JP4132297B2 - Method for producing oligosaccharide - Google Patents

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Description

【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、α−L−フコシダーゼを用いたα1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法に関する。
【0002】
【従来の技術】
糖タンパク質や糖脂質中に含まれる複合糖質の糖鎖の非還元未端あるいは枝分れ部分には、α−L−フコシル基を含むものが多く見出されている。例えば、植物キシログルカン由来のフコースを含むオリゴサッカライドにエリシター様の活性があることが報告されている。また、L−フコースを含む複合脂質中の糖鎖は、血液型の型決定基、肝臓への血清糖タンパク質の取り込み、マクロファージ遊走阻止因子の受容体、細胞−細胞相互作用など、さまざまな生理活性を有していると言われている。さらに細胞のガン化に伴い血中のL−フコース量が増加することが観察されている。
【0003】
α−L−フコシダーゼは糖鎖中のα−L−フコシド結合を加水分解する酵素であり、複合糖質中の糖鎖の構造解析や、構造と機能との関連あるいは生理活性などを研究する上で、L−フコースを特異的にはずす酵素試薬として重要な意味を持っている。一方、同様の理由から、α−L−フコシダーゼのL−フコース転移能を利用して、L−フコースを含むオリゴ糖を人工的に合成することが求められている。しかしながら、フコースを含む糖鎖の合成は一部のものが化学合成法または酵素法によりなされているにすぎないのが現状である。
【0004】
すなわち、化学合成法においては、水酸基のうちで反応に関与しない水酸基を保護した受容体の1位を活性化し、残りの水酸基を保護した供与体を作用させて縮合反応を行い、反応終了後に保護基を脱離させて目的物を得るという繁雑な工程を必要とする。しかも、工程の数が多いために必然的に収率は低いものとならざるを得ない。
【0005】
一方、酵素を用いてL−フコースを含むオリゴ糖を合成する試みは数多く行われている。例えば、スベンソン(Svensson)およびチエム(Thime)は、ブタ肝臓由来のα−L−フコシダーゼを用いて、L−フコースがα1→2またはα1→6結合したL−フコシル−メチル−β−D−ガラクトピラノシドを合成している(Carbohydr. Res., 200, 391-402. 1990)。しかしながら、このα−L−フコシダーゼは酵素活性が低く、またこのα−L−フコシダーゼを用いてα1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を製造することはできない。
【0006】
また、微生物由来のα−L−フコシダーゼを用いてL−フコースを含むオリゴ糖を製造する方法として、特開平5−137589号公報には、コリネバクテリウム属細菌由来のα−L−フコシダーゼを用いて、糖転移反応を行わせることにより、α1→2結合したL−フコースを含むオリゴ糖を製造する方法が記載されている。しかしながら、このα−L−フコシダーゼを用いて、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を製造することはできない。
【0007】
さらに、特開平8−242876号公報には、アルカリジェネス属に属する細菌の生産するα−L−フコシダーゼを用いて、糖転移反応を行わせることにより、α1→2結合したL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法が記載されている。しかしながら、このα−L−フコシダーゼを用いて、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を製造することはできない。
【0008】
また、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法として、特開平4−99492号公報には、アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)由来のα−L−フコシダーゼを用いて、糖転移反応を行わせることにより、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法が記載されている。そして実施例において、受容体としてD−グルコースまたはN−アセチル−D−グルコサミンの単糖を用いて糖転移反応を行うことにより、D−グルコースまたはN−アセチル−D−グルコサミンにα−L−フコースがα1→3結合した二糖類(オリゴ糖)を製造している。
【0009】
しかしながら、上記のα−L−フコシダーゼは、受容体としてD−ガラクトースを用いた場合には糖転移反応は起こらない(Carbohydr. Res., 224, 291-299(1992))。またラクトースまたは1−O−メチルラクトース等の二糖類に糖転移反応を行った実施例はなく、α−L−フコースがα1→3結合した三糖以上のオリゴ糖を製造することはできない。従って、糖転移反応受容体についてはスペクトラムが狭く、生体中での糖鎖の生理活性を明らかにするための試薬としては不向きである。
【0010】
またペニシリウム・マルチコラー(Penicillium multicolor)由来のα−L−フコシダーゼ(Carbohydr. Res., 309, 125-129(1998))も知られているが、このα−L−フコシダーゼの受容体に対する特異性は、前記特開平4−99492号公報のアスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)由来のα−L−フコシダーゼと同じであり、従って糖転移反応受容体についてはスペクトラムが狭く、生体中での糖鎖の生理活性を明らかにするための試薬としては不向きである。
【0011】
以上のように、α−L−フコースがα1→3結合した三糖以上のオリゴ糖を合成することができるα−L−フコシダーゼはこれまで知られておらず、このため糖鎖の構造解析や、生体中での糖鎖の生理活性などを研究する上で必要となるα1→3結合したα−L−フコースを含む三糖以上のオリゴ糖およびこのオリゴ糖を合成することができるα−L−フコシダーゼが求められている。
【0012】
【発明が解決しようとする課題】
以上のように、生体中の複合糖質中の糖鎖においてL−フコースを含むオリゴ糖は構造上および生理活性上重要な位置を占めており、特にα1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖は、その新たな生理活性に興味が持たれるところである。従って、糖転移反応受容体の種類や分子量に影響されることなく、L−フコースを受容体の3位に選択的に糖転移反応させ、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法が求められている。
【0013】
【発明が解決しようとする課題】
本発明の課題は、α−L−フコシダーゼを用いて、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を効率よく製造することができるオリゴ糖の製造方法を提案することである。
【0014】
本発明は次のオリゴ糖の製造方法である。
〔1〕 L−フコースの供与体と、L−フコースの受容体とを含む溶液に、下記の酵素学的性質を有するα−L−フコシダーゼを添加して糖移転反応を行う方法であって、前記α−L−フコシダーゼが、独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センターにFERM P−16944の受託番号で寄託されているアルカリジェネス・スピーシス・KSF−9687( Alcaligenes sp. KSF-9687 )菌株由来であることを特徴とするα1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法。
(1)作用
・天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα−L−フコシド結合を特異的に加水分解し、L−フコースを遊離する。
・α−L−フコシド結合しているL−フコースを、受容体である単糖または二糖以上のオリゴ糖に糖転移反応を行い、L−フコースを含むオリゴ糖を生成する。
(2)加水分解での基質特異性
・天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα1→2またはα1→3結合しているL−フコースを加水分解する。
・合成基質であるp−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシドを加水分解する。
・天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα1→4またはα1→6結合しているL−フコースには作用しない。
(3)糖転移反応での特異性
・α−L−フコシド結合しているL−フコースを、受容体である単糖または二糖以上のオリゴ糖に糖転移反応を行い、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を生成する。
・α1→2、α1→4またはα1→6結合したL−フコースを含むオリゴ糖は生成しない。
(4)至適pHおよび安定pH範囲
・至適pHはpH7.0〜8.0であり、安定pH範囲は、45℃で1時間の保持条件においてpH6.0〜9.0である。
(5)至適温度および安定温度範囲
・至適温度は55℃であり、pH7.0で10分間処理した時、50℃まで安定であり、65℃以上で失活する。
(6)阻害剤などの影響
・酵素活性は銅、水銀またはパラクロルメルクリ安息香酸により著しく阻害されるが、その他の金属イオン、SH試薬および糖によりほとんど影響を受けない。
(7)分子量
・PAGEにより測定した分子量は約102,000である。
・SDS−PAGEにより測定した分子量は約51,000である。
〔2〕 L−フコースの供与体がp−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシド、o−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシドまたはα−L−フコピラノシルフルオリドである上記〔1〕記載の製造方法。
〔3〕 L−フコースの受容体が単糖または二糖以上のオリゴ糖である上記〔1〕または〔2〕項記載の製造方法。
〔4〕 L−フコースの受容体がD−ガラクトース、1−O−メチル−D−ガラクトース、D−マンノース、ラクトースまたはN−アセチルラクトサミンである上記〔1〕ないし〔3〕のいずれかに記載の製造方法。
〔5〕 製造するオリゴ糖が下記式(1)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−D−ガラクトースである上記〔1〕ないし〔4〕のいずれかに記載の製造方法。
【化7】

Figure 0004132297
〔6〕 製造するオリゴ糖が下記式(2)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−D−マンノースである上記〔1〕ないし〔4〕のいずれかに記載の製造方法。
【化8】
Figure 0004132297
〔7〕 製造するオリゴ糖が下記式(3)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−1−O−メチル−D−ガラクトースである上記〔1〕ないし〔4〕のいずれかに記載の製造方法。
【化9】
Figure 0004132297
〔8〕 製造するオリゴ糖が下記式(4)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−ラクトースである上記〔1〕ないし〔4〕のいずれかに記載の製造方法。
【化10】
Figure 0004132297
〔9〕 製造するオリゴ糖が下記式(5)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−1−O−メチルラクトースである上記〔1〕ないし〔4〕のいずれかに記載の製造方法。
【化11】
Figure 0004132297
〔10〕 製造するオリゴ糖が下記式(6)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−N−アセチルラクトサミンである上記〔1〕ないし〔4〕のいずれかに記載の製造方法。
【化12】
Figure 0004132297
(式中、Acはアセチル基である。)
【0015】
本発明で用いるα−L−フコシダーゼはアルカリジェネス(Alcaligenes)属に属する菌株から得ることができる。アルカリジェネス属に属する菌株としては、、独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センターにFERM P−16944の受託番号で寄託されているアルカリジェネス・スピーシス・KSF−9687(Alcaligenes sp. KSF-9687)菌株を用いる。この菌株の菌学的性質は次の通りである。
