JP2023549426A - 免疫応答及び/又は安定性を改善するために共有結合で修飾された抗原 - Google Patents
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Abstract
Description
見出し及び他の識別子、例えば、(a)、(b)、(i)、(ii)などは、単に明細書や特許請求の範囲を読みやすくするために提示されている。明細書又は特許請求の範囲における見出し又は他の識別子の使用は、工程又は要素がアルファベット順若しくは数字順に、又はそれらが提示される順で実行されることを必ずしも必要とはしない。
本出願は2021年11月1日に作成されたコンピュータ可読形式の配列表を含む。コンピュータ可読形式は参照により本明細書に組み込まれる。
様々な態様において、本明細書は以下の項目のうちの1つ以上を記載する。
1.ポリペプチド抗原の免疫原性を改善する方法であって、修飾するポリペプチド抗原を供給する工程と、ポリペプチド抗原を1つ以上のステロイド酸部分と共有結合でコンジュゲート化して修飾ポリペプチド抗原を生成する工程を含み、修飾ポリペプチド抗原が、当該修飾のないポリペプチド抗原と比較して、細胞内送達時の修飾ポリペプチド抗原のエンドソーム脱出を増加させるために十分な数のステロイド酸部分とコンジュゲート化されており、修飾ポリペプチド抗原が、対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、対象への投与時に、当該ポリペプチド抗原に対する改善された適応免疫応答を誘発する、方法。
2.修飾ポリペプチド抗原が、修飾ポリペプチド抗原がコンジュゲート化の前のポリペプチド抗原よりも高い安定性(例えば、熱安定性)を示すように、修飾ポリペプチド抗原が十分な数のステロイド酸部分とコンジュゲート化される、項目1に記載の方法。
3.ポリペプチド抗原が、タンパク質抗原であり、及び/又は少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、もしくは150kDaの分子量を有する、項目1又は2に記載の方法。
4.ポリペプチド抗原が、1つ以上のMHCクラスIエピトープ及び/又はMHCクラスIIエピトープを含む、項目1~3のいずれか1つに記載の方法。
5.ポリペプチド抗原が、腫瘍関連抗原(TAA)、腫瘍特異的抗原(TSA)、ネオアンチゲン、ウイルス抗原、細菌抗原、真菌抗原、ワクチン接種及び/又は免疫療法による治療に適した疾患又は障害に関連する抗原、又はその任意の抗原性断片であるか、又はそれらを含む、項目1~4のいずれか1つに記載の方法。
6.ポリペプチド抗原が、コロナウイルス抗原(例えば、SARS-CoV-2スパイクタンパク質(配列番号3)もしくはSARS-CoVスパイクタンパク質(配列番号4)又はその抗原性断片、又は単一塩基変異体抗原、突然変異フレームシフト抗原、スプライス変異体抗原、遺伝子融合抗原、内因性レトロエレメント抗原などの癌抗原、又はヒト白血球抗原(HLA)-体細胞変異体由来抗原あるいは翻訳後TSA、ウイルス由来の癌抗原(例えばヒトパピローマウイルス(HPV)、サイトメガロウイルス、又はエプスタイン・バールウイルス(EBV))、癌-精巣抗原、HER2、PSA、TRP-1、TRP-2、EpCAM、GPC3、CEA、MUC1、MAGE-A1、NY-ESO-1、SSX-2、メソテリン(MSLN)、EGFR、細胞ライセート又は腫瘍由来の他の物質(例えば、腫瘍由来のエクソソーム)などの別のクラスの抗原であるか、又はそれらを含む、項目1~5のいずれか1つに記載の方法。
7.ステロイド酸がエンドソームの内側リーフレット上へのセラミド蓄積を誘発し、それによってエンドソーム膜を不安定化させ、細胞内送達時のポリペプチド抗原のエンドソーム脱出を促進する、項目1~6のいずれか1つに記載の方法。
8.ステロイド酸が、セラミドを形成するように酸性スフィンゴミエリナーゼ(ASM)に媒介されるスフィンゴミエリンの切断の増加を誘発する項目1~7のいずれか1つに記載の方法。
9.ステロイド酸が胆汁酸である、項目1~8のいずれか1つに記載の方法。
10.ステロイド酸が一次胆汁酸又は二次胆汁酸である、項目1~9のいずれか1つに記載の方法。
11.ステロイド酸が、(a)コール酸(CA)、ケノデオキシコール酸(CDCA)、デオキシコール酸(DCA)、リトコール酸(LCA)、グリコデオキシコール酸(GDCA)、グリココール酸(GCA)、タウロコール酸(TCA)、グリコデオキシコール酸(CDCA)、グリコケノデオキシコール酸(GCDCA)、タウロデオキシコール酸(TDCA)、グリコリトコール酸(GLCA)、タウロリトコール酸(TLCA)、タウロヒオデオキシコール酸(THDCA)、タウロケノデオキシコール酸(TCDCA)、ウルソコール酸(UCA)、タウロウルソデオキシコール酸(TUDCA)、ウルソデオキシコール酸(UDCA)、又はグリコウルソデオキシコール酸(GUDCA)である胆汁酸、(b)(a)の胆汁酸の類似体であって、エンドサイトーシスを誘導する;エンドソームの内側リーフレット上へのセラミド蓄積を誘発する;セラミドを形成するように酸性スフィンゴミエリナーゼ(ASM)に媒介されるスフィンゴミエリンの切断の増加を誘発する;及び/又はコール酸の疎水性よりも大きい疎水性を有する類似体、(c)コール酸よりも疎水性である胆汁酸又は胆汁酸類似体(例えば、CDCA、DCA、LCA、TCA、TDCA、TCDCA、GCA、GDCA、又はGCDCA)、(d)(a)~(c)の任意の組合せであるか、又はそれらを含む、項目1~10のいずれか1つに記載の方法。
12.各修飾ポリペプチド抗原分子が、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、又は50個のステロイド酸部分とコンジュゲート化される、項目1~11のいずれか1つに記載の方法。
13.修飾ポリペプチド抗原分子が、ポリペプチド抗原の溶媒露出アミン(例えば、一級アミン)及び/又はスルフヒドリル基でステロイド酸とコンジュゲート化される、項目1~12のいずれか1つに記載の方法。
14.修飾ポリペプチド抗原分子が、リンカー(例えば、二官能性、三官能性リンカー、又は多官能性リンカー)を介してステロイド酸とコンジュゲート化される、項目1~13のいずれか1つに記載の方法。
15.ステロイド酸がステロイド酸-ペプチドコンジュゲートに含まれて、ポリペプチド抗原がステロイド酸-ペプチドコンジュゲートと(例えば、当該ペプチドを介して、例えば、N又はC端残基において)コンジュゲート化される、項目1~14のいずれか1つに記載の方法。
16.ペプチドが、(i)エンドサイトーシス及び/又はエンドソーム形成を刺激するタンパク質形質導入ドメインを含む;(ii)細胞内標的化シグナルを含む;(iii)カチオン性ペプチド(例えば、細胞非透過性カチオン性ペプチド)である;(iv)非免疫原性ペプチドである;又は(v)(i)~(iv)の任意の組合せである、項目15に記載の方法。
17.細胞内標的化シグナルが、古典的NLS(例えば、SV-40ラージT抗原(例えば、PKKKRKV;配列番号7)又は他の古典的NLS由来のNLS)又は非古典的NLS(例えば、hnRNP A1タンパク質中の酸性M9ドメイン;酵母の転写リプレッサーMatα2中の配列KIPIK;PY-NLS;リボソームNLS;及びU snRNPの複合シグナル)などの核局在化シグナルである、項目16に記載の方法。
