JP2018527290A - Lag‐3結合分子及びその使用方法 - Google Patents
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Landscapes
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
Description
本出願は、米国特許出願第62/255,094号(2015年11月13日出願;係属)及び米国特許出願第62/172,277号(2015年6月8日出願;係属)に対する優先権を主張するものであり、上述の特許出願は、参照によりその全体が本出願に援用される。
本出願は、連邦規則法典第37巻第1.821節以下による1つ又は複数の配列表を含み、これらの配列表は、コンピュータ可読媒体(ファイル名:1301_0121PCT_Sequence_Listing_ST25.txt、2016年5月18日作成、サイズ:105,774バイト)において開示されており、上記ファイルは、参照によりその全体が本出願に援用される。
I.細胞仲介性免疫応答
ヒト及び他の哺乳類の免疫系は、感染及び疾患に対して保護を提供する役割を果たす。このような保護は、体液性免疫応答及び細胞仲介性免疫応答の両方によって提供される。体液性免疫応答により、異物標的(抗原)を認識して中和できる抗体及び他の生体分子の産生が得られる。対照的に、細胞仲介性免疫応答は、T細胞によるマクロファージ、ナチュラルキラー(NK)細胞及び抗原特異性細胞毒性Tリンパ球の活性化、並びに抗原の認識に応じた様々なサイトカインの放出を伴う(非特許文献1)。
リンパ球活性化遺伝子3は、「LAG‐3」又はCD223と呼ばれる細胞表面受容体タンパク質をエンコードする(非特許文献18)。LAG‐3は、活性化されたCD4+及びCD8+T細胞並びにNK細胞によって発現され、形質細胞様樹状細胞によって恒常的に発現される。LAG‐3はB細胞、単球又は試験された他のいずれの細胞タイプによって発現されない(非特許文献19)。
(A)(1)上記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 1の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号8、配列番号9及び配列番号10を有し;
(2)上記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 1の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号13、配列番号14及び配列番号15を有し;
又は
(B)(1)上記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、hLAG‐3 mAb 1の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号8、配列番号9及び配列番号10を有し;
(2)上記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、hLAG‐3 mAb 1の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号28、配列番号14及び配列番号15を有し;
又は
(C)(1)上記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 2の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号31、配列番号32及び配列番号33を有し;
(2)上記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 2の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号36、配列番号37及び配列番号38を有し;
又は
(D)(1)上記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 3の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号41、配列番号42及び配列番号43を有し;
(2)上記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 3の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号46、配列番号47及び配列番号48を有し;
又は
(E)(1)上記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 4の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号51、配列番号52及び配列番号53を有し;
(2)上記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 4の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号56、配列番号57及び配列番号58を有し;
又は
(F)(1)上記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 5の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号61、配列番号62及び配列番号63を有し;
(2)上記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 5の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号66、配列番号67及び配列番号68を有し;
又は
(G)(1)上記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 6 VH1の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号71、配列番号72及び配列番号73を有し;
(2)上記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 6の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号76、配列番号77及び配列番号78を有し;
又は
(H)(1)上記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 hAb 6の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号71、配列番号72及び配列番号73を有し;
(2)上記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、hLAG‐3 hAb 6の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号87、配列番号77及び配列番号78を有する。
(1)L234A;
(2)L235A;
(3)L234A及びL235A;
(4)M252Y;M252Y及びS254T;
(5)M252Y及びT256E;
(6)M252Y、S254T及びT256E;又は
(7)K288D及びH435K;
からなる群から選択される少なくとも1つのアミノ酸置換を含み、この番号付与は、KabatによるEUインデックスの番号付与である、全てのこのようなLAG‐3結合分子の実施形態に関する。
本発明の抗体は、当該免疫グロブリン分子の可変ドメインに位置する少なくとも1つのエピトープ認識部位によって、炭水化物、ポリヌクレオチド、脂質、ポリペプチド等の標的に免疫特異的に結合できる、免疫グロブリン分子である。
2つの重鎖のCH2及びCH3ドメインは相互作用してFc領域を形成し、このFc領域は、Fcγ受容体(FcγR)を含むがこれに限定されない細胞Fc受容体によって認識されるドメインである。本明細書において使用される場合、用語「Fc領域(Fc region)」は、IgG重鎖のC末端領域を定義するために使用される。例示的なヒトIgG1のCH2‐CH3ドメインのアミノ酸配列は、(配列番号1):
231 240 250 260 270 280
APELLGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVD
290 300 310 320 330
GVEVHNAKTK PREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK CKVSNKALPA
340 350 360 370 380
PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE
390 400 410 420 430
WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQG NVFSCSVMHE
440 447
ALHNHYTQKS LSLSPGX
であり、これはKabatによるEUインデックスによって番号付与されており、Xはリシン(K)であるか、又は不在である。
231 240 250 260 270 280
APPVA-GPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVQFNWYVD
290 300 310 320 330
GVEVHNAKTK PREEQFNSTF RVVSVLTVVH QDWLNGKEYK CKVSNKGLPA
340 350 360 370 380
PIEKTISKTK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDISVE
390 400 410 420 430
WESNGQPENN YKTTPPMLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQG NVFSCSVMHE
440 447
ALHNHYTQKS LSLSPGX
であり、これはKabatによるEUインデックスによって番号付与されており、Xはリシン(K)であるか、又は不在である。
231 240 250 260 270 280
APELLGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVQFKWYVD
290 300 310 320 330
GVEVHNAKTK PREEQYNSTF RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK CKVSNKALPA
340 350 360 370 380
PIEKTISKTK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE
390 400 410 420 430
WESSGQPENN YNTTPPMLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQG NIFSCSVMHE
440 447
ALHNRFTQKS LSLSPGX
であり、これはKabatによるEUインデックスによって番号付与されており、Xはリシン(K)であるか、又は不在である。
231 240 250 260 270 280
APEFLGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSQED PEVQFNWYVD
290 300 310 320 330
GVEVHNAKTK PREEQFNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK CKVSNKGLPS
340 350 360 370 380
SIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSQEEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE
390 400 410 420 430
WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSRL TVDKSRWQEG NVFSCSVMHE
440 447
ALHNHYTQKS LSLSLGX
であり、これはKabatによるEUインデックスによって番号付与されており、Xはリシン(K)であるか、又は不在である。
抗体の機能性は、2つの別個の異なる抗原(若しくは同一の抗原の異なるエピトープ)に同時に結合できる多重特異性抗体ベースの分子を生成することにより、並びに/又は同一のエピトープ及び/若しくは抗原に関してより高い価(即ち3つ以上の結合部位)を有する抗体ベースの分子を生成することにより、増強できる。
本発明の好ましいLAG‐3結合分子としては、抗体、ダイアボディ、BiTE等が挙げられ、これらは、ヒトLAG‐3の連続又は不連続(例えば配座)部分(エピトープ)に結合できる。本発明のLAG‐3結合分子は好ましくは、1つ又は複数の非ヒト種、特に霊長類種(及び特にカニクイザル等の霊長類種)のLAG‐3分子に結合する能力も示す。代表的なヒトLAG‐3ポリペプチド(NCBI配列NP_002277.4;22アミノ酸残基シグナル配列(下線)及び503アミノ酸残基成熟タンパク質を含む)は、アミノ酸配列(配列番号5):
MWEAQFLGLL FLQPLWVAPV KPLQPGAEVP VVWAQEGAPA QLPCSPTIPL
QDLSLLRRAG VTWQHQPDSG PPAAAPGHPL APGPHPAAPS SWGPRPRRYT
VLSVGPGGLR SGRLPLQPRV QLDERGRQRG DFSLWLRPAR RADAGEYRAA
VHLRDRALSC RLRLRLGQAS MTASPPGSLR ASDWVILNCS FSRPDRPASV
