JP2023550935A - Ｕｍｌｉｌｏアンチセンス転写阻害剤 - Google Patents

Abstract

ギャップマー化合物は、ＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３１）の領域Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、又はＦに対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写を阻害し、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオチドは、各々、ギャップマー化合物全体にわたって、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせによって連結され、修飾ヌクレオシドは、２’－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、又はそれらの組み合わせを含む。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０２０年１１月１８日に出願された仮出願第６３／１１５，４４８号、及び２０２１年８月２３日に出願された仮出願第６３／２３５，８９０号に対する優先権を主張する。両方の仮出願の全体の内容は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。

配列表
本出願は、電子形式の配列表とともに出願されている。配列表は、２６９６０７－４９８２６３＿ＳＬ．ｔｘｔと題され、２０２１年１１月１６日に作成されたファイルとして提供され、１８４，８０８バイトのサイズである。配列表の電子形式の情報は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。

本開示は、１２～２９個の連結ヌクレオシドを有する修飾オリゴヌクレオチドを含むギャップマー化合物を提供する。本開示はまた、炎症性ケモカイン遺伝子座ロングノンコーディングＲＮＡ（ｌｎｃＲＮＡ）の上流マスターＬｎｃＲＮＡ（ＵＭＬＩＬＯ）によって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写によって媒介される疾患又は状態を治療するための方法を提供する。

急性炎症性応答は、サイトカインシグナル伝達（例えば、ＴＮＦＡＩＰ３；ＩＬ１Ａ、ＩＬ－１Ｂ、ＩＬ－６）、走化性（例えば、ＣＣＬ２；ＣＸＣＬ１、２、３、８；ＣＳＦ２；ＣＸＣＲ７）、並びに接着及び遊走（例えば、ＩＣＡＭ１、４、５）と関与するものを含む、ＴＮＦ誘導後の多くの遺伝子の転写が伴う。したがって、当技術分野では急性炎症に対処するために転写阻害剤が必要とされている。

１つの潜在的な治療標的領域は、免疫遺伝子プライミングｌｎｃＲＮＡ又は「ＩＰＬ」などのｌｎｃＲＮＡのサブセットである。１つのＩＰＬは、ＥＬＲ＋ＣＸＣＬケモカイン遺伝子（ＩＬ－８、ＣＸＣＬ１、ＣＸＣＬ２、ＣＸＣＬ３；以下ＣＸＣＬケモカインと称される）と染色体接触を形成するためＵＭＬＩＬＯと名付けられた（Ｆａｎｕｃｃｈｉ，Ｓ．，Ｆｏｋ，Ｅ．Ｔ．，Ｄａｌｌａ，Ｅ．ｅｔ ａｌ．Ｉｍｍｕｎｅ ｇｅｎｅｓ ａｒｅ ｐｒｉｍｅｄ ｆｏｒ ｒｏｂｕｓｔ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｂｙ ｐｒｏｘｉｍａｌ ｌｏｎｇ ｎｏｎｃｏｄｉｎｇ ＲＮＡｓ ｌｏｃａｔｅｄ ｉｎ ｎｕｃｌｅａｒ ｃｏｍｐａｒｔｍｅｎｔｓ．Ｎａｔ Ｇｅｎｅｔ ５１，１３８－１５０（２０１９））。したがって、ＵＭＬＩＬＯによって誘導される複数の遺伝子の転写を阻害するための治療剤の必要性が存在する。本開示は、この必要性に対処する。

加齢黄斑変性症（ＡＭＤ）は、先進国の高齢者の失明の最も一般的な原因である。ＡＭＤの初期段階及び後期段階が存在する。後期ＡＭＤは、滲出型ＡＭＤ及び地理的萎縮（ＧＡ）に分けられる。脈絡膜血管新生（ＣＮＶ）は、「滲出型（ｗｅｔ）」、「滲出性（ｅｘｕｄａｔｉｖｅ）」、又は「血管新生（ｎｅｏｖａｓｃｕｌａｒ）」ＡＭＤの特徴であり、ＡＭＤによる重度の視力喪失の症例の約９０％を占める。血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）は、ＣＮＶ及び血管透過性の調節において重要な役割を果たすことが示されている。滲出型ＡＭＤは現在、抗ＶＥＧＦ治療薬で治療されているが、後者については現在承認された治療法は存在しない。

キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞は現在、様々ながんの治療のために承認されている。しかしながら、そのようなＣＡＲ－Ｔ療法は、重度のサイトカイン放出ストーム（ｓＣＲＳ）と呼ばれる頻繁かつ潜在的に致命的な副作用を有する。トシリズマブ及びホルモン療法は、ｓＣＲＳの治療に使用されている。しかし、これらのアプローチは高価であり、感染症などの更なる副作用のリスクを増加させる。更に、トシリズマブなどのモノクローナル抗体は、脳血液関門のために脳の損傷領域に到達することができない。ホルモン療法もまた、ＣＡＲ－Ｔ細胞機能を損ない、治療効果を弱める可能性がある。したがって、ＣＡＲ－Ｔ細胞の有効性に影響を与えることなく、ＣＡＲ－Ｔ細胞の臨床用途の安全性を改善するための効果的な療法／方法の必要性が存在する。

本開示は、ギャップマー化合物であって、約３～約７個の修飾ヌクレオシドの５’ウィング配列、約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドの中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドの３’ウィング配列を含む、１２～２９個の連結ヌクレオシドの長さを含み、
５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドが、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、及びそれらの組み合わせからなる群から選択され、
連結ヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結され、
修飾オリゴヌクレオチドが、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡ（配列番号２３１）の領域Ａヌクレオチド２５６～２８２、領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０、領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７、領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９、領域Ｅヌクレオチド８８～１０７、又は領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有する、ギャップマー化合物を提供する。

好ましくは、ギャップマー化合物は、配列番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０のうちのいずれか１つの核酸塩基配列を含むヌクレオチド配列を有する。好ましくは、ギャップマー化合物は、配列番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０のうちのいずれか１つの核酸塩基配列からなるヌクレオチド配列を有する。本発明のギャップマー化合物は、２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択されるギャップマー化合物を含む。好ましくは、本開示のギャップマー化合物は、２２３～２２７、３６～４２、５５～５６、１５１～１５３、１５５～１６２、及び２３０からなる群から選択されるギャップマー化合物を含む。

別の態様では、本発明は、ギャップマー化合物であって、１２～２９個の連結ヌクレオシドの長さからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択される核酸塩基配列を含み、ギャップマー化合物が、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を有し、５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドが、各々、２’－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ又はＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、又はそれらの組み合わせから選択される糖修飾を含み、連結ヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結され、修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号２３１のヌクレオチド配列を含むＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡのヌクレオチド配列に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有する、ギャップマー化合物を提供する。

本開示は更に、ＡＭＤ、例えば、滲出型ＡＭＤ又はサイトカインストームを治療するための方法であって、そのような治療を必要とする対象において、治療有効量のギャップマー化合物を含む組成物を対象に投与することを含み、ギャップマー化合物が、１２～２９個の連結ヌクレオシドの長さからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、ギャップマー化合物が、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を有し、５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドが、各々、２’－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、又はそれらの組み合わせから選択される糖修飾を含み、ギャップマー化合物の連結ヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結され、修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号２３１のヌクレオチド配列と１００％同一であるヌクレオチド配列を有する、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ａヌクレオチド２５６～２８２、領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０、領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７、領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９、領域Ｅヌクレオチド８８～１０７、又は領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有する、方法を提供する。好ましくは、記載される方法は、配列番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０のうちのいずれか１つで提供される修飾オリゴヌクレオチド配列を有するギャップマー化合物が使用される。好ましくは、記載される方法は、配列番号２２３～２２７、３６～４２、５５、５６、１５１～１６２、又は２３０からなる修飾オリゴヌクレオチド配列を有するギャップマー化合物が使用される。本明細書に記載される、例えば、ＡＭＤ又はサイトカインストームの治療のための方法において有用性が見出されるギャップマー化合物には、ギャップマー化合物番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択されるギャップマー化合物が含まれる。

定義
特に明記しない限り、以下の用語は以下のように定義される：

「２’－置換ヌクレオシド」とは、２’－置換糖部分を含むヌクレオシドを意味する。「２’置換」とは、糖部分に関して、Ｈ又はＯＨ以外の少なくとも１個の２’置換基を含む糖部分を意味する。

「２’－デオキシヌクレオシド」とは、デオキシリボヌクレオシド（ＤＮＡ）中に天然に存在することが見出される、２’－Ｈフラノシル糖部分を含むヌクレオシドを意味する。２’－デオキシヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含み得るか、又はＲＮＡ核酸塩基（例えば、ウラシル）を含み得る。

「２’－Ｏ－メトキシエチル」（更に２’－ＭＯＥ、ＭＯＥ、及び２’－Ｏ（ＣＨ_２）_２－ＯＣＨ_３）とは、フロシル環の２’位のＯ－メトキシ－エチル修飾を指す。２’－Ｏ－メトキシエチル修飾糖は、修飾糖である。

「２’－Ｏ－メトキシエチルヌクレオチド」とは、２’－Ｏ－メトキシエチル修飾糖部分を含むヌクレオチドを意味する。

「５－メチルシトシン」とは、５位に結合したメチル基で修飾されたシトシンを意味する。５－メチルシトシンは、修飾核酸塩基である。

「約」とは、提供される値のプラス又はマイナス７％を意味する。

「活性薬剤」とは、個体に投与された場合に治療上の利益を提供する薬学的組成物中の単数又は複数の物質を意味する。例えば、特定の実施形態では、ＵＭＬＩＬＯを標的とするギャップマー化合物は活性薬剤である。

「活性標的領域」又は「標的領域」とは、１つ以上の活性アンチセンス化合物が標的とする領域を意味する。「活性アンチセンス化合物」とは、標的遺伝子転写又は得られるタンパク質レベルを低減させるアンチセンス化合物を意味する。

「投与すること」とは、薬剤を個体に提供することを意味し、医療専門家による投与及び自己投与を含むが、これらに限定されない。

「動物」とは、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、ネコ、ブタ、並びにサル及びチンパンジーを含むがこれらに限定されない非ヒト霊長類を含むがこれらに限定されない、ヒト又は非ヒト動物を指す。

「アンチセンス活性」とは、アンチセンス化合物のその標的核酸とのハイブリダイゼーションに起因する任意の検出可能な及び／又は測定可能な変化を意味する。アンチセンス活性は、アンチセンス化合物の非存在下での標的核酸レベル又は標的タンパク質レベルと比較した、標的核酸若しくはそのような標的核酸によってコードされるタンパク質の量又は発現の減少である。

「アンチセンス化合物」とは、少なくとも１つのアンチセンス活性を達成することができるオリゴマー化合物を意味する。

「アルキル」基とは、１～８個（例えば、１～６個又は１～４個）の炭素原子を含む飽和脂肪族炭化水素基を指す。アルキル基は、直鎖状又は分枝鎖状であり得る。アルキル基の例には、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、ｓｅｃ－ブチル、ｔｅｒｔ－ブチル、ｎ－ペンチル、ｎ－ヘプチル、又は２－エチルヘキシルが含まれるが、これらに限定されない。アルキル基は、１つ以上の置換基、例えば、ハロ；脂環式［例えば、シクロアルキル又はシクロアルケニル］；ヘテロ脂環式［例えば、ヘテロシクロアルキル又はヘテロシクロアルケニル］；アリール；ヘテロアリール；アルコキシ；アロイル；ヘテロアロイル；アシル［例えば、（脂肪族）カルボニル、（脂環式）カルボニル、又は（ヘテロ脂環式）カルボニル］；ニトロ；シアノ；アミド［例えば、（シクロアルキルアルキル）カルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、アラルキルカルボニルアミノ、（ヘテロシクロアルキル）カルボニルアミノ、（ヘテロシクロアルキルアルキル）カルボニルアミノ、ヘテロアリールカルボニルアミノ、ヘテロアラルキルカルボニルアミノアルキルアミノカルボニル、シクロアルキルアミノカルボニル、ヘテロシクロアルキルアミノカルボニル、アリールアミノカルボニル、又はヘテロアリールアミノカルボニル］；アミノ［例えば、脂肪族アミノ、脂環式アミノ、又はヘテロ脂環式アミノ］；スルホニル［例えば、脂肪族－Ｓ（Ｏ）_２－］；スルフィニル；スルファニル；スルホキシ；尿素；チオ尿素；スルファモイル；スルファミド；オキソ；カルボキシ；カルバモイル；脂環式オキシ；ヘテロシクロ脂肪族オキシ；アリールオキシ；ヘテロアリールオキシ；アラルキルオキシ；ヘテロアリールアルコキシ；アルコキシカルボニル；アルキルカルボニルオキシ；又はヒドロキシで置換され得る（すなわち、任意に置換される）。限定されないが、置換アルキルのいくつかの例には、カルボキシアルキル（例えば、ＨＯＯＣ－アルキル、アルコキシカルボニルアルキル、及びアルキルカルボニルオキシアルキル）；シアノアルキル；ヒドロキシアルキル；アルコキシアルキル；アシルアルキル；アラルキル；（アルコキシアリール）アルキル；（スルホニルアミノ）アルキル（例えば、アルキル－Ｓ（Ｏ）_２－アミノアルキル）；アミノアルキル；アミドアルキル；（脂環式）アルキル；又はハロアルキルが含まれる。

「アルキレン」とは、二官能性アルキル基を指す。

「二官能性」部分とは、リンカー部分など、主化学構造と２カ所で結合している化学基を指す。二官能性部分は、任意の２つの化学的に実現可能な置換可能な点で主化学構造と結合することができる。特に明記しない限り、二官能性部分はどちらの方向であってもよく、例えば、二官能性部分「Ｎ－Ｏ」は－Ｎ－Ｏ－方向又は－Ｏ－Ｎ－方向で結合することができる。

「化学的に異なる領域」とは、同じアンチセンス化合物の別の領域とは何らかの形で化学的に異なるアンチセンス化合物の領域を指す。例えば、２’－Ｏ－メトキシエチルヌクレオチドを有する領域は、２’－Ｏ－メトキシエチル修飾のないヌクレオチドを有する領域とは化学的に異なる。

