JP2026032010A - 二重特異性抗体及びその応用 - Google Patents

二重特異性抗体及びその応用

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Abstract

【課題】血管内皮増殖因子(VEGF)/VEGF受容体及び免疫チェックポイント阻害剤を標的とする二重特異性抗体を提供する。【解決手段】VEGFを標的とするVHH、このVHHを基に開発したPD-1及びVEGFを標的とする二重特異性抗体並びにその応用が提供される。前記VHHは安定性が高く、発現及び精製が容易であるなどの様々な良好な効果を有する。構築されたPD-1及びVEGFを標的とする二重特異性抗体は、安定性が高く、VEGF高発現腫瘍の領域を標的として濃縮されることが可能であり、良好な薬効及び安全性を有し、治療効果に優れている。【選択図】なし

Description

本発明は、抗体分野に関し、具体的にはPD-1及びVEGFを標的とする二重特異性
抗体及びその応用に関する。
プログラム細胞死受容体1(programmed death receptor-1
、PD-1)は免疫グロブリンCD28/B7スーパーファミリーに属する免疫抑制性受
容体である。PD-1がPD-L1と結合すると、ホスファチジルイノシトール-3-キ
ナーゼのリン酸化、プロテインキナーゼBの更なる活性化、刺激性T細胞信号経路の活性
化、グルコース代謝及びインターフェロンの分泌などが起こるので、T細胞活性化の下流
シグナル伝達が阻害され、さらにT細胞の転写が効果的に抑制され、最終的にT細胞の免
疫反応が抑制され、このように、免疫応答の抑制的制御において重要な役割を果たしてい
る。PD-1抗体は広域スペクトルの抗腫瘍効果を持っているため、現在、いくつかの画
期的薬剤(ブロックバスター)、例えば、2014年12月22日に米国で承認されたオ
プジーボ(商品名:Opdivo;通用名:ニボルマブ)が上場され、最初に許可された
適応症が悪性黒色腫(メラノーマ)であるが、次に、非小細胞肺癌、腎細胞癌、ホジキン
リンパ腫、頭頚部扁平細胞癌、結腸・直腸癌、肝細胞癌、尿路上皮癌、結腸・直腸癌、肝
細胞癌、食道癌、食道扁平細胞癌、胸膜間皮腫、食道腺癌、食道胃接合部腺癌、胃癌など
の適応症が相次いで米国で承認されるようになった。しかし、既存の臨床データ(160
個の臨床試験からの28304例の患者データを含む)の分析(参考文献1:Effic
acy of PD-1/PD-L1 blockade monotherapy in c
linical trials,Bin Zhao,Hong Zhao,et al.,T
her Adv Med Oncol.2020,Vol.12,pp.1-22)による
と、全般的に、PD-1/PD-L1の単剤投与治療を受けた22165例の患者のうち
、計4747例の患者が治療効果を示した(客観的奏効率(ORR),20.21%;9
5%信頼区間(CI),18.34~22.15%)。19418例の癌患者のうち、8
62例の完全奏功(CR)が観察された。CRの全発生率が3.85%(95%CI,3
.06~4.73%)であった。また、ORRは異なる種類の癌及びPD-L1発現状態
で有意差が認められた。つまり、PD-1/PD-L1の単剤治療に関連する治療効果は
異なる種類の癌及びPD-L1発現レベルにおいて有意差が見られ、満たされていない臨
床ニーズがまだ多く存在している。
血管内皮増殖因子(vascular endothelial growth fac
tor、VEGF)は、血管透過性因子(vascular permeability
factor、VPF)とも呼ばれ、血管透過性の増加、細胞外基質の変性、血管内皮細
胞の遊走、増殖及び血管形成を促進する作用がある、高特異性を有する血管内皮細胞増殖
促進因子である。資料によると、VEGFは病理性血管生成において重要な役割を果たし
、腫瘍の増殖及び転移、黄斑変性、糖尿病性網膜病変、炎症過程(例えば、関節リウマチ
)、虚血過程(心筋虚血)、妊娠高血圧腎症などの疾患の発症及び進展を誘発する可能性
がある(参考文献2:Molecular and functional divers
ity of vascular endothelial growth factors
.Yamazaki Y.,Morita T.,Mol.Divers.Novemb
er 2006,Vol.10,No.4,pp.515-527)。血管内皮増殖因子
と特異的に結合する高親和性受容体は、血管内皮増殖因子受容体(Vascular E
ndothelial Growth Factor Receptor、VEGFR)と
呼ばれ、受容体型チロシンキナーゼであり、血管生成及び細胞遊走に必要な多くのシグナ
ル伝達経路において重要な役割を果たし、VEGFと結合するとシグナル伝達カスケード
を開始させて血管の生成を刺激する。従って、VEGF/VEGFRは、殆ど内皮細胞で
しか発現せず、かつ多くの腫瘍内皮細胞において高度にアップレギュレートされるから、
非常に重要な標的部位である。現在、癌または他の病理過程において、抗VEGF/VE
GFR療法を用いて血管新生を阻止することは極めて重要になると考えられている。血管
内皮増殖因子/血管内皮増殖因子受容体の阻害は、腎臓細胞癌、肝細胞癌などの一部の癌
を治療する主要な治療方法とされている。
現在、血管内皮増殖因子/血管内皮増殖因子受容体と免疫チェックポイント阻害剤とを
併用して癌を阻止するための治療中の安全性及び有効性を検討するための様々な臨床試験
が行われている。いくつかの早期研究によると、単一のVEGFR阻害剤または免疫阻害
剤と比較して、免疫チェックポイント阻害剤とVEGFR阻害剤との併用は良好な治療効
果を示す可能性がある(https://www.obroncology.com/a
rticle/combining-immune-checkpoint-and-v
egf-inhibitors-improves-survival-in-pret
reated-nsclc)。しかし、この有利な結果に関連するリスクはまだ不明であ
る(参考文献3:Combining Immune Checkpoint and VE
GFR Inhibition in Favorable Risk and Elderl
y Patients with Metastatic Renal Cell Carci
noma.Varkaris A,Xu W,Davis RB,Healy B,McD
ermott DF.Clin Genitourin Cancer.June 2020
, Vol.18,No.3,pp.179-184)。VEGFR/ICIの二重阻害
に関するいくつかの臨床試験(例えば、ペムブロリズマブ(pembrolizumab
)/パゾパニブ(Pazopanib)併用薬群、ニボルマブ(nivolumab)/
スニチニブ(sunitinib)併用薬群、ニボルマブ(nivolumab)/パゾ
パニブ(Pazopanib)併用薬群など)では、初期臨床研究段階で良好な治療効果
を示したが(参考文献4:A Phase I/II Study to Assess th
e Safety and Efficacy of Pazopanib and Pemb
rolizumab Combination Therapy in Patients
with Advanced Renal Cell Carcinoma.Chowdhu
ry S,Infante JR,et al.Clin Genitourin Canc
er.2021 rh October,Vol.19,No.5,pp.434-446
;参考文献5:Nivolumab(anti-PD-1;BMS-936558,ON
O-4538)in combination with sunitinib or pa
zopanib in patients (pts) with metastatic r
enal cell carcinoma(mRCC).Amin,A.et al.,J
ournal of Clinical Oncology.32,(suppl.),M
ay 20,2014,Abstract 5010)、その後の高用量群では重篤な毒性
作用が観察された。ニボルマブ/スニチニブ併用薬群、及びニボルマブ/パゾパニブ併用
薬群では、それぞれ73%及び60%の患者にグレード3以上の治療関連毒性が発見され
た。また、ニボルマブ/スニチニブ併用薬群では、23%の有害事象がさらに発生したた
め治療中止となった。ニボルマブ/パゾパニブ併用薬群でも、20%の有害事象が発生し
たため治療中止となった。同様に、ペムブロリズマブ/パゾパニブ併用薬群でも、高用量
に関連する肝毒性が発生した。これらの併用は臨床第III相試験において不適合と判断