HWFRNRGQGR VPVRESPHHH LAESFLFLPQ VSPMDSGPWG CILTYRDGFN
VSIMYNLTVL GLEPPTPLTV YAGAGSRVGL PCRLPAGVGT RSFLTAKWTP
PGGGPDLLVT GDNGDFTLRL EDVSQAQAGT YTCHIHLQEQ QLNATVTLAI
ITVTPKSFGS PGSLGKLLCE VTPVSGQERF VWSSLDTPSQ RSFSGPWLEA
QEAQLLSQPW QCQLYQGERL LGAAVYFTEL SSPGAQRSGR APGALPAGHL
LLFLILGVLS LLLLVTGAFG FHLWRRQWRP RRFSALEQGI HPPQAQSKIE
ELEQEPEPEP EPEPEPEPEP EPEQL
を有する。
(1)刺激ヒトT細胞の表面に内在的に発現したヒトLAG‐3に特異的に結合する;
(2)平衡結合定数(KD)40nM以下でヒトLAG‐3に特異的に結合する;
(3)平衡結合定数(KD)0.5nM以下でヒトLAG‐3に特異的に結合する;
(4)非ヒト霊長類LAG‐3(例えばカニクイザルのLAG‐3)に特異的に結合する;
(5)平衡結合定数(KD)50nM以下で非ヒト霊長類LAG‐3に特異的に結合する;
(6)平衡結合定数(KD)5nM以下で非ヒト霊長類LAG‐3に特異的に結合する;
(7)MHCクラスIIに対するLAG‐3の結合を阻害する(即ちブロックする、若しくはこれに干渉する);
(8)免疫応答を刺激する;
(9)単一の作用剤として、抗原特異的T細胞応答を刺激する;
(10)抗PD‐1抗体と相乗作用して、抗原特異的T細胞応答を刺激する;
(11)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1若しくはLAG‐3 mAb 6と同一のLAG‐3のエピトープに結合する;及び/又は
(12)(例えばBiacore分析によって測定される)LAG‐3結合に関して、抗LAG‐3抗体257F(BMS986016、Medarex/BMS)と競合しない。
(A)(1)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1又はhLAG‐3 mAb 1 VL4のVHドメインの3つのCDRH;
(2)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1のVLドメインの3つのCDRL;
(3)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1のVHドメインの3つのCDRH、及び抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1のVLドメインの3つのCDRL;
(4)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1のVHドメイン;
(5)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1のVLドメイン;
(6)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1のVH及びVLドメイン;
(B)(1)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 2のVHドメインの3つのCDRH;
(2)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 2のVLドメインの3つのCDRL;
(3)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 2のVHドメインの3つのCDRH、及び抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 2のVLドメインの3つのCDRL;
(4)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 2のVHドメイン;
(5)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 2のVLドメイン;
(6)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 2のVH及びVLドメイン;
(C)(1)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 3のVHドメインの3つのCDRH;
(2)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 3のVLドメインの3つのCDRL;
(3)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 3のVHドメインの3つのCDRH、及び抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 3のVLドメインの3つのCDRL;
(4)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 3のVHドメイン;
(5)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 3のVLドメイン;
(6)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 3のVH及びVLドメイン;
(D)(1)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 4のVHドメインの3つのCDRH;
(2)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 4のVLドメインの3つのCDRL;
(3)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 4のVHドメインの3つのCDRH、及び抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 4のVLドメインの3つのCDRL;
(4)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 4のVHドメイン;
(5)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 4のVLドメイン;
(6)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 4のVH及びVLドメイン;
(E)(1)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 5のVHドメインの3つのCDRH;
(2)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 5のVLドメインの3つのCDRL;
(3)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 5のVHドメインの3つのCDRH、及び抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 5のVLドメインの3つのCDRL;
(4)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 5のVHドメイン;
(5)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 5のVLドメイン;
(6)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 5のVH及びVLドメイン;
(F)(1)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 6のVHドメインの3つのCDRH;
(2)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 6のVLドメインの3つのCDRL;
(3)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 6のVHドメインの3つのCDRH、及び抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 6のVLドメインの3つのCDRL;
(4)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 6のVHドメイン;
(5)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 6のVLドメイン;
(6)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 6のVH及びVLドメイン;
(G)(1)抗LAG‐3抗体hLAG‐3 mAb 1 VL4のVLドメインの3つのCDRL;
(2)抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1のVHドメインの3つのCDRH、及び抗LAG‐3抗体hLAG‐3 mAb 1 VL4のVLドメインの3つのCDRL
を有するLAG‐3結合ドメインを備える、LAG‐3結合分子、又は
LAG‐3 mAb 1、LAG‐3 mAb 2、LAG‐3 mAb 3、LAG‐3 mAb 4、LAG‐3 mAb 5若しくはLAG‐3 mAb 6が免疫特異的に結合するエピトープに結合するか、若しくは上記エピトープとの結合に関して競合する、LAG‐3結合分子に関する。
1.マウス抗ヒト抗体LAG‐3 mAb 1
LAG‐3 mAb 1のVHドメインのアミノ酸配列(配列番号6)を以下に示す(CDRH残基は下線付きで示されている)。
QIQLVQSGPE LKKPGETVKI SCKASGYTFR NYGMNWVKQA PGKVLKWMGW
INTYTGESTY ADDFEGRFAF SLGTSASTAY LQINILKNED TATYFCARES
LYDYYSMDYW GQGTSVTVSS
LAG‐3 mAb 1のCDRH1(配列番号8):NYGMN
LAG‐3 mAb 1のCDRH2(配列番号9):WINTYTGESTYADDFEG
LAG‐3 mAb 1のCDRH3(配列番号10):ESLYDYYSMDY
cagatccagt tggtgcagtc tggacctgag ctgaagaagc ctggagagac
agtcaagatc tcctgcaagg cttctgggta taccttcaga aactatggaa
tgaactgggt gaagcaggct ccaggaaagg ttttaaagtg gatgggctgg
ataaacacct acactggaga gtcaacatat gctgatgact tcgagggacg
gtttgccttc tctttgggaa cctctgccag cactgcctat ttgcagatca
acatcctcaa aaatgaggac acggctacat atttctgtgc aagagaatcc
ctctatgatt actattctat ggactactgg ggtcaaggaa cctcagtcac
cgtctcctca
である。
DVVVTQTPLT LSVTIGQPAS ISCKSSQSLL HSDGKTYLNW LLQRPGQSPE
RLIYLVSELD SGVPDRFTGS GSGTDFTLKI SRVEAEDLGV YYCWQGTHFP
YTFGGGTKLE IK
LAG‐3 mAb 1のCDRL1(配列番号13):KSSQSLLHSDGKTYLN
LAG‐3 mAb 1のCDRL2(配列番号14):LVSELDS
LAG‐3 mAb 1のCDRL3(配列番号15):WQGTHFPYT
gatgttgtgg tgacccagac tccactcact ttgtcggtta ccattggaca
accagcctcc atctcttgca agtcaagtca gagcctctta catagtgatg
gaaagacata tttgaattgg ttgttacaga ggccaggcca gtctccagag
cgcctaatct atctggtgtc tgaactggac tctggagtcc ctgacaggtt
cactggcagt ggatcaggga cagatttcac actgaaaatc agcagagtgg
aggctgagga tttgggagtt tattattgct ggcaaggtac acattttccg
tacacgttcg gaggggggac caagctggaa ataaaa
である。
上述のマウス抗ヒトLAG‐3抗体LAG‐3 mAb 1をヒト化することによって、ヒトレシピエントへの投与の際の抗原性を低減するための、抗LAG‐3抗体のヒト化能力を実証した。上記ヒト化により、本明細書において「hLAG‐3 mAb 1 VH‐1」及び「hLAG‐3 mAb 1 VH‐2」と称される2つのヒト化VHドメイン、及び、「hLAG‐3 mAb 1 VL‐1」、「hLAG‐3 mAb 1 VL‐2」、「hLAG‐3 mAb 1 VL‐3」、及び「hLAG‐3 mAb 1 VL‐4」と称される4つのヒト化VLドメインが得られた。いずれの上記ヒト化VLドメインを上記ヒト化VHドメインと対合させてよい。従って、上記ヒト化VHドメインと対合させた上記ヒト化VLドメインのうちの1つを備えるいずれの抗体は、一般的に「hLAG‐3 mAb 1」と呼ばれ、ヒト化VH/VLドメインの特定の組み合わせは、特定のVH/VLドメインを参照することによって呼称され、例えばhLAG‐3 mAb 1 VH‐1及びhLAG‐3 mAb 1 VL‐2を備えるヒト化抗体は、具体的に「hLAG‐3 mAb 1(1.2)」と呼称される。
