JP2024505818A - 細胞表面を修飾された赤血球及びその調製方法 - Google Patents
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Abstract
本発明は、赤血球(RBC)の細胞表面マーカーを修飾する方法及びその使用に関する。特に、本方法は、ペプチドをRBCに対してライゲーションさせてRBC-ペプチドコンジュゲートを形成するのに適した条件下で、十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でRCEをペプチドと接触させることを含む。一実施形態では、リガーゼはOaAEPIリガーゼである。エフェクター分子をRBC-ペプチドに対してコンジュゲートさせてRBC-ペプチド-エフェクター分子コンジュゲートを形成させるのに適した条件下で、十分な時間にわたって、RBC-ペプチドコンジュゲートをエフェクター分子と更に接触させてもよい。【選択図】図2
Description
本出願は、2021年1月29日に出願されたシンガポール国特許出願第10202101003S号の優先権を主張し、その内容及び要素は、あらゆる目的のために参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は、概して分子生物学の分野に関する。特に、本発明は、赤血球の細胞表面タンパク質を修飾する方法及びその使用に関する。
治療用途のための、細胞表面を修飾された赤血球を調製する方法には、多くの課題がある。赤血球の化学的機能付加又は遺伝子操作などの、従来のほとんどの方法では、赤血球の長期生存に有害である過酷な化学処理と、前駆細胞の非常に高価な遺伝子操作及び培養との間で折り合いをつけなければならない。既存の酵素による方法は、事前の遺伝子操作なしでは非効率的である。したがって、治療用途のための、細胞表面を修飾された赤血球を、効率的に調製する方法を提供するというニーズは、未だに満たされていない。
本発明は、上記の考察に鑑みてなされたものである。
最も一般的には、本開示は、脱核後の赤血球を修飾する方法、並びに脱核後の細胞表面にエフェクター分子がコンジュゲートしている修飾赤血球に関する。特に、本開示は、遺伝子改変をなされていない赤血球を修飾する方法に関する。
一態様では、本開示は、
(a)ペプチド又はポリペプチドを赤血球(RBC)に対してライゲーションさせてRBC-ペプチド又はRBC-ポリペプチドコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でRBCをペプチド又はポリペプチドと接触させることを含み、
上記ペプチド又はポリペプチドがC末端リガーゼ認識配列を含む、方法を提供する。
(a)ペプチド又はポリペプチドを赤血球(RBC)に対してライゲーションさせてRBC-ペプチド又はRBC-ポリペプチドコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でRBCをペプチド又はポリペプチドと接触させることを含み、
上記ペプチド又はポリペプチドがC末端リガーゼ認識配列を含む、方法を提供する。
本方法は、RBC-ペプチドコンジュゲートを洗浄する工程、例えばRBCに対してコンジュゲートしていないペプチドを除去する工程を更に含み得る。
リガーゼは、OaAEP1リガーゼ、例えば変異型OaAEP1リガーゼ、例えばOaAEP1-Cys247Alaであり得る。
C末端認識配列は、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLから選択される配列を有し得る。
場合によっては、C末端認識配列は、OaAEP1リガーゼによる高いライゲーション効率を可能にしない。C末端認識配列は、配列Xaa1GGを有し得、Xaa1はG以外の任意のアミノ酸である。C末端認識配列は、配列NG又はNCLを有し得る。
いくつかの態様では、ペプチド又はポリペプチドは、エフェクター分子である。エフェクター分子は、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLから選択されるC末端認識配列を有し得る。
RBCがエフェクター分子にコンジュゲートされる場合、この方法は、「一工程法」と呼ばれ得る。
場合によっては、ペプチドはリンカーペプチドである。リンカーペプチドは、C末端リガーゼ認識配列を有する。リンカーペプチドは、別のペプチド又はポリペプチド、例えばエフェクター分子に対するコンジュゲーションのためのN末端モチーフを有する。N末端モチーフは、リガーゼ認識配列、クリックケミストリー官能基、又はビオチン部分であり得る。
リガーゼ認識配列は、OaAEP1リガーゼ、ソルターゼ、アスパラギニルペプチダーゼ、ブテラーゼ-1、又はこれらの任意の変異体若しくは多様体から選択されるリガーゼ、好ましくはOaAEP-Cys247Alaリガーゼの認識配列であり得る。
リンカーペプチドがN末端リガーゼ認識配列を有する場合、この配列は、G、GG、GL、GGG、GLG及びGGLを含み得る。
ペプチドがリンカーペプチドである場合、ペプチドのRBCへのライゲーションは、RBC-リンカーペプチドコンジュゲートの形成をもたらす。
RBC-リンカーペプチドコンジュゲートをエフェクター分子と接触させてもよい。かかる方法は、リンカーペプチドに対してコンジュゲーションする第1の工程と、エフェクター分子に対してコンジュゲーションする第2の工程とを含む「二工程法」と呼ばれ得る。
リンカーペプチドがN末端リガーゼ認識部位を有する場合、RBC-リンカーペプチドを、C末端リガーゼ認識配列を有するエフェクター分子と接触させてもよい。かかる接触は、リガーゼの存在下で、エフェクター分子をリンカーペプチドにライゲーションさせて、RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを形成するのに十分な時間及び適した条件下で起こり得る。かかる方法では、RBCをリンカーペプチドに接触させる間に存在するリガーゼは第1のリガーゼと呼ばれ得、RBC-リンカーコンジュゲートとエフェクター分子とを接触させる間に存在するリガーゼは第2のリガーゼと呼ばれ得る。第1及び第2のリガーゼは同じであってもよい。第1及び第2のリガーゼは異なってもよい。特に好ましい方法では、第1及び第2のリガーゼは、OaAEP1リガーゼ、好ましくはOaAEP1-Cys247Alaである。
そのような場合、リンカーペプチドのC末端リガーゼ認識配列は、第1のC末端リガーゼ認識配列と呼ばれ得、エフェクター分子のC末端リガーゼ認識配列は、第2のC末端リガーゼ認識配列と呼ばれ得る。かかる方法では、第1のC末端リガーゼ認識配列及び第2のC末端リガーゼ認識配列は同じでないことが一般に有利である。第1及び第2のリガーゼが両方とも同じである場合、第1のC末端リガーゼ認識配列及び第2のC末端リガーゼ認識配列は同じでないことが有利であり得る。特に、第1のC末端リガーゼ認識配列が第2のC末端リガーゼ認識配列よりもリガーゼ認識に最適化されていないことが有利であり得る。換言すれば、第1のリガーゼによるリンカーへのRBCのライゲーションは、エフェクター分子のRBC-リンカーペプチドに対するライゲーションよりも効率が低い可能性がある。理論に拘束されることを望むものではないが、ライゲーション効率の差異は、リンカーによるセルフライゲーションを減少させると考えられる。かかる方法では、第1のC末端リガーゼ認識配列は、配列Xaa1GGを有し、ここで、Xaa1は、G以外の任意のアミノ酸残基であるか、又は配列NG若しくはNCLを有し、第2のC末端リガーゼ認識配列は、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLから選択される配列を有する。
場合によっては、リンカーペプチドは、クリックケミストリー官能基をN末端に含むか、又はそうでなければクリックケミストリー官能基がリンカーペプチド上に露出している。クリックケミストリー官能基は、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分、ジアリールサイトオクチン(diarylcytooctyne)(DBCO)部分又はトランスシクロオクチン(TCO)部分から選択され得る。
場合によっては、リンカーペプチドは、N末端にビオチン部分含むか、又はそうでなければビオチン部分がリンカーペプチド上に露出している。
リンカーペプチドが、リガーゼ認識モチーフではない別のペプチドに対するコンジュゲーションのためのN末端モチーフを含む場合、例えば、リンカーペプチドが、N末端にビオチン部分のクリックケミストリー官能基を含むか、又はそうでなければビオチン部分のクリックケミストリー官能基がリンカーペプチド上に露出している場合、C末端のリガーゼ認識配列は、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLから選択され得る。N末端モチーフの選択は、エフェクター分子(GL-)上の第2のC末端モチーフに相補的であるように決定される。
リンカーペプチドがクリックケミストリー官能基を含む場合、RBC-リンカーコンジュゲートは、例えば、エフェクター分子のC末端にある、又はそうでなければエフェクター分子上に露出した、相補的なクリックケミストリー官能基を有するエフェクター分子と接触させてもよい。相補的なクリックケミストリー官能基は、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分、ジアリールサイトオクチン(DBCO)部分又はトランスシクロオクチン(TCO)部分から選択され得る。
リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がアジド部分である場合、エフェクター分子の相補的なクリックケミストリー官能基はDBCO部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がDBCO部分である場合、エフェクター分子の相補的なクリックケミストリー官能基はアジド部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がTCO部分である場合、エフェクター分子の相補的なクリックケミストリー官能基は、テトラジン部分又はメチルテトラジン部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がテトラジン部分又はメチルテトラジン部分である場合、エフェクター分子の相補的なクリックケミストリー官能基はTCO部分である。
リンカーペプチドがクリックケミストリー官能基を含む場合、RBC-リンカーペプチドコンジュゲートは、クリックケミストリーによるRBC-リンカーコンジュゲートのエフェクター分子に対するコンジュゲーションに十分な時間及び適した条件下でエフェクター分子による接触を受ける。
リンカーペプチドがビオチン部分を含む場合、リンカーコンジュゲートのビオチン部分をストレプトアビジン又はアビジンに対してコンジュゲートさせてRBC-リンカー-ストレプトアビジン又はRBC-リンカー-アビジンコンジュゲートを形成するのに十分な時間及び適した条件下で、RBC-リンカーコンジュゲートをストレプトアビジン又はアビジンと接触させる。RBC-リンカー-ストレプトアビジン又はRBC-リンカー-アビジンコンジュゲートは、ビオチン化エフェクター部分と接触させてもよい。ビオチン化エフェクター部分は、ビオチン部分を含むエフェクター部分、例えば、ビオチン部分にコンジュゲートされているエフェクター分子である。RBC-リンカー-ストレプトアビジン又はRBC-リンカー-アビジンコンジュゲートは、エフェクター分子のビオチン部分をRBC-リンカー-ストレプトアビジン又はRBC-リンカー-アビジンコンジュゲートのストレプトアビジン又はアビジン部分にコンジュゲートさせてRBC-リンカー-ストレプトアビジン-エフェクター分子コンジュゲート又はRBC-リンカー-アビジン-エフェクター分子コンジュゲートを形成するのに適した条件下及び十分な時間で、ビオチン化エフェクター部分と接触させてもよい。
上記のように、本明細書に開示されるある特定の方法は、リンカーに対してコンジュゲーションさせる第1の工程及びエフェクター分子に対してコンジュゲーションさせる第2の工程を含む「二工程」法である。
そのような一態様では、本開示は、
(a)ペプチドをRBCに対してライゲーションさせてRBC-リンカーコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でRBCをリンカーペプチドと接触させる工程であって、
リンカーペプチドが第1のC末端リガーゼ認識配列及びN末端リガーゼ認識配列を含む工程と、
(b)(a)からのRBC-リンカーコンジュゲートを、エフェクター分子をリガーゼにライゲーションさせてRBC-リンカー-エフェクターコンジュゲートを形成するのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でエフェクター分子と接触させる工程であって、
エフェクター分子が第2のC末端リガーゼ認識配列を含む工程と、
を含む方法を提供する。
(a)ペプチドをRBCに対してライゲーションさせてRBC-リンカーコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でRBCをリンカーペプチドと接触させる工程であって、
リンカーペプチドが第1のC末端リガーゼ認識配列及びN末端リガーゼ認識配列を含む工程と、
(b)(a)からのRBC-リンカーコンジュゲートを、エフェクター分子をリガーゼにライゲーションさせてRBC-リンカー-エフェクターコンジュゲートを形成するのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でエフェクター分子と接触させる工程であって、
エフェクター分子が第2のC末端リガーゼ認識配列を含む工程と、
を含む方法を提供する。
本方法は、RBC-リンカーコンジュゲートを洗浄する工程を含み得る。かかる洗浄工程は、好ましくは、RBC-リンカーコンジュゲートをエフェクター分子と接触させる前に行われる。
本方法は、RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを洗浄する工程を含み得る。
代替的な態様では、本開示は、
(a)リンカーペプチドをRBCに対してライゲーションさせてRBC-リンカーコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でRBCをリンカーペプチドと接触させる工程であって、
リンカーペプチドがC末端リガーゼ認識配列及びN末端ビオチン部分を含む工程と、
(b)リンカーのビオチン部分に対してストレプトアビジンを結合させてRBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートを形成するコンジュゲーションに適した条件下で十分な時間にわたって、(a)からのRBC-リンカーコンジュゲートをストレプトアビジンと接触させる工程と、
(c)ビオチン化エフェクター分子をRBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートに対してコンジュゲーションさせてRBC-リンカー-ストレプトアビジン-エフェクター分子コンジュゲートを形成するのに適した条件下で十分な時間にわたって、RBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートをビオチン化エフェクター分子と接触させる工程と、
を含む、方法を提供する。
(a)リンカーペプチドをRBCに対してライゲーションさせてRBC-リンカーコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下でRBCをリンカーペプチドと接触させる工程であって、
リンカーペプチドがC末端リガーゼ認識配列及びN末端ビオチン部分を含む工程と、
(b)リンカーのビオチン部分に対してストレプトアビジンを結合させてRBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートを形成するコンジュゲーションに適した条件下で十分な時間にわたって、(a)からのRBC-リンカーコンジュゲートをストレプトアビジンと接触させる工程と、
(c)ビオチン化エフェクター分子をRBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートに対してコンジュゲーションさせてRBC-リンカー-ストレプトアビジン-エフェクター分子コンジュゲートを形成するのに適した条件下で十分な時間にわたって、RBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートをビオチン化エフェクター分子と接触させる工程と、
を含む、方法を提供する。
本方法は、RBC-リンカーコンジュゲートを洗浄する工程を含み得る。かかる洗浄工程は、好ましくは、RBC-リンカーコンジュゲートをストレプトアビジンと接触させる前に行われる。
本方法は、RBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートを洗浄する工程を含み得る。かかる洗浄工程は、好ましくは、RBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートをエフェクター分子と接触させる前に行われる。
本方法は、RBC-リンカー-ストレプトアビジン-エフェクター分子コンジュゲートを洗浄する工程を含み得る。
別の代替的な態様では、本開示は、
(a)リンカーペプチドをRBCに対してライゲーションさせてRBC-リンカーコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下で、RBCをリンカーペプチドと接触させる工程であって、
リンカーペプチドがC末端リガーゼ認識配列及びクリックケミストリー官能基を含む工程と、
(b)(a)からのRBC-リンカーコンジュゲートを、相補的なクリックケミストリー官能基を含むエフェクター分子と接触させる工程であって、銅フリーのクリックケミストリーによりエフェクター分子をリンカーにコンジュゲーションさせてRBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを形成するのに適した条件下で十分な時間にわたって、RBC-リンカーコンジュゲートと、エフェクター分子とを接触させる工程と、
を含む方法を提供する。
(a)リンカーペプチドをRBCに対してライゲーションさせてRBC-リンカーコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下で、RBCをリンカーペプチドと接触させる工程であって、
リンカーペプチドがC末端リガーゼ認識配列及びクリックケミストリー官能基を含む工程と、
(b)(a)からのRBC-リンカーコンジュゲートを、相補的なクリックケミストリー官能基を含むエフェクター分子と接触させる工程であって、銅フリーのクリックケミストリーによりエフェクター分子をリンカーにコンジュゲーションさせてRBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを形成するのに適した条件下で十分な時間にわたって、RBC-リンカーコンジュゲートと、エフェクター分子とを接触させる工程と、
を含む方法を提供する。
本方法は、RBC-リンカーコンジュゲートを洗浄する工程を含み得る。かかる洗浄工程は、好ましくは、RBC-リンカーコンジュゲートをエフェクター分子と接触させる前に行われる。
本方法は、RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを洗浄する工程を含み得る。
クリックケミストリー官能基は、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分、ジアリールサイトオクチン(DBCO)部分又はトランスシクロオクチン(TCO)部分から選択され得る。
相補的なクリックケミストリー官能基は、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分、ジアリールサイトオクチン(DBCO)部分又はトランスシクロオクチン(TCO)部分から選択され得る。
リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がアジド部分である場合、エフェクター分子の相補的なクリックケミストリー官能基はDBCO部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がDBCO部分である場合、エフェクター分子の相補的なクリックケミストリー官能基はアジド部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がTCO部分である場合、エフェクター分子の相補的なクリックケミストリー官能基は、テトラジン部分又はメチルテトラジン部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がテトラジン部分又はメチルテトラジン部分である場合、エフェクター分子の相補的なクリックケミストリー官能基はTCO部分である。
本明細書に記載される特定の方法は、リンカーペプチドを含む。リンカーペプチドは、赤血球に対するライゲーションのためのC末端リガーゼ認識配列を含み得る。リンカーペプチドは、エフェクター分子などの別のペプチドに対するコンジュゲーションのためのN末端モチーフを含み得る。N末端モチーフは、リガーゼ認識配列、クリックケミストリー官能基、又はビオチン部分であり得る。
リンカーペプチドは、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN若しくはNG、好ましくはNGL、NPL若しくはNDLから選択される配列を有するか、又は配列Xaa1GGを有するC末端リガーゼ認識配列を含み、Xaa1は、G以外の任意のアミノ酸残基であるか、又は配列NG若しくはNCLを有する。
リンカーペプチドは、N末端リガーゼ認識配列を有し、この配列は、G、GG、GL、GGG、GLG及びGGLを含み得る。
リンカーペプチドがN末端リガーゼ認識配列を有する場合、C末端リガーゼ認識配列は、配列Xaa1GGを有し、Xaa1は、G以外の任意のアミノ酸であるか、又は配列NG若しくはNCLを有する。
リンカーペプチドは、クリックケミストリー官能基又はビオチン部分をN末端に有していてもよいか、又はそうでなければクリックケミストリー官能基又はビオチン部分を分子上に露出していてもよい。クリックケミストリー官能基は、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分、ジアリールサイトオクチン(DBCO)部分又はトランスシクロオクチン(TCO)部分から選択され得る。
リンカーペプチドがクリックケミストリー官能基、又はビオチン部分を有する場合、C末端リガーゼ認識配列は、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN若しくはNG、好ましくはNGL、NPL若しくはNDLから選択される配列を有し得るか、又は配列Xaa1GGを有し、Xaa1は、G以外の任意のアミノ酸であるか、又は配列NG若しくはNCLを有する。好ましくは、配列は、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNGから選択され、最も好ましくはNGL、NPL又はNDLである。
リンカーペプチドは、好ましくは、C末端リガーゼ認識配列と、N末端リガーゼ認識配列、クリックケミストリー官能基又はビオチン部分との間にリンカー本体配列を有する。リンカー本体配列は、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、又は30個のアミノ酸を含み得る。リンカー本体配列は、α-ヘリックスペプチド配列を含み得る。リンカー本体配列は、配列EAAAKの反復を含み得る。リンカー本体配列は、配列EAAAKの1~10個の反復、例えば配列EAAAKの1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10個の反復、好ましくは配列EAAAKの3個の反復を含み得る。リンカー本体配列は、配列EQKLISEEDLを含み得る。
リンカーは、下記から選択される配列を含み得るか、又はそれからなり得る。
GLGEQKLISEEDLGLPETGG;
DBCO-EAAAKEAAAKEAAAKNGL(ここで、DBCOは、ジアリールサイトオクチンを指す);
アジド-GSSGSGGEQKLISEEDLGGSGGSGSGNGL;
GLGEQKLISEEDLGLPETGG;
GGGEQKLISEEDLGLPETGG;
GLGEQKLISEEDLGNGL;
GGGEQKLISEEDLGNGL;及び
GLG(EAAAK)5LPETGG。
GLGEQKLISEEDLGLPETGG;
DBCO-EAAAKEAAAKEAAAKNGL(ここで、DBCOは、ジアリールサイトオクチンを指す);
アジド-GSSGSGGEQKLISEEDLGGSGGSGSGNGL;
GLGEQKLISEEDLGLPETGG;
GGGEQKLISEEDLGLPETGG;
GLGEQKLISEEDLGNGL;
GGGEQKLISEEDLGNGL;及び
GLG(EAAAK)5LPETGG。
本明細書に開示される特定の方法は、エフェクター分子を含む。エフェクター分子は、タンパク質、酵素、細胞表面マーカー、モノクローナル抗体、一本鎖抗体、ナノボディ、治療剤、サイトカイン、ケモカイン、抗体断片及びこれらの組み合わせからなる群から選択され得る。いくつかの好ましい態様では、エフェクター分子は、モノクローナル抗体、一本鎖抗体又はナノボディである。
いくつかの態様では、エフェクター分子は、サイトカイン又はケモカインである。例えば、エフェクター分子は、IL-8、IL-12、CD137L、IL-15、IL-7、IL-2、又はIL-10であり得る。いくつかの態様では、エフェクター分子は、免疫調節リガンド、例えば4-1BBリガンド(4-1BBL)である。
いくつかの態様では、エフェクター分子は酵素である。例えば、エフェクター分子は、L-アスパラギナーゼ、アルギニンデアミナーゼ、ウリカーゼ、又は酵素補充療法において有用であることが知られている他の酵素であり得る。
いくつかの態様では、エフェクター分子は、抗体、例えば一本鎖抗体、ナノボディ、モノクローナル抗体又は抗原結合断片である。例えば、エフェクターは、白血病細胞マーカーなどのがん細胞マーカーなどの、目的とする標的に対して作製(raised)され得る。マーカーとしては、CXCR4/CD33、EGFR、HER2又は別のがん細胞表面タンパク質が挙げられる。エフェクターは、ボツリヌス毒素などの毒素に対して、又は細菌若しくはウイルスなどの病原体に対して作製(raised)され得る。
エフェクター分子は、C末端リガーゼ認識分子を含み得る。C末端リガーゼ認識分子は、好ましくは、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLから選択される配列である。
エフェクター分子は、ビオチン化エフェクター部分であり得る。ビオチン化エフェクター部分は、ビオチン部分を含むエフェクター部分、例えば、ビオチン部分にコンジュゲートされているエフェクター分子である。ビオチン部分は、好ましくは、アビジン又はストレプトアビジンに対するコンジュゲーションに利用可能であるように、エフェクター部分上に露出される。
エフェクター分子は、相補的なクリックケミストリー官能基を含み得る。相補的なクリックケミストリー官能基は、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分、ジアリールサイトオクチン(DBCO)部分又はトランスシクロオクチン(TCO)部分から選択され得る。相補的なクリックケミストリー官能基は、リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基に対して相補的である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がアジド部分である場合、相補的なクリックケミストリー官能基はDBCO部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がDBCO部分である場合、相補的なクリックケミストリー官能基はアジド部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がTCO部分である場合、相補的なクリックケミストリー官能基は、テトラジン部分又はメチルテトラジン部分である。リンカーペプチドのクリックケミストリー官能基がテトラジン部分又はメチルテトラジン部分である場合、相補的なクリックケミストリー官能基はTCO部分である。
エフェクター分子は、少なくとも10kDaのサイズを有し得る。例えば、エフェクター分子は、少なくとも10kDaのサイズを有する抗体又は抗原結合断片であり得る。エフェクター分子は、少なくとも10kDa、少なくとも10.5kDa、少なくとも11kDa、少なくとも11.5kDa、少なくとも12kDa、少なくとも12.5kDa、少なくとも13kDa、少なくとも13.5kDa、少なくとも14kDa、少なくとも14.5kDa、少なくとも15kDa、少なくとも16kDa、少なくとも17kDa、少なくとも18kDa、少なくとも19kDa、少なくとも20kDa、少なくとも21kDa、少なくとも22kDa、少なくとも23kDa、少なくとも24kDa又は少なくとも25kDaのサイズを有し得る。
エフェクター分子は、少なくとも7kDaのサイズを有し得る。例えば、エフェクター分子は、少なくとも7kDaのサイズを有する小タンパク質又はポリペプチドであり得る。エフェクター分子は、少なくとも7kDa、少なくとも7.5kDa、少なくとも8kDa、少なくとも8.5kDa、少なくとも9kDa、少なくとも9.5kDa、少なくとも10kDa、少なくとも10.5kDa、少なくとも11kDa、少なくとも11.5kDa又は少なくとも12kDaのサイズを有し得る。
本明細書に開示される方法は、OaAEP1リガーゼ、ソルターゼA、アスパラギニルペプチダーゼ、ブテラーゼ-1、又はこれらの任意の変異体若しくは多様体からなる群から選択されるリガーゼ、好ましくはOaAEP-Cys247Alaリガーゼを含み得る。本方法が、リンカーペプチドのRBCに対するコンジュゲーション及びエフェクター分子のRBC-リンカーコンジュゲートに対するコンジュゲーションを含む二工程法である場合、リンカーペプチドをRBCに対してコンジュゲーションするためのリガーゼ(第1のリガーゼ)及びエフェクター分子をRBC-リンカーコンジュゲートに対してコンジュゲーションするためのリガーゼ(第2のリガーゼ)は、同じであっても異なっていてもよい。好ましい態様では、第1及び第2のリガーゼは同じである。特に好ましい態様では、第1及び第2のリガーゼは、OaAEP1リガーゼ、好ましくはOaAEP1-Cys247Alaリガーゼである。
本明細書に記載されるいくつかの方法では、RBCは脱グリコシル化RBCである。換言すれば、RBCは予め処理されて、RBC膜中の糖タンパク質から糖鎖(carbohydrate)が除去されている。RBCは、PNGaseF、EndoH、O-グリコシダーゼ及びエキソグリコシダーゼ(マンノシダーゼ、ノイラミニダーゼ及びβ-N-アセチルヘキソサミニダーゼ)からなる群から選択されるグリコシダーゼ酵素により脱グリコシル化されていてもよい。例えば、赤血球を、PNGaseF、EndoH、O-グリコシダーゼ又はエキソグリコシダーゼ(マンノシダーゼ、ノイラミニダーゼ及び/又はβ-N-アセチルヘキソサミニダーゼ)と接触させる工程。本明細書で提供されるいくつかの方法では、赤血球を脱グリコシル化する工程は、赤血球とエフェクター分子又はリンカーペプチドを接触させる任意の工程の前に行われる。本明細書に開示される方法は、脱グリコシル化赤血球とペプチドを接触させること、例えば、脱グリコシル化赤血球とエフェクター分子又はリンカーペプチドを接触させることを含み得る。
本開示はまた、本明細書に開示される方法によって産生される修飾赤血球、及びそのための使用を記載する。
修飾赤血球は、外表面上に、天然の赤血球膜タンパク質に対してコンジュゲートされているペプチドを含み得る。ペプチドはエフェクター分子であり得る。その場合、エフェクター分子は膜タンパク質に対して直接コンジュゲートされ得る。ペプチドはリンカーペプチドであり得る。その場合、エフェクター分子はリンカーペプチドに対してコンジュゲートされ得る。したがって、いくつかの態様では、本開示は、外表面上にエフェクター分子を含む修飾赤血球を提供し、エフェクター分子は、リンカーペプチドを介して天然の赤血球膜タンパク質に対してコンジュゲートされている。リンカーペプチドは、任意の適切なリンカーペプチド、例えば、上記のリンカーペプチドであり得る。エフェクター分子は、任意の適切なエフェクター分子、例えば、上記のエフェクター分子であり得る。修飾赤血球は、脱グリコシル化赤血球であり得る。
一態様では、本開示は、医薬における使用のための修飾赤血球、疾患若しくは障害を治療するための医薬品の製造における修飾赤血球の使用、又は治療を必要とする個体若しくは患者に修飾赤血球を投与することを含む治療方法を提供する。治療は、酵素欠損症、代謝疾患、免疫関連障害、血液疾患、又はがんの治療であり得る。
別の態様では、本開示は、天然の赤血球を脱核後に表面修飾する方法であって、対象から得られた天然の赤血球をエフェクター分子に曝露することと、エフェクター分子を赤血球に対してコンジュゲートさせて赤血球を修飾することと、を含む方法、並びに本明細書に開示される方法によって得られる修飾赤血球、治療に使用するための本明細書に開示される赤血球、及び疾患又は障害を治療する医薬品の製造における本明細書に開示される修飾赤血球の使用に関する。
本発明は、記載された態様及び好ましい特徴の組み合わせを、そのような組み合わせが明らかに許容されないか又は明示的に回避される場合を除いて含む。
本発明は、非限定的な実施例及び添付の図面と併せて考慮しながら詳細な説明を参照することにより、十分に理解されるであろう。
より人工的でかつ許容され得るリポソーム及びDNAポリプレックスなどの薬物送達系と比べて長年冷遇されてきたが、近年になって、改変赤血球(RBC)及び細胞外小胞(EV)などの同種細胞療法が、有望な薬物担体として脚光を浴びている(Chatin et al., 2015; Durymanov & Reineke, 2018)。赤血球中への治療薬の封入は臨床試験において急速な進展が見られているが、赤血球の原形質膜には選択透過性があることから、適用は限定されている。
解決策には、治療用分子を赤血球表面上に固定した表面機能化赤血球の使用があるが、表面改変赤血球を作成する既存の方法では、生体適合性、効率及びスケーラビリティの間のバランスを成立させることが困難である。現在使用されているほとんどの表面修飾方法は、造血前駆細胞に対する過酷な化学処理又は遺伝子修飾のいずれかの処理と、その後のインビトロでの分化とを含み、非常に費用及び時間のかかるプロセスである。第1の例では、より生体適合性の高い化学的修飾方法であっても、赤血球表面タンパク質が例えば崩壊促進因子によって損なわれて、最終的には補体による溶解に至ることにより、インビボ半減期が減少することが示されている。酵素によるアプローチも、Shi et al.(Shi et al, 2014)によって開示されている。このアプローチでは、ソルターゼAの認識モチーフを発現するよう遺伝子操作した赤血球表面上に、ソルターゼAによりペプチドをライゲートする。この手法により、遺伝子操作した赤血球表面上への生体適合性のペプチドライゲーションが可能となり、赤血球を改変するプラットフォームの開発につながった。しかしながら、遺伝子操作法は、幹細胞の培養及び分化という手間と費用のかかる手順を必要とする。更に最近では、成熟赤血球は、ソルターゼAを使用してペプチドと直接コンジュゲートされ得ることが見出された(Pishesha et al, 2017)。しかしながら、成熟赤血球とタンパク質との共有結合によるコンジュゲーションは、まだ実証されていない。他には、親和性ベースでの赤血球結合分子及び脂質挿入という形態で当該分野への貢献があった。しかしながら、これらは全て、これらの方法に特徴的な、一過性であるという性質を有している(Villa et al, 2016; Villa et al, 2017)。
本開示は、生体適合性酵素法、部位特異的表面機能化赤血球について記載しており、該赤血球は、任意の事前の化学修飾又は遺伝子改変を経由せずに、安定的にコンジュゲートされたペプチド/タンパク質(例えば、限定されないが、モノクローナル抗体、シングルドメイン抗体、酵素、機能性タンパク質など)の細胞当たりの高コピー数を維持する。得られる改変赤血球は、コンジュゲートされたタンパク質の機能を維持し、コンジュゲーション後に毒性の徴候を示さない。この酵素アプローチは、他の方法、例えば、限定されないが、生体直交型クリックケミストリー及びストレプトアビジンによるコンジュゲーションと組み合わせることによって更に拡張され、改変赤血球の汎用性及び機能性を更に高める。これらの改変赤血球は、遺伝子操作した赤血球及び化学修飾した赤血球に対して、よりスケーラブルな方法を提供する。次いで、これらの修飾赤血球は、酵素補充療法、細胞ベースの免疫療法並びに予防的及び治癒的な他の治療を含むがこれらに限定されない、さまざまな疾患のための前臨床開発に応用される。
一態様では、脱核後の赤血球を表面修飾する方法であって、天然の赤血球を曝露することと、エフェクター分子を赤血球にコンジュゲートして赤血球を修飾することと、を含む方法が開示される。一例では、赤血球は天然の赤血球である。別の例では、(天然の)赤血球はヒトから得られる。更に別の例では、赤血球は、遺伝子操作又は遺伝子改変をなされていない。遺伝子改変された赤血球は天然の赤血球とは異なり、当業者であればこれら2つを区別し得ることが理解される。
一態様では、本明細書に開示される方法は、シングルドメイン抗体(sdAB)を含むがこれに限定されない、少なくとも100個のアミノ酸を含有するタンパク質を用い天然の赤血球を生成/修飾するために使用される。別の例では、天然の赤血球は、本明細書に記載されるように、細胞表面上で酵素により修飾される。別の例では、エフェクター分子は、20個以上のアミノ酸を含むペプチドである。一例では、リンカーはペプチドである。別の例では、本明細書に記載されるリンカーは、ソルターゼ反応に適した一端と、タンパク質リガーゼ反応に適した他端とを有する。
本明細書には、生体適合性、効率、安定性、速度及びスケーラビリティの間のバランスを成立させるアプローチを使用して生成される、表面修飾された赤血球が提示される。これらの表面改変赤血球は、限定するものではないが主にタンパク質リガーゼ(例えば、限定されないが、ブテラーゼ-1、OaAEP1、それらの多様体及び変異体)を使用して修飾され、そのため、プロセスからの悪影響を受けない。ライゲーションが、タンパク質、ペプチド、モノクローナル抗体又は他の官能基を高いコピー数でRBC膜上に安定に組み込むことを可能にする。また、本明細書では、このワークフロー全体を通して確立された生体適合性プロファイルを維持しながら、このアプローチの汎用性を拡張し、さまざまな治療用タンパク質を赤血球表面上にコンジュゲートするための、二工程ライゲーション、生体直交型の銅フリーのクリックケミストリー、及びストレプトアビジンを介したビオチン化分子のコンジュゲーションが開示される。特に、銅フリーのクリックケミストリーと併せて酵素によるライゲーションを利用するコンビナトリアルアプローチは、目的とする任意のアジドタグ付加分子の、赤血球表面上への完全に生体適合性で共有結合による部位特異的コンジュゲーションを、高いコピー数でもたらす。一例では、本明細書に開示される赤血球には、リンカーによってエフェクター分子が付着する。別の例では、赤血球にリンカーが付着した後、リンカーにエフェクター分子が結合する。