18.核局在化シグナルが、SV40 NLS(例えば配列番号1又は7に含まれる)、GWG-SV40 NLS(例えば配列番号8に含まれる)、hnRNPA1 M9 NLS(例えば配列番号9に含まれる)、hnRNP D NLS(例えば配列番号10に含まれる)、hnRNP M NLS(例えば配列番号11に含まれる)、PQBP-1 NLS(例えば配列番号12に含まれる)、NLS2-RG Domain RPS17(例えば配列番号13に含まれる)、NLS1 RPS17(例えば配列番号14に含まれる)、NLS2 RPS17(例えば配列番号15に含まれる)、NLS3 RPS17(例えば配列番号16に含まれる)、cMyc NLS(例えば配列番号17に含まれる)、HuR NLS(例えば配列番号18に含まれる)、Tus NLS(例えば配列番号19に含まれる)、又はヌクレオプラスミンNLS(例えば配列番号20に含まれる)であるか、又は核局在化活性を有するNLSの変異体であり、ここで、NLSが、配列番号7~20のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、項目16又は17に記載の方法。
19.修飾ポリペプチド抗原が、(i)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、当該修飾ポリペプチド抗原のサイトゾル送達の増加;(ii)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、当該修飾ポリペプチド抗原の総細胞送達の増加;(iii)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、当該ポリペプチド抗原に対する細胞性免疫の増強;(iv)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、当該ポリペプチド抗原への曝露時のCD8+T細胞によるIFN-γの産生の増加;(v)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、当該ポリペプチド抗原に対する体液性免疫の増強;(vi)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、当該ポリペプチド抗原に対する抗体種の多様性の増大;又は(vii)(i)~(vi)の任意の組合せを誘発する、項目1~18のいずれか1つに記載の方法。
20.項目1~19のいずれか1つに記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原、又は項目1~19のいずれか1つに定義される修飾ポリペプチド抗原を含む(例えばインビトロ又はエクスビボの)細胞集団。
21.免疫細胞(例えば、T細胞)、抗原提示細胞(例えば、樹状細胞、マクロファージ、遺伝子操作された抗原提示細胞)、MHCクラスI発現細胞、MHCクラスII発現細胞、又はそれらの任意の組合せを含む、項目20に記載の細胞集団。
22.項目1~19のいずれか一つに記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原、項目1~19のいずれか一つに定義される修飾ポリペプチド抗原、項目20又は21に記載の細胞集団、又はそれらの任意の組合せと、薬学的に許容される賦形剤及び/又はアジュバント(例えば、エマルジョンアジュバント、水中油型エマルジョンアジュバント、又はスクアレンベースの水中油型エマルジョンアジュバント)とを含む、免疫原性組成物。
23.治療用又は予防用ワクチン(例えば、抗癌ワクチン、抗ウイルスワクチン、又は抗細菌ワクチン)である、項目22に記載の免疫原性組成物。
24.対象における目的の非修飾ポリペプチド抗原に対する増強された適応免疫応答を誘発する方法であって、項目22又は23に記載の免疫原性組成物を対象に投与することを含む方法。
25.感染症に対して対象にワクチン接種する方法であって、項目22又は23に記載の免疫原性組成物を対象に投与することを含み、ここで、ポリペプチド抗原が感染症を引き起こす病原体(例えば、ウイルス、細菌、真菌)の抗原性断片を含む、方法。
26.対象における癌を治療する方法であって、項目22又は23に記載の免疫原性組成物を対象に投与することを含む方法。
27.方法が、免疫チェックポイント阻害剤療法と組み合わされる、項目26に記載の方法。
28.対象における免疫応答を生じさせる際に使用するための、又は対象における免疫応答を生じさせるための免疫原性組成物の製造のための、項目1~19のいずれか一つに定義される修飾ポリペプチド抗原、又は項目1~19のいずれか1つに記載の方法によって生成される修飾ポリペプチド抗原。
29.対象における免疫応答を生じさせるための、又は対象における免疫応答を生じさせるための医薬(例えば、ワクチン)の製造のための、項目1~19のいずれか一つに定義される修飾ポリペプチド抗原、項目1~19のいずれか一つに記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原、項目20若しくは21に定義される細胞集団、又は項目22若しくは23に定義される免疫原性組成物の、使用。
30.免疫応答が、対応する非修飾ポリペプチド抗原から生成されるものと比較して、当該ポリペプチド抗原に対する細胞性免疫の増強、当該ポリペプチド抗原への曝露時のCD8+T細胞によるIFN-γの産生の増加、当該ポリペプチド抗原に対する体液性免疫の増強、又はそれらの任意の組合せを含む、項目28に記載の使用、又は項目29に記載の使用のための修飾ポリペプチド抗原。
31.ポリペプチド抗原を調製するための方法であって、非修飾ポリペプチド抗原を十分な数のステロイド酸部分とコンジュゲート化して、コンジュゲート化の前のポリペプチド抗原よりも高い安定性(例えば、熱安定性)を示す修飾ポリペプチド抗原を生成する工程を含む方法。
32.ポリペプチド抗原にコンジュゲート化されるステロイド酸部分の数が、当該修飾のないポリペプチド抗原と比較して、細胞内送達時の修飾ポリペプチド抗原のエンドソーム脱出を増加させるために十分な数である、項目31に記載の方法。
33.修飾ポリペプチド抗原が項目3~19のいずれか1つに定義されるとおりである、項目31又は32に記載の方法。
34.ポリペプチド抗原の免疫原性を改善する方法であって、修飾するポリペプチド抗原を供給する工程と、ポリペプチド抗原を1つ以上の胆汁酸-ペプチド部分と共有結合でコンジュゲート化して修飾ポリペプチド抗原を生成する工程とを含み、修飾ポリペプチド抗原が、対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、対象への投与時に当該ポリペプチド抗原に対する改善された適応免疫応答を誘発するために十分な数の胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化され、胆汁酸-ペプチド部分に含まれるペプチドが核局在化シグナル(NLS)を含む、方法。
35.修飾ポリペプチド抗原が、対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、細胞内送達時の修飾ポリペプチド抗原の抗原提示を増加させるために十分な数の胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化される、項目34に記載の方法。
36.修飾ポリペプチド抗原が、対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、より高い熱安定性を示すように、修飾ポリペプチド抗原が十分な数の胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化される、項目34又は35に記載の方法。
37.ポリペプチド抗原と1つ以上の胆汁酸-ペプチド部分との共有結合によるコンジュゲート化が、ポリペプチド抗原をモル過剰の胆汁酸-ペプチド部分と反応させることによって行われる、項目34~36のいずれか1つに記載の方法。
38.ポリペプチド抗原を2倍~100倍モル過剰の胆汁酸-ペプチド部分と反応させる、項目37に記載の方法。
39.ポリペプチド抗原を2倍~50倍モル過剰の胆汁酸-ペプチド部分と反応させる、項目37に記載の方法。
40.ポリペプチド抗原を5倍~25倍モル過剰の胆汁酸-ペプチド部分と反応させる、項目37に記載の方法。
