JP2023521347A - アンジオポエチン様3(angptl3)をサイレンシングするための遺伝子構築物及びその使用 - Google Patents

アンジオポエチン様3(angptl3)をサイレンシングするための遺伝子構築物及びその使用 Download PDF

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Abstract

本発明は、アンジオポエチン様3(ANGPTL3)遺伝子の発現をノックダウンするためのRNA分子、前記RNA分子を含む組成物、前記組成物の医学的使用、及び脂質異常症の治療に関する。【選択図】なし

Description

本発明は、アンジオポエチン様3(ANGPTL3)遺伝子の発現をノックダウンするためのRNA分子、RNA分子を含む組成物、組成物の医学的使用、並びに脂質異常症の治療及び/又は予防に関する。
脂質異常症は、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害である。脂質異常症患者では、総コレステロール(TC)、低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)、及びトリグリセリド(TG)の濃度レベルが上昇し、高密度リポタンパク質コレステロール(HDL-C)のレベルが低下している。TGリッチリポタンパク質のレベルの上昇は、急性膵炎を引き起こす可能性があり、LDL-C、レムナントリポタンパク質(つまり、非常に低密度のリポタンパク質コレステロール(VLDL-C)、中密度のリポタンパク質コレステロール(IDL-C))及びリポタンパク質(Lp)(a)のレベルの上昇は、アテローム性動脈硬化を引き起こす可能性がある(Nordestgaard,B.G.ら、2018;Rojas,M.P.ら、2018)。したがって、脂質異常症は、アテローム性心血管疾患等の他の疾患と関連していることが見出され、これらの疾患は、脂質異常症の治療の治療及び/又は予防を開始するための指標である。
スタチンは、脂質異常症患者及び冠動脈性心疾患患者の治療のために知られている薬物のクラスである。スタチンはLDL-Cレベルを低下させることができ、一定の冠動脈疾患リスクを有する患者の治療のために使用することができる(Ling,H.ら、2015;Toth,P.P.ら、2018)。しかし、スタチンにはいくつかの問題がある。スタチンは、高度に上昇したTGレベルを低下させることはできないことが分かっている(Toth,P.P.ら、2018)。さらに、一部の患者はスタチンに対する忍容性が低い。また、スタチンは、心不全又は末期腎疾患を有する患者には適していない(Ling,H.ら、2015)。他の薬物、例えば、エゼチミブ又はタンパク質変換酵素サブチリシン/ケキシン9型(PCSK9)阻害剤は、脂質レベルを低下させることができるが、これらの薬物の1つを単独で使用しても、アテローム性動脈硬化のリスクは低下しない。したがって、脂質異常症を治療するための現在知られている薬物は、医師及び/又は患者のニーズを満たしていない。
アンジオポエチン様3タンパク質(ANGPTL3)、アポリポタンパク質C-III(ApoC-III)、コレステロールエステル転送タンパク質(CETP)、及びLp(a)等のいくつかのタンパク質は、脂質異常症と関連していることが特定されており、コレステロール又はTG代謝におけるそれらの役割が検討された。例えば、ANGPTL3遺伝子の転写物は、リポタンパク質リパーゼ(LPL)の活性、したがって脂肪組織及び筋肉の毛細血管におけるTGの加水分解、並びに血清HDL-Cレベルに影響を及ぼす内皮リパーゼ(EL)の活性を阻害することができる(Olkkonen,V.M.ら、2018)。ANGPTL3遺伝子(NCBI参照配列:NG_028169.1;配列番号1)のヌルバリアントに対してホモ接合型又は複合ヘテロ接合型である人は、そのようなバリアントを有さない人よりも、血漿LDL-C及びTGのレベルが約70%低い。また、ANGPTL3遺伝子のヌルバリアントに対してホモ接合又は複合接合型である人は、脂肪性肝疾患の罹患率の増加又は心血管疾患の明らかなリスクの増加なしに、インスリン感受性が向上している(Graham,M.J.ら、2017)。ANGPTL3遺伝子の機能喪失変異は、疾患の症状なしに自然発生し、それによって変異は安全であると考えられることも分かった。ANGPTL3タンパク質レベルが低い個体は、全身のコレステロール恒常性に対する有害な影響を示さず、病理学的状態も示さなかった(Minicocci,I.ら、2012)。
低分子干渉RNA(siRNA)の操作に基づいて、FDA承認薬物であるARO-ANG3が開発された。この薬物は、複数の前臨床脂質異常症の小型及び大型動物モデルにおいて、肝臓及び血清のTG及びLDL-CにおけるANGPTL3発現を低下させる効果を示す。またARO-APOC3と呼ばれる別の薬物が、重度の高トリグリセリド血症(HTG)及び家族性カイロミクロン血症症候群の治療のためのsiRNAの操作に基づいて設計された。
しかしながら、これらの薬物は、人体への頻繁な注射を必要とし、それによって、これらの薬物の使用は、医師及び/又は患者にとって利便性が低い。さらに、そのような投与投薬レジームは、高い医療コストを生じ得る。したがって、それらの効果にもかかわらず、これらの薬物は、医師及び/又は患者にとって満足度が低いままである。
以上のことから、脂質異常症を治療するための、上記の全てのニーズを満たす薬物が必要とされている。
本発明によれば、核酸が提供される。前記核酸は、第1のRNA配列及び第2のRNA配列を含むRNA分子をコードする核酸配列を含み、前記第1のRNA配列は、前記第2のRNA配列に実質的に相補的であり、前記第1のRNA配列は、アンジオポエチン様3(ANGPTL3)遺伝子によってコードされているRNAに含まれる標的RNA配列に実質的に相補的である配列を含み、前記標的RNA配列に実質的に相補的である前記配列は、少なくとも19個のヌクレオチドを有する。前記RNA分子は、上述のように、二本鎖RNA(dsRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、マイクロRNA(miRNA)、ショートヘアピンRNA(shRNA)又はRNAヘアピンを含み、前記dsRNA、前記siRNA、前記miRNA、前記shRNA又は前記RNAヘアピンの第1の配列は、標的配列に実質的に相補的な配列を含む。
前記第1のRNA配列に含まれる前記配列は、上述のように、前記標的RNA配列に実質的に相補的であり、それにより、前記RNA分子は、上述のように、前記標的RNA配列に結合特異性を有する。前記第1のRNA配列に含まれる前記配列を、前記RNAi誘導サイレンシング複合体(RISC)にロードし、前記ANGPTL3遺伝子によってコードされている標的RNA配列に結合させた後、続いて、前記ANGPTL3遺伝子の転写物を切断し、それにより、前記転写物を減少させる及び/又はノックダウンする。好適には、前記ANGPTL3遺伝子の転写物は、ANGPTL3 mRNAである。結果として、人体におけるLPL及びELの活性は阻害されることなく残り、LDL-C、TC、及び/又はTGのレベルが低下する。また、アテローム性動脈硬化症や心血管疾患のリスクが低下する。
上記及び本明細書に記載されるように、前記核酸を使用することにより、血漿中のコレステロールレベル、リン脂質レベル、TC、LDL-C、及び/又はTGレベルが低減する及び/又は阻害される。
さらに、前記核酸は、上述のように、肝臓への投与が安全である。
上述のように、前記核酸の安全性は、血漿中のアラニントランスアミナーゼ(ALT)活性レベル及び/又は血漿中のアスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)活性レベルを測定することによって、好ましくは両方を測定することによって評価される。肝臓が損傷すると、肝臓に元々存在していたASTが血液中に放出され、それによって血漿中のASTレベルが上昇する。したがって、血漿中のAST活性レベルの上昇は、肝障害の指標である。ASTと同様に、ALTレベルの上昇も、肝障害の指標である。
上述のような前記核酸の使用は、AST及びALT活性レベルの永続的な上昇をもたらさない。したがって、前記核酸を哺乳類に投与することは安全である。
さらに、アテローム性動脈硬化の病変は、前記核酸を使用することによって阻害及び/又は低減される。したがって、前記核酸は、脂肪線条としても知られる初期病変(I~II型)、軽度病変(III型)、及び/又は(線維)アテローム病変としても知られる重度病変(IV~V型)の治療及び/又は予防に有用である。アテローム性動脈硬化病変の大きさ及び重症度を決定するために、米国心臓協会により、病変は5つのカテゴリーに分類された(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000):上記及び本明細書に記載のI型は初期脂肪線条であり、上記及び本明細書に記載のII型は定型脂肪線条であり、上記及び本明細書に記載のIII型は軽度プラークであり、上記のIV型は中等度プラークであり、上記及び本明細書に記載のV型は重度プラークである。
好ましくは、上述のように、前記RNA分子に含まれる前記第1のRNA配列は、前記第2のRNA配列に対して実質的に相補的である。
好ましくは、上述のように、前記RNA分子に含まれる前記第1のRNA配列は、前記第2のRNA配列に相補的であり、それにより、前記第1のRNA配列は、前記第2のRNA配列に結合する。
上述のように、前記核酸は、本明細書及び以下に記載されるように、例えば、アデノ随伴ウイルス(AAV)ビヒクルによって、標的細胞内に送達される。前記核酸は、続いて上述のようにRNA分子に転写される。前記標的細胞の核において、前記RNA分子は、上述のように、Drosha(つまり、クラス2のリボヌクレアーゼIII酵素)によって、RNA分子の5’端及び3’端に隣接領域を有さずにshRNA及び/又はRNAヘアピンへと切断される。続いて、切断されたRNA分子は細胞の細胞質に輸送される。ここで、前記切断されたRNA分子は、エンドリボヌクレアーゼダイサーによってさらに切断されないが、前記切断されたRNA分子は、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)のArgonaute-2(AGO-2)によってさらに切断され、特に、前記切断されたRNA分子の第2のRNA配列は、上述のように、前記切断されたRNA分子からトリミングされる(つまり、分解される)。したがって、前記RNA分子の前記第2のRNA配列のオフターゲットmRNAへの部分的相補性及び前記オフターゲットmRNAへの結合から生じる「オフターゲット」問題が低減及び/又は抑制される。前記第2のRNA配列はパッセンジャー鎖とも呼ばれる。これにより、ガイド鎖としても知られる前記第1のRNA配列の、前記標的RNA配列への結合が改善される。
好適には、上述のように、前記第1のRNA配列に相補的な配列は、上述のように、前記第2のRNA配列とは異なる、少なくとも5、6、7、8、9、10、又は11個のヌクレオチドを含む。
好適には、上述のように、前記第1のRNA配列に相補的な配列は、前記第2のRNA配列とは異なる、最大で12、13、14、15、又は16個のヌクレオチドを含む。
前記第1のRNA配列及び前記第2のRNA配列が、前記第2のRNA配列に対して十分な結合特異性を有するままであるのに対し、前記第1のRNA配列及び前記第2のRNA配列は、上述のように、複数のヌクレオチドにおいて相補的でない場合がある。したがって、前記第1及び第2のRNA配列は、上述のように、前記「オフターゲット」問題を阻害及び/又は低減するなどの、上述のニーズを満たすために使用することができる。好ましくは、上述のように前記核酸によってコードされているRNA分子は、上述のように、二本鎖RNA(dsRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、マイクロRNA(miRNA)、又はRNAヘアピンを含む二次構造を有し、前記dsRNA又は前記RNAヘアピンの第1の配列は、標的配列に実質的に相補的である配列を含む。
前記核酸は、上述のように、前記RNA分子へ転写することができる。前記RNA分子は、上述のように、前記「オフターゲット」問題を阻害及び/又はさらに低減するために、本発明において有用である。好ましくは、上述のように、前記RNAヘアピンは、ショートヘアピンRNA(shRNA)又はロングヘアピンRNA(lhRNA)である。より好ましくは、上述のように、RNA分子は、miR-451を含む。さらに好ましくは、前記RNA分子は、改変miR-451をコードする核酸配列である配列番号124からコードされている。配列番号124などの核酸配列又は前記miR-451をコードする配列は、AAV遺伝子治療ビヒクルなどの遺伝子治療ビヒクルで構成されるベクターに含められて標的臓器に送達されるのに好適である。さらに、前記核酸配列によってコードされている前記RNA分子を使用することによる前記「オフターゲット」問題は低減する及び/又は阻害される。これにより、前記核酸は、上述のようなニーズを満たす。
上述のように、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、任意選択で少なくとも15個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも16個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも17個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも18個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも19個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも20個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも21個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも22個のヌクレオチド、又は任意選択で少なくとも24個のヌクレオチドを有する。さらに、上述のように、前記第1のRNA配列に含まれる前記配列は、任意選択で最大30個のヌクレオチド、任意選択で最大28個のヌクレオチド、又は任意選択で最大26個のヌクレオチドを有する。上述のように、異なるヌクレオチドを含む前記第1のRNA配列は、上述のように、前記標的RNA配列に対して十分な結合特異性を有し、それにより、前記第1のRNA配列は、ANGPTL3遺伝子の転写物の低減及び/又はノックダウンに有用である。さらに、上述のように、異なる長さを有する前記第1のRNA配列の1つをコードする核酸配列を含む核酸は、遺伝子治療ビヒクルに含まれるベクターに好適及び/又は容易に埋め込むことができ、上述のように前記RNA二次構造にさらにフォールディングさせることができる。したがって、上述のように、異なるヌクレオチドを含む前記第1のRNA配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写物を標的化、結合、切断、及び/又はノックダウンするために使用するのに好適であり、上述のように、ニーズも満たす。
上述のように、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、以下に記載されるようにANGPTL3遺伝子に含まれる保存配列に基づいて設計される。
好ましくは、前記保存配列は、哺乳類保存配列であり、前記哺乳類保存配列は、マウスなどのげっ歯類、非ヒト霊長類(NHP)、及びヒトから選択されることが好ましい。
前記標的RNA配列は、ANGPTL3遺伝子によってコードされている配列に含まれる。好ましくは、上記及び本明細書に記載のANGPTL3遺伝子は、マウスANGPTL3遺伝子などの哺乳類ANGPTL3遺伝子である。より好ましくは、ANGPTL3遺伝子は、非ヒト霊長類(NHP)ANGPTL3遺伝子である。最も好ましくは、ANGPTL3遺伝子は、ヒトANGPTL3遺伝子である。
上述のように、前記第1のRNA配列をコードする核酸配列を含む前記核酸、前記第1のRNA配列を含む前記RNA分子は、哺乳類におけるANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンするのに有用であり得る。
好ましくは、上述のように、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、配列番号8~25からなる群から選択されるものである。より好ましくは、上述のように、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、配列番号8~17及び19~25からなる群から選択される配列である。さらにより好ましくは、第1のRNA配列に含まれる配列は、配列番号11、12、16、17、20及び25からなる群から選択される配列である。なおより好ましくは、第1のRNA配列に含まれる配列は、配列番号11、12、17、20及び25からなる群から選択される配列である。最も好ましくは、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、配列番号12を含む。
上述のように、前記核酸がRISC複合体にロードされると、前記第1のRNA配列をコードする核酸配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子のmRNA等のANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンすることができる。したがって、血漿中のコレステロールレベル、血漿中のリン脂質レベル、アテローム性動脈硬化病変、及び/又はTG TC)、及び/又はLDL-Cレベルが哺乳類において低下する。
上述のように、ANGPTL3遺伝子によってコードされている前記標的配列は、ANGPTL3遺伝子によってコードされている少なくとも1つの保存配列の全部又は一部を含むように設計される。ANGPTL3遺伝子の保存配列のいくつかを特定し、本発明のために選択する。好ましくは、保存された配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子のエクソン1、エクソン3、エクソン5、又はエクソン6に含まれる。より好ましくは、前記標的配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子のエクソン1、エクソン5又はエクソン6における保存配列の全部又は一部を含む。さらにより好ましくは、前記標的配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子のエクソン1又はエクソン5における保存配列の全部又は一部を含む。
上述のように、前記第1のRNA配列は、上記又は下記のように、ANGPTL3遺伝子のエクソン1、エクソン5又はエクソン6に含まれる前記保存された配列を標的にする、及び/又は結合することができ、それにより、前記ANGPTL3遺伝子の前記転写物を減少させる及び/又はノックダウンする。続いて、前記ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させ及び/又は阻害し、それによって血漿中のコレステロールレベル、血漿中のリン脂質レベル、アテローム性動脈硬化病変、及び/又は哺乳類におけるトリグリセリド(TG)、総コレステロール(TC)、及び/又は低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)レベルを低下させる及び/又は阻害する。
前記標的配列は、上述のように、前記ANGPTL3遺伝子によってコードされているRNAに含まれる。好ましくは、前記標的配列は、前記ANGPTL3遺伝子に含まれる1つのエクソンの少なくとも一部によってコードされているRNAに含まれる。さらに好ましくは、前記標的配列は、前記ANGPTL3遺伝子に含まれる、上述の1つのエクソンに含まれる少なくとも1つの保存配列によってコードされているRNAに含まれる。より好ましくは、上述のように、前記エクソンは、ANGPTL3遺伝子に含まれるエクソン1、エクソン3、エクソン5、又はエクソン6である。さらにより好ましくは、上述のように、前記エクソンは、ANGPTL3遺伝子に含まれるエクソン1、エクソン5、又はエクソン6である。なお好ましくは、少なくとも1つの保存配列は、ANGPTL3遺伝子のエクソン1に含まれる保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:139~166位のヌクレオチド、以下、配列番号3)、ANGPTL3遺伝子のエクソン1に含まれる保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:267~292位のヌクレオチド、以下、配列番号4)、ANGPTL3遺伝子のエクソン3に含まれる保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4、706~728位のヌクレオチド、以下、配列番号5)、エクソン5に含まれる保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:885~907位のヌクレオチド、以下、配列番号6)、又はエクソン6に含まれる保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:1134~1160位のヌクレオチド、以下、配列番号7)である。上述のように、in vivoにおいて、ANGPTL3遺伝子の前記位置を、前記第1のRNA配列で標的化することにより、上述のように、前記ANGPTL3遺伝子の前記転写物をノックダウンし、それにより、ANGPTL3遺伝子のmRNAを減少させる及び/又はノックダウンすることが見出された。それにより、血漿中のコレステロールレベル、血漿中のリン脂質レベル、アテローム性動脈硬化病変、及び/又はTG、TC、及び/又はLDL-Cレベルが、哺乳類において低減した。
前記アテローム性動脈硬化病変は、初期病変、軽度病変、及び/又は重度病変を含む。
アテローム性動脈硬化病変は、米国心臓協会に従ってI~V型に分類される(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)。前記初期病変は、I~II型を含む。前記軽度病変はIII型を含む。前記重度病変はIV~V型を含む。
したがって、上述の前記位置を標的化することにより、前記核酸は、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、混合高リポタンパク血症、及び/又は脂質異常症、並びに非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)などの脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害の治療及び/又は予防に使用され得る。
本発明によれば、上記RNA分子をコードする核酸を含む組成物が提供される。
前記RNA分子は、上述のように第2の構造にあり、ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンするために有用であり、それによって、血漿中のコレステロールレベル、血漿中のリン脂質レベル、アテローム性動脈硬化病変、並びに/又はトリグリセリド(TG)、総コレステロール(TC)、及び/若しくは低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)レベルが、哺乳類において低減する及び/又は阻害される。
好ましくは、前記組成物は、血漿コレステロールレベル、重度のアテローム性動脈硬化病変、及び/又はLDL-Cレベルをさらに低減させる及び/又は阻害する少なくとも1つの分子をさらに含む。
前記少なくとも1つの分子を加えることにより、血漿コレステロールレベル、重度のアテローム性動脈硬化病変、及び/又はLDL-Cレベルをさらに低減させる及び/又は阻害することができる。
さらに、組成物の使用は、血漿中のAST及びALT活性レベルの永続的な上昇をもたらさない。そのため、肝障害は引き起こされない。したがって、上述のように、前記組成物を哺乳類に投与することは安全である。
好ましくは、前記少なくとも1つの分子は、スタチンの群のうちの少なくとも1つを含む。
好ましくは、前記少なくとも1つのスタチンは、アトルバスタチン、セリバスタチン、フルバスタチン、ロバスタチン、メバスタチン、ピタバスタチン、プラバスタチン、ロスバスタチン、及びシンバスタチンからなる群から選択される。
前記スタチンは、上述のように、前記組成物と共に、血漿中のコレステロールレベル、LDL-Cレベル、及び/又は重度のアテローム性動脈硬化病変をさらに低減させる及び/又は阻害するために使用することができる。上述のように、前記重度のアテローム性動脈硬化病変は、米国心臓協会に従ってIV~V型を含む(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)。
より好ましくは、前記少なくとも1つの分子は、アトルバスタチン及び/又はシンバスタチンを含む。
前記組成物とアトルバスタチン及び/又はシンバスタチンとの併用は、哺乳類における血漿中のコレステロールレベル、重度のアテローム性動脈硬化病変、及び/又はLDL-Cレベルの低減及び/又は阻害に有用である。
本発明によれば、上述のように、組成物が医薬として使用される。上述のように、前記核酸の治療効果が本発明によって見出された。これにより、前記核酸を含む組成物は、医薬として使用することができる。
さらに、本発明によれば、組成物は、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンするための医薬として使用される。上述のように、前記核酸を含む前記組成物は治療効果を有するため、疾患を治療するために使用することができる。上述のように、本発明の前記組成物は、ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンすることができる。前記ANGPTL3遺伝子の前記転写物は、前記ANGPTL3遺伝子によってコードされているmRNAを含む。それにより、前記組成物は医薬として使用することができる。
また好ましくは、組成物は、上述のように、血漿中のコレステロールレベル、アテローム性動脈硬化病変、血漿中のリン脂質、LDL-C、及び/又はTCレベル、及び/又はTGレベルを低減させる及び/又は阻害するための医薬として使用される。上述のように、前記組成物を使用することによって、血漿中のコレステロール、アテローム性動脈硬化病変、血漿中のリン脂質、LDL-Cレベル、TCレベル、及び/又はTGレベルを低減させる及び/又は阻害することができる。
前記アテローム性動脈硬化病変は、初期病変、軽度病変、及び/又は重度病変を含む。
アテローム性動脈硬化病変は、米国心臓協会に従ってI~V型に分類される(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)。前記初期病変はI~II型を含む。前記軽度病変はIII型を含む。前記重度病変は上述のようにIV~V型を含む。
より好ましくは、組成物は、上述のように、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害の治療及び/又は予防のための医薬として使用される。
より好ましくは、組成物は、上述のように、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、混合高リポタンパク血症、脂質異常症、及び/又は非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)の治療及び/又は予防のために、上述のように医薬として使用される。
前記組成物は、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写物を低減させる及び/又は阻害することができ、また、上述のように、血漿コレステロールレベル、アテローム性動脈硬化病変、血漿中のリン脂質レベル、LDL-C、TC及び/又はTGを低減させる及び/又は阻害することができる。したがって、前記組成物は、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害、例えば高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、混合高リポタンパク血症、脂質異常症、及び/又は非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)などの治療及び/又は予防にも使用することができる。
最も好ましくは、組成物は、上述のように、脂質異常症の治療及び/又は予防のための医薬として使用される。本発明によれば、上記組成物の製造方法が提供される。前記方法は、上述のような前記核酸、又は上述のような前記RNA分子を、前記組成物に加えるステップを含む。
任意選択で、前記組成物は、水性液体、有機溶媒、緩衝液、及び賦形剤からなる群から選択される少なくとも1つの添加剤をさらに含む。任意選択で、水性液体は水である。また任意選択で、前記緩衝液は、酢酸塩、クエン酸塩、リン酸塩、トリス、ヒスチジン、及び4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンエタンスルホン酸(HEPES)からなる群から選択される。さらに任意選択で、有機溶媒は、エタノール、メタノール、及びジクロロメタンからなる群から選択される。さらに、賦形剤は、塩、糖、コレステロール又は脂肪酸である。さらに任意選択で、前記塩は、上述のように、塩化ナトリウム、塩化カリウムからなる群から選択される。さらに、任意選択で、前記糖類は、上述のように、スクロース、マンニトール、トレハロース、及び/又はデキストランである。
本発明によれば、DNA発現カセットが提供される。本発明のDNA発現カセットは、上述のように、前記RNA分子をコードするための核酸配列と、プロモーターと、ポリAテールとを含む。前記DNA発現カセットは、2つの逆位末端配列(ITR)によって隣接されている。
前記DNA発現カセットに含まれる前記核酸は、ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンするのに有用である。上述のように、前記核酸を含む前記DNA発現カセットは、アデノ随伴ウイルス(AAV)などのウイルス遺伝子治療ビヒクルに含めることができ、その後、標的臓器に送達することができる。したがって、前記DNA発現カセットは、脂質異常症などの脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害に罹患しているヒト対象を治療及び/又は予防するために有用である。好ましくは、前記プロモーターは、pol Iプロモーター、pol IIプロモーター、pol IIIプロモーター、PGKプロモーター、CBAプロモーター、CAGプロモーター、CMVプロモーター、誘導性プロモーター、α1-抗トリプシンプロモーター、甲状腺ホルモン結合グロブリンプロモーター、アルブミンプロモーター、LPS(チロキシン結合グロビン)プロモーター、HCR-ApoCIIハイブリッドプロモーター、HCR-hAATハイブリッドプロモーター、及びアポリポタンパク質Eプロモーター、HLP、最小TTRプロモーター、FVIIIプロモーター、ハイペロンエンハンサー、ealb-hAAT、EF1-αプロモーター、シンプレックスウイルスチミジンキナーゼ(TK)プロモーター、U1-1 snRNAプロモーター、アポリポタンパク質プロモーター、TREプロモーター、rtTA-TRE(誘導性プロモーター)、LP1プロモーター、Q1プロモーター、Q1-プライムプロモーター、C14プロモーター、C16プロモーター、並びに配列番号84~87、及び108~109、及び112~115から選択される任意の合成プロモーター、並びにそのバリアントからなる群から選択される。
前記プロモーターは、上述のように、前記DNA発現カセットに含まれる前記核酸の発現を開始するために有用である。
好ましくは、前記プロモーターは、上述のように、肝臓特異的プロモーターである。
より好ましくは、上記の肝臓特異的プロモーターは、α1-抗トリプシンプロモーター、甲状腺ホルモン結合グロブリンプロモーター、アルブミンプロモーター、LPS(チロキシン結合グロビン)プロモーター、HCR-ApoCIIハイブリッドプロモーター、HCR-20 hAATハイブリッドプロモーター、アポリポタンパク質Eプロモーター、LP1、HLP、最小TTRプロモーター、FVIIIプロモーター、ealb-hAAT、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(TK)プロモーター、アポリポタンパク質プロモーター、テトラサイクリン応答性エレメント(TRE)プロモーター、LP1プロモーター、Q1プロモーター、Q1-プライムプロモーター、C14プロモーター、C16プロモーター、並びに配列番号84~87及び108~109、及び112~115から選択される任意の合成プロモーター、並びにそのバリアントからなる群から選択される。