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT NYGMNWVRQA PGQGLEWMGW
INTYTGESTY ADDFEGRFVF SMDTSASTAY LQISSLKAED TAVYYCARES
LYDYYSMDYW GQGTTVTVSS
caggtgcaac tggttcaatc cggcgccgag gtgaaaaagc ctggcgcctc
cgtgaaagtg tcctgtaagg catctgggta tacgttcaca aattatggta
tgaactgggt gcgacaggca ccagggcagg gactggaatg gatggggtgg
atcaatactt atacaggcga gagtacttat gctgacgatt tcgagggcag
atttgtcttc tccatggaca ccagcgctag taccgcttat ctccagatta
gttctctcaa ggcggaggac acagctgttt attattgtgc ccgcgagagt
ttgtatgact actatagcat ggattactgg ggacaaggta caaccgtgac
agtgagttcc
である。
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT NYGMNWVRQA PGQGLEWMGW
INTYTGESTY ADDFEGRFVF SMDTSASTAY LQISSLKAED TAVYFCARES
LYDYYSMDYW GQGTTVTVSS
caggtgcaac tggttcaatc cggcgccgag gtgaaaaagc ctggcgcctc
cgtgaaagtg tcctgtaagg catctgggta tacgttcaca aattatggta
tgaactgggt gcgacaggca ccagggcagg gactggaatg gatggggtgg
atcaatactt atacaggcga gagtacttat gctgacgatt tcgagggcag
atttgtcttc tccatggaca ccagcgctag taccgcttat ctccagatta
gttctctcaa ggcggaggac acagctgttt atttctgtgc ccgcgagagt
ttgtatgact actatagcat ggattactgg ggacaaggta caaccgtgac
agtgagttcc
である。
DIVMTQTPLS LSVTPGQPAS ISCKSSQSLL HSDGKTYLNW LLQKPGQSPE
RLIYLVSELD SGVPDRFSGS GSGTDFTLKI SRVEAEDVGV YYCWQGTHFP
YTFGGGTKVE IK
gatatcgtta tgactcagac accactgtca ctgagtgtga ccccaggtca
gcccgctagt atttcctgta aatcatccca gtccctcctg catagcgatg
gaaagaccta tttgaactgg cttctgcaga aaccaggcca aagtccagag
agattgatct acctcgtttc agaactcgac agtggagtgc ccgatcgctt
ctcagggtcc ggctctggga ctgattttac tctcaagatc tcaagagtgg
aggccgagga cgtcggggtt tactactgtt ggcagggtac ccacttccct
tatacatttg gcggaggcac aaaagtggag attaaa
である。
DIVMTQTPLS LSVTPGQPAS ISCKSSQSLL HSDGKTYLNW LLQRPGQSPE
RLIYLVSELD SGVPDRFSGS GSGTDFTLKI SRVEAEDVGV YYCWQGTHFP
YTFGGGTKVE IK
gatatcgtta tgactcagac accactgtca ctgagtgtga ccccaggtca
gcccgctagt atttcctgta aatcatccca gtccctcctg catagcgatg
gaaagaccta tttgaactgg cttctgcaga gaccaggcca aagtccagag
agattgatct acctcgtttc agaactcgac agtggagtgc ccgatcgctt
ctcagggtcc ggctctggga ctgattttac tctcaagatc tcaagagtgg
aggccgagga cgtcggggtt tactactgtt ggcagggtac ccacttccct
tatacatttg gcggaggcac aaaagtggag attaaa
である。
DIVMTQTPLS LSVTPGQPAS ISCKSSQSLL HSDGKTYLNW LLQKPGQPPE
RLIYLVSELD SGVPDRFSGS GSGTDFTLKI SRVEAEDVGV YYCWQGTHFP
YTFGGGTKVE IK
gatatcgtta tgactcagac accactgtca ctgagtgtga ccccaggtca
gcccgctagt atttcctgta aatcatccca gtccctcctg catagcgatg
gaaagaccta tttgaactgg cttctgcaga aaccaggcca accgccagag
agattgatct acctcgtttc agaactcgac agtggagtgc ccgatcgctt
ctcagggtcc ggctctggga ctgattttac tctcaagatc tcaagagtgg
aggccgagga cgtcggggtt tactactgtt ggcagggtac ccacttccct
tatacatttg gcggaggcac aaaagtggag attaaa
DIVMTQTPLS LSVTPGQPAS ISCKSSQSLL HSDAKTYLNW LLQKPGQPPE
RLIYLVSELD SGVPDRFSGS GSGTDFTLKI SRVEAEDVGV YYCWQGTHFP
YTFGGGTKVE IK
gatatcgtta tgactcagac accactgtca ctgagtgtga ccccaggtca
gcccgctagt atttcctgta aatcatccca gtccctcctg catagcgatg
caaagaccta tttgaactgg cttctgcaga aaccaggcca accgccagag
agattgatct acctcgtttc agaactcgac agtggagtgc ccgatcgctt
ctcagggtcc ggctctggga ctgattttac tctcaagatc tcaagagtgg
aggccgagga cgtcggggtt tactactgtt ggcagggtac ccacttccct
tatacatttg gcggaggcac aaaagtggag attaaa
である。
LAG‐3 mAb 2のVHドメインのアミノ酸配列(配列番号29)を以下に示す(CDRH残基は下線付きで示されている):
EVQLQQSGPE LVKPGASVKI SCKTSGYTFT DYNIHWLRQS HGESLEWIGY
IYPYSGDIGY NQKFKNRATL TVDNSSSTAY MDLRSLTSED SAVFYCARWH
RNYFGPWFAY WGQGTPVTVS A
LAG‐3 mAb 2のCDRH1(配列番号31):DYNIH
LAG‐3 mAb 2のVH CDRH2(配列番号32):YIYPYSGDIGYNQKFKN
LAG‐3 mAb 2のVH CDRH3(配列番号33):WHRNYFGPWFAY
gaggtccagc ttcagcagtc aggacctgag ctggtgaaac ctggggcctc
agtgaagatt tcctgcaaga cttctggata cacatttact gactacaaca
tacactggtt gaggcagagc catggagaga gccttgagtg gattggatat
atttatcctt acagtggtga tattggatac aaccagaagt tcaagaacag
ggccacattg actgtagaca attcctccag cacagcctac atggatctcc
gcagcctgac atctgaagac tctgcagtct tttactgtgc aagatggcac
aggaactact ttggcccctg gtttgcttac tggggccaag ggactccggt
cactgtctct gca
である。
DIVLTQSPAS LAVSLGQRAT ISCKASQSVD YDGESYMNWY QQKPGQPPKL
LIYVVSNLES GIPARFSGSG SGTDFTLNIH PVEEEDAATY YCQQSSEDPL
TFGAGTKLEL K
LAG‐3 mAb 2のCDRL1(配列番号36):KASQSVDYDGESYMN
LAG‐3 mAb 2のCDRL2(配列番号37):VVSNLES
LAG‐3 mAb 2のCDRL3(配列番号38):QQSSEDPLT
gacattgtgc tgacccaatc tccagcttct ttggctgtgt ctctagggca
gagggccacc atctcctgca aggccagcca aagtgttgat tatgatggtg
aaagttatat gaactggtac caacagaaac caggacagcc acccaaactc
ctcatttatg ttgtatccaa tctagaatct gggatcccag ccaggtttag
tggcagtggg tctgggacag acttcaccct caacatccat cctgtggagg
aggaggatgc tgcaacctat tactgtcagc aaagtagtga ggatccgctc
acgttcggtg ctgggaccaa gctggagctg aaa
である。
LAG‐3 mAb 3のVHドメインのアミノ酸配列(配列番号39)を以下に示す(CDRH残基は下線付きで示されている):
EVRLQQSGPE LVKPGASVKI SCKASGYTFT DYNIHWVRQS HGQSLEWIGY
IYPYNGDTGY NQKFKTKATL TVDNSSNTAY MELRSLASED SAVYYCTRWS
RNYFGPWFAY WGQGTLVTVS A
LAG‐3 mAb 3のCDRH1(配列番号41):DYNIH
LAG‐3 mAb 3のCDRH2(配列番号42):YIYPYNGDTGYNQKFKT
LAG‐3 mAb 3のCDRH3(配列番号43):WSRNYFGPWFAY
gaggtccggc ttcagcagtc aggacctgag ctggtgaaac ctggggcctc
agtgaagata tcctgcaagg cttctggata cacattcact gactacaaca
ttcactgggt gaggcagagc catggacaga gccttgagtg gattggatat
atttatcctt ataatggtga tactggctac aaccagaagt tcaagaccaa
ggccacattg actgtagaca attcctccaa cacagcctac atggaactcc
gcagcctggc atctgaagac tctgcagtct attactgtac aagatggagc
aggaactact ttggcccctg gtttgcttac tggggccaag ggactctggt
cactgtctct gca
である。
DIVLTQSPTS LAVSLGQRAT ISCKASQSVD YDGDSYMNWY QQKPGQPPKL
LIYAASNLES GIPARFSGSG SGTDFTLNIH PVEEEDAATY YCQQSSEDPL
TFGAGTKLEL K
LAG‐3 mAb 3のCDRL1(配列番号46):KASQSVDYDGDSYMN
LAG‐3 mAb 3のCDRL2(配列番号47):AASNLES
LAG‐3 mAb 3のCDRL3(配列番号48):QQSSEDPLT
gacattgtgc tgacccaatc tccaacttct ttggctgtgt ctctagggca
gagggccacc atctcctgca aggccagcca aagtgttgat tatgatggtg
atagttatat gaactggtat caacagaaac caggacagcc acccaaactc
ctcatctatg ctgcatccaa tctagaatct gggatcccag ccaggtttag
tggcagtggg tctgggacag acttcaccct caacatccat cctgtggagg
aggaggatgc tgcaacctat tactgtcagc aaagtagtga ggatccgctc
acgttcggtg ctgggaccaa gctggagctg aaa
である。
LAG‐3 mAb 4のVHドメインのアミノ酸配列(配列番号49)を以下に示す(CDRH残基は下線付きで示されている):
EVQLHQSGPE LVKPGASVKI SCKTSGYTFT DYNIHWVKQS HGKSLEWIGY
IYPYNGDAGY NQNFKTKATL TVDNSSSTAY MELRSLTSED SAVYYCARWN
MNYFGPWFAY WGQGTLVTVS A
LAG‐3 mAb 4のCDRH1(配列番号51):DYNIH
LAG‐3 mAb 4のCDRH2(配列番号52):YIYPYNGDAGYNQNFKT
LAG‐3 mAb 4のCDRH3(配列番号53):WNMNYFGPWFAY
gaggtccagc ttcaccagtc aggacctgag ctggtgaaac ctggggcctc
agtgaagata tcctgcaaga cttctggata cactttcact gactacaaca
tacactgggt gaagcagagc catggaaaga gccttgagtg gattggatat
