JP3718734B2 - Novel polypeptide gene cDNA, vector containing the cDNA, host cell transformed with the vector, polypeptide produced thereby, method for producing the same, DNA encoding the polypeptide, and antibody of the polypeptide - Google Patents

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Description

【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は日本産アコヤガイ(Pinctada fucata)の外套膜組織(外套膜上皮細胞)が産生する新規ポリペプチド遺伝子のcDNA、該cDNAを含有するベクター、前記ベクターで形質転換された宿主細胞、それにより生産されるポリペプチド、その製造方法、前記ポリペプチドをコードするDNA、前記ポリペプチドの抗体、及び前記ポリペプチドまたはその分解ペプチドを含有する化粧品に関する。
【0002】
[発明の目的]
細胞からは、その維持、増殖および成長等に関連した様々な因子が産生されている。例えば、アコヤガイ外套膜上皮細胞からは、貝殻形成に係わる因子及び生体防御に係わる因子、その他、多くの因子が産生されている。本発明者らはこの点に注目し、ある種の細胞(例えば、アコヤガイ外套膜上皮細胞)が産生している新規な因子(ポリペプチド)を見出すべく鋭意検討を行った。
【0003】
また、化粧品の新たな原料の開発あるいは真珠養殖におけるピースの新たな選別方法の開発をも目的とする。
【0004】
【従来の技術と発明が解決しようとする課題】
従来、ある特定のポリペプチドまたはそれをコードするDNAを得ようとする場合、組織や細胞培養液中に目的とするポリペプチドを確認し、次いでポリペプチドの単離精製を経て、遺伝子をクローニングするという方法、あるいはその生物活性を指標として遺伝子を発現クローニングする方法が一般的に用いられていた。
【0005】
しかし、アコヤガイ外套膜上皮細胞が産生する因子に関する情報は極めて少なく、また不溶性を示すものが多いことが、その単離、精製および生物活性の確認を困難なものとしている。
【0006】
一方、cDNAの作製技術やシークエンス技術は急速に発展し、大量のcDNAのシークエンスを迅速に行なうことができるようになった。また、遺伝子からその遺伝子の機能を同定するリバースジェネティクス( Reverse Genetics )の諸方法の発展も著しい。
【0007】
そこで、本発明者らは、これらの方法を用いて新規なポリペプチドを見出すことにした。すなわち、アコヤガイ外套膜上皮細胞等からmRNAを単離し、これを出発材料としてcDNAを得、その塩基配列を決定し、アミノ酸配列を推定した。その結果、新規なポリペプチドをコードするDNAを見出すことに成功し、本発明を完成した。
【0008】
アミノ酸配列データベース(EMBL-GDB Rel.41 )、蛋白質データベース(SWISS-PROT Rel.30 )に登録されている既知のヌクレオチド配列およびアミノ酸配列を調査したが、同一は無論、相同性の高いものも無かった。従って、本発明のDNA、ポリペプチドは全く新規なものであることが確認された。
【0009】
ここで、アコヤガイ外套膜上皮細胞が分泌するポリペプチドについて説明する。アコヤガイはその外面を強固な殻で覆い、外敵等から身を守っている。一種の生体防御を担うこの殻は、外套膜上皮細胞により作られることが知られている。
貝殻は主に炭酸カルシウムの結晶とポリペプチドより構成する。さらにアコヤガイの貝殻は、3層からなる構造上の差異が存在し、各々は、外側から殻皮層、稜柱層、真珠層と呼ばれる。この構造上の違いはポリペプチドの違いによるものと考えられている。
【0010】
現在までに知られている、各層を構成するポリペプチドの違いは、そのアミノ酸組成の違いのみである。これは、大部分のポリペプチドが水やその他、ほとんどの溶媒に不溶なためであり、このことがこれらポリペプチドの解析を遅らせる要因となっている。
【0011】
これらポリペプチドの内、真珠層を構成するポリペプチドは、以前から様々な薬として利用されており、現在でも一部地域において利用されている。また、以前から化粧品の有効成分としても利用されている。
【0012】
また、貝殻構造上の真珠層は、宝石として広く人々に親しまれている真珠と同等であるとみなされている。真珠は他種の貝殻でてきた丸い核を、アコヤガイ外套膜の組織片であるピースとともにアコヤガイ生殖腺内に移植して、およそ1〜3年で出き上がる。
【0013】
このことから、宝石としての真珠の価値に大きく影響する色、巻に対して、これらポリペプチドが非常に重要な役割を果たしていることがうかがえる。
【0014】
【課題を解決するための手段】
本発明は以下の通りである。
【0015】
(請求項1)配列番号1の塩基配列をコードするcDNA。
【0016】
(請求項2)配列番号2の塩基配列をコードするcDNA。
【0017】
(請求項3)請求項1又は2記載のcDNAを有するクローニングベクター。
【0018】
(請求項4)配列番号1で示される塩基配列からなるDNA。
【0019】
(請求項5)配列番号2で示される塩基配列からなるDNA。
【0020】
(請求項6)請求項1又は2記載のcDNAを含有する発現ベクター。
【0021】
(請求項7)請求項6に記載の発現ベクターを保有する形質転換体。
【0022】
(請求項8)請求項7記載の形質転換体により生産され、請求項1又は請求項2に記載のcDNAにコードされるポリペプチド。
【0023】
(請求項9)配列番号3のアミノ酸配列からなる前項記載のポリペプチド。
【0024】
(請求項10)請求項8または9記載のポリペプチドを発現させるための条件下で請求項7記載の形質転換体を培養することからなるポリペプチドの製造方法。
【0025】
(請求項11)請求項8又は9記載のポリペプチドを抗原として調製した抗体。
【0026】
【発明の実施の形態】
上記において、配列番号1(又は2)で示される塩基配列を有するDNA(請求項4、5)とは、一般に、DNAの90%以上、例えば、95%、98%または99%が、配列番号1(又は2)で示される塩基配列を有するDNAであることを意味する。また、それらのホモローグのフラグメントとは、少なくとも10塩基、好ましくは少なくとも15塩基、例えば、20、25、30または40塩基部分を意味し、そのようなフラグメントも本発明のDNAに含まれる(同様の作用効果が得られる)。
【0027】
配列番号1で示される塩基配列を有するDNAがコードするポリペプチド、および配列番号3で示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドとは、一般にポリペプチドの90%以上、例えば、95、98または99%が、配列番号1で示される塩基配列を有するDNAがコードするアミノ酸配列を有するポリペプチドであることを意味する。また、それらのホモローグのフラグメントとは、一般に少なくとも20個、好ましくは少なくとも30個、例えば、40、60または100個の連続したアミノ酸領域で、少なくとも70%、好ましくは少なくとも80または90%、より好ましくは95%以上相同なものであり、そのようなホモローグは、以後本発明のポリペプチドとして記載される(同様の作用効果が得られる)。
【0028】
配列番号1または2で示される塩基配列を有するDNAに選択的にハイブリダイズするフラグメントとは、一般に、少なくとも20個、好ましくは少なくとも30個、例えば、40、60又は100個の連続した塩基配列領域で、少なくとも70%、好ましくは少なくとも80または90%、より好ましくは95%以上相同であるものであり、そのようなフラグメントは、以後本発明のDNAとして記載される(同様の作用効果が得られる)。
【0029】
さらに、本発明には、本発明のDNAからなるクローニングベクターまたは発現ベクターが含まれる。ベクターとしては、例えば、ori領域と、必要により上記DNAの発現のためのプロモーター、プロモーターの制御因子などからなるプラスミド、ウイルス、またはファージベクターが挙げられる。ベクターは一つまたはそれ以上の選択的マーカー遺伝子、例えば、アンピシリン耐性遺伝子を含んでいてもよい。ベクターは、イン・ビトロ( in vitro )に於いて、例えば、DNAに対応するRNAの製造、宿主細胞の形質転換に用いることができる。
【0030】
