JP2022152998A - NOVEL ENZYMATIC AGENT AND METHOD FOR PRODUCING β-GLUCOSE DISACCHARIDE-CONTAINING CARBOHYDRATE - Google Patents

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直人 磯野
Naoto Isono
涼一 石川
Ryoichi Ishikawa
健太 相沢
Kenta Aizawa
和典 柳原
Kazunori Yanagihara
宏基 高木
Hiromoto Takagi
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Japan Maize Products Co Ltd
Nihon Shokuhin Kako Co Ltd
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Nihon Shokuhin Kako Co Ltd
Mie University NUC
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Abstract

To provide novel enzymatic agents capable of selectively producing gentiobiose.SOLUTION: Provided is an enzymatic agent comprising a protein selected from the group consisting of (a), (b), and (c) below: (a) a protein comprising a specific amino acid sequence; (b) a protein consisting of an amino acid sequence having 70% or more identity to a specific amino acid sequence and having β-glucosidase activity; and (c) a protein consisting of an amino acid sequence in which one or more amino acids are modified, in a specific amino acid sequence and having β-glucosidase activity.SELECTED DRAWING: None

Description

本発明は、新規酵素剤および該酵素剤を用いたβ-グルコ二糖含有糖質の製造方法に関する。 The present invention relates to a novel enzymatic agent and a method for producing a β-glucodisaccharide-containing carbohydrate using the enzymatic agent.

β-グルコシダーゼは、セロビオースをはじめとするβ-グルコ二糖に作用し、そのβ-グリコシド結合を加水分解する反応を触媒する酵素である。一方で、高濃度のグルコース存在下においては、当該加水分解反応の逆反応である縮合反応によりβ-グルコオリゴ糖を生成することが知られている。 β-Glucosidase is an enzyme that acts on β-glucodisaccharides such as cellobiose and catalyzes a reaction to hydrolyze the β-glycosidic bond. On the other hand, it is known that β-glucooligosaccharides are produced by a condensation reaction, which is the reverse reaction of the hydrolysis reaction, in the presence of high-concentration glucose.

特許文献1には、微生物起源のβ-グルコシダーゼをグルコースに作用させてβ-グルコオリゴ糖を製造する方法が記載されている。特許文献2には、特定の理化学的性質を有することを特徴とする新規酵素と、該酵素を高濃度グルコース溶液に作用させてゲンチオオリゴ糖高含有シラップを製造する方法が記載されている。 Patent Document 1 describes a method for producing β-glucooligosaccharides by reacting microbial β-glucosidase on glucose. Patent Document 2 describes a novel enzyme characterized by having specific physicochemical properties, and a method for producing a gentiooligosaccharide-rich syrup by acting the enzyme on a high-concentration glucose solution.

上記手法により得られたβ-グルコ二糖中にはゲンチオビオースに加えて、ラミナリビオースやソホロースなど、ゲンチオビオース以外のβ-グルコ二糖がある程度含まれており、ゲンチオビオースの含量は十分ではなかった。一方、非特許文献1には、ハロバチルス・ハロフィラス(Halobacillus halophilus)由来のβ-グルコシダーゼを用いてグルコースを縮合反応させることでゲンチオビオースを合成できることが報告されている。 The β-glucodisaccharide obtained by the above method contained a certain amount of β-glucodisaccharides other than gentiobiose, such as laminaribiose and sophorose, in addition to gentiobiose, and the content of gentiobiose was not sufficient. On the other hand, Non-Patent Document 1 reports that gentiobiose can be synthesized by condensing glucose with β-glucosidase derived from Halobacillus halophilus .

特開平2-219584号公報JP-A-2-219584 特開平1-222779号公報JP-A-1-222779

2018年度日本農芸化学会大会講演要旨集、講演番号:2A26p05、「Halobacillus halophilus由来β-1,6-グルコシダーゼの機能解析」、寺田真衣、磯野直人2018 Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology and Agrochemistry, Lecture number: 2A26p05, "Functional analysis of β-1,6-glucosidase derived from Halobacillus halophilus", Mai Terada, Naoto Isono

本発明は、ゲンチオビオースを選択的に製造可能な新規酵素剤と、該酵素剤を用いたβ-グルコ二糖含有糖質の新規製造方法の提供を目的とする。 An object of the present invention is to provide a novel enzymatic agent capable of selectively producing gentiobiose, and a novel method for producing β-glucodisaccharide-containing carbohydrates using the enzymatic agent.

本発明者らは今般、選抜した7種のタンパク質がβ-グルコシダーゼ活性を有することを見出すとともに、該酵素を用いて特にゲンチオビオース含量の高いβ-グルコ二糖を製造できることを見出した。本発明はこれらの知見に基づくものである。 The present inventors have recently discovered that the selected seven proteins have β-glucosidase activity, and that the enzyme can be used to produce β-glucodisaccharide with a particularly high gentiobiose content. The present invention is based on these findings.

本発明によれば以下の発明が提供される。
[1]下記(a)、(b)および(c)からなる群から選択されるタンパク質を含んでなる酵素剤:
(a)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列を含んでなるタンパク質、
(b)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列に対して70%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質、および
(c)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列において、1または複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質。
[2]β-グルコ二糖の製造に用いるための、上記[1]に記載の酵素剤。
[3]β-グルコ二糖が少なくともゲンチオビオースを含む、上記[2]に記載の酵素剤。
[4]上記[1]~[3]のいずれか一項に記載の酵素剤をグルコースに作用させる工程を含んでなる、β-グルコ二糖またはそれを含む糖質組成物の製造方法。
[5]β-グルコ二糖が少なくともゲンチオビオースを含む、上記[4]に記載の製造方法。
[6]下記(i)、(ii)、(iii)および(iv)からなる群から選択される塩基配列からなるポリヌクレオチドまたは該ポリヌクレオチドを作動可能に連結してなる発現ベクターにより形質転換した宿主微生物を培養する工程を含んでなる、上記[1]~[3]のいずれか一項に記載の酵素剤の製造方法:
(i)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列、
(ii)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列と70%以上の同一性を有し、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列、
(iii)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列において、1または複数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列、および
(iv)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列の相補配列からなるポリヌクレオチドに対してストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列。
[7]配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列が、配列番号8~14のいずれかの塩基配列である、上記[6]に記載の製造方法。
According to the present invention, the following inventions are provided.
[1] An enzymatic agent comprising a protein selected from the group consisting of (a), (b) and (c) below:
(a) a protein comprising the amino acid sequence of any of SEQ ID NOS: 1-7;
(b) a protein consisting of an amino acid sequence having 70% or more identity to any of the amino acid sequences of SEQ ID NOS: 1-7 and having β-glucosidase activity, and (c) a protein of SEQ ID NOS: 1-7 A protein consisting of an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and/or added to any amino acid sequence and having β-glucosidase activity.
[2] The enzymatic agent according to [1] above for use in producing β-glucodisaccharide.
[3] The enzymatic agent according to [2] above, wherein the β-glucodisaccharide contains at least gentiobiose.
[4] A method for producing a β-glucodisaccharide or a carbohydrate composition containing the same, comprising a step of allowing the enzymatic agent according to any one of [1] to [3] above to act on glucose.
[5] The production method according to [4] above, wherein the β-glucodisaccharide contains at least gentiobiose.
[6] Transformed with a polynucleotide consisting of a base sequence selected from the group consisting of the following (i), (ii), (iii) and (iv) or an expression vector operably linked to the polynucleotide The method for producing the enzymatic agent according to any one of [1] to [3] above, comprising the step of culturing a host microorganism:
(i) a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOS: 1-7;
(ii) a nucleotide sequence that has 70% or more identity with the nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any of SEQ ID NOs: 1 to 7 and encodes a protein having β-glucosidase activity;
(iii) a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 7, consisting of a nucleotide sequence in which one or more nucleotides are deleted, substituted, inserted and/or added, and β-glucosidase hybridizes under stringent conditions to a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence encoding a protein having activity and (iv) a sequence complementary to the nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 7, and , a nucleotide sequence encoding a protein having β-glucosidase activity.
[7] The production method according to [6] above, wherein the nucleotide sequence encoding any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1-7 is any of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 8-14.

本発明によれば、ゲンチオビオース含量の高いβ-グルコ二糖の製造に有用な酵素剤が提供される。本発明の酵素剤をグルコースに作用させることで特にゲンチオビオース含量の高いβ-グルコ二糖を製造することができる。 INDUSTRIAL APPLICABILITY According to the present invention, an enzymatic agent useful for producing β-glucodisaccharide with a high gentiobiose content is provided. By allowing the enzymatic agent of the present invention to act on glucose, β-glucodisaccharide having a particularly high gentiobiose content can be produced.

