JP2021512965A - Treg細胞を標的とするための方法及び組成物 - Google Patents

Treg細胞を標的とするための方法及び組成物 Download PDF

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Abstract

抗体NEO−201は、Treg細胞に結合することが示されており、Treg細胞を標的化する際におけるその使用が説明されている。NEO−201は、活性なTreg細胞の単離、検出、もしくは精製、またはTreg細胞を死滅させるためにも使用してもよい。NEO−201を、任意に別の薬剤と組み合わせて使用する治療法及び併用療法が、説明されている。
【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2018年2月13日に出願された米国仮特許出願第62/630,084号への優先権を主張するものであり、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
配列表情報
本出願は、その開示の一部として、2019年2月13日に作成された32,546バイトのサイズをもつ「43282o4613.txt」という名前のファイル内の生物学的配列表を含み、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
CD4CD25制御性T細胞(Treg)のレベルの増加は、血液学的悪性腫瘍(Beyer M et al.Blood 2005,106,2018、Motta M et al.Leukemia 2005,19:1788、Yang ZZ et al.Blood,2006,107:3639)、ならびに非小細胞肺癌(Woo et al.Cancer Res 2001,61:4766)、悪性黒色腫(Javia et al.J Immunother.2003,26:85)、胃腸悪性腫瘍(Sasada et al.Cancer,2003:98:1089)、卵巣癌(Curiel JTet al.Nat Med 2004,10:942)、頭頸部の扁平上皮癌(Schaefer et al.Br.J.Cancer 2005,92:913)、肝細胞癌(Ormandy LA et al.Cancer Res,2005:2457)、乳癌(Liyanage UY et al.J Immunol,2002,169:2756)、膵臓癌(Liyanage UY et al.J Immunol,2002,169:2756)、中皮腫(Delong P,et al.Cancer Bio Ther 2006,4:342)、転移性腎細胞癌(Dannull J et al.J Clin Invest,2005,115:3623)、及び前立腺癌(Vergati M et al.Cancer Immunol Immunother.2011,60:197)に罹患している患者において報告されている。この増加は、腫瘍微小環境及び末梢血の両方で示されている。最近の研究(Miller AM,et al.J Immunol 2066,177:7398)は、前立腺切除後の前立腺癌患者の末梢血における高レベルのTregを報告し、これらのTregの免疫抑制機能をインビトロで示した。
黒色腫患者の臨床研究は、Tregが抗原特異的T細胞応答及び非特異的T細胞応答の両方を阻害することができることを示す(Mukhetji B.J Exp Med.1989,169:1961、Chakraborty NG et al.J Immunol 1990,145:2359)。卵巣癌患者では、腫瘍浸潤性Tregと全生存期間との間に直接的な相関関係が示されている(Curiel JT et al.Nat Med 2004,10:942)。これらの患者では、組換えインターロイキン2ジフテリア毒素とコンジュゲートしたDAB389IL2(デニロイキンディフティトックス、ONTAK)での治療により、Tregが減少し、抗腫瘍応答が改善された(Barnett B et al.Am J Reprod Immunol 2005,54:369)。デニロイキンディフティトックス(DAB389IL−2、ONTAK)は、ヒトIL−2とジフテリア毒素の酵素活性及び膜移行ドメインの融合タンパク質である。それは、CD25(IL−2Rα)、CD122(IL−2Rβ)、及びCD132(γ)からなる高親和性IL−2Rを発現する細胞に優先的に結合する。IL−2Rに結合した後、デニロイキンディフティトックスは、エンドサイトーシスによって内在化され、タンパク質合成を阻害し、最終的には細胞死をもたらす。デニロイキンディフティトックスは、転移性腎細胞癌患者の末梢血中のTregの数を大幅に減らし、インビボでTregを介した免疫抑制を無効にすることも示されている(Dannull J et al.J Clin Invest,2005,115:3623)。
要約すると、CD4CD25制御性T細胞が、免疫療法プロトコルの有効性を低下させ、これらの細胞の枯渇が、ワクチン薬用抗腫瘍免疫応答及び全生存を増強し得る(Dannull J et al.J Clin Invest,2005,115:3623、Vergati M et al.Cancer Immunol Immunother.2011,60:197、Antony PA,et al.J Immunother 2002,25:202)。
がんは、世界中で最も頻度の高い死亡原因の1つであり、早ければ2025年までに毎年推定2000万件の新しい症例があると予想されている(Ferlay et al.,2015)。手術、放射線、及び化学療法などの従来のがん治療法では、しばしば、重篤な副作用が誘発され、進行した疾患の大部分の患者を治癒することができず、再発につながる(Bodey et al.,1996)。最近の治療法は、正常で健康な組織を大部分節約しながら、がん性細胞を選択的に標的とするために開発された。その中でも、免疫療法は、がん治療の分野に革命を起こすため、がん患者にとって重要な治療選択肢となっている。
がん免疫療法の根本的な原理は、免疫編集として知られており(Mittal et al.,2014)、これは、細胞形質転換が起こり、がん抑制の内因性機構が失敗した後にのみ始まるがん抑制の外因性機構である。免疫編集プロセスは、排出、平衡、及び脱出の3つの相で行われる。排出相及び平衡相のそれぞれにおいて、がん細胞の免疫拒絶が優勢であるか、またはがん細胞の増殖と均衡して、悪性増殖を制御する。しかしながら、排出相では、一度抑制されたがん細胞は、免疫エフェクター機構への非感受性及び/または腫瘍微小環境における免疫抑制の誘導により、免疫認識を免れる可能性がある。免疫認識を免れたがん細胞は、より自由に増殖し、臨床的に明らかな疾患に成長することができる(Dunn et al.,2004)。がん免疫療法の目的は、抗腫瘍免疫応答を生成及び/または増幅して、腫瘍の成長を抑制し、腫瘍の再発を遅延させ、生存を延長することによって、がん細胞を排出相及び/または平衡相に保つことである(Carter,2001、Hodge et al.,2006、Vergati et al.,2010、Gabitzsch et al.,2015)。治療アプローチには、チェックポイント阻害抗体、抗腫瘍ワクチン、及びキメラ抗原受容体(CAR)−T細胞による患者を治療することが含まれ、これらはすべて、T細胞による適応免疫を利用する。しかしながら、先天性免疫は、抗腫瘍応答を生成及び増強することもでき、腫瘍標的モノクローナル抗体(mAb)を使用して、先天性抗腫瘍免疫を刺激することができる(Topalian et al.,2011)。
NEO−201は、Hollinshead同種結腸直腸癌ワクチンプラットフォームに対して生成された新規のヒト化IgG1 mAbである(Hollinshead et al.,1970、Hollinshead et al.,1972)。このワクチンの免疫原性成分は、79人の結腸癌患者からの外科的に切除された検体からプールされた腫瘍膜画分に由来する腫瘍関連抗原(TAA)であった(Hollinshead et al.,1985)。これらの膜画分は、半精製され、結腸癌患者対健常ボランティアの遅延型過敏症(DTH)についてスクリーニングされ、難治性結腸直腸癌患者における臨床試験で評価された(Hollinshead et al.,1985、Hollinshead,US4810781,1989、Bristol & Kantor,米国特許第7829678号,2010)。これらの試験は、ワクチンに対する細胞性応答に加えて持続的なIgG応答を発現した患者における抗腫瘍応答と全生存の有意な延長の両方によって定義される臨床的利益を報告し、それによりワクチンは抗腫瘍抗体を生成することができる免疫原性成分を含んでいたことが示唆された(Hollinshead,1991)。この元の結腸直腸癌ワクチンは、マウスでモノクローナル抗体を生成するために使用され、前述のエンシツキシマブ(NPC−1C/NEO−102)(Luka et al.,2011、Patel et al.,2013、Beg et al.,2016、Kim et al,2017)及びNEO−201が生成された。以前の研究では、NEO−201は、CEACAMファミリーメンバーの腫瘍関連バリアント、特にCEACAM5及びCEACAM6のがん関連バリアントに結合することが示されている(Zeligs et al.,2017)。
ヒトがん胎児性抗原(CEA)ファミリーは、染色体19q13.2にタンデムに配置された29個の遺伝子で構成されている。ヌクレオチド相同性に基づいて、これらの遺伝子は、2つの主要なサブファミリー、CEACAM及び妊娠特異的な糖タンパク質サブグループに分類される。CEACAMをコードするタンパク質には、CEA(CEACAM5)、CEA関連の細胞接着分子(CEACAM1、CEACAM3、CEACAM4、CEACAM6、CEACAM7、CEACAM8が含まれる。CEACAMファミリーは、Igスーパーファミリーに属する。構造的には、各ヒトCEACAMには、108〜110個のアミノ酸を含み、Ig可変ドメインと相同な1つのN末端ドメインが含まれ、その後に異なる数(0〜6)のIg C2タイプの定数様ドメインが続く。CEACAMタンパク質は、互いに同種親和性及び異好性相互作用することができる。CEACAM1は、その細胞質ドメインにITIM(免疫受容体チロシンベースの抑制モチーフ)様PD1が含まれているため、このファミリー内の独特なタンパク質である。この阻害効果は、ITIMによるチロシン残基のリン酸化によって引き起こされ、その結果、Srcホモロジー2ドメインを含むチロシンホスファターゼ−1及び−2が動員される。CEACAM1タンパク質は、単球、顆粒球、活性化T細胞、B細胞、及びNK細胞を含む様々な免疫細胞に発現する。CEACAM1は、いくつかのアイソフォームとして発生し、2つの主要なものは、CEACAM1−L及びCEACAM1−Sであり、それぞれ、長い(L)または短い(S)細胞質ドメインを有する。CEACAM1−Sの発現は、ヒト白血球では完全に欠如している。CEACAM1−Lは、CD16は陰性であるがCD56は陽性である活性化ヒトNK細胞の亜集団で発現する。
