JP2017515494A - コルネキシスチン及びヒドロキシコルネキシスチンの生合成のための遺伝子クラスター - Google Patents
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Abstract
Description
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンは、以前はペシロマイセス・バリオッティ(Paecilomyces variotii)SANK 21086として知られていた、真菌ペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)に由来する天然産物である。コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンはいずれも、トウモロコシ植物に毒性がないというユニークな性質を有する非常に強力な除草剤である。この性質ゆえに、両分子は研究上の関心を集めてきた。Sankyo Corporationは、除草剤用途で生物抽出物をスクリーニングした際に、コルネキシスチンを発見した(JP2256602)。コルネキシスチンは、除草剤として優れた活性を示すとともに、トウモロコシ植物に対しては相対的に不活性であることを示した。Sankyoの特性解析では、この真菌の天然産物が、中央の9員環、縮合無水マレイン酸、およびペンダントアルキル鎖を含む興味深い構造特性で知られるノナドリド(nonadride)ファミリーメンバーであることが示された。コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンは、ジアステレオマーのみ化学合成法によって合成されている(Org. Biomol. Chem., 2008, 6, 4012-4025)。9員炭素環構造は、一般に、天然ではまれであり、その合成ならびに合成に関わる遺伝子はいまだ知られておらず、報告もない。
発明の概要
本発明は、タラロマイセス・スティピタタスまたはビポラリス・マイディスから単離することができるコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチンの生成に関与する、遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子G、および遺伝子Hのポリヌクレオチドを提供する。本発明はまた、上記ポリヌクレオチドのバリアント、およびそうしたポリヌクレオチドを含有する組換え微生物も提供する。このような組換え微生物は、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチン、またはその両者を製造するために、さらに加えて、コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの前駆体を製造するために使用することができる。ポリヌクレオチドは発現カセットに含まれていることが好ましく、この発現カセットは、組換え微生物が、コードされたポリペプチドを発現できるようにするものであって、組換え微生物に遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子G、もしくは遺伝子Hのうち少なくとも1つの機能を提供することができるが、その微生物が遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子G、または遺伝子Hの各機能に関する内在性遺伝子をすでに有している場合には、組換え微生物に遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子G、もしくは遺伝子Hの機能に関する追加の遺伝子を提供することができる。
「コルネキシスチン」という用語は、式(I)の化合物を意味する。
本明細書に記載の式I〜IVの化合物は、幾何異性体、たとえばE/Z異性体、を形成することができる。こうした異性体はまた複数のキラル中心を有するので、その結果としてエナンチオマーまたはジアステレオマーとして存在しうる。式IIおよびIVの化合物は、塩を形成することができる。したがって、「コルネキシスチン」、「コルネキシスチンの二塩基酸」、「ヒドロキシコルネキシスチン」、および「ヒドロキシコルネキシスチンの二塩基酸」という用語はまた、広義では、異性体およびそれらの混合物、ならびに純粋なエナンチオマーおよびジアステレオマーおよびそれらの混合物、ならびに化合物I〜IVの化合物の塩、好ましくは化合物I〜IVの化合物の農業上許容される塩を包含することになるが、より好ましいのは化合物IIおよびIVの化合物の農業上許容される塩である。
Gap Weight: 12 Length Weight: 4
Average Match: 2,912 Average Mismatch:-2,003
2つのアミノ酸配列間の「配列同一性」という用語は、いずれの場合も完全長配列にわたる核酸配列(アミノ酸配列)の同一性パーセントを意味すると理解され、これはプログラムアルゴリズムGAP(Wisconsin Package Version 10.0, University of Wisconsin, Genetics Computer Group (GCG), Madison, USA)を用いたアラインメントにより、以下のパラメーターを設定して計算される:
Gap Weight: 8 Length Weight: 2
Average Match: 2,912 Average Mismatch:-2,003
1) DNA-DNAハイブリッド(Meinkoth and Wahl, Anal. Biochem., 138: 267-284, 1984):
Tm= 81.5℃ + 16.6xlog10[Na+]a + 0.41x%[G/Cb] - 500x[L]-1 - 0.61x% ホルムアミド
2) DNA-RNAまたはRNA-RNAハイブリッド:
Tm= 79.8℃+ 18.5 (log10[Na+]a) + 0.58 (%G/Cb) + 11.8 (%G/Cb)2 - 820/Lc
3) オリゴ-DNAまたはオリゴ-RNAd ハイブリッド:
<20ヌクレオチドについて:Tm= 2 (ln)
20-35ヌクレオチドについて:Tm= 22 + 1.46 (ln)
a または、他の一価カチオンに関するが、0.01-0.4 Mの範囲だけが正確である。
b %GCについては、30%〜75%の範囲だけが正確である。
c L = 塩基対としての二本鎖の長さ
d オリゴ、オリゴヌクレオチド;ln = 有効なプライマー長 = 2×(G/C数)+(A/T数)。
表1:保存的アミノ酸置換の例
第1の態様において、本発明は、コルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチンの微生物における生産を支えるために使用することができる、ポリペプチドをコードする核酸配列およびポリペプチドを提供する。本明細書で使用されるコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン合成は、コルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチンの生合成の全ステップを含む。したがって、コルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチンの合成に関わるポリペプチドは、基質をコルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンに変換するか、またはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生合成において生じる前駆体のいずれかを生成することができる。好ましくは、本発明のポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドは、生物、好ましくは本明細書に別記される組換え微生物において、発現の際に、コルネキシスチンおよび/もしくはヒドロキシコルネキシスチン、またはそれらの前駆体の量を増加させることができるであろう。こうした増加は、本発明のポリヌクレオチドの発現を欠いた対照生物と比較して統計的に有意であることが好ましい。対照生物は同一種であることが好ましく、組換え微生物を構築するために使用されたのと同一の系統(菌株)に属することが、さらにいっそう好ましい。増加が有意であるかどうかは、当技術分野で周知の統計学的検定によって判定することが可能であり、たとえば、スチューデントt検定などがある。より好ましくは、この増加は、前記対照と比較して、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、または少なくとも30%のコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチンの増加である。コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの量を確認して測定するために適当なアッセイは、当業者に知られており、たとえば、US4897104、US4990178、US5424278、およびUS14/084030に記載されている。
遺伝子Aの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)(配列番号1および2)およびペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)(配列番号13および14)から単離されうる。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)特徴a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
a2)配列番号14、15、16、17、18および/または19に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号13に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号13の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号13の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号14に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)特徴a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
a2)配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)特徴a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Bの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)(配列番号20および21)およびペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)(配列番号32および33)から単離されうる。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)特徴b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
b2)配列番号33、34、35、36、37および/または38に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号33に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号32の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号32の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号33に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)特徴b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
b2)配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号255に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号255の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号339に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)特徴b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Cの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)(配列番号39および40)およびペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)(配列番号51および52)から単離されうる。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)特徴c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
c2)配列番号52、53、54、55、56および/または57に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号51に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号51の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号51の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号52に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)特徴c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
c2)配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)特徴c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Dの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)(配列番号58および59)およびペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)(配列番号70および76)から単離されうる。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)特徴d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
d2)配列番号71、72、73、74、75および/または76に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号70に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号70の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号70の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号71に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)特徴d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
d2)配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)特徴d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Eの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)(配列番号77および78)およびペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)(配列番号89および90)から単離されうる。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)特徴e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
e2)配列番号90、91、92、93、94および/または95に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号89に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号89の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号89の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号90に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)特徴e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
e2)配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)特徴e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Fの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)(配列番号96および97)およびペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)(配列番号108および109)から単離されうる。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)特徴f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
e2)配列番号109、110、111、112、113および/または114に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号108に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号108の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号108の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号109に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)特徴f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
e2)配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)特徴f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Gの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)(配列番号115および116)およびペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)(配列番号127および128)から単離されうる。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)特徴g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
g2)配列番号128、129、130、131、132および/または133に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号127に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号127の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号127の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号128に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)特徴g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
g2)配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)特徴g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Hの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)(配列番号134および135)およびペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)(配列番号146および147)から単離されうる。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)特徴h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
h2)配列番号147、148、149、150、151および/または152に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号146に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号146の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号146の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号147に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)特徴h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
h2)配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
hg4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)特徴h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Iの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号153および154)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
i2)配列番号154、155、156、157、158および/または159に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i3)配列番号153に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号153の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i5)プライマー当たり配列番号153の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i6)特徴i1)、i2)、i3)、i4)およびi5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Jの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号160および161)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
j2)配列番号161、162、163、164、165および/または166に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j3)配列番号160に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号160の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j5)プライマー当たり配列番号160の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j6)特徴j1)、j2)、j3)、j4)およびj5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Kの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号167および168)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
