@H](CO)C(=NCC(=N[C@@H](CCC(=N)O)C(=NC(CS)C(=N[C@H]([C@H](C)O)C(=N[C@H](CS)C(=N[C@H](CO)C(=NCC(=N[C@H](CS)C(=NCC(=N[C@H](CCCCN)C(=O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)N=C([C@H](CS)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](C)N=C(CN=C([C@H](CO)N=C([C@H](CS)N=C(CN=C(C(CS)N=C(C(CC(=O)O)N=C(CN)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N 0.000 description 1
- NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 2,3-bis(butanoylsulfanyl)propyl butanoate Chemical compound CCCC(=O)OCC(SC(=O)CCC)CSC(=O)CCC NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010083651 3-galactosyl-N-acetylglucosaminide 4-alpha-L-fucosyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 101710197633 Actin-1 Proteins 0.000 description 1
- 239000004254 Ammonium phosphate Substances 0.000 description 1
- 101710145634 Antigen 1 Proteins 0.000 description 1
- 108020004491 Antisense DNA Proteins 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000201370 Autographa californica nucleopolyhedrovirus Species 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000186000 Bifidobacterium Species 0.000 description 1
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 1
- 101000800130 Bos taurus Thyroglobulin Proteins 0.000 description 1
- 241000186146 Brevibacterium Species 0.000 description 1
- 239000012619 Butyl Sepharose® Substances 0.000 description 1
- QLNSPJMIYWEWNF-UHFFFAOYSA-N CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C.CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C Chemical compound CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C.CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C QLNSPJMIYWEWNF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100032912 CD44 antigen Human genes 0.000 description 1
- 101100327917 Caenorhabditis elegans chup-1 gene Proteins 0.000 description 1
- BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N Calcium cation Chemical compound [Ca+2] BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 239000005635 Caprylic acid (CAS 124-07-2) Substances 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 101100007328 Cocos nucifera COS-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 description 1
- 241001517047 Corynebacterium acetoacidophilum Species 0.000 description 1
- 241001485655 Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 Species 0.000 description 1
- 241000807905 Corynebacterium glutamicum ATCC 14067 Species 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 108010040220 Datura stramonium lectin Proteins 0.000 description 1
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 1
- 241001452028 Escherichia coli DH1 Species 0.000 description 1
- 241001131785 Escherichia coli HB101 Species 0.000 description 1
- 241001646716 Escherichia coli K-12 Species 0.000 description 1
- 241001302584 Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 Species 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 1
- 101150094690 GAL1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010001498 Galectin 1 Proteins 0.000 description 1
- 102000000802 Galectin 3 Human genes 0.000 description 1
- 108010001517 Galectin 3 Proteins 0.000 description 1
- 102100024637 Galectin-10 Human genes 0.000 description 1
- 101001011019 Gallus gallus Gallinacin-10 Proteins 0.000 description 1
- 101001011021 Gallus gallus Gallinacin-12 Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101000868273 Homo sapiens CD44 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000608935 Homo sapiens Leukosialin Proteins 0.000 description 1
- 101000738771 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 description 1
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 description 1
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N Hypoxanthine nucleoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150102264 IE gene Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- 241000235649 Kluyveromyces Species 0.000 description 1
- 241001138401 Kluyveromyces lactis Species 0.000 description 1
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 1
- 102000008192 Lactoglobulins Human genes 0.000 description 1
- 108010060630 Lactoglobulins Proteins 0.000 description 1
- 102100039564 Leukosialin Human genes 0.000 description 1
- DUKURNFHYQXCJG-UHFFFAOYSA-N Lewis A pentasaccharide Natural products OC1C(O)C(O)C(C)OC1OC1C(OC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)C(NC(C)=O)C(OC2C(C(OC3C(OC(O)C(O)C3O)CO)OC(CO)C2O)O)OC1CO DUKURNFHYQXCJG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 1
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 1
- 102100035133 Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710116782 Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100038225 Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710116771 Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101710141452 Major surface glycoprotein G Proteins 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 240000004658 Medicago sativa Species 0.000 description 1
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 description 1
- 102000003792 Metallothionein Human genes 0.000 description 1
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 1
- 241001467578 Microbacterium Species 0.000 description 1
- 240000000249 Morus alba Species 0.000 description 1
- 235000008708 Morus alba Nutrition 0.000 description 1
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 1
- 101100536251 Mus musculus Tmem120a gene Proteins 0.000 description 1
- 241000204031 Mycoplasma Species 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N N-acetyl-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N 0.000 description 1
- 102100023315 N-acetyllactosaminide beta-1,6-N-acetylglucosaminyl-transferase Human genes 0.000 description 1
- 108010056664 N-acetyllactosaminide beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 229930182474 N-glycoside Natural products 0.000 description 1
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 1
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 1
- 229930182473 O-glycoside Natural products 0.000 description 1
- 150000008444 O-glycosides Chemical class 0.000 description 1
- 101150012394 PHO5 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- 229920002565 Polyethylene Glycol 400 Polymers 0.000 description 1
- 108010009736 Protein Hydrolysates Proteins 0.000 description 1
- 108010067787 Proteoglycans Proteins 0.000 description 1
- 102000016611 Proteoglycans Human genes 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 241000589776 Pseudomonas putida Species 0.000 description 1
- 102100037422 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Human genes 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108020005091 Replication Origin Proteins 0.000 description 1
- 229910003797 SPO1 Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910003798 SPO2 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 1
- 101100150136 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) SPO1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000235346 Schizosaccharomyces Species 0.000 description 1
- 241000235347 Schizosaccharomyces pombe Species 0.000 description 1
- 101100478210 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) spo2 gene Proteins 0.000 description 1
- 235000007238 Secale cereale Nutrition 0.000 description 1
- 244000082988 Secale cereale Species 0.000 description 1
- 108090000184 Selectins Proteins 0.000 description 1
- 102000003800 Selectins Human genes 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 241000607720 Serratia Species 0.000 description 1
- 241000881765 Serratia ficaria Species 0.000 description 1
- 241000218654 Serratia fonticola Species 0.000 description 1
- 241000607715 Serratia marcescens Species 0.000 description 1
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 1
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 1
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- QTENRWWVYAAPBI-YZTFXSNBSA-N Streptomycin sulfate Chemical compound OS(O)(=O)=O.OS(O)(=O)=O.OS(O)(=O)=O.CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](N=C(N)N)[C@@H](O)[C@H](N=C(N)N)[C@@H](O)[C@@H]1O.CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](N=C(N)N)[C@@H](O)[C@H](N=C(N)N)[C@@H](O)[C@@H]1O QTENRWWVYAAPBI-YZTFXSNBSA-N 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- 241001634922 Tausonia pullulans Species 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- 102000004338 Transferrin Human genes 0.000 description 1
- 108090000901 Transferrin Proteins 0.000 description 1
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 1
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 1
- 241000223230 Trichosporon Species 0.000 description 1
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 1
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 description 1
- 102000018265 Virus Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010066342 Virus Receptors Proteins 0.000 description 1
- 101710087237 Whey acidic protein Proteins 0.000 description 1
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 1
- MZVQCMJNVPIDEA-UHFFFAOYSA-N [CH2]CN(CC)CC Chemical group [CH2]CN(CC)CC MZVQCMJNVPIDEA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 238000005273 aeration Methods 0.000 description 1
- 239000012670 alkaline solution Substances 0.000 description 1
- SHGAZHPCJJPHSC-YCNIQYBTSA-N all-trans-retinoic acid Chemical compound OC(=O)\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C SHGAZHPCJJPHSC-YCNIQYBTSA-N 0.000 description 1
- CMQZRJBJDCVIEY-JEOLMMCMSA-N alpha-L-Fucp-(1->3)-[beta-D-Galp-(1->4)]-beta-D-GlcpNAc-(1->3)-beta-D-Galp-(1->4)-D-Glcp Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@H]([C@H](O[C@@H]3[C@H](OC(O)[C@H](O)[C@H]3O)CO)O[C@H](CO)[C@@H]2O)O)[C@@H]1NC(C)=O CMQZRJBJDCVIEY-JEOLMMCMSA-N 0.000 description 1
- 229940024546 aluminum hydroxide gel Drugs 0.000 description 1
- SMYKVLBUSSNXMV-UHFFFAOYSA-K aluminum;trihydroxide;hydrate Chemical compound O.[OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] SMYKVLBUSSNXMV-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910000148 ammonium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019289 ammonium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000002924 anti-infective effect Effects 0.000 description 1
- 230000003110 anti-inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003816 antisense DNA Substances 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010805 cDNA synthesis kit Methods 0.000 description 1
- 229910001424 calcium ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000005018 casein Substances 0.000 description 1
- BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N casein, tech. Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CC(C)C)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(C(C)O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(COP(O)(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(N)CC1=CC=CC=C1 BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000021240 caseins Nutrition 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000003729 cation exchange resin Substances 0.000 description 1
- 230000021164 cell adhesion Effects 0.000 description 1
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 230000007910 cell fusion Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000005859 cell recognition Effects 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000011098 chromatofocusing Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 229910000365 copper sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- ARUVKPQLZAKDPS-UHFFFAOYSA-L copper(II) sulfate Chemical compound [Cu+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] ARUVKPQLZAKDPS-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001351 cycling effect Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 235000013365 dairy product Nutrition 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011033 desalting Methods 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- MNNHAPBLZZVQHP-UHFFFAOYSA-N diammonium hydrogen phosphate Chemical compound [NH4+].[NH4+].OP([O-])([O-])=O MNNHAPBLZZVQHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 238000003113 dilution method Methods 0.000 description 1
- ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L dipotassium hydrogen phosphate Chemical compound [K+].[K+].OP([O-])([O-])=O ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000396 dipotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019797 dipotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L disodium hydrogen phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].OP([O-])([O-])=O BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000397 disodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019800 disodium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- BVTBRVFYZUCAKH-UHFFFAOYSA-L disodium selenite Chemical compound [Na+].[Na+].[O-][Se]([O-])=O BVTBRVFYZUCAKH-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011790 ferrous sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000003891 ferrous sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006451 grace's insect medium Substances 0.000 description 1
- 210000000224 granular leucocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 1
- 229940027941 immunoglobulin g Drugs 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 229910017053 inorganic salt Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L iron(2+) sulfate (anhydrous) Chemical compound [Fe+2].[O-]S([O-])(=O)=O BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000359 iron(II) sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 108010045069 keyhole-limpet hemocyanin Proteins 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- XIXADJRWDQXREU-UHFFFAOYSA-M lithium acetate Chemical compound [Li+].CC([O-])=O XIXADJRWDQXREU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000010841 mRNA extraction Methods 0.000 description 1
- GVALZJMUIHGIMD-UHFFFAOYSA-H magnesium phosphate Chemical compound [Mg+2].[Mg+2].[Mg+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O GVALZJMUIHGIMD-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 239000004137 magnesium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000157 magnesium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960002261 magnesium phosphate Drugs 0.000 description 1
- 235000010994 magnesium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004216 mammary stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 229940099596 manganese sulfate Drugs 0.000 description 1
- 239000011702 manganese sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000007079 manganese sulphate Nutrition 0.000 description 1
- SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L manganese(II) sulfate Chemical compound [Mn+2].[O-]S([O-])(=O)=O SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000037323 metabolic rate Effects 0.000 description 1
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 235000013379 molasses Nutrition 0.000 description 1
- 238000000329 molecular dynamics simulation Methods 0.000 description 1
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 1
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 1
- 229940126619 mouse monoclonal antibody Drugs 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- NUUHFTOLHKDBAV-CKDNLHRZSA-N n-[(2r,3r,4r,6r)-2-[[(3s,4s,5r,6s)-4-[(2s,3r,4r,5s,6r)-3-acetamido-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2s,3r,4s,5r,6r)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-6-[(2r,3s,4r,5r)-5-acetamido-1,2,4-trihydroxy-6-oxohexan-3-yl]oxy-3,5-dihydroxy Chemical compound C1([C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]([C@H]1O)NC(C)=O)OCC1O[C@H]([C@@H]([C@@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O3)O)[C@@H](CO)O2)NC(C)=O)[C@H]1O)O)O[C@@H]([C@H](O)[C@H](C=O)NC(=O)C)[C@H](O)CO)O[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O NUUHFTOLHKDBAV-CKDNLHRZSA-N 0.000 description 1
- PGSADBUBUOPOJS-UHFFFAOYSA-N neutral red Chemical compound Cl.C1=C(C)C(N)=CC2=NC3=CC(N(C)C)=CC=C3N=C21 PGSADBUBUOPOJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 238000011580 nude mouse model Methods 0.000 description 1
- 229960002446 octanoic acid Drugs 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 230000001582 osteoblastic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 101150019841 penP gene Proteins 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 229940066827 pertussis vaccine Drugs 0.000 description 1
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- AAEVYOVXGOFMJO-UHFFFAOYSA-N prometryn Chemical compound CSC1=NC(NC(C)C)=NC(NC(C)C)=N1 AAEVYOVXGOFMJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N propan-1-ol Chemical compound CCCO BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000029983 protein stabilization Effects 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 239000012521 purified sample Substances 0.000 description 1
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 1
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 description 1
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 229930002330 retinoic acid Natural products 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000013606 secretion vector Substances 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 229940098362 serratia marcescens Drugs 0.000 description 1
- 239000012679 serum free medium Substances 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 125000005629 sialic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000011781 sodium selenite Substances 0.000 description 1
- 235000015921 sodium selenite Nutrition 0.000 description 1
- 229960001471 sodium selenite Drugs 0.000 description 1
- YVZWXMAKQLIEOB-UHFFFAOYSA-M sodium;2-[2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetic acid;acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O.OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O YVZWXMAKQLIEOB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 description 1
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L sulfate group Chemical group S(=O)(=O)([O-])[O-] QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- 208000001608 teratocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 108010014765 tomato lectin Proteins 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 239000012581 transferrin Substances 0.000 description 1
- 229960001727 tretinoin Drugs 0.000 description 1
- HHLJUSLZGFYWKW-UHFFFAOYSA-N triethanolamine hydrochloride Chemical compound Cl.OCCN(CCO)CCO HHLJUSLZGFYWKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
- 235000021249 α-casein Nutrition 0.000 description 1
- 235000021247 β-casein Nutrition 0.000 description 1
Images
Description
【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチド、該ポリペプチドの製造法、該ポリペプチドをコードするDNA、該DNAの製造法、該DNAが組み込まれた組換え体ベクター、該組換え体ベクターを含有する形質転換体、該新規ポリペプチドを認識する抗体、該ポリペプチドを用いたポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の製造法、該組換え体ベクターを含有する形質転換体を用いたポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の製造法に関する。
【0002】
【従来の技術】
糖鎖は、発生・分化、細胞認識といった生命現象に関与しているほか、炎症、癌、感染症、自己免疫疾患、およびその他多くの病気の発生、進行に深く関係していると考えられている〔木幡陽・箱守仙一郎・永井克孝編,グリコバイオロジーシリーズ▲1▼〜▲6▼,講談社,(1993年)、Glycobiology, 3, 97 (1993)〕。
糖鎖は、タンパク質や脂質に付加して、糖タンパク質、プロテオグリカン、または糖脂質として存在するほか、オリゴ糖としても存在する。
【0003】
本発明で対象とするポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖は、N-アセチルラクトサミンがβ1,3結合で繰り返し結合した構造〔(Galβ1-4GlcNAcβ1-3)n;nは2以上〕を有する糖鎖で、糖タンパク質のN-グリコシド結合型糖鎖やO-グリコシド結合型糖鎖中に存在するほか、糖脂質の糖鎖中やオリゴ糖中にも存在する。
【0004】
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖は、β1,4-ガラクトース転移酵素とβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素活性が交互に働くことにより合成される。前者のβ1,4-ガラクトース転移酵素の遺伝子は既にクローン化されているが、後者のβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素の遺伝子はこれまでにクローン化されていない。ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素に関しては、これまでに部分精製の報告があるだけで、アミノ酸配列の情報も得られていない〔J. Biol. Chem., 268, 27118 (1993)、J. Biol. Chem., 267, 2994 (1992)、J. Biol. Chem., 263, 12461 (1988)、Jpn. J. Med. Sci. Biol.,42, 77 (1989)〕。
【0005】
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖中のガラクトース残基には、しばしばN-アセチルグルコサミンがβ1,6結合で結合し、Galβ1-4GlcNAcβ1-3(Galβ1-4GlcNAcβ1-6)Galβ1-4GlcNAcのような分岐鎖を有するポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖が合成される。この分岐部分のβ1,6結合したN-アセチルグルコサミンを転移する糖転移酵素がβ1,6-N−アセチルグルコサミン転移酵素(I-branching enzyme)である。本酵素遺伝子も既にクローン化されている。直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖(i抗原)は、抗i抗体により、分岐鎖を有するポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖(I抗原)は、抗I抗体により特異的に認識される〔J. Biol. Chem., 254, 3221 (1979)〕。
【0006】
直鎖型または分岐型のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖上には、フコース、シアル酸、N-アセチルガラクトラクトサミン、ガラクトースなどの糖、または硫酸基などが付加し、細胞特異的あるいは時期特異的に様々な糖鎖(機能性糖鎖、血液型糖鎖、癌関連糖鎖など)が形成される〔木幡陽・箱守仙一郎・永井克孝編,グリコバイオロジーシリーズ▲1▼〜▲6▼,講談社,(1993年)〕。
顆粒球、単球、または活性化T細胞上には、糖鎖の末端にSialyl-Lewis x糖鎖構造を有するポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖が存在していることが知られており、これらの糖鎖は接着分子であるE−セレクチンやP−セレクチンのリガンドとして機能し、これらの白血球が炎症部位へ集積するのに関与していると考えられている〔木幡陽・箱守仙一郎・永井克孝編,グリコバイオロジーシリーズ▲1▼〜▲6▼,講談社,(1993年)〕。
【0007】
また、大腸癌などの癌細胞上にも、末端にSialyl-Lewis x糖鎖やSialyl-Lewisa糖鎖構造を有するポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖が存在していることが知られており、これらの糖鎖もE−セレクチンやP-セレクチンのリガンドとして機能し、癌の転移に関与していることが示唆されている〔木幡陽・箱守仙一郎・永井克孝編,グリコバイオロジーシリーズ▲1▼〜▲6▼,講談社,(1993年)〕。
【0008】
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の構造は、胚発生、細胞分化、または細胞の癌化の過程で変化することが知られている〔木幡陽・箱守仙一郎・永井克孝編,グリコバイオロジーシリーズ▲1▼〜▲6▼,講談社,(1993年)〕。ヒトの胎児の赤血球では直鎖型のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖が発現しているのに対し、成人の赤血球では分岐型のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖が発現する〔木幡陽・箱守仙一郎・永井克孝編、グリコバイオロジーシリーズ▲1▼「糖鎖の多様な世界」、講談社、1993年〕。これら赤血球上のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の末端には、ABO式の血液型抗原が発現している。分岐したポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖のそれぞれの末端に血液型抗原が発現されると多価の抗原となり、血液型糖鎖に対する抗体との結合能は、直鎖型の抗原に比較して103以上も増加する。
【0009】
マウスの初期胚の発生過程においては、一連の糖鎖抗原が規則正しく発現されることが知られている。SSEA-1(stage specific embryonic antigen-1)抗原は、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖末端に存在するLewis x糖鎖〔Galβ1-4(Fucα1-3)GlcNAc〕であるが、この抗原の発現は8細胞期に始まり、桑実胚でピークとなり、胚盤胞期以降は徐々に消失していく〔木幡陽・箱守仙一郎・永井克孝編、グリコバイオロジーシリーズ▲3▼「細胞社会のグリコバイオロジー」、講談社、1993年〕。桑実胚期は、それまで細胞分裂による単純な数的増加を繰り返してきた胚細胞が、初めて分化した「形態」をもった胚盤胞の段階へ移行していく移行期にあたる。桑実胚の細胞は胚盤胞を形成する直前に互いに緊密に寄り集まり、細胞緊密化(cell compaction)を起こす。SSEA-1抗原を有するオリゴ糖を添加すると、この細胞緊密化は阻害され、その後の正常な発生も阻害される〔J. Exp. Med., 160, 1591 (1984)〕。また、マウスのテラトカルシノーマ細胞の接着が、抗SSEA-1抗体により阻害されることも知られている〔木幡陽・箱守仙一郎・永井克孝編、グリコバイオロジーシリーズ▲3▼「細胞社会のグリコバイオロジー」、講談社、1993年〕。以上のことは、SSEA-1抗原が接着分子あるいは糖鎖シグナルとして作用し、初期胚の発生に重要な役割を果たしていることを示している。
【0010】
癌細胞では、対応する正常細胞に比較して、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を多く発現することが知られている〔J. Biol. Chem., 259, 10834 (1984)、J. Biol. Chem., 261, 10772 (1986)、J. Biol. Chem., 266, 1772 (1991)、J. Biol. Chem., 267, 5700 (1992)〕。NIH3T3細胞にN-rasプロトオンコジーンを発現させると、細胞表面のN-結合型糖鎖の分子量が増加し、細胞は浸潤能を獲得するが、この時、N-結合型糖鎖中のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の量が増加するとともに、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するβ1,4-ガラクトース転移酵素とβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素の活性が増加していることが知られている〔J. Biol. Chem., 266, 21674 (1991)〕。
【0011】
ガレクチンは、β-ガラクトシドに親和性を有する一群のレクチンで、細胞の接着や情報伝達に関与し、癌などの疾患との関連も示唆されている〔Trends in Glycoscience and Glycotechnology, 9, 9 (1997)〕。哺乳類ではこれまでに10種類のものが知られている。このうちガレクチン-1および-3は、直鎖上のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖と高親和性で結合することが知られており、それらの糖鎖を含有する特定の糖タンパク質が、これらのガレクチンのリガンドであると推定されている〔Trends in Glycoscience and Glycotechnology, 9, 9 (1997)、Trends in Glycoscience and Glycotechnology, 9, 47 (1997)〕。
末端にシアル酸が付加したポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖は、マイコプラズマや微生物の受容体となっている〔Acta Paediatrica, 82, 903 (1993)〕。
このように、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖は、多くの機能性糖鎖(セレクチンリガンド糖鎖、微生物やウイルスの受容体糖鎖、SSEA-1糖鎖、癌関連糖鎖など)や血液型糖鎖の骨格糖鎖を形成し、それらの糖鎖を効率的に提示するのに重要な役割を果たしている。
Sialyl Lewis x糖鎖を有するポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖は、セレクチンのアンタゴニストとして、抗炎症効果あるいは癌転移抑制効果を有する医薬品となることが期待される。
【0012】
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖上に多価(4個)のSialyl Lewis x(4糖)が結合したオリゴ糖では、多価にしていないSialyl Lewis xオリゴ糖(4糖)に比較して、1/100以下の低濃度でセレクチンアンタゴニストとしての活性を示すことが知られている〔J. Exp. Med., 182, 1133 (1995)、Glycobiology, 6, 65 (1996)、Glycobiology, 7, 453 (1997)、Eur. J. Immunol., 27, 1360 (1997)〕。
これらのオリゴ糖のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖部分の合成には、部分精製されたβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素が利用されたが、この酵素の供給が律速となり、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を多量に合成することは難しい〔Glycobiology, 7, 453 (1997)〕。
【0013】
一方、化学合成によってもポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を合成可能であるが、その合成は非常に煩雑なスッテプを必要とする〔Tetrahedron Letter, 24, 5223 (1997)〕。
以上のことより、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の効率良い合成法が求められている。
【0014】
ヒトの乳中には、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖構造を有する様々なオリゴ糖が存在することが知られている〔Acta Paediatrica, 82, 903 (1993)〕。これらのオリゴ糖には、乳児がウイルスや微生物に感染するのを防ぐ働きや、毒素を中和する働きがあると考えられている。また、善玉の腸内細菌であるビフィズス菌の増殖を促す活性もある。一方、ウシやマウスなどの動物の乳中に存在するオリゴ糖の種類は少なく、大部分がラクトースであり、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を含有するオリゴ糖はほとんど存在しない〔Acta Paediatrica, 82, 903 (1993)、J. Biol. Chem., 270, 29515 (1995)〕。
【0015】
ヒトの乳中に含まれるポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を母核とする様々なオリゴ糖、あるいはそれらが含まれたミルクを効率よく生産することができれば、産業上非常に有用と思われるが、これまでにそのような方法は知られていない。
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖は、糖タンパク質の安定化にも重要である。
【0016】
lysosome associated membrane glycoprotein-1(lamp-1)およびlysosome associated membrane glycoprotein-2(lamp-2)は、リソソームに存在する糖タンパク質(一部は細胞表面にも存在する)で、リソソーム膜の内面をほとんどもれなくおおっている。lamp-1およびlamp-2には多くの糖鎖(いくつかはポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を含む)が付加しており、lamp-1およびlamp-2がリソソーム中の加水分解酵素によって分解されるのを防いでいる。ヒトの前骨芽球系細胞株であるHL-60をジメチルスルフォキシド(dimetyl sulfoxide)で処理すると、顆粒球系の細胞に分化するが、この分化の過程で、lamp-1およびlamp-2に付加するポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の数が増加し、それとともにlamp-1およびlamp-2の代謝速度(分解速度)が低下することが知られている〔J. Biol. Chem., 265, 20476 (1990)〕。
【0017】
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖はタンパク質の安定化に寄与していることから、任意のタンパク質に人為的にポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を付加することにより、タンパク質を安定化できると考えられる。また、血中タンパク質の腎臓からのクリアランス速度は、タンパク質の実効分子量が大きいほど遅くなることから、任意のタンパク質に人為的にポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を付加し、実効分子量を増加させることにより、腎臓からのクリアランス速度を低下させ、血中安定性を増加させることができると考えられる。さらに、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を付加することにより、任意のタンパク質を特定の細胞にターゲティングできる可能性もある。
【0018】
F9細胞をレチノイン酸で処理した場合や、Swiss 3T3細胞をTGF-βで処理した場合に、細胞の膜結合糖タンパク質の糖鎖にポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖が付加することが示されている〔J. Biol. Chem., 268, 1242 (1993)、Biochim.
