JP2016530892A - ラキニモド応答性を有する遺伝子発現バイオマーカー - Google Patents

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Abstract

この発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象においてラキニモド療法への臨床応答を予測する方法であって、対象でバイオマーカーの発現を評価することを含む、方法を提供する。この発明は、バイオマーカーの発現を評価することによって対象がラキニモド応答体であるかどうか判定することを含む、前記対象の処置方法も提供する。前記対象の処置で使用するためのラキニモドまたはラキニモドを含む医薬組成物、および前記対象への調剤で使用するための治療パッケージであって、対象はラキニモド応答体と特定されているか、または対象でのバイオマーカーの発現は上方制御もしくは抑制される、パッケージも提供される。

Description

本出願を通して、様々な刊行物が第一著者および刊行年により参照される。これらの刊行物の完全な引用は、特許請求の範囲直前の参考文献の章で提示される。参考文献の章でその全体が引用される刊行物の開示は、ここに記載の本発明の日付における最新技術をより詳細に記載するために、ここに参照により本出願に組み込まれる。
背景
多発性硬化症(MS)は、世界中で1,000,000人を超える人々を侵している神経系疾患である。それは若齢および中年齢の成人において神経障害の最も一般的な原因であり、対象および彼らの家族、友人および健康管理を担う団体に大きな物理的、精神的、社会的および財政的な影響を及ぼす(EMEA Guideline、2006)。
臨床的に孤立した症候群(CIS;clinically isolated syndrome)は、MSを示唆する単一の単一症状の発作、例えば視神経炎、脳幹症状および部分的脊髄炎である。第2の臨床発作を経験するCIS患者は、臨床的に明確な多発性硬化症(CDMS)を有すると一般に考えられる。MS疾患の様々なステージおよび/または型が多発性硬化症治療学で記載されている(Duntiz、1999)。それらの中で、再発寛解型多発性硬化症(RRMS)は、初期診断の時点で最も一般的な形である。RRMSの多くの対象は、初期再発寛解型の経過を5〜15年の間有し、その後それは二次性の進行性MS(SPMS)疾患経過に進行する。RRMSおよびSPMSを含む再発性MS(RMS)で使用するために承認されているいくつかの疾患修飾性医薬品が現在ある(The Disease Modifying Drug Brochure、2006)。これらには、インターフェロンβ1−a(Avonex(登録商標)およびRebif(登録商標))、インターフェロンβ1−b(Betaseron(登録商標))、酢酸グラチラマー(Copaxone(登録商標))、ミトキサントロン(Novantrone(登録商標))、ナタリズマブ(Tysabri(登録商標))およびフィンゴリモド(Gilenya(登録商標))が含まれる。一部の対象では、従来の療法の失敗の後に免疫抑制薬または細胞傷害剤が使用される。しかし、MSにおけるこれらの薬剤によって誘導される免疫応答の変化と臨床効能の間の関係は、解決からほど遠い(EMEA Guideline、2006)。
他の治療アプローチには症候的処置が含まれ、それは、疾患によって引き起こされる症状を改善するために適用されるすべての療法(EMEA Guideline、2006)およびコルチコステロイドによる急性再発の処置を指す。ステロイドは経時的にMSの経過に影響しないが、それらは一部の対象において発作の持続期間および重症度を低減することができる。
ラキニモド(LAQ)
ラキニモド(TV−5600)は、多発硬化症(MS)の処置のための経口用製剤として勧められている、経口生物学的利用能の高い新規合成化合物である(Polman、2005;Sandberg−Wollheim、2005;Comiら2008)。ラキニモドおよびそのナトリウム塩の形は、例えば、米国特許第6,077,851号に記載される。ラキニモドの作用機構は、完全に理解されているとは限らない。
動物研究は、それが、抗炎症プロファイルを有する、Th1(Tヘルパー1細胞、炎症誘発性サイトカインを生成する)からTh2(Tヘルパー2細胞、抗炎症サイトカインを生成する)へのシフトを引き起こすことを示す(Yang、2004;Brueck、2011)。別の研究は、ラキニモドが、抗原提示および対応する炎症経路に関係する遺伝子の抑制を誘導することを実証した(主にNFkB経路を通して)(Gurevich、2010)。他の示唆される潜在的作用機構には、CNSへの白血球遊走の阻害、軸索完全性の増加、サイトカイン生成のモジュレーション、および脳由来神経栄養因子(BDNF)のレベルの増加が含まれる(Runstroem、2002;Brueck、2011)。
ラキニモドは、2つのフェーズIII試験で良好な安全性および耐容性プロファイルを示した(フェーズIII BRAVO試験の結果は、多発性硬化症処置に関するラキニモドの特異なプロファイルを強化する;Teva Pharma、Active Biotech Post Positive Laquinimod Phase 3 ALLEGRO Results)。
IUPAC:5−クロロ−N−エチル−4−ヒドロキシ−1−メチル−2−オキソ−N−フェニル−1,2−ジヒドロキノリン−3−カルボキサミド
MS治療選択肢が増加するに従って、療法により、具体的にはラキニモドにより、良好に応答する対象を特定する能力がますます重要になった。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象においてラキニモド療法への臨床応答を予測する方法であって、対象でバイオマーカーの発現を評価し、それによってラキニモドへの臨床応答を予測することを含み、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法を提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象をラキニモドで処置する方法であって、a)対象でバイオマーカーの発現を評価することによって対象がラキニモド応答体であるかどうか判定する工程と、b)対象がラキニモド応答体と特定される場合だけ対象を処置するのに有効な量のラキニモドを対象に投与し、それによって対象を処置する工程とを含み、バイオマーカーが、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法を提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象を処置する方法であって、a)ラキニモドの治療的有効量を対象に投与する工程と、b)対象でバイオマーカーの発現を評価することによって対象がラキニモド応答体であるかどうか判定する工程と、c)対象がラキニモド応答体と特定される場合だけ対象を処置するのに有効な量のラキニモドを対象に投与するか、または対象がラキニモド応答体と特定されない場合は対象へのラキニモドの投与を修正し、それによって対象を処置する工程とを含み、バイオマーカーが、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法も提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、対象がラキニモド応答体と特定されている、ラキニモドも提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、対象がラキニモド応答体と特定されている、医薬組成物も提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、対象においてバイオマーカーの発現は上方制御され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、ラキニモドも提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、対象においてバイオマーカーの発現は上方制御され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、医薬組成物も提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、対象においてバイオマーカーの発現は抑制され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、ラキニモドも提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、対象においてバイオマーカーの発現は抑制され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、医薬組成物も提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈するラキニモド応答体と特定された対象に調剤するための、または調剤で使用するための治療パッケージであって:a)各単位用量が所定量のラキニモドを含む、1つ以上の単位用量、およびb)そのための完成した医薬容器であって、1つ以上の前記単位用量を含有し、前記対象の処置での前記パッケージの使用を指示する表示をさらに含有するかまたは含む容器を含むパッケージも提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象に調剤するための、または調剤で使用するための治療パッケージであって:a)各単位用量が所定量のラキニモドを含む、1つ以上の単位用量、およびb)そのための完成した医薬容器であって、1つ以上の前記単位用量を含有し、前記対象の処置での前記パッケージの使用を指示する表示をさらに含有するかまたは含む容器を含み、ここで、対象においてバイオマーカーの発現は抑制または上方制御され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せであるパッケージも提供する。
正規化の前(図1A)および後(図1B)のデータセットの変動(時点4)の源。 PCA分析。図2A−43個の遺伝子に基づくPCA分析は、処置の6カ月後にFDR基準に合格した。図2B−1564個の遺伝子に基づくPCA分析は、6カ月および24カ月の合わせた処置データでFDRに合格した。赤点はベースライン時の患者を表し、青色は処置後を表す。 TGFBの正規の経路。縁色は、TGFBをオーバレイした6カ月および24カ月の合わせたLAQ関連遺伝子発現サインからの抑制された遺伝子を表す。 MSにおけるTGFBの免疫調節作用。多発性硬化症における逆説的なTGFB作用を示す(Mirshafieyら、2009、による)。 LAQによる処置の後のRRMS患者のPBMCにおけるTGFB1の発現。6カ月のLAQ処置の後の患者(+)に由来するPBMCのフェノール/エタノール分画からタンパク質試料(30mg)を調製し、処置前の同じ患者(−)のPBMC試料と比較した(図5Aおよび5C)。各試料から30μgを10%SDS−PAGEで分離した。ブロットを、ウサギa−TGFb1(1:250)およびマウスチューブリン(1:500)とインキュベートした。タンパク質バンドおよびその周囲のバックグラウンドのシグナル強度を各タンパク質についてスキャンし、Quantity One 4.6.9ソフトウェア(Bio−Rad Laboratories、Hercules、California)を用いて数量化した。タンパク質発現の結果として生じたバックグラウンドを控除した値をチューブリンの値に正規化し、LAQ処置の有り無しの各患者の相対的タンパク質レベルとして次にプロットした(図5Bおよび5D)。 (同上) LAQによる処置の後の患者のPBMCにおけるPAI−1(セルピン1)の発現。6カ月のLAQ処置の後の患者(+)に由来するPBMCのフェノール/エタノール分画からタンパク質試料を調製し、処置前の同じ患者(−)のPBMC試料と比較した(A)。各試料から30mgを10%SDS−PAGEで分離した。ブロットを、ウサギa−PAI−1(1:500)およびマウスチューブリン(1:500)とインキュベートした。タンパク質バンドおよびその周囲のバックグラウンドのシグナル強度を各タンパク質についてスキャンし、Quantity One 4.6.9ソフトウェアを用いて数量化した。タンパク質発現の結果として生じたバックグラウンドを控除した値をチューブリンの値に正規化し、LAQ処置の有り無しの各患者の相対的タンパク質レベルとして次にプロットした(B)。 LAQ処置下のPTCRA、TGFB1およびTGFB1関連遺伝子PF4およびCSGP5のプロファイル。 図8Aおよび図8Bは、RRMS患者のPBMCに及ぼすLAQ効果の提案された機構を示す。 図8Cは、RRMS患者でLAQが白血球溢出を下方制御することを示す。LAQは、白血球溢出に関連する遺伝子の直接抑制による、またはTGFbスーパーファミリーおよび炎症性サイトカインの抑制を通じたCNSへの炎症性細胞の浸潤を阻害することができる。 図9Aは、RRMS患者における6カ月のLAQ処置が、TGFbおよびNFkBシグナル伝達、炎症誘発性サイトカイン、細胞の接着および遊走に関連する複数の遺伝子を下方制御することを示す。陰影のついた色は、下方制御された遺伝子を表す。 図9Bは、6カ月の処置後のRRMS患者におけるLAQ効果が、TGFbおよびNFkBシグナル伝達、炎症誘発性サイトカイン、細胞の接着および遊走に関連する複数の遺伝子の下方制御を実証することを示す。灰色は下方制御された遺伝子を表し、白色はそれらの発現レベルが不変の遺伝子を表す。 LAQで処置したRRMS患者におけるTGFb、ITGB1およびCXCR1の発現。処置前のRRMS患者(黒棒)に由来するPBMC試料からタンパク質抽出物を調製し、6カ月のLAQ処置後の同じ患者(白棒)のPBMC試料と比較した。タンパク質バンドのシグナル強度を、Quantity One 4.6.9ソフトウェアによって数量化した。タンパク質発現の結果として生じたバックグラウンドを控除した値をチューブリンの値に正規化し、LAQ処置の前後の各患者の相対的タンパク質レベルとして次に計算した。A、BおよびCのブロット像は、5人の患者から分析したバンドの密度計測によって同じく数量化した、それぞれTGFb、ITGB1およびCXCR1の下方制御を示している5人の分析患者の中の2人を表す。データは、平均±SEMで提供される。グラフで、統計的に有意な差が顕著である(n=5、対応のある片側t検定)。
発明の詳細な説明
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象においてラキニモド療法への臨床応答を予測する方法であって、対象でバイオマーカーの発現を評価し、それによってラキニモドへの臨床応答を予測することを含み、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法を提供する。
本発明の一態様では、この方法は、バイオマーカーが対象において上方制御される場合に、ラキニモドへの正の臨床応答を予測することをさらに含む。別の態様では、対象はラキニモドに対して未処置である。
本発明の別の態様では、この方法は、バイオマーカーが対象において抑制される場合に、ラキニモドへの正の臨床応答を予測することをさらに含む。別の態様では、対象は定期的なラキニモド投与を以前に受けたことがある。別の態様では、バイオマーカーの発現は、ベースライン時の患者の前記バイオマーカーの発現と比較して抑制される。
一態様では、対象は定期的なラキニモド投与を少なくとも1カ月の間受けたことがある。別の態様では、対象は定期的なラキニモド投与を少なくとも6カ月の間受けたことがある。別の態様では、対象は定期的なラキニモド投与を少なくとも12カ月の間受けたことがある。別の態様では、対象は定期的なラキニモド投与を少なくとも24カ月の間受けたことがある。
一態様では、炎症性応答に関連する遺伝子は、TGFbシグナル伝達、IL−12シグナル伝達、食細胞の接着の経路、好中球の化学走性、白血球の移行、カベオラ媒介エンドサイトーシス、クラスリン媒介エンドサイトーシスおよび/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、細胞運動に関連する遺伝子は、食細胞の接着および遊走、好中球の化学走性、白血球の移行、細胞の浸潤、細胞の接着および/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子は、細胞の接着および/または神経伝達の経路に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、細胞の発達に関連する遺伝子は、Gタンパク質共役受容体シグナル伝達、アラキドン酸代謝および/またはTGFβシグナル伝達の経路に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、血液系に関連する遺伝子は、血小板の凝集、血小板の活性化、血液細胞の凝集、血液の凝固、内在性のプロトロンビン活性化経路および/または凝固系の経路に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、遺伝子は、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである。
ここで記載される方法、使用、医薬組成物またはパッケージのいずれか1つの一態様では、遺伝子は、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/20/22、IL−9/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad2/3/4、PAI−1、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/13/20/22、IL−9/11/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAIー1、CCL19、IKKg、LTBP1、アルファチューブリン、BMP4/7、MIS、TCF2、IL5R、IL13R、IL20R、ITGB2、NKTR、TEF、CLSTN2、LUC7L2、FABP7、TPTE、FSTL1、SF3B1、LIMS1、PDE5A、XPNPEP1、C5orf4、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、KRT20、TBC1D1、GRHL2、C5orf4、SEPT6、KIAA1199、SSX2IP、TPM1、CDC14B、USP47、MMRN1、CTNNAL1、SMOX、ALOX12、GLRA3、CA2、GUCY1B3、RFPL1、CLEC1B、GNG11、TSPAN32、RGS10、CALD1、PRKAR2B、CYP4F11、CLCA3P、CELSR3、CDC14B、TPM1、SEPT6、PRKG1、MAX、CCDC93、ARMCX6、LOC653354、TUBB2B、HIST1H2AJ、MFAP3L、LIMS1、GNB5、GPRASP1、SRRT、C1orf116、FBXO7、PPM1A、GUCY1B3、CTDSPL、GNAS、IGF2BP3、TPM1、HIST1H2BK、DLG4、WDR48、CALD1、LOC157627、GNB5、ZNF415、ASAP2、PSD3、GNAS、POPDC3、NRGN、ABLIM3、XYLT1、PTGIS、ARHGEF10、PDGFA、PGRMC1、HIST1H2AC、GNAS、CLDN5、MFAP3L、PGRMC1、MYST3、CAPRIN1、CALD1、FBXW7、DNM3、CD84、PRPF4B、RBM25、WASF3、GRAP2、SPARC、TAL1、NENF、XK、GP1BA、HLA−E、CA5A、LYVE1、MARCH6、NAT8B、TRIM58、RET、SDPR、TBXA2R、TMED10、APBA2、MYL9、POU1F1、H2BFS、HIST1H2BK、FAM12B、VCL、GSPT1、ALDOB、LOC150776、SMPD4、SLC37A1、SPARC、GNAS、TAS2R4、CALM3、POM121、POM121C、GRIK2、GREM1、TNNC2、EPS15L2、ENDOD1、RGS6、SF3B1、TMSB15A、ZBTB20、FUT9、ATP9A、MAX、HIST1H2AI、BAT2D1、ABL1、SNCA、GFI1B、CTSA、SNX13、RPA1、FLNA、XPNPEP1、KIF2A、ZBTB33、PSMD11、UBE2N、FOLR1、TSC22D1、PCNP、CELSR3、ACSBG1、RNF11、SEMA3E、MARCH2、PCDH24、SUPT5H、HLA−E、EGF、HLA−C、FLNA、CDK2AP1、LEPROT、SH3TC2、TUBA4A、MTMR1、TF、PRKD1、NAP1L1、DAB2、FUCA1、HIP1、THPO、MAP1B、PARVB、GP1BB、SEPT5、GJA4、PTGS1、GUCY1A3、HIST1H2AG、GNAS、LRBA、HYAL3、GP6、IGHG1、CYP2A13、CDC14B、MAX、KDM2A、CALD1、GNAZ、C19orf22、ARHGAP6、RHOC、RBX1、GP1BB、SEPT5、PRDX6、PRB4、FLNA、HIST1H2BF、RHBDF2、NUP205、SYT1、EGFL8、PPT2、TUBB1、TMC6、FLJ11292、NAP1L1、ALDH1A3、CSNK1E、PRUNE、COL4A3、ZNF221、ILF3、CABP5、RPA1、ARF1、HIST1H2BI、PTGS1、PRKAA1、GNB5、HIST2H4A、HIST2H4B、CYB5R3、TNS1、DCT、GMPR、ABI3BP、GNAS、SASH1、AAK1、XPO6、CTSL2、QSER1、MAP1LC3B、TBX6、CABP2、MRE11A、MAPRE2、TMC6、BDKRB2、MGLL、HRASLS、WHAMML1、WHAMML2、CLU、STC1、C6orf54、PABPN1、PDLIM1、CLU、PHF20、UBL4A、RNF115、HGD、RASGRP2、PNN、SAPS3、SFI1、GOLGA2、HIST2H2BE、SGEF、HGD、DUS1L、MPP1、HLA−E、GRB14、MMD、ZFHX4、CSNK1G2、HIST1H2BE、MPDZ、B2M、TBXA2R、CTDSPL、SNCA、CD99、POLS、MPL、HIST1H3F、SFRS8、NR5A2、ZMYM2、C6orf10、TMEM40、RNF43、PRUNE、MSH6、PLCB4、PARVB、TOX3、PKNOX1、RUFY1、SNCA、C10orf81、PDGFA、ASMT、HMGB1、CCDC90A、PROS1、hCG_1757335、RAP1B、MTSS1、GNRHR、LRRN3、MCM3AP、PLOD2、NAP1L1、PLOD2、HOXD13 CASKIN2、MFAP5、PITX2、SNCA、MYLK、PBX1、PRDX6、H3F3A、H3F3B、LOC440926、TMEM158、TRIM58、FSTL1、SNCA、TNS1、ATP1B1、C5orf4、LRP12、CTNNAL1、GEM、KIAA1466、ALDH1A2、MAP4K3、SNCA、RAB6B、PSD3、RIPK2、RAMP3、CALD1、CYP2E1、PSD3、PDLIM7、COBLL1、FUT3、SMOX、TGM2、LRRC50、CST6、OR7A17、C6orf145、DLEU2、DLEU2L、CPT2、HGF、TNS1、SPRY1、PLOD2、CD80、KYNU、BCAT1、NHLH1、AHCTF1、HOXA10、MTMR3、VAC14、CLCF1、FGF5、TAL1、SAMD14、ELL2、CHN1、SLC7A1、GRK5、PARD3、VPS37B、CYP2B6、CYP2B7P1、MALL、ALX4、SOX15、KRT5、ESPL1、STARD8、PSD3、KIAA0195、MYO9B、HIP1R、LOC100294412、EFNB1、ERN1、RHD、MFAP3L、PLA1A、POFUT2、C8orf39、CRYBB2、CYP4A11、PVRL2、CLCNKB、MRAS、NFIB、FKSG2、SLC11A2、FZR1、ZNF550、GLP1R、SLC19A1、RTN2、PAPOLA、STC1、GK、EXOSC6、RAPSN、HFE、EHD2、RIOK3、UBE2I、C15orf2、DMD、PRLH、MAP2K2、TP63、DACH1、PPP5C、SLC26A1、NUDT7、KCNJ12、ENTPD7、SLC26A1、PRRG3、RGS6、ZBED2、FICD、ARHGAP1、ARHGDIA、SDHB、AMHR2、ABCA4、TCF20、BGN、CASP7、LPAR4、GNA12、CYP2W1、RAX、C4A、C4B、LOC100292046、LOC100294156、PXN、ESR2、MYL10、EFS、TFF3、SRPK1、LOC441601、BIRC5、CCT8L2、PPAP2B、CMA1、APOA2、KDELR2、ASCL3、RUNX1、BUB1、SLC6A8、HNRNPC、HNRNPCL1、LOC440563、LOC649330、RIBC2、CLIC4、RAB17、SCML2、SPINLW1、ANK1、EDA2R、HTR4、CDC42EP4、KANK2、ANK1、SYN1、DUX3、DUX4、FRG2C、HPX−2、LOC100134409、LOC652119、LOC653543、LOC653544、LOC653545、LOC728410、PKNOX2、MLLT4、APOA2、PENK、GNAT1、FURIN、SEMA6A、EGFL6、HRH1、TSPAN1、DBC1、TRPC7、GPR52、HAMP、PRSS2、GPR107、FLJ11292、FLJ20184、B4GALT1、NKX3−1、ASIP、EFCAB6、GPR20、CA5A、PLK4、TAAR5、SRPX2、CNTD2、AZGP1、TIMP3、RGS6、ADARB1、DYNC1I1、C10orf10、PDIA2、PITX3、HOXC13、LPAR3、CTRC、CTSL2、MUC8、AQP5、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A8、UGT1A9、KCNQ2、CYP2A13、ZNF155、KIAA0892、ATP2A2、FGF5、FGF18、FUT2、SHROOM2、PRSS3、CREB3L1、MGAT2、PLCE1、MLXIPL、OR10H3、ABCB11、CD84、ARHGEF4、ORC1L、PCIF1、CD177、C1orf116、IFT122、C11orf20、DUSP13、C6orf208、PLA2G5、PRAMEF1、PRAMEF2、CYP4F8、KCNA1、MFAP4、SLC4A3、IL1RAPL1、SERPINE1、ZCCHC14、POLR3G、C16orf68、FLJ14100、SMCHD1、ASCL1、FOXA2、SLC23A2、KLK13、MTSS1L、DNMT3L、RREB1、DNMBP、PKLR、C1orf106、CCDC134、MTSS1、CCDC40、HOXB1、SCNN1B、SEMA4G、RAPGEFL1、MAGEL2、PLSCR2、CHD2、PLCD1、C1orf116、CHRNA2、MBP、CDC42BPA、MYF6、PI15、LOC440895、SBF1、MAST1、GLT8D2、ERBB3、LOH3CR2A、AMH、HR、RDH8、PAWR、DRD3、CCT8、PRELP、SPOCK3、EPS8L3、NXN、SEMA4G、P2RY1、AVL9、TEK、MOGAT2、KLK7、MT1E、MT1H、MT1M、CLDN18、RHBDF2、SIX1、INPP5A、KCNMB3、MAP2K5、GPD1、LPO、LOC729143、MPRIP、WNT7A、RARG、CDH7、MBNL2、RASGRP2、RBMY2FP、MASP1、CASR、EGR4、APOC2、HECW1、HOXB3、IRF5、NNMT、AOC2、ESRRG、LPIN1、ACOT11、CCDC33、MBD2、ZNF323、NTRK2、TMEM151B、GPLD1、LENEP、HNF1B、NXPH3、ALDH1A3、PHF20L1、CKM、PARD6B、CRYGB、HAB1、LARGE、RAB40C、MPL、CHIT1、METTL10、DUS4L、PNLIPRP1、ELL、ST8SIA5、GRIN2B、MC4R、RTDR1、HDAC6、KCNJ13、CPSF1、SPANXC、CNOT4、LAMA2、SLC1A6、ABCA2、KLK11、GFRA3、CYP3A4、SLC1A3、ATP2B2、APBB2、VPS45、GHRHR、HOXD4、PRPH、ADCY2、LEFTY2、CYP1B1、PCP4、C8B、RANBP3、PDE6H、TRIM15、VGLL1、TRIM3、CRKL、ADH7、PSG3、GPR153、MFAP2、FGF13、NAPA、ALDH3A1、MCM1
0、TLE4、ITPR3、CCDC87、C9orf7、ACTC1、OBSL1、MAP2、CRYM、RNF122、SST、HLA−DRB6、SLC22A17、HSPG2、HIP1、GRIK2、UNKL、GPR144、KIR3DX1、NARFL、UCP3、PLXNA2、BTN1A1、ERCC4、CIITA、EGFR、KRT33A、CLTB、B3GALT5、AP3M2、GJC1、MYO3A、ARHGAP1、PPP2R3A、CLIC4、C20orf195、SIGLEC8、GPRC5A、CACNB1、MYL10、PRLR、OR2S2、NCR2、CHAF1B、EYA3、CDS1、FBXL18、ACTL6B、ZNF821、C16orf71、HBBP1、PLXNA1、CDC45L、MTCP1、PLCB4、PLVAP、PROX1、CYP3A43、IGHG1、RECQL5、IDUA、DLGAP4、PLXNB1、HSD17B14、FOXP3、C19orf26、EPB41L1、RBBP9、GJB4、UPK1B、CYP19A1、LOC55908、CLDN18、C2orf72、NTRK3、NRXN2、SPDEF、IGH@、IGHD、IGHG1、IGHM、LOC100289944、VSIG6、ACRV1、PHLDB1、SORBS1、HAPLN2、FABP3、EFS、ACVR1B、CHST3、UGT2A1、UGT2A2、TAF1、MT4、MFAP3、ETV5、UBQLN3、TBX10、GJB1、ABO、SPINK5、ATAD4、CDH11、CARD14、ALPP、ALPPL2、CBL、LRP4、CDKL2、SSX3、DSG2、SLC45A2、LAMA4、WFDC8、HTR7、EFNB3、TUBB2B、OR7E19P、PMS2L4、ASAP3、FRZB、PDLIM4、PVT1、TFR2、AHI1、TAF4、ADAMTSL2、CLDN4、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR3DP1、LOC727787、RAPGEF5、CRMP1、LDB3、F11、USP46、IBSP、SLC9A3、FLRT3、TRIM17、FGF17、CAMK1G、GLYR1、CSH1、NTF3、ABHD6、TRIM15、OR52A1、FGFR2、ORAI2、C17orf53、GLP1R、SLIT1、TP63、DDR1、CFTR、DIO2、LETM1、ACSM5、ACTA1、NPR1、KCND3、POPDC3、DNAH3、SPDEF、CLEC4M、SLC30A3、NAGLU、AAK1、DHX34、NNAT、AKAP9、ICMT、FAM189A1、C10orf81、MYOZ1、PKNOX2、MGC31957、PRDM11、RET、IGHG1、XPNPEP2、NTRK2、SLC25A10、NR1I2、GRM8、OR3A3、GIPR、PAH、PACRG、CLN8、ZNF215、TRIO、TTLL5、GRM1、PRKG1、HHLA1、LAMA3、SLC37A4、HOXC11、SLCO5A1、CA10、RRBP1、SOD3、NTRK3、CYR61、STRA6、SLC6A11、CNOT4、ATN1、BCAP29、NOVA2、RELN、LAMC2、RAD51、PRSS7、DCBLD2、TACR2、RAB11B、OR2J2、VSNL1、IFNA17、DPYSL4、MGC2889、RRBP1、POLQ、OR1A2、PURA、AIF1、CBS、NECAB2、PRKCE、NOX1、IHH、EXO1、GPRIN2、PDX1、GPR12、FAM188A、HS3ST3B1、ASCL1、ZNF484、CSH1、BCAN、DDN、DUOX2、MORN1、SLC39A2、CLCN7、RUNX2、TTYH1、ZNF280B、PAX3、LZTS1、SLC8A2、HAB1、KIF1A、ARL4D、UGT2B15、NACA2、THRB、C6orf15、GPR176、WSCD1、PLXNB3、CADM3、HAP1、CYP1A2、SPAM1、IL22RA1、CDC2L5、IRX5、PPFIA2、KDELR3、CEACAM7、KCMF1、DUOX1、CDC27、HIST2H2AA3、CAV3、APOA4、NPR3、PRG3、TBC1D22B、TUSC3、RIMS2、CYP4F12、TBXA2R、HBEGF、PSG9、PYGO1、RASGRF1、SCN2A、KLHL1、DTNB、GREM1、SNCG、C22orf24、PALM、COBLL1、DNPEP、MNS1、NFATC4、DLC1、HSPC072、MCAM、CA12、CSHL1、RPAIN、COL5A2、UGT1A8、UGT1A9、IGH@、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHM、LOC100126583、LOC100290036、LOC100290320、LOC100293211、LOC652494、ACSM5、ALOX12P2、ERBB4、CLDN16、CIB2、GALR3、MSMB、FABP7、ATXN3、KCNJ5、TRDN、CYP3A43、BAZ2A、ACCN4、SILV、DGCR14、SEMA6C、DIO2、PTHLH、LEP、PDZRN3、RGSL1、GJA4、SLC22A6、RASGRF1、MAPRE2、PVRL1、AKAP1、POMP、SOX21、DNAH9、HOXC5、SERHL2、KIAA0485、ITSN1、B4GALT1、NEK2、NUPR1、CCDC93、EPO、CRABP2、TYRO3、GOLGA2、SEMA3F、BFSP2、NCAM1、FOLH1、SSX2、TMPRSS4、DCN、LPHN3、POU4F3、CEACAM5、BCL3、EXTL3、CCNA1、DDR2、PAX8、SOX5、POU3F1、PEX16、NUP62、SIGLEC11、ALDOB、GPC3、IGFALS、WDR25、FGF1、OSR2、ARID1A、GYPA、KLK13、PARVB、LILRB5、RIMS2、C19orf21、HOXD1、PRSS3、FLT1、ATP6V1C1、LOX、CRYBB3、CA12、PRKG2、MASP1、LOC728395、LOC728403、TSPY1、PDCD1、GGTLC1、AQP8、KRT16、AICDA、BRD8、C1orf95、OR3A2、PFKFB2、FRZB、PAK3、MEIS2、ZSCAN2、MYH7、VWA1、LSAMP、SRC、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、DIO1、TADA3L、NFASC、CALCRL、NBLA00301、MAB21L1、FBXO42、COL10A1、CFB、SNX7、FOXN1、SRY、HLF、CLCA3P、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、GPR3、TMPRSS11E、EMID1、KCNMB2、MUC5AC、SORT1、HIF3A、MAPK4、TCP11L1、ZZEF1、DCAF7、DMWD、CLCA2、VAC14、CSPG5、STMN2、MLLT4、GALNT14、FGF12、MFAP5、SUMO3、HTR3A、GDF5、TSSK1B、CYP2A7P1、MARK1、ATP1B2、TBX6、PAX8、IL1R1、RALYL、OR2B2、TAAR3、C12orf32、IGHG1、LOC642131、DICER1、GLRA3、PPARD、HSPA4L、WNT2、VIPR2、CYP2C9、SRPX2、IGSF1、ALPK3、TFPI、KCNS3、MARCH8、FRMD4B、TACR3、FIGF、PDCD6、TNN、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、RHBDD3、SPP2、PDE10A、ZNF224、FGL1、PGAM2、CADM4、APOBEC2、SLC9A5、GNAT1、ARHGEF16、SMARCA2、DNAH9、RBM26、WNT2B、KCNK2、NPBWR2、SP2、TMPRSS11D、DENND2A、TNIP3、STC1、DOCK6、ADAM5P、SYDE1、TNPO2、LRTM1、USH1C、PDE12、SRCAP、OR10J1、OR2H2、KCNJ8、RP11−257K9.7、DOCK5、TPD52L1、PAEP、GGA2、PHLDA3、HES2、MLL、CHRNA6、CIB2、PTPRF、TM7SF4、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、ALX1、OR2F1、OR2F2、PLAT、HGC6.3、WNT11、PGK2、SNAI2、COL4A6、PRUNE2、ANKS1B、LOC81691、FERMT2、TIMP3、CST8、CAPN6、IDUA、GPR32、AKR1B10、GRHL2、FBXO24、HSF4、IGHG1、HCN2、LRP12、ARHGEF15、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A7、UGT1A8、GUCA2A、ITIH1、EGFR、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、MYOG、TMSB15A、TLX1、EDNRA、LOC100289791、MDFI、ZER1、MYH15、CDH20、GPR63、LOC440345、LOC440354、LOC595101、LOC641298、SMG1、HOXC10、KRTAP1−1、ARSD、CPLX3、LMAN1L、IFNA4、ABCC1、SEMA3E、MRE11A、C1QL1、LIPF、TRIM9、BBOX1、LRRC17、WNT2B、CYP3A4、SI、ANO3、OBSL1、CHRD、MSX2、PSG1、FAM107A、LRRC37B2、ANKLE2、PAX2、UNC5B、ADCYAP1R1、HFE、SYT1、GJC2、LOC100293871、FGF8、ACRV1、NRXN1、GDPD2、RGS4、CELA2A、IFNW1、MLNR、RNF17、LAD1、GLRA2、RASL12、MAGOH2、C6orf54、ZNF214、IKBKG、AP4E1、ZNRF4、OSBPL10、C1orf175、TTC4、PCDHB3、ADRBK1、ITSN1、XAGE1A、XAGE1B、XAGE1C、XAGE1D、XAGE1E、CDH22、FARP2、MYT1、TNC、MUC5AC、SLC6A15、PP14571、SMR3A、SMR3B、RXRG、SNX1、GLP1R、C6orf155、ATP1A2、TFAP4、PNPLA2、DIRAS3、ANO2、TACSTD2、MCM3AP、IL13RA2、TRIM10、RTEL1、PRRX2、TSHB、TIMELESS、FMO1、KIF18A、KIAA1199、CALB2、MFAP3L、PTGER3、EPAS1、SQSTM1、TSPY1、CPM、DLGAP1、CYP4F11、TLX3、PCDHA10、TAOK2、ERC1、TBX2、KALRN、DICER1、PAPPA、KIF5A、DNAJC22、OTUB1、KIAA1644、SEZ6L2、PCNXL2、HMHB1、ERG、SNTB2、GJA5、AGTR2、GJA3、GCK、LRRC61、CNTF、ZFP91、ZFP91−CNTF、PDLIM4、MPPED2、IFNA10、ACTN2、VGLL1、GJA9、LDLR、ANK2、COL1A1、TIMP3、OTOF、AGXT、GLI2、TRMT61A、FOXD2、TMEM212、DENND2A、B3GALT1、SPAG11A、PRDM4、TF、ELF5、GSC2、EPB41L4B、GYG2、LYZL6、DCHS2、OBP2A、OBP2B、ANGPTL3、MYH11、NES、SLC17A1、RBM15B、CSH1、HTR5A、CYP3A7、HTR2A、KCNV2、TOX3、CLOCK、MAGEA6、FAM12A、COL4A3、S1PR2、NAT8、ACE2、SLC22A6、SL
C13A2、MYH4、APBB2、RAP1GAP、SHOX2、SLCO1A2、ETV1、MAGEA12、PLA2G6、ADRA1A、SYT5、GPR161、SEMA3F、CYP3A43、HOMER2、KCNJ5、PPL、COL17A1、CSHL1、C9orf116、PARK2、UGT2B15、CDK6、FAM174B、CELA2A、CELA2B、SPDEF、EPB41、GAB1、SMR3A、PDE6G、COL5A1、ABCA6、DMD、CYLC2、CIDEA、RAG2、HIST1H2BN、FMO6P、MAOA、ANKRD53、HAPLN1、MT1M、EHD2、GAD2、CRISP2、CSN2、SULT1C2、PCDHGA3、SSX3、FGFR2、GPR161、ATN1、CHD5、A4GALT、MYBPH、CSHL1、NCAPH2、CAPN9、CNGB1、BCAM、DRD5、NR5A2、TEF、ELAVL2、DGKB、HTR7P、RHAG、GH2、COL4A6、BMP7、SOSTDC1、SOX14、TAS2R9、LPHN2、MAP1A、OSGIN2、SLC10A2、FAM13C、EMX1、FLJ40330、CHI3L1、CDH16、SPRR1A、LOX、CALCB、GABBR2、CPB2、RASL11B、CCDC81、RUNX1、CPA1、CLCNKA、CLCNKB、FHL5、THSD7A、TFAP2C、SPAG11B、CAP2、PODNL1、SSX4、SSX4B、G6PC、RPE65、TMEM222、KDR、CHP2、GPR64、TPM2、TCEB3B、E2F5、IL5RA、AOC3、ABCF3、CPN2、ACE、NRP2、INPP5J、SMAD9、FAM155A、GART、PIR、ZNF467、ITSN2、NR1D1、THRA、RP11−35N6.1、LAMB1、EPHB3、PLA2R1、RAPGEF4、DNAJC8、ARSJ、TRIM49、GC、CDH2、ATXN3L、BTF3L1、BICC1、FAM186A、PTPRF、TRPC4、TCL6、CYP4A22、FUT6、MUC1、DKFZP434B2016、LOC643313、LDHA、LOC100131613、TRIM3、MLLT10、DZIP1、ANKRD34C、BUB1、CSPG5、FBLN1、GAD2、CLDN1、CHRNA3、SCN11A、TEX11、IL20RA、AKAP5、KBTBD10、MSTN、TLL2、NACAD、UNC93A、PTGER1、OLAH、NHLH2、SERPINA6、KRT17、KCNMA1、PRKCA、STS、LAMA1、GPR88、ACTN2、TREH、AKAP4、DKK4、PRICKLE3、IRS4、TRPV4、PCDH11Y、APBB2、SLCO2A1、DRD2、MTMR7、ZNF471、TF、NRIP2、ST6GALNAC5、COMT、PAH、LRRC19、PRKAR1B、HPR、PRDM5、NCRNA00120、LOC79999、ITSN2、CACNB2、GPR98、PREX2、FAM182B、LAMA4、ARVCF、HAS2、YOD1、PPP2R3A、COL4A1、RBM12B、GSTA3、FAM66D、OR10H2、PTHLH、ZNF674、KRT19、ACCN2、COL6A1、LOC100288442、LOC100289169、LOC728888、LOC729602、NPIPL2、NPIPL3、PDXDC2、SLC37A1、ATP6V1B1、ABI3BP、HR44、ZNF324B、ZNF584、HOXD13、ADH6、IFNA8、MYOZ2、NFATC4、ADAMTS7、FOXL1、GPR17、SLC18A3、MYH6、BOK、FGA、TEAD4、GRM1、EDNRA、C8orf79、METTL7A、FOLH1、RAD54L、SOX11、CNOT3、NTS、MAPK12、DOCK6、DNAJC6、HS3ST3A1、LOC728395、TSPY1、TSPY3、PTH、LAMB4、ALDOB、FLG、MLANA、UBE2D4、LOC100287483、KRT20、POU1F1、SLCO1B3、CLTA、MECOM、C8orf71、SULT2A1、C6orf10、SLC27A6、PRKD1、SYNPO2L、THPO、GABRR1、CFTR、PPP2R3A、DCBLD2、ANP32A、ANP32C、ANP32D、LOC723972、XYLT1、STAB1、STAB1、SASH1、PID1、FUCA1、SASH1、LRRN3、LRRN3またはそれらの組合せである。