【0016】
《形態的所見》
(1)細胞の形態、大きさ:桿菌、0.7〜0.8×1.5〜2.5μm
(2)多形性:なし
(3)運動性:あり
(4)胞子:なし
(5)べん毛:周ベん毛
(6)グラム染色性:陰性
【0017】
《生育状態》
(1)肉汁寒天平板培養
集落の形状は円形であり、周縁は平滑で、表面隆起は扁平状である。また、集落の色調は半透明である。
(2)肉汁液体培養
生育し混濁する。
(3)ゼラチン穿刺培養
液化しない。
【0018】
Figure 0004132297
Figure 0004132297
【0019】
《その他》
後述する酵素学的および理化学的性質を有するα−L−フコシダーゼを菌体内および菌体外に産出する。
【0020】
以上の性質から、Bergey's Manual of Systematic Bacteriologyを参照し、この菌株をアルカリジェネスに属する菌株と同定し、アルカリジェネス・スピーシス・KSF−9687(Alcaligenes sp. KSF-9687)と命名した。最も類似した性質を示すものとしてアルカリジェネス・デニトリフィカンス(Alcaligenes denitrificans)があげられる。
【0021】
次に、上記アルカリジェネス・スピーシス・KSF−9687(Alcaligenes sp. KSF-9687)菌株により生産される本発明のα−L−フコシダーゼの酵素学的および理化学的性質について説明する。
(1)酵素の作用
本発明のα−L−フコシダーゼは天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα−L−フコシド結合を特異的に加水分解し、L−フコースを遊離する。またα−L−フコシド結合しているL−フコースを、受容体である単糖または二糖以上のオリゴ糖に糖転移反応を行い、L−フコースを含む二糖または三糖以上のオリゴ糖を生成する。
【0022】
(2)加水分解での基質特異性
本発明のα−L−フコシダーゼは天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα1→2またはα1→3結合しているL−フコースを加水分解する。また合成基質であるp−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシド(p−ニトロフェニル−α−L−フコシド)を加水分解する。しかし、天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα1→4またはα1→6結合しているL−フコースには作用しない。
【0023】
本発明のα−L−フコシダーゼの種々のα−L−フコシド結合含有基質に対する酵素活性を表1に示した。表1から明らかなように、本発明のα−L−フコシダーゼはp−ニトロフェニル−α−L−フコシドのような合成基質、ならびにα−L−フコピラノシル−(1→2’)−ラクトース(2′−フコシルラクトース)、α−L−フコピラノシル−(1→3’)−ラクトース(3′−フコシルラクトース)などのオリゴ糖およびムチン等の天然基質に作用することが分かる。すなわち、本発明のα−L−フコシダーゼは、合成基質中のα−L−フコシド結合を加水分解し、またオリゴ糖鎖中のα1→2またはα1→3結合しているフコースを加水分解することが分かる。一方、オリゴ糖鎖中および天然高分子基質中のα1→4またはα1→6結合しているL−フコースには作用しないことが分かる。なお、表1中の相対活性は、p−ニトロフェニル−α−L−フコシドに対する活性を100として表示した。
【0024】
【表1】
Figure 0004132297
【0025】
(3)糖転移反応での基質特異性
本発明のα−L−フコシダーゼが触媒する糖転移反応において、L−フコースの供与体となる化合物は、α−L−フコシド結合しているL−フコースを有する化合物である。供与体の具体的なものとしては、p−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシド、o−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシドまたはα−L−フコピラノシルフルオリドなどがあげられる。
本発明のα−L−フコシダーゼが触媒する糖転移反応において、L−フコースの受容体となる化合物は、D−ガラクトース、1−O−メチル−D−ガラクトースおよびD−マンノースなどの単糖;ラクトースおよびN−アセチルラクトサミンなどの二糖以上のオリゴ糖等である。
【0026】
本発明のα−L−フコシダーゼが触媒する糖転移反応では、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖が選択的に生成し、α1→2、α1→4またはα1→6結合したL−フコースを含むオリゴ糖は生成しない。すなわち、上記受容体の3位にL−フコースがα1→3フコシド結合したオリゴ糖だけが生成する。糖転移反応により生成するオリゴ糖は、二糖以上のオリゴ糖である。例えば、受容体として単糖を用いた場合には、この受容体にL−フコースがα1→3結合した二糖のオリゴ糖が生成し、受容体として二糖を用いた場合には、この受容体にL−フコースがα1→3結合した三糖のオリゴ糖が生成する。
【0027】
(4)至適pHおよび安定pH範囲
加水分解および糖転移反応の至適pHはpH7.0〜8.0である。安定pH範囲は、45℃で1時間の処理条件の場合、pH6.0〜9.0である。
【0028】
(5)力価の測定法
本発明のα−L−フコシダーゼの加水分解活性の測定は、p−ニトロフェニル−α−L−フコシドを基質として、pH7.0のリン酸カリウム緩衝液中、50℃で反応を行い、グリシン−NaOH緩衝液(pH10.0)を加えて反応を停止させた後、遊離したp−ニトロフェノールの量を410nm吸光度を測定することにより行うことができる。酵素の単位は1分間に1μmolのp−ニトロフェノールを遊離する酵素量を1ユニットとした。その他の基質については、pH7.0のリン酸カリウム緩衝液中、50℃で30分間反応を行った後、沸騰浴中3分間加熱して反応を停止し、次に遠心分離し、その上清中の遊離L−フコース量をシュードモナス由来のL−フコースデヒドロゲナーゼを用いて測定することにより行うことができる。あるいは、ピリジルアミノ化により蛍光ラベルした基質および生成物を高速液体クロマトグラフィーで分析することにより測定することもできる。
【0029】
また糖転移反応の活性の測定方法は次のようにして行うことができる。すなわち、L−フコース供与体と、受容体となるオリゴ糖とを緩衝液などに溶解し、この溶液に本発明のα−L−フコシダーゼを添加し、37℃付近で反応を行う。反応後、薄層クロマトグラフィー(TLC)または高速液体クロマトグラフィー(HPLC)などを用いて、反応生成物を確認する。
【0030】
(6)至適温度および安定温度
加水分解および糖転移反応の至適温度は55℃である。安定温度範囲は、pH7.0の10mMリン酸緩衝液中に各温度で10分間保温して残存活性を測定した時、50℃まで安定であり、55℃で約60%残存活性を示す。
【0031】
(7)pH、温度による失活の条件
65℃で10分間の処理により完全に失活する。またpH11以上において45℃で60分間の処理によって完全に失活する。
【0032】
(8)阻害剤等の影響
本発明のα−L−フコシダーゼに対する種々の添加物質の影響について検討したところ、加水分解および糖転移反応において、銅(0.1mM)、水銀(0.1mM)またはパラクロルメルクリ安息香酸(0.5mM)により著しく阻害されたが、その他の金属イオン(1mM)およびSH試薬(1mM)によりほとんど影響を受けない。また加水分解反応は、生成物であるL−フコース(1mM)によりほとんど影響を受けない。
【0033】
(9)精製方法
本発明のα−L−フコシダーゼの精製は、既知の精製法が単独または併用して利用され得る。本発明のα−L−フコシダーゼは菌体内および菌体外に生産されるが、酵素の精製には菌体外酵素を用いる方が望ましい。例えば、培養液を濾過または遠心分離にかけ菌体を除去し、次いで塩析法、各種クロマトグラフ法等を適宜に組み合せて行うことができる。精製法の一例を次に示す。
【0034】
培養終了後、ストリームライン−ディアエ(ファルマシア製)に菌体を含む培養物を通し、吸着した酵素を溶出する。活性画分を最終濃度1Mになるよう硫酸アンモニウムを加え、ブチルトヨパール650Mカラムに通し、活性画分を溶出する。活性画分を集め、フコース−セルロファインカラムに通し、吸着した酵素を溶出する。活性画分を、一晩透析を行い、FPLC−Mono Qカラムに通し、活性画分を溶出する。溶出された活性画分はこの時点で電気泳動的に単一バンドを示すが、ポリッシングのためセファクリルS−300HRカラムを用いてゲル濾過を行うこともできる。
【0035】
(10)分子量
本発明のα−L−フコシダーゼの分子量は、PAGE(ポリアクリルアミドゲル電気電気泳動)法により約102,000と測定された。
【0036】
(11)ポリアクリルアミド電気泳動
精製されたα−L−フコシダーゼは、PAGEおよびSDS−PAGE電気泳動において単一のバンドを示した。また、この時の分子量はそれぞれ102,000、51,000と測定された。
【0037】
以上のような本発明のα−L−フコシダーゼは菌体内および菌体外に生産されるため、菌から酵素を得る際には菌体外に生産された酵素を分離するだけで容易に得ることができる。例えば、菌の培養液からα−L−フコシダーゼを分離するだけで容易に得ることができる。このため、菌体を破砕して活性画分を抽出する操作を必要としないので、工業的生産に適している。また本発明のα−L−フコシダーゼは中性付近に至適pHを有し、しかも熱に安定であるので、糖鎖の構造解析や機能の研究に好適に利用することができる。
【0038】
上記性質をもつ新規なα−L−フコシダーゼを用いることによって、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法を確立した。本発明によるL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法を以下に詳細に記述する。
本発明のオリゴ糖の製造方法は、L−フコースの供与体と、L−フコースの受容体とを含む溶液に、前記本発明のα−L−フコシダーゼを添加して糖移転反応を行って、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を製造する方法である。
【0039】
上記L−フコースの供与体としては、p−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシド、o−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシドまたはα−L−フコピラノシルフルオリドなどがあげられる。これらの供与体は精製品はもちろん、これらの化合物を含む化合物などを用いることもできる。
上記L−フコースの受容体としては、D−ガラクトース、1−O−メチル−D−ガラクトース、D−マンノースなどの単糖;ラクトースまたはN−アセチルラクトサミンなどの二糖以上のオリゴ糖等があげられる。これらの受容体は精製品はもちろん、これらの糖を含む糖などを用いることもできる。
【0040】
本発明のオリゴ糖の製造方法では、前記本発明のα−L−フコシダーゼを用いているので、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を選択的に製造することができる。すなわち、本発明のオリゴ糖の製造方法では、α1→2、α1→4またはα1→6結合したL−フコースを含むオリゴ糖は生成しない。本発明のオリゴ糖の製造方法で選択的に得られるオリゴ糖は、前記受容体の3位にL−フコースがα1→3フコシド結合したオリゴ糖、すなわちα−L−フコピラノシル(1→3)基を含むオリゴ糖である。
【0041】
本発明のオリゴ糖の製造方法では、受容体を選択することにより、二糖または三糖以上のオリゴ糖を製造することができる。例えば受容体として単糖を用いることにより、L−フコースがα1→3結合した二糖のオリゴ糖を製造することができる。また、受容体として二糖を用いることにより、L−フコースがα1→3結合した三糖のオリゴ糖を製造することができる。
【0042】
本発明のオリゴ糖の製造方法の好ましい方法として、次の方法が例示できる。まず、リン酸カリウム緩衝液と、ジメチルスルフォキシド、N,N−ジメチルホルムアミドおよびアセトニトリル等の水溶性有機溶媒からなる群から選ばれる少なくとも1種の有機溶媒との混合溶液を調製する。この混合溶液に前記受容体および供与体を添加し、27℃〜60℃、好ましくは35℃〜55℃の間で6時間〜72時間、好ましくは18時間〜48時間反応させる。このときの受容体および供与体の濃度は0.01重量%〜10重量%、好ましくは0.1重量%〜10重量%とするのが望ましい。また受容体と供与体との混合比は、重量比で1:1〜20:1、好ましくは2:1〜10:1とするのが望ましい。反応温度は27℃〜60℃、好ましくは35℃〜55℃とするのが望ましい。反応pHは6〜9、好ましくはpH7〜8とするのが望ましい。使用するα−L−フコシダーゼは精製したほうが好ましいが、粗精製の酵素を使用することもできる。