atttatcctt acaatggtga tgctggctac aaccagaact tcaagaccaa
ggccacattg actgtagaca attcctccag cacagcctac atggagctcc
gcagcctgac atctgaggac tctgcagtct attactgtgc aagatggaac
atgaactact ttggcccctg gtttgcttac tggggccaag ggactctggt
cactgtctct gcg
である。
DIVLTQSPAS LAVSLGQRAT ISCKASQSVD YDGVTYINWY QQKPGQPPKL
LIFAASNLES GIPARFSGSG SGTDFTLNIH PVEEEDAATY YCQQSNEDPL
TFGAGTKLEL K
LAG‐3 mAb 4のCDRL1(配列番号56):KASQSVDYDGVTYIN
LAG‐3 mAb 4のCDRL2(配列番号57):AASNLES
LAG‐3 mAb 4のCDRL3(配列番号58):QQSNEDPLT
gacattgtgc tgacccaatc tccagcttct ttggctgtgt ctctagggca
gagggccacc atctcctgca aggccagcca aagtgttgat tatgatggtg
ttacttatat caactggtac caacagaaac caggacagcc acccaaactc
ctcatctttg ctgcatccaa tctagaatct gggatcccag ccaggtttag
tggcagtggg tctgggacag acttcaccct caacatccat cctgtggagg
aggaggatgc tgcaacctat tactgtcagc aaagtaatga ggatccgctc
acgttcggtg ctgggaccaa gctggagctg aaa
である。
LAG‐3 mAb 5のVHドメインのアミノ酸配列(配列番号59)を以下に示す(CDRH残基は下線付きで示されている):
EVQLQQSGPE LVKPGASVKI SCKASGYTFT DYNIHWVKQS PGKSLEWIGY
IYPYSGDFGY NQKFKSKATL TVDNSSSTAY MDLRSLTSED SAVFYCARWH
RNYFGPWFAY WGQGTLVTVS A
LAG‐3 mAb 5のCDRH1(配列番号61):DYNIH
LAG‐3 mAb 5のCDRH2(配列番号62):YIYPYSGDFGYNQKFKS
LAG‐3 mAb 5のCDRH3(配列番号63):WHRNYFGPWFAY
gaggtccagc ttcagcagtc aggacctgag ctggtgaaac ctggggcctc
agtgaagatt tcctgcaaag cttctggata cacatttact gactacaaca
tacactgggt gaagcagagc cctggaaaga gccttgaatg gattggatat
atttatcctt acagtggtga ttttggatac aaccagaagt tcaagagcaa
ggccacattg actgtagaca attcctccag cacagcctac atggatctcc
gcagcctgac atctgaggac tctgcagtct tttactgtgc aagatggcac
aggaactact ttggcccctg gtttgcttac tggggccaag ggactctggt
cactgtctct gca
である。
DIVLTQSPAS LAVSLGQRAT ISCKASQSVD YDGESYMNWY QQKPGQPPKL
LIYVVSNLES GIPARFSGSG SGTDFTLNIH PVEEEDAATY YCQQSSEDPL
TFGAGTKLEL K
LAG‐3 mAb 5のCDRL1(配列番号66):KASQSVDYDGESYMN
LAG‐3 mAb 5のCDRL2(配列番号67):VVSNLES
LAG‐3 mAb 5のCDRL3(配列番号68):QQSSEDPLT
gacattgtgc tgacccaatc tccagcttct ttggctgtgt ctctagggca
gagggccacc atctcctgca aggccagcca aagtgttgat tatgatggtg
aaagttatat gaactggtac caacagaaac caggacagcc acccaaactc
ctcatttatg ttgtttccaa tctagaatct gggatcccag ccaggtttag
tggcagtggg tctgggacag acttcaccct caacatccat cctgtggagg
aggaggatgc tgcaacctat tactgtcagc aaagtagtga ggatccgctc
acgttcggtg ctgggaccaa gctggagctg aaa
である。
1.マウス抗ヒト抗体LAG‐3 mAb 6
LAG‐3 mAb 6のVHドメインのアミノ酸配列(配列番号69)を以下に示す(CDRH残基は下線付きで示されている):
EVLLQQSGPE LVKPGASVKI PCKASGYTFT DYNMDWVKQS HGESLEWIGD
INPDNGVTIY NQKFEGKATL TVDKSSSTAY MELRSLTSED TAVYYCAREA
DYFYFDYWGQ GTTLTVSS
LAG‐3 mAb 6のCDRH1(配列番号71):DYNMD
LAG‐3 mAb 6のCDRH2(配列番号72):DINPDNGVTIYNQKFEG
LAG‐3 mAb 6のCDRH3(配列番号72):EADYFYFDY
gaggtcctgc tgcaacagtc tggacctgag ctggtgaagc ctggggcttc
agtgaagata ccctgcaagg cttctggata cacattcact gactacaaca
tggactgggt gaagcagagc catggagaga gccttgagtg gattggagat
attaatcctg acaatggtgt tactatctac aaccagaagt ttgagggcaa
ggccacactg actgtagaca agtcctccag tacagcctac atggagctcc
gcagcctgac atctgaggac actgcagtct attactgtgc aagagaggcg
gattacttct actttgacta ctggggccaa ggcaccactc tcacagtctc
ctca
である。
DIVMTQSHRF MSTSVGDRVS ITCKASQDVS SVVAWYQQKP GQSPKLLIFS
ASYRYTGVPD RFTGSGSGTD FTFTISSVQA ADLAVYYCQQ HYSTPWTFGG
GTKLEIK
LAG‐3 mAb 6のCDRL1(配列番号76):KASQDVSSVVA
LAG‐3 mAb 6のCDRL2(配列番号77):SASYRYT
LAG‐3 mAb 6のCDRL3(配列番号78):HYSTPWT
gacattgtga tgacccagtc tcacagattc atgtccacat cagttggaga
cagggtcagc atcacctgca aggccagtca ggatgtgagt tctgttgtag
cctggtatca acagaaacca ggacaatctc ctaaattact gattttttcg
gcatcctacc ggtacactgg agtccctgat cgcttcactg gcagtggatc
tgggacggat ttcactttca ccatcagcag tgtgcaggct gcagacctgg
cagtttatta ctgtcagcaa cattatagta ctccgtggac gttcggtgga
ggcaccaagc tggaaatcaa a
である。
上述のマウス抗LAG‐3抗体LAG‐3 mAb 6をヒト化して、ヒトレシピエントへの投与時にその抗原性を低減するための抗LAG‐3抗体のヒト化の能力を実証した。ヒト化により、ここでは「hLAG‐3 mAb 6 VH‐1」及び「hLAG‐3 mAb 6 VH‐2」と呼ばれる2つのヒト化VHドメインと、ここでは「hLAG‐3 mAb 6 VL‐1」及び「hLAG‐3 mAb 6 VL‐2」と呼ばれる2つのヒト化VLドメインとが得られた。上記ヒト化VLドメインのうちのいずれは、上記ヒト化VHドメインのうちの一方とペアとすることができる。従って、上記ヒト化VHドメインとペアとなった上記ヒト化VLドメインのうちの一方を備えるいずれの抗体は、一般に「hLAG‐3 mAb 6」と呼ばれ、ヒト化VH/VLドメインの特定の組み合わせは、特定のVH/VLドメインを参照して呼称される。例えばhLAG‐3 mAb 6 VH‐1及びhLAG‐3 mAb 6 VL‐2を備えるヒト化抗体は、具体的に「hLAG‐3 mAb 6(1.2)」と呼ばれる。
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT DYNMDWVRQA PGQGLEWMGD INPDNGVTIY NQKFEGRVTM TTDTSTSTAY MELRSLRSDD TAVYYCAREA DYFYFDYWGQ GTTLTVSS
caggtccagc tggtgcagtc tggcgccgaa gtgaagaaac ctggcgcaag
cgtgaaggtg tcctgcaagg ccagcggcta caccttcacc gactacaaca
tggactgggt ccgacaggcc ccaggacagg gcctggaatg gatgggcgac
atcaaccccg acaacggcgt gaccatctac aaccagaaat tcgagggcag
agtgaccatg accaccgaca ccagcaccag caccgcctac atggaactgc
ggtccctgcg gagcgacgac accgccgtgt actactgcgc cagagaggcc
gactacttct acttcgacta ctggggccag ggcaccaccc tgaccgtgtc
ctcc
である。
EVQLVESGGG LVKPGGSLRL SCAASGFTFS DYNMDWVRQA PGKGLEWVSD
INPDNGVTIY NQKFEGRFTI SRDNAKNSLY LQMNSLRAED TAVYYCAREA
DYFYFDYWGQ GTTLTVSS
gaggtccagc tggtggaatc tggcggcgga ctggtcaagc ctggcggcag
cctgagactg agctgcgctg ccagcggctt caccttcagc gactacaaca
tggactgggt ccgacaggcc cctggcaagg gcctggaatg ggtgtccgac
atcaaccccg acaacggcgt gaccatctac aaccagaagt tcgagggccg
gttcaccatc agccgggaca acgccaagaa cagcctgtac ctgcagatga
acagcctgcg ggccgaggac accgccgtgt actactgcgc cagagaggcc
gactacttct acttcgacta ctggggccag ggcaccaccc tgaccgtgtc
ctcc
である。
DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQDVS SVVAWYQQKP GKAPKLLIYS
ASYRYTGVPS RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQQ HYSTPWTFGG
GTKLEIK
gacatccaga tgacccagag ccccagcagc ctgagcgcca gcgtgggcga
cagagtgacc atcacctgtc gggccagcca ggatgtgtcc agcgtggtgg
cctggtatca gcagaagccc ggcaaggccc ccaagctgct gatctacagc
gccagctacc ggtacacagg cgtgcccagc agattcagcg gcagcggctc
cggcaccgac ttcaccctga ccatcagcag cctgcagccc gaggacttcg
ccacctacta ctgccagcag cactacagca ccccctggac cttcggcgga
ggcaccaagc tggaaatcaa g
である。
DIVMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQDVS SVVAWYQQKP GKAPKLLIYS
ASYRYTGVPD RFSGSGSGTD FTFTISSLQP EDIAVYYCQQ HYSTPWTFGG
GTKLEIK
gacatcgtga tgacccagag ccccagcagc ctgagcgcca gcgtgggcga
cagagtgacc atcacctgtc gggccagcca ggatgtgtcc agcgtggtgg
cctggtatca gcagaagccc ggcaaggccc ccaagctgct gatctacagc
gccagctacc ggtacacagg cgtgcccgat agattcagcg gcagcggctc
cggcaccgac ttcaccttca ccatcagcag cctgcagccc gaggacatcg
ccgtttacta ctgccagcag cactacagca ccccctggac cttcggcgga
ggcaccaagc tggaaatcaa g
である。
