JP2023542528A - Ｓｏｘ２抗原を標的とする免疫療法 - Google Patents

Ｓｏｘ２抗原を標的とする免疫療法 Download PDF

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Abstract

本開示は、例えば、がんを治療又は管理するためにＳＯＸ２抗原を標的とする組成物及び方法を提供する。提供される組成物は、ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体と結合することが可能な結合タンパク質を含む。ＳＯＸ２抗原と特異的に結合するＴ細胞受容体やキメラ抗原受容体等の結合タンパク質をコードするポリヌクレオチド及びトランスジーンコンストラクトも提供する。このようなポリヌクレオチド及びトランスジーンコンストラクトをＴ細胞等の免疫細胞に導入し、ＳＯＸ２発現若しくは活性に関連するがんを有する対象又はその危険のある対象における免疫療法で使用することができる。本開示は、ＳＯＸ２抗原を含む免疫原性組成物と、関連用途も提供する。

Description

多発性骨髄腫を含む種々の悪性腫瘍は、臨床アウトカムが不良であり、標準治療後に疾患が再発すると、予後が極めて不良になる。標準治療レジメンとしては、外科療法、放射線療法、及び／又は化学療法が採用されているが、これらのアプローチは全ての患者に奏効する訳ではなく、毒性を伴う可能性もある。そのため、治療が困難ながんを標的とする新規なストラテジーが必要とされている。本開示はこのような必要性に取り組み、更に他の関連する利点も提供する。
ゴルジプラグとゴルジブロックの存在下に、１μｇ／ｍｌのＳＯＸ２ペプチド、培地、又は細胞刺激カクテルで４時間刺激後に、ＳＯＸ２に反応性であった典型的なＣＤ８＋Ｔ細胞株（上段）と、ＳＯＸ２に非反応性であった典型的なＣＤ８＋Ｔ細胞株（下段）におけるＩＦＮ－γ産生Ｔ細胞の百分率を示すフローサイトメトリープロットを提供する。データは、３ラウンド刺激後の１０～１４日目からのものである。 ＳＯＸ２反応性で且つＨＬＡ－Ａ＊０２：０１拘束性であった典型的なＣＤ８＋Ｔ細胞株に由来するＩＦＮ－γ産生Ｔ細胞の百分率を示すフローサイトメトリープロットを提供する。データは、ゴルジプラグとゴルジブロックの存在下に、１μｇ／ｍｌのＳＯＸ２ペプチド、培地、又はＳＯＸ２ペプチド若しくは培地をプレロードしたＴ２細胞で４時間３ラウンド刺激後の１０～１４日目のものである。 （指定した）６種類の異なるＳＯＸ２ペプチドに応答したＣＤ８＋Ｔ細胞株におけるＩＦＮ－γ産生Ｔ細胞の百分率を示すフローサイトメトリープロットを提供する。 標準プロテアソーム（２９３Ｅ－ＳＰ）又は免疫プロテアソーム（２９３Ｅ－ＩＰ）を発現するように改変された２９３Ｅ標的細胞がＳＯＸ２を発現することを示すデータを提供する。 実施例に記載するような、標識ＳＯＸ２＋２９３Ｅ標的細胞を使用する殺傷アッセイ（ＩｎｃｕＣｙｔｅ）の実験機構を示す模式図を提供する。 ＳＯＸ２（２７７－２８７）エピトープとＳＯＸ２（５８－６６）エピトープが標準プロテアソーム（ＳＰ）によりプロセシングされることを示すＩｎｃｕＣｙｔｅ殺傷アッセイからのデータを提供する。ウェルをＩｎｃｕＣｙｔｅ Ｓ３システムで２日間に渡ってイメージングし、ＲａｐｉｄＲｅｄ＋カスパーゼ３／７緑色＋標的細胞の量を定量した。 ＳＯＸ２（２７７－２８７）エピトープとＳＯＸ２（５８－６６）エピトープが免疫プロテアソーム（ＩＰ）によりプロセシングされることを示すＩｎｃｕＣｙｔｅ殺傷アッセイからのデータを提供する。ウェルをＩｎｃｕＣｙｔｅ Ｓ３システムで２日間に渡ってイメージングし、ＲａｐｉｄＲｅｄ＋カスパーゼ３／７緑色＋標的細胞の量を定量した。 ＳＯＸ２（２７７－２８７）特異的Ｔ細胞がＳＯＸ２＋形質細胞性白血病細胞を殺傷することを示すＩｎｃｕＣｙｔｅ殺傷アッセイからのデータを提供する。ウェルをＩｎｃｕＣｙｔｅ Ｓ３システムで２日間に渡ってイメージングし、ＲａｐｉｄＲｅｄ＋カスパーゼ３／７緑色＋標的細胞の量を定量した。 ＳＯＸ２（２７７－２８７）特異的Ｔ細胞がＳＯＸ２＋卵巣がん細胞を殺傷することを示すＩｎｃｕＣｙｔｅ殺傷アッセイからのデータを提供する。ウェルをＩｎｃｕＣｙｔｅ Ｓ３システムで２日間に渡ってイメージングし、ＲａｐｉｄＲｅｄ＋カスパーゼ３／７緑色＋標的細胞の量を定量した。 ＳＯＸ２特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞を選別するために使用したペプチド：ＨＬＡ四量体ゲーティングアッセイからのデータを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ａは、ＳＯＸ２ペプチドプールに応答するＣＤ８＋Ｔ細胞株によるＩＦＮ－γ産生を評価するための実験スキーム（上段）と、代表的なデータ（下段）を示す 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｂは、一定の濃度範囲のＳＯＸ２ペプチドに応答するＣＤ８＋Ｔ細胞株によるＩＦＮ－γ産生を評価するための実験スキームを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｃ及び１１Ｄは、図１１Ｂに示した実験スキームを使用して所定のＴ細胞株から得られたデータを示す 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｃ及び１１Ｄは、図１１Ｂに示した実験スキームを使用して所定のＴ細胞株から得られたデータを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｅは、ＳＯＸ２ペプチドをパルスしたＴ２細胞に応答するＣＤ８＋Ｔ細胞株によるＩＦＮ－γ産生を評価するための実験スキームを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｆは、図１１Ｅに示した実験スキームを使用して所定のＴ細胞株から得られたデータを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｇは、ＳＯＸ２ペプチドの存在下で増殖させたＣＤ８＋Ｔ細胞における（活性化の尺度としての）ＣＤ１３７発現を評価するための実験スキームを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｈは、図１１Ｇに示した実験スキームを使用してＴ細胞株から得られたデータを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｉは、ＩｎｃｕＣｙｔｅ（Ｒ）殺傷アッセイで標識Ｌ３６３標的細胞を使用してＳＯＸ２ペプチドの存在下で増殖させたＣＤ８＋Ｔ細胞株による殺傷活性を評価するための実験スキームを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｊは、図１１Ｉに示した実験スキームを使用して所定のＴ細胞株から得られたデータを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｋは、Ｌ３６３細胞をヒト化マウスモデルに注入するための実験スキームを示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｌは、２種類の用量のＬ３６３細胞を移植したヒト化マウスと、細胞を移植しないヒト化マウスの経時的生存率を示す。 図１１Ａ～１１Ｍは、本開示に係る典型的なＳＯＸ２特異的Ｔ細胞に関連する追加データ及び実験デザインと、その使用例を提供する。図１１Ｍは、インビボ（マウス３匹）又はインビトロでのＬ３６３細胞における安定なＳＯＸ２発現を示す。 所定のＳＯＸ２ ２７７－２８７特異的ＴＣＲの機能的アビディティ（ペプチド抗原ｌｏｇＥＣ５０）を示す。「ＴＣＲ２」は、配列番号３０のＶαアミノ酸配列と、配列番号２５のＶβアミノ酸配列を含む。「ＴＣＲ４」は、配列番号４２のＶαアミノ酸配列と、配列番号３７のＶβアミノ酸配列を含む。「ＴＣＲ５」は、配列番号５４のＶαアミノ酸配列と、配列番号４９のＶβアミノ酸配列を含む。「ＴＣＲ６」は、配列番号６６のＶαアミノ酸配列と、配列番号６１のＶβアミノ酸配列を含む。「ＴＣＲ９」は、配列番号９０のＶαアミノ酸配列と、配列番号８５のＶβアミノ酸配列を含む。「ＴＣＲ１０」は、配列番号１０２のＶαアミノ酸配列と、配列番号９７のＶβアミノ酸配列を含む。「ＴＣＲ１１」は、配列番号１１４のＶαアミノ酸配列と、配列番号１０９のＶβアミノ酸配列を含む。「ＴＣＲ１３」は、配列番号１２６のＶαアミノ酸配列と、配列番号１２１のＶβアミノ酸配列を含む。 内在的にプロセシング・提示されたＳＯＸ２エピトープのＴ細胞による認識を試験する終夜Ｔ細胞：腫瘍細胞共培養の機構を示す模式図である。 図１４及び１４Ａ～１４Ｄは、ＳＯＸ２＋腫瘍細胞株に応答するＴＣＲ５又はＴＣＲ１０を導入したＴ細胞の認識（ＣＤ１３７を発現するＴ細胞の百分率）を示す。図１４Ａ～１４Ｄは、図１４の各部分の拡大図を示す。 図１４及び１４Ａ～１４Ｄは、ＳＯＸ２＋腫瘍細胞株に応答するＴＣＲ５又はＴＣＲ１０を導入したＴ細胞の認識（ＣＤ１３７を発現するＴ細胞の百分率）を示す。図１４Ａ～１４Ｄは、図１４の各部分の拡大図を示す。 図１４及び１４Ａ～１４Ｄは、ＳＯＸ２＋腫瘍細胞株に応答するＴＣＲ５又はＴＣＲ１０を導入したＴ細胞の認識（ＣＤ１３７を発現するＴ細胞の百分率）を示す。図１４Ａ～１４Ｄは、図１４の各部分の拡大図を示す。 図１４及び１４Ａ～１４Ｄは、ＳＯＸ２＋腫瘍細胞株に応答するＴＣＲ５又はＴＣＲ１０を導入したＴ細胞の認識（ＣＤ１３７を発現するＴ細胞の百分率）を示す。図１４Ａ～１４Ｄは、図１４の各部分の拡大図を示す。 図１４及び１４Ａ～１４Ｄは、ＳＯＸ２＋腫瘍細胞株に応答するＴＣＲ５又はＴＣＲ１０を導入したＴ細胞の認識（ＣＤ１３７を発現するＴ細胞の百分率）を示す。図１４Ａ～１４Ｄは、図１４の各部分の拡大図を示す。
詳細な説明
本開示は一般には、ＳＯＸ２抗原と、ＳＯＸ２抗原に特異的な結合タンパク質及び免疫細胞（例えば、Ｔ細胞）に関する。背景として、がんによっては免疫療法が有効であると考えられる。例えば、ＣＤ１９を標的とするキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を用いて遺伝子改変した治療用Ｔ細胞が臨床試験で急性リンパ球性白血病（ＡＬＬ）に対して評価され、優れた結果が得られたことから例証されるように、Ｔ細胞免疫療法は造血器悪性腫瘍に非常に有効であると考えられる。しかし、抗体（例えば、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ）に由来する結合ドメインを含むＣＡＲは、標的とする細胞表面発現分子が限られる場合があり、疾患特異的発現パターンを有する（即ち、健康な細胞と組織では発現されない）標的細胞表面抗原を同定することは、難題であると思われる。その他の免疫療法ストラテジーとしては、内在性細胞タンパク質に由来し、ＨＬＡ分子と共に細胞表面に提示されるペプチド抗原に特異的なＴ細胞受容体（人工ＴＣＲを含むＴＣＲ）を天然で発現するか、又は発現するように改変されたＴ細胞を投与又は誘導する方法が挙げられる。
免疫療法が有効であるためには、適切な抗原標的を選択することが重要である。細胞表面抗原（例えば、多発性骨髄腫におけるＣＤ１９、ＢＣＭＡ、又はＣＤ１３８）は、治療後に発現が低下することが多く、抗原に対して低値又は陰性の細胞が増殖し、疾患が再発する可能性がある。したがって、免疫療法の成功に繋がる抗原標的としては、腫瘍で選択的に発現されるもの、疾患集団に非常に多く存在し、広く発現されるＨＬＡ対立遺伝子により提示されるものであり、悪性表現型の誘導又は維持に関与するものが挙げられる。
本開示は、ＳＯＸ２が、がん免疫療法のこのような候補抗原標的の１種であることを教示する。本開示は、一面において、免疫細胞応答を誘導することが可能であり、例えば、多発性骨髄腫、形質細胞性白血病、卵巣がん、神経膠腫、肺がん、頸部がん、及び子宮頸がん等の所定のがんで発現されるＳＯＸ２に由来する抗原ペプチドを提供する。
所定の実施形態において、前記抗原ペプチドは、所定の非造血器悪性腫瘍でがん細胞により使用される標準プロテアソーム（ＳＰ）プロセシング経路を介すると共に、所定の造血器がんでがん細胞により使用されるが、固形腫瘍細胞では使用頻度が低いか、又は全く使用されない免疫プロテアソーム（ＩＰ）プロセシング経路を介して予想外に有利にプロセシングされる。
したがって、ある種の実施形態において、前記抗原ペプチドは、悪性腫瘍細胞がＳＰプロセシング、ＩＰプロセシング、又はその両方のいずれを利用するかに関係なく、各種悪性腫瘍を標的とするのに有用である。
本開示は更に、（例えば、ペプチド：ＨＬＡ複合体における）ＳＯＸ２抗原と結合することが可能な結合タンパク質も提供する。前記結合タンパク質は、（例えば、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞）等の宿主細胞により発現される場合に）（例えば、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１等のＨＬＡ分子との複合体における）このような抗原を提示する細胞と結合してその殺傷を促進することが可能である。ある種の実施形態において、結合は、本願に開示する特異的結合を含む。本開示は更に、ＳＯＸ２抗原を含むペプチドと、結合タンパク質をコードする単離ポリヌクレオチドとに結合することが可能なＳＯＸ２特異的結合タンパク質をコードし、このようなタンパク質を発現することが可能な宿主細胞（例えば、Ｔ細胞等の免疫細胞）を提供する。所定の実施形態では、本開示のＳＯＸ２抗原を含むペプチドと結合することが可能な結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む改変免疫細胞と、特に、疾患（例えば、がん）の治療、免疫応答の誘導、又は抗原反応性細胞の同定における本願に開示する組成物の使用が提供される。
本願に開示する結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、組成物、及び方法は、固形腫瘍、造血器悪性腫瘍、又はその両方を治療するために有用である。所定の実施形態において、本願に開示する結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、組成物、及び方法は、がん細胞がＳＯＸ２と標準プロテアソームを発現するがん、又はがん細胞がＳＯＸ２と免疫プロテアソームを発現するがん、又はがん細胞がＳＯＸ２と標準プロテアソームと免疫プロテアソームを発現するがんを治療するために有用である。
本開示をより詳細に説明する前に、本願で使用する所定の用語の定義を提供することが本開示を理解するのに役立つと思われる。他の定義も本開示の随所に記載する。
本願の記載において、全濃度範囲、百分率範囲、比の範囲又は整数範囲は、特に指定しない限り、明記する範囲内の全整数値と、適切な場合にはその分数（例えばある整数の１０分の１や１００分の１）を含むものと理解すべきである。また、ポリマーサブユニット、サイズ又は厚さ等の全物理的特徴に関して本願中に明記する全数値範囲は、特に指定しない限り、明記する範囲内の全整数を含むものと理解すべきである。本願で使用する「約」なる用語は、特に指定しない限り、指定範囲、数値又は構造の±２０％を意味する。本願で使用する不定冠詞は、列挙する要素の「１以上」を意味すると理解すべきである。選択肢（例えば、「又は」）の使用は、その選択肢のいずれか一方、両方、又は任意のその組み合わせを意味すると理解すべきである。本願で使用する「包含する」、「有する」、及び「含む」なる用語は、同義に使用され、これらの用語とその変形は、非限定的に解釈すべきである。
更に、本願に記載する構造及び置換基の種々の組み合わせにより得られる個々の化合物又は化合物群は、各化合物又は化合物群が個々に記載されている場合と同程度まで本願により開示されていると理解すべきである。したがって、特定構造又は特定置換基の選択が本開示の範囲内に含まれる。
「から本質的に構成される」なる用語は、「含む」と等価ではなく、請求する指定材料又は工程を意味し、あるいは、請求する保護対象の基本的特徴に実質的に影響を与えない材料又は工程を意味する。例えば、タンパク質ドメイン、領域、若しくはモジュール（例えば、結合ドメイン、ヒンジ領域、リンカーモジュール）又は（１個以上のドメイン、領域、若しくはモジュールを有することができる）タンパク質は、ドメイン、領域、モジュール又はタンパク質のアミノ酸配列が、合計でドメイン、領域、モジュール、又はタンパク質の長さの最大２０％（例えば、最大１５％、１０％、８％、６％、５％、４％、３％、２％又は１％）に寄与し、前記ドメイン、領域、モジュール、又はタンパク質の活性（例えば、結合タンパク質の標的結合親和性）に実質的に影響を与えない（即ち、活性の低下が５０％を超えない、例えば４０％以下、３０％以下、２５％以下、２０％以下、１５％以下、１０％以下、５％以下、又は１％以下となるような）延長、欠失、突然変異、又はその組み合わせ（例えば、アミノ末端若しくはカルボキシ末端又はドメイン間のアミノ酸）を含むときに、特定のアミノ酸配列「から本質的に構成される」。
本願で使用する「タンパク質」又は「ポリペプチド」とは、アミノ酸残基のポリマーを意味する。タンパク質としては、天然アミノ酸ポリマーに加え、１個以上のアミノ酸残基が対応する天然アミノ酸及び非天然アミノ酸ポリマーの人工化学的ミメティックであるアミノ酸ポリマーも含める。
「免疫グロブリンスーパーファミリー結合タンパク質」又は「ＩｇＳＦ結合タンパク質」とは、標的（例えば、細胞、抗原、可溶性因子）の認識、標的との結合及び／又は接着に関与し、１個以上の免疫グロブリンドメイン及び／又は免疫グロブリン折り畳みを含む細胞表面又は可溶性タンパク質を意味する。本開示のＩｇＳＦ結合タンパク質は、（任意のアイソタイプの）抗体若しくはその抗原結合断片又はＴ細胞受容体若しくはその抗原結合断片に存在するような可変ドメイン又は可変領域（例えば、ＩｇＶ領域）等の抗原認識ドメインを含む。ＩｇＳＦタンパク質は、標的に対する天然の結合特異性を有することができ、あるいは、標的に対する結合特異性及び／又は親和性を有するように又は強化するように工学的に作製することができる。本開示で使用される他のＩｇＳＦタンパク質としては、例えば、ＩｇＣ１ドメイン、ＩｇＣ２ドメイン、及び／又はＩｇＩドメインを含むタンパク質、キラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）、白血球免疫グロブリン様受容体（ＬＩＬＲ）、細胞接着分子（ＣＡＭ）、並びにこれらの組み合わせが挙げられる。
本願で使用する「免疫系細胞」又は「免疫細胞」なる用語は、（単球、マクロファージ、樹状細胞、巨核球及び顆粒球等の骨髄系細胞へと分化する）骨髄系前駆細胞と、（Ｔ細胞、Ｂ細胞及びナチュラルキラー（ＮＫ）細胞等のリンパ系細胞へと分化する）リンパ系前駆細胞の２種類の主要な系列へと分化する骨髄中の造血幹細胞に由来する免疫系の任意の細胞を意味する。典型的な免疫系細胞としては、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４－ＣＤ８－ダブルネガティブＴ細胞、γδＴ細胞、制御性Ｔ細胞、幹細胞メモリーＴ細胞、ナチュラルキラー細胞、ナチュラルキラーＴ細胞、及び樹状細胞が挙げられる。マクロファージと樹状細胞は、「抗原提示細胞」又は「ＡＰＣ」と呼ぶことができ、ペプチドと複合体を形成したＡＰＣの表面の主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）受容体がＴ細胞の表面のＴＣＲと相互作用するときにＴ細胞を活性化させることができる特殊な細胞である。
「Ｔ細胞」又は「Ｔリンパ球」は、胸腺で成熟してＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を産生する免疫系細胞である。Ｔ細胞は、ナイーブＴ細胞（「ＴＮ」）（（抗原に曝露されたことがなく、（本願に記載する）ＴＣＭに比較してＣＤ６２Ｌ、ＣＣＲ７、ＣＤ２８、ＣＤ３、ＣＤ１２７、及びＣＤ４５ＲＡの発現が亢進し、ＣＤ４５ＲＯの発現が低下又は消失している）、幹細胞メモリーＴ細胞を含むメモリーＴ細胞（ＴＭ）（抗原に曝露され、寿命が長い）、及びエフェクター細胞（抗原に曝露され、細胞傷害性）とすることができる。ＴＭは更に、セントラルメモリーＴ細胞（ＴＣＭと呼ばれ、ＣＤ６２Ｌ、ＣＣＲ７、ＣＤ２８、ＣＤ９５、ＣＤ４５ＲＯ、及びＣＤ１２７を発現する）と、エフェクターメモリーＴ細胞（ＴＥＭと呼ばれ、ＣＤ４５ＲＯを発現し、ＣＤ６２Ｌ、ＣＣＲ７、ＣＤ２８、及びＣＤ４５ＲＡの発現が低下している）のサブセットに分類することができる。エフェクターＴ細胞（ＴＥ）とは、抗原に曝露され、ＣＤ４５ＲＡを発現し、ＴＣＭに比較してＣＤ６２Ｌ、ＣＣＲ７、及びＣＤ２８の発現が低下しており、グランザイムとパーフォリンに陽性であるＣＤ８＋細胞傷害性Ｔリンパ球を意味する。ヘルパーＴ細胞（ＴＨ）は、サイトカインを放出することにより他の免疫細胞の活性に影響を与えるＣＤ４＋細胞である。ＣＤ４＋Ｔ細胞は、適応免疫応答を活性化することと、抑制することができ、これらの２種類の機能のどちらが誘導されるかは、他の細胞及びシグナルの存在によって異なる。Ｔ細胞は公知技術を使用して採取することができ、抗体との親和性結合、フローサイトメトリー、又は免疫磁気選択等の公知技術により、各種亜集団又はその組み合わせを集積又は減少させることができる。他の典型的なＴ細胞としては、ＣＤ４＋ＣＤ２５＋（Ｆｏｘｐ３＋）制御性Ｔ細胞やＴｒｅｇ１７細胞等の制御性Ｔ細胞に加え、Ｔｒ１、Ｔｈ３、ＣＤ８＋ＣＤ２８－、及びＱａ－１拘束性Ｔ細胞が挙げられる。
「Ｔ細胞受容体」（ＴＣＲ）なる用語は、ＭＨＣ受容体と結合した抗原ペプチドと特異的に結合することが可能な免疫グロブリンスーパーファミリーメンバーを意味する（可変結合ドメイン、定常ドメイン、膜貫通領域、及び短い細胞質テールを有する；例えば、Ｊａｎｅｗａｙ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｂｉｏｌｏｇｙ：Ｔｈｅ Ｉｍｍｕｎｅ Ｓｙｓｔｅｍ ｉｎ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｄｉｓｅａｓｅ，３ｒｄ Ｅｄ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ｐ．４３３，１９９７参照）。ＴＣＲは、細胞の表面に存在することもできるし、可溶性形態で存在することもでき、一般に、αポリペプチドとβポリペプチド（それぞれＴＣＲα及びＴＣＲβとも言う）、又はγポリペプチドとδポリペプチド（それぞれＴＣＲγ及びＴＣＲδとも言う）のヘテロダイマーから構成される。
他の免疫グロブリン（例えば、抗体）と同様に、ＴＣＲポリペプチド（例えば、αポリペプチド、βポリペプチド）の細胞外部分は、２個の免疫グロブリンドメイン、即ちＮ末端の可変ドメイン（例えば、一般的にカバットナンバリング（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，“Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，”ＵＳ Ｄｅｐｔ．Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，１９９１，５ｔｈ ｅｄ．）による１～１１６位のアミノ酸から成るαポリペプチド可変ドメイン若しくはＶαポリペプチド又はＶβポリペプチド）と、細胞膜に隣接する１個の定常ドメイン（例えば、一般的にカバットによる１１７～２５９位の５アミノ酸から成るα鎖定常ドメイン又はＣα、一般的にカバットによる１１７～２９５位のアミノ酸から成るβ鎖定常ドメイン又はＣβ）を含む。また、抗体と同様に、可変ドメインは、フレームワーク領域（ＦＲ）により相互に分離された相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む（例えば、Ｊｏｒｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：９１３８，１９９０；Ｃｈｏｔｈｉａ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．７：３７４５，１９８８参照；Ｌｅｆｒａｎｃ ｅｔ ａｌ．，Ｄｅｖ．Ｃｏｍｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２７：５５，２００３も参照）。本開示で使用するＴＣＲの資源は、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、又は他の哺乳動物等の種々の動物種のいずれに由来するものでもよい。
「可変領域」又は「可変ドメイン」なる用語は、免疫グロブリンスーパーファミリー結合タンパク質（例えば、ＴＣＲαポリペプチド又はβポリペプチド（又はγδＴＣＲでは、γポリペプチドとδポリペプチド））のドメインであって、前記免疫グロブリンスーパーファミリー結合タンパク質（例えば、ＴＣＲ、抗体）と抗原の結合に関与するドメインを意味する。天然ＴＣＲのαポリペプチド及びβポリペプチドの可変ドメイン（それぞれＶα及びＶβ）は、一般に類似の構造であり、各ドメインは、４個の保存されたフレームワーク領域（ＦＲ）と３個のＣＤＲを含む。Ｖαドメインは、可変遺伝子セグメントと結合遺伝子セグメント（Ｖ－Ｊ）の２個の別個のＤＮＡセグメントによりコードされ、Ｖβドメインは、可変遺伝子セグメントと多様性遺伝子セグメントと結合遺伝子セグメント（Ｖ－Ｄ－Ｊ）の３個の別個のＤＮＡセグメントによりコードされる。抗原結合特異性を付与するためには１個のＶαドメイン又はＶβドメインで十分であると思われる。更に、特定の抗原と結合するＴＣＲは、前記抗原と結合するＴＣＲに由来するＶαドメイン又はＶβドメインを使用してそれぞれ相補的Ｖαドメイン又はＶβドメインのライブラリーをスクリーニングすることにより、単離することができる。
「相補性決定領域」及び「ＣＤＲ」なる用語は、「超可変領域」又は「ＨＶＲ」と同義であり、当技術分野で公知であり、抗原特異性及び／又は結合親和性を付与し、フレームワーク領域により相互に分離された免疫グロブリン（例えば、ＴＣＲ）可変領域内のアミノ酸の配列を意味する。一般に、各ＴＣＲαポリペプチド可変領域に３個のＣＤＲ（αＣＤＲ１、αＣＤＲ２、αＣＤＲ３）が存在し、各ＴＣＲβポリペプチド可変領域に３個のＣＤＲ（βＣＤＲ１、βＣＤＲ２、βＣＤＲ３）が存在する。（重鎖のみの抗体を除く）抗体の場合には、重鎖可変領域と軽鎖可変領域の両方が存在し、これらの各々が３個のＣＤＲ（ＣＤＲＨ１、ＣＤＲＨ２、ＣＤＲＨ３、ＣＤＲＬ１、ＣＤＲＬ２、ＣＤＲＬ３）を含む。
ＴＣＲにおいて、プロセシングされた抗原の認識を担う主要なＣＤＲはＣＤＲ３であると考えられる。一般的に、ＣＤＲ１とＣＤＲ２は主にＭＨＣと相互作用する。
ＣＤＲ１とＣＤＲ２は、ＴＣＲ可変領域コーディング配列の可変遺伝子セグメント内でコードされ、ＣＤＲ３は、Ｖαでは可変セグメントと結合セグメントに跨る領域によりコードされ、Ｖβでは可変セグメントと多様性セグメントと結合セグメントに跨る領域によりコードされる。したがって、Ｖα又はＶβの可変遺伝子セグメントが分かっている場合には、それらの対応するＣＤＲ１及びＣＤＲ２の配列を推定することができる。ＣＤＲ１とＣＤＲ２に比較して、ＣＤＲ３は、組換え過程におけるヌクレオチドの増減により、一般的に著しく多様性である。一般的に、ＴＣＲにおけるＣＤＲ３βと、抗体におけるＣＤＲＨ３がこれに該当する。
ＴＣＲ及び抗体可変ドメイン配列をナンバリングスキーム（例えば、Ｋａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ、Ｅｎｈａｎｃｅｄ Ｃｈｏｔｈｉａ、ＥＵ、ＩＭＧＴ、及びＡｈｏ）と整列させると、等価残基位置に注釈を付けることができ、例えば、ＡＮＡＲＣＩソフトウェアツール（２０１６，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ １５：２９８－３００）を使用して種々の分子を比較することができる。ナンバリングスキームは、ＴＣＲ可変ドメインにおけるフレームワーク領域とＣＤＲの標準化区分を提供する。所定の実施形態において、可変ドメイン配列は、ＩＭＧＴナンバリングスキームに従う（Ｌｅｆｒａｎｃ ｅｔ ａｌ．，Ｄｅｖ．Ｃｏｍｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２７：５５，２００３及びｉｍｇｔ．ｏｒｇ参照）。ある種の実施形態において、ＴＣＲのＣＤＲ配列（アミノ酸又はコーディングヌクレオチド）は、Ｖ対立遺伝子とＪ対立遺伝子のジャンクション又はＶ対立遺伝子とＤ対立遺伝子のジャンクション又はＤ対立遺伝子とＪ対立遺伝子のジャンクションでコードされる配列（アミノ酸又はコーディングヌクレオチド）を含む。ＩＭＧＴジャンクションは、当技術分野における通常の知識を有する者により認識される。例えば、配列番号２５に記載のＴＣＲＶβ配列であるＤＶＫＶＴＱＳＳＲＹＬＶＫＲＴＧＥＫＶＦＬＥＣＶＱＤＭＤＨＥＮＭＦＷＹＲＱＤＰＧＬＧＬＲＬＩＹＦＳＹＤＶＫＭＫＥＫＧＤＩＰＥＧＹＳＶＳＲＥＫＫＥＲＦＳＬＩＬＥＳＡＳＴＮＱＴＳＭＹＬＣＡＳＳＬＩＬＡＧＲＮＴＧＥＬＦＦＧＥＧＳＲＬＴＶＬＥにおいて、ＩＭＧＴＣＤＲ３アミノ酸配列は、ＡＳＳＬＩＬＡＧＲＮＴＧＥＬＦ（配列番号２８）であり、ジャンクションアミノ酸を含むＩＭＧＴＣＤＲ３アミノ酸配列は、ＣＡＳＳＬＩＬＡＧＲＮＴＧＥＬＦＦ（配列番号２９）である。本願に開示する所定のＣＤＲ配列は、ジャンクションアミノ酸を含む。
所定の実施形態において、ＴＣＲは、Ｔ細胞（又はＴリンパ球）の表面に存在し、ＣＤ３複合体と会合する。「ＣＤ３」は、Ｔ細胞における抗原シグナル伝達に関連する６ポリペプチドの多タンパク質複合体である（Ａｂｂａｓ ａｎｄ Ｌｉｃｈｔｍａｎ，２００３；Ｊａｎｅｗａｙ ｅｔ ａｌ．，ｐ．１７２及び１７８，１９９９参照）。哺乳動物において、前記複合体は、ＣＤ３γ鎖と、ＣＤ３δポリペプチドと、２個のＣＤ３εポリペプチドと、ＣＤ３ζポリペプチドのホモダイマーを含む。前記ＣＤ３γ、ＣＤ３β、及びＣＤ３εポリペプチドは、単一の免疫グロブリンドメインを含む免疫グロブリンスーパーファミリーの相互に関連する細胞表面タンパク質である。前記ＣＤ３γ、ＣＤ３β、及びＣＤ３εポリペプチドの膜貫通領域は負に帯電しているため、正に帯電しているＴ細胞受容体ポリペプチドとこれらのポリペプチドを会合させることができると考えられている。前記ＣＤ３γ、ＣＤ３β、及びＣＤ３εポリペプチドの細胞内テールは、各々免疫受容体チロシン活性化モチーフ又はＩＴＡＭと呼ばれる単一の保存されたモチーフを含み、各ＣＤ３ζ鎖は３個のＩＴＡＭを有する。理論に拘束する意図はないが、ＴＣＲ複合体のシグナル伝達能にはＩＴＡＭが重要であると考えられる。本開示で使用するＣＤ３は、ヒト、マウス、ラット、又は他の哺乳動物を含む種々の動物種に由来することができる。
本願で使用する「ＴＣＲ複合体」なる用語は、ＣＤ３とＴＣＲの会合により形成される複合体を意味する。例えば、ＴＣＲ複合体は、ＣＤ３γポリペプチドと、ＣＤ３βポリペプチドと、２個のＣＤ３εポリペプチドと、ＣＤ３ζポリペプチドのホモダイマーと、ＴＣＲαポリペプチドと、ＴＣＲβポリペプチドから構成することができる。あるいは、ＴＣＲ複合体は、ＣＤ３γ鎖と、ＣＤ３β鎖と、２本のＣＤ３ε鎖と、ＣＤ３ζ鎖のホモダイマーと、ＴＣＲγ鎖と、ＴＣＲβ鎖から構成することができる。
本願で使用する「ＴＣＲ複合体のコンポーネント」とは、ＴＣＲ鎖（即ち、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＴＣＲγ又はＴＣＲδ）、ＣＤ３鎖（即ち、ＣＤ３γ、ＣＤ３δ、ＣＤ３ε又はＣＤ３ζ）、又は２個以上のＴＣＲポリペプチド若しくはＣＤ３ポリペプチドにより形成される複合体（例えば、ＴＣＲαとＴＣＲβの複合体、ＴＣＲγとＴＣＲδの複合体、ＣＤ３εとＣＤ３δの複合体、ＣＤ３γとＣＤ３εの複合体、又はＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＣＤ３γ、ＣＤ３δ、及び２個のＣＤ３εポリペプチドのサブＴＣＲ複合体）を意味する。
「キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）」とは、天然では生じない方法又は宿主細胞に天然では生じない方法で相互に連結された２個以上の天然アミノ酸配列を含むように工学的に作製された融合タンパク質を意味し、前記融合タンパク質は、細胞の表面に存在するときに受容体として機能することができる。ＣＡＲは、（例えば、がん抗原に特異的なＴＣＲから入手若しくは取得されるＴＣＲ結合ドメインや、抗体から入手又は取得されるｓｃＦｖや、ＮＫ細胞に由来するキラー免疫受容体から入手又は取得される抗原結合ドメインのように、免疫グロブリン又は免疫グロブリン様分子から取得又は入手される）抗原結合ドメインを含む細胞外部分を膜貫通ドメインと、（任意に共刺激ドメインを含む）１個以上の細胞内シグナル伝達ドメインとに連結したものとすることができる（例えば、Ｓａｄｅｌａｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｄｉｓｃｏｖ．，３（４）：３８８（２０１３）参照；Ｈａｒｒｉｓ ａｎｄ Ｋｒａｎｚ，Ｔｒｅｎｄｓ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｓｃｉ．，３７（３）：２２０（２０１６），Ｓｔｏｎｅ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．，６３（１１）：１１６３（２０１４）、及びＷａｌｓｅｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｒｅｐｏｒｔｓ ７：１０７１３（２０１７）も参照でき、ＣＡＲコンストラクトとその作製方法を本願に援用する）。ある種の実施形態において、（例えば、ペプチド：ＨＬＡ複合体における）抗原と特異的に結合する本開示のＣＡＲは、ＴＣＲＶαドメインとＶβドメインを含む。
本願で使用する「融合タンパク質」又は「融合ポリペプチド」とは、少なくとも２個の別個のドメイン、配列、モチーフを単一鎖に有するタンパク質を意味し、前記ドメイン、配列、又はモチーフは、タンパク質に天然では（例えば、特定の配置、順序、若しくは数、又は全てにおいて）共存しない。所定の実施形態において、融合タンパク質は、単一のペプチド又はポリペプチドに天然では共存しない少なくとも２個の別個のドメイン又はモチーフを含む。融合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、ＰＣＲを使用して作製することもできるし、組換えにより工学的に作製することもできるし、このような融合タンパク質を合成することもできる。
本願で使用する「抗原」又は「Ａｇ」とは、免疫応答を誘導する免疫原性分子を意味する。この免疫応答は、抗体産生、特定の免疫担当細胞（例えば、Ｔ細胞）の活性化、又はその両方を含むことができる。抗原（免疫原性分子）は、例えば、ペプチド、糖ペプチド、ポリペプチド、糖ポリペプチド、ポリヌクレオチド、多糖、脂質等とすることができる。当然のことながら、抗原は、合成することもできるし、組換え生産することもできるし、生体試料から入手することもできる。１種以上の抗原を含有する可能性のある典型的な生体試料としては、組織試料、腫瘍試料、細胞、体液、又はその組み合わせが挙げられる。抗原は、抗原を発現するように改変又は遺伝子工学的に作製された細胞により産生させることもできるし、免疫原性の突然変異又は多形を（例えば、人的介入による改変又は遺伝子工学的操作を介さずに）内在的に発現する細胞により産生させることもできる。
「エピトープ」又は「抗原エピトープ」なる用語は、免疫グロブリン、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）、キメラ抗原受容体、又は他の結合分子、ドメイン若しくはタンパク質等のコグネイト結合分子により認識され、特異的に結合された任意の分子、構造、アミノ酸配列又はタンパク質決定基を含む。エピトープ決定基は、一般に、アミノ酸や糖側鎖等の化学的に活性な表面分子群を含み、特定の三次元構造特性と特定の電荷特性を有することができる。
「ＳＯＸ２」は、当技術分野で「ＳＲＹ－２」及び「性別決定領域Ｙ」とも呼ばれ、未分化胚性幹細胞の自己再生、胚性幹細胞及び神経幹細胞の維持、並びに所定のがんの悪性表現型に関与する転写因子である。ＳＯＸ２は、共通して約８０アミノ酸の高移動度群（ＨＭＧ）ボックスドメインを有するＳｏｘファミリー転写因子のメンバーである。ヒトＳＯＸ２のアミノ酸配列を配列番号１に示す。
本願で使用する「ＳＯＸ２抗原」なる用語は、約７アミノ酸～約２５アミノ酸長、又はそれ以上のＳＯＸ２タンパク質の天然生産又は合成生産されたペプチドを意味する。ある種の実施形態において、ＳＯＸ２抗原は、約９アミノ酸長、約１０アミノ酸長、約１１アミノ酸長、約１２アミノ酸長、約１３アミノ酸長、約１４アミノ酸長、約１５アミノ酸長、約１６アミノ酸長、約１７アミノ酸長、約１８アミノ酸長、約１９アミノ酸長、約２０アミノ酸長、約２１アミノ酸長、約２２アミノ酸長、約２３アミノ酸長、約２４アミノ酸長、約２５アミノ酸長、約３０アミノ酸長、約３５アミノ酸、又はそれ以上を含む。ある種の実施形態において、ＳＯＸ２抗原は、９アミノ酸長、１０アミノ酸長、１１アミノ酸長、１２アミノ酸長、１３アミノ酸長、１４アミノ酸長、１５アミノ酸長、１６アミノ酸長、１７アミノ酸長、１８アミノ酸長、１９アミノ酸長、２０アミノ酸長、２１アミノ酸長、２２アミノ酸長、２３アミノ酸長、２４アミノ酸長、又は２５アミノ酸長を含む。所定の実施形態において、「ＳＯＸ２抗原」は、「ＳＯＸ２ペプチド」又は「ＳＯＸ２抗原ペプチド」又は「ＳＯＸ２ペプチド抗原」と同義に使用される。ある種の実施形態において、ＳＯＸ２抗原は、配列番号２、３、４、５、６、若しくは７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される。配列番号２、３、４、５、６、若しくは７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される基準ＳＯＸ２抗原の抗原性アミノ酸配列変異体も想定される。変異体は、一般的に基準ＳＯＸ２抗原と同一長であるが、基準ＳＯＸ２抗原の抗原性、ＨＬＡ適合性、並びに一般構造及び電荷特性を維持しながら、基準ＳＯＸ２抗原に比較して翻訳後修飾の１箇所以上のアミノ酸置換及び／又は変異を含むことができる。
（樹状細胞、マクロファージ、リンパ球又は他の細胞種等の）抗原提示細胞（ＡＰＣ）による抗原プロセシングと、（例えば、抗原提示に重要なＭＨＣ遺伝子の少なくとも１個の対立遺伝子を共有する）免疫適合性ＡＰＣとＴ細胞の間の主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）拘束性提示を含むＡＰＣによるＴ細胞への抗原提示の原理は確立している（例えば、Ｍｕｒｐｈｙ，Ｊａｎｅｗａｙ’ｓ Ｉｍｍｕｎｏｂｉｏｌｏｇｙ（８ｔｈ Ｅｄ．）２０１１ Ｇａｒｌａｎｄ Ｓｃｉｅｎｃｅ，ＮＹ；第６章、９章及び１６章参照）。例えば、サイトゾルに由来するプロセシングされた抗原ペプチド（例えば、腫瘍抗原、細胞内病原体）は、一般に約７アミノ酸～約１１アミノ酸長であり、ＭＨＣ（ＨＬＡ）クラスＩ分子と会合し、小胞系（例えば、細菌、ウイルス）でプロセシングされたペプチドは、約１０アミノ酸～約２５アミノ酸長であり、ＭＨＣ（ＨＬＡ）クラスＩＩ分子と会合する。
「主要組織適合性複合体」（ＭＨＣ）とは、ペプチド抗原を全有核細胞の細胞表面に輸送する糖タンパク質を意味する。ＭＨＣクラスＩ分子は、（３個のαドメインを有する）αポリペプチドと、非共有結合的に会合したβ２ミクログロブリンに跨る膜を有するヘテロダイマーである。ＭＨＣクラスＩＩ分子は、いずれも前記膜に跨るα及びβの２個の膜貫通糖タンパク質から構成される。各ポリペプチドは２個のドメインを有する。ＭＨＣクラスＩ分子は、サイトゾルに由来するペプチドを細胞表面に輸送し、そこで、ペプチド：ＭＨＣ複合体は、ＣＤ８＋Ｔ細胞により認識される。ＭＨＣクラスＩＩ分子は、小胞系に由来するペプチドを細胞表面に輸送し、そこで、ＣＤ４＋Ｔ細胞により認識される。ヒトＭＨＣは、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）と呼ばれる。「クラスＩ」ＭＨＣに対応するＨＬＡは、細胞の内側からペプチドを提示し、例えば、ＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、及びＨＬＡ－Ｃが挙げられる。対立遺伝子としては、例えば、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ－Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ－Ａ＊１１：０１、ＨＬＡ－Ｂ＊４０：０１、ＨＬＡ－Ｂ＊４４：０２、又はＨＬＡ－Ｂ＊４４：０３が挙げられる。「クラスＩＩ」ＭＨＣに対応するＨＬＡは、細胞の外側からペプチドを提示し、例えば、ＨＬＡ－ＤＰ、ＨＬＡ－ＤＭ、ＨＬＡ－ＤＯＡ、ＨＬＡ－ＤＯＢ、ＨＬＡ－ＤＱ、及びＨＬＡ－ＤＲが挙げられる。
本願で使用する「ＣＤ８コレセプター」又は「ＣＤ８」なる用語は、α－αホモダイマー又はα－βヘテロダイマーとしての細胞表面糖タンパク質ＣＤ８を意味する。ＣＤ８コレセプターは、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＤ８＋）の機能を補助し、その細胞質チロシンリン酸化経路を介するシグナル伝達により機能する（Ｇａｏ ａｎｄ Ｊａｋｏｂｓｅｎ，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｔｏｄａｙ ２１：６３０－６３６，２０００；Ｃｏｌｅ ａｎｄ Ｇａｏ，Ｃｅｌｌ．Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１：８１－８８，２００４）。５種類のＣＤ８βポリペプチドアイソフォーム（ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ識別子Ｐ１０９６６参照）と、１種類のＣＤ８αポリペプチド（ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ識別子Ｐ０１７３２参照）が知られている。
「ＣＤ４」は、ＴＣＲが抗原提示細胞と連絡するのを補助する免疫グロブリンコレセプター糖タンパク質である（Ｃａｍｐｂｅｌｌ ＆ Ｒｅｅｃｅ，Ｂｉｏｌｏｇｙ ９０９（Ｂｅｎｊａｍｉｎ Ｃｕｍｍｉｎｇｓ，Ｓｉｘｔｈ Ｅｄ．，２００２）参照）。ＣＤ４は、Ｔヘルパー細胞、単球、マクロファージ、及び樹状細胞等の免疫細胞の表面に存在し、細胞表面に発現される４個の免疫グロブリンドメイン（Ｄ１～Ｄ４）を含む。抗原提示中に、ＣＤ４は、ＴＣＲ複合体と共に動員され、ＭＨＣＩＩ分子の種々の領域と結合する（ＣＤ４はＭＨＣＩＩβ２と結合し、ＴＣＲ複合体はＭＨＣＩＩα１／β１と結合する）。理論に拘束する意図はないが、ＴＣＲ複合体との近接により、ＣＤ４関連キナーゼ分子が、ＣＤ３の細胞質ドメインに存在する免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）をリン酸化できると考えられる。この活性は、各種Ｔヘルパー細胞を産生するように、活性化されたＴＣＲにより発生されるシグナルを増幅すると考えられる。
本願中で特に異なる定義を示さない限り、抗体技術分野の当業者に認識されている用語は、各々同技術分野で採用されている意味である。例えば、「抗体」なる用語は、ジスルフィド結合により相互に連結された少なくとも２本の重（Ｈ）鎖と２本の軽（Ｌ）鎖を含む無傷の抗体に加え、無傷の抗体の任意の抗原結合部分又は断片であって、前記無傷の抗体により認識される抗原標的分子と結合する能力を有する又は維持するもの（例えば、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、又はＦａｂ’２断片）を意味する。つまり、本願では「抗体」なる用語を最も広義の意味で使用し、ポリクローナル抗体とモノクローナル抗体を含み、無傷の抗体とその機能的（抗原結合）抗体断片を含み、断片抗原結合（Ｆａｂ）断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、Ｆａｂ’断片、Ｆｖ断片、組換えＩｇＧ（ｒＩｇＧ）断片、一本鎖可変領域断片（ｓｃＦｖ）を含む一本鎖抗体断片、及びシングルドメイン抗体（例えば、ｓｄＡｂ、ｓｄＦｖ、ナノボディ）断片が挙げられる。この用語は、イントラボディ、ペプチボディ、キメラ抗体、完全ヒト抗体、ヒト化抗体、ヘテロコンジュゲート抗体、多重特異性（例えば、二重特異性）抗体、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、タンデムジｓｃＦｖ、及びタンデムトリｓｃＦｖ等の遺伝子工学的に作製された形態及び／又は他の方法で改変された形態の免疫グロブリンを包含する。特に指定しない限り、「抗体」なる用語は、その機能的抗体断片を包含すると理解すべきである。この用語は更に、ＩｇＧとそのサブクラス（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４）、ＩｇＭ、ＩｇＥ、ＩｇＡ、及びＩｇＤ等の任意のクラス又はサブクラスの抗体を含む無傷又は全長抗体も包含する。
「ＶＬ」又は「ＶＬ」と「ＶＨ」又は「ＶＨ」なる用語は、それぞれ抗体軽鎖と抗体重鎖に由来する可変結合領域又はドメインを意味する。所定の実施形態において、ＶＬは、カッパ（κ）クラス（本願では、「ＶＫ」とも言う）である。所定の実施形態において、ＶＬは、ラムダ（λ）クラスである。ＴＣＲ可変ドメインと同様に、抗体の可変ドメインは、ＣＤＲとフレームワーク領域（ＦＲ）を含む。各抗体可変ドメインに３個のＣＤＲが存在する（ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、ＬＣＤＲ３であり、それぞれＣＤＲＨ及びＣＤＲＬとも言う）。所定の実施形態において、抗体ＶＨは、ＦＲ１－ＨＣＤＲ１－ＦＲ２－ＨＣＤＲ２－ＦＲ３－ＨＣＤＲ３－ＦＲ４の順に４個のＦＲと３個のＣＤＲを含み、抗体ＶＬは、ＦＲ１－ＬＣＤＲ１－ＦＲ２－ＬＣＤＲ２－ＦＲ３－ＬＣＤＲ３－ＦＲ４の順に４個のＦＲと３個のＣＤＲを含む。一般に、ＶＨとＶＬは一緒になり、それぞれのＣＤＲを介して抗原結合部位を形成する。
ＴＣＲミミック抗体は、ペプチド：ＭＨＣ複合体と結合する（即ち、前記ペプチド：ＭＨＣ複合体を認識してこれと結合する）ことが可能な（任意のアイソタイプ、例えば、ＩｇＧ（１、２、３、４）、ＩｇＥ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、ＩｇＭの）抗体である。ある種の実施形態において、ＴＣＲミミック抗体は、Ｔ細胞受容体と同様の抗原特異的な主要組織適合性複合体適合性又は拘束性を有する。ＴＣＲミミック抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５（１９７５）に記載されているハイブリドーマ法により作製することもできるし、細菌、真核動物、又は植物細胞で組換えＤＮＡ法を使用して作製することもできる（例えば、米国特許第４，８１６，５６７号参照）。ＴＣＲミミック抗体は、例えば、Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３５２：６２４－６２８（１９９１）及びＭａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２２：５８１－５９７（１９９１）と、Ｎｏｙ ｅｔ ａｌ．Ｅｘｐｅｒｔ Ｒｅｖ．Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．５（３）：５２３－５３６（２００５）に記載されている技術を使用してファージ抗体ライブラリーから単離することもでき、これらの技術については、その開示内容全体を本願に援用する。ＴＣＲミミック抗体は、ＰＣＴ公開第ＷＯ２００４／０７６６７７Ａ２号に開示されている方法を使用しても得られる。ＴＣＲミミック抗体の抗原結合断片（例えば、ＣＤＲ、ＶＨ、ＶＬ、Ｆａｂ、Ｆｄ等）も想定される。
