JP2016539658A - テンポリンSHaのアナログおよびその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
F−L−K−G−I−K−G−M−L−G−K−L−F(配列番号:3);
F−L−K−G−I−V−G−K−L−G−K−L−F(配列番号:4);
F−L−K−G−I−V−G−M−L−G−K−L−L(配列番号:5);
F−L−K−G−I−V−G−M−L−G−K−L−W(配列番号:6);
F−L−K−G−I−V−G−M−L−G−K−L−I(配列番号:7);
F−L−K−G−I−K−G−M−L−G−K−L−L(配列番号:8);
F−L−K−G−I−K−G−M−L−G−K−L−W(配列番号:9);
F−L−K−G−I−K−G−M−L−G−K−L−I(配列番号:10);
F−L−K−G−I−V−G−K−L−G−K−L−W(配列番号:11);
F−L−K−G−I−V−G−K−L−G−K−L−L(配列番号:12);
F−L−K−G−I−V−G−K−L−G−K−L−I(配列番号:13);
F−L−K−G−I−K−G−K−L−G−K−L−F(配列番号:14);
F−L−K−G−I−K−G−K−L−G−K−L−L(配列番号:15);
F−L−K−G−I−K−G−K−L−G−K−L−W(配列番号:16);および
F−L−K−G−I−K−G−K−L−G−K−L−I(配列番号:17)
からなる群より選択される配列を含む、または該配列からなるペプチドからなる群より選択されてもよい。
本明細書において、「ペプチド」、「オリゴペプチド」、「ポリペプチド」および「タンパク質」なる語は、互換的に利用され、ペプチド結合により連結したアミノ酸の鎖をいい、その鎖を形成するアミノ酸の数は関係ない。
F−L−X1−G−I−X2−G−M−L−G−K−L−F(配列番号:18)、
F−L−X1−G−I−V−G−X3−L−G−K−L−F(配列番号:19)、
F−L−X1−G−I−V−G−M−L−G−K−L−X4(配列番号:20)、
F−L−X1−G−I−X2−G−X3−L−G−K−L−F(配列番号:21)、
F−L−X1−G−I−X2−G−M−L−G−K−L−X4(配列番号:22)、
F−L−X1−G−I−V−G−X3−L−G−K−L−X4(配列番号:23)および
F−L−X1−G−I−X2−G−X3−L−G−K−L−X4(配列番号:2)
(ここで、X1、X2およびX3は、同一または異なり、R、HおよびKからなる群より選択され、そしてX4はI、LおよびWからなる群より、好ましくはLおよびWからなる群より選択される)
からなる群より選択される配列を含むか、または該配列からなる。
F−L−K−G−I−K−G−M−L−G−K−L−F(配列番号:3)、
F−L−K−G−I−V−G−K−L−G−K−L−F(配列番号:4)、
F−L−K−G−I−V−G−M−L−G−K−L−L(配列番号:5)、
F−L−K−G−I−V−G−M−L−G−K−L−W(配列番号:6)、
F−L−K−G−I−V−G−M−L−G−K−L−I(配列番号:7)、
F−L−K−G−I−K−G−M−L−G−K−L−L(配列番号:8)、
F−L−K−G−I−K−G−M−L−G−K−L−W(配列番号:9)、
F−L−K−G−I−K−G−M−L−G−K−L−I(配列番号:10)、
F−L−K−G−I−V−G−K−L−G−K−L−W(配列番号:11)、
F−L−K−G−I−V−G−K−L−G−K−L−L(配列番号:12)、
F−L−K−G−I−V−G−K−L−G−K−L−I(配列番号:13)、
F−L−K−G−I−K−G−K−L−G−K−L−F(配列番号:14)、
F−L−K−G−I−K−G−K−L−G−K−L−L(配列番号:15)、
F−L−K−G−I−K−G−K−L−G−K−L−W(配列番号:16)および
F−L−K−G−I−K−G−K−L−G−K−L−I (配列番号:17)
からなる群より選択される配列を含むか、または該配列からなる。
