JP2023509423A - 神経変性状態のためのバイオマーカーとしてのキナーゼ - Google Patents
神経変性状態のためのバイオマーカーとしてのキナーゼ Download PDFInfo
- Publication number
- JP2023509423A JP2023509423A JP2022540337A JP2022540337A JP2023509423A JP 2023509423 A JP2023509423 A JP 2023509423A JP 2022540337 A JP2022540337 A JP 2022540337A JP 2022540337 A JP2022540337 A JP 2022540337A JP 2023509423 A JP2023509423 A JP 2023509423A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- neurodegenerative
- subject
- kinase
- protein
- synuclein
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 230000000626 neurodegenerative effect Effects 0.000 title claims abstract description 255
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 title claims abstract description 189
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 title claims abstract description 189
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 title claims description 226
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 197
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 193
- 230000011664 signaling Effects 0.000 claims abstract description 158
- 210000001808 exosome Anatomy 0.000 claims abstract description 121
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims abstract description 48
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims abstract description 41
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims abstract description 31
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims abstract description 31
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 claims abstract description 27
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 claims abstract description 23
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 claims abstract description 22
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 247
- 108090000185 alpha-Synuclein Proteins 0.000 claims description 191
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 80
- 241000894007 species Species 0.000 claims description 69
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 66
- 108010026424 tau Proteins Proteins 0.000 claims description 58
- 102000013498 tau Proteins Human genes 0.000 claims description 57
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 50
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 48
- 102000013455 Amyloid beta-Peptides Human genes 0.000 claims description 44
- 108010090849 Amyloid beta-Peptides Proteins 0.000 claims description 44
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims description 44
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 42
- 230000008859 change Effects 0.000 claims description 39
- 108010007457 Extracellular Signal-Regulated MAP Kinases Proteins 0.000 claims description 37
- 102000007665 Extracellular Signal-Regulated MAP Kinases Human genes 0.000 claims description 37
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 37
- 102000043136 MAP kinase family Human genes 0.000 claims description 36
- 108091054455 MAP kinase family Proteins 0.000 claims description 36
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 35
- 108010051975 Glycogen Synthase Kinase 3 beta Proteins 0.000 claims description 34
- 102100038104 Glycogen synthase kinase-3 beta Human genes 0.000 claims description 34
- 208000023105 Huntington disease Diseases 0.000 claims description 32
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 claims description 30
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 claims description 30
- 208000018737 Parkinson disease Diseases 0.000 claims description 29
- 239000004090 neuroprotective agent Substances 0.000 claims description 28
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 claims description 28
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 claims description 27
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 claims description 26
- 208000024827 Alzheimer disease Diseases 0.000 claims description 24
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 24
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 claims description 23
- 208000032859 Synucleinopathies Diseases 0.000 claims description 22
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 claims description 19
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 claims description 19
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 claims description 19
- -1 MirapexTM) Chemical compound 0.000 claims description 18
- 102000004232 Mitogen-Activated Protein Kinase Kinases Human genes 0.000 claims description 18
- 108090000744 Mitogen-Activated Protein Kinase Kinases Proteins 0.000 claims description 18
- 108091008611 Protein Kinase B Proteins 0.000 claims description 18
- 102100033810 RAC-alpha serine/threonine-protein kinase Human genes 0.000 claims description 18
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 18
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 17
- 201000002832 Lewy body dementia Diseases 0.000 claims description 17
- 230000000324 neuroprotective effect Effects 0.000 claims description 17
- 208000009829 Lewy Body Disease Diseases 0.000 claims description 16
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 claims description 16
- 208000015122 neurodegenerative disease Diseases 0.000 claims description 15
- FASDKYOPVNHBLU-ZETCQYMHSA-N pramipexole Chemical compound C1[C@@H](NCCC)CCC2=C1SC(N)=N2 FASDKYOPVNHBLU-ZETCQYMHSA-N 0.000 claims description 15
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 15
- 208000034799 Tauopathies Diseases 0.000 claims description 14
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 14
- 238000012774 diagnostic algorithm Methods 0.000 claims description 14
- 229960003089 pramipexole Drugs 0.000 claims description 14
- 239000003136 dopamine receptor stimulating agent Substances 0.000 claims description 13
- 238000010801 machine learning Methods 0.000 claims description 13
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 12
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 11
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 claims description 11
- 238000001262 western blot Methods 0.000 claims description 11
- XSVMFMHYUFZWBK-NSHDSACASA-N Rivastigmine Chemical compound CCN(C)C(=O)OC1=CC=CC([C@H](C)N(C)C)=C1 XSVMFMHYUFZWBK-NSHDSACASA-N 0.000 claims description 10
- 238000012417 linear regression Methods 0.000 claims description 10
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 claims description 10
- VYFYYTLLBUKUHU-UHFFFAOYSA-N dopamine Chemical compound NCCC1=CC=C(O)C(O)=C1 VYFYYTLLBUKUHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 9
- UHSKFQJFRQCDBE-UHFFFAOYSA-N ropinirole Chemical compound CCCN(CCC)CCC1=CC=CC2=C1CC(=O)N2 UHSKFQJFRQCDBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- MEZLKOACVSPNER-GFCCVEGCSA-N selegiline Chemical compound C#CCN(C)[C@H](C)CC1=CC=CC=C1 MEZLKOACVSPNER-GFCCVEGCSA-N 0.000 claims description 9
- 238000012549 training Methods 0.000 claims description 9
- FASDKYOPVNHBLU-UHFFFAOYSA-N N6-Propyl-4,5,6,7-tetrahydro-1,3-benzothiazole-2,6-diamine Chemical group C1C(NCCC)CCC2=C1SC(N)=N2 FASDKYOPVNHBLU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- ATALOFNDEOCMKK-OITMNORJSA-N aprepitant Chemical group O([C@@H]([C@@H]1C=2C=CC(F)=CC=2)O[C@H](C)C=2C=C(C=C(C=2)C(F)(F)F)C(F)(F)F)CCN1CC1=NNC(=O)N1 ATALOFNDEOCMKK-OITMNORJSA-N 0.000 claims description 8
- 229960001372 aprepitant Drugs 0.000 claims description 8
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 8
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 claims description 8
- IVTMXOXVAHXCHI-YXLMWLKOSA-N (2s)-2-amino-3-(3,4-dihydroxyphenyl)propanoic acid;(2s)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)-2-hydrazinyl-2-methylpropanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C(O)=C1.NN[C@@](C(O)=O)(C)CC1=CC=C(O)C(O)=C1 IVTMXOXVAHXCHI-YXLMWLKOSA-N 0.000 claims description 7
- 102000006378 Catechol O-methyltransferase Human genes 0.000 claims description 6
- 108020002739 Catechol O-methyltransferase Proteins 0.000 claims description 6
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 claims description 6
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 6
- 108010012255 Neural Cell Adhesion Molecule L1 Proteins 0.000 claims description 6
- VMWNQDUVQKEIOC-CYBMUJFWSA-N apomorphine Chemical compound C([C@H]1N(C)CC2)C3=CC=C(O)C(O)=C3C3=C1C2=CC=C3 VMWNQDUVQKEIOC-CYBMUJFWSA-N 0.000 claims description 6
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 claims description 6
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 claims description 6
- JRURYQJSLYLRLN-BJMVGYQFSA-N entacapone Chemical compound CCN(CC)C(=O)C(\C#N)=C\C1=CC(O)=C(O)C([N+]([O-])=O)=C1 JRURYQJSLYLRLN-BJMVGYQFSA-N 0.000 claims description 6
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 6
- 210000003061 neural cell Anatomy 0.000 claims description 6
- 239000002742 neurokinin 1 receptor antagonist Substances 0.000 claims description 6
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 6
- 238000012628 principal component regression Methods 0.000 claims description 6
- RUOKEQAAGRXIBM-GFCCVEGCSA-N rasagiline Chemical compound C1=CC=C2[C@H](NCC#C)CCC2=C1 RUOKEQAAGRXIBM-GFCCVEGCSA-N 0.000 claims description 6
- KFQYTPMOWPVWEJ-INIZCTEOSA-N rotigotine Chemical compound CCCN([C@@H]1CC2=CC=CC(O)=C2CC1)CCC1=CC=CS1 KFQYTPMOWPVWEJ-INIZCTEOSA-N 0.000 claims description 6
- MIQPIUSUKVNLNT-UHFFFAOYSA-N tolcapone Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1C(=O)C1=CC(O)=C(O)C([N+]([O-])=O)=C1 MIQPIUSUKVNLNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 238000005199 ultracentrifugation Methods 0.000 claims description 6
- 238000000585 Mann–Whitney U test Methods 0.000 claims description 5
- 238000001793 Wilcoxon signed-rank test Methods 0.000 claims description 5
- 238000000540 analysis of variance Methods 0.000 claims description 5
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 claims description 5
- 229940108366 exelon Drugs 0.000 claims description 5
- 238000007477 logistic regression Methods 0.000 claims description 5
- 238000007427 paired t-test Methods 0.000 claims description 5
- 238000000611 regression analysis Methods 0.000 claims description 5
- 229960004136 rivastigmine Drugs 0.000 claims description 5
- 239000003369 serotonin 5-HT3 receptor antagonist Substances 0.000 claims description 5
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 5
- 238000001629 sign test Methods 0.000 claims description 5
- 238000011870 unpaired t-test Methods 0.000 claims description 5
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims description 5
- FELGMEQIXOGIFQ-UHFFFAOYSA-N Ondansetron Chemical group CC1=NC=CN1CC1C(=O)C(C=2C(=CC=CC=2)N2C)=C2CC1 FELGMEQIXOGIFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 102000003799 beta-Synuclein Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000182 beta-Synuclein Proteins 0.000 claims description 4
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 claims description 4
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims description 4
- 229960005343 ondansetron Drugs 0.000 claims description 4
- 238000012706 support-vector machine Methods 0.000 claims description 4
- WTDRDQBEARUVNC-LURJTMIESA-N L-DOPA Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C(O)=C1 WTDRDQBEARUVNC-LURJTMIESA-N 0.000 claims description 3
- WTDRDQBEARUVNC-UHFFFAOYSA-N L-Dopa Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C(O)=C1 WTDRDQBEARUVNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 102000010909 Monoamine Oxidase Human genes 0.000 claims description 3
- 108010062431 Monoamine oxidase Proteins 0.000 claims description 3
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 claims description 3
- HWHLPVGTWGOCJO-UHFFFAOYSA-N Trihexyphenidyl Chemical group C1CCCCC1C(C=1C=CC=CC=1)(O)CCN1CCCCC1 HWHLPVGTWGOCJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- DKNWSYNQZKUICI-UHFFFAOYSA-N amantadine Chemical compound C1C(C2)CC3CC2CC1(N)C3 DKNWSYNQZKUICI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 229960003805 amantadine Drugs 0.000 claims description 3
- 229940070343 apokyn Drugs 0.000 claims description 3
- 229960004046 apomorphine Drugs 0.000 claims description 3
- 238000013528 artificial neural network Methods 0.000 claims description 3
- 229940031774 azilect Drugs 0.000 claims description 3
- GIJXKZJWITVLHI-PMOLBWCYSA-N benzatropine Chemical compound O([C@H]1C[C@H]2CC[C@@H](C1)N2C)C(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 GIJXKZJWITVLHI-PMOLBWCYSA-N 0.000 claims description 3
- 229960001081 benzatropine Drugs 0.000 claims description 3
- CPFJLLXFNPCTDW-BWSPSPBFSA-N benzatropine mesylate Chemical compound CS([O-])(=O)=O.O([C@H]1C[C@H]2CC[C@@H](C1)[NH+]2C)C(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 CPFJLLXFNPCTDW-BWSPSPBFSA-N 0.000 claims description 3
- 239000000544 cholinesterase inhibitor Substances 0.000 claims description 3
- 229940097480 cogentin Drugs 0.000 claims description 3
- 229940087613 comtan Drugs 0.000 claims description 3
- 238000003066 decision tree Methods 0.000 claims description 3
- 229940084238 eldepryl Drugs 0.000 claims description 3
- 229960003337 entacapone Drugs 0.000 claims description 3
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 3
- 229960004502 levodopa Drugs 0.000 claims description 3
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims description 3
- 229940020452 neupro Drugs 0.000 claims description 3
- 238000010238 partial least squares regression Methods 0.000 claims description 3
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000007637 random forest analysis Methods 0.000 claims description 3
- 229960000245 rasagiline Drugs 0.000 claims description 3
- 229940113775 requip Drugs 0.000 claims description 3
- 229960001879 ropinirole Drugs 0.000 claims description 3
- 229960003179 rotigotine Drugs 0.000 claims description 3
- 229940013066 rytary Drugs 0.000 claims description 3
- 229960003946 selegiline Drugs 0.000 claims description 3
- 229940001089 sinemet Drugs 0.000 claims description 3
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 claims description 3
- 229940000238 tasmar Drugs 0.000 claims description 3
- 229960004603 tolcapone Drugs 0.000 claims description 3
- 229960001032 trihexyphenidyl Drugs 0.000 claims description 3
- 229940068543 zelapar Drugs 0.000 claims description 3
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 claims description 2
- 241000270322 Lepidosauria Species 0.000 claims description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims description 2
- 241000288906 Primates Species 0.000 claims description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 claims description 2
- 238000000432 density-gradient centrifugation Methods 0.000 claims description 2
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 claims description 2
- 230000003228 microsomal effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000004112 neuroprotection Effects 0.000 claims description 2
- 244000052769 pathogen Species 0.000 claims description 2
- 239000008177 pharmaceutical agent Substances 0.000 claims description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 2
- 238000013180 random effects model Methods 0.000 claims description 2
- 102000003802 alpha-Synuclein Human genes 0.000 claims 48
- 229940122041 Cholinesterase inhibitor Drugs 0.000 claims 1
- 102000019009 Neural Cell Adhesion Molecule L1 Human genes 0.000 claims 1
- 230000001078 anti-cholinergic effect Effects 0.000 claims 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 abstract description 21
- 102100026882 Alpha-synuclein Human genes 0.000 description 147
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 34
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 33
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 26
- 230000004770 neurodegeneration Effects 0.000 description 24
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 18
- 208000001089 Multiple system atrophy Diseases 0.000 description 12
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 11
- 238000009534 blood test Methods 0.000 description 11
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 11
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 10
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 10
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 10
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 10
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 10
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 10
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 10
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 10
- 102000019355 Synuclein Human genes 0.000 description 9
- 108050006783 Synuclein Proteins 0.000 description 9
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 9
- 229940000406 drug candidate Drugs 0.000 description 9
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 9
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 9
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 8
- ADEBPBSSDYVVLD-UHFFFAOYSA-N donepezil Chemical compound O=C1C=2C=C(OC)C(OC)=CC=2CC1CC(CC1)CCN1CC1=CC=CC=C1 ADEBPBSSDYVVLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 8
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 8
- 102100040347 TAR DNA-binding protein 43 Human genes 0.000 description 7
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 7
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 7
- 210000002682 neurofibrillary tangle Anatomy 0.000 description 7
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 7
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 7
- 238000002877 time resolved fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 7
- 101000834898 Homo sapiens Alpha-synuclein Proteins 0.000 description 6
- 101710150875 TAR DNA-binding protein 43 Proteins 0.000 description 6
- 102100023038 WD and tetratricopeptide repeats protein 1 Human genes 0.000 description 6
- 230000035508 accumulation Effects 0.000 description 6
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 6
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 6
- 230000006870 function Effects 0.000 description 6
- ASUTZQLVASHGKV-JDFRZJQESA-N galanthamine Chemical compound O1C(=C23)C(OC)=CC=C2CN(C)CC[C@]23[C@@H]1C[C@@H](O)C=C2 ASUTZQLVASHGKV-JDFRZJQESA-N 0.000 description 6
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 6
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 6
- 230000004043 responsiveness Effects 0.000 description 6
- 206010012289 Dementia Diseases 0.000 description 5
- 201000011240 Frontotemporal dementia Diseases 0.000 description 5
- 102100024964 Neural cell adhesion molecule L1 Human genes 0.000 description 5
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 5
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 5
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 238000007635 classification algorithm Methods 0.000 description 5
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 5
- 238000006384 oligomerization reaction Methods 0.000 description 5
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 5
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 5
- 102100032693 Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 2 Human genes 0.000 description 4
- 208000027089 Parkinsonian disease Diseases 0.000 description 4
- 206010034010 Parkinsonism Diseases 0.000 description 4
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 4
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 4
- 102100038376 Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial Human genes 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 4
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 4
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 4
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 4
- 238000009509 drug development Methods 0.000 description 4
- 238000002296 dynamic light scattering Methods 0.000 description 4
- 238000000021 kinase assay Methods 0.000 description 4
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 231100000189 neurotoxic Toxicity 0.000 description 4
- 230000002887 neurotoxic effect Effects 0.000 description 4
- 238000009116 palliative therapy Methods 0.000 description 4
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 4
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 4
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 4
- 239000000902 placebo Substances 0.000 description 4
- 229940068196 placebo Drugs 0.000 description 4
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 238000013517 stratification Methods 0.000 description 4
- 210000003523 substantia nigra Anatomy 0.000 description 4
- 101800001718 Amyloid-beta protein Proteins 0.000 description 3
- 102100022207 E3 ubiquitin-protein ligase parkin Human genes 0.000 description 3
- 101000941879 Homo sapiens Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 2 Proteins 0.000 description 3
- 108010055717 JNK Mitogen-Activated Protein Kinases Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 102000011732 Proline-Directed Protein Kinases Human genes 0.000 description 3
- 108010076669 Proline-Directed Protein Kinases Proteins 0.000 description 3
- 102000013530 TOR Serine-Threonine Kinases Human genes 0.000 description 3
- 108010065917 TOR Serine-Threonine Kinases Proteins 0.000 description 3
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 3
- VREFGVBLTWBCJP-UHFFFAOYSA-N alprazolam Chemical compound C12=CC(Cl)=CC=C2N2C(C)=NN=C2CN=C1C1=CC=CC=C1 VREFGVBLTWBCJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 206010002026 amyotrophic lateral sclerosis Diseases 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 3
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 3
- 238000003759 clinical diagnosis Methods 0.000 description 3
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 3
- 229960003638 dopamine Drugs 0.000 description 3
