JP2023529730A - 磁気共鳴スキャナのシミュレーション方法 - Google Patents

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Abstract

本発明は、MRIシミュレータにおける磁気共鳴(MR)スキャナのシミュレーションのための方法を説明し、前記方法は、- MRIシミュレータのウェブインターフェースへのデータパラメータの入力であって、データパラメータの入力は、少なくともパルスシーケンス及び解剖学的モデルであることと、- データパラメータをクラウドベースシミュレータエンジンに転送するためにウェブインターフェースをMRIシミュレータのクラウドベースシミュレータエンジンに接続することであって、前記方法は、- パルスシーケンス計算モデルをインポートすることと、- 入力データを設定することと、- ウェブインターフェースにおいて、得られた画像においてスライス選択を行うこと、をも含み、前記方法は、- 1つ以上のシミュレートされたMR信号を提供するためのデータパラメータの再計算であって、前記再計算はクラウドで実行されること、をも含み、前記方法は、- 前記1つ以上のシミュレートされたMR信号に基づいてMR画像を再構成すること、前記MR画像の再構成は、クラウドで実行されることと、- 前記MR画像を前記ウェブインターフェースに送信すること、を含む。【選択図】図1

Description

本発明は、磁気共鳴スキャナのシミュレーション方法に関する。
本発明は、MRIシミュレータにおける磁気共鳴(MR)スキャナのシミュレーションのための方法に関するものであり、前記方法は、以下を含む。
- MRIシミュレータのウェブインターフェースへのデータパラメータの入力であって、前記データパラメータの入力は、少なくともパルスシーケンス及び解剖学的モデルであることと、
- データパラメータをクラウドベースシミュレータエンジンに転送するために前記ウェブインターフェースを前記MRIシミュレータの前記クラウドベースシミュレータエンジンに接続することであって、前記方法は、
- パルスシーケンス計算モデルをインポートすることと、
- 入力データを設定することと、
- ウェブインターフェースにおいて、得られた画像においてスライス選択を行うこと、
も含み、前記方法は、
- 1つ以上のシミュレートされたMR信号を提供するためのデータパラメータの再計算であって、前記再計算はクラウドで実行されること、をも含み、前記方法は、
- 前記1つ以上のシミュレートされたMR信号に基づいてMR画像を再構成すること、前記MR画像の再構成はクラウドで実行されることと、
- 前記MR画像を前記ウェブインターフェースに送信すること、
も含む。
“coreMRI: A high-performance, publicly available MR simulation platform on the cloud”, PLOSONE, Christos G. Xanthis, Anthony H. Aletrasにおいて、高度なMRIシミュレーションのためのクラウド向きのエンジン(coreMRI)が開示されている。この研究の目的は、オンデマンドでスケーラブルなクラウドベース及びGPUベースのインフラを通じて、ウェブサービスとして提供される最初の高度なMRシミュレーションプラットフォームを開発することであった。前述の通り、このオンラインMRシミュレーションプラットフォームは、仮想MRIスキャナとしてだけでなく、シミュレーションベースの定量MR(qMR)法における高度なMRシミュレーションのためのクラウドベースの高性能エンジンとしても利用することができる。使用される方法では、MRIシミュレーション手順を可能にするためにスライシングも実行される。本発明に従って提案されたアプローチは、この論文で開示又は示唆されていないことに留意されたい。
本発明は、上記の論文で提供される手順のような、クラウドベースのMRシミュレーションの実装のための改良された方法を提供する。本発明によって提供される改善は、スライス手順に関連し、例えば、異なるユニットがどのように相互作用するか(CPU、GPU、ユーザインターフェースなど)に言及するシステムレベルにも関連する。
図1では、本発明による方法の一実施形態のプロセススキームが示されている。 図2では、本発明によるプラットフォーム及び方法との相互作用のためのシステムセットアップのブロックスキームが示されている。
本発明によるいくつかの具体的な実施形態が以下に提供され、さらに説明される。
本発明によれば、この方法は、前記1つ以上のシミュレーションされたMR信号に基づいてMR画像を再構成すること、MR画像の前記再構成はクラウドで行われること、及びMR画像をウェブインターフェースに送信することを含む。
上記から理解されるべきこととして、再構成は、本発明による実際のシミュレーションに続くステップである。
再構成は、本発明による方法の一部であってもよいが、本発明による方法は、生データが指示された意図された出力である場合、又はシミュレーションに基づく定量的MRの場合も具現化すると言うべきである。
本発明のさらに別の具体的な実施形態によれば、データパラメータの入力は、少なくともパルスシーケンスと解剖学的モデルである。また、本発明による方法において、他のパラメータが入力されてもよい。例えば、一般的な構成がそのような入力として指定されてもよい。