Biophys. Acta.,1221, 330 (1994)〕。
NIH3T3細胞にN-rasプロトオンコジーンを発現させると、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するβ1,4-ガラクトース転移酵素とβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素の活性が増加し、膜タンパク質のN-結合型糖鎖中のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖量が増加することが知られている〔J. Biol. Chem., 266, 21674 (1991)〕。
【0019】
T細胞株EL-4中でコア2β1,6-N−アセチルグルコサミン転移酵素遺伝子を発現させると、細胞表面の膜タンパク質であるCD43、CD45、またはCD44の分子量が増加する〔J. Biol. Chem., 271, 18732 (1996)〕。これは、コア2β1,6-N−アセチルグルコサミン転移酵素により合成された糖鎖が、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するβ1,3-N−アセチルグルコサミン転移酵素のよい基質となるためと考えられる。
【0020】
また、HL-60細胞を27℃で培養すると、lamp-1またはlamp-2に付加するポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の量が増加することが知られている〔J. Biol. Chem., 266, 23185 (1991)〕。
しかし、組換え糖タンパク質の生産に適した宿主細胞において、上述した方法が有効かどうかは定かではない。したがって、組換え糖タンパク質の生産に適した宿主細胞(例えばNamalwa細胞、Namalwa KJM-1細胞、CHO細胞など)のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成能を増加させる方法の開発は、産業上重要な課題である。
【0021】
上述の炎症反応と癌転移の機構を考慮すると、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の発現を抑制することによって、炎症反応を抑制したり癌転移を防止できることが期待される。しかし、これまでにポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の発現を効率よく抑制する方法は知られていない。
また、炎症性白血球や癌細胞、あるいは血清中でのポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する遺伝子(例えばポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖合成の鍵酵素であるβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素の遺伝子などがあげられる)、またはそれらがコードするポリペプチドの発現を調べることにより、炎症性疾患や癌の悪性度を診断できることが期待される。しかし、これまでにそのような方法は知られていない。
【0022】
【発明が解決しようとする課題】
本発明は、抗炎症、抗感染症、癌転移抑制等の医薬品、乳製品等の食品、および、タンパク質の改善法、炎症性疾患や癌の悪性度の診断法を提供する。
【0023】
【課題を解決するための手段】
本発明は、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチド、該ポリペプチドの製造法、該ポリペプチドをコードするDNA、該DNAの製造法、該DNAを組み込んで得られる組換え体ベクター、該組換え体ベクターを保有する形質転換体、該ポリペプチドを認識する抗体、該DNAあるいは該ポリペプチドを用いるポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の製造法、該DNA、該ポリペプチドあるいは該抗体を用いた炎症または癌等の疾病の診断および治療、該抗体を用いる本発明のポリペプチドの定量法および免疫染色、該ポリぺプチドをコードする遺伝子の発現を変動させる化合物のスクリーニング法、該ポリペプチドの有する活性を変動させる物質のスクリーニング法に関する。
【0024】
以下、本発明を詳細に説明する。
本発明のDNAは、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチドをコードするDNAであり、例えば、配列番号1で表されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするDNA、配列番号1で表されるアミノ酸配列を有するポリペプチドのアミノ酸配列のうち一個以上のアミノ酸が置換、欠失または付加したアミノ酸配列を有し、かつポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するポリペプチドをコードするDNA、または該DNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するポリペプチドをコードするDNAをあげることができる。
【0025】
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチドとしては、例えば、β1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素活性を有するポリペプチドをあげることができる。
ストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なDNAとは、該DNAをプローブとして、コロニー・ハイブリダイゼーション法、プラーク・ハイブリダイゼーション法あるいはサザンブロットハイブリダイゼーション法等を用いることにより得られるDNAを意味し、具体的には、コロニーあるいはプラーク由来のDNAを固定化したフィルターを用いて、0.7〜1.0MのNaCl存在下、65℃でハイブリダイゼーションを行った後、0.1倍〜2倍濃度のSSC溶液(1倍濃度のSSC溶液の組成は、150mM塩化ナトリウム、15mMクエン酸ナトリウムよりなる)を用い、65℃条件下でフィルターを洗浄することにより同定できるDNAをあげることができる。ハイブリダイゼーションは、モレキュラー・クローニング第2版等に記載されている方法に準じて行うことができる。ハイブリダイズ可能なDNAとして具体的には、配列番号1で表されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするDNAの塩基配列と少なくとも60%以上の相同性を有するDNA、好ましくは80%以上の相同性を有するDNA、更に好ましくは95%以上の相同性を有するDNAをあげることができる。
【0026】
本発明のポリペプチドは、上述のDNAによりコードされるポリペプチドをあげることができ、具体的には、配列番号1で表されるアミノ酸配列を有するポリペプチド、あるいは配列番号1で表されるアミノ酸配列を有するポリペプチドのアミノ酸配列のうち一個以上のアミノ酸が置換、欠失または付加したアミノ酸配列を有し、かつポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチドなどをあげることができる。
【0027】
ポリペプチドのアミノ酸配列のうち一個以上のアミノ酸が置換、欠失または付加したアミノ酸配列を有し、かつポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するポリペプチドは、Nucleic Acids Research, 10, 6487 (1982)、Proc. Natl. Acad. Sci., USA,79, 6409(1982)、Proc. Natl. Acad. Sci., USA,81,5662 (1984)、Science,224, 1431 (1984)、PCT WO85/00817(1985)、Nature, 316, 601 (1985)、Gene, 34, 315 (1985)、Nucleic Acids Research, 13, 4431 (1985)、カレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジー(Current Protocols in Molecular Biology), 8章 Mutagenesis of ClonedDNA,John Wiley & Sons,Inc.(1989)等に記載の方法に準じて調製することができる。
本発明の抗体は、上述のポリペプチドを認識する抗体をあげることができる。
【0028】
【発明の実施の形態】
(1)ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するポリペプチドをコードするDNAの製造法
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を発現している細胞より、常法によりcDNAライブラリーを作製する。
【0029】
cDNAライブラリー作製法としては、モレキュラー・クローニング 第2版やカレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジー(Current Protocols in Molecular Biology),サプルメント1〜34(Supplement 1〜34),グリーン・パブリシング・アソシエイツ・アンド・ウェイリーインターサイエンス(Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience),1987-1996年版(以下、カレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジー サプルメント1〜34と略記する)等に記載された方法、あるいは市販のキット、例えばスーパースクリプト・プラスミド・システム・フォー・cDNA・シンセシス・アンド・プラスミド・クローニング〔SuperScript Plasmid System for cDNA Synthesis and Plasmid Cloning;ギブコBRL(Gibco BRL)社製〕やザップ−cDNA・シンセシス・キット〔ZAP-cDNA Synthesis Kit、ストラタジーン社製〕を用いる方法などがあげられる。
【0030】
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を発現している細胞としては、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を発現している細胞であればいかなる細胞でも用いることができ、例えば、ヒト・メラノーマ細胞株WM266-4(ATCC CRL 1676)、ヒト大腸癌細胞株SW1116(ATCC CRL 233)、ヒト単球系細胞株THP-1(ATCC TIB 202)、ヒト単球系細胞株U-937(ATCC CRL 1593)、ヒト顆粒球系細胞株HL-60(ATCC CCL 240)等を用いることができる。
【0031】
cDNAライブラリーを作成するための、クローニングベクターとしては、大腸菌K12株中で自立複製できるものであれば、ファージベクター、プラスミッドベクター等いずれでも使用できる。具体的には、ZAP Express〔ストラタジーン社製、Strategies, 5, 58 (1992)〕、pBluescript II SK(+)〔ヌクレイック・アシッド・リサーチ(Nucleic Acids Research), 17, 9494 (1989)〕、λzap II(ストラタジーン社製)、λgt10、λgt11〔DNAクローニング、ア・プラクティカル・アプローチ(DNA Cloning, A Practical Approach ), 1, 49 (1985)〕、Lambda BlueMid(クローンテック社製)、λExCell(ファルマシア社製)、pT7T3 18U (ファルマシア社製)、pcD2〔モレキュラー・アンド・セルラー・バイオロジー(Mol. Cell. Biol.), 3, 280 (1983)〕、pUC18〔ジーン(Gene), 33, 103 (1985)〕、pAMo〔J.Biol.Chem., 268, 22782-22787 (1993)、別名pAMoPRC3Sc(特開平05-336963)〕等をあげることができる。
【0032】
宿主微生物としては、大腸菌に属する微生物であればいずれでも用いることができる。具体的には、Escherichia coli XL1-Blue MRF'〔ストラタジーン社製、Strategies, 5, 81 (1992)〕、Escherichia coli C600〔Genetics, 39, 440 (1954)〕、Escherichia coli Y1088〔Science,222, 778 (1983)〕、Escherichia co li Y1090〔Science,222, 778 (1983)〕、Escherichia coli NM522〔J. Mol. Biol.,166, 1 (1983)〕、Escherichia coli K802〔J. Mol. Biol.,16, 118 (1966)〕およびEscherichia coli JM105〔Gene, 38, 275 (1985)〕等が用いられる。
【0033】
cDNAライブラリーとしては、WM266-4またはSW1116由来のmRNAよりGIBCO BRL社製のcDNA合成システム(cDNA Synthesis System)キットを用いてcDNAを合成し、該DNAの両末端にSfiIリンカーを付与した後、クローングベクターpAMoのSfiI部位に挿入して作製されたプラスミドを用い、E. coli LE392を形質転換して得られたcDNAライブラリーをあげることができる。
【0034】
該cDNAライブラリーより挿入DNAを切り出し、動物細胞あるいは昆虫細胞で発現できるベクターに組み込む。cDNAライブラリー作製時に、動物細胞あるいは昆虫細胞で発現できるベクターを用いた場合には、該操作を行うことなく、以下に述べる発現ベクターとして利用することができる。
該ベクターとしては、該cDNAを組み込んで発現できるベクターであればいかなるものでも用いることができ、例えば、pcDNAI/Amp、pcDNAI、pCDM8(いずれもフナコシ社より市販)、pAGE107〔特開平3-22979、Cytotechnology, 3, 133 (1990)〕、pREP4(インビトロジェン社製)、pAGE103〔J. Biochem.,101, 1307 (1987)〕、pAMo、pAMoA〔J. Biol. Chem., 268, 22782-22787 (1993)、別名pAMoPRSA(特開平05-336963)〕、pAS3−3(特開平2-227075)、pVL1392(インビトロジェン社製)、pVL1393(インビトロジェン社製)、pBlueBacIII(インビトロジェン社製)等を用いることができる。
【0035】
cDNAライブラリーより切り出されたDNAが組み込まれた発現ベクターを、該発現ベクターを用いて目的とするDNAを発現可能な動物細胞あるいは昆虫細胞に導入し、形質転換細胞を取得する。
該発現ベクターの導入方法としては、動物細胞あるいは昆虫細胞にDNAを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、エレクトロポレーション法〔Cytotechnology, 3, 133 (1990)〕、リン酸カルシウム法(特開平2-227075)、リポフェクション法〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 7413 (1987)〕、Baculovirus Expression Vectors,W.H.Freeman and Company, New York (1992)、Molecular Biology, A Laboratory Manual、Current Protocols in Molecular Biology、Bio/Technology, 6, 47 (1988)等をあげることができる。
【0036】
動物細胞あるいは昆虫細胞としては、ヒトの細胞であるNamalwa細胞、サルの細胞であるCOS細胞、チャイニーズ・ハムスターの細胞であるCHO細胞、HBT5637(特開昭63−299)、Spodopterafrugiperdaの卵巣細胞であるSf9、Sf21〔Baculovirus Expression Vectors (1992)〕、Trichoplusianiの卵巣細胞であるHigh 5(インビトロジェン社製)等を用いることができる。好ましい宿主細胞としては、Namalwa細胞をあげることができる。
【0037】
得られた形質転換細胞を抗ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖抗体またはポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を認識するレクチンを用いて蛍光染色した後、フルオレッセンス・アクティベーテッド・セル・ソーター(Fluorescence Activated Cell Sorter;以下、FACSと略記する)を利用して、直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を認識する抗体またはレクチンの結合量が増加した細胞を濃縮分離する。
【0038】
ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖に対する抗体としては、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖と反応する抗体であれば、いかなるものでも用いることができ、例えば、直鎖上のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を認識する抗体である抗i抗体〔J.Biol.Chem., 254, 3221 (1979)〕をあげることができる。また、抗体の代わりにポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を認識するレクチンを使用することもでき、例えば、Daturastramoniumレクチン(DSA)、Lycopersiconesculentumレクチン(LEA)、Phytolaccaamericana レクチン(PWA)をあげることができる。
【0039】
このようにして濃縮分離された細胞から公知の方法、例えば、ハート法〔Mol. Cell. Biol., 8, 2837 (1988)〕により、本発明のDNAを含むプラスミドを回収し、該DNAを含むDNA断片を取得することができる。
本発明のDNAを含むプラスミドとしては、例えば、pVL1393-iをあげることができる。pVL1393-iを含む大腸菌であるEscherichia coli MM294/pVL1393-iは、平成9年10月16日付で工業技術院生命工学工業技術研究所にFERM BP−6145として寄託されている。
【0040】
上記の方法により取得されたDNAの塩基配列は、該DNA断片をそのままあるいは適当な制限酵素などで切断後常法によりベクターに組み込み、通常用いられる塩基配列解析方法、例えばサンガー(Sanger)らのジデオキシ法〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74, 5463 (1977)〕あるいは373A・DNAシークエンサー〔パーキン・エルマー(Perkin Elmer)社製〕等の塩基配列分析装置を用いて分析することにより決定することができる。
【0041】
該方法により取得されるDNAとして、例えば、配列番号1で表されるペプチドをコードするDNA等をあげることができ、具体的には、配列番号2で表される塩基配列を有するDNA等をあげることができる。
決定されたDNAの塩基配列に基づいて、DNA合成機で化学合成することにより目的とするDNAを調製することもできる。DNA合成機としては、チオホスファイト法を利用した島津製作所社製のDNA合成機、フォスフォアミダイト法を利用したパーキン・エルマー社製のDNA合成機model392等をあげることができる。
【0042】
また、後述のオリゴヌクレオチドをセンスプライマーおよびアンチセンスプライマーとして用い、これらDNAに相補的なmRNAを発現している細胞のmRNAから調製したcDNAを鋳型として、ポリメラーゼ・チェイン・リアクション(Polymerase Chain Reaction;以下、PCRと略記する)〔モレキュラー・クローニング 第2版およびPCRProtocols Academic Press (1990)〕等を行うことによっても、目的とするDNAを調製することができる。
【0043】
上述の方法で取得した本発明のDNAおよびDNA断片を用いて、常法あるいはDNA合成機により、本発明のDNAの一部の配列を有するアンチセンス・オリゴヌクレオチド、センス・オリゴヌクレオチド等のオリゴヌクレオチドを調製することができる。該オリゴヌクレオチドとしては、上記DNAの有する塩基配列中の連続した10〜50塩基と同じ配列を有するDNAまたは該DNAと相補的な配列を有するDNAをあげることができ、具体的には、配列番号2で表される塩基配列を有するDNAの有する塩基配列中の連続した10〜50塩基と同じ配列を有するDNAまたは該DNAと相補的な配列を有するDNAをあげることができる。センスプライマーおよびアンチセンスプライマーとして用いる場合には、両者の融解温度(Tm)および塩基数が極端に変わることのない上記記載のオリゴヌクレオチドが好ましい。
【0044】
該オリゴヌクレオチドも本発明のDNAとしてあげることができる。
更に、これらオリゴヌクレオチドの誘導体も本発明のDNAとしてあげることができる。該誘導体DNAとしては、DNA中のリン酸ジエステル結合がホスフォロチオエート結合に変換された誘導体DNA、DNA中のリン酸ジエステル結合がN3'−P5'ホスフォアミデート結合に変換された誘導体DNA、DNA中のリボースとリン酸ジエステル結合がペプチド核酸結合に変換された誘導体DNA、DNA中のウラシルがC−5プロピニルウラシルで置換された誘導体DNA、DNA中のウラシルがC−5チアゾールウラシルで置換された誘導体DNA、DNA中のシトシンがC−5プロピニルシトシンで置換された誘導体DNA、DNA中のシトシンがフェノキサジン修飾シトシン(phenoxazine-modified cytosine)で置換された誘導体DNA、DNA中のリボースが2'−O−プロピルリボースで置換された誘導体DNA、あるいはDNA中のリボースが2'−メトキシエトキシリボースで置換された誘導体DNA等をあげることができる〔細胞工学, 16, 1463 (1997)〕。
【0045】
(2)ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチドの製造法
上記の方法により得られた本発明のDNAを宿主細胞中で発現させ、本発明のポリペプチドを製造するために、モレキュラー・クローニング 第2版、カレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジー サプルメント1〜34等に記載された方法等を用いることができる。
【0046】
即ち、本発明のDNAを適当な発現ベクターのプロモーター下流に挿入した組換え体ベクターを造成し、該ベクターを宿主細胞に導入することにより、本発明のポリペプチドを発現する形質転換体を取得し、該形質転換体を培養することにより、本発明のポリペプチドを製造することができる。
宿主細胞としては、原核細胞、酵母、動物細胞、昆虫細胞、植物細胞等、目的とする遺伝子を発現できるものであればいずれも用いることができる。また、動物個体や植物個体を用いることができる。
【0047】
発現ベクターとしては、上記宿主細胞において自立複製が可能、または染色体中への組込みが可能で、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する遺伝子の転写に適した位置にプロモーターを含有しているものが用いられる。
細菌等の原核生物を宿主細胞として用いる場合、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する遺伝子の発現ベクターは、原核生物中で自立複製可能であると同時に、プロモーター、リボソーム結合配列、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する遺伝子、転写終結配列、より構成されていることが好ましい。
プロモーターを制御する遺伝子が含まれていてもよい。
【0048】
発現ベクターとしては、例えば、pBTrp2、pBTac1、pBTac2(いずれもベーリンガーマンハイム社より市販)、pSE280(インビトロジェン社製)、pGEMEX−1(Promega社製)、pQE−8(QIAGEN社製)、pKYP10( 特開昭58−110600)、pKYP200〔Agric. Biol. Chem., 48, 669 (1984)〕、pLSA1〔Agric. Biol. Chem., 53, 277 (1989)〕、pGEL1〔Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 82, 4306 (1985)〕、pBluescript II SK(-)(STRATAGENE社)、pBluescript II SK(+)(STRATAGENE社)、pTrs30(FERM BP−5407)、pTrs32(FERM BP−5408)、pGHA2(FERM BP−400)、pGKA2(FERM BP−6798)、pTerm2(特開平3−22979、US4,686,191、US4,939,094、US5,160,735)、pKK233−2(Pharmacia社製)、pGEX(Pharmacia社製)、pETシステム(Novagen社製)、pSupex、pUB110、pTP5、pC194、pTrxFus(Invitrogen社)、pMAL−c2(New England Biolabs社)、pEG400〔J. Bacteriol.,172, 2392 (1990)〕等を例示することができる。
【0049】
プロモーターとしては、大腸菌等の宿主細胞中で機能するものであればいかなるものでもよい。例えば、trpプロモーター(Ptrp)、lacプロモーター(Plac)、PLプロモーター、PRプロモーター、PletIプロモーター、PSEプロモーター等の、大腸菌やファージ等に由来するプロモーター、SPO1プロモーター、SPO2プロモーター、penPプロモーター等をあげることができる。またPtrpを2つ直列させたプロモーター(Ptrpx2)、tacプロモーターのように人為的に設計改変されたプロモーター等も用いることができる。
シャイン−ダルガノ(Shine-Dalgarno)配列と開始コドンとの間を適当な距離(例えば6〜18塩基)に調節したプラスミドを用いることが好ましい。
本発明のDNAの発現には転写終結配列は必ずしも必要ではないが、好適には構造遺伝子直下に転写終結配列を配置することが望ましい。
【0050】
宿主細胞としては、エッシェリヒア属、セラチア属、コリネバクテリウム属、ブレビバクテリウム属、シュードモナス属、バチルス属、ミクロバクテリウム属等に属する微生物をあげることができ、具体的には、Escherichia coli XL1-Blue、Escherichia coli XL2-Blue、Escherichia coli DH1、Escherichia coli MC1000、Escherichia coli KY3276、Escherichia coli W1485、Escherichia coli JM109、Escherichia coli HB101、Escherichia coli No.49、Escherichia coli W3110、Escherichia coli NY49、Escherichia coli GI698、Escherichia coli GI724、Escherichia coli TB1、Bacillussubtilis、Bacillusamyloliquefacines、Brevibacteriumammmoniagenes、Brevibacteriumimmariophilum ATCC14068、Brevibacteriumsaccharolyticum ATCC14066、Brevibacteriumflavum ATCC14067、Brevibacteriumlactofermentum ATCC13869、Corynebacterium glutamicum ATCC13032、Corynebacterium glutamicum ATCC14297、Corynebacterium glutamicum ATCC13869、Corynebacterium acetoacidophilum ATCC13870、Microbacteriumammoniaphilum ATCC15354、Pseudomonas putida、Pseudomonas sp. D-0110、Serratiamarcescens、Serratiaficaria、Serratiafonticola、Serratialiuefaciens等をあげることができる。
【0051】
組換えベクターの導入方法としては、上記宿主細胞へDNAを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、カルシウムイオンを用いる方法〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 69, 2110 (1972)〕、プロトプラスト法(特開昭63-248394)、Gene, 17, 107 (1982)やMolecular & General Genetics, 168, 111 (1979)に記載の方法等をあげることができる。
酵母菌株を宿主細胞として用いる場合には、発現ベクターとして、例えば、YEp13(ATCC37115)、YEp24(ATCC37051)、YCp50(ATCC37419)、pHS19、pHS15等を例示することができる。
【0052】
プロモーターとしては、酵母菌株中で発現できるものであればいかなるものでもよい。例えば、PHO5プロモーター、PGKプロモーター、GAPプロモーター、ADHプロモーター、gal1プロモーター、gal10プロモーター、ヒートショック蛋白質プロモーター、MFα1プロモーター、CUP1プロモーター等のプロモーターをあげることができる。
宿主細胞としては、クルイベロミセス属、サッカロマイセス属、シゾサッカロマイセス属、トリコスポロン属、シワニオミセス属等に属する酵母菌株をあげることができ、具体的には、Saccharomyces cerevisiae、Schizosaccharomyces pombe、Kluyveromyces lactis、Trichosporonpullulans、Schwanniomycesalluvius等をあげることができる。
組換えベクターの導入方法としては、酵母にDNAを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、エレクトロポレーション法〔Methods Enzymol., 194, 182 (1990)〕、スフェロプラスト法〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 1929 (1978)〕、酢酸リチウム法〔J. Bacteriol.,153, 163 (1983)〕、Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 1929 (1978)記載の方法等をあげることができる。
【0053】
動物細胞を宿主細胞として用いる場合には、発現ベクターとして、例えば、pcDNAI、pcDM8(フナコシ社より市販)、pAGE107〔特開平3-22979;Cytotechnology, 3, 133, (1990)〕、pAS3−3(特開平2-227075)、pCDM8〔Nature, 329, 840, (1987)〕、pcDNAI/Amp(Invitrogen社製)、pREP4(Invitrogen社製)、pAGE103〔J. Biochem.,101, 1307 (1987)〕、pAGE210等を例示することができる。
【0054】
プロモーターとしては、動物細胞中で機能するものであればいずれも用いることができ、例えば、サイトメガロウイルス(ヒトCMV)のIE(immediate early)遺伝子のプロモーター、SV40の初期プロモーター、モロニー・ミュリン・ロイケミア・ウイルス(Moloney Murine Leukemia Virus)のロング・ターミナル・リピート・プロモーター(Long Terminal Repeat Promoter)、レトロウイルスのプロモーター、ヒートショックプロモーター、SRαプロモーター、あるいはメタロチオネインのプロモーター等をあげることができる。また、ヒトCMVのIE遺伝子のエンハンサーをプロモーターと共に用いてもよい。 宿主細胞としては、マウス・ミエローマ細胞、ラット・ミエローマ細胞、マウス・ハイブリドーマ細胞、チャイニーズ・ハムスターの細胞であるCHO細胞、BHK細胞、アフリカミドリザル腎臓細胞、ヒトの細胞であるNamalwa細胞、ヒト胎児腎臓細胞、ヒト白血病細胞、HBT5637(特開昭63−299)等をあげることができる。
【0055】
マウス・ミエローマ細胞としては、SP2/0、NSO等、ラット・ミエローマ細胞としてはYB2/0等、ヒト胎児腎臓細胞としてはHEK293(ATCC: CRL-1573)、293等、ヒト白血病細胞としては、BALL-1等、アフリカミドリザル腎臓細胞としてはCOS-1、COS-7等をあげることができる。
組換えベクターの導入方法としては、動物細胞にDNAを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、エレクトロポレーション法〔Cytotechnology, 3, 133 (1990)〕、リン酸カルシウム法(特開平2-227075)、 リポフェクション法〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 7413 (1987)〕、Virology, 52, 456 (1973)に記載の方法等をあげることができる。
【0056】
昆虫細胞を宿主として用いる場合には、例えば、バキュロウイルス・イクスプレッション・ベクターズア・ラボラトリー・マニュアル〔Baculovirus Expression Vectors, A Laboratory Manual, W. H. Freeman and Company, New York (1992)〕、モレキュラー・バイオロジーア・ラボラトリー・マニュアル(Molecular Biology, A Laboratory Manual)、カレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジーサプルメント1-38(Current Protocols in Molecular Biology)、Bio/Technology, 6, 47 (1988)等に記載された方法によって、タンパク質を発現することができる。
【0057】
即ち、組換え遺伝子導入ベクターおよびバキュロウイルスを昆虫細胞に共導入して昆虫細胞培養上清中に組換えウイルスを得た後、さらに組換えウイルスを昆虫細胞に感染させ、タンパク質を発現させることができる。
該方法において用いられる遺伝子導入ベクターとしては、例えば、pVL1392、pVL1393、pBlueBacIII(すべてインビトロジェン社製)等をあげることができる。
【0058】
バキュロウイルスとしては、例えば、夜盗蛾科昆虫に感染するウイルスであるアウトグラファ・カリフォルニカ・ヌクレアー・ポリヘドロシス・ウイルス(Autographa californica nuclear polyhedrosis virus)などを用いることができる。
昆虫細胞としては、Spodopterafrugiperdaの卵巣細胞、Trichoplusianiの卵巣細胞、カイコ卵巣由来の培養細胞等を用いることができる。
【0059】
Spodopterafrugiperdaの卵巣細胞としてはSf9、Sf21(バキュロウイルス・イクスプレッション・ベクターズア・ラボラトリー・マニュアル)等、Trichoplusianiの卵巣細胞としてはHigh 5、BTI-TN-5B1-4(インビトロジェン社製)等、カイコ卵巣由来の培養細胞としてはBombyxmori N4等をあげることができる。組換えウイルスを調製するための、昆虫細胞への上記組換え遺伝子導入ベクターと上記バキュロウイルスの共導入方法としては、例えば、リン酸カルシウム法(特開平2-227075)、リポフェクション法〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 7413 (1987)〕等をあげることができる。
【0060】
また、動物細胞にDNAを導入する方法と同様の方法を用いて、昆虫細胞にDNAを導入することもでき、例えば、エレクトロポレーション法〔Cytotechnology, 3, 133 (1990)〕、リン酸カルシウム法(特開平2-227075)、リポフェクション法〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 7413 (1987)〕等をあげることができる。
植物細胞または植物個体を宿主として用いる場合には、公知の方法〔組織培養, 20 (1994)、組織培養, 21 (1995)、Trends in Biotechnology,15, 45 (1997)〕に準じてタンパク質を生産することができる。
【0061】
遺伝子発現に用いるプロモーターとしては、植物細胞中で発現できるものであればいずれも用いることができ、例えば、カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)の35Sプロモーター、イネアクチン1プロモーター等をあげることができる。また、プロモーターと発現させる遺伝子の間に、トウモロコシのアルコール脱水素酵素遺伝子のイントロン1などを挿入することにより、遺伝子の発現効率をあげることもできる。
【0062】
宿主細胞としては、ポテト、タバコ、トウモロコシ、イネ、アブラナ、大豆、トマト、小麦、大麦、ライ麦、アルファルファ、亜麻などの植物細胞等をあげることができる。
組換えベクターの導入方法としては、植物細胞にDNAを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、アグロバクテリウム(Agrobacterium)、エレクトロポレーション法〔Cytotechnology, 3, 133 (1990)〕、パーティクルガン(遺伝子銃)を用いる方法等をあげることができる。
【0063】
遺伝子を導入した植物の細胞や器官は、ジャーファーメンターを用いて大量培養することができる。また、遺伝子導入した植物細胞を再分化させることにより、遺伝子が導入された植物個体(トランスジェニック植物)を造成することもできる。
動物個体を用いて本発明のタンパク質を生産することもできる。例えば、公知の方法〔American Journal of Clinical Nutrition, 63, 639S (1996)、American Journal of Clinical Nutrition, 63, 627S (1996)、Bio/Technology, 9, 830 (1991)〕に準じて、遺伝子を導入した動物中に本発明のタンパク質を生産することができる。
【0064】
プロモーターとしては、動物で発現できるものであればいずれも用いることができるが、例えば、乳腺細胞特異的なプロモーターであるαカゼインプロモーター、βカゼインプロモーター、βラクトグロブリンプロモーター、ホエー酸性プロテインプロモーター等が好適に用いられる。
本発明のポリペプチドをコードするDNAを組み込んだ組換え体ベクターを保有する形質転換体を、通常の培養方法に従って培養し、該ポリペプチドを生成蓄積させ、該培養物より該ポリペプチドを採取することにより、該ポリペプチドを製造することができる。
【0065】
形質転換体が動物個体または植物個体の場合は、通常の方法に従って、飼育または栽培し、該ポリペプチドを生成蓄積させ、該動物個体または植物個体より該ポリペプチドを採取することにより、該ポリペプチドを製造することができる。即ち、動物個体の場合、例えば、本発明のDNAを保有する非ヒトトランスジェニック動物を飼育し、該組換え体DNAのコードするポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチドを該動物中に生成・蓄積させ、該動物中より該ポリペプチドを採取することにより、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチドを製造することができる。該動物中の生成・蓄積場所としては、例えば、該動物のミルク、卵等をあげることができる。
【0066】
植物個体の場合、例えば、本発明のDNAを保有するトランスジェニック植物を栽培し、該組換え体DNAのコードするポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチドを該植物中に生成蓄積させ、該植物中より該ポリペプチドを採取することにより、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチドを製造することができる。
本発明のポリペプチド製造用形質転換体が大腸菌等の原核生物、酵母菌等の真核生物である場合、これら生物を培養する培地は、該生物が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、形質転換体の培養を効率的に行える培地であれば天然培地、合成培地のいずれでもよい。
【0067】
炭素源としては、それぞれの微生物が資化し得るものであればよく、グルコース、フラクトース、スクロース、これらを含有する糖蜜、デンプンあるいはデンプン加水分解物等の炭水化物、酢酸、プロピオン酸等の有機酸、エタノール、プロパノールなどのアルコール類が用いられる。
窒素源としては、アンモニア、塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、酢酸アンモニウム、リン酸アンモニウム等の各種無機酸や有機酸のアンモニウム塩、その他含窒素化合物、並びに、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、コーンスチープリカー、カゼイン加水分解物、大豆粕および大豆粕加水分解物、各種発酵菌体およびその消化物等が用いられる。
【0068】
無機塩としては、リン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸第一鉄、硫酸マンガン、硫酸銅、炭酸カルシウム等が用いられる。 培養は、振盪培養または深部通気攪拌培養などの好気的条件下で行う。培養温度は15〜40℃がよく、培養時間は、通常16時間〜7日間である。培養中pHは、3.0〜9.0に保持する。培地のpHの調整は、無機あるいは有機の酸、アルカリ溶液、尿素、炭酸カルシウム、アンモニアなどを用いて行う。
【0069】
また培養中必要に応じて、アンピシリンやテトラサイクリン等の抗生物質を培地に添加してもよい。
プロモーターとして誘導性のプロモーターを用いた発現ベクターで形質転換した微生物を培養するときには、必要に応じてインデューサーを培地に添加してもよい。
例えば、lacプロモーターを用いた発現ベクターで形質転換した微生物を培養するときにはイソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド(IPTG)等を、trpプロモーターを用いた発現ベクターで形質転換した微生物を培養するときにはインドールアクリル酸(IAA)等を培地に添加してもよい。
【0070】
本発明のポリペプチド製造用形質転換体が動物細胞である場合、該細胞を培養する培地は、一般に使用されているRPMI1640培地〔The Journal of the American Medical Association,199, 519 (1967)〕、EagleのMEM培地〔Science,122, 501 (1952)〕、DMEM培地〔Virology, 8, 396 (1959)〕、199培地〔Proceeding of the Society for the Biological Medicine,73, 1 (1950)〕またはこれら培地に牛胎児血清等を添加した培地等が用いられる。
【0071】
培養は、通常pH6〜8、30〜40℃、5%CO2存在下等の条件下で1〜7日間行う。
また培養中必要に応じて、カナマイシン、ペニシリン等の抗生物質を培地に添加してもよい。
昆虫細胞を宿主細胞として得られた形質転換体を培養する培地としては、一般に使用されているTNM−FH培地〔ファーミンジェン(Pharmingen)社製〕、Sf-900 II SFM培地(Life Technologies社製)、ExCell400、ExCell405〔いずれもJRHバイオサイエンシーズ(JRH Biosciences)社製〕、Grace's Insect Medium〔Grace, T.C.C.,ネイチャー(Nature), 195, 788 (1962)〕等を用いることができる。
【0072】
pH6〜7、培養温度25〜30℃がよく、培養時間は、通常1〜5日間である。
また、培養中必要に応じて、ゲンタマイシン等の抗生物質を培地に添加してもよい。
遺伝子の発現方法としては、直接発現以外に、モレキュラー・クローニング第2版に記載されている方法等に準じて、分泌生産、融合タンパク質発現等を行うことができる。
【0073】
本発明のポリペプチドの生産方法としては、宿主細胞内に生産させる方法、宿主細胞外に分泌させる方法、あるいは宿主細胞外膜上に生産させる方法があり、使用する宿主細胞や、生産させるポリペプチドの構造を変えることにより、該方法を選択することができる。
本発明のポリペプチドが宿主細胞内あるいは宿主細胞外膜上に生産される場合、ポールソンらの方法〔J. Biol. Chem.,264, 17619 (1989)〕、ロウらの方法〔Proc. Natl. Acad. Sci., USA,86, 8227 (1989)、Genes Develop., 4, 1288(1990)〕、または特開平05-336963、特開平06-823021等に記載の方法を準用することにより、該ポリペプチドを宿主細胞外に積極的に分泌させることができる。
【0074】
すなわち、遺伝子組換えの手法を用いて、本発明のポリペプチドの活性部位を含むポリペプチドの手前にシグナルペプチドを付加した形で発現させることにより、本発明のポリペプチドを宿主細胞外に積極的に分泌させることができる。
また、特開平2-227075に記載されている方法に準じて、ジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子等を用いた遺伝子増幅系を利用して生産量を上昇させることもできる。
本発明ポリペプチド製造用形質転換体の培養物から、本発明のポリペプチドを単離・精製するには、通常の酵素の単離・精製法を用いることができる。
【0075】
例えば、本発明のポリペプチドが本発明のポリペプチド製造用形質転換体の細胞内に溶解状態で蓄積する場合には、培養物を遠心分離することにより、培養物中の細胞を集め、該細胞を洗浄した後に、超音波破砕機、フレンチプレス、マントンガウリンホモゲナイザー、ダイノミル等により細胞を破砕し、無細胞抽出液を得る。
【0076】
該無細胞抽出液を遠心分離することにより得られた上清から、溶媒抽出法、硫安等による塩析法脱塩法、有機溶媒による沈殿法、ジエチルアミノエチル(DEAE)−セファロース、DIAION HPA-75(三菱化成社製)等レジンを用いた陰イオン交換クロマトグラフィー法、S-Sepharose FF(ファルマシア社製)等のレジンを用いた陽イオン交換クロマトグラフィー法、ブチルセファロース、フェニルセファロース等のレジンを用いた疎水性クロマトグラフィー法、分子篩を用いたゲルろ過法、アフィニティークロマトグラフィー法、クロマトフォーカシング法、等電点電気泳動等の電気泳動法等の手法を用い、精製標品を得ることができる。
【0077】
また、該ポリペプチドが細胞内に不溶体を形成して発現した場合は、同様に細胞を回収後破砕し、遠心分離を行うことにより得られた沈殿画分より、通常の方法により該ポリペプチドを回収後、該ポリペプチドの不溶体をポリペプチド変性剤で可溶化する。該可溶化液を、ポリペプチド変性剤を含まないあるいはポリペプチド変性剤の濃度がポリペプチドが変性しない程度に希薄な溶液に希釈、あるいは透析し、該ポリペプチドを正常な立体構造に構成させた後、上記と同様の単離精製法により精製標品を得ることができる。
細胞外に該ポリペプチドが分泌される場合には、該培養物を遠心分離等の手法により処理し、可溶性画分を取得する。該可溶性画分から、上記無細胞抽出液上清からの単離精製法と同様の手法により、該ポリペプチドの精製標品を得ることができる。
【0078】
また、糖転移酵素の精製法を利用することもできる。該精製法として、例えば、β1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素の部分精製に使用された方法〔Methods Enzymol.,83, 458 (1982)、J. Biol. Chem., 268, 27118 (1993)、J. Biol. Chem., 267, 2994 (1992)、J. Biol. Chem., 263, 12461 (1988)、Jpn.J.Med.Sci.Biol, 42, 77 (1989)〕をあげることができる。
【0079】
また、本発明のポリペプチドを他のタンパク質との融合タンパク質として生産し、融合したタンパク質に親和性をもつ物質を用いたアフィニティークロマトグラフィーを利用して精製することもできる。例えば、ロウらの方法〔Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,86, 8227 (1989)、Genes Develop., 4, 1288(1990)〕、特開平05-336963、特開平06-823021に記載の方法に準じて、本発明のポリペプチドをプロテインAとの融合タンパク質として生産し、イムノグロブリンGを用いるアフィニティークロマトグラフィーにより精製することができる。また、本発明のポリペプチドをFlagペプチドとの融合タンパク質として生産し、抗Flag抗体を用いるアフィニティークロマトグラフィーにより精製することができる〔Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,86, 8227 (1989)、Genes Develop., 4, 1288(1990)〕。更に、該ポリペプチド自身に対する抗体を用いたアフィニティークロマトグラフィーで精製することもできる。
【0080】
本発明のポリペプチドがβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素活性を有する場合、公知の測定法〔J. Biol. Chem., 268, 27118 (1993)、J. Biol. Chem., 267, 2994 (1992)、J. Biol. Chem., 263, 12461 (1988)、Jpn. J. Med. Sci. Biol, 42, 77 (1989)〕に準じてβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素の活性を測定することができる。
【0081】
(3)ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖またはその修飾糖鎖が付加した糖タンパク質、糖脂質、またはオリゴ糖の製造法
上述(2)の本発明のポリペプチドを製造できる形質転換体で、糖鎖合成のできる形質転換体を培養液中で培養し、該培養物中にポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を生成・蓄積させ、該培養物中よりポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を採取することにより、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を製造することができる。
培養は上述(2)に準じて行うことができる。
【0082】
形質転換体が糖転移酵素遺伝子(例えばβ1,4−ガラクトース転移酵素遺伝子)を同時に発現する場合には、より効率的にポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、糖脂質またはオリゴ糖を生産できる。