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 3
- 230000007310 pathophysiology Effects 0.000 description 3
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 3
- 229950010601 pramipexole dihydrochloride monohydrate Drugs 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 201000002212 progressive supranuclear palsy Diseases 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 3
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 3
- 239000013638 trimer Substances 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- MKJIEFSOBYUXJB-WEZHFFAMSA-N (3s,11bs)-3-(2-methylpropyl)-9,10-bis(trideuteriomethoxy)-1,3,4,6,7,11b-hexahydrobenzo[a]quinolizin-2-one Chemical compound C1CN2C[C@H](CC(C)C)C(=O)C[C@H]2C2=C1C=C(OC([2H])([2H])[2H])C(OC([2H])([2H])[2H])=C2 MKJIEFSOBYUXJB-WEZHFFAMSA-N 0.000 description 2
- 208000014644 Brain disease Diseases 0.000 description 2
- 230000005653 Brownian motion process Effects 0.000 description 2
- 208000011990 Corticobasal Degeneration Diseases 0.000 description 2
- 101710173364 Cyclin-dependent kinase 5 homolog Proteins 0.000 description 2
- 102100026805 Cyclin-dependent-like kinase 5 Human genes 0.000 description 2
- 101710133745 Cyclin-dependent-like kinase 5 Proteins 0.000 description 2
- 108010044266 Dopamine Plasma Membrane Transport Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 2
- 229940121710 HMGCoA reductase inhibitor Drugs 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101000619542 Homo sapiens E3 ubiquitin-protein ligase parkin Proteins 0.000 description 2
- 101000891092 Homo sapiens TAR DNA-binding protein 43 Proteins 0.000 description 2
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 2
- 102000016252 Huntingtin Human genes 0.000 description 2
- 108050004784 Huntingtin Proteins 0.000 description 2
- PCZOHLXUXFIOCF-UHFFFAOYSA-N Monacolin X Natural products C12C(OC(=O)C(C)CC)CC(C)C=C2C=CC(C)C1CCC1CC(O)CC(=O)O1 PCZOHLXUXFIOCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000016285 Movement disease Diseases 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 2
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 2
- 101150110423 SNCA gene Proteins 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100033928 Sodium-dependent dopamine transporter Human genes 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 206010044565 Tremor Diseases 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 2
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 2
- 229940065524 anticholinergics inhalants for obstructive airway diseases Drugs 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-N arachidonic acid Chemical compound CCCCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCC(O)=O YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-N 0.000 description 2
- 229940039856 aricept Drugs 0.000 description 2
- 210000004227 basal ganglia Anatomy 0.000 description 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 2
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 2
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 2
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000000055 blue native polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000005537 brownian motion Methods 0.000 description 2
- 210000001638 cerebellum Anatomy 0.000 description 2
- 210000003710 cerebral cortex Anatomy 0.000 description 2
- 230000002490 cerebral effect Effects 0.000 description 2
- 239000000812 cholinergic antagonist Substances 0.000 description 2
- 238000011278 co-treatment Methods 0.000 description 2
- 230000006999 cognitive decline Effects 0.000 description 2
- 208000010877 cognitive disease Diseases 0.000 description 2
- 230000001149 cognitive effect Effects 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 2
- 230000002559 cytogenic effect Effects 0.000 description 2
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 2
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 2
- 230000001934 delay Effects 0.000 description 2
- 238000002298 density-gradient ultracentrifugation Methods 0.000 description 2
- 229960003530 donepezil Drugs 0.000 description 2
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 2
- 239000003777 experimental drug Substances 0.000 description 2
- 238000001249 flow field-flow fractionation Methods 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 229960003980 galantamine Drugs 0.000 description 2
- ASUTZQLVASHGKV-UHFFFAOYSA-N galanthamine hydrochloride Natural products O1C(=C23)C(OC)=CC=C2CN(C)CCC23C1CC(O)C=C2 ASUTZQLVASHGKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002471 hydroxymethylglutaryl coenzyme A reductase inhibitor Substances 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- NTHXOOBQLCIOLC-UHFFFAOYSA-N iohexol Chemical compound OCC(O)CN(C(=O)C)C1=C(I)C(C(=O)NCC(O)CO)=C(I)C(C(=O)NCC(O)CO)=C1I NTHXOOBQLCIOLC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 2
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 2
- 210000004558 lewy body Anatomy 0.000 description 2
- PCZOHLXUXFIOCF-BXMDZJJMSA-N lovastatin Chemical compound C([C@H]1[C@@H](C)C=CC2=C[C@H](C)C[C@@H]([C@H]12)OC(=O)[C@@H](C)CC)C[C@@H]1C[C@@H](O)CC(=O)O1 PCZOHLXUXFIOCF-BXMDZJJMSA-N 0.000 description 2
- 229960004844 lovastatin Drugs 0.000 description 2
- QLJODMDSTUBWDW-UHFFFAOYSA-N lovastatin hydroxy acid Natural products C1=CC(C)C(CCC(O)CC(O)CC(O)=O)C2C(OC(=O)C(C)CC)CC(C)C=C21 QLJODMDSTUBWDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 2
- 210000002487 multivesicular body Anatomy 0.000 description 2
- 238000001426 native polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 2
- 230000003961 neuronal insult Effects 0.000 description 2
- 230000002981 neuropathic effect Effects 0.000 description 2
- 238000011859 neuroprotective therapy Methods 0.000 description 2
- 239000002581 neurotoxin Substances 0.000 description 2
- 231100000618 neurotoxin Toxicity 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- DIVDFFZHCJEHGG-UHFFFAOYSA-N oxidopamine Chemical compound NCCC1=CC(O)=C(O)C=C1O DIVDFFZHCJEHGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002638 palliative care Methods 0.000 description 2
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 108010040003 polyglutamine Proteins 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 2
- 230000001144 postural effect Effects 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 2
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 2
- 229940051845 razadyne Drugs 0.000 description 2
- 238000012502 risk assessment Methods 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 230000009747 swallowing Effects 0.000 description 2
- 108010061506 tau-protein kinase Proteins 0.000 description 2
- 238000011285 therapeutic regimen Methods 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 2
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 2
- MKJIEFSOBYUXJB-HOCLYGCPSA-N (3S,11bS)-9,10-dimethoxy-3-isobutyl-1,3,4,6,7,11b-hexahydro-2H-pyrido[2,1-a]isoquinolin-2-one Chemical compound C1CN2C[C@H](CC(C)C)C(=O)C[C@H]2C2=C1C=C(OC)C(OC)=C2 MKJIEFSOBYUXJB-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 1
- AUFIRGPROMANKW-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-3,6-dihydro-2h-pyridine Chemical compound CN1CCC=CC1 AUFIRGPROMANKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000000044 Amnesia Diseases 0.000 description 1
- 208000037259 Amyloid Plaque Diseases 0.000 description 1
- 101710137189 Amyloid-beta A4 protein Proteins 0.000 description 1
- 102100022704 Amyloid-beta precursor protein Human genes 0.000 description 1
- 101710151993 Amyloid-beta precursor protein Proteins 0.000 description 1
- 206010006100 Bradykinesia Diseases 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 101150117962 DUSP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010067889 Dementia with Lewy bodies Diseases 0.000 description 1
- 102100034428 Dual specificity protein phosphatase 1 Human genes 0.000 description 1
- 206010013887 Dysarthria Diseases 0.000 description 1
- 208000012661 Dyskinesia Diseases 0.000 description 1
- 101710179006 E3 ubiquitin-protein ligase parkin Proteins 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000032274 Encephalopathy Diseases 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 229910052693 Europium Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 208000036119 Frailty Diseases 0.000 description 1
- 208000002339 Frontotemporal Lobar Degeneration Diseases 0.000 description 1
- 230000005526 G1 to G0 transition Effects 0.000 description 1
- 206010017577 Gait disturbance Diseases 0.000 description 1
- 206010018341 Gliosis Diseases 0.000 description 1
- 208000004547 Hallucinations Diseases 0.000 description 1
- 101000605835 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 208000006083 Hypokinesia Diseases 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 208000015592 Involuntary movements Diseases 0.000 description 1
- FFFHZYDWPBMWHY-VKHMYHEASA-N L-homocysteine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCS FFFHZYDWPBMWHY-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010020246 Leucine-Rich Repeat Serine-Threonine Protein Kinase-2 Proteins 0.000 description 1
- 108010047357 Luminescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000006830 Luminescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 101150070547 MAPT gene Proteins 0.000 description 1
- 101150012093 MKP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000026139 Memory disease Diseases 0.000 description 1
- 102000009664 Microtubule-Associated Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010020004 Microtubule-Associated Proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010061296 Motor dysfunction Diseases 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 208000002740 Muscle Rigidity Diseases 0.000 description 1
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 1
- 102000001068 Neural Cell Adhesion Molecules Human genes 0.000 description 1
- 108010069196 Neural Cell Adhesion Molecules Proteins 0.000 description 1
- 208000009668 Neurobehavioral Manifestations Diseases 0.000 description 1
- 206010029350 Neurotoxicity Diseases 0.000 description 1
- 101710138657 Neurotoxin Proteins 0.000 description 1
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010089430 Phosphoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000007982 Phosphoproteins Human genes 0.000 description 1
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 208000000609 Pick Disease of the Brain Diseases 0.000 description 1
- 208000024571 Pick disease Diseases 0.000 description 1
- 206010037180 Psychiatric symptoms Diseases 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 206010071390 Resting tremor Diseases 0.000 description 1
- 101100478343 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) srk1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710168567 Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 208000036278 TDP-43 proteinopathy Diseases 0.000 description 1
- 101710173511 Tensin homolog Proteins 0.000 description 1
- 241001455273 Tetrapoda Species 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 206010044221 Toxic encephalopathy Diseases 0.000 description 1
- 208000030886 Traumatic Brain injury Diseases 0.000 description 1
- 206010047571 Visual impairment Diseases 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- DZHSAHHDTRWUTF-SIQRNXPUSA-N amyloid-beta polypeptide 42 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)[C@@H](C)CC)C(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1N=CNC=1)NC(=O)[C@H](CC=1N=CNC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1N=CNC=1)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)C(C)C)C(C)C)C1=CC=CC=C1 DZHSAHHDTRWUTF-SIQRNXPUSA-N 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 1
- 229940114079 arachidonic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000021342 arachidonic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000000149 argon plasma sintering Methods 0.000 description 1
- 206010003549 asthenia Diseases 0.000 description 1
- 210000001130 astrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000003376 axonal effect Effects 0.000 description 1
- 229940049706 benzodiazepine Drugs 0.000 description 1
- 150000001557 benzodiazepines Chemical class 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- OWMVSZAMULFTJU-UHFFFAOYSA-N bis-tris Chemical compound OCCN(CCO)C(CO)(CO)CO OWMVSZAMULFTJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000117 blood based biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000008499 blood brain barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 1
- 210000001218 blood-brain barrier Anatomy 0.000 description 1
- 230000005978 brain dysfunction Effects 0.000 description 1
- 210000000133 brain stem Anatomy 0.000 description 1
- 210000005013 brain tissue Anatomy 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000005779 cell damage Effects 0.000 description 1
- 230000006727 cell loss Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 210000002583 cell-derived microparticle Anatomy 0.000 description 1
- 208000015114 central nervous system disease Diseases 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000000978 circular dichroism spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000007621 cluster analysis Methods 0.000 description 1
- 239000008119 colloidal silica Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 1
- 230000005786 degenerative changes Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000008021 deposition Effects 0.000 description 1
- 230000006866 deterioration Effects 0.000 description 1
- 229950005031 deutetrabenazine Drugs 0.000 description 1
- 238000012631 diagnostic technique Methods 0.000 description 1
- 238000003748 differential diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 229940042399 direct acting antivirals protease inhibitors Drugs 0.000 description 1
- 238000011979 disease modifying therapy Methods 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 229940052760 dopamine agonists Drugs 0.000 description 1
- 210000005064 dopaminergic neuron Anatomy 0.000 description 1
- 239000003596 drug target Substances 0.000 description 1
- 238000003255 drug test Methods 0.000 description 1
- 238000001493 electron microscopy Methods 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 230000002121 endocytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- OGPBJKLSAFTDLK-UHFFFAOYSA-N europium atom Chemical compound [Eu] OGPBJKLSAFTDLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 238000001825 field-flow fractionation Methods 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 238000002795 fluorescence method Methods 0.000 description 1
- 238000001506 fluorescence spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 238000004817 gas chromatography Methods 0.000 description 1
- 208000016361 genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002518 glial effect Effects 0.000 description 1
- 230000007387 gliosis Effects 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000007417 hierarchical cluster analysis Methods 0.000 description 1
- 210000001320 hippocampus Anatomy 0.000 description 1
- 102000055128 human TARDBP Human genes 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000007154 intracellular accumulation Effects 0.000 description 1
- 210000002977 intracellular fluid Anatomy 0.000 description 1
- 229960004359 iodixanol Drugs 0.000 description 1
- NBQNWMBBSKPBAY-UHFFFAOYSA-N iodixanol Chemical compound IC=1C(C(=O)NCC(O)CO)=C(I)C(C(=O)NCC(O)CO)=C(I)C=1N(C(=O)C)CC(O)CN(C(C)=O)C1=C(I)C(C(=O)NCC(O)CO)=C(I)C(C(=O)NCC(O)CO)=C1I NBQNWMBBSKPBAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001025 iohexol Drugs 0.000 description 1
- 238000004811 liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 230000006984 memory degeneration Effects 0.000 description 1
- 208000023060 memory loss Diseases 0.000 description 1
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 1
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 1
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 1
- 229940101972 mirapex Drugs 0.000 description 1
- 230000006676 mitochondrial damage Effects 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 description 1
- 230000017311 musculoskeletal movement, spinal reflex action Effects 0.000 description 1
- 210000001577 neostriatum Anatomy 0.000 description 1
- 208000033510 neuroaxonal dystrophy Diseases 0.000 description 1
- 230000003188 neurobehavioral effect Effects 0.000 description 1
- 239000003176 neuroleptic agent Substances 0.000 description 1
- 230000016273 neuron death Effects 0.000 description 1
- 231100000228 neurotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000007135 neurotoxicity Effects 0.000 description 1
- 230000003957 neurotransmitter release Effects 0.000 description 1
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002417 nutraceutical Substances 0.000 description 1
- 235000021436 nutraceutical agent Nutrition 0.000 description 1
- 210000003487 olivary nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 230000036542 oxidative stress Effects 0.000 description 1
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 1
- 230000005298 paramagnetic effect Effects 0.000 description 1
- FIKAKWIAUPDISJ-UHFFFAOYSA-L paraquat dichloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].C1=C[N+](C)=CC=C1C1=CC=[N+](C)C=C1 FIKAKWIAUPDISJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 238000003909 pattern recognition Methods 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 230000003836 peripheral circulation Effects 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 210000001428 peripheral nervous system Anatomy 0.000 description 1
- 229920000155 polyglutamine Polymers 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 238000002600 positron emission tomography Methods 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 208000037821 progressive disease Diseases 0.000 description 1
- 230000007101 progressive neurodegeneration Effects 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 238000010384 proximity ligation assay Methods 0.000 description 1
- 239000012521 purified sample Substances 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 229940080817 rotenone Drugs 0.000 description 1
- JUVIOZPCNVVQFO-UHFFFAOYSA-N rotenone Natural products O1C2=C3CC(C(C)=C)OC3=CC=C2C(=O)C2C1COC1=C2C=C(OC)C(OC)=C1 JUVIOZPCNVVQFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003118 sandwich ELISA Methods 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000005201 scrubbing Methods 0.000 description 1
- 208000019116 sleep disease Diseases 0.000 description 1
- 208000022925 sleep disturbance Diseases 0.000 description 1
- 238000004498 smFRET spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 1
- 210000000278 spinal cord Anatomy 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 238000002636 symptomatic treatment Methods 0.000 description 1
- 230000000946 synaptic effect Effects 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 229960005333 tetrabenazine Drugs 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 1
- 230000009529 traumatic brain injury Effects 0.000 description 1
- 238000011179 visual inspection Methods 0.000 description 1
- 230000021542 voluntary musculoskeletal movement Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/573—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for enzymes or isoenzymes
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/483—Physical analysis of biological material
- G01N33/487—Physical analysis of biological material of liquid biological material
- G01N33/49—Blood
- G01N33/491—Blood by separating the blood components
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
- A61K31/365—Lactones
- A61K31/366—Lactones having six-membered rings, e.g. delta-lactones
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/41—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with two or more ring hetero atoms, at least one of which being nitrogen, e.g. tetrazole
- A61K31/425—Thiazoles
- A61K31/426—1,3-Thiazoles
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/535—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with at least one nitrogen and one oxygen as the ring hetero atoms, e.g. 1,2-oxazines
- A61K31/5375—1,4-Oxazines, e.g. morpholine
- A61K31/5377—1,4-Oxazines, e.g. morpholine not condensed and containing further heterocyclic rings, e.g. timolol
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
- A61P25/14—Drugs for disorders of the nervous system for treating abnormal movements, e.g. chorea, dyskinesia
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
- A61P25/14—Drugs for disorders of the nervous system for treating abnormal movements, e.g. chorea, dyskinesia
- A61P25/16—Anti-Parkinson drugs
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
- A61P25/28—Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
- G01N33/6896—Neurological disorders, e.g. Alzheimer's disease
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H10/00—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data
- G16H10/40—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data for data related to laboratory analysis, e.g. patient specimen analysis
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H50/00—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
- G16H50/70—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for mining of medical data, e.g. analysing previous cases of other patients
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H70/00—ICT specially adapted for the handling or processing of medical references
- G16H70/60—ICT specially adapted for the handling or processing of medical references relating to pathologies
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
- G01N2333/91—Transferases (2.)