発明の具体的説明Specific description of the invention

<<本発明の酵素剤>>
本発明の酵素剤は、前記(a)、(b)および(c)からなる群から選択される少なくとも一つのタンパク質(以下、「本発明のタンパク質」ということがある)を含んでなるものである。本発明の酵素剤はβ-グルコシダーゼ活性を有する酵素剤であり、特にβ-1,6-グリコシド結合特異的なグルコシダーゼ活性を示すことから、ゲンチオビオースの選択的合成および選択的分解に有用な酵素剤である。
<<Enzyme agent of the present invention>>
The enzymatic agent of the present invention comprises at least one protein selected from the group consisting of (a), (b) and (c) (hereinafter sometimes referred to as "the protein of the present invention"). be. The enzymatic agent of the present invention is an enzymatic agent having β-glucosidase activity, and since it exhibits β-1,6-glycoside bond-specific glucosidase activity, it is useful for selective synthesis and selective degradation of gentiobiose. is.

本発明において「β-グルコシダーゼ活性」は、β-グルコ二糖を加水分解し、グルコースを生成する反応を触媒する酵素活性である。さらに本酵素は、縮合反応や糖転移反応も触媒する。この縮合反応や糖転移反応では、グルコースを基質としてβ-グルコ二糖が生成する。β-グルコ二糖としては、ゲンチオビオース(β-1,6-グルコ二糖)、ソホロ―ス(β-1,2-グルコ二糖)、ラミナリビオース(β-1,3-グルコ二糖)、セロビオース(β-1,4-グルコ二糖)、イソトレハロース(β-1,1-グルコ二糖)が挙げられる。 In the present invention, "β-glucosidase activity" is an enzymatic activity that catalyzes a reaction that hydrolyzes β-glucodisaccharide to produce glucose. Furthermore, this enzyme also catalyzes condensation reactions and transglycosylation reactions. In this condensation reaction and glycosyltransferase reaction, β-glucodisaccharide is produced using glucose as a substrate. β-glucodisaccharides include gentiobiose (β-1,6-glucodisaccharide), sophorose (β-1,2-glucodisaccharide), laminaribiose (β-1,3-glucodisaccharide) , cellobiose (β-1,4-glucodisaccharide), and isotrehalose (β-1,1-glucodisaccharide).

本発明の酵素剤が前記(a)のタンパク質を含む場合、本発明のタンパク質は、配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列を含んでなるものであっても、配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列からなるものであってもよい。 When the enzymatic agent of the present invention contains the protein (a), the protein of the present invention may comprise any amino acid sequence of SEQ ID NOS: 1-7, or any of SEQ ID NOS: 1-7. It may consist of any amino acid sequence.

前記(b)において、「同一性」は「相同性」を含む意味で用いられる。ここで「同一性」は、例えば、比較する配列同士を適切に整列(アライメント)させたときの同一性の程度であり、前記配列間のアミノ酸の正確な一致の出現率(%)を意味する。同一性の算出にあたっては、例えば、配列におけるギャップの存在およびアミノ酸の性質が考慮される(Wilbur, Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80:726-730(1983))。前記アライメントは、例えば、任意のアルゴリズムの利用により行うことができ、具体的に、BLAST(Basic local alignment search tool)(Altschul et al., J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990))、FASTA(Peasron et al., Methods in Enzymology 183:63-69 (1990))、Smith-Waterman(Meth. Enzym., 164, 765 (1988))などの公に利用可能な相同性検索ソフトウェアを使用することができる。また、同一性の算出は、例えば、前記のような公に利用可能な相同性検索プログラムを用いて行うことができ、例えば、米国国立生物工学情報センター(NCBI)の相同性アルゴリズムBLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)において、デフォルトのパラメーターを用いることによって算出することができる。 In (b) above, "identity" is used in the sense of including "homology". Here, "identity" is, for example, the degree of identity when the sequences to be compared are properly aligned (aligned), and means the occurrence rate (%) of exact amino acid matches between the sequences. . In calculating identity, for example, the presence of gaps in the sequence and the nature of the amino acids are taken into account (Wilbur, Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80:726-730 (1983)). The alignment can be performed, for example, by using any algorithm, specifically BLAST (Basic local alignment search tool) (Altschul et al., J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990)). , FASTA (Peasron et al., Methods in Enzymology 183:63-69 (1990)), Smith-Waterman (Meth. Enzym., 164, 765 (1988)). can do. In addition, the identity can be calculated using, for example, a publicly available homology search program such as those described above, for example, the homology algorithm BLAST (https: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) by using the default parameters.

前記(b)における同一性は、例えば、70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは85%以上、さらに好ましくは90%以上、さらに一層好ましくは95%以上、特に好ましくは96%以上、97%以上、98%以上、99%以上または99.5%である。 The identity in (b) is, for example, 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 85% or more, still more preferably 90% or more, even more preferably 95% or more, particularly preferably 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, or 99.5%.

前記(c)のタンパク質は、配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列において、欠失、置換、挿入および付加からなる群から選択される1個または複数個の改変を有していてもよい。改変されるアミノ酸の個数は、例えば、1~100個、好ましくは1~50個、より好ましくは1~20個、さらに好ましくは1~10個、さらに一層好ましくは1~6個、特に好ましくは1~数個、1~4個、1~3個、1~2個または1個である。改変されるアミノ酸の個数はまた、部位突然変異誘発法などの公知の方法により生じる程度の変異数、あるいは、天然に生じる程度の変異数とすることができる。このため「改変」は変異を含む意味で用いられるものとする。前記アミノ酸配列において、前記改変は、連続して生じてもよいし、不連続に生じてもよい。前記改変はまた、複数の同種の改変(例えば、複数の置換)であってもよいし、複数の異種の改変(例えば、1個以上の欠失と1個以上の置換の組合せ)であってもよい。 The protein (c) may have one or more modifications selected from the group consisting of deletion, substitution, insertion and addition in the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 7. . The number of amino acids to be modified is, for example, 1 to 100, preferably 1 to 50, more preferably 1 to 20, still more preferably 1 to 10, even more preferably 1 to 6, particularly preferably 1 to several, 1 to 4, 1 to 3, 1 to 2 or 1. The number of amino acids to be modified can also be the number of mutations produced by known methods such as site mutagenesis, or the number of mutations produced naturally. Therefore, the term "modification" is used in the sense of including mutation. In the amino acid sequence, the modifications may occur continuously or discontinuously. The modification may also be multiple homologous modifications (e.g., multiple substitutions) or multiple heterologous modifications (e.g., a combination of one or more deletions and one or more substitutions), good too.

また、前記(c)におけるアミノ酸の挿入としては、例えば、アミノ酸配列の内部への挿入が挙げられる。さらに、アミノ酸の付加は、例えば、アミノ酸配列のN末端およびC末端のいずれかへの付加であっても、N末端およびC末端の両末端への付加であってもよい。 In addition, the amino acid insertion in (c) above includes, for example, insertion into the inside of the amino acid sequence. Furthermore, addition of amino acids may be, for example, addition to either the N-terminus or the C-terminus of the amino acid sequence, or addition to both the N-terminus and the C-terminus.

前記アミノ酸の改変は保存的改変(例えば、保存的変異)であってもよい。「保存的改変」または「保存的変異」は、タンパク質の機能を実質的に改変しないように、1個または複数個のアミノ酸を改変し、または変異させることを意味する。前記アミノ酸の置換はまた、保存的置換であってもよい。「保存的置換」は、タンパク質の機能を実質的に改変しないように、1個または複数個のアミノ酸を、別のアミノ酸および/またはアミノ酸誘導体に置換することを意味する。保存的置換において、置換されるアミノ酸と置換後のアミノ酸とは、例えば、性質および/または機能が類似していることが好ましい。具体的には、疎水性および親水性の指標、極性、電荷などの化学的性質、あるいは二次構造などの物理的性質が類似していることが好ましい。このように、性質および/または機能が類似するアミノ酸またはアミノ酸誘導体は、当該技術分野において公知である。例えば、非極性アミノ酸(疎水性アミノ酸)としては、例えば、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシン、プロリン、トリプトファン、フェニルアラニン、メチオニンなどが挙げられる。極性アミノ酸(中性アミノ酸)は、グリシン、セリン、スレオニン、チロシン、グルタミン、アスパラギン、システインなどが挙げられる。陽電荷を有するアミノ酸(塩基性アミノ酸)は、アルギニン、ヒスチジン、リジンなどが挙げられ、負電荷を有するアミノ酸(酸性アミノ酸)は、アスパラギン酸、グルタミン酸などが挙げられる。 The amino acid alterations may be conservative alterations (eg, conservative mutations). A "conservative modification" or "conservative mutation" means modifying or mutating one or more amino acids so as not to substantially alter the function of the protein. The amino acid substitutions may also be conservative substitutions. A "conservative substitution" refers to the replacement of one or more amino acids with another amino acid and/or amino acid derivative that does not substantially alter the function of the protein. In conservative substitution, the substituted amino acid and the substituted amino acid are preferably similar in properties and/or functions, for example. Specifically, it is preferred that the indices of hydrophobicity and hydrophilicity, chemical properties such as polarity and charge, or physical properties such as secondary structure are similar. Thus, amino acids or amino acid derivatives with similar properties and/or functions are known in the art. For example, nonpolar amino acids (hydrophobic amino acids) include alanine, valine, isoleucine, leucine, proline, tryptophan, phenylalanine, methionine, and the like. Polar amino acids (neutral amino acids) include glycine, serine, threonine, tyrosine, glutamine, asparagine, cysteine and the like. Examples of positively charged amino acids (basic amino acids) include arginine, histidine, and lysine, and examples of negatively charged amino acids (acidic amino acids) include aspartic acid and glutamic acid.

