JP2019531553A - Ihc画像解析用の自動化された核の面積/数の推定 - Google Patents

Ihc画像解析用の自動化された核の面積/数の推定 Download PDF

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Abstract

【課題】医用画像化の分野において、接触する場合(例えば、核同士が互いに接続されている場合)には、数の推定がさらに困難になる。自動化された核数の推定を開発するとき、過小推定および過大推定が2つの大きな問題である。【解決手段】自動化された核の面積/数の推定は、2段階の推定フレームワークを利用して、先ず面積を推定し、続いて数を推定する。面積情報を決定した後、各局在的なパッチの形状特徴は、抽出されて、局在的な投票規則を定義することができる。結果として得られる投票スコアは、各局在的な投票ピークの強度を決定する。投票ピークの数は、まさしく核の数である。【選択図】図1

Description

本発明は画像化の分野に関する。より具体的には、本発明は医用画像化に関する。
免疫組織化学(IHC)は、組織切片の細胞中のタンパク質を検出するプロセスを指す。IHC染色は、癌性腫瘍に見られる異常細胞などの異常細胞の診断に広く使用されている。病理検査室での一般的な実務は、IHC染色画像をスコア化することである。腫瘍が陰性または陽性であることを示すことによって、陽性に染色された腫瘍細胞核の割合を報告することができ、これは病理学者が最終的なスコア化する目的のために役立つことができる。
陽性染色された腫瘍細胞核の百分率推定についていくつかの研究が行われてきた。目標は、複数染色成分(ジアミノベンジジンおよびヘマトキシリン)を分離するための色逆畳み込みアルゴリズムと、核面積の区分のための適応的な閾値処理とを使用することによって達成される。定量的な結果は、究極の判断基準として視覚的に定義された細胞数を用いて較正される。
核面積の推定アルゴリズムでは、多くの場合、陽性/陰性を定義するためにカットオフ閾値をユーザーが手動で指定する必要がある。この種のユーザー相互作用は可能であるが、改善することができる。
しかしながら、既存の調査作業は、多くの場合核面積の推定を行うことであり、核面積の推定は、高速であるが核数の推定を与えない。病理学者によると、数情報は、プラスであり、IHC染色画像をスコア化するとき追加の手がかりを与えることができる。
核の形状同士および画像強度同士は、大きく変動する。接触する場合(例えば、核同士が互いに接続されている場合)には、数の推定がさらに困難になる。自動化された核数の推定を開発するとき、過小推定および過大推定が2つの大きな問題である。
自動化された核の面積/数の推定は、2段階の推定フレームワークを利用して、先ず面積を推定し、続いて数を推定する。面積情報を決定した後、各局在的なパッチの形状特徴は、抽出されて、局在的な投票規則を定義することができる。結果として得られる投票スコアは、各局在的な投票ピークの強度を決定する。投票ピークの数は、まさしく核の数である。
1つの態様では、装置の非一時的メモリにプログラムされた方法は、核面積の推定を行う工程と、異常細胞を検出するために核数の推定を行なう工程とを備える。核面積の推定を行う工程は、カラー画像を受け取る工程を備える。核面積の推定を行う工程は、2つの優勢な色成分を分離するために染色分離を利用し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程を備える。核面積の推定を行う工程は、各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理する工程を備える。核面積の推定を行う工程は、モデルのトレーニングについて小さい関心面積が選択される工程を備える。核面積の推定を行う工程は、ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程を備える。核面積の推定を行う工程は、ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程を備える。核面積の推定を行う工程は、平均染色分離値が最高であるクラスを選択する工程を備える。核面積の推定を行う工程は、核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用することを備える。閾値はユーザーが指定した値である。閾値は検索された最適値である。核数の推定を行う工程は、切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票のための規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程を備える。核数の推定を行う工程は、各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心になりやすいように投票する工程を備える。核数の推定を行う工程は、人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程を備える。核数の推定を行う工程は、投票ピークの数に基づいて核数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程を備える。装置は、個人コンピュータ、膝のせ型コンピュータ、コンピュータワークステーション、サーバ、大型コンピュータ、手持ち型コンピュータ、携帯情報端末、携帯電話/移動電話、スマート電気器具、ゲーム機、デジタルカメラ、デジタルカムコーダー、カメラ付き携帯電話、スマートフォン、携帯音楽プレーヤ、タブレットコンピュータ、携帯機器、ビデオプレーヤ、ビデオディスク書込み装置/画像再生装置、高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、超高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、テレビジョン、家庭用娯楽機器システムまたはスマート時計を備える。
