JP2025118564A - 検出項目の設定方法および装置 - Google Patents

検出項目の設定方法および装置

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Abstract

【課題】検出項目の設定更新方法および装置、制御端末並びに試料分析システムの提供。
【解決手段】本方法は、目標検出項目の手順マッピング関係を取得するステップであって、手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含むステップと、目標第2実験手順の手順設定情報を取得するステップであって、目標第2実験手順は、前記目標検出項目の項目タイプと一義的に対応しているステップと、手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、目標検出項目を設定するステップとを含む。本願の技術案によれば、項目設定の便利性および効率を向上させるとともに、試料登録の効率および正確性を向上させることができる。
【選択図】図2

Description

本願は、コンピュータの技術分野に関し、特に検出項目の設定方法および装置、コンピュータ読取可能な記憶媒体、制御端末並びに試料分析システムに関する。
体外診断とは、生体外において、実験方法によって生体試料に対して検出分析を行うことである。試料の分析は、通常、試料分析機器および制御端末に関わっており、制御端末は、情報の管理と実験の制御を担当し、試料分析機器は、実験操作の実行を担当する。
ユーザは、検出項目に対して関連の実験手順を設定することを含めて制御端末に検出項目を設定する必要がある。その後、検出待ち試料に対して試料情報の入力および検出待ち項目の登録を行って、制御端末によって、検出待ち試料と検出待ち項目の状況に基づいて、対応する実験操作を実行するように試料分析機器を制御する必要がある。
しかしながら、従来の検出項目の設定方式では、同一種類の検出項目に対して、制御端末に複数の検出項目を作成して設定する必要があるので、設定操作が煩雑であるとともに効率が低く、かつ後続の項目の設定を修正する時の作業量も大きく、そして、ユーザが試料の登録を行う時に混同が発生しやすく、実験の検出進度を遅延させ、ひいては誤って登録して不良な結果を引き起こすことがある。
これに基づいて、従来技術で提案された項目設定の操作が煩雑であるとともに効率が低く、修正の作業量が大きく、実験検出を遅延させるなどの技術的問題に対して、検出項目の設定更新方法および装置、制御端末並びに試料分析システムを提供する必要がある。
本願に係る検出項目の設定方法は、
目標検出項目の手順マッピング関係を取得するステップであって、前記手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含むステップと、
目標第2実験手順の手順設定情報を取得するステップであって、前記目標第2実験手順は、前記目標検出項目の項目タイプと一義的に対応しているステップと、
前記手順マッピング関係および前記目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記目標検出項目を設定するステップと、を含む。
本願に係る検出項目の設定装置は、
目標検出項目の手順マッピング関係を取得するためのマッピング関係取得モジュールであって、前記手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含むマッピング関係取得モジュールと、
目標第2実験手順の手順設定情報を取得するための手順設定取得モジュールであって、前記目標第2実験手順は、前記目標検出項目の項目タイプと一義的に対応している手順設定取得モジュールと、
前記手順マッピング関係および前記目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記目標検出項目を設定するための検出項目設定モジュールと、を備える。
本願に係るコンピュータ読取可能な記憶媒体は、プロセッサによって実行される場合に上記の方法のステップを前記プロセッサに実行させるコンピュータプログラムが記憶されるものである。
本願に係る制御端末は、メモリとプロセッサとを備え、前記メモリには、前記プロセッサによって実行される場合に上記の方法を前記プロセッサに実行させるコンピュータプログラムが記憶される。
本願に係る試料分析システムは、上記の制御端末と試料分析機器とを含み、前記制御端末と前記試料分析機器とは通信可能に接続されており、
前記制御端末は、目標検出項目の手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報を取得して記憶するためのものであり、前記手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、前記目標第2実験手順は、前記目標検出項目の項目タイプと一義的に対応しており、
前記制御端末は、検出待ち試料の試料タイプおよび検出待ち項目に基づいて前記検出待ち試料に対して実験バッチを区分けし、かつ前記実験バッチのそれぞれに対して、当該実験バッチの試料タイプおよび当該実験バッチの検出待ち項目の手順マッピング関係と第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記試料分析機器に実験制御指令を送信させるためにも用いられ、そのうち、同一の実験バッチにおける前記検出待ち試料は、同一の試料タイプおよび検出待ち項目を有し、または同一の実験バッチにおける前記検出待ち試料は、同一の第1実験手順に対応するとともに同一の検出待ち項目を有し、
前記試料分析機器は、前記実験制御指令に基づいて、前記実験バッチのそれぞれにおける検出待ち試料に対応する実体試料に対して対応する実験操作をそれぞれ行うためのものである。
上記の検出項目の設定方法および装置、コンピュータ読取可能な記憶媒体、制御端末並びに試料分析システムによれば、目標検出項目に対応する複数の試料タイプと少なくとも1つの第1実験手順との間のマッピング関係を取得するとともに、目標検出項目の項目タイプと一意的に対応する第2実験手順の手順設定情報を取得し、当該マッピング関係および手順設定情報に基づいて目標検出項目を設定する。これにより、1つの検出項目に対して異なる試料タイプに対応する第1実験手順を設定することができ、1つの検出項目が複数の試料タイプを有する場合、各試料タイプのそれぞれに対して1つの検出項目をそれぞれ作成する必要がなく、1つの検出項目のみを作成すればよいので、項目設定および後続の修正の作業を簡略化させたとともに、項目設定の便利性および効率を向上させ、かつ、試料登録インタフェースにおいて同一種類の検出項目に対しても1つの検出項目のみが表示されるため、ユーザが試料登録を行う際の混同を効果的に回避し、登録効率および正確性を向上させた。
1つの実施例における検出項目の設定方法の適用環境を示す図である。 1つの実施例における検出項目の設定方法のフローチャートである。 1つの実施例において検出項目に対して第1実験手順を設定する操作を示す図である。 1つの実施例における項目設定インターフェースのインターフェース模式図である。 1つの実施例における項目設定インターフェースのインターフェース模式図である。 1つの実施例における制御ソフトウェアのソフトウェアインターフェース模式図である。 核酸抽出手順の作成および設定の一例の過程を示す図である。 核酸抽出手順の作成および設定の一例の過程を示す図である。 核酸検出項目の作成および設定の一例の過程を示す図である。 核酸検出項目の作成および設定の一例の過程を示す図である。 1つの実施例における検出項目の設定装置の構成を示すブロック図である。 1つの実施例における制御端末の構成を示すブロック図である。
本願に用いられる技術用語について、「含む」、「包含」、「有する」、「表示される」のような用語およびそれらの如何なる変形は、非排他的な包含をカバーすることを意図し、例えば、一連のステップまたはユニットを含む過程、方法、システム、製品または機器は、明確にリストアップされたステップまたはユニットに限らず、明確にリストアップされていないステップまたはユニット、またはこれらの過程、方法、製品または機器に固有の他のステップまたはユニットをさらに含んでもよい。「複数」、「複数種類」のような用語およびそれらの如何なる変形は、特に明確かつ具体的に限定しない限り、少なくとも2つを意味する。「第1」、「第2」などのような用語は、類似する対象を名称的に区別するためのものであるが、これらの対象自体はこれらの用語によって制限されず、相対的な重要性を指示または暗示し、または指示されている技術的特徴の数、特定の順序または主副関係などを暗黙的に明示すると理解されるべきではない。
本願の目的および利点をより明瞭にさせるために、本発明者が従来技術において対応する問題が存在していることを発見したことを詳細に説明する。
体外診断の分野では、試料分析を行う過程において、検出項目に対して関連の実験手順を設定することを含めて制御端末に検出項目を設定する必要がある。通常、検出項目の試料タイプに関する実験手順である第1実験手順と、検出項目の項目タイプに関する実験手順である第2実験手順とを少なくとも含む複数種類の実験手順を検出項目に対して設定する必要があり、例えば、核酸検出項目を設定する場合、核酸検出項目の試料タイプに関する核酸抽出手順と、核酸検出項目の項目タイプに関する核酸増幅手順とを設定する必要がある。
しかし、本発明者は、従来の設定方式では、制御端末に1つの検出項目を作成して、当該検出項目に対して1つの試料タイプに対応する第1実験手順を設定するとともに、このような検出項目に対応する第2実験手順を設定しているが、1種類の検出項目が複数の試料タイプに対応する可能性があり、複数の試料タイプが複数の第1実験手順に対応する可能性があるので、これに対して、制御端末に複数の検出項目を作成して、各検出項目のそれぞれに対してそのうちの1つの試料タイプに対応する第1実験手順を設定する必要があり、また、複数の検出項目の項目タイプが同様である(すなわち、同一種類の検出項目である)ため、各検出項目のそれぞれに対して同様な第2実験手順を設定することを発見した。例えば、新型コロナウイルス核酸検出項目が咽頭拭い液、血清、糞便という3つの試料タイプに対応し、この3つの試料タイプが核酸抽出手順TQ1、TQ2およびTQ3にそれぞれ対応し、かつ、新型コロナウイルス核酸検出といった検出項目が核酸増幅手順KZに対応しているので、制御端末は、3つの新型コロナウイルス核酸検出項目P1、P2およびP3を作成して、新型コロナウイルス核酸検出項目P1に対して核酸抽出手順TQ1および核酸増幅手順KZ、新型コロナウイルス核酸検出項目P2に対して核酸抽出手順TQ2および核酸増幅手順KZ、新型コロナウイルス核酸検出項目P3に対して核酸抽出手順TQ3および核酸増幅手順KZをそれぞれ設定する。
このように、同一種類の検出項目に対して、複数の検出項目を作成して設定する必要があり、複数の検出項目に多くの共通の設定情報が存在しているので、項目設定および後続の修正のいずれにも多くの重複操作が存在し、設定の作業量が大きくなり、操作が煩雑となるとともに効率が低くなる。
そして、発明者は、項目設定が完了した後、検出待ち試料に対して検出待ち項目を登録する場合、制御端末は、既に作成された全ての検出項目の項目名称を試料登録インターフェースに羅列して表示し、ユーザは、項目名称によって検出項目を識別し、さらに各検出待ち試料のそれぞれに対して対応する検出項目を選択して登録するようになっていることを見出した。しかしながら、1種類の検出項目に対して複数の検出項目が作成された場合、試料登録インターフェースにおいて複数の検出項目が同時に表示され、例えば、上記の新型コロナウイルス核酸検出項目P1、P2およびP3が同時に表示される。
このように、ユーザは、表示されている各検出項目に対応する試料タイプを忘れやすくなり、検出待ち試料に対してどの検出項目を選択して登録するかを明確に区別することができなく、例えば、ユーザは、咽頭拭い液という試料に対して検出待ち項目を選択する場合、P1、P2、P3のうちのどちらが咽頭拭い液という試料タイプに適合するかを明確に区別できない可能性があり、これにより登録効率を低下させ、実験の検出進度を遅延させ、そして、登録エラーを引き起こして不良な結果をもたらす可能性もある。
上記の問題を解決するために、本願は、1つの検出項目に対して異なる試料タイプに対応する第1実験手順を設定する検出項目の設定方法および装置、コンピュータ読取可能な記憶媒体、制御端末並びに試料分析システムを提供し、1種類の検出項目が複数の試料タイプを有する場合であっても、各試料タイプのそれぞれに対して1つの検出項目を作成する必要がなく、1つの検出項目のみを作成すればよく、項目設定および後続の修正の作業を簡略化させ、項目設定の便利性および効率を向上させたとともに、試料登録インタフェースにおいて同一種類の検出項目に対しても1つの検出項目のみが表示されるため、ユーザが試料登録を行う際の混同を効果的に回避し、登録効率および正確率を向上させた。
本願の技術の実現を容易に理解できるために、本願の適用分野および適用環境を詳細に説明する。
本願は、体外診断の分野に適用可能であり、詳細な分野の具体例として、例えば核酸検出がある。適用環境は、図1に示すように、制御端末110と試料分析機器120とを含み、制御端末110に制御ソフトウェアがインストールされ、制御端末110と試料分析機器120とは通信可能に接続される。
具体的には、まず、制御端末110における制御ソフトウェアによって検出項目を設定し、すなわち、制御ソフトウェアは、検出項目の項目設定情報を取得し、さらに関連の項目設定情報に基づいて検出項目を設定し、そのうち、項目設定情報は、検出項目に対応する複数の試料タイプと少なくとも1つの第1実験手順との間のマッピング関係、および検出項目の項目タイプに一義的に対応する第2実験手順の手順設定情報を含む。ユーザは、試料を試料分析機器120に入れた後、制御ソフトウェアにおいて試料登録を行い、具体的には、検出待ち試料の試料情報を入力するとともに検出待ち試料に対して検出待ち項目を登録することにより、試料登録情報を獲得する。さらに、制御ソフトウェアは、検出待ち試料の試料登録情報および登録された検出待ち項目の項目設定情報に基づいて、実験制御指令を生成して試料分析機器120に送信する。
試料分析機器120は、実験制御指令が指示する実験操作方式に従って、検出待ち試料に対して対応する実験操作を実行することにより、実験検出データを獲得して制御ソフトウェアに送信する。これに対応して、制御ソフトウェアは、実験検出データを分析処理することにより、実験検出結果を得てユーザに表示する。
ここで、制御端末110は、各種の卓上型コンピュータ、ノートパソコン、タブレットコンピュータ、IoT(Internet of Things)機器、スマートフォンであってもよいが、これらに限定されるものではない。試料分析機器120は、体外診断機器であり、PCR機器などであってもよいが、これに限定されるものではない。
なお、本願の適用環境に、サーバ(図示せず)が増設されてもよく、制御端末110は、試料分析機器120およびサーバにそれぞれ通信可能に接続され、そのうち、サーバは、独立したサーバまたは複数のサーバからなるサーバクラスタによって実現することができる。これによれば、制御端末110における制御ソフトウェアは、ユーザが関連操作を行うためのヒューマンマシンインタラクションインターフェースの提供を担当し、対応するデータ処理および記憶のタスクは、サーバによって実現され、具体的には、例えば、ユーザは、制御ソフトウェアのインターフェースにおいて関連操作を行い、制御ソフトウェアは、検出項目の項目設定情報および検出待ち試料の試料登録情報を獲得して、これらの情報をサーバに送信し、さらに、サーバは、これらの情報をさらに処理して記憶し、実験を開始するときに、サーバは、関連情報に基づいて実験制御指令を生成して、制御端末110における制御ソフトウェアによって試料分析機器120に送信する。
なお、本願の適用環境は、スマート実験機器、例えば図1における制御端末110および試料分析機器120の機能を一体に集積したスマート試料分析機器のみを含んでもよく、このように、情報管理、実験制御および実験操作の実行などの全工程事項を全て単一の機器に集中して実現することができる。
本願の適用環境をより明確に理解できるように、本願が体外診断の核酸検出という細分化分野に適用されることを例として補足的に説明する。
図1に示す適用環境における制御端末110は、制御ソフトウェアがインストールされるPC上位コンピュータであってもよく、試料分析機器120は、PCR複合機であってもよい。