また、本発明のポリペプチドおよび任意の組換え糖タンパク質(例えば医薬用組換えタンパク質)を、形質転換体中で同時に生産させることにより、該組換え糖タンパク質にポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖を付加することができる。
【0083】
更に上記形質転換体が、糖転移酵素遺伝子(例えばβ1,4-ガラクトース転移酵素遺伝子)も同時に発現する場合には、より効率的にポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した組換え糖タンパク質を生産できる。
上記方法により生産されるポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、糖脂質またはオリゴ糖から公知の酵素的手法または化学的手法によりオリゴ糖の一部を切り出すことができる〔日本生化学会編,続生化学実験講座,第4巻,複合糖質研究法I,II,東京化学同人,(1986年)、谷口直之・鈴木明身・古川清・菅原和幸 監修,グリコバイオロジー実験プロトコール,秀潤社,(1996年)〕。
【0084】
本発明のポリペプチドがβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素活性を有するポリペプチドの場合には、該本発明のポリペプチド、UDP-GlcNAc、および、ラクトサミン構造(Galβ1-4GlcNAc構造)を糖鎖の非還元末端に有する糖タンパク質、ラクトサミン構造を糖鎖の非還元末端に有する糖脂質、ラクトサミン構造を糖鎖の非還元末端に有するオリゴ糖およびラクトース(Galβ1-4Glc)から選ばれる受容基質を水性媒体中に存在せしめ、該水性媒体中に、該受容基質のラクトサミン構造の末端にあるガラクトースにβ1,3結合でN-アセチルグルコサミンの付与された反応産物を生成・蓄積させ、該水性媒体中より該反応産物を採取することにより、該受容基質のラクトサミン構造の末端にあるガラクトースにβ1,3結合でN-アセチルグルコサミンの付与された反応産物を製造することができる。
【0085】
さらに、該製造法で得られた生産物、UDP-Galおよびβ1,4-ガラクトース転移酵素を水性媒体中に存在せしめ、該水性媒体中に、該生産物中のN-アセチルグルコサミンにβ1,4結合でガラクトースの付与された反応産物を生成・蓄積させ、該水性媒体中より該反応産物を採取することにより、該生産物のN-アセチルグルコサミンにβ1,4結合でガラクトースの付与された反応産物を製造法することができる。
【0086】
また、本発明のポリペプチド、UDP-GlcNAc、UDP-Gal、β1,4-ガラクトース転移酵素、および、ラクトサミン構造を糖鎖の非還元末端に有する糖タンパク質、ラクトサミン構造を糖鎖の非還元末端に有する糖脂質、ラクトサミン構造を糖鎖の非還元末端に有するオリゴ糖およびラクトースから選ばれる受容基質を水性媒体中に存在せしめ、該水性媒体中に、該受容基質のラクトサミン構造の末端にポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖〔(Galβ1-4GlcNAcβ1-3)n;nは2以上〕の付与された反応産物を生成・蓄積させ、該水性媒体中より該反応産物を採取することにより、該受容基質のラクトサミン構造の末端にポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の付与された反応産物を製造することができる。
【0087】
β1,4-ガラクトース転移酵素としては、ウシやヒトのミルクから精製された酵素(Sigma社から市販)や組換え酵素(Calbiochem社から市販)などを利用することができる。
また、動物個体または植物個体を用い、上記(2)の方法に準じて、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を製造することができる。
【0088】
即ち、動物個体の場合、例えば、本発明のDNAを保有する非ヒトトランスジェニック動物を飼育し、該動物中に、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を生成・蓄積させ、該動物中よりポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を採取することにより、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を製造することができる。該動物中の生成・蓄積場所としては、例えば、該動物のミルク、卵等をあげることができる。
【0089】
植物個体の場合、例えば、本発明のDNAを保有するトランスジェニック植物を栽培し、該植物中に、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を生成・蓄積させ、該植物中よりポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を採取することにより、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖タンパク質、ポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖の付加した糖脂質またはポリ-N-アセチルラクトサミンを含有するオリゴ糖を製造することができる。
【0090】
(4)本発明のDANまたはオリゴヌクレオチドを用いた疾患の治療や診断等への利用
本発明のDNAは、アンチセンスRNA/DNA技術〔バイオサイエンスとインダストリー, 50, 322 (1992)、化学, 46, 681 (1991)、Biotechnology,9, 358 (1992)、Trends in Biotechnology,10, 87 (1992) 、Trends in Biotechnology,10, 152 (1992)、細胞工学, 16, 1463 (1997)〕あるいはトリプル・ヘリックス技術〔Trends in Biotechnology,10, 132 (1992)〕を用いた炎症や癌等の疾病の治療、ノーザンハイブリダイゼーション法またはPCR法を用いたそれら疾病の診断に利用することが可能である。
【0091】
例えば、上記(1)記載の本発明のオリゴヌクレオチドまたはその誘導体を投与することにより、本発明のポリペプチドの生産を抑制することができる。
また、本発明のDNAあるいは該DNAより調製した上記オリゴヌクレオチドを用い、ノーザンハイブリダイゼーション法またはPCR法により、本発明のポリペプチドをコードするDNAの発現量を定量することができる。
【0092】
更に、本発明のDNAをプローブとして、公知の方法〔東京大学医科学研究所制癌研究部編、新細胞工学実験プロトコール、秀潤社(1993年)〕を用いて、該遺伝子のプロモーター領域を取得することが可能である。
プロモーター領域としては、哺乳動物細胞において本発明のポリペプチドをコードする遺伝子の転写に関与するすべてのプロモーター領域があげられる。例えば、ヒトメラノーマ細胞、ヒト大腸癌細胞、またはヒト白血球細胞において、本発明のポリペプチドをコードする遺伝子の転写に関与するプロモータ領域をあげることができる。該プロモーターは後述のスクリーニング法に利用することができる。
【0093】
(5)本発明のポリペプチドを認識する抗体の調製
(i)ポリクローナル抗体の調製
上記(2)に記載の方法により取得した本発明のポリペプチドの全長または部分断片精製標品を抗原として用い、適当なアジュバント〔例えば、フロインドの完全アジュバント(Complete Freund's Adjuvant)または、水酸化アルミニウムゲルと百日咳菌ワクチンなど〕とともに、動物に投与することによりポリクローナル抗体を作製することができる。ペプチド合成機で合成した本発明のポリペプチドの部分アミノ酸配列を有するペプチドを抗原として用いることもできる。
【0094】
投与する動物として、ウサギ、ヤギ、3〜20週令のラット、マウス、ハムスター等を用いることができる。
該抗原の投与量は動物1匹当たり50〜100μgが好ましい。
ペプチドを用いる場合は、ペプチドをスカシガイヘモシアニン(keyhole limpet haemocyanin)や牛チログロブリン等のキャリア蛋白に共有結合させたものを抗原とするのが望ましい。
【0095】
該抗原の投与は、1回目の投与の後1〜2週間おきに3〜10回行う。各投与後、3〜7日目に眼底静脈叢より採血し、該血清が免疫に用いた抗原と反応することを酵素免疫測定法〔酵素免疫測定法(ELISA法):医学書院刊 1976年、Antibodies-A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1988)〕等で確認する。
免疫に用いた抗原に対し、該血清が充分な抗体価を示した非ヒトほ乳動物より血清を取得し、該血清を分離、精製することによりポリクローナル抗体を取得することができる。
【0096】
抗体を分離、精製する方法としては、遠心分離、40〜50%飽和硫酸アンモニウムによる塩析、カプリル酸沈殿〔Antibodies,A Laboratory manual,Cold Spring Harbor Laboratory, (1988)〕、またはDEAE−セファロースカラム、陰イオン交換カラム、プロテインAまたはG−カラムあるいはゲル濾過カラム等を用いるクロマトグラフィー等を、単独または組み合わせて処理する方法があげられる。
【0097】
(ii)モノクローナル抗体の作製
(a)抗体産性細胞の調製
免疫に用いた本発明のポリペプチドの部分断片ポリペプチドに対し、その血清が十分な抗体価を示したラットを抗体産生細胞の供給源として供する。
該抗体価を示したラットに抗原物質を最終投与した後3〜7日目に、脾臓を摘出する。
【0098】
該脾臓をMEM培地(日水製薬社製)中で細断し、ピンセットでほぐし、1,200rpmで5分間遠心分離した後、上清を捨てる。
得られた沈殿画分の脾細胞をトリス−塩化アンモニウム緩衝液(pH7.65)で1〜2分間処理し赤血球を除去した後、MEM培地で3回洗浄し、得られた脾細胞を抗体産生細胞として用いる。
【0099】
(b)骨髄腫細胞の調製
骨髄腫細胞としては、マウスまたはラットから取得した株化細胞を使用する。たとえば、8-アザグアニン耐性マウス(BALB/c由来)骨髄腫細胞株P3-X63Ag8-U1(以下、P3−U1と略す)〔Curr. Topics. Microbiol. Immunol.,81, 1 (1978)、Europ. J. Immunol., 6, 511 (1976)〕、SP2/0-Ag14(SP-2)〔Nature, 276, 269 (1978)〕、P3-X63-Ag8653(653)〔J. Immunol.,123, 1548 (1979)]、P3-X63-Ag8(X63)〔Nature, 256, 495 (1975)〕等を用いることができる。これらの細胞株は、8−アザグアニン培地〔RPMI−1640培地にグルタミン(1.5mM)、2−メルカプトエタノール(5×10-5M)、ジェンタマイシン(10μg/ml)および牛胎児血清(FCS)(CSL社製、10%)を加えた培地(以下、正常培地という)に、さらに8−アザグアニン(15μg/ml)を加えた培地〕で継代するが、細胞融合の3〜4日前に正常培地で培養し、融合には該細胞を2×107個以上用いる。
【0100】
(c)ハイブリドーマの作製
(a)で取得した抗体産生細胞と(b)で取得した骨髄腫細胞をMEM培地またはPBS(リン酸二ナトリウム1.83g、リン酸一カリウム0.21g、食塩7.65g、蒸留水1リットル、pH7.2)でよく洗浄し、細胞数が、抗体産生細胞:骨髄腫細胞=5〜10:1になるよう混合し、1,200rpmで5分間遠心分離した後、上清を捨てる。
【0101】
得られた沈澱画分の細胞群をよくほぐし、該細胞群に、攪拌しながら、37℃で、108抗体産生細胞あたり、ポリエチレングライコール−1000(PEG−1000)2g、MEM2mlおよびジメチルスルホキシド(DMSO)0.7mlを混合した溶液を0.2〜1ml添加し、更に1〜2分間毎にMEM培地1〜2mlを数回添加する。
【0102】
添加後、MEM培地を加えて全量が50mlになるように調製する。
該調製液を900rpmで5分間遠心分離後、上清を捨てる。
得られた沈殿画分の細胞を、ゆるやかにほぐした後、メスピペットによる吸込み、吹出しでゆるやかにHAT培地〔正常培地にヒポキサンチン(10-4M)、チミジン(1.5×10-5M)およびアミノプテリン(4×10-7M)を加えた培地〕100ml中に懸濁する。
【0103】
該懸濁液を96穴培養用プレートに100μl/穴ずつ分注し、5%CO2インキュベーター中、37℃で7〜14日間培養する。
培養後、培養上清の一部をとりアンチボディイズ〔Antibodies, A Laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Chapter 14 (1988)〕等に述べられている酵素免疫測定法により、本発明のポリペプチドの部分断片ポリペプチドに特異的に反応するハイブリドーマを選択する。
【0104】
酵素免疫測定法の具体的例として、以下の方法をあげることができる。
免疫の際、抗原に用いた本発明のポリペプチドの部分断片ポリペプチドを適当なプレートにコートし、ハイブリドーマ培養上清もしくは後述の(d)で得られる精製抗体を第一抗体として反応させ、さらに第二抗体としてビオチン、酵素、化学発光物質あるいは放射線化合物等で標識した抗ラットまたは抗マウスイムノグロブリン抗体を反応させた後に標識物質に応じた反応を行ない、本発明のポリペプチドに特異的に反応するものを本発明のポリペプチドモノクローナル抗体を生産するハイブリドーマとして選択する。
【0105】
該ハイブリドーマを用いて、限界希釈法によりクローニングを2回繰り返し〔1回目は、HT培地(HAT培地からアミノプテリンを除いた培地)、2回目は、正常培地を使用する〕、安定して強い抗体価の認められたものを本発明のポリペプチドの抗ポリペプチド抗体産生ハイブリドーマ株として選択する。
【0106】
(d)モノクローナル抗体の調製
プリスタン処理〔2,6,10,14−テトラメチルペンタデカン(Pristane)0.5mlを腹腔内投与し、2週間飼育する〕した8〜10週令のマウスまたはヌードマウスに、(c)で取得した本発明のポリペプチドモノクローナル抗体産生ハイブリドーマ細胞5〜20×106細胞/匹を腹腔内に注射する。10〜21日間でハイブリドーマは腹水癌化する。
【0107】
該腹水癌化したマウスから腹水を採取し、3,000rpmで5分間遠心分離して固形分を除去する。
得られた上清より、ポリクローナル抗体で用いた方法と同様の方法でモノクローナル抗体を精製、取得することができる。また、モノクローナル抗体を生産するハイブリドーマ株の培養上清中からも同様の方法でモノクローナル抗体を精製、取得することができる。
【0108】
抗体のクラスおよびサブクラスの決定は、マウスモノクローナル抗体タイピングキットまたはラットモノクローナル抗体タイピングキットを用いて行う。蛋白質量は、ローリー法あるいは280nmでの吸光度より算出する。
抗体のクラスとは抗体のアイソタイプのことでヒトでは、IgG、IgA、IgM、IgD、IgEがあげられる。サブクラスとは、クラス内のアイソタイプのことで、マウスでは、IgG1、IgG2a、IgG2b、IgG3、ヒトでは、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4があげられる。
【0109】
(6)本発明の抗体の利用
(a)本発明の抗体を用いて、本発明のポリペプチドを検出することができる。具体的にはマイクロタイタープレートを用いるELISA法・蛍光抗体法、ウェスタンブロット法等を用いた検出法に本発明の抗体を用いることができる。
(b)本発明の抗体を用いて、本発明のポリペプチドを発現する細胞の免疫組織染色に利用できる。
(c)本発明の抗体を用いて、炎症または癌等の疾病の診断や治療に利用することができる。
【0110】
(7)スクリーニング法への応用。
本発明のポリペプチドは、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有することから、該ポリペプチドの活性を増強または阻害する化合物を用いて、細胞におけるポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成量を増加または低下させることが可能である。
【0111】
また、該ポリペプチドをコードする遺伝子の転写過程、あるいは転写産物からタンパク質への翻訳過程を促進または抑制する化合物は、該ポリペプチドの発現を制御し、細胞におけるポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成量を制御することが可能である。
上記化合物は、炎症や癌などの疾病の治療や、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に有用である。
該化合物は、以下(a)〜(e)に示す方法により取得可能である。
【0112】
(a)上記(2)で記載した本発明のポリペプチド、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を合成することのできる細胞の抽出液、被験試料、UDP-GlcNAc、UDP-Gal、および受容基質糖鎖(ラクトサミン構造を末端に有する糖鎖)の存在下、公知の方法〔J. Biol. Chem., 268, 27118 (1993)、J. Biol. Chem., 267, 2994 (1992)、J. Biol. Chem., 263, 12461 (1988)、Jpn. J. Med. Sci. Biol, 42, 77 (1989)〕に準じて反応、測定を行い、該反応により生成される生産物の量を増加または低下させる化合物を選択・取得する。
【0113】
(b)本発明のポリペプチドがβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素活性を有するポリペプチドの場合には、上記(2)で記載した方法を用いて調製した該ポリペプチド(該ポリペプチドを発現する形質転換体の細胞抽出液あるいは精製物)を酵素として用い、被験試料の存在下、上述した方法を用いてβ1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素活性を測定し、β1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素活性を増加または低下させる活性を有する化合物を選択・取得する。
【0114】
(c)本発明のポリぺプチドを発現する細胞または上記(2)で記載した形質転換体を、被験試料の存在下、上記(2)で記載の培養法で2時間から1週間培養後、細胞表面のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の量を抗i抗体を用いて測定し、該糖鎖量を増加または低下させる活性を有する化合物を選択・取得する。
抗i抗体を用いた測定法としては、例えば、マイクロタイタープレートを用いるELISA法・蛍光抗体法、ウェスタンブロット法、免疫組織染色等を用いた検出法をあげることができる。
【0115】
(d)本発明のポリぺプチドを発現する細胞を、被験試料の存在下、上記(2)で記載の培養法で2時間から1週間培養後、細胞中の該ポリぺプチド量を、上記(5)で記載した本発明の抗体を用いて測定し、該ポリぺプチド量を増加または低下させる活性を有する化合物を選択・取得する。
本発明の抗体を用いた測定法としては、例えば、マイクロタイタープレートを用いるELISA法・蛍光抗体法、ウェスタンブロット法、免疫組織染色等を用いた検出法をあげることができる。
【0116】
(e)本発明のポリぺプチドを発現する細胞を、被験試料の存在下、上記(2)で記載の培養法で2時間から1週間培養後、細胞中の該ポリぺプチドをコードする遺伝子転写産物の量を、上記(4)で記載したノーザンハイブリダイゼーション法、PCR法等の方法を用いて測定し、該転写産物量を増加または低下させる活性を有する化合物を選択・取得する。
【0117】
(f)上記(4)で取得したプロモーターの下流にレポーター遺伝子を連結したDNAを組み込んだプラスミドを公知の方法により作製し、上記(2)記載の動物細胞に、上記(2)記載の方法に準じて導入し、形質転換体を取得する。該形質転換体を、被験試料の存在下、上記(2)記載の培養法で2時間から1週間培養後、細胞中のレポーター遺伝子の発現量を、公知の方法〔東京大学医科学研究所制癌研究部編, 新細胞工学実験プロトコール, 秀潤社 (1993),Biotechniques,20, 914 (1996)、J. Antibiotics, 49, 453 (1996)、Trends in Biochemical Sciences, 20, 448 (1995)、細胞工学, 16, 581 (1997)〕を用いて測定し、該発現量を増加または低下させる活性を有する化合物を選択・取得する。
レポーター遺伝子としては、例えば、クロラムフェニコール・アセチルトランスフェラーゼ遺伝子、β-ガラクトシダーゼ遺伝子、ルシフェラーゼ遺伝子、グリーン・フルオレッセント・プロテイン(GFP)遺伝子等をあげることができる。
【0118】
【実施例】
以下実施例を示す。遺伝子操作的手法として、特に断らない限りモレキュラー・クローニング第2版に記載された公知の方法を用いた。
【0119】
実施例1 抗i抗体(Den)との反応性を増加させる遺伝子(cDNA)のクローン化
(1)ヒトメラノーマ細胞株WM266-4およびヒト大腸癌細胞株SW1116からのmRNAの取得
1×108個のヒト・メラノーマ細胞株WM266-4(ATCC CRL 1676)およびヒト大腸癌細胞株SW1116(ATCC CRL 233)より、インビトロジェン(Invitrogen)社製のmRNA抽出キットであるファーストトラック(Fast Track;商品番号K1593-02)を用いて、それぞれ約30μgのmRNAを取得した。具体的試薬および方法は、キットに付与されている説明書に従った。
【0120】
(2)WM266-4およびSW1116のcDNAのライブラリーの作製
上記(1)で取得したWM266-4およびSW1116由来のmRNA各々8μg、およびGIBCO BRL社製のcDNA合成システム(cDNA Synthesis System)キットを用い、オリゴdTをプライマーとして2本鎖cDNAを合成した。ただし、逆転写酵素はキットに含まれているMoloney Murine Leukemia Virus (M-MLV) reverse transcriptaseではなく、同社のSuper ScriptTMRNAse H− Reverse Transcriptaseを用いた。
【0121】
これら二本鎖cDNAの両末端に以下の方法でSfiIリンカーを付与した。〔SfiIリンカーの付与〕
配列番号3で示された一本鎖DNAおよび配列番号4で示された一本鎖DNAをアプライド・バイオシステムズ社380A・DNA合成機を用いて合成した。該合成一本鎖DNAをそれぞれ50μgずつ、別々に50mMトリス−HCl(pH7.5)、10mMMgCl2、5mMジチオスレイトール(以下、DTTと略記する)、0.1mMEDTAおよび1mMATPを含む緩衝液(以下、T4キナーゼ緩衝液と略記する)50μlに溶解し、T4ポリヌクレオチドキナーゼ(宝酒造社製)30単位を加えて、37℃で16時間リン酸化反応を行ない、11塩基および8塩基のリンカーを取得した。
【0122】
11塩基のリンカー4μg、8塩基のリンカー2.9μgおよび上記で合成した2本鎖cDNAをT4リガーゼ緩衝液45μlに溶解後、T4DNAリガーゼ1050単位を加え、16℃で16時間反応させ、該二本鎖DNA各々にSfiIリンカーを付与した。
得られた反応液をアガロースゲル電気泳動に供し、それぞれ約1.6kb以上のDNA断片を回収した。
【0123】
また、上記で得られたWM266-4由来のmRNA 8μgを用い、GIBCO BRL社製のcDNA合成システム(cDNA Synthesis System)キットを用いて、ランダムプライマーをプライマーとして2本鎖cDNAを合成した。本合成反応においても、逆転写酵素には同社のSuper ScriptTMRNAse H− Reverse Transcriptaseを用いた。
該cDNAの両末端に、上記と同様の方法でSfiIリンカーを付与後、アガロースゲル電気泳動を行ない、約1.2kb以上のDNA断片を回収した。
【0124】
直接発現クローニングベクター(Expression Cloning Vector)であるpAMo〔J.Biol.Chem., 268, 22782(1993)、別名pAMoPRC3Sc(特開平05-336963)〕24μgを、10mMトリス−HCl(pH7.5)、6mMMgCl2、50mMNaCl、6mM2−メルカプトエタノールからなる緩衝液(以下、Y−50緩衝液と略記する)590μlに溶解後、80単位のSfiI(宝酒造社製、以下、特に断らないかぎり制限酵素は宝酒造社製のものを用いた)を加え、37℃で16時間消化反応を行なった。
【0125】
該反応液に40単位のBamHIを加え、37℃で2時間消化反応を行なった。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供し、約8.8kbのDNA断片を回収した。
上記で調製したSfiIリンカーを付与した3種類のDNA(mRNA8μg由来分)を別々にT4リガーゼ緩衝液250μlに溶解後、それぞれの溶解液に、該約8.8kbのDNA断片2μgおよびT4DNAリガーゼ2000単位を加えて、16℃で16時間結合反応を行なった。
【0126】
反応後、それぞれの反応液にトランスファーRNA(tRNA)5μgを添加し、エタノール沈殿後、得られた沈殿を10mMトリス−HCl(pH8.0)および1mMEDTA(エチレンジアミン4酢酸ナトリウム)からなる緩衝液(以下、TE緩衝液と略記する)20μlに溶解した。
該反応液を用い、エレクトロポーレーション法〔Nucleic Acids Res., 16, 6127(1988)〕により大腸菌LE392株〔モレキュラー・クローニング第2版〕を形質転換し、オリゴdTプライマーを用いたWM266-4由来のDNAを用いた場合には約26万個の、ランダムプライマーを用いたWM266-4由来のDNAを用いた場合には約30万個の、オリゴdTプライマーを用いたSW1116由来のDNAを用いた場合には約48万個のアンピシリン耐性を有する形質転換体を取得し、それぞれのDNA由来のcDNAライブラリーを構築した。
【0127】
(3)抗i抗体(Den)との反応性を増加させる遺伝子(cDNA)のクローン化
上記(2)で取得したcDNAライブラリーごとに、キィアジェン(Qiagen)社製のプラスミド調製キットである/plasmid/maxi kit(商品番号 41031)を用いてプラスミドを調製した。
該プラスミドをエタノール沈殿後、1μg/μlになるようにTE緩衝液に溶解した。
【0128】
該プラスミド溶解液を用いて、リポフェクション法により無血清培地馴化Namalwa細胞(Namalwa KJM-1細胞)〔Cytotechnology, 1, 151 (1988)〕にプラスミドを導入した。プラスミドの導入には、リポフェクチン(Lipofectin:GIBCO BRL社製)を用い、該製品説明書に記載のリポフェクション法に準じた方法を用いた。該方法において、無血清培地としてはペニシリン・ストレプトマイシンを含まないRPMI1640・ITPSGF培地〔7.5%NaHCO3を1/40量、200mML−グルタミン溶液(GIBCO社製)を3%、ペニシリン・ストレプトマイシン溶液(GIBCO社製、5000units/mlペニシリン、5000μg/mlストレプトマイシン)を0.5%、N−2−ヒドロキシエチルピペラジン−N'−2−エタンスルフォニック・アシッド(N-2-hydroxyethylpiperazine-N'-2-ethane-sulfonic acid; HEPES)(10mM)、インシュリン(3μg/ml)、トランスフェリン(5μg/ml)、ピルビン酸ナトリウム(5mM)、亜セレン酸ナトリウム(125nM)、ガラクトース(1mg/ml)を添加したRPMI1640培地(日水製薬社製)〕を用いた。
【0129】
具体的には、ペニシリン・ストレプトマイシンを含まないRPMI1640・ITPSGF培地で1.0×106細胞/mlに調製した細胞懸濁液0.8mlに対し、3.25μlのリポフェクチンと2μgのプラスミドを加え、CO2インキュベーター中(37℃)で終夜培養した。
培養後、6.5mlのRPMI1640・ITPSGF培地を添加し、さらに2日間培養した後、10倍量のRPMI1640・ITPSGF培地とG418(GIBCOBRL社製;終濃度0.5mg/ml)を添加して、さらに10日培養し、安定形質転換細胞を得た。
【0130】
該方法により、オリゴdTプライマーを用いたWM266-4由来cDNAライブラリーに関しては約33μgのプラスミドを、ランダムプライマーを用いたWM266-4由来cDNAライブラリーに関しては約39μgのプラスミドを、オリゴdTプライマーを用いたSW1116由来cDNAライブラリーに関しては約60μgのプラスミドをNamalwa KJM-1細胞に導入し、安定形質転換細胞を得た。
得られた形質転換細胞をライブラリー毎に混合後、直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を認識する抗体である抗i抗体(Den)〔J. Biol. Chem., 254, 3221 (1979)〕を用いた間接蛍光抗体染色に供した。具体的方法を以下に示す。
【0131】
約4×107の安定形質転換細胞を50mlの遠心チューブ(2059チューブ:ファルコン社製)にとり、遠心分離(130×g、10分間)により細胞を集めた。
該細胞を、0.1%のアジ化ナトリウムを含むリン酸緩衝液PBS(A−PBS:8g/lNaCl、0.2g/lKCl、1.15g/lNa2HPO4(無水)、0.2g/lKH2PO4、0.1%アジ化ナトリウム)20mlを用いて洗浄した。
【0132】
該洗浄菌体に、A−PBSで100倍希釈した抗i抗体(Den)を0.5ml加えて懸濁し、4℃で1時間反応させた。
反応後、細胞をA−PBS20mlで1回洗浄した後、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)で蛍光標識した抗ヒトIgM抗体(DAKO社製)をA−PBSで30倍希釈した溶液を300μl加えて懸濁し、4℃で30分間反応させた。
【0133】
反応後、細胞をA−PBSで1回洗浄した後、A−PBS1mlに懸濁し、フルオレッセンス・アクティベーティド・セル・ソーター〔エピックス・エリート・フローサイトメーター(EPICS Elite Flow Cytometer);コールター(COULTER)社製〕を用いて、蛍光強度の高い細胞(上位2.8%)を無菌的に分離回収した(図1)。
【0134】
回収した細胞を、0.5mg/mlのG418を含むRPMI1640・ITPSGF培地で培養し増殖させた後、上記と同様の操作により蛍光強度の高い細胞を無菌的に分離回収した。該操作を再度繰り返し、蛍光強度の高い細胞を分離濃縮した。
2回目の操作では蛍光強度の高い細胞(上位1.3%)を、3回目の操作では蛍光強度の高い細胞(上位1.1%)を分離回収した(図1)。
【0135】
該分離操作により、蛍光強度の増加した細胞、すなわち直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の発現量の増加した細胞を取得した(図1参照)。
該細胞を0.5mg/mlのG418を含むRPMI1640・ITPSGF培地で培養後、約2×106個の細胞からハート法〔Mol. Cell. Biol., 8, 2837(1988)〕によりプラスミドを回収した。
【0136】
該プラスミドを、エレクトロポーレーション法〔Nucleic Acids Res., 16, 6127(1988)〕により大腸菌MC1061A株に導入し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体75個より、クラボ(KURABO)社製のプラスミド自動分離装置PI−100を用いてプラスミドを調製し、それぞれのプラスミドを、制限酵素(HindIIIとAsp718)で切断して挿入されたcDNAの構造を調べた。
【0137】
その結果、取得したプラスミドは18種類に分類された。
該18種類のプラスミドについて、フェノール/クロロホルム(1:1)抽出とエタノール沈澱を行った後、TE緩衝液10μlに溶解し、エレクトロポーレーション法〔Cytotechnology, 3, 133 (1990)〕によりそれぞれのプラスミドをNamalwa KJM−1細胞に導入した。
即ち、1.0〜1.6×106個の細胞(200μl)に対し、上記で調製したプラスミド3μl、またはpAMo(コントロールプラスミド)4μgをそれぞれ導入した後、8mlのRPMI1640・ITPSGF培地に懸濁し、CO2インキュベーターで37℃で24時間培養した。
【0138】
培養後、G418(GIBCOBRL社製)を0.5mg/mlになるように添加して、さらに10〜14日培養し、形質転換細胞を取得した。
得られた形質転換細胞について、抗i抗体(Den)を用いた間接蛍光抗体染色を行なったところ、16−2−12と命名したプラスミドを導入した細胞においては、pAMoを導入した細胞に比較して、抗i抗体(Den)への反応性(ヒストグラムのピーク値)が約7倍に増加していた(図2)。一方、他のプラスミドを導入した形質転換細胞の抗i抗体(Den)への反応性は、コントロールプラスミド(pAMo)を導入した細胞と比較してほとんど変化がみられなかった(図2)。
【0139】
以上の結果より、プラスミド16−2−12中に挿入されているcDNAにより形質転換細胞の抗i抗体(Den)への反応性が増加することが明らかとなった。
抗i抗体(Den)を用いた間接蛍光抗体染色は以下のようにして行なった。
約1×106個の形質転換細胞をマイクロチューブ(1.5ml:エッペンドルフ社製)にとり、遠心分離(550×g、7分間)により細胞を集めた。
【0140】
該細胞をA−PBS0.9mlで洗浄した後、該洗浄細胞に、A−PBSで100倍希釈した抗i抗体(Den)を20μl加えて懸濁し、4℃で1時間反応させた。
【0141】
反応後、細胞をA−PBS0.9mlで1回洗浄した後、FITCで蛍光標識した抗ヒトIgM抗体(DAKO社製)をA−PBSで30倍希釈した溶液を20μl加えて懸濁し、4℃で30分間反応させた。
反応後、細胞をA−PBS0.9mlで1回洗浄した後、A−PBS0.6mlに懸濁し、フルオレッセンス・アクティベーティド・セル・ソーター(FACSCaliber;Becton Dickinson Immunocytometry Systems USA社製)を用いて解析を行なった。また対照実験として、抗i抗体(Den)の代わりにA-PBSを用いて同様の解析を行なった(図2の細線)。
【0142】
(4)プラスミド16−2−12中に挿入されているcDNAの塩基配列の決定(3)で得られたプラスミド16−2−12が含むcDNAの制限酵素地図を作成後、該cDNA由来のDNA断片をpBluescript II SK(+)にサブクローニングし、該cDNAの全塩基配列を決定した。
即ち、キィアジェン(Qiagen)社製のプラスミド調製キットである/plasmid/maxi kit(商品番号 41031)を用いてプラスミド16−2−12を調製し、該プラスミドを種々の制限酵素で切断することにより、該プラスミドが含むcDNAの制限酵素地図を作成した。結果を図3に示す。
【0143】
該プラスミド16−2−12のHindIII-StuI断片(約0.8kb:図3のNo.2断片)およびHindIII-SmaI断片(約0.6kb:図3のNo.12断片)を単離し、pBluescript II SK(+)のHindIII-HincII間にサブクローニングした。また、プラスミド16−2−12のHindIII-SmaI断片(約1.0kb:図3のNo.13断片)を単離し、pBluescript II SK(+)のHindIII-HincII間にサブクローニングした。また、プラスミド16−2−12のHindIII-Asp718断片(約0.6kb:図3のNo.7断片)およびHindIII-Asp718断片(約0.4kb:図3のNo.11断片)を単離し、pBluescript II SK(+)のHindIII-Asp718間にサブクローニングした。また、プラスミド16−2−12のStuI-SacI断片(約0.7kb:図3のNo.19断片)を単離し、pBluescript II SK(+)のSacI-HincII間にサブクローニングした。
【0144】
上記のようにして作製した6種類のサブクローン化プラスミドを鋳型として、それらが含むcDNA断片の塩基配列をパーキンエルマー社のDNAシークエンサー377を用いて決定した。塩基配列の決定は、パーキンエルマー社のキットを使用し、キットの指示に従って行った。その結果をつなぎ合わせることにより、プラスミド16−2−12が含むcDNAの全塩基配列(2011bp)を決定した。
【0145】
該cDNAの塩基配列を配列番号2に示した。
該cDNAは、糖転移酵素に特徴的な構造を有する415アミノ酸からなるポリペプチドをコードしていた。該ポリペプチドはこれまでに構造が明らかになった公知のタンパク質のアミノ酸配列とは相同性を示さなかった。該ポリペプチドのアミノ酸配列を配列番号1に示した。
【0146】
該ポリペプチドは、N末端の8アミノ酸を細胞質側に出し、それに続く28アミノ酸からなる疎水性に富む領域で膜に結合し、残りの大半のC末端部分(触媒部位を含む)をゴルジ体内腔に露出するといった構造をとると考えられる。
以下、該cDNAをiGnTcDNA、該cDNAがコードするタンパク質をiGnTと呼ぶ。
【0147】
実施例2.実施例1で取得したiGnTcDNAの発現プラスミドを導入したNamalwa KJM−1細胞におけるポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成
(1)iGnTcDNAを動物細胞で発現するためのプラスミドpAMo−iの造成(図4)
1μgのpAMoをY−50緩衝液20μlに溶解し、20単位のHindIIIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0148】
反応後、NaClを150mMになるように添加し、20単位のNotIを加え、さらに37℃2時間消化反応を行った。該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約8.7kbのHindIII−NotI処理DNA断片を回収した。
また、実施例1で取得したプラスミド16−2−12を1μg、Y−50緩衝液20μlに溶解し、20単位のHindIIIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0149】
反応後、NaClを150mMになるように添加し、20単位のBstXIを加え、さらに37℃2時間消化反応を行った。該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約0.5kbのHindIII−BstXI処理DNA断片を回収した。
また、プラスミド16−2−12(1μg)を10mMトリス−HCl(pH7.5)、6mMMgCl2、150mMNaCl、6mM2−メルカプトエタノールからなる緩衝液(以下、Y−150緩衝液と略記する)30μlに溶解し、20単位のBstXIと20単位のNotIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約1.5kbのBstXI−NotI処理DNA断片を回収した。
【0150】
上記で取得した約8.7kbのHindIII-NotI処理DNA断片0.02μg、約0.5kbのHindIII−BstXI処理DNA断片0.02μg、および約1.5kbのBstXI−NotI処理DNA断片0.05μgをT4リガーゼ緩衝液20μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行った。
【0151】
該反応液を用いて大腸菌MM294株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離し、その構造を制限酵素消化により確認した。以下、該プラスミドをpAMo−iと呼ぶ(図4)。
【0152】
(2)pAMo−iを導入したNamalwa KJM−1細胞におけるポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成(図5)
プラスミドpAMoおよびpAMo−iをそれぞれ、1μg/μl になるようにTE緩衝液に溶解した後、実施例1の(3)で記載したリポフェクション法により、Namalwa KJM−1細胞に導入し、形質転換細胞を得た。
直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を認識する抗体である抗i抗体(Den)は、非還元末端にシアル酸が付加したポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖は認識しにくいと考えられる〔Roelckeら:Vox Sanguinis,48, 181-183 (1985)〕。そこで、上記で得られた形質転換細胞をシアリダーゼ(sialidase)処理することにより、末端のシアル酸を除去した後に、抗i抗体(Den)を用いて間接蛍光抗体染色を行ない、これらの細胞における直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の発現を調べた。
【0153】
pAMo−iまたはコントロールプラスミドpAMoを導入したNamalwa KJM-1細胞(5×106個)を、20mUのClostridium perfringensのノイラミニダーゼ(neuraminidase、Sigma社製 N 2133)を含む100μlのPBSに懸濁して、37℃で1時間反応することにより、形質転換細胞のシアリダーゼ処理を行った(+sialidase)。対照細胞は、ノイラミニダーゼを含まないPBS中で37℃で1時間反応して調製した(-sialidase)。
これら約1×106個の細胞を、抗i抗体(Den)またはA−PBSを用いて、間接蛍光抗体染色し、直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の発現を調べた。
【0154】
間接蛍光抗体染色は、実施例1の(3)に記載した方法に従って行った。結果を図5に示した。
シアリダーゼ処理により、pAMo−iまたはコントロールプラスミドpAMoを導入したNamalwa KJM-1細胞の抗i抗体(Den)との反応性が増加することより、これらの形質転換細胞が、非還元末端にシアル酸が付加した直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を発現していたことがわかる。
【0155】
コントロールプラスミドpAMoを導入したNamalwa KJM-1細胞において、抗i抗体(Den)で染色した細胞の蛍光強度(図5太線)は、A-PBSで染色した対照細胞の蛍光強度(図5細線)と比較して強いことより、Namalwa KJM-1細胞がもともと直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を発現していることがわかる。
一方、pAMo−iを導入したNamalwa KJM−1細胞の抗i抗体(Den)との反応性は、シアリダーゼ処理および無処理のいずれの条件においても、コントロールプラスミドpAMoを導入したNamalwa KJM−1細胞に比較してさらに強くなっている。
【0156】
このことは、iGnTcDNAをNamalwa KJM−1細胞で発現させることにより、細胞表面の糖タンパク質あるいは糖脂質の糖鎖上に直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖が新たに合成されていることを意味し、更に、iGnTcDNAを発現させた細胞から分泌される糖タンパク質の糖鎖にも、直鎖状のポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖を新たに合成できることが理解できる。
以上のことより、該cDNAを発現させた細胞を宿主として、有用な糖タンパク質を分泌生産することにより、分泌生産される糖タンパク質にポリ-N-アセチルラクトサミンを含有する糖鎖を付与することが可能である。
【0157】
実施例3 Namalwa KJM−1細胞を宿主としたプロテインA融合型iGnTの分泌生産
(1)iGnT分泌発現用プラスミドpAMoA−i52Sの造成(図6、7)クローン化したiGnTはその一次配列から、N末端側の細胞質領域(8アミノ酸)とそれに続く膜結合領域(28アミノ酸)およびC末端の触媒活性を有する領域(379アミノ酸)からなると推定されるため、iGnTのN末端側の細胞質領域と膜結合領域を除去し、該除去領域にヒト顆粒球コロニー刺激因子のシグナル配列ならびに黄色ブドウ球菌(Staphylococcusaureus)のプロテインAのIgG結合領域を付加することによりiGnTの分泌発現を試みた。
【0158】
触媒活性を有すると考えられる領域〔配列番号1の52番目のセリンから415番目のシステインまで〕をコードするDNA領域をPCR法を用いて調製し、下記記載のα1,3-フコース転移酵素(Fuc-TIII)を分泌発現するためのプラスミドであるpAMoA−FT3中のFuc-TIII遺伝子部分を、iGnTの推定触媒領域をコードするDNAで置き換えることにより、iGnTを分泌発現するためのプラスミドpAMoA−i52Sを造成した。
【0159】
pAMoA−FT3は下記の方法で造成した(図6)。
1μgのpAMoAを10mMトリス−HCl(pH7.5)、6mMMgCl2、100mMNaCl、6mM2−メルカプトエタノールからなる緩衝液
(以下、Y−100緩衝液と略記する)20μlに溶解し、20単位のStuIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0160】
反応後、NaClを150mMになるように添加し、20単位のNotIを加え、さらに37℃2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約9.1kbのStuI-NotI処理DNA断片を回収した。
また、pAMo−FT3〔ササキ(Sasaki)ら:ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー(J.Biol.Chem.), 269, 14730-14737(1994)〕2μgをY−100緩衝液20μlに溶解し、20単位のBamHIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0161】
反応後、エタノール沈殿を行い、得られた沈殿を30μlのDNAポリメラーゼI緩衝液に溶かし、6単位の大腸菌DNAポリメラーゼI・クレノー断片を加え、37℃で60分間反応させ、BamHI消化によって生じた5'突出末端を平滑末端に変えた。
反応をフェノール抽出によって止め、クロロホルム抽出とエタノール沈澱を行った後、Y−150緩衝液30μlに溶解し、20単位のNotIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0162】
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約1.8kbのBamHI(平滑末端)-NotI処理DNA断片を回収した。
上記で得た、約9.1kbのStuI−NotI断片0.05μgと約1.8kbのBamHI(平滑末端)−NotI断片0.05μgをT4リガーゼ緩衝液20μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行った。
【0163】
該反応液を用いて大腸菌MM294株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離し、該プラスミドの構造を制限酵素消化により確認した。このプラスミドをpAMoA−FT3と呼ぶ。
【0164】
iGnTを分泌発現するためのプラスミドpAMoA−i52Sを以下の方法で造成した(図7)。
PCR用のプライマーとして、配列番号5で示されるDNA(以下、C12−7と呼ぶ)および配列番号6で示されるDNA(以下、C12−9と呼ぶ)を合成した(サワディー・テクノロジーから購入することも可能)。
C12−7にはBamHIサイトがC12−9にはNotIサイトが導入されるようにデザインされているため、PCRで増幅されたDNA断片はBamHIとNotIで切断した後に、pAMoA−FT3のBamHIサイトとNotIサイト間に組み込むことができる。
【0165】
PCRは、宝酒造社製のキット(GeneAmpTM DNA Amplification Reagent Kit with AmpliTaqTM Recombinant TaqDNA Polymerase)を用いて行った。反応液の調製はキットの方法に従って行い、DNAサーマルサイクラー(PERKIN ELMER CETUSDNA Thermal Cycler;宝酒造社販売)を用いて、94℃-30秒、65℃-1分、72℃-2分の反応を10サイクル行った後、さらに72℃で7分間反応させた。鋳型としては、実施例2で造成したプラスミドpAMo−iを10ng使用した。
【0166】
反応終了後、クロロホルム抽出およびエタノール沈澱を行った後、Y−150緩衝液30μlに溶解し、20単位のBamHIおよび20単位のNotIを加え、37℃で3時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約1.1kbのDNA断片を回収した。
また、上記で得たpAMoA−FT3を1μg、Y−150緩衝液30μlに溶解し、20単位のBamHIとNotIを加え37℃で2時間消化反応を行った。
【0167】
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約9.1kbのBamHI−NotI処理DNA断片を回収した。
上記で取得した、約1.1kbのBamHI−NotI処理DNA断片0.1μgと約9.1kbのBamHI−NotI処理DNA断片0.1μgをT4リガーゼ緩衝液30mlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行った。
【0168】
該反応液を用いて大腸菌MM294をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離し、その構造を制限酵素消化により確認した。このプラスミドをpAMoA−i52Sと呼ぶ。
【0169】
(2)分泌型iGnTのNamalwa KJM-1細胞での発現と分泌型iGnTの取得
コントロールプラスミドpAMoAおよび上記で造成したiGnTの分泌発現用プラスミドpAMoA−i52Sをキィアジェン(Qiagen)社製のプラスミド調製キット(/plasmid/maxi kit;商標番号41031)を用いて調製した。
調製取得したプラスミドはエタノール沈殿の後、1μg/μlになるようにTE緩衝液に溶解した。
溶解後、実施例1で述べたリポフェクション法により、両プラスミドをそれぞれNamalwa KJM-1細胞に導入し、形質転換体を取得した。
【0170】
取得した形質転換体を、G418を0.5mg/ml含むRPMI1640・ITPSGF培地30mlに5×104細胞/mlになるように懸濁し、CO2インキュベーターで37℃、9日間培養した。
培養後、160×g、10分間および1500×g、10分間の条件で遠心分離することにより細胞を除き、上清を回収した。
該培養上清は、−80℃で保存することが可能で、使用時に解凍して用いることができる。
【0171】
プラスミドpAMoA−i52SのコードするiGnTは、黄色ブドウ球菌(Staphylococcusaureus)のプロテインAのIgG結合領域との融合タンパク質として分泌発現されることになるため、IgGセファロース(Sepharose)を用いて、容易に精製が可能である。
上記で取得した培養上清にアジ化ナトリウムを最終濃度0.1%になるように添加した後、製品説明書に従って前処理したIgGセファロース〔ファルマシア(Pharmacia)製〕を30μl添加し、4℃で一晩ゆっくり攪拌した。
【0172】
攪拌後、160×gで10分間、遠心分離することによりIgGセファロースを回収し、該セファロースを50mMトリス−塩酸(pH7.6)、150mM塩化ナトリウム、0.05%Tween20を含む緩衝液1mlで3回洗浄した。
洗浄後、0.5M酢酸緩衝液(酢酸アンモニウムでpHを3.4に調整したもの)30μlでIgGセファロースに吸着したタンパク質を溶出後、160×gで10分間、遠心分離することによりIgGセファロースを除いた。
該溶出液に2Mトリスを9μl添加しpHを7.0に調整した。
