JP2023528309A - 体軸幹細胞、その生成方法及び使用 - Google Patents
体軸幹細胞、その生成方法及び使用 Download PDFInfo
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Abstract
Description
本発明は、体軸幹細胞(AxSC)を生成する方法、並びに、例えばこのような方法によって生成される体軸幹細胞(AxSC)及びその使用に関する。本発明はさらに、多能性細胞ではない;領域特異的分化複能性幹細胞;多能性幹細胞から得ることができる;胚のすべての組織の細胞型に分化することができるわけではない;胚発生中に中心体軸の領域から出現する細胞型(例えば、硬節、皮筋板及び末梢ニューロン)にのみ分化することができる;奇形腫を形成することができない;軸領域(例えば、運動ニューロン、末梢ニューロン、末梢神経系ニューロン、感覚ニューロン、骨、軟骨、腱、靭帯及び/又は骨格筋の細胞)を生じる前駆体の特性を模倣することができる;一過性細胞ではない;運動ニューロン、末梢ニューロン、筋肉、軟骨又は骨の前駆体に分化することができる;幹細胞を無制限に複製(更新)する;クローンとして増殖することができる、の特徴のうちの1つ以上を有する体軸幹細胞(AxSC)に関する。
配列番号1:(SYBR Green qPCRのための)GAPDH順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号2:(SYBR Green qPCRのための)GAPDH逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号3:(SYBR Green qPCRのための)MNX1(HB9)順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号4:(SYBR Green qPCRのための)MNX1(HB9)逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号5:(SYBR Green qPCRのための)PRPH順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号6:(SYBR Green qPCRのための)PRPH逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号7:(SYBR Green qPCRのための)POU4F1順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号8:(SYBR Green qPCRのための)POU4F1逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号9:(SYBR Green qPCRのための)RUNX2順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号10:(SYBR Green qPCRのための)RUNX2逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号11:(SYBR Green qPCRのための)BGLAP順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号12:(SYBR Green qPCRのための)BGLAP逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号13:(SYBR Green qPCRのための)COL1A1順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号14:(SYBR Green qPCRのための)COL1A1逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号15:(SYBR Green qPCRのための)NKX3-2順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号16:(SYBR Green qPCRのための)NKX3-2逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号17:(SYBR Green qPCRのための)COMP順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号18:(SYBR Green qPCRのための)COMP逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号19:(SYBR Green qPCRのための)ACAN順方向プライマーのDNA配列である。
配列番号20:(SYBR Green qPCRのための)ACAN逆方向プライマーのDNA配列である。
配列番号21は、例えば、UniProtKB受入番号P48431に対応するヒトSOX-2タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号22は、例えば、UniProtKB受入番号Q01860-1に対応するヒトPOU5F1タンパク質(OCT4としても知られる)の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号23は、例えば、UniProtKB受入番号Q9H9S0-1に対応するヒトNANOGタンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号24は、例えば、UniProtKB受入番号O15178-1に対応するヒトTBXTタンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号25は、例えば、UniProtKB受入番号Q99626-1に対応するヒトCDX2タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号26は、例えば、UniProtKB受入番号Q9H2W2-1に対応するヒトMIXL1タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号27は、例えば、UniProtKB受入番号P26367-1に対応するヒトPAX6タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号28は、例えば、UniProtKB受入番号P49841-1に対応するヒトGSK3Bタンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号29は、例えば、UniProtKB受入番号P09038-4に対応するヒトFGF2タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号30は、例えば、UniProtKB受入番号P01137-1に対応するヒトTGFB1タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号31は、例えば、UniProtKB受入番号Q6ZN17-1に対応するヒトLIN28Bタンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号32は、例えば、UniProtKB受入番号P04198-1に対応するヒトMYCNタンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号33は、例えば、UniProtKB受入番号O95409-1に対応するヒトZIC2タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号34は、例えば、UniProtKB受入番号P78415-1に対応するヒトIRX3タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号35は、例えば、UniProtKB受入番号O00570-1に対応する、ヒトSOX1タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号36は、例えば、UniProtKB受入番号P35716-1に対応する、ヒトSOX11タンパク質の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号37は、例えば、UniProtKB受入番号P43699-1に対応するヒトホメオボックスタンパク質Nkx-2.1の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号38は、例えば、UniProtKB受入番号Q2Q1W2-1に対応するヒトE3ユビキチンタンパク質リガーゼTRIM71の例示的なアミノ酸配列である。
配列番号39は、例えば、UniProtKB受入番号Q99853-1に対応するヒトフォークヘッドボックスタンパク質B1の例示的なアミノ酸配列である。
本明細書に記載されるように、UniProtKB受入番号(http://www.uniprot.org/、例えば、2020年2月26日に公開されたUniProtKB Release 2020_01において入手可能)が参照される。
(d)工程(c)からのWnt/β-カテニンシグナル伝達経路の上記連続活性化は、線維芽細胞増殖因子2(例えば、UniProtKB-P09038)及び/又はTGF-β阻害剤(例えば、UniProtKB-P01137)の存在下で行われ、好ましくは、
