JP2016039805A - 増強された抗腫瘍効果を有する改変パルボウイルス - Google Patents

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Abstract

【課題】治療に使用するための改良されたパルボウイルスの提供【解決手段】野生型パルボウイルスと比較して高い抗腫瘍能力を示すパルボウイルス変異体であって、変異体が、(a)NS−2のLys96位及び/又はNS−2のLeu103位でのアミノ酸置換、変化もしくは付加、好ましくは置換(後者はNS−1のTyr595位でのアミノ酸置換も誘導)、または(b)パルボウイルスゲノム内のインフレーム欠失、好ましくはNS−2の中央部分(アミノ酸96〜133)およびNS−1のC末端部分(アミノ酸587〜624)の両方において大きなアミノ酸欠失を生じさせる欠失を特徴とする。癌療法のための前記パルボウイルス変異体の使用方法。【選択図】なし

Description

本発明は、野生型パルボウイルスと比較して高い抗腫瘍能力を示すパルボウイルス変異体であって、前記変異体が、(a)NS2のLys96位および/またはNS2のLeu103位(後者はNS1のTyr595位でのアミノ酸置換も誘導する)でのアミノ酸置換、欠失もしくは付加、好ましくは置換、または(b)H−1PVゲノムの左側の部分におけるインフレーム欠失、好ましくはそれらのC末端および中央部分各々における38アミノ酸の欠失を有するNS1およびNS2タンパク質の翻訳を生じさせる欠失を特徴とするパルボウイルス変異体に関する。本発明はさらに、癌療法のための前記パルボウイルス変異体の使用に関する。
腫瘍退縮ウイルス、例えば齧歯類パルボウイルスは、癌治療にとっての新規なツールを表す(非特許文献1[1]、非特許文献2[2])。特に癌細胞を殺滅する(腫瘍退縮)の他に、これらの物質はさらに免疫系がウイルス感染腫瘍を排除するように刺激する危険信号を発生する(非特許文献3[3])。腫瘍退縮事象の結果として、先天性および後天性免疫系は腫瘍抗原に接近し、クロスプライミングおよびワクチン接種作用を生じさせることができる(非特許文献4[4]、非特許文献5[5])。齧歯類パルボウイルスは、「内因性」腫瘍退縮活性を有する一本鎖DNAウイルスである、つまり齧歯類パルボウイルスは、マウスおよびヒト両方の起源の癌細胞中で優先的に複製して該癌細胞を殺滅する(非特許文献6[6]、非特許文献7[7])。それでもヒト臨床用途にとって最も前途有望な候補(H−1PVを含む)の抗癌有効性は依然、改良の必要がある。現在までに、改良のために以下の戦略が適用された。
(a)治療遺伝子(例、ケモカインもしくはサイトカイン)の導入によるPVをベースとするベクターの作製(非特許文献8[8]、非特許文献9[9]、非特許文献10[10])、
(b)化学療法薬(例、ゲムシタビン)と組み合わせた天然齧歯類PVの使用(非特許文献11[11])、および、
(c)大きな非構造タンパク質NS1の潜在的リン酸化部位で点突然変異するPV変異体の作製(非特許文献12[12])。
しかし、得られた結果は、特に現在使用されている天然PVと比較してより高い抗腫瘍能力および製造工程中の時間の短縮に関して一層の改良を必要とする。
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このため、本発明の目的は、治療に使用するための改良されたパルボウイルスを提供することである。
本発明によると、この課題は、特許請求の範囲に規定した主題によって達成される。本発明は、同時感染した細胞培養中での標準wt H−1PVに取って代わるH−1PV変異体の本出願人による単離に基づいている[13]。本発明は、さらに齧歯類PVの小さな非構造タンパク質およびそれらとウイルス適応のための特定細胞パートナーとの相互作用が果たす極めて重要な役割[14,15]ならびにこれらのウイルスタンパク質内のわずかな修飾によってマウスパルボウイルスの適応度を改良することができる可能性[16]に基づいている。
本発明者らは、齧歯類PVの小さな非構造タンパク質の活性を改良することは、さらにウイルス産生およびそれらの抗腫瘍能力におけるこれらのウイルスのより高い有効性の原因となるという前提から出発した。これらの前提は、これらの突然変異をH−1PVゲノム内に導入して、(a)生殖細胞から回収された子孫ビリオンの量、および(b)ヒト腫瘍モデルに対する該生殖細胞の腫瘍毒性/腫瘍退縮活性に関して試験することによって確証された。これらの改良されたH−1PVを用いて得られたデータは、実際に子孫ビリオンのより高いバーストおよびウイルスストック内の感染性粒子対完全粒子の上昇した比率、細胞培養内でのより速い増殖および腫瘍異種移植片に対するより優れた抗癌活性を証明した。
これらを要約すると、本発明の改良されたPVは、(a)前臨床アッセイにおいて現在使用されている天然PVと比較して高い抗腫瘍能力を示す、ならびに(b)製造工程中の時間の短縮および(c)(前)臨床アッセイ中に使用する完全ビリオンの用量の削減をもたらす。したがって、本発明のウイルスは、治療遺伝子の存在および効果的療法のための化学療法薬との併用を必要としない。
(A)pPMut1H−1PV、(B)pPMut2H−1PV、(C)pPMut3H−1PV、(D)pPMut4H−1PVおよび(E)pDelH−1PV感染性分子クローンの略図 ウイルスゲノムは、グレーの囲み枠で表示した。ウイルスプロモーターP4およびP38は、黒色矢印として示した。グレーの囲み枠の上方に記載した「NS1/NS2」および「VP1/2」は、非構造的NS1/NS2およびカプシドVP1/VP2タンパク質各々をコードするゲノム領域を示している。pUC19発現ベクターは、黒色のレーンによって示した。点突然変異の部位(A〜D)はグレーのバーとして指示し、欠失(E)はグレーの三角形として指示した。ヌクレオチド(nt)の修飾(A〜D)または欠失(E)は、ゲノムの下方にイタリック体で指示した。ゲノムの下方のグレーの矢印は、結果として生じるウイルスタンパク質を適切な場合はグレーで指示した結果として生じるアミノ酸(aa)の修飾(A〜D)または欠失(E)とともに示している。Leu、Pro、Tyr、His、Lys、Glu、Metは、各々、アミノ酸のロイシン、プロリン、チロシン、ヒスチジン、リシン、グルタミン酸およびメチオニンを示す。 wt H−1PVと比較して増加したDel H−1PVの感染性、ならびにDel H−1PVと比較してPMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PV変異体の類似もしくはより一層良好な感染性 ウイルスはNB−324K細胞の感染によって作製し、プラークアッセイ(PFU=プラーク形成単位の数を得る)、ハイブリダイゼーションアッセイ(RU=複製単位の数を得る)およびドットブロット(完全ウイルス粒子の数を得る)によって分析した。 グレーの数は、wt(野生型) H−1PVを用いて得られた数値より小さいP/I値を示している。 矢印上のグレーおよびパターン模様の囲み枠は、wt H−1PVのP/I比と対応するH−1PV欠失もしくは点突然変異体のP/I比との間の減少(/)または増大(×)因数を示している。 感染NB−324K細胞内のwt H−1PVと比較したDel H−1PVの増大した増殖(A)新規に作製されたwt H−1PV、Del H−1PV、PMut1 H−1PV、PMut2 H−1PVおよびPMut3 H−1PVウイルスストックは、NB−324K細胞を用いたプラークアッセイによって分析した。各ウイルスストックを用いて得られたプラークの1例は、該プラークのサイズを例示するために示した。(B)wt H−1PV(グレーの囲み枠)またはDel H−1PV(黒色の囲み枠)ウイルスストックを用いた所定サイズを示しているプラークの比率は、各場合について試験したプラークの総量(n>100プラーク)のパーセンテージとして示した。wt H−1PVまたはDel H−1PVウイルスストックを用いて得られたプラークの平均サイズはグレーもしくは黒色の囲み枠内に示し、各々グレーまたは黒色の点線によって示した。 感染NB−324K細胞内のウイルスタンパク質の蓄積 1.5×10のNB−324K細胞は、3PFU/細胞の感染多重度(MOI)でwt H−1PV、Del H−1PV、PMut1 H−1PVまたはPMut2 H−1PVを用いて感染させた。全細胞溶解は感染後の指定時点(時間)に実施し、10μgの全タンパク質抽出物を12% SDS−ポリアクリルアミドゲル上に移し、続いてイムノブロッティングによって分析した。非構造タンパク質NS1およびNS2ならびにウイルスカプシドタンパク質VPは、各々ウサギポリクローナル抗体SP8、抗NS2Pおよび抗VPpepを用いて検出した。白色および黒色の矢印は、PMut変異体NS1およびVPタンパク質各々の、感染8時間または24時間後でのwt H−1PV感染細胞抽出物中で観察された蓄積に比較して増加した、および/または早期の蓄積を示している。野生型NS2タンパク質と比較したDelまたはPMut変異体NS2タンパク質の蓄積における変動は、黒色の囲み枠によって強調されている。タンパク質マーカーのサイズは、右側に示した。擬似(mock)は非感染培地処理細胞を、kDはキロダルトンを示す。 ヒトNB−324K細胞内の感染後の早期の時点でのPMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PV変異体の増加した増殖阻害およびウイルス産生(A)NB−324K細胞は、3PFU/細胞のMOIでwt H−1PV、Del H−1PV、PMut1 H−1PVまたはPMut2 H−1PVを用いて感染させた。生細胞の量は、CASY細胞計数システムを使用して感染後(p.i)の指定時点(日)に決定した。感染させたサンプル中の生細胞の比率は、擬似(Mock)処理サンプル中の生細胞の数のパーセンテージとして表示した。ライトグレーのバーは擬似(mock)(非感染の培地処理)、黒色のバーは野生型、白色のバーはDel H−1PV、ダークグレーのバーはPMut1 H−1PV、グレーの破線のバーはPMut2 H−1PVを示す。(B)1.5×10のNB−324K細胞は、0.5PFU/細胞のMOIでwt H−1PV、Del H−1PV、PMut1 H−1PVまたはPMut2 H−1PVを用いて感染させた。ウイルスは、感染後の指示時点(日)に回収し、プラーク形成単位(PFU)の総量は、プラークアッセイによって決定した。wt H−1PV、Del H−1PV、PMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PVを用いて得られたデータは、グラフにおいて指示したように、黒色またはグレーのレーンによって表示した。 感染NB−324K細胞の核および細胞質内のPFU分布 5×10のNB−324K細胞は、1PFU/細胞のMOIでwt H−1PV(上方および下方パネル)、Del H−1PV(上方および下方パネル)、PMut1 H−1PV(下方パネル)、PMut2 H−1PV(下方パネル)またはPMut4 H−1PV(下方パネル)を用いて感染させた。ウサギ中和ポリクローナル抗体PV1は、二次感染を阻止するために感染2時間後に感染細胞の培地中に加えた。感染細胞の核および細胞質分画の単離は、感染後の指定時点(時間)に実施した。各核(A、C)および細胞質(B、D)分画内のプラーク形成単位(PFU)の総量は、プラークアッセイによって決定した。 Del H−1PVの生活環の一部の過程はwt H−1PVの生活環の一部の過程より高速である NB−324K細胞は、3PFU/細胞のMOIでハイブリッドhH−1PVまたはハイブリッドDel hH−1PVを用いて感染させた。細胞は感染後の指定時点(時間)に固定し、遊離もしくは集合したカプシドタンパク質は一次抗体として3c3F12を用いた免疫蛍光染色法によって検出した。白色(Del hH−1PVについては白丸)で表示した数は、優勢な核染色を示す陽性細胞のパーセンテージを表している。白色矢印は、感染細胞から出てくるビリオンを示している。3c3F12はウイルスカプシドVPタンパク質および全カプシドの両方を認識するマウスモノクローナル抗体、DAPIは4’,6−ジアミジノ−2−フェニルインドール、DNAに結合する蛍光染色を示す。 Del H−1PVはwt H−1PVより低い細胞毒性を示す NB−324K細胞は、様々なMOIで野生型(wt)H−1PVまたはDel H−1PVを用いて感染させた(Bを参照)。感染細胞は感染4時間後に回収し、低密度で新鮮細胞培養皿上に播種した。(A)細胞コロニーの増殖は再播種後数日間追跡し、細胞を固定し、クリスタルバイオレットを用いて染色すると光学顕微鏡によってコロニーが容易に検出された。(B)野生型(wt)H−1PVまたはDel H−1PVを用いた感染後の生存細胞のパーセンテージは、各々グレーまたは黒色のレーンで表示した。 様々な膵臓癌細胞系およびHeLa細胞内でのDel H−1PVの増加したウイルス産生 1×10個のNB−324K、MiaPaCa−2、Panc−1またはHeLa+細胞は、0.5PFU/細胞のMOIでDel H−1PVまたは野生型(wt)H−1PVを用いて感染させた。ウイルスは、感染後の指定時点(日)に回収し、プラーク形成単位(PFU)の総量は、プラークアッセイによって決定した。Del H−1PVおよびwt H−1PVによって産生した感染性粒子の量は、各々レーンおよび黒色ドットまたは黒色四角形を用いて表示した。 Del H−1PVは腫瘍増殖の抑制においてより効率的である(A)4×10のPanc−1細胞は、3RU/細胞のMOIで野生型(wt)H−1PVまたはDel H−1PVを用いて感染させた(RU=複製単位)。細胞は感染4時間後に採取し、5×10個の細胞を続いてBalb/cヌードマウスに注射した。(B)腫瘍サイズは、細胞移植後の83日間測定し、mmで提示した。擬似(mock)処理(すなわち、非感染)、wt H−1PV感染またはDel H−1PV感染Panc−1細胞を受容した動物における腫瘍サイズは、各々ダークグレーのレーンおよび小さな四角形、黒色レーンおよび大きな四角形、またはライトグレーのレーンおよび三角形によって示した。(C)測定値は、290mm超の腫瘍サイズのパーセンテージとして提示した。擬似(mock)処理(すなわち、非感染)、wt H−1PV感染またはDel H−1PV感染Panc−1細胞を受容した動物における腫瘍サイズは、各々ダークグレーのレーンおよび小さな四角形、黒色レーンおよび大きな四角形、またはライトグレーのレーンおよび三角形によって示した。 H−1PV完全ゲノム配列(ヌクレオチドで)ならびにH−1PV NSおよびVPタンパク質配列(アミノ酸で) H−1PVゲノム配列は、Gene Databankアクセッション番号X01457.1:−gi|60993|emb|X01457.1|パルボウイルス(Parvovirus) h−1、完全ゲノム(complete genome)−Rhode S.L.III., Paradiso P.R. “Parvovirus genome : nucleotide sequence of h−1 and mapping of its genes by hybrid-arrested translation”J. Virol. 