【0173】
このようにして調整した溶出液15μlを用いてSDS−PAGEを行なった後、銀染色キットワコー(和光純薬工業社製)を用いて銀染色を行った(図8)。
pAMoA−i52Sを導入したNamalwa KJM-1細胞の培養上清由来の溶出液を使用した際には、約57kDのバンドが確認された。一方、ベクターであるpAMoAを導入したNamalwa KJM-1細胞の培養上清由来の溶出液を使用した際には、約57kDのバンドは検出されなかった。
以上の結果より、分泌型iGnTは、黄色ブドウ球菌のプロテインAのIgG結合領域との融合蛋白質として培養上清中に分泌生産可能であり、該融合タンパク質はIgGセファロースを用いて容易に精製可能であることが示された。
【0174】
実施例4 Namalwa KJM−1細胞を宿主としたFlag融合型iGnTの分泌生産
(1)Flag融合型分泌ベクターpAMoF2の造成(図9)
Flagペプチド(配列番号17)を任意のタンパク質のN末端に付加した形で分泌発現するための分泌ベクターpAMoF2の造成を行った。免疫グロブリンκのシグナル配列およびFlagペプチドをコードするDNAは、6種の合成DNAを用いて作製した。
【0175】
1μgのpAMoを10mMトリス−HCl(pH7.5)、6mMMgCl2、80mMNaCl、6mM2−メルカプトエタノールからなる緩衝液(以下、Y−80緩衝液と略記する)20μlに溶解し、20単位のHindIIIと20単位のAsp718を加え、37℃で2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約8.7kbのHindIII−Asp718処理DNA断片を回収した。
【0176】
また別に、HindIII切断部位とAsp718切断部位を連結するためのリンカーとして以下の6種のDNA[IgK−1(配列番号7)、IgK−2(配列番号8)、IgK−3(配列番号9)、IgK−4(配列番号10)、IgK−5(配列番号11)、IgK−6(配列番号12)]を合成した。なお、これらのDNAによって構築されるリンカー中にはPmaCI、StuI、SnaBIの各制限酵素切断部位が組み込まれている。6種のDNAはそれぞれアプライド・バイオシステムズ社380A・DNA合成機を用いて合成した。合成したDNAはそれぞれ0.2μgずつ、T4キナーゼ緩衝液20μlに溶解し、T4ポリヌクレオチドキナーゼ(宝酒造社製、以下同じ)30単位を加えて、37℃で2時間リン酸化反応を行なった。
【0177】
上記で取得した6種のリン酸化合成DNA(各々5ng)と約8.7kbのHindIII-Asp718処理DNA断片0.05μgをT4リガーゼ緩衝液20μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行った。
該反応液を用いて大腸菌MM294株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離し、その構造を制限酵素消化と塩基配列決定により確認した。以下、該プラスミドをpAMoF2と呼ぶ(図9)。
【0178】
(2)Flag融合型iGnT分泌発現用プラスミドpAMoF2−i52Sの造成(図10、11)
クローン化したiGnTはその一次配列から、N末端側の細胞質領域(8アミノ酸)とそれに続く膜結合領域(28アミノ酸)およびC末端の触媒活性を有する領域(379アミノ酸)からなると推定されるため、iGnTのN末端側の細胞質領域と膜結合領域を除去し、該除去領域に免疫グロブリンのシグナル配列ならびにFlagペプチドを付加することによりiGnTの分泌発現を試みた。
【0179】
まず、iGnTの触媒活性を有すると考えられる領域〔配列番号1の52番目のセリンから415番目のシステインまで〕をコードするDNA断片(実施例1で調製)を、T−ベクターであるpT7Blue(R)(Novagen社製)に組み込むことにより、プラスミドpT7B−i52S No.3を造成した。
pT7B−i52S No.3は下記の方法で造成した(図10)。
【0180】
実施例3の(1)で調製した約1.1kbのPCR増幅DNA断片0.1μgと、T−ベクターpT7Blue(R)(Novagen社製)0.02μgをT4リガーゼ緩衝液30μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行った。
該反応液を用いて大腸菌MM294をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離し、その構造を制限酵素消化により確認した。このプラスミドをpT7B−i52S No.3と呼ぶ(図10)。
【0181】
次いで、Flag融合型iGnT分泌発現用プラスミドpAMoF2−i52Sの造成を行った(図11)。
1μgのpAMoF2をY−100緩衝液20μlに溶解し、20単位のStuIと20単位のBanIIIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約7.2kbのStuI-BanIII処理DNA断片を回収した。
また、1μgのpAMoをY−100緩衝液20μlに溶解し、20単位のBanIIIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0182】
反応後、NaClを150mMになるように添加し、20単位のNotIを加え、さらに37℃2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約1.7kbのBanIII-NotI処理DNA断片を回収した。
また、1μgのpT7B−i52S No.3をY−100緩衝液20μlに溶解し、20単位のBamHIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0183】
反応後、エタノール沈殿を行い、得られた沈殿を30μlのDNAポリメラーゼI緩衝液に溶かし、6単位の大腸菌DNAポリメラーゼI・クレノー断片を加え、37℃で60分間反応させ、BamHI消化によって生じた5'突出末端を平滑末端に変えた。
反応をフェノール抽出によって止め、クロロホルム抽出とエタノール沈澱を行った後、Y−150緩衝液30μlに溶解し、20単位のNotIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0184】
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約1.1kbのBamHI(平滑末端)-NotI処理DNA断片を回収した。
上記で得た、7.2kbのStuI-BanIII処理DNA断片0.05μgと約1.7kbのBanIII-NotI処理DNA断片0.01μg、および約1.1kbのBamHI(平滑末端)−NotI断片0.05μgをT4リガーゼ緩衝液20μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行った。
【0185】
該反応液を用いて大腸菌MM294株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離し、該プラスミドの構造を制限酵素消化により確認した。このプラスミドをpAMoF2−i52Sと呼ぶ(図11)。
【0186】
(2)Flag融合型分泌型iGnTのNamalwa KJM-1細胞での発現
コントロールプラスミドpAMoF2および上記で造成したiGnTのFlag融合型分泌発現プラスミドpAMoF2−i52Sをキィアジェン(Qiagen)社製のプラスミド調製キット(/plasmid/maxi kit;商標番号41031)を用いて調製した。
調製取得したプラスミドはエタノール沈殿の後、1μg/μlになるようにTE緩衝液に溶解した。
【0187】
溶解後、実施例1で述べたリポフェクション法により、両プラスミドをそれぞれNamalwa KJM-1細胞に導入し、形質転換体を取得した。
取得した形質転換体を、G418を0.5mg/ml、牛胎児血清を2%含むRPMI1640培地30mlに5×104細胞/mlになるように懸濁し、CO2インキュベーターで37℃、9日間培養した。
【0188】
培養後、160×g、10分間および1500×g、10分間の条件で遠心分離することにより細胞を除き、上清を回収した。
該培養上清は、−80℃で保存することが可能で、使用時に解凍して用いることができる。
プラスミドpAMoF2−i52SのコードするiGnTは、Flagペプチドとの融合タンパク質として分泌発現されることになるため、抗Flag M1アフィニティーゲル(Anti-Flag M1 Affinity Gel;コスモ・バイオ社)を用いて、容易に精製が可能である。
【0189】
上記で取得した培養上清にアジ化ナトリウム、塩化ナトリウム、および塩化カルシウムを、それぞれ最終濃度0.1%、150mM、および2mMになるように添加した後、抗Flag M1アフィニティーゲル(Anti-Flag M1 Affinity Gel;コスモ・バイオ社)を30μl添加し、4℃で一晩ゆっくり攪拌した。
攪拌後、160×gで10分間、遠心分離することにより抗Flag M1アフィニティーゲルを回収し、該ゲルを50mMトリス−塩酸(pH7.4)、150mM塩化ナトリウム、1mM塩化カルシウムを含む緩衝液1mlで2回洗浄した。
【0190】
洗浄後、該ゲルに50mMトリス−塩酸(pH7.4)、150mM塩化ナトリウム、2mMEDTAを含む緩衝液30μlを添加し、4℃で30分間処理することにより、ゲルに吸着したタンパク質を溶出した。その後、160×gで10分間遠心分離することにより上清を取得した。該ゲルに再度50mMトリス−塩酸(pH7.4)、150mM塩化ナトリウム、2mMEDTAを含む緩衝液30μlを添加し、4℃で10分間処理した後、160×gで10分間遠心分離することにより上清を取得した。その後、上記の操作を再度行い、合計3回溶出操作を行った。
該溶出液には、最終濃度が4mMになるように1M塩化カルシウムを添加した。
【0191】
このようにして調整した1回目の溶出液の15μlを用いてSDS−PAGEを行なった後、銀染色キットワコー(和光純薬工業社製)を用いて銀染色を行った(図12)。
pAMoF2−i52Sを導入したNamalwa KJM-1細胞の培養上清由来の溶出液を使用した際には、約49kDのバンドが確認された。一方、ベクターであるpAMoF2を導入したNamalwa KJM-1細胞の培養上清由来の溶出液を使用した際には、約49kDのバンドは検出されなかった。
以上の結果より、Flag融合型iGnTが培養上清中に分泌生産され、抗FlagM1アフィニティーゲルを用いて精製可能であることが示された。
【0192】
実施例5 昆虫細胞を宿主としたiGnT生産用組換えウイルス溶液の調製
(1)iGnTを昆虫細胞で発現するための組換えウィルスの作製
目的タンパク質をコードするDNAをトランスファーベクターと呼ばれる特殊なプラスミドに組み込む工程(工程1)と、工程1で作製した目的DNAを組み込んだトランスファーベクターと野生型ウィルスとを昆虫細胞にコトランスフェクションし、相同組み換えにより組換えウィルスを取得する工程(工程2)の2工程で、組換えウィルスを作製した。
該工程は、ファーミンジェン社製バキュロゴールドスターターキット(製品番号PM-21001K)を用い、該キットのマニュアルに従い以下の手順で行った。
【0193】
(工程1)iGnTcDNAのトランスファーベクターへの組み込み(図13)
トランスファーベクターpVL1393に存在するマルチクローニングサイトのSmaIサイトとBglIIサイトの間に、iGnTcDNAを組み込んだプラスミドpVL1393−iの造成を行った。
1μgのpVL1393を、25μlの10mMトリス−HCl(pH7.5)、6mMMgCl2、20mMKCl、6mM2−メルカプトエタノールからなる緩衝液(以下、K−20緩衝液と略記する)に溶解し、20単位のSmaIを加え、37℃で2時間消化反応を行なった。
【0194】
反応後、NaClを80mMになるように添加し、20単位のBstPIを加え、さらに60℃で2時間消化反応を行なった。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約3.2kbのSmaI-BstPI処理DNA断片を回収した。
また、1μgのpVL1393を、25μlのY−80緩衝液に溶解し、20単位のBglIIを加え、37℃で2時間消化反応を行なった。
【0195】
反応後、20単位のBstPIを加え、さらに60℃で2時間消化反応を行なった。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約6.4kbのBglII-BstPI処理DNA断片を回収した。
1μgのpAMo−iを、25μlのY−150緩衝液に溶解し、20単位のBglIIと20単位のEcoRVとを加え、37℃で2時間消化反応を行なった。
【0196】
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約2.0kbのEcoRV-BglII処理DNA断片を回収した。
上記で得られたpVL1393由来の約3.2kbのSmaI-BstPI処理DNA断片0.1μgとpVL1393由来の約6.4kbのBglII-BstPI処理DNA断片0.2μg、およびpAMo−i由来の約2.0kbのEcoRV−BglII処理DNA断片0.2μgをT4リガーゼ緩衝液30μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行なった。
該反応液を用いて大腸菌MM294株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性株を得た。この形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離した。このプラスミドをpVL1393−iと名付け、その構造を制限酵素消化により確認した(図13)。
【0197】
(工程2)組換えウィルスの作製
TNM−FHインセクトメディウム(ファーミンジェン社製)を用いて培養した昆虫細胞Sf9(ファーミンジェン社製)に、線状バキュロウィルスDNA〔バキュロゴールド・バキュロウィルスDNA(BaculoGold baculovirusDNA)、ファーミンジェン社製〕および上記プラスミドpVL1393−iをリポフェクチン法〔蛋白質核酸酵素、37, 2701(1992)〕により導入することにより、以下のようにして組換えバキュロウィルスを作製した。
【0198】
1〜5μgのpVL1393−iおよび15ngの線状バキュロウィルスDNAを12μlの蒸留水に溶解後、リポフェクチン(GIBCO BRL社製)6μl(6μg)と蒸留水6μlとを混和したものを添加し、室温で15分間放置した。
約2×106個のSf9細胞を2mlのSf900−II培地(GIBCO BRL社製)に懸濁し、直径35mmの細胞培養用プラスチックシャーレに入れた後、pVL1393−i、線状バキュロウィルスDNA、およびリポフェクチンの混和溶液全量を添加し、27℃で3日間培養した。
【0199】
該培養液より、組換えウィルスを含む培養上清1mlを採取した。
該培養上清を取得したシャーレには、TNM−FHインセクトメディウムを1ml加え、更に27℃で4日間培養した。培養後、同様にして組換えウィルスを含む培養上清を更に1.5ml取得した。
【0200】
(2)組み換えウィルス溶液の取得
約8×106個のSf9細胞を5mlのSf900−II培地に懸濁し、25cm2フラスコ(グライナー社製)に入れ、室温で30分放置して細胞をフラスコに付着させた後、上清を除き、該フラスコに1mlのSf900−II培地と上記(1)で取得した組換えウィルスを含む培養上清1mlを添加した。
添加後、室温で1時間緩やかに振とうすることにより、細胞とウイルスを十分に接触させた後、TNM−FHインセクトメディウムを4ml加え、27℃で4日間培養した。
【0201】
該培養液を1500×gで10分間遠心分離することにより、組換えウイルスの感染したSf9細胞および組換えウィルス溶液5.5mlを得た。
約2×107個のSf9細胞を15mlのSf900−II培地に懸濁し、75cm2フラスコ(グライナー社製)に入れ、室温で30分放置して細胞をフラスコに付着させた後、上清を除き、該フラスコに5mlのSf900−II培地と上記で取得した組み換えウィルス溶液1mlを添加した。
【0202】
添加後、室温で1時間緩やかに振とうすることにより、細胞とウイルスを十分に接触させた後、TNM−FHインセクトメディウムを10ml加え、27℃で4日間培養した。
該培養液を1500×gで10分間遠心分離することにより、換えウイルスが感染したSf9細胞および組み換えウィルス溶液15mlを得た。
【0203】
該組み換えウィルス溶液のウィルスの力価を以下の方法で算定した〔ファーミンジェン社製バキュロゴールドスターターキット・マニュアル〕。
約6×106個のSf9細胞を4mlのSf900−II培地に懸濁し、直径60mmの細胞培養用プラスチックシャーレに入れ、室温で30分間放置して細胞をシャーレに付着させた後、上清を除き、該シャーレにSf900−II培地400μlおよびSf900−II培地で10-4または10-5に希釈した上記組み換えウィルス溶液100μlを添加した。
【0204】
添加後、該シャーレを室温で1時間緩やかに振とうすることにより、細胞とウイルスを十分に接触させた。
接触後、シャーレより培地を除去し、該シャーレに、2%低融点アガロース〔アガープラーク・アガロース(Agarplaque Agarose);ファーミンジェン社製〕を含む2mlのSf900−II培地(42℃に保温)と、2mlのTNM−FHインセクトメディウム(42℃に保温)の混合液を流し込み、室温で15分間放置した。
【0205】
放置後、乾燥を防ぐために該シャーレにビニルテープをまき、密閉可能なプラスチック製容器に該シャーレを入れ、27℃で5日間培養した。
培養後、該シャーレに0.01%ニュートラルレッドを含むPBS緩衝液1mlを加え、更に1日培養した後、出現したプラークの数を数えた。
以上の操作より該組換えウィルス溶液は約1.2×108プラークフォーミングユニット(PFU)/mlのウィルスを含んでいることがわかった。
また、トランスファーベクターpVL1393を用いて、コントロール用の組換えウイルスと該ウイルスが感染したSf9細胞を調製した。コントロール用の組換えウィルス溶液は約1.4×108プラークフォーミングユニット(PFU)/mlのウィルスを含んでいることがわかった。
【0206】
実施例6 昆虫細胞を宿主としたプロテインA融合型iGnTの分泌生産
実施例3で示したプロテインA融合型iGnTの昆虫細胞での分泌発現を行った。
(1)プロテインA融合型iGnTを昆虫細胞で分泌発現するための組換えウィルスの作製(工程1)プロテインA融合分泌型iGnTをコードするDNAのトランスファーベクターへの組み込み(図14)
トランスファーベクターpVL1393に存在するマルチクローニングサイトのSmaIサイトとNotIサイトの間に、実施例3で示したプロテインA融合分泌型iGnTをコードするDNAを組み込んだプラスミドpVL1393−Ai52Sの造成を行った。
【0207】
1μgのpVL1393を、K−20緩衝液に溶解し、20単位のSmaIを加え、37℃で2時間消化反応を行なった。
反応後、NaClを80mMになるように添加し、20単位のBstPIを加え、さらに60℃で2時間消化反応を行なった。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約3.2kbのSmaI-BstPI処理DNA断片を回収した。
また、1μgのpVL1393を、25μlのY−80緩衝液に溶解し、20単位のBstPIを加え、60℃で2時間消化反応を行なった。
【0208】
反応後、NaClを150mMになるように添加し、20単位のNotIを加え、さらに37℃で2時間消化反応を行なった。
【0209】
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約6.4kbのNotI-BstPI処理DNA断片を回収した。
【0210】
1μgのpAMoA−i52S(実施例3で作製)を、25μlのY−100緩衝液に溶解し、20単位のSalIを加え、37℃で2時間消化反応を行なった。
反応後、エタノール沈殿を行い、得られた沈殿を30μlのDNAポリメラーゼI緩衝液に溶かし、6単位の大腸菌DNAポリメラーゼI・クレノー断片を加え、37℃で60分間反応させ、SalI消化によって生じた5'突出末端を平滑末端に変えた。
【0211】
該反応をフェノール抽出によって止め、クロロホルム抽出とエタノール沈澱を行った後、Y−150緩衝液30μlに溶解し、20単位のNotIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約1.4kbのSalI(平滑末端)-NotI処理DNA断片を回収した。
【0212】
上記で得られたpVL1393由来の約3.2kbのSmaI-BstPI処理DNA断片0.1μgとpVL1393由来の約6.4kbのNotI-BstPI処理DNA断片0.2μg、およびpAMoA−i52S由来の約1.4kbのSalI(平滑末端)-NotI処理DNA断片0.2μgをT4リガーゼ緩衝液30μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行なった。
【0213】
該反応液を用いて大腸菌MM294株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を得た。該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離した。このプラスミドをpVL1393−Ai52Sと名付け、その構造を制限酵素消化により確認した(図14)。
【0214】
(工程2)組換えウィルスの作製
実施例5の(工程2)で示した方法と同様にして、pVL1393−Ai52S由来の組換えバキュロウィルス溶液を1.5ml取得した。
(2)組換えウイルスが感染したSf9細胞と組み換えウィルス溶液の取得
実施例5の(2)で示した方法と同様にして、約8×106個のSf9細胞を上記(1)で取得した組換えウィルスで感染させ、組換えウイルスの感染したSf9細胞および組換えウィルス溶液5.5mlを得た。
【0215】
また、実施例5の(2)で示した方法と同様にして、約2×107個のSf9細胞を上記で取得した組換えウィルスで感染させ、組換えウイルスの感染したSf9細胞および組換えウィルス溶液15mlを得た。
また、トランスファーベクターpVL1393を用いて、コントロール用の組換えウイルスと該ウイルスが感染したSf9細胞を調製した。
【0216】
(3)プロテインA融合型iGnTポリペプチドの分泌生産と精製
プラスミドpVL1393−Ai52S由来の組換えウイルスのコードするiGnTは、黄色ブドウ球菌(Staphylococcusaureus)のプロテインAのIgG結合領域との融合タンパク質として分泌発現されることになるため、IgGセファロース(Sepharose)を用いて、容易に精製が可能である。
約2×107個のSf21細胞を15mlのSf900−II培地に懸濁し、75cm2フラスコ(グライナー社製)に入れ、室温で30分放置して細胞をフラスコに付着させた後、上清を除き、該フラスコに5mlのSf900−II培地と上記(2)で取得した組み換えウィルス溶液1mlを添加した。
【0217】
添加後、室温で1時間緩やかに振とうすることにより、細胞とウイルスを十分に接触させた後、TNM−FHインセクトメディウムを10ml加え、27℃で4日間培養した。
該培養液を1500×gで10分間遠心分離することにより、分泌型iGnTを含むと思われる培養上清を15mlを得た。
上記で取得した培養上清10mlにアジ化ナトリウムを最終濃度0.1%になるように添加した後、製品説明書に従って前処理したIgGセファロース〔ファルマシア(Pharmacia)製〕を100μl添加し、4℃で一晩ゆっくり攪拌した。
【0218】
攪拌後、160×gで10分間、遠心分離することによりIgGセファロースを回収し、該セファロースを50mMトリス−塩酸(pH7.6)、150mM塩化ナトリウム、0.05%Tween20を含む緩衝液1mlで3回洗浄した。
洗浄後、0.5M酢酸緩衝液(酢酸アンモニウムでpHを3.4に調整したもの)100μlでIgGセファロースに吸着したタンパク質を溶出後、160×gで10分間、遠心分離することによりIgGセファロースを除いた。
該溶出液に2Mトリス30μlを添加しpHを7.0に調整した。
【0219】
このようにして調整した溶出液15μlを用いてSDS−PAGEを行った後、クーマジ・ブリリアント・ブルーを用いて染色を行った(図15)。
pVL1393−Ai52S由来の組換えウイルスを感染させたSf21の培養上清から調製した溶出液を使用した際には、約50kDのバンドが確認された。一方、ベクターであるpVL1393由来の組換えウイルスを感染させたSf21の培養上清から調製した溶出液を使用した際には、約50kDのバンドは検出されなかった。
以上の結果より、分泌型iGnTは、黄色ブドウ球菌のプロテインAのIgG結合領域との融合タンパク質として培養上清中に分泌生産可能であり、該分泌タンパク質は、IgGセファロースを用いて精製可能であることが示された。
【0220】
実施例7 昆虫細胞を宿主としたFlagペプチド融合型iGnTの分泌生産
実施例4で示したFlagペプチド融合型iGnTの昆虫細胞での分泌発現を行った。
(1)Flagペプチド融合型iGnTを昆虫細胞で分泌発現するための組換えウィルスの作製(工程1)Flagペプチド融合分泌型iGnTをコードするDNAのトランスファーベクターへの組み込み(図16)
トランスファーベクターpVL1393に存在するマルチクローニングサイトのSmaIサイトとNotIサイトの間に、実施例4で示したFlagペプチド融合分泌型iGnTをコードするDNAを組み込んだプラスミドpVL1393−F2i52Sの造成を行った。
【0221】
実施例4で作製したpAMoF2−i52Sを1μg、25μlのY−80緩衝液に溶解し、20単位のHindIIIを加え、37℃で2時間消化反応を行なった。
反応後、エタノール沈殿を行い、得られた沈殿を30μlのDNAポリメラーゼI緩衝液に溶かし、6単位の大腸菌DNAポリメラーゼI・クレノー断片を加え、37℃で60分間反応させ、HindIII消化によって生じた5'突出末端を平滑末端に変えた。
【0222】
反応をフェノール抽出によって止め、クロロホルム抽出とエタノール沈澱を行った後、Y−150緩衝液30μlに溶解し、20単位のNotIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約1.2kbのHindIII(平滑末端)-NotI処理DNA断片を回収した。
【0223】
上記で得た約1.2kbのHindIII(平滑末端)-NotI処理DNA断片0.2μgと、実施例5の(1)で得たpVL1393由来の約3.2kbのSmaI-BstPI処理DNA断片0.1μg、および実施例5の(1)で得たpVL1393由来の約6.4kbのNotI-BstPI処理DNA断片0.2μgをT4リガーゼ緩衝液30μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行なった。
該反応液を用いて大腸菌MM294株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性株を得た。この形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離した。このプラスミドをpVL1393−F2i52S(図16)と名付け、その構造を制限酵素消化により確認した。
【0224】
(工程2)組換えウィルスの作製
実施例5の(工程2)で示した方法と同様にして、pVL1393−F2i52S由来の組換えバキュロウィルス溶液を1.5ml取得した。
(2)組換えウイルスが感染したSf9細胞と組み換えウィルス溶液の取得
実施例5の(2)で示した方法と同様にして、約8×106個のSf9細胞を上記(1)で取得した組換えウィルスで感染させ、組換えウイルスの感染したSf9細胞および組換えウィルス溶液5.5mlを得た。
実施例5の(2)で示した方法と同様にして、約2×107個のSf9細胞を上記で取得した組換えウィルスで感染させ、組換えウイルスの感染したSf9細胞および組換えウィルス溶液15mlを得た。
また、トランスファーベクターpVL1393を用いて、コントロール用の組換えウイルスと該ウイルスが感染したSf9細胞を調製した。
【0225】
(3)Flagペプチド融合型iGnTポリペプチドの分泌生産と精製
プラスミドpVL1393−F2i52S由来の組換えウイルスのコードするiGnTは、Flagペプチドとの融合タンパク質として分泌発現されることになるため、抗Flag M1アフィニティーゲル(Anti-Flag M1 Affinity Gel;コスモ・バイオ社)を用いて、容易に精製が可能である。
約2×107個のSf21細胞を15mlのSf900−II培地に懸濁し、75cm2フラスコ(グライナー社製)に入れ、室温で30分放置して細胞をフラスコに付着させた後、上清を除き、該フラスコに5mlのSf900−II培地と上記(2)で取得した組み換えウィルス溶液1mlを添加した。
【0226】
添加後、室温で1時間緩やかに振とうすることにより、細胞とウイルスを十分に接触させた後、TNM−FHインセクトメディウムを10ml加え、27℃で4日間培養した。該培養液を1500×gで10分間遠心分離することにより、分泌型iGnTを含むと思われる培養上清を15mlを得た。
上記で取得した培養上清10mlにアジ化ナトリウム、塩化ナトリウム、および塩化カルシウムを、それぞれ最終濃度0.1%、150mM、および2mMになるように添加した後、抗FlagM1アフィニティーゲル(Anti-Flag M1 Affinity Gel;コスモ・バイオ社)を80μl添加し、4℃で一晩ゆっくり攪拌した。
【0227】
攪拌後、160×gで10分間、遠心分離することにより抗Flag M1アフィニティーゲルを回収し、該ゲルを50mMトリス−塩酸(pH7.4)、150mM塩化ナトリウム、1mM塩化カルシウムを含む緩衝液1mlで2回洗浄した。
洗浄後、該ゲルに50mMトリス−塩酸(pH7.4)、150mM塩化ナトリウム、2mMEDTAを含む緩衝液80μlを添加し、4℃で30分間処理することにより、ゲルに吸着したタンパク質を溶出した。その後、160×gで10分間遠心分離することにより上清を取得した。該ゲルに再度50mMトリス−塩酸(pH7.4)、150mM塩化ナトリウム、2mMEDTAを含む緩衝液80μlを添加し、4℃で10分間処理した後、160×gで10分間遠心分離することにより上清を取得した。その後、上記の操作を再度行い、合計3回溶出操作を行った。
【0228】
該溶出液には、最終濃度が4mMになるように1M塩化カルシウムを添加した。
このようにして調整した溶出液の15μlを用いてSDS−PAGEを行った後、クーマジ・ブリリアント・ブルーを用いて染色を行った(図17)。
pVL1393−F2i52S由来の組換えウイルスを感染させたSf21の培養上清から調製した溶出液を使用した際には、約43kDのバンドが確認された。一方、ベクターであるpVL1393由来の組換えウイルスを感染させたSf21の培養上清から調製した溶出液を使用した際には、約43kDのバンドは検出されなかった。
以上の結果より、Flag融合型iGnTが培養上清中に分泌生産され、抗Flag M1アフィニティーゲルを用いて容易に精製可能であることが示された。
【0229】
実施例8 iGnT転写産物のPCR法による定量法の確立と各種細胞における発現量の検討iGnT転写産物の定量は、定量的PCR法〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA.,87, 2725 (1990)〕に従って行った。各種細胞および細胞株におけるiGnT転写産物の量は、いずれの細胞においても同程度発現していると考えられるβ-アクチンの転写産物の量を100とした時の相対値として表示した。
【0230】
(1)スタンダード用プラスミドpBSK+iGnT13の造成(図18)
実施例1の(4)で造成したiGnTcDNAのシークエンス決定用のプラスミドの一つ(pBSK+iGnT13と命名)をスタンダードプラスミドとして用いた。該プラスミドは、プラスミド16−2−12のHindIII-SmaI断片(約1.0kb:図3のNo.13断片)を、pBluescript II SK(+)のHindIII-HincII間にサブクローニングすることによって作製した。該プラスミドの造成法を以下に示す。
【0231】
プラスミド16−2−12を1μg、25μlの10mMトリス−HCl(pH7.5)、6mMMgCl2、60mMKCl、6mM2−メルカプトエタノールからなる緩衝液に溶解し、20単位のHindIIIと20単位のSmaIを加え37℃で2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約1.0kbのHindIII−SmaI処理DNA断片を回収した。
【0232】
pBluescript II SK(+)を1μg、Y−50緩衝液25μlに溶解し、20単位のHindIIIと20単位のHincIIを加え37℃で2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約2.95kbのHindIII−HincII処理DNA断片を回収した。
【0233】
上記で得られた、約1.0kbのHindIII−SmaI処理DNA断片0.1μgおよび約2.95kbのHindIII−HincII処理DNA断片0.05μgをT4リガーゼ緩衝液20μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行った。
該反応液を用いて大腸菌JM105株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離した。
該プラスミドをpBSK+iGnT13と名付け、その構造を制限酵素消化および塩基配列の決定により確認した。該プラスミドの構造を図18に示した。
【0234】
(2)内部コントロール用プラスミドpBSK+iGnT13dの造成(図19)
上記(1)で造成したpBSK+iGnT13に含まれるiGnTcDNA内に欠失変異を有するプラスミドpBSK+iGnT13dの造成を行った。
【0235】
pBSK+iGnT13を1μg、25μlのY−100緩衝液に溶解し、20単位のXhoIと20単位のStuIを加え37℃で2時間消化反応を行った。
【0236】
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約3.1kbのXhoI−StuI処理DNA断片を回収した。
pBSK+iGnT13を1μg、25μlのY−100緩衝液に溶解し、20単位のXhoIと20単位のHincIIを加え37℃で2時間消化反応を行った。
該反応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、約0.6kbのXhoI−HincII処理DNA断片を回収した。
【0237】
上記で得られた、約3.1kbのXhoI−StuI処理DNA断片0.05μgおよび約0.6kbのXhoI−HincII処理DNA断片0.1μgをT4リガーゼ緩衝液20μlに溶解し、T4DNAリガーゼ175単位を加えて、12℃で16時間結合反応を行った。
該反応液を用いて大腸菌MM294株をコーエンらの方法によって形質転換し、アンピシリン耐性を有する形質転換体を取得した。
該形質転換体から公知の方法に従ってプラスミドを単離した。
該プラスミドをpBSK+iGnT13dと名付け、その構造を制限酵素消化により確認した。該プラスミドの構造を図19に示した。
【0238】
(3)定量的PCR法を用いた各種細胞および細胞株におけるiGnT転写産物の定量
(a)各種細胞および細胞株由来の一本鎖cDNA(定量的PCRの鋳型として使用)の合成
細胞株としては、Namalwa KJM-1細胞、WM266-4細胞、THP-1細胞、HL-60細胞、U-937細胞、Colo205細胞、LS180細胞、SW1116細胞およびJurkat細胞を用いた。
【0239】
WM266-4細胞、THP-1細胞、HL-60細胞、U-937細胞、Colo205細胞およびLS180細胞はアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(American Type Culture Collection;ATCC)より入手した。また、SW1116細胞(ATCCより入手可能)およびJurkat細胞(理研ジーンバンク;RIKEN GENE BANKより入手可能)は愛知県がんセンターの高橋博士より入手した。
【0240】
また、健康な成人の末梢血よりナイコメッド・ファーマ(Nycomed Pharma)社製のキットであるPolymorphprepTMを用いて多形核白血球と単核球を分離取得した。
取得した単核球は常法〔J. Immunol.,130, 706 (1983)〕に従ってさらに単球およびリンパ球に分離して取得した。
各細胞の全RNAは常法〔Biochemistry, 18, 5294 (1977)〕に従って調製した。
【0241】
全RNAから一本鎖cDNAの合成はキット(SUPERSCRIPTTM Preamplification System;BRL社製)を用いて行った。
細胞株については5μgの全RNAから、血球細胞については、1μgの全RNAから一本鎖cDNAを合成し、それぞれ水で50倍および10倍希釈してPCRの鋳型として使用した。
【0242】
(b)定量的PCR用のスタンダードおよび内部コントロールの調製
上記(1)および(2)で取得したpBSK+iGnT13およびpBSK+iGnT13dをcDNA部分を切り出す制限酵素で切断して直鎖状DNAに変換した後、それぞれiGnT転写産物定量用のスタンダードおよび内部コントロールとして用いた。
BSK+iGnT13およびpBSK+iGnT13dをそれぞれ1μgずつY−100緩衝液36μlに溶解し、20単位のXhoIおよび20単位のBamHIを加え、37℃で2時間消化反応を行った。
【0243】
該反応液の一部10μlをアガロースゲル電気泳動に供し、完全に切断された事を確認後、酵母のトランスファーRNAを1μg/ml含む水で段階的に希釈して使用した。
β−アクチンの転写産物定量用のスタンダードとして、pUC119−ACTをcDNA部分を切り出す制限酵素(HindIIIとAsp718)で切断して直鎖状DNAに変換したものを用いた〔J. Biol. Chem., 269, 14730 (1994)、特開平06-181759〕。
【0244】
β-アクチンの転写産物定量用の内部コントロールとしては、pUC119−ACTdをcDNA部分を切り出す制限酵素(HindIIIとAsp718)で切断して直鎖状DNAに変換したものを用いた〔J. Biol. Chem., 269, 14730 (1994)、特開平06-181759〕。
【0245】
(c)定量的PCR法を用いたiGnT転写産物の定量
(b)で調製した内部コントロール(XhoIおよびBamHIで切断したpBSK+iGnT13d)5fgの存在下で、(a)で調製した各種細胞および細胞株由来の一本鎖cDNAを鋳型としてPCRを行った。
PCR用のプライマーとして、配列番号13に示されたDNA(以下、C12−3と略す)および配列番号14に示されたDNA(以下、C12−4と略す)を合成した(サワデー・テクノロジーから購入することも可能)。
【0246】
PCR反応は、宝酒造社製のキット(GeneAmpTM DNA Amplification Reagent Kit with AmpliTaqTM Recombinant TaqDNA Polymerase)を用いて行った。
反応液の調製はキットの方法に従った。その際、ジメチルスルホキシド(dimethyl sulfoxide)を最終濃度が5%になるように加えた。
【0247】
Taq DNAポリメラーゼ以外を加えた反応液29μlをパーキン・エルマー・シータス社のサーマル・サイクラー(PERKIN ELMER CETUS DNA Thermal Cycler;宝酒造社が販売)を用いて、97℃で5分間処理した後、氷中で急冷した。
【0248】
急冷後、該反応液に6.7分の1に希釈したTaq DNAポリメラーゼ1μlを加え、パーキン・エルマー・シータス社のサーマル・サイクラーを用いて、94℃−30秒間、60℃−1分間、72℃−2分間の反応を27サイクル行った。
【0249】
該反応液の一部7μlをアガロースゲル電気泳動に供した後、ゲルをSYBR Green I nucleic acid stain(Molecular Probes社製)で染色した。増幅されたDNA断片のパターンをフルオロイメージャー(FluorImager SI; Molecular Dynamics社製)で解析することにより、増幅されたDNA断片の量を測定した。
また、各種細胞および細胞株由来の一本鎖cDNAのかわりに、(b)で調製したスタンダード(XhoIおよびBamHIで切断したpBSK+iGnT13)を鋳型として同様にPCRを行い、検量線を作成した。
【0250】
iGnT転写産物およびスタンダード由来のDNA断片の大きさは615bp、内部コントロール由来のDNA断片の大きさは416bpであり、両者のDNA断片の量比からiGnT転写産物の量(モル数)を算出した。より正確な転写産物の定量を行なうため、上記のようにして求めた転写産物の量に近い量の内部コントロールを用いて、再度それぞれのサンプルについて同様のPCRを行った。PCRのサイクル数は内部コントロールの量に応じて変化させた。
【0251】
βーアクチンの転写産物の定量についても同様に2段階のPCRにより行った。内部コントロールとしては(b)で述べたHindIIIおよびAsp718で切断したpUC119−ACTdを、スタンダードとしては(b)で述べたHindIIIおよびAsp718で切断したpUC119−ACTを用いた。
PCR用のプライマーとして、配列番号15に示したDNA(以下、Ac−1と略す)および配列番号16に示したDNA(以下、Ac−3と略す)をアプライド・バイオシステムズ社380A・DNA合成機を用いて合成したものを使用した。
【0252】
1回目のPCRは内部コントロールを10pg用いて、サイクル数17で行った。
β−アクチンの場合は、PCR反応液にジメチルスルホキシドは加えなかった。iGnT転写産物の最終的な発現量は、βーアクチンの転写産物の量を100としたときの相対値(%)として求めた。
結果を第1表に示す。
上記方法によりiGnTの転写量を測定できることが示された。
【0253】
【表1】
【0254】
【発明の効果】
本発明により、ポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与する活性を有するポリペプチド、該ポリペプチドの製造法、該ポリペプチドをコードするDNA、該DNAの製造法、該DNAを組み込んで得られる組換え体ベクター、該組換え体ベクターを保有する形質転換体、該ポリペプチドを認識する抗体、該DNAあるいは該ポリペプチドを用いるポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の製造法、該DNA、該ポリペプチドあるいは該抗体を用いた炎症または癌転移の疾病の診断および治療、該抗体を用いる本発明のポリペプチドの定量法および免疫染色、該ポリぺプチドをコードする遺伝子の発現を変動させる化合物のスクリーニング法、該ポリペプチドの有する活性を変動させる物質のスクリーニング法を提供することができる。
【0255】
【配列表】
【0256】
【配列表フリーテキスト】
配列番号3−人工配列の説明:合成DNA
配列番号4−人工配列の説明:合成DNA
配列番号5−人工配列の説明:合成DNA
配列番号6−人工配列の説明:合成DNA
配列番号7−人工配列の説明:合成DNA
配列番号8−人工配列の説明:合成DNA
配列番号9−人工配列の説明:合成DNA
配列番号10−人工配列の説明:合成DNA
配列番号11−人工配列の説明:合成DNA
配列番号12−人工配列の説明:合成DNA
配列番号13−人工配列の説明:合成DNA
配列番号14−人工配列の説明:合成DNA
配列番号15−人工配列の説明:合成DNA
配列番号16−人工配列の説明:合成DNA
配列番号17−人工配列の説明:市販のアミノ酸配列
【図面の簡単な説明】
【図1】発現クローニングの過程を示したものである。WM266-4およびSW1116由来のcDNAライブラリーを導入したNamalwa KJM-1細胞を、抗i抗体を用いて蛍光染色した後、FACSに供し、抗i抗体との反応性が高い細胞を集めた。バーで示した部分の細胞を集め、次のFACSに供した。3回のFACSの後、抗i抗体との反応性が高い細胞が濃縮された。
【図2】抗i抗体との反応性が高い細胞から回収されたプラスミド(16−2−12および16-2-31)、およびコントロールプラスミドpAMoを、それぞれNamalwa KJM-1細胞に導入し、抗i抗体(太線)またはA-PBS(細線)を用いた間接蛍光抗体染色の後、FACSを用いて解析した結果である。
【図3】プラスミド16-2-12が含有するcDNA、およびその近傍のベクター部分(太線)の制限酵素マップを示したものである。ナンバーのついたバーは、cDNAの塩基配列を決定するためにpBluescriptIISK(+)にサブクローン化したDNA断片を示している。詳細は本文参照。
【図4】プラスミドpAMo-iの造成工程を示す図である。
【図5】iGnT発現プラスミドpAMo-iおよびコントロールプラスミドpAMoを、それぞれNamalwa KJM-1細胞に導入し、抗i抗体(太線)またはA-PBS(細線)を用いた間接蛍光抗体染色の後、FACSを用いて解析した結果である。間接蛍光抗体染色の前に、細胞をsialidase処理したもの(+sialidase)と、しないもの(-sialidase)で反応性を比較した。
【図6】プラスミドpAMoA-FT3の造成工程を示す図である。
【図7】プラスミドpAMoA-i52Sの造成工程を示す図である。
【図8】プラスミドpAMoA-i52Sを導入したNamalwa KJM-1細胞の培養上清から、IgGセファロースを用いてプロテインA融合分泌型iGnTを精製し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した結果である(レーン2)。コントロールとして、pAMoAを導入したNamalwa KJM-1細胞の培養上清から同様にしてサンプルを調製し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した(レーン1)。
【図9】プラスミドpAMoF2の造成工程を示す図である。
【図10】プラスミドpT7B-i52S No.3の造成工程を示す図である。
【図11】プラスミドpAMoF2-i52Sの造成工程を示す図である。
【図12】プラスミドpAMoF2-i52Sを導入したNamalwa KJM-1細胞の培養上清から、抗Flag M1アフィニティーゲルを用いてFlagペプチド融合分泌型iGnTを精製し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した結果である(レーン2)。コントロールとして、pAMoF2を導入したNamalwa KJM-1細胞の培養上清から同様にしてサンプルを調製し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した(レーン1)。
【図13】プラスミドpVL1393-iの造成工程を示す図である。
【図14】プラスミドpVL1393-Ai52Sの造成工程を示す図である。
【図15】プラスミドpVL1393-Ai52S由来の組換えウイルスが感染したSf21細胞の培養上清から、IgGセファロースを用いてプロテインA融合分泌型iGnTを精製し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した結果である (レーン2)。コントロールとして、プラスミドpVL1393由来の組換えウイルスが感染したSf21細胞の培養上清から同様にしてサンプルを調製し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した(レーン1)。
【図16】プラスミドpVL1393-F2i52Sの造成工程を示す図である。
【図17】プラスミドpVL1393-F2i52S由来の組換えウイルスが感染したSf21細胞の培養上清から、抗Flag M1アフィニティーゲルを用いてFlagペプチド融合分泌型iGnTを精製し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した結果である(レーン2)。コントロールとして、プラスミドpVL1393由来の組換えウイルスが感染したSf21細胞の培養上清から同様にしてサンプルを調製し、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した(レーン1)。
【図18】プラスミドpBSK+iGnT13の造成工程を示す図である。
【図19】プラスミドpBSK+iGnT13dの造成工程を示す図である。
【符号の説明】
bp:塩基対 (base pairs)
kb:キロ塩基対 (kilobase pairs)
G418 / Km :トランスポゾン5(Tn5) 由来G418、カナマイシン耐性遺伝子
Ap:pBR322由来アンピシリン耐性遺伝子
Tc:pBR322由来テトラサイクリン耐性遺伝子
P1:pBR322由来P1プロモーター
Ptk:ヘルペス・シンプレックス・ウイルス(Herpes simplex virus; HSV) チミジンキナーゼ(tk)遺伝子プロモーター
Sp. BG:ラビットβグロビン遺伝子スプライシングシグナル
A.BG:ラビットβグロビン遺伝子ポリA付加シグナル
A. SE:シミアン・ウィルス (simian virus) 40 (SV40) 初期遺伝子ポリA付加シグナル
Atk:ヘルペス・シンプレックス・ウイルス(Herpes simplex virus ; HSV)チミジンキナーゼ(tk)遺伝子のポリA付加シグナル
Pse:シミアン・ウィルス (simian virus) 40 (SV40) 初期遺伝子プロモーター
Pmo:モロニー・マウス白血病ウイルスのロング・ターミナル・リピート(long terminal repeat : LTR)プロモーター
EBNA-1:エプシュタイン・バール・ウイルス(Epstein -Barr virus )のEBNA-1遺伝子
oriP:エプシュタイン・バール・ウイルス(Epstein -Barr virus )の複製開始点
S:ヒト顆粒球コロニー刺激因子または免疫グロブリンκのシグナルペプチドをコードする遺伝子部分
A または ProA:黄色ブドウ球菌StaphylococcusaureusのプロテインAのIgGとの結合領域をコードする遺伝子部分
F:Flagペプチドをコードする遺伝子部分
iGnT:本発明で取得したポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するポリペプチドをコードするDNA(全長または部分長)
cDNA:本発明で取得したポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するポリペプチドをコードするDNA(全長または部分長)
cDNA del:約0.2kbの欠失を有する、本発明で取得したポリ-N-アセチルラクトサミン糖鎖の合成に関与するポリペプチドをコードする部分長DNA[0001]
BACKGROUND OF THE INVENTION
The present invention relates to a polypeptide having an activity involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain, a method for producing the polypeptide, a DNA encoding the polypeptide, a method for producing the DNA, and the DNA being incorporated. Recombinant vector, transformant containing the recombinant vector, antibody recognizing the novel polypeptide, method for producing poly-N-acetyllactosamine sugar chain using the polypeptide, the recombinant The present invention relates to a method for producing a poly-N-acetyllactosamine sugar chain using a transformant containing a vector.