- G01N2333/912—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/28—Neurological disorders
- G01N2800/2814—Dementia; Cognitive disorders
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/28—Neurological disorders
- G01N2800/2835—Movement disorders, e.g. Parkinson, Huntington, Tourette
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Public Health (AREA)
- Neurosurgery (AREA)
- Neurology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Psychology (AREA)
- Primary Health Care (AREA)
- Psychiatry (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
Abstract
Description
本出願は、2019年12月31日に出願された米国仮出願第62/956,029号の優先日の恩典を主張し、この内容はそれらの全体が本明細書に組み入れられる。
神経変性疾患は、ニューロンの機能低下および死を含む、脳内の変性変化によって特徴付けられる。神経変性疾患としては、非限定的に、パーキンソン病、アルツハイマー病、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症およびレヴィー小体認知症が挙げられる。
図1を参照して、キナーゼについてのアッセイは以下の操作を含む:対象由来の体液試料、例えば血液または唾液試料を得る(100)。血液画分、例えば血漿試料を提供するために、血液試料を処理してもよい。血液試料を神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮する(例えば、神経細胞由来エキソソームを血液試料から単離する)(110)。これは、第一に、総エキソソームを単離すること(111)、および、第二に、総エキソソームから神経細胞由来エキソソームを濃縮すること(112)を伴う、二段階操作であり得る。単離エキソソームをそれらの内部内容物について濃縮する(120)。これは、それらの表面へ結合したタンパク質を除去するためのスクラビングを伴い得る(121)。エキソソームの内部濃縮内容物を分析のために放出する(122)。分析は、以下のいずれかより選択されるバイオマーカーを試料において測定することを伴う:(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態(例えば、オリゴマーアルファシヌクレイン)の量、または(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々の量(例えば、活性)。任意で、神経変性タンパク質の1つまたは複数の形態、例えば、モノマーαシヌクレインおよび/またはオリゴマーαシヌクレインおよびタウまたはアミロイドβの量もまた測定することができる。オリゴマー形態と組み合わせての、キナーゼの測定は、偽陽性分類を減らすことができる。
以下の工程:
a)生体試料のコレクション中の各生体試料を、神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮する工程であって、
(i)生体試料のコレクションが対象のコホート中の対象に由来し、コホートが、以下を含む対象:
(1)複数の異なる病期の各々にある神経変性状態と診断された複数の対象であって、診断された対象の各々が推定神経保護剤を受けたことがある、複数の対象、および/または
(2)複数の健康な対照対象
を含み、生体試料が、推定神経保護剤の投与前に、および投与中に再び1回または複数回、および、任意で、投与後に、収集された、工程;
b)バイオマーカー試料を生成するために、微粒子、例えばエキソソームの内部区画からタンパク質内容物を単離する工程;
c)データセットを作成するために、
バイオマーカー試料において、バイオマーカーのセットを測定する工程
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
d)(i)疾患進行速度または推定神経保護剤に対する反応の程度を予測する診断アルゴリズムを決定するため、経時的に個々の対象において、または
(ii)(1)病原診断を行う、(2)臨床的に類似しているが病因的に異なる神経変性障害サブグループを分ける、または(3)対象が推定神経保護剤に反応する可能性が高いかどうかもしくは対象が推定神経保護剤に反応する可能性が高い程度を予測する、診断アルゴリズムを決定するため、異なる対象間で、
バイオマーカーセットの差を比較するためにデータセットに対して統計解析を行う工程
を含む、方法。
一態様において、方法は、濃縮する工程の前に:
I)対象のコホートを提供する工程であって、コホートが、以下を含む対象:
(i)複数の異なる病期の各々にある神経変性状態と診断された複数の対象、および/または
(ii)複数の健康な対照対象
を含む、工程;
II)診断された対象の各々へ推定神経保護剤を投与する工程;
III)推定神経保護剤の投与前に、および投与中に再び1回または複数回、および、任意で、投与後に、コホート中の対象の各々から生体試料を収集する工程
をさらに含む。
別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質は、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである。別の態様において、方法は、e)標準臨床的尺度に対して診断アルゴリズムのうちの1つまたは複数を検証する工程をさらに含む。別の態様において、統計解析は、相関、ピアソン相関、スピアマン相関、カイ二乗、平均値の比較(例えば、対応のあるT検定、独立T検定、ANOVA)、回帰分析(例えば、単回帰、重回帰、線形回帰、非線形回帰、ロジスティック回帰、多項回帰、段階的回帰、リッジ回帰、ラッソ回帰、エラスティックネット回帰)またはノンパラメトリック分析(例えば、ウィルコクソン順位和検定、ウィルコクソン符号順位検定、符号検定)を含む。別の態様において、統計解析はコンピューターによって実行される。別の態様において、統計解析は機械学習を含む。別の態様において、対象はヒトである。別の態様において、神経変性状態はシヌクレイノパチー障害である。別の態様において、シヌクレイノパチー障害はパーキンソン病である。別の態様において、シヌクレイノパチー障害はレヴィー小体認知症である。別の態様において、標準臨床的尺度は、UPDRSスコア、CGIスコア、および放射線学的所見より選択される。別の態様において、神経変性状態は、アミロイドパチー、タウオパチー、またはハンチントン病である。別の態様において、生体試料は静脈血試料を含む。別の態様において、異なる病期は、疑いあり、初期、中期、および臨床的進行のうちの1つまたは複数を含む。別の態様において、投与中または投与後の時間は、処置後1、2、3ヵ月またはそれ以上より選択される。別の態様において、濃縮する工程は、1つまたは複数の脳特異的タンパク質マーカーを使用することを含む。別の態様において、脳特異的マーカーのうちの少なくとも1つはK1camを含む。別の態様において、単離する工程は、表面膜結合タンパク質を除去するために各濃縮試料中のエキソソームを洗浄することを含む。別の態様において、エキソソームをPBSで洗浄する。別の態様において、神経変性タンパク質の形態を、ゲル電気泳動、ウェスタンブロット、または蛍光技術によって測定する。
以下の工程:
a)対象由来の生体試料を、神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮する工程;
b)バイオマーカー試料を生成するために、微粒子、例えばエキソソームの内部区画からタンパク質内容物を単離する工程;
c)データセットを作成するために、
バイオマーカー試料において、バイオマーカーのセットを測定する工程
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
d)データセットを使用する工程であって、以下:
(1)病原診断を行う、
(2)複数の臨床的に類似しているが病因的に異なる神経変性障害サブグループのうちの1つへ対象を分類する、または
(3)対象が推定神経保護剤に反応する可能性が高いかどうかもしくは対象が推定神経保護剤に反応する可能性が高い程度を予測する
のうちの1つを行う、工程
を含む、方法。
別の態様において、使用する工程は、データセットに対して、本明細書に記載されるような診断アルゴリズムを実行することを含む。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質は、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである。別の態様において、神経細胞由来エキソソームを単離する工程は以下:(i)超遠心分離;(ii)密度勾配遠心分離;または(iii)サイズ排除クロマトグラフィー、を含む。別の態様において、神経細胞由来エキソソームを単離する工程は、脳特異的タンパク質へ結合する結合部分を使用して神経細胞由来エキソソームを捕捉することを含む。別の態様において、脳特異的タンパク質はL1CAMである。別の態様において、単離エキソソームの表面からタンパク質を除去する工程は、単離エキソソームを水溶液(例えば、リン酸緩衝食塩水(「PBS」))で洗浄することを含む。別の態様において、神経変性タンパク質の量を決定する工程は以下:i)オリゴマーα-シヌクレインの種を複数の画分へ分離すること;ii)1つまたは複数の分離されたオリゴマーα-シヌクレイン種、ならびに、任意で、モノマーα-シヌクレイン、タウ-シヌクレインコポリマー、アミロイドβ-シヌクレインコポリマー、およびタウ-アミロイドβ-シヌクレインコポリマーより選択される1つまたは複数の種の各々を測定すること、を含む。別の態様において、種を複数の画分へ分離することは、電気泳動によって分離することを含む。別の態様において、種を複数の画分へ分離することは、クロマトグラフィーによって分離することを含む。別の態様において、分離された種の中でも、2~約100個の単量体単位、4~16個の単量体単位、および約30個以下の単量体単位を有する形態より選択されるα-シヌクレインのうちの少なくとも1つのオリゴマー形態を決定する。別の態様において、分離された種の中でも、モノマーα-シヌクレインの定量的測定値を決定する。別の態様において、分離された種の中でも、複数の異なるオリゴマーα-シヌクレイン種を測定する。別の態様において、分離された種の中でも、α-シヌクレインおよびタウを含むコポリマーを測定する。別の態様において、分離された種の中でも、α-シヌクレインおよびアミロイドβを含むコポリマーの定量的測定値を決定する。別の態様において、分離された種を測定することは、1つまたは複数の分離された種をイムノアッセイによって検出することを含む。別の態様において、イムノアッセイはイムノブロッティングを含む。別の態様において、イムノアッセイはウェスタンブロットを含む。別の態様において、イムノアッセイは、直接標識へカップリングされた抗体を使用する。別の態様において、イムノアッセイは、間接標識へカップリングされた抗体を使用する。別の態様において、方法は、以下の工程:I)推定神経保護剤の投与の前および後に対象中のバイオマーカーを測定する工程;およびII)タンパク質の量の変化またはバイオマーカーのパターンの変化を決定する工程であって、正常な量またはパターンへの変化が神経保護剤の効能を示す、工程、をさらに含む。別の態様において、方法は、以下の工程:2つの異なる時点で対象中のバイオマーカーを測定する工程;およびタンパク質の量の変化またはバイオマーカーのパターンの変化を決定する工程であって、変化が神経変性状況の変化を示す、工程、をさらに含む。別の態様において、方法は、ある期間にわたって対象から複数の生体試料を収集する工程を含み、任意で対象は該期間中に推定または公知の神経保護剤を受けており、診断アルゴリズムは、疾患進行速度または推定神経保護剤に対する反応の程度を予測する。
以下の工程:
a)複数の対象の各々について、(1)神経変性状態の状況、および(2)バイオマーカーのセットの測定値を示す値を含むデータセットを提供する工程であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
b)個体における神経変性状態の状況を推測するモデルを開発するために、データセットに対して統計解析を行う工程
を含む、方法。
一態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質は、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである。別の態様において、統計解析はコンピューターによって行われる。別の態様において、統計解析はコンピューターによって行われない。別の態様において、統計解析は、相関、ピアソン相関、スピアマン相関、カイ二乗、平均値の比較(例えば、対応のあるT検定、独立T検定、ANOVA)、回帰分析(例えば、単回帰、重回帰、線形回帰、非線形回帰、ロジスティック回帰、多項回帰、段階的回帰、リッジ回帰、ラッソ回帰、エラスティックネット回帰)またはノンパラメトリック分析(例えば、ウィルコクソン順位和検定、ウィルコクソン符号順位検定、符号検定)を含む。別の態様において、統計解析は、データセットに対して機械学習アルゴリズムを訓練することを含む。別の態様において、機械学習アルゴリズムは以下:人工神経回路網(例えば、バックプロパゲーションネットワーク)、デシジョンツリー(例えば、再帰分割プロセス、CART)、ランダムフォレスト、判別分析(例えば、BayesianクラシファイヤーまたはFischer分析)、線形分類器(例えば、多重線形回帰(MLR)、部分最小二乗(PLS)回帰、主成分回帰(PCR))、混合または変量効果モデル、ノンパラメトリック分類器(例えば、k最近傍)、サポートベクターマシン、およびアンサンブル法(例えば、バギング、ブースティング)より選択される。別の態様において、状況は、神経変性状態の診断、病期、予後、または進行より選択される。別の態様において、状況は、カテゴリー変数(例えば、バイナリー状況、または複数のカテゴリー状況のうちの1つ)として測定される。別の態様において、カテゴリーは、神経変性状態を有することと一致する診断(例えば、陽性または有すると診断される)、および神経変性状態を有することと矛盾する診断(例えば、陰性または有さないと診断される)を含む。別の態様において、カテゴリーは、神経変性状態の異なる病期を含む。別の態様において、状況は、(例えば、スケールにおける)連続変数として測定される。別の態様において、連続変数は、神経変性状態の範囲または程度である。別の態様において、対象は、動物、例えば、魚類、鳥類、両生類、爬虫類、または哺乳動物、例えば、げっ歯動物、霊長動物、もしくはヒトである。別の態様において、複数の対象は、少なくとも10、25、50、100、200、400、または800のうちのいずれかである。別の態様において、各対象について、定量的測定値が決定される試料を第1の時点で採取し、神経変性状態の状況を、後の時点である第2の時点で決定する。別の態様において、生体試料は、血液または血液画分(例えば、血漿または血清)を含む。別の態様において、神経変性状態は、シヌクレイノパチー、例えば、パーキンソン病またはレヴィー小体認知症である。別の態様において、神経変性状態は、アミロイドパチー、例えばアルツハイマー病、タウオパチー、例えばアルツハイマー病、またはハンチントン病である。
神経変性タンパク質によって特徴付けられる神経変性状態の、発症リスク、診断、病期、予後、または進行を推測する方法であって、以下の工程:
a)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する工程
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
b)データセットに対してモデル、例えば、本明細書に記載されるようなモデルを実行する工程であって、神経変性状態の、発症リスク、診断、病期、予後、または進行を推測する、工程
を含む、方法。
一態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質は、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである。別の態様において、定量的測定値が決定される神経変性タンパク質形態は、以下:(I)少なくとも1つのオリゴマー形態;(II)複数のオリゴマー形態;(III)少なくとも1つのオリゴマー形態および少なくとも1つのモノマー形態;(IV)複数のオリゴマー形態および少なくとも1つのモノマー形態;(V)少なくとも1つのオリゴマー形態および複数のモノマー形態;ならびに(VI)複数のオリゴマー形態および複数のモノマー形態、より選択される。別の態様において、オリゴマー形態のうちの少なくとも1つは、神経変性タンパク質の種のコレクションを構成する。別の態様において、モデルは、神経変性タンパク質のモノマー形態に対するオリゴマー形態の相対量を、統計的に有意な数の対照個体における相対量と比較することを含む。別の態様において、モデルは、複数のオリゴマー形態の相対量のパターンを検出することを含み、これからモデルが推測を行う。別の態様において、対象は、神経変性状態について無症候または症状発現前である。別の態様において、対象は、定期的な通院中にまたは医師の通常の医療活動の一部として、医師などの医療提供者へ示す。別の態様において、モデルはコンピューターによって実行される。別の態様において、モデルはコンピューターによって実行されない。
神経変性状態の処置における治療的介入の有効性を決定するための方法であって、以下の工程:
(a)以下の段階:
(1)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する段階
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、段階、および
(2)モデル、例えば、本明細書に記載されるようなモデルを使用して、初期状況を推測する段階
によって、神経変性状態の初期状況を、複数の対象を含む集団中の各対象において、推測する工程;
(b)推測する工程後、対象へ治療的介入を施す工程;
(c)施す工程後、以下の段階:
(1)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する段階
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、段階、および
(2)モデルを使用して後続状況を推測する段階
によって、神経変性状態の後続する後続状況(a subsequent a subsequent state)を、集団中の各対象個体において、推測する工程;ならびに
(d)集団中の初期および後続の推測に基づいて、後続の推測が初期の推測と比較して正常状況の方への統計的に有意な変化を示す場合は、治療的介入が有効であること、または、後続の推測が初期の推測と比較して正常状況の方への統計的に有意な変化を示さない場合は、治療的介入が有効ではないことを決定する工程
を含む、方法。
