JP2016028606A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2016028606A5 JP2016028606A5 JP2015224220A JP2015224220A JP2016028606A5 JP 2016028606 A5 JP2016028606 A5 JP 2016028606A5 JP 2015224220 A JP2015224220 A JP 2015224220A JP 2015224220 A JP2015224220 A JP 2015224220A JP 2016028606 A5 JP2016028606 A5 JP 2016028606A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- image
- region
- colony
- medium
- detection system
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 36
- 239000002609 media Substances 0.000 claims 26
- 239000001963 growth media Substances 0.000 claims 16
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims 8
- 239000000284 extract Substances 0.000 claims 6
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 claims 3
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 claims 3
- 230000000873 masking Effects 0.000 claims 3
- 239000003086 colorant Substances 0.000 claims 1
Claims (20)
前記培地の形状を特定するためのテンプレート画像に基づいて前記撮像画像上を走査し、予め定められた条件を有する領域を前記培地画像の画像部分として特定することによって、前記撮像画像の中から前記培地画像の画像部分を抽出する画像抽出手段と、
前記抽出された培地画像に対して画像解析を実行し、前記培地に培養された前記コロニーの画像化に用いられているコロニーピクセルを特定して当該コロニーを検出する検出手段と、
を備え、
前記テンプレート画像が、抽出すべき前記培地と同一形状を有する第1領域を含み、
前記第1領域が、前記撮像画像上に当該第1領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を無効化する特性を有するマスク領域であることを特徴とするコロニー検出システム。 An acquisition means for acquiring captured image data as captured image data including a culture medium image in which a culture medium in which a specimen is placed and a colony is cultured is imaged;
Scanning on the captured image based on a template image for specifying the shape of the culture medium, and specifying an area having a predetermined condition as an image portion of the culture medium image, from among the captured images Image extracting means for extracting an image portion of the medium image;
Detecting means for performing image analysis on the extracted medium image, identifying a colony pixel used for imaging the colony cultured in the medium, and detecting the colony;
With
The template image includes a first region having the same shape as the medium to be extracted ;
Colonies detecting said first region, characterized in that it is a mask area that have the property to disable the color feature amount of each pixel of the captured image if the first area on the captured image is superimposed system.
前記テンプレート画像が、前記第1領域の周縁に所定の形状を有する第2領域を更に含み、
前記第2領域が、前記撮像画像上に当該第1領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を有効にする特性を有する領域であり、
前記画像抽出手段が、
各走査位置にて前記第1領域に重畳された領域をマスクしつつ、前記第2領域によって重畳された領域に属する各ピクセルの色特徴量に基づいて、前記撮像画像の中から前記培地画像の画像部分を抽出することを特徴とするコロニー検出システム。 In the colony detection system according to claim 1,
The template image further includes a second region having a predetermined shape on the periphery of the first region ,
The second region is a region having characteristics that enable the color feature amount of each pixel of the captured image when the first region is superimposed on the captured image ,
The image extracting means;
While masking the region superimposed on the first region at each scanning position, based on the color feature amount of each pixel belonging to the region superimposed on the second region, the medium image is selected from the captured images. A colony detection system characterized by extracting an image portion .
前記テンプレート画像が、前記第2領域の外縁に形成された第3領域を含み、
当該第3領域が、前記撮像画像上に当該第3領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を無効化する特性を有するマスク領域である、コロニー検出システム。 In the colony detection system according to claim 2,
The template image includes a third region formed at an outer edge of the second region ;
The colony detection system, wherein the third region is a mask region having a characteristic of invalidating a color feature amount of each pixel of the captured image when the third region is superimposed on the captured image.
前記取得手段が、前記培地の種別を示す種別情報を取得し、
前記画像抽出手段が、前記取得された種別情報に基づいて、複数の前記テンプレート画像の中から一のテンプレート画像を選択し、当該選択したテンプレート画像を用いて前記培地画像を抽出する、コロニー検出システム。 In the colony detection system of any one of Claims 1-3,
The acquisition means acquires type information indicating the type of the medium,
The colony detection system, wherein the image extraction unit selects one template image from the plurality of template images based on the acquired type information, and extracts the culture medium image using the selected template image .