従来の免疫機能では、抗体‐抗原複合体と免疫系の細胞との相互作用は、抗体依存性細胞毒性、肥満細胞脱顆粒及び食作用等のエフェクタ機能から、リンパ球増殖及び抗体分泌を制御するもの等の免疫調節性信号にまで及ぶ、広範な応答をもたらす。これらの相互作用は全て、抗体又は免疫複合体のFc領域の、造血細胞上の特殊化された細胞表面受容体への結合によって開始される。抗体及び免疫複合体によってトリガされる細胞応答の多様性は、3つのFc受容体:FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)及びFcγRIII(CD16)の構造不均質性によって得られる。FcγRI(CD64)、FcγRIIA(CD32A)及びFcγRIII(CD16)は活性化(即ち免疫系増強)受容体であり;FcγRIIB(CD32B)は阻害性(即ち免疫系減衰)受容体である。更に、新生児Fc受容体(FcRn)との相互作用は、エンドソームから細胞表面へのIgG分子の再循環及び血中への放出を仲介する。例示的なIgG1(配列番号1)、IgG2(配列番号2)、IgG3(配列番号3)及びIgG4(配列番号4)のアミノ酸配列は、既に提示されている。
(A)F243L、R292P、Y300L、V305I、及びP396Lからなる群から選択される、少なくとも1つの置換;
(B)(1)F243L及びP396L;
(2)F243L及びR292P;並びに
(3)R292P及びV305I;
からなる群から選択される、少なくとも2つの置換;
(C)(1)F243L、R292P及びY300L;
(2)F243L、R292P及びV305I;
(3)F243L、R292P及びP396L;並びに
(4)R292P、V305I及びP396L;
からなる群から選択される、少なくとも3つの置換;
(D)(1)F243L、R292P、Y300L及びP396L;並びに
(2)F243L、R292P、V305I及びP396L;
からなる群から選択される、少なくとも4つの置換;又は
(E)(1)F243L、R292P、Y300L、V305I及びP396L;並びに
(2)L235V、F243L、R292P、Y300L及びP396L
からなる群から選択される、少なくとも5つの置換。
(A)F243L、R292P、及びY300L;
(B)L235V、F243L、R292P、Y300L、及びP396L;又は
(C)F243L、R292P、Y300L、V305I、及びP396L。
(A)252Y、254T及び256E;
(B)M252Y及びS254T;
(C)M252Y及びT256E;
(D)250Q及び428L;
(E)T307Q及びN434A;
(F)A378V及びN434A;
(G)N434A及びY436I;
(H)V308P及びN434A;又は
(I)K288D及びH435K。
(A)エフェクタ機能及び/又はFcγRを変化させる1つ又は複数の突然変異;並びに
(B)血清半減期を延長させる1つ又は複数の突然変異
を含む、変異型Fc領域も包含する。
本発明の一実施形態は、「第1のエピトープ」及び「第2のエピトープ」に結合できる二重特異性結合分子に関し、ここで上記第1のエピトープは、ヒトLAG‐3のエピトープであり、上記第2のエピトープは、LAG‐3の同一の若しくは異なるエピトープであり、又は免疫細胞(例えばTリンパ球等)の表面上に存在して免疫チェックポイントの制御に関与する別の分子のエピトープである。特定の実施形態では、上記第2のエピトープは好ましくはLAG‐3のエピトープではない。一実施形態では、上記第2のエピトープは、B7‐H3、B7‐H4、BTLA、CD3、CD8、CD16、CD27、CD32、CD40、CD40L、CD47、CD64、CD70、CD80、CD86、CD94、CD137、CD137L、CD226、CTLA‐4、ガレクチン‐9、GITR、GITRL、HHLA2、ICOS、ICOSL、KIR、LAG‐3、LIGHT、MHCクラスI若しくはII、NKG2a、NKG2d、OX40、OX40L、PD1H、PD‐1、PD‐L1、PD‐L2、PVR、SIRPa、TCR、TIGIT、TIM‐3又はVISTAのエピトープである。ある具体的実施形態では、上記第2のエピトープは、CD137、PD‐1、OX40、TIGIT又はTIM‐3である。特定の実施形態では、このような二重特異性分子は、3つ以上のエピトープ結合部位を備える。このような二重特異性分子は例えば、LAG‐3の2つ以上の異なるエピトープ、及びLAG‐3ではない分子の少なくとも1つのエピトープに結合してよい。
本発明の一実施形態は、第1のポリペプチド鎖及び第2のポリペプチド鎖を含み、最も好ましくは上記第1のポリペプチド鎖及び第2のポリペプチド鎖からなる、二重特異性1価ダイアボディに関し、その配列は、上記ポリペプチド鎖が互いに対して共有結合して、第1のエピトープ(「エピトープ1」)及び第2のエピトープ(「エピトープ2」)(これらのエピトープは互いに同一ではない)に同時に結合できる共有結合ダイアボディを形成することを可能とする。従ってこのような二重特異性ダイアボディは、上記第1のエピトープに結合できる「VL1」/「VH1」ドメイン(VLエヒ゜トーフ゜1/VHエヒ゜トーフ゜1)と、上記第2のエピトープに結合できる「VL2」/「VH2」ドメイン(VLエヒ゜トーフ゜2/VHエヒ゜トーフ゜2)とを備える。表記法「VL1」及び「VH1」はそれぞれ、このような二重特異性ダイアボディの「第1の」エピトープに結合する可変軽鎖ドメイン及び可変重鎖ドメインを指す。同様に、表記法「VL2」及び「VH2」はそれぞれ、このような二重特異性ダイアボディの「第2の」エピトープに結合する可変軽鎖ドメイン及び可変重鎖ドメインを指す。一実施形態では、このようなダイアボディ分子のエピトープ1は、LAG‐3のエピトープであり、このようなダイアボディ分子のエピトープ2は、LAG‐3のエピトープではない(例えばB7‐H3、B7‐H4、BTLA、CD40、CD80、CD86、CD137、CTLA‐4、ICOS、KIR、MHCクラスI又はII、OX40、PD‐1、PD‐L1、TCR、TIM‐3等のエピトープである)。
LAEAKVLANR ELDKYGVSDY YKNLID 66NAKS 70 A 71EGVKALIDE ILAALP(配列番号106)
又はアミノ酸配列:
LAEAKVLANR ELDKYGVSDY YKNA 64 A 65NNAKT VEGVKALIA 79E ILAALP(配列番号107)
又はアミノ酸配列:
LAEAKVLANR ELDKYGVSDY YKNLIS 66NAKS 70 VEGVKALIA 79E ILAALP(配列番号108)を有する、変異型脱免疫化ABDが特に好ましい。というのは、このような脱免疫化ABDは、MHCクラスII結合の減衰を提供しながら、略野生型の結合を呈するためである。従って、ABDを有するこのようなダイアボディの上記第1のポリペプチド鎖は、好ましくはこのようなポリペプチド鎖のEコイル(又はKコイル)ドメインに対してC末端に位置決めされることによって、上記Eコイル(又はKコイル)ドメインとABD(これは好ましくは脱免疫化ABDである)との間に介在する、第3のリンカー(リンカー3)を含有する。このようなリンカー3の好ましい配列は、配列番号90:GGGSである。
本発明の一実施形態は、LAG‐3及び第2のエピトープ(例えばB7‐H3、B7‐H4、BTLA、CD40、CD80、CD86、CD137、CTLA‐4、ICOS、KIR、MHCクラスI又はII、OX40、PD‐1、PD‐L1、TCR、TIM‐3等)に同時に結合できるFc領域を備える、二重特異性ダイアボディに関する。上記ダイアボディポリペプチド鎖のうちの一方又は両方にIgG CH2‐CH3ドメインを追加して、上記ダイアボディ鎖の複合体化によってFc領域が形成されるようにすると、上記ダイアボディの生物学的半減期が増大し、及び/又は価数が変化する。上記ダイアボディポリペプチドの両方にIgG CH2‐CH3ドメインを組み込むと、2鎖二重特異性Fc領域含有ダイアボディの形成が可能となる(図2)。
本発明の更なる実施形態は、Fc領域を備え、第1のエピトープ、第2のエピトープ及び第3のエピトープに同時に結合できる、二重特異性、3価結合分子に関し、ここで上記エピトープのうちの少なくとも1つは、上記エピトープのうちの別のものと同一ではない。従ってこのような二重特異性ダイアボディは、第1のエピトープに結合できる「VL1」/「VH1」ドメイン、第2のエピトープに結合できる「VL2」/「VH2」ドメイン、及び第3のエピトープに結合できる「VL3」/「VH3」ドメインを備える。一実施形態では、上記エピトープのうちの1つ又は2つは、LAG‐3のエピトープであり、上記エピトープのうちの別の(又は他の)ものは、LAG‐3のエピトープではない(例えばB7‐H3、B7‐H4、BTLA、CD40、CD80、CD86、CD137、CTLA‐4、ICOS、KIR、LAG‐3、MHCクラスI又はII、OX40、PD‐1、PD‐L1、TCR、TIM‐3等のエピトープである)。このような二重特異性3価結合分子は、3つのエピトープ結合部位を備え、そのうちの2つは、結合部位A及び結合部位Bを提供するダイアボディ型結合ドメインであり、1つは、結合部位Cを提供する非ダイアボディ型結合ドメインである(例えば図6A〜6F、並びにPCT出願第PCT/US15/33081号、及びPCT出願第PCT/US15/33076号参照)。
ここで提示されるのは、本発明のLAG‐3結合分子(例えば、抗体、ダイアボディ、3価結合分子等)の生成に有用な抗体定常ドメインである。
RTVAAPSVFI FPPSDEQLKS GTASVVCLLN NFYPREAKVQ WKVDNALQSG
NSQESVTEQD SKDSTYSLSS TLTLSKADYE KHKVYACEVT HQGLSSPVTK
SFNRGEC
である。
QPKAAPSVTL FPPSSEELQA NKATLVCLIS DFYPGAVTVA WKADSSPVKA
GVETTPSKQS NNKYAASSYL SLTPEQWKSH RSYSCQVTHE GSTVEKTVAP
TECS
である。
ASTKGPSVFP LAPSSKSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV
HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YICNVNHKPS NTKVDKRV
である。
ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV
HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSNFGTQT YTCNVDHKPS NTKVDKTV
である。
ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV
HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTKT YTCNVDHKPS NTKVDKRV
である。
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVD
GVEVHNAKTK PREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK CKVSNKALPA
PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE
WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQG NVFSCSVMHE
ALHNHYTQKS LSLSPGX
を有し、ここでXはリシン(K)であるか又は不在である。
(A)エフェクタ機能及び/又はFcγRを変化させる、1つ又は複数の突然変異;並びに
(B)血清半減期を延長させる、1つ又は複数の突然変異
を含む変異型Fc領域を備える、本発明のFc領域含有分子を包含する。
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVD
GVEVHNAKTK PREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK CKVSNKALPA
PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE
WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQG NVFSCSVMHE
ALHNHYTQKS LSLSPGX
を含み、ここでXはリシン(K)であるか又は不在である。
APEFLGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSQED PEVQFNWYVD
GVEVHNAKTK PREEQFNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK CKVSNKGLPS
SIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSQEEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE
WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSRL TVDKSRWQEG NVFSCSVMHE
ALHNHYTQKS LSLSLGX
を含み、ここでXはリシン(K)であるか又は不在である。
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVD
GVEVHNAKTK PREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK CKVSNKALPA
PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLWCLVK GFYPSDIAVE
WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQG NVFSCSVMHE
ALHNHYTQKS LSLSPGX