モノクローナル抗体(mAb)は、既定のmAbに特異的である固有の抗原結合領域(断片抗原結合、Fab)と、同じアイソタイプのすべてのmAbに共通の定常領域(断片結晶化可能、Fc)と、からなる。Fc領域は、特定の免疫細胞タイプの表面に発現するFc受容体(FcR)ファミリーのメンバーに関与することによって、免疫細胞の活性を調節することができる。特に、ヒトIgG1 mAbは、マクロファージ及びNK細胞に発現するFcガンマ受容体IIIa(FcγRIIIa、CD16)と相互作用することができる。この相互作用は、マクロファージを刺激して、mAbオプソニン化されたがん細胞を貪食することができ、NK細胞を活性化して、抗体依存性細胞毒性(ADCC)として知られる機構を介してがん細胞を脱顆粒及び溶解することができる。ADCCは、多くの前臨床試験においてインビボでの抗腫瘍効果の主要なメディエーターであることが示され、がん治療に使用されるいくつかのmAbの作用機構において重要な役割を果たす(Seidel et al.,2013)。ADCCを媒介することができる臨床的に承認されたmAbの例には、乳癌に対してはHER2受容体を標的とするトラスツズマブ(Seidel et al.,2013、Petricevic et al.,2013)、リンパ腫に対して汎B細胞マーカーCD20を標的とするリツキシマブ(Seidel et al.,2013、Dall’Ozzo et al.,2004)、大腸癌及び頭頸部癌に対して上皮増殖因子受容体(EGFR)を標的とするセツキシマブ(Seidel et al.,2013、Levy et al.,2009、Kawaguchi et al.,2007、Lopez−Albaitero et al.,2009)、メルケル細胞癌及び膀胱癌に対して免疫抑制リガンドPD−L1を標的とするアベルマブ(Boyerinas et al.,2015)が含まれる。さらに、Fc領域は、C1複合体と潜在的に相互作用して、補体依存性細胞傷害(CDC)を活性化することができ、タンパク質分解カスケードにより、抗体の標的となる細胞の溶解を引き起こす原形質膜の孔が形成される。抗腫瘍CDCが、インビトロで実証された場合でも、それががんにおけるmAb療法の臨床的有効性に重要であるかどうかについては論争がある(Meyer et al.,2014)。
出願者の以前の米国特許第5,688,657号、同第7,314,622号、同第7,491,801号、同第7,763,720号、同第7,829,678号、同第8,470,326号、同第8,524,456号、同第8,535,667号、同第8,802,090号、同第9,034,588号、同第9,068,014号、同第9,371,375号、同第9,592,290号、同第9,718,866号、及びRE39,760(これらのそれぞれは、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる)は、様々な抗がん抗体、がん抗原、及び関連技術を開示している。
NEO−201が、CEACAM5及びCEACAM6のがん関連バリアントに、特にこれらのタンパク質のがん関連グリコシル化バリアントを介して結合することをこれまでに示している。NEO−201は、プールされた同種結腸腫瘍組織抽出物からの腫瘍関連抗原の免疫原性調製物に由来するヒト化IgG1モノクローナル抗体である。NEO−201は、多くの異なるがん腫からの大部分の腫瘍組織に対して反応するが、正常組織の大部分には反応しない。機能分析は、NEO−201が腫瘍細胞に対する抗体依存性細胞毒性(ADCC)及び補体依存性細胞毒性(CDC)の両方を媒介することができることが明らかになった。以前の研究は、NEO−201がマウスのヒト腫瘍異種移植片の成長を減衰させることを示し、観察された唯一の悪影響である循環好中球の一時的な減少を伴う非ヒト霊長類における安全性及び忍容性を示す。
出願者は、NEO−201がTreg細胞に結合し、それによりTreg細胞、例えば活性Treg細胞の精製、及びTreg細胞の死滅にも使用することができることを本明細書で示した。NEO−201抗原(CEACAM5及びCEACAM6のがん関連グリコシル化バリアント)はTreg細胞によって発現されないと考えられているため、これらの結果は特に予想外であった。これらの結果に基づいて、NEO−201抗原の性質が、再評価されている。理論によって制限されることを意図するものではないが、Treg細胞が、NEO−201抗原を構成するCEACAM5/6のがん関連グリコシル化と同じかまたは類似のグリコシル化を有する細胞表面で1つ以上のタンパク質を発現し得ると考えられている。
Treg細胞の浸潤は、多くのがんの種類に関連しており、いくつかの研究では、Treg細胞の選択的除去が抗がん免疫応答を促進することが示されている。新たに説明されたNEO−201のTreg細胞を死滅させる能力は、がん自体によるNEO−201抗原発現に関係なく、抗がん免疫応答を増強するためのNEO−201の使用を支援する。例えば、NEO−201は、ワクチン薬用の抗腫瘍免疫応答を増強することが期待されている。NEO−201を使用してTreg細胞を選択的に切除すると、神経変性状態(アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、及び多発性硬化症(MS))を含む、Treg細胞が役割を果たすと考えられるまたは思われている他の疾患に有益であり得る。
加えて、NEO−201結合は、研究用または治療用のいずれであっても、Treg細胞の精製のために使用することができる。ヒトTregの抑制機能の低下は、自己免疫疾患及び状態の一般的な特徴であると思われる。Treg細胞の精製は、診断的及び/または治療的有用性を有し得る。例えば、健康なドナーからの精製されたTreg細胞は、その状態を治療するために、自己免疫状態を有する個体に移植されてもよい。加えて、精製された自己または異種のTregは、自己免疫疾患の治療のために操作され、患者に導入されてもよい。
作業例は、表現型及び機能の分析のために正常なドナーからのPBMCを使用して行われた実験について説明する。EasySep(商標)StemCell Treg単離キット及び抗ビオチンキットは、製造業者が提供するTreg精製試薬とともに使用するか、ビオチン標識NEO−201 mAbを使用してカスタマイズして、PBMCからTregを単離した。表現型分析は、フローサイトメトリーによって、CD4、CD25、CD127、FoxP3、CD15s、CD45RA、CCR4、NEO−201抗原、CEACAM5、及びCEACAM6のマーカーに対して行われた。NEO−201で単離されたTregが自己CD4+T応答細胞の増殖を抑制する能力を、Treg共培養抑制アッセイを使用して評価した。CD4+CD25高CD127−FoxP3+CD15s+CCR4+Tregの集団におけるNEO−201+細胞の割合は、61.8%〜81.9%の範囲であった。NEO−201+Tregは、CD45RA−であった。単離されたCD4+NEO−201+Tregは、CD4+T応答細胞の増殖を抑制することができた。
加えて、NEO−201がオプソニン化されたTregの死滅を媒介する能力を、CDCアッセイを使用して評価した。NEO−201 mAbは、Tregに対するCDC活性を媒介することができることが実証された。
これらの結果から、NEO−201がヒトTregに対して反応し、Tregの同定及び精製のための新規マーカーとして使用することができると結論付けられた。NEO−201 mAbを使用して単離されたTregは、機能的に抑制され、CDCによって除去され得る。抗体がTreg細胞に結合する能力に基づいて、ADCCを媒介したTreg細胞では、死滅も発生し得る。本出願は、この抗がん剤が抗腫瘍免疫のTregを媒介した免疫抑制を標的とすることにも有用性があり得ることを初めて実証する。
NEO−201による機能的Treg細胞の単離。市販のキット(ヒトCD4+CD127低CD25+)を使用して単離された機能的Tregの割合またはNEO−201発現に基づく選択。EasySep(商標)ヒトCD4+CD127低CD25+制御性T細胞単離キットは、67.14%の活性なTreg細胞を産生したが、NEO−201陽性発現に基づく選択は、99.12%の活性なTreg細胞を産生した。 制御性T細胞は、フローサイトメトリーによって決定されるように、CEACAM−5及びCEACAM−6陰性である。単離されたT−reg(EasySep(商標)ヒトCD4+CD127低CD25+制御性T細胞単離キット(HD19)の表現型分析。細胞を、CD66a(CEACAM1)、CD66c(CEACAM6)、CD66d(CEACAM3)、及びCD66e(CEACAM5)を認識するPEマウス抗ヒトCD66抗体(クローンB1.1/CD66)で染色した。44.84%のCD4+/CD25高/CD127−/FOXp3+細胞は、NEO−201+/CEACAM5−細胞及びCEACAM6−細胞である。 NEO−201は、CD4CD15sTregに対してCDCを媒介する。Treg細胞は、CD4及びCD15s(シアリルルイスXグリカン)を発現する。補体だけでは、Tregは死滅しなかった。NEO−201は、Treg細胞に対するCDCを介した。CD4+CD15s+Tregの集団が53.4%減少した。手順:CD4+T細胞をPBMCから単離した。細胞を、−/+NEO−201 mAb(10μg/mL)で処理した。次いで、細胞を、−/+補体(1:8希釈、2時間)で処理した。細胞を洗浄し、CD4及びCD15sマーカーについて染色した。マーカー発現は、フローサイトメトリーによって測定された。
一態様では、本開示は、インビボでTreg細胞を死滅させる方法であって、有効量のNEO−201抗体を患者に投与することを含む、方法を提供する。
別の態様では、本開示は、患者における抗がん免疫応答を増強する方法であって、有効量のNEO−201抗体を当該患者に投与することを含む、方法を提供する。
本方法は、がんワクチンを当該患者に投与することをさらに含み得る。投与され得る例示的ながんワクチンは、例えば、Fisher et al.,Immun Inflamm Dis.2017 Mar;5(1):16−28、Klages et al.,Cancer Res October 15 2010(70)(20)7788−7799、Reginato et al.,Br J Cancer.2013 Oct 15;109(8):2167−2174、Litzinger MT et al.,Blood 2007,110:3192に開示されており、これらのそれぞれは、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
別の態様では、本開示は、患者におけるがんのTreg細胞浸潤を減少させる方法であって、有効量のNEO−201抗体を当該患者に投与することを含む、方法を提供する。