(d1)工程(c)からのWnt/β-カテニンシグナル伝達の上記連続活性化は、約5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、線維芽細胞増殖因子2(例えば、UniProtKB-P09038)及びTGF-β(例えば、UniProtKB-P01137)阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは、上記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好好ましくは、上記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、さらにさらに最も好ましくは、上記線維芽細胞増殖因子2は約20~約100ng/mlの濃度で使用され、工程(d1)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431)、T-box転写因子T(例えば、UniProtKB-O15178)及びホメオボックスタンパク質MIXL1(例えば、UniProtKB-Q9H2W2)を内因的に発現しているが、ペアードボックスタンパク質Pax-6(例えば、UniProtKB-P26367)を内因的に発現しておらず、任意選択で、ホメオボックスタンパク質CDX-2(例えば、UniProtKB-Q99626)をさらに内因的に発現しているか、又は
(d2)工程(c)からのWnt/β-カテニンシグナル伝達の上記連続活性化は、約5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、好ましくはTGF-β(例えば、UniProtKB-P01137)阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは上記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好ましくは上記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、工程(d2)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431)及びペアードボックスタンパク質Pax-6(例えば、UniProtKB-P26367)を内因的に発現しているが、T-box転写因子T(例えば、UniProtKB-O15178)、ホメオボックスタンパク質MIXL1(例えば、UniProtKB-Q9H2W2)及びホメオボックスタンパク質CDX-2(例えば、UniProtKB-Q99626)を内因的に発現していないか、又は
(d3)工程(c)からのWnt/β-カテニンシグナル伝達の上記連続活性化は、約7.5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、好ましくはTGF-β(例えば、UniProtKB-P01137)阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは上記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好ましくは、上記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、工程(d3)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431)、T-box転写因子T(例えば、UniProtKB-O15178)、ホメオボックスタンパク質MIXL1(例えば、UniProtKB-Q9H2W2)及びペアードボックスタンパク質Pax-6(例えば、UniProtKB-P26367)を内因的に発現しており、任意選択で、ホメオボックスタンパク質CDX-2(例えば、UniProtKB-Q99626)をさらに内因的に発現している
方法を提供する。
(例えば、https://www.sigmaaldrich.com/life-science/cell-culture/learning-center/media-formulations/rpmi-1640.htmlに記載されるとおり)
1)空の滅菌した1Lガラス瓶に、合計100gのBSA Fraction V IgG free Fatty Acid Poor粉末(Invitrogen)及び500mlのNeurobasal培地を挿入する(残りの300mlのNeurobasalを、以下に示す成分のいくつかを溶解するために使用する)。
2)ビオチン(100mgの1単位、例えばSigma製)を10mlのNeurobasal培地に溶解し、添加して混合する。
3)カタラーゼ(100mgの1単位、例えばSigma)を10mlのNeurobasal培地に溶解し、添加して混合する。
4)すべての4単位のスーパーオキシドジスムターゼを10mlのNeurobasal培地に溶解し、添加して混合する。
5)40mgのグルタチオンを秤量し、直接添加して混合する。
6)すべての2単位のホロトランスフェリニンを10mlのNeurobasal培地に溶解し、添加して混合する。
7)80mgのL-カルニチンを秤量し、直接添加して混合する。
8)600mgのD-ガラクトースを秤量し、直接添加して混合する。
9)644mgのプトレシンを秤量し、直接添加して混合する。
10)40μLのエタノールアミンを直接添加して混合する。
11)1バイアルの(エタノールに溶解し、-80で凍結した)プロゲステロンストックを直接添加して混合する。プロゲステロンストック調製:10mgのプロゲステロンを10mlのエタノールに溶解することによって1mg/mlのストックを調製する。-80℃で保存する。252μlの個々のアリコートを作製する(800mlのB27あたり1バイアルを使用する)。
12)5バイアルのインスリンストック(溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
13)1バイアルのT3(エタノールに溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
14)1バイアルのピペコリン酸ストック(水に溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
15)1バイアルのオレイン酸ストック(エタノールに溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
16)1バイアルのリノール酸ストック(エタノールに溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
17)1バイアルのリノレン酸ストック(エタノールに溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
18)1バイアルの酢酸レチノールストック(エタノールに溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。ビタミンAを含まないB27サプリメントの調製のために、酢酸レチノールを組成物から除外する。
19)1バイアルのDL-α-トコフェロール(ビタミンE)ストック(エタノールに溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
20)1バイアルのDL-α-トコフェロール酢酸エステルストック(エタノールに溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
21)1バイアルのコルチコステロンストック(エタノールに溶解し、-80で凍結した)を直接添加して混合する。
22)1バイアルの亜セレン酸ナトリウムストック(エタノールに溶解し、-80で凍結)を直接添加して混合する。
23)300mlのNeurobasalの残っているもの(残り)を加える。瓶を穏やかに混合する(ピペッティング又は激しい振盪の必要はない)。10回穏やかに揺らす。最適な溶解のために瓶を4℃で12時間(一晩)放置する(いかなる振盪もなく、光から保護されたままにする)。翌日、5mlアリコートを作製し、光から保護された状態で-20で保存する。(-20で1年間安定)。凍結及び解凍の繰り返しを回避する。混合物は、濾過するには粘性が高すぎるが、後で培地に添加すると濾過することができる。マウスPSCについては、500mlの培地瓶あたり5ml(1アリコート)のB27を使用することができる。ヒトPSCについては、500mlの培地瓶あたり10ml(2アリコート)のB27を使用することができる。
1. 体軸幹細胞(AxSC)(若しくは神経筋骨格幹細胞)を生成(又は誘導)する方法であって、
a)多能性幹細胞、胚性幹細胞又は人工多能性幹細胞(例えば、ヒトPSC及び/又はESC及び/又はiPSC、例えば、ヒトESC株H9(WA09)又はヒトiPSC株HMGU#1)を提供する工程であって、好ましくは、上記誘導/生成の前に、上記多能性細胞は、適切な多能性細胞培地(例えば、mTESR1又はiPS-Brew等)中で維持され、さらに好ましくは、上記適切な多能性細胞培地は、上記誘導/生成のために(すなわち上記誘導/生成の前に)ビタミンAを含む又は含まないB27サプリメントを補充したRPMI1640培地で置き換えられる工程と、
