JP2020020791A - 情報処理装置、情報処理方法、情報処理システム、およびプログラム - Google Patents
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Abstract
Description
1.概要
2.実施形態
3.実施例
4.ハードウェア構成例
5.備考
6.システム構成の変形例
7.まとめ
8.応用例
まず、本開示の概要について説明する。
上記では、本開示の概要について説明した。続いて、本開示の一実施形態について説明する。
まず、図3を参照して、本実施形態に係る情報処理システムの構成例について説明する。図3に示すように、本実施形態に係る情報処理システムは、情報処理装置100と、データベース200と、を備え、情報処理システムへの入力として、蛍光試薬10、標本20と、蛍光染色標本30と、が存在する。
蛍光試薬10は、標本20の染色に使用される薬品である。蛍光試薬10は、例えば、蛍光抗体(直接標識に使用される一次抗体、または間接標識に使用される二次抗体が含まれる)、蛍光プローブ、または核染色試薬などであるが、蛍光試薬10の種類はこれらに特に限定されない。また、蛍光試薬10は、蛍光試薬10(および蛍光試薬10の製造ロット)を識別可能な識別情報(以降「試薬識別情報11」と呼称する)を付されて管理される。試薬識別情報11は、例えばバーコード情報など(一次元バーコード情報や二次元バーコード情報など)であるが、これに限定されない。蛍光試薬10は、同一(同種類)の製品であっても、製造方法や抗体が取得された細胞の状態などに応じて製造ロット毎にその性質が異なる。例えば、蛍光試薬10において、製造ロット毎にスペクトル情報、量子収率、または蛍光標識率(「F/P値:Fluorescein/Protein」とも呼称される。抗体を標識する蛍光分子数を指す)などが異なる。そこで、本実施形態に係る情報処理システムにおいて、蛍光試薬10は、試薬識別情報11を付されることによって製造ロット毎に管理される(換言すると、各蛍光試薬10の試薬情報は製造ロット毎に管理される)。これによって、情報処理装置100は、製造ロット毎に現れる僅かな性質の違いも考慮した上で蛍光シグナルと自家蛍光シグナルとを分離することができる。なお、蛍光試薬10が製造ロット単位で管理されることはあくまで一例であり、蛍光試薬10は製造ロットよりも細かい単位で管理されてもよい。
標本20は、人体から採取された検体または組織サンプルから病理診断または臨床検査などを目的に作製されたものである。標本20について、使用される組織(例えば臓器または細胞など)の種類、対象となる疾病の種類、対象者の属性(例えば、年齢、性別、血液型、または人種など)、または対象者の生活習慣(例えば、食生活、運動習慣、または喫煙習慣など)は特に限定されない。また、標本20は、各標本20を識別可能な識別情報(以降、「標本識別情報21」と呼称する)を付されて管理される。標本識別情報21は、試薬識別情報11と同様に、例えばバーコード情報など(一次元バーコード情報や二次元バーコード情報など)であるが、これに限定されない。標本20は、使用される組織の種類、対象となる疾病の種類、対象者の属性、または対象者の生活習慣などに応じてその性質が異なる。例えば、標本20において、使用される組織の種類などに応じて計測チャネルまたはスペクトル情報などが異なる。そこで、本実施形態に係る情報処理システムにおいて、標本20は、標本識別情報21を付されることによって個々に管理される。これによって、情報処理装置100は、標本20毎に現れる僅かな性質の違いも考慮した上で蛍光シグナルと自家蛍光シグナルとを分離することができる。
蛍光染色標本30は、標本20が蛍光試薬10によって染色されることで作成されたものである。本実施形態において、蛍光染色標本30は、標本20が少なくとも1つの蛍光試薬10によって染色されることを想定しているところ、染色に用いられる蛍光試薬10の数は特に限定されない。また、染色方法は、標本20および蛍光試薬10それぞれの組み合わせなどによって決まり、特に限定されるものではない。蛍光染色標本30は、情報処理装置100に対して入力され、撮像される。
情報処理装置100は、図3に示すように、取得部110と、保存部120と、処理部130と、表示部140と、制御部150と、操作部160と、を備える。
取得部110は、情報処理装置100の各種処理に使用される情報を取得する構成である。図3に示すように、取得部110は、情報取得部111と、画像取得部112と、を備える。