別の態様では、本開示は、患者におけるがんの退縮を刺激する方法であって、有効量のNEO−201抗体を当該患者に投与し、それにより当該患者における抗がん免疫を活性化、増強、または刺激することを含む、方法を提供する。
当該がんは、CEACAM5またはCEACAM6を発現し得ない。
当該方法は、当該投与前または投与時に、当該がんが、CEACAM5及びCEACAM6陰性であることを決定することをさらに含み得、これは、任意に、例えば、CEACAM5及びCEACAM6の両方に特異的に結合する交差反応性抗体などのCEACAM5及び/またはCEACAM6に特異的な抗体で染色することによって、CEACAM5及びCEACAM6タンパク質の発現について試験することによって決定され得る。
別の態様では、本開示は、がんを治療または予防する、がんの負荷を軽減する、またはがんの成長もしくは増殖速度を低下させる方法であって、有効量のNEO−201抗体を、それを必要とする患者に投与することを含む、方法を提供し、当該がんは、CEACAM5及びCEACAM6陰性である。
当該方法は、別の治療剤を当該患者に投与することをさらに含み得る。当該他の薬剤は、(a)微小管阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、プラチン、アルキル化剤、及び代謝拮抗剤、(b)MK−2206、ON 013105、RTA 402、BI 2536、ソラフェニブ、ISIS−STAT3Rx、微小管阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、プラチン、アルキル化剤、代謝拮抗剤、パクリタキセル、ゲムシタビン、ドキソルビシン、ビンブラスチン、エトポシド、5−フルオロウラシル、カルボプラチン、アルトレタミン、アミノグルテチミド、アムサクリン、アナストロゾール、アザシチジン、ブレオマイシン、ブスルファン、カルムスチン、クロラムブシル、2−クロロデオキシアデノシン、シスプラチン、コルヒチン、シクロホスファミド、シタラビン、シトキサン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドセタキセル、リン酸エストラムスチン、フロクスウリジン、フルダラビン、ゲンツズマブ、ヘキサメチルメラミン、ヒドロキシ尿素、イフォスファミド、イマチニブ、インターフェロン、イリノテカン、ロムスチン、メクロレタミン、メルファレン、6−メルカプトプリン、メトトレキサート、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、ペントスタチン、プロカルバジン、リツキシマブ、ストレプトゾシン、タモキシフェン、テモゾロミド、テニポシド、6−チオグアニン、トポテカン、トラスツズマブ、ビンクリスチン、ビンデシン、及び/またはビノレルビン、(c)1−D−リボフラノシル−1,2,4−トリアゾール−3カルボキサミド、9−>2−ヒドロキシ−エトキシメチルグアニン、アダマンタンアミン、5−ヨード−2’−デオキシウリジン、トリフルオロチミジン、インターフェロン、アデニンアラビノシド、プロテアーゼ阻害剤、チミジンキナーゼ阻害剤、糖または糖タンパク質合成阻害剤、構造タンパク質合成阻害剤、付着及び吸着阻害剤、ならびにアシクロビル、ペンシクロビル、バラシクロビル、及びガンシクロビルなどのヌクレオシド類似体、(d)PD−1阻害剤、またはKEYTRUDA(登録商標)(ペンブロリズマブ)もしくはOPDIVO(登録商標)(ニボルマブ)などの抗PD−1抗体、あるいは(e)CTLA−4阻害剤、またはYERVOY(登録商標)イピリムマブなどの抗CTLA−4抗体、から選択され得る。免疫チェックポイント阻害(PD−1阻害及び/またはCTLA−4阻害)とTregアブレーションの組み合わせが、がん治療に特に有効であると予想される。Vargas et al.,Immunity.2017 Apr 18;46(4):577−586及びTaylor et al.,J Clin Invest.2017;127(9):3472−3483を参照されたく、これらのそれぞれは、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
当該NEO−201抗体は、患者における抗がん免疫応答を誘発または増大させ得る。
別の態様では、本開示は、インビトロでTreg細胞を死滅させる方法であって、当該Treg細胞をNEO−201抗体と接触させることを含む、方法を提供する。当該方法は、当該Treg細胞を補体と接触させることをさらに含み得る。当該Treg細胞は、CDCによって死滅させ得る。当該方法は、当該Treg細胞をナチュラルキラー細胞などのエフェクター細胞と接触させることをさらに含み得る。当該Treg細胞は、ADCCによって死滅させ得る。
別の態様では、本開示は、エクスビボでTreg細胞を死滅させる方法であって、Treg細胞を含むサンプルを有効量のNEO−201抗体と接触させることを含む、方法を提供する。当該サンプルは、患者から得られ得る。
当該NEO−201抗体は、細胞毒性部分に結合され得る。
別の態様では、本開示は、Treg細胞を検出する方法であって、当該Treg細胞によるNEO−201抗原の発現を検出することを含み、任意に、血液または生検サンプルなどの患者サンプル中のTreg細胞のレベルが、がんを診断するまたはがんの進行を決定するために使用される、方法を提供する。任意に、当該方法は、Treg細胞の検出に基づいて、患者に治療を割り当てるまたは投与することをさらに含み得る。例えば、患者は、当該患者サンプル中にTreg細胞が検出される場合、投与されるように割り当てられ得るか、またはTreg細胞を死滅させるのに有効な量でNEO−201を投与され得る。
当該方法は、当該Treg細胞をNEO−201抗体と接触させることを含み得る。
当該検出は、細胞選別、任意に、蛍光活性化細胞選別を含み得る。
別の態様では、本開示は、Treg細胞を検出する方法であって、細胞をNEO−201抗体と接触させることと、NEO−201を発現する細胞を検出することと、を含む、方法を提供する。当該NEO−201抗体は、直接的または間接的に標識され得る。
別の態様では、本開示は、Treg細胞を染色する方法であって、細胞をNEO−201抗体と接触させることを含む、方法を提供する。当該NEO−201抗体は、直接的または間接的に標識され得る。
別の態様では、本開示は、Treg細胞を単離する方法であって、NEO−201抗原を発現する細胞を単離することを含む、方法を提供する。当該方法は、Treg細胞を含有するサンプルをNEO−201抗体と接触させることを含み得、任意に、当該NEO−201抗体が、直接的または間接的に標識される。当該サンプルは、血液または骨髄であり得るか、またはそれを含み得る。当該方法は、NEO−201陽性Treg細胞をNEO−201陰性細胞から分離することを含み得る。当該方法は、当該Treg細胞を遺伝子改変することと、任意に、当該細胞を当該患者または別の個体に導入することと、をさらに含み得る。
当該Treg細胞は、細胞選別、任意に、蛍光活性化細胞選別により単離され得る。
当該Treg細胞は、サンプルを、NEO−201抗体を含む支持体と接触させることによって単離され得、それにより当該Treg細胞が、当該支持体上に保持される。
染色または検出の当該方法は、別のマーカー、または発現の存在、不在、及び/またはレベルが、NEO−201と組み合わせて、Treg細胞、例えば、CD4+、CD15s+、FoxP3+、CD25+、CCR4+及び/またはCD127またはCD127−、例えば、CD4+CD15s+、CD4+FoxP3+CD25+、またはCD4+FoxP3+CD25+CD127を示すマーカーの組み合わせの発現を検出することをさらに含み得る。例えば、NEO−201+CD4+CD15s+、NEO−201+CD4+CD15s+FoxP3+CD25+、NEO−201+CD4+CD15s+FoxP3+CD25+CD127、NEO−201+CD4+FoxP3+CD25+、またはNEO−201+CD4+FoxP3+CD25+CD127、好ましくはNEO−201+CD4+CD15s+、または好ましくはNEO−201+CD4+CD127CD25+、または好ましくは、CD4+CD25CD127−FoxP3+CD15s+CCR4+である細胞は、本明細書に開示される方法に従ってTreg細胞として特定、検出、単離、及び/または精製され得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、配列番号28及び配列番号29に含まれるCDR配列の少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または好ましくは6つすべてを含み得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、配列番号38に対して少なくとも90%の同一性を有する可変重鎖配列を含み得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、配列番号39に対して少なくとも90%の同一性を有する可変軽鎖配列を含み得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、配列番号38に対して少なくとも90%の同一性を有する可変重鎖配列及び配列番号39に対して少なくとも90%の同一性を有する可変軽鎖配列を含み得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、配列番号28のアミノ酸20〜470に対して少なくとも90%の同一性を有する重鎖配列及び配列番号29のアミノ酸20〜233に対して少なくとも90%の同一性を有する軽鎖配列を含み得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、配列番号28及び配列番号29に含まれるCDR配列の6つすべてを含み得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、ヒトIgG1定常ドメインを含み得る。あるいは、当該NEO−201抗体は、ヒトIgG2、ヒトIgG3、もしくはヒトIgG4定常ドメイン、または2つ以上のヒトIgG1、IgG2、IgG3、もしくはIgG4を含むハイブリッドもしくはキメラドメインを含み得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、ヒト化され得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、別の部分にコンジュゲートされ得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、別の細胞毒性部分、標識、放射性部分、または親和性タグにコンジュゲートされ得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該NEO−201抗体は、NEO−201抗原への結合に関して、配列番号28及び配列番号29に含まれる抗体と競合し得る。