さらに、本発明には、配列番号1または2で示される塩基配列、またはそれらのオープンリーディングフレームを有するDNAを含む、本発明のDNAを複製または発現させるためのベクターで形質転換された宿主細胞も含まれる。細胞としては例えば細菌、酵母、昆虫、昆虫細胞または哺乳動物細胞が挙げられる。
【0031】
さらに、本発明には、本発明のポリペプチドを発現させるための条件下で本発明の宿主細胞を培養することからなるポリペプチドの製造方法も含まれる。培養は本発明のポリペプチドが発現し、宿主細胞より製造される条件下で行われることが好ましい。
【0032】
本発明のDNAは、上記のようなベクターのアンチセンス領域に挿入することでアンチセンスRNAを製造することもできる。このようなアンチセンスRNAは、細胞中の本発明のポリペプチドのレベルを制御することに用いることもできる。
【0033】
また、本発明のDNA、そのホモローグまたはフラグメントは、ノーザン(Northern)解析のプローブとして、あるいはPCR(Polymerase Chain Reaction )のプライマーとして利用することで、各個体間での本ポリペプチドの発現量、その他の比較が可能となる。
【0034】
本発明は、本発明におけるポリペプチドのモノクローナルまたはポリクローナル抗体も含む。さらに本発明は、本発明におけるポリペプチドのモノクローナルまたはポリクローナル抗体の製造方法も含む。モノクローナル抗体は、本発明のポリペプチドまたは、その断片を抗原として用い、通常のハイブリドーマの技術により製造することができる。ポリクローナル抗体は、宿主動物、例えば、ラットやウサギ等に本発明のポリペプチドを接種し血清を回収するといった通常の方法により製造することができる。
【0035】
本発明のポリペプチドとしては、配列番号3で示されたアミノ酸配列を有するもの以外に、その一部が欠損したもの、その一部が他のアミノ酸と置換したもの(例えば、物性の類似したアミノ酸に置換したもの)、およびその一部に他のアミノ酸が付加または挿入されたものも含まれる。
【0036】
よく知られているように、1つのアミノ酸をコードするコドンは1〜6種類が知られている。従って、ポリペプチドのアミノ酸配列を変えることなくDNAの塩基配列を変えることができる。
【0037】
配列番号1で示される本発明のDNAには、配列番号3で示されるポリペプチドをコードする全ての塩基配列群が含まれる。塩基配列を変えることによって、ポリペプチドの生産が向上することがある。
【0038】
配列番号2で示される本発明のDNAは配列番号1で示されるDNAの一態様であり、天然型配列を表す。
【0039】
配列番号2で示される塩基配列を有するDNAの作製は、以下の方法に従って行われる。すなわち、
(I)本発明のポリペプチドを産生するアコヤガイ外套膜組織からmRNAを分離し、
(II)該mRNAから1本鎖DNA(ファーストストランド)、次いで2本鎖DNA(セカンドストランド)を合成し(cDNAの合成)、
(III)該cDNAを適当なファージベクターに組込み、
(IV)パッケージングの後、得られた組み換え感染性ファージを宿主細胞に感染させ(cDNAライブラリーの作製)、
(V)得られたcDNAライブラリーを特異プローブでスクリーニングし、
(VI)得られたクローンについて、その全長をシークエンスすることによって作製することができる。
【0040】
説明を加えると、工程(I)は、アコヤガイ外套膜を材料として、Chomczynski,p.等の方法[Anal.Biochem.,162,156(1987) に記載。]に従って行われる。
【0041】
(II)、(III)および(IV)の工程はcDNAライブラリー作製の工程であり、改変したGubler & Hoffman法[Gene.,25,263(1983)に記載。]に準じて行われる。(III)の工程で用いられるファージベクターとしては多数知られているが(例えばλgt10, λgt11)、ここで言うファージベクターには、ヘルパーファージを感染させることでプラスミドに変換できるファージベクター(Phagemid)も含まれる。
【0042】
(V)の工程は、Molecular Cloning [Sambrook,J.,Frisch,E.F.,and Maniatis,T.Cold Spring Harbor Laboratory Press,(1989) ]に記載の方法に従って行われる。
【0043】
(VI)の工程のシークエンシングはマキサム・ギルバート(Maxam-Gilbert )法やジデオキシ・ターミネーター法により行われる。
【0044】
このようにして得られたDNAは、(A)その塩基配列を可能な読み枠においてアミノ酸配列に変換し、(B)得られたアミノ酸配列から、疎水性プロファイルを調製し、さらに開始コドン(ATG)のすぐ後ろにある(分泌蛋白は、そのN末端に高疎水性領域のシグナルペプチドを有している)高疎水性領域の存在を確認し、さらに(C)該DNAが全長あるいは略全長であることを確認する必要がある。
【0045】
上記の確認操作中、(C)はノーザン(Northern)解析により行われる。配列番号1および2で示される塩基配列が、一旦確定されると、その後は化学合成によって、あるいはPCR(Polymerase Chain Reaction )法によって、あるいは該塩基配列の断片をプローブとしてハイブリダイズさせることにより、本発明のDNAを得ることができる。さらに、本発明のDNAを含有するベクターDNAを適当な宿主に導入し、これを増殖させることによって、本発明のDNAを必要量得ることができる。
【0046】
本発明のポリペプチドを取得する方法としては、(1)生体または培養細胞から単離精製する方法。(2)ペプチド合成する方法、または(3)遺伝子組み換え技術を用いて生産する方法、などが挙げられるが、工業的には(3)に記載した方法が好ましい。
【0047】
遺伝子組み換え技術を用いてポリペプチドを生産するための発現系(宿主−ベクター系)としては、例えば、細菌、酵母、昆虫、昆虫細胞および哺乳動物細胞の発現系が挙げられる。
【0048】
例えば、大腸菌(Escherichia coli)で発現させる場合は、配列番号1で示される塩基配列を有するDNAを適当なプロモーター(例えば、trpプロモーター、lacプロモーター、λPLプロモーター、T7プロモーター等)の下流に接続し、大腸菌内で機能するベクター(例えば、pBR322,pUC18,pUC19等)に挿入して、発現ベクターを作製する。あるいは、市販の発現ベクター(例えば、pKK223−3:Pharmacia 、pETベクター:Stratagene、pTVベクター:Takara等)に、配列番号1で示されるDNAを接続して作製することもできる。
【0049】
大腸菌としては、たとえば、E.coli JM109,E.coli HB101,E.coli DH5株等が使用できるがこれに限定されるものではない。
【0050】
次に、この発現ベクターで形質転換した大腸菌を適当な培地で培養して、その菌体より目的とするポリペプチドを得ることができる。また、バクテリアのシグナルペプチド(例えば、pelBのシグナルペプチド)を利用すれば、ペリプラズム中に目的とするポリペプチドを分泌することもできる。さらに、他のポリペプチドとの融合蛋白(fusion protein)として生産し、目的とするポリペプチドを得ることもできる。
【0051】
また、昆虫または昆虫細胞で発現させる場合には、例えば、配列番号1あるいは2で示されるDNAを適当なベクターに挿入してトランスファーベクターを作製する。次に、バキュロウイルス(Autographa california NPV )のプロモーターを持つベクターとともにコ・トランスフェクトして組み換えウイルスを作製する。得られた組み換えウイルスを、適当な昆虫細胞(例えば、Sf9、Sf21、あるいはTn5細胞等)あるいは昆虫体内(例えば、カイコ等)に導入し、目的とするポリペプチドが生産される。
【0052】
また、哺乳動物細胞で発現させる場合には、例えば、配列番号1あるいは2で示されるDNAを適当なベクター(例えば、レトロウイルスベクター、パピローマウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、SV40系ベクター等)中の適当なプロモーター(例えば、SV40プロモーター、LTRプロモーター、メタロチオネインプロモーター等)の下流に挿入して発現ベクターを作製する。次に、得られた発現ベクターで適当な哺乳動物細胞(例えば、サルCOS細胞、チャイニーズハムスターCHO細胞、マウスL細胞等)を形質転換し、形質転換体を適当な培地で培養することによって、その細胞中に目的とするポリペプチドが生産される。以上のようにして得られたポリペプチドは、一般的な生化学的方法によって単離精製することができる。
【0053】
本発明のポリペプチドは化粧品への適用が可能となる。すなわち、本発明のポリペプチドを、通常使用されている他成分と混合して化粧用組成物とすることができる。