「キメラアンチセンス化合物」とは、少なくとも２つの化学的に異なる領域を有するアンチセンス化合物を意味する。

「共投与」とは、２つ以上の薬剤を個体に投与することを意味する。２つ以上の薬剤は、単一の薬学的組成物中に存在し得るか、又は別個の薬学的組成物中に存在し得る。２つ以上の薬剤の各々は、同じ又は異なる投与経路を通じて投与され得る。共投与は、並行投与又は連続投与を包含する。

「相補性」とは、第１の核酸及び第２の核酸の核酸塩基間の対形成能力を意味する。

「連続する核酸塩基」とは、互いに直接隣接する核酸塩基を意味する。

「希釈剤」とは、薬理学的活性を欠くが、薬学的に必要又は望ましい組成物中の成分を意味する。例えば、注入される組成物中の希釈剤は、液体、例えば、生理食塩水であり得る。

「用量」とは、単回投与において、又は特定の期間において提供される、特定の量の薬剤を意味する。特定の実施形態では、用量は、１回、２回、若しくはそれ以上のボーラス、錠剤、又は注射で投与され得る。例えば、皮下投与が望ましい特定の実施形態では、所望の用量は、単回の注射では容易に収容できない体積を必要とするため、所望の用量を達成するために２回以上の注射を使用することができる。特定の実施形態では、薬剤は、長期間にわたって、又は連続的に注入によって投与される。用量は、時間、日、週、又は月当たりの薬剤の量として記載され得る。

「有効量」とは、薬剤を必要とする個体において所望の生理学的結果を達成するのに十分な活性薬剤の量を意味する。有効量は、治療される個体の健康及び身体状態、治療される個体の分類群、組成物の製剤、個体の病状の評価、及び他の関連する要因に応じて、個体間で変化し得る。

「完全に相補的」又は「１００％相補的」とは、第１の核酸の各核酸塩基が第２の核酸と相補的な核酸塩基を有することを意味する。特定の実施形態では、第１の核酸は、ギャップマー化合物であり、標的核酸は、第２の核酸、例えば、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡの核酸配列である。

オリゴヌクレオチドに関する「相補的」とは、オリゴヌクレオチド及び他の核酸の核酸塩基配列が反対方向に整列している場合に、オリゴヌクレオチド又はその１つ以上の領域の核酸塩基及び別の核酸又はその１つ以上の領域の核酸塩基の少なくとも７０％が互いに水素結合できることを意味する。相補的核酸塩基とは、互いに水素結合を形成することができる核酸塩基を意味する。

相補的な核酸塩基対には、アデニン（Ａ）及びチミン（Ｔ）、アデニン（Ａ）及びウラシル（Ｕ）、シトシン（Ｃ）及びグアニン（Ｇ）、５－メチルシトシン（ｍＣ）及びグアニン（Ｇ）が含まれる。相補的オリゴヌクレオチド及び／又は核酸は、各ヌクレオシドにおいて核酸塩基相補性を有する必要はない。むしろ、いくつかのミスマッチが許容される。オリゴヌクレオチドに関する「完全に相補的」又は「１００％相補的」とは、オリゴヌクレオチドが、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドにおいて別のオリゴヌクレオチド又は核酸と相補的であることを意味する。

オリゴヌクレオチドとの関連での「連続する」とは、互いに直接隣接するヌクレオシド、核酸塩基、糖部分、又はヌクレオシド間結合を指す。例えば、「連続する核酸塩基」とは、配列内で互いに直接隣接する核酸塩基を意味する。

「ギャップマー化合物」（又は互換的に使用されるギャップマー）は、１つ以上のヌクレオシドを有する外部領域の間に位置する複数のＤＮＡヌクレオシドを有する内部「ギャップ」領域を含む修飾オリゴヌクレオチドを意味し、内部領域を構成するヌクレオシドは、外部領域を構成するヌクレオシドとは化学的に異なる。内部領域は「ギャップ」と称されることが多く、外部領域は「ウィング」と称されることが多い。特に明記しない限り、ギャップマーのギャップ中央領域のヌクレオシドの糖部分は、未修飾２’－デオキシリボシルである。したがって、「ＭＯＥギャップマー」という用語は、両ウィングに２’－ＭＯＥヌクレオシドの糖モチーフ及び２’－デオキシヌクレオシドのギャップを有するギャップマーを指す。特に明記しない限り、２’－ＭＯＥギャップマーは、１つ以上の修飾ヌクレオシド間結合及び／又は修飾核酸塩基を含み得、そのような修飾は必ずしも糖修飾のギャップマーパターンに従うとは限らない。ギャップマー化合物は、本明細書に記載の「配列番号」で示されるヌクレオシド配列を含み、各修飾ヌクレオシドの修飾糖部分によって示される修飾ウィングセグメントを有する。本明細書で使用される場合、例示されるギャップマー化合物は、そのそれぞれの配列番号と同一であり、互換的に使用され得る。例えば、ギャップマー化合物２２３は、ギャップマー化合物配列番号２２３と同じである。

「ハイブリダイゼーション」とは、相補的なオリゴヌクレオチド及び／若しくは核酸の対形成又はアニーリングを意味する。特定の機構に限定されないが、ハイブリダイゼーションの最も一般的な機構は、相補的核酸塩基間のワトソン・クリック、フーグスティーン、又は逆フーグスティーン水素結合などの水素結合を伴う。

「直接隣接する」とは、直接隣接する要素の間に介在要素がないことを意味する。

「ＵＭＬＩＬＯを阻害する」とは、ＩＬ－８、ＣＸＣＬ１、ＣＸＣＬ２、及びＣＸＣＬ３を含むがこれらに限定されない、ＵＭＬＩＬＯによって調節される遺伝子の転写を低減することを意味する。

本明細書において互換的に使用される「個体」又は「対象」とは、治療若しくは療法のために選択されるヒト又は非ヒト動物を意味する。

「修飾ヌクレオチド塩基」及び「修飾ヌクレオシド」は、天然核酸に見出されない１つ以上の化学的部分を有するように修飾されるデオキシリボースヌクレオチド又はリボースヌクレオチドを指す。修飾ヌクレオチド塩基及び「修飾ヌクレオシド」の例は、本明細書に記載の式Ｉａ、式Ｉｂ、式ＩＩａ、又は式ＩＩｂの化合物である。

「非二環修飾糖部分」とは、化学修飾が糖部分の二環式又は多環式環系への変換を含まない、本明細書に記載の修飾ヌクレオチド塩基の糖部分を指す。

「単環式ヌクレオシド」とは、二環式糖部分ではない修飾糖部分を含むヌクレオシドを指す。特定の実施形態では、ヌクレオシドの糖部分、又は糖部分類似体は、任意の位置で修飾又は置換され得る。

「２’修飾糖」とは、２’位で修飾されたフラノシル糖を意味する。かかる修飾には、本明細書に記載の置換基が含まれる。

「二環式ヌクレオシド」（ＢＮＡ）は、二環式糖部分を含む修飾ヌクレオシドを指す。二環式ヌクレオシドの例には、４’と２’リボシル環原子との間の架橋を含むヌクレオシドが含まれるが、これらに限定されない。二環式ヌクレオシドの合成は、例えば米国特許第７，３９９，８４５号、ＷＯ／２００９／００６４７８、ＷＯ／２００８／１５０７２９、ＵＳ２００４－０１７１５７０、米国特許第７，４２７，６７２号、Ｃｈａｔｔｏｐａｄｈｙａｙａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．２００９，７４，１１８－１３４、ＷＯ９９／１４２２６、及びＷＯ２００８／１５４４０１に開示されている。メチレンオキシ（４’－ＣＨ_２－Ｏ－２’）ＢＮＡモノマーのアデニン、シトシン、グアニン、５－メチルシトシン、チミン、ウラシルの合成及び調製、並びにそれらのオリゴマー化、及び核酸認識特性について記載されている（Ｋｏｓｈｋｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９８，５４，３６０７－３６３０）。ＢＮＡ及びそれらの調製もまた、ＷＯ９８／３９３５２及びＷＯ９９／１４２２６にも記載されている。メチレンオキシ（４’－ＣＨ_２－Ｏ－２’）ＢＮＡ及び２’－チオ－ＢＮＡの類似体も調製されている（Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９８，８，２２１９－２２２２）。核酸ポリメラーゼの基質としてオリゴデオキシリボヌクレオチド二本鎖を含むロックドヌクレオシド類似体の調製も記載されている（ＷＯ９９／１４２２６）。更に、新規の立体構造的に制限された高親和性オリゴヌクレオチド類似体である２’－アミノ－ＢＮＡの合成が当該技術分野で説明されている（Ｓｉｎｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９８，６３，１００３５－１００３９）。加えて、２’－アミノ－ＢＮＡ及び２’－メチルアミノ－ＢＮＡが調製されており、相補的なＲＮＡ及びＤＮＡ鎖とのそれらの二重鎖の熱安定性が以前に報告されている。４’－（ＣＨ_２）_３－２’架橋及びアルケニル類似体架橋４’－ＣＨ＝ＣＨ－ＣＨ_２－２’を有する１つの炭素環式二環式ヌクレオシドが記載されている（Ｆｒｅｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９７，２５（２２），４４２９－４４４３、及びＡｌｂａｅｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００６，７１，７７３１－７７４０）。炭素環式二環式ヌクレオシドの合成及び調製、並びにそれらのオリゴマー化及び生化学的研究についても記載されている（Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，２００７，１２９（２６），８３６２－８３７９）。

「４’－２’二環式ヌクレオシド」又は「４’－２’二環式ヌクレオシド」は、糖環の２’炭素原子及び４’炭素原子を接続するフラノース環の２つの炭素原子を接続する架橋を含むフラノース環を含む二環式ヌクレオシドである。

「ロックド核酸」（ＬＮＡ）は、修飾ヌクレオチド塩基であり、化学修飾は、糖部分の二環式又は多環式環系への変換である。ロックド核酸化合物の２つの具体例は、β－Ｄ－メチレンオキシヌクレオチド、又は「拘束メチル」（ｃＭｅ）ヌクレオチド及びβ－Ｄ－エチレンオキシヌクレオチド、又は「拘束エチル」（ｃＥｔ）ヌクレオチドである。

「ミスマッチ」又は「非相補的」とは、第１及び第２のオリゴヌクレオチドが整列した場合に、第２のオリゴヌクレオチド又は標的核酸の対応する核酸塩基と相補的ではない第１のオリゴヌクレオチドの核酸塩基を意味する。

「モチーフ」は、オリゴヌクレオチド中の未修飾及び／若しくは修飾糖部分、核酸塩基、並びに／又はヌクレオシド間結合のパターンを意味する。

「核酸塩基」とは、未修飾核酸塩基又は修飾核酸塩基を意味する。「未修飾核酸塩基」は、アデニン（Ａ）、チミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）、ウラシル（Ｕ）、及びグアニン（Ｇ）である。

「修飾核酸塩基」は、少なくとも１つの未修飾核酸塩基と対形成することができる、未修飾Ａ、Ｔ、Ｃ、Ｕ、又はＧ以外の原子の基である。「５－メチルシトシン」は、修飾核酸塩基である。ユニバーサル塩基は、５つの未修飾核酸塩基のうちのいずれか１つと対形成することができる修飾核酸塩基である。「核酸塩基配列」とは、いかなる糖又はヌクレオシド間結合修飾からも独立した、核酸又はオリゴヌクレオチドにおける連続する核酸塩基の順序を意味する。

「ヌクレオシド」とは、核酸塩基及び糖部分を含む化合物を意味する。核酸塩基及び糖部分はそれぞれ、独立して、未修飾又は修飾である。「修飾ヌクレオシド」とは、修飾核酸塩基及び／又は修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。修飾ヌクレオシドには、核酸塩基を欠く脱塩基ヌクレオシドが含まれる。「連結ヌクレオシド」は、連続する配列で接続されたヌクレオシドである（すなわち、追加のヌクレオシドが連結されたそれらの間に存在しない）。

「ヌクレオシド模倣体」には、糖、又は糖及び塩基を置換するために使用されるそれらの構造が含まれ、必ずしもオリゴマー化合物の１つ以上の位置における結合、例えば、モルホリノ、シクロヘキセニル、シクロヘキシル、テトラヒドロピラニル、ビシクロ、又はトリシクロ糖模倣体、例えば、非フラノース糖単位を有するヌクレオシド模倣体を含むものではない。ヌクレオチド模倣体には、例えば、ペプチド核酸又はモルホリノ（－Ｎ（Ｈ）－Ｃ（＝Ｏ）－Ｏ－又は他の非ホスホジエステル結合によって連結されたモルホリノ）などのオリゴマー化合物の１つ以上の位置でヌクレオシド及び結合を置換するために使用されるそれらの構造が含まれる。糖代替物は、ヌクレオシド模倣物という少し広範な用語と重複するが、糖単位（フラノース環）のみの置換を示すことを意図している。本明細書で提供されるテトラヒドロピラニル環は、フラノース糖基がテトラヒドロピラニル環系で置換された糖代替物の例を示す。

「非経口投与」とは、注射（例えば、ボーラス注射）又は注入による投与を意味する。非経口投与には、皮下投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、腹腔内投与、又は頭蓋内投与、例えば、くも膜下腔内若しくは脳室内投与が含まれる。

「薬学的に許容される担体」とは、化合物の生理学的及び薬学的に許容される担体を意味する。薬学的に許容される担体は、親化合物の所望の生物学的活性を保持し、それに望ましくない毒性学的な影響を付与しない。

「薬学的組成物」とは、動物に投与するのに好適な物質の混合物を意味する。例えば、薬学的組成物は、オリゴマー化合物及び滅菌水溶液を含み得る。特定の実施形態では、薬学的組成物は、特定の細胞株における遊離取り込みアッセイにおいて活性を示す。

「ホスホロチオエート結合」は、非架橋酸素原子の１つを硫黄原子で置換することによってホスホジエステル結合が修飾されるヌクレオシド間の結合を意味する。

「一部」とは、核酸の定義された数の連続する（すなわち、連結）核酸塩基を意味する。特定の実施形態では、一部は、標的核酸の定義された数の連続する核酸塩基である。特定の実施形態では、一部は、ギャップマー化合物の定義された数の連続する核酸塩基である。

「プロドラッグ」とは、内因性酵素又は他の化学物質若しくは条件の作用によって、身体又はその細胞内で活性型に変換される不活性型で調製される治療剤を意味する。

「量若しくは活性の低減又は阻害」は、未処理若しくは対照試料中の転写発現又は活性と比較した転写発現若しくは活性の低減又は遮断を指し、必ずしも転写発現又は活性の完全な除去を示すものではない。