別の態様では、装置の非一時的メモリにプログラムされた方法は、核面積の推定を行う工程であって、カラー画像を受け取る工程と、染色分離を利用してカラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程とを含む工程と、異常細胞を検出するために核数の推定を行う工程であって、切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、投票ピークの数に基づいて核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程とを含む工程と、を備える。変更できない閾値は、ユーザーが指定した値である。変更できない閾値は、検索された最適値である。装置は、個人コンピュータ、膝のせ型コンピュータ、コンピュータワークステーション、サーバ、大型コンピュータ、手持ち型コンピュータ、携帯情報端末、携帯電話/移動電話、スマート電気器具、ゲーム機、デジタルカメラ、デジタルカムコーダー、カメラ付き携帯電話、スマートフォン、携帯音楽プレーヤ、タブレットコンピュータ、携帯機器、ビデオプレーヤ、ビデオディスク書込み装置/画像再生装置、高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、超高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、テレビジョン、家庭用娯楽機器システムまたはスマート時計を備える。
別の態様では、装置は、アプリケーションを保存するための非一時的メモリであって、アプリケーションは、核面積の推定に適し、推定は、カラー画像を受け取る工程と、染色分離を利用してカラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程とを含み、およびアプリケーションは、異常細胞を検出するために核数の推定を行うのに適し、推定は、切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、投票ピークの数に基づいて核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程とを含む、非一時的メモリと、メモリに接続され、アプリケーションを処理するように構成された処理構成部品とを備える。変更できない閾値は、ユーザーが指定した値である。変更できない閾値は、検索された最適値である。
さらに別の態様では、装置は、アプリケーションを保存するための非一時的メモリであって、アプリケーションは、核面積の推定を行うのに適し、および異常細胞を検出するために核数の推定を行うのに適する非一時的メモリと、メモリに接続され、アプリケーションを処理するように構成された処理構成部品とを備える。核面積の推定を行う工程は、カラー画像を受け取る工程と、染色分離を利用してカラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程とを含む。異常細胞を検出するために核数の推定を行う工程は、切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、投票ピークの数に基づいて核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程とをさらに含む。
いくつかの実施形態による自動化された核の面積および数の推定方法のフローチャートである。 いくつかの実施形態による自動化された核の面積/数の推定方法を実施するように構成された例示的なコンピュータ装置のブロック図である。
自動化された核の面積および数の推定方法ならびにシステムにより、改良された免疫組織化学(IHC)画像解析が可能になる。
自動化された核の面積および数の推定システムは、2段階の推定フレーム構造、すなわち核の面積の推定(例えば、核のピクセル数)と、それに続く核の数の推定とを使用する。核の面積は、二値化された1つまたは複数のパッチから推定され、これらの切片に分けたパッチは、数の推定を容易にできる局在的な形状特徴を与える。
核の標的と人為構造とをより良く区別するために、染色分離の画質を強化し、そのために、モデルのトレーニング/選択を介してユーザーが選択した関心面積(ROI)に基づいて適応的なクラスタリングを行なう。
核の面積を推定するために、染色分離を適用して2つの優勢な色成分を分離し、一方が陽性染色に対応し、他方が陰性染色に対応する。面積の推定は、各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理によって行う。システムは、ユーザーが選択したROIをトレーニングデータとして自動制御可能に利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する。モデルのトレーニングに関しては、ガウス分布混合モデル(GMM)が適用されてユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積については、クラスタリング(モデル選択)が行なわれる。核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像は、ユーザーが指定した値または探索された最適値の何れかによって変更できないように閾値処理される。
核数の推定は、上述した核面積の推定に基づく。より具体的には、切片に分けたパッチを決定した後、各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析(CCA)を適用する。これらの形状特徴は、局在的な中心投票の規則を定義するのに役に立つ。局在的な中心投票は、核番号を決定するための重要なアルゴリズムである。この勾配ベースのアルゴリズムは、投票スコアが高いほど真の核中心になるように、各スコアの中心に投票する。これらの局在的な形状を決定規則は、人為構造によって引き起こされたピークにフィルタをかけるのに役立つ。最後に、投票ピークの数はまさしく核の数である。以下の形状特徴が利用される(ただし、他の形状特徴も使用できる)。
・凸比
・長径長さ/短径長さ
図1は、いくつかの実施形態による自動化された核の面積および数の推定方法のフローチャートを示す。工程100において、IHCカラー画像を取得する。例えば、IHCカラー画像は、データ記憶装置から検索される。工程102において、染色分離を利用して2つの優勢な色成分を分離し、一方が陽性染色に対応し、他方が陰性染色に対応する。染色の分離は任意の様式で行うことができ、たとえば、2つの異なる色を自動的に検出する。面積の推定は、閾値が画像全体にわたって動的に変化するように、各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理によって行なう。工程104において、モデルのトレーニング用の小さなROI(例えば、2%などの画像の指定された割合未満)が選択される。システムは、ユーザーが選択した(またはコンピュータが選択した)ROIをトレーニングデータとして自動制御可能に利用し、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する。モデルのトレーニングに関して、工程106において、ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザー選択データ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリング(モデル選択)を行なう。クラスタリングにより、平均染色分離値に基づいてクラスタまたはクラスが発生する。工程108において、平均染色分離値が最高のクラスが選択される。工程110において、核の面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像が、工程112におけるユーザーが指定した値によって、または工程114における検索された最適値によって変更できないように閾値処理される。例えば、核の面積を推定するために、特定の閾値を用いる。