前記(b)および(c)において、「β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質」であるか否かは、被験タンパク質の加水分解活性を指標に評価することができ、例えば、被験タンパク質を基質であるβ-グルコ二糖に作用させ、分解により生じたグルコース量を測定することにより評価することができる。β-グルコシダーゼ活性の強さは、分解により生じたグルコース量を指標にして評価することができる。β-グルコシダーゼ活性は、例えば、β-グルコ二糖を基質として、本発明のタンパク質(酵素)を作用させ、酵素反応により生成されるグルコース量をグルコースC-IIテストワコー(富士フイルム和光純薬社)による発色反応により測定し、ここで得られた値と、反応に用いた酵素の添加量を以って評価することができる。 In (b) and (c) above, whether or not the "protein having β-glucosidase activity" can be evaluated using the hydrolytic activity of the test protein as an index. - It can be evaluated by acting on glucodisaccharide and measuring the amount of glucose produced by decomposition. The strength of β-glucosidase activity can be evaluated using the amount of glucose produced by decomposition as an index. The β-glucosidase activity can be measured, for example, by allowing the protein (enzyme) of the present invention to act on β-glucodisaccharide as a substrate, and measuring the amount of glucose produced by the enzymatic reaction with Glucose C-II Test Wako (Fujifilm Wako Pure Chemical Industries, Ltd.). ), and can be evaluated based on the value obtained here and the added amount of the enzyme used in the reaction.

本発明のタンパク質が配列番号1のアミノ酸配列に基づいて定められた前記(b)または前記(c)のタンパク質である場合、該タンパク質は温度30~40℃、pH6~8の条件下で配列番号1のアミノ酸配列からなるタンパク質の約70%以上の活性、約80%以上の活性、約90%以上の活性、約95%以上の活性または約100%以上の活性を有するものとすることができる。本発明のタンパク質が配列番号2~7のいずれかに基づいて定められた前記(b)または前記(c)のタンパク質である場合も上記と同様にそれぞれ配列番号2~7のいずれかのアミノ酸配列からなるタンパク質との対比でその活性の強さを定めることができる。 When the protein of the present invention is the protein (b) or (c) defined based on the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, the protein can be prepared at a temperature of 30 to 40° C. and a pH of 6 to 8. It can have about 70% or more activity, about 80% or more activity, about 90% or more activity, about 95% or more activity, or about 100% or more activity of a protein consisting of one amino acid sequence. . When the protein of the present invention is the protein (b) or (c) defined based on any of SEQ ID NOs: 2 to 7, the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 2 to 7, respectively, in the same manner as above The strength of its activity can be determined by contrasting it with a protein consisting of

本発明の酵素剤は、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質を有効成分とするものである。前記の通り、β-グルコシダーゼの縮合反応や糖転移反応により、グルコースからゲンチオビオース含量の高いβ-グルコ二糖が生成する。本発明の酵素剤を用いたβ-グルコ二糖の製造は後述する。 The enzymatic agent of the present invention contains a protein having β-glucosidase activity as an active ingredient. As described above, β-glucodisaccharide with a high content of gentiobiose is produced from glucose by condensation reaction and transglycosylation reaction of β-glucosidase. Production of β-glucodisaccharide using the enzymatic agent of the present invention will be described later.

<<β-グルコ二糖含有糖質の製造方法>>
本発明によれば、本発明の酵素剤をグルコースに作用させる工程を含んでなる、β-グルコ二糖またはそれを含む糖質組成物の製造方法が提供される。
<<Method for producing carbohydrate containing β-glucodisaccharide>>
According to the present invention, there is provided a method for producing a β-glucodisaccharide or a carbohydrate composition containing the same, comprising a step of allowing the enzymatic agent of the present invention to act on glucose.

本発明の酵素剤をグルコースに作用させることで二分子のグルコースが縮合しβ-グルコ二糖が生成する。本発明の製造方法で得られるβ-グルコ二糖を含む糖質組成物は、具体的には、縮合反応で生成したβ-グルコ二糖に加え、グルコースなどの原料糖質や、縮合反応で生成した重合度3以上の糖質などを含みうる混合物である。 By allowing the enzymatic agent of the present invention to act on glucose, two molecules of glucose are condensed to produce β-glucodisaccharide. Specifically, the saccharide composition containing β-glucodisaccharide obtained by the production method of the present invention includes, in addition to β-glucodisaccharide produced by the condensation reaction, raw saccharides such as glucose, It is a mixture that can contain the produced saccharides having a degree of polymerization of 3 or more.

β-グルコシダーゼによるグルコースの縮合反応においては、製造されるグルコース縮合反応物はグルコース同士がβ-グルコシド結合したもの(β-グルコオリゴ糖)であり、様々な結合様式(β-1,6-結合、β-1,3-結合など)のものが混在していることが知られている。したがって、本発明の製造方法により得られるβ-グルコ二糖にはゲンチオビオース(β-1,6-結合)以外のβ-グルコ二糖が含まれていてもよい。本発明の製造方法により得られるβ-グルコ二糖の糖組成は特に制限はないが、β-グルコ二糖中のゲンチオビオースの含量が60質量%以上であるものとすることができ、好ましくは70質量%以上、80質量%以上、85質量%以上、90質量%以上、91質量%以上、92質量%以上、93質量%以上、94質量%以上または95質量%以上とすることができる。なお、本明細書において、糖組成の比率に言及するときは、固形分当たりの各糖成分の含量(質量%)を意味する。 In the condensation reaction of glucose by β-glucosidase, the produced glucose condensation product is a β-glucoside bond between glucose (β-gluco-oligosaccharide), and various bonding modes (β-1,6-bond, β-1,3-bonds, etc.) are known to be mixed. Therefore, the β-glucodisaccharide obtained by the production method of the present invention may contain β-glucodisaccharide other than gentiobiose (β-1,6-linkage). The sugar composition of the β-glucodisaccharide obtained by the production method of the present invention is not particularly limited. % by mass or more, 80% by mass or more, 85% by mass or more, 90% by mass or more, 91% by mass or more, 92% by mass or more, 93% by mass or more, 94% by mass or more, or 95% by mass or more. In this specification, when referring to the sugar composition ratio, it means the content (% by mass) of each sugar component per solid content.

本発明の製造方法において、原料となるグルコースはグルコース水溶液(グルコースシラップ)を用いることができ、その反応効率を考慮すると固形分濃度40質量%以上の濃度の水溶液とすることが好ましく、より好ましくは固形分濃度50質量%以上の水溶液である。原料のグルコースは純品でもよいが、コストや入手し易さを考慮すると他の糖質が混合した糖組成物でもよく、例えば、グルコース含量20~100質量%の澱粉分解物、グルコース含量50~100質量%の澱粉分解物、グルコース含量60~100質量%の澱粉分解物、またはグルコース含量70~100質量%の澱粉分解物を原料として用いることができる。 In the production method of the present invention, an aqueous glucose solution (glucose syrup) can be used as the raw material glucose, and considering the reaction efficiency, it is preferable to use an aqueous solution having a solid content concentration of 40% by mass or more, more preferably. It is an aqueous solution with a solid content concentration of 50% by mass or more. Glucose as a raw material may be a pure product, but considering cost and availability, it may be a sugar composition in which other sugars are mixed. A starch hydrolyzate with a glucose content of 100% by mass, a starch hydrolyzate with a glucose content of 60-100% by mass, or a starch hydrolyzate with a glucose content of 70-100% by mass can be used as a raw material.