これらの表面機能化赤血球を生成するために本明細書で使用される手順は、迅速であり(目的とする分子に応じて3~5時間以内に完了することができる)、容易に拡張可能であり(血液は血液バンク/患者から容易に得ることができ、他の試薬は社内で容易に製造することができる)、目的とする分子を一貫して高いコピー数でもたらす。コンジュゲートされた分子は安定であり、インビトロ及びインビボのいずれでも赤血球表面上でそのままの状態及び機能を保持する。したがって、このプラットフォームは、限定するものではないが、酵素欠損症(例えば、赤血球表面への酵素の固定を介して半減期を延長させ、頻繁な投薬の必要性を減少させる)、免疫関連障害(例えば、人工赤血球ベースのAPCを介した抗原の提示)、代謝疾患(例えば、家族性高コレステロール血症、ゴーシェ病、Hunter症候群、クラッベ病、メープルシロップ尿症、異染性白質ジストロフィー、ミトコンドリア脳症、乳酸アシドーシス、脳卒中様エピソード(MELAS)、ニーマン・ピック病、フェニルケトン尿症(PKU)、ポルフィリン症、テイ・サックス病、及びウィルソン病)、血液疾患(例えば、慢性疾患の貧血、再生不良性貧血、赤血球増多症、ヘモクロマトーシス、凝固亢進障害、免疫性血小板減少性紫斑病、鉄欠乏性貧血、白血球増加症、白血球減少症、真性赤血球増加症、鎌状赤血球貧血、及び血栓性血小板減少性紫斑病)、並びにがん(例えば、赤血球表面でのアスパラギナーゼなどの酵素を介した腫瘍飢餓(tumour starvation)などの、さまざまな疾患の治療のための代替手段を提供する。
一態様では、天然の赤血球がビオチン化ペプチドに対してコンジュゲートされる。別の例では、赤血球はB-TL5に対してコンジュゲートされる。別の例では、赤血球はリンカーに対してコンジュゲートされ、リンカーはラクダ科動物由来のシングルドメイン抗体(約15~30kDa)に対してコンジュゲートされる。別の例では、赤血球はリンカーにコンジュゲートされ、リンカーは抗EGFR単一ドメイン抗体に対してコンジュゲートされる。更に別の例では、赤血球は、ビオチン化抗hisタグモノクローナル抗体コンジュゲートヒト赤血球である。別の例では、赤血球は、DBCOタグ付加ペプチド(EK18)とコンジュゲートされる。
赤血球は、さまざまな抗体及び/又はタンパク質を高いコピー数で安定的にコンジュゲートされ、コンジュゲーション後に機能を維持することができる。
大きなタンパク質分子を高いコピー数でもたらす安定な表面修飾の既存の方法は、赤血球/前駆細胞の化学的操作又は遺伝子操作のいずれかを採用するものであり、赤血球の半減期及び機能のいずれにも有害であるか、又は費用及び時間がかかる前駆細胞の操作を伴う。本願は、以前は大がかりな遺伝子操作/化学的操作後にのみ利用可能であった汎用性及び高いコピー数を、酵素による方法で得ることができるようにした最初の例である。クリックケミストリー及び/又はストレプトアビジンを使用するこのアプローチの拡張は、表面機能化赤血球の機能性を高めるのに更に役立つ。特に、酵素によるライゲーションと組み合わせた銅フリーのクリックケミストリーは、検出され得る有害作用若しくは免疫原性作用、又はインビボ半減期の減少、を全く伴わずに、赤血球表面に対する高いコピー数でのタンパク質の部位特異的、生体直交型で、共有結合によるコンジュゲーションを可能にする。
表面改変赤血球は赤血球としての機能が損なわれず、かつ改変赤血球を生成するプロセスは、酵素によるタンパク質ライゲーション、生体直交型のクリックケミストリー及び強い親和性相互作用などの、生体適合性の方法を用いる。
本願の方法は表面機能化のための高度に生体適合性の方法を利用し、処理段階中の赤血球に対する損傷又は有害な処理による一切のリスクを回避する。本願は、更なる処理のために赤血球膜上に官能基を導入する又は完全なタンパク質上に官能基を導入するのに化学修飾を利用する必要がある他の方法を上回る利点を提供する。既存のデータは、赤血球の直接的な化学的ビオチン化などの化学修飾方法が、赤血球上の崩壊促進因子(DAF)を損なう可能性があり、補体による溶解につながり得ることを示している。
コンジュゲート部分は、未修飾の赤血球の場合と同様に、長期間にわたってインビボで赤血球の表面上で安定である。
これらの改変赤血球は、未修飾の赤血球と同様のインビボ半減期を示すだけでなく、これらの改変赤血球はまた、コンジュゲート部分をインビボで維持して分解からある程度保護する。更に、コンジュゲーションの共有結合による性質及び安定な性質は、時間が経ってもコンジュゲート部分が赤血球表面から脱落しないことを意味する。脱落しないことは、時間が経つとコンジュゲート分子がRBCから分離する傾向がある、ペプチド/抗体介在性の親和性ベースのコンジュゲーション方法と比較して有利である。
この方法は、効率及び生体適合性を維持する赤血球表面修飾のための任意の既存の方法よりも安価、迅速かつ単純である。更に、スケールアップが容易である。血液は治療の数時間前にドナーから得ることができ、3~5時間以内に洗浄して、表面が十分に機能化された赤血球を得ることができる。これらの赤血球は、輸血と同様の方法で患者に安全に投与して戻すことができる。毒性であり得る化学物質及び/又は遺伝的修飾が存在しないことで、本願方法はより容易に臨床に転用可能となる。
赤血球はヒトから得る必要がある。赤血球は、意図されたレシピエントに由来していてもよいし、適合性のある供血者(O型供血者が好ましい)である任意の他の個体由来であってもよい。
先行技術において開示される方法では、特にナノボディなどのより大きなタンパク質分子の効率的なソルタギング(sortagging)(ソルターゼによる表面修飾を意味する)のために、遺伝子操作された赤血球を使用する必要がある。本願に開示された方法ではそのような赤血球を使用する必要はない。当該技術分野に開示されている方法はまた、未修飾細胞に対するペプチドの酵素コンジュゲーションのみを含み、この方法は以前にはソルターゼを用いて実証されていた。したがって、一例では、本明細書に開示される方法は、ソルターゼを使用せずに表面修飾赤血球を生成する。別の例では、ソルターゼは、コンジュゲーション目的では使用されない。
しかしながら、先行技術は、酵素による方法を、例えば、酵素などのより大きな機能性分子のコンジュゲーションに採用していない。先行技術に開示されているいくつかの方法は、化学的方法を使用した赤血球の直接ビオチン化を開示しており、それらの方法は、特に長期インビボ研究において、赤血球に悪効果を及ぼすことが示されている。
現在の酵素補充療法は、不足している酵素を補充するために頻繁に精製酵素を投与することによる。これらの酵素は非常に短い半減期を有しており、速やかに循環血から失われる。しかしながら、本コンジュゲーション方法は、成熟赤血球の半減期(30日~90日)と同等の半減期を提供し、この半減期は既存の方法よりも著しく長い。
抗体/デコイ受容体でコーティングされた赤血球を使用する予防/中和療法は、抗原/ウイルス/毒素に結合し、中和することができる。しかしながら、かかる療法は有効性が低く、コストが高いため、臨床試験段階には至っていない。本方法は、この制限を克服する。
免疫系を活性化するための細胞ベース療法の使用もまた、本出願の範囲において企図される。かかる戦略の1つは、赤血球を抗原提示細胞(APC)として使用することを含む。このプラットフォームを使用して、抗原分子を共刺激分子と併せて提示して、免疫系の抗原認識部位(specific arms)を活性化することができる。
本明細書に開示される方法に基づき、赤血球は、例えば、さまざまな抗体及び/又はタンパク質と高いコピー数で安定的にコンジュゲートし、かつコンジュゲーション後に機能を維持することができる。クリックケミストリー及び/又はストレプトアビジンを使用するこのアプローチの拡張は、表面機能化赤血球の機能性を高めるのに更に役立つ。酵素によるライゲーションと組み合わせた銅フリーのクリックケミストリーは、検出され得る有害作用若しくは免疫原性作用、又はインビボ半減期の減少、をほとんど~全く伴わずに、赤血球表面に対する高いコピー数でのタンパク質の部位特異的、生体直交型で、共有結合によるコンジュゲーションを可能にする。
表面改変赤血球は、生体適合性の方法、例えば、酵素タンパク質ライゲーション、生体直交型のクリックケミストリー、及び表面機能化のための強い親和性相互作用を利用し、処理段階中の赤血球に対する、損傷又は有害な処理による一切のリスクを回避する。
酵素補充療法:現在の酵素補充療法は、不足している酵素を補充するために頻繁に精製酵素を投与することによる。精製酵素は非常に短い半減期を有しており、速やかに循環血から失われる。それらはまた、しばしば半減期を延長させる分子(例えば、PEG)とコンジュゲートされる。しかしながら、そのようなコンジュゲートは薬物のインビボ半減期を僅かに延長するだけである。代わりに赤血球へのコンジュゲーションは、成熟赤血球の半減期(30日~90日)と同等の半減期を提供し、この半減期は既存の方法よりも著しく長い。酵素補充療法の臨床試験では多くの赤血球ベースの療法が存在するが、それらの全ては、赤血球の内部に酵素を封入することを含む。この手法の適用は、酵素基質が(赤血球膜の既存の内因性輸送体を介して)赤血球に自然に入ることができる酵素に限られる。本開示に記載される改変赤血球は、そのような制限を有さず、赤血球ベースの酵素補充療法の範囲を広げる。酵素補充療法において有用であることが知られている酵素としては、アスパラギナーゼ、アルギニンデアミナーゼ及びウリカーゼが挙げられる。
予防/中和療法:抗体/ウイルス/毒素に結合し、中和することができる、抗体/デコイ受容体でコーティングされた赤血球。複数のグループが本願の概念について証拠を提出しているが、いずれも臨床試験には到達しておらず、そのほとんどは有効性の低さ及び高コストによる制限がある。本開示で提示される単純かつ効率的なアプローチは、これらの制限のいくつかを克服することができる。
免疫調節:多くのグループが、免疫系を活性化するための細胞ベース療法の使用を調査している。かかる戦略の1つは、赤血球を抗原提示細胞(APC)として使用することを含む。このプラットフォームを使用して、抗原分子を共刺激分子と併せて提示して、免疫系の抗原認識部位を活性化することができる。本明細書に開示される方法は、赤血球を含む。本方法は、単個の赤血球又は複数の赤血球を用意する工程を含み得る。本方法は、全血のサンプルを用意することと、全血から赤血球のサンプルを調製することと、を含み得る。
好ましくは、RBCは、ヒト若しくは動物の血液サンプルに由来するか、又は初代細胞若しくは不死化赤血球細胞株に由来する赤血球である。血液細胞は、治療を受ける患者と型が一致していてもよく、したがって、血液細胞は、A型、B型、AB型、O型、又はOh型であってもよい。好ましくは、血液はO型である。血液は、Rh陽性又はRh陰性であり得る。場合によっては、血液は、O型及び/又はRh陰性、例えばO-型である。血液は、疾患又は障害がないこと、例えば、HIV、鎌状赤血球貧血、マラリアがないことが確認されていてよい。しかしながら、任意の血液型を使用してもよい。場合によっては、RBCは自己由来であり、治療を受ける患者から得られた血液サンプルに由来する。場合によっては、RBCは同種異系であり、治療を受ける患者から得られた血液サンプルに由来しない。
サンプルは全血サンプルであってもよい。好ましくは、サンプルの細胞成分が赤血球であるように、赤血球以外の細胞がサンプルから除去されている。
サンプル中の赤血球は濃縮されていてもよく、又は全血サンプルの他の成分、例えば白血球)から分けられていてもよい。赤血球は遠心分離によって濃縮され得る。サンプルは、白血球除去フィルターなどによる白血球の低減に供され得る。サンプルは、PBS洗浄などの洗浄などによって、血漿及び血小板を除去するように処理されてもよい。
赤血球は、低速遠心分離によって、かつ白血球除去フィルターを使用して、白血球及び血漿を含有する全血サンプルから分離することができる。場合によっては、赤血球サンプルは、他の細胞型、例えば白血球を含有しない。換言すれば、赤血球サンプルは実質的に赤血球から構成される。
得られたRBCは、更なる処理、例えば、洗浄、タグ付加、及び任意選択的にローディングなどに供され得る。
特に、RBCは脱グリコシル化されてもよい。
本明細書に開示される方法は、修飾赤血球の産生をもたらす。かかる赤血球は、外表面上に修飾を受けている。このような赤血球は、表面修飾赤血球、表面機能化赤血球又は修飾赤血球と呼ばれ得る。これらの用語は、本明細書において互換的に使用される。
本明細書に開示される方法は、エフェクター分子のRBCに対するコンジュゲーションに関する。「コンジュゲーション」という用語は、エフェクター分子のRBCに対する結合を指す。コンジュゲーションは、直接的(すなわち、リンカーなしでエフェクター分子がRBCに結合する)又は間接的(すなわち、リンカーによってエフェクター分子がRBCに結合する)であり得る。コンジュゲーションは、共有結合の形成をもたらし得る。コンジュゲーションは、リガーゼによって触媒される、酵素によるライゲーションなどのライゲーションであってもよい。コンジュゲーションは、ビオチン-ストレプトアビジン相互作用であってもよい。コンジュゲーションは、クリックケミストリーから生じてもよい。
本明細書で使用される場合、「クリックケミストリー」という用語は、化学合成における概念を指す。「クリック」ケミストリーは、バイオコンジュゲーションにおいて一般的に使用され、選択された基質と特定の生体分子とを結合させる、生体適合性の小分子反応の一種を指す。クリックケミストリーは単一の特異的反応ではなく、自然界に見られるように産物を生成し、かつ小さなモジュール単位を結合させることによって物質を生成する方法であると理解されている。クリック反応の使用例としては、生体分子とレポーター分子との結合が挙げられるが、これに限定されない。クリックケミストリーは、生物学的条件に限定されず、「クリック」反応の概念は、薬理学的用途及びさまざまなバイオミメティクス用途において使用されている。しかしながら、クリックケミストリーは、特に生体分子の検出、局在化及び定量化において役立っている。本明細書に開示される方法は、一般に銅フリーのクリックケミストリーと呼ばれる生体適合性のクリックケミストリーを使用する。
クリック反応は、典型的にはワンポットで生じ、水によって妨害されず、最小限かつ無害な副産物を生成し、熱力学的駆動力が高く、高い反応特異性(場合によっては、位置特異性及び立体特異性の両方を有する)で反応を迅速かつ不可逆的に、高収率で単一反応産物へと駆動する。これらの性質は、クリック反応を、複雑な生体環境下で分子を分離及び標的化する際の課題に特に適したものにする。したがって、そのような環境下では、反応産物は生理学的に安定である必要があり、任意の副産物は非毒性である必要がある(例えば、インビボ系での使用のために)。
本明細書に開示される方法に有用なクリックケミストリーの方法は、SPAAC(strain-promoted alkyne-azide cycloaddition)及び逆電子要請型Diels-Alder(IEDDA)である。SPACCは、相補的なクリックケミストリー官能基ジアリールシクロオクチン(DBCO)及びアジドを含み得る。IEDDAは、相補的なクリックケミストリー官能基トランスシクロオクチン(TCO)及びテトラジン又はメチルテトラジンを含み得る。
特異的かつ制御可能な生体直交型反応(すなわち、天然の生化学プロセスに干渉せずに生体系の内部で生じ得る任意の化学反応)を開発することによって、例えば、標的を認識し、その標識にクリック反応により結合する小分子プローブを使用することで、クリックケミストリーは生細胞での使用に適合したものとなった。要するに、クリックケミストリーは、高収率であり、対象が広く、クロマトグラフィーを行わずとも除去することができる副産物のみを生成し、立体特異的であり、実施するのが簡単であり、容易に除去可能な溶媒又は低負荷溶媒(benign solvents)中で行うことができる反応について記載する。
本明細書に記載される方法は、リガーゼの存在下で、赤血球をリンカー分子又はエフェクター分子と接触させることを含む。「接触させる」とは、成分にコンジュゲーションさせるのに十分近くに各成分を近接させることを意味する。「接触させる」及び「インキュベートする」という用語は、互換的に使用される。接触は、室温、例えば約20℃で行うことができる。接触は、好ましくはリガーゼの存在下で行われる。接触を行う温度は、リガーゼの任意の機能のための温度に従って最適化することもできる。好ましくは、リガーゼはOaAEP1リガーゼであり、温度は約25℃である。接触は、リガーゼにコンジュゲーションを触媒させるための期間などの、コンジュゲーションを生じさせるのに適した期間にわたって行われ得る。適切な期間は当業者であれば容易に認識可能であり、1日、1日未満、12時間、又は12時間未満、例えば、約12時間、約11時間、約10時間、約9時間、約8時間、約7時間、約6時間、約5時間、約4時間、約3時間、約2時間、約1時間の接触を含み得る。多くの場合、適切な時間は約3時間である。
リンカー又はエフェクター分子を赤血球にコンジュゲートする工程は、RBC-リンカー又はRBC-エフェクターコンジュゲートの形成をもたらす。RBC-リンカーコンジュゲート又はRBC-エフェクター分子コンジュゲートの形成後、例えば接触工程の後、洗浄工程が存在してもよい。換言すれば、RBC-リンカーコンジュゲート又はRBC-エフェクター分子コンジュゲートを洗浄することができる。洗浄は、RBCに対してコンジュゲートされていないエフェクター分子又はリンカーなどの、コンジュゲートされていない混合物成分を除去することができる。洗浄は、リガーゼ又はストレプトアビジンを除去することができる。適切な洗浄方法は当業者であれば認識可能であり、緩衝液中での洗浄、例えばPBS中での洗浄を含み得る。本方法は、RBC-リンカーコンジュゲート又はRBC-エフェクター分子コンジュゲートが、コンジュゲートされていないリンカー又はエフェクター分子又はリガーゼを実質的に含まないように、1回、2回、3回、4回以上の洗浄、又は任意の回数の洗浄を含み得る。
第1の接触工程がRBCのリンカーに対するコンジュゲーションを含む場合、更なる接触工程を使用してもよい。そのような工程は、RBC-リンカーコンジュゲートをエフェクター分子と接触させることを含む。接触は、室温、例えば約20℃で行うことができる。接触は、リガーゼの存在下で行われ得る。そのような場合、接触を行う温度は、リガーゼの任意の機能のための温度に従って最適化することもできる。接触を行う温度は、ビオチン-ストレプトアビジン相互作用のために最適化することもできる。接触を行う温度は、クリックケミストリーのために最適化することもできる。接触は、コンジュゲーションが起こるのに適した期間にわたって行われ得る。適切な期間は当業者であれば容易に認識可能であり、1日、1日未満、12時間、又は12時間未満、例えば、約12時間、約11時間、約10時間、約9時間、約8時間、約7時間、約6時間、約5時間、約4時間、約3時間、約2時間、約1時間の接触を含み得る。多くの場合、適切な時間は約3時間である。
リンカー又はエフェクター分子を赤血球に対してコンジュゲートする工程は、RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートの形成をもたらす。RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートの形成後、例えば接触工程後に、洗浄工程が存在してもよい。換言すれば、RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを洗浄してもよい。洗浄は、RBCに対してコンジュゲートされていないエフェクター分子などの、コンジュゲートされていない混合物成分を除去することができる。洗浄は、リガーゼを除去することもできる。適切な洗浄方法は当業者であれば認識可能であり、緩衝液中での洗浄、例えばPBS中での洗浄を含み得る。本方法は、RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートが、コンジュゲートされていないエフェクター分子及び/又はリガーゼを実質的に含まないように、1回、2回、3回、4回以上の洗浄、又は任意の回数の洗浄を含み得る。