別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質は、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである。別の態様において、治療的介入は、薬物または薬物の組み合わせの投与を含む。別の態様において、集団は、少なくとも20、少なくとも50、少なくとも100、または少なくとも200の対象を含み、対象のうちの少なくとも20%、少なくとも35%、少なくとも50%、または少なくとも75%は、タンパク質のモノマー形態に対するタンパク質のオリゴマー形態の上昇した相対量を最初に有する。別の態様において、対象のうちの少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、または少なくとも35%、少なくとも50%、少なくとも66%、少なくとも80%、または100%は、神経変性状態の診断を最初に有する。別の態様において、推測はコンピューターによって行われる。別の態様において、推測はコンピューターによって行われない。
神経変性状態の処置または予防のための治療的介入の臨床試験について対象を認定するための方法であって、以下の工程:
a)以下の段階:
(1)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する段階
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、段階、
(2)プロフィールに対してモデル、例えば、本明細書に記載されるようなモデルを実行する段階であって、対象が神経変性状態に関して異常であることを推測する、段階
によって、神経変性状態に関して対象が異常であることを決定する工程;ならびに
b)該神経変性状態についての潜在的治療的介入の臨床試験に対象を登録する工程
を含む、方法。
一態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質は、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである。別の態様において、モデルはコンピューターによって実行される。別の態様において、モデルはコンピューターによって実行されない。
神経変性状態についての治療的介入における対象の経過をモニタリングする方法であって、以下の工程:
(a)以下の段階:
(1)神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットの測定値を決定する段階であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、段階、および
(2)モデル、例えば、本明細書に記載されるようなモデルを実行する段階であって、神経変性状態の初期状況を推測する、段階
によって、神経変性状態の初期状況を、対象において、推測する工程;
(b)推測する工程後、対象へ治療的介入を施す工程;
(c)施す工程後、以下の段階:
(1)データセットを作成するために、
神経細胞由来ミクロソーム粒子について濃縮される対象からの生体試料から、複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々の量を含むバイオマーカープロフィールを決定する段階、および
(2)モデル、例えば、本明細書に記載されるようなモデルを実行する段階であって、神経変性状態の後続状況を推測する、段階
によって、神経変性状態の後続状況を、対象において、推測する工程;
(d)初期状況および後続状況の推測に基づいて、後続の推測が初期の推測と比較して正常状況の方への変化を示す場合は、対象が治療的介入に対してポジティブに反応していること、または、後続の推測が初期の推測と比較して正常状況の方への変化を示さない場合は、治療的介入が有効ではないことを決定する工程
を含む、方法。
一態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質は、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである。別の態様において、モデルはコンピューターによって実行される。別の態様において、モデルはコンピューターによって実行されない。
(a)本明細書に開示されるような方法によって、対象が神経変性状態を有することを決定する工程;および
(b)状態を処置するために効果的な緩和的または神経保護的な治療的介入を対象へ施す工程
を含む、方法。
一態様において、治療的介入は、正常の方へ対象のバイオマーカープロフィールを移動させ、正常の方への移動は神経保護を示す。
本明細書に開示されるような方法によってバイオマーカーの異常なパターンを有すると決定された対象へ、状態を処置するために有効な緩和的または神経保護的な治療的介入を施す工程
を含む、方法。
一態様において、対象は、神経変性状態について無症候または症状発現前である。
(1)シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つおよび神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態;または
(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
のいずれかを検出するために十分な試薬を含む、キット。
一態様において、試薬は抗体を含む。
神経変性状態の、発症リスク、診断、病期、予後、または進行を推測する方法であって、以下の工程:
a)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する工程
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
b)データセットを、神経変性状態の、発症リスク、診断、病期、予後、または進行と関連付ける工程
を含む、方法。
一態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである。別の態様において、シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つは、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質は、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される。別の態様において、神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである。
以下の工程:
(a)神経変性状態を有するかまたは神経変性状態についての処置に対してポジティブに反応する可能性が高い対象を特定する工程であって、特定する工程が以下の段階:
(1)バイオマーカープロフィールを作成するために、神経細胞由来エキソソームについて濃縮される対象からの試料において(例えば、エキソソームの内部内容物から)、バイオマーカーのセットを測定する段階であって、バイオマーカーのセットが、1つまたは複数のシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態を含む、段階、および
(2)異常なバイオマーカープロフィールに基づいて、対象が神経変性状態に罹患していると決定する段階
を含む、工程;ならびに
(b)特定された対象へ、神経変性状態を処置するために有効量の薬学的組成物を投与する工程
を含む、方法。
一態様において、神経変性状態は、シヌクレオパチー状態(synucleopathic condition)であり、薬学的組成物は、ドーパミンアゴニスト(例えば、プラミペキソール(例えば、Mirapex(商標))、ロピニロール(例えば、Requip)、ロチゴチン(例えば、Neupro)、アポモルフィン(例えば、Apokyn))、レボドパ、カルビドパ-レボドパ(例えば、Rytary、Sinemet)、MAO-B阻害剤(例えば、セレギリン(例えば、Eldepryl、Zelapar)もしくはラサギリン(例えば、Azilect))、カテコール-O-メチルトランスフェラーゼ(COMT)阻害剤(例えば、エンタカポン(Comtan)もしくはトルカポン(Tasmar))、抗コリン作用薬(例えば、ベンズトロピン(例えば、Cogentin)もしくはトリヘキシフェニジル)、アマンタジンまたはコリンエステラーゼ阻害剤(例えば、リバスチグミン(Exelon))を含む。別の態様において、シヌクレオパチー状態はパーキンソン病である。別の態様において、薬学的組成物は、ドーパミンアゴニストを含む。別の態様において、薬学的組成物は、NK1-アンタゴニストをさらに含む。別の態様において、ドーパミンアゴニストは6-プロピルアミノ-4,5,6,7-テトラヒドロ-1,3-ベンゾチアゾール-2-アミンであり、NK1-アンタゴニストはアプレピタントまたはロラピタントである。別の態様において、薬学的組成物は5HT3-アンタゴニストをさらに含む。別の態様において、ドーパミンアゴニストは6-プロピルアミノ-4,5,6,7-テトラヒドロ-1,3-ベンゾチアゾール-2-アミンであり、5HT3アンタゴニストはオンダンセトロン塩酸塩二水和物である。
神経変性状態を示すバイオマーカープロフィールを有するかまたは神経変性状態についての処置に対してポジティブに反応する可能性が高いと特徴付けられた対象へ、神経変性状態を処置するために有効量の薬学的組成物を投与する工程
を含む方法であって、
バイオマーカーパネルが
神経細胞由来エキソソームについて濃縮される対象からの試料から(例えば、エキソソームの内部内容物から)測定された、1つまたは複数のシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態
を含む、バイオマーカーのセット
を含む、方法。
一態様において、別の態様において、神経変性状態はパーキンソン病であり、薬学的組成物はドーパミンアゴニストを含む。
I.神経変性状態についてのバイオマーカー
本明細書に開示される方法は、様々な神経変性状態の診断およびこれらについての薬物開発のために有用である。これらとしては、非限定的に、シヌクレイノパチー(例えば、パーキンソン病、レヴィー小体認知症、多系統萎縮症)、アミロイドパチー(例えば、アルツハイマー病)、タウオパチー(例えば、アルツハイマー病、進行性核上性麻痺、大脳皮質基底核変性症)、およびハンチントン病が挙げられる。
バイオマーカーは、単独でまたは組み合わせて、特定の状態と正または負に関連している分析物である。バイオマーカーとして機能し得る分析物は、対象または対象試料において検出可能である任意の生体分子または有機もしくは無機分子を含む。バイオマーカーとして働くことができる生体分子としては、非限定的に、例えばタンパク質およびペプチドを含む、ポリペプチドおよびポリヌクレオチドが挙げられる。
これらの疾患は、特定のシグナル伝達キナーゼの活性の異常な変化(増加または減少)によって特徴付けられる。対象におけるこれらのシグナル伝達キナーゼの活性の測定は、診断、予後、患者の進行、患者の層別化、ならびに薬物開発および試験のために使用することができる。
本明細書において使用される場合、用語「神経変性タンパク質」は、オリゴマー化形態で、神経変性に関連する、タンパク質を指す。神経変性タンパク質としては、非限定的に、アルファ-シヌクレイン、タウ、アミロイドβ、およびハンチンチンが挙げられる。
A.シヌクレイノパチー
1.状態
本明細書において使用される場合、用語「シヌクレイノパチー」および「シヌクレオパチー状態」は、アルファ-シヌクレインの異常な凝集形態である、オリゴマーアルファ-シヌクレインの異常プロフィールによって特徴付けられる状態を指す。ある態様において、シヌクレイノパチーは、例えば、PD、レヴィー小体認知症、多系統萎縮症、およびいくつかの形態のアルツハイマー病、ならびに他の稀な神経変性障害、例えば、様々な神経軸索ジストロフィーなどの、臨床的に明らかなシヌクレオパチー疾患として発現する。シヌクレイノパチー疾患の臨床診断に十分な徴候、および、任意で、症状は、そのような臨床診断をするためにそのような状態の診断の分野における当業者に一般に十分なものである。
アルファ-シヌクレインはヒト脳中に見られるタンパク質である。ヒトアルファ-シヌクレインタンパク質は、140個のアミノ酸で作られており、SNCA遺伝子(PARK1とも呼ばれる)によってコードされる。(アルファ-シヌクレイン: 遺伝子ID: 6622; ホモサピエンス; 細胞遺伝学的位置: 4q22.1.)。
1.状態
本明細書において使用される場合、用語「アミロイドパチー」は、脳内のアミロイドポリマーの蓄積によって特徴付けられる状態を指す。アミロイドパチーとしては、非限定的に、アルツハイマー病およびある他の神経変性障害、例えば、後期PDが挙げられる。アルツハイマー病は認知症の最も一般的な形態である。それは、β-アミロイドの凝集形態から作られるアミロイド斑の蓄積、ならびに神経原線維変化によって、解剖学的なレベルで特徴付けられる。症状的には、進行性記憶喪失、認知低下および神経行動変化によって特徴付けられる。アルツハイマー病は進行性であり、現在、この疾患を停止または逆転させる公知の方法はない。
アミロイドベータ(アミロイド-β、Aβ、A-ベータおよびベータ-アミロイドとも呼ばれる)は、アミロイド前駆体タンパク質のペプチド断片である。アミロイドβは、典型的に、36~43個のアミノ酸を有する。アミロイドβは、凝集し、いくつかの形態で存在し得る可溶性オリゴマーを形成する。アミロイドβのミスフォールドされたオリゴマーは、他のアミロイドβ分子に、ミスフォールドされたオリゴマー形態をとらせ得ると考えられている。A-β1-42は、アミノ酸配列:
を有する。
1.状態
本明細書において使用される場合、用語「タウオパチー」は、神経変性に関連する蓄積および凝集によって特徴付けられる状態を指す。タウオパチーとしては、非限定的に、アルツハイマー病(「AD」)、進行性核上性麻痺、大脳皮質基底核変性症、17番染色体に連鎖しパーキンソニズムを伴う前頭側頭型認知症、およびピック病が挙げられる。
タウは、最長のタウアイソフォーム上に79個の潜在的なセリン(Ser)およびトレオニン(Thr)リン酸化部位を有する、リンタンパク質である。タウは、結合ドメインの数によって識別される、6つのアイソフォームで存在する。3つのアイソフォームは3つの結合ドメインを有し、他の3つは4つの結合ドメインを有する。アイソフォームは、タウ遺伝子のエクソン2、3、および10における選択的スプライシングに起因する。タウは、11個のエクソンを有する、MAPT遺伝子よってコードされる。ハプログループH1は、アルツハイマー病などの、ある認知症の増加した確率に関連するようである。
1.ハンチントン病
ハンチントン病は、ハンチンチン遺伝子中の常染色体優性突然変異によって引き起こされる遺伝性疾患である。突然変異は、CAGトリプレットの複製によって特徴付けられる。それは進行性神経変性によって特徴付けられる。症状としては、運動障害、例えば、不随意運動、歩行障害、ならびに嚥下および発語での困難が挙げられる。それはまた、進行性の認知低下によって特徴付けられる。
ハンチントンタンパク質は、HTTまたはHDとも呼ばれるハンチントン遺伝子によってコードされる。正常なハンチントンタンパク質は約3144個のアミノ酸を有する。タンパク質は、通常は、約300 KdAである。
A.生体試料
本明細書において使用される場合、用語「試料」は、分析物を含む組成物を指す。試料は、生の試料(ここで、分析物は、その天然形態で他の材料と混合されている)(例えば、供給源材料)、分画試料(ここで、分析物は、少なくとも部分的に濃縮されている)、または精製試料(ここで、分析物は少なくとも実質的に純粋である)であり得る。本明細書において使用される場合、用語「生体試料」は、例えば、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、多糖類、脂質、およびより高次レベルのこれらの物質、例えば、エキソソーム、細胞、組織または器官を含む、生物学的物質を含む試料を指す。
1.シグナル伝達キナーゼ
キナーゼは基質のリン酸化においてATPをADPに変換する。キナーゼ活性を測定するための様々なアッセイタイプが当技術分野において公知である。
放射性シンチレーションアッセイはキナーゼによる基質への32Pの取り込みを測定する。
これらのアッセイのいくつかはキナーゼ活性の指標としてATPまたはADPの量を使用する。そのようなアッセイの1つにおいて、キナーゼ活性について試験される試料、キナーゼについての基質、およびATPが組み合わされる。キナーゼが存在する場合、それはATPを用いて基質をリン酸化することになる。残存するADPは、様々なアッセイによって検出することができる。そのようなアッセイの1つはFRET(蛍光共鳴エネルギー移動)アッセイであり、ここでは、反応後の試料中のADPがドナーまたはアクセプターフルオロフォアの1つでタグ化される。ADPに結合し、対の他方のフルオロフォア、即ち、アクセプターまたはドナーフルオロフォアを含む抗体を、混合物に添加する。抗体はADPに結合する。励起すると、ドナーフルオロフォアはアクセプターフルオロフォアにエネルギーを移し、これは蛍光を発し、検出することができる。
別のアッセイにおいて、特定のキナーゼを、キナーゼに特異的な抗体を用いて免疫沈降させることができる。沈降したキナーゼは、キナーゼの基質とのリン酸化反応に用いられる。キナーゼ反応の生成物は、ウェスタンブロットによって検出される。
多くのキナーゼアッセイが市販されている。これらとしては、例えば、多数の異なるキナーゼに特異的である、Promega (Promega.com)から入手可能なアッセイが挙げられる。別の例は、Thermo Fisher Scientific (ThermoFisher.com)から入手可能なAdapta(登録商標)Universal Kinase Assay Systemである。PerkinElmer(商標)(PerkinElmer.com)は、蛍光標識基質とユーロピウム標識抗リン酸化抗体を使用して、FRETを介して検出可能なリン酸化生成物を認識する、LANCE(登録商標)キナーゼアッセイを商品化している。Samdi Tech, Inc. (SamdiTech.com)は、質量分析法を使用するラベルフリーアッセイを商品化している。
タンパク質のモノマーおよびオリゴマー形態は、非限定的に、イムノアッセイ(例えば、ELISA)、質量分析、サイズ排除クロマトグラフィー、ウェスタンブロットおよび蛍光ベースの方法(例えば、蛍光分光法またはFRET)および近接ライゲーションアッセイを含む、当技術分野において公知の任意の方法によって検出することができる。
モノマーアルファ-シヌクレインおよびオリゴマーアルファ-シヌクレインの量は、個々に決定され得る。代わりに、試料中の総アルファ-シヌクレインが、モノマーアルファ-シヌクレインまたはオリゴマーアルファ-シヌクレインのいずれかと共に測定され得、他方の種の量は差に基づいて決定され得る。
オリゴマーおよびモノマーは、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)を使用して識別することができる。このアッセイはサンドイッチELISAに似ている。Aβモノマーは1つのエピトープを含有し、一方、オリゴマーは複数のこれらのエピトープを含有する。従って、上記ユニークエピトープに向かうエピトープ重複抗体が、捕捉および検出抗体のために使用される場合、特異的かつユニークなエピトープへの結合は、これら2つの抗体間での競合を生じさせるだろう。換言すると、モノマーは、捕捉抗体または検出抗体によって占有され、その両方によってではないだろう。("Oligomeric forms of amyloid-β protein in plasma as a potential blood-based biomarker for Alzheimer's disease”, Wang MJ et al. Alzheimers Res Ther. 2017 Dec 15;9(1):98.“Potential fluid biomarkers for pathological brain changes in Alzheimer's disease: Implication for the screening of cognitive frailty”, Ruan Q et al., Mol Med Rep. 2016 Oct; 14(4):3184-98. "Methods for the Specific Detection and Quantitation of Amyloid-β Oligomers in Cerebrospinal Fluid,” Schuster J, Funke SA. J Alzheimers Dis. 2016 May 7;53(1):53-67)。