改変ドメイン又は改変タンパク質若しくは誘導体としては、同一アミノ酸の可能な全コドン選択に基づくものと、保存的アミノ酸置換によるコドン選択に基づくものが挙げられる。例えば、以下の６群、即ち、１）アラニン（ａｌａ；Ａ）、セリン（ｓｅｒ；Ｓ）、トレオニン（ｔｈｒ；Ｔ）；２）アスパラギン酸（ａｓｐ；Ｄ）、グルタミン酸（ｇｌｕ；Ｅ）；３）アスパラギン（ａｓｎ；Ｎ）、グルタミン（ｇｌｎ；Ｑ）；４）アルギニン（ａｒｇ；Ｒ）、リジン（ｌｙｓ；Ｋ）；５）イソロイシン（ｉｌｅ；Ｉ）、ロイシン（Ｌ）、メチオニン（ｍｅｔ；Ｍ）、バリン（ｖａｌ；Ｖ）；及び６）フェニルアラニン（ｐｈｅ；Ｆ）、チロシン（ｔｙｒ；Ｙ）、トリプトファン（ｔｒｐ；Ｗ）は、各々相互に保存的置換であるアミノ酸を含むことができる。（ＷＯ９７／０９４３３の１０頁，Ｌｅｈｎｉｎｇｅｒ，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２ｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｗｏｒｔｈ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｉｎｃ．，ＮＹ，ＮＹ，ｐｐ．７１－７７，１９７５；Ｌｅｗｉｎ Ｇｅｎｅｓ ＩＶ，Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ ａｎｄ Ｃｅｌｌ Ｐｒｅｓｓ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，ＭＡ，ｐ．８，１９９０；Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ １９８４も参照）。更に、コードされる配列中の１アミノ酸又は低百分率のアミノ酸を置換、付加又は欠失させる個々の置換、欠失又は付加も「保存的置換」である。
本願で使用する「核酸」又は「核酸分子」又は「ポリヌクレオチド」とは、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）又はインビトロ翻訳により生成されたデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）、リボ核酸（ＲＮＡ）、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、その断片のいずれかを意味し、更に、ライゲーション、切断、エンドヌクレアーゼ作用、又はエキソヌクレアーゼ作用により生成された断片も意味する。所定の実施形態において、本開示の核酸はＰＣＲにより生産される。核酸は、（デオキシリボヌクレオチドやリボヌクレオチド等の）天然ヌクレオチド、天然ヌクレオチドのアナログ（例えば、天然ヌクレオチドのα－エナンチオマー）、又はその両方の組み合わせである単量体から構成することができる。改変ヌクレオチドは、糖部分、ピリミジン塩基部分又はプリン塩基部分に修飾又は置換を有することができる。核酸単量体は、ホスホジエステル結合又はこのような結合のアナログにより連結することができる。ホスホジエステル結合のアナログとしては、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレノエート、ホスホロジセレノエート、ホスホロアニリノチオエート、ホスホロアニリデート、ホスホロアミデート等が挙げられる。核酸分子は、一本鎖でも二本鎖でもよい。
「単離」なる用語は、材料がその由来元の環境（例えば、天然に存在する場合には天然環境）から取り出されていることを意味する。例えば、生きた動物の体内に存在する天然核酸又はポリペプチドは単離されていないが、天然系で共存する材料の一部又は全部から分離された同一核酸又はポリペプチドは、単離されている。このような核酸は、ベクターの一部でもよく、及び／又はこのような核酸若しくはポリペプチドは、組成物の一部（例えば、細胞ライセート）でもよく、このようなベクター又は組成物が、前記核酸又はポリペプチドの天然環境の一部でないという点で、このような核酸又はポリペプチドはやはり単離されている。「遺伝子」なる用語は、ポリペプチド鎖の生成に関与するＤＮＡのセグメントを意味し、コーディング領域の前後の領域（「リーダー及びトレーラー」）と、個々のコーディングセグメント（エキソン）間の介在配列（イントロン）を含む。
本願で使用する「組換え」、「人工」、及び「改変」なる用語は、外来核酸分子の導入により改変された細胞、微生物、核酸分子、ポリペプチド、タンパク質、プラスミド、又はベクターを意味し、あるいは、人的介入により遺伝子工学的に作製された、即ち異種核酸分子の導入により改変された細胞又は微生物を意味し、あるいは、内在性核酸分子又は遺伝子の発現が制御されるように、調節解除されるように又は構成的となるように改変された細胞又は微生物を意味し、このような改変又は修飾は遺伝子工学により導入することができる。人工的に行われる遺伝子改変としては、例えば、１種以上のタンパク質又は酵素をコードする核酸分子（プロモーター等の発現制御エレメントでもよい）を導入する修飾や、他の核酸分子付加、欠失、置換、又は細胞の遺伝子材料の他の機能的破壊若しくは付加が挙げられる。典型的な修飾としては、基準又は親分子に由来する異種又は相同ポリペプチドのコーディング領域又はその機能的断片における修飾が挙げられる。
本願で使用する「突然変異」とは、核酸分子又はポリペプチド分子の配列がそれぞれ基準又は野生型核酸分子又はポリペプチド分子と比較して変異していることを意味する。突然変異の結果、ヌクレオチド又はアミノ酸の置換、挿入又は欠失を含む数種の異なる種類の変異を生じることができる。所定の実施形態において、突然変異は、１若しくは３個のコドン若しくはアミノ酸の置換、１～約５個のコドン若しくはアミノ酸の欠失、又はその組み合わせである。
「保存的置換」は、あるアミノ酸が類似の性質を有する別のアミノ酸で置換されることとして当技術分野で認められている。典型的な保存的置換は、当技術分野で周知である（例えば、ＷＯ９７／０９４３３の１０頁；Ｌｅｈｎｉｎｇｅｒ，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２ｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ；Ｗｏｒｔｈ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｉｎｃ．ＮＹ，ＮＹ，ｐｐ．７１－７７，１９７５；Ｌｅｗｉｎ，Ｇｅｎｅｓ ＩＶ，Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ ａｎｄ Ｃｅｌｌ Ｐｒｅｓｓ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，ＭＡ，ｐ．８，１９９０参照）。
「コンストラクト」なる用語は、組換え核酸分子を含む任意のポリヌクレオチドを意味する。「トランスジーン」又は「トランスジーンコンストラクト」とは、天然では存在しない配置で機能的に連結された２個以上の遺伝子を含むコンストラクトを意味する。「機能的連結」（又は本願における「機能的に連結された」）なる用語は、２個以上の核酸分子の１個の機能が他の分子の機能の影響を受けるように、これらの核酸分子が単一の核酸断片上で会合していることを意味する。例えば、プロモーターは、コーディング配列の発現に影響を与えることができるとき（即ち、前記コーディング配列が前記プロモーターの転写制御下にあるとき）に、前記コーディング配列と機能的に連結されている。「連結されていない」とは、会合した遺伝子エレメントが相互に密接に会合しておらず、あるエレメントの機能が他のエレメントの機能に影響を与えないことを意味する。ある種の実施形態において、トランスジーンに存在する遺伝子は、発現制御配列（例えば、プロモーター）と機能的に連結されている。
コンストラクト（例えば、トランスジーン）は、ベクター（例えば、細菌ベクター、ウイルスベクター）に存在することもできるし、ゲノムに組込むこともできる。「ベクター」とは、別の核酸分子を輸送することが可能な核酸分子である。ベクターは、例えば、プラスミド、コスミド、ウイルス、ＲＮＡベクター又は直鎖状若しくは環状ＤＮＡ若しくはＲＮＡ分子とすることができ、染色体、非染色体、半合成又は合成核酸分子を含むことができる。典型的なベクターは、自律複製可能なベクター（エピソーマルベクター）又は連結した核酸分子を発現させることが可能なベクター（発現ベクター）である。本開示の組成物及び方法で有用なベクターについては本願中に詳述する。
本願で使用する「発現」なる用語は、遺伝子等の核酸分子のコーディング配列に基づいてポリペプチドが産生されるプロセスを意味する。このプロセスは、転写、転写後調節、転写後修飾、翻訳、翻訳後調節、翻訳後修飾、又は任意のその組み合わせを含むことができる。
核酸分子を細胞に挿入する関連で「導入」なる用語は、「トランスフェクション」、又は「形質転換」、又は「形質導入」を意味し、核酸分子を真核細胞又は原核細胞に取り込むという意味を含み、前記核酸分子を細胞のゲノム（例えば、染色体、プラスミド、プラスチド、又はミトコンドリアＤＮＡ）に取り込むこと、自律的レプリコンに変換すること、又は一過性に発現させることができる（例えば、ｍＲＮＡトランスフェクション）。
本願で使用する「異種」又は「外来」核酸分子、コンストラクト又は配列とは、天然では宿主細胞に存在しないが、前記宿主細胞に由来する核酸分子に相同であるか、又は核酸分子の一部であり得る核酸分子又は核酸分子の一部を意味する。前記異種又は外来核酸分子、コンストラクト又は配列の資源は、異なる属又は種とすることができる。所定の実施形態では、例えば、コンジュゲーション、形質転換、トランスフェクション、形質導入、エレクトロポレーション等により、異種又は外来核酸分子を宿主細胞又は宿主ゲノムに付加し（即ち、内在性又は固有ではない）、前記付加された分子は、前記宿主ゲノムに組込むこともできるし、染色体外遺伝子材料として（例えば、プラスミド又は他の形態の自己複製ベクターとして）存在することもでき、複数コピーで存在することができる。更に、「異種」とは、宿主細胞が相同のタンパク質又は活性をコードするとしても、前記宿主細胞に導入された外来核酸分子によりコードされる非天然酵素、タンパク質又は他の活性を意味する。当然のことながら、異種ポリヌクレオチドを含む宿主細胞の場合には、前記ポリヌクレオチドは、子孫自体が前記ポリヌクレオチドを含むように操作（例えば、形質導入）されているか否かに拘わらず、前記宿主細胞の子孫に対して「異種」である。本願の宿主細胞自体が前記ポリヌクレオチドを含むように改変されているか、又は本願の宿主細胞の先祖細胞が前記ポリヌクレオチド配列を含むように改変されているかに拘わらず、このような子孫を「改変」宿主細胞と呼ぶことができる。
本願に記載するように、２個以上の異種又は外来核酸分子を別々の核酸分子として、又は複数の個々に制御される遺伝子として、又はポリシストロン性核酸分子として、又は融合タンパク質をコードする単一の核酸分子として、又は任意のその組み合わせとして宿主細胞に導入することができる。２個以上の外来核酸分子を宿主細胞に導入する場合には、当然のことながら、前記２個以上の外来核酸分子を（例えば、単一のベクターで）単一の核酸分子として導入することもできるし、別々のベクターで導入することもできるし、宿主染色体の単一部位又は複数部位に組込むこともできるし、任意のその組み合わせでもよい。言及する異種核酸分子又はタンパク質活性の数値は、コードする核酸分子の数又はタンパク質活性の数を表し、宿主細胞に導入される個々の核酸分子の数を表すものではない。
本願で使用する「内在性」又は「固有」なる用語は、正常な状態で宿主細胞に存在する遺伝子、タンパク質、又は活性を意味する。更に、親遺伝子、タンパク質又は活性に比較して突然変異、過剰発現、シャフリング、重複又は他の方法で改変された遺伝子、タンパク質又は活性も、その特定宿主細胞に内在性又は固有であるとみなされる。例えば、第１の遺伝子に由来する内在性制御配列（例えば、プロモーター、翻訳減衰配列）を使用して第２の固有遺伝子又は核酸分子の発現を改変又は調節することができ、前記第２の固有遺伝子又は核酸分子の発現又は調節は、親細胞における正常な発現又は調節と異なる。
「相同」又は「ホモログ」なる用語は、宿主細胞、種又は系統に存在又は由来する分子又は活性を意味する。例えば、異種又は外来核酸分子は、固有宿主細胞遺伝子と相同とすることができ、任意に発現レベルの改変、異なる配列、活性の改変、又は任意のその組み合わせを有することができる。
本願で使用する「配列同一性」とは、所定の配列と別の基準ポリペプチド配列を整列させ、必要に応じて配列同一性百分率を最大にするようにギャップを導入した後に、前記所定の配列中のアミノ酸残基のうちで前記基準配列中のアミノ酸残基と一致する百分率を意味し、保存的置換は、配列同一性の一部とみなさない。パラメーターをデフォルト値に設定し、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．（１９９７），Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５：３３８９－３４０２により定義されているようにＮＣＢＩ ＢＬＡＳＴ２．０ソフトウェアを使用して配列同一性百分率値を算出することができる。
免疫原性組成物
所定の態様において、本開示は、本願に開示する１種以上のＳＯＸ２ペプチド抗原を含むか、又は前記抗原から構成される免疫原性組成物を提供する。所定の実施形態において、前記免疫原性組成物は、配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド又はポリペプチドを含む。本願に開示する免疫原性組成物は、ＳＯＸ２発現（所定の実施形態では、過剰発現を含む）及び／又は活性を特徴とするか、又は他の点でこれらに関連する疾患又は障害（例えば、多発性骨髄腫）に対する免疫応答（例えば、抗原特異的Ｔ細胞、抗体、サイトカイン等の産生）を誘導することが可能である。所定の実施形態において、組成物は、配列番号２～７に記載のアミノ酸配列のいずれか１種、２種、３種、４種、５種又は６種を含み、例えば、融合ポリペプチドにおいて及び／又は単離ポリペプチドとして、各々独立して約２５０アミノ酸長以下、約２００アミノ酸長以下、約１５０アミノ酸長以下、約１００アミノ酸長以下、約５０アミノ酸長以下、約２５アミノ酸長以下、約２０アミノ酸長以下、又は約１５アミノ酸長以下である。典型的な免疫原性融合ポリペプチドは、配列番号２～７に記載のアミノ酸配列の２種以上を任意の順序で含むことができ、配列番号２～７に記載のアミノ酸配列のいずれか１種以上の２コピー以上を含むことができる。ある種の実施形態では、融合体の２個のＳＯＸ２ペプチドの間に自己切断ペプチド（例えば、Ｐ２Ａ、Ｔ２Ａ、Ｅ２Ａ、Ｆ２Ａ）が配置されている。所定の実施形態において、前記免疫原性組成物は更に、薬学的に許容されるアジュバントを含む。アジュバントは、前記免疫原性ペプチド及び前記ペプチドを含む融合ポリペプチドに対する免疫応答を増強（又は改善、増大）すること（即ち、前記免疫原性ペプチド又は融合ポリペプチドに対する特異的免疫応答のレベルを前記アジュバントの非投与下の特異的免疫応答のレベルに比較して統計的、生物学的又は臨床的に有意に上昇させること）を目的とする。
ヒトに投与する場合、薬学的に許容されるアジュバントは、該当規制当局により人体投与用に承認されているもの又は承認可能なものとする。望ましいアジュバントは、定性的免疫応答に悪影響を与えるようなコンホメーション変化を免疫原に生じることなく、前記免疫原性ペプチド又は融合ポリペプチドに対する応答を増大する。適切なアジュバントとしては、ミョウバン（硫酸アルミニウムカリウム）等のアルミニウム塩、又は水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、若しくは硫酸アルミニウム等の他のアルミニウム含有アジュバントが挙げられる。他の薬学的に適切なアジュバントとしては、非限定的な例として、非毒性モノホスホリルリピドＡ（例えば、Ｐｅｒｓｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｔｒｅｎｄｓ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２５ １０：ｓ３２－ｓ３７（２００２）参照）等の非毒性リピドＡ関連アジュバントが挙げられ、例えば、３－Ｏ－脱アシル化モノホスホリルリピドＡ（ＭＰＬ）（例えば、英国特許出願第ＧＢ２２２０２１１号参照）が挙げられる。他の有用なアジュバントとしては、南米に自生するキラヤ（Ｑｕｉｌｌａｊａ ｓａｐｏｎａｒｉａ Ｍｏｌｉｎａ）樹木の樹皮から単離されたトリテルペングリコシド又はサポニンを含むＱＳ２１とＱｕｉｌＡが挙げられる（例えば、Ｋｅｎｓｉｌ ｅｔ ａｌ．，ｉｎ Ｖａｃｃｉｎｅ Ｄｅｓｉｇｎ：Ｔｈｅ Ｓｕｂｕｎｉｔ ａｎｄ Ａｄｊｕｖａｎｔ Ａｐｐｒｏａｃｈ（ｅｄｓ．Ｐｏｗｅｌｌ ａｎｄ ３０ Ｎｅｗｍａｎ，Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ，１９９５）；米国特許第５，０５７，５４０号参照）。他の適切なアジュバントとしては、任意にモノホスホリルリピドＡ等の免疫刺激剤と併用した水中油エマルションが挙げられる（例えば、Ｓｔｏｕｔｅ ｅｔ ａｌ．，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３３６，８６－９１（１９９７）参照）。他の適切なアジュバントとしては、ポリグルタミン酸又はポリリジン、リポソーム、及びＣｐＧ等のポリマー又はモノマーアミノ酸が挙げられる（例えば、Ｋｌｉｎｍａｎ，３５ Ｉｎｔ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２５（３－４）：１３５－５４（２００６）；米国特許第７，４０２，５７２号；欧州特許第７７２６１９号参照）。本願で提供する免疫原性ＳＯＸ２ペプチド又は融合ポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドを含む宿主細胞も提供する。所定の実施形態において、宿主細胞は、ヒト免疫細胞等の免疫細胞を含む。所定の実施形態において、宿主細胞は、樹状細胞又はＴ細胞を含む。所定の実施形態では、ＨＬＡ－Ａ：０２＊０１＋である対象に免疫原性組成物又は宿主細胞を投与する。
ある種の実施形態において、免疫原性組成物は、（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；及び／又は（ｖｉｉ）配列番号２、３、４、５、６、若しくは７に比較して１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸変異を有する（ｉ）～（ｖｉ）のいずれか１種の単離ペプチド若しくはポリペプチドの変異体を含み、（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１種の単離ペプチド又はポリペプチドは、単離全長ヒトＳＯＸ２を含まない。所定の実施形態では、（ａ）（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１種の１コピー以上及び／又は（ｂ）（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれかの１種以上が融合ポリペプチドに存在しており、前記融合ポリペプチドは、任意に更に自己切断ペプチドのアミノ酸配列を含む。
所定の実施形態において、前記免疫原性組成物は、がん細胞に対する免疫応答を対象に誘導することが可能であり、任意に、前記がん細胞は、多発性骨髄腫細胞、神経膠腫細胞、頸部がん細胞、肺がん細胞、形質細胞性白血病細胞、及び／又は卵巣がん細胞を含む。
所定の実施形態において、前記免疫原性組成物は更にアジュバントを含む。
（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；及び／又は（ｖｉｉ）配列番号２、３、４、５、６、若しくは７に比較して１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸変異を有する（ｉ）～（ｖｉ）のいずれか１種のペプチド若しくはポリペプチドの変異体をコードする単離ポリヌクレオチドも提供され、前記ポリヌクレオチドは、任意にベクターに含まれ、及び／又は（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれかの１種のペプチド若しくはポリペプチドは、全長ヒトＳＯＸ２を含まない。所定の実施形態において、前記ポリヌクレオチドは、宿主細胞で発現するようにコドン最適化されており、前記宿主細胞は、任意に樹状細胞又はＴ細胞である。前記ポリヌクレオチドを含む宿主細胞も提供され、前記ポリヌクレオチドは、前記宿主細胞に対して異種であり、前記宿主細胞は、任意に免疫細胞であり、更に任意にプロフェッショナル抗原提示細胞である。ある種の実施形態において、前記宿主細胞は、樹状細胞又はＴ細胞である。
ＳＯＸ２発現又は活性に関連する疾患又は障害に対する免疫応答を対象に誘導する方法も提供され、前記方法は、本願に開示する結合タンパク質、結合タンパク質をコードするポリヌクレオチド、ベクター、結合タンパク質をコード／発現する宿主細胞、組成物、免疫原性組成物、ペプチドをコードするポリヌクレオチド、及び／又はペプチドをコードする宿主細胞を前記対象に投与することを含む。
（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；及び／又は（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチドから選択されるペプチド（例えば、ペプチド：ＨＬＡ複合体に含まれるペプチド）と結合するＴ細胞集団を拡大する方法も提供され、前記方法は、前記ペプチドと結合する１個以上のＴ細胞を含有する試料を、前記免疫原性組成物、ペプチドをコードするポリヌクレオチド、ペプチドをコードする宿主細胞、及び／又は配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチドと接触させた抗原提示細胞と接触させることを含む。
Ｔ細胞の作製及び／又は単離方法も提供され、前記方法は、任意に末梢血細胞を含有するＴ細胞含有試料を、本願に開示する免疫原性組成物、ペプチドをコードするポリヌクレオチド、ペプチドをコードする宿主細胞、及び／又は配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原を発現するか、若しくは前記抗原と接触させた抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させる工程と、任意に前記試料中の他の細胞からＴ細胞を選別する工程を含むことにより、Ｔ細胞を単離及び／又は生成する。前記方法により単離及び／又は生成されたＴ細胞も提供する。
結合タンパク質及び宿主細胞
所定の態様において、本開示は、ペプチド：ＨＬＡ複合体に含まれるもの等のＳＯＸ２抗原と結合する（例えば、特異的に結合する）ことが可能な結合タンパク質を提供する。ある種の実施形態において、前記ＨＬＡは、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１を含み、及び／又は前記ＳＯＸ２抗原は、配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される。更に、前記結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドと、このようなポリヌクレオチドを含み、前記コードされる結合タンパク質を発現することが可能な宿主細胞も提供する。
本願で使用する「ＳＯＸ２特異的結合タンパク質」なる用語は、例えば、細胞表面でＳＯＸ２ペプチド抗原：ＨＬＡ複合体と結合することが可能なタンパク質又はポリペプチド（例えば、ＴＣＲ又はその抗原結合ドメイン若しくは断片、あるいはＣＡＲの抗原結合ドメイン、あるいはＴＣＲミミック抗体又はその抗原結合ドメイン若しくは断片）を意味する。ある種の実施形態において、ＳＯＸ２特異的結合タンパク質は、ＳＯＸ２ペプチド抗原を含まないタンパク質若しくはポリペプチドと結合せず、及び／又はこのようなペプチドを含むＨＬＡ複合体と結合しない。本開示のＳＯＸ特異的結合タンパク質を（即ち、異種又は他の方法で）コード及び／又は発現する（例えば、免疫細胞等の）宿主細胞を、状況によっては「ＳＯＸ２特異的」細胞と呼ぶ。
ＴＣＲ、ｓｃＴｖ、ｓｃＴＣＲ、ＣＡＲ、及びＴＣＲミミック抗体とその抗原結合断片等の本開示の結合タンパク質は、ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体に含まれるもの等のＳＯＸ２抗原と結合することが可能な結合ドメインを含む。本願で使用する「結合ドメイン」（「結合領域」又は「結合部分」とも言う）とは、標的（例えば、抗原ペプチド又はペプチド：ＭＨＣ複合体）と特異的且つ非共有的に会合、合体、又は結合する能力を有する分子又はその部分（例えば、ペプチド、オリゴペプチド、ポリペプチド、タンパク質）を意味する。結合ドメインは、生体分子、分子複合体（即ち、２個以上の生体分子を含む複合体）、又は他の該当標的に対する任意の天然、合成、半合成、又は組換え生産結合パートナーを含む。所定の結合ドメインは、免疫グロブリン可変領域又は免疫グロブリン可変領域を含む一本鎖コンストラクト（例えば、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）、ｓｃＴｖ、ｓｃＦｖ）を含む。
所定の実施形態において、結合タンパク質は、免疫グロブリンスーパーファミリー結合タンパク質に由来する１個以上の可変ドメインを含む。ある種の実施形態において、結合タンパク質は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）α鎖可変ドメイン（Ｖα）及び／又はＴＣＲβ鎖可変ドメイン（Ｖβ）を含む。ある種の実施形態において、結合タンパク質は、ＴＣＲミミック抗体に由来する１個以上の可変ドメインを含む（例えば、Ｋｕｒｏｓａｗａ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉ Ｒｅｐｏｒｔｓ ９：９８２７（２０１９）；Ｔｒｅｎｅｖｓｋａ ｅｔ ａｌ．Ｆｒｏｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．（２０１７）ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．３３８９／ｆｉｍｍｕ．２０１７．０１００１；Ｄａｈａｎ ＆ Ｒｅｉｔｅｒ，Ｅｘｐｅｒｔ Ｒｅｃ．Ｍｏｌ．Ｍｅｄ．１４ ｅ６（２０１２）ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１０１７／ｅｒｍ．２０１２．２；Ｃｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｅｘｐｅｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｌ Ｔｈｅｒ １６：９７９－９８７（２０１６）ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１０８０／１４７１２５９８．２０１６．１１７６１３８）；Ｎｏｙ ｅｔ ａｌ．，Ｅｘｐｅｒｔ Ｒｅｖ．Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．５（３）：５２３－２３６（２００５）参照）。
ある種の実施形態において、結合タンパク質は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）αポリペプチド可変（Ｖα）ドメインとＴＣＲβポリペプチド可変（Ｖβ）ドメインを含み、前記結合タンパク質は、ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体を含むペプチドと結合することが可能であり、前記ＳＯＸ２抗原は、配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される。
本願に開示する実施形態のいずれかにおいて、前記ＨＬＡは、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１を含む。
ある種の実施形態において、ＳＯＸ２ペプチド抗原：ＨＬＡ複合体との結合は、特異的結合を含む。結合相互作用に関連して本願で使用する「特異的に結合する」又は「～に特異的」とは、結合タンパク質（例えば、ＴＣＲ受容体、ｓｃＴｖ、ｓｃＴＣＲ、ＣＡＲ、ＴＣＲミミック抗体）又は結合ドメイン（又はその融合タンパク質）が（この会合反応の結合速度定数［ｋｏｎ］と解離速度定数［ｋｏｆｆ］の比に等しい）１０５Ｍ－１以上の親和性又はＫａ（即ち、１／Ｍの単位で表した特定の結合相互作用の平衡結合定数）で標的分子と会合又は合体し、試料中の他の分子又はコンポーネントとは有意に会合又は合体しないことを意味する。結合タンパク質又は結合ドメイン（又はその融合タンパク質）は、「高親和性」結合タンパク質若しくは結合ドメイン（若しくはその融合タンパク質）又は「低親和性」結合タンパク質若しくは結合ドメイン（若しくはその融合タンパク質）に分類することができる。「高親和性」結合タンパク質又は結合ドメインとは、Ｋａが少なくとも１０７Ｍ－１、少なくとも１０８Ｍ－１、少なくとも１０９Ｍ－１、少なくとも１０１０Ｍ－１、少なくとも１０１１Ｍ－１、少なくとも１０１２Ｍ－１、又は少なくとも１０１３Ｍ－１である結合タンパク質又は結合ドメインを意味する。「低親和性」結合タンパク質又は結合ドメインとは、Ｋａが１０７Ｍ－１まで、１０６Ｍ－１まで、１０５Ｍ－１までである結合タンパク質又は結合ドメインを意味する。あるいは、Ｍの単位（例えば、１０－５Ｍ～１０－１３Ｍ）で表した特定の結合相互作用の平衡解離定数（Ｋｄ）として親和性を定義することもできる。
所定の実施形態において、本開示の結合タンパク質は、ＳＯＸ２含有ペプチド（又はＳＯＸ２ペプチド：ＨＬＡ複合体）と約１０－８Ｍ未満、約１０－９Ｍ未満、約１０－１０Ｍ未満、約１０－１１Ｍ未満、約１０－１２Ｍ未満、又は約１０－１３Ｍ未満のＫｄで結合し、あるいは、例えば、同一アッセイにより測定した場合に、本願に記載する典型的なＳＯＸ２特異的ＴＣＲ等の本願に記載する典型的な結合タンパク質により示される親和性とほぼ同一、少なくともほぼ同一、又はほぼ同一以上の親和性で前記ペプチドと結合する。所定の実施形態において、ＳＯＸ２結合タンパク質は、ＳＯＸ２特異的免疫グロブリンスーパーファミリー結合タンパク質又はその結合部分を含む。
所定の実施形態において、受容体又は結合ドメインは、「高親和性」を有することができ、即ち、野生型（又は親）結合ドメインよりも標的抗原と強く結合するように選択又は工学的に作製された受容体又は結合ドメインを意味する。例えば、高親和性は、標的抗原に対するＫａ（平衡結合定数）が野生型結合ドメインよりも高い場合、標的抗原に対するＫｄ（解離定数）が野生型結合ドメインよりも低い場合、標的抗原に対する解離速度定数（ｋｏｆｆ）が野生型結合ドメインよりも低い場合、又はその組み合わせにより得られる。
特定の標的と特異的に結合する本開示の結合ドメインを同定するアッセイや、結合ドメイン又は結合タンパク質親和性を測定するアッセイとしては、多量体／四量体染色法（例えば、ペプチド：ＭＨＣ四量体）、ウェスタンブロット法、ＥＬＩＳＡ、超遠心分析法、分光法及び表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ（Ｒ））分析法等の種々のアッセイが知られている（例えば、Ｄｏｌｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ １４６：１１－２２，２０１５，Ｓｃａｔｃｈａｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．ＮＹ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．５１：６６０，１９４９；Ｗｉｌｓｏｎ，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２０２９５：２１０３，２００２；Ｗｏｌｆｆ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５３：２５６０，１９９３；及び米国特許第５，２８３，１７３号、５，４６８，６１４号、又は同等文献が参照され、いずれも本願に援用する）。本願に記載するＳＯＸ２ペプチド抗原又はＳＯＸ２ペプチド抗原：ＨＬＡ複合体に対する反応性／結合について、例えば、Ｔ細胞、Ｂ細胞、形質細胞、ＰＢＭＣ、又はハイブリドーマをスクリーニングすることにより、結合ドメインを同定することもできる。例えば、該当抗原を発現するか、又はパルスした抗原提示細胞にこれらの細胞又はその上清を曝露することができる。該当抗原が外来性となるようなマウス、ウサギ、ラクダ、非ヒト霊長類、又はサメ等の適切な宿主に前記抗原を導入することにより、結合タンパク質を産生させた後に、前記宿主からＴ細胞、ＮＫＴ細胞、ＮＫ細胞、Ｂ細胞、脾細胞、形質細胞等を単離し、単離された細胞が前記抗原に特異的な結合タンパク質を発現するか否かを判定することもできる。
所定の実施形態において、本開示の結合タンパク質又は融合タンパク質（例えば、ＴＣＲ、ｓｃＴＣＲ、ＣＡＲ、ｓｃＴｖ、ＴＣＲミミック抗体又は抗原結合断片）は、前記結合タンパク質が細胞表面で受容体として機能することが可能な場合には、好ましくは細胞表面で宿主細胞（例えば、結合タンパク質を異種発現するＴ細胞、ＮＫ細胞、又はＮＫＴ細胞）により発現される。ＳＯＸ２ペプチド抗原又はＳＯＸ２ペプチド抗原：ＨＬＡ複合体に対するこのような宿主細胞のアビディティは、例えば、前記ペプチド又は（例えば、四量体として構成される）ペプチド：ＨＬＡ複合体、又は任意にペプチド：ＨＬＡ複合体に含まれる前記ペプチドを前記宿主細胞に提示する抗原提示細胞（ＡＰＣ）に前記宿主細胞を曝露した後、前記宿主細胞の活性を測定することにより求めることができ、このような活性としては、例えば、サイトカイン（例えば、ＩＦＮ－γ、ＴＮＦα）の産生若しくは分泌、宿主細胞シグナル伝達若しくは活性化成分（例えば、ＣＤ１３７（４－１ＢＢ））の発現亢進、前記宿主細胞の増殖、又は（例えば、標識クロム放出アッセイ又はカスパーゼ３／７アッセイを使用して測定する）前記ＡＰＣの殺傷が挙げられる。ＴＣＲミミック抗体の活性は、例えば ＥＬＩＳＡ、ＢＬＩ、ＳＰＲ、標的細胞と（例えば、細胞活性化レポーターエレメントのＦｃγＲ駆動発現を発現する）免疫エフェクター細胞を使用するようなエフェクター機能アッセイ等の標準抗体アッセイを使用して評価することができる。
「機能的アビディティ」なる用語は、所与濃度のリガンド（例えば、抗原）に対するインビトロ免疫細胞（例えば、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞）応答の生物学的尺度又は活性化閾値を意味し、前記生物学的尺度としては、サイトカイン産生（例えば、ＩＦＮγ産生、ＩＬ－２産生等）、細胞傷害活性、活性化、及び増殖が挙げられる。例えば、サイトカインを産生すること、細胞傷害性であること、活性化マーカーを発現すること、又は増殖することにより、低抗原用量にインビトロで生物学的に（免疫学的に）応答するＴ細胞は、機能的アビディティが高いとみなされ、機能的アビディティの低いＴ細胞は、アビディティの高いＴ細胞により得られると同様の免疫応答が誘導されるまでに、より多量の抗原が必要である。当然のことながら、機能的アビディティは、親和性及びアビディティとは異なる。親和性とは、結合タンパク質とその抗原／リガンドの間の所与の結合の強さを意味する。結合タンパク質には多価のものもあり、複数の抗原と結合するが、この場合には、結合全体の強度がアビディティである。
機能的アビディティと免疫応答の有効性の間には多数の相関がある。エクスビボ試験により、個々のＴ細胞機能（例えば、（例えば、ＥＬＩＳＡ、Ｌｕｍｉｎｅｘ（例えば、Ｌｕｍｉｎｅｘ ｘＭＡＰ（Ｒ））等を使用して測定又は検出されるような）増殖、サイトカイン産生）を異なる閾値で誘発できることを示したものもある（例えば、Ｂｅｔｔｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７２：６４０７，２００４；Ｌａｎｇｅｎｋａｍｐ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．３２：２０４６，２００２参照）。機能的アビディティに影響を与える可能性のある因子としては、（ａ）ｐＭＨＣ複合体に対するＴＣＲの親和性、即ちＴＣＲとｐＭＨＣの相互作用の強さ（Ｃａｗｔｈｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６７：２５７７，２００１）、（ｂ）ＴＣＲ及びＣＤ４又はＣＤ８コレセプターの発現レベル、並びに（ｃ）シグナル伝達分子の分布と組成（Ｖｉｏｌａ ａｎｄ Ｌａｎｚａｖｅｃｃｈｉａ，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２７３：１０４，１９９６）が挙げられ、更にＴ細胞機能とＴＣＲシグナル伝達を低下させる分子の発現レベルも挙げられる。
指定曝露時間後にベースラインから最大応答までの間の最大応答の５０％を誘導するために必要な抗原の濃度を「５０％効果濃度」又は「ＥＣ５０」と言う。ＥＣ５０値は、一般にモラー（モル／リットル）量として表されるが、ｌｏｇ１０（ＥＣ５０）のように対数値に変換されることが多い。例えば、ＥＣ５０が１μＭ（１０－６Ｍ）であるならば、ｌｏｇ１０（ＥＣ５０）値は－６である。使用される別の数値は、ＥＣ５０の負の対数（－ｌｏｇ１０（ＥＣ５０））として定義されるｐＥＣ５０である。例えば、図１２参照。上記例において、１μＭに等価のＥＣ５０は、ｐＥＣ５０では６である。所定の実施形態において、本開示の結合タンパク質の機能的アビディティは、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞、ＮＫ細胞）によるＩＦＮγ産生を促進するその能力の尺度となり、当技術分野で公知のアッセイ及び／又は本願に記載するアッセイを使用して測定することができる。「機能的アビディティの高い」ＴＣＲ又はその結合ドメインとは、ＥＣ５０が少なくとも１０－４Ｍ、少なくとも約１０－５Ｍ、又は少なくとも約１０－６ＭであるＴＣＲ又はその結合ドメインを意味する。
本開示に係るＴＣＲ又はｓｃＴＣＲ又はｓｃＴｖ可変ドメインを抗体（例えば、ＩｇＧ（１、２、３、４）、ＩｇＥ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、ＩｇＭ、及びその変異体）又はその断片（例えば、実施形態によっては、１種以上のＦｃ受容体、Ｃ１ｑ、プロテインＡ、プロテインＧ、又は任意のその組み合わせとの結合を維持する断片であり、免疫グロブリン重鎖単量体及び多量体、例えば、Ｆｃ二量体が挙げられる）の定常ドメインと連結させた融合タンパク質も想定される。例えば、Ｗｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１９８：１ Ｓｕｐｐ．（２０１７）参照。例えば、ＦｃＲｎ又は他のＦｃ受容体との結合を強化、抑制又は排除する突然変異を含む変異体Ｆｃポリペプチドが公知であり、本開示の範囲内で想定される。
「改変ドメイン」又は「改変タンパク質」とは、野生型モチーフ、領域、ドメイン、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質（例えば、野生型ＴＣＲαポリペプチド、ＴＣＲβポリペプチド、ＴＣＲα定常ドメイン、ＴＣＲβ定常ドメイン）と同一の配列ではなく、配列同一性が少なくとも８５％（例えば、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、９９．９％）であるモチーフ、領域、ドメイン、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質を意味する。
所定の実施形態において、本開示に係る結合タンパク質は、基準又は野生型配列に対する変異体配列（例えば、本願に記載するＴ細胞のＴＣＲの親又は野生型ＴＣＲＣＤＲ３βに対する変異体ＴＣＲＣＤＲ３β）を含む。本願で使用する「変異体」アミノ酸配列、ペプチド、又はポリペプチドとは、基準又は野生型アミノ酸配列に比較して１箇所又は２箇所のアミノ酸置換、欠失又は挿入を有するアミノ酸配列（又はペプチド又はポリペプチド）を意味する。所定の実施形態において、変異体アミノ酸配列、ペプチド、又はポリペプチドは、前記基準又は野生型分子と実質的に同一の機能性（例えば、ペプチド：ＨＬＡ複合体に対する結合特異性及び親和性）を維持し、例えば、本願に開示する変異体ＴＣＲＣＤＲ３βは、親又は野生型ＴＣＲＣＤＲ３βに比較して抗原結合特異性又は親和性の約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、約９５％、約９９％、又は１００％を維持する。
ＴＣＲ可変ドメインフレームワーク領域を工学的に操作すると、場合により、結合機能を低下又は実質的に低下せずにタンパク質発現を改善できることが示されている（Ｔｈｏｍａｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎｓ １０：４４５１（２０１９）；ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１０３８／ｓ４１４６７－０１９－１２４４１－ｗ；そのフレームワーク突然変異を本願に援用する）。発現と機能を潜在的に改善するように、このような突然変異をＴＣＲ定常領域で任意にシステイン突然変異（例えば、Ｔ４８Ｃ（Ｃα）とＳ７９Ｃ又はＳ５７Ｃ（Ｃβ））と組み合わせて利用することができる。
（内在性ＴＣＲに対する）人工ＴＣＲの「優性」発現に関連するアミノ酸としては、以下のものが挙げられる。
・Ｖα：
－フレームワーク領域１における、ＩＭＧＴ５位のＴ、ＩＭＧＴ８位のＱ、ＩＭＧＴ１９位のＶ、ＩＭＧＴ２０位のＴ、及び／又はＩＭＧＴ２４位のＴ；
－フレームワーク領域２における、ＩＭＧＴ３９位のＬ、ＩＭＧＴ５０位のＭ、及び／又はＩＭＧＴ５５位のＲ；並びに
－フレームワーク領域３における、ＩＭＧＴ６６位のＡ、ＩＭＧＴ８６位のＳ、及びＩＭＧＴ９６位のＬ。
・Ｖβ：
－フレームワーク領域１における、ＩＭＧＴ９位のＲ及び／又はＩＭＧＴ１０位のＹ；並びに
－フレームワーク領域２における、ＩＭＧＴ４３位のＱ。
したがって、（天然アミノ酸配列に既に存在していない場合に）上記アミノ酸の１種以上を指定位置のＴＣＲＶ領域に導入すると、発現と任意に機能が潜在的に改善された変異体を作製することができる。
ある種の実施形態では、ＳＯＸ２ペプチド：ＨＬＡ複合体と結合することが可能な単離結合タンパク質が提供され、前記ＳＯＸ２ペプチドは、配列番号５、２、３、４、６、又は７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、任意に、前記結合は特異的結合を含む。所定の実施形態において、前記ＨＬＡは、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１を含む。
ある種の実施形態において、結合タンパク質は、免疫グロブリンスーパーファミリー可変ドメインを含む。ある種の実施形態において、前記結合タンパク質は、ＴＣＲα鎖可変ドメイン（Ｖα）及び／又はＴＣＲβ鎖可変ドメイン（Ｖβ）を含む。ある種の実施形態において、前記結合タンパク質は、ＴＣＲミミック抗体の重鎖可変ドメイン（ＶＨ）及び／又は軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含む。
所定の実施形態において、結合タンパク質は、（ｉ）配列番号５２、５３、１００、１０１、１６、１７、２８、２９、４０、４１、６４、６５、７６、７７、８８、８９、１１２、１１３、１２４、１２５、１３６、１３７、１４８及び１４９のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ３βである。）；（ｉｉ）配列番号５１、９９、１５、２７、３９、６３、７５、８７、１１１、１２３、１３５及び１４７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ２βである。）；（ｉｉｉ）配列番号５０、９８、１４、２６、３８、６２、７４、８６、１１０、１２２、１３４及び１４６のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ１βである。）；（ｉｖ）配列番号５７、５８、１０５、１０６、２１、２２、３３、３４、４５、４６、６９、７０、８１、８２、９３、９４、１１７、１１８、１２９、１３０、１４１、１４２、１５３及び１５４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ３αである。）；（ｖ）配列番号５６、１０４、２０、３２、４４、６８、８０、９２、１１６、１２８、１４０及び１５２のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ２αである。）；及び／又は（ｖｉ）配列番号５５、１０３、１９、３１、４３、６７、７９、９１、１１５、１２７、１３９及び１５１のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ１αである。）を含む。
ある種の実施形態において、結合タンパク質は、（１）ＣＤＲ１α、ＣＤＲ２α、及びＣＤＲ３αを含むＴＣＲＶαと；（２）ＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、及びＣＤＲ３βを含むＴＣＲＶβを含み、前記ＣＤＲ１α、ＣＤＲ２α、ＣＤＲ３α、ＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、及びＣＤＲ３βは、（ｉ）それぞれ配列番号５５、５６、５７若しくは５８、５０、５１、及び５２若しくは５３；（ｉｉ）それぞれ配列番号１０３、１０４、１０５若しくは１０６、９８、９９、及び１００若しくは１０１；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号１９、２０、２１若しくは２２、１４、１５、及び１６若しくは１７；（ｉｖ）それぞれ配列番号３１、３２、３３若しくは３４、２６、２７、及び２８若しくは２９；（ｖ）配列番号４３、４４、４５若しくは４６、３８、３９、及び４０若しくは４１；（ｖｉ）それぞれ配列番号６７、６８、６９若しくは７０、６２、６３、及び６４若しくは６５；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号７９、８０、８１若しくは８２、７４、７５、及び７６若しくは７７；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９１、９２、９３若しくは９４、８６、８７、及び８８若しくは８９；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１５、１１６、１１７若しくは１１８、１１０、１１１、及び１１２若しくは１１３；（ｘ）それぞれ配列番号１２７、１２８、１２９若しくは１３０、１２２、１２３、及び１２４若しくは１２５；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３９、１４０、１４１若しくは１４２、１３４、１３５、及び１３６若しくは１３７；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５１、１５２、１５３若しくは１５４、１４６、１４７、及び１４８若しくは１４９に記載の通りである。