[0002]
[Prior art]
In addition to being involved in life phenomena such as development / differentiation and cell recognition, sugar chains are thought to be deeply involved in the development and progression of inflammation, cancer, infectious diseases, autoimmune diseases, and many other diseases. [Kiyoyo, Hakomori Senichiro, Nagai Katsutaka, Glycobiology Series (1)-(6), Kodansha, (1993), Glycobiology,Three, 97 (1993)].
Sugar chains are added to proteins and lipids to exist as glycoproteins, proteoglycans, or glycolipids, and also exist as oligosaccharides.
[0003]
The poly-N-acetyllactosamine sugar chain targeted in the present invention is a sugar having a structure [(Galβ1-4GlcNAcβ1-3) n; n is 2 or more] in which N-acetyllactosamine is repeatedly bonded by β1,3 bonds. It is present in glycoprotein N-glycoside-linked sugar chains and O-glycoside-linked sugar chains, as well as in glycolipid sugar chains and oligosaccharides.
[0004]
Poly-N-acetyllactosamine sugar chains are synthesized by the alternating action of β1,4-galactosyltransferase and β1,3-N-acetylglucosaminetransferase. The former β1,4-galactosyltransferase gene has already been cloned, but the latter β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase gene has not been cloned so far. Regarding β1,3-N-acetylglucosamine transferase involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain, only partial purification has been reported so far, and no amino acid sequence information has been obtained [J Biol. Chem.,268, 27118 (1993), J. Biol. Chem.,267, 2994 (1992), J. Biol. Chem.,263, 12461 (1988), Jpn. J. Med. Sci. Biol.,42, 77 (1989)].
[0005]
N-acetylglucosamine is often linked to the galactose residue in the poly-N-acetyllactosamine sugar chain via a β1,6 bond, such as Galβ1-4GlcNAcβ1-3 (Galβ1-4GlcNAcβ1-6) Galβ1-4GlcNAc A poly-N-acetyllactosamine sugar chain having a chain is synthesized. A glycosyltransferase that transfers β1,6-linked N-acetylglucosamine at this branched portion is β1,6-N-acetylglucosaminetransferase (I-branching enzyme). This enzyme gene has already been cloned. The linear poly-N-acetyllactosamine sugar chain (i antigen) is specifically produced by the anti-i antibody, and the branched poly-N-acetyllactosamine sugar chain (I antigen) is specifically produced by the anti-I antibody. Recognized [J. Biol. Chem.,254, 3221 (1979)].
[0006]
On a linear or branched poly-N-acetyllactosamine sugar chain, sugars such as fucose, sialic acid, N-acetylgalactlactosamine, galactose, or sulfate groups are added, and cell-specific or timing Various sugar chains (functional sugar chains, blood type sugar chains, cancer-related sugar chains, etc.) are formed specifically [Yo Kiso, Seiichiro Hakomori, Katsutaka Nagai, Glycobiology Series (1)-(6) ▼, Kodansha, (1993)].
It is known that a poly-N-acetyllactosamine sugar chain having a Sialyl-Lewis x sugar chain structure is present at the end of the sugar chain on granulocytes, monocytes, or activated T cells, These sugar chains function as ligands for adhesion molecules such as E-selectin and P-selectin, and are thought to be involved in the accumulation of these leukocytes in the inflammatory site [Kiyoyo, Hakomori Senichiro, Edited by Katsutaka Nagai, Glycobiology series (1)-(6), Kodansha, (1993)].
[0007]
In addition, it is known that poly-N-acetyllactosamine sugar chains having Sialyl-Lewis x sugar chains and Sialyl-Lewisa sugar chain structures are present on cancer cells such as colorectal cancer, These sugar chains also function as ligands for E-selectin and P-selectin and have been suggested to be involved in cancer metastasis [edited by Yosuke Kiso, Senichiro Hakomori, Katsutaka Nagai, Glycobiology Series ▲ 1 ▼ ~ ▲ 6 ▼, Kodansha (1993)].
[0008]
Poly-N-acetyllactosamine sugar chain structure is known to change during embryogenesis, cell differentiation, or canceration of cells [edited by Yosuke Kiso, Senichiro Hakomori, Katsutaka Nagai, glycobiology Series (1)-(6), Kodansha, (1993)]. In human fetal erythrocytes, linear poly-N-acetyllactosamine sugar chains are expressed, whereas in adult erythrocytes, branched poly-N-acetyllactosamine sugar chains are expressed [Kiyoyo・ Senichiro Hakomori and Katsutaka Nagai, Glycobiology Series (1) “Diverse world of sugar chains”, Kodansha, 1993]. An ABO blood group antigen is expressed at the end of the poly-N-acetyllactosamine sugar chain on these erythrocytes. When a blood group antigen is expressed at each end of a branched poly-N-acetyllactosamine sugar chain, it becomes a multivalent antigen, and its ability to bind an antibody to the blood group sugar chain is higher than that of a linear antigen. 10ThreeThat will also increase.
[0009]
It is known that a series of sugar chain antigens are regularly expressed during the development process of the early mouse embryo. SSEA-1 (stage specific embryonic antigen-1) antigen is Lewis x sugar chain [Galβ1-4 (Fucα1-3) GlcNAc] existing at the end of poly-N-acetyllactosamine sugar chain. Begins in the 8-cell stage, peaks in the morula, and gradually disappears after the blastocyst stage [Kiyoyo, Henmori Senichiro, Katsutaka Nagai, Glycobiology Series (3) “Glyco in Cellular Society Biology ", Kodansha, 1993]. The morula stage is a transitional stage in which embryo cells, which have been repeatedly subjected to simple numerical increases due to cell division, move to a blastocyst stage with a differentiated “morphology” for the first time. Mulberry embryo cells gather closely together just before forming a blastocyst, causing cell compaction. Addition of oligosaccharides with SSEA-1 antigen inhibits this cell compaction and subsequent normal development [J. Exp. Med.,160, 1591 (1984)]. It is also known that the adhesion of mouse teratocarcinoma cells is inhibited by anti-SSEA-1 antibodies [edited by Yoyo Kiso, Senichiro Hakomori and Katsutaka Nagai, Glycobiology Series (3) “ Glycobiology ", Kodansha, 1993]. The above indicates that the SSEA-1 antigen acts as an adhesion molecule or sugar chain signal and plays an important role in early embryogenesis.
[0010]
Cancer cells are known to express more poly-N-acetyllactosamine sugar chains than the corresponding normal cells [J. Biol. Chem.,259, 10834 (1984), J. Biol. Chem.,261, 10772 (1986), J. Biol. Chem.,266, 1772 (1991), J. Biol. Chem.,267, 5700 (1992)]. When N-ras proto-oncogene is expressed in NIH3T3 cells, the molecular weight of the N-linked glycans on the cell surface increases and the cells acquire the invasion ability. As the amount of N-acetyllactosamine sugar chain increases, the activities of β1,4-galactose transferase and β1,3-N-acetylglucosamine transferase involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain increase [J. Biol. Chem.,266, 21674 (1991)].
[0011]
Galectins are a group of lectins that have an affinity for β-galactoside, are involved in cell adhesion and signal transduction, and have been suggested to be associated with diseases such as cancer [Trends in Glycoscience and Glycotechnology,9, 9 (1997)]. There are 10 known mammals so far. Of these, galectin-1 and -3 are known to bind with high affinity to linear poly-N-acetyllactosamine sugar chains, and specific glycoproteins containing these sugar chains are Presumed to be ligands for these galectins (Trends in Glycoscience and Glycotechnology,9, 9 (1997), Trends in Glycoscience and Glycotechnology,9, 47 (1997)].
Poly-N-acetyllactosamine sugar chain with sialic acid added to the end serves as a receptor for mycoplasma and microorganisms [Acta Paediatrica,82903 (1993)].
In this way, poly-N-acetyllactosamine sugar chains are composed of many functional sugar chains (selectin ligand sugar chains, microorganism and virus receptor sugar chains, SSEA-1 sugar chains, cancer-related sugar chains, etc.) and blood It plays an important role in forming the skeleton sugar chains of the type sugar chains and efficiently presenting those sugar chains.
Poly-N-acetyllactosamine sugar chain having Sialyl Lewis x sugar chain is expected to be a selectin antagonist and to be a drug having anti-inflammatory effect or cancer metastasis inhibiting effect.
[0012]
Oligosaccharides with polyvalent (4) Sialyl Lewis x (tetrasaccharide) bound to poly-N-acetyllactosamine sugar chain compared to non-polyvalent Sialyl Lewis x oligosaccharide (tetrasaccharide) It is known that it exhibits activity as a selectin antagonist at a low concentration of 1/100 or less [J. Exp. Med.,182, 1133 (1995), Glycobiology,6, 65 (1996), Glycobiology,7, 453 (1997), Eur. J. Immunol.,27, 1360 (1997)].
Partially purified β1,3-N-acetylglucosamine transferase was used to synthesize the poly-N-acetyllactosamine sugar chain portion of these oligosaccharides. It is difficult to synthesize N-acetyllactosamine sugar chains in large quantities [Glycobiology,7453 (1997)].
[0013]
On the other hand, poly-N-acetyllactosamine sugar chains can also be synthesized by chemical synthesis, but the synthesis requires very complicated steps [Tetrahedron Letter,twenty four, 5223 (1997)].
In view of the above, an efficient synthesis method of poly-N-acetyllactosamine sugar chain is required.
[0014]
It is known that various oligosaccharides having a poly-N-acetyllactosamine sugar chain structure exist in human milk [Acta Paediatrica,82903 (1993)]. These oligosaccharides are thought to have a function of preventing infants from being infected with viruses and microorganisms and a function of neutralizing toxins. It also has the activity of promoting the growth of bifidobacteria, which are good intestinal bacteria. On the other hand, there are few kinds of oligosaccharides present in the milk of animals such as cattle and mice, most are lactose, and oligosaccharides containing poly-N-acetyllactosamine sugar chains are hardly present [Acta Paediatrica,82, 903 (1993), J. Biol. Chem.,270, 29515 (1995)].
[0015]
If it is possible to efficiently produce various oligosaccharides containing poly-N-acetyllactosamine sugar chains contained in human milk as a mother nucleus, or milk containing them, it would be very useful industrially. But so far no such method is known.
Poly-N-acetyllactosamine sugar chains are also important for glycoprotein stabilization.
[0016]
lysosome associated membrane glycoprotein-1 (lamp-1) and lysosome associated membrane glycoprotein-2 (lamp-2) are glycoproteins that are present on lysosomes (some of which are also present on the cell surface). It ’s covered. Many sugar chains (some of which contain poly-N-acetyllactosamine sugar chains) are added to lamp-1 and lamp-2. Lamp-1 and lamp-2 are added by hydrolyzing enzymes in lysosomes. Preventing it from being disassembled. When human HL-60, a human osteoblastic cell line, is treated with dimethyl sulfoxide, it differentiates into granulocyte cells. During this differentiation, lamp-1 and lamp-2 It is known that the number of poly-N-acetyllactosamine sugar chains added to the enzyme increases, and the metabolic rate (degradation rate) of lamp-1 and lamp-2 decreases with it [J. Biol. Chem. ,265, 20476 (1990)].
[0017]
Since poly-N-acetyllactosamine sugar chains contribute to protein stabilization, it is possible to stabilize proteins by artificially adding poly-N-acetyllactosamine sugar chains to any protein. Conceivable. In addition, since the clearance rate of blood protein from the kidney decreases as the effective molecular weight of the protein increases, the effective molecular weight is increased by artificially adding poly-N-acetyllactosamine sugar chains to any protein. Thus, it is considered that the clearance rate from the kidney can be reduced and the blood stability can be increased. Furthermore, by adding a poly-N-acetyllactosamine sugar chain, there is a possibility that any protein can be targeted to a specific cell.
[0018]
When F9 cells were treated with retinoic acid or Swiss 3T3 cells were treated with TGF-β, it was shown that poly-N-acetyllactosamine sugar chains were added to the sugar chains of cell membrane-bound glycoproteins. [J. Biol. Chem.,268, 1242 (1993), Biochim.
Biophys. Acta.,1221, 330 (1994)].
When N-ras proto-oncogene is expressed in NIH3T3 cells, the activities of β1,4-galactosyltransferase and β1,3-N-acetylglucosaminetransferase involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chains are increased. It is known that the amount of poly-N-acetyllactosamine sugar chain in the N-linked sugar chain of the membrane protein increases [J. Biol. Chem.,266, 21674 (1991)].
[0019]
When the core 2β1,6-N-acetylglucosaminyltransferase gene is expressed in the T cell line EL-4, the molecular weight of CD43, CD45, or CD44, which is a membrane protein on the cell surface, increases [J. Biol. Chem. ,271, 18732 (1996)]. This is because the sugar chain synthesized by core 2β1,6-N-acetylglucosamine transferase is a good substrate for β1,3-N-acetylglucosamine transferase, which is involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain. It is thought to be.
[0020]
It is also known that when HL-60 cells are cultured at 27 ° C., the amount of poly-N-acetyllactosamine sugar chain added to lamp-1 or lamp-2 increases (J. Biol. Chem. ,266, 23185 (1991)].
However, it is not clear whether the above method is effective in a host cell suitable for production of recombinant glycoprotein. Therefore, the development of methods for increasing the ability to synthesize poly-N-acetyllactosamine sugar chains in host cells (eg Namalwa cells, Namalwa KJM-1 cells, CHO cells, etc.) suitable for the production of recombinant glycoproteins This is an important issue.
[0021]
Considering the mechanism of inflammatory reaction and cancer metastasis described above, it is expected that the inflammatory reaction can be suppressed or cancer metastasis can be prevented by suppressing the expression of poly-N-acetyllactosamine sugar chain. However, a method for efficiently suppressing the expression of poly-N-acetyllactosamine sugar chain has not been known so far.
In addition, genes involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chains in inflammatory leukocytes, cancer cells, or serum (for example, β1,3-, which is a key enzyme for poly-N-acetyllactosamine sugar chain synthesis) N-acetylglucosamine transferase genes and the like), or the expression of polypeptides encoded by them, is expected to diagnose the malignancy of inflammatory diseases and cancer. However, no such method has been known so far.
[0022]
[Problems to be solved by the invention]
The present invention provides pharmaceuticals such as anti-inflammation, anti-infection, and cancer metastasis suppression, foods such as dairy products, protein improvement methods, and diagnostic methods for malignancy of inflammatory diseases and cancer.
[0023]
[Means for Solving the Problems]
The present invention relates to a polypeptide having an activity involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain, a method for producing the polypeptide, a DNA encoding the polypeptide, a method for producing the DNA, and incorporating the DNA Recombinant vector obtained, transformant harboring the recombinant vector, antibody recognizing the polypeptide, method for producing the DNA or poly-N-acetyllactosamine sugar chain using the polypeptide, the DNA Diagnosis and treatment of diseases such as inflammation or cancer using the polypeptide or the antibody, quantification method and immunostaining of the polypeptide of the present invention using the antibody, and changing the expression of the gene encoding the polypeptide The present invention relates to a method for screening a compound and a method for screening a substance that varies the activity of the polypeptide.
[0024]
Hereinafter, the present invention will be described in detail.
The DNA of the present invention is a DNA encoding a polypeptide having an activity involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain, for example, encoding a polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. Synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain having an amino acid sequence in which one or more amino acids are substituted, deleted or added in the amino acid sequence of DNA or a polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. DNA that encodes a polypeptide that participates in the DNA, or DNA that hybridizes with the DNA under stringent conditions and encodes a polypeptide that is involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chains .
[0025]
Examples of the polypeptide having an activity involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain include a polypeptide having β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase activity.
DNA that can hybridize under stringent conditions means DNA obtained by using colony hybridization method, plaque hybridization method, Southern blot hybridization method, or the like using the DNA as a probe. Specifically, hybridization was performed at 65 ° C. in the presence of 0.7 to 1.0 M NaCl using a filter on which DNA derived from colonies or plaques was immobilized, and then the concentration was 0.1 to 2 times. Examples of the DNA that can be identified by using an SSC solution (the composition of a 1-fold concentration SSC solution is 150 mM sodium chloride and 15 mM sodium citrate) and washing the filter at 65 ° C. can be mentioned. Hybridization can be performed according to the method described in Molecular Cloning 2nd edition. Specifically, the DNA capable of hybridizing is DNA having at least 60% homology with the base sequence of DNA encoding the polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, preferably 80% or more homology. And DNA having homology, more preferably DNA having homology of 95% or more.
[0026]
Examples of the polypeptide of the present invention include the polypeptide encoded by the above-described DNA. Specifically, the polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, or the amino acid represented by SEQ ID NO: 1 A polypeptide having an amino acid sequence in which one or more amino acids are substituted, deleted or added in the amino acid sequence of the polypeptide having a sequence and having an activity involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain, etc. I can give you.
[0027]
A polypeptide having an amino acid sequence in which one or more amino acids of the polypeptide amino acid sequence are substituted, deleted or added, and involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain is Nucleic Acids Research,Ten, 6487 (1982), Proc. Natl. Acad. Sci., USA,79, 6409 (1982), Proc. Natl. Acad. Sci., USA,81, 5662 (1984), Science,224, 1431 (1984), PCT WO85 / 00817 (1985), Nature,316, 601 (1985), Gene,34, 315 (1985), Nucleic Acids Research,13, 4431 (1985), Current Protocols in Molecular Biology, Chapter 8, Mutagenesis of Cloned DNA, John Wiley & Sons, Inc. (1989) can do.
Examples of the antibody of the present invention include antibodies that recognize the aforementioned polypeptides.
[0028]
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
(1) Method for producing DNA encoding a polypeptide involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain
A cDNA library is prepared from cells expressing poly-N-acetyllactosamine sugar chains by a conventional method.
[0029]
cDNA library preparation methods include Molecular Cloning 2nd Edition, Current Protocols in Molecular Biology, Supplements 1-34 (Supplement 1-34), and Green Publishing Associates.・ Methods described in Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience, 1987-1996 (hereinafter abbreviated as Current Protocols in Molecular Biology Supplements 1-34), etc., or Commercially available kits such as Superscript Plasmid System for cDNA Synthesis and Plasmid Cloning (Gibco BRL) or Zapp-cDNA Seshisu Kit [ZAP-cDNA Synthesis Kit, Stratagene] a method using thereof.
[0030]
As the cell expressing poly-N-acetyllactosamine sugar chain, any cell expressing poly-N-acetyllactosamine sugar chain can be used, for example, human melanoma cell Strain WM266-4 (ATCC CRL 1676), human colon cancer cell line SW1116 (ATCC CRL 233), human monocytic cell line THP-1 (ATCC TIB 202), human monocytic cell line U-937 (ATCC CRL 1593) ), Human granulocyte cell line HL-60 (ATCC CCL 240) and the like can be used.
[0031]
As a cloning vector for preparing a cDNA library, any vector such as a phage vector or a plasmid vector can be used as long as it can autonomously replicate in E. coli K12. Specifically, ZAP Express (Stratagies, made by Stratagene,Five, 58 (1992)], pBluescript II SK (+) [Nucleic Acids Research,17, 9494 (1989)], λzap II (Stratagene), λgt10, λgt11 (DNA cloning, A Practical Approach),1, 49 (1985)], Lambda BlueMid (Clontech), λExCell (Pharmacia), pT7T3 18U (Pharmacia), pcD2 (Mol. Cell. Biol.),Three, 280 (1983)], pUC18 [Gene,33, 103 (1985)], pAMo [J. Biol. Chem.,268, 22782-22787 (1993), also known as pAMoPRC3Sc (Japanese Patent Laid-Open No. 05-336963)].
[0032]
As the host microorganism, any microorganism belonging to E. coli can be used. In particular,Escherichia coli XL1-Blue MRF '(Stratagies, made by Stratagene,Five, 81 (1992)),Escherichia coli C600 (Genetics,39, 440 (1954)),Escherichia coli Y1088 (Science,222, 778 (1983)),Escherichia co li Y1090 (Science,222, 778 (1983)),Escherichia coli NM522 [J. Mol. Biol.,166, 1 (1983)],Escherichia coli K802 [J. Mol. Biol.,16, 118 (1966)) andEscherichia coli JM105 (Gene,38, 275 (1985)].
[0033]
As a cDNA library, cDNA was synthesized from mRNA derived from WM266-4 or SW1116 using a cDNA Synthesis System kit manufactured by GIBCO BRL, and both ends of the DNA were synthesized.SfiAfter adding the I linker, the cloning vector pAMoSfiUsing a plasmid created by inserting into the I site,E.coli A cDNA library obtained by transforming LE392 can be mentioned.
[0034]
The inserted DNA is excised from the cDNA library and incorporated into a vector that can be expressed in animal cells or insect cells. When a vector that can be expressed in animal cells or insect cells is used at the time of preparation of the cDNA library, it can be used as an expression vector described below without performing this operation.
As the vector, any vector can be used as long as it can be expressed by incorporating the cDNA. For example, pcDNAI / Amp, pcDNAI, pCDM8 (all are commercially available from Funakoshi), pAGE107 [Japanese Patent Laid-Open No. 3-22979, Cytotechnology,Three, 133 (1990)], pREP4 (manufactured by Invitrogen), pAGE103 [J. Biochem.,101, 1307 (1987)], pAMo, pAMoA [J. Biol. Chem.,268, 22782-22787 (1993), also known as pAMoPRSA (Japanese Patent Laid-Open No. 05-336963)], pAS3-3 (Japanese Patent Laid-Open No. 2-227075), pVL1392 (manufactured by Invitrogen), pVL1393 (manufactured by Invitrogen), pBlueBacIII (manufactured by Invitrogen) Etc. can be used.
[0035]
An expression vector into which DNA excised from the cDNA library is incorporated is introduced into animal cells or insect cells capable of expressing the target DNA using the expression vector to obtain transformed cells.
As the method for introducing the expression vector, any method can be used as long as it is a method for introducing DNA into animal cells or insect cells. For example, electroporation [Cytotechnology,Three, 133 (1990)], calcium phosphate method (Japanese Patent Laid-Open No. 2-227075), lipofection method [Proc. Natl. Acad. Sci. USA,84, 7413 (1987)), Baculovirus Expression Vectors, W.H.Freeman and Company, New York (1992), Molecular Biology, A Laboratory Manual, Current Protocols in Molecular Biology, Bio / Technology,6, 47 (1988).
[0036]
Animal cells or insect cells include human cells, Namalwa cells, monkey cells, COS cells, Chinese hamster cells, CHO cells, HBT5637 (Japanese Patent Laid-Open No. 63-299),SpodopterafrugiperdaOvary cells Sf9, Sf21 (Baculovirus Expression Vectors (1992)),TrichoplusianiHigh 5 (manufactured by Invitrogen) and the like, which are ovarian cells of the above, can be used. Preferred host cells include Namalwa cells.
[0037]
The obtained transformed cells are fluorescently stained with an anti-poly-N-acetyllactosamine sugar chain antibody or a lectin that recognizes poly-N-acetyllactosamine sugar chains, and then a fluorescence activated cell sorter. (Fluorescence Activated Cell Sorter; hereinafter abbreviated as FACS) is used to concentrate and separate cells that have increased binding amount of antibodies or lectins that recognize linear poly-N-acetyllactosamine sugar chains.
[0038]
As the antibody against poly-N-acetyllactosamine sugar chain, any antibody that reacts with poly-N-acetyllactosamine sugar chain can be used, for example, linear poly-N-acetyl Anti-i antibody [J. Biol. Chem., Which is an antibody that recognizes lactosamine sugar chain,254, 3221 (1979)]. Alternatively, a lectin that recognizes a poly-N-acetyllactosamine sugar chain can be used instead of an antibody, for example,DaturastramoniumLectin (DSA),LycopersiconesculentumLectin (LEA),PhytolaccaamericanaLectin (PWA) can be mentioned.
[0039]
A method known from the cells thus concentrated and separated, for example, the heart method [Mol. Cell. Biol.,8, 2837 (1988)], the plasmid containing the DNA of the present invention can be recovered and a DNA fragment containing the DNA can be obtained.
An example of a plasmid containing the DNA of the present invention is pVL1393-i. E. coli containing pVL1393-iEscherichia coli MM294 / pVL1393-i was deposited as FERM BP-6145 at the Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology on October 16, 1997.
[0040]
The base sequence of the DNA obtained by the above-mentioned method is obtained by cleaving the DNA fragment as it is or with a suitable restriction enzyme and then incorporating the DNA fragment into a vector by a conventional method, for example, a base sequence analysis method commonly used, such as Sanger et al. Act [Proc. Natl. Acad. Sci. USA,74, 5463 (1977)] or a 373A DNA sequencer (manufactured by Perkin Elmer) or the like.
[0041]
Examples of the DNA obtained by the method include a DNA encoding the peptide represented by SEQ ID NO: 1, and specifically a DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 be able to.
The target DNA can also be prepared by chemical synthesis with a DNA synthesizer based on the determined DNA base sequence. Examples of the DNA synthesizer include a DNA synthesizer manufactured by Shimadzu Corporation using the thiophosphite method, a DNA synthesizer model 392 manufactured by Perkin Elmer using the phosphoramidite method, and the like.
[0042]
In addition, using the oligonucleotides described below as sense and antisense primers, and using cDNA prepared from mRNA of cells expressing mRNA complementary to these DNAs as a template, polymerase chain reaction (hereinafter referred to as Polymerase Chain Reaction) , Abbreviated as PCR) [Molecular Cloning Second Edition and PCR Protocols Academic Press (1990)] and the like can also be used to prepare the target DNA.
[0043]
Oligonucleotides such as antisense oligonucleotides and sense oligonucleotides having a partial sequence of the DNA of the present invention using the DNA and DNA fragments of the present invention obtained by the above-described method, using a conventional method or a DNA synthesizer Can be prepared. Examples of the oligonucleotide include DNA having the same sequence as 10 to 50 bases in the base sequence of the DNA or DNA having a sequence complementary to the DNA. Specifically, SEQ ID NO: Examples thereof include DNA having the same sequence as 10 to 50 consecutive bases in the DNA having the base sequence represented by 2, or DNA having a sequence complementary to the DNA. When used as a sense primer and an antisense primer, the above-mentioned oligonucleotides in which the melting temperature (Tm) and the number of bases of both do not change extremely are preferable.
[0044]
Such oligonucleotides can also be mentioned as the DNA of the present invention.
Furthermore, derivatives of these oligonucleotides can also be mentioned as the DNA of the present invention. The derivative DNA includes a derivative DNA in which a phosphodiester bond in DNA is converted to a phosphorothioate bond, and a derivative DNA in which a phosphodiester bond in DNA is converted to an N3′-P5 ′ phosphoramidate bond. Derivative DNA in which ribose and phosphodiester bonds in DNA are converted to peptide nucleic acid bonds, Derivative DNA in which uracil in DNA is replaced with C-5 propynyluracil, and uracil in DNA is replaced with C-5 thiazole uracil Derivative DNA, derivative DNA in which cytosine in DNA is substituted with C-5 propynylcytosine, derivative DNA in which cytosine in DNA is substituted with phenoxazine-modified cytosine, ribose in DNA is 2 Derivative DNA substituted with '-O-propylribose, or D Can be mentioned derivative DNA ribose in A is substituted with 2'-methoxyethoxy ribose or the like [Cell Engineering,16, 1463 (1997)].
[0045]
(2) Method for producing a polypeptide having an activity involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain
In order to produce the polypeptide of the present invention by expressing the DNA of the present invention obtained by the above method in a host cell, Molecular Cloning 2nd Edition, Current Protocols in
[0046]
That is, a recombinant vector in which the DNA of the present invention is inserted downstream of a promoter of an appropriate expression vector is constructed, and the vector is introduced into a host cell to obtain a transformant that expresses the polypeptide of the present invention. The polypeptide of the present invention can be produced by culturing the transformant.