生体液、例えばCSF中のタウオリゴマーは、抗タウオリゴマー抗体を使用してELISAおよびウェスタンブロット分析によって測定することができる(Sengupta U, et al., “Tau oligomers in cerebrospinal fluid in Alzheimer's disease”, Ann Clin Transl Neurol. 2017 Apr; 4(4): 226-235。
最近の定量化研究はTR-FRETベースのイムノアッセイを使用した。サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)および時間分解蛍光共鳴エネルギー移動(TR-FRET)を組み合わせる一つの検出方法は、脳内における天然可溶性mHtt種および不溶性凝集体の形成および凝集の分解および定義を可能にする。“Fragments of HdhQ150 mutant huntingtin form a soluble oligomer pool that declines with aggregate deposition upon aging”, Marcellin D. et al., PLoS One. 2012;7(9):e44457。
エキソソームは、中間エンドサイトーシス区画である、多小胞体(MVB)の、原形質膜との融合時に細胞から放出されると考えられている細胞外小胞である。このプロセスにおいて放出される小胞は、エキソソームと呼ばれる。エキソソームは、典型的に、約20 nm~約100 nmの範囲内にある。
免疫親和性捕捉方法は、抽出部分へ結合された抗体を使用し、エキソソームに結合し、試料中の他の材料からそれらを分離する。固体支持体は、例えば、磁気的に誘引可能な微粒子であり得る。ラテックスイムノビーズを使用することができる。
サイズベースの単離方法としては、例えば、サイズ排除クロマトグラフィーおよび限外濾過が挙げられる。サイズ排除クロマトグラフィーにおいて、多孔性固定相が、サイズに基づいてエキソソームを分離するために使用される。限外濾過において、多孔性膜フィルターが、それらのサイズまたは分子量に基づいてエキソソームを2つに分離するために使用される。
分画超遠心分離は、試料中の他の成分から密度およびサイズの差に基づいてエキソソームを単離するために、異なる遠心力および期間の、一連の遠心分離サイクルを伴う。遠心力は、例えば、約100,000~120,000 x gであり得る。タンパク質分解を防ぐために、プロテアーゼ阻害剤を使用することができる。試料から他の大きな物質を除去するために、事前の浄化ステップを使用することができる。
密度勾配超遠心分離は、スクロース、Nycodenz (イオヘキソール)、およびイオジキサノールなどの勾配媒体を用いてエキソソームを選別する。エキソソームは、超遠心分離によって層へ単離され、ここで、勾配媒体の密度はエキソソームのそれに等しい。
エキソソームは、それらの可溶性または分散性を変えることによって生物学的物質の溶液から単離することができる。例えば、例えば8000 Daの分子量を有する、ポリエチレングリコール(PEG)などのポリマーの添加を、溶液からエキソソームを沈殿させるために使用することができる。
マイクロ流体ベースの方法を、エキソソームを単離するために使用することができる。これらとしては、例えば、音波、電気泳動および電磁方法が挙げられる。例えば、アコースティックナノフィルターは、それらのサイズおよび密度に従って試料中のエキソソームを分離するために超音波定在波を使用する。
神経由来エキソソームを単離する他の方法は、例えば、Kanninnen, KM et al., “Exosomes as new diagnostic tools in CNS diseases”, Biochimica et Biophysica Acta, 1862 (2016) 40 Differential ultracentrifugation-410に記載されている。
神経由来エキソソームは、ニューロンによって生成されるエキソソームである。好ましくは、研究の目的は、CNS由来のエキソソームである、つまり、末梢神経系とは区別されて、中枢神経系において生成されるエキソソームである。本明細書に記載の方法は、神経由来エキソソーム、および拡大して、CNS由来エキソソームに関するエキソソームを含む、生体試料を濃縮する。
ヒト神経変性疾患の病因へ結び付けられる、キナーゼを含む多くのタンパク質は、CNSの外側でならびに脳内で生成され、エキソソームの外表面へ結合され得、これは、血液脳関門を通り抜けて末梢循環に達する。従って、本明細書に開示される方法のある態様において、エキソソーム画分は、エキソソーム表面へ結合された分子を除去するために処理される。これは、例えば、リン酸緩衝液液(PBS)でなど、ストリンジェントな洗浄手順によって行われ得る。そのような処理後、エキソソームの内容物をアッセイのために処理することができる。
(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、あるいは、(2)1つまたは複数の異なるシグナル伝達キナーゼのそれぞれから選択される、生体試料中のバイオマーカーの量を含む、バイオマーカープロフィール、ならびに経時的なプロフィールの変化は、神経変性タイプの神経変性状態の存在、重症度および方向性を示す。特に、本明細書に開示されるタンパク質バイオマーカーの、異常な比率、例えば、上昇した量は、神経変性のプロセスを示す。このプロセスは、検査されずに、シヌクレオパチー状態における症状を発現するように至らせ得る。従って、1つまたは複数のバイオマーカータンパク質の異常な量によって特徴付けられる神経変性状態(各々、本明細書において、「ニューロパチー状態」、例えば、「シヌクレイノパチー状態」、「アミロイドパチー状態」、「タウオパチー状態」、「ハンチントン状態」と呼ばれる)の診断、病期、進行、速度、予後、薬物反応性および発症リスクを対象(例えば、症候性または無症候性の個体)において確認する方法を本明細書に提供する。
神経変性状態の診断、病期、進行、予後およびリスクを決定することは、疾患/健康(診断)、ステージI/ステージII/ステージIII(病期)、寛解する可能性が高い/進行する可能性が高い(予後)またはある範囲におけるスコアを割り当てることなどの、異なる状態またはある状況内の異なるクラスもしくは状態へ、対象を分類するプロセスである。バイオマーカープロフィールを使用する分類方法は、様々な状況に特徴的であるプロフィールを同定すること、およびクラスまたは状況を有する対象由来のプロフィールと関連付けることを伴い得る。そのようなプロフィールを同定することは、異なる状況に属する対象由来のバイオマーカープロフィールの解析、およびパターンまたはプロフィール間の差異を見分けることを伴う。解析はプロフィールの目視検査によってまたは統計解析によって行うことができる。
典型的に、解析は、統計的に有意な結果を提供するために十分に多い数の試料の統計解析を伴う。当技術分野における公知の任意の統計法がこの目的のために使用することができる。そのような方法、またはツールとしては、非限定的に、相関、ピアソン相関、スピアマン相関、カイ二乗、平均値の比較(例えば、対応のあるT検定、独立T検定、ANOVA)、回帰分析(例えば、単回帰、重回帰、線形回帰、非線形回帰、ロジスティック回帰、多項回帰、段階的回帰、リッジ回帰、ラッソ回帰、エラスティックネット回帰)またはノンパラメトリック分析(例えば、ウィルコクソン順位和検定、ウィルコクソン符号順位検定、符号検定)が挙げられる。そのようなツールは、MATLAB、JMP Statistical SoftwareおよびSASなどの市販の統計パッケージ中に含まれている。そのような方法は、特定のバイオマーカープロフィールを特定の状況へ分類するために使用することができるモデルまたはクラシファイヤーを作る。
ある態様において、統計解析は、機械学習ツールの使用によって増強される。そのようなツールは学習アルゴリズムを用い、ここで、関連する変数(複数可)が、異なる可能な状況において測定され、状況を区別するパターンが決定され、試験対象を分類するために使用される。従って、本開示の任意の分類方法が、特定のシヌクレイノパチー状況内の様々な状態に属する対象における1つまたは複数の変数の測定を比較することによって、開発され得る。これは、例えば、様々な診断を有するかまたは様々な時点での様々な病期にある対象における、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーの量を含むバイオマーカープロフィールを決定し、診断、病期、進行、予後、薬物反応性またはリスクの予測を可能にすることを含む。家族歴、生活習慣、化学物質への曝露、様々な表現型形質などの、他の変数が同様に含まれ得る。
訓練データセットは、複数の対象(より一般にはオブジェクトと呼ばれる)の各々についての複数の特徴の各々についての測定値のベクターを典型的に含むデータセットである。特徴のうちの1つは、対象の分類、例えば、診断またはスケールにおける程度の測定値であり得る。これは、教師あり学習法において使用され得る。他の特徴は、例えば、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーの測定量であり得る。従って、例えば、個々の対象についてのベクターは、神経変性状態の診断(例えば、パーキンソン病を有するまたは有さないと診断)、ならびに本明細書に記載される複数のバイオマーカーのうちの各々の測定値を含み得る。ある態様において、クラシファイヤーを作製するために使用される訓練データセットは、少なくとも100、少なくとも200、または少なくとも400の異なる対象からのデータを含む。状態を有すると分類された対象 対 状態を有さないと分類された対象の比は、少なくとも2:1、少なくとも1:1、または少なくとも1:2であり得る。代わりに、状態を有すると事前分類された対象は、対象の66%以下、50%以下、33%以下、または20%以下を含み得る。
機械学習アルゴリズムとも呼ばれる、学習アルゴリズムは、例えば、クラスタリング、分類またはプロフィール認識について、解析モデル構築を自動化する、コンピューター実行アルゴリズムである。学習アルゴリズムは、アルゴリズムへ提供された訓練データセットに対して解析を行う。
モデルは、検証データセットを使用して続いて検証され得る。検証データセットは、典型的に、訓練データセットと同じ特徴についてのデータを含む。モデルが訓練データセットに対して実行され、真陽性、真陰性、偽陽性および偽陰性の数が、モデルの性能の指標として、決定される。
本明細書に記載される状況のいずれかに基づく対象の状態の分類は、プログラム可能なデジタルコンピューターによって行うことができる。コンピューターは、対象中の、タンパク質バイオマーカーの1つまたは複数のオリゴマー形態、および、任意で、モノマー形態(例えば、シグナル伝達キナーゼ、および、神経変性タンパク質)の少なくとも測定値を受容しそして任意で保存する有形メモリ、ならびに分類アルゴリズムを具体化するコードの実行によってこのデータを処理するプロセッサーを含むことができる。分類アルゴリズムは、オペレーターが実行した、または機械学習で実行した、統計解析の結果であり得る。
選択されたモデルは、オペレーター実行統計解析または機械学習のいずれかに由来し得る。いずれの場合でも、モデルは、試験対象について推測(例えば、予測)を行うために使用され得る。例えば、モデルによって使用される特徴の値を含有する、ベクターを含む、例えば、試験データセットの形態の、バイオマーカープロフィールは、試験対象から採取された試料から作成することができる。試験データセットは、訓練データセット中に使用された同じ特徴の全て、またはこれらの特徴のサブセットを含み得る。モデルは、次いで、試験データセットへ適用されるかまたはこれに対して実行される。バイオマーカープロフィールを状態、疾患状況、予後、進行のリスク、薬物応答の見込みなどと関連付けることは、モデルを実行する形式である。関連付けは人によってまたは機械によって行うことができる。選択は関連付けの操作の複雑さに依存し得る。これは、推測、例えば、クラスもしくはクラスター群(例えば、診断)、またはスケールにおける場所(例えば、治療的介入に対して反応する見込み)に属するとしての対象の分類をもたらす。
別の局面において、神経変性状態、例えば、シヌクレオパチー状態、アミロイドパチー状態、タウオパチー状態、およびハンチントン病についての治療的介入の実際的な開発を可能にする方法を、本明細書に提供する。方法は、数ある中でも、臨床試験について対象を選択する工程、および対象のセットにおける治療的介入の有効性を決定する工程を伴う。
臨床試験は、医薬などの、潜在的な治療的介入の効能および安全性を試験するための対象の登録を伴う。典型的に、対象は、状況の異なる状態を有するように選択される;例えば、疾患の診断を有するもしくは有さない、または異なる疾患病期にある、または異なる疾患サブタイプ、または異なる予後の対象。臨床試験対象は、同じにまたは異なって処置される異なる群へ層別化することができる。層別化は、疾患の病期を含む、任意の数の因子に基づき得る。疾患病期分類は、診断所見を使用する分類システムであり、病因、病態生理学および重症度などの因子に基づいて患者のクラスターをもたらす。それは、臨床的に均質な患者をクラスター化し、ケアの質、臨床転帰の分析、リソースの利用、および代替処置の効能を評価するための基礎として役立ち得る。
臨床試験の開始で、異なる層別化群に対する治療的介入の有効性は、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールに対する効果の関数として迅速に決定することができる。より具体的には、バイオマーカープロフィールの変化は、治療的介入の臨床的有効性を予測する。方法は、シグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質を含むバイオマーカープロフィールを決定するために、個体を先ず試験する工程を一般に伴う。測定後、治療的介入、例えば、実験的薬物を、対象の少なくともサブセットへ投与する。典型的に、対象の少なくともサブセットにプラセボを与えるかまたは処置を与えない。場合によっては、対象はそれら自身の対照として役立ち、先ずプラセボを受容し、次いで、比較のために、実験的介入を受容し、または逆を受容する。ある場合において、これは、既に認識された処置形態の投与と併せて行われ得る。集団は治療的介入の投薬、タイミングおよび投与速度によって分けられ得る。倫理規定は、統計的に有意な改善が試験対象において見られる場合には試験を中止することを要求し得る。本明細書において使用される場合、「実験的薬物」および「薬物候補」は、治療効果について試験されたかまたは試験される薬剤を指す。「推定神経保護剤」は、神経保護作用を有すると試験されたかまたは試験される薬剤を指す。
対象は、臨床症状において臨床的に有意な変化を示す場合、治療に対して反応すると言われる。試験される薬物の効能は、典型的には、臨床的測定によって、例えば、疾患の症状、徴候および病期を決定することによって、検証される。そのような臨床的尺度としては、修正ホーン・ヤールの重症度分類尺度および統一パーキンソン病評価尺度(UPDRS)などの、本明細書に記載のものが挙げられる。本明細書に記載されるバイオマーカープロフィールもまた、治療に対する反応の指標を提供し、他の形態の臨床評価よりも遥かに早い時期にそうすることができる。これは、典型的には、薬物が従来の方法を使用して検証された後に起こる。しかし、バイオマーカープロフィールは、対象または対象の集団における薬物の効能を決定するために、臨床マーカーに加えて、または臨床マーカーの代わりに使用することができる。例えば、治療開始から約18ヶ月後になって初めて従来の手段によって検出することができる反応は、バイオマーカープロフィールにおいては、治療開始後わずか12ヶ月、6ヶ月または3ヶ月で検出することができる。従って、いくつかの態様において、治療に対する反応の決定は、第1の時点で対象の第1バイオマーカープロフィールを決定し、治療的介入を対象に施すこと;治療介入を施した後、例えば、治療開始の約1ヶ月以内、3ヶ月以内、6ヶ月以内、9ヶ月以内、12ヶ月以内、15ヶ月以内、または18ヶ月以内のいずれかで第2バイオマーカープロフィールを決定すること;および、変化を同定するために第1および第2のバイオマーカープロフィールを比較することを含む。バイオマーカープロフィールにおいて統計的に有意な差がないことは、治療に対する反応がないことを示す。正常なバイオマーカープロフィールの方への統計的に有意な変化は、治療に対する肯定的な反応を示し、一方、正常なプロフィールから離れた統計的に有意な変化は、治療または疾患の進行に対する否定的な反応を示す。治療介入が開始される前に正常なプロフィールがわかっている場合、第1のバイオマーカープロフィールの測定は省略することができ、決定は第2のバイオマーカープロフィールに依存することができる。
本明細書に記載されるようなバイオマーカープロフィールに基づいて対象が分類される神経変性状態(例えば、シヌクレオパチー状態、アミロイドパチー状態、タウオパチー状態、ハンチントン病)の病期またはクラスに依存して、対象は治療的介入の必要があり得る。本明細書に開示される方法によって、神経変性状態(例えば、シヌクレオパチー状態、およびアミロイドパチー状態、タウオパチー状態、ハンチントン病)を示すと決定された対象を、状態を処置するために有効な治療的介入で処置する方法を本明細書に提供する。シグナル伝達キナーゼのレベル、および、任意で、神経変性タンパク質のレベルを変化させる治療的介入、特に、それを戻す治療的介入は、有効な処置、例えば、本明細書中の方法によって開発され、そして臨床的に検証された治療的介入を反映する。
ある態様において、PDについての症状修飾治療的介入(即ち、対症または緩和療法)は、ドーパミンアゴニスト(例えば、プラミペキソール(例えば、Mirapex)、ロピニロール(例えば、Requip)、ロチゴチン(例えば、Neupro)、アポモルフィン(例えば、Apokyn))、レボドパ、カルビドパ-レボドパ(例えば、Rytary、Sinemet)、MAO-B阻害剤(例えば、セレギリン(例えば、Eldepryl、Zelapar)もしくはラサギリン(例えば、Azilect))、カテコール-O-メチルトランスフェラーゼ(COMT)阻害剤(例えば、エンタカポン(Comtan)もしくはトルカポン(Tasmar))、抗コリン作用薬(例えば、ベンズトロピン(例えば、Cogentin)もしくはトリヘキシフェニジル)、アマンタジンまたはコリンエステラーゼ阻害剤(例えば、リバスチグミン(Exelon))またはいくつかの同様の薬剤もしくは薬剤の群より選択される薬物の投与を含む。
ある態様において、アミロイドパチー状態についての症状修飾治療的介入(即ち、対症または緩和療法)は、Razadyne(登録商標)(ガランタミン)、Exelon(登録商標)(リバスチグミン)、およびAricept(登録商標)(ドネペジル)などの薬物の投与を含む。