そのうち、PCR複合機は、核酸複合機とも呼ばれ、PCR機器のうちの1つであり、PCRは、ポリメラーゼ連鎖反応(Polymerase chain reaction)の略称である。PCR複合機は、試薬調製モジュールと、核酸抽出モジュールと、核酸増幅モジュールとを含む。そのうち、試薬調製モジュールは、抽出プレートおよび増幅プレートを配置するタスクを完成し、すなわち、抽出試薬を用いて抽出プレートを配置し、および増幅試薬を用いて増幅プレートを配置するためのものである。核酸抽出モジュールは、試料の添加、核酸の抽出、核酸の転移などのタスクを完了し、すなわち、試料管から試料を採取して抽出プレートに添加し、その後、抽出プレートにおける試料に対して核酸抽出を行って、抽出した核酸を増幅プレートに転移するためのものである。核酸増幅モジュールは、PCR技術によって増幅プレートにおける核酸を増幅して、PCR検出データを得るためのものである。
検出待ち試料がある核酸検出項目を必要とする場合、PC上位コンピュータの制御ソフトウェアに対応する核酸検出項目を設定することができ、すなわち、制御ソフトウェアは、核酸検出項目の項目設定情報を取得して、関連の項目設定情報に基づいて核酸検出項目を設定し、ここで、項目設定情報は、核酸検出項目に対応する複数の試料タイプと少なくとも1つの核酸抽出手順との間のマッピング関係、およびこのような核酸検出項目に対応する核酸増幅手順の手順設定情報を含む。ユーザは、試料をPCR複合機の試料室にいれた後、制御ソフトウェアにおいて試料登録を行い、具体的には、検出待ち試料の試料情報を入力するとともに、上記のように設定した核酸検出項目を検出待ち試料の検出待ち項目として登録することにより、試料登録情報を獲得する。さらに、制御ソフトウェアは、検出待ち試料の試料登録情報および登録された検出待ち項目の項目設定情報に基づいて実験制御指令を生成して、PCR複合機に送信する。
PCR複合機は、実験制御指令が指示する実験操作方式に従って、抽出プレートおよび増幅プレートの配置、抽出プレートへの試料の添加、核酸の抽出、核酸の転移、核酸の増幅などの実験操作を対応的に完了してPCR検出データを獲得し、かつPCR検出データを制御ソフトウェアに送信する。さらに、制御ソフトウェアは、PCR検出データに対して分析処理を行うことにより、検出待ち試料の実験検出結果を得て関連インターフェースに表示する。
以下、図面および実施例を参照しながら本願をさらに詳細に説明する。なお、以下では、本願に係る方法が図1における制御端末に適用されることを例として説明するが、これは例示的な説明に過ぎず、制御端末のみが当該方法を実行できると限定されるものではない。
1つの実施例では、図2に示すように、以下のステップS202~S206を含む検出項目の設定方法を提供する。
S202において、目標検出項目の手順マッピング関係を取得する。
検出項目とは、生体試料に対して検出分析を行って検出結果を提供する医学項目であり、そのうち、生体試料は、採取されて検出分析に用いられる体液または組織、例えば血液、唾液、尿、皮膚または他の組織である。異なる試料分析機器に対応して、検出項目は、核酸検出項目、具体的に例えば新型コロナウイルス核酸検出項目、HPV核酸検出項目(Human Papilloma Virus、ヒトパピローマウイルス)などであってもよい。
目標検出項目は、設定を待っている検出項目である。ユーザによる操作に基づいて目標検出項目を確定することができ、例えばユーザが制御ソフトウェアをトリガーして1つの検出項目を新規作成し、制御ソフトウェアが新規作成した検出項目を目標検出項目としたり、また、例えば制御ソフトウェアが既に作成した検出項目を表示し、ユーザがそのうちの1つの検出項目を選択し、制御ソフトウェアが選択された検出項目を目標検出項目としたりするなどであってもよい。
本実施例では、目標検出項目に対して実験手順を設定する必要があり、設定する実験手順は、第1実験手順を含む。実験手順は、検出項目に係る実験段階の操作フローを指し、第1実験手順は、検出項目の試料タイプに関する実験手順を指し、例えば、核酸検出項目に対して、第1実験手順は、核酸抽出手順を含み、核酸抽出手順は、核酸検出項目における核酸抽出段階の操作フローを指し、通常は移液ステップと抽出ステップとを含み、核酸検出項目の試料タイプに関するものである。
手順マッピング関係と検出項目とは一対一で対応する関係であり、すなわち、1つの検出項目は、1組の手順マッピング関係に対応しており、手順マッピング関係は、検出項目の複数の試料タイプと少なくとも1つの第1実験手順との間のマッピング関係を含む。これに対応して、目標検出項目の手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、そのうち、目標試料タイプは、当該目標検出項目に対応する試料タイプであり、目標第1実験手順は、当該目標検出項目に対応する第1実験手順である。データ処理という点から、手順マッピング関係は、良く見られるデータ構造、例えばマッピングテーブルを用いて実現することができる。
本実施例では、1つの目標検出項目に対して、その手順マッピング関係が3つの場合を有する。
場合1では、手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと複数の目標第1実験手順とが一対一で対応するマッピング関係を含み、異なる目標試料タイプは、異なる目標第1実験手順に対応してもよい。例えば、目標検出項目A1に対して、手順マッピング関係は、5つの目標試料タイプと5つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、5つの目標試料タイプと5つの目標第1実験手順とが一対一で対応しており、すなわち、5つの異なる目標試料タイプは、5つの異なる目標第1実験手順に対応している。
場合2では、手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと複数の目標第1実験手順との間のマッピング関係を含んでいるが、一対一で対応する関係ではなく、目標試料タイプの数が目標第1実験手順よりも多く、各目標第1実験手順が1つまたは複数の目標試料タイプに対応しており、そのうちの少なくとも1つの目標第1実験手順が同時に複数の目標試料タイプに対応しており、すなわち、複数の目標試料タイプのそれぞれがいずれも1つの目標第1実験手順に対応しているが、一部の目標試料タイプが同様な目標第1実験手順に対応してもよい。例えば、目標検出項目A2に対して、手順マッピング関係は、5つの目標試料タイプと4つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、そのうち、2つの目標試料タイプが同一の目標第1実験手順に対応し、他の3つの目標試料タイプが他の3つの目標第1実験手順と一対一で対応している。または、目標検出項目A3に対して、手順マッピング関係は、5つの目標試料タイプと3つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、そのうち、2つの目標試料タイプが同一の目標第1実験手順に対応し、他の2つの目標試料タイプが他の1つの目標第1実験手順に対応し、残りの1つの目標試料タイプが残りの1つの目標第1実験手順に対応している。
場合3では、手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含んでおり、全ての目標試料タイプが同一の目標第1実験手順に対応してもよい。例えば、目標検出項目A4に対して、手順マッピング関係は、2つの目標試料タイプと1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、2つの試料タイプがいずれも同一の目標第1実験手順に対応している。
また、目標検出項目の手順マッピング関係のソースは複数種類存在しており、例えば、制御ソフトウェアの関連インターフェースでのユーザの入力操作に基づいて獲得したり、コードスキャン方式によって獲得したり、他の機器から制御端末へ伝送したりするなどとしてもよい。これに対応して、目標検出項目の手順マッピング関係を取得する具体的な方式として、まず、1つの目標試料タイプと対応する目標第1実験手順との間のマッピング関係を獲得し、その後、次の目標試料タイプと対応する目標第1実験手順との間のマッピング関係を獲得し、目標検出項目の全ての目標試料タイプと全ての目標第1実験手順との間のマッピング関係を獲得したまでこのように類推することにより、目標検出項目の手順マッピング関係を獲得するようにしてもよい。また、目標検出項目の全ての目標試料タイプと全ての目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、すなわち、目標検出項目の手順マッピング関係を含むデータパケットを直接的に獲得してもよい。
S204において、目標第2実験手順の手順設定情報を取得する。
本実施例では、目標検出項目に対して第1実験手順を設定することに加えて、第2実験手順を設定する必要があり、第2実験手順は、検出項目の項目タイプに関する実験手順を指し、異なるタイプの検出項目は、異なる第2実験手順に対応することができる。例えば、核酸検出項目に対して、第2実験手順は、核酸増幅手順を含んでもよく、新型コロナウイルス核酸検出項目およびHPV核酸検出項目は、異なる核酸増幅手順に対応してもよいが、新型コロナウイルス核酸検出項目であれば、その試料タイプが咽頭拭い液、血清、糞便のうちのどちらであっても核酸増幅手順が同様である。
これに対応して、目標第2実験手順は、目標検出項目に対応する第2実験手順を指し、目標第2実験手順は、目標検出項目の項目タイプと一義的に対応する。このように、本実施例では、1つの目標検出項目に対して、当該目標検出項目の複数の試料タイプに対応して当該目標検出項目に対して1つまたは複数の第1実験手順を設定することができるが、当該目標検出項目の項目タイプが一定でかつ唯一であるため、当該目標検出項目に対して1つのみの第2実験手順を設定することができると理解できろう。
手順設定情報は、実験手順を設定するための情報である。手順設定情報に含まれる内容は、検出需要に応じて設定されてもよく、例えば、第2実験手順の手順設定情報は、通常、対応する実験段階の実験操作方式を指示するための実験操作情報を含み、すなわち、試料分析機器は、実験段階において対応する実験操作情報が指示する実験操作方式に従って実験操作を実行し、例えば、核酸検出項目に対して、核酸増幅手順の実験操作情報は、手順セグメント分布情報および手順セグメントの具体的な設置情報を含み、手順セグメント分布情報は、例えば恒温セグメント、循環セグメントおよび融解セグメントの数および各手順セグメントの前後順序関係などを含み、手順セグメントの具体的な設置情報は、例えば恒温セグメントの温度、時間、循環回数などを含み、制御ソフトウェアは、当該実験操作情報が指示する実験操作方式に従って核酸増幅処理を行うように試料分析機器を制御するようにしてもよい。また、第2実験手順の手順設定情報は、第2実験手順の基本状況を記述するための手順基本情報、例えば第2実験手順の一義的な識別子である手順識別子をさらに含んでもよく、具体的には、制御ソフトウェアが第2実験手順に対して1つの手順IDを手順識別子として生成したり、制御ソフトウェアが第2実験手順の関連情報(例えば、手順名称)を取得して手順識別子としたりするなどであってもよい。
同様に、目標第2実験手順の手順設定情報のソースも複数種類存在しており、例えば、制御ソフトウェアの関連インターフェースでのユーザの入力操作に基づいて獲得したり、コードスキャン方式によって獲得したり、他の機器から制御端末へ伝送したりするなどとしてもよい。
S206において、手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、目標検出項目を設定する。
本実施例では、目標検出項目の設定過程において、目標検出項目の手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、目標検出項目に対して対応する実験手順を設定することができ、すなわち、目標検出項目の手順マッピング関係に基づいて目標検出項目に対して第1実験手順を設定するとともに、目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて目標検出項目に対して第2実験手順を設定することができる。
なお、目標検出項目に対して第1実験手順を設定することは、1つの検出項目を作成したが、まだ第1実験手順を設定していなく、後続きでそれを目標検出項目として、その手順マッピング関係を獲得した後、手順マッピング関係に基づいて、無から有になるように目標検出項目に対して第1実験手順を設定するようにしてもよい。他の実施形態では、1つの検出項目を作成して第1実験手順を既に設定していたが、後続で当該検出項目に対して第1実験手順を修正する必要があると、それを目標検出項目としてその手順マッピング関係を獲得し、手順マッピング関係に基づいて目標検出項目に対して第1実験手順を更新設定するようにしてもよい。目標検出項目に対する第2実験手順の設定は同様であるので、ここではその説明を省略する。
具体的には、目標検出項目に対して第1実験手順および第2実験手順を設定する実施方式は、目標検出項目の手順マッピング関係を目標検出項目の項目識別子と関連付けて記憶するとともに、目標第2実験手順の手順設定情報を目標検出項目の項目識別子と関連付けて記憶してもよく、そのうち、項目識別子は、目標検出項目の一義的な識別子であり、具体的には、制御ソフトウェアが目標検出項目に対して1つの項目IDを項目識別子として生成したり、制御ソフトウェアが目標検出項目の関連情報(例えば、項目名称)を項目識別子として取得したりするなどであってもよい。
以下では、容易に理解できるように、1つの具体的な実施形態を参照しながら例示的に説明する。制御ソフトウェアは、項目識別子、試料タイプ、第1実験手順の手順識別子および第2実験手順の手順識別子などのフィールドを含む項目マッピングテーブルを予め生成し、1つの目標検出項目に対して、制御ソフトウェアは、その項目識別子、当該目標検出項目の複数の試料タイプのタイプ識別子および各試料タイプに対応する第1実験手順の手順識別子が含まれる手順マッピング関係、および第2実験手順の手順識別子が含まれる第2実験手順の手順設定情報を取得し、獲得した項目識別子、複数のタイプ識別子、少なくとも1つの第1実験手順の手順識別子および第2実験手順の手順識別子などの情報を全てデータベースに記憶される項目マッピングテーブルに対応付けて保存することにより、当該目標検出項目に対して第1実験手順および第2実験手順を設定する。また、他の目標検出項目に対して第1実験手順および第2実験手順を設定することも、当該目標検出項目の上記情報を当該項目マッピングテーブルに保存することであり、当該項目マッピングテーブルにおいて、予め設定されたフィールドに従って制御ソフトウェアに作成された全ての検出項目の関連設定情報を記録する。
なお、目標検出項目を設定する場合、係る設定アイテムを項目の実際の状況に応じて確定することができ、目標検出項目に対して第1実験手順および第2実験手順を設定することに加えて、目標検出項目に対して他の設定アイテムを設定することができる。例えば、核酸検出項目を設定する場合、通常、核酸検出項目に対して抽出手順および増幅手順を設定することに加えて、当該核酸検出項目に対して項目基本情報、試薬組成、検出目標、結果判定および品質管理設定という5つの設定アイテムを設定することができ、これにより、目標検出項目の手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報を取得することに加えて、他の設定アイテムの関連設定情報を取得し、これに基づいて目標検出項目に対して対応する設定アイテムを設定することができる。
上記の検出項目の設定方法によれば、目標検出項目に対応する複数の試料タイプと少なくとも1つの第1実験手順との間のマッピング関係を取得するとともに、目標検出項目の項目タイプに一意的に対応する第2実験手順の手順設定情報を取得し、当該マッピング関係および手順設定情報に基づいて目標検出項目を設定する。これにより、1つの検出項目に対して異なる試料タイプに対応する第1実験手順を設定することができ、1つの検出項目が複数の試料タイプを有する場合、各試料タイプのそれぞれに対して1つの検出項目をそれぞれ作成する必要がなく、1つの検出項目のみを作成すればよいので、項目設定および後続の修正の作業を簡略化させたとともに、項目設定の便利性および効率を向上させ、かつ、試料登録インタフェースにおいて同一種類の検出項目に対しても1つの検出項目のみが表示されるため、ユーザが試料登録を行う際の混同を効果的に回避し、登録効率および正確性を向上させた。
1つの実施例では、目標検出項目の手順マッピング関係を取得するステップであるステップS202は、項目設定インターフェースでのユーザの試料タイプ入力操作に基づいて、複数の目標試料タイプを確定するステップと、各目標試料タイプに対して、予め記憶された第1実験手順の手順設定情報に基づいて、当該目標試料タイプに関連付けられる第1実験手順を確定するとともに、項目設定インターフェースでのユーザの手順選択操作に基づいて、関連付けられる第1実験手順から当該目標試料タイプに対応する目標第1実験手順を確定するステップと、確定した複数の目標試料タイプおよびそれらとそれぞれ対応する目標第1実験手順に基づいて、目標検出項目の手順マッピング関係を獲得するステップと、を含んでもよい。