されたため中止となってしまった。また、VEGFR/ICIの二重阻害に関する別のい
くつかの臨床試験(例えば、ベバシズマブクローナル抗体(Bevacizumab)と
アテゾリズマブクローナル抗体(Atezolizumab)の併用)の臨床第III相
試験(参考文献6:IMmotion151:a randomized phase I
II study of atezolizumab plus bevacizumab v
s sunitinib in untreated metastatic renal c
ell carcinoma(mRCC),Motzer,RJ et al.Journ
al of Clinical Oncology.36,abstr.578(2018
).)において、積極的な治療効果データも報告された。この試験では、患者の奏効率が
ある程度に上昇したが、併用療法による治療に伴う副作用も増えたので、MSKCC基準
により、この臨床試験では20%の治療意図患者だけに適切なリスクがある。
併用療法の検討に加えて、VEGF/VEGF受容体及びPD-1を標的とするいくつ
の二重特異性抗体は、まだ検討されており、例として、中山康方生物医薬有限公司が開発
したAK112(中国特許出願CN109053895)がある。しかし、これまで、全
世界で血管内皮増殖因子/血管内皮増殖因子受容体及び免疫チェックポイント阻害剤を標
的とする二重特異性抗体は、まだ承認発売を取得せず、依然として大きな臨床ニーズ及び
開発課題が存在している。
発明者らは鋭意研究を行い、複数ラウンドのスクリーニング及び最適化を行うことでV
EGFを標的とするVHHを得るとともに、VHHを結合機能領域モジュールコンポネン
トとしてPD-1抗体と結合させることによって、PD-1及びVEGFを標的とする二
重特異性抗体を開発することに至った。係る二重特異性抗体は、
(a)PD-1を標的とする第1の結合機能領域と、
(b)VEGFを標的とする第2の結合機能領域と、を含み、
ここで、
前記PD-1を標的とする第1の結合機能領域が抗PD-1抗体(Ab)または抗原結
合断片(Ab’)であり、
前記VEGFを標的とする第2の結合機能領域が以下のアミノ酸配列で特定されるCD
R1~3のVHHドメイン(variable domain of heavy chai
n of heavy-chain antibody)を含む。
さらに、前記CDR2における変異の部位が58位および/または65位にある。
さらに、前記CDR2における変異がN58Y変異および/またはD65G変異である
好ましくは、前記CDR2における変異がN58Y及びD65G変異である。
好ましくは、前記CDR2の変異発生後のアミノ酸配列は配列番号24で示されるアミ
ノ酸配列と一致している。
好ましくは、前記VEGFを標的とする第2の結合機能領域のVHHドメインのCDR
1~3の組み合わせは、以下の通りである。
さらに、前記VHHドメインはヒト化VHHドメインである。
さらに、前記VEGFを標的とする第2の結合機能領域は、
1)配列番号4で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号4で示さ
れるアミノ酸配列と比べて1個または2個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ド
メインFR1、および/または
2)配列番号5で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号5で示さ
れるアミノ酸配列と比べて1個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメインFR
2、および/または
3)配列番号6で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号6で示さ
れるアミノ酸配列と比べて1~5個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメイン
FR3、および/または
4)配列番号7で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号7で示さ
れるアミノ酸配列と比べて1個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメインFR
4をさらに含む。
またさらに、FR1ドメインにおける前記1個または2個のアミノ酸変異は、1位およ
び/または5位にあり、さらに好ましくはQ1Eおよび/またはQ5L変異である。
またさらに、FR2ドメインにおける前記1個のアミノ酸変異は、49位にあり、さら
に好ましくはA49S変異である。
またさらに、FR3ドメインにおける前記1~5個のアミノ酸変異は、74位、82B
位、83位、84位及び89位から選ばれる1または2または3または4または5個であ
り、さらに好ましくはD74S、V(82B)S、K83R、P84A及びM89Vから
選ばれる1位または2位または3位または4位または5位にある。
またさらに、FR4ドメインにおける前記1個のアミノ酸変異は、108位にあり、さ
らに好ましくはQ108Lである。
またさらに、前記VEGFを標的とする第2の結合機能領域は、
1)配列番号4または配列番号9で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワー
ク領域ドメインFR1、および/または
2)配列番号5または配列番号10で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワ
ーク領域ドメインFR2、および/または
3)配列番号6または配列番号11で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワ
ーク領域ドメインFR3、および/または
4)配列番号7または配列番号12で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワ
ーク領域ドメインFR4をさらに含む。
さらに、前記VEGFを標的とする第2の結合機能領域は、以下のアミノ酸で特定され
るフレームワーク領域の組み合わせを含む。
さらに、前記VEGFを標的とする第2の結合機能領域は、配列番号8で示されるアミ
ノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号8で示されるアミノ酸配列と比べて1~1
1個(1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個または11個)
のアミノ酸変異を有する。さらに、前記変異の部位は、1位、5位、49位、58位、6
5位、74位、82B位、83位、84位、89位及び108位から選ばれることが好ま
しい。さらに、前記変異は、Q1E、Q5L、A49S、N58Y、D65G、D74S
、V(82B)S、K83R、P84A、M89V、Q108Lから選ばれる1~11個
(1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個または11個)であ
ることが好ましい。
さらに好ましくは、前記VEGFを標的とする第2の結合機能領域のアミノ酸配列は、
配列番号8、配列番号13または配列番号14で示されるアミノ酸配列と一致している。
さらに、前記抗PD-1抗体(Ab)またはその抗原結合断片(Ab')は、ヒト化抗体ま
たはその抗原結合断片、キメラ抗体またはその抗原結合断片、ヒト抗体またはその抗原結
合断片である。
さらに、前記抗PD-1抗体(Ab)またはその抗原結合断片(Ab')はIgG型抗体で
ある。
またさらに、前記抗PD-1抗体(Ab)またはその抗原結合断片(Ab')は、IgG1
型、IgG2型、またはIgG4型である。
さらに、前記PD-1を標的とする第1の結合機能領域は、ニボルマブ(Nivolu
mab、Opdivo)抗体またはペムブロリズマブ(Pembrolizumab、K
eytruda)抗体と同一の軽鎖及び重鎖CDRのアミノ酸配列を有する。
さらに、前記PD-1を標的とする第1の結合機能領域は、ニボルマブ(Nivolu
mab、Opdivo)抗体またはペムブロリズマブ(Pembrolizumab、K
eytruda)抗体と同一の重鎖可変領域のアミノ酸配列を有する。
前記PD-1を標的とする第1の結合機能領域は、ニボルマブ(Nivolumab、
Opdivo)抗体またはペムブロリズマブ(Pembrolizumab、Keytr
uda)抗体と同一の軽鎖可変領域のアミノ酸配列を有する。
さらに、前記PD-1を標的とする第1の結合機能領域の重鎖部分は、さらに、重鎖定