本明細書に開示されるいくつかの方法は、脱グリコシル化赤血球に対するコンジュゲーションを含む。赤血球は、リンカー及び/若しくはエフェクター分子に対するコンジュゲーションの前に、又はリンカーに対するコンジュゲーションの後に、又はリンカーのエフェクター分子に対するコンジュゲーションの後に脱グリコシル化され得る。好ましくは、赤血球は、リンカー/エフェクター分子のコンジュゲーションの前に脱グリコシル化される。換言すれば、任意のコンジュゲーション工程の前に、赤血球は脱グリコシル化を受けていてもよい。場合によっては、赤血球は、コンジュゲーション方法の前に脱グリコシル化される。すなわち、最初の又は唯一の接触工程に供された赤血球は脱グリコシル化されている。いくつかの方法では、本方法の第1の工程は、赤血球を脱グリコシル化することである。赤血球を脱グリコシル化する方法は当該技術分野において公知であり、赤血球をPNGaseF、EndoH、O-グリコシダーゼ又はエキソグリコシダーゼ(マンノシダーゼ、ノイラミニダーゼ及び/又はβ-N-アセチルヘキソサミニダーゼ)と接触させることなどによる酵素による脱グリコシル化が含まれる。いくつかの方法では、赤血球は、O-グリコシダーゼとエキソグリコシダーゼとの組み合わせで脱グリコシル化される。
本明細書に開示されるいくつかの方法では、赤血球は、N末端ビオチン部分を含むリンカーに対してコンジュゲートされる。そのような方法は、ビオチン化エフェクター分子を赤血球に対してコンジュゲートさせて赤血球-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを形成するのに有用であり得る。そのような実施形態では、リンカー及びエフェクター分子の両方がビオチン部分を含み得る。そのような方法では、赤血球-リンカーコンジュゲートをビオチンコンジュゲートエフェクター分子と接触させる前に、赤血球-リンカーコンジュゲートをストレプトアビジンなどのビオチン結合分子と接触させる更なる工程を含む必要がある。
本明細書で使用される場合、「エフェクター分子」という用語は、特定の予測可能な効果を有することによって、その効果が、本明細書に開示される方法及び修飾赤血球を扱う者の裁量で選択され得る、分子又は活性物質を指す。例えば、がんを治療することが意図される場合、赤血球に対してコンジュゲートさせるエフェクター分子は、前出のがんに対する抗体、又はがん特異的受容体若しくはがん細胞に結合するタンパク質であり得る。エフェクター分子の例としては、タンパク質、酵素、細胞表面マーカー、モノクローナル抗体などの抗体、サイトカイン、ケモカイン、抗体断片、ナノボディ、治療剤、及びこれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。別の例では、本明細書に開示されるエフェクター分子は、機能性ペプチド、例えば、限定されないが、蛍光タンパク質、タグ付加タンパク質及び親和性結合のためのタンパク質などを付加することによって更に修飾することができる。
「抗体」には、その断片若しくは誘導体、又は合成抗体若しくは合成抗体断片が含まれる。モノクローナル抗体技術に関する今日の技術を考慮すると、抗体はほとんどの抗原に対して作製することができる。
選択された抗原に対する適切なモノクローナル抗体を、公知の技術、例えば、Monoclonal Antibodies: A manual of techniques, H Zola (CRC Press, 1988)及びMonoclonal Hybridoma Antibodies: Techniques and Applications, J G R Hurrell (CRC Press, 1982)に開示される技術によって作製することもできる。キメラ抗体は、Neuberger et al (1988), 8th International Biotechnology Symposium Part 2, 792-799)によって考察されている。
Fab断片及びFab2断片などの断片は、遺伝子操作された抗体及び抗体断片と同様に使用することができる。抗体の重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインが抗原認識に関与していることは、初期のプロテアーゼ消化実験によって最初に認識された。更なる確認は、げっ歯類抗体の「ヒト化」によってなされた。げっ歯類の可変ドメインは、得られる抗体がげっ歯類親抗体の抗原特異性を保持するように、ヒトの定常ドメインに融合させることもできる(Morrison et al (1984)Proc. Natl. Acad. Sd. USA 81, 6851-6855)。本明細書に開示される表面機能化赤血球において有用な抗体又は抗原結合断片は、標的分子を認識及び/又は結合する。
抗原特異性が可変ドメインによって付与され、定常ドメインとは無関係であることは、全てが1つ以上の可変ドメインを含有する抗体断片の細菌発現を伴う実験から知られている。これらの分子としては、Fab様分子(Better et al. (1988) Science 240, 1041)、Fv分子(Skerra et al. (1988) Science 240, 1038)、VH及びVLパートナードメインが柔軟なオリゴペプチドを介して結合されている一本鎖Fv(ScFv)分子(Bird et al. (1988) Science 242, 423、Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sd. USA 85, 5879)並びに単離されたVドメインを含むシングルドメイン抗体(dAb)(Ward et al. (1989) Nature 341, 544)が挙げられる。それらの特異的結合部位を保持する抗体断片の合成に関与する技術の一般的な概説は、Winter & Milstein (1991) Nature 349, 293-299に見られる。本明細書で有用な抗体及び断片は、ヒト若しくはヒト化、マウス、ラクダ科動物、キメラ、又は任意の他の適切な供給源からのものであり得る。
「ScFv分子」とは、VH及びVLパートナードメインが、例えば、ペプチドによって、又はフレキシブルなオリゴペプチドによって直接共有結合している分子を意味する。Fab、Fv、ScFv及びsdAb抗体断片は全て大腸菌(E. coli)による発現及び分泌が可能であり、したがって当該断片の大量産生は容易である。
全抗体及びF(ab’)2断片は「二価」である。「二価」とは、当該抗体及びF(ab’)2断片が2つの抗原結合部位を有することを意味する。対照的に、Fab、Fv、ScFv及びsdAb断片は一価であり、抗原結合部位を1つのみ有する。一価の抗体断片はサイズが小さいため、タグとして特に有用である。
場合によっては、結合分子は、単鎖抗体又はscAbである。scAbは、共有結合したVH及びVLパートナードメイン(例えば、直接的に、ペプチドによって、又はフレキシブルなオリゴペプチドによって)と、任意選択的に軽鎖定常ドメインと、からなる。
いくつかの好ましい実施形態では、抗体は検出可能に標識されているか、又は少なくとも検出可能である。例えば、抗体は、放射性原子又は着色分子又は蛍光分子又は任意の他の方法で容易に検出され得る分子で標識され得る。適切な検出分子としては、蛍光タンパク質、ルシフェラーゼ、酵素基質、及び放射性標識が挙げられる。抗体は、検出可能な標識で直接標識されてもよく、又は間接的に標識されてもよい。例えば、抗体は標識されていなくてもよく、標識済みの別の抗体によって検出することができる。あるいは、二次抗体にビオチンを結合させ、標識ストレプトアビジンを該ビオチンに結合させることにより一次抗体を間接的に標識してもよい。
本明細書に開示される特定の方法では、エフェクター分子はナノボディである。本明細書で使用される場合、単一ドメイン抗体(sdAb)又はVHHとしても知られる「ナノボディ」という用語は、単一の可変抗体ドメイン単量体からなる抗体断片を指す。ナノボディは、全抗体と同様に選択的に特異的抗原に結合することができる。通常12~15kDaの分子量を有し、単一ドメイン抗体は、2つのタンパク質重鎖と2つの軽鎖とで構成される一般的な抗体(通常150~160kDa)よりもはるかに小さく、Fab断片(およそ50kDa、1つの軽鎖及び半分の重鎖)並びに単鎖可変断片(およそ25kDa、2つの可変ドメイン、1つは軽鎖由来、1つは重鎖由来)よりも更に小さい。
モノクローナル抗体及びナノボディなどの抗体及び抗原結合断片は、任意の適切な標的を対象とし得る(すなわち、結合し得る)。例えば、抗体又は抗原結合断片は、EGFR若しくはIL8に結合してもよく、又はT細胞/免疫細胞活性化抗体、又は抗毒素抗体若しくは抗病原体抗体であってもよい。
本明細書に開示されるいくつかの方法は、OaAEP1リガーゼを使用する。OaAEP1リガーゼは、植物種Oldenlandia affinis(O. affinis)に由来する。OaAEP1リガーゼは、アスパラギニルエンドペプチダーゼ(AEP)ファミリーの原核生物酵素である。AEP酵素は典型的にはプロテアーゼとして作用するが、OaAEP1などのいくつかのAEP酵素は、進化したリガーゼ機能を有する。本明細書に開示される方法による好ましいOaAEP1リガーゼは、OaAEP-Cys247Alaリガーゼである。OaAEP-Cys247Alaリガーゼは247位にCysからAlaへの点変異を有しており、カルボキシル末端選別シグナルを認識及び切断することによって表面タンパク質を修飾する。OaAEP1リガーゼのほとんどの基質について、認識シグナルは、モチーフ-N-X1L(Asn-X1-Leu、ここで、X1は、任意のアミノ酸、好ましくはA、C、D、E、F、H、K、G、I、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、W又はY、最も好ましくはG、D又はPから選択される任意のアミノ酸)からなる。切断は、アスパラギン(N)と隣接残基との間で起こる。場合によっては、リガーゼ認識配列は、N末端に配列GG(Gly-Gly)を含む。この場合、リガーゼ認識シグナルは、モチーフLPXTG(Leu-Pro-any-Thr-Gly)を含み得る。OaAEP1リガーゼ、及びOaAEP!-Cys247Alaリガーゼは、国際公開第2018/056899号(A1)に記載されており、その全内容は参照により本明細書に組み込まれる。リガーゼは、下表に示す配列と少なくとも80%の同一性、少なくとも85%の同一性、少なくとも90%の同一性、少なくとも95%の同一性、少なくとも98%の同一性又は100%の同一性、好ましくは少なくとも95%の同一性、少なくとも98%の同一性又は100%の同一性を有する配列を有し得る。
本明細書で使用される場合、「ソルターゼ」という用語は、カルボキシル末端選別シグナルを認識及び切断することによって表面タンパク質を修飾する原核生物酵素の群を指す。ソルターゼ酵素のほとんどの基質では、認識シグナルは、モチーフLPXTG(Leu-Pro-any-Thr-Gly)と、次いで高度に疎水性の膜貫通配列と、続いて塩基性残基(例えば、アルギニンなど)のクラスターとからなる。切断は、スレオニン(Thr)残基とグリシン(Gly)残基との間で生じ、スレオニン(Thr)残基を介して活性部位システイン(Cys)残基に一時的に付加し、続いてタンパク質を細胞壁成分に共有結合させるペプチド転移が生じる。ソルターゼは、ほとんど全てのグラム陽性細菌及び時折グラム陰性細菌(例えば、Shewanella putrefaciens)又は古細菌(例えば、Methanobacterium thermoautotrophicum)に存在する。ソルターゼは、Creative Enzyme(EXWM-4247)及びActive Motif(13100)などの多くの供給元から市販されている。特に好ましいソルターゼは、Addgeneに#51141として寄託されたpet30b-7M SrtAプラスミドによってコードされるソルターゼAヘプタミュータント(heptamutant)である。
本明細書に開示されるいくつかの方法は、ビオチンとストレプトアビジンとの相互作用を含む。ビオチンは、タンパク質又はペプチドの機能又は活性を変化させずに当該タンパク質及びペプチドに容易に付加することができる、小さく安定な複素環式化合物である。多くのタンパク質が、ストレプトアビジンを含むビオチンに結合し、強い非共有結合相互作用を形成することが知られている。タンパク質又はペプチドをビオチンにコンジュゲートするためのキット及び方法は、当該技術分野において周知であり、当業者であれば容易に認識され、例えば、ビオチンコンジュゲーションキット(タイプB、Abcam(商標)、ab201796)が挙げられる。
本明細書に記載の方法に有用なエフェクター分子は、修飾されてもよい。特に、エフェクター分子は、赤血球膜タンパク質又はリンカーへのエフェクター分子のコンジュゲーションを容易にするように操作されてもよい。特に、エフェクター分子は、リガーゼ認識配列、ビオチン若しくはストレプトアビジン部分、又はアジド、テトラジン、メチルテトラジン、ジアリールサイトオクチン(DBCO)若しくはトランスシクロオクチン(TCO)部分を含み得るか、又は含むように操作され得る。
いくつかの態様では、エフェクター分子は、C末端リガーゼ認識配列、好ましくはC末端リガーゼ認識配列を含む。特異的リガーゼ認識配列は、コンジュゲーションを行うために使用されるリガーゼによって異なる。好ましくは、リガーゼ認識配列はOaAEP1リガーゼ認識配列である。リガーゼ認識配列は、以下:NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNGから選択される、任意のリガーゼ認識配列であり得る。好ましい方法では、エフェクター分子は、C末端NGL、NDP又はNPLモチーフ、最も好ましくはNGLを含む。いくつかの方法では、エフェクター分子は、C末端に-NGLモチーフを含み、例えば、C末端にモチーフを含むように設計されている。いくつかの方法では、エフェクター分子はC末端に-GGを含み、例えば、N末端にモチーフを含むように設計されており、例えば、エフェクター分子は、配列LPXTGGを含むように設計されている。追加のリガーゼ認識配列/モチーフなどの追加の配列を含むようにタンパク質及びペプチドを設計する方法は、当業者に周知であり、例えば、Sambrook et al.に報告されている方法が挙げられる。かかるエフェクター分子を、エフェクター分子がRBCに直接コンジュゲートされる「一工程」法において使用することもできる。かかるエフェクター分子はまた、最初にRBCにリンカーをコンジュゲートし、続いてリンカーにエフェクター分子をコンジュゲートする「二工程」法において使用することもできる。
他の態様では、エフェクター分子は、C末端ビオチンモチーフを含み、好ましくはC末端にビオチンモチーフを含む。エフェクター分子は、C末端にビオチン部分を含むように設計されていてもよい。追加の配列を含むようにタンパク質及びペプチドを設計する方法、例えばビオチン部分を付加する方法は当業者に周知であり、例えば、Sambrook et al.に報告されている方法が挙げられる。
更に他の態様では、エフェクター分子はC末端アジド部分を含む。エフェクター分子は、エフェクター分子とアジドとのコンジュゲーション後にC末端アジド分子を含んでもよい。アジド部分に対するタンパク質及びペプチドのコンジュゲーションのための方法及びキットは、当該技術分野において周知であり、例えばThermoFisher(商標)製のNHS-アジドキット(カタログ番号88902)が挙げられる。エフェクター分子は、C末端DBCO部分を含み得る。
エフェクター分子は、機能性を高めるために更に操作することもできる。例えば、エフェクター分子がナノボディ又は他の抗体断片である場合、エフェクター分子の折り畳みを促進するために、1つ以上のリンカー配列を含むようにエフェクター分子を設計することが適切であり得る。
エフェクター分子には、例えば、エフェクター分子の作製、モニタリング又は追跡を容易にするために、タグ又は標識などの追加の配列を含むよう、更なる改変を行うこともできる。タンパク質及びペプチドのタグ又は標識は、このような配列を含むようにタンパク質又はペプチドを作製する方法と同様に、当該技術分野において周知である。例えば、エフェクター分子は、Hisタグ(6×His)、FLAGタグ、Mycタグ又はビオチンのうちの1つ以上を含み得る。
本明細書に記載される特定の方法は、リンカーを含む。リンカーはアミノ酸配列を含み、エフェクター分子を赤血球に直接コンジュゲートさせずにエフェクター分子を赤血球に接続させるのに有用である。このようなリンカーは、赤血球に近接することによる立体障害や、エフェクター分子の折り畳みの歪みを引き起こすことによる立体障害などのエフェクター分子の機能阻害を生じさせることなく、赤血球に接続させる。
リンカーは、下記アミノ酸配列を含むか、又はそれからなっていてもよい。
[A]-[Y]-[B]
式中、
[A]は、リガーゼ認識配列、ビオチン、アジド又はDBCO部分であり、
[Y]は、リンカー本体配列であり、
[B]は、リガーゼ認識配列である。
[A]-[Y]-[B]
式中、
[A]は、リガーゼ認識配列、ビオチン、アジド又はDBCO部分であり、
[Y]は、リンカー本体配列であり、
[B]は、リガーゼ認識配列である。
[A]がリガーゼ認識配列である場合、アミノ酸配列NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLを有する。
[A]がリガーゼ認識配列である場合、[B]はXaa1GGのアミノ酸配列を有し、Xaa1は、G以外の任意のアミノ酸であるか、又は[B]は配列NG、GGG若しくはNCLを有する。[A]がリガーゼ認識配列であるいくつかの態様では、[B]はアミノ酸配列LPX3TGGを有し、X3は任意のアミノ酸である。好ましくは、X3は、E、グルタミン酸であり、したがってリガーゼ認識配列はアミノ酸配列LPETGGを有する。
いくつかの態様では、[A]は、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分又はジアリールサイトオクチン(DBCO)部分若しくはトランスシクロオクチン(TCO)部分又はビオチン部分を含む。
[A]が、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分又はジアリールサイトオクチン(DBCO)部分若しくはトランスシクロオクチン(TCO)部分又はビオチン部分を含む場合、[B]は、アミノ酸配列NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLを有する。
リンカー本体[Y]は、任意の適切なアミノ酸配列を含み得る。好ましくは、[Y]は、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個又は30個のアミノ酸のからなるアミノ酸の配列を含む。場合によっては、[Y]は、αヘリックスペプチドを含む。場合によっては、[Y]は、配列EAAAK(Glu-Ala-Ala-Ala-Lys)を含む。場合によっては、[Y]は、配列EAAAKの反復、例えば1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個又は10個の反復を含む。好ましくは、リンカーは、EAAAKの1個~10個又は1個~5個の反復を含む。最も好ましくは、リンカーは、EAAAKの1個又は5個の反復を含む。場合によっては、リンカーは、配列EQKLISEEDLを含むか、又はそれからなる。
場合によっては、リンカーは、29個のアミノ酸を含むか、又はそれからなり、N末端GLモチーフ及びC末端LPETGGモチーフを含む。場合によっては、リンカーは、GN20リンカーの配列、すなわちGL-GEQKLISEEDLG-LPETGGからなる。
場合によっては、リンカーはストレプトアビジン部分を含まない。
本明細書で使用される場合、「天然の赤血球」という用語は、予め処理されていない赤血球を指す。当業者であれば理解するように、天然の赤血球は、脱核されており、両凹形状を有する。すなわち、赤血球は、本明細書に開示される方法に従って使用する前に遺伝子操作(又は他の方法)による改変を受けていない。特に、赤血球は、赤血球膜に関して遺伝子改変されていなくてもよい。したがって、本明細書に開示される方法において使用される赤血球の膜は、本明細書に開示される方法の赤血球が由来する同種個体における赤血球の膜と区別できないものであり得る。特定の態様では、RBCは、遺伝子改変された赤血球から脱核されていなくてもよい。本明細書に記載されるRBCは、未改変/未修飾の赤血球である。RBCは、赤血球由来細胞外小胞ではない。