本発明の製造方法において、酵素剤を基質に作用させる条件は特に制限はなく、酵素の特性に合わせて適宜調整すればよいが、例えば、pH6~8、温度30~60℃の条件で、12~144時間反応させることができる。 In the production method of the present invention, the conditions under which the enzymatic agent acts on the substrate are not particularly limited, and may be appropriately adjusted according to the characteristics of the enzyme. Allow to react for ~144 hours.

本発明の製造方法においては、所望のβ-グルコ二糖が得られた後、必要に応じて酵素の失活処理、濾過・脱色・脱臭・脱塩などの精製処理および/または濃縮処理を行うことができる。これらの処理は常法に従って実施することができる。また、得られたβ-グルコ二糖は、適宜濃縮して液状品としてもよく、噴霧乾燥などにより粉末品としてもよい。さらに、膜分画、樹脂分画などの分画処理や、微生物による資化処理などによって残存した原料や副産物を除去したり、特定重合度のものを分取したりすることにより、β-グルコ二糖含量、特にゲンチオビオース含量をより高めることができる。 In the production method of the present invention, after the desired β-glucodisaccharide is obtained, enzyme deactivation treatment, purification treatment such as filtration, decolorization, deodorization, and desalting and/or concentration treatment are performed as necessary. be able to. These treatments can be carried out according to conventional methods. Further, the obtained β-glucodisaccharide may be appropriately concentrated into a liquid product, or may be powdered by spray drying or the like. In addition, β-glucolysis can be achieved by removing raw materials and by-products remaining after fractionation such as membrane fractionation and resin fractionation, assimilation by microorganisms, and by separating those with a specific degree of polymerization. Disaccharide content, especially gentiobiose content, can be higher.

<本発明の酵素剤の製造方法>
本発明の酵素剤は、本発明のタンパク質の産生能を有する天然微生物あるいは後述の組換え微生物を培養することにより製造することができる。
<Method for Producing Enzyme Preparation of the Present Invention>
The enzymatic agent of the present invention can be produced by culturing natural microorganisms or recombinant microorganisms described later that are capable of producing the protein of the present invention.

すなわち、本発明の別の側面によれば、前記(i)、(ii)、(iii)および(iv)からなる群から選択される塩基配列からなるポリヌクレオチド(以下、「本発明のポリヌクレオチド」ということがある)または該ポリヌクレオチドを作動可能に連結してなる発現ベクターにより形質転換した宿主微生物を培養する工程を含んでなる、本発明の酵素剤の製造方法が提供される。本発明の製造方法は、培養工程の後、培養して得られた宿主微生物および/または培養物から発現産物を採取し、場合によっては酵素剤を単離または精製する工程をさらに含んでいてもよい。 That is, according to another aspect of the present invention, a polynucleotide consisting of a base sequence selected from the group consisting of (i), (ii), (iii) and (iv) (hereinafter referred to as "polynucleotide of the present invention There is provided a method for producing the enzymatic agent of the present invention, which comprises the step of culturing a host microorganism transformed with an expression vector operatively linked with said polynucleotide. After the culturing step, the production method of the present invention may further include a step of collecting the expression product from the cultured host microorganism and/or the culture, and optionally isolating or purifying the enzymatic agent. good.

本発明において「ポリヌクレオチド」には、DNAおよびRNAが含まれ、さらには、これらの修飾体や人工核酸が含まれるが、好ましくはDNAである。また、DNAには、cDNA、ゲノムDNAおよび化学合成DNAが含まれる。 In the present invention, "polynucleotide" includes DNA and RNA, and further includes modified forms thereof and artificial nucleic acids, preferably DNA. In addition, DNA includes cDNA, genomic DNA and chemically synthesized DNA.

前記(i)、(ii)、(iii)および(iv)において、「アミノ酸配列をコードする塩基配列」とは、特定のアミノ酸配列が与えられることによって、遺伝暗号(すなわち、コドン)に基づいて特定することができる。例えば、配列番号1~7のアミノ酸配列を、対応するコドンに置き換えることによって塩基配列を特定することができ、具体例としては、配列番号8~14の塩基配列が挙げられる。 In the above (i), (ii), (iii) and (iv), the "nucleotide sequence encoding an amino acid sequence" means that given a specific amino acid sequence, based on the genetic code (i.e., codon) can be specified. For example, a nucleotide sequence can be identified by replacing the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1-7 with the corresponding codons, and specific examples include the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 8-14.

前記(ii)において、「同一性」は「相同性」を含む意味で用いられる。ここで、「同一性」は、前記(b)について述べたのと同様に、比較する配列同士を適切に整列(アライメント)させたときの同一性の程度であり、前記配列間の塩基の正確な一致の出現率(%)を意味する。同一性の算出にあたっては、例えば、配列におけるギャップの存在および塩基の性質が考慮される(Wilbur, Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80:726-730 (1983))。アライメントや同一性の算出は、前記(b)についての記載内容に従って実施することができる。 In (ii) above, "identity" is used in the sense of including "homology". Here, "identity" is the degree of identity when the sequences to be compared are properly aligned, as described in (b) above. means the occurrence rate (%) of good matches. In calculating identity, for example, the presence of gaps in the sequence and the nature of the bases are taken into account (Wilbur, Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80:726-730 (1983)). Alignment and identity calculation can be performed according to the description of (b) above.

前記(ii)における同一性は、例えば、70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは85%以上、さらに好ましくは90%以上、さらに一層好ましくは95%以上、特に好ましくは96%以上、97%以上、98%以上、99%以上または99.5%以上である。 The identity in (ii) is, for example, 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 85% or more, still more preferably 90% or more, even more preferably 95% or more, particularly preferably 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more.

前記(iii)の塩基配列は、配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列において、欠失、置換、挿入および付加からなる群から選択される1個または複数個の改変を有していてもよい。改変される塩基の個数は、例えば、1~100個、好ましくは1~50個、より好ましくは1~20個、さらに好ましくは1~10個、さらに一層好ましくは1~6個、特に好ましくは1~数個、1~4個、1~3個、1~2個または1個である。改変される塩基の個数はまた、部位突然変異誘発法などの公知の方法により生じる程度の変異数、あるいは、天然に生じる程度の変異数とすることができる。このため「改変」は変異を含む意味で用いられるものとする。前記欠失、挿入および/または付加された塩基配列は、特に制限されないが、例えば、配列番号1~7のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と、同じ読み枠の塩基配列である。前記欠失、挿入および/または付加される塩基は、例えば、連続する3つの塩基からなるコドンが好ましく、このようなコドンの数は、例えば、1~30個、好ましくは1~20個、より好ましくは1~10個、さらに好ましくは1~6個、特に好ましくは1~数個、1~3個、1~2個または1個である。前記塩基配列において、前記改変は、連続して生じてもよいし、不連続に生じてもよい。前記改変はまた、複数の同種の改変(例えば、複数の置換)であってもよいし、複数の異種の改変(例えば、1個以上の欠失と1個以上の置換の組合せ)であってもよい。 The nucleotide sequence of (iii) has one or more alterations selected from the group consisting of deletion, substitution, insertion and addition in the nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any of SEQ ID NOs: 1 to 7. may have. The number of bases to be modified is, for example, 1 to 100, preferably 1 to 50, more preferably 1 to 20, still more preferably 1 to 10, even more preferably 1 to 6, particularly preferably 1 to several, 1 to 4, 1 to 3, 1 to 2 or 1. The number of modified bases can also be the number of mutations produced by a known method such as site mutagenesis, or the number of mutations produced naturally. Therefore, the term "modification" is used in the sense of including mutation. The deleted, inserted and/or added base sequences are not particularly limited, but are, for example, base sequences in the same reading frame as the base sequences of the polynucleotides encoding the amino acid sequences of SEQ ID NOS: 1-7. The deleted, inserted and/or added bases are, for example, preferably codons consisting of three consecutive bases, and the number of such codons is, for example, 1 to 30, preferably 1 to 20, and more. The number is preferably 1 to 10, more preferably 1 to 6, particularly preferably 1 to several, 1 to 3, 1 to 2 or 1. In the base sequence, the modifications may occur continuously or discontinuously. The modification may also be multiple homologous modifications (e.g., multiple substitutions) or multiple heterologous modifications (e.g., a combination of one or more deletions and one or more substitutions), good too.