情報取得部111は、試薬情報および標本情報を取得する構成である。より具体的には、情報取得部111は、蛍光染色標本30の生成に使用された蛍光試薬10に付された試薬識別情報11、および標本20に付された標本識別情報21を取得する。例えば、情報取得部111は、バーコードリーダーなどを用いて試薬識別情報11および標本識別情報21を取得する。そして、情報取得部111は、試薬識別情報11に基づいて試薬情報を、標本識別情報21に基づいて標本情報をそれぞれデータベース200から取得する。情報取得部111は、取得したこれらの情報を後述する情報保存部121に保存する。
画像取得部112は、蛍光染色標本30(少なくとも1つの蛍光試薬10で染色された標本20)の画像情報を取得する構成である。より具体的には、画像取得部112は、任意の撮像素子(例えば、CCDやCMOSなど)を備えており、当該撮像素子を用いて蛍光染色標本30を撮像することで画像情報を取得する。ここで、「画像情報」は、蛍光染色標本30の画像自体だけでなく、像として視覚化されていない測定値なども含む概念であることに留意されたい。例えば、画像情報には、蛍光染色標本30から放射した蛍光の波長スペクトル(以下、蛍光スペクトルという)に関する情報が含まれていてもよい。画像取得部112は、画像情報を後述する画像情報保存部122に保存する。
保存部120は、情報処理装置100の各種処理に使用される情報、または各種処理によって出力された情報を保存(記憶)する構成である。図3に示すように、保存部120は、情報保存部121と、画像情報保存部122と、解析結果保存部123と、を備える。
情報保存部121は、情報取得部111によって取得された試薬情報および標本情報を保存する構成である。なお、後述する解析部131による解析処理および画像生成部132による画像情報の生成処理(画像情報の再構築処理)が終了した後には、情報保存部121は、処理に用いられた試薬情報および標本情報を削除することで空き容量を増やしてもよい。
画像情報保存部122は、画像取得部112によって取得された蛍光染色標本30の画像情報を保存する構成である。なお、情報保存部121と同様に、解析部131による解析処理および画像生成部132による画像情報の生成処理(画像情報の再構築処理)が終了した後には、画像情報保存部122は、処理に用いられた画像情報を削除することで空き容量を増やしてもよい。
解析結果保存部123は、後述する解析部131によって行われた解析処理の結果を保存する構成である。例えば、解析結果保存部123は、解析部131によって分離された、蛍光試薬の蛍光シグナルまたは標本20の自家蛍光シグナルを保存する。また、解析結果保存部123は、別途、機械学習などによって解析精度を向上させるために、解析処理の結果をデータベース200へ提供する。なお、解析結果保存部123は、解析処理の結果をデータベース200へ提供した後には、自らが保存している解析処理の結果を適宜削除することで空き容量を増やしてもよい。
処理部130は、画像情報、試薬情報、および標本情報を用いて各種処理を行う機能構成である。図3に示すように、処理部130は、解析部131と、画像生成部132と、を備える。
解析部131は、画像情報、標本情報、および試薬情報を用いて各種解析処理を行う構成である。例えば、解析部131は、標本情報および試薬情報に基づいて画像情報から標本20の自家蛍光シグナルと蛍光試薬10の蛍光シグナルとを分離する処理を行う。
画像生成部132は、解析部131によって分離された蛍光シグナルまたは自家蛍光シグナルに基づいて画像情報を生成(再構成)する構成である。例えば、画像生成部132は、蛍光シグナルのみが含まれる画像情報を生成したり、自家蛍光シグナルのみが含まれる画像情報を生成したりすることができる。その際、蛍光シグナルが複数の蛍光成分によって構成されていたり、自家蛍光シグナルが複数の自家蛍光成分によって構成されたりしている場合、画像生成部132は、それぞれの成分単位で画像情報を生成することができる。さらに、解析部131が分離後の蛍光シグナルまたは自家蛍光シグナルを用いた各種処理(例えば、標本20の固定化状態の解析、セグメンテーション、またはS/N値の算出など)を行った場合、画像生成部132は、それらの処理の結果を示す画像情報を生成してもよい。本構成によれば、標的分子等に標識された蛍光試薬10の分布情報、つまり蛍光の二次元的な広がりや強度、波長、及びそれぞれの位置関係が可視化され、特に標的物質の情報が複雑な組織画像解析領域においてユーザである医師や研究者の視認性を向上させることができる。
表示部140は、画像生成部132によって生成された画像情報をディスプレイに表示することでユーザへ提示する構成である。なお、表示部140として用いられるディスプレイの種類は特に限定されない。また、本実施形態では詳細に説明しないが、画像生成部132によって生成された画像情報がプロジェクターによって投影されたり、プリンターによってプリントされたりすることでユーザへ提示されてもよい(換言すると、画像情報の出力方法は特に限定されない)。