k2)配列番号168、169、170、171、172および/または173に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k3)配列番号167に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号167の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k5)プライマー当たり配列番号167の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k6)特徴k1)、k2)、k3)、k4)およびk5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Lの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号174および175)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
l2)配列番号175、176、177、178、179および/または180に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l3)配列番号174に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号174の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l5)プライマー当たり配列番号174の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l6)特徴l1)、l2)、l3)、l4)およびl5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Mの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号181および182)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
m2)配列番号182、183、184、185、186および/または187に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m3)配列番号181に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号181の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m5)プライマー当たり配列番号181の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m6)特徴m1)、m2)、m3)、m4)およびm5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Nの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号188および189)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
n2)配列番号189、190、191、192、193および/または194に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n3)配列番号188に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号188の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n5)プライマー当たり配列番号188の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n6)特徴n1)、n2)、n3)、n4)およびn5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Oの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号195および196)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
o2)配列番号196、197、198、199、200および/または201に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o3)配列番号195に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号195の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o5)プライマー当たり配列番号195の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o6)特徴o1)、o2)、o3)、o4)およびo5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Pの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号202および208)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
p2)配列番号203、204、205、206、207および/または208に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p3)配列番号202に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号202の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p5)プライマー当たり配列番号202の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p6)特徴p1)、p2)、p3)、p4)およびp5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Qの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号209および210)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
q2)配列番号210、211、212、213、214および/または215に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q3)配列番号209に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号209の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q5)プライマー当たり配列番号209の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q6)特徴q1)、q2)、q3)、q4)およびq5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子Rの機能をもたらすポリヌクレオチドおよびポリペプチドはペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)から単離されうる(配列番号216および217)。これらのポリペプチドの変異体としては、例えば、限定的なものではないが以下のものが挙げられる。
r2)配列番号217、218、219、220、221および/または222に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r3)配列番号216に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号216の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r5)プライマー当たり配列番号216の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r6)特徴r1)、r2)、r3)、r4)およびr5)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子G、遺伝子H、遺伝子I、遺伝子J、遺伝子K、遺伝子L、遺伝子M、遺伝子N、遺伝子O、遺伝子P、遺伝子Qおよび遺伝子Rの機能をもたらすポリペプチドは、参照配列に対する種々の度合の同一性、与えられた配列にハイブリダイズするそれらの能力、またはコルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムからのそれらの入手可能性の、ポリペプチドおよびポリヌクレオチド配列に関する異なる特徴1〜6の組合せにより前記に記載されている。これらの特徴は、それぞれの機能をもたらすポリペプチドを記載するために個々に又は組合せて用いられうる、と当業者は理解するであろう。
本発明は、組換え微生物、特に、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方およびそれらの前駆体の産生に使用されうる組換え微生物を構築するために使用されうるポリヌクレオチドを提供する。好ましくは、記載されているポリペプチドのための組換え体である組換え微生物を作製するために使用される微生物はコルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方を既に産生しうる。通常、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方の産生能を増強するために該微生物を形質転換するが、幾つかの実施形態においては、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方の産生能を有する微生物を得るために、欠失遺伝子機能を相補するために該微生物を形質転換する。幾つかの実施形態においては、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方の産生能を破壊またはダウンレギュレーションするために該微生物を形質転換する。好ましくは、該微生物は、後記の「組換え微生物」において定められている微生物の群の少なくとも1つに属する。
aa)aa1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
aa2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
aa3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
aa4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズする、あるいは
aa5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
aa6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
aa7)aa1)、aa2)、aa3)、aa4)、aa5)およびaa6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
bb)bb1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
bb2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
bb3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
bb4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズする、あるいは
bb5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
bb6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
bb7)bb1)、bb2)、bb3)、bb4)、bb5)およびbb6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
cc)cc1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
cc2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
cc3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
cc4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズする、あるいは
cc5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
cc6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
cc7)cc1)、cc2)、cc3)、cc4)、cc5)およびcc6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
dd)dd1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
dd2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
dd3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
dd4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズする、あるいは
dd5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
dd6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
dd7)dd1)、dd2)、dd3)、dd4)、dd5)およびdd6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
ee)e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ee2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ee3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
ee4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズする、あるいは
ee5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
ee6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
ee7)ee1)、ee2)、ee3)、ee4)、ee5)およびee6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
ff)ff1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ff2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ff3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
ff4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズする、あるいは
ff5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
ff6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
ff7)ff1)、ff2)、ff3)、ff4)、ff5)およびff6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
gg)gg1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
gg2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
gg3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
gg4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズする、あるいは
gg5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
gg6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
gg7)gg1)、gg2)、gg3)、gg4)、gg5)およびgg6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
hh)hh1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
hh2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
hh3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
hh4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズする、あるいは
hh5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
hh6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
hh7)hh1)、hh2)、hh3)、hh4)、hh5)およびhh6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
本発明のもう1つの実施形態は、前記のポリヌクレオチドのいずれか1つを含むベクターである。
I)配列番号223に示されている核酸配列と同一であり、あるいは
II)配列番号236に示されている核酸配列に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、あるいは
III)配列番号236に示されている核酸配列を含むポリヌクレオチドに高いストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で該プロモーターがハイブリダイズすることを可能にし、あるいは
IV)野生型ペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)またはバイソクラミス・ベルコサ(Byssochlamys verrucosa)ゲノムの発現カセット(ここで、該発現カセットは、配列番号238に示されているアミノ酸配列に対して少なくとも90%、95%または100%同一であるポリペプチド配列をコードするポリヌクレオチドを含む)から入手可能であり、配列番号236に示されている核酸配列に対して少なくとも60%、75%または80%同一であり、あるいは
V)野生型ペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)またはバイソクラミス・ベルコサ(Byssochlamys verrucosa)ゲノムの発現カセット(ここで、該発現カセットは、配列番号237に示されている核酸配列に対して少なくとも90%、95%または100%同一である核酸配列を有するポリヌクレオチドを含む)から入手可能であり、配列番号236に示されている核酸配列に対して少なくとも60%、75%または80%同一であり、
前記の作動的に連結されたポリペプチドは以下のものである:
a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
a7)特徴a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つを含むポリヌクレオチド、あるいは
b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
b7)特徴b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つを含むポリヌクレオチド、あるいは
c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
c7)特徴c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つを含むポリヌクレオチド、あるいは
d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
d7)特徴d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つを含むポリヌクレオチド、あるいは
e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
e7)特徴e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つを含むポリヌクレオチド、あるいは
f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
f7)特徴f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つを含むポリヌクレオチド、あるいは
g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
g7)特徴g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つを含むポリヌクレオチド、あるいは
h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいは
h7)特徴h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つを含むポリヌクレオチド。
a)該ポリペプチドの産生を可能にする条件下、本発明の組換え微生物を培養し、
b)工程a)の組換え微生物から該ポリペプチドを得ることを含み、ここで、該ポリペプチドは以下のものである:
a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)特徴a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つを含むポリペプチド、あるいは
b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)特徴b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つを含むポリペプチド、あるいは
c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)特徴c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つを含むポリペプチド、あるいは
d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)特徴d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つを含むポリペプチド、あるいは
e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)特徴e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つを含むポリペプチド、あるいは
f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)特徴f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つを含むポリペプチド、あるいは
g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)特徴g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つを含むポリペプチド、あるいは
h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)特徴h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つを含むポリペプチド。
本発明のポリヌクレオチドおよびベクターは微生物(これは、遺伝子またはポリヌクレオチドの該微生物の天然の組合せに加えて、前記ポリヌクレオチドの少なくとも1つを含む)におけるコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの製造に特に適している。好ましくは、ポリヌクレオチドをコードするポリペプチドはそれぞれの微生物に対してコドンが最適化される。
a)a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
b)b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
c)c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