別の態様では、遺伝子は、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/20/22、IL−9/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad2/3/4、PAI−1、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/13/20/22、IL−9/11/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである。別の態様では、遺伝子は、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである。
ここに記載される方法、使用、医薬組成物またはパッケージのいずれか1つの一態様では、遺伝子は、TNFSF4、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/5/8/20/22、IL−9/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、Smad2/3/4、PAI−1、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1、IL8R(CXCR1/2)、アルファチューブリン、BMP2/4/7、MIS、TCF2、LFA−1、VLA−4、IL5R、IL13R、IL20R、ITGB2、IFNガンマ、TNFアルファ、NKTR、TEF、CLSTN2、LUC7L2、FABP7、TPTE、FSTL1、SF3B1、LIMS1、PDE5A、XPNPEP1、C5orf4、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、KRT20、TBC1D1、GRHL2、C5orf4、SEPT6、KIAA1199、SSX2IP、TPM1、CDC14B、USP47、MMRN1、CTNNAL1、SMOX、ALOX12、GLRA3、CA2、GUCY1B3、RFPL1、CLEC1B、GNG11、TSPAN32、RGS10、CALD1、PRKAR2B、CYP4F11、CLCA3P、CELSR3、CDC14B、TPM1、SEPT6、PRKG1、MAX、CCDC93、ARMCX6、LOC653354、TUBB2B、HIST1H2AJ、MFAP3L、LIMS1、GNB5、GPRASP1、SRRT、C1orf116、FBXO7、PPM1A、GUCY1B3、CTDSPL、GNAS、IGF2BP3、TPM1、HIST1H2BK、DLG4、WDR48、CALD1、LOC157627、GNB5、ZNF415、ASAP2、PSD3、GNAS、POPDC3、NRGN、ABLIM3、XYLT1、PTGIS、ARHGEF10、PDGFA、PGRMC1、HIST1H2AC、GNAS、CLDN5、MFAP3L、PGRMC1、MYST3、CAPRIN1、CALD1、FBXW7、DNM3、CD84、PRPF4B、RBM25、WASF3、GRAP2、SPARC、TAL1、NENF、XK、GP1BA、HLA−E、CA5A、LYVE1、MARCH6、NAT8B、TRIM58、RET、SDPR、TBXA2R、TMED10、APBA2、MYL9、POU1F1、H2BFS、HIST1H2BK、FAM12B、VCL、GSPT1、ALDOB、LOC150776、SMPD4、SLC37A1、SPARC、GNAS、TAS2R4、CALM3、POM121、POM121C、GRIK2、GREM1、TNNC2、EPS15L2、ENDOD1、RGS6、SF3B1、TMSB15A、ZBTB20、FUT9、ATP9A、MAX、HIST1H2AI、BAT2D1、ABL1、SNCA、GFI1B、CTSA、SNX13、RPA1、FLNA、XPNPEP1、KIF2A、ZBTB33、PSMD11、UBE2N、FOLR1、TSC22D1、PCNP、CELSR3、ACSBG1、RNF11、SEMA3E、MARCH2、PCDH24、SUPT5H、HLA−E、EGF、HLA−C、FLNA、CDK2AP1、LEPROT、SH3TC2、TUBA4A、MTMR1、TF、PRKD1、NAP1L1、DAB2、FUCA1、HIP1、THPO、MAP1B、PARVB、GP1BB、SEPT5、GJA4、PTGS1、GUCY1A3、HIST1H2AG、GNAS、LRBA、HYAL3、GP6、IGHG1、CYP2A13、CDC14B、MAX、KDM2A、CALD1、GNAZ、C19orf22、ARHGAP6、RHOC、RBX1、GP1BB、SEPT5、PRDX6、PRB4、FLNA、HIST1H2BF、RHBDF2、NUP205、SYT1、EGFL8、PPT2、TUBB1、TMC6、FLJ11292、NAP1L1、ALDH1A3、CSNK1E、PRUNE、COL4A3、ZNF221、ILF3、CABP5、RPA1、ARF1、HIST1H2BI、PTGS1、PRKAA1、GNB5、HIST2H4A、HIST2H4B、CYB5R3、TNS1、DCT、GMPR、ABI3BP、GNAS、SASH1、AAK1、XPO6、CTSL2、QSER1、MAP1LC3B、TBX6、CABP2、MRE11A、MAPRE2、TMC6、BDKRB2、MGLL、HRASLS、WHAMML1、WHAMML2、CLU、STC1、C6orf54、PABPN1、PDLIM1、CLU、PHF20、UBL4A、RNF115、HGD、RASGRP2、PNN、SAPS3、SFI1、GOLGA2、HIST2H2BE、SGEF、HGD、DUS1L、MPP1、HLA−E、GRB14、MMD、ZFHX4、CSNK1G2、HIST1H2BE、MPDZ、B2M、TBXA2R、NGFRAP1、CTDSPL、SNCA、CD99、POLS、MPL、HIST1H3F、SFRS8、NR5A2、ZMYM2、C6orf10、TMEM40、RNF43、PRUNE、MSH6、PLCB4、PARVB、TOX3、PKNOX1、RUFY1、SNCA、C10orf81、PDGFA、ASMT、HMGB1、CCDC90A、PROS1、hCG_1757335、RAP1B、MTSS1、GNRHR、LRRN3、MCM3AP、PLOD2、NAP1L1、PLOD2、HOXD13 CASKIN2、MFAP5、PITX2、SNCA、MYLK、PBX1、PRDX6、EIF2AK1、H3F3A、H3F3B、LOC440926、TMEM158、TRIM58、FSTL1、SNCA、TNS1、ATP1B1、C5orf4、LRP12、CTNNAL1、GEM、KIAA1466、ALDH1A2、MAP4K3、SNCA、RAB6B、PSD3、RIPK2、RAMP3、CALD1、CYP2E1、PSD3、PDLIM7、COBLL1、FUT3、SMOX、TGM2、LRRC50、CST6、OR7A17、C6orf145、DLEU2、DLEU2L、CPT2、HGF、TNS1、SPRY1、PLOD2、CD80、KYNU、BCAT1、NHLH1、AHCTF1、HOXA10、MTMR3、VAC14、CLCF1、FGF5、TAL1、SAMD14、ELL2、CHN1、SLC7A1、GRK5、PARD3、VPS37B、CYP2B6、CYP2B7P1、MALL、ALX4、SOX15、KRT5、ESPL1、STARD8、PSD3、KIAA0195、MYO9B、HIP1R、LOC100294412、EFNB1、ERN1、RHD、MFAP3L、PLA1A、POFUT2、C8orf39、CRYBB2、CYP4A11、PVRL2、CLCNKB、MRAS、NFIB、FKSG2、SLC11A2、FZR1、ZNF550、GLP1R、SLC19A1、RTN2、PAPOLA、STC1、GK、EXOSC6、RAPSN、HFE、EHD2、RIOK3、UBE2I、C15orf2、DMD、PRLH、MAP2K2、TP63、DACH1、PPP5C、SLC26A1、NUDT7、KCNJ12、ENTPD7、SLC26A1、PRRG3、RGS6、ZBED2、FICD、ARHGAP1、ARHGDIA、SDHB、AMHR2、ABCA4、TCF20、BGN、CASP7、LPAR4、GNA12、CYP2W1、RAX、C4A、C4B、LOC100292046、LOC100294156、ELAVL4、PXN、ESR2、MYL10、EFS、TFF3、SRPK1、LOC441601、BIRC5、CCT8L2、PPAP2B、CMA1、APOA2、KDELR2、ASCL3、RUNX1、BUB1、SLC6A8、HNRNPC、HNRNPCL1、LOC440563、LOC649330、RIBC2、CLIC4、RAB17、SCML2、SPINLW1、ANK1、EDA2R、HTR4、CDC42EP4、KANK2、ANK1、SYN1、DUX3、DUX4、FRG2C、HPX−2、LOC100134409、LOC652119、LOC653543、LOC653544、LOC653545、LOC728410、PKNOX2、MLLT4、APOA2、PENK、GNAT1、FURIN、SEMA6A、EGFL6、HRH1、TSPAN1、DBC1、TRPC7、MDM2、GPR52、HAMP、PRSS2、GPR107、FLJ11292、FLJ20184、B4GALT1、NKX3−1、ASIP、EFCAB6、GPR20、CA5A、PLK4、TAAR5、SRPX2、CNTD2、AZGP1、TIMP3、RGS6、ADARB1、DYNC1I1、C10orf10、PDIA2、PITX3、HOXC13、LPAR3、CTRC、CTSL2、MUC8、AQP5、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A8、UGT1A9、KCNQ2、CYP2A13、ZNF155、KIAA0892、ATP2A2、FGF5、FGF18、FUT2、SHROOM2、PRSS3、CREB3L1、MGAT2、PLCE1、MLXIPL、OR10H3、ABCB11、CD84、ARHGEF4、ORC1L、PCIF1、CD177、C1orf116、IFT122、C11orf20、DUSP13、C6orf208、PLA2G5、PRAMEF1、PRAMEF2、CYP4F8、KCNA1、MFAP4、C6、SLC4A3、IL1RAPL1、SERPINE1、ZCCHC14、POLR3G、C16orf68、FLJ14100、SMCHD1、ASCL1、FOXA2、SLC23A2、KLK13、MTSS1L、DNMT3L、RREB1、DNMBP、PKLR、C1orf106、CCDC134、MTSS1、CCDC40、HOXB1、SCNN1B、SEMA4G、RAPGEFL1、MAGEL2、PLSCR2、CHD2、PLCD1、C1orf116、CHRNA2、MBP、CDC42BPA、MYF6、PI15、LOC440895、SBF1、MAST1、GLT8D2、ERBB3、LOH3CR2A、AMH、HR、RDH8、PAWR、DRD3、CCT8、PRELP、SPOCK3、EPS8L3、NXN、SEMA4G、P2RY1、AVL9、TEK、MOGAT2、KLK7、MT1E、MT1H、MT1M、CLDN18、RHBDF2、SIX1、INPP5A、KCNMB3、MAP2K5、GPD1、LPO、LOC729143、MPRIP、WNT7A、RARG、CDH7、MBNL2、RASGRP2、RBMY2FP、MASP1、CASR、EGR4、APOC2、HECW1、HOXB3、IRF5、NNMT、AOC2、ESRRG、LPIN1、ACOT11、CCDC33、MBD2、ZNF323、NTRK2、TMEM151B、GPLD1、LENEP、HNF1B、NXPH3、ALDH1A3、PHF20L1、CKM、PARD6B、CRYGB、HAB1、LARGE、RAB40C、MPL、CHIT1、METTL10、DUS4L、PNLIPRP1、ELL、ST8SIA5、GRIN2B、MC4R、RTDR1、HDAC6、KCNJ13、CPSF1、SPANXC、CNOT4、LAMA2、SLC1A6、ABCA2、KLK11、GFR
A3、CYP3A4、SLC1A3、ATP2B2、APBB2、VPS45、GHRHR、HOXD4、PRPH、ADCY2、LEFTY2、CYP1B1、PCP4、C8B、RANBP3、PDE6H、TRIM15、VGLL1、TRIM3、CRKL、ADH7、PSG3、GPR153、MFAP2、FGF13、NAPA、ALDH3A1、MCM10、TLE4、ITPR3、CCDC87、C9orf7、ACTC1、OBSL1、MAP2、CRYM、RNF122、SST、HLA−DRB6、SLC22A17、HSPG2、HIP1、GRIK2、UNKL、GPR144、KIR3DX1、NARFL、UCP3、PLXNA2、BTN1A1、ERCC4、CIITA、EGFR、KRT33A、CLTB、B3GALT5、AP3M2、GJC1、MYO3A、ARHGAP1、PPP2R3A、CLIC4、C20orf195、SIGLEC8、GPRC5A、CACNB1、MYL10、PRLR、OR2S2、NCR2、CHAF1B、EYA3、CDS1、FBXL18、ACTL6B、ZNF821、C16orf71、HBBP1、PLXNA1、CDC45L、MTCP1、PLCB4、PLVAP、PROX1、CYP3A43、IGHG1、RECQL5、IDUA、DLGAP4、PLXNB1、HSD17B14、FOXP3、C19orf26、EPB41L1、RBBP9、GJB4、UPK1B、CYP19A1、LOC55908、CLDN18、C2orf72、NTRK3、NRXN2、SPDEF、IGH@、IGHD、IGHG1、IGHM、LOC100289944、VSIG6、ACRV1、PHLDB1、SORBS1、HAPLN2、FABP3、EFS、ACVR1B、CHST3、UGT2A1、UGT2A2、TAF1、MT4、MFAP3、ETV5、UBQLN3、TBX10、GJB1、ABO、SPINK5、ATAD4、CDH11、CARD14、ALPP、ALPPL2、CBL、LRP4、CDKL2、SSX3、DSG2、SLC45A2、LAMA4、WFDC8、HTR7、EFNB3、TUBB2B、OR7E19P、PMS2L4、ASAP3、FRZB、PDLIM4、PVT1、TFR2、AHI1、TAF4、ADAMTSL2、CLDN4、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR3DP1、LOC727787、RAPGEF5、CRMP1、LDB3、F11、USP46、PTN、IBSP、SLC9A3、FLRT3、TRIM17、FGF17、CAMK1G、GLYR1、CSH1、NTF3、ABHD6、TRIM15、OR52A1、FGFR2、ORAI2、C17orf53、GLP1R、SLIT1、TP63、DDR1、CFTR、DIO2、LETM1、ACSM5、ACTA1、NPR1、KCND3、POPDC3、DNAH3、SPDEF、CLEC4M、SLC30A3、NAGLU、AAK1、DHX34、NNAT、AKAP9、ICMT、FAM189A1、C10orf81、MYOZ1、PKNOX2、MGC31957、PRDM11、RET、IGHG1、XPNPEP2、NTRK2、SLC25A10、NR1I2、GRM8、OR3A3、GIPR、PAH、PACRG、CLN8、ZNF215、TRIO、TTLL5、GRM1、PRKG1、HHLA1、LAMA3、PTN、SLC37A4、HOXC11、SLCO5A1、CA10、RRBP1、SOD3、NTRK3、CYR61、STRA6、SLC6A11、CNOT4、ATN1、BCAP29、NOVA2、RELN、LAMC2、RAD51、PRSS7、DCBLD2、TACR2、RAB11B、OR2J2、VSNL1、IFNA17、DPYSL4、MGC2889、RRBP1、POLQ、OR1A2、PURA、AIF1、CBS、NECAB2、PRKCE、NOX1、IHH、EXO1、GPRIN2、PDX1、GPR12、FAM188A、HS3ST3B1、ASCL1、ZNF484、CSH1、BCAN、DDN、DUOX2、MORN1、SLC39A2、CLCN7、RUNX2、TTYH1、ZNF280B、PAX3、LZTS1、SLC8A2、HAB1、KIF1A、ARL4D、UGT2B15、NACA2、THRB、C6orf15、GPR176、WSCD1、PLXNB3、CADM3、HAP1、CYP1A2、SPAM1、IL22RA1、CDC2L5、IRX5、PPFIA2、KDELR3、CEACAM7、KCMF1、DUOX1、CDC27、HIST2H2AA3、CAV3、APOA4、NPR3、PRG3、TBC1D22B、TUSC3、RIMS2、CYP4F12、TBXA2R、HBEGF、PSG9、PYGO1、RASGRF1、SCN2A、KLHL1、DTNB、GREM1、SNCG、C22orf24、PALM、COBLL1、DNPEP、MNS1、NFATC4、DLC1、HSPC072、MCAM、CA12、CSHL1、RPAIN、COL5A2、UGT1A8、UGT1A9、IGH@、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHM、LOC100126583、LOC100290036、LOC100290320、LOC100293211、LOC652494、TGFB2、ACSM5、ALOX12P2、ERBB4、CLDN16、CIB2、GALR3、MSMB、FABP7、ATXN3、KCNJ5、TRDN、CYP3A43、BAZ2A、ACCN4、SILV、DGCR14、SEMA6C、DIO2、PTHLH、LEP、PDZRN3、RGSL1、GJA4、SLC22A6、RASGRF1、MAPRE2、PVRL1、AKAP1、POMP、SOX21、DNAH9、HOXC5、SERHL2、KIAA0485、ITSN1、B4GALT1、NEK2、NUPR1、CCDC93、EPO、CRABP2、TYRO3、GOLGA2、SEMA3F、BFSP2、NCAM1、FOLH1、SSX2、TMPRSS4、DCN、LPHN3、POU4F3、CEACAM5、BCL3、EXTL3、CCNA1、DDR2、PAX8、SOX5、POU3F1、PEX16、IL4I1、NUP62、SIGLEC11、ALDOB、GPC3、IGFALS、WDR25、FGF1、OSR2、ARID1A、GYPA、KLK13、PARVB、LILRB5、RIMS2、C19orf21、HOXD1、PRSS3、FLT1、ATP6V1C1、LOX、CRYBB3、CA12、PRKG2、MASP1、LOC728395、LOC728403、TSPY1、PDCD1、GGTLC1、AQP8、IL1F9、KRT16、AICDA、BRD8、C1orf95、OR3A2、PFKFB2、FRZB、PAK3、MEIS2、ZSCAN2、MYH7、VWA1、LSAMP、SRC、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、DIO1、TADA3L、NFASC、CALCRL、NBLA00301、MAB21L1、FBXO42、COL10A1、CFB、SNX7、FOXN1、SRY、HLF、CLCA3P、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、GPR3、TMPRSS11E、EMID1、KCNMB2、MUC5AC、SORT1、HIF3A、MAPK4、TCP11L1、ZZEF1、DCAF7、DMWD、CLCA2、VAC14、CSPG5、STMN2、MLLT4、GALNT14、FGF12、MFAP5、SUMO3、HTR3A、GDF5、TSSK1B、CYP2A7P1、MARK1、ATP1B2、TBX6、PAX8、IL1R1、RALYL、OR2B2、TAAR3、C12orf32、IGHG1、LOC642131、DICER1、GLRA3、PPARD、HSPA4L、WNT2、VIPR2、CYP2C9、SRPX2、IGSF1、ALPK3、TFPI、KCNS3、MARCH8、FRMD4B、TACR3、FIGF、PDCD6、TNN、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、RHBDD3、SPP2、PDE10A、ZNF224、FGL1、PGAM2、CADM4、APOBEC2、SLC9A5、GNAT1、ARHGEF16、SMARCA2、DNAH9、RBM26、WNT2B、KCNK2、NPBWR2、SP2、TMPRSS11D、DENND2A、TNIP3、STC1、DOCK6、ADAM5P、SYDE1、TNPO2、LRTM1、USH1C、PDE12、SRCAP、OR10J1、OR2H2、KCNJ8、RP11−257K9.7、DOCK5、TPD52L1、PAEP、GGA2、PHLDA3、HES2、MLL、PTN、CHRNA6、CIB2、PTPRF、TM7SF4、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、ALX1、OR2F1、OR2F2、PLAT、HGC6.3、WNT11、PGK2、SNAI2、COL4A6、PRUNE2、ANKS1B、LOC81691、FERMT2、TIMP3、CST8、CAPN6、IDUA、GPR32、AKR1B10、GRHL2、FBXO24、HSF4、IGHG1、HCN2、LRP12、ARHGEF15、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A7、UGT1A8、GUCA2A、MDK、ITIH1、EGFR、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、MYOG、TMSB15A、TLX1、EDNRA、LOC100289791、MDFI、ZER1、MYH15、CDH20、GPR63、LOC440345、LOC440354、LOC595101、LOC641298、SMG1、HOXC10、KRTAP1−1、ARSD、CPLX3、LMAN1L、IFNA4、ABCC1、SEMA3E、MRE11A、C1QL1、LIPF、TRIM9、BBOX1、LRRC17、WNT2B、CYP3A4、SI、ANO3、OBSL1、CHRD、MSX2、PSG1、FAM107A、LRRC37B2、ANKLE2、PAX2、UNC5B、ADCYAP1R1、HFE、SYT1、GJC2、LOC100293871、FGF8、ACRV1、NRXN1、GDPD2、RGS4、CELA2A、IFNW1、MLNR、RNF17、LAD1、GLRA2、RASL12、MAGOH2、C6orf54、ZNF214、IKBKG、AP4E1、ZNRF4、OSBPL10、C1orf175、TTC4、PCDHB3、ADRBK1、ITSN1、XAGE1A、XAGE1B、XAGE1C、XAGE1D、XAGE1E、CDH22、FARP2、MYT1、TNC、MUC5AC、SLC6A15、PP14571、SMR3A、SMR3B、RXRG、SNX1、GLP1R、C6orf155、ATP1A2、TFAP4、PNPLA2、DIRAS3、ANO2、TACSTD2、MCM3AP、IL13RA2、TRIM10、RTEL1、PRRX2、TSHB、TIMELESS、FMO1、KIF18A、KIAA1199、CALB2、MFAP3L、PTGER3、EPAS1、SQSTM1、TSPY1、CPM、DLGAP1、CYP4F11、TLX3、PCDHA10、TAOK2、ERC1、TBX2、KALRN、DICER1、PAPPA、KIF5A、DNAJC22、OTUB1、KIAA1644、SEZ6L2、PCNXL2、HMHB1、ERG、SNTB2、GJA5、AGTR2、GJA3、GCK、LRRC61、CNTF、ZFP91、ZFP91−CNTF、PDLIM4、MPPED2、IFNA10、ACTN2、VGLL1、GJA9、LDLR、ANK2、COL1A1、TIMP3、OTOF、AGXT、GLI2、TRMT61A、FOXD2、TME
M212、DENND2A、B3GALT1、SPAG11A、PRDM4、TF、ELF5、GSC2、EPB41L4B、GYG2、LYZL6、DCHS2、OBP2A、OBP2B、ANGPTL3、MYH11、NES、SLC17A1、RBM15B、CSH1、HTR5A、CYP3A7、HTR2A、KCNV2、TOX3、CLOCK、MAGEA6、FAM12A、COL4A3、S1PR2、NAT8、ACE2、SLC22A6、SLC13A2、MYH4、APBB2、RAP1GAP、SHOX2、SLCO1A2、ETV1、MAGEA12、PLA2G6、ADRA1A、SYT5、GPR161、SEMA3F、CYP3A43、HOMER2、KCNJ5、PPL、COL17A1、CSHL1、C9orf116、PARK2、UGT2B15、CDK6、FAM174B、CELA2A、CELA2B、SPDEF、EPB41、GAB1、SMR3A、PDE6G、COL5A1、ABCA6、DMD、CYLC2、CIDEA、RAG2、HIST1H2BN、FMO6P、MAOA、ANKRD53、HAPLN1、MT1M、EHD2、GAD2、CRISP2、CSN2、SULT1C2、PCDHGA3、SSX3、FGFR2、GPR161、ATN1、CHD5、A4GALT、MYBPH、CSHL1、NCAPH2、CAPN9、CNGB1、BCAM、DRD5、NR5A2、TEF、ELAVL2、DGKB、HTR7P、RHAG、GH2、COL4A6、BMP7、SOSTDC1、SOX14、TAS2R9、LPHN2、MAP1A、OSGIN2、SLC10A2、FAM13C、EMX1、FLJ40330、CHI3L1、CDH16、SPRR1A、LOX、CALCB、GABBR2、CPB2、RASL11B、CCDC81、RUNX1、CPA1、CLCNKA、CLCNKB、FHL5、THSD7A、TFAP2C、SPAG11B、CAP2、PODNL1、SSX4、SSX4B、G6PC、RPE65、TMEM222、KDR、CHP2、GPR64、TPM2、TCEB3B、E2F5、IL5RA、AOC3、ABCF3、CPN2、ACE、NRP2、INPP5J、SMAD9、FAM155A、GART、PIR、ZNF467、ITSN2、NR1D1、THRA、RP11−35N6.1、LAMB1、EPHB3、PLA2R1、RAPGEF4、DNAJC8、ARSJ、TRIM49、GC、IL12B、CDH2、ATXN3L、BTF3L1、BICC1、FAM186A、PTPRF、TRPC4、TCL6、CYP4A22、FUT6、MUC1、DKFZP434B2016、LOC643313、LDHA、LOC100131613、TRIM3、MLLT10、DZIP1、ANKRD34C、BUB1、CSPG5、FBLN1、GAD2、CLDN1、CHRNA3、SCN11A、TEX11、IL20RA、AKAP5、KBTBD10、MSTN、TLL2、NACAD、UNC93A、PTGER1、OLAH、NHLH2、SERPINA6、KRT17、KCNMA1、PRKCA、STS、LAMA1、GPR88、ACTN2、TREH、AKAP4、DKK4、PRICKLE3、IRS4、TRPV4、PCDH11Y、APBB2、SLCO2A1、DRD2、MTMR7、ZNF471、TF、NRIP2、ST6GALNAC5、COMT、PAH、LRRC19、PRKAR1B、HPR、PRDM5、NCRNA00120、LOC79999、ITSN2、CACNB2、GPR98、PREX2、FAM182B、LAMA4、ARVCF、HAS2、YOD1、PPP2R3A、COL4A1、RBM12B、GSTA3、FAM66D、OR10H2、PTHLH、ZNF674、KRT19、ACCN2、COL6A1、LOC100288442、LOC100289169、LOC728888、LOC729602、NPIPL2、NPIPL3、PDXDC2、SLC37A1、ATP6V1B1、PTN、ABI3BP、HR44、ZNF324B、ZNF584、HOXD13、ADH6、IFNA8、MYOZ2、NFATC4、ADAMTS7、FOXL1、GPR17、SLC18A3、MYH6、BOK、FGA、TEAD4、GRM1、EDNRA、C8orf79、METTL7A、FOLH1、RAD54L、SOX11、CNOT3、NTS、MAPK12、DOCK6、DNAJC6、HS3ST3A1、LOC728395、TSPY1、TSPY3、PTH、LAMB4、ALDOB、FLG、MLANA、UBE2D4、LOC100287483、KRT20、POU1F1、SLCO1B3、CLTA、MECOM、C8orf71、SULT2A1、C6orf10、SLC27A6、PRKD1、SYNPO2L、THPO、GABRR1、CFTR、PPP2R3A、DCBLD2、ANP32A、ANP32C、ANP32D、LOC723972、XYLT1、STAB1、STAB1、SASH1、PID1、FUCA1、SASH1、LRRN3、LRRN3またはそれらの任意の組合せである。
別の態様では、遺伝子は、TNFSF4、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/5/8/20/22、IL−9/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、Smad2/3/4、PAI−1、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの任意の組合せである。さらに別の態様では、遺伝子は、TNFSF4、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/5/8/20/22、IL−9/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、Smad2/3/4、PAI−1またはそれらの任意の組合せである。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象をラキニモドで処置する方法であって、a)対象でバイオマーカーの発現を評価することによって対象がラキニモド応答体であるかどうか判定する工程と、b)対象がラキニモド応答体と特定される場合だけ対象を処置するのに有効な量のラキニモドを対象に投与し、それによって対象を処置する工程とを含み、バイオマーカーが、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法も提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象を処置する方法であって、a)ラキニモドの治療的有効量を対象に投与する工程と、b)対象でバイオマーカーの発現を評価することによって対象がラキニモド応答体であるかどうか判定する工程と、c)対象がラキニモド応答体と特定される場合だけ対象を処置するのに有効な量のラキニモドを対象に投与するか、または対象がラキニモド応答体と特定されない場合は対象へのラキニモドの投与を修正し、それによって対象を処置する工程とを含み、バイオマーカーが、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法も提供する。
一態様では、バイオマーカーが対象で上方制御される場合は、対象はラキニモド応答体と特定される。別の態様では、バイオマーカーが対象で抑制される場合は、対象はラキニモド応答体と特定される。
一態様では、炎症性応答に関連する遺伝子は、TGFbシグナル伝達、IL−12シグナル伝達、食細胞の接着の経路、好中球の化学走性、白血球の移行、カベオラ媒介エンドサイトーシス、クラスリン媒介エンドサイトーシスおよび/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、細胞運動に関連する遺伝子は、食細胞の接着および遊走、好中球の化学走性、白血球の移行、細胞の浸潤、細胞の接着および/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子は、細胞の接着および/または神経伝達の経路に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、細胞の発達に関連する遺伝子は、Gタンパク質共役受容体シグナル伝達、アラキドン酸代謝および/またはTGFβシグナル伝達の経路に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、血液系に関連する遺伝子は、血小板の凝集、血小板の活性化、血液細胞の凝集、血液の凝固、内在性のプロトロンビン活性化経路および/または凝固系の経路に関連または関与する遺伝子である。
別の態様では、遺伝子は、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである。
ここに記載される方法、使用、医薬組成物またはパッケージのいずれか1つの一態様では、遺伝子は、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/20/22、IL−9/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad2/3/4、PAI−1、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/13/20/22、IL−9/11/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1、アルファチューブリン、BMP4/7、MIS、TCF2、IL5R、IL13R、IL20R、ITGB2、NKTR、TEF、CLSTN2、LUC7L2、FABP7、TPTE、FSTL1、SF3B1、LIMS1、PDE5A、XPNPEP1、C5orf4、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、KRT20、TBC1D1、GRHL2、C5orf4、SEPT6、KIAA1199、SSX2IP、TPM1、CDC14B、USP47、MMRN1、CTNNAL1、SMOX、ALOX12、GLRA3、CA2、GUCY1B3、RFPL1、CLEC1B、GNG11、TSPAN32、RGS10、CALD1、PRKAR2B、CYP4F11、CLCA3P、CELSR3、CDC14B、TPM1、SEPT6、PRKG1、MAX、CCDC93、ARMCX6、LOC653354、TUBB2B、HIST1H2AJ、MFAP3L、LIMS1、GNB5、GPRASP1、SRRT、C1orf116、FBXO7、PPM1A、GUCY1B3、CTDSPL、GNAS、IGF2BP3、TPM1、HIST1H2BK、DLG4、WDR48、CALD1、LOC157627、GNB5、ZNF415、ASAP2、PSD3、GNAS、POPDC3、NRGN、ABLIM3、XYLT1、PTGIS、ARHGEF10、PDGFA、PGRMC1、HIST1H2AC、GNAS、CLDN5、MFAP3L、PGRMC1、MYST3、CAPRIN1、CALD1、FBXW7、DNM3、CD84、PRPF4B、RBM25、WASF3、GRAP2、SPARC、TAL1、NENF、XK、GP1BA、HLA−E、CA5A、LYVE1、MARCH6、NAT8B、TRIM58、RET、SDPR、TBXA2R、TMED10、APBA2、MYL9、POU1F1、H2BFS、HIST1H2BK、FAM12B、VCL、GSPT1、ALDOB、LOC150776、SMPD4、SLC37A1、SPARC、GNAS、TAS2R4、CALM3、POM121、POM121C、GRIK2、GREM1、TNNC2、EPS15L2、ENDOD1、RGS6、SF3B1、TMSB15A、ZBTB20、FUT9、ATP9A、MAX、HIST1H2AI、BAT2D1、ABL1、SNCA、GFI1B、CTSA、SNX13、RPA1、FLNA、XPNPEP1、KIF2A、ZBTB33、PSMD11、UBE2N、FOLR1、TSC22D1、PCNP、CELSR3、ACSBG1、RNF11、SEMA3E、MARCH2、PCDH24、SUPT5H、HLA−E、EGF、HLA−C、FLNA、CDK2AP1、LEPROT、SH3TC2、TUBA4A、MTMR1、TF、PRKD1、NAP1L1、DAB2、FUCA1、HIP1、THPO、MAP1B、PARVB、GP1BB、SEPT5、GJA4、PTGS1、GUCY1A3、HIST1H2AG、GNAS、LRBA、HYAL3、GP6、IGHG1、CYP2A13、CDC14B、MAX、KDM2A、CALD1、GNAZ、C19orf22、ARHGAP6、RHOC、RBX1、GP1BB、SEPT5、PRDX6、PRB4、FLNA、HIST1H2BF、RHBDF2、NUP205、SYT1、EGFL8、PPT2、TUBB1、TMC6、FLJ11292、NAP1L1、ALDH1A3、CSNK1E、PRUNE、COL4A3、ZNF221、ILF3、CABP5、RPA1、ARF1、HIST1H2BI、PTGS1、PRKAA1、GNB5、HIST2H4A、HIST2H4B、CYB5R3、TNS1、DCT、GMPR、ABI3BP、GNAS、SASH1、AAK1、XPO6、CTSL2、QSER1、MAP1LC3B、TBX6、CABP2、MRE11A、MAPRE2、TMC6、BDKRB2、MGLL、HRASLS、WHAMML1、WHAMML2、CLU、STC1、C6orf54、PABPN1、PDLIM1、CLU、PHF20、UBL4A、RNF115、HGD、RASGRP2、PNN、SAPS3、SFI1、GOLGA2、HIST2H2BE、SGEF、HGD、DUS1L、MPP1、HLA−E、GRB14、MMD、ZFHX4、CSNK1G2、HIST1H2BE、MPDZ、B2M、TBXA2R、CTDSPL、SNCA、CD99、POLS、MPL、HIST1H3F、SFRS8、NR5A2、ZMYM2、C6orf10、TMEM40、RNF43、PRUNE、MSH6、PLCB4、PARVB、TOX3、PKNOX1、RUFY1、SNCA、C10orf81、PDGFA、ASMT、HMGB1、CCDC90A、PROS1、hCG_1757335、RAP1B、MTSS1、GNRHR、LRRN3、MCM3AP、PLOD2、NAP1L1、PLOD2、HOXD13 CASKIN2、MFAP5、PITX2、SNCA、MYLK、PBX1、PRDX6、H3F3A、H3F3B、LOC440926、TMEM158、TRIM58、FSTL1、SNCA、TNS1、ATP1B1、C5orf4、LRP12、CTNNAL1、GEM、KIAA1466、ALDH1A2、MAP4K3、SNCA、RAB6B、PSD3、RIPK2、RAMP3、CALD1、CYP2E1、PSD3、PDLIM7、COBLL1、FUT3、SMOX、TGM2、LRRC50、CST6、OR7A17、C6orf145、DLEU2、DLEU2L、CPT2、HGF、TNS1、SPRY1、PLOD2、CD80、KYNU、BCAT1、NHLH1、AHCTF1、HOXA10、MTMR3、VAC14、CLCF1、FGF5、TAL1、SAMD14、ELL2、CHN1、SLC7A1、GRK5、PARD3、VPS37B、CYP2B6、CYP2B7P1、MALL、ALX4、SOX15、KRT5、ESPL1、STARD8、PSD3、KIAA0195、MYO9B、HIP1R、LOC100294412、EFNB1、ERN1、RHD、MFAP3L、PLA1A、POFUT2、C8orf39、CRYBB2、CYP4A11、PVRL2、CLCNKB、MRAS、NFIB、FKSG2、SLC11A2、FZR1、ZNF550、GLP1R、SLC19A1、RTN2、PAPOLA、STC1、GK、EXOSC6、RAPSN、HFE、EHD2、RIOK3、UBE2I、C15orf2、DMD、PRLH、MAP2K2、TP63、DACH1、PPP5C、SLC26A1、NUDT7、KCNJ12、ENTPD7、SLC26A1、PRRG3、RGS6、ZBED2、FICD、ARHGAP1、ARHGDIA、SDHB、AMHR2、ABCA4、TCF20、BGN、CASP7、LPAR4、GNA12、CYP2W1、RAX、C4A、C4B、LOC100292046、LOC100294156、PXN、ESR2、MYL10、EFS、TFF3、SRPK1、LOC441601、BIRC5、CCT8L2、PPAP2B、CMA1、APOA2、KDELR2、ASCL3、RUNX1、BUB1、SLC6A8、HNRNPC、HNRNPCL1、LOC440563、LOC649330、RIBC2、CLIC4、RAB17、SCML2、SPINLW1、ANK1、EDA2R、HTR4、CDC42EP4、KANK2、ANK1、SYN1、DUX3、DUX4、FRG2C、HPX−2、LOC100134409、LOC652119、LOC653543、LOC653544、LOC653545、LOC728410、PKNOX2、MLLT4、APOA2、PENK、GNAT1、FURIN、SEMA6A、EGFL6、HRH1、TSPAN1、DBC1、TRPC7、GPR52、HAMP、PRSS2、GPR107、FLJ11292、FLJ20184、B4GALT1、NKX3−1、ASIP、EFCAB6、GPR20、CA5A、PLK4、TAAR5、SRPX2、CNTD2、AZGP1、TIMP3、RGS6、ADARB1、DYNC1I1、C10orf10、PDIA2、PITX3、HOXC13、LPAR3、CTRC、CTSL2、MUC8、AQP5、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A8、UGT1A9、KCNQ2、CYP2A13、ZNF155、KIAA0892、ATP2A2、FGF5、FGF18、FUT2、SHROOM2、PRSS3、CREB3L1、MGAT2、PLCE1、MLXIPL、OR10H3、ABCB11、CD84、ARHGEF4、ORC1L、PCIF1、CD177、C1orf116、IFT122、C11orf20、DUSP13、C6orf208、PLA2G5、PRAMEF1、PRAMEF2、CYP4F8、KCNA1、MFAP4、SLC4A3、IL1RAPL1、SERPINE1、ZCCHC14、POLR3G、C16orf68、FLJ14100、SMCHD1、ASCL1、FOXA2、SLC23A2、KLK13、MTSS1L、DNMT3L、RREB1、DNMBP、PKLR、C1orf106、CCDC134、MTSS1、CCDC40、HOXB1、SCNN1B、SEMA4G、RAPGEFL1、MAGEL2、PLSCR2、CHD2、PLCD1、C1orf116、CHRNA2、MBP、CDC42BPA、MYF6、PI15、LOC440895、SBF1、MAST1、GLT8D2、ERBB3、LOH3CR2A、AMH、HR、RDH8、PAWR、DRD3、CCT8、PRELP、SPOCK3、EPS8L3、NXN、SEMA4G、P2RY1、AVL9、TEK、MOGAT2、KLK7、MT1E、MT1H、MT1M、CLDN18、RHBDF2、SIX1、INPP5A、KCNMB3、MAP2K5、GPD1、LPO、LOC729143、MPRIP、WNT7A、RARG、CDH7、MBNL2、RASGRP2、RBMY2FP、MASP1、CASR、EGR4、APOC2、HECW1、HOXB3、IRF5、NNMT、AOC2、ESRRG、LPIN1、ACOT11、CCDC33、MBD2、ZNF323、NTRK2、TMEM151B、GPLD1、LENEP、HNF1B、NXPH3、ALDH1A3、PHF20L1、CKM、PARD6B、CRYGB、HAB1、LARGE、RAB40C、MPL、CHIT1、METTL10、DUS4L、PNLIPRP1、ELL、ST8SIA5、GRIN2B、MC4R、RTDR1、HDAC6、KCNJ13、CPSF1、SPANXC、CNOT4、LAMA2、SLC1A6、ABCA2、KLK11、GFRA3、CYP3A4、SLC1A3、ATP2B2、APBB2、VPS45、GHRHR、HOXD4、PRPH、ADCY2、LEFTY2、CYP1B1、PCP4、C8B、RANBP3、PDE6H、TRIM15、VGLL1、TRIM3、CRKL、ADH7、PSG3、GPR153、MFAP2、FGF13、NAPA、ALDH3A1、MCM1