b)上記多能性幹細胞、胚性幹細胞又は人工多能性幹細胞においてWnt/β-カテニンシグナル伝達経路を活性化する工程であって(例えば、GO:0016055;例えば、Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路は、標的細胞の表面上のfrizzledファミリー受容体へのWntタンパク質の結合によって開始され、細胞状態の変化で終わる一連の分子シグナルである(Huelsken J、Birchmeier W. New aspects of Wnt signalling pathways in higher vertebrates. Current Opinion in Genetics & Development. 2001年10月;11(5):547-553))、好ましくは上記活性化は、GSK3bタンパク質(例えば、UniProtKB-P49841又は配列番号28)の阻害剤を使用することによって行われ、さらに好ましくは上記阻害剤はCHIR99021であり、さらに最も好ましくは上記CHIR99021阻害剤は約5μM~約10μMの濃度で使用され、さらに最も好ましくは、上記CHIR99021阻害剤は約24時間使用される工程と、
c)工程(b)から誘導される細胞を、継代の間の上記細胞におけるWnt/β-カテニンシグナル伝達経路の連続活性化の条件下で継代する工程であって、好ましくは、上記継代は少なくとも約3~9回(例えば、3回、4回、5回、6回、7回、8回、又は9回)行われ、さらに好ましくは上記継代は連続継代であり、さらに最も好ましくは、上記継代は、工程(b)から誘導される細胞を、新鮮な無血清培地(例えば、ビタミンAを含む又は含まないB27サプリメントを補充したRPMI1640培地)中により低い密度で再播種すること(例えば、再播種は、単細胞又は細胞の塊へのコロニーの解離及びそれらのプレーティングである)を含み、好ましくは、Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路の上記連続活性化は、Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路の阻害剤を使用することによって行われ、さらに好ましくは、上記阻害剤はCHIR99021であり、さらに最も好ましくは、上記CHIR99021阻害剤は、少なくとも約5μM(例えば、約7.5μM)の濃度で使用され、工程(c)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431又は配列番号21)を内因的に発現している工程と
を含み、
d)任意選択で、工程(c)からのWnt/β-カテニンシグナル伝達経路の上記連続活性化は、線維芽細胞増殖因子2(例えば、UniProtKB-P09038又は配列番号29)及び/又はTGF-β(例えば、UniProtKB-P01137又は配列番号30)阻害剤の存在下で行われ、好ましくは、
(d1)工程(c)からのWnt/β-カテニンシグナル伝達の上記連続活性化は、約5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、線維芽細胞増殖因子2(例えば、UniProtKB-P09038若しくは配列番号29)及びTGF-β(例えば、UniProtKB-P01137若しくは配列番号30)阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは、上記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好ましくは、上記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、さらにさらに最も好ましくは、上記線維芽細胞増殖因子2は約20~約100ng/mlの濃度で使用され、工程(d1)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431若しくは配列番号21)、T-box転写因子T(例えば、UniProtKB-O15178若しくは配列番号24)及びホメオボックスタンパク質MIXL1(例えば、UniProtKB-Q9H2W2若しくは配列番号26)を内因的に発現しているが、ペアードボックスタンパク質Pax-6(例えば、UniProtKB-P26367若しくは配列番号27)を内因的に発現しておらず、任意選択で、ホメオボックスタンパク質CDX-2(例えば、UniProtKB-Q99626若しくは配列番号25)さらに内因的に発現しているか、又は
(d2)工程(c)からのWnt/β-カテニンシグナル伝達の上記連続活性化は、約5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、好ましくはTGF-β(例えば、UniProtKB-P01137若しくは配列番号30)阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは、上記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好ましくは、上記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、工程(d2)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431若しくは配列番号21)及びペアードボックスタンパク質Pax-6(例えば、UniProtKB-P26367若しくは配列番号27)を内因的に発現しているが、Tボックス転写因子T(例えば、UniProtKB-O15178若しくは配列番号24)、ホメオボックスタンパク質MIXL1(例えば、UniProtKB-Q9H2W2若しくは配列番号26)及びホメオボックスタンパク質CDX-2(例えば、UniProtKB-Q99626若しくは配列番号25)を内因的に発現していないか、又は
(d3)工程(c)からのWnt/β-カテニンシグナル伝達の上記連続活性化は、約7.5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、好ましくはTGF-β(例えば、UniProtKB-P01137若しくは配列番号30)阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは上記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好ましくは、上記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、工程(d3)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431若しくは配列番号21)、Tボックス転写因子T(例えば、UniProtKB-O15178若しくは配列番号24)、ホメオボックスタンパク質MIXL1(例えば、UniProtKB-Q9H2W2若しくは配列番号26)及びペアードボックスタンパク質Pax-6(例えば、UniProtKB-P26367若しくは配列番号27)を内因的に発現しており、任意選択で、ホメオボックスタンパク質CDX-2(例えば、UniProtKB-Q99626若しくは配列番号25)をさらに内因的に発現している
方法。
i)転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431若しくは配列番号21)を発現する、
ii)OCT4転写因子(例えば、UniProtKB-Q01860若しくは配列番号22)を実質的に発現しない、
iii)ホメオボックスタンパク質NANOG(例えば、UniProtKB-Q9H9S0若しくは配列番号23)を実質的に発現しない、
iv)多能性ではない、
v)領域特異的分化複能性幹細胞である、
vi)多能性幹細胞、胚性幹細胞若しくは人工多能性幹細胞(例えば、ヒトPSC及び/若しくはESC及び/若しくはiPSC、例えば、ヒトESC株H9(WA09)若しくはヒトiPSC株HMGU#1)から得ることができる、
vii)胚のすべての組織の細胞型に分化することができるわけではない、
viii)胚発生中に中心体軸の領域から出現する細胞型(例えば、硬節、皮筋板及び末梢ニューロン)にのみ分化することができる、
ix)奇形腫を形成することができない、
x)軸領域(例えば、運動ニューロン、末梢ニューロン、末梢神経系ニューロン、感覚ニューロン、骨、軟骨、腱、靱帯及び/若しくは骨格筋の細胞)を生じる前駆体の特性を模倣することができる、
xi)一過性細胞ではない、
xii)運動ニューロン、末梢ニューロン、筋肉、軟骨若しくは骨の前駆体に分化することができる、
xiii)無制限に複製する幹細胞である、
xiv)クローンとして増殖することができる、
xv)神経中胚葉前駆体(NMp)ではない、並びに/又は
xvi)人工神経幹細胞(iNSC)ではない、
の特徴のうちの1つ以上を有する項目1から項目4のいずれか1つに記載の体軸幹細胞(若しくは神経筋骨格幹細胞)を生成(又は誘導)する方法。
i)好ましくはUniProtKB-P04198又は配列番号32を有するN-myc癌原遺伝子タンパク質(MYCN)、
ii)好ましくはUniProtKB-Q6ZN17又は配列番号31を有するタンパク質lin-28ホモログB(LIN28B)、
iii)好ましくはUniProtKB-P78415又は配列番号34を有するIroquois(イロコイ)クラスホメオドメインタンパク質IRX-3(IRX3)、
iv)好ましくはUniProtKB-O00570又は配列番号35を有する転写因子SOX-1(SOX1)、
v)好ましくはUniProtKB-O95409又は配列番号33を有するジンクフィンガータンパク質ZIC2(ZIC2)、
vi)好ましくはUniProtKB-P35716又は配列番号36を有する転写因子SOX-11(SOX11)、
のうちの1つ以上を発現し、
vii)好ましくは、上記AxSCは、(i)~(vi)に規定されるMYCN、LIN28B、ZIC2及びSOX11を発現する基底状態AxSCであり、
viii)好ましくは、上記AxSCは、(i)~(vi)に規定されるMYCN、LIN28B、IRX3、SOX1、ZIC2及びSOX11を発現するプライミング状態AxSCである項目1から項目12のいずれか1つに記載の体軸幹細胞を生成する方法。