常領域CH1ドメイン(CH1)、ヒンジ領域(Hinge)、重鎖定常領域CH2ドメ
イン(CH2)、重鎖定常領域CH3ドメイン(CH3)から選ばれる1つ以上を含む。
前記PD-1を標的とする第1の結合機能領域は、軽鎖定常領域ドメイン(CL)をさ
らに含む。
さらに、前記抗PD-1抗体は、N端からC端に向かって重鎖可変領域ドメイン(VH
)、重鎖定常領域CH1ドメイン(CH1)、ヒンジ領域(Hinge)、重鎖定常領域
CH2ドメイン(CH2)、重鎖定常領域CH3ドメイン(CH3)を順次に含む重鎖部
分と、N端からC端に向かって軽鎖可変領域ドメイン(VH)、軽鎖定常領域ドメイン(
CH)を順次に含む軽鎖部分とを含む。
さらに、前記抗PD-1抗体のFcドメイン(すなわちヒンジ領域、重鎖定常領域CH
2ドメイン、重鎖定常領域CH3ドメイン)はIgG1 Fcドメインまたはそのサイレ
ントIgG1変異である。
さらに、前記Fcドメインは配列番号15で示されるアミノ酸配列と一致しているか、
あるいは配列番号15で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、9
3%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれ以上の相同性を有
するアミノ酸配列である。
さらに、前記PD-1を標的とする第1の結合機能領域は、以下のアミノ酸配列からな
る軽鎖と重鎖の組み合わせを含む。
1)配列番号16で示されるアミノ酸配列と一致している重鎖、および/または
配列番号17で示されるアミノ酸配列と一致している軽鎖;あるいは
2)配列番号18で示されるアミノ酸配列と一致している重鎖、および/または
配列番号19で示されるアミノ酸配列と一致している軽鎖。
さらに、前記第2の結合機能領域は、前記第1の結合機能領域のC端またはN端にある

さらに、前記VHHドメインは、前記抗体(Ab)またはその抗原結合断片(Ab')の重
鎖部分のC端またはN端に直接的に連結されているか、あるいはペプチドリンカーを介し
て連結されている。
さらに、前記ペプチドリンカーは可撓性ペプチドリンカーである。
さらに、前記ペプチドリンカーは1つ以上のアミノ酸を含む。
さらに、前記ペプチドリンカーは少なくとも5つのアミノ酸を含む。
好ましくは、前記ペプチドリンカーのアミノ酸配列は(GGGGS)nで表される(た
だし、前記nは1、2、3または4である)。
さらに、前記二重特異性抗体は二価、三価または四価の二重特異性抗体である。
さらに、前記二重特異性抗体は、配列番号20で示される重鎖と配列番号21で示され
る軽鎖との組み合わせを含むか、あるいは配列番号22で示される重鎖と配列番号23で
示される軽鎖との組み合わせを含む。
本発明は、さらにVEGFを標的とするVHHドメインに関する。前記VHHドメイン
は、以下のアミノ酸配列で特定されるCDR1~3を含む。
さらに、前記CDR2における変異の部位は58位および/または65位にある。
またさらに、前記CDR2における変異はN58Y変異および/またはD65G変異で
ある。
さらに、前記VHHドメインはヒト化VHHドメインである。
さらに、前記VHHドメインは、
1)配列番号4で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号4で示さ
れるアミノ酸配列と比べて1個または2個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ド
メインFR1、および/または
2)配列番号5で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号5で示さ
れるアミノ酸配列と比べて1個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメインFR
2、および/または
3)配列番号6で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号6で示さ
れるアミノ酸配列と比べて1~5個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメイン
FR3、および/または
4)配列番号7で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号7で示さ
れるアミノ酸配列と比べて1個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメインFR
4をさらに含む。
またさらに、FR1ドメインにおける前記1個または2個のアミノ酸変異は1位および
/または5位にあり、さらに好ましくはQ1Eおよび/またはQ5L変異である。
またさらに、FR2ドメインにおける前記1個のアミノ酸変異は49位にあり、さらに
好ましくはA49S変異である。
またさらに、FR3ドメインにおける前記1~5個のアミノ酸変異は、74位、82B
位、83位、84位及び89位から選ばれる1または2または3または4または5個であ
り、さらに好ましくはD74S、V(82B)S、K83R、P84A及びM89Vから
選ばれる1位または2位または3位または4位または5位にある。
またさらに、FR4ドメインにおける前記1個のアミノ酸変異は、108位にあり、Q
108Lであることがさらに好ましい。
またさらに、前記VEGFを標的とするVHHドメインは、
1)配列番号4または配列番号9で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワー
ク領域ドメインFR1、および/または
2)配列番号5または配列番号10で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワ
ーク領域ドメインFR2、および/または
3)配列番号6または配列番号11で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワ
ーク領域ドメインFR3、および/または
4)配列番号7または配列番号12で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワ
ーク領域ドメインFR4をさらに含む。
さらに、前記VHHドメインは、以下のアミノ酸で特定されるフレームワーク領域の組
み合わせを含む。
さらに、前記VHHドメインのアミノ酸配列は、配列番号8で示されるアミノ酸配列と
一致しているか、あるいは配列番号8で示されるアミノ酸配列と比べて1~11個(1個
、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個)のアミノ酸部位
の変異を有する。さらに、前記アミノ酸変異の部位は1位、5位、49位、58位、65
位、74位、82B位、83位、84位、89位及び108位から選ばれることが好まし
い。さらに、前記変異はQ1E、Q5L、A49S、N58Y、D65G、D74S、V
(82B)S、K83R、P84A、M89V、Q108Lから選ばれる1~11個(1
個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個)であることが
好ましい。
さらに好ましくは、前記VHHドメインのアミノ酸配列は、配列番号8、配列番号13
または配列番号14で示されるアミノ酸配列と一致している。
本発明は、さらに、組換えタンパク質の構築における前記VHHドメインの使用に関す
る。
本発明は、さらに、前記VEGFを標的とするVHHドメインを含む組換えタンパク質
に関する。
さらに、前記組換えタンパク質には、二重特異性抗体、多重特異性抗体、抗体薬物コン
ジュゲートが含まれる。
本発明は、さらに、前記何れか1項に記載の二重特異性抗体、多重特異性抗体、組換え
タンパク質、またはVHHドメインをコードする、ポリヌクレオチドに関する。
本発明は、さらに、前記何れか1項に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクターに
関する。
本発明は、さらに、前記何れか1項に記載の発現ベクターを含むか、またはそのゲノム
上に前記何れか1項に記載のポリヌクレオチドが統合された、宿主細胞に関する。
本発明は、さらに、前記何れか1項に記載のVHHドメイン、二重特異性抗体、多重特
異性抗体または組換えタンパク質及びその薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物に
関する。
本発明は、さらに、癌治療薬の調製における、前記何れか1項に記載の二重特異性抗体
、多重特異性抗体、組換えタンパク質またはVHHドメインの使用に関する。
本発明は、さらに、必要とする被験者に、前記何れか1項に記載のVHHドメイン、二