45:173-184(1983)から検索され、そして、NSコーディング領域内で見いだされた配列の誤りの修正を含み、そして、−Faisst S, Faisst SR, DupressoirT, Plaza S, Pujol A, JauniauxJC, Rhode SL, Rommelaere J. “Isolation of a fully infectious variant of parvovirus H-1 supplanting the standard strain in human cells”J. Virol., 1995, 69:4538-4543. nt a305c NS1 aa T14:silent & NS2 aaT14:silentntc634a NS1 aa P124Q nt g1101a NS1 aa E280Kで更に公表された。これらの修正は、H−1PVヌクレオチドおよびアミノ酸配列内で下線が引かれている。これらの修正はいずれも、本文献に記載されたNS1およびNS2タンパク質配列内のアミノ酸およびアミノ酸の位置に影響を及ぼさない。 H−1PV完全ゲノム配列(ヌクレオチドで)ならびにH−1PV NSおよびVPタンパク質配列(アミノ酸で) H−1PVゲノム配列は、Gene Databankアクセッション番号X01457.1:−gi|60993|emb|X01457.1|パルボウイルス(Parvovirus) h−1、完全ゲノム(complete genome)−Rhode S.L.III., Paradiso P.R. “Parvovirus genome : nucleotide sequence of h−1 and mapping of its genes by hybrid-arrested translation”J. Virol. 45:173-184(1983)から検索され、そして、NSコーディング領域内で見いだされた配列の誤りの修正を含み、そして、−Faisst S, Faisst SR, DupressoirT, Plaza S, Pujol A, JauniauxJC, Rhode SL, Rommelaere J. “Isolation of a fully infectious variant of parvovirus H-1 supplanting the standard strain in human cells”J. Virol., 1995, 69:4538-4543. nt a305c NS1 aa T14:silent & NS2 aaT14:silentntc634a NS1 aa P124Q nt g1101a NS1 aa E280Kで更に公表された。これらの修正は、H−1PVヌクレオチドおよびアミノ酸配列内で下線が引かれている。これらの修正はいずれも、本文献に記載されたNS1およびNS2タンパク質配列内のアミノ酸およびアミノ酸の位置に影響を及ぼさない。 H−1PV完全ゲノム配列(ヌクレオチドで)ならびにH−1PV NSおよびVPタンパク質配列(アミノ酸で) H−1PVゲノム配列は、Gene Databankアクセッション番号X01457.1:−gi|60993|emb|X01457.1|パルボウイルス(Parvovirus) h−1、完全ゲノム(complete genome)−Rhode S.L.III., Paradiso P.R. “Parvovirus genome : nucleotide sequence of h−1 and mapping of its genes by hybrid-arrested translation”J. Virol. 45:173-184(1983)から検索され、そして、NSコーディング領域内で見いだされた配列の誤りの修正を含み、そして、−Faisst S, Faisst SR, DupressoirT, Plaza S, Pujol A, JauniauxJC, Rhode SL, Rommelaere J. “Isolation of a fully infectious variant of parvovirus H-1 supplanting the standard strain in human cells”J. Virol., 1995, 69:4538-4543. nt a305c NS1 aa T14:silent & NS2 aaT14:silentntc634a NS1 aa P124Q nt g1101a NS1 aa E280Kで更に公表された。これらの修正は、H−1PVヌクレオチドおよびアミノ酸配列内で下線が引かれている。これらの修正はいずれも、本文献に記載されたNS1およびNS2タンパク質配列内のアミノ酸およびアミノ酸の位置に影響を及ぼさない。 H−1PV完全ゲノム配列(ヌクレオチドで)ならびにH−1PV NSおよびVPタンパク質配列(アミノ酸で) H−1PVゲノム配列は、Gene Databankアクセッション番号X01457.1:−gi|60993|emb|X01457.1|パルボウイルス(Parvovirus) h−1、完全ゲノム(complete genome)−Rhode S.L.III., Paradiso P.R. “Parvovirus genome : nucleotide sequence of h−1 and mapping of its genes by hybrid-arrested translation”J. Virol. 45:173-184(1983)から検索され、そして、NSコーディング領域内で見いだされた配列の誤りの修正を含み、そして、−Faisst S, Faisst SR, DupressoirT, Plaza S, Pujol A, JauniauxJC, Rhode SL, Rommelaere J. “Isolation of a fully infectious variant of parvovirus H-1 supplanting the standard strain in human cells”J. Virol., 1995, 69:4538-4543. nt a305c NS1 aa T14:silent & NS2 aaT14:silentntc634a NS1 aa P124Q nt g1101a NS1 aa E280Kで更に公表された。これらの修正は、H−1PVヌクレオチドおよびアミノ酸配列内で下線が引かれている。これらの修正はいずれも、本文献に記載されたNS1およびNS2タンパク質配列内のアミノ酸およびアミノ酸の位置に影響を及ぼさない。 H−1PV完全ゲノム配列(ヌクレオチドで)ならびにH−1PV NSおよびVPタンパク質配列(アミノ酸で) H−1PVゲノム配列は、Gene Databankアクセッション番号X01457.1:−gi|60993|emb|X01457.1|パルボウイルス(Parvovirus) h−1、完全ゲノム(complete genome)−Rhode S.L.III., Paradiso P.R. “Parvovirus genome : nucleotide sequence of h−1 and mapping of its genes by hybrid-arrested translation”J. Virol. 45:173-184(1983)から検索され、そして、NSコーディング領域内で見いだされた配列の誤りの修正を含み、そして、−Faisst S, Faisst SR, DupressoirT, Plaza S, Pujol A, JauniauxJC, Rhode SL, Rommelaere J. “Isolation of a fully infectious variant of parvovirus H-1 supplanting the standard strain in human cells”J. Virol., 1995, 69:4538-4543. nt a305c NS1 aa T14:silent & NS2 aaT14:silentntc634a NS1 aa P124Q nt g1101a NS1 aa E280Kで更に公表された。これらの修正は、H−1PVヌクレオチドおよびアミノ酸配列内で下線が引かれている。これらの修正はいずれも、本文献に記載されたNS1およびNS2タンパク質配列内のアミノ酸およびアミノ酸の位置に影響を及ぼさない。 H−1PV完全ゲノム配列(ヌクレオチドで)ならびにH−1PV NSおよびVPタンパク質配列(アミノ酸で) H−1PVゲノム配列は、Gene Databankアクセッション番号X01457.1:−gi|60993|emb|X01457.1|パルボウイルス(Parvovirus) h−1、完全ゲノム(complete genome)−Rhode S.L.III., Paradiso P.R. “Parvovirus genome : nucleotide sequence of h−1 and mapping of its genes by hybrid-arrested translation”J. Virol. 45:173-184(1983)から検索され、そして、NSコーディング領域内で見いだされた配列の誤りの修正を含み、そして、−Faisst S, Faisst SR, DupressoirT, Plaza S, Pujol A, JauniauxJC, Rhode SL, Rommelaere J. “Isolation of a fully infectious variant of parvovirus H-1 supplanting the standard strain in human cells”J. Virol., 1995, 69:4538-4543. nt a305c NS1 aa T14:silent & NS2 aaT14:silentntc634a NS1 aa P124Q nt g1101a NS1 aa E280Kで更に公表された。これらの修正は、H−1PVヌクレオチドおよびアミノ酸配列内で下線が引かれている。これらの修正はいずれも、本文献に記載されたNS1およびNS2タンパク質配列内のアミノ酸およびアミノ酸の位置に影響を及ぼさない。 H−1PV完全ゲノム配列(ヌクレオチドで)ならびにH−1PV NSおよびVPタンパク質配列(アミノ酸で) H−1PVゲノム配列は、Gene Databankアクセッション番号X01457.1:−gi|60993|emb|X01457.1|パルボウイルス(Parvovirus) h−1、完全ゲノム(complete genome)−Rhode S.L.III., Paradiso P.R. “Parvovirus genome : nucleotide sequence of h−1 and mapping of its genes by hybrid-arrested translation”J. Virol. 45:173-184(1983)から検索され、そして、NSコーディング領域内で見いだされた配列の誤りの修正を含み、そして、−Faisst S, Faisst SR, DupressoirT, Plaza S, Pujol A, JauniauxJC, Rhode SL, Rommelaere J. “Isolation of a fully infectious variant of parvovirus H-1 supplanting the standard strain in human cells”J. Virol., 1995, 69:4538-4543. nt a305c NS1 aa T14:silent & NS2 aaT14:silentntc634a NS1 aa P124Q nt g1101a NS1 aa E280Kで更に公表された。これらの修正は、H−1PVヌクレオチドおよびアミノ酸配列内で下線が引かれている。これらの修正はいずれも、本文献に記載されたNS1およびNS2タンパク質配列内のアミノ酸およびアミノ酸の位置に影響を及ぼさない。 H−1PV完全ゲノム配列(ヌクレオチドで)ならびにH−1PV NSおよびVPタンパク質配列(アミノ酸で) H−1PVゲノム配列は、Gene Databankアクセッション番号X01457.1:−gi|60993|emb|X01457.1|パルボウイルス(Parvovirus) h−1、完全ゲノム(complete genome)−Rhode S.L.III., Paradiso P.R. “Parvovirus genome : nucleotide sequence of h−1 and mapping of its genes by hybrid-arrested translation”J. Virol. 45:173-184(1983)から検索され、そして、NSコーディング領域内で見いだされた配列の誤りの修正を含み、そして、−Faisst S, Faisst SR, DupressoirT, Plaza S, Pujol A, JauniauxJC, Rhode SL, Rommelaere J. “Isolation of a fully infectious variant of parvovirus H-1 supplanting the standard strain in human cells”J. Virol., 1995, 69:4538-4543. nt a305c NS1 aa T14:silent & NS2 aaT14:silentntc634a NS1 aa P124Q nt g1101a NS1 aa E280Kで更に公表された。これらの修正は、H−1PVヌクレオチドおよびアミノ酸配列内で下線が引かれている。これらの修正はいずれも、本文献に記載されたNS1およびNS2タンパク質配列内のアミノ酸およびアミノ酸の位置に影響を及ぼさない。 Del H−1PVの腫瘍内注射はwt H−1PVに比較してHeLa細胞由来腫瘍の増殖抑制においてより効果的である 2×10個のHeLa細胞をBalb/cヌードマウスの右側腹部へ皮下注射した。移植9日後、10PFUのDel H−1PVまたはwt H−1PVを腫瘍内へ注射した。腫瘍サイズは、注射42日後までモニタリングした。(A)各群における1,000mm超の腫瘍を持つマウスのパーセンテージ。(B)屠殺することを阻止した3,000mm未満腫瘍を持つマウスのパーセンテージ。 野生型NS2Pタンパク質と比較したDel NS2Pの増加した新規合成および不安定性 8×10個のNB−324K細胞は、最初に低温(すなわち、非放射性)完全培地中で18時間インキュベートし、その後Tran35S標識培地(すなわち、35S標識システインおよびメチオニンアミノ酸を含有する)の存在下において30分パルスでインキュベートした、10PFU/細胞のMOIで野生型(wt)またはDel H−1PVを用いて感染させた。細胞は、直ちに(追跡(チェイス)時点0分)または未標識培地中で追加の20、40、60または240分間のさらなる追跡期間後のいずれかに採取した。タンパク質をRIPA緩衝液中で抽出し、35S−Cys/Met標識NS1もしくはNS2タンパク質中で抽出し、ウサギポリクローナル抗体SP8および抗NS2Pを用いて各々免疫沈降させ、SDS−12%ポリアクリルアミドゲル上での電気泳動法によって分離し、オートラジオグラフィーによって視認した。 