項目設定インターフェースは、項目設定を実現するためのソフトウェアインタラクションインターフェースである。項目設定インターフェースは、シングルページまたはマルチページなどの様々な実現方式を有することができる。例えば、項目設定インターフェースは、Tabsタブページを採用することができ、すなわち、項目設定インターフェースには、目標検出項目の複数の設定アイテムにそれぞれ対応する複数のタブオプションが含まれ、そのうちのいずれか1つのタブオプションを選択すると、対応する設定アイテムの設定ページを表示し、ここで、第1実験手順という設定アイテムに対応するタブオプションが含まれ、当該タブオプションを選択すると、第1実験手順の設定ページを対応的に表示して、ユーザが関連の設定操作を行うことにより、目標検出項目に対して第1実験手順を設定することを実現することができる。
試料タイプ入力操作は、ユーザが項目設定インターフェースにおいて目標検出項目に対して試料タイプを入力する操作、すなわち目標試料タイプを入力する操作である。試料タイプ入力操作の実施方式は、例えばユーザがプルダウンボックスに表示される試料タイプから選択したり、また、例えばユーザがテキストコントロールにおいて目標試料タイプの関連情報を記入したりするなどであってもよい。
手順選択操作は、ユーザが項目設定インターフェースにおいて目標検出項目に対して第1実験手順を入力する操作、すなわち目標試料タイプに対して対応する目標第1実験手順を選択する操作である。手順選択操作の実施方式は、例えば、ユーザがプルダウンボックスに表示される第1実験手順から選択することを含む。
本実施例では、ユーザが入力した目標試料タイプのいずれかに対して、予め記憶された第1実験手順の手順設定情報に基づいて、当該目標試料タイプに関連付けられる第1実験手順を確定する。これにより、目標試料タイプに関連付けられる第1実験手順を確定する前に、目標検出項目に対して設定しようとする第1実験手順自体に対して手順設定を予め行う必要があり、すなわち、目標第1実験手順自体の手順設定タスクを予め完成して、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶する必要があり、そして、目標第1実験手順の手順設定情報には、少なくとも当該目標第1実験手順に関連付けられる試料タイプが含まれると理解できろう。前述したように、新型コロナウイルス核酸検出項目は、咽頭拭い液、血清、糞便の3つの試料タイプに対応しており、当該新型コロナウイルス核酸検出項目に対して核酸抽出手順を設定する前に、まず、TQ1、TQ2およびTQ3という3つの核酸抽出手順自体に対して手順設定を行うことにより、当該3つの核酸抽出手順のそれぞれの手順設定情報を取得して記憶する必要があり、TQ1、TQ2およびTQ3の手順設定情報には、それが咽頭拭い液、血清および糞便の試料タイプに関連付けられると対応的に記録される。
なお、いずれかの目標試料タイプに対して、予め記憶された第1実験手順の手順設定情報に基づいて確定した関連付けられる第1実験手順は、1つのみである可能性があり、複数である可能性もある。実際の応用では、通常、制御ソフトウェアに複数の目標検出項目が次々と設定されるため、データベースには、複数の検出項目に対して設定された複数の第1実験手順の手順設定情報が同時に記憶され、いずれかの目標試料タイプに対して、データベースに現在記憶されている複数の第1実験手順の手順設定情報のいずれにも当該目標試料タイプに関連付けられると記録されていると、確定した当該目標試料タイプに関連付けられる第1実験手順が複数存在し、ユーザが自分で判断してそのうちの1つを選択する必要があるが、データベースにおいて当該目標試料タイプに関連付けられると記録されている第1実験手順の手順設定情報が1つのみであると、確定した当該目標試料タイプに関連付けられる第1実験手順も1つのみであり、ユーザは確認すればよい。
なお、ユーザは、目標検出項目に対して複数の試料タイプを入力し、かつ各試料タイプに対して対応する第1実験手順をそれぞれ選択する必要があり、その具体的な実施方式が複数種類存在しており、例えば、ユーザは、目標検出項目に対して1つの試料タイプを入力して、当該試料タイプに対して対応する第1実験手順を選択し、その後、次の試料タイプを入力して、当該試料タイプに対して対応する第1実験手順を選択するように順次操作を行い、目標検出項目に対して全ての試料タイプを入力し、かつ各試料タイプに対して対応する第1実験手順をそれぞれ選択したまでこのように類推することができる。また、例えば、ユーザは、目標検出項目の全ての試料タイプを1回で入力して、各試料タイプに対して対応する第1実験手順をそれぞれ選択してもよい。
以下、明確に理解できるように、具体例を参照しながら本実施例における手順マッピング関係の獲得過程を説明する。1つの目標検出項目に対して、第1実験手順を設定する前に、制御ソフトウェアは、当該目標検出項目に対して設定する必要がある第1実験手順に対して手順設定を予め行い、すなわち、目標第1実験手順に対して手順設定を予め行って、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶し、手順設定情報には、それと関連付けられる試料タイプのタイプ識別子が含まれる。
その後、制御ソフトウェアは、図3に示す項目設定インターフェースを表示し、項目設定インターフェースには、第1実験手順という設定アイテムに対応するタグオプション301が表示され、ユーザが当該タグオプション301を選択すると、制御ソフトウェアは、第1実験手順の設定ページを表示する。ユーザは、当該設定ページにおいて試料タイプ入力操作を行うことにより、1つの目標試料タイプを入力する。具体的には、ユーザが当該設定ページにおける新規追加ボタン302をクリックすると、設定ページにおいて設定ポップアップボックス303をポップアップし、設定ポップアップボックスには試料プルダウンボックス3031および手順プルダウンボックス3032が表示され、ユーザは、試料プルダウンボックス3031内に表示される試料タイプのうちの1つを選択し、選択した試料タイプは、入力すべき1つの目標試料タイプであり、制御ソフトウェアは、そのタイプ識別子を取得する。さらに、制御ソフトウェアは、当該タイプ識別子およびデータベースに予め記憶された第1実験手順の手順設定情報に基づいて、当該目標試料タイプに関連付けられる第1実験手順を確定して手順プルダウンボックス3032に表示し、ユーザは、手順選択操作を行って手順プルダウンボックス内に表示された第1実験手順のうちの1つを選択し、制御ソフトウェアは、選択した第1実験手順を当該目標試料タイプに対応する目標第1実験手順とするとともにその手順識別子を取得する。その後、ユーザが設定ポップアップボックスにおける保存ボタン3033をクリックすると、制御ソフトウェアは、目標試料タイプのタイプ識別子と目標第1実験手順の手順識別子とをバインディングして両者の対応関係を獲得し、かつ入力した当該目標試料タイプおよびそれと対応する目標第1実験手順を設定ページに表示し、例えば、ユーザが羊水という試料タイプおよび番号が20221013151156である第1実験手順を選択すると、図3において羊水および20221013151156を対応的に表示する。ユーザが全ての目標試料タイプを入力しかつ各目標試料タイプのそれぞれに対して対応する目標第1実験手順を選択し、制御ソフトウェアが複数の目標試料タイプのタイプ識別子、少なくとも1つの目標第1実験手順の手順識別子、およびそれらの間の対応関係を対応的に獲得したまで上記の操作を繰り返すことにより、目標検出項目の手順マッピング関係を獲得した。
なお、本実施例では、項目設定インターフェースにおいて試料入力操作および手順選択操作を行うことにより、目標検出項目に対して第1実験手順を設定するだけでなく、項目設定インターフェースにおいて関連設定操作を行うことにより、目標検出項目に対して第2実験手順および他の設定アイテムを設定することもでき、具体的な実施方式は、本分野での任意の適用方式を採用可能であるので、ここではその説明を省略する。
総括して言えば、本実施例では、項目設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて目標検出項目の設定を実現することにより、ユーザが項目設定情報を柔軟に入力することができ、サードパーティメーカーの項目設定に対する互換性が高く、かつ操作が便利である。
1つの実施例では、目標検出項目の手順マッピング関係を取得するステップの前、すなわちステップS202の前に、項目設定インターフェースでのユーザの基本情報入力操作に基づいて、目標検出項目の項目基本情報を取得するステップと、ユーザによる項目新規作成操作に応答して、項目基本情報に基づいて目標検出項目を作成するステップとをさらに含んでもよい。これに基づいて、手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて目標検出項目を設定するステップであるステップS206は、手順マッピング関係および第2実験手順の手順設定情報に基づいて目標検出項目を更新するステップを含んでもよい。
基本情報入力操作は、ユーザが項目設定インターフェースにおいて目標検出項目に対してその項目基本情報を入力する操作である。そのうち、項目基本情報は、例えば項目名称、項目タイプなどの目標検出項目の基本状況を記述するためのものである。基本情報入力操作の実施方式は、例えばユーザがテキストコントロールに項目基本情報を記入したり、ユーザがプルダウンボックスから選択したり、これらの2つの方式を組み合わせたりするなどであってもよい。
項目新規作成操作は、目標検出項目の作成をトリガーさせる操作であり、すなわち、ユーザが項目新規作成操作を行うと、目標検出項目を作成するように制御ソフトウェアをトリガーさせる。項目新規作成操作の実施方式は、例えば、ユーザが項目設定インターフェースにおける項目保存ボタンに対するクリック操作、または項目設定インターフェースにおいて予め設定されたジェスチャー操作を行い、具体的には、例えばユーザがタッチ方式またはマウス操作方式で項目設定インターフェースにおいて予め設定された軌跡を描くことであってもよい。
具体的には、まず、ユーザが項目設定インターフェースにおいて基本情報入力操作を行い、制御ソフトウェアが目標検出項目の項目基本情報を獲得し、さらに、ユーザが項目新規作成操作を行い、制御ソフトウェアが当該操作に応答して項目基本情報に基づいて目標検出項目を作成し、これまで、制御ソフトウェアは、1つの目標検出項目を作成したが、当該目標検出項目に対して項目基本情報を設定しただけであり、第1実験手順および第2実験手順などの他の設定アイテムを設定していない。その後、ユーザが当該目標検出項目に対して試料タイプ入力操作および手順選択操作を行い、制御ソフトウェアが当該目標検出項目の手順マッピング関係を獲得して、当該手順マッピング関係に基づいて目標検出項目に対して第1実験手順を設定するとともに、当該目標第2実験手順の手順設定情報を取得して、当該手順設定情報に基づいて目標検出項目に対して第2実験手順を設定することにより、目標検出項目の関連設定を更新する。
総括して言えば、本実施例では、ユーザは、目標検出項目の項目基本情報を入力するだけで、制御ソフトウェアをトリガーさせて目標検出項目を作成することができ、その後、実際の状況に応じてタイミングを選択して目標検出項目に対して実験手順などの他の設定アイテムをさらに設定することができ、ユーザが全ての設定アイテムの関連設定情報を1回で入力する必要がないので、項目設定の柔軟性が高く、異なるシーンでのユーザの需要をよりよく満足することができる。
なお、他の実施例では、ユーザが目標検出項目の全ての設定アイテムの関連設定情報を入力しなければ、目標検出項目の作成を許可しないように設定されてもよく、当該方式では、ユーザが多くの情報を1回で入力する必要があるので、操作圧力が大きくなるが、項目設定内容を漏らして悪影響を引き起こすのを回避することができ、例えば、実験検出を開始した後に項目設定内容を漏らしたことを発見した場合、手直しをする必要があるので、実験過程に対して大きな影響を与えることがある。
1つの実施例では、目標検出項目の手順マッピング関係を取得するステップであるステップS202は、コードスキャン装置でのスキャンによって獲得される項目図形コード情報を解析して、目標検出項目の手順マッピング関係を取得するステップを含んでもよい。
項目図形コードは、目標検出項目を設定するための図形コードであり、項目図形コードと目標検出項目とは一対一で対応する関係であり、すなわち、1つの目標検出項目は、1つの項目図形コードと対応している。具体的には、項目図形コードは、関連の項目設定情報を記憶できればよく、2次元コードまたはバーコードなどであってもよい。実際の応用では、項目図形コードは、通常キットに印刷される。
コードスキャン装置は、項目図形コードをスキャンするための装置であり、具体的には、コードスキャンガン、タブレット、携帯電話または他の任意の適用機器であってもよい。また、コードスキャナ装置は、制御端末と有線または無線で通信可能に接続される。
本実施例では、ユーザは、コードスキャン装置を用いて項目図形コードをスキャンし、制御ソフトウェアは、項目図形コード情報を獲得し、かつ予め設定された復号手順に従って項目図形コード情報を解析して、目標検出項目の手順マッピング関係を獲得し、具体的には、制御ソフトウェアは、項目図形コード情報を解析して複数の目標試料タイプのタイプ識別子、少なくとも1つの目標第1実験手順の手順識別子およびそれらの間の対応関係を得る。
総括して言えば、本実施例では、ユーザが大量の情報を手動で入力する必要がなく、コードスキャン方式によって目標検出項目の手順マッピング関係を獲得することができるので、項目設定情報の入力を効率的かつ容易に完了することができ、そして、項目設定情報が図形コードに予めパッケージングされ、情報内容が外部に開示されることがないため、自己研究・生産のシーンに対して、情報秘匿に有利である。
1つの実施例では、手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて目標検出項目を設定するステップの前、すなわちステップS206の前に、項目図形コードを解析して目標検出項目の項目基本情報を獲得するステップをさらに含んでもよい。これに基づいて、目標第2実験手順の手順設定情報を取得するステップであるステップS204は、前記項目図形コードを解析して目標第2実験手順の手順設定情報を獲得するステップを含んでもよい。そして、手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて目標検出項目を設定するステップであるステップS206は、項目基本情報、手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて目標検出項目を作成して設定するステップを含んでもよい。
本実施例では、制御ソフトウェアは、予め設定された復号手順に従って項目図形コード情報を解析した後、目標検出項目の手順マッピング関係に加えて、目標検出項目の項目基本情報および第2実験手順の手順設定情報を獲得し、さらに目標検出項目を作成するとともに目標検出項目に対して項目基本情報、第1実験手順および第2実験手順を設定することができる。項目図形コードをスキャンすることによって目標検出項目のより多くの項目設定情報を獲得することにより、項目設定を効率的かつ容易に行うことができる。
なお、他の実施例では、項目図形コードをスキャンすることによって目標検出項目のすべての設定アイテムの関連設定情報を獲得し、さらに目標検出項目を作成するとともに目標検出項目に対してすべての設定アイテムを設定してもよい。例を挙げて説明すると、前述したように、核酸検出項目に対して、項目基本情報、試薬組成、検出目標、結果判定、核酸抽出手順、核酸増幅手順および品質管理設置という7つの設定アイテムを設定する必要があり、これに対して、項目図形コードには、当該7つの設定アイテムの関連設定情報がパッケージングされており、ユーザがコードスキャン装置を用いて項目図形コードをスキャンし、制御端末が予め設定された復号手順に従って項目図形コード情報を解析することにより、当該7つの設定アイテムのそれぞれに対応する設定情報を獲得するようにしてもよく、これにより、対応する核酸検出項目の作成および設定のタスクを効率的に完了することができる。
1つの実施例では、本願に係る検出項目の設定方法は、
項目設定インターフェースを表示するステップであって、項目設定インターフェースは、モード選択コントロール、項目リスト領域および項目編集領域を含み、モード選択コントロールは、オープン型オプションおよびクローズド型オプションを含むステップと、
モード選択コントロールがオープン型オプションに対応する場合、項目リスト領域にオープン型検出項目を表示するステップであって、オープン型検出項目は、項目設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて作成された検出項目を含むステップと、