また、前記(iii)における塩基の挿入としては、例えば、塩基配列の内部への挿入が挙げられる。さらに、塩基の付加は、例えば、塩基配列の5’末端および3’末端のいずれかへの付加であっても、5’末端および3’末端の両末端への付加であってもよい。 In addition, the insertion of bases in (iii) above includes, for example, insertion into the interior of the base sequence. Furthermore, the addition of bases may be, for example, addition to either the 5' end or the 3' end of the base sequence, or addition to both the 5' end and the 3' end.

前記(iv)において、「ハイブリダイズする」とは、あるポリヌクレオチドが標的となるポリヌクレオチドと相補的なそれぞれの塩基同士の水素結合により二本鎖を形成することをいう。「ハイブリダイズ」は、各種ハイブリダイゼーションアッセイにより検出することができる。ハイブリダイゼーションアッセイとしては、例えば、サザンハイブリダイゼーションアッセイ、コロニーハイブリダイゼーションアッセイなどの公知の方法が挙げられる。 In (iv) above, "hybridize" means that a certain polynucleotide forms a double strand by hydrogen bonding between bases complementary to the target polynucleotide. "Hybridization" can be detected by various hybridization assays. Hybridization assays include, for example, known methods such as Southern hybridization assays and colony hybridization assays.

前記(iv)において、「ハイブリダイズ」あるいは「ハイブリダイゼーション」は、ストリンジェントな条件下で実施することができ、例えば、ハイブリダイゼーション緩衝液中でハイブリダイゼーション反応を行った後、洗浄緩衝液で洗浄することにより実施することができる。ここで「ストリンジェントな条件」は、ポリヌクレオチド間で特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいい、ある塩基配列とその相補鎖との二重鎖のTm(℃)および必要な塩濃度などに依存して決定することができる。例えば、配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列(例えば、配列番号8~14のいずれかの塩基配列)を選択した後にそれに応じたストリンジェントな条件を設定することは当業者に周知の技術である(例えば、J. Sambrook, E. F. Frisch, T. Maniatis; Molecular Cloning 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory(1989)参照)。ストリンジェントな条件としては、例えば、ハイブリダイゼーションに通常用いられる適切な緩衝液(例えば、SSC溶液)中で、塩基配列によって決定されるTmよりわずかに低い温度(例えば、Tmよりも0~10℃低い温度、Tmよりも0~5℃低い温度あるいはTmよりも0~2℃低い温度)においてハイブリダイゼーション反応を実施することが挙げられる。ストリンジェントな条件としてはまた、ハイブリダイゼーション反応後の洗浄を非特異的なハイブリッド形成をした二本鎖ポリヌクレオチドに対して厳しい条件(例えば、高温低塩濃度溶液)で実施することが挙げられる。 In (iv) above, "hybridization" or "hybridization" can be performed under stringent conditions. It can be implemented by Here, "stringent conditions" refer to conditions under which specific hybrids are formed between polynucleotides and non-specific hybrids are not formed, and Tm (° C. ) and the required salt concentration, etc. For example, after selecting a nucleotide sequence encoding any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 7 (eg, any of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 8 to 14), it is appropriate to set stringent conditions accordingly. Techniques well known to those skilled in the art (see, eg, J. Sambrook, E. F. Frisch, T. Maniatis; Molecular Cloning 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory (1989)). Stringent conditions include, for example, a temperature slightly lower than the Tm determined by the nucleotide sequence (for example, 0 to 10° C. lower than the Tm) in an appropriate buffer (eg, SSC solution) commonly used for hybridization. and performing the hybridization reaction at a low temperature, 0 to 5° C. lower than the Tm or 0 to 2° C. lower than the Tm. Stringent conditions also include post-hybridization washing under stringent conditions (eg, high temperature, low salt solution) for non-specifically hybridized double-stranded polynucleotides.

前記(ii)、(iii)および(iv)において、「β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質」であるか否かは、被験タンパク質の加水分解活性を指標に評価することができ、例えば、被験タンパク質を基質であるβ-グルコ二糖に作用させ、分解により生じたグルコース量を測定することにより評価することができる。β-グルコシダーゼ活性の強さは、分解により生じたグルコース量を指標にして評価することができる。 In (ii), (iii) and (iv) above, whether or not the protein is a "protein having β-glucosidase activity" can be evaluated using the hydrolytic activity of the test protein as an index. It can be evaluated by acting on the substrate β-glucodisaccharide and measuring the amount of glucose produced by decomposition. The strength of β-glucosidase activity can be evaluated using the amount of glucose produced by decomposition as an index.

本発明のポリヌクレオチドが配列番号1のアミノ酸配列をコードする塩基配列に基づいて定められた前記(ii)、(iii)または(iv)の塩基配列からなる場合、該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質は温度30~40℃、pH6~8の条件下で配列番号1のアミノ酸配列からなるタンパク質の約70%以上の活性、約80%以上の活性、約90%以上の活性、約95%以上の活性または約100%以上の活性を有するものとすることができる。本発明のポリヌクレオチドが配列番号2~7のいずれかをコードする塩基配列に基づいて定められた前記(ii)、(iii)または(iv)の塩基配列からなる場合も上記と同様にそれぞれ配列番号2~7のいずれかのアミノ酸配列からなるタンパク質との対比でその活性の強さを定めることができる。 When the polynucleotide of the present invention consists of the nucleotide sequence (ii), (iii) or (iv) defined based on the nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, the protein encoded by the polynucleotide is about 70% or more activity, about 80% or more activity, about 90% or more activity, about 95% or more of the protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 under conditions of temperature 30 to 40 ° C. and pH 6 to 8 It can have activity or about 100% or more activity. When the polynucleotide of the present invention consists of the nucleotide sequence (ii), (iii) or (iv) defined based on the nucleotide sequence encoding any of SEQ ID NOs: 2 to 7, the same sequence as above The strength of the activity can be determined by comparison with a protein consisting of any one of the amino acid sequences of numbers 2-7.

本発明の酵素剤を、本発明のタンパク質の産生能を有する組換え微生物を用いて製造する場合、該組換え微生物としては、前記(i)、(ii)、(iii)および(iv)から選択される塩基配列からなるポリヌクレオチドまたは該ポリヌクレオチドを作動可能に連結してなる発現ベクターにより形質転換した宿主微生物が挙げられる。前記発現ベクターとしては、例えば、大腸菌や枯草菌などの宿主微生物への導入に適したベクターを選択することができ、pET21b、pUC18、pET15b、pET32a、pColdI、pGEX-4T、pJEXOPT2(特開2009-17841号公報参照)、pHT01、pHT43などのプラスミドベクターが挙げられる。これらのうち、本発明のタンパク質を大腸菌で発現させる場合には、pET21b、pUC18、pET15b、pET32a、pColdIおよびpGEX-4Tが好ましく、枯草菌で発現させる場合には、pJEXOPT2、pHT01およびpHT43が好ましい。また、発現ベクターへのポリヌクレオチドの連結は、常法に従って実施することができる。 When the enzymatic agent of the present invention is produced using a recombinant microorganism capable of producing the protein of the present invention, the recombinant microorganism includes (i), (ii), (iii) and (iv) Examples include host microorganisms transformed with a polynucleotide consisting of a selected nucleotide sequence or an expression vector operably linked to the polynucleotide. As the expression vector, for example, a vector suitable for introduction into host microorganisms such as Escherichia coli and Bacillus subtilis can be selected. 17841), pHT01 and pHT43. Among these, pET21b, pUC18, pET15b, pET32a, pColdI and pGEX-4T are preferable when the protein of the present invention is expressed in E. coli, and pJEXOPT2, pHT01 and pHT43 are preferable when it is expressed in Bacillus subtilis. In addition, ligation of polynucleotides to expression vectors can be carried out according to conventional methods.

このようにして得られた発現ベクターは、大腸菌、枯草菌をはじめとする宿主微生物に導入し、組換え微生物(すなわち、形質転換体)を得ることができる。宿主微生物への導入は、常法に従って実施することができる。また、前記(i)、(ii)、(iii)および(iv)から選択される塩基配列からなるポリヌクレオチドは、エレクトロポレーション法、リポフェクション法などによりベクターを使用せずに宿主微生物に導入し、組換え微生物を得ることもできる。 The expression vector thus obtained can be introduced into host microorganisms such as Escherichia coli and Bacillus subtilis to obtain recombinant microorganisms (ie, transformants). Introduction into host microorganisms can be carried out according to conventional methods. Also, a polynucleotide consisting of a base sequence selected from (i), (ii), (iii) and (iv) above can be introduced into a host microorganism without using a vector by electroporation, lipofection or the like. , a recombinant microorganism can also be obtained.