前記DNA発現カセットにおいて前記肝臓特異的プロモーターを使用することにより、肝臓における前記核酸の発現が誘導され、このことは、前記ANGPTL3遺伝子の転写物が主に肝臓において発現されるため、前記ANGPTL3遺伝子の転写物をノックダウンするために有用である。
さらにより好ましくは、前記プロモーターは、上述のように、前記Q1-プライムプロモーターを含む。
前記Q1-プライムプロモーターは、肝臓特異的プロモーターであり、前記Q1-プライムプロモーターは、上述のように、肝臓における前記核酸の発現をさらに増強することができる。
任意選択で、前記配列番号84~87及び108~109及び112~115のバリアントはそれぞれ、配列番号84~87及び108~109及び112~115と本質的に同一の核酸配列を有し、前記バリアントは、上述のように、前記RNA分子をコードする核酸配列の転写を開始する配列番号84~87及び108~109及び112~115と実質的に同じ機能を有する。
任意選択で、配列番号84~87、108~109、及び112~115の前記バリアントのそれぞれは、配列番号84~87、及び108~109、及び112~115の配列とは異なる、少なくとも1、2、3、4、又は5個のヌクレオチドを含む核酸配列を有する。
任意選択で、配列番号84~87及び108~109及び112~115の前記バリアントのそれぞれは、配列番号84~87及び108~109及び112~115の配列とは異なる、最大で40、35、30、25、又は20個のヌクレオチドを含む核酸配列を有する。
好ましくは、前記DNA発現カセットに含まれる前記ポリAテールは、上述のように、前記RNA分子の3’末端に作動可能に連結している。好ましくは、前記ポリAテールは、サルウイルス40ポリアデニル化(SV40ポリA)、合成ポリアデニル化、ウシ成長ホルモンポリアデニル化(BGHポリA)である。
前記DNA発現カセットに隣接する前記ITRは、上述のように、前記プロモーターに、及び上述のように、前記ポリAテールに、作動可能に連結されている。好ましくは、前記ITRは、アデノ随伴ウイルス(AAV)ITR配列からなる群から選択される。より好ましくは、前記ITR配列は、AAV1、AAV2、AAV5、AAV6、又はAAV8 ITR配列を含む。任意選択で、前記2つのITR配列は、両方のAAV1、両方のAAV2、両方のAAV5、両方のAAV6、又は両方のAAV8 ITR配列を含む。また任意選択で、前記DNA発現カセットの5’末端の前記ITR配列は、前記DNA発現カセットの3’末端の前記ITR配列とは異なり、前記ITR配列は、AAV1、AAV2、AAV5、AAV6、又はAAV8 ITR配列から選択されるものである。本発明によれば、上述のように、前記RNA分子をコードする前記核酸配列を含む前記DNA発現カセットを含むウイルスビヒクルが提供される。
上述のように、前記核酸は、前記ウイルスビヒクルに含まれる前記DNA発現カセットに含めることができ、それにより、肝臓などの標的臓器に送達することができる。前記ウイルスビヒクルの使用により、反復投与が最小限に抑えられるため、ヒト対象に治療部分を注射する頻度が最小限に抑えられる。それによって、免疫応答を低減させる及び/又は阻害することができ、及び/又は前記ヒト対象の生活の質がさらに改善される。
任意選択で、上述のように、前記ウイルスビヒクルは、アルファウイルス、フラビウイルス、単純ヘルペスウイルス(HSV)、麻疹ウイルス、ラブドウイルス、レトロウイルス、ニューカッスル病ウイルス(NDV)、ポックスウイルス、ピコルナウイルス、レンチウイルス、アデノウイルスベクター、又はアデノ随伴ウイルス(AAV)を含む。
好ましくは、上述のように、RNA分子をコードするための核酸は、上述のように、前記AAV遺伝子治療ビヒクルに含まれる前記DNA発現カセットに含まれる。
AAVが、上述のように、前記核酸又は前記DNA発現カセットを哺乳類に送達するための有用な遺伝子治療ビヒクルであることが分かった。AAVは、分裂ヒト細胞だけでなく、非分裂ヒト細胞にも効率的に感染する能力を有する。さらに、AAVは、いずれの疾患にも関連しない。
さらに好ましくは、上述のように、DNA発現カセットは、上述のように、前記AAV遺伝子治療ビヒクルに含まれる。
前記核酸又は前記DNA発現カセットは、上述のように、前記AAV遺伝子治療ビヒクルに含めて、続いて標的臓器に送達することができる。前記AAV遺伝子治療ビヒクルを使用することにより、前記核酸又は前記DNA発現カセットを、免疫応答のリスクが最小限で、及び/又は治療過程中の反復注射なしで、ヒト対象に導入することができる。
好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドは、上述のように、AAV5キャプシドタンパク質配列を含む。さらに好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドは、上述のように、AAV2キャプシドタンパク質配列を含む。さらに好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドは、上述のように、AAV8キャプシドタンパク質配列を含む。
前記キャプシドタンパク質配列を含むAAV遺伝子治療ビヒクルは、上述のように、本発明で使用されるのに好適である。詳細には、抗AAV5中和抗体(Nab)の有病率が他の血清型よりも低いため、AAV5キャプシドタンパク質配列を含む前記AAV遺伝子治療ビヒクルが本発明のために有用である。加えて、AAV5に対する既存の抗体(Ab)又は低既存の抗体は、標的臓器における前記AAV遺伝子治療ビヒクルの形質導入、及び/又は前記核酸の発現に影響を及ぼさない。さらに、AAV5に対する細胞傷害性T細胞応答は、臨床試験において見出されていない。任意選択で、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドは、上述のように、AAV5/AAV2ハイブリッドキャプシドタンパク質配列を含む。任意選択で、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドは、上述のように、AAV5/AAV8ハイブリッドキャプシドタンパク質配列を含む。
前記ハイブリッドキャプシドタンパク質配列を含む前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、記載されるように、前記AAV遺伝子治療ビヒクルの標的臓器への形質導入有効性を向上させ、並びに/又は前記標的臓器への標的化及び/若しくは結合を改善するために有用であり得る。
本発明によれば、上述のように、前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む組成物が提供される。
前記組成物において、上述のように、前記組成物中に含まれる前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、上述のように、前記DNA発現カセットを含む。前記DNA発現カセットは、上述のように、前記ITR配列に隣接しており、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、AAV5キャプシドタンパク質又はAAV5/AAV2ハイブリッドキャプシドタンパク質を含む。さらに、前記DNA発現カセットは、第1のRNA配列をコードする配列を含む。好ましくは、第1のRNA配列に含まれる配列は、配列番号11、12、16、17、20及び25からなる群から選択される配列である。さらに好ましくは、第1のRNA配列に含まれる配列は、配列番号11、12、17、20及び25からなる群から選択される配列である。最も好ましくは、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、配列番号12を含む。さらに最も好ましくは、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、上述のように、配列番号12からなる。
前記ビヒクルは、前記RNA分子又は前記DNA発現カセットをコードする前記核酸配列を標的臓器に送達させ、それによって、前記RNA分子又は前記DNA発現カセットを前記標的臓器内で安定して発現させるのに有用である。
前記ビヒクルは、本明細書に記載されるように、前記DNA発現カセットを標的臓器に移行するために使用され、それによって、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写物を阻害及び/又はノックダウンする上述の前記RNA分子の発現を達成し得る。
そのようなDNA発現カセットを含むAAV遺伝子治療ビヒクルの好適な作製方法は、上述のように、その全体が本明細書に組み込まれる国際公開第2007/046703号、国際公開第2007/148971号、国際公開第2009/014445号、国際公開第2009/104964号、国際公開第2011/122950号、及び国際公開第2013/036118号に記載されている。
前記組成物は、上述のように、in vivoにおいて、ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンすることができ、それにより、上述のように、血漿コレステロールレベル、アテローム性動脈硬化病変、血漿中のリン脂質、LDL-C、TC及び/又はTGのレベルを低減させる及び/又は阻害することができることが見出された。したがって、前記組成物は、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害、例えば高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、混合高リポタンパク血症、脂質異常症、及び/又は非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)などの治療及び/又は予防にも使用することができる。
前記アテローム性動脈硬化病変は、初期病変、軽度病変、及び/又は重度病変を含む。
アテローム性動脈硬化病変は、米国心臓協会に従ってI~V型に分類される(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)。前記初期病変はI~II型を含む。前記軽度病変はIII型を含む。前記重度病変はIV~V型を含む。
好ましくは、少なくとも1つの分子をさらに含む前記組成物は、血漿中のコレステロールレベル、重度のアテローム性動脈硬化病変、及び/又はLDL-Cレベルをさらに低減させる及び/又は阻害する。
前記少なくとも1つの分子を前記組成物に加えることにより、上述のように、in vivoにおいて、重度のアテローム性動脈硬化病変、血漿中のコレステロールレベル、及び/又はLDL-Cレベルをさらに低下させることができることが見出された。
さらに、前記少なくとも1つの分子を前記組成物に加えることは、上述のように、血漿中のALT及びAST活性レベルの永続的な上昇をもたらさない。これにより、肝障害は生じない。したがって、前記組成物を、上述のように哺乳類に投与することは安全である。
好ましくは、上述のように、前記少なくとも1つの分子は、スタチンのうちの少なくとも1つを含む。
好ましくは、前記少なくとも1つのスタチンは、上述のように、アトルバスタチン、セリバスタチン、フルバスタチン、ロバスタチン、メバスタチン、ピタバスタチン、プラバスタチン、ロスバスタチン及びシンバスタチンからなる群から選択される。
前記スタチンは、上述のように、血漿コレステロールレベル、重度のアテローム性動脈硬化病変、及び/又はLDL-Cレベルをさらに低減させる及び/又は阻害するために、前記組成物と共に使用することができる。
より好ましくは、前記組成物において、上述のように、前記少なくとも1つの分子は、アトルバスタチン及び/又はシンバスタチンを含む。
記載されるように、前記組成物の使用と比較して、アトルバスタチン及び/又はシンバスタチンと前記組成物との併用は、in vivoにおいて、哺乳類における血漿中のコレステロールレベル、重度のアテローム性動脈硬化病変、及び/又はLDL-Cレベルを低減させる及び/又は阻害することに有用であることが見出された。
任意選択で、前記組成物は、上述のように、水性液体、有機溶媒、緩衝液、及び賦形剤からなる群から選択される少なくとも1つの添加剤をさらに含む。任意選択で、水性液体は水である。また任意選択で、前記緩衝液は、酢酸塩、クエン酸塩、リン酸塩、トリス、ヒスチジン、及び4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンエタンスルホン酸(HEPES)からなる群から選択される。さらに任意選択で、有機溶媒は、エタノール、メタノール、及びジクロロメタンからなる群から選択される。さらに、賦形剤は、塩、糖、コレステロール又は脂肪酸である。さらに任意選択で、前記塩は、上述のように、塩化ナトリウム、塩化カリウムからなる群から選択される。さらに、任意選択で、前記糖は、上述のように、スクロース、マンニトール、トレハロース、及び/又はデキストランである。
本発明によれば、前記AAV遺伝子治療ビヒクル又は上記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む前記組成物の医薬としての使用が提供される。
上述のように、本発明によって、前記AAV遺伝子治療ビヒクル又は前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む前記組成物の治療効果が実証される。したがって、前記AAV遺伝子治療ビヒクル及び前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む組成物は、上述のように、医薬として使用することができる。
好ましくは、前記医薬は、ANGPTL3遺伝子によってコードされている転写物を減少させる及び/又はノックダウンする。
前記AAV遺伝子治療ビヒクル又は前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む前記組成物は、上述のように、in vivoにおいて、ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンする機能を有することが見出された。ANGPTL3遺伝子の前記転写物は、ANGPTL3遺伝子によってコードされているmRNAを含む。それによって、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは医薬として使用することができる。
好ましくは、前記医薬は、血漿中のコレステロールレベル、リン脂質レベル、初期、軽度及び/若しくは重度のアテローム性動脈硬化病変、TCレベル、TGレベル、並びに/又はLDL-Cレベルを阻害する及び/又は低下させるために使用することができる。
前記AAV遺伝子療法ビヒクルの投与によって得られる治療効果は、血漿中のコレステロールレベルの低下、リン脂質レベルの低下、初期、軽度、及び/若しくは重度のアテローム性動脈硬化病変の減少、並びに/又はTC、TG、及び/若しくはLDL-Cレベルの低下を実証するin vivo試験において示された。
前記アテローム性動脈硬化病変は、初期病変、軽度病変、及び/又は重度病変を含む。
アテローム性動脈硬化病変は、米国心臓協会に従ってI~V型に分類される(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)。前記初期の病変はI~II型を含む。前記軽度病変はIII型を含む。前記重度病変はIV~V型を含む。
より好ましくは、前記医薬は、上述のように、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害の治療及び/又は予防のために使用される。
さらにより好ましくは、前記医薬は、上述のように、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、混合高リポタンパク血症、脂質異常症、及び/又は非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)の治療及び/又は予防のために使用される。
前記AAV遺伝子治療ビヒクルを投与することにより、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写物が減少し、及び/又はノックダウンされ、それによって、血漿中のコレステロールレベルが低下し、リン脂質のレベルが低下し、並びに/又は初期、軽度及び/若しくは重度のアテローム性動脈硬化病変が減少し、並びに/又は総コレステロール(TC)レベル、トリグリセリド(TG)レベル、及び/若しくは低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)が低下することが見出された。したがって、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、脂質異常症などの脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害の予防及び/又は治療に有用である。
アテローム性動脈硬化病変は、米国心臓協会に従ってI~V型に分類される(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)。前記初期の病変はI~II型を含む。前記軽度病変はIII型を含む。前記重度病変はIV~V型を含む。
最も好ましくは、前記医薬は、上述のように、脂質異常症の治療及び/又は予防のために使用される。
前記AAV遺伝子治療ビヒクルの投与が、in vivoにおいて、ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンすることが実証されたように、AAV遺伝子治療ビヒクルは、上述のように、ANGPTL3遺伝子が関与する疾患の治療及び/又は予防に有用である。さらに、in vivo実験にも示されるように、血漿中のコレステロールレベル、リン脂質レベル、アテローム性動脈硬化病変、TC、TG、及び/又はLDL-Cレベルが低減する及び/又は阻害される。したがって、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、脂質異常症の治療及び/又は予防において医薬として使用され得る。
好ましくは、前記医薬は、上述のように、血漿コレステロールレベル、レベル、LDL-Cレベル、及び/又は重度のアテローム性動脈硬化病変を低減させる及び/又は阻害する、少なくとも1つの分子をさらに含む。
前記AAV遺伝子治療ビヒクル又は前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む前記組成物の投与に加えて、上述のように、前記少なくとも1つの化合物を加えることは、in vivoにおいて、血漿中のコレステロールレベル、重度のアテローム性動脈硬化病変、及び/又はLDL-Cレベルのさらなる低減及び/又は阻害等の少なくとも1つの治療効果をさらに増強することができることが見出された。
さらに、血漿中のAST及びALT活性レベルの永続的な上昇が生じず、それによって、前記AAV遺伝子治療ビヒクル及び前記分子の併用によって肝障害が引き起こされないことがin vivoで実証された。したがって、前記併用は、肝臓にとって安全である。
より好ましくは、前記少なくとも1つの分子は、スタチンのうちの少なくとも1つを含む。さらにより好ましくは、前記少なくとも1つの分子は、アトルバスタチン、セリバスタチン、フルバスタチン、ロバスタチン、メバスタチン、ピタバスタチン、プラバスタチン、ロスバスタチン、及びシンバスタチンからなる群から選択される。最も好ましくは、前記少なくとも1つの分子は、アトルバスタチン及び/又はシンバスタチンを含む。
前記少なくとも1つのスタチンを、上述のように、前記AAV遺伝子治療ビヒクル又は前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む前記組成物にさらに加えることにより、血漿中のコレステロールレベル、重度のアテローム性動脈硬化病変、及び/又はLDL-Cレベルがさらに低減することが見出された。また、in vivo試験から、前記AAV遺伝子治療ビヒクル又は前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む前記組成物を、前記スタチンのうちの少なくとも1つと併用すると、上述のように、AST及びALTの活性レベルの永続的な上昇をもたらさないことが実証された。これにより、肝障害は生じなかった。したがって、上述のような前記AAV遺伝子治療ビヒクルと、上述のような前記少なくとも1つのスタチンとを組み合わせて哺乳類に投与することは、安全である。これにより、前記併用は、哺乳類にとって安全である。
本発明によれば、上述のように、前記RNA分子をコードするための前記核酸を含むキットが提供される。
本発明によれば、上述のように、前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含むキットが提供される。好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む前記キットは、上述のように、血漿中のコレステロールレベル、LDL-Cレベル、及び/又は重度のアテローム性動脈硬化病変を低減及び/又は阻害する化合物をさらに含む。
本発明によれば、上述のように、前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含む前記組成物を含むキットが提供される。
本発明によれば、上述のように、前記キットを製造する方法が提供される。
示される選択された保存標的RNA配列(配列番号3~7)を有するアンジオポエチン様3(ANGPTL3)cDNA配列の概略図。列挙される配列は、NCBI参照配列:NM_014495.4、そのヌクレオチド(nt)1~1278の一部であり、ANGPTL3転写物(の一部)のDNA配列(cDNA)を表す。したがって、対応するRNAは、図1-1~1-4に示されるように、Tの代わりにUを有することを除いて、同一の配列を有する。ヌクレオチド1~542はエクソン1を表し、nt543~653はエクソン2を表し、nt654~768はエクソン3を表し、nt769~882はエクソン4を表し、nt883~978はエクソン5を表し、nt979~1245はエクソン6を表す。選択された標的RNA配列、つまり、それに対応するDNA配列もまた、図1-1~1-4に示される。配列番号3は、エクソン1のnt139~166に対応し、配列番号4は、エクソン1のnt267~292に対応し、配列番号5は、エクソン3のnt706~728に対応し、配列番号6は、エクソン5のnt885~907に対応し、配列番号7は、エクソン6のnt1134~1160に対応する。 図1-1の続きである。 図1-2の続きである。 図1-3の続きである。 miRBaseデータベース(www.mirbase.org)からのホモ・サピエンス(Homo sapiens)pri-miR-451。(A)22ntのガイド鎖(下線付き)を、成熟miANG又はmiANG-SCRに置き換えた。(B)アポリポタンパク質E遺伝子座制御領域、ヒトα1-アンチトリプシン(HCR-hAAT)、ヘアピンの5’及び3’に90ntの隣接部(flank)を有する、pri-miANGからなるプロモーター、及びシミアンウイルス40ポリアデニル化(SV40ポリA)シグナルによる終結で構成された、発現カセットの概略図。(C)ウミシイタケルシフェラーゼカセット(RL)の下流にANGPTL3標的配列を含有し、miANG構築物のin vitroスクリーニングに使用される、2つのLucレポーターの概略図。 Lucレポーターで試験された17個のmiANG構築物のノックダウン有効性。ヒト肝細胞癌細胞(Huh-7)に、50ng若しくは250ngのmiANG構築物及び50ngのLucANG-A若しくはLucANG-Bのレポーターをコトランスフェクトした。ウミシイタケルシフェラーゼ(RL)及びホタルルシフェラーゼ(FL)を、トランスフェクション2日後に測定し、RLをFL発現に対して正規化した。スクランブル(miANG-SCR1)は、陰性対照として機能し、100%に設定した。データは、miANG15、miANG17及びmiANG18についての3回の独立した実験又は2回の独立した実験を代表するものである。 滴定実験における6つのmiANG構築物のノックダウン効力。ヒト肝細胞癌細胞(Huh-7)に10ngのLucANG-A若しくはLucANG-Bレポーター、及び1、10、50、若しくは250ngのmiANG構築物をコトランスフェクトした。ウミシイタケルシフェラーゼ(RL)及びホタルルシフェラーゼ(FL)を、トランスフェクション2日後に測定し、RLをFL発現に対して正規化した。スクランブル(miANG-SCR1)は、陰性対照として機能し、100%に設定した。データは、3つの独立した実験を代表するものである。 プラスミドのトランスフェクションの際のin vitroでのANGPTL3 mRNAのノックダウン。Huh-7に、(A)250ng又は(B)400ngのmiANG5、miANG10及びmiANG13の構築物をトランスフェクトした。トランスフェクション2日後の細胞単層を、全RNA抽出のために収集し、ANGPTL3のmRNAレベルを、TaqMan RT-QPCRによって測定した。相対的ANGPTL3 mRNAレベルを、データをヒトβ-アクチンmRNAレベルで正規化することによって取得した。miANG-SCR1試料中のANGPTL3 mRNAレベルを100%に設定した。 miANG5 pre-miRNAへのリードのマッピングの配列分布(%)。Huh-7に、(A)250ng又は(B)400ngのmiANG5構築物をトランスフェクトした。トランスフェクション2日後の細胞単層を、全RNA抽出のために収集した。低分子RNA次世代シーケンシングからの結果は、上位50位の最も豊富なmiRNAを示しており、miANG5の発現レベルが強調して示されている。 miANG10 pre-miRNAへのリードのマッピングの配列分布(%)。Huh-7に、(A)250ng又は(B)400ngのmiANG10構築物をトランスフェクトした。トランスフェクション2日後の細胞単層を、全RNA抽出のために収集した。低分子RNA次世代シーケンシングからの結果は、上位50位の最も豊富なmiRNAを示しており、miANG10の発現レベルが強調して示されている。 miANG13 pre-miRNAへのリードのマッピングの配列分布(%)。Huh-7に、(A)250ng又は(B)400ngのmiANG13構築物をトランスフェクトした。トランスフェクション2日後の細胞単層を、全RNA抽出のために収集した。低分子RNA次世代シーケンシングからの結果は、上位50位の最も豊富なmiRNAを示しており、miANG13の発現レベルが強調して示されている。 NGSによって決定された発現miANG5 miRNAの長さの分布。Huh-7に、(A)250ng又は(B)400ngのmiANG5構築物をトランスフェクトした。トランスフェクション2日後の細胞単層を、全RNA抽出のために収集した。RNAをDNAseで処理し、低分子RNA NGSのために外部委託した。2%未満を示したリードは図から外した。 NGSによって決定された発現miANG10 miRNAの長さの分布。Huh-7に、(A)250ng又は(B)400ngのmiANG10構築物をトランスフェクトした。トランスフェクション2日後の細胞単層を、全RNA抽出のために収集した。RNAをDNAseで処理し、低分子RNA NGSのために外部委託した。2%未満を示したリードは図から外した。 NGSによって決定された発現miANG13 miRNAの長さの分布。Huh-7に、(A)250ng又は(B)400ngのmiANG13構築物をトランスフェクトした。トランスフェクション2日後の細胞単層を、全RNA抽出のために収集した。RNAをDNAseで処理し、低分子RNA NGSのために外部委託した。2%未満を示したリードは図から外した。 ビヒクル又はAAV5を注射した野生型マウスの肝臓における、ゲノムDNAのgc/μgとして表した、ベクターDNAレベル。 ビヒクル又はAAV5を注射した野生型マウスの肝臓におけるマウスAngptl3 mRNAレベル。データは、100%に設定したビヒクル群に対する相対値として示す。 ビヒクル又はAAV5を注射した野生型マウスの肝臓における(A)24ntアッセイ又は(B)23ntアッセイのバリアントTで測定したmiANG5発現レベル。データは、分子/細胞として表す。LLOQ:定量の下限。 ANGPTL3タンパク質レベル(ng/ml)を、ビヒクル又はAAV5-miANG5又はmiANG-SCR1を注射した野生型マウスの血漿中で測定した。統計分析:Dunnett事後検定を伴ったANOVA。:p≦0.05、**:p≦0.01、***:p≦0.001。 ビヒクル又はAAV5-miANG5又はmiANG-SCR1を注射した野生型マウスの血漿中で測定したアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)活性レベル(mU/ml)。統計分析:Dunnett事後検定を伴ったANOVA。:p≦0.05。 ビヒクル、AAV5-miANG5又はmiANG-SCR1を注射した野生型マウスの血漿中で測定したアラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)活性レベル(mU/ml)。統計分析:Dunnett事後検定を伴ったANOVA又はDunn事後検定を伴ったKruskal-Wallis。:p≦0.05。 ビヒクル、AAV5-miANG5又はmiANG-SCR1を注射した野生型マウスにおける(A)コレステロール及び(B)トリグリセリドの血漿レベル。統計分析:Dunnett事後検定を伴ったANOVA。**:p≦0.01。 ビヒクル又はAAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの肝臓における、ゲノムDNAのgc/μgとして表した、ベクターDNAレベル。 ビヒクル又はAAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの肝臓におけるマウスAngptl3 mRNAレベル。データは、100%に設定したビヒクル群に対する相対値として示す。 ビヒクルAAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの肝臓において、(A)24ntアッセイ又は(B)23ntアッセイのバリアントT発現レベルで測定したmiANG5。データは、分子/細胞として表す。LLOQ:定量の下限。 ビヒクル又はAAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの、記録された(A)体重及び(B)食物摂取。 AAV5-miANG5、AAV5-miANG13又はmiANG-SCR1を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中の、測定された(A)総コレステロール及び(B)トリグリセリド。統計分析:Bonferroni事後検定を伴ったANOVA。:p≦0.05、**:p≦0.01、***:p≦0.001対ビヒクル群;#:p≦0.05、##:p≦0.01、###:p≦0.001対miANG-SCR1群。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中のAAV注射前のリポタンパク質プロファイル(コレステロール及びリン脂質)。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中のAAV注射後4週目のリポタンパク質プロファイル(コレステロール及びリン脂質)。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中のAAV注射後8週目のリポタンパク質プロファイル(コレステロール及びリン脂質)。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中のAAV注射後12週目のリポタンパク質プロファイル(コレステロール及びリン脂質)。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中のAAV注射後16週目のリポタンパク質プロファイル(コレステロール及びリン脂質)。 ビヒクル又はAAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中の(A)ALT及び(B)ASTの活性レベル。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中のマウスANGPTL3タンパク質レベル。統計分析:Dunn事後検定を伴ったKruskal-Wallis。:p≦0.05;**:p≦0.01;***:p≦0.001。 アトルバスタチンの存在下又は非存在下でのAAV-miANG5を試験するためのAPOE*3-Leiden.CETPマウスのマウス研究の概略図。 AAV5-miANG5及びシンバスタチンを試験するための食事誘発性脂質異常症NHPの概略図。 AAV5-miANG5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスにおけるNGSにより決定した発現miANG5 miRNAの長さの分布(n=5、AAV用量:5E+13gc/kg)。