「副作用」とは、所望の効果以外の治療に起因する生理学的反応を意味する。副作用には、注射部位反応、肝機能検査異常、腎機能異常、肝毒性、腎毒性、中枢神経系異常、ミオパシー、及び倦怠感が含まれる。例えば、血清中のアミノトランスフェラーゼレベルの増加は、肝毒性又は肝機能異常を示し得る。例えば、ビリルビンの増加は、肝毒性又は肝機能異常を示し得る。

「一本鎖オリゴヌクレオチド」とは、相補鎖とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチドを意味する。

「糖部分」とは、未修飾糖部分又は修飾糖部分を意味する。本明細書で使用される場合、「未修飾糖部分」は、ＲＮＡに見られる２’－ＯＨ（Ｈ）リボシル部分（「未修飾ＲＮＡ糖部分」）、又はＤＮＡに見られる２’－Ｈ（Ｈ）デオキシリボシル部分（「未修飾ＤＮＡ糖部分」）を意味する。未修飾糖部分は、１’、３’、及び４’位の各々に１つの水素、３’位に１つの酸素、及び５’位に２つの水素を有する。本明細書で使用される場合、「修飾糖部分」又は「修飾糖」は、修飾フラノシル糖部分又は糖代替物を意味する。

「糖代替物」とは、ヌクレオシド間結合、共役基、又はオリゴヌクレオチドの末端基など、核酸塩基を別の基と連結できるフラノシル部分以外を有する修飾糖部分を意味する。糖代替物を含む修飾ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチド内の１つ以上の位置に組み込むことができ、そのようなオリゴヌクレオチドは、相補的なオリゴマー化合物又は標的核酸とハイブリダイズすることができる。

「標的化」又は「標的とする」とは、標的核酸と特異的にハイブリダイズして所望の効果を誘導するアンチセンス化合物の設計及び選択のプロセスを意味する。

「標的セグメント」とは、アンチセンス化合物が標的とする標的核酸のヌクレオチド配列を意味する。「５’標的部位」とは、標的セグメントの最も５’側のヌクレオチドを指す。「３’標的部位」とは、標的セグメントの最も３’側のヌクレオチドを指す。

「標的核酸」及び「標的ＲＮＡ」は、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡなど、ギャップマー化合物が影響を与えるように設計された核酸を意味する。

「標的領域」とは、オリゴマー化合物がハイブリダイズするように設計された標的核酸の一部を意味する。

「治療有効量」とは、個体に治療上の利益を提供する薬剤の量を意味する。

「治療」とは、疾患、障害、若しくは状態の変化又は改善をもたらすために薬学的組成物を投与することを指す。

「毎週」とは、６～８日ごとを意味する。

「未修飾ヌクレオチド」とは、天然に存在する核酸塩基、糖部分、及びヌクレオシド間結合から構成されるヌクレオチドを意味する。未修飾ヌクレオチドは、ＲＮＡヌクレオチド（すなわち、β－Ｄ－リボヌクレオシド）又はＤＮＡヌクレオチド（すなわち、β－Ｄ－デオキシリボヌクレオシド）である。

オリゴマー合成
修飾ヌクレオシド及び未修飾ヌクレオシドのオリゴマー化は、ＤＮＡ（Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｆｏｒ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ａｎａｌｏｇｓ，Ｅｄ．Ａｇｒａｗａｌ（１９９３），Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ）及び／又はＲＮＡ（Ｓｃａｒｉｎｇｅ，Ｍｅｔｈｏｄｓ（２００１），２３，２０６－２１７．Ｇａｉｔ ｅｔ ａｌ．，Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌｌｙ ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｄ ＲＮＡ ｉｎ ＲＮＡ：Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ，Ｅｄ．Ｓｍｉｔｈ（１９９８），１－３６．Ｇａｌｌｏ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ（２００１），５７，５７０７－５７１３）の文献手順に従ってルーチン的に実施することができる。

オリゴマー化合物は、固相合成の周知の技術を通じて、便利かつルーチン的に作製することができる。かかる合成のための装置は、例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，Ｃａｌｉｆ．）を含む、いくつかのベンダーによって販売される。当該技術分野で公知のそのような合成のための他の任意の手段が追加的に又は代替的に利用され得る。同様の技術を使用して、ホスホロチオエート及びアルキル化誘導体などのオリゴヌクレオチドを調製することは周知である。

オリゴヌクレオチド合成
オリゴマー化合物及びホスホラアミダイトは、当業者に周知の方法によって製造される。修飾ヌクレオシド及び未修飾ヌクレオシドのオリゴマー化は、必要に応じて、ＤＮＡ様化合物（Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｆｏｒ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ａｎａｌｏｇｓ，Ｅｄ．Ａｇｒａｗａｌ（１９９３），Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ）及び／又はＲＮＡ様化合物（Ｓｃａｒｉｎｇｅ，Ｍｅｔｈｏｄｓ（２００１），２３，２０６－２１７．Ｇａｉｔ ｅｔ ａｌ．，Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌｌｙ ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｄ ＲＮＡ ｉｎ ＲＮＡ：Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ，Ｅｄ．Ｓｍｉｔｈ（１９９８），１－３６．Ｇａｌｌｏ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ（２００１），５７，５７０７－５７１３）の合成に関する文献手順に従って実施される。代替的に、オリゴマーは、例えば、Ｃａｒｅ Ｂａｙ、Ｇｅｎ Ｓｃｒｉｐｔ、又はＭｉｃｒｏｓｙｎｔｈなどの様々なオリゴヌクレオチド合成会社から購入することもできる。

使用される特定のプロトコルにかかわらず、本発明に従って使用されるオリゴマー化合物は、固相合成の周知の技術を介して都合よくかつルーチン的に作製され得る。かかる合成のための装置は、例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，ＣＡ，ＵＳＡ）を含む、いくつかのベンダーによって販売される。当該技術分野で公知のそのような合成のための他の任意の手段が追加的に又は代替的に利用され得る（液相合成を含む）。

オリゴヌクレオチドの単離及び分析方法は、当該技術分野において周知である。９６ウェルプレートフォーマットは、小規模用途のオリゴヌクレオチドの合成、単離、及び分析に特に有用である。

実施形態
本開示は、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡの領域（ギャップマー化合物と同等の長さ）と相補的であり（例えば、ギャップマー化合物の全長にわたる１００％の相補性を含む、約９１％の相補性～約１００％の相補性）、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写を阻害する、ギャップマー化合物を提供する。本開示の様々な実施形態では、ギャップマー化合物は、１２～２９個の連結ヌクレオシドの長さの修飾オリゴヌクレオチドを含む。ギャップマー化合物は、ＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３１）の領域（ギャップマー化合物と比較して同等の長さ）と少なくとも９１％相補的であり（例えば、ギャップマー化合物の全長にわたって１個以下のヌクレオチドミスマッチ（すなわち、０又は１個のミスマッチ）を有する）、複数の急性炎症性遺伝子転写がＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡによって調節されるのを阻害する。全ての事例において、ヌクレオチドミスマッチは、ウィングセグメントのうちの１つで発生するが、中央ギャップ領域では発生しない。ギャップマー化合物は、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を有し、
５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドは、各々、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される糖修飾を含み、ギャップマー化合物ヌクレオシドは、各々、ギャップマー化合物の全長にわたってホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結される。ギャップマー化合物の修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２３１のＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ａ、ヌクレオチド２５６～２８２、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ｂ、ヌクレオチド５１１～５４０、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ｃ、ヌクレオチド５２３～５４７、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ｄ、ヌクレオチド４４１～４６９、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ｅ、ヌクレオチド８８～１０７、又はＵＭＬＩＬＯロングノンコーディング（ｌｎｃ）ＲＮＡの領域Ｆ、ヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有する。ギャップマー化合物は、配列番号２３１のヌクレオチド配列に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的、例えば、本明細書に記載の領域Ａ～Ｆのうちの１つに対して９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％相補的であるヌクレオチド配列を有する。

好ましくは、ギャップマー化合物は、配列番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５、５６、８８、１００～１０２、１２３、１２４、１２７、１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択される修飾ヌクレオシド配列を有する。

本開示は、ＵＭＬＩＬＯの領域Ｄ（配列番号２３１の塩基４４１～４６９）と相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子の転写を阻害するギャップマー化合物を提供し、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオチドは、各々、ギャップマー化合物全体にわたって、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせによって連結され、修飾ヌクレオシド修飾は、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）ヌクレオチド、ロックド核酸ヌクレオチド（ＬＮＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。好ましくは、領域Ｄと結合し、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写を阻害するギャップマー化合物のヌクレオシド配列は、配列番号２２３～２２７、３６～４２、５５、５６、１５１～１５３、１５５～１６２、及び２３０からなる群から選択される。領域Ｄと結合し、本明細書に記載の方法において有用な本開示のギャップマー化合物には、ギャップマー化合物２２３～２２７、３６～４２、５５、５６、１５１～１５３、１５５～１６２、及び２３０が含まれる。

本開示は、ＵＭＬＩＬＯの領域Ａ（配列番号２３１の塩基２５６～２８２）と相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子の転写を阻害するギャップマー化合物を提供し、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオシドは、各々、ギャップマー化合物全体にわたって、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせによって連結され、修飾ヌクレオシド修飾は、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）ヌクレオチド、ロックド核酸ヌクレオチド（ＬＮＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。好ましくは、領域Ａと結合し、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写を阻害するギャップマー化合物のヌクレオシド配列は、配列番号１２である。領域Ａと結合し、本明細書に記載の方法において有用な本開示のギャップマー化合物には、ギャップマー化合物１２が含まれる。

本開示は、ＵＭＬＩＬＯの領域Ｂ（配列番号２３１の塩基５１１～５４０）と相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子の転写を阻害するギャップマー化合物を提供し、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオチドは、各々、ギャップマー化合物全体にわたって、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせによって連結され、修飾ヌクレオシド修飾は、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）ヌクレオチド、ロックド核酸ヌクレオチド（ＬＮＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。好ましくは、領域Ｂと結合し、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写を阻害するギャップマー化合物のヌクレオシド配列は、配列番号２１である。領域Ｂと結合し、本明細書に記載の方法において有用な本開示のギャップマー化合物には、ギャップマー化合物２１が含まれる。

本開示は、ＵＭＬＩＬＯの領域Ｃ（配列番号２３１の塩基５３２～５４７）と相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡからの複数の急性炎症性遺伝子の転写を阻害するギャップマー化合物を提供し、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオシドは、各々、ギャップマー化合物全体にわたって、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせによって連結され、修飾ヌクレオシド修飾は、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）ヌクレオチド、ロックド核酸ヌクレオチド（ＬＮＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。好ましくは、領域Ｃと結合し、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写を阻害するギャップマー化合物のヌクレオシド配列は、配列番号３５である。領域Ｃと結合し、本明細書に記載の方法において有用な本開示のギャップマー化合物には、ギャップマー化合物３５が含まれる。

本開示は、ＵＭＬＩＬＯの領域Ｅ（配列番号２３１、塩基８８～１０７）と相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡからの複数の急性炎症性遺伝子の転写を阻害するギャップマー化合物を提供し、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオチドは、各々、ギャップマー化合物全体にわたって、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせによって連結され、修飾ヌクレオシド修飾は、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）ヌクレオチド、ロックド核酸ヌクレオチド（ＬＮＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。好ましくは、領域Ｅと結合し、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写を阻害するギャップマー化合物のヌクレオシド配列は、配列番号１００である。領域Ｅと結合し、本明細書に記載の方法において有用な本開示のギャップマー化合物には、ギャップマー化合物１００が含まれる。

本開示は、ＵＭＬＩＬＯの領域Ｆ（配列番号２３１の塩基５４７～５６７）と相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子の転写を阻害するギャップマー化合物を提供し、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオシドは、各々、ギャップマー化合物全体にわたって、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせによって連結され、修飾ヌクレオシド修飾は、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）ヌクレオチド、ロックド核酸ヌクレオチド（ＬＮＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。好ましくは、領域Ｆと結合し、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子転写を阻害するギャップマー化合物のヌクレオシド配列は、配列番号１２８である。領域Ｆと結合し、本明細書に記載の方法において有用な本開示のギャップマー化合物には、ギャップマー化合物１２８が含まれる。

本開示は、標的ＵＮＭＩＬＯ配列番号２３１に対してその全長にわたって少なくとも９１％の配列相補性を有するギャップマー化合物を提供し、
（ａ）各修飾ヌクレオシドが、２’－ＭＯＥ、フラノース環を置換するテトラヒドロピラン環、４’－ＣＨ（ＣＨ_３）－Ｏ－２’架橋を有する又は有しない二環式糖、拘束エチルヌクレオシド（ｃＥｔ）、ヌクレオシド模倣物、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される修飾糖を有する、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約８～約１５個の２’デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）各ヌクレオシドが、２’－ＭＯＥ、フラノース環を置換するテトラヒドロピラン環、４’－ＣＨ（ＣＨ_３）－Ｏ－２’架橋を有する又は有しない二環式糖、拘束エチルヌクレオシド（ｃＥｔ）、ヌクレオシド模倣物、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される修飾糖を有する、約３～約６個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオシドは、各々、ギャップマー全体にわたってホスホロチオエートヌクレオチド間結合によって連結される。好ましくは、ギャップマー化合物の中央ギャップ領域は、配列番号２２３、３６～４２、５５、５６、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、２３０からなる群から選択される配列からのヌクレオチド５～ヌクレオチド１５までの１０個のヌクレオチド配列、又はその８若しくは９量体断片である。好ましくは、５’及び３’ウィング修飾ヌクレオシドは、２’置換ヌクレオシドである。より好ましくは、５’及び３’ウィング修飾修飾ヌクレオシドは、２’－ＭＯＥヌクレオシドである。

いくつかの例示的な実施形態では、本開示は、ギャップマー化合物、又はその薬学的に許容される担体であって、１２～２４個の連結ヌクレオシドの長さからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、ギャップマー化合物が、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、約６～約１０個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を有し、
５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドが、各々、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、又はそれらの組み合わせから選択される糖修飾を含み、
連結ヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結され、
ギャップマー化合物が、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡの領域Ａヌクレオチド２５６～２８２、領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０、領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７、領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９、領域Ｅヌクレオチド８８～１０７、又は領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有し、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃＲＮＡが、配列番号２３１のヌクレオチド配列を有する、ギャップマー化合物、又はその薬学的に許容される担体を提供する。