i)基底体軸幹細胞(例えば、本明細書では「CFS」とも呼ばれる、無制限に複製する基底体軸幹細胞)であって、この基底体軸幹細胞は、
a)転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431又は配列番号21)、
b)T-box転写因子T(例えば、UniProtKB-O15178又は配列番号24)、
c)ホメオボックスタンパク質CDX-2(例えば、UniProtKB-Q99626又は配列番号25)、及び
d)ホメオボックスタンパク質MIXL1(例えば、UniProtKB-Q9H2W2又は配列番号26)
を発現し、
e)好ましくは、ホメオボックスタンパク質Nkx-2.1(NKX2.1)、例えばUniProtKB-P43699又は配列番号37をさらに発現し、
f)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q6ZN17又は配列番号31を有するタンパク質lin-28ホモログB(LIN28B)をさらに発現し、
g)好ましくは、例えば、UniProtKB-P04198又は配列番号32を有するN-myc癌原遺伝子タンパク質(MYCN)をさらに発現し、
h)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q2Q1W2又は配列番号38を有するE3ユビキチンタンパク質リガーゼTRIM71(TRIM71)をさらに発現し、
i)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q99853又は配列番号39を有するフォークヘッドボックスタンパク質B1(FOXB1)をさらに発現する
基底体軸幹細胞に、
ii)プライミング状態体軸幹細胞(例えば、本明細書において「CS」とも呼ばれる、無制限に複製するプライミング状態体軸幹細胞)であって、このプライミングされた体軸幹細胞は、
j)転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431又は配列番号21)、及び
k)ペアードボックスタンパク質PAX-6(例えば、UniProtKB-P26367又は配列番号27)
を発現し、
l)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q6ZN17又は配列番号31を有するタンパク質lin-28ホモログB(LIN28B)をさらに発現し、
m)好ましくは、例えば、UniProtKB-P04198又は配列番号32を有するN-myc癌原遺伝子タンパク質(MYCN)をさらに発現し、
n)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q2Q1W2又は配列番号38を有するE3ユビキチンタンパク質リガーゼTRIM71(TRIM71)をさらに発現し、
o)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q99853又は配列番号39を有するフォークヘッドボックスタンパク質B1(FOXB1)をさらに発現する
プライミング状態体軸幹細胞に
無制限に複製及び分化することができる項目1から項目13のいずれか1つに記載の体軸幹細胞(若しくは神経筋骨格幹細胞)を生成(又は誘導)する方法。
i)領域特異的分化複能性幹細胞である、
ii)多能性幹細胞、胚性幹細胞又は人工多能性幹細胞(例えば、ESC及び/又はiPSC、例えば、ヒトESC株H9(WA09)又はヒトiPSC株HMGU#1)から得ることができる、
iii)胚のすべての組織の細胞型に分化することができるわけではない、
iv)胚発生中に中心体軸の領域から出現する細胞型(例えば、硬節、皮筋板及び末梢ニューロン)にのみ分化することができる、
v)奇形腫を形成することができない、
vi)軸領域(例えば、運動ニューロン、末梢ニューロン、末梢神経系ニューロン、感覚ニューロン、骨、軟骨、腱、靭帯及び/又は骨格筋の細胞)を生じる前駆体の特性を模倣することができる、
vii)一過性細胞ではない、
viii)運動ニューロン、末梢ニューロン、筋肉、軟骨又は骨の前駆体に分化することができる、
ix)無制限に複製する幹細胞である、
x)クローンとして成長することができる、
xi)神経中胚葉前駆体(NMp)ではない、
xii)人工神経幹細胞(iNSC)ではない、
のうちの1つ以上をさらに有する単離体軸幹細胞(AxSC)(又は神経筋骨格幹細胞)。
i)好ましくはUniProtKB-P04198又は配列番号32を有するN-myc癌原遺伝子タンパク質(MYCN)、
ii)好ましくはUniProtKB-Q6ZN17又は配列番号31を有するタンパク質lin-28ホモログB(LIN28B)、
iii)好ましくはUniProtKB-P78415又は配列番号34を有するIroquoisクラスホメオドメインタンパク質IRX-3(IRX3)、
iv)好ましくはUniProtKB-O00570又は配列番号35を有する転写因子SOX-1(SOX1)、
v)好ましくはUniProtKB-O95409又は配列番号33を有するジンクフィンガータンパク質ZIC2(ZIC2)、
vi)好ましくはUniProtKB-P35716又は配列番号36を有する転写因子SOX-11(SOX11)
のうちの1つ以上を発現し、
vii)好ましくは、上記AxSCは、(i)~(vi)に規定されるMYCN、LIN28B、ZIC2及びSOX11を発現する基底状態AxSCであり、
viii)好ましくは、上記AxSCは、(i)~(vi)に規定されるMYCN、LIN28B、IRX3、SOX1、ZIC2及びSOX11を発現するプライミング状態AxSCである
項目17から項目24のいずれか1つに記載の体軸幹細胞(又は神経筋骨格幹細胞)。
i)基底体軸幹細胞(例えば、本明細書では「CFS」とも呼ばれる、無制限に複製する基底体軸幹細胞)であって、この基底体軸幹細胞は、
a)転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431又は配列番号21)、
b)T-box転写因子T(例えば、UniProtKB-O15178又は配列番号24)、
c)ホメオボックスタンパク質CDX-2(例えば、UniProtKB-Q99626又は配列番号25)、及び
d)ホメオボックスタンパク質MIXL1(例えば、UniProtKB-Q9H2W2又は配列番号26)
を発現し、
e)好ましくは、ホメオボックスタンパク質Nkx-2.1(NKX2.1)、例えばUniProtKB-P43699又は配列番号37をさらに発現し、
f)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q6ZN17又は配列番号31を有するタンパク質lin-28ホモログB(LIN28B)をさらに発現し、
g)好ましくは、例えば、UniProtKB-P04198又は配列番号32を有するN-myc癌原遺伝子タンパク質(MYCN)をさらに発現し、
h)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q2Q1W2又は配列番号38を有するE3ユビキチンタンパク質リガーゼTRIM71(TRIM71)をさらに発現し、
i)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q99853又は配列番号39を有するフォークヘッドボックスタンパク質B1(FOXB1)をさらに発現する
基底体軸幹細胞に、
ii)プライミング状態体軸幹細胞(例えば、本明細書において「CS」とも呼ばれる、無制限に複製するプライミング状態体軸幹細胞)であって、このプライミングされた体軸幹細胞は、
j)転写因子SOX-2(例えば、UniProtKB-P48431又は配列番号21)、及び
k)ペアードボックスタンパク質PAX-6(例えば、UniProtKB-P26367又は配列番号27)
を発現し、
l)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q6ZN17又は配列番号31を有するタンパク質lin-28ホモログB(LIN28B)をさらに発現し、
m)好ましくは、例えば、UniProtKB-P04198又は配列番号32を有するN-myc癌原遺伝子タンパク質(MYCN)をさらに発現し、
n)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q2Q1W2又は配列番号38を有するE3ユビキチンタンパク質リガーゼTRIM71(TRIM71)をさらに発現し、
o)好ましくは、例えば、UniProtKB-Q99853又は配列番号39を有するフォークヘッドボックスタンパク質B1(FOXB1)をさらに発現する
プライミング状態体軸幹細胞に
分化することができる項目17から項目25のいずれか1つに記載の体軸幹細胞(又は神経筋骨格幹細胞)。
ii)骨及び/若しくは軟骨の障害の治療、低減、予防並びに/又は診断の方法、
iii)筋障害の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
iv)細胞、組織、器官及び/又は身体の再生治療の方法、
v)疾患(例えば、末梢神経系の疾患若しくは体軸幹細胞に関連する疾患、例えば筋肉関連、運動ニューロン関連、末梢ニューロン関連、感覚ニューロン関連、軟骨関連、腱関連(例えば、変性)疾患)に対する活性について、及び/又は神経毒性スクリーニングについて候補化合物をスクリーニングする方法、
vi)体軸幹細胞に関連する疾患、例えば筋肉関連、運動ニューロン関連、末梢ニューロン関連、感覚ニューロン関連、軟骨関連、腱関連(例えば、変性)疾患の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