を有し、ここでXはリシン(K)であるか又は不在である。
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVD
GVEVHNAKTK PREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK CKVSNKALPA
PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLSCAVK GFYPSDIAVE
WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLVSKL TVDKSRWQQG NVFSCSVMHE
ALHNRYTQKS LSLSPGX
を有し、ここでXはリシン(K)であるか又は不在である。
APEX1X2GGPSV FLFPPKPKDT LX3IX4RX5PEVT CVVVDVSHED
PEVKFNWYVD GVEVHNAKTK PREEQYNSTY RVVSVLTVLH
QDWLNGKEYK CKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT
LPPSREEMTK NQVSLX6CX7VK GFYPSDIAVE WESNGQPENN
YKTTPPVLDS DGSFFLX8SKL TVDKSRWQQG NVFSCSVMHE
ALHX9X10YTQKS LSLSPGX11
であり、ここで:
(a)X1及びX2はいずれもL(野生型)であるか、又はいずれもA(FcγR結合低下)であり;
(b)X3、X4及びX5はそれぞれM、S及びT(野生型)であるか、又はY、T及びE(半減期延長)であり;
(c)X6、X7及びX8はそれぞれT、L及びY(野生型)であるか、又はW、L及びY(ノブ)、若しくはS、A及びV(ホール)であり;
(d)X9及びX10はそれぞれN及びH(野生型)であるか、又はN及びR(タンパク質A結合なし)、若しくはA及びK(タンパク質A結合なし)であり;
(e)X11はKであるか、又は不在である。
A.基準抗LAG‐3抗体
本発明の新規の抗LAG‐3結合分子を評価及び特性決定するために、以下の基準抗体を採用した:25F7(BMS‐986016、Medarex/BMS、本明細書では「LAG‐3 mAb A」と呼ぶ)。
25F7(「LAG‐3 mAb A」)のVHドメインのアミノ酸配列(配列番号129)を以下に示す(CDRH残基は下線付きで示されている):
QVQLQQWGAG LLKPSETLSL TCAVYGGSFS DYYWNWIRQP PGKGLEWIGE
INHNGNTNSN PSLKSRVTLS LDTSKNQFSL KLRSVTAADT AVYYCAFGYS
DYEYNWFDPW GQGTLVTVSS
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASQSIS SYLAWYQQKP GQAPRLLIYD
ASNRATGIPA RFSGSGSGTD FTLTISSLEP EDFAVYYCQQ RSNWPLTFGQ
GTNLEIK
抗PD‐1抗体と組み合わせた本発明の新規の抗LAG‐3結合分子を評価及び特性決定するために、基準抗体を用いてよい。PD‐1に免疫特異的な抗体は公知であり(例えば米国特許第8,008,449号;米国特許第8,552,154号;国際公開第2012/135408号;国際公開第2012/145549号;及び国際公開第2013/014668号参照):本明細書では「PD‐1 mAb 1」と呼ばれるニボルマブ(5C4、BMS‐936558、ONO‐4538、MDX‐1106としても公知、Bristol‐Myers SquibbがOPDIVO(登録商標)として市販);本明細書では「PD‐1 mAb 2」と呼ばれるペンブロリズマブ(以前はランブロリズマブとして公知、MK‐3475、SCH‐900475としても公知、MerckがKEYTRUDA(登録商標)として市販);本明細書では「PD‐1 mAb 3」と呼ばれるEH12.2H7(Dana Farber);本明細書では「PD‐1 mAb 4」と呼ばれるピジリズマブ(CT‐011(CureTech)としても公知)を含む。
PD‐1 mAb 1の重鎖可変ドメインのアミノ酸配列は、アミノ酸配列(配列番号131)(CDRH残基は下線付きで示されている):
QVQLVESGGG VVQPGRSLRL DCKASGITFS NSGMHWVRQA PGKGLEWVAV
IWYDGSKRYY ADSVKGRFTI SRDNSKNTLF LQMNSLRAED TAVYYCATND
DYWGQGTLVT VSS
を有する。
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASQSVS SYLAWYQQKP GQAPRLLIYD
ASNRATGIPA RFSGSGSGTD FTLTISSLEP EDFAVYYCQQ SSNWPRTFGQ
GTKVEIK
を有する。
PD‐1 mAb 2の重鎖可変ドメインのアミノ酸配列は、アミノ酸配列(配列番号133)(CDRH残基は下線付きで示されている):
QVQLVQSGVE VKKPGASVKV SCKASGYTFT NYYMYWVRQA PGQGLEWMGG
INPSNGGTNF NEKFKNRVTL TTDSSTTTAY MELKSLQFDD TAVYYCARRD
YRFDMGFDYW GQGTTVTVSS
を有する。
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASKGVS TSGYSYLHWY QQKPGQAPRL
LIYLASYLESGVPARFSGSG SGTDFTLTIS SLEPEDFAVY YCQHSRDLPL
TFGGGTKVEIK
を有する。
PD‐1 mAb 3の重鎖可変ドメインのアミノ酸配列は、アミノ酸配列(配列番号135)(CDRH残基は下線付きで示されている):
QVQLQQSGAE LAKPGASVQM SCKASGYSFT SSWIHWVKQR PGQGLEWIGY
IYPSTGFTEY NQKFKDKATL TADKSSSTAY MQLSSLTSED SAVYYCARWR
DSSGYHAMDY WGQGTSVTVSS
を有する。
DIVLTQSPAS LTVSLGQRAT ISCRASQSVS TSGYSYMHWY QQKPGQPPKL
LIKFGSNLESGIPARFSGSG SGTDFTLNIH PVEEEDTATY YCQHSWEIPY
TFGGGTKLEI K
を有する。
PD‐1 mAb 4の重鎖可変ドメインのアミノ酸配列は、アミノ酸配列(配列番号137)(CDRH残基は下線付きで示されている):
QVQLVQSGSE LKKPGASVKI SCKASGYTFT NYGMNWVRQA PGQGLQWMGW
INTDSGESTY AEEFKGRFVF SLDTSVNTAY LQITSLTAED TGMYFCVRVG
YDALDYWGQG TLVTVSS
を有する。
EIVLTQSPSS LSASVGDRVT ITCSARSSVS YMHWFQQKPG KAPKLWIYRT
SNLASGVPSR FSGSGSGTSY CLTINSLQPE DFATYYCQQR SSFPLTFGGG
TKLEIK
を有する。
抗LAG‐3ポリペプチド、並びに他のLAG‐3アゴニスト、アンタゴニスト及びモジュレータは、当該技術分野において公知の方法によって、例えば合成又は組み換えにより、LAG‐3 mAb 1、LAG‐3 mAb 2、LAG‐3 mAb 3、LAG‐3 mAb 4、LAG‐3 mAb 5又はLAG‐3 mAb 6抗体のポリヌクレオチド及び/又は配列から生成できる。このようなペプチドアゴニスト、アンタゴニスト及びモジュレータを製造する1つの方法は、ポリペプチドの化学合成と、これに続く、天然立体配座、即ち正しいジスルフィド結合を得るために適切な酸化条件下での処理とを伴う。これは、当業者に公知の方法論を用いて達成できる(例えばKelley, R. F. et al. (1990) In: Genetic Engineering Principles and Methods, Setlow, J.K. Ed., Plenum Press, N.Y., vol. 12, pp 1‐19; Stewart, J.M et al. (1984) Solid Phase Peptide Synthesis, Pierce Chemical Co., Rockford, ILを参照;米国特許第4,105,603号;米国特許第3,972,859号;米国特許第3,842,067号;及び米国特許第3,862,925号も参照)。
本発明は、本発明のLAG‐3結合分子(例えば、抗LAG‐3抗体、抗LAG‐3二重特異性ダイアボディ等)、このような分子由来のポリペプチド、このような分子又はポリペプチドをエンコードする配列を含むポリヌクレオチド、及び本明細書に記載の他の作用剤を含む、医薬組成物を含む組成物を包含する。
本発明の組成物は、医薬組成物の製造に使用できるバルク薬剤組成物(例えば不純又は非滅菌組成物)、及び単位剤形の調製に使用できる医薬組成物(即ち被験体又は患者への投与に好適な組成物)を含む。これらの組成物は、予防的又は治療的有効量の本発明のLAG‐3結合分子、又はこのような作用剤と薬学的に許容可能なキャリアとの組み合わせを含む。好ましくは、本発明の組成物は、予防的又は治療的有効量の本発明のLAG‐3結合分子のうちの1つ又は複数と、薬学的に許容可能なキャリアとを含む。本発明は特に、LAG‐3結合分子が:LAG‐3 mAb 1、LAG‐3 mAb 2、LAG‐3 mAb 3、LAG‐3 mAb 4、LAG‐3 mAb 5若しくはLAG‐3 mAb 6抗体;ヒト化LAG‐3 mAb 1; LAG‐3 mAb 2、LAG‐3 mAb 3、LAG‐3 mAb 4、LAG‐3 mAb 5若しくはLAG‐3 mAb 6抗体;いずれのこのような抗体のLAG‐3結合断片である、医薬組成物、又はLAG‐3結合分子が二重特異性LAG‐3ダイアボディ(例えば、LAG‐3×PD‐1二重特異性ダイアボディ)である、医薬組成物を包含する。特に包含されるのは:LAG‐3 mAb 1の3つのCDRL及び3つのCDRHを含む;又はLAG‐3 mAb 2の3つのCDRL及び3つのCDRHを含む;又はLAG‐3 mAb 3の3つのCDRL及び3つのCDRHを含む;又はLAG‐3 mAb 4の3つのCDRL及び3つのCDRHを含む;又はLAG‐3 mAb 5の3つのCDRL及び3つのCDRHを含む;又はLAG‐3 mAb 6の3つのCDRL及び3つのCDRHを含む、分子である。
本発明の組成物は、有効量の本発明の融合タンパク質若しくはコンジュゲート分子又は本発明の融合タンパク質若しくはコンジュゲート分子を含む医薬組成物を被験体に投与することによる、疾患、障害又は感染症に関連する1つ又は複数の症状の治療、予防及び改善のために提供できる。好ましい態様では、上記組成物は実質的に精製される(即ち上記組成物の効果を制限する、又は望ましくない副作用を生成する物質を実質的に含まない)。ある具体的実施形態では、被験体は動物、好ましくは非霊長類(例えばウシ属、ウマ科、ネコ科、イヌ科、げっ歯類等)又は霊長類(例えばカニクイザル等のサル、ヒト等)といった哺乳類である。ある好ましい実施形態では、被験体はヒトである。
6つのマウスモノクローナル抗体を、ヒト及びカニクイザルLAG‐3の両方に免疫特異的に結合できるものとして単離し、「LAG‐3 mAb 1」、「LAG‐3 mAb 2」、「LAG‐3 mAb 3」、「LAG‐3 mAb 4」、「LAG‐3 mAb 5」及び「LAG‐3 mAb 6」の呼称を与えた。これらの抗体のCDRは異なることが分かっており、上述されている。LAG‐3 mAb 1をヒト化すると、本明細書において「hLAG‐3 mAb 1 VH‐1」及び「hLAG‐3 mAb 1 VH‐2」と呼ばれる2つのヒト化VHドメイン、並びに本明細書において「hLAG‐3 mAb 1 VL‐1」、「hLAG‐3 mAb 1 VL‐2」、「hLAG‐3 mAb 1 VL‐3」及び「hLAG‐3 mAb 1 VL‐4」と呼ばれる4つのヒト化VLドメインが得られた。またLAG‐3 mAb 6をヒト化すると、本明細書において「hLAG‐3 mAb 6 VH‐1」及び「hLAG‐3 mAb 6 VH‐2」と呼ばれる2つのヒト化VHドメイン、並びに本明細書において「hLAG‐3 mAb 6 VL‐1」及び「hLAG‐3 mAb 6 VL‐2」と呼ばれる2つのヒト化VLドメインが得られた。上述されているように、所与の抗体のヒト化重鎖及び軽鎖可変ドメインは、いずれの組み合わせで使用してよく、ヒト化可変ドメインの特定の組み合わせは、具体的なVH/VLドメインに対する参照によって呼称され、例えばhLAG‐3 mAb 1 VH‐1及びhLAG‐3 mAb 1 VL‐2を含むヒト化抗体は具体的に「hLAG‐3 mAb 1(1.2)」と呼ばれる。
ASTKGPSVFP LAPSSKSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV
HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YICNVNHKPS NTKVDKRVEP
KSCDKTHTCP PCPAPEAAGG PSVFLFPPKP KDTLMISRTP EVTCVVVDVS
HEDPEVKFNW YVDGVEVHNA KTKPREEQYN STYRVVSVLT VLHQDWLNGK
EYKCKVSNKA LPAPIEKTIS KAKGQPREPQ VYTLPPSREE MTKNQVSLTC
LVKGFYPSDI AVEWESNGQP ENNYKTTPPV LDSDGSFFLY SKLTVDKSRW
QQGNVFSCSV MHEALHNHYT QKSLSLSPGX
であり、ここでXはリシン(K)であるか、又は不在である。
ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV
HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTKT YTCNVDHKPS NTKVDKRVES
KYGPPCPPCP APEFLGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSQED
PEVQFNWYVD GVEVHNAKTK PREEQFNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYK
CKVSNKGLPS SIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSQEEMTK NQVSLTCLVK
GFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSRL TVDKSRWQEG
NVFSCSVMHE ALHNHYTQKS LSLSLGX
であり、ここでXはリシン(K)であるか、又は不在である。
以下に記載の実験における、細胞上のチェックポイント阻害物質:PD‐1及びLAG‐3の発現レベルを決定するための実験は、以下の適切に蛍光標識された市販の抗体(フィコエリトリン‐シアニン7(PE‐Cy7)コンジュゲート抗CD4[クローンSK3]又はフルオレセインイソチオシアネート(FITC)コンジュゲート抗CD4[クローンRPA‐T4]、フィコエリトリン(PE)コンジュゲート抗LAG‐3[クローン3DS223H]、フィコエリトリン(PE)コンジュゲート抗PD‐1[クローンEH12.2H7]又はアロフィコシアニン(APC)コンジュゲート(eBiosciences若しくはBioLegend))、及び適切なアイソタイプ対照を使用した。全ての抗体は、製造元が推奨する濃度で使用した。一次抗体の添加のために、暗所において、氷上で30分間、FACSバッファ(PBS中、10%FCS)中での細胞染色を実施した。2回洗浄した後、細胞を、暗所において、氷上で30分間、適切な二次試薬で染色するか、又はフローサイトメーターで直ちに分析した。死亡細胞を排除するために、全ての試料を生存性染料:7‐アミノアクチノマイシンD(7‐AAD)(BD Biosciences若しくはBioLegend)、又は4',6‐ジアミジノ‐2‐フェニルインドール、ジヒドロクロリド(DAPI)(Life Technologies)を用いて共染色した。全ての試料を、FACS Calibur又はFortessaフローサイトメーター(BD Biosciences)で分析し、FlowJoソフトウェア(TreeStar、アシュランド、オレゴン州)を用いて分析した。
LAG‐3の発現、及び単離したLAG‐3抗体の、CD3/CD28刺激T細胞の表面上のLAG‐3に特異的に結合する能力を試験した。T細胞は、末梢血単核細胞(PBMC)から得た。簡潔に述べると、PBMCを、製造元の指示に従ってFicoll‐Paque Plus (GE Healthcare)密度勾配遠心法を用いて、健康なドナーからインフォームドコンセントのもとで得た全血から精製し、続いて製造元の指示に従ってDynabeads(登録商標)非接触ヒトT細胞キット(Life Technologies)を用いて、T細胞を精製した。刺激のために、単離したT細胞を、製造元の指示に従い、組み換えヒトIL‐2[30U/ml](Peprotech)及びDynabeads(登録商標)ヒトT細胞アクティベータビーズ(Life Technologies)の存在下で10〜14日間培養した。単離したばかりの未刺激CD4+T細胞、及び刺激CD4+T細胞(11日目又は14日目に培養物から取得)上におけるLAG‐3の発現を、FITCコンジュゲート抗CD4及びPEコンジュゲート抗LAG‐3を用いて、上述のようにフローサイトメトリーによって試験した。
黄色ブドウ球菌エンテロトキシンB型(SEB)は、高い割合のT細胞(5〜30%)を活性化できる、微生物超抗原である。SEBは、ペプチド結合溝の外側でMHC IIに結合するため、MHC II依存性であるが、制限されておらず、またTCR仲介性でもない。T細胞のSEB刺激により、オリゴクローナルT細胞増殖及びサイトカイン産生がもたらされる(ただしドナーによる変動性は観察され得る)。SEB刺激PBMC上での、抗LAG‐3及び抗PD‐1抗体の単独での及び組み合わせての発現を試験した。
ヒト化抗体hLAG‐3 mAb 6(1.1)及び基準抗体LAG‐3 mAb Aの、カニクイザルPBMC上に発現する内因性LAG‐3に結合する能力を、FACSによって調査した。この研究のために、PBMCをドナーであるカニクイザルの全血から単離し、単独で、又は概ね上述されているようにSEB刺激(500ng/mL)を伴って、培養した。SEB刺激の66時間後、(未刺激及び刺激)細胞を、hLAG‐3 mAb 6(1.1)、LAG‐3 mAb A又はPD‐1 mAb 1抗体(10倍段階希釈)で染色した。上記抗体を、ヤギ抗ヒトFc‐APC標識二次抗体を用いて検出した。2体のカニクイザルドナーに関して、図18A〜18Bに結合をプロットしている。
配列番号1:IgG1 Fc領域;Xaa217はリジン(K)又は不在である
配列番号2:IgG2 Fc領域;Xaa216はリジン(K)又は不在である
配列番号3:IgG3 Fc領域;Xaa217はリジン(K)又は不在である
配列番号4:IgG4 Fc領域;Xaa217はリジン(K)又は不在である
配列番号5:LAG−3
配列番号6:LAG−3 mAb 1のVH
配列番号7:LAG−3 mAb 1のVHをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号8:LAG−3 mAb 1のVH CDR1
配列番号9:LAG−3 mAb 1のVH CDR2
配列番号10:LAG−3 mAb 1のVH CDR3
配列番号11:LAG−3 mAb 1のVL
配列番号12:LAG−3 mAb 1のVLをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号13:LAG−3 mAb 1のVL CDR1
配列番号14:LAG−3 mAb 1のVL CDR2
配列番号15:LAG−3 mAb 1のVL CDR3
配列番号16:hLAG−3 mAb 1のVH1
配列番号17:hLAG−3 mAb 1のVH1をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号18:hLAG−3 mAb 1のVH2
配列番号19:hLAG−3 mAb 1のVH2をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号20:hLAG−3 mAb 1のVL1
配列番号21:hLAG−3 mAb 1のVL1をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号22:hLAG−3 mAb 1のVL2
配列番号23:hLAG−3 mAb 1のVL2をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号24:hLAG−3 mAb 1のVL3
配列番号25:hLAG−3 mAb 1のVL3をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号26:hLAG−3 mAb 1のVL4
配列番号27:hLAG−3 mAb 1のVL4をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号28:hLAG−3 mAb 1のVL4 CDR1
配列番号29:LAG−3 mAb 2のVH
配列番号30:LAG−3 mAb 2のVHをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号31:LAG−3 mAb 2のVH CDR1
配列番号32:LAG−3 mAb 2のVH CDR2
配列番号33:LAG−3 mAb 2のVH CDR3
配列番号34:LAG−3 mAb 2のVL
配列番号35:LAG−3 mAb 2のVLをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号36:LAG−3 mAb 2のVL CDR1
配列番号37:LAG−3 mAb 2のVL CDR2
配列番号38:LAG−3 mAb 2のVL CDR3
配列番号39:LAG−3 mAb 3のVH
配列番号40:LAG−3 mAb 3のVHをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号41:LAG−3 mAb 3のVH CDR1
配列番号42:LAG−3 mAb 3のVH CDR2
配列番号43:LAG−3 mAb 3のVH CDR3
配列番号44:LAG−3 mAb 3のVL
配列番号45:LAG−3 mAb 3のVLをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号46:LAG−3 mAb 3のVL CDR1
配列番号47:LAG−3 mAb 3のVL CDR2
配列番号48:LAG−3 mAb 3のVL CDR3
配列番号49:LAG−3 mAb 4のVH
配列番号50:LAG−3 mAb 4のVHをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号51:LAG−3 mAb 4のVH CDR1
配列番号52:LAG−3 mAb 4のVH CDR2
配列番号53:LAG−3 mAb 4のVH CDR3
配列番号54:LAG−3 mAb 4のVL
配列番号55:LAG−3 mAb 4のVLをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号56:LAG−3 mAb 4のVL CDR1
配列番号57:LAG−3 mAb 4のVL CDR2
配列番号58:LAG−3 mAb 4のVL CDR3
配列番号59:LAG−3 mAb 5のVH
配列番号60:LAG−3 mAb 5のVHをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号61:LAG−3 mAb 5のVH CDR1
配列番号62:LAG−3 mAb 5のVH CDR2
配列番号63:LAG−3 mAb 5のVH CDR3
配列番号64:LAG−3 mAb 5のVL
配列番号65:LAG−3 mAb 5のVLをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号66:LAG−3 mAb 5のVL CDR1
配列番号67:LAG−3 mAb 5のVL CDR2
配列番号68:LAG−3 mAb 5のVL CDR3
配列番号69:LAG−3 mAb 6のVH
配列番号70:LAG−3 mAb 6のVHをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号71:LAG−3 mAb 6のVH CDR1
配列番号72:LAG−3 mAb 6のVH CDR2
配列番号73:LAG−3 mAb 6のVH CDR3
配列番号74:LAG−3 mAb 6のVL
配列番号75:LAG−3 mAb 6のVLをエンコードするポリヌクレオチド
配列番号76:LAG−3 mAb 6のVL CDR1
配列番号77:LAG−3 mAb 6のVL CDR2
配列番号78:LAG−3 mAb 6のVL CDR3
配列番号79:hLAG−3 mAb 6のVH−1
配列番号80:hLAG−3 mAb 6のVH−1をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号81:hLAG−3 mAb 6のVH−2
配列番号82:hLAG−3 mAb 6のVH−2をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号83:hLAG−3 mAb 6のVL−1
配列番号84:hLAG−3 mAb 6のVL−1をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号85:hLAG−3 mAb 6のVL−2
配列番号86:hLAG−3 mAb 6のVL−2をエンコードするポリヌクレオチド
配列番号87:hLAG−3 mAb 6のVL−1/VL−2 CDRL1
配列番号88:リンカー
配列番号89:Cysリンカー2
配列番号90:ABDリンカー
配列番号91〜95:リンカー
配列番号96〜100:ヘテロ二量体促進ドメイン
配列番号101:Eコイル
配列番号102:Kコイル
配列番号103:修飾されたEコイル
配列番号104:修飾されたKコイル
配列番号105:ABD
配列番号106〜108:脱免疫化ABD
配列番号109:ヒンジリンカー
配列番号110:リンカー
配列番号111:Cysリンカー
配列番号112〜113:リンカー
配列番号114:IgG1ヒンジ
配列番号115:IgG2ヒンジ
配列番号116:IgG4ヒンジ
配列番号117:IgG4ヒンジ(S228P)
配列番号118:LCκ
配列番号119:LCλ
配列番号120:IgG1 CH1
配列番号121:IgG2 CH1
配列番号122:IgG4 CH1
配列番号123:IgG1(AA);Xaa217はリジン(K)又は不在である
配列番号124:IgG1 Fc(AA/YTE);Xaa217はリジン(K)又は不在である
配列番号125:IgG4 Fc(YTE);Xaa217はリジン(K)又は不在である
配列番号126:ノブFcドメイン;Xaa217はリジン(K)又は不在である
配列番号127:ホールFc;Xaa217はリジン(K)又は不在である