【0043】
上記のような方法によりL−フコースの糖転移反応を行うことにより、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を選択的に容易に製造することができる。このような方法により製造することができるオリゴ糖の具体的なものとしては、前記式(1)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−D−ガラクトース、前記式(2)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−D−マンノース、前記式(3)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−1−O−メチル−D−ガラクトース、前記式(4)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−ラクトース、前記式(5)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−1−O−メチルラクトース、前記式(6)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−N−アセチルラクトサミンなどがあげられる。これらはいずれも新規な化合物であり、糖鎖の構造解析、糖の機能の研究および糖の代謝の研究などに有用であるほか、生理活性が期待される。
【0044】
【発明の効果】
本発明で用いるα−L−フコシダーゼは天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα−L−フコシド結合を特異的に加水分解し、しかもα1→3結合したα−L−フコースを含む三糖以上のオリゴ糖を合成することができるので、糖鎖の構造解析や機能の研究に有用である。
【0046】
本発明で用いるアルカリジェネス・スピーシス・KSF−9687(Alcaligenes sp. KSF-9687)菌株はα−L−フコシダーゼ生産能を有しており、しかも菌体外にこの酵素を生産するので、この菌株を用いることにより、α−L−フコシダーゼを容易に製造、精製することができる。
【0047】
本発明のL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法は、上記α−L−フコシダーゼを用いて糖転移反応を行っているので、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を容易に製造することができる。
【0048】
本発明で製造するα1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖は新規な化合物であり、糖鎖の構造解析、糖の機能の研究および糖の代謝の研究などに有用である。
【0049】
【発明の実施の形態】
以下、実施例により本発明を詳しく説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
【0050】
実施例1
p−ニトロフェニル−α−L−フコシド0.05重量%、グルコース1重量%、ペプトン0.5重量%、カザミノ酸0.25重量%、KH2PO4 0.1重量%、MgSO4・7H2O 0.02重量%および寒天2重量%を含む培地をpH9.0に調整した。また静岡県掛川市より採取した土壌を滅菌水により希釈し、土壌懸濁液とした。この土壌懸濁液を上記培地からなる平板培地上に広げ、37℃で2日間培養を行った。培養後、培地中の黄色く発色しているコロニーを分離した。このようにしてアルカリジェネス・スピーシス・KSF−9687(Alcaligenes sp. KSF-9687)菌株をスクリーニングした。
【0051】
実施例2
《α−L−フコシダーゼの製造》
ペプトン0.5重量%、酵母エキス0.25重量%、塩化ナトリウム0.5重量%(pH7.2)を含む培地500mlにアルカリジェネス・スピーシス・KSF−9687(Alcaligenes sp. KSF-9687)菌株を植菌し、容振とう培養して種培養液とした。次いで種培養と同組成の培地3 literを5 liter容ジャーファーメンター3基に入れ、121℃で20分間殺菌した。冷却後、上記の種培養液を接種し、37℃で2日間、毎分3 literの通気量と毎分300回転の攪拌速度の条件で培養した。
【0052】
培養終了後、予め10mMリン酸緩衝液(pH7.0)に溶解し、同緩衝液で平衡化したストリームライン−ディアエカラム(ファルマシア製、5.0×17cm)に菌体を含む培養物を通し、吸着した酵素を0.2M塩化ナトリウムを含む10mMリン酸緩衝液で溶出した。活性画分を集め、最終濃度1Mになるように硫酸アンモニウムを溶解した。1M硫酸アンモニウムを含む10mMリン酸緩衝液で予め平衡化したブチルヨパール650Mカラム(東ソー製、2.6×30cm)に通し、1M〜0Mの硫酸アンモニウムを含む10mMリン酸緩衝液のリニアーグラジェント法で溶出した。溶出された活性画分を集めて予め10mMリン酸緩衝液(pH7.0)で平衡化したフコースセルロファインカラム(1.6×7.5cm)に通し、吸着した酵素を50mM L−フコースを含む同緩衝液で溶出した。活性画分を一晩10mMリン酸緩衝液(pH7.0)にて透析を行った。次に同緩衝液にて平衡化したFPLC−Mono Q(ファルマシア製)に通し、吸着した酵素を0M〜0.3Mの塩化ナトリウムを含む10mMリン酸緩衝液のリニアーグラジェント法で溶出した。
【0053】
この時点で当酵素は電気泳動的に単一バンドを与えるが、ポリッシングのため活性画分を濃縮後セファクリルS−300HR(ファルマシア製、1.6×60cm)を行い、α−L−フコシダーゼの精製標品74μg(比活性126units/mg、収率20重量%)を得た。
【0054】
実施例3
実施例2で得られたα−L−フコシダーゼの種々の基質に対する加水分解活性を次のようにして測定した。
p−ニトロフェニル−α−L−フコシドを基質とした場合は、pH7.0の100mMリン酸カリウム緩衝液に100μlの酵素および200μlの基質を加え、50℃で15分間反応を行った後、グリシン−NaOH緩衝液(pH10.0)を加えて反応を停止させた。次に、遊離したp−ニトロフェノールの量を410nm吸光度を測定することにより定量した。その他の基質についてはpH7.0の100mMリン酸カリウム緩衝液に100μlの酵素および200μlの基質を加え、50℃で30分間反応を行った後、沸騰浴中で3分間加熱して反応を停止し、次に遠心分離し、上清中の遊離L−フコース量をシュードモナス由来のL−フコースデヒドロゲナーゼを用いて定量した。結果は表1に示した通りである。
【0055】
実施例4
《α−L−フコピラノシル−(1→3)−D−ガラクトースの合成》
L−フコースの受容体としての単糖のD−ガラクトース(500mg)と、L−フコースの供与体としてのp−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシド(50mg)とを、0.1Mリン酸カリウム緩衝液(pH7.0、10ml)とジメチルスルフォキシド(1000μl)との混合溶液に溶解した。この混合溶液に、実施例2で得られたα−L−フコシダーゼを加え、37℃で48時間糖転移反応を行った。
【0056】
得られた反応物を活性炭素カラムクロマトグラフィーにかけ、0〜20%(v/v)のエタノール水溶液グラジエント(合計400ml)で溶出して、二糖類の画分に相当する分画を集めた。集めた画分の溶媒を蒸留で留去したところ、非晶性固体を20.5mg得た。このときの回収率は18重量%であった。
【0057】
この非晶性固体の分子量を測定したところ326であった。また1H−NMRを測定し、得られたスペクトルを解析した。得られた1H−NMRのスペクトラムを図1に示す。これらの結果から、得られた非晶性固体は前記式(1)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−D−ガラクトース(3−フコピラノシル−D−ガラクトース)であることが判明した。
【0058】
実施例5
《α−L−フコピラノシル−(1→3)−D−マンノースの合成》
L−フコースの受容体としての単糖のD−マンノース(500mg)と、L−フコースの供与体としてのp−ニトロフェニルα−L−フコピラノシド(100mg)とを、0.1Mリン酸カリウム緩衝液(pH7.0、10ml)とディメチルスルフォキシド(1000μl)との混合溶液に溶解した。この混合溶液に、実施例2で得られたα−L−フコシダーゼを加え、37℃で48時間糖転移反応を行った。
【0059】
得られた反応物を活性炭素カラムクロマトグラフィーにかけ、0〜20%(v/v)のエタノール水溶液グラジエント(合計400ml)で溶出して、二糖類の画分に相当する分画を集めた。集めた画分の溶媒を蒸留で留去したところ、非晶性固体を10.3mg得た。このときの回収率は9重量%であった。
【0060】
この非晶性固体の分子量を測定したところ326であった。また1H−NMRを測定し、得られたスペクトルを解析した。得られた1H−NMRのスペクトラムを図2に示す。これらの結果から、得られた非晶性固体は前記式(2)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−D−マンノース(3−フコピラノシル−D−マンノース)であることが判明した。
【0061】
実施例6
《α−L−フコピラノシル−(1→3)−1−O−メチル−D−ガラクトースの合成》
L−フコースの受容体としての単糖の1−O−メチル−D−ガラクトース(300mg)と、L−フコースの供与体としてのp−ニトロフェニルα−L−フコピラノシド(24mg)とを、10mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.0、4.2ml)とディメチルスルフォキシド(420μl)との混合溶液に溶解した。この混合溶液に、実施例2で得られたα−L−フコシダーゼを加え、37℃で48時間糖転移反応を行った。
【0062】
得られた反応物を活性炭素カラムクロマトグラフィーにかけ、0〜20%(v/v)のエタノール水溶液グラジエント(合計400ml)で溶出して、二糖類の画分に相当する分画を集めた。集めた画分の溶媒を蒸留で留去したところ、非晶性固体を10mg得た。このときの回収率は23重量%であった。
【0063】
この非晶性固体の分子量を測定したところ340であった。また1H−NMRを測定し、得られたスペクトルを解析した。得られた1H−NMRのスペクトラムを図3に示す。これらの結果から、得られた非晶性固体は前記式(3)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−1−O−メチル−D−ガラクトース(3−フコピラノシル−1−O−メチルガラクトース)であることが判明した。
【0064】
実施例7
《α−L−フコピラノシル−(1→3’)−ラクトースの合成》
L−フコースの受容体としての二糖のラクトース(500mg)と、L−フコースの供与体としてのp−ニトロフェニルα−L−フコピラノシド(50mg)とを、10mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.0、4.2ml)とジメチルスルフォキシド(420μl)との混合溶液に溶解した。この混合溶液に、実施例2で得られたα−L−フコシダーゼを加え、37℃で48時間糖転移反応を行った。
【0065】
得られた反応物を活性炭素カラムクロマトグラフィーにかけ、0〜20%(v/v)のエタノール水溶液グラジエント(合計400ml)で溶出して、三糖類の画分に相当する分画を集めた。集めた画分の溶媒を蒸留で留去したところ、非晶性固体を20.5mg得た。このときの回収率は23重量%であった。
【0066】
この非晶性固体の分子量を測定したところ488であった。また1H−NMRを測定し、得られたスペクトルを解析した。得られた1H−NMRのスペクトラムを図4に示す。これらの結果から、得られた非晶性固体は前記式(4)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−ラクトース(3′−フコピラノシル−ラクトース)であることが判明した。
【0067】
実施例8
《α−L−フコピラノシル−(1→3’)−1−O−メチルラクトースの合成》
L−フコースの受容体としての二糖の1−O−メチルラクトース(300mg)と、L−フコースの供与体としてのp−ニトロフェニルα−L−フコピラノシド(24mg)とを、10mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.0、4.2ml)とディメチルスルフォキシド(420μl)との混合溶液に溶解した。この混合溶液に、実施例2で得られたα−L−フコシダーゼを加え、37℃で48時間糖転移反応を行った。