0、TLE4、ITPR3、CCDC87、C9orf7、ACTC1、OBSL1、MAP2、CRYM、RNF122、SST、HLA−DRB6、SLC22A17、HSPG2、HIP1、GRIK2、UNKL、GPR144、KIR3DX1、NARFL、UCP3、PLXNA2、BTN1A1、ERCC4、CIITA、EGFR、KRT33A、CLTB、B3GALT5、AP3M2、GJC1、MYO3A、ARHGAP1、PPP2R3A、CLIC4、C20orf195、SIGLEC8、GPRC5A、CACNB1、MYL10、PRLR、OR2S2、NCR2、CHAF1B、EYA3、CDS1、FBXL18、ACTL6B、ZNF821、C16orf71、HBBP1、PLXNA1、CDC45L、MTCP1、PLCB4、PLVAP、PROX1、CYP3A43、IGHG1、RECQL5、IDUA、DLGAP4、PLXNB1、HSD17B14、FOXP3、C19orf26、EPB41L1、RBBP9、GJB4、UPK1B、CYP19A1、LOC55908、CLDN18、C2orf72、NTRK3、NRXN2、SPDEF、IGH@、IGHD、IGHG1、IGHM、LOC100289944、VSIG6、ACRV1、PHLDB1、SORBS1、HAPLN2、FABP3、EFS、ACVR1B、CHST3、UGT2A1、UGT2A2、TAF1、MT4、MFAP3、ETV5、UBQLN3、TBX10、GJB1、ABO、SPINK5、ATAD4、CDH11、CARD14、ALPP、ALPPL2、CBL、LRP4、CDKL2、SSX3、DSG2、SLC45A2、LAMA4、WFDC8、HTR7、EFNB3、TUBB2B、OR7E19P、PMS2L4、ASAP3、FRZB、PDLIM4、PVT1、TFR2、AHI1、TAF4、ADAMTSL2、CLDN4、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR3DP1、LOC727787、RAPGEF5、CRMP1、LDB3、F11、USP46、IBSP、SLC9A3、FLRT3、TRIM17、FGF17、CAMK1G、GLYR1、CSH1、NTF3、ABHD6、TRIM15、OR52A1、FGFR2、ORAI2、C17orf53、GLP1R、SLIT1、TP63、DDR1、CFTR、DIO2、LETM1、ACSM5、ACTA1、NPR1、KCND3、POPDC3、DNAH3、SPDEF、CLEC4M、SLC30A3、NAGLU、AAK1、DHX34、NNAT、AKAP9、ICMT、FAM189A1、C10orf81、MYOZ1、PKNOX2、MGC31957、PRDM11、RET、IGHG1、XPNPEP2、NTRK2、SLC25A10、NR1I2、GRM8、OR3A3、GIPR、PAH、PACRG、CLN8、ZNF215、TRIO、TTLL5、GRM1、PRKG1、HHLA1、LAMA3、SLC37A4、HOXC11、SLCO5A1、CA10、RRBP1、SOD3、NTRK3、CYR61、STRA6、SLC6A11、CNOT4、ATN1、BCAP29、NOVA2、RELN、LAMC2、RAD51、PRSS7、DCBLD2、TACR2、RAB11B、OR2J2、VSNL1、IFNA17、DPYSL4、MGC2889、RRBP1、POLQ、OR1A2、PURA、AIF1、CBS、NECAB2、PRKCE、NOX1、IHH、EXO1、GPRIN2、PDX1、GPR12、FAM188A、HS3ST3B1、ASCL1、ZNF484、CSH1、BCAN、DDN、DUOX2、MORN1、SLC39A2、CLCN7、RUNX2、TTYH1、ZNF280B、PAX3、LZTS1、SLC8A2、HAB1、KIF1A、ARL4D、UGT2B15、NACA2、THRB、C6orf15、GPR176、WSCD1、PLXNB3、CADM3、HAP1、CYP1A2、SPAM1、IL22RA1、CDC2L5、IRX5、PPFIA2、KDELR3、CEACAM7、KCMF1、DUOX1、CDC27、HIST2H2AA3、CAV3、APOA4、NPR3、PRG3、TBC1D22B、TUSC3、RIMS2、CYP4F12、TBXA2R、HBEGF、PSG9、PYGO1、RASGRF1、SCN2A、KLHL1、DTNB、GREM1、SNCG、C22orf24、PALM、COBLL1、DNPEP、MNS1、NFATC4、DLC1、HSPC072、MCAM、CA12、CSHL1、RPAIN、COL5A2、UGT1A8、UGT1A9、IGH@、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHM、LOC100126583、LOC100290036、LOC100290320、LOC100293211、LOC652494、ACSM5、ALOX12P2、ERBB4、CLDN16、CIB2、GALR3、MSMB、FABP7、ATXN3、KCNJ5、TRDN、CYP3A43、BAZ2A、ACCN4、SILV、DGCR14、SEMA6C、DIO2、PTHLH、LEP、PDZRN3、RGSL1、GJA4、SLC22A6、RASGRF1、MAPRE2、PVRL1、AKAP1、POMP、SOX21、DNAH9、HOXC5、SERHL2、KIAA0485、ITSN1、B4GALT1、NEK2、NUPR1、CCDC93、EPO、CRABP2、TYRO3、GOLGA2、SEMA3F、BFSP2、NCAM1、FOLH1、SSX2、TMPRSS4、DCN、LPHN3、POU4F3、CEACAM5、BCL3、EXTL3、CCNA1、DDR2、PAX8、SOX5、POU3F1、PEX16、NUP62、SIGLEC11、ALDOB、GPC3、IGFALS、WDR25、FGF1、OSR2、ARID1A、GYPA、KLK13、PARVB、LILRB5、RIMS2、C19orf21、HOXD1、PRSS3、FLT1、ATP6V1C1、LOX、CRYBB3、CA12、PRKG2、MASP1、LOC728395、LOC728403、TSPY1、PDCD1、GGTLC1、AQP8、KRT16、AICDA、BRD8、C1orf95、OR3A2、PFKFB2、FRZB、PAK3、MEIS2、ZSCAN2、MYH7、VWA1、LSAMP、SRC、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、DIO1、TADA3L、NFASC、CALCRL、NBLA00301、MAB21L1、FBXO42、COL10A1、CFB、SNX7、FOXN1、SRY、HLF、CLCA3P、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、GPR3、TMPRSS11E、EMID1、KCNMB2、MUC5AC、SORT1、HIF3A、MAPK4、TCP11L1、ZZEF1、DCAF7、DMWD、CLCA2、VAC14、CSPG5、STMN2、MLLT4、GALNT14、FGF12、MFAP5、SUMO3、HTR3A、GDF5、TSSK1B、CYP2A7P1、MARK1、ATP1B2、TBX6、PAX8、IL1R1、RALYL、OR2B2、TAAR3、C12orf32、IGHG1、LOC642131、DICER1、GLRA3、PPARD、HSPA4L、WNT2、VIPR2、CYP2C9、SRPX2、IGSF1、ALPK3、TFPI、KCNS3、MARCH8、FRMD4B、TACR3、FIGF、PDCD6、TNN、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、RHBDD3、SPP2、PDE10A、ZNF224、FGL1、PGAM2、CADM4、APOBEC2、SLC9A5、GNAT1、ARHGEF16、SMARCA2、DNAH9、RBM26、WNT2B、KCNK2、NPBWR2、SP2、TMPRSS11D、DENND2A、TNIP3、STC1、DOCK6、ADAM5P、SYDE1、TNPO2、LRTM1、USH1C、PDE12、SRCAP、OR10J1、OR2H2、KCNJ8、RP11−257K9.7、DOCK5、TPD52L1、PAEP、GGA2、PHLDA3、HES2、MLL、CHRNA6、CIB2、PTPRF、TM7SF4、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、ALX1、OR2F1、OR2F2、PLAT、HGC6.3、WNT11、PGK2、SNAI2、COL4A6、PRUNE2、ANKS1B、LOC81691、FERMT2、TIMP3、CST8、CAPN6、IDUA、GPR32、AKR1B10、GRHL2、FBXO24、HSF4、IGHG1、HCN2、LRP12、ARHGEF15、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A7、UGT1A8、GUCA2A、ITIH1、EGFR、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、MYOG、TMSB15A、TLX1、EDNRA、LOC100289791、MDFI、ZER1、MYH15、CDH20、GPR63、LOC440345、LOC440354、LOC595101、LOC641298、SMG1、HOXC10、KRTAP1−1、ARSD、CPLX3、LMAN1L、IFNA4、ABCC1、SEMA3E、MRE11A、C1QL1、LIPF、TRIM9、BBOX1、LRRC17、WNT2B、CYP3A4、SI、ANO3、OBSL1、CHRD、MSX2、PSG1、FAM107A、LRRC37B2、ANKLE2、PAX2、UNC5B、ADCYAP1R1、HFE、SYT1、GJC2、LOC100293871、FGF8、ACRV1、NRXN1、GDPD2、RGS4、CELA2A、IFNW1、MLNR、RNF17、LAD1、GLRA2、RASL12、MAGOH2、C6orf54、ZNF214、IKBKG、AP4E1、ZNRF4、OSBPL10、C1orf175、TTC4、PCDHB3、ADRBK1、ITSN1、XAGE1A、XAGE1B、XAGE1C、XAGE1D、XAGE1E、CDH22、FARP2、MYT1、TNC、MUC5AC、SLC6A15、PP14571、SMR3A、SMR3B、RXRG、SNX1、GLP1R、C6orf155、ATP1A2、TFAP4、PNPLA2、DIRAS3、ANO2、TACSTD2、MCM3AP、IL13RA2、TRIM10、RTEL1、PRRX2、TSHB、TIMELESS、FMO1、KIF18A、KIAA1199、CALB2、MFAP3L、PTGER3、EPAS1、SQSTM1、TSPY1、CPM、DLGAP1、CYP4F11、TLX3、PCDHA10、TAOK2、ERC1、TBX2、KALRN、DICER1、PAPPA、KIF5A、DNAJC22、OTUB1、KIAA1644、SEZ6L2、PCNXL2、HMHB1、ERG、SNTB2、GJA5、AGTR2、GJA3、GCK、LRRC61、CNTF、ZFP91、ZFP91−CNTF、PDLIM4、MPPED2、IFNA10、ACTN2、VGLL1、GJA9、LDLR、ANK2、COL1A1、TIMP3、OTOF、AGXT、GLI2、TRMT61A、FOXD2、TMEM212、DENND2A、B3GALT1、SPAG11A、PRDM4、TF、ELF5、GSC2、EPB41L4B、GYG2、LYZL6、DCHS2、OBP2A、OBP2B、ANGPTL3、MYH11、NES、SLC17A1、RBM15B、CSH1、HTR5A、CYP3A7、HTR2A、KCNV2、TOX3、CLOCK、MAGEA6、FAM12A、COL4A3、S1PR2、NAT8、ACE2、SLC22A6、SL
C13A2、MYH4、APBB2、RAP1GAP、SHOX2、SLCO1A2、ETV1、MAGEA12、PLA2G6、ADRA1A、SYT5、GPR161、SEMA3F、CYP3A43、HOMER2、KCNJ5、PPL、COL17A1、CSHL1、C9orf116、PARK2、UGT2B15、CDK6、FAM174B、CELA2A、CELA2B、SPDEF、EPB41、GAB1、SMR3A、PDE6G、COL5A1、ABCA6、DMD、CYLC2、CIDEA、RAG2、HIST1H2BN、FMO6P、MAOA、ANKRD53、HAPLN1、MT1M、EHD2、GAD2、CRISP2、CSN2、SULT1C2、PCDHGA3、SSX3、FGFR2、GPR161、ATN1、CHD5、A4GALT、MYBPH、CSHL1、NCAPH2、CAPN9、CNGB1、BCAM、DRD5、NR5A2、TEF、ELAVL2、DGKB、HTR7P、RHAG、GH2、COL4A6、BMP7、SOSTDC1、SOX14、TAS2R9、LPHN2、MAP1A、OSGIN2、SLC10A2、FAM13C、EMX1、FLJ40330、CHI3L1、CDH16、SPRR1A、LOX、CALCB、GABBR2、CPB2、RASL11B、CCDC81、RUNX1、CPA1、CLCNKA、CLCNKB、FHL5、THSD7A、TFAP2C、SPAG11B、CAP2、PODNL1、SSX4、SSX4B、G6PC、RPE65、TMEM222、KDR、CHP2、GPR64、TPM2、TCEB3B、E2F5、IL5RA、AOC3、ABCF3、CPN2、ACE、NRP2、INPP5J、SMAD9、FAM155A、GART、PIR、ZNF467、ITSN2、NR1D1、THRA、RP11−35N6.1、LAMB1、EPHB3、PLA2R1、RAPGEF4、DNAJC8、ARSJ、TRIM49、GC、CDH2、ATXN3L、BTF3L1、BICC1、FAM186A、PTPRF、TRPC4、TCL6、CYP4A22、FUT6、MUC1、DKFZP434B2016、LOC643313、LDHA、LOC100131613、TRIM3、MLLT10、DZIP1、ANKRD34C、BUB1、CSPG5、FBLN1、GAD2、CLDN1、CHRNA3、SCN11A、TEX11、IL20RA、AKAP5、KBTBD10、MSTN、TLL2、NACAD、UNC93A、PTGER1、OLAH、NHLH2、SERPINA6、KRT17、KCNMA1、PRKCA、STS、LAMA1、GPR88、ACTN2、TREH、AKAP4、DKK4、PRICKLE3、IRS4、TRPV4、PCDH11Y、APBB2、SLCO2A1、DRD2、MTMR7、ZNF471、TF、NRIP2、ST6GALNAC5、COMT、PAH、LRRC19、PRKAR1B、HPR、PRDM5、NCRNA00120、LOC79999、ITSN2、CACNB2、GPR98、PREX2、FAM182B、LAMA4、ARVCF、HAS2、YOD1、PPP2R3A、COL4A1、RBM12B、GSTA3、FAM66D、OR10H2、PTHLH、ZNF674、KRT19、ACCN2、COL6A1、LOC100288442、LOC100289169、LOC728888、LOC729602、NPIPL2、NPIPL3、PDXDC2、SLC37A1、ATP6V1B1、ABI3BP、HR44、ZNF324B、ZNF584、HOXD13、ADH6、IFNA8、MYOZ2、NFATC4、ADAMTS7、FOXL1、GPR17、SLC18A3、MYH6、BOK、FGA、TEAD4、GRM1、EDNRA、C8orf79、METTL7A、FOLH1、RAD54L、SOX11、CNOT3、NTS、MAPK12、DOCK6、DNAJC6、HS3ST3A1、LOC728395、TSPY1、TSPY3、PTH、LAMB4、ALDOB、FLG、MLANA、UBE2D4、LOC100287483、KRT20、POU1F1、SLCO1B3、CLTA、MECOM、C8orf71、SULT2A1、C6orf10、SLC27A6、PRKD1、SYNPO2L、THPO、GABRR1、CFTR、PPP2R3A、DCBLD2、ANP32A、ANP32C、ANP32D、LOC723972、XYLT1、STAB1、STAB1、SASH1、PID1、FUCA1、SASH1、LRRN3、LRRN3またはそれらの組合せである。
別の態様では、遺伝子は、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/20/22、IL−9/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad2/3/4、PAI−1、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/13/20/22、IL−9/11/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである。別の態様では、遺伝子は、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである。
ここに記載される方法、使用、医薬組成物またはパッケージのいずれか1つの一態様では、遺伝子は、TNFSF4、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/5/8/20/22、IL−9/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、Smad2/3/4、PAI−1、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1、IL8R(CXCR1/2)、アルファチューブリン、BMP2/4/7、MIS、TCF2、LFA−1、VLA−4、IL5R、IL13R、IL20R、ITGB2、IFNガンマ、TNFアルファ、NKTR、TEF、CLSTN2、LUC7L2、FABP7、TPTE、FSTL1、SF3B1、LIMS1、PDE5A、XPNPEP1、C5orf4、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、KRT20、TBC1D1、GRHL2、C5orf4、SEPT6、KIAA1199、SSX2IP、TPM1、CDC14B、USP47、MMRN1、CTNNAL1、SMOX、ALOX12、GLRA3、CA2、GUCY1B3、RFPL1、CLEC1B、GNG11、TSPAN32、RGS10、CALD1、PRKAR2B、CYP4F11、CLCA3P、CELSR3、CDC14B、TPM1、SEPT6、PRKG1、MAX、CCDC93、ARMCX6、LOC653354、TUBB2B、HIST1H2AJ、MFAP3L、LIMS1、GNB5、GPRASP1、SRRT、C1orf116、FBXO7、PPM1A、GUCY1B3、CTDSPL、GNAS、IGF2BP3、TPM1、HIST1H2BK、DLG4、WDR48、CALD1、LOC157627、GNB5、ZNF415、ASAP2、PSD3、GNAS、POPDC3、NRGN、ABLIM3、XYLT1、PTGIS、ARHGEF10、PDGFA、PGRMC1、HIST1H2AC、GNAS、CLDN5、MFAP3L、PGRMC1、MYST3、CAPRIN1、CALD1、FBXW7、DNM3、CD84、PRPF4B、RBM25、WASF3、GRAP2、SPARC、TAL1、NENF、XK、GP1BA、HLA−E、CA5A、LYVE1、MARCH6、NAT8B、TRIM58、RET、SDPR、TBXA2R、TMED10、APBA2、MYL9、POU1F1、H2BFS、HIST1H2BK、FAM12B、VCL、GSPT1、ALDOB、LOC150776、SMPD4、SLC37A1、SPARC、GNAS、TAS2R4、CALM3、POM121、POM121C、GRIK2、GREM1、TNNC2、EPS15L2、ENDOD1、RGS6、SF3B1、TMSB15A、ZBTB20、FUT9、ATP9A、MAX、HIST1H2AI、BAT2D1、ABL1、SNCA、GFI1B、CTSA、SNX13、RPA1、FLNA、XPNPEP1、KIF2A、ZBTB33、PSMD11、UBE2N、FOLR1、TSC22D1、PCNP、CELSR3、ACSBG1、RNF11、SEMA3E、MARCH2、PCDH24、SUPT5H、HLA−E、EGF、HLA−C、FLNA、CDK2AP1、LEPROT、SH3TC2、TUBA4A、MTMR1、TF、PRKD1、NAP1L1、DAB2、FUCA1、HIP1、THPO、MAP1B、PARVB、GP1BB、SEPT5、GJA4、PTGS1、GUCY1A3、HIST1H2AG、GNAS、LRBA、HYAL3、GP6、IGHG1、CYP2A13、CDC14B、MAX、KDM2A、CALD1、GNAZ、C19orf22、ARHGAP6、RHOC、RBX1、GP1BB、SEPT5、PRDX6、PRB4、FLNA、HIST1H2BF、RHBDF2、NUP205、SYT1、EGFL8、PPT2、TUBB1、TMC6、FLJ11292、NAP1L1、ALDH1A3、CSNK1E、PRUNE、COL4A3、ZNF221、ILF3、CABP5、RPA1、ARF1、HIST1H2BI、PTGS1、PRKAA1、GNB5、HIST2H4A、HIST2H4B、CYB5R3、TNS1、DCT、GMPR、ABI3BP、GNAS、SASH1、AAK1、XPO6、CTSL2、QSER1、MAP1LC3B、TBX6、CABP2、MRE11A、MAPRE2、TMC6、BDKRB2、MGLL、HRASLS、WHAMML1、WHAMML2、CLU、STC1、C6orf54、PABPN1、PDLIM1、CLU、PHF20、UBL4A、RNF115、HGD、RASGRP2、PNN、SAPS3、SFI1、GOLGA2、HIST2H2BE、SGEF、HGD、DUS1L、MPP1、HLA−E、GRB14、MMD、ZFHX4、CSNK1G2、HIST1H2BE、MPDZ、B2M、TBXA2R、NGFRAP1、CTDSPL、SNCA、CD99、POLS、MPL、HIST1H3F、SFRS8、NR5A2、ZMYM2、C6orf10、TMEM40、RNF43、PRUNE、MSH6、PLCB4、PARVB、TOX3、PKNOX1、RUFY1、SNCA、C10orf81、PDGFA、ASMT、HMGB1、CCDC90A、PROS1、hCG_1757335、RAP1B、MTSS1、GNRHR、LRRN3、MCM3AP、PLOD2、NAP1L1、PLOD2、HOXD13 CASKIN2、MFAP5、PITX2、SNCA、MYLK、PBX1、PRDX6、EIF2AK1、H3F3A、H3F3B、LOC440926、TMEM158、TRIM58、FSTL1、SNCA、TNS1、ATP1B1、C5orf4、LRP12、CTNNAL1、GEM、KIAA1466、ALDH1A2、MAP4K3、SNCA、RAB6B、PSD3、RIPK2、RAMP3、CALD1、CYP2E1、PSD3、PDLIM7、COBLL1、FUT3、SMOX、TGM2、LRRC50、CST6、OR7A17、C6orf145、DLEU2、DLEU2L、CPT2、HGF、TNS1、SPRY1、PLOD2、CD80、KYNU、BCAT1、NHLH1、AHCTF1、HOXA10、MTMR3、VAC14、CLCF1、FGF5、TAL1、SAMD14、ELL2、CHN1、SLC7A1、GRK5、PARD3、VPS37B、CYP2B6、CYP2B7P1、MALL、ALX4、SOX15、KRT5、ESPL1、STARD8、PSD3、KIAA0195、MYO9B、HIP1R、LOC100294412、EFNB1、ERN1、RHD、MFAP3L、PLA1A、POFUT2、C8orf39、CRYBB2、CYP4A11、PVRL2、CLCNKB、MRAS、NFIB、FKSG2、SLC11A2、FZR1、ZNF550、GLP1R、SLC19A1、RTN2、PAPOLA、STC1、GK、EXOSC6、RAPSN、HFE、EHD2、RIOK3、UBE2I、C15orf2、DMD、PRLH、MAP2K2、TP63、DACH1、PPP5C、SLC26A1、NUDT7、KCNJ12、ENTPD7、SLC26A1、PRRG3、RGS6、ZBED2、FICD、ARHGAP1、ARHGDIA、SDHB、AMHR2、ABCA4、TCF20、BGN、CASP7、LPAR4、GNA12、CYP2W1、RAX、C4A、C4B、LOC100292046、LOC100294156、ELAVL4、PXN、ESR2、MYL10、EFS、TFF3、SRPK1、LOC441601、BIRC5、CCT8L2、PPAP2B、CMA1、APOA2、KDELR2、ASCL3、RUNX1、BUB1、SLC6A8、HNRNPC、HNRNPCL1、LOC440563、LOC649330、RIBC2、CLIC4、RAB17、SCML2、SPINLW1、ANK1、EDA2R、HTR4、CDC42EP4、KANK2、ANK1、SYN1、DUX3、DUX4、FRG2C、HPX−2、LOC100134409、LOC652119、LOC653543、LOC653544、LOC653545、LOC728410、PKNOX2、MLLT4、APOA2、PENK、GNAT1、FURIN、SEMA6A、EGFL6、HRH1、TSPAN1、DBC1、TRPC7、MDM2、GPR52、HAMP、PRSS2、GPR107、FLJ11292、FLJ20184、B4GALT1、NKX3−1、ASIP、EFCAB6、GPR20、CA5A、PLK4、TAAR5、SRPX2、CNTD2、AZGP1、TIMP3、RGS6、ADARB1、DYNC1I1、C10orf10、PDIA2、PITX3、HOXC13、LPAR3、CTRC、CTSL2、MUC8、AQP5、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A8、UGT1A9、KCNQ2、CYP2A13、ZNF155、KIAA0892、ATP2A2、FGF5、FGF18、FUT2、SHROOM2、PRSS3、CREB3L1、MGAT2、PLCE1、MLXIPL、OR10H3、ABCB11、CD84、ARHGEF4、ORC1L、PCIF1、CD177、C1orf116、IFT122、C11orf20、DUSP13、C6orf208、PLA2G5、PRAMEF1、PRAMEF2、CYP4F8、KCNA1、MFAP4、C6、SLC4A3、IL1RAPL1、SERPINE1、ZCCHC14、POLR3G、C16orf68、FLJ14100、SMCHD1、ASCL1、FOXA2、SLC23A2、KLK13、MTSS1L、DNMT3L、RREB1、DNMBP、PKLR、C1orf106、CCDC134、MTSS1、CCDC40、HOXB1、SCNN1B、SEMA4G、RAPGEFL1、MAGEL2、PLSCR2、CHD2、PLCD1、C1orf116、CHRNA2、MBP、CDC42BPA、MYF6、PI15、LOC440895、SBF1、MAST1、GLT8D2、ERBB3、LOH3CR2A、AMH、HR、RDH8、PAWR、DRD3、CCT8、PRELP、SPOCK3、EPS8L3、NXN、SEMA4G、P2RY1、AVL9、TEK、MOGAT2、KLK7、MT1E、MT1H、MT1M、CLDN18、RHBDF2、SIX1、INPP5A、KCNMB3、MAP2K5、GPD1、LPO、LOC729143、MPRIP、WNT7A、RARG、CDH7、MBNL2、RASGRP2、RBMY2FP、MASP1、CASR、EGR4、APOC2、HECW1、HOXB3、IRF5、NNMT、AOC2、ESRRG、LPIN1、ACOT11、CCDC33、MBD2、ZNF323、NTRK2、TMEM151B、GPLD1、LENEP、HNF1B、NXPH3、ALDH1A3、PHF20L1、CKM、PARD6B、CRYGB、HAB1、LARGE、RAB40C、MPL、CHIT1、METTL10、DUS4L、PNLIPRP1、ELL、ST8SIA5、GRIN2B、MC4R、RTDR1、HDAC6、KCNJ13、CPSF1、SPANXC、CNOT4、LAMA2、SLC1A6、ABCA2、KLK11、GFR
A3、CYP3A4、SLC1A3、ATP2B2、APBB2、VPS45、GHRHR、HOXD4、PRPH、ADCY2、LEFTY2、CYP1B1、PCP4、C8B、RANBP3、PDE6H、TRIM15、VGLL1、TRIM3、CRKL、ADH7、PSG3、GPR153、MFAP2、FGF13、NAPA、ALDH3A1、MCM10、TLE4、ITPR3、CCDC87、C9orf7、ACTC1、OBSL1、MAP2、CRYM、RNF122、SST、HLA−DRB6、SLC22A17、HSPG2、HIP1、GRIK2、UNKL、GPR144、KIR3DX1、NARFL、UCP3、PLXNA2、BTN1A1、ERCC4、CIITA、EGFR、KRT33A、CLTB、B3GALT5、AP3M2、GJC1、MYO3A、ARHGAP1、PPP2R3A、CLIC4、C20orf195、SIGLEC8、GPRC5A、CACNB1、MYL10、PRLR、OR2S2、NCR2、CHAF1B、EYA3、CDS1、FBXL18、ACTL6B、ZNF821、C16orf71、HBBP1、PLXNA1、CDC45L、MTCP1、PLCB4、PLVAP、PROX1、CYP3A43、IGHG1、RECQL5、IDUA、DLGAP4、PLXNB1、HSD17B14、FOXP3、C19orf26、EPB41L1、RBBP9、GJB4、UPK1B、CYP19A1、LOC55908、CLDN18、C2orf72、NTRK3、NRXN2、SPDEF、IGH@、IGHD、IGHG1、IGHM、LOC100289944、VSIG6、ACRV1、PHLDB1、SORBS1、HAPLN2、FABP3、EFS、ACVR1B、CHST3、UGT2A1、UGT2A2、TAF1、MT4、MFAP3、ETV5、UBQLN3、TBX10、GJB1、ABO、SPINK5、ATAD4、CDH11、CARD14、ALPP、ALPPL2、CBL、LRP4、CDKL2、SSX3、DSG2、SLC45A2、LAMA4、WFDC8、HTR7、EFNB3、TUBB2B、OR7E19P、PMS2L4、ASAP3、FRZB、PDLIM4、PVT1、TFR2、AHI1、TAF4、ADAMTSL2、CLDN4、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR3DP1、LOC727787、RAPGEF5、CRMP1、LDB3、F11、USP46、PTN、IBSP、SLC9A3、FLRT3、TRIM17、FGF17、CAMK1G、GLYR1、CSH1、NTF3、ABHD6、TRIM15、OR52A1、FGFR2、ORAI2、C17orf53、GLP1R、SLIT1、TP63、DDR1、CFTR、DIO2、LETM1、ACSM5、ACTA1、NPR1、KCND3、POPDC3、DNAH3、SPDEF、CLEC4M、SLC30A3、NAGLU、AAK1、DHX34、NNAT、AKAP9、ICMT、FAM189A1、C10orf81、MYOZ1、PKNOX2、MGC31957、PRDM11、RET、IGHG1、XPNPEP2、NTRK2、SLC25A10、NR1I2、GRM8、OR3A3、GIPR、PAH、PACRG、CLN8、ZNF215、TRIO、TTLL5、GRM1、PRKG1、HHLA1、LAMA3、PTN、SLC37A4、HOXC11、SLCO5A1、CA10、RRBP1、SOD3、NTRK3、CYR61、STRA6、SLC6A11、CNOT4、ATN1、BCAP29、NOVA2、RELN、LAMC2、RAD51、PRSS7、DCBLD2、TACR2、RAB11B、OR2J2、VSNL1、IFNA17、DPYSL4、MGC2889、RRBP1、POLQ、OR1A2、PURA、AIF1、CBS、NECAB2、PRKCE、NOX1、IHH、EXO1、GPRIN2、PDX1、GPR12、FAM188A、HS3ST3B1、ASCL1、ZNF484、CSH1、BCAN、DDN、DUOX2、MORN1、SLC39A2、CLCN7、RUNX2、TTYH1、ZNF280B、PAX3、LZTS1、SLC8A2、HAB1、KIF1A、ARL4D、UGT2B15、NACA2、THRB、C6orf15、GPR176、WSCD1、PLXNB3、CADM3、HAP1、CYP1A2、SPAM1、IL22RA1、CDC2L5、IRX5、PPFIA2、KDELR3、CEACAM7、KCMF1、DUOX1、CDC27、HIST2H2AA3、CAV3、APOA4、NPR3、PRG3、TBC1D22B、TUSC3、RIMS2、CYP4F12、TBXA2R、HBEGF、PSG9、PYGO1、RASGRF1、SCN2A、KLHL1、DTNB、GREM1、SNCG、C22orf24、PALM、COBLL1、DNPEP、MNS1、NFATC4、DLC1、HSPC072、MCAM、CA12、CSHL1、RPAIN、COL5A2、UGT1A8、UGT1A9、IGH@、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHM、LOC100126583、LOC100290036、LOC100290320、LOC100293211、LOC652494、TGFB2、ACSM5、ALOX12P2、ERBB4、CLDN16、CIB2、GALR3、MSMB、FABP7、ATXN3、KCNJ5、TRDN、CYP3A43、BAZ2A、ACCN4、SILV、DGCR14、SEMA6C、DIO2、PTHLH、LEP、PDZRN3、RGSL1、GJA4、SLC22A6、RASGRF1、MAPRE2、PVRL1、AKAP1、POMP、SOX21、DNAH9、HOXC5、SERHL2、KIAA0485、ITSN1、B4GALT1、NEK2、NUPR1、CCDC93、EPO、CRABP2、TYRO3、GOLGA2、SEMA3F、BFSP2、NCAM1、FOLH1、SSX2、TMPRSS4、DCN、LPHN3、POU4F3、CEACAM5、BCL3、EXTL3、CCNA1、DDR2、PAX8、SOX5、POU3F1、PEX16、IL4I1、NUP62、SIGLEC11、ALDOB、GPC3、IGFALS、WDR25、FGF1、OSR2、ARID1A、GYPA、KLK13、PARVB、LILRB5、RIMS2、C19orf21、HOXD1、PRSS3、FLT1、ATP6V1C1、LOX、CRYBB3、CA12、PRKG2、MASP1、LOC728395、LOC728403、TSPY1、PDCD1、GGTLC1、AQP8、IL1F9、KRT16、AICDA、BRD8、C1orf95、OR3A2、PFKFB2、FRZB、PAK3、MEIS2、ZSCAN2、MYH7、VWA1、LSAMP、SRC、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、DIO1、TADA3L、NFASC、CALCRL、NBLA00301、MAB21L1、FBXO42、COL10A1、CFB、SNX7、FOXN1、SRY、HLF、CLCA3P、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、GPR3、TMPRSS11E、EMID1、KCNMB2、MUC5AC、SORT1、HIF3A、MAPK4、TCP11L1、ZZEF1、DCAF7、DMWD、CLCA2、VAC14、CSPG5、STMN2、MLLT4、GALNT14、FGF12、MFAP5、SUMO3、HTR3A、GDF5、TSSK1B、CYP2A7P1、MARK1、ATP1B2、TBX6、PAX8、IL1R1、RALYL、OR2B2、TAAR3、C12orf32、IGHG1、LOC642131、DICER1、GLRA3、PPARD、HSPA4L、WNT2、VIPR2、CYP2C9、SRPX2、IGSF1、ALPK3、TFPI、KCNS3、MARCH8、FRMD4B、TACR3、FIGF、PDCD6、TNN、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、RHBDD3、SPP2、PDE10A、ZNF224、FGL1、PGAM2、CADM4、APOBEC2、SLC9A5、GNAT1、ARHGEF16、SMARCA2、DNAH9、RBM26、WNT2B、KCNK2、NPBWR2、SP2、TMPRSS11D、DENND2A、TNIP3、STC1、DOCK6、ADAM5P、SYDE1、TNPO2、LRTM1、USH1C、PDE12、SRCAP、OR10J1、OR2H2、KCNJ8、RP11−257K9.7、DOCK5、TPD52L1、PAEP、GGA2、PHLDA3、HES2、MLL、PTN、CHRNA6、CIB2、PTPRF、TM7SF4、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、ALX1、OR2F1、OR2F2、PLAT、HGC6.3、WNT11、PGK2、SNAI2、COL4A6、PRUNE2、ANKS1B、LOC81691、FERMT2、TIMP3、CST8、CAPN6、IDUA、GPR32、AKR1B10、GRHL2、FBXO24、HSF4、IGHG1、HCN2、LRP12、ARHGEF15、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A7、UGT1A8、GUCA2A、MDK、ITIH1、EGFR、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、MYOG、TMSB15A、TLX1、EDNRA、LOC100289791、MDFI、ZER1、MYH15、CDH20、GPR63、LOC440345、LOC440354、LOC595101、LOC641298、SMG1、HOXC10、KRTAP1−1、ARSD、CPLX3、LMAN1L、IFNA4、ABCC1、SEMA3E、MRE11A、C1QL1、LIPF、TRIM9、BBOX1、LRRC17、WNT2B、CYP3A4、SI、ANO3、OBSL1、CHRD、MSX2、PSG1、FAM107A、LRRC37B2、ANKLE2、PAX2、UNC5B、ADCYAP1R1、HFE、SYT1、GJC2、LOC100293871、FGF8、ACRV1、NRXN1、GDPD2、RGS4、CELA2A、IFNW1、MLNR、RNF17、LAD1、GLRA2、RASL12、MAGOH2、C6orf54、ZNF214、IKBKG、AP4E1、ZNRF4、OSBPL10、C1orf175、TTC4、PCDHB3、ADRBK1、ITSN1、XAGE1A、XAGE1B、XAGE1C、XAGE1D、XAGE1E、CDH22、FARP2、MYT1、TNC、MUC5AC、SLC6A15、PP14571、SMR3A、SMR3B、RXRG、SNX1、GLP1R、C6orf155、ATP1A2、TFAP4、PNPLA2、DIRAS3、ANO2、TACSTD2、MCM3AP、IL13RA2、TRIM10、RTEL1、PRRX2、TSHB、TIMELESS、FMO1、KIF18A、KIAA1199、CALB2、MFAP3L、PTGER3、EPAS1、SQSTM1、TSPY1、CPM、DLGAP1、CYP4F11、TLX3、PCDHA10、TAOK2、ERC1、TBX2、KALRN、DICER1、PAPPA、KIF5A、DNAJC22、OTUB1、KIAA1644、SEZ6L2、PCNXL2、HMHB1、ERG、SNTB2、GJA5、AGTR2、GJA3、GCK、LRRC61、CNTF、ZFP91、ZFP91−CNTF、PDLIM4、MPPED2、IFNA10、ACTN2、VGLL1、GJA9、LDLR、ANK2、COL1A1、TIMP3、OTOF、AGXT、GLI2、TRMT61A、FOXD2、TME