より好ましくは、該ペプチドは、配列番号:3〜6および8の配列からなる群より選択される配列を含むか、または該配列からなり、さらにより好ましくは、配列番号:3、5および6の配列からなる群より選択される配列を含むか、または該配列からなる。
材料および方法
固相ペプチド合成
固相ペプチド合成は、Vanhoyeら(Vanhoyeら、2004)によって記載されるプロトコルに従い、Fmoc保護アミノ酸(Novabiochem, Switzerland)およびRinkアミドMBHA樹脂(Senn Chemicals, Switzerland)を利用することにより、自動ペプチド合成装置(Applied Biosystems 433A)を用いて実施された。
次の菌株:エシェリキア・コリ(ATCC25922およびML−35p)、スタフィロコッカス・アウレウス(ATCC25923およびST1065)、エンテロコッカス・フェカリス(ATCC29212)、シュードモナス・エルギノーサ(ATCC27853)、ストレプトコッカス・ピオゲネス(ATCC19615)、リステリア・イバノビ、サルモネラ・エンテリカ(血清型エンテリディディス)、アシネトバクター・バウマンニ(ATCC19606)およびクラブシエラ・ニューモニエ(ATCC13883)を抗微生物活性の試験に用いた。2種の抗生物質耐性菌株(エス・アウレウスATCC43300およびATCCBAA−44)も用いた。
3種の酵母菌株:サッカロミセス・セレビシア、カンジダ・アルビカンス(ATCC90028)、カンジダ・パラシローシス(ATCC22019)を試験した。これらの菌株を最初にYPD寒天上で最低48時間増殖させた。次に酵母懸濁液を、YPDブロス培地中で、細菌が106cfu/mLに正確に調整されるように、調製した。
ペプチドのリーシュマニア活性は、内臓リーシュマニア症に関与する、前鞭毛型の小児リーシュマニア(菌株 MHOM/MA/67/ITMAP−263)について評価された。
80μLの前鞭毛虫懸濁液(105寄生虫/ウェル)を20μLのペプチド溶液(50ないし3.125μMの最終濃度)と一緒にマイクロタイタープレートの各ウェルにアリコートした。負の対照では、ペプチド溶液を20μLのSDM79培地と置き換えた。正の対照では、20μLの溶液の代わりに最高濃度のペプチドを用いて実施された。実験は各ペプチド濃度で3回重複して行われた。
増殖%=[(L平均値−bgd)ペプチドx100]/(L平均値−bgd)負の対照
(ここで、「L平均値」は平均蛍光値を、そして「bgd」は培地により発せされる蛍光に相当するバックグラウンドでの蛍光値を意味する)
に従って算定した。前鞭毛虫の増殖を50%まで阻害する濃度(IC50)を決定した。
抗微生物ペプチドの細胞毒性活性を、ラット赤血球、ヒト白血病単球細胞株のTHP−1、THP−1単球誘導のマクロファージについて、HepG2のヒト肝がん誘導細胞(ヒト肝がん由来細胞株)およびヒト線維芽細胞について確かめた。マクロファージはリーシュマニアの宿主細胞である。
抗微生物ペプチドの溶血活性をラット赤血球を用いて評価した。赤血球溶血はヘモグロビンの反応媒体への放出により明らかにされ、その濃度は450nmで分光光度的に測定される。
細胞を、指数増殖期に達するまで、RPMI培地(10%FCS、1/100グルタマックス(登録商標)(Invitrogen)および100U/mLのペニシリン、100μg/mLのストレプトマイシン)にて培養した。トーマ(Thoma)計数チャンバーにて計数した後、RPMI1640培地中で細胞密度を6.25x105細胞/mLに調整した。5倍に濃縮した抗微生物ペプチドの溶液をこのRPMI培地中で調製した(250〜15.6μM)。
増殖%=[(OD平均値−bgd)ペプチドx100]/(OD平均値−bgd)負の対照
(ここで、「bgd」は培地による吸光度に相当するバックグラウンドでのODを意味する)
で示されるように算定された。負の対照(100%増殖)はペプチドを含有しなかった。