【0068】
得られた反応物を活性炭素カラムクロマトグラフィーにかけ、0〜20%(v/v)のエタノール水溶液グラジエント(合計400ml)で溶出して、二糖類の画分に相当する分画を集めた。集めた画分の溶媒を蒸留で留去したところ、非晶性固体を10mg得た。このときの回収率は23重量%であった。
【0069】
この非晶性固体の分子量を測定したところ502であった。また1H−NMRを測定し、得られたスペクトルを解析した。得られた1H−NMRのスペクトラムを図5に示す。これらの結果から、得られた非晶性固体は前記式(5)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−1−O−メチルラクトース(3′−フコピラノシル−1−O−メチルラクトース)であることが判明した。
【0070】
実施例9
《α−L−フコピラノシル−(1→3’)−N−アセチルラクトサミンの合成》
L−フコースの受容体としての二糖のN−アセチルラクトサミン(500mg)と、L−フコースの供与体としてのp−ニトロフェニルα−L−フコピラノシド(30mg)とを、10mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.0、5.0ml)とディメチルスルフォキシド(500μl)との混合溶液に溶解した。この混合溶液に、実施例2で得られたα−L−フコシダーゼを加え、37℃で48時間糖転移反応を行った。
【0071】
得られた反応物を活性炭素カラムクロマトグラフィーにかけ、0〜20%(v/v)のエタノール水溶液グラジエント(合計400ml)で溶出して、二糖類の画分に相当する分画を集めた。集めた画分の溶媒を蒸留で留去したところ、非晶性固体を8.4mg得た。このときの回収率は15重量%であった。
【0072】
この非晶性固体の分子量を測定したところ529であった。また1H−NMRを測定し、得られたスペクトルを解析した。得られた1H−NMRのスペクトラムを図6に示す。これらの結果から、得られた非晶性固体は前記式(6)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−N−アセチルラクトサミン(3′−フコピラノシル−N−アセチルラクトサミン)であることが判明した。
【図面の簡単な説明】
【図1】実施例4で得られた1H−NMRのスペクトラムである。
【図2】実施例5で得られた1H−NMRのスペクトラムである。
【図3】実施例6で得られた1H−NMRのスペクトラムである。
【図4】実施例7で得られた1H−NMRのスペクトラムである。
【図5】実施例8で得られた1H−NMRのスペクトラムである。
【図6】実施例9で得られた1H−NMRのスペクトラムである。[0001]
BACKGROUND OF THE INVENTION
  The present invention, Α-Production of oligosaccharides containing α1- → 3-linked L-fucose using L-fucosidaseTo the lawRelated.
[0002]
[Prior art]
Many non-reducing unbranched or branched portions of glycoconjugate sugar chains contained in glycoproteins and glycolipids contain an α-L-fucosyl group. For example, it has been reported that oligosaccharides containing fucose derived from plant xyloglucan have elicitor-like activity. In addition, sugar chains in complex lipids containing L-fucose have various physiological activities such as blood group type determinants, uptake of serum glycoproteins into the liver, macrophage migration inhibitory factor receptors, and cell-cell interactions. It is said to have. Furthermore, it has been observed that the amount of L-fucose in the blood increases as cells become cancerous.
[0003]
  α-L-fucosidase is an enzyme that hydrolyzes α-L-fucoside bonds in sugar chains, and is used to study the structural analysis of sugar chains in complex carbohydrates, the relationship between structure and function, and physiological activities. So L-fucose specificallyZuzuIt has an important meaning as an enzyme reagent. On the other hand, for the same reason, it is required to artificially synthesize oligosaccharides containing L-fucose using the L-fucose transfer ability of α-L-fucosidase. However, at present, the synthesis of sugar chains containing fucose is only partially made by chemical synthesis or enzymatic methods.
[0004]
That is, in the chemical synthesis method, the 1-position of the acceptor that protected the hydroxyl group that does not participate in the reaction among the hydroxyl groups is activated, and the donor is protected by the action of the donor that protects the remaining hydroxyl groups. This requires a complicated process of removing the group to obtain the target product. Moreover, since the number of processes is large, the yield is inevitably low.
[0005]
On the other hand, many attempts have been made to synthesize oligosaccharides containing L-fucose using enzymes. For example, Svensson and Thime use L-fucosyl-methyl-β-D-galacto in which L-fucose is α1 → 2 or α1 → 6 linked using α-L-fucosidase from porcine liver. Pyranoside has been synthesized (Carbohydr. Res., 200, 391-402. 1990). However, this α-L-fucosidase has low enzyme activity, and it is not possible to produce an oligosaccharide containing α1- → 3-linked L-fucose using this α-L-fucosidase.
[0006]
As a method for producing an oligosaccharide containing L-fucose using α-L-fucosidase derived from a microorganism, JP-A-5-137589 uses α-L-fucosidase derived from a Corynebacterium bacterium. Thus, a method for producing an oligosaccharide containing α- → 2-linked L-fucose by performing a sugar transfer reaction is described. However, this α-L-fucosidase cannot be used to produce oligosaccharides containing α1- → 3-linked L-fucose.
[0007]
Further, JP-A-8-242876 discloses an oligo-containing oligosaccharide containing α1- → 2-linked L-fucose by performing a transglycosylation reaction using α-L-fucosidase produced by bacteria belonging to the genus Alkaligenes. A method for producing sugar is described. However, this α-L-fucosidase cannot be used to produce oligosaccharides containing α1- → 3-linked L-fucose.
[0008]
As a method for producing an oligosaccharide containing α- → 3-linked L-fucose, JP-A-4-99492 discloses Aspergillus niger (Aspergillus niger) -Derived α-L-fucosidase, and a method for producing oligosaccharides containing α1- → 3-linked L-fucose by performing a transglycosylation reaction is described. In the examples, D-glucose or N-acetyl-D-glucosamine was subjected to a transglycosylation reaction using D-glucose or N-acetyl-D-glucosamine monosaccharide as a receptor, whereby α-L-fucose was converted to D-glucose or N-acetyl-D-glucosamine. Manufactures disaccharides (oligosaccharides) linked by α1 → 3.
[0009]
However, the above-mentioned α-L-fucosidase does not cause a transglycosylation reaction when D-galactose is used as a receptor (Carbohydr. Res., 224, 291-299 (1992)). In addition, there is no example in which a sugar transfer reaction is performed on a disaccharide such as lactose or 1-O-methyl lactose, and it is not possible to produce an oligosaccharide of trisaccharide or more in which α-L-fucose is α1 → 3 linked. Therefore, the glycosyltransferase receptor has a narrow spectrum and is not suitable as a reagent for clarifying the physiological activity of sugar chains in the living body.