M212、DENND2A、B3GALT1、SPAG11A、PRDM4、TF、ELF5、GSC2、EPB41L4B、GYG2、LYZL6、DCHS2、OBP2A、OBP2B、ANGPTL3、MYH11、NES、SLC17A1、RBM15B、CSH1、HTR5A、CYP3A7、HTR2A、KCNV2、TOX3、CLOCK、MAGEA6、FAM12A、COL4A3、S1PR2、NAT8、ACE2、SLC22A6、SLC13A2、MYH4、APBB2、RAP1GAP、SHOX2、SLCO1A2、ETV1、MAGEA12、PLA2G6、ADRA1A、SYT5、GPR161、SEMA3F、CYP3A43、HOMER2、KCNJ5、PPL、COL17A1、CSHL1、C9orf116、PARK2、UGT2B15、CDK6、FAM174B、CELA2A、CELA2B、SPDEF、EPB41、GAB1、SMR3A、PDE6G、COL5A1、ABCA6、DMD、CYLC2、CIDEA、RAG2、HIST1H2BN、FMO6P、MAOA、ANKRD53、HAPLN1、MT1M、EHD2、GAD2、CRISP2、CSN2、SULT1C2、PCDHGA3、SSX3、FGFR2、GPR161、ATN1、CHD5、A4GALT、MYBPH、CSHL1、NCAPH2、CAPN9、CNGB1、BCAM、DRD5、NR5A2、TEF、ELAVL2、DGKB、HTR7P、RHAG、GH2、COL4A6、BMP7、SOSTDC1、SOX14、TAS2R9、LPHN2、MAP1A、OSGIN2、SLC10A2、FAM13C、EMX1、FLJ40330、CHI3L1、CDH16、SPRR1A、LOX、CALCB、GABBR2、CPB2、RASL11B、CCDC81、RUNX1、CPA1、CLCNKA、CLCNKB、FHL5、THSD7A、TFAP2C、SPAG11B、CAP2、PODNL1、SSX4、SSX4B、G6PC、RPE65、TMEM222、KDR、CHP2、GPR64、TPM2、TCEB3B、E2F5、IL5RA、AOC3、ABCF3、CPN2、ACE、NRP2、INPP5J、SMAD9、FAM155A、GART、PIR、ZNF467、ITSN2、NR1D1、THRA、RP11−35N6.1、LAMB1、EPHB3、PLA2R1、RAPGEF4、DNAJC8、ARSJ、TRIM49、GC、IL12B、CDH2、ATXN3L、BTF3L1、BICC1、FAM186A、PTPRF、TRPC4、TCL6、CYP4A22、FUT6、MUC1、DKFZP434B2016、LOC643313、LDHA、LOC100131613、TRIM3、MLLT10、DZIP1、ANKRD34C、BUB1、CSPG5、FBLN1、GAD2、CLDN1、CHRNA3、SCN11A、TEX11、IL20RA、AKAP5、KBTBD10、MSTN、TLL2、NACAD、UNC93A、PTGER1、OLAH、NHLH2、SERPINA6、KRT17、KCNMA1、PRKCA、STS、LAMA1、GPR88、ACTN2、TREH、AKAP4、DKK4、PRICKLE3、IRS4、TRPV4、PCDH11Y、APBB2、SLCO2A1、DRD2、MTMR7、ZNF471、TF、NRIP2、ST6GALNAC5、COMT、PAH、LRRC19、PRKAR1B、HPR、PRDM5、NCRNA00120、LOC79999、ITSN2、CACNB2、GPR98、PREX2、FAM182B、LAMA4、ARVCF、HAS2、YOD1、PPP2R3A、COL4A1、RBM12B、GSTA3、FAM66D、OR10H2、PTHLH、ZNF674、KRT19、ACCN2、COL6A1、LOC100288442、LOC100289169、LOC728888、LOC729602、NPIPL2、NPIPL3、PDXDC2、SLC37A1、ATP6V1B1、PTN、ABI3BP、HR44、ZNF324B、ZNF584、HOXD13、ADH6、IFNA8、MYOZ2、NFATC4、ADAMTS7、FOXL1、GPR17、SLC18A3、MYH6、BOK、FGA、TEAD4、GRM1、EDNRA、C8orf79、METTL7A、FOLH1、RAD54L、SOX11、CNOT3、NTS、MAPK12、DOCK6、DNAJC6、HS3ST3A1、LOC728395、TSPY1、TSPY3、PTH、LAMB4、ALDOB、FLG、MLANA、UBE2D4、LOC100287483、KRT20、POU1F1、SLCO1B3、CLTA、MECOM、C8orf71、SULT2A1、C6orf10、SLC27A6、PRKD1、SYNPO2L、THPO、GABRR1、CFTR、PPP2R3A、DCBLD2、ANP32A、ANP32C、ANP32D、LOC723972、XYLT1、STAB1、STAB1、SASH1、PID1、FUCA1、SASH1、LRRN3、LRRN3またはそれらの任意の組合せである。
別の態様では、遺伝子は、TNFSF4、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/5/8/20/22、IL−9/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、Smad2/3/4、PAI−1、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの任意の組合せである。さらに別の態様では、遺伝子は、TNFSF4、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/5/8/20/22、IL−9/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、Smad2/3/4、PAI−1またはそれらの任意の組合せである。
一態様では、ラキニモドは経口投与される。別の態様では、ラキニモドは毎日投与される。
一態様では、ラキニモドは0.6mg/日未満の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは0.1〜40.0mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは0.1〜2.5mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは0.25〜2.0mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは0.5〜1.2mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは0.25mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは0.3mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは0.5mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは0.6mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは1.0mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは1.2mg/日の用量で投与される。別の態様では、ラキニモドは1.5mg/日の用量で投与される。さらに別の態様では、ラキニモドは2.0mg/日の用量で投与される。
一態様では、対象は未処置対象である。別の態様では、対象はラキニモドに対して未処置である。別の態様では、対象はラキニモドを以前に投与されたことがある。別の態様では、対象はラキニモド以外の多発性硬化症薬を以前に投与されたことがある。
一態様では、バイオマーカーの発現を評価する工程は、対象の遺伝子発現の正規化を含む。別の態様では、バイオマーカーの発現を評価する工程は、参照値に対して対象の発現レベルを比較することを含む。別の態様では、参照値は、ラキニモド不応答体集団でのバイオマーカーの発現レベルに基づく。別の態様では、参照値は、健康な対照集団でのバイオマーカーの発現レベルに基づく。さらに別の態様では、参照値は、ベースライン時の対象の発現レベルに基づく。
一態様では、バイオマーカーの発現が参照値よりも高い場合は、対象はラキニモド応答体と特定される。さらに別の態様では、バイオマーカーの発現レベルが参照値よりも低い場合は、対象はラキニモド応答体と特定される。
一態様では、バイオマーカーの発現は、対象の血液で評価される。別の態様では、バイオマーカーの発現は、対象の末梢血単核細胞(PBMC)で評価される。別の態様では、バイオマーカーの発現は、ラキニモド処置の前に評価される。
一態様では、バイオマーカーの発現は、ラキニモド処置の開始後に評価される。別の態様では、バイオマーカーの発現は、ラキニモド処置の開始から1カ月後に評価される。別の態様では、バイオマーカーの発現は、ラキニモド処置の開始から6カ月後に評価される。別の態様では、バイオマーカーの発現は、ラキニモド処置の開始から12カ月後に評価される。別の態様では、バイオマーカーの発現は、ラキニモド処置の開始から24カ月後に評価される。
一態様では、対象がラキニモド応答体と特定される場合は、対象は単独療法としてラキニモドおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物をその後投与される。別の態様では、対象がラキニモド応答体と特定される場合は、対象は別の多発性硬化症薬と併用してラキニモドおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物をその後投与される。別の態様では、対象がラキニモド非応答体と特定される場合は、対象はラキニモドではない多発性硬化症薬をその後投与される。
一態様では、対象はヒト患者である。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、対象がラキニモド応答体と特定されている、ラキニモドも提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、対象がラキニモド応答体と特定されている、医薬組成物も提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、対象においてバイオマーカーの発現は上方制御され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、ラキニモドも提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、対象においてバイオマーカーの発現は上方制御され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、医薬組成物も提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、対象においてバイオマーカーの発現は抑制され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、ラキニモドも提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、対象においてバイオマーカーの発現は抑制され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、医薬組成物も提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈するラキニモド応答体と特定された対象に調剤するための、または調剤で使用するための治療パッケージであって:a)各単位用量が所定量のラキニモドを含む、1つ以上の単位用量、およびb)そのための完成した医薬容器であって、1つ以上の前記単位用量を含有し、前記対象の処置での前記パッケージの使用を指示する表示をさらに含有するかまたは含む容器を含むパッケージも提供する。
本発明は、多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象に調剤するための、または調剤で使用するための治療パッケージであって:a)各単位用量が所定量のラキニモドを含む、1つ以上の単位用量、およびb)そのための完成した医薬容器であって、1つ以上の前記単位用量を含有し、前記対象の処置での前記パッケージの使用を指示する表示をさらに含有するかまたは含む容器を含み、対象においてバイオマーカーの発現は抑制または上方制御され、バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、パッケージも提供する。
上記態様について、ここに開示される各態様は、他の開示される態様の各々に適用可能であると考えられる。例えば、方法態様で列挙される要素は、ここに記載される使用およびパッケージ態様で使用することができ、逆もまた同じである。
本出願で用いられるラキニモドの薬学的に許容される塩には、リチウム、ナトリウム、カリウム、マグネシウム、カルシウム、マンガン、銅、亜鉛、アルミニウムおよび鉄が含まれる。ラキニモドの塩製剤およびそれを調製するための方法は、例えば米国特許出願公開第2005/0192315号およびPCT国際出願公開番号WO2005/074899号に記載され、それらはここに参照により本出願に組み込まれる。
投薬量単位は、単一の化合物またはその化合物の混合物を含むことができる。投薬量単位は、経口剤形、例えば錠剤、カプセル剤、丸剤、散剤および顆粒剤のために調製することができる。
ラキニモドは、意図する投与形式に関して、および従来の製薬慣行と一貫するように適切に選択される、適する医薬用の希釈剤、増量剤、賦形剤または担体(ここでは薬学的に許容される担体と総称する)と混合して投与することができる。単位は、経口投与に適する形になる。ラキニモドは単独で投与することができるが、薬学的に許容される担体と一般に混合され、錠剤もしくはカプセル剤、リポソームの形で、または凝集粉末として同時投与される。適切な固体担体の例には、ラクトース、スクロース、ゼラチンおよび寒天が含まれる。カプセル剤または錠剤は容易に製剤化することができ、飲み込むことまたは噛むことを容易にすることができる。他の固体の形態には、顆粒剤および混合散剤が含まれる。錠剤は、適する結合剤、滑沢剤、希釈剤、崩壊剤、着色剤、着香料、流動誘導剤および融解剤を含有することができる。
本発明の経口剤形を製剤化するために使用することができる技術、薬学的に許容される担体および賦形剤の具体例は、例えば、米国特許出願公開第2005/0192315号、PCT国際出願公開番号WO2005/074899、WO2007/047863および2007/146248に記載されている。
本発明で有用な剤形を作製するための一般的な技術および組成は、以下の参考文献に記載されている:7 Modern Pharmaceutics、チャプター9および10(Banker&Rhodes編、1979);Pharmaceutical Dosage Forms:Tablets(Liebermanら、1981);Ansel、Introduction to Pharmaceutical Dosage Forms 第2版(1976);Remington’s Pharmaceutical Sciences、第17版(Mack Publishing Company、Easton、Pa.、1985);Advances in Pharmaceutical Sciences(David Ganderton、Trevor Jones編、1992);Advances in Pharmaceutical Sciences 第7巻(David Ganderton、Trevor Jones、James McGinity編、1995);Aqueous Polymeric Coatings for Pharmaceutical Dosage Forms(Drugs and the Pharmaceutical Sciences、シリーズ36(James McGinity編、1989);Pharmaceutical Particulate Carriers:Therapeutic Applications:Drugs and the Pharmaceutical Sciences、第61巻(Alain Rolland編、1993);Drug Delivery to the Gastrointestinal Tract(Ellis Horwood Books in the Biological Sciences。Series in Pharmaceutical Technology;J.G.Hardy、S.S.Davis、Clive G.Wilson編);Modern Pharmaceutics Drugs and the Pharmaceutical Sciences、第40巻(Gilbert S.Banker、Christopher T.Rhodes編)。これらの参考文献は、ここに参照によりその全体が本出願に組み込まれる。
錠剤は、適する結合剤、滑沢剤、崩壊剤、着色剤、着香料、流動誘導剤および融解剤を含有することができる。例えば、錠剤またはカプセル剤の投薬単位剤形での経口投与については、活性薬物成分は、経口用の非毒性の薬学的に許容される不活性担体、例えば、ラクトース、ゼラチン、寒天、デンプン、スクロース、グルコース、メチルセルロース、リン酸二カルシウム、硫酸カルシウム、マンニトール、ソルビトール、微結晶性セルロースなどと組み合わせることができる。適する結合剤には、デンプン、ゼラチン、天然の糖類、例えばグルコースもしくはベータラクトース、トウモロコシデンプン、天然および合成のゴム、例えばアカシア、トラガカンタ、またはアルギン酸ナトリウム、ポビドン、カルボキシメチルセルロース、ポリエチレングリコール、ワックスなどが含まれる。これらの剤形で使用される滑沢剤には、オレイン酸ナトリウム、ステアリン酸ナトリウム、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、ステアリン酸、ステアリルフマル酸ナトリウム、タルクなどが含まれる。崩壊剤には、限定されずに、デンプン、メチルセルロース、寒天、ベントナイト、キサンタンガム、クロスカルメロースナトリウム、グリコール酸デンプンナトリウムなどが含まれる。
用語
ここで用いるように、および特に明記しない限り、以下の用語の各々は、下に示す定義を有するものとする。
ここで用いるように、「ラキニモド」はラキニモド酸または薬学的に許容されるその塩を意味する。
ここで用いるように、ミリグラムで計量される薬剤、例えばラキニモドの「量」または「用量」は、調製物の形に関係なく調製物中に存在する薬剤、例えばラキニモド酸のミリグラムを指す。「0.6mgのラキニモドの用量」は、調製物の形に関係なく調製物中のラキニモド酸の量が0.6mgであることを意味する。したがって、塩の形、例えばラキニモドナトリウム塩の場合、0.6mgのラキニモドの用量を提供するのに必要な塩の形の重量は、追加の塩イオンの存在のために0.6mgを超えるであろう(例えば、0.64mg)。
ここで用いるように、「単位用量」、「単位用量(複数)」および「単位剤形(複数可)」は、単一薬物投与実体/実体(複数)を意味する。
ここで用いるように、数の値または範囲との関連で「約」は、列挙または請求される数の値または範囲の±10%を意味する。
ここで用いるように、所定量のラキニモドまたはラキニモドを使用する治療レジメンに言及するとき、「有効」または「治療的有効」は、所望の治療応答を与えるのに十分である量のラキニモドまたはレジメンを指す。効能は、多発性硬化症の症状の改善によって測定することができる。そのような症状には、MRIによって監視される多発性硬化症の疾患活動、再発率、身体障害の蓄積、再発の頻度、確認された疾患進行までの時間、確認された再発までの時間、臨床増悪の頻度、脳萎縮、神経細胞機能不全、神経細胞損傷、神経細胞変性、神経細胞アポトーシス、確認された進行の危険、視覚的機能、疲労、障害のある可動性、認知障害、脳体積、全脳MTRヒストグラムで観察される異常、一般健康状態、機能的状態、生活の質および/または作業中の症状重症度を含めることができる。
ここで用いるように、「臨床応答」は、薬剤、例えばラキニモドへの患者の応答の程度の尺度である。正の臨床応答は、ラキニモドを受けることに好都合に応答する患者および/またはそれから恩恵を受ける患者(ラキニモド応答体)に相当し、負の臨床応答は、ラキニモドを受けることに不都合に応答する患者および/またはそれから恩恵を受けない患者(ラキニモド不応答体)に相当する。
ここで用いるように、過程または系「に関連する遺伝子」、例えば、炎症性応答に関連する遺伝子または血液系に関連する遺伝子は、その過程または系で役割をする遺伝子である。一例として、炎症性応答に関連する遺伝子は、IL−1R、IL−8R、IL−22R、IL−9、TNFRSF4またはRORCであってもよい。
「対象に投与する」ことまたは「(ヒト)患者に投与する」ことは、状態、例えば病態に関連する症状を軽減、治癒または低減するために、対象/患者に医薬、薬物または治療薬を与えること、調剤することまたは適用することを意味する。投与は、定期的投与であってもよい。ここで用いるように、「定期的投与」は、時間で区切られた反復/回帰性の投与を意味する。投与間の時間は、好ましくはその時々で一貫している。定期的投与は、例えば、1日1回、1日2回、1日3回、1日4回、毎週、週2回、週3回、週4回、等々の投与などを含むことができる。
ここで用いるように、「処置する」ことは、例えば、疾患もしくは障害、例えば再発性MS(RMS)の阻害、退行もしくは静止を誘導すること、またはその疾患もしくは障害の症状を軽減、減弱化、抑制、阻害すること、その重症度を低減すること、消去もしくは実質的に消去すること、または改善することを包含する。CISを呈する患者に適用される「処置する」ことは、多発性硬化症と一致する最初の臨床エピソードを経験し、臨床的に明確な多発性硬化症(CDMS)を発症する危険の高い患者において、CDMSの発症を遅らせること、CDMSへの進行を遅らせること、CDMSへの変換の危険を低減すること、または再発の頻度を低減することを意味する。
対象における疾患進行または疾患合併症の「阻害」は、対象において疾患進行および/または疾患合併症を予防または低減することを意味する。
MSまたはRMSに関連する「症状」には、MSまたはRMSに関連する任意の臨床または検査徴候が含まれ、対象が感じるかまたは観察することができるものに限定されない。
ここで用いるように、「多発性硬化症に冒されている対象」または「再発性多発性硬化症に冒されている対象」は、多発性硬化症または再発寛解型多発性硬化症(RRMS)および二次性の進行性多発性硬化症(SPMS)を含む再発性多発性硬化症(RMS)を有すると臨床的に診断された対象を意味する。
ここで用いるように、「ベースライン」時の対象は、ラキニモドの投与より前の対象である。
ここで用いる「MSを発症する危険がある患者」(すなわち臨床的に明確なMS)は、MSの公知の危険因子のいずれかを呈する患者である。MSの公知の危険因子には、臨床的に孤立した症候群(CIS)、病変なしでMSを示唆する単一の発作、臨床発作なしの病変の存在(CNS、PNSまたは髄鞘のいずれかにおける)、環境因子(地理的位置、気候、食事、毒素、日光)、遺伝学(HLA−DRB1、IL7R−アルファおよびIL2R−アルファをコードする遺伝子の変異)、および免疫学的構成要素(例えばEBウイルスによるウイルス感染症、高結合力CD4+T細胞、CD8+T細胞、抗NF−L、抗CSF114(Glc))のいずれか1つが含まれる。
ここで用いる「臨床的に孤立した症候群(CIS)」は、1)MSを示唆する単一の臨床発作(ここでは「最初の臨床事象」および「最初の脱髄性事象」と互換的に使用される)であり、それは、例えば、視神経炎、かすみ目、二重視、不随意急速眼球運動、盲目、平衡喪失、振戦、運動失調、めまい、四肢の不器用さ、協調の欠如、1つ以上の四肢の脱力、変化した筋緊張、筋肉のこり、痙攣、チクチク感、感覚異常、灼熱感、筋肉痛、顔面痛、三叉神経痛、突き刺すような鋭痛、灼熱ヒリヒリ感、会話の速度が落ちること、単語の不明瞭な発音、会話のリズムの変化、嚥下障害、疲労、膀胱の問題(切迫、頻度、不完全な排尿および失禁を含む)、腸の問題(便秘および腸調節の喪失を含む)、不能症、性的興奮の減退、感覚の喪失、熱過敏、短期記憶の喪失、集中力の喪失または判断もしくは推理の喪失のエピソードとして現れ、ならびに2)MSを示唆する少なくとも1つの病変を指す。具体例では、CIS診断は、単一の臨床発作および直径6mm以上のMSを示唆する少なくとも2つの病変に基づくだろう。
ここで用いるように、「多発性硬化症薬」は、臨床的に明確なMS、CIS、任意の形の神経変性もしくは脱髄性疾患、または上述の疾患のいずれかの症状の処置を目的とする薬物または薬剤である。「多発性硬化症薬」には、限定されずに、抗体、免疫抑制薬、抗炎症剤、免疫調節薬、サイトカイン、細胞傷害剤およびステロイドを含めることができ、臨床的に明確なMS、CISまたは任意の形の神経変性もしくは脱髄性疾患の処置を目的とする、承認薬、臨床試験中の薬物、または代替療法が含まれてもよい。「多発性硬化症薬」には、限定されずに、インターフェロンおよびその誘導体(BETASERON(登録商標)、AVONEX(登録商標)およびREBIF(登録商標)を含む)、ミトキサントロンおよびナタリズマブが含まれる。他の自己免疫性疾患の処置のために承認されたか、または試験中であるが、MSまたはCISを処置するためにMSまたはCIS患者で使用される薬剤も含まれる。
ここで用いるように、「未処置患者」は、ここで規定される多発性硬化症薬で処置されていない対象である。同様に、薬剤、例えばラキニモドに対して「未処置である」患者または対象は、前記薬剤で処置されていない患者または対象である。
ここで用いるように、「対象の血液」は、対象の血液に由来するPBMC、リンパ球、単球、マクロファージ、好塩基球、樹状細胞または他の細胞に代表される。
ここで用いるように、「参照値」は、規定の健康状態の特定集団を特徴付ける値または値の範囲である。
「薬学的に許容される担体」は、理にかなった有益性/危険度比に相応して、不相応な有害副作用(例えば、毒性、炎症およびアレルギー応答)なしでヒトおよび/または動物での使用に適する担体または賦形剤を指す。それは、対象へ本化合物を送達するための薬学的に許容される溶媒、懸濁剤またはビヒクルであってもよい。
パラメータ範囲が提供される場合は、その範囲内の全ての整数、およびその10分の1の数も本発明によって提供されているものと理解される。例えば、「0.1〜2.5mg/日」は、0.1mg/日、0.2mg/日、0.3mg/日、0.4mg/日、0.5mg/日など、最高2.5mg/日までを含む。
本発明は以下の実験詳細を参照してよりよく理解されるが、詳述される具体的な実験は、その後に続く特許請求の範囲でより完全に記載されているように、本発明を例示するだけであることを当業者は容易に認識する。
[実験詳細]
例1:再発寛解型多発性硬化症における末梢血単核細胞に及ぼすラキニモドの効果を評価するフェーズIII臨床試験(「ALLEGRO」またはMS−LAQ−301)のためのハイスルーアウトプット遺伝子発現補助研究
Gurevichら(Gurevichら2010)による以前の研究では、健康な対象および再発寛解型多発性硬化症(RRMS)患者の末梢血単核細胞(PBMC)でのラキニモド(LAQ)のin vitro分子効果は、遺伝子発現マイクロアレイによって特徴付けられた。Gurevichらは、LAQが、抗原提示および対応する炎症経路に関係する遺伝子の抑制を誘導することを実証した。RRMSを示している患者の処置の後のLAQの治療効果の根底にある分子機構(複数可)をさらに解明するために、ALLEGRO臨床試験への補助研究として、LAQで処置したRRMS患者からのPBMCの遺伝子発現マイクロアレイ分析を発明者らは実施した。
ALLEGRO臨床試験
ALLEGROは、24カ月の期間、再発寛解型多発性硬化症(RRMS)の対象においてラキニモド0.6mgの毎日の経口投与の効能、安全性および耐容性を評価するために実行された、多国籍(24カ国)多施設(およそ139施設)の無作為化二重盲検並行群プラセボ対照臨床試験であった。
1106人の患者を、ラキニモド0.6mgまたはプラセボのいずれかに等しく無作為化し、二重盲検式に処置し、ベースライン特性は群間で均衡させた。研究の主要エンドポイントは、二重盲検処置期間中に確認された再発の数であって、それは、年率に換算した再発率(ARR−全患者の全曝露で割った再発数)に相当する。副次的エンドポイントには、3カ月時に確認した拡張障害状態スケール(EDSS)の変化、ならびにガドリニウム増強(GdE)および新/拡大T2 MRI病変の累積数によって測定された障害が含まれた。
研究期間
スクリーニング段階:1カ月。
二重盲検処置段階:0.6mgラキニモドまたは対応プラセボの日用量の24カ月の1日1回の経口投与。
母集団進行の盲検化した分散および検定力再評価(第1の対象が20カ月の処置を完了する前に予定された)の結果、二重盲検試験期間は30カ月まで延長することができる。これは、障害蓄積に及ぼすラキニモドの影響を検出する統計検定力を強化するために計画される。研究期間を延長する推奨は、所定の規則に基づく。
試験計画
適格対象を、以下の処置群の1つに1:1の比で等しく無作為化した:
1.ラキニモドカプセル剤0.6mg:0.6mgラキニモド1カプセルを、1日1回経口投与した。0.6mgラキニモドカプセル剤は、1カプセルあたり0.6mgのラキニモド酸をメグルミンと含有し、2007年12月21日に公開されたPCT国際出願公開番号WO/2007/146248に開示される方法によって製造された(10頁5行目〜11頁3行目を参照)。
2.ラキニモド群の対応プラセボ:1カプセル剤を1日1回投与する。
−1カ月(スクリーニング)、0カ月(ベースライン)、1、2、3、6、9、12、15、18、21および24カ月(終了/早期中止)時の、二重盲検段階の12回のスケジュール診察時に、対象を試験施設で評価した。6カ月の延長試験の場合には、27および30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に対象を試験施設で評価し、この場合には、24カ月が定期的なスケジュール診察であった。
全患者において、EDSSは3カ月おきに、MSFCは6カ月おきに評価し、MRIを毎年実施した。患者のサブグループ(n=189)は、3および6カ月時に追加のMRIスキャンを受けた。試験を完了した対象は、1年の非盲検延長試験に加わる機会を提供された。有害事象のために中止した者を除いて、試験を中止した患者は最後の終了時診察を受け、さらに評価されなかった。
指定時点で、以下の評価を実施した:
1.各試験診察で生命徴候を測定した。
2.−1カ月時(スクリーニング)、0カ月時(ベースライン)、1、3、6、12、18および24カ月時(終了/早期中止コア試験)に、検診を実施する。6カ月の延長試験の場合には、30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に追加の検査を実施した。
3.以下の安全性臨床検査を実施した:
a.示差的完全血球算定(CBC)−全てのスケジュール診察時に。0カ月時(ベースライン)および24/30カ月時(終了/早期中止)に、網状赤血球算定をCBCに加えた。
b.血清化学(電解質、肝酵素、直接および総ビリルビン、ならびに膵臓のアミラーゼおよびCPKを含む)、および尿検査−全てのスケジュール診察時になされる。
c.ベースライン時(0カ月)およびその後の各スケジュール試験診察時に、妊娠の可能性のある女性で急速尿β−hCG検査を実施した(施設で)。
d.妊娠の可能性のある女性でのβ−hCGは、全てのスケジュール診察時に実施した。
e.3カ月時の診察から開始して、妊娠の可能性のある女性で急速尿β−hCG検査を28(±2)日おきに実施した。検査の実施が予定されてから72時間以内に対象に電話で接触し、検査に関して特定の質問をした。妊娠が疑われた場合(陽性の尿β−hCG検査結果)、発信者は治験薬が中止されたことを確認し、対象は全治験薬を持参してできるだけ早く施設に到着するように指示された。
4.炎症のマーカー(血清中の従来のC反応性タンパク質およびフィブリノゲン)−スクリーニング時、ベースライン時およびその後全てのスケジュール診察時。
5.最初の3カ月の間、2週間毎に施設職員が定期電話をかけた。脈管血栓症を示唆する徴候/症状に関する所定の質問リストを対象に提示した。
6.−1カ月時(スクリーニング;QTcが450msec未満の場合は追加の記録を最高30分間隔で実施する)、(ベースライン;3回の記録、15分間隔)、1、2、3、6、12、18および24カ月時(終了/早期中止)にECGを実施した。6カ月の延長試験の場合には、30カ月時(延長試験の終了/早期中止)にECGを実施する。
7.−1カ月時(スクリーニング)に胸部X線を実施する(スクリーニング診察の7カ月前以内に実施されない場合)。
8.有害事象(AE)を試験の間監視する。
9.併用医薬品を試験の間監視する。
10.拡張障害状態スケール(EDSS)、25フィート歩行検査/歩行運動指数(AI)、機能系(FS)を含む神経学的評価を、−1カ月時(スクリーニング)、0カ月時(ベースライン)、ならびに試験および延長試験期間中に3カ月毎に実施する。
11.MS機能複合体(MSFC)を、−1カ月時(スクリーニング)(訓練目的だけのために3回実施)、0カ月時(ベースライン)、6、12、18および24カ月時(終了/早期中止)に評価した。6カ月の延長試験の場合には、30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に最後のMSFCを実施した。
12.対象が報告した疲労は、0、6、12、18および24カ月時(終了/早期中止)に修正疲労影響スケール(MFIS)によって評価された。6カ月の延長試験の場合には、30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に追加のMFISを実施した。
13.一般健康状態は、0カ月時(ベースライン)および24カ月時(試験の終了/早期中止)にEuroQoL(EQ5D)アンケートによって評価した。6カ月の延長試験の場合には、24カ月の代わりに30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に最後のEuroQoL(EQ5D)を実施した。
14.一般健康状態は、0カ月時(ベースライン)およびその後終了/早期中止まで6カ月ごとの、短い形式の一般健康調査(SF−36)の対象アンケート報告によって評価した。
15.各評価で、対象は、0カ月時(ベースライン)、6、12、18および24カ月時(終了/早期中止)に、100%、2.5%および1.25%のコントラストレベルチャート[Sloan文字またはタンブリング−E]を使用する両眼低コントラスト視覚的鋭敏さの評価を5回受けた。試験を6カ月延長する場合は、追加の両眼低コントラスト視覚的鋭敏さ評価を、30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に実施する。
16.ラキニモドの潜在的作用機構および炎症の追加のバイオマーカーおよびMS疾患の潜在的バイオマーカーを調査するために、0、1、12および24カ月時に血清試料を全対象から収集した。試験を6カ月延長する場合には、24カ月の代わりに30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に最後の血清試料を実施する。
17.対象は、0カ月時(ベースライン)、12および24カ月時(終了/早期中止)にMRIスキャンを3回受けた。6カ月の延長試験の場合には、30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に追加のMRIを実施した。
18.母集団PK研究(PPK):PPK評価のための血液試料は、1、12および24カ月時に全対象から収集した。試験を6カ月延長する場合には、24カ月の代わりに30カ月時(延長試験の終了/早期中止)に最後のPPK評価を実施した。
19.試験を通して、再発を確認/監視した。「試験での」再発の定義は客観的な神経学的評価で裏づけられなければならないので、疑似再発を排除するのに十分長く神経学的欠陥が持続しなければならない。したがって、この臨床試験では、再発は1つ以上の新しい神経学的異常の出現または1つ以上の以前に観察された神経学的異常の再発であり、ここで、臨床状態の変化は少なくとも48時間持続し、前の再発の発症から少なくとも30日間の神経学的状態の改善が直前にある。
20.再発のために認められた処置は、最高5日間連続の静脈内メチルプレドニゾロン1gr/日であった。
組入れ/除外基準
組入基準
1.対象は、改訂されたマクドナルド基準(Polman、2005)によって規定される、再発寛解型の疾患経過の、確認され実証された診断を有しなければならない。
2.対象は、通院時、0〜5.5の変換されたKurtzke EDSSスコアでなければならない。
3.対象は、安定した神経学的状態でなければならず、またスクリーニングの30日前(−1カ月)にコルチコステロイド処置[静脈内(iv)、筋肉内(im)および/または経口(po)]なしでなければならない。
4.対象は、以下の1つを経験していなければならない:
a.スクリーニングの前の12カ月間中に少なくとも1つの実証された再発。
b.スクリーニングの前の24カ月間中に少なくとも2つの実証された再発。
c.スクリーニングの12カ月前以内に実施されるMRIで少なくとも1つの実証されたT1−Gd強化病変を有する、スクリーニングの12〜24カ月前の1つの実証された再発。
5.対象は、18歳以上および55歳以下でなければならない。
6.対象は、スクリーニングの前に少なくとも6カ月(最初の症状から)の疾患持続期間を有しなければならない。
7.妊娠の可能性がある女性は、許容される受胎調節方法を実施しなければならない。この研究で許容される受胎調節方法には、以下のものが含まれる:避妊手術、子宮内器具、経口避妊薬、避妊パッチ、持続性の注射可能な避妊薬、パートナーの精管切除または二重障壁方法(コンドームまたはペッサリーと殺精子剤)。
8.試験に参加する前に、対象はインフォームドコンセント用紙に署名し、日付を記入することができなければならない。
9.対象は試験の持続期間のプロトコール必要条件を自発的に満たさなければならず、かつ、満たすことができなければならない。
除外基準
1.進行型MSを有する対象。
2.−1カ月(スクリーニング)から0カ月(ベースライン)の間の再発の開始、不安定神経学的状態またはコルチコステロイド[(iv)、筋肉内(im)および/または経口(po)]もしくはACTHによるいかなる処置。
3.スクリーニングの6カ月前以内の実験的または治験の薬物の使用および/または薬物臨床試験への参加。
4.スクリーニング診察の6カ月前以内のミトキサントロン(Novantrone(登録商標))を含む免疫抑制薬または細胞傷害剤の使用。
5.以下のいずれか1つの以前の使用:ナタリズマブ(Tysabri(登録商標))、カルドリビン、ラキニモド。
6.スクリーニング診察の2カ月前以内の酢酸グラチラマー(copaxone(登録商標))インターフェロン−β(1aまたは1bのいずれか)または静脈内免疫グロブリン(IVIG)による以前の処置。
7.スクリーニング診察の2カ月前以内の連続≧30日の期間の全身性コルチコステロイド処置。
8.以前の放射線全身照射または全リンパ系照射。
9.以前の幹細胞処置、自家骨髄移植または同種骨髄移植。
10.既知の結核の病歴。
11.ベースライン診察の2週前の急性感染症。
12.ベースラインの2週前の大きな外傷または手術。
13.ベースライン診察の2週前以内のCYP3A4の阻害剤の使用(フルオキセチンでは1カ月)。
14.スクリーニング診察の2年前以内のアミオダロンの使用。
15.妊娠または母乳栄養。
16.スクリーニング時のALTまたはASTのいずれかの≧3×のULN血清上昇。
17.スクリーニング時の≧2×のULNである血清直接ビリルビン。
18.以下から得られる450msec(機器アウトプットによる)であるQTc区間:
a.スクリーニング診察時の2つのECG記録、または
b.3つのベースラインECG記録から計算した平均値。
19.病歴、検診、ECG、臨床検査または胸部X線検査から判断される、安全で完全な試験参加を妨げるであろう臨床的に重要であるかまたは不安定な医学的もしくは外科的状態を有する対象。そのような状態には、以下を含めることができる:
a.試験プロトコールによって認められる標準処置によってうまく制御することができない心臓血管または肺の障害。
b.試験医薬品の吸収に影響を及ぼすことができる胃腸障害。
c.腎臓または代謝疾患。
d.いかなる形の慢性肝疾患。
e.既知のヒト免疫不全ウイルス(HIV)陽性状態。
f.長いQT症候群の家族歴。
g.薬物および/またはアルコール乱用の病歴。
h.主要な精神障害。
20.Gd感受性の既知の病歴。
21.MRIスキャンをうまく受けることができないこと。
22.ラキニモドの投与を妨げるであろう既知の薬物過敏性、例えばマンニトール、メグルミンまたはフマル酸ステアリルナトリウムへの過敏性。
補助ハイスルーアウトプット遺伝子発現研究
この補助研究の目標は、LAQ処置によってRRMS患者のPBMCで誘導される遺伝子発現の変化および対応する生物学的機構を特徴付けることであった。ALLEGRO臨床試験の組入基準により、25人の患者をLAQ(n=13、年齢38.8±2.3歳、女性/男性比:8/5)またはプラセボ(n=12、年齢37.2±3.4歳、女性/男性比:8/4)を受けるように無作為割付けした。
遺伝子マイクロアレイ分析のために、LAQ処置またはプラセボの開始の前のベースライン時、0、1、6および24カ月の処置(ALLEGRO臨床試験プロトコールによる0、1、6および7の診察に対応する)の後、末梢血液試料をRRMS患者から得た。
簡潔にいうと、1)ALLEGROに参加して0.6mgのLAQまたはプラセボで毎日処置されたRRMS患者から、末梢血単核細胞(PBMC)を得た。ベースライン時ならびに1および6カ月のLAQ処置時にPBMCを遺伝子発現分析(HU−133A−2−Affymatrixアレイ)にかけた;2)Partek Genomics Solutionソフトウェアによってデータを分析した。最も有益な遺伝子(MIG)は、p<0.01で群を区別したものと規定した。遺伝子機能アノテーション、濃縮および経路分析は、Ingenuityソフトウェアによって実施した。各時点について、プラセボ群で変化した遺伝子はさらなる分析から除外した;3)LAQ関連の機構の検証は、ウエスタンブロットによって実施した。
LAQは、1カ月の処置で354個のMIGおよび6カ月の処置で1562個のMIGの示差的遺伝子発現を誘導することが見出された。
この研究は、PBMCの接着、遊走および化学走性に関連する遺伝子をLAQが直接的に、またはTGFb抑制を通して下方制御することを示す。これらの効果は1カ月のLAQ処置の後に観察され、6カ月のLAQ処置の後に強化された。LAQはPAI−1も下方制御し、フィブリン溶解、およびおそらく以降の神経保護の活性化を示唆する。両方の効果は、MS臨床症状の改善に寄与することができる。
RNA単離およびハイブリダイゼーション
15mlの末梢血からPBMCを抽出し、Ficoll−Hypaque勾配によって分離した。DNアーゼ消化工程を含むTrizol(Invitrogen、USA)およびPhase−Lock−Gelカラム(Eppendorf、Germany)を使用して、全RNAを抽出した。RNA Experion自動電気泳動システム(Bio−Rad Laboratories、Hercules、California)によってRNA完全性を評価した。