前記画像抽出手段が、前記種別情報に基づいて前記撮像画像から前記培地画像が形成されていると想定される探索領域を決定し、当該決定した探索領域内について前記選択したテンプレート画像を走査することによって前記培地画像を抽出する、コロニー検出システム。 In the colony detection system according to claim 4,
The image extracting means determines a search area where the medium image is assumed to be formed from the captured image based on the type information, and scans the selected template image within the determined search area. A colony detection system that extracts the medium image by
前記取得手段が、前記培地の種別を示す種別情報を取得し、
前記画像抽出手段が、前記種別情報に基づいて前記撮像画像から前記培地画像が形成されていると想定される探索領域を決定し、当該決定した探索領域内について前記テンプレート画像を走査することによって前記培地画像を抽出する、コロニー検出システム。 In the colony detection system of any one of Claims 1-3,
The acquisition means acquires type information indicating the type of the medium,
The image extraction means determines a search area where the culture medium image is assumed to be formed from the captured image based on the type information, and scans the template image within the determined search area. Colony detection system that extracts media images.
前記検出手段が、
前記抽出された培地画像を構成するピクセルの色に関する色特徴量をそれぞれ抽出する特徴量抽出手段と、
前記抽出された各ピクセルの色特徴量に基づいて、前記コロニーを画像化するために用いられているコロニーピクセルを特定する特定手段と、
前記特定されたコロニーピクセルに基づいて、前記培地に培養された前記コロニーを検出するコロニー検出手段と、
を含むことを特徴とするコロニー検出システム。 In the colony detection system of any one of Claims 1-6,
The detection means is
Feature quantity extraction means for extracting color feature quantities relating to the colors of pixels constituting the extracted medium image;
Identifying means for identifying a colony pixel used to image the colony based on the color feature of each extracted pixel;
Based on the identified colony pixels, colony detection means for detecting the colonies cultured in the medium;
A colony detection system comprising:
前記取得手段が、前記培地の種別を示す種別情報を取得し、
前記特定手段が、前記抽出された各ピクセルの色特徴量とともに前記取得された種別情報に基づいて、前記コロニーピクセルを特定する、コロニー検出システム。 In the colony detection system according to claim 7,
The acquisition means acquires type information indicating the type of the medium,
The colony detection system in which the specifying unit specifies the colony pixel based on the acquired type information together with the extracted color feature amount of each pixel.
前記取得手段が、前記培地の種別を示す種別情報を取得し、
前記コロニー検出手段が、前記特定されたコロニーピクセルとともに、前記取得された種別情報に基づいて、前記培地に培養された前記コロニーを検出する、コロニー検出システム。 In the colony detection system according to claim 7 or 8,
The acquisition means acquires type information indicating the type of the medium,
The colony detection system in which the colony detection unit detects the colonies cultured in the medium based on the acquired type information together with the identified colony pixels.
前記検出されたコロニーに関する情報を培地情報としてデータベースに登録する登録手段を更に備える、コロニー検出システム。 In the colony detection system of any one of Claims 1-9,
A colony detection system further comprising registration means for registering information on the detected colonies as culture medium information in a database.
検体を載置してコロニーを培養する培地が画像化された培地画像を含む撮像画像のデータを撮像画像データとして取得する取得手段、
前記培地の形状を特定するためのテンプレート画像に基づいて前記撮像画像上を走査し、予め定められた条件を有する領域を前記培地画像の画像部分として特定することによって、前記撮像画像の中から前記培地画像の画像部分を抽出する画像抽出手段、及び
前記抽出された培地画像に対して画像解析を実行し、前記培地に培養された前記コロニーの画像化に用いられているコロニーピクセルを特定して当該コロニーを検出する検出手段、
として機能させ
前記テンプレート画像が、抽出すべき前記培地と同一形状を有する第1領域を含み、
前記第1領域が、前記撮像画像上に当該第1領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を無効化する特性を有するマスク領域であることを特徴とするプログラム。 Computer
An acquisition means for acquiring captured image data as captured image data including a culture medium image in which a culture medium in which a specimen is placed and a colony is cultured is imaged;
Scanning on the captured image based on a template image for specifying the shape of the culture medium, and specifying an area having a predetermined condition as an image portion of the culture medium image, from among the captured images Image extracting means for extracting an image portion of the medium image, and performing image analysis on the extracted medium image to identify a colony pixel used for imaging the colonies cultured in the medium Detection means for detecting the colony;
The template image includes a first region having the same shape as the medium to be extracted ,
The program first region, characterized in that it is a mask area that have the characteristics to disable the color feature amount of each pixel of the captured image if the first area on the captured image is superimposed.