赤血球及び赤血球細胞外小胞は、含む又は提示する表面タンパク質に関して異なることに留意されたい。赤血球細胞外小胞の生合成の間、多くのタンパク質及び脂質が反転プロセスを経ることで、細胞質の赤血球タンパク質が赤血球表面に現れる。逆に、同反転プロセスにより、いくつかの赤血球表面タンパク質は小胞の内側に移動する。
本明細書に記載の修飾血液細胞、及び修飾赤血球を含む組成物は、治療において、例えば、疾患又は障害の処置、予防及び/又は改善において使用することもできる。
投与は、好ましくは「治療有効量」であり、これは個体に利益を示すのに十分な量である。投与される実際の量、並びに投与の速度及び時間経過は、治療する疾患の性質及び重篤度によって異なる。処置の処方、例えば投与量の決定などは、一般開業医及び他の医師の責任の範囲内であり、典型的には、処置する障害、個別の患者の症状、送達部位、投与方法及び開業医に知られている他の因子を考慮する。上述の技術及びプロトコルの例は、Remington’s Pharmaceutical Sciences, 20th Edition, 2000, pub. Lippincott, Williams & Wilkinsに見出され得る。
処置される対象は、任意の動物又はヒトであり得る。対象は、好ましくは哺乳動物、より好ましくはヒトである。対象は非ヒト哺乳動物であってもよいが、より好ましくはヒトである。対象は男性又は女性であり得る。対象は患者であり得る。治療目的使用は、ヒト又は動物(獣医学的使用)におけるものであり得る。
本明細書に記載される修飾赤血球は、非経口、静脈内、動脈内、筋肉内、腫瘍内、経口及び経鼻を含むがこれらに限定されないいくつかの経路による投与のために製剤化され得る。
本明細書に記載の修飾赤血球は、エフェクター分子を標的細胞に送達するために使用され得る。場合によっては、方法は、インビトロ又はエクスビボの方法である。他の場合には、方法はインビボ方法である。「インビトロ」という用語は、実験室条件又は培養における材料、生物学的物質、細胞及び/又は組織を用いた実験を包含することを意図し、一方、「インビボ」という用語は、改変されてない多細胞生物を用いた実験及び手順を包含することを意図する。「エクスビボ」は、生物の外部、例えばヒト又は動物の体外に存在するか又は生じるものを指し、これは生物から採取された組織(例えば全臓器)又は細胞上に存在する場合もある。
本明細書に記載される方法によって産生される修飾赤血球は、以下の特徴のうちの1つ以上と関連し得る:
・天然の赤血球と比較して、赤血球表面の減少したグリコシル化残基レベル;
・赤血球の外表面にコンジュゲートされた少なくとも100,000コピーの外因性ペプチド、例えば、エフェクター分子又はリンカーペプチド;
・赤血球の外表面に対してコンジュゲートされた少なくとも100,000分子のビオチン及び任意選択的にストレプトアビジン;
・標的細胞(例えば、がん細胞など)に結合する能力であって、該標的細胞は赤血球に対してコンジュゲートしたエフェクター分子のリガンドを発現する能力。
・天然の赤血球と比較して、赤血球表面の減少したグリコシル化残基レベル;
・赤血球の外表面にコンジュゲートされた少なくとも100,000コピーの外因性ペプチド、例えば、エフェクター分子又はリンカーペプチド;
・赤血球の外表面に対してコンジュゲートされた少なくとも100,000分子のビオチン及び任意選択的にストレプトアビジン;
・標的細胞(例えば、がん細胞など)に結合する能力であって、該標的細胞は赤血球に対してコンジュゲートしたエフェクター分子のリガンドを発現する能力。
一態様では、エフェクター分子に対してコンジュゲートした脱グリコシル化赤血球が本明細書で提供される。エフェクター分子は、抗体、抗原結合断片又は酵素であり得る。
本明細書に開示される方法は、赤血球を表面修飾する効率的な方法を提供する。本方法は、平均して、赤血球当たり少なくとも80,000個のペプチド、赤血球当たり少なくとも90,000個のペプチド、赤血球当たり少なくとも100,000個のペプチド、又は赤血球当たり少なくとも10,500個のペプチド、好ましくは赤血球当たり少なくとも100,000個のペプチドで修飾された赤血球の生成をもたらし得る。「平均」という用語は、平均値(mean average)を指す。
本明細書に例示的に記載される本発明は、本明細書に具体的に開示されていない任意の要素、限定、又は制限が存在しない場合であっても適切に実施され得る。したがって、例えば、「含む(comprising)」、「包含する(including)」、「含有する(containing)」などの用語は、拡大的に解釈され、限定的なものではない。更に、本明細書で用いられる用語及び表現は、説明的な用語として使用され、限定的なものではなく、かかる用語及び表現又はその一部の使用は、表示及び記載された特徴のいかなる均等物をも除外する意図はなく、特許請求される本発明の範囲内で様々な修正が可能であることが理解される。したがって、本発明は、好ましい実施形態によって具体的に開示されるものであり、本明細書に具体化された形で開示される本発明の任意選択的な特徴、修飾、及び変形は、当業者により再現され得、またかかる修飾及び変形は本発明の範囲内にあると考えられることを理解されたい。
本願で使用する場合、単数形を表す「a」、「an」及び「the」には、文脈が明らかにそうでないことを示さない限り、複数形も含まれる。例えば、「遺伝子マーカー」という用語は、混合物及び組み合わせを含む、複数種の遺伝子マーカーを含む。
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、製剤の成分の濃度の文脈において、典型的には、記載された値の±5%、より典型的には、記載された値の±4%、より典型的には、記載された値の±3%、より典型的には、記載された値の±2%、更により典型的には、記載された値の±1%、更により典型的には、記載された値の±0.5%を意味する。
本開示を通して、特定の実施形態は、範囲形式で開示され得る。範囲形式での記載は、単に利便性及び簡潔さのためであり、開示される範囲の柔軟性を欠く限定的なものと解釈すべきではないことを理解されたい。したがって、範囲の記載は、全ての可能な部分範囲、及びその範囲内の個々の数値を具体的に開示しているとみなされるべきである。例えば、1~6などの範囲の記載は、1~3、1~4、1~5、2~4、2~6、3~6などの部分範囲のみならず、その範囲内の個々の数値、例えば1、2、3、4、5及び6も具体的に開示するとみなされるべきである。これは、範囲の大きさに関わらず適用される。
特定の実施形態はまた、本明細書において広くかつ全般的に記載され得る。全般的な開示に含まれるより狭い種及び準全般的なグループ化の各々もまた、本開示の一部を形成する。これは、個々の群から任意の主題を除外する但し書き又は否定的な限定を伴う実施形態の全般的な説明を含むものであり、除外される材料が本明細書に具体的に列挙されているか否かに関係ない。
本発明は、本明細書において広範囲かつ全般的に記載されている。全般的な開示内に含まれるより狭い種及び準全般的なグループ化の各々もまた、本発明の一部を形成する。これは、個々の群から任意の主題を除外する但し書き又はネガティブ限定を伴う本発明の全般的な説明を含むものであり、除外される材料が本明細書に具体的に列挙されているか否かに関係ない。
他の実施形態が、以下の特許請求の範囲及び非限定的な実施例内に存在する。加えて、本発明の特徴又は態様がマーカッシュ群として記載される場合、当業者は、それによって本発明がマーカッシュグループのメンバーの任意の個々のメンバー又はサブグループに関して記載されていることを認識するであろう。
前述の説明、又は以下の特許請求の範囲、又は添付の図面に開示された特徴は、それらの具体的な形態で、又は開示された機能を実行するための手段、又は開示された結果を得るための方法若しくはプロセスの観点から適宜表現され、別個に、又はそのような特徴の任意の組み合わせで、その多様な形態で本発明を実現するために利用することができる。
上記の例示的な実施形態と併せて本発明を説明してきたが、多くの等価な修正形態及び変形形態が、本開示を与えられたときに当業者には明らかになるであろう。したがって、上述した本発明の例示的な実施形態は例示的なものであり、限定的なものではないと考えられる。記載された実施形態に対する様々な変更が、本発明の趣旨及び範囲から逸脱することなく行われ得る。
誤解を避けるために、本明細書で提供される任意の理論的説明は、読者による理解を向上させる目的で提供される。本発明者らは、これらの理論的説明のいずれにも拘束されることを望まない。
本明細書で使用される任意のセクション見出しは、構成上の目的のみのためであり、記載される主題を限定するものとして解釈されるべきではない。
特許請求の範囲を含む本明細書全体を通して、文脈上他の意味に解すべき場合を除き、「含む(comprise)」及び「含む(include)」、並びに「含む(comprises)」、「含む(comprising)」」、及び「含む(including)」などの変形は、記載された整数若しくは工程又は整数若しくは工程の群を含むが、任意の他の整数若しくは工程又は整数若しくは工程の群を除外しないことを意味すると理解されるであろう。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「a」、「an」、及び「the」は、文脈が明らかにそうではないことを指示しない限り、複数の指示対象を含むことに留意されたい。範囲は、本明細書において、「約」1つの特定の値から、及び/又は「約」別の特定の値までとして表現され得る。そのような範囲が表現される場合、別の実施形態は、1つの特定の値から、及び/又は他の特定の値までを含む。同様に、値が先行詞「約」の使用によって近似値として表される場合、特定の値が別の実施形態を形成することが理解されるであろう。数値に関する「約」という用語は任意選択的であり、例えば±10%を意味する。
番号付けされた項目
以下の番号付けされた項目は、本発明に関連して企図される特徴及び特徴の組み合わせの更なる記述を提供する。
以下の番号付けされた項目は、本発明に関連して企図される特徴及び特徴の組み合わせの更なる記述を提供する。
項目1 天然の赤血球を脱核後に表面修飾する方法であって、
a.対象から得られた天然の赤血球をエフェクター分子に曝露することと、
b.エフェクター分子を赤血球に対してコンジュゲートすることと、
c.それによって赤血球を修飾することと、
を含む方法。
a.対象から得られた天然の赤血球をエフェクター分子に曝露することと、
b.エフェクター分子を赤血球に対してコンジュゲートすることと、
c.それによって赤血球を修飾することと、
を含む方法。
項目2 エフェクター分子が少なくとも10kDaのサイズを有する、項目1に記載の方法。
項目3 エフェクター分子が、タンパク質、酵素、細胞表面マーカー、モノクローナル抗体、ナノボディ、治療剤、抗体断片及びこれらの組み合わせからなる群から選択される、項目1又は2に記載の方法。
項目4 コンジュゲーション工程が、1つ以上の酵素反応、ビオチン化及び/若しくはストレプトアビジンベースのコンジュゲーションからなる群から選択される方法を使用して、又は銅フリーのクリックケミストリーを使用して行われる、項目1~3のいずれか一つに記載の方法。
項目5 1つ以上の酵素反応が、ブテラーゼ1、OaAEP1リガーゼ、アスパラギニルペプチダーゼ、又はこれらの任意の変異体若しくは多様体からなる群から選択される1つ以上の酵素を使用して触媒される、項目4に記載の方法。
項目6 酵素反応がソルターゼによって触媒されない、項目4又は5に記載の方法。
項目7 コンジュゲーション工程が、エフェクター分子と天然の赤血球との間に共有結合を生成する、項目1~6のいずれか一つに記載の方法。
項目8 天然の赤血球が、リンカーを介してエフェクター分子に対してコンジュゲートされている、項目1~7のいずれか一つに記載の方法。
項目9 天然の赤血球が脱核され、両凹形状を有している、項目1~8のいずれか一つに記載の方法。
項目10 酵素反応がOaAEP1リガーゼを使用して触媒され、エフェクター分子がナノボディである、項目1~9のいずれか一つに記載の方法。
項目11 項目1~10のいずれか一つに記載の方法によって得られる修飾赤血球。
項目12 脱核後の表面にコンジュゲートされたエフェクター分子を含む、修飾赤血球。
項目13 エフェクター分子が少なくとも10kDaのサイズを有する、項目12に記載の赤血球。
項目14 エフェクター分子が、1つ以上の酵素反応、ビオチン化及び/又はストレプトアビジンベースのコンジュゲーションからなる群から選択される方法を使用して、あるいは銅フリーのクリックケミストリーを使用して、コンジュゲートされている、項目12又は13に記載の赤血球。
項目15 方法が、エフェクター分子と赤血球との間に共有結合をもたらす、項目14に記載の赤血球。
項目16 酵素反応が、ブテラーゼ1、OaAEP1リガーゼ、代替アスパラギニルペプチダーゼ、又はこれらの任意の変異体若しくは多様体からなる群から選択される酵素によって触媒される、項目12に記載の赤血球。
項目17 エフェクター分子が、タンパク質、酵素、細胞表面マーカー、モノクローナル抗体、ナノボディ、抗体断片、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される、項目12~16のいずれか一つに記載の赤血球。
項目18 リンカーが赤血球とエフェクター分子との間にコンジュゲートされている、項目12~17のいずれか一つに記載の赤血球。
項目19 エフェクター分子がモノクローナル抗体である、項目12~18のいずれか一つに記載の赤血球。
項目20 赤血球がヒト又は動物に由来する、項目1~11のいずれか一つに記載の方法又は項目12~19のいずれか一つに記載の赤血球。
項目21 コンジュゲートされたエフェクター分子が治療効果を発揮する、項目1~11及び20のいずれか一つに記載の方法、又は項目12~19のいずれか一つに記載の赤血球。
項目22 治療に使用するための項目12~21のいずれか一つに記載の赤血球。
項目23 疾患又は障害を治療する医薬品の製造における、項目12~22のいずれか一つに記載の修飾赤血球の使用。
項目24 疾患又は障害が、酵素欠損症、代謝疾患、免疫関連障害、血液疾患、及びがんからなる群から選択される、項目23に記載の使用。
次に、添付の図面を参照して本発明の態様及び実施形態を説明する。更なる態様及び実施形態は、当業者には明らかであろう。本明細書で言及される全ての文献は、参照により本明細書に組み込まれる。
実施例1 材料及び方法
赤血球(RBC)の精製
ヒト全血をクエン酸-リン酸-デキストロースアデニン緩衝液中に採取し、更なる処理まで4℃で保存した。全血を白血球除去フィルターに通して大部分の白血球を除去した。得られた血液を、過剰量の滅菌リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を使用して3回洗浄して、血漿及び大部分の血小板を除去した。得られた赤血球ペレットを赤血球保存緩衝液に再懸濁し、将来の実験のために4℃で保存した。EDTAをコートした管にマウスの血液を心臓穿刺により得た。血液は、凝固した血液を除去するために40μmのセルストレーナーで濾し、白血球を除去するためにAcrodisc(登録商標)WBC(白血球)シリンジフィルターで濾した。細胞を過剰量のPBSで3回洗浄して、微量の血漿及び血小板を除去した。続いて、血球計を使用して細胞を計数した。
赤血球(RBC)の精製
ヒト全血をクエン酸-リン酸-デキストロースアデニン緩衝液中に採取し、更なる処理まで4℃で保存した。全血を白血球除去フィルターに通して大部分の白血球を除去した。得られた血液を、過剰量の滅菌リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を使用して3回洗浄して、血漿及び大部分の血小板を除去した。得られた赤血球ペレットを赤血球保存緩衝液に再懸濁し、将来の実験のために4℃で保存した。EDTAをコートした管にマウスの血液を心臓穿刺により得た。血液は、凝固した血液を除去するために40μmのセルストレーナーで濾し、白血球を除去するためにAcrodisc(登録商標)WBC(白血球)シリンジフィルターで濾した。細胞を過剰量のPBSで3回洗浄して、微量の血漿及び血小板を除去した。続いて、血球計を使用して細胞を計数した。
ペプチド及びナノボディの設計
表1に掲載するペプチドは、ライゲーションを促進するために、OaAEP1タンパク質リガーゼが認識するC末端モチーフ(-NGL)を含むように設計した。必要に応じて単一の第一級アミン基をビオチン化して、ペプチドの検出を容易にした。ペプチドを固相合成し、HPLC(中国、上海、GL Biochem Ltd)を使用して精製した。上皮成長因子(EGFR)ナノボディ配列をRoovers et al.(Roovers et al., 2011; DOI: 10.1002/ijc.26145)から入手し、N末端には6×Hisタグを含み、C末端にはFLAGタグ及びリガーゼ結合部位を含むように修飾した。ナノボディの機能性を高めるために、各エピトープタグ間には以下:(HHHHHH-GSG-VHH-GSG-FLAG-NGL)に示すとおりのフレキシブルリンカー配列が含まれていた。ナノボディをコードするDNAの合成、及びT7プロモーターに続けてのpET32(a+)プラスミドへの挿入はGuangzhou IGE Biotechnology Ltd(中国)が行った。OaAEP1-Cys247Alaをコードするプラスミドは、南洋理工大学(Nanyang Technology University)のBin Wu博士により提供を受けた。eGFP、組換えヒトIL-8及びL-アスパラギナーゼの予備精製品は、商業的供給源から得た。
表1に掲載するペプチドは、ライゲーションを促進するために、OaAEP1タンパク質リガーゼが認識するC末端モチーフ(-NGL)を含むように設計した。必要に応じて単一の第一級アミン基をビオチン化して、ペプチドの検出を容易にした。ペプチドを固相合成し、HPLC(中国、上海、GL Biochem Ltd)を使用して精製した。上皮成長因子(EGFR)ナノボディ配列をRoovers et al.(Roovers et al., 2011; DOI: 10.1002/ijc.26145)から入手し、N末端には6×Hisタグを含み、C末端にはFLAGタグ及びリガーゼ結合部位を含むように修飾した。ナノボディの機能性を高めるために、各エピトープタグ間には以下:(HHHHHH-GSG-VHH-GSG-FLAG-NGL)に示すとおりのフレキシブルリンカー配列が含まれていた。ナノボディをコードするDNAの合成、及びT7プロモーターに続けてのpET32(a+)プラスミドへの挿入はGuangzhou IGE Biotechnology Ltd(中国)が行った。OaAEP1-Cys247Alaをコードするプラスミドは、南洋理工大学(Nanyang Technology University)のBin Wu博士により提供を受けた。eGFP、組換えヒトIL-8及びL-アスパラギナーゼの予備精製品は、商業的供給源から得た。
タンパク質の発現及び精製
本研究の前半では、組換えナノボディ及びタンパク質リガーゼの発現及び精製を行った。簡単に説明すると、BL21(DE3)大腸菌(E. coli)で発現させた後、該大腸菌を溶解させ、Ni-NITAアフィニティークロマトグラフィーに続けてサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を含むFPLCシステムによりタンパク質を精製した。酵素OaAEP1は、精製した不活性酵素をpH3.7の酢酸緩衝液中で室温にて一晩インキュベートすることによって活性化させた。
