JP2023034230A - 細胞画像解析システム、細胞画像解析装置、および、細胞画像解析方法 - Google Patents
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Abstract
Description
図1に示す細胞画像解析システム200は、細胞培養などを行うユーザが、細胞画像30の撮像、細胞画像30に対する解析処理、および解析処理を行った画像の閲覧を単一のシステムで統合して実施することが可能な細胞画像解析システムである。
細胞画像解析システム200は、細胞画像解析装置100と、コンピュータ110と、撮像装置120と、を備える。
図2に示すように、細胞画像30は、たとえば、細胞培養器具を用いて培養された培養細胞90の顕微鏡画像である。細胞画像30に写る細胞90としては、たとえば、接着細胞(非コロニー形成)であり、たとえば、間葉系幹細胞、線維芽細胞、血管内皮細胞、扁平上皮癌細胞、子宮内膜細胞を含む。
図3は、細胞画像解析装置100が老化指標情報24(仮足90bの長さの分布24aおよび指標値24b)を取得する構成と、重畳細胞画像80を生成する構成と、各構成の概略を示したブロック図である。
次に、本実施形態の細胞画像解析方法を説明する。本実施形態の細胞画像解析方法は、細胞画像30に写る細胞90の老化の程度を解析するための細胞画像解析方法である。細胞画像解析方法は、細胞画像解析装置100(プロセッサ10)によって実行することができる。
(1)細胞90が写る細胞画像30を取得するステップ
(2)細胞画像30から細胞領域91を取得するステップ
(3)細胞領域91のうちの仮足90bの領域92を取得するステップ
(4)個々の仮足90bの長さに基づいて、細胞90の老化の程度を示す老化指標情報24を取得するステップ
ステップS1において、細胞画像取得部11(図3参照)が、記憶部20、撮像装置120またはコンピュータ110から、細胞画像30を取得する。ステップS1の処理は、上記ステップ(1)の処理である。
ステップS2において、細胞領域取得部12(図3参照)が、ステップS1で取得された細胞画像30から、細胞領域91(図5参照)を取得する処理(上記ステップ(2))を実施する。図5を参照して、細胞領域91を取得する処理の詳細を説明する。
図4のステップS3において、仮足領域取得部13が、細胞領域取得部12によって取得された細胞領域91から、仮足90bの領域92を取得する処理(上記ステップ(3))を実行する。図6を参照して、仮足90bの領域92を取得する処理の詳細を説明する。
図4のステップS4において、仮足領域取得部13(図3参照)は、仮足90b(図2参照)の領域92(図2参照)のうち、細胞90(図2参照)の本体90a(図2参照)から分離した仮足90bの領域92を、老化指標情報24の取得対象から除外する処理を実行する。図7を参照して、仮足領域取得部13が、細胞90の本体90aから分離した仮足90bの領域92を除外する処理の詳細を説明する。
図4のステップS5において、仮足領域取得部13は、仮足90bの領域92のうち、細胞画像30の端部と接する仮足90bを、老化指標情報24の取得対象から除外する処理を実行する。図8を参照して、細胞画像30の端部と接する仮足90bを除外する処理の詳細を説明する。
図4のステップS6において、老化指標情報取得部14(図3参照)は、個々の仮足90bの長さに基づいて、細胞90の老化の程度を示す老化指標情報24を取得する処理(上記ステップ(4))を実行する。本実施形態では、老化指標情報取得部14は、仮足90bの長さが所定の長さ以上の仮足90bに基づいて、老化指標情報24を取得する。図9を参照して、老化指標情報取得部14が、老化指標情報24を取得する処理の詳細を説明する。
指標値=長い仮足の数/(所定の長さ以上の仮足の数)×100
ここで、長い仮足の数とは、長さが100μm以上の仮足90bである。また、所定の長さ以上の仮足の数とは、仮足領域画像36に写る仮足90bのうち、所定の長さ以上の仮足90bの数である。すなわち、所定の長さ以上の仮足の数は、長さが40μm以上100μm未満の仮足90bの数と、長さが100μm以上の仮足90bの数との足し算により取得することができる。なお、長い仮足90bとする長さは、100μm以外であってもよい。長い仮足90bとする長さは、細胞90の種類、細胞90を培養する環境によって基準を決定する実験を行い、実験的に設定される。本実施形態では、一例として、仮足90bの長さが100μm以上となる細胞90を、老化が進行している細胞90としている。
図4のステップS7において、重畳細胞画像生成部15は、細胞画像30と、仮足90bの長さとに基づいて、重畳細胞画像80を生成する処理を実行する。図11を参照して、重畳細胞画像80を生成する処理の詳細を説明する。
図4のステップS8において、プロセッサ10は、老化指標情報24、および、重畳細胞画像80を、ネットワーク130を介してコンピュータ110に送信する。
本実施形態では、以下のような効果を得ることができる。