標準のAffymetrix,Inc.USAプロトコールに従って、3μgの全RNA、ハイブリダイゼーション、検出およびスキャンを用いてプローブ合成を実施した;Two−Cycle cDNA合成キット(Affymetrix,Inc.、USA)を用いてcDNAを合成し、GeneChip IVT Labelingキット(Affymetrix,Inc.、USA)でin vitro転写を実施した。各々14,500個のよく注釈のつけられたヒト遺伝子に対応する18,400個の遺伝子転写物を含有するHG−U133A−2アレイにビオチン標識IVT−RNAをハイブリダイズさせ、GeneChip Fluidics Station 450(Hewlett Packard、USA、GeneArray−TMスキャナG2500A)で洗浄し、製造業者のプロトコール(Affymetrix,Inc.USA)に従ってスキャンした。
データ分析
データ分析は、Partek Genomics Solutionソフトウェア(www.partek.com;Partek Incorporated、St.Louis、MO)で実施した。頑健なマルチチップ平均(RMA)バックグラウンド補正アルゴリズムを適用することによって、生のCELファイルから発現値を計算した。RMA補正は以下を含んでいた:1)バックグラウンド補正値;2)五分位正規化;3)log2変換;および4)中央値洗練集計(median polish summarization)。LAQ効果を評価するために、Partekソフトウェアで関連づけられたANOVA、反復測定および相関分析を適用した。最も有益な遺伝子MIGは、p<0.01で実験群を区別したものと規定した。p=0.05での偽発見率(FDR)複数検定補正について、全てのp値を計算した。
さらに、複数の検定のために5%FDRのデータの重複順列に基づくブートストラッピングアプローチを用いたパラメトリックT検定および非パラメトリックマン−ホイットニー検定によって、個々の遺伝子の有意性を検定した。
LAQ処置の下で作動する主要な生物学的経路を特定する遺伝子機能アノテーション、濃縮および経路分析を、Ingenuity Pathways Analysisソフトウェア(www.ingenuity.com)によって実施した。濃縮は、所与の遺伝子セットにおいて予想されるものより偶然に有意に(p<0.05)より高い遺伝子の割合と規定された。
ウエスタンブロット分析
タンパク質レベルで鍵となる遺伝子の確認のために、ウエスタンブロット分析を実施した。上清を収集し、製造業者のガイドラインに従ってBradfordアッセイ(Pierce、Rockford、IL、USA)を用いてタンパク質濃度を判定した。等量のタンパク質を試料緩衝液に懸濁させ、5分間沸騰させた。細胞溶解物を10%SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)で分解した。ゲルをニトロセルロース膜(Amersham、Buckinghamshire、UK)に移し、トリス緩衝食塩水Tween(TBST)緩衝液(20mMトリス、137mM NaClおよび0.1%Tween20)中の1%BSAでブロックし、4℃で一晩、一次抗体とインキュベートした。TBST緩衝液で3回洗浄した後に、ブロットをアルカリ性ペルオキシダーゼコンジュゲート二次抗体とインキュベートした。抗体を、ブロッキング溶液で希釈した。ブロットを次にTBST緩衝液で3回洗浄し、会社のプロトコールに従って標準の化学発光(Supersignalキット、Pierce、Rockford、IL、USA)によって分析した。
結果
補助研究の目的により、72個の血液試料を収集した。試料数および対応する人口統計データを表1に提示する。
表1.対象の臨床および人口統計データ
ANOVA分析
1、6または24カ月のLAQ処置の後のPBMC遺伝子発現をベースラインの遺伝子発現と比較するために、ANOVA分析を使用した。
各時点について、発明者らはデータセットでの変動源分析を実施した。(図1)。年齢、性およびバッチ効果は、LAQまたはプラセボ関連の変化に関する交絡因子と考えられた。各時点について、プラセボ効果に関連する遺伝子を評価し、さらなる分析から除外した。
下の表2は、ベースラインと比較して、各時点でANOVA検定によって有意に変化した遺伝子数を示す。
表2.ANOVAのp値によるLAQ関連のMIGの数。
下の表3および表4は、LAQによって影響される主な生物学的経路および機能を示す。
表3.LAQによって影響される主な生物学的経路および機能
表4.LAQによって影響される主な生物学的経路および機能
各時点で有意な変化を示した大多数の遺伝子は、下方制御された。1カ月の処置後に影響された354個の遺伝子の機能強化分析は、炎症性応答の異なる機構に関連する50個の分子の抑制を示した(3.4×10-10〜1.1×10-2のp値)。これには、例えば、対応するTGFB1、ITGB1、ITGB3、ITGB5およびCXCL5、ITGB1、MMP1、TGFB1の抑制に基づく、食細胞の接着(p=1.2×10-3)および好中球の化学走性(p=6.0×10-3)の抑制が含まれた。最も有意な正規経路は、カベオラおよびクラスリン媒介エンドサイトーシスシグナル伝達の抑制である(p=1.8×10-4および2.1×10-4)。興味深い知見は、Tリンパ球とアクセサリー細胞の間の接着相互作用で機能するPTCRおよびCD84の抑制である。
表2に示すように、LAQによって有意に(p<0.01)影響された遺伝子の数は、1カ月および6カ月の処置の間で354個から1562個に変化し、43個の遺伝子は6カ月の処置についてのストリンジェントなFDR基準を通過した(図2A)。1562個の内の合計260個の遺伝子は、細胞運動機能の抑制に関係していた(4.6×10-7〜5.4×10-3の濃縮のp値)。Gタンパク質共役受容体シグナル伝達(p=3.1×10-5)、アラキドン酸代謝(p=2.2×10-3)、白血球溢出シグナル伝達(p=9.4×10-3)、カベオラ媒介エンドサイトーシスシグナル伝達(p=2.1×10-2)、TGFβシグナル伝達(p=4.3×10-2)、細胞接着(p=2.4×10-5)、神経伝達(p=2.1×10-5)、内在性プロトロンビン活性化経路(p=6.2×10-2)および凝固系(p=7.4×10-2)は、処置の6カ月後に最も有意に下方制御された正規経路であった。
24カ月の処置時の分析に含まれた患者の数は比較的少なく、したがって、統計的検定力を向上させるために、発明者らは6および24カ月からのデータを合わせ、その結果p<0.01の2922個の遺伝子およびFDR基準を通過した1564個の遺伝子の評価となった(図2B)。合わせた6および24カ月のLAQサインの高い統計的有意性のために、最も詳細な機能分析を適用した。
LAQは、遊走/接着分子の発現を下方制御する
6カ月を超える処置の後にFDR基準を通過した1564個の遺伝子の機能分析は、1.5×10-3〜4.5×10-14のp値で異なる種類の細胞運動機構に関連している下方制御された遺伝子(n=305)の有意な濃縮を示した。これには、例えば、細胞遊走機能(n=233、p=4.5×10-14)および化学走性(n=78、p=4.3×10-5)の抑制が含まれた。
LAQは、一定範囲のメタロプロテイナーゼファミリーメンバー、例えばMMP1、MMP14、MMP16、MMP24、MMP25、MMP26、MMP28、ADAM12およびADAM22を有意に下方制御した。LAQ処置により、いくつかのインテグリンおよびケモカイン関連遺伝子が下方制御された:ITGB1、ITGB5、ITGB6、ITGA8、ITGB8、およびGPIIB−III3(フィブリノゲン受容体)、CXCL4、CCL14、CCL18、CCXCR1(XCR1)、CXCL7(PPBP)。
これらの結果は、EAEマウスにおけるT細胞の遊走能力をLAQが妨害することを報告している以前の研究と一致している(Wegnerら、2010、Jadidi−Niaraghら、2011)。
LAQは、炎症誘発性構成要素を下方制御する
細胞遊走能力の抑制に加えて、LAQ処置はIL−1R、IL−8RおよびIL−22R、IL−9、TNFRSF4およびRORC(RORガンマ)の有意な下方制御を実証したが、その全てはEAEで一役担うことが公知である炎症関連遺伝子である(Jadidi−Niaraghら、2011)。近年、IL−9がCNSの自己免疫性炎症におけるT細胞の活性化および分化にとって重要であること、ならびにIL−9−/−マウスがそれらのWT対応物より有意に軽いEAEを発症することが示されている(Liら、2011)。この結果は、TGFb1およびICOSLG(誘導可能なT細胞共同刺激因子リガンド)によって間接的に調節されるSOCS(サイトカインシグナル伝達のサプレッサー)、免疫応答の負の調節因子の発現の低減を示す。炎症誘発性構成要素の下方制御と相関して、LAQ処置はCSF1、CSF2およびCSF3の発現を有意に低減し、FoxP3発現に間接的に影響した。ROR(RORガンマ)は、FoxP3と直接的に相互作用することができる。しかし、LAQ効果に関する以前の研究のいずれもTregに及ぼす効果を記載していないので、この相互作用の機能的結果は明白でない。クラスリンおよびカベオラによって媒介されるエンドサイトーシス経路は、処置の1カ月後に有意に抑制される(p=5.0×10-4およびp=5.9×10-4)。
TGFB1関連の機構
6カ月以上のLAQ処置は、TGFB経路に関係がある遺伝子の有意な抑制を誘導した(p=1.9×10-2)(図3)
TGFBは、造血細胞に多様な効果がある強力な調節サイトカインである。免疫系におけるTGFBの重要な機能は、リンパ球の増殖、分化および生存の調節を通して耐性を維持することである。T細胞の中で、CD4+CD25+FOXP3+T regは、炎症部位で免疫応答を抑制するTGFBの主供与源を含有する。T細胞でのTGFB1の発現またはそのシグナル伝達の欠損は、いくつかの自己免疫性疾患の発症と相関する。その抗炎症役割の他に、TGFBは炎症誘発性サイトカインとして逆説的に作用し、IL−6が生成される炎症応答の間、IL−17産生病原性ヘルパーT細胞(ThIL−17細胞)を誘導することが以前に示されている(MirshafieyおよびMohsenzadegan、2009)(図4)。TGFBの提案された炎症誘発性役割と一貫して、我々の分析はいくつかのTGFB関連遺伝子および以下を含むその下流シグナル伝達構成要素の下方制御を示した:LTBP1(潜在性のトランスフォーミング増殖因子β結合タンパク質1)、I型受容体、Smad2/3、Smad4、TCF[肝細胞第4核因子アルファ(HNF4A)]およびPAI−1(図3)。
6カ月のLAQ処置を受けた5人の患者の4人におけるウエスタンブロット分析は、チューブリンに対して正規化したバンド強度の数量化が示すように、TGFB1タンパク質レベルの20〜50%の下方制御を検証した(図5Aおよび5B)。
LAQは、セルピン1[プラスミノーゲン活性化因子阻害剤1(PAI−1)]および凝固系の他のメンバーの下方制御を誘導した
LAQの抗炎症特性は以前に報告されている(Gurevichら、2010、BrueckおよびWegner、2011)が、この研究は、F2(トロンビン)、F7(第VII因子)、F10(第X因子)、FGB(フィブリノゲンベータ鎖)、TFPI[(組織因子経路凝固インヒビター(リポタンパク質関連の凝固阻害剤)]、セルピン1[プラスミノーゲン活性化因子阻害剤(PAI−1)]ならびにセルピン1ファミリーの2つの他のメンバー(セルピンA3およびセルピンB3)を含む凝固経路のいくつかのメンバーの下方制御を実証した。PAI−1はセリンプロテアーゼ組織プラスミノーゲン活性化因子(tPA)およびuPA/ウロキナーゼを阻害し、このように、それはフィブリン溶解、血餅を分解する生理過程の阻害剤である。tPA−プラスミンカスケードは興奮毒によって誘導される神経細胞死において神経変性を促進するが、それは、軸索損傷を悪化させるフィブリンを除去することによってBBB破壊による炎症性状態において保護的役割を有することが実証された(Gvericら、2003)。さらに、MSのマウスモデルでは、EAEの発生率および臨床重症度がPAI−1−/−マウスで低減され、そこでは臨床再発はPAI−1−/−マウスに存在せず、PAI−1−/−マウスからの脊髄試料において、神経炎の以降の低減は、tPA活性の増加に関連してフィブリン溶解のより高い能力と連動していた(Eastら、2008)。
重要なことに、PAI−1の有意な下方制御を示す我々の遺伝子発現結果と一貫して、図6に示すウエスタンブロット分析は、6カ月のLAQ処置の後の5人の患者中の4人におけるPAI−1タンパク質の発現の30〜50%の低減を証明する。バンド強度の数量化は、チューブリンに対して正規化した。in vitroでLAQによって処置したPBMCの以前の遺伝子発現分析も、PAI−1の有意な下方制御を示した(Gurevichら、2010)。これらの結果は、TGFB1およびPAI−1発現のLAQによって誘導された下方制御の間の正の相関を示唆し、Eastら、2008およびGvericら、2003によって証明されたような、PAI−1の神経変性的役割の抑制におけるLAQの関与を示唆する。PBMSに及ぼすLAQ効果の提案された機構は、図8Aおよび図8Bに示す。
相関および反復測定分析。
ANOVAモデルでは、各患者は、各条件下で独立していなければならない。しかし反復測定アルゴリズムでは、独立要件は排除され、各患者は異なる条件で検査を繰り返し受けることができ、同じ患者からの応答が関連づけられる。反復測定は統計的検定力を増加させ、したがって、十分な検定力のためにより少ない対象しか必要としない。発明者らは、すべての診察にわたって同じ患者で評価されたLAQの効果に、反復測定分析を適用した(7人の患者に関連する28回のマイクロアレイ)。先ず、このアプローチを用いて発明者らはプラセボ効果を評価し、プラセボ関連の遺伝子をさらなる分析から除外した。LAQの効果は、p<0.0004でFDR基準を通過する174個の遺伝子の有意な変化で実現された。この遺伝子リストの機能分析はANOVA結果を確認し、中でもPTCRA、ITGB3、ITGA2B、ITGB5、PF4およびTGFB1遺伝子を含んだ。それらの遺伝子プロファイルの同じものが図7で実証される。
要約
PBMCに及ぼすLAQのin vivo効果は、細胞運動性、接着、化学走性、IL1およびIL8媒介炎症、ならびにクラスリンおよびカベオラ媒介エンドサイトーシス経路などに関与する遺伝子を含む、表3および4に示す遺伝子の下方制御を示した。
1カ月のLAQ処置時の最も有益な遺伝子の機能的濃縮分析は、炎症性応答に関連する遺伝子、TGFb1、TGFb1I1およびLTBP1を含むTGFbシグナル伝達に関連する遺伝子(p値範囲=3.8×10-4〜6.7×10-3)(表4を参照)ならびに細胞運動および遊走に関連する他の遺伝子(TNFSF4、SELP、ITGA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7およびBMP6遺伝子)の下方制御を実証した。
6カ月のLAQ処置の後、炎症の抑制がさらに強化され、接着、遊走および白血球溢出シグナル伝達に関連した多数の遺伝子の抑制があり(ITGA2/8、ITGb1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28およびADAM12/18/22)、それにはIL−1/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/BおよびIFNA4/8/10/17の抑制が付随した。注目すべきことに、LAQ処置は、その下流シグナル伝達構成要素(LTBP4、MEK1/2、I型TGFB受容体およびsmad2/3/4)を含むTGFBの発現も下方制御した。ラキニモド処置は、その関連するシグナル伝達構成要素(LTBP4、II型BMPRおよびsmad1/4/5/6/8)を含むTGFb発現、およびNFkBシグナル伝達構成要素(IL−1、IL−1RおよびIKKg)を下方制御した(図9Aを参照)。興味深いことに、TGFb経路の最後の下流の影響を受ける分子は、ローリング、接着、活性化および移動に関与し、それによってCCL19、MMPおよびADAMと協力して細胞運動を調節するいくつかのインテグリンのITGB1構成要素である。TGFBおよびITGB1の抑制は、ウエスタンブロットによって確認した(図5を参照)。PBMCに及ぼすラキニモド効果の提案された機構は、図8Aおよび図8Bに示す。LAQ処置の基礎をなす機構は、セルピン1(プラスミノーゲン活性化因子阻害剤1、PAI−1)、フィブリン溶解の強力な阻害剤およびTGFB経路の影響を受ける最後の下流分子、ならびに凝固系の他のメンバーの下方制御によって特徴付けられる。これらの結果は、サイトカイン発現および接着/遊走をモジュレートするその能力に加えて、LAQは凝固経路もモジュレートし、フィブリン溶解に寄与し(有効なフィブリン除去によって)、それによって神経細胞傷害を低減することを示唆する。この報告書に記載される大多数の変化は、かなりの抑制TGFB1機構によって説明することができた。
結論
・ラキニモドは、炎症誘発性サイトカイン、TGFbおよびNFkB経路の遺伝子の下方制御によって示される通り、炎症を抑制する。
・ラキニモドは、白血球溢出の多段階パラダイムに関連する遺伝子の全セットを抑制し、CNSへの炎症細胞の浸潤を阻害するその能力を示唆する。
・炎症および細胞運動へのこれらの効果は、直接的にまたはTGFb抑制を通して起こり、1カ月のラキニモド処置の後に観察され、6カ月のラキニモド処置の後に強化された。
・ラキニモドによるTGFb、NFkBおよび細胞運動構成要素の下方制御は、CNS浸潤の減少および軸索傷害の以降の低減を強く示唆し、これは、MS臨床症状の改善におけるラキニモドの治療的有益性に寄与することができる。
実施例2:再発寛解型多発性硬化症における免疫応答のモジュレーションでのラキニモドの役割:遺伝子発現サインからの教訓。
要旨
発明者らは、遺伝子発現マイクロアレイ分析を使用するALLEGRO試験に参加した患者において、LAQ処置によって誘導される分子経路を分析した。LAQによって誘導されたMIG(p<0.01)および作動経路を特定するために、処置の1および6カ月後の血液の転写変化をベースラインと比較した。
発明者らは、1カ月の処置時に354個のMIGを特定し、6カ月の処置時に1562個のMIGを特定した。LAQ処置効果は、処置の持続期間によって増強され、TGFbおよびNFkBシグナル伝達を通した炎症応答の下方制御と共に、接着、遊走および白血球溢出シグナル伝達様インテグリン、ケモカインおよびメタロプロテイナーゼを含む細胞運動に関連した遺伝子の抑制、さらに炎症誘発性サイトカインをコードする遺伝子のさらなる下方制御によって特徴付けられた。
これらの結果は、LAQが白血球溢出の停止を主に通した炎症の抑制を通して作用し、それによってRRMS患者において疾患活動の改善に寄与することができたことを実証する。
1.序論
LAQは、急性の実験的自己免疫性脳脊髄炎(EAE)の発達を阻害し、疾患発症の後に処置されたマウスでEAE臨床スコアを低減することが実証された(BrueckおよびWegner、2011;Brunmarkら、2002;Jolivelら、2013;Ruffiniら、2013;Schulze−Topphoffら、2012;Wegnerら、2010)。臨床で、LAQは、102人のプラセボ投与RRMS患者と比較して、106人のRRMS患者において、脳MRIでのガドリニウム増強病変の累積数の約40%の低減を実証した(Comiら、2008)。近年、Assessment of Oral Laquinimod in Preventing Progression in Multiple Sclerosis(Filippiら、2014)研究は、LAQ処置が、24カ月間処置したRRMS患者において、再発の年率を軽く減少させ、障害の進行を遅らせ、白質および灰白質の萎縮を阻止することを実証した(Comiら、2008;Filippiら、2014)。
LAQがEAEの発達を抑制する機構は、Th1/Th2応答のモジュレーション、T細胞の遊走能力に対する干渉(BruckおよびVollmer、2013;BrueckおよびWegner、2011;Wegnerら、2010;Yangら、2004;Zouら、2002)、およびEAEで起こる炎症誘導シナプス変化の阻止(Ruffiniら、2013)を含む。さらに、MS患者では、LAQがB細胞およびT細胞へのそれらの調節効果をモジュレートし(Toubiら、2012)、樹状細胞の免疫原性を下方制御する(Jolivelら、2013)ことが報告されている。
以前の研究(Gurevichら、2010)では、発明者らは、遺伝子発現マイクロアレイを使用して、RRMS患者から得られた分離免疫細胞サブタイプにおいてLAQのin vitroの分子効果を特徴付けた。発明者らは、LAQが、抗原提示ならびにNFkBシグナル伝達、プレイオトロフィン誘導炎症性サイトカイン、ケモカインおよびtoll様受容体シグナル伝達を含む対応する炎症経路に関係する遺伝子の抑制、CD14+マクロファージおよびCD4+T細胞でのTh2応答の下方制御、CD8+T細胞での増殖の抑制、ならびにNFkB経路の抑制を通したCD19+B細胞での抗原提示および接着の抑制を誘導することを実証した。
RRMSにおけるLAQの治療効果の根底にある分子機構をさらに解明するために、発明者らは、ALLEGRO試験に参加したRRMS患者からのPBMCのハイスループット遺伝子発現マイクロアレイ分析を実施した。
2.方法
Assessment of Oral Laquinimod in Preventing Progression in Multiple Sclerosis試験への補助研究として、LAQ 0.6mg/日またはプラセボで処置したRRMS患者から末梢血液試料を得た(Filippiら、2014)。血液試料は、ベースライン時と処置の1および6カ月後に得た。
2.1.RNAの単離およびハイブリダイゼーション
15mlの末梢血からPBMCを抽出し、Ficoll−Hypaque勾配によって分離した。DNアーゼ消化工程を含むTrizolを用いて、全RNAを抽出した。RNAの完全性は、RNA Experion自動電気泳動システムによって評価した。標準のAffymetrix,Inc.USAプロトコールに従って、3μgの全RNA、ハイブリダイゼーション、検出およびスキャンを用いてプローブ合成を実施した;Two−Cycle cDNA合成キット(Affymetrix,Inc.、USA)を用いてcDNAを合成し、GeneChip IVT Labelingキット(Affymetrix,Inc.、USA)でin vitro転写を実施した。14,500個のよく注釈されたヒト遺伝子を含有するHG−U133A−2アレイ(Affymetrix,Inc.、USA)にビオチン標識IVT−RNAをハイブリダイズし、GeneChip Fluidics Station 450で洗浄し、GeneArray−TMスキャナG2500A(Hewlett Packard、USA)を使用して製造業者のプロトコールに従ってスキャンした。
2.2.データ分析
Partek Genomics Solutionソフトウェア(www.partek.com)を用いてデータ分析を実施した。頑健なマルチチップ平均(RMA)バックグラウンド補正アルゴリズムを適用することによって、生のCELファイルから発現値を計算した。RMA補正は以下を含んだ:1)バックグラウンド補正値;2)五分位正規化;3)log2変換;および4)中央値洗練集計。ベースラインと比較して1および6カ月のLAQ/プラセボ処置の後のPBMC遺伝子発現を比較するために、ANOVA分析を適用した。年齢、性別およびバッチ効果は、ANOVAモデルにおける交絡因子と考えた。LAQ効果に排他的に関連する遺伝子だけをもたらすために、ベースラインと比較してプラセボ処置患者で有意に変化した遺伝子はさらなる分析から除外した。MIGは、p<0.01で群を区別したものと規定した。関与する生物学的経路を特定する遺伝子機能アノテーション、濃縮および経路分析を、Ingenuity Pathways Analysisソフトウェア(www.ingenuity.com)によって実施した。p=0.05のカットオフでFalse Discovery Rate(FDR)方法を用いて、複数の試験補正のために全てのp値を適用した。
2.3.ウエスタンブロットによる検証
ベースライン時および6カ月のLAQ処置の後に、5人の患者のPBMCからタンパク分画を精製した。タンパク質をTRIZOL分画から抽出し、Hummonら、2007(Hummonら、2007)によって報告された方法に従って可溶化した。等量のタンパク質を10%SDS−PAGEで分解し、TGFb、ITGB1、CXCR1およびアルファチューブリンに特異的な抗体(Santa Cruz Biotechnology,Inc Santa Cruz、CA、USA)による以降の免疫ブロッティングのためにニトロセルロース膜(Invitrogenキット)の上に移した。標準の化学発光(Supersignalキット、Pierce、Rockford、IL、USA)によってブロットを分析し、ChemiDoc(商標)XRSシステム(Bio−Rad)によって可視化した。
3.結果
試料は、年齢38.0±2.0歳、女性/男性比16/9の25人のRRMS患者から得た。LAQ処置群は、女性/男性比8/5、年齢38.8±2.3歳の13人の患者からなり、プラセボ群は、女性/男性比8/4、年齢37.2±3.4歳の12人の患者からなる。
処置の1カ月後にLAQは354個のMIGの示差的遺伝子発現を誘導し、6カ月の後にMIGの数は1562に増加した(表6および7)。
1および6カ月の処置時にLAQ処置の下で発現を有意に変えた大多数の遺伝子は、下方制御された(それぞれ98%および99%)。
3.1.LAQ処置に関連した生物学的経路:TGFbおよびNFkBシグナル伝達ならびに炎症誘発性サイトカインの下方制御
1カ月のLAQ処置の後の354個のMIGの機能的濃縮分析は、表5に示す炎症性応答および細胞運動の異なる機構に関連する分子の抑制を明らかにした。実際に、6カ月後の1562個のMIGの分析は、これらの機構に関与するますます多くの遺伝子を示した。有意に抑制された経路の中で、TGFbスーパーファミリーシグナル伝達(表5、p=3.2×10-3)は、6カ月だけでなく1カ月のLAQ処置の後にも抑制された(p=4.32×10-2)。
表5.LAQ処置によって影響される主な生物学的経路および機能
1カ月のLAQ処置の後のTGFbシグナル伝達経路の下方制御は、TGFbおよびLTBP1遺伝子の抑制から明白であり、後者はTGFbの分泌および活性化を調節し、したがってフィードバック機構を促進する。6カ月の後、追加のTGFbスーパーファミリー関連の遺伝子、例えばBMP2/4/7、MIS、II型BMP受容体、Smad14/5/6/8、TCF20、TCF2、Runx2および下流のITGB1の下方制御が実証された(図9B)。
さらに、LAQは、免疫細胞の接着でITGB1と一緒に作用するLFA−1およびVLA−4発現の下方制御を誘導した。6カ月のLAQ処置の後のTGFb経路の抑制には、IL−12シグナル伝達経路(p=6.2×10-3)ならびに広範囲の他の炎症誘発性サイトカイン、例えばIL−9/11/12/20/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、さらにIL−5/13/20/22の受容体(p=3×10-3〜9×10-3)の下方制御が付随した。
6カ月の後のLAQの分子サインは、IL−1、IL−1RおよびIKKgを含む、炎症で役割を果たすNFkBシグナル伝達のメンバーの下方制御によって実証される通り、NFkBシグナル伝達の抑制によっても特徴付けられた(図9B)。
全体として、これらの知見は、6カ月のLAQ処置の後の炎症誘発性サイトカインならびに鍵となるTGFbおよびNFkB経路の包括的抑制の理解に至る。炎症誘発性サイトカインの遺伝子の下方制御に先行する1カ月時のTGFbの早期の下方制御を考慮すると、発明者らは、TGFbシグナル伝達が炎症性サイトカインの抑制に先行すること、およびLAQがTGFbの抑制を通してサイトカイン発現を下方制御することを示唆する。
1および6カ月時に、5個のLAQ応答性MIGだけが一般的な3つの遺伝子SASH1、FUCA1およびXYLT1と上方制御された。それらのいずれも安定した正規経路に組み込まれていなかったが、SASH1およびFUCA1の過剰発現は細胞の成長、増殖および浸潤の阻害に関連している(Mengら、2013)。
3.2.LAQは、遊走、接着および白血球溢出遺伝子の発現を下方制御する
細胞運動および遊走の示差的発現は、1カ月のLAQ処置の後に既に観察された(p=3.49×10-4)。これらには、食細胞の接着および遊走(p=1.2×10-3)、好中球の化学走性(p=6×10-3)および白血球の移行(p=1.9×10-3)に関連する遺伝子の下方制御が含まれた。細胞運動に関連し、LAQによって抑制された遺伝子は、接着の初期に関与するPセレクチン、ならびにインテグリンファミリーメンバー、例えば白血球溢出の間の接着および移動の後の段階に関与するITGB1/3/5/6/8およびITGA8(p値1.72×10-3〜5.5×10-3)であった。
細胞接着およびインテグリン発現へのLAQの抑制効果は、細胞浸潤(p=5.6×10-5)、接着(p=2.4×10-5)および白血球溢出(p=9.4×10-3)を含む細胞運動機構(p値3.15×10-6〜3.79×10-3)に関連する遺伝子の下方制御から明白なように(表5、上記)、処置の6カ月後にさらに増強された。
処置の1カ月後のインテグリンファミリーメンバーの発現抑制の観察された効果に類似して、6カ月のLAQ処置の後、インテグリン遺伝子、例えばITGB/5/6/8、ITGA8、ITGB8およびITGA2Bを含め、抑制はさらにより明白であった(p値9.84×10-4〜1.1×10-3)。さらに、炎症関連のケモカイン、例えばCCL19およびケモカイン受容体CXCR1/2の抑制も実証された(p=6.79×10-3)。さらに、LAQは、一定範囲のメタロプロテイナーゼファミリーメンバー、例えば、溢出の間に役割を果たす、MMP16/24/26/28、およびADAM12/18/22を下方制御した(p=4.95×10-4〜1.26×10-3)。
3.3.LAQ誘導分子経路に関連する鍵となる遺伝子の検証
ウエスタンブロット分析によって実施した検証実験は、LAQの最も有意に影響を受ける生物学的機構に関連する鍵となる遺伝子の有意な下方制御を示す。バンド強度の数量化から見ることができるように、6カ月のLAQ処置の後のTGFbタンパク質は69.0%(p=0.009)抑制された(図10A)。したがって、図10Bは、ITGB1、異なるインテグリン受容体の共通サブユニットの40%(p=0.03)の下方制御、およびCXCR1の24.7%(p=0.014)の下方制御を示す(図10C)。
4.考察
結果は、LAQの最も有意な効果がTGFbおよびNFkB経路を通した炎症性応答の抑制の導入、ならびに接着、遊走および白血球溢出を含む細胞運動過程の減少であることを実証する。
発明者らは、炎症誘発性サイトカインの抑制を伴う、インテグリン、ケモカインおよびメタロプロテイナーゼが関与するシグナル伝達経路の下方制御を観察した。これらの効果は、ベースラインと比較して、6カ月間にわたって処置したRRMS患者で観察された。注目すべきことに、LAQの抑制効果は、より低い程度であるものの処置の開始から1カ月後という早い時期に既に検出され、時間依存性の処置効果を示唆する。
免疫系におけるTGFbの重要な機能は、抗炎症性であり、リンパ球の増殖、分化および生存の調節を通して耐性を維持することである。しかし、MSでは、その抗炎症的役割に加えて、TGFbは病原性EAE誘導TH17細胞の発生に関与する炎症誘発性因子として逆説的に作用することできることが示された。したがって、活性化T細胞からのTGFb遺伝子の削除はTh17細胞分化を抑止し、EAEからのほとんど完全な保護をもたらすことが公知であり、TGFb炎症誘発能力を確認する(OhおよびLi、2013)。同じ事象の経過で、TGFbは炎症性細胞接着、遊走および溢出の刺激に関与し、中枢神経系(CNS)への自己攻撃的なリンパ球の浸透を促進することができた(Bartolomeら、2003;Brillら、2001)。TGFbは、IL−9(Takamiら、2012)およびIL−22(Sanjabiら、2009)の発現を調節し、それによって炎症に関連する分子の発現を増強することも知られている。TGFb自体はIL−1が活性化することができる(Luoら、2009)が、IL−1はLAQ遺伝子発現サインで抑制されることも見出された。
TGFbを炎症過程に関連づける観察により、LAQによるTGFbおよびTGFb経路のメンバーの抑制は、MSで活動的炎症の有益な低減をもたらすことができた。LAQによるTGFbシグナル伝達の抑制は、CD14+細胞でTGFb活性化によって媒介される細胞増殖の強力な正の調節因子であるMAP3K7(TAK1)をLAQが抑制するという以前の刊行物の確証となる(Gurevichら、2010;Wanら、2006)。
発明者らは、LAQ処置の下で白血球溢出の異なる段階に関与する多数の細胞接着および細胞運動分子の抑制された発現を実証した。末梢からCNSに移動する炎症細胞の能力は、MSで重要な多段階過程であり、以下の構成要素がLAQによって下方制御される:a)ローリングおよび初期白血球−内皮相互作用を媒介するセレクチンPおよびIL−8R(CXCR1/2);b)白血球接着および移行を媒介するVLA−4、LFA−1、ITGA2/8およびITGB1−6インテグリン;c)インテグリン活性化のためのケモカインおよびケモカイン受容体、例えば白血球の停止および移行を担うCCL19、およびIL−8受容体(CXCR1/2)。これらの遺伝子は、CNSへの溢出の間、免疫細胞のローリング、活性化、接着、移動突出および移行の段階によく適合している(図8Cに示す通り)。総合すると、本研究の知見は、LAQが免疫細胞運動、接着および移行の阻害を通じて作用し、それによって脳血液関門(BBB)を通過する活動的炎症細胞の遊走能力を低減することを示唆する。これらの細胞遊走機能の抑制は、LAQの以前に報告された、様々なサイトカインおよびインテグリン、例えばIL−12、IL−13、IL−17、IFN−γ、TNF−αおよびVLA−4媒介粘着性の下方制御を誘導し、EAEでのT細胞の遊走能力に対する干渉をもたらすという効果(BrueckおよびWegner、2011;Jadidi−Niaraghら、2011;Wegnerら、2010)の確証となる。
同様に、MS患者では、発明者らは、LAQが炎症誘発性NFkB経路に関連するIL−1、IL−1R、IL12およびIKKg遺伝子を下方制御することを実証した。LAQによるNFkB機構の抑制は、MS患者から得られたPBMCでのin vitro研究(Gurevichら、2010)およびクプリゾン誘導脱髄モデルにおけるLAQ処置に続く星状神経膠細胞(Bruckら、2012)でも実証された。NFkBシグナル伝達は、マクロファージでIL−12活性化を媒介する(Murphyら、1995)。発明者らは、LAQがNFkBシグナル伝達の下方制御を通してIL1およびIL12依存性炎症を抑制することができると判定した。
LAQのこれらの炎症相殺効果は、ALLEGRO試験でのLAQの正の画像化効果(positive imaging effect)の分子基盤になることができる(Comiら、2012;Filippiら、2014)。
LAQによって5個の遺伝子だけが上方制御された;これらの上方制御された遺伝子の3つは、処置の1カ月後に既に上方制御されており、6カ月時には持続効果があった;Sash1およびFUCA1は増殖の抑制に関与し、XYLTはグリコサミノグリカンの生合成を触媒し、その高い活性がBBB障害を有する患者で報告された(Ponighausら、2007)。処置の6カ月後、別の増殖阻害遺伝子PID1が過剰発現し、LAQによるCD8+細胞の増殖抑制が確認された(Gurevichら、2010)。
発明者らは、これが、直接的な、またはTGFbスーパーファミリーおよびNFkBシグナル伝達の抑制を通した、炎症性サイトカインおよび白血球溢出のLAQ抑制を実証し、それによってMSの疾患経過の改善に寄与する、RRMS患者のLAQ誘導転写プロファイルを特徴付ける最初の研究であると考える。
表6
表7
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以下に、本願の出願当初の請求項を、実施の態様として付記する。
[1] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象においてラキニモド療法への臨床応答を予測する方法であって、前記対象でバイオマーカーの発現を評価し、それによってラキニモドへの臨床応答を予測することを含み、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法。
[2] 前記バイオマーカーが前記対象において上方制御される場合に、ラキニモドへの正の臨床応答を予測することをさらに含む、[1]に記載の方法。
[3] 前記対象がラキニモドに対して未処置である、[2]に記載の方法。
[4] 前記バイオマーカーが前記対象において抑制される場合に、ラキニモドへの正の臨床応答を予測することをさらに含む、[1]に記載の方法。
[5] 前記対象が定期的なラキニモド投与を以前に受けたことがある、[4]に記載の方法。
[6] 少なくとも1カ月間、少なくとも6カ月間、少なくとも12カ月間または少なくとも24カ月間、前記対象が定期的なラキニモド投与を受けたことがある、[5]に記載の方法。
[7] 前記炎症性応答に関連する遺伝子が、TGFbシグナル伝達、IL−12シグナル伝達、食細胞の接着の経路、好中球の化学走性、白血球の移行、カベオラ媒介エンドサイトーシス、クラスリン媒介エンドサイトーシスおよび/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である、[1]〜[6]の何れか一項に記載の方法。
[8] 前記細胞運動に関連する遺伝子が、食細胞の接着および遊走、好中球の化学走性、白血球の移行、細胞の浸潤、細胞の接着および/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である、[1]〜[7]の何れか一項に記載の方法。
[9] 前記細胞シグナル伝達に関連する遺伝子が、細胞の接着および/または神経伝達の経路に関連または関与する遺伝子である、[1]〜[8]の何れか一項に記載の方法。
[10] 前記細胞の発達に関連する遺伝子が、Gタンパク質共役受容体シグナル伝達、アラキドン酸代謝および/またはTGFβシグナル伝達の経路に関連または関与する遺伝子である、[1]〜[9]の何れか一項に記載の方法。
[11] 前記血液系に関連する遺伝子が、血小板の凝集、血小板の活性化、血液細胞の凝集、血液の凝固、内在性のプロトロンビン活性化経路および/または凝固系の経路に関連または関与する遺伝子である、[1]〜[10]の何れか一項に記載の方法。
[12] 前記遺伝子が、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである、[1]〜[11]の何れか一項に記載の方法。