【0054】
【実施例】
以下に実施例を挙げて本発明をより具体的に説明するが、これらは本発明の範囲を制限するものではない。
【0055】
実施例1(mRNAの分離精製)
アコヤガイ(Pinctada fucata)の外套膜上皮細胞(前記アコヤガイは、今日において、国内外において容易に入手可能である。なお、これの外套膜上皮細胞は凍結保存に耐えられず、また、その他の保存方法、保存条件(培地など)も未だ見い出されていないことから、現在のところ、分離した状態では(細胞としては)生存できない。これを理由に、工業技術院生命工学工業技術研究所の特許微生物寄託センターによってこの細胞の受託が拒否された。受託拒否証明書入手済(識別のための表示:P.fucata−M01)。またアコヤガイ自身の受託も認められなかった。上記したアコヤガイ(Pinctada fucata)は、出願人自らが保管しており譲渡可能である。)の約3gを用い、Chomczynski,P.等の方法[Anal.Biochem.,162,156(1987) に記載。]に従って、全RNAを分離した。
【0056】
すなわち、4M GTC溶液(4Mグアニジンチオシアネート、25mMクエン酸ナトリウム、0.5%サルコシル、0.1M2−メルカプトエタノール)中で組織をホモジナイズし、フェノール/クロロホルム抽出を2回した後、イソプロパノールを加え、遠心(10,000×g、10分)して、沈殿中に約200μgの全RNAを回収した。さらにこれから、オリゴ(dT)ラテックス粒子(TAKARAより販売)を使い、mRNAを分離し、2.5μgのPoly(A)RNAを精製回収した。
【0057】
実施例2(cDNAライブラリーの作製)
cDNAライブラリーは、Gubler & Hoffman法[Gene.,25,263(1983)に記載]の変法にて作製した。
【0058】
すなわち、実施例1で分離精製したPoly(A)RNA2.5μgから、ランダムヘキサマープライマー、およびオリゴ(dT)プライマーを用いて、逆転写酵素により1本鎖DNA(ファーストストランド)を合成した。続いて2本鎖DNA(セカンドストランド)を合成した後、ゲル濾過カラムクロマトグラフィーにより未反応のプライマーおよびRNAを除き、EcoRIアダプターのライゲーションを行った。再度、ゲル濾過カラムクロマトグラフィーにより未反応のアダブターを除き、cDNAフラクションを回収した。
【0059】
以上のcDNA合成ステップは、タイムセーバーcDNA合成キット(Time Saver cDNA Synthesis kit,Pharmacia 社より販売)を用いて行った。
【0060】
上記で作製したcDNAとλgt10ファージベクターをライゲーションした後、ラムダイン(In vitro Packaging Kit LAMBDA IN、ニッポンジーン社より販売)を用いてパッケージングを行い、常法によりそのタイターを確認した。その結果、インディベンデントクローン数 5.5×105 pfu のcDNAライブラリーが得られた。
【0061】
実施例3(クローニング)
実施例2で得られたcDNAライブラリーより、10cm×14cmのLBプレートに約10,000pfu /プレートの密度となるよう調製した。一方、本発明者らが既に得たデータをもとに依頼合成(バイオロジカ社より販売)により20mer の合成ヌクレオチドを作製し(アコヤガイ真珠層不溶性タンパク質のCNBr分解ペプチドより得たアミノ酸配列を参考にして作製したもの)、これを[γ−32P]アデノシン三リン酸とT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてアイソトープ標識し、標識プローブを作製した。次に、Molecular Cloning [Sambrook,J.,Fritsch,E.F.,and Maniatis,T.Cold Spring Harbor Laboratory Press,(1989)]に記載の方法に従ってプラークハイブリダイゼーションによりスクリーニングし、多数の陽性クローンを得た。
【0062】
実施例4(クローンの解析)
さらに得られたファージクローンのDNAを制限酵素EcoRIで切断し、その中の1つ(クローンCl−6)をプローブとして常法に従いサザンプロットハイブリダイゼーションを行った。その結果、12クローン中、8クローンが同一クローンであった。
【0063】
さらにこのクローンCl−6をpUC118プラスミドベクターのEcoRI部位にサブクローニングし、常法によりプラスミドDNAを分離精製した(クローニングベクター)。
【0064】
そこで、得られたCl−6のノーザンブロット解析を行った。すなわち、アコヤガイ各組織より抽出した全RNAをアガロースゲル電気泳動後、ナイロンメンブレン上にブロッティングした。Cl−6のcDNAインサートをプローブとしてハイブリダイズさせると、外套膜にのみ特異的で、約1500b の位置に非常に多量に発現しているバンドが認められた。Cl−6クローンのインサートの大きさが約1300bpであったが、上記、サザンハイブリダイゼーションの結果も考えあわせ、Cl−6クローンは略全長のcDNAであることが確かめられた。
【0065】
実施例5(シークエンシング)
プラスミドは図1で示される構造となっているので、M13系フォワードプライマー(Foward primer )およびリバースプライマーを用いシークエンスを行った。これによりクローニングされたcDNAの5′側および3′側からヌクレオチド配列を読むことができる。また、cDNAの内部を読むため、常法に従いディレーションクローンを作製した。DNAのシークエンシングはSanger,F. 等のジデオキシ・ターミネーター法に基づいた、ブカベストシークエンシングキット(BcaBEST Dideoxy Sequencing Kit,TAKARA 社より販売)を用い行った。
【0066】
このようにして得られたシークエンスデータは、GENETYX のDNAシークエンス連結プログラムを用いて、連続したシークエンスに編集し、配列番号2に示す塩基配列を得た。このcDNA全長シークエンスデータからオープンリーティングフレームを決定し、さらにアミノ酸に翻訳して配列番号3に示す配列を得た。
配合表(配合番号4)にcDNAの全塩基配列とこれにコードされるタンパク質のアミノ酸一次配列を示した。
【0067】
実施例6(形質転換菌の作成)
実施例4でCl−6蛋白のcDNAをサブクローニングしたpUC118プラスミドベクターをEcoRIで切断し、Cl−6蛋白のcDNAを調製し、これを発現プラスミドpGEX−4T−3(Pharmacia 社より販売)に組み込んだ。この発現ベクターを大腸菌DH5に導入して形質転換菌を得た。この形質転換菌は、工業技術院生命工学工業研究所 特許寄託センターに寄託されている(識別表示:E.coli MK001、受託番号:FERM P−15316)。
【0068】
実施例7(ポリペプチドの製造)
実施例6で得た形質転換菌を1リットルのアンピシリン含有L−ブロース中で吸光度が0.6になるまで培養した後、IPTGを0.5mMになるように加え、さらに3時間培養を続けた。
【0069】
次いで、菌体を集菌した後、超音波処理し、菌体破砕物を除いた上清をグルタチオンセファロース(Pharmacia 社より販売)と混ぜ、グルタチオンセファロースをリン酸緩衝液で洗浄した後、5mMのグルタチオンを含むリン酸緩衝液でCl−6蛋白を遊離させた。この蛋白をリン酸緩衝液で透析した後、一部をSDS−ポリアクリルアミドゲルにて分析した結果、純度90%以上のGST融合蛋白が合成されていた。
【0070】
実施例8(抗体の作成)
実施例7で精製したCl−6蛋白を、完全フロイントアジュバントとともに家兎に2週間おきに3回皮下接種したのち、その血清を採取した。
【0071】
この血清は、ウエスタンブロッティング法を用いて試験したところ、約1000の希釈でもCl−6蛋白に対する確かな反応性を示したことから、Cl−6蛋白に対する抗体として使用可能であることが確認された。
【0072】
【発明の効果】
本発明によれば、未知の有用なポリペプチドを効率的に大量生産することができる。このポリペプチドは、化粧用原料として用いることができる。
【0073】
また、真珠養殖におけるピースの新たな選別方法の開発が可能となる。
【0074】
【配合表】
配列番号:1
配列の長さ:1002
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
起源
生物名:アコヤ貝(Pinctada fucata )
細胞の種類:外套膜上皮細胞
配列
ATGAAGCCCT TTGTCACACT CGCAAGCTTG ATCGTCTTAA TTGCTTCGGC TTCTGCCGAC 60