重特異性抗体、多重特異性抗体または組換えタンパク質を有効量で投与することを含む、
癌の治療方法に関する。
さらに、前記何れか1項に記載の使用または治療方法においては、前記癌が結腸・直腸
癌である。
本発明による有益な効果は以下の通りである。すなわち、本発明においてスクリーニン
グ及び最適化されたVEGFを標的とするVHHドメインは構造が安定で、熱安定性が高
く、ヒトVEGF-AともマウスVEGF-Aとも高い結合活性を示し、動物モデルにお
いて同時に検証するのに有利であるため、薬物開発の成功率が高められ、またタンパク質
の高発現及び精製に有利な特徴を持っている。また、本発明においてこのVHHドメイン
をもとに開発された二重特異性抗体は独特な二重特異性抗体構造形態を有し、高度にヒト
化され、人工的に添加された冗長配列を含まず、かつVEGF高発現腫瘍中で局所的に濃
縮する可能性があるため、より選択的な腫瘍抑制作用を発揮し、より有効な腫瘍抑制効果
を発揮し、PD-1/PD-L1阻害剤の薬効が不十分であったという問題を解決するこ
とができる。
複数ラウンドの変異改造が行われた抗体とVEGFとの結合状況を示す。 二重特異性抗体の構造概略図を示す。 MLR反応における被験抗体によるインターロイキン2(IL-2)の放出量を示す。 MLR反応における被験抗体によるインターフェロンγ(IFN-γ)の放出量を示す。 被験抗体によるHUVEC細胞増殖の相対阻害率を示す。 被験抗体によるHUVEC細胞遊走の阻害作用を示す。 VEGF磁気ビーズに結合させた抗体の残余量のELISA法による定量化を示す。 被験抗体で処置した担癌マウスモデル中の腫瘍体積を示す。
定義
特に反対の説明がない限り、本発明の用語は当分野の技術範囲内のウイルス学、免疫学
、微生物学、分子生物学、組換えDNA技術の従来の方法を用いるか、又は当業者に一般
的に理解される意味と同じである。これらの多くは説明のために以下に記述されているが
、このような技術は文献においても十分に説明されている。
本明細書で使用される用語「抗体」とは、抗体断片ではなく、実質的に完全な形を持つ
抗体のことを指す。具体的には、本明細書における「抗体」は、好ましくは完全な形の抗
体であり、それぞれの2本の重鎖(H鎖)と2本の軽鎖(L鎖)とからなり、これらの鎖
同士がジスルフィド結合及び非共有結合を介して連結されて4本のポリペプチド鎖からな
るモノマー分子が形成されるような、4本のポリペプチド鎖からなる対称構造を有する。
本明細書で使用される用語「抗原結合断片」は、完全な形の抗体の一部を含み、好まし
くは完全な形の抗体の抗原結合領域および/または可変領域である。抗体断片の例として
は、Fab、Fab’、F(ab’)2、およびFv断片などが挙げられる。
本明細書で使用される用語「ヒト化抗体またはその抗原結合断片」とは、ヒト免疫グロ
ブリン(受容体抗体)を指し、その中で受容体由来HVRの残基は、マウス、ラット、ウ
サギまたは非ヒト霊長類のような所望の特異性、親和性、および/または能力を有する非
ヒト種(ドナー抗体)由来のHVRの残基によって置換される。場合によっては、ヒト免
疫グロブリンのフレームワーク(「FR」)残基は、対応する非ヒト残基によって置換さ
れる。また、ヒト化抗体またはその抗原結合断片は、受容体抗体またはドナー抗体に存在
しない残基を含むことができる。結合親和性などの抗体特性をさらに改善するために、こ
れらの修正を行うことができる。一般的に言えば、ヒト化抗体または抗原結合断片は、典
型的に2つの可変ドメインの実質的にすべてを含み、少なくとも1つを含む。ここで、す
べてまたは実質的にすべての超可変ループは非ヒト免疫グロブリン配列のそれらに対応し
、かつすべてまたは実質的にすべてのFRドメインはヒト免疫グロブリン配列のそれらで
あるが、FR領域は、結合親和性、異性化、免疫原性などの抗体性能を改善する1つまた
は複数の単独のFR残基置換基を含むことができる。ヒト化抗体は、任意選択的に、典型
的にヒト免疫グロブリンの免疫グロブリン定常領域(Fc)の少なくとも一部を含むこと
もできる。他の詳細については、例えば、Jonesら、Nature 321:522
-525(1986)、Riechmannら、Nature 332:323-329
(1988)、およびPresta、Curr.Op.Struct.Biol.2:5
93-596(1992)を参照されたい。さらに、例えば、VaswaniとHami
lton、Ann.Allergy、Asthma&Immunol.1:105-11
5(1998)、Harris,Biochem.Soc.Transactions
23:1035-1038(1995);HurleとGross,Curr.Op.B
iotech.5:428-433(1994)、および米国特許第6,982,321
号並びに米国特許第7,087,409号を参照されたい。
本明細書で使用される用語「ヒト抗体」とは、ヒトによって産生される抗体に対応する
アミノ酸配列を有し、かつ/あるいはヒト抗体を製造するための技術のいずれかを用いて
調製される抗体である。ヒト抗体のこの定義からは、非ヒト抗原結合残基を含むヒト化抗
体が明確に除外されている。ヒト抗体は、ファージディスプレイライブラリーを含む、当
分野で知られている様々な技術を用いて作成することができる。Hoogenboomと
Winter,J.Mol.Biol.,227:381(1991)、Marksら、
J.Mol.Biol.222:581(1991)。さらにヒトモノクローナル抗体の
作成に使用できるのは、Coleら、Monoclonal Antibodies an
d Cancer Therapy,Alan R.Liss,77ページ(1985)、
Boernerら、J.Immunol.,147(1):86-95(1991)など
の文献に記載されている方法である。また、van Dijkおよびvan de Win
kel、Curr.Opin.Pharmacol.,5:368-74(2001)を
参照されたい。ヒト抗体は、抗原攻撃に応答するそのような抗体を産生するために修飾さ
れたが内在性遺伝子座が禁用されたトランスジェニック動物(例えば、免疫異種マウス)
に抗原を投与することによって調製することができる(例えば、XENOMOUSETM
技術に関する米国特許第6075181号および第6150584号を参照)。また、L
iら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、103:3557-3562(
2006)に開示されたヒトB細胞ハイブリドーマ技術によって産生されたヒト抗体に関
する内容も参照されたい。
本明細書で使用される用語「CDR」(すなわち相補性決定領域)は、カバットシステ
ムによって定義されるように、超可変領域のことを指すために使用される。Kabatら
、Sequences of Proteins of Immunological In
terest、バージョン5、Public Health Service,Nati
onal Institutes of Health,Bethesda,Md.(19
91)を参照されたい。またCDRについては、IMGT、Chothia、AbM、C
ontactなどの他の定義形式も存在する。
特に説明しない限り、本発明における免疫グロブリン残基の番号はカバット番号付けシ
ステムに従って番号付けたものである。
本明細書で使用される用語「Fcドメイン」は一般にヒンジ領域、重鎖定常領域CH2
ドメイン、重鎖定常領域CH3ドメイン(すなわちヒンジ-CH2-CH3)を含む。F
cドメインは常にジスルフィド結合の形態として二量体を形成する。現在最も一般的に使
用されている融合パートナーは免疫グロブリンIgGのFc断片であり、ただし、抗体F
cは抗体定常領域の一部である(ヒンジ領域-CH2-CH3を含み、抗体定常領域のC
H1を含まない)。Fc断片と融合した後、分子量の増加、FcRn媒介の再循環メカニ
ズムにより融合分子の安定性が増加し、体内半減期が延長されるとともに、Fc断片を利
用してADCC、CDCなどの各種生物学的機能を媒介することができるが、このような
融合タンパク質は抗体の可変領域がなく、その薬理及び薬効が主にFcと融合した機能分
子に依存する。ヒト免疫グロブリンGには4つの亜型があり、異なる免疫グロブリンG亜
型の生物学的活性が異なる。現在最も多く応用されているのはIgG1型抗体であり、近
年、新適応症の開拓、新作用機序抗体薬物の出現に伴い、細胞毒性の低いIgG2、Ig
G4亜型が重視されるようになっている。本発明において、前記「Fcドメイン」は、I
gG 1型抗体のFcドメインまたはIgG4型抗体のFcドメインであることが好まし
い。
本明細書で使用される用語「特異性」とは、抗原特定エピトープを選択的に識別する抗