制御部150は、情報処理装置100が行う処理全般を統括的に制御する機能構成である。例えば、制御部150は、操作部160を介して行われるユーザによる操作入力に基づいて、上記で説明したような各種処理(例えば、蛍光染色標本30の撮像処理、解析処理、画像情報の生成処理(画像情報の再構築処理)、および画像情報の表示処理など)の開始や終了などを制御する。なお、制御部150の制御内容は特に限定されない。例えば、制御部150は、汎用コンピュータ、PC、タブレットPCなどにおいて一般的に行われる処理(例えば、OS(Operating System)に関する処理)を制御してもよい。
操作部160は、ユーザからの操作入力を受ける構成である。より具体的には、操作部160は、キーボード、マウス、ボタン、タッチパネル、またはマイクロホンなどの各種入力手段を備えており、ユーザはこれらの入力手段を操作することで情報処理装置100に対して様々な入力を行うことができる。操作部160を介して行われた操作入力に関する情報は制御部150へ提供される。
データベース200は、標本情報、試薬情報、および解析処理の結果を管理する装置である。より具体的に説明すると、データベース200は、標本識別情報21と標本情報、試薬識別情報11と試薬情報をそれぞれ紐づけて管理する。これによって、情報取得部111は、計測対象である標本20の標本識別情報21に基づいて標本情報を、蛍光試薬10の試薬識別情報11に基づいて試薬情報をデータベース200から取得することができる。
上記では、本実施形態に係る情報処理システムの構成例について説明した。続いて、図4および図5を参照して、情報処理装置100による各種処理のフローの例について説明する。
(3.1.自家蛍光シグナルの除去の実施例)
上記では、情報処理装置100による各種処理のフローの例について説明した。続いて、自家蛍光シグナルの除去の実施例について説明する。
また、上述にもあるように、複数のマーカ分子を複数の蛍光色素で各々標識した抗体分子を用いて標本20を染色し、その蛍光染色標本30を撮像することで得られた画像情報から自家蛍光シグナルと蛍光シグナルとを色分離計算することで、特異的な染色を確認することできる。
続いて、蛍光シグナルの抽出に使用する自家蛍光シグナルの実施例について説明する。上述したように、標本20に使用される組織、対象となる疾病の種類、対象者の属性、および対象者の生活習慣などの観点で同一または類似の標本20が複数存在する場合、これらの標本20の自家蛍光シグナルは類似している可能性が高い。これは、同一の患者から採取した組織に限られず、異なる患者から採取した組織についても同様に言えることである。
上記では、自家蛍光シグナルの除去の実施例について説明した。続いて、標本20の固定化状態の解析の実施例について説明する。
上記では、標本20の固定化状態の解析の実施例について説明した。続いて、画像情報に含まれる物体(例えば、細胞、細胞内構造(細胞質、細胞膜、核、など)、または組織(腫瘍部、非腫瘍部、結合組織、血管、血管壁、リンパ管、繊維化構造、壊死、など))の領域を認識するセグメンテーション(または領域分割)について説明する。
上記では、本開示に係る技術を用いたセグメンテーションについて説明した。続いて、図18を参照して、情報処理装置100のハードウェア構成例について説明する。
上記では、一般的に、実際の標本情報および試薬情報はカタログ値や文献値とは異なる場合が多いため、標本情報および試薬情報が本開示に係る情報処理システム内で独自に計測され管理される方がより好ましい旨を説明した。そこで備考として、図19および図20を参照しながら、実際の標本情報および試薬情報がカタログ値や文献値と異なることを説明する。
なお、上述した実施形態に係る情報処理システム(図3参照)は、サーバ・クライアント型のシステム構成とすることも可能である。図21は、サーバ・クライアント型で構成された情報処理システムの概略構成例を示すブロック図である。
以上で説明してきたように、本開示に係る情報処理装置100は、標本情報および試薬情報に基づいて、少なくとも1つの蛍光試薬10で染色された標本20の画像情報から標本20の自家蛍光シグナルと、蛍光試薬10の蛍光シグナルとを分離することができる。また、情報処理装置100は、分離後の蛍光シグナルまたは自家蛍光シグナルを用いて各種処理(例えば、標本20の固定化状態の解析、またはセグメンテーションなど)を行うことができる。さらに、情報処理装置100は、データベース200にて管理されている標本情報、試薬情報、および解析処理の結果を用いて機械学習を行うことで、自家蛍光シグナルと蛍光シグナルの分離処理などの上記処理を改善していくことができる。