d)d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
e)e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
f)f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
g)g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
h)h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット、
ここで、a)〜h)の発現カセットの少なくとも1つは組換え発現カセットであり、あるいはa)〜h)の発現カセットの少なくとも1つは組換えポリヌクレオチドに含まれる。
a)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む少なくとも1つの発現カセット、あるいは
b)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む少なくとも1つの発現カセット、あるいは
c)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む少なくとも1つの発現カセット、あるいは
d)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む少なくとも1つの発現カセット、あるいは
e)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む少なくとも1つの発現カセット、あるいは
f)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む少なくとも1つの発現カセット、あるいは
g)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む少なくとも1つの発現カセット、あるいは
h)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む少なくとも1つの発現カセット。
a)は、
a1)配列番号2または14に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号14、15、16、17、18および/または19に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1または13に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1または13の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号13の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号21または33に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号33、34、35、36、37および/または38に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20または32に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20または32の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号32の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号40または52に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号52、53、54、55、56および/または57に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39または51に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39または51の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号51の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号59または71に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号71、72、73、74、75および/または76に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58または70に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58または70の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号70の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号78または90に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号90、91、92、93、94および/または95に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77または89に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77または89の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号89の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号97または109に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号109、110、111、112、113および/または114に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96または108に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96または108の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号108の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号116または128に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号128、129、130、131、132および/または133に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115または127に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115または127の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号127の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号135または147に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号147、148、149、150、151および/または152に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134または146に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134または146の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号146の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
i)は、
i1)配列番号154に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i2)配列番号154、155、156、157、158および/または159に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i3)配列番号153に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号153の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i5)プライマー当たり配列番号153の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i6)i1)、i2)、i3)、i4)およびi5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
j)は、
j1)配列番号161に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j2)配列番号161、162、163、164、165および/または166に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j3)配列番号160に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号160の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j5)プライマー当たり配列番号160の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j6)j1)、j2)、j3)、j4)およびj5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
k)は、
k1)配列番号168に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k2)配列番号168、169、170、171、172および/または173に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k3)配列番号167に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号167の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k5)プライマー当たり配列番号167の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k6)k1)、k2)、k3)、k4)およびk5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
l)は、
l1)配列番号175に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l2)配列番号175、176、177、178、179および/または180に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l3)配列番号174に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号174の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l5)プライマー当たり配列番号174の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l6)l1)、l2)、l3)、l4)およびl5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
m)は、
m1)配列番号182に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m2)配列番号182、183、184、185、186および/または187に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m3)配列番号181に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号181の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m5)プライマー当たり配列番号181の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m6)m1)、m2)、m3)、m4)およびm5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
n)は、
n1)配列番号189に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n2)配列番号189、190、191、192、193および/または194に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n3)配列番号188に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号188の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n5)プライマー当たり配列番号188の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n6)n1)、n2)、n3)、n4)およびn5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
o)は、
o1)配列番号196に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o2)配列番号196、197、198、199、200および/または201に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o3)配列番号195に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号195の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o5)プライマー当たり配列番号195の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o6)o1)、o2)、o3)、o4)およびo5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
p)は、
p1)配列番号203に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p2)配列番号203、204、205、206、207および/または208に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p3)配列番号202に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号202の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p5)プライマー当たり配列番号202の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p6)p1)、p2)、p3)、p4)およびp5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
q)は、
q1)配列番号210に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q2)配列番号210、211、212、213、214および/または215に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q3)配列番号209に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号209の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q5)プライマー当たり配列番号209の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q6)q1)、q2)、q3)、q4)およびq5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
r)は、
r1)配列番号217に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r2)配列番号217、218、219、220、221および/または222に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r3)配列番号216に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号216の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r5)プライマー当たり配列番号216の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r6)r1)、r2)、r3)、r4)およびr5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
ここで、a)〜h)の発現カセットの少なくとも1つは以下のものである:
a)a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
b)b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
c)c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
d)d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
e)e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
f)f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
g)g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
h)h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
そして、ここで、a)〜r)の発現カセットの少なくとも1つは組換え発現カセットであり、あるいはa)〜r)の発現カセットの少なくとも1つは組換えポリヌクレオチドに含まれる。
a)は、
a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである。
a)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
b)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
c)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
d)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
e)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
f)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
g)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
h)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドを含む。
i)配列番号153に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
j)配列番号160に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
k)配列番号167に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
l)配列番号174に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
m)配列番号181に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
n)配列番号188に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
o)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号195の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチド、あるいは
p)配列番号202に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
q)配列番号209に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは
r)配列番号216に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド。
本発明のもう1つの部分は、a)遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子G、遺伝子Hの少なくとも1つの機能をもたらしうるポリヌクレオチドまたはそのようなポリヌクレオチドを含むベクターで微生物を形質転換し、b)該ポリヌクレオチドまたは該ベクターを含む微生物を選択する工程を含む組換え微生物の製造(生産)方法である。
組換えポリヌクレオチド、ポリペプチド、発現カセットおよびベクターは、コルネキシスチン、ヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方を産生しうる組換え微生物を得るために使用されうる。これらの微生物は、コルネキシスチン、ヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方の製造のための方法およびプロセスにおいて使用されうる。したがって、本発明のもう1つの部分は、
a)遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子G、遺伝子Hの少なくとも1つの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドで微生物を形質転換し、
b)該ポリヌクレオチドの少なくとも1つを含む微生物を選択し、
c)工程の組換え微生物を選択し、
d)コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方を産生させる工程を含む、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの製造またはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの製造のための組換え微生物の製造(生産)方法であり、ここで、該組換え微生物は、遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子Gおよび遺伝子Hの少なくとも1つの機能をもたらすのに適した前記のタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)から単離される少なくとも1つのポリペプチドおよびその変異体を含む。
a)遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子G、遺伝子Hの少なくとも1つの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む組換え微生物を、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの該組換え微生物による産生を可能にする条件下で培養し、
b)産生したコルネキシスチンまたは産生したヒドロキシコルネキシスチンを得、あるいは産生したコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンを得る工程を含む、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方の製造方法を提供する。好ましくは、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンを培養ブロスから得、ここで、該組換え微生物は、遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子Gおよび遺伝子Hの少なくとも1つの機能をもたらすのに適した前記のタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)から単離される少なくとも1つのポリペプチドおよびその変異体を含む。
a)請求項1〜11のいずれか1項記載の組換え微生物を、該組換え微生物によるコルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの産生またはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする条件下で培養し、