なお、今回開示された実施形態は、すべての点で例示であって制限的なものではないと考えられるべきである。本発明の範囲は、上記した実施形態の説明ではなく特許請求の範囲によって示され、さらに特許請求の範囲と均等の意味および範囲内でのすべての変更(変形例)が含まれる。
上記した例示的な実施形態は、以下の態様の具体例であることが当業者により理解される。
細胞が写る細胞画像を取得する細胞画像取得部と、
前記細胞画像から細胞領域を取得する細胞領域取得部と、
前記細胞画像の前記細胞領域のうちの細長い領域である仮足の領域を取得する仮足領域取得部と、
個々の前記仮足の長さに基づいて、前記細胞の老化の程度を示す老化指標情報を取得する老化指標情報取得部と、を備える、細胞画像解析システム。
前記老化指標情報を表示する表示部をさらに備える、項目1に記載の細胞画像解析システム。
前記老化指標情報取得部は、前記仮足の長さが所定の長さ以上の前記仮足に基づいて、前記老化指標情報を取得するように構成されている、項目2に記載の細胞画像解析システム。
前記老化指標情報取得部は、前記仮足の長さの分布、および、取得された前記仮足のうちの所定の長さ以上の前記仮足の割合を示す指標値の少なくともいずれかを取得するように構成されており、
前記表示部は、前記仮足の長さの分布、および、前記指標値の少なくともいずれかを表示するように構成されている、項目3に記載の細胞画像解析システム。
前記老化指標情報取得部は、前記仮足の領域の長手方向の長さを取得することにより、前記仮足の長さを取得するように構成されている、項目1~4のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
前記老化指標情報取得部は、前記仮足の領域の最小外接矩形の長辺の長さを取得することにより、前記仮足の領域の長手方向の長さを取得するように構成されている、項目5に記載の細胞画像解析システム。
前記仮足領域取得部は、前記細胞領域から前記仮足を除去した仮足除去画像を取得するとともに、前記細胞画像と前記仮足除去画像との差分に基づいて、前記仮足の領域を取得するように構成されている、項目1~6のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
前記仮足領域取得部は、前記細胞画像に対して収縮処理および膨張処理を行うことにより、前記仮足除去画像を取得するように構成されている、項目7に記載の細胞画像解析システム。
前記仮足領域取得部は、前記仮足の領域のうち、前記細胞の本体から分離した前記仮足の領域を、前記老化指標情報の取得対象から除外するように構成されている、項目1~8のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
前記仮足領域取得部は、前記仮足の領域のうち、前記細胞領域に占める前記仮足の領域の割合が所定の大きさ以上の前記仮足の領域を、前記老化指標情報の取得対象から除外するように構成されている、項目9に記載の細胞画像解析システム。
前記仮足領域取得部は、前記仮足の領域のうち、前記細胞画像の端部と接する前記仮足を、前記老化指標情報の取得対象から除外するように構成されている、項目1~10のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
前記細胞領域取得部は、前記細胞が写る教師用画像から、細胞骨格の領域を抽出することにより、前記細胞領域を取得することを学習させた学習済みモデルと、前記細胞画像とに基づいて、前記細胞領域を取得するように構成されている、項目1~11のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
前記細胞画像に対して、前記細胞領域および前記仮足の領域を重畳するとともに、前記仮足の領域に対して、前記仮足の長さを示す標識を重畳した重畳細胞画像を生成する重畳細胞画像生成部をさらに備える、項目1~12のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
前記重畳細胞画像生成部は、前記仮足の領域の長さに応じて、表示態様を異ならせた前記標識を重畳するように構成されている、項目13に記載の細胞画像解析システム。
前記重畳細胞画像生成部は、前記仮足の長さが所定の長さ以上の前記仮足に対して、前記仮足の長さが所定の長さ未満の前記仮足と表示態様を異ならせた前記標識を重畳するように構成されている、項目14に記載の細胞画像解析システム。
細胞が写る細胞画像を取得する細胞画像取得部と、
前記細胞画像から細胞領域を取得する細胞領域取得部と、
前記細胞画像の前記細胞領域のうちの細長い領域である仮足の領域を取得する仮足領域取得部と、
個々の前記仮足の長さに基づいて、前記細胞の老化の程度を示す老化指標情報を取得する老化指標情報取得部と、を備える、細胞画像解析装置。
細胞が写る細胞画像を取得するステップと、
前記細胞画像から細胞領域を取得するステップと、
前記細胞領域のうちの仮足の領域を取得するステップと、
個々の前記仮足の長さに基づいて、前記細胞の老化の程度を示す老化指標情報を取得するステップと、を備える、細胞画像解析方法。
12 細胞領域取得部
13 仮足領域取得部
14 老化指標情報取得部
15 重畳細胞画像生成部