[0010]
Penicillium multi-collar (Penicillium multicolor) -Derived α-L-fucosidase (Carbohydr. Res., 309, 125-129 (1998)) is also known. The specificity of α-L-fucosidase for the receptor is described in JP-A-4-99492. Aspergillus niger (Aspergillus niger) -Derived α-L-fucosidase, and thus the glycosyltransferase receptor has a narrow spectrum and is not suitable as a reagent for clarifying the physiological activity of sugar chains in the living body.
[0011]
As described above, α-L-fucosidase capable of synthesizing oligosaccharides of α-L-fucose with α1- → 3-linked trisaccharide or higher has not been known so far. , A trisaccharide or more oligosaccharide containing α1-L-fucose linked to α1 → 3 and α-L capable of synthesizing this oligosaccharide, which are necessary for studying physiological activities of sugar chains in the living body -Fucosidase is sought.
[0012]
[Problems to be solved by the invention]
As described above, oligosaccharides containing L-fucose occupy important positions in terms of structure and physiological activity in sugar chains in glycoconjugates in living organisms, and in particular, oligosaccharides containing α1- → 3-linked L-fucose. Sugars are of interest for their new physiological activity. Accordingly, L-fucose is selectively transglycosylated at the 3-position of the receptor without being affected by the type and molecular weight of the transglycosylation receptor to produce an oligosaccharide containing α1- → 3-linked L-fucose. There is a need for a method.
[0013]
[Problems to be solved by the invention]
  The subject of the present invention is, ΑIt is to propose a method for producing an oligosaccharide that can efficiently produce an oligosaccharide containing α1- → 3-linked L-fucose using L-fucosidase.The
[0014]
  The present invention is the following oligosaccharide production method.
  [1] An α-L-fucosidase having the following enzymatic properties is added to a solution containing an L-fucose donor and an L-fucose acceptor to perform a sugar transfer reaction.In the method, the α-L-fucosidase is transferred to FERM in the Patent Organism Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology. Alkaline Genesis sp. KSF-9687 (deposited under the deposit number of P-16944) Alcaligenes sp. KSF-9687 ) Derived from strainThe manufacturing method of the oligosaccharide containing the alpha 1-> 3-linked L-fucose characterized by the above-mentioned.
  (1) Action
  -Specific hydrolysis of α-L-fucoside bonds in natural polymer substrates, oligosaccharides or synthetic substrates to release L-fucose.
  -L-fucose bonded with α-L-fucoside is subjected to a transglycosylation reaction with a monosaccharide or a disaccharide or higher oligosaccharide as a receptor to produce an oligosaccharide containing L-fucose.
  (2) Substrate specificity in hydrolysis
  Hydrolyze L-fucose linked to α1 → 2 or α1 → 3 in natural polymer substrate, oligosaccharide or synthetic substrate.
  Hydrolyze the synthetic substrate p-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside.
  • Does not act on L-fucose linked to α1 → 4 or α1 → 6 in natural polymeric substrates, oligosaccharides or synthetic substrates.
  (3) Specificity in transglycosylation
  ・ L-fucose with α-L-fucoside bond is transglycosylated to monosaccharide or disaccharide or higher oligosaccharide as a receptor to produce oligosaccharide containing α1- → 3-linked L-fucose .
  • No oligosaccharides containing L-fucose linked to α1 → 2, α1 → 4 or α1 → 6 are produced.
  (4) Optimum pH and stable pH range
  The optimum pH is 7.0 to 8.0, and the stable pH range is 6.0 to 9.0 at 45 ° C. for 1 hour.
  (5) Optimum temperature and stable temperature range
  -The optimum temperature is 55 ° C, and when treated at pH 7.0 for 10 minutes, it is stable up to 50 ° C and deactivated at 65 ° C or higher.
  (6) Effects of inhibitors
  Enzyme activity is significantly inhibited by copper, mercury or parachloromercuribenzoic acid, but is hardly affected by other metal ions, SH reagents and sugars.
  (7) Molecular weight
  -The molecular weight measured by PAGE is about 102,000.
  -The molecular weight measured by SDS-PAGE is about 51,000.
  [2]  The production method of the above-mentioned [1], wherein the donor of L-fucose is p-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside, o-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside or α-L-fucopyranosyl fluoride.
  [3] The production method of the above-mentioned [1] or [2], wherein the L-fucose receptor is a monosaccharide or a disaccharide or higher oligosaccharide.
  [4] Any one of [1] to [3] above, wherein the L-fucose receptor is D-galactose, 1-O-methyl-D-galactose, D-mannose, lactose or N-acetyllactosamine. Manufacturing method.
  [5]  [1] to [1], wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-galactose represented by the following formula (1):[4]The manufacturing method in any one of.
[Chemical 7]
Figure 0004132297
  [6]  [1] to [1], wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-mannose represented by the following formula (2):[4]The manufacturing method in any one of.
[Chemical 8]
Figure 0004132297
  [7]  [1] to [1] above, wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -1-O-methyl-D-galactose represented by the following formula (3):[4]The manufacturing method in any one of.
[Chemical 9]
Figure 0004132297
  [8]  [1] to [1] above, wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-lactose represented by the following formula (4):[4]The manufacturing method in any one of.
Embedded image
Figure 0004132297
  [9]  [1] to [1], wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-1-O-methyl lactose represented by the following formula (5):[4]The manufacturing method in any one of.
Embedded image
Figure 0004132297
  [10]  [1] to [1], wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-N-acetyllactosamine represented by the following formula (6):[4]The manufacturing method in any one of.
Embedded image
Figure 0004132297
(In the formula, Ac is an acetyl group.)
[0015]
  The α-L-fucosidase used in the present invention is alkaline genes (Alcaligenes) It can be obtained from a strain belonging to the genus. As a strain belonging to the genus Alkaligenes,FERM to Patent Organism Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology Deposited with P-16944 accession numberAlkali Genes spissis KSF-9687 (Alcaligenes sp. KSF-9687)UsingThe The bacteriological properties of this strain are as follows.
[0016]
<< Morphological Findings >>
(1) Cell morphology and size: Neisseria gonorrhoeae, 0.7-0.8 × 1.5-2.5 μm
(2) Polymorphism: None
(3) Mobility: Yes
(4) Spore: None
(5) Flagella: Peripheral flagella
(6) Gram stainability: negative
[0017]
<< Growth state >>
(1) Meat broth agar plate culture
The shape of the village is circular, the periphery is smooth, and the surface bumps are flat. The color of the village is translucent.
(2) Meat broth liquid culture
Grows and becomes cloudy.
(3) Gelatin puncture culture
Does not liquefy.
[0018]
Figure 0004132297
Figure 0004132297
[0019]
<Others>
Α-L-fucosidase having enzymological and physicochemical properties described later is produced inside and outside the cells.
[0020]
  Based on the above properties, with reference to Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, this strain was identified as a strain belonging to Alkaline Genes, and Alkaline Genes sp. KSF-9687 (Alcaligenes sp. KSF-9687). Alkaline Genes denitrificans (the most similar property)Alcaligenes denitrificans)The
[0021]
Next, the above-mentioned Alkaline Genes spissis KSF-9687 (Alcaligenes sp. KSF-9687) The enzymatic and physicochemical properties of the α-L-fucosidase of the present invention produced by the strain will be described.
(1) Enzyme action
The α-L-fucosidase of the present invention specifically hydrolyzes α-L-fucoside bonds in natural polymer substrates, oligosaccharides or synthetic substrates to release L-fucose. In addition, α-L-fucoside-bonded L-fucose is transglycosylated to a monosaccharide or disaccharide or higher oligosaccharide which is a receptor, and a disaccharide or trisaccharide or higher oligosaccharide containing L-fucose is converted. Generate.
[0022]
(2) Substrate specificity in hydrolysis
The α-L-fucosidase of the present invention hydrolyzes L-fucose linked to α1 → 2 or α1 → 3 in a natural polymer substrate, oligosaccharide or synthetic substrate. Also, p-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside (p-nitrophenyl-α-L-fucoside), which is a synthetic substrate, is hydrolyzed. However, it does not act on L-fucose linked to α1 → 4 or α1 → 6 in natural polymer substrates, oligosaccharides or synthetic substrates.
[0023]
Table 1 shows enzyme activities of the α-L-fucosidase of the present invention with respect to various α-L-fucoside bond-containing substrates. As is apparent from Table 1, the α-L-fucosidase of the present invention is a synthetic substrate such as p-nitrophenyl-α-L-fucoside, as well as α-L-fucopyranosyl- (1 → 2 ′)-lactose (2 It can be seen that it acts on oligosaccharides such as '-fucosyl lactose) and α-L-fucopyranosyl- (1 → 3')-lactose (3'-fucosyl lactose) and natural substrates such as mucin. That is, the α-L-fucosidase of the present invention hydrolyzes α-L-fucoside bond in a synthetic substrate and hydrolyzes fucose having α1 → 2 or α1 → 3 bond in an oligosaccharide chain. I understand. On the other hand, it can be seen that it does not act on L-fucose bonded to α1 → 4 or α1 → 6 in the oligosaccharide chain and in the natural polymer substrate. In addition, the relative activity in Table 1 is shown with the activity for p-nitrophenyl-α-L-fucoside as 100.
[0024]
[Table 1]
Figure 0004132297
[0025]
(3) Substrate specificity in transglycosylation reaction
In the transglycosylation reaction catalyzed by α-L-fucosidase of the present invention, the compound serving as a donor of L-fucose is a compound having L-fucose bonded with α-L-fucoside. Specific examples of the donor include p-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside, o-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside, α-L-fucopyranosyl fluoride and the like.
In the transglycosylation reaction catalyzed by the α-L-fucosidase of the present invention, the compound serving as the acceptor of L-fucose is a monosaccharide such as D-galactose, 1-O-methyl-D-galactose and D-mannose; lactose And oligosaccharides having two or more sugars such as N-acetyllactosamine.