GGATATGATG ACTATAAGAA ATACGGAAGT GTCGGTTATG GACCTGGCAT CAGCCTTGGA 120
GGTGGTGGTT TAGGTGGCGG AGGAGGCATT ATCTCGGTTG GAGGCGGAGG AGGCCTCGGA 180
GGAGGCCTCG GAGGAGGCTT GGGTTGTGGT CTCGTAGGTG TCGGAGGCGG TGGACTTATC 240
GGAGGAGGGT TTGGCCCCGG TAGAGTGTCT GGTACCATCA ACGCAGGAGG TGGAGTTTTC 300
GCAAGCGGAT CCGGATTGGG AGGACTCTCA CCAGCTGGAA GAGGTGCAGC ACAAGGTGCA 360
GCCACTCTAA GCGCTCTCCA AATTGCTTCC GGAAGACCAG GCAGAGTCTC AGGTGTATCC 420
GTCGGAACTG GAGGAGGTCG TGCTGTTGTT TCCGGAAGTG CTACTCCAGT TGGAGGCTTT 480
GGTGTTCCCT ATGGAGGTTA CGGATACAAT TACGGTGTCC CAAGTTATGG AGTTGGCCTC 540
CCAAGCTACG GAGTCAGCCT TCCAAGTTAC GGAGTAGGTT TGGGAGGAGG TTATGGTGGC 600
TATGGATACG GACTAGACCT TGCCAGCTTC CAAGGTTCTA CCTACGGAAA TCTTGCAACT 660
GGACAAATTA ATACCGCAGT GGTAGCATTC CATATGGCGG TTCTCTTGGA ATCTATGGAA 720
GCGGAATCGG ATACGGAGGT GGATACGGAG GATATGGACT CGGAGGAGGA TATGGAATCG 780
GAGGAGGATA CGGAATCGGA GGAGGATACG GAATCGGAGG AGGATACGGA ATCGGAGGAG 840
GATATGGAAT CGGAGGAGGA TATGGACTCG GAGTCCTCGG TGGTGGATCA AGTCTCTATG 900
GTGTATCCCA ATCACTTTAC GGGGGACGTG CTGTTCTGTC AGGTCAGGCT TCAGGAGCTG 960
GAGTTCCCAG CTTTGGAAGC ATTAGTTTCG GTGGTTTTGG AG 1002
【0075】
【配合表】
配列番号:2
配列の長さ:1326
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:アコヤ貝(Pinctada fucata )
細胞の種類:外套膜上皮細胞
配列の特徴:mRNA
存在位置:1..1326
特徴を決定した方法:E
配列
AACATCTCCA GATAAAGAAC GGTACCCATC CACAATCATG AAGCCCTTTG TCACACTCGC 60
AAGCTTGATC GTCTTAATTG CTTCGGCTTC TGCCGACGGA TATGATGACT ATAAGAAATA 120
CGGAAGTGTC GGTTATGGAC CTGGCATCAG CCTTGGAGGT GGTGGTTTAG GTGGCGGAGG 180
AGGCATTATC TCGGTTGGAG GCGGAGGAGG CCTCGGAGGA GGCCTCGGAG GAGGCTTGGG 240
TTGTGGTCTC GTAGGTGTCG GAGGCGGTGG ACTTATCGGA GGAGGGTTTG GCCCCGGTAG 300
AGTGTCTGGT ACCATCAACG CAGGAGGTGG AGTTTTCGCA AGCGGATCCG GATTGGGAGG 360
ACTCTCACCA GCTGGAAGAG GTGCAGCACA AGGTGCAGCC ACTCTAAGCG CTCTCCAAAT 420
TGCTTCCGGA AGACCAGGCA GAGTCTCAGG TGTATCCGTC GGAACTGGAG GAGGTCGTGC 480
TGTTGTTTCC GGAAGTGCTA CTCCAGTTGG AGGCTTTGGT GTTCCCTATG GAGGTTACGG 540
ATACAATTAC GGTGTCCCAA GTTATGGAGT TGGCCTCCCA AGCTACGGAG TCAGCCTTCC 600
AAGTTACGGA GTAGGTTTGG GAGGAGGTTA TGGTGGCTAT GGATACGGAC TAGACCTTGC 660
CAGCTTCCAA GGTTCTACCT ACGGAAATCT TGCAACTGGA CAAATTAATA CCGCAGTGGT 720
AGCATTCCAT ATGGCGGTTC TCTTGGAATC TATGGAAGCG GAATCGGATA CGGAGGTGGA 780
TACGGAGGAT ATGGACTCGG AGGAGGATAT GGAATCGGAG GAGGATACGG AATCGGAGGA 840
GGATACGGAA TCGGAGGAGG ATACGGAATC GGAGGAGGAT ATGGAATCGG AGGAGGATAT 900
GGACTCGGAG TCCTCGGTGG TGGATCAAGT CTCTATGGTG TATCCCAATC ACTTTACGGG 960
GGACGTGCTG TTCTGTCAGG TCAGGCTTCA GGAGCTGGAG TTCCCAGCTT TGGAAGCATT 1020
AGTTTCGGTG GTTTTGGAGT AGGTAGTCCA TACAGTATTT ATGGAGGTGG ATATCCAATT 1080
GGAATTGGAG GCGGCGGCGG TGGTATCATC GGCGGAGGTG GTATCATCGG CGGAGGTGGT 1140
ATAGGAGGCG GTATCATCGG CGGAGGTGGT ATCGGACCAA TCGGCGGTGG AATCATTAGA 1200
AAGAAGAAGT ATTAAGCTGA TGTTTGATGT ATGGGAATTG CCAAATGGAC TCACCTTTTT 1260
CCTGGATATA CCTTTTTCAT GGATGTTTGA TATTTAATTT TTTGCAATAA ATGAGCATAT 1320
ACAAAA 1326
【0076】
【配合表】
配列番号:3
配列の長さ:334
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:アコヤ貝(Pinctada fucata )
細胞の種類:外套膜上皮細胞
配列の特徴
特徴を表す記号:peptide
存在位置:1..334
特徴を決定した方法:E

Figure 0003718734
Figure 0003718734
【0077】
【配合表】
配列番号:4
配列の長さ:1326
配列の型:核酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:アコヤ貝(Pinctada fucata )
細胞の種類:外套膜上皮細胞
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:38..1039
特徴を決定した方法:P
Figure 0003718734
Figure 0003718734
Figure 0003718734

【図面の簡単な説明】
【図1】本発明のクローニングベクターの一実施例を示す構成図である。[0001]
BACKGROUND OF THE INVENTION
The present invention relates to a cDNA of a novel polypeptide gene produced by mantle tissue (mantle epithelial cell) of Japanese pearl oyster (Pincta fucata), a vector containing the cDNA, a host cell transformed with the vector, and a product produced thereby The present invention relates to a polypeptide to be produced, a method for producing the same, a DNA encoding the polypeptide, an antibody to the polypeptide, and a cosmetic containing the polypeptide or a degradation peptide thereof.