本開示に係る技術は、様々な製品へ応用することができる。例えば、本開示に係る技術は、医師等が患者から採取された細胞や組織を観察して病変を診断する病理診断システムやその支援システム等(以下、診断支援システムと称する)に適用されてもよい。この診断支援システムは、デジタルパソロジー技術を利用して取得された画像に基づいて病変を診断又はその支援をするDPI(Digital Pathology Imaging)システムであってもよい。
(1)
蛍光試薬で染色された標本の画像情報を取得する画像取得部と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報を取得する情報取得部と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から第1蛍光シグナルと第2蛍光シグナルを分離する解析部と、
を備える情報処理装置。
(2)
前記第1蛍光シグナルは、前記標本の自家蛍光シグナルであり、
前記第2蛍光シグナルは、前記蛍光試薬の蛍光シグナルである、
前記(1)に記載の情報処理装置。
(3)
前記標本は、第1自家蛍光成分と第2自家蛍光成分を含み、
前記第1蛍光シグナルは、前記第1自家蛍光成分の自家蛍光シグナルであり、
前記第2蛍光シグナルは、前記第2自家蛍光成分の自家蛍光シグナルである、
前記(1)に記載の情報処理装置。
(4)
前記蛍光試薬は、第1蛍光試薬と第2蛍光試薬を含み、
前記第1蛍光シグナルは、前記第1蛍光試薬の蛍光シグナルであり、
前記第2蛍光シグナルは、前記第2蛍光試薬の蛍光シグナルである、
前記(1)に記載の情報処理装置。
(5)
前記解析部は、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から更に第3蛍光シグナルを分離し、
前記第3蛍光シグナルは、前記標本の自家蛍光シグナルである、
前記(4)に記載の情報処理装置。
(6)
前記解析部は、前記第1自家蛍光成分の自家蛍光シグナルと前記第2自家蛍光成分の自家蛍光シグナルの構成比に基づいて前記標本の固定化状態を解析する、
前記(3)に記載の情報処理装置。
(7)
前記標本に関する情報は、標本に含まれる自家蛍光成分、および前記自家蛍光成分のスペクトル情報を含む、
前記(1)〜(6)の何れか1項に記載の情報処理装置。
(8)
前記標本に含まれる自家蛍光成分は、NADH(nicotinamide adenine dinucleotide還元型)、FAD(flavin adenine dinucleotide)、およびPorphinのうち少なくとも1つ以上である、
前記(7)に記載の情報処理装置。
(9)
前記標本に関する情報は、更に、使用される組織の種類、対象となる疾病の種類、対象者の属性、対象者の生活習慣に関する情報を含む、
前記(7)に記載の情報処理装置。
(10)
前記蛍光試薬に関する情報は、前記蛍光試薬に含まれる蛍光成分のスペクトル情報を含む、
前記(1)〜(9)の何れか1項に記載の情報処理装置。
(11)
前記情報取得部は、前記標本を識別可能な標本識別情報に基づいて前記標本に関する情報を取得し、前記蛍光試薬を識別可能な試薬識別情報に基づいて前記蛍光試薬に関する情報を取得する、
前記(1)〜(10)の何れか1項に記載の情報処理装置。
(12)
前記試薬識別情報は、前記蛍光試薬の製造ロットを更に識別可能である、
前記(11)に記載の情報処理装置。
(13)
前記第1蛍光シグナルまたは前記第2蛍光シグナルに基づいて生成された画像情報を表示する表示部をさらに備える、
前記(1)〜(12)の何れか1項に記載の情報処理装置。
(14)
前記表示部は、前記第1蛍光シグナルと前記第2蛍光シグナルを区別するよう制御し生成された画像情報を表示する、
前記(13)に記載の情報処理装置。
(15)
前記第1蛍光シグナルは、前記標本の自家蛍光シグナルであり、
前記第2蛍光シグナルは、前記蛍光試薬の蛍光シグナルであり、
前記表示部は、前記標本の自家蛍光シグナルを減算処理して前記蛍光試薬の蛍光シグナルを区別するよう制御し、生成された画像を表示する、
前記(14)に記載の情報処理装置。
(16)
前記解析部は、分離された前記自家蛍光シグナルを用いて、他の標本の画像情報に対して減算処理を行うことで前記他の標本の画像情報から前記蛍光シグナルを抽出する、
前記(2)に記載の情報処理装置。
(17)
前記解析部は、前記画像情報における前記第1蛍光シグナルおよび前記第2蛍光シグナルの分布に基づいて前記画像情報に含まれる物体の領域を認識する、
前記(1)〜(16)の何れか1項に記載の情報処理装置。
(18)