原結合タンパク質または抗体を意味する。例えば、天然抗体は単特異的である。本明細書
で使用される用語「二重特異性」または「多重特異性」は、抗原結合タンパク質または抗
体が2つ以上の抗原結合部位を有することを意味し、その中の少なくとも2つの部位が異
なる抗原または同一抗原の異なるエピトープと結合する。
本明細書で使用される用語「二価」、「三価」、「四価」とは、「原子価」のことを指
し、すなわち抗原結合タンパク質または抗体分子中に存在する結合部位の所定数のことを
表す。従って、用語「二価」、「三価」、「四価」とは、抗原結合タンパク質または抗体
分子中にそれぞれ2つの結合部位、3つの結合部位、4つの結合部位が存在することを意
味する。
「VHHドメイン」(variable domain of heavy chain
of heavy-chain antibody)は、VHH、VHH抗体断片とも呼ば
れ、最初には「重鎖抗体」(heavy-chain antibody、hcAb、す
なわち「軽鎖が欠損した抗体」)の抗原結合免疫グロブリン可変ドメインに由来した(C
.Hamers-Casterman、T.Atarhouch,et al.Natu
rally occuring antibodies devoid of ligh
t chains.Nature、1993年6月3日、Vol.363,pp.446
-448)。用語「VHHドメイン」は、このような可変ドメインを、2本の軽鎖および
2本の重鎖からなる従来の抗体(以下、「従来の抗体」と略称する)に存在する重鎖可変
ドメイン(本明細書では「VHドメイン」または「VHドメイン」と称する)と、従来の
抗体に存在する軽鎖可変ドメイン(本明細書では「VLドメイン」または「VLドメイン
」と称する)から区別することに用いられる。VHHドメインは、他の抗原結合ドメイン
をいらずに、特異的にエピトープと結合する(これは、従来の抗体においてVLドメイン
とVHドメインとの組み合わせによりエピトープを識別するという従来の抗体中のVHま
たはVLドメインとは逆である)。VHHドメインは単一免疫グロブリンドメインから形
成される抗原識別ユニットである。
本明細書では、用語「重鎖シングルドメイン抗体(single domain ant
ibody、sdAb)」、「VHHドメイン」、「VHH」、「VHH抗体断片」、「
VHH抗体」、「ナノボディ」及び「ナノボディドメイン」を互換的に使用することがで
きる。
本明細書で使用される用語「相同性」は、シーケンスの最大相同性パーセントを達成す
るために配列アライメント、(必要であれば)ギャップ導入が行われた後、特定のペプチ
ドまたはポリペプチド配列中のアミノ酸残基に対する候補配列中の同じアミノ酸残基のパ
ーセントを意味するが、シーケンス相同性の一部として保存的置換は考慮されない。アミ
ノ酸配列の相同性パーセントを決定するためのアライメントは、例えば、BLAST、B
LAST-2、ALIGN、またはMEGALIGN-(DNASTAR)ソフトウェア
のような、一般的に入手可能なコンピュータソフトウェアを使用して、当分野の技術範囲
内で様々な方法で実行することができる。アライメントの測定に用いられる適切なパラメ
ータ、例えば比較シーケンスの全長にわたって最大アライメントを達成するために必要な
任意のアルゴリズムなどは、当業者であれば決定することができる。
本明細書で使用される用語「治療」とは、臨床病理学的過程において治療される個体ま
たは細胞の自然プロセスを変更するように設計された臨床介入を指す。所望の治療効果と
しては、疾患の進行速度の低減、疾患状態の改善または緩和、および予後の緩和または改
善が挙げられる。例えば、治療される疾患または病症(例えば、癌、炎症または自己免疫
疾患など)に関連する1つまたは複数の症状の軽減または除去が挙げられる。
本明細書で使用される用語「有効量」とは、被験者の疾患または病症を治療するのに有
効な薬剤または薬物の量を意味する。癌の場合は、本出願による抗VEGFシングルドメ
イン抗原結合断片、二重特異性抗体、多重特異性抗原結合構築体、医薬組成物、免疫コン
ジュゲートの有効量によれば、癌細胞の数を減らし、腫瘍のサイズを小さくし、癌細胞の
周辺器官への浸潤を抑制(すなわちある程度遅延、好ましくは阻害)し、腫瘍癌細胞の転
移を抑制(すなわちある程度遅延、好ましくは阻止)、ある程度で腫瘍の増殖を抑制し、
かつ/あるいは癌に関連する1つまたは複数の症状をある程度で緩和することができる。
臨床環境で理解されるように、医薬品、化合物または医薬組成物の有効量は他の医薬品、
化合物または医薬組成物と併用することにより実現されるか、実現されなくてもよい。し
たがって、1つ以上の治療剤を投与する場合には「有効量」を考慮することができ、かつ
1つ以上の他の薬剤と併用する場合には、有効量で単一の薬剤を提供することで所望の結
果を実現または達成することができると考えられる。
本明細書で使用される用語「被験者」は哺乳動物であることが好ましく、ヒト、ウシ、
ウマ、ネコ科動物、イヌ科動物、げっ歯動物、または霊長類が挙げられるが、これらに限
定されない。いくつかの実施形態では、前記個体はヒトである。
以下、実施例を参照しながら、本発明の実施形態について詳細に説明するが、以下の実
施例が本発明を説明するためにのみ使用され、本発明の範囲を限定するものとして解釈さ
れるべきではないことは、当業者に理解されるであろう。
[実施例1]
VEGFを標的とするVHHのスクリーニング及び開発
それぞれ500μgのヒト、マウスVEGF-Aタンパク質を等体積アジュバントと混
合して免疫原を調製し、2歳雌アルパカに2週間隔で4ラウンドの免疫接種を行った。免
疫後、高免疫血清を収集し、末梢血単核細胞を分離し、RNAを抽出した。RT-PCR
によりナノボディの可変領域遺伝子を増幅した。次に、制限酵素で切断し、ライゲーショ
ン、エレクトロポレーションを行い、VEGF-A免疫抗体ライブラリーを得た。
調製したVEGF-A免疫抗体ライブラリーについて、それぞれイムノチューブ固相パ
ンニングと磁気ビーズ液相スクリーニングとを用いてそれぞれ2ラウンドのパンニングを
行い、単一クローンを選択してELISA検出を行った。陽性クローンを配列決定し、最
終的に81株の異なる抗体遺伝子を得た。こうして得られたすべての81株の菌株に対し
てVHH-FcのDNA断片を構築し、配列決定した後、293T細胞をトランスフェク
ションして真核発現を行い発現上清を収集して、ELISA特異性検出を行った。検出の
結果、(#6)6号株はヒト及びマウスVEGF-Aの両方に対して優れた結合能を示す
唯一の抗体であることが分かった(下記表7及び表8を参照)。
菌株6(#6)を配列決定した結果、そのアミノ酸配列は以下の通りである。
配列番号8[CDR1-3を太字及び下線部で表示している(カバット番号)]
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTSTMSWYRQAPGKERELVAFITSAGATTNYADSVKDRFTMSRDNDKNT
VYLQMNVLKPEDTAMYYCRALVTLWNVYWGQGTQVTVSS
[実施例2]
VEGF VHH初期シーケンスのヒト化及び安定性の最適化
6号株のVHHの熱安定性及びヒト化程度をさらに高めるために、構造生物学に基づく
タンパク質構造シミュレーションと組み合わせて、5ラウンドの配列最適化及び修飾を行
い、良好な熱安定性及び高度なヒト化を有する2つのVHH配列を得た。
#6 (配列番号8):
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTSTMSWYRQAPGKERELVAFITSAGATTNYADSVKDRFTMSRDNDKNT
VYLQMNVLKPEDTAMYYCRALVTLWNVYWGQGTQVTVSS
#48 (配列番号13):
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTSTMSWYRQAPGKERELVSFITSAGATTYYADSVKGRFTMSRDNSKNT
VYLQMNSLRAEDTAVYYCRALVTLWNVYWGQGTLVTVSS
#49 (配列番号14):
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTSTMSWYRQAPGKERELVAFITSAGATTYYADSVKGRFTMSRDNSKNT
VYLQMNSLRAEDTAVYYCRALVTLWNVYWGQGTLVTVSS
#48シーケンスの場合、Q1E+Q5LはFR1領域に位置し、A49SはFR2領
域に位置し、N58Y+D65GはCDR2領域に位置し、D74S+V(82B)S+