上記または下記の方法のいずれかにおいて、当該がんは、血液学的悪性腫瘍、非小細胞肺癌などの肺癌、黒色腫、胃腸癌、卵巣癌、頭頸部の扁平上皮癌、肝細胞癌、乳癌、膵臓癌、中皮腫、転移性腎細胞癌、及び前立腺癌から選択され得る。当該がんは、Treg細胞を含み得る。
定義
別途定義されない限り、本明細書で用いるすべての技術的及び科学的用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を表す。本明細書に記載されるものと同様または同等の方法及び材料は、本発明または本発明の試験で使用され得るが、適切な方法及び材料が本明細書に記載される。材料、方法、及び実施例は単なる例示であり、限定することを意図するものではない。
本明細書の説明において、及び下記特許請求の範囲にわたって用いられる場合、文脈が別途明確に指示しない限り、「a」、「an」、及び「the」の意味は、複数の指示対象を含む。
本明細書で使用される「アミノ酸」という用語は、天然アミノ酸、合成アミノ酸、ならびに天然アミノ酸と同様の形で機能するアミノ酸類似体及びアミノ酸模倣体を指す。天然アミノ酸は、遺伝暗号によってコードされるものと、それらのアミノ酸が後で修飾されたもの、例えば、ヒドロキシプロリン、γ−カルボキシグルタメート及びO−ホスホセリンである。アミノ酸類似体とは、天然アミノ酸と同じ基本化学構造、すなわち、水素、カルボキシル基、アミノ基、及びR基に結合しているα炭素を有する化合物、例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチオニンスルホキシド、メチオニンメチルスルホニウムを指す。このような類似体は、修飾されたR基を有するか(例えばノルロイシン)または修飾されたペプチド主鎖を有するが、天然アミノ酸と同じ基本化学構造を保持している。アミノ酸模倣体とは、アミノ酸の一般的な化学構造とは異なる構造を有するが、天然アミノ酸と同様の形で機能する化学化合物を指す。
本明細書で使用される「NK枯渇」または「ナチュラルキラー枯渇」という用語は、正常範囲と比較して低いナチュラルキラー(NK)細胞レベルを有する患者を指す。NK細胞は、細胞傷害性自然免疫リンパ球である。典型的には、NK細胞は、健常な個体における末梢血単核球(PBMC)の5〜20%を占める。5%未満のPMBCを含むNK細胞を有する患者は、NK枯渇と称される。加えて、NK細胞が3%未満のPMBCを含む場合、この患者は、重度のNK細胞枯渇と称される。加えて、正常な個人では、最大90%のPBMC NK細胞が、CD56dimCD16NK細胞であり、これらは最も細胞毒性のサブセットとみなされる。70%未満のPBMC NK細胞がCD56dimCD16NK細胞である場合、この患者は、NK枯渇と称される。加えて、50%未満のPBMC NK細胞がCD56dimCD16NK細胞である場合、この患者は、重度のNK枯渇と称される。所定の患者は、これらの個々の基準のいずれかまたは両方を満たすことに基づいて、NK枯渇または重度のNK枯渇と称され得る。一般的に言えば、NK枯渇または重度のNK枯渇としての患者の状態は、患者から採取されたサンプル、例えば、血液サンプル、例えば、1週間または2週間前に得られ、試験されたサンプルを試験することによって決定される。NK枯渇または重度のNK枯渇としての患者の状態は、疾患の診断及び/またはこのようなNK細胞の枯渇に関連する一連の治療からも推定され得る。
「抗体」は、本明細書で用いられる場合、エピトープに適合し、それを認識する特定形状を有する任意のポリペプチド鎖含有分子構造を広く指し、1つ以上の非共有結合相互作用は、分子構造とエピトープとの間の複合体を安定化する。典型的な抗体分子は、免疫グロブリンであり、全ての源、例えば、ヒト、齧歯類、ウサギ、ウシ、ヒツジ、ブタ、イヌ、ニワトリからのあらゆる種類の免疫グロブリン、IgG、IgM、IgA、IgE、IgDが「抗体」であると考えられる。抗体には、キメラ抗体、ヒト抗体、及び他の非ヒト哺乳動物抗体、ヒト化抗体、単鎖抗体(scFv)、ラクダボディ、ナノボディ、IgNAR(サメに由来する単鎖抗体)、小モジュラー免疫薬(SMIP)、及び抗体断片(例えば、Fab、Fab’F(ab’))が含まれるが、これらに限定されない。多数の抗体コード配列が記載され、他のものは、当該技術分野で周知の方法によって生じてもよい。Streltsov,et al.(2005)Protein Sci.14(11):2901−9、Greenberg,et al.(1995)Nature374(6518):168−173、Nuttall,et al.(2001)Mol Immunol.38(4):313−26、Hamers−Casterman,et al.(1993)Nature363(6428):446−8、Gill,et al.(2006)Curr Opin Biotechnol.17(6):653−8を参照のこと。
「NEO−201抗体」とは、配列番号28及び配列番号29の重鎖及び軽鎖、または任意に、その中に含まれる定常領域と一緒に可変領域、ならびにそれらの断片及びバリアントを含む抗体を指す。そのようなバリアントには、配列番号28及び配列番号29に含まれるCDR配列の1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは好ましくは6つすべてを含む配列、すなわち、配列番号32の重鎖CDR1、配列番号33の重鎖CDR2、配列番号34の重鎖CDR3、配列番号35の軽鎖CDR1、配列番号36の軽鎖CDR2、及び配列番号37の軽鎖CDR3が含まれる。そのようなバリアントはまた、NEO−201抗原への結合に関して、NEO−201と競合する抗体も含む。当該抗体は、ヒト化され得る。当該抗体は、1つ以上のリーダー配列を含んで発現され得、発現中及び/または抗体の処理及び分泌に除去され得る。当該抗体は、当該NEO−201抗体配列及び異なる抗体の結合断片を含む二特異的または多特異的抗体を含むが、これらに限定されない、一価、二価、またはより多価の形式で提示され得る。典型的には、当該抗体は、がん細胞に特異的に結合し、がん細胞への結合に関して、配列番号38の可変重鎖及び配列番号39の可変軽鎖を含むか、または配列番号28の重鎖及び配列番号29の軽鎖を含む抗体と競合する。配列番号28及び/または配列番号29に含まれるCDR配列のうちの1つ以上は、バリアント配列、例えば、配列番号1もしくは4の軽鎖CDR1、配列番号2もしくは5の軽鎖CDR2、配列番号3もしくは6の軽鎖CDR3、配列番号7の重鎖CDR1、配列番号8、10、30、もしくは31の重鎖CDR2、配列番号9もしくは11または配列番号30〜31の重鎖CDR3と置換され得る。軽鎖は、配列番号14、16、17、18、19、20、21、または29の軽鎖配列に含まれるCDRを含み得る。重鎖は、配列番号15、22、23、24、25、26、27、または29の重鎖配列に含まれるCDRを含み得る。当該抗体は、配列番号38に対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有する可変重鎖配列、及び/または配列番号39に対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有する可変軽鎖配列を含み得、任意に、当該重鎖配列及び/または軽鎖配列は、配列番号28及び配列番号29に含まれるCDR配列の1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または好ましくは6つすべて、すなわち、配列番号32の重鎖CDR1、配列番号33の重鎖CDR2、配列番号34の重鎖CDR3、配列番号35の軽鎖CDR1、配列番号36の軽鎖CDR2、及び配列番号37の軽鎖CDR3が含まれる。当該抗体は、細胞毒性部分、放射性部分、標識、または精製タグなどの別の部分にコンジュゲートされ得る。
本明細書で使用される「抗原」は、動物がその抗原のエピトープに結合することができる抗体を産生するようにさらに誘導することができる抗体が結合することができる分子または分子の一部を広く指す。抗原は、1つのエピトープを有していても、1つを超えるエピトープを有していてもよい。本明細書で言及される特定の反応は、抗原が、非常に選択的な方法で、その対応する抗体と反応し、他の抗原によって誘発され得る多数の他の抗体とは反応しないことを示す。抗原は、腫瘍特異的であり得る(例えば、膵臓及び結腸癌の腫瘍性細胞によって発現される)。
本明細書で使用される「がん」は、悪性の成長または腫瘍を引き起こす異常で制御されない細胞分裂を特徴とする任意の腫瘍性疾患(侵襲性または転移性のいずれであっても)を広く指す。
本明細書で使用される「がんワクチン」は、がん細胞に対する免疫応答を誘発するか、または誘発することを目的とする免疫原性組成物を指す。
本明細書で使用される「キメラ抗体」は、定常領域またはその一部分が、変更、代替、または交換されているため、抗原結合部位(可変領域)が異なるまたは変更されたクラス、エフェクター機能及び/または種の定常領域、またはキメラ抗体に新しい特性を付与する完全に異なる分子、例えば、酵素、毒素、ホルモン、成長因子、薬物などに結合され、または、可変領域またはその一部分は、異なるまたは変更された抗原特異性を有する可変領域で変更、代替、または交換されている、抗体分子を広く指す。
本明細書で使用される「保存的に改変されたバリアント」は、アミノ酸及び核酸配列の両方に適用され、特定の核酸配列に関して、保存的に改変されたバリアントを広く指し、同一または本質的に同一のアミノ酸配列をコードする核酸を指すか、または、核酸がアミノ酸配列をコードしない場合、本質的に同一の配列を指す。遺伝暗号の縮重のために、多数の機能的に同一の核酸が、任意の所与のタンパク質をコードする。このような核酸変異は「サイレント変異」であり、保存的に改変された変異の1つの種である。ポリペプチドをコードする本明細書中のすべての核酸配列はまた、核酸の可能なあらゆるサイレント変動を表す。当業者ならば、核酸における各コドンを、機能的に同一の分子を生じるために改変することができると理解できるであろう(ただし、通常メチオニンの唯一のコドンであるAUG、及び通常トリプトファンの唯一のコドンであるTGGは除く)。
本明細書で使用される「相補性決定領域」、「超可変領域」、または「CDR」は、抗体の軽または重鎖の可変領域に見出される1つ以上の超可変領域または相補的決定領域(CDR)を広く指す。Kabat,et al.(1987)“Sequences of Proteins of Immunological Interest”National Institutes of Health,Bethesda,MDを参照されたい。これらの表現には、Kabat,et al.(1983)“Sequences of Proteins of Immunological Interest”U.S.Dept.of Health and Human Services or the hypervariable loops in 3−dimensional structures of antibodies.Chothia and Lesk(1987)J Mol.Biol.196:901−917によって定義される、超可変領域が含まれる。各鎖内のCDRは、フレームワーク領域によって極めて近接して保持され、他の鎖のCDRとともに、抗原結合部位の形成に寄与する。CDR内で、抗体抗原相互作用において、CDRによって使用される必須の接触残基を表す選択性決定領域(SDR)として説明される選択アミノ酸が存在する。Kashmiri(2005)Methods36:25−34。