表示したオープン型検出項目に対する選択操作に基づいて、選択されたオープン型検出項目に対応する設定ページを項目編集領域に表示するステップであって、オープン型検出項目に対応する設定ページは、第1実験手順の設定ページおよび第2実験手順の設定ページを含むステップと、
モード選択コントロールがクローズド型オプションに対応する場合、項目リスト領域にクローズド型検出項目を表示するステップであって、クローズド型検出項目は、項目図形コードによって作成された検出項目を含むステップと、
表示したクローズド型検出項目に対する選択操作に基づいて、選択されたクローズド型検出項目に対応する設定ページを項目編集領域に表示するステップであって、クローズド型検出項目に対応する設定ページは、第1実験手順の設定ページおよび第2実験手順の設定ページを含まないステップと、をさらに含んでもよい。
ここで、モード選択コントロールは、オープン型オプションとクローズド型オプションとの間の切り替えを実現するためのものであり、ユーザは、実際の需要に応じてオープン型オプションおよびクローズド型オプションを選択することができ、具体的な実施にあっては、プルダウンボックスまたは他の任意の適用可能な表示コントロールを採用することができる。項目リスト領域は、既に作成した検出項目を表示するための領域であり、項目編集領域は、検出項目に対応する設定ページを表示するための領域であり、具体的には、項目リスト領域に表示される検出項目のうちの1つを選択すると、項目編集領域において、選択した検出項目に対応する設定ページを対応的に表示する。項目設定インターフェースにおいて、モード選択コントロール、項目リスト領域および項目編集領域の配列位置およびサイズはいずれも複数種類の実施方式が存在しており、実際の需要に応じて柔軟に設計することができ、例えば、項目リスト領域および項目編集領域はそれぞれ項目設定インターフェースの左側および右側に設けられ、モード選択コントロールは項目リスト領域の上方に設けられる。
具体的には、モード選択コントロールがクローズド型オプションに対応する場合、項目リスト領域において、既に作成した全てのクローズド型検出項目を集中的に表示し、そのうち、クローズド型検出項目は、項目図形コードによって作成された検出項目を含み、具体的な表示方式として、例えば、各クローズド型検出項目をリスト形式で羅列してもよく、これにより、ユーザは、項目リスト領域を介してクローズド型検出項目の全体状況、例えば項目の総数を把握するとともに、項目リスト領域において具体的なクローズド型検出項目を選択して、さらに関連内容を閲覧および編集することができる。
ユーザが項目リスト領域に表示されるクローズド型検出項目のうちの1つを選択すると、項目編集領域において、選択したクローズド型検出項目に対応する設定ページを表示する。具体的には、設定ページは、クローズド型検出項目の公開設定アイテムと対応し、設定ページと公開設定アイテムとは一対一で対応してもよく、クローズド型検出項目の公開設定アイテムは、実際の需要に応じて予め設定することができ、1つ設けられてもよいし、複数設けられてもよいが、情報秘匿を考慮して、クローズド型検出項目に対して設けられる公開設定アイテムは通常比較的に少なく、例えば、公開設定アイテムが項目基本情報という設定アイテムのみを含むように予め設定され、これにより、クローズド型検出項目に対して、項目編集領域において、他の設定アイテムの設定ページを表示せず、項目基本情報の設定ページのみを表示する。なお、本実施例では、クローズド型検出項目の公開設定アイテムが第1実験手順および第2実験手順という2つの設定アイテムを含まないと要求されており、すなわち、クローズド型検出項目に対して、項目編集領域において第1実験手順の設定ページおよび第2実験手順の設定ページを表示しない。
設定ページにおける具体的な表示内容は、通常、対応する公開設定アイテムの公開設定情報、すなわち外部に開示された設定情報を含み、公開設定情報は、実際の需要に応じて予め設定されてもよく、具体的には、編集許可情報および編集禁止情報を含んでもよく、設定ページにおいて、編集禁止情報は、編集が不可能な状態となっており、ユーザによる編集が許可されず閲覧のみが許可され、編集許可情報は、編集が可能な状態となっており、閲覧も編集も可能となっている。
例を挙げて説明すると、試料分析機器はPCR複合機であり、これに対応して、制御ソフトウェアに核酸検出項目を設定し、クローズド型検出項目の公開設定アイテムは、試薬組成、検出目標、結果判定、核酸抽出手順および核酸増幅手順という5つの設定アイテムを含まず、項目基本情報と品質管理設定という2つの設定アイテムのみを含むように予め設定され、そして、項目基本情報という公開設定アイテムにおける公開設定情報は、項目略称、項目名称、項目タイプ、項目番号、LISチャンネル番号、繰り返し回数、結果単位および表示順序を含み、品質管理設定の公開設定情報は、各バッチの実験に必要な品質管理タイプを含むように予め設定され、そのうち、LISチャンネル番号、繰り返し回数、結果単位、表示順序および品質管理タイプが編集許可情報であり、残りが編集禁止情報であるように予め設定される。
なお、項目編集領域に設定ページを表示する実施方式は複数種類存在しており、例えば、Tabsタブページを採用することができ、項目編集領域に各公開設定アイテムにそれぞれ対応するタブオプションが表示され、いずれか1つのタブオプションを選択すると、項目編集領域において対応する公開設定アイテムの設定ページを表示し、その後、別のタブオプションに変更して選択すると、項目編集領域において別の公開設定アイテムの設定ページに切り替えて表示する。前述したように、核酸検出項目に対して、項目設定インターフェースは、図4に示すように、モード選択コントロール401においてクローズド型オプションを選択した場合、項目リスト領域402において既に作成した全てのクローズド型核酸検出項目を表示し、ユーザがそのうちの「(クローズド)COVID」というクローズド型核酸検出項目を選択すると、項目編集領域403において、項目基本情報および品質管理設定という2つの公開設定アイテムにそれぞれ対応するタブオプション4031および4032を表示し、かつ、制御ソフトウェアは、項目基本情報に対応するタブオプション4031をデフォルトで選択したため、項目編集領域において、当該クローズド型核酸検出項目の項目基本情報の設定ページ4033をデフォルトで表示し、その後、ユーザが品質管理設定に対応するタブオプション4032に変更して選択すると、項目編集領域において、当該クローズド型核酸検出項目の品質管理設定の設定ページ(図示せず)に切り替えて表示する。
モード選択コントロールがオープン型オプションに対応する場合、項目リスト領域において、既に作成した全てのオープン型検出項目を集中的に表示し、そのうち、オープン型検出項目は、項目設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて作成された検出項目を含み、同様に、具体的な表示方式は、例えば各オープン型検出項目をリスト形式で羅列してもよく、ユーザは、項目リスト領域を介してオープン型検出項目の全体状況を把握することができ、かつ、項目設定インターフェースにオープン型検出項目を新規作成するとともに関連内容を設定することができ、または、項目リスト領域から具体的なオープン型検出項目を直接的に選択して、さらに関連内容を閲覧および設定することができる。
クローズド型と同様に、ユーザが項目リスト領域に表示されるオープン型検出項目のうちの1つを選択すると、項目編集領域において選択したオープン型検出項目に対応する設定ページを表示する。具体的には、設定ページは、オープン型検出項目の公開設定アイテムに対応しており、1つの設定ページが1つの公開設定アイテムに対応してもよく、オープン型検出項目の公開設定アイテムは、実際の需要に応じて予め設定されてもよく、通常は、複数設定され、ユーザに関連設定アイテムの関連設定情報を完全に入力させることにより、実験検出が正常に行われることを確保するようになっている。本実施例では、オープン型検出項目の公開設定アイテムは、第1実験手順および第2実験手順という2つの設定アイテムを含むように要求され、すなわち、オープン型検出項目に対して、項目編集領域には、第1実験手順の設定ページおよび第2実験手順の設定ページが表示される。また、同様に、設定ページには、対応する公開設定アイテムの公開設定情報が具体的に表示され、実際の需要に応じて予め設定されてもよく、具体的には、編集許可情報および編集禁止情報を含むが、ここではその説明を省略する。
同様に、核酸検出項目を例に挙げて説明すると、オープン型検出項目の公開設定アイテムは、項目基本情報、試薬組成、検出目標、結果判定、核酸抽出手順、核酸増幅手順および品質管理設定の7つの設定アイテムを含み、項目基本情報の公開設定情報は、項目略称、項目名称、項目タイプ、項目番号、LISチャンネル番号、繰り返し回数、結果単位、表示順序、核酸添加量および外因性内部標準添加量を含むように予め設定され、項目タイプが編集禁止情報に設定される以外に、残りがいずれも編集許可情報に設定され、核酸抽出手順の公開設定情報は、試料タイプおよび核酸抽出手順を含み、いずれも編集許可情報に設定され、核酸増幅手順の公開設定情報は、手順セグメント分布情報および手順セグメントの具体的な設定情報を含み、いずれも編集許可情報に設定され、他の設定アイテムの公開設定情報も実際の需要に応じて設定されるが、本願の重点内容ではないので、ここではその説明を省略する。
また、項目編集領域においてオープン型検出項目に対応する設定ページを表示する実施方式は、上記のクローズド型検出項目と同様であるので、ここではその説明を省略する。前述したように、Tabsタブページを採用し、図5に示すように、モード選択コントロール501においてオープン型オプションを選択した場合、項目リスト領域502において、既に作成した全てのオープン型核酸検出項目を表示し、ユーザがそのうちの「(オープン)COVID」というオープン型核酸検出項目を選択すると、項目編集領域503において、項目基本情報、試薬組成、検出目標、結果判定、核酸抽出手順、核酸増幅手順および品質管理設定という7つの設定アイテムにそれぞれ対応するタブオプションを表示し、そして、制御ソフトウェアは、項目基本情報に対応するタブオプション5031をデフォルトで選択するので、項目編集領域において、当該オープン型核酸検出項目の項目基本情報の設定ページ5032をデフォルトで表示し、その後、ユーザが核酸抽出手順に対応するタブオプション5033に変更して選択すると、項目編集領域において、当該オープン型核酸検出項目の核酸抽出手順の設定ページ5034に切り替えて表示する。
総括して言えば、本実施例では、クローズド型とオープン型との2種類の情報入力モードを同時に支持でき、オープン型では、項目設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて目標検出項目を作成して設定し、ユーザが項目設定インターフェースにおいて関連の項目設定情報の入力および閲覧を行い、クローズド型では、コードスキャン方式で目標検出項目を作成して設定し、さらにユーザが項目設定インターフェースにおいて少量の項目設定情報の閲覧および編集を行うようになっている。これにより、異なるシーンでの項目設定の需要を柔軟に満足することができ、自己研究・生産のシーンに対して、項目設定を効率よく、容易かつ安全に行うことができ、サードパーティメーカーのシーンに対しても、互換性がよく、項目設定情報を柔軟に入力することができる。
1つの実施例では、本願に係る検出項目の設定方法は、手順設定インターフェースでのユーザの手順情報入力操作に基づいて、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶する第1項と、手順図形コード情報を解析して、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶する第2項とのうちの少なくとも1つを含んでもよい。
前述したように、目標第1実験手順自体に対して手順設定を行って、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶する必要がある。目標検出項目の設定と同様に、手順設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて目標第1実験手順を作成して設定してもよいし、コードスキャン方式で目標第1実験手順を作成して設定してもよいし、またはこの2つの方式を同時に支持できてもよい。
1つの実施例では、手順設定インターフェースでのユーザの手順情報入力操作に基づいて、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶する。
そのうち、手順設定インターフェースは、第1実験手順の設定を実現するためのソフトウェアインタラクションインターフェースであり、項目設定インターフェースと同様に、手順設定インターフェースは、シングルページまたはマルチページなどの実施方式を採用し、具体的には、例えばTabsタグページを採用することができる。手順情報入力操作は、手順設定インターフェースにおいて目標第1実験手順に対して手順設定情報を入力する操作であり、具体的には、例えばユーザがテキストコントロールに手順設定情報を記入したり、ユーザがプルダウンボックスにおいて選択したり、この2つの方式を組み合わせたりするなどで実施することができる。第1実験手順の手順設定情報は、手順基本情報および実験ステップ情報を含み、手順基本情報は、第1実験手順の基本状況を記述するためのものであり、少なくとも第1実験手順に関連付けられる試料タイプを含み、通常、手順名称などをさらに含んでいる。実験ステップ情報は、対応する実験段階の実験操作方式を指示するためのものであり、例えば、核酸検出項目に対して、その核酸抽出手順の実験操作情報が移液ステップ情報と抽出ステップ情報とを含む。
手順設定インターフェースがTabsタブページを採用することを例として説明する。目標第1実験手順の手順設定を行う場合、手順設定インターフェースには、目標第1実験手順の複数の設定アイテムにそれぞれ対応する複数のタブオプションが含まれ、そのうちのいずれかのタブオプションを選択すると、手順基本情報および実験ステップのような設定アイテムに対応するタブオプションを含む対応する設定アイテムの設定ページを表示し、手順基本情報に対応するタブオプションを選択すると、手順基本情報の設定ページを対応的に表示し、実験ステップに対応するタブオプションを選択すると、実験ステップの設定ページを対応的に表示して、ユーザが関連の設定情報を入力することにより、目標第1実験手順自体に対する手順設定を実現する。
本実施例では、手順設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて目標第1実験手順の手順設定を実現し、ユーザが手順設定情報を柔軟に入力することを支持でき、サードパーティメーカーの手順設定に対する互換性が高く、かつ操作が容易となる。
別の実施例では、手順図形コード情報を解析することにより、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶する。
そのうち、手順図形コードは、目標第1実験手順を設定するための図形コードであり、項目図形コードと同様に、手順図形コードと目標第1実験手順とは一対一で対応する関係であり、具体的には、2次元コードまたはバーコードなどであってもよい。同様に、本実施例では、目標第1実験手順の手順設定情報も手順基本情報および実験ステップ情報を含み、コードスキャン装置も上記の説明と同様であるので、その説明を省略する。
具体的には、ユーザがコードスキャン装置を用いて手順図形コードをスキャンすると、制御端末は、手順図形コード情報を獲得し、かつ予め設定された復号手順に従って手順図形コード情報を解析することにより、目標第1実験手順の手順設定情報を獲得して記憶する。当該方式は、ユーザが大量の情報を手動で記入する必要がなく、手順設定情報の入力を効率よくかつ容易に完了することができ、そして、手順設定情報が図形コードに予めパッケージングされ、情報内容が外部に開示されないので、情報の秘匿に有利である。
また別の実施例では、制御ソフトウェアは、上記の2つの方式を同時に支持でき、ユーザは、手順設定インターフェースにおいて手順情報入力操作を行ってもよいし、コードスキャン装置を用いて手順図形コードをスキャンしてもよく、制御ソフトウェアは、手順情報入力操作を検出すると、当該操作に基づいて目標第1実験手順の手順設定情報を取得し、手順図形コード情報を獲得すると、それを解析して目標第1実験手順の手順設定情報を獲得し、異なるシーンの需要を柔軟に満足することができる。
1つの実施例では、本願に係る検出項目の設定方法は、検出待ち試料と候補検出項目が表示される試料登録インターフェースを表示するステップと、試料登録インターフェースでの試料選択操作に基づいて、検出待ち試料から登録待ち試料を確定するステップと、試料登録インターフェースでの項目選択操作に基づいて、候補検出項目から検出待ち項目を確定するステップと、登録トリガー操作に応答して、登録待ち試料に対して検出待ち項目を登録するステップと、をさらに含んでもよい。