vii)インビトロ、エキソビボ又はインビボでの方法である(i)~(vi)のいずれか
のうちの1つ以上において使用するための項目16から項目27及び項目29から項目31のいずれか1つに記載の体軸幹細胞(若しくは神経筋骨格幹細胞)、組成物、調製物又はキット。
i)神経変性疾患の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
ii)骨及び/若しくは軟骨の障害の治療、低減、予防並びに/又は診断の方法、
iii)筋障害の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
iv)細胞、組織、器官及び/又は身体の再生治療の方法、
v)疾患(例えば、末梢神経系の疾患)に対する活性について、及び/又は神経毒性スクリーニングについて、候補化合物をスクリーニングする方法、
のうちの1つ以上であり、
当該方法は、
a)項目16から項目27及び項目29から項目32のいずれか1つに記載の体軸幹細胞、組成物、調製物又はキットを上記試料又は対象に提供する工程と、
b)治療有効量の上記体軸幹細胞、組成物、調製物又はキットを上記試料又は対象に投与する工程と
を含む方法。
i)神経変性疾患の治療、低減、予防及び/又は診断、
ii)骨及び/若しくは軟骨の障害の治療、低減、予防並びに/又は診断、
iii)筋障害の治療、低減、予防及び/又は診断、
iv)細胞、組織、器官及び/又は身体の再生治療、
v)疾患(例えば、末梢神経系の疾患)に対する活性について、及び/又は神経毒性スクリーニングについて候補化合物をスクリーニングすること、
vi)インビトロ、エキソビボ又はインビボでの使用である(i)~(v)のいずれか、
のうちの1つ以上のための項目16から項目27及び項目29から項目32のいずれか1つに記載の体軸幹細胞、組成物、調製物及び/又はキットの使用。
材料及び方法
細胞培養
ヒトESC株H9(WA09)及びヒトiPSC株HMGU#1(Kunzeら、2018)は、mTesR1(Stem Cell Technologies(ステムセル・テクノロジーズ))又はiPS Brew XP(Miltenyi Biotech(ミルテニーバイオテク))培地のいずれかにおいて、マトリゲル(Matrigel)コーティング(BD Corning(ビーディー・コーニング))プレート上で増殖させた。コンフルエンス>70%のときに、Passaging solution XF(Miltenyi Biotech)を用いて1:10の比で細胞を分割した。H9細胞は42~65継代、HMGU#1は21~34継代で使用した。すべての実験において、新鮮な培地を毎日適用し、細胞を5%CO2で培養した。
細胞を上記のように播種し、10μM CHIRで24時間処理した。その後、細胞を、維持培地(L-グルタミン、1×非必須アミノ酸、ビタミンAを含まない1×B-27サプリメント、及びそれぞれのリガンド(表1参照)を補充したRPMI-1640)を含有するマトリゲルコーティングした6ウェルプレートに1:20~1:30の比で分割し、培養物を、それらがコンフルエントになるまでインキュベートした。継代9で定義される樹立期の終わりまで、コンフルエントな培養物を1:10~1:20の比で常法により分割した。分割は、Passaging solution XF又はVersene(Life Technologies)のいずれかを用いて行った。FGF2含有培地を毎週新たに調製し、FGF2を含まない培地を少なくとも2週間毎に調製した。分化した細胞の手動のコロニー採取又は掻き取りは、細胞株の樹立中のいずれの段階でも採用しなかった。
構成的に活性なβ-カテニン(N末端からの最初の90アミノ酸の欠失を含む)のテトラサイクリン誘導性過剰発現を生成するために、H9細胞を、P3初代細胞4Dヌクレオフェクターキット(Lonza(ロンザ))を使用して、PB-GFP-P2A-ΔNβCATプラスミド及びPiggybacトランスポザーゼコードプラスミドでヌクレオフェクト(nucleofect)した。48時間後、細胞を10cm皿に分割し、50μg/mlハイグロマイシンB(Life Technologies)を用いて2週間選択した。その後、25μg/mlのハイグロマイシンBの存在下で親H9株と同じ方法でポリクローナル安定株を増殖させた。
運動ニューロン分化:AxSC株をAccutaseで解離し、1.5×105細胞を、10μM Y-27632を補充したそれぞれの維持培地を含有するマトリゲルでコーティングした12ウェルプレートの1つのウェルに播種した。翌日、培地をニューロン分化培地、1×B-27サプリメント、1×N2サプリメント、0.1μM レチノイン酸(Sigma)、100ng/ml組換えソニックヘッジホッグ(R&D)、10ng/ml BDNF(R&D)、10ng/ml GDNF(R&D)、10ng/ml IGF-1(Peprotech(ぺプロテック))、0.1μMの化合物E(Merck(メルク))及び100μMのcAMP(Sigma)を含む1:1比のDMEM/F12及びNeurobasal培地A、に交換した。最初の5日間は培地を毎日交換し、その後隔日に交換した。
RNeasyミニキット(Qiagen(キアゲン))を用いて全RNAを単離した。cDNAを、0.2~1μgの全RNA(各実験内の試料間で正規化した量)から、Verso cDNA合成キット(Thermo Scientific(サーモ・サイエンティフィック))を製造業者の指示に従って使用して合成した。1μlのcDNA(1:5希釈物)を、10μlのqPCR反応において鋳型として使用した。PCRは、Taqman Gene Expression Master Mixと共に予め設計されたTaqman Gene Expression Assays(両方ともThermo Scientific製)、又はPower SYBR Green master mix(Thermo Scientific)と共にカスタム設計されたプライマーのいずれかを使用して設定した。すべてのプライマー及びTaqmanプローブの詳細は、例えば、表2に列挙されている。反応におけるプライマー濃度は、すべてのプライマーについて250nMであった。PCRは、QuantStudio 12K Flex Real-Time PCR System(Thermo Scientific)で、予め規定されたサイクリングパラメータを用いて行った。各反応について2つの技術的反復を実施した。使用したTaqmanアッセイ及びプライマーを、例えば、表2に列挙する。GAPDHは、すべての実験においてハウスキーピング遺伝子として機能した。遺伝子発現における相対的倍率変化(FC)を、ΔΔCt法(Livak及びSchmittgen、2001)を用いて計算した。結果は、特段の記載がない限り、生物学的反復間の平均ΔΔCt±平均の標準誤差として提示する。プロットは、Rバージョン3.5.1(R Core Team、2018)を実行するRStudioソフトウェア中のggplot2パッケージ(Wickham、2009)を使用して作成した。
免疫蛍光分析のために、細胞を、マトリゲルコーティングガラスカバースリップ又はマトリゲルコーティング4ウェルμ-スライド(Ibidi(イビディ))のいずれかに播種した。分化した運動ニューロン上のIFについては、AxCS株をカバースリップ上で直接分化させた。PBS中4%のメタノール不含ホルムアルデヒド(Thermo Scientific)で、室温(RT)で15分間固定した後、細胞を0.2%Triton X-100(Sigma-Aldrich)で10分間透過処理し、続いてPBS/0.05%Triton-X100中の5%ヤギ血清(Sigma-Aldrich)を用いてRTで40分間ブロックした。ブロッキング緩衝液中の一次抗体希釈物(例えば、表3)を添加し、4℃で一晩インキュベートした。翌日、細胞をPBSで3回洗浄し、PBSに希釈した二次抗体と共にRTで1時間インキュベートした。カバースリップを、DAPIを含むProLong Goldマウント試薬を用いてマウントした。画像は、Apotome.2及びZenソフトウェアを備えたZeiss Axio Observer.ZI落射蛍光顕微鏡(Zeiss(ツァイス))を用いて63倍の倍率で得た。
分化した細胞をPBSで2回洗浄し、4%ホルムアルデヒドで、室温で30分間固定した。蒸留水で3回洗浄した後、骨細胞を40mMアリザリンレッド溶液(Sigma-Aldrich)で30分間染色した。軟骨細胞は、3%酢酸、pH2.5中の1%アルシアンブルー溶液で、室温で1時間染色した。アルシアンブルーを3%酢酸で1回洗浄し、続いて蒸留水で3回洗浄し、各洗浄を15分間行った。アリザリンレッド洗浄物を蒸留水で洗浄し、各洗浄を15分間行った。Leica ICC50HDカラーカメラを用いて10倍の倍率でウェルの画像を取得した。