核数の推定は、上述した核面積の推定に基づいている。より具体的には、切片に分けたパッチを決定した後、各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析(CCA)を適用する。これらの形状特徴は、工程116において、局在的な中心投票のための規則を定義するのに役に立つ。局在的な中心投票は、核の数を決定するための重要なアルゴリズムである。局在的な中心投票は、勾配ベースのアルゴリズムであり、工程118において、各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する。局在的な形状決定規則は、工程120において、人為構造によって引き起こされたピークにフィルタをかけるのに役に立つ。最後に、工程122において、投票ピークの数はまさしく核の数である。
図2は、本発明の実施形態による、自動化された核の面積/数の推定方法を実施するように構成された例示的なコンピュータ装置のブロック図を示す。コンピュータ装置200は、画像およびビデオなどの情報を取得、保存、計算、処理、通信および/または表示するために使用できる。一般的に、コンピュータ装置200を実装するのに適したハードウェア構造は、ネットワークインターフェース202、メモリ204、プロセッサ206、入力/出力装置(複数可)208、バス210および記憶装置212を含む。プロセッサの選択は、速度が十分な適切なプロセッサが選択される限り、重要ではない。メモリ204は、当技術分野で公知の従来のあらゆるコンピュータメモリにすることができる。記憶装置212は、ハードドライブ、CDROM、CDRW、DVD、DVDRW、高精細ディスク/ドライブ、超HDドライブ、フラッシュメモリカード、または他の任意の記憶装置を含むことができる。コンピュータ装置200は、1つまたは複数のネットワークインターフェース202を含むことができる。ネットワークインターフェースの例は、イーサネットまたは他の種類のLANに接続されたネットワークカードを含む。入力/出力装置(複数可)208は、以下のキーボード、マウス、モニタ、スクリーン、プリンタ、モデム、タッチスクリーン、ボタンインタフェースおよび他の装置の1つまたは複数を含むことができる。自動化された核の面積/数の推定方法を行うために用いる、自動化された核の面積/数の推定アプリケーション(複数可)230は、記憶装置212およびメモリ204に保存されるのに適し、アプリケーションが一般的に処理されるにつれて処理されるのに適する。コンピュータ装置200には、図2に示す構成部品よりも多いまたはより少ない構成部品を含めることができる。いくつかの実施形態では、自動化された核の面積/数の推定ハードウェア220が含まれている。図2のコンピュータ装置200は、自動化された核の面積/数の推定方法用のアプリケーション230およびハードウェア220を含むが、自動化された核の面積/数の推定方法は、コンピュータ装置に、ハードウェア、ファームウェア、ソフトウェアまたは任意の組合せで実装することができる。例えば、いくつかの実施形態では、自動化された核の面積/数の推定アプリケーション230は、メモリ内にプログラムされ、プロセッサを用いて実行される。別の例では、いくつかの実施形態では、自動化された核の面積/数の推定ハードウェア220は、自動化された核の面積/数の推定方法を実装するように具体的に設計されたゲートを含む、プログラムされたハードウェア論理である。
いくつかの実施形態では、自動化された核の面積/数の推定アプリケーション(複数可)230は、数個のアプリケーションおよび/または数個のモジュールを含む。いくつかの実施形態では、モジュールは、1つまたは複数のサブモジュールも含む。いくつかの実施形態では、モジュールをより少なくしまたはより多くすることができる。
適切なコンピュータ装置の例は、個人コンピュータ、膝のせ型コンピュータ、コンピュータワークステーション、サーバ、大型コンピュータ、手持ち型コンピュータ、携帯情報端末、携帯電話/移動電話、スマート電気器具、ゲーム機、デジタルカメラ、デジタルカムコーダー、カメラ付き携帯電話、スマートフォン、携帯音楽プレーヤ、タブレットコンピュータ、携帯機器、ビデオプレーヤ、ビデオディスク書込み装置/画像再生装置(例えば、DVD書込み装置/画像再生装置、高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、超高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置)、テレビジョン、家庭用娯楽機器システム、拡張現実感デバイス、仮想現実感デバイス、スマート宝石類(例えば、スマート時計)、または他の任意の適切なコンピュータ装置を含むことができる。
自動化された核の面積/数の推定を利用するために、自動化された核の面積/数の推定を用いてIHCカラー画像が解析される。病理学者は、自動化された核の面積/数の推定の結果に基づいて、腫瘍が癌性であるか否かをさらに決定することができる。
動作時、自動化された核の面積/数の推定は、その2段階の推定フレームワークに基づいて、すなわち先ず面積推定に、続いて数の推定に基づいて利点を与える。面積情報を決定した後、各局在的なパッチの形状特徴は、抽出されて局在的な投票規則を定義することができる。結果として得られる投票スコアは、各局在的な投票ピークの強度を決定する。投票ピークの数はまさしく核の数である。
IHC画像解析用の自動化された核の面積/数の推定のいくつかの実施形態
1.装置の非一時的メモリにプログラムされた方法であって、
a.核面積の推定を行う工程と、
b.異常細胞を検出するために核数の推定を行なう工程と、を備えることを特徴とする方法。