マクロファージの生存能をトリパンブルーをベースとするミクロアッセイを用いて確かめた。中間対数増殖期にある培養懸濁液からのTHP−1細胞を96ウェルプレートに5x105細胞/mLの密度(100μL/ウェル、すなわち5x104細胞/ウェル)でプレートし、上記されるように分化させた。ペプチド(60μM〜7.5μM、最終濃度)の存在下、37℃で5%CO2と共に72時間インキュベートした後、接着したマクロファージを予め暖めたRPMI1640培地で一度に洗浄し、RPMI1640培地に2倍に希釈した100μLのトリパンブルーで5分間染色させた。網目状接眼レンズを用いてウェルに付き3つに焦点を当てて生存白血球を顕微鏡により計数した。
VI=[N平均値ペプチドx100]/N平均値負の対照
(ここで、N平均値は生存する寄生虫の平均数である)
を用いて各ペプチド濃度について算定した。負の対照(100%増殖)は20μLのRPMI1640培地を該ペプチド溶液の代わりに含有した。
HepG2ヒト肝細胞がん誘導の細胞を96ウェルプレート上の10%の補体除去したウシ胎児血清、1/100グルタマックス(登録商標)(Invitrogen)および100IUのペニシリン/mL、および100μgのストレプトマイシン/mLを補足したMEM培地に5x105細胞/mLの密度で播種し、37℃および5%CO2で72時間増殖かつ接着させた。連続希釈したペプチドを100μLの補足MEM培地に添加した(100μM〜600μM)。72時間インキュベートした後、ヒト単球のTHP−1について上記されるのと同様にしてMTTベースのマイクロアッセイを用いて細胞生存能を評価した。
ヒト包皮線維芽細胞を、10%ウシ胎児血清(FBS;Invitrogen)、4mMグルタミン、500U/mlのペニシリン、および250μg/mlのストレプトマイシンを補足したダルベコ修飾イーグル培地(DMEM;Invitrogen)にて、37℃で5%CO2下で培養した。104細胞/ウェル(96ウェルプレート)を播種した。24時間後、連続希釈したペプチドを添加し、72時間後の増殖期に、テトラゾリウム化合物の(3-(4,5-ジメチルチアゾール-2-イル)-5-(3-カルボキシメトキシフェニル)-2-(4-スルホフェニル)-2H-テトラゾリウム)を培養ウェルに直接添加した。生存細胞により産生されたホルマザンの生体内還元された色相を96ウェルプレートのリーダー(吸光度、490nm)で定量した。LC50は非線形回帰分析により決定された。
それらの物理化学的特性に基づき、テンポリンSHaの一連の欠失または置換されたアナログを設計して強力な抗微生物活性および細胞毒性の減少を得た(図2)。これらのアナログの抗微生物活性は、異なるグラム陽性菌、グラム陰性菌、および抗生物質耐性菌の参考菌株について、および真菌株について評価された。
その結果は、[K3]テンポリンSHaは、グラム陽性菌株(抗生物質耐性のエス・アウレウス菌株を含む)および臨床的に関心のあるグラム陰性菌株、ならびに酵母に対して同じ効能(MIC=3−6μM)で作用する強力な広域スペクトルの抗微生物剤である(図4)。[K3]テンポリンSHaの配列での2個の残基の内部欠失(残基V6およびM8の欠失)およびC−末端切断は該ペプチドを不活化する(図示せず):ただし、[K3]テンポリンSHa(3−13)はグラム陽性菌およびグラム陰性菌に対する活性を保存する(図4)。興味のあることに、このN−末端切断したアナログは酵母(シー・アルビカンスおよびシー・パラプシローシス)に対して、およびピー・アエルギノーザ(大多数のテンポリンに対して耐性を示すグラム陰性菌株)に対してテンポリンSHaと比べて2倍の活性を示し、その溶血活性も喪失している(LC50=618μM)。[K3]テンポリンSHa(3−13)と同様の物理化学特性を有する、C−末端切断したアナログの[K3]テンポリンSHa(1−11)で活性のないことは、テンポリンSHaのC−末端の疎水性鎖が抗微生物活性に必要不可欠であることを示す。N−末端およびC−末端切断したアナログの[K3]テンポリンSHa(3−11)もまた不活性であるということはC−末端の重要性を確認するものである。