b)産生したコルネキシスチンまたは産生したヒドロキシコルネキシスチンを得、あるいは産生したコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンを得る工程を含み、ここで、該組換え微生物は、遺伝子A、遺伝子B、遺伝子C、遺伝子D、遺伝子E、遺伝子F、遺伝子Gおよび遺伝子Hの少なくとも1つの機能をもたらすのに適した前記のタラロミセス・スチピタタス(Talaromyces stipitatus)から単離される少なくとも1つのポリペプチドおよびその変異体を含む。
遺伝子Aの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Bの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Cの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Dの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Eの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Fの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Gの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Hの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Iの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Jの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Kの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Lの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Nの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Oの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Pの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Qの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む。
遺伝子Aの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Bの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Cの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Dの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Eの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Fの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Gの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Hの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Iの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Jの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Kの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Lの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Mの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Nの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Oの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Pの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Qの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、
遺伝子Rの機能をもたらしうる少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む。
a)は、
a1)配列番号2または14に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号14、15、16、17、18および/または19に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1または13に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1または13の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号13の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号21または33に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号33、34、35、36、37および/または38に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20または32に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20または32の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号32の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号40または52に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号52、53、54、55、56および/または57に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39または51に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39または51の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号51の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号59または71に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号71、72、73、74、75および/または76に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58または70に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58または70の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号70の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号78または90に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号90、91、92、93、94および/または95に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77または89に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77または89の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号89の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号97または109に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号109、110、111、112、113および/または114に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96または108に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96または108の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号108の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号116または128に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号128、129、130、131、132および/または133に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115または127に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115または127の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号127の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号135または147に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号147、148、149、150、151および/または152に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134または146に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134または146の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号146の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
i)は、
i1)配列番号154に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i2)配列番号154、155、156、157、158および/または159に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i3)配列番号153に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号153の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i5)プライマー当たり配列番号153の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i6)i1)、i2)、i3)、i4)およびi5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
j)は、
j1)配列番号161に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j2)配列番号161、162、163、164、165および/または166に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j3)配列番号160に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号160の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j5)プライマー当たり配列番号160の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j6)j1)、j2)、j3)、j4)およびj5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
k)は、
k1)配列番号168に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k2)配列番号168、169、170、171、172および/または173に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k3)配列番号167に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号167の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k5)プライマー当たり配列番号167の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k6)k1)、k2)、k3)、k4)およびk5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
l)は、
l1)配列番号175に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l2)配列番号175、176、177、178、179および/または180に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l3)配列番号174に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号174の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l5)プライマー当たり配列番号174の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l6)l1)、l2)、l3)、l4)およびl5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
m)は、
m1)配列番号182に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m2)配列番号182、183、184、185、186および/または187に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m3)配列番号181に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号181の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m5)プライマー当たり配列番号181の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m6)m1)、m2)、m3)、m4)およびm5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
n)は、
n1)配列番号189に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n2)配列番号189、190、191、192、193および/または194に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n3)配列番号188に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号188の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n5)プライマー当たり配列番号188の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n6)n1)、n2)、n3)、n4)およびn5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
o)は、
o1)配列番号196に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o2)配列番号196、197、198、199、200および/または201に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o3)配列番号195に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号195の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o5)プライマー当たり配列番号195の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o6)o1)、o2)、o3)、o4)およびo5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
p)は、
p1)配列番号203に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p2)配列番号203、204、205、206、207および/または208に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p3)配列番号202に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号202の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p5)プライマー当たり配列番号202の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p6)p1)、p2)、p3)、p4)およびp5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
q)は、
q1)配列番号210に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q2)配列番号210、211、212、213、214および/または215に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q3)配列番号209に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号209の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q5)プライマー当たり配列番号209の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q6)q1)、q2)、q3)、q4)およびq5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
r)は、
r1)配列番号217に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r2)配列番号217、218、219、220、221および/または222に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r3)配列番号216に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号216の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r5)プライマー当たり配列番号216の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r6)r1)、r2)、r3)、r4)およびr5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
ここで、a)〜h)の発現カセットの少なくとも1つは以下のものである:
a)a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
b)b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
c)c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
d)d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
e)e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
f)f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
g)g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
h)h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
そして、ここで、a)〜r)の発現カセットの少なくとも1つは組換え発現カセットであり、あるいはa)〜r)の発現カセットの少なくとも1つは組換えポリヌクレオチドに含まれる。
I)コルネキシスチンまたはヒドロキシコルネキシスチンを産生しうる微生物の細胞を準備(用意)する工程;
II)a)〜h)の少なくとも1つで該細胞を形質転換する工程;ここで、
a)は
a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
III)工程II)のa)〜h)の少なくともいずれかの、発現カセットを少なくとも1つ含む形質転換微生物を特定する工程;
IV)工程III)の形質転換微生物細胞を、該形質転換微生物によるコルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする又はコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする条件下で培養する工程。
a)a1)配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
b)b1)配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
c)c1)配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
d)d1)配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
e)e1)配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
f)f1)配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
g)g1)配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
h)h1)配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
hg4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
ここで、発現カセットa)〜h)の少なくとも1つは組換え発現カセットであり、あるいは発現カセットa)〜h)の少なくとも1つは組換えポリヌクレオチドに含まれる。
b)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
c)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
d)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
e)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
f)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
g)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
h)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、前記微生物。
a)は、