前記テンプレート画像が、前記第1領域の周縁に所定の形状を有する第2領域を更に含み、
前記第2領域が、前記撮像画像上に当該第1領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を有効にする特性を有する領域であり、
前記画像抽出手段が、
各走査位置にて前記第1領域に重畳された領域をマスクしつつ、前記第2領域によって重畳された領域に属する各ピクセルの色特徴量に基づいて、前記撮像画像の中から前記培地画像の画像部分を抽出する、プログラム。 The program according to claim 11,
The template image further includes a second region having a predetermined shape on the periphery of the first region ,
The second region is a region having characteristics that enable the color feature amount of each pixel of the captured image when the first region is superimposed on the captured image ,
The image extracting means;
While masking the region superimposed on the first region at each scanning position, based on the color feature amount of each pixel belonging to the region superimposed on the second region, the medium image is selected from the captured images. A program that extracts image parts .
前記テンプレート画像が、前記第2領域の外縁に形成された第3領域を含み、
当該第3領域が、前記撮像画像上に当該第3領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を無効化する特性を有する領域である、プログラム。 The program according to claim 12,
The template image includes a third region formed at an outer edge of the second region ;
The program, wherein the third region is a region having a characteristic of invalidating a color feature amount of each pixel of the captured image when the third region is superimposed on the captured image.
前記培地の形状を特定するためのテンプレート画像に基づいて前記撮像画像上を走査し、予め定められた条件を有する領域を前記培地画像の画像部分として特定することによって、前記撮像画像の中から前記培地画像の画像部分を抽出する画像抽出工程と、
前記抽出された培地画像に対して画像解析を実行し、前記培地に培養された前記コロニーの画像化に用いられているコロニーピクセルを特定して当該コロニーを検出する検出工程と、
を含み、
前記テンプレート画像が、抽出すべき前記培地と同一形状を有する第1領域を含み、
前記第1領域が、前記撮像画像上に当該第1領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を無効化する特性を有するマスク領域であることを特徴とするコロニー検出方法。 An acquisition step of acquiring, as captured image data, data of a captured image including a culture medium image in which a culture medium in which a specimen is placed and a colony is cultured is imaged;
Scanning on the captured image based on a template image for specifying the shape of the culture medium, and specifying an area having a predetermined condition as an image portion of the culture medium image, from among the captured images An image extraction step of extracting an image portion of the medium image;
A detection step of performing image analysis on the extracted medium image, identifying a colony pixel used for imaging the colony cultured in the medium, and detecting the colony;
Including
The template image includes a first region having the same shape as the medium to be extracted ;
The colony detection method, wherein the first region is a mask region having a characteristic of invalidating a color feature amount of each pixel of the captured image when the first region is superimposed on the captured image. .
前記テンプレート画像が、
前記テンプレート画像が、前記第1領域の周縁に所定の形状を有する第2領域を更に含み、
前記第2領域が、前記撮像画像上に当該第1領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を有効にする特性を有する領域であり、
前記画像抽出手段が、
各走査位置にて前記第1領域に重畳された領域をマスクしつつ、前記第2領域によって重畳された領域に属する各ピクセルの色特徴量に基づいて、前記撮像画像の中から前記培地画像の画像部分を抽出する、コロニー検出方法。 In the colony detection method according to claim 14,
The template image is
Said template image, further to include a second region having a predetermined shape on the periphery of the first region,
The second region is a region having characteristics that enable the color feature amount of each pixel of the captured image when the first region is superimposed on the captured image ,
The image extracting means;
While masking the region superimposed on the first region at each scanning position, based on the color feature amount of each pixel belonging to the region superimposed on the second region, the medium image is selected from the captured images. A colony detection method for extracting an image portion .
前記テンプレート画像が、前記第2領域の外縁に形成された第3領域を含み、
当該第3領域が、前記撮像画像上に当該第3領域が重畳された場合に当該撮像画像の各ピクセルの色特徴量を無効化する特性を有する領域である、コロニー検出方法。 In the colony detection method of Claim 15,
The template image includes a third region formed at an outer edge of the second region ;
The colony detection method, wherein the third region is a region having a characteristic of invalidating a color feature amount of each pixel of the captured image when the third region is superimposed on the captured image.
前記画像抽出処理手段が、前記決定した探索領域内について前記テンプレート画像を走査する際に、当該テンプレート画像を撮像画像上に重畳させた各走査位置と、当該各走査位置に隣接する探索領域上の走査位置と、における当該テンプレート画像によって特定される撮像画像上の所定領域の色特徴量の関係に基づいて、前記探索領域内の走査範囲を制限しつつ、前記テンプレート画像を走査することによって前記培地画像を抽出する、コロニー検出システム。 In the colony detection system according to claim 5 or 6,
When the image extraction processing unit scans the template image within the determined search area, each scan position where the template image is superimposed on the captured image, and a search area adjacent to each scan position The medium is scanned by scanning the template image while limiting the scanning range in the search region based on the relationship between the scanning position and the color feature amount of the predetermined region on the captured image specified by the template image. Colony detection system that extracts images.