マウス11。全RNAを肝臓試料から単離し、DNAseで処理し、低分子RNA NGSのために外部委託した。2%未満を示したリードは図から外した。 AAV5-miANG5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスにおけるNGSにより決定した発現miANG5 miRNAの長さの分布(n=5、AAV用量:5E+13gc/kg)。マウス12。全RNAを肝臓試料から単離し、DNAseで処理し、低分子RNA NGSのために外部委託した。2%未満を示したリードは図から外した。 AAV5-miANG5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスにおけるNGSにより決定した発現miANG5 miRNAの長さの分布(n=5、AAV用量:5E+13gc/kg)。マウス13。全RNAを肝臓試料から単離し、DNAseで処理し、低分子RNA NGSのために外部委託した。2%未満を示したリードは図から外した。 AAV5-miANG5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスにおけるNGSにより決定した発現miANG5 miRNAの長さの分布(n=5、AAV用量:5E+13gc/kg)。マウス14。全RNAを肝臓試料から単離し、DNAseで処理し、低分子RNA NGSのために外部委託した。2%未満を示したリードは図から外した。 AAV5-miANG5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスにおけるNGSにより決定した発現miANG5 miRNAの長さの分布(n=5、AAV用量:5E+13gc/kg)。マウス15。全RNAを肝臓試料から単離し、DNAseで処理し、低分子RNA NGSのために外部委託した。2%未満を示したリードは図から外した。 ビヒクル又はAAV5を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの肝臓における、ゲノムDNAのgc/μgとして表した、ベクターDNAレベル。LLOQ:定量の下限。 ビヒクル又はAAV5を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの肝臓におけるマウスAngptl3 mRNAレベル。データは、100%に設定したビヒクル群に対する相対値として示す。 ビヒクル AAV5を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの肝臓におけるmiANG5(23nt)発現レベル。データは、分子/細胞として表す。LLOQ:定量の下限。 ビヒクル又はAAV5を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの、記録された(A)体重及び(B)食物摂取。 ビヒクル、AAV5-miANG5又はmiANG-SCR1を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの、測定された(A)血漿総コレステロールレベル、及び計算された(B)コレステロール曝露。統計分析:Bonferroni事後検定を伴ったANOVA。:p≦0.05、**:p≦0.01、***:p≦0.001対ビヒクル群;#:p≦0.05、##:p≦0.01、###:p≦0.001対miANG-SCR1群;(A)&&:p≦0.01、&&&:p≦0.001対miANG-SCR1+アトルバスタチン群;(B)&&&:p≦0.001。 ビヒクル、AAV5-miANG5又はmiANG-SCR1を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの、測定された(A)血漿トリグリセリドレベル、及び計算された(B)トリグリセリド曝露。統計解析:Bonferroni事後検定を伴ったANOVA。**:p≦0.01、***:p≦0.001対ビヒクル群;##:p≦0.01、###:p≦0.001対miANG-SCR1群;(A)&&:p≦0.01、&&&:p≦0.001対miANG-SCR1+アトルバスタチン群;(B)&&&:p≦0.001。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中の、(A)AAV注射前、並びにAAV注射後(B)4週目、(C)8週目、及び(D)12週目の、プールされたコレステロールリポタンパク質プロファイルの測定値。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中の、(A)AAV注射前、並びにAAV注射後(B)4週目、(C)8週目、及び(D)12週目の、プールされたリン脂質リポタンパク質プロファイルの測定値。 AAV5を注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中の、AAV注射後16週目の(A)コレステロール、(B)リン脂質、及び(C)トリグリセリドリポタンパク質プロファイルの個々の測定値。 ビヒクル又はAAV5を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中で測定したANGPTL3タンパク質レベル(ng/ml)。統計解析:Bonferroni事後検定を伴ったANOVA又はDunn事後検定を伴ったKruskal-Wallis。:p≦0.05;**:p≦0.01;***:p≦0.001。 ビヒクル又はAAV5を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿中の(A)ALT及び(B)ASTの活性レベル。 ビヒクル又はAAV5を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスの大動脈根における、測定されたアテローム性動脈硬化の全病変面積。統計解析:Kruskal-Wallis検定、続いて個別のMann-Whitney検定。**:p≦0.01、***:p≦0.001対ビヒクル群;###:p≦0.001対miANG-SCR1群;^^^:p≦0.001;&&&:p≦0.001。 ビヒクル又はAAV5を(単独で又はアトルバスタチンとの併用で)注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスにおける、断面あたりの決定されたアテローム性動脈硬化(A)病変の重症度(B)病変の数。統計解析:Kruskal-Wallis検定、続いて個別のMann-Whitney検定。:p≦0.05、**:p≦0.01、***:p≦0.001対ビヒクル群;#:p≦0.05、##:p≦0.01、###:p≦0.001対miANG-SCR1群;&:p≦0.05、&&:p≦0.01;^:p≦0.05、^^:p≦0.01。 AAV5-miANG5及びビヒクルを投与した脂質異常性NHPの血漿脂質レベル(トリグリセリド及びLDL-コレステロール)。C1~C3:ビヒクル投与動物。T1~T5:AAV5-miANG5投与動物。投与前の-40日目から-27日目まで、及び投与後の57日目から84日目までの間に、動物にシンバスタチンを共投与した。 AAV5-miANG5及びビヒクルを投与した脂質異常性NHPの血漿脂質レベル(HDL-コレステロール及び総コレステロール)。C1~C3:ビヒクル投与動物。T1~T5:AAV5-miANG5投与動物。投与前の-40日目から-27日目まで、及び投与後の57日目から84日目までの間に、動物にシンバスタチンを共投与した。 対照群及びAAV5-miANG5投与群について、投与前のレベル(ベースライン)と比較して、投与後90日の平均パーセンテージ変化を算出した。この算出のため、投与前及び投与後90日の期間にわたって曲線下面積を計算した。 ビヒクル又はAAV5-miANG5を投与したNHPにおける血漿ALT及びASTレベル。C1~C3:ビヒクル投与動物。T1~T5:AAV5-miANG5投与動物。
本発明は、遺伝子治療に関するものであり、特に、アンジオポエチン様3(ANGPTL3)遺伝子、好ましくはヒトANGPTL3遺伝(OMIM:604774、https://www.omim.org/)によってコードされているRNAを標的化するための遺伝子治療におけるRNA干渉(RNAi)の使用に関する。
本発明の目的の一つは、第1のRNA配列及び第2のRNA配列を含むRNA分子であって、前記第1のRNA配列が、ANGPTL3遺伝子によってコードされているRNAに含まれる標的RNA配列に実質的に相補的な配列を含み、前記標的RNA配列に相補的な前記配列が少なくとも19ヌクレオチドを有する、RNA分子を提供することである。
本明細書で使用される場合、「実質的に相補的」という用語は、2つの核酸配列が互いに相補的かつ逆平行であり、それによって、2つの核酸配列が互いに結合することを指す。「実質的に」という用語は、2つの配列間の相補性が、少なくとも部分的な阻害効果を有するのに十分な時間にわたって互いに結合するのに十分であることを意味する。相補性が完全であることが当然ながら好ましいが、いくつかのギャップ及び/又はミスマッチは許容され得る。ミスマッチの数は10%以下であるべきである。重要な特徴は、相補性が、2本鎖のin situでの結合を可能にするために十分であることである。結合は、阻害効果を発揮するために十分に強いものでなければならない。
完全又は部分的な第1のRNA配列は、上述のように、ガイド鎖内にある。ガイド鎖は、センス標的RNA配列に対して相補的(「アンチ」)であるため、アンチセンス鎖とも呼ばれる。センス標的RNA配列は、ANGPTL3遺伝子によってコードされているRNAに含まれる。
前記第2のRNA配列は、本明細書で記載される場合、前記標的RNA配列と、本明細書で記載されるような実質的に同一の配列同一性を有する「センス鎖」を指す。第1及び第2のRNA配列は、二本鎖RNAに含まれ、実質的に相補的である。本発明による前記二本鎖RNAは、RNAiを誘導し、それによってANGPTL3転写物の発現を低減することである。
前記RNA分子において、上述のように、第1のRNA配列に含まれる配列は、任意選択で、ANGPTL3遺伝子、好ましくはヒトANGPTL3遺伝子によってコードされているRNAに含まれる前記標的配列の相補配列とは異なる、最大4個のヌクレオチド、5個のヌクレオチド、又は6個のヌクレオチドを有する。任意選択で、第1のRNA配列に含まれる配列は、任意選択で、ANGPTL3遺伝子、好ましくはヒトANGPTL3遺伝子によってコードされているRNAに含まれる前記標的配列の相補配列とは異なる、少なくとも1個のヌクレオチド、2個のヌクレオチド、又は3個のヌクレオチドを有する。任意選択で、前記第1のRNA配列に含まれる前記配列は、前記ANGPTL3遺伝子、好ましくは前記ヒトANGPTL3遺伝子によってコードされているRNAに含まれる前記標的配列の相補配列と同一である。
これにより、前記RNA分子は、上述のように、RNAiを誘導することができる。また、これにより、前記RNA分子は、標的RNA配列を含む配列に配列特異的に結合する。したがって、前記第1のRNA配列に含まれる前記配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子によってコードされている前記標的RNA配列に配列特異的結合を有する。
好ましくは、前記ANGPTL3遺伝子は、本明細書に記載されるように、哺乳類ANGPTL3遺伝子である。より好ましくは、前記ANGPTL3遺伝子は、マウスANGPTL3遺伝子、又は非ヒト霊長類(NHP)ANGPTL3遺伝子である。最も好ましくは、前記ANGPTL3遺伝子は、ヒトANGPTL3遺伝子(OMIM:604774)である。
好ましくは、前記標的RNA配列は、本明細書に記載されるように、図1-1~1-4に示されるDNA配列(配列番号2のヌクレオチド1~2926)によってコードされているRNA配列に含まれる。前記DNA配列は、ヒトANGPTL3遺伝子のスプライシングmRNAをコードする。
本発明によれば、配列番号1は、ANGPTL3遺伝子の参照遺伝子配列(つまり、NCBI参照配列:NG_028169.1)として使用される。それにより、配列番号1のエクソン1~7配列は、図1-1~1-4に示されるように、配列番号2のエクソン1~7に対応する。つまり、配列番号1のエクソン1は、配列番号2のヌクレオチド5005~5546に対応し、配列番号1のエクソン2は、配列番号2のヌクレオチド6181~6291に対応し、配列番号1のエクソン3は、配列番号2のヌクレオチド8567~8681に対応し、配列番号1のエクソン4は、配列番号2のヌクレオチド9254~9367に対応し、配列番号1のエクソン5は、配列番号2のヌクレオチド9770~9865に対応し、配列番号1のエクソン6は、配列番号2のヌクレオチド11454~11720に対応し、配列番号1のエクソン7は、配列番号2のヌクレオチド12118~13798に対応する。
本明細書で記載される場合、「少なくとも1つ」という用語は、本明細書に記載されるように、示された対象、例えばエクソンが、1つ、2つ、3つ、又はそれ以上の量であることを指す。
本明細書で記載される場合、「保存配列」又は「保存領域」という用語は、高いレベルの類似性で様々な種に見出すことができる、短い長さの配列を指す。保存配列は、同一のRNA又は同一のタンパク質をコードするための様々な種由来のいくつかの核酸配列を整列させることによって同定することができ、それによって配列の一部が実質的に同一であることが見出され得る。用語「保存(conserved)配列」は、「保存(conservative)配列」又は「保存領域」としても知られる。
本明細書で記載される場合、「エクソン」という用語は、タンパク質をコードする遺伝子の領域を指す。
ANGPTL3遺伝子によってコードされている前記標的配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子によってコードされている少なくとも1つの保存配列の全部又は一部を含むように設計される。ANGPTL3遺伝子の保存配列のいくつかを特定し、本発明のために選択する。
好ましくは、保存配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子のエクソン1、エクソン3、エクソン5又はエクソン6に含まれる。より好ましくは、前記標的配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子のエクソン1、エクソン5又はエクソン6における保存配列の全部又は一部を含む。さらにより好ましくは、前記標的配列は、上述のように、ANGPTL3遺伝子のエクソン1又はエクソン5における保存配列の全部又は一部を含む。
上述のように、本発明によるRNA分子は、ANGPTL3遺伝子の転写物をノックダウンする。さらに、RNA分子は、上述のように、RNAiに基づく遺伝子治療に典型的に存在する「オフターゲット」問題を改善する。本明細書で記載される場合、「オフターゲット」問題は、本明細書に記載されるように、RNA分子の前記第2のRNA配列が、意図されていない標的RNA配列に結合することを指す。したがって、RNA分子は、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写を効果的に抑制又は阻害することができる。
さらに、RNA分子を用いて、上述のように、医師及び/又は患者は、前記RNA分子、組成物、AAVビヒクル、又は前記RNA分子を含む製剤を、簡便かつ単純な方法でヒト体内に投与することができる。したがって、RNA分子は、上述のように、脂質異常症の治療及び/又は予防に対する前述のニーズを満たす。好ましくは、前記RNA分子において、上述のように、前記第1のRNA配列は、前記第2のRNA配列に対して実質的に相補的である。
前記RNA分子は、上述のように、好ましくはRNAヘアピン又は二本鎖RNA(dsRNA)を含む。より好ましくは、前記RNA分子は、miR-451を含む。
本明細書で記載される場合、「RNAヘアピン」という用語は、互いに相補的である2つの鎖を含み、さらに2つの鎖を接続するループを含む、RNAの二次構造を指す。RNAヘアピンは、RNAフォールディングを導き、リボザイム内の相互作用を決定し、メッセンジャーRNA(mRNA)を分解から保護し、RNA結合タンパク質の認識モチーフとして機能することができる。
本明細書で記載される場合、「dsRNA」という用語は、互いに相補的かつ逆平行である2つの核酸鎖を指す。2つの鎖は水素結合によって安定化されている。
本明細書で記載される場合、「shRNA」という用語は、標的mRNAを分解若しくは切断するためのRNAiにおいて使用され得るか、又は標的mRNAの翻訳を抑制し得る、ヘアピン構造を有する人工RNA分子を指す。
本明細書で記載される場合、「miR-451」という用語は、マイクロRNA451aから得られる特定の骨格を指す。miR-451のpri-miRNA骨格を図2のAに示す。この骨格は、特に、RNAiがこの骨格のガイド鎖によって誘導されるという点で、RNAiを誘導することを可能にする。pri-miR451骨格は、古典的miRNAプロセシング経路とはプロセシングが異なるため、パッセンジャー鎖をもたらさない(Cheloufi,S.ら、2010及びYang,J.S.ら、2010)。したがって、miR-451の使用は、パッセンジャー鎖による望ましくない潜在的なオフターゲティングが起こる可能性を防止又は低減することができる。
前記RNA分子において、上述のように、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、任意選択で少なくとも15個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも16個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも17個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも18個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも19個のヌクレオチド、任意選択で少なくとも22個のヌクレオチド、又は任意選択で少なくとも24個のヌクレオチドを有する。また、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、上述のように、任意選択で最大30個のヌクレオチド、任意選択で最大28個のヌクレオチド、又は任意選択で最大26個のヌクレオチドを有する。
好ましくは、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、上述のように、配列番号8~25からなる群から選択される配列である。より好ましくは、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、上述のように、配列番号8~17及び19~25からなる群から選択される配列である。さらにより好ましくは、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、配列番号11、12、16、17、20及び25からなる群から選択される配列である。なお好ましくは、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、配列番号11、12、17、20及び25からなる群から選択される配列である。最も好ましくは、第1のRNA配列に含まれる前記配列は、配列番号12を含む。さらに最も好ましくは、第1のRNA配列に含まれる配列は、上述のように、配列番号12からなる。
Figure 2023521347000001
前記RNA分子において、上述のように、前記第1のRNA配列は、本明細書に記載されるように、前記標的配列に実質的に相補的な配列を含む。
第1のRNA配列に含まれる前記配列は、上述のように、エクソンの1つに含まれる保存配列の1つに基づいて、上述のように、設計される。
そのような第1のRNA配列は、第2のRNA配列と組み合わされる。当業者は、上述のように、細胞内のRNAiを誘導する、前記第1のRNA配列と組み合わせるのに好適な第2のRNA配列を設計及び選択することができる。好適な第2のRNA配列は、下記の表2に列挙する。
Figure 2023521347000002
好ましくは、前記第1のRNA配列は、miRNA骨格、より好ましくはmiR-451骨格に含まれる。
前記第1及び第2のRNA配列を含む好ましい骨格は、上述のように、表3及び4に列挙される配列の群から選択される配列を含む。
任意選択で、表3に列挙される配列は、さらなる配列を含む。また、任意選択で、表3に列挙される配列は、pri-miRNA骨格、好ましくは表4のpri-miRNA骨格の配列に含まれる。
Figure 2023521347000003
Figure 2023521347000004

Figure 2023521347000005
前記RNA分子において、上述のように、前記標的配列は、前記ANGPTL3遺伝子によってコードされているRNAに含まれる。好ましくは、少なくとも1つのエクソンの一部によってコードされているRNAに含まれる前記標的配列は、前記ANGPTL3遺伝子に含まれる。さらに好ましくは、前記エクソンは、上述のように、ANGPTL3遺伝子に含まれるエクソン1、エクソン3、エクソン5、又はエクソン6である。より好ましくは、前記エクソンは、上述のように、ANGPTL3遺伝子に含まれるエクソン1、エクソン5、又はエクソン6である。さらにより好ましくは、RNAに含まれる前記標的配列は、前記ANGPTL3遺伝子によってコードされている。好ましくは、RNAに含まれる前記標的配列は、上述のように、前記ANGPTL3遺伝子に含まれる1つのエクソンに含まれる少なくとも1つの保存配列によってコードされている。好ましくは、保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:139~166位のヌクレオチド、以下、配列番号3と称する)は、ANGPTL3遺伝子のエクソン1に含まれ、保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:267~292位のヌクレオチド、以下、配列番号4と称する)は、ANGPTL3遺伝子のエクソン1に含まれ、保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:706~728位のヌクレオチド、以下、配列番号5と称する)は、ANGPTL3遺伝子のエクソン3に含まれ、保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:885~907位のヌクレオチド、以下、配列番号6と称する)は、エクソン5に含まれ、又は保存配列(NCBI参照配列:NM_014495.4:1134~1160位のヌクレオチド、以下、配列番号7と称する)は、エクソン6に含まれる。
Figure 2023521347000006
配列番号3~7は、ANGPTL3遺伝子(NCBI参照配列:NM_014495.4(配列番号2))のエクソンに含まれる。配列番号3:エクソン1の139~166、配列番号4:エクソン1の267~292、配列番号5:エクソン3の706~728、配列番号6:エクソン5の885~907、配列番号7:エクソン6の1134~1160。標的RNA配列の配列番号3、4、5、及び6は、ヒト、サル、マウス、及びラットなどのいくつかの動物において完全に又は本質的に保存されている。標的RNA配列の配列番号7を、(Graham,M.J.ら、2017)によって示されるように選択して、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)IONIS-ANGPTL3-LRXの標的RNA配列とした。
本発明の目的の一つは、上述のように、前記RNAを含む組成物、又は、上述のように、前記RNAをコードする核酸、又は前記RNAを含むAAV遺伝子治療ビヒクルを提供することである。
上記及び本明細書で使用される場合、「血漿コレステロールレベル」又は「血漿中のコレステロールレベル」という用語は、血漿中に存在するコレステロールの量を指す。
上記及び本明細書で使用される場合、「TC」という用語は、血漿及び血清中に存在するコレステロールの量を指す。
任意選択で、前記組成物は、添加剤をさらに含む。前記添加剤は、より長い保存期間、容易な保管、容易な輸送、及び/又は、より少ない分解など、前記組成物の安定性をさらに向上させるためのものである。
上記及び本明細書で記載される場合、「添加剤」という用語は、上記組成物の特性をさらに増強するために、又は上記組成物の有効性及び/若しくは特性を変更又は影響することなく充填剤として機能するために、前記組成物にさらに添加される物質を指す。
本発明の目的の一つは、上述のように、医薬としての前記組成物の使用である。好ましくは、上述のように、前記組成物は、ANGPTL3遺伝子の転写物をノックダウンするための医薬として用いられる。
上記及び本明細書で使用される場合、「転写物」という用語は、上述のように、遺伝子、例えばANGPTL3遺伝子などによってコードされている遺伝子産物を指す。前記遺伝子産物は、上述のように、ANGPTL3遺伝子からコードされているRNA、及びANGPTL3遺伝子からコードされているタンパク質を含む。
本明細書で使用される場合、「ノックダウン(knockdown)」、「ノックダウン(knock down)」、又は「ノックダウンする(knocking down)」という用語は、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写物のレベルを、低下させる、低減させる、抑制する、及び/又は減少させることを指す。また、本明細書で使用される場合、「ノックダウン(knockdown)」、「ノックダウン(knock down)」、又は「ノックダウンする(knocking down)」という用語は、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写物のレベルを阻害するか、又はサイレンシングすることを指す。
RNA分子は、上述のように、ANGPTL3遺伝子の転写物をノックダウンする。したがって、上述のように、組成物は、リン脂質、血漿コレステロールレベル、LDL-C、TC及び/若しくはTGのレベルを低下させ、及び/若しくは阻害し、並びに/又はヒト体内の初期、軽度及び/若しくは重度のアテローム性動脈硬化病変を低減させ、及び/若しくは阻害し、それにより、前記組成物は、上述のように、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害の治療及び/又は予防のために使用される。好ましくは、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害は、家族性高コレステロール血症、LDL-高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、混合高リポタンパク血症、及び非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)などの高脂血症を含む。好ましくは、組成物は、上述のように、脂質異常症の治療及び/又は予防のための医薬として使用される。
「アテローム性動脈硬化病変」という用語は、アテローム性動脈硬化の病変の重症度及び/又は病変の大きさを意味する。前記アテローム性動脈硬化病変は、米国心臓協会に従って5つのカテゴリーに分類される(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000):I型は早期脂肪線条であり、II型は定型脂肪線条であり、III型は軽度のプラークであり、IV型は中等度のプラークであり、V型は重度のプラークである。上記及び本明細書で使用されるアテローム性動脈硬化病変は、初期病変、軽度病変、及び/又は重度病変を含む。
「初期病変」という用語は、上記及び本明細書で記載される場合、早期及び定型脂肪線条を含むものとして称される。このことはまた、初期病変が、米国心臓協会(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)に従ったI~II型を含むことを意味する。
上記及び本明細書で記載される場合、「軽度病変」という用語は、軽度プラークを含むものとして称される。このことはまた、軽度病変が、米国心臓協会(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)に従ったIII型を含むことを意味する。
本明細書に記載される「重度病変」という用語は、中等度のプラーク及び重度のプラークを含むものとして称される。このことはまた、重度病変が、米国心臓協会(Stary,H.C.ら、1995;Stary,H.C.、2000)に従ったIV型及びV型を含むことを意味する。
本発明の目的の一つは、DNA発現カセットを提供することである。
本明細書で記載される場合、「DNA発現カセット」という用語は、RNA分子をコードする遺伝子又は核酸配列、プロモーター、及びポリAテールをコードする核酸配列を含むDNA核酸配列を指す。前記DNA発現カセットは、ITRに隣接しており、ウイルスビヒクルに含まれ、その後、肝臓等の標的臓器に送達される。
本明細書で使用される場合、「RNA分子」という用語は、ヘアピン、二本鎖RNA(dsRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、及びマイクロRNA(miRNA)を指す。前記ヘアピンは、好ましくは、ショートヘアピンRNA(shRNA)又はロングヘアピンRNA(lhRNA)である。より好ましくは、前記RNA分子は、miR-451、又は配列番号124によってコードされているRNA分子である。
本明細書で使用される場合、「プロモーター」という用語は、連結された核酸配列の転写を駆動又は開始するための、典型的には、転写開始部位の5’末端に位置するDNA配列を指す。好ましくは、前記プロモーターは、ANGPTL3が主に肝臓で発現されるので、肝臓特異的プロモーターを含む。
より好ましくは、前記プロモーターは、上述のように、pol Iプロモーター、pol IIプロモーター、pol IIIプロモーター、誘導性又は抑制性プロモーター、α1-抗トリプシンプロモーター、甲状腺ホルモン結合グロブリンプロモーター、アルブミンプロモーター、LPS(チロキシン結合グロビン)プロモーター、HCR-ApoCIIハイブリッドプロモーター、HCR-hAATハイブリッドプロモーター、及びアポリポタンパク質Eプロモーター、HLP、最小TTRプロモーター、FVIIIプロモーター、ハイペロンエンハンサー、ealb-hAAT、EF1-αプロモーター、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(TK)プロモーター、U1-1 snRNAプロモーター、アポリポタンパク質プロモーター、TREプロモーター、rtTA-TRE(誘導性プロモーター)、LP1プロモーター、Q1プロモーター、Q1-プライムプロモーター、C14プロモーター、C16プロモーター、又は配列番号84~87及び108~109及び112~115から選択される任意の合成プロモーター、並びにこれらのバリアントからなる群から選択される。
任意選択で、配列番号84~87及び108~109及び112~115の前記バリアントはそれぞれ、上述のように、配列番号84~87、108~109及び112~115と実質的に同一の配列を有し、前記バリアントは、配列番号84~87及び108~109及び112~115と実質的に同一の機能を有する。
任意選択で、配列番号84~87、108~109及び112~115の前記バリアントのそれぞれは、上述のように、配列番号84~87及び108~109、及び112~115の配列とは異なる、少なくとも1、2、3、4、又は5個のヌクレオチドを含む核酸配列を有する。
任意選択で、配列番号84~87及び108~109及び112~115の前記バリアントのそれぞれは、配列番号84~87及び108~109及び112~115の配列とは異なる最大で40、35、30、25、又は20個のヌクレオチドを含む核酸配列を有する。
本明細書で記載される場合、「ポリAテール」という用語は、RNA分子の安定性を増加させるためにmRNA分子に付加される、アデニンヌクレオチドの長鎖を指す。好ましくは、ポリAテールは、サルウイルス40ポリアデニル化(SV40ポリA;配列番号88)、ウシ成長ホルモン(BGH)ポリアデニル化、及び合成ポリアデニル化である。
本明細書で記載される場合、「RNA分子をコードする核酸配列」という用語は、ヘアピン、二本鎖RNA(dsRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、及びマイクロRNA(miRNA)などのRNA分子をコードする核酸配列を指す。好ましくは、前記核酸配列は、miR451骨格に基づくマイクロRNAをコードする。好ましくは、前記核酸配列は、配列番号124を含む。前記RNA分子は、ANGPTL3遺伝子の転写物を低減させる及び/又はノックダウンするのに使用することができる。