本明細書で使用される「対照量」は、マーカーの試験量に対して比較される任意の量または量の範囲であり得るマーカーを広く指す。例えば、マーカーの対照量は、特定の疾患または状態を有する患者またはそのような疾患または状態を有さない人におけるマーカーの量であり得る。対照量は、絶対量(例えば、マイクログラム/ml)または相対量(例えば、シグナルの相対強度)のいずれかであり得る。
本明細書で使用される「差次的に存在する」とは、疾患の1つを有さない患者から採取された同等のサンプルと比較して疾患または状態を有する患者から採取されたサンプル中に存在するマーカーの量または質における、差異を広く指す。例えばハイブリダイゼーション及び/またはNATベースのアッセイによって測定されるように、例えば、あるサンプル中の核酸断片の量が、もう一方のサンプル中の核酸断片の量と著しく異なる場合、核酸断片は、任意に2つのサンプル間に差次的に存在し得る。あるサンプル中のポリペプチドの量が、もう一方のサンプル中のポリペプチドの量と著しく異なる場合、ポリペプチドは、2つのサンプル間で差次的に存在する。マーカーが一方のサンプルで検出可能であるが、もう一方のサンプルで検出可能でない場合、そのようなマーカーは差次的に存在するとみなすことができることに注意すべきである。任意に、比較的少量の上方調節が、マーカーとして役立ち得る。
本明細書で使用される「診断的」は、病態の存在または性質を特定することを広く指す。診断的方法は、それらの感度及び特異性において異なる。診断的アッセイの「感度」は、検査で陽性を示す罹患した個体のパーセンテージである(「真の陽性」のパーセント)。アッセイによって検出されない罹患した個体は、「偽の陰性」である。罹患していない、かつアッセイにおいて検査で陰性を示す対象は、「真の陰性」と呼ばれる。診断的アッセイの「特異性」は、1−偽の陽性率であり、「偽の陽性」率は、検査で陽性を示す疾患のない者の割合として定義される。特定の診断的方法は、状態の確定診断を提供しないことがあるが、この方法が診断を補助する陽性表示を提供することをもって足りる。
本明細書で使用される「診断する」は、疾患または症状を分類することと、疾患の重症度を決定することと、疾患の進行を監視することと、疾患の転帰及び/または回復の見通しを予測することと、を広く指す。「検出する」という用語も、前述のいずれかを任意に包含し得る。本発明に従う疾患の診断は、いくつかの実施形態において、対象から得られた生物試料中の本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドのレベルを決定することによって影響されることがあり、決定されるレベルは、疾患に対する素因、または疾患の存在もしくは非存在と相関し得る。「対象から得られた生物試料」は、対象から物理的に除去されていない試料も任意に含み得ることに留意すべきである。
本明細書で使用される「有効量」は、所望の結果を達成する化合物、抗体、抗原、または細胞の量を広く指す。「有効量」は、疾患を治療するために患者に投与されたときに、その疾患についてそのような治療を行うのに十分である。有効量は、予防に有効な量、及び/または防止に有効な量であり得る。有効量は、兆候/症状の発生を低減するために有効な量、防止するために有効な量、兆候/症状の発生の重症度を低減するため、兆候/症状の発生を排除するため、兆候/症状の発生の発達を遅延させるため、兆候/症状の発生の発達を防止するため、及び/または兆候/症状の発生の予防をもたらすために有効な量であり得る。「有効量」は、疾患及びその重症度、ならびに治療される患者の年齢、体重、病歴、感受性、及び既存状態に応じて異なり得る。「有効量」という用語は、本開示の目的で「治療上有効な量」と同義である。
本明細書で使用される「発現ベクター」は、本開示の核酸配列を、インビトロまたはインビボで原核生物、酵母、真菌、植物、昆虫、または哺乳動物の細胞を含むいずれかの細胞において、構成的または誘導的に発現させる目的での、いずれの組換え発現系を広く指す。この用語には、線状または環状の発現系が含まれる。この用語には、エピソームのままであるかまたは宿主細胞のゲノムに組み込まれた発現系が含まれる。この発現系は、自己複製能力を有することも有しないこともでき、すなわち、細胞内で一過性の発現のみを駆動することもできる。この用語には、組換え核酸の転写に必要な最低限の要素のみを含む組換え発現カセットが含まれる。
本明細書で使用される「フレームワーク領域」または「FR」は、抗体の軽鎖及び重鎖の可変領域内の1つ以上のフレームワーク領域を広く指す。Kabat,et al.(1987)“Sequences of Proteins of Immunological Interest,”National Institutes of Health,Bethesda,MDを参照のこと。これらの表現は、抗体の軽鎖及び重鎖の可変領域内で、CDRの間に挿入されるアミノ酸配列領域を含む。
本明細書で使用される「異種」は、核酸が、自然では互いに同一の関係では見出されない2つ以上の部分配列を含むことを示す核酸の一部を広く指す。例えば、核酸は、典型的には、組換えにより生成され、新しい機能的核酸を作製するように配置された無関係の遺伝子由来の2つ以上の配列を有し、例えばある供給源からのプロモーター及び他の供給源からのコード領域を有する。同様に、異種タンパク質は、タンパク質が自然では互いに同一の関係では見出されない2つ以上の部分配列を含むこと(例えば、融合タンパク質)を示す。
本明細書で使用される「高親和性」とは、標的抗原に対して少なくとも10−8M、より好ましくは少なくとも10−9M、さらにより好ましくは少なくとも10−10MのKDを有する抗体を広く指す。しかしながら、「高親和性」結合は、他の抗体アイソタイプに対して変動し得る。例えば、IgMアイソタイプに対する「高親和性」結合は、少なくとも10−7M、より好ましくは少なくとも10−8MのKDを有する抗体を指す。
本明細書で使用される「相同性」は、核酸配列と参照核酸配列との間、またはポリペプチド配列と参照ポリペプチド配列との間の類似性の程度を広く指す。相同性は、部分的または完全なものであり得る。完全な相同性は、核酸またはアミノ酸配列が同一であることを示す。部分的に相同な核酸またはアミノ酸配列は、参照核酸またはアミノ酸配列に同一でないものである。相同性の程度は、配列比較によって決定することができる。「配列同一性」という用語は、「相同性」と互換的に使用され得る。
本明細書で使用される「宿主細胞」は、発現ベクターを含み、かつ発現ベクターの複製または発現を支持する細胞を広く指す。宿主細胞は、原核細胞、例えばE.coli、または真核細胞、例えば酵母、昆虫(例えば、SF9)、両生類または哺乳動物の細胞、例えばCHO、HeLa、HEK−293、例えば、培養細胞、外植片及びインビボでの細胞であり得る。
本明細書で使用される「ハイブリダイゼーション」は、鎖が互いに逆平行に配置されたときの相補的ヌクレオチド間の水素結合の形成による相補的(部分的相補を含む)ポリヌクレオチド鎖の物理的相互作用を広く指す。
本明細書で使用される「K−assoc」または「Ka」は、特定の抗体抗原相互作用の会合速度を広く指し、一方、本明細書で使用される「Kdiss」または「Kd」という用語は、特定の抗体抗原相互作用の解離速度を指す。本明細書で使用される「KD」という用語は、Kd対Kaの比(すなわち、Kd/Ka)から得られ、モル濃度(M)として表される解離速度を指す。抗体に対するKD値は、当該技術分野で十分に確立されている方法を使用して決定することができる。
本明細書で使用される「イムノアッセイ」は、抗体を使用して抗原に特異的に結合させるアッセイを広く指す。イムノアッセイは、抗原を単離、標的、及び/または定量する特定の抗体の特異的結合特性の使用を特徴とし得る。
本明細書で使用される「単離された」は、それが天然に存在するその元の環境から除去され、したがってその天然環境からヒトの手によって改変された材料を広く指す。単離された材料は、例えば、ベクター系に含まれる外因性核酸、宿主細胞内に含有される外因性核酸、またはその元の環境から除去され、したがってヒトの手によって改変された任意の材料(例えば、「単離された抗体」)であり得る。
本明細書で使用される「標識」または「検出可能な部分」は、顕微鏡的、光化学的、生化学的、免疫化学的、化学的、または他の物理的手段によって検出可能な組成物を広く指す。
本明細書で使用される「低ストリンジェンシー」、「中ストリンジェンシー」、「高ストリンジェンシー」、または「非常に高ストリンジェンシーの条件」は、核酸ハイブリダイゼーション及び洗浄についての条件を広く指す。ハイブリダイゼーション反応を行うための手引きは、Ausubel,et al.(2002)Short Protocols in Molecular Biology(5th Ed.)John Wiley & Sons,NYに見出すことができる。例示的な特定のハイブリダイゼーション条件には、(1)低ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件:約45Cで、6×ナトリウム/クエン酸ナトリウム(SSC)中、次いで少なくとも50Cで0.2×SSC、0.1%SDS中で2回洗浄(低ストリンジェンシー条件では、洗浄温度は55Cまで上昇させることができる)、(2)中ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件:約45Cで、6×SSC、次いで60C、0.2×SSC、0.1%SDS中で1回以上洗浄、(3)高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件:約45Cで、6×SSC中、次いで、65C、0.2×SSC、0.1%SDS中で1回以上洗浄、及び(4)非常に高いストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件:65Cで、0.5Mリン酸ナトリウム、7%SDS、次いで、65C、0.2×SSC、1%SDSで1回以上洗浄、が含まれるが、これらに限定されない。