a1)配列番号244または14に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号14、15、16、17、18および/または19に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号243または13に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243または13の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号13の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号256または340または33に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号33、34、35、36、37および/または38に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号256または340または32に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号256または340または32の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号32の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図9において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号267または52に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号52、53、54、55、56および/または57に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号267または51に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267または51の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号51の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号280または71に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号71、72、73、74、75および/または76に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号279または70に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279または70の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号70の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号292または90に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号90、91、92、93、94および/または95に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号291または89に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291または89の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号89の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号304または109に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号109、110、111、112、113および/または114に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号303または108に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303または108の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号108の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号316または128に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号128、129、130、131、132および/または133に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号315または127に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315または127の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号127の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号328または147に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号147、148、149、150、151および/または152に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号328または146に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号328または146の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号146の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
i)は、
i1)配列番号154に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i2)配列番号154、155、156、157、158および/または159に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i3)配列番号153に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号153の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i5)プライマー当たり配列番号153の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i6)i1)、i2)、i3)、i4)およびi5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
j)は、
j1)配列番号161に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j2)配列番号161、162、163、164、165および/または166に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j3)配列番号160に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号160の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j5)プライマー当たり配列番号160の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j6)j1)、j2)、j3)、j4)およびj5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
k)は、
k1)配列番号168に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k2)配列番号168、169、170、171、172および/または173に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k3)配列番号167に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号167の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k5)プライマー当たり配列番号167の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k6)k1)、k2)、k3)、k4)およびk5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
l)は、
l1)配列番号175に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l2)配列番号175、176、177、178、179および/または180に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l3)配列番号174に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号174の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l5)プライマー当たり配列番号174の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l6)l1)、l2)、l3)、l4)およびl5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
m)は、
m1)配列番号182に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m2)配列番号182、183、184、185、186および/または187に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m3)配列番号181に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号181の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m5)プライマー当たり配列番号181の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m6)m1)、m2)、m3)、m4)およびm5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
n)は、
n1)配列番号189に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n2)配列番号189、190、191、192、193および/または194に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n3)配列番号188に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号188の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n5)プライマー当たり配列番号188の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n6)n1)、n2)、n3)、n4)およびn5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
o)は、
o1)配列番号196に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o2)配列番号196、197、198、199、200および/または201に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o3)配列番号195に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号195の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o5)プライマー当たり配列番号195の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o6)o1)、o2)、o3)、o4)およびo5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
p)は、
p1)配列番号203に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p2)配列番号203、204、205、206、207および/または208に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p3)配列番号202に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号202の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p5)プライマー当たり配列番号202の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p6)p1)、p2)、p3)、p4)およびp5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
q)は、
q1)配列番号210に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q2)配列番号210、211、212、213、214および/または215に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q3)配列番号209に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号209の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q5)プライマー当たり配列番号209の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q6)q1)、q2)、q3)、q4)およびq5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
r)は、
r1)配列番号217に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r2)配列番号217、218、219、220、221および/または222に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r3)配列番号216に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号216の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r5)プライマー当たり配列番号216の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r6)r1)、r2)、r3)、r4)およびr5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
ここで、a)〜h)の発現カセットの少なくとも1つは以下のものである:
a)a1)配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
b)b1)配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現される、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現される、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図9において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
c)c1)配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
d)d1)配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
e)e1)配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
f)f1)配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
g)g1)配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
h)h1)配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
そして、ここで、a)〜r)の発現カセットの少なくとも1つは組換え発現カセットであり、あるいはa)〜r)の発現カセットの少なくとも1つは組換えポリヌクレオチドに含まれる、微生物。
a)は、
a1)配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現される、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現される、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図9において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである、微生物。
b)は、配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
c)は、配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
d)は、配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
e)は、配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
f)は、配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
g)は、配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
h)は、配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、上記に記載した微生物。
j)は、配列番号160に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
k)は、配列番号167に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
l)は、配列番号174に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
m)は、配列番号181に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
n)は、配列番号188に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
o)は、配列番号195に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
p)は、配列番号202に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
q)は、配列番号209に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
r)は、配列番号216に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、上記に記載した微生物。
aa)aa1)配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
aa2)配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
aa3)配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
aa4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズする、あるいは
aa5)プライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
aa6)配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
aa7)aa1)、aa2)、aa3)、aa4)、aa5)およびaa6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
bb)bb1)配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
bb2)配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
bb3)配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
bb4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズする、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズする、あるいは
bb5)プライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用して、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
bb6)配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図9において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは
bb7)bb1)、bb2)、bb3)、bb4)、bb5)およびbb6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
cc)cc1)配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
cc2)配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
cc3)配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
cc4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズする、あるいは
cc5)プライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
cc6)配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
cc7)cc1)、cc2)、cc3)、cc4)、cc5)およびcc6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
dd)dd1)配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
dd2)配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
dd3)配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
dd4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズする、あるいは
dd5)プライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
dd6)配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
dd7)dd1)、dd2)、dd3)、dd4)、dd5)およびdd6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
ee)e1)配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ee2)配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ee3)配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
ee4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズする、あるいは
ee5)プライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
ee6)配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
ee7)ee1)、ee2)、ee3)、ee4)、ee5)およびee6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
ff)ff1)配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ff2)配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ff3)配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
ff4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズする、あるいは
ff5)プライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
ff6)配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
ff7)ff1)、ff2)、ff3)、ff4)、ff5)およびff6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;