ある態様において、タウオパチー状態についての症状修飾治療的介入(即ち、対症または緩和療法)は、Razadyne(登録商標)(ガランタミン)、Exelon(登録商標)(リバスチグミン)、およびAricept(登録商標)(ドネペジル)、またはPDの対症療法について使用される本明細書において引用されるものなどの薬物の投与を含む。
ある態様において、ハンチントン病についての症状修飾治療的介入(即ち、対症または緩和療法)は、テトラベナジン(Austedo(登録商標)(デューテトラベナジン)、IONIS-HTTRx、ならびに様々な神経弛緩薬およびベンゾジアゼピン類などの薬物の投与を含む。
神経変性障害(例えば、シヌクレオパチー状態、アミロイドパチー状態、タウオパチー状態、ハンチントン病)に罹患している対象において、治療的介入の有効性または治療的介入に対する対象の反応性は、バイオマーカープロフィールに対する治療的介入の効果を評価することによって決定することができる。これは、任意の神経変性状況、例えば、診断、病期、進行、予後およびリスクにおける有効性を含む。より正常のプロフィールの方へのバイオマーカープロフィールの変化は、治療的介入の有効性を示す。
別の局面において、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを検出し、そのように得られた結果を解釈するためのキットを、本明細書に提供する。キットは、体液からエキソソームを単離するための試薬、全てのエキソソームから神経細胞由来エキソソームを優先的に単離するための試薬、ならびにキナーゼおよび/または神経変性タンパク質の形態を検出するために十分な試薬を保持するための容器を含むことができる。
シヌクレイノパチー状態と診断され、活性な治療的介入を与えられ、次いで、異なる、不活性であることが恐らく知られているものまたはその逆が与えられる、個体のコホートが、研究の対象である。または、シヌクレイノパチー状態と診断された複数の対象中のシヌクレイノパチー状態について無症候である複数の対象を含むコホートが、研究の対象である。いずれの場合においても、静脈血試料を、ベースラインまたは対照(例えば、不活性介入処置)条件下で、および潜在的に活性な(例えば、実験的介入)処置の投与中に再び、を含む様々な時間で、静脈穿刺によって各対象から採取する。神経細胞由来エキソソームを、本明細書に記載される方法を使用して血液から単離する。単離されたエキソソーム内に含有される、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーの量を測定する。発現のパターンを決定する。結果は、シヌクレイノパチー状態と診断された対象のコホートにおいて、シグナル伝達キナーゼの活性および神経変性タンパク質のオリゴマー形態は、統計的に有意な程度まで異なることを示す。このバイオマーカーアッセイの結果において有意な変化を有すると分かったものは、臨床状況において比例した変化を有すると後で分かる。
PDを有さないおよびPDを有するボランティアの対象を試験し、神経細胞由来エキソソーム中の、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーの量を決定する。決定された量に基づいて、また、上記実施例において決定されたカットオフを使用して、対象をいくつかの試験群へクラスター化する。ある試験群にプラセボを与える。他の試験群に、臨床試験において異なる量の化合物を投与する。投与中および/または投与後に、試験を繰り返す。収集した測定値を解析する。治療的介入は、シグナル伝達キナーゼの活性および神経変性タンパク質のオリゴマー形態の量の統計的に有意な変化をもたらすと決定される。
第II相試験の目的は、PDおよび関連障害を有する患者において、アプレピタントと共にかつ任意でロバスタチンまたは同様に有効な薬物有りまたは無しで与えられる、プラミペキソールの安全性、認容性および初期効能を評価することである。PD(PD)、多系統萎縮症(MSA)、レヴィー小体認知症(LBD)、または関連するシヌクレイノパチー障害を有する最大30人の患者において、連続処置、漸増用量、交差、外来患者で試験を行う。医学的に許容されると見なされる程度まで試験の全体にわたって安定用量で維持される、レボドパ-カルビドパ(Sinemet)を除き、参加者の誰も、臨床研究エントリー前の3ヵ月間中にドーパミンアゴニストまたは他の中枢作用薬で処置されることは認められない。統一PD評価尺度(UPDRS-パートIII)およびバイオマーカータンパク質決定を含む、ベースライン臨床および実験室評価に続いて、登録基準を満たしている同意する個体を、研究前PD処置レジメンからプラミペキソールERおよびアプレピタントを含むものへ切り替える。プラミペキソールER用量を、最適に許容される用量(または最大9 mg/日)へ用量設定し、次いで、最大約12~16週間安定に維持する。その最大認可用量で与えられる追加の薬物(例えば、スタチン)での共処置を、臨床的に適切であると見なされる場合は、追加の3ヵ月間について次いで開始してもよく、この時、全ての対象を、それらの入院前処置レジメンへ戻す。試験の間、バイオマーカーレベルの決定を含む、ベースライン効能および安全性測定を一定間隔で繰り返した。効能は、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールの、正常の方への統計的に有意な変化の関数として決定される。
対象は、PDと一致するある症状を有することを示すが、この病気の顕著な臨床的特徴の多くを未だ欠いている場合は症状発現前レベルである。血液を静脈穿刺によって対象から採取する。(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーの量を血液中の神経細胞由来エキソソームから測定する。バイオマーカープロフィールを決定する。診断アルゴリズムは、プロフィールについて、PDの診断と一致する、と分類する。対象をPDと診断し、症状を軽減するための緩和的処置、または神経保護の目的での疾患の病因に向けられた処置のいずれかの、治療レジメンに供する。
対象は、PDであるとの診断を受ける。医師は対象に対して血液検査を命じ、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。バイオマーカープロフィールに基づいて、医師は、対象がPDの初期にあり、従って特定の治療的介入に対してより反応性であることを決定する。
対象は、PDであるとの診断を受ける。医師は、数ヵ月間離して、対象に対して第1および第2の血液検査を命じ、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。バイオマーカープロフィールに基づいて、医師は、対象の疾患が徐々に進行していること、および、対象が、危険な治療的介入無しでさえ、数年間の寿命を有すると予想されることを決定する。
対象は、身体検査について、シヌクレイノパチー疾患の症状を有さないことを示す。この場合、この個体は、遺伝的または環境的リスク因子を自覚している。医師は対象に対して血液検査を命じ、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。健康な対照個体と比較して、一部のまたは全部の測定可能な種の相対的に正常なバイオマーカープロフィールに基づいて、医師は、対象がPDを発症する低い確率を有することを決定する。
対象は、PDであるとの診断を受ける。医師は、対象に対して最初の血液検査を命じ、処置を開始する前に、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。一連の処置後、しかし臨床症状が変化する前に、医師は第2の血液検査を命じる。プロフィールにおける正常の方への変化に基づいて、医師は、処置が有効であること、または用量を変更するかまたは繰り返す必要があるかどうかを決定する。
PDを有さないおよび異なる診断された病期にあるPDを有するボランティアの対象を試験し、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。決定されたバイオマーカープロフィールに基づいて、対象を、疾患の存在または非存在、および、任意で、疾患の病期を示すと分類する。プロフィールは、コンピューター化学習アルゴリズムを使用して決定され、これは、データ解析後、診断を推測する分類アルゴリズムを生じさせる。推測モデルは、所望の感度および特異性で試験をもたらすように選択される。
研究の対象である個体のコホートは、シヌクレイノパチー状態と診断されている。対象に、活性な治療的介入、次いで、異なる、不活性であることが恐らく知られているものを与える。代わりに、介入を逆の順序で与えることができる。または、シヌクレイノパチー状態と診断された複数の対象中の、シヌクレイノパチー状態について無症候である複数の対象を含むコホートが、研究の対象である。いずれの場合においても、静脈血試料を、ベースラインまたは対照(例えば、不活性介入処置)条件下で、および潜在的に活性な(例えば、実験的介入)処置の投与中に再び、を含む様々な時間で、静脈穿刺によって各対象から採取する。神経細胞由来エキソソームを、本明細書に記載される方法を使用して血液から単離する。単離されたエキソソーム内に含有される、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーの量を測定する。これらのデータをデータセットへと組み合わせる。データセットを、統計法を使用して解析し、この場合、学習アルゴリズム(例えば、サポートベクターマシン)を訓練するために使用し、対象がシヌクレイノパチー状態を有するまたは有さないと分類されるべきかどうかを推測するモデルを開発する。結果は、シヌクレイノパチー状態と診断された対象のコホートにおいて、ある種のシグナル伝達キナーゼが、他のシグナル伝達キナーゼと比べて、統計的に有意な程度まで異なる活性を有することを示す。さらに、神経変性タンパク質のオリゴマー形態もまた統計的に有意な程度まで変化する。このバイオマーカーアッセイの結果において有意な変化を有すると分かったものは、臨床状況において比例した変化を有すると後で分かる。
PDを有さないおよびPDを有するボランティアの対象を試験し、神経細胞由来エキソソーム中の、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。決定されたバイオマーカープロフィールに基づいて、また、上記実施例において決定されたクラシファイヤーを使用して、対象をいくつかの試験群へクラスター化する。ある試験群にプラセボを与える。他の試験群に、臨床試験において異なる量の化合物を投与する。投与中に、および、任意で、投与後に、試験を繰り返す。収集した測定値を解析する。治療的介入は、バイオマーカープロフィールの正常の方への統計的に有意な変化をもたらすと決定される。
第II相試験の目的は、PDおよび関連障害を有する患者において、アプレピタントと共にかつ任意でロバスタチンまたは同様に有効な薬物有りまたは無しで与えられる、プラミペキソールの安全性、認容性および初期効能を評価することである。PD(PD)、多系統萎縮症(MSA)、レヴィー小体認知症(LBD)、または関連するシヌクレイノパチー障害を有する最大30人の患者において、連続処置、漸増用量、交差、外来患者で試験を行う。医学的に許容されると見なされる程度まで試験の全体にわたって安定用量で維持される、レボドパ-カルビドパ(Sinemet)を除き、参加者の誰も、臨床研究エントリー前の3ヵ月間中にドーパミンアゴニストまたは他の中枢作用薬で処置されることは認められない。統一PD評価尺度(UPDRS-パートIII)、ならびに、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカー決定を含む、ベースライン臨床および実験室評価に続いて、登録基準を満たしている同意する個体を、研究前PD処置レジメンからプラミペキソールERおよびアプレピタントを含むものへ切り替える。プラミペキソールER用量を、最適に許容される用量(または最大9 mg/日)へ用量設定し、次いで、最大約12~16週間安定に維持する。その最大認可用量で与えられる追加の薬物(例えば、スタチン)での共処置を、臨床的に適切であると見なされる場合は、追加の3ヵ月間について次いで開始してもよく、この時、全ての対象を、それらの入院前処置レジメンへ戻す。試験の間、バイオマーカーレベルの決定を含む、ベースライン効能および安全性測定を一定間隔で繰り返した。効能は、バイオマーカープロフィールの正常の方への統計的に有意な変化の関数として決定される。
対象は、PDと一致するある症状を有することを示すが、この病気の顕著な臨床的特徴の多くを未だ欠いている場合は症状発現前レベルである。血液を静脈穿刺によって対象から採取する。(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーの量を血液中の神経細胞由来エキソソームから測定する。バイオマーカープロフィールを決定する。診断アルゴリズムは、プロフィールについて、PDの診断と一致する、と分類する。対象をPDと診断し、症状を軽減するための緩和的処置、または神経保護の目的での疾患の病因に向けられた処置のいずれかの、治療レジメンに供する。
対象は、PDであるとの診断を受ける。医師は対象に対して血液検査を命じ、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。バイオマーカープロフィールに基づいて、医師は、対象がPDの初期にあり、従って特定の治療的介入に対してより反応性であることを決定する。
対象は、PDであるとの診断を受ける。医師は、数ヵ月間離して、対象に対して第1および第2の血液検査を命じ、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。バイオマーカープロフィールに基づいて、医師は、対象の疾患が徐々に進行していること、および、対象が、危険な治療的介入無しでさえ、数年間の寿命を有すると予想されることを決定する。
対象は、身体検査について、シヌクレイノパチー疾患の症状を有さないことを示す。この場合、この個体は、遺伝的または環境的リスク因子を自覚している。医師は対象に対して血液検査を命じ、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。健康な対照個体と比較して、バイオマーカーの一部のまたは全部の測定可能な種の相対的に異常なバイオマーカープロフィールに基づいて、医師は、対象がPDを発症する低い確率を有することを決定する。
対象は、PDであるとの診断を受ける。医師は、対象に対して最初の血液検査を命じ、処置を開始する前に、(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または(2)1つもしくは複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々より選択されるバイオマーカーを含むバイオマーカープロフィールを決定する。一連の処置後、しかし臨床症状が変化する前に、医師は第2の血液検査を命じる。aにおける(in the a)正常の方への変化に基づいて、医師は、処置が有効であること、または用量を変更するかまたは繰り返す必要があるかどうかを決定する。
Claims (130)
- 以下の工程:
a)生体試料のコレクション中の各生体試料を、神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮する工程であって、
(i)生体試料のコレクションが対象のコホート中の対象に由来し、コホートが、以下を含む対象:
(1)複数の異なる病期の各々にある神経変性状態と診断された複数の対象であって、診断された対象の各々が推定神経保護剤を受けたことがある、複数の対象、および/または
(2)複数の健康な対照対象
を含み、生体試料が、推定神経保護剤の投与前に、および投与中に再び1回または複数回、および、任意で、投与後に、収集された、工程;
b)バイオマーカー試料を生成するために、微粒子、例えばエキソソームの内部区画からタンパク質内容物を単離する工程;
c)データセットを作成するために、
バイオマーカー試料において、バイオマーカーのセットを測定する工程
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
d)(i)疾患進行速度または推定神経保護剤に対する反応の程度を予測する診断アルゴリズムを決定するため、経時的に個々の対象において、または
(ii)(1)病原診断を行う、(2)臨床的に類似しているが病因的に異なる神経変性障害サブグループを分ける、または(3)対象が推定神経保護剤に反応する可能性が高いかどうかもしくは対象が推定神経保護剤に反応する可能性が高い程度を予測する、診断アルゴリズムを決定するため、異なる対象間で、
バイオマーカーセットの差を比較するためにデータセットに対して統計解析を行う工程
を含む、方法。 - 濃縮する工程の前に:
I)対象のコホートを提供する工程であって、コホートが、以下を含む対象:
(i)複数の異なる病期の各々にある神経変性状態と診断された複数の対象、および/または
(ii)複数の健康な対照対象
を含む、工程;
II)診断された対象の各々へ推定神経保護剤を投与する工程;
III)推定神経保護剤の投与前に、および投与中に再び1回または複数回、および、任意で、投与後に、コホート中の対象の各々から生体試料を収集する工程
をさらに含む、請求項1記載の方法。 - シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである、請求項1記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される、請求項1記載の方法。
- 神経変性タンパク質が、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される、請求項1記載の方法。
- 神経変性タンパク質のオリゴマー形態が、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである、請求項1記載の方法。
- e)標準臨床的尺度に対して診断アルゴリズムのうちの1つまたは複数を検証する工程
をさらに含む、請求項1記載の方法。 - 統計解析が、相関、ピアソン相関、スピアマン相関、カイ二乗、平均値の比較(例えば、対応のあるT検定、独立T検定、ANOVA)、回帰分析(例えば、単回帰、重回帰、線形回帰、非線形回帰、ロジスティック回帰、多項回帰、段階的回帰、リッジ回帰、ラッソ回帰、エラスティックネット回帰)またはノンパラメトリック分析(例えば、ウィルコクソン順位和検定、ウィルコクソン符号順位検定、符号検定)を含む、請求項1記載の方法。
- 統計解析がコンピューターによって実行される、請求項1~8のいずれか一項記載の方法。
- 統計解析が機械学習を含む、請求項9記載の方法。
- 対象がヒトである、請求項1記載の方法。
- 神経変性状態がシヌクレイノパチー障害である、請求項1記載の方法。
- シヌクレイノパチー障害がパーキンソン病である、請求項12記載の方法。
- シヌクレイノパチー障害がレヴィー小体認知症である、請求項12記載の方法。
- 標準臨床的尺度が、UPDRSスコア、CGIスコア、および放射線学的所見より選択される、請求項13記載の方法。
- 神経変性状態が、アミロイドパチー、タウオパチー、またはハンチントン病である、請求項1記載の方法。
- 生体試料が静脈血試料を含む、請求項1記載の方法。
- 異なる病期が、疑いあり、初期、中期、および臨床的進行のうちの1つまたは複数を含む、請求項1記載の方法。
- 投与中または投与後の時間が、処置後1、2、3ヵ月またはそれ以上より選択される、請求項1記載の方法。