一実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する。

更なる実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ａヌクレオチド２５６～２８２に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する。

更なる実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ａヌクレオチド２５６～２８２に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する。

更なる実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する。

更なる実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｅヌクレオチド８８～１０７に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する。

更なる実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｅヌクレオチド８８～１０７に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する。

更なる実施形態では、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である。

一実施形態では、ギャップマー化合物配列は、配列番号２２３～２２７、３６～４２、５５、５６、１５１～１５３、１５５～１６２、又は２３０のうちのいずれか１つの修飾ヌクレオシド配列を含む。

一実施形態では、ギャップマー化合物は、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２３の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、５’ウィングセグメントは、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、３’ウィングセグメントは、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２４の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、５’ウィングセグメントは、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、３’ウィングセグメントは、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

一実施形態では、ギャップマー化合物は、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２５の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、５’ウィングセグメントは、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシドからなり、３’ウィングセグメントは、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２６の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個のロックドヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個のロックドヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、５’ウィングセグメントは、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシドからなり、３’ウィングセグメントは、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２７の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、ギャップセグメントは、９個のデオキシヌクレオシド、及びギャップセグメントの５’位から始まる１０個のヌクレオシドのうちの３位での１個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、５’ウィングセグメントは、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド（ｃＭｅ）からなり、３’ウィングセグメントは、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド（ｃＭｅ）からなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号１５０の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、ギャップセグメントは、１０個のデオキシヌクレオシドからなり、５’ウィングセグメントは、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド（ｃＭｅ）からなり、３’ウィングセグメントは、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド（ｃＭｅ）からなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

いくつかの実施形態では、本発明は、ギャップマー化合物であって、１２～２９個の連結ヌクレオシドの長さからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号２２３～２２７、１２、２１、３５～４２、５５、５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、及び２３０からなる群から選択されるヌクレオシド配列を含み、ギャップマー化合物が、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、約６～約１０個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を有し、
５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドが、各々、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、又はそれらの組み合わせから選択される糖修飾を含み、
連結ヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結され、
修飾オリゴヌクレオチドが、炎症性ケモカイン遺伝子座ロングノンコーディングＲＮＡの上流マスターＬｎｃＲＮＡ（ＵＭＬＩＬＯ）に対して、その全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有し（すなわち、ギャップマー化合物は、０個又は最大で１個のミスマッチを有し、例えば、配列番号２３１と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は少なくとも１００％相補的である）、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡが、配列番号２３１のヌクレオチド配列を有する、ギャップマー化合物を含む。ミスマッチはウィングセグメントの１つでのみ発生するが、中央ギャップ領域では発生しない。

一実施形態では、本開示のギャップマー化合物は、表１に提供されるギャップマー化合物番号２２３～２２７、１２、２１、３５～４２、５５、５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、及び２３０のうちのいずれか１つを含む。

一実施形態では、ギャップマー化合物は、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２３の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、５’ウィングセグメントは、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、３’ウィングセグメントは、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２４の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、５’ウィングセグメントは、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、３’ウィングセグメントは、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

一実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２３０の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有し、修飾オリゴヌクレオチドは、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、ギャップセグメントは、５’から３’方向へ５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、５’ウィングセグメントは、３個の２’Ｆ－ＡＮＡ修飾ヌクレオシドからなり、３’ウィングセグメントは、３個の２’Ｆ－ＡＮＡ修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

一実施形態では、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾は、拘束エチル（ｃＥｔ）修飾及び拘束メチル（ｃＭｅ）修飾から選択される。

いくつかの実施形態では、本明細書に記載のギャップマー化合物は、シトシンが５－メチルシトシンである核酸塩基配列を有する。

本開示は、ＡＭＤ又はサイトカインストームを治療するための方法であって、ＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３１）の領域（ギャップマー化合物の長さと比較して同等の長さ）に対してギャップマー化合物修飾オリゴヌクレオチドの全長にわたって少なくとも９１％相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡによって調節される複数の急性炎症性遺伝子の転写を阻害する治療有効量のギャップマー化合物を投与することを含み、ギャップマー化合物が、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオシドが、各々、ギャップマー化合物全体にわたって、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせによって連結され、修飾ヌクレオシド修飾が、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）ヌクレオチド、ロックド核酸ヌクレオチド（ＬＮＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、方法を提供する。ギャップマー化合物の修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２３１のＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ａ、ヌクレオチド２５６～２８２、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ｂ、ヌクレオチド５１１～５４０、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ｃ、ヌクレオチド５２３～５４７、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ｄ、ヌクレオチド４４１～４６９、ＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡの領域Ｅ、ヌクレオチド８８～１０７、又はＵＭＬＩＬＯロングノンコーディング（ｌｎｃ）ＲＮＡの領域Ｆ、ヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有する。ギャップマー化合物は、配列番号２３１のヌクレオチド配列に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的、例えば、本明細書に記載のＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３１）の領域Ａ～Ｆのうちの１つに対して９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％相補的であるヌクレオチド配列を有する。最も好ましくは、ギャップマー化合物は、配列番号２３１の領域Ｄ塩基４４１～４６９の一部（ギャップマー化合物の長さと比較して同等の長さ）に対して（ギャップマー化合物の全長にわたって）少なくとも９１％相補的である。本明細書に記載される、例えば、ＡＭＤ又はサイトカインストームの治療のための方法において有用性が見出されるギャップマー化合物には、ギャップマー化合物番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択されるギャップマー化合物が含まれる。

本開示は、加齢黄斑変性、例えば、滲出型ＡＭＤを治療するための方法であって、ＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３１）の領域に対してギャップマー化合物修飾オリゴヌクレオチドの全長にわたって少なくとも９１％相補的であり、ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡからの複数の急性炎症性遺伝子の転写を阻害する治療有効量のギャップマー化合物を投与することを含み、（ａ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、（ｂ）約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び（ｃ）約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を含み、ギャップマーヌクレオシドが、各々、ギャップマー全体にわたってホスホロチオエートヌクレオチド間結合によって連結され、修飾ヌクレオシド修飾が、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）ヌクレオシド、ロックド核酸ヌクレオシド（ＬＮＡ）、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、方法を提供する。好ましくは、ギャップマー化合物は、配列番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５、５６、８８、１００～１０２、１２３、１２４、１２７、１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択されるヌクレオシド配列を有する。ＵＭＬＩＬＯ配列の領域は、領域Ａ塩基２５６～２８２、領域Ｂ塩基５１１～５４０、領域Ｃ塩基５２３～５４７、領域Ｄ塩基４４１～４６９、領域Ｅ塩基８８～１０７、及び領域Ｆ塩基５４７～５６７からなる群から選択される。最も好ましくは、ギャップマーは、領域Ｄ塩基４４１～４６９の一部と相補的である。本明細書に記載のＡＭＤ、例えば、滲出型ＡＭＤの治療方法において有用性が見出されるギャップマー化合物には、ギャップマー化合物番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択される治療有効量のギャップマー化合物の投与が含まれる。

一実施形態では、ギャップマー化合物は、ＡＭＤ又はサイトカインストームの治療に有用であり、ＡＭＤ又はサイトカインストームを有する対象に、配列番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０のうちのいずれか１つを含む修飾オリゴヌクレオチド配列を有するギャップマー化合物と、薬学的に許容される賦形剤と、を含む、治療有効量の組成物を投与することが含まれる。好ましくは、ギャップマー化合物は、ＡＭＤ又はサイトカインストームの治療に有用であり、ギャップマー化合物２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択されるギャップマー化合物を含む治療有効量の組成物、より好ましくは、ギャップマー化合物２２３～２２７、３６～４２、５５～５６、１５１、１５３、１５５～１６２、及び２３０からなる群から選択される治療有効量のギャップマー化合物を投与することを含む。

ＵＭＬＩＬＯ標的
ＵＭＬＩＬＯ ＲＮＡ配列（配列番号２３１）は、５７５塩基の長さであり、以下の配列を有する：
５’ＡＴＡＣＡＴＧＴＧＧＡＧＡＴＴＡＡＧＡＣＣＣＡＴＡＡＴＡＡＣＡＡＴＧＡＣＡＡＣＡＣＴＴＴＣＡＴＡＡＣＡＧＴＴＣＡＴＣＴＧＴＧＴＴＡＡＣＡＴＡＣＡＡＡＴＴＣＴＣＧＣＡＧＣＡＡＣＡＣＴＣＣＡＧＧＧＣＧＣＴＴＴＡＴＧＴＧＴＧＧＡＴＣＴＴＴＴＴＴＡＧＴＣＴＧＣＡＴＡＴＴＡＡＣＣＣＴＡＣＡＡＧＴＴＧＧＡＡＡＴＧＧＣＴＣＣＴＣＴＣＡＡＡＣＡＣＴＧＧＡＧＡＴＡＧＡＧＣＡＧＣＣＣＡＡＡＴＧＴＡＴＣＴＧＣＴＡＣＴＧＴＧＧＴＧＣＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＧＣＡＡＡＡＣＴＣＴＣＴＧＡＧＧＡＧＣＴＧＡＧＡＡＴＡＴＧＴＣＴＡＣＴＧＣＴＡＣＣＡＡＡＡＴＴＧＴＡＡＣＣＣＣＣＡＴＣＡＴＣＴＡＧＴＡＡＡＧＡＧＴＴＧＧＴＡＣＡＣＧＧＴＧＡＡＣＡＴＴＴＧＣＴＧＴＧＧＧＡＡＴＧＴＡＴＴＣＴＧＣＴＴＣＡＴＴＣＣＡＧＡＧＧＣＣＴＧＣＣＡＡＴＴＣＴＴＡＡＴＣＴＣＡＣＴＡＴＡＧＧＣＴＧＡＡＧＡＧＣＴＧＣＴＣＡＣＡＴＡＧＡＡＴＡＣＴＴＧＴＡＧＴＧＡＣＴＴＣＣＡＴＴＴＴＣＡＣＣＡＧＴＴＴＡＧＡＴＣＡＧＴＧＧＡＣＡＧＡＧＡＧＡＴＧＣＴＧＡＡＴＴＡＣＴＧＣＴＣＡＡＧＡＡＧＴＡＴＡＧＡＴＣＣＡＣＡＴＧＣＣＴＴＣＡＡＣＴＴＣＡＧＡＡＴＣＴＴＡＡＡＴＴＡＧＡＧＧＣＧＡＡＴＧＴＴＧＡＧＴＣＴＡＣＴＡＡＡＣＴＧＴＡＴＡＧＴＣＴＧＴＡＡＡＧＧＣＡＧＧＡＡＣＴＧＴＡＴＴＴＡＴＣＴＣＡＧＴＣＡＴＡＴＴＴＡＡＴ ３’。

長さ
開示されるギャップマー化合物は、１２～２９個の連結ヌクレオチドを有する修飾オリゴヌクレオチドであり、２個のウィングセグメントの間に６～１５個の連結デオキシヌクレオチドのギャップセグメントを有し、各ウィングセグメントは、各々独立して、３～７個の連結修飾ヌクレオシドを有する。好ましくは、ウィングセグメントにおける修飾ヌクレオシドの修飾は、ＭＯＥ、２’－ＯＭｅ、２’Ｆ－ＡＮＡ、ｃＭｅ、及びｃＥｔから選択される。

好ましくは、ギャップマー化合物は、
（ｉ）連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、
（ｉｉ）連結修飾ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、
（ｉｉｉ）連結修飾ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、ギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントとの間に配置され、各ウィングセグメントの各修飾ヌクレオシドは、修飾糖を含み、
（ｉｖ）任意に、シチジン残基は、５－メチルシチジンである。

好ましくは、ギャップマー化合物は、
（ｉ）１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、
（ｉｉ）５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、
（ｉｉｉ）５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、ギャップセグメントは、５’ウィングセグメント及び３’ウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置され、各ウィングセグメントの各修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メトキシエチル糖及び／又はロックド核酸修飾ヌクレオシドを含み、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、
（ｉｖ）任意に、シチジン残基は、５－メチルシチジンである。

好ましくは、ギャップマー化合物は、
（ｉ）１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、
（ｉｉ）４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、
（ｉｉｉ）４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、ギャップセグメントは、５’ウィングセグメント及び３’ウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置され、各ウィングセグメントの各修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）糖又はロックド核酸修飾ヌクレオシド（ＬＮＡ）を含み、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、
（ｉｖ）任意に、シチジン残基は、５－メチルシチジンである。

好ましくは、ギャップマー化合物は、
（ｉ）８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、
（ｉｉ）６個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、
（ｉｉｉ）５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、ギャップセグメントは、５’ウィングセグメント及び３’ウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置され、各ウィングセグメントの各修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メトキシエチル糖又はロックド核酸修飾ヌクレオシドを含み、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、
（ｉｖ）任意に、シチジン残基は、５－メチルシチジンである。

好ましくは、ギャップマー化合物は、
（ｉ）８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、
（ｉｉ）５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、
（ｉｉｉ）５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、ギャップセグメントは、５’ウィングセグメント及び３’ウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置され、各ウィングセグメントの各修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メトキシエチル糖及び／又はロックド核酸修飾ヌクレオシドを含み、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、
（ｉｖ）任意に、シチジン残基は、５－メチルシチジンである。

好ましくは、ギャップマー化合物は、
（ｉ）１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、
（ｉｉ）５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、
（ｉｉｉ）５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、ギャップセグメントは、５’ウィングセグメント及び３’ウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置され、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メトキシエチル糖を含み、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、核酸塩基配列は、配列番号１～２９７に記載される核酸塩基配列の少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む。

好ましくは、ギャップマー化合物は、
（ｉ）８～１０個（８、又は９、又は１０個）の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、
（ｉｉ）３～５個（３、又は４、又は５個）の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、
（ｉｉｉ）３～５個（３、又は４、又は５個）の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、ギャップセグメントは、５’ウィングセグメント及び３’ウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置され、各ウィングセグメントの各修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メトキシエチル糖及び／又はロックド核酸修飾ヌクレオシドを含み、各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合であり、
（ｉｖ）任意に、シチジン残基は、５－メチルシチジンであり、ギャップマー化合物の核酸塩基配列は、配列番号１～２９７のうちのいずれか１つに記載される。