gg)gg1)配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
gg2)配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
gg3)配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
gg4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズする、あるいは
gg5)プライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
gg6)配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
gg7)gg1)、gg2)、gg3)、gg4)、gg5)およびgg6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;ならびに
hh)hh1)配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
hh2)配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
hh3)配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
hh4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズする、あるいは
hh5)プライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
hh6)配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
hh7)hh1)、hh2)、hh3)、hh4)、hh5)およびhh6)の少なくとも2つのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
aa)配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
bb)配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号223に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
cc)配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
dd)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
ee)配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
ff)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
gg)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、および
hh)配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド。
b)産生したコルネキシスチンもしくは産生したヒドロキシコルネキシスチンを得、または産生したコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンを得る工程を含む、コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの製造またはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの製造のための製造方法。
I)コルネキシスチンまたはヒドロキシコルネキシスチンを産生しうる微生物の細胞を準備する工程;
II)a)〜h)の少なくとも1つで該細胞を形質転換する工程;ここで、
a)は、
a1)配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現される、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現される、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図9において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
III)工程II)のa)〜h)の少なくとも1つの、少なくとも1つの発現カセットを含む形質転換微生物を特定する工程;
IV)工程III)の形質転換微生物細胞を、該形質転換微生物によるコルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする又はコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする条件下で培養する工程を含む方法。
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産を増加させるために、ペシロマイセス・ディバリカタス由来の強力なHSP9プロモーター(配列番号223)を用いてトランスポータータンパク質2(配列番号135、これは配列番号134によりコードされる)を過剰発現させる。
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。
表20:実施例1の結果
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産を増加させるために、ペシロマイセス・ディバリカタス由来の強力なHSP9プロモーター(配列番号223)を用いてトランスポータータンパク質1(配列番号116、これは配列番号115によりコードされる)を過剰発現させる。
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。前培養物2 mLを用いて、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた生産培地(50g/Lポテトフレーク、50 g/Lグリセロール、4 g/L尿素、pH 6.0)100 mLに植菌する。全フラスコは、26℃にて220 rpmで13日間インキュベートする。菌糸体を収集し、上清を抽出して、コルネキシスチン生産をHPLCで分析する(US14/084030およびEP13182735.4を参照されたい)。結果は、クローンごとに2つの独立した振盪フラスコの平均力価を示す。
表21:実施例2の結果
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産を増加させるために、ペシロマイセス・ディバリカタス由来の強力なHSP9プロモーター(配列番号223)を用いて仮想タンパク質(配列番号78、これは配列番号77によりコードされる)を過剰発現させる。
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。
表22:実施例3の結果
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産を増加させるために、ペシロマイセス・ディバリカタス由来の強力なHSP9プロモーター(配列番号223)を用いてメチルクエン酸シンターゼ(配列番号59、これは配列番号58によりコードされる)を過剰発現させる。
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。
表23:実施例4の結果
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産を増加させるために、ペシロマイセス・ディバリカタス由来の強力なHSP9プロモーター(配列番号223)を用いてチオエステラーゼ(配列番号97、これは配列番号96によりコードされる)を過剰発現させる。
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。
表24:実施例5の結果
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産を増加させるために、ペシロマイセス・ディバリカタス由来の強力なHSP9プロモーター(配列番号223)を用いてポリケチド合成酵素(配列番号2、これは配列番号1によりコードされる)を過剰発現させる。
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。
表25:実施例6の結果
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産を増加させるために、ペシロマイセス・ディバリカタス由来の強力なHSP9プロモーター(配列番号223)を用いてポリケチドシクラーゼ(配列番号21、これは配列番号20によりコードされる)を過剰発現させる。
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。
表26:実施例7の結果
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産を増加させるために、ペシロマイセス・ディバリカタス由来の強力なHSP9プロモーター(配列番号223)を用いてクエン酸シンターゼ(配列番号40、これは配列番号39によりコードされる)を過剰発現させる。
ハイグロマイシン耐性クローンからゲノムDNAを単離する(US14/084030およびEP13182735.4を参照されたい)。プライマーであるPhsp9 fwおよびCitrate synthase Ts rv(配列番号225および240)を用いてPCRを実施し、組み込まれた過剰発現構築物を有するクローンを同定する。
野生株および3つのクエン酸シンターゼ過剰発現クローンのコルネキシスチン生産を、振盪フラスコ実験によって検討する:
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。
表27:実施例8の結果
コルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチン生産の増加が、明確に、ペシロマイセス・ディバリカタスにおけるタラロマイセス・スティピタタス由来相同遺伝子の組み込みおよび過剰発現によるものであることを実証するために、対照プラスミドpHOFF6-Phsp9(配列番号241)で形質転換し(形質転換法についてはUS14/084030およびEP13182735.4を参照されたい)、ペシロマイセス・ディバリカタスゲノムにおいて異所性に組み込む。このプラスミドはPhsp9プロモーターおよびtrpCターミネーターのみを含有し、制御配列の間に当該の遺伝子を含有しない。
ペシロマイセス・ディバリカタス分生子懸濁液2 mL(胞子約109個/mL、野生株または過剰発現クローンに由来する)を、整流装置のない500 mL三角フラスコに満たされた前培養培地(20 g/Lグルコース一水和物、20 g/Lポリペプトン、10 g/L麦芽エキス、10 g/L酵母エキス、1 g/L K2HPO4、 0.5 g/L MgSO4 x 7 H2O、0.001 % シリコン油AR 1000、pH 7.0)100 mL中で培養する。フラスコは、26℃にて220 rpmで3日間インキュベートする。
表28:実施例9の結果
Claims (25)
- 以下のa)〜h)、すなわち、
a)a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
b)b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現される、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現される、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
c)c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
d)d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
e)e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
f)f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
g)g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
h)h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット
の少なくとも1つを含む微生物であって、ここで、a)〜h)の発現カセットの少なくとも1つは組換え発現カセットであり、あるいはa)〜h)の発現カセットの少なくとも1つは組換えポリヌクレオチドに含まれる、微生物。 - コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方を産生しうる、請求項1記載の微生物。
- ペシロマイセス・ディバリカタス(P. divaricatus)種に属する、請求項1または2記載の微生物。
- a)に関する少なくとも1つの発現カセット、b)に関する少なくとも1つの発現カセット、c)に関する少なくとも1つの発現カセット、d)に関する少なくとも1つの発現カセット、e)に関する少なくとも1つの発現カセット、f)に関する少なくとも1つの発現カセット、g)に関する少なくとも1つの発現カセットおよびh)に関する少なくとも1つの発現カセットを含む、請求項1〜3のいずれか1項記載の微生物。
- a)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは少なくとも1つの発現カセットが、配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
b)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは少なくとも1つの発現カセットが、配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
c)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは少なくとも1つの発現カセットが、配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
d)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは少なくとも1つの発現カセットが、配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
e)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは少なくとも1つの発現カセットが、配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
f)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは少なくとも1つの発現カセットが、配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
g)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは少なくとも1つの発現カセットが、配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは
h)少なくとも1つの発現カセットが、配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは少なくとも1つの発現カセットが、配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、
請求項1〜4のいずれか1項記載の微生物。 - a)、b)、c)、d)、e)、f)、g)、h)を含み、そしてi)、j)、k)、l)、m)、n)、o)、p)、q)およびr)の少なくとも2つを含む微生物、ここで、
a)は、
a1)配列番号2または14に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244または14に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号14、15、16、17、18および/または19に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号14、15、16、17、18および/または19に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1または13に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号243または13に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1または13の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243または13の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号13の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号13の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号21または33に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256または340または33に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号33、34、35、36、37および/または38に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号33、34、35、36、37および/または38に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20または32に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号256または340または32に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20または32の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号256または340または32の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号32の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号32の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号40または52に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号267または52に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号52、53、54、55、56および/または57に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号52、53、54、55、56および/または57に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39または51に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号267または51に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39または51の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267または51の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号51の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号51の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号59または71に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280または71に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号71、72、73、74、75および/または76に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号71、72、73、74、75および/または76に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58または70に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号279または70に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58または70の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279または70の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号70の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号70の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号78または90に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292または90に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号90、91、92、93、94および/または95に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号90、91、92、93、94および/または95に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77または89に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号291または89に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77または89の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291または89の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号89の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号89の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号97または109に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304または109に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号109、110、111、112、113および/または114に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号109、110、111、112、113および/または114に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96または108に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号303または108に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96または108の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303または108の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号108の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号108の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号116または128に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316または128に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号128、129、130、131、132および/または133に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号128、129、130、131、132および/または133に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115または127に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号315または127に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115または127の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315または127の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号127の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号127の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号135または147に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328または147に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号147、148、149、150、151および/または152に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号147、148、149、150、151および/または152に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134または146に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号328または146に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134または146の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号328または146の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号146の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいはプライマー当たり配列番号146の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