- 濃縮する工程が、1つまたは複数の脳特異的タンパク質マーカーを使用することを含む、請求項1記載の方法。
- 脳特異的マーカーのうちの少なくとも1つがK1camを含む、請求項20記載の方法。
- 単離する工程が、表面膜結合タンパク質を除去するために各濃縮試料中のエキソソームを洗浄することを含む、請求項1記載の方法。
- エキソソームをPBSで洗浄する、請求項22記載の方法。
- 神経変性タンパク質の形態を、ゲル電気泳動、ウェスタンブロット、または蛍光技術によって測定する、請求項1記載の方法。
- 以下の工程:
a)対象からの生体試料を、神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮する工程;
b)バイオマーカー試料を生成するために、微粒子、例えばエキソソームの内部区画からタンパク質内容物を単離する工程;
c)データセットを作成するために、
バイオマーカー試料において、バイオマーカーのセットを測定する工程
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
d)データセットを使用する工程であって、以下:
(1)病原診断を行う、
(2)複数の臨床的に類似しているが病因的に異なる神経変性障害サブグループのうちの1つへ対象を分類する、または
(3)対象が推定神経保護剤に反応する可能性が高いかどうかもしくは対象が推定神経保護剤に反応する可能性が高い程度を予測する
のうちの1つを行う、工程
を含む、方法。 - 使用する工程が、データセットに対して、請求項1記載の診断アルゴリズムを実行することを含む、請求項25記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである、請求項25記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される、請求項25記載の方法。
- 神経変性タンパク質が、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される、請求項25記載の方法。
- 神経変性タンパク質のオリゴマー形態が、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである、請求項25記載の方法。
- 神経細胞由来エキソソームを単離する工程が以下:
(i)超遠心分離;
(ii)密度勾配遠心分離;または
(iii)サイズ排除クロマトグラフィー
を含む、請求項25記載の方法。 - 神経細胞由来エキソソームを単離する工程が、脳特異的タンパク質へ結合する結合部分を使用して神経細胞由来エキソソームを捕捉することを含む、請求項25記載の方法。
- 脳特異的タンパク質がL1CAMである、請求項32記載の方法。
- 単離エキソソームの表面からタンパク質を除去する工程が、単離エキソソームを水溶液(例えば、リン酸緩衝食塩水(「PBS」))で洗浄することを含む、請求項25記載の方法。
- 神経変性タンパク質の量を決定する工程が:
i)オリゴマーα-シヌクレインの種を複数の画分へ分離する段階;
ii)1つまたは複数の分離されたオリゴマーα-シヌクレイン種、ならびに、任意で、モノマーα-シヌクレイン、タウ-シヌクレインコポリマー、アミロイドβ-シヌクレインコポリマー、およびタウ-アミロイドβ-シヌクレインコポリマーより選択される1つまたは複数の種の各々を測定する段階
を含む、請求項25記載の方法。 - 種を複数の画分へ分離する段階が、電気泳動によって分離することを含む、請求項35記載の方法。
- 種を複数の画分へ分離する段階が、クロマトグラフィーによって分離することを含む、請求項35記載の方法。
- 分離された種の中でも、2~約100個の単量体単位、4~16個の単量体単位、および約30個以下の単量体単位を有する形態より選択されるα-シヌクレインのうちの少なくとも1つのオリゴマー形態を決定する、請求項35記載の方法。
- 分離された種の中でも、モノマーα-シヌクレインの定量的測定値を決定する、請求項35記載の方法。
- 分離された種の中でも、複数の異なるオリゴマーα-シヌクレイン種を測定する、請求項35記載の方法。
- 分離された種の中でも、α-シヌクレインおよびタウを含むコポリマーを測定する、請求項35記載の方法。
- 分離された種の中でも、α-シヌクレインおよびアミロイドβを含むコポリマーの定量的測定値を決定する、請求項35記載の方法。
- 分離された種を測定する段階が、1つまたは複数の分離された種をイムノアッセイによって検出することを含む、請求項35記載の方法。
- イムノアッセイがイムノブロッティングを含む、請求項43記載の方法。
- イムノアッセイがウェスタンブロットを含む、請求項43記載の方法。
- イムノアッセイが、直接標識へカップリングされた抗体を使用する、請求項43記載の方法。
- イムノアッセイが、間接標識へカップリングされた抗体を使用する、請求項43記載の方法。
- 以下の工程:
I)推定神経保護剤の投与の前および後に対象中のバイオマーカーを測定する工程;および
II)タンパク質の量の変化またはバイオマーカーのパターンの変化を決定する工程であって、正常な量またはパターンへの変化が神経保護剤の効能を示す、工程
をさらに含む、請求項25記載の方法。 - 以下の工程:
2つの異なる時点で対象中のバイオマーカーを測定する工程;および
タンパク質の量の変化またはバイオマーカーのパターンの変化を決定する工程であって、変化が神経変性状況の変化を示す、工程
をさらに含む、請求項25記載の方法。 - ある期間にわたって対象から複数の生体試料を収集する工程を含み、任意で対象が該期間中に推定または公知の神経保護剤を受けており、診断アルゴリズムが、疾患進行速度または推定神経保護剤に対する反応の程度を予測する、請求項25記載の方法。
- 以下の工程:
a)複数の対象の各々について、(1)神経変性状態の状況、および(2)バイオマーカーのセットの測定値を示す値を含むデータセットを提供する工程であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
b)個体における神経変性状態の状況を推測するモデルを開発するために、データセットに対して統計解析を行う工程
を含む、方法。 - シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである、請求項51記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される、請求項51記載の方法。
- 神経変性タンパク質が、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される、請求項51記載の方法。
- 神経変性タンパク質のオリゴマー形態が、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである、請求項51記載の方法。
- 統計解析がコンピューターによって行われる、請求項51記載の方法。
- 統計解析がコンピューターによって行われない、請求項51記載の方法。
- 統計解析が、相関、ピアソン相関、スピアマン相関、カイ二乗、平均値の比較(例えば、対応のあるT検定、独立T検定、ANOVA)、回帰分析(例えば、単回帰、重回帰、線形回帰、非線形回帰、ロジスティック回帰、多項回帰、段階的回帰、リッジ回帰、ラッソ回帰、エラスティックネット回帰)またはノンパラメトリック分析(例えば、ウィルコクソン順位和検定、ウィルコクソン符号順位検定、符号検定)を含む、請求項51記載の方法。
- 統計解析が、データセットに対して機械学習アルゴリズムを訓練することを含む、請求項52記載の方法。
- 機械学習アルゴリズムが以下:人工神経回路網(例えば、バックプロパゲーションネットワーク)、デシジョンツリー(例えば、再帰分割プロセス、CART)、ランダムフォレスト、判別分析(例えば、BayesianクラシファイヤーまたはFischer分析)、線形分類器(例えば、多重線形回帰(MLR)、部分最小二乗(PLS)回帰、主成分回帰(PCR))、混合または変量効果モデル、ノンパラメトリック分類器(例えば、k最近傍)、サポートベクターマシン、およびアンサンブル法(例えば、バギング、ブースティング)より選択される、請求項59記載の方法。
- 状況が、神経変性状態の診断、病期、予後、または進行より選択される、請求項51記載の方法。
- 状況が、カテゴリー変数(例えば、バイナリー状況、または複数のカテゴリー状況のうちの1つ)として測定される、請求項51記載の方法。
- カテゴリーが、神経変性状態を有することと一致する診断(例えば、陽性または有すると診断される)、および神経変性状態を有することと矛盾する診断(例えば、陰性または有さないと診断される)を含む、請求項62記載の方法。
- カテゴリーが、神経変性状態の異なる病期を含む、請求項62記載の方法。
- 状況が、(例えば、スケールにおける)連続変数として測定される、請求項51記載の方法。
- 連続変数が、神経変性状態の範囲または程度である、請求項61記載の方法。
- 対象が、動物、例えば、魚類、鳥類、両生類、爬虫類、または哺乳動物、例えば、げっ歯動物、霊長動物、もしくはヒトである、請求項51記載の方法。
- 複数の対象が、少なくとも10、25、50、100、200、400、または800のうちのいずれかである、請求項51記載の方法。
- 各対象について、定量的測定値が決定される試料を第1の時点で採取し、神経変性状態の状況を、後の時点である第2の時点で決定する、請求項51記載の方法。
- 生体試料が、血液または血液画分(例えば、血漿または血清)を含む、請求項51記載の方法。
- 神経変性状態が、シヌクレイノパチー、例えば、パーキンソン病またはレヴィー小体認知症である、請求項51記載の方法。
- 神経変性状態が、アミロイドパチー、例えばアルツハイマー病、タウオパチー、例えばアルツハイマー病、またはハンチントン病である、請求項51記載の方法。
- 神経変性タンパク質によって特徴付けられる神経変性状態の、発症リスク、診断、病期、予後、または進行を推測する方法であって、以下の工程:
a)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する工程
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
b)データセットに対してモデル、例えば、請求項51記載のモデルを実行する工程であって、神経変性状態の、発症リスク、診断、病期、予後、または進行を推測する、工程
を含む、方法。 - シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである、請求項73記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される、請求項73記載の方法。
- 神経変性タンパク質が、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される、請求項73記載の方法。
- 神経変性タンパク質のオリゴマー形態が、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである、請求項73記載の方法。
- 定量的測定値が決定される神経変性タンパク質形態が、以下:
(I)少なくとも1つのオリゴマー形態;
(II)複数のオリゴマー形態;
(III)少なくとも1つのオリゴマー形態および少なくとも1つのモノマー形態;
(IV)複数のオリゴマー形態および少なくとも1つのモノマー形態;
(V)少なくとも1つのオリゴマー形態および複数のモノマー形態;ならびに
(VI)複数のオリゴマー形態および複数のモノマー形態
より選択される、請求項73記載の方法。 - オリゴマー形態のうちの少なくとも1つが、神経変性タンパク質の種のコレクションを構成する、請求項73記載の方法。
- モデルが、神経変性タンパク質のモノマー形態に対するオリゴマー形態の相対量を、統計的に有意な数の対照個体における相対量と比較することを含む、請求項73記載の方法。
- モデルが、複数のオリゴマー形態の相対量のパターンを検出することを含み、これからモデルが推測を行う、請求項73記載の方法。
- 対象が、神経変性状態について無症候または症状発現前である、請求項73記載の方法。
- 対象が、定期的な通院中にまたは医師の通常の医療活動の一部として、医師などの医療提供者へ示す、請求項73記載の方法。
- モデルがコンピューターによって実行される、請求項73記載の方法。
- モデルがコンピューターによって実行されない、請求項73記載の方法。
- 神経変性状態の処置における治療的介入の有効性を決定するための方法であって、以下の工程:
(a)以下の段階:
(1)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する段階
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、段階、および
(2)モデル、例えば、請求項51記載のモデルを使用して、初期状況を推測する段階
によって、神経変性状態の初期状況を、複数の対象を含む集団中の各対象において、推測する工程;
(b)推測する工程後、対象へ治療的介入を施す工程;
(c)施す工程後、以下の段階:
(1)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する段階
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、段階、および
(2)モデルを使用して後続状況を推測する段階
によって、神経変性状態の後続する後続状況(a subsequent a subsequent state)を、集団中の各対象個体において、推測する工程;ならびに
(d)集団中の初期および後続の推測に基づいて、後続の推測が初期の推測と比較して正常状況の方への統計的に有意な変化を示す場合は、治療的介入が有効であること、または、後続の推測が初期の推測と比較して正常状況の方への統計的に有意な変化を示さない場合は、治療的介入が有効ではないことを決定する工程
を含む、方法。 - シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである、請求項86記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される、請求項86記載の方法。
- 神経変性タンパク質が、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される、請求項86記載の方法。
- 神経変性タンパク質のオリゴマー形態が、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである、請求項86記載の方法。
- 治療的介入が、薬物または薬物の組み合わせの投与を含む、請求項86記載の方法。
- 集団が、少なくとも20、少なくとも50、少なくとも100、または少なくとも200の対象を含み、対象のうちの少なくとも20%、少なくとも35%、少なくとも50%、または少なくとも75%が、タンパク質のモノマー形態に対するタンパク質のオリゴマー形態の上昇した相対量を最初に有する、請求項86記載の方法。
- 対象のうちの少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、または少なくとも35%、少なくとも50%、少なくとも66%、少なくとも80%、または100%が、神経変性状態の診断を最初に有する、請求項86記載の方法。
- 推測がコンピューターによって行われる、請求項86記載の方法。
- 推測がコンピューターによって行われない、請求項86記載の方法。
- 神経変性状態の処置または予防のための治療的介入の臨床試験について対象を認定するための方法であって、以下の工程:
a)以下の段階:
(1)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する段階
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、段階、
(2)プロフィールに対してモデル、例えば、請求項51記載のモデルを実行する段階であって、対象が神経変性状態に関して異常であることを推測する、段階
によって、神経変性状態に関して対象が異常であることを決定する工程;ならびに
b)該神経変性状態についての潜在的治療的介入の臨床試験に対象を登録する工程
を含む、方法。 - シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである、請求項96記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される、請求項96記載の方法。
- 神経変性タンパク質が、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される、請求項96記載の方法。
- 神経変性タンパク質のオリゴマー形態が、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである、請求項96記載の方法。
- モデルがコンピューターによって実行される、請求項96記載の方法。
- モデルがコンピューターによって実行されない、請求項96記載の方法。
- 神経変性状態についての治療的介入における対象の経過をモニタリングする方法であって、以下の工程:
(a)以下の段階:
(1)神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットの測定値を決定する段階であって、バイオマーカーのセットが以下:
(i)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(ii)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、段階、および
(2)モデル、例えば、請求項51記載のモデルを実行する段階であって、神経変性状態の初期状況を推測する、段階
によって、神経変性状態の初期状況を、対象において、推測する工程;
(b)推測する工程後、対象へ治療的介入を施す工程;
(c)施す工程後、以下の段階:
(1)データセットを作成するために、
神経細胞由来ミクロソーム粒子について濃縮される対象からの生体試料から、複数の異なるシグナル伝達キナーゼの各々の量を含むバイオマーカープロフィールを決定する段階、および
(2)モデル、例えば、請求項51記載のモデルを実行する段階であって、神経変性状態の後続状況を推測する、段階
によって、神経変性状態の後続状況を、対象において、推測する工程;
(d)初期状況および後続状況の推測に基づいて、後続の推測が初期の推測と比較して正常状況の方への変化を示す場合は、対象が治療的介入に対してポジティブに反応していること、または、後続の推測が初期の推測と比較して正常状況の方への変化を示さない場合は、治療的介入が有効ではないことを決定する工程
を含む、方法。 - シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである、請求項103記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される、請求項103記載の方法。
- 神経変性タンパク質が、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される、請求項103記載の方法。
- 神経変性タンパク質のオリゴマー形態が、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである、請求項103記載の方法。