[13] 前記遺伝子が、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/20/22、IL−9/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad2/3/4、PAI−1、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/13/20/22、IL−9/11/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1、アルファチューブリン、BMP4/7、MIS、TCF2、IL5R、IL13R、IL20R、ITGB2、NKTR、TEF、CLSTN2、LUC7L2、FABP7、TPTE、FSTL1、SF3B1、LIMS1、PDE5A、XPNPEP1、C5orf4、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、KRT20、TBC1D1、GRHL2、C5orf4、SEPT6、KIAA1199、SSX2IP、TPM1、CDC14B、USP47、MMRN1、CTNNAL1、SMOX、ALOX12、GLRA3、CA2、GUCY1B3、RFPL1、CLEC1B、GNG11、TSPAN32、RGS10、CALD1、PRKAR2B、CYP4F11、CLCA3P、CELSR3、CDC14B、TPM1、SEPT6、PRKG1、MAX、CCDC93、ARMCX6、LOC653354、TUBB2B、HIST1H2AJ、MFAP3L、LIMS1、GNB5、GPRASP1、SRRT、C1orf116、FBXO7、PPM1A、GUCY1B3、CTDSPL、GNAS、IGF2BP3、TPM1、HIST1H2BK、DLG4、WDR48、CALD1、LOC157627、GNB5、ZNF415、ASAP2、PSD3、GNAS、POPDC3、NRGN、ABLIM3、XYLT1、PTGIS、ARHGEF10、PDGFA、PGRMC1、HIST1H2AC、GNAS、CLDN5、MFAP3L、PGRMC1、MYST3、CAPRIN1、CALD1、FBXW7、DNM3、CD84、PRPF4B、RBM25、WASF3、GRAP2、SPARC、TAL1、NENF、XK、GP1BA、HLA−E、CA5A、LYVE1、MARCH6、NAT8B、TRIM58、RET、SDPR、TBXA2R、TMED10、APBA2、MYL9、POU1F1、H2BFS、HIST1H2BK、FAM12B、VCL、GSPT1、ALDOB、LOC150776、SMPD4、SLC37A1、SPARC、GNAS、TAS2R4、CALM3、POM121、POM121C、GRIK2、GREM1、TNNC2、EPS15L2、ENDOD1、RGS6、SF3B1、TMSB15A、ZBTB20、FUT9、ATP9A、MAX、HIST1H2AI、BAT2D1、ABL1、SNCA、GFI1B、CTSA、SNX13、RPA1、FLNA、XPNPEP1、KIF2A、ZBTB33、PSMD11、UBE2N、FOLR1、TSC22D1、PCNP、CELSR3、ACSBG1、RNF11、SEMA3E、MARCH2、PCDH24、SUPT5H、HLA−E、EGF、HLA−C、FLNA、CDK2AP1、LEPROT、SH3TC2、TUBA4A、MTMR1、TF、PRKD1、NAP1L1、DAB2、FUCA1、HIP1、THPO、MAP1B、PARVB、GP1BB、SEPT5、GJA4、PTGS1、GUCY1A3、HIST1H2AG、GNAS、LRBA、HYAL3、GP6、IGHG1、CYP2A13、CDC14B、MAX、KDM2A、CALD1、GNAZ、C19orf22、ARHGAP6、RHOC、RBX1、GP1BB、SEPT5、PRDX6、PRB4、FLNA、HIST1H2BF、RHBDF2、NUP205、SYT1、EGFL8、PPT2、TUBB1、TMC6、FLJ11292、NAP1L1、ALDH1A3、CSNK1E、PRUNE、COL4A3、ZNF221、ILF3、CABP5、RPA1、ARF1、HIST1H2BI、PTGS1、PRKAA1、GNB5、HIST2H4A、HIST2H4B、CYB5R3、TNS1、DCT、GMPR、ABI3BP、GNAS、SASH1、AAK1、XPO6、CTSL2、QSER1、MAP1LC3B、TBX6、CABP2、MRE11A、MAPRE2、TMC6、BDKRB2、MGLL、HRASLS、WHAMML1、WHAMML2、CLU、STC1、C6orf54、PABPN1、PDLIM1、CLU、PHF20、UBL4A、RNF115、HGD、RASGRP2、PNN、SAPS3、SFI1、GOLGA2、HIST2H2BE、SGEF、HGD、DUS1L、MPP1、HLA−E、GRB14、MMD、ZFHX4、CSNK1G2、HIST1H2BE、MPDZ、B2M、TBXA2R、CTDSPL、SNCA、CD99、POLS、MPL、HIST1H3F、SFRS8、NR5A2、ZMYM2、C6orf10、TMEM40、RNF43、PRUNE、MSH6、PLCB4、PARVB、TOX3、PKNOX1、RUFY1、SNCA、C10orf81、PDGFA、ASMT、HMGB1、CCDC90A、PROS1、hCG_1757335、RAP1B、MTSS1、GNRHR、LRRN3、MCM3AP、PLOD2、NAP1L1、PLOD2、HOXD13 CASKIN2、MFAP5、PITX2、SNCA、MYLK、PBX1、PRDX6、H3F3A、H3F3B、LOC440926、TMEM158、TRIM58、FSTL1、SNCA、TNS1、ATP1B1、C5orf4、LRP12、CTNNAL1、GEM、KIAA1466、ALDH1A2、MAP4K3、SNCA、RAB6B、PSD3、RIPK2、RAMP3、CALD1、CYP2E1、PSD3、PDLIM7、COBLL1、FUT3、SMOX、TGM2、LRRC50、CST6、OR7A17、C6orf145、DLEU2、DLEU2L、CPT2、HGF、TNS1、SPRY1、PLOD2、CD80、KYNU、BCAT1、NHLH1、AHCTF1、HOXA10、MTMR3、VAC14、CLCF1、FGF5、TAL1、SAMD14、ELL2、CHN1、SLC7A1、GRK5、PARD3、VPS37B、CYP2B6、CYP2B7P1、MALL、ALX4、SOX15、KRT5、ESPL1、STARD8、PSD3、KIAA0195、MYO9B、HIP1R、LOC100294412、EFNB1、ERN1、RHD、MFAP3L、PLA1A、POFUT2、C8orf39、CRYBB2、CYP4A11、PVRL2、CLCNKB、MRAS、NFIB、FKSG2、SLC11A2、FZR1、ZNF550、GLP1R、SLC19A1、RTN2、PAPOLA、STC1、GK、EXOSC6、RAPSN、HFE、EHD2、RIOK3、UBE2I、C15orf2、DMD、PRLH、MAP2K2、TP63、DACH1、PPP5C、SLC26A1、NUDT7、KCNJ12、ENTPD7、SLC26A1、PRRG3、RGS6、ZBED2、FICD、ARHGAP1、ARHGDIA、SDHB、AMHR2、ABCA4、TCF20、BGN、CASP7、LPAR4、GNA12、CYP2W1、RAX、C4A、C4B、LOC100292046、LOC100294156、PXN、ESR2、MYL10、EFS、TFF3、SRPK1、LOC441601、BIRC5、CCT8L2、PPAP2B、CMA1、APOA2、KDELR2、ASCL3、RUNX1、BUB1、SLC6A8、HNRNPC、HNRNPCL1、LOC440563、LOC649330、RIBC2、CLIC4、RAB17、SCML2、SPINLW1、ANK1、EDA2R、HTR4、CDC42EP4、KANK2、ANK1、SYN1、DUX3、DUX4、FRG2C、HPX−2、LOC100134409、LOC652119、LOC653543、LOC653544、LOC653545、LOC728410、PKNOX2、MLLT4、APOA2、PENK、GNAT1、FURIN、SEMA6A、EGFL6、HRH1、TSPAN1、DBC1、TRPC7、GPR52、HAMP、PRSS2、GPR107、FLJ11292、FLJ20184、B4GALT1、NKX3−1、ASIP、EFCAB6、GPR20、CA5A、PLK4、TAAR5、SRPX2、CNTD2、AZGP1、TIMP3、RGS6、ADARB1、DYNC1I1、C10orf10、PDIA2、PITX3、HOXC13、LPAR3、CTRC、CTSL2、MUC8、AQP5、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A8、UGT1A9、KCNQ2、CYP2A13、ZNF155、KIAA0892、ATP2A2、FGF5、FGF18、FUT2、SHROOM2、PRSS3、CREB3L1、MGAT2、PLCE1、MLXIPL、OR10H3、ABCB11、CD84、ARHGEF4、ORC1L、PCIF1、CD177、C1orf116、IFT122、C11orf20、DUSP13、C6orf208、PLA2G5、PRAMEF1、PRAMEF2、CYP4F8、KCNA1、MFAP4、SLC4A3、IL1RAPL1、SERPINE1、ZCCHC14、POLR3G、C16orf68、FLJ14100、SMCHD1、ASCL1、FOXA2、SLC23A2、KLK13、MTSS1L、DNMT3L、RREB1、DNMBP、PKLR、C1orf106、CCDC134、MTSS1、CCDC40、HOXB1、SCNN1B、SEMA4G、RAPGEFL1、MAGEL2、PLSCR2、CHD2、PLCD1、C1orf116、CHRNA2、MBP、CDC42BPA、MYF6、PI15、LOC440895、SBF1、MAST1、GLT8D2、ERBB3、LOH3CR2A、AMH、HR、RDH8、PAWR、DRD3、CCT8、PRELP、SPOCK3、EPS8L3、NXN、SEMA4G、P2RY1、AVL9、TEK、MOGAT2、KLK7、MT1E、MT1H、MT1M、CLDN18、RHBDF2、SIX1、INPP5A、KCNMB3、MAP2K5、GPD1、LPO、LOC729143、MPRIP、WNT7A、RARG、CDH7、MBNL2、RASGRP2、RBMY2FP、MASP1、CASR、EGR4、APOC2、HECW1、HOXB3、IRF5、NNMT、AOC2、ESRRG、LPIN1、ACOT11、CCDC33、MBD2、ZNF323、NTRK2、TMEM151B、GPLD1、LENEP、HNF1B、NXPH3、ALDH1A3、PHF20L1、CKM、PARD6B、CRYGB、HAB1、LARGE、RAB40C、MPL、CHIT1、METTL10、DUS4L、PNLIPRP1、ELL、ST8SIA5、GRIN2B、MC4R、RTDR1、HDAC6、KCNJ13、CPSF1、SPANXC、CNOT4、LAMA2、SLC1A6、ABCA2、KLK11、GFRA3、CYP3A4、SLC1A3、ATP2B2、APBB2、VPS45、GHRHR、HOXD4、PRPH、ADCY2、LEFTY2、CYP1B1、PCP4、C8B、RANBP3、PDE6H、TRIM15、VGLL1、TRIM3、CRKL、ADH7、PSG3、GPR153、MFAP2、FGF13、NAPA、ALDH3A1、MCM10、TLE4、ITPR3、CCDC87、C9orf7、ACTC1
、OBSL1、MAP2、CRYM、RNF122、SST、HLA−DRB6、SLC22A17、HSPG2、HIP1、GRIK2、UNKL、GPR144、KIR3DX1、NARFL、UCP3、PLXNA2、BTN1A1、ERCC4、CIITA、EGFR、KRT33A、CLTB、B3GALT5、AP3M2、GJC1、MYO3A、ARHGAP1、PPP2R3A、CLIC4、C20orf195、SIGLEC8、GPRC5A、CACNB1、MYL10、PRLR、OR2S2、NCR2、CHAF1B、EYA3、CDS1、FBXL18、ACTL6B、ZNF821、C16orf71、HBBP1、PLXNA1、CDC45L、MTCP1、PLCB4、PLVAP、PROX1、CYP3A43、IGHG1、RECQL5、IDUA、DLGAP4、PLXNB1、HSD17B14、FOXP3、C19orf26、EPB41L1、RBBP9、GJB4、UPK1B、CYP19A1、LOC55908、CLDN18、C2orf72、NTRK3、NRXN2、SPDEF、IGH@、IGHD、IGHG1、IGHM、LOC100289944、VSIG6、ACRV1、PHLDB1、SORBS1、HAPLN2、FABP3、EFS、ACVR1B、CHST3、UGT2A1、UGT2A2、TAF1、MT4、MFAP3、ETV5、UBQLN3、TBX10、GJB1、ABO、SPINK5、ATAD4、CDH11、CARD14、ALPP、ALPPL2、CBL、LRP4、CDKL2、SSX3、DSG2、SLC45A2、LAMA4、WFDC8、HTR7、EFNB3、TUBB2B、OR7E19P、PMS2L4、ASAP3、FRZB、PDLIM4、PVT1、TFR2、AHI1、TAF4、ADAMTSL2、CLDN4、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR3DP1、LOC727787、RAPGEF5、CRMP1、LDB3、F11、USP46、IBSP、SLC9A3、FLRT3、TRIM17、FGF17、CAMK1G、GLYR1、CSH1、NTF3、ABHD6、TRIM15、OR52A1、FGFR2、ORAI2、C17orf53、GLP1R、SLIT1、TP63、DDR1、CFTR、DIO2、LETM1、ACSM5、ACTA1、NPR1、KCND3、POPDC3、DNAH3、SPDEF、CLEC4M、SLC30A3、NAGLU、AAK1、DHX34、NNAT、AKAP9、ICMT、FAM189A1、C10orf81、MYOZ1、PKNOX2、MGC31957、PRDM11、RET、IGHG1、XPNPEP2、NTRK2、SLC25A10、NR1I2、GRM8、OR3A3、GIPR、PAH、PACRG、CLN8、ZNF215、TRIO、TTLL5、GRM1、PRKG1、HHLA1、LAMA3、SLC37A4、HOXC11、SLCO5A1、CA10、RRBP1、SOD3、NTRK3、CYR61、STRA6、SLC6A11、CNOT4、ATN1、BCAP29、NOVA2、RELN、LAMC2、RAD51、PRSS7、DCBLD2、TACR2、RAB11B、OR2J2、VSNL1、IFNA17、DPYSL4、MGC2889、RRBP1、POLQ、OR1A2、PURA、AIF1、CBS、NECAB2、PRKCE、NOX1、IHH、EXO1、GPRIN2、PDX1、GPR12、FAM188A、HS3ST3B1、ASCL1、ZNF484、CSH1、BCAN、DDN、DUOX2、MORN1、SLC39A2、CLCN7、RUNX2、TTYH1、ZNF280B、PAX3、LZTS1、SLC8A2、HAB1、KIF1A、ARL4D、UGT2B15、NACA2、THRB、C6orf15、GPR176、WSCD1、PLXNB3、CADM3、HAP1、CYP1A2、SPAM1、IL22RA1、CDC2L5、IRX5、PPFIA2、KDELR3、CEACAM7、KCMF1、DUOX1、CDC27、HIST2H2AA3、CAV3、APOA4、NPR3、PRG3、TBC1D22B、TUSC3、RIMS2、CYP4F12、TBXA2R、HBEGF、PSG9、PYGO1、RASGRF1、SCN2A、KLHL1、DTNB、GREM1、SNCG、C22orf24、PALM、COBLL1、DNPEP、MNS1、NFATC4、DLC1、HSPC072、MCAM、CA12、CSHL1、RPAIN、COL5A2、UGT1A8、UGT1A9、IGH@、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHM、LOC100126583、LOC100290036、LOC100290320、LOC100293211、LOC652494、ACSM5、ALOX12P2、ERBB4、CLDN16、CIB2、GALR3、MSMB、FABP7、ATXN3、KCNJ5、TRDN、CYP3A43、BAZ2A、ACCN4、SILV、DGCR14、SEMA6C、DIO2、PTHLH、LEP、PDZRN3、RGSL1、GJA4、SLC22A6、RASGRF1、MAPRE2、PVRL1、AKAP1、POMP、SOX21、DNAH9、HOXC5、SERHL2、KIAA0485、ITSN1、B4GALT1、NEK2、NUPR1、CCDC93、EPO、CRABP2、TYRO3、GOLGA2、SEMA3F、BFSP2、NCAM1、FOLH1、SSX2、TMPRSS4、DCN、LPHN3、POU4F3、CEACAM5、BCL3、EXTL3、CCNA1、DDR2、PAX8、SOX5、POU3F1、PEX16、NUP62、SIGLEC11、ALDOB、GPC3、IGFALS、WDR25、FGF1、OSR2、ARID1A、GYPA、KLK13、PARVB、LILRB5、RIMS2、C19orf21、HOXD1、PRSS3、FLT1、ATP6V1C1、LOX、CRYBB3、CA12、PRKG2、MASP1、LOC728395、LOC728403、TSPY1、PDCD1、GGTLC1、AQP8、KRT16、AICDA、BRD8、C1orf95、OR3A2、PFKFB2、FRZB、PAK3、MEIS2、ZSCAN2、MYH7、VWA1、LSAMP、SRC、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、DIO1、TADA3L、NFASC、CALCRL、NBLA00301、MAB21L1、FBXO42、COL10A1、CFB、SNX7、FOXN1、SRY、HLF、CLCA3P、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、GPR3、TMPRSS11E、EMID1、KCNMB2、MUC5AC、SORT1、HIF3A、MAPK4、TCP11L1、ZZEF1、DCAF7、DMWD、CLCA2、VAC14、CSPG5、STMN2、MLLT4、GALNT14、FGF12、MFAP5、SUMO3、HTR3A、GDF5、TSSK1B、CYP2A7P1、MARK1、ATP1B2、TBX6、PAX8、IL1R1、RALYL、OR2B2、TAAR3、C12orf32、IGHG1、LOC642131、DICER1、GLRA3、PPARD、HSPA4L、WNT2、VIPR2、CYP2C9、SRPX2、IGSF1、ALPK3、TFPI、KCNS3、MARCH8、FRMD4B、TACR3、FIGF、PDCD6、TNN、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、RHBDD3、SPP2、PDE10A、ZNF224、FGL1、PGAM2、CADM4、APOBEC2、SLC9A5、GNAT1、ARHGEF16、SMARCA2、DNAH9、RBM26、WNT2B、KCNK2、NPBWR2、SP2、TMPRSS11D、DENND2A、TNIP3、STC1、DOCK6、ADAM5P、SYDE1、TNPO2、LRTM1、USH1C、PDE12、SRCAP、OR10J1、OR2H2、KCNJ8、RP11−257K9.7、DOCK5、TPD52L1、PAEP、GGA2、PHLDA3、HES2、MLL、CHRNA6、CIB2、PTPRF、TM7SF4、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、ALX1、OR2F1、OR2F2、PLAT、HGC6.3、WNT11、PGK2、SNAI2、COL4A6、PRUNE2、ANKS1B、LOC81691、FERMT2、TIMP3、CST8、CAPN6、IDUA、GPR32、AKR1B10、GRHL2、FBXO24、HSF4、IGHG1、HCN2、LRP12、ARHGEF15、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A7、UGT1A8、GUCA2A、ITIH1、EGFR、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、MYOG、TMSB15A、TLX1、EDNRA、LOC100289791、MDFI、ZER1、MYH15、CDH20、GPR63、LOC440345、LOC440354、LOC595101、LOC641298、SMG1、HOXC10、KRTAP1−1、ARSD、CPLX3、LMAN1L、IFNA4、ABCC1、SEMA3E、MRE11A、C1QL1、LIPF、TRIM9、BBOX1、LRRC17、WNT2B、CYP3A4、SI、ANO3、OBSL1、CHRD、MSX2、PSG1、FAM107A、LRRC37B2、ANKLE2、PAX2、UNC5B、ADCYAP1R1、HFE、SYT1、GJC2、LOC100293871、FGF8、ACRV1、NRXN1、GDPD2、RGS4、CELA2A、IFNW1、MLNR、RNF17、LAD1、GLRA2、RASL12、MAGOH2、C6orf54、ZNF214、IKBKG、AP4E1、ZNRF4、OSBPL10、C1orf175、TTC4、PCDHB3、ADRBK1、ITSN1、XAGE1A、XAGE1B、XAGE1C、XAGE1D、XAGE1E、CDH22、FARP2、MYT1、TNC、MUC5AC、SLC6A15、PP14571、SMR3A、SMR3B、RXRG、SNX1、GLP1R、C6orf155、ATP1A2、TFAP4、PNPLA2、DIRAS3、ANO2、TACSTD2、MCM3AP、IL13RA2、TRIM10、RTEL1、PRRX2、TSHB、TIMELESS、FMO1、KIF18A、KIAA1199、CALB2、MFAP3L、PTGER3、EPAS1、SQSTM1、TSPY1、CPM、DLGAP1、CYP4F11、TLX3、PCDHA10、TAOK2、ERC1、TBX2、KALRN、DICER1、PAPPA、KIF5A、DNAJC22、OTUB1、KIAA1644、SEZ6L2、PCNXL2、HMHB1、ERG、SNTB2、GJA5、AGTR2、GJA3、GCK、LRRC61、CNTF、ZFP91、ZFP91−CNTF、PDLIM4、MPPED2、IFNA10、ACTN2、VGLL1、GJA9、LDLR、ANK2、COL1A1、TIMP3、OTOF、AGXT、GLI2、TRMT61A、FOXD2、TMEM212、DENND2A、B3GALT1、SPAG11A、PRDM4、TF、ELF5、GSC2、EPB41L4B、GYG2、LYZL6、DCHS2、OBP2A、OBP2B、ANGPTL3、MYH11、NES、SLC17A1、RBM15B、CSH1、HTR5A、CYP3A7、HTR2A、KCNV2、TOX3、CLOCK、MAGEA6、FAM12A、COL4A3、S1PR2、NAT8、ACE2、SLC22A6、SLC13A2、MYH4、APBB2、RAP1GAP、SHOX2、S
LCO1A2、ETV1、MAGEA12、PLA2G6、ADRA1A、SYT5、GPR161、SEMA3F、CYP3A43、HOMER2、KCNJ5、PPL、COL17A1、CSHL1、C9orf116、PARK2、UGT2B15、CDK6、FAM174B、CELA2A、CELA2B、SPDEF、EPB41、GAB1、SMR3A、PDE6G、COL5A1、ABCA6、DMD、CYLC2、CIDEA、RAG2、HIST1H2BN、FMO6P、MAOA、ANKRD53、HAPLN1、MT1M、EHD2、GAD2、CRISP2、CSN2、SULT1C2、PCDHGA3、SSX3、FGFR2、GPR161、ATN1、CHD5、A4GALT、MYBPH、CSHL1、NCAPH2、CAPN9、CNGB1、BCAM、DRD5、NR5A2、TEF、ELAVL2、DGKB、HTR7P、RHAG、GH2、COL4A6、BMP7、SOSTDC1、SOX14、TAS2R9、LPHN2、MAP1A、OSGIN2、SLC10A2、FAM13C、EMX1、FLJ40330、CHI3L1、CDH16、SPRR1A、LOX、CALCB、GABBR2、CPB2、RASL11B、CCDC81、RUNX1、CPA1、CLCNKA、CLCNKB、FHL5、THSD7A、TFAP2C、SPAG11B、CAP2、PODNL1、SSX4、SSX4B、G6PC、RPE65、TMEM222、KDR、CHP2、GPR64、TPM2、TCEB3B、E2F5、IL5RA、AOC3、ABCF3、CPN2、ACE、NRP2、INPP5J、SMAD9、FAM155A、GART、PIR、ZNF467、ITSN2、NR1D1、THRA、RP11−35N6.1、LAMB1、EPHB3、PLA2R1、RAPGEF4、DNAJC8、ARSJ、TRIM49、GC、CDH2、ATXN3L、BTF3L1、BICC1、FAM186A、PTPRF、TRPC4、TCL6、CYP4A22、FUT6、MUC1、DKFZP434B2016、LOC643313、LDHA、LOC100131613、TRIM3、MLLT10、DZIP1、ANKRD34C、BUB1、CSPG5、FBLN1、GAD2、CLDN1、CHRNA3、SCN11A、TEX11、IL20RA、AKAP5、KBTBD10、MSTN、TLL2、NACAD、UNC93A、PTGER1、OLAH、NHLH2、SERPINA6、KRT17、KCNMA1、PRKCA、STS、LAMA1、GPR88、ACTN2、TREH、AKAP4、DKK4、PRICKLE3、IRS4、TRPV4、PCDH11Y、APBB2、SLCO2A1、DRD2、MTMR7、ZNF471、TF、NRIP2、ST6GALNAC5、COMT、PAH、LRRC19、PRKAR1B、HPR、PRDM5、NCRNA00120、LOC79999、ITSN2、CACNB2、GPR98、PREX2、FAM182B、LAMA4、ARVCF、HAS2、YOD1、PPP2R3A、COL4A1、RBM12B、GSTA3、FAM66D、OR10H2、PTHLH、ZNF674、KRT19、ACCN2、COL6A1、LOC100288442、LOC100289169、LOC728888、LOC729602、NPIPL2、NPIPL3、PDXDC2、SLC37A1、ATP6V1B1、ABI3BP、HR44、ZNF324B、ZNF584、HOXD13、ADH6、IFNA8、MYOZ2、NFATC4、ADAMTS7、FOXL1、GPR17、SLC18A3、MYH6、BOK、FGA、TEAD4、GRM1、EDNRA、C8orf79、METTL7A、FOLH1、RAD54L、SOX11、CNOT3、NTS、MAPK12、DOCK6、DNAJC6、HS3ST3A1、LOC728395、TSPY1、TSPY3、PTH、LAMB4、ALDOB、FLG、MLANA、UBE2D4、LOC100287483、KRT20、POU1F1、SLCO1B3、CLTA、MECOM、C8orf71、SULT2A1、C6orf10、SLC27A6、PRKD1、SYNPO2L、THPO、GABRR1、CFTR、PPP2R3A、DCBLD2、ANP32A、ANP32C、ANP32D、LOC723972、XYLT1、STAB1、STAB1、SASH1、PID1、FUCA1、SASH1、LRRN3、LRRN3またはそれらの組合せである、[1]〜[11]の何れか一項に記載の方法。
[14] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象をラキニモドで処置する方法であって、
a)前記対象でバイオマーカーの発現を評価することによって前記対象がラキニモド応答体であるかどうか判定する工程と、
b)前記対象がラキニモド応答体と特定される場合だけ前記対象を処置するのに有効な量のラキニモドを前記対象に投与し、それによって前記対象を処置する工程と
を含み、
前記バイオマーカーが、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法。
[15] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象を処置する方法であって、
a)ラキニモドの治療的有効量を前記対象に投与する工程と、
b)前記対象でバイオマーカーの発現を評価することによって前記対象がラキニモド応答体であるかどうか判定する工程と、
c)前記対象がラキニモド応答体と特定される場合だけ前記対象を処置するのに有効な量のラキニモドを前記対象に投与するか、または前記対象がラキニモド応答体と特定されない場合は前記対象へのラキニモドの投与を修正し、それによって前記対象を処置する工程と
を含み、前記バイオマーカーが、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法。
[16] 前記バイオマーカーが前記対象で上方制御される場合は、前記対象はラキニモド応答体と特定される、[14]または[15]に記載の方法。
[17] 前記バイオマーカーが前記対象で抑制される場合は、前記対象はラキニモド応答体と特定される、[14]または[15]に記載の方法。
[18] 前記炎症性応答に関連する遺伝子が、TGFbシグナル伝達、IL−12シグナル伝達、食細胞の接着の経路、好中球の化学走性、白血球の移行、カベオラ媒介エンドサイトーシス、クラスリン媒介エンドサイトーシスおよび/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である、[14]〜[17]の何れか一項に記載の方法。
[19] 前記細胞運動に関連する遺伝子が、食細胞の接着および遊走、好中球の化学走性、白血球の移行、細胞の浸潤、細胞の接着および/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である、[14]〜[18]の何れか一項に記載の方法。
[20] 前記細胞シグナル伝達に関連する遺伝子が、細胞の接着および/または神経伝達の経路に関連または関与する遺伝子である、[14]〜[19]の何れか一項に記載の方法。
[21] 前記細胞の発達に関連する遺伝子が、Gタンパク質共役受容体シグナル伝達、アラキドン酸代謝および/またはTGFβシグナル伝達の経路に関連または関与する遺伝子である、[14]〜[20]の何れか一項に記載の方法。
[22] 前記血液系に関連する遺伝子が、血小板の凝集、血小板の活性化、血液細胞の凝集、血液の凝固、内在性のプロトロンビン活性化経路および/または凝固系の経路に関連または関与する遺伝子である、[14]〜[21]の何れか一項に記載の方法。
[23] 前記遺伝子が、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである、[14]〜[22]の何れか一項に記載の方法。
[24] 前記遺伝子が、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/20/22、IL−9/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad2/3/4、PAI−1、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/13/20/22、IL−9/11/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1、アルファチューブリン、BMP4/7、MIS、TCF2、IL5R、IL13R、IL20R、ITGB2、NKTR、TEF、CLSTN2、LUC7L2、FABP7、TPTE、FSTL1、SF3B1、LIMS1、PDE5A、XPNPEP1、C5orf4、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、KRT20、TBC1D1、GRHL2、C5orf4、SEPT6、KIAA1199、SSX2IP、TPM1、CDC14B、USP47、MMRN1、CTNNAL1、SMOX、ALOX12、GLRA3、CA2、GUCY1B3、RFPL1、CLEC1B、GNG11、TSPAN32、RGS10、CALD1、PRKAR2B、CYP4F11、CLCA3P、CELSR3、CDC14B、TPM1、SEPT6、PRKG1、MAX、CCDC93、ARMCX6、LOC653354、TUBB2B、HIST1H2AJ、MFAP3L、LIMS1、GNB5、GPRASP1、SRRT、C1orf116、FBXO7、PPM1A、GUCY1B3、CTDSPL、GNAS、IGF2BP3、TPM1、HIST1H2BK、DLG4、WDR48、CALD1、LOC157627、GNB5、ZNF415、ASAP2、PSD3、GNAS、POPDC3、NRGN、ABLIM3、XYLT1、PTGIS、ARHGEF10、PDGFA、PGRMC1、HIST1H2AC、GNAS、CLDN5、MFAP3L、PGRMC1、MYST3、CAPRIN1、CALD1、FBXW7、DNM3、CD84、PRPF4B、RBM25、WASF3、GRAP2、SPARC、TAL1、NENF、XK、GP1BA、HLA−E、CA5A、LYVE1、MARCH6、NAT8B、TRIM58、RET、SDPR、TBXA2R、TMED10、APBA2、MYL9、POU1F1、H2BFS、HIST1H2BK、FAM12B、VCL、GSPT1、ALDOB、LOC150776、SMPD4、SLC37A1、SPARC、GNAS、TAS2R4、CALM3、POM121、POM121C、GRIK2、GREM1、TNNC2、EPS15L2、ENDOD1、RGS6、SF3B1、TMSB15A、ZBTB20、FUT9、ATP9A、MAX、HIST1H2AI、BAT2D1、ABL1、SNCA、GFI1B、CTSA、SNX13、RPA1、FLNA、XPNPEP1、KIF2A、ZBTB33、PSMD11、UBE2N、FOLR1、TSC22D1、PCNP、CELSR3、ACSBG1、RNF11、SEMA3E、MARCH2、PCDH24、SUPT5H、HLA−E、EGF、HLA−C、FLNA、CDK2AP1、LEPROT、SH3TC2、TUBA4A、MTMR1、TF、PRKD1、NAP1L1、DAB2、FUCA1、HIP1、THPO、MAP1B、PARVB、GP1BB、SEPT5、GJA4、PTGS1、GUCY1A3、HIST1H2AG、GNAS、LRBA、HYAL3、GP6、IGHG1、CYP2A13、CDC14B、MAX、KDM2A、CALD1、GNAZ、C19orf22、ARHGAP6、RHOC、RBX1、GP1BB、SEPT5、PRDX6、PRB4、FLNA、HIST1H2BF、RHBDF2、NUP205、SYT1、EGFL8、PPT2、TUBB1、TMC6、FLJ11292、NAP1L1、ALDH1A3、CSNK1E、PRUNE、COL4A3、ZNF221、ILF3、CABP5、RPA1、ARF1、HIST1H2BI、PTGS1、PRKAA1、GNB5、HIST2H4A、HIST2H4B、CYB5R3、TNS1、DCT、GMPR、ABI3BP、GNAS、SASH1、AAK1、XPO6、CTSL2、QSER1、MAP1LC3B、TBX6、CABP2、MRE11A、MAPRE2、TMC6、BDKRB2、MGLL、HRASLS、WHAMML1、WHAMML2、CLU、STC1、C6orf54、PABPN1、PDLIM1、CLU、PHF20、UBL4A、RNF115、HGD、RASGRP2、PNN、SAPS3、SFI1、GOLGA2、HIST2H2BE、SGEF、HGD、DUS1L、MPP1、HLA−E、GRB14、MMD、ZFHX4、CSNK1G2、HIST1H2BE、MPDZ、B2M、TBXA2R、CTDSPL、SNCA、CD99、POLS、MPL、HIST1H3F、SFRS8、NR5A2、ZMYM2、C6orf10、TMEM40、RNF43、PRUNE、MSH6、PLCB4、PARVB、TOX3、PKNOX1、RUFY1、SNCA、C10orf81、PDGFA、ASMT、HMGB1、CCDC90A、PROS1、hCG_1757335、RAP1B、MTSS1、GNRHR、LRRN3、MCM3AP、PLOD2、NAP1L1、PLOD2、HOXD13 CASKIN2、MFAP5、PITX2、SNCA、MYLK、PBX1、PRDX6、H3F3A、H3F3B、LOC440926、TMEM158、TRIM58、FSTL1、SNCA、TNS1、ATP1B1、C5orf4、LRP12、CTNNAL1、GEM、KIAA1466、ALDH1A2、MAP4K3、SNCA、RAB6B、PSD3、RIPK2、RAMP3、CALD1、CYP2E1、PSD3、PDLIM7、COBLL1、FUT3、SMOX、TGM2、LRRC50、CST6、OR7A17、C6orf145、DLEU2、DLEU2L、CPT2、HGF、TNS1、SPRY1、PLOD2、CD80、KYNU、BCAT1、NHLH1、AHCTF1、HOXA10、MTMR3、VAC14、CLCF1、FGF5、TAL1、SAMD14、ELL2、CHN1、SLC7A1、GRK5、PARD3、VPS37B、CYP2B6、CYP2B7P1、MALL、ALX4、SOX15、KRT5、ESPL1、STARD8、PSD3、KIAA0195、MYO9B、HIP1R、LOC100294412、EFNB1、ERN1、RHD、MFAP3L、PLA1A、POFUT2、C8orf39、CRYBB2、CYP4A11、PVRL2、CLCNKB、MRAS、NFIB、FKSG2、SLC11A2、FZR1、ZNF550、GLP1R、SLC19A1、RTN2、PAPOLA、STC1、GK、EXOSC6、RAPSN、HFE、EHD2、RIOK3、UBE2I、C15orf2、DMD、PRLH、MAP2K2、TP63、DACH1、PPP5C、SLC26A1、NUDT7、KCNJ12、ENTPD7、SLC26A1、PRRG3、RGS6、ZBED2、FICD、ARHGAP1、ARHGDIA、SDHB、AMHR2、ABCA4、TCF20、BGN、CASP7、LPAR4、GNA12、CYP2W1、RAX、C4A、C4B、LOC100292046、LOC100294156、PXN、ESR2、MYL10、EFS、TFF3、SRPK1、LOC441601、BIRC5、CCT8L2、PPAP2B、CMA1、APOA2、KDELR2、ASCL3、RUNX1、BUB1、SLC6A8、HNRNPC、HNRNPCL1、LOC440563、LOC649330、RIBC2、CLIC4、RAB17、SCML2、SPINLW1、ANK1、EDA2R、HTR4、CDC42EP4、KANK2、ANK1、SYN1、DUX3、DUX4、FRG2C、HPX−2、LOC100134409、LOC652119、LOC653543、LOC653544、LOC653545、LOC728410、PKNOX2、MLLT4、APOA2、PENK、GNAT1、FURIN、SEMA6A、EGFL6、HRH1、TSPAN1、DBC1、TRPC7、GPR52、HAMP、PRSS2、GPR107、FLJ11292、FLJ20184、B4GALT1、NKX3−1、ASIP、EFCAB6、GPR20、CA5A、PLK4、TAAR5、SRPX2、CNTD2、AZGP1、TIMP3、RGS6、ADARB1、DYNC1I1、C10orf10、PDIA2、PITX3、HOXC13、LPAR3、CTRC、CTSL2、MUC8、AQP5、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A8、UGT1A9、KCNQ2、CYP2A13、ZNF155、KIAA0892、ATP2A2、FGF5、FGF18、FUT2、SHROOM2、PRSS3、CREB3L1、MGAT2、PLCE1、MLXIPL、OR10H3、ABCB11、CD84、ARHGEF4、ORC1L、PCIF1、CD177、C1orf116、IFT122、C11orf20、DUSP13、C6orf208、PLA2G5、PRAMEF1、PRAMEF2、CYP4F8、KCNA1、MFAP4、SLC4A3、IL1RAPL1、SERPINE1、ZCCHC14、POLR3G、C16orf68、FLJ14100、SMCHD1、ASCL1、FOXA2、SLC23A2、KLK13、MTSS1L、DNMT3L、RREB1、DNMBP、PKLR、C1orf106、CCDC134、MTSS1、CCDC40、HOXB1、SCNN1B、SEMA4G、RAPGEFL1、MAGEL2、PLSCR2、CHD2、PLCD1、C1orf116、CHRNA2、MBP、CDC42BPA、MYF6、PI15、LOC440895、SBF1、MAST1、GLT8D2、ERBB3、LOH3CR2A、AMH、HR、RDH8、PAWR、DRD3、CCT8、PRELP、SPOCK3、EPS8L3、NXN、SEMA4G、P2RY1、AVL9、TEK、MOGAT2、KLK7、MT1E、MT1H、MT1M、CLDN18、RHBDF2、SIX1、INPP5A、KCNMB3、MAP2K5、GPD1、LPO、LOC729143、MPRIP、WNT7A、RARG、CDH7、MBNL2、RASGRP2、RBMY2FP、MASP1、CASR、EGR4、APOC2、HECW1、HOXB3、IRF5、NNMT、AOC2、ESRRG、LPIN1、ACOT11、CCDC33、MBD2、ZNF323、NTRK2、TMEM151B、GPLD1、LENEP、HNF1B、NXPH3、ALDH1A3、PHF20L1、CKM、PARD6B、CRYGB、HAB1、LARGE、RAB40C、MPL、CHIT1、METTL10、DUS4L、PNLIPRP1、ELL、ST8SIA5、GRIN2B、MC4R、RTDR1、HDAC6、KCNJ13、CPSF1、SPANXC、CNOT4、LAMA2、SLC1A6、ABCA2、KLK11、GFRA3、CYP3A4、SLC1A3、ATP2B2、APBB2、VPS45、GHRHR、HOXD4、PRPH、ADCY2、LEFTY2、CYP1B1、PCP4、C8B、RANBP3、PDE6H、TRIM15、VGLL1、TRIM3、CRKL、ADH7、PSG3、GPR153、MFAP2、FGF13、NAPA、ALDH3A1、MCM10、TLE4、ITPR3、CCDC87、C9orf7、ACTC1