i)は、
i1)配列番号154に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i2)配列番号154、155、156、157、158および/または159に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
i3)配列番号153に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号153の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i5)プライマー当たり配列番号153の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
i6)i1)、i2)、i3)、i4)およびi5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
j)は、
j1)配列番号161に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j2)配列番号161、162、163、164、165および/または166に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
j3)配列番号160に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号160の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j5)プライマー当たり配列番号160の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
j6)j1)、j2)、j3)、j4)およびj5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
k)は、
k1)配列番号168に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k2)配列番号168、169、170、171、172および/または173に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
k3)配列番号167に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号167の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k5)プライマー当たり配列番号167の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
k6)k1)、k2)、k3)、k4)およびk5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
l)は、
l1)配列番号175に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l2)配列番号175、176、177、178、179および/または180に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
l3)配列番号174に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号174の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l5)プライマー当たり配列番号174の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
l6)l1)、l2)、l3)、l4)およびl5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
m)は、
m1)配列番号182に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m2)配列番号182、183、184、185、186および/または187に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
m3)配列番号181に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号181の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m5)プライマー当たり配列番号181の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
m6)m1)、m2)、m3)、m4)およびm5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
n)は、
n1)配列番号189に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n2)配列番号189、190、191、192、193および/または194に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
n3)配列番号188に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号188の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n5)プライマー当たり配列番号188の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
n6)n1)、n2)、n3)、n4)およびn5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
o)は、
o1)配列番号196に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o2)配列番号196、197、198、199、200および/または201に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
o3)配列番号195に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号195の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o5)プライマー当たり配列番号195の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
o6)o1)、o2)、o3)、o4)およびo5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
p)は、
p1)配列番号203に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p2)配列番号203、204、205、206、207および/または208に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
p3)配列番号202に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号202の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p5)プライマー当たり配列番号202の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
p6)p1)、p2)、p3)、p4)およびp5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
q)は、
q1)配列番号210に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q2)配列番号210、211、212、213、214および/または215に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
q3)配列番号209に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号209の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q5)プライマー当たり配列番号209の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
q6)q1)、q2)、q3)、q4)およびq5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
r)は、
r1)配列番号217に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r2)配列番号217、218、219、220、221および/または222に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
r3)配列番号216に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号216の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r5)プライマー当たり配列番号216の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
r6)r1)、r2)、r3)、r4)およびr5)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
ここで、a)〜h)の発現カセットの少なくとも1つは以下のものである:
a)a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
b)b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現される、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現される、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
c)c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
d)d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
e)e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
f)f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
g)g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
h)h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセット;
そして、ここで、a)〜r)の発現カセットの少なくとも1つは組換え発現カセットであり、あるいはa)〜r)の発現カセットの少なくとも1つは組換えポリヌクレオチドに含まれる、微生物。 - コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはそれらの両方を産生しうる、請求項6記載の微生物。
- ペシロマイセス・ディバリカタス(P. divaricatus)種に属する、請求項6または7記載の微生物。
- a)は、
a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットであり、
b)は、
b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現される、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現される、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットであり、
c)は、
c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットであり、
d)は、
d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットであり、
e)は、
e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットであり、
f)は、
f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットであり、
g)は、
g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットであり、
h)は、
h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットであり、
該微生物が少なくとも1つの発現カセットa)、少なくとも1つの発現カセットb)、少なくとも1つの発現カセットc)、少なくとも1つの発現カセットd)、少なくとも1つの発現カセットe)、少なくとも1つの発現カセットf)、少なくとも1つの発現カセットg)および少なくとも1つの発現カセットh)を含む、請求項6〜8のいずれか1項記載の微生物。 - a)は、配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセット、あるいは配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
b)は、配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセット、あるいは配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
c)は、配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセット、あるいは配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
d)は、配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセット、あるいは配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
e)は、配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセット、あるいは配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
f)は、配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセット、あるいは配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
g)は、配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセット、あるいは配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
h)は、配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセット、あるいは配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、
請求項6〜9のいずれか1項記載の微生物。 - i)は、配列番号153に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
j)は、配列番号160に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
k)は、配列番号167に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
l)は、配列番号174に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
m)は、配列番号181に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
n)は、配列番号188に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
o)は、中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号195の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
p)は、配列番号202に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
q)は、配列番号209に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、あるいは
r)は、配列番号216に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチドをコードする少なくとも1つの発現カセットである、
請求項6〜10のいずれか1項記載の微生物。 - aa)ポリヌクレオチドであって、
aa1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
aa2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
aa3)配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
aa4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズする、あるいは
aa5)プライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
aa6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
aa7)特徴aa1)、aa2)、aa3)、aa4)、aa5)およびaa6)の少なくとも2つを有する、
ポリヌクレオチド;
bb)ポリヌクレオチドであって、
bb1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードするポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
bb2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
bb3)配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現される、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
bb4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズする、あるいは
bb5)プライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現される、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
bb6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
bb7)特徴bb1)、bb2)、bb3)、bb4)、bb5)およびbb6)の少なくとも2つを有する、
ポリヌクレオチド;
cc)ポリヌクレオチドであって、
cc1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
cc2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、をコードする、あるいは
cc3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
cc4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズする、あるいは
cc5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
cc6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
cc7)特徴cc1)、cc2)、cc3)、cc4)、cc5)およびcc6)の少なくとも2つを有する、
ポリヌクレオチド;
dd)ポリヌクレオチドであって、
dd1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
dd2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
dd3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
dd4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズする、あるいは
dd5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
dd6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
dd7)特徴dd1)、dd2)、dd3)、dd4)、dd5)およびdd6)の少なくとも2つを有する、
ポリヌクレオチド;
ee)ポリヌクレオチドであって、
e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
ee2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ee3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
ee4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズする、あるいは
ee5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
ee6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチドをコードする、あるいは
ee7)特徴ee1)、ee2)、ee3)、ee4)、ee5)およびee6)の少なくとも2つを有する、
ポリヌクレオチド;
ff)ポリヌクレオチドであって、
ff1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
ff2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
ff3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
ff4)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズする、あるいは
ff5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
ff6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