41.修飾ポリペプチド抗原当たりのコンジュゲート化された胆汁酸-ペプチド部分の平均数が、少なくとも約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、又は50であるか、又は、約1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10とnの間であり、ここでnが、コンジュゲート化に利用可能なポリペプチド抗原上の溶媒露出部位の総数である、項目34~40のいずれか1つに記載の方法。
42.胆汁酸が、コール酸(CA)、ケノデオキシコール酸(CDCA)、デオキシコール酸(DCA)、リトコール酸(LCA)、グリコデオキシコール酸(GDCA)、グリココール酸(GCA)、タウロコール酸(TCA)、グリコデオキシコール酸(CDCA)、グリコケノデオキシコール酸(GCDCA)、タウロデオキシコール酸(TDCA)、グリコリトコール酸(GLCA)、タウロリトコール酸(TLCA)、タウロヒオデオキシコール酸(THDCA)、タウロケノデオキシコール酸(TCDCA)、ウルソコール酸(UCA)、タウロウルソデオキシコール酸(TUDCA)、ウルソデオキシコール酸(UDCA)、又はグリコウルソデオキシコール酸(GUDCA)である、項目34~41のいずれか1つに記載の方法。
43.胆汁酸が、CA、CDCA、DCA、LCA、GDCA、GCA、TCA、CDCA、GCDCA、TDCA、GLCA、TLCA、THDCA、TCDCA、UCA、TUDCA、UDCA、又はGUDCAの類似体であり、類似体が、エンドサイトーシスを誘導する;エンドソームの内側リーフレット上へのセラミド蓄積を誘発する;又はセラミドを形成するように酸性スフィンゴミエリナーゼ(ASM)に媒介されるスフィンゴミエリンの切断の増加を引き起こす、項目34~42のいずれか1つに記載の方法。
44.核局在化シグナルが、SV40 NLS(配列番号1又は7)、GWG-SV40 NLS(配列番号8)、hnRNPA 1 M9 NLS(配列番号9)、hnRNP D NLS(配列番号10)、hnRNP M NLS(配列番号11)、PQBP-1 NLS(配列番号12)、NLS2-RG Domain RPS17(配列番号13)、NLS1 RPS17(配列番号:14)、NLS2 RPS17(配列番号15)、NLS3 RPS17(配列番号16)、cMyc NLS(配列番号17)、HuR NLS(配列番号18)、Tus NLS(配列番号19)、又はヌクレオプラスミンNLS(配列番号20)である、項目34~43のいずれか1つに記載の方法。
45.核局在化シグナルが、核局在化活性を有するNLSの変異体であり、NLSが、配列番号7~20のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、又はそれからなる、項目34~44のいずれか1つに記載の方法。
46.ポリペプチド抗原が、リンカーを介して1つ以上の胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化される、項目34~45のいずれか1つに記載の方法。
47.リンカーが二官能性リンカー、三官能性リンカー又は多官能性リンカーである、項目46に記載の方法。
48.修飾ポリペプチド抗原分子が、ポリペプチド抗原の溶媒露出官能基を介して1つ以上の胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化される、項目34~47のいずれか1つに記載の方法。
49.ポリペプチド抗原が、腫瘍関連抗原(TAA)、腫瘍特異的抗原(TSA)、腫瘍由来の細胞ライセート、腫瘍由来のエクソソーム、ネオアンチゲン、ウイルス抗原、細菌抗原、真菌抗原、又はワクチン接種及び/もしくは免疫療法による処置に適した疾患もしくは障害に関連する他の抗原であるか、又はそれを含む、項目34~48のいずれか1つに記載の方法。
50.ポリペプチド抗原が、SARS-CoVスパイクタンパク質又はその抗原性断片であるか、又はそれを含む、項目34~49のいずれか1つに記載の方法。
51.項目34~50のいずれか1つに記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原又は項目34~50のいずれか1つに記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原を含む細胞集団と、薬学的に許容される賦形剤及び/又はアジュバントとを含む、免疫原性組成物。
52.細胞集団が、樹状細胞、B細胞、T細胞、マクロファージ、遺伝子操作された抗原提示細胞、MHCクラスI発現細胞、MHCクラスII発現細胞、又はそれらの任意の組合せを含む、項目51に記載の免疫原性組成物。
53.対象における目的の非修飾ポリペプチド抗原に対する増強された適応免疫応答を誘発する方法であって、項目52に記載の免疫原性組成物を対象に投与することを含む方法。
動物及び倫理
6~8週齢のBALB/cマウスをジャクソン・ラボラトリー(バーハーバー、メイン州、米国)から購入し、同様の年齢のC57BL/6マウスをチャールス・リバー(モントリオール、ケベック州、カナダ)から購入した。同腹仔のマウスを交配させ、Institute for Research in Immunology and Cancer(IRIC)の動物施設において病原体フリーの環境で飼育した。動物実験プロトコルは、モントリオール大学の動物実験委員会によって承認された。
全ての細胞培養培地及び試薬は、別途示されない限り、Wisent Bioproducts(サンブルーノ、ケベック州、カナダ)から購入した。全てのフローサイトメトリー抗体は、別途示されない限り、BD Biosciences(サンノゼ、カリフォルニア州、米国)から購入した。ニワトリ卵白由来のアルブミン(オボアルブミン;OVA)、LPS及びNunc MaxiSorp(商標)プレートは、シグマ・アルドリッチ(セントルイス、ミズーリ州、米国)から購入した。OVA-DQ(商標)は、サーモフィッシャー(ウォルサム、マサチューセッツ州、米国)から購入した。SIINFEKLペプチドは、ジェンスクリプト(ピスカタウェイ、ニュージャージー州、米国)によって合成された。ブラッドフォード試薬は、バイオ・ラッド(ハーキュリーズ、カリフォルニア州、米国)から購入した。全てのサイトカインELISAは、別途示されない限り、R&Dシステムズ(ミネアポリス、ミネソタ州、米国)から購入した。組換えGM-CSGは、Peprotech(ロッキーヒル、ニュージャージー州、米国)から購入した。CD8及びCD4T細胞単離キットは、StemCell Technologies(バンクーバー、ブリティッシュ コロンビア州、カナダ)から購入した。インビボの研究で使用したPD-1抗体(クローンRMP1-14)は、BioXCell(ウェスト・レバノン、ニューハンプシャー州、米国)から購入した。
マウス骨髄由来DC(BMDC)は、10%ウシ胎児血清(FBS)、50U/mLのペニシリン-ストレプトマイシン、2mMのL-グルタミン、10mMのHEPES、1%MEM非必須アミノ酸、1mMのピルビン酸ナトリウム、0.5mMのp-メルカプトエタノールを補充したRPMI(商標)1640を使用して、マウス大腿骨から全骨髄を洗い流すことによって生成した。赤血球を溶解させた後、細胞を50ng/mLのマウス組換えGM-CSFを補充した培地中で培養した。培地を2、4、6及び8日目に交換した。9日目に、培地を、組換えマウスGM-CSF及び大腸菌Olli由来のLPS(1ng/mL)を含むように置き換えて、DCの成熟を刺激した。成熟したDCを、それらの表面のCD3、CD19、NK1.1、CD11c、CD80、CD86、及びI-Abの発現についてフローサイトメトリーで評価した。
抗原の3D構造を、RCSB PDB及びSwiss-Model Expasy(商標)フリーアクセスソフトウェアを使用してモデル化した。リジン残基を表す溶媒露出アミノ酸を同定し、それらの溶媒への露出の割合に従って強調した(青色:高;緑:中程度、黄:低)。