23 学習済みモデル
24 老化指標情報
24a 仮足の長さの分布
24b 指標意
30 細胞画像
70 標識
71 最小外接矩形
80 重畳細胞画像
90 細胞
90a 細胞の本体
90b 仮足
91 細胞領域
92 仮足の領域
100 細胞画像解析装置
200 細胞画像解析システム
L 最小外接矩形の長辺の長さ
Claims (17)
- 細胞が写る細胞画像を取得する細胞画像取得部と、
前記細胞画像から細胞領域を取得する細胞領域取得部と、
前記細胞画像の前記細胞領域のうちの細長い領域である仮足の領域を取得する仮足領域取得部と、
個々の前記仮足の長さに基づいて、前記細胞の老化の程度を示す老化指標情報を取得する老化指標情報取得部と、を備える、細胞画像解析システム。 - 前記老化指標情報を表示する表示部をさらに備える、請求項1に記載の細胞画像解析システム。
- 前記老化指標情報取得部は、前記仮足の長さが所定の長さ以上の前記仮足に基づいて、前記老化指標情報を取得するように構成されている、請求項2に記載の細胞画像解析システム。
- 前記老化指標情報取得部は、前記仮足の長さの分布、および、取得された前記仮足のうちの所定の長さ以上の前記仮足の割合を示す指標値の少なくともいずれかを取得するように構成されており、
前記表示部は、前記仮足の長さの分布、および、前記指標値の少なくともいずれかを表示するように構成されている、請求項3に記載の細胞画像解析システム。 - 前記老化指標情報取得部は、前記仮足の領域の長手方向の長さを取得することにより、前記仮足の長さを取得するように構成されている、請求項1~4のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
- 前記老化指標情報取得部は、前記仮足の領域の最小外接矩形の長辺の長さを取得することにより、前記仮足の領域の長手方向の長さを取得するように構成されている、請求項5に記載の細胞画像解析システム。
- 前記仮足領域取得部は、前記細胞領域から前記仮足を除去した仮足除去画像を取得するとともに、前記細胞画像と前記仮足除去画像との差分に基づいて、前記仮足の領域を取得するように構成されている、請求項1~6のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
- 前記仮足領域取得部は、前記細胞画像に対して収縮処理および膨張処理を行うことにより、前記仮足除去画像を取得するように構成されている、請求項7に記載の細胞画像解析システム。
- 前記仮足領域取得部は、前記仮足の領域のうち、前記細胞の本体から分離した前記仮足の領域を、前記老化指標情報の取得対象から除外するように構成されている、請求項1~8のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
- 前記仮足領域取得部は、前記仮足の領域のうち、前記細胞領域に占める前記仮足の領域の割合が所定の大きさ以上の前記仮足の領域を、前記老化指標情報の取得対象から除外するように構成されている、請求項9に記載の細胞画像解析システム。
- 前記仮足領域取得部は、前記仮足の領域のうち、前記細胞画像の端部と接する前記仮足を、前記老化指標情報の取得対象から除外するように構成されている、請求項1~10のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
- 前記細胞領域取得部は、前記細胞が写る教師用画像から、細胞骨格の領域を抽出することにより、前記細胞領域を取得することを学習させた学習済みモデルと、前記細胞画像とに基づいて、前記細胞領域を取得するように構成されている、請求項1~11のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
- 前記細胞画像に対して、前記細胞領域および前記仮足の領域を重畳するとともに、前記仮足の領域に対して、前記仮足の長さを示す標識を重畳した重畳細胞画像を生成する重畳細胞画像生成部をさらに備える、請求項1~12のいずれか1項に記載の細胞画像解析システム。
- 前記重畳細胞画像生成部は、前記仮足の領域の長さに応じて、表示態様を異ならせた前記標識を重畳するように構成されている、請求項13に記載の細胞画像解析システム。
- 前記重畳細胞画像生成部は、前記仮足の長さが所定の長さ以上の前記仮足に対して、前記仮足の長さが所定の長さ未満の前記仮足と表示態様を異ならせた前記標識を重畳するように構成されている、請求項14に記載の細胞画像解析システム。
- 細胞が写る細胞画像を取得する細胞画像取得部と、
前記細胞画像から細胞領域を取得する細胞領域取得部と、
前記細胞画像の前記細胞領域のうちの細長い領域である仮足の領域を取得する仮足領域取得部と、
個々の前記仮足の長さに基づいて、前記細胞の老化の程度を示す老化指標情報を取得する老化指標情報取得部と、を備える、細胞画像解析装置。 - 細胞が写る細胞画像を取得するステップと、
前記細胞画像から細胞領域を取得するステップと、
前記細胞領域のうちの仮足の領域を取得するステップと、
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