Del NS2Pは、依然として核外輸送因子Crm1および14−3−3タンパク質ファミリーのメンバーと相互作用することができる(A)事前に擬似(mock)処理した(φ)、または18時間wt H−1PVもしくはDel H−1PV(MOI=10PFU/細胞)のいずれかを用いて感染させ、Tran35S−Cys/Metを用いて2時間代謝標識したNB−324K細胞の溶解液をSDSの存在下(+)または非存在下(−)で調製し、CRM1(左のパネル)もしくは14−3−3(右のパネル)に対する抗血清を用いて免疫沈降させた。オートラジオグラムは、SDS−12%ポリアクリルアミドゲル電気泳動法による分離後に免疫沈降した物質を示している。野生型(wt)NS2(25kDa)、Del NS2(約18kDa)、CRM1(123kDa)および14−3−3(30kDa)の位置は図の左および/または右側に表示した、αは抗、kDaはキロダルトンでの分子サイズを示す。(B)事前に擬似(mock)処理した(φ)、または18時間wt H−1PVもしくはDel H−1PV(MOI=10PFU/細胞)のいずれかを用いて感染させ、Tran35S−Cys/Metを用いて2時間代謝標識したNB−324K細胞の溶解液をSDSの存在下(+)または非存在下(−)で調製し、NS2Pに向けられたウサギポリクローナル抗血清を用いて免疫沈降させた。オートラジオグラムは、SDS−12%ポリアクリルアミドゲル電気泳動法による分離後に免疫沈降した物質を示している。野生型(wt)NS2(25kDa)およびDel NS2(約18kDa)の位置は図の右側に表示した。αは抗、kDaはキロダルトンでの分子サイズを示す。 Del H−1PVビリオンは、wt H−1PVビリオンよりも熱変性に対して感受性である 精製完全ウイルス粒子を10分間様々な指示温度(PCR装置において生成)に曝露させ、この処理後に入手可能になったウイルスゲノムの量はDNase処理およびアルカリ溶菌後の定量的リアルタイムPCRによって滴定した。ポイントA(すなわち、59.11℃)およびポイントB(すなわち、61.53℃)は、50%のDel H−1PVビリオン(実線)およびwt H−1PVビリオン(破線)が各々破壊された温度を示している。この結果は、2.42℃の温度差を生じさせる。この図に示したデータは、2つの独立実験の平均値を示している。 Del H−1PVを用いた改良された細胞結合および取り込み(A)5×10個のNB−324K細胞は、wt H−1PVまたはDel H−1PVを用いて細胞1個当たり10個のウイルスゲノムの感染多重度で4℃にて1時間感染させた。細胞培養培地を取り除き、細胞は掻爬による細胞収集の前にPBSを用いて洗浄した。膜結合完全粒子の量は、細胞溶解およびDNA精製後の定量的リアルタイムPCRによって決定し、全ウイルス完全粒子の%として表示した。データは、2つの独立実験からの2回の測定値の平均値±標準偏差を表している。***p<0.001。(B)8×10個のNB−324K細胞は、wt H−1PVまたはDel H−1PVを用いて細胞1個当たり10個のウイルスゲノムの感染多重度で感染させ、37℃で0.5時間、1時間、2時間または3時間インキュベートした。細胞培養培地を除去し、膜結合ウイルス粒子はトリプシン/EDTA処理によって分離した。細胞内部のウイルス粒子の量は、細胞溶解およびDNA精製後の定量的リアルタイムPCRによって決定した。データは、3回ずつ実施された1回の代表的実験の平均値を表している。p<0.05、**p<0.01。 感染NB−324K細胞内でのDel H−1PVゲノムの早期の複製および一本鎖DNAの高度の蓄積(A)9×10個のNB−324K細胞は、野生型(wt)H−1PVまたはDel H−1PVを用いて細胞1個当たり6,844個のウイルスゲノムの感染多重度で感染させ、さらに感染後(p.i.)の指定時点での収集される前の二次感染を回避するために中和抗体PV1の存在下でインキュベートした。ウイルスDNA複製型は細胞溶解物から抽出し、1%アガロースゲル電気泳動法によって分離し、サザンブロット分析にかけた。ウイルス複製中間体は、NS1特異的32P−放射標識プローブおよびオートラジオグラフィーを用いたハイブリダイゼーションを通して解明された。二量体複製型(dRF)、単量体複製型(mRF)および一本鎖(ss)ゲノムの位置は、図の右側に指示した。(B)Del H−1PVまたはwt H−1PV感染サンプルにおいて検出された単量体複製型(mRF)、二量体複製型(dRF)および一本鎖(ss)DNAに対応するシグナル強度は、Phospho Imager分析によって定量した。シグナル強度は、感染9時間、12時間、16時間および24時間後のwt H−1PVに比したmRF、dRFおよびss DNAのDel H−1PVの比率として表示した。 Del H−1PVまたはwt H−1PVのいずれかを用いたNB−324K細胞のトランスフェクション後、複製型の蓄積に差は見られない 2×10個のNB−324K細胞は、6μgのpwtH−1PVまたはpDelH−1PVプラスミド構築体を用いてトランスフェクトし、二次感染を防止するためにトランスフェクション4時間後に細胞培養培地中へ中和抗体PV1を加えた(+PV1)。細胞をトランスフェクション後(p.t.)の指定時点に収集し、ウイルスDNA分子を細胞溶解物から抽出し、Dpnl消化にかけ、32P標識したNS1−コーディング領域特異的プローブを用いたサザンブロット法によって分析し、オートラジオグラフィーによって検出した。mRFは単量体複製型、dRFは二量体複製型を示す。 wt H−1PV完全ビリオンの遊離に比較したトランスフェクトNB−324K細胞の培地中でのDel H−1PV完全ビリオンの増加した、および/またはより迅速な遊離 2×10個のNB−324K細胞は、6μgのpwtH−1PVまたはpDelH−1PVプラスミド構築体を用いてトランスフェクトし、さらに中和抗体PV1の存在下(+PV1)または非存在下(−PV1)でさらにインキュベートした。細胞培養上清は、トランスフェクション後(p.t.)の指定時点に回収した。一本鎖DNA分子(ssDNA)はトランスフェクト細胞培養の上清からHirt抽出によって単離し、NS1特異的32P−放射標識プローブおよびオートラジオグラフィーを用いたハイブリダイゼーションを通してサザンブロット法によって分析した。さらに、完全ウイルス粒子およびトランスフェクション72時間後にトランスフェクトされたNB−324K細胞の上清中に存在する感染性ウイルス粒子の量は、DNase処理およびアルカリ溶菌後のウイルスゲノム(vg)の量を前者の場合には定量的リアルタイムPCRによっておよび後者の場合にはプラーク形成単位(PFU)の量をプラークアッセイによって測定し分析した。 wt H−1PVおよび野生型hH−1PVに比較したヒト293T細胞のトランスフェクションによって生成されるDel H−1PVおよびDel hH−1PVの増加した感染性 トランスフェクトヒト293 T細胞内で生成した新規に作製されたDel H−1PV、Del hH−1PV、wt H−1PVおよび野生型hH−1PVウイルスストックは、ストックの感染力価(PFU/mLで提示)を決定するためのプラークアッセイおよびウイルスゲノム力価(vg/mLで提示)を決定するための定量的リアルタイムPCRによって分析した。P/I比は粒子対感染性比を示す。
そこで本発明は、以下の発明を提供する。
1.野生型パルボウイルスと比較して高い抗腫瘍能力を示すパルボウイルス変異体であって、前記変異体は、(a)NS−2のLys96位および/またはNS−2のLeu103位でのアミノ酸置換、欠失もしくは付加、または(b)NS2タンパク質配列の中央部分およびNS1タンパク質配列のC末端部分の両方に影響を及ぼすパルボウイルスゲノムの左側部分におけるインフレーム欠失を特徴とするパルボウイルス変異体。
2.アミノ酸置換を特徴とする上記1.の(a)または1.の(b)に記載のパルボウイルス変異体であって、前記欠失は、アミノ酸587〜624の欠失を有するNS1タンパク質およびアミノ酸96〜133の欠失を有するNS2タンパク質の翻訳を結果として生じさせるヌクレオチド2022〜2135であるパルボウイルス変異体。
3.NS−2の96位でのLysは親水性極性アミノ酸によって置換される、および/またはNS−2の103位でのLeuは中性非極性アミノ酸によって置換される、上記2.のパルボウイルス変異体。
4.NS−2のアミノ酸置換Lys96Gluおよび/またはLeu103Proを含む、上記3.のパルボウイルス変異体。
5.以下の置換、
(a)NS2のLys96Glu、または、
(b)NS2のLeu103ProおよびNS1のTyr595Hisを含む、上記4.のパルボウイルス変異体。
6.パルボウイルスH−1(H−1PV)由来または関連齧歯類パルボウイルス由来である、上記1.〜5.のいずれかのパルボウイルス変異体。
7.前記関連齧歯類パルボウイルスは、LuIII、マウス微小ウイルス(MMV)、マウスパルボウイルス(MPV)、マウスの微小ウイルス(MVM)、ラット微小ウイルス(RMV)、ラットパルボウイルス(RPV)、ラットウイルス(RV)またはキルハムラットウイルス(KRV)である、上記6.のパルボウイルス変異体。
8.上記1.〜7.のいずれかのパルボウイルス変異体をコードするDNA。
9.上記8.のDNAを含む発現ベクター。
10.上記9.の発現ベクターを含む宿主細胞。
11.上記10.の形質転換体を適切な条件下で培養する工程を含む、上記1.〜7.のいずれかのパルボウイルス変異体を生成する方法。
12.変異体NS−1またはNS−2タンパク質にのみ結合して野生型NS−1またはNS−2タンパク質には結合しないことをさらに特徴とする、上記1.〜7.のいずれかのパルボウイルス変異体に対する抗体。
13.(a)上記1.〜7.のいずれかのパルボウイルス変異体、
(b)上記8.のDNA、
(c)上記12.の抗体、および/または場合により、
(d)従来型補助物質、例えば溶媒、緩衝液、担体、マーカーおよびコントロールを含むキットであって、
このとき成分(a)〜(d)の内で、1つ以上の代表的な成分が各々存在してよいキット。
14.(a)上記1.〜7.のいずれかのパルボウイルス、上記8.のDNA、上記9.の発現ベクター、上記10.の形質転換体または上記12.の抗体および(b)薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
15.癌を治療するための医薬組成物を製造するための上記1.〜7.のいずれかのパルボウイルス、上記8.のDNA、上記9.の発現ベクター、上記10.の形質転換体または上記12.の抗体の使用。
16.癌を治療する方法において使用するための上記1.〜7.のいずれかのパルボウイルス、上記8.のDNA、上記9.の発現ベクター、上記10.の形質転換体または上記12.の抗体。
17.前記癌は、膵臓癌、子宮頸癌、肝臓癌またはリンパ腫である、上記15.または16.の使用。
野生型パルボウイルスと比較して高い抗腫瘍能力を示すパルボウイルス変異体であって、前記変異体が、(a)NS2のLys96位および/またはNS2のLeu103位(後者はNS1のTyr595位でのアミノ酸置換も誘導する)に対応する位置でのアミノ酸置換、欠失もしくは付加、好ましくは置換、または(b)NS2タンパク質配列の中央部分およびNS1タンパク質配列のC末端部分の両方に影響を及ぼすH−1PVゲノムの左側部分におけるインフレーム欠失を特徴とするパルボウイルス変異体を提供する。
上記に記載したアミノ酸の位置は参照ポイント点としてのH−1PVと関連しているが、当業者であればNS1/NS2タンパク質のホモロジーに基づいていずれかのパルボウイルス内の対応するアミノ酸位置を容易に決定することができる。好ましくは、この欠失は、少なくとも1個、好ましくは少なくとも10個、より好ましくは少なくとも20個および一層より好ましくは少なくとも30個のアミノ酸の長さを有する。好ましくは、前記欠失は、連続アミノ酸の欠失である、および/または(野生型に比較した)また別の変異は存在しない。特に好ましいのは、587〜624の欠失を有するNS1タンパク質およびアミノ酸96〜133の欠失を有するNS2タンパク質(例、Del H−1PV)を結果として生じさせるヌクレオチド2022〜2135のフレーム内欠失である。
用語「野生型パルボウイルスと比較して高い抗腫瘍能力を示す」は、感染1日後のNB−324K細胞の増殖阻害が野生型と比較して少なくとも1.4倍、好ましくは少なくとも1.7倍、より好ましくは少なくとも2倍高いことを意味する。
本明細書で使用する用語「パルボウイルス」は、野生型もしくはそれらの改変された複製能力のある誘導体ならびにそのようなウイルスもしくは誘導体をベースとする関連ウイルスもしくはベクターを含んでいる。適切なパルボウイルス、誘導体等ならびに前記パルボウイルスを生成するために使用可能な細胞は、無用な実験努力をせずに、本明細書の開示に基づけば当業者であれば容易に決定することができる。語句「パルボウイルス」は、任意のパルボウイルス、特に齧歯類パルボウイルス、例えばマウスの微小ウイルス(MVM)およびH−1ウイルス(H−1PV)を含んでいる。当業者であればNS2のLys96位および/またはNS2のLeu103位でのアミノ酸変化(後者の場合にはNS1のTyr595位でのアミノ酸変化とともに)またはNS2タンパク質配列の96〜133位およびNS1タンパク質の587から624位の両方での大きな欠失をパルボウイルスの構造タンパク質および非構造タンパク質の公知の核酸配列およびアミノ酸配列、例えばパルボウイルスH−1PVから出発する標準方法にしたがって導入することができる(図11および[17]、さらに配列修正については[13]および[18]も参照されたい)。当業者であれば、さらに特定の変異体が列挙した所望の生物学的特性を示すか、以下の実施例で説明するアッセイを使用して、例えば哺乳動物細胞、例えばNB−324K細胞の感染性または増殖阻害の野生型に比較した増加を比較することによって容易にアッセイすることができる。
好ましいのはアミノ酸置換である上述した部位の1つ以上の部位での点突然変異または上述した部位でのウイルスNS1およびNS2両方のタンパク質配列におけるアミノ酸の大きな欠失のいずれかを有するパルボウイルス変異体である。
本発明のより好ましい実施形態では、NS2の96位のLysはまた別の親水性極性アミノ酸(例、Arg、Glu、Asp、GinまたはAsn)で置換される、および/またはNS2の103位のLeuは天然非極性アミノ酸(例、ProまたはGly)によって置換され、後者は天然極性アミノ酸(例、Ser、HisまたはThr)によるNS1の595位のTyrの置換を誘導する。
本発明の一層より好ましい実施形態では、本パルボウイルス変異体は、(a)以下のアミノ酸置換NS2、Lys96GluまたはNS2、Leu103Pro(後者は置換NS1、Tyr595Hisも誘導する)、または(b)以下のアミノ酸欠失NS2、Δ96〜133およびNS1、Δ587〜624を含んでいる。
特に好ましいのは、以下の修飾、
(a)NS2 Lys96Gluの置換(PMut2 H−1PV変異体)、
(b)NS2 Leu103ProおよびNS1 Tyr595Hisの置換(PMut1 H−1PV変異体)、または
(c)NS2 アミノ酸96〜133およびNS1 アミノ酸587〜624の欠失(Del H−1PV変異体)を有するパルボウイルス変異体である。
好ましくは、本発明のパルボウイルスは、パルボウイルスH−1(H−1PV)由来または関連齧歯類パルボウイルスに由来する。好ましい関連齧歯類パルボウイルスの例としては、LuIII、マウス微小ウイルス(MMV)、マウスパルボウイルス(MPV)、マウスの微小ウイルス(MVM)、ラット微小ウイルス(RMV)、ラットパルボウイルス(RPV)、ラットウイルス(RV)またはキルハムラム(Kilham)ラットウイルス(KRV)が挙げられる。