2.核面積の推定を行う工程は、カラー画像を受け取る工程を備える、節1に記載の方法。

3.核面積の推定を行う工程は、2つの優勢な色成分を分離するために染色分離を利用し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程を備える、節2に記載の方法。

4.核面積の推定を行う工程は、各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理する工程を備える、節3に記載の方法。

5.核面積の推定を行う工程は、モデルのトレーニングについて小さい関心面積が選択される工程を備える、節4に記載の方法。

6.核面積の推定を行う工程は、ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程を備える、節5に記載の方法。

7.核面積の推定を行う工程は、ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程を備える、節6に記載の方法。

8.核面積の推定を行う工程は、平均染色分離値が最高であるクラスを選択する工程を備える、節7に記載の方法。

9.核面積の推定を行う工程は、核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用することを備える、節8に記載の方法。

10.閾値はユーザーが指定した値である、節9に記載の方法。

11.閾値は検索された最適値である、節9に記載の方法。

12.核数の推定を行う工程は、切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票のための規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程を備える、節1記載の方法。

13.核数の推定を行う工程は、各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心になりやすいように投票する工程を備える、節12に記載の方法。

14.核数の推定を行う工程は、人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程を備える、節13に記載の方法。

15.核数の推定を行う工程は、投票ピークの数に基づいて核数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程を備える、節14に記載の方法。

16.装置は、個人コンピュータ、膝のせ型コンピュータ、コンピュータワークステーション、サーバ、大型コンピュータ、手持ち型コンピュータ、携帯情報端末、携帯電話/移動電話、スマート電気器具、ゲーム機、デジタルカメラ、デジタルカムコーダー、カメラ付き携帯電話、スマートフォン、携帯音楽プレーヤ、タブレットコンピュータ、携帯機器、ビデオプレーヤ、ビデオディスク書込み装置/画像再生装置、高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、超高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、テレビジョン、家庭用娯楽機器システムまたはスマート時計を備える、節1に記載の方法。