3μgの全RNAをTURBO DNase(Life Technologies)で処理し、RNeasy Minelute RNAクリーンアップキット(Qiagen)を用いて精製した。RNA品質を、RNA Pico 6000キット(Agilent(アジレント))を用いたAgilent 2100 Bioanalyzerでのマイクロキャピラリー電気泳動を使用して評価し、RIN値>8のRNAのみをさらに処理した。RNA-seqライブラリーごとに、1μgのDNAse処理RNAをRiboZero Gold(Human/Mouse/Rat)キット(Illumina(イルミナ))で処理してrRNAを除去し、その後、RNeasy Minelute RNAクリーンアップキットを用いてRNAクリーンアップを行った。配列決定ライブラリーを、TruSeq Stranded total RNA LTキット(Illumina)を製造業者の指示に従って使用し、11サイクルの濃縮PCRを使用して等量のrRNA枯渇RNAから調製した。ライブラリーの品質は、DNA 1000キット(Agilent)を用いてAgilent 2100 Bioanalyzerを用いて評価した。Qubit dsDNA HS Assay Kit(Life Technologies)を用いてライブラリー濃度を測定した。製造業者の指示に従ってライブラリーの多重化を実施した。CHIR時間経過実験からの多重化ライブラリーを、NextSeq 500(Illumina)を使用して配列決定して、75ntシングルエンドリード(読み取り)を生成した。配列決定の深さ(シークエンシング深度)は、ライブラリーあたり20~40Mioリードであった。樹立されたAxCS株由来のライブラリーをHiSeq2500装置で配列決定して、50bpのシングルエンドリードを生成した。配列決定の深さは、試料あたり12~14Mioリードであった。
CHIR時間経過実験のために、リードを、kallisto(バージョン0.43.0_3)(Brayら、2016)を使用して、ヒトトランスクリプトーム(EnsemblバージョンGRChg38.86)に疑似整列させた。得られた推定転写物レベルの存在量を遺伝子あたりのカウントに集計し、Tximport(バージョン1.10.1)パイプライン(Sonesonら、2015)を使用してエクスポートした。RのDESeq2パッケージ(バージョン1.22.2)(Loveら、2014)を使用して、各刺激時間点における遺伝子発現を未分化親細胞株と比較することによって、差異的遺伝子発現分析を行った。正規化カウントをDESeq2オブジェクトから抽出した。PCAプロットを、rlog変換された生のカウントから構築した。
ヒト胚軸様前駆体をインビトロで永続的に捕捉するために、本発明者らはまず、SOX2、TBXT/BRA発現のそれらの特徴に似ている状態を樹立しようとした。SOX2は未分化hESCにおいて既に高度に発現されているので、本発明者らは、初期原始線条においてこの遺伝子を調節するWnt/β-カテニンシグナル伝達(Arnoldら、2000)の活性化によって、最も高い可能性のある内因性TBXT発現を誘導することに焦点を当てた。本発明者らは、この経路のアゴニストとしてCHIR99021を使用して、Wnt/β-カテニンの連続活性化を、外側中胚葉の前駆体を作り出す24時間(h)の一過性活性化(Lianら、2012)と比較した。本発明者らは、連続的な10μM処理が高レベルのTBXTを維持した(例えば、図1A)ことに注目した。連続的なWNT活性化下での分化段階を特徴付けるために、本発明者らは、時系列RNA配列決定を行った(例えば、図1B)。本発明者らは、原始線条において発現される遺伝子(TBXT、MIXL1、GSC、EVX1)並びに神経遺伝子(ZIC1、CDH2、GBX2)及び伸長軸に特徴的な遺伝子(HOX遺伝子クラスターの初期及び中期のメンバー)の48~72時間以内にプラトーになった上方制御の急激な傾向(例えば、図1C~E)に注目した。遺伝子オントロジー分析により、トランスクリプトームと中胚葉、外胚葉及び神経の発生との関連性が、連続CHIR99021処理の72時間時点で確認された(例えば、図1D、E)。これは、体軸前駆体及びそれらの自律的調節が、hESCにおけるGSK-3βの連続的阻害によって形成し始めることを示す。
次に、本発明者らは、2つの軸性状態を表す幹細胞様株の誘導を試験した。Wnt/β-カテニン及びFGFシグナル伝達によるSOX2及びTBXT状態の維持、又はWnt/β-カテニン単独によるSOX2状態の維持に従って、本発明者らは、FGF2、並びにTGF-β及びBMPシグナル伝達のリガンド並びに阻害剤の添加を伴う又は伴わない、CHIR99021の濃度範囲をスクリーニングした(例えば、図4)。本発明者らは、24時間のCHIR99021処理及び連続継代後にこれらの条件を適用することにより、数ヶ月の培養にわたって表現型的に安定な株を樹立することができるかどうかを調べた(例えば、図2A)。
推定体軸幹細胞株を特徴付けるために、本発明者らはまず、FGF2処理をするしないで切り替えることによってそれらの階層を分析した。本発明者らは、FGF2の不存在下で、基底様体軸細胞株がTBXT/CDX2を下方制御し、PAX6を上方制御したが、SOX2及びPAX6の発現は、SOX2/PAX6体軸細胞株へのFGF2の添加後に変化しなかったこと(例えば、図3A)に注目した。これは、SOX2/TBXT体軸細胞株がSOX2/PAX6段階の前駆体を表すという前提を実証した。次に、本発明者らは、網羅的トランスクリプトームによって基底の、中間の及びプライミングされた体軸幹細胞状態を分析した。興味深いことに、それぞれ基底状態及びプライミング状態でのT/CDX2及びPAX6の相互排他的発現にもかかわらず、本発明者らは、プライミング状態の上方制御された遺伝子のコホートが、ほぼ完全に(約90%)基底状態に含まれることを見出した(例えば、図3B)。これは、初期軸性状態の調節が、おそらくTBXT/CDX2/MIXL1及び/又はFGFシグナル伝達によって媒介される遺伝子のより大きいコホートの発現を伴うことを示す。さらに、本発明者らは、中間状態が、他の状態と重複しなかった遺伝子の約10%を含むユニークなコホートの上方制御を示すことを見出した。これらの相違にもかかわらず、濃縮された組織カテゴリーの分析は、基底状態、プライミング状態、及び中間状態の発生上の対応が類似しており、ニューロン系及び骨格系に分化する潜在能力を有することを示した(例えば、図3C)。
SOX2は、胚性幹細胞及び神経幹細胞(NSC)の維持において重要な役割を有し(Boyerら、2005;Avilionら、2003;Grahamら、2003;Pevny及びNicolis、2010)、NSB、CLE及びCNHに存在する末梢神経系の分化複能性前駆体、例えば、体軸前駆体において(Henriqueら、2015)、又は神経堤由来感覚ニューロン前駆体において(Cimadamoreら、2011)も発現される。本発明者らは、本実施例で、経路の活性化の24時間後に始まる細胞継代と併せてWnt/β-カテニン経路を絶えず活性化することによって、ヒトESCにおけるようにSOX2の発現を高く保つことができることを示す。これにより、体軸前駆体分化におけるSOX2、PAX6及びTBXTの調節におけるWnt/β-カテニン及びFGFの役割を解くことが可能になった。TBXTは、体軸前駆体を樹立及び維持するために必要であるWnt/β-カテニンとFGFシグナル伝達との間の正のフィードバックループを形成すると考えられている(Garriockら、2015;Goutiら、2014;Kochら、2017;Turnerら、2014;Martin及びKimelman、2010)にもかかわらず、本発明者らの結果は、Wnt/β-カテニン単独で、体軸前駆体におけるSOX2の発現を維持するのに充分であることを示す。代わりに、FGF及びWnt/β-カテニンシグナル伝達はともに、TBXT及びSOX2を共発現する体軸前駆体の状態を樹立及び維持するために必要である。それにもかかわらず、TBXTは、Wnt/β-カテニンの活性化及び継代後に一過性に発現され、FGFは、内因的に産生されることが可能であるようであり(例えば、図1F)、これは、TBXT及びFGFが、すべての形態の体軸前駆体の樹立に一過性に関与することを示す。これは、Wnt/β-カテニン単独によるSOX2、TBXT→SOX2、PAX6軸性状態の一方向変換によって支持される。重要なことに、hPSCがWnt/β-カテニン刺激後に継代されない場合、SOX2は急速に下方制御され、これは体軸前駆体の誘導を完全に妨げる。従って、本発明者らは、Wnt/β-カテニン及び継代が、bFGFの存在下でTBXT及びSOX2の軸性基底状態を、又はWnt/β-カテニンシグナル伝達のみが活性であるときにSOX2及びPAX6を共発現するプライミング状態(例えば、図3K)を促進すると結論付ける。
胚及びESCからのNSCの誘導は、中枢神経系の研究及び治療における新しい時代の開始を告げた。AxSC株の誘導は、ALS及び筋ジストロフィーを含む、感覚及び運動末梢神経系並びに骨格筋に影響を及ぼす疾患及び外傷のための治療を研究及び創出するためのシステムを提供することによって、これらの重要な知見を補完する。
CHIR+TGFi及びCHIR+FGF2+TGFi処理は、安定な細胞株の誘導を可能にしたので、それゆえ、樹立プロセスの間の最初の継代において上述のマーカー遺伝子の発現傾向をチェックするためにこれらの条件を使用することによって、さらなる誘導を実施した。継代5、9及び26についての以前の結果と同様に、体軸前駆体マーカー(SOX2、TBXT及びCDX2)は、CHIR+FGF2+TGFi(CFS)処理によって最初の継代において高レベルで検出されたが(図8A)、CHIR+TGFi(CS)処理は、徐々に増加したPAX6とは逆に、体軸前駆体マーカーの段階的な減少をもたらした(図8B)。いずれの株も、中胚葉マーカーを発現しなかったか、又は非常に低いレベルで発現した。