[0002]
[Object of invention]
Various factors related to the maintenance, proliferation and growth of cells are produced from the cells. For example, from the pearl oyster mantle epithelial cells, factors relating to shell formation, factors relating to biological defense, and many other factors are produced. The present inventors paid attention to this point, and intensively studied to find a novel factor (polypeptide) produced by certain types of cells (for example, pearl oyster mantle epithelial cells).
[0003]
It also aims to develop new raw materials for cosmetics or a new method for sorting pieces in pearl culture.
[0004]
[Prior art and problems to be solved by the invention]
Conventionally, when obtaining a specific polypeptide or DNA encoding the same, the target polypeptide is confirmed in tissue or cell culture medium, and then the gene is cloned through isolation and purification of the polypeptide. Or the method of expression cloning of genes using their biological activity as an indicator.
[0005]
However, there is very little information on factors produced by the pearl oyster mantle epithelial cells, and many of them show insolubility, which makes it difficult to isolate, purify and confirm biological activity.
[0006]
On the other hand, cDNA production technology and sequencing technology have rapidly developed, and it has become possible to rapidly sequence a large amount of cDNA. In addition, the development of reverse genetics methods for identifying the function of genes from genes is also remarkable.
[0007]
Therefore, the present inventors decided to find a novel polypeptide using these methods. That is, mRNA was isolated from pearl oyster mantle epithelial cells and the like, cDNA was obtained using this as a starting material, the base sequence was determined, and the amino acid sequence was deduced. As a result, the inventors succeeded in finding a DNA encoding a novel polypeptide and completed the present invention.
[0008]
The known nucleotide sequence and amino acid sequence registered in the amino acid sequence database (EMBL-GDB Rel.41) and protein database (SWISS-PROT Rel.30) were investigated. It was. Therefore, it was confirmed that the DNA and polypeptide of the present invention are completely novel.
[0009]
Here, the polypeptide secreted by the pearl oyster mantle epithelial cells will be described. The pearl oyster covers its outer surface with a strong shell to protect itself from foreign enemies. It is known that this shell responsible for a kind of biological defense is made by mantle epithelial cells.
The shell is mainly composed of calcium carbonate crystals and polypeptides. Further, the pearl oyster shell has structural differences of three layers, which are called the shell layer, the ridge column layer, and the nacre layer from the outside. This structural difference is believed to be due to differences in polypeptides.
[0010]
The only difference in the polypeptide constituting each layer, known to date, is the difference in the amino acid composition. This is because most polypeptides are insoluble in water and most other solvents, and this is a factor that delays the analysis of these polypeptides.
[0011]
Among these polypeptides, the polypeptide constituting the nacre has been used as various drugs for some time and is still used in some areas. It has also been used as an active ingredient in cosmetics for a long time.
[0012]
In addition, the nacre on the shell structure is considered to be equivalent to the pearl that is widely loved by people as a gem. Pearls emerge from the pearl oyster gonad along with a piece that is a piece of pearl oyster mantle in about 1-3 years.
[0013]
From this, it can be seen that these polypeptides play a very important role for the colors and windings that greatly affect the value of pearls as gems.
[0014]
[Means for Solving the Problems]
The present invention is as follows.
[0015]
(Claim 1) A cDNA encoding the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1.
[0016]
(Claim 2) A cDNA encoding the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2.
[0017]
(Claim 3) A cloning vector having the cDNA according to claim 1 or 2.
[0018]
(Claim 4) DNA comprising the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 .
[0019]
(Claim 5) A DNA comprising the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 .
[0020]
(Claim 6) An expression vector containing the cDNA according to claim 1 or 2.
[0021]
(Claim 7) form transformants who hold the expression vector of claim 6.
[0022]
(Claim 8) A polypeptide produced by the transformant according to claim 7 and encoded by the cDNA according to claim 1 or 2 .
[0023]
(Claim 9) The polypeptide according to the above item consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3.
[0024]
(Claim 10) A method for producing a polypeptide, comprising culturing the transformant according to claim 7 under conditions for expressing the polypeptide according to claim 8 or 9.
[0025]
(11) An antibody prepared by using the polypeptide of claim 8 or 9 as an antigen.
[0026]
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
In the above, the DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 (or 2) (Claims 4 and 5) is generally 90% or more, for example, 95%, 98% or 99% of DNA. It means that the DNA has a base sequence represented by 1 (or 2). In addition, these homologous fragments mean at least 10 bases, preferably at least 15 bases, for example, 20, 25, 30 or 40 bases, and such fragments are also included in the DNA of the present invention (similarly Effect).
[0027]
The polypeptide encoded by the DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 and the polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3 are generally 90% or more, for example, 95, 98 or 99% of the polypeptide. Means a polypeptide having the amino acid sequence encoded by the DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 1. Also, the homologous fragments are generally at least 20, preferably at least 30, for example 40, 60 or 100 consecutive amino acid regions, at least 70%, preferably at least 80 or 90%, more preferably Are homologous more than 95%, and such homologues are hereinafter described as polypeptides of the present invention (similar effects are obtained).
[0028]
The fragment that selectively hybridizes to the DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2 generally has at least 20, preferably at least 30, for example, 40, 60, or 100 consecutive base sequence regions. And at least 70%, preferably at least 80 or 90%, more preferably 95% or more homologous, and such fragments are hereinafter described as DNA of the present invention (similar effects can be obtained). ).
[0029]
Furthermore, the present invention includes a cloning vector or expression vector comprising the DNA of the present invention. Examples of the vector include a plasmid, virus, or phage vector comprising an ori region and, if necessary, a promoter for expression of the DNA, a promoter control factor, and the like. The vector may contain one or more selective marker genes, such as an ampicillin resistance gene. The vector can be used in vitro, for example, for production of RNA corresponding to DNA and transformation of host cells.
[0030]
Furthermore, the present invention also includes a host cell transformed with a vector for replicating or expressing the DNA of the present invention, which comprises DNA having the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2, or an open reading frame thereof. included. Examples of the cell include bacteria, yeast, insects, insect cells, and mammalian cells.
[0031]
Furthermore, the present invention includes a method for producing a polypeptide comprising culturing the host cell of the present invention under conditions for expressing the polypeptide of the present invention. Culturing is preferably performed under conditions where the polypeptide of the present invention is expressed and produced from a host cell.