試料登録インターフェースは、試料登録機能を実現するためのソフトウェアインタラクションページである。試料分析の過程において、目標検出項目を作成して設定した後、検出待ち試料に対する検出待ち項目の登録を含む試料登録を行う必要があり、本実施例では、試料登録インターフェースを介して試料登録を実現することができる。
具体的には、試料登録インターフェースに検出待ち試料が表示され、検出待ち試料は、試料分析機器に入れた目標実体試料と一対一で対応しており、目標実体試料は、試料分析機器に入れた実験検出を必要とする実体試料である。例を挙げて説明すると、検査科では、N個の実体試料に対して実験検出を行う必要があり、ユーザは、当該N個の実体試料を試料分析機器に入れ、当該N個の実体試料は、目標実体試料であってもよく、制御ソフトウェアは、ユーザが試料登録に関する操作を行うように、当該N個の目標実体試料と一対一で対応するN個の検出待ち試料を試料登録インターフェースに表示する。また、検出待ち試料は、具体的にはインターフェース要素であってもよく、例えば、試料登録インターフェースに試料アイコンが表示され、各試料アイコンがそれぞれ1つの検出待ち試料を表し、または試料登録インターフェースに試料リストが表示され、試料リストにおける各エントリがそれぞれ1つの検出待ち試料を表すなどとすることができる。
そして、試料登録インターフェースには、候補検出項目がさらに表示され、候補検出項目は、上記のクローズド型検出項目とオープン型検出項目とを含めて制御ソフトウェアに既に作成した全ての検出項目を含み、すなわち、制御ソフトウェアに既に作成した検出項目であれば、ユーザが試料登録を行う時に使用するように試料登録インターフェースに表示される。
試料選択操作は、試料登録インターフェースに表示される検出待ち試料から登録待ち試料を選択する操作であり、登録待ち試料は、現在では試料登録を行う必要がある検出待ち試料である。具体的には、ユーザが1回で1つの検出待ち試料のみを選択して単独で登録する単一選択操作であってもよいし、ユーザが1回で複数の検出待ち試料を選択して一括で登録する複数選択操作であってもよい。具体的な実施にあっては、試料選択操作は、検出待ち試料に対するクリック操作、または各検出待ち試料のそれぞれに対して設定されたチェックボックスに対するチェック操作、または検出待ち試料に対するフレーム選択操作などであってもよい。
項目選択操作は、登録待ち試料に対して検出待ち項目を選択する操作である。同様に、ユーザが1回で登録待ち試料に対して1つの検出待ち項目のみを選択して登録する単一選択操作であってもよいし、ユーザが1回で登録待ち試料に対して複数の検出待ち項目を選択して登録する複数選択操作であってもよい。同様に、具体的には、クリック、チェック、フレーム選択などの任意の適用可能な操作方式を採用することができる。
本実施例では、制御ソフトウェアは、検出待ち試料と候補検出項目とが羅列して表示される試料登録インターフェースを表示し、ユーザは、当該インターフェースにおいて試料選択操作を行って、1つまたは複数の検出待ち試料を登録待ち試料として選択するとともに、項目選択操作を行って候補検出項目から1つまたは複数の検出項目を検出待ち項目として選択し、さらに、ユーザが登録トリガー操作を行った後、制御ソフトウェアは、登録待ち試料に対して検出待ち項目を登録する。また、ユーザは、実際の需要に応じて上記の操作を繰り返して、複数の検出待ち試料に対して試料登録を行い、その後、試料登録が完了した検出待ち試料に対して対応する実験検出を行うことができる。
なお、試料登録は、検出待ち試料に対して検出待ち項目を登録する以外に、他の登録事項、例えば検出待ち試料に対して試料情報を入力することを含んでもよく、試料情報は、具体的に実際の需要に応じて設定されてもよく、例えば試料番号および試料タイプなどを含む。次に、試料登録インターフェースの表示をトリガーさせる方式は、例えばユーザが試料登録ボタンをクリックしてトリガーさせるか、またはユーザが予め設定されたジェスチャー操作を行ってトリガーさせるなどの複数種類が存在してもよい。また、試料登録インターフェースは、試料登録機能を実現できればよく、任意の適用可能なページ設計案を採用することができる。
1つの実施例では、本願に係る検出項目の設定方法は、実験開始操作に応答して、検出待ち試料の試料タイプおよび検出待ち項目に基づいて、検出待ち試料に対して実験バッチを区分けするステップと、各実験バッチに対して、当該実験バッチの試料タイプ、および当該実験バッチの検出待ち項目の手順マッピング関係と第2実験手順の手順設定情報に基づいて、当該実験バッチにおける検出待ち試料に対応する目標実体試料に対して対応する実験操作を行うように試料分析機器を制御するステップと、をさらに含んでもよい。
実験開始操作は、実験検出をトリガーさせる操作である。試料分析過程において、試料登録を完了した後に実験検出を開始することができ、例えば、ユーザが実験開始ボタンをクリックすることにより、対応する実験操作の実行を開始するように試料分析機器をトリガーさせることができる。
本実施例では、制御ソフトウェアは、実験開始操作を検出した後、検出待ち試料に対して実験バッチを区分けし、具体的には、検出待ち試料の試料タイプおよび登録された検出待ち項目に基づいて区分けすることができる。その後、各実験バッチに対してそれぞれ対応する実験検出を行い、各実験バッチに対して、当該実験バッチの試料タイプと当該実験バッチの検出待ち項目の手順マッピング関係および第2実験手順の手順設定情報に基づいて、当該実験バッチにおける検出待ち試料に対応する目標実体試料に対して対応する実験操作を行うように試料分析機器を制御し、具体的には、当該実験バッチの試料タイプおよび当該実験バッチの検出待ち項目の手順マッピング関係に基づいて当該実験バッチに対応する第1実験手順を確定し、かつデータベースから当該第1実験手順の手順設定情報を取得するとともに、当該実験バッチの検出待ち項目の第2実験手順の手順設定情報を取得し、さらに、当該第1実験手順の手順設定情報および当該第2実験手順の手順設定情報に基づいて、当該実験バッチにおける検出待ち試料に対応する目標実体試料に対して対応する実験操作を行うように試料分析機器を制御するようにしてもよい。
実験バッチの区分けの具体的な方式について、1つの実施形態では、同一の実験バッチに区分けされる検出待ち試料は、同一の試料タイプおよび検出待ち項目を有するようにしてもよい。
別の実施形態では、同一の実験バッチに区分けされる検出待ち試料は、同一の第1実験手順に対応するとともに同一の検出待ち項目を有してもよく、すなわち、同一の実験バッチにおける検出待ち試料は、各試料タイプがいずれも同一の第1実験手順に対応すればよく、異なる試料タイプであってもよい。例えば、5つの検出待ち試料があり、いずれも同一の検出待ち項目が登録されているが、5つの検出待ち試料は、3つの異なる試料タイプであり、そのうちの2つの検出待ち試料S1とS2が第1の試料タイプであり、2つの検出待ち試料S3とS4が第2の試料タイプであり、検出待ち試料S5が第3の試料タイプであり、手順マッピング関係において、第1の試料タイプおよび第2の試料タイプはいずれも同一の第1実験手順に対応し、第3の試料タイプは別の異なる第1実験手順に対応すると、実験バッチを区分けする場合、検出待ち試料S1-S4を同一の実験バッチに区分けし、検出待ち試料S5を別の実験バッチに区分けするようにしてもよい。
これに対して、発明者は、従来技術において、同一種類の検出項目に対して複数の検出項目を作成して設定し、かつ制御端末が試料分析機器を制御して実験検出を行う必要があり、バッチ毎に実験検出を行う場合、1つの実験バッチにおいて1つの検出項目のみを設定し、複数の検出待ち試料に対して、同一種類の検出項目を行っても、試料タイプが異なると異なる検出項目が登録され、さらに異なる実験バッチに区分けされてそれぞれ検出を行うようになっており、例えば、前述したように、10個の検出待ち試料のそれぞれに対して新型コロナウイルス核酸検出項目を行い、そのうちの3つが咽頭拭い液であり、3つが血清であり、4つが糞便であり、それぞれP1、P2、P3の3つの新型コロナウイルス核酸検出項目が登録され、さらに3つの実験バッチに区分けされることを発見した。このように、実験バッチが増加し、さらに実験検出に掛かる時間の延長、実験試薬および消耗品などの資源の浪費が発生した。しかしながら、本願では、1つの検出項目に対して、異なる試料タイプに対応する第1実験手順を設定し、かつ同一の実験バッチにおける検出待ち試料は、同一の第1実験手順に対応するとともに同一の検出待ち項目を有するため、より多くの検出待ち試料を同一の実験バッチに区分けして実験検出を行うことができ、実験バッチを減少させ、実験時間を節約させるとともに実験資源の浪費を減少させた。
なお、試料分析過程において、制御ソフトウェアは、色々な情報を統合して試料分析機器を制御して実験操作を行うようになっている。以上では、検出待ち項目の第1実験手順および第2実験手順に関する部分のみを説明したが、品質管理、試薬などの他の部分は、本願の重点ではなく、本分野における任意の適用方式で実現することができるので、ここではその説明を省略する。
以下、明確かつ直感的に理解できるように、1つの具体的な適用例を参照しながら本願の主要な内容を説明する。
本実施例では、核酸検出分野に適用され、10個の試料に対して新型コロナウイルス核酸検出を行い、そのうち、3つが咽頭拭い液であり、3つが血清であり、4つが糞便であり、この3つの試料タイプは、それぞれ核酸抽出手順TQ1、TQ2およびTQ3に対応し、かつ新型コロナウイルス核酸検出項目は、核酸増幅手順KZに対応する。
具体的には、適用環境は、制御端末およびPCR複合機を含み、制御端末に制御ソフトウェアがインストールされている。制御ソフトウェアには、試料モジュール、結果モジュール、試薬モジュール、品質管理モジュール、キャリブレーションモジュール、設定モジュールなどの主な機能モジュールが設けられている。制御ソフトウェアのインターフェースは、図6に示すように、その左側に案内領域601が設けられ、頂部に実験制御領域602が設けられ、中間に機能領域603が設けられ、そのうち、案内領域601には、試料(6012)、結果、試薬、品質管理、キャリブレーション、設定(6011)およびホームページなどの機能ボタンが設けられ、いずれかの機能ボタンをクリックすると、機能領域603に対応する機能インターフェースが表示され、実験制御領域602には、実験の開始(6021)、一時停止試料添加およびシャットダウンなどの機能ボタンが設けられ、いずれかの機能ボタンをクリックすると、PCR複合機を対応する作動状態に移行させるように制御する。
上記の10個の試料に対して新型コロナウイルス核酸検出を行うことは、主に核酸抽出手順の手順設定、新型コロナウイルス核酸検出項目の設定、試料の登録、および実験検出の制御という4つの方面に関する内容に関わっており、以下ではそれぞれ説明する。
1.核酸抽出手順の手順設定
まず、TQ1、TQ2およびTQ3という3つの核酸抽出手順のそれぞれに対して手順設定を行い、これら3つの核酸抽出手順の手順設定情報を取得して記憶する必要がある。
ユーザが案内領域601における設定ボタン6011をクリックして、機能領域603にソフトウェア設定インターフェースを表示し、ユーザが当該インターフェースにおける抽出手順設定ボタンをクリックして、図7の上図に示すように、制御ソフトウェアは、手順設定インターフェースを表示し、手順設定インターフェースは、モードプルダウンボックス701と、手順リスト領域702と、手順編集領域703とを含む。制御ソフトウェアは、クローズド型およびオープン型の2つの情報入力モードを支持でき、モードプルダウンボックス701においてクローズド型オプションを選択した場合、手順リスト領域702において、手順二次元コードによって作成された全ての核酸抽出手順(以下、クローズド型核酸抽出手順と称される)をリスト形式で集中的に表示し、そして、手順リスト領域702において具体的な核酸抽出手順を選択し、さらに手順編集領域703において関連内容を閲覧することができる。モードプルダウンボックス701においてオープン型オプションを選択した場合、手順リスト領域702には、手順設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて作成された全ての核酸抽出手順(以下、オープン型核酸抽出手順と称される)をリスト形式で集中的に表示し、そして、手順リスト領域702において具体的な核酸抽出手順を選択し、さらに手順編集領域703において関連内容を閲覧および編集することができる。
以下、クローズド型およびオープン型を採用して制御ソフトウェアにおいてTQ1、TQ2およびTQ3という3つの核酸抽出手順を作成して設定する過程をそれぞれ説明する。
1)クローズド型を採用する場合
ユーザは、コードスキャンガンを用いて核酸抽出手順TQ1に対応する手順二次元コードをスキャンし、制御ソフトウェアは、手順二次元コード情報を解析して核酸抽出手順TQ1の手順設定情報を得られ、具体的には、核酸抽出手順TQ1の手順基本情報、移液ステップおよび抽出ステップという3つの設定アイテムに関する設定情報を含み、そのうち、手順基本情報は、手順名称、試料タイプおよび試料添加量を含み、移液ステップは、試薬組成および添加量を含み、抽出ステップは、ステップ分布情報および各ステップのパラメータ設定情報(例えば、熱分解、磁気吸引ビーズ、結合、洗浄I、洗浄IIなどのステップの時間、回転速度、温度などのパラメータ)を含む。さらに、制御ソフトウェアは、核酸抽出手順TQ1を作成して設定するように、核酸抽出手順TQ1の手順識別子と上記手順設定情報とを関連付けて記憶する。その後、上記の手順を繰り返して、核酸抽出手順TQ2およびTQ3を作成して設定する。
そして、図7の下図に示すように、手順設定インターフェースにおけるモードプルダウンボックス701がクローズド型オプションに対応する場合、当該インターフェースの手順リスト領域702には、核酸抽出手順TQ1、TQ2およびTQ3がリスト形式で表示される。また、ユーザが手順リスト領域702においてクローズド型核酸抽出手順TQ1を選択すると、手順編集領域703において、移液ステップおよび抽出ステップの設定ページを表示せずに、手順基本情報の設定ページを表示し、かつ、手順基本情報の設定ページにおいて、核酸抽出手順TQ1の手順名称、試料タイプおよび試料添加量を具体的に表示し、これらの公開設定情報は、いずれも編集を許可せず、ユーザによる閲覧のみを許可する。なお、手順リスト領域702には、既に作成された全てのクローズド型核酸抽出手順が表示され、TQ1~TQ3の以外に、他のクローズド型核酸抽出手順も作成されていると併せて表示され、そして、ユーザによる手順リスト領域702におけるいずれか1つの核酸抽出手順のクリックは、TQ1に対するクリックと類似するので、ここではその説明を省略する。
2)オープン型を採用する場合
制御ソフトウェアにおいて、オープン型抽出手順の公開設定アイテムが手順基本情報、移液ステップおよび抽出ステップという3つの設定アイテムを含むように予め設定され、かつ、必要に応じて、例えば手順基本情報の公開設定情報が手順名称、試料タイプおよび試料添加量を含み、移液ステップの公開設定情報が試薬組成および添加量などを含むように各公開設定アイテムの公開設定情報が予め設定され、かつ、いずれも内容の編集を許可するように設定されている。
これに基づいて、図8の上図に示すように、制御ソフトウェアは、手順設定インターフェースを表示し、ユーザが当該インターフェースにおけるモードプルダウンボックス801においてオープン型オプションを選択すると、当該インターフェースにおける手順リスト領域802において全てのオープン型核酸抽出手順をリスト形式で集中的に表示する(図8の上図は、制御ソフトウェアにおいてオープン型核酸抽出手順がまだ作成されていない場合に対応するので、手順リスト領域802は空白である)。手順編集領域803において、手順基本情報、移液ステップおよび抽出ステップという3つの公開設定アイテムにそれぞれ対応する3つのタブオプションを表示し、3つのタブオプションは、3つの公開設定アイテムの設定ページにそれぞれ対応し、手順編集領域803において、選択されたタブオプションに対応する公開設定アイテムの設定ページを表示し、具体的には、制御ソフトウェアは、手順基本情報に対応するタブオプションをデフォルトで選択し、これにより、ユーザは、モードプルダウンボックス801においてオープン型オプションを選択し、手順編集領域803において手順基本情報の設定ページを直接的に表示し、その後、ユーザは、移液ステップに対応するタブオプションに変更して選択し、手順編集領域803において移液ステップの設定ページに切り替えて表示する。