CD127などのマーカーに関して使用される「低レベル」または「低」という用語は、当該技術分野でよく知られており、対象となる細胞マーカー(例えば、CD127)の発現レベルを指し、細胞マーカーの発現レベルは全体として分析されている細胞集団における他の細胞におけるその細胞マーカーの発現レベルと比較して低い。より具体的には、「低」という用語は、1つ以上の他の別個の細胞集団よりも低いレベルで細胞マーカーを発現する別個の細胞集団を指す。したがって、CD127は、例えば、CD127−亜集団よりも高いがCD127+亜集団よりも低いレベルで、標識されたCD127抗体と接触したときにわずかにまたはぼんやりと染色する種類の細胞を指す。
「哺乳動物」は、本明細書で用いられる場合、皮膚の体毛被覆、及び雌において、子を育てるための乳汁産生乳腺を特徴とする、ヒトを含む哺乳類クラスの任意かつ全ての温血脊椎動物を広く指す。哺乳動物の例には、アルパカ、アルマジロ、カピバラ、ネコ、ラクダ、チンパンジー、チンチラ、ウシ、イヌ、ヤギ、ゴリラ、ハムスター、ウマ、ヒト、キツネザル、ラマ、マウス、非ヒト霊長類、ブタ、ラット、ヒツジ、トガリネズミ、リス、及びバクが含まれるが、これらに限定されない。哺乳動物には、ウシ科、イヌ科、ウマ科、ネコ科、ネズミ科、ヒツジ科、ブタ科、霊長類、及び齧歯類が含まれるが、これらに限定されない。哺乳動物には、Washington DCにあるSmithsonian自然史博物館によって維持される世界の哺乳類に列挙される任意かつすべてのものも含まれる。
本明細書で使用される「核酸」または「核酸配列」は、一本鎖または二本鎖のいずれかの形態のデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドオリゴヌクレオチドを広く指す。この用語は、天然ヌクレオチドの既知の類似体を含む核酸、すなわちオリゴヌクレオチドを包含する。この用語はまた、合成骨格を有する核酸様構造も包含する。他に示されない限り、特定の核酸配列はまた、保存的に改変されたそのバリアント(例えば、縮重コドン置換)及び相補的配列、ならびに明確に示された配列を暗に包含する。核酸という用語は、遺伝子、cDNA、mRNA、オリゴヌクレオチド、及びポリヌクレオチドと互換的に使用される。
本明細書で使用される「作動可能に連結された」とは、2つのDNA断片によってコードされるアミノ酸配列がインフレームに維持されるように2つのDNA断片が結合されるときを広く指す。
本明細書で使用される「パラトープ」とは、抗原を認識する抗体の一部(例えば、抗体の抗原結合部位)を広く指す。パラトープは、抗体のFv領域の小さな領域(例えば、15〜22アミノ酸)であり得、抗体の重鎖及び軽鎖の一部を含み得る。Goldsby,et al.Antigens(Chapter 3)Immunology(5th Ed.)New York:W.H.Freeman and Company,pages 57−75を参照のこと。
「患者」は、本明細書で用いられる場合、疾患状態を軽減するか、または疾患状態の発生もしくは再発を防止するかのいずれかのために治療を必要とする任意の動物を広く指す。また、本明細書で使用される「患者」は、危険因子、病歴、感受性、症状、兆候を有し、疾患が以前に診断されたか、疾患の危険性があるか、または疾患の患者集団の一員である、任意の動物を広く指す。患者は、ヒトなどの臨床患者、または随伴動物、家畜動物、畜産動物、珍しい動物、または動物園動物であり得る。「対象」という用語は、「患者」という用語と互換的に使用され得る。本明細書に開示される本発明の好ましい実施形態において、患者は、ヒトである。
「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という用語は、互換的に使用され、アミノ酸残基のポリマーを広く指す。これらの用語は、1つ以上のアミノ酸残基が、対応する天然アミノ酸の類似体または模倣体であるアミノ酸ポリマーと、天然アミノ酸ポリマーに適用される。これらの用語は、1つ以上のアミノ酸残基が、対応する天然アミノ酸の人工的な化学的模倣体であるアミノ酸ポリマーと、天然アミノ酸ポリマーと、非天然アミノ酸ポリマーに適用される。ポリペプチドは、例えば、糖タンパク質を形成するための炭水化物残基の添加によって改変され得る。「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という用語には、糖タンパク質、ならびに非糖タンパク質が含まれる。
本明細書で使用される「プロモーター」は、核酸の転写を支配する一連の核酸配列を広く指す。本明細書で使用される場合、プロモーターは、ポリメラーゼII型プロモーターの場合においては、TATA要素などの、転写の開始部位の近くで必要な核酸配列を含む。プロモーターはまた、任意に、転写の開始部位から数千塩基も離れて位置することができる遠位エンハンサーまたはリプレッサーエレメントを含むことができる。「構成性」プロモーターは、ほとんどの環境及び発達条件下で活性であるプロモーターである。「誘導性」プロモーターは、環境及び発達制御下で活性であるプロモーターである。
本明細書で使用される「予防的有効量」は、疾患の予防または疾患の再発の防止のために患者に投与されたときに、その疾患または再発についてそのような予防をもたらすのに十分である化合物の量を広く指す。予防的有効量は、兆候及び/または症状の発生を防止するのに有効な量であり得る。「予防的有効量」は、疾患及びその重症度、ならびに治療される患者の年齢、体重、病歴、状態になりやすい傾向、先行する状態に応じて異なり得る。
本明細書で使用される「予防」は、兆候及び/または症状が患者に存在しない、寛解期であり、または患者において以前に存在していた、一連の治療を広く指す。予防は、患者において疾患の治療の後で疾患が起こることを防止することを含む。さらに、防止は、疾患を潜在的に発症し得る患者、特に、疾患に影響されやすい患者(例えば、患者集団のメンバー、危険因子を有する、または疾患を発生する危険性のあるもの)を治療することを含む。
本明細書で使用される「組換え」は、産物、例えば、細胞、または核酸、タンパク質、またはベクターに関して広く指し、細胞、核酸、タンパク質、またはベクターが、異種核酸もしくはタンパク質、または天然の核酸もしくはタンパク質の導入、または細胞がそのように改変された細胞に由来することを示す。したがって、例えば、組換え細胞は、細胞の天然(非組換え)形態内に見出されない遺伝子を発現するか、さもなければ異常に発現され、発現が不十分または全く発現されない天然遺伝子を発現する。
本明細書で使用される、抗体に「特異的に(または選択的に)結合する」または「特異的に(または選択的に)免疫反応する」または「特異的に相互作用するまたは結合する」は、タンパク質またはペプチド(または他のエピトープ)を広く指し、いくつかの実施形態において、タンパク質及び他の生物製剤の不均一な集団におけるタンパク質の存在を決定する結合反応を指す。例えば、指定されたイムノアッセイ条件下で、特定された抗体は、バックグラウンド(非特異的シグナル)よりも少なくとも2倍多い特定のタンパク質に結合し、サンプルに存在する他のタンパク質に有意な量で実質的に結合しない。典型的に、特異的または選択的反応は、少なくとも2倍のバックグラウンド信号またはノイズであり、より典型的には約10〜100倍超のバックグラウンドである。
本明細書で使用される「特異的にハイブリダイズ可能」及び「相補的」とは、核酸が、従来のワトソンクリックまたは他の従来とは異なる種類のいずれかによって別の核酸配列と水素結合(複数可)を形成することができることを広く指す。核酸分子とその相補的配列の結合自由エネルギーは、核酸の関連する機能、例えばRNAi活性が進むことを可能にするのに十分である。核酸分子の結合自由エネルギーの測定は、当該技術分野でよく知られている。例えば、Turner,et al.(1987)CSH Symp.Quant.Biol.LII:123−33、Frier,et al.(1986)PNAS83:9373−77、Turner,et al.(1987)J.Am.Chem.Soc.109:3783−85を参照のこと。相補性パーセントは、第2の核酸配列と水素結合(例えば、ワトソンクリック型塩基対合)を形成することができる核酸分子中の連続する残基の割合を示す(例えば、10個のうち少なくとも約5、6、7、8、9、10個が少なくとも約50%、60%、70%、80%、90%、及び100%の相補性を有する)。「完全に相補的」または100%の相補性とは、第2の核酸配列中の同じ数の連続する残基と水素結合する核酸配列の連続する残基のすべてを広く指す。「実質的な相補的」とは、非相補的であるように選択されたオーバーハングなどのポリヌクレオチド鎖の領域を除いて、少なくとも約90%の相補性を示すポリヌクレオチド鎖を指す。特異的結合は、特異的結合が望まれる条件下で、すなわちインビボアッセイまたは治療的処置の場合には生理学的条件下で、またはインビトロアッセイの場合にはアッセイが行われる条件下で、非標的配列へのオリゴマー化合物の非特異的結合を回避するのに十分な程度の相補性を必要とする。非標的配列は、典型的には、少なくとも5ヌクレオチドが異なり得る。
本明細書で使用される疾患の「兆候」は、患者の検査で発見可能な、疾患を示す任意の異常、疾患を示す主観である兆候とは対照的に、疾患を示す目的を広く指す。
本明細書で使用される「固体支持体」、「支持体」、及び「基板」は、平滑な支持体(例えば、金属、ガラス、プラスチック、シリコン、及びセラミックの表面)、ならびに、凹凸がある、及び多孔質の材料を含むが、これらに限定されない、別の材料が連結され得る固体または半固体構造を提供する任意の材料を広く指す。例示的な固体支持体には、活性化ビーズ、磁気応答性ビーズ、または蛍光標識ビーズなどのビーズが含まれる。
本明細書で使用される「対象」は、本明細書に開示される本発明に従って治療されるのに適した者を広く指し、限定されないが鳥類及び哺乳類対象を含み、好ましくは哺乳類である。本開示される本発明の文脈における哺乳動物には、イヌ科、ネコ科、ウシ科、ヤギ科、ウマ科、ヒツジ科、ブタ科、齧歯類(例えば、ラット及びマウス)、ウサギ科、霊長類、ヒトが含まれるが、これらに限定されない。本明細書に開示される本発明に従って治療されることを必要とする任意の哺乳類対象が適している。両性別及び任意の発達段階(すなわち、新生児、幼児、若年、青年、成人)のヒト対象を、本発明に従って治療することができる。本発明は、獣医目的で、ならびに薬物スクリーニング及び薬物開発の目的で、動物対象、特にマウス、ラット、イヌ、ネコ、ウシ、ヤギ、ヒツジ、及びウマなどの哺乳類対象で実行されてもよい。「対象」は、「患者」と互換的に使用される。開示される本発明の好ましい実施形態において、対象は、ヒトである。
本明細書で使用される疾患の「症状」は、患者によって経験され、疾患を示す任意の病的現象または構造、機能、もしくは感覚の正常からの離脱を広く指す。