本発明のまた別の主題は、核酸、特に上述のパルボウイルス変異体をコードするDNAに関する。
本発明によるDNAは、各々ベクターおよび発現ベクター内に存在する可能性がある。当業者であれば、それらの例に習熟している。E.coli(大腸菌)のための発現ベクターの場合には、例えばpGEMEX、pUC誘導体、pGEX−2T、pET3b、T7をベースとする発現ベクターおよびpQE−8である。酵母内での発現のためには、例えばpY100およびYcpad1が挙げられ、動物細胞内の発現のためには、例えばpCMV、pCI、pKCR、pEFBOS、cDM8、pMSCNDおよびpCEV4を指定しなければならない。バキュロウイルス発現ベクターpAcSGHisNT−Aは、昆虫細胞内の発現のために特に適合する。
好ましい実施形態では、本発明によるDNAを含有するベクターは、ウイルス、例えばアデノウイルス、ワクシニアウイルス、AAVウイルスまたはパルボウイルス、例えばMVMまたはH−1PVであるが、パルボウイルスが好ましい。このベクターは、さらにまたレトロウイルス、例えばMoMULV、MoMuLV、HaMuSV、MuMTV、RSVまたはGaLVであってよい。
本発明によるDNAを含有する発現ベクターを構築するためには、当分野において公知の一般的方法を使用することができる。これらの方法には、例えば、in vitro組換え技術、合成法およびin vivo組換え法が含まれる。
さらに、本発明は、上述したベクターを含有する宿主細胞に関する。これらの宿主細胞には、細菌、酵母、昆虫および動物細胞、好ましくは哺乳動物細胞が含まれる。E.coli菌株HB101、DH1、x1776、JM101、JM109、BL21、XL1Blue、SG13009およびSure(登録商標)、後者は完全パルボウイルスゲノムをベースとするベクターのために好ましく、酵母菌株サッカロミセス・セレビジエ(Saccharomyces cerevisiae)および動物細胞L、A9、3T3、FM3A、CHO、COS、Vero、HeLa、293TおよびNB−324K、後者2つはH−1PVベクターのために好ましく、昆虫細胞sf9が好ましい。これらの宿主細胞を形質転換させる方法、形質転換体を表現型に関して選択する方法および上述したベクターを使用することによって本発明によるDNAを発現させる方法は、当分野において公知である。
そこで、本発明は、本発明のパルボウイルス変異体を生成する方法であって、本発明の形質転換体を適切な条件下で培養する工程および細胞または培養物からパルボウイルス変異体を収集する工程を含む方法も提供する。
さらに、本発明は、上述したパルボウイルス変異体NS1もしくはNS2タンパク質、すなわち野生型に比較して高い抗腫瘍能力の原因となる変異が所在する該パルボウイルス変異体タンパク質の領域、を特異的に認識する抗体に関する。抗体は、モノクローナル、ポリクローナルもしくは合成抗体またはそれらのフラグメント、例えばFab、FvまたはscFVフラグメントであってよい。好ましくは、モノクローナル抗体に関する。産生のためには、動物、特にポリクローナル抗体のためにはウサギもしくはヤギおよびモノクローナル抗体のためにはマウスを上述したパルボウイルス変異体の非構造タンパク質またはそれらのフラグメントで免疫することが好ましい。動物のまた別の追加免疫は、同一パルボウイルス変異体の非構造タンパク質またはそれらのフラグメントを用いて実施することができる。ポリクローナル抗体は、次に動物血清から入手し、さらに精製することができる。モノクローナル抗体は、標準方法にしたがって得られるが、特にKohler and Milstein[19−Nature 256(1975), 495]およびGalfre and Milstein[20−Meth. Enzymol. 73(1981), 3]による方法を参照されたい。この場合には、マウス骨髄腫細胞が免疫された動物に由来する脾臓細胞と融合される。本発明による抗体は、多数の方法で、例えば上述したパルボウイルス変異体から発現した変異体非構造タンパク質を免疫沈降させるため、またはそれらを単離するために使用することができる。これらの抗体は、イムノアッセイにおいて液相内に、または固体担体へ結合させることができる。これに関連して、抗体は、様々な方法で標識することができる。当業者であれば、適切なマーカーおよび標識法に習熟している。イムノアッセイの例として、ELISA、RIAならびに(共)免疫沈降法、免疫蛍光法およびイムノブロッティング法が挙げられる。
そこで、本発明は、治療(および診断)目的のために適合する生成物を提供する。特に、本発明による発現ベクター、例えばパルボウイルスは、遺伝子治療手段のために使用することができる。さらに、本発明によるパルボウイルス変異体は、例えば腫瘍疾患を治療するための毒素として適当である。
このため、本発明の適用のためのキットも提供される。このキットは、以下、
(a)本発明によるパルボウイルス変異体、
(b)本発明によるDNA、例えば発現ベクター、特にパルボウイルス、
(c)本発明による抗体、ならびに
(d)従来型補助物質、例えば溶媒、緩衝液、担体、マーカーおよびコントロールを含んでいる。
成分(a)〜(d)の内で、1つ以上の代表的な成分が各々存在してよい。
本発明は、さらに本発明のパルボウイルス変異体、前記パルボウイルス変異体を産生するベクターもしくは細胞(「パルボ治療薬」もしくは「パルボ治療用組成物」)、例えばヒト293(T)、ヒトNB−324KまたはラットRG2細胞を含有する医薬組成物を提供する。
投与するために、本パルボ治療薬は、適切な医薬担体と結合することができる。当分野において周知のタイプおよび市販の容易に入手可能な適切な医薬担体には、リン酸緩衝食塩(PBS)液、水、エマルジョン、例えば油/水型エマルジョン、様々なタイプの湿潤剤、造影剤(例、Visipaque)、無菌溶液などが含まれる。そのような担体は、適切な用量で被験者に投与するための従来型調製方法によってパルボ治療薬とともに調製することができる。
追加の医薬上適合する担体は、ゲル、生体吸収性マトリックス材料、該治療薬を含有する移植成分または任意の他の適切な媒体(vehicle)、送達もしくは分注手段もしくは物質を含むことができる。
本発明のパルボ治療薬によって治療可能な患者には、ヒトならびに非ヒト動物が含まれる。後者の例には、制限なく、動物、例えばウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、イヌおよびネコが含まれる。
パルボ治療用医薬組成物の患者、例えば脳腫瘍患者への投与は、数多くの適切な方法のいずれか、例えば静脈内、腹腔内、皮下、筋肉内、局所、皮内、頭蓋内および腫瘍内投与によって実行することができる。投与経路は、当然ながら、疾患の性質および該医薬組成物中に含有された特定の治療薬に左右される。
そのようなパルボ治療薬が血液脳関門を通って進入する能力を備える感染性ウイルス粒子を含む場合、治療は、該ウイルス治療薬、例えばH−1PV変異体の静脈内注射によって実施できる、または少なくとも開始できる。
長期静脈内治療はウイルス治療薬に対する中和抗体が形成されるために非効率になり易いので、静脈内ウイルス投与の初期投与計画後に様々な投与様式を採用することができる、またはそのような様々な投与技術、例えば頭蓋内もしくは腫瘍内ウイルス投与を、パルボウイルス治療の全経過を通して代替的に使用することができる。
また別の特殊な投与技術として、パルボ治療薬(ウイルス、ベクターおよび/または細胞剤)は、患者に移植された起源から該患者に投与することができる。例えば、シリコーンもしくは他の生体適合性材料製のカテーテルを、それ以上の外科的介入を行わずに様々な時点に該パルボ治療用組成物を局所的に注射することを可能にするために腫瘍除去中もしくは別個の手技によって該患者内に設置された小さな皮下リザーバー(Rickhamリザーバー)に接続することができる。パルボウイルス変異体もしくはパルボウイルス由来ベクターは、定位固定外科技術または神経ナビゲーションターゲティング技術によって例えば腫瘍内に注射することもできる。
パルボウイルス剤もしくは組成物の投与は、移植されたカテーテルを通して低流量でウイルス粒子もしくはウイルス粒子を含有する流体の、適切なポンプシステム、例えば蠕動式注入ポンプまたは対流強化送達(CED)ポンプを使用した連続注入によって実施することもできる。
パルボ治療用組成物のさらにまた別の投与方法は、所望の場所、例えば腫瘍へ該パルボ治療薬を分注するために構築および配置された移植器具からである。例えば、パルボ治療用組成物、例えばパルボウイルスH−1変異体が含浸されたウエハーを使用することができるが、このとき該ウエハーを外科的腫瘍切除の終了時に切除腔の辺縁に付着させる。そのような治療的介入において複数のウエハーを使用することができる。
パルボ治療薬を能動的に生成する細胞、例えばパルボウイルスH−1PV変異体またはH−1PVベクターは、所望の組織、例えば腫瘍内へ、または腫瘍切除後の腫瘍腔内へ注射することができる。
上述した投与様式の2つ以上の組み合わせは、任意の適切な方法、例えば同時に、同時期に、または連続的に使用することができる。
パルボ治療薬の投与レジメンは、当分野の技術の範囲内で、患者データ、観察所見および他の臨床因子、例えば患者のサイズ、体表面積、年齢、性別および投与される特定ウイルス、ベクター、細胞など、投与の時間および経路、疾患のタイプ、例えば腫瘍のタイプおよび特性、患者の一般的健康状態ならびに該患者が受ける他の薬物もしくは療法に基づいて担当医が容易に決定することができる。
したがって、本発明は、癌を治療するための医薬組成物を調製するための本発明によるパルボウイルス変異体、前記パルボウイルス変異体を産生する細胞、本発明のDNA、発現ベクターまたは抗体の使用にさらに関する。好ましい癌は、本発明の薬剤を用いた治療に特に影響を受け易いと期待される膵臓癌、子宮頸癌、肝細胞癌およびリンパ腫である。
以下の実施例では、本発明をより詳細に説明する。
材料および方法
(A)細胞および試薬
サルウイルス40−形質転換ヒト新生児腎臓NB−324K細胞[21]は、5%ウシ胎仔血清、グルタミンおよび抗生物質(100μg/mLのペニシリンおよび100U/mLのストレプトマイシン、Gibco/Invitrogen社、独国カールスルーエ)を補給したイーグル最小必須培地(Sigma−Aldrich社)中で増殖させた。
ヒトPDAC細胞系Panc−1およびMiaPaCa−2(原発腫瘍から樹立)は、A.Vecchi氏(Instituto Clinico Humanitas社、イタリア国ロッツァーノ)の厚意により提供された。ヒトHeLa+細胞系は、E.Schwarz氏(German Cancer Research Center、独国ハイデルベルク)の厚意により提供された。Panc−1、MiaPaCa−2およびHeLa+細胞は、10%ウシ胎仔血清(PAA Laboratories社、オーストリア国パッシング)および2mMのL−グルタミン(Gibco/Invitrogen社)を補給したダルベッコの変法イーグル培地(DMEM、Sigma−Aldrich社、独国タウフキルヒェン)中で増殖させた。
SV40 T抗原−、Ad5−形質転換ヒト胚腎臓293T細胞系[28]は、10%のFCS、2mMのL−グルタミン、100U/mLのペニシリンおよび100μg/mLのストレプトマイシンを補給したダルベッコの変法イーグル培地(DMEM、Sigma社)中で培養した。
(B)ウイルスの注射および産生
ウイルス感染は、37℃で1時間、補給物を含まない細胞培養培地中でプレートを定期的に揺動させながら希釈した精製ウイルスの6cmの細胞培養皿(Sarstedt社、独国ニュルンブレヒト)1枚当たり400μLの接種菌を用いて実施した。
Del H−1PVおよびPMut H−1PV変異体は、最初に適切なプラスミド構築体を使用して、以前に説明された293T細胞のトランスフェクション[18]によって生成した。H−1PV変異体ならびにwt H−1PVは、続いて低い感染多重度(MOI)、すなわち10−3PFU/細胞でNB−324K細胞の感染によって生成した。感染3日後または細胞変性作用の出現後に細胞を採取し、3回の冷凍−解凍サイクルによってVTE緩衝液(50mMのTris(pH8.7)、0.5mMのEDTA)中に溶解させた。細胞破壊片を遠心分離によって除去し、ウイルスストックはイオジキサノールステップ勾配遠心分離によって精製した[22]。
子孫ウイルス産生を測定するために、1×10個の細胞を0.5PFU/細胞のMOIでH−1PV変異体もしくはwt H−1PVを用いて感染させた。感染後の様々な時点に培地を採取し、感染した培養を収集し、VTE緩衝液中で3回の冷凍−解凍サイクルにかけた。ウイルス力価は、プラークアッセイによって細胞抽出物および培養培地の両方について決定した。
(C)感染性ウイルスの滴定
ウイルスストックは、NB−324K指標細胞上でプラークアッセイ[23]または感染細胞ハイブリダイゼーションアッセイ[24]によって滴定した。ウイルス力価は、他のどこかで記載された[18,23,25]ウイルス懸濁液1ミリリットル(mL)当たりのプラーク形成単位(PFU)または複製単位(RU)として表示した。
(D)完全ウイルス粒子の滴定
ウイルスストック内に存在する完全ウイルス粒子の量は、以前に記載された定量的ドットブロットハイブリダイゼーションアッセイ[26]によって決定し、ウイルス懸濁液1ミリリットル当たりの完全ウイルス粒子数として表示した。
(E)増殖阻害の測定
感染NB−324K細胞の増殖動態は、Casy細胞計数システム(Casy社、独国ロイトリンゲン)を使用して電子パルス面積分析法によって監視した。
(F)イムノブロッティング法
1.5×10個のNB−324K細胞は、3PFU/細胞のMOIでDel H−1PV、PMut1 H−1PV、PMut2 H−1PVまたはwt H−1PVを用いて感染させた。細胞は、感染6、8、24および48時間後に収集し、プロテアーゼ阻害剤(Roche社、独国)を補給したRIPA緩衝液(150mMのNaCl、10mMのTris(pH7.5)、1mMのEDTA(pH8.0)、1%のNP−40、0.5%のデオキシコール酸ナトリウム、0.1%のSDS)中に溶解させた。タンパク質の定量(Bio−Radタンパク質アッセイ、Bio−Rad Laboratories社、独国ミュンヘン)後、10μgの全タンパク質をSDS 12%−ポリアクリルアミドゲル電気泳動法(SDS−PAGE)によって分離し、Protranニトロセルロース膜(PerkinElmer Life Sciences社、独国イーバーリンゲン)へ電気移送した。この膜は、最初にNS1(SP8、[27])、NS2(α−NS2p、[18])もしくはウイルスカプシドタンパク質(α−VPpep、[25])に向けられたウサギポリクローナル抗血清のいずれかと、次に適切な二次ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合抗体(Promega社、独国マンハイム)とインキュベートした。免疫反応性タンパク質は、さらに強化化学発光法(GE Healthcare Europe社、独国フライブルク)によって解明した。
(G)感染培養細胞からの核および細胞質タンパク質分画