前記解析部は、分離後の前記第1蛍光シグナルおよび前記第2蛍光シグナルと、分離に用いられた前記画像情報、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報とを用いて行われた機械学習の結果に基づいて前記分離を行う、
前記(1)〜(17)の何れか1項に記載の情報処理装置。
(19)
前記第1及び第2蛍光シグナルのうち少なくとも1つは、自家蛍光シグナルであり、
前記蛍光試薬に関する情報は、前記蛍光試薬に関する量子収率、蛍光標識率、および吸収断面積もしくはモル吸光係数を含み、
前記解析部は、前記自家蛍光シグナルが除去された前記画像情報、および前記蛍光試薬に関する情報を用いて、前記画像情報における蛍光分子の数、または前記蛍光分子と結合している抗体の数のうちの少なくともいずれか一方を算出する、
前記(1)〜(18)の何れか1項に記載の情報処理装置。
(20)
蛍光試薬で染色された標本の画像情報を取得する画像取得部と、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報を取得する情報取得部とを有する情報処理装置と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から第1蛍光シグナルと第2蛍光シグナルを分離するよう制御する制御機能を情報処理装置に実行させるプログラムと、
を有する顕微鏡システム。
(21)
少なくとも1つの蛍光試薬で染色された標本の画像情報を取得する画像取得部と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報を取得する情報取得部と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から前記標本の自家蛍光シグナルと前記蛍光試薬の蛍光シグナルの分離を行う解析部と、を備える、
情報処理装置。
(22)
前記標本が2以上の蛍光試薬で染色される場合、
前記解析部は、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から前記2以上の蛍光試薬それぞれの前記蛍光シグナルの分離を行う、
前記(21)に記載の情報処理装置。
(23)
前記自家蛍光シグナルが自家蛍光を発する2以上の成分によって構成される場合、
前記解析部は、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から前記自家蛍光を発する2以上の成分それぞれの前記自家蛍光シグナルの分離を行う、
前記(21)または(22)に記載の情報処理装置。
(24)
前記解析部は、前記自家蛍光を発する2以上の成分それぞれの前記自家蛍光シグナルの構成比に基づいて前記標本の固定化状態を解析する、
前記(23)に記載の情報処理装置。
(25)
前記標本に関する情報は、前記標本が有する自家蛍光を発する成分を示す情報、および前記自家蛍光を発する成分のスペクトル情報を含む、
前記(21)〜(24)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(26)
前記蛍光試薬に関する情報は、前記蛍光試薬に含まれる蛍光成分のスペクトル情報を含む、
前記(21)〜(25)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(27)
前記情報取得部は、前記標本を識別可能な標本識別情報に基づいて前記標本に関する情報を取得し、前記蛍光試薬を識別可能な試薬識別情報に基づいて前記蛍光試薬に関する情報を取得する、
前記(21)〜(26)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(28)
前記試薬識別情報は、前記蛍光試薬の製造ロットも識別可能である、
前記(27)に記載の情報処理装置。
(29)
前記蛍光シグナルまたは前記自家蛍光シグナルに基づいて生成された画像情報を表示する表示部をさらに備える、
前記(21)〜(28)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(30)
前記解析部は、前記自家蛍光シグナルを用いて、他の標本の画像情報に対して減算処理を行うことで前記他の標本の画像情報から前記蛍光シグナルを抽出する、
前記(21)〜(29)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(31)
前記解析部は、前記画像情報における前記自家蛍光シグナルおよび前記蛍光シグナルの分布に基づいて前記画像情報に含まれる物体の領域を認識する、
前記(21)〜(30)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(32)