癌細胞ライセートを調製するために、培養したEL4細胞を、1500rpmで5分間遠心分離して収集し、続いてPBSで2回洗浄して微量のFBSを除去した。次いで、細胞を液体窒素/沸騰水中でそれぞれ5回凍結させ融解させた。大きな粒子を除去するために、G26ニードルを用いてライセートを細断し、70μmのセルストレーナーに通し、次いで0.45μmのフィルターで濾過した。次いで、得られたライセートを、ブラッドフォード試薬を用いて定量し、アリコートに分けて、使用するまで-80℃で保存した。
ChAcNLSは、別途示されない限り、以前にBeaudoinら、2016に記載されているように合成した。OVA、OVA-DQ、又は癌細胞ライセートを、他の配合成分を含めて又は含めずに、しかしアミン(NH3)又はスルフヒドリル(SH)基は含めずに、滅菌PBS中、1~10mg/mLで可溶化した。様々なモル過剰比(5x、10x、25x、50x)を使用して、SM(PEG)4架橋リンカーを加えて1時間反応させた。遊離のSM(PEG)4架橋リンカーを、Centricon(商標)濾過及びSephadex(商標)カラムによって除去した。ChAcNLSを同じモル過剰比で添加し、1時間インキュベートして、抗原当たりで様々な量で結合したChAcNLS部分を得た。別途示されない限り、実施例で試験したcOVAコンジュゲートは、50Xモル過剰比を用いて生成した。遊離の未結合ChAcNLSをCentricon濾過及びSephadexカラムによって除去した。ChAcNLS-修飾抗原を滅菌PBS中で濃縮し、UV吸光度によって決定して最終濃度5~10mg/mLを得た。
ChAcNLS-OVA修飾抗原を特徴付けるために、1)示差走査熱量測定又は動的光散乱、2)円二色性(CD)遠紫外及び近紫外スペクトルスキャン及びフーリエ変換赤外分光法(FTIR)、3)多角度レーザー光散乱を備えたサイズ排除クロマトグラフィー、4)固有トリプトファン蛍光(ITF)、5)ペプチドマッピング(LCMS/MSによる参照標準の特徴付け)、ならびに6)LC-MSによるインタクト及びサブユニット分子量を含む一連の試験を、チャールズリバー(ウィルミントン、マサチューセッツ州、米国)で実施した。
胆汁酸-NLS部分は、別途示されない限り、以前にBeaudoinら、2016に記載されたコール酸-NLS(ChAcNLS)の合成と同様に合成した。例えば、CA-SV40 NLSでは、コール酸を、リンカーアミノ酸に隣接するSV40ラージT抗原(配列番号7)由来の核局在化シグナルを含む13merペプチド(CGYGPKKKRKVGG;配列番号1)のN端システイン残基の遊離アミノ基とコンジュゲート化した。
Applied Photophysics(レザーヘッド、サリー、英国)のChirascan(商標)Q100円偏光二色性(CD)分光計を固有トリプトファン蛍光(ITF)分析に使用し、VWRデジタルヒートブロック(ラドノール、ペンシルバニア州)をドライブロックの温度のインキュベーションに使用した。Chirscan Q100オートサンプラーラック冷却システムを全ての4℃のインキュベーションに使用した。データはMATLABソフトウェア(ネイティック、マサチューセッツ州)を使用して分析した。簡潔には、試料を-20℃の貯蔵庫から取り出して、室温に平衡化させた。次いで、試料を4~5mg/mLの範囲のストック濃度からPBS中0.8mg/mLに希釈した。次いで、希釈したサンプルを、熱ストレスに曝露せずに(ネイティブ)、又はドライブロックでのインキュベーションによる10分間の熱ストレスの後に、ITFについて分析した。各希釈試料のアリコートを4℃でインキュベートし、第2のアリコートを37℃でインキュベートし、第3のアリコートを80℃でインキュベートした。0.8mg/mLに希釈したBSAを、上記の各熱条件下で試料に含めた。インキュベーションの後、全ての試料を室温に再平衡化した。ITF分析は、280nmでの励起、200~600nmの発光スキャン範囲、1.0nmの帯域幅、1秒のポイント当たりの時間、及び0.5のステップで、8つのトリプリケートで行った。トリプリケートのスペクトルをブランクで減算し、平均し、MALTABソフトウェアを用いてmdeg単位から相対蛍光強度に変換した。希釈したBSA溶液を、サンプルの配列の前と後に対照としてアッセイした。
このアッセイのために、15x103個のDC2.4細胞を、24ウェルプレート中の滅菌カバースライド上に播種した。eGFP-hGal3哺乳動物発現ベクターでDC2.4細胞をトランスフェクションした2日後に、0.1mg/mLのnOVA又はcOVAを細胞に添加し、次いで37℃で3時間インキュベートした。次いで、細胞を2回洗浄して過剰のタンパク質を除去した後、スライドに載せた。スライドを蛍光顕微鏡(ニコン、エクリプス(商標)Ti2-U)で観察し、結果をIMAGE J(商標)ソフトウェアを使用して解析した。
細胞表面マーカーの発現を評価するために、BMDCを、染色バッファー(2%FBSを含有するPBS)を用いて製造業者の説明に従って希釈した様々な抗体と共に、暗所において4℃で30分間インキュベートした。染色バッファーを用いて十分に洗浄した後、細胞を400μLの染色バッファーに再懸濁した。試料をCANTOII(商標)上のBD FACSDiva(商標)によって得て、次いでFlowJo(商標)v10を使用して解析した。
OVAのプロセシングを評価するために、細胞を10pg/mLのOVA-DQ(ChAcNLS修飾有り又は無し)と共に37℃でインキュベートした。30分後、細胞を洗浄し、通常の培地を加えた。指定のインキュベーション時間の終わりに、細胞を回収し、2%FBSを含有する冷PBSで洗浄した。フローサイトメトリーで細胞を分析して蛍光をモニターした。
抗原交差提示を評価するために、細胞を24ウェルプレート(Coming、マサチューセッツ、米国)に1ウェル当たり25×103個の細胞で播種し、その後、様々な濃度の抗原を3時間パルスした。パルス時間の終わりに、細胞を洗浄して過剰な抗原を除去し、製造業者のプロトコルに従ってT細胞単離キットを使用して、それぞれOT-II又はOT-Iマウスの脾臓から精製した106個/mLのCD4又はCD8 T細胞と共培養した。72時間後、上清を回収して、市販の酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)によってサイトカインの産生を定量するために使用した。
Nunc MaxiSorp(商標)プレートを、4℃でコーティングバッファー中に希釈した1μgのOVAで一晩コーティングした。翌日、プレートを洗浄し、次いで3%スキムミルクで室温、1時間ブロッキングした。この工程に続いて、プレートを洗浄した後、希釈血清(2倍希釈液を調製した)を加えた。2時間のインキュベーション時間の後、プレートを洗浄して、1:1000の希釈でHRP結合抗マウスIgG二次抗体を加えた。2時間後にプレートを洗浄し、次いで室温でHRPと共に10~20分間インキュベートした。HRPをクエンチした後、シグナルを、Synergy(商標)H1マイクロプレートリーダー(Biotek、ウィヌースキー、バーモント州、米国)を使用して検出した。
予防的ワクチン接種では、雌のC57BL/6マウス(n=10/群)に、0日目及び14日目に、OVA/OVA-ChAcNLS(1μg/投与)、OVA製剤(0.1mg/mL)又は腫瘍ライセート(0.1mg/mL)でパルスした104個のBMDCを皮下(SC)注射した。2回目のワクチン接種の2週間後に、マウスに5×105個のEG.7又はEL4細胞を皮下(SC)移植し、腫瘍の増殖を経時的に評価した。抗原特異的なCD8 T細胞の活性化を評価するために、免疫したマウスから単離した脾細胞を最初にインビトロで1μg/mLのOVAで刺激し、次いで3日後に上清を回収して、Luminex(商標)によってサイトカイン/ケモカインの産生を評価した。