さらに、上記から理解され得るように、本発明による方法は、本発明によるプラットフォーム・システムに関与する異なるインターフェースとユニットの相互作用に向けた明確な方向性を有している。この文脈において、本発明は、プラットフォームがGPU(グラフィック処理ユニット)ベース、クラウドベース、及びウェブベースでもある、教育目的のための解析的又は数値的MRIシミュレーションのためのプラットフォームの提供に対する明確な方向性を有することを言及することができる。また、研究及びAI目的のためのような、本発明による他の興味ある応用もある。
さらに、これに関して、1つの特定の実施形態によれば、クラウドベースシミュレータエンジンが再計算を実行し、再計算されたデータをMRIシミュレータの1つ又は複数のGPU(グラフィック処理ユニット)に送り、このGPUが前記1つ又は複数のシミュレーションされたMR信号を送り返すとも言うことができる。
さらに、本発明のさらに別の具体的な実施形態によれば、MR画像の再構成のステップは、クラウド内のMRIシミュレータの1つ以上のCPU(中央処理装置)及び/又は1つ以上のGPU(グラフィック処理ユニット)によって実行される。
この文脈では、GPUカードの特性/仕様が、実験がどのように小さく分割されるかを定義することも言及され得る。さらに、GPUリソースの制限(最大スレッド数、共有メモリ容量、スレッドあたりの最大レジスタ数、レジスタファイル容量など)があり、GPUの利用率に上限がある場合がある。最適なGPUカードは、実験を細かく分割することなく、またGPUの使用率を低下させることなく、1回の反復で実験全体を転送、ホスト及び実行できるようにする。そのような最適なGPUカードは、リソースの累積要求がカーネルの要求に関してGPUのリソース容量に等しいとき、最大GPU使用率を達成するであろう。本発明によれば、実行される方法の部分のコーディングのためにも、異なるタイプの計算ツール及びソフトウェアが使用され得る。1つの具体的な実施形態によれば、再計算の少なくとも一部を実行するために、MATLAB(登録商標)が使用される。
上述したように、本発明によるシステムには、すなわち方法が実行され得るように、異なる形式の入力が提供される。そのようなパラメータの1つは、使用されるパルスシーケンスである。これに沿って、定義を設定すると、1つの特定の実施形態によれば、パルスシーケンスは、信号を生成するために空間内のあらゆる点がどのように振る舞うべきかを変更するイベントのシーケンスである。再び、また一般的な構成は、本発明に従って入力を設定することができる。例としては、使用される座標系のタイプや、例えば3Dモデル又は4Dモデルに基づいているかどうかが挙げられる。さらに、実際に使用される解剖学的モデルも、システム及び本発明による方法の出発点を定義するパラメータの1つである。この点に関して、解剖学的モデルは人間であっても動物であってもよいことも言及され得る。また、幻像物体(phantom objects)や、実際には他のあらゆるタイプのオブジェクトが全て可能である。しかしながら、人間又は動物の解剖学的モデルが、本発明による方法及びシステムのための重要な焦点であることは言及されるべきである。
本発明によれば、
- MRIシミュレータのウェブインターフェースへのデータパラメータの入力と、
- データパラメータをクラウドベースシミュレータエンジンに転送するためにウェブインターフェースをMRIシミュレータのクラウドベースシミュレータエンジンに接続すること、の手順があり、
好ましくは、
- パルスシーケンス計算モデルをインポートすることと、
- 入力データを設定することと、
- ウェブインターフェースにおいて、得られた画像においてスライス選択を行うこと、
とを含む。
この点に関して、パルスシーケンス計算モデルはいくつかのパラメータを含むことがあり、それらの少なくともいくつかは調整可能であることが言及されるべきである。そのような調整可能な例の1つは、コントラストである。また、そのようなものとしてのスライシングは、本発明による関連する態様である。本発明の1つの具体的な実施形態によれば、各新しいスライス選択は、次のスライス選択のための基準として機能する。さらに、別の実施形態によれば、位相エンコード方向及び周波数エンコード方向は、スライス選択方向と直交する各1軸を表す。例えば、所定のX、Y、Z座標において、これら2つのパラメータは、それぞれX、Yで表されてもよい。
さらに、一実施形態によれば、スライス選択は、単一スライス選択2D収集(複数可)又は3D収集(複数可)におけるスラブ(slab)である。
さらに、上記の続きとして、本発明のさらに別の具体的な実施形態によれば、以下の手順が実行される。
- ウェブインターフェースにおいて得られた画像においてスライス選択を行うことと、
- 新たな画像を取得することと、
- 異なる方向で新たなスライス選択を実行することと、
- 新たな画像を取得し、最後に
- さらに別のスライス選択が実行されること、
であって、好ましくは、得られた各画像は、スライス選択が実行された画像に対する断面の平面である。
本発明による方法で使用することが可能なスライス時の方向の転換は、場合によっては、さらに改善された画像を、得ることを可能にする。
一般に、本発明による方法は、MRイメージングの分野における教育目的に大いに役立つ。例えば、本発明による方法を使用すると、スライシングの計画を非常に効率的な方法で訓練することができる。さらに、本方法は、MRイメージングの観点から解剖学的モデルの背後にある物理を理解することも可能である。しかし、本発明は、他のいくつかのアプリケーション、例えば、研究、AIなどでも使用されると言うことができる。
さらに、本発明による方法は、異なるパルスシーケンス、計算モデル、及び異なるタイプのスライスプロトコルを使用すること、すなわちインポートすることを可能にするので、この方法は、多かれ少なかれ、人間又は動物のあらゆるタイプの解剖学的モデルに使用され得る。