手順基本情報の設定ページに新規追加ボタンが設けられ、ユーザが当該新規追加ボタンをクリックすると、制御ソフトウェアは、当該設定ページにおける手順名称欄に新規作成しようとする核酸抽出手順の手順名称を自動的に入力し(例えば、「20231213100907」という一連のコードを自動的に記入するが、ユーザが自分で修正することを許可し、図8の下図に示すように、ユーザがTQ1に修正する)、さらに、ユーザが当該設定ページにおいて核酸抽出手順TQ1の試料タイプおよび試料添加量を手動で入力した後、当該設定ページにおける保存ボタンをクリックすると、制御ソフトウェアは、核酸抽出手順TQ1を作成して手順基本情報という設定アイテムを設定するように、核酸抽出手順TQ1の手順識別子を上記の入力した手順設定情報と関連付けて記憶し、そして、ユーザが保存ボタンをクリックすると、図8の下図に示すように、手順リスト領域801において核酸抽出手順TQ1を追加表示し、かつそれを自動的に選択する。
さらに、ユーザが手順編集領域803において移液ステップに対応するタグオプションを選択すると、制御ソフトウェアは、移液ステップの設定ページを表示し、ユーザが当該設定ページにおいて核酸抽出手順TQ1の移液ステップに関する設定情報を手動で入力すると、制御ソフトウェアは、核酸抽出手順TQ1に対して移液ステップという設定アイテムを設定するように、ユーザが入力した情報を核酸抽出手順TQ1の手順識別子と関連付けて記憶し、そして、ユーザが抽出ステップという設定アイテムに対応するタグオプションをクリックすると、制御ソフトウェアは、抽出ステップの設定ページを表示し、ユーザが当該設定ページにおいて抽出ステップに関する設定情報を手動で入力すると、制御ソフトウェアは、核酸抽出手順TQ1に対して抽出ステップという設定アイテムを設定するようにユーザが入力した情報を核酸抽出手順TQ1の手順識別子と関連付けて記憶し、これまで、制御ソフトウェアは、TQ1というオープン型核酸抽出手順の作成および設定を完了した。
その後、上記の手順を繰り返して、核酸抽出手順TQ2およびTQ3(図示せず)の作成および設定を行う。
2.核酸検出項目の設定
核酸抽出手順TQ1、TQ2およびTQ3を作成して設定した後、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDを作成して設定する。
ユーザが図6に示すソフトウェア設定インターフェースにおいてPCR項目設定ボタンをクリックすると、図9の上図に示すように、制御ソフトウェアは、モードプルダウンボックス901と、項目リスト領域902と、項目編集領域903とを含む項目設定インターフェースを表示する。同様に、制御ソフトウェアは、クローズド型およびオープン型の2つの情報入力モードを支持でき、モードプルダウンボックス901においてクローズド型オプションを選択した場合、項目リスト領域902において項目二次元コードによって作成された全ての核酸検出項目(以下、クローズド型核酸検出項目と称される)をリスト形式で集中的に表示し、項目リスト領域902において具体的なクローズド型核酸検出項目を選択し、さらに項目編集領域903において関連内容を閲覧および編集することができる。モードプルダウンボックス901においてオープン型オプションを選択した場合、項目リスト領域902において項目設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて作成された全ての核酸検出項目(以下、オープン型核酸検出項目と称される)をリスト形式で集中的に表示し、項目リスト領域902から具体的なオープン型核酸検出項目を選択し、さらに項目編集領域903において関連内容を閲覧および編集することができる。(なお、図9の上図は、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDを作成する前に、制御ソフトウェアが「HPV(クローズド)」、「HBV(クローズド)」という2つのクローズド型核酸検出項目のみを作成したと想定した場合を示しているため、項目リスト領域902にはこの2つのみが表示される。)
以下では、クローズド型およびオープン型を採用して制御ソフトウェアにおいて新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDを作成して設定する過程をそれぞれ説明する。
1)クローズド型を採用する場合
ユーザは、コードスキャンガンを使用して新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDに対応する項目二次元コードをスキャンし、制御ソフトウェアは、項目二次元コード情報を解析して新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目設定情報を得られ、具体的には、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目基本情報、試薬組成、検出目標、結果判定、核酸抽出手順、核酸増幅手順、品質管理設定という7つの設定アイテムに関する設定情報を含み、さらに、制御ソフトウェアは、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目識別子を上記の項目設定情報と関連付けて記憶し、これまで、この新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの作成および設定が完了した。
そのうち、項目基本情報について、項目二次元コードを解析して新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目略称、項目名称、項目タイプ、項目番号、LISチャンネル番号、繰り返し回数、結果単位、表示順序、核酸添加量および外因性内部標準を具体的に獲得する。核酸抽出手順について、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの手順マッピング関係、すなわち咽頭拭い液、血清および糞便という3つの試料タイプとTQ1、TQ2およびTQ3という3つの核酸抽出手順との間の一対一のマッピング関係を獲得する。核酸増幅手順について、核酸増幅手順KZの手順設定情報を獲得し、具体的には、前述した手順セグメント分布情報および手順セグメントの具体的な設定情報などを含んでもよい。試薬組成、検出目標、結果判定、品質管理設定という4つの設定アイテムについて、本願の重点内容ではなく、関連の設定情報が本分野の常軌要求を満足できればよいので、ここではその説明を省略する。
さらに、項目設定インターフェースにおけるモードプルダウンボックス901がクローズド型オプションに対応する場合、図9の下図に示すように、当該インターフェースの項目リスト領域902において、HPV(クローズド)、HBV(クローズド)および新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDを含めて既に作成された全てのクローズド型核酸検出項目をリスト形式で表示する。
そして、ユーザが項目リストエリア902において新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDを選択すると、項目編集エリア903において、項目基本情報および品質管理設定という2つの設定アイテムにそれぞれ対応するタブオプション9031と9032を表示し、2つのタブオプションは、項目基本情報の設定ページおよび品質管理設定の設定ページにそれぞれ対応し、項目編集領域903において、選択したタブオプションに対応する公開設定アイテムの設定ページを表示する。具体的には、制御ソフトウェアは、項目基本情報に対応するタグオプション9031をデフォルトで選択し、これにより、項目編集領域903において、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目基本情報の設定ページをデフォルトで表示し、その後、ユーザは、品質管理設定に対応するタグオプション9032に変更して選択し、項目編集領域903において、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの品質管理設定の設定ページに切り替えて表示する。また、具体的には、設定ページに表示される情報のうちの一部の情報、例えば項目基本情報における項目略称、項目名称、項目タイプおよび項目番号は、編集が許可されず、ユーザによる閲覧のみが許可されるものであり、他部の情報、例えば項目基本情報におけるLISチャンネル番号、繰り返し回数、結果単位、表示順序および品質管理設定における各バッチの実験に必要な品質管理タイプは、ユーザによる閲覧も編集も許可されるものである。
2)オープン型を採用する場合
制御ソフトウェアにおいて、オープン型核酸検出項目の公開設定アイテムが項目基本情報、試薬組成、検出目標、結果判定、核酸抽出手順、核酸増幅手順、品質管理設定という7つの設定アイテムを含み、そのうち、項目基本情報の公開設定情報が項目略称、項目名称、項目タイプ、項目番号、LISチャンネル番号、繰り返し回数、結果単位、表示順序、核酸添加量および外因性内部標準を含み、核酸抽出手順の公開設定情報が手順マッピング関係、すなわち試料タイプと核酸抽出手順との間のマッピング関係を含み、核酸増幅手順の公開設定情報が手順セグメント分布情報および手順セグメントの具体的な設定情報を含むように予め設定され、かついずれも内容の編集が許可されるように設定され、試薬組成、検出目標、結果判定、品質管理設定という4つの設定アイテムは、本願の重点内容ではなく、その公開設定情報が本分野の常軌要求を満足できればよいので、ここではその説明を省略する。
これに基づいて、図10の上図に示すように、制御ソフトウェアは、項目設定インターフェースを表示し、ユーザが当該インターフェースにおけるモードプルダウンボックス1001においてオープン型オプションを選択すると、項目リスト領域1002において既に作成された全てのオープン型核酸抽出項目をリスト形式で集中的に表示する(図10の上図は、制御ソフトウェアにおいてオープン型核酸検出項目がまだ作成されていない場合に対応するので、項目リスト領域1002は空白である)。項目編集領域1003には、上記の7つの公開設定アイテムにそれぞれ対応する7つのタブオプションが表示され、7つのタブオプションは、7つの公開設定アイテムの設定ページにそれぞれ対応し、項目編集領域1003には、選択されたタブオプションに対応する公開設定アイテムの設定ページが表示され、具体的には、制御ソフトウェアは、項目基本情報に対応するタブオプションをデフォルトで選択し、これにより、ユーザがモードプルダウンボックス1001においてオープン型オプションを選択すると、項目編集領域1003において項目基本情報の設定ページを直接的に表示し、その後、ユーザは、核酸抽出手順に対応するタブオプションに変更して選択し、項目編集領域1003は、核酸抽出手順の設定ページに切り替えて表示する。
項目基本情報の設定ページに新規追加ボタンが設けられ、ユーザが当該新規追加ボタンをクリックし、さらに当該設定ページにおいて具体的に項目略称、項目名称、項目タイプなどを含む新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目基本情報を手動で入力して保存ボタンをクリックすると、制御ソフトウェアは、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDを作成して項目基本情報という設定アイテムを設定するように、上記の入力した項目基本情報を新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目識別子と関連付けて記憶し、そして、ユーザが保存ボタンをクリックした後、図10の下図に示すように、項目リスト領域1002において新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDを追加表示するとともにそれを自動的に選択する。
さらに、ユーザが項目編集領域1003において核酸抽出手順に対応するタグオプションを選択すると、制御ソフトウェアは、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの核酸抽出手順の設定ページを表示し、ユーザは、当該インターフェースにおいて関連操作を行って、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDに対して試料タイプおよび核酸抽出手順を入力する。
具体的には、前述した図3に対応する例で示すように、ユーザが当該設定ページにおける新規追加ボタンをクリックすると、制御ソフトウェアは、試料タイププルダウンボックスおよび核酸抽出手順プルダウンボックスを含む抽出手順ポップアップボックスを表示し、ユーザが試料タイププルダウンボックスにおいて咽頭拭い液試料タイプを選択すると、制御ソフトウェアは、対応するタイプ識別子を獲得し、かつ当該タイプ識別子と予め記憶された複数の核酸抽出手順の手順設定情報とに基づいて咽頭拭い液試料タイプに関連付けられる核酸抽出手順を確定し、仮に、TQ1、TQ2、TQ3の3つの核酸抽出手順の手順設定情報のみが予め記憶されていると、核酸抽出手順TQ1を咽頭拭い液試料タイプに関連付けられる核酸抽出手順として確定し、核酸抽出手順プルダウンボックスにおいて核酸抽出手順TQ1のみを表示し、ユーザが核酸抽出手順TQ1を選択すると、制御ソフトウェアは、核酸抽出手順TQ1の手順識別子を獲得し、ユーザがポップアップボックスにおける保存ボタンをクリックすると、制御ソフトウェアは、咽頭拭い液試料タイプのタイプ識別子を核酸抽出手順TQ1の手順識別子と関連付けて記憶して、両者のマッピング関係を得られ、すなわち、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDに対して咽頭拭い液試料タイプを入力するとともに対応する核酸抽出手順TQ1を確定した。その後、上記の操作を繰り返して、引き続き新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDに対して血清および糞便の2つの試料タイプを入力するとともに対応する核酸抽出手順TQ2とTQ3を確定し、これまで、制御ソフトウェアは、3つの試料タイプと3つの核酸抽出手順との間の一対一のマッピング関係、すなわち新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの手順マッピング関係を獲得した。
そして、ユーザが項目編集領域1003において核酸増幅手順に対応するタグオプションを選択すると、制御ソフトウェアは、核酸増幅手順の設定ページを表示し、ユーザが当該設定ページにおいて核酸増幅手順の手順設定情報を手動で入力して、保存ボタンをクリックすると、制御ソフトウェアは、ユーザが入力した手順基本情報を新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目識別子と関連付けて記憶して、当該項目に対して核酸増幅手順を設定する。
また、ユーザが試薬組成、検出目標、結果判定および品質管理設定に対応するタグオプションをそれぞれ選択すると、制御ソフトウェアは、対応する設定ページをそれぞれ表示し、ユーザは、設定ページにおいて新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDに対応する設定情報を手動で入力し、制御ソフトウェアは、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDに対して対応する設定アイテムを設定するが、これらの設定アイテムは、本願の重点内容ではなく、いかなる適用方式で実現すればよいので、ここではその説明を省略する。
これまで、制御ソフトウェアは、当該新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの作成および設定を完了した。
3.試料登録
新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDを作成して設定した後、上記10個の試料に対して試料登録を行うことにより、試料情報を入力するとともに検出待ち項目を登録する。
具体的には、ユーザが10個の試料をPCR複合機の試料室に入れ、さらに図6に示す案内領域601において試料ボタン6012をクリックすると、制御ソフトウェアは、試料登録インターフェース(図示せず)を表示する。試料登録インターフェースには、上記10個の試料と一対一で対応する10個の検出待ち試料が表示され、ユーザは、試料登録インターフェースにおいて、この10個の検出待ち試料に対して試料情報をそれぞれ入力し、例えば、試料タイプを入力し、具体的には、そのうちの3つの検出待ち試料に対して入力した試料タイプは、咽頭拭い液であり、他の3つは、血清であり、残りの4つは、糞便である。さらに、ユーザが当該10個の検出待ち試料にチェックを入れて、試料登録インターフェースにおける項目登録ボタンをクリックすると、制御ソフトウェアは、項目登録ポップアップボックスを表示し、ポップアップボックスには、新型コロナウイルス検出項目COVIDを含む制御ソフトウェアに既に作成された全ての検出項目が表示され、ユーザが新型コロナウイルス検出項目COVIDを選択して確定ボタンをクリックすると、制御ソフトウェアは、当該10個の検出待ち試料の試料識別子を新型コロナウイルス検出項目COVIDの項目識別子とバインディングし、すなわち、当該10個の検出待ち試料に対して新型コロナウイルス検出項目COVIDを登録する。