本研究の前半では、組換えナノボディ及びタンパク質リガーゼの発現及び精製を行った。簡単に説明すると、BL21(DE3)大腸菌(E. coli)で発現させた後、該大腸菌を溶解させ、Ni-NITAアフィニティークロマトグラフィーに続けてサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を含むFPLCシステムによりタンパク質を精製した。酵素OaAEP1は、精製した不活性酵素をpH3.7の酢酸緩衝液中で室温にて一晩インキュベートすることによって活性化させた。
OaAEP1リガーゼを使用した、赤血球に対するペプチド、ナノボディ又はモノクローナル抗体のコンジュゲーション
ライゲーションのため、1×107個の赤血球を、pH7のPBS緩衝液中、500μMのペプチド又はVHH及び0.26mg/mLのリガーゼと共に、総体積20μLで、エンド・オーバー・エンド式撹拌機で穏やかに撹拌しながら(30rpm)室温で3時間インキュベートした。
ライゲーションのため、1×107個の赤血球を、pH7のPBS緩衝液中、500μMのペプチド又はVHH及び0.26mg/mLのリガーゼと共に、総体積20μLで、エンド・オーバー・エンド式撹拌機で穏やかに撹拌しながら(30rpm)室温で3時間インキュベートした。
ナノボディライゲーションには二工程法を利用した。最初に、リンカーペプチド(酵素のN末端モチーフ及びC末端モチーフを両方含有する)をライゲーションし、続いてPBSで2回洗浄した。次いで、該リンカーペプチドをライゲーションした赤血球を、ペプチドのライゲーションと同じ条件で500μMのVHH及び0.26mg/mLのリガーゼとインキュベートした。ライゲーション後、800×g、4℃で5分間遠心分離し、赤血球を洗浄した。
ビオチン化モノクローナル抗体のコンジュゲーションのために、赤血球にビオチン化ペプチドをライゲートした。十分に洗浄した後、酵素によりビオチン化された赤血球を、ストレプトアビジンの最終濃度0.04μg/μLで組換えストレプトアビジンタンパク質(Abcam社)と共に4℃で30分間インキュベートした。更に洗浄した後、これらの赤血球をビオチン化モノクローナル抗体と共にインキュベートした。これらの抗体は、市販のものを入手したか、又はBiotin Conjugation Kit(タイプB、Abcam社)を使用して社内でビオチン化した。遊離(すなわち未結合)抗体を、最終洗浄工程により洗い流した。
SPAAC(strain-promoted alkyne-azide cycloaddition)又は銅フリーのクリックケミストリーを用いるDBCOコンジュゲートペプチド/抗体のコンジュゲーションのために、DBCOコンジュゲートリンカーペプチドを最初に赤血球にライゲートした。次いで、これらの赤血球とアジドコンジュゲート分子とを室温で3~12時間インキュベートして、クリックケミストリーにより安定的にコンジュゲートさせた。アジド-NHSキットを使用して、アジドをタンパク質にコンジュゲートした。モノクローナル抗体には、Fcドメインのグリカン基にアジドがコンジュゲートしている部位特異的に修飾された市販の抗体を入手した。
ウェスタンブロット解析
ライゲートした赤血球を、最初に、プロテアーゼ阻害剤(Biotool社)の存在下でACK(塩化アンモニウム、カリウム)溶解緩衝液で処理して、赤血球の細胞膜ゴーストを得た(細胞内ヘモグロビン含量を減少させる)。細胞膜を21,000×gで2時間の遠心分離によってペレットにした。この赤血球細胞膜のペレットを、プロテアーゼ阻害剤(Biotool社)を添加したRIPA緩衝液を使用して氷上で15分間インキュベートした。Pierce BCAタンパク質アッセイキットを使用してタンパク質を定量し、Nanodropリーダー(420nm及び586nmでの吸光度)を使用してヘモグロビンを定量した。
ライゲートした赤血球を、最初に、プロテアーゼ阻害剤(Biotool社)の存在下でACK(塩化アンモニウム、カリウム)溶解緩衝液で処理して、赤血球の細胞膜ゴーストを得た(細胞内ヘモグロビン含量を減少させる)。細胞膜を21,000×gで2時間の遠心分離によってペレットにした。この赤血球細胞膜のペレットを、プロテアーゼ阻害剤(Biotool社)を添加したRIPA緩衝液を使用して氷上で15分間インキュベートした。Pierce BCAタンパク質アッセイキットを使用してタンパク質を定量し、Nanodropリーダー(420nm及び586nmでの吸光度)を使用してヘモグロビンを定量した。
溶解液をLaemmli緩衝液で処理し、95℃で5分間インキュベートしてタンパク質を変性させた。タンパク質を10%又は12%ポリアクリルアミドゲルで分離し、ポリビニリデンジフルオリド(PVDF)メンブレン(Immobilon-P)に転写した。PM5100 ExcelBand 3-color protein ladder(台湾、SmoBio社)をマーカーとしてロードして分子サイズを評価した。0.1%Tween-20を添加したトリス緩衝生理食塩水(TBST)中5%ミルク(Difco Skim Milk)を使用してメンブレンを1時間ブロッキングし、続いて一次抗体:ウサギ抗FLAG(Sigma社、カタログ番号F3165、希釈1:3000)と共に4℃で一晩インキュベートした。ブロットをTBSTで3回洗浄し、次いで西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)コンジュゲート抗ウサギ二次抗体(Vector社、希釈1:5000)と共に室温で1時間インキュベートした。ビオチン化ペプチドの検出のために、ブロットをPierce高感度ストレプトアビジン-HRP(Thermo Fisher社、希釈1:5000)と共に直接インキュベートした。ブロットの画像をBio-Rad Chemidocゲル撮影装置で取得した。
フローサイトメトリー(FACS)解析
細胞をPBSで2回洗浄し、100μLのFACS緩衝液(0.5%ウシ胎児血清を含むPBS)に再懸濁した。細胞表面タンパク質を解析するために、細胞を2μLの蛍光標識抗体と共に氷上、暗所で30分間インキュベートし、1mLのFACS緩衝液で2回洗浄した。RBCのFACS解析は、CytoFLEX-S又はCytoFLEX LXサイトメーター(Beckman Coulter社)又はS1000Ex Flow Cytometer(Stratedigm社)で行った。得られたFCSファイルを、Flowjo V10(米国、Flowjo社)を使用して解析した。まずは細胞をFSC-A値対SSC-A値でゲーティングして、デブリ及び死細胞を除くそれぞれの細胞集団を同定した。次いで、ダブレット及び凝集塊を除いた単個細胞を、FSC幅対FSC高さによってゲーティングした。続いて、ビーズ又は細胞の蛍光陽性集団を、AF488又はCFSEの場合はFITC、AF647の場合はAPC、及びmCherryの場合はECDのように設定した蛍光チャネルによってゲーティングした。
細胞をPBSで2回洗浄し、100μLのFACS緩衝液(0.5%ウシ胎児血清を含むPBS)に再懸濁した。細胞表面タンパク質を解析するために、細胞を2μLの蛍光標識抗体と共に氷上、暗所で30分間インキュベートし、1mLのFACS緩衝液で2回洗浄した。RBCのFACS解析は、CytoFLEX-S又はCytoFLEX LXサイトメーター(Beckman Coulter社)又はS1000Ex Flow Cytometer(Stratedigm社)で行った。得られたFCSファイルを、Flowjo V10(米国、Flowjo社)を使用して解析した。まずは細胞をFSC-A値対SSC-A値でゲーティングして、デブリ及び死細胞を除くそれぞれの細胞集団を同定した。次いで、ダブレット及び凝集塊を除いた単個細胞を、FSC幅対FSC高さによってゲーティングした。続いて、ビーズ又は細胞の蛍光陽性集団を、AF488又はCFSEの場合はFITC、AF647の場合はAPC、及びmCherryの場合はECDのように設定した蛍光チャネルによってゲーティングした。
L-アスパラギナーゼアッセイ
アスパラギン依存性Sup-B15細胞を、20%iFBS及び0.05mMの2-メルカプトエタノールを添加したIMDM培地で培養した。RBCに上記のようにビオチン化L-アスパラギナーゼをコンジュゲートした。コンジュゲートされていないビオチン化L-アスパラギナーゼ、又はL-アスパラギナーゼによりコンジュゲーションされた若しくはコンジュゲーションされていないRBCを、Sup-B15細胞と1:5の比(RBC対Sup-B15細胞)で共培養した。4日後、10μLのCCK8試薬を各ウェルに添加し、プレートを37℃で1時間インキュベートした。続いて、プレートリーダーを使用して450nmで吸光度を測定した。
アスパラギン依存性Sup-B15細胞を、20%iFBS及び0.05mMの2-メルカプトエタノールを添加したIMDM培地で培養した。RBCに上記のようにビオチン化L-アスパラギナーゼをコンジュゲートした。コンジュゲートされていないビオチン化L-アスパラギナーゼ、又はL-アスパラギナーゼによりコンジュゲーションされた若しくはコンジュゲーションされていないRBCを、Sup-B15細胞と1:5の比(RBC対Sup-B15細胞)で共培養した。4日後、10μLのCCK8試薬を各ウェルに添加し、プレートを37℃で1時間インキュベートした。続いて、プレートリーダーを使用して450nmで吸光度を測定した。
免疫蛍光イメージング
1%のBSAを添加した冷PBSで赤血球細胞(105個)を2回洗浄した。体積を100μLにした。スライド及びプレウェットフィルターを用意し、サンプルをそれぞれのサイトスピンフューネルのウェルにピペットで入れた。スライドを800×gで3分間回転させた。スライド上に固定した赤血球には触れずに、フィルターをスライドから除去した。細胞を暗所で30分間それぞれの抗体で染色し、BSA-PBSを使用して3回洗浄した。スライドを覆い、Leica Thunder顕微鏡で画像を取得した。画像の取得は盲検様式で行い、画像を無作為に取得した後、Coloc 2(ImageJ)を使用して盲検で共局在解析を行った。
1%のBSAを添加した冷PBSで赤血球細胞(105個)を2回洗浄した。体積を100μLにした。スライド及びプレウェットフィルターを用意し、サンプルをそれぞれのサイトスピンフューネルのウェルにピペットで入れた。スライドを800×gで3分間回転させた。スライド上に固定した赤血球には触れずに、フィルターをスライドから除去した。細胞を暗所で30分間それぞれの抗体で染色し、BSA-PBSを使用して3回洗浄した。スライドを覆い、Leica Thunder顕微鏡で画像を取得した。画像の取得は盲検様式で行い、画像を無作為に取得した後、Coloc 2(ImageJ)を使用して盲検で共局在解析を行った。
インビボ半減期分析
表面修飾(ビオチンペプチドライゲート)又は未修飾赤血球をCFSEで37℃にて20分間標識し、2回洗浄し、尾静脈を介してマウスに注射した。ランセットを使用して顎下静脈から(頬出血を介して)一定の間隔で採血した。全血をスピンダウンし、計数し、0.2mg/mLの濃度のストレプトアビジン-AF647で染色するために5,000万個の細胞を採取した。細胞を1時間染色した後、2回洗浄し、フローサイトメトリーによって解析した。注入した赤血球と内在性赤血球とをCFSEにより区別し、ライゲートしたペプチドのインビボでの安定性はストレプトアビジン-AF647により経時的にモニターした。
表面修飾(ビオチンペプチドライゲート)又は未修飾赤血球をCFSEで37℃にて20分間標識し、2回洗浄し、尾静脈を介してマウスに注射した。ランセットを使用して顎下静脈から(頬出血を介して)一定の間隔で採血した。全血をスピンダウンし、計数し、0.2mg/mLの濃度のストレプトアビジン-AF647で染色するために5,000万個の細胞を採取した。細胞を1時間染色した後、2回洗浄し、フローサイトメトリーによって解析した。注入した赤血球と内在性赤血球とをCFSEにより区別し、ライゲートしたペプチドのインビボでの安定性はストレプトアビジン-AF647により経時的にモニターした。
データ解析
GraphPad Prism 8を使用してデータの統計解析を行い、グラフを作成した。P値<0.05を有意であるとみなした。BioRender.com及び/又はAdobe illustratorを使用して実験概要の図を作成した。ウェスタンブロット解析、共局在解析及び単位細胞面積当たりの平均蛍光を、FIJIを使用して評価した。FlowJo V10を使用してFACSプロットを生成した。
GraphPad Prism 8を使用してデータの統計解析を行い、グラフを作成した。P値<0.05を有意であるとみなした。BioRender.com及び/又はAdobe illustratorを使用して実験概要の図を作成した。ウェスタンブロット解析、共局在解析及び単位細胞面積当たりの平均蛍光を、FIJIを使用して評価した。FlowJo V10を使用してFACSプロットを生成した。
実施例2:結果
OaAEP1 Cys247Alaを使用して、ヒト赤血球(hRBC)表面にペプチドを共有結合させることができる。
OaAEP1 Cys247Alaを使用して、ヒト赤血球(hRBC)表面にペプチドを共有結合させることができる。
OaAEP1又はソルターゼなどのタンパク質リガーゼを使用すると、特別に設計したペプチドのRBCに対する共有結合を触媒することができる。OaAEP1タンパク質リガーゼによるペプチドのヒト赤血球に対するコンジュゲートの効率を試験するために、赤血球に対してコンジュゲートさせるためのリガーゼ認識部位を備えているビオチン化ペプチド(B-ペプチド/B-TL5)を設計した。ライゲーション後、得られた赤血球を、ビオチン化タンパク質の存在についてウェスタンブロットによって解析した。ビオチン化ペプチド(B-TL5)をライゲートした赤血球をウェスタンブロットしたところ、対照のいずれにおいても観察されなかった約40kDaのビオチン化タンパク質の明瞭なバンドが示された(図1A、レーン1~6)。データは、この酵素アプローチを用いると、赤血球膜タンパク質に対して、ペプチドをコンジュゲートすること、及び/又は共有結合により官能基を導入できることを実証した(図1A)。ライゲーションの効率を更に検証するために、本発明者らは、コンジュゲートされたペプチドのヒト赤血球(hRBC)当たりのコピー数を測定することにした。モノビオチン化ペプチド(B-TL5)によるヒト赤血球の標識を、ストレプトアビジン-HRPを用いた免疫ブロッティングにより定量した。ジビオチン化HRPを定量のための参照として使用した。タンパク質の分子量マーカー(kDa)を各ブロットの左側に示す。その後の解析により、単個のヒト赤血球に平均して100,000個を超えるペプチドがコンジュゲートしていたことが明らかになった(図1B)。この結果を、フローサイトメトリーを使用して更に検証した。ビオチン化ペプチドをライゲートさせたヒト赤血球又は対照ヒト赤血球をストレプトアビジン-AF647で染色し、フローサイトメトリーによって解析した。酵素の存在下でB-TL5とライゲートさせたヒト赤血球でのみ細胞集団の有意なシフトが生じ、ヒト赤血球表面のB-TL5ペプチドの存在が確認された(図1C)。ライゲート処理及び未処理ヒト赤血球を免疫蛍光イメージングにより観察したところ、ライゲートさせたペプチド(PEコンジュゲート抗ビオチン抗体を用い緑色に染色)はヒト赤血球細胞膜(CellMask Deep Red Plasma membrane Stainを使用して染色;図1D)上に共局在していた。ビオチン化ペプチドをライゲートしたヒト赤血球及び未ライゲートのヒト赤血球の、1条件当たりおよそ約100個の細胞についての、単位細胞面積当たり(CellMask染色をマスクとして使用して)のPE-ビオチン染色による平均蛍光を定量した。図1Eに示す。更に、共局在解析を使用してCellMask及びビオチンの共局在化の程度をより正確に定量したところ、ピアソンのR値は0.96であることが判明し、酵素によるライゲーションの成功が存在する場合でのみ2つのシグナルが強く共局在していることが確認された。
本発明者らはまた、C末端認識モチーフであるXの配列をさまざまに変えた(EAAAK)3-Xペプチドのライゲーション効率をスクリーニングすることによって、ペプチド配列がライゲーション収率にどのように影響するかを調査した。興味深いことに、本発明者らは、さまざまなC末端配列でRBCライゲーションが機能的であることを発見した(図9A)。XがNDL又はNPLである場合に得られた最適なライゲーション収率は、有意により高いライゲーション収率をもたらした。
(EAAAK)反復単位の数をさまざまに変えたαヘリックスペプチドを使用して、ペプチド長の影響も評価した。8アミノ酸から28アミノ酸までの長さのペプチド(1~5個のEAAAK反復)は、総じて効率的なライゲーションを示した。試験したなかで最も短いペプチド(EAAAK反復1つ、8個のアミノ酸長)は、より長い配列を有するペプチドよりも有意に高い収率を示した。EAAAK反復の数を増加させると、ライゲーション収率は13アミノ酸から18アミノ酸(EAAAK反復2個から4個)に僅かに減少した(図9B)。驚くべきことに、28アミノ酸(5個のEAAAK反復)を有するペプチドは、18アミノ酸のペプチドと比較してライゲーション収率の僅かな増加を示した。
二工程法を用い、hRBC表面に対してシングルドメイン抗体を共有結合させることができる。
二工程法を用い、ヒト赤血球表面に対してシングルドメイン抗体を共有結合させることができる。このデータにより、著しく大きなタンパク質、例えば限定するものではないがヒト赤血球表面上のシングルドメイン抗体(VHH)などは、おそらくより大きくより複雑な構造のため、直接的にライゲーションさせることはできないことも明らかになった。したがって、かかるタンパク質の、完全に酵素により介在されるコンジュゲーションのために、二工程法が考案された。第1の工程では、OaAEP1リガーゼを使用してリンカーペプチドGN20をヒト赤血球にコンジュゲートさせ、第2の工程では、同じ酵素を使用してリンカーペプチドをラクダ科動物由来のシングルドメイン抗体(約15~30kDa)とコンジュゲートさせた(図2A)。結果として、図2Bでフローサイトメトリーにより示されるように、この方法は、FLAGタグを有する抗EGFR単一ドメイン抗体をヒト赤血球表面に効率的にライゲートした。このデータは、ヒト赤血球の100%がシングルドメイン抗体とライゲートされることを明確に示す。
免疫蛍光イメージングもこれを裏付けており、二工程法はペプチドコンジュゲーション法と比較して効率性に劣るが、機能的ではあることが確認された(図2C、VHHEGFRのFLAGタグ(抗FLAG-AF488を使用して緑色に染色)がヒト赤血球細胞膜(CellMask(商標)Deep Red Plasma membrane Stainを使用して赤色に染色)に共局在したことを示す)。CellMask及びVHHの共局在化も定量した。図2Dに、未ライゲートのヒト赤血球及び対照ヒト赤血球についての単位細胞面積当たりの平均AF488シグナルとして示す。VHHをライゲートしたヒト赤血球のピアソンのR値は0.51であることが判明し、ペプチドライゲーションと比較して、VHHの細胞膜への共局在化の程度は低いことが確認された。
二工程法のためのリンカーペプチドは、シングルドメイン抗体をhRBC表面に対して共有結合させるよう設計することができる。
本発明者らは更に、二工程ライゲーション法の効率を検証し、それぞれN末端及びC末端の両方に酵素認識モチーフを有するいくつかの異なるリンカーペプチドの相対効率を比較した。リンカーペプチドのライゲーション後、RBCに抗EGFR単一ドメイン抗体(EGFR VHH)をコンジュゲートさせた。続いて、抗FLAGタグ抗体を使用して、RBC表面上のFLAGタグ付加単一ドメイン抗体を検出した。最初のフローサイトメトリー解析により、ナノボディをRBCに対して直接的にライゲーションしても顕著なライゲーションは全く得られないことが明らかになった(図10A~図10B)。しかしながら、本発明者らは、特異的な認識モチーフを両末端に有する特別に設計したリンカーペプチド(GN20)の存在下では、hRBCの100%が効率的にEGFR VHHコンジュゲーションしていることを観察することができた。注目すべきことに、同様の長さの非リンカースクランブルペプチド(TL20)又はN末端にビオチンを付加したGN20(B-GN20)ではライゲーションは無効になり、二工程リンカーペプチド法のコンジュゲーション効率を示した(図10A~図10B)。