本明細書で使用される「治療法」、「治療的」、「治療する」、または「治療」は、疾患を治療すること、疾患もしくはその臨床症状の発達を停止もしくは低減すること、及び/または疾患を緩和し、疾患もしくはその臨床症状の退行を引き起こすことを広く指す。治療法は、疾患、疾患の兆候、及び/または症状の予防、治療、修復、低減、軽減、及び/または緩和の提供を包含する。治療法は、進行中の疾患の兆候及び/または症状(例えば、腫瘍の成長、転移)を有する患者における兆候及び/または症状の軽減を包含する。治療法は、「予防」も包含する。「低減された」という用語は、治療の目的で、兆候及び/または症状の臨床的に有意な低減を広く指す。治療法は、再燃または再発性の兆候及び/または症状の兆候(例えば、腫瘍の成長、転移)を治療することを含む。治療法は、兆候及び/または症状をいつでも除外すること、ならびに既存の兆候及び/または症状を低減すること、及び既存の兆候及び/または症状を排除することを包含するが、これらに限定されない。治療法は、慢性疾患(「維持」)及び急性疾患を治療することを含む。例えば、治療は、兆候及び/または症状(例えば、腫瘍の成長、転移)の再燃または再発を治療または予防することを含む。
本明細書で使用される「可変領域」または「VR」は、抗体の抗原への結合に直接関与する抗体の軽鎖及び重鎖の各ペア内のドメインを広く指す。各重鎖は、一方の端に可変ドメイン(V)を有し、続いて、いくつかの定常ドメインを有する。各軽鎖は、一方の端に可変ドメイン(V)を有し、その他方の端に定常ドメインを有し、軽鎖の定常ドメインは、重鎖の第1の定常ドメインと整列し、軽鎖の可変ドメインは、重鎖の可変ドメインと整列している。
本明細書で使用される「ベクター」は、宿主細胞内で自発的に複製することができ、1つまたは少数の制限エンドヌクレアーゼ認識部位を特徴とするプラスミド、コスミド、ファージミド、ファージDNA、または他のDNA分子を広く指し、そのようなDNA配列がベクターの本質的な生物学的機能を失うことなく決定可能な方法で切断され得、その複製及びクローニングを生じさせるためにDNAが挿入され得る。ベクターはさらに、ベクターで形質転換された細胞の同定に使用するのに適したマーカーを含んでもよい。
技術及び手順は一般に、当該技術分野において周知である従来の方法に従って、かつ本明細書全体を通して引用され、考察される、一般的かつより具体的な様々な参考文献に記載されるように実行される。例えば、Sambrook,et al.(2001)Molec.Cloning:Lab.Manual[3rd Ed] Cold Spring Harbor Laboratory Pressを参照のこと。組換えDNA、オリゴヌクレオチド合成、ならびに組織培養及び形質転換(例えば、電気穿孔、リポフェクション)には、標準技術が使用され得る。酵素反応及び精製技術は、製造業者の仕様書に従って、または当該技術分野において一般的に達成されるように、または本明細書に記載されるように実行され得る。本明細書に記載の分析化学、合成有機化学、ならびに医化学及び製薬化学に関連して用いられる命名法は、当該技術分野で周知であり、一般に使用されるものである。標準の技術は、化学合成、化学分析、薬学的調製、配合、及び送達、ならびに患者の治療において使用され得る。
ここで一般に説明される本発明は、単に本発明のある特定の態様及び実施形態の説明の目的で含まれ、本発明を限定するものではない次の実施例を参照することによって、より容易に理解されるであろう。
実施例1
NEO−201は、機能的なTreg細胞を単離することができる。
この実施例では、NEO−201結合に基づく細胞選別が、機能的なTregの高い割合を生み出すことが示される。市販のキット(ヒトCD4+CD127低CD25+)を使用してまたはNEO−201発現に基づく選択により単離された機能的Tregの割合を図1に示す。EasySep(商標)ヒトCD4+CD127低CD25+制御性T細胞単離キットは、67.14%の活性なTreg細胞を産生したが、NEO−201陽性発現に基づく選択は、99.12%の活性なTreg細胞を産生した。
出願者らは、NEO−201がCEACAM5及びCEACAM6のがん関連糖タンパク質バリアントに結合することをこれまでに示している。Treg細胞が、CEACAM5及びCEACAM6を発現することは知られていない。Treg細胞へのNEO−201の結合の基準をさらに決定するために、細胞をフローサイトメトリーによってCEACAM5及びCEACAM6発現について試験した。制御性T細胞は、CEACAM−5及びCEACAM−6陰性である(図2)。
方法 単離されたヒトTregへのヒトTregマーカーの結合を、フローサイトメトリーによって分析した。Treg(1.0×10)は、1×リン酸緩衝生理食塩水(PBS)中の試験ごとに1μLのLIVE/DEAD Fixable Aqua(Thermo Fisher Scientific,Waltham,MA,USA)で、4°Cで30分間インキュベートして、生細胞と死細胞を区別した。次いで、細胞を遠心分離し、冷PBSで2回洗浄し、次いで、1×PBS+1% BSA(Teknova,Hollister,CA,USA)中の、パシフィックブルーコンジュゲートNEO−201抗体、抗CD25−APC−H7、抗CD15s−Alexa 488、抗CD127−APCで染色し、抗Foxp3−PerCP−CY5.5.(BioLegend,San Diego,CA)を用いて4℃で30分間細胞内染色した。染色後、細胞を、冷PBSで2回洗浄し、FACSVerseフローサイトメーター(BD Biosciences,San Jose,CA,USA)を使用して検査した。細胞の蛍光分析は、BD FACSuiteソフトウェア(BD Biosciences,San Jose,CA,USA)を使用して行った。市販のキットによるT−regの単離は、製造業者の指示に従ってEasySep(商標)ヒトCD4+CD127低CD25+制御性T細胞単離キット(HD19)を使用して行った。CEACAM発現の分析のために、細胞を、CD66a(CEACAM1)、CD66c(CEACAM6)、CD66d(CEACAM3)、及びCD66e(CEACAM5)を認識するPEマウス抗ヒトCD66抗体(クローンB1.1/CD66)で染色した。44.84%のCD4+/CD25高/CD127−/FOXp3+細胞は、NEO−201+/CEACAM5−細胞及びCEACAM6−細胞である。
実施例2
NEO−201は、補体依存性細胞毒性(CDC)によってTregを死滅させることができる。
この実施例は、NEO−201がCD4+CD15s+Tregに対してCDCを媒介することができることを示す。Treg細胞は、CD4及びCD15s(シアリルルイスXグリカン)を発現する。CD4+T細胞は、PBMCから分離され、細胞は、−/+NEO−201 mAb(10μg/mL)で処理された。次いで、細胞を、−/+補体(1:8希釈、2時間)で処理した。次いで、細胞を洗浄し、CD4及びCD15sマーカーについて染色した。マーカー発現は、フローサイトメトリーによって測定された。補体だけでは、Tregは死滅しなかった。しかしながら、TregがNEO−201及び補体の両方で処理された場合、CD4+CD15s+Tregの集団は、53.4%減少し、CDCが発生したことを示す。
補体依存性細胞毒性(CDC)アッセイ法。CDCアッセイは、以前に記載された手順の変更を使用して実行された(Konishiet al.,2008)。CD4+T細胞を分離し、次いで、10μg/mLのNEO−201を用いてまたは用いずに37°Cで15分間処理して、細胞をオプソニン化した。次いで、精製したウサギ補体(MP Biomedicals,Santa Ana,CA)を、1:8の希釈で細胞に添加した。37℃で120分間インキュベートした後、細胞を洗浄し、CD4及びCD15sに対して蛍光標識抗体で染色した。30分間インキュベーションした後、細胞を洗浄し、BD FACSVerseを使用してフローサイトメトリーによって蛍光を測定した。細胞の蛍光分析は、BD FACSuiteソフトウェア(BD Biosciences,San Jose,CA,USA)を使用して行った。
実施例3
ヒト化NEO−201モノクローナル抗体の作製
Hollinshead結腸癌特異的ワクチンは、マウスにおけるモノクローナル抗体を生成するための免疫原性物質として使用された。腫瘍関連タンパク質及びペプチドの調製のための方法は、これまで記載されている(Hollinshead,US4810781,1989)。簡潔に言えば、がん組織を細かく切り刻み、単一細胞懸濁液を生成するために使用し、次いで、低張性食塩水膜抽出、一連の遠心分離ステップ、その後の低周波超音波処理を行った。得られた膜抽出タンパク質を、Sephadex G−200樹脂または電気泳動法によって分画し、濃縮及び定量した(Hollinshead et al,1970、Hollinshead et al.,1972、Hollinshead et al.,1985)。TAA製剤を、フロイントの完全アジュバントと混合し、BALB/cマウスに皮下注射した。これに続いて、フロイントの不完全アジュバントに2〜3週間間隔で3回のブースター注射を行った。マウス血清を、免疫化抗原に対する抗体応答についてELISAによって試験し、強力な応答を有するマウスを使用して、脾臓からのマウスB細胞をSP2/0−Ag14骨髄腫細胞株と融合させて、マウス免疫グロブリン(IgG)を成長させ、産生した細胞を選択することによって不死化ハイブリドーマ細胞を生成した。これらのマウスIgGから、マウスの16C3クローン(m16C3)は、ELISAによって決定されたLS174TまたはHT−29細胞由来の結腸腫瘍細胞膜抽出物との反応性に基づいて選択された。重鎖及び軽鎖IgG1をコードするcDNAは、ハイブリドーマクローン16C3 E12から単離されたRNAから決定され、固有であることが示された(Bristol & Kantor,US7829678,2010)。m16C3タンパク質配列は、h16C3としてヒト化され、NEO−201と表された。ヒト化は、重鎖及び軽鎖タンパク質の両方のFab領域の相補性決定領域(CDR)の外側のマウス配列を、ヒトFab配列で置き換え、各鎖からの3つのマウスCDR配列を保持することによって、コンピュータ内で行われた。重鎖及び軽鎖のFc領域は、他のヒト化承認済みmAb製品で使用されているヒトIgG1アイソタイプから選択された。アミノ酸配列は、CHO細胞でのタンパク質発現のために最適化されたDNAに逆翻訳された。次いで、重鎖及び軽鎖h16C3のDNAを化学合成し、哺乳動物発現プラスミドにクローニングし、哺乳動物細胞株(HEK293T及びCHO)にトランスフェクトした。組換えh16C3を発現するいくつかの安定したCHO細胞株が誘導され、保存された。精製された組換えh16C3は、ヒト化16C3抗体が元のm16C3抗体(Bristol & Kantor,US7829678,2010)として類似の特徴を有した。
これらの実施例で使用されたNEO−201抗体配列は、以下の図に含まれている。
Figure 2021512965
発現リーダー配列、可変領域、及び定常領域の間の境界は、各配列中のフォワードスラッシュ(「/」)で区切られ、CDR配列は、太字の下線付きテキストで示されている。使用された抗体配列は、示されている可変及び定常領域を含んだ。これらには、配列番号32の重鎖CDR1、配列番号33の重鎖CDR2、配列番号34の重鎖CDR3、配列番号35の軽鎖CDR1、配列番号36の軽鎖CDR2、及び配列番号37の軽鎖CDR3が含まれる。