[0032]
Antisense RNA can also be produced by inserting the DNA of the present invention into the antisense region of the vector as described above. Such antisense RNA can also be used to control the level of a polypeptide of the invention in a cell.
[0033]
In addition, the DNA of the present invention, its homologue or fragment can be used as a probe for Northern analysis or as a primer for PCR (Polymerase Chain Reaction), so that the expression level of this polypeptide between individuals, Can be compared.
[0034]
The present invention also includes monoclonal or polyclonal antibodies of the polypeptides of the present invention. The present invention further includes a method for producing a monoclonal or polyclonal antibody of the polypeptide of the present invention. A monoclonal antibody can be produced by a conventional hybridoma technique using the polypeptide of the present invention or a fragment thereof as an antigen. Polyclonal antibodies can be produced by conventional methods such as inoculating a host animal such as a rat or rabbit with the polypeptide of the present invention and recovering serum.
[0035]
As the polypeptide of the present invention, in addition to the polypeptide having the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 3, a part thereof is deleted, a part thereof is substituted with another amino acid (for example, amino acids having similar physical properties) And those having other amino acids added or inserted in part thereof are also included.
[0036]
As is well known, 1 to 6 codons encoding one amino acid are known. Therefore, the base sequence of DNA can be changed without changing the amino acid sequence of the polypeptide.
[0037]
The DNA of the present invention represented by SEQ ID NO: 1 includes all the base sequence groups encoding the polypeptide represented by SEQ ID NO: 3. By changing the base sequence, production of the polypeptide may be improved.
[0038]
The DNA of the present invention represented by SEQ ID NO: 2 is an embodiment of the DNA represented by SEQ ID NO: 1 and represents a natural sequence.
[0039]
The DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 is produced according to the following method. That is,
(I) isolating mRNA from the pearl oyster mantle tissue producing the polypeptide of the present invention;
(II) Synthesize single-stranded DNA (first strand) and then double-stranded DNA (second strand) from the mRNA (synthesis of cDNA),
(III) incorporating the cDNA into an appropriate phage vector;
(IV) After packaging, infect host cells with the resulting recombinant infectious phage (production of cDNA library),
(V) screening the obtained cDNA library with a specific probe;
(VI) The obtained clone can be prepared by sequencing its full length.
[0040]
As an explanation, step (I) is described in the method of Chomczynski, p. Et al. [Anal. Biochem., 162, 156 (1987), using pearl oyster mantle as a material. ] Is performed according to the above.
[0041]
Steps (II), (III) and (IV) are steps for preparing a cDNA library, and are described in the modified Gubler & Hoffman method [Gene., 25, 263 (1983). ] Is performed according to. There are many known phage vectors used in the step (III) (for example, λgt10, λgt11). Phage vectors referred to here include phage vectors (Phagemid) that can be converted into plasmids by infecting helper phages. included.
[0042]
Step (V) is performed according to the method described in Molecular Cloning [Sambrook, J., Frisch, EF, and Maniatis, T. Cold Spring Harbor Laboratory Press, (1989)].
[0043]
The sequencing of the step (VI) is performed by the Maxam-Gilbert method or the dideoxy terminator method.
[0044]
The DNA thus obtained (A) converts its base sequence into an amino acid sequence in a possible reading frame, (B) a hydrophobic profile is prepared from the obtained amino acid sequence, and an initiation codon (ATG) ) Immediately after (the secreted protein has a signal peptide of the highly hydrophobic region at its N-terminus), and (C) the DNA is full-length or almost full-length It is necessary to confirm that there is.
[0045]
During the above confirmation operation, (C) is performed by Northern analysis. Once the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 1 and 2 are confirmed, the DNA sequence is then synthesized by chemical synthesis, by PCR (Polymerase Chain Reaction) method, or by hybridizing a fragment of the nucleotide sequence as a probe. The inventive DNA can be obtained. Furthermore, a necessary amount of the DNA of the present invention can be obtained by introducing a vector DNA containing the DNA of the present invention into an appropriate host and propagating it.
[0046]
The method for obtaining the polypeptide of the present invention includes (1) a method for isolation and purification from a living body or cultured cells. (2) A method for peptide synthesis, or (3) a method for production using a gene recombination technique, and the like. Among them, the method described in (3) is preferred industrially.
[0047]
Examples of an expression system (host-vector system) for producing a polypeptide using a gene recombination technique include expression systems for bacteria, yeast, insects, insect cells, and mammalian cells.
[0048]
For example, when expressed in Escherichia coli, a DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 is connected downstream of a suitable promoter (eg, trp promoter, lac promoter, λPL promoter, T7 promoter, etc.) An expression vector is prepared by inserting into a vector that functions in E. coli (for example, pBR322, pUC18, pUC19, etc.). Alternatively, it can also be prepared by connecting the DNA represented by SEQ ID NO: 1 to a commercially available expression vector (for example, pKK223-3: Pharmacia, pET vector: Stratagene, pTV vector: Takara, etc.).
[0049]
Examples of E. coli include E. coli. coli JM109, E. coli. coli HB101, E. coli. E. coli DH5 strain can be used, but is not limited thereto.
[0050]
Next, E. coli transformed with this expression vector is cultured in an appropriate medium, and the desired polypeptide can be obtained from the cells. In addition, if a bacterial signal peptide (for example, a pelB signal peptide) is used, the target polypeptide can be secreted into the periplasm. Furthermore, it can be produced as a fusion protein with other polypeptides to obtain the desired polypeptide.
[0051]
For expression in insects or insect cells, for example, a transfer vector is prepared by inserting the DNA represented by SEQ ID NO: 1 or 2 into an appropriate vector. Next, a recombinant virus is produced by co-transfecting with a vector having a promoter of baculovirus (Autographa california NPV). The obtained recombinant virus is introduced into an appropriate insect cell (for example, Sf9, Sf21, or Tn5 cell) or the body of an insect (for example, silkworm) to produce the desired polypeptide.
[0052]
When expressed in mammalian cells, for example, the DNA represented by SEQ ID NO: 1 or 2 in an appropriate vector (for example, a retrovirus vector, papilloma virus vector, vaccinia virus vector, SV40 vector, etc.) An expression vector is prepared by inserting it downstream of an appropriate promoter (for example, SV40 promoter, LTR promoter, metallothionein promoter, etc.). Next, an appropriate mammalian cell (eg, monkey COS cell, Chinese hamster CHO cell, mouse L cell, etc.) is transformed with the obtained expression vector, and the transformant is cultured in an appropriate medium. The desired polypeptide is produced in the cell. The polypeptide obtained as described above can be isolated and purified by a general biochemical method.
[0053]
The polypeptide of the present invention can be applied to cosmetics. That is, the polypeptide of the present invention can be mixed with other commonly used components to make a cosmetic composition.
[0054]
【Example】
The present invention will be described more specifically with reference to the following examples, but these examples do not limit the scope of the present invention.
[0055]
Example 1 (Separation and purification of mRNA)
Mantle epithelial cells of pearl oysters (Pinctada fucata) (the oyster oysters are readily available at home and abroad today. These mantle epithelial cells cannot withstand cryopreservation, and other preservation methods are also available. However, since the storage conditions (medium, etc.) have not yet been found, it is not possible to survive in the separated state (as a cell) at present. The center has refused to accept this cell.Acceptance of the acceptance rejection certificate has been obtained (indication for identification: P. fucata-M01) and the acceptance of the pearl oyster itself has not been accepted. , Using the method of Chomczynski, P. et al. Anal. Biochem., 162, 156 (1987). ] To isolate total RNA.