17.装置の非一時的メモリにプログラムされた方法であって、
a.核面積の推定を行う工程であって、
i.カラー画像を受け取る工程と、
ii.染色分離を利用してカラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、
iii.各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、
iv.モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、
v.ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、
vi.ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、
vii.平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、
viii.核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程と、を含む工程と、
b.異常細胞を検出するために核数の推定を行う工程であって、
i.切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、
ii.各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、
iii.人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、
iv.投票ピークの数に基づいて核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程とを含む工程と、を備えることを特徴とする方法。

18.変更できない閾値は、ユーザーが指定した値である、節17に記載の方法。

19 変更できない閾値は、検索された最適値である、節17に記載の方法。

20.装置は、個人コンピュータ、膝のせ型コンピュータ、コンピュータワークステーション、サーバ、大型コンピュータ、手持ち型コンピュータ、携帯情報端末、携帯電話/移動電話、スマート電気器具、ゲーム機、デジタルカメラ、デジタルカムコーダー、カメラ付き携帯電話、スマートフォン、携帯音楽プレーヤ、タブレットコンピュータ、携帯機器、ビデオプレーヤ、ビデオディスク書込み装置/画像再生装置、高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、超高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、テレビジョン、家庭用娯楽機器システムまたはスマート時計を備える、節17に記載の方法。

21.装置であって、
a.アプリケーションを保存するための非一時的メモリであって、アプリケーションは、
i.核面積の推定に適し、推定は、
(1)カラー画像を受け取る工程と、
(2)染色分離を利用してカラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、
(3)各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、
(4)モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、
(5)ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、
(6)ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、
(7)平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、
(8)核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程と、を含み、およびアプリケーションは
ii.異常細胞を検出するために核数の推定を行うのに適し、推定は、
(1)切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、
(2)各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、
(3)人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、
(4)投票ピークの数に基づいて核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程と、を含む非一時的メモリと、
b.メモリに接続され、アプリケーションを処理するように構成された処理構成部品と、を備えることを特徴とする装置。

22.変更できない閾値は、ユーザーが指定した値である、節21に記載の装置。

23 変更できない閾値は、検索された最適値である、節21に記載の装置。

24.装置であって、
a.アプリケーションを保存するための非一時的メモリであって、アプリケーションは、
i.核面積の推定を行うのに適し、および
ii.異常細胞を検出するために核数の推定を行うのに適する非一時的メモリと、
b.メモリに接続され、アプリケーションを処理するように構成された処理構成部品と、を備えることを特徴とする装置。

25.核面積の推定を行う工程は、
(1)カラー画像を受け取る工程と、
(2)染色分離を利用してカラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、
(3)各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、
(4)モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、
(5)ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、
(6)ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、
(7)平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、
(8)核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程と、を含む、節24に記載の装置。

26.異常細胞を検出するために核数の推定を行う工程は、
(1)切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、
(2)各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、
(3)人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、
(4)投票ピークの数に基づいて核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程と、をさらに含む、節24に記載の装置。
本発明は、本発明の構成および動作の原理の理解を容易にするために詳細を組み込む、特定の実施形態の点から記載されている。本明細書において、そのような特定の実施形態およびその詳細を参照することは、本明細書に添付された特許請求の範囲をそれらに限定することを意図しない。当業者には、例示のために選ばれた実施形態において、特許請求の範囲によって定まる本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく、他の様々な修正をなし得ることは容易に明白である。

Claims (26)

