JP2019523940A5

JP2019523940A5 -

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Publication number: JP2019523940A5
Application number: JP2018563706A
Authority: JP
Filing date: 2017-06-09
Publication date: 2020-07-02

Claims

増強されたポリヌクレオチド合成を提供するための方法であって：前記方法は
ａ）１つ以上の設計命令を受信する工程であって、ここで、設計命令は複数の生物学的配列を含み、生物学的配列の各々はせいぜい５００の塩基の長さであり、および複数の生物学的配列は核酸またはアミノ酸配列を含む、工程；
ｂ）複数の生物学的配列の少なくとも２つの生物学的配列がまとめて、データベースにおける有害な生物学的配列の少なくとも２０％に相当するか否かを自動的に決定する工程；および、
ｃ）有害な生物学的配列の少なくとも２０％が検出された場合に、自動的に警報を発生させる工程、を含む、方法。
警報が発生されない場合、複数の配列が合成されることを特徴とする、請求項１に記載の方法。
有害な生物学的配列を取り除くために、有害な生物学的配列の少なくとも２０％に相当する複数の生物学的配列の少なくとも２つの生物学的配列を変更するための命令を受信する工程をさらに含む、請求項１に記載の方法。
増強されたポリヌクレオチド合成を提供するための方法であって：前記方法は
ａ）１つ以上の設計命令を受信する工程であって、ここで、設計命令は複数の生物学的配列を含み、複数の生物学的配列は、ベクター配列、および複数の追加の挿入配列を含む、工程；
ｂ）ベクター、および複数の挿入配列の少なくとも１つがまとめて、データベースにおける有害な生物学的配列の少なくとも２０％に相当するか否かを自動的に決定する工程；および、
ｃ）有害な生物学的配列の少なくとも２０％が検出された場合に、自動的に警報を発生させる工程、を含む、方法。
生物学的配列は、物理的な核酸またはタンパク質サンプルの配列決定から得られることを特徴とする、請求項４に記載の方法。
有害な生物学的配列を取り除くために、有害な生物学的配列の少なくとも２０％に相当するベクターおよび複数の挿入配列の少なくとも１つを変更するための命令を受信することを特徴とする、請求項４に記載の方法。
警報が発生されない場合、１つ以上の生物学的配列が合成されることを特徴とする、請求項４〜６のいずれか１つに記載の方法。
有害な生物学的配列は、翻訳または転写されると病原生物をもたらす、遺伝子または遺伝子断片をコードすることを特徴とする、請求項１または４に記載の方法。
遺伝子は、細菌またはウイルスのゲノムに由来することを特徴とする、請求項８に記載の方法。
１つ以上の設計命令は、１つ以上の時点において受信されることを特徴とする、請求項１〜９のいずれか１つに記載の方法。
１つ以上の設計命令は、様々なソースからのものであることを特徴とする、請求項１〜９のいずれか１つに記載の方法。
１つ以上の設計命令は、３つ以上の様々なソースからのものであることを特徴とする、請求項１１に記載の方法。
１つ以上の受信された設計命令は、５つ以上の様々なソースからのものであることを特徴とする、請求項１１に記載の方法。
１つ以上の受信された設計命令は、１０以上の様々なソースからのものであることを特徴とする、請求項１１に記載の方法。
複数の生物学的配列は、せいぜい２００の塩基の長さであることを特徴とする、請求項１〜１４のいずれか１つに記載の方法。
複数の生物学的配列は、各々せいぜい１００の塩基の長さであることを特徴とする、請求項１５に記載の方法。
複数の生物学的配列は、各々せいぜい５０の塩基の長さであることを特徴とする、請求項１５に記載の方法。
複数の生物学的配列は、各々せいぜい２０の塩基の長さであることを特徴とする、請求項１５に記載の方法。