前記解析部は、分離後の前記蛍光シグナルおよび前記自家蛍光シグナルと、分離に用いられた前記画像情報、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報とを用いて行われた機械学習の結果に基づいて前記分離を行う、
前記(21)〜(31)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(33)
前記蛍光試薬に関する情報は、前記蛍光試薬に関する量子収率、蛍光標識率、および吸収断面積もしくはモル吸光係数を含み、
前記解析部は、前記自家蛍光シグナルが除去された前記画像情報、および前記蛍光試薬に関する情報を用いて、前記画像情報における蛍光分子の数、または前記蛍光分子と結合している抗体の数のうちの少なくともいずれか一方を算出する、
前記(21)〜(32)のいずれか1項に記載の情報処理装置。
(34)
少なくとも1つの蛍光試薬で染色された標本の画像情報を取得することと、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報を取得することと、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から前記標本の自家蛍光シグナルと前記蛍光試薬の蛍光シグナルの分離を行うことと、を有する、
コンピュータにより実行される情報処理方法。
(35)
少なくとも1つの蛍光試薬で染色された標本の画像情報を取得することと、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報を取得することと、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から前記標本の自家蛍光シグナルと前記蛍光試薬の蛍光シグナルの分離を行うことと、
をコンピュータに実現させるためのプログラム。
(36)
少なくとも1つの蛍光試薬で染色された標本の画像情報を取得する画像取得部と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報を取得する情報取得部と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から前記標本の自家蛍光シグナルと前記蛍光試薬の蛍光シグナルの分離を行う解析部と、
前記蛍光シグナルまたは前記自家蛍光シグナルに基づいて生成された画像情報を表示する表示部と、を備える、
情報処理システム。
11 試薬識別情報
20 標本
21 標本識別情報
30 蛍光染色標本
100 情報処理装置
100A クライアント端末
100B サーバ装置
110 取得部
111 情報取得部
112 画像取得部
120 保存部
121 情報保存部
122 画像情報保存部
123 解析結果保存部
130 処理部
131 解析部
132 画像生成部
140 表示部
150 制御部
160 操作部
200 データベース
300 ネットワーク
Claims (20)
- 蛍光試薬で染色された標本の画像情報を取得する画像取得部と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報を取得する情報取得部と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から第1蛍光シグナルと第2蛍光シグナルを分離する解析部と、
を備える情報処理装置。 - 前記第1蛍光シグナルは、前記標本の自家蛍光シグナルであり、
前記第2蛍光シグナルは、前記蛍光試薬の蛍光シグナルである、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記標本は、第1自家蛍光成分と第2自家蛍光成分を含み、
前記第1蛍光シグナルは、前記第1自家蛍光成分の自家蛍光シグナルであり、
前記第2蛍光シグナルは、前記第2自家蛍光成分の自家蛍光シグナルである、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記蛍光試薬は、第1蛍光試薬と第2蛍光試薬を含み、
前記第1蛍光シグナルは、前記第1蛍光試薬の蛍光シグナルであり、
前記第2蛍光シグナルは、前記第2蛍光試薬の蛍光シグナルである、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記解析部は、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から更に第3蛍光シグナルを分離し、
前記第3蛍光シグナルは、前記標本の自家蛍光シグナルである、
請求項4に記載の情報処理装置。 - 前記解析部は、前記第1自家蛍光成分の自家蛍光シグナルと前記第2自家蛍光成分の自家蛍光シグナルの構成比に基づいて前記標本の固定化状態を解析する、