本明細書で記載される場合、「逆位末端配列(ITR)」という用語は、上述のように、DNA複製の起点及びウイルスのパッケージングシグナルとしてcisで機能する、前記DNA発現カセットの5’及び3’末端における配列を指す。前記ITRは、好ましくは、アデノ随伴ウイルス(AAV)ITR配列からなる群から選択される。より好ましくは、前記ITR配列は、両方がAAV1、両方がAAV2、両方がAAV5、両方がAAV6、又は両方がAAV5のITR配列である。また、より好ましくは、前記DNA発現カセットの5’末端の前記ITR配列は、前記DNA発現カセットの3’末端の前記ITR配列とは異なり、前記ITR配列は、AAV1、AAV2、AAV5、AAV6、及びAAV8のITR配列から選択される。
本発明の目的の一つは、上述のように、前記RNA分子をコードする前記DNA発現カセットを含むウイルスビヒクルを提供することである。
本明細書で記載される場合、「遺伝子治療ビヒクル」、「ウイルスビヒクル」又は「ウイルスのビヒクル」という用語は、目的の遺伝子、目的の核酸、目的の遺伝子を含むベクター、又は目的の核酸を含むベクター、又はRNA分子をコードする前記遺伝子若しくは核酸を含むDNA発現カセット等の遺伝子材料を、標的細胞、臓器又は組織内に運ぶためのビヒクルとして機能する野生型又は組換えウイルスを指す。好適なウイルスビヒクルは、アルファウイルス、フラビウイルス、単純ヘルペスウイルス(HSV)、シミアンウイルス40、麻疹ウイルス、ラブドウイルス、レトロウイルス、ニューカッスル病ウイルス(NDV)、ポックスウイルス、ピコルナウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、又はAAVであり得る。好ましくは、前記ウイルスビヒクルはAAV遺伝子治療ビヒクルであり、上述のように、前記DNA発現カセットを含む、前記AAV遺伝子治療ビヒクルである。より好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、前記DNA発現カセットを含み、前記DNA発現カセットは、上述のようなRNA分子をコードする核酸配列、上述のようなプロモーター、及び上述のようなポリAテールを含み、前記DNA発現カセットの末端のそれぞれが、上述のように、ITR配列に隣接している。
本明細書で記載される場合、「AAV遺伝子治療ビヒクル」という用語は、アデノ随伴ウイルス遺伝子治療ビヒクルである。AAVウイルスは、ウイルスキャプシドタンパク質(VP)配列及び抗原性に基づいて、いくつかのクレードに分類される。本明細書に記載の好適なAAV遺伝子治療ビヒクルは、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV2/5ハイブリッド、AAV7、又はAAV8キャプシドタンパク質配列を有するキャプシドタンパク質を含む。好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドタンパク質は、AAV2、AAV2/5ハイブリッド、AAV3又はAAV5キャプシドタンパク質配列を有する。より好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドタンパク質は、上述のように、AAV2/5ハイブリッド又はAAV5キャプシドタンパク質配列によってコードされている。
また、本明細書に記載されるように、好適なAAV遺伝子治療ビヒクルは、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、又はAAV8のキャプシドタンパク質配列を有するキャプシドタンパク質、又は例えば、キャプシドシャッフリング技術及びAAVキャプシドライブラリによって得られる新たに開発されたAAV様粒子を含む。
任意選択で、本発明において使用されるキャプシドタンパク質VP1、VP2、及び/又はVP3は、既知の42の血清型から選択される。
任意選択で、本明細書に記載される、前記AAV遺伝子治療ビヒクルの前記キャプシドタンパク質は、VP1、VP2、及び/又はVP3を含む。また、任意選択で、前記AAV遺伝子治療ビヒクルの前記キャプシドタンパク質は、本明細書に記載されるように、VP1及び/又はVP3を含む。
任意選択で、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、前記DNA発現カセットを含み、前記DNA発現カセットは、RNA分子をコードする配列番号124を含むか、又は前記DNA発現カセットは、miR-451をコードし、前記RNA分子は、ANGPTL3遺伝子の転写物を標的化、切断及び/又はノックダウンすることができ、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドタンパク質は、AAV2/5ハイブリッドキャプシドタンパク質配列によって、又はAAV5キャプシドタンパク質配列によってコードされている。
本発明の目的の一つは、上述のように、上記ウイルスビヒクルを医薬として使用することである。好ましくは、前記医薬は、本明細書に記載されるように、ANGPTL3遺伝子の転写物を減少させる及び/又はノックダウンするための医薬として使用される。好ましくは、前記ウイルスビヒクルは、上述のように、前記AAV遺伝子治療ビヒクルである。さらに好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、上述のように、ヒト対象等の哺乳類における血漿中のコレステロールレベル、LDL-Cレベル、TCレベル、TGレベル、リン脂質レベル、並びに/又は軽度、中等度、及び/若しくは重度のアテローム性動脈硬化病変を低減させる及び/又は阻害するための医薬として使用される。したがって、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、上述のように、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害の治療及び/又は予防のために使用される。好ましくは、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害は、家族性高コレステロール血症、LDL-高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、混合高リポタンパク血症、及び非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)などの高脂血症を含む。好ましくは、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、上述のように、脂質異常症の治療及び/又は予防のために使用される。
本明細書で使用される場合、「組成物」という用語は、上述の核酸又は上述のAAV遺伝子治療ビヒクルを含む、混合物、組合せ、及び/又は製剤を指す。好ましくは、血漿中のコレステロールレベル、LDL-Cレベル、及び/又は重度のアテローム性動脈硬化病変を低減させる及び/又は阻害することが可能な少なくとも1つの分子が、前記組成物にさらに含まれる。
任意選択で、前記組成物は、水性液体、有機溶媒、緩衝液、及び賦形剤からなる群から選択される少なくとも1つの添加剤をさらに含む。任意選択で、水性液体は水である。また、任意選択で、前記緩衝液は、酢酸塩、クエン酸塩、リン酸塩、トリス、ヒスチジン、及び4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンエタンスルホン酸(HEPES)からなる群から選択される。さらに任意選択で、有機溶媒は、エタノール、メタノール、及びジクロロメタンからなる群から選択される。さらに、賦形剤は、塩、糖、コレステロール又は脂肪酸である。さらに任意選択で、前記塩は、上述のように、塩化ナトリウム、塩化カリウムからなる群から選択される。さらに任意選択で、前記糖は、上述のように、スクロース、マンニトール、トレハロース、及び/又はデキストランである。
本発明の目的の一つは、上述のような前記核酸、上述のような前記RNA分子、上述のような前記RNA分子を含む前記組成物、上述のような前記核酸を含む前記組成物、又は上述のような前記AAV遺伝子治療ビヒクルを含むキットを提供することである。
上述のような疾患又は障害を治療及び/又は予防する目的のために、上述のように、前記組成物、及び任意選択で上述の賦形剤等の少なくとも1つの添加剤を、キットに都合よく組み合わせることができる。したがって、本明細書に記載される「キット」という用語は、上述の少なくとも前記核酸、上述の少なくとも前記RNA分子、上述の少なくとも前記AAV遺伝子治療ビヒクル、又は上述の前記組成物、並びに前記核酸、前記AAV遺伝子治療ビヒクル、前記RNA分子、又は前記組成物を保持するための手段、例えば容器若しくはボトルを保持するための手段を含む。
好適には、上記及び本明細書に記載されるように前記RNA分子を含む組成物、及び/又は上記及び本明細書に記載されるように前記核酸を含む前記組成物は、キットに含まれる容器に保持される。医師及び患者は、上述のように前記組成物及び/又は前記AAV遺伝子治療ビヒクルをヒト対象などの哺乳類に適用するための標識及び/又は指示を容易に理解することができる。
脂質異常症治療の主な適応は、アテローム性心血管疾患の予防である。脂質障害のある患者は、薬物療法が処方されているかどうかに関わらず、健康的なライフスタイル(心臓に優しい食事、定期的な運動、禁煙、健康的な体重の維持)をとる必要がある。スタチンは、脂質を低下させるために好ましい薬物である。PCSK9阻害剤であるエゼチミブなど、脂質を減少させる薬剤としてさらなる薬剤が出現している。しかしながら、これらの薬物だけでは、アテローム性動脈硬化症のリスクは低下しない。一次予防のためには推奨されない薬理学的介入には、フィブラート、胆汁酸結合樹脂、オメガ3脂肪酸サプリメント、植物ステロール又はスタノール、及びナイアシンが含まれる(Kopin,L.及びLowenstein,C.、2017)。食事や脂質低下薬に反応しない非常に高いレベルのLDL-Cを有する人のためには、コレステロールレベルを低下させる医学的処置(リポタンパク質アフェレーシスなど)が用意される。そのような人には、家族性高コレステロール血症を有する人が含まれる(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK425700/)。大きく上昇したレムナントリポタンパク質、トリグリセリドリッチリポタンパク質及び/又はLp(a)のレベルを低下させることができる有効な薬剤は、現在、ほとんどない。これらのリポタンパク質は、リポタンパク質の産生又は除去において重要な役割を果たすタンパク質を標的とすることによって、ASO阻害及び低分子干渉RNA(siRNA)技術などの新規の遺伝子サイレンシング手法を使用して低減することができる(Nordestgaard,B.G.ら、2018)。アンジオポエチン様3(ANGPTL3)タンパク質は、TG及びトリグリセリドリッチリポタンパク質(TRL)代謝の中心的な調節因子の1つであり、魅力的な治療標的と考えられる(Olkkonen,V.M.ら、2018)。以前の研究において、機能を喪失させる変異が天然に生じているANGPTL3を標的とすることは安全であると報告されている。循環ANGPTL3タンパク質が欠損又は減少した個体は、全身のコレステロール恒常性に乱れがなく、病理学的状態と関連しなかった(Minicocci,I.ら、2012)。
本発明者らは、血清型5のアデノ随伴ウイルスベクター(AAV5)で送達されるマイクロRNA構築物を用いてヒトANGPTL3遺伝子発現をサイレンシングすることによって、ヒトへの使用のために安全かつ有効である脂質異常症の治療のための遺伝子治療アプローチを提供することを追求する。非ヒト霊長類(NHP)、ヒト、さらに理想的にはげっ歯類にわたるANGPTL3の保存された標的領域を、マイクロRNA構築物(miANG)を使用して標的化する。18個の構築物を生成し、ヒト肝臓細胞におけるルシフェラーゼレポーター構築物及び内因性mRNA発現をノックダウンする能力についてスクリーニングした。げっ歯類及び脂質異常マウスモデルにおけるAAVベクターを使用したさらなる試験のために、3つの有力なサイレンシング構築物を選択した。小動物における首尾のよい概念実証(PoC)にあたり、AAVを、脂質異常マウス及びNHPにおいて、スタチンと組み合わせて試験した。
[アンジオポエチン様タンパク質3(ANGPTL3)を標的とする治療用miRNAの設計]
ANGPTL3 RNA標的配列解析及びガイド鎖設計
異なる種にわたるANGPTL3遺伝子の保存されたRNA配列を標的とするmiRNAガイド鎖であるmiANGを設計した。選択された種(ホモ・サピエンス、NCBI受託番号NM_014495.4、配列番号2、マカカ・ファスシクラリス(Macaca fascicularis)、NCBI受託番号XM_005543185.2、配列番号89、ムス・ムスクルス(Mus musculus)、NCBI受託番号NM_013913.4、配列番号90、ラッツス・ノルベジクス(Rattus norvegicus)、NCBI受託番号NM_001025065.1、配列番号91)のANGPTL3 mRNA配列の全長を整列させた。Log-Expectatio(MUSCLE)アラインメントツールによる複数の配列比較を用いて、ANGPTL3 mRNA配列のデフォルト設定(https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/)とのアラインメントを行った。ヒト、サル、マウス、及びラットにおけるANGPTL3 mRNA配列の4つの保存配列(配列番号3~6)を同定し、14個のmiRNA(配列番号8~21)の設計に使用した。保存された配列の各々を、「タイリング戦略」で22個のヌクレオチド(nt)を有するいくつかの異なるガイド鎖を生成するために使用した。この戦略は、22ntを超える保存配列を完全に覆うように、又は保存配列が19ntより短い場合に保存配列を5’若しくは3’方向に伸長するように、重複する22ntのガイドを設計することから構成された。ANGPTL3を標的とする7つのガイド(名称miANG1~miANG7、配列番号8~14)を、エクソン1に位置する第1の保存領域(NM_014495.4:139~166位のnt)に設計した。ANGPTL3を標的とする3つのガイド(名称miANG8~miANG10、配列番号15~17)を、エクソン1に位置する第2の保存領域(NM_014495.4:267~292位のnt)に設計した。ANGPTL3標的とする2つのガイド(名称miANG11及びmiANG12、配列番号18及び19)を、エクソン3に位置する第3の保存領域(NM_014495.4:706~728位のnt)に設計した。ANGPTL3を標的とする2つのガイド(名称miANG13及びmiANG14、配列番号20及び21)を、エクソン5に位置する第4の保存領域(NM_014495.4:885~907位のnt)に設計した。Ionisによって開発されたASO IONIS-ANGPLT3Rxを重複させることにより、4つのガイド(配列番号22~25)を設計した。IONIS-ANGPTL3Rx(配列番号7)は、ヌクレオチド配列5’-GGACATTGCCAGTAATCGCA-3’からなるANGPTL3 mRNA配列を標的とする第二世代2’-O-メトキシエチル(2’-MOE)キメラアンチセンスオリゴヌクレオチド薬物である(Graham,M.J.ら、2017)。IONIS-ANGPTL3Rxのヌクレオチド配列は、NCBI NM_014495.4を有する配列の1136~1155位のANGPTL3 mRNAコード配列のエクソン6内の20nt配列に相補的である。新たに設計された配列miANG15、miANG16及びmiANG17(配列番号22~24)は、それぞれ、ASO IONIS-ANGPTL3Rxに対して配列の5’にさらに2つのntを有するもの、配列の5’及び3’にさらに1つのヌクレオチドを有するもの、並びに配列の3’にさらに2つのntを有するものと同一であった(NM_014495.4:1134~1157位)。miANG18(配列番号25)は、ASO IONIS-ANGPTL3Rx(NM_014495.4:1139~1155位)と重複する17ntの配列と、配列の3’にさらに4つのヌクレオチド(NM_014495.4:1156~1160位)とを有する。陰性対照を生成するために、GenScriptソフトウェア(https://www.genscript.com/tools/create-scrambled-sequence)を使用して、miANG6及びガイドをスクランブルした。スクランブルガイドは、miANG-SCR1及びmiANG-SCR2(配列番号92及び93)と命名した。
DNA構築物
miANG及びmiANG-SCR対照を、90ntの5’及び3’隣接領域に隣接するヒトのpre-miR-451骨格(図2のA)に埋め込んだ。AscI及びNotIの制限部位をそれぞれ5’及び3’に加え、完全な配列を遺伝子合成した(GeneArt、Thermo Fisher Scientific)。pri-miANGカセットを、HCR-hAATプロモーター(アポリポタンパク質E遺伝子座制御領域、ヒトα1-アンチトリプシン、配列番号94)から発現させ、サルウイルス40ポリアデニル化(SV40ポリA、配列番号88)シグナルによって終結させた(図2のB)。2つのルシフェラーゼレポーターのLucANG-A(配列番号95)及びLucANG-B(配列番号96)を、それぞれエクソン1、3、4、5(NM_014495.4:128~177位、255~304位、692~741位、871~920位;図2のC)並びにエクソン6及び7(NM_014495.4:1121~1170位;図2のC)の断片を組み合わせることによって生成した。5’及び3’の隣接領域は、AscI及びNotI制限部位と共に含めた。psiCHECK-2ベクター(Promega、Thermo Fisher Scientific)のウミシイタケルシフェラーゼ(RL)遺伝子の3’UTRにおける完全な配列とクローニングを、GeneArt(Invitrogen、Thermo Fisher Scientific)によって合成し、クローニングした。RNA転写物の二次構造は、mfoldプログラム(http://mfold.rna.albany.edu/?q=mfold、Zucker 2013)を使用して予測した。
[材料及び方法]
in vitro実験
トランスフェクションアッセイ及び細胞
ヒト肝細胞由来細胞癌Huh-7細胞を、10%ウシ胎児血清(Greiner、Kremsmuenster)を含有するダルベッコ改変イーグル培地(Thermo Fisher Scientific)中で37℃及び5%COで維持した。ルシフェラーゼアッセイ及び低分子RNA NGSについては、細胞を、トランスフェクションの1日前に、ダルベッコ改変イーグル培地(Thermo Fisher Scientific)中に、ウェルあたり1E+05細胞の密度で24ウェルプレートに播種した。トランスフェクションは、Lipofectamine3000試薬(Thermo Fisher Scientific)を用いて、製造業者の説明書に従って行った。
デュアルレポータールシフェラーゼアッセイ
Huh-7細胞に、miANG発現構築物、及びANGPTL3標的配列に融合したRL遺伝子とホタルルシフェラーゼ(FL)遺伝子との両方を含むルシフェラーゼレポーターを三連でコトランスフェクトした。pBluescriptを添加して等量のDNAをトランスフェクトした。トランスフェクトされた細胞を、トランスフェクト後48時間で、100μlの1×受動溶解緩衝液(Promega、Thermo Fisher Scientific)中で、室温で15分間穏やかに揺らすことによってアッセイした。細胞溶解物を4,000rpmで5分間遠心分離し、10μlの上清を用いて、デュアルルシフェラーゼレポーターアッセイシステム(Promega、Thermo Fisher Scientific)でFL活性及びRL活性を測定した。相対的ルシフェラーゼ活性は、RL活性とFL活性との比として計算した。
RNA単離及び次世代シーケンシング(NGS)
Huh-7細胞に、250ng又は400ngのmiANG5、miANG10、及びmiANG13の構築物を、Lipofectamine3000試薬(Thermo Fisher Scientific)を使用してトランスフェクトした。トランスフェクション48時間後に、TRIzol(登録商標)試薬(Thermo Fisher Scientific)及びDirect-zol RNA Miniprep(Zymo Research)を製造業者のプロトコルに従って使用して、全RNAを細胞から単離した。RNA試料を、Thermo Fisher ScientificからのdsDNaseで、製造業者の説明書に従って処理した。シーケンシングについて、miANG5、miANG10、miANG13及び未トランスフェクトHuh-7からの全RNA試料を、低分子RNAシーケンシングのために外部に送付した(BaseClear B.V.)。Illuminaプラットフォーム用の低分子RNAシーケンシングライブラリを、BaseClear B.V.で調製してシーケンシングした。
NGSデータ解析
トランスフェクトしたHuh-7細胞におけるmiRNAの発現及びプロセシングの解析は、CLC Genomics Workbench10を使用して行った。得られたリードをアダプタートリミングした。トリミングに使用したカスタムアダプター配列は、プラス鎖ではTGGAATTCTCGGGTGCCAAGGであり、マイナス鎖ではCCTTGGCACCCGAGAATTCCAであった。第2のトリミングを実施し、各リードの5’及び3’から4ntを除去した。曖昧N記号を含むリード、15ntより短いリード又は70ntより長いリードの全てを除外した。次に、得られた独自の低分子RNAリードを、miRNAヒトデータベース(miRBase)を使用してアノテーションし、pri-miANG構築物の参照配列に整列させた。内因性miRNAの総プールにおけるmiANG5、miANG10及びmiANG13の発現のパーセンテージを、アノテーション処理中にソフトウェアCLC Genomics Workbench10によって計算した。miANG5、miANG10及びmiANG13のプロセシングを調べるために、それぞれの成熟miRNA種の長さ及び割合を、適切なpri-miANG配列(配列番号66、77及び75)に対する上位20位の最も豊富なアノテーション(100%に設定)を考慮することによって評価した。
内因性Huh-7 ANGPTL3 mRNAノックダウンの測定
RT-QPCRを実施して、内因性ANGPTL3 mRNAのノックダウンによるmiRNAの発現を確認した。Huh-7細胞に、miANG5、miANG10、miANG13、miANG-SCR1及びmiANG-SCR2の構築物をトランスフェクトした。トランスフェクション2日後に、培地を新しいものにした。トランスフェクション48時間後にTRIzol(登録商標)試薬(Thermo Fisher Scientific)を用いて細胞単層を回収し、Direct-zol RNA Miniprep(Zymo Research,)を製造業者の説明書に従って使用して、RNAを単離した。DNase処理及びcDNA合成は、Ambion(登録商標)TURBO DNA-free(商標)DNase Treatment(ThermoFisher Scientific)及びMaxima First Strand cDNA Synthesis Kit(Thermo Fisher Scientific)を製造業者の説明書に従って使用して実施した。QPCRは、Gene Expression Assay(Thermo Fisher Scientific)からのTaqMan即時使用型プライマー-プローブ(Thermo Fisher Scientific):ANGPTL3(アッセイID:Hs00205581_m1、Thermo Fisher Scientific.)、及びハウスキーピング遺伝子としてのβ-アクチン(ACTB)(アッセイID:Hs01060665_g1、Thermo Fisher Scientific)を用いて行った。相対遺伝子発現データを、ヒトACTBを基準遺伝子としてANGPTL3データを正規化して得た。100%に設定したmiANG-SCR1試料と比較して、結果を示す。
バキュロウイルスのシード生成のためのDNA構築物
発現カセットを、AAV ITRをコードするプラスミドに組み込んだ。発現カセットは、ANGPLT3を標的とするmiRNAの発現を駆動するプロモーター配列を含む。例で使用される発現カセットは、例えば、アポリポタンパク質E遺伝子座制御領域(HCR)を表す配列番号94に列挙されるものなどのプロモーター配列、ヒトα1-アンチトリプシン(hAAT)プロモーター(HRC-hAAT)を、例えば、配列番号66(pri-miANG5)に列挙されるものなどのmiRNAコード配列との組合せで含む。本研究で使用される例示的な発現カセットを、配列番号97(hAAT-pri-miANG5)に列挙する。代表的なウイルスベクターゲノムの例を、hAAT-pri-miANG5発現カセットを含む配列番号98に列挙する。
AAV5ベクター
発現カセットを保有する組換えAAV5(配列番号99)は、SF+昆虫細胞(Protein Sciences Corporation、Meriden,Connecticut,USA)に、Rep、Cap、及び導入遺伝子をコードする2つのバキュロウイルスを感染させることによって産生させた。AVBセファロース(GE Healthcare)を用いた高速タンパク質液体クロマトグラフィーシステム(AKTA Explorer、GE30 Healthcare)の標準的なタンパク質精製手順に従って、QPCRを用いて精製AAVの力価を決定した。
Huh-7細胞のAAV5形質導入
ヒト肝細胞由来細胞癌Huh-7細胞を、10%ウシ胎児血清(Greiner)を含有するダルベッコ改変イーグル培地(Thermo Fisher Scientific)中で37℃及び5%COで維持した。形質導入アッセイのために、細胞を、24ウェルプレートに、ダルベッコ改変イーグル培地(Thermo Fisher Scientific)中、ウェルあたり1E+05細胞の密度で、形質導入の1日前に播種した。細胞を、1細胞あたり1E+05、1E+06及び1E+07ゲノムコピー(gc)の多重感染度(MOI)で、100μLのAAV5ベクターを用いて三連で形質導入した。形質導入の3日後、単層を200μlのRTL+緩衝液(AllPrep DNA/RNA Mini Kit、Qiagen)中で採取した。同じ条件に属する3つのウェルを、DNA抽出のためにプールした。
細胞からのベクターDNAの単離及び定量
DNA抽出は、AllPrep DNA/RNA Mini Kit(Qiagen)を使用し、製造業者の説明書に従って実施した。TaqMan QPCRアッセイ(Thermo Fisher scientific)(配列番号100~102)を用いてベクターゲノムコピーを定量化し、ACTB SybrGreenアッセイを、ローディング対照遺伝子(配列番号103及び配列番号104)として使用した。
動物研究
マウス研究
AAV5ベクターのIV注射後のC57BL/6マウスにおけるANGPTL3 mRNA及びタンパク質の低減を研究するために、6~8週齢の雄野生型C57/BL6JRjマウス(n=6)に、1E+13、5E+13及び2.5E+14gc/kgのAAV5-miANG5並びに2.5E+14gc/kgのAAV5-miANG-SCR1のベクターをマウス尾静脈に投与した。投与後2、4、6、8週間で、血液試料を採取して、血漿中のANGPTL3タンパク質レベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)及びアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)レベル、総コレステロール(TC)レベル、及びTGレベルを決定した。8週目に、動物を屠殺し、マウスから肝臓を採取して、ベクターゲノム定量のためのDNA、並びにマウスAngptl3 mRNA発現及びmiANG5定量のためのRNAを抽出した。
ANGPTL3のAAV媒介遺伝子サイレンシングが血漿脂質代謝及びアテローム性動脈硬化の発症に及ぼす効果を検討するために、APOE*3-Leiden.CETPマウスを使用した(TNO、オランダ)。約8~10週齢の82匹のAPOE*3-Leiden.CETPトランスジェニック雌マウスに、0.15%のコレステロール及び15%の飽和脂肪を含む西洋型食事(WTD)を与えた。3週間の慣らし期間の後、17匹の低応答マウスを研究から除き、残りの65匹のマウスを4つの群に細分した。20匹のマウスの1群を除き、全ての群はn=15であり、4時間の絶食後、年齢、体重、血漿総TC、及びTGを整合させた。0週目に、AAV5ベクターのIV尾静脈注射を、5E+13gc/kgのAAV5-miANG-SCR1(群2)又はAAV5-miANG5(群3)又はAAV5-miANG13(群4)の用量でマウスに投与した。対照群(群1)には、製剤緩衝液(ビヒクル)のみを投与した。0、1、2、4、6、8、10、12、14、及び16週目に、体重(個体)及び食物摂取(ケージあたり)を決定した。血漿総コレステロール及びトリグリセリドを、0、2、4、6、8、10、12、14、及び16週目に測定した。肝障害のマーカーとしての血漿ALT及びASTを、群のプールされた血漿試料を使用して、0、1、4、8、12、及び16週目に測定した。0、4、8、12及び16週目に、群のプールされた血漿試料を用いてリポタンパク質プロファイルを測定した。12週目に、群1の5匹のマウスを、絶食させずにCO窒息を介して屠殺し、大動脈根部におけるアテローム性動脈硬化の発症を評価した。パイロット屠殺で選択されたマウスにおけるコレステロール曝露及びアテローム性動脈硬化の発症、対照群における残りのマウスのコレステロール曝露、並びに病変部とコレステロール曝露との関係を示す曲線に基づいて、研究を、AAV注射後、合計16週まで延長した。AAV注射後、16週目において、マウスを、絶食させずにCO窒息を介して屠殺した。EDTA-血漿を、心臓穿刺を介して得た。心臓、大動脈、肝臓、脾臓組織を回収した。肝臓を使用して、ベクターゲノム定量のためのDNA、並びにマウスAngplt3発現及びmiANG5レベルのためのRNAを抽出した。
ApoE*3-Leiden.CETPマウス(TNO、オランダ)において、ANGPTL3のAAV媒介遺伝子サイレンシングが単独で及びアトルバスタチン投与との組合せでアテローム性動脈硬化の発症に与える効果を検討するための研究を行った。約8~12週齢の100匹の雌APOE*3Leiden.CETPマウスに、0.15%のコレステロール及び15%の飽和脂肪を含む西洋型食事(WTD)を与えた。3週間の慣らし期間の後、20匹の低応答マウスを研究から除き、残りの80匹のマウスを、20匹のマウスの1つの対照群(群1)及び4つのAAV投与群に細分した。投与群を、4時間絶食後、年齢、体重、血漿コレステロール、及びトリグリセリドについて整合させる。動物に、IV尾静脈注射を介して1E+14gc/kgのAAVベクターを投与する。アトルバスタチンを、0,0035%(w/w)の濃度(約3.5mg/kg体重/日)で、食事への混合物によって投与する。群は以下のとおりである:群1:製剤緩衝液(ビヒクル)n=20、群2:AAV-miANG-SCR n=15、群3:AAV-miANG5 n=15、群4:AAV-miANG-SCR+アトルバスタチン n=15、及び群5:AAV-miANG5+アトルバスタチン。体重(個体)及び食物摂取(ケージあたり)を、0、1、2、4、6、8、10、12、14、及び16週目に決定する。血漿総コレステロール及びトリグリセリドを、0、2、4、6、8、10、12、14、及び16週目に測定する。肝障害のマーカーとしての血漿ALT及びASTを、群のプールされた血漿試料を使用して、0、1、4、8、12、及び16週目に測定する。0週目、4週目、8週目、12週目、及び16週目において、リポタンパク質プロファイルを、群のプールされた血漿試料を使用して測定する。プールには、血漿コレステロール及び/又はトリグリセリドへの効果が確認されたマウスの試料を含め、注射の失敗により正確なAAV用量を投与されていないマウスの包含は排除する。12週目に、群1の5匹のマウスを、絶食させずにCO2窒息を介して屠殺し、大動脈根部におけるアテローム性動脈硬化の発症を評価する。約280mMの数週のコレステロール曝露(血漿コレステロール濃度×持続時間)により、約160,000μm2の予測病変面積(病変面積とコレステロール曝露との関係を示す曲線に基づくデータで、TNOにより実施された雌E3L.CETPトランスジェニックマウスにおける以前の研究を基礎に作成したデータ)が観察される。パイロット屠殺で選択されたマウスにおけるコレステロール曝露及びアテローム性動脈硬化の発症、対照群における残りのマウスのコレステロール曝露、並びに病変部とコレステロール曝露との関係を示す曲線に基づいて、対照群のアテローム動脈硬化の発症予想値の予測を行う。対照群のアテローム性動脈硬化の発症予想値が100,000μm2未満の場合、治験委託者と協議の上、治験計画を調整し、治験を2週間延長して、AAV注射後合計18週間としてもよい。これに当てはまらない場合、残りのマウスは16週目に屠殺する。AAV注射後16週目又は18週目に、絶食させずに、CO窒息を介してマウスを屠殺する。EDTA-血漿は心臓穿刺を介して取得する。心臓、大動脈、肝臓、腎臓、脾臓の組織を回収する。