ある種の実施形態において、Ｖαは、配列番号５４、１０２、１８、３０、４２、６６、７８、９０、１１４、１２６、１３８及び１５０のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される。ある種の実施形態において、Ｖβは、配列番号４９、９７、１３、２５、３７、６１、７３、８５、１０９、１２１、１３３及び１４５のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される。
所定の実施形態において、結合タンパク質は、（ｉ）それぞれ配列番号５４及び４９；（ｉｉ）それぞれ配列番号１０２及び９７；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号１８及び１３；（ｉｖ）それぞれ配列番号３０及び２５；（ｖ）それぞれ配列番号４２及び３７；（ｖｉ）それぞれ配列番号６６及び６１；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号７８及び７３；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９０及び８５；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１４及び１０９；（ｘ）それぞれ配列番号１２６及び１２１；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３８及び１３３；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５０及び１４５に記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるＶαとＶβを含む。
ある種の実施形態では、（ｉ）それぞれ配列番号５４及び４９；（ｉｉ）それぞれ配列番号１０２及び９７；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号１８及び１３；（ｉｖ）それぞれ配列番号３０及び２５；（ｖ）それぞれ配列番号４２及び３７；（ｖｉ）それぞれ配列番号６６及び６１；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号７８及び７３；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９０及び８５；（ｉｘ）配列番号１１４及び１０９；（ｘ）それぞれ配列番号１２６及び１２１；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３８及び１３３；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５０及び１４５に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるＶαとＶβを含む結合タンパク質が提供される。
ある種の実施形態において、結合タンパク質は、配列番号４８、９６、１２、２４、３６、６０、７２、８４、１０８、１２０、１３２、及び１４４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列に含まれる。
所定の実施形態において、結合タンパク質は、ＴＣＲＶαドメインとＴＣＲＶβドメインを含み、（ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲに係るＣＤＲ３β；（ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲに係るＣＤＲ３α；（ｉｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶαドメインに対して少なくとも９０％（９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又はそれ以上）のアミノ酸同一性を有するＶαドメイン；又は（ｉｖ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶβドメインに対して少なくとも９０％（９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又はそれ以上）のアミノ酸同一性を有するＶβドメインを含み、但し、（ａ）前記ＣＤＲの少なくとも３個又は４個は突然変異がなく；（ｂ）突然変異を有するＣＤＲは、２アミノ酸までの置換、連続する５アミノ酸までの欠失、又はその組み合わせに止まり；（ｃ）前記コードされる結合タンパク質は、ＳＯＸ２：ＨＬＡ複合体を含むペプチド（例えば、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１分子との複合体における配列番号２、３、４、５、６、又は７に記載のＳＯＸ２ペプチド）と結合するその能力を維持する。
更なる実施形態において、前記結合タンパク質は更に、ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、又はドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲに係るＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、ＣＤＲ１α、及び／又はＣＤＲ２αを含む。
本願に開示するＳＯＸ２特異的Ｔ細胞株のＴＣＲとＴ細胞クローンは同定可能であり、公知方法を使用して決定可能な配列を有する。例えば、Ｂｌｅａｋｌｅｙ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １１５：４９２３－４９３３，２０１０；Ｗａｒｒｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ ９１（６）：２１９７－２２０７（１９９８）；Ｗａｌｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３３３（１６）：１０３８－１０４４；ＰＣＴ公開第ＷＯ２０１８／０５８００２号（実施例１）が参照され、その方法と関連試薬を本願に援用する。例えば、５’末端第一鎖相補的ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）増幅法や、ＳＭＡＲＴｅｒ ＲＡＣＥ ｃＤＮＡ増幅キット（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）を使用するｃＤＮＡ末端の迅速増幅法－ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＡＣＥ－ＰＣＲ）により、全長ＴＣＲ領域を同定することができる。要約すると、５’ＣＤＳプライマーＡ、ＳＭＡＲＴｅｒ ＩＩＡオリゴ、及びＳＭＡＲＴＳｃｒｉｂｅ逆転写酵素を使用してＲＮＡからｃＤＮＡを合成する。次にｃＤＮＡを使用し、ＰｈｕｓｉｏｎハイフィデリティＤＮＡポリメラーゼと、ＴＣＲα鎖（ｈＴＣＲ＿Ｃα－Ｒ ５’－ＣＡＧＣＣＧＣＡＧＣＧＴＣＡＴＧＡＧＣＡＧＡＴＴＡ－３’（配列番号８））又はＴＣＲβ鎖（ｈＴＣＲ＿Ｃｂ１－Ｒ ５’－ＣＣＡＣＴＴＣＣＡＧＧＧＣＴＧＣＣＴＴＣＡＧＡＡＡＴＣ－３’（配列番号９）及びｈＴＣＲ＿Ｃｂ２－Ｒ ５’－ＴＧＧＧＡＴＧＧＴＴＴＴＧＧＡＧＣＴＡＧＣＣＴＣＴＧＧ－３’（配列番号１０））の遺伝子特異的プライマーを使用してＲＡＣＥ－ＰＣＲ反応を実施する。ＲＡＣＥ－ＰＣＲ産物を精製し、配列決定し、ＴＣＲα及びβポリペプチドを同定する。ＩＭＧＴ／Ｖ－ＱＵＥＳＴソフトウェアを使用してＴＣＲ可変領域、多様性領域、及び結合領域を同定することができる。
ＴＣＲは、各ＳＯＸ２／ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１特異的Ｔ細胞クローンで優性ポリペプチドをコードするＴＲＡ配列とＴＲＢ配列を対合することにより作製することができる。ＴＲＡ配列とＴＲＢ配列は、適切なＶ領域の５’末端に由来するフォワードプライマーと、ＴＲＡ又はＴＲＢ定常領域に由来するリバースプライマーを使用してＰＣＲを行った後に、サンガーシーケンシングにより確認される。
本願に開示する実施形態のいずれかにおいて、前記結合タンパク質は、ＴＣＲ、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）、ｓｃＴＣＲ、ｓｃＴｖ、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、又は任意のその組み合わせを含む。本開示のＴＣＲの例としては、ＴＣＲ１、ＴＣＲ２、ＴＣＲ１、ＴＣＲ２、ＴＣＲ４、ＴＣＲ５、ＴＣＲ６、ＴＣＲ７、ＴＣＲ９、ＴＣＲ１０、ＴＣＲ１１、ＴＣＲ１３、ＴＣＲ１５、及びＴＣＲ１６が挙げられる（あるいは、それぞれＳＯＸ２ＴＣＲ＃０１、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃０２、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃０４、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃０５、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃０６、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃０７、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃０９、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃１０、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃１１、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃１３、ＳＯＸ２ＴＣＲ＃１５、及びＳＯＸ２ＴＣＲ＃１６とも言う）。これらのＴＣＲのアミノ酸配列を本願中に示す。
人工ＴＣＲの作製方法は、例えば、Ｂｏｗｅｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，４６（１５）：３０００（２００９）に記載されており、その技術を本願に援用する。ＣＡＲの作製方法は公知であり、例えば、米国特許第６，４１０，３１９号；米国特許第７，４４６，１９１号；米国特許公開第２０１０／０６５８１８号；米国特許第８，８２２，６４７号；ＰＣＴ公開第ＷＯ２０１４／０３１６８７号；米国特許第７，５１４，５３７号；及びＢｒｅｎｔｊｅｎｓ ｅｔ ａｌ．，２００７，Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．１３：５４２６に記載されており、その技術を本願に援用する。
所定の実施形態において、ＳＯＸ２特異的結合ドメインは単独で（即ち、結合タンパク質の他の部分の不在下で）可溶性とすることができ、約１０－８Ｍ未満、約１０－９Ｍ未満、約１０－１０Ｍ未満、約１０－１１Ｍ未満、約１０－１２Ｍ未満、又は約１０－１３Ｍ未満のＫｄで前記抗原又は抗原：ＨＬＡ複合体と結合することができる。特定の実施形態において、ＳＯＸ２特異的結合ドメインは、抗原特異的ｓｃＴＣＲ（例えば、Ｖα－Ｌ－Ｖβ、Ｖβ－Ｌ－Ｖα、Ｖα－Ｃα－Ｌ－Ｖα、又はＶα－Ｌ－Ｖβ－Ｃβ等の一本鎖αβＴＣＲタンパク質であり、上記式中、Ｖα及びＶβは、それぞれＴＣＲα及びβ可変ドメインであり、Ｃα及びＣβは、それぞれＴＣＲα及びβ定常ドメインであり、Ｌはリンカーである。）を含む。
所定の実施形態において、前記結合タンパク質は更に、ＴＣＲβポリペプチド定常ドメイン（Ｃβ）、ＴＣＲαポリペプチド定常ドメイン（Ｃα）、又はその両方を含む。ＶβとＣβは一緒になってＴＣＲβポリペプチド又は鎖を構成する。ＶαとＣαは一緒になってＴＣＲαポリペプチド又は鎖を構成する。ある種の実施形態において、前記Ｃβは、配列番号１５６若しくは１５７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、及び／又は前記Ｃαは、配列番号１５５に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される。
所定の実施形態において、前記Ｃβ及び／又は前記Ｃαは、前記Ｃβと前記Ｃαが会合して二量体を形成するときに、前記Ｃβと前記Ｃαの間に非天然ジスルフィド結合が形成されるような位置に１個以上の非天然アミノ酸を含み、任意に、前記非天然アミノ酸は、前記Ｃβにシステインを含み、及び／又は前記Ｃαにシステインを含む。ある種の実施形態において、前記結合タンパク質は、ＴＣＲＣβとＴＣＲＣαを含み、前記ＴＣＲＣβは、アミノ酸５７位の天然セリンの代わりにシステインアミノ酸を含み（例えば、ＧＶ（Ｓ→Ｃ）ＴＤ）、前記ＴＣＲＣαは、アミノ酸４８位の天然トレオニンの代わりにシステインアミノ酸を含む。（例えば、ＤＫ（Ｔ→Ｃ）ＶＬ；例えば、Ｃｏｈｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．６７（８）：３８９８－３９０３（２００７）参照）。
所定の実施形態において、結合タンパク質は、細胞表面で会合して機能的結合タンパク質を形成することができる２個のコンポーネント（例えば、αポリペプチドとβポリペプチド）を含む。前記２個の会合したコンポーネントは、成熟タンパク質を構成することができる。所定の実施形態において、ＴＣＲの抗原結合断片は、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）を含み、ＴＣＲＶαドメインとＴＣＲＶβドメインの両方を含むが、ＴＣＲ定常ドメインは一方（Ｃα又はＣβ）しか含まない。
更なる実施形態において、ＴＣＲ又はキメラ抗原受容体の抗原結合断片は、（例えば、２種以上のドナー又は生物種に由来するアミノ酸残基又はモチーフを含む）キメラ断片、（例えば、ヒトにおける免疫原性の危険を減らすように改変又は置換された非ヒト生物に由来する残基を含む）ヒト化断片、又はヒト断片である。
本開示の結合タンパク質は、例えば、細胞表面分子（例えば、ＴＣＲ、ｓｃＴＣＲ、ＣＡＲ）として発現されるか、又は可溶性分子（例えば、ＴＣＲミミック抗体、ｓｃＴｖ（例えば、Ｎｏｖｏｔｙ ｅｔ ａｌ．ＰＮＡＳ ８８（１９）：８６４６－８６５０（１９９１）参照））として発現されるかに拘わらず、宿主細胞により発現させることができる。
本開示の宿主細胞（例えば、免疫細胞）は、本願に記載する結合タンパク質をコードする単一のポリヌクレオチドを含むものでもよいし、前記結合タンパク質は、２個以上のポリヌクレオチドによりコードされていてもよい。換言するならば、結合タンパク質のコンポーネント又は部分は、２個以上のポリヌクレオチドによりコードされていてもよく、これらのポリヌクレオチドは、単一の核酸分子上に含まれるものでもよいし、２個以上の核酸分子上に含まれるものでもよい。
所定の実施形態において、本開示の結合タンパク質の２個以上のコンポーネント又は部分をコードするポリヌクレオチドは、単一のオープンリーディングフレーム内で機能的に結合された２個以上のコーディング配列を含む。このように配置すると、所望の遺伝子産物の協調発現を実現できるという利点があり、例えば、ＴＣＲのαポリペプチドとβポリペプチドが約１：１の比で産生されるように同時に発現させることが可能になる。所定の実施形態において、ＴＣＲ（例えば、α鎖とβ鎖）やＴＣＲミミック抗体（例えば、重鎖と軽鎖）等の本開示の結合タンパク質の２個以上の置換成分である遺伝子産物は、別々の分子として発現され、翻訳後に会合する。更なる実施形態において、本開示の結合タンパク質の２個以上の置換成分である遺伝子産物は、切断可能又は除去可能なセグメントにより分離された部分を有する単一ペプチドとして発現される。例えば、単一のポリヌクレオチド又はベクターによりコードされる分離可能なポリペプチドの発現に有用な自己切断ペプチドは、当技術分野で公知であり、例えば、豚テシオウイルス－１由来２Ａ（Ｐ２Ａ）ペプチド、トセア・アシグナ（Ｔｈｏｓｅａａｓｉｇｎａ）ウイルス由来２Ａ（Ｔ２Ａ）ペプチド、馬鼻炎Ａウイルス（ＥＲＡＶ）由来２Ａ（Ｅ２Ａ）ペプチド、及び口蹄疫ウイルス由来２Ａ（Ｆ２Ａ）ペプチドが挙げられる。
所定の実施形態において、本開示の結合タンパク質は、１個以上のジャンクションアミノ酸を含む。「ジャンクションアミノ酸」又は「ジャンクションアミノ酸残基」とは、結合ドメインとこれに隣接する定常ドメインの間や、ＴＣＲ鎖とこれに隣接する自己切断ペプチドの間等のポリペプチドの２個の隣接するモチーフ、領域又はドメイン間の１個以上（例えば、２～約１０個）のアミノ酸残基を意味する。ジャンクションアミノ酸は、融合タンパク質をコードするコンストラクトのデザインにより得られ（例えば、融合タンパク質をコードする核酸分子の作製中に制限酵素部位を使用することに得られるアミノ酸残基）、あるいは、例えば、本開示のコードされる結合タンパク質の１個以上のドメインに隣接する自己切断ペプチドの切断により得られる（例えば、ＴＣＲαポリペプチドとＴＣＲβポリペプチドの間に配置されたＰ２Ａペプチドが自己切断すると、αポリペプチド、ＴＣＲβポリペプチド、又はその両方に１個以上のジャンクションアミノ酸が得られる）。
本願に記載する実施形態のいずれかにおいて、本開示のコードされるポリペプチドは、「シグナルペプチド」（リーダー配列、リーダーペプチド、又はトランジットペプチドとも言う）を含むことができる。シグナルペプチドは、新規に合成されたポリペプチドを細胞の内側又は外側のそれらの適切な位置に輸送する。シグナルペプチドは、ポリペプチドの局在又は分泌が行われている間又は完了した後にポリペプチドから除去することができる。シグナルペプチドを有するポリペプチドを本願では「プレタンパク質」と呼び、シグナルペプチドを除去したポリペプチドを本願では「成熟」タンパク質又はポリペプチドと呼ぶ。
本願に開示する実施形態のいずれかにおいて、結合タンパク質（及び、任意に、１以上のアクセサリータンパク質）をコードするポリヌクレオチドは、宿主細胞で発現するようにコドン最適化することができる。コーディング配列が識別又は同定されたら、公知技術及びツール、例えば、ＧｅｎＳｃｒｉｐｔ（Ｒ）ＯｐｔｉｍｉｕｍＧｅｎｅ（ＴＭ）ツールを使用してコドン最適化を実施することができる（Ｓｃｈｏｌｔｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１１９：１３５，２００６も参照）。コドン最適化配列としては、部分的にコドン最適化された（即ち、１個以上のコドンが宿主細胞で発現するように最適化された）配列と、完全にコドン最適化された配列が挙げられる。
任意の適切な宿主細胞により本開示の結合タンパク質をコードすることもできるし、本開示の結合タンパク質をコードする異種ポリヌクレオチドを含むように、任意の適切な宿主細胞を工学的に操作することもできる。ある種の実施形態では、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、Ｂ細胞、又は形質細胞）が好ましい。ある種の実施形態において、免疫細胞は、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、又はその両方を含む。Ｔ細胞に所望の核酸をトランスフェクト／形質導入する方法は、従来記載されており（例えば、米国特許出願公開第ＵＳ２００４／００８７０２５号）、所望の標的特異性のＴ細胞を使用する養子移入法も記載されており（例えば、Ｓｃｈｍｉｔｔ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ．Ｇｅｎ．２０：１２４０，２００９；Ｄｏｓｓｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．１７：７４２，２００９；Ｔｉｌｌ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １１２：２２６１，２００８；Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．１８：７１２，２００７；Ｋｕｂａｌｌ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １０９：２３３１，２００７；ＵＳ２０１１／０２４３９７２；ＵＳ２０１１／０１８９１４１；Ｌｅｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２５：２４３，２００７）、本願の教示に基づいて、本願に開示する実施形態にこれらの技法を応用することが想定される。
所定の実施形態において、本開示の結合タンパク質（例えば、ＴＣＲ）をコードするポリヌクレオチドは、免疫系の細胞、造血幹細胞、Ｔ細胞、初代Ｔ細胞、Ｔ細胞株、ＮＫ細胞、又はナチュラルキラーＴ細胞等の特定の宿主細胞における発現を強化するように、コドン最適化することができる。典型的なＴ細胞としては、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、及びその同族亜集団（例えば、ナイーブ、セントラルメモリー、エフェクターメモリー、幹細胞メモリー）が挙げられる。
前記細胞（例えば、Ｔ細胞）にトランスフェクト若しくは形質導入するため、又は本願の方法のポリヌクレオチド若しくは組成物を投与するためには、任意の適切な方法を使用することができる。ポリヌクレオチドを宿主細胞に送達するための公知方法としては、例えば、カチオン性ポリマー、脂質様分子、及び所定の市販製品（例えば、ＩＮ－ＶＩＶＯ－ＪＥＴ ＰＥＩ）の使用が挙げられる。他の方法としては、エクスビボ形質導入法、注入法、エレクトロポレーション法、ＤＥＡＥ－デキストラン法、超音波ローディング法、リポソーム仲介トランスフェクション法、受容体仲介形質導入法、パーティクルガン法、トランスポゾン仲介導入法等が挙げられる。宿主細胞の更に他のトランスフェクション又は形質導入法は、本願に詳細に記載するベクターを利用する。結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを宿主細胞又は宿主細胞ゲノムに導入する他の方法としては、例えば、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステム等の遺伝子工学ストラテジーが挙げられる。
本願に開示する実施形態のいずれかにおいて、前記免疫細胞は、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、又は任意のその組み合わせを含む。所定の実施形態において、前記免疫細胞は、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４＋Ｔ細胞、又はその両方を含む。所定の実施形態において、宿主細胞（例えば、本開示のＳＯＸ特異的結合タンパク質を発現するＴ細胞（例えば、ＣＤ８＋Ｔ細胞）等の免疫細胞）は、配列番号２～７のいずれか１種以上に記載のＳＯＸ２ペプチド抗原の存在下にあるときに、サイトカインを産生することが可能である。所定の実施形態において、前記サイトカインは、ＩＦＮ－γであるか、又はＩＦＮ－γを含む。所定の実施形態において、前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が約１ｎｇ／ｍＬ、約１０ｎｇ／ｍＬ、約１００ｎｇ／ｍＬ、又は約１０００ｎｇ／ｍＬの濃度で存在するときに、宿主細胞はサイトカインを産生する。ある種の実施形態では、ペプチド：ＨＬＡ複合体中の前記ＳＯＸ２ペプチド抗原をプロセシング及び提示することが可能な標的又は抗原提示細胞が更に存在する。
所定の実施形態において、本開示のＳＯＸ特異的結合タンパク質を発現する宿主細胞（例えば、Ｔ細胞等の免疫細胞）は、配列番号２～７のいずれか１種以上に記載のＳＯＸ２ペプチド抗原（及び、任意に樹状細胞又はＴ２細胞等の抗原提示細胞）の存在下にあるとき、任意に更にサイトカインの存在下にあるときに増殖することが可能である。所定の実施形態において、前記サイトカインは、ＩＦＮ－γであるか、又はＩＦＮ－γを含む。所定の実施形態において、前記ＳＯＸ２ペプチド抗原は、約１ｎｇ／ｍＬ、約１０ｎｇ／ｍＬ、約１００ｎｇ／ｍＬ、又は約１０００ｎｇ／ｍＬの濃度で存在する。
所定の実施形態において、本開示のＳＯＸ特異的結合タンパク質を発現する宿主細胞（例えば、Ｔ細胞等の免疫細胞）は、多発性骨髄腫細胞と共培養（例えば、１２時間細胞培養）したときにＣＤ１３７の発現が亢進している。所定の実施形態において、前記多発性骨髄腫細胞は、Ｌ３６３細胞（ＤＳＭＺ Ｎｏ．ＡＣＣ４９）である。所定の実施形態において、前記多発性骨髄腫細胞は、患者由来である。
所定の実施形態において、本開示のＳＯＸ特異的結合タンパク質を発現する宿主細胞（例えば、Ｔ細胞等の免疫細胞）は、多発性骨髄腫細胞を（例えば、インビトロ、エクスビボ、又はインビボで）殺傷することが可能である。所定の実施形態において、前記多発性骨髄腫細胞は、Ｌ３６３細胞（ＤＳＭＺ Ｎｏ．ＡＣＣ４９）である。所定の実施形態において、前記多発性骨髄腫細胞は患者由来である。
ある種の実施形態において、宿主細胞は、ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体の存在下にあるときに、ＩＦＮ－γを産生し、任意に、前記ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体は、標的細胞の表面に発現される。所定の実施形態において、前記結合タンパク質は、６．０～９．０（即ち、６．０、９．０、及びその間の任意の数値）、６．０～８．５、６．０～８．０、６．０～７．５、６．０～７．０、６．０～６．５、６．５～９．０、６．５～８．５、６．５～８．０、６．５～７．５、６．５～７．０、７．０～９．０、７．０～８．５、７．０～８．０、７．０～７．５、７．５～９．０、７．５～８．５、７．５～８．０、８．０～９．０、８．０～８．５、又は８．２～９．０のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である。
宿主細胞のある種の実施形態において、前記結合タンパク質は、約６．０、約６．１、約６．２、約６．３、約６．４、約６．５、約６．６、約６．７、約６．８、約６．９、約７．０、約７．１、約７．２、約７．３、約７．４、約７．５、約７．６、約７．７、約７．８、約７．９、約８．０、約８．１、約８．２、約８．３、約８．４、約８．５、約８．６、約８．７、約８．８、約８．９、又は約９．０のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である。
宿主細胞のある種の実施形態において、前記結合タンパク質は、６．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である。宿主細胞のある種の実施形態において、前記結合タンパク質は、６．５以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である。宿主細胞のある種の実施形態において、前記結合タンパク質は、７．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である。宿主細胞のある種の実施形態において、前記結合タンパク質は、７．５以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である。宿主細胞のある種の実施形態において、結合タンパク質は、８．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である。ある種の実施形態において、宿主細胞は、以下の腫瘍細胞株、即ち、ＣＦＰＡＣ１、Ｈ４４１、Ｐａｎｃ０８．１３、ＳＷ６２０、ＳＷ５２７、Ｌ３６３、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＭＭ１Ｒ及びＨＬＡ－Ａ２を発現するＩＮＡ６のいずれか１種以上の細胞の存在下にあるときに、ＣＤ１３７を発現し、任意に、ＣＤ１３７発現は、前記宿主細胞を前記１種以上の腫瘍細胞株の１個以上の細胞と共にインキュベーション後に、前記宿主細胞のフローサイトメトリーにより評価される。ある種の実施形態において、以下の腫瘍細胞株、即ち、ＣＦＰＡＣ１、Ｈ４４１、Ｐａｎｃ０８．１３、ＳＷ６２０、ＳＷ５２７、Ｌ３６３、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＭＭ１Ｒ、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＩＮＡ６のいずれか１種以上と共にインキュベーション後に、試料中に存在する複数の前記宿主細胞のうち、前記複数の前記宿主細胞の５％以上、１０％以上、１５％以上、２０％以上、２５％以上、３０％以上、３５％以上、４０％以上、４５％以上、５０％以上、５５％以上、６０％以上、６５％以上、７０％以上、７５％以上、又は８０％以上が、ＣＤ１３７の発現に陽性である。ある種の実施形態において、前記インキュベーションは、約１６時間～約１８時間の持続時間を含み、任意に前記インキュベーションは、１６～１８時間の持続時間を含む。所定の更なる実施形態では、前記インキュベーションの前に、前記腫瘍細胞株の細胞におけるＨＬＡ－Ａ２発現を亢進するための物質を前記腫瘍細胞株の細胞に投与し、任意に、前記物質は、ＩＦＮ－γを含む。
上記実施形態のいずれかにおいて、免疫シグナル伝達又は他の関連活性に関与するポリペプチドをコードする１種以上の内在性遺伝子の発現を低下又は消失させるように宿主細胞（例えば、Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞、又はＮＫ細胞等の免疫細胞）を改変することができる。遺伝子ノックアウトの例としては、ＰＤ－１、ＬＡＧ－３、ＣＴＬＡ４、ＴＩＭ３、ＨＬＡ分子、ＴＣＲコンポーネント等をコードするものが挙げられる。理論に拘束する意図はないが、所定の内在的に発現される免疫細胞タンパク質は、改変免疫細胞を移植した同種宿主により外来性であると認識され、前記改変免疫細胞（例えば、ＨＬＡ対立遺伝子）が排除されたり、前記改変免疫細胞（例えば、ＰＤ－１、ＬＡＧ－３、ＣＴＬＡ４）の免疫活性がダウンレギュレーションされたり、異種発現される本開示の結合タンパク質の結合活性が妨害されたりする（例えば、非ＳＯＸ２抗原と結合する改変Ｔ細胞の内在性ＴＣＲは、ＳＯＸ２抗原を発現する細胞と前記改変Ｔ細胞の結合を妨害したり、ＳＯＸ２抗原に対するＴ細胞応答を開始したり、Ｔ細胞が消耗する一因又は原因となる）と考えられる。
したがって、このような内在性遺伝子又はタンパク質の発現又は活性を低下又は消失させると、自家又は同種宿主条件下の宿主細胞の活性、耐性、又は持続性を改善することができ、（例えば、ＨＬＡ型に関係なく任意のレシピエントへの）細胞の普遍的な投与が可能になると思われる。所定の実施形態において、宿主細胞は、ドナー細胞（例えば、同種）又は自家細胞である。所定の実施形態において、本開示の宿主細胞は、ＰＤ－１をコードする遺伝子、ＬＡＧ－３をコードする遺伝子、ＣＴＬＡ４をコードする遺伝子、ＴＩＭ３をコードする遺伝子、ＴＩＧＩＴをコードする遺伝子、ＨＬＡコンポーネントをコードする遺伝子（例えば、α１マクログロブリン、α２マクログロブリン、α３マクログロブリン、β１ミクログロブリン、又はβ２ミクログロブリンをコードする遺伝子）、又はＴＣＲコンポーネントをコードする遺伝子（例えば、ＴＣＲ可変領域又はＴＣＲ定常領域をコードする遺伝子）の１種以上の染色体遺伝子ノックアウトを含む（例えば、Ｔｏｒｉｋａｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｓｃｉ．Ｒｅｐ．６：２１７５７（２０１６）；Ｔｏｒｉｋａｉ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １１９（２４）：５６９７（２０１２）；及びＴｏｒｉｋａｉ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １２２（８）：１３４１（２０１３）が参照され、その遺伝子編集技術、組成物、及び養子細胞療法に関する開示内容全体を本願に援用する）。
本願で使用する「染色体遺伝子ノックアウト」なる用語は、機能的に活性な内在性ポリペプチド産物が宿主細胞により産生されるのを防止（例えば、低下、遅延、抑制又は阻止）するように、宿主細胞に遺伝子改変を行うこと又は阻害剤を導入することを意味する。染色体遺伝子ノックアウトを生じる改変としては、例えば、（未成熟終止コドンの形成を含む）ナンセンス突然変異、ミスセンス突然変異、遺伝子欠失、及び核酸鎖切断の導入に加え、宿主細胞における内在性遺伝子発現を阻害する阻害性核酸分子の異種発現を挙げることができる。
所定の実施形態において、染色体遺伝子ノックアウト又は遺伝子ノックインは、宿主細胞の染色体編集により実施される。染色体編集は、例えば、エンドヌクレアーゼを使用して実施することができる。本願で使用する「エンドヌクレアーゼ」とは、ポリヌクレオチド鎖内のホスホジエステル結合の切断を触媒することが可能な酵素を意味する。所定の実施形態において、エンドヌクレアーゼは、標的遺伝子を切断することにより、前記標的遺伝子を不活性化又は「ノックアウト」することが可能である。エンドヌクレアーゼは、天然エンドヌクレアーゼ、組換えエンドヌクレアーゼ、遺伝子改変エンドヌクレアーゼ、又は融合エンドヌクレアーゼとすることができる。エンドヌクレアーゼにより生じる核酸鎖切断は、一般に、相同組換え又は非相同末端結合（ＮＨＥＪ）のそれぞれ異なるメカニズムにより修復される。相同組換え時には、ドナー遺伝子を「ノックイン」するため、標的遺伝子を「ノックアウト」するため、及び任意にドナー遺伝子ノックイン又は標的遺伝子ノックアウトイベントにより標的遺伝子を不活性化するために、ドナー核酸分子を使用することができる。ＮＨＥＪは、切断部位にＤＮＡ配列の変異（例えば、少なくとも１ヌクレオチドの置換、欠失又は付加）を高頻度で生じるエラープローン修復法である。ＮＨＥＪは、標的遺伝子を「ノックアウト」するために使用することができる。エンドヌクレアーゼの例としては、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、ＴＡＬＥ－ヌクレアーゼ、ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓヌクレアーゼ、メガヌクレアーゼ、及びメガＴＡＬが挙げられる。
本願で使用する「ジンクフィンガーヌクレアーゼ（ＺＦＮ）」とは、ジンクフィンガーＤＮＡ結合ドメインを非特異的ＤＮＡ切断ドメイン（例えば、Ｆｏｋｌエンドヌクレアーゼ）と融合した融合タンパク質を意味する。約３０アミノ酸の各ジンクフィンガーモチーフが、約３塩基対のＤＮＡと結合し、トリプレット配列特異性を改変するように所定の残基のアミノ酸を変異させることができる（例えば、Ｄｅｓｊａｒｌａｉｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９０：２２５６－２２６０，１９９３；Ｗｏｌｆｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２８５：１９１７－１９３４，１９９９参照）。約９～約１８塩基対長を有する領域等の所望のＤＮＡ配列に対する結合特異性を生じるように、複数のジンクフィンガーモチーフをタンデムに連結することができる。背景として、ＺＦＮは、ゲノムにおける部位特異的ＤＮＡ二本鎖切断（ＤＳＢ）の形成を触媒することによりゲノム編集を仲介し、ゲノムに相同のフランキング配列を含むトランスジーンのＤＳＢ部位への標的組込みが相同組換え修復により助長される。あるいは、ＺＦＮにより生じたＤＳＢの結果として、切断部位にヌクレオチドの挿入又は欠失をもたらすエラープローン細胞修復経路である非相同末端結合（ＮＨＥＪ）による修復を介して標的遺伝子をノックアウトすることができる。所定の実施形態において、遺伝子ノックアウトは、挿入、欠失、突然変異又はその組み合わせを含み、ＺＦＮ分子を使用して実施される。
本願で使用する「転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ（ＴＡＬＥＮ）」とは、ＴＡＬＥ ＤＮＡ結合ドメインとＤＮＡ切断ドメイン（例えば、ＦｏｋＩエンドヌクレアーゼ）を含む融合タンパク質を意味する。「ＴＡＬＥ ＤＮＡ結合ドメイン」又は「ＴＡＬＥ」は、一般に１２番目と１３番目の多様性アミノ酸を含む高度に保存された３３～３５アミノ酸配列を各々有する１個以上のＴＡＬＥリピートドメイン／単位から構成される。ＴＡＬＥリピートドメインは、ＴＡＬＥと標的ＤＮＡ配列の結合に関与する。これらの多様性アミノ酸残基は、反復可変二残基（Ｒｅｐｅａｔ Ｖａｒｉａｂｌｅ Ｄｉｒｅｓｉｄｕｅ（ＲＶＤ））と呼ばれ、特異的ヌクレオチド認識と相関する。これらのＴＡＬＥのＤＮＡ認識の天然（カノニカル）コードは、ＴＡＬＥの１２位と１３位がＨＤ（ヒスチジン－アスパラギン酸）配列であれば、ＴＡＬＥがシトシン（Ｃ）と結合し、ＮＧ（アスパラギン－グリシン）であればＴヌクレオチドと結合し、ＮＩ（アスパラギン－イソロイシン）であればＡと結合し、ＮＮ（アスパラギン－アスパラギン）であればＧ又はＡヌクレオチドと結合し、ＮＧ（アスパラギン－グリシン）であればＴヌクレオチドと結合するように決定されている。非カノニカル（非定型）ＲＶＤも知られている（例えば、米国特許公開第ＵＳ２０１１／０３０１０７３号が参照され、その非定型ＲＶＤに関する開示内容全体を本願に援用する）。Ｔ細胞のゲノムに部位特異的二本鎖切断（ＤＳＢ）を誘導するために、ＴＡＬＥＮを使用することができる。非相同末端結合（ＮＨＥＪ）は、アニーリングのための配列オーバーラップが殆ど又は全くない二本鎖切断の両側からＤＮＡを繋ぎ合わせることにより、エラーを導入し、遺伝子発現をノックアウトする。あるいは、トランスジーンに相同フランキング配列が存在する場合には、相同組換え修復により、ＤＳＢ部位にトランスジーンを導入することができる。所定の実施形態において、遺伝子ノックアウトは、挿入、欠失、突然変異又はその組み合わせを含み、ＴＡＬＥＮ分子を使用して実施される。
本願で使用する「クラスター化された規則的に間隔を空けた短いパリンドロームリピート／Ｃａｓ」（ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ）ヌクレアーゼシステムとは、ＣＲＩＳＰＲ ＲＮＡ（ｃｒＲＮＡ）先導型Ｃａｓヌクレアーゼを利用して塩基対合相補性により（プロトスペーサーと呼ばれる）ゲノム内の標的部位を認識した後、相補的標的配列の３’末端の直後に短い保存されたプロトスペーサー隣接モチーフ（ＰＡＭ）が存在する場合には、ＤＮＡを切断するシステムを意味する。ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステムは、Ｃａｓヌクレアーゼの配列と構造に基づいて３種類（即ち、Ｉ型、ＩＩ型、及びＩＩＩ型）に分類される。Ｉ型及びＩＩＩ型におけるｃｒＲＮＡ先導型監視複合体は、複数のＣａｓサブユニットを必要とする。ＩＩ型システムは、最もよく研究されており、ＲＮＡ先導型Ｃａｓ９ヌクレアーゼと、ｃｒＲＮＡと、トランス活性化型ｒＲＮＡ（ｔｒａｃｒＲＮＡ）の少なくとも３成分を含む。ｔｒａｃｒＲＮＡは、デュプレックス形成領域を含む。ｃｒＲＮＡとｔｒａｃｒＲＮＡは、Ｃａｓ９ヌクレアーゼと相互作用し、ｃｒＲＮＡ上のスペーサーとＰＡＭの上流の標的ＤＮＡ上のプロトスペーサーのワトソンクリック塩基対合により、Ｃａｓ９／ｃｒＲＮＡ：ｔｒａｃｒＲＮＡ複合体を標的ＤＮＡ上の特定部位に先導することが可能なデュプレックスを形成する。Ｃａｓ９ヌクレアーゼは、ｃｒＲＮＡスペーサーにより規定される領域内の二本鎖切断を誘導する。ＮＨＥＪによる修復の結果、挿入及び／又は欠失が生じ、標的座位の発現が妨害される。あるいは、相同組換え修復により、相同フランキング配列を有するトランスジーンをＤＳＢ部位に導入することもできる。ｃｒＲＮＡとｔｒａｃｒＲＮＡを工学的にシングルガイドＲＮＡ（ｓｇＲＮＡ又はｇＲＮＡ）に一体化することもできる（例えば、Ｊｉｎｅｋ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ３３７：８１６－２１，２０１２参照）。更に、所望の配列を標的とするように、標的部位に相補的なガイドＲＮＡの領域を改変又はプログラムすることもできる（各々本願に援用するＸｉｅ ｅｔ ａｌ．，ＰＬＯＳ Ｏｎｅ ９：ｅ１００４４８，２０１４；米国特許出願公開第ＵＳ２０１４／００６８７９７号、米国特許出願公開第ＵＳ２０１４／０１８６８４３号、米国特許第８，６９７，３５９号、及びＰＣＴ公開第ＷＯ２０１５／０７１４７４号）。所定の実施形態において、遺伝子ノックアウトは、挿入、欠失、突然変異又はその組み合わせを含み、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓヌクレアーゼシステムを使用して実施される。
典型的なｇＲＮＡ配列と、このような配列を使用して免疫細胞タンパク質をコードする内在性遺伝子をノックアウトする方法としては、Ｒｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．２３（９）：２２５５－２２６６（２０１７）に記載されているものが挙げられ、そのｇＲＮＡ、ＣＡＳ９ＤＮＡ、ベクター、及び遺伝子ノックアウト技術に関する開示内容全体を本願に援用する。
他のＣａｓヌクレアーゼを使用してもよく、限定されないが、Ｃａｓ１２ヌクレアーゼ、Ｃａｓ１３ヌクレアーゼ、及びＣａｓ１４ヌクレアーゼとその変異体が挙げられる。例えば、ＷＯ２０１９／１７８４２７に開示されているＣａｓヌクレアーゼを利用することができ、（同文献に開示されているＣａｓヌクレアーゼ、ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓシステム、及び関連方法を含めて）その開示内容全体を本願に援用する。
本願で使用する「メガヌクレアーゼ」、別称「ホーミングエンドヌクレアーゼ」とは、大きな認識部位（約１２～約４０塩基対の二本鎖ＤＮＡ配列）を特徴とするエンドデオキシリボヌクレアーゼを意味する。メガヌクレアーゼは、配列及び構造モチーフに基づいて、ＬＡＧＬＩＤＡＤＧ、ＧＩＹ－ＹＩＧ、ＨＮＨ、Ｈｉｓ－Ｃｙｓボックス及びＰＤ－（Ｄ／Ｅ）ＸＫの５種類のファミリーに分けることができる。典型的なメガヌクレアーゼとしては、Ｉ－ＳｃｅＩ、Ｉ－ＣｅｕＩ、ＰＩ－ＰｓｐＩ、ＰＩ－Ｓｃｅ、Ｉ－ＳｃｅＩＶ、Ｉ－ＣｓｍＩ、Ｉ－ＰａｎＩ、Ｉ－ＳｃｅＩＩ、Ｉ－ＰｐｏＩ、Ｉ－ＳｃｅＩＩＩ、Ｉ－ＣｒｅＩ、Ｉ－ＴｅｖＩ、Ｉ－ＴｅｖＩＩ及びＩ－ＴｅｖＩＩＩが挙げられ、その認識配列は公知である（例えば、米国特許第５，４２０，０３２号及び６，８３３，２５２号；Ｂｅｌｆｏｒｔ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５：３３７９－３３８８，１９９７；Ｄｕｊｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ ８２：１１５－１１８，１９８９；Ｐｅｒｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２２：１１２５－１１２７，１９９４；Ｊａｓｉｎ，Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｅｎｅｔ．１２：２２４－２２８，１９９６；Ｇｉｍｂｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２６３：１６３－１８０，１９９６；Ａｒｇａｓｔ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２８０：３４５－３５３，１９９８参照）。
所定の実施形態では、ＰＤ－１、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＣＴＬＡ４、ＴＩＧＩＴ、ＨＬＡをコードする遺伝子、又はＴＣＲコンポーネントをコードする遺伝子から選択される標的の部位特異的ゲノム修飾を促進するために天然メガヌクレアーゼを使用することができる。他の実施形態では、標的遺伝子に対する新規な結合特異性を有する人工メガヌクレアーゼを部位特異的ゲノム修飾に使用する（例えば、Ｐｏｒｔｅｕｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２３：９６７－７３，２００５；Ｓｕｓｓｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３４２：３１－４１，２００４；Ｅｐｉｎａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．３１：２９５２－６２，２００３；Ｃｈｅｖａｌｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃ．Ｃｅｌｌ １０：８９５－９０５，２００２；Ａｓｈｗｏｒｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ４４１：６５６－６５９，２００６；Ｐａｑｕｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．７：４９－６６，２００７；米国特許公開第ＵＳ２００７／０１１７１２８号、ＵＳ２００６／０２０６９４９号、ＵＳ２００６／０１５３８２６号、ＵＳ２００６／００７８５５２号、及びＵＳ２００４／０００２０９２号参照）。更なる実施形態では、メガＴＡＬと呼ばれる融合タンパク質を作製するようにＴＡＬＥＮのモジュラーＤＮＡ結合ドメインで修飾したホーミングエンドヌクレアーゼを使用して染色体遺伝子ノックアウトを行う。メガＴＡＬは、１種以上の標的遺伝子をノックアウトするためだけでなく、該当ポリペプチドをコードする外来ドナー鋳型と併用した場合には、異種又は外来ポリヌクレオチドを導入（ノックイン）するために利用することもできる。
所定の実施形態において、染色体遺伝子ノックアウトは、腫瘍関連抗原と特異的に結合する抗原特異的受容体をコードする異種ポリヌクレオチドを含む宿主細胞（例えば、免疫細胞）に阻害性核酸分子を導入することを含み、前記阻害性核酸分子は、標的特異的阻害剤をコードし、前記コードされる標的特異的阻害剤は、前記宿主細胞における（即ち、ＰＤ－１、ＴＩＭ３、ＬＡＧ３、ＣＴＬＡ４、ＴＩＧＩＴ、ＨＬＡコンポーネント、若しくはＴＣＲコンポーネント、又は任意のその組み合わせの）内在性遺伝子発現を阻害する。
染色体遺伝子ノックアウトは、ノックアウト工程又はノックアウト剤の使用後に宿主細胞のＤＮＡシーケンシングにより直接確認することができる。染色体遺伝子ノックアウトは、ノックアウト後の遺伝子発現の不在（例えば、前記遺伝子によりコードされるｍＲＮＡ又はポリペプチド産物の不在）から推測することもできる。
ある種の実施形態において、結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、前記宿主細胞に対して異種であり、前記宿主細胞の内在性ＴＣＲ遺伝子座に含まれる。
別の態様において、本願では、（例えば、有効量の）本開示の結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、又は宿主細胞と、薬学的に許容される基剤、希釈剤、又は賦形剤を含む組成物が提供される。