アンチセンス化合物モチーフ
ギャップマーでは、複数のヌクレオチド又は連結ヌクレオシドを有する内部領域が、内部領域のヌクレオチド又は連結ヌクレオシドとは化学的に異なる複数のヌクレオチド又は連結ヌクレオシドを有する外部領域の間に配置される。ギャップマーモチーフを有するアンチセンスオリゴヌクレオチドの場合、ギャップセグメントは、概して、エンドヌクレアーゼ切断のための基質として機能するが、ウィングセグメントは、修飾ヌクレオシドを含む。ギャップマーの領域（５’ウィング、ギャップ配列、及び３’ウィング）は、各異なる領域を構成する糖部分の種類によって区別される。ギャップマーの領域を区別するために使用される糖部分の種類には、β－Ｄ－リボヌクレオシド、β－Ｄ－デオキシリボヌクレオシド、２’－修飾ヌクレオシド（そのような２’－修飾ヌクレオシドには、特に２’－ＭＯＥ、及び２’－Ｏ－ＣＨ_３が含まれ得る）、及び二環式糖修飾ヌクレオシド（そのような二環式糖修飾ヌクレオシドには、４’－（ＣＨ_２）_ｎ－Ｏ－２’架橋を有するものが含まれ得、ｎ＝１又はｎ＝２である）が含まれる。好ましくは、各別個の領域は均一な糖部分を含む。ウィング－ギャップ－ウィングモチーフは、しばしば「Ｘ－Ｙ－Ｚ」と記載され、「Ｘ」は、５’ウィング領域の長さを表し、「Ｙ」は、ギャップ領域の長さを表し、「Ｚ」は、３’ウィング領域の長さを表す。概して、「Ｘ－Ｙ－Ｚ」と記載されるギャップマーは、ギャップセグメントが、５’ウィングセグメント及び３’ウィングセグメントの各々のすぐ隣に配置されるような構成を有する。したがって、５’ウィングセグメントとギャップセグメント、又はギャップセグメントと３’ウィングセグメントとの間には、介在するヌクレオチドは存在しない。記載されるギャップマー化合物３６～４２、５５、５６、１５１～１６２、２２３～２２７、２３０の各々は、ギャップマーモチーフを有する。多くの場合、Ｘ及びＺは、ヌクレオシドの一部として修飾糖の同じ化学であるか、又はそれらは異なる。好ましくは、Ｙは、８～１５個のヌクレオチドである。Ｘ又はＺは、３、４、５、６、７、８、９、又は１０個のヌクレオチドのうちのいずれかであり得る。したがって、ギャップマー化合物には、例えば、５－１０－５、４－８－４、４－１２－３、４－１２－４、３－１４－３、２－１３－５、２－１６－２、１－１８－１、３－１０－３、２－１０－２、１－１０－１、２－８－２、６－８－６、又は５－８－５が含まれるが、これらに限定されない。

好ましい実施形態では、ギャップマー化合物は、４又は５個の化学修飾ヌクレオシドのウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置される１０個の２’－デオキシリボヌクレオチドのギャップセグメントを有する。特定の実施形態では、ウィングにおける化学修飾は、２’糖修飾を含む。別の実施形態では、化学修飾は、２’－ＭＯＥ又はＬＮＡ糖修飾を含む。好ましくは、ギャップマー化合物は、４又は５個の化学修飾ヌクレオシドのウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置される８個の２’－デオキシリボヌクレオチドのギャップセグメントを有し、化学修飾は、２’－ＭＯＥ又はＬＮＡ糖修飾を含む。

別の実施形態では、ギャップマー化合物は、４～６個の化学修飾ヌクレオシドのウィングセグメントのすぐ隣に、かつそれらの間に配置される８個の２’－デオキシリボヌクレオチドのギャップセグメントを有する。化学修飾は、２’－ＭＯＥ又はＬＮＡ糖修飾を含む。

ハイブリダイゼーション
ハイブリダイゼーションは、ギャップマー化合物と標的ＵＭＬＩＬＯ核酸［配列番号２３１］との間で生じる。ハイブリダイゼーションの最も一般的な機構は、核酸分子の相補的核酸塩基間の水素結合（例えば、ワトソン・クリック、フーグスティーン、又は逆フーグスティーン水素結合）を伴う。ハイブリダイゼーションは、様々な条件下で生じ得る。ストリンジェント条件は配列依存性であり、ハイブリダイズする核酸分子の性質及び組成によって決定される。

修飾糖部分
ギャップマー化合物は、糖基が修飾されている１つ以上のヌクレオシドを含む。そのような糖修飾ヌクレオシドは、ヌクレアーゼ安定性の向上、結合親和性の増加、又はいくつかの他の有益な生物学的特性をアンチセンス化合物に付与し得る。ヌクレオシドは、化学修飾リボフラノース環部分を含む。化学修飾リボフラノース環の例には、置換基の付加（５’及び２’置換基を含む、二環式核酸（ＢＮＡ）を形成するための非ジェミナル環原子の架橋、リボシル環酸素原子のＳ、Ｎ（Ｒ）、又はＣ（Ｒ_１）（Ｒ_２）（Ｒ、Ｒ_１、及びＲ_２は、各々独立して、Ｈ、Ｃ_１－Ｃ_１２アルキル、又は保護基である）による置換、及びそれらの組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。化学修飾糖の例には、２’－Ｆ－５’－メチル置換ヌクレオシド（他の開示された５’，２’－ビス置換ヌクレオシドについてはＷＯ２００８／１０１１５７）、又はリボシル環酸素原子のＳによる置換と２’位での更なる置換（米国特許出願第２００５／０１３０９２３号）、あるいはＢＮＡの５’－置換（ＷＯ２００７／１３４１８１、ＬＮＡは、例えば、５’－メチル又は５’－ビニル基で置換される）が含まれる。

修飾ヌクレオチド塩基
一態様では、本発明は、式Ｉａ、式Ｉｂ、式ＩＩａ、又は式ＩＩｂの修飾ヌクレオチド塩基を有するギャップマー化合物を含む：
式中、
各Ｘは、独立して、Ｏ又はＳであり、０、１、又は２つのＸの例はＳであり、
各Ｗは、独立して、Ｈ、ＯＨ、ハロ、又は－Ｏ－Ｃ_１－６アルキルであり、アルキルは、任意に、Ｃ_１－４アルキル、Ｃ_１－４アルコキシ、ハロ、アミノ、ＣＮ、ＮＯ_２、又はＯＨのうちの最大３個の例で置換され、
各Ｑ_ａは、独立して、二官能性Ｃ_１－６アルキレンであり、任意に、Ｃ_１－４アルキル、Ｃ_１－４アルコキシ、ハロ、又はＯＨのうちの最大２個の例で置換され、
各Ｑ_ｂは、独立して、－Ｏ－、－Ｓ－、－Ｎ－Ｏ－、－Ｎ（Ｒ）－、－Ｃ（Ｏ）－、－Ｃ（Ｏ）Ｏ－、及び－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ）－から選択される結合又は二官能性部分であり、Ｒは、非置換Ｃ_１－４アルキルである。

一実施形態では、各Ｘは、Ｏである。別の実施形態では、Ｘの１つの例は、Ｓである。

一実施形態では、ギャップマー化合物は、式Ｉａ又は式Ｉｂの１つ以上のヌクレオチドを含み、式中、Ｗは、ハロである。更なる実施形態では、Ｗは、フルオロである。別の更なる実施形態では、ギャップマー化合物は、式Ｉａの１つ以上のヌクレオチドを含む。別の更なる実施形態では、ギャップマー化合物は、式Ｉｂの１つ以上のヌクレオチドを含む。

一実施形態では、ギャップマー化合物は、式Ｉａ又は式Ｉｂの１つ以上のヌクレオチドを含み、Ｗは、－Ｏ－Ｃ_１－６アルキルであり、アルキルは、任意に、Ｃ_１－４アルキル、Ｃ_１－４アルコキシ、ハロ、アミノ、又はＯＨのうちの最大３個の例で置換される。更なる実施形態では、Ｗは、－Ｏ－Ｃ_１－６アルキルであり、アルキルは、任意に、Ｃ_１－４アルコキシで置換される。更なる実施形態では、Ｗは、非置換－Ｏ－Ｃ_１－６アルキルである。別の更なる実施形態では、Ｗは、－Ｏ－Ｃ_１－６アルキルであり、アルキルは、Ｃ_１－４アルコキシで置換される。更なる実施形態では、Ｗは、メトキシ及び－Ｏ－ＣＨ_２ＣＨ_２－ＯＣＨ_３から選択される。一実施形態では、ギャップマー化合物は、式Ｉａの１つ以上のヌクレオチドを含む。別の実施形態では、ギャップマー化合物は、式Ｉｂの１つ以上のヌクレオチドを含む。

一実施形態では、ギャップマー化合物は、式ＩＩａの１つ以上のβ－Ｄヌクレオチド又は式ＩＩｂのα－Ｌヌクレオチドを含み、Ｑ_ａは、非置換二官能性Ｃ_１－６アルキレンであり、Ｑ_ｂは、結合、又は－Ｏ－、－Ｓ－、－Ｎ－Ｏ－、及び－Ｎ（Ｒ）－から選択される二官能性部分である。更なる実施形態では、Ｑ_ａは、－ＣＨ_２－、－ＣＨ_２－ＣＨ_２－、－ＣＨ（ＣＨ_３）－、－ＣＨ_２－ＣＨ_２（ＣＨ_３）－から選択され、Ｑ_ｂは、結合、又は－Ｏ－、－Ｓ－、－Ｎ（Ｒ）－Ｏ－、及び－Ｎ（Ｒ）－から選択される二官能性部分であり、Ｒは、Ｈ又はＣ_１－６アルキルである。

式ＩＩａ又は式ＩＩｂの一実施形態では、Ｑ_ａは、－ＣＨ_２－であり、Ｑ_ｂは、－Ｏ－である。式ＩＩａ又は式ＩＩｂの別の実施形態では、Ｑ_ａは、－ＣＨ_２－ＣＨ_２－であり、Ｑ_ｂは、－Ｏ－である。式ＩＩａ又は式ＩＩｂの別の実施形態では、Ｑ_ａは、－ＣＨ_２－であり、Ｑ_ｂは、－Ｎ（Ｒ）－Ｏ－であり、Ｒは、Ｈ又はＣ_１－６アルキルである。式ＩＩａ又は式ＩＩｂの別の実施形態では、Ｑ_ａは、－ＣＨ（ＣＨ_３）－であり、Ｑ_ｂは、－Ｏ－である。式ＩＩａ又は式ＩＩｂの別の実施形態では、Ｑ_ａは、－ＣＨ_２－であり、Ｑ_ｂは、－Ｓ－である。式ＩＩａ又は式ＩＩｂの別の実施形態では、Ｑ_ａは、－ＣＨ_２－であり、Ｑ_ｂは、－Ｎ（Ｒ）－であり、Ｒは、Ｈ又はＣ_１－６アルキルである。式ＩＩａ又は式ＩＩｂの別の実施形態では、Ｑ_ａは、－ＣＨ_２－ＣＨ（ＣＨ_３）－であり、Ｑ_ｂは、結合である。

いくつかの実施形態では、ギャップマー化合物は、以下のヌクレオチドから選択される１つ以上のヌクレオチドを含む：

アンチセンス化合物に組み込むためにヌクレオシドを修飾するために使用できる他の多くのビシクロ及びトリシクロ糖代替環系も当技術分野で既知である（例えば、総説：Ｌｅｕｍａｎｎ，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．，２００２，１０，８４１－８５４）。

本発明のギャップマー化合物の単一の例は、ギャップマー化合物番号２２３（配列番号２２３）であり、これは、各々４個の２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾を有する修飾ヌクレオシドの５’ウィング及び３’ウィングセグメントと、１０個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列と、を含み、連結ヌクレオシドは、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合で連結される。ギャップマー化合物２２３の修飾配列は、「ＭＭＭＭｄｄｄｄｄｄｄｄｄｄＭＭＭＭ」であり、「Ｍ」は、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾であり、「ｄ」は、未修飾デオキシリボースである。ギャップマー化合物２２３の塩基配列は、ＴＴＣＴＴＧＡＧＣＡＧＴＡＡＴＴＣＡであり、構造は以下に示され、「接続‘Ａ’及び接続‘Ｂ’は、示される３つの断片がどのように一緒に接続されるかを示す。

投与
本明細書に記載のギャップマーは、局所又は全身治療が所望されるかどうか、及び治療される領域に応じて、いくつかの方法で投与され得る。投与は、局所、肺、例えば、ネブライザーによるものを含む粉末若しくはエアロゾルの吸引又は吸入によるものであってもよく、気管内、眼内、鼻腔内、表皮及び経皮、経口又は非経口であってもよい。本明細書に記載の化合物及び組成物は、眼、骨髄又は脳等の特定の組織を標的とするように送達することができる。本明細書に記載の化合物及び組成物は、非経口的に投与される。「非経口投与」とは、注射又は注入による投与を意味する。非経口投与には、皮下投与、静脈内投与、眼内投与、筋肉内投与、動脈内投与、腹腔内投与、又は頭蓋内投与、例えば、脳内投与、くも膜下腔内投与、側脳室内投与、脳室投与、脳室内投与、大脳側脳室内投与、又は大脳脳室投与が含まれる。投与は、連続的、又は慢性的、又は短期的、又は断続的であり得る。

非経口投与もまた、注入によって行われる。注入は、ポンプ又は注射によって、慢性的又は連続的又は短期的又は断続的であり得る。又は非経口投与は、皮下である。

そのような組成物は、薬学的に許容される溶媒、例えば、水又は生理食塩水、希釈剤、担体、アジュバントを含む。薬学的組成物は、局所又は全身治療が所望されるかどうか、及び治療される領域に応じて、いくつかの方法で投与され得る。投与は、局所（眼並びに膣及び直腸送達を含む粘膜へを含む）、肺、ネブライザーによるものを含む粉末若しくはエアロゾルの吸引又は吸入によるものであってもよく、気管内、鼻腔内、表皮及び経皮）、経口又は非経口であってもよい。非経口投与には、静脈内、動脈内、皮下、腹腔内、若しくは筋肉内注射又は注入、あるいは頭蓋内（くも膜下腔内又は側脳室内投与）が含まれる。

ギャップマー化合物はまた、取り込み、分布、及び／又は吸収を補助するために、他の分子、分子構造、又は化合物の混合物、例えば、リポソーム、受容体標的分子、又は他の製剤と混合、共役、又は他の方法で会合してもよい。