さまざまなバリエーションのN末端及びC末端ライゲーションモチーフを比較する更なる解析により、GN20ペプチドにおいて使用した組み合わせにより最適な収率が得られた一方で、本発明者らが以前にRBCEVコンジュゲーションに使用したペプチド、GG20、EL17及びGL17は、著しく低いライゲーション効率を示したことが明らかになった(図10C)。新たに設計したGN20ペプチドでは最良のライゲーション収率が得られ、100%のRBCのコンジュゲーションと、次に最良なペプチドであるGG20と比較して約3倍のコピー数増加とがもたらされた(図10C)。GN20を介することで得られる高コピー数は、GN20の最適化されたライゲーションモチーフが、ライゲーションの第2の工程において、VHHに対するN末端でのより効率的なライゲーションを促進することに起因する(図10B)。本発明者らのデータはまた、二工程ライゲーションの際のN末端及びC末端モチーフの僅かな違いも明らかにした。GN20のN末端モチーフをGLG-からGLA-又はALG-に変えると、ライゲーション反応が完全に無効になった(図10C)。更に、C末端モチーフ-LPETGGへの追加のGの付加(結果としてLGETGGGが生じる)もまた、二工程ライゲーションを完全に阻害した。しかしながら本発明者らは、GG39リンカーペプチドを使用した、hRBCへのVHHの効率的なライゲーションによって実証されるように、二工程ライゲーションを完全に損なうことなくGN20ペプチドの内部配列及び長さを改変できることを実証できた(図10C)。
実施例2:RBCの脱グリコシル化は、RBC上へのタンパク質のライゲーションを促進する。
本発明者らはまた、タンパク質のライゲーション前にRBCを脱グリコシル化することによる効果を比較した(図11A)。注目すべきことに、本発明者らは、脱グリコシル化そのものはRBCの基底蛍光に影響を及ぼさないことを実証する(図11B)。しかしながら、本発明者らは、その後のタンパク質(EGFR VHH)のライゲーション時にライゲーション効率の増加を検出することができた。最も顕著な増加はO-グリカンの除去後に見られた(図11B)。重要なことに、本発明者らは、EGFR VHHライゲーションの前に脱グリコシル化とリンカーペプチドによるライゲーションとの両方を行うことによって、脱グリコシル化戦略が、上記で概説した二工程ライゲーション法と相乗的であることを実証することができた(図11C)。興味深いことに、PNGase Fで脱グリコシル化し、かつGL17リンカーペプチドでライゲーションすると、EGFR VHHライゲーション収率のかなりの増加が得られ、その収率は、いずれかの条件のみで得られる収率よりもはるかに高かった。注目すべきことに、本発明者らは、脱グリコシル化をリンカーペプチドライゲーションの前に行った場合にライゲーション収率のより大きな増加を観察したが、その逆は観察されなかった。脱グリコシル化プロセスがリンカーペプチドのより効率的なコンジュゲーションを促進し、続いてEGFR VHHコンジュゲーションを増加させることができたことが示唆される(図11C)。
本発明者らはまた、タンパク質のライゲーション前にRBCを脱グリコシル化することによる効果を比較した(図11A)。注目すべきことに、本発明者らは、脱グリコシル化そのものはRBCの基底蛍光に影響を及ぼさないことを実証する(図11B)。しかしながら、本発明者らは、その後のタンパク質(EGFR VHH)のライゲーション時にライゲーション効率の増加を検出することができた。最も顕著な増加はO-グリカンの除去後に見られた(図11B)。重要なことに、本発明者らは、EGFR VHHライゲーションの前に脱グリコシル化とリンカーペプチドによるライゲーションとの両方を行うことによって、脱グリコシル化戦略が、上記で概説した二工程ライゲーション法と相乗的であることを実証することができた(図11C)。興味深いことに、PNGase Fで脱グリコシル化し、かつGL17リンカーペプチドでライゲーションすると、EGFR VHHライゲーション収率のかなりの増加が得られ、その収率は、いずれかの条件のみで得られる収率よりもはるかに高かった。注目すべきことに、本発明者らは、脱グリコシル化をリンカーペプチドライゲーションの前に行った場合にライゲーション収率のより大きな増加を観察したが、その逆は観察されなかった。脱グリコシル化プロセスがリンカーペプチドのより効率的なコンジュゲーションを促進し、続いてEGFR VHHコンジュゲーションを増加させることができたことが示唆される(図11C)。
実施例4:EGFR結合単一ドメイン抗体をライゲートしたRBCは、EGFR陽性転移性乳がん細胞に付着することができる。
本発明者らはまた、対照RBC又はGN20連結EGFR VHHライゲートRBCのいずれかを、tdTomato及びヒトEGFR(hEGFR)を発現する4T1細胞と共に手短に10分間インキュベートして、EGFR VHHコンジュゲートRBCの機能を検証した。続いて、RBCを4T1-tdTomato-hEGFR細胞から分離し、溶解させ、EGFRをウェスタンブロットすることによって、がん細胞プルダウンの効率を解析した。図11Dに示されるように、GN20リンカーペプチドのみが、がん細胞のかなりのプルダウンをもたらすのに十分なEGFR VHHコンジュゲーションをもたらすことができ、シングルドメイン抗体とライゲートされたこれらの改変RBC(engineered RBC)の、対応する受容体を発現するがん細胞に対する結合能が確認された。HBAはRBCの内部対照として使用しており、各条件において等量のRBCがプルダウンに使用されたことを示す。本発明者らはまた、プレートリーダーを使用してそれぞれのプルダウンサンプルのtdTomato蛍光を読み取ることによって、このデータを検証した(図11E)。4T1細胞は転移性乳がん細胞であり、通常、原発腫瘍から循環血液を介して離れた部位に播種し、高頻度で転移を形成する。4T1細胞はEGFRを天然に発現するが、この試験では、ヒトのがん細胞を模倣するために、EGFRのヒト相同体を4T1細胞で発現させる。EGFRは、乳がんを含むヒトがんにおける一般的な受容体である。したがって、EGFR-VHH被覆RBCの4T1細胞に対する結合は、かかるRBCが、転移性がんを有する患者に注入されることで、循環血中のEGFR陽性腫瘍細胞を認識し得ることを示唆している。次いで、RBC-腫瘍細胞のデュプレックスが除去又は排除されることで、転移速度が低下し得る。
本発明者らはまた、対照RBC又はGN20連結EGFR VHHライゲートRBCのいずれかを、tdTomato及びヒトEGFR(hEGFR)を発現する4T1細胞と共に手短に10分間インキュベートして、EGFR VHHコンジュゲートRBCの機能を検証した。続いて、RBCを4T1-tdTomato-hEGFR細胞から分離し、溶解させ、EGFRをウェスタンブロットすることによって、がん細胞プルダウンの効率を解析した。図11Dに示されるように、GN20リンカーペプチドのみが、がん細胞のかなりのプルダウンをもたらすのに十分なEGFR VHHコンジュゲーションをもたらすことができ、シングルドメイン抗体とライゲートされたこれらの改変RBC(engineered RBC)の、対応する受容体を発現するがん細胞に対する結合能が確認された。HBAはRBCの内部対照として使用しており、各条件において等量のRBCがプルダウンに使用されたことを示す。本発明者らはまた、プレートリーダーを使用してそれぞれのプルダウンサンプルのtdTomato蛍光を読み取ることによって、このデータを検証した(図11E)。4T1細胞は転移性乳がん細胞であり、通常、原発腫瘍から循環血液を介して離れた部位に播種し、高頻度で転移を形成する。4T1細胞はEGFRを天然に発現するが、この試験では、ヒトのがん細胞を模倣するために、EGFRのヒト相同体を4T1細胞で発現させる。EGFRは、乳がんを含むヒトがんにおける一般的な受容体である。したがって、EGFR-VHH被覆RBCの4T1細胞に対する結合は、かかるRBCが、転移性がんを有する患者に注入されることで、循環血中のEGFR陽性腫瘍細胞を認識し得ることを示唆している。次いで、RBC-腫瘍細胞のデュプレックスが除去又は排除されることで、転移速度が低下し得る。
実施例5:ストレプトアビジンリンカーを介した、より大きくより複雑なタンパク質のヒト赤血球(hRBC)表面に対するコンジュゲーション。
ヒト赤血球に対する比較的小さいサイズ~中程度のサイズのタンパク質の二工程式リンカーペプチドコンジュゲーション方法は確立されていたが、ヒト赤血球表面にモノクローナル抗体(mAb)及び酵素などのより大きいタンパク質を固定する方法を見出すことが更に求められていた。この目的のために、図3Aに概説されているように、ビオチン化ペプチドライゲートヒト赤血球をストレプトアビジン及び選択したビオチン化タンパク質と順次単純にインキュベートすることをベースとして、モジュール式のストレプトアビジンによるコンジュゲーションアプローチを確立した。親和性相互作用であるにもかかわらず、ストレプトアビジン法は非常に安定であることが実証され、各ストレプトアビジン分子の4つの結合部位は、対象とするビオチン化タンパク質の赤血球当たりのコピー数を増強した。フローサイトメトリーを使用してビオチン化抗hisタグモノクローナル抗体コンジュゲートヒト赤血球を解析した。二次蛍光抗体での染色後に集団全体の蛍光が大きくシフトすることによる可視化により、ヒト赤血球表面上のモノクローナル抗体の存在を確認した(図3B)。ビオチン化ウサギモノクローナル抗体(ロバ抗ウサギAF488抗体を使用して緑色に染色)がヒト赤血球細胞膜(CellMask(商標)deep red plasma membrane stainを使用して赤色に染色)に共局在していることを示す、免疫蛍光イメージングも、モノクローナル抗体のヒト赤血球に対する高効率でのコンジュゲーションの成功を実証するのに用いた(図3C)。共局在解析により、モノクローナル抗体コンジュゲートヒト赤血球のピアソンのR値は0.86であることが明らかになった。この値は、VHHコンジュゲーションに以前に使用されていた二工程リンカーペプチド法よりも有意に高く、本アプローチの効率がより高いことを示している。図3Dはまた、条件毎に、AF488チャネルにおける単位細胞面積当たりの平均蛍光(cell maskを参照とする)を示す。モノクローナル抗体コンジュゲートヒト赤血球は機能的であり、ビオチン化抗hisタグ抗体コンジュゲートヒト赤血球による、hisタグ付加タンパク質(検出のためのFLAGタグも含有する)のプルダウンによって実証されるように、溶液から標的抗原をプルダウンすることができることが示された(図3E)。FLAGタグ抗体を使用して、ヒト赤血球表面上の標的抗原を検出した。このアプローチの汎用性を更に実証するために、ビオチン化HRPも赤血球の表面にコンジュゲートした。赤血球を内在性ペルオキシダーゼで漂白し、次いでビオチン化HRPとコンジュゲートした後、DAB色素原(3,3’-ジアミノベンジジン)とインキュベートし、続いてH&E染色した。特徴的な褐色沈殿物の形成により、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)活性を測定した(図3F)。これはまた、酵素がコンジュゲーション後にもRBC表面で機能を保有していることを実証する。
ヒト赤血球に対する比較的小さいサイズ~中程度のサイズのタンパク質の二工程式リンカーペプチドコンジュゲーション方法は確立されていたが、ヒト赤血球表面にモノクローナル抗体(mAb)及び酵素などのより大きいタンパク質を固定する方法を見出すことが更に求められていた。この目的のために、図3Aに概説されているように、ビオチン化ペプチドライゲートヒト赤血球をストレプトアビジン及び選択したビオチン化タンパク質と順次単純にインキュベートすることをベースとして、モジュール式のストレプトアビジンによるコンジュゲーションアプローチを確立した。親和性相互作用であるにもかかわらず、ストレプトアビジン法は非常に安定であることが実証され、各ストレプトアビジン分子の4つの結合部位は、対象とするビオチン化タンパク質の赤血球当たりのコピー数を増強した。フローサイトメトリーを使用してビオチン化抗hisタグモノクローナル抗体コンジュゲートヒト赤血球を解析した。二次蛍光抗体での染色後に集団全体の蛍光が大きくシフトすることによる可視化により、ヒト赤血球表面上のモノクローナル抗体の存在を確認した(図3B)。ビオチン化ウサギモノクローナル抗体(ロバ抗ウサギAF488抗体を使用して緑色に染色)がヒト赤血球細胞膜(CellMask(商標)deep red plasma membrane stainを使用して赤色に染色)に共局在していることを示す、免疫蛍光イメージングも、モノクローナル抗体のヒト赤血球に対する高効率でのコンジュゲーションの成功を実証するのに用いた(図3C)。共局在解析により、モノクローナル抗体コンジュゲートヒト赤血球のピアソンのR値は0.86であることが明らかになった。この値は、VHHコンジュゲーションに以前に使用されていた二工程リンカーペプチド法よりも有意に高く、本アプローチの効率がより高いことを示している。図3Dはまた、条件毎に、AF488チャネルにおける単位細胞面積当たりの平均蛍光(cell maskを参照とする)を示す。モノクローナル抗体コンジュゲートヒト赤血球は機能的であり、ビオチン化抗hisタグ抗体コンジュゲートヒト赤血球による、hisタグ付加タンパク質(検出のためのFLAGタグも含有する)のプルダウンによって実証されるように、溶液から標的抗原をプルダウンすることができることが示された(図3E)。FLAGタグ抗体を使用して、ヒト赤血球表面上の標的抗原を検出した。このアプローチの汎用性を更に実証するために、ビオチン化HRPも赤血球の表面にコンジュゲートした。赤血球を内在性ペルオキシダーゼで漂白し、次いでビオチン化HRPとコンジュゲートした後、DAB色素原(3,3’-ジアミノベンジジン)とインキュベートし、続いてH&E染色した。特徴的な褐色沈殿物の形成により、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)活性を測定した(図3F)。これはまた、酵素がコンジュゲーション後にもRBC表面で機能を保有していることを実証する。
本発明者らは更に、RBCコンジュゲーションアプローチは、さまざまなサイズ及び機能を有するさまざまな異なるタンパク質に転用可能であることを、図3G~図3H(抗IL-8抗体を使用して検出されたヒトIL-8コンジュゲーション)及び図3I(改変RBCとの共培養においてアスパラギン依存性Sup-B15細胞の効率的な生存率抑制をもたらすL-アスパラギナーゼコンジュゲーション)において実証する。注目すべきことに、GFPの内因性蛍光と、L-アスパラギナーゼコンジュゲートhRBCがSup-B15細胞の生存率及び増殖を減少させる能力とによって実証されるように、コンジュゲートタンパク質は機能を保持することが示される。
酵素によるライゲーションとクリックケミストリーとを介した、大分子のヒト赤血球に対する完全に生体直交型である共有結合による効率的なコンジュゲーション。
ストレプトアビジン法が、大きな分子をヒト赤血球に効率的にコンジュゲートする能力は実証されたが、ストレプトアビジン分子が細菌起源であることを考慮すると、ストレプトアビジン分子そのものが免疫原性を有しており、特定の臨床用途では使用が忌避される。したがって、本発明者らは、銅フリーのクリックケミストリーと酵素によるライゲーションとの組み合わせを利用して、図4Aに示すように、任意のアジド/DBCOタグ付加分子の、ヒト赤血球表面上への完全に生体直交型のコンジュゲーションを実証した。第1の酵素工程の使用により、第1の反応性基(この場合、DBCOタグを付加されたペプチド)のヒト赤血球膜に対する生体適合性及び共有結合による導入を、いかなる過酷な化学修飾も必要とせずに可能にする。第2に、銅フリーのクリックケミストリー/SPAAC(strain-promoted alkyne-azide cycloaddition)の使用により、相補的反応性官能基(この場合、アジド-抗体)タグを付加された第2のより大きな機能性分子の、ヒト赤血球表面に対するその後のコンジュゲーションを可能にする。プロセス全体は完全に生体適合性であり、免疫原性分子を利用せず、対象とする分子の完全に共有結合によるコンジュゲーションをもたらす。クリックケミストリーの成功を実証するために、hRBCにDBCOタグ付加ペプチド(EK18)をコンジュゲートし、続いて、クリックケミストリーによる活性化の際にのみ蛍光を発する蛍光標識アジドプローブであるCalFluor 647アジドと共にインキュベートした。図4Bは、DBCO-ペプチドでライゲート処理した及び未処理のRBCと共にインキュベートしたCalFluor 647の平均蛍光を示し、EK18ペプチドライゲートhRBCが銅フリーのクリックケミストリー反応を受ける能力を明確に示している。より重要なことに、100%のhRBCがCalFluor 647蛍光に対して陽性であり、全てのhRBCの効率的なコンジュゲーションを示した。図4Cは、全ての対照でhRBCに対するアジド-ペプチド(TK3)又はアジド-モノクローナル抗体のいずれかのコンジュゲーションが成功したことを示しており、酵素によるEK18ペプチドのライゲーションがクリックケミストリーの成功のための前提条件であることを実証する。データはまた、モノクローナル抗体(mAb)コンジュゲーションはペプチドコンジュゲーションよりも僅かに効率が低いことを実証している。この差は、コンジュゲーション工程に使用したモノクローナル抗体はサイズがより大きく、濃度がより低かったことに起因する可能性がある。しかしながら、FACSヒストグラムにおける集団全体のシフトによって示されるように、コピー数の変動にもかかわらず、RBCの>95%がペプチド及びモノクローナル抗体の両方について陽性であったことは注目に値する(図4C)。クリックケミストリーを介した効率的なモノクローナル抗体コンジュゲーションは、免疫蛍光イメージングによっても実証され、クリックケミストリーが成功したヒト赤血球でのみ、二次抗体により細胞表面で強い蛍光が検出される(図4D)。図4Eは、このデータを、条件毎に単位細胞面積当たりの平均蛍光として更に要約する。このアプローチを他の分子に転用できることを実証するために、本発明者らはまた、GFPなどの異なるサイズの他のタンパク質もまた、同方法を使用してRBCに対して首尾よくコンジュゲートできることを実証した(図4F~図4G)。
実施例6:ヒト赤血球(hRBC)ライゲーションアプローチは、マウス赤血球(mRBC)に転用可能である。
これまで、全ての実験はヒト赤血球(hRBC)に対して行った。マウス赤血球(mRBC)も同様に修飾され得るかどうかを検証することが求められた。酵素によりB-TL5をライゲートしたマウス赤血球又は対照マウス赤血球のフローサイトメトリー(図5A)及び免疫蛍光イメージング(図5B)により、コンジュゲーションがマウス赤血球でも成功したことが明らかになった。FACSヒストグラムによって示されるように、99%を超えるマウス赤血球が首尾よくペプチドをコンジュゲートされた。より重要なことに、このことはまた、ストレプトアビジンによるコンジュゲーションと銅フリーのクリックケミストリーとを含む、上記で実証された拡張アプローチが、マウス赤血球にも適用でき、アプローチの有効性を試験するための前臨床試験をはるかに単純にできることを示す。免疫蛍光画像の解析により、ペプチドライゲートマウス赤血球と未ライゲートマウス赤血球との間で抗ビオチン-PE蛍光における有意差が示された(図5C)。共局在解析では、ビオチン化ペプチドライゲートマウス赤血球のピアソンのR値は0.81であり、ヒト赤血球と比較してコンジュゲーションが僅かに低効率であることが明らかになった。これはおそらく、これらの2つの種間で赤血球の膜プロテオームの組成が僅かに異なることに起因する。