本発明者らは、体軸幹細胞が末梢ニューロンを生成する能力を調査しようとし、それゆえ、本発明者らは、文献に基づいて脊髄発生及び脊髄ニューロン特定化を模倣するためのサイトカイン群を含む培地を用いて(図12A)運動ニューロン分化を実施した。分化の際の細胞形態に基づいて、本発明者らは、体軸幹細胞の2つの状態がCSについては2日及び少なくともCFS細胞については7日と、神経形態を発生させる異なる速度を示すということを認めた(図12B)。本発明者らは、16日目以降のCFS分化における細胞不均質性に注目した。遺伝子発現分析に基づいて、ペリフェリン(末梢ニューロンマーカー)、ISL1及びCHAT(成熟ニューロンマーカー)は、すべての実験において上方調節されたが、OLIG2(運動ニューロン前駆体マーカー)は、いかなるものにおいても検出されなかった(図12C~D)。驚くべきことに、CFS及びCS分化は、それぞれ運動ニューロンマーカー及び感覚ニューロンマーカーであるMNX1及びPOU4F1の発現について異なるパターンを示した。両方の転写因子は、CFS誘導物由来の28日目分化細胞において検出されたが(図12C~E)、CS由来細胞は、14日目でMNX1を発現するが(図12F)、CFS分化物と同様に両方の転写因子の発現を示すCS-1誘導物由来の分化細胞(図12D)を除き、後の時間点(28日目)ではMNX1又はPOU4F1のいずれかを発現する。
SOX2は、多能性幹細胞(Avilionら、2003、Boyerら、2005)だけでなく系譜特異的幹細胞(Grahamら、2003、Favaroら、2009)においても自己複製の主要制御因子(マスターレギュレーター)として公知である。T発現は、初期中胚葉前駆体の顕著な特徴である(Showellら、2004、Tosicら、2019)。これらの2つの重要な転写因子の共発現は、神経中胚葉前駆体(NMP)を特定するために使用されている。NMPは、マウス、ニワトリ及びヒトの胚において特定されている。初期発生の現在の科学的理解により、WNT及びFGFシグナル伝達経路を操作して、インビトロで一過性にNMPを生成することが可能である。これまでのところ、NMPの長期インビトロ維持が実証されている研究はない。一般に記載されるNMP集団(Henriqueら、2015、Wymeerschら、2019)は一過性かつ不等質であり、これは、疾患モデリング又は細胞療法産物の製造のためのこの発生前駆体の使用に課題を提起する。
本発明の体軸幹細胞(AxSC)は神経中胚葉前駆体(NMP)ではない。これは、NMPは一過性であり、これはNMPは増殖できないということを意味するが、AxSCは一過性細胞ではなく、増殖することができ無制限に複製されることが可能であるというのが主たる理由である。
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Claims (20)
- 体軸幹細胞(AxSC)を生成する方法であって、
a)多能性幹細胞、胚性幹細胞又は人工多能性幹細胞を提供する工程であって、好ましくは前記生成の前に、前記多能性細胞は、適切な多能性細胞培地中で維持され、さらに好ましくは、前記適切な多能性細胞培地は、前記生成のためにビタミンAを含む又は含まないB27サプリメントを補充したRPMI1640培地で置き換えられる工程と、
b)前記多能性幹細胞、胚性幹細胞又は人工多能性幹細胞においてWnt/β-カテニンシグナル伝達経路を活性化する工程であって、好ましくは、前記活性化は、GSK3bタンパク質の阻害剤を使用することによって行われ、さらに好ましくは、前記阻害剤はCHIR99021であり、さらに最も好ましくは前記CHIR99021阻害剤は約5μM~約10μMの濃度で使用され、さらに最も好ましくは前記CHIR99021阻害剤は約24時間使用される工程と、
c)工程(b)から誘導される細胞を、継代の間の前記細胞における前記Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路の連続活性化の条件下で継代する工程であって、好ましくは、前記継代は少なくとも約3~9回行われ、さらに好ましくは前記継代は連続継代であり、さらに最も好ましくは前記継代は、工程(b)から誘導される細胞を、新鮮な無血清培地中により低い密度で再播種することを含み、好ましくは、前記Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路の前記連続活性化は、前記Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路の阻害剤を使用することによって行われ、さらに好ましくは、前記阻害剤はCHIR99021であり、さらに最も好ましくは前記CHIR99021阻害剤は少なくとも約5μMの濃度で使用され、工程(c)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2を内因的に発現している工程と
を含み、
d)任意選択で、工程(c)からの前記Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路の前記連続活性化は、線維芽細胞増殖因子2及び/又はTGF-β阻害剤の存在下で行われ、好ましくは、
d1)工程(c)からの前記Wnt/β-カテニンシグナル伝達の前記連続活性化は、約5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、線維芽細胞増殖因子2及びTGF-β阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは、前記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好ましくは、前記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、さらにさらに最も好ましくは前記線維芽細胞増殖因子2は約20~約100ng/mlの濃度で使用され、工程(d1)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2、T-box転写因子T及びホメオボックスタンパク質MIXL1を内因的に発現しているが、ペアードボックスタンパク質Pax-6内因的に発現しておらず、任意選択で、ホメオボックスタンパク質CDX-2をさらに内因的に発現しているか、又は
d2)工程(c)からの前記Wnt/β-カテニンシグナル伝達の前記連続活性化は、約5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、好ましくはTGF-β阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは、前記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好ましくは前記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、工程(d2)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2及びペアードボックスタンパク質Pax-6を内因的に発現しているが、T-box転写因子T、ホメオボックスタンパク質MIXL1及びホメオボックスタンパク質CDX-2を内因的に発現していないか、又は
d3)工程(c)からの前記Wnt/β-カテニンシグナル伝達の前記連続活性化は、約7.5μMの濃度のCHIR99021阻害剤を用いて、好ましくはTGF-β阻害剤の存在下で行われ、さらに好ましくは、前記TGF-β阻害剤はSB-431542であり、さらに最も好ましくは前記SB-431542阻害剤は約10μMの濃度で使用され、工程(d3)から誘導される細胞は、転写因子SOX-2、T-box転写因子T、ホメオボックスタンパク質MIXL1及びペアードボックスタンパク質Pax-6を内因的に発現しており、任意選択で、ホメオボックスタンパク質CDX-2をさらに内因的に発現している、体軸幹細胞を生成する方法。 - 前記工程(c)及び/又は工程(d)に由来する前記細胞を継代する工程をさらに含む請求項1に記載の体軸幹細胞を生成する方法。
- 工程(d)を含み、工程(d1)、(d2)又は(d3)をさらに含む請求項1又は請求項2に記載の体軸幹細胞を生成する方法。
- 前記体軸幹細胞が、以下の特徴、
i)好ましくはUniProtKB-P48431若しくは配列番号21を有する転写因子SOX-2を発現する、
ii)好ましくはUniProtKB-Q01860若しくは配列番号22を有するOCT4転写因子を実質的に発現しない、
iii)好ましくはUniProtKB-Q9H9S0若しくは配列番号23を有するホメオボックスタンパク質NANOGを実質的に発現しない、
iv)多能性ではない、
v)領域特異的分化複能性幹細胞である、
vi)多能性幹細胞、胚性幹細胞若しくは人工多能性幹細胞から得ることができる、
vii)胚のすべての組織の細胞型に分化することができるわけではない、
viii)胚発生中に中心体軸の領域から出現する細胞型、好ましくは硬節、皮筋板及び末梢ニューロンにのみ分化することができる、
ix)奇形種を形成することができない、
x)軸領域、好ましくは運動ニューロン、末梢ニューロン、末梢神経系ニューロン、感覚ニューロン、骨、軟骨、腱、靱帯及び/若しくは骨格筋の細胞を生じる前駆体の特性を模倣することができる、
xi)一過性細胞ではない、
xii)運動ニューロン、末梢ニューロン、筋肉、軟骨若しくは骨の前駆体に分化することができる、
xiii)無制限に複製する幹細胞である、
xiv)クローンとして増殖することができる、
xv)神経中胚葉前駆体(NMp)ではない、並びに/又は
xvi)人工神経幹細胞(iNSC)ではない
のうちの1つ以上を有する請求項1から請求項3のいずれか1項に記載の体軸幹細胞を生成する方法。 - 前記体軸幹細胞が神経中胚葉前駆体(NMp)ではなく、前記体軸幹細胞が、以下のタンパク質、
i)好ましくはUniProtKB-P04198又は配列番号32を有するN-myc癌原遺伝子タンパク質(MYCN)、
ii)好ましくはUniProtKB-Q6ZN17又は配列番号31を有するタンパク質lin-28ホモログB(LIN28B)、
iii)好ましくはUniProtKB-P78415又は配列番号34を有するIroquoisクラスホメオドメインタンパク質IRX-3(IRX3)、