前記画像抽出処理手段が、水平走査又は垂直走査におけるテンプレート画像を撮像画像上に重畳させた各走査位置と、直前の走査位置を基準にテンプレート画像を撮像画像上に重畳させた各走査位置と、における当該テンプレート画像によって特定される撮像画像上の所定領域の色特徴量の関係に基づいて、前記探索領域を制限する、コロニー検出システム。 The colony detection system according to claim 17,
The image extraction processing means, each scanning position where the template image in horizontal scanning or vertical scanning is superimposed on the captured image, each scanning position where the template image is superimposed on the captured image based on the immediately preceding scanning position, The colony detection system which restrict | limits the said search area | region based on the relationship of the color feature-value of the predetermined area | region on the captured image specified by the said template image in.
前記画像抽出処理手段が、前記テンプレート画像を撮像画像上に重畳させた特定の走査位置と、当該特定の走査位置に隣接する複数の走査位置と、における当該テンプレート画像によって特定される撮像画像上の所定領域の色特徴量の関係に基づいて、前記探索領域を制限する、コロニー検出システム。 The colony detection system according to claim 17,
The image extraction processing unit is on a captured image specified by the template image at a specific scanning position where the template image is superimposed on the captured image and a plurality of scanning positions adjacent to the specific scanning position. The colony detection system which restrict | limits the said search area | region based on the relationship of the color feature-value of a predetermined area | region.
前記画像抽出処理手段が、任意の単一の水平走査ライン又は垂直走査において、当該テンプレート画像を撮像画像上に重畳させた各走査位置と、当該各走査位置に隣接する探索領域上の走査位置と、における当該テンプレート画像によって特定される撮像画像上の所定領域の色特徴量の関係に基づいて、水平走査又は垂直走査を行うための前記探索領域の範囲を特定し、当該特定した範囲に水平走査又は垂直走査を制限しつつ、前記テンプレート画像を走査することによって前記培地画像を抽出する、コロニー検出システム。 The colony detection system according to claim 17,
The image extraction processing means includes, in any single horizontal scanning line or vertical scanning, each scanning position where the template image is superimposed on the captured image, and a scanning position on a search area adjacent to each scanning position. The range of the search area for performing horizontal scanning or vertical scanning is specified based on the relationship between the color feature amounts of the predetermined area on the captured image specified by the template image in, and the horizontal scanning is performed in the specified range. Or the colony detection system which extracts the said culture medium image by scanning the said template image, restrict | limiting vertical scanning.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2015224220A JP6497300B2 (en) | 2014-03-31 | 2015-11-16 | Colony detection system, colony detection method, and program |
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2014074941 | 2014-03-31 | ||
JP2014074941 | 2014-03-31 | ||
JP2014137101 | 2014-07-02 | ||
JP2014137101 | 2014-07-02 | ||
JP2015224220A JP6497300B2 (en) | 2014-03-31 | 2015-11-16 | Colony detection system, colony detection method, and program |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2015074345A Division JP5904295B2 (en) | 2014-03-31 | 2015-03-31 | Colony detection system, colony detection method, and program |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2016028606A JP2016028606A (en) | 2016-03-03 |
JP2016028606A5 true JP2016028606A5 (en) | 2016-04-14 |
JP6497300B2 JP6497300B2 (en) | 2019-04-10 |
Family
ID=55352178
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2015074345A Active JP5904295B2 (en) | 2014-03-31 | 2015-03-31 | Colony detection system, colony detection method, and program |
JP2015224220A Active JP6497300B2 (en) | 2014-03-31 | 2015-11-16 | Colony detection system, colony detection method, and program |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2015074345A Active JP5904295B2 (en) | 2014-03-31 | 2015-03-31 | Colony detection system, colony detection method, and program |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (2) | JP5904295B2 (en) |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5904295B2 (en) * | 2014-03-31 | 2016-04-13 | 大日本印刷株式会社 | Colony detection system, colony detection method, and program |
JP7092463B2 (en) * | 2016-03-31 | 2022-06-28 | 株式会社フコク | MFD inspection support system and inspection method using MFD |