異なるペプチドC末端モチーフの比較により、mRBCが、多様な範囲のC末端配列を示すペプチドにより効率的にライゲートされ得ることが明らかになった(図5D)。しかしながら、この傾向は、おそらくヒトRBCとマウスRBCとでRBC膜タンパク質の組成に違いがあることに起因して、hRBCで見られるものとは異なっている。しかしながら、ペプチド長の比較により、8アミノ酸~28アミノ酸(EAAAK反復1~5個)のペプチドでは全てが効率的にライゲーションするという同様の傾向が明らかになった(図5E)。最も短いペプチド(EAAAK反復1個、8アミノ酸)で最良の収率が見られ、ライゲーション収率は長さに伴い13アミノ酸から18アミノ酸で減少した。興味深いことに、28アミノ酸ペプチド(EAAAK反復5個)は、8アミノ酸のEAAAK反復ペプチド1つと同等の収率を有した(図5E)。
赤血球のコンジュゲーションは効率的であり、汎用性がある。
酵素によるライゲーション効率を確認するために、ヒト赤血球及びマウス赤血球とB-TL5ペプチドとの完全なコンジュゲーションにかかる時間を検証した(図6A)。ヒト赤血球コンジュゲーションは3時間以内に飽和し、>90%の効率が90分以内に達成された。マウス赤血球は、おそらくマウス赤血球上のペプチドのコピー数がより少ないことに起因して、はるかに速くコンジュゲートした(約30分)。更に、クリックケミストリーを介したこのアプローチの拡張も、効率及び汎用性について評価した。66μMのアジド-ペプチド濃度又は3時間という短いインキュベーション時間であっても、条件範囲全体で、クリックケミストリーの成功による100%のヒト赤血球のコンジュゲーションが観察された(図6B)。しかしながら、最適なコンジュゲーションは、約250μMのペプチド濃度で、12時間までのインキュベーション時間で観察された。図6Cはまた、官能基の配置を切り替えた(ヒト赤血球にアジド-ペプチドをライゲート、続いてDBCOタグ付加ペプチドとインキュベーション)コンジュゲーションの可能性を実証する。銅フリーのクリックケミストリーを用い、酵素によるライゲーションを利用するコンビナトリアルアプローチの汎用性を示す。
ライゲーションプロトコルは生体適合性であり、インビボで安定かつ機能的なコンジュゲーションをもたらす。
この方法の生体適合性を試験するために、アポトーシスの誘導を表し得るPSの存在を検査するアネキシンVを使用して、ビオチン化ペプチドライゲート後又は未修飾のヒト赤血球及びマウス赤血球を解析した。図7Aに示すように、B-ペプチドライゲート赤血球は、未修飾赤血球と比較してアネキシンVの結合の増加を示さず、この方法が穏やかで生体適合性であることが確認された。更に、本発明者らは、インビボで改変マウス赤血球の安定性を実証した。この目的のために、B-TL5ペプチドコンジュゲートマウス赤血球又は対照マウス赤血球をCFSEで標識し、マウスに尾静脈注射した。24時間にわたって一定間隔で顎下静脈から採血した。細胞をストレプトアビジンAlexa Fluor 647で染色して、マウス赤血球表面のビオチンを検出した。図7Bの散布図によって示されるように、改変マウス赤血球は、未修飾(対照)マウス赤血球(CFSE蛍光を使用して検出される)と同様に血液中に保持された。更に、コンジュゲートペプチドのN末端ビオチンタグは、実験期間中安定なままであった(図7C)。図7Dはまた、PBS又はB-TL5ペプチドライゲート又は未ライゲートのCFSE染色後マウス赤血球を注射したマウスから24時間の時点で採取した血液塗抹標本の、代表的な免疫蛍光画像を示す。改変赤血球の性質がインビボで安定なものであることが確認される。免疫不全のNSG-SGM3又は免疫能力のあるC57BL/6マウスでも、39日間にわたって同じ実験を行った(図8A)。図8Bの散布図によって示されるように、改変mRBCは、両方のマウスモデルにおいて、未修飾(対照)mRBC(CFSE蛍光を使用して検出される)と同様に血液中に保持された。注目すべきことに、本発明者らは、改変RBCの約50%が注射の21日後まで循環血中に残存していることを検出することができた。更に、コンジュゲートペプチドのN末端ビオチンタグは、実験期間中ほとんど安定のまま維持されたが(図8C)、本発明者らは、血清プロテアーゼへの長期曝露後に表面ペプチドの分解に起因し得るシグナルの漸減を観察している。これにもかかわらず、本発明者らは、注射の3週間後にも元のライゲート産物の最大50%を尚も検出することができる。
実施例7:赤血球膜タンパク質と赤血球由来細胞外小胞との比較
本発明者らは、以前に、LFQ-質量分析とビオチンプルダウン実験とを併用して、OaAEP1リガーゼによってビオチン化ペプチドがライゲートされたRBCEVの候補タンパク質のリストを同定した(図12を参照)(Pham et al, Journal of Extracellular Vesicles, 2021から入手)。これらの候補タンパク質を全RBCEVタンパク質の別個の質量分析と比較することにより、候補タンパク質のうちの3つ(相対存在度で33位、119位及び57位にランク付けされるACKR1、ICAM4及びF11R)が、他の全てのRBCEVタンパク質と比較してRBCEVにおいて高度に豊富に含まれていることが明らかになった(LFQ(ラベルフリー定量)強度に基づいて計算された相対存在度)。
本発明者らは、以前に、LFQ-質量分析とビオチンプルダウン実験とを併用して、OaAEP1リガーゼによってビオチン化ペプチドがライゲートされたRBCEVの候補タンパク質のリストを同定した(図12を参照)(Pham et al, Journal of Extracellular Vesicles, 2021から入手)。これらの候補タンパク質を全RBCEVタンパク質の別個の質量分析と比較することにより、候補タンパク質のうちの3つ(相対存在度で33位、119位及び57位にランク付けされるACKR1、ICAM4及びF11R)が、他の全てのRBCEVタンパク質と比較してRBCEVにおいて高度に豊富に含まれていることが明らかになった(LFQ(ラベルフリー定量)強度に基づいて計算された相対存在度)。
このデータと既存のRBC膜プロテオーム研究との相互比較により(図13を参照)、RBCでは、これらのタンパク質の相対存在度が非常に低い(全て490未満)ことが実証される(Relative abundance obtained from ‘Quantitative analysis of human red blood cell proteome; Authors: Agata Bryk and Jacek R. Wisniewski (Biochemical Proteomics Group, Department of Proteomics and Signal Transduction, Max-Planck-Institute of Biochemistry, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Germany))。更に、コピー数の比較により、RBCEVと同じタンパク質がライゲートされた場合、RBCのペプチドのコピー数が非常に少なくなることが実証され、ライゲーションアプローチがRBCには効率的に応用できない可能性があることが示唆される。
これは、100,000をはるかに超えるコピーを示す本発明者らのライゲーションデータとは対照的である。このことは、RBCとRBCEVとで異なるタンパク質がライゲートされることを示している。この差異は、フリッパーゼ及びトランスロカーゼに起因する膜のフリッピング、又はライゲーションを遮断するグリコシル化などの他の修飾のいずれかによる、小胞化中の膜タンパク質組成の変化に起因する可能性が最も高い。
実施例7:ソルターゼ及びOaAEP1リガーゼのライゲーション効率の比較
本発明者らは、ソルターゼ及びOaAEP1リガーゼのライゲーション効率を比較した。本発明者らは、ソルターゼが、シングル工程法(脱グリコシル化RBCによるものを含む)において、又は両方のライゲーション工程(リンカーをRBCにライゲーションすることと、抗体をリンカーにライゲートすることとの両方)においてソルターゼを使用する二工程ライゲーションの使用において、シングルドメイン抗体のライゲーションを触媒できないことを見出した。本発明者らが上記のOaAEP1リガーゼを使用して達成した顕著な効率とは対照的に、これらの方法ではライゲーションは本質的に0%であった。
本発明者らは、ソルターゼ及びOaAEP1リガーゼのライゲーション効率を比較した。本発明者らは、ソルターゼが、シングル工程法(脱グリコシル化RBCによるものを含む)において、又は両方のライゲーション工程(リンカーをRBCにライゲーションすることと、抗体をリンカーにライゲートすることとの両方)においてソルターゼを使用する二工程ライゲーションの使用において、シングルドメイン抗体のライゲーションを触媒できないことを見出した。本発明者らが上記のOaAEP1リガーゼを使用して達成した顕著な効率とは対照的に、これらの方法ではライゲーションは本質的に0%であった。
更に調査するために、本発明者らは、適切なモチーフを有するペプチドをヒトRBCに対してライゲートするソルターゼの能力を調査した。
以下のペプチドをhRBCと共に室温で一晩インキュベートした。
図14に示すように、ソルターゼは適切なペプチドをhRBCに対してライゲーションすることができるが、そのライゲーション収率はOaAEP1リガーゼと比較してはるかに低い。-LPETGG又は-LPETGGG(ソルターゼAの最適なC末端モチーフ)を-NGL又は-NDL(OaAEP1の最適なC末端モチーフ)と比較した場合、ソルターゼのライゲーション収率は、それぞれ5倍及び10倍低い。
参考文献
本発明及び本発明が関係する現在の技術をより十分に説明及び開示するために、いくつかの刊行物を上記に引用している。これらの参考文献についての完全な引用を以下に提供する。これらの参考文献の各々の全体は、本明細書に組み込まれる。
本発明及び本発明が関係する現在の技術をより十分に説明及び開示するために、いくつかの刊行物を上記に引用している。これらの参考文献についての完全な引用を以下に提供する。これらの参考文献の各々の全体は、本明細書に組み込まれる。
標準的な分子生物学技術については、Sambrook, J., Russel, D.W. Molecular Cloning, A Laboratory Manual. 3ed. 2001, Cold Spring Harbor, New York: Cold Spring Harbor Laboratory Pressを参照されたい。
配列番号1: AG20
配列番号2: ペプチド
配列番号3: ペプチド
配列番号4: ペプチドリンカー
配列番号5: ペプチドリンカー
配列番号6: ペプチドリンカー
配列番号7: B-EK15-LPETGG
配列番号8: B-EK15-LPETGGG
配列番号9: B-EK15-NDL
配列番号10: EK18
配列番号11: ペプチドリンカー
配列番号12: ペプチドリンカー
配列番号13: GG20
配列番号14: EL17
配列番号15: GA20
配列番号16: GG39
配列番号17: GN20
配列番号18: GL17
配列番号19: GK25
配列番号20: B-GG8
配列番号21: TL20
配列番号22: GL29
配列番号23: ペプチドリンカー
配列番号24: ペプチドリンカー
配列番号25: ペプチドリンカー
配列番号26: ペプチドリンカー
配列番号27: ペプチドリンカー、3位のXaaは任意の天然アミノ酸であり得る
配列番号28: ペプチドリンカー、3位のXaaは任意の天然アミノ酸であり得る
配列番号29: ペプチドリンカー
配列番号30: ペプチドリンカー
配列番号31: TL5
配列番号2: ペプチド
配列番号3: ペプチド
配列番号4: ペプチドリンカー
配列番号5: ペプチドリンカー
配列番号6: ペプチドリンカー
配列番号7: B-EK15-LPETGG
配列番号8: B-EK15-LPETGGG
配列番号9: B-EK15-NDL
配列番号10: EK18
配列番号11: ペプチドリンカー
配列番号12: ペプチドリンカー
配列番号13: GG20
配列番号14: EL17
配列番号15: GA20
配列番号16: GG39
配列番号17: GN20
配列番号18: GL17
配列番号19: GK25
配列番号20: B-GG8
配列番号21: TL20
配列番号22: GL29
配列番号23: ペプチドリンカー
配列番号24: ペプチドリンカー
配列番号25: ペプチドリンカー
配列番号26: ペプチドリンカー
配列番号27: ペプチドリンカー、3位のXaaは任意の天然アミノ酸であり得る
配列番号28: ペプチドリンカー、3位のXaaは任意の天然アミノ酸であり得る
配列番号29: ペプチドリンカー
配列番号30: ペプチドリンカー
配列番号31: TL5
Claims (31)
- (a)ペプチドを赤血球(RBC)に対してライゲーションさせてRBC-ペプチドコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、リガーゼの存在下で前記RBCを前記ペプチドと接触させることを含み、
前記ペプチドがC末端リガーゼ認識配列を含む、方法。 - 前記リガーゼがOaAEP1リガーゼ、好ましくはOaAEP1-Cys247Alaである、請求項1に記載の方法。
- 前記ペプチドがエフェクター分子である、請求項1又は2に記載の方法。
- 前記エフェクター分子が、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLから選択されるC末端リガーゼ認識配列を有する、請求項3に記載の方法。
- 前記ペプチドがリンカーペプチドである、請求項1又は2に記載の方法。
- 前記リンカーペプチドが、C末端リガーゼ認識配列と、エフェクター分子に対してコンジュゲートさせるためのモチーフとを含み、別の分子に対してコンジュゲートさせるための前記モチーフが、N末端リガーゼ認識配列、クリックケミストリー官能基、又はビオチン部分である、請求項5に記載の方法。
- 前記RBC-ペプチドコンジュゲートが、RBC-リンカーペプチドコンジュゲートであり、前記方法が、
(b)エフェクター分子を前記RBC-リンカーペプチドに対してコンジュゲートさせて、RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、前記RBC-リンカーペプチドコンジュゲートを前記エフェクター分子と接触させることを更に含む、請求項6に記載の方法。 - 前記リンカーペプチドがN末端リガーゼ認識配列を含み、前記C末端リガーゼ認識配列がXaa1GGであり、Xaa1が、G以外の任意のアミノ酸であるか、又は配列NG若しくはNCLを有する、請求項7に記載の方法。
- 前記N末端リガーゼ認識配列が、G、GG、GL、GGG、GLG又はGGLである、請求項8に記載の方法。
- 前記エフェクター分子が、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLからなる群から選択されるC末端リガーゼ認識配列を含む、請求項8又は請求項9に記載の方法。
- 前記エフェクター分子を前記RBC-リンカーペプチドに対してライゲーションさせて、RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、前記RBC-リンカーペプチドコンジュゲートを前記エフェクター分子と接触させる、請求項8~10のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(a)の前記リガーゼが、工程(b)の前記リガーゼと同じであり、好ましくはOaAEP1リガーゼ、より好ましくはOaAEP1-Cys247Alaである、請求項11に記載の方法。
- 前記リンカーが、クリックケミストリー官能基と、NGL、NDL、NPL、NAL、NCL、NEL、NFL、NHL、NKL、NIL、NLL、NQL、NRL、NSL、NTL、NVL、NWL、NYL、NSLD、NSLAN又はNG、好ましくはNGL、NPL又はNDLからなる群から選択されるC末端リガーゼ認識配列とを含む、請求項6に記載の方法。
- 前記クリックケミストリー官能基が、アジド部分、テトラジン部分、メチルテトラジン部分、ジアリールサイトオクチン(diarylcytooctyne)(DBCO)部分又はトランスシクロオクチン(TCO)部分を含む、請求項13に記載の方法。
- 前記エフェクター分子が相補的なクリックケミストリー官能基を含む、請求項14に記載の方法。
- 銅フリーのクリックケミストリーによって前記エフェクター分子を前記RBC-リンカーコンジュゲートに対してコンジュゲートさせるのに適した条件下で、十分な時間にわたって、前記RBC-リンカーコンジュゲートを前記エフェクター分子と接触させる、請求項13~15のいずれか一項に記載の方法。
- 前記RBC-ペプチドコンジュゲートがRBC-リンカーコンジュゲートであり、前記リンカーがビオチン部分を含み、前記方法が、
(b)前記RBC-リンカーペプチドの前記ビオチン部分をストレプトアビジンに対してコンジュゲートさせてRBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、前記RBC-リンカーペプチドコンジュゲートをストレプトアビジンと接触させることと、
(c)エフェクター分子のビオチン部分を前記RBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートの前記ストレプトアビジンに対してコンジュゲートさせてRBC-リンカー-ストレプトアビジン-エフェクター分子コンジュゲートを形成させるのに適した条件下で十分な時間にわたって、前記RBC-リンカー-ストレプトアビジンコンジュゲートを前記ビオチン化エフェクター分子と接触させることと
を更に含む、請求項6に記載の方法。 - 前記RBC-ペプチドコンジュゲート、前記RBC-リンカー-エフェクター分子コンジュゲート又は前記RBC-リンカー-ストレプトアビジン-エフェクター分子コンジュゲートを洗浄することを更に含む、請求項1~17のいずれか一項に記載の方法。
- 前記リンカーペプチドがリンカー本体配列を含み、前記リンカー本体配列が、
(a)1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29又は30個のアミノ酸を含むか若しくはそれからなる、
(b)αヘリックスペプチド配列を含む、
(c)配列EAAAKの反復を含む、又は
(d)配列EQKLISEEDLを含む、
請求項5~18のいずれか一項に記載の方法。 - 前記リンカーが、下記からなる群から選択される配列からなる、請求項19に記載の方法。
GLGEQKLISEEDLGLPETGG;
DBCO-EAAAKEAAAKEAAAKNGL;
アジド-GSSGSGGEQKLISEEDLGGSGGSGSGNGL;
GLGEQKLISEEDLGLPETGG;
GGGEQKLISEEDLGLPETGG;
GLGEQKLISEEDLGNGL;
GGGEQKLISEEDLGNGL;及び
GLG(EAAAK)5LPETGG。 - 前記RBCが脱グリコシル化される、請求項1~20のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項1~21のいずれか一項に記載の方法によって産生される、修飾赤血球(RBC)。
- 修飾されたRBCであって、前記RBCの外表面上にペプチドを含み、前記ペプチドが天然の赤血球タンパク質に対してコンジュゲートされている、修飾RBC。
- 前記ペプチドがエフェクター分子である、請求項23に記載の修飾RBC。
- 前記ペプチドがリンカータンパク質である、請求項23に記載の修飾RBC。
- 前記リンカータンパク質がエフェクター分子に対して更にコンジュゲートされている、請求項25に記載の修飾RBC。
- 前記RBCが脱グリコシル化されている、請求項23~26のいずれか一項に記載の修飾RBC。
- 請求項22~27のいずれか一項に記載の修飾RBCを、それを必要とする個体に投与することを含む、治療方法。
- 治療方法における使用のための、請求項22~27のいずれか一項に記載の修飾RBC。
- 治療に使用する医薬品の製造における、請求項22~27のいずれか一項に記載の修飾RBCの使用。
- 前記治療が、酵素欠損症、代謝疾患、免疫関連障害、血液疾患、又はがんの治療である、請求項28、29又は30に記載の治療方法、使用するための修飾RBC、又は修飾RBCの使用。
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