ギャップマー化合物には、任意の薬学的に許容される担体、エステル、若しくはそのようなエステルの担体、又はヒトを含む動物に投与すると、その生物学的に活性な代謝産物又は残基を（直接的又は間接的に）提供することができる任意の他の化合物が含まれる。

「薬学的に許容される賦形剤、担体、又は希釈剤」という用語は、ギャップマー化合物の生理学的及び薬学的に許容される賦形剤、担体、又は希釈剤、すなわち、親化合物の所望の生物学的活性を保持し、それに望ましくない毒性効果を与えない担体を指す。本開示のギャップマー化合物について、薬学的に許容される担体の好ましい例及びその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。ナトリウム担体は、オリゴヌクレオチド薬剤の好適な形態であることが示されている。

製剤には、リポソーム製剤が含まれる。「リポソーム」という用語は、球状二重層又は複数の二重層に配置された両親媒性脂質からなる小胞を意味する。リポソームは、親油性材料から形成された膜、及び送達される組成物を含む水性内部を有する単層又は多層小胞である。カチオン性リポソームは、正に荷電したリポソームであり、負に荷電したＤＮＡ分子と相互作用して安定な複合体を形成すると考えられている。ｐＨ感受性又は負に荷電したリポソームは、ＤＮＡと複合体を形成するのではなく、ＤＮＡを封入すると考えられている。カチオン性リポソームと非カチオン性リポソームの両方が、ＤＮＡを細胞に送達するために使用されている。

リポソームはまた、「立体的に安定化された」リポソームを含み、この用語は、本明細書で使用される場合、リポソームに組み込まれると、そのような特殊化された脂質を欠くリポソームと比較して循環寿命の延長をもたらす１つ以上の特殊化された脂質を含むリポソームを指す。リポソーム及びその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されており、これは本明細書に組み込まれる。

局所投与のための好ましい製剤には、オリゴヌクレオチドが脂質、リポソーム、脂肪酸、脂肪酸エステル、ステロイド、キレート剤、及び界面活性剤などの局所送達剤と混合されているものが含まれる。好ましい脂質及びリポソームには、中性（例えば、ジオレオイルホスファチジルＤＯＰＥエタノールアミン、ジミリストイルホスファチジルコリンＤＭＰＣ、ジステアロリホスファチジルコリン）陰性（例えば、ジミリストイルホスファチジルグリセロールＤＭＰＧ）、及びカチオン性（例えば、ジオレオイルテトラメチルアミノプロピルＤＯＴＡＰ及びジオレオイルホスファチジルエタノールアミンＤＯＴＭＡ）が含まれる。

脂質ナノ粒子
ＬＮＰは、典型的には、イオン化可能なアミノ脂質、リン脂質、コレステロール、及びポリエチレングリコール（ＰＥＧ）脂質からなる多成分系であり、これらの成分の全ては、核酸薬物カーゴの効率的な送達及び粒子の安定性に寄与する（Ｓｃｈｒｏｅｄｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｌｉｐｉｄ－ｂａｓｅｄ ｎａｎｏｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ ｆｏｒ ｓｉＲＮＡ ｄｅｌｉｖｅｒｙ．Ｊ．Ｉｎｔｅｒｎ．Ｍｅｄ．２０１０；２６７：９－２１）。カチオン性脂質は、負に荷電したＲＮＡをナノ粒子に静電的に凝縮し、酸性ｐＨで正に荷電したイオン化可能な脂質の使用は、エンドソームエスケープを増強すると考えられている。ｓｉＲＮＡを送達するための製剤は、臨床的及び非臨床的の両方で、主にＤＬｉｎ－ＭＣ３－ＤＭＡ（ＭＣ３）などのカチオン性脂質に基づいている。（Ｋａｎａｓｔｙ ｅｔ ａｌ．“Ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｍａｔｅｒｉａｌｓ ｆｏｒ ｓｉＲＮＡ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ．”Ｎａｔ．Ｍａｔｅｒ．２０１３；１２：９６７－９７７、及びＸｕｅ ｅｔ ａｌ．“Ｌｉｐｉｄ－ｂａｓｅｄ ｎａｎｏｃａｒｒｉｅｒｓ ｆｏｒ ＲＮＡ ｄｅｌｉｖｅｒｙ．”Ｃｕｒｒ．Ｐｈａｒｍ．Ｄｅｓ．２０１５；２１：３１４０－３１４７）。

更なるＬＮＰには、（ａ）少なくとも１つのペルフルオロカーボン化合物、乳化成分からなる、（ｂ）リン脂質及び任意にヘルパー脂質、並びにエンドサイトーシス増強成分など、（ｃ）ナノエマルジョンの細胞取り込みを誘導する少なくとも１つの化合物を含む、パーフルオロカーボン成分を有するナノエマルションが含まれる。成分（ａ）のパーフルオロカーボン化合物は、好ましくは、構造Ｃ_ｍＦ_２ｍ＋１Ｘ、ＸＣ_ｍＦ_２ｍＸ、ＸＣ_ｎＦ_２ｎＯＣ_ｏＦ_２ｏＸ、Ｎ（Ｃ_ｏＦ_２ｏＸ）_３、及びＮ（Ｃ_ｏＦ_２ｏ＋１）_３を有する化合物から選択され、ｍは３～１０の整数であり、ｎ及びｏは、１～５の整数であり、Ｘは、更なる出現とは独立して、Ｃｌ、Ｂｒ、及びＩから選択される。

乳化剤の例には、式Ｉで表されるリン脂質化合物などのリン脂質が含まれる：
式中、
Ｒ^１及びＲ^２は、独立して、Ｈ及びＣ_{１６－２４}アシル残基から選択され、これらは飽和又は不飽和であり得、１～３個の残基Ｒ^３を有し得、１つ以上のＣ原子は、Ｏ又はＮＲ^４によって置換され得、
Ｘは、Ｈ、－（ＣＨ_２）_ｐ－Ｎ（Ｒ^４）_３ ^＋、－（ＣＨ_２）_ｐ－ＣＨ（Ｎ（Ｒ^４）_３ ^＋）－ＣＯＯ^－、－（ＣＨ_２）_ｐ－ＣＨ（ＯＨ）－ＣＨ_２ＯＨ、及び－ＣＨ_２（ＣＨＯＨ）_ｐ－ＣＨ_２ＯＨから選択され（ｐは１～５の整数であり、
Ｒ^３は、独立して、Ｈ、低級アルキル、Ｆ、Ｃｌ、ＣＮ、及びＯＨから選択され、
Ｒ^４は、独立して、Ｈ、ＣＨ_３、及びＣＨ_２ＣＨ_３から選択されるか、又はその薬理学的に許容される担体である。

皮下（ｓ．ｃ．）投与後、ＬＮＰ及びそれらのｍＲＮＡカーゴは、主に注射部位に保持され、その結果、高い局所濃度をもたらすことが予想される。ＬＮＰは炎症誘発性であることが知られているため、主にＬＮＰに存在するイオン化性脂質に起因するため（Ｓａｂｎｉｓ ｅｔ ａｌ．“Ａ ｎｏｖｅｌ ａｍｉｎｏ ｌｉｐｉｄ ｓｅｒｉｅｓ ｆｏｒ ｍＲＮＡ ｄｅｌｉｖｅｒｙ： ｉｍｐｒｏｖｅｄ ｅｎｄｏｓｏｍａｌ ｅｓｃａｐｅ ａｎｄ ｓｕｓｔａｉｎｅｄ ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｓａｆｅｔｙ ｉｎ ｎｏｎ－ｈｕｍａｎ ｐｒｉｍａｔｅｓ．”Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．２０１８；２６：１５０９－１５１９）、ＬＮＰに製剤化されたｍＲＮＡのｓ．ｃ投与が用量制限的炎症応答と関連することは予想外ではない。デキサメタゾンとＬＮＰの共投与は、ｉ．ｖ．投与後の免疫炎症応答を低減させる（Ａｂｒａｍｓ ｅｔ ａｌ．“Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ ｅｆｆｉｃａｃｙ，ｂｉｏｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ，ａｎｄ ｉｎｆｌａｍｍａｔｉｏｎ ｆｏｒ ａ ｐｏｔｅｎｔ ｓｉＲＮＡ ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅ：Ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｄｅｘａｍｅｔｈａｓｏｎｅ ｃｏ－ｔｒｅａｔｍｅｎｔ．”Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．２０１０；１８：１７１－１８０）。更に、Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ．（“Ｄｅｘａｍｅｔｈａｓｏｎｅ ｐｒｏｄｒｕｇｓ ａｓ ｐｏｔｅｎｔ ｓｕｐｐｒｅｓｓｏｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ｉｍｍｕｎｏｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｌｉｐｉｄ ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅ ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄｓ．”Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．Ｒｅｌｅａｓｅ．２０１８；２８６：４６－５４．）は、ＬＮＰ含有核酸内に親油性デキサメタゾンプロドラッグを組み込むことにより、全身投与後の免疫刺激が低減することを示した。

投薬
最適な投与スケジュールは、患者の体内での薬物蓄積の測定から計算される。最適な投薬量は、個々のギャップマー化合物の相対的な効力に応じて変化し、一般に、インビトロ及びインビボ動物モデルで有効であることが見出されたＥＣ_５０に基づいて推定することができる。一般に、投薬量は、体重ｋｇ当たり０．０１μｇ～１００ｇであり、毎日、毎週、毎月、若しくは毎年、又は所望の間隔で１回以上与えることができる。治療が成功した後、疾患状態の再発を防止するために、患者に維持療法を受けさせることが望ましい場合があり、ギャップマー化合物は、体重ｋｇ当たり０．０１μｇ～１００ｇの範囲の維持用量で１日１回以上投与される。

追加の実施形態は、以下の実施例において更に詳細に開示されるが、これらは特許請求の範囲を限定することを意図するものではない。

実施例１
本実施例は、ロングノンコーディングＲＮＡ ＵＭＬＩＬＯによって調節される遺伝子転写を阻害するための候補ギャップマーのインビトロアッセイのためのスクリーニング系を提供する。

細胞培養及びオリゴヌクレオチド処理：
ギャップマー化合物の効果を、ＲＴ－ＰＣＲによって標的核酸発現（例えば、メッセンジャーＲＮＡ）についてスクリーニングした。

ＴＨＰ－１細胞
ＴＨＰ－１ヒト単球細胞株（急性白血病患者に由来する）をＩｎｖｉｖｏＧｅｎから得た。ＴＨＰ１細胞を、２５ｍＭのＨＥＰＥＳ、１０％のＦＢＳ、１００μｇ／ｍｌのノルモシン、ペニシリン－ストレプトマイシン（１００Ｕ／ｍｌ）、ブラストサイジン（１０μｇ／ｍｌ）、及びゼオシン（１００μｇ／ｍｌ）を補充したＲＰＭＩ１６４０、１％（２ｍＭ）ＧｌｕｔａＭＡＸ Ｌ－グルタミンからなる完全培地中で維持した。

アンチセンス化合物による処理：
スクリーニングのために播種する前に、ＴＨＰ－１単球培養物を５０％分割して、細胞が指数関数的増殖相に再び入ることを可能にした。２５０，０００個の細胞を、各ウェルに１８０μＬの完全培地を含む９６ウェルプレートに四重でウェルごとに播種した。試験した各ギャップマー化合物を、最終濃度１０μＭでＴＨＰ－１細胞に添加し、穏やかに混合した。プレートを３７℃、５％ＣＯ_２で２４時間インキュベートした。次いで、ＬＰＳ（１０ｎｇ／ｍＬ）を各ウェルに添加し、プレートを３７℃、５％ＣＯ_２で更に２４時間インキュベートした。

ＵＭＬＩＬＯ発現のオリゴヌクレオチド阻害の分析：
特定の遺伝子上のＵＭＬＩＬＯ発現のアンチセンス調節をリアルタイムＰＣＲ（ＲＴ－ＰＣＲ）によってアッセイした。

ＲＮＡ分析を全細胞ＲＮＡ又はポリ（Ａ）＋ｍＲＮＡに対して実施した。ＲＮＡを製造元が推奨するプロトコルに従って、ＴＲＩＺＯＬ（登録商標）試薬（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）、及びＤｉｒｅｃｔ－ｚｏｌ ＲＮＡ Ｍｉｎｉｐｒｅｐキット（Ｚｙｍｏ Ｒｅｓｅａｒｃｈ）を使用して単離及び調製した。

ｍＲＮＡレベルのリアルタイム定量ＰＣＲ分析：
標的ＲＮＡレベルの定量は、ＣＦＸリアルタイムｑＰＣＲ検出システム（Ｂｉｏｒａｄ）を使用した定量的リアルタイムＰＣＲによって達成した。リアルタイムＰＣＲの前に、単離ＲＮＡを逆転写酵素（ＲＴ）反応に供し、これにより相補的ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）を生成し、これをリアルタイムＰＣＲ増幅のための基質として使用した。ＲＴ反応試薬及びリアルタイムＰＣＲ試薬を、ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃから入手し、それらの使用プロトコルは製造元から提供された。リアルタイムＰＣＲによって得られた遺伝子（又はＲＮＡ）標的量は、ＨＰＲＴ又はＲＰＬ３７Ａなどの発現が一定である遺伝子の発現レベルを使用して正規化した。総ＲＮＡを製造元のプロトコルに従って、Ｑｕｂｉｔ蛍光光度計（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ／ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｃｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）、及びＱｕｂｉｔ ＲＮＡ ＨＳアッセイキット（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃカタログ番号Ｑ３２８５２）を使用して定量した。Ｑｕｂｉｔ蛍光光度計をタンダードで較正した。