WO2018061131A1 (en) * | 2016-09-28 | 2018-04-05 | オリンパス株式会社 | Cell status assessment device |
JP7319407B2 (en) * | 2018-04-04 | 2023-08-01 | 株式会社日立ハイテク | Bacteriological test device and bacteriological test method |
JP7032216B2 (en) * | 2018-04-04 | 2022-03-08 | 株式会社日立ハイテク | Bacterial test equipment and bacterial test method |
CN112119313B (en) * | 2018-07-23 | 2024-04-05 | 株式会社岛津制作所 | Microfluidic device viewing apparatus |
Family Cites Families (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH0755429A (en) * | 1993-08-17 | 1995-03-03 | Toshiba Corp | Position recognition system |
JP3175518B2 (en) * | 1995-01-31 | 2001-06-11 | 株式会社日立製作所 | Microbial monitoring device |
US7298885B2 (en) * | 2002-11-27 | 2007-11-20 | 3M Innovative Properties Company | Biological growth plate scanner with automated image processing profile selection |
JP3883124B2 (en) * | 2003-12-05 | 2007-02-21 | 独立行政法人理化学研究所 | Template matching processing method and processing apparatus in image processing |
JP4635651B2 (en) * | 2005-03-08 | 2011-02-23 | パナソニック株式会社 | Pattern recognition apparatus and pattern recognition method |
JP4821279B2 (en) * | 2005-11-11 | 2011-11-24 | 株式会社ニコン | Incubator |
JP2009122859A (en) * | 2007-11-13 | 2009-06-04 | Toyota Motor Corp | Object detector |
JP5418324B2 (en) * | 2010-03-16 | 2014-02-19 | 大日本印刷株式会社 | Image processing apparatus, image processing method, program, and storage medium |
JP2012173725A (en) * | 2011-02-24 | 2012-09-10 | Nikon Corp | Image generation device and microscope device |
EP2889366A4 (en) * | 2012-08-23 | 2016-04-27 | Dainippon Printing Co Ltd | Culture medium information registration system, colony detection device, program, and health management system |
WO2014030673A1 (en) * | 2012-08-23 | 2014-02-27 | 大日本印刷株式会社 | Culture-medium information registration system, health management system, and program |
JP2015154718A (en) * | 2014-02-19 | 2015-08-27 | 学校法人 埼玉医科大学 | Colony-counting apparatus, colony-counting method, and colony-counting program |
JP5904295B2 (en) * | 2014-03-31 | 2016-04-13 | 大日本印刷株式会社 | Colony detection system, colony detection method, and program |
-
2015
- 2015-03-31 JP JP2015074345A patent/JP5904295B2/en active Active
- 2015-11-16 JP JP2015224220A patent/JP6497300B2/en active Active
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2016028606A5 (en) | ||
US9349062B2 (en) | Character recognition method and device | |
CN104794421B (en) | A kind of positioning of QR codes and recognition methods | |
JP2018525746A5 (en) | ||
JP2018198053A5 (en) | ||
WO2016107478A1 (en) | Vehicle chassis inspection method and system | |
US10453195B2 (en) | Method of detecting tissue area of interest in digital pathology imaging by executing computer-executable instructions stored on a non-transitory computer-readable medium | |
RU2009102124A (en) | VIDEO INFORMATION PROCESSING DEVICE FOR ALARM SYSTEM | |
JP2014203038A5 (en) | ||
US10699423B2 (en) | Registration of tissue slice image | |
JP2019134269A5 (en) | ||
JP2011183483A5 (en) | ||
CN101009755B (en) | Watermarked image generation apparatus and method, watermarked image analysis apparatus | |
CN104268853A (en) | Infrared image and visible image registering method | |
US20170011512A1 (en) | Cell recognition device, method, and program | |
US20160180198A1 (en) | System and method for determining clutter in an acquired image | |
JP2016027444A5 (en) | ||
CN103699876B (en) | Method and device for identifying vehicle number based on linear array CCD (Charge Coupled Device) images | |
CN107220972B (en) | A kind of quality of poultry eggs discrimination method based on infrared image | |
JP2013102425A5 (en) | Image processing apparatus and image processing method | |
JP6326622B2 (en) | Human detection device | |
Deng et al. | A new measuring method of wool fiber diameter based on image processing | |
JP4675055B2 (en) | Marker processing method, marker processing apparatus, program, and recording medium | |
DK2901415T3 (en) | PROCEDURE FOR IDENTIFICATION OF CELLS IN A BIOLOGICAL Tissue | |
JPWO2021112205A5 (en) |