ff7)特徴ff1)、ff2)、ff3)、ff4)、ff5)およびff6)の少なくとも2つを有する、
ポリヌクレオチド;
gg)ポリヌクレオチドであって、
gg1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
gg2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
gg3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
gg4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズする、あるいは
gg5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
gg6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
gg7)特徴gg1)、gg2)、gg3)、gg4)、gg5)およびgg6)の少なくとも2つを有する、
ポリヌクレオチド;
hh)ポリヌクレオチドであって、
hh1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
hh2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチドをコードする、あるいは
hh3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは
hh4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズする、あるいは
hh5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうる、あるいは
hh6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
hh7)特徴hh1)、hh2)、hh3)、hh4)、hh5)およびhh6)の少なくとも2つを有する、
ポリヌクレオチド
からなる群から選択される組換えポリヌクレオチド。 - aa)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
bb)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号255または339または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号223に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
cc)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
dd)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
ee)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
ff)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、
gg)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、あるいは配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、および
hh)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド、配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチド
の群から選択される、請求項12記載の組換えポリヌクレオチド。 - 請求項12または13記載の組換えポリヌクレオチドを含むベクター。
- 請求項12もしくは13記載の組換えポリヌクレオチドまたは請求項14記載のベクターを含む微生物。
- 該組換え微生物が細菌、真菌または酵母である、請求項15記載の組換え微生物。
- a)請求項1〜11のいずれか1項記載の組換え微生物を、該組換え微生物によるコルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする又はコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする条件下で培養し、
b)産生したコルネキシスチンもしくは産生したヒドロキシコルネキシスチンを得、または産生したコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンを得る工程を含む、
コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの製造またはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの製造のための製造方法。 - コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンまたはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンを培養ブロスから得る、請求項17記載の製造方法。
- コルネキシスチンまたはヒドロキシコルネキシスチンの少なくとも1つをその二塩基酸として、またはその農業上許容される塩の形態で得る、請求項17または18のいずれか1項記載の製造方法。
- コルネキシスチンまたはヒドロキシコルネキシスチン産生微生物におけるコルネキシスチンまたはヒドロキシコルネキシスチンの産生を増強するための方法であって、
I)コルネキシスチンまたはヒドロキシコルネキシスチンを産生しうる微生物の細胞を準備する工程;
II)a)〜h)の少なくとも1つで該細胞を形質転換する工程;ここで、
a)は、
a1)配列番号2に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a2)配列番号2、3、4、5、6、7、8、9、10、11および/または12に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号244、245、246、247、248、249、250、251、252、253および/または254に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
a3)配列番号1に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号243に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号1の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号243の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a5)プライマー当たり配列番号1の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号243の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
a6)配列番号2に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号244に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図1において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
a7)a1)、a2)、a3)、a4)、a5)およびa6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
b)は、
b1)配列番号21に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b2)配列番号21、22、23、24、25、26、27、28、29、30および/または31に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号256、257、258、259、260、261、262、263、264、265および/または266に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一である、あるいは配列番号340、341、342、343、344、345、346、347、348、349および/または350に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
b3)配列番号20に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号255または339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現される、あるいは配列番号339に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号20の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号255または339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現される、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号339の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b5)プライマー当たり配列番号20の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号255または339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現される、あるいはプライマー当たり配列番号339の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
b6)配列番号21に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号256に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含む、あるいは配列番号340に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図2において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
b7)b1)、b2)、b3)、b4)、b5)およびb6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
c)は、
c1)配列番号40に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c2)配列番号40、41、42、43、44、45、46、47、48、49および/または50に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号268、269、270、271、272、273、274、275、276、277および/または278に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
c3)配列番号39に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号267に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号39の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号267の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c5)プライマー当たり配列番号39の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号267の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
c6)配列番号40に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号268に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図3において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
c7)c1)、c2)、c3)、c4)、c5)およびc6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
d)は、
d1)配列番号59に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d2)配列番号59、60、61、62、63、64、65、66、67、68および/または69に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号280、281、282、283、284、285、286、287、288、289および/または290に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
d3)配列番号58に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号279に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号58の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号279の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d5)プライマー当たり配列番号58の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号279の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
d6)配列番号59に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号280に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図4において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
d7)d1)、d2)、d3)、d4)、d5)およびd6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
e)は、
e1)配列番号78に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e2)配列番号78、79、80、81、82、83、84、85、86、87および/または88に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号292、293、294、295、296、297、298、299、300、301および/または302に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
e3)配列番号77に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号291に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号77の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号291の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e5)プライマー当たり配列番号77の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号291の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
e6)配列番号78に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号292に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図5において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
e7)e1)、e2)、e3)、e4)、e5)およびe6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
f)は、
f1)配列番号97に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f2)配列番号97、98、99、100、101、102、103、104、105、106および/または107に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号304、305、306、307、308、309、310、311、312、313および/または314に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
f3)配列番号96に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号303に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号96の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号303の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f5)プライマー当たり配列番号96の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号303の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
f6)配列番号97に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号304に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図6において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
f7)f1)、f2)、f3)、f4)、f5)およびf6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
g)は、
g1)配列番号116に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g2)配列番号116、117、118、119、120、121、122、123、124、125および/または126に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号316、317、318、319、320、321、322、323、324、325および/または326に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
g3)配列番号115に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号315に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号115の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号315の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g5)プライマー当たり配列番号115の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号315の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
g6)配列番号116に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号316に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図7において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
g7)g1)、g2)、g3)、g4)、g5)およびg6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
h)は、
h1)配列番号135に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h2)配列番号135、136、137、138、139、140、141、142、143、144および/または145に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは配列番号328、329、330、331、332、333、334、335、336、337および/または338に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリペプチド、あるいは
h3)配列番号134に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは配列番号327に対して少なくとも80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h4)中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号134の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは中等度のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で配列番号327の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h5)プライマー当たり配列番号134の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してパママイシン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいはプライマー当たり配列番号327の少なくとも15個の連続的ポリヌクレオチドのプライマーペアを使用してコルネキシスチンおよび/またはヒドロキシコルネキシスチン産生生物のゲノムDNAまたはcDNA上のPCRにより得られうるポリヌクレオチドから発現されるポリペプチド、あるいは
h6)配列番号135に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは配列番号328に対して少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、82%、84%、86%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一であり、図8において黒色の矢印で示されたアミノ酸の少なくとも80%、90%または全てを含むポリペプチド、あるいは
h7)h1)、h2)、h3)、h4)、h5)およびh6)の少なくとも2つのポリペプチド
をコードする少なくとも1つの発現カセットである;
III)工程II)のa)〜h)の少なくとも1つの、少なくとも1つの発現カセットを含む形質転換微生物を特定する工程;
IV)工程III)の形質転換微生物細胞を、該形質転換微生物によるコルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする又はコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの産生を可能にする条件下で培養する工程を含む方法。 - コルネキシスチンまたはヒドロキシコルネキシスチンを産生しうる微生物がペシロマイセス・ディバリカタス(Paecilomyces divaricatus)である、請求項20記載の方法。
- コルネキシスチンまたはヒドロキシコルネキシスチンの少なくとも1つをその二塩基酸として、またはその農業上許容される塩の形態で得る、請求項20または21記載の方法。
- 請求項1〜11、15もしくは16のいずれか1項記載の組換え微生物を製造するための、請求項12もしくは13記載のポリヌクレオチドの少なくとも1つ、または請求項14記載のベクターの少なくとも1つの使用。
- 請求項17〜19のいずれか1項記載の製造方法または請求項20もしくは21記載の方法における、請求項12もしくは13記載のポリヌクレオチドの少なくとも1つ、または請求項14記載のベクターの少なくとも1つの使用。
- コルネキシスチンもしくはヒドロキシコルネキシスチンの製造のための、またはコルネキシスチンおよびヒドロキシコルネキシスチンの製造のための、請求項12もしくは13記載のポリヌクレオチドの少なくとも1つ、または請求項14記載のベクターの少なくとも1つ、または請求項1〜11、15もしくは16のいずれか1項記載の組換え微生物の少なくとも1つの使用。
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