  1. 装置の非一時的メモリにプログラムされた方法であって、
    a.核面積の推定を行う工程と、
    b.異常細胞を検出するために核数の推定を行なう工程と、を備えることを特徴とする方法。
  2. 核面積の推定を行う工程は、カラー画像を受け取る工程を備える、請求項1に記載の方法。
  3. 核面積の推定を行う工程は、2つの優勢な色成分を分離するために染色分離を利用し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程を備える、請求項2に記載の方法。
  4. 核面積の推定を行う工程は、各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理する工程を備える、請求項3に記載の方法。
  5. 核面積の推定を行う工程は、モデルのトレーニングについて小さい関心面積が選択される工程を備える、請求項4に記載の方法。
  6. 核面積の推定を行う工程は、ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程を備える、請求項5に記載の方法。
  7. 核面積の推定を行う工程は、ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程を備える、請求項6に記載の方法。
  8. 核面積の推定を行う工程は、平均染色分離値が最高であるクラスを選択する工程を備える、請求項7に記載の方法。
  9. 核面積の推定を行う工程は、核面積を決定するために、適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用することを備える、請求項8に記載の方法。
  10. 前記閾値はユーザーが指定した値である、請求項9に記載の方法。
  11. 前記閾値は検索された最適値である、請求項9に記載の方法。
  12. 核数の推定を行う工程は、切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票のための規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程を備える、請求項1記載の方法。
  13. 前記核数の推定を行う工程は、各核面積の中心に、前記投票スコアが高いほど真の核中心になりやすいように投票する工程を備える、請求項12に記載の方法。
  14. 核数の推定を行う工程は、人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程を備える、請求項13に記載の方法。
  15. 核数の推定を行う工程は、投票ピークの数に基づいて核数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程を備える、請求項14に記載の方法。
  16. 前記装置は、個人コンピュータ、膝のせ型コンピュータ、コンピュータワークステーション、サーバ、大型コンピュータ、手持ち型コンピュータ、携帯情報端末、携帯電話/移動電話、スマート電気器具、ゲーム機、デジタルカメラ、デジタルカムコーダー、カメラ付き携帯電話、スマートフォン、携帯音楽プレーヤ、タブレットコンピュータ、携帯機器、ビデオプレーヤ、ビデオディスク書込み装置/画像再生装置、高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、超高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、テレビジョン、家庭用娯楽機器システムまたはスマート時計を備える、請求項1に記載の方法。
  17. 装置の非一時的メモリにプログラムされた方法であって、
    a.核面積の推定を行う工程であって、
    i.カラー画像を受け取る工程と、
    ii.染色分離を利用して前記カラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、
    iii.各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、
    iv.モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、
    v.ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、
    vi.ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、
    vii.平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、
    viii.核面積を決定するために、前記適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程と、を含む工程と、
    b.異常細胞を検出するために核数の推定を行う工程であって、
    i.切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、
    ii.各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、
    iii.人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、
    iv.前記投票ピークの数に基づいて前記核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程とを含む工程と、を備えることを特徴とする方法。
  18. 前記変更できない閾値は、ユーザーが指定した値である、請求項17に記載の方法。
  19. 前記変更できない閾値は、検索された最適値である、請求項17に記載の方法。
  20. 前記装置は、個人コンピュータ、膝のせ型コンピュータ、コンピュータワークステーション、サーバ、大型コンピュータ、手持ち型コンピュータ、携帯情報端末、携帯電話/移動電話、スマート電気器具、ゲーム機、デジタルカメラ、デジタルカムコーダー、カメラ付き携帯電話、スマートフォン、携帯音楽プレーヤ、タブレットコンピュータ、携帯機器、ビデオプレーヤ、ビデオディスク書込み装置/画像再生装置、高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、超高精細度ディスク書込み装置/画像再生装置、テレビジョン、家庭用娯楽機器システムまたはスマート時計を備える、請求項17に記載の方法。
  21. 装置であって、
    a.アプリケーションを保存するための非一時的メモリであって、前記アプリケーションは、
    i.核面積の推定に適し、推定は、
    (1)カラー画像を受け取る工程と、
    (2)染色分離を利用して前記カラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、
    (3)各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、
    (4)モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、
    (5)ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、
    (6)ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、
    (7)平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、
    (8)核面積を決定するために、前記適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程と、を含み、および前記アプリケーションは
    ii.異常細胞を検出するために核数の推定を行うのに適し、推定は、
    (1)切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、
    (2)各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、
    (3)人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、
    (4)前記投票ピークの数に基づいて前記核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程と、を含む非一時的メモリと、
    b.前記メモリに接続され、前記アプリケーションを処理するように構成された処理構成部品と、を備えることを特徴とする装置。
  22. 前記変更できない閾値は、ユーザーが指定した値である、請求項21に記載の装置。
  23. 前記変更できない閾値は、検索された最適値である、請求項21に記載の装置。
  24. 装置であって、
    a.アプリケーションを保存するための非一時的メモリであって、前記アプリケーションは、
    i.核面積の推定を行うのに適し、および
    ii.異常細胞を検出するために核数の推定を行うのに適する非一時的メモリと、
    b.前記メモリに接続され、前記アプリケーションを処理するように構成された処理構成部品と、を備えることを特徴とする装置。
  25. 核面積の推定を行う工程は、
    (1)カラー画像を受け取る工程と、
    (2)染色分離を利用して前記カラー画像の2つの優勢な色成分を分離し、第1の色が陽性染色に対応し、第2の色が陰性染色に対応する工程と、
    (3)各色チャネルに基づいて適応的な閾値処理を行う工程と、
    (4)モデルのトレーニング用の小さな関心面積を選択する工程と、
    (5)ユーザーが選択した関心面積をトレーニングデータとして利用して、モデルのトレーニングおよび選択を介して染色分離の画質を強化する工程と、
    (6)ガウス混合モデル(GMM)を適用してユーザーが選択したデータ分布をパラメータ化し、残りの面積についてクラスタリングを行う工程と、
    (7)平均染色分離値が最高のクラスを選択する工程と、
    (8)核面積を決定するために、前記適応的に強化された染色分離画像に変更できない閾値を適用する工程と、を含む、請求項24に記載の装置
  26. 異常細胞を検出するために核数の推定を行う工程は、
    (1)切片に分けたパッチを受け取った後、局在的な中心投票の規則を定義する各局在的なパッチの形状を解析するために、連結成分解析を適用する工程と、
    (2)各核面積の中心に、投票スコアが高いほど真の核中心となりやすいように投票する工程と、
    (3)人為構造によって引き起こされたピークを局在的な形状決定規則を用いてフィルタにかける工程と、
    (4)前記投票ピークの数に基づいて前記核の数を決定し、投票ピークの数は核の数と同じである工程と、をさらに含む、請求項24に記載の装置。
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Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10360434B2 (en) * 2016-07-25 2019-07-23 Case Western Reserve University Multi-pass adaptive voting for nuclei detection in histopathological images
JPWO2018131091A1 (ja) * 2017-01-11 2019-12-19 オリンパス株式会社 画像処理装置、画像処理方法、及び画像処理プログラム
US10783627B2 (en) 2017-03-03 2020-09-22 Case Western Reserve University Predicting cancer recurrence using local co-occurrence of cell morphology (LoCoM)
WO2020166469A1 (ja) * 2019-02-15 2020-08-20 コニカミノルタ株式会社 情報提供方法、情報提供装置及びプログラム
CN109940614B (zh) * 2019-03-11 2021-01-22 东北大学 一种融合记忆机制的机械臂多场景快速运动规划方法
CN110263811B (zh) * 2019-05-21 2021-03-26 上海应势信息科技有限公司 一种基于数据融合的设备运行状态监测方法及系统
CN110736688B (zh) * 2019-10-25 2022-04-01 陕西科技大学 一种原油乳状液粒径检测方法、装置及可读存储介质
US11961218B2 (en) * 2021-07-29 2024-04-16 Zebra Technologies Corporation Machine vision systems and methods for automatically generating one or more machine vision jobs based on region of interests (ROIs) of digital images
CN117522863B (zh) * 2023-12-29 2024-03-29 临沂天耀箱包有限公司 基于图像特征的集成箱体质量检测方法

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2008546990A (ja) * 2005-06-15 2008-12-25 ティシュー グノースティクス ゲーエムベーハー 白血球を分割する方法
WO2010041423A1 (ja) * 2008-10-09 2010-04-15 日本電気株式会社 病理組織診断支援システム、病理組織診断支援プログラム、病理組織診断支援方法
US20140257857A1 (en) * 2011-07-27 2014-09-11 Omnyx, LLC Systems and Methods in Digital Pathology
JP2015522243A (ja) * 2012-03-17 2015-08-06 ソニー株式会社 デジタル病理画像における蛍光ドット計数法
JP2016128821A (ja) * 2016-01-20 2016-07-14 シスメックス株式会社 細胞分析方法および細胞分析装置

Family Cites Families (23)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7218764B2 (en) * 2000-12-04 2007-05-15 Cytokinetics, Inc. Ploidy classification method
US20020186875A1 (en) * 2001-04-09 2002-12-12 Burmer Glenna C. Computer methods for image pattern recognition in organic material
WO2002097714A1 (en) 2001-04-09 2002-12-05 Lifespan Biosciences, Inc. Computer method for image pattern recognition in organic material
US20050136549A1 (en) * 2003-10-30 2005-06-23 Bioimagene, Inc. Method and system for automatically determining diagnostic saliency of digital images
US20050136509A1 (en) 2003-09-10 2005-06-23 Bioimagene, Inc. Method and system for quantitatively analyzing biological samples
EP2227774B1 (en) * 2007-12-04 2014-07-09 University College Dublin, National University of Ireland Dublin Method and system for image analysis
US8116575B1 (en) * 2008-02-26 2012-02-14 Hrl Laboratories, Llc System for anomaly detection using sub-space analysis
JP5292886B2 (ja) * 2008-03-27 2013-09-18 日本電気株式会社 画像解析装置、その方法、プログラムおよび記録媒体
US20130121565A1 (en) * 2009-05-28 2013-05-16 Jue Wang Method and Apparatus for Local Region Selection
EP2779089B1 (en) * 2010-07-30 2018-11-14 Fundação D. Anna Sommer Champalimaud E Dr. Carlos Montez Champalimaud Systems and methods for segmentation and processing of tissue images and feature extraction from same for treating, diagnosing, or predicting medical conditions
US8831327B2 (en) * 2011-08-30 2014-09-09 General Electric Company Systems and methods for tissue classification using attributes of a biomarker enhanced tissue network (BETN)
CN104081412A (zh) * 2012-02-01 2014-10-01 文塔纳医疗系统公司 用于检测组织样本中的基因的系统
EP2847738B1 (en) * 2012-05-11 2017-07-12 Dako Denmark A/S Method and apparatus for image scoring and analysis
US20130315466A1 (en) * 2012-05-25 2013-11-28 Metavi Labs Inc. Automated detection, tracking and analysis of cell migration in a 3-d matrix system
US9014444B2 (en) * 2012-07-13 2015-04-21 Sony Corporation Method and apparatus for automatic HER2 scoring of tissue samples
US9626583B2 (en) * 2013-12-12 2017-04-18 University of Pittsburg—Of the Commonwealth System of Higher Education Automated epithelial nuclei segmentation for computational disease detection algorithms
WO2015145644A1 (ja) * 2014-03-27 2015-10-01 コニカミノルタ株式会社 画像処理装置および画像処理プログラム
JP6629762B2 (ja) * 2014-05-23 2020-01-15 ベンタナ メディカル システムズ, インコーポレイテッド 画像内の生物学的構造及び/又はパターンの検出のためのシステム及び方法
US20180040120A1 (en) * 2014-12-29 2018-02-08 Flagship Biosciences, Inc. Methods for quantitative assessment of mononuclear cells in muscle tissue sections
EP3241180B1 (en) * 2014-12-30 2021-06-30 Ventana Medical Systems, Inc. Systems and methods for co-expression analysis in immunoscore computation
WO2016120442A1 (en) * 2015-01-30 2016-08-04 Ventana Medical Systems, Inc. Foreground segmentation and nucleus ranking for scoring dual ish images
AU2016211885A1 (en) * 2015-01-31 2017-06-29 Ventana Medical Systems, Inc. Systems and methods for area-of-interest detection using slide thumbnail images
JP6605716B2 (ja) * 2015-09-16 2019-11-13 ライカ バイオシステムズ イメージング インコーポレイテッド 病理学的明視野画像における自動染色検出

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2008546990A (ja) * 2005-06-15 2008-12-25 ティシュー グノースティクス ゲーエムベーハー 白血球を分割する方法
WO2010041423A1 (ja) * 2008-10-09 2010-04-15 日本電気株式会社 病理組織診断支援システム、病理組織診断支援プログラム、病理組織診断支援方法
US20140257857A1 (en) * 2011-07-27 2014-09-11 Omnyx, LLC Systems and Methods in Digital Pathology
JP2015522243A (ja) * 2012-03-17 2015-08-06 ソニー株式会社 デジタル病理画像における蛍光ドット計数法
JP2016128821A (ja) * 2016-01-20 2016-07-14 シスメックス株式会社 細胞分析方法および細胞分析装置

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
吉見 崇 ほか: "肝病理組織標本2次元画像からの3次元的各密度推定", 電子情報通信学会2005年総合大会講演論文集 情報・通信システム2, vol. D−16−6, JPN6020014108, 7 March 2005 (2005-03-07), JP, pages 308, ISSN: 0004254754 *

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