本発明の酵素剤の有効成分であるタンパク質を生成する組換え微生物および天然微生物は、当該微生物の培養に適した培地において培養することができる。使用する培地は、微生物が生育でき、本発明の酵素剤の有効成分であるタンパク質を産生しうる栄養培地であれば特に限定されず、合成培地および天然培地のいずれでもよい。また、時間、温度などの培養条件は、培養する微生物に適した条件を適宜選択することができる。 Recombinant microorganisms and natural microorganisms that produce the protein that is the active ingredient of the enzymatic agent of the present invention can be cultured in a medium suitable for culturing the microorganism. The medium to be used is not particularly limited as long as it is a nutrient medium in which microorganisms can grow and the protein which is the active ingredient of the enzymatic agent of the present invention can be produced, and it may be either a synthetic medium or a natural medium. In addition, culture conditions such as time and temperature can be selected as appropriate for the microorganisms to be cultured.

本発明の酵素剤の製造方法では、組換え微生物または天然微生物を培養した後、本発明の酵素剤の有効成分であるタンパク質を採取する工程を含んでいてもよい。本発明の酵素剤の製造方法では、例えば、天然微生物あるいは組換え微生物を培養した後、溶菌剤、界面活性剤、超音波破砕またはビーズショッカーなどを用いて菌体細胞を破砕し、そのままもしくは不溶性画分を分離したものを粗酵素液とすることができる。本発明においては、粗酵素液をそのまま用いても、濃縮してから用いてもよい。濃縮法としては、硫安塩析法、アセトンおよびアルコール沈殿法、平膜、中空膜法などを採用することができる。 The method for producing the enzymatic agent of the present invention may include a step of collecting the protein, which is the active ingredient of the enzymatic agent of the present invention, after culturing the recombinant or natural microorganism. In the method for producing the enzymatic agent of the present invention, for example, after culturing natural microorganisms or recombinant microorganisms, bacterial cells are crushed using a bacteriolytic agent, a surfactant, ultrasonic disruption, a bead shocker, or the like, and The separated fraction can be used as a crude enzyme solution. In the present invention, the crude enzyme solution may be used as it is or after concentrating. As a concentration method, an ammonium sulfate salting-out method, an acetone and alcohol precipitation method, a flat membrane method, a hollow membrane method, or the like can be employed.

本発明の酵素剤は、上記のように、粗酵素液をそのまままたは濃縮して用いることができるものの、必要に応じてカラムクロマトグラフィーなどにより分離・精製したものを利用することができる。例えば、培養液の上清または破砕処理物についてアフィニティークロマトグラフィーを用いて精製することにより、本発明の酵素剤の有効成分であるタンパク質を、電気泳動的に単一バンドを示す精製酵素として得ることができる。 As described above, the enzymatic preparation of the present invention can be used as is or after concentration, but can be separated and purified by column chromatography or the like, if necessary. For example, the protein, which is the active ingredient of the enzymatic preparation of the present invention, can be obtained as a purified enzyme that electrophoretically exhibits a single band by purifying the culture supernatant or the homogenate using affinity chromatography. can be done.

本発明の酵素剤の有効成分であるタンパク質が組換えタンパク質である場合には、組換え微生物の種類によっては酵素が菌体内に蓄積したり、培養液に蓄積したりすることがある。このような場合にも、前記のように、菌体またはその培養物をそのまま使用してもよいが、必要に応じて、細胞を破砕したものを用いてもよい。 When the protein, which is the active ingredient of the enzymatic agent of the present invention, is a recombinant protein, depending on the type of the recombinant microorganism, the enzyme may accumulate in the cells or in the culture medium. In such a case, as described above, the bacterial cells or their culture may be used as they are, but if necessary, disrupted cells may be used.

以下の例に基づき本発明をより具体的に説明するが、本発明はこれらの例に限定されるものではない。 The present invention will be described more specifically based on the following examples, but the present invention is not limited to these examples.

例1:枯草菌を宿主としたタンパク質発現
(1)発現プラスミドの構築
種々の微生物について新規酵素探索を実施した。具体的には、非特許文献1に記載のハロバチルス・ハロフィラス(Halobacillus halophilus)由来のβ-1,6-グルコシダーゼのアミノ酸配列と相同性検索を行い、当該酵素のアミノ酸配列とアミノ酸配列の同一性が60~70%程度である仮想タンパク質(配列番号1~7)を選出し、その機能を解析した。選出された各仮想タンパク質について、配列番号、由来微生物、NCBI登録情報(NCBI Reference Sequence)および非特許文献1に記載の酵素のアミノ酸配列との配列同一性は表1に示される通りであった。
Example 1: Expression of protein using Bacillus subtilis as a host (1) Construction of expression plasmid Various microorganisms were searched for novel enzymes. Specifically, a homology search was performed with the amino acid sequence of β-1,6-glucosidase derived from Halobacillus halophilus described in Non-Patent Document 1, and the identity of the amino acid sequence with the amino acid sequence of the enzyme was confirmed. Hypothetical proteins (SEQ ID NOS: 1 to 7) with about 60 to 70% were selected and their functions were analyzed. For each hypothetical protein selected, the sequence identity with the amino acid sequence of the enzyme described in SEQ ID, originating microorganism, NCBI registration information (NCBI Reference Sequence) and Non-Patent Document 1 is shown in Table 1.

Figure 2022152998000001
Figure 2022152998000001

配列番号1~7(以下、「目的アミノ酸配列」という場合がある)に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質(以下、「目的タンパク質」という場合がある)を枯草菌(バチルス・サブティリス:Bacillus subtilis、以下同様)で発現させるための発現プラスミドを構築した。まず、目的アミノ酸配列のC末端側にHisタグ配列を結合した。次いで、枯草菌発現用ベクターであるpJEXOPT2(特開2009-17841号公報および特開2009-17842号公報参照)を本試験に最適化するために改変したプラスミド(以下、「線状プラスミド」という場合がある)を作製した。該改変プラスミドとの相同領域をクローニング用の付加配列として、上記Hisタグ配列を付加した目的アミノ酸配列のN末端側およびC末端側に付して、人工遺伝子合成用の配列を設計した。当該設計配列をpUC57ベクターに挿入したプラスミドを設計し、人工遺伝子合成を行った(人工合成プラスミド)。なお、目的タンパク質部分に該当する塩基配列については、枯草菌での発現に最適化するためのコドン補正を行った。配列番号1~7のアミノ酸配列をコードする塩基配列(以下、「目的遺伝子」という)はそれぞれ配列番号8~14に示される通りであった。 A protein consisting of the amino acid sequences shown in SEQ ID NOs: 1 to 7 (hereinafter sometimes referred to as "target amino acid sequence") (hereinafter sometimes referred to as "target protein") is prepared by Bacillus subtilis , The same applies hereinafter) to construct an expression plasmid for expression. First, a His tag sequence was ligated to the C-terminal side of the target amino acid sequence. Next, pJEXOPT2 (see JP-A-2009-17841 and JP-A-2009-17842), which is a Bacillus subtilis expression vector, was modified to optimize it for this test (hereinafter referred to as "linear plasmid" ) was produced. A sequence for artificial gene synthesis was designed by attaching the region homologous to the modified plasmid as an additional sequence for cloning to the N-terminal side and C-terminal side of the target amino acid sequence to which the above His tag sequence was added. A plasmid was designed by inserting the design sequence into the pUC57 vector, and artificial gene synthesis was performed (artificially synthesized plasmid). The base sequence corresponding to the target protein portion was subjected to codon correction to optimize expression in Bacillus subtilis. The nucleotide sequences encoding the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1-7 (hereinafter referred to as "target genes") were as shown in SEQ ID NOs: 8-14, respectively.

得られた人工合成プラスミドおよび線状プラスミドを鋳型として、In-Fusion HD Cloning Kit(タカラバイオ社)において使用する目的遺伝子断片および線状プラスミドをPCR増幅した。目的遺伝子断片および線状プラスミドのPCR増幅には表2および表3に示されるプライマーをそれぞれ用いた。 Using the resulting artificially synthesized plasmid and linear plasmid as templates, the target gene fragment and linear plasmid used in the In-Fusion HD Cloning Kit (Takara Bio Inc.) were amplified by PCR. The primers shown in Tables 2 and 3 were used for PCR amplification of the target gene fragment and linear plasmid, respectively.