As the host cell, any prokaryotic cell, yeast, animal cell, insect cell, plant cell or the like can be used so long as it can express the target gene. Moreover, an animal individual or a plant individual can be used.
[0047]
The expression vector contains a promoter at a position suitable for transcription of a gene involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain, which can be autonomously replicated in the above host cell or can be integrated into the chromosome. Is used.
When a prokaryote such as a bacterium is used as a host cell, an expression vector for a gene involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain is capable of autonomous replication in a prokaryote, and at the same time a promoter, a ribosome binding sequence, It is preferably composed of a gene involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain and a transcription termination sequence.
A gene that controls the promoter may also be included.
[0048]
Examples of expression vectors include pBTrp2, pBTac1, pBTac2 (all commercially available from Boehringer Mannheim), pSE280 (manufactured by Invitrogen), pGEMEX-1 (manufactured by Promega), pQE-8 (manufactured by QIAGEN), pKYP10 (special 58-110600), pKYP200 [Agric. Biol. Chem., 48, 669 (1984)], pLSA1 [Agric. Biol. Chem., 53, 277 (1989)], pGEL1 [Proc. Natl. Acad. Sci , USA, 82, 4306 (1985)], pBluescript II SK (-) (STRATAGENE), pBluescript II SK (+) (STRATAGENE), pTrs30 (FERM BP-5407), pTrs32 (FERM BP-5408), pGHA2 (FERM BP-400), pGKA2 (FERM BP-6798), pTerm2 (Japanese Patent Laid-Open No. 3-22979, US Pat. No. 4,686,191, US Pat. No. 4,939,09) 4, US 5,160,735), pKK233-2 (Pharmacia), pGEX (Pharmacia), pET system (Novagen), pSupex, pUB110, pTP5, pC194, pTrxFus (Invitrogen), pMAL-c2. (New England Biolabs), pEG400 [J. Bacteriol.,172, 2392 (1990)].
[0049]
Any promoter may be used as long as it functions in host cells such as E. coli. For example,trpPromoter (Ptrp),lacPromoter (Plac), PLPromoter, PRPromoter, PletI promoter, PSEExamples of the promoter include promoters derived from E. coli and phages, SPO1 promoter, SPO2 promoter, penP promoter, and the like. In addition, a promoter (Ptrpx2),tacAn artificially designed and modified promoter such as a promoter can also be used.
It is preferable to use a plasmid in which the distance between the Shine-Dalgarno sequence and the start codon is adjusted to an appropriate distance (for example, 6 to 18 bases).
Although the transcription termination sequence is not necessarily required for the expression of the DNA of the present invention, it is preferable to arrange the transcription termination sequence immediately below the structural gene.
[0050]
Examples of host cells include microorganisms belonging to the genus Escherichia, Serratia, Corynebacterium, Brevibacterium, Pseudomonas, Bacillus, Microbacterium, etc., specifically,Escherichia coli XL1-Blue,Escherichia coli XL2-Blue,Escherichia coli DH1,Escherichia coli MC1000,Escherichia coli KY3276,Escherichia coli W1485,Escherichia coli JM109,Escherichia coli HB101,Escherichia coli No. 49,Escherichia coli W3110,Escherichia coli NY49,Escherichia coli GI698,Escherichia coli GI724,Escherichia coli TB1,Bacillussubtilis,Bacillusamyloliquefacines,Brevibacteriumammmoniagenes,BrevibacteriumimmariophilumATCC14068,BrevibacteriumsaccharolyticumATCC14066,Brevibacteriumflavum ATCC14067,Brevibacteriumlactofermentum ATCC13869,Corynebacterium glutamicum ATCC13032,Corynebacterium glutamicum ATCC14297,Corynebacterium glutamicum ATCC13869,Corynebacterium acetoacidophilum ATCC13870,MicrobacteriumammoniaphilumATCC15354,Pseudomonas putida,Pseudomonassp. D-0110,Serratiamarcescens,Serratiaficaria,Serratiafonticola,SerratialiuefaciensEtc.
[0051]
As a method for introducing the recombinant vector, any method can be used as long as it is a method for introducing DNA into the host cell, for example, a method using calcium ions [Proc. Natl. Acad. Sci. USA,69, 2110 (1972)], protoplast method (Japanese Patent Laid-Open No. 63-248394), Gene,17, 107 (1982) and Molecular & General Genetics,168, 111 (1979).
When yeast strains are used as host cells, examples of expression vectors include YEp13 (ATCC37115), YEp24 (ATCC37051), YCp50 (ATCC37419), pHS19, pHS15 and the like.
[0052]
Any promoter can be used as long as it can be expressed in a yeast strain. For example, promoters such as PHO5 promoter, PGK promoter, GAP promoter, ADH promoter, gal1 promoter, gal10 promoter, heat shock protein promoter, MFα1 promoter, CUP1 promoter and the like can be mentioned.
Examples of host cells include yeast strains belonging to the genus Kluyveromyces, Saccharomyces, Schizosaccharomyces, Trichosporon, Swaniomyces, and the like.Saccharomyces cerevisiae,Schizosaccharomyces pombe,Kluyveromyces lactis,Trichosporonpullulans,SchwanniomycesalluviusEtc.
As a method for introducing the recombinant vector, any method for introducing DNA into yeast can be used. For example, the electroporation method [Methods Enzymol.,194, 182 (1990)], spheroplast method [Proc. Natl. Acad. Sci. USA,75, 1929 (1978)], lithium acetate method [J. Bacteriol.,153, 163 (1983)], Proc. Natl. Acad. Sci. USA,75, 1929 (1978).
[0053]
When animal cells are used as host cells, examples of expression vectors include pcDNAI, pcDM8 (commercially available from Funakoshi), pAGE107 [Japanese Patent Laid-Open No. 3-22979; Cytotechnology,Three, 133, (1990)], pAS3-3 (JP-A-2-27075), pCDM8 [Nature,329, 840, (1987)], pcDNAI / Amp (Invitrogen), pREP4 (Invitrogen), pAGE103 [J. Biochem.,1011307 (1987)], pAGE210 and the like.
[0054]
Any promoter can be used so long as it functions in animal cells. For example, cytomegalovirus (human CMV) IE (immediate early) gene promoter, SV40 early promoter, Moloney Mullin Leukemia Examples thereof include a virus (Moloney Murine Leukemia Virus) long terminal repeat promoter, a retrovirus promoter, a heat shock promoter, an SRα promoter, and a metallothionein promoter. In addition, an enhancer of human CMV IE gene may be used together with a promoter. Host cells include mouse myeloma cells, rat myeloma cells, mouse hybridoma cells, Chinese hamster CHO cells, BHK cells, African green monkey kidney cells, human cells Namalwa cells, human fetal kidney cells And human leukemia cells, HBT5637 (Japanese Patent Laid-Open No. 63-299), and the like.
[0055]
As mouse myeloma cells, SP2 / 0, NSO, etc., as rat myeloma cells, YB2 / 0, etc., as human embryonic kidney cells, HEK293 (ATCC: CRL-1573), 293, etc., as human leukemia cells, BALL -1, etc. Examples of African green monkey kidney cells include COS-1, COS-7, and the like.
As a method for introducing a recombinant vector, any method can be used as long as it is a method for introducing DNA into animal cells. For example, an electroporation method [Cytotechnology,Three, 133 (1990)], calcium phosphate method (JP-A-2-27075), lipofection method [Proc. Natl. Acad. Sci. USA,84, 7413 (1987)], Virology,52456 (1973).
[0056]
When insect cells are used as hosts, for example, Baculovirus Expression Vectors, A Laboratory Manual, WH Freeman and Company, New York (1992), Molecular Biology Laboratory -Manual (Molecular Biology, A Laboratory Manual), Current Protocols in Molecular Biology Supplement 1-38 (Current Protocols in Molecular Biology), Bio / Technology,6, 47 (1988), etc., can be used to express the protein.
[0057]
That is, the recombinant gene transfer vector and baculovirus are co-introduced into insect cells to obtain the recombinant virus in the insect cell culture supernatant, and then the recombinant virus is further infected into insect cells to express the protein. it can.
Examples of gene transfer vectors used in the method include pVL1392, pVL1393, pBlueBacIII (all manufactured by Invitrogen) and the like.
[0058]
As the baculovirus, for example, Autographa californica nuclear polyhedrosis virus, which is a virus that infects the night stealing insects, can be used.
As an insect cell,SpodopterafrugiperdaOvary cells,TrichoplusianiOvary cells, cultured cells derived from silkworm ovary, and the like can be used.
[0059]
SpodopterafrugiperdaAs ovary cells, Sf9, Sf21 (Baculovirus Expression Vectors Laboratory Manual), etc.TrichoplusianiAs the ovarian cells of
[0060]
In addition, DNA can be introduced into insect cells using a method similar to the method for introducing DNA into animal cells. For example, electroporation [Cytotechnology,Three, 133 (1990)], calcium phosphate method (Japanese Patent Laid-Open No. 2-227075), lipofection method [Proc. Natl. Acad. Sci. USA,84, 7413 (1987)].
When a plant cell or plant individual is used as a host, a known method [tissue culture, 20 (1994), tissue culture, 21 (1995), Trends in Biotechnology,15, 45 (1997)] can be produced.
[0061]
Any promoter can be used as long as it can be expressed in plant cells, for example, cauliflower mosaic virus (CaMV) 35S promoter,
[0062]
Examples of host cells include plant cells such as potato, tobacco, corn, rice, rape, soybean, tomato, wheat, barley, rye, alfalfa and flax.
As a method for introducing a recombinant vector, any method for introducing DNA into plant cells can be used. For example, Agrobacterium (Agrobacterium), Electroporation [Cytotechnology,Three, 133 (1990)], a method using a particle gun (gene gun), and the like.
[0063]
Plant cells and organs into which a gene has been introduced can be cultured in large quantities using a jar fermenter. In addition, a plant individual into which a gene has been introduced (transgenic plant) can be created by redifferentiating the plant cell into which the gene has been introduced.
The protein of the present invention can also be produced using an animal individual. For example, a known method [American Journal of Clinical Nutrition,63, 639S (1996), American Journal of Clinical Nutrition,63, 627S (1996), Bio / Technology,9, 830 (1991)], the protein of the present invention can be produced in an animal into which a gene has been introduced.
[0064]
Any promoter can be used as long as it can be expressed in animals. For example, α-casein promoter, β-casein promoter, β-lactoglobulin promoter, whey acidic protein promoter, etc., which are specific for mammary cells are suitable. Used for.
A transformant having a recombinant vector incorporating the DNA encoding the polypeptide of the present invention is cultured according to a normal culture method, the polypeptide is produced and accumulated, and the polypeptide is collected from the culture. Thus, the polypeptide can be produced.
[0065]
When the transformant is an animal individual or plant individual, the polypeptide is reared or cultivated according to a normal method, the polypeptide is produced and accumulated, and the polypeptide is collected from the animal individual or plant individual. Can be manufactured. That is, in the case of an individual animal, for example, a non-human transgenic animal carrying the DNA of the present invention is bred and has an activity involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain encoded by the recombinant DNA. A polypeptide having activity involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain can be produced by generating and accumulating the polypeptide in the animal and collecting the polypeptide from the animal. . Examples of the production / accumulation place in the animal include milk and eggs of the animal.
[0066]
In the case of a plant individual, for example, a transgenic plant carrying the DNA of the present invention is cultivated, and a polypeptide having an activity involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain encoded by the recombinant DNA is A polypeptide having an activity involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain can be produced by producing and accumulating in a plant and collecting the polypeptide from the plant.
When the transformant for producing the polypeptide of the present invention is a prokaryote such as Escherichia coli or a eukaryote such as yeast, the medium for culturing these organisms includes a carbon source, a nitrogen source, inorganic salts that can be assimilated by the organism Any of a natural medium and a synthetic medium may be used as long as the medium can efficiently culture the transformant.
[0067]
Any carbon source may be used as long as it can be assimilated by each microorganism. Glucose, fructose, sucrose, molasses containing these, carbohydrates such as starch or starch hydrolysate, organic acids such as acetic acid and propionic acid, ethanol Alcohols such as propanol are used.
Examples of nitrogen sources include ammonium salts of various inorganic and organic acids such as ammonia, ammonium chloride, ammonium sulfate, ammonium acetate, and ammonium phosphate, other nitrogen-containing compounds, peptone, meat extract, yeast extract, corn steep liquor, and casein. A hydrolyzate, soybean meal, soybean meal hydrolyzate, various fermented cells, digested products thereof, and the like are used.
[0068]
As the inorganic salt, monopotassium phosphate, dipotassium phosphate, magnesium phosphate, magnesium sulfate, sodium chloride, ferrous sulfate, manganese sulfate, copper sulfate, calcium carbonate and the like are used. The culture is performed under aerobic conditions such as shaking culture or deep aeration stirring culture. The culture temperature is preferably 15 to 40 ° C., and the culture time is usually 16 hours to 7 days. During the culture, the pH is maintained at 3.0 to 9.0. The pH of the medium is adjusted using an inorganic or organic acid, an alkaline solution, urea, calcium carbonate, ammonia or the like.
[0069]
Moreover, you may add antibiotics, such as an ampicillin and a tetracycline, to a culture medium as needed during culture | cultivation.
When culturing a microorganism transformed with an expression vector using an inducible promoter as a promoter, an inducer may be added to the medium as necessary.
For example,lacWhen culturing a microorganism transformed with an expression vector using a promoter, isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside (IPTG), etc.,trpWhen culturing a microorganism transformed with an expression vector using a promoter, indoleacrylic acid (IAA) or the like may be added to the medium.
[0070]
When the transformant for producing a polypeptide of the present invention is an animal cell, a medium for culturing the cell is a commonly used RPMI 1640 medium [The Journal of the American Medical Association,199519 (1967)], Eagle's MEM medium [Science,122, 501 (1952)], DMEM medium [Virology,8, 396 (1959)], 199 medium [Proceeding of the Society for the Biological Medicine,73, 1 (1950)] or media obtained by adding fetal calf serum or the like to these media.
[0071]
Culture is usually pH 6-8, 30-40 ° C., 5% CO2Perform for 1-7 days under conditions such as presence.
Moreover, you may add antibiotics, such as kanamycin and penicillin, to a culture medium as needed during culture | cultivation.
As a medium for culturing a transformant obtained by using insect cells as host cells, generally used TNM-FH medium (Pharmingen), Sf-900 II SFM medium (Life Technologies) ), ExCell400, ExCell405 (both manufactured by JRH Biosciences), Grace's Insect Medium [Grace, TCC, Nature,195, 788 (1962)] and the like.
[0072]
The pH is 6 to 7, the culture temperature is 25 to 30 ° C., and the culture time is usually 1 to 5 days.
Moreover, you may add antibiotics, such as a gentamicin, to a culture medium as needed during culture | cultivation.
As a gene expression method, in addition to direct expression, secretory production, fusion protein expression, and the like can be performed according to the method described in Molecular Cloning 2nd edition.
[0073]
As a method for producing the polypeptide of the present invention, there are a method for producing in the host cell, a method for secreting it outside the host cell, or a method for producing it on the outer membrane of the host cell. The method can be selected by changing the structure.
When the polypeptide of the present invention is produced in the host cell or on the host cell outer membrane, the method of Paulson et al. [J. Biol. Chem.,264, 17619 (1989)], Law et al. [Proc. Natl. Acad. Sci., USA,86, 8227 (1989), Genes Develop.,Four, 1288 (1990)], or by applying the method described in JP-A Nos. 05-336963 and 06-823021, the polypeptide can be actively secreted outside the host cell.
[0074]
That is, by using a gene recombination technique, the polypeptide of the present invention can be actively expressed outside the host cell by expressing in a form in which a signal peptide is added in front of the polypeptide containing the active site of the polypeptide of the present invention. Can be secreted.
Further, in accordance with the method described in JP-A-2-27075, the production amount can be increased using a gene amplification system using a dihydrofolate reductase gene or the like.
In order to isolate and purify the polypeptide of the present invention from the culture of the transformant for producing the polypeptide of the present invention, the usual enzyme isolation and purification methods can be used.
[0075]
For example, when the polypeptide of the present invention accumulates in the dissolved state in the cells of the transformant for producing the polypeptide of the present invention, the culture is centrifuged to collect the cells in the culture, and the cells After washing, the cells are crushed with an ultrasonic crusher, French press, Manton Gaurin homogenizer, dyno mill or the like to obtain a cell-free extract.
[0076]
From the supernatant obtained by centrifuging the cell-free extract, a solvent extraction method, a salting-out method using ammonium sulfate, a desalting method, a precipitation method using an organic solvent, diethylaminoethyl (DEAE) -sepharose, DIAION HPA-75 (Mitsubishi Kasei Co., Ltd.) Anion exchange chromatography method using resin, cation exchange chromatography method using resin such as S-Sepharose FF (Pharmacia), resin such as butyl sepharose, phenyl sepharose The purified sample can be obtained by using a method such as hydrophobic chromatography, gel filtration using molecular sieve, affinity chromatography, chromatofocusing, and electrophoresis such as isoelectric focusing.
[0077]
In addition, when the polypeptide is expressed by forming an insoluble substance in the cell, the polypeptide is similarly collected from the precipitate fraction obtained by crushing and centrifuging, and the polypeptide is obtained by a usual method. After the recovery, the insoluble substance of the polypeptide is solubilized with a polypeptide denaturant. The solubilized solution was diluted or dialyzed into a dilute solution not containing a polypeptide denaturant or having a polypeptide denaturant concentration that does not denature the polypeptide, thereby forming the polypeptide into a normal three-dimensional structure. Thereafter, a purified preparation can be obtained by the same isolation and purification method as described above.
When the polypeptide is secreted extracellularly, the culture is treated by a technique such as centrifugation to obtain a soluble fraction. From the soluble fraction, a purified preparation of the polypeptide can be obtained by a method similar to the method of isolation and purification from the cell-free extract supernatant.
[0078]
A glycosyltransferase purification method can also be used. Examples of the purification method include, for example, a method [Methods Enzymol., Used for partial purification of β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase.83, 458 (1982), J. Biol. Chem.,268, 27118 (1993), J. Biol. Chem.,267, 2994 (1992), J. Biol. Chem.,263, 12461 (1988), Jpn.J.Med.Sci.Biol,42, 77 (1989)].
[0079]
In addition, the polypeptide of the present invention can be produced as a fusion protein with another protein and purified using affinity chromatography using a substance having affinity for the fused protein. For example, the method of Law et al. [Proc. Natl. Acad. Sci., USA,86, 8227 (1989), Genes Develop.,Four, 1288 (1990)], affinity chromatography using immunoglobulin G, which produces the polypeptide of the present invention as a fusion protein with protein A according to the methods described in JP-A Nos. 05-336963 and 06-823021 Can be purified. Moreover, the polypeptide of the present invention can be produced as a fusion protein with a Flag peptide and purified by affinity chromatography using an anti-Flag antibody [Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 86, 8227 (1989). Genes Develop., 4, 1288 (1990)]. Furthermore, it can also be purified by affinity chromatography using an antibody against the polypeptide itself.
[0080]
When the polypeptide of the present invention has β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase activity, a known measurement method [J. Biol. Chem.,268, 27118 (1993), J. Biol. Chem.,267, 2994 (1992), J. Biol. Chem.,263, 12461 (1988), Jpn. J. Med. Sci. Biol,42, 77 (1989)], the activity of β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase can be measured.
[0081]
(3) Production method of glycoprotein, glycolipid, or oligosaccharide to which poly-N-acetyllactosamine sugar chain or its modified sugar chain is added
A transformant capable of producing the polypeptide of the present invention described in (2) above, wherein the transformant capable of synthesizing sugar chains is cultured in a culture solution, and a sugar containing poly-N-acetyllactosamine in the culture Glycoproteins with added chains, glycolipids with added sugar chains containing poly-N-acetyllactosamine or oligosaccharides containing poly-N-acetyllactosamine are generated and accumulated, and poly- Collecting a glycoprotein with a sugar chain containing N-acetyllactosamine, a glycolipid with a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine or an oligosaccharide containing poly-N-acetyllactosamine To contain a glycoprotein with a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine, a glycolipid with a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine or poly-N-acetyllactosamine. It can be produced oligosaccharides.
The culture can be performed according to the above (2).
[0082]
When a transformant simultaneously expresses a glycosyltransferase gene (for example, β1,4-galactosetransferase gene), a glycoprotein and a sugar to which a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine is added more efficiently. Lipids or oligosaccharides can be produced.
The recombinant glycoprotein contains poly-N-acetyllactosamine by simultaneously producing the polypeptide of the present invention and any recombinant glycoprotein (for example, a recombinant protein for pharmaceutical use) in a transformant. Can be added.
[0083]
Furthermore, when the above transformant also expresses a glycosyltransferase gene (for example, β1,4-galactosyltransferase gene), a group to which a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine is added more efficiently. Can produce a modified glycoprotein.
A part of the oligosaccharide can be excised from the glycoprotein, glycolipid or oligosaccharide having a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine produced by the above method by a known enzymatic method or chemical method. [Japan Biochemical Society, Second Biochemistry Experiments, Volume 4, Complex Carbohydrate Research Methods I and II, Tokyo Chemical Doujin (1986), Supervised by Naoyuki Taniguchi, Akemi Suzuki, Kiyoshi Furukawa and Kazuyuki Sugawara, Glycobio Rosie Experiment Protocol, Shujunsha, (1996)].
[0084]
When the polypeptide of the present invention is a polypeptide having β1,3-N-acetylglucosamine transferase activity, the polypeptide of the present invention, UDP-GlcNAc, and the lactosamine structure (Galβ1-4GlcNAc structure) are sugar chains. An aqueous acceptor substrate selected from glycoproteins having non-reducing ends of glycoproteins, glycolipids having lactosamine structures at the non-reducing ends of sugar chains, oligosaccharides having lactosamine structures at the non-reducing ends of sugar chains, and lactose (Galβ1-4Glc) In the aqueous medium, galactose at the end of the lactosamine structure of the acceptor substrate generates and accumulates a reaction product to which N-acetylglucosamine is added with β1,3 bonds. By collecting the reaction product, N-acetylglucosamine is imparted to the galactose at the end of the lactosamine structure of the acceptor substrate through a β1,3 bond. It may be prepared the reaction product.
[0085]
Further, the product obtained by the production method, UDP-Gal and β1,4-galactosyltransferase are present in an aqueous medium, and N-acetylglucosamine in the product is added to β1,4 in the aqueous medium. A reaction product to which galactose has been added is generated and accumulated by binding, and the reaction product is collected from the aqueous medium. Can be manufactured.
[0086]
In addition, the polypeptide of the present invention, UDP-GlcNAc, UDP-Gal, β1,4-galactosyltransferase, a glycoprotein having a lactosamine structure at the non-reducing end of the sugar chain, and a lactosamine structure at the non-reducing end of the sugar chain An acceptor substrate selected from oligosaccharides and lactose having a glycolipid, a lactosamine structure at the non-reducing end of a sugar chain, and poly-N at the end of the lactosamine structure of the acceptor substrate in the aqueous medium. By generating and accumulating a reaction product to which -acetyllactosamine sugar chain [(Galβ1-4GlcNAcβ1-3) n; n is 2 or more] is collected and collecting the reaction product from the aqueous medium, A reaction product having a poly-N-acetyllactosamine sugar chain attached to the end of the lactosamine structure can be produced.
[0087]
As β1,4-galactosyltransferase, an enzyme purified from bovine or human milk (commercially available from Sigma) or a recombinant enzyme (commercially available from Calbiochem) can be used.
In addition, using an individual animal or plant individual, a glycoprotein containing a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine or a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine according to the method of (2) above An oligosaccharide containing a glycolipid or poly-N-acetyllactosamine can be produced.
[0088]
That is, in the case of an animal individual, for example, a non-human transgenic animal carrying the DNA of the present invention is bred, and a glycoprotein to which a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine is added, poly- Glycolipids containing sugar chains containing N-acetyllactosamine or oligosaccharides containing poly-N-acetyllactosamine are generated and accumulated, and sugar chains containing poly-N-acetyllactosamine from the animal Poly-N-acetyllactosamine is collected by collecting glycoproteins with added sugar, glycolipids with added sugar chains containing poly-N-acetyllactosamine or oligosaccharides containing poly-N-acetyllactosamine Glycoprotein with added sugar chain, glycolipid with added sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine or oligosaccharide containing poly-N-acetyllactosamine It can be produced. Examples of the production / accumulation place in the animal include milk and eggs of the animal.
[0089]
In the case of a plant individual, for example, a transgenic plant having the DNA of the present invention is cultivated, and a glycoprotein, poly-N-acetyl lactate, to which a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine is added, is added to the plant. Glycolipids containing sugar chains containing samine or oligosaccharides containing poly-N-acetyllactosamine are produced and accumulated, and sugars containing poly-N-acetyllactosamine are added from the plant. Glycolipids containing poly-N-acetyllactosamine by collecting glycolipids with added sugar chains containing proteins, poly-N-acetyllactosamine or oligosaccharides containing poly-N-acetyllactosamine Glycoproteins with added sugar, glycolipids with added sugar chains containing poly-N-acetyllactosamine or oligosaccharides containing poly-N-acetyllactosamine Can.
[0090]
(4) Use of DAN or oligonucleotide of the present invention for treatment or diagnosis of diseases
The DNA of the present invention comprises antisense RNA / DNA technology [Bioscience and Industry,50, 322 (1992), chemistry,46, 681 (1991), Biotechnology,9, 358 (1992), Trends in Biotechnology,Ten, 87 (1992), Trends in Biotechnology,Ten, 152 (1992), Cell engineering,16, 1463 (1997)] or triple helix technology (Trends in Biotechnology,Ten, 132 (1992)] for the treatment of diseases such as inflammation and cancer, and the diagnosis of those diseases using the Northern hybridization method or the PCR method.
[0091]
For example, the production of the polypeptide of the present invention can be suppressed by administering the oligonucleotide of the present invention or the derivative thereof described in (1) above.
In addition, the expression level of the DNA encoding the polypeptide of the present invention can be quantified by the Northern hybridization method or the PCR method using the DNA of the present invention or the oligonucleotide prepared from the DNA.
[0092]
Furthermore, using the DNA of the present invention as a probe, the promoter region of the gene can be determined using a known method (Edition of Cancer Research, University of Tokyo, New Cell Engineering Experiment Protocol, Shujunsha (1993)). It is possible to obtain.
Examples of the promoter region include all promoter regions involved in transcription of a gene encoding the polypeptide of the present invention in mammalian cells. For example, in human melanoma cells, human colon cancer cells, or human white blood cells, a promoter region involved in transcription of a gene encoding the polypeptide of the present invention can be mentioned. The promoter can be used in the screening method described below.
[0093]
(5) Preparation of an antibody that recognizes the polypeptide of the present invention
(I) Preparation of polyclonal antibody
Using the full-length or partial fragment purified preparation of the polypeptide of the present invention obtained by the method described in (2) above as an antigen, a suitable adjuvant [for example, Freund's complete adjuvant (Complete Freund's Adjuvant) or aluminum hydroxide gel And pertussis vaccine, etc.], and polyclonal antibodies can be produced by administration to animals. A peptide having a partial amino acid sequence of the polypeptide of the present invention synthesized by a peptide synthesizer can also be used as an antigen.
[0094]
As animals to be administered, rabbits, goats, 3 to 20-week-old rats, mice, hamsters and the like can be used.
The dose of the antigen is preferably 50 to 100 μg per animal.
When a peptide is used, it is desirable that the peptide is covalently bound to a carrier protein such as keyhole limpet haemocyanin or bovine thyroglobulin as an antigen.
[0095]
The antigen is administered 3 to 10 times every 1 to 2 weeks after the first administration. Three to seven days after each administration, blood was collected from the fundus venous plexus, and the reaction of the serum with the antigen used for immunization was determined by enzyme immunoassay [enzyme immunoassay (ELISA): 1976, published by Medical Shoin. Antibodies-A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1988)].
Polyclonal antibodies can be obtained by obtaining serum from a non-human mammal whose serum showed a sufficient antibody titer against the antigen used for immunization, and separating and purifying the serum.
[0096]
Methods for separating and purifying antibodies include centrifugation, salting out with 40-50% saturated ammonium sulfate, precipitation of caprylic acid (Antibodies, A Laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratory, (1988)), or DEAE-Sepharose column, Examples thereof include a method of treating chromatography or the like using an ion exchange column, protein A or G-column or gel filtration column alone or in combination.
[0097]
(Ii) Production of monoclonal antibodies
(a) Preparation of antibody-producing cells
Rats whose serum showed a sufficient antibody titer against the partial fragment polypeptide of the polypeptide of the present invention used for immunization are used as a source of antibody-producing cells.
The spleen is removed 3 to 7 days after the final administration of the antigenic substance to the rat showing the antibody titer.
[0098]
The spleen is shredded in MEM medium (Nissui Pharmaceutical Co., Ltd.), loosened with tweezers, centrifuged at 1,200 rpm for 5 minutes, and the supernatant is discarded.
The spleen cells of the obtained precipitate fraction were treated with Tris-ammonium chloride buffer (pH 7.65) for 1 to 2 minutes to remove erythrocytes and then washed 3 times with MEM medium. Used as a cell.
[0099]
(b) Preparation of myeloma cells
As myeloma cells, cell lines obtained from mice or rats are used. For example, 8-azaguanine resistant mice (derived from BALB / c) myeloma cell line P3-X63Ag8-U1 (hereinafter abbreviated as P3-U1) [Curr. Topics. Microbiol. Immunol.,81, 1 (1978), Europ. J. Immunol.,6, 511 (1976)], SP2 / 0-Ag14 (SP-2) (Nature,276, 269 (1978)], P3-X63-Ag8653 (653) [J. Immunol.,one two Three, 1548 (1979)], P3-X63-Ag8 (X63) [Nature,256, 495 (1975)]. These cell lines consisted of 8-azaguanine medium [RPMI-1640 medium with glutamine (1.5 mM), 2-mercaptoethanol (5 × 10 5-FiveM), gentamicin (10 μg / ml) and fetal calf serum (FCS) (manufactured by CSL, 10%) were further added with 8-azaguanine (15 μg / ml). Medium], but cultured in
[0100]
(c) Production of hybridoma
The antibody-producing cells obtained in (a) and the myeloma cells obtained in (b) are mixed with MEM medium or PBS (1.83 g of disodium phosphate, 0.21 g of monopotassium phosphate, 7.65 g of sodium chloride, 1 liter of distilled water). Wash well with pH 7.2), mix so that the number of cells is antibody-producing cells: myeloma cells = 5 to 10: 1, centrifuge at 1,200 rpm for 5 minutes, and discard the supernatant.
[0101]
Thoroughly loosen the cell group of the obtained precipitate fraction and stir the cell group at 37 ° C. with stirring.80.2 to 1 ml of a solution prepared by mixing 2 g of polyethylene glycol-1000 (PEG-1000), 2 ml of MEM and 0.7 ml of dimethyl sulfoxide (DMSO) is added to each antibody-producing cell, and
[0102]
After the addition, MEM medium is added to prepare a total volume of 50 ml.
The preparation is centrifuged at 900 rpm for 5 minutes, and the supernatant is discarded.
Loosely loosen the cells of the resulting precipitate fraction, and then gently suck in and blow out with a pipette to gently add HAT medium [hypoxanthine (10%-FourM), thymidine (1.5 × 10-FiveM) and aminopterin (4 × 10-7Medium supplemented with M)] Suspend in 100 ml.
[0103]
The suspension was dispensed at 100 μl / well into a 96-well culture plate, and 5
After culturing, a part of the culture supernatant is taken and the enzyme immunoassay described in Antibodies, A Laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Chapter 14 (1988) etc. A hybridoma that specifically reacts with the partial fragment polypeptide is selected.
[0104]
The following methods can be given as specific examples of the enzyme immunoassay.
During immunization, a partial fragment polypeptide of the polypeptide of the present invention used as an antigen is coated on an appropriate plate, and the hybridoma culture supernatant or the purified antibody obtained in (d) described below is reacted as a first antibody, After reacting with anti-rat or anti-mouse immunoglobulin antibody labeled with biotin, enzyme, chemiluminescent substance or radiation compound as the second antibody, it reacts according to the labeling substance and reacts specifically with the polypeptide of the present invention. Is selected as a hybridoma producing the polypeptide monoclonal antibody of the present invention.
[0105]
Using this hybridoma, cloning was repeated twice by the limiting dilution method (the first time was HT medium (a medium obtained by removing aminopterin from HAT medium), the second time was using a normal medium), a stable and strong antibody Those having a recognized valence are selected as anti-polypeptide antibody-producing hybridoma strains of the polypeptide of the present invention.
[0106]
(d) Preparation of monoclonal antibody
Obtained in (c) from 8-10 week old mice or nude mice treated with pristane [0.5 ml of 2,6,10,14-tetramethylpentadecane (Pristane) intraperitoneally and bred for 2 weeks] The polypeptide monoclonal antibody-producing hybridoma cells of the present invention 5-20 × 106Cells / animals are injected intraperitoneally. The hybridoma becomes ascites tumor in 10 to 21 days.
[0107]
Ascites is collected from the mouse with ascites tumor, and centrifuged at 3,000 rpm for 5 minutes to remove solids.
From the obtained supernatant, the monoclonal antibody can be purified and obtained by the same method as that used for the polyclonal antibody. Monoclonal antibodies can also be purified and obtained from the culture supernatant of hybridoma strains producing monoclonal antibodies by the same method.
[0108]
Determination of antibody class and subclass is performed using a mouse monoclonal antibody typing kit or a rat monoclonal antibody typing kit. Protein mass is calculated from the Raleigh method or absorbance at 280 nm.
The antibody class is an antibody isotype. In humans, IgG, IgA, IgM, IgD, and IgE are listed. The subclass refers to an isotype within the class, and includes IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG3 in mice, and IgG1, IgG2, IgG3, IgG4 in humans.
[0109]
(6) Use of the antibody of the present invention
(A) The polypeptide of the present invention can be detected using the antibody of the present invention. Specifically, the antibody of the present invention can be used in a detection method using an ELISA method, a fluorescent antibody method, a Western blot method, or the like using a microtiter plate.
(B) The antibody of the present invention can be used for immunohistochemical staining of cells expressing the polypeptide of the present invention.
(C) The antibody of the present invention can be used for diagnosis and treatment of diseases such as inflammation or cancer.
[0110]
(7) Application to screening methods.
Since the polypeptide of the present invention has an activity involved in the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain, a compound that enhances or inhibits the activity of the polypeptide can be used to produce poly-N-acetyllactide in cells. It is possible to increase or decrease the synthesis amount of samine sugar chains.
[0111]
In addition, a compound that promotes or suppresses the transcription process of a gene encoding the polypeptide or the translation process from a transcription product to a protein controls the expression of the polypeptide, and the poly-N-acetyllactosamine sugar chain in the cell It is possible to control the amount of synthesis.
The above compounds are useful for the treatment of diseases such as inflammation and cancer and the synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chains.
The compound can be obtained by the methods shown in the following (a) to (e).
[0112]
(A) The polypeptide of the present invention described in (2) above, a cell extract capable of synthesizing a poly-N-acetyllactosamine sugar chain, a test sample, UDP-GlcNAc, UDP-Gal, and a receptor substrate In the presence of a sugar chain (a sugar chain having a lactosamine structure at the end), a known method [J. Biol. Chem.,268, 27118 (1993), J. Biol. Chem.,267, 2994 (1992), J. Biol. Chem.,263, 12461 (1988), Jpn. J. Med. Sci. Biol,42, 77 (1989)], and a compound that increases or decreases the amount of the product produced by the reaction is selected and obtained.
[0113]
(B) When the polypeptide of the present invention is a polypeptide having β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase activity, the polypeptide prepared by using the method described in (2) above (the polypeptide The cell transformant or purified product of the transformant to be expressed) is used as an enzyme, and β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase activity is measured using the method described above in the presence of the test sample, and β1,3-N -Select and obtain compounds that have activity to increase or decrease acetylglucosamine transferase activity.
[0114]
(C) The cell expressing the polypeptide of the present invention or the transformant described in (2) above is cultured in the presence of the test sample for 2 hours to 1 week by the culture method described in (2) above. The amount of poly-N-acetyllactosamine sugar chain on the cell surface is measured using an anti-i antibody, and a compound having an activity to increase or decrease the sugar chain amount is selected and obtained.
Examples of the measurement method using an anti-i antibody include a detection method using an ELISA method / fluorescent antibody method using a microtiter plate, a Western blot method, immunohistochemical staining, and the like.
[0115]
(D) After culturing cells expressing the polypeptide of the present invention in the presence of the test sample by the culture method described in (2) above for 2 hours to 1 week, the amount of the polypeptide in the cells is Measurement is performed using the antibody of the present invention described in (5), and a compound having an activity of increasing or decreasing the amount of the polypeptide is selected and obtained.