、OBSL1、MAP2、CRYM、RNF122、SST、HLA−DRB6、SLC22A17、HSPG2、HIP1、GRIK2、UNKL、GPR144、KIR3DX1、NARFL、UCP3、PLXNA2、BTN1A1、ERCC4、CIITA、EGFR、KRT33A、CLTB、B3GALT5、AP3M2、GJC1、MYO3A、ARHGAP1、PPP2R3A、CLIC4、C20orf195、SIGLEC8、GPRC5A、CACNB1、MYL10、PRLR、OR2S2、NCR2、CHAF1B、EYA3、CDS1、FBXL18、ACTL6B、ZNF821、C16orf71、HBBP1、PLXNA1、CDC45L、MTCP1、PLCB4、PLVAP、PROX1、CYP3A43、IGHG1、RECQL5、IDUA、DLGAP4、PLXNB1、HSD17B14、FOXP3、C19orf26、EPB41L1、RBBP9、GJB4、UPK1B、CYP19A1、LOC55908、CLDN18、C2orf72、NTRK3、NRXN2、SPDEF、IGH@、IGHD、IGHG1、IGHM、LOC100289944、VSIG6、ACRV1、PHLDB1、SORBS1、HAPLN2、FABP3、EFS、ACVR1B、CHST3、UGT2A1、UGT2A2、TAF1、MT4、MFAP3、ETV5、UBQLN3、TBX10、GJB1、ABO、SPINK5、ATAD4、CDH11、CARD14、ALPP、ALPPL2、CBL、LRP4、CDKL2、SSX3、DSG2、SLC45A2、LAMA4、WFDC8、HTR7、EFNB3、TUBB2B、OR7E19P、PMS2L4、ASAP3、FRZB、PDLIM4、PVT1、TFR2、AHI1、TAF4、ADAMTSL2、CLDN4、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR3DP1、LOC727787、RAPGEF5、CRMP1、LDB3、F11、USP46、IBSP、SLC9A3、FLRT3、TRIM17、FGF17、CAMK1G、GLYR1、CSH1、NTF3、ABHD6、TRIM15、OR52A1、FGFR2、ORAI2、C17orf53、GLP1R、SLIT1、TP63、DDR1、CFTR、DIO2、LETM1、ACSM5、ACTA1、NPR1、KCND3、POPDC3、DNAH3、SPDEF、CLEC4M、SLC30A3、NAGLU、AAK1、DHX34、NNAT、AKAP9、ICMT、FAM189A1、C10orf81、MYOZ1、PKNOX2、MGC31957、PRDM11、RET、IGHG1、XPNPEP2、NTRK2、SLC25A10、NR1I2、GRM8、OR3A3、GIPR、PAH、PACRG、CLN8、ZNF215、TRIO、TTLL5、GRM1、PRKG1、HHLA1、LAMA3、SLC37A4、HOXC11、SLCO5A1、CA10、RRBP1、SOD3、NTRK3、CYR61、STRA6、SLC6A11、CNOT4、ATN1、BCAP29、NOVA2、RELN、LAMC2、RAD51、PRSS7、DCBLD2、TACR2、RAB11B、OR2J2、VSNL1、IFNA17、DPYSL4、MGC2889、RRBP1、POLQ、OR1A2、PURA、AIF1、CBS、NECAB2、PRKCE、NOX1、IHH、EXO1、GPRIN2、PDX1、GPR12、FAM188A、HS3ST3B1、ASCL1、ZNF484、CSH1、BCAN、DDN、DUOX2、MORN1、SLC39A2、CLCN7、RUNX2、TTYH1、ZNF280B、PAX3、LZTS1、SLC8A2、HAB1、KIF1A、ARL4D、UGT2B15、NACA2、THRB、C6orf15、GPR176、WSCD1、PLXNB3、CADM3、HAP1、CYP1A2、SPAM1、IL22RA1、CDC2L5、IRX5、PPFIA2、KDELR3、CEACAM7、KCMF1、DUOX1、CDC27、HIST2H2AA3、CAV3、APOA4、NPR3、PRG3、TBC1D22B、TUSC3、RIMS2、CYP4F12、TBXA2R、HBEGF、PSG9、PYGO1、RASGRF1、SCN2A、KLHL1、DTNB、GREM1、SNCG、C22orf24、PALM、COBLL1、DNPEP、MNS1、NFATC4、DLC1、HSPC072、MCAM、CA12、CSHL1、RPAIN、COL5A2、UGT1A8、UGT1A9、IGH@、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHM、LOC100126583、LOC100290036、LOC100290320、LOC100293211、LOC652494、ACSM5、ALOX12P2、ERBB4、CLDN16、CIB2、GALR3、MSMB、FABP7、ATXN3、KCNJ5、TRDN、CYP3A43、BAZ2A、ACCN4、SILV、DGCR14、SEMA6C、DIO2、PTHLH、LEP、PDZRN3、RGSL1、GJA4、SLC22A6、RASGRF1、MAPRE2、PVRL1、AKAP1、POMP、SOX21、DNAH9、HOXC5、SERHL2、KIAA0485、ITSN1、B4GALT1、NEK2、NUPR1、CCDC93、EPO、CRABP2、TYRO3、GOLGA2、SEMA3F、BFSP2、NCAM1、FOLH1、SSX2、TMPRSS4、DCN、LPHN3、POU4F3、CEACAM5、BCL3、EXTL3、CCNA1、DDR2、PAX8、SOX5、POU3F1、PEX16、NUP62、SIGLEC11、ALDOB、GPC3、IGFALS、WDR25、FGF1、OSR2、ARID1A、GYPA、KLK13、PARVB、LILRB5、RIMS2、C19orf21、HOXD1、PRSS3、FLT1、ATP6V1C1、LOX、CRYBB3、CA12、PRKG2、MASP1、LOC728395、LOC728403、TSPY1、PDCD1、GGTLC1、AQP8、KRT16、AICDA、BRD8、C1orf95、OR3A2、PFKFB2、FRZB、PAK3、MEIS2、ZSCAN2、MYH7、VWA1、LSAMP、SRC、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、DIO1、TADA3L、NFASC、CALCRL、NBLA00301、MAB21L1、FBXO42、COL10A1、CFB、SNX7、FOXN1、SRY、HLF、CLCA3P、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、GPR3、TMPRSS11E、EMID1、KCNMB2、MUC5AC、SORT1、HIF3A、MAPK4、TCP11L1、ZZEF1、DCAF7、DMWD、CLCA2、VAC14、CSPG5、STMN2、MLLT4、GALNT14、FGF12、MFAP5、SUMO3、HTR3A、GDF5、TSSK1B、CYP2A7P1、MARK1、ATP1B2、TBX6、PAX8、IL1R1、RALYL、OR2B2、TAAR3、C12orf32、IGHG1、LOC642131、DICER1、GLRA3、PPARD、HSPA4L、WNT2、VIPR2、CYP2C9、SRPX2、IGSF1、ALPK3、TFPI、KCNS3、MARCH8、FRMD4B、TACR3、FIGF、PDCD6、TNN、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、RHBDD3、SPP2、PDE10A、ZNF224、FGL1、PGAM2、CADM4、APOBEC2、SLC9A5、GNAT1、ARHGEF16、SMARCA2、DNAH9、RBM26、WNT2B、KCNK2、NPBWR2、SP2、TMPRSS11D、DENND2A、TNIP3、STC1、DOCK6、ADAM5P、SYDE1、TNPO2、LRTM1、USH1C、PDE12、SRCAP、OR10J1、OR2H2、KCNJ8、RP11−257K9.7、DOCK5、TPD52L1、PAEP、GGA2、PHLDA3、HES2、MLL、CHRNA6、CIB2、PTPRF、TM7SF4、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、ALX1、OR2F1、OR2F2、PLAT、HGC6.3、WNT11、PGK2、SNAI2、COL4A6、PRUNE2、ANKS1B、LOC81691、FERMT2、TIMP3、CST8、CAPN6、IDUA、GPR32、AKR1B10、GRHL2、FBXO24、HSF4、IGHG1、HCN2、LRP12、ARHGEF15、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A7、UGT1A8、GUCA2A、ITIH1、EGFR、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、MYOG、TMSB15A、TLX1、EDNRA、LOC100289791、MDFI、ZER1、MYH15、CDH20、GPR63、LOC440345、LOC440354、LOC595101、LOC641298、SMG1、HOXC10、KRTAP1−1、ARSD、CPLX3、LMAN1L、IFNA4、ABCC1、SEMA3E、MRE11A、C1QL1、LIPF、TRIM9、BBOX1、LRRC17、WNT2B、CYP3A4、SI、ANO3、OBSL1、CHRD、MSX2、PSG1、FAM107A、LRRC37B2、ANKLE2、PAX2、UNC5B、ADCYAP1R1、HFE、SYT1、GJC2、LOC100293871、FGF8、ACRV1、NRXN1、GDPD2、RGS4、CELA2A、IFNW1、MLNR、RNF17、LAD1、GLRA2、RASL12、MAGOH2、C6orf54、ZNF214、IKBKG、AP4E1、ZNRF4、OSBPL10、C1orf175、TTC4、PCDHB3、ADRBK1、ITSN1、XAGE1A、XAGE1B、XAGE1C、XAGE1D、XAGE1E、CDH22、FARP2、MYT1、TNC、MUC5AC、SLC6A15、PP14571、SMR3A、SMR3B、RXRG、SNX1、GLP1R、C6orf155、ATP1A2、TFAP4、PNPLA2、DIRAS3、ANO2、TACSTD2、MCM3AP、IL13RA2、TRIM10、RTEL1、PRRX2、TSHB、TIMELESS、FMO1、KIF18A、KIAA1199、CALB2、MFAP3L、PTGER3、EPAS1、SQSTM1、TSPY1、CPM、DLGAP1、CYP4F11、TLX3、PCDHA10、TAOK2、ERC1、TBX2、KALRN、DICER1、PAPPA、KIF5A、DNAJC22、OTUB1、KIAA1644、SEZ6L2、PCNXL2、HMHB1、ERG、SNTB2、GJA5、AGTR2、GJA3、GCK、LRRC61、CNTF、ZFP91、ZFP91−CNTF、PDLIM4、MPPED2、IFNA10、ACTN2、VGLL1、GJA9、LDLR、ANK2、COL1A1、TIMP3、OTOF、AGXT、GLI2、TRMT61A、FOXD2、TMEM212、DENND2A、B3GALT1、SPAG11A、PRDM4、TF、ELF5、GSC2、EPB41L4B、GYG2、LYZL6、DCHS2、OBP2A、OBP2B、ANGPTL3、MYH11、NES、SLC17A1、RBM15B、CSH1、HTR5A、CYP3A7、HTR2A、KCNV2、TOX3、CLOCK、MAGEA6、FAM12A、COL4A3、S1PR2、NAT8、ACE2、SLC22A6、SLC13A2、MYH4、APBB2、RAP1GAP、SHOX2、S
LCO1A2、ETV1、MAGEA12、PLA2G6、ADRA1A、SYT5、GPR161、SEMA3F、CYP3A43、HOMER2、KCNJ5、PPL、COL17A1、CSHL1、C9orf116、PARK2、UGT2B15、CDK6、FAM174B、CELA2A、CELA2B、SPDEF、EPB41、GAB1、SMR3A、PDE6G、COL5A1、ABCA6、DMD、CYLC2、CIDEA、RAG2、HIST1H2BN、FMO6P、MAOA、ANKRD53、HAPLN1、MT1M、EHD2、GAD2、CRISP2、CSN2、SULT1C2、PCDHGA3、SSX3、FGFR2、GPR161、ATN1、CHD5、A4GALT、MYBPH、CSHL1、NCAPH2、CAPN9、CNGB1、BCAM、DRD5、NR5A2、TEF、ELAVL2、DGKB、HTR7P、RHAG、GH2、COL4A6、BMP7、SOSTDC1、SOX14、TAS2R9、LPHN2、MAP1A、OSGIN2、SLC10A2、FAM13C、EMX1、FLJ40330、CHI3L1、CDH16、SPRR1A、LOX、CALCB、GABBR2、CPB2、RASL11B、CCDC81、RUNX1、CPA1、CLCNKA、CLCNKB、FHL5、THSD7A、TFAP2C、SPAG11B、CAP2、PODNL1、SSX4、SSX4B、G6PC、RPE65、TMEM222、KDR、CHP2、GPR64、TPM2、TCEB3B、E2F5、IL5RA、AOC3、ABCF3、CPN2、ACE、NRP2、INPP5J、SMAD9、FAM155A、GART、PIR、ZNF467、ITSN2、NR1D1、THRA、RP11−35N6.1、LAMB1、EPHB3、PLA2R1、RAPGEF4、DNAJC8、ARSJ、TRIM49、GC、CDH2、ATXN3L、BTF3L1、BICC1、FAM186A、PTPRF、TRPC4、TCL6、CYP4A22、FUT6、MUC1、DKFZP434B2016、LOC643313、LDHA、LOC100131613、TRIM3、MLLT10、DZIP1、ANKRD34C、BUB1、CSPG5、FBLN1、GAD2、CLDN1、CHRNA3、SCN11A、TEX11、IL20RA、AKAP5、KBTBD10、MSTN、TLL2、NACAD、UNC93A、PTGER1、OLAH、NHLH2、SERPINA6、KRT17、KCNMA1、PRKCA、STS、LAMA1、GPR88、ACTN2、TREH、AKAP4、DKK4、PRICKLE3、IRS4、TRPV4、PCDH11Y、APBB2、SLCO2A1、DRD2、MTMR7、ZNF471、TF、NRIP2、ST6GALNAC5、COMT、PAH、LRRC19、PRKAR1B、HPR、PRDM5、NCRNA00120、LOC79999、ITSN2、CACNB2、GPR98、PREX2、FAM182B、LAMA4、ARVCF、HAS2、YOD1、PPP2R3A、COL4A1、RBM12B、GSTA3、FAM66D、OR10H2、PTHLH、ZNF674、KRT19、ACCN2、COL6A1、LOC100288442、LOC100289169、LOC728888、LOC729602、NPIPL2、NPIPL3、PDXDC2、SLC37A1、ATP6V1B1、ABI3BP、HR44、ZNF324B、ZNF584、HOXD13、ADH6、IFNA8、MYOZ2、NFATC4、ADAMTS7、FOXL1、GPR17、SLC18A3、MYH6、BOK、FGA、TEAD4、GRM1、EDNRA、C8orf79、METTL7A、FOLH1、RAD54L、SOX11、CNOT3、NTS、MAPK12、DOCK6、DNAJC6、HS3ST3A1、LOC728395、TSPY1、TSPY3、PTH、LAMB4、ALDOB、FLG、MLANA、UBE2D4、LOC100287483、KRT20、POU1F1、SLCO1B3、CLTA、MECOM、C8orf71、SULT2A1、C6orf10、SLC27A6、PRKD1、SYNPO2L、THPO、GABRR1、CFTR、PPP2R3A、DCBLD2、ANP32A、ANP32C、ANP32D、LOC723972、XYLT1、STAB1、STAB1、SASH1、PID1、FUCA1、SASH1、LRRN3、LRRN3またはそれらの組合せである、[14]〜[22]の何れか一項に記載の方法。
[25] ラキニモドが経口投与される、[14]〜[24]の何れか一項に記載の方法。
[26] ラキニモドが毎日投与される、[14]〜[25]の何れか一項に記載の方法。
[27] ラキニモドが、0.6mg/日未満、0.1〜40.0mg/日、0.1〜2.5mg/日、0.25〜2.0mg/日、0.5〜1.2mg/日、0.25mg/日、0.3mg/日、0.5mg/日、0.6mg/日、1.0mg/日、1.2mg/日、1.5mg/日または2.0mg/日の用量で投与される、[14]〜[26]の何れか一項に記載の方法。
[28] 前記対象がラキニモドに対して未処置である、[14]〜[27]の何れか一項に記載の方法。
[29] 前記対象がラキニモドを以前に投与されたことがある、[14]〜[27]の何れか一項に記載の方法。
[30] 前記対象がラキニモド以外の多発性硬化症薬を以前に投与されたことがある、[14]〜[27]の何れか一項に記載の方法。
[31] 前記バイオマーカーの発現を評価する工程が、前記対象の遺伝子発現の正規化を含む、[14]〜[30]の何れか一項に記載の方法。
[32] 前記バイオマーカーの発現を評価する工程が、参照値に対して前記対象の発現レベルを比較することを含む、[14]〜[31]の何れか一項に記載の方法。
[33] 前記参照値が、ラキニモド不応答体集団での前記バイオマーカーの発現レベルに基づく、[32]に記載の方法。
[34] 前記参照値が、健康対照集団での前記バイオマーカーの発現レベルに基づく、[32]に記載の方法。
[35] 前記バイオマーカーの発現が参照値よりも高い場合は、前記対象はラキニモド応答体と特定される、[32]〜[34]の何れか一項に記載の方法。
[36] 前記バイオマーカーの発現レベルが参照値よりも低い場合は、前記対象はラキニモド応答体と特定される、[32]〜[34]の何れか一項に記載の方法。
[37] 前記バイオマーカーの発現が前記対象の血液で評価される、[1]〜[36]の何れか一項に記載の方法。
[38] 前記バイオマーカーの発現が前記対象の末梢血単核細胞(PBMC)で評価される、[37]に記載の方法。
[39] 前記バイオマーカーの発現がラキニモド処置の前に評価される、[14]〜[38]の何れか一項に記載の方法。
[40] 前記バイオマーカーの発現がラキニモド処置の開始後に評価される、[14]〜[38]の何れか一項に記載の方法。
[41] 前記バイオマーカーの発現がラキニモド処置の開始から1カ月、6カ月、12カ月または24カ月後に評価される、[40]に記載の方法。
[42] 前記対象がラキニモド応答体と特定される場合は、前記対象は単独療法としてラキニモドおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物をその後投与される、[14]〜[41]の何れか一項に記載の方法。
[43] 前記対象がラキニモド応答体と特定される場合は、前記対象はラキニモドおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を別の多発性硬化症薬と併用してその後投与される、[14]〜[41]の何れか一項に記載の方法。
[44] 前記対象がラキニモド非応答体と特定される場合は、前記対象はラキニモドではない多発性硬化症薬をその後投与される、[14]〜[43]の何れか一項に記載の方法。
[45] 前記対象がヒト患者である、[1]〜[44]の何れか一項に記載の方法。
[46] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、前記対象がラキニモド応答体と特定されている、ラキニモド。
[47] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、前記対象がラキニモド応答体と特定されている、医薬組成物。
[48] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、前記対象においてバイオマーカーの発現は上方制御され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、ラキニモド。
[49] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、前記対象においてバイオマーカーの発現は上方制御され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、医薬組成物。
[50] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、前記対象においてバイオマーカーの発現は抑制され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、ラキニモド。
[51] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、前記対象においてバイオマーカーの発現は抑制され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、医薬組成物。
[52] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈するラキニモド応答体と特定された対象に調剤するための、または調剤で使用するための治療パッケージであって、
a)各単位用量が所定量のラキニモドを含む、1つ以上の単位用量、および
b)そのための完成した医薬容器であって、1つ以上の前記単位用量を含有し、前記対象の処置での前記パッケージの使用を指示する表示をさらに含有するかまたは含む容器
を含むパッケージ。
[53] 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象に調剤するための、または調剤で使用するための治療パッケージであって、
a)各単位用量が所定量のラキニモドを含む、1つ以上の単位用量、および
b)そのための完成した医薬容器であって、1つ以上の前記単位用量を含有し、前記対象の処置での前記パッケージの使用を指示する表示をさらに含有するかまたは含む容器
を含み、
前記対象においてバイオマーカーの発現は抑制または上方制御され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、パッケージ。
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Claims (53)

  1. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象においてラキニモド療法への臨床応答を予測する方法であって、前記対象でバイオマーカーの発現を評価し、それによってラキニモドへの臨床応答を予測することを含み、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法。
  2. 前記バイオマーカーが前記対象において上方制御される場合に、ラキニモドへの正の臨床応答を予測することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記対象がラキニモドに対して未処置である、請求項2に記載の方法。
  4. 前記バイオマーカーが前記対象において抑制される場合に、ラキニモドへの正の臨床応答を予測することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
  5. 前記対象が定期的なラキニモド投与を以前に受けたことがある、請求項4に記載の方法。
  6. 少なくとも1カ月間、少なくとも6カ月間、少なくとも12カ月間または少なくとも24カ月間、前記対象が定期的なラキニモド投与を受けたことがある、請求項5に記載の方法。
  7. 前記炎症性応答に関連する遺伝子が、TGFbシグナル伝達、IL−12シグナル伝達、食細胞の接着の経路、好中球の化学走性、白血球の移行、カベオラ媒介エンドサイトーシス、クラスリン媒介エンドサイトーシスおよび/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である、請求項1〜6の何れか一項に記載の方法。
  8. 前記細胞運動に関連する遺伝子が、食細胞の接着および遊走、好中球の化学走性、白血球の移行、細胞の浸潤、細胞の接着および/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である、請求項1〜7の何れか一項に記載の方法。
  9. 前記細胞シグナル伝達に関連する遺伝子が、細胞の接着および/または神経伝達の経路に関連または関与する遺伝子である、請求項1〜8の何れか一項に記載の方法。
  10. 前記細胞の発達に関連する遺伝子が、Gタンパク質共役受容体シグナル伝達、アラキドン酸代謝および/またはTGFβシグナル伝達の経路に関連または関与する遺伝子である、請求項1〜9の何れか一項に記載の方法。
  11. 前記血液系に関連する遺伝子が、血小板の凝集、血小板の活性化、血液細胞の凝集、血液の凝固、内在性のプロトロンビン活性化経路および/または凝固系の経路に関連または関与する遺伝子である、請求項1〜10の何れか一項に記載の方法。
  12. 前記遺伝子が、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである、請求項1〜11の何れか一項に記載の方法。
  13. 前記遺伝子が、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/20/22、IL−9/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad2/3/4、PAI−1、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/13/20/22、IL−9/11/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1、アルファチューブリン、BMP4/7、MIS、TCF2、IL5R、IL13R、IL20R、ITGB2、NKTR、TEF、CLSTN2、LUC7L2、FABP7、TPTE、FSTL1、SF3B1、LIMS1、PDE5A、XPNPEP1、C5orf4、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、KRT20、TBC1D1、GRHL2、C5orf4、SEPT6、KIAA1199、SSX2IP、TPM1、CDC14B、USP47、MMRN1、CTNNAL1、SMOX、ALOX12、GLRA3、CA2、GUCY1B3、RFPL1、CLEC1B、GNG11、TSPAN32、RGS10、CALD1、PRKAR2B、CYP4F11、CLCA3P、CELSR3、CDC14B、TPM1、SEPT6、PRKG1、MAX、CCDC93、ARMCX6、LOC653354、TUBB2B、HIST1H2AJ、MFAP3L、LIMS1、GNB5、GPRASP1、SRRT、C1orf116、FBXO7、PPM1A、GUCY1B3、CTDSPL、GNAS、IGF2BP3、TPM1、HIST1H2BK、DLG4、WDR48、CALD1、LOC157627、GNB5、ZNF415、ASAP2、PSD3、GNAS、POPDC3、NRGN、ABLIM3、XYLT1、PTGIS、ARHGEF10、PDGFA、PGRMC1、HIST1H2AC、GNAS、CLDN5、MFAP3L、PGRMC1、MYST3、CAPRIN1、CALD1、FBXW7、DNM3、CD84、PRPF4B、RBM25、WASF3、GRAP2、SPARC、TAL1、NENF、XK、GP1BA、HLA−E、CA5A、LYVE1、MARCH6、NAT8B、TRIM58、RET、SDPR、TBXA2R、TMED10、APBA2、MYL9、POU1F1、H2BFS、HIST1H2BK、FAM12B、VCL、GSPT1、ALDOB、LOC150776、SMPD4、SLC37A1、SPARC、GNAS、TAS2R4、CALM3、POM121、POM121C、GRIK2、GREM1、TNNC2、EPS15L2、ENDOD1、RGS6、SF3B1、TMSB15A、ZBTB20、FUT9、ATP9A、MAX、HIST1H2AI、BAT2D1、ABL1、SNCA、GFI1B、CTSA、SNX13、RPA1、FLNA、XPNPEP1、KIF2A、ZBTB33、PSMD11、UBE2N、FOLR1、TSC22D1、PCNP、CELSR3、ACSBG1、RNF11、SEMA3E、MARCH2、PCDH24、SUPT5H、HLA−E、EGF、HLA−C、FLNA、CDK2AP1、LEPROT、SH3TC2、TUBA4A、MTMR1、TF、PRKD1、NAP1L1、DAB2、FUCA1、HIP1、THPO、MAP1B、PARVB、GP1BB、SEPT5、GJA4、PTGS1、GUCY1A3、HIST1H2AG、GNAS、LRBA、HYAL3、GP6、IGHG1、CYP2A13、CDC14B、MAX、KDM2A、CALD1、GNAZ、C19orf22、ARHGAP6、RHOC、RBX1、GP1BB、SEPT5、PRDX6、PRB4、FLNA、HIST1H2BF、RHBDF2、NUP205、SYT1、EGFL8、PPT2、TUBB1、TMC6、FLJ11292、NAP1L1、ALDH1A3、CSNK1E、PRUNE、COL4A3、ZNF221、ILF3、CABP5、RPA1、ARF1、HIST1H2BI、PTGS1、PRKAA1、GNB5、HIST2H4A、HIST2H4B、CYB5R3、TNS1、DCT、GMPR、ABI3BP、GNAS、SASH1、AAK1、XPO6、CTSL2、QSER1、MAP1LC3B、TBX6、CABP2、MRE11A、MAPRE2、TMC6、BDKRB2、MGLL、HRASLS、WHAMML1、WHAMML2、CLU、STC1、C6orf54、PABPN1、PDLIM1、CLU、PHF20、UBL4A、RNF115、HGD、RASGRP2、PNN、SAPS3、SFI1、GOLGA2、HIST2H2BE、SGEF、HGD、DUS1L、MPP1、HLA−E、GRB14、MMD、ZFHX4、CSNK1G2、HIST1H2BE、MPDZ、B2M、TBXA2R、CTDSPL、SNCA、CD99、POLS、MPL、HIST1H3F、SFRS8、NR5A2、ZMYM2、C6orf10、TMEM40、RNF43、PRUNE、MSH6、PLCB4、PARVB、TOX3、PKNOX1、RUFY1、SNCA、C10orf81、PDGFA、ASMT、HMGB1、CCDC90A、PROS1、hCG_1757335、RAP1B、MTSS1、GNRHR、LRRN3、MCM3AP、PLOD2、NAP1L1、PLOD2、HOXD13 CASKIN2、MFAP5、PITX2、SNCA、MYLK、PBX1、PRDX6、H3F3A、H3F3B、LOC440926、TMEM158、TRIM58、FSTL1、SNCA、TNS1、ATP1B1、C5orf4、LRP12、CTNNAL1、GEM、KIAA1466、ALDH1A2、MAP4K3、SNCA、RAB6B、PSD3、RIPK2、RAMP3、CALD1、CYP2E1、PSD3、PDLIM7、COBLL1、FUT3、SMOX、TGM2、LRRC50、CST6、OR7A17、C6orf145、DLEU2、DLEU2L、CPT2、HGF、TNS1、SPRY1、PLOD2、CD80、KYNU、BCAT1、NHLH1、AHCTF1、HOXA10、MTMR3、VAC14、CLCF1、FGF5、TAL1、SAMD14、ELL2、CHN1、SLC7A1、GRK5、PARD3、VPS37B、CYP2B6、CYP2B7P1、MALL、ALX4、SOX15、KRT5、ESPL1、STARD8、PSD3、KIAA0195、MYO9B、HIP1R、LOC100294412、EFNB1、ERN1、RHD、MFAP3L、PLA1A、POFUT2、C8orf39、CRYBB2、CYP4A11、PVRL2、CLCNKB、MRAS、NFIB、FKSG2、SLC11A2、FZR1、ZNF550、GLP1R、SLC19A1、RTN2、PAPOLA、STC1、GK、EXOSC6、RAPSN、HFE、EHD2、RIOK3、UBE2I、C15orf2、DMD、PRLH、MAP2K2、TP63、DACH1、PPP5C、SLC26A1、NUDT7、KCNJ12、ENTPD7、SLC26A1、PRRG3、RGS6、ZBED2、FICD、ARHGAP1、ARHGDIA、SDHB、AMHR2、ABCA4、TCF20、BGN、CASP7、LPAR4、GNA12、CYP2W1、RAX、C4A、C4B、LOC100292046、LOC100294156、PXN、ESR2、MYL10、EFS、TFF3、SRPK1、LOC441601、BIRC5、CCT8L2、PPAP2B、CMA1、APOA2、KDELR2、ASCL3、RUNX1、BUB1、SLC6A8、HNRNPC、HNRNPCL1、LOC440563、LOC649330、RIBC2、CLIC4、RAB17、SCML2、SPINLW1、ANK1、EDA2R、HTR4、CDC42EP4、KANK2、ANK1、SYN1、DUX3、DUX4、FRG2C、HPX−2、LOC100134409、LOC652119、LOC653543、LOC653544、LOC653545、LOC728410、PKNOX2、MLLT4、APOA2、PENK、GNAT1、FURIN、SEMA6A、EGFL6、HRH1、TSPAN1、DBC1、TRPC7、GPR52、HAMP、PRSS2、GPR107、FLJ11292、FLJ20184、B4GALT1、NKX3−1、ASIP、EFCAB6、GPR20、CA5A、PLK4、TAAR5、SRPX2、CNTD2、AZGP1、TIMP3、RGS6、ADARB1、DYNC1I1、C10orf10、PDIA2、PITX3、HOXC13、LPAR3、CTRC、CTSL2、MUC8、AQP5、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A8、UGT1A9、KCNQ2、CYP2A13、ZNF155、KIAA0892、ATP2A2、FGF5、FGF18、FUT2、SHROOM2、PRSS3、CREB3L1、MGAT2、PLCE1、MLXIPL、OR10H3、ABCB11、CD84、ARHGEF4、ORC1L、PCIF1、CD177、C1orf116、IFT122、C11orf20、DUSP13、C6orf208、PLA2G5、PRAMEF1、PRAMEF2、CYP4F8、KCNA1、MFAP4、SLC4A3、IL1RAPL1、SERPINE1、ZCCHC14、POLR3G、C16orf68、FLJ14100、SMCHD1、ASCL1、FOXA2、SLC23A2、KLK13、MTSS1L、DNMT3L、RREB1、DNMBP、PKLR、C1orf106、CCDC134、MTSS1、CCDC40、HOXB1、SCNN1B、SEMA4G、RAPGEFL1、MAGEL2、PLSCR2、CHD2、PLCD1、C1orf116、CHRNA2、MBP、CDC42BPA、MYF6、PI15、LOC440895、SBF1、MAST1、GLT8D2、ERBB3、LOH3CR2A、AMH、HR、RDH8、PAWR、DRD3、CCT8、PRELP、SPOCK3、EPS8L3、NXN、SEMA4G、P2RY1、AVL9、TEK、MOGAT2、KLK7、MT1E、MT1H、MT1M、CLDN18、RHBDF2、SIX1、INPP5A、KCNMB3、MAP2K5、GPD1、LPO、LOC729143、MPRIP、WNT7A、RARG、CDH7、MBNL2、RASGRP2、RBMY2FP、MASP1、CASR、EGR4、APOC2、HECW1、HOXB3、IRF5、NNMT、AOC2、ESRRG、LPIN1、ACOT11、CCDC33、MBD2、ZNF323、NTRK2、TMEM151B、GPLD1、LENEP、HNF1B、NXPH3、ALDH1A3、PHF20L1、CKM、PARD6B、CRYGB、HAB1、LARGE、RAB40C、MPL、CHIT1、METTL10、DUS4L、PNLIPRP1、ELL、ST8SIA5、GRIN2B、MC4R、RTDR1、HDAC6、KCNJ13、CPSF1、SPANXC、CNOT4、LAMA2、SLC1A6、ABCA2、KLK11、GFRA3、CYP3A4、SLC1A3、ATP2B2、APBB2、VPS45、GHRHR、HOXD4、PRPH、ADCY2、LEFTY2、CYP1B1、PCP4、C8B、RANBP3、PDE6H、TRIM15、VGLL1、TRIM3、CRKL、ADH7、PSG3、GPR153、MFAP2、FGF13、NAPA、ALDH3A1、MCM10、TLE4、ITPR3、CCDC87、C9orf7、ACTC1、OBSL1、
    MAP2、CRYM、RNF122、SST、HLA−DRB6、SLC22A17、HSPG2、HIP1、GRIK2、UNKL、GPR144、KIR3DX1、NARFL、UCP3、PLXNA2、BTN1A1、ERCC4、CIITA、EGFR、KRT33A、CLTB、B3GALT5、AP3M2、GJC1、MYO3A、ARHGAP1、PPP2R3A、CLIC4、C20orf195、SIGLEC8、GPRC5A、CACNB1、MYL10、PRLR、OR2S2、NCR2、CHAF1B、EYA3、CDS1、FBXL18、ACTL6B、ZNF821、C16orf71、HBBP1、PLXNA1、CDC45L、MTCP1、PLCB4、PLVAP、PROX1、CYP3A43、IGHG1、RECQL5、IDUA、DLGAP4、PLXNB1、HSD17B14、FOXP3、C19orf26、EPB41L1、RBBP9、GJB4、UPK1B、CYP19A1、LOC55908、CLDN18、C2orf72、NTRK3、NRXN2、SPDEF、IGH@、IGHD、IGHG1、IGHM、LOC100289944、VSIG6、ACRV1、PHLDB1、SORBS1、HAPLN2、FABP3、EFS、ACVR1B、CHST3、UGT2A1、UGT2A2、TAF1、MT4、MFAP3、ETV5、UBQLN3、TBX10、GJB1、ABO、SPINK5、ATAD4、CDH11、CARD14、ALPP、ALPPL2、CBL、LRP4、CDKL2、SSX3、DSG2、SLC45A2、LAMA4、WFDC8、HTR7、EFNB3、TUBB2B、OR7E19P、PMS2L4、ASAP3、FRZB、PDLIM4、PVT1、TFR2、AHI1、TAF4、ADAMTSL2、CLDN4、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR3DP1、LOC727787、RAPGEF5、CRMP1、LDB3、F11、USP46、IBSP、SLC9A3、FLRT3、TRIM17、FGF17、CAMK1G、GLYR1、CSH1、NTF3、ABHD6、TRIM15、OR52A1、FGFR2、ORAI2、C17orf53、GLP1R、SLIT1、TP63、DDR1、CFTR、DIO2、LETM1、ACSM5、ACTA1、NPR1、KCND3、POPDC3、DNAH3、SPDEF、CLEC4M、SLC30A3、NAGLU、AAK1、DHX34、NNAT、AKAP9、ICMT、FAM189A1、C10orf81、MYOZ1、PKNOX2、MGC31957、PRDM11、RET、IGHG1、XPNPEP2、NTRK2、SLC25A10、NR1I2、GRM8、OR3A3、GIPR、PAH、PACRG、CLN8、ZNF215、TRIO、TTLL5、GRM1、PRKG1、HHLA1、LAMA3、SLC37A4、HOXC11、SLCO5A1、CA10、RRBP1、SOD3、NTRK3、CYR61、STRA6、SLC6A11、CNOT4、ATN1、BCAP29、NOVA2、RELN、LAMC2、RAD51、PRSS7、DCBLD2、TACR2、RAB11B、OR2J2、VSNL1、IFNA17、DPYSL4、MGC2889、RRBP1、POLQ、OR1A2、PURA、AIF1、CBS、NECAB2、PRKCE、NOX1、IHH、EXO1、GPRIN2、PDX1、GPR12、FAM188A、HS3ST3B1、ASCL1、ZNF484、CSH1、BCAN、DDN、DUOX2、MORN1、SLC39A2、CLCN7、RUNX2、TTYH1、ZNF280B、PAX3、LZTS1、SLC8A2、HAB1、KIF1A、ARL4D、UGT2B15、NACA2、THRB、C6orf15、GPR176、WSCD1、PLXNB3、CADM3、HAP1、CYP1A2、SPAM1、IL22RA1、CDC2L5、IRX5、PPFIA2、KDELR3、CEACAM7、KCMF1、DUOX1、CDC27、HIST2H2AA3、CAV3、APOA4、NPR3、PRG3、TBC1D22B、TUSC3、RIMS2、CYP4F12、TBXA2R、HBEGF、PSG9、PYGO1、RASGRF1、SCN2A、KLHL1、DTNB、GREM1、SNCG、C22orf24、PALM、COBLL1、DNPEP、MNS1、NFATC4、DLC1、HSPC072、MCAM、CA12、CSHL1、RPAIN、COL5A2、UGT1A8、UGT1A9、IGH@、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHM、LOC100126583、LOC100290036、LOC100290320、LOC100293211、LOC652494、ACSM5、ALOX12P2、ERBB4、CLDN16、CIB2、GALR3、MSMB、FABP7、ATXN3、KCNJ5、TRDN、CYP3A43、BAZ2A、ACCN4、SILV、DGCR14、SEMA6C、DIO2、PTHLH、LEP、PDZRN3、RGSL1、GJA4、SLC22A6、RASGRF1、MAPRE2、PVRL1、AKAP1、POMP、SOX21、DNAH9、HOXC5、SERHL2、KIAA0485、ITSN1、B4GALT1、NEK2、NUPR1、CCDC93、EPO、CRABP2、TYRO3、GOLGA2、SEMA3F、BFSP2、NCAM1、FOLH1、SSX2、TMPRSS4、DCN、LPHN3、POU4F3、CEACAM5、BCL3、EXTL3、CCNA1、DDR2、PAX8、SOX5、POU3F1、PEX16、NUP62、SIGLEC11、ALDOB、GPC3、IGFALS、WDR25、FGF1、OSR2、ARID1A、GYPA、KLK13、PARVB、LILRB5、RIMS2、C19orf21、HOXD1、PRSS3、FLT1、ATP6V1C1、LOX、CRYBB3、CA12、PRKG2、MASP1、LOC728395、LOC728403、TSPY1、PDCD1、GGTLC1、AQP8、KRT16、AICDA、BRD8、C1orf95、OR3A2、PFKFB2、FRZB、PAK3、MEIS2、ZSCAN2、MYH7、VWA1、LSAMP、SRC、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、DIO1、TADA3L、NFASC、CALCRL、NBLA00301、MAB21L1、FBXO42、COL10A1、CFB、SNX7、FOXN1、SRY、HLF、CLCA3P、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、GPR3、TMPRSS11E、EMID1、KCNMB2、MUC5AC、SORT1、HIF3A、MAPK4、TCP11L1、ZZEF1、DCAF7、DMWD、CLCA2、VAC14、CSPG5、STMN2、MLLT4、GALNT14、FGF12、MFAP5、SUMO3、HTR3A、GDF5、TSSK1B、CYP2A7P1、MARK1、ATP1B2、TBX6、PAX8、IL1R1、RALYL、OR2B2、TAAR3、C12orf32、IGHG1、LOC642131、DICER1、GLRA3、PPARD、HSPA4L、WNT2、VIPR2、CYP2C9、SRPX2、IGSF1、ALPK3、TFPI、KCNS3、MARCH8、FRMD4B、TACR3、FIGF、PDCD6、TNN、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、RHBDD3、SPP2、PDE10A、ZNF224、FGL1、PGAM2、CADM4、APOBEC2、SLC9A5、GNAT1、ARHGEF16、SMARCA2、DNAH9、RBM26、WNT2B、KCNK2、NPBWR2、SP2、TMPRSS11D、DENND2A、TNIP3、STC1、DOCK6、ADAM5P、SYDE1、TNPO2、LRTM1、USH1C、PDE12、SRCAP、OR10J1、OR2H2、KCNJ8、RP11−257K9.7、DOCK5、TPD52L1、PAEP、GGA2、PHLDA3、HES2、MLL、CHRNA6、CIB2、PTPRF、TM7SF4、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、ALX1、OR2F1、OR2F2、PLAT、HGC6.3、WNT11、PGK2、SNAI2、COL4A6、PRUNE2、ANKS1B、LOC81691、FERMT2、TIMP3、CST8、CAPN6、IDUA、GPR32、AKR1B10、GRHL2、FBXO24、HSF4、IGHG1、HCN2、LRP12、ARHGEF15、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A7、UGT1A8、GUCA2A、ITIH1、EGFR、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、MYOG、TMSB15A、TLX1、EDNRA、LOC100289791、MDFI、ZER1、MYH15、CDH20、GPR63、LOC440345、LOC440354、LOC595101、LOC641298、SMG1、HOXC10、KRTAP1−1、ARSD、CPLX3、LMAN1L、IFNA4、ABCC1、SEMA3E、MRE11A、C1QL1、LIPF、TRIM9、BBOX1、LRRC17、WNT2B、CYP3A4、SI、ANO3、OBSL1、CHRD、MSX2、PSG1、FAM107A、LRRC37B2、ANKLE2、PAX2、UNC5B、ADCYAP1R1、HFE、SYT1、GJC2、LOC100293871、FGF8、ACRV1、NRXN1、GDPD2、RGS4、CELA2A、IFNW1、MLNR、RNF17、LAD1、GLRA2、RASL12、MAGOH2、C6orf54、ZNF214、IKBKG、AP4E1、ZNRF4、OSBPL10、C1orf175、TTC4、PCDHB3、ADRBK1、ITSN1、XAGE1A、XAGE1B、XAGE1C、XAGE1D、XAGE1E、CDH22、FARP2、MYT1、TNC、MUC5AC、SLC6A15、PP14571、SMR3A、SMR3B、RXRG、SNX1、GLP1R、C6orf155、ATP1A2、TFAP4、PNPLA2、DIRAS3、ANO2、TACSTD2、MCM3AP、IL13RA2、TRIM10、RTEL1、PRRX2、TSHB、TIMELESS、FMO1、KIF18A、KIAA1199、CALB2、MFAP3L、PTGER3、EPAS1、SQSTM1、TSPY1、CPM、DLGAP1、CYP4F11、TLX3、PCDHA10、TAOK2、ERC1、TBX2、KALRN、DICER1、PAPPA、KIF5A、DNAJC22、OTUB1、KIAA1644、SEZ6L2、PCNXL2、HMHB1、ERG、SNTB2、GJA5、AGTR2、GJA3、GCK、LRRC61、CNTF、ZFP91、ZFP91−CNTF、PDLIM4、MPPED2、IFNA10、ACTN2、VGLL1、GJA9、LDLR、ANK2、COL1A1、TIMP3、OTOF、AGXT、GLI2、TRMT61A、FOXD2、TMEM212、DENND2A、B3GALT1、SPAG11A、PRDM4、TF、ELF5、GSC2、EPB41L4B、GYG2、LYZL6、DCHS2、OBP2A、OBP2B、ANGPTL3、MYH11、NES、SLC17A1、RBM15B、CSH1、HTR5A、CYP3A7、HTR2A、KCNV2、TOX3、CLOCK、MAGEA6、FAM12A、COL4A3、S1PR2、NAT8、ACE2、SLC22A6、SLC13A2、MYH4、APBB2、RAP1GAP、SHOX2、SLCO1A2、