5×10個のNB−324K細胞は、1PFU/細胞のMOIでDel H−1PV、PMut1 H−1PV、PMut2 H−1PV、PMut4 H−1PVもしくはwt H−1PVを用いて感染させた。感染16、20、24および42時間後に細胞を採取し、核および細胞質タンパク質分画をNE−PER核および細胞質抽出試薬キット(Thermo Fisher Scientific社、米国ロックフォード)を製造業者の取扱説明書にしたがって使用し実施した。各分画中に存在する感染性粒子の数をプラークアッセイによって決定し、全PFUとして表示した。
(H)細胞クローン形成能の測定
NB−324K細胞は、様々なMOIでwt H−1PVまたはDel H−1PVを用いて感染させた。4時間後、感染細胞をトリプシン処理によって採取し、6cm細胞培養皿上に単一細胞として、すなわち培養皿1枚当たり細胞100〜200個で再播種した。2.5%の抗H−1カプシド血清PV1を含有する完全培地中での培養13〜17日後に、細胞を固定し、クリスタルバイオレット溶液(100mLの70% EtOH中に希釈させた1gのクリスタルバイオレット)を用いて染色した。細胞コロニー数を計数し、各MOIについて擬似(mock)処理細胞と比較した生存細胞のパーセンテージとして表示した。
(I)免疫蛍光法
1.5×10個のNB−324K細胞は、カバースリップ(診断用顕微鏡スライド、Erie Scientific社、米国ポーツマス)上で増殖させ、Del H−1PVまたはwt H−1PVを用いて3PFU/細胞のMOIで感染させた。感染の15および21時間後に、細胞を3.7%ホルムアルデヒド中で10分間固定し、低温メタノールを用いて5分間、低温アセトンを用いて2分間処理し、10分間0.2%のTriton X−100([4−(1,1,3,3−テトラメチルブチル)フェノール]エトキシレート)を用いて透過化した。PBSを用いて洗浄した後、細胞は約30分間10%ウシ胎仔血清を含有するブロッキング溶液を用いて処理した。細胞は、連続的に一次抗体としてのマウスモノクローナル抗体3C3F12(1:100の希釈率)(C.Dinsart、未公表)および二次抗体としてのロバ抗マウスalexa fluor 488結合抗体(1:600の希釈率、Santa Cruz Biotechnology社、米国オレゴン州ユージーン)とともに各々室温で1時間インキュベートし、続いてリン酸緩衝食塩液により3回洗浄した。全ての溶液および希釈液は、リン酸緩衝食塩液中で調製した。DAPI(4’,6−ジアミジノ−2−フェニルインドール)を用いたDNAの高速染色後、カバースリップをエタノールを用いて乾燥させ、ポリビニルアルコール(Elvanol、Serva社、独国ハイデルベルク)の存在下でスライドガラス上に載せた。サンプルをLeica DMRBE顕微鏡を用いて63倍の倍率で油浸対物レンズを用いて試験し、画像をHamamatsu Orcaデジタルカメラを用いて記録し、Openlab2(Improvision社、英国)およびAdobe Photoshop CS2ソフトウエアを使用して処理した。所定の表現型のパーセンテージを決定するために、1表現型当たり200個の細胞を試験した。
(J)腫瘍抑制のin vivo測定
4×10個のPanC−1細胞は、3RU/細胞のMOIでDel H−1PVまたはwt H−1PVのいずれかを用いてin vitroで感染させた。感染4時間後に、マウス1匹当たり5×10個の細胞をBalb/cヌードマウスの右側腹部へ皮下(s.c.)注射した。7匹のヌードマウスに擬似(mock)処理(つまり、緩衝液処理)細胞を注射し、7匹のヌードマウスにwt H−1PV感染細胞を注射し、他方6匹のヌードマウスにはDel H−1PV感染細胞を注射した。
マウス(6〜7週齢の雌、1ケージ当たり5匹)は21〜24℃、40〜60%の湿度に設定した騒音絶縁室内で維持した。腫瘍サイズは、カリパスを用いて約3カ月間の期間にわたり週2〜3回測定した。腫瘍容積は、式V=1/2×長さ×(幅)にしたがって計算し、総容積(mm)の平均値または290mm超の腫瘍を有する1群のマウスのパーセンテージのいずれかで表示した。
2×10個のHeLa細胞をBalb/cヌードマウスの右側腹部へ皮下注射した。移植9日後に、5匹のヌードマウスに各々100μLのPBSを注射し、5匹のヌードマウスに各10PFUのDel H−1PV(100μLのPBS中)を注射し、5匹のヌードマウスに各々10PFUのwt H−1PV(100μLのPBS中)を注射した。
マウス(6〜7週齢の雌、1ケージ当たり5匹)は21〜24℃、40〜60%の湿度に設定した騒音絶縁室内で維持した。腫瘍サイズは、カリパスを用いて約6週間の期間にわたり週2〜3回測定した。腫瘍容積は、式V=1/2×長さ×幅にしたがって計算し、総容積(mm)の平均値または1,000mm超の腫瘍を有する1群のマウスのパーセンテージのいずれかで表示した。
(K)パルス・チェイス代謝放射標識および細胞抽出物
9×10個のNB−324K細胞は、3PFU/細胞のMOIでDel H−1PVもしくはwt H−1PVまたは擬似(mock)処理(すなわち、緩衝液処理)のいずれかを用いて感染させた。感染18時間後、培養を30分間に、5%透析ウシ胎仔血清、1%のL−グルタミンおよび1%ゲンタマイシンを補給したMetおよびCys非含有ダルベッコ変法イーグル培地(DMEM)中の200μCiのTran35S標識(1,175Ci/mmol、MP Biomedicals社)を用いて代謝標識した。その後、標識培地を吸引し、細胞は血清非含有MEMを用いて1回洗浄した。細胞は続いて溶解させた、または37℃の未標識完全培地(チェイス)中で再インキュベートし、その後、標識合成タンパク質の分解を調査するためにインキュベーション後の様々な時点に溶解させた。溶解は、プロテイナーゼ阻害剤の混合物(Complete、ロッシュ社、独国マンハイム)を補給したRIPA緩衝液(150mMのNaCl、10mMのTris[pH7.5]、1mMのEDTA[pH8.0]、1%(v/v)のNonidet P−40、0.5%のデオキシコール酸ナトリウム、0.1%(w/v)のドデシル硫酸ナトリウム(SDS))を使用して実施した。タンパク質は、4℃にて10分間全速力でエッペンドルフ遠心管中での遠心分離によって細胞破壊片を除去した後に採取した。
(L)細胞およびウイルスタンパク質の(共)免疫沈降法
5×10cpmの標識タンパク質抽出物は、4℃で1時間連続回転下(Reax 2、Heidolph社)のH−1PV NS1、H−1PV NS2、ヒトCRM1もしくは14−3−3タンパク質のいずれかに向けられた8〜10μLのウサギポリクローナル抗血清の存在下でインキュベートし、さらに100μLのプロテインAセファロース(6MB、GE Healthcare社)を各サンプルに加えた後に4℃で1時間インキュベートした。サンプルは、5分間5,500rpmおよび4℃で遠心した(Sigma 2K15)。タンパク質−抗体−ビーズ複合体は、次に各1mLのRIPA(+/−SDS)緩衝液を用いて3回洗浄した。サンプルペレットを適切な量の2×SDSローディング色素(80〜100μL)中に再懸濁させ、タンパク質を12%(w/v)ポリアクリルアミドゲル電気泳動法によって分離した。Amplify(Amersham社)を用いた30分間のインキュベーション後、ゲルを乾燥させ、さらにオートラジオグラフィーフィルム(BioMaxm、MS Film、Kodak社)に露光させた。
(M)ウイルスの熱変性および定量的リアルタイムPCRによるパッケージ化ウイルスDNAの検出
精製Del H−1PVもしくは精製wt H−1PVいずれかの10個の完全ウイルス粒子を含有するDNAse−緩衝液希釈液(400mMのTris−HCl[pH8.0]、100mMのMgSO、10mMのCaCl、Promega社、独国マンハイム)を10分間既定温度(PCR装置を用いて発生させた50〜70℃の範囲内の温度)へ加熱した。サンプルは、続いて37℃で1時間DNAseI[0.1U/μL、Promega社、独国マンハイム]を用いて処理した。無傷カプシドの数を決定できるように、ウイルス粒子はアルカリ溶菌によって崩壊させ、パッケージ化ウイルスDNAを他の場所で記載されたように[29]Mastercycler(登録商標)ep realplex(Eppendorf社、独国ハンブルク)を使用して定量的リアルタイムPCRによって検出した。個々の反応混合物(20μL)は、1×TaqMan Universal PCR Master MixTM(Applied Biosystems社)、0.28μMの標識NS1−TagManTMプローブ、0.28μMの各フォワードプライマーおよびリバースプライマーならびに2.85μLのテンプレートを含有していた。ウイルス力価は、ウイルス懸濁液1mL当たりのウイルスゲノム(vg/mL)として表示し、以下の式にしたがって計算した。
ウイルス力価[vg/mL]=I[1/mL].35000
因数35000=[46.7μL/(6.7μL×20μL)]×(100μL/10μL)×1000μL
IQはサンプルの定量蛍光強度を意味し、因数35000は1ウエル当たり(46.7μL/(6.7μL×20μL)、アルカリ溶菌(1000μL/10μL)のために使用されるウイルス懸濁液10μL当たりおよび1mLのウイルスストック液当たりのウイルス力価を表示するための1mL(1000μL)当たりの量を計算するために必要とされる。
(N)ヒトNB−324K細胞へのウイルスの結合
5×10個のヒトNB−324K細胞は、104vg/細胞のMOIでwt H−1PVまたはDel H−1PVを用いて感染させ、さらに1時間4℃でインキュベートした。細胞は、氷温1×PBSを用いて洗浄し、500μLの1×PBS中で剥離させ、4℃で5分間3,500rpmで遠心することによりペレット化した(centrifuge 5417R、Eppendorf社)。上清は、Eppendorf試験管中に保管した。細胞は次に200μLの氷温1×PBS中に再懸濁させ、DNAは細胞溶解後にDNeasy Blood and Tissueキット(Qiagen社)を製造業者の取扱説明書にしたがって使用し精製した。細胞溶解液は、ウイルス粒子を変性させるために85℃で30分間インキュベートし(HBT130、Haep Labor Consult社)、遊離したウイルスDNAはHirt抽出によって回収した。上清分画内または細胞に結合した状態いずれかで存在するウイルスゲノムの定量は、他の場所で記載された定量的リアルタイムPCR[28]によって決定した。
(O)ウイルスの取り込み
8×10個のNB−324K細胞は、104vg/細胞のMOIでwt H−1PVまたはDel H−1PVのいずれかを用いて感染させ、さらに37℃でインキュベートした。感染後の時点(0.5〜3時間)に、細胞を1×PBSで洗浄し、膜結合ウイルス粒子をトリプシン/EDTA(Invitrogen社)処理によって剥離させた。次に細胞を5分間3,500rpmおよび室温での遠心分離によってペレット化した(centrifuge 5417R、Eppendorf社)。細胞はDNeasy Blood and Tissueキット(Qiagen社)を製造業者の取扱説明書にしたがって使用して溶解させ、内在化ウイルスDNAはHirt抽出によって抽出した。内在化ウイルスゲノムの定量は、他の場所で記載された定量的リアルタイムPCR[28]によって決定した。
(P)哺乳動物細胞からの低分子量ウイルスDNAの抽出(Hirt抽出)
感染もしくはトランスフェクト細胞または細胞上清からの低分子量ウイルスDNAの抽出は、他の場所で記載されたHirt抽出[30]によって、またはDNeasy Blood and Tissueキット(Qiagen社)のいずれかによって実施した。
(Q)サザンブロッティング
ウイルスDNA複製型は、1%−アガロースゲル電気泳動法によって分離した。各30分間の2回の変性処理およびゲル各々についての15分間の2回の中和処理後、DNA分子を室温で15〜20時間ニトロセルロースフィルター(Protran、GE Healthcare社)上へ10×SSC緩衝液の存在下での毛細管作用によって移した。膜をブロットから取り外し、DNA分子は膜のUV処理によって固定化した。膜はその後、32P放射標識NS特異的プローブとともにハイブリダイズし、さらにオートラジオグラフィーフィルム上、−80℃で露光させた(BioMax、MS Film、Kodak社)。
(R)トランスフェクション
− CaPO を使用するトランスフェクション
6μgのpwtH−1PVおよびpDelH−1PVプラスミドDNAは、HEPES緩衝食塩液と塩化カルシウム(CaCl)溶液の混合液中で他の箇所で記載されたように[28]沈降させ、さらに完全培地中の10cm培養皿中の2×10の293T細胞に加え、その後37℃および5%のCOでインキュベートした。
−リポフェクタミン 2000を使用するトランスフェクション
トランスフェクションの30〜60分前に、完全細胞培養培地を補給物が補給されていない新鮮培地と交換した。その間に、6μgのpwtH−1PVおよびpDelH−1PVプラスミドDNAをOPTI−MEM(Invitrogen社)中に希釈させ、リポフェクタミン 2000(Invitrogen社)およびOPTI−MEMの混合液を製造業者の取扱説明書にしたがって調製した。2種の溶液を混合し、室温で25分間インキュベートした後、混合液をサブコンフルエントなNB−324K細胞の細胞培養培地へ滴下した。トランスフェクション4時間後、トランスフェクション培地を新鮮完全細胞培養培地と交換した。
パルボウイルス変異体の構築
(A)Del H−1PV変異体
H−1PVゲノム内のNS−コーディング配列(すなわち、Δ2022〜2135ヌクレオチド)における欠失は、pSR19プラスミド[13]および表1に列挙したプライマーを用いてPCRによって構築した。欠失した領域を含有するApoI−HindIIIフラグメントを変異したDNAから切断し、引き続いてpDelH−1PVプラスミド構築体を生成するために所望のベクター内の同等の野生型ApoI−HindIIIフラグメントと置換した。この構築体は、全置換ApoI−HindIIIフラグメント(GATC Biotech社、独国コンスタンス)を配列決定することによって確認した。
Figure 2016039805
(B)PMut H−1PV変異体
単一および二重点突然変異の感染性H−1PVクローンpSR19内への導入は、特定部位突然変異誘発によって、QuickChange(登録商標)特定部位突然変異誘発キット(Stratagene社、オランダ国アムステルダム)を製造業者の取扱説明書にしたがって、および表2に記載したプライマーを使用して実施した。全ての構築体は、シーケンシングによって検証した(GATC Biotech社、独国コンスタンス)。
Figure 2016039805
野生型H−1PVに比較してDel H−1PVの増加した感染性、およびDel H−1PVに比較してPMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PV変異体の類似、もしくは一層良好な感染性
ウイルスストックの感染性は、完全ウイルス粒子(P)対感染性粒子(I)の比率、つまりP/I比によって規定される。このため、P/I比が低いほどウイルスストックの感染性は高くなる。