Examples of the measurement method using the antibody of the present invention include a detection method using an ELISA method / fluorescent antibody method using a microtiter plate, a Western blot method, immunohistochemical staining, and the like.
[0116]
(E) a gene encoding the polypeptide in the cell after culturing the cell expressing the polypeptide of the present invention in the presence of the test sample in the culture method described in (2) above for 2 hours to 1 week. The amount of the transcription product is measured using the method such as the Northern hybridization method and the PCR method described in the above (4), and a compound having the activity to increase or decrease the transcription product amount is selected and obtained.
[0117]
(F) A plasmid incorporating a reporter gene-linked DNA downstream of the promoter obtained in (4) above is prepared by a known method, and the animal cell described in (2) above is applied to the method described in (2) above. Introduce accordingly, and obtain a transformant. The transformant is cultured in the presence of the test sample by the culture method described in (2) above for 2 hours to 1 week, and the expression level of the reporter gene in the cell is determined by a known method [Medical Research Institute, University of Tokyo]. Cancer Research Department, New Cell Engineering Experimental Protocol, Shujunsha (1993), Biotechniques,20, 914 (1996), J. Antibiotics,49, 453 (1996), Trends in Biochemical Sciences, 20, 448 (1995), Cell engineering,16, 581 (1997)], and a compound having an activity to increase or decrease the expression level is selected and obtained.
Examples of the reporter gene include chloramphenicol acetyltransferase gene, β-galactosidase gene, luciferase gene, green fluorescent protein (GFP) gene and the like.
[0118]
【Example】
Examples are shown below. As a genetic manipulation technique, a known method described in Molecular Cloning 2nd edition was used unless otherwise specified.
[0119]
Example 1 Cloning of a gene (cDNA) that increases the reactivity with anti-i antibody (Den)
(1) Acquisition of mRNA from human melanoma cell line WM266-4 and human colon cancer cell line SW1116
1 × 108Fast Track (product number K1593), an mRNA extraction kit manufactured by Invitrogen, from human melanoma cell line WM266-4 (ATCC CRL 1676) and human colon cancer cell line SW1116 (ATCC CRL 233) -02), about 30 μg of mRNA was obtained for each. Specific reagents and methods followed the instructions given in the kit.
[0120]
(2) Preparation of cDNA library of WM266-4 and SW1116
Double-stranded cDNA was synthesized using oligo dT as a primer using 8 μg each of the mRNA derived from WM266-4 and SW1116 obtained in (1) above and a cDNA synthesis system kit manufactured by GIBCO BRL. However, the reverse transcriptase was not the Moloney Murine Leukemia Virus (M-MLV) reverse transcriptase included in the kit, but its Super ScriptTM RNAse H-Reverse Transcriptase.
[0121]
At the both ends of these double-stranded cDNAs,SfiI linker was applied. [SfiGiving I linker]
The single-stranded DNA represented by SEQ ID NO: 3 and the single-stranded DNA represented by SEQ ID NO: 4 were synthesized using an Applied Biosystems 380A DNA synthesizer. 50 μg each of the synthetic single-stranded DNA, 50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 10 mM MgCl2Dissolve in 50 μl of a buffer solution (hereinafter abbreviated as T4 kinase buffer) containing 5 mM dithiothreitol (hereinafter abbreviated as DTT), 0.1 mM EDTA and 1 mM ATP, and 30 units of T4 polynucleotide kinase (Takara Shuzo) And a phosphorylation reaction was carried out at 37 ° C. for 16 hours to obtain 11-base and 8-base linkers.
[0122]
After dissolving 11 base linker 4 μg, 8-base linker 2.9 μg and the double-stranded cDNA synthesized above in T4 ligase buffer 45 μl, add 1050 units of T4 DNA ligase, and react at 16 ° C. for 16 hours. Each strand DNASfiI linker was applied.
The obtained reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, and DNA fragments of about 1.6 kb or more were collected.
[0123]
In addition, 8 μg of the WM266-4-derived mRNA obtained above was used to synthesize a double-stranded cDNA using a cDNA synthesis system kit manufactured by GIBCO BRL with a random primer as a primer. In this synthesis reaction, Super ScriptTM RNAse H-Reverse Transcriptase was also used as the reverse transcriptase.
At both ends of the cDNA, the same method as aboveSfiAfter adding the I linker, agarose gel electrophoresis was performed to recover a DNA fragment of about 1.2 kb or more.
[0124]
PAMo [J. Biol. Chem., A direct expression cloning vector]268, 22782 (1993), also known as pAMoPRC3Sc (Japanese Patent Laid-Open No. 05-336963)] 24 μg, 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 6 mM MgCl2, 50 mM NaCl, 6 mM 2-mercaptoethanol buffer solution (hereinafter abbreviated as Y-50 buffer solution) 590 μl,SfiI (manufactured by Takara Shuzo Co., Ltd., unless otherwise specified, the restriction enzyme was manufactured by Takara Shuzo Co., Ltd.) and digestion reaction was carried out at 37 ° C. for 16 hours.
[0125]
40 units of the reaction solutionBamHI was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
The reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, and a DNA fragment of about 8.8 kb was recovered.
Prepared aboveSfiThree types of DNA (I mRNA derived from 8 μg) to which I linker was added were separately dissolved in 250 μl of T4 ligase buffer, and 2 μg of the approximately 8.8 kb DNA fragment and 2000 units of T4 DNA ligase were added to each lysate, The binding reaction was performed at 16 ° C. for 16 hours.
[0126]
After the reaction, 5 μg of transfer RNA (tRNA) was added to each reaction solution, and after ethanol precipitation, the resulting precipitate was buffered with 10 mM Tris-HCl (pH 8.0) and 1 mM EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid sodium acetate) , Abbreviated as TE buffer).
Using the reaction solution, an electroporation method [Nucleic Acids Res.,16, 6127 (1988)] by transforming Escherichia coli LE392 strain (Molecular Cloning Second Edition) and using DNA derived from WM266-4 using oligo dT primer, about 260,000 random primers were used. Approximately 300,000 transformants with ampicillin resistance obtained when using DNA derived from WM266-4 used, and about 300,000 when using DNA derived from SW1116 using oligo dT primer Then, cDNA libraries derived from the respective DNAs were constructed.
[0127]
(3) Cloning of a gene (cDNA) that increases the reactivity with anti-i antibody (Den)
For each cDNA library obtained in (2) above, a plasmid was prepared using a plasmid preparation kit / plasmid / maxi kit (product number 41031) manufactured by Qiagen.
The plasmid was precipitated in ethanol and dissolved in TE buffer so as to be 1 μg / μl.
[0128]
Using the plasmid lysate, serum-free medium-conditioned Namalwa cells (Namalwa KJM-1 cells) [Cytotechnology,1, 151 (1988)]. For the introduction of the plasmid, Lipofectin (manufactured by GIBCO BRL) was used, and a method according to the lipofection method described in the product instructions was used. In this method, as the serum-free medium, RPMI1640 • ITPSGF medium [7.5
[0129]
Specifically, 1.0 × 10 5 in RPMI1640 • ITPSGF medium without penicillin / streptomycin.6To 0.8 ml of cell suspension prepared to cells / ml, add 3.25 μl of lipofectin and 2 μg of plasmid,2The cells were cultured overnight in an incubator (37 ° C).
After the culture, 6.5 ml of RPMI1640 · ITPSGF medium was added, and further cultured for 2 days. Then, 10 times the amount of RPMI1640 · ITPSGF medium and G418 (GIBCOBRL; final concentration 0.5 mg / ml) were added, Further, the cells were cultured for 10 days to obtain stably transformed cells.
[0130]
By this method, about 33 μg of plasmid was used for the WM266-4 derived cDNA library using oligo dT primer, about 39 μg of plasmid was used for the WM266-4 derived cDNA library using random primer, and oligo dT primer was used. With respect to the SW1116-derived cDNA library, about 60 μg of plasmid was introduced into Namalwa KJM-1 cells to obtain stable transformed cells.
The obtained transformed cells are mixed for each library, and then anti-i antibody (Den) [J. Biol. Chem., Which is an antibody that recognizes a linear poly-N-acetyllactosamine sugar chain.254, 3221 (1979)]. A specific method is shown below.
[0131]
About 4 × 107The stably transformed cells were taken in a 50 ml centrifuge tube (2059 tube: manufactured by Falcon), and the cells were collected by centrifugation (130 × g, 10 minutes).
The cells were washed with phosphate buffer PBS containing 0.1% sodium azide (A-PBS: 8 g / l NaCl, 0.2 g / l KCl, 1.15 g / l Na2HPOFour(Anhydrous), 0.2 g / lKH2POFour, 0.1% sodium azide).
[0132]
To the washed cells, 0.5 ml of anti-i antibody (Den) diluted 100-fold with A-PBS was added and suspended, and reacted at 4 ° C. for 1 hour.
After the reaction, the cells were washed once with 20 ml of A-PBS, then suspended by adding 300 μl of a 30-fold diluted solution of anti-human IgM antibody (manufactured by DAKO) fluorescently labeled with fluorescein isothiocyanate (FITC) in A-PBS. The reaction was performed at 4 ° C. for 30 minutes.
[0133]
After the reaction, the cells were washed once with A-PBS, suspended in 1 ml of A-PBS, and fluoresce activated cell sorter [EPICS Elite Flow Cytometer; Coulter ( COULTER)] was used to aseptically separate and collect cells with high fluorescence intensity (upper 2.8%) (FIG. 1).
[0134]
The recovered cells were cultured and grown in RPMI1640 · ITPSGF medium containing 0.5 mg / ml G418, and then cells with high fluorescence intensity were aseptically separated and recovered by the same operation as described above. This operation was repeated again to separate and concentrate cells with high fluorescence intensity.
In the second operation, cells with high fluorescence intensity (upper 1.3%) were separated and in the third operation, cells with higher fluorescence intensity (upper 1.1%) were separated and recovered (FIG. 1).
[0135]
By the separation operation, cells with increased fluorescence intensity, that is, cells with increased expression level of linear poly-N-acetyllactosamine sugar chains were obtained (see FIG. 1).
After culturing the cells in RPMI1640 · ITPSGF medium containing 0.5 mg / ml G418, about 2 × 106From the individual cells, the Heart method [Mol. Cell. Biol.,8, 2837 (1988)].
[0136]
The plasmid was electroporated [Nucleic Acids Res.,16, 6127 (1988)] and introduced into Escherichia coli MC1061A strain to obtain a transformant having ampicillin resistance.
Plasmids were prepared from 75 of the transformants using an automated plasmid separator PI-100 manufactured by KURABO, and each plasmid was treated with a restriction enzyme (HindIII andAspThe structure of cDNA inserted by cutting in 718) was examined.
[0137]
As a result, the obtained plasmids were classified into 18 types.
The 18 kinds of plasmids were extracted with phenol / chloroform (1: 1) and precipitated with ethanol, dissolved in 10 μl of TE buffer, and electroporation [Cytotechnology,Three, 133 (1990)], each plasmid was introduced into Namalwa KJM-1 cells.
That is, 1.0 to 1.6 × 106Each cell (200 μl) was introduced with 3 μl of the plasmid prepared above or 4 μg of pAMo (control plasmid), suspended in 8 ml of RPMI1640 · ITPSGF medium,2The cells were cultured at 37 ° C. for 24 hours in an incubator.
[0138]
After the culture, G418 (manufactured by GIBCOBRL) was added to a concentration of 0.5 mg / ml, and the cells were further cultured for 10 to 14 days to obtain transformed cells.
The obtained transformed cells were subjected to indirect fluorescent antibody staining using an anti-i antibody (Den). As a result, a cell introduced with a plasmid designated 16-2-12 was compared with a cell introduced with pAMo. In addition, the reactivity to anti-i antibody (Den) (the peak value of the histogram) increased about 7 times (FIG. 2). On the other hand, the reactivity of the transformed cells introduced with other plasmids to the anti-i antibody (Den) hardly changed compared to the cells introduced with the control plasmid (pAMo) (FIG. 2).
[0139]
From the above results, it was revealed that the reactivity of the transformed cells to the anti-i antibody (Den) is increased by the cDNA inserted in the plasmid 16-2-12.
Indirect fluorescent antibody staining using anti-i antibody (Den) was performed as follows.
About 1 × 106Individual transformed cells were collected in a microtube (1.5 ml: Eppendorf), and the cells were collected by centrifugation (550 × g, 7 minutes).
[0140]
The cells were washed with 0.9 ml of A-PBS, 20 μl of anti-i antibody (Den) diluted 100-fold with A-PBS was added to the washed cells, and the cells were reacted at 4 ° C. for 1 hour.
[0141]
After the reaction, the cells were washed once with 0.9 ml of A-PBS, then suspended by adding 20 μl of a 30-fold diluted solution of anti-human IgM antibody (manufactured by DAKO) fluorescently labeled with FITC in A-PBS, 4 ° C. For 30 minutes.
After the reaction, the cells were washed once with 0.9 ml of A-PBS, suspended in 0.6 ml of A-PBS, and then used with a fluorescence activated cell sorter (FACSCaliber; Becton Dickinson Immunocytometry Systems USA). Analysis. As a control experiment, the same analysis was performed using A-PBS instead of the anti-i antibody (Den) (thin line in FIG. 2).
[0142]
(4) Determination of base sequence of cDNA inserted into plasmid 16-2-12 After preparing a restriction enzyme map of cDNA contained in plasmid 16-2-12 obtained in (3), DNA derived from the cDNA The fragment was subcloned into pBluescript II SK (+), and the entire nucleotide sequence of the cDNA was determined.
That is, by preparing plasmid 16-2-12 using a plasmid preparation kit / plasmid / maxi kit (product number 41031) manufactured by Qiagen, and cleaving the plasmid with various restriction enzymes, A restriction enzyme map of cDNA contained in the plasmid was prepared. The results are shown in FIG.
[0143]
Of the plasmid 16-2-12HindIII-StuI fragment (approximately 0.8 kb: No. 2 fragment in FIG. 3) andHindIII-SmaAn I fragment (about 0.6 kb: No. 12 fragment in FIG. 3) was isolated from pBluescript II SK (+)HindIII-HincSubcloned between II. In addition, plasmid 16-2-12HindIII-SmaThe I fragment (about 1.0 kb: No. 13 fragment in FIG. 3) was isolated and the pBluescript II SK (+)HindIII-HincSubcloned between II. In addition, plasmid 16-2-12HindIII-Asp718 fragment (about 0.6 kb: No. 7 fragment in FIG. 3) andHindIII-Asp718 fragment (about 0.4 kb: No. 11 fragment of FIG. 3) was isolated and pBluescript II SK (+)HindIII-AspSubcloned between 718. In addition, plasmid 16-2-12StuI-SacI fragment (about 0.7 kb: No. 19 fragment of FIG. 3) was isolated and pBluescript II SK (+)SacI-HincSubcloned between II.
[0144]
Using the six types of subcloned plasmids prepared as described above as templates, the nucleotide sequences of the cDNA fragments contained in them were determined using a DNA sequencer 377 from PerkinElmer. The base sequence was determined using a Perkin Elmer kit according to the instructions of the kit. By joining the results, the entire nucleotide sequence (2011 bp) of the cDNA contained in plasmid 16-2-12 was determined.
[0145]
The base sequence of the cDNA is shown in SEQ ID NO: 2.
The cDNA encoded a polypeptide consisting of 415 amino acids having a structure characteristic of glycosyltransferase. The polypeptide did not show homology with the amino acid sequences of known proteins whose structures have been elucidated so far. The amino acid sequence of the polypeptide is shown in SEQ ID NO: 1.
[0146]
The polypeptide has 8 amino acids at the N-terminus to the cytoplasm side, followed by a hydrophobic region consisting of 28 amino acids and bound to the membrane, and the remaining C-terminal part (including the catalytic site) is attached to the Golgi body lumen. It is thought that the structure is exposed to the sun.
Hereinafter, the cDNA is referred to as iGnT cDNA, and the protein encoded by the cDNA is referred to as iGnT.
[0147]
Example 2 Synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain in Namalwa KJM-1 cells into which the expression plasmid of iGnT cDNA obtained in Example 1 was introduced
(1) Construction of plasmid pAMo-i for expressing iGnT cDNA in animal cells (FIG. 4)
1 μg of pAMo is dissolved in 20 μl of Y-50 buffer and 20 units ofHindIII was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0148]
After the reaction, NaCl was added to 150 mM, and 20 units ofNotI was added, and a digestion reaction was further performed at 37 ° C. for 2 hours. After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 8.7 kbHindIII-NotI-treated DNA fragments were recovered.
Also, 1 μg of the plasmid 16-2-12 obtained in Example 1 was dissolved in 20 μl of Y-50 buffer to obtain 20 units.HindIII was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0149]
After the reaction, NaCl was added to 150 mM, and 20 units ofBstXI was added, and a digestion reaction was further performed at 37 ° C. for 2 hours. After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 0.5 kbHindIII-BstThe XI-treated DNA fragment was recovered.
In addition, plasmid 16-2-12 (1 μg) was mixed with 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 6 mM MgCl.2, 150 mM NaCl, 6 mM 2-mercaptoethanol buffer solution (hereinafter abbreviated as Y-150 buffer solution) 30 μl,BstXI and 20 unitsNotAdd I and digest at 37 ° C for 2 hourswent. After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 1.5 kb of BstXI-NotI-treated DNA fragments were recovered.
[0150]
About 8.7 kb obtained aboveHindIII-NotI-treated DNA fragment 0.02 μg, about 0.5 kbHindIII-BstXI-treated DNA fragment 0.02 μg, and about 1.5 kbBstXI-Not0.05 μg of I-treated DNA fragment was dissolved in 20 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
[0151]
Escherichia coli MM294 strain was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance.
A plasmid was isolated from the transformant according to a known method, and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion. Hereinafter, this plasmid is called pAMo-i (FIG. 4).
[0152]
(2) Synthesis of poly-N-acetyllactosamine sugar chain in Namalwa KJM-1 cells introduced with pAMo-i (FIG. 5)
Plasmids pAMo and pAMo-i were each dissolved in TE buffer so as to be 1 μg / μl, and then introduced into Namalwa KJM-1 cells by the lipofection method described in Example 1, (3), and transformed cells. Got.
Anti-i antibody (Den), an antibody that recognizes linear poly-N-acetyllactosamine sugar chains, is difficult to recognize poly-N-acetyllactosamine sugar chains with sialic acid added to the non-reducing end [Roelcke et al .: Vox Sanguinis,48, 181-183 (1985)]. Therefore, the transformed cells obtained above are treated with sialidase to remove terminal sialic acid, and then subjected to indirect fluorescent antibody staining with anti-i antibody (Den), and the cells directly The expression of chain poly-N-acetyllactosamine sugar chain was examined.
[0153]
Namalwa KJM-1 cells transfected with pAMo-i or control plasmid pAMo (5 × 10 56) 20mUClostridium perfringensOf the neuraminidase (neuraminidase, N2133, manufactured by Sigma) was suspended in 100 μl of PBS and reacted at 37 ° C. for 1 hour, whereby the transformed cells were treated with sialidase (+ sialidase). Control cells were prepared by reacting for 1 hour at 37 ° C. in PBS without neuraminidase (-sialidase).
About 1 × 10 of these6Cells were stained with indirect fluorescent antibody using anti-i antibody (Den) or A-PBS, and the expression of linear poly-N-acetyllactosamine sugar chain was examined.
[0154]
Indirect fluorescent antibody staining was performed according to the method described in Example 1 (3). The results are shown in FIG.
As the sialidase treatment increases the reactivity of Namalwa KJM-1 cells introduced with pAMo-i or control plasmid pAMo with anti-i antibody (Den), these transformed cells have sialic acid at the non-reducing end. It can be seen that the added linear poly-N-acetyllactosamine sugar chain was expressed.
[0155]
In Namalwa KJM-1 cells into which control plasmid pAMo has been introduced, the fluorescence intensity of cells stained with anti-i antibody (Den) (FIG. 5 bold line) is the fluorescence intensity of control cells stained with A-PBS (FIG. 5 thin line). The strength is relatively high, indicating that Namalwa KJM-1 cells originally expressed linear poly-N-acetyllactosamine sugar chains.
On the other hand, the reactivity of Namalwa KJM-1 cells transfected with pAMo-i with anti-i antibody (Den) is similar to that of Namalwa KJM-1 cells transfected with control plasmid pAMo, in both sialidase-treated and untreated conditions. It is stronger than that.
[0156]
This is because a linear poly-N-acetyllactosamine sugar chain is newly synthesized on a glycoprotein or glycolipid sugar chain on the cell surface by expressing iGnT cDNA in Namalwa KJM-1 cells. Furthermore, it can be understood that a linear poly-N-acetyllactosamine sugar chain can be newly synthesized also in a sugar chain of a glycoprotein secreted from a cell in which iGnT cDNA is expressed.
As described above, by secreting and producing a useful glycoprotein using the cell expressing the cDNA as a host, a sugar chain containing poly-N-acetyllactosamine is added to the secreted glycoprotein. Is possible.
[0157]
Example 3 Secretory production of protein A fusion type iGnT using Namalwa KJM-1 cells as a host
(1) Construction of iGnT secretion expression plasmid pAMoA-i52S (FIGS. 6 and 7) From the primary sequence of cloned iGnT, an N-terminal cytoplasmic region (8 amino acids) followed by a membrane-binding region (28 amino acids) and Since it is presumed to consist of a C-terminal catalytic activity region (379 amino acids), the cytoplasmic region and membrane-bound region on the N-terminal side of iGnT are removed, and the signal sequence of human granulocyte colony stimulating factor and yellow Staphylococcus (StaphylococcusaureusThe secretory expression of iGnT was attempted by adding the IgG binding region of protein A.
[0158]
A DNA region encoding a region considered to have catalytic activity [from the 52nd serine to the 415th cysteine of SEQ ID NO: 1] was prepared using PCR, and α1,3-fucose transferase (Fuc) described below was prepared. The plasmid pAMoA-i52S for secreting and expressing iGnT is obtained by replacing the Fuc-TIII gene part in pAMoA-FT3, which is a plasmid for secreting and expressing -TIII), with DNA encoding the putative catalytic region of iGnT. Created.
[0159]
pAMoA-FT3 was constructed by the following method (FIG. 6).
1 μg of pAMoA in 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 6 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 6 mM 2-mercaptoethanol buffer solution
Dissolved in 20 μl (hereinafter abbreviated as Y-100 buffer)StuI was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0160]
After the reaction, NaCl was added to 150 mM, and 20 units ofNotI was added, and a digestion reaction was further performed at 37 ° C. for 2 hours.
After subjecting the reaction solution to agarose gel electrophoresis, about 9.1 kbStuI-NotI-treated DNA fragments were recovered.
In addition, pAMo-FT3 [Sasaki et al .: Journal of Biological Chemistry (J. Biol. Chem.),269, 14730-14737 (1994)] Dissolve 2 μg in 20 μl of Y-100 buffer,BamHI was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0161]
After the reaction, ethanol precipitation is performed, the obtained precipitate is dissolved in 30 μl of DNA polymerase I buffer, 6 units of E. coli DNA polymerase I / Klenow fragment is added, and the mixture is reacted at 37 ° C. for 60
The reaction was stopped by phenol extraction, chloroform extraction and ethanol precipitation were performed, then dissolved in 30 μl of Y-150 buffer, and 20 units ofNotI was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0162]
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 1.8 kbBamHI (blunt end)-NotI-treated DNA fragments were recovered.
About 9.1 kb obtained aboveStuI-NotI fragment 0.05μg and about 1.8kbBamHI (blunt end)-Not0.05 μg of I fragment was dissolved in 20 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
[0163]
Escherichia coli MM294 strain was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance.
A plasmid was isolated from the transformant according to a known method, and the structure of the plasmid was confirmed by restriction enzyme digestion. This plasmid is called pAMoA-FT3.
[0164]
Plasmid pAMoA-i52S for secreting and expressing iGnT was constructed by the following method (FIG. 7).
As primers for PCR, DNA represented by SEQ ID NO: 5 (hereinafter referred to as C12-7) and DNA represented by SEQ ID NO: 6 (hereinafter referred to as C12-9) were synthesized (purchased from Sawaddy Technology). Is also possible).
In C12-7BamHI site is in C12-9NotSince the I site is designed to be introduced, the DNA fragment amplified by PCR isBamHI andNotAfter cutting with I, pAMoA-FT3BamWith HI siteNotIt can be incorporated between I sites.
[0165]
PCR was performed using a kit (GeneAmp ™ DNA Amplification Reagent Kit with AmpliTaq ™ Recombinant Taq DNA Polymerase) manufactured by Takara Shuzo. The reaction solution was prepared according to the method of the kit. Using a DNA thermal cycler (PERKIN ELMER CETUS DNA Thermal Cycler; sold by Takara Shuzo Co., Ltd.), the reaction was performed at 94 ° C. for 30 seconds, 65 ° C. for 1 minute, 72 ° C. for 2 minutes for 10 minutes. After cycling, the reaction was further continued at 72 ° C. for 7 minutes. As a template, 10 ng of the plasmid pAMo-i constructed in Example 2 was used.
[0166]
After completion of the reaction, chloroform extraction and ethanol precipitation were performed, and then dissolved in 30 μl of Y-150 buffer to obtain 20 units.BamHI and 20 unitsNotI was added and digestion was performed at 37 ° C. for 3 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, a DNA fragment of about 1.1 kb was recovered.
In addition, 1 μg of the pAMoA-FT3 obtained above was dissolved in 30 μl of Y-150 buffer, and 20 units ofBamHI andNotI was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0167]
After subjecting the reaction solution to agarose gel electrophoresis, about 9.1 kbBamHI-NotI-treated DNA fragments were recovered.
About 1.1 kb obtained aboveBamHI-Not0.1 μg of I-treated DNA fragment and about 9.1 kbBamHI-Not0.1 μg of I-treated DNA fragment was dissolved in 30 ml of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
[0168]
Escherichia coli MM294 was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance.
A plasmid was isolated from the transformant according to a known method, and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion. This plasmid is called pAMoA-i52S.
[0169]
(2) Expression of secreted iGnT in Namalwa KJM-1 cells and acquisition of secreted iGnT
The control plasmid pAMoA and the plasmid pAMoA-i52S for secretory expression of iGnT constructed as described above were prepared using a plasmid preparation kit (/ plasmid / maxi kit; trademark number 41031) manufactured by Qiagen.
The prepared and obtained plasmid was dissolved in TE buffer so as to be 1 μg / μl after ethanol precipitation.
After lysis, both plasmids were introduced into Namalwa KJM-1 cells by the lipofection method described in Example 1 to obtain transformants.
[0170]
The obtained transformant is 5 × 10 5 in 30 ml of RPMI1640 · ITPSGF medium containing 0.5 mg / ml of G418.FourSuspend to cells / ml, CO2The cells were cultured at 37 ° C. for 9 days in an incubator.
After culturing, the cells were removed by centrifugation under conditions of 160 × g, 10 minutes and 1500 × g, 10 minutes, and the supernatant was collected.
The culture supernatant can be stored at −80 ° C. and can be thawed before use.
[0171]
IGnT encoded by the plasmid pAMoA-i52S is S. aureus (StaphylococcusaureusThe protein A is secreted and expressed as a fusion protein with the IgG binding region of protein A, and thus can be easily purified using IgG Sepharose.
After adding sodium azide to the culture supernatant obtained above to a final concentration of 0.1%, 30 μl of IgG sepharose (Pharmacia) pretreated according to the product instructions was added, and overnight at 4 ° C. Stir slowly.
[0172]
After stirring, IgG Sepharose was recovered by centrifugation at 160 × g for 10 minutes, and the Sepharose was mixed with 1 ml of a buffer containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.6), 150 mM sodium chloride, 0.05% Tween20. Washed twice.
After washing, the protein adsorbed to IgG sepharose was eluted with 30 μl of 0.5 M acetate buffer (pH adjusted to 3.4 with ammonium acetate), and then IgG sepharose was centrifuged at 160 × g for 10 minutes. Excluded.
9 μl of 2M Tris was added to the eluate to adjust the pH to 7.0.
[0173]
SDS-PAGE was performed using 15 μl of the eluate thus prepared, and then silver staining was performed using a silver staining kit Wako (manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) (FIG. 8).
When an eluate derived from the culture supernatant of Namalwa KJM-1 cells introduced with pAMoA-i52S was used, a band of about 57 kD was confirmed. On the other hand, when an eluate derived from the culture supernatant of Namalwa KJM-1 cells introduced with the vector pAMoA was used, a band of about 57 kD was not detected.
From the above results, secretory iGnT can be secreted and produced in the culture supernatant as a fusion protein with the IgG binding region of S. aureus protein A, and the fusion protein can be easily purified using IgG sepharose. It was shown that there is.
[0174]
Example 4 Secretion production of Flag-fused iGnT using Namalwa KJM-1 cells as a host
(1) Construction of Flag fusion type secretion vector pAMoF2 (FIG. 9)
A secretory vector pAMoF2 for secreting and expressing a Flag peptide (SEQ ID NO: 17) added to the N-terminus of an arbitrary protein was constructed. The signal sequence of immunoglobulin κ and the DNA encoding the Flag peptide were prepared using 6 types of synthetic DNA.
[0175]
1 μg of pAMo was added to 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 6 mM MgCl.2, 80 mM NaCl, 6 mM 2-mercaptoethanol buffer solution (hereinafter abbreviated as Y-80 buffer solution) 20 μl,HindIII and 20 unitsAsp718 was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 8.7 kbHindIII-AspThe 718-treated DNA fragment was recovered.
[0176]
Separately,HindIII cleavage site andAspThe following 6 types of DNA [IgK-1 (SEQ ID NO: 7), IgK-2 (SEQ ID NO: 8), IgK-3 (SEQ ID NO: 9), IgK-4 (SEQ ID NO: 7)] are used as linkers for linking 718 cleavage sites. 10), IgK-5 (SEQ ID NO: 11), IgK-6 (SEQ ID NO: 12)]. In the linker constructed by these DNAs,PmaCI,StuI,SnaEach restriction enzyme cleavage site of BI is incorporated. Each of the six DNAs was synthesized using an Applied Biosystems 380A DNA synthesizer. 0.2 μg of each synthesized DNA was dissolved in 20 μl of T4 kinase buffer, 30 units of T4 polynucleotide kinase (Takara Shuzo Co., Ltd., hereinafter the same) was added, and phosphorylation was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0177]
Six types of phosphorylated synthetic DNA (5 ng each) obtained above and about 8.7 kbHindIII-Asp0.05 μg of 718-treated DNA fragment was dissolved in 20 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
Escherichia coli MM294 strain was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance.
A plasmid was isolated from the transformant according to a known method, and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion and nucleotide sequencing. Hereinafter, this plasmid is called pAMoF2 (FIG. 9).
[0178]
(2) Construction of Flag-fused iGnT secretion expression plasmid pAMoF2-i52S (FIGS. 10 and 11)
Since the cloned iGnT is presumed from its primary sequence, it consists of an N-terminal cytoplasmic region (8 amino acids) followed by a membrane-bound region (28 amino acids) and a C-terminal catalytic activity region (379 amino acids). The cytoplasmic region and the membrane-bound region on the N-terminal side of iGnT were removed, and an immunoglobulin signal sequence and a Flag peptide were added to the removed region to attempt secretory expression of iGnT.
[0179]
First, a DNA fragment (prepared in Example 1) encoding a region considered to have iGnT catalytic activity (from the 52nd serine of SEQ ID NO: 1 to the 415th cysteine) was prepared from the T-vector pT7Blue (R ) (Manufactured by Novagen), the plasmid pT7B-i52S No. 3 was created.
pT7B-i52S No. 3 was formed by the following method (FIG. 10).
[0180]
0.1 μg of the approximately 1.1 kb PCR amplified DNA fragment prepared in (1) of Example 3 and 0.02 μg of T-vector pT7Blue (R) (manufactured by Novagen) were dissolved in 30 μl of T4 ligase buffer, and T4 DNA was dissolved. 175 units of ligase was added and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
Escherichia coli MM294 was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance.
A plasmid was isolated from the transformant according to a known method, and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion. This plasmid was designated as pT7B-i52S No. 3 (FIG. 10).
[0181]
Subsequently, the construction of a flag fusion type iGnT secretion expression plasmid pAMoF2-i52S was performed (FIG. 11).
1 μg of pAMoF2 is dissolved in 20 μl of Y-100 buffer and 20 units ofStuI and 20 unitsBanIII was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After subjecting the reaction solution to agarose gel electrophoresis, about 7.2 kbStuI-BanIII-treated DNA fragments were recovered.
Also, 1 μg of pAMo is dissolved in 20 μl of Y-100 buffer, and 20 units ofBanIII was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0182]
After the reaction, NaCl was added to 150 mM, and 20 units ofNotI was added, and a digestion reaction was further performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 1.7 kbBanIII-NotI-treated DNA fragments were recovered.
In addition, 1 μg of pT7B-i52S No. 3 is dissolved in 20 μl of Y-100 buffer and 20 units ofBamHI was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0183]
After the reaction, ethanol precipitation is performed, the obtained precipitate is dissolved in 30 μl of DNA polymerase I buffer, 6 units of E. coli DNA polymerase I / Klenow fragment is added, and the mixture is reacted at 37 ° C. for 60
The reaction was stopped by phenol extraction, chloroform extraction and ethanol precipitation were performed, then dissolved in 30 μl of Y-150 buffer, and 20 units ofNotI was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0184]
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 1.1 kbBamHI (blunt end)-NotI-treated DNA fragments were recovered.
The 7.2 kb obtained above.StuI-BanIII-treated DNA fragment of 0.05 μg and about 1.7 kbBanIII-Not0.01 μg of I-treated DNA fragment, and about 1.1 kbBamHI (blunt end)-Not0.05 μg of I fragment was dissolved in 20 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
[0185]
Escherichia coli MM294 strain was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance.
A plasmid was isolated from the transformant according to a known method, and the structure of the plasmid was confirmed by restriction enzyme digestion. This plasmid is called pAMoF2-i52S (FIG. 11).
[0186]
(2) Expression of Flag fusion secretory iGnT in Namalwa KJM-1 cells
The control plasmid pAMoF2 and the iGnT Flag fusion secretion expression plasmid pAMoF2-i52S constructed as described above were prepared using a plasmid preparation kit (/ plasmid / maxi kit; trademark number 41031) manufactured by Qiagen.
The prepared and obtained plasmid was dissolved in TE buffer so as to be 1 μg / μl after ethanol precipitation.
[0187]
After lysis, both plasmids were introduced into Namalwa KJM-1 cells by the lipofection method described in Example 1 to obtain transformants.
The obtained transformant was 5 × 10 5 in 30 ml of RPMI1640 medium containing 0.5 mg / ml of G418 and 2% of fetal calf serum.FourSuspend to cells / ml, CO2The cells were cultured at 37 ° C. for 9 days in an incubator.
[0188]
After culturing, the cells were removed by centrifugation under conditions of 160 × g, 10 minutes and 1500 × g, 10 minutes, and the supernatant was collected.
The culture supernatant can be stored at −80 ° C. and can be thawed before use.
Since iGnT encoded by the plasmid pAMoF2-i52S is secreted and expressed as a fusion protein with the Flag peptide, it can be easily obtained using an anti-Flag M1 Affinity Gel (Cosmo Bio). Purification is possible.
[0189]
After adding sodium azide, sodium chloride, and calcium chloride to the culture supernatant obtained above to a final concentration of 0.1%, 150 mM, and 2 mM, respectively, anti-Flag M1 Affinity Gel (Anti-Flag M1 Affinity Gel) Cosmo Bio) was added, and the mixture was stirred slowly at 4 ° C. overnight.
After stirring, the anti-Flag M1 affinity gel was recovered by centrifuging at 160 × g for 10 minutes, and the gel was collected with 1 ml of a buffer containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.4), 150 mM sodium chloride, 1 mM calcium chloride. Washed twice.
[0190]
After washing, 30 μl of a buffer solution containing 50 mM Tris-hydrochloric acid (pH 7.4), 150 mM sodium chloride, and 2 mM EDTA was added to the gel, followed by treatment at 4 ° C. for 30 minutes to elute the protein adsorbed on the gel. Thereafter, the supernatant was obtained by centrifugation at 160 × g for 10 minutes. To the gel, 30 μl of a buffer containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.4), 150 mM sodium chloride, and 2 mM EDTA was added again, treated at 4 ° C. for 10 minutes, and then centrifuged at 160 × g for 10 minutes. Acquired. Then, said operation was performed again and elution operation was performed 3 times in total.
To the eluate, 1M calcium chloride was added to a final concentration of 4 mM.
[0191]
SDS-PAGE was performed using 15 μl of the first eluate prepared as described above, and then silver staining was performed using a silver staining kit Wako (manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) (FIG. 12).
When an eluate derived from the culture supernatant of Namalwa KJM-1 cells introduced with pAMoF2-i52S was used, a band of about 49 kD was confirmed. On the other hand, when an eluate derived from the culture supernatant of Namalwa KJM-1 cells into which the vector pAMoF2 was introduced, a band of about 49 kD was not detected.