本願では、有効量の改変免疫細胞又は前記宿主細胞を含む組成物を含むユニットドーズ製剤も提供される。所定の実施形態において、ユニットドーズ製剤は、（ｉ）少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、又は少なくとも約９５％の改変ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む組成物と、（ｉｉ）少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、又は少なくとも約９５％の改変ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む組成物を約１：１の比で含み、前記ユニットドーズ製剤は、ナイーブＴ細胞の含有量が少ないか、又は実質的にゼロである（即ち、ユニットドーズ製剤に存在するナイーブＴ細胞集団が、同等数のＰＢＭＣを有する患者試料に比較して約５０％未満、約４０％未満、約３０％未満、約２０％未満、約１０％未満、約５％未満、又は約１％未満である）。
ある種の実施形態において、ユニットドーズ製剤は、（ｉ）少なくとも約５０％の改変ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む組成物と、（ｉｉ）少なくとも約５０％の改変ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む組成物を約１：１の比で含み、前記ユニットドーズ製剤は、ナイーブＴ細胞の含有量が少ないか、又は実質的にゼロである。更なる実施形態において、ユニットドーズ製剤は、（ｉ）少なくとも約６０％の改変ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む組成物と、（ｉｉ）少なくとも約６０％の改変ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む組成物を約１：１の比で含み、前記ユニットドーズ製剤は、ナイーブＴ細胞の含有量が少ないか、又は実質的にゼロである。更に他の実施形態において、ユニットドーズ製剤は、（ｉ）少なくとも約７０％の人工ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む組成物と、（ｉｉ）少なくとも約７０％の人工ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む組成物を約１：１の比で含み、前記ユニットドーズ製剤は、ナイーブＴ細胞の含有量が少ないか、又は実質的にゼロである。ある種の実施形態において、ユニットドーズ製剤は、（ｉ）少なくとも約８０％の改変ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む組成物と、（ｉｉ）少なくとも約８０％の改変ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む組成物を約１：１の比で含み、前記ユニットドーズ製剤は、ナイーブＴ細胞の含有量が少ないか、又は実質的にゼロである。ある種の実施形態において、ユニットドーズ製剤は、（ｉ）少なくとも約８５％の改変ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む組成物と、（ｉｉ）少なくとも約８５％の改変ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む組成物を約１：１の比で含み、前記ユニットドーズ製剤は、ナイーブＴ細胞の含有量が少ないか、又は実質的にゼロである。ある種の実施形態において、ユニットドーズ製剤は、（ｉ）少なくとも約９０％の改変ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む組成物と、（ｉｉ）少なくとも約９０％の改変ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む組成物を約１：１の比で含み、前記ユニットドーズ製剤は、ナイーブＴ細胞の含有量が少ないか、又は実質的にゼロである。
当然のことながら、本開示のユニットドーズ製剤は、本願に記載する（即ち、ＳＯＸ２抗原に特異的な結合タンパク質をコードし、任意に発現する）宿主細胞と、別の抗原（例えば、別のＳＯＸ２抗原、又は別のタンパク質若しくは標的に由来する抗原、例えば、ＢＣＭＡ、ＣＤ３、ＣＥＡＣＡＭ６、ｃ－Ｍｅｔ、ＥＧＦＲ、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＥｒｂＢ２、ＥｒｂＢ３、ＥｒｂＢ４、ＥｐｈＡ２、ＩＧＦ１Ｒ、ＧＤ２、Ｏ－アセチルＧＤ２、Ｏ－アセチルＧＤ３、ＧＨＲＨＲ、ＧＨＲ、ＦＬＴ１、ＫＤＲ、ＦＬＴ４、ＣＤ４４ｖ６、ＣＤ１５１、ＣＡ１２５、ＣＥＡ、ＣＴＬＡ－４、ＧＩＴＲ、ＢＴＬＡ、ＴＧＦＢＲ２、ＴＧＦＢＲ１、ＩＬ６Ｒ、ｇｐ１３０、Ｌｅｗｉｓ Ａ、Ｌｅｗｉｓ Ｙ、ＴＮＦＲ１、ＴＮＦＲ２、ＰＤ１、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、ＨＶＥＭ、ＭＡＧＥ－Ａ（例えば、ＭＡＧＥ－Ａ１、ＭＡＧＥ－Ａ３、及びＭＡＧＥ－Ａ４を含む）、メソテリン、ＮＹ－ＥＳＯ－１、ＰＳＭＡ、ＲＡＮＫ、ＲＯＲ１、ＴＮＦＲＳＦ４、ＣＤ４０、ＣＤ１３７、ＴＷＥＡＫ－Ｒ、ＨＬＡ、ＨＬＡと結合した腫瘍若しくは病原体関連ペプチド、ＨＬＡと結合したｈＴＥＲＴペプチド、ＨＬＡと結合したチロシナーゼペプチド、ＨＬＡと結合したＷＴ－１ペプチド、ＬＴβＲ、ＬＩＦＲβ、ＬＲＰ５、ＭＵＣ１、ＯＳＭＲβ、ＴＣＲα、ＴＣＲβ、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ２５、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ５２、ＣＤ５６、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ８０、ＣＤ８１、ＣＤ８６、ＣＤ１２３、ＣＤ１７１、ＣＤ２７６、Ｂ７Ｈ４、ＴＬＲ７、ＴＬＲ９、ＰＴＣＨ１、ＷＴ－１、ＨＡ１－Ｈ、Ｒｏｂｏ１、α－フェトプロテイン（ＡＦＰ）、Ｆｒｉｚｚｌｅｄ、ＯＸ４０、ＰＲＡＭＥ、及びＳＳＸ－２等）に特異的な結合タンパク質を発現する細胞（例えば、Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞、又はＮＫ細胞等の免疫細胞）を含むことができる。例えば、ユニットドーズ製剤は、ＳＯＸ２－ＨＬＡ複合体と特異的に結合する結合タンパク質を発現する改変ＣＤ８＋Ｔ細胞と、ＣＤ１９抗原と特異的に結合する結合タンパク質（例えば、ＣＡＲ）を発現する改変ＣＤ４＋Ｔ細胞（及び／又は改変ＣＤ８＋Ｔ細胞）を含むことができる。同様に当然のことながら、本願に開示する免疫細胞のいずれも併用療法で投与することができる。
本願に記載する実施形態のいずれかにおいて、ユニットドーズ製剤は、同数又はほぼ同数の人工ＣＤ４５ＲＡ－ＣＤ３＋ＣＤ８＋細胞と、改変ＣＤ４５ＲＡ－ＣＤ３＋ＣＤ４＋ＴＭ細胞を含む。
本開示に係るＴＣＲミミック抗体又は抗原結合断片を発現させるための宿主細胞と、ＴＣＲミミック抗体又は抗原結合断片をコードするベクター又はポリヌクレオチドを含むか、又は導入した宿主細胞も提供する。
このような細胞の例としては、限定されないが、真核細胞（例えば、酵母細胞、動物細胞、昆虫細胞、植物細胞）と、大腸菌等の原核細胞が挙げられる、ある種の実施形態において、前記細胞は、哺乳動物細胞である。所定の実施形態において、前記細胞は、（例えば、不死化された及び／又は前記抗体若しくは抗原結合断片をコードするように工学的に操作された）Ｂ細胞、形質細胞、又は造血前駆細胞である。所定の実施形態において、前記細胞は、ＣＨＯ細胞（例えば、ＤＨＦＲ－ＣＨＯ細胞（Ｕｒｌａｕｂ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ７７：４２１６（１９８０））、ヒト胚性腎細胞（例えば、ＨＥＫ２９３Ｔ細胞）、ＰＥＲ．Ｃ６細胞、Ｙ０細胞、Ｓｐ２／０細胞、ＮＳ０細胞、ヒト肝細胞（例えば、ＨｅｐａＲＧ細胞）、骨髄腫細胞又はハイブリドーマ細胞である。哺乳動物宿主細胞株の他の例としては、マウスセルトリ細胞（例えば、ＴＭ４細胞）、ＳＶ４０により形質転換されたサル腎臓由来ＣＶ１株（ＣＯＳ－７）、ベビーハムスター腎細胞（ＢＨＫ）、アフリカミドリザル腎細胞（ＶＥＲＯ－７６）、サル腎細胞（ＣＶ１）、ヒト子宮頸がん細胞（ＨＥＬＡ）、ヒト肺細胞（Ｗ１３８）、ヒト肝細胞（ＨｅｐＧ２）、イヌ腎細胞（ＭＤＣＫ）、バッファローラット肝細胞（ＢＲＬ３Ａ）、マウス乳腺腫瘍（ＭＭＴ０６０５６２）、ＴＲＩ細胞、ＭＲＣ５細胞、及びＦＳ４細胞が挙げられる。抗体産生に適した哺乳動物宿主細胞株としては、例えば、Ｙａｚａｋｉ ａｎｄ Ｗｕ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．２４８（Ｂ．．Ｋ．Ｃ．Ｌｏ，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，Ｎ．Ｊ．），ｐｐ．２５５－２６８（２００３）に記載されているものが挙げられる。
所定の実施形態において、宿主細胞は、大腸菌等の原核細胞である。大腸菌等の原核細胞におけるペプチドの発現は確立している（例えば、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ，Ａ．Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ９：５４５－５５１（１９９１）参照）。例えば、特にグリコシル化とＦｃエフェクター機能が不要な場合には、抗体を細菌で産生させてもよい。細菌における抗体断片とポリペプチドの発現については、例えば、米国特許第５，６４８，２３７号、５，７８９，１９９号、及び５，８４０，５２３号を参照されたい。
特定の実施形態では、本願の記載に係るベクターを細胞にトランスフェクトすることができる。トランスフェクションは、例えば、エレクトロポレーション、例えば、カチオン性脂質及び／又はリポソームによるリポフェクション、リン酸カルシウム沈殿法、ナノ粒子によるトランスフェクション、ウイルスによるトランスフェクション、あるいはＤＥＡＥ－デキストランやポリエチレンイミン等のカチオン性ポリマーによるトランスフェクション等の方法を使用して実施することができる。所定の実施形態において、前記導入は非ウイルス性である。
更に、例えば、本開示に係る抗体又はその抗原結合断片を発現させるために、本開示に係るベクターを本開示の宿主細胞に安定的又は一過性にトランスフェクトすることができる。このような実施形態では、本願に記載するベクターを細胞に安定的にトランスフェクトすることができる。あるいは、本願に開示する抗体又は抗原結合断片をコードする本開示に係るベクターを細胞に一過性にトランスフェクトすることができる。本願に開示する実施形態のいずれかにおいて、ポリヌクレオチドは、宿主細胞に対して異種とすることができる。
したがって、本開示は、本開示の抗体又は抗原結合断片を発現する組換え宿主細胞も提供する。例えば、前記細胞は、前記抗体の全部又は一部を入手した由来元の生物種と異なる生物種に由来することができる（例えば、ヒト抗体又は人工ヒト抗体を発現するＣＨＯ細胞）。ある種の実施形態において、前記宿主細胞の細胞種は、天然では前記抗体又は抗原結合断片を発現しない。更に、前記宿主細胞は、前記抗体又は抗原結合断片の天然状態（あるいは抗体又は抗原結合断片が工学的に作製又は取得される由来元の親抗体の天然状態）では存在しない翻訳後修飾（ＰＴＭ、例えば、グリコシル化又はフコシル化）を前記抗体又は抗原結合断片に付与することができる。このようなＰＴＭは、機能的変化（例えば、免疫原性低下）を生じることができる。したがって、本願に開示する宿主細胞により産生される本開示の抗体又は抗原結合断片は、その天然状態の抗体（又は親抗体）とは異なる１箇所以上の翻訳後修飾を含むことができる（例えば、ＣＨＯ細胞により産生されるヒト抗体は、ヒトから単離される場合及び／又は天然ヒトＢ細胞若しくは形質細胞により産生される場合の抗体とは異なる翻訳後修飾を含むことができる）。
抗体又は抗原結合断片を発現させるのに有用な昆虫細胞としては、例えば、ツマジロクサヨトウ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒａ）Ｓｆ９細胞、イラクサギンウワバ（Ｔｒｉｃｈｏｐｌｕｓｉａ ｎｉ）ＢＴＩ－ＴＮ５Ｂ１－４細胞、及びツマジロクサヨトウＳｆＳＷＴ０１「Ｍｉｍｉｃ（ＴＭ）」細胞が挙げられる。例えば、Ｐａｌｍｂｅｒｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１５３（３－４）：１６０－１６６（２０１１）参照。昆虫細胞と組み合わせて使用することができる多数のバキュロウイルス系が同定されており、特にツマジロクサヨトウ細胞へのトランスフェクションに用いられている。
糸状菌や酵母等の真核微生物もタンパク質をコードするベクターのクローニング又は発現に適しており、部分的又は完全ヒトグリコシル化パターンを有する抗体が産生されるように「ヒト化」グリコシル化経路を有する真菌及び酵母系が挙げられる。Ｇｅｒｎｇｒｏｓｓ，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．２２：１４０９－１４１４（２００４）；Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．２４：２１０－２１５（２００６）参照。
植物細胞も本開示の抗体又は抗原結合断片を発現させるための宿主として利用することができる。例えば、（例えば、米国特許第５，９５９，１７７号、６，０４０，４９８号、６，４２０，５４８号、７，１２５，９７８号及び６，４１７，４２９号に記載されている）ＰＬＡＮＴＩＢＯＤＩＥＳ（ＴＭ）テクノロジーは、抗体を産生させるためにトランスジェニック植物を利用している。
所定の実施形態において、前記宿主細胞は、哺乳動物細胞を含む。特定の実施形態において、前記宿主細胞は、ＣＨＯ細胞、ＨＥＫ２９３細胞、ＰＥＲ．Ｃ６細胞、Ｙ０細胞、Ｓｐ２／０細胞、ＮＳ０細胞、ヒト肝細胞、骨髄腫細胞、又はハイブリドーマ細胞である。
ポリヌクレオチド、トランスジーン、及びベクター
更なる態様において、本開示は、本願に記載する免疫原性ペプチド、融合ポリペプチド、又は結合タンパク質（例えば、ＳＯＸ２特異的ＴＣＲ、ｓｃＴｖ、ＴＣＲミミック抗体若しくはその抗原結合断片、ｓｃＴＣＲ、又は本願に記載するＴＣＲＶαドメイン及びＶβドメインを含む（更に、任意に、本願に記載する定常ドメイン又は他のコンポーネントを含む）ＣＡＲ）をコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
所定の実施形態において、本開示の結合タンパク質の２個以上のコンポーネント又は部分をコードするポリヌクレオチドは、単一のオープンリーディングフレーム内で機能的に結合された２個以上のコーディング配列を含む。このように配置すると、所望の遺伝子産物の協調発現を実現できるという利点があり、例えば、ＴＣＲのα鎖とβ鎖が約１：１の比で産生されるように同時に発現させることが可能になる。所定の実施形態において、ＴＣＲ（例えば、α鎖とβ鎖）等の本開示の結合タンパク質の２個以上の置換成分である遺伝子産物は、別々の分子として発現され、翻訳後に会合する。更なる実施形態において、本開示の結合タンパク質の２個以上の置換成分である遺伝子産物は、切断可能又は除去可能なセグメントにより分離された部分を有する単一ペプチドとして発現される。例えば、単一のポリヌクレオチド又はベクターによりコードされる分離可能なポリペプチドの発現に有用な自己切断ペプチドは、当技術分野で公知であり、例えば、豚テシオウイルス－１由来２Ａ（Ｐ２Ａ）ペプチド、トセア・アシグナ（Ｔｈｏｓｅａａｓｉｇｎａ）ウイルス由来２Ａ（Ｔ２Ａ）ペプチド、馬鼻炎Ａウイルス（ＥＲＡＶ）由来２Ａ（Ｅ２Ａ）ペプチド、及び口蹄疫ウイルス由来２Ａ（Ｆ２Ａ）ペプチドが挙げられる。
ある種の実施形態において、ポリヌクレオチドは、ＤＮＡ、ＲＮＡ（任意にｍＲＮＡ）、又はその両方を含む。所定の実施形態において、ポリヌクレオチドは、ＤＮＡを含む。
所定の実施形態において、（１）前記ポリヌクレオチドは、配列番号４８、９６、１２、２４、３６、６０、７２、８４、１０８、１２０、１３２及び１４４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列をコードする；及び／又は（２）前記ポリヌクレオチドは、配列番号４７、９５、１１、２３、３５、４７、５９、７１、８３、１０７、１１９、１３１及び１４３のいずれか１つに記載の核酸配列を含むか、又は前記核酸配列から構成されるか、又は前記核酸配列に対して少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するポリヌクレオチドを含む。
ある種の実施形態において、ポリヌクレオチドは、宿主細胞で発現するようにコドン最適化されており、任意に、前記宿主細胞は、免疫系細胞を含み、更に任意に、前記免疫系細胞は、Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞、又はＮＫ細胞を含む。
本開示の宿主細胞は、本願に記載する結合タンパク質をコードする単一のポリヌクレオチドを含むものでもよいし、前記結合タンパク質は、２個以上のポリヌクレオチドによりコードされていてもよい。換言するならば、結合タンパク質のコンポーネント又は部分は、２個以上のポリヌクレオチドによりコードされていてもよく、これらのポリヌクレオチドは、単一の核酸分子上に含まれるものでもよいし、２個以上の核酸分子上に含まれるものでもよい。
更なる実施形態において、結合タンパク質は、安全性スイッチタンパク質、タグ、選択マーカー、ＣＤ８コレセプターβ鎖、α鎖若しくはその両方、又は任意のその組み合わせ等の１種以上の他のアクセサリータンパク質をコードするトランスジーンコンストラクトの一部として発現される。結合タンパク質とアクセサリーコンポーネント（例えば、安全性スイッチタンパク質、選択マーカー、ＣＤ８コレセプターβ鎖、又はＣＤ８コレセプターα鎖の１種以上）をコード・発現させるために有用なポリヌクレオチド及びトランスジーンコンストラクトも提供する。
所定の実施形態では、望ましい場合にこのような細胞の活性を選択的に調節する（例えば、低下又は消失させる）ためにコグネイト薬又は他の化合物を使用して安全性スイッチタンパク質を標的とすることができる。その際に使用される安全性スイッチタンパク質としては、例えば、細胞外Ｎ末端リガンド結合ドメインと細胞内受容体チロシンキナーゼ活性を欠失するが、天然アミノ酸配列と、Ｉ型膜貫通細胞表面局在と、医薬品グレード抗ＥＧＦＲモノクローナル抗体であるセツキシマブ（Ｅｒｂｉｔｕｘ）ｔＥＧＦ受容体（ｔＥＧＦｒ；Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １１８：１２５５－１２６３，２０１１）に対する立体構造的に無傷の結合エピトープを維持する短縮型ＥＧＦ受容体ポリペプチド（ｈｕＥＧＦＲｔ）、カスパーゼポリペプチド（例えば、ｉＣａｓｐ９；Ｓｔｒａａｔｈｏｆ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １０５：４２４７－４２５４，２００５；Ｄｉ Ｓｔａｓｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３６５：１６７３－１６８３，２０１１；Ｚｈｏｕ ａｎｄ Ｂｒｅｎｎｅｒ，Ｅｘｐ．Ｈｅｍａｔｏｌ．ｐｉｉ：Ｓ０３０１－４７２Ｘ（１６）３０５１３－６．ｄｏｉ：１０．１０１６／ｊ．ｅｘｐｈｅｍ．２０１６．０７．０１１）、ＲＱＲ８（Ｐｈｉｌｉｐ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １２４：１２７７－１２８７，２０１４）、本願に記載するようなヒトｃ－ｍｙｃタンパク質（Ｍｙｃ）の１０アミノ酸タグ（Ｋｉｅｂａｃｋ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０５：６２３－６２８，２００８）、及びＲＱＲ（ＣＤ２０＋ＣＤ３４；Ｐｈｉｌｉｐ ｅｔ ａｌ．，２０１４）等のマーカー／安全性スイッチポリペプチドが挙げられる。
治療用細胞に有用な他のアクセサリーコンポーネントは、細胞の同定、選別、単離、集積、又は追跡を可能にするタグ又は選択マーカーを含む。例えば、所望の特性（例えば、抗原特異的ＴＣＲ及び安全性スイッチタンパク質）を有する免疫細胞に標識し、試料中の未標識細胞から選別し、所望の純度の治療製品に配合するようにより効率的に活性化・増殖させることができる。
本願で使用する「選択マーカー」なる用語は、選択マーカーを含むポリヌクレオチドが導入された免疫細胞の検出と陽性選択を可能にする識別可能な変異を細胞に付与する核酸コンストラクトを含む。ＲＱＲは、ＣＤ２０の主要な細胞外ループと、２個の最小ＣＤ３４結合部位を含む選択マーカーである。ある種の実施形態において、ＲＱＲをコードするポリヌクレオチドは、１６アミノ酸のＣＤ３４の最小エピトープをコードするポリヌクレオチドを含む。ある種の実施形態（例えば、本願の実施例に記載する所定の実施形態）では、このようなＣＤ３４の最小エピトープをＣＤ８ストークドメインのアミノ末端位置に組み込む（Ｑ８）。更なる実施形態では、このようなＣＤ３４の最小結合部位配列をＣＤ２０の標的エピトープと組み合わせてＴ細胞のコンパクトなマーカー／自殺遺伝子を形成することができる（ＲＱＲ８）（本願に援用するＰｈｉｌｉｐ ｅｔ ａｌ．，２０１４）。このコンストラクトでは、例えば、磁気ビーズ（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）と結合したＣＤ３４特異抗体を使用して前記コンストラクトを発現する免疫細胞を選択することができ、臨床的に承認されている医薬品抗体であるリツキシマブを利用でき、トランスジーンを発現する人工Ｔ細胞を選択的に欠損させることができる（Ｐｈｉｌｉｐ ｅｔ ａｌ．，２０１４）。
他の典型的な選択マーカーとしては、通常ではＴ細胞で発現されない数種の短縮型Ｉ型膜貫通タンパク質も挙げられ、例えば、短縮型低親和性神経成長因子、短縮型ＣＤ１９、及び短縮型ＣＤ３４が挙げられる（例えば、Ｄｉ Ｓｔａｓｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３６５：１６７３－１６８３，２０１１；Ｍａｖｉｌｉｏ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ ８３：１９８８－１９９７，１９９４；Ｆｅｈｓｅ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．１：４４８－４５６，２０００が参照され、各々その開示内容全体を本願に援用する）。ＣＤ１９とＣＤ３４の１つの特徴は、臨床グレード選別用にこれらのマーカーを標的とすることができる既製のＭｉｌｔｅｎｙｉ ＣｌｉｎｉＭＡＣｓ（ＴＭ）選択システムを利用できる点である。一方、ＣＤ１９とＣＤ３４は、比較的大きな細胞タンパク質であり、組込みベクターのベクターパッケージング能と転写効率の点で不利となり得る。細胞外非シグナル伝達ドメイン又は種々のタンパク質を含む表面マーカー（例えば、ＣＤ１９、ＣＤ３４、ＬＮＧＦＲ）も利用できる。適正製造規範に適合するものであれば、どのような選択マーカーも利用することができる。所定の実施形態において、選択マーカーは、該当遺伝子産物（例えば、ＴＣＲやＣＡＲ等の本開示の結合タンパク質）をコードするポリヌクレオチドと共に発現される。選択マーカーの更なる例としては、例えば、ＧＦＰ、ＥＧＦＰ、β－ｇａｌ又はクロラムフェニコールアセチルトランスフラーゼ（ＣＡＴ）等のレポーターが挙げられる。所定の実施形態では、例えば、ＣＤ３４等の選択マーカーを細胞により発現させ、本願に記載する方法で使用するために形質導入された該当細胞を（例えば、免疫磁気選択法により）選択、集積、又は単離するためにＣＤ３４を使用することができる。本願で使用するＣＤ３４マーカーは、抗ＣＤ３４抗体、又は、例えば、ｓｃＦｖ、ＴＣＲ、若しくはＣＤ３４と結合する他の抗原認識部分とは区別される。所定の実施形態において、選択マーカーは、ＲＱＲポリペプチド、短縮型低親和性神経成長因子（ｔＮＧＦＲ）、短縮型ＣＤ１９（ｔＣＤ１９）、短縮型ＣＤ３４（ｔＣＤ３４）、又は任意のその組み合わせを含む。
本開示の結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドと、前記ポリヌクレオチドを含む宿主細胞は、所定の実施形態において、更にＣＤ８コレセプタータンパク質、又はそのβ鎖若しくはα鎖成分をコードするポリヌクレオチドを含む。背景として、ＣＤ４＋Ｔ細胞を免疫療法細胞製剤に利用すると、ＩＬ－２分泌を抗原により誘導することができ、移入された細胞傷害性ＣＤ８＋Ｔ細胞の持続及び機能を増強することができる（例えば、Ｋｅｎｎｅｄｙ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．２２２：１２９（２００８）；Ｎａｋａｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ４６２（７２７２）：５１０（２００９）参照）。所定の状況において、ＣＤ４＋Ｔ細胞におけるクラスＩ拘束性ＴＣＲは、クラスＩ ＨＬＡペプチド複合体に対するＴＣＲの感受性を強化するためにＣＤ８コレセプターの移入を必要とする場合がある。ＣＤ４コレセプターは、構造がＣＤ８と異なるため、ＣＤ８コレセプターの代用として有効に利用することができない（例えば、Ｓｔｏｎｅ ＆ Ｋｒａｎｚ，Ｆｒｏｎｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．４：２４４（２０１３）参照；Ｃｏｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ １３７（２）：１３９（２０１２）も参照）。そこで、本開示の組成物及び方法で使用される別のアクセサリータンパク質は、ＣＤ８コレセプター又はそのコンポーネントを含む。
コードされるＣＤ８コレセプターは、ある種の実施形態において、β鎖を含む（例えば、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ識別子Ｐ１０９６６－１、Ｐ１０９６６－２、Ｐ１０９６６－３、Ｐ１０９６６－４、Ｐ１０９６６－６、Ｐ１０９６６－７、Ｐ１０９６６－８、及びＰ１０９６６－９参照）。更なる実施形態において、前記コードされるＣＤ８コレセプターは、ＲＱＲポリペプチドを更に含む組換えＣＤ８コレセプターである。理論に拘束する意図はないが、ＲＱＲポリペプチドが選択マーカー／安全性スイッチとして機能するためには宿主細胞表面からの距離が重要であると考えられる（Ｐｈｉｌｉｐ ｅｔ ａｌ．，２０１０（前出））。ある種の実施形態において、前記コードされるＲＱＲポリペプチドは、前記コードされるＣＤ８コレセプターのβ鎖、α鎖、又はその両方に含まれる。特定の実施形態において、改変免疫細胞は、ｉＣａｓｐ９をコードする異種ポリヌクレオチドに加え、ＲＱＲポリペプチドを含むβ鎖と更にＣＤ８α鎖を含む組換えＣＤ８コレセプタータンパク質をコードする異種ポリヌクレオチドを含む。
更なる実施形態において、宿主細胞は、ｉＣａｓｐ９をコードする異種ポリヌクレオチドに加え、ＲＱＲポリペプチドを含むα鎖と更にＣＤ８β鎖を含む組換えＣＤ８コレセプタータンパク質をコードする異種ポリヌクレオチドを含む。ある種の実施形態では、前記コードされるＣＤ８α鎖と前記コードされるＣＤ８β鎖の両方がＲＱＲポリペプチドを含む。
結合タンパク質、安全性スイッチタンパク質、選択マーカー、及びＣＤ８コレセプタータンパク質をコードする単一ポリヌクレオチドを含むように宿主細胞に効率的に形質導入し、効率的に発現させることができる。例えば、ある種の実施形態において、本開示の宿主細胞は、５’から３’の方向に、（［ｉＣａｓｐ９ポリペプチド］－［豚テシオウイルス由来２Ａ（Ｐ２Ａ）ペプチド］－［ＴＣＲβ鎖］－［Ｐ２Ａペプチド］－［ＴＣＲα鎖］－［Ｐ２Ａペプチド］－［ＲＱＲポリペプチドを含むＣＤ８β鎖］－［Ｐ２Ａペプチド］－［ＣＤ８α鎖］）をコードする異種ポリヌクレオチドを含む。
ある種の実施形態において、結合タンパク質をコードするポリヌクレオチド（又はこのようなポリヌクレオチドを含む宿主細胞）は、更に、（ｉ）ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターα鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターα鎖を含む。）；（ｉｉ）ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターβ鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターβ鎖を含む。）；又は（ｉｉｉ）（ｉ）のポリヌクレオチドと（ｉｉ）のポリヌクレオチドを含むことができる。理論に拘束するものではないが、所定の実施形態では、結合タンパク質とＣＤ８コレセプタータンパク質又はＨＬＡ分子と結合するように機能するその部分を共発現又は同時発現させると、前記結合タンパク質を単独で発現させる場合に比較して宿主細胞（例えば、Ｔ細胞、任意にＣＤ４＋Ｔ細胞等の免疫細胞）の１種以上の所望の活性を改善できると考えられる。当然のことながら、結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドとＣＤ８コレセプターポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、（例えば、同一発現ベクター内の）単一の核酸分子上に存在していてもよいし、宿主細胞内の別々の核酸分子上に存在していてもよい。
所定の更なる実施形態において、ポリヌクレオチドは、（ａ）ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；（ｂ）ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；及び（ｃ）（ａ）のポリヌクレオチドと（ｂ）のポリヌクレオチドの間に配置された自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む（又は宿主細胞は、上記（ａ）～（ｃ）を含むポリヌクレオチドを含む）。更なる実施形態において、ポリヌクレオチドは、自己切断ペプチドをコードし、（１）結合タンパク質（例えば、本開示のＴＣＲ）をコードするポリヌクレオチドと、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの間；及び／又は（２）結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドと、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの間に配置されたポリヌクレオチドを含む。
更に他の実施形態において、ポリヌクレオチドは、インフレームで機能的に連結された（ｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲ）；（ｉｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲ）；（ｉｉｉ）（ｐｎＴＣＲ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）；（ｉｖ）（ｐｎＴＣＲ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）；（ｖ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）；又は（ｖｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）を含むことができ、上記式中、ｐｎＣＤ８αは、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＣＤ８βは、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＴＣＲは、ＴＣＲをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＳＣＰ１及びｐｎＳＣＰ２は、各々独立して自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、前記ポリヌクレオチド及び／又は前記コードされる自己切断ペプチドは、任意に同一であるか、又は異なる（例えば、Ｐ２Ａ、Ｔ２Ａ、Ｆ２Ａ、Ｅ２Ａ）。
ある種の実施形態において、前記コードされるＴＣＲは、ＴＣＲα鎖とＴＣＲβ鎖を含み、前記ポリヌクレオチドは、ＴＣＲα鎖をコードするポリヌクレオチドとＴＣＲβ鎖をコードするポリヌクレオチドの間に配置された自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。ある種の実施形態において、前記ポリヌクレオチドは、インフレームで機能的に連結された（ｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲα）；（ｉｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲα）；（ｉｉｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲβ）；（ｉｖ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲβ）；（ｖ）（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８β）；（ｖｉ）（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８α）；（ｖｉｉ）（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８β）；又は（ｖｉｉｉ）（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８α）を含み、上記式中、ｐｎＣＤ８αは、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＣＤ８βは、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＴＣＲαは、ＴＣＲα鎖をコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＴＣＲβは、ＴＣＲβ鎖をコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＳＣＰ１、ｐｎＳＣＰ２、及びｐｎＳＣＰ３は、各々独立して自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、前記ポリヌクレオチド及び／又は前記コードされる自己切断ペプチドは、任意に同一であるか、又は異なる。
所定の実施形態において、前記単離ポリヌクレオチドの少なくとも一部は、宿主細胞（例えば、本願に開示する抗原提示細胞又は人工免疫細胞）で発現するようにコドン最適化されている。
特に、前記宿主細胞に含まれる（例えば、本開示の結合タンパク質のいずれかをコードする）上記異種ポリヌクレオチドのいずれも、上記に加えて又は上記に代えて単離形で提供することができる。ある種の実施形態において、前記ポリヌクレオチドは、宿主細胞で発現するようにコドン最適化されている。
所定の実施形態では、ＴＣＲＶα又はαポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドと、ＴＣＲＶβ又はβポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドが、前記宿主細胞に含まれる単一のオープンリーディングフレームに含まれ、前記単一のオープンリーディングフレームは更に、Ｖα（又はαポリペプチド）をコードするポリヌクレオチドとＶβ（又はβポリペプチド）をコードするポリヌクレオチドの間に配置された自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
本願に記載する実施形態のいずれかにおいて、単離ポリヌクレオチドは、Ｔ細胞等の免疫細胞で発現するようにコドン最適化されている。
本願では、本開示のトランスジーンコンストラクトを含むベクターも提供する。ベクターの数例を挙げると、プラスミド、ウイルスベクター、コスミド等が挙げられる。ベクターによっては、それらが導入される宿主細胞で自律複製が可能なものもあり（例えば、細菌複製起点を有する細菌ベクターや、エピソーマル哺乳動物ベクター）、また、宿主細胞のゲノムに組込むことができるものや、宿主細胞に導入後に前記ポリヌクレオチドインサートの組込みを促進することにより、宿主ゲノムと共に複製するものもある（例えば、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター）。更に、ベクターによっては、それらが機能的に連結された遺伝子の発現を誘導することが可能なものもある（これらのベクターを「発現ベクター」と呼ぶことができる）。関連実施形態によると、更に当然のことながら、１種以上の物質（例えば、本願に記載する結合タンパク質をコードするポリヌクレオチド）を対象に併用投与する場合には、前記各物質を別々のベクターに配置してもよいし、同一のベクターに配置してもよく、（各々異なる物質又は同一の物質を含む）複数のベクターを細胞又は細胞集団に導入してもよいし、対象に投与してもよい。
所定の実施形態では、本開示のポリヌクレオチドをベクターの所定のエレメントと機能的に連結することができる。例えば、コーディング配列に繋ぎ合わせてそれらの発現とプロセシングに影響を与えるために必要なポリヌクレオチド配列を機能的に連結することができる。発現制御配列としては、適切な転写開始、終結、プロモーター及びエンハンサー配列；スプライシングシグナルやポリアデニル化シグナル等の効率的ＲＮＡプロセシングシグナル；細胞質ｍＲＮＡを安定化させる配列；翻訳効率を強化する配列（即ち、コザックコンセンサス配列）；タンパク質安定性を強化する配列；並びに場合により、タンパク質分泌を強化する配列が挙げられる。発現制御配列は、該当遺伝子と隣接している場合及び該当遺伝子を制御するようにトランス位置又は一定距離で作用する場合に、機能的に連結されているということができる。
所定の実施形態において、前記ベクターは、プラスミドベクター又はウイルスベクター（例えば、レンチウイルスベクター又はγ－レトロウイルスベクターから選択されるベクター）を含む。ウイルスベクターとしては、レトロウイルス、アデノウイルス、パルボウイルス（例えば、アデノ随伴ウイルス）、コロナウイルス、オルトミクソウイルス（例えば、インフルエンザウイルス）、ラブドウイルス（例えば、狂犬病ウイルスや水疱性口内炎ウイルス）、パラミクソウイルス（例えば、麻疹ウイルスやセンダイウイルス）等のマイナス鎖ＲＮＡウイルス、ピコルナウイルス及びアルファウイルス等のプラス鎖ＲＮＡウイルス、並びにアデノウイルス、ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス１型及び２型、エプスタイン・バールウイルス、サイトメガロウイルス）、及びポックスウイルス（例えば、ワクシニア、鶏痘及びカナリア痘）を含む二本鎖ＤＮＡウイルスが挙げられる。他のウイルスとしては、例えば、ノーウォークウイルス、トガウイルス、フラビウイルス、レオウイルス、パポバウイルス、ヘパドナウイルス、及び肝炎ウイルスが挙げられる。レトロウイルスの例としては、トリ白血病肉腫ウイルス、哺乳動物Ｃ型、Ｂ型ウイルス、Ｄ型ウイルス、ＨＴＬＶ－ＢＬＶグループ、レンチウイルス、及びスプマウイルスが挙げられる（Ｃｏｆｆｉｎ，Ｊ．Ｍ．，Ｒｅｔｒｏｖｉｒｉｄａｅ：Ｔｈｅ ｖｉｒｕｓｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｉｎ Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，Ｔｈｉｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｂ．Ｎ．Ｆｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ．，Ｅｄｓ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ－Ｒａｖｅｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，１９９６）。
「レトロウイルス」は、ＲＮＡゲノムを有するウイルスであり、逆転写酵素を使用してＤＮＡに逆転写され、その後、逆転写されたＤＮＡは宿主細胞ゲノムに取り込まれる。「ガンマレトロウイルス」とは、レトロウイルス科の一属を意味する。ガンマレトロウイルスの例としては、マウス幹細胞ウイルス、マウス白血病ウイルス、ネコ白血病ウイルス、ネコ肉腫ウイルス、及びトリ細網内皮症ウイルスが挙げられる。「レンチウイルス」とは、レトロウイルス科の一属を意味する。本願で使用する「レンチウイルスベクター」とは、遺伝子送達用のＨＩＶベースのレンチウイルスベクターを意味し、組込み型でも非組込み型でもよく、パッケージング容量が比較的大きく、種々の細胞種に導入することができる。レンチウイルスベクターは、通常では、３種（パッケージング、エンベロープ及び移入）以上のプラスミドを産生細胞に一過性にトランスフェクション後に生成される。ＨＩＶと同様に、レンチウイルスベクターは、ウイルス表面糖タンパク質と細胞表面上の受容体の相互作用を介して標的細胞に侵入する。侵入すると、ウイルスＲＮＡは、ウイルス逆転写酵素複合体を介して逆転写される。逆転写産物は二本鎖線状ウイルスＤＮＡであり、感染細胞のＤＮＡへのウイルス組込みの基質である。
所定の実施形態において、前記ウイルスベクターは、ガンマレトロウイルスとすること又はガンマレトロウイルスに由来することができる（例えば、モロニーマウス白血病ウイルス（ＭＬＶ）由来ベクター）。他の実施形態において、前記ウイルスベクターは、より複雑なレトロウイルス由来ベクターとすることができる（例えば、レンチウイルス由来ベクター）。ＨＩＶ－１由来ベクターは、この分類に属する。他の例としては、ＨＩＶ－２、ＦＩＶ、ウマ伝染性貧血ウイルス、ＳＩＶ、及びマエディ・ビスナウイルス（ヒツジレンチウイルス）に由来するレンチウイルスベクターが挙げられる。ＴＣＲ又はＣＡＲトランスジーンを含むウイルス粒子を哺乳動物宿主細胞に導入するためにレトロウイルス及びレンチウイルスベクターとパッケージング細胞を使用する方法は、当技術分野で公知であり、例えば、米国特許第８，１１９，７７２号；Ｗａｌｃｈｌｉ ｅｔ ａｌ．，ＰＬｏＳ Ｏｎｅ ６：３２７９３０，２０１１；Ｚｈａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７４：４４１５，２００５；Ｅｎｇｅｌｓ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．１４：１１５５，２００３；Ｆｒｅｃｈａ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．１８：１７４８，２０１０；及びＶｅｒｈｏｅｙｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．５０６：９７，２００９に既に記載されている。レトロウイルス及びレンチウイルスベクターコンストラクトと発現システムは市販品も利用できる。ＤＮＡウイルスベクターを含む他のウイルスベクターもポリヌクレオチド送達に使用することができ、例えば、アデノウイルスベースベクターとアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベースベクターや、アンプリコンベクター、複製欠損ＨＳＶ及び減衰ＨＳＶを含む単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）に由来するベクターが挙げられる（Ｋｒｉｓｋｙ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．５：１５１７，１９９８）。
遺伝子治療用に開発された他のベクターを本開示の組成物及び方法で使用することもできる。このようなベクターとしては、バキュロウイルスとアルファウイルスに由来するもの（Ｊｏｌｌｙ，Ｄ Ｊ．１９９９．Ｅｍｅｒｇｉｎｇ ｖｉｒａｌ ｖｅｃｔｏｒｓ．ｐｐ ２０９－４０ ｉｎ Ｆｒｉｅｄｍａｎｎ Ｔ．ｅｄ．Ｔｈｅ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ．Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂ）、又は（Ｓｌｅｅｐｉｎｇ Ｂｅａｕｔｙや、他のトランスポゾンベクター等の）プラスミドベクターが挙げられる。
ウイルスベクターゲノムが宿主細胞で別々の転写産物として発現させる複数のポリヌクレオチドを含む場合には、ウイルスベクターは、バイシストロン性又はマルチシストロン性発現を可能にするように、２個（以上）の転写産物の間に更に付加配列を含むことができる。ウイルスベクターで使用されるこのような配列の例としては、配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）、フーリン切断部位、ウイルス２Ａペプチド、又は任意のその組み合わせが挙げられる。
所定の実施形態において、ベクターは、トランスジーンコンストラクトを宿主細胞（例えば、造血前駆細胞又はヒト免疫系細胞）に送達することが可能である。特定の実施形態において、ベクターは、例えば、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４－ＣＤ８－ダブルネガティブＴ細胞、γδＴ細胞、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、又は任意のその組み合わせ等のヒト免疫系細胞にトランスジーンコンストラクトを送達することが可能である。更なる実施形態において、ベクターは、ナイーブＴ細胞、セントラルメモリーＴ細胞、エフェクターメモリーＴ細胞、又は任意のその組み合わせにトランスジーンコンストラクトを送達することが可能である。ある種の実施形態において、本開示のポリヌクレオチド又はトランスジーンコンストラクトをコードするベクターは、更に、宿主細胞で染色体ノックアウトを実施するために使用することができるヌクレアーゼ（例えば、本願に開示するＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓエンドヌクレアーゼ又は別のエンドヌクレアーゼ）又は遺伝子置換療法若しくは遺伝子修復療法で治療用トランスジーン若しくはその部分を宿主細胞に送達するために使用することができるヌクレアーゼをコードするポリヌクレオチドを含むことができる。あるいは、本開示のポリヌクレオチド又はトランスジーンコンストラクトをコードするベクターとは無関係の宿主細胞に、染色体ノックアウト又は遺伝子置換若しくは遺伝子修復療法に使用されるヌクレアーゼを送達することもできる。
使用法