- モデルがコンピューターによって実行される、請求項103記載の方法。
- モデルがコンピューターによって実行されない、請求項103記載の方法。
- (a)請求項73記載の方法によって、対象が神経変性状態を有することを決定する工程、および
(b)状態を処置するために効果的な緩和的または神経保護的な治療的介入を対象へ施す工程
を含む、方法。 - 治療的介入が、正常の方へ対象のバイオマーカープロフィールを移動させ、正常の方への移動が神経保護を示す、請求項110記載の方法。
- 請求項73記載の方法によってバイオマーカーの異常なパターンを有すると決定された対象へ、状態を処置するために有効な緩和的または神経保護的な治療的介入を施す工程
を含む、方法。 - 対象が、神経変性状態について無症候または症状発現前である、請求項112記載の方法。
- (1)シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つおよび神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態;または
(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
のいずれかを検出するために十分な試薬を含む、キット。 - 試薬が抗体を含む、請求項114記載のキット。
- 神経変性状態の、発症リスク、診断、病期、予後、または進行を推測する方法であって、以下の工程:
a)データセットを作成するために、
神経細胞由来微粒子、例えばエキソソームについて濃縮される対象からの生体試料から、バイオマーカーのセットを測定する工程
であって、バイオマーカーのセットが以下:
(1)少なくとも1つのシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態、または
(2)複数の異なるシグナル伝達キナーゼ
を含む、工程;ならびに
b)データセットを、神経変性状態の、発症リスク、診断、病期、予後、または進行と関連付ける工程
を含む、方法。 - シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、PI3K-Akt-mTORシグナル伝達経路のキナーゼである、請求項116記載の方法。
- シグナル伝達キナーゼのうちの少なくとも1つが、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPKまたはMEK)、細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)、グリコーゲン合成酵素キナーゼ3β(GSK3B)、AKTキナーゼ、およびベクリンより選択される、請求項116記載の方法。
- 神経変性タンパク質が、アルファシヌクレイン、アミロイドβ、タウ、またはハンチンチンより選択される、請求項116記載の方法。
- 神経変性タンパク質のオリゴマー形態が、オリゴマー形態、例えば、アルファシヌクレインのオリゴマー、例えば、アルファシヌクレイン2-50、例えば、アルファシヌクレイン4-30、例えば、アルファシヌクレイン4-20のコレクションである、請求項116記載の方法。
- 以下の工程:
(a)神経変性状態を有するかまたは神経変性状態についての処置に対してポジティブに反応する可能性が高い対象を特定する工程であって、特定する工程が以下の段階:
(1)バイオマーカープロフィールを作成するために、神経細胞由来エキソソームについて濃縮される対象からの試料において(例えば、エキソソームの内部内容物から)、バイオマーカーのセットを測定する段階であって、バイオマーカーのセットが、1つまたは複数のシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態を含む、段階、および
(2)異常なバイオマーカープロフィールに基づいて、対象が神経変性状態に罹患していると決定する段階
を含む、工程;ならびに
(b)特定された対象へ、神経変性状態を処置するために有効量の薬学的組成物を投与する工程
を含む、方法。 - 神経変性状態がシヌクレオパチー状態であり、
薬学的組成物が、ドーパミンアゴニスト(例えば、プラミペキソール(例えば、Mirapex(商標))、ロピニロール(例えば、Requip)、ロチゴチン(例えば、Neupro)、アポモルフィン(例えば、Apokyn))、レボドパ、カルビドパ-レボドパ(例えば、Rytary、Sinemet)、MAO-B阻害剤(例えば、セレギリン(例えば、Eldepryl、Zelapar)もしくはラサギリン(例えば、Azilect))、カテコール-O-メチルトランスフェラーゼ(COMT)阻害剤(例えば、エンタカポン(Comtan)もしくはトルカポン(Tasmar))、抗コリン作用薬(例えば、ベンズトロピン(例えば、Cogentin)もしくはトリヘキシフェニジル)、アマンタジンまたはコリンエステラーゼ阻害剤(例えば、リバスチグミン(Exelon))を含む、請求項121記載の方法。 - シヌクレオパチー状態がパーキンソン病である、請求項121記載の方法。
- 薬学的組成物が、ドーパミンアゴニストを含む、請求項123記載の方法。
- 薬学的組成物が、NK1-アンタゴニストをさらに含む、請求項124記載の方法。
- ドーパミンアゴニストが6-プロピルアミノ-4,5,6,7-テトラヒドロ-1,3-ベンゾチアゾール-2-アミンであり、NK1-アンタゴニストがアプレピタントまたはロラピタントである、請求項125記載の方法。
- 薬学的組成物が5HT3-アンタゴニストをさらに含む、請求項124記載の方法。
- ドーパミンアゴニストが6-プロピルアミノ-4,5,6,7-テトラヒドロ-1,3-ベンゾチアゾール-2-アミンであり、5HT3アンタゴニストがオンダンセトロン塩酸塩二水和物である、請求項127記載の方法。
- 神経変性状態を示すバイオマーカープロフィールを有するかまたは神経変性状態についての処置に対してポジティブに反応する可能性が高いと特徴付けられた対象へ、神経変性状態を処置するために有効量の薬学的組成物を投与する工程
を含む方法であって、
バイオマーカーパネルが、
神経細胞由来エキソソームについて濃縮される対象からの試料から(例えば、エキソソームの内部内容物から)測定された、1つまたは複数のシグナル伝達キナーゼ、および、任意で、神経変性タンパク質の少なくとも1つのオリゴマー形態
を含む、バイオマーカーのセット
を含む、方法。 - 神経変性状態がパーキンソン病であり、薬学的組成物がドーパミンアゴニストを含む、請求項129記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201962956029P | 2019-12-31 | 2019-12-31 | |
US62/956,029 | 2019-12-31 | ||
PCT/US2020/067368 WO2021138364A1 (en) | 2019-12-31 | 2020-12-29 | Kinases as biomarkers for neurodegenerative conditions |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2023509423A true JP2023509423A (ja) | 2023-03-08 |
JPWO2021138364A5 JPWO2021138364A5 (ja) | 2024-01-12 |
Family
ID=76686821
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2022540337A Pending JP2023509423A (ja) | 2019-12-31 | 2020-12-29 | 神経変性状態のためのバイオマーカーとしてのキナーゼ |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20230349906A1 (ja) |
EP (1) | EP4084827A4 (ja) |
JP (1) | JP2023509423A (ja) |
KR (1) | KR20220163936A (ja) |
CN (1) | CN115884788A (ja) |
AU (1) | AU2020416213A1 (ja) |
CA (1) | CA3163308A1 (ja) |
IL (1) | IL294408A (ja) |
MX (1) | MX2022008111A (ja) |
WO (1) | WO2021138364A1 (ja) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20240023113A (ko) * | 2021-06-15 | 2024-02-20 | 체이스 테라퓨틱스 코포레이션 | 신경퇴행성 병태에 대한 진단 인덱스들 |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20080014194A1 (en) * | 2003-10-31 | 2008-01-17 | Elan Pharmaceuticals, Inc. | Prevention and Treatment of Synucleinopathic and Amyloidogenic Disease |
US20110034442A1 (en) * | 2007-08-08 | 2011-02-10 | Jaun Jose Legarda Ibanez | Use and Methods of Use for an Antagonist of the Serotin3 Receptor (5-HT3) and a Selective Modulator of Chloride Channels for the Treatment of Addiction to or Dependence on Medicines/Drugs or Nervous System Disorders |
WO2010037135A2 (en) * | 2008-09-29 | 2010-04-01 | The Regents Of The University Of California | Compounds for reversing and inhibiting protein aggregation, and methods for making and using them |
CA2882248A1 (en) * | 2012-08-15 | 2014-02-20 | The University Of Chicago | Exosome-based therapeutics against neurodegenerative disorders |
EP3060913A4 (en) * | 2013-10-24 | 2018-04-18 | Nanosomix Inc. | Biomarkers and diagnostic methods for alzheimer's disease and other neurodegenerative disorders |
US20200309791A1 (en) * | 2016-05-06 | 2020-10-01 | Nanosomix, Inc. | Synaptic protein biomarkers and differential diagnosis of alzheimer's disease and other neurodegenerative disorders |
PL3728567T3 (pl) * | 2017-12-19 | 2023-11-13 | Chase Therapeutics Corporation | Metoda oceny synukleinopatii |
US20210393595A1 (en) * | 2018-09-25 | 2021-12-23 | Chase Therapeutics Corporation | Anti-neurodegenerative combinations and use for treatment of neurodegenerative diseases |
-
2020
- 2020-12-29 IL IL294408A patent/IL294408A/en unknown
- 2020-12-29 KR KR1020227026640A patent/KR20220163936A/ko not_active Application Discontinuation
- 2020-12-29 US US17/789,423 patent/US20230349906A1/en active Pending
- 2020-12-29 CN CN202080097905.9A patent/CN115884788A/zh active Pending
- 2020-12-29 AU AU2020416213A patent/AU2020416213A1/en active Pending
- 2020-12-29 WO PCT/US2020/067368 patent/WO2021138364A1/en unknown
- 2020-12-29 CA CA3163308A patent/CA3163308A1/en active Pending
- 2020-12-29 JP JP2022540337A patent/JP2023509423A/ja active Pending
- 2020-12-29 EP EP20910389.4A patent/EP4084827A4/en active Pending
- 2020-12-29 MX MX2022008111A patent/MX2022008111A/es unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2021138364A1 (en) | 2021-07-08 |
KR20220163936A (ko) | 2022-12-12 |
CA3163308A1 (en) | 2021-07-08 |
CN115884788A (zh) | 2023-03-31 |
US20230349906A1 (en) | 2023-11-02 |
MX2022008111A (es) | 2023-02-22 |
IL294408A (en) | 2022-08-01 |
AU2020416213A1 (en) | 2022-07-21 |
EP4084827A1 (en) | 2022-11-09 |
EP4084827A4 (en) | 2024-01-10 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Milà-Alomà et al. | Latest advances in cerebrospinal fluid and blood biomarkers of Alzheimer’s disease | |
Yao et al. | Identification of blood biomarkers for Alzheimer's disease through computational prediction and experimental validation | |
EP3728567B1 (en) | Method for assessing a synucleinopathy | |
JP7480180B2 (ja) | アルファ-シヌクレインアッセイ | |
US20220057409A1 (en) | Combinatorial temporal biomarkers and precision medicines with detection and treatment methods for use in neuro injury, neuro disease, and neuro repair | |
US20230349906A1 (en) | Kinases as biomarkers for neurodegenerative conditions | |
JP7495878B2 (ja) | 神経変性状態を処置するための医薬を開発するための方法 | |
CA3222315A1 (en) | Diagnostic indices for neurodegenerative conditions | |
Manzine et al. | Potential Protein Blood-based Biomarkers in Different Types of Dementia: A Therapeutic Overview | |
EP3765854A1 (en) | Markers of synaptopathy in neurodegenerative disease | |
US20230190967A1 (en) | Method and Composition for Evaluating Response to Neurodegenerative Disease Treatment Agent | |
Rexrode et al. | Molecular profiling of the hippocampus of children with autism spectrum disorder | |
Saboowala | Exploring the Clinical use of Blood GFAP as an emerging Biomarker in Brain/Spinal cord Disorders and Neurological Diseases. A Systematic Evidence-based Overview. | |
Panyard et al. | Large-scale proteome and metabolome analysis of CSF implicates altered glucose metabolism and succinylcarnitine in Alzheimer’s disease | |
WO2023174946A1 (en) | Early and non-invasive method for assessing a subject's risk of having parkinson's disease | |
Tokuda et al. | Alpha-Synuclein in Cerebrospinal Fluid | |
Lauridsen et al. | Cerebrospinal fluid A? 43 is reduced in early-onset compared to late-onset Alzheimer's disease, but has similar diagnostic accuracy to A? 42 | |
Gauthier | Biological markers Douglas Galasko |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20221021 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20221102 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20231228 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20231228 |
|
RD04 | Notification of resignation of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424 Effective date: 20240207 |