[0026]
In the transglycosylation reaction catalyzed by the α-L-fucosidase of the present invention, an oligosaccharide containing α1- → 3-linked L-fucose is selectively produced, and α1- → 2, α1-> 4 or α1-> 6-linked L- Oligosaccharides containing fucose are not produced. That is, only oligosaccharides in which L-fucose is α1 → 3 fucoside-bonded at the 3-position of the receptor are produced. The oligosaccharide produced by the transglycosylation reaction is a disaccharide or higher oligosaccharide. For example, when a monosaccharide is used as a receptor, a disaccharide oligosaccharide in which L-fucose is α1 → 3 linked to this receptor is generated, and when a disaccharide is used as a receptor, this receptor is received. A trisaccharide oligosaccharide in which L-fucose is α1 → 3 linked to the body is produced.
[0027]
(4) Optimum pH and stable pH range
The optimum pH for the hydrolysis and transglycosylation reaction is pH 7.0-8.0. The stable pH range is pH 6.0-9.0 in the case of processing conditions at 45 ° C. for 1 hour.
[0028]
(5) Method for measuring titer
The measurement of the hydrolysis activity of α-L-fucosidase of the present invention was carried out using p-nitrophenyl-α-L-fucoside as a substrate in a potassium phosphate buffer solution at pH 7.0 at 50 ° C. After stopping the reaction by adding NaOH buffer (pH 10.0), the amount of liberated p-nitrophenol can be measured by measuring the absorbance at 410 nm. The unit of the enzyme was defined as the amount of enzyme that liberates 1 μmol of p-nitrophenol per minute. For other substrates, react in potassium phosphate buffer at pH 7.0 for 30 minutes at 50 ° C., then heat in a boiling bath for 3 minutes to stop the reaction, then centrifuge and remove the supernatant The amount of free L-fucose therein can be measured by using L-fucose dehydrogenase derived from Pseudomonas. Alternatively, the measurement can be performed by analyzing the substrate and product fluorescently labeled by pyridylamination by high performance liquid chromatography.
[0029]
The method for measuring the activity of the transglycosylation reaction can be performed as follows. That is, an L-fucose donor and an oligosaccharide serving as an acceptor are dissolved in a buffer solution, and α-L-fucosidase of the present invention is added to this solution, and the reaction is carried out at around 37 ° C. After the reaction, the reaction product is confirmed using thin layer chromatography (TLC) or high performance liquid chromatography (HPLC).
[0030]
(6) Optimum temperature and stable temperature
The optimum temperature for hydrolysis and transglycosylation is 55 ° C. The stable temperature range is stable up to 50 ° C. and shows about 60% residual activity at 55 ° C. when the remaining activity is measured by keeping it in 10 mM phosphate buffer at pH 7.0 for 10 minutes at each temperature.
[0031]
(7) Conditions for deactivation due to pH and temperature
It is completely inactivated by treatment at 65 ° C. for 10 minutes. Further, it is completely deactivated by treatment at 45 ° C. for 60 minutes at pH 11 or higher.
[0032]
(8) Effects of inhibitors, etc.
When the influence of various additives on the α-L-fucosidase of the present invention was examined, copper (0.1 mM), mercury (0.1 mM) or parachloromercuribenzoic acid (0. 5 mM), but is hardly affected by other metal ions (1 mM) and SH reagent (1 mM). The hydrolysis reaction is hardly affected by the product L-fucose (1 mM).
[0033]
(9) Purification method
For purification of the α-L-fucosidase of the present invention, known purification methods can be used alone or in combination. The α-L-fucosidase of the present invention is produced inside and outside the cells, but it is preferable to use the extracellular enzyme for purification of the enzyme. For example, the culture solution can be filtered or centrifuged to remove the bacterial cells, and then salting out, various chromatographic methods, etc. can be combined appropriately. An example of the purification method is shown below.
[0034]
After completion of the culture, the adsorbed enzyme is eluted by passing the culture containing the cells through Streamline-Diae (Pharmacia). Ammonium sulfate is added to the active fraction to a final concentration of 1M, passed through a butyl Toyopearl 650M column, and the active fraction is eluted. The active fraction is collected and passed through a fucose-cellulofine column to elute the adsorbed enzyme. The active fraction is dialyzed overnight and passed through a FPLC-Mono Q column to elute the active fraction. The eluted active fraction shows an electrophoretically single band at this point, but gel filtration can also be performed using a Sephacryl S-300HR column for polishing.
[0035]
(10) Molecular weight
The molecular weight of the α-L-fucosidase of the present invention was measured to be about 102,000 by PAGE (polyacrylamide gel electrophoresis) method.
[0036]
(11) Polyacrylamide electrophoresis
The purified α-L-fucosidase showed a single band in PAGE and SDS-PAGE electrophoresis. Further, the molecular weights at this time were measured as 102,000 and 51,000, respectively.
[0037]
Since the α-L-fucosidase of the present invention as described above is produced inside and outside the cells, it can be easily obtained by simply separating the enzyme produced outside the cells when obtaining the enzyme from the cells. Can do. For example, it can be easily obtained simply by separating α-L-fucosidase from a bacterial culture. For this reason, since operation which crushes a microbial cell and extracts an active fraction is not required, it is suitable for industrial production. The α-L-fucosidase of the present invention has an optimum pH in the vicinity of neutrality and is stable to heat, so that it can be suitably used for structural analysis of sugar chains and functional studies.
[0038]
By using a novel α-L-fucosidase having the above properties, a method for producing oligosaccharides containing α1- → 3-linked L-fucose was established. The method for producing an oligosaccharide containing L-fucose according to the present invention will be described in detail below.
The method for producing an oligosaccharide of the present invention comprises adding the α-L-fucosidase of the present invention to a solution containing an L-fucose donor and an L-fucose acceptor to perform a sugar transfer reaction, This is a method of producing an oligosaccharide containing α1- → 3-linked L-fucose.
[0039]
Examples of the L-fucose donor include p-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside, o-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside, and α-L-fucopyranosyl fluoride. These donors can be not only purified products but also compounds containing these compounds.
Examples of the L-fucose receptor include monosaccharides such as D-galactose, 1-O-methyl-D-galactose, and D-mannose; oligosaccharides such as lactose or N-acetyllactosamine and the like. It is done. As these receptors, not only purified products but also sugars containing these sugars can be used.
[0040]
In the method for producing an oligosaccharide of the present invention, the α-L-fucosidase of the present invention is used, so that an oligosaccharide containing α- → 3-linked L-fucose can be selectively produced. That is, in the method for producing an oligosaccharide of the present invention, an oligosaccharide containing L-fucose linked with α1 → 2, α1 → 4 or α1 → 6 is not generated. The oligosaccharide selectively obtained by the method for producing an oligosaccharide of the present invention is an oligosaccharide in which L-fucose is α1 → 3 fucoside-bonded at the 3-position of the receptor, that is, an α-L-fucopyranosyl (1 → 3) group. Is an oligosaccharide containing
[0041]
In the method for producing an oligosaccharide of the present invention, an oligosaccharide having a disaccharide or a trisaccharide or more can be produced by selecting a receptor. For example, by using a monosaccharide as a receptor, a disaccharide oligosaccharide in which L-fucose is α1 → 3 linked can be produced. Further, by using a disaccharide as a receptor, a trisaccharide oligosaccharide in which L-fucose is α1 → 3 linked can be produced.
[0042]
The following method can be illustrated as a preferable method of the manufacturing method of the oligosaccharide of this invention. First, a mixed solution of a potassium phosphate buffer and at least one organic solvent selected from the group consisting of water-soluble organic solvents such as dimethyl sulfoxide, N, N-dimethylformamide, and acetonitrile is prepared. The acceptor and donor are added to this mixed solution and reacted at 27 to 60 ° C, preferably 35 to 55 ° C for 6 to 72 hours, preferably 18 to 48 hours. In this case, the concentration of the acceptor and the donor is preferably 0.01% by weight to 10% by weight, and preferably 0.1% by weight to 10% by weight. The mixing ratio of the acceptor and the donor is 1: 1 to 20: 1 by weight, preferably 2: 1 to 10: 1. The reaction temperature is 27 ° C to 60 ° C, preferably 35 ° C to 55 ° C. The reaction pH is 6-9, preferably pH 7-8. The α-L-fucosidase to be used is preferably purified, but a crudely purified enzyme can also be used.
[0043]
By performing the transglycosylation reaction of L-fucose by the method as described above, an oligosaccharide containing α1- → 3-linked L-fucose can be selectively and easily produced. Specific examples of the oligosaccharide that can be produced by such a method include α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-galactose represented by the above formula (1), and the above formula (2). Α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-mannose represented by the formula: α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -1-O-methyl-D-galactose represented by the formula (3) Α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-lactose represented by the formula (4), α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-1-O represented by the formula (5) -Methyl lactose, α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-N-acetyllactosamine represented by the formula (6), and the like. These are all novel compounds, and are useful for the structural analysis of sugar chains, the study of sugar functions, the study of sugar metabolism, and the like, and are expected to have physiological activities.
[0044]
【The invention's effect】
  The present inventionUsed inα-L-fucosidase specifically hydrolyzes α-L-fucoside bonds in natural polymer substrates, oligosaccharides or synthetic substrates, and more than trisaccharide oligos containing α1-L-fucose linked to α1 → 3. Since sugars can be synthesized, it is useful for structural analysis and functional studies of sugar chains.
[0046]
  The present inventionUsed inAlkali Genes spissis KSF-9687 (Alcaligenes sp. KSF-9687),Since it has the ability to produce α-L-fucosidase and produces this enzyme outside the cells, α-L-fucosidase can be easily produced and purified by using this strain.