他の態様において、本開示は、造血器悪性腫瘍（例えば、多発性骨髄腫）等の配列番号２～７のいずれか１種に記載のＳＯＸ２抗原の発現に関連するがんに対する免疫応答（例えば、サイトカイン産生、Ｔ細胞の増殖、Ｔ細胞の活性化（例えば、ＣＤ１３７の発現亢進、細胞内カルシウムの産生、ＴＣＲシグナル伝達タンパク質のリン酸化の亢進）、Ｂ細胞の増殖、抗体産生、又は任意のその組み合わせ）を誘導する方法を提供し、前記方法は、前記がんを有するか、又はその疑いのあるヒト対象に、有効量の本願に開示する免疫原性組成物若しくは前記組成物を発現する宿主細胞、ＳＯＸ２特異的結合タンパク質、ＳＯＸ２特異的融合タンパク質、又はＳＯＸ２特異的結合タンパク質をコードし、発現することが可能な宿主細胞（例えば、Ｔ細胞）を投与することを含む。
任意に抗原：ＨＬＡ複合体における配列番号２～７のいずれか１種に記載のＳＯＸ２抗原と特異的に結合するＴ細胞集団を拡大する方法も提供し、前記方法は、前記抗原と特異的に結合する１個以上のＴ細胞を含有する試料を、本開示の免疫原性組成物（又は免疫原性ＳＯＸ２ペプチド若しくは融合ポリペプチドをコードする宿主細胞）と接触させることを含む。
Ｔ細胞の作製及び／又は単離方法も提供し、前記方法は、末梢血細胞又は全血を、（ａ）本開示の免疫原性組成物；又は（ｂ）配列番号２～７のいずれか１種以上に記載のアミノ酸配列を含むＳＯＸ２抗原を発現する（例えば、ＨＬＡ分子内で提示する）か、若しくは前記抗原をパルスした抗原提示細胞（ＡＰＣ）、又は（ｉｖ）（ｉ）～（ｉｉｉ）の任意の組み合わせと接触させる工程と；任意に前記末梢血細胞からＴ細胞を選別する工程を含むことにより、Ｔ細胞を単離及び／又は生成する。
更に他の態様において、本開示は、対象における配列番号２～７のいずれか１種に記載のＳＯＸ２抗原に関連する（例えば、前記抗原を発現する、又は発現すると考えられているか、若しくは発現することが知られている、又は発現することが確認されている）疾患又は障害の治療方法を提供し、前記方法は、本開示のＳＯＸ２特異的宿主（例えば、免疫）細胞、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、融合タンパク質、組成物、又は免疫原性組成物を前記対象に投与することにより、疾患又は病態を治療することを含む。配列番号２～７のいずれか１種に記載のＳＯＸ２抗原に関連する疾患若しくは障害の治療用としての、及び／又は配列番号２～７のいずれか１種に記載のＳＯＸ２抗原に関連する疾患若しくは障害の治療用医薬の製造用としての、本願に開示する結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、組成物、及び免疫原性組成物も提供する。
「治療する」又は「治療」又は「改善する」なる用語は、対象（例えば、ヒト、又は霊長類、ウマ、ネコ、イヌ、ヤギ、マウス、若しくはラット等の非ヒト哺乳動物）の疾患、障害又は病態の医療的管理を意味する。一般に、治療又は予防効果を誘発するために十分な量で本開示の改変免疫細胞と任意にアジュバントを含む適切な用量又は治療レジメンを適用する。治療又は予防／防止効果は、臨床アウトカムの改善、疾患に関連する症状の軽減若しくは緩和、症状の発生低下、生活の質の改善、無病状態の延長、疾患の程度の低減、疾患状態の安定化、疾患進行の遅延、緩解、生存、生存期間の延長、又は任意のその組み合わせを含む。
本願で使用する「治療有効量」又は「有効量」とは、臨床アウトカムの改善、疾患に関連する症状の軽減若しくは緩和、症状の発生低下、生活の質の改善、無病状態の延長、疾患の程度の低減、疾患状態の安定化、疾患進行の遅延、緩解、生存、又は生存期間の延長を含む治療効果を統計的に有意にもたらすために十分な組成物の量を意味する。単独で投与される個々の活性成分又は単一の活性成分を発現する細胞について言及する場合、治療有効量とは、前記成分又は前記成分を発現する細胞の単独の効果を意味する。併用について言及する場合、治療有効量とは、逐次投与するか、又は連続投与するかを問わず、複数の活性成分の併用又は活性成分を発現する細胞と付加活性成分の併用により治療効果を生じる合計量を意味する。併用は、２種以上の活性成分を発現する細胞でもよい。
本願で使用する「統計的に有意」とは、スチューデントのｔ検定を使用して計算した場合にｐ値が０．０５０以下であることを意味し、測定される特定の事象又は結果が偶然に生じたとは考えにくいことを示す。
「薬学的に許容される賦形剤又は基剤」又は「生理的に許容される賦形剤又は基剤」なる用語は、本願に詳細に記載し、ヒト又は他の非ヒト哺乳動物対象に投与するのに適しており、一般に安全であること又は重大な有害イベントを生じないことが認められている生物学的に適合可能な媒体、例えば、生理食塩水を意味する。
所定の実施形態において、本願に開示する方法に従って治療される対象は、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１＋である。ある種の実施形態において、前記疾患又は病態は、がんである。所定の実施形態において、前記がんは、造血器悪性腫瘍又は固形腫瘍を含む。
所定の実施形態において、前記造血器悪性腫瘍は、例えば、多発性骨髄腫等の骨髄腫を含む。所定の実施形態において、前記造血器悪性腫瘍は、白血病（例えば、急性白血病又は慢性白血病）を含む。特定の実施形態において、前記白血病は、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、急性リンパ球性白血病（ＡＬＬ）、混合表現型急性白血病（ＭＰＡＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、Ｂ細胞前リンパ球性白血病、ヘアリー細胞白血病、又は慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）を含む。所定の実施形態において、前記造血器悪性腫瘍は、リンパ腫を含む。所定の実施形態において、前記リンパ腫は、ホジキンリンパ腫（ＨＬ）、非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）、中枢神経系リンパ腫、小リンパ球性リンパ腫（ＳＬＬ）、ＣＤ３７＋樹状細胞リンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、脾辺縁帯リンパ腫、形質細胞骨髄腫、髄外性形質細胞腫、粘膜関連（ＭＡＬＴ）リンパ組織の節外性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、節性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、縦隔（胸腺）大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、前駆Ｂリンパ芽球性リンパ腫、免疫芽球性大細胞型リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、バーキットリンパ腫／白血病、悪性度不明なＢ細胞増殖、リンパ腫様肉芽腫症、及び移植後増殖性疾患を含む。所定の実施形態において、前記造血器悪性腫瘍は、例えば、単一血球系統の異形成を伴う不応性血球減少症（不応性貧血、不応性好中球減少症、及び不応性血小板減少症）、環状鉄芽球を伴う不応性貧血（ＲＡＲＳ）、環状鉄芽球と血小板増多症を伴う不応性貧血（ＲＡＲＳ－ｔ）、多血球系異形成を伴う不応性血球減少症（ＲＣＭＤ）、多血球系異形成と環状鉄芽球を伴う不応性血球減少症（ＲＣＭＤ－ＲＳ）、芽球増加を伴う不応性貧血（ＲＡＥＢ）、分類不能型骨髄異形成症、及び小児不応性血球減少症等の骨髄異形成疾患を含む。
本開示の組成物及び方法で標的とする又は治療することができる固形腫瘍を形成する可能性のある典型的ながんの例としては、肉腫と癌腫が挙げられ、例えば、軟骨肉腫；線維肉腫（線維芽細胞肉腫）；隆起性皮膚線維肉腫（ＤＦＳＰ）；骨肉腫；横紋筋肉腫；ユーイング肉腫；消化管間質腫瘍；平滑筋肉腫；脈管肉腫（血管肉腫）；カポジ肉腫；脂肪肉腫；多形肉腫；滑膜肉腫；扁平上皮がん；腺がん；腺扁平上皮がん；退形成性癌；大細胞がん；小細胞がん；乳がん（例えば、上皮内（非浸潤性）乳管がん、上皮内（非浸潤性）小葉がん、浸潤性乳管がん、浸潤性小葉がん、非浸潤性がん）；肝臓がん（例えば、肝細胞がん、肝内胆管がん又は胆管がん）；肺がん（例えば、腺がん、扁平上皮がん（類表皮がん）、未分化大細胞がん、細気管支肺胞上皮がん）；卵巣がん（例えば、表層上皮性・間質性腫瘍（腺がん）又は（漿液性腫瘍、類内膜腫瘍及び粘液性嚢胞腺がんを含む）上皮性卵巣がん、類表皮がん（扁平上皮がん）、胎児性がん及び絨毛がん（胚細胞腫瘍））；腎臓がん（例えば、腎腺がん、副腎腫、移行上皮がん（腎盂）、扁平上皮がん、ベリニ管がん、明細胞腺がん、移行上皮がん、腎盂カルチノイド腫瘍）；副腎がん（例えば、副腎皮質がん）；精巣がん（例えば、胚細胞がん（セミノーマ、絨毛がん、胎児性がん、奇形がん）、漿液性がん）；胃がん（例えば、腺がん）；腸のがん（例えば、十二指腸腺がん）；大腸がん；又は皮膚がん（例えば、基底細胞がん、扁平上皮がん）、神経芽腫、肝芽腫、脳腫瘍亜型（例えば、神経膠腫、ＰＮＥＴ、頭蓋咽頭腫、脈絡叢腫瘍、神経鞘腫、髄膜腫）、ウィルムス腫瘍、胚細胞腫瘍が挙げられる。
所定の実施形態において、本開示の方法は、卵巣がん、上皮性卵巣がん、子宮頸部腺がん又は小細胞がん、膵臓がん、大腸がん（例えば、腺がん又は扁平上皮がん）、肺がん、乳管がん、又は前立腺がんから選択されるがんにより形成される固形腫瘍を標的とする又は治療する。
ある種の実施形態において、がんは、多発性骨髄腫、形質細胞性白血病、卵巣がん、神経膠腫（例えば、Ｓｃｈｍｉｔｚ ｅｔ ａｌ．Ｂｒ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ ９６（８）：１２９３－１３０１（２００７）参照）、肺がん、頸部がん、子宮頸がん、又は任意のその組み合わせを含む。
固形腫瘍に対する免疫応答（例えば、ＣＴＬ（細胞傷害性Ｔリンパ球）免疫応答）のレベルは、本願に記載する多数の免疫学的方法のいずれか１種により測定することができる。例えば、Ｔ細胞により発現される本願に記載する抗原特異的結合受容体のいずれか１種の投与前後にＣＴＬ免疫応答のレベルを測定することができる。ＣＴＬ活性を測定するための細胞傷害性アッセイは、数種の技術及び方法のいずれか１種を使用して実施することができる（例えば、Ｈｅｎｋａｒｔ ｅｔ ａｌ．，“Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ Ｔ－Ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅｓ”ｉｎ Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｐａｕｌ（ｅｄ．）（２００３ Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ Ｗｉｌｌｉａｍｓ ＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ），１１２７～５０頁とその引用文献；（例えば、本願に記載するような）ＩｎｃｕＣｙｔｅ（Ｒ）アッセイ参照）。
ある種の実施形態において、本開示の方法により治療可能ながんは、膠芽腫、髄芽腫、乳がん、大腸がん、肺がん（例えば、非小細胞肺がん）、食道がん、リンパ腫、白血病（例えば、急性骨髄性白血病）、メラノーマ、肝内胆管がん、膀胱がん、子宮頸がん、膵臓がん、又は肝細胞がん、神経芽腫、肝芽腫、脳腫瘍亜型（例えば、神経膠腫、ＰＮＥＴ、頭蓋咽頭腫、脈絡叢腫瘍、神経鞘腫、髄膜腫）、ウィルムス腫瘍、胚細胞腫瘍を含む。
本発明により治療することができる対象は、一般に、ヒト対象と、獣医学目的のサルや類人猿等の他の霊長類対象である。上記実施形態のいずれかにおいて、前記対象は、ヒト対象とすることができる。前記対象はいずれの性別でもよく、任意の適切な年齢とすることができ、幼児、青少年、青年、成人、及び老人対象を含む。小児科対象とは、幼児、青少年、又は青年対象を意味する。本開示に係る細胞は、治療しようとする疾患、病態、又は障害に適した方法で投与することができ、このような方法は、医療分野の当業者により決定される。上記実施形態のいずれかにおいて、本願に記載する人工免疫細胞又はユニットドーズ製剤は、標的細胞（例えば、がん細胞）に遭遇するように静脈内、腹腔内、腫瘍内、脳内、骨髄内、リンパ節内、又は脳脊髄液内に投与される。前記組成物の適切な用量、適切な投与期間、及び投与頻度は、患者の健康状態；疾患、病態、又は障害のサイズ、種類、及び重症度；活性成分の特定の形態；並びに投与方法に応じて決定されよう。
治療用宿主細胞の場合、組成物又はユニットドーズ製剤における細胞の量は、少なくとも細胞１個（例えば、ＳＯＸ２特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞亜集団１個、ＳＯＸ２特異的ＣＤ４＋Ｔ細胞亜集団１個）であり、又はより一般的には、細胞１０２個超、例えば、１０６個まで、１０７個まで、１０８個まで、１０９個まで、又は１０１０個超（例えば、１０１１個）とする。所定の実施形態では、約１０６～約１０１０個／ｍ２の範囲、好ましくは約１０５～約１０１１個／ｍ２の範囲の前記細胞を投与する。細胞数は、前記組成物の最終用途と、前記組成物に含まれる細胞の種類により異なる。例えば、特定の抗原に特異的な融合タンパク質を含むように改変された細胞は、少なくとも３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％又はそれ以上のこのような細胞を含む細胞集団を含む。本願に記載する用途の場合、細胞は一般に１リットル以下、５００ｍｌ以下、２５０ｍｌ以下、又は１００ｍｌ以下の体積とする。各種実施形態において、所望の細胞の密度は、一般的に１０４個／ｍｌ超、一般に１０７個／ｍｌ超、一般に１０８個／ｍｌ以上である。細胞は、１回の輸液で投与してもよいし、一定期間にわたって複数回の輸液で投与してもよい。累計が１０６個以上、１０７個以上、１０８個以上、１０９個以上、１０１０個以上、又は１０１１個以上となるように、臨床的に妥当な数の免疫細胞を複数回の輸液に配分することができる。所定の実施形態では、前記改変免疫細胞のユニットドーズ製剤を同種ドナーに由来する造血幹細胞と（例えば、同時又は同一期間に）併用投与することができる。
本願に開示するＳＯＸ２特異的結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、融合タンパク質、又は免疫原性組成物と、薬学的に許容される基剤、希釈剤、又は賦形剤を含む医薬組成物（即ち、組成物）も想定される。適切な賦形剤としては、水、食塩水、ブドウ糖、グリセロール等とその組み合わせが挙げられる。各種実施形態において、本願に開示する融合タンパク質又は宿主細胞を含む組成物は、更に、適切な輸液溶媒を含む。適切な輸液溶媒は、任意の等張溶媒製剤とすることができ、一般的には、生理食塩水、Ｎｏｒｍｏｓｏｌ Ｒ（Ａｂｂｏｔｔ）又はＰｌａｓｍａ－Ｌｙｔｅ Ａ（Ｂａｘｔｅｒ）、５％ブドウ糖水溶液、乳酸リンゲル液を利用することができる。輸液溶媒には、ヒト血清アルブミン又は他のヒト血清成分を補充することができる。
医薬組成物は、治療（又は予防）しようとする疾患又は病態に適した方法で投与することができ、このような方法は、医療分野の当業者により決定される。前記組成物の適切な用量と適切な投与期間及び投与頻度は、患者の健康状態、患者の体格（即ち、体重、質量、又は体表面積）、患者の病態の種類と重症度、活性成分の特定形態、及び投与方法等の因子に応じて決定されよう。一般に、適切な投与量と治療レジメンは、（より高頻度の完全若しくは部分的緩解、又は無病生存期間及び／若しくは全生存期間の延長、又は症状重症度の軽減等の臨床アウトカムを含め、本願に記載するような）治療及び／又は予防効果を生じるために十分な量の組成物を提供する。
医薬組成物の有効量とは、必要な投与量と時間で本願に記載するような所望の臨床結果又は有益な治療を達成するために十分な量を意味する。１回以上の投与で有効量を送達することができる。疾患又は疾患状態を有することが既に分かっているか、又は確認されている対象に投与する場合には、治療に関して「治療量」なる用語を使用することができ、「予防有効量」なる用語は、疾患又は疾患状態に罹り易いか、又はその発症（例えば、再発）の危険のある対象に予防処置として有効量を投与することを表すために使用することができる。
一般に、抗体又は抗原結合断片の治療有効用量は、（７０ｋｇの哺乳動物では）約０．００１ｍｇ／ｋｇ（即ち、０．０７ｍｇ）～約１００ｍｇ／ｋｇ（即ち、７．０ｇ）であり、治療有効用量は、（７０ｋｇの哺乳動物では）約０．０１ｍｇ／ｋｇ（即ち、０．７ｍｇ）～約５０ｍｇ／ｋｇ（即ち、３．５ｇ）が好ましく、治療有効用量は、（７０ｋｇの哺乳動物では）約１ｍｇ／ｋｇ（即ち、７０ｍｇ）～約２５ｍｇ／ｋｇ（即ち、１．７５ｇ）がより好ましい。本開示のポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、及び関連組成物では、治療有効用量は、抗体又は抗原結合断片と異なっていてもよい。
ある種の実施形態では、ＴＣＲミミック抗体若しくは抗原結合断片又はその一部をコードするＤＮＡプラスミドコンストラクトを含むベクターが提供される（例えば、所謂「ＤＭＡｂ」；例えば、Ｍｕｔｈｕｍａｎｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｉｎｆｅｃｔ Ｄｉｓ．２１４（３）：３６９－３７８（２０１６）；Ｍｕｔｈｕｍａｎｉ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｖａｃｃｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ ９：２２５３－２２６２（２０１３））；Ｆｌｉｎｇａｉ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉ Ｒｅｐ．５：１２６１６（２０１５）；及びＥｌｌｉｏｔｔ ｅｔ ａｌ．，ＮＰＪ Ｖａｃｃｉｎｅｓ １８（２０１７）が参照され、抗体をコードするＤＮＡコンストラクトと、その投与方法を含む関連する使用方法に関する開示内容を本願に援用する）。所定の実施形態において、ＤＮＡプラスミドコンストラクトは、前記抗体又は抗原結合断片の重鎖と軽鎖（又はＶＨとＶＬ）をコードする単一のオープンリーディングフレームを含み、前記重鎖をコードする配列と、前記軽鎖をコードする配列は任意に、プロテアーゼ切断部位をコードするポリヌクレオチド及び／又は自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドにより分離されている。ある種の実施形態において、前記抗体又は抗原結合断片の置換成分であるコンポーネントは、単一のプラスミドに含まれるポリヌクレオチドによりコードされる。他の実施形態において、前記抗体又は抗原結合断片の置換成分であるコンポーネントは、２個以上のプラスミドに含まれるポリヌクレオチドによりコードされる（例えば、第１のプラスミドは、重鎖、ＶＨ、又はＶＨ＋ＣＨをコードするポリヌクレオチドを含み、第２のプラスミドは、コグネイト軽鎖、ＶＬ、又はＶＬ＋ＣＬをコードするポリヌクレオチドを含む）。発現ベクターの１例は、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ（Ｒ）から市販されているｐＶａｘ１である。本開示のＤＮＡプラスミドは、例えば、エレクトロポレーション（例えば、筋肉内エレクトロポレーション）、又は適切な製剤（例えば、ヒアルロニダーゼ）により対象に送達することができる。
本願に記載する医薬組成物は、密閉アンプル又はバイアル等のユニットドーズ又はマルチドーズ容器の形態とすることができる。このような容器は、患者に輸液するまで製剤の安定性を維持するために凍結することができる。所定の実施形態において、ユニットドーズ製剤は、約１０７個／ｍ２～約１０１１個／ｍ２の用量の本願に記載するＳＯＸ２特異的免疫細胞を含む。本願に記載する特定の組成物を使用するのに適した投与及び治療レジメンの開発は、種々の治療レジメンで実施され、例えば、非経口又は静脈内投与又は製剤が挙げられる。
本願の組成物を非経口投与する場合には、前記組成物は、更に滅菌水性又は油性溶液剤又は懸濁剤を含むことができる。適切な非毒性の非経口投与に許容される希釈剤又は溶剤としては、水、リンゲル液、等張塩類溶液、１，３－ブタンジオール、エタノール、プロピレングリコール又はポリエチレングリコール類と水の混液が挙げられる。水性溶液剤又は懸濁剤は、更に酢酸ナトリウム、クエン酸ナトリウム、ホウ酸ナトリウム又は酒石酸ナトリウム等の１種以上の緩衝剤を含有することができる。当然のことながら、全ての用量単位製剤を製造するために使用される全ての材料は、医薬品用純度であり、利用される量で実質的に非毒性でなければならない。更に、持続放出製品及び製剤に活性化合物を配合してもよい。本願で使用する用量単位剤形とは、治療しようとする対象に単位用量として適切な物理的に分離した単位を意味し、各単位は、適切な医薬品基剤と共に所望の効果を生じるように計算された所定量の人工免疫細胞又は活性化合物を含有することができる。
一般に、適切な投与量と治療レジメンは、効果を生じるために十分な量の活性分子又は細胞を提供する。このような応答は、無治療対象と比較して治療後の対象における臨床アウトカムの改善（例えば、より高頻度の完全若しくは部分的緩解、又は無病生存期間の延長）を確認することによりモニターすることができる。腫瘍タンパク質に対する既存免疫応答の増大は、一般に臨床アウトカムの改善に相関する。このような免疫応答は一般に、日常的手法である標準増殖アッセイ、細胞傷害性アッセイ又はサイトカインアッセイを使用して評価することができる。
予防用では、疾患若しくは障害を予防するため、その発症を遅延させるため、又はそれに関連する疾患重症度を軽減するために十分な用量とすべきである。本願に記載する方法に従って投与される免疫原性組成物の予防効果は、（インビトロ及びインビボ動物試験を含む）前臨床試験及び臨床試験を実施し、得られたデータをいずれも当業者により容易に実施可能な適切な統計的、生物学的、及び臨床的方法及び技術により解析することにより、判定することができる。
本願で使用する場合に、組成物の投与とは、送達経路又は方式に関係なく、前記組成物を対象に送達することを意味する。投与は、連続的又は断続的で非経口的に実施することができる。投与は、既知の病態、疾患又は疾患状態を有することが既に確認されている対象を治療するために実施してもよいし、このような病態、疾患又は疾患状態に罹り易いか、又はその発症の危険のある対象を治療するために実施してもよい。補助療法との併用投与としては、複数の物質を任意の順序で任意の投与スケジュールに従って同時及び／又は逐次送達する方法が挙げられる（例えば、人工免疫細胞を１種以上のサイトカインと併用する方法や、カルシニューリン阻害剤、コルチコステロイド、微小管阻害剤、低用量ミコフェノール酸プロドラッグ、又は任意のその組み合わせ等の免疫抑制療法と併用する方法が挙げられる）。
所定の実施形態では、本願に記載する結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物を前記対象に約２～約４週間の投与間隔で複数回投与することができる。
本開示の治療又は予防方法は、本願に開示するユニットドーズ製剤、細胞、又は組成物の投与の前又は後に追加治療を含むことができる治療クール又はレジメンの一部として対象に投与することができる。例えば、所定の実施形態において、前記宿主細胞のユニットドーズ製剤を投与する対象は、造血細胞移植（ＨＣＴ；骨髄破壊的及び非骨髄破壊的ＨＣＴを含む）を受療中であるか、又は過去に受療している。ＨＣＴを実施するための技術とレジメンは当技術分野で公知であり、臍帯血、骨髄、若しくは末梢血に由来する細胞、造血幹細胞、動員幹細胞、又は羊水に由来する細胞等の任意の適切なドナー細胞の移植を含むことができる。したがって、所定の実施形態では、改変ＨＣＴ療法で造血幹細胞と同時又はその直後に本開示の宿主細胞を投与することができる。
更なる実施形態において、前記対象は、ＳＯＸ２特異的免疫細胞又はＨＣＴを移植する前に、リンパ球除去化学療法を過去に受療している。所定の実施形態において、リンパ球除去化学療法は、シクロホスファミド、フルダラビン、抗胸腺細胞グロブリン、又はその組み合わせを含むコンディショニングレジメンを含む。
所定の実施形態において、前記対象は、本願に記載する療法又は当技術分野で公知の療法を含む外科療法、放射線療法、又は化学療法の１種以上を過去に受療している。所定の実施形態において、例えば、化学療法は、ビンクリスチン、シスプラチン、シクロホスファミド、フィルグラスチム、エトポシド、チオテパ、又は任意のその組み合わせを含む。
本開示に係る方法は更に、併用療法で前記疾患又は障害を治療するための１種以上の他の物質を投与することを含むことができる。例えば、所定の実施形態において、併用療法は、本願に開示する組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を免疫チェックポイント阻害剤と（同一期間、同時、又は逐次に）併用投与することを含む。ある種の実施形態において、併用療法は、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を刺激性免疫チェックポイント剤のアゴニストと併用投与することを含む。更なる実施形態において、併用療法は、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を化学療法剤、放射線療法、外科療法、抗体、又は任意のその組み合わせ等の補助療法と併用投与することを含む。
本願で使用する「免疫抑制剤」又は「免疫抑制物質」なる用語は、免疫応答を制御又は抑制するのを補助するために阻害シグナルを提供する１種以上の細胞、タンパク質、分子、化合物又は複合体を意味する。例えば、免疫抑制剤としては、免疫刺激を部分的若しくは完全に阻止する分子、免疫活性化を抑制、防止若しくは遅延させる分子、又は免疫抑制を増強、活性化、若しくはアップレギュレーションする分子が挙げられる。（例えば、免疫チェックポイント阻害剤の）標的とする典型的な免疫抑制剤としては、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、ＬＡＧ３、ＣＴＬＡ４、Ｂ７－Ｈ３、Ｂ７－Ｈ４、ＣＤ２４４／２Ｂ４、ＨＶＥＭ、ＢＴＬＡ、ＣＤ１６０、ＴＩＭ３、ＧＡＬ９、ＫＩＲ、ＰＶＲ１Ｇ（ＣＤ１１２Ｒ）、ＰＶＲＬ２、アデノシン、Ａ２ａＲ、免疫抑制性サイトカイン（例えば、ＩＬ－１０、ＩＬ－４、ＩＬ－１ＲＡ、ＩＬ－３５）、ＩＤＯ、アルギナーゼ、ＶＩＳＴＡ、ＴＩＧＩＴ、ＬＡＩＲ１、ＣＥＡＣＡＭ－１、ＣＥＡＣＡＭ－３、ＣＥＡＣＡＭ－５、Ｔｒｅｇ細胞、又は任意のその組み合わせが挙げられる。免疫抑制剤阻害剤（免疫チェックポイント阻害剤とも言う）は、化合物、抗体、抗体断片若しくは融合ポリペプチド（例えば、ＣＴＬＡ４－ＦｃやＬＡＧ３－Ｆｃ等のＦｃ融合体）、アンチセンス分子、リボザイム若しくはＲＮＡｉ分子、又は低分子量有機分子とすることができる。
本開示に開示する実施形態のいずれかにおいて、方法は、単独又は任意の組み合わせの以下の免疫抑制成分のいずれか１種の１種以上の阻害剤と共に、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を含むことができる。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＰＤ－１阻害剤、例えば、ピジリズマブ、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０（旧称ＡＭＰ－５１４）、ＡＭＰ－２２４、ＢＭＳ－９３６５５８又は任意のその組み合わせ等のＰＤ－１特異抗体又はその結合断片と併用する。更なる実施形態では、本開示の組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＢＭＳ－９３６５５９、デュルバルマブ（ＭＥＤＩ４７３６）、アテゾリズマブ（ＲＧ７４４６）、アベルマブ（ＭＳＢ００１０７１８Ｃ）、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、又は任意のその組み合わせ等のＰＤ－Ｌ１特異抗体又はその結合断片と併用する。所定の実施形態では、本開示の組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＬＡＧ５２５、ＩＭＰ３２１、ＩＭＰ７０１、９Ｈ１２、ＢＭＳ－９８６０１６、又は任意のその組み合わせ等のＬＡＧ３阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＣＴＬＡ４の阻害剤と併用する。特定の実施形態では、ＳＯＸ２特異的免疫細胞をイピリムマブ、トレメリムマブ、ＣＴＬＡ４－Ｉｇ融合タンパク質（例えば、アバタセプト、ベラタセプト）、又は任意のその組み合わせ等のＣＴＬＡ４特異抗体又はその結合断片と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をエノブリツズマブ（ＭＧＡ２７１）、３７６．９６、又はその両方等のＢ７－Ｈ３特異抗体又はその結合断片と併用する。Ｂ７－Ｈ４抗体結合断片は、例えば、Ｄａｎｇａｊ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．７３：４８２０，２０１３に記載されているｓｃＦｖ又はその融合タンパク質や、米国特許第９，５７４，０００号とＰＣＴ特許公開第ＷＯ／２０１６４０７２４Ａ１号及びＷＯ２０１３／０２５７７９Ａ１号に記載されているものとすることができる。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＣＤ２４４の阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＢＬＴＡ、ＨＶＥＭ、ＣＤ１６０、又は任意のその組み合わせの阻害剤と併用する。抗ＣＤ－１６０抗体は、例えば、ＰＣＴ公開第ＷＯ２０１０／０８４１５８号に記載されている。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＴＩＭ３の阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＧａｌ９の阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をデコイアデノシン受容体等のアデノシンシグナル伝達の阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＡ２ａＲの阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をリリルマブ（ＢＭＳ－９８６０１５）等のＫＩＲの阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を阻害性サイトカイン（典型的には、ＴＧＦβ以外のサイトカイン）又はＴｒｅｇ発生若しくは活性の阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をレボ－１－メチルトリプトファン、エパカドスタット（ＩＮＣＢ０２４３６０；Ｌｉｕ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １１５：３５２０－３０，２０１０）、エブセレン（Ｔｅｒｅｎｔｉｓ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍ．４９：５９１－６００，２０１０）、インドキシモド、ＮＬＧ９１９（Ｍａｕｔｉｎｏ ｅｔ ａｌ．，Ａｍｅｒｉｃａｎ Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｆｏｒ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １０４ｔｈ Ａｎｎｕａｌ Ｍｅｅｔｉｎｇ ２０１３；Ａｐｒ ６－１０，２０１３）、１－メチルトリプトファン（１－ＭＴ）－チラパザミン、又は任意のその組み合わせ等のＩＤＯ阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＮ（ω）－ニトロ－Ｌ－アルギニンメチルエステル（Ｌ－ＮＡＭＥ）、Ｎ－ω－ヒドロキシ－ｎｏｒ－ｌ－アルギニン（ｎｏｒ－ＮＯＨＡ）、Ｌ－ＮＯＨＡ、２（Ｓ）－アミノ－６－ボロノヘキサン酸（ＡＢＨ）、Ｓ－（２－ボロノエチル）－Ｌ－システイン（ＢＥＣ）、又は任意のその組み合わせ等のアルギナーゼ阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＣＡ－１７０（Ｃｕｒｉｓ，Ｌｅｘｉｎｇｔｏｎ，Ｍａｓｓ．）等のＶＩＳＴＡの阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を例えばＣＯＭ９０２（Ｃｏｍｐｕｇｅｎ，Ｔｏｒｏｎｔｏ，Ｏｎｔａｒｉｏ Ｃａｎａｄａ）等のＴＩＧＩＴの阻害剤、例えばＣＯＭ７０１（Ｃｏｍｐｕｇｅｎ）等のＣＤ１５５の阻害剤、又はその両方と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＰＶＲＩＧ、ＰＶＲＬ２、又はその両方の阻害剤と併用する。抗ＰＶＲＩＧ抗体は、例えば、ＰＣＴ公開第ＷＯ２０１６／１３４３３３号に記載されている。抗ＰＶＲＬ２抗体は、例えば、ＰＣＴ公開第ＷＯ２０１７／０２１５２６号に記載されている。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＬＡＩＲ１阻害剤と併用する。所定の実施形態では、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）をＣＥＡＣＡＭ－１、ＣＥＡＣＡＭ－３、ＣＥＡＣＡＭ－５、又は任意のその組み合わせの阻害剤と併用する。
所定の実施形態では、刺激性免疫チェックポイント分子の活性を増強する物質（即ち、アゴニスト）と、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を併用する。例えば、（例えば、ウレルマブ等の）ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）アゴニスト、（例えば、ＭＥＤＩ６４６９、ＭＥＤＩ６３８３、又はＭＥＤＩ０５６２等の）ＣＤ１３４（ＯＸ－４０）アゴニスト、レナリドミド、ポマリドミド、（例えば、ＣＤＸ－１１２７等の）ＣＤ２７アゴニスト、（例えば、ＴＧＮ１４１２、ＣＤ８０、又はＣＤ８６等の）ＣＤ２８アゴニスト、（例えば、ＣＰ－８７０，８９３、ｒｈｕＣＤ４０Ｌ、又はＳＧＮ－４０等の）ＣＤ４０アゴニスト、（例えば、ＩＬ－２等の）ＣＤ１２２アゴニスト、（例えば、ＰＣＴ特許公開第ＷＯ２０１６／０５４６３８号に記載されているヒト化抗ＧＩＴＲモノクローナル抗体等の）ＧＩＴＲのアゴニスト、（例えば、ＧＳＫ３３５９６０９、ｍＡｂ８８．２、ＪＴＸ－２０１１、Ｉｃｏｓ１４５－１、Ｉｃｏｓ３１４－８、又は任意のその組み合わせ等の）ＩＣＯＳ（ＣＤ２７８）のアゴニストと組成物を併用することができる。本願に開示する実施形態のいずれかにおいて、方法は、単独又は任意の組み合わせの上記のいずれかを含む刺激性免疫チェックポイント分子の１種以上のアゴニストと組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を併用投与することを含むことができる。
所定の実施形態において、併用療法は、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）と、非炎症性固形腫瘍により発現されるがん抗原に特異的な抗体若しくはその抗原結合断片、放射線治療、外科療法、化学療法剤、サイトカイン、ＲＮＡｉ、又は任意のその組み合わせの１種以上を含む補助療法を含む。
所定の実施形態において、併用療法は、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を投与することと、更に放射線治療又は外科療法を適用することを含む。放射線療法は、当技術分野で周知であり、ガンマ線照射等のＸ線療法と、放射性医薬品療法が挙げられる。対象における所定のがんを治療するのに適した外科療法及び外科技術は、当技術分野における通常の知識を有する者に周知である。
所定の実施形態において、併用療法は、組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）を投与することと、更に化学療法剤を投与することを含む。化学療法剤としては、限定されないが、クロマチン機能の阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、微小管阻害薬、ＤＮＡ損傷剤、（葉酸アンタゴニスト、ピリミジンアナログ、プリンアナログ、及び糖鎖修飾アナログ等の）代謝拮抗薬、ＤＮＡ合成阻害剤、（インターカレート剤等の）ＤＮＡ相互作用剤、及びＤＮＡ修復阻害剤が挙げられる。化学療法剤の例としては、限定されないが、以下の群が挙げられる：ピリミジンアナログ（５－フルオロウラシル、フロクスウリジン、カペシタビン、ゲムシタビン及びシタラビン）とプリンアナログ、葉酸アンタゴニスト及び関連阻害剤（メルカプトプリン、チオグアニン、ペントスタチン及び２－クロロデオキシアデノシン（クラドリビン））等の代謝拮抗剤／抗がん剤；ビンカアルカロイド類（ビンブラスチン、ビンクリスチン、及びビノレルビン）等の天然物質、タキサン（パクリタキセル、ドセタキセル）、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ノコダゾール、エポチロン及びナベルビン等の微小管攪乱物質、エピジポドフィロトキシン類（エトポシド、テニポシド）、ＤＮＡ損傷剤（アクチノマイシン、アムサクリン、アントラサイクリン、ブレオマイシン、ブスルファン、カンプトテシン、カルボプラチン、クロラムブシル、シスプラチン、シクロホスファミド、シトキサン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、エピルビシン、ヘキサメチルメラミンオキサリプラチン、イホスファミド、メルファラン、メクロレタミン、マイトマイシン、ミトキサントロン、ニトロソウレア、プリカマイシン、プロカルバジン、タキソール、タキソテール、テモゾロミド、テニポシド、トリエチレンチオホスホロアミド及びエトポシド（ＶＰ１６））を含む抗増殖／抗有糸分裂剤；ダクチノマイシン（アクチノマイシンＤ）、ダウノルビシン、ドキソルビシン（アドリアマイシン）、イダルビシン、アントラサイクリン、ミトキサントロン、ブレオマイシン、プリカマイシン（ミトラマイシン）及びマイトマイシン等の抗生物質；酵素（Ｌ－アスパラギンを全身で代謝し、それ自体のアスパラギンを合成する能力のない細胞を除去するＬ－アスパラギナーゼ）；抗血小板薬；ナイトロジェンマスタード類（メクロレタミン、シクロホスファミド及びアナログ、メルファラン、クロラムブシル）、エチレンイミン及びメチルメラミン類（ヘキサメチルメラミン及びチオテパ）、スルホン酸アルキル類－ブスルファン、ニトロソウレア類（カルムスチン（ＢＣＮＵ）及びアナログ、ストレプトゾシン）、トリアゼン類－ダカルバジン（ＤＴＩＣ）等の抗増殖性／抗有糸分裂性アルキル化剤；葉酸アナログ（メトトレキサート）等の抗増殖性／抗有糸分裂性代謝拮抗薬；白金配位錯体（シスプラチン、カルボプラチン）、プロカルバジン、ヒドロキシウレア、ミトタン、アミノグルテチミド；ホルモン、ホルモンアナログ（エストロゲン、タモキシフェン、ゴセレリン、ビカルタミド、ニルタミド）及びアロマターゼ阻害剤（レトロゾール、アナストロゾール）；抗凝固薬（ヘパリン、合成ヘパリン及び他のトロンビン阻害剤）；（組織プラスミノーゲン活性化因子、ストレプトキナーゼ及びウロキナーゼ等の）血栓溶解剤、アスピリン、ジピリダモール、チクロピジン、クロピドグレル、アブシキシマブ；抗遊走剤；抗分泌剤（ブレフェルジン（ｂｒｅｖｅｌｄｉｎ））；免疫抑制剤（シクロスポリン、タクロリムス（ＦＫ－５０６）、シロリムス（ラパマイシン）、アザチオプリン、ミコフェノール酸モフェチル）；抗血管新生化合物（ＴＮＰ４７０、ゲニステイン）及び増殖因子阻害剤（血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）阻害剤、線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）阻害剤）；アンジオテンシン受容体拮抗薬；一酸化窒素ドナー；アンチセンスオリゴヌクレオチド；抗体（トラスツズマブ、リツキシマブ）；キメラ抗原受容体；細胞周期阻害剤及び分化誘導剤（トレチノイン）；ｍＴＯＲ阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤（ドキソルビシン（アドリアマイシン）、アムサクリン、カンプトテシン、ダウノルビシン、ダクチノマイシン、ゲニポシド（ｅｎｉｐｏｓｉｄｅ）、エピルビシン、エトポシド、イダルビシン、イリノテカン（ＣＰＴ－１１）及びミトキサントロン、トポテカン、イリノテカン）、コルチコステロイド（コルチゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、プレドニゾン、及びプレドニゾロン）；増殖因子シグナル伝達キナーゼ阻害剤；ミトコンドリア機能障害誘導剤、コレラ毒素、リシン、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）外毒素、百日咳菌（Ｂｏｒｄｅｔｔｅｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）由来アデニル酸シクラーゼ毒素、又はジフテリア毒素等の毒素、及びカスパーゼ活性化剤；並びにクロマチン攪乱物質。
抗がん活性に対する宿主免疫応答を操作するためにサイトカインを使用することができる。例えば、Ｆｌｏｒｏｓ ＆ Ｔａｒｈｉｎｉ，Ｓｅｍｉｎ．Ｏｎｃｏｌ．４２（４）：５３９－５４８，２０１５参照。免疫抗がん又は抗腫瘍応答を促進するのに有用なサイトカインとしては、例えば、ＩＦＮ－α、ＩＬ－２、ＩＬ－３、ＩＬ－４、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２、ＩＬ－１３、ＩＬ－１５、ＩＬ－１６、ＩＬ－１７、ＩＬ－１８、ＩＬ－２１、ＩＬ－２４、及びＧＭ－ＣＳＦが挙げられ、単独又は任意の組み合わせで本開示の組成物（例えば、結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、又は組成物）と併用する。
本開示は、更に以下の非限定的な実施形態を提供する。
実施形態１．ＳＯＸ２ペプチド抗原：ＨＬＡ複合体と結合することが可能な単離結合タンパク質であって、前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号５、２、３、４、６、若しくは７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、任意に、前記結合が、特異的結合を含む、前記単離結合タンパク質。
実施形態２．前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号５に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１に記載の結合タンパク質。
実施形態３．前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号２に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１に記載の結合タンパク質。
実施形態４．前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号３に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１に記載の結合タンパク質。
実施形態５．前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号４に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１に記載の結合タンパク質。
実施形態６．前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号６に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１に記載の結合タンパク質。
実施形態７．前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１に記載の結合タンパク質。