略語
筋萎縮性側索硬化症(ALS)、抗体依存性細胞毒性(ADCC)、時間0から無限大までの血漿濃度−時間曲線下面積(AUCinf)、時間0から無限までの血漿濃度−時間曲線下用量正規化面積(AUCinf/D)、ベースライン(BL)、補体依存性細胞毒性(CDC)、クリアランス(CL)、最大観測血漿濃度(Cmax)、用量で正規化した測定最大血漿濃度(Cmax/D)、エストロゲン受容体(ER)、半減期(HL)、免疫組織化学(IHC)、多発性硬化症(MS)ナチュラルキラー(NK)、非小細胞肺癌(NSCLC)、末梢血単核細胞(PBMC)、プロゲステロン受容体(PR)、腫瘍関連抗原(TAA)、最大観察血漿中濃度の時間(Tmax)、分布体積(Vz)。
参考文献
以下の表の各文書を含む、本明細書で引用される各文書は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
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Claims (40)

  1. インビボでTreg細胞を死滅させる方法であって、有効量のNEO−201抗体を患者に投与することを含む、前記方法。
  2. 患者における抗がん免疫応答を増強する方法であって、有効量のNEO−201抗体を前記患者に投与することを含む、前記方法。
  3. がんワクチンを前記患者に投与することをさらに含む、請求項2に記載の方法。
  4. 患者におけるがんのTreg細胞浸潤を減少させる方法であって、有効量のNEO−201抗体を前記患者に投与することを含む、前記方法。
  5. 前記がんが、CEACAM5またはCEACAM6を発現しない、請求項2〜4のいずれか1項に記載の方法。
  6. 前記投与前または投与時に、前記がんが、CEACAM5及びCEACAM6陰性であると決定することをさらに含む、請求項3〜5のいずれか1項に記載の方法。
  7. がんを治療または予防する、がんの負荷を軽減する、またはがんの成長もしくは増殖速度を低下させる方法であって、有効量のNEO−201抗体を、それを必要とする患者に投与することを含み、前記がんが、CEACAM5及びCEACAM6陰性である、前記方法。
  8. 別の治療剤を前記患者に投与することをさらに含む、請求項7に記載の方法。
  9. 前記他の薬剤が、(a)微小管阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、プラチン、アルキル化剤、及び代謝拮抗剤、(b)MK−2206、ON 013105、RTA 402、BI 2536、ソラフェニブ、ISIS−STAT3Rx、微小管阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、プラチン、アルキル化剤、代謝拮抗剤、パクリタキセル、ゲムシタビン、ドキソルビシン、ビンブラスチン、エトポシド、5−フルオロウラシル、カルボプラチン、アルトレタミン、アミノグルテチミド、アムサクリン、アナストロゾール、アザシチジン、ブレオマイシン、ブスルファン、カルムスチン、クロラムブシル、2−クロロデオキシアデノシン、シスプラチン、コルヒチン、シクロホスファミド、シタラビン、シトキサン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドセタキセル、リン酸エストラムスチン、フロクスウリジン、フルダラビン、ゲンツズマブ、ヘキサメチルメラミン、ヒドロキシ尿素、イフォスファミド、イマチニブ、インターフェロン、イリノテカン、ロムスチン、メクロレタミン、メルファレン、6−メルカプトプリン、メトトレキサート、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、ペントスタチン、プロカルバジン、リツキシマブ、ストレプトゾシン、タモキシフェン、テモゾロミド、テニポシド、6−チオグアニン、トポテカン、トラスツズマブ、ビンクリスチン、ビンデシン、及び/またはビノレルビン、(c)1−D−リボフラノシル−1,2,4−トリアゾール−3カルボキサミド、9−>2−ヒドロキシ−エトキシメチルグアニン、アダマンタンアミン、5−ヨード−2’−デオキシウリジン、トリフルオロチミジン、インターフェロン、アデニンアラビノシド、プロテアーゼ阻害剤、チミジンキナーゼ阻害剤、糖または糖タンパク質合成阻害剤、構造タンパク質合成阻害剤、付着及び吸着阻害剤、ならびにアシクロビル、ペンシクロビル、バラシクロビル、及びガンシクロビルなどのヌクレオシド類似体、(d)PD−1阻害剤、またはKEYTRUDA(登録商標)(ペンブロリズマブ)もしくはOPDIVO(登録商標)(ニボルマブ)などの抗PD−1抗体、あるいは(e)CTLA−4阻害剤、またはYLERVOY(登録商標)イピリムマブなどの抗CTLA−4抗体、から選択される、請求項8に記載の方法。
  10. 前記NEO−201抗体が、前記患者における抗がん免疫応答を誘発または増大させる、請求項7〜9のいずれか1項に記載の方法。
  11. インビトロでTreg細胞を死滅させる方法であって、前記Treg細胞をNEO−201抗体と接触させることを含む、前記方法。
  12. 前記Treg細胞を補体と接触させることをさらに含む、請求項11に記載の方法。
  13. 前記Treg細胞が、CDCによって死滅する、請求項11または12に記載の方法。
  14. 前記Treg細胞をエフェクター細胞と接触させることをさらに含む、請求項11に記載の方法。
  15. 前記エフェクター細胞が、ナチュラルキラー細胞を含む、請求項14に記載の方法。
  16. 前記Treg細胞が、ADCCによって死滅する、請求項11、14、または15に記載の方法。
  17. 前記NEO−201抗体が、細胞毒性部分に結合されている、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  18. Treg細胞を検出する方法であって、前記Treg細胞による前記NEO−201抗原の発現を検出することを含み、任意に、血液または生検サンプルなどの患者サンプル中のTreg細胞のレベルが、がんを診断するまたはがんの進行を決定するために使用される、前記方法。
  19. 前記Treg細胞をNEO−201抗体と接触させることを含み、任意に、前記NEO−201抗体が、標識に直接的または間接的に結合される、請求項18に記載の方法。
  20. 前記検出が、細胞選別、任意に、蛍光活性化細胞選別を含む、請求項18または19に記載の方法。
  21. Treg細胞を染色する方法であって、細胞をNEO−201抗体と接触させることを含む、前記方法。
  22. 前記NEO−201抗体が、標識に直接的または間接的に結合される、請求項21に記載の方法。
  23. Treg細胞を単離する方法であって、前記NEO−201抗原を発現する細胞を単離することを含む、前記方法。
  24. Treg細胞を含有するサンプルをNEO−201抗体と接触させることを含み、任意に、前記NEO−201抗体が、直接的または間接的に標識される、請求項23に記載の方法。
  25. 前記サンプルが、血液または骨髄であるか、またはそれを含む、請求項24に記載の方法。
  26. NEO−201陽性Treg細胞をNEO−201陰性細胞から分離することを含む、請求項23〜25のいずれか1項に記載の方法。
  27. 前記Treg細胞が、細胞選別、任意に、蛍光活性化細胞選別によって単離される、請求項23〜26のいずれか1項に記載の方法。
  28. 前記Treg細胞が、サンプルを、NEO−201抗体を含む支持体と接触させることによって単離され、それにより前記Treg細胞が、前記支持体上に保持される、請求項23〜26のいずれか1項に記載の方法。
  29. 前記NEO−201抗体が、配列番号28及び配列番号29に含まれるCDR配列の少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つすべてを含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  30. 前記NEO−201抗体が、配列番号38に対して少なくとも90%の同一性を有する可変重鎖配列を含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  31. 前記NEO−201抗体が、配列番号39に対して少なくとも90%の同一性を有する可変軽鎖配列を含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  32. 前記NEO−201抗体が、配列番号38に対して少なくとも90%の同一性を有する可変重鎖配列及び配列番号39に対して少なくとも90%の同一性を有する可変軽鎖配列を含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  33. 前記NEO−201抗体が、配列番号28のアミノ酸20〜470に対して少なくとも90%の同一性を有する重鎖配列及び配列番号29のアミノ酸20〜233に対して少なくとも90%の同一性を有する軽鎖配列を含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  34. 前記NEO−201抗体が、配列番号28及び配列番号29に含まれるCDR配列の6つすべてを含む、請求項32または33に記載の方法。
  35. 前記NEO−201抗体が、ヒトIgG1定常ドメインを含む、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  36. 前記NEO−201抗体が、ヒト化されている、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  37. 前記NEO−201抗体が、別の部分にコンジュゲートされている、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  38. 前記NEO−201抗体が、別の細胞毒性部分、標識、放射性部分、または親和性タグにコンジュゲートされている、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  39. 前記がんが、血液学的悪性腫瘍、非小細胞肺癌などの肺癌、黒色腫、胃腸癌、卵巣癌、頭頸部の扁平上皮癌、肝細胞癌、乳癌、膵臓癌、中皮腫、転移性腎細胞癌、及び前立腺癌から選択される、請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法。
  40. 前記Treg細胞を遺伝子改変することと、任意に、前記細胞を前記患者または別の個体に導入することと、をさらに含む、請求項23〜28のいずれか1項に記載の方法。
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