それらを切除した後、腫瘍塊を最初に秤量し、次いで、5%FBSを補充したDMEM中で混合した2mg/mLのコラゲナーゼD、2mg/mLのコラゲナーゼIV、及び100μg/mLのDNase IV型を含有する4~5mLのマスターミックス中で外科用ハサミを用いて小片に切断した。次いで、混合物を37℃の細胞培養インキュベーター中で撹拌した。30分間インキュベーションした後、10mLのDMEMを加えて酵素反応を中和した。消化した溶液を70μmの細胞ストレーナーを用いて濾過し、ストレーナーの上部に保持された全ての断片をプランジャーで粉砕し、続いて1~2のDMEMを加えてストレーナーを洗浄した。次いで、収集した細胞を1200rpm(4℃)で5分間遠心分離し、赤血球溶解バッファーで1分間処理し、次いで、5%FBSを補充した3~4mLのDMEM中に再懸濁した。細胞を洗浄した後、5%FBSを補充したDMEM中にペレットを再懸濁して、フローサイトメトリー分析のための細胞染色を始めた。
様々な胆汁酸-NLS結合体を、B3Zレポーター系を用いてスクリーニングした。B3Z細胞株は、H2-Kb-SIINFEKL複合体に特異的なT細胞ハイブリドーマである。そのTCRを介して活性化されると、LacZレポーター遺伝子(NF ATプロモーターの制御下)が発現される。簡潔には、1.5×105個のBMDC又は単離されたB細胞を、オボアルブミン(OVA)-胆汁酸-NLSコンジュゲートで処理した5×104個のB3Z細胞と、37℃、5%CO2で一晩共培養した。翌日、全ての細胞をPBS(pH 7.4)で2回洗浄し、細胞ペレットを、0.15mMのクロロフェノールレッド-β-D-ガラクトピラノシド(CPGR)基質(Calbiochem、ラホヤ、カリフォルニア)、0.125%NP40(EMD Sciences、ラホヤ、カリフォルニア)、9mMのMgCl2(アルドリッチ、米国)及び100mMの2-メルカプトエタノールをPBS中に含有する100μLの溶解バッファーを加えて溶解させた。37℃で5時間又は24時間インキュベートした後、636nmを参照波長として570nmで吸光度を測定した。これらの実験では、胆汁酸-NLS-OVAコンジュゲート(10Xモル比の胆汁酸-NLS部分対OVAで調製した)をPBS(pH7.3)中に0.1mg/mLで再懸濁し、OVA単独は5mg/mLで再懸濁した。
p-値は一元配置分散分析(ANOVA)を用いて計算した。結果は、S.D.エラーバーと共に平均として表され、統計的有意性は、アスタリスクで表される:*P<0.05、**P<0.01、***P<0.001。
ステロイド酸-ペプチドのコンジュゲート、ChAcNLSを、実施例1に記載のように合成した。簡潔には、コール酸を13merペプチドのN端システイン残基の遊離アミノ基とコンジュゲート化した。ペプチド
は、リンカーアミノ酸に隣接するSV40ラージT抗原由来の核局在化シグナル(下線)を含んでいた。次いで、複数のChAcNLS部分を、プロトタイプのポリペプチド抗原OVA(配列番号2;図IC)の溶媒露出リジン残基のイプシロン-アミノ基とコンジュゲート化した。ChAcNLS部分への所与の抗原の共有結合を表す概略図を図1Aに示す。次いで、ChAcNLS-OVAを実施例1に記載したように生化学的に特徴付け、結合をクマシーブルー染色図1B及びウェスタンブロット図1Eによって確認した。生化学的特徴付けにより、25xの比でコンジュゲート化したChAcNLS-OVA(図1B、ライン2)は、OVA当たり平均で約4個のコンジュゲート化されたChAcNLS部分を有し、約8.6kDaのMWの増加に対応することが明らかになった。50xの比でコンジュゲート化したChAcNLS-OVA(図1B、ライン3)は、OVA当たり平均で約8個のコンジュゲート化されたChAcNLS部分を有し、約19.2kDaのMWに対応した。溶媒露出の高い(青色)、中程度の(緑色)又は低い(黄色)リジン残基であると予測されるリジン残基と共にOVAタンパク質のリボン構造を図1Dに示す。
BMDCを生成するために、雌のC57BL/6又はBALB/cマウスの大腿骨及び脛骨を洗い流して、全有核細胞を収集した。次いで、細胞を組換えGM-CSF(10ng/mL)と共に8日間プレート培養し、2日毎に交換した。LPSを9日目に添加して、抗原をパルスする前にDCの成熟を誘発した。BMDCの成熟をフローサイトメトリーによって確認した。T細胞、B細胞又はNK細胞は9日目に検出されず、BMDCの80%超がCD11c+、CD80+、CD86+、及びI-Ab+を発現した。次いで、BMDCを、様々な濃度のもとのままのOVA(nOVA)又はChAcNLS-OVA(cOVA)のいずれかと共にインキュベートし、OT-IIトランスジェニックマウス由来のCD4+T細胞又はOT-Iトランスジェニックマウス由来のCD8+T細胞のいずれかを添加した。
予防用ワクチンとしてのChAcNLS修飾OVAの有効性を決定するために、細胞ベースのワクチン又は単独型ワクチンのいずれかでcOVAをマウスにワクチン接種した。細胞ベースのワクチンでは、nOVA又はcOVAのいずれかをパルスしたBMDCをマウスに皮下注射した後、EG.7リンパ腫細胞を移植し、続いて再チャレンジした。免疫化のスキームを図3Aに示す。
治療ワクチンとしての胆汁酸とコンジュゲート化したポリペプチド抗原の有効性を決定するために、マウスにまずEG.7リンパ腫細胞を移植し、次いで、免疫チェックポイント阻害剤/抗がん剤の抗PD-1抗体の存在下又は非存在下で、nOVA又はcOVAのいずれかをパルスしたBMDCで免疫した。免疫化のスキームを図5Aに示す。
微生物感染、特にSARS-CoV-2などのウイルス感染に対する治療ワクチンとしての胆汁酸とコンジュゲート化されたポリペプチド抗原の有効性を決定するために、実施例1、2及び4に記載したcOVAワクチンの構築と同様に、SARS-CoV-2スパイクタンパク質に共有結合したChAcNLSから構成されるワクチンを構築した。
異なる変異株に由来するスパイクタンパク質を使用したSARS-CoV-2ワクチンが同じ構築を用いて有効であるかどうかを決定するために、cSpike-CoV-2-INワクチンを、インド変異株由来のスパイクタンパク質を使用して生成した。
OVAとコンジュゲート化された様々な胆汁酸-NLSコンジュゲートを生成し、B3ZレポーターアッセイにおいてDC又はB細胞のOVA抗原提示を増強するそれらの能力について評価した。胆汁酸-NLS-OVAコンジュゲートは、図16のSDS-PAGEに示されるように、OVAに対して10X又は50Xのモル過剰比の胆汁酸-NLSで生成したが、10Xのモル過剰比で生成されたコンジュゲートを用いた結果のみを、図17(樹状細胞)及び図18(B細胞)の抗原表示アッセイに示す。SDS-PAGEの結果から計算された相対移動距離(Rf)から(例えば、図16)、10Xモル過剰の胆汁酸-NLS反応物では、OVA分子当たり約1~4個の胆汁酸-NLS部分がコンジュゲート化され、25Xモル過剰の胆汁酸-NLS反応物では、OVA分子当たり約5~9個の胆汁酸-NLS部分がコンジュゲート化され、50Xモル過剰の胆汁酸-NLS反応物では、OVA分子当たり約12~20個の胆汁酸-NLS部分がコンジュゲート化された。