実施形態８．前記ＨＬＡが、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１を含む、実施形態１～７のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態９．免疫グロブリンスーパーファミリー可変ドメインを含む、実施形態１～８のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１０．ＴＣＲα鎖可変ドメイン（Ｖα）及び／又はＴＣＲβ鎖可変ドメイン（Ｖβ）を含む、実施形態１～９のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１１．ＴＣＲミミック抗体の重鎖可変ドメイン（ＶＨ）及び／又は軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含む、実施形態１～９のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１２．前記結合タンパク質が、（ｉ）配列番号５２、５３、１００、１０１、１６、１７、２８、２９、４０、４１、６４、６５、７６、７７、８８、８９、１１２、１１３、１２４、１２５、１３６、１３７、１４８及び１４９のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ３βである。）；（ｉｉ）配列番号５１、９９、１５、２７、３９、６３、７５、８７、１１１、１２３、１３５及び１４７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ２βである。）；（ｉｉｉ）配列番号５０、９８、１４、２６、３８、６２、７４、８６、１１０、１２２、１３４及び１４６のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ１βである。）；（ｉｖ）配列番号５７、５８、１０５、１０６、２１、２２、３３、３４、４５、４６、６９、７０、８１、８２、９３、９４、１１７、１１８、１２９、１３０、１４１、１４２、１５３及び１５４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ３αである。）；（ｖ）配列番号５６、１０４、２０、３２、４４、６８、８０、９２、１１６、１２８、１４０及び１５２のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ２αである。）；及び／又は（ｖｉ）配列番号５５、１０３、１９、３１、４３、６７、７９、９１、１１５、１２７、１３９及び１５１のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ１αである。）を含む、実施形態１～１１のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１３．（１）ＣＤＲ１α、ＣＤＲ２α、及びＣＤＲ３αを含むＴＣＲＶαと；（２）ＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、及びＣＤＲ３βを含むＴＣＲＶβを含み、前記ＣＤＲ１α、ＣＤＲ２α、ＣＤＲ３α、ＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、及びＣＤＲ３βが、（ｉ）それぞれ配列番号５５、５６、５７若しくは５８、５０、５１、及び５２若しくは５３；（ｉｉ）それぞれ配列番号１０３、１０４、１０５若しくは１０６、９８、９９、及び１００若しくは１０１；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号１９、２０、２１若しくは２２、１４、１５、及び１６若しくは１７；（ｉｖ）それぞれ配列番号３１、３２、３３若しくは３４、２６、２７、及び２８若しくは２９；（ｖ）それぞれ配列番号４３、４４、４５若しくは４６、３８、３９、及び４０若しくは４１；（ｖｉ）それぞれ配列番号６７、６８、６９若しくは７０、６２、６３、及び６４若しくは６５；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号７９、８０、８１若しくは８２、７４、７５、及び７６若しくは７７；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９１、９２、９３若しくは９４、８６、８７、及び８８若しくは８９；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１５、１１６、１１７若しくは１１８、１１０、１１１、及び１１２若しくは１１３；（ｘ）それぞれ配列番号１２７、１２８、１２９若しくは１３０、１２２、１２３、及び１２４若しくは１２５；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３９、１４０、１４１若しくは１４２、１３４、１３５、及び１３６若しくは１３７；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５１、１５２、１５３若しくは１５４、１４６、１４７、及び１４８若しくは１４９に記載の通りである、実施形態１～１０及び１２のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１４．前記Ｖαが、配列番号５４、１０２、１８、３０、４２、６６、７８、９０、１１４、１２６、１３８及び１５０のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１０及び１２～１３のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１５．前記Ｖβが、配列番号４９、９７、１３、２５、３７、６１、７３、８５、１０９、１２１、１３３及び１４５のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１０及び１２～１４のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１６．（ｉ）それぞれ配列番号５４及び４９；（ｉｉ）それぞれ配列番号１０２及び９７；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号１８及び１３；（ｉｖ）それぞれ配列番号３０及び２５；（ｖ）それぞれ配列番号４２及び３７；（ｖｉ）それぞれ配列番号６６及び６１；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号７８及び７３；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９０及び８５；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１４及び１０９；（ｘ）それぞれ配列番号１２６及び１２１；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３８及び１３３；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５０及び１４５に記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるＶαとＶβを含む、実施形態１０及び１２～１５のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１７．（ｉ）それぞれ配列番号５４及び４９；（ｉｉ）それぞれ配列番号１０２及び９７；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号１８及び１３；（ｉｖ）配列番号３０及び２５；（ｖ）それぞれ配列番号４２及び３７；（ｖｉ）それぞれ配列番号６６及び６１；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号７８及び７３；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９０及び８５；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１４及び１０９；（ｘ）それぞれ配列番号１２６及び１２１；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３８及び１３３；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５０及び１４５に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるＶαとＶβを含む、実施形態１０及び１２～１６のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１８．前記結合タンパク質が、配列番号４８、９６、１２、２４、３６、６０、７２、８４、１０８、１２０、１３２及び１４４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列に含まれる、実施形態１０及び１２～１７のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態１９．前記結合タンパク質が、（ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＣＤＲ３β、ＣＤＲ２β、及び／又はＣＤＲ１β；及び／又は（ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＣＤＲ３α、ＣＤＲ２α、及び／又はＣＤＲ１αを含む、実施形態１～１１のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態２０．前記結合タンパク質が、（ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶαに対して少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するＶα；及び／又は（ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶβに対して少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するＶβを含み、但し、（ａ）前記ＣＤＲの少なくとも３個又は４個は突然変異がなく、（ｂ）突然変異を有するＣＤＲは、２アミノ酸までの置換、連続する５アミノ酸までの欠失、又はその組み合わせに止まり；（ｃ）前記結合タンパク質は、ＳＯＸ２ペプチド：ＨＬＡ複合体と結合するその能力を維持する、実施形態１～１１のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態２１．更に、ＴＣＲβポリペプチド定常ドメイン（Ｃβ）、ＴＣＲαポリペプチド定常ドメイン（Ｃα）、又はその両方を含み、任意に、（１）前記Ｖβと前記Ｃβが一緒になってＴＣＲβ鎖を構成し、及び／又は前記Ｖαと前記Ｃαが一緒になってＴＣＲα鎖を構成し、及び／又は（２）前記Ｃβが、配列番号１５６若しくは１５７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、及び／又は前記Ｃαが、配列番号１５５に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、実施形態１～２０のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態２２．ＴＣＲＣβとＴＣＲＣαを含み、前記Ｃβ及び／又は前記Ｃαは、前記Ｃβと前記Ｃαが会合して二量体を形成するときに、前記Ｃβと前記Ｃαの間に非天然ジスルフィド結合が形成されるような位置に１個以上の非天然アミノ酸を含み、任意に、前記非天然アミノ酸が、前記Ｃβにシステインを含み、及び／又は前記Ｃαにシステインを含む、実施形態２１に記載の結合タンパク質。
実施形態２３．ＴＣＲＣβとＴＣＲＣαを含み、前記ＴＣＲＣβが、アミノ酸５７位にシステインアミノ酸を含み、前記ＴＣＲＣαが、アミノ酸４８位にシステインアミノ酸を含む、実施形態２１又は２２に記載の結合タンパク質。
実施形態２４．前記結合タンパク質が、ＴＣＲ、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）、ｓｃＴｖ、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、ＴＣＲミミック抗体若しくはその抗原結合断片、又は任意のその組み合わせを含む、実施形態１～２３のいずれか一つに記載の結合タンパク質。
実施形態２５．結合タンパク質が、ＴＣＲを含む、実施形態２４に記載の結合タンパク質。
実施形態２６．前記結合タンパク質が、ｓｃＴｖを含む、実施形態２４に記載の結合タンパク質。
実施形態２７．前記結合タンパク質が、ｓｃＴＣＲを含む、実施形態２４に記載の結合タンパク質。
実施形態２８．前記結合タンパク質が、ＣＡＲを含む、実施形態２４に記載の結合タンパク質。
実施形態２９．前記結合タンパク質が、ＴＣＲミミック抗体又はその抗原結合断片を含む、実施形態２４に記載の結合タンパク質。
実施形態３０．実施形態１～２９のいずれか一つに記載の結合タンパク質をコードする単離ポリヌクレオチド。
実施形態３１．前記ポリヌクレオチドが、宿主細胞で発現するようにコドン最適化されており、任意に、前記宿主細胞が、免疫系細胞を含み、更に任意に、前記免疫系細胞が、Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞、又はＮＫ細胞を含む、実施形態３０に記載のポリヌクレオチド。
実施形態３２．更に、（ｉ）ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターα鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターα鎖を含む。）；（ｉｉ）ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターβ鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターβ鎖を含む。）；又は（ｉｉｉ）（ｉ）のポリヌクレオチドと（ｉｉ）のポリヌクレオチドを含む、実施形態３１に記載のポリヌクレオチド。
実施形態３３．（ａ）ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと；（ｂ）ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと；（ｃ）（ａ）のポリヌクレオチドと（ｂ）のポリヌクレオチドの間に配置された自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、実施形態３２に記載のポリヌクレオチド。
実施形態３４．更に、自己切断ペプチドをコードし、（１）結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドと、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの間；及び／又は（２）結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドと、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの間に配置されたポリヌクレオチドを含む、実施形態３２又は３３に記載のポリヌクレオチド。
実施形態３５．インフレームで機能的に連結された（ｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＢＰ）；（ｉｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＢＰ）；（ｉｉｉ）（ｐｎＢＰ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）；（ｉｖ）（ｐｎＢＰ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）；（ｖ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＢＰ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）；又は（ｖｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＢＰ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）を含み、上記式中、ｐｎＣＤ８αは、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＣＤ８βは、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＢＰは、結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＳＣＰ１及びｐｎＳＣＰ２は、各々独立して自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、前記ポリヌクレオチド及び／又は前記コードされる自己切断ペプチドは、任意に同一であるか、又は異なる、実施形態３２～３４のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド。
実施形態３６．前記コードされる結合タンパク質が、ＴＣＲα鎖とＴＣＲβ鎖を含み、前記ポリヌクレオチドが、ＴＣＲα鎖をコードするポリヌクレオチドと、ＴＣＲβ鎖をコードするポリヌクレオチドの間に配置された自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、実施形態３０～３５のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド。
実施形態３７．インフレームで機能的に連結された（ｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲα）；（ｉｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲα）；（ｉｉｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲβ）；（ｉｖ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲβ）；（ｖ）（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８β）；（ｖｉ）（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８α）；（ｖｉｉ）（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８β）；又は（ｖｉｉｉ）（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８α）を含み、上記式中、ｐｎＣＤ８αは、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＣＤ８βは、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＴＣＲαは、ＴＣＲα鎖をコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＴＣＲβは、ＴＣＲβ鎖をコードするポリヌクレオチドであり、ｐｎＳＣＰ１、ｐｎＳＣＰ２、及びｐｎＳＣＰ３は、各々独立して自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、前記ポリヌクレオチド及び／又は前記コードされる自己切断ペプチドは、任意に同一であるか、又は異なる、実施形態３６に記載のポリヌクレオチド。
実施形態３８．前記ポリヌクレオチドが、ＤＮＡ、ＲＮＡ（任意にｍＲＮＡ）、又はその両方を含む、実施形態３０～３７のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド。
実施形態３９．ＤＮＡを含む、実施形態３８に記載のポリヌクレオチド。
実施形態４０．（１）前記ポリヌクレオチドが、配列番号４８、９６、１２、２４、３６、６０、７２、８４、１０８、１２０、１３２及び１４４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列をコードする；及び／又は（２）前記ポリヌクレオチドが、配列番号４７、９５、１１、２３、３５、４７、５９、７１、８３、１０７、１１９、１３１及び１４３のいずれか１つに記載の核酸配列を含むか、又は前記核酸配列から構成されるか、又は前記核酸配列に対して少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するポリヌクレオチドを含む、実施形態３０～３９のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド。
実施形態４１．実施形態３０～４０のいずれか一つに記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
実施形態４２．前記ベクターが、ウイルスベクターを含む、実施形態４１に記載のベクター。
実施形態４３．前記ウイルスベクターが、レンチウイルスベクター又はγ－レトロウイルスベクターを含む、実施形態４２に記載のベクター。
実施形態４４．前記ベクターが、前記ポリヌクレオチドを宿主細胞に送達することが可能である、実施形態４１～４３のいずれか一つに記載のベクター。
実施形態４５．前記宿主細胞が、造血前駆細胞又はヒト免疫系細胞である、実施形態４４に記載のベクター。
実施形態４６．前記ヒト免疫系細胞が、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４－ＣＤ８－ダブルネガティブＴ細胞、γδＴ細胞、ナチュラルキラー細胞、ナチュラルキラーＴ細胞、マクロファージ、単球、樹状細胞、又は任意のその組み合わせである、実施形態４５に記載のベクター。
実施形態４７．前記細胞が、ナイーブＴ細胞、セントラルメモリーＴ細胞、エフェクターメモリーＴ細胞、又は任意のその組み合わせである、実施形態４６に記載のベクター。
実施形態４８．実施形態３０～４０のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド及び／又は実施形態４１～４７のいずれか一つに記載のベクターを含む、及び／又は実施形態１～２９のいずれか一つに記載の結合タンパク質を発現する宿主細胞であって、前記ポリヌクレオチド、ベクター、又は結合タンパク質が、任意に前記宿主細胞に対して異種である、前記宿主細胞。
実施形態４９．前記宿主細胞が、造血前駆細胞及び／又は免疫細胞、任意にヒト免疫細胞を含む、実施形態４８に記載の宿主細胞。
実施形態５０．前記宿主細胞が、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、樹状細胞、マクロファージ、単球、Ｂ細胞、形質細胞、又は任意のその組み合わせを含む、実施形態４９に記載の宿主細胞。
実施形態５１．前記宿主細胞が、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４－ＣＤ８－ダブルネガティブＴ細胞、γδＴ細胞、又は任意のその組み合わせを含み、
任意に、前記宿主細胞が、ＣＤ４＋Ｔ細胞とＣＤ８＋Ｔ細胞を含み、更に任意に、前記ＣＤ４＋Ｔ細胞、前記ＣＤ８＋Ｔ細胞、又はその両方が、（ｉ）ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターα鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターα鎖を含む。）；（ｉｉ）ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターβ鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターβ鎖を含む。）；又は（ｉｉｉ）（ｉ）のポリヌクレオチドと（ｉｉ）のポリヌクレオチドを含む、実施形態５０に記載の宿主細胞。
実施形態５２．前記宿主細胞が、ＣＤ８＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞を含む、実施形態５０又は５１に記載の宿主細胞。
実施形態５３．前記宿主細胞が、ＰＤ－１遺伝子、ＬＡＧ３遺伝子、ＴＩＭ３遺伝子、ＣＴＬＡ４遺伝子、ＨＬＡコンポーネント遺伝子、ＴＩＧＩＴ遺伝子、ＴＣＲコンポーネント遺伝子、ＦａｓＬ遺伝子、又は任意のその組み合わせの染色体遺伝子ノックアウトを含む、実施形態４８～５２のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態５４．前記染色体遺伝子ノックアウトが、α１マクログロブリン遺伝子、α２マクログロブリン遺伝子、α３マクログロブリン遺伝子、β１ミクログロブリン遺伝子、又はβ２ミクログロブリン遺伝子から選択されるＨＬＡコンポーネント遺伝子のノックアウトを含む、実施形態５３に記載の宿主細胞。
実施形態５５．前記染色体遺伝子ノックアウトが、ＴＣＲα可変領域遺伝子、ＴＣＲβ可変領域遺伝子、ＴＣＲ定常領域遺伝子、又はその組み合わせから選択されるＴＣＲコンポーネント遺伝子のノックアウトを含む、実施形態５３又は５４に記載の宿主細胞。
実施形態５６．前記結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドが、前記宿主細胞に対して異種であり、内在性ＴＣＲ遺伝子座に含まれる、実施形態４８～５５のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態５７．更に、（ｉ）安全性スイッチタンパク質；（ｉｉ）選択マーカー；（ｉｉｉ）ＣＤ８コレセプターβ鎖；（ｉｖ）ＣＤ８コレセプターα鎖；又は（ｖ）任意のその組み合わせをコードする異種ポリヌクレオチドを含む、実施形態４８～５６のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態５８．前記宿主細胞が、ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体の存在下にあるときに、ＩＦＮ－γを産生し、任意に、前記ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体が、標的細胞の表面に発現される、実施形態４８～５７のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態５９．前記結合タンパク質が、６．０～９．０（即ち、６．０、９．０、及びその間の任意の数値を含む）、６．０～８．５、６．０～８．０、６．０～７．５、６．０～７．０、６．０～６．５、６．５～９．０、６．５～８．５、６．５～８．０、６．５～７．５、６．５～７．０、７．０～９．０、７．０～８．５、７．０～８．０、７．０～７．５、７．５～９．０、７．５～８．５、７．５～８．０、８．０～９．０、８．０～８．５、又は８．２～９．０のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、実施形態４８～５８のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６０．前記結合タンパク質が、約６．０、約６．１、約６．２、約６．３、約６．４、約６．５、約６．６、約６．７、約６．８、約６．９、約７．０、約７．１、約７．２、約７．３、約７．４、約７．５、約７．６、約７．７、約７．８、約７．９、約８．０、約８．１、約８．２、約８．３、約８．４、約８．５、約８．６、約８．７、約８．８、約８．９、又は約９．０のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、実施形態４８～５９のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６１．前記結合タンパク質が、６．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、実施形態４８～６０のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６２．前記結合タンパク質が、６．５以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、実施形態４８～６１のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６３．前記結合タンパク質が、７．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、実施形態４８～６２のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６４．前記結合タンパク質が、７．５以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、実施形態４８～６３のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６５．前記結合タンパク質が、８．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、実施形態４８～６４のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６６．前記宿主細胞が、以下の腫瘍細胞株、即ち、ＣＦＰＡＣ１、Ｈ４４１、Ｐａｎｃ０８．１３、ＳＷ６２０、ＳＷ５２７、Ｌ３６３、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＭＭ１Ｒ、及びＨＬＡ－Ａ２を発現するＩＮＡ６のいずれか１種以上の細胞の存在下にあるときにＣＤ１３７を発現し、任意に、ＣＤ１３７発現が、前記宿主細胞を前記１種以上の腫瘍細胞株の１個以上の細胞と共にインキュベーション後に前記宿主細胞のフローサイトメトリーにより評価される、実施形態４８～６５のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６７．以下の腫瘍細胞株、即ち、ＣＦＰＡＣ１、Ｈ４４１、Ｐａｎｃ０８．１３、ＳＷ６２０、ＳＷ５２７、Ｌ３６３、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＭＭ１Ｒ、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＩＮＡ６のいずれか１種以上と共にインキュベーション後に、試料中に存在する複数の前記宿主細胞のうち、前記複数の前記宿主細胞の５％以上、１０％以上、１５％以上、２０％以上、２５％以上、３０％以上、３５％以上、４０％以上、４５％以上、５０％以上、５５％以上、６０％以上、６５％以上、７０％以上、７５％以上、又は８０％以上が、ＣＤ１３７の発現に陽性である、実施形態４８～６６のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態６８．前記インキュベーションが、約１６時間～約１８時間の持続時間を含み、任意に、前記インキュベーションが、１６～１８時間の持続時間を含む、実施形態６７に記載の宿主細胞。
実施形態６９．前記インキュベーションの前に、前記腫瘍細胞株の細胞におけるＨＬＡ－Ａ２発現を亢進するための物質を前記腫瘍細胞株の細胞に投与し、任意に、前記物質が、ＩＦＮ－γを含む、実施形態６６～６８のいずれか一つに記載の宿主細胞。
実施形態７０．（ｉ）実施形態１～２９のいずれか一つに記載の結合タンパク質；（ｉｉ）実施形態３０～４０のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド；（ｉｉｉ）実施形態４１～４７のいずれか一つに記載のベクター；及び／又は（ｉｖ）任意にＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、若しくはその両方を含む実施形態４８～４９のいずれか一つに記載の宿主細胞と、薬学的に許容される基剤、賦形剤、又は希釈剤を含む組成物。
実施形態７１．前記組成物が、前記宿主細胞を含み、前記宿主細胞が、免疫細胞、任意にＣＤ８＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞を含み、更に任意に、前記ＣＤ８＋Ｔ細胞及びＣＤ４＋Ｔ細胞が、約１：１の比で存在し、及び／又は前記組成物が、実質的にナイーブＴ細胞を含まない、実施形態７０に記載の組成物。
実施形態７２．対象における配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現、又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害の治療方法であって、前記方法が、有効量の（ｉ）実施形態１～２９のいずれか一つに記載の結合タンパク質；（ｉｉ）実施形態３０～４０のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド；（ｉｉｉ）実施形態４１～４７のいずれか一つに記載のベクター；（ｉｖ）実施形態４８～４９のいずれか一つに記載の宿主細胞；及び／又は（ｖ）実施形態７０若しくは７１に記載の組成物を前記対象に投与することにより、前記疾患又は病態を治療することを含む、前記方法。
実施形態７３．配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現、又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害を有する対象に免疫応答を誘導する方法、及び／又は対象における前記疾患又は障害の治療方法であって、前記方法が、標的細胞の表面に発現されるペプチド：ＨＬＡ複合体と特異的に結合するＴＣＲを発現するＴ細胞の有効量を前記対象に投与することを含み、前記ペプチドが、配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、前記ＨＬＡが、任意にＨＬＡ－Ａ＊０２：０１である、前記方法。
実施形態７４．対象における配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現、又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害の治療方法で使用するための、実施形態１～２９のいずれか一つに記載の結合タンパク質、実施形態３０～４０のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド、実施形態４１～４７のいずれか一つに記載のベクター、実施形態４８～４９のいずれか一つに記載の宿主細胞、及び／又は実施形態７０若しくは７１に記載の組成物。
実施形態７５．対象における配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現、又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害の治療用医薬の製造で使用するための、実施形態１～２９のいずれか一つに記載の結合タンパク質、実施形態３０～４０のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド、実施形態４１～４７のいずれか一つに記載のベクター、実施形態４８～４９のいずれか一つに記載の宿主細胞、及び／又は実施形態７０若しくは７１に記載の組成物。
実施形態７６．前記対象が、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１＋である、実施形態７２若しくは７３に記載の方法、又は実施形態７４若しくは７５に記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
実施形態７７．前記疾患又は病態ががんである、実施形態７２、７３、若しくは７６、又は７２若しくは７３に記載の方法、又は実施形態７４～７６のいずれか一つに記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
実施形態７８．前記がんが、造血器悪性腫瘍又は固形腫瘍を含む、実施形態７７に記載の方法、又は実施形態７７に記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
実施形態７９．前記がんが、多発性骨髄腫、形質細胞性白血病、卵巣がん、神経膠腫、肺がん、頸部がん、子宮頸がん、又は任意のその組み合わせを含む、実施形態７７若しくは７８に記載の方法、又は実施形態７７若しくは７８に記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
実施形態８０．前記対象がヒトである、実施形態７２、７３、若しくは７６～７９のいずれか一つに記載の方法、又は実施形態７４～７９のいずれか一つに記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
実施形態８１．前記対象が、（ｉ）外科療法、（ｉｉ）放射線療法、（ｉｉｉ）化学療法、（ｉｖ）造血幹細胞移植（ＨＳＣ）、及び（ｖ）任意にＣＡＲを発現するＴ細胞を含む養子細胞療法の１種以上を過去に受療しており、
前記疾患又は障害が、任意に過去の療法に不応である、実施形態７２、７３、若しくは７６～８０のいずれか一つに記載の方法、又は実施形態７４～８０のいずれか一つに記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
実施形態８２．前記組成物に含まれる前記宿主細胞の１種以上が、前記対象の自己由来である、実施形態７２、７３、若しくは７６～８１のいずれか一つに記載の方法、又は実施形態７４～８１のいずれか一つに記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
実施形態８３．更に、免疫チェックポイント分子の阻害剤を前記対象に投与することを含む、実施形態７２、７３、若しくは７６～８２のいずれか一つに記載の方法、又は実施形態７４～８１のいずれか一つに記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
実施形態８４．（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；及び／又は（ｖｉｉ）配列番号２、３、４、５、６、若しくは７に比較して１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸変異を有する（ｉ）～（ｖｉ）のいずれか１種の単離ペプチド若しくはポリペプチドの変異体を含む免疫原性組成物であって、（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１種の単離ペプチド又はポリペプチドが、単離全長ヒトＳＯＸ２を含まない、前記免疫原性組成物。
実施形態８５．（ａ）（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１種の１コピー以上及び／又は（ｂ）（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれかの１種以上が、融合ポリペプチドに存在しており、前記融合ポリペプチドが、任意に更に自己切断ペプチドのアミノ酸配列を含む、実施形態８４に記載の免疫原性組成物。
実施形態８６．前記疫原性組成物が、がん細胞に対する免疫応答を対象に誘導することが可能であり、任意に、前記がん細胞が、多発性骨髄腫細胞、形質細胞性白血病細胞、及び／又は卵巣がん細胞を含む、実施形態８４又は８５に記載の免疫原性組成物。
実施形態８７．更にアジュバントを含む、実施形態８４～８６のいずれか一つに記載の免疫原性組成物。
実施形態８８．（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；及び／又は（ｖｉｉ）配列番号２、３、４、５、６、若しくは７に比較して１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸変異を有する（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１種のペプチド若しくはポリペプチドの変異体をコードする単離ポリヌクレオチドであって、前記ポリヌクレオチドが、任意にベクターに含まれ、及び／又は（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１種のペプチド若しくはポリペプチドが、全長ヒトＳＯＸ２を含まない、前記ポリヌクレオチド。
実施形態８９．前記ポリヌクレオチドドが、宿主細胞で発現するようにコドン最適化されており、前記宿主細胞が、任意に樹状細胞又はＴ細胞である、実施形態８８に記載のポリヌクレオチド。
実施形態９０．実施形態８８又は８９に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞であって、前記ポリヌクレオチドが、前記宿主細胞に対して異種であり、前記宿主細胞が、任意に免疫細胞であり、更に任意にプロフェッショナル抗原提示細胞である、前記宿主細胞。
実施形態９１．前記宿主細胞が、樹状細胞又はＴ細胞である、実施形態９０に記載の宿主細胞。
実施形態９２．ＳＯＸ２発現又は活性に関連する疾患又は障害に対する免疫応答を対象に誘導する方法であって、前記方法が、実施形態１～２９のいずれか一つに記載の結合タンパク質、実施形態３０～４０のいずれか一つに記載のポリヌクレオチド、実施形態４１～４８のいずれか一つに記載のベクター、実施形態４９～６９のいずれか一つに記載の宿主細胞、実施形態７０若しくは７１に記載の組成物、実施形態８４～８７のいずれか一つに記載の免疫原性組成物、実施形態８８若しくは８９に記載のポリヌクレオチド、及び／又は実施形態９０若しくは９１に記載の宿主細胞を前記対象に投与することを含む、前記方法。
実施形態９３．（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；及び／又は（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチドから選択されるペプチド（例えば、ペプチド：ＨＬＡ複合体に含まれるペプチド）と結合するＴ細胞集団を拡大する方法であって、前記方法が、前記ペプチドと結合する１個以上のＴ細胞を含有する試料を、実施形態８４～８７のいずれか一つに記載の免疫原性組成物、実施形態８８若しくは８９に記載のポリヌクレオチド、実施形態９０若しくは９１に記載の宿主細胞、及び／又は配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチドと接触させた抗原提示細胞と接触させることを含む、前記方法。
実施形態９４．Ｔ細胞の作製及び／又は単離方法であって、前記方法が、任意に末梢血細胞を含有するＴ細胞含有試料を、（ｉ）実施形態８４～８７のいずれか一つに記載の免疫原性組成物；（ｉｉ）実施形態８８若しくは８９に記載のポリヌクレオチド；（ｉｉｉ）実施形態９０若しくは９１に記載の宿主細胞；及び／又は（ｉｖ）配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原を発現するか、若しくは前記抗原と接触させた抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させる工程と、任意に前記試料中の他の細胞からＴ細胞を選別する工程を含むことにより、Ｔ細胞を単離及び／又は生成する、前記方法。
実施形態９５．実施形態９４に記載の方法により単離及び／又は生成されたＴ細胞。
本開示は、更に以下の非限定的な追加実施形態を提供する。
追加実施形態１．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）α鎖可変（Ｖα）ドメインとＴＣＲβ鎖可変（Ｖβ）ドメインを含む結合タンパク質をコードする異種ポリヌクレオチドを含む改変免疫細胞であって、前記コードされる結合タンパク質が、ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体と特異的に結合することが可能であり、前記ＳＯＸ２抗原が、配列番号２、３、４、５、６、又は７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、前記改変免疫細胞。
追加実施形態２．前記ＨＬＡが、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１を含む、追加実施形態１に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態３．前記コードされる結合タンパク質が、（ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＣＤＲ３β、ＣＤＲ２β、及び／又はＣＤＲ１β；及び／又は（ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＣＤＲ３α、ＣＤＲ２α、及び／又はＣＤＲ１αを含む、追加実施形態１又は２に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態４．前記コードされる結合タンパク質が、（ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶαドメインに対して少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するＶαドメイン；及び／又は（ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶβドメインに対して少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するＶβドメインを含み、但し、（ａ）前記ＣＤＲの少なくとも３個又は４個は突然変異がなく；（ｂ）突然変異を有するＣＤＲは、２アミノ酸までの置換、連続する５アミノ酸までの欠失、又はその組み合わせに止まり；（ｃ）前記コードされる結合タンパク質は、ＳＯＸ２：ＨＬＡ複合体と結合するその能力を維持する、追加実施形態１～３のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態５．前記コードされる結合タンパク質が、（ｉ）配列番号１６、１７、２８、２９、４０、４１、５２、５３、６４、６５、７６、７７、８８、８９、１００、１０１、１１２、１１３、１２４、１２５、１３６、１３７、１４８、若しくは１４９に記載のＣＤＲ３βアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；（ｉｉ）配列番号１５、２７、３９、５１、６３、７５、８７、９９、１１１、１２３、１３５、若しくは１４７に記載のＣＤＲ２βアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；（ｉｉｉ）配列番号１４、２６、３８、５０、６２、７４、８６、９８、１１０、１２２、１３４、１４６に記載のＣＤＲ１βアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；（ｉｖ）配列番号２１、２２、３３、３４、４５、４６、５７、５８、６９、７０、８１、８２、９３、９４、１０５、１０６、１１７、１１８、１２９、１３０、１４１、１４２、１５３、若しくは１５４に記載のＣＤＲ３αアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；（ｖ）配列番号２０、３２、４４、５６、６８、８０、９２、１０４、１１６、１２８、１４０、１５２に記載のＣＤＲ２αアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；及び／又は（ｖｉ）配列番号１９、３１、４３、５５、６７、７９、９１、１０３、１１５、１２７、１３９、若しくは１５１に記載のＣＤＲ１αアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、追加実施形態１又は２に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態６．前記コードされる結合タンパク質が、（ｉ）それぞれ配列番号１９、２０、２１若しくは２２、１４、１５、及び１６若しくは１７；（ｉｉ）それぞれ配列番号３１、３２、３３若しくは３４、２６、２７、及び２８若しくは２９；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号４３、４４、４５若しくは４６、３８、３９、及び４０若しくは４１；（ｉｖ）それぞれ配列番号５５、５６、５７若しくは５８、５０、５１、及び５２若しくは５３；（ｖ）それぞれ配列番号６７、６８、６９若しくは７０、６２、６３、及び６４若しくは６５；（ｖｉ）それぞれ配列番号７９、８０、８１若しくは８２、７４、７５、及び７６若しくは７７；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号９１、９２、９３若しくは９４、８６、８７、及び８８若しくは８９；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号１０３、１０４、１０５若しくは１０６、９８、９９、及び１００若しくは１０１；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１５、１１６、１１７若しくは１１８、１１０、１１１、及び１１２若しくは１１３；（ｘ）それぞれ配列番号１２７、１２８、１２９若しくは１３０、１２２、１２３、及び１２４若しくは１２５；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３９、１４０、１４１若しくは１４２、１３４、１３５、及び１３６若しくは１３７；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５１、１５２、１５３若しくは１５４、１４６、１４７、及び１４８若しくは１４９に記載のＣＤＲ１α、ＣＤＲ２α、ＣＤＲ３α、ＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、及びＣＤＲ３βアミノ酸配列を含む、追加実施形態５に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態７．前記コードされるＶαドメインが、配列番号１８、３０、４２、５４、６６、７８、９０、１０２、１１４、１２６、１３８又は１５０のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、追加実施形態１、２、５、又は６に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態８．前記コードされるＶβドメインが、配列番号１３、２５、３７、４９、６１、７３、８５、９７、１０９、１２１、１３３又は１４５のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、追加実施形態１、２、又は５～７のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態９．前記コードされるＶαドメインと前記コードされるＶβドメインが、（ｉ）それぞれ配列番号１８及び１３；（ｉｉ）それぞれ配列番号３０及び２５；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号４２及び３７；（ｉｖ）それぞれ配列番号５４及び４９；（ｖ）それぞれ配列番号６６及び６１；（ｖｉ）それぞれ配列番号７８及び７３；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号９０及び８５；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号１０２及び９７；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１４及び１０９；（ｘ）それぞれ配列番号１２６及び１２１；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３８及び１３３；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５０及び１４５に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、追加実施形態５～８のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１０．前記コードされる結合タンパク質が、配列番号１２、２４、３６、４８、６０、７２、８４、９６、１０８、１２０、１３２又は１４４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するアミノ酸配列に含まれる、追加実施形態１～９のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１１．結合タンパク質をコードする前記ポリヌクレオチドが、配列番号１１、２３、３５、４７、５９、７１、８３、９５、１０７、１１９、１３１又は１４３のいずれか１つに記載の核酸配列に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するポリヌクレオチドを含む、追加実施形態１～１０のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１２．前記コードされる結合タンパク質が、ＴＣＲ、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）、ｓｃＴｖ、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、又は任意のその組み合わせを含む、追加実施形態１～１１のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１３．更に、ＴＣＲβポリペプチド定常ドメイン（Ｃβ）をコードするポリヌクレオチド、ＴＣＲαポリペプチド定常ドメイン（Ｃα）をコードするポリヌクレオチド、又はその両方を含む、追加実施形態１～１２のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１４．ＴＣＲＣβをコードするポリヌクレオチドと、ＴＣＲＣαをコードするポリヌクレオチドを含み、前記コードされるＴＣＲＣβが、アミノ酸５７位にシステインアミノ酸を含み、前記コードされるＴＣＲＣαが、アミノ酸４８位にシステインアミノ酸を含む、追加実施形態１３に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１５．前記免疫細胞が、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、又は任意のその組み合わせを含む、追加実施形態１～１４のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１６．前記免疫細胞が、ＣＤ８＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞を含む、追加実施形態１５に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１７．前記結合タンパク質をコードする異種ポリヌクレオチドが、宿主細胞で発現するようにコドン最適化されている、追加実施形態１～１６のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１８．前記免疫細胞が、ＰＤ－１遺伝子、ＬＡＧ３遺伝子、ＴＩＭ３遺伝子、ＣＴＬＡ４遺伝子、ＨＬＡコンポーネント遺伝子、ＴＣＲコンポーネント遺伝子、又は任意のその組み合わせの染色体遺伝子ノックアウトを含む、追加実施形態１～１７のいずれか一つに記載の改変免疫細胞。