Figure 2022152998000002
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Figure 2022152998000003
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PCR反応に用いる反応液の組成は、Primestar max Premix(タカラバイオ社)のマニュアルに従って調製し反応液の総量は50μLとした。PCR増幅反応のプログラムは、96℃に1分間保持した後、98℃で10秒間→55℃で5秒間→72℃で35秒間を1サイクルとして35サイクル行い、次いで、72℃で5分間保持とした。得られたPCR産物をアガロースゲル電気泳動し、増幅断片に相当するバンドをゲルから切り出し、illustraTM GFXTM PCR DNA and Gel Band Purification Kit(GE Healthcare社)を用いて抽出し精製した。得られた目的遺伝子の増幅断片および線状プラスミドの増幅断片を、In-Fusion HD Cloning Kit(タカラバイオ社)を用いて連結した。連結反応は50℃に15分間保持して行った。次いで、連結反応液1.5μLを用いて、E.coli DH5αを形質転換し、該大腸菌を培養した培養液からillustraTM plasmidPrep Mini Spin Kit(GE Healthcare社)を用いてプラスミドDNAを調製した(以下、「枯草菌発現用プラスミド」という場合がある)。 The composition of the reaction solution used in the PCR reaction was prepared according to the Primestar max Premix (Takara Bio Inc.) manual, and the total volume of the reaction solution was 50 μL. The program for the PCR amplification reaction was held at 96° C. for 1 minute, followed by 35 cycles of 98° C. for 10 seconds→55° C. for 5 seconds→72° C. for 35 seconds, and then held at 72° C. for 5 minutes. did. The resulting PCR product was subjected to agarose gel electrophoresis, and a band corresponding to the amplified fragment was excised from the gel, extracted and purified using illustra GFX PCR DNA and Gel Band Purification Kit (GE Healthcare). The resulting amplified fragment of the target gene and the amplified fragment of the linear plasmid were ligated using the In-Fusion HD Cloning Kit (Takara Bio Inc.). The ligation reaction was held at 50°C for 15 minutes. Then, using 1.5 μL of the ligation reaction mixture, E. E. coli DH5α was transformed, and a plasmid DNA was prepared from the culture medium obtained by culturing the E. coli using illustra plasmidPrep Mini Spin Kit (GE Healthcare) (hereinafter sometimes referred to as "Bacillus subtilis expression plasmid").

(2)組換えタンパク質の枯草菌における発現および酵素サンプルの調製
上記(1)で調製した枯草菌発現用プラスミドDNAを、プロトプラスト化した枯草菌ISW1214(タカラバイオ社)に導入し、7.5μg/mLテトラサイクリンを含む再生寒天培地(組成:8.1%コハク酸ナトリウム、1%寒天、0.5%カザミノ酸、0.5%酵母エキス、0.15%リン酸2水素カリウム、0.35%リン酸水素2カリウム、0.5%グルコース、0.4%塩化マグネシウム、0.01%ウシ血清アルブミン、0.001%メチオニン、および0.001%ロイシン)において30℃で2日間培養した。得られたコロニーを前培養培地、続いて本培養培地で培養した。なお、該培養は、培地の組成以外は特開2009-17841号公報および特開2009-17842号公報に記載の通りとした。次いで、培養物を遠心分離(1500×g、4℃、15分間)し、上清を0.45μmフィルター(メルク社)で濾過したものを培養上清とした。得られた培養上清を、Amicon Ultra-0.5、30kDa(メルク社)を用いた限外ろ過により、50mM リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.0)に置換することで培地成分を除去し、得られた溶液をそれぞれ酵素サンプル1~7とした。なお、酵素サンプル1~7はそれぞれ配列番号1~7のアミノ酸配列からなるタンパク質である。
(2) Expression of recombinant protein in Bacillus subtilis and preparation of enzyme sample The Bacillus subtilis expression plasmid DNA prepared in (1) above was introduced into protoplasted Bacillus subtilis ISW1214 (Takara Bio Inc.), and 7.5 μg/ Regeneration agar medium containing mL tetracycline (composition: 8.1% sodium succinate, 1% agar, 0.5% casamino acids, 0.5% yeast extract, 0.15% potassium dihydrogen phosphate, 0.35% Dipotassium hydrogen phosphate, 0.5% glucose, 0.4% magnesium chloride, 0.01% bovine serum albumin, 0.001% methionine, and 0.001% leucine) for 2 days at 30°C. The colonies obtained were cultured in the pre-culture medium and then in the main culture medium. The culture was performed as described in JP-A-2009-17841 and JP-A-2009-17842, except for the composition of the medium. Then, the culture was centrifuged (1500×g, 4° C., 15 minutes), and the supernatant was filtered through a 0.45 μm filter (Merck) to obtain a culture supernatant. The resulting culture supernatant was subjected to ultrafiltration using Amicon Ultra-0.5, 30 kDa (Merck) to remove medium components by replacing with 50 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0). The resulting solutions were designated as enzyme samples 1 to 7, respectively. Enzyme samples 1 to 7 are proteins consisting of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1 to 7, respectively.

(3)β-グルコシダーゼ活性の確認
上記(2)で調製した酵素サンプル1~7について、β-グルコ二糖類を基質とした加水分解活性(β-グルコシダーゼ活性)を以下に示す手順で測定した。適宜希釈した各酵素サンプル10μLと各種β-グルコ二糖類(ソホロース、ラミナリビオース、セロビオース、ゲンチオビオース)溶液10μLを混合し、37℃、pH7で5分間反応を行い、99.9℃で10分間保持して反応を停止した。これをサンプル反応液とした。また、酵素サンプル1~7を事前に99.9℃、10分間の熱処理を行うことにより失活させた失活酵素サンプル1~7を、上記と同様の手順で各β-グルコ二糖類溶液と反応させた後、反応を停止した。これをブランク反応液1~7とした。次いで、各反応液(サンプル反応液およびブランク反応液)にグルコースCII-テストワコー(富士フィルム和光純薬社)180μLを添加し、37℃で5分間保持した後、波長492nmにおける吸光度(A492)を測定した。ブランク反応液をブランクとして、サンプル反応液における酵素サンプル1~7の反応により生成したグルコースに由来するA492の測定値を求めた。結果は、表4に示される通りであった。いずれの酵素サンプルについても、ゲンチオビオースを基質とした場合にのみ、グルコースの生成が確認された。これらの結果から、酵素サンプル1~7はβ-1,6-グリコシド結合特異的なβ-グルコシダーゼ活性を有することが示された。
(3) Confirmation of β-Glucosidase Activity For the enzyme samples 1 to 7 prepared in (2) above, the hydrolysis activity (β-glucosidase activity) using β-glucodisaccharide as a substrate was measured by the following procedure. 10 μL of each appropriately diluted enzyme sample and 10 μL of various β-glucodisaccharide (sophorose, laminaribiose, cellobiose, gentiobiose) solutions are mixed, reacted at 37° C. and pH 7 for 5 minutes, and held at 99.9° C. for 10 minutes. to stop the reaction. This was used as a sample reaction solution. In addition, inactivated enzyme samples 1 to 7, which were previously inactivated by heat treatment at 99.9° C. for 10 minutes, were treated with each β-glucodisaccharide solution in the same manner as above. After reacting, the reaction was stopped. These were used as blank reaction solutions 1-7. Then, 180 μL of glucose CII-Test Wako (Fujifilm Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) was added to each reaction solution (sample reaction solution and blank reaction solution), and after holding at 37° C. for 5 minutes, the absorbance (A492) at a wavelength of 492 nm was measured. It was measured. Using the blank reaction solution as a blank, the measured value of A492 derived from glucose produced by the reaction of the enzyme samples 1 to 7 in the sample reaction solution was determined. The results were as shown in Table 4. For all enzyme samples, glucose production was confirmed only when gentiobiose was used as a substrate. These results indicated that enzyme samples 1-7 had β-1,6-glycosidic bond-specific β-glucosidase activity.

Figure 2022152998000004
Figure 2022152998000004

例2:酵素サンプルの特性の評価
(1)酵素サンプルを用いた縮合反応
例1(2)で調製した酵素サンプル1~7について、グルコースを基質とした縮合反応を行った。具体的には、100mgグルコースに対し、75μLの酵素サンプル1~7をそれぞれ添加した混合液を調製し、37℃、pH7で72時間保持することで縮合反応を行った。反応後、各反応液を10分間沸騰水中に保持して酵素を失活させた。次いで、各サンプルを冷却および適宜希釈した後、アンバーライトMB-4を加えて脱塩した。脱塩後、各サンプルを0.45μmフィルターでろ過し、得られた反応生成物をそれぞれ反応生成物1~7として糖組成分析に用いた。なお、反応生成物1~7はそれぞれ酵素サンプル1~7を用いて反応させた生成物である。
Example 2: Evaluation of properties of enzyme samples (1) Condensation reaction using enzyme samples Enzyme samples 1 to 7 prepared in Example 1 (2) were subjected to a condensation reaction using glucose as a substrate. Specifically, mixed solutions were prepared by adding 75 μL of each of the enzyme samples 1 to 7 to 100 mg of glucose, and the condensation reaction was performed by maintaining the mixture at 37° C. and pH 7 for 72 hours. After the reaction, each reaction solution was kept in boiling water for 10 minutes to inactivate the enzyme. After cooling and diluting each sample appropriately, Amberlite MB-4 was added for desalting. After desalting, each sample was filtered through a 0.45 μm filter, and the obtained reaction products were used for sugar composition analysis as reaction products 1 to 7, respectively. Reaction products 1 to 7 are products obtained by reacting enzyme samples 1 to 7, respectively.