[0056]
That is, the tissue was homogenized in 4M GTC solution (4M guanidine thiocyanate, 25 mM sodium citrate, 0.5% sarkosyl, 0.1M 2-mercaptoethanol), phenol / chloroform extraction was performed twice, isopropanol was added, and centrifugation was performed. (10,000 × g, 10 minutes) and about 200 μg of total RNA was recovered during precipitation. Furthermore, from this, using oligo (dT) latex particles (sold by TAKARA), mRNA was separated, and 2.5 μg of Poly (A) + RNA was purified and recovered.
[0057]
Example 2 (Preparation of cDNA library)
The cDNA library was prepared by a modification of the Gubler & Hoffman method [described in Gene., 25, 263 (1983)].
[0058]
That is, single-stranded DNA (first strand) was synthesized from 2.5 μg of Poly (A) + RNA separated and purified in Example 1 using reverse transcriptase using a random hexamer primer and an oligo (dT) primer. Subsequently, after synthesizing double-stranded DNA (second strand), unreacted primers and RNA were removed by gel filtration column chromatography, and EcoRI adapter was ligated. Again, the unreacted adapter was removed by gel filtration column chromatography, and the cDNA fraction was recovered.
[0059]
The above cDNA synthesis step was performed using a time saver cDNA synthesis kit (Time Saver cDNA Synthesis kit, sold by Pharmacia).
[0060]
After ligation of the cDNA prepared above and the λgt10 phage vector, packaging was performed using lambdain (In vitro Packaging Kit LAMBDA IN, sold by Nippon Gene), and the titer was confirmed by a conventional method. As a result, a cDNA library having 5.5 × 10 5 pfu of independent clones was obtained.
[0061]
Example 3 (Cloning)
From the cDNA library obtained in Example 2, a density of about 10,000 pfu / plate was prepared on a 10 cm × 14 cm LB plate. On the other hand, a 20-mer synthetic nucleotide was prepared by requested synthesis (sold by Biologica) based on the data already obtained by the present inventors (with reference to the amino acid sequence obtained from the CNBr-degrading peptide of the pearl oyster nacre layer insoluble protein). This was labeled with an isotope using [γ- 32 P] adenosine triphosphate and T4 polynucleotide kinase to prepare a labeled probe. Next, screening was performed by plaque hybridization according to the method described in Molecular Cloning [Sambrook, J., Fritsch, EF, and Maniatis, T. Cold Spring Harbor Laboratory Press, (1989)], and a number of positive clones were obtained.
[0062]
Example 4 (Clone analysis)
Furthermore, the DNA of the obtained phage clone was cleaved with the restriction enzyme EcoRI, and Southern plot hybridization was performed according to a conventional method using one of them (clone Cl-6) as a probe. As a result, 8 clones out of 12 clones were the same clone.
[0063]
Further, this clone Cl-6 was subcloned into the EcoRI site of the pUC118 plasmid vector, and the plasmid DNA was separated and purified by a conventional method (cloning vector).
[0064]
Therefore, Northern blot analysis of the obtained Cl-6 was performed. That is, total RNA extracted from each pearl oyster tissue was subjected to agarose gel electrophoresis and then blotted onto a nylon membrane. When the Cl-6 cDNA insert was hybridized as a probe, a band that was specific only to the mantle and expressed in a large amount at a position of about 1500b was observed. Although the insert size of the Cl-6 clone was about 1300 bp, it was confirmed that the Cl-6 clone was a substantially full-length cDNA in consideration of the result of the Southern hybridization.
[0065]
Example 5 (Sequencing)
Since the plasmid has the structure shown in FIG. 1, sequencing was performed using an M13 forward primer and a reverse primer. Thus, the nucleotide sequence can be read from the 5 ′ side and 3 ′ side of the cloned cDNA. In addition, in order to read the inside of the cDNA, a dilation clone was prepared according to a conventional method. DNA sequencing was performed using a Bucabest sequencing kit (BcaBEST Dideoxy Sequencing Kit, sold by TAKARA) based on the dideoxy terminator method of Sanger, F. et al.
[0066]
The sequence data thus obtained was edited into a continuous sequence using the GENETYX DNA sequence linking program, and the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 2 was obtained. An open reading frame was determined from this cDNA full-length sequence data and further translated into amino acids to obtain the sequence shown in SEQ ID NO: 3.
The formulation table (Formulation No. 4) shows the entire base sequence of cDNA and the primary amino acid sequence of the protein encoded thereby.
[0067]
Example 6 (Preparation of transformed bacteria)
The pUC118 plasmid vector into which the Cl-6 protein cDNA was subcloned in Example 4 was cleaved with EcoRI to prepare a Cl-6 protein cDNA, which was incorporated into the expression plasmid pGEX-4T-3 (sold by Pharmacia). . This expression vector was introduced into E. coli DH5 to obtain a transformed bacterium. This transformed bacterium has been deposited at the Patent Deposit Center, National Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (identification: E. coli MK001, accession number: FERM P-15316).
[0068]
Example 7 (Production of polypeptide)
The transformant obtained in Example 6 was cultured in 1 liter of ampicillin-containing L-broth until the absorbance reached 0.6, then IPTG was added to 0.5 mM, and the culture was further continued for 3 hours. .
[0069]
Next, the cells were collected, sonicated, and the supernatant from which the crushed cells had been removed was mixed with glutathione sepharose (sold by Pharmacia). After washing the glutathione sepharose with a phosphate buffer, 5 mM Cl-6 protein was released with a phosphate buffer containing glutathione. After dialysis of this protein with a phosphate buffer, a part thereof was analyzed by SDS-polyacrylamide gel. As a result, a GST fusion protein having a purity of 90% or more was synthesized.
[0070]
Example 8 (Production of antibodies)
The Cl-6 protein purified in Example 7 was inoculated subcutaneously in rabbits three times every two weeks with complete Freund's adjuvant, and the serum was collected.
[0071]
When this serum was tested using a Western blotting method, it showed a certain reactivity to Cl-6 protein even at a dilution of about 1000, confirming that it could be used as an antibody against Cl-6 protein. .
[0072]
【The invention's effect】
According to the present invention, unknown useful polypeptides can be efficiently mass-produced. This polypeptide can be used as a cosmetic raw material.
[0073]
In addition, it becomes possible to develop a new method for sorting pieces in pearl culture.