追加実施形態１９．前記染色体遺伝子ノックアウトが、α１マクログロブリン遺伝子、α２マクログロブリン遺伝子、α３マクログロブリン遺伝子、β１ミクログロブリン遺伝子、若しくはβ２ミクログロブリン遺伝子、又は任意のその組み合わせから選択されるＨＬＡコンポーネント遺伝子のノックアウトを含む、追加実施形態１８に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態２０．前記染色体遺伝子ノックアウトが、ＴＣＲα可変領域遺伝子、ＴＣＲβ可変領域遺伝子、ＴＣＲ定常領域遺伝子、又は任意のその組み合わせから選択されるＴＣＲコンポーネント遺伝子のノックアウトを含む、追加実施形態１８又は１９に記載の改変免疫細胞。
追加実施形態２１．追加実施形態１～２０のいずれか一つに記載の改変免疫細胞と、薬学的に許容される基剤、希釈剤、又は賦形剤を含む組成物。
追加実施形態２２．対象における配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現、又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害の治療方法であって、前記方法が、有効量の追加実施形態１～２０のいずれか一つに記載の改変免疫細胞又は追加実施形態２１に記載の組成物を前記対象に投与することにより、前記疾患又は病態を治療することを含む、前記方法。
追加実施形態２３．配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現、又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害を有する対象に免疫応答を誘導する方法、及び／又は対象における前記疾患又は障害の治療方法であって、前記方法が、標的細胞の表面に発現されるペプチド：ＨＬＡ複合体と特異的に結合するＴＣＲを発現するＴ細胞の有効量を前記対象に投与することを含み、前記ペプチドが、配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、前記ＨＬＡが、任意にＨＬＡ－Ａ＊０２：０１である、前記方法。
追加実施形態２４．前記対象が、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１＋である、追加実施形態２２又は２３に記載の方法。
追加実施形態２５．前記疾患又は病態ががんである、追加実施形態２２～２４のいずれか一つに記載の方法。
追加実施形態２６．前記がんが、造血器悪性腫瘍又は固形腫瘍を含む、追加実施形態２５に記載の方法。
追加実施形態２７．前記がんが、多発性骨髄腫、形質細胞性白血病、又は卵巣がんを含む、追加実施形態２５又は２６に記載の方法。
追加実施形態２８．前記対象がヒトである、追加実施形態２２～２７のいずれか一つに記載の方法。
追加実施形態２９．前記対象が、（ｉ）外科療法、（ｉｉ）放射線療法、（ｉｉｉ）化学療法、（ｉｖ）造血幹細胞移植（ＨＳＣ）、又は（ｖ）任意にＣＡＲを発現するＴ細胞を含む養子細胞療法の１種以上を過去に受療しており、前記疾患又は障害が、任意に過去の療法に不応である、追加実施形態２２～２８のいずれか一つに記載の方法。
追加実施形態３０．前記組成物に含まれる前記改変免疫細胞の１種以上が前記対象の自己由来である、追加実施形態２２～２９のいずれか一つに記載の方法。
追加実施形態３１．更に、免疫チェックポイント分子の阻害剤を前記対象に投与することを含む、追加実施形態２２～３０のいずれか一つに記載の方法。
追加実施形態３２．Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）αポリペプチド可変（Ｖα）ドメインと、ＴＣＲβポリペプチド可変（Ｖβ）ドメインを含む結合タンパク質をコードする単離ポリヌクレオチドであって、前記コードされる結合タンパク質が、ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体と特異的に結合することが可能であり、前記ＳＯＸ２抗原が、配列番号２、３、４、５、６、又は７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、前記ポリヌクレオチドが、任意に宿主細胞で発現するようにコドン最適化されている、前記単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態３３．前記ＨＬＡが、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１を含む、追加実施形態３２に記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態３４．前記コードされる結合タンパク質が、（ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＣＤＲ３β、ＣＤＲ２β、及び／又はＣＤＲ１β；及び／又は（ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＣＤＲ３α、ＣＤＲ２α、及び／又はＣＤＲ１αを含む、追加実施形態３３に記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態３５．前記コードされる結合タンパク質が、（ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶαドメインに対して少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するＶαドメイン；及び／又は（ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶβドメインに対して少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するＶβドメインを含み、但し、（ａ）前記ＣＤＲの少なくとも３個又は４個は突然変異がなく；（ｂ）突然変異を有するＣＤＲは、２アミノ酸までの置換、連続する５アミノ酸までの欠失、又はその組み合わせに止まり；（ｃ）前記コードされる結合タンパク質は、ＳＯＸ２：ＨＬＡ複合体と結合するその能力を維持する、追加実施形態３２～３４のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態３６．前記コードされる結合タンパク質が、（ｉ）配列番号１６、１７、２８、２９、４０、４１、５２、５３、６４、６５、７６、７７、８８、８９、１００、１０１、１１２、１１３、１２４、１２５、１３６、１３７、１４８、若しくは１４９のいずれか１種に記載のＣＤＲ３βアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；（ｉｉ）配列番号１５、２７、３９、５１、６３、７５、８７、９９、１１１、１２３、１３５、若しくは１４７のいずれか１種に記載のＣＤＲ２βアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；（ｉｉｉ）配列番号１４、２６、３８、５０、６２、７４、８６、９８、１１０、１２２、１３４、１４６のいずれか１種に記載のＣＤＲ１βアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；（ｉｖ）配列番号２１、２２、３３、３４、４５、４６、５７、５８、６９、７０、８１、８２、９３、９４、１０５、１０６、１１７、１１８、１２９、１３０、１４１、１４２、１５３、若しくは１５４のいずれか１種に記載のＣＤＲ３αアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；（ｖ）配列番号２０、３２、４４、５６、６８、８０、９２、１０４、１１６、１２８、１４０、１５２のいずれか１種に記載のＣＤＲ２αアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体；及び／又は（ｖｉ）配列番号１９、３１、４３、５５、６７、７９、９１、１０３、１１５、１２７、１３９、若しくは１５１のいずれか１種に記載のＣＤＲ１αアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、追加実施形態３２又は３３に記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態３７．前記コードされる結合タンパク質が、（ｉ）それぞれ配列番号１９、２０、２１若しくは２２、１４、１５、及び１６若しくは１７；（ｉｉ）それぞれ配列番号３１、３２、３３若しくは３４、２６、２７、及び２８若しくは２９；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号４３、４４、４５若しくは４６、３８、３９、及び４０若しくは４１；（ｉｖ）それぞれ配列番号５５、５６、５７若しくは５８、５０、５１、及び５２若しくは５３；（ｖ）それぞれ配列番号６７、６８、６９若しくは７０、６２、６３、及び６４若しくは６５；（ｖｉ）それぞれ配列番号７９、８０、８１若しくは８２、７４、７５、及び７６若しくは７７；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号９１、９２、９３若しくは９４、８６、８７、及び８８若しくは８９；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号１０３、１０４、１０５若しくは１０６、９８、９９、及び１００若しくは１０１；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１５、１１６、１１７若しくは１１８、１１０、１１１、及び１１２若しくは１１３；（ｘ）それぞれ配列番号１２７、１２８、１２９若しくは１３０、１２２、１２３、及び１２４若しくは１２５；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３９、１４０、１４１若しくは１４２、１３４、１３５、及び１３６若しくは１３７；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５１、１５２、１５３若しくは１５４、１４６、１４７、及び１４８若しくは１４９に記載のＣＤＲ１α、ＣＤＲ２α、ＣＤＲ３α、ＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、及びＣＤＲ３βアミノ酸配列を含む、追加実施形態３６に記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態３８．前記コードされるＶαドメインが、配列番号１８、３０、４２、５４、６６、７８、９０、１０２、１１４、１２６、１３８又は１５０のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、追加実施形態３２、３３、３６、又は３７のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態３９．前記コードされるＶβドメインが、配列番号１３、２５、３７、４９、６１、７３、８５、９７、１０９、１２１、１３３又は１４５のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、追加実施形態３２、３３、又は３６～３８のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４０．前記コードされるＶαドメインと、前記コードされるＶβドメインが、（ｉ）それぞれ配列番号１８及び１３；（ｉｉ）それぞれ配列番号３０及び２５；（ｉｉｉ）それぞれ配列番号４２及び３７；（ｉｖ）それぞれ配列番号５４及び４９；（ｖ）それぞれ配列番号６６及び６１；（ｖｉ）それぞれ配列番号７８及び７３；（ｖｉｉ）それぞれ配列番号９０及び８５；（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号１０２及び９７；（ｉｘ）それぞれ配列番号１１４及び１０９；（ｘ）それぞれ配列番号１２６及び１２１；（ｘｉ）それぞれ配列番号１３８及び１３３；又は（ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５０及び１４５に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、追加実施形態３６～３９のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４１．配列番号１２、２４、３６、４８、６０、７２、８４、９６、１０８、１２０、１３２又は１４４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の同一性を有するアミノ酸配列をコードする、追加実施形態３２～４０のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４２．配列番号１１、２３、３５、４７、５９、７１、８３、９５、１０７、１１９、１３１又は１４３のいずれか１つに記載の核酸配列に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の同一性を有するポリヌクレオチドを含む、追加実施形態３２～４１のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４３．前記コードされる結合タンパク質が、ＴＣＲ、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）、ｓｃＴｖ、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、又は任意のその組み合わせを含む、追加実施形態３２～４２のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４４．更に、ＴＣＲβポリペプチド定常ドメイン（Ｃβ）をコードするポリヌクレオチド、ＴＣＲαポリペプチド定常ドメイン（Ｃα）をコードするポリヌクレオチド、又はその両方を含む、追加実施形態３２～４３のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４５．ＴＣＲＣβをコードするポリヌクレオチドと、ＴＣＲＣαをコードするポリヌクレオチドを含み、前記コードされるＴＣＲＣβが、アミノ酸５７位にシステインアミノ酸を含み、前記コードされるＴＣＲＣαが、アミノ酸４８位にシステインアミノ酸を含む、追加実施形態４４に記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４６．前記ポリヌクレオチドが、免疫細胞で発現するようにコドン最適化されている、追加実施形態３２～４５のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４７．前記免疫細胞が、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、又はＮＫＴ細胞である、追加実施形態４６に記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４８．前記免疫細胞が、ＣＤ８＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞を含む、追加実施形態４７に記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態４９．ＶβをコードするポリヌクレオチドとＶαをコードするポリヌクレオチドの間、又はＴＣＲβポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとＴＣＲαポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの間に配置された自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、追加実施形態３２～４８のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態５０．追加実施形態３２～４９のいずれか一つに記載の単離ポリヌクレオチドを含むベクター。
追加実施形態５１．（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；及び／又は（ｖｉｉ）配列番号２、３、４、５、６、若しくは７に比較して１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸変異を有するＳＯＸ２抗原の変異体を含む、免疫原性組成物。
追加実施形態５２．（ａ）（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１種の２コピー以上及び／又は（ｂ）（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれかの２種以上が、融合ポリペプチドに存在しており、前記融合ポリペプチドが、任意に更に自己切断ペプチドのアミノ酸配列を含む、追加実施形態５１に記載の免疫原性組成物。
追加実施形態５３．前記免疫原性組成物が、多発性骨髄腫細胞、形質細胞性白血病細胞、及び／又は卵巣がん細胞に対する免疫応答を誘導することが可能である、追加実施形態５１又は５２に記載の免疫原性組成物。
追加実施形態５４．更にアジュバントを含む、追加実施形態５１～５３のいずれか一つに記載の免疫原性組成物。
追加実施形態５５．（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；及び／又は（ｖｉｉ）配列番号２、３、４、５、６、若しくは７に比較して１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸変異を有するＳＯＸ２抗原の変異体をコードする単離ポリヌクレオチドであって、前記ポリヌクレオチドが、任意にベクターに含まれる、前記単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態５６．前記ポリヌクレオチドが、宿主細胞で発現するようにコドン最適化されており、前記宿主細胞が、任意に樹状細胞又はＴ細胞である、追加実施形態５５に記載の単離ポリヌクレオチド。
追加実施形態５７．追加実施形態４７又は４８に記載の単離ポリヌクレオチドを含む宿主細胞であって、前記宿主細胞が、任意に免疫細胞であり、更に任意にプロフェッショナル抗原提示細胞である、前記宿主細胞。
追加実施形態５８．前記宿主細胞が、樹状細胞又はＴ細胞である、追加実施形態５７に記載の宿主細胞。
追加実施形態５９．ＳＯＸ２発現又は活性に関連する疾患又は障害に対する免疫応答を対象に誘導する方法であって、前記方法が、追加実施形態１～２０のいずれか一つに記載の改変免疫細胞、追加実施形態２１に記載の組成物、追加実施形態５１～５４のいずれか一つに記載の免疫原性組成物、追加実施形態５５若しくは５６に記載のポリヌクレオチド、及び／又は追加実施形態５７若しくは５８に記載の宿主細胞を前記対象に投与することを含む、前記方法。
追加実施形態６０．（ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；（ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原；及び／又は（ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原から選択されるＳＯＸ２抗原と特異的に結合するＴ細胞集団を拡大する方法であって、
前記方法が、前記抗原と特異的に結合する１個以上のＴ細胞を含有する試料を、追加実施形態５１～５４のいずれか一つに記載の免疫原性組成物、追加実施形態５５若しくは５６に記載のポリヌクレオチド、追加実施形態５７若しくは５８に記載の宿主細胞、及び／又は配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原をパルスした抗原提示細胞と接触させることを含む、前記方法。
追加実施形態６１．Ｔ細胞の作製及び／又は単離方法であって、前記方法が、（ｉ）追加実施形態５１～５４のいずれか一つに記載の免疫原性組成物；（ｉｉ）追加実施形態５５若しくは５６に記載のポリヌクレオチド；（ｉｉｉ）追加実施形態５７若しくは５８に記載の宿主細胞；及び／又は（ｉｖ）配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原をパルスしているか、若しくは他の方法で前記抗原と接触させた抗原提示細胞（ＡＰＣ）と、末梢血細胞を接触させる工程と、任意に末梢血細胞からＴ細胞を選別する工程を含むことにより、Ｔ細胞を単離及び／又は生成する前記方法。
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［実施例１］ＳＯＸ２エピトープの同定とＳＯＸ２抗原反応性Ｔ細胞株の作製
多発性骨髄腫（ＭＭ）は、骨髄におけるクローン抗体産生形質細胞の無制御な増殖に起因する。この疾患は、米国で２番目に多い造血器悪性腫瘍であり、殆どの場合は死に至る。ＭＭの治療法としては、養子細胞療法（ＡＣＴ）が台頭しつつあるが、再現性よく有効な標準治療を提供するために尚も研究が続けられている。ＭＭ細胞表面で発現される細胞表面ＣＤ１９、ＢＣＭＡ、又はＣＤ１３８抗原を標的とするキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞は、ある程度成功している。しかし、残念ながら、抗原陰性ＭＭ細胞の増殖により、多くの患者は再発している。悪性腫瘍表現型の誘導又は維持に関与するタンパク質を標的とすることは、ＡＣＴの成功に重要なアプローチであると思われる。転写因子ＳＯＸ２は、ＭＭ及び他のがんにおける細胞増殖と自己再生を調節することができるので、ＡＣＴの有望な標的である。
方法：ＢＩＭＡＳ、ＳＹＦＰＥＩＴＨＩ、ＮｅｔＭＨＣ、ＩＥＤＢ及びｈｍＭＨＣ（Ａｌｓｐａｃｈ ｅｔ ａｌ，Ｎａｔｕｒｅ ２０１９）エピトープ予測アルゴリズムを使用し、ＳＯＸ２由来ペプチドが、米国人口の約４０％（ＩＥＤＢ人口データ）に存在するＨＬＡ－Ａ＊０２：０１対立遺伝子と優先的に結合するか否かを予測した。これらのインシリコ（ｉｎ ｓｉｌｉｃｏ）試行により、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１と優先的に結合すると予測される１７種のペプチドを同定した。
ＳＯＸ２に特異的なＣＤ８＋Ｔ細胞株を作製するために、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１対立遺伝子と強く結合すると予測されるＳＯＸ２ペプチドをパルスした自家樹状細胞と、１０人の健康なＨＬＡ－Ａ＊０２：０１＋ドナーに由来するＣＤ８＋Ｔ細胞を共培養した。この方法により、ドナー１人当たり１０種の異なるＣＤ８＋Ｔ細胞株（合計１００株）を得た。１０～１４日間培養（「刺激１」）後、放射線照射して同一セットのＳＯＸ２由来ペプチドをパルスした自家末梢血単核細胞で各ＣＤ８＋Ｔ細胞株を再刺激した（「刺激２」）。これを更に１～２回繰り返し、合計で３～４ラウンドの刺激を行った。最後の刺激後、Ｔ細胞株をＳＯＸ２ペプチドプール、個々のＳＯＸ２ペプチド、又は結合したＨＬＡ－Ａ＊０２：０１／ＳＯＸ２四量体に対する応答について試験した。応答細胞を選別し、１０～１４日間、迅速に増殖させた。迅速増殖プロトコール後に、標的殺傷アッセイを実施した。これらのアッセイについては、追って詳述する。
［実施例２］Ｔ細胞は、特定のＳＯＸ２エピトープに応答する。
方法：ＣＤ８＋Ｔ細胞株を個々にＳＯＸ２ペプチドプールで刺激し、前記Ｔ細胞株がＳＯＸ２反応性ＣＤ８＋Ｔ細胞を含んでいるか否かを調べた。要約すると、各株からのＣＤ８＋Ｔ細胞５０，０００～１００，０００個をゴルジプラグとゴルジブロックの存在下で、１μｇ／ｍｌのＳＯＸ２ペプチド、培地、又は細胞刺激カクテルと共に４時間インキュベートした。インキュベーション時間後に、細胞を抗ＣＤ８抗体で染色し、固定し、透過処理し、抗ＩＦＮγ抗体で染色した。３本のレーザーを搭載したＢＤ Ｃａｎｔｏ ２機器に試料を流した。Ｄｉｖａソフトウェア（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用してデータを取得し、ＦｌｏｗＪｏ（ＦｌｏｗＪｏ Ｉｎｃ．）を使用して解析した。
結果：ペプチド刺激後のＩＦＮγ＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の百分率がバックグラウンドよりも有意に高い場合に、その株はＳＯＸ２反応性であるとみなした。図１は、ＳＯＸ２反応性Ｔ細胞株（ＩＦＮγ＋細胞２１．５％；上段プロット；ドナー１８５７５，株３）と、ＳＯＸ２反応性であるとみなされなかった株（ＩＦＮγ＋細胞０．２７％；下段プロット；ドナー１８５７５，株４）の例を示す。反応性であるとみなされた株を更に機能的に特性決定した。このアッセイによると、全体で１００株のＣＤ８＋Ｔ細胞株のうちの４９株がＳＯＸ２反応性であった。
［実施例３］ＳＯＸ２ペプチドに特異的な典型的なＴ細胞は、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１拘束性である。
確認されたＳＯＸ２特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞株をＨＬＡ－Ａ＊０２：０１拘束性について試験した。これは、観測された結果が、ＳＯＸ２ペプチドを提示するために内在性ＨＬＡＩ足場タンパク質を使用するＴ細胞に起因するものではないことを検証するために実施した。ＳＯＸ２ペプチド提示がＨＬＡ－Ａ＊０２：０１のみを介して行われたことを検証するために、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１＋Ｔ２リンパ芽球細胞をペプチド提示細胞として使用した。Ｔ２細胞は、ＨＬＡを介する内在性ペプチドの提示に重要なトランスポーターを欠損するが、外部から提供されたペプチドを提示することができる（但し、前記ペプチドがＨＬＡと強く結合することを前提とする；Ｌｏｆｔ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２００１）。
方法：各株からのＣＤ８＋Ｔ細胞５０，０００～１００，０００個をゴルジプラグとゴルジブロックの存在下で、１μｇ／ｍｌのＳＯＸ２ペプチド、ＳＯＸ２ペプチドを（少なくとも１時間）プレロードした（後に洗浄した）Ｔ２細胞、プレロードしたＴ２細胞＋ペプチド、又は培地と共に４時間インキュベートした。インキュベーション時間後に、細胞を抗ＣＤ８抗体で染色し、固定し、透過処理し、抗ＩＦＮγ抗体で染色した。３本のレーザーを搭載したＢＤ Ｃａｎｔｏ ２機器に試料を流した。Ｄｉｖａソフトウェア（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用してデータを取得し、ＦｌｏｗＪｏ（ＦｌｏｗＪｏ Ｉｎｃ．）を使用して解析した。各種インキュベーション条件後のＩＦＮγ＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度を示す。ドナー番号と株番号をスライドに表示する。
結果：図２は、（１）Ｔ細胞がＳＯＸ２ペプチドを相互に提示する機会があったときと、（２）ＳＯＸ２ペプチド提示がＴ２細胞に制限されたときに、同等量のＩＦＮγを産生した典型的なＣＤ８＋Ｔ細胞株（ドナー１８６４８，株２）を示す。この結果をＴ細胞株のＨＬＡ－Ａ＊０２：０１拘束性の指標として解釈した。全体で、４９株のＳＯＸ２特異的Ｔ細胞株のうちの４７株がＨＬＡ－Ａ＊０２：０１拘束性であった。
［実施例４］ＳＯＸ２特異的Ｔ細胞株の検証
ＳＯＸ２特異的で且つＨＬＡ－Ａ＊０２：０１拘束性であった４７株のＣＤ８＋Ｔ細胞株をＳＯＸ２ペプチドの認識について試験した。
方法：ＣＤ８＋Ｔ細胞５０，０００～１００，０００個に個々のペプチドをパルスし、４時間後に上記のようにＩＦＮγ産生を試験した。要約すると、各株からのＣＤ８＋Ｔ細胞５０，０００～１００，０００個をゴルジプラグとゴルジブロックの存在下で、１μｇ／ｍｌの個々のＳＯＸ２ペプチド、培地、又は細胞刺激カクテルで４時間刺激した。インキュベーション時間後に、細胞を抗ＣＤ８抗体で染色し、固定し、透過処理し、抗ＩＦＮγ抗体で染色した。３本のレーザーを搭載したＢＤ Ｃａｎｔｏ ２機器に試料を流した。Ｄｉｖａソフトウェア（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用してデータを取得し、ＦｌｏｗＪｏ（ＦｌｏｗＪｏ Ｉｎｃ．）を使用して解析した。ＩＦＮγ＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の頻度を示す。ドナー番号及び株番号と、対応する刺激条件を表示する。
結果：ＣＤ８＋Ｔ細胞株は、６種類のペプチドに応答した。図３は、培地又は指定したＳＯＸ２ペプチドの存在下におけるＩＦＮγ＋ＣＤ８＋Ｔ細胞の典型的プロットを提供する。この試験の結果、以下の６種類のペプチドがＨＬＡ－Ａ＊０２：０１に関して潜在的に免疫原性であるとして同定された。
・ＳＯＸ２ペプチド（５８－６６）ＫＭＡＱＥＮＰＫＭ（配列番号６）
・ＳＯＸ２ペプチド（１１８－１２７）ＴＬＭＫＫＤＫＹＴＬ（配列番号７）
・ＳＯＸ２ペプチド（２１６－２２５）ＹＭＮＧＳＰＴＹＳＭ（配列番号３）
・ＳＯＸ２ペプチド（２７５－２８３）ＳＭＹＬＰＧＡＥＶ（配列番号２）
・ＳＯＸ２ペプチド（２７７－２８７）ＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）
・ＳＯＸ２ペプチド（３０６－３１４）ＴＡＩＮＧＴＬＰＬ（配列番号４）。
［実施例５］ＳＯＸ２エピトーププロセシング
以下の実験を実施し、ＳＯＸ２エピトープがどのようにプロセシングされ、提示されるかを調べた。
多発性骨髄腫は形質細胞性悪性腫瘍であり、形質細胞が一般に免疫プロテアソーム（「ＩＰ」）を発現する。一方、多発性骨髄腫患者を治療するために、プロテアソーム阻害剤を使用する場合があり（Ｒａｊｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ，Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｄｉｓ Ｐｒｉｍｅｒｓ ２０１７）、プロテアソームサブユニット発現を変化させ、プロテアソーム触媒能に影響を与え、ＨＬＡクラスＩリガンドームを変化させることができる。ＳＯＸ２は、小細胞肺がん細胞（Ｒｕｄｉｎ ｅｔ ａｌ，Ｎａｔ Ｇｅｎｅｔ ２０１２）と膠芽腫細胞（Ａｌｏｎｓｏ ｅｔ ａｌ，ＰＬＯＳ Ｏｎｅ ２０１１）でも発現される。これらの固形腫瘍細胞は、標準プロテアソーム（「ＳＰ」）を発現し、（Ｔ細胞により産生された）ＩＦＮｇの存在下で免疫プロテアソーム（ＩＰ）を活性化させることができると思われる。
ＳＰとＩＰは、異なる方法でペプチドを切断する。したがって、プロテアソームプロセシングは、ＳＯＸ２ペプチド：ＨＬＡ複合体を標的とする免疫療法の範囲、有効性及び安全性に潜在的に影響を与えることができる。例えば、ＳＰとＩＰに依存性のペプチドを標的とするＴＣＲ免疫療法は、骨髄腫と固形腫瘍で有益であると思われる。このようなＴＣＲ免疫療法は、ＩＰサブユニット低下の場合でも有効であると思われる（Ｇｒｅｅｎｂｅｒｇ ａｎｄ Ｃｈａｐｕｉｓ ｅｔ ａｌ．，未公開）。標準プロテアソーム（ＳＰ）プロセシング経路に由来する１又は複数のエピトープのみを標的とするＴＣＲ免疫療法は、骨髄腫では有用性が低いか、又は有用でないと思われるが、非造血器悪性腫瘍では有用であると思われる。逆に、免疫プロテアソーム（ＩＰ）プロセシング経路に由来する１又は複数のエピトープを標的とするＴＣＲ免疫療法は、骨髄腫では有用であると思われるが、固形腫瘍では有用性が低いか、又は有用でないと思われる。
ＳＯＸ２エピトープがどのようにプロセシングされるかを解明するために、（Ｇｕｉｌｌａｍｅ ｅｔ ａｌ，ＰＮＡＳ ２０１０に記載されている）標準（２９３Ｅ－ＳＰ）又は免疫プロテアソーム（２９３Ｅ－ＩＰ）を発現するように改変された２９３Ｅ細胞を使用した。
図４は、フローサイトメトリーにより測定した２９３Ｅ－ＳＰ細胞と２９３－ＩＰ細胞におけるＳＯＸ２発現を示す。要約すると、細胞１５０，０００個を固定し、透過処理し、ＰＥタグ付きアイソタイプ対照又はＰＥタグ付き抗ＳＯＸ２抗体で染色した。３本のレーザーを搭載したＢＤ Ｃａｎｔｏ ２機器に試料を流した。Ｄｉｖａソフトウェア（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用してデータを取得し、ＦｌｏｗＪｏ（ＦｌｏｗＪｏ Ｉｎｃ．）を使用して解析した。グラフは、ＰＥチャンネルにおける蛍光染色強度を示す。
方法：２９３Ｅ－ＳＰ細胞又は２９３Ｅ－ＩＰ細胞をＩｎｃｕＣｙｔｅ殺傷アッセイで標的細胞として使用した。図５は、実験デザインを模式的に示す。２９３Ｅ細胞（ＳＰ又はＩＰ）をＲａｐｉｄＲｅｄ Ｃｙｔｏｌｉｇｈｔ Ｄｙｅ（Ｓａｒｔｏｒｉｕｓ）で標識し、９６ウェルプレートにウェル当たり細胞５，０００個の密度で撒いて終夜培養し、プレートへの接着を促進した。翌日、実施例４に記載した６種類の異なるＳＯＸ２ペプチドに特異的なＴ細胞株、又はＳＯＸ２に特異的ではないが、ＳＯＸ２特異的Ｔ細胞と同一の迅速増殖周期にあるＴ細胞を加えた。細胞内でカスパーゼ３／７が活性である場合に緑色の蛍光を発するカスパーゼレポーター試薬（Ｓａｒｔｏｒｉｕｓ）も加えた。プレートをＩｎｃｕＣｙｔｅ Ｓ３システムにセットし、２日間に渡り２時間間隔でウェル当たり４画像を取得した。ＩｎｃｕＣｙｔｅ Ｓ３ソフトウェアを使用してアポトーシス標的細胞（Ｃｙｔｏｌｉｇｈｔ Ｒｅｄ＋カスパーゼ３／７緑色＋）の量を定量した。
結果：図６は、ＳＯＸ２特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞株の存在下におけるアポトーシス２９３Ｅ－ＳＰ標的細胞の量を示す。無関係の特異性のＴ細胞を対照として加えた。図の凡例において囲み枠内の文字は、最良の殺傷を誘導した２種類のＴ細胞株、即ち、（Ｓｏｘ２ ５８－６６に特異的な）１７５３０株６と（Ｓｏｘ２ ２７７－２８７に特異的な）２２０５８株１９を示す。これらの結果から、ＳＯＸ２エピトープ５８－６６及び２７７－２８７は、標準プロテアソーム（ＳＰ）によりプロセシングされると判断される。図７は、ＳＯＸ２特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞株の存在下におけるアポトーシス２９３Ｅ－ＩＰ標的細胞の量を示す。図の凡例において囲み枠内の文字は、最良の殺傷を誘導した２種類のＴ細胞株、即ち、（Ｓｏｘ２ ５８－６６に特異的な）１７５３０株６と（Ｓｏｘ２ ２７７－２８７に特異的な）２２０５８株１９を示す。これらの結果から、ＳＯＸ２エピトープ５８－６６及び２７７－２８７は、免疫プロテアソーム（ＩＰ）でもプロセシングされると判断される。ＳＯＸ２ ２７７－２８７ペプチド配列はＳＯＸ２に固有であるため、このエピトープに特異的なＴ細胞を機能的特性決定用に選択した。
［実施例６］ＳＯＸ２（２７７－２８７）特異的ＣＤ８＋Ｔ細胞は、腫瘍細胞を殺傷する。
ＳＯＸ２（２７７－２８７）特異的Ｔ細胞株がＳＯＸ２発現腫瘍細胞を認識して殺傷することができるか否かを調べるために、ＳＯＸ２（２７７－２８７）エピトープの存在下で増殖させたＨＬＡ－Ａ＊０２：０１ドナーに由来するＴ細胞株を使用してＩｎｃｕＣｙｔｅ殺傷アッセイを実施した。標的細胞は、形質細胞性白血病（後期ステージ骨髄腫）株Ｌ３６３と卵巣がん細胞株ＯＶＣＡＲ３とした。
方法：上記のようにＩｎｃｕＣｙｔｅ実験を実施し、ＩｎｃｕＣｙｔｅ Ｓ３ソフトウェアを使用してアポトーシス（Ｃｙｔｏｌｉｇｈｔ ＲａｐｉｄＲｅｄ＋カスパーゼ３／７緑色＋）標的細胞の量を定量した。
結果：図８及び９に示すように、ＳＯＸ２（２７７－２８７）特異的Ｔ細胞は、Ｌ３６３とＯＶＣＡＲ３の細胞アポトーシスを誘導し、このエピトープに特異的なこれらのＴ細胞が機能的に重要であることを示唆している。
［実施例７］ＳＯＸ２（２７７－２８７）特異的Ｔ細胞の選別とシーケンシング
シーケンシングの前に、異なるドナーに由来する該当Ｔ細胞株をプールし、等分し、種々の濃度の関連するＨＬＡ－Ａ＊０２：０１／ペプチド四量体で染色した。次に、四量体＋細胞（各染色条件で多量・上位の結合細胞）と四量体陰性細胞を選別し、シーケンシング（Ａｄａｐｔｉｖｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ及び１０Ｘ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ）に備えた。種々の四量体濃度を用いると、結合性の強いＴＣＲは、特に低濃度の四量体の染色条件下で「上位結合細胞」の分類に集積されるので、同定が可能になる。
ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１／Ｓｏｘ２（２７７－２８７）四量体滴定からの結果に基づき、５人のドナー（１７８６１、１８３１５、２２０５８、２２０８７、２２２１４）からプールしたＴ細胞株の染色・選別ストラテジーを考案した。細胞を１：２００（最適四量体濃度）と１：２０００（低四量体濃度）のＨＬＡ－Ａ＊０２：０１／ＳＯＸ２（２７７－２８７）四量体で染色し、選別した。典型的なデータを図１０に示す。
Ａｄａｐｔｉｖｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ用の試料は（細胞ペレットとして）選別後に凍結し、１０Ｘ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ用の試料はすぐにプロセシングした。Ａｄａｐｔｉｖｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ社の市販品であるＩｍｍｕｎｏＳＥＱアッセイにより、種々の試料に存在するＴＣＲβ配列が得られ、（ユニークなＣＤＲ３配列により同定される）各ＴＣＲβの集積倍率を計算することができた。シングルセルで１０Ｘ Ｇｅｎｏｍｉｃｓシーケンシングを実施し、ＩｍｍｕｎｏＳＥＱにおいて「高集積度で」出現した各ＴＣＲβをその対応するＴＣＲαと対合させた。ＴＣＲ遺伝子使用を表１にまとめる。
Figure 2023542528000026
野生型ＴＣＲａ及びＴＣＲｂ配列をコドン最適化させ、Ｐ２Ａ自己切断ペプチドと連結した。相補的システイン残基をＴＲＡ及びＴＲＢ定常ドメインに組込み、外来性ＴＣＲ対合を増加させ、内在性ＴＣＲとの誤対合を減少させた（例えば、Ｄｏｓｓａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １３１：１０８－１２０（２０１８）参照）。
初代ＣＤ８＋Ｔ細胞におけるレンチウイルス産生及び試験用にギブソン・アセンブリを使用してこれらのＴＣＲ発現カセットをｐＲＲＬＳＩＮベクターに挿入した。
［実施例８］初代ＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＳＯＸ２（２７７－２８７）特異的ＴＣＲの検証
方法：ギブソン・アセンブリ後にＴＣＲ発現ベクターを配列決定し、ＴＣＲ発現カセットをｐＲＲＬＳＩＮベクターに挿入するのに成功したことを確認した。２９３Ｔ／１７パッケージング細胞株とＥｆｆｅｃｔｅｎｅキット（Ｑｉａｇｅｎ）を使用してレンチウイルス粒子を作製した。負の磁気分離（Ｅａｓｙ Ｓｅｐ Ｋｉｔ，ＳＴＥＭＣＥＬＬ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を使用して健康なドナー（１８６４８）からＣＤ８＋Ｔ細胞を単離し、抗ＣＤ３／ＣＤ２８ビーズ（Ｄｙｎａｂｅａｄｓ）で４時間刺激し、２９３Ｔ／１７細胞から採取したＳＯＸ２－ＴＣＲをコードするレンチウイルス粒子を導入した。導入後５日目に、導入したＣＤ８＋Ｔ細胞を四量体染色について評価した。ＳＯＸ２－ＴＣＲ＋ＣＤ８＋Ｔ細胞を迅速増殖用に選別し、種々のペプチド濃度に対する応答と標的殺傷について評価した。
［実施例９］Ｌ３６３骨髄腫細胞は、ヒト免疫系機能のマウスモデルにおいて進行性腫瘍増殖を示し、インビボでＳＯＸ２発現を維持する。
ヒト化マウスに大腿骨内注射により０．５×１０６個又は１×１０６個のＬ３６３細胞を注入し、生存率を追跡した。骨髄浸潤Ｌ３６３細胞におけるＳＯＸ２発現をフローサイトメトリーにより確認し、インビトロで増殖させたＬ３６３細胞と比較した。
［実施例１０］追加試験
１実験では、（２人の異なるドナーに由来する）ＴＣＲを導入したＣＤ８＋Ｔ細胞５０，０００～１００，０００個を、ゴルジプラグとゴルジブロックの存在下に、種々の濃度のＳＯＸ２ ２７７－２８７ペプチド（１０μｇ／ｍｌ～０．０１ｎｇ／ｍｌ）、培地、又は細胞刺激カクテルで４時間刺激した。インキュベーション時間後に、細胞を抗ＣＤ８抗体で染色し、固定し、透過処理し、抗ＩＦＮγ抗体で染色した。３本のレーザーを搭載したＢＤ Ｃａｎｔｏ ２機器に試料を流した。Ｄｉｖａソフトウェア（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用してデータを取得し、ＦｌｏｗＪｏ（ＦｌｏｗＪｏ Ｉｎｃ．）を使用して解析した。非線形回帰分析法を使用して各ＴＣＲのＬｏｇＥＣ５０をＰｒｉｓｍ（Ｖ９，ＧｒａｐｈＰａｄ）で計算した。データを図１２に示す。別の実験では、Ｓｏｘ２を発現するＨＬＡ－Ａ２＋腫瘍細胞と、Ｓｏｘ２－ＴＣＲを導入したＣＤ８＋Ｔ細胞を３：１の比で播種した。場合により、ＨＬＡ－Ａ２発現の亢進を促進するために、腫瘍細胞をＩＦＮγで前処理した。細胞を終夜（１６～１８時間）共培養し、ＣＤ１３７発現をＣＤ８＋Ｔ細胞でフローサイトメトリーにより評価した。共培養機構の模式図を図１３に示す。
別の実験では、ＣＤ８＋Ｔ細胞にＴＣＲ５又はＴＣＲ１０を導入し、ＨＬＡ－Ａ２とＳＯＸ２を発現する（未処理又はＩＦＮ－γで前処理した）腫瘍細胞と共に終夜インキュベートした。ＣＤ１３７発現（２人のドナー間の±ＳＥＭ）を図１４に示す。
上述した種々の実施形態を組合わせ、他の実施形態を提供することができる。２０２０年９月２４日付け米国仮特許出願第６３／０８３，０６９号を含めて、本明細書中に言及及び／又は出願データシートに列挙した全ての米国特許、米国特許出願公開、米国特許出願、米国外特許、米国外特許出願及び非特許文献は、その開示内容全体を本願に援用する。必要に応じて上記各種特許、出願及び文献の概念を利用して更に他の実施形態を提供するように、上記実施形態の諸事項を変更することができる。