iv)好ましくはUniProtKB-O00570又は配列番号35を有する転写因子SOX-1(SOX1)、
v)好ましくはUniProtKB-O95409又は配列番号33を有するジンクフィンガータンパク質ZIC2(ZIC2)、
vi)好ましくはUniProtKB-P35716又は配列番号36を有する転写因子SOX-11(SOX11)、
のうちの1つ以上を発現し、
vii)好ましくは、前記AxSCは、MYCN、LIN28B、ZIC2及びSOX11を発現する基底状態AxSCであり、
viii)好ましくは、前記AxSCは、MYCN、LIN28B、IRX3、SOX1、ZIC2及びSOX11を発現するであるプライミング状態AxSCである
請求項1から請求項4のいずれか1項に記載の体軸幹細胞を生成する方法。 - 前記体軸幹細胞が、
i)基底体軸幹細胞であって、好ましくは、前記基底体軸幹細胞は無制限に複製する基底体軸幹細胞であり、前記基底体軸幹細胞は、
a)好ましくはUniProtKB-P48431又は配列番号21を有する転写因子SOX-2、
b)好ましくはUniProtKB-O15178又は配列番号24を有するT-box転写因子T、
c)好ましくはUniProtKB-Q99626又は配列番号25を有するホメオボックスタンパク質CDX-2、及び
d)好ましくはUniProtKB-Q9H2W2又は配列番号26を有するホメオボックスタンパク質MIXL1
を発現する基底体軸幹細胞に、
ii)プライミング状態体軸幹細胞であって、好ましくは、前記プライミング状態体軸幹細胞は無制限に複製するプライミング状態体軸幹細胞であり、前記プライミングされた体軸幹細胞は、
e)好ましくはUniProtKB-P48431又は配列番号21を有する転写因子SOX-2、及び
f)好ましくはUniProtKB-P26367又は配列番号27を有するペアードボックスタンパク質PAX-6
を発現するプライミング状態体軸幹細胞に
無制限に複製及び分化することができる請求項1から請求項5のいずれか1項に記載の体軸幹細胞を生成する方法。 - 前記体軸幹細胞がヒト体軸幹細胞である請求項1から請求項6のいずれか1項に記載の体軸幹細胞を生成する方法。
- 請求項1から請求項7のいずれか1項に記載の体軸幹細胞を生成する方法によって生成される体軸幹細胞。
- 単離された体軸幹細胞(AxSC)であって、前記体軸幹細胞は、転写因子SOX-2を発現し、OCT4転写因子を実質的に発現せず、ホメオボックスタンパク質NANOGを実質的に発現せず、前記AxSCは多能性ではなく、前記AxSCは、以下の特徴、
i)領域特異的分化複能性幹細胞である、
ii)多能性幹細胞、胚性幹細胞又は人工多能性幹細胞から得ることができる、
iii)胚のすべての組織の細胞型に分化することができるわけではない、
iv)胚発生中に中心体軸の領域から出現する細胞型、好ましくは硬節、皮筋板及び末梢ニューロンにのみ分化することができる、
v)奇形種を形成することができない、
vi)軸領域、好ましくは運動ニューロン、末梢ニューロン、末梢神経系ニューロン、感覚ニューロン、骨、軟骨、腱、靱帯及び/又は骨格筋の細胞を生じる前駆体の特性を模倣することができる、
vii)一過性細胞ではない、
viii)運動ニューロン、末梢ニューロン、筋肉、軟骨又は骨の前駆体に分化することができる、
ix)無制限に複製する幹細胞である、
x)クローンとして増殖することができる、
xi)神経中胚葉前駆体(NMp)ではない、
xii)人工神経幹細胞(iNSC)ではない
のうちの1つ以上さらに有する体軸幹細胞。 - 前記体軸幹細胞が神経中胚葉前駆体(NMp)ではなく、前記体軸幹細胞が、以下のタンパク質、
i)好ましくはUniProtKB-P04198又は配列番号32を有するN-myc癌原遺伝子タンパク質(MYCN)、
ii)好ましくはUniProtKB-Q6ZN17又は配列番号31を有するタンパク質lin-28ホモログB(LIN28B)、
iii)好ましくはUniProtKB-P78415又は配列番号34を有するIroquoisクラスホメオドメインタンパク質IRX-3(IRX3)、
iv)好ましくはUniProtKB-O00570又は配列番号35を有する転写因子SOX-1(SOX1)、
v)好ましくはUniProtKB-O95409又は配列番号33を有するジンクフィンガータンパク質ZIC2(ZIC2)、
vi)好ましくはUniProtKB-P35716又は配列番号36を有する転写因子SOX-11(SOX11)
のうちの1つ以上を発現し、
vii)好ましくは、前記AxSCは、MYCN、LIN28B、ZIC2及びSOX11を発現する基底状態AxSCであり、
viii)好ましくは、前記AxSCは、MYCN、LIN28B、IRX3、SOX1、ZIC2及びSOX11を発現するプライミング状態AxSCである
請求項9に記載の体軸幹細胞。 - 前記体軸幹細胞が、自身を無制限に複製することができ、
i)基底体軸幹細胞であって、前記基底体軸幹細胞は、
a)好ましくはUniProtKB-P48431又は配列番号21を有する転写因子SOX-2、
b)好ましくはUniProtKB-O15178又は配列番号24を有するT-box転写因子T、
c)好ましくはUniProtKB-Q99626又は配列番号25を有するホメオボックスタンパク質CDX-2、及び
d)好ましくはUniProtKB-Q9H2W2又は配列番号26を有するホメオボックスタンパク質MIXL1
を発現する基底体軸幹細胞に、
ii)プライミング状態体軸幹細胞であって、前記プライミングされた体軸幹細胞は、
e)好ましくはUniProtKB-P48431又は配列番号21を有する転写因子SOX-2、及び
f)好ましくはUniProtKB-P26367又は配列番号27を有するペアードボックスタンパク質PAX-6
を発現するプライミング状態体軸幹細胞に
分化することができる請求項9又は請求項10に記載の体軸幹細胞。 - 前記体軸幹細胞がヒト体軸幹細胞である請求項9から請求項11のいずれか1項に記載の体軸幹細胞。
- 前記体軸幹細胞が、請求項9から請求項12のいずれか1項に記載の体軸幹細胞である請求項1から請求項7のいずれか1項に記載の体軸幹細胞を生成する方法。
- 請求項8から請求項12のいずれか1項に記載の体軸幹細胞を含む組成物、調製物又はキット。
- 前記組成物、調製物又はキットが、医薬及び/又は診断用の組成物、調製物又はキットである請求項14に記載の組成物、調製物又はキット。
- 医薬として使用するための、請求項8から請求項12及び請求項14から請求項15のいずれか1項に記載の体軸幹細胞、組成物、調製物又はキット。
- i)神経変性疾患の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
ii)骨及び/若しくは軟骨の障害の治療、低減、予防並びに/又は診断の方法、
iii)筋障害の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
iv)細胞、組織、器官及び/又は身体の再生治療の方法、
v)疾患、好ましくは末梢神経系の疾患、又は体軸幹細胞に関連する疾患、好ましくは筋肉関連、運動ニューロン関連、末梢ニューロン関連、感覚ニューロン関連、軟骨関連、腱関連の疾患に対する活性について、及び/又は神経毒性スクリーニングについて候補化合物をスクリーニングする方法、
vi)体軸幹細胞に関連する疾患、好ましくは筋肉関連、運動ニューロン関連、末梢ニューロン関連、感覚ニューロン関連、軟骨関連、腱関連の疾患の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
vii)インビトロ、エキソビボ又はインビボでの方法である(i)~(vi)のいずれか
のうちの1つ以上において使用するための請求項8から請求項12及び請求項14から請求項16のいずれか1項に記載の体軸幹細胞、組成物、調製物又はキット。 - 必要とする試料又は対象の状態を改善する方法であって、前記方法は、以下の、
i)神経変性疾患の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
ii)骨及び/若しくは軟骨の障害の治療、低減、予防並びに/又は診断の方法、
iii)筋障害の治療、低減、予防及び/又は診断の方法、
iv)細胞、組織、器官及び/又は身体の再生治療の方法、
v)疾患、好ましくは末梢神経系の疾患に対する活性について、及び/又は神経毒性スクリーニングについて、候補化合物をスクリーニングする方法
のうちの1つ以上であり、
前記方法は、
a)請求項8から請求項12及び請求項14から請求項17のいずれか1項に記載の体軸幹細胞、組成物、調製物又はキットを前記試料又は対象に提供する工程と、
b)治療有効量の前記体軸幹細胞、組成物、調製物又はキットを前記試料又は対象に投与する工程と
を含む方法。 - 前記方法が、インビトロ、エキソビボ又はインビボでの方法である請求項18に記載の方法。
- i)神経変性疾患の治療、低減、予防及び/又は診断、
ii)骨及び/若しくは軟骨の障害の治療、低減、予防並びに/又は診断、
iii)筋障害の治療、低減、予防及び/又は診断、
iv)細胞、組織、器官及び/又は身体の再生治療、
v)疾患、好ましくは末梢神経系の疾患に対する活性について、及び/又は神経毒性スクリーニングについて、候補化合物をスクリーニングすること、
vi)インビトロ、エキソビボ又はインビボでの使用である(i)~(v)のいずれか、
のうちの1つ以上のための、請求項8から請求項12及び請求項14から請求項17のいずれか1項に記載の体軸幹細胞、組成物、調製物及び/又はキットの使用。
Applications Claiming Priority (5)
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