カニクイザルにおける食事誘発性脂質異常症におけるAAV試験
生体内実験手順は、動物愛護法、実験動物の管理及び使用に関する指針、実験動物愛護局に準拠した。動物は、個々にステンレス鋼ケージに収容する(混合の期間を除く)。動物は、AAV注射前の少なくとも8週間、少なくとも1日2回、Teklad TD110084又はLabDiet(登録商標)5AVO(LabDiet(登録商標)5040w/高フルクトース、脂肪、及び0.25%コレステロール)又はLabDiet(登録商標)9GA6(LabDiet(登録商標)5040w/高フルクトース、脂肪、及び0.05%コレステロール)(LabDiet、U.S.A.)のいずれかを受ける。測定されたトリグリセリドレベルが少なくとも85mg/dLの動物のみを研究に含める。さらに、動物を、それらのAAV5中和抗体価、標的領域の配列(肝生検)、血漿脂質プロファイル、及び食事の嗜好について事前にスクリーニングして、動物を投与群に割り当てる。
雄カニクイザルマカク(マカカ・ファスシクラリス;1群あたりn=3)に、ANGPTL3を標的とするmiRNAをコードする1E+14gc/kgの用量のAAV又は製剤緩衝液を単回静脈内投与した。AAV注射前に及び研究期間を通じて血液を収集し、ANGPTL3及びmiRNAのレベル、脂質プロファイル、ベクタークリアランス、臨床化学及び血液マーカーを検出する。AAV注射後57~84日目に、20mg/kgの用量でシンバスタチンを動物に毎日投与し、シンバスタチンと組み合わせた遺伝子治療の効果を研究した。食事前、食事直後、及びAAV投与後29日目、57日目、85日目及び120日目に、動物に、麻酔及び鎮痛下で外科的肝生検を行った。投与後141日目に、動物を屠殺し、検査する。副腎、脳、心臓、腎臓、肝臓、脾臓、精巣、肺、皮下腹部白色脂肪を含むいくつかの臓器を収集する。
マウス及びサル肝臓におけるベクターDNA、mRNA及びmiANG5の定量
DNeasy(登録商標)血液及び組織キット(Qiagen)を、供給業者のプロトコルに従って使用して、肝臓由来のDNAを抽出する。ベクターゲノムコピーを、「細胞からのベクターDNAの単離及び定量」の項に記載のとおりに定量する。肝臓におけるANGPTL3 mRNAレベルは、「内因性Huh-7 ANGPTL3 mRNAノックダウンの測定」の項で先に記載しているように決定する。miANG5を定量化するために、24nt(プライマー標的配列、配列番号105)又は23nt(バリアントT)処理されたmiANG5(プライマー標的配列、配列番号125)に特異的な逆転写プライマーを有するTaqMan MicroRNA逆転写キット(Thermo Fisher Scientific)を使用して、肝臓由来のRNAを逆転写する。2つのカスタムTaqMan QPCR低分子RNAアッセイ(Thermo Fischer Scientific)を実施して、24nt(アッセイID CTFVKZT、ラックID、配列番号106)又は23nt(バリアントT)の長さ(アッセイID CTGZFJP、配列番号126)の最も豊富なmiANG5種を測定する。合成RNAオリゴの連続希釈を標準として使用して、肝臓試料あたりのmiANG5の24nt(配列番号107)又は23nt(バリアントT;配列番号127)分子/細胞の量を計算する(Integrated DNA Technologies)。
マウスANGPTL3 ELISA
血漿中のマウスANGPTL3タンパク質を、製造業者の説明書に従って、市販の酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)キットのRAB0756(Sigma-Aldrich)で決定した。提供された希釈緩衝液中で血漿試料を希釈し、基準標準曲線に適合する光学密度(O.D.)値を得、各血漿試料を二重に測定した。基準曲線は、供給業者のプロトコルに従って、ELISAキットに含まれる標準品の段階希釈液を調製することによって生成する。
マウス血漿中の脂質プロファイルの測定
マウス血漿中の総コレステロールレベルを測定するために、市販のAmplex Red Colesterol Assay Kit(カタログ番号A12216、Thermo Fisher Scientific)を、製造業者の説明書に従って使用した。マウス血漿中のトリグリセリドレベルは、トリグリセリド定量キット(カタログ番号MAK266,Sigma-Aldrich)を製造業者の説明書に従って使用して決定した。
ALT及びAST活性アッセイ
マウス血漿試料において、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)及びアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)活性のアッセイを行って、肝細胞障害を検出した。2つの市販のキット、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ活性アッセイキット(カタログ番号MAK055、Sigma-Aldrich)及びアラニンアミノトランスフェラーゼ活性アッセイキット(カタログ番号MAK052、Sigma-Aldrich)を製造業者の説明書に従って使用した。
[結果]
in vitro実験結果
人工miANG構築物のin vitroサイレンシング有効性
in vitroでのmiANG構築物のmiANGノックダウン有効性を評価するために、Huh-7細胞に、ANG標的配列及び前記miANG構築物をコードするウミシイタケルシフェラーゼレポーターをコトランスフェクトした。ホタルルシフェラーゼ(FL)遺伝子を同じレポーターベクターから発現させ、トランスフェクション効率を補正する内部対照として機能させた。最初のスクリーニングにおいて、Huh-7細胞に、それぞれ50ng又は250ngのmiANG構築物、miANG-SCR1、miANG-SCR2及びpBlueScript(pBS)、並びにそれぞれ50ngのLucANG-A又はLucANG-Bをコトランスフェクトした。ANGPTL3エクソン1、3及び5を標的とするように設計されたmiANG1-miANG14構築物から、miANG1、miANG2、miANG3、miANG6、miANG8及びmiANG13は、25~65%の穏やかなルシフェラーゼノックダウンを誘導した。miANG4、miANG5、miANG9、miANG10及びmiANG18(ANGPTL3エクソン6を標的とする)構築物は非常に有効であり、ANGPTL3ルシフェラーゼレポータープラスミドの70%を超える阻害を誘導した(図3)。効力をさらに決定するために、いくつかのmiANG構築物を力価実験のために選択した(4、5、9、10、13、及び18)。構築物を、10ngのANGPTL3ルシフェラーゼレポータープラスミドと共に、異なる濃度(1、10、50、又は250ng)のHuh-7細胞に、コトランスフェクトした(図4)。試験した最低miRNA濃度の1ng(ルシフェラーゼ:miRNAの比率は10:1)で、およそ20%~40%のノックダウンを誘発することができた。増加させたmiRNA濃度で測定したノックダウンは、10ng miRNA(ルシフェラーゼ:miRNAの比は1:1)でそれぞれ20~75%、50ng miRNA(ルシフェラーゼ:miRNAの比は1:5)で60~90%、250ng miRNA(ルシフェラーゼ:miRNAの比は1:25)で70~96%であった。最も強力な構築物は、miANG5及びmiANG4であった。miANG5及びmiANG4は、いずれも、ANGPTL3エクソン1の類似領域を標的とし、次いで、miANG18、miANG10、及びmiANG13を標的とした。ANGPTL3エクソン3及びエクソン5をそれぞれ標的とするmiANG5並びにmiANG10及びmiANG13は、さらなるin vitro試験、NGS分析、バキュロウイルス生成及びAAV5産生の候補であった。miANG18は、そのLUCノックダウンポテンシャルに基づいて強力な候補であったが、その特異性はヒト及びサル種に限定され、げっ歯類種に対してはないため、さらなる試験を行わなかった。
トランスフェクト細胞における内因性ANGPTL3発現の低下
細胞におけるANGPTL3 mRNA発現のノックダウンを試験するために、miANG5、miANG10及びmiANG13の構築物を選択した。Huh-7細胞における内因性ANGPTL3遺伝子発現のノックダウンは、トランスフェクト細胞のRT-QPCRによって確認した。250ngのmiRNAプラスミドのトランスフェクションは、miANG5によりANGPTL3 mRNAの発現の約60%減少に至り、miANG10及びmiANG13により、それぞれ約50%及び20%のノックダウンに至った(図5のA)。400ngのmiRNAプラスミドのトランスフェクションは、250ngの構築物を使用したトランスフェクションと同様の結果を示した(図5のB)。
トランスフェクト細胞におけるmiRNAの発現レベル(NGSデータ)
成熟miRNAの発現レベルは、miRBase及び目的のpre-miRNA配列(配列番号66、71及び74)を使用してアノテーションされた総リードの数に基づいて定量した。図6のA及びBは、250ng又は400ngのmiANG5をトランスフェクトしたHuh-7における上位50位の最も発現されたmiRNAの発現レベルを示した。miANG5は、Huh-7において見出される2番目に豊富な成熟miRNAであった。miANG5の全てのプロセシング形態は、アノテーションされたリードの総数の3.7%(250ngトランスフェクション)及び4.9%(400ngトランスフェクション)を占めた。miANG5と同様に、miANG10は、トランスフェクトされたHuh-7において最も豊富なmiRNAのうちの1つであり、250ngのDNAをトランスフェクトした場合に3番目に多く発現し、3.1%の発現レベルを示し(図7のA)、400ngのDNAを使用した場合には2番目に多く発現し、4.7%の発現レベルに達した。(図7のB)。miANG13の存在量からの結果を図8のA及びBに示す。miANG13の全てのプロセシング形態は、アノテーションされたリードの総数の0.7%(250ngトランスフェクション)及び1%(400ngトランスフェクション)を占めた。両方の実験のセットにおいて、その結果から、トランスフェクトされたmiRNAの発現レベルが内因性Huh-7miRNAの発現レベルを超えておらず、より高いDNA濃度では、miRNAの発現レベルの上昇に対応することが示された。
細胞内でのトランスフェクション時のmiANG構築物のプロセシング(NGSデータ)
miRNAプロセシングもまた、配列番号66、71及び74のpre-miRNA配列へのリードのアラインメントによって調査した。アノテーションプロセスから得られた上位20位の最も豊富な成熟形態を、図示のために検討し、100%に設定した。参照配列とのミスマッチは許容されず、2%未満で表されるリードは示していない。Huh-7細胞におけるトランスフェクトされたmiRNAプラスミド(250ng又は400ng)の量とは独立して、最も存在量の多い形態の長さは、miANG5に関して24ntであり(図9のA及びB)、miANG10に関しては24ntであり(図10のA及びB)、miANG13に関しては23ntであった(図11のA及びB)。参照配列との観察されたミスマッチは、アデニン又はチミン(ウラシル)が成熟ガイド配列に加えられた3’での配列改変にあった。全ての構築物について、これらのバリアントのいずれも、分析のために設定された2%を超える閾値に達しなかった。これは、様々な細胞株及び組織における3’末端編集イベントに関する以前に公表されたデータ(Landgraf,P.ら、2007)と合致する。しかしながら、モノウリジル化及びモノアデニル化の正確な役割は、さらに決定される必要がある。
細胞内でのAAV5-miANG形質導入
得られたAAV5-miANG5、AAV5-miANG10、AAV5-miANG13及びAAV5-miANG-SCR1が、パッケージ化された発現カセットを形質導入及び送達する能力を調べるために、Huh-7細胞を、1E+07(miANG5及びmiANG-SCRについてのみ試験)、1E+06及び1E+05gc/細胞の感染多重度(MOI)で形質導入した(n=1)。ベクターDNAは、QPCRにより定量した。結果から、より高いMOIで、検出されたベクターゲノムDNAコピーの用量依存的増加が示された(表6)。
Figure 2023521347000007
in vivo実験結果
APOE*3-Leiden.CETPトランスジェニックマウスの肝臓におけるmiANG5のプロセシング
AAV5-miANG5を注射したマウスの肝臓試料(実験試料11~15、注射用量5e13gc/kg)において、成熟miANG5形態の長さを調べた。miRNAプロセシングを、配列番号66のpre-miRNA配列へのアラインメントによって分析した。アノテーションプロセスから得られた上位20位の最も豊富な成熟形態を、図示の目的で検討し、100%に設定した。参照配列との2つのミスマッチは許容された。2%未満で表されるリードは示していない。試料12~15において、参照配列との観察されたミスマッチは、アデニン又はチミン(ウラシル)が成熟ガイド配列に加えられた3’での配列改変において観察された(図29B、29C、29D、及び29E)。試料11は、3’において、成熟ガイド配列にアデニン、チミン(ウラシル)、又はグアニンが加えられた、より大きな配列改変を示した(図29A)。成熟miANG5の最も豊富な形態の長さは、試料11(5’-TAGCAAATCTTGATTTTGGCTCC-3’)における23nt、又は試料12~15における1つのヌクレオチドバリアントを有する23nt(5’-TAGCAAATCTTGATTTTGGCTCT-3’)である。
野生型マウスにおけるAAV5-miANG5ベクターのサイレンシング有効性
in vivoでのmiANG5の安全性及びサイレンシング有効性を調べるために、陰性対照として機能するmiANG5及びmiANG-SCR1をコードするAAV5ベクターを生成した。C57BL/6雌マウスに、1E+13gc/kgの低用量、5E+13の中用量、及び2.5E+14gc/kgの高用量(n=6)で、尾静脈にIV注射した。miANG-SCR1対照群は、2.5E+14gc/kgの最高用量のみを投与した。
ベクターDNA測定は、誤注入された動物が存在しなかったこと、及びgc数の増加が用量依存的であり、miANG5低用量では平均4.7E+4gc/μgのDNA、miANG5中用量では平均4.4E+5gc/μgのDNA、miANG5及びmiANG5-SCRの高用量ではそれぞれ3.1E+6及び4.2E+6gc/μgのDNAであったことを示した(図12)。AAV5-miANG5注射時のマウスAngptl3 mRNA発現の減少には、明確な用量依存性パターンが存在する。高用量ではビヒクル注射群と比較して約77%の最大減少に達し、中用量では60%、低用量では25%に達した(図13)。AAV5-miANG-SCR1を注射した群は、ビヒクル群と比較して、Angptl3 mRNA発現の約40%の増加を示したが、より高いANGPTL3血漿タンパク質レベルで反映されなかったため、アッセイのばらつきに起因することが示唆された。フォローアップ研究において、APOE*3-Leiden.CETPマウスに、より低用量(5E+13gc/kg対2.5E+14gc/kg)でmiANG-SCR1を注射し、ビヒクル群と比較して、Angptl3発現レベルに差は観察されなかった。ベクターDNA及びmRNAの結果に従い、成熟miANG5(24nt又は23ntのバリアントT)の用量依存的な増加が、肝臓において検出され、miANG5低用量で、平均約6±8分子/細胞、miANG5中用量で約47±30分子/細胞、及びmiANG5高用量で約299±125分子/細胞が計算された(miANG5 24nt、図14のA)。miANG5低用量で平均約3±3分子/細胞、miANG5中用量で約12±7分子/細胞、及びmiANG5高用量で約224±86分子/細胞が計算された(miANG5 23ntバリアントT、図14のB)。23ntバリアントTは、マウス肝臓におけるmiANG5の最も豊富な成熟形態であり、検出されるmiANG5 24nt分子/細胞の数が多いのは、アッセイのバックグラウンドに起因する可能性が最も高い。miANG5の発現は、マウスにおける循環ANGPTL3タンパク質の強力かつ用量依存的な低下を誘導した(図15)。ANGPTL3タンパク質の最大90%ノックダウンが最高用量群において検出され、ANGPTL3タンパク質レベルの約50%及び25%のノックダウンが中用量群及び低用量群において検出された。ALT及びASTを測定し、肝機能をモニタリングした。肝細胞細胞質内のALTの濃度は、AST及び他の全ての組織内のALTと同等であり、特にALT活性がASTより著しく低い(Vroon,DH.及びIsraili,Z.、1990)。AAV注射後2週目及び8週目のASTレベルは、miRNA発現マウス(miANG又はmiANG-SCR1)において、ビヒクル注射マウスと比較して上昇しなかった。AAV投与後4週目のASTでは、ビヒクル群と比較して、わずかに有意な増加が観察された(図16)。同じ群の動物内でのAST活性レベルが、ASTレベルと比較してより大きく広がっていることは、おそらくより高い生理学的変動に起因する。肝細胞損傷は、通常、ASTレベルの10~20倍の上昇をもたらす;したがって、観察された小さな上昇は、病理学的状態に関連したものではなかった(Vroon,DH.及びIsraili,Z.、1990)。マウスにおけるAAV注射後2週目及び8週目のALTの測定は、ビヒクル注射マウスと比較して有意な増加を示さなかった。注射されたmiANG5高用量注射マウスでは、一過性の増加がわずか4週目に見出された(図17)。AAV投与後のマウスにおける肝細胞障害は、はるかに高いかつ持続的なALTレベルによって特徴づけられる(Borel,F.ら、2011)。このことは、病理学的ALT上昇ではなく、アッセイ又はマウスの生理学的変動に関連している可能性が高いことを示唆する。注射後4週目において、TC及びTGレベルは、AAV5-miANG5を投与された最高用量群では、ビヒクル群と比較して有意に低く、TCレベルのみでは、出血前測定と比較しても有意に低かった(図18のA及びB)。
APOE*3-Leiden.CETPトランスジェニックマウスにおけるAAV5-miANG5及びAAV5-miANG10ベクターのサイレンシングの有効性
APOE*3-Leiden.CETPマウスを使用して、miANG5及びmiANG13の有効性を研究した。このマウスモデルは、HDL/LDL比の低下及び食事誘発性アテローム性動脈硬化に対する感受性の増加を含む脂質代謝に関してヒトの特性を有し、スタチン、フィブラート、ナイアシン、エゼチミブ及び抗PCSK9モノクローナル抗体等の全ての登録された脂質低下薬に対してヒトと同様に応答する。高脂血症は、西洋型食事とコレステロール含有食事を使用することで誘発した。APOE*3-Leiden.CETP雌マウスに、5E+13のAAV5-miANG5、AAV5-miANG13又はAAV5-miANG-SCR1を用いてIV注射した(n=15)。16週目に、動物を屠殺し、続いて、肝臓におけるベクターゲノムコピー、Angptl3 mRNA発現、ANGPTL3タンパク質及びmiANG5(23ntバリアントT成熟形態)レベルを決定した。体重、食物摂取、TC、TG、脂質プロファイル、血漿ANGPTL3タンパク質発現及びALT/ASTレベルを、AAV5-miANG5及びAAV5-miANG5-SCR1については最大16週間、AAV5-miANG13については最大12週間評価した。
等しいベクターgc数が群内で検出され、それぞれAAV5-miANG5では平均1.38E+05gc/μgのDNA、AAV5-miANG13では平均3.01E+05gc/μgのDNA、AAV5-miANG5-SCR1では平均1.41E+05gc/μgのDNAであった(図19)。部分的な投与を受け、全ての分析から除外された動物は少なく、AAV5-miANG5群からのマウス36及び45、AAV5-miANG13群からのマウス51、54及び61、並びに<3,07E+03gc/μgのDNAを有するAAV5-miANG-SCR1群のマウス24であった。AAV5-miANG5を注射した群では、マウスAngptl3 mRNA発現の約30%の低下が認められたが、AAV5-miANG13及びAAV5-miANG-SCR1を注射したマウスでは、効果は認められなかった(図20)。16週目のAngptl3 mRNA発現の軽度の減少は、12週目及び16週目のANGPTL3タンパク質発現データと一致する。miANG5の24ntの成熟形態を検出し、発現は平均105±62分子/細胞であった(図21のA)。また、23ntバリアントTのmiANG5の成熟形態も検出され、発現は平均13±9分子/細胞であった(図21のB)。23ntバリアントTは、マウス肝臓におけるmiANG5の最も豊富な成熟形態であり、検出されるmiANG5 24nt分子/細胞の数が多いのは、アッセイのバックグラウンドに起因する可能性が最も高い。
結果は、研究の期間を通じて、ビヒクル群とAAV5注射群との間で、体重及び食物摂取に差がないことを示した(図22のA及びB)。血漿総コレステロールは、ビヒクル群と比較した場合、4週目(約25%)、6週目(約29%)及び8週目(約22%)のAAV5-miANG5投与により低下し、4週目(約27%)、6週目(約24%)、8週目(約25%)、10週目(約24%)及び14週目(約20%)のAAV5-miANG-SCR1により低下した(図23のA)。AAV5-miANG5群の4週目の血漿TGも、SCR及びビヒクル群と比較して有意に低かった(最大約58%)(図23のB)。AAV5-miANG13を受けた群は、一貫した効果を示さなかった。AAV5-miANG13群の4週目(約27%)、8週目(約23%)、10週目(約26%)及び12週目(約27%)における血漿TGレベルは、ビヒクル群と比較して有意に低下したが、AAV5-miANG-SCR1群と比較した場合は有意ではなかった。これは、8週目(約20%)及び16週目(約29%)のAAV5-miANG5-SCR1対照群におけるTGレベルが、ビヒクル群と比較して低下したことに起因する。リポタンパク質プロファイルデータは、AAV5-miANG5群で観察された血漿総コレステロール及びTGの低下が(V)LDL画分で生じたことを示した。(V)LDL分画における減少は、4週目から16週目まで観察された(図24A~24E)。プールした血漿試料において、ALT/AST肝毒性マーカーのレベルは正常範囲内であり、AAVの投与による肝臓関連障害は示唆されなかった(図25のA及びB)。ANGPTL3タンパク質は、研究全体を通じて、AAV5-miANG5注射APOE*3-Leiden.CETPマウスの血漿において有意に低かったが、一方で、AAV5-miANG13注射マウスは、IV後8週目にわずか(約20%)ではあるが有意な低下を示した(図26)。miANG5の最大サイレンシング効果は、8週目で、ビヒクル群及びAAV5-miANG-SCR1注射群と比較して、ANGPTL3タンパク質発現における約54%の減少に達した。
APOE*3-Leiden.CETPトランスジェニックマウスにおけるアテローム性動脈硬化の発症に対するAAV5-miANG5単独又はアトルバスタチンとの併用のサイレンシング有効性
本研究のねらいは、ANGPTL3の遺伝子サイレンシングを単独で又はアトルバスタチン投与との併用で誘導するAAV5-miANG5の、APOE*3-Leiden.CETPにおけるアテローム性動脈硬化の発症に対する効果を検討することであった。高脂血症は、西洋型食事とコレステロール含有食事を使用することで誘発した。APOE*3-Leiden.CETP雌マウスに、ビヒクル溶液(n=20)、1E+14gc/kgのAAV5-miANG5(単独又はアトルバスタチンとの併用、1群あたりn=15)又はAAV5-miANG-SCR1(単独又はアトルバスタチンとの併用、1群あたりn=15)を静脈内注射した。16週目に、動物を屠殺し、続いて、肝臓におけるベクターゲノムコピー、Angptl3 mRNA発現、ANGPTL3タンパク質及びmiANG5(23ntバリアントT成熟形態)レベルを決定した。体重、食物摂取、TC、TG、脂質プロファイル、血漿ANGPTL3タンパク質発現、及びALT/ASTレベルを最大16週まで評価した。12週目(5匹のパイロットマウス)及び16週目(1群あたり15匹のマウス)に、大動脈根におけるアテローム性動脈硬化の測定(重症度及び病変部)を行った。
等しいベクターgc数が群内で検出され、AAV5-miANG-SCR1で平均4.26E+05gc/μgのDNA、AAV5-miANG5中で5.56E+05gc/μgのDNA、AAV5-miANG-SCR1+アトルバスタチン中で4.27E+05gc/μgのDNA、及びAAV5-miANG5+アトルバスタチン中で5.65E+05gc/μgのDNAであった(図30)。ベクターDNA測定は、(AAV5-miANG-SCR1群に属する)マウス31が、LLOQ未満のgc/μgのDNAを有する誤注入された動物である可能性が最も高いことを示した。AAV5-miANG5及びAAV5-miANG5にアトルバスタチンを注射した群では、マウスAngptl3 mRNA発現の約30%の低下が観察された(図31)。同様に、APOE*3-Leiden.CETPマウスにおける前回の研究で観察されたように、ビヒクルにおけるAngplT3 mRNA発現及びAAV5-miANG-SCR群は、非常に変動のあるレベルを示した。定量レベルのmiANG5 23ntバリアントTは、AAV5-miANG5注射群でのみ検出され、AAV5-miANG5を単独で、及びアトルバスタチンと組み合わせて投与した群で、それぞれ平均約87及び約107分子/細胞であった(図32)。
結果は、研究期間を通じて、ビヒクル群とAAV5注射群との間で、体重及び食物摂取に差がないことを示した(図33のA及びB)。
ビヒクル群で測定された血漿総コレステロールレベルは、研究中、約15~18mmol/L(群1)であり、miANG-SCR1群では約15~19mmol/Lであった(群2)。したがって、ビヒクルとスクランブル対照群との間で、いずれの時点でも血漿総コレステロールレベルに差がなかった(図34のA)。AAV5-miANG5のみを投与した動物(群3)は、投与開始後の全ての週において、ビヒクル対照群及びスクランブル対照群の両方と比較して、血漿総コレステロールレベルが低下していた。AAV5の注射後の血漿総コレステロールの試料ポイントあたりの平均減少率は、ビヒクル対照群と比較して-43%であり、スクランブルmiRNA対照群と比較して-48%であった。コレステロール曝露に基づくと、研究16週目までの血漿コレステロールの平均低下は、ビヒクル対照群及びスクランブル対照群と比較して、それぞれ-41%及び-46%であった(図34のA)。スクランブルmiANG-SCR1及びアトルバスタチンを投与した動物(群4)は、ビヒクル対照群と比較して、血漿総コレステロールレベルの低下を、研究の6週目(-21%)及び10週目(-27%)に示した。スクランブル対照と比較して、血漿総コレステロールレベルは、研究の4週目から16週目まで低下した。研究の8週目から16週目までで、血漿総コレステロールの減少は、≧-25%であった(図34のA)。アトルバスタチンとの併用でAAV5-mANG5を投与した動物(群5)は、投与開始後の全ての週において、ビヒクル対照群及びスクランブル対照群の両方と比較して、血漿総コレステロールレベルが低下していた。AAV5の注射後の血漿総コレステロールの試料ポイントあたりの平均減少は、ビヒクル対照群と比較して-61%、スクランブルmiRNA対照群と比較して-64%、アトルバスタチン投与群と比較して-53%、及びAAV5-miANG5のみを投与した群と比較して-32%であった(図34のA)。コレステロール曝露に基づくと、研究の16週目までの血漿コレステロールの平均低下は、ビヒクル対照群及びスクランブル対照群と比較してそれぞれ-58%及び-61%であった。miANG-SCR1の投与と比較して、AAV5-miANG5及びアトルバスタチンの投与は、投与開始後の全ての週において血漿総コレステロールレベルを低下させた。コレステロール曝露に基づくと、16週目までの血漿コレステロールの平均低下は-50%であった。AAV5-miANG5のみの投与と比較して、併用投与は、個々の時点のいずれにおいても、血漿総コレステロールレベルに統計的に有意な影響を与えなかったが、6週目、14週目及び16週目に有意差に向かう傾向が見出され、コレステロール曝露は統計的に有意な減少(-29%)を示した(図34のB)。
ビヒクル対照群(群1)は、研究中に約4~8mmol/Lの血漿トリグリセリドレベル及び約5~8mmol/LのmiANG-SCR1群(群2)レベルを示した。したがって、いずれの時点においても、ビヒクル群及びスクランブル対照群との間で血漿トリグリセリドレベルに差がなかった(図35のA)。AAV5-miANG5のみを投与した動物(群3)は、ビヒクル対照群及びスクランブル対照群と比較して、それぞれ研究の2週目から12週目及び14週目まで、血漿トリグリセリドレベルが低下した。AAV5注射後の血漿トリグリセリド中の試料ポイントあたりの平均減少は、ビヒクル対照群と比較して-60%であり、スクランブルmiRNA対照群と比較して-61%であった。トリグリセリド曝露に基づくと、16週目までの血漿トリグリセリドの平均減少は、ビヒクル対照群及びスクランブル対照群と比較して、それぞれ-54%及び-58%であった(図35のA)。スクランブルmiRNA及びアトルバスタチンを投与した動物(群4)は、両方の対照と比較して、血漿トリグリセリドレベルに差を示さなかった。アトルバスタチンと併用してAAV5-miANG5を投与した動物(群5)は、ビヒクル群及びスクランブル対照群と比較して、それぞれ研究の2週目から12週目及び14週目まで血漿トリグリセリドレベルが低下した。AAV5注射後の血漿総トリグリセリドの試料ポイントあたりの平均減少は、ビヒクル対照群と比較して-57%、スクランブルmiRNA対照群と比較して-59%、及びアトルバスタチン投与群と比較して-60%であった(図35のA)。トリグリセリド曝露に基づくと、16週目までの血漿トリグリセリドの平均減少は、ビヒクル対照群及びmiANG-SCR1と比較してそれぞれ-51%及び-55%であった。スクランブルmiRNA及びアトルバスタチンの投与と比較して、AAV5-miANG5及びアトルバスタチンの投与は、投与開始後の全ての週において、血漿トリグリセリドレベルを低下させた。コレステロール曝露に基づくと、16週目までの血漿トリグリセリドの平均減少率は-56%であった。AAV5-miANG5のみの投与と比較して、併用投与は、いずれの試験時点でも血漿トリグリセリドレベルに影響を及ぼさなかった(図35のB)。
リポタンパク質測定(コレステロール及びリン脂質)は、研究の0、4、8、及び12週目の群ごとのプールされた血漿試料(図36及び37)及び研究の16週目の個々の試料(図38)で実施した。分画3~8をVLDL、分画9~16をIDL/LDL、及び分画17~24をHDLとする。この分析のための統計は行わなかった。リポタンパク質プロファイルは、AAV5-miANG5のみ(群3)及びAAV5-miANG5とアトルバスタチンとの併用(群5)の注射がコレステロール低下効果を有し、VLDL-コレステロール及びLDL-コレステロールを低下させるが、HDL-コレステロールには効果がないようにみえることを確認する。
ANGPTL3血漿タンパク質は、AAV5-miANG5のみを注射したAPOE*3-Leiden.CETPマウスにおいて、ビヒクル群及びmiRNAスクランブル群と比較して、16週間の研究全体を通して有意に低下した(miANG-SCR1と比較して、4週目で約78%低下;図39)。AAV5-miANG5及びアトルバスタチンを投与した動物は、研究全体の間に有意なANGPTL3血漿タンパク質低下を示し(miANG-SCR1と比較して、4週目で約83%低下)、miANG5のみを注射したマウスと比較して、血漿タンパク質低下に対する追加的効果は観察されなかった。miANG-SCR1群では、ビヒクル対照群と比較して、ANGPTL3血漿タンパク質レベルに有意な差は観察されなかった。miANG-SCR1及びアトルバスタチンを投与した群において、ANGPTL3血漿タンパク質レベルの有意な低下は、12週目にのみ観察された(図39)。
マウス肝臓において、ANGPTL3タンパク質レベルは、ビヒクル(約21%低下)及びmiANG-SCR1対照群(約17%低下)と比較して、AAV5-miANG-SCR1及びアトルバスタチン群で有意に低下した。ANGPTL3タンパク質レベルは、ビヒクル(約27%低下)及びmiANG-SCR1対照群(約24%低下)と比較して、AAV5-miANG5及びアトルバスタチンを注射したマウスの肝臓においても有意に低下した。AAV5-miANG5のみを投与した群では、有意なANGPTL3タンパク質低下は観察されなかった(図40)。