図17に示すように、試験した様々な胆汁酸-NLSコンジュゲートの全てが、CA-SV40のそれ(すなわち、ChAcNLS;図17に破線で示す)と同等以上のレベルでBMDCによるOVAの提示を増強した。驚くべきことに、図17で試験した全ての胆汁酸-NLSコンジュゲートについて観察された抗原提示の増加は、OVAコンジュゲート(0.1mg/mL)と比較して50倍高い濃度のOVA抗原(5mg/mL)を使用したという事実にもかかわらず、「OVA単独」対照よりも優れていた。興味深いことに、CDCA-SV40、UDCA-SV40、GDCA-SV40、GDCA-NLS2-RPS17、及びLCA-NLS2-RPS17などのいくつかの胆汁酸-NLSコンジュゲートは、CA-SV40)(図17)と比較して、OVAの提示を顕著に増強した。さらに、OVAをSV40ペプチド単独(胆汁酸なし)とコンジュゲート化し、0.1mg/mLというより同等の濃度で使用した陰性対照(図17中の「SV40」)は「PBS」陰性対照と同様の結果を与えた。胆汁酸-NLSコンジュゲート「SV40-CA」は、主にコール酸基の配置においてコンジュゲート「CA-SV40」と異なる。すなわち、「SV40-CA」コンジュゲートにおいて、コール酸基は、SV40 NLSペプチドに付加されたC端リジン残基を介してSV40 NLSペプチドのC端にコンジュゲート化される。図17に示すように、コンジュゲート「SV40-CA」及び「CA-SV40」の両方は同様のB3Z応答を生じ、このことは、ペプチド部分に対するコール酸基の配置が、胆汁酸-NLS部分の免疫刺激効果に影響を及ぼさないことを示唆している。
図18に示すように、試験した様々な胆汁酸-NLSコンジュゲートの大部分は、50倍高い用量のOVA単独(5mg/mL)対照と比較して、又はCA-SV40(すなわち、ChAcNLS)と比較して、同等又は増強されたB細胞による抗原提示を生じた。興味深いことに、DCA-SV40、UDCA-SV40、LCA-SV40、GDCA-GWG-SV40、GDCA-PQBP1、DCA-hnRNP M、CA-NLS2-RPS17、GDCA-hnRNPA1 M9、CA-cMyc、GDCA-SV40、GUDCA-PQBP1、及びCDCA-NLS3-RPS17などのいくつかの胆汁酸-NLSコンジュゲートは、CA-SV40と比較してOVAの提示を顕著に増強した。
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Claims (53)
- ポリペプチド抗原の免疫原性を改善する方法であって、修飾するポリペプチド抗原を供給する工程と、前記ポリペプチド抗原を1つ以上のステロイド酸部分と共有結合でコンジュゲート化して修飾ポリペプチド抗原を生成する工程を含み、前記修飾ポリペプチド抗原が、前記修飾のないポリペプチド抗原と比較して、細胞内送達時の前記修飾ポリペプチド抗原のエンドソーム脱出を増加させるために十分な数のステロイド酸部分とコンジュゲート化されており、前記修飾ポリペプチド抗原が、対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、対象への投与時に、前記ポリペプチド抗原に対する改善された適応免疫応答を誘発する、方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原が、前記修飾ポリペプチド抗原がコンジュゲート化の前のポリペプチド抗原よりも高い安定性(例えば、熱安定性)を示すように十分な数のステロイド酸部分とコンジュゲート化される、請求項1に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原が、タンパク質抗原であり、及び/又は少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、若しくは150kDaの分子量を有する、請求項1又は2に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原が、1つ以上のMHCクラスIエピトープ及び/又はMHCクラスIIエピトープを含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原が、腫瘍関連抗原(TAA)、腫瘍特異的抗原(TSA)、ネオアンチゲン、ウイルス抗原、細菌抗原、真菌抗原、ワクチン接種及び/又は免疫療法による治療に適した疾患又は障害に関連する抗原、若しくはその任意の抗原性断片であるか、又はそれらを含む、請求項1~4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原が、コロナウイルス抗原(例えば、SARS-CoV-2スパイクタンパク質(配列番号3)若しくはSARS-CoVスパイクタンパク質(配列番号4)又はその抗原性断片、又は単一塩基変異体抗原、突然変異フレームシフト抗原、スプライス変異体抗原、遺伝子融合抗原、内因性レトロエレメント抗原などの癌抗原、又はヒト白血球抗原(HLA)-体細胞変異体由来抗原あるいは翻訳後TSA、ウイルス由来の癌抗原(例えばヒトパピローマウイルス(HPV)、サイトメガロウイルス、又はエプスタイン・バールウイルス(EBV))、癌-精巣抗原、HER2、PSA、TRP-1、TRP-2、EpCAM、GPC3、CEA、MUC1、MAGE-A1、NY-ESO-1、SSX-2、メソテリン(MSLN)、EGFR、細胞ライセート又は腫瘍由来の他の物質(例えば、腫瘍由来のエクソソーム)などの別のクラスの抗原であるか、又はそれらを含む、請求項1~5のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ステロイド酸が、エンドソームの内側リーフレット上へのセラミド蓄積を誘発し、それによってエンドソーム膜を不安定化させ、細胞内送達時の前記ポリペプチド抗原のエンドソーム脱出を促進する、請求項1~6のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ステロイド酸が、セラミドを形成するように酸性スフィンゴミエリナーゼ(ASM)に媒介されるスフィンゴミエリンの切断の増加を誘発する、請求項1~7のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ステロイド酸が胆汁酸である、請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ステロイド酸が一次胆汁酸又は二次胆汁酸である、請求項1~9のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ステロイド酸が、
(a)コール酸(CA)、ケノデオキシコール酸(CDCA)、デオキシコール酸(DCA)、リトコール酸(LCA)、グリコデオキシコール酸(GDCA)、グリココール酸(GCA)、タウロコール酸(TCA)、グリコデオキシコール酸(CDCA)、グリコケノデオキシコール酸(GCDCA)、タウロデオキシコール酸(TDCA)、グリコリトコール酸(GLCA)、タウロリトコール酸(TLCA)、タウロヒオデオキシコール酸(THDCA)、タウロケノデオキシコール酸(TCDCA)、ウルソコール酸(UCA)、タウロウルソデオキシコール酸(TUDCA)、ウルソデオキシコール酸(UDCA)、又はグリコウルソデオキシコール酸(GUDCA)である胆汁酸、
(b)(a)の胆汁酸の類似体であって、エンドサイトーシスを誘導する;エンドソームの内側リーフレット上へのセラミド蓄積を誘発する;セラミドを形成するように酸性スフィンゴミエリナーゼ(ASM)に媒介されるスフィンゴミエリンの切断の増加を誘発する;及び/又はコール酸の疎水性よりも大きい疎水性を有する類似体、
(c)コール酸よりも疎水性である胆汁酸又は胆汁酸類似体(例えば、CDCA、DCA、LCA、TCA、TDCA、TCDCA、GCA、GDCA、又はGCDCA)、又は
(d)(a)~(c)の任意の組合せであるか、又はそれらを含む、請求項1~10のいずれか一項に記載の方法。 - 各修飾ポリペプチド抗原分子が、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、又は50個のステロイド酸部分とコンジュゲート化される、請求項1~11のいずれか一項に記載の方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原分子が、前記ポリペプチド抗原の溶媒露出アミン(例えば、一級アミン)及び/又はスルフヒドリル基で前記ステロイド酸とコンジュゲート化される、請求項1~12のいずれか一項に記載の方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原分子が、リンカー(例えば、二官能性、三官能性リンカー、又は多官能性リンカー)を介して前記ステロイド酸とコンジュゲート化される、請求項1~13のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ステロイド酸が、ステロイド酸-ペプチドコンジュゲートに含まれて、前記ポリペプチド抗原が、前記ステロイド酸-ペプチドコンジュゲートと(例えば、前記ペプチドを介して、例えば、N又はC端残基において)コンジュゲート化される、請求項1~14のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ペプチドが、