Claims (9)

  1. MRIシミュレータにおける磁気共鳴(MR)スキャナのシミュレーションのための方法であって、前記方法は、
    - MRIシミュレータのウェブインターフェースへのデータパラメータの入力であって、データパラメータの入力は、少なくともパルスシーケンス及び解剖学的モデルであることと、
    - データパラメータをクラウドベースシミュレータエンジンに転送するために前記ウェブインターフェースを前記MRIシミュレータの前記クラウドベースシミュレータエンジンに接続することであって、前記方法は、
    - パルスシーケンス計算モデルをインポートすることと、
    - 入力データを設定することと、
    - 前記ウェブインターフェースにおいて、得られた画像においてスライス選択を行うこと、も含み、前記方法は、
    - 1つ以上のシミュレートされたMR信号を提供するためのデータパラメータの再計算であって、前記再計算は前記クラウドで実行されること、も含み、前記方法は、
    - 前記1つ以上のシミュレートされたMR信号に基づいてMR画像を再構成すること、前記MR画像の再構成は、前記クラウドで実行されることと、
    - 前記MR画像を前記ウェブインターフェースに送信すること、
    を含む方法。
  2. 前記クラウドベースシミュレータエンジンは、前記再計算を行い、再計算されたデータを前記MRIシミュレータの1つ以上のGPU(グラフィック処理ユニット)に送り、このGPUは、前記1つ以上のシミュレートされたMR信号を送り返す、請求項1に記載の方法。
  3. MR画像を再構成するステップは、前記クラウド内の前記MRIシミュレータの1つ以上のCPU(中央処理装置)及び/又は1つ以上のGPU(グラフィック処理ユニット)により実行される、請求項1-2のいずれかに記載の方法。
  4. 前記再計算の少なくとも一部を実行するためにMATLABが使用される先行する請求項のいずれかに記載の方法。
  5. パルスシーケンスは、信号を生成するために空間内の各点がどのように振る舞うべきかを変更するイベントのシーケンスである先行する請求項のいずれかに記載の方法。
  6. 各新しいスライス選択は、次のスライス選択のための基準として機能する先行する請求項のいずれかに記載の方法。
  7. 位相エンコード方向と周波数エンコード方向は、前記スライス選択方向と直交する各1軸を表す先行する請求項のいずれかに記載の方法。
  8. 前記スライス選択は、単一スライス選択2D収集又は3D収集におけるスラブである先行する請求項のいずれかに記載の方法。
  9. 以下の手順を実行すること、
    - 前記ウェブインターフェースにおいて得られた画像においてスライス選択を行うことと、
    - 新たな画像を取得することと、
    - 異なる方向で新たなスライス選択を行うことと、
    - 新たな画像を取得し、最後に
    - さらに別のスライス選択が実行されること、
    であって、好ましくは、得られた各画像は、前記スライス選択が実行された前記画像に対する断面の平面である、
    先行する請求項のいずれかに記載の方法。
JP2022576442A 2020-06-10 2021-06-09 磁気共鳴スキャナのシミュレーション方法 Pending JP2023529730A (ja)

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