[0047]
In the method for producing an oligosaccharide containing L-fucose according to the present invention, since the transglycosylation reaction is carried out using the α-L-fucosidase, an oligosaccharide containing α1- → 3-linked L-fucose is easily produced. be able to.
[0048]
  The present inventionManufactured withOligosaccharides containing α1- → 3-linked L-fucose are novel compounds, and are useful for structural analysis of sugar chains, studies of sugar functions, and studies of sugar metabolism.
[0049]
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
EXAMPLES Hereinafter, although an Example demonstrates this invention in detail, this invention is not limited to these.
[0050]
Example 1
p-nitrophenyl-α-L-fucoside 0.05 wt%, glucose 1 wt%, peptone 0.5 wt%, casamino acid 0.25 wt%, KH2POFour 0.1% by weight, MgSOFour・ 7H2A medium containing 0.02 wt% O and 2 wt% agar was adjusted to pH 9.0. In addition, soil collected from Kakegawa City, Shizuoka Prefecture was diluted with sterilized water to obtain a soil suspension. This soil suspension was spread on a plate medium composed of the above medium and cultured at 37 ° C. for 2 days. After culturing, colonies that developed yellow color in the medium were isolated. In this way, Alkali Genes spissis KSF-9687 (Alcaligenes sp. KSF-9687) strain was screened.
[0051]
Example 2
<< Production of α-L-fucosidase >>
To 500 ml of a medium containing 0.5% by weight of peptone, 0.25% by weight of yeast extract and 0.5% by weight of sodium chloride (pH 7.2), Alkali Genes sp. KSF-9687 (Alcaligenes sp. KSF-9687) was inoculated and shake-cultured to obtain a seed culture solution. Next, medium 3 liter having the same composition as the seed culture was placed in three 5-liter jar fermenters and sterilized at 121 ° C. for 20 minutes. After cooling, the seed culture solution was inoculated and cultured at 37 ° C. for 2 days under the conditions of an aeration rate of 3 liters per minute and a stirring speed of 300 revolutions per minute.
[0052]
After completion of the culture, the culture containing the bacterial cells was passed through a streamline-diae column (Pharmacia, 5.0 × 17 cm) which was previously dissolved in 10 mM phosphate buffer (pH 7.0) and equilibrated with the same buffer. The adsorbed enzyme was eluted with 10 mM phosphate buffer containing 0.2 M sodium chloride. The active fractions were collected and ammonium sulfate was dissolved to a final concentration of 1M. It was passed through a butyl yopal 650M column (manufactured by Tosoh, 2.6 × 30 cm) pre-equilibrated with 10 mM phosphate buffer containing 1 M ammonium sulfate, and eluted by a linear gradient method of 10 mM phosphate buffer containing 1 M to 0 M ammonium sulfate. . The eluted active fraction was collected and passed through a fucose cellulose fine column (1.6 × 7.5 cm) previously equilibrated with 10 mM phosphate buffer (pH 7.0), and the adsorbed enzyme contained 50 mM L-fucose. Elute with the same buffer. The active fraction was dialyzed overnight with 10 mM phosphate buffer (pH 7.0). Next, it was passed through FPLC-Mono Q (manufactured by Pharmacia) equilibrated with the same buffer, and the adsorbed enzyme was eluted by a linear gradient method of 10 mM phosphate buffer containing 0 M to 0.3 M sodium chloride.
[0053]
At this point, the enzyme electrophoretically gives a single band, but the active fraction is concentrated for polishing, followed by Sephacryl S-300HR (Pharmacia, 1.6 × 60 cm) to purify α-L-fucosidase. 74 μg of a sample (specific activity 126 units / mg, yield 20% by weight) was obtained.
[0054]
Example 3
The hydrolysis activity of α-L-fucosidase obtained in Example 2 on various substrates was measured as follows.
When p-nitrophenyl-α-L-fucoside was used as a substrate, 100 μl enzyme and 200 μl substrate were added to 100 mM potassium phosphate buffer at pH 7.0, and the reaction was carried out at 50 ° C. for 15 minutes. -NaOH buffer (pH 10.0) was added to stop the reaction. Next, the amount of p-nitrophenol released was quantified by measuring the absorbance at 410 nm. For other substrates, add 100 μl enzyme and 200 μl substrate to 100 mM potassium phosphate buffer at pH 7.0, react at 50 ° C. for 30 minutes, and then heat in a boiling bath for 3 minutes to stop the reaction. Then, the mixture was centrifuged, and the amount of free L-fucose in the supernatant was quantified using P-monas-derived L-fucose dehydrogenase. The results are as shown in Table 1.
[0055]
Example 4
<< Synthesis of α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-galactose >>
Monosaccharide D-galactose (500 mg) as an acceptor for L-fucose and p-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside (50 mg) as an L-fucose donor with 0.1 M potassium phosphate buffer The solution (pH 7.0, 10 ml) was dissolved in a mixed solution of dimethyl sulfoxide (1000 μl). To this mixed solution, α-L-fucosidase obtained in Example 2 was added, and a transglycosylation reaction was performed at 37 ° C. for 48 hours.
[0056]
The obtained reaction product was subjected to activated carbon column chromatography and eluted with a 0-20% (v / v) aqueous ethanol gradient (total 400 ml) to collect fractions corresponding to the disaccharide fraction. When the solvent of the collected fractions was distilled off, 20.5 mg of an amorphous solid was obtained. The recovery rate at this time was 18% by weight.
[0057]
The molecular weight of this amorphous solid was measured and found to be 326. Also11 H-NMR was measured and the obtained spectrum was analyzed. Obtained1The spectrum of H-NMR is shown in FIG. From these results, the obtained amorphous solid is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-galactose (3-fucopyranosyl-D-galactose) represented by the formula (1). found.
[0058]
Example 5
<< Synthesis of α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-mannose >>
A monosaccharide D-mannose (500 mg) as an acceptor of L-fucose and p-nitrophenyl α-L-fucopyranoside (100 mg) as a donor of L-fucose were mixed with 0.1 M potassium phosphate buffer. (PH 7.0, 10 ml) was dissolved in a mixed solution of dimethyl sulfoxide (1000 μl). To this mixed solution, α-L-fucosidase obtained in Example 2 was added, and a transglycosylation reaction was performed at 37 ° C. for 48 hours.
[0059]
The obtained reaction product was subjected to activated carbon column chromatography and eluted with a 0-20% (v / v) aqueous ethanol gradient (total 400 ml) to collect fractions corresponding to the disaccharide fraction. The solvent of the collected fractions was distilled off to obtain 10.3 mg of an amorphous solid. The recovery rate at this time was 9% by weight.
[0060]
The molecular weight of this amorphous solid was measured and found to be 326. Also11 H-NMR was measured and the obtained spectrum was analyzed. Obtained1The spectrum of H-NMR is shown in FIG. From these results, the obtained amorphous solid is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-mannose (3-fucopyranosyl-D-mannose) represented by the formula (2). found.
[0061]
Example 6
<< Synthesis of α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -1-O-methyl-D-galactose >>
Monosaccharide 1-O-methyl-D-galactose (300 mg) as an acceptor for L-fucose and p-nitrophenyl α-L-fucopyranoside (24 mg) as a donor for L-fucose Dissolved in a mixed solution of potassium acid buffer (pH 7.0, 4.2 ml) and dimethyl sulfoxide (420 μl). To this mixed solution, α-L-fucosidase obtained in Example 2 was added, and a transglycosylation reaction was performed at 37 ° C. for 48 hours.
[0062]
The obtained reaction product was subjected to activated carbon column chromatography and eluted with a 0-20% (v / v) aqueous ethanol gradient (total 400 ml) to collect fractions corresponding to the disaccharide fraction. When the solvent of the collected fraction was distilled off, 10 mg of an amorphous solid was obtained. The recovery rate at this time was 23% by weight.
[0063]
The molecular weight of this amorphous solid was measured and found to be 340. Also11 H-NMR was measured and the obtained spectrum was analyzed. Obtained1The spectrum of H-NMR is shown in FIG. From these results, the obtained amorphous solid was expressed by the formula (3) α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -1-O-methyl-D-galactose (3-fucopyranosyl-1- O-methylgalactose).
[0064]
Example 7
<< Synthesis of α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ')-lactose >>
Disaccharide lactose (500 mg) as an acceptor for L-fucose and p-nitrophenyl α-L-fucopyranoside (50 mg) as a donor for L-fucose were added to a 10 mM potassium phosphate buffer (pH 7.0). 4.2 ml) and dimethyl sulfoxide (420 μl). To this mixed solution, α-L-fucosidase obtained in Example 2 was added, and a transglycosylation reaction was performed at 37 ° C. for 48 hours.
[0065]
The obtained reaction product was subjected to activated carbon column chromatography, and eluted with a 0-20% (v / v) ethanol aqueous gradient (total 400 ml) to collect fractions corresponding to the trisaccharide fraction. When the solvent of the collected fractions was distilled off, 20.5 mg of an amorphous solid was obtained. The recovery rate at this time was 23% by weight.
[0066]
The molecular weight of this amorphous solid was measured and found to be 488. Also11 H-NMR was measured and the obtained spectrum was analyzed. Obtained1The spectrum of H-NMR is shown in FIG. From these results, it was found that the obtained amorphous solid was α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-lactose (3′-fucopyranosyl-lactose) represented by the above formula (4). .
[0067]
Example 8
<< Synthesis of α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ')-1-O-methyl lactose >>
Disaccharide 1-O-methyl lactose (300 mg) as L-fucose acceptor and p-nitrophenyl α-L-fucopyranoside (24 mg) as L-fucose donor in 10 mM potassium phosphate buffer Dissolved in a mixed solution of liquid (pH 7.0, 4.2 ml) and dimethyl sulfoxide (420 μl). To this mixed solution, α-L-fucosidase obtained in Example 2 was added, and a transglycosylation reaction was performed at 37 ° C. for 48 hours.