(i)エンドサイトーシス及び/又はエンドソーム形成を刺激するタンパク質形質導入ドメインを含む;
(ii)細胞内標的化シグナルを含む;
(iii)カチオン性ペプチド(例えば、細胞非透過性カチオン性ペプチド)である;
(iv)非免疫原性ペプチドである;又は
(v)(i)~(iv)の任意の組合せである、請求項15に記載の方法。 - 前記細胞内標的化シグナルが、核局在化シグナル、例えば、古典的NLS(例えば、SV-40ラージT抗原(例えば、PKKKRKV;配列番号7)又は他の古典的NLS由来のNLS)又は非古典的NLS(例えば、hnRNP A1タンパク質中の酸性M9ドメイン;酵母転写リプレッサーMatα2、PY-NLS中の配列KIPIK;リボソームNLS;及びU snRNPの複合シグナル)などの核局在化シグナルである、請求項16に記載の方法。
- 前記核局在化シグナルが、SV40 NLS(例えば配列番号1又は7に含まれる)、GWG-SV40 NLS(例えば配列番号8に含まれる)、hnRNPA1 M9 NLS(例えば配列番号9に含まれる)、hnRNP D NLS(例えば配列番号10に含まれる)、hnRNP M NLS(例えば配列番号11に含まれる)、PQBP-1 NLS(例えば配列番号12に含まれる)、NLS2-RG Domain RPS17(例えば配列番号13に含まれる)、NLS1 RPS17(例えば配列番号14に含まれる)、NLS2 RPS17(例えば配列番号15に含まれる)、NLS3 RPS17(例えば配列番号16に含まれる)、cMyc NLS(例えば配列番号17に含まれる)、HuR NLS(例えば配列番号18に含まれる)、Tus NLS(例えば配列番号19に含まれる)、又はヌクレオプラスミンNLS(例えば配列番号20に含まれる)であるか、又は核局在化活性を有するNLSの変異体であり、前記NLSが、配列番号7~20のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項16又は17に記載の方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原が、
(i)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、前記修飾ポリペプチド抗原のサイトゾル送達の増加;
(ii)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、前記修飾ポリペプチド抗原の総細胞送達の増加;
(iii)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、前記ポリペプチド抗原に対する細胞性免疫の増強;
(iv)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、前記ポリペプチド抗原への曝露時のCD8+T細胞によるIFN-γの産生の増加;
(v)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、前記ポリペプチド抗原に対する体液性免疫の増強;
(vi)対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、前記ポリペプチド抗原に対する抗体種の多様性の増加;又は
(vii)(i)~(vi)の任意の組合せを誘発する、請求項1~18のいずれか一項に記載の方法。 - 請求項1~19のいずれか一項に記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原、又は請求項1~19のいずれか一項に定義される修飾ポリペプチド抗原を含む、(例えば、インビトロ又はエクスビボの)細胞集団。
- 免疫細胞(例えば、T細胞)、抗原提示細胞(例えば、樹状細胞、マクロファージ、遺伝子操作された抗原提示細胞)、MHCクラスI発現細胞、MHCクラスII発現細胞、又はそれらの任意の組合せを含む、請求項20に記載の細胞集団。
- 請求項1~19のいずれか一項に記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原、請求項1~19のいずれか一項に記載の修飾ポリペプチド抗原、請求項20もしくは21に記載の細胞集団、又はそれらの任意の組合せと、薬学的に許容される賦形剤及び/又はアジュバント(例えば、エマルジョンアジュバント、水中油型エマルジョンアジュバント、又はスクアレンベースの水中油型エマルジョンアジュバント)と、を含む、免疫原性組成物。
- 治療用又は予防用ワクチン(例えば、抗癌ワクチン、抗ウイルスワクチン、又は抗細菌ワクチン)である、請求項22に記載の免疫原性組成物。
- 対象における目的の非修飾ポリペプチド抗原に対する増強された適応免疫応答を誘発する方法であって、請求項22又は23に記載の免疫原性組成物を前記対象に投与することを含む、方法。
- 感染症に対して対象にワクチン接種する方法であって、請求項22又は23に記載の免疫原性組成物を前記対象に投与することを含み、前記ポリペプチド抗原が、前記感染症を引き起こす病原体(例えば、ウイルス、細菌、真菌)の抗原性断片を含む、方法。
- 対象における癌を治療するための方法であって、請求項22又は23に記載の免疫原性組成物を前記対象に投与することを含む、方法。
- 前記方法が、免疫チェックポイント阻害剤療法と組み合わされる、請求項26に記載の方法。
- 対象における免疫応答を生じさせる際に使用するための、又は対象において免疫応答を生じさせるための免疫原性組成物の製造のための、請求項1~19のいずれか一項に定義される修飾ポリペプチド抗原、又は請求項1~19のいずれか一項に記載の方法によって生成される、修飾ポリペプチド抗原。
- 対象において免疫応答を生じさせるための、又は対象において免疫応答を生じさせるための薬剤(例えば、ワクチン)の製造のための、請求項1~19のいずれか一項に定義される修飾ポリペプチド抗原、請求項1~19のいずれか一項に記載の方法によって生成される修飾ポリペプチド抗原、請求項20又は21に定義される細胞集団、若しくは請求項22又は23に定義される免疫原性組成物の、使用。
- 前記免疫応答が、対応する非修飾ポリペプチド抗原から生成されるものと比較して、前記ポリペプチド抗原に対する細胞性免疫の増強、前記ポリペプチド抗原への曝露時のCD8+T細胞によるIFN-γの産生の増加、前記ポリペプチド抗原に対する体液性免疫の増強、又はそれらの任意の組合せを含む、請求項28に記載の使用又は請求項29に記載の使用のための修飾ポリペプチド抗原。
- ポリペプチド抗原を調製するための方法であって、非修飾ポリペプチド抗原を十分な数のステロイド酸部分とコンジュゲート化して、コンジュゲート化の前のポリペプチド抗原よりも高い安定性(例えば、熱安定性)を示す修飾ポリペプチド抗原を生成する工程を含む方法。
- 前記ポリペプチド抗原にコンジュゲート化される前記ステロイド酸部分の数が、前記修飾のないポリペプチド抗原と比較して、細胞内送達時の前記修飾ポリペプチド抗原のエンドソーム脱出を増加させるために十分である、請求項31に記載の方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原が、請求項3~19のいずれか一項に定義されるとおりである、請求項31又は32に記載の方法。