本開示の一連のギャップマー化合物は、ヒトＵＭＬＩＬＯ ｌｎｃ ＲＮＡ（Ｅｎｓｅｍｂｌ Ｇｅｎｅ ＩＤ：ＥＮＳＧ０００００２２８２７７）（配列番号２３１）の異なる領域を標的とするように設計した。化合物を表１に示す。表１のギャップマー化合物は、ａ）５個のヌクレオチドの「ウィング」が両側（５’から３’方向）に隣接し、１０個の２’－デオキシヌクレオチドを含む中央「ギャップ」領域で構成される、２０個（５－１０－５）のヌクレオチドの長さの構成を有するキメラオリゴヌクレオチド（「ギャップマー化合物」）である。いくつかの例示的なギャップマー化合物において、ウィングは、２’－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）糖修飾ヌクレオシドから構成され、ヌクレオチド間（骨格）結合は、オリゴヌクレオチド配列全体にわたってホスホロチオエートであった。シチジン残基は、別途示されない限り、５－メチルシチジンであり、この場合、それらはシチジン残基であり、又はｂ）３個のヌクレオチドの「ウィング」が両側（５’から３’方向）に隣接し、１０個の２’－デオキシヌクレオチドを含む中央「ギャップ」領域で構成される、１６個（３－１０－３）のヌクレオチドの長さであった。ウィングセグメントの他の構成及び修飾ヌクレオシドを表１に示す。いくつかの事例では、ウィングは、ｃＭｅロックド核酸修飾を利用したロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌセロシドから構成された。ヌクレオチド間（骨格）結合は、オリゴヌクレオチド配列全体にわたってホスホロチオエートであった。シチジン残基は、別途示されない限り、５－メチルシチジンであり、この場合、それらはシチジン残基であった。

表１は合成及び試験した２９７個のギャップマー化合物の群を記載する。

オリゴヌクレオチド及びオリゴヌクレオシド合成
アンチセンス化合物を、ホスホロチオエート及びアルキル化誘導体による固相合成によって作製した。かかる合成のための装置は、例えば、ＫａｒｅＢａｙ Ｂｉｏ（Ｎｅｗ Ｊｅｒｓｅｙ，ＵＳＡ）を含む、いくつかのベンダーによって販売される。オリゴヌクレオチド：非置換及び置換ホスホジエステル（Ｐ＝Ｏ）オリゴヌクレオチドを、ヨウ素による酸化を伴う標準的なホスホラミダイト化学を使用して、自動ＤＮＡ合成装置（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓモデル３９４）で合成した。

ＵＭＬＩＬＯを標的とする二本鎖アンチセンス化合物の設計及びスクリーニング
オリゴヌクレオチド合成－９６ウェルプレート形式
オリゴヌクレオチドを、９６ウェル形式で同時に９６個の配列を組み立てることができる自動合成装置で、固相Ｐ（ＩＩＩ）ホスホラミダイト化学を介して合成した。ホスホジエステルヌクレオチド間結合は、水性ヨウ素による酸化によって得た。ホスホロチオエートヌクレオチド間結合は、無水アセトニトリル中で３，Ｈ－１，２ベンゾジチオール－３－オン１，１ジオキシド（Ｂｅａｕｃａｇｅ試薬）を利用した硫化によって生成した。標準的な塩基保護ベータ－シアノエチル－ジイソ－プロピルホスホラミダイトは、商業的ベンダー（例えば、ＰＥ－Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，ＣＡ又はＰｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）から購入した。非標準的なヌクレオシドは、標準又は特許取得済みの方法に従って合成した。これらは、塩基保護ベータ－シアノエチルジイソプロピルホスホルアミダイトとして利用した。

オリゴヌクレオチドを支持体から切断し、濃ＮＨ４ＯＨを用いて高温（５５～６０℃）で１２～１６時間脱保護し、放出された生成物を真空中で乾燥させた。次に、乾燥させた生成物を滅菌水に再懸濁してマスタープレートを得て、次いで、そこから全ての分析プレート試料及び試験プレート試料をロボットピペッターを利用して希釈した。

ＵＭＬＩＬＯはＩＬ－８転写を調節するｌｎｃＲＮＡであるため、これらの化合物のＩＬ－８転写に対する効果を定量的リアルタイムＰＣＲによって分析した。化合物を、定量的リアルタイムＰＣＲによってＴＮＦＲＳＦ１０ｂ転写をアッセイすることによって、細胞毒性に対するそれらの効果について分析した。また、化合物を、定量的リアルタイムＰＣＲによって分泌型胚性アルカリホスファターゼ（ＳＥＡＰ）レポーター遺伝子の転写をアッセイすることによって、Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）シグナル伝達活性化に対するそれらの効果について分析した。データは、ＴＨＰ１細胞を表１のアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理した３つの実験の平均である。存在する場合、「Ｎ．Ｄ．」は「データなし」を示す。データは、ＲＰＬ３７Ａハウスキーピング遺伝子に対する倍率変化として表される。

ギャップマー化合物配列番号１２、２１、３５、３７、８８、１００、１０２、１２３、１２４、及び１２７は、このアッセイにおいてヒトＩＬ－８発現の少なくとも７０％阻害を示した。表２に更に示すように、ギャップマー化合物配列番号１２、３５、３７、８８、１００、１０２、１２３、１２４、及び１２７は、ＴＮＦＲＳＦ１０ｂ（細胞毒性の尺度）の０又は最大５０％阻害を示し、これは細胞毒性が低い。配列番号１２、２１、３５、３７、８８、１００、１０２、及び１２７は、ＳＥＡＰ（免疫活性化の尺度）０又は最大５０％阻害を示し、免疫刺激活性が低いことを示した。

表３は、ＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３１）を標的とするキメラホスホロチオエートギャップマー配列番号１５２～２２２によるＩＬ－８発現の阻害を示す。データは、ＲＰＬ３７Ａハウスキーピング遺伝子に対する倍率変化として表される。

表１～４のスクリーニングデータに基づいて、ギャップマー配列番号１２、２１、３５、３７、１００、及び１２８について、標的ＵＭＬＩＬＯ配列（配列番号２３１）上の６つの領域が見出された。表４Ａ及び４Ｂは、ＵＭＬＩＬＯの領域Ａ～Ｆを標的とするギャップマーの（１）ＩＬ－８、（２）ＳＥＡＰ、及び（３）ＴＮＦＲＳＦ１０ｂの平均阻害を提供する。

ＵＭＬＩＬＯの領域Ａ～Ｆ、２５６～２８５、５１１～５４０、５２３～５４７、４４１～４６９、８８～１０７、５４７～５６７の位置をそれぞれ標的とした全てのギャップマーは、各々、ＩＬ－８発現の７０％を超える阻害を示した。更に、表４Ａ及び４Ｂで試験したギャップマーについてのＳＥＡＰ活性が２０％を越えて低減した。領域Ｄ（ＵＭＬＩＬＯ配列番号２３１の位置４４１～４６９）は、全体として最も低い細胞毒性を示した。領域Ｄを標的とするギャップマーは、配列番号３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、５５、５６、１５２、１５３、１５５、１５６、１５７、１５８、１５９、１６０、１６１、１６２、２２３、及び２２４からなる群から選択される。

異なる種のＵＭＬＩＬＯ交差反応アンチセンス化合物の設計及び試験：
ヒト及びブタＵＭＬＩＬＯ標的配列を相同性領域について比較したが、いずれも２０個のヌクレオチドほどの長さであることが見出されなかった。しかしながら、ヒト及びブタＵＭＬＩＬＯ標的配列間の配列相同性に基づいて、ヒト及びブタＵＭＬＩＬＯのいずれかと相補的であり、ヒト及びブタＵＭＬＩＬＯに対して１個以下のミスマッチを有する一連のギャップマーアンチセンス配列を設計した。

したがって、このようなギャップマーは、ヒト細胞を用いたインビトロモデルとブタのインビボモデルの両方で機能するように設計した。しかしながら、相対的なアンチセンス有効性は、一方のＵＭＬＩＬＯ又は他方に対する不完全な相同性のために、２つの形態について等しくない場合がある。

表５は、スクリーニングされたギャップマーの第３の群としての５つのより活性なギャップマーの配列を示す。配列番号２２３、２２５、２２７は、ヒトＵＭＬＩＬＯと１００％相補的である。配列番号２２４及び２２６は、ヒトＵＭＬＩＬＯに対して単一のミスマッチを有し、ブタＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３２）と１００％相補的である（５’ＧＴＴＡＣＡＴＧＴＡＧＡＧＡＴＧＧＡＡＡＣＴＴＧＣＡＡＴＡＡＣＡＡＴＧＧＡＴＣＡＡＡＣＣＣＴＣＡＣＡＡＴＧＣＴＡＧＣＴＧＴＣＡＣＣＡＴＡＴＴＡＧＧＣＴＡＧＡＴＧＡＴＡＧＡＡＡＣＡＴＧＴＧＡＡＴＡＡＣＴＧＣＴＣＡＡＧＡＡＡＡＴＡＴＡＧＡＡＣＣＡＣＡＴＣＣＴＴＴＧＡＡＡＴＴＣＡＧＡＡＧＣＴＴＣＡＡＣＴＧＧＧＡＧＧＧＣＴＣＴＴＧＡＧＣＣＴＧＣＴＧＧＡＣＴＧＴＡＴＡＣＴＣＴＧＴＡＡＡＡＡＣＡＧＡＡＣＴＧＴＣＴＴＣＧＴＣＴＣＡＣＴＣＡＣＴＡＴＴＴＴＡ ３’）。

実施例２．ＵＭＬＩＬＯ転写のインビトロ阻害
本実施例は、定量的リアルタイムＰＣＲによる、ギャップマー化合物で処理したＴＨＰ１におけるＵＭＬＩＬＯ ｍＲＮＡ発現によって決定された、候補ギャップマー化合物によるＴＨＰ１におけるＵＭＬＩＬＯ阻害の効果を示す。ギャップマーを、対照ギャップマー（ＡＡＣＡＣＧＴＣＴＡＴＡＣＧＣ 配列番号２２８）と比較したＵＭＬＩＬＯ発現の阻害パーセントとして試験した。各ギャップマー濃度は１０μＭであり、細胞と４８時間インキュベートした。データは、対照ギャップマー処理細胞に対するＵＭＬＩＬＯの阻害％として表６に表す。

ギャップマー配列番号１２、２１、３５、３７、１００、及び１２８は、ＴＨＰ１におけるヒトＵＭＬＩＬＯ発現の少なくとも６０％阻害を示し、ギャップマー配列番号１５０よりも優れている。

実施例３．ヒト初代単球におけるインビトロＵＭＬＩＬＯ発現阻害。
本実施例は、定量的リアルタイムＰＣＲによる、ギャップマー化合物処理ヒト初代単球におけるＵＭＬＩＬＯ ｍＲＮＡ発現によって決定された、候補ギャップマー化合物を用いた初代ヒト単球におけるＵＭＬＩＬＯ発現を示す。２つのギャップマー化合物を試験して、ヒト初代単球中に存在するＵＭＬＩＬＯの阻害パーセントを測定した。得られた結果は、任意のＵＭＬＩＬＯ配列（ＡＡＣＡＣＧＴＣＴＡＴＡＣＧＣ 配列番号２２８）に相補的ではないギャップマー化合物対照である、陰性対照と比較したＵＭＬＩＬＯ発現の阻害パーセントとして表される。各ギャップマー化合物濃度は１０μＭであった。配列番号２２３は、ヒトＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３１）の塩基４４４～４６１と１００％相補的である。

ギャップマー配列番号２２３は、３つの別々のドナーからの単球におけるヒトＵＭＬＩＬＯ発現の少なくとも６６％阻害を示した（表７）。

実施例４．ギャップマー化合物によるＵＭＬＩＬＯ阻害を介したＰＢＭＣにおけるＩＬ－８発現の阻害。
本実施例は、未刺激ＰＢＭＣにおけるサイトカインタンパク質レベル産生及び発現に対するＵＭＬＩＬＯ阻害の効果を決定するための実験の結果を提供する。Ｆｉｃｏｌｌ－Ｐａｇｕｅ（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を使用した密度勾配遠心分離により、末梢血単核球（ＰＢＭＣ）を個体から単離し、血液の他の成分（赤血球及び顆粒球など）から分離した。ＰＢＭＣは、ＲＰＭＩ １６４０培地中で維持した。ギャップマー化合物をジムノシスによって細胞内に送達した（例えば、Ｈ．ｅｔ ａｌ．，（２０１２）”Ｓｉｌｅｎｃｉｎｇ ｏｆ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｂｙ ｇｙｍｎｏｔｉｃ ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｏｆ ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ”Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．，Ｖｏｌ．８１５：３３３－４６に記載の方法を参照されたく、その開示内容全体が参照により本明細書に組み込まれる）。ジムノシスは、配列特異的な遺伝子サイレンシングを生じる任意の担体又は抱合の非存在下で、アンチセンスオリゴデオキシヌクレオチド（本開示のギャップマー化合物など）を細胞に送達するプロセスである。ギャップマー化合物で処理したＰＢＭＣからのＩＬ－８タンパク質発現をＥＬＩＳＡによって測定した。データは、ＩＬ－８タンパク質のｐｇ／ｍＬとして表す。配列番号２２４は、ヒトＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３１）の塩基４４９でヒトＵＭＬＩＬＯに対する単一のミスマッチを有し、ブタＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３２）と１００％相補的である。

ギャップマー化合物配列番号２２４及び２２３（ギャップマー化合物２２４及び２２３）は、未刺激ＰＢＭＣにおいて用量依存的にＩＬ８タンパク質分泌を阻害した（表８）。

実施例５．ＬＰＳ刺激ＰＢＭＣにおけるサイトカインタンパク質レベルに対するＵＭＬＩＬＯ阻害
本実施例は、ＬＰＳ刺激ＰＢＭＣにおけるサイトカインタンパク質レベルに対するＵＭＬＩＬＯ阻害の効果を示す。実施例３のようにＰＢＭＣを個体から単離し、次いでＬＰＳ（１０ｎｇ／ｍＬ、Ｓｉｇｍａ）で２４時間刺激して、ＩＬ－８などのサイトカインの発現を誘導した。ギャップマー化合物（配列番号２２３及び２２４）は、実施例３と同様にジムノシスによって細胞内に送達した。ＩＬ－８タンパク質の発現をＥＬＩＳＡによって決定した。データは、ＩＬ－８タンパク質発現のｐｇ／ｍＬとして表す。得られた結果は、任意のＩＬ－８配列（ＡＡＣＡＣＧＴＣＴＡＴＡＣＧＣ 配列番号２２８）に相補的ではないギャップマー化合物対照である、陰性対照と比較したＵＭＬＩＬＯ発現の阻害パーセントとして表される。

ギャップマー配列番号２２４及び２２３は、ＬＰＳ刺激ＰＢＭＣにおいて用量依存的にＩＬ８タンパク質分泌を阻害した。配列番号２２３は、配列番号２２４と比較して、ＩＬ－８阻害についてより高い効力を示した。