請求項3に記載の情報処理装置。 - 前記標本に関する情報は、標本に含まれる自家蛍光成分、および前記自家蛍光成分のスペクトル情報を含む、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記標本に含まれる自家蛍光成分は、NADH(nicotinamide adenine dinucleotide還元型)、FAD(flavin adenine dinucleotide)、およびPorphinのうち少なくとも1つ以上である、
請求項7に記載の情報処理装置。 - 前記標本に関する情報は、更に、使用される組織の種類、対象となる疾病の種類、対象者の属性、対象者の生活習慣に関する情報を含む、
請求項7に記載の情報処理装置。 - 前記蛍光試薬に関する情報は、前記蛍光試薬に含まれる蛍光成分のスペクトル情報を含む、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記情報取得部は、前記標本を識別可能な標本識別情報に基づいて前記標本に関する情報を取得し、前記蛍光試薬を識別可能な試薬識別情報に基づいて前記蛍光試薬に関する情報を取得する、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記試薬識別情報は、前記蛍光試薬の製造ロットを更に識別可能である、
請求項11に記載の情報処理装置。 - 前記第1蛍光シグナルまたは前記第2蛍光シグナルに基づいて生成された画像情報を表示する表示部をさらに備える、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記表示部は、前記第1蛍光シグナルと前記第2蛍光シグナルを区別するよう制御し生成された画像情報を表示する、
請求項13に記載の情報処理装置。 - 前記第1蛍光シグナルは、前記標本の自家蛍光シグナルであり、
前記第2蛍光シグナルは、前記蛍光試薬の蛍光シグナルであり、
前記表示部は、前記標本の自家蛍光シグナルを減算処理して前記蛍光試薬の蛍光シグナルを区別するよう制御し、生成された画像を表示する、
請求項14に記載の情報処理装置。 - 前記解析部は、分離された前記自家蛍光シグナルを用いて、他の標本の画像情報に対して減算処理を行うことで前記他の標本の画像情報から前記蛍光シグナルを抽出する、
請求項2に記載の情報処理装置。 - 前記解析部は、前記画像情報における前記第1蛍光シグナルおよび前記第2蛍光シグナルの分布に基づいて前記画像情報に含まれる物体の領域を認識する、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記解析部は、分離後の前記第1蛍光シグナルおよび前記第2蛍光シグナルと、分離に用いられた前記画像情報、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報とを用いて行われた機械学習の結果に基づいて前記分離を行う、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 前記第1及び第2蛍光シグナルのうち少なくとも1つは、自家蛍光シグナルであり、
前記蛍光試薬に関する情報は、前記蛍光試薬に関する量子収率、蛍光標識率、および吸収断面積もしくはモル吸光係数を含み、
前記解析部は、前記自家蛍光シグナルが除去された前記画像情報、および前記蛍光試薬に関する情報を用いて、前記画像情報における蛍光分子の数、または前記蛍光分子と結合している抗体の数のうちの少なくともいずれか一方を算出する、
請求項1に記載の情報処理装置。 - 蛍光試薬で染色された標本の画像情報を取得する画像取得部と、前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報を取得する情報取得部とを有する情報処理装置と、
前記標本に関する情報および前記蛍光試薬に関する情報に基づいて、前記画像情報から第1蛍光シグナルと第2蛍光シグナルを分離するよう制御する制御機能を情報処理装置に実行させるプログラムと、
を有する顕微鏡システム。
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Cited By (6)
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---|---|---|---|---|
EP3961194A1 (en) * | 2020-08-25 | 2022-03-02 | Korea Advanced Institute of Science and Technology | Method and apparatus for multiplexed imaging of biomolecule through iterative unmixing of fluorophore signals |