- ポリペプチド抗原の免疫原性を改善する方法であって、修飾するポリペプチド抗原を供給する工程と、前記ポリペプチド抗原を1つ以上の胆汁酸-ペプチド部分と共有結合でコンジュゲート化して修飾ポリペプチド抗原を生成する工程とを含み、前記修飾ポリペプチド抗原が、対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、対象への投与時に前記ポリペプチド抗原に対する改善された適応免疫応答を誘発するために十分な数の胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化され、前記胆汁酸-ペプチド部分に含まれる前記ペプチドが核局在化シグナル(NLS)を含む、方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原が、対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、細胞内送達時の前記修飾ポリペプチド抗原の抗原提示を増加させるために十分な数の前記胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化される、請求項34に記載の方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原が、対応する非修飾ポリペプチド抗原と比較して、より高い熱安定性を示すように、前記修飾ポリペプチド抗原が十分な数の前記胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化される、請求項34又は35に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原と1つ以上の前記胆汁酸-ペプチド部分との共有結合によるコンジュゲート化が、前記ポリペプチド抗原をモル過剰の前記胆汁酸-ペプチド部分と反応させることによって行われる、請求項34~36のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原を2倍~100倍モル過剰の前記胆汁酸-ペプチド部分と反応させる、請求項37に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原を2倍~50倍モル過剰の前記胆汁酸-ペプチド部分と反応させる、請求項37に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原を5倍~25倍モル過剰の前記胆汁酸-ペプチド部分と反応させる、請求項37に記載の方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原当たりのコンジュゲートされた前記胆汁酸-ペプチド部分の平均数が、少なくとも約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、又は50であるか、又は約1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10とnの間であり、nが、コンジュゲート化に利用可能な前記ポリペプチド抗原上の溶媒露出部位の総数である、請求項34~40のいずれか一項に記載の方法。
- 前記胆汁酸が、コール酸(CA)、ケノデオキシコール酸(CDCA)、デオキシコール酸(DCA)、リトコール酸(LCA)、グリコデオキシコール酸(GDCA)、グリココール酸(GCA)、タウロコール酸(TCA)、グリコデオキシコール酸(CDCA)、グリコケノデオキシコール酸(GCDCA)、タウロデオキシコール酸(TDCA)、グリコリトコール酸(GLCA)、タウロリトコール酸(TLCA)、タウロヒオデオキシコール酸(THDCA)、タウロケノデオキシコール酸(TCDCA)、ウルソコール酸(UCA)、タウロウルソデオキシコール酸(TUDCA)、ウルソデオキシコール酸(UDCA)、又はグリコウルソデオキシコール酸(UDCA)である、請求項34~41のいずれか一項に記載の方法。
- 前記胆汁酸が、CA、CDCA、DCA、LCA、GDCA、GCA、TCA、CDCA、GCDCA、TDCA、GLCA、TLCA、THDCA、TCDCA、UCA、TUDCA、UDCA、又はGUDCAの類似体であり、前記類似体が、エンドサイトーシスを誘導し、エンドソームの内側リーフレット上へのセラミド蓄積を誘発するか、又はセラミドを形成するように酸性スフィンゴミエリナーゼ(ASM)に媒介されるスフィンゴミエリンの切断の増加を誘発する、請求項34~42のいずれか一項に記載の方法。
- 前記核局在化シグナルが、SV40 NLS(配列番号1又は7)、GWG-SV40NLS(配列番号8)、hnRNPA1 M9 NLS(配列番号9)、hnRNP D NLS(配列番号10)、hnRNP M NLS(配列番号11)、PQBP-1 NLS(配列番号12)、NLS2-RG Domain RPS17(配列番号13)、NLS1 RPS17(配列番号14)、NLS2 RPS17(配列番号15)、NLS3 RPS17(配列番号16)、cMyc NLS(配列番号17)、HuR NLS(配列番号18)、Tus NLS(配列番号19)又はヌクレオプラスミンNLS(配列番号20)である、請求項34~43のいずれか一項に記載の方法。
- 前記核局在化シグナルが、核局在化活性を有するNLSの変異体であり、前記NLSが、配列番号7~20のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、又はそれからなる、請求項34~44のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原が、リンカーを介して前記1つ以上の胆汁酸-ペプチド部分にコンジュゲート化される、請求項34~45のいずれか一項に記載の方法。
- 前記リンカーが、二官能性リンカー、三官能性リンカー又は多官能性リンカーである、請求項46に記載の方法。
- 前記修飾ポリペプチド抗原分子が、前記ポリペプチド抗原の溶媒露出官能基を介して前記1つ以上の胆汁酸-ペプチド部分とコンジュゲート化される、請求項34~47のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原が、腫瘍関連抗原(TAA)、腫瘍特異的抗原(TSA)、腫瘍由来の細胞ライセート、腫瘍由来のエクソソーム、ネオアンチゲン、ウイルス抗原、細菌抗原、真菌抗原、又はワクチン接種及び/もしくは免疫療法による処置に適した疾患もしくは障害に関連する他の抗原であるか、又はそれを含む、請求項34~48のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリペプチド抗原が、SARS-CoVスパイクタンパク質又はその抗原性断片であるか、又はそれを含む、請求項34~49のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項34~50のいずれか一項に記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原、又は請求項34~50のいずれか一項に記載の方法によって生成された修飾ポリペプチド抗原を含む細胞集団と、薬学的に許容される賦形剤及び/又はアジュバントと、を含む、免疫原性組成物。
- 前記細胞集団が、樹状細胞、B細胞、T細胞、マクロファージ、遺伝子操作された抗原提示細胞、MHCクラスI発現細胞、MHCクラスII発現細胞、又はそれらの任意の組合せを含む、請求項51に記載の免疫原性組成物。
- 対象における目的の非修飾ポリペプチド抗原に対する増強された適応免疫応答を誘発する方法であって、請求項52に記載の免疫原性組成物を前記対象に投与することを含む方法。
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