表１０は、ギャップマー化合物で処理した細胞における腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）阻害を示す。ＴＮＦタンパク質の発現をＥＬＩＳＡによって決定した。データは、ＴＮＦタンパク質のｐｇ／ｍＬとして表す。

ギャップマー配列番号２２４及び２２３（ギャップマー化合物２２４及び２２３）は、ＬＰＳ刺激ＰＢＭＣにおいて用量依存的にＴＮＦタンパク質分泌を阻害した。配列番号２２３は、配列番号２２４と比較して高い効力を示した。

実施例６．ＬＰＳ処理ＰＢＭＣにおけるＵＭＬＩＬＯ ＲＮＡの発現に対するギャップマー化合物の効果。
本実施例は、ＬＰＳ刺激ヒトＰＢＭＣにおけるサイトカインｍＲＮＡレベルに対するＵＭＬＩＬＯ阻害の効果を示す。ＵＭＬＩＬＯ ｍＲＮＡ発現を、ギャップマー化合物処置ヒトＰＢＭＣにおいて決定した。ギャップマーを定量的リアルタイムＰＣＲによってＵＭＬＩＬＯ転写に対するそれらの効果について分析した。表１１は、ハウスキーピング遺伝子ＲＰＬ３７Ａの発現に対するＵＭＬＩＬＯの測定された発現を示す。発現値＜１．０は、その遺伝子の転写が阻害されたことを意味する。

ギャップマー化合物２２４及び２２３は、ＬＰＳ刺激ＰＢＭＣにおいてＵＭＬＩＬＯ ＲＮＡ発現を用量依存的に阻害した。ギャップマー化合物２２３（配列番号２２３）は、配列番号２２４と比較して高い効力を示した。

ＩＬ－８ ｍＲＮＡ発現を、ギャップマー処置ヒトＰＢＭＣにおいて決定した。ギャップマーを定量的リアルタイムＰＣＲによってＩＬ－８転写に対するそれらの効果について分析した。ＩＬ－８の測定された発現を、ハウスキーピング遺伝子ＲＰＬ３７Ａの発現と比較して提供する。発現値＜１．０は、その遺伝子の転写が阻害されたことを意味する。

ギャップマー化合物２２４及び２２３（配列番号２２４及び２２３）は、ＬＰＳ刺激ＰＢＭＣにおけるＩＬ－８ ＲＮＡ発現を阻害した。配列番号２２３は、配列番号２２４と比較して高い効力を示した。

実施例７．ＬＰＳ刺激ブタマクロファージにおけるサイトカインｍＲＮＡレベルに対するＵＭＬＩＬＯ阻害
本実施例は、ＬＰＳ刺激ブタマクロファージにおけるサイトカインｍＲＮＡレベルに対するＵＭＬＩＬＯ阻害の効果を示す。これは、定量的リアルタイムＰＣＲによる、ギャップマー化合物処理ブタ初代マクロファージにおけるＵＭＬＩＬＯ ｍＲＮＡ発現によって決定した。２つのギャップマー化合物２２３及び２２４（配列番号２２３及び２２４）、並びに対照（ＡＡＣＡＣＧＴＣＴＡＴＡＣＧＣ 配列番号２２８）を試験した。表１３は、対照オリゴヌクレオチド配列番号２２８と比較した阻害パーセントを示す。配列番号２２４は、ヒトＵＭＬＩＬＯ（配列番号３３１）の塩基４４９でヒトＵＭＬＩＬＯに対する単一のミスマッチを有し、ブタＵＭＬＩＬＯ（配列番号３３２）と１００％相補的である。

ギャップマー配列番号２２４は、配列番号２２３と比較してブタＵＭＬＩＬＯのより大きな阻害を示した。ギャップマー化合物配列番号２２４は、ブタＵＭＬＩＬＯ（配列番号２３２）上の領域に対して１００％相補的な配列同一性を有する。配列番号２２３のギャップマー化合物は、ブタＵＭＬＩＬＯ配列の配列番号２３２に対して単一のミスマッチを有する。

実施例８．関節リウマチ（ＲＡ）滑膜移植片を用いた細胞培養におけるＵＭＬＩＬＯ発現及びサイトカイン産生の阻害。
本実施例は、関節リウマチ（ＲＡ）患者からの滑膜外植片組織におけるＵＭＬＩＬＯ発現のギャップマー化合物阻害を測定した。関節置換手術中、ヒトＲＡ滑膜組織をゲンタマイシンを含むＲＰＭＩ培地に採取した。滑膜組織は、３ｍｍの皮膚生検パンチを使用して滑膜生検で直ちに処理した。ドナーごとに、実験群当たり３つの生検を使用し、治療群に無作為に分けた。表１４は、無関係の対照ギャップマー（ＡＡＣＡＣＧＴＣＴＡＴＡＣＧＣ 配列番号２２８）と比較した阻害パーセントを示す。ギャップマー濃度は１μＭ及び５μＭであった。生検を９６ウェルプレート内の２００μｌ中で２４時間培養した。培養の最後に、ＲＡ滑膜移植片を収集し、Ｌｕｍｉｎｅｘビーズアレイ技術を使用してサイトカインレベルを決定した。表１４は、２４時間培養後の上清中のＩＬ－８、ＩＬ－６、ＩＬ－１Ｂ、及びＴＮＦの阻害率を示す。数字は、３ドナーからの３つの別々の実験の結果である。

Ｆ＝２’Ｆ－ＡＮＡ修飾ヌクレオシド、ｄ＝ＤＮＡ塩基

ギャップマー化合物２３０（配列番号２３０）は、生検から分泌されるＩＬ－８、ＩＬ－６、ＩＬ－１Ｂ、及びＴＮＦサイトカインレベルを用量依存的に低減させた。

実施例９．ブタ血管新生モデルにおけるギャップマー化合物活性のインビボ分析。
本実施例は、眼性血管新生を研究するための、脈絡膜血管新生（ＣＮＶ）のブタモデルにおける眼の誘発血管新生状態について、ブタの眼に直接ギャップマー化合物を投与するインビボ研究を提供する。雄の家畜ブタ（８～１０ｋｇ）を、両眼にレーザー治療によりＣＮＶ病変に供した。ＣＮＶの程度を、２週間後にフルオレセイン血管造影によって決定した。ブタ細胞において示されたそのより高い効力のために、５０μｌの生理食塩水中のギャップマー化合物２２４（配列番号２２４）の単回硝子体内注射（７．８μＭ又は１５μＭ）を、ＣＮＶ誘導の日に実施した。５匹のブタを３つの処理群（生理食塩水、７．８μＭ、又は１５μＭ）の各々に含め、硝子体内注射を両眼に実施した（群当たりｎ＝１０の眼）。血管新生応答を測定するために、硝子体内注射後１４日目にフルオレセイン血管造影を実施した。測定値は、補正された全細胞蛍光（ＣＴＬＦ）として表す。低減されたＣＴＬＦレベルは、新生血管応答の改善を示す。

表１５．脈絡膜血管新生（ＣＮＶ）病変を有するギャップマー化合物で処理された動物における眼性血管新生の阻害の結果。

ギャップマー化合物２２４（配列番号２２４）は、用量依存的にＣＴＬＦを低減させた。

角膜血管新生は、視力の深刻な低下につながり得る重篤な状態である。異常な血管は光を遮断し、角膜瘢痕化を引き起こし、視力を損ない、炎症及び浮腫を引き起こし得る。角膜血管新生は、血管新生因子と抗血管新生因子との間のバランスが血管新生分子に傾いたときに生じる。血管新生の最も重要な媒介物質の１つである血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）は、新生血管形成中に上方制御される。抗ＶＥＧＦ剤は、新生血管加齢性黄斑変性症、糖尿病性網膜症、黄斑浮腫、新生血管緑内障、及び他の血管新生疾患に対する有効性を有する。これらと同様の薬剤は、角膜血管新生の治療のための大きな可能性を有する。ギャップマー化合物２２４は、脈絡膜血管新生（ＣＮＶ）病変に応答して血管形成を低減させることが示された。

Claims (29)

1. ギャップマー化合物であって、１２～２９個の連結ヌクレオシドの長さを有する修飾オリゴヌクレオチドを含み、前記ギャップマー化合物が、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を有し、
   前記５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドが、各々、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される糖修飾を含み、
   前記連結ヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結され、
   前記修飾オリゴヌクレオチドが、炎症性ケモカイン遺伝子座ロングノンコーディングＲＮＡの上流マスターＬｎｃ ＲＮＡ（ＵＭＬＩＬＯ）（配列番号２３１）の領域Ａヌクレオチド２５６～２８２、領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０、領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７、領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９、領域Ｅヌクレオチド８８～１０７、又は領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有する、ギャップマー化合物。
2. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する、請求項１に記載のギャップマー化合物。
3. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である、請求項２に記載のギャップマー化合物。
4. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ａヌクレオチド２５６～２８２に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する、請求項１に記載のギャップマー化合物。
5. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ａヌクレオチド２５６～２８２に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である、請求項４に記載のギャップマー化合物。
6. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する、請求項１に記載のギャップマー化合物。
7. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である、請求項６に記載のギャップマー化合物。
8. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する、請求項１に記載のギャップマー化合物。
9. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である、請求項８に記載のギャップマー化合物。
10. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｅヌクレオチド８８～１０７に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する、請求項１に記載のギャップマー化合物。
11. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｅヌクレオチド８８～１０７に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である、請求項１０に記載のギャップマー化合物。
12. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって０～１個のミスマッチを有する、請求項１に記載のギャップマー化合物。
13. 前記ギャップマー化合物が、配列番号２３１の領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも１００％相補的である、請求項１２に記載のギャップマー化合物。
14. ギャップマー化合物番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択される、請求項１に記載のギャップマー化合物。
15. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２３の核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項１に記載のギャップマー化合物。
16. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２４の前記核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項１に記載のギャップマー化合物。
17. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２５の前記核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項１に記載のギャップマー化合物。
18. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２６の前記核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個のロックドヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個のロックドヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項１に記載のギャップマー化合物。
19. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２７の前記核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記ギャップセグメントが、９個のデオキシヌクレオシド、及び前記ギャップセグメントの５’位から始まる１０個のヌクレオシドのうちの３位での１個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、前記５’ウィングセグメントが、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項１に記載のギャップマー化合物。
20. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号１５０の前記核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記ギャップセグメントが、１０個のデオキシヌクレオシドからなり、前記５’ウィングセグメントが、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、３個のロックド核酸（ＬＮＡ）修飾ヌクレオシド修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項１に記載のギャップマー化合物。
21. ギャップマー化合物であって、１２～２９個の連結ヌクレオシドの長さを有する修飾オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択される核酸塩基配列を含み、前記ギャップマー化合物が、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、約６～約１０個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を有し、
    前記５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドが、各々、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、又はそれらの組み合わせから選択される糖修飾を含み、
    前記連結ヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結され、
    前記修飾オリゴヌクレオチドが、炎症性ケモカイン遺伝子座ロングノンコーディングＲＮＡの上流マスターＬｎｃＲＮＡ（ＵＭＬＩＬＯ）に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有し、前記ＵＭＬＩＬＯロングノンコーディングＲＮＡが、配列番号２３１である、ギャップマー化合物。
22. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２３の核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項２１に記載のギャップマー化合物。
23. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２４の前記核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項２１に記載のギャップマー化合物。
24. ＡＭＤ又はサイトカインストームを治療するための方法であって、それを必要とする対象に、治療有効量のギャップマー化合物及び薬学的に許容される賦形剤を含む組成物を投与することを含み、
    前記ギャップマー化合物が、１２～２９個の連結ヌクレオシドの長さを有する修飾オリゴヌクレオチドを含み、前記ギャップマー化合物が、約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する５’ウィング配列、約６～約１５個の２’－デオキシヌクレオシドを有する中央ギャップ領域配列、及び約３～約７個の修飾ヌクレオシドを有する３’ウィング配列を有し、
    前記５’ウィング及び３’ウィングの修飾ヌクレオシドが、各々、２’－メトキシエチル（ＭＯＥ）修飾、ロックド核酸（ＬＮＡ）修飾、２’Ｆ－ＡＮＡ修飾、２’－Ｏ－メトキシエチル（２’ＯＭｅ）修飾、又はそれらの組み合わせから選択される糖修飾を含み、
    前記ギャップマー化合物の連結ヌクレオシドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合、ホスホロチオレートヌクレオシド間結合、又はそれらの組み合わせで連結され、
    前記修飾オリゴヌクレオチドが、炎症性ケモカイン遺伝子座ロングノンコーディングＲＮＡの上流マスターＬｎｃＲＮＡ（ＵＭＬＩＬＯ）（配列番号２３１）の領域Ａヌクレオチド２５６～２８２、領域Ｂヌクレオチド５１１～５４０、領域Ｃヌクレオチド５２３～５４７、領域Ｄヌクレオチド４４１～４６９、領域Ｅヌクレオチド８８～１０７、又は領域Ｆヌクレオチド５４７～５６７に対してその全長にわたって少なくとも９１％相補的である核酸塩基配列を有する、方法。
25. 前記ギャップマー化合物が、ギャップマー化合物番号２２３、１２、２１、３５～４２、５５～５６、８８、１００～１０２、１２３～１２４、１２７～１２８、１５１～１５３、１５５～１６２、２２４～２２７、及び２３０からなる群から選択される、請求項２４に記載の方法。
26. 前記ギャップマー化合物が、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２３の核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項２４に記載の方法。
27. 前記ギャップマー化合物が、１８個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２２４の前記核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、４個の２’－Ｏ－メトキシエチル（２’－ＭＯＥ）修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項２４に記載の方法。
28. 前記ギャップマー化合物が、１６個の連結ヌクレオシドの長さであり、配列番号２３０の前記核酸塩基配列からなる前記核酸塩基配列を有し、前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、及び３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し、前記ギャップセグメントが、５’から３’方向へ前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントとの間に配置され、前記５’ウィングセグメントが、３個の２’Ｆ－ＡＮＡ修飾ヌクレオシドからなり、前記３’ウィングセグメントが、３個の２’Ｆ－ＡＮＡ修飾ヌクレオシドからなり、各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であり、各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項２４に記載の方法。
29. 前記ロックド核酸の修飾が、拘束エチル（ｃＥｔ）修飾及び拘束メチル（ｃＭｅ）修飾から選択される、請求項１～２３のいずれか一項に記載のギャップマー化合物。