以上の詳細な説明に照らしてこれら及び他の変更を上記実施形態に加えることができる。一般に、以下の特許請求の範囲で使用する用語は、明細書と特許請求の範囲に開示する特定の実施形態に特許請求の範囲を制限するものと解釈すべきではないが、考えられる全実施形態と、このような特許請求の範囲の権利が及ぶ最大限の均等物を含むものと解釈すべきである。したがって、特許請求の範囲は、以上の開示に制限されない。

Claims (95)

  1. ＳＯＸ２ペプチド抗原：ＨＬＡ複合体と結合することが可能な単離結合タンパク質であって、前記ＳＯＸ２ペプチドが、配列番号５、２、３、４、６、若しくは７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、任意に、前記結合が、特異的結合を含む、前記単離結合タンパク質。
  2. 前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号５に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、請求項１に記載の結合タンパク質。
  3. 前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号２に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、請求項１に記載の結合タンパク質。
  4. 前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号３に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、請求項１に記載の結合タンパク質。
  5. 前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号４に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、請求項１に記載の結合タンパク質。
  6. 前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号６に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、請求項１に記載の結合タンパク質。
  7. 前記ＳＯＸ２ペプチド抗原が、配列番号７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、請求項１に記載の結合タンパク質。
  8. 前記ＨＬＡが、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１を含む、請求項１～７のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  9. 免疫グロブリンスーパーファミリー可変ドメインを含む、請求項１～８のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  10. ＴＣＲα鎖可変ドメイン（Ｖα）及び／又はＴＣＲβ鎖可変ドメイン（Ｖβ）を含む、請求項１～９のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  11. ＴＣＲミミック抗体の重鎖可変ドメイン（ＶＨ）及び／又は軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）を含む、請求項１～９のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  12. 前記結合タンパク質が、
    （ｉ）配列番号５２、５３、１００、１０１、１６、１７、２８、２９、４０、４１、６４、６５、７６、７７、８８、８９、１１２、１１３、１２４、１２５、１３６、１３７、１４８及び１４９のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ３βである。）；
    （ｉｉ）配列番号５１、９９、１５、２７、３９、６３、７５、８７、１１１、１２３、１３５及び１４７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ２βである。）；
    （ｉｉｉ）配列番号５０、９８、１４、２６、３８、６２、７４、８６、１１０、１２２、１３４及び１４６のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ１βである。）；
    （ｉｖ）配列番号５７、５８、１０５、１０６、２１、２２、３３、３４、４５、４６、６９、７０、８１、８２、９３、９４、１１７、１１８、１２９、１３０、１４１、１４２、１５３及び１５４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ３αである。）；
    （ｖ）配列番号５６、１０４、２０、３２、４４、６８、８０、９２、１１６、１２８、１４０及び１５２のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ２αである。）；及び／又は
    （ｖｉ）配列番号５５、１０３、１９、３１、４３、６７、７９、９１、１１５、１２７、１３９及び１５１のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、又は１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸置換を含むその変異体（なお、前記アミノ酸配列は、任意にＣＤＲ１αである。）を含む、請求項１～１１のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  13. （１）ＣＤＲ１α、ＣＤＲ２α、及びＣＤＲ３αを含むＴＣＲＶα、並びに
    （２）ＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、及びＣＤＲ３βを含むＴＣＲＶβを含み、
    前記ＣＤＲ１α、ＣＤＲ２α、ＣＤＲ３α、ＣＤＲ１β、ＣＤＲ２β、及びＣＤＲ３βが、
    （ｉ）それぞれ配列番号５５、５６、５７若しくは５８、５０、５１、及び５２若しくは５３；
    （ｉｉ）それぞれ配列番号１０３、１０４、１０５若しくは１０６、９８、９９、及び１００若しくは１０１；
    （ｉｉｉ）それぞれ配列番号１９、２０、２１若しくは２２、１４、１５、及び１６若しくは１７；
    （ｉｖ）それぞれ配列番号３１、３２、３３若しくは３４、２６、２７、及び２８若しくは２９；
    （ｖ）それぞれ配列番号４３、４４、４５若しくは４６、３８、３９、及び４０若しくは４１；
    （ｖｉ）それぞれ配列番号６７、６８、６９若しくは７０、６２、６３、及び６４若しくは６５；
    （ｖｉｉ）それぞれ配列番号７９、８０、８１若しくは８２、７４、７５、及び７６若しくは７７；
    （ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９１、９２、９３若しくは９４、８６、８７、及び８８若しくは８９；
    （ｉｘ）それぞれ配列番号１１５、１１６、１１７若しくは１１８、１１０、１１１、及び１１２若しくは１１３；
    （ｘ）それぞれ配列番号１２７、１２８、１２９若しくは１３０、１２２、１２３、及び１２４若しくは１２５；
    （ｘｉ）それぞれ配列番号１３９、１４０、１４１若しくは１４２、１３４、１３５、及び１３６若しくは１３７；又は
    （ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５１、１５２、１５３若しくは１５４、１４６、１４７、及び１４８若しくは１４９に記載の通りである、請求項１～１０及び１２のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  14. 前記Ｖαが、配列番号５４、１０２、１８、３０、４２、６６、７８、９０、１１４、１２６、１３８及び１５０のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、請求項１０及び１２～１３のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  15. 前記Ｖβが、配列番号４９、９７、１３、２５、３７、６１、７３、８５、１０９、１２１、１３３及び１４５のいずれか１つに記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成される、請求項１０及び１２～１４のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  16. （ｉ）それぞれ配列番号５４及び４９；
    （ｉｉ）それぞれ配列番号１０２及び９７；
    （ｉｉｉ）それぞれ配列番号１８及び１３；
    （ｉｖ）それぞれ配列番号３０及び２５；
    （ｖ）それぞれ配列番号４２及び３７；
    （ｖｉ）それぞれ配列番号６６及び６１；
    （ｖｉｉ）それぞれ配列番号７８及び７３；
    （ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９０及び８５；
    （ｉｘ）それぞれ配列番号１１４及び１０９；
    （ｘ）それぞれ配列番号１２６及び１２１；
    （ｘｉ）それぞれ配列番号１３８及び１３３；又は
    （ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５０及び１４５
    に記載のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるＶα及びＶβを含む、請求項１０及び１２～１５のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  17. （ｉ）それぞれ配列番号５４及び４９；
    （ｉｉ）それぞれ配列番号１０２及び９７；
    （ｉｉｉ）それぞれ配列番号１８及び１３；
    （ｉｖ）それぞれ配列番号３０及び２５；
    （ｖ）それぞれ配列番号４２及び３７；
    （ｖｉ）それぞれ配列番号６６及び６１；
    （ｖｉｉ）それぞれ配列番号７８及び７３；
    （ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号９０及び８５；
    （ｉｘ）それぞれ配列番号１１４及び１０９；
    （ｘ）それぞれ配列番号１２６及び１２１；
    （ｘｉ）それぞれ配列番号１３８及び１３３；又は
    （ｘｉｉ）それぞれ配列番号１５０及び１４５
    に記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるＶα及びＶβを含む、請求項１０及び１２～１６のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  18. 前記結合タンパク質が、配列番号４８、９６、１２、２４、３６、６０、７２、８４、１０８、１２０、１３２及び１４４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列に含まれる、請求項１０及び１２～１７のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  19. 前記結合タンパク質が、
    （ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＣＤＲ３β、ＣＤＲ２β、及び／若しくはＣＤＲ１β；並びに／又は
    （ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＣＤＲ３α、ＣＤＲ２α、及び／若しくはＣＤＲ１α
    を含む、請求項１～１１のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  20. 前記結合タンパク質が、
    （ｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶαに対して少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するＶα；及び／又は
    （ｉｉ）ドナー１株１、ドナー１株３、ドナー２株８、ドナー２株１、ドナー２株１３、ドナー２株１１、若しくはドナー２株１９に由来するＴ細胞のＴＣＲのＶβに対して少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するＶβを含み、
    但し、
    （ａ）前記ＣＤＲの少なくとも３つ又は４つは変異がなく；
    （ｂ）変異を有するＣＤＲは、２個までのアミノ酸の置換、連続する５個までのアミノ酸の欠失、又はその組み合わせのみを有し；
    （ｃ）前記結合タンパク質は、ＳＯＸ２ペプチド：ＨＬＡ複合体と結合するその能力を維持する、請求項１～１１のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  21. 更に、ＴＣＲβポリペプチド定常ドメイン（Ｃβ）、ＴＣＲαポリペプチド定常ドメイン（Ｃα）、又はその両方を含み、任意に、
    （１）前記Ｖβ及び前記Ｃβが一緒になってＴＣＲβ鎖を構成し、並びに／又は前記Ｖα及び前記Ｃαが一緒になってＴＣＲα鎖を構成し、並びに／或いは
    （２）前記Ｃβが、配列番号１５６若しくは１５７に記載のアミノ酸配列を含むか、又は若しくは前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成され、並びに／或いは前記Ｃαが、配列番号１５５に記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される、請求項１～２０のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  22. ＴＣＲＣβ及びＴＣＲＣαを含み、前記Ｃβ及び／又は前記Ｃαが、前記Ｃβと前記Ｃαが会合して二量体を形成するときに、前記Ｃβと前記Ｃαとの間に非天然ジスルフィド結合が形成されるように、ある位置に１個以上の非天然アミノ酸を含み、任意に、前記非天然アミノ酸が、前記Ｃβにシステインを含み、及び／又は前記Ｃαにシステインを含む、請求項２１に記載の結合タンパク質。
  23. ＴＣＲＣβ及びＴＣＲＣαを含み、前記ＴＣＲＣβが、アミノ酸５７位にシステインアミノ酸を含み、前記ＴＣＲＣαが、アミノ酸４８位にシステインアミノ酸を含む、請求項２１又は２２に記載の結合タンパク質。
  24. 前記結合タンパク質が、ＴＣＲ、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）、ｓｃＴｖ、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、ＴＣＲミミック抗体若しくはその抗原結合断片、又は任意のそれらの組み合わせを含む、請求項１～２３のいずれか一項に記載の結合タンパク質。
  25. 前記結合タンパク質が、ＴＣＲを含む、請求項２４に記載の結合タンパク質。
  26. 前記結合タンパク質が、ｓｃＴｖを含む、請求項２４に記載の結合タンパク質。
  27. 前記結合タンパク質が、ｓｃＴＣＲを含む、請求項２４に記載の結合タンパク質。
  28. 前記結合タンパク質が、ＣＡＲを含む、請求項２４に記載の結合タンパク質。
  29. 前記結合タンパク質が、ＴＣＲミミック抗体又はその抗原結合断片を含む、請求項２４に記載の結合タンパク質。
  30. 請求項１～２９のいずれか一項に記載の結合タンパク質をコードする単離ポリヌクレオチド。
  31. 前記ポリヌクレオチドが、宿主細胞での発現のためにコドン最適化されており、任意に、前記宿主細胞が、免疫系細胞を含み、更に任意に、前記免疫系細胞が、Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞、又はＮＫ細胞を含む、請求項３０に記載のポリヌクレオチド。
  32. 更に、
    （ｉ）ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターα鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターα鎖を含む）；
    （ｉｉ）ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターβ鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターβ鎖を含む）；又は
    （ｉｉｉ）（ｉ）のポリヌクレオチド及び（ｉｉ）のポリヌクレオチド
    を含む、請求項３１に記載のポリヌクレオチド。
  33. （ａ）ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
    （ｂ）ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、及び
    （ｃ）（ａ）のポリヌクレオチドと（ｂ）のポリヌクレオチドとの間に配置された自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチド
    を含む、請求項３２に記載のポリヌクレオチド。
  34. 更に、自己切断ペプチドをコードし、
    （１）結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドと、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとの間；及び／又は
    （２）結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドと、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとの間
    に配置されたポリヌクレオチドを含む、請求項３２又は３３に記載のポリヌクレオチド。
  35. インフレームで動作可能に連結された
    （ｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＢＰ）；
    （ｉｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＢＰ）；
    （ｉｉｉ）（ｐｎＢＰ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）；
    （ｉｖ）（ｐｎＢＰ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）；
    （ｖ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＢＰ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）；又は
    （ｖｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＢＰ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）を含み、
    ｐｎＣＤ８αが、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、
    ｐｎＣＤ８βが、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、
    ｐｎＢＰが、結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドであり、
    ｐｎＳＣＰ１及びｐｎＳＣＰ２が、各々独立して、自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、前記ポリヌクレオチド及び／又は前記コードされる自己切断ペプチドは、任意に同一であるか、又は異なる、請求項３２～３４のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  36. 前記コードされる結合タンパク質が、ＴＣＲα鎖及びＴＣＲβ鎖を含み、前記ポリヌクレオチドが、ＴＣＲα鎖をコードするポリヌクレオチドと、ＴＣＲβ鎖をコードするポリヌクレオチドとの間に配置された自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項３０～３５のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  37. インフレームで動作可能に連結された
    （ｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲα）；
    （ｉｉ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲα）；
    （ｉｉｉ）（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲβ）；
    （ｉｖ）（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＴＣＲβ）；
    （ｖ）（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８β）；
    （ｖｉ）（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８α）；
    （ｖｉｉ）（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８α）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８β）；又は
    （ｖｉｉｉ）（ｐｎＴＣＲα）－（ｐｎＳＣＰ１）－（ｐｎＴＣＲβ）－（ｐｎＳＣＰ２）－（ｐｎＣＤ８β）－（ｐｎＳＣＰ３）－（ｐｎＣＤ８α）を含み、
    ｐｎＣＤ８αは、ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、
    ｐｎＣＤ８βが、ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、
    ｐｎＴＣＲαが、ＴＣＲα鎖をコードするポリヌクレオチドであり、
    ｐｎＴＣＲβが、ＴＣＲβ鎖をコードするポリヌクレオチドであり、
    ｐｎＳＣＰ１、ｐｎＳＣＰ２、及びｐｎＳＣＰ３が、各々独立して、自己切断ペプチドをコードするポリヌクレオチドであり、前記ポリヌクレオチド及び／又は前記コードされる自己切断ペプチドは、任意に同一であるか、又は異なる、請求項３６に記載のポリヌクレオチド。
  38. 前記ポリヌクレオチドが、ＤＮＡ、ＲＮＡ（任意にｍＲＮＡ）、又はその両方を含む、請求項３０～３７のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  39. ＤＮＡを含む、請求項３８に記載のポリヌクレオチド。
  40. （１）前記ポリヌクレオチドが、配列番号４８、９６、１２、２４、３６、６０、７２、８４、１０８、１２０、１３２及び１４４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は若しくは前記アミノ酸配列から構成されるか、又は前記アミノ酸配列に対して少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列をコードする；並びに／或いは
    （２）前記ポリヌクレオチドが、配列番号４７、９５、１１、２３、３５、４７、５９、７１、８３、１０７、１１９、１３１及び１４３のいずれか１つに記載の核酸配列を含むか、若しくは前記核酸配列から構成されるか、又は前記核酸配列に対して少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％の同一性を有するポリヌクレオチドを含む、請求項３０～３９のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  41. 請求項３０～４０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
  42. 前記ベクターが、ウイルスベクターを含む、請求項４１に記載のベクター。
  43. 前記ウイルスベクターが、レンチウイルスベクター又はγ－レトロウイルスベクターを含む、請求項４２に記載のベクター。
  44. 前記ベクターが、前記ポリヌクレオチドを宿主細胞に送達することが可能である、請求項４１～４３のいずれか一項に記載のベクター。
  45. 前記宿主細胞が、造血前駆細胞又はヒト免疫系細胞である、請求項４４に記載のベクター。
  46. 前記ヒト免疫系細胞が、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４－ＣＤ８－ダブルネガティブＴ細胞、γδＴ細胞、ナチュラルキラー細胞、ナチュラルキラーＴ細胞、マクロファージ、単球、樹状細胞、又は任意のそれらの組み合わせである、請求項４５に記載のベクター。
  47. 前記Ｔ細胞が、ナイーブＴ細胞、セントラルメモリーＴ細胞、エフェクターメモリーＴ細胞、又は任意のそれらの組み合わせである、請求項４６に記載のベクター。
  48. 請求項３０～４０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド、及び／又は請求項４１～４７のいずれか一項に記載のベクターを含む、及び／又は請求項１～２９のいずれか一項に記載の結合タンパク質を発現する、宿主細胞であって、前記ポリヌクレオチド、ベクター、又は結合タンパク質が、任意に前記宿主細胞に対して異種である、前記宿主細胞。
  49. 前記宿主細胞が、造血前駆細胞及び／又は免疫細胞、任意にヒト免疫細胞を含む、請求項４８に記載の宿主細胞。
  50. 前記宿主細胞が、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、樹状細胞、マクロファージ、単球、Ｂ細胞、形質細胞、又は任意のその組み合わせを含む、請求項４９に記載の宿主細胞。
  51. 前記宿主細胞が、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４－ＣＤ８－ダブルネガティブＴ細胞、γδＴ細胞、又は任意のそれらの組み合わせを含み、
    任意に、前記宿主細胞が、ＣＤ４＋Ｔ細胞及びＣＤ８＋Ｔ細胞を含み、更に任意に、前記ＣＤ４＋Ｔ細胞、前記ＣＤ８＋Ｔ細胞、又はその両方が、（ｉ）ＣＤ８コレセプターα鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターα鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターα鎖を含む）；（ｉｉ）ＣＤ８コレセプターβ鎖の細胞外部分を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド（なお、任意に、前記コードされるポリペプチドは、ＣＤ８コレセプターβ鎖であるか、又はＣＤ８コレセプターβ鎖を含む）；又は（ｉｉｉ）（ｉ）のポリヌクレオチド及び（ｉｉ）のポリヌクレオチドを含む、請求項５０に記載の宿主細胞。
  52. 前記宿主細胞が、ＣＤ８＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞を含む、請求項５０又は５１に記載の宿主細胞。
  53. 前記宿主細胞が、ＰＤ－１遺伝子、ＬＡＧ３遺伝子、ＴＩＭ３遺伝子、ＣＴＬＡ４遺伝子、ＨＬＡコンポーネント遺伝子、ＴＩＧＩＴ遺伝子、ＴＣＲコンポーネント遺伝子、ＦａｓＬ遺伝子、又は任意のそれらの組み合わせの染色体遺伝子ノックアウトを含む、請求項４８～５２のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  54. 前記染色体遺伝子ノックアウトが、α１マクログロブリン遺伝子、α２マクログロブリン遺伝子、α３マクログロブリン遺伝子、β１ミクログロブリン遺伝子、又はβ２ミクログロブリン遺伝子から選択されるＨＬＡコンポーネント遺伝子のノックアウトを含む、請求項５３に記載の宿主細胞。
  55. 前記染色体遺伝子ノックアウトが、ＴＣＲα可変領域遺伝子、ＴＣＲβ可変領域遺伝子、ＴＣＲ定常領域遺伝子、又はそれらの組み合わせから選択されるＴＣＲコンポーネント遺伝子のノックアウトを含む、請求項５３又は５４に記載の宿主細胞。
  56. 前記結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドが、前記宿主細胞に対して異種であり、内在性ＴＣＲ遺伝子座に含まれる、請求項４８～５５のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  57. 更に、
    （ｉ）安全性スイッチタンパク質；
    （ｉｉ）選択マーカー；
    （ｉｉｉ）ＣＤ８コレセプターβ鎖；
    （ｉｖ）ＣＤ８コレセプターα鎖；又は
    （ｖ）任意のそれらの組み合わせ
    をコードする異種ポリヌクレオチドを含む、請求項４８～５６のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  58. 前記宿主細胞が、ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体の存在下でＩＦＮ－γを産生し、任意に、前記ＳＯＸ２抗原：ＨＬＡ複合体が、標的細胞の表面で発現される、請求項４８～５７のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  59. 前記結合タンパク質が、６．０～９．０（即ち、６．０、９．０、及びその間の任意の数値を含む）、６．０～８．５、６．０～８．０、６．０～７．５、６．０～７．０、６．０～６．５、６．５～９．０、６．５～８．５、６．５～８．０、６．５～７．５、６．５～７．０、７．０～９．０、７．０～８．５、７．０～８．０、７．０～７．５、７．５～９．０、７．５～８．５、７．５～８．０、８．０～９．０、８．０～８．５、又は８．２～９．０のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、請求項４８～５８のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  60. 前記結合タンパク質が、約６．０、約６．１、約６．２、約６．３、約６．４、約６．５、約６．６、約６．７、約６．８、約６．９、約７．０、約７．１、約７．２、約７．３、約７．４、約７．５、約７．６、約７．７、約７．８、約７．９、約８．０、約８．１、約８．２、約８．３、約８．４、約８．５、約８．６、約８．７、約８．８、約８．９、又は約９．０のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、請求項４８～５９のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  61. 前記結合タンパク質が、６．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、請求項４８～６０のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  62. 前記結合タンパク質が、６．５以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、請求項４８～６１のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  63. 前記結合タンパク質が、７．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、請求項４８～６２のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  64. 前記結合タンパク質が、７．５以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、請求項４８～６３のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  65. 前記結合タンパク質が、８．０以上のＩＦＮγ産生ｐＥＣ５０でＹＬＰＧＡＥＶＰＥＰＡ（配列番号５）：ＨＬＡ複合体と結合することが可能である、請求項４８～６４のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  66. 前記宿主細胞が、以下の腫瘍細胞株：ＣＦＰＡＣ１、Ｈ４４１、Ｐａｎｃ０８．１３、ＳＷ６２０、ＳＷ５２７、Ｌ３６３、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＭＭ１Ｒ、及びＨＬＡ－Ａ２を発現するＩＮＡ６のいずれか１種以上の細胞の存在下でＣＤ１３７を発現し、任意に、ＣＤ１３７発現が、前記宿主細胞を前記腫瘍細胞株の１種以上の細胞と共にインキュベーション後に前記宿主細胞のフローサイトメトリーにより評価される、請求項４８～６５のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  67. 以下の腫瘍細胞株：ＣＦＰＡＣ１、Ｈ４４１、Ｐａｎｃ０８．１３、ＳＷ６２０、ＳＷ５２７、Ｌ３６３、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＭＭ１Ｒ、ＨＬＡ－Ａ２を発現するＩＮＡ６のいずれか１つ以上と共にインキュベーション後に、試料中に存在する複数の前記宿主細胞のうち、前記複数の前記宿主細胞の５％以上、１０％以上、１５％以上、２０％以上、２５％以上、３０％以上、３５％以上、４０％以上、４５％以上、５０％以上、５５％以上、６０％以上、６５％以上、７０％以上、７５％以上、又は８０％以上が、ＣＤ１３７の発現について陽性である、請求項４８～６６のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  68. 前記インキュベーションが、約１６時間～約１８時間の持続時間を含み、任意に、前記インキュベーションが、１６～１８時間の持続時間を含む、請求項６７に記載の宿主細胞。
  69. 前記インキュベーションの前に、前記腫瘍細胞株の細胞におけるＨＬＡ－Ａ２発現を増加させるための物質を前記腫瘍細胞株の細胞に投与し、任意に、前記物質が、ＩＦＮ－γを含む、請求項６６～６８のいずれか一項に記載の宿主細胞。
  70. （ｉ）請求項１～２９のいずれか一項に記載の結合タンパク質；
    （ｉｉ）請求項３０～４０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド；
    （ｉｉｉ）請求項４１～４７のいずれか一項に記載のベクター；及び／又は
    （ｉｖ）任意にＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、若しくはその両方を含む、請求項４８～４９のいずれか一項に記載の宿主細胞、並びに
    薬学的に許容される基剤、賦形剤、又は希釈剤を含む、組成物。
  71. 前記組成物が、前記宿主細胞を含み、前記宿主細胞が、免疫細胞、任意にＣＤ８＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞を含み、更に任意に、前記ＣＤ８＋Ｔ細胞及びＣＤ４＋Ｔ細胞が、約１：１の比で存在し、並びに／又は前記組成物が、実質的にナイーブＴ細胞を含まない、請求項７０に記載の組成物。
  72. 対象における配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害の治療方法であって、前記方法が、有効量の
    （ｉ）請求項１～２９のいずれか一項に記載の結合タンパク質；
    （ｉｉ）請求項３０～４０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド；
    （ｉｉｉ）請求項４１～４７のいずれか一項に記載のベクター；
    （ｉｖ）請求項４８～４９のいずれか一項に記載の宿主細胞；及び／又は
    （ｖ）請求項７０若しくは７１に記載の組成物
    を前記対象に投与することにより、前記疾患又は病態を治療することを含む、前記方法。
  73. 配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害を有する対象において免疫応答を誘導する方法、及び／又は対象における前記疾患又は障害の治療方法であって、前記方法が、有効量の、標的細胞の表面に発現されるペプチド：ＨＬＡ複合体と特異的に結合するＴＣＲを発現するＴ細胞を前記対象に投与することを含み、前記ペプチドが、配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、又は前記アミノ酸配列から構成され、前記ＨＬＡが、任意にＨＬＡ－Ａ＊０２：０１である、前記方法。
  74. 対象における配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害の治療方法で使用するための、請求項１～２９のいずれか一項に記載の結合タンパク質、請求項３０～４０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド、請求項４１～４７のいずれか一項に記載のベクター、請求項４８～４９のいずれか一項に記載の宿主細胞、及び／又は請求項７０若しくは７１に記載の組成物。
  75. 対象における配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原の発現、又はＳＯＸ２発現若しくは活性に関連する疾患又は障害の治療用医薬の製造で使用するための、請求項１～２９のいずれか一項に記載の結合タンパク質、請求項３０～４０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド、請求項４１～４７のいずれか一項に記載のベクター、請求項４８～４９のいずれか一項に記載の宿主細胞、及び／又は請求項７０若しくは７１に記載の組成物。
  76. 前記対象が、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１＋である、請求項７２若しくは７３に記載の方法、又は請求項７４若しくは７５に記載の使用のための結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
  77. 前記疾患又は病態ががんである、請求項７２、７３、若しくは７６、又は７２若しくは７３のいずれか一項に記載の方法、又は請求項７４～７６のいずれか一項に記載の使用のための結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
  78. 前記がんが、造血器悪性腫瘍又は固形腫瘍を含む、請求項７７に記載の方法、又は請求項７７に記載の用途における結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
  79. 前記がんが、多発性骨髄腫、形質細胞性白血病、卵巣がん、神経膠腫、肺がん、頸部がん、子宮頸がん、又は任意のそれらの組み合わせを含む、請求項７７若しくは７８に記載の方法、又は請求項７７若しくは７８に記載の使用のための結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
  80. 前記対象がヒトである、請求項７２、７３、若しくは７６～７９のいずれか一項に記載の方法、又は請求項７４～７９のいずれか一項に記載の使用のための結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
  81. 前記対象が、（ｉ）外科療法、（ｉｉ）放射線療法、（ｉｉｉ）化学療法、（ｉｖ）造血幹細胞移植（ＨＳＣ）、及び（ｖ）任意にＣＡＲを発現するＴ細胞を含む養子細胞療法の１つ以上を以前に受けており、
    前記疾患又は障害が、任意に以前の療法に難治性である、
    請求項７２、７３、若しくは７６～８０のいずれか一項に記載の方法、又は請求項７４～８０のいずれか一項に記載の使用のための結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
  82. 前記組成物に含まれる前記宿主細胞の１種以上が、前記対象の自己由来である、請求項７２、７３、若しくは７６～８１のいずれか一項に記載の方法、又は請求項７４～８１のいずれか一項に記載の使用のための結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
  83. 更に、免疫チェックポイント分子の阻害剤を前記対象に投与することを含む、請求項７２、７３、若しくは７６～８２のいずれか一項に記載の方法、又は請求項７４～８１のいずれか一項に記載の使用のための結合タンパク質、ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、若しくは組成物。
  84. （ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成される単離ペプチド若しくはポリペプチド；及び／又は
    （ｖｉｉ）配列番号２、３、４、５、６、若しくは７と比較して１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸変異を有する（ｉ）～（ｖｉ）のいずれか１つの単離ペプチド若しくはポリペプチドの変異体を含む、免疫原性組成物であって、
    （ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１つの単離ペプチド又はポリペプチドが、単離全長ヒトＳＯＸ２を含まない、前記免疫原性組成物。
  85. （ａ）（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１つの１コピー以上及び／又は
    （ｂ）（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれかの１つ以上
    が、融合ポリペプチドに存在しており、前記融合ポリペプチドが、任意に更に自己切断ペプチドのアミノ酸配列を含む、請求項８４に記載の免疫原性組成物。
  86. 前記免疫原性組成物が、がん細胞に対する免疫応答を対象において誘導することが可能であり、任意に、前記がん細胞が、多発性骨髄腫細胞、形質細胞性白血病細胞、神経膠腫細胞、頸部がん細胞、肺がん細胞、及び／又は卵巣がん細胞を含む、請求項８４又は８５に記載の免疫原性組成物。
  87. 更にアジュバントを含む、請求項８４～８６のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
  88. （ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；
    （ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチド；及び／又は
    （ｖｉｉ）配列番号２、３、４、５、６、若しくは７と比較して１つ、２つ若しくは３つのアミノ酸変異を有する（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１つのペプチド若しくはポリペプチドの変異体をコードする、単離ポリヌクレオチドであって、
    前記ポリヌクレオチドが、任意にベクターに含まれ、及び／又は（ｉ）～（ｖｉｉ）のいずれか１つのペプチド若しくはポリペプチドが、全長ヒトＳＯＸ２を含まない、前記ポリヌクレオチド。
  89. 前記ポリヌクレオチドが、宿主細胞での発現のためにコドン最適化されており、前記宿主細胞が、任意に樹状細胞又はＴ細胞である、請求項８８に記載のポリヌクレオチド。
  90. 請求項８８又は８９に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞であって、前記ポリヌクレオチドが、前記宿主細胞に対して異種であり、前記宿主細胞が、任意に免疫細胞であり、更に任意にプロフェッショナル抗原提示細胞である、前記宿主細胞。
  91. 前記宿主細胞が、樹状細胞又はＴ細胞である、請求項９０に記載の宿主細胞。
  92. ＳＯＸ２発現又は活性に関連する疾患又は障害に対する免疫応答を対象において誘導する方法であって、前記方法が、請求項１～２９のいずれか一項に記載の結合タンパク質、請求項３０～４０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド、請求項４１～４８のいずれか一項に記載のベクター、請求項４９～６９のいずれか一項に記載の宿主細胞、請求項７０若しくは７１に記載の組成物、請求項８４～８７のいずれか一項に記載の免疫原性組成物、請求項８８若しくは８９に記載のポリヌクレオチド、及び／又は請求項９０若しくは９１に記載の宿主細胞を前記対象に投与することを含む、前記方法。
  93. （ｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；
    （ｉｉ）配列番号３のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；
    （ｉｉｉ）配列番号４のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；
    （ｉｖ）配列番号５のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；
    （ｖ）配列番号６のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド；及び／又は
    （ｖｉ）配列番号７のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド
    から選択されるペプチド（例えば、ペプチド：ＨＬＡ複合体に含まれるペプチド）と結合するＴ細胞集団を増やす方法であって、
    前記方法が、前記ペプチドと結合する１個以上のＴ細胞を含有する試料を、請求項８４～８７のいずれか一項に記載の免疫原性組成物、請求項８８若しくは８９に記載のポリヌクレオチド、請求項９０若しくは９１に記載の宿主細胞、及び／又は配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるペプチド若しくはポリペプチドと接触させた抗原提示細胞と接触させることを含む、前記方法。
  94. Ｔ細胞の生成及び／又は単離方法であって、前記方法が、任意に末梢血細胞を含有する、Ｔ細胞含有試料を、
    （ｉ）請求項８４～８７のいずれか一項に記載の免疫原性組成物；
    （ｉｉ）請求項８８若しくは８９に記載のポリヌクレオチド；
    （ｉｉｉ）請求項９０若しくは９１に記載の宿主細胞；及び／又は
    （ｉｖ）配列番号２～７のいずれか１つに記載のアミノ酸配列を含むか、若しくは前記アミノ酸配列から構成されるＳＯＸ２抗原を発現するか、若しくは前記抗原と接触させた抗原提示細胞（ＡＰＣ）
    と接触させる工程と、
    任意に前記試料中の他の細胞からＴ細胞を選別する工程を含むことにより、
    Ｔ細胞を単離及び／又は生成する、前記方法。
  95. 請求項９４に記載の方法により単離及び／又は生成されたＴ細胞。
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