K83R+P84A+M89VはFR3領域に位置し、Q108LはFR4領域に位置す
る。
#49シーケンスの場合、Q1E+Q5LはFR1領域に位置し、N58Y+D65G
はCDR2領域に位置し、D74S+V(82B)S+K83R+P84A+M89Vは
FR3領域に位置し、Q108LはFR4領域に位置する。
VEGF結合能及び熱安定性を測定した結果、#48、#49はいずれも#6に匹敵す
る良好なVEGF結合能を示した(図1を参照)。熱安定性を測定した結果、組み合わせ
変異配列は、熱安定性が10℃程度向上し、Tm値がそれぞれ64.1℃、64.7°C
であった。
[実施例3]
候補二重特異性抗体分子構造のスクリーニング及び対照物質の構築
#48 VHH及び抗PD-1抗体であるニボルマブ(Opdivo)またはペムブロ
リズマブ(Keytruda)の抗原結合領域断片をもとに、様々な二重特異性抗体構造
形式に対して評価及びスクリーニングを行った。活性化、発現量及び安定性などを総合的
に評価した後、図2に示す二重特異性抗体構造を用いることを決定した。また、#10、
#16の二重特異性抗体分子をさらに構築し評価した。原子価がいずれも二価+二価(2
+2)であり、Fcが機能サイレントIgG1変異(AEASS)であった。構築された
分子のアミノ酸配列を下記表18に示す。
対照として、PD-1及びVEGFを標的とする二重特異性抗体AK112アナログを
用いた(配列番号25の重鎖アミノ酸配列及び配列番号26の軽鎖アミノ酸配列から自社
で発現・調製したもの)。
配列番号25:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTFTNYGMNWVRQAPGKGLEWVGWINTYTGEPTYAADFKRRFTFSLDTSKSTAY
LQMNSLRAEDTAVYYCAKYPHYYGSSHWYFDVWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV
TVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEA
AGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWL
NGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTT
PPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESG
GGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSSYDMSWVRQAPGKGLDWVATISGGGRYTYYPDSVKGRFTISRDNSKNNLYLQMNSLRA
EDTALYYCANRYGEAWFAYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSMSASVGDRVTFTCRASQDIN
TYLSWFQQKPGKSPKTLIYRANRLVSGVPSRFSGSGSGQDYTLTISSLQPEDMATYYCLQYDEFPLTFGAGTKLELK
配列番号26:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSASQDISNYLNWYQQKPGKAPKVLIYFTSSLHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQP
EDFATYYCQQYSTVPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ
ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
[実施例4]
ヒトPD-1とヒトVEGFとの結合
ELISA法により抗体とヒトPD-1との結合を検出した。具体的には、1μg/m
LのヒトPD-1(アクロ社製、Hisタグ)をELISAプレートに一晩被覆しブロッ
キングし、二重特異性抗体サンプル及び対照抗体の段階希釈液を加えてインキュベートし
洗浄した。次に、HRP標識抗ヒトIgG Fc二次抗体を加えてインキュベートしてか
ら洗浄した。TMB発色液を加えて発色させた後、マイクロプレートリーダーでOD45
0吸光度を測定した(下記表19を参照)。ELISA法により抗体とヒトVEGFとの
結合を検出するために、50ng/mLのヒトVEGF(アクロ社製、Hisタグ)でE
LISAプレートを一晩被覆しブロッキングし、被験サンプルと対照抗体との段階希釈液
を加えてインキュベートし洗浄した。次に、プレートにHRP標識抗ヒトIgG Fc二
重特異性抗体を加えてインキュベートし洗浄した。最後に、TMB発色液を加えて発色さ
せた後、マイクロアプレートリーダーでOD 450吸光度を測定した(下記表20を参
照)。ELISA検出の結果から明らかなように、#10、#16とヒトPD-1との結
合能はオプジーボ及びキイトルーダに匹敵するが、更に高いTopシグナル及び対照AK
112アナログよりも更に強い結合能を示した。#10、#16とVEGFとの結合パタ
ーンは非常にユニークで、#48とVEGFとの結合能と比べて、#10、#16とVE
GFとの結合能がやや低下し、Top吸光度が約#48の半分であったことから、構造生
物学に基づく最適化により#10、#16とVEGFとの結合状態が変化したので、より
多くの薬物濃縮を実現できたことが判明した。一方、AK112アナログの抗VEGF部
分にベバシズマブ抗体断片が使用され、VEGFとの結合においてベバシズマブと類似す
る特徴が示された。(対照物質はすべて自社で発現・精製したもの)
[実施例5]
ヒトVEGFとヒトPD-1との二重結合能
#10、#16及びAK112アナログがヒトVEGFともヒトPD-1とも結合する
二重結合能をさらに検証した。96ウェルELISAプレートを50ng/mLのヒトV
EGF(シノバイオロジカル社製、タグなし)で一晩被覆し、洗浄し、1時間ブロッキン
グした後、被験抗体の段階希釈液を加えて2時間インキュベートし続けた。次に、1μg
/mLのヒトPD-1(アクロ社製、Hisタグ)を加えて2時間インキュベートし洗浄
した後、HRP標識抗His抗体を加えて1時間インキュベートした。最後に、TMB発
色液を加えて発色させた後、マイクロプレートリーダーでOD 450nm吸光度を測定
した。その結果、下記表21に示すように、単一標的抗体は2つの標的分子に同時に結合
できなかったが、#10、#16及びAK112アナログはいずれもヒトVEGF及びヒ
トPD-1との二重結合能を有し、EC50値がそれぞれ0.279nM、0.326n
M、0.254nMであった。
VEGF及びPD-1結合の順序を変更してELISA二重検出を行った。96ウェル
ELISAプレートを1μg/mLのヒトPD-1(アクロ社製、Hisタグ)で一晩被
覆し、洗浄し、1時間ブロッキングした後、特異性抗体の段階希釈液を加えて2時間イン
キュベートした。次に、50ng/mLのビオチン標識ヒトVEGF(アクロ社製、ビオ
チン化タンパク質)を加えて2時間インキュベートし、洗浄した後、HRP標識ストレプ
トアビジンを加えて1時間インキュベートした。最後に、TMB発色液を加えて発色させ
、マイクロプレートリーダーでOD 450nm吸光度を測定した。その結果、下記表2
1に示すように、単一標的抗体は2つの標的分子に同時に結合できなかったが、#10、
#16及びAK112アナログはいずれもヒトPD-1及びヒトVEGFとの二重結合能
を有し、EC50値がそれぞれ0.114nM、0.117nM、0.634nMであっ
た。EC50値の比較から、#10、#16はヒトPD-1及びヒトVEGFとの二重結
合能力が、競合品AK112アナログよりも5~6倍優れていることが分かった。
[実施例6]
異種抗原との結合
ELISA法を用いて候補分子と異なる菌種の競合品抗原との結合を検出した。サル由
来のVEGFシーケンスはヒト化VEGFシーケンスと全く一致し、候補抗体はサルVE
GFとの結合能がヒトVEGFとの結合能と同等であった。ELISA法を用いて抗体と
サルPD-1との結合を検出した。ELISAプレートを1μg/mLのサルPD-1(
アクロ社製、Hisタグ)で一晩被覆しブロッキングした後、被験サンプル及び対照抗体
の段階希釈液を加えてインキュベートし洗浄した。次に、HRP標識抗ヒトIgG Fc
の二重特異性抗体を加えてインキュベートし洗浄した。最後に、TMB発色液を加えて発
色させた後、マイクロプレートリーダーでOD 450吸光度を測定した(下記表22を
参照)。ヒトPD-1との結合結果と一致しているように、#10、#16はサルPD-
1との結合能がオプジーボ及びキイトルーダに匹敵し、競合品AK112アナログよりも