From the above results, it was shown that Flag-fused iGnT is secreted and produced in the culture supernatant and can be purified using an anti-FlagM1 affinity gel.
[0192]
Example 5 Preparation of recombinant virus solution for iGnT production using insect cells as hosts
(1) Production of recombinant virus for expressing iGnT in insect cells
A step of incorporating a DNA encoding a target protein into a special plasmid called a transfer vector (step 1), a transfer vector incorporating the target DNA prepared in
This step was performed according to the following procedure according to the manual of the kit using a Pharmingen Baculo Gold Starter Kit (Product No. PM-21001K).
[0193]
(Step 1) Integration of iGnT cDNA into transfer vector (FIG. 13)
Of the multiple cloning site present in the transfer vector pVL1393SmaWith I siteBglA plasmid pVL1393-i incorporating iGnT cDNA was constructed between the II sites.
1 μg of pVL1393 was added to 25 μl of 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 6 mM MgCl.2, 20 mM KCl, 6 mM 2-mercaptoethanol in a buffer solution (hereinafter abbreviated as K-20 buffer solution)SmaI was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0194]
After the reaction, NaCl was added to 80 mM, and 20 units ofBstPI was added, and a digestion reaction was further performed at 60 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 3.2 kbSmaI-BstThe PI-treated DNA fragment was recovered.
Also, 1 μg of pVL1393 was dissolved in 25 μl of Y-80 buffer, and 20 units ofBglII was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0195]
After the reaction, 20 unitsBstPI was added, and a digestion reaction was further performed at 60 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 6.4 kb was obtained.BglII-BstThe PI-treated DNA fragment was recovered.
1 μg of pAMo-i is dissolved in 25 μl of Y-150 buffer and 20 units ofBglII and 20 unitsEcoRV was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0196]
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 2.0 kbEcoRV-BglII-treated DNA fragments were recovered.
About 3.2 kb derived from pVL1393 obtained aboveSmaI-BstPI-treated DNA fragment 0.1 μg and about 6.4 kb derived from pVL1393BglII-Bst0.2 μg of PI-treated DNA fragment, and about 2.0 kb derived from pAMo-iEcoRV-BglII-treated DNA fragment (0.2 μg) was dissolved in 30 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
Using the reaction solution, E. coli MM294 strain was transformed by the method of Cohen et al. To obtain an ampicillin resistant strain. A plasmid was isolated from this transformant according to a known method. This plasmid was named pVL1393-i, and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion (FIG. 13).
[0197]
(Step 2) Production of recombinant virus
Insect cells Sf9 (manufactured by Pharmingen) cultured using TNM-FH insect medium (manufactured by Pharmingen) have linear baculovirus DNA (BaculoGold baculovirus DNA), Pharmingen And the plasmid pVL1393-i was prepared by the lipofectin method [protein nucleic acid enzyme,37, 2701 (1992)], a recombinant baculovirus was prepared as follows.
[0198]
1-5 μg of pVL1393-i and 15 ng of linear baculovirus DNA were dissolved in 12 μl of distilled water, and then 6 μl (6 μg) of Lipofectin (GIBCO BRL) and 6 μl of distilled water were mixed and added at room temperature. Left for 15 minutes.
About 2 × 106Sf9 cells were suspended in 2 ml of Sf900-II medium (GIBCO BRL), placed in a plastic dish for cell culture with a diameter of 35 mm, and then the total amount of a mixed solution of pVL1393-i, linear baculovirus DNA, and lipofectin Was added and cultured at 27 ° C. for 3 days.
[0199]
1 ml of the culture supernatant containing the recombinant virus was collected from the culture solution.
1 ml of TNM-FH insect medium was added to the petri dish from which the culture supernatant was obtained, and further cultured at 27 ° C. for 4 days. After the culture, 1.5 ml of a culture supernatant containing the recombinant virus was obtained in the same manner.
[0200]
(2) Acquisition of recombinant virus solution
About 8 × 106Individual Sf9 cells were suspended in 5 ml of Sf900-II medium,2Place in a flask (manufactured by Greiner) and let stand at room temperature for 30 minutes to allow cells to adhere to the flask, remove the supernatant, and add 1 ml of Sf900-II medium and the recombinant virus obtained in (1) above to the flask. 1 ml of culture supernatant containing was added.
After the addition, the cells and the virus were sufficiently brought into contact by gently shaking at room temperature for 1 hour, and then 4 ml of TNM-FH insect medium was added and cultured at 27 ° C. for 4 days.
[0201]
The culture solution was centrifuged at 1500 × g for 10 minutes to obtain Sf9 cells infected with the recombinant virus and 5.5 ml of the recombinant virus solution.
About 2 × 107Individual Sf9 cells are suspended in 15 ml of Sf900-II medium,2Place in a flask (manufactured by Greiner) and leave at room temperature for 30 minutes to allow cells to adhere to the flask. Remove the supernatant and add 5 ml of Sf900-II medium and 1 ml of the recombinant virus solution obtained above to the flask. did.
[0202]
After the addition, the cells and the virus were brought into sufficient contact by gently shaking at room temperature for 1 hour, and then 10 ml of TNM-FH insect medium was added and cultured at 27 ° C. for 4 days.
The culture solution was centrifuged at 1500 × g for 10 minutes to obtain Sf9 cells infected with the replacement virus and 15 ml of the recombinant virus solution.
[0203]
The virus titer of the recombinant virus solution was calculated by the following method (Pharmingen Baculo Gold Starter Kit Manual).
About 6 × 106Each Sf9 cell was suspended in 4 ml of Sf900-II medium, placed in a plastic petri dish for cell culture having a diameter of 60 mm, and allowed to stand at room temperature for 30 minutes to allow the cells to adhere to the petri dish. Sf900-II medium 400 μl and Sf900-II medium 10-FourOr 10-Five100 μl of the above-mentioned recombinant virus solution diluted in 1 ml was added.
[0204]
After the addition, the petri dish was gently shaken at room temperature for 1 hour to sufficiently bring the cells and the virus into contact.
After contact, the medium was removed from the petri dish, and 2 ml of Sf900-II medium (incubated at 42 ° C.) containing 2% low melting point agarose (Agarplaque Agarose; manufactured by Pharmingen) in the petri dish. A mixture of 2 ml of TNM-FH insect medium (kept at 42 ° C.) was poured and left at room temperature for 15 minutes.
[0205]
After leaving, the petri dish was covered with vinyl tape to prevent drying, and the petri dish was placed in a sealable plastic container and cultured at 27 ° C. for 5 days.
After culturing, 1 ml of PBS buffer containing 0.01% neutral red was added to the petri dish, and after further culturing for 1 day, the number of plaques that appeared was counted.
From the above operation, the recombinant virus solution is about 1.2 × 108It was found to contain plaque forming unit (PFU) / ml virus.
Further, using the transfer vector pVL1393, a recombinant virus for control and Sf9 cells infected with the virus were prepared. Recombinant virus solution for control is about 1.4 × 108It was found to contain plaque forming unit (PFU) / ml virus.
[0206]
Example 6 Secretory production of protein A-fused iGnT using insect cells as hosts
Secretory expression of the protein A fusion type iGnT shown in Example 3 in insect cells was performed.
(1) Preparation of recombinant virus for secretory expression of protein A fusion type iGnT in insect cells (Step 1) Incorporation of DNA encoding protein A fusion type iGnT into a transfer vector (FIG. 14)
Of the multiple cloning site present in the transfer vector pVL1393SmaWith I siteNotA plasmid pVL1393-Ai52S incorporating the DNA encoding protein A fusion secretory iGnT shown in Example 3 was constructed between the I sites.
[0207]
1 μg of pVL1393 is dissolved in K-20 buffer and 20 units ofSmaI was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction, NaCl was added to 80 mM, and 20 units ofBstPI was added, and a digestion reaction was further performed at 60 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 3.2 kbSmaI-BstPI-treated DNA fragments were recovered.
Also, 1 μg of pVL1393 was dissolved in 25 μl of Y-80 buffer, and 20 units ofBstPI was added and digestion was performed at 60 ° C. for 2 hours.
[0208]
After the reaction, NaCl was added to 150 mM, and 20 units ofNotI was added, and a digestion reaction was further performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0209]
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 6.4 kb was obtained.NotI-BstPI-treated DNA fragments were recovered.
[0210]
1 μg of pAMoA-i52S (made in Example 3) was dissolved in 25 μl of Y-100 buffer and 20 units ofSalI was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction, ethanol precipitation is performed, the obtained precipitate is dissolved in 30 μl of DNA polymerase I buffer, 6 units of E. coli DNA polymerase I / Klenow fragment is added, and the mixture is reacted at 37 ° C. for 60
[0211]
The reaction was stopped by phenol extraction, chloroform extraction and ethanol precipitation were performed, then dissolved in 30 μl of Y-150 buffer, and 20 units ofNotI was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 1.4 kbSalI (blunt end)-NotI-treated DNA fragments were recovered.
[0212]
About 3.2 kb derived from pVL1393 obtained aboveSmaI-BstPI-treated DNA fragment 0.1 μg and about 6.4 kb derived from pVL1393NotI-Bst0.2 μg of PI-treated DNA fragment, and about 1.4 kb derived from pAMoA-i52SSalI (blunt end)-Not0.2 μg of I-treated DNA fragment was dissolved in 30 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
[0213]
Escherichia coli MM294 strain was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance. A plasmid was isolated from the transformant according to a known method. This plasmid was named pVL1393-Ai52S, and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion (FIG. 14).
[0214]
(Step 2) Production of recombinant virus
In the same manner as in Example 5 (Step 2), 1.5 ml of a recombinant baculovirus solution derived from pVL1393-Ai52S was obtained.
(2) Acquisition of recombinant virus solution and Sf9 cells infected with recombinant virus
In the same manner as the method shown in (2) of Example 5, about 8 × 106Sf9 cells were infected with the recombinant virus obtained in the above (1) to obtain Sf9 cells infected with the recombinant virus and 5.5 ml of the recombinant virus solution.
[0215]
Further, in the same manner as the method shown in (2) of Example 5, approximately 2 × 107Individual Sf9 cells were infected with the recombinant virus obtained above to obtain Sf9 cells infected with the recombinant virus and 15 ml of the recombinant virus solution.
Further, using the transfer vector pVL1393, a recombinant virus for control and Sf9 cells infected with the virus were prepared.
[0216]
(3) Secretion production and purification of protein A fusion type iGnT polypeptide
IGnT encoded by the recombinant virus derived from plasmid pVL1393-Ai52S is S. aureus (StaphylococcusaureusThe protein A is secreted and expressed as a fusion protein with the IgG binding region of protein A, and thus can be easily purified using IgG Sepharose.
About 2 × 107Individual Sf21 cells were suspended in 15 ml of Sf900-II medium,2Place in a flask (manufactured by Greiner) and let stand at room temperature for 30 minutes to allow cells to adhere to the flask. Then remove the supernatant and add 5 ml of Sf900-II medium and the recombinant virus solution obtained in (2) above to the flask. 1 ml was added.
[0217]
After the addition, the cells and the virus were brought into sufficient contact by gently shaking at room temperature for 1 hour, and then 10 ml of TNM-FH insect medium was added and cultured at 27 ° C. for 4 days.
The culture solution was centrifuged at 1500 × g for 10 minutes to obtain 15 ml of a culture supernatant that was thought to contain secreted iGnT.
After adding sodium azide to a final concentration of 0.1% to 10 ml of the culture supernatant obtained above, 100 μl of IgG sepharose (manufactured by Pharmacia) pretreated according to the product instructions was added, and 4 ° C. Stir slowly overnight.
[0218]
After stirring, IgG Sepharose was recovered by centrifugation at 160 × g for 10 minutes, and the Sepharose was mixed with 1 ml of a buffer containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.6), 150 mM sodium chloride, 0.05% Tween20. Washed twice.
After washing, 100 μl of 0.5 M acetate buffer (pH adjusted to 3.4 with ammonium acetate) was used to elute the protein adsorbed to IgG sepharose, and then centrifuged at 160 × g for 10 minutes to obtain IgG sepharose. Excluded.
30 μl of 2M Tris was added to the eluate to adjust the pH to 7.0.
[0219]
SDS-PAGE was performed using 15 μl of the eluate thus prepared, and then staining was performed using Coomassie Brilliant Blue (FIG. 15).
When an eluate prepared from the culture supernatant of Sf21 infected with the recombinant virus derived from pVL1393-Ai52S was used, a band of about 50 kD was confirmed. On the other hand, when an eluate prepared from the culture supernatant of Sf21 infected with a recombinant virus derived from the vector pVL1393 was used, a band of about 50 kD was not detected.
From the above results, secreted iGnT can be secreted and produced in the culture supernatant as a fusion protein with the IgG binding region of S. aureus protein A, and the secreted protein can be purified using IgG sepharose. It was shown that.
[0220]
Example 7 Secretory production of Flag peptide-fused iGnT using insect cells as hosts
Secreted expression in insect cells of the Flag peptide-fused iGnT shown in Example 4 was performed.
(1) Preparation of recombinant virus for secretory expression of Flag peptide-fused iGnT in insect cells (Step 1) Incorporation of DNA encoding Flag peptide-fused secretory iGnT into a transfer vector (FIG. 16)
Of the multiple cloning site present in the transfer vector pVL1393SmaWith I siteNotA plasmid pVL1393-F2i52S incorporating the DNA encoding the Flag peptide fusion secretory iGnT shown in Example 4 was constructed between the I sites.
[0221]
PAMoF2-i52S prepared in Example 4 was dissolved in 1 μg, 25 μl of Y-80 buffer, and 20 units ofHindIII was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction, ethanol precipitation is performed, the obtained precipitate is dissolved in 30 μl of DNA polymerase I buffer, 6 units of E. coli DNA polymerase I / Klenow fragment is added, and the mixture is reacted at 37 ° C. for 60
[0222]
The reaction was stopped by phenol extraction, chloroform extraction and ethanol precipitation were performed, then dissolved in 30 μl of Y-150 buffer, and 20 units ofNotI was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 1.2 kbHindIII (blunt end)-NotI-treated DNA fragments were recovered.
[0223]
About 1.2 kb obtained aboveHindIII (blunt end)-Not0.2 μg of I-treated DNA fragment and about 3.2 kb derived from pVL1393 obtained in (1) of Example 5SmaI-BstPI-treated DNA fragment 0.1 μg and about 6.4 kb derived from pVL1393 obtained in Example 5 (1)NotI-Bst0.2 μg of the PI-treated DNA fragment was dissolved in 30 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
Using the reaction solution, E. coli MM294 strain was transformed by the method of Cohen et al. To obtain an ampicillin resistant strain. A plasmid was isolated from this transformant according to a known method. This plasmid was named pVL1393-F2i52S (FIG. 16), and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion.
[0224]
(Step 2) Production of recombinant virus
In the same manner as in Example 5 (Step 2), 1.5 ml of a recombinant baculovirus solution derived from pVL1393-F2i52S was obtained.
(2) Acquisition of recombinant virus solution and Sf9 cells infected with recombinant virus
In the same manner as the method shown in (2) of Example 5, about 8 × 106Sf9 cells were infected with the recombinant virus obtained in the above (1) to obtain Sf9 cells infected with the recombinant virus and 5.5 ml of the recombinant virus solution.
In the same manner as the method shown in (2) of Example 5, approximately 2 × 107Individual Sf9 cells were infected with the recombinant virus obtained above to obtain Sf9 cells infected with the recombinant virus and 15 ml of the recombinant virus solution.
Further, using the transfer vector pVL1393, a recombinant virus for control and Sf9 cells infected with the virus were prepared.
[0225]
(3) Secretion production and purification of Flag peptide-fused iGnT polypeptide
Since iGnT encoded by a recombinant virus derived from the plasmid pVL1393-F2i52S is secreted and expressed as a fusion protein with the Flag peptide, an anti-Flag M1 affinity gel (Cosmo Bio) was used. And can be easily purified.
About 2 × 107Individual Sf21 cells were suspended in 15 ml of Sf900-II medium,2Place in a flask (manufactured by Greiner) and let stand at room temperature for 30 minutes to allow cells to adhere to the flask. Then remove the supernatant and add 5 ml of Sf900-II medium and the recombinant virus solution obtained in (2) above to the flask. 1 ml was added.
[0226]
After the addition, the cells and the virus were brought into sufficient contact by gently shaking at room temperature for 1 hour, and then 10 ml of TNM-FH insect medium was added and cultured at 27 ° C. for 4 days. The culture solution was centrifuged at 1500 × g for 10 minutes to obtain 15 ml of a culture supernatant that was thought to contain secreted iGnT.
After adding sodium azide, sodium chloride, and calcium chloride to 10 ml of the culture supernatant obtained above to a final concentration of 0.1%, 150 mM, and 2 mM, respectively, anti-FlagM1 affinity gel (Anti-Flag M1 Affinity Gel) ; Cosmo Bio) was added and slowly stirred at 4 ° C. overnight.
[0227]
After stirring, the anti-Flag M1 affinity gel was recovered by centrifuging at 160 × g for 10 minutes, and the gel was collected with 1 ml of a buffer containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.4), 150 mM sodium chloride, 1 mM calcium chloride. Washed twice.
After washing, 80 μl of a buffer solution containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.4), 150 mM sodium chloride, and 2 mM EDTA was added to the gel, followed by treatment at 4 ° C. for 30 minutes to elute the protein adsorbed on the gel. Thereafter, the supernatant was obtained by centrifugation at 160 × g for 10 minutes. To the gel, 80 μl of a buffer containing 50 mM Tris-HCl (pH 7.4), 150 mM sodium chloride, and 2 mM EDTA was added again, treated at 4 ° C. for 10 minutes, and then centrifuged at 160 × g for 10 minutes. Acquired. Then, said operation was performed again and elution operation was performed 3 times in total.
[0228]
To the eluate, 1M calcium chloride was added to a final concentration of 4 mM.
After performing SDS-PAGE using 15 μl of the eluate thus prepared, staining was performed using Coomassie Brilliant Blue (FIG. 17).
When an eluate prepared from the culture supernatant of Sf21 infected with the recombinant virus derived from pVL1393-F2i52S was used, a band of about 43 kD was confirmed. On the other hand, when an eluate prepared from the culture supernatant of Sf21 infected with a recombinant virus derived from the vector pVL1393 was used, a band of about 43 kD was not detected.
From the above results, it was shown that Flag-fused iGnT is secreted and produced in the culture supernatant and can be easily purified using an anti-Flag M1 affinity gel.
[0229]
Example 8 Establishment of Quantification Method of iGnT Transcript by PCR Method and Examination of Expression Level in Various Cells Quantification of iGnT transcript was performed by quantitative PCR method [Proc. Natl. Acad. Sci. USA.,87, 2725 (1990)]. The amount of iGnT transcript in various cells and cell lines was expressed as a relative value when the amount of β-actin transcript thought to be expressed to the same extent in all cells was taken as 100.
[0230]
(1) Construction of standard plasmid pBSK + iGnT13 (FIG. 18)
One of the plasmids for determining the iGnT cDNA sequence (named pBSK + iGnT13) constructed in (4) of Example 1 was used as a standard plasmid. The plasmid is plasmid 16-2-12.HindIII-SmaThe I fragment (about 1.0 kb: No. 13 fragment in FIG. 3) of pBluescript II SK (+)HindIII-HincPrepared by subcloning between II. The method for constructing the plasmid is shown below.
[0231]
1 μg of plasmid 16-2-12, 25 μl of 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 6 mM MgCl2, 60 mM KCl, 6 mM 2-mercaptoethanol.HindIII and 20 unitsSmaI was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 1.0 kbHinThe dIII-SmaI treated DNA fragment was recovered.
[0232]
Dissolve pBluescript II SK (+) in 1 μg, 25 μl of Y-50 buffer,HindIII and 20 unitsHincII was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 2.95 kbHindIII-HincII-treated DNA fragments were recovered.
[0233]
About 1.0 kb obtained aboveHindIII-Sma0.1 μg of I-treated DNA fragment and about 2.95 kbHindIII-HincII-treated DNA fragment 0.05 μg was dissolved in 20 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
Escherichia coli JM105 strain was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance.
A plasmid was isolated from the transformant according to a known method.
The plasmid was named pBSK + iGnT13, and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion and nucleotide sequence determination. The structure of the plasmid is shown in FIG.
[0234]
(2) Construction of plasmid pBSK + iGnT13d for internal control (FIG. 19)
Plasmid pBSK + iGnT13d having a deletion mutation in iGnT cDNA contained in pBSK + iGnT13 constructed in (1) above was constructed.
[0235]
pBSK + iGnT13 was dissolved in 1 μg, 25 μl of Y-100 buffer, and 20 units ofXhoI and 20 unitsStuI was added and digestion reaction was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0236]
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 3.1 kbXhoI-StuI-treated DNA fragments were recovered.
pBSK + iGnT13 was dissolved in 1 μg, 25 μl of Y-100 buffer, and 20 units ofXhoI and 20 unitsHincII was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
After the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, about 0.6 kbXhoI-HincII-treated DNA fragments were recovered.
[0237]
About 3.1 kb obtained aboveXhoI-Stu0.05 μg of I-treated DNA fragment and about 0.6 kbXhoI-HincII-treated DNA fragment (0.1 μg) was dissolved in 20 μl of T4 ligase buffer, 175 units of T4 DNA ligase was added, and a binding reaction was performed at 12 ° C. for 16 hours.
Escherichia coli MM294 strain was transformed with the reaction solution by the method of Cohen et al. To obtain a transformant having ampicillin resistance.
A plasmid was isolated from the transformant according to a known method.
The plasmid was named pBSK + iGnT13d, and its structure was confirmed by restriction enzyme digestion. The structure of the plasmid is shown in FIG.
[0238]
(3) Quantification of iGnT transcripts in various cells and cell lines using quantitative PCR
(A) Synthesis of single-stranded cDNA (used as a template for quantitative PCR) derived from various cells and cell lines
As cell lines, Namalwa KJM-1 cells, WM266-4 cells, THP-1 cells, HL-60 cells, U-937 cells, Colo205 cells, LS180 cells, SW1116 cells and Jurkat cells were used.
[0239]
WM266-4 cells, THP-1 cells, HL-60 cells, U-937 cells, Colo205 cells and LS180 cells were obtained from the American Type Culture Collection (ATCC). SW1116 cells (available from ATCC) and Jurkat cells (RIKEN Gene Bank; available from RIKEN GENE BANK) were obtained from Dr. Takahashi of Aichi Cancer Center.
[0240]
In addition, polymorphonuclear leukocytes and mononuclear cells were obtained from peripheral blood of healthy adults using Polymorphprep ™, a kit manufactured by Nycomed Pharma.
The obtained mononuclear cells can be obtained by conventional methods (J. Immunol.,130, 706 (1983)], were further separated into monocytes and lymphocytes.
The total RNA of each cell is measured using a conventional method [Biochemistry,18, 5294 (1977)].
[0241]
Synthesis of single-stranded cDNA from total RNA was performed using a kit (SUPERSCRIPT ™ Preamplification System; manufactured by BRL).
Single-stranded cDNA was synthesized from 5 μg of total RNA for cell lines and 1 μg of total RNA for blood cells, diluted 50-fold and 10-fold with water, respectively, and used as a PCR template.
[0242]
(B) Preparation of standards and internal controls for quantitative PCR
The pBSK + iGnT13 and pBSK + iGnT13d obtained in (1) and (2) above were cleaved with a restriction enzyme that cleaves the cDNA portion and converted into linear DNA, and then used as a standard for quantifying iGnT transcripts and an internal control, respectively.
1 μg each of BSK + iGnT13 and pBSK + iGnT13d was dissolved in 36 μl of Y-100 buffer, and 20 units ofXhoI and 20 unitsBamHI was added and digestion was performed at 37 ° C. for 2 hours.
[0243]
A 10 μl portion of the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, and after confirming that it was completely cleaved, it was used by diluting stepwise with water containing 1 μg / ml of yeast transfer RNA.
As a standard for quantifying β-actin transcripts, a restriction enzyme (pUC119-ACT) that cleaves the cDNA portion (HindIII andAsp718) and converted to linear DNA [J. Biol. Chem.,26914730 (1994), JP 06-181759].
[0244]
As an internal control for quantifying β-actin transcripts, a restriction enzyme that cleaves pUC119-ACTd from the cDNA portion (HindIII andAsp718) and converted to linear DNA [J. Biol. Chem.,26914730 (1994), JP 06-181759].
[0245]
(C) Quantification of iGnT transcript using quantitative PCR
Internal control prepared in (b) (XhoI andBamIn the presence of 5fg of pBSK + iGnT13d) cleaved with HI, PCR was performed using single-stranded cDNAs derived from the various cells and cell lines prepared in (a) as templates.
As primers for PCR, the DNA shown in SEQ ID NO: 13 (hereinafter abbreviated as C12-3) and the DNA shown in SEQ ID NO: 14 (hereinafter abbreviated as C12-4) were synthesized (purchased from Sawasday Technology). Can also be).
[0246]
The PCR reaction was performed using a kit (GeneAmp ™ DNA Amplification Reagent Kit with AmpliTaq ™ Recombinant Taq DNA Polymerase) manufactured by Takara Shuzo.
The reaction solution was prepared according to the method of the kit. At that time, dimethyl sulfoxide was added to a final concentration of 5%.
[0247]
After treatment with 29 μl of a reaction solution other than Taq DNA polymerase at 97 ° C. for 5 minutes using PERKIN ELMER CETUS DNA Thermal Cycler (sold by Takara Shuzo) in ice, Quenched quickly.
[0248]
After quenching, 1 μl of Taq DNA polymerase diluted to 1 / 6.7 is added to the reaction solution, and then used at 94 ° C. for 30 seconds, 60 ° C. for 1 minute, 72 hours using a thermal cycler manufactured by Perkin Elmer Citas. The reaction at -2 minutes was carried out for 27 cycles.
[0249]
A 7 μl portion of the reaction solution was subjected to agarose gel electrophoresis, and then the gel was stained with SYBR Green I nucleic acid stain (Molecular Probes). The amount of the amplified DNA fragment was measured by analyzing the pattern of the amplified DNA fragment with a fluoroimager (FluorImager SI; manufactured by Molecular Dynamics).
In addition, instead of the single-stranded cDNA derived from various cells and cell lines, the standard (b) prepared (XhoI andBamPCR was performed in the same manner using pBSK + iGnT13) cleaved with HI as a template to prepare a calibration curve.
[0250]
The size of the iGnT transcript and the standard-derived DNA fragment was 615 bp, the size of the DNA fragment derived from the internal control was 416 bp, and the amount (in moles) of the iGnT transcript was calculated from the quantitative ratio of the two DNA fragments. In order to more accurately quantify transcripts, similar PCR was performed again on each sample using an internal control in an amount close to the amount of transcripts obtained as described above. The number of PCR cycles was varied according to the amount of internal control.
[0251]
Similarly, the β-actin transcript was quantified by two-step PCR. As described in (b) for internal controlHindIII andAspPUC119-ACTd cleaved at 718 was described in (b) as a standard.HindIII andAspPUC119-ACT cut at 718 was used.
As a primer for PCR, the DNA shown in SEQ ID NO: 15 (hereinafter abbreviated as Ac-1) and the DNA shown in SEQ ID NO: 16 (hereinafter abbreviated as Ac-3) were applied Biosystems 380A DNA synthesizer. What was synthesize | combined using was used.
[0252]
The first PCR was performed with 17 cycles using 10 pg of internal control.
In the case of β-actin, dimethyl sulfoxide was not added to the PCR reaction solution. The final expression level of the iGnT transcript was determined as a relative value (%) when the amount of β-actin transcript was 100.
The results are shown in Table 1.
It was shown that the amount of iGnT transferred can be measured by the above method.
[0253]
[Table 1]
[0254]
【The invention's effect】
According to the present invention, a polypeptide having an activity involved in the synthesis of a poly-N-acetyllactosamine sugar chain, a method for producing the polypeptide, a DNA encoding the polypeptide, a method for producing the DNA, and incorporating the DNA Recombinant vector obtained, transformant harboring the recombinant vector, antibody recognizing the polypeptide, method for producing the DNA or poly-N-acetyllactosamine sugar chain using the polypeptide, the DNA Diagnosis and treatment of diseases of inflammation or cancer metastasis using the polypeptide or the antibody, quantification method and immunostaining of the polypeptide of the present invention using the antibody, and changing the expression of the gene encoding the polypeptide A screening method for a compound and a screening method for a substance that changes the activity of the polypeptide can be provided.
[0255]
[Sequence Listing]
[0256]
[Sequence Listing Free Text]
SEQ ID NO: 3 Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 4-Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 5-description of artificial sequence: synthetic DNA
SEQ ID NO: 6 Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 7--Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 8-Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 9—Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 10—Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 11—Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 12—Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 13—Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 14—Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 15—Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 16—Description of Artificial Sequence: Synthetic DNA
SEQ ID NO: 17—Description of artificial sequence: commercially available amino acid sequence
[Brief description of the drawings]
FIG. 1 shows the process of expression cloning. Namalwa KJM-1 cells into which cDNA libraries derived from WM266-4 and SW1116 were introduced were fluorescently stained with an anti-i antibody and then subjected to FACS to collect cells highly reactive with the anti-i antibody. The portion of cells indicated by the bar was collected and subjected to the next FACS. After three FACS, cells highly reactive with anti-i antibody were concentrated.
[Fig. 2] Plasmids (16-2-12 and 16-2-31) recovered from cells highly reactive with anti-i antibody and control plasmid pAMo were introduced into Namalwa KJM-1 cells, respectively. It is the result of analyzing using FACS after indirect fluorescent antibody staining using i antibody (thick line) or A-PBS (thin line).
FIG. 3 shows a restriction enzyme map of cDNA contained in plasmid 16-2-12 and a vector portion (bold line) in the vicinity thereof. Numbered bars indicate DNA fragments subcloned into pBluescriptIISK (+) to determine the base sequence of the cDNA. See text for details.
FIG. 4 is a diagram showing a construction process of plasmid pAMo-i.
FIG. 5: iGnT expression plasmid pAMo-i and control plasmid pAMo were introduced into Namalwa KJM-1 cells, respectively. After indirect fluorescent antibody staining with anti-i antibody (thick line) or A-PBS (thin line), FACS It is the result of having analyzed using. Prior to indirect fluorescent antibody staining, the reactivity of cells treated with sialidase (+ sialidase) and not (-sialidase) was compared.
FIG. 6 is a diagram showing a construction process of plasmid pAMoA-FT3.
FIG. 7 is a diagram showing a construction process of plasmid pAMoA-i52S.
FIG. 8 shows the result of purifying protein A fusion secreted iGnT from the culture supernatant of Namalwa KJM-1 cells introduced with plasmid pAMoA-i52S using IgG sepharose and subjecting it to SDS polyacrylamide gel electrophoresis ( Lane 2). As a control, a sample was prepared in the same manner from the culture supernatant of Namalwa KJM-1 cells into which pAMoA had been introduced, and subjected to SDS polyacrylamide gel electrophoresis (lane 1).
FIG. 9 is a diagram showing a construction process of plasmid pAMoF2.
FIG. 10 is a diagram showing a construction process of plasmid pT7B-i52S No. 3.
FIG. 11 is a diagram showing a construction process of plasmid pAMoF2-i52S.
FIG. 12 shows the result of purifying Flag peptide fusion secreted iGnT from the culture supernatant of Namalwa KJM-1 cells introduced with plasmid pAMoF2-i52S using an anti-Flag M1 affinity gel and subjecting it to SDS polyacrylamide gel electrophoresis. (Lane 2). As a control, a sample was prepared in the same manner from the culture supernatant of Namalwa KJM-1 cells into which pAMoF2 had been introduced, and subjected to SDS polyacrylamide gel electrophoresis (lane 1).
FIG. 13 is a diagram showing a construction process of plasmid pVL1393-i.
FIG. 14 is a diagram showing a construction process of plasmid pVL1393-Ai52S.
FIG. 15 shows the result of purifying protein A fusion secreted iGnT using IgG sepharose from the culture supernatant of Sf21 cells infected with a recombinant virus derived from plasmid pVL1393-Ai52S and subjecting it to SDS polyacrylamide gel electrophoresis. Yes (lane 2). As a control, a sample was prepared in the same manner from the culture supernatant of Sf21 cells infected with a recombinant virus derived from plasmid pVL1393, and subjected to SDS polyacrylamide gel electrophoresis (lane 1).
FIG. 16 is a diagram showing a construction process of plasmid pVL1393-F2i52S.
[Fig. 17] Flag peptide fusion secreted iGnT was purified from the culture supernatant of Sf21 cells infected with a recombinant virus derived from plasmid pVL1393-F2i52S using anti-Flag M1 affinity gel, and subjected to SDS polyacrylamide gel electrophoresis. (Lane 2). As a control, a sample was prepared in the same manner from the culture supernatant of Sf21 cells infected with a recombinant virus derived from plasmid pVL1393, and subjected to SDS polyacrylamide gel electrophoresis (lane 1).
FIG. 18 is a diagram showing a construction process of plasmid pBSK + iGnT13.
FIG. 19 is a diagram showing a construction process of plasmid pBSK + iGnT13d.
[Explanation of symbols]
bp: base pairs
kb: kilobase pairs
G418 / Km: G418 derived from transposon 5 (Tn5), kanamycin resistance gene
Ap: pBR322-derived ampicillin resistance gene
Tc: pBR322-derived tetracycline resistance gene
P1: P1 promoter derived from pBR322
Ptk: Herpes simplex virus (HSV) thymidine kinase (tk) gene promoter
Sp. BG: Rabbit β-globin gene splicing signal
A.BG: Rabbit β-globin gene poly A addition signal
A. SE: Simian virus 40 (SV40) early gene poly A addition signal
Atk: Herpes simplex virus (HSV) thymidine kinase (tk) gene poly A addition signal
Pse: Simian virus 40 (SV40) early gene promoter
Pmo: Moloney murine leukemia virus long terminal repeat (LTR) promoter
EBNA-1: EBNA-1 gene of Epstein-Barr virus
oriP: Epstein-Barr virus replication origin
S: Gene part encoding human granulocyte colony-stimulating factor or immunoglobulin κ signal peptide
A or ProA: Staphylococcus aureusStaphylococcusaureusPart of the gene encoding the binding region of IgG of protein A
F: part of the gene encoding the Flag peptide
iGnT: DNA encoding a polypeptide involved in the synthesis of the poly-N-acetyllactosamine sugar chain obtained in the present invention (full length or partial length)
cDNA: DNA (full length or partial length) encoding a polypeptide involved in the synthesis of the poly-N-acetyllactosamine sugar chain obtained in the present invention
cDNA del: partial length DNA encoding a polypeptide involved in the synthesis of the poly-N-acetyllactosamine sugar chain obtained in the present invention having a deletion of about 0.2 kb
Claims (42)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP31150998A JP4220033B2 (en) | 1997-10-31 | 1998-10-30 | Novel polypeptide |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP9-300715 | 1997-10-31 | ||
JP30071597 | 1997-10-31 | ||
JP31150998A JP4220033B2 (en) | 1997-10-31 | 1998-10-30 | Novel polypeptide |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH11236398A JPH11236398A (en) | 1999-08-31 |
JP4220033B2 true JP4220033B2 (en) | 2009-02-04 |
Family
ID=26562428
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP31150998A Expired - Fee Related JP4220033B2 (en) | 1997-10-31 | 1998-10-30 | Novel polypeptide |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP4220033B2 (en) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5773415B2 (en) * | 2011-04-19 | 2015-09-02 | 学校法人 東洋大学 | Method for detecting glycated protein and biosensor chip for detecting glycated protein |
-
1998
- 1998-10-30 JP JP31150998A patent/JP4220033B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JPH11236398A (en) | 1999-08-31 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US7291491B2 (en) | Polypeptides | |
JP4628679B2 (en) | Cells in which the activity of a protein involved in GDP-fucose transport is reduced or deleted | |
US7629150B2 (en) | Transformed cell harboring DNA or RNA encoding sugar chain synthesizing agent having β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase activity | |
US8722366B2 (en) | Methods for synthesizing sugar chains using β1,3-N-acetylglucosaminyltransferase | |
US20080015165A1 (en) | Novel polypeptide | |
JPWO2003055993A1 (en) | Antibody composition that specifically binds to CD20 | |
JP4689047B2 (en) | Novel polypeptide | |
JP4220033B2 (en) | Novel polypeptide | |
WO2000042180A1 (en) | Novel protein | |
WO2000031132A1 (en) | Novel polypeptide | |
JP2000189168A (en) | New transcription elongation suppressing factor | |
AU2008200610A1 (en) | Novel polypeptide | |
EP1108725A1 (en) | Novel polypeptide | |
JP2000041681A (en) | New protein | |
WO2000040609A1 (en) | Novel protein |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20051025 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20080722 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20080902 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20081021 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20081113 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20111121 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |