JP2019524871A - α(V)β(6)インテグリン結合ペプチドおよびその使用方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2016年6月13日出願の米国仮出願第62/349,615号の優先権を主張し、その開示全体があらゆる目的で参照により本明細書に組み入れられる。
本発明は、米国エネルギー省が授与した助成番号DE-SC0002061および国立衛生研究所が授与した助成番号NIH 1RC4EB01 2836-01に基づく政府支援によりなされた。政府は本発明において一定の権利を有する。
インテグリンは、細胞-細胞接着および細胞-細胞外マトリックス(ECM)接着の媒介を担う細胞表面受容体の大きなファミリーである。少なくとも24種の異なるインテグリンが存在し、それぞれαおよびβサブユニットで構成されるヘテロ二量体であり、その発現は、組織型、発生段階、ならびに炎症および癌などの様々な組織病態を含むいくつかの要因により決定される。インテグリンは固有の酵素活性を有さないが、リガンド結合の後に、インテグリンは細胞質構造分子とシグナル伝達分子の複合体を並置することで細胞外の合図を細胞内シグナルに変換し、次にこれらは相互作用して細胞応答を決定する。インテグリンが運動、増殖、浸潤、および生存を含む細胞挙動の大部分の要素に関与していることから、疾患におけるインテグリンの役割が広く報告されている。実際、いくつかのインテグリンは、癌を含む特定の疾患を促進する上で能動的役割を果たすと考えられる。例えば、αvβ3インテグリンは、浸潤促進メタロプロテイナーゼを上方制御することならびに遊走促進シグナルおよび生存シグナルを与えることを含むその複数の能力の結果として、黒色腫および神経膠芽腫の浸潤性表現型を促進することに関与している。αvβ3が血管新生性血管の内皮細胞上でも上方制御されており、癌における新生血管の発生のために同様のシグナルを与えうることから、そのようなデータによって、多くの薬学的および学術的拠点は、その多くがペプチドまたはペプチド模倣体であるαvβ3アンタゴニストを、治療目的で開発するに至った。したがって、インテグリン-リガンド相互作用の構造的基礎を理解することは、改善されたインテグリンアンタゴニストの設計に役立つであろう。
一局面において、本発明は、アミノ酸配列
を含むペプチドと、部分とを含む、結合体を提供する。いくつかの態様において、前記部分は、前記ペプチドに共有結合的に結合されている。他の態様において、前記ペプチドの長さは約8〜約20アミノ酸である。
と、部分とを含む。
を含むように、1つのさらなるリジン残基が前記ペプチドのC末端に結合され、FB基がさらなるリジン残基の側鎖には結合されている。特定の態様において、結合体は、配列
を含むように、前記ペプチドのN末端に結合されたFB基と、C末端リジン残基に結合されたPEG28部分とをさらに含む。
を含み、結合体は、アミノ酸配列
の二量体を含み、PEG12部分は二量体の各メンバーのC末端に結合され、両方のPEG12部分は2つのさらなるリジン残基の最初のリジン残基に結合され、かつFB基は2つのさらなるリジン残基の2番目のリジン残基の側鎖に結合されている。特定の態様において、結合体が、配列
を含むように、FB基は二量体の各ペプチドのN末端に結合されている。いくつかの態様において、結合体は、配列
を含み、結合体は、アミノ酸配列
の四量体を含む。いくつかの態様において、リジン残基に結合されたFB基は18Fで放射標識されている。
I. 序論
本発明は、フルオロベンゾイル1ビーズ1化合物(OBOC)ペプチドライブラリーから、インテグリンαvβ6を標的指向する結合体を同定する目的で混合蛍光細胞を用いる新規の一段階オンビーズスクリーニングアプローチを用いて同定された結合体の発見に、一部基づいている。配列決定のために、アッセイから単離した5種類のビーズが選択され、競合的結合ELISAを用いて、αvβ6、αvβ3、αvβ5、αvβ1、およびαvβ8に対する結合特異性が評価された。引き続いて、高い親和性および高い選択性比でαvβ6インテグリンに結合した結合体が最適化され、ポジトロン放出断層撮影法(PET)による非侵襲画像化に有用な18F-結合体(すなわち、18F放射性核種がフルオロベンゾイル基に結合されている結合体)へと開発した。
別途具体的に指示がない限り、本明細書において使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者が通常理解するものと同一の意味を有する。さらに、本明細書に記載の方法または材料と同様または等価である任意の方法または材料を、本発明の実施において使用することができる。本発明においては以下の用語が定義される。
1) アラニン(A)、グリシン(G);
2) アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E);
3) アスパラギン(N)、グルタミン(Q);
4) アルギニン(R)、リジン(K);
5) イソロイシン(I)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、バリン(V);
6) フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、トリプトファン(W);
7) セリン(S)、スレオニン(T); および
8) システイン(C)、メチオニン(M)
(例えばCreighton, Proteins, 1993を参照)。
本発明は、αvβ6インテグリンなどのインテグリンを標的指向する結合体および組成物を提供する。いくつかの態様において、結合体は、アミノ酸配列VGDLTYLK(SEQ ID NO:1)を含むペプチドと、部分とを含む。部分または複数の部分は、ペプチドに共有結合的または非共有結合的に結合することができる。他の態様において、結合体は1つまたは複数のさらなるアミノ酸残基をさらに含む。好ましい態様において、結合体は1つまたは複数のさらなるリジン残基をさらに含む。1つまたは複数のさらなるアミノ酸残基(例えば、リジン残基)は、ペプチドのどこにでも(例えば、ペプチドのN末端、ペプチドのC末端、および/または1つもしくは複数の部分に)結合することができる。特定の態様において、もう1つのアミノ酸残基(例えば、リジン残基)がC末端および/または1つもしくは複数の部分に結合される。いくつかの態様において、結合体は、アミノ酸配列
と、部分とを含む。
を含む。特定の態様において、SEQ ID NO:2に示す結合体のFB基は放射標識されている。場合によっては、FB基は18Fで放射標識されている。
を有するように、ペプチドのN末端に結合されたFB基と、C末端リジン残基に結合されたPEG28基をさらに含む。N末端FB基および/またはリジン残基に結合されたFB基は(例えば、18Fで)放射標識することができる。
を含んでもよく、結合体は、アミノ酸配列
の二量体を含み、PEG12部分は二量体の各メンバーのC末端に結合され、両方のPEG12部分は2つのさらなるリジン残基の最初のリジン残基に結合され、かつFB基は2つのさらなるリジン残基の2番目のリジン残基の側鎖に結合されている。別の非限定的な例として、SEQ ID NO:4に示す結合体は、配列
を含むように、二量体の各ペプチドのN末端に結合されたFB基をさらに含んでよい。N末端FB基および/またはリジン残基に結合されたFB基の一方または両方を(例えば、18Fで)放射標識することができる。場合によっては、SEQ ID NO:4または5に示す結合体のリジン残基に結合されたFB基は(例えば、18Fで)放射標識される。
ある特定の局面において、本発明は、ペプチドを含む結合体を提供する。いくつかの態様において、ペプチドはインテグリン結合ペプチドである。インテグリンは、細胞外マトリックスリガンド、細胞表面リガンド、および可溶性リガンドに結合する細胞接着受容体のスーパーファミリーである。インテグリンは膜貫通αβヘテロ二量体であり、少なくとも18種類のαサブユニットと8種類のβサブユニットがヒトにおいて公知であり、このため24種類のヘテロ二量体がある。αサブユニットとβサブユニットは別個のドメイン構造を有し、各サブユニットからの細胞外ドメインがヘテロ二量体のリガンド結合部位に寄与する。インテグリンの非限定的な例には、α1β1、α2β1、α3β1、α4β1、α5β1、α6β1、α7β1、α8β1、α9β1、α10β1、α11β1、αvβ1、αvβ3、αvβ5、αvβ6、αvβ8、αIIbβ3、α4β7、αEβ7、α6β4、αLβ2、αMβ2、αXβ2、αDβ2、およびそれらの組み合わせが含まれる。いくつかの態様において、インテグリンは、αvβ3インテグリン、αIIbβ3インテグリン、またはαvβ6インテグリンである。
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む。
本発明の結合体(例えば、SEQ ID NO:1に示すアミノ酸配列を含むペプチドと、部分とを含む)および本発明の組成物(例えば、本発明の結合体または複数の本発明の結合体を含む)は、ヒトおよび獣医学における画像化、治療用途、予後判定用途、ならびに診断用途において特に有用である。例えば、結合体および組成物は、臓器および癌組織を画像化するために使用することができる。適切な腫瘍の非限定的な例には、膵臓の悪性腫瘍(例えば、腺癌、漿液性嚢胞腺腫、腺房細胞癌、膵神経内分泌腫瘍、例えば、インスリノーマなど)、乳房、結腸、直腸、前立腺、頭頚部の悪性腫瘍(例えば、口腔扁平上皮癌)、または他の任意の組織もしくは臓器の悪性腫瘍が含まれる。結合体および組成物はまた、疾患および障害、例えば、癌(例えば、膵臓癌、乳癌、結腸癌、子宮頚癌、肺癌など)、炎症性疾患、自己免疫疾患、慢性線維症、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、肺気腫、放射線誘発性肺線維症、および慢性創傷性皮膚疾患を処置するためにも有用である。特に、結合体は、インテグリン(例えば、αvβ6インテグリン)によって媒介される疾患または障害を画像化、処置、診断、および予後判定するために有用である。場合によっては、前記疾患または障害はインテグリンの発現、過剰発現、または活性化に関連する。
本発明の結合体(例えば、SEQ ID NO:1に示すアミノ酸配列を含むペプチドと、部分とを含む)および本発明の組成物(例えば、本発明の結合体または複数の本発明の結合体を含む)は、腫瘍の画像化、臓器の断層撮影画像化、臓器機能のモニタリング、冠動脈造影法、蛍光内視鏡検査、レーザー誘導手術、光音響法、および音響蛍光法などを含むが、これに限定されない様々な生物医学的用途における組織および臓器のインビボ光学画像化剤(例えば、放射性トレーサーまたは画像化プローブ)として有用である。いくつかの態様において、本発明の結合体および組成物は、特定の結合体が対象のどこに集まっているのかモニタリングすることによって腫瘍および他の異常の存在を検出するために有用である。他の態様において、結合体および組成物は、腹腔鏡検査の際に腫瘍の微小転移を検出するためのレーザー支援誘導手術に有用である。さらに他の態様では、結合体および組成物はアテローム性動脈硬化巣および血餅の診断において有用である。
本発明の結合体(例えば、SEQ ID NO:1に示すアミノ酸配列を含むペプチドと、部分とを含む)および本発明の組成物(例えば、本発明の結合体または複数の本発明の結合体を含む)は、対象(例えば、疾患および障害の予防または処置を必要とする対象)における疾患および障害(例えば、インテグリン媒介性の疾患または障害)の予防または処置に有用である。いくつかの態様において、予防または処置の方法は、治療的有効量の本発明の結合体または組成物を投与する工程であって、結合体が治療剤を含む工程を含む。特定の態様において、結合体または組成物の治療的有効量は、治療剤の送達をインテグリン(例えば、αvβ6インテグリン)発現細胞に標的指向するために十分な量である。本発明の結合体および組成物は、インテグリン(例えば、αvβ6インテグリン)の発現、過剰発現、または活性化に関連する疾患および障害を処置するために特に有用である。本明細書に記載の結合体および組成物による処置に好適な疾患または障害の例としては、アレルギー、不安障害、自己免疫疾患、行動障害、先天性欠損、血液障害、骨疾患、癌、慢性線維症、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、慢性創傷性皮膚疾患、循環器疾患、歯科疾患、うつ病性障害、解離性障害、耳状態、摂食障害、眼状態、食物アレルギー、食中毒、胃腸疾患、遺伝性障害、心疾患、ホルモン障害、免疫不全、感染性疾患、炎症性疾患、昆虫伝染病、栄養障害、腎疾患、白質ジストロフィー、肝疾患、肺気腫、メンタルヘルス障害、代謝疾患、気分障害、筋変性障害、神経障害、神経変性障害、神経筋障害、人格障害、恐怖症、妊娠合併症、プリオン病、前立腺疾患、心理障害、精神障害、呼吸器疾患、性障害、皮膚状態、睡眠障害、言語障害、スポーツ外傷、熱帯病、前庭障害、および消耗性疾患が挙げられるがそれに限定されない。好ましくは、αvβ6媒介性の疾患または障害は癌、炎症性疾患、自己免疫疾患、慢性線維症、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、肺気腫、および慢性創傷性皮膚疾患(例えば表皮水疱症)である。
本発明はまた、本発明の結合体(例えば、SEQ ID NO:1に示すアミノ酸配列を含むペプチドと、部分とを含む)および本発明の組成物(例えば、本発明の結合体または複数の本発明の結合体を含む)の使用を容易にする、および/または標準化するための、ならびに本明細書に記載の方法を容易にするためのキットも提供する。いくつかの態様において、キットは本発明の結合体および/または組成物を含む。これらの様々な方法を行うための材料および試薬は、前記方法の実行を容易にするためにキットの形で提供することができる。本明細書で使用する「キット」という用語は、プロセス、アッセイ、分析、または操作を容易にする物品の組み合わせを含む。特に、本発明の結合体または組成物を含むキットは、例えば、治療(例えば、免疫療法)およびインビボ画像化(例えば、細胞、腫瘍、臓器、組織、生物凝集物(bioaggregate)、バイオフィルムなどのインビボ画像化)を含む広範囲の用途において有用である。
本発明は、具体的な実施例によってさらに詳細に説明される。以下の実施例は例示目的のためだけに提供され、いかなる方法によっても本発明を限定することが意図されない。
概要
本実施例は、フルオロベンゾイルOBOCペプチドライブラリーからインテグリンαvβ6標的ペプチドを含む結合体を同定するための、混合蛍光細胞を用いた新規の一段階オンビーズスクリーニングアプローチ(図1)と、その後の、ポジトロン放出断層撮影法(PET)による非侵襲画像化用の18F-ペプチドへの開発について説明する。オンビーズスクリーニングにおいて使用する蛍光細胞株DX3/ITGB6 mCherryおよびDX3 EmGFPを、ヒトメラノーマDX3puroB6(αvβ6陽性)細胞株およびDX3puro(αvβ6陰性)細胞株から作製した。インテグリンαvβ6は、非常に多くの高悪性度癌において過剰発現している細胞表面受容体である。このフルオロベンゾイルペプチドライブラリーは、インテグリンαvβ6結合XXDLXXLモチーフと、18F-ペプチド開発用のフルオロベンゾイル(FB)部分を特徴とし、1)αvβ6インテグリンを標的指向し、2)機能と標的特異性の喪失を引き起こす可能性がある、同定されたペプチドのスクリーニング後改変を無くすように設計された。このフルオロベンゾイルペプチドライブラリーは、Fmoc-Lys(alloc)-OHのカップリングから始まる標準的なFmoc-化学固相ペプチド合成を用いて1グラムの90μm TentaGel樹脂と一緒に組み立てた。スプリットミックス(split-mix)合成アプローチを利用し、XXDLXXLXモチーフの中にXで示したランダムな位置に19種類の天然アミノ酸を用いてライブラリーを作製した。ライブラリー合成が終わったらalloc保護基を除去し、4-フルオロ安息香酸(FBA)とカップリングして、フルオロベンゾイル
ペプチドライブラリーを作製した。1ビーズ2色(one-bead-two-color)(OBTC)細胞スクリーニングアプローチを用いて、5日で185種類のインテグリンαvβ6標的ペプチドが直接同定された。概念実証として、配列決定のために、このアッセイから単離した5種類のビーズを選択し、競合的結合ELISAを用いて、αvβ6、αvβ3、αvβ5、αvβ1、およびαvβ8に対する結合特異性を評価した。ペプチドは、αvβ6インテグリンにはnM以下の親和性で(IC50値0.3〜6.6nM)、αvβ5、αvβ3、およびαvβ1と比べて10,000:1、αvβ8インテグリンと比べて500:1という最も高い選択性比で結合することが確かめられた。
以下でさらに説明するように、9マー
ペプチドライブラリーを、標準的なFmoc化学を用いてTentaGel樹脂(1g、約3,000,000個のビーズ)上で組み立てた。少量のアリコート(50mg、約150,000個のビーズ)を、赤色蛍光DX3ITGβ6 mCherry(αvβ6陽性)細胞および緑色蛍光DX3 EmGFP(αvβ6陰性)細胞の混合物と3時間インキュベートし、蛍光顕微鏡下で評価した。赤色(すなわち、αvβ6陽性)細胞でしか覆われていないビーズを単離した。その後に、これらのビーズをEdman配列決定によって特徴付けた。同定されたペプチドを合成した後、標的αvβ6インテグリンならびに密接に関連するαv-インテグリンに対する結合特異性を評価するために、精製インテグリンを用いて競合的結合ELISAを行った。
DX3Puro(1)およびDX3Puroβ6(2)は以前に説明されており、Dr.John Marshallからの惜しみない贈り物であった。DX3/EmGFPおよびDX3/ITGβ6 mCherryを作製するために、DX3Puro細胞およびDX3Puroβ6細胞に、EmGFPまたはmCherry(EF1αプロモーターの制御下)およびブラストサイジン耐性遺伝子(ハイブリッドSV40/EM7プロモーターの制御下)を運ぶレンチウイルスを形質導入した。形質導入された細胞を、10%FBSおよびブラストサイジン(10μg/mL)を加えたダルベッコ変法イーグル培地(DMEM)中、空気中5%CO2の存在下で超低密度で37℃で21日間培養した。次いで、DX3/EmGFPおよびDX3/ITGβ6 mCherryのクローン集団を単離し、拡大し、蛍光があるかどうか、DX3/ITGβ6 mCherryの場合はITGβ6発現が保持されているかどうかスクリーニングした。
TentaGel樹脂(1g、90μm)をN,N-ジメチルホルムアミド(DMF、10mL; EMD)に入れて1時間膨張させ、水気を切り、その後に、DMF(10mL)に溶解した、Nα-Fmoc-Nε-alloc-L-リジン(3当量; GLS-China)、2-(7-アザ-1H-ベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート(HATU、2.7当量; GL Biochem)、およびN-N-ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA、6当量; Sigma)の混合物を添加した。カップリング反応を室温で2時間行い、DMFに溶解した20%v/vピペリジン溶液10mLを用いて30分にわたってFmocを脱保護した。いくつかに分けたDMF(3x各10mL)、メタノール(MeOH)、およびDMFを用いて減圧下でビーズを徹底的に洗浄した後に、19のアリコートに等分した。各アリコートに、1種類のNα-Fmoc-アミノ酸(3倍過剰、NovaBiochem)をHATU(2.7等量)およびDIPEA(6等量)と一緒に添加した。カップリング反応が終わったら、全アリコートを組み合わせ、徹底的に混合し、洗浄し、次いで、次のカップリング工程のために複数のアリコートに再分配した。ペプチドライブラリーが完全に組み立てられるまで「スプリットミックス」手順を繰り返した。5mol%Pd(PPh3)4およびフェニルシラン(20等量; Acros)を用いて、リジン上にあるアリルオキシカルボニル(alloc)保護基を除去し、その後に、HATU(2.7倍過剰)およびDIPEA(6倍過剰)で活性化した4-フルオロ安息香酸(FBA、3倍過剰; Sigma)をカップリングした。樹脂をトリフルオロ酢酸(TFA、EMD)、1,2-エタンジチオール(EDT; Fluka)、水、およびトリイソプロピルシラン(TIPS; Aldrich)(94/2.5/2.5/1 vol/vol/vol/vol)の混合物で室温で3時間処理することによって、全ての保護基の側鎖脱保護を行った。MeOH、DMF、水、および70%エタノール(EtOH)溶液を用いて、樹脂を徹底的に洗浄した。TentaGelビーズ上にあるペプチドは、ビーズ1個あたり1014コピー(0.13μgのST1-62)で示された。
1.ビーズ調製物のプレスクリーニング
ライブラリービーズ(凍結乾燥器に入れて一晩乾燥させた)を脱イオン水(10x)を用いて減圧下で洗浄し、水に入れて1時間膨張させ、その後に、PBS(Gibco)で5回洗浄し、PBSに15分間懸濁した。
前記のように、ヒトメラノーマ細胞株DX3からDX3/ITGβ6 mCherry細胞株およびDX3/EmGFP細胞株を調製した。図2Aおよび図2Bに示したように、各細胞株の等しい集団(合計500,000個の細胞)を10%胎仔ウシ血清(FBS)フェノールレッドフリーダルベッコ変法イーグル培地(DMEM; Gibco)に懸濁し、TCで処理していない培養皿(100mm; Spectrum Chemicals and Laboratory Products)に添加し、次いで、インキュベーターに入れて37℃で1時間混合した後に、ライブラリービーズを用いてスクリーニングした。混合したDX3/ITGβ6 mCherry細胞とDX3/EmGFP細胞を含有するペトリ皿にビーズを添加し、穏やかに混合しながら37℃で3時間インキュベートした。インキュベートした後に、ビーズを蛍光顕微鏡下で分析した。DX3/ITGβ6 mCherry細胞(αvβ6特異的)で>80%が覆われているビーズを、マイクロピペットを用いて手作業で選択した。アッセイから単離した陽性ビーズを、エドマン分解を用いて配列決定した(図3および図4)。ペプチド配列を表1に開示した。
C末端アミドが生じるように、標準的なFmoc化学を用いてペプチドをNova Syn TGR樹脂(0.25mmol/g)上で手作業で作製した。樹脂をDMF(5mL)に入れて1時間膨張させ、Fmoc-Nε-1-(4,4-ジメチル-2,6-ジオキソシクロヘキシ-1-リデン)-3-メチルブチル-L-リジン(Fmoc-Lys(ivDde)-OH、3倍過剰)を、2-(7-アザ-1H-ベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート(HATU、2.7倍過剰)およびN-Nジイソプロピルエチルアミン(DIPEA、6倍過剰)と一緒に添加した。20%ピペリジン溶液を用いてFmocを除去し、その後に、DMFおよびMeOHを用いて徹底的に洗浄した後に、次のアミノ酸をカップリングした。ペプチド鎖を伸張させ、最後に、tert-ブチルオキシカルボニル(Boc)で保護されたアミノ酸がN末端にくるようにカップリングサイクルを繰り返した。次に、DMFに溶解した新たに調製された2%ヒドラジン5mLを用いて、ivDde脱保護を30分間(2x15分)行った。最後に、2.7倍過剰のHATUおよび6倍過剰のDIPEAを用いて、4-フルオロ安息香酸(FBA、3等量)をC末端リジンの側鎖とカップリングした。合成が終わったら、TFA/H2O/EDT/TIPS(1mL、94/2.5/2.5/1 vol/vol/vol/vol)の混合物を用いて、N-Boc基を含む全ての側鎖保護基を室温で3時間切断した。上清を収集し、TFA混合物を蒸発させた後に、ジエチルエーテルで抽出するためにmilliQ水に再懸濁した。
Nunc MaxiSorp96ウェルプレート上に抗αv捕捉用抗体P2W7(5μg/mL, Novus Biologicals)をコーティングし、その後にBSAで4℃で一晩ブロックした。全てのウェルをPBSで3回洗浄し、その後に精製インテグリン(3μg/mL)をプレートし、高湿度のチャンバーに入れて室温で1時間インキュベートした。滴定し(αvβ6インテグリンの場合は1μM〜1pM、αvβ3インテグリンの場合は100μM〜100pM)、ビオチン化天然リガンドと混合したペプチド溶液を、インテグリンでコーティングしたウェルに添加し、これを3回繰り返した。室温で1時間インキュベートした後に、プレートを洗浄用緩衝液で3回洗浄した。捕捉されたビオチン化天然リガンドをExtrAvidin-HRPによって検出し、TMB基質によって発色させた。GraphPad Prism 6.0においてS字形用量反応モデルにフィットさせて、ペプチドの最大半量阻害濃度(half-maximal inhibitory concentration)(IC50)を求めた(図5A)。結果を図5Bおよび以下の表2に示した。
細胞結合試験のために、固相上でペプチドST1-62を[18F]フルオロ安息香酸で放射標識した(図6A)。この実験には、DX3puroβ6(αvβ6陽性)細胞株およびDX3puro(αvβ6陰性)細胞株を使用した。放射標識ペプチドを4μCi/mLでPBSに溶解して処方した。DX3puroβ6細胞およびDX3puro細胞を75x106細胞/mLで無血清培地に懸濁し、1種類の細胞株につきエッペンドルフ1個につき50μLのアリコートにした(n=3)。50μLの4μCi/mL放射性トレーサーを各エッペンドルフチューブに添加し、細胞と60分間インキュベートした。上清および細胞ペレットの活性をガンマカウンターで測定し、放射性トレーサーのパーセント結合を(細胞ペレットの放射能)/(細胞ペレットおよび上清の全放射能)で表した。例示的な放射化学アッセイ結果を図6Bに示した。
ペプチド1(ST1-62)(SEQ ID NO:2)の血清安定性試験分析は、最初に、放射標識されたペプチド([18F]; 25μCi)を市販のマウス血清と37℃で1時間インキュベートすることによって行った。このタンパク質を冷EtOHを用いて沈殿させることによって、放射性トレーサーを血清から取り出し、次いで、分析のためにHPLCに注入した。多くのNH2-ペプチドについて予想されたように、このペプチドは、HPLCトレースに示されたように1時間以内にプロテアーゼによって切断された。血清安定性アッセイの結果を図7Aおよび図7Bに示した。
全ペプチドの選択性プロファイルに基づいて、logP、血清安定性、および細胞結合試験のために、[18F]フルオロ安息香酸による放射標識に向けて前進するようにST1-62ペプチドを選択した。LogP=-1.09±0.02(図6B)。ペプチドの血清安定性を、マウス血清と37℃でインキュベートして1時間後に求めた(図7A)。
とDX3puroβ6細胞およびDX3puro細胞との結合をアッセイした。図8Aおよび図8Bに示したように、ペプチドは、10μMおよび100μMのペプチド濃度では、αvβ6陰性細胞よりもαvβ6陽性細胞との結合の方が強いことを示した。
蛍光細胞を用いて、OBOCライブラリーオンビーズスクリーニングアプローチが簡素化された。αvβ6標的ペプチドの一段階スクリーニングおよび予備的な配列決定によって、αvβ6インテグリンに対して強い親和性と高い選択性をもつペプチドが得られた。
開示された本発明の内容に従って提供される例示的な態様は、添付の特許請求の範囲および以下の態様を含むが、これに限定されない。
を含むペプチドと、
(b)部分と
を含む、結合体。
2. 前記部分が前記ペプチドに共有結合的に結合されている、態様1の結合体。
3. 前記ペプチドの長さが約8〜約20アミノ酸である、態様1または2の結合体。
4. 1つまたは複数のさらなるリジン残基をさらに含む、態様1〜3のいずれか一つの結合体。
5. 1つまたは複数のさらなるリジン残基が、前記ペプチドのC末端および/または1つもしくは複数の部分に結合されている、態様4の結合体。
6. アミノ酸配列
と、部分とを含む、態様4または5の結合体。
7. 前記ペプチドがインテグリンに結合する、態様1〜6のいずれか一つの結合体。
8. インテグリンがαvβ6インテグリンである、態様7の結合体。
9. 前記ペプチドが、インテグリン、およびインテグリンと同時発現している受容体に結合する、態様7または8の結合体。
10. インテグリンと同時発現している受容体がCXCR4である、態様9の結合体。
11. 前記部分が、ポリエチレングリコール(PEG)部分、フルオロベンゾイル(FB)基、メチル基、アセチル基、画像化剤、治療剤、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、態様1〜10のいずれか一つの結合体。
12. PEG部分が約3,000ダルトン(Da)未満の分子量を有する、態様11の結合体。
13. PEG部分が、PEG12(PEG 800)、PEG28(PEG 1,500)、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、態様11または12の結合体。
14. PEG部分が、規定の鎖長を有する単分散PEG部分である、態様11〜13のいずれか一つの結合体。
15. 単分散PEG部分が約95%を超えるオリゴマー純度を有する、態様14の結合体。
16. 画像化剤が、FB基、放射性核種、ビオチン、フルオロフォア、蛍光タンパク質、抗体、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、態様11〜15のいずれか一つの結合体。
17. 放射性核種が、11C、13N、15O、18F、61Cu、62Cu、64Cu、67Cu、68Ga、111In、124I、125I、および131Iからなる群より選択される、態様16の結合体。
18. 放射性核種が18Fである、態様16または17の結合体。
19. 前記部分が、前記ペプチド、1つもしくは複数のさらなるリジン残基、および/または別の部分に結合されている、態様4〜18のいずれか一つの結合体。
20. 結合体が配列
を含むように、1つのさらなるリジン残基が前記ペプチドのC末端に結合され、かつFB基がさらなるリジン残基の側鎖に結合されている、態様19の結合体。
21. 結合体が配列
を含むように、前記ペプチドのN末端に結合されたFB基と、C末端リジン残基に結合されたPEG28部分とをさらに含む、態様20の結合体。
22. 配列
を含み、
アミノ酸配列
の二量体を含む、結合体であって、
PEG12部分が二量体の各メンバーのC末端に結合され、両方のPEG12部分が2つのさらなるリジン残基の最初のリジン残基に結合され、かつFB基が2つのさらなるリジン残基の2番目のリジン残基の側鎖に結合されている、態様19の結合体。
23. 結合体が配列
を含むように、FB基が二量体の各ペプチドのN末端に結合されている、態様22の結合体。
24. リジン残基に結合されたFB基が18Fで放射標識されている、態様20〜23のいずれか一つの結合体。
25. 治療剤が、放射性核種、アポトーシス促進ペプチド、ナノ粒子、化学療法剤、ナノドロップレット、リポソーム薬物、サイトカイン、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、態様11〜24のいずれか一つの結合体。
26. 放射性核種が、90Yおよび177Luからなる群より選択される、態様25の結合体。
27. 放射性核種が、キレート剤を介して前記ペプチドまたはPEG部分に結合されている、態様25または26の結合体。
28. アポトーシス促進ペプチドがD(KLAKLAK)2を含む、態様25の結合体。
29. アポトーシス促進ペプチドが、グリシンリンカーを介して前記ペプチドまたはPEG部分に結合されている、態様25または28の結合体。
30. ナノ粒子が、化学療法剤が装填されたPEG5KCA8を含む、態様25の結合体。
31. 化学療法剤がパクリタキセル(PTX)である、態様25または30の結合体。
32. 前記ペプチドまたはPEG部分に共有結合的に結合されたアルブミン結合モチーフをさらに含む、態様1〜31のいずれか一つの結合体。
33. アルブミン結合モチーフが4-(4-ヨードフェニル)酪酸である、態様32の結合体。
34. 態様1〜33のいずれか一つの結合体または複数のその結合体を含む、組成物。
35. 規定の鎖長を有する単分散PEG部分が複数の結合体に存在する、態様34の組成物。
36. 複数の結合体が互いに連結されて多量体結合体を形成している、態様34または35の組成物。
37. 多量体結合体が複数の結合体の二量体または四量体である、態様36の組成物。
38. 薬学的担体または賦形剤をさらに含む、態様34〜37のいずれか一つの組成物。
39. 態様1〜33のいずれか一つの結合体または態様34〜38のいずれか一つの組成物を含む、画像化または治療のためのキット。
40. 使用のための説明書をさらに含む、態様39のキット。
41. 1種類または複数種の試薬をさらに含む、態様39または40のキット。
42. 以下の工程を含む、対象において標的組織を画像化するための方法:
(a)態様1〜33のいずれか一つの結合体または態様34〜38のいずれか一つの組成物を対象に投与する工程であって、結合体が画像化剤を含む、工程、および
(b)結合体が対象のどこに集まっているのか決定するために、結合体を検出する工程。
43. 画像化剤が、前記ペプチド、FB基、またはPEG部分に共有結合的に結合されている、態様42の方法。
44. 標的組織が、癌組織または臓器である、態様42または43の方法。
45. 癌組織が、膵臓癌、乳癌、結腸直腸癌、前立腺癌、または口腔扁平上皮癌に関連する、態様44の方法。
46. 画像化剤が放射性核種である、態様42〜45のいずれか一つの方法。
47. 放射性核種がFB基に共有結合的に結合されている、態様46の方法。
48. 結合体が対象のどこに集まっているのか決定するために、放射性核種からの放射線が用いられる、態様46または47の方法。
49. 結合体が、磁気共鳴画像法(MRI)、磁気共鳴分光法(MRS)、単一光子放射型コンピュータ断層撮影法(SPECT)、ポジトロン放出断層撮影法(PET)、または光学画像化によって検出される、態様42〜48のいずれか一つの方法。
50. 結合体が、インテグリンによって媒介される疾患または障害を診断または予後判定するために検出される、態様42〜49のいずれか一つの方法。
51. 疾患または障害が、インテグリンの発現、過剰発現、または活性化に関連する、態様50の方法。
52. 疾患または障害が、αvβ6インテグリン媒介性の疾患または障害である、態様50または51の方法。
53. 治療的有効量の態様1〜33のいずれか一つの結合体または態様34〜38のいずれか一つの組成物を対象に投与する工程であって、結合体が治療剤を含む、工程
を含む、対象においてインテグリン媒介性の疾患または障害を予防または処置するための方法。
54. 治療剤が、前記ペプチドまたはPEG部分に共有結合的に結合されている、態様53の方法。
55. 疾患または障害が、インテグリンの発現、過剰発現、または活性化に関連する、態様53または54の方法。
56. 疾患または障害が、癌、炎症性疾患、自己免疫疾患、慢性線維症、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、肺気腫、放射線誘発性肺線維症、および慢性創傷性皮膚疾患からなる群より選択される、態様53〜55のいずれか一つの方法。
57. 疾患または障害が、αvβ6インテグリン媒介性の疾患または障害である、態様53〜56のいずれか一つの方法。
58. αvβ6インテグリン媒介性の疾患または障害が、膵臓癌、乳癌、結腸直腸癌、前立腺癌、または口腔扁平上皮癌である、態様57の方法。
59. 結合体または組成物の治療的有効量が、治療剤の送達をインテグリン発現細胞に標的指向するために十分な量である、態様53〜58のいずれか一つの方法。
Claims (46)
- 前記部分が前記ペプチドに共有結合的に結合されている、請求項1記載の結合体。
- 前記ペプチドの長さが約8〜約20アミノ酸である、請求項1記載の結合体。
- 1つまたは複数のさらなるリジン残基をさらに含む、請求項1記載の結合体。
- 1つまたは複数のさらなるリジン残基が、前記ペプチドのC末端および/または1つもしくは複数の部分に結合されている、請求項4記載の結合体。
- 前記ペプチドがインテグリンに結合する、請求項1記載の結合体。
- インテグリンがαvβ6インテグリンである、請求項7記載の結合体。
- 前記部分が、ポリエチレングリコール(PEG)部分、フルオロベンゾイル(FB)基、メチル基、アセチル基、画像化剤、治療剤、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項1記載の結合体。
- PEG部分が約3,000ダルトン(Da)未満の分子量を有する、請求項9記載の結合体。
- PEG部分が、PEG12(PEG 800)、PEG28(PEG 1,500)、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項9記載の結合体。
- PEG部分が、規定の鎖長を有する単分散PEG部分である、請求項9記載の結合体。
- 単分散PEG部分が約95%を超えるオリゴマー純度を有する、請求項12記載の結合体。
- 画像化剤が、FB基、放射性核種、ビオチン、フルオロフォア、蛍光タンパク質、抗体、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項9記載の結合体。
- 放射性核種が、11C、13N、15O、18F、61Cu、62Cu、64Cu、67Cu、68Ga、111In、124I、125I、および131Iからなる群より選択される、請求項14記載の結合体。
- 放射性核種が18Fである、請求項14記載の結合体。
- 前記部分が、前記ペプチド、1つもしくは複数のさらなるリジン残基、および/または別の部分に結合されている、請求項4記載の結合体。
- リジン残基に結合されたFB基が18Fで放射標識されている、請求項18または20記載の結合体。
- 治療剤が、放射性核種、アポトーシス促進ペプチド、ナノ粒子、化学療法剤、ナノドロップレット、リポソーム薬物、サイトカイン、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項9記載の結合体。
- 請求項1記載の結合体または複数の請求項1記載の結合体を含む、組成物。
- 規定の鎖長を有する単分散PEG部分が複数の結合体に存在する、請求項24記載の組成物。
- 薬学的担体または賦形剤をさらに含む、請求項24記載の組成物。
- 請求項1記載の結合体または請求項24記載の組成物を含む、画像化または治療のためのキット。
- 使用のための説明書をさらに含む、請求項27記載のキット。
- 1種類または複数種の試薬をさらに含む、請求項27記載のキット。
- 以下の工程を含む、対象において標的組織を画像化するための方法:
(a)請求項1記載の結合体または請求項24記載の組成物を対象に投与する工程であって、結合体が画像化剤を含む、工程、および
(b)結合体が対象のどこに集まっているのか決定するために、結合体を検出する工程。 - 画像化剤が、前記ペプチド、FB基、またはPEG部分に共有結合的に結合されている、請求項30記載の方法。
- 標的組織が、癌組織または臓器である、請求項30記載の方法。
- 癌組織が、膵臓癌、乳癌、結腸直腸癌、前立腺癌、または口腔扁平上皮癌に関連する、請求項32記載の方法。
- 画像化剤が放射性核種である、請求項30記載の方法。
- 放射性核種がFB基に共有結合的に結合されている、請求項34記載の方法。
- 結合体が対象のどこに集まっているのか決定するために、放射性核種からの放射線が用いられる、請求項34記載の方法。
- 結合体が、インテグリンによって媒介される疾患または障害を診断または予後判定するために検出される、請求項30記載の方法。
- 疾患または障害が、インテグリンの発現、過剰発現、または活性化に関連する、請求項37記載の方法。
- 疾患または障害が、αvβ6インテグリン媒介性の疾患または障害である、請求項37記載の方法。
- 治療的有効量の請求項1記載の結合体または請求項24記載の組成物を対象に投与する工程であって、結合体が治療剤を含む、工程
を含む、対象においてインテグリン媒介性の疾患または障害を予防または処置するための方法。 - 治療剤が、前記ペプチドまたはPEG部分に共有結合的に結合されている、請求項40記載の方法。
- 疾患または障害が、インテグリンの発現、過剰発現、または活性化に関連する、請求項40記載の方法。
- 疾患または障害が、癌、炎症性疾患、自己免疫疾患、慢性線維症、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、肺気腫、放射線誘発性肺線維症、および慢性創傷性皮膚疾患からなる群より選択される、請求項40記載の方法。
- 疾患または障害が、αvβ6インテグリン媒介性の疾患または障害である、請求項40記載の方法。
- αvβ6インテグリン媒介性の疾患または障害が、膵臓癌、乳癌、結腸直腸癌、前立腺癌、または口腔扁平上皮癌である、請求項44記載の方法。
- 結合体または組成物の治療的有効量が、治療剤の送達をインテグリン発現細胞に標的指向するために十分な量である、請求項40記載の方法。
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