図2は、NB−324K細胞内で新規に生成されたウイルスストック由来のwt H−1PVに比較した様々な欠失および点突然変異H−1PV変異体のP/I比(粒子対感染性比)を示している。各ウイルスストックについて、完全粒子の量はこのストックのゲノム力価にしたがって決定したが、感染性粒子の量は完全粒子が(i)プラークを形成する(プラーク形成単位もしくはPFUで与えられる)、および(ii)参照NB−324K細胞系内のそれらのゲノムを複製する(複製単位もしくはRUで与えられる)能力にしたがって決定した。2つのP/I比は、さらに完全粒子(すなわち、ウイルスゲノムを含有するカプシド)の量を、
−最初にPFUの量(完全ビリオンが細胞溶解を通して培養内に拡散する能力を特徴付ける)(図2の比1)と、
−次にRUの量(それらのゲノムを増幅させることのできる完全ビリオンを特徴付ける)(図2の比2)と比較することによって決定した。
図2に示したように、PMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PV点突然変異体ならびにDel H−1PV欠失変異体は、完全粒子がそれらのゲノムを増幅させる(図2、比2)または細胞培養内で増殖する(図2、比1)いずれかの能力に関してwt H−1PVよりも低いP/I比を示した。実際に、Del H−1PVおよびPMut2 H−1PVの両方のP/I比ならびにPMut1 H−1PVのP/I比は、wt H−1PVのP/I比と比較して、各々少なくとも5分の1および8分の1である。これは、これらの変異体の感染性がより高いことを示しており、PMut1 H−1PVは最高水準を示している。
これとは対照的に、PMut3 H−1PVおよびPMut4 H−1PV点突然変異体は、完全ビリオンがゲノムを増幅させる、および増殖する両方の能力に関して3つの他の変異体(Del H−1PV、PMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PV)と比較して高い、このため不良なP/I比を示した。これらの2つの変異体はさらに、少なくとも細胞培養内でそれらが増殖する能力によると、wt H−1PVよりも不良な(すなわち、2倍以上高い)P/I比を示した。これらのデータは、PMut3 H−1PVおよびPMut4 H−1PV両方の点突然変異体の減少した感染性を示している。PMut1およびPMut2 H−1PV内に導入された点突然変異は単独で該変異体の感染性を増加させたが、他方両方の点突然変異の組み合わせはPMut4 H−1PVにおけるのと同様に反対の影響を有すると思われ、感染性完全粒子より多い悲感染性粒子をもたらしたことは注目に値する。
要するに、点突然変異体PMut1 H−1PV(NS2 Leu103ProおよびNS1 Tyr595His)の感染性は欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)または点突然変異体PMut2 H−1PV(NS2 Lys96Glu)のいずれか1つより一層良好であり、これら2つの後者の感染性は既にwt H−1PVの感染性に比較して有意に(すなわち、少なくとも5倍)増加した。
感染NB−324K細胞内のwt H−1PVと比較したDel H−1PVの増加した、および/またはより高速の増殖
欠失変異体Del H−1PVおよび点突然変異体PMut1 H−1PV、PMut2 H−1PVおよびPMut3 H−1PVならびにwt H−1PVのウイルス産生をプラークアッセイによって分析した。力価の決定を可能にする他、この方法は、ウイルスが隣接細胞を感染させ、それにより単層細胞培養内で拡散する能力を意味するプラーク形成能力を示している。プラークアッセイは常に、ウイルスストックが何であれ、おそらく感染している場合は細胞が細胞周期の様々な段階にあるという事実に起因して、小さなプラークおよび大きなプラークの混合物を生じさせるが、パルボウイルス複製周期は細胞周期のS期でしか開始できないことは注目に値する。しかし、プラークが大きく、ウイルスによって産生する大きなプラークの量が多いほど、このウイルスが細胞培養内で増殖する能力は良好である。
図3のAは、参照NB−324K細胞系内で様々なH−1PV変異体およびwt H−1PVによって形成されたプラークのサイズを例示している。PMut3 H−1PVは、wt H−1PVより小さなプラークを明確に産生したが、これは少なくともヒトNB−324K細胞内でこの変異体の増殖効率が低いことを示唆している。これらのデータはさらに、NB−324K細胞内の上述したこの変異体の低い感染性とも一致している(実施例3および図2を参照されたい)。
これとは対照的に、3つの他の変異体PMut1 H−1PV、PMut2 H−1PVおよびDel H−1PVによって生成されたプラークは、一般にPMut3 H−1PVを用いて得られたプラークより大きかったが、これはこれらの変異体を用いた場合のより良好な増殖効率を示唆している。しかし、PMut2 H−1PVおよびPMut1 H−1PVは、wt H−1PVを用いて得られたプラークより各々小さい、および大きいプラークを産生すると思われた。これらの2つの点突然変異体によって形成されたプラークの様々なサイズおよびwt H−1PVまたはDel H−1PVを用いて得られたものと比較したそれらの比率を決定するためにはまた別の実験が実施される。
図3のAに示したように、欠失変異体Del H−1PVは、wt H−1PVより大きなプラークを産生した。実際に図3のBに示したように、大きな、つまり25mm超のプラークのより高い比率は、Del H−1PV変異体を用いた感染後に形成されたが、wt H−1PVは、小さな、つまり20mmまでのプラークの高い比率を生成した。さらに、Del H−1PVは、wt H−1PV(各々、13mmおよび67mm)に比較して高い平均および最高サイズ(各々、19mmおよび118mm)のプラークを生じさせた。これを言い換えると、Del H−1PV変異体を用いて得られたプラークサイズの平均値は、wt H−1PVを用いて得られたプラークサイズの平均値に比較して1.5倍高く、これはDel H−1PV変異体のより良好な増殖効率および/または高速の感染周期を示唆している。これらのデータはさらに、NB−324K細胞内の上述したこのDel H−1PV変異体の高い感染性とも一致している(実施例3および図2を参照されたい)。
要するに、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)の増殖は、NB−324K細胞内のwt H−1PVと比較して増加する、および/または高速である。点突然変異体PMut1 H−1PV(NS2 Leu103ProおよびNS1 Tyr595His)がwt H−1PVと同様に、またはより良好に増殖するかどうかについては、今後決定される。
感染NB−324K細胞内のウイルスタンパク質の蓄積
ウイルスタンパク質の蓄積は、Del H−1PV、PMut1 H−1PV、PMut2 H−1PVまたはwt H−1PVを用いて感染させたNB−324K細胞内での免疫ブロッティングアッセイによって決定した。図4は、感染6時間、8時間、24時間および48時間後の非構造的NS1およびNS2タンパク質ならびにカプシドVPタンパク質の蓄積を示している。試験したウイルス全部が非構造タンパク質およびカプシドタンパク質を発現することができた。しかし、これらのタンパク質の蓄積パターンは、ウイルス毎に相違していた。
全感染NB−324K細胞では、カプシドタンパク質VP1およびVP2は、感染24時間および48時間後に検出可能であったが、より早期の6時間および8時間後には検出できなかった。感染24時間後、欠失および点突然変異体で感染させた細胞は、wt H−1PV感染細胞と比較して高い量のVPタンパク質を示した(図4、黒色矢印)。感染24時間〜48時間後には、Del H−1PVは、VPタンパク質蓄積における強度の増加をもたらしたが、PMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PV変異体またはwt H−1PVを用いた場合はVPタンパク質の増加は全く、またはわずかしか観察されなかった。
wt H−1PVおよびDel H−1PV感染とは対照的に、非構造タンパク質NS1は、PMut1 H−1PVまたはPMut2 H1−PVのいずれかによる感染8時間後に既に検出可能であった(図4、赤色の矢印)。さらに、これら2つの点突然変異体はさらに感染24時間および/または48時間後に観察されたようにwt H−1PVまたはDel H−1PVを用いて得られたものに比較してNS1の高い蓄積レベルをもたらしたが、後者は少なくとも感染後の分析した期間内にNS1の最低蓄積レベルを生じさせると思われた。
全ての場合に感染早期、つまり感染6時間後または8時間後にはNS2タンパク質を検出することができなかったが、NS2の蓄積パターンは感染後期には全4種のウイルス間で際だって相違していた(図4、黒色の囲み枠)。感染8時間〜24時間後、NS2は、Del H−1PVを除く全ウイルスを用いて検出可能なレベルに蓄積した。感染の24時間および48時間後の時点に、NS2蓄積のレベルはwt H−1PVを用いて感染させた細胞内で類似であったが、各々PMut1 H−1PVまたはPMut2 H−1PVを用いた感染後有意に増加または減少した。Del H−1PVを用いて感染させた細胞内では、NS2は、分析した最後の時点、つまり感染48時間後にはほとんど検出不能であった。
要するに、点突然変異体PMut1 H−1PV(NS2 Leu103ProおよびNS1 Tyr595His)およびPMut2 H−1PV(NS2 Lys96Glu)は、どちらも高度に細胞毒性であると思われ(実施例6および図5を参照されたい)、非構造タンパク質NS1のより早期および高度の蓄積を生じさせたが、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)は、より高速で増殖すると思われ(実施例4および図3を参照されたい)、また、少なくとも参照ヒトNB−324K細胞系内および分析した期間内にカプシドタンパク質VP1およびVP2のより高速の蓄積ならびに非構造タンパク質NS2の最低蓄積を生じさせた。
PMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PV変異体を用いた増加した細胞培養増殖阻害および増加した感染性子孫ビリオンの産生
点突然変異体PMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PVの細胞毒性および生殖特性を感染ヒトNB−324K内の欠失変異体Del H−1PVおよびwt H−1PVの細胞毒性および生殖特性と比較した。このため細胞培養増殖および感染性子孫ビリオンの産生をどちらも4日間追跡した。他方、生細胞および死細胞の量を、Casy細胞計数システムを用いて測定し、図5Aは、擬似(mock)処理細胞内で得られた生細胞の平均値に基づいた生細胞の平均パーセンテージを示している。他方、プラークを形成可能な新規に作製されたビリオンの量はプラークアッセイによって決定し、図5Bは、感染1、2、3および4日後に得られた全プラーク形成単位の量を示している。
図5Aに示したように、全ウイルスは細胞培養増殖を阻害することができ、欠失変異体Del H−1PVおよびwt H−1PVは、少なくとも感染後第1日に類似レベルの細胞増殖阻害を示した。しかしはるかに高い細胞毒性作用、つまり約1.5および2倍の細胞集団増殖のより強力な阻害は、少なくとも感染後第1日のDel H−1PVまたはwt H−1PV感染細胞と比較した場合に点突然変異体PMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1各々を用いたNB−324K細胞の感染後に明白に観察された。
図5Bに示したように、全ウイルスは、ヒトNB−324K細胞内で感染性子孫ビリオンを産生することができた。しかし、点突然変異体PMut1 H−1PVおよびPMut2 H−1PVの両方ならびに欠失変異体Del H−1PVはwt H−1PVに比較して高い感染性子孫ビリオンの産生を生じさせ、これは少なくとも感染1日後に全プラーク形成単位の量における各々約12倍、7.5倍および5倍の増加を示した。
要するに、点突然変異体PMut1 H−1PV(NS2 Leu103ProおよびNS1 Tyr595His)およびPMut2 H−1PV(NS2 Lys96Glu)は、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)およびwt H−1PVに比較して一層強度にNB−324K細胞集団の増殖を阻害する。全3種の変異体、つまりPMut1 H−1PV、PMut2 H−1PVおよびDel H−1PVはさらに、wt H−1PVが少なくともヒトNB−324K細胞において生じさせたより高度の感染性子孫ビリオンの産生を生じさせた。
感染ヒトNB−324K細胞の核および細胞質内のPFU分布
図6は、wt H−1PVまたは変異体Del H−1PV、PMut1 H−1PVもしくはPMut2 H−1PVのいずれかを用いて感染させたNB−324K細胞内の二次感染の非存在下での感染性子孫ビリオンの産生および細胞内分布を示している。細胞の核および細胞質分画内に存在する感染性子孫ビリオンをプラークアッセイによって感染16時間、20時間、24時間および42時間後に定量し、プラーク形成単位(すなわち、プラーク形成粒子もしくはビリオン)として表示した。
図6のa)に示したように、NB−324K細胞の核分画から回収したプラーク形成性、つまり感染性子孫ビリオンの量は、試験した全時点でDel H−1PVまたはwt H−1PVのいずれかによる感染後に同等であり、経過時間に伴って同様に増加した。
これとは対照的に、そして図6のb)に示したように、wt H−1PV感染NB−324K細胞と比較してDel H−1PV内の感染24時間および48時間後の細胞質分画から有意に高い量のプラーク形成ビリオンが回収された。これらのデータは、wt H−1PV感染細胞と比較してDel H−1PVによる感染後のNB−324K細胞の核から細胞質への新規に作製された感染性ビリオンのより早期および/または増加した輸送とともに一次感染の結果としての子孫ビリオンの増加した産生を明らかに示した。
PMut1 H−1PV、PMut2 H−1PVまたはPMut4 H−1PVを用いて感染させたNB−324K細胞の核分画内でのプラーク形成子孫ビリオンの蓄積パターンは、wt H−1PVまたはDel H−1PVのいずれかによる感染後に得られた蓄積パターンとは相違していた。
図6のc)に示したように、二重点突然変異体PMut4 H−1PVは、試験した全ての他のウイルスと比較して、NB−324K細胞の核分画内ではるかに高い量のプラーク形成粒子、すなわち感染20時間後の7倍および感染24時間後の5倍の増加を生じさせた。感染24時間後、PMut1 H−1PVはさらに、PMut2 H−1PV、Del H−1PVおよびwt H−1PVと比較してNB−324K細胞の核分画内で有意に高い量のプラーク形成粒子を生じさせた。なおPMut1 H−1PV、PMut2 H−1PVもしくはPMut3 H−1PVを用いた感染後に核内で見いだされた核形成粒子の量が、感染24時間〜42時間後の時点に欠失変異体Del H−1PVもしくはwt H−1PVとは対照的に低下したことは興味深い。