4つの異なる時点(研究4、8、12及び16週目)における30匹のAPOE*3-Leiden.CETPマウス(6匹のマウス/群)において、ALT及びASTパラメータを分析した(図40のA及びB)。測定されたレベルは、これらの変化が一時点でのみ観察された場合、投与期間に関して明らかな傾向のない状況で、又は統計的有意性が達成されなかった場合に、生物学的に関連性はないと考えられた。加えて、選択された組織の顕微鏡検査は、いずれの群についても顕微鏡的な変化において何らの差異も明らかにしなかった。
ビヒクル対照群(群1)及びmiANG-SCR1群(群2)において、それぞれ184及び206×103μm2の平均総病変面積が見られた。マウス2(群1に属する)では、685×103μm2の総病変面積が見られ、これに基づいて、マウス2のデータは、さらなる統計解析から除外した。AAV5-mANG5のみを投与した動物(群3)は、ビヒクル対照群(-53%)及びmiANG-SCR1群(-58%)と比較して、総病変が減少していた。miANG-SCR1及びアトルバスタチンを投与した動物(群4)は、ビヒクル対照群(-46%)及びmiANG-SCR1群(-52%)と比較して総病変が減少したが、AAV5-miANG5のみを投与した群(+15%)との比較では減少していなかった。AAV5-miANG5をアトルバスタチンと組み合わせて投与した動物(群5)は、ビヒクル対照群(-84%)及びmiANG-SCR1群(-86%)と比較して、総病変が減少した。miANG-SCR1及びアトルバスタチン又はAAV5-miANG5のみを投与した動物と比較して、総病変面積のそれぞれ-70%及び-66%の減少が見られた(図41)。
ビヒクル対照群(群1)と比較して、アトルバスタチンとの併用でAAV5-miANG5を投与したマウス(群5)は、大動脈根において非疾患の、正常であるセグメントの割合が高い(図42のA)。miANG-SCR1群(群2)と比較して、AAV5-miANG5を投与したマウス、アトルバスタチンを投与したマウス、又はそれらの組合せは、大動脈根部において非疾患の又は正常であるセグメントの割合が高い。加えて、アトルバスタチンとの併用によるAAV5-miANG5の投与(群5)も、AAV5-miANG5又はアトルバスタチンのみの投与と比較した場合に、非疾患のセグメントが保たれていた(図42のA)。AAV5-miANG5の単独又はアトルバスタチンと組み合わせた投与は、両方の対照群と比較した場合、重度のIV型及びV型病変の発生の低減と関連付けられた。AAV5-miANG5及びアトルバスタチンの投与は、AAV5-miANG5又はアトルバスタチンによる単独投与と比較して、重度のIV型及びV型病変の発生のさらなる低減をもたらした(図42のA)。
AAV5-miANG5のみを投与した動物(群3)は、miANG-SCR1群と比較して病変数が減少した。AAV5-miANG5をアトルバスタチンと併用した投与(群5)は、両方の対照群と比較して、及び両方の単独投与群と比較して、病変数のさらなる減少をもたらした(図42のB)。
オートファジーを誘導するための化合物の効果、AAVビヒクルの形質導入効率
10%FBS及び1%P/Sを補足したDMEM培地1ml中の1ウェルあたり100万個のHuh7細胞を、37℃及び5%CO2で増殖させた培養液から調製した。細胞を6つのウェルプレートに播種し、さらに1mLの新鮮な培地を補充した。o/nインキュベーション後、細胞を1×DPBSで洗浄し、その後、オートファジーを活性化又は阻害する必要がある細胞を、DMEMと共に100nM/mLの濃度のラパマイシン(活性化剤)又はバフィロマイシン(阻害剤)との混合物で2時間の前処理を行った。細胞を、1mLの培地、及び適用可能な場合は5000gc/細胞の濃度のAAV5、及び1:64の用量の20%イントラリピッド(Sigma I141)中で、以下の条件で処理した。処理:a)未処理+AAV5、b)活性化物質、c)阻害剤、d)イントラリピッド+AAV5、5)イントラリピッド+阻害剤+AAV5、e)イントラリピッド+活性化物質+AAV5、f)活性化物質+AAV5、g)阻害剤+AAV5。全ての処理は、生物学的三連で行った。細胞を4時間インキュベートした後、回収し、その後、DNA又はRNAを、それぞれZymo researchカタログ番号D4074のquick DNAキット及びPromega RNAミニプレップシステムカタログ番号Z6010を使用して単離した。合計で25ngのDNAを、ヒト第IX因子についての特異的プライマー、LC3(オートファゴソームマーカー)及びハウスキーピング遺伝子としてのGAPDHを用いてqPCR反応(Promega GoTaQ)に使用した。反応を実行し、ABI7500システムで分析した。
qPCRプライマー:
GAPDH
F:AGATCCCTCCAAAATCAAGTGG
R:GGCAGAGATGATGACCCTTTT
ヒト第IX因子
F:CAAGTATGGCATCTACACCAAAGTCT
R:GCAATAGCATCACAAATTTCACAAA
LC3
F:CGTCCTGGACAAGACCAAGT
R:ATTGCTGTCCCGAATGTCTC
脂質異常性NHPにおける血漿脂質レベルに対するAAV5-miANG5の効果
大型動物におけるAAV5-miANG5の有効性及び安全性を評価するために、AAV5-miANG5を脂質異常性カニクイザルマカクにIV注射した。NHPは、試験試料の投与前に、167日間にわたって高カロリー食を受けた。総コレステロール及びトリグリセリドレベルは、高カロリー食のために、全ての動物において上昇した。しかしながら、各動物の食事に対する応答は非常に変動が大きかった。投与前に、シンバスタチンに対する応答を調べるために動物にシンバスタチンを投与し、その後、洗浄期間を設けた。3匹の動物にビヒクル(製剤緩衝液)を投与し、5匹の動物に1E+14gc/kgの用量のAAV5-miANG5を静脈内投与した。研究の目的は、AAV5-miANG5によるANGPTL3のサイレンシングの安全性、及びシンバスタチンとの同時投与における血漿脂質プロファイルへの影響を調べることであった。トリグリセリド、LDL-C、HDL-C、及び総コレステロールのレベルに関する結果は、高カロリー食事に応答して、動物におけるレベルの変動が大きいことを示した(図43-1及び43-2)。シンバスタチン投与は、単独で、またAAV5-miANG5との併用で、脂質マーカーに対する(追加的)効果を示さなかった。したがって、シンバスタチン投与を含む投与前及び投与後90日間の脂質マーカーレベルを使用して、TG、TC、LDL-C及びHDL-Cにおけるベースラインレベルの変化を計算した(図44)。変動性にもかかわらず、トリグリセリド、総コレステロール、及びLDL-CについてのAAV5-miANG5投与NHPにおいて、投与90日後に減少が示されるようであった(図45)。しかしながら、この結論は変動が大きいため慎重に導き出した。脂質異常性NHPへのシンバスタチン及び/又はAAV5-miANG5の投与は、一部の動物においてALT/ASTの一過性の増加をもたらした。これは、スタチン及び/又はAAV媒介性遺伝子療法に対して予測される応答である(図45)。標的分析(例えば、miRNA及びANGPTL3)において、組織病理学及び他の追加的脂質マーカーを測定する。
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[配列]
配列番号1 NA配列ヒトANGPTL3遺伝子
AATGACAAACTGAAAAAATCTATTGTTTGTTATATATATAACAAAGAATTAGTATCCACAATATGTAAATAATTCCTAAAATTAGTCAGAAAGAGACAAACTTAAAAAGAGGGTAACAAGGAGGGGAGCAAATTATGTACATAACCAGATGATTCGCAAAGACGGCAACAGAGATGGCCAGCAAAACAAACTAGATATATACTTGTCTATTAGATTTATCAACATTTTTTGCCTTTTTCATTAAAAGCATTTGTAAAAGGATATAGGAAAAGAGGAACTCTCATATACTCCTGGCAGGGATGTAAATTGGTACAACCCTTTTGAAGGACAATCTGACAAAAGCAATCGTAAGTTACAAGTCAACATCTATGAATGTATATGAAAATATTTATATACATACATCACCACCATAAAAGCATTTTCTATACATACTGTTTATAATTAGAAAATTGGAAACAAATGATTAAAAGGGGGCTGATTAAATTAAGGTTCATCTATATAACAGGATTATGCAGCTATTAAAAAGGACGTGGTAACTCTATAGACATTCATAGGAAAATAAATTTTAAAATACTAAGATCCTGAATGATATATATATCATGAGCTATTATACATAACAAGATCCCACTTGTGTTATAAAAAATTATGTTTAGTCATTCAAAGGGTCTGGTATGATAGACCCAAAATGTTAATAGAGTCGAGATTTTTATTTTTTATAGGTTTTTGAAATACCTGAATTTTCACAATAAGTACTTTGCACATTAAAAATCTTAGCTGGGCATGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGTAGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGTCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCTTGGTTGGGGGTGCCTGTAATTCCAGATACTCGGGAAGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGGGGAAGTTGCAGTGAGCTGAGATCACGACGCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAATAAATAAAGAAAAAATCTTTACATGTCCAAAGATACGGCTGTTCAACTAAAAAATATATATGTATAAAACTTAACATGTTAATAGTGAACACACAAAACAGTAAGATAGATAAAATTATTCCTTCAAAGCTCACTTAACCTCTGGATCTACACTGTCCAAAAAGACGGTCTAATGAGACAATTGAGCACTTGATAGGTGAGTGGTTCTAACTGAGATATGTTCTCAGTATAAAACATACAATAGGATCTTCCTATACAACATTAATTAAAAAACAAACTATTGTAGTTAAAAAGGAAAAAATTAGAGATACTATGTAAAAAAGAGCCAAAATACCTTGTATTTTATTTGAAAGACATATCTCCATAAGATTACACAACCTCGTGTAGGATAAAGGACTTTGCTTTGCTTGGAATTTAAACAATTTAGGCTCTTAAATGTCCTAAAATTCTCTGTAGCTAAGAAATTTTTATATTGGTTCCTAGGAACTAGGAATCCTTAAATTAGGCCCTACATTTGCTTACAAGTTTATTTTCCTTGGCATAAAATTTTTTAGTTTTTACATTACTGGTTATATTTGATCAGGGTTCTATTTAAATAGGCACAAGTTCAAGCAAAGATCAGATTCTGCTTTTAGCAGTGTGTACTCAGACAGGAAGTATTAAAAGGCAGGCAGAAAATCCTTTATAAAATTACTACTTTCAATGCATTTTCCCACGTTGAAATGCTTCTGCAGTTTATAATTAGGCAAATTACTTTAATTATAATCAATAATGCTGTTCAAATTACTATAAGAATTATACAGATATTTATACCAAGAGACAATATACTAGAAACCAAGACTACGTGACCATTACCTCTACTCTGTCAGTGTTATTTGTGAGAAATTGCACAAATTTTGCAAAAAGTGTTAGTATCCTACTACAGTAGGATATAATATAGAAGGAAATAATTTCATAAAGCCTGTCTTTGGTACTAGTGCTCAGTTACTTTCATTAACTAAAAAAGGGGCTACTCTTCAAATTCCCTTCTCTAAAAAGAATGTACTATATCAAAAGGGGGTAAACACTACTACGTATACATTCTGCACTTAGAAATCCCTATATGTTGATTTTATCATTCTCTTATTCAATAAATATTGTTTCTACAATGTGTAAGGCATTACTGTACTAAAGCATTATAAGGAATATAAGTTAAAAACACATACAAATCTTGCCAATCAACAGCTTATAGTGTAATAGGGGAGAGAAGCTGGCCCATCTATATTCTCCCTCAACTAGCAAGTGGATGAAATATCAGGGTCAATAGTTATAAGCCACAAAAGCTGACAGCTTAATTAAGAGAAGTTTTGAAATATGTATTTCATGACCAATAATTACAACTGTAACTTTTCTATTTAAAGAAGGAGAAAATTTGAATTTCTTCTCTAGCTCAACATACACTTCTATAATTCCATTACATGAACCAGAGTAAAGGGTAAGATGGAAATGAAGAATATTTTCTTACCCTTTTGTGGTTCTATATTGGACACTTAAAAATCATACACAACCTAATCAAAAGATGTAATTCTTTAAAAAGGTACGAGACCAAAATTCAGAAAATCTAGACTATAACAAAATTTCTCAATTTACATTATCTTAATATGCAATTAATTTTCACCAGTAAAATACTATAGTATGGGTACAAATGCATTGATTAGTTCTAATTACAAAAATGGCTAATATATAATACTGTGTAGTGTTTATGATACATCAGATAATGTTCTAAGTGCTCTGAAAATATAAACTTTTAATCTTTTATACGACCCTATAAAATAGGTGTTATTCTCACTGGAGAGATGAGAAAACAGGGGTTCAGAGATGTGAAGTAATTTGACCAAAGGTCACAAAGCTGAAGAATATGAAATCCGGGATTCTGATTCAGGCAGTCTTATTCCAGAATCATGCTCTTAACCACTATGGAATACTGCCTCTACTGTAACTATTATACCCAAAACCCTTAATCCTAAGTCATCAAAAGGAAGAGCCTCTATTTTACACAATGAAGAGGCATTTCTAAGAATAGAAATTTAGGGACGAGCACAGTGGCTTACTCCTTTAATATCAGCACTTTGAGAGGCTGATATGGGAGGTTCACTTGAAGTCAGGAGTTCAAGGTCAGCTTGGGCAACATAGTGAAACACAGTCTCTACAAAATATTTAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTATAGTCTCAGCTACTTGGGAGACAGAGGGAGGAGGCTTGCTCGAGCCCAGGAGTTCGTGGCTATAGTGAGCTATGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCAAGACCCTGTCTCTAAAAAAGAAAAGAAATTTGGAAATGGTTTATTTTGTATTAACAATTTATAATTTACACTGAAATTTATTATGATAAAACTTTTCCCTGTGTTAAAAAGCTATTAACTTTATGAAAAATTTCTTTTAGGTAAGGTTGATTATATATACCCACACACATACACAGGTTAAAAGTTAGTTTCATGTGACATAATAACTAGCATTTTGAGCACTACCTGTTTGCCCAGCACTGTTCTAAGTGCTCTACATGTATTATTGTTAAATTATCATAACACTATGAATTATGTACTATAATTACCCCAGCTTTACAGATGAGGAGACTAATCCATGGGGAGGTTAAGTAACTTGTCCAAGGCCAGACAGCTAGAGCCGGCTTTTGGACCCACACCACAGTCTGACTCCAGCACCCATATTCTTAACAATTTCACCATATTAATATGTCAAGATTAAGCAGTTTTAAAGGATGCTATTTTCTCACAAATTTCTTAATATGAACACTCAATAAGAATAATCACTAATATAAGCATTTAGTATTTTTTTAACACTAAGTTGGAAGCATAGTGGAACATTTATTTTTAGAAATATTATTAATTGGCTGGGCTCACGCTTGTAATCGGCTGGGCTCATGCCTGTAAATTTTGGGAGGCCAAGGTAAAAGAATTGCTTGAGCCCAGTATTTCCAGACCAGCATGGGCAATACATTAAGACATCATCTTTAAAAAAAAAATGTTATTAATCTCCTCTTTTTGTTAAATGTATATTATCAAAATTGTTACTAAGCTAACAAACTTCAGAAAAACTTATGATGGGCAAGCTGCTTGTGACATTGAAGGTATTTAAGATTCAATTCTAGTTTGGTCCTAGATGACCACATATCCATTGTTCCTTCAACGAGCACATGGTAAAGAGCCTAGAACACAGAGACACAGAACACAGTGGAGAAAAGGGAGTGAAATGTCTTTAATGACACTTACTATATATGGGATTTTGTGACAATATACAAGGATGGTTAAGACATATAAGGTGATGCAAAAAAACATATTAACAATTATAGTGACAAAAAATGAGGAGCATATAATTATACATTGATTTATACAGAGTACCAGAGGAACACAGCATTGAGAGCCGTAACACCACCTGAGGGAGTGGAGAAAGGCTTCAGAGAGAAAGTGTTTTTTGGAATGGATCACTGTTTCCAAAAGAACTAAAGTACAGTTTGAGAAATGCATACTTAATTCATTACTTTTTTCCCCTCAACTTTAATAATAAATTTACCCAACAAAAAAGTTTATTTTTGACTTGTAAATCTCTTAAAATCATAAAAAAGTAAAATTAGCTTTTAAAAACAGGTAGTCACCATAGCATTGAATGTGTAGTTTATAATACAGCAAAGTTAAATACAATTTCAAATTACCTATTAAGTTAGTTGCTCATTTCTTTGATTTCATTTAGCATTGATCTAACTCAATGTGGAAGAAGGTTACATTCGTGCAAGTTAACACGGCTTAATGATTAACTATGTTCACCTACCAACCTTACCTTTTCTGGGCAAATATTGGTATATATAGAGTTAAGAAGTCTAGGTCTGCTTCCAGAAGAAAACAGTTCCACGTTGCTTGAAATTGAAAATCAAGATAAAAATGTTCACAATTAAGCTCCTTCTTTTTATTGTTCCTCTAGTTATTTCCTCCAGAATTGATCAAGACAATTCATCATTTGATTCTCTATCTCCAGAGCCAAAATCAAGATTTGCTATGTTAGACGATGTAAAAATTTTAGCCAATGGCCTCCTTCAGTTGGGACATGGTCTTAAAGACTTTGTCCATAAGACGAAGGGCCAAATTAATGACATATTTCAAAAACTCAACATATTTGATCAGTCTTTTTATGATCTATCGCTGCAAACCAGTGAAATCAAAGAAGAAGAAAAGGAACTGAGAAGAACTACATATAAACTACAAGTCAAAAATGAAGAGGTAAAGAATATGTCACTTGAACTCAACTCAAAACTTGAAAGCCTCCTAGAAGAAAAAATTCTACTTCAACAAAAAGTGAAATATTTAGAAGAGCAACTAACTAACTTAATTCAAAATCAACCTGAAACTCCAGAACACCCAGAAGTAACTTCACTTAAAGTAAGTAGAAAATAAAGAGGGTTCATGTTTATGTTTTCAATGTGGATCTTTTAAAAAAAATATTTCTAAGGCATGCCATTTGAAATACTTTGTTGCATTGTTGAAATACTTTTTTTTCCAAGAAAAATAATCTCCAGAAAATAAAATTTCCTATTATAATTTCAAGTTAGTTTTTTGTTTCCCTAATGTTATATATGAAAACACTGAAAATTTGCATTTTATATGAAAATTACAAATCGGTTAAATTATACAATCTAGAACACTATGTCATTACACTATTGTAAATTACTGAAGGTAAGTAAAAAGTTAAAAAAAATTTAAAACTATTCTCCAGTGTTTAAAACAGATTAAATAATACAGTAAATGGAAAAGATTTATTCATATGAAAATATGCTGGGCTTTTTCTTTTAATTGAAGTTCAGAAAATCAAATTTTAGAGATAGTACAATTTAAATAAAATGTTAAGGACAAAAATATGTGCTATTTGAAAGAAGCATACAAGGGGAAGGAATTGCCAATATTCATTTTTCAAATCCATTATTAGTTTAAAAATTTAGATTATGATAGTGTTACAGGAAATTAATAGAAAAGAAAGAGGAAAGCAACTTATAACCAACCTACTCTCTATATCCAGACTTTTGTAGAAAAACAAGATAATAGCATCAAAGACCTTCTCCAGACCGTGGAAGACCAATATAAACAATTAAACCAACAGCATAGTCAAATAAAAGAAATAGAAAATCAGGTAAGTCAGTATTTTAATGGTATGTCCCATCTTTCACACAGGTCTGTAAAAACACTGAATCCTAAAATTATTTACAAGCTTTAACTGGATCATGAGTAAAATTATCACATCAGCATAACTGTTAAAATTGCAGGCTCTGAAGCTAATAAACTACCTGCATTTAAACCATGGCTCTAAAACTTTGTGTGACCTTGAATAAATTACTTCACCCCTTTATCTCTCAGTTTCCTCACATATACTACAAAGATAATAACAGAACTTATAGGATTATTGTAAGAAAAAAAATTAATTCATAGCAGCCAATGTCATCTTACTAAAATTCAAATTAGATCATGTTTCTCTTTGCTCAAAACCACACAATAGCTTTCCATTTCACTCATATTGGCTCTTTAGACCAAGATTACCCAACCCTTCGTCATCTCACTGACTTCACCTCCTCTACTCTAGTTATTCTGACCGCTTTACCAGTATTCAAACACATCAAACATACTGCCACCTCAAAGCCTTTGCCCTTGTTGTTTCCTCTAACTGGAACGCTCTTCTGCCCTGGTATCTACGTGGCCCACTCTCTGATTTCCCTTAGGGTCGTTATCAAACAAAAAATTCCCAATGAAGACTTACAAGGTCACTTAACCAAAAATCACAACCGCCTGGTCCCATCCCTGAAAACTTCTACTTCCTTAGCTACTTTTCTCCTGCACACTCACCTTTATTTAACATAACATAAATTTTAGTTATTTATCTCTTCTATTCCTGCACTAAAATGTAAGCTCTGTGAATACAGGGATTTTTTCCATTATCTTCATATTTTCCATTATTTGTATATACTCCAGAATATAGAATACTGTATGGCACACAGTAGGCATTTCTGTTGAATTAATAAATGTAATGTCATATTCACACAGAAGCGTGTGCTATGATTATTATTACTTGGATTACTAGAAATAGTGTGCCTCATAATTAAAGGTCAACATTCAACAATGTAATTAATCTACAATGTAAACATCTGGTGAAGTGACAGAGGGAAGCACTTGTTTAGAAAAAAGCTATGTCAGAATCCATGTATTCTAATATGCAGTACAATAGTTTAAAAATATTAATAATACTCTCAAACAGCTATTCAAGAGGATTCAAAAAACATAATATAAACTCAGAGAAACTGGTAAACAAAATCATTTTCAAGAGATATAAAACAAATATTATTACCAATTTCCACTAAACAAACATAATGTTAGTAGTGCTGCTAAAAGGTTTTTTATCAACTACTTTTGGTTTCCATACTTTCCTTCTTATGATGTTATTATTCTAAATTCTTTTCAATTATATCTTTTACTATGATTAAATGAACCTGCTCCCCAAAGCAAAATGTTACTATAGTAATATACATTGTGTCTAAAAATAAAAATGTGTGAAGAAACCAAAACAATGAATTTCTGAGTTGGAAGAAGAGTTAGATCATTTAACTTTCTCATATTTAAATTAAAAAAACAAAACTCTAAAAATTTAAGTAACTTTAAGATCACATAGTTACTTAGTAGAAAAGAGTAATACCCAGCAAGCAAACTTTACAATAGATCCTTTTAAATAAGGTCCTAGGAAATATCATTCATGCCAGCATCAAAAAACTAACACTAATAATGCAAGATATTATATATTCTGCTTTTCTTACTGTCAATGAGAAAAACTATCATTCAATAAATTGCAAACCCAACACACTTAAATAAAAATAAAATGTTACTGCTAAACTAACGATAAACTACTGAATATATAGAAAGTAAGCAAACAAACTTGCCAACCTGCCAACATCTACAGATATGTTTACAGGTCAAAAATTATCAAATTATCAAGAAAGCCTGGTTCAAATTATGTATTATGTCTTTATCACAGGTCTGAAGATCAGTAAGACCTAAAACTGAAAATTATTAAACTTAAAATCTGAACAGAATATCAAATATATTTTATTCATATAAATAAAAGAATACATTACAATATTCTAAGCAAAGCAGTCTCTACTTTTGGCCTTGCTCTGTTTTCCGACCAATGTCTGCTTTTTTGCCTTGCTTTATTTTTTTATCTTATTAAATAATGTCCCTGATTAAATATTTTGAGAACAGGTAATCTGTACAATCTGAATAACACTGTTTATCTAAATATCAAACACCGTTATAACATTATGAACTGAAAGACAAACTGTACTTCTGACATCCTTACTCAGATTTCCCCTAATTGTATATTCAGTATCATTTTAAAAAACAGATTTATATTCTTTTATCAGCTCAGAAGGACTAGTATTCAAGAACCCACAGAAATTTCTCTATCTTCCAAGCCAAGAGCACCAAGAACTACTCCCTTTCTTCAGTTGAATGAAATAAGAAATGTAAAACATGATGGTAAGACACTTTGGTGGGTTTCCTTCTTGAAGCTATTATTATCAAATTCCCTATTCTTAGGACTTGTTCTAGACTAAAAGATAGTTAAGAGATATCCATCAAATACAATGTATCAACCTAAACTGGATGCTGGGGTTCTTTTTACACCCTATAAAAGACATACCTAAGACAATCAGAGAAATACAAATATGGACTTGATTATTAGATAATATAGAAGGTTTATTAATTTTCTTAGATGTGATCATGGTATTGCAGTTTTAAAGGAGAACAATCTCCTGTTTAAGAGATACATGCTGAAATATTTACGGAGTTAAAGGTCACTGGACTCCAGACTGGTGATAGAACAAGACTCTGTCTCTAAAAAATAATTAATTTTTTAAAAGAAAATAGTTTGGTAAGATGATTCTTACATTCTTAAATAACACGCCATCTAAGAAAAATGCTTTAACATAAACATTACTGAAAAAATGCTACATTTGCCACAACTTCATAAAATGTCAAGTGAAATCTCAAGCTCCAAAGATATTATTCCTATTACTAAATCTGATGTAATAACATTTTATTGATTCTAGGCATTCCTGCTGAATGTACCACCATTTATAACAGAGGTGAACATACAAGTGGCATGTATGCCATCAGACCCAGCAACTCTCAAGTTTTTCATGTCTACTGTGATGTTATATCAGGTAAAACCTGTCTAAGGAGAATAGACAGTAGTTAGTTCAACTTACTCATTACGTATTAGGAAGATTAACCTGGTTATCATTGTTTTATACATATATATATGAAATATATATGAGTATTCGTATAAATATAATACTTTTACCTTGTTTATGTATTTACTCAATATTCTCCTTTTCCTCTAAAATAATCTGAAGTGACTATTATCAATAAGTTTACTATGCCAAAATTCATTAATTGCCTTTCACTTAACTTTTGGGACCATAATAAATAATAAAATGTATTGCCATAACATTAATAAACTACCTTACAAAACCACCAATTAAAATCAAACAAACAAAAAAGTGTTATTTACATCTGTCAACATAAATCTACTAAAAATACATGATTTCATTCATTATATTCAGGTAGTCCATGGACATTAATTCAACATCGAATAGATGGATCACAAAACTTCAATGAAACGTGGGAGAACTACAAATATGGTTTTGGGAGGCTTGATGGTAAGGGGACTACATTCAATCATTCATTCACTTGCTAATCTACAAATATTTACTGAGAACCTCTTATGGACCAGGTATTAGGAAAAGTAGTAACGAACGAGAAGCAGTCTCAGCCTTCATATAATTTATTATCAA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ACGTTTTACATATCAATTAATTGGAAGTTAAAAGGACCAGGAAACTCAGACATACAGTATACATTTTAAAATTTCAATTATTTAAATATAATATATAGAATGTATGGCTTATAATGAATTAGTTAACTCAATGCAAATTATTCTATTTTGATTACAAATAGTAAAATAAGCAAGATAAAATAACAGATGTTTAAAATCCAAAAAGCACATACAAAAATCCATGAATGATGTCTAAGTACTCACTTATAAAGTAGAAGACATTCATTATTATATCAAATTTTTAAATGCTCAGTACTATTTGACCATTTAAAAATTTTGTATTCAAACTACCAGTGAAAGCCCTACCTAGAAGGTATACTCAGTGATAAGTTTTGTAGCTCCAAATCTTCTAATAGTGAGTGTAACCCCAAAATAAAAGGCTGACAGGTAAGTCGAGAATACTCACTTAATTCTGGTAAGAAAGCAACCCATTTGTACTTGTATTTACCAGCAATCCTTAAAATGAAGCTTCCTACTAACTCAATAGCAATAAGACAATAGTGAATGTTTAATGAAAACAGTATTTTATAAATACTTTAATAAAAAGGATTGTGATGAAGAACAATCTATTTATATTTGTTATTTGTTTTTAATTCCAATAAAAATAATTTTTAAAATTACAGAAAAAAGTTATTAAGAACCATGCTTTTAAATTTAAAATGATTTTTTAAATTTATTCCTGTCTTTTTCTACAAAGAAAGCATACATTAAGCAAATACCAAAGGCCAGGTTTACATTTGAAGAAAGTGACATTATTATTACTCAAGTCTCTAGGAATACTTAACACATCTCTTGACTGTATATGGATGTTAATAAATAGCTGACAGTAAAGTTTATCCATATAAAGACTTGCAAATATTCCTCTACCAATGACGAGACTTTAAAATATCTATAATAATGTAACACATTTCACTGGTGAAACATGTCTTGTCATATGCATTATAGAAAGGATAATCAGACTTTCAGTTATATTAATATTTTTAACATTTTTGTGCACATAGCTATCTTCAATAAAATTGTTTTAAAAGGTATTATTTTAAGATACACTAAAATGATCAAGGGATTCAAGACTAAACAACTCAATTAGTTGCACCAATAAAAAACACTTAAAAAAACTGTCAGTGTCCAACCTGTACTTAATAACTCACAGATTTTTAAAACTTTTCTTTTCAGGAGAATTTTGGTTGGGCCTAGAGAAGATATACTCCATAGTGAAGCAATCTAATTATGTTTTACGAATTGAGTTGGAAGACTGGAAAGACAACAAACATTATATTGAATATTCTTTTTACTTGGGAAATCACGAAACCAACTATACGCTACATCTAGTTGCGATTACTGGCAATGTCCCCAATGCAATCCCGGAAAACAAAGATTTGGTGTTTTCTACTTGGGATCACAAAGCAAAAGGACACTTCAACTGTCCAGAGGGTTATTCAGGTATCTTTTTCTGATACCAATACTTTATTTTCATATCTTCAAAGTATCTTCCCACATTATTAGCTATTATCTGCAATGACAACTTTTAAAAATCCGAATCCCAAATAAGCGTTTTCTCTCTAGACGAAAACCTCTTAACTATAATGAAAGTGTTCATTCTAGTTCAATCAGGTATTTTACCTCTAATCTTCCTCAGATTTTCTATTTTTTGGTAGTGTATAGATTATTTATACAGATTATTTAAAATTGGGACTTATACAGATTATTTAAAACTGGGATACATGCATCTAAAACACTGTAATATTTATAAGAAAGGAAGATAAACTTACGGGGAAATACAGTAACAGTAACTACATACGAGTCTGTACCCATTAAATTGCATATCTATCTCCTTTAGGAGGCTGGTGGTGGCATGATGAGTGTGGAGAAAACAACCTAAATGGTAAATATAACAAACCAAGAGCAAAATCTAAGCCAGAGAGGAGAAGAGGATTATCTTGGAAGTCTCAAAATGGAAGGTTATACTCTATAAAATCAACCAAAATGTTGATCCATCCAACAGATTCAGAAAGCTTTGAATGAACTGAGGCAAATTTAAAAGGCAATAATTTAAACATTAACCTCATTCCAAGTTAATGTGGTCTAATAATCTGGTATTAAATCCTTAAGAGAAAGCTTGAGAAATAGATTTTTTTTATCTTAAAGTCACTGTCTATTTAAGATTAAACATACAATCACATAACCTTAAAGAATACCGTTTACATTTCTCAATCAAAATTCTTATAATACTATTTGTTTTAAATTTTGTGATGTGGGAATCAATTTTAGATGGTCACAATCTAGATTATAATCAATAGGTGAACTTATTAAATAACTTTTCTAAATAAAAAATTTAGAGACTTTTATTTTAAAAGGCATCATATGAGCTAATATCACAACTTTCCCAGTTTAAAAAACTAGTACTCTTGTTAAAACTCTAAACTTGACTAAATACAGAGGACTGGTAATTGTACAGTTCTTAAATGTTGTAGTATTAATTTCAAAACTAAAAATCGTCAGCACAGAGTATGTGTAAAAATCTGTAATACAAATTTTTAAACTGATGCTTCATTTTGCTACAAAATAATTTGGAGTAAATGTTTGATATGATTTATTTATGAAACCTAATGAAGCAGAATTAAATACTGTATTAAAATAAGTTCGCTGTCTTTAAACAAATGGAGATGACTACTAAGTCACATTGACTTTAACATGAGGTATCACTATACCTTATTTGTTAAAATATATACTGTATACATTTTATATATTTTAACACTTAATACTATGAAAACAAATAATTGTAAAGGAATCTTGTCAGATTACAGTAAGAATGAACATATTTGTGGCATCGAGTTAAAGTTTATATTTCCCCTAAATATGCTGTGATTCTAATACATTCGTGTAGGTTTTCAAGTAGAAATAAACCTCGTAACAAGTTACTGAACGTTTAAACAGCCTGACAAGCATGTATATATGTTTAAAATTCAATAAACAAAGACCCAGTCCCTAAATTATAGAAATTTAAATTATTCTTGCATGTTTATCGACATCACAACAGATCCCTAAATCCCTAAATCCCTAAAGATTAGATACAAATTTTTTACCACAGTATCACTTGTCAGAATTTATTTTTAAATATGATTTTTTAAAACTGCCAGTAAGAAATTTTAAATTAAACCCATTTGTTAAAGGATATAGTGCCCAAGTTATATGGTGACCTACCTTTGTCAATACTTAGCATTATGTATTTCAAATTATCCAATATACATGTCATATATATTTTTATATGTCACATATATAAAAGATATGTATGATCTATGTGAATCCTAAGTAAATATTTTGTTCCAGAAAAGTACAAAATAATAAAGGTAAAAATAATCTATAATTTTCAGGACCACAGACTAAGCTGTCGAAATTAACGCTGATTTTTTTAGGGCCAGAATACCAAAATGGCTCCTCTCTTCCCCCAAAATTGGACAATTTCAAATGCAAAATAATTCATTATTTAATATATGAGTTGCTTCCTCTATTTGGTTTCCTTAAAAAAAAAAAAAACTCTCATAGGACATGTTTCATTTTGTTCCTTTCAGGAGTAGTAAATTAGACGTTTTCCCCATATAAAGCTTTTTTCTACCAGAAAGATACTTCTGGTAGAAGAAGAGAAAGGAGCTCTTTATGGTTCACACGACTGTCTCCTGTCCTAACTACTTTGCTTAAAGTGCTCAAATTCCATCACTACTCACAGTTGTCTAATCTAAGTCTAATCCCCTTTGATCTCTCAGACTACCTTCCCTTTTATCTCTCTACTACTTAATAATAAGAATATCTTTTTTTCAAACTTGACCTTCATTTTGCTTTCACAATACTATACTCTCCATGGATTATCCCTTATCTGAATCCATCTTTATAACCCTATTCCTTTCTCATATTTAGTACTGTGGGCCAATGGACAACCTTCAATCATCTTTTCTACACTGACCCTCAGACATTCTATCTGCTCTCACGGACTCCTTTATTTACCATGAATAAAGTTCCAAAATCTACATATTCATCCCAAGTCTCTTTCCAGTTCCCCTTCTTACATTGCCTATTTGCCATTTCTCCCTTCAATACCCTATACTTCACTCAAATTCAACATACCAAAAATAAAAGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGGACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTCTGACCAGCCTGACCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACCTAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCATGTGCCTACAGTCCCAGCTACTCAAGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCAATGCACTGGGTGACAGAACAAGACTGACTCAAAAAAAAATAAATAACAAATTCCCCAGCCCCTTACTGCTACTGCTATCCCTTTCTACCCACCTTTCCCTCCTTTATACTCTTTCACACCATCTTCCTCACTTCTTTATATCCATTAATATGACCAGCATGTTCCCAGTCACAGAAGCCTGGAACCCGGAAGACATCTCTGGCTTTTCACTCAACTTTGTAAACTACCTCTTTTGTATCATAAGCCACCAAGTTCAATACAATCTTCTCTTGAAACGTCTCTTAATCTTATAAGCTTTCTTCCCCAAAGACTGTCTTTAACTTCAGTGCTAGATTATATAAGT
配列番号2 NA配列ヒトANGPTL3 mRNA
AGAAGAAAACAGTTCCACGTTGCTTGAAATTGAAAATCAAGATAAAAATGTTCACAATTAAGCTCCTTCTTTTTATTGTTCCTCTAGTTATTTCCTCCAGAATTGATCAAGACAATTCATCATTTGATTCTCTATCTCCAGAGCCAAAATCAAGATTTGCTATGTTAGACGATGTAAAAATTTTAGCCAATGGCCTCCTTCAGTTGGGACATGGTCTTAAAGACTTTGTCCATAAGACGAAGGGCCAAATTAATGACATATTTCAAAAACTCAACATATTTGATCAGTCTTTTTATGATCTATCGCTGCAAACCAGTGAAATCAAAGAAGAAGAAAAGGAACTGAGAAGAACTACATATAAACTACAAGTCAAAAATGAAGAGGTAAAGAATATGTCACTTGAACTCAACTCAAAACTTGAAAGCCTCCTAGAAGAAAAAATTCTACTTCAACAAAAAGTGAAATATTTAGAAGAGCAACTAACTAACTTAATTCAAAATCAACCTGAAACTCCAGAACACCCAGAAGTAACTTCACTTAAAACTTTTGTAGAAAAACAAGATAATAGCATCAAAGACCTTCTCCAGACCGTGGAAGACCAATATAAACAATTAAACCAACAGCATAGTCAAATAAAAGAAATAGAAAATCAGCTCAGAAGGACTAGTATTCAAGAACCCACAGAAATTTCTCTATCTTCCAAGCCAAGAGCACCAAGAACTACTCCCTTTCTTCAGTTGAATGAAATAAGAAATGTAAAACATGATGGCATTCCTGCTGAATGTACCACCATTTATAACAGAGGTGAACATACAAGTGGCATGTATGCCATCAGACCCAGCAACTCTCAAGTTTTTCATGTCTACTGTGATGTTATATCAGGTAGTCCATGGACATTAATTCAACATCGAATAGATGGATCACAAAACTTCAATGAAACGTGGGAGAACTACAAATATGGTTTTGGGAGGCTTGATGGAGAATTTTGGTTGGGCCTAGAGAAGATATACTCCATAGTGAAGCAATCTAATTATGTTTTACGAATTGAGTTGGAAGACTGGAAAGACAACAAACATTATATTGAATATTCTTTTTACTTGGGAAATCACGAAACCAACTATACGCTACATCTAGTTGCGATTACTGGCAATGTCCCCAATGCAATCCCGGAAAACAAAGATTTGGTGTTTTCTACTTGGGATCACAAAGCAAAAGGACACTTCAACTGTCCAGAGGGTTATTCAGGAGGCTGGTGGTGGCATGATGAGTGTGGAGAAAACAACCTAAATGGTAAATATAACAAACCAAGAGCAAAATCTAAGCCAGAGAGGAGAAGAGGATTATCTTGGAAGTCTCAAAATGGAAGGTTATACTCTATAAAATCAACCAAAATGTTGATCCATCCAACAGATTCAGAAAGCTTTGAATGAACTGAGGCAAATTTAAAAGGCAATAATTTAAACATTAACCTCATTCCAAGTTAATGTGGTCTAATAATCTGGTATTAAATCCTTAAGAGAAAGCTTGAGAAATAGATTTTTTTTATCTTAAAGTCACTGTCTATTTAAGATTAAACATACAATCACATAACCTTAAAGAATACCGTTTACATTTCTCAATCAAAATTCTTATAATACTATTTGTTTTAAATTTTGTGATGTGGGAATCAATTTTAGATGGTCACAATCTAGATTATAATCAATAGGTGAACTTATTAAATAACTTTTCTAAATAAAAAATTTAGAGACTTTTATTTTAAAAGGCATCATATGAGCTAATATCACAACTTTCCCAGTTTAAAAAACTAGTACTCTTGTTAAAACTCTAAACTTGACTAAATACAGAGGACTGGTAATTGTACAGTTCTTAAATGTTGTAGTATTAATTTCAAAACTAAAAATCGTCAGCACAGAGTATGTGTAAAAATCTGTAATACAAATTTTTAAACTGATGCTTCATTTTGCTACAAAATAATTTGGAGTAAATGTTTGATATGATTTATTTATGAAACCTAATGAAGCAGAATTAAATACTGTATTAAAATAAGTTCGCTGTCTTTAAACAAATGGAGATGACTACTAAGTCACATTGACTTTAACATGAGGTATCACTATACCTTATTTGTTAAAATATATACTGTATACATTTTATATATTTTAACACTTAATACTATGAAAACAAATAATTGTAAAGGAATCTTGTCAGATTACAGTAAGAATGAACATATTTGTGGCATCGAGTTAAAGTTTATATTTCCCCTAAATATGCTGTGATTCTAATACATTCGTGTAGGTTTTCAAGTAGAAATAAACCTCGTAACAAGTTACTGAACGTTTAAACAGCCTGACAAGCATGTATATATGTTTAAAATTCAATAAACAAAGACCCAGTCCCTAAATTATAGAAATTTAAATTATTCTTGCATGTTTATCGACATCACAACAGATCCCTAAATCCCTAAATCCCTAAAGATTAGATACAAATTTTTTACCACAGTATCACTTGTCAGAATTTATTTTTAAATATGATTTTTTAAAACTGCCAGTAAGAAATTTTAAATTAAACCCATTTGTTAAAGGATATAGTGCCCAAGTTATATGGTGACCTACCTTTGTCAATACTTAGCATTATGTATTTCAAATTATCCAATATACATGTCATATATATTTTTATATGTCACATATATAAAAGATATGTATGATCTATGTGAATCCTAAGTAAATATTTTGTTCCAGAAAAGTACAAAATAATAAAGGTAAAAATAATCTATAATTTTCAGGACCACAGACTAAGCTGTCGAAATTAACGCTGATTTTTTTAGGGCCAGAATACCAAAATGGCTCCTCTCTTCCCCCAAAATTGGACAATTTCAAATGCAAAATAATTCATTATTTAATATATGAGTTGCTTCCTCTATTTGGTTTCC
配列番号85 HCR-hAATプロモーター配列
GGCTCAGAGGCACACAGGAGTTTCTGGGCTCACCCTGCCCCCTTCCAACCCCTCAGTTCCCATCCTCCAGCAGCTGTTTGTGTGCTGCCTCTGAAGTCCACACTGAACAAACTTCAGCCTACTCATGTCCCTAAAATGGGCAAACATTGCAAGCAGCAAACAGCAAACACACAGCCCTCCCTGCCTGCTGACCTTGGAGCTGGGGCAGAGGTCAGAGACCTCTCTGGGCCCATGCCACCTCCAACATCCACTCGACCCCTTGGAATTTCGGTGGAGAGGAGCAGAGGTTGTCCTGGCGTGGTTTAGGTAGTGTGAGAGGATCTTGCTACCAGTGGAACAGCCACTAAGGATTCTGCAGTGAGAGCAGAGGGCCAGCTAAGTGGTACTCTCCCAGAGACTGTCTGACTCACGCCACCCCCTCCACCTTGGACACAGGACGCTGTGGTTTCTGAGCCAGGTACAATGACTCCTTTCGGTAAGTGCAGTGGAAGCTGTACACTGCCCAGGCAAAGCGTCCGGGCAGCGTAGGCGGGCGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGATCCACTGCTTAAATACGGACGAGGACAGGGCCCTGTCTCCTCAGCTTCAGGCACCACCACTGACCTGGGACAGTGAATCGTAAGT
配列番号80 Q1プロモーター配列
AAGCAAATAT TTGTGGTTAT GGATTAACTC GAACTGTTTG CCCACTCTATTTGCCCGGCGCCCTTTGGAC CTTTTGCAAT CCTGGAGCAA ACAGCAAACACGGACTTAGC CCCTGTTTGC TCCTCCGATAACTGGGGTGA CCTTGGTTAATATTCACCAG CAGCCTCGGG CATATAAAAC AGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCA ATCACCACCA AGCCTGGAAT AACTGCAGCC ACC
配列番号81 Q1-プライムプロモーター配列
AAGCAAATAT TTGTGGTTAT GGATTAACTC GAACTGTTTG CCCACTCTAT TTGCCCGGCGCCCTTTGGAC CTTTTGCAAT CCTGGAGCAA ACAGCAAACA CGACTCAGAT CCCAGCCAGT GGACTTAGCC CCTGTTTGCTCCTCCGATAA CTGGGGTGAC CTTGGTTAAT ATTCACCAGC AGCCTCCCCC GTTGCCCCTC TGGGGCATATAAAACAGGGG CAAGGCACAG ACTCATAGCA GAGCAATCAC CACCAAGCCT GGAATAACTG CAGCCACC
配列番号82 C14プロモーター配列
TTAATATTTAACATCCTAGCACAGCTTCACTTCCAGGTATGACCTTTGAACCTCTTCTAGAAGGGTAATTATTAACCTAGCTAGGTATGACCTTCGAACCTCTTCTAGAAGTGAAGCTGGGCATATAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATTACCACCAAGCCTGGAATAGCTGCAGCCACC
配列番号83 C16プロモーター配列
GGTTAATAATTACCCTTCTAGGATTGAGTCACTTCTAGAAGCTGGACTTTGGACTCATCCTAGAAGTCACTTCCTCTTTTTTACCTAGAAGAGGTTCAAAGGTCATACCTAGCATAGCTTCACTTCTAGAAGGGTAATTATTAACCGGGCATATAAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATCACCACCAGGCCTGGAATAACTGCAGCCACC
配列番号84 プロモーター配列
AAGCAAATATTTGTGGTTATGGATTAACTCGAACTGTTTGCCCACTCTATTTGCCCGGCGCCCTTTGGACCTTTTGCAATCCTGGAGCAAACAGCAAACACGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCATGAGCGGAAGTGGGTCTCAACCACTATAAATCCTCTCTGTGCCCGTCCGGAGCTGGTGAGGACAGCCACC
配列番号85 プロモーター配列
TAAAGCAAATATTTGTGGTTATGGATTAACTCGAACTTCTAGAAGCTGTTTGCCCACTCTATTTGCCCATCCTAGGTAGGCGCCCTTTGGACCTTTTGCAATCCTGGCTTCTAGAAGAGCAAACAGCAAACACATCCTAGGTAGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCAT
配列番号86 プロモーター配列
AAGCAAATATTTGTGGTTATGGATTAACTCGAACTGTTTGCCCACTCTATTTGCCCGGCGCCCTTTGGACCTTTTGCAATCCTGGAGCAAACAGCAAACACGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCGGGCATATAAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATCACCACCAAGCCTGGAATAACTGCAGCCACC
配列番号87 プロモーター配列
AAGCAAATATTTGTGGTTATGGATTAACTCGAACTGTTTGCCCACTCTATTTGCCCGGCGCCCTTTGGACCTTTTGCAATCCTGGAGCAAACAGCAAACACGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGGGCATATAAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATCACCACCAAGCCTGGAATAACTGCAGCCACC
配列番号88 SV40ポリA配列
TGCTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTTAACAACAACAATTGCATTCATTTTATGTTTCAGGTTCAGGGGGAGGTGTGGGAGGTTTTTTAAA
配列番号89 マカカ・ファスシクラリス、NCBIアクセッション番号XM_005543185.2、予測:マカカ・ファスシクラリス アンジオポエチン様3(ANGPTL3)、mRNA
TACAATTTCAAATTACCTATTAAGTTAGTTGCTCATTTCTTTGATTTCATTTAGCATTGATGTAACTCAATGTGGAAGAAGGTTACATTCGTGCAAGTTAACATGGCTTAATGATTAACTATATTCACCTGCCAACCTTGCCTTTTCTGTGGCAAATATTGGTATATATAGAGTTAAGAAGTCTAGGTCTGCTTCCAGAAGAACACAGTTCCACGCTGCTTGAAATTGAAAATCAGGATAAAAATGTTCACAATTAAGCTCCTTCTTTTTATTGTTCCTCTAGTTATTTCCTCCAGAATTGACCAAGACAATTCATCATTTGATTCTGTATCTCCAGAGCCAAAATCAAGATTTGCTATGTTAGACGATGTAAAAATTTTAGCCAATGGCCTCCTTCAGTTGGGACATGGTCTTAAAGACTTTGTCCATAAGACTAAGGGCCAAATTAATGACATATTTCAAAAACTCAACATATTTGATCAGTCTTTTTATGATCTATCACTGCAAACCAGTGAAATCAAAGAAGAAGAAAAGGAACTGAGAAGAACTACATATAAACTACAAGTCAAAAATGAAGAGGTAAAGAATATGTCACTTGAACTCAACTCAAAACTTGAAAGCCTCCTAGAAGAAAAAATTCTACTTCAACAAAAAGTGAAATATTTAGAAGAGCAACTAACTAACTTAATTCAAAATCAACCTGCAACTCCAGAACATCCAGAAGTAACTTCACTTAAAAGTTTTGTAGAAAAACAAGATAATAGCATCAAAGACCTTCTCCAGACTGTGGAAGAACAATATAAGCAATTAAACCAACAGCATAGTCAAATAAAAGAAATAGAAAATCAGCTCAGAATGACTAATATTCAAGAACCCACAGAAATTTCTCTATCTTCCAAGCCAAGAGCACCAAGAACTACTCCCTTTCTTCAGCTGAATGAAATAAGAAATGTAAAACATGATGGCATTCCTGCTGATTGTACCACCATTTACAATAGAGGTGAACATATAAGTGGCACGTATGCCATCAGACCCAGCAACTCTCAAGTTTTTCATGTCTACTGTGATGTTGTATCAGGTAGTCCATGGACATTAATTCAACATCGAATAGATGGATCACAAAACTTCAATGAAACGTGGGAGAACTACAAATATGGTTTCGGGAGGCTTGATGGAGAATTCTGGTTGGGCCTAGAGAAGATATACTCCATAGTGAAGCAATCTAATTACGTTTTACGAATTGAGTTGGAAGACTGGAAAGACAACAAACATTATATTGAATATTCTTTTTACTTGGGAAATCACGAAACCAACTATACGCTACATGTAGTTAAGATTACTGGCAATGTCCCCAATGCAATCCCGGAAAACAAAGATTTGGTGTTTTCTACTTGGGATCACAAAGCAAAAGGACACTTCAGCTGTCCAGAGAGTTATTCAGGAGGCTGGTGGTGGCATGATGAGTGTGGAGAAAACAACCTAAATGGTAAATATAACAAACCAAGAACAAAATCTAAGCCAGAGCGGAGAAGAGGATTATCCTGGAAGTCTCAAAATGGAAGGTTATACTCTATAAAATCAACCAAAATGTTGATCCATCCAACAGATTCAGAAAGCTTTGAATGAACTGAGGCAAATTTAAAAGGCAATAAATTAAACATTAAACTCATTCCAAGTTAATGTGGTTTAATAATCTGGTATTAAATCCTTAAGAGAAGGCTTGAGAAATAGATTTTTTTATCTTAAAGTCACTGTCAATTTAAGATTAAACATACAATCACATAACCTTAAAGAATACCATTTACATTTCTCAATCAAAATTCTTACAACACTATTTGTTTTATATTTTGTGATGTGGGAATCAATTTTAGATGGTCGCAATCTAAATTATAATCAACAGGTGAACTTACTAAATAACTTTTCTAAATAAAAAACTTAGAGACTTTAATTTTAAAAGTCATCATATGAGCTAATATCACAATTTTCCCAGTTTAAAAAACTAGTTTTCTTGTTAAAACTCTAAACTTGACTAAATAAAGAGGACTGATAATTATACAGTTCTTAAATTTGTTGTAATATTAATTTCAAAACTAAAAATTGTCAGCACAGAGTATGTGTAAAAATCTGTAATATAAATTTTTAAACTGATGCCTCATTTTGCTACAAAATAATCTGGAGTAAATTTTTGATAGGATTTATTTATGAAACCTAATGAAGCAGGATTAAATACTGTATTAAAATAGGTTCGCTGTCTTTTAAACAAATGGAGATGATGATTACTAAGTCACATTGACTTTAATATGAGGTATCACTATACCTTAACATATTTGTTAAAACGTATACTGTATACATTTTGTGTATTTTAATACTTAATACTATGAAAACAAGTAATTGTAAACGTATCTTGTCAGATTACAATAGGAATGAACATATTGGTGACATCGAGTTAAAGTTTATATTTCCCCTAAATATGCTGCGATTCCAATATATTCATGTAGGTTTTCAAGCAGAAATAAACCTTGTAACAAGTTACTGACTAAACAGCCTGACAAGTATGTATATATGTTTAAAATTCAATAAATAAAGACCCAGTCTTCTAAATTATAAAAATTTAAATTAGTCTTGCACAAATTAAATTATTCATCACAAAAGATGTATTGTTATTTTTAAGTCATTTAAGCCCTAAATCCCTAAAGATTAGATATAAATTTTTTTTGCCAGAGTATAAATTGTCAGAATTTATTTTTAAATATATTTTTTAAAACTACCAGTAAGAAATTTTAAATTAAACCCATTTGTTAAAGGATATAGTGCCCAAGTTATACGGTGACCTACCTTTGTCAATATTTAGCATTATGTATTTCAAATTATCCAATATACATGTCATATATATTTTTATATGTTGCATATATAAAAGATATACACGATTTATGTGAATCCTATGTAAATATTTTGTTCCAGAAAAGTACAAAATAATAAAGGTAAAAATAATCCA
配列番号90 NA配列マウスAngptl3 mRNA
ACAGGAGGGAGAAGTTCCAAATTGCTTAAAATTGAATAATTGAGACAAAAAATGCACACAATTAAATTATTCCTTTTTGTTGTTCCTTTAGTAATTGCATCCAGAGTGGATCCAGACCTTTCATCATTTGATTCTGCACCTTCAGAGCCAAAATCAAGATTTGCTATGTTGGATGATGTCAAAATTTTAGCGAATGGCCTCCTGCAGCTGGGTCATGGACTTAAAGATTTTGTCCATAAGACTAAGGGACAAATTAACGACATATTTCAGAAGCTCAACATATTTGATCAGTCTTTTTATGACCTATCACTTCGAACCAATGAAATCAAAGAAGAGGAAAAGGAGCTAAGAAGAACTACATCTACACTACAAGTTAAAAACGAGGAGGTGAAGAACATGTCAGTAGAACTGAACTCAAAGCTTGAGAGTCTGCTGGAAGAGAAGACAGCCCTTCAACACAAGGTCAGGGCTTTGGAGGAGCAGCTAACCAACTTAATTCTAAGCCCAGCTGGGGCTCAGGAGCACCCAGAAGTAACATCACTCAAAAGTTTTGTAGAACAGCAAGACAACAGCATAAGAGAACTCCTCCAGAGTGTGGAAGAACAGTATAAACAATTAAGTCAACAGCACATGCAGATAAAAGAAATAGAAAAGCAGCTCAGAAAGACTGGTATTCAAGAACCCTCAGAAAATTCTCTTTCTTCTAAATCAAGAGCACCAAGAACTACTCCCCCTCTTCAACTGAACGAAACAGAAAATACAGAACAAGATGACCTTCCTGCCGACTGCTCTGCCGTTTATAACAGAGGCGAACATACAAGTGGCGTGTACACTATTAAACCAAGAAACTCCCAAGGGTTTAATGTCTACTGTGATACCCAATCAGGCAGTCCATGGACATTAATTCAACACCGGAAAGATGGCTCACAGGACTTCAACGAAACATGGGAAAACTACGAAAAGGGCTTTGGGAGGCTCGATGGAGAATTTTGGTTGGGCCTAGAGAAGATCTATGCTATAGTCCAACAGTCTAACTACATTTTACGACTCGAGCTACAAGACTGGAAAGACAGCAAGCACTACGTTGAATACTCCTTTCACCTGGGCAGTCACGAAACCAACTACACGCTACATGTGGCTGAGATTGCTGGCAATATCCCTGGGGCCCTCCCAGAGCACACAGACCTGATGTTTTCTACATGGAATCACAGAGCAAAGGGACAGCTCTACTGTCCAGAAAGTTACTCAGGTGGCTGGTGGTGGAATGACATATGTGGAGAAAACAACCTAAATGGAAAATACAACAAACCCAGAACCAAATCCAGACCAGAGAGAAGAAGAGGGATCTACTGGAGACCTCAGAGCAGAAAGCTCTATGCTATCAAATCATCCAAAATGATGCTCCAGCCCACCACCTAAGAAGCTTCAACTGAACTGAGACAAAATAAAAGATCAATAAATTAAATATTAAAGTCCTCCCGATCACTGTAGTAATCTGGTATTAAAATTTTAATGGAAAGCTTGAGAATTGAATTTCAATTAGGTTTAAACTCATTGTTAAGATCAGATATCACCGAATCAACGTAAACAAAATTTATCTTTTTCAATC
配列番号91 NA配列ラットAngptl3 mRNA