[0074]
[Composition table]
SEQ ID NO: 1
Sequence length: 1002
Sequence type: Number of nucleic acid strands: Double-stranded topology: Linear organism name: Pinctada fucata
Cell type: mantle epithelial cell array
ATGAAGCCCT TTGTCACACT CGCAAGCTTG ATCGTCTTAA TTGCTTCGGC TTCTGCCGAC 60
GGATATGATG ACTATAAGAA ATACGGAAGT GTCGGTTATG GACCTGGCAT CAGCCTTGGA 120
GGTGGTGGTT TAGGTGGCGG AGGAGGCATT ATCTCGGTTG GAGGCGGAGG AGGCCTCGGA 180
GGAGGCCTCG GAGGAGGCTT GGGTTGTGGT CTCGTAGGTG TCGGAGGCGG TGGACTTATC 240
GGAGGAGGGT TTGGCCCCGG TAGAGTGTCT GGTACCATCA ACGCAGGAGG TGGAGTTTTC 300
GCAAGCGGAT CCGGATTGGG AGGACTCTCA CCAGCTGGAA GAGGTGCAGC ACAAGGTGCA 360
GCCACTCTAA GCGCTCTCCA AATTGCTTCC GGAAGACCAG GCAGAGTCTC AGGTGTATCC 420
GTCGGAACTG GAGGAGGTCG TGCTGTTGTT TCCGGAAGTG CTACTCCAGT TGGAGGCTTT 480
GGTGTTCCCT ATGGAGGTTA CGGATACAAT TACGGTGTCC CAAGTTATGG AGTTGGCCTC 540
CCAAGCTACG GAGTCAGCCT TCCAAGTTAC GGAGTAGGTT TGGGAGGAGG TTATGGTGGC 600
TATGGATACG GACTAGACCT TGCCAGCTTC CAAGGTTCTA CCTACGGAAA TCTTGCAACT 660
GGACAAATTA ATACCGCAGT GGTAGCATTC CATATGGCGG TTCTCTTGGA ATCTATGGAA 720
GCGGAATCGG ATACGGAGGT GGATACGGAG GATATGGACT CGGAGGAGGA TATGGAATCG 780
GAGGAGGATA CGGAATCGGA GGAGGATACG GAATCGGAGG AGGATACGGA ATCGGAGGAG 840
GATATGGAAT CGGAGGAGGA TATGGACTCG GAGTCCTCGG TGGTGGATCA AGTCTCTATG 900
GTGTATCCCA ATCACTTTAC GGGGGACGTG CTGTTCTGTC AGGTCAGGCT TCAGGAGCTG 960
GAGTTCCCAG CTTTGGAAGC ATTAGTTTCG GTGGTTTTGG AG 1002
[0075]
[Composition table]
SEQ ID NO: 2
Sequence length: 1326
Sequence type: Number of nucleic acid strands: Double-stranded topology: Linear sequence type: cDNA to mRNA
Origin organism name: Akoya oyster (Pinctada fucata)
Cell type: Mantle epithelial cell Sequence characteristics: mRNA
Location: 1..1326
Method for determining characteristics: E
Array
AACATCTCCA GATAAAGAAC GGTACCCATC CACAATCATG AAGCCCTTTG TCACACTCGC 60
AAGCTTGATC GTCTTAATTG CTTCGGCTTC TGCCGACGGA TATGATGACT ATAAGAAATA 120
CGGAAGTGTC GGTTATGGAC CTGGCATCAG CCTTGGAGGT GGTGGTTTAG GTGGCGGAGG 180
AGGCATTATC TCGGTTGGAG GCGGAGGAGG CCTCGGAGGA GGCCTCGGAG GAGGCTTGGG 240
TTGTGGTCTC GTAGGTGTCG GAGGCGGTGG ACTTATCGGA GGAGGGTTTG GCCCCGGTAG 300
AGTGTCTGGT ACCATCAACG CAGGAGGTGG AGTTTTCGCA AGCGGATCCG GATTGGGAGG 360
ACTCTCACCA GCTGGAAGAG GTGCAGCACA AGGTGCAGCC ACTCTAAGCG CTCTCCAAAT 420
TGCTTCCGGA AGACCAGGCA GAGTCTCAGG TGTATCCGTC GGAACTGGAG GAGGTCGTGC 480
TGTTGTTTCC GGAAGTGCTA CTCCAGTTGG AGGCTTTGGT GTTCCCTATG GAGGTTACGG 540
ATACAATTAC GGTGTCCCAA GTTATGGAGT TGGCCTCCCA AGCTACGGAG TCAGCCTTCC 600
AAGTTACGGA GTAGGTTTGG GAGGAGGTTA TGGTGGCTAT GGATACGGAC TAGACCTTGC 660
CAGCTTCCAA GGTTCTACCT ACGGAAATCT TGCAACTGGA CAAATTAATA CCGCAGTGGT 720
AGCATTCCAT ATGGCGGTTC TCTTGGAATC TATGGAAGCG GAATCGGATA CGGAGGTGGA 780
TACGGAGGAT ATGGACTCGG AGGAGGATAT GGAATCGGAG GAGGATACGG AATCGGAGGA 840
GGATACGGAA TCGGAGGAGG ATACGGAATC GGAGGAGGAT ATGGAATCGG AGGAGGATAT 900
GGACTCGGAG TCCTCGGTGG TGGATCAAGT CTCTATGGTG TATCCCAATC ACTTTACGGG 960
GGACGTGCTG TTCTGTCAGG TCAGGCTTCA GGAGCTGGAG TTCCCAGCTT TGGAAGCATT 1020
AGTTTCGGTG GTTTTGGAGT AGGTAGTCCA TACAGTATTT ATGGAGGTGG ATATCCAATT 1080
GGAATTGGAG GCGGCGGCGG TGGTATCATC GGCGGAGGTG GTATCATCGG CGGAGGTGGT 1140
ATAGGAGGCG GTATCATCGG CGGAGGTGGT ATCGGACCAA TCGGCGGTGG AATCATTAGA 1200
AAGAAGAAGT ATTAAGCTGA TGTTTGATGT ATGGGAATTG CCAAATGGAC TCACCTTTTT 1260
CCTGGATATA CCTTTTTCAT GGATGTTTGA TATTTAATTT TTTGCAATAA ATGAGCATAT 1320
ACAAAA 1326
[0076]
[Composition table]
SEQ ID NO: 3
Sequence length: 334
Sequence type: Amino acid Topology: Linear sequence type: Protein origin organism: Pinctada fucata
Cell type: Characteristic features of mantle epithelial cell sequence: peptide
Location: 1..334
Method for determining characteristics: E
Figure 0003718734
Figure 0003718734
[0077]
[Composition table]
SEQ ID NO: 4
Sequence length: 1326
Sequence type: Nucleic acid Topology: Linear sequence type: cDNA to mRNA
Origin organism name: Akoya oyster (Pinctada fucata)
Cell type: Characteristic features of mantle epithelial cell sequence: CDS
Location: 38..1039
Method for determining characteristics: P
Figure 0003718734
Figure 0003718734
Figure 0003718734

[Brief description of the drawings]
FIG. 1 is a block diagram showing an example of a cloning vector of the present invention.

Claims (11)

配列番号1の塩基配列をコードするcDNA。 A cDNA encoding the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1. 配列番号2の塩基配列をコードするcDNA。 A cDNA encoding the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2. 請求項1または2記載のcDNAを含有するクローニングベクター。 A cloning vector containing the cDNA according to claim 1 or 2. 配列番号1で示される塩基配列からなるDNA。 DNA consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 . 配列番号2で示される塩基配列からなるDNA。 A DNA consisting of the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 . 請求項1又は2記載のcDNAを含有する発現ベクター。 An expression vector containing the cDNA according to claim 1 or 2. 請求項6記載の発現ベクターを有する形質転換体。 Form transformants that have a expression vector of claim 6 wherein. 請求項7記載の形質転換体により生産され、請求項1又は請求項2に記載のcDNAにコードされるポリペプチド。A polypeptide produced by the transformant according to claim 7 and encoded by the cDNA according to claim 1 or 2 . 配列番号3のアミノ酸配列からなる請求項8記載のポリペプチド。The polypeptide according to claim 8, which consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. 請求項8または9記載のポリペプチドを発現させるための条件下で請求項7記載の形質転換体を培養することからなるポリペプチドの製造方法。 A method for producing a polypeptide, comprising culturing the transformant according to claim 7 under conditions for expressing the polypeptide according to claim 8 or 9. 請求項8又は9記載のポリペプチドを抗原として調製した抗体。 An antibody prepared by using the polypeptide according to claim 8 or 9 as an antigen.
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