(2)反応生成物の糖組成分析
上記(1)で調製された反応生成物1~7の固形分当たりの糖組成を高速液体クロマトグラフ(HPLC)分析した。分析条件は分析条件1および分析条件2に記載の通りとした。各分析条件における、特定のピーク面積の、基準物質のピーク面積に対する比率を、基準物質中のその特定のピーク由来物質の含有比率(固形分%)と定義した。
(2) Sugar Composition Analysis of Reaction Products The sugar compositions per solid content of the reaction products 1 to 7 prepared in (1) above were analyzed by high performance liquid chromatography (HPLC). The analytical conditions were as described in the analytical conditions 1 and 2. The ratio of the specific peak area to the peak area of the reference substance under each analysis condition was defined as the content ratio (solid content %) of the specific peak-derived substance in the reference substance.

反応生成物中の各重合度の糖質(単糖、二糖および三糖)の糖組成を分析する条件は分析条件1の通りとした。なお、各重合度の糖質の糖組成(固形分%)は、各重合度の糖質に対応するピーク面積の、検出されたピークの総面積に対する比率(%)により算出した。 Analysis conditions 1 were used to analyze the sugar composition of sugars (monosaccharides, disaccharides and trisaccharides) of each degree of polymerization in the reaction product. The sugar composition (solid content %) of the sugar with each degree of polymerization was calculated from the ratio (%) of the peak area corresponding to the sugar with each degree of polymerization to the total area of the detected peaks.

<分析条件1>
カラム:Ultron PS80N・L (信和化工社)
溶離液:超純水
流速:0.9mL/分
カラム温度:50℃
検出器:示差屈折計
サンプル注入量:10μL
分析時間:20分
<Analysis conditions 1>
Column: Ultron PS80N L (Shinwa Kako Co., Ltd.)
Eluent: Ultrapure water Flow rate: 0.9 mL/min Column temperature: 50°C
Detector: Differential refractometer Sample injection volume: 10 μL
Analysis time: 20 minutes

反応生成物中の二糖画分中のゲンチオビオースの含有比率を分析する条件は分析条件2の通りとした。なお、二糖画分中のゲンチオビオースの含有比率(固形分%)は、ゲンチオビオースに対応するピーク面積の二糖画分に対応するピークの総面積に対する比率(%)により算出した。 Analysis condition 2 was used as the condition for analyzing the content ratio of gentiobiose in the disaccharide fraction in the reaction product. The content ratio (solid content %) of gentiobiose in the disaccharide fraction was calculated from the ratio (%) of the peak area corresponding to gentiobiose to the total area of the peak corresponding to the disaccharide fraction.

<分析条件2>
カラム:HILICpak VG-50 4E(Shodex社)
溶離液:80%アセトニトリル
流速:0.6mL/分
カラム温度:40℃
検出器:Corona荷電化粒子検出器
サンプル注入量:1μL
分析時間:60分
<Analysis conditions 2>
Column: HILICpak VG-50 4E (Shodex)
Eluent: 80% acetonitrile Flow rate: 0.6 mL/min Column temperature: 40°C
Detector: Corona charged particle detector Sample injection volume: 1 μL
Analysis time: 60 minutes

反応生成物1~7の糖組成の分析結果は表5および表6に示される通りであった。 The sugar composition analysis results of reaction products 1-7 were as shown in Tables 5 and 6.

Figure 2022152998000005
Figure 2022152998000005

Figure 2022152998000006
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表5の結果から、グルコースを基質とした縮合反応により得られた反応生成物において、反応生成物中の二糖画分の含有比率は、5.57~16.05(固形分%)であることが確認された。また、表6の結果から、グルコースを基質とした縮合反応により得られた反応生成物において、反応生成物中の二糖画分中のゲンチオビオースの含有比率は、95.11~96.45(固形分%)であることが確認された。これらの結果から、配列番号1~7に示されるアミノ酸配列からなる酵素サンプル1~7は、グルコースを基質とした縮合反応において、二糖生成物としてβ-グルコ二糖類であるゲンチオビオースを選択的に生成することが示された。 From the results in Table 5, the content ratio of the disaccharide fraction in the reaction product obtained by the condensation reaction using glucose as a substrate is 5.57 to 16.05 (solid content %). was confirmed. Further, from the results in Table 6, in the reaction product obtained by the condensation reaction using glucose as a substrate, the content ratio of gentiobiose in the disaccharide fraction in the reaction product was 95.11 to 96.45 (solid minutes %). From these results, enzyme samples 1 to 7 consisting of the amino acid sequences shown in SEQ ID NOS: 1 to 7 selectively produced gentiobiose, which is a β-glucodisaccharide, as a disaccharide product in the condensation reaction using glucose as a substrate. It was shown to generate

Claims (7)

下記(a)、(b)および(c)からなる群から選択されるタンパク質を含んでなる酵素剤:
(a)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列を含んでなるタンパク質、
(b)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列に対して70%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質、および
(c)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列において、1または複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質。
An enzymatic agent comprising a protein selected from the group consisting of (a), (b) and (c) below:
(a) a protein comprising the amino acid sequence of any of SEQ ID NOS: 1-7;
(b) a protein consisting of an amino acid sequence having 70% or more identity to any of the amino acid sequences of SEQ ID NOS: 1-7 and having β-glucosidase activity, and (c) a protein of SEQ ID NOS: 1-7 A protein consisting of an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and/or added to any amino acid sequence and having β-glucosidase activity.
β-グルコ二糖の製造に用いるための、請求項1に記載の酵素剤。 The enzymatic agent according to claim 1, which is used for producing β-glucodisaccharide. β-グルコ二糖が少なくともゲンチオビオースを含む、請求項2に記載の酵素剤。 3. The enzymatic agent according to claim 2, wherein the β-glucodisaccharide contains at least gentiobiose. 請求項1~3のいずれか一項に記載の酵素剤をグルコースに作用させる工程を含んでなる、β-グルコ二糖またはそれを含む糖質組成物の製造方法。 A method for producing a β-glucodisaccharide or a carbohydrate composition containing the same, comprising a step of allowing the enzymatic agent according to any one of claims 1 to 3 to act on glucose. β-グルコ二糖が少なくともゲンチオビオースを含む、請求項4に記載の製造方法。 The production method according to claim 4, wherein the β-glucodisaccharide contains at least gentiobiose. 下記(i)、(ii)、(iii)および(iv)からなる群から選択される塩基配列からなるポリヌクレオチドまたは該ポリヌクレオチドを作動可能に連結してなる発現ベクターにより形質転換した宿主微生物を培養する工程を含んでなる、請求項1~3のいずれか一項に記載の酵素剤の製造方法:
(i)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列、
(ii)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列と70%以上の同一性を有し、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列、
(iii)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列において、1または複数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列、および
(iv)配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列の相補配列からなるポリヌクレオチドに対してストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつ、β-グルコシダーゼ活性を有するタンパク質をコードする塩基配列。
A host microorganism transformed with a polynucleotide consisting of a base sequence selected from the group consisting of the following (i), (ii), (iii) and (iv) or an expression vector operably linked to the polynucleotide: The method for producing the enzymatic preparation according to any one of claims 1 to 3, comprising the step of culturing:
(i) a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOS: 1-7;
(ii) a nucleotide sequence that has 70% or more identity with the nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 7 and encodes a protein having β-glucosidase activity;
(iii) a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 7, consisting of a nucleotide sequence in which one or more nucleotides are deleted, substituted, inserted and/or added, and β-glucosidase hybridizes under stringent conditions to a polynucleotide consisting of a nucleotide sequence encoding a protein having activity and (iv) a sequence complementary to the nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 7, and , a nucleotide sequence encoding a protein having β-glucosidase activity.
配列番号1~7のいずれかのアミノ酸配列をコードする塩基配列が、配列番号8~14のいずれかの塩基配列である、請求項6に記載の製造方法。 7. The production method according to claim 6, wherein the nucleotide sequence encoding any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1-7 is any of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 8-14.
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