強かったことが示された。
[実施例7]
PD-1とPD-L1との結合ブロック能力
被験抗体がPD-1とPD-L1との結合をブロックする能力をさらに検証した。EL
ISAプレートを1μg/mLのヒトPD-1(アクロ社製、Fcタグ)で一晩被覆し、
洗浄し、ブロッキングした後、段階希釈済みの抗体及びヒトPD-L1(シノバイオロジ
カル社製、Hisタグ)の混合液を加えて2時間インキュベートした。次に、HRP標識
抗His抗体を加えて1時間インキュベートした。最後に、TMB発色液を加えて発色さ
せた後、マイクロプレートリーダーでOD 450吸光度を測定した(下記表23を参照
)。結果に示すように、VEGFのみに結合した#48を除き、残りの抗体はいずれもP
D-1とPD-L1との結合をブロックすることができ、かつブロック活性が同等であっ
た。
[実施例8]
VEGFとVEGFR1又はVEGFR2との結合のブロック能力
被験抗体がVEGFとVEGFR1又はVEGFR2との結合をブロックする能力を検
証した。ELISAプレートをそれぞれ2μg/mLのヒトVEGFR1と5μg/mL
のヒトEGFR2(自社で構築・発現したもの、Fcタグ)で一晩被覆した後、洗浄し、
ブロッキングした後、それぞれ段階希釈済みの抗体とヒトVEGF(アクロ社製、ビオチ
ン化タンパク質)との混合液を加えて2時間インキュベートし洗浄した。次に、それぞれ
HRP標識ストレプトアビジンを加えて1時間インキュベートした。最後に、TMB発色
液を加えて発色させた後、マイクロプレートリーダーでOD 450nm吸光度を測定し
た。その結果、♯10、♯16はVEGFとVEGFR1との結合をブロックする能力が
さらに強く、IC50値がそれぞれ0.491nM、0.507nMで、♯48のブロッ
ク能力より優れていることから、構築された二重特異性抗体の空間構造変化による優位性
が示された。競合品AK112アナログはブロック能力がベバシズマブのブロック能力に
匹敵し、IC50値がそれぞれ4.610nM、5.647nMであった。また、検出の
結果、♯10、♯16はVEGFとVEGFR2との結合をブロックする能力がさらに強
く、IC50値がそれぞれ3.643nM、3.249nMで、#48のブロック能力(
IC50値が5.841nM)より優れていることから、二重特異性抗体の空間構造変化
による優位性が示された。一方、競合品AK112アナログはブロック能力がベバシズマ
ブのブロック能力に匹敵し、IC50値がそれぞれ6.481nM、6.637nMであ
った。
[実施例9]
混合リンパ球反応(MLR)法を用いたPD-1ブロック後のT細胞の反応の検証
被験候補分子及び競合品AK112アナログの機能を細胞レベルでさらに比較した。P
D-1ブロック後のT細胞の反応を混合リンパ球反応(MLR)法により検証した。1つ
のドナー由来の2×104個のDC細胞と別のドナー由来の2×105個のCD4+T細胞
を等体積で混合し、段階希釈済みの被験抗体を加えて72時間培養した後、細胞培養上清
を収集し、ELISA定量キットを用いて細胞上清中から放出されたIL-2(図3)及
びIFNγ(図4)の含有量を測定した。その結果、#10、#16によって促進された
MLR反応におけるCD4+T細胞放出のIL-2及びIFNγの含有量が競合品AK1
12アナログによる量より高かったから、#10、#16はT細胞に与える影響がより強
いことが示された。
[実施例10]
血管内皮細胞(HUVEC)増殖抑制試験を用いた、被験抗体がVEGFによるHUV
EC細胞増殖への刺激を阻害する能力の検証
96ウェル細胞プレートの上で1%FBSを含有する培地中に5×103個のHUVE
C細胞/ウェルを加え、37℃、5%二酸化炭素のインキュベータで一晩培養した。翌日
、培地を除去し、70ng/mLのVEGF及び段階希釈済みの被験抗体並びに競合品A
K112アナログを加えた。反応プレートを37℃、5%二酸化炭素のインキュベータに
入れて4日間培養した後、CTG試薬を加えてマイクロプレートリーダーで相対蛍光信号
値を測定した。1%FBSを含有するECM培地及びVEGF刺激を加えた細胞群(無抗
体)の蛍光値は阻害率0に対応することとして定義し、PBSのみ加えた群(1%FBS
を含有するECM培地がなく、VEGF刺激及び抗体も添加しなかった)の蛍光値は10
0%阻害率と定義した。そして、相対阻害率を曲線としてフィッティングした。図5に示
すように、#10、#16の最大阻害率は約60%であったのに対して、競合品AK11
2アナログの最大阻害率は約40%であったから、#10、#16の阻害率が競合品AK
112アナログよりも高かった。
[実施例11]
HUVEC細胞遊走への阻害能力
ポアサイズが8μmのトランスウェルチャンバを使用して、抗体がHUVEC細胞遊走
を阻害する能力を検出した。トランスウェルは上側チャンバと下側チャンバとからなる。
5×103個のHUVEC細胞/ウェルを上側チャンバに加えて、37℃、5%二酸化炭
素のインキュベータで30分間培養した。次に、200ng/mLのVEGFと異なる濃
度の被験抗体及び競合品AK112アナログを下側チャンバに加え、各群に3レプリケー
トウェルを設け、37℃、5%二酸化炭素のインキュベータで24時間培養した。次に、
4%パラホルムアルデヒドで固定化した後、クリスタルバイオレットで染色した。写真撮
影後、上側チャンバの裏面に遊走した細胞数をカウントした。細胞数が少ないほど阻害率
が高いということで、図6の結果は、#10、#16は競合品AK112アナログよりも
阻害率が高いことを示した。
[実施例12]
抗体濃縮増加の特性
構造生物学的シミュレーションから、#10の立体配座により抗VEGFナノ抗体とV
EGFとの結合パターンが変化する可能性があり、二量体VEGFタンパク質によって抗
体の濃縮を行うことができることが明らかになった。#10による抗体濃縮増加の特性を
検証するために、ヒトVEGFタンパク質にカップリングされた磁気ビーズ(アクロ社製
)をPBSでそれぞれ250ng/mL、125ng/mL及び50ng/mLまで希釈
し、それぞれ10nMの#10、#16及び競合品AK112アナログを加えて1時間イ
ンキュベートした後、磁石上にセットし2分間吸着させ、上清を吸引し、ELISA法に
よるタンパク質の定量化を行った。その結果、図7に示すように、#10、#16の残留
抗体量が競合品AK112アナログの量よりも少なかったことから、VEGFを含有する
磁気ビーズによって濃縮された二重特異性抗体がより多かったことが明らかになった。ま
た、抗体とVEGFとの架橋の程度を検証するためにELISA定量化試験を行い、まず
抗体をVEGF磁気ビーズに架橋させ、次に、ELISA法により架橋されていない残留
抗体量を検出した。その結果、#10、#16は競合品AK112アナログと比べて、V
EGFとの架橋度がより高かったことが示された。構造生物学的シミュレーションの結果
と互いに裏付けられるように、腫瘍局所におけるVEGFの高発現によって腫瘍局所にお
ける濃縮を図すことができ、#10、#16二重特異性抗体の差異化特徴及び治療潜在力
も示された。
[実施例13]
動物モデルにおける薬効評価
マウスモデルにおける被験抗体の薬効を評価するために、ヒトPD-1を導入したBa
lb/cマウスを選択し、野生型CT26腫瘍細胞(結腸癌細胞)を接種した。ベバシズ
マブ及びAK112アナログはいずれもマウスVEGFに結合しないため、この2群を除
外とし、ヒトVEGF及びマウスVEGFに結合できるVEGF-Trap(VEGFR
1の第2のドメイン、VEGFR2の第3のドメイン、およびヒトIgGFcからなる融
合タンパク質)を対照群として、計6群を設計した。実験設計、投与量及び投与経路など
を下記表24に示す。
図8に示すように、#10、#16による担癌マウスの腫瘍阻害率はそれぞれ57%、
62%であり、オプジーボ単剤治療群(20%)及びVEGF-Trap単剤治療群(4
5%)の腫瘍阻害率より高く、オプジーボとVEGF-Trapとの併用治療群(56%
)の腫瘍阻害率と同等であった。14日目には、#10、#16治療群の平均腫瘍体積が
併用治療群よりわずかに小さかった。また、マウスの体重変化が腫瘍増殖の傾向と一致し
た。14日目には、#10、#16治療群の体重変化が10%以内であったことから、#
10、#16は良好な薬効作用及び安全性を有することが明らかになった。
[実施例14]
免疫再構築したヒト悪性黒色腫皮下移植モデルにおける#10分子の相乗作用研究
免疫再構築したヒト悪性黒色腫モデルにおける#10の相乗作用研究を評価するために
、免疫不全マウスB-NDGを選択し、ヒトPD-L1を導入したA375腫瘍細胞(悪
性黒色腫細胞)を接種し、ヒト末梢血単核細胞(huPBMC)を接種して担癌マウスの