[0068]
The obtained reaction product was subjected to activated carbon column chromatography and eluted with a 0-20% (v / v) aqueous ethanol gradient (total 400 ml) to collect fractions corresponding to the disaccharide fraction. When the solvent of the collected fraction was distilled off, 10 mg of an amorphous solid was obtained. The recovery rate at this time was 23% by weight.
[0069]
The molecular weight of this amorphous solid was measured and found to be 502. Also11 H-NMR was measured and the obtained spectrum was analyzed. Obtained1The spectrum of H-NMR is shown in FIG. From these results, the obtained amorphous solid was found to be α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-1-O-methyl lactose (3′-fucopyranosyl-1-O) represented by the above formula (5). -Methyl lactose).
[0070]
Example 9
<< Synthesis of α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ')-N-acetyllactosamine >>
10 mM potassium phosphate buffer containing disaccharide N-acetyllactosamine (500 mg) as an acceptor for L-fucose and p-nitrophenyl α-L-fucopyranoside (30 mg) as a donor for L-fucose (PH 7.0, 5.0 ml) was dissolved in a mixed solution of dimethyl sulfoxide (500 μl). To this mixed solution, α-L-fucosidase obtained in Example 2 was added, and a transglycosylation reaction was performed at 37 ° C. for 48 hours.
[0071]
The obtained reaction product was subjected to activated carbon column chromatography and eluted with a 0-20% (v / v) aqueous ethanol gradient (total 400 ml) to collect fractions corresponding to the disaccharide fraction. The solvent of the collected fractions was distilled off to obtain 8.4 mg of an amorphous solid. The recovery rate at this time was 15% by weight.
[0072]
It was 529 when the molecular weight of this amorphous solid was measured. Also11 H-NMR was measured and the obtained spectrum was analyzed. Obtained1The spectrum of H-NMR is shown in FIG. From these results, the obtained amorphous solid was found to be α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ′)-N-acetyllactosamine (3′-fucopyranosyl-N-acetyllacto) represented by the above formula (6). Sammin).
[Brief description of the drawings]
FIG. 1 obtained in Example 41It is a spectrum of H-NMR.
FIG. 2 obtained in Example 51It is a spectrum of H-NMR.
FIG. 3 obtained in Example 61It is a spectrum of H-NMR.
FIG. 4 obtained in Example 71It is a spectrum of H-NMR.
FIG. 5 obtained in Example 81It is a spectrum of H-NMR.
FIG. 6 obtained in Example 91It is a spectrum of H-NMR.

Claims (10)

L−フコースの供与体と、L−フコースの受容体とを含む溶液に、下記の酵素学的性質を有するα−L−フコシダーゼを添加して糖移転反応を行う方法であって、前記α−L−フコシダーゼが、独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センターにFERM P−16944の受託番号で寄託されているアルカリジェネス・スピーシス・KSF−9687( Alcaligenes sp. KSF-9687 )菌株由来であることを特徴とするα1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖の製造方法。
(1)作用
・天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα−L−フコシド結合を特異的に加水分解し、L−フコースを遊離する。
・α−L−フコシド結合しているL−フコースを、受容体である単糖または二糖以上のオリゴ糖に糖転移反応を行い、L−フコースを含むオリゴ糖を生成する。
(2)加水分解での基質特異性
・天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα1→2またはα1→3結合しているL−フコースを加水分解する。
・合成基質であるp−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシドを加水分解する。
・天然高分子基質、オリゴ糖または合成基質中のα1→4またはα1→6結合しているL−フコースには作用しない。
(3)糖転移反応での特異性
・α−L−フコシド結合しているL−フコースを、受容体である単糖または二糖以上のオリゴ糖に糖転移反応を行い、α1→3結合したL−フコースを含むオリゴ糖を生成する。
・α1→2、α1→4またはα1→6結合したL−フコースを含むオリゴ糖は生成しない。
(4)至適pHおよび安定pH範囲
・至適pHはpH7.0〜8.0であり、安定pH範囲は、45℃で1時間の保持条件においてpH6.0〜9.0である。
(5)至適温度および安定温度範囲
・至適温度は55℃であり、pH7.0で10分間処理した時、50℃まで安定であり、65℃以上で失活する。
(6)阻害剤などの影響
・酵素活性は銅、水銀またはパラクロルメルクリ安息香酸により著しく阻害されるが、その他の金属イオン、SH試薬および糖によりほとんど影響を受けない。
(7)分子量
・PAGEにより測定した分子量は約102,000である。
・SDS−PAGEにより測定した分子量は約51,000である。
A method for performing a sugar transfer reaction by adding α-L-fucosidase having the following enzymatic properties to a solution containing an L-fucose donor and an L-fucose acceptor , L-fucosidase is FERM in the patent biological deposit center of the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology Production of oligosaccharides containing α1- → 3-linked L-fucose, which is derived from Alkaligene sp. KSF-9687 ( Alcaligenes sp. KSF-9687 ) strain deposited under the deposit number of P-16944 Method.
(1) Action ・ Specifically hydrolyzes α-L-fucoside bond in natural polymer substrate, oligosaccharide or synthetic substrate to release L-fucose.
-L-fucose bonded with α-L-fucoside is subjected to a transglycosylation reaction with a monosaccharide or a disaccharide or higher oligosaccharide as a receptor to produce an oligosaccharide containing L-fucose.
(2) Substrate specificity in hydrolysis • Hydrolyzes α1- → 2 or α1- → 3-linked L-fucose in a natural polymer substrate, oligosaccharide or synthetic substrate.
Hydrolyze the synthetic substrate p-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside.
• Does not act on L-fucose linked to α1 → 4 or α1 → 6 in natural polymeric substrates, oligosaccharides or synthetic substrates.
(3) Specificity in transglycosylation reaction • α-L-fucoside-linked L-fucose was subjected to a transglycosylation reaction to a monosaccharide or a disaccharide or more oligosaccharide as a receptor, and α1 → 3 linked. An oligosaccharide containing L-fucose is produced.
• No oligosaccharides containing L-fucose linked to α1 → 2, α1 → 4 or α1 → 6 are produced.
(4) Optimum pH and stable pH range-The optimum pH is pH 7.0 to 8.0, and the stable pH range is pH 6.0 to 9.0 under a holding condition at 45 ° C for 1 hour.
(5) Optimum temperature and stable temperature range-The optimum temperature is 55 ° C. When treated at pH 7.0 for 10 minutes, it is stable up to 50 ° C and deactivated at 65 ° C or more.
(6) Effects of inhibitors, etc. Enzyme activity is significantly inhibited by copper, mercury or parachloromercuribenzoic acid, but is hardly affected by other metal ions, SH reagent and sugar.
(7) Molecular weight The molecular weight measured by PAGE is about 102,000.
-The molecular weight measured by SDS-PAGE is about 51,000.
L−フコースの供与体がp−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシド、o−ニトロフェニル−α−L−フコピラノシドまたはα−L−フコピラノシルフルオリドである請求項1記載の製造方法。  The process according to claim 1, wherein the donor of L-fucose is p-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside, o-nitrophenyl-α-L-fucopyranoside or α-L-fucopyranosyl fluoride. L−フコースの受容体が単糖または二糖以上のオリゴ糖である請求項1または2記載の製造方法。  The method according to claim 1 or 2, wherein the L-fucose receptor is a monosaccharide or a disaccharide or higher oligosaccharide. L−フコースの受容体がD−ガラクトース、1−O−メチル−D−ガラクトース、D−マンノース、ラクトースまたはN−アセチルラクトサミンである請求項1ないし3のいずれかに記載の製造方法。  The production method according to any one of claims 1 to 3, wherein the L-fucose receptor is D-galactose, 1-O-methyl-D-galactose, D-mannose, lactose or N-acetyllactosamine. 製造するオリゴ糖が下記式(1)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−D−ガラクトースである請求項1ないしのいずれかに記載の製造方法。
Figure 0004132297
The production method according to any one of claims 1 to 4 , wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-galactose represented by the following formula (1).
Figure 0004132297
製造するオリゴ糖が下記式(2)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−D−マンノースである請求項1ないしのいずれかに記載の製造方法。
Figure 0004132297
The production method according to any one of claims 1 to 4 , wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -D-mannose represented by the following formula (2).
Figure 0004132297
製造するオリゴ糖が下記式(3)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3)−1−O−メチル−D−ガラクトースである請求項1ないしのいずれかに記載の製造方法。
Figure 0004132297
The production method according to any one of claims 1 to 4 , wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3) -1-O-methyl-D-galactose represented by the following formula (3). .
Figure 0004132297
製造するオリゴ糖が下記式(4)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−ラクトースである請求項1ないしのいずれかに記載の製造方法。
Figure 0004132297
Alpha-L-fucopyranosyl oligosaccharides production is represented by the following formula (4) - (1 → 3 ') - The process according to any one of claims 1 to 4 is lactose.
Figure 0004132297
製造するオリゴ糖が下記式(5)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−1−O−メチルラクトースである請求項1ないしのいずれかに記載の製造方法。
Figure 0004132297
The production method according to any one of claims 1 to 4 , wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ')-1-O-methyl lactose represented by the following formula (5).
Figure 0004132297
製造するオリゴ糖が下記式(6)で表されるα−L−フコピラノシル−(1→3’)−N−アセチルラクトサミンである請求項1ないしのいずれかに記載の製造方法。
Figure 0004132297
(式中、Acはアセチル基である。)
The production method according to any one of claims 1 to 4 , wherein the oligosaccharide to be produced is α-L-fucopyranosyl- (1 → 3 ')-N-acetyllactosamine represented by the following formula (6).
Figure 0004132297
(In the formula, Ac is an acetyl group.)
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