JP2019535017A5

JP2019535017A5 -

Info

Publication number: JP2019535017A5
Application number: JP2019518463A
Authority: JP
Filing date: 2017-10-05
Publication date: 2020-10-15
Anticipated expiration: 2037-10-05

Claims

エピジェネティックリプログラミングのための標的の同定方法であって、
癌を有する対象由来のＤＮＡを含有する試料中の大型組織化ヘテロクロマチンリジン（Ｋ）−９修飾ドメイン（ＬＯＣＫ）および大型ＤＮＡ低メチル化ブロックを検出することを含む、方法。
前記試料は固形腫瘍由来である、請求項１に記載の方法。
前記対象は、ＰＤＡＣを有する、または、ＰＤＡＣおよび／もしくはその転移を有する危険性がある、請求項１に記載の方法。
前記検出は、Ｈ３Ｋ９Ｍｅ２／３および／またはＨ４Ｋ２０Ｍｅ３の分析を含み、
任意に、前記検出は、Ｈ３Ｋ９Ｍｅ２／３および／またはＨ４Ｋ２０Ｍｅ３に対する抗体についてのＣｈＩＰによるものであり、任意にその後に配列決定が続く、請求項１に記載の方法。
前記検出は、Ｈ３Ｋ２７Ａｃおよび／またはＨ３Ｋ９Ａｃの分析を含み、
任意に、前記検出は、Ｈ３Ｋ２７Ａｃおよび／またはＨ３Ｋ９Ａｃに対する抗体についてのＣｈＩＰによるものであり、任意にその後に配列決定が続く、請求項１に記載の方法。
前記検出は、ウエスタンブロッティングによる、請求項１に記載の方法。
前記検出は、全ゲノム亜硫酸水素塩配列決定によるものである、請求項１に記載の方法。
遺伝子発現分析をさらに含む、請求項２〜６のいずれか１つに記載の方法。
転移についてのドライバー変異が存在しない、請求項１〜８のいずれか１つに記載の方法。
ユークロマチンアイランドおよび／またはユークロマチンＬＯＣＫの分析をさらに含む、請求項１〜９のいずれか１つに記載の方法。
ＤＮＡ試料中のユークロマチンドメイン（ＥＣＤ）の変化を同定する方法であって、
治療計画の前後でのＥＣＤの分析を含み、治療計画に対する応答性の予後または分析を提供する、方法。
ＤＮＡ試料中のＬＯＣＫの変化を同定する方法であって、
治療計画の前後でのＬＯＣＫの分析を含み、治療計画に対する応答性の予後または分析を提供する、方法。
前記分析がコンビナトリアル法によるものである、請求項１１または１２に記載の方法。
原発腫瘍における転移傾向を同定するための、差次的に発現される遺伝子の使用であって、
該遺伝子は、本明細書の表中の遺伝子、酸化ストレス遺伝子、ＥＭＴ遺伝子、免疫学的応答遺伝子、ＤＮＡ修復遺伝子、グルコース代謝遺伝子、ｏｘＰＰＰ遺伝子、およびＰＧＤ遺伝子から選択される、使用。
ｏｘＰＰＰの阻害を含むエピゲノム変化に影響を与える作用物質または化合物を同定するための方法であって、
作用物質または化合物と接触させる前後に、請求項１に記載の対象由来の試料を分析し、エピゲノム変化に対する作用物質または化合物の効果を測定することを含む、方法。