テンポリンSHaの置換したすべてのアナログは、小児リーシュマニアの前鞭毛虫に対してその活性が様々な程度で減少し、アナログ[K3,K6]、[K3,K8]および[K3,K6,L13]テンポリンSHaでは単球に対する細胞毒性レベルが接近している。細菌の場合、アナログ[K3,L13]および[K3,W13]の抗リーシュマニア活性はあまり変わらない。
テンポリンSHaおよびそのアナログは、原核生物であるグラム陽性およびグラム陰性菌、ならびに真核生物である酵母の増殖を予防しうるため、広域スペクトルの活性を示す。
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Claims (15)
- 13〜100個のアミノ酸からなる大きさのペプチドであって、抗微生物活性を示し、配列:F−L−X1−G−I−X2−G−X3−L−G−K−L−X4(配列番号:2)
ここで、
X1はR、HおよびKからなる群より選択されるアミノ酸であり;
X2はV、R、HおよびKからなる群より選択されるアミノ酸であり;
X3はM、R、HおよびKからなる群より選択されるアミノ酸であり;および
X4はF、I、LおよびWからなる群より選択されるアミノ酸である:
ただしX2がVである場合、その時にはX3はK、RおよびHからなる群より選択され、および/またはX4はL、IおよびWからなる群より選択される
を含むペプチド、ならびに該ペプチドの機能的誘導体および医薬的に許容される塩。 - X1がKを表し、X2がVおよびKからなる群より選択されるアミノ酸であり、X3がMおよびKからなる群より選択されるアミノ酸であり、X4がF、LおよびWからなる群より選択されるアミノ酸である、請求項1に記載のペプチド。
- 配列番号3〜17の配列からなる群より選択される配列、好ましくは配列番号:3〜6、8、9、11、12および14〜16の配列からなる群より選択される配列、より好ましくは配列番号:3〜6および8の配列からなる群より選択される配列を含むか、または該配列からなる、請求項1または2に記載のペプチド。
- 請求項1〜3のいずれか一項に記載のペプチドをコードする核酸。
- 請求項4に記載の核酸を含む発現カセット。
- 請求項4に記載の核酸または請求項5に記載の発現カセットを含む発現ベクター。
- 請求項4に記載の核酸、請求項5に記載の発現カセット、または請求項6に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
- 請求項1〜3のいずれか一項に記載の少なくとも1つのペプチド、および医薬的に許容される支持体および/または賦形剤を含む医薬組成物。
- 薬剤としての請求項1〜3のいずれか一項に記載のペプチド。
- 薬剤が細菌、ウイルス、真菌または寄生虫による感染を治療するものとする、請求項9に記載のペプチド。
- 寄生虫がリーシュマニア属に属する、請求項10に記載のペプチド。
- 微生物感染の治療における使用のための、請求項1〜3のいずれか一項に記載に記載のペプチド、請求項4に記載の核酸、請求項5に記載の発現カセット、または請求項6に記載のベクター。
- 請求項1〜3のいずれか一項に記載のペプチドの、殺菌剤、保存剤または殺虫剤としての使用。
- 請求項1〜3のいずれか一項に記載のペプチドで被覆されるか、または該ペプチドを含む少なくとも1つの表面を有する本体を含む医療装置またはインプラント。
- 請求項4に記載の核酸、請求項5に記載の発現カセット、または請求項6に記載のベクターを含み、請求項1〜3のいずれか一項に記載に記載のペプチドを発現しうるか、または発現しているトランスジェニック植物。
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