4.実験検出
試料登録が完了した後、ユーザが図6に示す実験制御領域602において実験開始ボタン6021をクリックすると、制御ソフトウェアは、関連の実験操作を実行するようにPCR複合機を制御することができる。
具体的には、制御ソフトウェアは、検出待ち試料に対して試験バッチを区分けし、同一の試験バッチに区分けされる検出待ち試料は、同一の試料タイプおよび検出待ち項目を有し、10個の検出待ち試料は、いずれも新型コロナウイルス検出項目COVIDを登録したため、3つの試料タイプに対応して3つの試験バッチに区分けされる。さらに、制御ソフトウェアは、実験バッチ毎に対応する実験操作を行うようにPCR複合機を制御して、3つの咽頭拭い液検出待ち試料が属する実験バッチを例として、制御ソフトウェアは、咽頭拭い液試料タイプのタイプ識別子と新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目設定情報とに基づいて、対応する実験操作方式で抽出プレートの設定、増幅プレートの設定、試料の添加、核酸の抽出、核酸の転移、核酸の増幅などの操作を行うようにPCR複合機を制御し、これにより、PCR複合機は、当該3つの検出待ち試料の実験検出データを獲得して制御ソフトウェアに送信する。
なお、核酸抽出部分に対して、制御ソフトウェアは、咽頭拭い液試料タイプのタイプ識別子および新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目識別子に基づいて、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの手順マッピング関係から核酸抽出手順TQ1の手順識別子を検索し、かつ当該手順識別子に基づいて核酸抽出手順TQ1の手順設定情報を検索し、その後、制御ソフトウェアは、当該手順設定情報が指示する実験操作方式に従って核酸抽出処理を行うようにPCR複合機を制御する。核酸増幅部分に対して、制御ソフトウェアは、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの項目識別子に基づいて、新型コロナウイルス核酸検出項目COVIDの核酸増幅手順の手順設定情報を検索し、その後、当該手順設定情報が指示する実験操作方式に従って核酸増幅処理を行うようにPCR複合機を制御する。また、前述したように、制御ソフトウェアが1つの実験バッチに対して全ての実験操作を完成するようにPCR複合機を制御することは、例えば品質管理処理、キャリブレーション処理などの非常に多くの内容に関わっているが、本願の重点ではなく、本分野における任意の適用方式で実現することができるので、ここではその説明を省略する。
その後、制御ソフトウェアは、3つの血清検出待ち試料および4つの糞便検出待ち試料がそれぞれ属する実験バッチに対して、類似する方式に従って、対応する実験操作を実行するようにPCR複合機を制御することにより、これら7つの検出待ち試料の実験検出データを獲得して制御ソフトウェアに送信し、その具体的な説明を省略する。これまで、10個の試料の新型コロナウイルス核酸検出が完了した。
前述した各実施例に係るフローチャートにおける各ステップは、矢印の指示に従って順次に表示されるが、これらのステップは必ずしも矢印が指示する順序に従って順次に実行されるものではないと合理的に理解されるべきである。本明細書に特に説明しない限り、これらのステップの実行順序は、厳密に限定されるものではなく、これらのステップを他の順序で実行してもよい。そして、各フローチャートにおける少なくとも一部のステップは、複数のサブステップまたは複数の段階を含んでもよく、これらのサブステップまたは段階は、必ずしも同一のタイミングで実行される必要がなく、異なるタイミングで実行されてもよく、これらのサブステップまたは段階の実行順序も必ずしも順次に行われるものではなく、他のステップあるいは他のステップのサブステップまたは段階の少なくとも一部と順番にまたは交互に実行されてもよい。
1つの実施例では、図11に示すように、以下のモジュール1102~1106を含む検出項目の設定装置1100をさらに提供する。
マッピング関係取得モジュール1102は、目標検出項目の手順マッピング関係を取得するためのものであり、手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含む。
手順設定取得モジュール1104は、目標第2実験手順の手順設定情報を取得するためのものであり、目標第2実験手順は、目標検出項目の項目タイプと一義的に対応している。
検出項目設定モジュール1106は、手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、目標検出項目を設定するためのものである。
上記の検出項目の設定装置によれば、目標検出項目に対応する複数の試料タイプと少なくとも1つの第1実験手順との間のマッピング関係を取得するとともに、目標検出項目の項目タイプに一意的に対応する第2実験手順の手順設定情報を取得し、当該マッピング関係および手順設定情報に基づいて目標検出項目を設定する。これにより、1つの検出項目に対して異なる試料タイプに対応する第1実験手順を設定することができ、1つの検出項目が複数の試料タイプを有する場合、各試料タイプのそれぞれに対して1つの検出項目をそれぞれ作成する必要がなく、1つの検出項目のみを作成すればよいので、項目設定および後続の修正の作業を簡略化させたとともに、項目設定の便利性および効率を向上させ、かつ、試料登録インタフェースにおいて同一種類の検出項目に対しても1つの検出項目のみが表示されるため、ユーザが試料登録を行う際の混同を効果的に回避し、登録効率および正確性を向上させた。
1つの実施例では、マッピング関係取得モジュール1102は、試料タイプ確定モジュールと、第1の実験手順確定モジュールと、マッピング関係獲得モジュールとを含む。そのうち、試料タイプ確定モジュールは、項目設定インターフェースでのユーザの試料タイプ入力操作に基づいて、複数の目標試料タイプを確定するためのものであり、第1の実験手順確定モジュールは、各目標試料タイプに対して、予め記憶された第1実験手順の手順設定情報に基づいて、当該目標試料タイプに関連付けられた第1実験手順を確定するとともに、項目設定インターフェースでのユーザの手順選択操作に基づいて、関連付けられた第1実験手順から当該目標試料タイプに対応する目標第1実験手順を確定するためのものであり、マッピング関係獲得モジュールは、確定した複数の目標試料タイプおよびそれらとそれぞれ対応する目標第1実験手順に基づいて、目標検出項目の手順マッピング関係を獲得するためのものである。
1つの実施例では、検出項目の設定装置1100は、項目基本情報取得モジュールと第1の検出項目作成モジュールとを含む。そのうち、項目基本情報取得モジュールは、項目設定インターフェースでのユーザの基本情報入力操作に基づいて、目標検出項目の項目基本情報を取得するためのものであり、第1検出項目作成モジュールは、ユーザによる項目新規作成操作に応答して、項目基本情報に基づいて目標検出項目を作成するためのものである。これに基づいて、検出項目設定モジュール1106は、手順マッピング関係および第2実験手順の手順設定情報に基づいて、目標検出項目を更新するための検出項目更新モジュールを含む。
1つの実施例では、マッピング関係取得モジュール1102は、コードスキャン装置によってスキャンして獲得した項目図形コード情報を解析して、目標検出項目の手順マッピング関係を取得するための第1解析モジュールを含む。
1つの実施例では、検出項目の設定装置1100は、項目図形コードを解析して目標検出項目の項目基本情報を獲得するための第2解析モジュールを含む。これに基づいて、手順設定取得モジュール1104は、項目図形コードを解析して目標第2実験手順の手順設定情報を獲得するための第3解析モジュールを含む。そして、検出項目設定モジュール1106は、項目基本情報、手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、目標検出項目を作成して設定するための第2検出項目作成モジュールを含む。
1つの実施例では、検出項目の設定装置1100は、
項目設定インターフェースを表示するための設定インターフェース表示モジュールであって、項目設定インターフェースは、モード選択コントロール、項目リスト領域および項目編集領域を含み、モード選択コントロールは、オープン型オプションおよびクローズド型オプションを含む設定インターフェース表示モジュールと、
モード選択コントロールがオープン型オプションに対応する場合、項目リスト領域にオープン型検出項目を表示するためのオープン型項目表示モジュールであって、オープン型検出項目は、項目設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて作成された検出項目を含むオープン型項目表示モジュールと、
表示したオープン型検出項目に対する選択操作に基づいて、選択されたオープン型検出項目に対応する設定ページを項目編集領域に表示するためのオープン型設定ページ表示モジュールであって、オープン型検出項目に対応する設定ページは、第1実験手順の設定ページおよび第2実験手順の設定ページを含むオープン型設定ページ表示モジュールと、
モード選択コントロールがクローズド型オプションに対応する場合、項目リスト領域にクローズド型検出項目を表示するためのクローズド型項目表示モジュールであって、クローズド型検出項目は、項目図形コードによって作成された検出項目を含むクローズド型項目表示モジュールと、
表示したクローズド型検出項目に対する選択操作に基づいて、選択されたクローズド型検出項目に対応する設定ページを項目編集領域に表示するためのクローズド型設定ページ表示モジュールであって、クローズド型検出項目に対応する設定ページは、第1実験手順の設定ページおよび第2実験手順の設定ページを含まないクローズド型設定ページ表示モジュールと、を含んでもよい。
1つの実施例では、検出項目の設定装置1100は、
手順設定インターフェースでのユーザの手順情報入力操作に基づいて、目標第1実験手順の手順基本情報および実験ステップ情報を含む目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶する第1項と、
コードスキャン装置によってスキャンして獲得した手順図形コード情報を解析して、目標第1実験手順の手順基本情報および実験ステップ情報を含む目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶する第2項とのうちの少なくとも1つを実行するための第1実験手順設定モジュールを含んでもよい。
1つの実施例では、検出項目の設定装置1100は、登録インターフェース表示モジュールと、登録待ち試料確定モジュールと、検出待ち項目確定モジュールと、登録モジュールとを含む。そのうち、登録インターフェース表示モジュールは、検出待ち試料および候補検出項目が表示される試料登録インターフェースを表示するためのものであり、検出待ち試料は、試料分析機器に入れられる目標実体試料と一対一で対応しており、登録待ち試料確定モジュールは、試料登録インターフェースでの試料選択操作に基づいて、検出待ち試料から登録待ち試料を確定するためのものであり、検出待ち項目確定モジュールは、試料登録インターフェースでの項目選択操作に基づいて、候補検出項目から検出待ち項目を確定するためのものであり、登録モジュールは、登録トリガー操作に応答して、登録待ち試料に対して検出待ち項目を登録するためのものである。
1つの実施例では、検出項目の設定装置1100は、実験バッチ区分けモジュールと実験制御モジュールとを含む。そのうち、実験バッチ区分けモジュールは、実験開始操作に応答して、検出待ち試料の試料タイプおよび検出待ち項目に基づいて、検出待ち試料に対して実験バッチを区分けするためのものであり、そのうち、同一の実験バッチにおける検出待ち試料は、同一の試料タイプおよび検出待ち項目を有し、または同一の実験バッチにおける検出待ち試料は、同一の第1実験手順に対応するとともに同一の検出待ち項目を有する。実験制御モジュールは、各実験バッチに対して、当該実験バッチの試料タイプ、および当該実験バッチの検出待ち項目の手順マッピング関係と第2実験手順の手順設定情報に基づいて、当該実験バッチにおける検出待ち試料に対応する目標実体試料に対して対応する実験操作を行うように試料分析機器を制御するためのものである。
なお、検出項目の設定装置1100についての具体的な限定は、以上の検出項目の設定方法に対する限定を参照できるので、ここではその説明を省略する。上記の検出項目の設定装置1100における各モジュールは、その全部または一部がソフトウェア、ハードウェアおよびそれらの組み合わせによって実現されてもよい。上記各モジュールは、ハードウェアの形式でコンピュータ機器におけるプロセッサに埋め込まれまたは独立されてもよいし、プロセッサが上記各モジュールに対応する操作を呼び出して実行するようにソフトウェアの形式でコンピュータ機器におけるメモリに記憶されてもよい。
1つの実施例では、メモリとプロセッサとを含み、前記メモリには、コンピュータプログラムが記憶され、前記プロセッサが前記コンピュータプログラムを実行する場合に本願の実施例のいずれか1つが提供する検出項目の設定方法のステップを実現する制御端末を提供する。
具体的には、当該制御端末の内部構成は、図12に示すように、システムバスを介して接続されるプロセッサ、メモリ、ネットワークインターフェース、表示スクリーン、入力装置および音声収集装置を含む。そのうち、プロセッサは、算出および制御の能力を提供するためのものである。メモリは、不揮発性記憶媒体および内部メモリを含み、当該制御端末の不揮発性記憶媒体には、オペレーティングシステムおよびコンピュータプログラムが記憶されており、当該コンピュータプログラムがプロセッサによって実行される場合に、本願の実施例のいずれか1つが提供する検出項目の設定方法をプロセッサに実現させることができる。当該内部メモリは、不揮発性記憶媒体におけるオペレーティングシステムおよびコンピュータプログラムの動作に対して環境を提供する。ネットワークインターフェースは、外部の端末とネットワークを介して接続して通信するためのものである。表示スクリーンは、液晶ディスプレイまたは電子インクディスプレイであってもよい。入力装置は、表示クリーンに被覆されるタッチ層であってもよいし、コンピュータ装置のケースに設けられたボタン、トラックボールまたはタッチパネルであってもよいし、外付けのキーボード、タッチパネルまたはマウスであってもよい。当業者が理解できるように、図12に示す構成は、本願の技術案に関する一部の構成のブロック図に過ぎなく、本願の技術案を応用する制御端末を限定するためのものではなく、具体的な制御端末は、図12に示したものよりも多くまたは少ない部材を含んだり、ある部材と組み合わせたり、異なる部材の配置を有したりしてもよい。
1つの実施例では、本願が提供する検出項目の設定装置は、図12に示す制御端末で動作可能なコンピュータプログラムとして実現することができる。制御端末のメモリには、例えば図11に示すマッピング関係取得モジュール1102、手順設定取得モジュール1104などのような当該装置を構成する各プログラムモジュールが記憶される。各プログラムモジュールで構成されるコンピュータプログラムは、本明細書で説明した本願の各実施例に係る検出項目の設定方法におけるステップをプロセッサに実行させ、例えば、図12に示す制御端末は、図11に示す検出項目の設定装置1100におけるマッピング関係取得モジュール1102によってステップS202、手順設定取得モジュール1104によってステップS204をそれぞれ実行させるなどとしてもよい。
当業者は、上記の実施例の方法における全部または一部のフローを実現することは、コンピュータプログラムによって関連のハードウェアが完了するように指示することができることを理解することができ、当該プログラムは、不揮発性のコンピュータ読取可能な記憶媒体に記憶することができ、当該プログラムが実行される場合に、上記の各方法の実施例のフローを含み得る。そのうち、本願が提供する各実施例に用いられる、メモリ、記憶、データベースまたはその他の媒体に対する如何なる引用は、いずれも不揮発性および/または揮発性のメモリを含むことができる。不揮発性メモリは、ROM(Read Only Memory)、PROM(Programmable Read Only Memory)、EPROM(Electrical Programmable Read Only Memory)、EEPROM(Electrically Erasable Programmable Read Only Memory)またはフラッシュメモリを含んでもよい。揮発性メモリは、RAM(Random Access Memory)または外部キャッシュメモリを含んでもよい。RAMは、特に制限しない限り、例えばSRAM(Static RAM)、DRAM(Dynamic RAM)、SDRAM(Synchronous Dynamic RAM)、DDRSDRAM(Double Data Rate Synchronous Dynamic RAM)、ESDRAM(Enhanced Synchronous Dynamic RAM)、SLDRAM(Synchlink Dynamic RAM)、RDRAM(Rambus Direct RAM)、DRDRAM(Direct Rambus Dynamic RAM)、およびRDRAM(Rambus Dynamic RAM)等の種々の形態で実現することができる。