免疫系を再構築した。抗PD-1薬であるオプジーボ(Opdivo)、抗VEGF薬で
あるベバシズマブ、#48を単一標的対照群として、AK112アナログ(AK112
analog、自社で発現・調製したもの)を#10の対照薬として、計8群を設計した
。実験設計、投与量及び投与経路を下記表25に示す。
21日目に検出したところ、この実験システムにおいて、オプジーボ単剤治療群は抗腫
瘍作用を示さなかったこと、#10は腫瘍阻害率TGI=73%であり、腫瘍抑制レベル
がベバシズマブ単剤治療群(TGI=53%)、#48単剤治療群(TGI=57%)、
オプジーボと#48との併用治療群(TGI=50%)より有意に高く、またオプジーボ
とベバシズマブとの併用治療群(TGI=68%の腫瘍阻害率を基準としたとき、#10
分子による腫瘍相対阻害率が7%向上した)、およびAK112アナログ(TGI=64
%の腫瘍阻害率を基準としたとき、#10分子による腫瘍相対阻害率が14%向上した)
よりも優れたことが明らかになった。その結果、本発明の二重特異性抗体は相乗作用が生
じ、対照分子より顕著な優位性を有することが明らかになった。
なお、以上に開示されたのは、本発明のいくつかの実施例に過ぎず、いかなる形で本発
明を限定するものではない。本発明は各実施形態に限定されないことは当業者であれば理
解されるであろう。当業者にとって本発明の原理から逸脱せずにいくつかの改良および修
正を行う可能性があるが、これらの改良および修正も本発明の請求項の保護範囲内に収ま
る。

Claims (9)

  1. 以下のアミノ酸配列で特定されるCDR1~3を含む、VEGFを標的とするVHHドメインであって、
    前記CDR1のアミノ酸配列が配列番号1で示されるアミノ酸配列と一致しており、
    前記CDR2のアミノ酸配列が配列番号2で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号2で示されるアミノ酸配列と比べて1個または2個のアミノ酸変異を有し、
    前記CDR3のアミノ酸配列が配列番号3で示されるアミノ酸配列と一致しており、
    好ましくは、前記CDR2における変異の部位が58位および/または65位にあり、
    好ましくは、前記CDR2における変異がN58Y変異および/またはD65G変異であり、
    好ましくは、前記VHHドメインがヒト化VHHドメインであり、
    好ましくは、前記VHHドメインが、
    1)配列番号4で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号4で示されるアミノ酸配列と比べて1個または2個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメインFR1、および/または
    2)配列番号5で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号5で示されるアミノ酸配列と比べて1個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメインFR2、および/または
    3)配列番号6で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号6で示されるアミノ酸配列と比べて1~5個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメインFR3、および/または
    4)配列番号7で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号7で示されるアミノ酸配列と比べて1個のアミノ酸変異を有するフレームワーク領域ドメインFR4をさらに含み、
    好ましくは、FR1ドメインにおける前記1個または2個のアミノ酸変異は、1位および/または5位にあり、さらに好ましくはQ1Eおよび/またはQ5L変異であり、
    好ましくは、FR2ドメインにおける前記1個のアミノ酸変異は、49位にあり、さらに好ましくはA49S変異であり、
    好ましくは、FR3ドメインにおける前記1~5個のアミノ酸変異は、74位、82B位、83位、84位及び89位から選ばれる1または2または3または4または5個であり、さらに好ましくはD74S、V(82B)S、K83R、P84A及びM89Vから選ばれる1位または2位または3位または4位または5位にあり、
    好ましくは、FR4ドメインにおける前記1個のアミノ酸変異は、108位にあり、さらに好ましくはQ108Lであり、
    好ましくは、前記VHHドメインが、
    1)配列番号4または配列番号9で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワーク領域ドメインFR1、および/または
    2)配列番号5または配列番号10で示されるアミノ酸配列と一致しているフレームワーク領域ドメインFR2、および/または
    3)配列番号6または配列番号11で示されるアミノ酸配列を含むフレームワーク領域ドメインFR3、および/または
    4)配列番号7または配列番号12で示されるアミノ酸配列を含むフレームワーク領域ドメインFR4
    をさらに含み、
    好ましくは、前記VHHドメインが、以下のアミノ酸で特定されるフレームワーク領域の組み合わせ:
    1)配列番号4で示されるアミノ酸配列と一致しているFR1、配列番号5で示されるアミノ酸配列と一致しているFR2、配列番号6で示されるアミノ酸配列と一致しているFR3、及び配列番号7で示されるアミノ酸配列と一致しているFR4;
    2)配列番号9で示されるアミノ酸配列と一致しているFR1、配列番号10で示されるアミノ酸配列と一致しているFR2、配列番号11で示されるアミノ酸配列と一致しているFR3、及び配列番号12で示されるアミノ酸配列と一致しているFR4;
    3)配列番号9で示されるアミノ酸配列と一致しているFR1、配列番号5で示されるアミノ酸配列と一致しているFR2、配列番号11で示されるアミノ酸配列と一致しているFR3、及び配列番号12で示されるアミノ酸配列と一致しているFR4
    を含む、
    ことを特徴とするVHHドメイン。
  2. 前記VHHドメインのアミノ酸配列が、配列番号8で示されるアミノ酸配列と一致しているか、あるいは配列番号8で示されるアミノ酸配列と比べて1~11個のアミノ酸変異を有し、
    好ましくは、前記アミノ酸変異の部位が1位、5位、49位、58位、65位、74位、82B位、83位、84位、89位及び108位から選ばれ、
    好ましくは、前記アミノ酸変異がQ1E、Q5L、A49S、N58Y、D65G、D74S、V(82B)S、K83R、P84A、M89V、Q108Lから選ばれる1~11個であり、
    好ましくは、前記変異が以下の変異の組み合わせ:
    1)Q1E+Q5L+A49S+N58Y+D65G+D74S+V(82B)S+K83R+P84A+M89V+Q108L
    2)Q1E+Q5L+N58Y+D65G+D74S+V(82B)S+K83R+P84A+M89V+Q108L
    であり、
    好ましくは、前記VHHドメインのアミノ酸配列が、配列番号8、配列番号13または配列番号14で示されるアミノ酸配列と一致している、ことを特徴とする請求項1に記載のVHHドメイン。
  3. 組換えタンパク質の構築に用いられる請求項1又は2に記載のVHHドメイン。
  4. 請求項1又は2に記載のVHHドメインを含み、
    好ましくは、二重特異性抗体、多重特異性抗体、又は抗体薬物コンジュゲートである、ことを特徴とする組換えタンパク質。
  5. 請求項1又は2に記載のVHHドメイン、または請求項4に記載の組換えタンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
  6. 請求項5に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
  7. 請求項6に記載の発現ベクターを含むか、またはそのゲノム上に請求項5に記載のポリヌクレオチドが統合された、宿主細胞。
  8. 請求項1または2に記載のVHHドメイン、または請求項4に記載の組換えタンパク質、及びその薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
  9. 請求項1または2に記載のVHHドメイン、または請求項4に記載の組換えタンパク質を含む癌治療用薬であって、
    好ましくは前記癌が結腸・直腸癌である癌治療用薬。
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