細胞質分画内では、および図6のd)に示したように、二重点突然変異体PMut4 H−1PVは、感染の少なくとも42時間後にDel H−1PVを用いて得られた量にほぼ近似した野生型に比較して感染20時間、24時間および42時間後のプラーク形成粒子の量の明白な増加を示した。単一点突然変異体PMut1 H−1PVはwt H−1PVと比較して、さらに少なくとも感染の24時間および48時間後と比較して高い量のプラーク形成子孫ビリオンを生じさせたが、Del H−1PVを用いて得られた量ほど高くはなかった。他の変異体とは対照的に、PMut2 H−1PVを用いて感染させたNB−324K細胞の細胞系質内で見いだされたプラーク形成粒子の量は、試験した全時点において実質的に一定のままであり、したがってwt H−1PVを用いて感染させたサンプル内で見いだされた量より低いままであった。後者のデータは、子孫ビリオンの増加した細胞質蓄積を可能にする感染周期の一部の過程は他の変異体とは対照的にPMut2 H−1PVを用いると損傷される可能性があることを示唆している。
これらをまとめると、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)および二重点突然変異体PMut4 H−1PV(NS2 Lys96Glu、Leu103ProおよびNS1 Tyr595His)は野生型と比較して子孫ビリオンの明白に増加した産生を示したが、PMut4 H−1PVは核内の早期の蓄積もまた示し、Del H−1PVは野生型と比較して新規に作製された感染性ビリオンの早期の核輸送を示している。単一点突然変異体PMut1 H−1PV(NS2 Leu103ProおよびNS1 Tyr595His)は、だが少なくとも試験した時点にはより少ない量のプラーク形成粒子を備える二重点突然変異体PMut4 H−1PVと同様に挙動すると思われるが、他方単一点突然変異体PMut2 H−1PV(NS2 Lys96Glu)は、感染細胞の細胞系質内で感染性子孫ビリオンを蓄積するその能力が損傷していると思われる。
Del H−1PVの生活環の一部の過程は野生型H−1PVの生活環の一部の過程より高速である
図7は、感染15時間および21時間後の免疫蛍光アッセイによって検出されたように感染NB−324K内の単細胞レベルでのウイルス粒子の蓄積および細胞内局在を示している。この実験では、ヒトNB−324K細胞をハイブリッド(h)欠失変異体Del hH−1PVまたはH−1PVゲノムの左側の部分が等価の領域によって、つまり密接に関連するパルボウイルスMVMp(pdB−MVp構築体から回収された、[25])由来のゲノムのヌクレオチド1〜ヌクレオチド990と置換されたハイブリッド野生型hH−1PVのいずれかを用いて感染させた。これは、ウイルスプロモーターP34ならびにそれらのアミノ末端でのNS1の最初の244アミノ酸およびNS2の85アミノ酸はMVMp起源であり、他方NS1およびNS2タンパク質の両方のカルボキシ末端ならびにウイルスプロモーターP38および完全VPタンパク質はH−1PV起源であることを意味している。
Del H−1PVにより感染させた細胞集団間では、wt H−1PVにより感染させた集団と比較して、核内で新規に集合した粒子を示すより多数の細胞が15時間および21時間後の時点に観察された。さらに、核から細胞質へ既に遊離された子孫ビリオンを示している多数の細胞はまた感染21時間後にwt H−1PVにより感染させた集団と比較してDel H−1PVにより感染させた細胞集団間でも観察された(図7、白い矢印)。これらのデータはハイブリッドDel hH−1PVおよびハイブリッド野生型hH−1PVを用いて得られたが、これらのデータは、wt H−1PVを用いて感染させたものに比較してDel H−1PVにより感染させたNB−324K細胞の細胞質分画内での感染性子孫ビリオンの、上述したより高速の蓄積と一致している(実施例7および図6を参照されたい)。
要するに、欠失変異体Del hH−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)を産生する細胞内で野生型hH−1PVを産生する細胞に比較して子孫ウイルス粒子のより早期の核退出が発生するが、これはDel hH−1PV感染周期の一部の過程が少なくとも参照ヒトNB−324K細胞系においてはwt H−1PV感染周期の一部の過程よりも高速で進行することを示唆している。
欠失変異体Del H−1PVは、野生型H−1PVより低い細胞毒性を示す
欠失変異体Del H−1PVの細胞毒性は、クローン形成性アッセイとその後のクリスタルバイオレット染色を使用してNB−324K細胞上のwt H−1PVの細胞毒性と比較した。
図8のAに示したように、コロニーを形成可能な、つまり欠失変異体H−1PVによる感染後に増殖可能な細胞の量は、wt H−1PVによる感染後に検出された細胞コロニーの量よりある程度多い。
図8のBに示したように、この作用は特に、細胞を低度または中等度の感染多重度(すなわち、0.5PFU/細胞または2.5PFU/細胞)で感染させた場合に観察される。これらのデータは全部で、wt H−1PVの毒性と比較して欠失変異体Del H−1PVの減少した毒性を示している。これらは予備試験データである。しかし、欠失変異体Del H−1PVの減少した毒性は、少なくともヒトNB−324K細胞内での子孫ビリオンのより良好な産生と相関付けることができる。実際に、これらのデータは、本発明者らの研究所で以前に得られた子孫ビリオンの優れた生産者である細胞系は感染過程中にはあまり迅速には死滅しないという観察所見と一致する。
要するに、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)は、ウイルス産生の増加に好都合であると思われるwt H−1PVと比較して低い毒性を示す。
様々な膵臓癌細胞系およびHeLa細胞内でのDel H−1PVの増加したウイルス産生
上述したように、標準wt H−1PVに比した欠失変異体Del H−1PVの有意な利点は、参照ヒトNB−324K細胞系における感染性および産生率に関して観察された。Del H−1PV変異体のこの作用は、様々なヒト腫瘍細胞系で確証された。
図9は、感染後の様々な時点でのプラークアッセイによって決定されたように、ヒトNB−324K、ヒト膵臓癌Panc−1およびMiaPaCa−2ならびにヒト子宮頸癌HeLa+細胞系においてwt H−1PVを用いて得られた感染性粒子の量と比較した欠失変異体Del H−1PVによって産生した感染性粒子の量を示している。
図9に示したように、試験した全ヒト細胞系におけるwt H−1PVと比較してDel H−1PVによる感染後に感染性子孫ビリオンの増加した産生が観察された。
要するに、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)は、ヒト参照細胞系NB−324Kだけではなくヒト腫瘍由来の異なる膵臓癌または子宮頸癌細胞においても産生率に関してwt H−1PVに比して有意な利点を示す。
欠失変異体Del H−1PVは腫瘍増殖抑制において野生型H−1PVよりも優れた効率を示す
上述したin vitro実験に加えて、欠失変異体Del H−1PVが腫瘍増殖に及ぼす作用をin vivoアッセイにおいても調査した。
図10のAは、実施されたin vivoアッセイの略図を示している。ヒト膵臓癌Panc−1細胞を緩衝液で処理した(擬似(mock)処理細胞)、またはDel H−1PVもしくはwt H−1PVを用いて1RU/細胞の感染多重度で感染させた(RU、すなわち、複製単位は、そのウイルスゲノムを宿主細胞内へ送達して増幅させることのできる完全ウイルス粒子に対応する)。擬似(mock)処理Panc−1細胞もしくはパルボウイルス感染Panc−1細胞を、さらに以下のようにBalb/cヌードマウスに皮下注射した。7匹のヌードマウスは擬似(mock)処理Panc−1細胞を受容し、7匹のヌードマウスはwt H−1PVより感染させたPanc−1細胞を受容し、6匹のヌードマウスはDel H−1PV変異体により感染させたPanc−1細胞を受容した。
腫瘍増殖を感染後83日の期間追跡し(図10)、290mm超のサイズの腫瘍のパーセンテージについても決定した(図10のC)。
データは、擬似(mock)処理腫瘍と比較してパルボウイルス感染Panc−1腫瘍の出現および増殖における強度の遅延を示した。さらに、明白に減少した腫瘍増殖は、wt H−1PVにより感染させたPanc−1腫瘍細胞が注射されたヌードマウスに比較してDel H−1PV感染Panc−1腫瘍細胞を受容したヌードマウスにおいても観察された。実際、290mm超のサイズを有するヒトPanc−1腫瘍は、Panc−1細胞がwt H−1PVを受容した場合に比較してDel H−1PVを受容した場合は約10日後に検出され、移植83日後、290mm超のサイズを有するヒトPanc−1腫瘍は55%超のwt H−1PVと比較してDel H−1PVにより感染させた場合は20%未満であった(図10のC)。
要するに、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)は、動物におけるヒト腫瘍増殖抑制においてwt H−1PVより強度の効率を示す。
Del H−1PVの腫瘍内注射は野生型H−1PVに比較してHeLa細胞由来腫瘍の増殖抑制においてより効率的である
in−vivoアッセイでは、2×10個のHeLa細胞をBalb/cヌードマウスの右側腹部へ皮下注射した。マウスがHeLa細胞由来腫瘍を発現した9日後に、マウス1匹当たり10PFU(100μLの容積のPBS中)のDel H−1PVまたはwt H−1PVを腫瘍増殖部位の近く、すなわち腫瘍内へ注射した。腫瘍増殖は、移植42時間後まで監視した。図12は、欠失変異体Del H−1PVが腫瘍内に注射された場合にHeLa細胞由来子宮頸癌腫瘍の増殖に及ぼす作用を示している。
加速された腫瘍増殖は、おそらくはウイルスの腫瘍内注射による腫瘍細胞質量の崩壊に起因するこれらの条件下で観察された。接種材料の液圧が腫瘍細胞の拡散に寄与し、それにより強度に加速された腫瘍増殖に関与した可能性が最も高かった。しかし、wt H−1PVと比較してDel H−1PVを用いるとこれらの条件下で一層改良された腫瘍抑制を観察することができた。図12のAに示したように、1,000mm超の腫瘍を発現するマウスの数は、Del H−1PVの注射後にはmock処理(緩衝液)マウスまたはwt H−1PV注射マウスと比較して遅延した。実際、wt H−1PVが腫瘍内注射された場合は60%のマウス(つまり5匹中3匹のマウス)が注射6日後に既に1,000mm超の腫瘍を発現したが、Del H−1PVが腫瘍内注射された場合は注射25日後にしか発現しなかった(つまり、ほぼ20日遅い)。
図12のBは、各群における1,000mm未満の腫瘍を有する(これにより動物の犠死を防止する)マウスのパーセンテージで提示したマウスの生存率を示している。Del H−1PVにより処理されたマウスの80%(つまり5匹中4匹)は注射35日後まで生存したが、wt H−1PVで処理されたマウスは既に注射17日後から40%(つまり5匹中2匹)しか生存していなかった。
要するに、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)は、in vivoでのHeLa細胞由来ヒト腫瘍の増殖抑制においてwt H−1PVより強力な能力を示している。
野生型NS2Pタンパク質と比較したDel NS2Pタンパク質の増加した新規合成および不安定性
ウイルス非構造タンパク質の新規合成および安定性をDel H−1PVまたはwt H−1PVにより感染させたNB−324K細胞からパルス・チェイス標識および免疫沈降アッセイによって決定した。図13は、30分の標識期間後の新規合成された非構造NS1およびNS2Pタンパク質の量ならびにそれらの合成の240分後までの時間内のこれらのウイルスタンパク質の残留量を示している。
新規合成された野生型NS1に比較して、より高い量の新規合成されたDel NS1が検出された(図13、上方パネル、チェイス0分間)。しかし、切断形のNS1(Del NS1)は、少なくとも60分のチェイス期間までは野生型形と同様に安定性であるように見えた。野生型NS1の場合、追加のより緩徐に移動するバンドがチェイス期間の開始時(0分〜20分の時点)にわずかに検出できたが、少なくとも40分〜240分のチェイス期間には明白に見られるようになり、その量は時間の経過に伴って増加し、NS1のより高速で移動する形態は漸進的に減少した。これは、進行性および/または一時的に発生すると思われる野生型NS1の一部の翻訳後修飾の出現を表示している。野生型NS1ほど明白には見られないが、Del NS1もまた少なくとも120分のチェイス期間まではダブレットとして移動すると思われたが、240分のチェイス期間後にはDel NS1のより緩徐に移動する形態しか検出されず、これは野生型NS1と比較してDel NS1タンパク質の翻訳後修飾が相違する、および/またはより高速に発生することを示唆している。
図13に示したように(下方のパネル)、Del NS2Pタンパク質の合成および分解はどちらも、野生型NS2Pの合成および分解と比較して衝撃的に促進された。実際、新規合成されたDel NS2Pタンパク質の量は標識期間後(チェイス0分の時点)に野生型タンパク質の1つよりはるかに高かったが、大多数のDel NS2Pは60分のチェイス期間後既に消失し、240分のチェイス期間後には新規合成されたDel NS2Pはもはや検出されなかったが、新規合成された野生型NS2Pは依然検出可能であった。
要するに、Del NS2Pの合成および代謝回転は、野生型NS2Pと比較して明白に強化される。NS1の翻訳後修飾は、さらにタンパク質の野生型形と比較して切断形(Del)において変化させられる可能性がある。まとめると、これらのデータは、114−ヌクレオチド長の、Del H−1PVゲノム内のインフレーム欠失および/または結果として生じる非構造Del NS1およびDel NS2タンパク質における37アミノ酸の切断がこれらのウイルスタンパク質の一部の調節機構に影響を及ぼすことを強力に示唆している。これらの変化がDel H−1PV子孫ビリオンの観察された、より高度の感染性および/またはより早期の核退出において重要な問題となるかは、今後調査する。
Del NS2Pは核外輸送因子Crmlおよび14−3−3タンパク質ファミリーメンバーと依然として相互作用することができる
ウイルスタンパク質が特定の細胞タンパク質と相互作用する能力は、Del H−1PVまたはwt H−1PVにより感染させたNB−324K細胞の代謝的に35S標識したタンパク質抽出物をもちいた共免疫沈降アッセイによって決定した。
図14のAに示したように、等価量の細胞タンパク質Crm1(左のパネル)および14−3−3(右のパネル)は、適切な抗体を用いた免疫沈降後に全試験サンプル中で検出された。さらに、等価量の野生型NS2およびDel NS2タンパク質が、SDSの非存在下で調製されたサンプル中ではCrm1または14−3−3のいずれかと共沈降することが見いだされた(各々、図14のA、レーン3および5ならびにレーン7および9)。Crm1および14−3−3両方とのウイルスDel NS2および野生型NS2タンパク質の共沈降は、Del NS2または野生型NS2がmock処理細胞由来のサンプル中(図14のA、レーン1および10)またはタンパク質−タンパク質相互作用を中断させるSDSの存在下で調製されたサンプル中(図14のA、レーン2および4ならびにレーン6および8)で検出されなかったため特異的であった。