    ETV1、MAGEA12、PLA2G6、ADRA1A、SYT5、GPR161、SEMA3F、CYP3A43、HOMER2、KCNJ5、PPL、COL17A1、CSHL1、C9orf116、PARK2、UGT2B15、CDK6、FAM174B、CELA2A、CELA2B、SPDEF、EPB41、GAB1、SMR3A、PDE6G、COL5A1、ABCA6、DMD、CYLC2、CIDEA、RAG2、HIST1H2BN、FMO6P、MAOA、ANKRD53、HAPLN1、MT1M、EHD2、GAD2、CRISP2、CSN2、SULT1C2、PCDHGA3、SSX3、FGFR2、GPR161、ATN1、CHD5、A4GALT、MYBPH、CSHL1、NCAPH2、CAPN9、CNGB1、BCAM、DRD5、NR5A2、TEF、ELAVL2、DGKB、HTR7P、RHAG、GH2、COL4A6、BMP7、SOSTDC1、SOX14、TAS2R9、LPHN2、MAP1A、OSGIN2、SLC10A2、FAM13C、EMX1、FLJ40330、CHI3L1、CDH16、SPRR1A、LOX、CALCB、GABBR2、CPB2、RASL11B、CCDC81、RUNX1、CPA1、CLCNKA、CLCNKB、FHL5、THSD7A、TFAP2C、SPAG11B、CAP2、PODNL1、SSX4、SSX4B、G6PC、RPE65、TMEM222、KDR、CHP2、GPR64、TPM2、TCEB3B、E2F5、IL5RA、AOC3、ABCF3、CPN2、ACE、NRP2、INPP5J、SMAD9、FAM155A、GART、PIR、ZNF467、ITSN2、NR1D1、THRA、RP11−35N6.1、LAMB1、EPHB3、PLA2R1、RAPGEF4、DNAJC8、ARSJ、TRIM49、GC、CDH2、ATXN3L、BTF3L1、BICC1、FAM186A、PTPRF、TRPC4、TCL6、CYP4A22、FUT6、MUC1、DKFZP434B2016、LOC643313、LDHA、LOC100131613、TRIM3、MLLT10、DZIP1、ANKRD34C、BUB1、CSPG5、FBLN1、GAD2、CLDN1、CHRNA3、SCN11A、TEX11、IL20RA、AKAP5、KBTBD10、MSTN、TLL2、NACAD、UNC93A、PTGER1、OLAH、NHLH2、SERPINA6、KRT17、KCNMA1、PRKCA、STS、LAMA1、GPR88、ACTN2、TREH、AKAP4、DKK4、PRICKLE3、IRS4、TRPV4、PCDH11Y、APBB2、SLCO2A1、DRD2、MTMR7、ZNF471、TF、NRIP2、ST6GALNAC5、COMT、PAH、LRRC19、PRKAR1B、HPR、PRDM5、NCRNA00120、LOC79999、ITSN2、CACNB2、GPR98、PREX2、FAM182B、LAMA4、ARVCF、HAS2、YOD1、PPP2R3A、COL4A1、RBM12B、GSTA3、FAM66D、OR10H2、PTHLH、ZNF674、KRT19、ACCN2、COL6A1、LOC100288442、LOC100289169、LOC728888、LOC729602、NPIPL2、NPIPL3、PDXDC2、SLC37A1、ATP6V1B1、ABI3BP、HR44、ZNF324B、ZNF584、HOXD13、ADH6、IFNA8、MYOZ2、NFATC4、ADAMTS7、FOXL1、GPR17、SLC18A3、MYH6、BOK、FGA、TEAD4、GRM1、EDNRA、C8orf79、METTL7A、FOLH1、RAD54L、SOX11、CNOT3、NTS、MAPK12、DOCK6、DNAJC6、HS3ST3A1、LOC728395、TSPY1、TSPY3、PTH、LAMB4、ALDOB、FLG、MLANA、UBE2D4、LOC100287483、KRT20、POU1F1、SLCO1B3、CLTA、MECOM、C8orf71、SULT2A1、C6orf10、SLC27A6、PRKD1、SYNPO2L、THPO、GABRR1、CFTR、PPP2R3A、DCBLD2、ANP32A、ANP32C、ANP32D、LOC723972、XYLT1、STAB1、STAB1、SASH1、PID1、FUCA1、SASH1、LRRN3、LRRN3またはそれらの組合せである、請求項1〜11の何れか一項に記載の方法。
  14. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象をラキニモドで処置する方法であって、
    a)前記対象でバイオマーカーの発現を評価することによって前記対象がラキニモド応答体であるかどうか判定する工程と、
    b)前記対象がラキニモド応答体と特定される場合だけ前記対象を処置するのに有効な量のラキニモドを前記対象に投与し、それによって前記対象を処置する工程と
    を含み、
    前記バイオマーカーが、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法。
  15. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象を処置する方法であって、
    a)ラキニモドの治療的有効量を前記対象に投与する工程と、
    b)前記対象でバイオマーカーの発現を評価することによって前記対象がラキニモド応答体であるかどうか判定する工程と、
    c)前記対象がラキニモド応答体と特定される場合だけ前記対象を処置するのに有効な量のラキニモドを前記対象に投与するか、または前記対象がラキニモド応答体と特定されない場合は前記対象へのラキニモドの投与を修正し、それによって前記対象を処置する工程と
    を含み、前記バイオマーカーが、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、方法。
  16. 前記バイオマーカーが前記対象で上方制御される場合は、前記対象はラキニモド応答体と特定される、請求項14または15に記載の方法。
  17. 前記バイオマーカーが前記対象で抑制される場合は、前記対象はラキニモド応答体と特定される、請求項14または15に記載の方法。
  18. 前記炎症性応答に関連する遺伝子が、TGFbシグナル伝達、IL−12シグナル伝達、食細胞の接着の経路、好中球の化学走性、白血球の移行、カベオラ媒介エンドサイトーシス、クラスリン媒介エンドサイトーシスおよび/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である、請求項14〜17の何れか一項に記載の方法。
  19. 前記細胞運動に関連する遺伝子が、食細胞の接着および遊走、好中球の化学走性、白血球の移行、細胞の浸潤、細胞の接着および/または白血球溢出シグナル伝達に関連または関与する遺伝子である、請求項14〜18の何れか一項に記載の方法。
  20. 前記細胞シグナル伝達に関連する遺伝子が、細胞の接着および/または神経伝達の経路に関連または関与する遺伝子である、請求項14〜19の何れか一項に記載の方法。
  21. 前記細胞の発達に関連する遺伝子が、Gタンパク質共役受容体シグナル伝達、アラキドン酸代謝および/またはTGFβシグナル伝達の経路に関連または関与する遺伝子である、請求項14〜20の何れか一項に記載の方法。
  22. 前記血液系に関連する遺伝子が、血小板の凝集、血小板の活性化、血液細胞の凝集、血液の凝固、内在性のプロトロンビン活性化経路および/または凝固系の経路に関連または関与する遺伝子である、請求項14〜21の何れか一項に記載の方法。
  23. 前記遺伝子が、TNFSF4、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6遺伝子、ITGA2/8、ITGβ1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−1/1R/5/8/13/20/22R、IL−9/11/12/36、TNFRSF11A/B、IFNA4/8/10/17、TGβ、LTBP4、MEK1/2、TGFβ1型受容体、II型BMPR、smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1またはそれらの組合せである、請求項14〜22の何れか一項に記載の方法。
  24. 前記遺伝子が、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/20/22、IL−9/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad2/3/4、PAI−1、SELP、ITFA8、ITGB1/3/5、CXCL5/7、BMP6、ITGA2/8、ITGB1/3/4/5/6、ITGBL1、MMP16/24/26/28、ADAM12/18/22、IL−5/13/20/22、IL−9/11/36、TNFRSF11A/B、TGβ、LTBP4、MEK1/2、Smad1/2/3/4/5/6/8、PAI−1、CCL19、IKKg、LTBP1、アルファチューブリン、BMP4/7、MIS、TCF2、IL5R、IL13R、IL20R、ITGB2、NKTR、TEF、CLSTN2、LUC7L2、FABP7、TPTE、FSTL1、SF3B1、LIMS1、PDE5A、XPNPEP1、C5orf4、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、KRT20、TBC1D1、GRHL2、C5orf4、SEPT6、KIAA1199、SSX2IP、TPM1、CDC14B、USP47、MMRN1、CTNNAL1、SMOX、ALOX12、GLRA3、CA2、GUCY1B3、RFPL1、CLEC1B、GNG11、TSPAN32、RGS10、CALD1、PRKAR2B、CYP4F11、CLCA3P、CELSR3、CDC14B、TPM1、SEPT6、PRKG1、MAX、CCDC93、ARMCX6、LOC653354、TUBB2B、HIST1H2AJ、MFAP3L、LIMS1、GNB5、GPRASP1、SRRT、C1orf116、FBXO7、PPM1A、GUCY1B3、CTDSPL、GNAS、IGF2BP3、TPM1、HIST1H2BK、DLG4、WDR48、CALD1、LOC157627、GNB5、ZNF415、ASAP2、PSD3、GNAS、POPDC3、NRGN、ABLIM3、XYLT1、PTGIS、ARHGEF10、PDGFA、PGRMC1、HIST1H2AC、GNAS、CLDN5、MFAP3L、PGRMC1、MYST3、CAPRIN1、CALD1、FBXW7、DNM3、CD84、PRPF4B、RBM25、WASF3、GRAP2、SPARC、TAL1、NENF、XK、GP1BA、HLA−E、CA5A、LYVE1、MARCH6、NAT8B、TRIM58、RET、SDPR、TBXA2R、TMED10、APBA2、MYL9、POU1F1、H2BFS、HIST1H2BK、FAM12B、VCL、GSPT1、ALDOB、LOC150776、SMPD4、SLC37A1、SPARC、GNAS、TAS2R4、CALM3、POM121、POM121C、GRIK2、GREM1、TNNC2、EPS15L2、ENDOD1、RGS6、SF3B1、TMSB15A、ZBTB20、FUT9、ATP9A、MAX、HIST1H2AI、BAT2D1、ABL1、SNCA、GFI1B、CTSA、SNX13、RPA1、FLNA、XPNPEP1、KIF2A、ZBTB33、PSMD11、UBE2N、FOLR1、TSC22D1、PCNP、CELSR3、ACSBG1、RNF11、SEMA3E、MARCH2、PCDH24、SUPT5H、HLA−E、EGF、HLA−C、FLNA、CDK2AP1、LEPROT、SH3TC2、TUBA4A、MTMR1、TF、PRKD1、NAP1L1、DAB2、FUCA1、HIP1、THPO、MAP1B、PARVB、GP1BB、SEPT5、GJA4、PTGS1、GUCY1A3、HIST1H2AG、GNAS、LRBA、HYAL3、GP6、IGHG1、CYP2A13、CDC14B、MAX、KDM2A、CALD1、GNAZ、C19orf22、ARHGAP6、RHOC、RBX1、GP1BB、SEPT5、PRDX6、PRB4、FLNA、HIST1H2BF、RHBDF2、NUP205、SYT1、EGFL8、PPT2、TUBB1、TMC6、FLJ11292、NAP1L1、ALDH1A3、CSNK1E、PRUNE、COL4A3、ZNF221、ILF3、CABP5、RPA1、ARF1、HIST1H2BI、PTGS1、PRKAA1、GNB5、HIST2H4A、HIST2H4B、CYB5R3、TNS1、DCT、GMPR、ABI3BP、GNAS、SASH1、AAK1、XPO6、CTSL2、QSER1、MAP1LC3B、TBX6、CABP2、MRE11A、MAPRE2、TMC6、BDKRB2、MGLL、HRASLS、WHAMML1、WHAMML2、CLU、STC1、C6orf54、PABPN1、PDLIM1、CLU、PHF20、UBL4A、RNF115、HGD、RASGRP2、PNN、SAPS3、SFI1、GOLGA2、HIST2H2BE、SGEF、HGD、DUS1L、MPP1、HLA−E、GRB14、MMD、ZFHX4、CSNK1G2、HIST1H2BE、MPDZ、B2M、TBXA2R、CTDSPL、SNCA、CD99、POLS、MPL、HIST1H3F、SFRS8、NR5A2、ZMYM2、C6orf10、TMEM40、RNF43、PRUNE、MSH6、PLCB4、PARVB、TOX3、PKNOX1、RUFY1、SNCA、C10orf81、PDGFA、ASMT、HMGB1、CCDC90A、PROS1、hCG_1757335、RAP1B、MTSS1、GNRHR、LRRN3、MCM3AP、PLOD2、NAP1L1、PLOD2、HOXD13 CASKIN2、MFAP5、PITX2、SNCA、MYLK、PBX1、PRDX6、H3F3A、H3F3B、LOC440926、TMEM158、TRIM58、FSTL1、SNCA、TNS1、ATP1B1、C5orf4、LRP12、CTNNAL1、GEM、KIAA1466、ALDH1A2、MAP4K3、SNCA、RAB6B、PSD3、RIPK2、RAMP3、CALD1、CYP2E1、PSD3、PDLIM7、COBLL1、FUT3、SMOX、TGM2、LRRC50、CST6、OR7A17、C6orf145、DLEU2、DLEU2L、CPT2、HGF、TNS1、SPRY1、PLOD2、CD80、KYNU、BCAT1、NHLH1、AHCTF1、HOXA10、MTMR3、VAC14、CLCF1、FGF5、TAL1、SAMD14、ELL2、CHN1、SLC7A1、GRK5、PARD3、VPS37B、CYP2B6、CYP2B7P1、MALL、ALX4、SOX15、KRT5、ESPL1、STARD8、PSD3、KIAA0195、MYO9B、HIP1R、LOC100294412、EFNB1、ERN1、RHD、MFAP3L、PLA1A、POFUT2、C8orf39、CRYBB2、CYP4A11、PVRL2、CLCNKB、MRAS、NFIB、FKSG2、SLC11A2、FZR1、ZNF550、GLP1R、SLC19A1、RTN2、PAPOLA、STC1、GK、EXOSC6、RAPSN、HFE、EHD2、RIOK3、UBE2I、C15orf2、DMD、PRLH、MAP2K2、TP63、DACH1、PPP5C、SLC26A1、NUDT7、KCNJ12、ENTPD7、SLC26A1、PRRG3、RGS6、ZBED2、FICD、ARHGAP1、ARHGDIA、SDHB、AMHR2、ABCA4、TCF20、BGN、CASP7、LPAR4、GNA12、CYP2W1、RAX、C4A、C4B、LOC100292046、LOC100294156、PXN、ESR2、MYL10、EFS、TFF3、SRPK1、LOC441601、BIRC5、CCT8L2、PPAP2B、CMA1、APOA2、KDELR2、ASCL3、RUNX1、BUB1、SLC6A8、HNRNPC、HNRNPCL1、LOC440563、LOC649330、RIBC2、CLIC4、RAB17、SCML2、SPINLW1、ANK1、EDA2R、HTR4、CDC42EP4、KANK2、ANK1、SYN1、DUX3、DUX4、FRG2C、HPX−2、LOC100134409、LOC652119、LOC653543、LOC653544、LOC653545、LOC728410、PKNOX2、MLLT4、APOA2、PENK、GNAT1、FURIN、SEMA6A、EGFL6、HRH1、TSPAN1、DBC1、TRPC7、GPR52、HAMP、PRSS2、GPR107、FLJ11292、FLJ20184、B4GALT1、NKX3−1、ASIP、EFCAB6、GPR20、CA5A、PLK4、TAAR5、SRPX2、CNTD2、AZGP1、TIMP3、RGS6、ADARB1、DYNC1I1、C10orf10、PDIA2、PITX3、HOXC13、LPAR3、CTRC、CTSL2、MUC8、AQP5、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A8、UGT1A9、KCNQ2、CYP2A13、ZNF155、KIAA0892、ATP2A2、FGF5、FGF18、FUT2、SHROOM2、PRSS3、CREB3L1、MGAT2、PLCE1、MLXIPL、OR10H3、ABCB11、CD84、ARHGEF4、ORC1L、PCIF1、CD177、C1orf116、IFT122、C11orf20、DUSP13、C6orf208、PLA2G5、PRAMEF1、PRAMEF2、CYP4F8、KCNA1、MFAP4、SLC4A3、IL1RAPL1、SERPINE1、ZCCHC14、POLR3G、C16orf68、FLJ14100、SMCHD1、ASCL1、FOXA2、SLC23A2、KLK13、MTSS1L、DNMT3L、RREB1、DNMBP、PKLR、C1orf106、CCDC134、MTSS1、CCDC40、HOXB1、SCNN1B、SEMA4G、RAPGEFL1、MAGEL2、PLSCR2、CHD2、PLCD1、C1orf116、CHRNA2、MBP、CDC42BPA、MYF6、PI15、LOC440895、SBF1、MAST1、GLT8D2、ERBB3、LOH3CR2A、AMH、HR、RDH8、PAWR、DRD3、CCT8、PRELP、SPOCK3、EPS8L3、NXN、SEMA4G、P2RY1、AVL9、TEK、MOGAT2、KLK7、MT1E、MT1H、MT1M、CLDN18、RHBDF2、SIX1、INPP5A、KCNMB3、MAP2K5、GPD1、LPO、LOC729143、MPRIP、WNT7A、RARG、CDH7、MBNL2、RASGRP2、RBMY2FP、MASP1、CASR、EGR4、APOC2、HECW1、HOXB3、IRF5、NNMT、AOC2、ESRRG、LPIN1、ACOT11、CCDC33、MBD2、ZNF323、NTRK2、TMEM151B、GPLD1、LENEP、HNF1B、NXPH3、ALDH1A3、PHF20L1、CKM、PARD6B、CRYGB、HAB1、LARGE、RAB40C、MPL、CHIT1、METTL10、DUS4L、PNLIPRP1、ELL、ST8SIA5、GRIN2B、MC4R、RTDR1、HDAC6、KCNJ13、CPSF1、SPANXC、CNOT4、LAMA2、SLC1A6、ABCA2、KLK11、GFRA3、CYP3A4、SLC1A3、ATP2B2、APBB2、VPS45、GHRHR、HOXD4、PRPH、ADCY2、LEFTY2、CYP1B1、PCP4、C8B、RANBP3、PDE6H、TRIM15、VGLL1、TRIM3、CRKL、ADH7、PSG3、GPR153、MFAP2、FGF13、NAPA、ALDH3A1、MCM10、TLE4、ITPR3、CCDC87、C9orf7、ACTC1、OBSL1、
    MAP2、CRYM、RNF122、SST、HLA−DRB6、SLC22A17、HSPG2、HIP1、GRIK2、UNKL、GPR144、KIR3DX1、NARFL、UCP3、PLXNA2、BTN1A1、ERCC4、CIITA、EGFR、KRT33A、CLTB、B3GALT5、AP3M2、GJC1、MYO3A、ARHGAP1、PPP2R3A、CLIC4、C20orf195、SIGLEC8、GPRC5A、CACNB1、MYL10、PRLR、OR2S2、NCR2、CHAF1B、EYA3、CDS1、FBXL18、ACTL6B、ZNF821、C16orf71、HBBP1、PLXNA1、CDC45L、MTCP1、PLCB4、PLVAP、PROX1、CYP3A43、IGHG1、RECQL5、IDUA、DLGAP4、PLXNB1、HSD17B14、FOXP3、C19orf26、EPB41L1、RBBP9、GJB4、UPK1B、CYP19A1、LOC55908、CLDN18、C2orf72、NTRK3、NRXN2、SPDEF、IGH@、IGHD、IGHG1、IGHM、LOC100289944、VSIG6、ACRV1、PHLDB1、SORBS1、HAPLN2、FABP3、EFS、ACVR1B、CHST3、UGT2A1、UGT2A2、TAF1、MT4、MFAP3、ETV5、UBQLN3、TBX10、GJB1、ABO、SPINK5、ATAD4、CDH11、CARD14、ALPP、ALPPL2、CBL、LRP4、CDKL2、SSX3、DSG2、SLC45A2、LAMA4、WFDC8、HTR7、EFNB3、TUBB2B、OR7E19P、PMS2L4、ASAP3、FRZB、PDLIM4、PVT1、TFR2、AHI1、TAF4、ADAMTSL2、CLDN4、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR3DP1、LOC727787、RAPGEF5、CRMP1、LDB3、F11、USP46、IBSP、SLC9A3、FLRT3、TRIM17、FGF17、CAMK1G、GLYR1、CSH1、NTF3、ABHD6、TRIM15、OR52A1、FGFR2、ORAI2、C17orf53、GLP1R、SLIT1、TP63、DDR1、CFTR、DIO2、LETM1、ACSM5、ACTA1、NPR1、KCND3、POPDC3、DNAH3、SPDEF、CLEC4M、SLC30A3、NAGLU、AAK1、DHX34、NNAT、AKAP9、ICMT、FAM189A1、C10orf81、MYOZ1、PKNOX2、MGC31957、PRDM11、RET、IGHG1、XPNPEP2、NTRK2、SLC25A10、NR1I2、GRM8、OR3A3、GIPR、PAH、PACRG、CLN8、ZNF215、TRIO、TTLL5、GRM1、PRKG1、HHLA1、LAMA3、SLC37A4、HOXC11、SLCO5A1、CA10、RRBP1、SOD3、NTRK3、CYR61、STRA6、SLC6A11、CNOT4、ATN1、BCAP29、NOVA2、RELN、LAMC2、RAD51、PRSS7、DCBLD2、TACR2、RAB11B、OR2J2、VSNL1、IFNA17、DPYSL4、MGC2889、RRBP1、POLQ、OR1A2、PURA、AIF1、CBS、NECAB2、PRKCE、NOX1、IHH、EXO1、GPRIN2、PDX1、GPR12、FAM188A、HS3ST3B1、ASCL1、ZNF484、CSH1、BCAN、DDN、DUOX2、MORN1、SLC39A2、CLCN7、RUNX2、TTYH1、ZNF280B、PAX3、LZTS1、SLC8A2、HAB1、KIF1A、ARL4D、UGT2B15、NACA2、THRB、C6orf15、GPR176、WSCD1、PLXNB3、CADM3、HAP1、CYP1A2、SPAM1、IL22RA1、CDC2L5、IRX5、PPFIA2、KDELR3、CEACAM7、KCMF1、DUOX1、CDC27、HIST2H2AA3、CAV3、APOA4、NPR3、PRG3、TBC1D22B、TUSC3、RIMS2、CYP4F12、TBXA2R、HBEGF、PSG9、PYGO1、RASGRF1、SCN2A、KLHL1、DTNB、GREM1、SNCG、C22orf24、PALM、COBLL1、DNPEP、MNS1、NFATC4、DLC1、HSPC072、MCAM、CA12、CSHL1、RPAIN、COL5A2、UGT1A8、UGT1A9、IGH@、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHM、LOC100126583、LOC100290036、LOC100290320、LOC100293211、LOC652494、ACSM5、ALOX12P2、ERBB4、CLDN16、CIB2、GALR3、MSMB、FABP7、ATXN3、KCNJ5、TRDN、CYP3A43、BAZ2A、ACCN4、SILV、DGCR14、SEMA6C、DIO2、PTHLH、LEP、PDZRN3、RGSL1、GJA4、SLC22A6、RASGRF1、MAPRE2、PVRL1、AKAP1、POMP、SOX21、DNAH9、HOXC5、SERHL2、KIAA0485、ITSN1、B4GALT1、NEK2、NUPR1、CCDC93、EPO、CRABP2、TYRO3、GOLGA2、SEMA3F、BFSP2、NCAM1、FOLH1、SSX2、TMPRSS4、DCN、LPHN3、POU4F3、CEACAM5、BCL3、EXTL3、CCNA1、DDR2、PAX8、SOX5、POU3F1、PEX16、NUP62、SIGLEC11、ALDOB、GPC3、IGFALS、WDR25、FGF1、OSR2、ARID1A、GYPA、KLK13、PARVB、LILRB5、RIMS2、C19orf21、HOXD1、PRSS3、FLT1、ATP6V1C1、LOX、CRYBB3、CA12、PRKG2、MASP1、LOC728395、LOC728403、TSPY1、PDCD1、GGTLC1、AQP8、KRT16、AICDA、BRD8、C1orf95、OR3A2、PFKFB2、FRZB、PAK3、MEIS2、ZSCAN2、MYH7、VWA1、LSAMP、SRC、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、DIO1、TADA3L、NFASC、CALCRL、NBLA00301、MAB21L1、FBXO42、COL10A1、CFB、SNX7、FOXN1、SRY、HLF、CLCA3P、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、GPR3、TMPRSS11E、EMID1、KCNMB2、MUC5AC、SORT1、HIF3A、MAPK4、TCP11L1、ZZEF1、DCAF7、DMWD、CLCA2、VAC14、CSPG5、STMN2、MLLT4、GALNT14、FGF12、MFAP5、SUMO3、HTR3A、GDF5、TSSK1B、CYP2A7P1、MARK1、ATP1B2、TBX6、PAX8、IL1R1、RALYL、OR2B2、TAAR3、C12orf32、IGHG1、LOC642131、DICER1、GLRA3、PPARD、HSPA4L、WNT2、VIPR2、CYP2C9、SRPX2、IGSF1、ALPK3、TFPI、KCNS3、MARCH8、FRMD4B、TACR3、FIGF、PDCD6、TNN、SPANXB1、SPANXB2、SPANXF1、RHBDD3、SPP2、PDE10A、ZNF224、FGL1、PGAM2、CADM4、APOBEC2、SLC9A5、GNAT1、ARHGEF16、SMARCA2、DNAH9、RBM26、WNT2B、KCNK2、NPBWR2、SP2、TMPRSS11D、DENND2A、TNIP3、STC1、DOCK6、ADAM5P、SYDE1、TNPO2、LRTM1、USH1C、PDE12、SRCAP、OR10J1、OR2H2、KCNJ8、RP11−257K9.7、DOCK5、TPD52L1、PAEP、GGA2、PHLDA3、HES2、MLL、CHRNA6、CIB2、PTPRF、TM7SF4、DAZ1、DAZ2、DAZ3、DAZ4、ALX1、OR2F1、OR2F2、PLAT、HGC6.3、WNT11、PGK2、SNAI2、COL4A6、PRUNE2、ANKS1B、LOC81691、FERMT2、TIMP3、CST8、CAPN6、IDUA、GPR32、AKR1B10、GRHL2、FBXO24、HSF4、IGHG1、HCN2、LRP12、ARHGEF15、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A7、UGT1A8、GUCA2A、ITIH1、EGFR、UGT1A1、UGT1A10、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A5、UGT1A6、UGT1A7、UGT1A8、UGT1A9、MYOG、TMSB15A、TLX1、EDNRA、LOC100289791、MDFI、ZER1、MYH15、CDH20、GPR63、LOC440345、LOC440354、LOC595101、LOC641298、SMG1、HOXC10、KRTAP1−1、ARSD、CPLX3、LMAN1L、IFNA4、ABCC1、SEMA3E、MRE11A、C1QL1、LIPF、TRIM9、BBOX1、LRRC17、WNT2B、CYP3A4、SI、ANO3、OBSL1、CHRD、MSX2、PSG1、FAM107A、LRRC37B2、ANKLE2、PAX2、UNC5B、ADCYAP1R1、HFE、SYT1、GJC2、LOC100293871、FGF8、ACRV1、NRXN1、GDPD2、RGS4、CELA2A、IFNW1、MLNR、RNF17、LAD1、GLRA2、RASL12、MAGOH2、C6orf54、ZNF214、IKBKG、AP4E1、ZNRF4、OSBPL10、C1orf175、TTC4、PCDHB3、ADRBK1、ITSN1、XAGE1A、XAGE1B、XAGE1C、XAGE1D、XAGE1E、CDH22、FARP2、MYT1、TNC、MUC5AC、SLC6A15、PP14571、SMR3A、SMR3B、RXRG、SNX1、GLP1R、C6orf155、ATP1A2、TFAP4、PNPLA2、DIRAS3、ANO2、TACSTD2、MCM3AP、IL13RA2、TRIM10、RTEL1、PRRX2、TSHB、TIMELESS、FMO1、KIF18A、KIAA1199、CALB2、MFAP3L、PTGER3、EPAS1、SQSTM1、TSPY1、CPM、DLGAP1、CYP4F11、TLX3、PCDHA10、TAOK2、ERC1、TBX2、KALRN、DICER1、PAPPA、KIF5A、DNAJC22、OTUB1、KIAA1644、SEZ6L2、PCNXL2、HMHB1、ERG、SNTB2、GJA5、AGTR2、GJA3、GCK、LRRC61、CNTF、ZFP91、ZFP91−CNTF、PDLIM4、MPPED2、IFNA10、ACTN2、VGLL1、GJA9、LDLR、ANK2、COL1A1、TIMP3、OTOF、AGXT、GLI2、TRMT61A、FOXD2、TMEM212、DENND2A、B3GALT1、SPAG11A、PRDM4、TF、ELF5、GSC2、EPB41L4B、GYG2、LYZL6、DCHS2、OBP2A、OBP2B、ANGPTL3、MYH11、NES、SLC17A1、RBM15B、CSH1、HTR5A、CYP3A7、HTR2A、KCNV2、TOX3、CLOCK、MAGEA6、FAM12A、COL4A3、S1PR2、NAT8、ACE2、SLC22A6、SLC13A2、MYH4、APBB2、RAP1GAP、SHOX2、SLCO1A2、
    ETV1、MAGEA12、PLA2G6、ADRA1A、SYT5、GPR161、SEMA3F、CYP3A43、HOMER2、KCNJ5、PPL、COL17A1、CSHL1、C9orf116、PARK2、UGT2B15、CDK6、FAM174B、CELA2A、CELA2B、SPDEF、EPB41、GAB1、SMR3A、PDE6G、COL5A1、ABCA6、DMD、CYLC2、CIDEA、RAG2、HIST1H2BN、FMO6P、MAOA、ANKRD53、HAPLN1、MT1M、EHD2、GAD2、CRISP2、CSN2、SULT1C2、PCDHGA3、SSX3、FGFR2、GPR161、ATN1、CHD5、A4GALT、MYBPH、CSHL1、NCAPH2、CAPN9、CNGB1、BCAM、DRD5、NR5A2、TEF、ELAVL2、DGKB、HTR7P、RHAG、GH2、COL4A6、BMP7、SOSTDC1、SOX14、TAS2R9、LPHN2、MAP1A、OSGIN2、SLC10A2、FAM13C、EMX1、FLJ40330、CHI3L1、CDH16、SPRR1A、LOX、CALCB、GABBR2、CPB2、RASL11B、CCDC81、RUNX1、CPA1、CLCNKA、CLCNKB、FHL5、THSD7A、TFAP2C、SPAG11B、CAP2、PODNL1、SSX4、SSX4B、G6PC、RPE65、TMEM222、KDR、CHP2、GPR64、TPM2、TCEB3B、E2F5、IL5RA、AOC3、ABCF3、CPN2、ACE、NRP2、INPP5J、SMAD9、FAM155A、GART、PIR、ZNF467、ITSN2、NR1D1、THRA、RP11−35N6.1、LAMB1、EPHB3、PLA2R1、RAPGEF4、DNAJC8、ARSJ、TRIM49、GC、CDH2、ATXN3L、BTF3L1、BICC1、FAM186A、PTPRF、TRPC4、TCL6、CYP4A22、FUT6、MUC1、DKFZP434B2016、LOC643313、LDHA、LOC100131613、TRIM3、MLLT10、DZIP1、ANKRD34C、BUB1、CSPG5、FBLN1、GAD2、CLDN1、CHRNA3、SCN11A、TEX11、IL20RA、AKAP5、KBTBD10、MSTN、TLL2、NACAD、UNC93A、PTGER1、OLAH、NHLH2、SERPINA6、KRT17、KCNMA1、PRKCA、STS、LAMA1、GPR88、ACTN2、TREH、AKAP4、DKK4、PRICKLE3、IRS4、TRPV4、PCDH11Y、APBB2、SLCO2A1、DRD2、MTMR7、ZNF471、TF、NRIP2、ST6GALNAC5、COMT、PAH、LRRC19、PRKAR1B、HPR、PRDM5、NCRNA00120、LOC79999、ITSN2、CACNB2、GPR98、PREX2、FAM182B、LAMA4、ARVCF、HAS2、YOD1、PPP2R3A、COL4A1、RBM12B、GSTA3、FAM66D、OR10H2、PTHLH、ZNF674、KRT19、ACCN2、COL6A1、LOC100288442、LOC100289169、LOC728888、LOC729602、NPIPL2、NPIPL3、PDXDC2、SLC37A1、ATP6V1B1、ABI3BP、HR44、ZNF324B、ZNF584、HOXD13、ADH6、IFNA8、MYOZ2、NFATC4、ADAMTS7、FOXL1、GPR17、SLC18A3、MYH6、BOK、FGA、TEAD4、GRM1、EDNRA、C8orf79、METTL7A、FOLH1、RAD54L、SOX11、CNOT3、NTS、MAPK12、DOCK6、DNAJC6、HS3ST3A1、LOC728395、TSPY1、TSPY3、PTH、LAMB4、ALDOB、FLG、MLANA、UBE2D4、LOC100287483、KRT20、POU1F1、SLCO1B3、CLTA、MECOM、C8orf71、SULT2A1、C6orf10、SLC27A6、PRKD1、SYNPO2L、THPO、GABRR1、CFTR、PPP2R3A、DCBLD2、ANP32A、ANP32C、ANP32D、LOC723972、XYLT1、STAB1、STAB1、SASH1、PID1、FUCA1、SASH1、LRRN3、LRRN3またはそれらの組合せである、請求項14〜22の何れか一項に記載の方法。
  25. ラキニモドが経口投与される、請求項14〜24の何れか一項に記載の方法。
  26. ラキニモドが毎日投与される、請求項14〜25の何れか一項に記載の方法。
  27. ラキニモドが、0.6mg/日未満、0.1〜40.0mg/日、0.1〜2.5mg/日、0.25〜2.0mg/日、0.5〜1.2mg/日、0.25mg/日、0.3mg/日、0.5mg/日、0.6mg/日、1.0mg/日、1.2mg/日、1.5mg/日または2.0mg/日の用量で投与される、請求項14〜26の何れか一項に記載の方法。
  28. 前記対象がラキニモドに対して未処置である、請求項14〜27の何れか一項に記載の方法。
  29. 前記対象がラキニモドを以前に投与されたことがある、請求項14〜27の何れか一項に記載の方法。
  30. 前記対象がラキニモド以外の多発性硬化症薬を以前に投与されたことがある、請求項14〜27の何れか一項に記載の方法。
  31. 前記バイオマーカーの発現を評価する工程が、前記対象の遺伝子発現の正規化を含む、請求項14〜30の何れか一項に記載の方法。
  32. 前記バイオマーカーの発現を評価する工程が、参照値に対して前記対象の発現レベルを比較することを含む、請求項14〜31の何れか一項に記載の方法。
  33. 前記参照値が、ラキニモド不応答体集団での前記バイオマーカーの発現レベルに基づく、請求項32に記載の方法。
  34. 前記参照値が、健康対照集団での前記バイオマーカーの発現レベルに基づく、請求項32に記載の方法。
  35. 前記バイオマーカーの発現が参照値よりも高い場合は、前記対象はラキニモド応答体と特定される、請求項32〜34の何れか一項に記載の方法。
  36. 前記バイオマーカーの発現レベルが参照値よりも低い場合は、前記対象はラキニモド応答体と特定される、請求項32〜34の何れか一項に記載の方法。
  37. 前記バイオマーカーの発現が前記対象の血液で評価される、請求項1〜36の何れか一項に記載の方法。
  38. 前記バイオマーカーの発現が前記対象の末梢血単核細胞(PBMC)で評価される、請求項37に記載の方法。
  39. 前記バイオマーカーの発現がラキニモド処置の前に評価される、請求項14〜38の何れか一項に記載の方法。
  40. 前記バイオマーカーの発現がラキニモド処置の開始後に評価される、請求項14〜38の何れか一項に記載の方法。
  41. 前記バイオマーカーの発現がラキニモド処置の開始から1カ月、6カ月、12カ月または24カ月後に評価される、請求項40に記載の方法。
  42. 前記対象がラキニモド応答体と特定される場合は、前記対象は単独療法としてラキニモドおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物をその後投与される、請求項14〜41の何れか一項に記載の方法。
  43. 前記対象がラキニモド応答体と特定される場合は、前記対象はラキニモドおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を別の多発性硬化症薬と併用してその後投与される、請求項14〜41の何れか一項に記載の方法。
  44. 前記対象がラキニモド非応答体と特定される場合は、前記対象はラキニモドではない多発性硬化症薬をその後投与される、請求項14〜43の何れか一項に記載の方法。
  45. 前記対象がヒト患者である、請求項1〜44の何れか一項に記載の方法。
  46. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、前記対象がラキニモド応答体と特定されている、ラキニモド。
  47. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、前記対象がラキニモド応答体と特定されている、医薬組成物。
  48. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、前記対象においてバイオマーカーの発現は上方制御され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、ラキニモド。
  49. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、前記対象においてバイオマーカーの発現は上方制御され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、医薬組成物。
  50. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するためのラキニモドであって、前記対象においてバイオマーカーの発現は抑制され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、ラキニモド。
  51. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象の処置で使用するための量のラキニモドを含む医薬組成物であって、前記対象においてバイオマーカーの発現は抑制され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、医薬組成物。
  52. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈するラキニモド応答体と特定された対象に調剤するための、または調剤で使用するための治療パッケージであって、
    a)各単位用量が所定量のラキニモドを含む、1つ以上の単位用量、および
    b)そのための完成した医薬容器であって、1つ以上の前記単位用量を含有し、前記対象の処置での前記パッケージの使用を指示する表示をさらに含有するかまたは含む容器
    を含むパッケージ。
  53. 多発性硬化症に冒されているかまたは臨床的に孤立した症候群を呈する対象に調剤するための、または調剤で使用するための治療パッケージであって、
    a)各単位用量が所定量のラキニモドを含む、1つ以上の単位用量、および
    b)そのための完成した医薬容器であって、1つ以上の前記単位用量を含有し、前記対象の処置での前記パッケージの使用を指示する表示をさらに含有するかまたは含む容器
    を含み、
    前記対象においてバイオマーカーの発現は抑制または上方制御され、前記バイオマーカーは、炎症性応答に関連する遺伝子、細胞運動に関連する遺伝子、細胞シグナル伝達に関連する遺伝子、細胞の発達に関連する遺伝子、血液系に関連する遺伝子またはそれらの組合せである、パッケージ。
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