WO2023276219A1 (ja) * | 2021-06-29 | 2023-01-05 | ソニーグループ株式会社 | 情報処理装置、生体試料観察システム及び画像生成方法 |
WO2023026742A1 (ja) * | 2021-08-25 | 2023-03-02 | 浜松ホトニクス株式会社 | 色素画像取得方法、色素画像取得装置、及び色素画像取得プログラム |
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WO2023157755A1 (ja) * | 2022-02-16 | 2023-08-24 | ソニーグループ株式会社 | 情報処理装置、生体試料解析システム及び生体試料解析方法 |
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EP2972223B1 (en) * | 2013-03-15 | 2020-05-06 | Ventana Medical Systems, Inc. | Spectral unmixing |
CN103903231B (zh) * | 2014-04-08 | 2016-09-07 | 西安电子科技大学 | 一种多光谱激发荧光成像中去除自体荧光干扰的方法 |
EP3167278B1 (en) * | 2014-07-09 | 2019-06-26 | Caliper Life Sciences, Inc. | Pure spectrum extraction from biological samples |
US9625387B2 (en) * | 2014-09-16 | 2017-04-18 | Lawrence Livermore National Security, Llc | System and method for controlling depth of imaging in tissues using fluorescence microscopy under ultraviolet excitation following staining with fluorescing agents |
CA2963987A1 (en) * | 2014-09-29 | 2016-04-07 | Novadaq Technologies Inc. | Imaging a target fluorophore in a biological material in the presence of autofluorescence |
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Cited By (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3961194A1 (en) * | 2020-08-25 | 2022-03-02 | Korea Advanced Institute of Science and Technology | Method and apparatus for multiplexed imaging of biomolecule through iterative unmixing of fluorophore signals |
DE112022002756T5 (de) | 2021-05-26 | 2024-04-18 | Sony Group Corporation | Informationsverarbeitungsvorrichtung, system zur beobachtung biologischer proben und bilderzeugungsverfahren |
WO2023276219A1 (ja) * | 2021-06-29 | 2023-01-05 | ソニーグループ株式会社 | 情報処理装置、生体試料観察システム及び画像生成方法 |
WO2023026742A1 (ja) * | 2021-08-25 | 2023-03-02 | 浜松ホトニクス株式会社 | 色素画像取得方法、色素画像取得装置、及び色素画像取得プログラム |
WO2023157756A1 (ja) * | 2022-02-16 | 2023-08-24 | ソニーグループ株式会社 | 情報処理装置、生体試料解析システム及び生体試料解析方法 |
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