GACGTTCCAAATTGCTTGAAATTGAATAATTGAAACAAAAATGCACACAATTAAGCTGCTCCTTTTTGTTGTTCCTCTAGTAATTTCGTCCAGAGTTGATCCAGACCTTTCGCCATTTGATTCTGTACCGTCAGAGCCAAAATCAAGATTTGCTATGTTGGATGATGTCAAAATTTTAGCCAATGGCCTCCTGCAGCTGGGTCATGGTCTTAAAGATTTTGTCCATAAGACAAAGGGACAAATTAATGACATATTTCAGAAGCTCAACATATTTGATCAGTGTTTTTATGACCTATCACTTCAAACCAATGAAATCAAAGAAGAGGAAAAGGAGCTAAGAAGAACCACATCTAAACTACAAGTTAAAAACGAAGAGGTGAAGAATATGTCACTTGAACTGAACTCAAAGCTTGAAAGTCTACTGGAGGAGAAGATGGCGCTCCAACACAGAGTCAGGGCTTTGGAGGAACAGCTGACCAGCTTGGTTCAGAACCCGCCTGGGGCTCGGGAGCACCCAGAGGTAACGTCACTTAAAAGTTTTGTAGAACAGCAAGATAACAGCATAAGAGAACTCCTCCAGAGTGTGGAAGAACAATATAAACAACTAAGTCAACAGCACATTCAGATAAAAGAAATAGAAAATCAGCTCAGAAAGACTGGCATTCAAGAACCCACTGAAAATTCTCTTTATTCTAAACCAAGAGCACCAAGAACTACTCCCCCTCTTCATCTGAAGGAAGCAAAAAATATAGAACAAGATGATCTGCCTGCTGACTGCTCTGCCATTTATAACAGAGGTGAACATACAAGTGGCGTGTATACTATTAGACCAAGCAGCTCTCAAGTGTTTAATGTCTACTGTGACACCCAATCAGGCACTCCACGGACATTAATTCAACACCGGAAAGATGGCTCTCAAAACTTCAACCAAACGTGGGAAAACTACGAAAAGGGTTTTGGGAGGCTTGATGGTAAAGTGATTTCCTTGCATCACTCACTTATCTGTTGATTTAATAGTATTAGTTGGGTGTGTTGACACAGGCCTGAGACCATAGCGCTTTTGGGCAAGGGGGGAGGAGGAGCAGCAGGTGAATTGAAAGTTCAAGACCAGTCTGGGCCACACATTGATACTCCTTCTCGACATTAAGAATTATAAATTAAGCAGCAATTATAAAATGGGCTGTGGAAATGTAACAATAAGCAAAAGCAGACCCCAGTCTTCATAAAACTGATTGGTAAATATTATCCATGATAGCAACTGCAATGATCTCATTGTACTTATCACTACTGCATGCCTGCAGTATGCTTGTTGAAACTTAATTCTATAGTTCATGGTTATCATAAGTCTTATTAAGGAACATAGTATACGCCATTGGCTCTAGTGAGGGGCCATGCTACAAATGAGCTGCAAAGATAGCAGTATAGAGCTCTTTCAGTGATATCCTAAGCACAACGTAACACAGGTGAAATGGGCTGGAGGCACAGTTGTGGTGGAACACGCGGCCAGCAGGACACTGGGACTGATCCCCAGCAGCACAAAGAAAGTGATAGGAACACAGAGCGAGAGTTAGAAGGGACAGGGTCACCGTCAGAGATACGGTGTCTAACTCCTGCAACCCTACCTGTAATTATTCCATATTATAAACATATACTATATAACTGTGGGTCTCTGCATGTTCTAGAATATGAATTCTATTTGATTGTAAAACAAAACTATAAAAATAAGTAAAAAAATAAAAAATAAACAGATACTTAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
配列番号92 NA配列miANG-SCR1ガイド
GTAGTTCTATTAGCGCTTACTA
配列番号93 NA配列miANG-SCR2ガイド
ATGGATCGAGTCTCGTTATATA
配列番号94 HCR-hAATプロモーター配列
GGCTCAGAGGCACACAGGAGTTTCTGGGCTCACCCTGCCCCCTTCCAACCCCTCAGTTCCCATCCTCCAGCAGCTGTTTGTGTGCTGCCTCTGAAGTCCACACTGAACAAACTTCAGCCTACTCATGTCCCTAAAATGGGCAAACATTGCAAGCAGCAAACAGCAAACACACAGCCCTCCCTGCCTGCTGACCTTGGAGCTGGGGCAGAGGTCAGAGACCTCTCTGGGCCCATGCCACCTCCAACATCCACTCGACCCCTTGGAATTTCGGTGGAGAGGAGCAGAGGTTGTCCTGGCGTGGTTTAGGTAGTGTGAGAGGATCTTGCTACCAGTGGAACAGCCACTAAGGATTCTGCAGTGAGAGCAGAGGGCCAGCTAAGTGGTACTCTCCCAGAGACTGTCTGACTCACGCCACCCCCTCCACCTTGGACACAGGACGCTGTGGTTTCTGAGCCAGGTACAATGACTCCTTTCGGTAAGTGCAGTGGAAGCTGTACACTGCCCAGGCAAAGCGTCCGGGCAGCGTAGGCGGGCGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGATCCACTGCTTAAATACGGACGAGGACAGGGCCCTGTCTCCTCAGCTTCAGGCACCACCACTGACCTGGGACAGTGAATCGTAAGT
配列番号95 NA配列LucANG-A
TTCTCTATCTCCAGAGCCAAAATCAAGATTTGCTATGTTAGACGATGTAAGACATATTTCAAAAACTCAACATATTTGATCAGTCTTTTTATGATCTATCTCTATCTTCCAAGCCAAGAGCACCAAGAACTACTCCCTTTCTTCAGTTGAATGTTATATCAGGTAGTCCATGGACATTAATTCAACATCGAATAGATGGA
配列番号96 NA配列LucANG-B
TACGCTACATCTAGTTGCGATTACTGGCAATGTCCCCAATGCAATCCCGG
配列番号97 NA hAAT-pri-miANG5カセット
GGCTCAGAGGCACACAGGAGTTTCTGGGCTCACCCTGCCCCCTTCCAACCCCTCAGTTCCCATCCTCCAGCAGCTGTTTGTGTGCTGCCTCTGAAGTCCACACTGAACAAACTTCAGCCTACTCATGTCCCTAAAATGGGCAAACATTGCAAGCAGCAAACAGCAAACACACAGCCCTCCCTGCCTGCTGACCTTGGAGCTGGGGCAGAGGTCAGAGACCTCTCTGGGCCCATGCCACCTCCAACATCCACTCGACCCCTTGGAATTTCGGTGGAGAGGAGCAGAGGTTGTCCTGGCGTGGTTTAGGTAGTGTGAGAGGATCTTGCTACCAGTGGAACAGCCACTAAGGATTCTGCAGTGAGAGCAGAGGGCCAGCTAAGTGGTACTCTCCCAGAGACTGTCTGACTCACGCCACCCCCTCCACCTTGGACACAGGACGCTGTGGTTTCTGAGCCAGGTACAATGACTCCTTTCGGTAAGTGCAGTGGAAGCTGTACACTGCCCAGGCAAAGCGTCCGGGCAGCGTAGGCGGGCGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGATCCACTGCTTAAATACGGACGAGGACAGGGCCCTGTCTCCTCAGCTTCAGGCACCACCACTGACCTGGGACAGTGAATCGTAAGTCTCTGGAGCCTGACAAGGAGGACAGGAGAGATGCTGCAAGCCCAAGAAGCTCTCTGCTCAGCCTGTCACAACCTACTGACTGCCAGGGCACTTGGGAATGGCAAGGTAGCAAATCTTGATTTTGGCTCCAAAATCAAGATTTGCTCTCTTGCTATACCCAGAAAACGTGCCAGGAAGAGAACTCAGGACCCTGAAGCAGACTACTGGAAGGGAGACTCCAGCTCAAACAAGGCAGGGGTGGGGGCGTGGGATTGCTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTTAACAACAACAATTGCATTCATTTTATGTTTCAGGTTCAGGGGGAGGTGTGGGAGGTTTTTTAAA
配列番号98 hAATのウイルスベクターゲノム-pri-miANG5
TTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTGGAGGGGTGGAGTCGTGACGTGAATTACGTCATAGGGTTAGGGAGGTCAGATCTGAGCTCCATGGCGCGCCGGCTCAGAGGCACACAGGAGTTTCTGGGCTCACCCTGCCCCCTTCCAACCCCTCAGTTCCCATCCTCCAGCAGCTGTTTGTGTGCTGCCTCTGAAGTCCACACTGAACAAACTTCAGCCTACTCATGTCCCTAAAATGGGCAAACATTGCAAGCAGCAAACAGCAAACACACAGCCCTCCCTGCCTGCTGACCTTGGAGCTGGGGCAGAGGTCAGAGACCTCTCTGGGCCCATGCCACCTCCAACATCCACTCGACCCCTTGGAATTTCGGTGGAGAGGAGCAGAGGTTGTCCTGGCGTGGTTTAGGTAGTGTGAGAGGATCTTGCTACCAGTGGAACAGCCACTAAGGATTCTGCAGTGAGAGCAGAGGGCCAGCTAAGTGGTACTCTCCCAGAGACTGTCTGACTCACGCCACCCCCTCCACCTTGGACACAGGACGCTGTGGTTTCTGAGCCAGGTACAATGACTCCTTTCGGTAAGTGCAGTGGAAGCTGTACACTGCCCAGGCAAAGCGTCCGGGCAGCGTAGGCGGGCGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGATCCACTGCTTAAATACGGACGAGGACAGGGCCCTGTCTCCTCAGCTTCAGGCACCACCACTGACCTGGGACAGTGAATCGTAAGTCTCTGGAGCCTGACAAGGAGGACAGGAGAGATGCTGCAAGCCCAAGAAGCTCTCTGCTCAGCCTGTCACAACCTACTGACTGCCAGGGCACTTGGGAATGGCAAGGTAGCAAATCTTGATTTTGGCTCCAAAATCAAGATTTGCTCTCTTGCTATACCCAGAAAACGTGCCAGGAAGAGAACTCAGGACCCTGAAGCAGACTACTGGAAGGGAGACTCCAGCTCAAACAAGGCAGGGGTGGGGGCGTGGGATTGCTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTTAACAACAACAATTGCATTCATTTTATGTTTCAGGTTCAGGGGGAGGTGTGGGAGGTTTTTTAAAGCGGCCGCAGATCTGTAGATAAGTAGCATGGCGGGTTAATCATTAACTACAAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAA
配列番号99 VP3 AAV5構築物(ハイブリッドVP1)30
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPTGKRIDDHFPKRKKARTEEDSKPSTSSDAEAGPSGSQQLQIPAQPASSLGADTMSAGGGGPLGDNNQGADGVGNASGDWHCDSTWMGDRVVTKSTRTWVLPSYNNHQYREIKSGSVDGSNANAYFGYSTPWGYFDFNRFHSHWSPRDWQRLINNYWGFRPRSLRVKIFNIQVKEVTVQDSTTTIANNLTSTVQVFTDDDYQLPYVVGNGTEGCLPAFPPQVFTLPQYGYATLNRDNTENPTERSSFFCLEYFPSKMLRTGNNFEFTYNFEEVPFHSSFAPSQNLFKLANPLVDQYLYRFVSTNNTGGVQFNKNLAGRYANTYKNWFPGPMGRTQGWNLGSGVNRASVSAFATTNRMELEGASYQVPPQPNGMTNNLQGSNTYALENTMIFNSQPANPGTTATYLEGNMLITSESETQPVNRVAYNVGGQMATNNQSSTTAPATGTYNLQEIVPGSVWMERDVYLQGPIWAKIPETGAHFHPSPAMGGFGLKHPPPMMLIKNTPVPGNITSFSDVPVSSFITQYSTGQVTVEMEWELKKENSKRWNPEIQYTNNYNDPQFVDFAPDSTGEYRTTRPIGTRYLTRPL
配列番号100 ベクターゲノム定量のためのプライマーフォワード
GGGAGGTGTGGGAGGTTT
配列番号101 ベクターゲノム定量のためのプライマーリバース
AATGATTAACCCGCCATGCT
配列番号102 ベクターゲノム定量のためのプローブ
[FAM] ACT TAT CTA CAG ATC TGC GGC CGC T [TAMRA]
配列番号103 ACTB定量のためのプライマーフォワード
AGGTGCACAGTAGGTCTGAACAGA
配列番号104 ACTB定量のためのプライマーリバース
TGCAAAGAACACGGCTAAGTGT
配列番号105 逆転写miANG5 24ntプライマーの標的配列
TAGCAAATCTTGATTTTGGCTCCA
配列番号106 プローブ24nt miANG5の設計のための標的配列
[FAM] TAGCAAATCTTGATTTTGGCTCCA [NFQ]
配列番号107 miANG5 24ntの定量のための合成RNAオリゴ
rUrArGrCrArArArUrCrUrUrGrArUrUrUrUrGrGrCrUrCrCrA
配列番号108 プロモーター配列
TAAAGCAAATATTTGTGGTTATGGATTAACTCGAACTTCTAGAAGCTGTTTGCCCACTCTATTTGCCCATCCTAGGTAGGCGCCCTTTGGACCTTTTGCAATCCTGGCTTCTAGAAGAGCAAACAGCAAACACATCCTAGGTAGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCATGCTAGCCTCGAGGATATCAGATCTGGGCGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGATCCACTGCTTAAATACGGACGAGGACAGGGCCCTGTCTCCTCAGCTTCAGGCACCACCACTGACCTGGGACAGTGAATCGCCACC
配列番号109 プロモーター配列
TAAAGCAAATATTTGTGGTTATGGATTAACTCGAACTTCTAGAAGCTGTTTGCCCACTCTATTTGCCCATCCTAGGTAGGCGCCCTTTGGACCTTTTGCAATCCTGGCTTCTAGAAGAGCAAACAGCAAACACATCCTAGGTAGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCATGCTAGCCTCGAGGATATCAGATCTTCATCTATTTCCTGCCCACATCTGGTATAAAAGGAGGCAGTGGCCCACAGAGGAGCACAGCTGTGCCACC
配列番号110 プロモーター配列
TTAATATTTAACATCCTAGCACAGCTTCACTTCCAGGTATGACCTTTGAACCTCTTCTAGAAGGGTAATTATTAACCTAGCTAGGTATGACCTTCGAACCTCTTCTAGAAGTGAAGCTGGGCATATAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATTACCACCAAGCCTGGAATAGCTGCAGCCACC
配列番号111 プロモーター配列
GGTTAATAATTACCCTTCTAGGATTGAGTCACTTCTAGAAGCTGGACTTTGGACTCATCCTAGAAGTCACTTCCTCTTTTTTACCTAGAAGAGGTTCAAAGGTCATACCTAGCATAGCTTCACTTCTAGAAGGGTAATTATTAACCGGGCATATAAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATCACCACCAGGCCTGGAATAACTGCAGCCACC
配列番号112 プロモーター配列
CATAGCTTCACTTCTAGAAGAGGTCAGGGTGACCTGGGCCTACCTAGCTAGGTTAATAATTACCCTTCTAGAAGTGACTCAATCCTAGAAGCCGGAAGTGGCATCCTAGAAGAGGTTCAAAGGTCATACCTAGGTAAAAAAGAGGAAGTGACTTCTAGGATAAGGAAGTACTTCTAGAAGTACTTCCTTATCCTAGCATAGCTTCACTTCTAGAAGAGGTTCAAAGGTCATACCTAGGTATGACCTTTGAACCTCTTCTANAAGTTAATATTTAACATCCTAGAAGGGTAATTATTAACCTAGCAAGGCTGACTACACGAGCACATATCAGCGCGTCGACGATATCAGACCTGGGCATATAAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATCACCACCAAGCCTGGAATAACTGCAGCCACCATGG
配列番号113 プロモーター配列
TTTCTCTGGCCTAACTGGCCGGTACCGTCGACTGTGCTCGGACCTGTAGATGCTAGTCTAGAAGAGGTTCAAAGGTCATACCTAGGATAAGGAAGTACTTCTAGGTAGGCCCAGGTCACCCTGACCTCTTCTAGGATAAGGAAGTACTTCTAGAAGAGGTCAGGGTGACCTGGGCCTACCTAGAAGTACTTCCTTATCCTAGGTATGACCTTTGAACCTCTTCTAGACTAGCATCTACAGGTCCGAGCACAGTCGACGGTACCGGCCAGTTAGGCCAGAGAAATGTTCTGNCACCTG
配列番号114 プロモーター配列
TAGTAGGGCAAAGGTCACTTCTAGAAGCCGGAAGTGGCATCCTAGAAGTGACTCAATCCTAGAAGAGGTCAGGGTGACCTGGGCCTACCTAGAAGTGACTCAATCCTAGGATGTTAAATATTAACTTCTAGTAGCAAGGCTGACTACACGAGCACATATCAACGCGTCGACGATATCAGATCTGGGCATATAAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATCACCACCAAGCCTGGAATAACTGCAGCCACCATGG
配列番号115 配列番号94の誘導体
AAGCAAATATTTGTGGTTATGGATTAACTCGAACTGTTTGCCCACTCTATTTGCCCGGCGCCCTTTGGACCTTTTGCAATCCTGGAGCAAACAGCAAACACGACTCAGATCCCAGCCAGTGGACTTAGCCCCTGTTTGCTCCTCCGATAACTGGGGTGACCTTGGTTAATATTCACCAGCAGCCTCCCCCGTTGCCCCTCTGGGGCATATAAAACAGGGGCAAGGCACAGACTCATAGCAGAGCAATCACCACCAAGCCTGGAATAACTGCAGCCACC
配列番号124 改変miR-451をコードする核酸配列
CTCTGGAGCCTGACAAGGAGGACAGGAGAGATGCTGCAAGCCCAAGAAGCTCTCTGCTCAGCCTGTCACAACCTACTGACTGCCAGGGCACTTGGGAATGGCAAGGTAGCAAATCTTGATTTTGGCTCCAAAATCAAGATTTGCTCTCTTGCTATACCCAGAAAACGTGCCAGGAAGAGAACTCAGGACCCTGAAGCAGACTACTGGAAGGGAGACTCCAGCTCAAACAAGGCAGGGGTGGGGGCGTGGGAT
配列番号125 逆転写miANG5 23ntバリアントTプライマーのための標的配列
TAGCAAATCTTGATTTTGGCTCT
配列番号126 プローブmiANG5 23ntバリアントT設計のための標的配列
TAGCAAATCTTGATTTTGGCTCT
配列番号127 miANG5 23ntバリアントT定量のための合成RNAオリゴ
rUrArGrCrArArArUrCrUrUrGrArUrUrUrUrGrGrCrUrCrU
前記核酸は、上述のように、前記RNA分子へ転写することができる。前記RNA分子は、上述のように、前記「オフターゲット」問題を阻害及び/又はさらに低減するために、本発明において有用である。好ましくは、上述のように、前記RNAヘアピンは、ショートヘアピンRNA(shRNA)又はロングヘアピンRNA(lhRNA)である。より好ましくは、上述のように、RNA分子は、miR-451を含む。さらに好ましくは、前記RNA分子は、改変miR-451をコードする核酸配列である配列番号116からコードされている。配列番号116などの核酸配列又は前記miR-451をコードする配列は、AAV遺伝子治療ビヒクルなどの遺伝子治療ビヒクルで構成されるベクターに含められて標的臓器に送達されるのに好適である。さらに、前記核酸配列によってコードされている前記RNA分子を使用することによる前記「オフターゲット」問題は低減する及び/又は阻害される。これにより、前記核酸は、上述のようなニーズを満たす。
本明細書で使用される場合、「RNA分子」という用語は、ヘアピン、二本鎖RNA(dsRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、及びマイクロRNA(miRNA)を指す。前記ヘアピンは、好ましくは、ショートヘアピンRNA(shRNA)又はロングヘアピンRNA(lhRNA)である。より好ましくは、前記RNA分子は、miR-451、又は配列番号116によってコードされているRNA分子である。
本明細書で記載される場合、「RNA分子をコードする核酸配列」という用語は、ヘアピン、二本鎖RNA(dsRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、及びマイクロRNA(miRNA)などのRNA分子をコードする核酸配列を指す。好ましくは、前記核酸配列は、miR451骨格に基づくマイクロRNAをコードする。好ましくは、前記核酸配列は、配列番号116を含む。前記RNA分子は、ANGPTL3遺伝子の転写物を低減させる及び/又はノックダウンするのに使用することができる。
任意選択で、前記AAV遺伝子治療ビヒクルは、前記DNA発現カセットを含み、前記DNA発現カセットは、RNA分子をコードする配列番号116を含むか、又は前記DNA発現カセットは、miR-451をコードし、前記RNA分子は、ANGPTL3遺伝子の転写物を標的化、切断及び/又はノックダウンすることができ、前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドタンパク質は、AAV2/5ハイブリッドキャプシドタンパク質配列によって、又はAAV5キャプシドタンパク質配列によってコードされている。
マウス及びサル肝臓におけるベクターDNA、mRNA及びmiANG5の定量
DNeasy(登録商標)血液及び組織キット(Qiagen)を、供給業者のプロトコルに従って使用して、肝臓由来のDNAを抽出する。ベクターゲノムコピーを、「細胞からのベクターDNAの単離及び定量」の項に記載のとおりに定量する。肝臓におけるANGPTL3 mRNAレベルは、「内因性Huh-7 ANGPTL3 mRNAノックダウンの測定」の項で先に記載しているように決定する。miANG5を定量化するために、24nt(プライマー標的配列、配列番号105)又は23nt(バリアントT)処理されたmiANG5(プライマー標的配列、配列番号117)に特異的な逆転写プライマーを有するTaqMan MicroRNA逆転写キット(Thermo Fisher Scientific)を使用して、肝臓由来のRNAを逆転写する。2つのカスタムTaqMan QPCR低分子RNAアッセイ(Thermo Fischer Scientific)を実施して、24nt(アッセイID CTFVKZT、ラックID、配列番号106)又は23nt(バリアントT)の長さ(アッセイID CTGZFJP、配列番号118)の最も豊富なmiANG5種を測定する。合成RNAオリゴの連続希釈を標準として使用して、肝臓試料あたりのmiANG5の24nt(配列番号107)又は23nt(バリアントT;配列番号119)分子/細胞の量を計算する(Integrated DNA Technologies)。
配列番号116 改変miR-451をコードする核酸配列
CTCTGGAGCCTGACAAGGAGGACAGGAGAGATGCTGCAAGCCCAAGAAGCTCTCTGCTCAGCCTGTCACAACCTACTGACTGCCAGGGCACTTGGGAATGGCAAGGTAGCAAATCTTGATTTTGGCTCCAAAATCAAGATTTGCTCTCTTGCTATACCCAGAAAACGTGCCAGGAAGAGAACTCAGGACCCTGAAGCAGACTACTGGAAGGGAGACTCCAGCTCAAACAAGGCAGGGGTGGGGGCGTGGGAT
配列番号117 逆転写miANG5 23ntバリアントTプライマーのための標的配列
TAGCAAATCTTGATTTTGGCTCT
配列番号118 プローブmiANG5 23ntバリアントT設計のための標的配列
TAGCAAATCTTGATTTTGGCTCT
配列番号119 miANG5 23ntバリアントT定量のための合成RNAオリゴ
rUrArGrCrArArArUrCrUrUrGrArUrUrUrUrGrGrCrUrCrU

Claims (33)

  1. RNA分子をコードする核酸配列を含む核酸であって、前記RNA分子が第1のRNA配列及び第2のRNA配列を含み、前記第1のRNA配列が、アンジオポエチン様3(ANGPTL3)遺伝子によってコードされているRNAに含まれる標的RNA配列に実質的に相補的な配列を含み、前記標的RNA配列に実質的に相補的な前記配列が少なくとも19個のヌクレオチドを有し、前記RNA分子がヘアピン、二本鎖RNA(dsRNA)、低分子干渉RNA(siRNA)、及びマイクロRNA(miRNA)を含む、核酸。
  2. 前記ヘアピンが、ショートヘアピンRNA(shRNA)又はロングヘアピンRNA(lhRNA)である、請求項1に記載の核酸。
  3. 前記RNA分子がmiR451を含む、請求項1又は2に記載の核酸。
  4. 前記標的RNA配列に実質的に相補的な前記配列が、少なくとも15個のヌクレオチドを有し、好ましくは少なくとも22個のヌクレオチドを有する、請求項1~3のいずれか一項に記載の核酸。
  5. 前記標的RNA配列に実質的に相補的な前記配列が、最大30個のヌクレオチドを有し、好ましくは最大28個のヌクレオチドを有する、請求項1~4のいずれか一項に記載の核酸。
  6. 前記標的RNA配列が、前記ANGPTL3遺伝子に含まれる少なくとも1つのエクソンの一部によってコードされているRNA配列を含み、好ましくは、前記エクソンが、エクソン1、エクソン3、エクソン5、又はエクソン6である、請求項1~5のいずれか一項に記載の核酸。
  7. 前記標的RNA配列が、前記ANGPTL3遺伝子に含まれる前記少なくとも1つのエクソンの一部によってコードされているRNA配列を含み、前記エクソンは、エクソン1、エクソン5、又はエクソン6である、請求項1~6のいずれか一項に記載の核酸。
  8. 前記ANGPTL3遺伝子に含まれる前記少なくとも1つのエクソンの一部が、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、又は配列番号7を含む、請求項1~7のいずれか一項に記載の核酸。
  9. 前記標的RNA配列に実質的に相補的な前記配列が、配列番号8~25からなる群から選択される、請求項1~8のいずれか一項に記載の核酸。
  10. 前記標的RNA配列に実質的に相補的な前記配列が、配列番号11、配列番号12、配列番号16、配列番号17、配列番号20、及び配列番号25、好ましくは配列番号12からなる群から選択される、請求項1~9のいずれか一項に記載の核酸。
  11. DNA分子である、請求項1~10のいずれか一項に記載の核酸。
  12. 請求項1~10のいずれか一項に記載の核酸を含むDNA発現カセットであって、プロモーター、ポリAテールをさらに含み、2つの逆位末端配列(ITR)に隣接している、DNA発現カセット。
  13. 前記プロモーターが肝臓特異的プロモーターを含む、請求項11又は12に記載のDNA発現カセット。
  14. 請求項12又は13に記載のDNA発現カセットが含まれる、AAV遺伝子治療ビヒクル。
  15. 前記AAV遺伝子治療ビヒクルのキャプシドが、AAV5キャプシドタンパク質配列を含む、請求項14に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル。
  16. 請求項14又は15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクルを含む、組成物。
  17. 血漿中のコレステロールレベル、低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)レベル及び/又はアテローム性動脈硬化病変を低減させる及び/又は阻害する少なくとも1つの分子をさらに含む、請求項16に記載の組成物。
  18. 前記アテローム性動脈硬化病変が、重度のアテローム性動脈硬化病変を含む、請求項17に記載の組成物。
  19. 前記少なくとも1つの分子が、スタチンのうちの少なくとも1つを含む、請求項17又は18に記載の組成物。
  20. 前記少なくとも1つの分子が、アトルバスタチン、セリバスタチン、フルバスタチン、ロバスタチン、メバスタチン、ピタバスタチン、プラバスタチン、ロスバスタチン、及びシンバスタチンからなる群より選択される、請求項16~19のいずれか一項に記載の組成物。
  21. 前記少なくとも1つの分子が、アトルバスタチン及び/又はシンバスタチンを含む、請求項16~20のいずれか一項に記載の組成物。
  22. 医薬としての使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  23. ANGPTL3遺伝子によってコードされている転写物を減少させる及び/又はノックダウンする医薬としての使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  24. 前記医薬が、血漿中のコレステロールレベル、リン脂質レベル、アテローム性動脈硬化病変、トリグリセリド(TG)レベル、総コレステロール(TC)レベル及び/又は低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)レベルを低下させる及び/又は阻害する、請求項22又は23に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  25. 前記アテローム性動脈硬化病変が、初期、軽度、及び/又は重度のアテローム性動脈硬化病変を含む、請求項24に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  26. 前記医薬が、血漿中のコレステロールレベル、低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)レベル及び/又はアテローム性動脈硬化病変をさらに低減させる及び/又は阻害する少なくとも1つの分子をさらに含む、請求項22~25のいずれか一項に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  27. 前記アテローム性動脈硬化病変が、重度のアテローム性動脈硬化病変を含む、請求項26に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  28. 前記少なくとも1つの分子が、スタチンのうち少なくとも1つを含む、請求項26又は27に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  29. 前記少なくとも1つの分子が、アトルバスタチン、セリバスタチン、フルバスタチン、ロバスタチン、メバスタチン、ピタバスタチン、プラバスタチン、ロスバスタチン、及びシンバスタチンからなる群から選択される、請求項26~28のいずれか一項に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  30. 前記少なくとも1つの分子が、アトルバスタチン及び/又はシンバスタチンを含む、請求項26~29のいずれか一項に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  31. 前記医薬が、脂質及び/又はリポタンパク質代謝障害の治療及び/又は予防のために使用される、請求項22~30のいずれか一項に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  32. 前記医薬が、脂質異常症の治療及び/又は予防のために使用される、請求項22~31のいずれか一項に記載の使用のための、請求項14若しくは15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクル又は請求項16~21のいずれか一項に記載の組成物。
  33. 請求項14又は15に記載のAAV遺伝子治療ビヒクルと、スタチンを含む組成物とを含む、パーツのキット(kit of parts)。
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