これによれば、1つの実施例では、プロセッサによって実行される場合に本願の実施例のいずれか1つに係る検出項目の設定方法のステップをプロセッサに実行させるコンピュータプログラムが記憶されるコンピュータ読取可能な記憶媒体を提供する。
1つの実施例では、試料分析機器と上記の制御端末とを含み、そのうち、制御端末は、目標検出項目の手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報を取得して記憶するためのものであり、手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、目標第2実験手順と目標検出項目の項目タイプとは一義的に対応しており、制御端末は、検出待ち試料の試料タイプおよび検出待ち項目に基づいて検出待ち試料に対して実験バッチを区分けし、かつ各実験バッチに対して、当該実験バッチの試料タイプと当該実験バッチの検出待ち項目の手順マッピング関係および第2実験手順の手順設定情報に基づいて、試料分析機器に実験制御指令を送信させるためにも用いられ、そのうち、同一の実験バッチにおける検出待ち試料は、同一の試料タイプおよび検出待ち項目を有し、または同一の実験バッチにおける検出待ち試料は、同一の第1実験手順に対応するとともに同一の検出待ち項目を有する。試料分析機器は、実験制御指令に基づいて、各実験バッチにおける検出待ち試料に対応する実体試料に対して対応する実験操作をそれぞれ行うためのものである。
以上の実施例の各技術的特徴は、任意に組み合わせが可能であり、説明を簡潔にするために、上記実施例における各技術特徴の全ての組み合わせについて説明していないが、これらの技術特徴の組み合わせが矛盾しない限り、本明細書に記載された範囲に含まれると考えられるべきである。
以上の実施例は本願の幾つかの実施例を示したに過ぎず、具体的かつ詳細に説明したが、本願の特許請求の範囲を限定するものであると理解すべきではない。なお、当業者であれば、本願の構想を逸脱することなく若干の変形や改良を行うことができ、これらはいずれも本願の保護範囲に含まれる。従って、本願の保護範囲は添付の特許請求の範囲を参酌すべきである。

Claims (13)

  1. 目標検出項目の手順マッピング関係を取得するステップであって、前記手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含むステップと、
    目標第2実験手順の手順設定情報を取得するステップであって、前記目標第2実験手順は、前記目標検出項目の項目タイプと一義的に対応しているステップと、
    前記手順マッピング関係および前記目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記目標検出項目を設定するステップと、を含む、
    ことを特徴とする検出項目の設定方法。
  2. 前記目標検出項目の手順マッピング関係を取得する前記ステップは、
    項目設定インターフェースでのユーザの試料タイプ入力操作に基づいて、複数の目標試料タイプを確定するステップと、
    前記目標試料タイプのそれぞれに対して、予め記憶された第1実験手順の手順設定情報に基づいて、当該目標試料タイプに関連付けられる第1実験手順を確定するとともに、前記項目設定インターフェースでのユーザの手順選択操作に基づいて、前記関連付けられる第1実験手順から当該目標試料タイプに対応する目標第1実験手順を確定するステップと、
    確定した前記複数の目標試料タイプおよびそれらとそれぞれ対応する目標第1実験手順に基づいて、目標検出項目の手順マッピング関係を獲得するステップと、を含む、
    ことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  3. 前記目標検出項目の手順マッピング関係を取得する前記ステップの前に、
    項目設定インターフェースでのユーザの基本情報入力操作に基づいて、目標検出項目の項目基本情報を取得するステップと、
    ユーザによる項目新規作成操作に応答して、前記項目基本情報に基づいて前記目標検出項目を作成するステップとをさらに含み、
    前記手順マッピング関係および前記目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記目標検出項目を設定する前記ステップは、
    前記手順マッピング関係および前記第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記目標検出項目を更新するステップを含む、
    ことを特徴とする請求項2に記載の方法。
  4. 前記目標検出項目の手順マッピング関係を取得する前記ステップは、
    項目図形コード情報を解析して、目標検出項目の手順マッピング関係を取得するステップであって、前記項目図形コード情報は、コードスキャン装置によってスキャンして獲得したものであるステップを含む、
    ことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  5. 前記手順マッピング関係および前記目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記目標検出項目を設定する前記ステップの前に、
    前記項目図形コード情報を解析して前記目標検出項目の項目基本情報を獲得するステップをさらに含み、
    前記目標第2実験手順の手順設定情報を取得する前記ステップは、
    前記項目図形コードを解析して、目標第2実験手順の手順設定情報を獲得するステップを含み、
    前記手順マッピング関係および前記目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記目標検出項目を設定する前記ステップは、
    前記項目基本情報、前記手順マッピング関係および前記目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、目標検出項目を作成して設定するステップを含む、
    ことを特徴とする請求項4に記載の方法。
  6. 項目設定インターフェースを表示するステップであって、前記項目設定インターフェースは、モード選択コントロール、項目リスト領域および項目編集領域を含み、前記モード選択コントロールは、オープン型オプションおよびクローズド型オプションを含むステップと、
    前記モード選択コントロールがオープン型オプションに対応する場合、前記項目リスト領域にオープン型検出項目を表示するステップであって、前記オープン型検出項目は、前記項目設定インターフェースでのユーザの操作に基づいて作成された検出項目を含むステップと、
    表示したオープン型検出項目に対する選択操作に基づいて、選択されたオープン型検出項目に対応する設定ページを前記項目編集領域に表示するステップであって、オープン型検出項目に対応する設定ページは、前記第1実験手順の設定ページおよび前記第2実験手順の設定ページを含むステップと、
    前記モード選択コントロールがクローズド型オプションに対応する場合、前記項目リスト領域にクローズド型検出項目を表示するステップであって、前記クローズド型検出項目は、項目図形コード情報によって作成された検出項目を含むステップと、
    表示したクローズド型検出項目に対する選択操作に基づいて、選択されたクローズド型検出項目に対応する設定ページを前記項目編集領域に表示するステップであって、前記クローズド型検出項目に対応する設定ページは、前記第1実験手順の設定ページおよび前記第2実験手順の設定ページを含まないステップと、をさらに含む、
    ことを特徴とする請求項2に記載の方法。
  7. 手順設定インターフェースでのユーザの手順情報入力操作に基づいて、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶し、前記手順設定情報は、前記目標第1実験手順の手順基本情報および実験ステップ情報を含むことと、
    手順図形コード情報を解析して、目標第1実験手順の手順設定情報を取得して記憶し、前記手順図形コード情報は、コードスキャン装置によってスキャンして獲得したものであり、前記手順設定情報は、目標第1実験手順の手順基本情報および実験ステップ情報を含むこととのうちの少なくとも1つを含む、
    ことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  8. 試料登録インターフェースを表示するステップであって、前記試料登録インターフェースには、検出待ち試料および候補検出項目が表示され、前記検出待ち試料は、試料分析機器に入れられる目標実体試料と一対一で対応しているステップと、
    前記試料登録インターフェースでの試料選択操作に基づいて、前記検出待ち試料から登録待ち試料を確定するステップと、
    前記試料登録インターフェースでの項目選択操作に基づいて、前記候補検出項目から検出待ち項目を確定するステップと、
    登録トリガー操作に応答して、前記登録待ち試料に対して前記検出待ち項目を登録するステップと、をさらに含む、
    ことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  9. 実験開始操作に応答して、検出待ち試料の試料タイプおよび検出待ち項目に基づいて、前記検出待ち試料に対して実験バッチを区分けするステップであって、同一の実験バッチにおける前記検出待ち試料は、同一の試料タイプおよび検出待ち項目を有し、または同一の実験バッチにおける前記検出待ち試料は、同一の第1実験手順に対応するとともに同一の検出待ち項目を有するステップと、
    前記実験バッチのそれぞれに対して、当該実験バッチの試料タイプ、および当該実験バッチの検出待ち項目の手順マッピング関係と第2実験手順の手順設定情報に基づいて、当該実験バッチにおける検出待ち試料に対応する目標実体試料に対して対応する実験操作を行うように試料分析機器を制御するステップと、をさらに含む、
    ことを特徴とする請求項8に記載の方法。
  10. 目標検出項目の手順マッピング関係を取得するためのマッピング関係取得モジュールであって、前記手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含むマッピング関係取得モジュールと、
    目標第2実験手順の手順設定情報を取得するための手順設定取得モジュールであって、前記目標第2実験手順は、前記目標検出項目の項目タイプと一義的に対応している手順設定取得モジュールと、
    前記手順マッピング関係および前記目標第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記目標検出項目を設定するための検出項目設定モジュールと、を備える、
    ことを特徴とする検出項目の設定装置。
  11. コンピュータプログラムが記憶されるコンピュータ読取可能な記憶媒体であって、
    前記コンピュータプログラムがプロセッサによって実行される場合に、請求項1~9のいずれか1つに記載の方法のステップを前記プロセッサに実行させる、
    ことを特徴とするコンピュータ読取可能な記憶媒体。
  12. メモリとプロセッサとを備え、前記メモリにコンピュータプログラムが記憶される制御端末であって、
    前記プロセッサが前記コンピュータプログラムを実行する場合に、請求項1~9のいずれか1つに記載の方法のステップを実現する、
    ことを特徴とする制御端末。
  13. 試料分析機器と請求項12に記載の制御端末とを含み、前記試料分析機器と前記制御端末とは通信可能に接続されており、
    前記制御端末は、目標検出項目の手順マッピング関係および目標第2実験手順の手順設定情報を取得して記憶するためのものであり、前記手順マッピング関係は、複数の目標試料タイプと少なくとも1つの目標第1実験手順との間のマッピング関係を含み、前記目標第2実験手順は、前記目標検出項目の項目タイプと一義的に対応しており、
    前記制御端末は、検出待ち試料の試料タイプおよび検出待ち項目に基づいて前記検出待ち試料に対して実験バッチを区分けし、かつ前記実験バッチのそれぞれに対して、当該実験バッチの試料タイプおよび当該実験バッチの検出待ち項目の手順マッピング関係と第2実験手順の手順設定情報に基づいて、前記試料分析機器に実験制御指令を送信させるためにも用いられ、そのうち、同一の実験バッチにおける前記検出待ち試料は、同一の試料タイプおよび検出待ち項目を有し、または同一の実験バッチにおける前記検出待ち試料は、同一の第1実験手順に対応するとともに同一の検出待ち項目を有し、
    前記試料分析機器は、前記実験制御指令に基づいて、前記実験バッチのそれぞれにおける検出待ち試料に対応する実体試料に対して対応する実験操作をそれぞれ行うためのものである、
    ことを特徴とする試料分析システム。

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Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN119294046B (zh) * 2024-09-06 2026-01-06 煤炭科学研究总院有限公司 岩石力学实验的标准化实验方法及装置

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2007132820A (ja) * 2005-11-10 2007-05-31 Hitachi Ltd 自動分析装置
JP2013024785A (ja) * 2011-07-25 2013-02-04 Hitachi High-Technologies Corp 自動分析装置
JP2013096733A (ja) * 2011-10-28 2013-05-20 Hitachi High-Technologies Corp 分析装置および分析方法
JP2020527341A (ja) * 2017-07-10 2020-09-10 ジェン−プローブ・インコーポレーテッド 試料割り当てパラメータを使用した核酸増幅のための分析システムおよび方法
JP2021060234A (ja) * 2019-10-04 2021-04-15 株式会社日立ハイテクサイエンス オートサンプラの制御装置及びそれを含む自動測定システム

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2016287731B2 (en) * 2015-06-30 2021-11-25 Emerald Cloud Lab, Inc. Laboratory experiment data exploration and visualization
EP3182133B1 (en) * 2015-12-16 2020-01-15 F. Hoffmann-La Roche AG Automated analytical system and method for operating thereof

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2007132820A (ja) * 2005-11-10 2007-05-31 Hitachi Ltd 自動分析装置
JP2013024785A (ja) * 2011-07-25 2013-02-04 Hitachi High-Technologies Corp 自動分析装置
JP2013096733A (ja) * 2011-10-28 2013-05-20 Hitachi High-Technologies Corp 分析装置および分析方法
JP2020527341A (ja) * 2017-07-10 2020-09-10 ジェン−プローブ・インコーポレーテッド 試料割り当てパラメータを使用した核酸増幅のための分析システムおよび方法
JP2021060234A (ja) * 2019-10-04 2021-04-15 株式会社日立ハイテクサイエンス オートサンプラの制御装置及びそれを含む自動測定システム

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