配列番号128:IgG1 Fcユニバーサル;Xaa4(X1)及びXaa5(X2)はいずれもL(野生型)であるか、又はいずれもA(FcγR結合低下)であり;Xaa22(X3)、 Xaa24(X4)及びXaa26(X5)はそれぞれM、S及びT(野生型)であるか、又はY、T及びE(半減期延長)であり;Xaa136(X6)及びXaa138(X7)はそれぞれT及びL(野生型)であるか、又はW及びL(野生型)、若しくはS及びA(ノブ)であり;Xaa177(X8)は、Xaa136(X6)がT又はWの何れかでXaa138(X7)がLの時、Y(野生型)であるか、Xaa136(X6)及びXaa138(X7)がそれぞれS及びAの時、V(ノブ)であり;Xaa204(X9)及びXaa205(X10)はそれぞれN及びH(野生型)であるか、又はN及びR(タンパク質A結合なし)、若しくはA及びK(タンパク質A結合なし)であり;Xaa217(X11)はKであるか、又は不在である
配列番号129:LAG−3 mAb AのVH
配列番号130:LAG−3 mAb AのVL
配列番号131:PD−1 mAb 1のVH
配列番号132:PD−1 mAb 1のVL
配列番号134:PD−1 mAb 2のVL
配列番号135:PD−1 mAb 3のVH
配列番号136:PD−1 mAb 3のVL
配列番号137:PD−1 mAb 4のVH
配列番号138:PD−1 mAb 4のVL
配列番号139:IgG1全定常領域(AA);Xaa330はKであるか、又は不在である
配列番号140:IgG4全定常領域(P);Xaa327はKであるか、又は不在である
Claims (20)
- ヒトLAG‐3及びカニクイザルLAG‐3の両方に結合できるLAG‐3結合分子であって、
前記LAG‐3結合分子は、可変重鎖ドメイン及び可変軽鎖ドメインを備え、
前記可変重鎖ドメインは、CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインを含み、前記可変軽鎖ドメインは、CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインを含み:
(A)(1)前記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 1の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号8、配列番号9及び配列番号10を有し;
(2)前記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 1の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号13、配列番号14及び配列番号15を有し;
又は
(B)(1)前記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、hLAG‐3 mAb 1の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号8、配列番号9及び配列番号10を有し;
(2)前記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、hLAG‐3 mAb 1の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号28、配列番号14及び配列番号15を有し;
又は
(C)(1)前記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 2の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号31、配列番号32及び配列番号33を有し;
(2)前記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 2の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号36、配列番号37及び配列番号38を有し;
又は
(D)(1)前記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 3の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号41、配列番号42及び配列番号43を有し;
(2)前記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 3の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号46、配列番号47及び配列番号48を有し;
又は
(E)(1)前記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 4の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号51、配列番号52及び配列番号53を有し;
(2)前記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 4の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号56、配列番号57及び配列番号58を有し;
又は
(F)(1)前記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 5の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号61、配列番号62及び配列番号63を有し;
(2)前記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 5の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号66、配列番号67及び配列番号68を有し;
又は
(G)(1)前記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 mAb 6 VH1の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号71、配列番号72及び配列番号73を有し;
(2)前記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、LAG‐3 mAb 6の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号76、配列番号77及び配列番号78を有し;
又は
(H)(1)前記CDRH1ドメイン、CDRH2ドメイン及びCDRH3ドメインは、LAG‐3 hAb 6の重鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号71、配列番号72及び配列番号73を有し;
(2)前記CDRL1ドメイン、CDRL2ドメイン及びCDRL3ドメインは、hLAG‐3 hAb 6の軽鎖CDRであり、それぞれアミノ酸配列:配列番号87、配列番号77及び配列番号78を有する、LAG‐3結合分子。 - 前記分子は抗体である、請求項1に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記分子は、キメラ抗体又はヒト化抗体である、請求項2に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記分子は、配列番号16、配列番号18、配列番号79又は配列番号81のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインを備える、請求項1又は3に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記分子は、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号83又は配列番号85のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインを備える、請求項1、3又は4に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記分子は、ヒトLAG‐3及び第2のエピトープに同時に結合できる二重特異性結合分子である、請求項1〜5のいずれか1項に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記第2のエピトープは、免疫細胞の表面に存在する免疫チェックポイントの制御に関与する分子のエピトープである、請求項6に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記第2のエピトープは、B7‐H3、B7‐H4、BTLA、CD40、CD40L、CD47、CD70、CD80、CD86、CD94、CD137、CD137L、CD226、CTLA‐4、ガレクチン‐9、GITR、GITRL、HHLA2、ICOS、ICOSL、KIR、LAG‐3、LIGHT、MHCクラスI若しくはII、NKG2a、NKG2d、OX40、OX40L、PD1H、PD‐1、PD‐L1、PD‐L2、PVR、SIRPa、TCR、TIGIT、TIM‐3又はVISTAのエピトープである、請求項6に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記分子は:
(a)ダイアボディであり、前記ダイアボディは、2つ若しくは3つ若しくは4つの異なるポリペプチド鎖を含む共有結合複合体である:又は
(b)3価結合分子であり、前記3価結合分子は、3つ、4つ若しくは5つのポリペプチド鎖を含む共有結合複合体である、請求項6〜8のいずれか1項に記載のLAG‐3結合分子。 - 前記分子はFc領域を備える、請求項9に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記分子は、アルブミン結合ドメイン(ABD)を備える、請求項9に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記ABDは、脱免疫化ABDである、請求項11に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記Fc領域は変異型Fc領域であり、前記変異型Fc領域は:
(a)FcγRに対する前記変異型Fc領域の親和性を低減する、1つ若しくは複数のアミノ酸修飾;及び/又は
(b)前記変異型Fc領域の血清半減期を増大させる1つ又は複数のアミノ酸修飾
を含む、請求項2〜5又は10のうちのいずれか1項に記載のLAG‐3結合分子。 - (a)前記変異型Fc領域の親和性を低減する、1つ又は複数の前記アミノ酸修飾は、置換:
(1)L234A;L235A;又は
(2)L234A及びL235A;
を含み、
(b)前記変異型Fc領域の血清半減期を増大させる1つ又は複数の前記アミノ酸修飾は、置換:
(1)M252Y;M252Y及びS254T;
(2)M252Y及びT256E;
(3)M252Y、S254T及びT256E;又は
(4)K288D及びH435K
を含み、
前記番号付与は、KabatによるEUインデックスの番号付与である、請求項13に記載のLAG‐3結合分子。 - 前記分子は、T細胞仲介型免疫応答の刺激を必要とする被験者のT細胞仲介型免疫応答を刺激するために使用される、請求項1〜14のいずれか1項に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記分子は、抑制された免疫系に関連する疾患又は状態の治療に使用される、請求項1〜14のいずれか1項に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記疾患又は状態は、癌又は感染症である、請求項16に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記疾患又は状態は:副腎癌;AIDS関連癌;胞巣状軟部肉腫;星細胞腫瘍;膀胱癌;骨癌;脳及び脊髄癌;転移性脳腫瘍;乳癌;頸動脈球腫瘍;子宮頸癌;軟骨肉腫;脊索腫;発色性腎細胞癌;明細胞癌;大腸癌;結腸直腸癌;皮膚良性線維性組織球腫;線維形成性小円形細胞腫瘍;上衣腫;ユーイング腫瘍;骨外性粘液型軟骨肉腫;骨性線維形成不全症;線維性骨異形成症;胆嚢若しくは胆管癌;消化器癌;妊娠性絨毛性疾患;胚細胞腫瘍;頭頸部癌;肝細胞癌;膵島細胞腫;カポジ肉腫;腎臓癌、白血病、脂肪腫/良性リポソーム腫瘍、脂肪肉腫/悪性リポソーム腫瘍、肝臓癌;リンパ腫;肺癌;髄芽腫;黒色腫;髄膜腫;多発性内分泌腫瘍;多発性骨髄腫;骨髄異形成症候群;神経芽細胞腫;神経内分泌腫瘍;卵巣癌;膵臓癌;乳頭状甲状腺癌;副甲状腺腫瘍;小児癌;末梢神経鞘腫瘍;褐色細胞腫;下垂体腫瘍;前立腺癌;後部ブドウ膜黒色腫;希少な血液学的障害;腎転移性癌;ラブドイド腫瘍;横紋筋肉腫;肉腫;皮膚癌;軟組織肉腫;扁平上皮細胞癌;胃癌;滑膜肉腫;精巣癌;胸腺癌;胸腺腫;甲状腺転移性癌;及び子宮癌の細胞からなる群から選択される癌細胞の存在を特徴とする癌である、請求項17に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記疾患又は状態は:結腸直腸癌;肝細胞癌;神経膠腫;腎臓癌;乳癌;多発性骨髄腫;膀胱癌;神経芽細胞腫;肉腫;非ホジキンリンパ腫;非小細胞肺癌;卵巣癌:膵臓癌;直腸癌;急性骨髄性白血病(AML);慢性骨髄性白血病(CML);急性Bリンパ芽球性白血病(B‐ALL);慢性リンパ球性白血病(CLL);毛様細胞白血病(HCL);芽球性形質細胞様樹状細胞新生物(BPDCN);マントル細胞白血病(MCL)及び小リンパ球性リンパ腫(SLL)を含む非ホジキンリンパ腫(NHL);ホジキンリンパ腫;全身性肥満細胞症;又はバーキットリンパ腫である、請求項17に記載のLAG‐3結合分子。
- 前記分子は検出可能に標識され、LAG‐3の検出に使用される、請求項1〜14のいずれか1項に記載のLAG‐3結合分子。
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