図14のBは、類似量のDel NS2および野生型NS2タンパク質をNS2P特異的抗血清を使用した場合に感染したサンプルから免疫沈降させたことを示す。これらのデータは、サンプル中に存在するDel NS2または野生型NS2タンパク質の全量の一分画だけがCrm1または14−3−3のいずれかと相互反応できたことも指示している。
要するに、ウイルスDel NS2タンパク質はCrm1および14−3−3細胞生成物両方と野生型NS2と同様に効率的に相互作用するが、これはH−1PV NS2タンパク質配列中の37アミノ酸の欠失がウイルスタンパク質とその細胞パートナーとの結合特性を無効にしないこと、そしてH−1PV NS2の一部の立体配座構造が切断(Del)形において依然として維持されたことを示唆している。
Del H−1PVビリオンは、熱変性に対して野生型H−1PVビリオンよりも感受性である
感染細胞内のウイルスゲノムの脱カプシド過程は、in vitroでは熱変性アッセイによって模倣することができる。H−1PV粒子の熱変性への感受性は、完全ビリオンを様々な温度へ曝露させ、DNase処理してその後にアルカリ溶菌を行った後に残留する無傷ビリオンの定量的リアルタイムPCRによって該サンプル中に依然として存在するウイルスゲノムの量を決定することによってin vitroで分析した。図15に示したように、Del H−1PVおよびwt H−1PVビリオンの安定性は、精製完全粒子を各10分間50℃〜70℃の(PCR装置内で生成される)温度に曝露させることによって調査した。
図15は、熱変性後に回収されたDel H−1PVゲノム(総量の%で表示)は、野生型ゲノムの1つと比較した場合に、試験した全温度で低かった。完全粒子の50%の変性をもたらした温度は、Del H−1PVおよびwt H−1PV間の2.42℃の差を生じさせ、前者の場合は59.11℃であり、後者の場合は61.53℃であった。
要するに、Del H−1PV粒子は、熱変性に対してwt H−1PV粒子よりも感受性であった。これは、Del H−1PVウイルスゲノムが、wt H−1PVゲノムより効率的に脱カプシド化することができ、これはさらに前者の増加した感染性に好都合でもあろうことを示唆している。
Del H−1PVを用いた改良された細胞結合および取り込み
完全粒子の細胞表面への結合は、ウイルス内在化を防止するために4℃で1時間のインキュベーション後に感染NB−324K細胞から回収されたウイルスゲノムの量を定量的リアルタイムPCRによって測定し決定した。
完全粒子の取り込みは、ウイルス侵入を可能にするために事前に37℃でインキュベートし、血漿膜結合ウイルス粒子を取り除くためにトリプシン/EDTAにより処理した感染細胞から感染後の様々な時点(0.5時間〜3時間)の内在化ウイルスゲノムの量を定量的リアルタイムPCRによって測定し調査した。図16のAは細胞膜結合完全粒子のパーセンテージを示しているが、図16のBはDel H−1PVまたはwt H−1PVいずれかによるNB−324K細胞の感染後の両方の内在化ウイルスゲノムの量を示している。
図16のAに示したように、細胞膜に結合した完全粒子のパーセンテージは野生型H−1Vと比較してDel H−1PVによる感染後には9.7倍高かったが、これはDel H−1PVがwt H−1PVビリオンに比較して感染細胞の血漿膜で結合することにより感受性であることを指示している。
図16のBに示したように、試験した全細胞溶解物中で、つまり試験した全インキュベーション時間で、wt H−1PVと比較して有意に高い量のウイルスゲノムがDel H−1PVによる感染後に回収された。既に感染30分後に、ほぼ9倍の増加が観察された。これらのデータは、wt H−1PVと比較してDel H−1PVビリオンの上述した、より良好な結合効率と相関している。
要するに、Del H−1PVの血漿膜での結合、および可能性のある結果として感染細胞の内側でのその取り込みは、野生型ウイルスに比較して有意に改善される。熱変性に対する上述したより高い感受性とともに増強された結合/取り込み(実施例15、図15)およびこの欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)の感染性子孫ビリオンのより早期/高速の核退出(実施例7、図6および実施例8、図7)をDel H−1PVウイルス粒子の一部の微細な修飾に帰せることができるかは、今後調査する。
Del H−1PVゲノムの早期の複製および感染NB−324K細胞内の一本鎖DNAの高度の蓄積
ウイルス複製型の蓄積は、Del H−1PVまたはwt H−1PVにより感染させたNB−324K細胞由来の細胞抽出物を使用してサザンブロッティングアッセイによって分析した。図17のAは、細胞の感染がアッセイ中の二次感染を防止するために中和抗体の存在下で実施されたため、感染3時間、9時間、12時間、16時間および24時間後の一次感染の結果としてのウイルス単量体複製型(mRF)、二量体複製型(dRF)の蓄積を示している。これらのウイルスDNA形各々のシグナル強度はPhospho Imager分析によって定量し、図17のBは、感染後の指示時点でのこれらの形態各々のシグナル強度のDel H−1PV対野生型の比率を示している。
どちらのウイルスも全ウイルス複製型を蓄積することができた。しかし、これらの複製型の蓄積パターンは、Del H−1PVと比較してwt H−1PVによる感染後に幾らか遅延した。
全感染NB−324K細胞内では、より早期の3時間後の時点にウイルス複製型は検出できなかった。感染9時間後、mRFおよびdRFはどちらも明白に視認することができ、wt H−1PVに比較してDel H−1PVによる感染後にはより高い強度を伴った(図17のA)。実際、Del H−1PV mRFおよびdRFの蓄積におけるwt H−1PVに比較した各々7倍および11倍の増加は、感染9時間後に測定された(図17のB)。感染12時間後、Del H−1PV mRFおよびdRFはwt H−1PV mRFおよびdRFと比較してどちらも依然として高量で、しかしより低い程度(5倍未満)で存在したが、dRF分子のNS1−依存性開裂の生成物であるssDNAの蓄積は、wt H−1PV ssDNAの蓄積と比較して19倍の増加に達するDel H−1PV感染サンプル中で有意に検出可能になった。これらのデータは、感染9時間後のDel H−1PV感染細胞中でのwt H−1PV感染細胞に比較して少なくとも感染12時間後まで持続する強度の大きい複製活性を示している。
感染後の後期の時点には、全3種の複製型は、両方の感染サンプル(図17のA)中で明白に見ることができ、野生型に比較してDel H−1PV複製型の4倍未満(感染16時間後)および2倍未満(感染20時間後)の上昇した蓄積を伴った。これらのデータは、wt H−1PV感染サンプル中の複製活性が感染12時間〜16時間後により強度になったが、それでも感染後の早期の時点に観察された強度に比較して、Del H−1PVサンプル中ほど高くなかった。
要するに、欠失変異体Del H−1PVゲノム(Δヌクレオチド 2022〜2135)の複製は、NB−324K細胞内のwt H−1PVゲノム複製と比較してより早期に発生する。これらのデータは、wt H−1PVと比較したDel H−1PVビリオンの上述した、より良好な結合、およびNB−324K細胞内に進入するより良好な効率(実施例16および図16)ならびにDel H−1PVビリオンの熱変性に対する高い感受性(実施例15、図15)と一致している。
Del H−1PVまたは野生型H−1PVのいずれかを用いたNB−324K細胞のトランスフェクション後の複製型の蓄積に差は見られない
Del H−1PVおよびwt H−1PV複製型の蓄積は、中和抗体の存在下でプラスミド構築体pDelH−1PVもしくはpwtH−1PVを用いたヒトNB−324K細胞のトランスフェクション後に評価し、その後にサザンブロッティングアッセイによるトランスフェクトサンプルの分析を実施した。この実験は、パルボウイルス生活環のいずれかの早期の過程の非存在下でのDel H−1PVおよびwt H−1PVゲノムの複製活性を比較するために設計されたが、これは上述したように、特定細胞結合(取り込み)においてwt H−1PVと比較してDel H−1PVを用いると強化されることが明らかになった(実施例16および図16)。図18は、トランスフェクション12時間、16時間および24時間後のウイルス単量体複製型(mRF)および二量体複製型(dRF)の蓄積を示している。
図18に示したように、ウイルスmRFおよびdRF分子の外観および蓄積における有意差は、pwtH−1PVと比較したプラスミド構築体pDelH−1PVを用いたトランスフェクション後の早期の時点に観察された。ウイルスmRFおよびdRF複製型はいずれもトランスフェクション12時間後に検出できなかった。Del H−1PVおよびwt H−1PVゲノム両方からのmRFおよびdRFはトランスフェクション16時間後に可視できるようになり、それら両方の量はトランスフェクション24時間後に有意に増加した。
要するに、Del H−1PVゲノム自体の複製は早期には発生しない、および/またはwt H−1PVゲノム複製に比較してトランスフェクトNB−324K細胞内では強化されない。
野生型H−1PV完全ビリオンの遊離に比較したトランスフェクトNB−324K細胞の培地中でのDel H−1PV完全ビリオンの増加した、および/またはより迅速な遊離
子孫ビリオンの遊離は、中和抗体の存在下(+PV1)または非存在下(−PV1)においてpDelH−1PVまたはpwtH−1PVのいずれかを用いたNB−324K細胞のトランスフェクション10時間、17時間および72時間後に収集した細胞培養上清から観察した。ウイルスssDNA分子は、Hirt抽出によって上清サンプルから回収し、サザンブロッティング分析によって検出した。トランスフェクション72時間後の上清サンプル中に存在した完全および感染粒子は、定量的リアルタイムPCRによってウイルスゲノム(vg)の量およびプラークアッセイによってプラーク形成単位(PFU)の量を各々測定し定量した。
図19は、トランスフェクション10時間および17時間後に上清サンプル中でsssDNAは検出可能ではなかったことを示している。トランスフェクション72時間後、ssDNAの検出可能な量は全試験上清サンプルから二次感染の発生を許容する中和抗体の非存在下で実施されたものに比較して二次感染を防止する中和抗体の存在下で実施されたトランスフェクションサンプルからはるかに低い程度で回収された。それでも両方の場合に、トランスフェクト293T細胞の上清から得られたDel H−1PV子孫ssDNAのシグナル強度は、wt H−1PV子孫ssDNAのシグナル強度に比較して高かった。これらのデータは、Del H−1PV子孫ビリオンの遊離がwt H−1PVと比較して改良されることを示しており、これはウイルス生活環の早期の過程(細胞表面へのウイルス結合および内在化、ウイルスゲノムの脱カプシド化および転換)の非存在下でさえ生じる。
さらに図19に示したように、トランスフェクション72時間後の上清中に存在するDel H−1PV子孫ビリオンは、wt H−1PVに比較した場合により低いP/I比を示した。実際、中和抗体の存在下で生成されたDel H−1PV子孫ビリオンのP/I比は、wt H−1PVと比較して21分の1まで減少した。
要するに、Del H−1PV子孫ビリオンは、wt H−1PV子孫ビリオンと比較してトランスフェクト細胞の細胞培養培地中でより早期に、および/またはより優れた効率で遊離される。さらに、それらがトランスフェクションによって生成された場合でさえ、欠失変異体Del H−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)の子孫ビリオンは、wt H−1PVと比較して増強された感染性を示した。
野生型H−1PVおよび野生型hH−1PVに比較したヒト293T細胞のトランスフェクションによって生成されるDel H−1PVおよびDel hH−1PVの増加した感染性
Del H−1PV、Del hH−1PV、wt H−1PV、野生型hH−1PVの粒子対感染性(P/I)比は、適切なプラスミド構築体によるヒト293T細胞のトランスフェクション後に生成し、トランスフェクション3日後に細胞ペレットから回収されたウイルスストックから決定した。各ウイルスストックについて、完全粒子の量は、ウイルス粒子含有ゲノムの数(1mL当たりのウイルスゲノム(vg)で与えられる)を決定するために、ストックのDNAse処理およびアルカリ溶菌後に実施した定量的リアルタイムPCRによって測定した。各ウイルスストックについて、感染粒子の量は、参照NB−324K細胞系内で完全粒子がプラークを形成する能力(1mL当たりのプラーク形成単位(PFU)で与えられる)を決定するために、プラークアッセイによって測定した。
図20に示したように、Del H−1PVおよびDel hH−1PVは、wt H−1PVおよび野生型hH−1PVよりも4.5分の1および5.8分の1のP/I比を示した。これは、より感染性の粒子が、ウイルスがそれらのゲノムのNS−コーディング配列中での114ヌクレオチド長の欠失を含有する場合にヒト293T細胞のトランスフェクション後に生成されたウイルスストックによって生成されたことを示している。
要するに、欠失変異体Del H−1PVおよびDel hH−1PV(Δヌクレオチド 2022〜2135)はどちらも、wt H−1PVおよびhH−1PVと比較してトランスフェクションによって生成された場合さえより優れた感染性を示す。
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本発明は増強された抗腫瘍効果を有する改変パルボウイルスを提供し、抗腫瘍効果を有する物質の研究及び開発を要する全ての技術分野に利用可能であり、特に、癌治療などの医療分野に応用することができる。

Claims (5)

  1. 野生型パルボウイルスと比較して高い抗腫瘍能力を示すパルボウイルス変異体であって、前記変異体は、(a)NS−2のLys96位および/またはNS−2のLeu103位でのアミノ酸置換、欠失もしくは付加、または(b)NS2タンパク質配列の中央部分およびNS1タンパク質配列のC末端部分の両方に影響を及ぼすパルボウイルスゲノムの左側部分におけるインフレーム欠失を特徴とするパルボウイルス変異体。
  2. アミノ酸置換を特徴とする請求項1(a)または請求項1(b)に記載のパルボウイルス変異体であって、前記欠失は、アミノ酸587〜624の欠失を有するNS1タンパク質およびアミノ酸96〜133の欠失を有するNS2タンパク質の翻訳を結果として生じさせるヌクレオチド2022〜2135であるパルボウイルス変異体。
  3. NS−2の96位でのLysは親水性極性アミノ酸によって置換される、および/またはNS−2の103位でのLeuは中性非極性アミノ酸によって置換される、請求項2に記載のパルボウイルス変異体。
  4. パルボウイルスH−1(H−1PV)由来または関連齧歯類パルボウイルス由来である、請求項1〜3のいずれか一項に記載のパルボウイルス変異体。
  5. (a)請求項1〜4のいずれか一項に記載のパルボウイルス(b)薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
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